JP7663492B2 - 細胞透過性ペプチド - Google Patents
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Description
少なくとも4アミノ酸残基をそれぞれ含む2つ以上のカチオン性ドメインと、
少なくとも3アミノ酸残基をそれぞれ含む1つまたは複数の疎水性ドメイン
を含む、40アミノ酸残基以下の全長を有するペプチドであって、
人工アミノ酸残基を含まないペプチドが提供される。
本発明者らは、治療用分子を細胞に送達するための細胞透過性ペプチドとしての使用に適する一連のペプチドを生成した。
本発明は、人工アミノ酸残基が存在しない特定の構造を有する短い細胞透過性ペプチドに関する。
少なくとも4アミノ酸残基をそれぞれ含む2つ以上のカチオン性ドメインと、
少なくとも3アミノ酸残基をそれぞれ含む1つまたは複数の疎水性ドメイン
を含む、40アミノ酸残基以下の全長を有するペプチドであって、
少なくとも1つのカチオン性ドメインがヒスチジン残基を含むペプチドが提供される。
本発明は、ある特定の長さを有する少なくとも2つのカチオン性ドメインが存在する特定の構造を有する短い細胞透過性ペプチドに関する。
本発明は、ある特定の長さを有する少なくとも1つの疎水性ドメインが存在する特定の構造を有する短い細胞透過性ペプチドに関する。
本発明は、病状の処置における治療用カーゴ分子の輸送で使用するための短い細胞透過性ペプチドに関する。
[カチオン性ドメイン]-[疎水性ドメイン]-[カチオン性ドメイン]。
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本発明のペプチドは、コンジュゲートを提供するため、治療用分子に共有結合され得る。
[ペプチド]-[リンカー]-[治療用分子]。
[ペプチド]-[リンカー]-[治療用分子]。
本発明のコンジュゲートは、医薬組成物に製剤化することができる。
本発明のペプチドを含むコンジュゲートは、疾患を処置するための医薬として使用することができる。
本発明のペプチドは、任意の標準のタンパク質合成方法、例えば、化学合成、半化学合成によって、または発現系の使用を介して、生成することができる。
1.1 P-PMO合成および調製
9-フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)保護L-アミノ酸、ベンゾトリアゾール-1-イル-オキシ-トリス-ピロリジノ-ホスホニウム(PyBOP)、2-(1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HBTU)、およびFmoc-β-Ala-OHがプレローディングされているWang樹脂(0.19または0.46mmol・g-1)は、Merck(Hohenbrunn、Germany)から入手した。HPLCグレードのアセトニトリル、メタノールおよび合成グレードのN-メチル-2-ピロリドン(NMP)は、Fisher Scientific(Loughborough、UK)から購入した。ペプチド合成グレードのN,N-ジメチルホルムアミド(DMF)およびジエチルエーテルは、VWR(Leicestershire、UK)から入手した。ピペリジンおよびトリフルオロ酢酸(TFA)は、Alfa Aesar(Heysham、England)から入手した。PMOは、Gene Tools Inc.(Philomath、USA)から購入した。ニワトリ胚抽出物およびウマ血清は、Sera Laboratories International Ltd(West Sussex、UK)から入手した。インターフェロンは、Roche Applied Science(Penzberg、Germany)から入手した。全ての他の試薬は、別段の記述がない限り、Sigma-Aldrich(St.Louis、MO、USA)から入手した。MALDI-TOF質量分析は、Voyager DE Pro BioSpectrometryワークステーションを使用して行った。水中50%アセトニトリル中の10mg・mL-1のα-シアノ-4-ヒドロキシ桂皮酸またはシナピン酸の保存液を鋳型として使用した。エラーバーは、±0.1%である。
a)ペプチド変異体のライブラリーの調製
ペプチドは、Fmoc-β-Ala-OHがプレローディングされているWang樹脂(0.19もしくは0.46mmol・g-1、Merck Millipore)を使用して、標準的なFmoc化学を適用し、製造業者の推奨手順に従うことにより、Intavis Parallel Peptide Synthesizerを使用して10μmolスケールで調製するか、またはCEM Liberty Blue(商標)Peptide Synthesizer(Buckingham、UK)を使用して100μmolスケールで調製した。Intavis Parallel Peptide Synthesizerを使用して合成する場合、PyBOP/NMMカップリング混合物での二重カップリングステップを使用し、続いて、それぞれのステップ後に無水酢酸のキャッピングを行った。CEM Liberty Blue Peptide Synthesizerを使用する場合、二重カップリングによって行ったアルギニンを除いて、全てのアミノ酸に対して一本鎖カップリングを実行した。カップリングは、それぞれ2回カップリングしたアルギニン残基を除いて、1回、75℃で5分間、60ワットのマイクロ波出力で行った。それぞれの脱保護反応は、75℃で2回、1回は30秒間、次いで3分間、35ワットのマイクロ波出力で行った。合成が完了したら、樹脂をDMF(3×50mL)で洗浄し、固相結合ペプチドのN末端をDIPEAの存在下、室温で、無水酢酸でアセチル化した。N末端のアセチル化後、ペプチド樹脂をDMF(3×20mL)およびDCM(3×20mL)で洗浄した。トリフルオロ酢酸(TFA):H2O:トリイソプロピルシラン(TIPS)(95%:2.5%:2.5%:3~10mL)からなる切断カクテルでの3時間、室温での処理により、ペプチドを固体支持体から切断した。ペプチド放出後、過剰なTFAを窒素でのスパージングにより除去した。粗ペプチドを冷ジエチルエーテル(合成規模に依存して15~40mL)の添加および3200rpmで5分間の遠心分離により沈殿させた。粗ペプチドペレットを、3回、冷ジエチルエーテル(3×15mL)で洗浄し、445-LC Scale-upモジュールと440-LCフラクションコレクターとを取り付けたVarian 940-LC HPLC Systemを使用してRP-HPLCにより精製した。0.1%TFA/H2O中のCH3CNの線形勾配を使用して15mL・分-1の流速でRP-C18カラム(10×250mm、Phenomenex Jupiter)を用いて半分取HPLCによりペプチドを精製した。検出は、220nmおよび260nmで行った。所望のペプチドを含有する画分を併せ、凍結乾燥させて、ペプチドを白色固体として得た。
表1:N末端アセチル化およびC末端ベータ-アラニンリンカーを有する、実施例で試験するために合成したペプチド。Pip9b2およびR6Glyは、比較ペプチドである。R6Glyは、C末端グリシンをリンカーとして使用する。
マウスジストロフィン第23番エクソンの25-mer PMOアンチセンス配列(GGCCAAACCTCGGCTTACCTGAAAT(配列番号90))を使用した。ペプチドをそのC末端カルボキシル基によってPMOの3’末端にコンジュゲートした。これは、ペプチドに対して2.3当量のDIPEA、およびDMSOに溶解したPMOに対して2.5倍過剰のペプチドの存在下、NMP中の2.3および2当量のPyBOPおよびHOAtをそれぞれ使用して達成した。少数の例では、ペプチドのC末端カルボキシル基の活性化のために2.3当量のHBTUをPyBOPの代わりに使用した。一般に、N-メチルピロリドン(NMP、80μL)中のペプチド(2500nmol)の溶液に、PyBOP(NMP中0.3Mの19.2μL)、(16.7μLの0.3M NMP)中のHOAt、DIPEA(1.0μL)、およびPMO(DMSO中10mMの100μL)を添加した。混合物を2.5時間、40℃で放置し、H2O(300μL)中の0.1%TFAの添加により反応を停止させた。この溶液を、改造Gilson HPLCシステムを使用してイオン交換クロマトグラフィーにより精製した。20%CH3CNを含有するリン酸ナトリウム緩衝剤(25mM、pH7.0)中の塩化ナトリウム(0~1M)の線形勾配を使用して4mL・分-1の流速でイオン交換カラム(Resource S 4mL、GE Healthcare)を用いてPMO-ペプチドコンジュゲートを精製した。所望のペプチドを含有する画分を併せ、凍結乾燥させて、ペプチド-PMO誘導体を白色固体として得た。ペプチド-PMOコンジュゲートからの過剰な塩の除去は、イオン交換後に回収した画分を、Amicon(登録商標)ultra-15 3K遠心式フィルターデバイスを使用して濾過することにより行った。コンジュゲートを凍結乾燥させ、MALDI-TOFにより分析した。使用前に、コンジュゲートを滅菌水に溶解し、0.22μm酢酸セルロース膜に通して濾過した。ペプチド-PMOの濃度は、0.1N HCl溶液中のコンジュゲートの265nmでのモル吸収により判定した。(収率については表2を参照されたい)。
表2.細胞培養分析のためのP-PMOコンジュゲートの収率(収率は、凍結乾燥させた精製ppmoの乾燥重量に基づく。P-PMOの純度は、220nmおよび260nmで順相HPLCにより確認して95%より高い。(a)P-PMOは、PyBOPの代わりにHBTU活性化を使用して合成した)。
マウスH2k mdx筋芽細胞を、ゼラチン(0.01%)被覆フラスコ内で20%熱不活性化ウシ胎仔血清(FBS Gold、PAA laboratories)と、2%ニワトリ胚抽出物(Seralab)と、1%ペニシリン-ストレプトマイシン-ネオマイシン抗生物質混合物(PSN、Gibco)と、3pg/μLのγ-インターフェロン(Roche)とを補充したダルベッコ変性イーグル培地(DMEM PPA laboratories)において10%CO2下、33℃で培養した。細胞をゼラチン(0.01%)被覆24ウェルプレートに2×105細胞/mLの密度で播種し、2日間、33℃、10%CO2で放置した。筋管への分化後、5%ウマ血清(Sigma)と1%PSNとを補充したDMEMにおいて37℃で、5%CO2下、2日間細胞をさらに増殖させた。
無血清Opti-MEM中で作製した、上記の通り調製したペプチド-PMOコンジュゲートとともに、細胞をインキュベートし、350μLをそれぞれのウェルに二重反復で添加し、37℃で4時間インキュベートした。次いで、トランスフェクション培地を、5%ウマ血清と1%PSNとを補充したDMEMで置換し、細胞をさらに20時間、37℃でインキュベートした。細胞をPBSで洗浄し、0.5mLのTRI RNA(Sigma)単離試薬をそれぞれのウェルに添加した。細胞を-80℃で1時間、凍結させた。
全細胞RNAを、TRI試薬を使用して抽出し、エタノールでの追加のさらなる沈殿を行った。精製されたRNAを、Nanodrop(登録商標)ND-1000(Thermo Scientific)を使用して定量した。OneStep RT-PCR Kit(Roche、Indianapolis、USA)を使用するRT-PCRの鋳型として、RNA(400ng)を使用した。プライマー配列については、表4を参照されたい。最初の逆転写のサイクル条件は、30分間50℃および7分間94℃を1サイクル、その後、20秒間94℃、40秒間55℃および80秒間68℃を30サイクルであった。1マイクロリットルのRT-PCR産物を第2のPCRステップの鋳型として使用した。0.5UのSuperTAQを使用して、94℃で30秒間、55℃で1分間および72℃で1分間での25サイクルで、増幅を行った。1.5%アガロースゲルを使用して電気泳動により産物を分離した。アガロースゲルの画像をMolecular Imager ChemiDoc(商標)XRS+イメージングシステム(BioRad、UK)で撮影し、Image Lab(V4.1)を使用して画像を解析した。Microsoft Excelを使用してエクソンスキッピングアッセイデータを解析してプロットし、少なくとも3回の独立した実験からの第23番エクソンスキッピングのパーセンテージとして表した。
a)ペプチド変異体の合成
CEM Liberty Blue(商標)マイクロ波Peptide Synthesizer(Buckingham、UK)およびFmoc化学を製造業者の推奨手順に従って使用して、ペプチドを100μmol規模で合成した。使用した側鎖保護基は、トリフルオロ酢酸処理に対して不安定であり、DIPEAの存在下、PyBOP(5倍過剰)を使用して活性化させた5倍過剰のFmoc保護アミノ酸(0.25mmol)を使用してペプチドを合成した。ピペリジン(DMF中20% v/v)を使用して、N-Fmoc保護基を除去した。カップリングは、それぞれ2回カップリングしたアルギニン残基を除いて、1回、75℃で5分間、60ワットのマイクロ波出力で行った。それぞれの脱保護反応は、75℃で2回、1回は30秒間、次いで1回は3分間、35ワットのマイクロ波出力で行った。合成が完了したら、樹脂をDMF(3×50mL)で洗浄し、固相結合ペプチドのN末端をDIPEAの存在下、室温で、無水酢酸でアセチル化した。N末端のアセチル化後、ペプチド樹脂をDMF(3×20mL)およびDCM(3×20mL)で洗浄した。トリフルオロ酢酸(TFA):H2O:トリイソプロピルシラン(TIPS)(95%:2.5%:2.5%、10mL)からなる切断カクテルでの3時間、室温での処理により、ペプチドを固体支持体から切断した。過剰なTFAを窒素でのスパージングにより除去した。切断されたペプチドを氷冷ジエチルエーテルの添加によって沈殿させ、3000rpmで5分間、遠心分離した。粗ペプチドペレットを、3回、冷ジエチルエーテル(3×40mL)で洗浄し、445-LC Scale-upモジュールと440-LCフラクションコレクターとを取り付けたVarian 940-LC HPLC Systemを使用してRP-HPLCにより精製した。0.1%TFA/H2O中のCH3CNの線形勾配を使用して15mL・分-1の流速でRP-C18カラム(10×250mm、Phenomenex Jupiter)を用いて半分取HPLCによりペプチドを精製した。検出は、220nmおよび260nmで行った。
マウスジストロフィン第23番エクソンの25-mer PMOアンチセンス配列(GGCCAAACCTCGGCTTACCTGAAAT(配列番号90))を使用した。ペプチドをそのC末端カルボキシル基によってPMOの3’末端にコンジュゲートした。これは、ペプチドに対して2.3当量のDIPEA、およびDMSOに溶解したPMOに対して2.5倍過剰のペプチドの存在下、NMP中の2.3および2倍当量のPyBOPおよびHOAtをそれぞれ使用して達成した。少数の例では、ペプチドのC末端カルボキシル基の活性化のためにHBTU(2.3当量)をPyBOPの代わりに使用した。一般に、N-メチルピロリドン(NMP、100μL)中のペプチド(10μmol)の溶液に、PyBOP(NMP中0.3Mの76.6μL)、(66.7μLの0.3M NMP)中のHOAt、DIPEA(4.0μL)、およびPMO(DMSO中10mMの400μL)を添加した。混合物を2時間、40℃で放置し、0.1%TFA(1mL)の添加により反応を停止させた。20%CH3CNを含有するリン酸ナトリウム緩衝剤(25mM、pH7.0)中の塩化ナトリウム(0~1M)の線形勾配を使用して6mL・分-1の流速でカチオン交換クロマトグラフィーカラム(Resource S 6mL column、GE Healthcare)を用いて反応物を精製した。ペプチド-PMOコンジュゲートからの過剰な塩の除去は、イオン交換後に回収した画分を、Amicon(登録商標)ultra-15 3K遠心式フィルターデバイスを使用して濾過することにより行った。コンジュゲートを凍結乾燥させ、MALDI-TOFにより分析した。使用前に、コンジュゲートを滅菌水に溶解し、0.22μm酢酸セルロース膜に通して濾過した。ペプチド-PMOの濃度は、0.1N HCl溶液中のコンジュゲートの265nmでのモル吸収により判定した。全収率(表3)は、PMOに基づいて25~36%であった。
表3.in vivoでの分析のためにより大きい規模で合成したP-PMOコンジュゲートの収率(収率は、凍結乾燥させた精製ppmoの乾燥重量に基づく。PPMOの純度は、220nmおよび260nmで順相HPLCにより確認して95%より高い。(a)PPMOは、PyBOPの代わりにHBTU活性化を使用して合成した)。
実験は、University of OxfordのBiomedical Sciences UnitにおいてHome Office Project Licence authorisationのもとで施設内倫理審査に従って行った。マウスを最小疾患施設で飼育し、環境を12時間の昼夜サイクルで温度制御した。動物は、市販の齧歯動物用固形飼料および水を自由に摂取した。
単回投与後のジストロフィン修復期間を評定するために、筋肉の3分の1(TAおよび横隔膜について)または7μm厚の横断凍結切片(心臓について)を300μlの緩衝剤(50mM Tris pH8、150mM NaCl、1%NP40、0.5%デオキシコール酸ナトリウム、10%SDSおよびプロテアーゼ/ホスファターゼ阻害剤)に溶解した後、10分間、13000rpmで遠心分離した(Heraeus、#3325B)。上清を回収し、100℃で3分間、加熱した。BCA法によりタンパク質を定量し、40μgタンパク質/試料をNuPage 3~8%Tris酢酸塩ゲルで以前に記載された(19)ように分離した。タンパク質を、孔径0.45μmのPVDF膜に1時間、30Vで、その後、1時間100Vで転写し、モノクローナル抗ジストロフィン(1:200、NCL-DYS1、Novocastra)および抗ビンキュリン(ローディング対照、1:100000、hVIN-1、Sigma)抗体で以前に記載された(37)ようにプローブした。二次抗体IRDye 800CWヤギ抗マウスを1:20000の希釈で使用した(LiCOR)。
ペプチド-PMOで処理した骨格筋および心臓組織を用いて、マウスDmd転写物からの第23番エクソンのエクスクルージョンの定量を行った。手短に述べると、均質化された組織からTrizolに基づく抽出法を使用してRNAを抽出し、ランダムプライマーを使用してcDNAを合成した。プライマー/プローブは、Integrated DNA Technologiesによって合成され、非スキップ産物を表す第23~24番エクソンにわたる領域を増幅するように設計された(mDMD23-24、表4を参照されたい)または第22番エクソンと第24番エクソンの境界にわたるプローブを使用して第23番エクソンを欠いている転写物を特異的に増幅するように設計された(mDMD22-24)。既知の転写物量を使用して作成した標準曲線に対してそれぞれの転写物レベルを較正し、[スキップ]/[スキップ+非スキップ]によりスキッピングパーセンテージを導出した。
表4:ネステッドRT-PCR法または定量的RT-PCR法による第23番エクソンスキッピングの定量のためのプライマーおよびプローブ配列
8~10週齢のメスC57BL/6マウスに0.9%食塩水中のペプチド-PMOの単一用量30mg/kgを尾静脈へのボーラス静脈内注射により投与した。投与後2日目および7日目に、代謝ケージ(Tecniplast、UK)に20時間収容した後、冷却条件下で尿を非侵襲的に採取した。7日目の剖検時に頸静脈から血清を採取し、前脛骨筋、横隔膜および心臓組織も採取した。
ここで提供する結果は、細胞内でのエクソンスキッピング活性においてここで生成したペプチド-PMOコンジュゲートの明らかな用量応答効果を実証する(図1、2および12)。これらの図は、DPEP1およびDPEP3系の全て、すなわち本発明のペプチドが、治療上の使用の考慮に足る細胞内への十分な細胞透過有効性を有することも強調する。
P-PMO合成および調製
9-フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)保護L-アミノ酸、ベンゾトリアゾール-1-イル-オキシ-トリス-ピロリジノ-ホスホニウム(PyBOP)、2-(1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HBTU)、およびFmoc-β-Ala-OHがプレローディングされているWang樹脂(0.19または0.46mmol・g-1)は、Merck(Hohenbrunn、Germany)から入手した。1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール(HOAt)は、Sigma-Aldrichから入手した。HPLCグレードのアセトニトリル、メタノールおよび合成グレードのN-メチル-2-ピロリドン(NMP)は、Fisher Scientific(Loughborough、UK)から購入した。ペプチド合成グレードのN,N-ジメチルホルムアミド(DMF)およびジエチルエーテルは、VWR(Leicestershire、UK)から入手した。ピペリジンおよびトリフルオロ酢酸(TFA)は、Alfa Aesar(Heysham、England)から入手した。PMOは、Gene Tools Inc.(Philomath、USA)から購入した。全ての他の試薬は、別段の記述がない限り、Sigma-Aldrich(St.Louis、MO、USA)から入手した。MALDI-TOF質量分析は、Voyager DE Pro BioSpectrometryワークステーションを使用して行った。水中50%アセトニトリル中の10mg・mL-1のα-シアノ-4-ヒドロキシ桂皮酸またはシナピン酸の保存液を鋳型として使用した。エラーバーは、±0.1%である。
a)ペプチド変異体のライブラリーの調製
ペプチドは、Fmoc-β-Ala-OHがプレローディングされているWang樹脂(0.19もしくは0.46mmol・g-1、Merck Millipore)を使用して、標準的なFmoc化学を適用し、製造業者の推奨手順に従うことにより、Intavis Parallel Peptide Synthesizerを使用して10μmolスケールで調製するか、またはCEM Liberty Blue(商標)Peptide Synthesizer(Buckingham、UK)を使用して100μmolスケールで調製した。Intavis Parallel Peptide Synthesizerを使用して合成する場合、PyBOP/NMMカップリング混合物での二重カップリングステップを使用し、続いて、それぞれのステップ後に無水酢酸のキャッピングを行った。CEM Liberty Blue Peptide Synthesizerを使用する場合、二重カップリングによって行ったアルギニンを除いて、全てのアミノ酸に対して一本鎖カップリングを実行した。カップリングは、それぞれ2回カップリングしたアルギニン残基を除いて、1回、75℃で5分間、60ワットのマイクロ波出力で行った。それぞれの脱保護反応は、75℃で2回、1回は30秒間、次いで3分間、35ワットのマイクロ波出力で行った。合成が完了したら、樹脂をDMF(3×50mL)で洗浄し、固相結合ペプチドのN末端をDIPEAの存在下、室温で、無水酢酸でアセチル化した。N末端のアセチル化後、ペプチド樹脂をDMF(3×20mL)およびDCM(3×20mL)で洗浄した。トリフルオロ酢酸(TFA):H2O:トリイソプロピルシラン(TIPS)(95%:2.5%:2.5%:3~10mL)からなる切断カクテルでの3時間、室温での処理により、ペプチドを固体支持体から切断した。ペプチド放出後、過剰なTFAを窒素でのスパージングにより除去した。粗ペプチドを冷ジエチルエーテル(合成規模に依存して15~40mL)の添加および3200rpmで5分間の遠心分離により沈殿させた。粗ペプチドペレットを、3回、冷ジエチルエーテル(3×15mL)で洗浄し、445-LC Scale-upモジュールと440-LCフラクションコレクターとを取り付けたVarian 940-LC HPLC Systemを使用してRP-HPLCにより精製した。0.1%TFA/H2O中のCH3CNの線形勾配を使用して15mL・分-1の流速でRP-C18カラム(10×250mm、Phenomenex Jupiter)を用いて半分取HPLCによりペプチドを精製した。検出は、220nmおよび260nmで行った。所望のペプチドを含有する画分を併せ、凍結乾燥させて、ペプチドを白色固体として得た(収率について表5を参照されたい)。
表5:N末端アセチル化(Ac)、C末端β-アラニンリンカー(B)を有する、実施例で試験するために合成したペプチド。S*は、グルコシル化セリン残基である。DPEP5.7、Pip9b2、およびPip6aは、比較ペプチドである。
別名[CAG]7として公知のトリプレットリピート配列(CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG(配列番号107))の21-mer PMOアンチセンス配列を使用した。ペプチドをそのC末端カルボキシル基によってPMOの3’末端にコンジュゲートした。これは、2.5当量のDIPEA、およびDMSOに溶解したPMOに対して2.5倍過剰のペプチドの存在下、NMP中の2.5および2当量のPyBOPおよびHOAtをそれぞれ使用して達成した。一般に、N-メチルピロリドン(NMP、80μL)中のペプチド(2500nmol)の溶液に、PyBOP(NMP中0.3Mの19.2μL)、(16.7μLの0.3M NMP)中のHOAt、DIPEA(1.0mL)、およびPMO(DMSO中10mMの180μL)を添加した。混合物を2.5時間、40℃で放置し、H2O(300μL)中の0.1%TFAの添加により反応を停止させた。この溶液を、改造Gilson HPLCシステムを使用してイオン交換クロマトグラフィーにより精製した。20%CH3CNを含有するリン酸ナトリウム緩衝剤(25mM、pH7.0)の線形勾配を使用してイオン交換カラム(Resource S 4mL、GE Healthcare)を用いてPMO-ペプチドコンジュゲートを精製した。塩化ナトリウム溶液(1M)を使用してコンジュゲートをカラムから4mL・分-1または6mL・分-1のどちらかの流速で溶出した。所望の化合物を含有する画分を併せ、直ちに脱塩した。ペプチド-PMOコンジュゲートからの過剰な塩の除去は、イオン交換後に回収した画分を、Amicon(登録商標)ultra-15 3K遠心式フィルターデバイスを使用して濾過することにより行った。コンジュゲートを凍結乾燥させ、MALDI-TOFにより分析した。使用前に、コンジュゲートを滅菌水に溶解し、0.22μm酢酸セルロース膜に通して濾過した。ペプチド-PMOの濃度は、0.1N HCl溶液中のコンジュゲートの265nmでのモル吸収により判定した。(収率については表6を参照されたい)。
表6.細胞培養分析およびin vivoでの実験のためのP-PMOコンジュゲートの収率(収率は、凍結乾燥させた精製P-PMOの乾燥重量に基づく。P-PMOの純度は、220nmおよび260nmで順相HPLCにより確認して95%より高い。
前記の通りにペプチドを合成し、PMOにコンジュゲートした。CUG/CTG伸長リピート(5’-CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG-3’(配列番号107))を標的とするPMO配列は、Gene Tools LLCから購入した。これを本明細書の他の箇所では[CAG]7 PMOと呼ぶ。
健常個体または2600のCTGリピートを有するDM1患者からの不死化筋芽細胞を、20%FBS(Life technologies)と、50μg/mlのゲンタマイシン(Life technologies)と、25μg/mlのフェチュインと、0.5ng/mlのbFGFと、5ng/mlのEGFと、0.2μg/mlのデキサメタゾン(Sigma-Aldrich)とを補充した、M199:DMEMの混合物(1:4比、Life technologies)からなる増殖培地で培養した。コンフルエントな細胞培養物を、筋芽細胞用の5μg/mlのインスリン(Sigma-Aldrich)を補充したDMEM培地に切替えることにより、筋分化を誘導した。処理のために、WTまたはDM1細胞を4日間、分化させた。次いで、培地を、1、2、5、10、20または40μM濃度のペプチド-PMOコンジュゲートを含有する新鮮分化培地と交換した。処理の48時間後に分析のために細胞を回収した。ヒト肝細胞への40uMのまたはヒト筋芽細胞への1、2、5、10、20もしくは40μM濃度のペプチド-PMOのトランスフェクションの2日後に、ヒト肝細胞およびヒト筋芽細胞における細胞生存率を、蛍光ベースアッセイ(Promega)を使用して定量した。
マウス組織の場合:RNA抽出前に、FastprepシステムおよびLysing Matrix Dチューブ(MP biomedicals)を使用してTriReagent(Sigma-Aldrich)で筋肉を破壊した。ヒト細胞の場合:RNA抽出前に、細胞をプロテインキナーゼK緩衝剤(500mM NaCl、10mM Tris-HCl、pH7.2、1.5mM MgCl2、10mM EDTA、2%SDSおよび0.5mg/mlのプロテインキナーゼK)に45分間、55℃で溶解した。TriReagentを製造業者のプロトコールに従って使用して全RNAを単離した。合計20μLのM-MLV第1鎖合成系(Life Technologies)を製造業者の使用説明書に従って使用して、1マイクログラムのRNAを逆転写した。その後、1マイクロリットルのcDNA調製物を半定量的PCR分析において標準プロトコール(ReddyMix、Thermo Scientific)に従って使用した。それぞれの遺伝子について線形増幅範囲内で25~35サイクルのPCR増幅を行った。PCR産物を1.5~2%アガロースゲルで分離し、臭化エチジウム染色し、ImageJソフトウェアで定量した。エクソンインクルージョン率を、アイソフォームシグナルの全強度に対するインクルージョンのパーセンテージとして定量した。プライマーを次の表7に示す。
表7:PCR用のプライマー
上のセクション1.10で説明したように毒物学評定を行った。
処置したDM1患者由来の筋肉細胞(筋芽細胞)は、DPEP1または3ペプチド-[CAG]7PMOコンジュゲートが特異的に突然変異型CUGexp-DMPK転写物を標的として、スプライシング欠陥および筋ジストロフィーの原因となる、核RNA病巣によるMBNL1スプライシング因子の有害な隔離およびその結果としてのMBNL1機能低下を抑止することを示した。DPEP1/3ペプチド-[CAG]7PMOコンジュゲートは、細胞を透過し、高い有効性でスプライシング正常化を誘導する(図13)。いわゆる「DPEP1およびDPEP3」ペプチドのこれらの新規生成は、CAG7リピートアンチセンスオリゴヌクレオチドPMOとコンジュゲートしたときin vitroでスプライシング欠陥を修正する高い有効性を示した。これは、DM1の処置のための治療に使用できる可能性があることを示す。
Claims (18)
- 式
[カチオン性ドメイン]-[疎水性ドメイン]-[カチオン性ドメイン]
[ここで、カチオン性ドメインは、RBRRBRR(配列番号1)、RBRBR(配列番号2)、RBRR(配列番号3)、RBRRBR(配列番号4)、RRBRBR(配列番号5)、RBRRB(配列番号6)、BRBR(配列番号7)、RBHBH(配列番号8)、HBHBR(配列番号9)、RBRHBHR(配列番号10)、RBRBBHR(配列番号11)、RBRRBH(配列番号12)、HBRRBR(配列番号13)、HBHBH(配列番号14)、BHBH(配列番号15)、BRBSB(配列番号16)、BRB[Hyp]B(配列番号17)、R[Hyp]H[Hyp]HB(配列番号18)、R[Hyp]RR[Hyp]R(配列番号19)(ここで、Bはβ-アラニンであり、[Hyp]はヒドロキシプロリンである)から選ばれるアミノ酸配列からなり;及び疎水性ドメインは、YQFLI(配列番号20)、FQILY(配列番号21)、ILFQY(配列番号22)、FQIY(配列番号23)、WWW,WWPWW(配列番号24)、WPWW(配列番号25)、WWPW(配列番号26)から選ばれるアミノ酸配列からなる]で表される、細胞透過性ペプチド。 - 細胞透過性ペプチドがN末端でN-アセチル化されている、請求項1に記載の細胞透過性ペプチド。
- 配列:RBRRBRRFQILYRBRBR(配列番号27)、RBRRBRFQILYRRBRBR(配列番号29)、RBRBRFQILYRBRRBRR(配列番号30)、RBRRBRRYQFLIRBRBR(配列番号31)、RBRRBRRILFQYRBRBR(配列番号32)、RBRRBRFQILYRBRBR(配列番号33)、RBRRBRFQILYBRBR(配列番号35)、RBRRBFQILYRBRBR(配列番号36)、RBRRBRRFQILYRBHBH(配列番号37)、RBRRBRRFQILYHBHBR(配列番号38)、RBRRBRRYQFLIRBHBH(配列番号40)、RBRRBRRILFQYRBHBH(配列番号41)、RBRHBHRFQILYRBRBR(配列番号42)、RBRRBRFQILYRBHBH(配列番号44)、RBRRBRWWWBRBR(配列番号104)、及びRBRRBRWWPWWBRBR(配列番号105)の1つからなる、請求項1又は2に記載の細胞透過性ペプチド。
- 配列RBRRBRRFQILYRBRBR(配列番号27)からなる請求項1~3のいずれかに記載の細胞透過性ペプチド。
- RBRRBRFQILYRBHBH(配列番号44)からなる請求項1~3のいずれかに記載の細胞透過性ペプチド。
- RBRRBRFQILYBRBR(配列番号35)からなる請求項1~3のいずれかに記載の細胞透過性ペプチド。
- アンチセンスオリゴヌクレオチドに共有結合されている請求項1~6のいずれかに記載の細胞透過性のペプチドを含んでなる、コンジュゲート。
- さらにリンカーを含み、前記リンカーが細胞透過性ペプチドをアンチセンスオリゴヌクレオチドに連結する、請求項7に記載のコンジュゲート。
- リンカーがG、BC、XC、C、GGC、BBC、BXC、XBC、X、XX、B、BB、BX及びXBから選択される、請求項8に記載のコンジュゲート。
- 医薬としての使用のための請求項7~9のいずれかに記載のコンジュゲート。
- 筋神経系又は筋骨格系の疾患、筋神経系又は筋骨格系の遺伝疾患、筋神経系又は筋骨格系の遺伝性遺伝疾患、又は筋神経系又は筋骨格系の遺伝性X連鎖遺伝疾患の治療における医薬としての使用のための請求項10に記載のコンジュゲート。
- デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)の治療における医薬としての使用のための請求10又は11に記載のコンジュゲート。
- アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ジストロフィン遺伝子におけるエクソンスキッピングを誘導するための配列からなるものである、請求項10に記載のコンジュゲート。
- アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ジストロフィン遺伝子の単一エクソンのエクソンスキッピングを誘導するための配列からなるものである、請求項10に記載のコンジュゲート。
- エクソンがジストロフィン遺伝子のエクソン45、51、又は53である、請求項13又は14に記載のコンジュゲート。
- アンチセンスオリゴヌクレオチドに共有結合された細胞透過性ペプチドを含んでなるコンジュゲートであって、前記細胞透過性ペプチドが、配列:RBRRBRRFQILYRBRBR(配列番号27)、RBRRBRRYQFLIRBRBR(配列番号31)、RBRRBRRILFQYRBRBR(配列番号32)、RBRRBRFQILYBRBR(配列番号35)、RBRRBRRFQILYRBHBH(配列番号37)、RBRRBRRFQILYHBHBR(配列番号38)、RBRRBRFQILYRBHBH(配列番号44)の1つからなり、前記コンジュゲートは、筋神経系又は筋骨格系の疾患、筋神経系又は筋骨格系の遺伝疾患、筋神経系又は筋骨格系の遺伝性遺伝疾患、又は筋神経系又は筋骨格系の遺伝性X連鎖遺伝疾患の治療における使用のためのものである、コンジュゲート。
- さらにリンカーを含み、前記リンカーが細胞透過性ペプチドをアンチセンスオリゴヌクレオチドに連結する、請求項16に記載のコンジュゲート。
- 疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)である、請求項16又は17に記載のコンジュゲート。
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| BR112021010982A2 (pt) | 2018-12-07 | 2021-08-31 | Oxford University Innovation Limited | Ligantes |
| CA3211038A1 (en) | 2021-02-12 | 2022-08-18 | Oxford University Innovation Limited | Cell-penetrating peptide conjugates and methods of their use |
| US20240200062A1 (en) * | 2021-03-12 | 2024-06-20 | Pepgen Inc. | Methods of treating duchenne muscular dystrophy using peptide-oligonucleotide conjugates |
| GEAP202416440A (en) * | 2021-06-23 | 2024-04-25 | Entrada Therapeutics Inc | Antisense compounds and methods for targeting cug repeats |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2011523557A (ja) | 2008-06-04 | 2011-08-18 | メディカル リサーチ カウンシル | ペプチド |
| WO2013030569A2 (en) | 2011-08-30 | 2013-03-07 | Michael John Gait | Peptides |
| JP2013531988A (ja) | 2010-06-14 | 2013-08-15 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | 細胞透過性ペプチドおよびその使用 |
| WO2015022504A2 (en) | 2013-08-12 | 2015-02-19 | Medical Research Council | Peptide conjugates |
Family Cites Families (62)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA2328457A1 (en) | 1998-06-20 | 1999-12-29 | Washington University | Membrane-permeant peptide complexes for medical imaging, diagnostics, and pharmaceutical therapy |
| IL127773A0 (en) | 1998-12-28 | 1999-10-28 | Yeda Res & Dev | Saccharide conjugates and pharmaceutical compositions comprising them |
| SE0201863D0 (en) | 2002-06-18 | 2002-06-18 | Cepep Ab | Cell penetrating peptides |
| US9740817B1 (en) | 2002-10-18 | 2017-08-22 | Dennis Sunga Fernandez | Apparatus for biological sensing and alerting of pharmaco-genomic mutation |
| AU2003225410A1 (en) | 2003-03-21 | 2004-10-11 | Academisch Ziekenhuis Leiden | Modulation of exon recognition in pre-mrna by interfering with the secondary rna structure |
| DE602004028930D1 (de) | 2003-04-29 | 2010-10-14 | Avi Biopharma Inc | Zusammensetzungen zur verbesserung der antisense-wirksamkeit und des transports von nukleinsäureanalog in zellen |
| DE602004027936D1 (de) | 2003-10-29 | 2010-08-12 | Sonus Pharmaceutical Inc | Tocopherolmodifizierte therapeutische arzneimittelverbindung |
| EP2206781B1 (en) | 2004-06-28 | 2015-12-02 | The University Of Western Australia | Antisense oligonucleotides for inducing exon skipping and methods of use thereof |
| US7838657B2 (en) | 2004-12-03 | 2010-11-23 | University Of Massachusetts | Spinal muscular atrophy (SMA) treatment via targeting of SMN2 splice site inhibitory sequences |
| EP1857548A1 (en) | 2006-05-19 | 2007-11-21 | Academisch Ziekenhuis Leiden | Means and method for inducing exon-skipping |
| IE20060565A1 (en) | 2006-07-28 | 2008-02-06 | Eurand Pharmaceuticals Ltd | Drug delivery system based on regioselectively amidated hyaluronic acid |
| US20080311040A1 (en) | 2007-03-06 | 2008-12-18 | Flagship Ventures | METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVED THERAPEUTIC EFFECTS WITH siRNA |
| US20080306001A1 (en) | 2007-04-04 | 2008-12-11 | Anzelika Liik | Transcriptional modulation of extracellular matrix (ecm) of dermal fibroblasts |
| US20100016215A1 (en) | 2007-06-29 | 2010-01-21 | Avi Biopharma, Inc. | Compound and method for treating myotonic dystrophy |
| AU2008271050B2 (en) | 2007-06-29 | 2014-11-06 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Tissue specific peptide conjugates and methods |
| ES2639852T3 (es) | 2007-10-26 | 2017-10-30 | Academisch Ziekenhuis Leiden | Medios y métodos para contrarrestar los trastornos musculares |
| WO2009102075A1 (en) | 2008-02-13 | 2009-08-20 | Kao Corporation | Method for producing hippocastanaceae plant seed extract |
| US20110130346A1 (en) | 2008-05-30 | 2011-06-02 | Isis Innovation Limited | Peptide conjugates for delvery of biologically active compounds |
| US8084601B2 (en) | 2008-09-11 | 2011-12-27 | Royal Holloway And Bedford New College Royal Holloway, University Of London | Oligomers |
| EP2762567B1 (en) | 2008-10-24 | 2016-07-13 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Multiple exon skipping compositions for DMD |
| PT2344637E (pt) | 2008-10-27 | 2015-03-23 | Academisch Ziekenhuis Leiden | Métodos e meios para o salto eficiente do exão 45 no pré-mrna de distrofia muscular de duchenne |
| US20110269665A1 (en) | 2009-06-26 | 2011-11-03 | Avi Biopharma, Inc. | Compound and method for treating myotonic dystrophy |
| PL2499249T3 (pl) | 2009-11-12 | 2019-03-29 | Univ Western Australia | Cząsteczki antysensowne i sposoby leczenia patologii |
| EP2394665A1 (en) | 2010-06-14 | 2011-12-14 | F. Hoffmann-La Roche AG | Cell-penetrating peptides and uses therof |
| KR101900770B1 (ko) | 2010-07-19 | 2018-09-20 | 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 | 근육긴장성 이영양증-단백질 키나제(dmpk) 발현의 조절 방법 |
| TWI541024B (zh) | 2010-09-01 | 2016-07-11 | 日本新藥股份有限公司 | 反義核酸 |
| JP6069212B2 (ja) | 2010-12-02 | 2017-02-01 | ビオノール イミュノ エーエスBionor Immuno As | ペプチド骨格設計 |
| WO2012090150A2 (en) | 2010-12-27 | 2012-07-05 | Compugen Ltd | New cell-penetrating peptides and uses thereof |
| US9161948B2 (en) | 2011-05-05 | 2015-10-20 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Peptide oligonucleotide conjugates |
| CN103619356B (zh) | 2011-05-05 | 2017-09-12 | 萨勒普塔医疗公司 | 肽寡核苷酸缀合物 |
| US9580708B2 (en) | 2011-09-14 | 2017-02-28 | Rana Therapeutics, Inc. | Multimeric oligonucleotides compounds |
| CA2869283A1 (en) | 2012-06-26 | 2014-01-03 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Cell penetrating peptides & methods of identifying cell penetrating peptides |
| CA2884677C (en) | 2012-09-13 | 2020-06-23 | Universite De Geneve | Cell penetrating peptides derived from the epstein barr virus, compositions and methods thereof |
| EP2895200B1 (en) | 2012-09-14 | 2019-11-06 | Translate Bio MA, Inc. | Multimeric oligonucleotide compounds |
| JP6404219B2 (ja) | 2012-09-25 | 2018-10-10 | ジェンザイム・コーポレーション | 筋強直性ジストロフィーを治療するためのペプチド結合モルホリノアンチセンスオリゴヌクレオチド |
| NZ631132A (en) | 2013-03-14 | 2017-06-30 | Sarepta Therapeutics Inc | Exon skipping compositions for treating muscular dystrophy |
| PT3094728T (pt) | 2014-01-16 | 2022-05-19 | Wave Life Sciences Ltd | Desenho quiral |
| EP3099797B1 (en) | 2014-01-30 | 2019-08-21 | F. Hoffmann-La Roche AG | Poly oligomer compound with biocleavable conjugates |
| US10119140B2 (en) | 2014-04-18 | 2018-11-06 | Board Of Regents Of The Nevada System Of Higher Education On Behalf Of The University Of Nevada, Reno | Methods for enhancing or decreasing the levels of MIR124 and MIR29 in subjects with muscular dystrophy |
| RU2708237C2 (ru) | 2014-08-22 | 2019-12-05 | Общество с ограниченной ответственностью "НооГен" | Модифицированные олигонуклеотиды и способ их получения |
| GB201421379D0 (en) | 2014-12-02 | 2015-01-14 | Isis Innovation Ltd And Medical Res Council | Molecule |
| EP3034074A1 (en) | 2014-12-18 | 2016-06-22 | Universitat De València, Estudi General | Compound for treatment of myotonic dystrophy type 1 |
| CA2981705A1 (en) | 2015-03-23 | 2016-09-29 | Riptide Bioscience, Inc. | Antimicrobial peptides and methods of use thereof |
| CN115300640A (zh) | 2015-08-10 | 2022-11-08 | 杭州多禧生物科技有限公司 | 新型连接体及其用于药物和生物分子的特异性偶联 |
| US10858410B2 (en) | 2015-08-12 | 2020-12-08 | Arizona Board Of Regents On Behalf Of The University Of Arizona | Glycosylated peptides with pseudoproline residues and having enhanced half-lives and ability to cross the blood brain barrier |
| BR112018007066A2 (pt) | 2015-10-09 | 2018-10-23 | Sarepta Therapeutics Inc | composições e métodos para tratamento da distrofia muscular de duchene e distúrbios relacionados |
| DK3463308T3 (da) | 2016-06-01 | 2022-01-31 | Servier Ip Uk Ltd | Formuleringer af polyalkylenoxid-asparaginase og fremgangsmåder til fremstilling og anvendelse deraf |
| CN110392583B (zh) | 2016-09-15 | 2023-01-03 | 加利福尼亚大学董事会 | 改进的杂化的末端树枝状聚合物 |
| WO2018150196A1 (en) | 2017-02-17 | 2018-08-23 | Oxford University Innovation Limited | Cell penetrating peptides modified by glycosylation |
| JP2020536058A (ja) | 2017-09-28 | 2020-12-10 | サレプタ セラピューティクス, インコーポレイテッド | 筋ジストロフィーを処置するための併用療法 |
| EP3687519A1 (en) | 2017-09-28 | 2020-08-05 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Combination therapies for treating muscular dystrophy |
| EP3687547A1 (en) | 2017-09-28 | 2020-08-05 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Combination therapies for treating muscular dystrophy |
| GB201812980D0 (en) | 2018-08-09 | 2018-09-26 | Univ Oxford Innovation Ltd | Cell-penetrating peptides |
| GB201812972D0 (en) | 2018-08-09 | 2018-09-26 | Univ Oxford Innovation Ltd | Cell-penetrating peptides |
| BR112021010982A2 (pt) | 2018-12-07 | 2021-08-31 | Oxford University Innovation Limited | Ligantes |
| EP3955966A1 (en) | 2019-04-18 | 2022-02-23 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Compositions for treating muscular dystrophy |
| WO2020257489A1 (en) | 2019-06-19 | 2020-12-24 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Methods for treating muscular dystrophy |
| EP3997228A4 (en) | 2019-07-09 | 2024-05-15 | The Governors of the University of Alberta | SKIP OF EXONS 45 TO 55 USING MUTATION-ADAPTED COCKTAILS, OF ANTISENS MORPHOLINOS, IN THE DMD GENE |
| GB201911403D0 (en) | 2019-08-09 | 2019-09-25 | Univ Oxford Innovation Ltd | Conjugate and uses thereof |
| CA3211038A1 (en) | 2021-02-12 | 2022-08-18 | Oxford University Innovation Limited | Cell-penetrating peptide conjugates and methods of their use |
| US20240200062A1 (en) | 2021-03-12 | 2024-06-20 | Pepgen Inc. | Methods of treating duchenne muscular dystrophy using peptide-oligonucleotide conjugates |
| EP4304657A2 (en) | 2021-03-12 | 2024-01-17 | Pepgen Inc. | Methods of treating myotonic dystrophy type 1 using peptide-oligonucleotide conjugates |
-
2018
- 2018-08-09 GB GBGB1812972.6A patent/GB201812972D0/en not_active Ceased
-
2019
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-
2025
- 2025-04-04 JP JP2025062268A patent/JP2025106403A/ja active Pending
- 2025-11-10 AU AU2025263913A patent/AU2025263913A1/en active Pending
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2011523557A (ja) | 2008-06-04 | 2011-08-18 | メディカル リサーチ カウンシル | ペプチド |
| JP2013531988A (ja) | 2010-06-14 | 2013-08-15 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | 細胞透過性ペプチドおよびその使用 |
| WO2013030569A2 (en) | 2011-08-30 | 2013-03-07 | Michael John Gait | Peptides |
| WO2015022504A2 (en) | 2013-08-12 | 2015-02-19 | Medical Research Council | Peptide conjugates |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2020030927A1 (en) | 2020-02-13 |
| AU2025263913A1 (en) | 2025-12-18 |
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| IL280678A (en) | 2021-03-25 |
| GB201812972D0 (en) | 2018-09-26 |
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