JP7652705B2 - Btn2に対する特異性を有する抗体及びその使用 - Google Patents
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Description
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する特性、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する特性、
iii.NK細胞の活性化を、直接誘発する特性、
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する特性
のうちの少なくとも1つを呈する抗体を提示する。
マクロファージの表現型及び機能性を、炎症促進性M1マクロファージへとシフトさせることにより、抗腫瘍性微小環境を優先的にもたらすことから、炎症促進性サイトカインの分泌をもたらすこと、及び/又は
NK細胞の活性化を、直接誘発し、これにより、それらの細胞溶解活性を、さらに強化すること
が可能である。
(i)配列番号19のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、(ii)配列番号20のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む参照マウス抗体である、mAb 101G5、又は
(i)配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む参照マウス抗体である、mAb 107G3
のうちのいずれか1つと競合する。
配列番号17の65、68、69、72、78、84、85、95、97、100位、又は
配列番号17の212、213、218、220、224、229位
に位置するアミノ酸残基を含むエピトープ
に結合する。
配列番号3を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号4を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号5を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号6を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号7を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号8を含む、軽鎖可変領域であるCDR3、又は
配列番号21を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号22を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号23を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号24を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号25を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号26を含む、軽鎖可変領域であるCDR3
を含む。
配列番号1のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域、又は
配列番号19のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び20のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含む。
Vγ9Vδ2 T細胞からの、細胞溶解性分子の分泌を活性化させる特性、
Vγ9Vδ2 T細胞の細胞溶解機能を活性化させる特性、及び/又は
Vγ9Vδ2 T細胞の増殖を活性化させる特性
のうちの少なくとも1つをさらに呈する。
配列番号3を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号4を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号5を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号6を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号7を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号8を含む、軽鎖可変領域であるCDR3、又は
配列番号1のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域、又は
配列番号1のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含みうる。
定義
本明細書で使用される、「BTN2」という用語は、当技術分野における、その一般的な意味を有し、配列番号17のBTN2A1又は配列番号18のBTN2A2を含む、ヒトBTN2ポリペプチドを指す。
MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAVDVVLDPDTAHPDLFLSEDRRSVRRCPFRHLGESVPDNPERFDSQPCVLGRESFASGKHYWEVEVENVIEWTVGVCRDSVERKGEVLLIPQNGFWTLEMHKGQYRAVSSPDRILPLKESLCRVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPRSAFSVPVRPFFRLGCEDSPIFICPALTGANGVTVPEEGLTLHRVGTHQSL
MEPAAALHFSLPASLLLLLLLLLLSLCALVSAQFTVVGPANPILAMVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRITFVSKDINRGSVALVIHNVTAQENGIYRCYFQEGRSYDEAILRLVVAGLGSKPLIEIKAQEDGSIWLECISGGWYPEPLTVWRDPYGEVVPALKEVSIADADGLFMVTTAVIIRDKYVRNVSCSVNNTLLGQEKETVIFIPESFMPSASPWMVALAVILTASPWMVSMTVILAVFIIFMAVSICCIKKLQREKKILSGEKKVEQEEKEIAQQLQEELRWRRTFLHAADVVLDPDTAHPELFLSEDRRSVRRGPYRQRVPDNPERFDSQPCVLGWESFASGKHYWEVEVENVMVWTVGVCRHSVERKGEVLLIPQNGFWTLEMFGNQYRALSSPERILPLKESLCRVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPRSAFTVPVRPFFRLGSDDSPIFICPALTGASGVMVPEEGLKLHRVGTHQSL
MQRQFSKASRPCLPWVLMEPAAALHFSLPASLILLLLLLRLCALVSAQFTVVGPTDPILAMVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALIIHNVTAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLMVAGLGSKPLVEMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGRVVPALKEVFPPDTDGLFMVTTAVIIRDKSMRNMSCSISDTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCVVALPIIVVFLMIIIAVCIYWINRLQKETKILSGEKESERKTREIAVKELKKERVQKEKELQVKEQLQEELRWRRTVLHAVDVVLDPDTAHPDLLLSEDRRSVRRCPLGHLGESVPDNPERFNSEPCVLGRESFASGKHYWEVEVENVIEWTVGVCRDSVERKEEVLLRPRNGFWTLEMCKGQYRALSSPKRILPLKESLCRVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPRLAFSVPVRPFFRIGSDDSPIFICPALTGASGITVPEEGLILHRVGTNQSLMPVGTRCYGHGMRPTGFIRMREERGIHRTTREEREPDMQNFDLGAHWSNNLPSARSREFLNSDLVPDHSLESPVTPGLANKTGEPQAEVTCLCFSLPSSELRAFPSTATNHNHKATALGSDLHIEVKGYEDGGIHLECRSTGWYPQPQIQWSNTKGQHIPAVKAPVVADGVGLYAVAASVIMRGSSGEGVSCIIRNSLLGLEKTASISITDPFFRNAQPWIAALAGTLPISLLLLAGASYFLWRQQKEKIALSRETEREREMKEMGYAATKQEISLRGGEKSLAYHGTHISYLAAPERWEMAVFPNSGLPRCLLTLILLQLPKLDSAPFDVIGPPEPILAVVGEDAELPCRLSPNASAEHLELRWFRKKVSPAVLVHRDGREQEAEQMPEYRGRATLVQDGIAEGRVALRIRGVRVSDDGEYTCFFREDGSYEEALVHLKVAALGSDPHISMQVQENGEIWLECTSVGWYPEPQVQWRTSKGEKFPSTSESRNPDEEGLFTVAASVIIRDTSVKNVSCYIQNLLLGQEKEVEIFIPG
で規定される、配列番号35の配列を有する、カニクイザルBTN2A1オーソログ(cynoBTN2A1;NCBIref.XP_015304392.1)と交差反応する。
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する特性、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する特性、
iii.NK細胞の直接的な活性化を誘発する特性、
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する特性
のうちの少なくとも1つを有することにおいても、さらに特徴づけられる。
M2マクロファージが、その対照アイソタイプと比較して、本開示の抗BTN2A抗体の存在下で発生させられる場合に、少なくとも1つのM1マーカーの著明な増大が観察される場合;及び/又は
M2マクロファージが、その対照アイソタイプなど、その陰性対照と比較して、抗BTN2A抗体の存在下で発生させられる場合に、少なくとも1つのM2マーカーの著明な減少が観察される場合
に、本開示の抗BTN2Aにより誘導される。
M2マクロファージが、その対照アイソタイプなどの陰性対照と比較して、本開示の抗BTN2A抗体の存在下で培養される場合に、少なくとも1つのM2関連サイトカインの分泌の著明な減少が、観察される場合、及び/又は
M2マクロファージが、その対照アイソタイプなどの陰性対照と比較して、本開示の抗BTN2A抗体の存在下で培養される場合に、少なくとも1つのM1関連サイトカインの分泌の著明な増大が、観察される場合
に、本開示の抗BTN2A抗体の作用から生じると考えられうる。
M2関連マーカー(典型的に、CD14及び/又はCD163)の発現について、0.05μg/mL、とりわけ、0.1μg/mL~100μg/mL、とりわけ、50μg/mLの範囲のIC50、及び/又は
M2関連サイトカイン(典型的に、IL-10)の分泌について、0.01μg/mL、とりわけ、0.05μg/mL~100μg/mL、とりわけ、50μg/mL、最も特定すると、0.1~20μg/mLの範囲のIC50
を呈する。
M1関連マーカー(典型的に、CD86及び/又はPDL1)の発現について、0.01μg/mL、とりわけ、0.1μg/mL~100μg/mL、とりわけ、50μg/mL、最も特定すると、1~50μg/mLの範囲のEC50、及び/又は
M1関連サイトカイン(典型的に、TNFα)の分泌について、0.01μg/mL、とりわけ、0.05μg/mL~100μg/mL、とりわけ、50μg/mL、最も特定すると、0.1~10μg/mLの範囲のEC50
を呈する。
M2マクロファージが、その対照アイソタイプと比較して、前記抗BTN2A抗体の存在下で培養される場合に、M1マーカーの著明な増大が観察される場合、及び/又は
M2マクロファージが、その対照アイソタイプなどの陰性対照と比較して、前記抗BTN2A抗体の存在下で培養される場合に、M2マーカーの著明な減少が観察される場合
に、本開示の抗BTN2A抗体により誘導される。
1)BTN2Aに対する特異性を有し、とりわけ、前出で規定された通り、BTN2A1に対する特異性を有する抗体、特に、以下の特性:
典型的に、細胞株、例えば、実施例で記載される通りに、ヒトBTN2A1をコードするプラスミドをトランスフェクトされた、HEK293T細胞株で発現される、ヒトBTN2A1に結合する、より詳細には、50μg/mLを下回り、より詳細には、40μg/mLを下回るEC50で結合するか、又はBTN2A1に、10nM若しくはこれ未満のKDで結合する、及び/或いは約10:1、約20:1、約50:1、約100:1、10.000:1、又はこれを超える、BTN2A1への結合アフィニティーの、非特異的結合と対比した比を有する特性;
BTN3と交差反応しない特性
のうちの少なくとも1つを有する抗体;
並びに
2)さらに、又は代替的に、機能的特性:
Vγ9/Vδ2 T細胞による、細胞溶解性分子(とりわけ、IFN-γ)の産生を活性化させる特性、及び/又は
Vγ9/Vδ2 T細胞の細胞溶解機能を活性化させる特性、及び/又は
Vγ9/Vδ2 T細胞の増殖を活性化させる特性
のうちの1つ又は複数を呈する抗体も包含する。
本明細書で開示される抗体は、参照モノクローナル抗体である、それぞれ、配列番号19及び20で規定される、それぞれのVH領域及びVL領域を含むmAb 101G5と、それぞれ、配列番号1及び2で規定される、それぞれのVH領域及びVL領域を含むmAb 107G3とを含む。
実施例で提示される実験データにより示される通り、参照mAbである、107G3は、ヒトBTN2A1の65、68、69、72、78、84、85、95、97、100位における残基に結合する。したがって、本開示は、配列番号17の60~100位に位置するアミノ酸残基を含むコンフォメーションエピトープに結合し、最も特定すると、配列番号17の65、68、69、72、78、84、85、95、97、100位におけるアミノ酸残基を含むコンフォメーションエピトープに結合し、前出で規定され、下記でさらに想起される機能的特性のうちの1つ又は複数を有する、特に、参照mAbである、107G3の機能的特性のうちの1つ又は複数を有するmAbを包含する。
i.BTN2A1に対する特異性、特に、細胞株、例えば、実施例で記載される通りに、ヒトBTN2A1をコードするプラスミドをトランスフェクトされたHEK-293T BTN2 KO細胞において発現されるヒトBTN2A1への結合の特性、より詳細には、50μg/mLを下回り、より詳細には、40μg/mLを下回るEC50、或いは表面プラズモン共鳴(SPR)(典型的に、25℃で)、又はLuminexアッセイ(実施例で例示される)若しくはオクテット(登録商標)(Abdicheら、2008)により測定される、10nM又はこれ未満のKDを伴う特性、及び/或いは約10:1、約20:1、約50:1、約100:1、10.000:1、又はこれを超えるBTN2A1への結合アフィニティーの、非特異的結合と対比した比を有する特性;並びに/或いは
ii.典型的に、実施例節で例示される通りに評価される、単球の、M2マクロファージへの分極の阻害、及び/又は
iii.典型的に、実施例節で例示される通りに評価される、M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰の誘導、及び/又は
iv.典型的に、実施例節で例示される通りに評価される、NK細胞活性化の直接的な誘発、及び/又は
v.典型的に、実施例節で例示される通りに評価される、NK細胞媒介性細胞傷害作用の増強
からなる群から選択されうる。
vi.典型的に、実施例で例示される通りに評価される、Vγ9/Vδ2 T細胞からの、細胞溶解性分子(例えば、IFNγ又はTNFα)の産生の活性化、
vii.典型的に、実施例で例示される通りに評価される、Vγ9/Vδ2 T細胞の細胞溶解機能の活性化;及び/又は
viii.典型的に、実施例で例示される通りに評価される、Vγ9/Vδ2 T細胞の増殖の活性化
からなる群からさらに選択されうる。
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する特性、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する特性、
iii.NK細胞の直接的な活性化を誘発する特性、
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する特性
のうちの少なくとも1つを呈する、機能的バリアント抗体に関する。
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する特性、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する特性、
iii.NK細胞の直接的な活性化を誘発する特性、
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する特性、
v.Vγ9/Vδ2 T細胞による、IFNγ又はTNFαの産生を活性化させる特性、
vi.Vγ9/Vδ2 T細胞の細胞溶解機能を活性化させる特性、
vii.Vγ9/Vδ2 T細胞の増殖を活性化させる特性
のうちの少なくとも1つを呈する、機能的バリアント抗体にも関する。
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する特性、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する特性、
iii.NK細胞の直接的な活性化を誘発する特性、
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する特性
のうちの少なくとも1つを呈する、機能的バリアント抗体にさらに関する。
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する特性、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する特性、
iii.NK細胞の直接的な活性化を誘発する特性、及び/又は
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する特性、
v.Vγ9/Vδ2 T細胞による、細胞溶解性分子(IFNγ又はTNFα)の産生を活性化させる特性、
vi.Vγ9/Vδ2 T細胞の細胞溶解機能を活性化させる特性、及び/又は、
vii.Vγ9/Vδ2 T細胞の増殖を活性化させる特性
のうちの少なくとも1つを呈する、機能的バリアント抗体にさらに関する。
脂肪族残基:I、L、V、及びM
シクロアルケニル会合残基:F、H、W、及びY
疎水性残基:A、C、F、G、H、I、L、M、R、T、V、W、及びY
負帯電残基:D及びE
極性残基:C、D、E、H、K、N、Q、R、S、及びT
正帯電残基:H、K、及びR
小型残基:A、C、D、G、N、P、S、T、及びV
極小型残基:A、G、及びS
ターンの形成に関与する残基:A、C、D、E、G、H、K、N、Q、R、S、P、及びT
可撓性の残基:Q、T、K、S、G、P、D、E、及びR
の通りに反映されたアミノ酸クラス内の置換により規定されうる。さらなる保存的置換の群分けは、バリン-ロイシン-イソロイシン、フェニルアラニン-チロシン、リシン-アルギニン、アラニン-バリン、及びアスパラギン-グルタミンを含む。バリアントCDRでは、疎水性/親水性特性及び残基の重量/サイズに関する保存もまた、mAb1~mAb6のうちのいずれか1つのCDRと比較して、実質的に保持される。当技術分野では、タンパク質に対する、相互作用的生物学的機能の付与における、アミノ酸の疎水性指数の重要性が、一般に理解されている。アミノ酸の相対疎水性特徴は、結果として得られるタンパク質の二次構造に寄与し、これが、タンパク質の、他の分子、例えば、酵素、基質、受容体、DNA、抗体、抗原などとの相互作用を規定することが受容されている。各アミノ酸は、それらの疎水性及び電荷特徴に基づき、疎水性指数を割り当てられており、これらは、イソロイシン(+4.5);バリン(+4.2);ロイシン(+3.8);フェニルアラニン(+2.8);システイン/シスチン(+2.5);メチオニン(+1.9);アラニン(+1.8);グリシン(-0.4);スレオニン(-0.7);セリン(-0.8);トリプトファン(-0.9);チロシン(-1.3);プロリン(-1.6);ヒスチジン(-3.2);グルタメート(-3.5);グルタミン(-3.5);アスパラギン酸(-3.5);アスパラギン(-3.5);リシン(-3.9);及びアルギニン(-4.5)である。類似する残基の保持はまた、又は代替的に、BLASTプログラム(例えば、標準設定:BLOSUM62、Open Gap=11、及びExtended Gap=1を使用する、NCBIから入手可能な、BLAST 2.2.8)の使用により決定される、類似性スコアによっても測定されうる。適切なバリアントは、典型的に、親ペプチドに対する、少なくとも約80%の同一性を呈する。本開示に従い、第2のアミノ酸配列と、少なくとも約70%の同一性を有する、第1のアミノ酸配列とは、第1の配列が、第2のアミノ酸配列と、70;71;72;73;74;75;76;77;78;79;80;81;82;83;84;85;86;87;88;89;90;91;92;93;94;95;96;97;98;99;又は100%の同一性を有することを意味する。本開示に従い、第2のアミノ酸配列と、少なくとも約50%の同一性を有する、第1のアミノ酸配列とは、第1の配列が、第2のアミノ酸配列と、50;51;52;53;54;55;56;57;58;59;60;61;62;63;64;65;66;67;68;69;70;71;72;73;74;75;76;77;78;79;80;81;82;83;84;85;86;87;88;89;90;91;92;93;94;95;96;97;98;99;又は100%の同一性を有することを意味する。
本明細書で開示される参照mAbである、101G5、又は参照mAbである、107G3の、類似する有利な特性を伴う、さらなる抗体は、標準的なBTN2A1結合アッセイにおいて、上記で記載した、前記参照mAbである、107G3と、統計学的に有意に交差競合する(例えば、この結合を、競合的に阻害する)それらの能力に基づき同定されうる。
i.BTN2A1に対する特異性を有する、特に、細胞株、例えば、実施例で記載される通りに、ヒトBTN2A1をトランスフェクトされたHEK-293T BTN2 KO細胞において発現されるヒトBTN2A1に結合する、より詳細には、50μg/mLを下回り、より詳細には、40μg/mLを下回るEC50、或いは表面プラズモン共鳴(SPR)、又はLuminexアッセイ(実施例で例示される)若しくはオクテット(登録商標)アッセイにより測定される、10nM又はこれ未満のKDで結合する、及び/或いは約10:1、約20:1、約50:1、約100:1、10.000:1、又はこれを超える、BTN2A1への結合アフィニティーの、非特異的結合と対比した比を有する(さらなる詳細についてはまた、上記も参照されたい);並びに/或いは
ii.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する、
iii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する、
iv.NK細胞の直接的な活性化を誘発する、及び/又は
v.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する
単離抗体を提示する。
vi.典型的に、実施例で例示される通りに評価される、Vγ9/Vδ2 T細胞による、細胞溶解性分子(例えば、IFNγ又はTNFα)の産生を活性化させる;及び/又は
vii.典型的に、実施例で例示される通りに評価される、Vγ9/Vδ2 T細胞の細胞溶解機能を活性化させる;及び/又は
viii.典型的に、実施例で例示される通りに評価される、Vγ9/Vδ2 T細胞の増殖を活性化させる。
本開示の抗体は、限定せずに述べると、単独で、又は組合せによる、任意の化学法、生物学法、遺伝子法、又は酵素法など、当技術分野で公知の、任意の技法により作製される。典型的に、所望の配列のアミノ酸配列を知れば、当業者は、ポリペプチドを作製するための標準的な技法により、前記抗体を、たやすく作製することができる。例えば、本開示の抗体は、周知の固相法を使用して、典型的に、市販のペプチド合成装置(Applied Biosystems、Foster City、California製のペプチド合成装置など)を使用し、製造元の指示書に従い合成されうる。代替的に、本開示の抗体は、当技術分野で周知の組換えDNA法により合成されうる。例えば、抗体は、抗体をコードするDNA配列の、発現ベクターへの組込み、及び所望の抗体を発現させる、適切な真核宿主又は原核宿主への、このようなベクターの導入の後における、DNA発現産物としてとして得られ、周知の技法を使用して、これらの宿主から単離されうる。
本明細書で開示される抗体は、上記で記載した態様の、機能的特徴又は構造的特徴のうちの1つ又は複数により特徴づけられる場合もあり、選択された機能的特徴及び構造的特徴の任意の組合せにより特徴づけられる場合もある。
配列番号3を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号4を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号5を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号6を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号7を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号8を含む、軽鎖可変領域であるCDR3、又は
配列番号21を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号22を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号23を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号24を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号25を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号26を含む、軽鎖可変領域であるCDR3
を含む、1つの抗原結合性部分を含みうる。
別の態様では、本開示は、組成物、例えば、薬学的に許容できる担体と併せて製剤化される、本明細書で開示される、少なくとも1種の抗体を含有する医薬組成物を提示する。このような組成物は、上記で記載した抗体のうちの1つ又は組合せ(例えば、2つ又はこれを超える異なる抗体)を含みうる。本明細書で開示される医薬組成物はまた、組合せ療法で、すなわち、他の薬剤と組み合わせても投与されうる。
本開示の抗体は、in vitro及びin vivoにおける、診断的有用性及び治療的有用性を有する。例えば、これらの分子は、様々な障害を処置、防止、又は診断するように、例えば、in vitro、ex vivo、又はin vivoにおいて、培養物における細胞へと投与される場合もあり、例えば、in vivoの対象において投与される場合もある。
治療有効量の、本開示の抗BTN2A1抗体、及び少なくとも1つの第2の原薬の、例えば、共時的であるか、又は逐次的である共投与を含み、前記第2の原薬が、例えば、上記で指し示された、抗ウイルス剤若しくは抗増殖剤若しくは免疫療法剤、又はサイトカイン若しくは細胞療法生成物(γδ T細胞など)である、上記で規定された方法
を提示する。
(a)NK細胞を含む血液細胞、例えば、PBMCを、対象の血液試料から単離するステップと、
(b)NK細胞、任意選択で、他の腫瘍細胞又はアクセサリー細胞を、in vitroの、本明細書で開示される抗BTN2A1の存在下で拡大するステップと、
(c)拡大されたNK細胞を回収するステップと、
(d)任意選択で、拡大されたNK細胞を製剤化し、治療有効量の、前記NK細胞を、対象へと投与するステップと
を含む方法に関する。
(i)前記対象において、有効量の、本明細書で開示される抗BTN2A1抗体を投与するステップと、
(ii)前記対象において、有効量のNK細胞組成物を投与するステップと、
を含み、前記有効量の抗BTN2A1抗体が、前記NK細胞組成物により媒介される、前記腫瘍細胞に対する、抗腫瘍細胞溶解を強化する能力を有する方法に関する。本開示はまた、それを必要とする対象を処置するための方法であって、NK細胞、例えば、CAR NK細胞と、本明細書で開示されるヒト化抗体との組合せ(共時的又は逐次的)投与を含む方法にも関する。
(a)Vγ9/Vδ2 T細胞を含む血液細胞、例えば、PBMCを、対象の血液試料から単離するステップと、
(b)Vγ9/Vδ2 T細胞、任意選択で、他の腫瘍細胞又はアクセサリー細胞を、in vitroの、本明細書で開示される抗BTN2A1の存在下で拡大するステップと、
(c)拡大されたVγ9/Vδ2 T細胞を回収するステップと、
(d)任意選択で、拡大されたVγ9/Vδ2 T細胞を製剤化し、治療有効量の、前記Vγ9/Vδ2 T細胞を、対象へと投与するステップと
を含む方法に関する。
(i)前記対象において、有効量の、本明細書で開示される抗BTN2A1抗体を投与するステップと、
(ii)前記対象において、有効量のγδ T細胞組成物を投与するステップと、
を含み、前記有効量の抗BTN2A1抗体が、前記γδ T細胞組成物により媒介される、前記腫瘍細胞に対する、抗腫瘍細胞溶解を強化する能力を有する方法に関する。本開示はまた、それを必要とする対象を処置するための方法であって、CAR T細胞、例えば、CAR γδ T細胞と、本明細書で開示されるヒト化抗体との組合せ(共時的又は逐次的)投与を含む方法にも関する。
細胞培養物、単球及びNK細胞の分取:
末梢血単核細胞(PBMC)は、地域の血液バンク(Etablissement Francais du Sang(EFS)、Marseille、France)により提供される、健常ドナー(HD)に由来するEDTA(エチレンジアミン四酢酸)バフィーコートから得、密度勾配における遠心分離(Eurobio)により単離した。採取したてのPBMCを、37℃で、5%CO2、10%のウシ胎仔血清(FBS)及び1%のペニシリン/ストレプトマイシン(P/S)を補充した、Roswell Park Memorial Institute培地1640(RPMI;Lonza)において培養した。
6種の異なるMHCの組合せを保有する、48匹のマウスを、組換えヒトBTN2A1-Fc融合タンパク質で免疫化することにより、マウス抗ヒトBTN2A1抗体を作出した。21日後に、マウスから採血し、Luminexアッセイを介して、BTN2A1特異的ポリクローナル抗体の血清力価を決定した。最高のBTN2A1特異的抗体力価を呈するマウスを安楽死させた。陽性選択を介して、脾臓B細胞を単離し、ハイブリドーマを作出するために、骨髄腫細胞とのPEG誘導性融合を施した。
エフェクターVγ9/Vδ2-T細胞は、0日目に始めて、HVに由来するPBMCを、ソレドロネート(Sigma、1μM)、及び組換えヒト(rh)IL-2(プロロイキン、200IU/mL)の存在下で培養することにより確立した。5日目から、rhIL-2を、隔日で補給し、合計15日間にわたり、細胞密度を、1mL当たり1.15×106に保った。最終日に、Vγ9/Vδ2-T細胞の純度を、フローサイトメトリーにより査定した。80%より高値の、Vγ9/Vδ2-T細胞純度に到達した細胞培養物だけを、機能試験において使用される細胞培養物として選択した。精製Vγ9/Vδ2-T細胞は、使用まで凍結させた。
COOH磁気ビーズ(Biorad)を、製造元の指示書に従い、rhBTN2A1タンパク質(R&D)へとコンジュゲートし、ビーズは、使用まで、保管緩衝液(Biorad)において、-20℃で保管した。マウス血清の滴定のために、Luminexアッセイ緩衝液(Nanotool)において、1:50から始めて、希釈段階を1:4とする血清希釈系列を作り、100μLのビーズ懸濁液を、100μLの血清希釈液と混合し、RTで、1時間にわたりインキュベートし、この後、ビーズを、洗浄緩衝液において、3回にわたり洗浄し、Luminexアッセイ緩衝液に、1μg/mLのビオチニル化ヤギ抗マウスIgG-Fcと共にインキュベートし、Luminexアッセイ緩衝液における、さらに3回にわたる洗浄を行った。最後に、ビーズを、Luminexアッセイ緩衝液に、1μg/mLのストレプトアビジンPEと共に、1時間にわたりインキュベートしてから、Luminexリード緩衝液(Nanotool)における、3回にわたる最終的な洗浄を行った。ビーズを、Luminexリード緩衝液に再懸濁させ、Luminex 100/200システムにおいて、データを収集した。ヒットの同定のために、30μLの上清を、96ウェルプレートへと移し、90μLのLuminexアッセイ緩衝液を添加した。100マイクロリットルのビーズ懸濁液を、100μLの上清希釈液と混合し、RTで、16時間にわたりインキュベートしてから、上記で記載したプロトコールへと進んだ。ヒットの同定のために、標的に対するアフィニティーが最高であり、関連しない対照タンパク質(Rank-Fc)に対するアフィニティーが最低であるビーズ懸濁液を選択した。アフィニティー/Kdの計算のために、Luminexアッセイ緩衝液における、40.000pMで始め、希釈段階を1:4とする系列希釈を、ハイブリドーマ上清に施し、上記で記載した通りに解析した。Kdは、対応する結合曲線の中点に対応する。
FlowJo 10.5.3ソフトウェア(FlowJo)を使用する、BD LSRFortessa(BD Biosciences)、CytoFlex LX、又はCytoFlex S(Beckman Coulter)における解析の前に、精製Vγ9Vδ2-T細胞(T細胞又は細胞株)であるPBMCを、指定のmAbと共にインキュベートした。Vγ9Vδ2-T細胞脱顆粒アッセイに使用された抗体は、抗CD107a-FITC(BD Biosciences)、抗CD107b-FITC(BD Biosciences)、抗CD3-PeVio700(Miltenyi)、抗PanTγδ-PE(Miltenyi)、live/dead near IR(Thermofisher)であった。全ての免疫染色は、FcR Block試薬(Miltenyi)、ヤギ抗マウス-PE 1:100(Jackson Immunoresearch)、及びlive/dead near IR(Thermofisher)の存在下で、10μg/mLの精製mAbを使用して実施した。マウス抗ヒトCD277(また、BTN3Aとしても公知である;IgG2aアイソタイプを伴うクローン103.2)については、既に開示された(国際公開第2012/080351号)。抗BTN2A1 mAbの特異性を評価するために、トランスフェクションの24時間後、HEK-293T BTN2 KO細胞(試料1例当たり5×104個)を回収し、上記で記載した通り、表示濃度(5ng/mL~75μg/mL)の抗ヒトBTN2A1 107G3 mAbで染色した。マウスIgG1抗体(Miltenyi)を、染色についてのアイソタイプ対照として使用した。
HVから精製されたVγ9/Vδ2-T細胞を、rhIL-2(200UI/mL)において、一晩にわたり培養した。次いで、Vγ9/Vδ2-T細胞を、37℃で、以下のmAb(表示の通りの、50μLのハイブリドーマ上清又は10μg/mlの精製mAb):抗BTN2A1 mAb、mIgG1(アイソタイプ対照抗体)又はハイブリドーマ培養培地を伴うか、又は伴わずに、表示の標的細胞株(エフェクター:標的(E:T)比を1:1とする)と共に共培養した。イオノマイシン(1μg/mL)を伴う、ホルボール12-ミリステート13-アセテート(PMA、20ng/mL)を、Vγ9/Vδ2-T細胞の活性化についての陽性対照として使用した。第1ラウンドのハイブリドーマ上清スクリーニングのために、培養物上清を、4時間後に回収し、Human IFNγ ELISA set(BD Biosciences)を使用して、Vγ9/Vδ2-T細胞の活性化の指標としての、それらのIFNγ含量について調べた。第2ラウンドのハイブリドーマ上清の特徴づけのために、Vγ9/Vδ2-T細胞脱顆粒を、GolgiStop(BD Biosciences)及び可溶性CD107(a&b)-FITCの存在下における、4時間にわたるインキュベーションにより評価した。4時間後、細胞を回収し、PBSに2%のパラホルムアルデヒドにおいて固定し、FlowJo 10.5.3ソフトウェア(FlowJo)を使用する、CytoFlex LX(Beckman Coulter)において解析した。
抗TCRγδマイクロビーズキット(Miltenyi Biotec)を使用して、Vγ9/Vδ2-T細胞を、健常ドナーのPBMCから単離した。フローサイトメトリーにより評価された、γδ-T細胞の純度は、80%より大きかった。γδ-T細胞を、CellTrace Violetにより、37℃で、20分間にわたり標識付けした。次いで、CellTrace標識付け細胞5×105個を、pAgを伴うか、又は伴わず、精製抗BTN2A1 107G3抗体(10μg/ml)を伴うか、又は伴わない、IL-2(200UI/ml)の存在下にある、96ウェル丸底プレートにおいて培養した。培養の5日後、FlowJo 10.5.3ソフトウェア(FlowJo)を使用する、CytoFlex LX(Beckman Coulter)において、フローサイトメトリーにより、CellTraceの希釈率を査定した。
Vγ9/Vδ2-T細胞脱顆粒について、結果は、平均値±SEMとして表す。精製抗BTN2A1 mAbの、BTN2A1トランスフェクトHEK-293T BTN2 KO細胞に対するEC50は、傾き可変モデルに従う非線形回帰の後における、log(用量)反応曲線に基づき決定した。全ての解析は、GraphPad Prism 7.04ソフトウェア(GraphPad)を使用して実施した。
VH及びVLのシーケンシングの後、上記で記載した、マウスハイブリドーマの作出から得られた、23種の抗BTN2A mAbを、キメラIgG1フォーマット下で作製した。略述すると、マウス抗BTN2A mAbのVH配列及びVK配列を、in vitroにおいて合成し、PrimeSTAR Max DNA Polymerase(タカラバイオ株式会社)を使用するPCRにより増幅した。In Fusionシステム(Clontech)を使用して、PCR生成物を、重鎖及び軽鎖の発現ベクター(MI-mAb)にクローニングし、プラスミドにより、Stellar competent cell(Clontech)を形質転換した。抗BTN2A mAbをバリデーションするために、ベクターシーケンシング(MWG Eurofins)を実施してから、さらなるトランスフェクションのためのプラスミドの、大スケール(maxi)の調製を行った。各抗BTN2Aクローンについて、マッチさせた軽鎖及び重鎖をコードするベクターを、重鎖/軽鎖の比を1:1.2として、HEK-293細胞に、一過性にトランスフェクトし(1mL当たりの細胞2.9×106個)、18時間後に、培地を交換した。トランスフェクションの7日後、mAbの精製のために、培養物上清を採取した。抗体のアフィニティー精製は、Protein A Sepharose Fast Flow(GE Healthcare)により、44℃で、一晩にわたり実施した。結合緩衝液は、0.5Mのグリシン、3MのNaCl、pH8.9であった。溶出は、以下の緩衝液:0.1Mのクエン酸pH3により実施した。1Mのトリス-HCl、pH9(10% v/v)による溶出の直後に、試料を中和した。最後に、キメラ抗BTN2A mAbを、1倍濃度のPBSへと透析し、0.22μMのフィルター(Millex GV hydrophilic PVDF、Millipore)を通して濾過した。キメラ抗BTN2A mAb濃度は、抗体の減衰係数を考慮に入れて、Nanodrop 2000 Spectrophotometer(ThermoScientific)において決定した。mAb単量体の画分により規定される純度は、Acquity UPLC-HClass Bio(Waters)を、Acquity UPLC Protein-BEH-200A、1.7μm、4.6×50mmカラム(Waters)と共に使用する、UPLC-SECにより決定した。抗体の質量は、逆相カラム(PLRP-S 4000 A、5μm、50×2.1 mm(Agilent technologies)を使用する、Xevo G2-S Q-Tof質量分析計(Waters)において決定した。全ての試料は、37℃で、PNGase F glycosidase(New England Biolabs)による脱グリコシル化の後で解析した。予測外の質量が見出された場合は、バイオインフォマティックスツールを使用して、一次アミノ酸配列を解析して、Fab領域内の、推定グリコシル化部位を同定した。精製抗体に対するSDS-PAGEは、無染色型のMini protean TGX gel 4-15(Biorad)による、最終素材の断片化及び/又は凝集の検出を可能とした。内毒素レベルは、ClarioStar分光光度計(BMG Labtech)を使用する、Chromogenic LAL Limulus Amebocyte lysate kineticアッセイ(Charles River Endosafe)を使用して決定した。
M1マクロファージ又はM2マクロファージを、健常ドナーから分取された単球から分極させた。この目的で、分取された単球を、GM-CSF又はM-CSF(40ng/mL;Miltenyi)の存在下で培養して、それぞれ、M1マクロファージ又はM2マクロファージを発生させた。5日後、結果として得られるマクロファージを、表現型解析のために回収するか、又はLPS(200ng/mL)で、さらに2日間にわたり刺激した。一部の実験では、4日目に、IL-4(20ng/mL)を、M2マクロファージへと添加したところ、これは、「M2+IL-4」マクロファージの発生を結果としてもたらした。一部の実験では、M-CSFの補充を伴わずに、PANC-1がん細胞で条件付けされた培地(0日目及び3日目に、培養培地において、30% v/vに希釈された)の存在下で、単球を培養することにより、M2マクロファージを発生させた。本出願では、結果として得られるM2マクロファージを、「Tum-ind-M2」と呼ぶ。抗BTN2A mAbを、M2分化をモジュレートする、それらの能力についてスクリーニングするために、上記で記載した通り、表示の濃度で、キメラ抗BTN2A mAb、又はそれらのアイソタイプ対照(ヒトIgG1;Sigma)を伴うか、又は伴わずに、単球から、M2マクロファージを発生させた。全てのmAbをウェットコーティングした(1倍濃度のPBSにおいて、RTで一晩にわたり)。M2分化の阻害についての対照として、GM-CSF(40ng/mL)及びIFNγ(100ng/mL、BioTechne)を、M-CSF誘導性M2分極時の、単球へと添加した。GM-CSFの存在下で分極させたM1マクロファージを、表現型対照として使用した。分極の後、結果として得られるマクロファージ、及びそれらの培養物上清を回収し、細胞膜における、M1関連マーカー及びM2関連マーカーの発現を、フローサイトメトリーにより評価した。加えて、製造元の指示書に従い、IL-10 and TNFα ELISA kit(ThermoFisher Scientific)を使用して、培養物上清におけるサイトカイン含量を定量した。
M2マクロファージを、上記で記載した通り、参照mAbの非存在下、M-CSFの存在下で、単球から発生させた。M2マクロファージを回収し、LPSを伴うか、又は伴わずに、10μg/mLの参照抗体、又はそれらの対照アイソタイプmAb(Sigma製のヒトIgG1)で、一晩にわたり、あらかじめウェットコーティングされた培養ウェルにおいて、2日間にわたり培養した。M2復帰の対照として、GM-CSF(40ng/mL)及びIFNγ(100ng/mL)を、M2マクロファージ培養物へと、2日間にわたり添加した。GM-CSFの存在下で分極させたM1マクロファージを、表現型対照として使用した。復帰実験の後、LPSの添加を伴わずに復帰させられたマクロファージを、フローサイトメトリーによる表現型解析のために回収した。LPS刺激により復帰させられたマクロファージからの培養物上清を、ELISAを使用するサイトカイン定量のために採取した。
上記で記載した通り、参照抗体、又はそれらのアイソタイプ対照mAbの添加を伴うか、又は伴わずに、M1マクロファージ及びM2マクロファージを発生させた。製造元の指示書に従い、CD3+マイクロビーズキット(Miltenyi)を使用することにより、CD3+ T細胞を、健常ドナーPBMCから分取し、共培養まで凍結させた。活性化CD3+ T細胞は、以下の通りに作出した:CD3+ T細胞を、5μMのCellTrace Violet色素(ThermoFisher Scientific)で染色し、次いで、このような細胞105個を、1μg/mLの抗CD3 mAb(クローンOKT3、BD biosciences)であらかじめコーティングされた96ウェル平底プレートにおいて、20U/mLのIL-2(Miltenyi)、LPS(200ng/mL)、及びCountBright absolute counting beads(ウェル1つ当たり5×103個、ThermoFisher Scientific)を補充されたX-Vivo 10培地において培養した。マクロファージとの共培養のために、同種の、M1マクロファージ、M2マクロファージ、又はM-CSF及び参照mAb若しくはそれらの対照アイソタイプの存在下で分極させられたマクロファージ2×104個を、同種の活性化CD3+細胞へと添加した。共培養の5日後、サイトカイン産生を増強するために、GolgiStopタンパク質輸送阻害剤の存在下で、5時間にわたり、20ng/mLのPMA及び0,5μg/mLのイオノマイシンを、共培養物へと添加した。次いで、細胞を、フローサイトメトリーによる表現型解析のために回収した。CellTraceの希釈率を、CD3+ T細胞増殖の指標として使用した。表現型及び増殖の結果は、1mL当たりの百分率又は絶対細胞数で表した(absolute counting beadsによる較正の後で)。
健常ドナーから分取されたナチュラルキラー(NK)細胞を標識付けし、次いで、IL-15(10ng/mL)刺激を伴うか、又は伴わずに、10%のFBS及び1%のP/S、IL-2(50UI/mL)を補充されたRPMIにおいて、5%CO2、37℃で培養した。0日目に、参照抗BTN2A mAb又は対照アイソタイプ(10μg/mL)を、培養物へと添加した。5日後、NK細胞を、活性化マーカーの発現について、細胞外表現型解析にかけた。NKの活性化を、CD69発現及びCD25発現(百分率及び蛍光強度中央値MFI)の誘導により評価した。NK細胞についてのゲーティング戦略を、図4に示す。NK細胞による細胞傷害作用の測定のために、3例の健常ドナーから分取されたNK細胞を、IL-2(50UI/mL)及びIL-15(10ng/mL)を伴うか、又は伴わずに、RPMI、10%のFBS、及び1%のP/Sにおいて、5%CO2、37℃で培養した。参照抗BTN2A mAb又は対照アイソタイプ(10μg/mL)を、非刺激NK細胞、又はIL-2/IL-15で刺激されたNK細胞に、一晩にわたり添加した。翌日、NK細胞を、表示の血液又は癌腫細胞株と、1:1の比で共培養し、FITCで標識付けされた抗CD107a mAb及び抗CD107b mAb(全て、BD Biosciences製)を、共培養物へと添加し、4時間にわたりインキュベートした。NK細胞の脱顆粒を、フローサイトメトリーにより、CD107αβ+細胞非刺激NK細胞、又はIL-2/IL-15刺激NK細胞における百分率として評価した。NK細胞の脱顆粒増強についてのEC50の計算のために、参照抗BTN2A mAb、及びそれらのアイソタイプ対照mAbを、0.005nM~300nMの範囲の濃度で使用した。がん細胞における、NK細胞媒介性殺滅を評価するために、精製NK細胞を、10%のFBS及び1%のP/Sを補充したRPMIにおいて、5%CO2、37℃で、10μg/mLの、参照mAbである、101G5 mAb及び107G3 mAb、又は対応するIgG1対照と共に、一晩にわたりプレインキュベートした。IL-2(50UI/mL)及びIL-15(10ng/mL)を、陽性対照として使用した。翌日、NK細胞を、表示の、CellTraceで標識付けされたがん細胞株と共に、1:1の比で、4時間にわたり共培養した。がん細胞の死は、腫瘍細胞株において、セルイベント(CellEvent)(商標)Caspase-3/7 Green Detection reagent(Thermofisher Scientific)を使用して、カスパーゼ3/7+細胞の百分率を評価することにより査定した。
染色の前に、PBMC/NK細胞及び単球/マクロファージを、Fc受容体を飽和させるために、ヒトFcブロック(Miltenyi)又はヒトIgG1(Sigma)と共に、10分間にわたりインキュベートした。使用された標識付けmAbは、以下:CD14-FITC及びCD14-APC-Vio770(Miltenyi)、CD163-VioBlue(Miltenyi)、DC-SIGN-PE-Vio770(Miltenyi)、CD80-PE(BD Biosciences)、PDL1-APC(BD Biosciences)、CD3-PE-CF594(BD Biosciences)及びCD3-BV605(Biolegend)、CD56-PE-Vio770(Miltenyi)及びCD56-BV605(BD Biosciences)、CD69-BV421(BD Biosciences)、CD25-APC(BD Biosciences)の通りであった。細胞を、抗体カクテルと共に、4℃で、30分間にわたりインキュベートした。「生」ゲートを規定するのに、live/dead near IR dye(ThermoFisher Scientific)を使用して、死細胞を除外した。細胞内IFNγ染色のために、Intracellular Fixation & Permeabilization Buffer Set(eBioscience)を使用して、細胞外染色細胞を、固定及び透過化し、APC-labelled anti-IFNγ(BD Biosciences)と共にインキュベートした。収集は、FlowJo 10ソフトウェアを使用する、Fortessaフローサイトメーター(BD Biosciences)において実施した。BTN2A1及びBTN2A2についての表現型解析のために、精製抗BTN2A1特異的抗体(mAb5)及び抗BTN2A2特異的抗体(mAb17)を、10μg/mLで使用し、PE-labelled anti-IgG(H+L)(Jackson Immunoresearch)により表現型を明示した。NK細胞は、単一細胞の選択後における、「生」ゲート内の、CD45+ CD14- CD3- CD56+細胞であった。単球は、単一細胞の選択後における、「生」ゲート内の、CD45+ CD19- CD3- CD56- CD14+細胞であった。収集は、Cytoflex LSフローサイトメーター(Beckman Coulter)、iQue Screenerフローサイトメーター(Intellicyt)又はFortessaフローサイトメーター(BD Biosciences)において実施し、データは、FlowJo 10ソフトウェアを使用して解析した。結果は、対応する染色対照により得られた値を差し引いた後の蛍光強度中央値(MFI)として表す。
キメラIgG1フォーマットにおける、参照抗BTN2A抗体の作出の後、この標的の、2つの異なるアイソフォーム(BTN2A1及びBTN2A2)に対するアフィニティーを、査定し、競合アッセイを実施して、これらのmAbが、BTN2A1の、同じエピトープ領域を認識したのかどうかを決定した。アフィニティー実験及びビニング実験を、バイオレイヤー干渉(BLI)技術に基づくシステムである、Octet Red96プラットフォーム(Fortebio/PALL)において実施した。アフィニティー実験のために、製造元の指示書に従い、EZリンク(EZ-Link)(商標)NHS-PEG4ビオチニル化キットを使用して、組換えヒト(rh)BTN2A1-Fc(GTP)をビオチニル化させ、ビオチニル化rhBTN2A2-Fcを、R&D Systemsから購入した。BTN2A1アフィニティーアッセイの場合、ビオチニル化rhBTN2A1-Fcを、ストレプトアビジン(SA)バイオセンサー(ForteBio)へとロードし、Kinetic Buffer 1X(ForteBio)において、約1nmのローディング標的レベルへと希釈し、キメラ抗BTN2A抗体を、解析物として使用した。BTN2A2アフィニティーアッセイのためには、キメラ抗BTN2A抗体を、上記で記載した通りに、FAB2Gセンサー(抗ヒトCH1;Fortebio)へとロードし、ビオチニル化rhBTN2A2-Fcを、解析物として使用した。いずれの場合にも、解析物は、溶液において維持し、それらの作業濃度は、Kinetic Buffer 10X(ForteBio)において希釈した。1回目の試行には、標準的な作業濃度は、200~3.125nMの範囲にわたった。2回目の試行に必要な場合は、作業濃度を、80~1.25nMに調整した。全ての試行(ローディング、平衡化、センサーの、解析物への会合/浸漬、解離、及び再生を含む)は、1000rpmの振盪を伴う、30℃で実施した。解析は、良好な当てはめ計算を可能とする、Octetソフトウェアにより計算される、1:1又は2:1のラングミュアモデル(BTN2A1又はBTN2A2のそれぞれについて)を使用して実施した。ビニング実験のために、Hisタグ付けBTN2A1(rhBTN2A-His)を、R&D Systemsから購入した。参照抗BTN2A抗体を、BTN2A1に対して、対応のある形で調べた。ビニング実験は、以下の「インタンデム」フォーマットにより実施したが、これは、rhBTN2A-Hisを、バイオセンサー(抗Penta-His「HIS1K」バイオセンサー;ForteBio/PALL)に固定化し、2種の競合抗体へと、連続ステップで提示したことを意味する。この反応速度スクリーニングでは、rhBTN2A-Hisの、HIS1K(シグナル強度:1nm)へのローディングに続き、10μg/mLの抗体との、3分間にわたる会合ステップ、次いで、3分間にわたる解離ステップを行った。rhBTN2A1-His活性は、ビニングアッセイと同じフォーマット(センサーにおけるリガンド/捕捉物質としてのBTN2A1、及び解析物としての抗体)で実施される、反応速度スクリーニングアッセイを介して確認した。全ての抗体(飽和mAb又は競合mAb)を、Kinetic Buffer 1Xにおいて希釈される、10μg/mLで使用した。この反応速度スクリーニングでは、rhBTN2A1-Hisの、HIS1K(シグナル強度:1nm)へのローディングに続き、抗体との、3分間にわたる会合ステップ、次いで、3分間にわたる解離ステップを行った。アッセイステップは、以下の通り:「インタンデム」スキームに従う、ベースライン→抗原の捕捉→ベースライン→飽和抗体→ベースライン→競合抗体→再生であった。ビニングデータは、Octet Data Analysis HT 11.1を使用する、エピトープビン計算を使用して解析した。
BTN2A1と、参照mAbである、107G3及び101G5との相互作用を、BTN2A1単独、又は107G3若しくは101G5を伴うBTN2A1のペプチドマスフィンガープリントについての示差的評価により評価した。エピトープマッピングを開始する前に、CovalX製のHM4相互作用モジュール(CovalX)を装備したAutoflex II MALDI ToF質量分析器(Bruker)を使用して、それらの完全性及び凝集レベルを検証するために、rhBTN2A1-Fcタンパク質(GTP Technologies)に対して、高質量MALDI解析を実施し、これにより、BTN2A1の非共有結合的凝集物又は多量体が、試料中に存在しないことを確認した。BTN2A1を特徴づけ、BTN2A1/107G3及びBTN2A1/101G5のエピトープを決定するために、本発明者らは、試料を、トリプシン、キモトリプシン、Asp-N、エラスターゼ、及びテルモリシンによるタンパク質分解に続く、nLC Ultimate 3000-RSLCシステムを、LTQ-Orbitrap質量分析器(Thermo Scientific)と連結して使用する、nLC-LTQ-Orbitrap MS/MS解析にかけた。BTN2A1/107G3複合体及びBTN2A1/101G5複合体については、タンパク質複合体を、重水素化架橋剤と共にインキュベートしてから、多酵素切断にかけた。架橋ペプチドのエンリッチメントの後で、試料をアッセイし、XQuest 2.0ソフトウェア及びStavrox 3.6ソフトウェアを使用して、生成されたデータを解析した。試料調製のために、還元アルキル化は、以下の通りに実施した:室温で、180分間にわたるインキュベーション時間の前に、BTN2A1(4.04μM)を、DSS d0/d12(2mg/mL;DMF)と混合した。インキュベーション後、室温で、1時間にわたるインキュベーションの前に、1μLの重炭酸アンモニウム(20mMの最終濃度)を添加することにより、反応を停止させた。次いで、SpeedVacを使用して、溶液を乾燥させてから、H2Oに8Mの尿素に懸濁させた(10μL)。混合の後、1μLのDTT(500mM)を、溶液へと添加した。次いで、混合物を、37℃で、1時間にわたりインキュベートした。インキュベーションの後、暗所、室温で、1時間にわたるインキュベーション時間の前に、1μlのヨードアセトアミド(1M)を添加した。インキュベーション後、100μlのタンパク質分解緩衝液を添加した。トリプシン緩衝液は、50mMのAmbic pH 8.5、5%のアセトニトリルを含有し、キモトリプシン緩衝液は、100mMのトリスHCl、10mMのCaCl2 pH7.8を含有し、ASP-N緩衝液は、50mMのリン酸緩衝液pH7.8を含有し、エラスターゼ緩衝液は、50mMのトリスHCl pH 8.0を含有し、テルモリシン緩衝液は、50mMのトリスHCl、0.5mMのCaCl2 pH9.0を含有する。トリプシンによるタンパク質分解のために、100μLの還元/アルキル化BTN2A1を、1μLのトリプシン(Roche Diagnostic)と、1/100の比で混合した。タンパク質分解混合物を、37℃で、一晩にわたりインキュベートした。キモトリプシンによるタンパク質分解のために、100μLの還元/アルキル化BTN2A1を、0.5μLのキモトリプシン(Roche Diagnostic)と、1/200の比で混合した。タンパク質分解混合物を、25℃で、一晩にわたりインキュベートした。ASP-Nによるタンパク質分解のために、100μLの還元/アルキル化BTN2A1を、0.5μLのASP-N(Roche Diagnostic)と、1/200の比で混合した。タンパク質分解混合物を、37℃で、一晩にわたりインキュベートした。エラスターゼによるタンパク質分解のために、100μLの還元/アルキル化BTN2A1を、1μLのエラスターゼ(Roche Diagnostic)と、1/100の比で混合した。タンパク質分解混合物を、37℃で、一晩にわたりインキュベートした。テルモリシンによるタンパク質分解のために、100μLの還元/アルキル化BTN2A1を、2μLのテルモリシン(Roche Diagnostic)と、1/50の比で混合した。タンパク質分解混合物を、70℃で、一晩にわたりインキュベートした。消化の後、最終濃度を1%とするギ酸を、溶液へと添加した。タンパク質分解の後、タンパク質分解により作出された、10μLのペプチド溶液を、以下の設定:A:95/05/0.1 H2O/ACN/HCOOH v/v/v;B:20/80/0.1 H2O/ACN/HCOOH v/v/v、勾配:35分間で、注入容量10μLにおけるBを、5~40%とする、プレカラム内径:300μm×5mmC18ペップマップ(PepMap)(商標)、プレカラム流量:20μL/分、カラム内径:75μm×15cmC18 PepMapRSLC、カラム流量:200nL/分で、ナノ液体クロマトグラフィーシステム(Ultimate 3000-RSLC)へとロードした。
BLAST検索の後、ヒトBTN2A1アミノ酸配列を使用して、カニクイザルBTN2A1オーソログ配列(XM_015448906.1)を同定し、EcoRI/EcoRV制限部位を使用して、その細胞外ドメインを、pFUSE-hIgG1FC2ベクター(InvivoGen)へとクローニングした。製造元の指示書に従う、エクスパイフェクタミン(ExpiFectamine)(商標)293(ThermoFisher)による、エクスパイ293F(Expi293F)(商標)細胞への、結果として得られるpFUSE-hIgG1FC2-cynoBTN2A1プラスミドのトランスフェクションにより、組換えcynoBTN2A1-Fc融合タンパク質を作製した。6日目に回収した細胞培養物上清を、アフィニティー精製カラムを通した精製のために使用した。精製cynoBTN2A1-Fcタンパク質を、分子量及び純度の測定のための、SDS-PAGE及びウェスタンブロット法により解析した。cynoBTN2A1-Fcタンパク質の濃度は、BSAを標準物質とするブラッドフォードアッセイにより決定した。ELISAのために、プレートを、cynoBTN2A1-Fcタンパク質、又は組換えヒトBTN2A1-Fc(huBTN2A1-Fc;GTP Technologies)(1倍濃度のPBSに、5μg/mL)により、4℃で、一晩にわたりコーティングした。PBSにおける、3回にわたる洗浄の後、プレートを、PBSに2% v/vのBSAにより、室温で、1時間にわたり飽和させ、次いで、飽和mAb緩衝液を廃棄した。参照mAbである、101G5及び107G3、又は対照ヒトIgG1を、PBSに2%のBSAにおいて、1μMから始めて、1pMまでの10倍希釈カスケードで希釈し、ウェル1つ当たりの各希釈液100μLを添加し、プレートシェーカーにおいて、室温で90分間にわたりインキュベートした。Goat anti-mouse IgG HRP(Jackson ImmunoResearch;PBSに2%のBSAにおける、1:10000の希釈率)の添加、及び室温で、1時間にわたるインキュベーションの前に、全てのウェルを、PBSにおいて、3回にわたり洗浄した。次いで、全てのウェルを、PBSにおいて、3回にわたり洗浄し、Spark分光計(Tecan)において、405nmの吸光度により評価される結合を明らかにするために、1-step ABTS solution(ThermoFisher)を添加した。全ての試料を、二連で評価した。
参照抗体である、抗BTN2A1 107G3の同定
参照抗BTN2A1 107G3抗体は、以下の通りに同定した:マウスを、BTN2A1-Fc抗原で免疫化し、BTN2A1特異的血清の最高力価を呈するマウスに由来する脾臓細胞を回収し、骨髄腫細胞株と融合させて、ハイブリドーマを得た。BTN2A1に対する、最高のアフィニティー提示する、ハイブリドーマ培養物上清を、Vγ9/Vδ2-T細胞によるIFN-γの分泌をモジュレートする、それらの能力に基づく、第1ラウンドのスクリーニングのために選択した。この第1ラウンドのスクリーニングから選択されたクローンを、サブクローニングし、IFN-γ分泌及びVγ9/Vδ2-T細胞脱顆粒を誘導する、それらの能力、とりわけ、Vγ9Vδ2-T細胞の脱顆粒を誘導するそれらの能力について調べ(図1C及び図2)、参照mAbである、107G3の同定をもたらした。これらのサブクローンのVH領域及びVL領域のシーケンシングを実施した(下記の表2を参照されたい)。
精製Vγ9/Vδ2 T細胞を、健常ドナーのPBMCから拡大し、抗BTN2A1 107G3ハイブリドーマ培養物上清を伴うか、又は伴わずに、標的細胞としての、Daudi(バーキットリンパ腫)細胞、Jurkat(急性T細胞白血病)細胞、L-IPC(膵腺癌)細胞、及びMDA-MB-134(乳腺癌腫)細胞を含む、異なるがん細胞株と共に共培養した。図2及び表3に示される通り、抗BTN2A1 107G3ハイブリドーマ上清の添加は、CD107+脱顆粒細胞の百分率により測定される、Vγ9/Vδ2 T細胞の細胞溶解機能の、標的細胞単独を伴う共培養物、又は対照ハイブリドーマ培養培地の存在下にある共培養物と比較した誘導をもたらす。Vγ9/Vδ2 T細胞の、PMA/イオノマイシンによる処理は、予測される通り、標的細胞に依存しない、それらの細胞溶解機能の、最大の誘導をもたらす。
抗BTN2A1 mAb 107G3の、BTN2A1アイソフォームだけに対する特異性を確立するために、両方のBTN2アイソフォームに対する、CRISPR-Cas9媒介性不活化を保有する、HEK-293T BTN2 KO細胞に、BTN2A1をCFP融合タンパク質としてコードするプラスミドを、一過性にトランスフェクトした。図3Aに示される通り、精製抗BTN2A1 mAb 107G3による染色は、BTN2A1をコードするプラスミドをトランスフェクトされたHEK-293T BTN2 KO細胞だけで検出され、HEK-293T BTN2 KO細胞単独では検出されなかった。
抗BTN2A1 107G3 mAbの、その標的に対するアフィニティーを測定するために、BTN2A1をコードするプラスミドをトランスフェクトされたHEK-293T BTN2 KO細胞を、漸増濃度(5ng/mL~75μg/mL)の精製抗BTN2A1 107G3 mAb又は対照mIgG1で染色した(図3B)。平均値蛍光強度データについての非線形回帰分析は、抗BTN2A1 107G3 mAbについて、0.32μg/mL(95%IC:0.21~0.46μg/mL)のEC50を見出した。
23種のモノクローナル抗体を、HEK-293T細胞において、一過性に作製し、異なる範囲の生産性を達成した。大半の抗BTN2A抗体は、高レベル(>100mg/Lであり、且つ、最大で430mg/L)で産生された。1種の抗体である、抗BTN2A mAb3(表3)は、HEK-293T細胞における、6~8mg/Lの範囲の、極めて低度の産生を呈した。アミノ酸配列解析は、そのFab部分内における、Nグリコシル化部位を、そのVHのCDR1において明らかにした。他の2種の抗体である、抗BTN2A mAb9及び抗BTN2A mAb11もまた、それらのFab領域内において(mAb9についての、CDR1_VH、及びmAb11についての、CDR1_VLにおいて)、Nグリコシル化部位を呈した。6種の抗体は、低純度レベル(<95%が単量体である)を呈したが、抗BTN2A mAb1及び抗BTN2A mAb3だけは、純度レベルが<90%(それぞれ、86%及び75%)であった。全ての最終精製抗BTN2A mAbは、極めて低レベル(0.1EU/mgの範囲)の細胞内毒素を呈した。mAb3だけは、他の抗体より高度の細胞内毒素レベル(0.73EU/mg)を有したが、なおも、許容基準(<1EU/mg)内にあった。ビオチニル化組換えFc融合可溶性タンパク質を使用する、Octet技術を使用することにより、23種の抗BTN2AキメラmAbのアフィニティー定数(KD、kon、及びkoff)を、BTN2A1アイソフォーム及びBTN2A2アイソフォームについて決定した。表4は、各抗BTN2A mAbについて、KD定数を再掲する。mAb6及びmAb9について、KDの計算は、測定時に観察される解離の非存在(koff<10-7/秒)のために、可能でなかったが、これは、それらの標的からの解離を緩徐化させる、これらの抗体のアビディビィー効果により説明されるであろう。8種の抗BTN2A mAbは、BTN2A1アイソフォーム(mAb2、mAb3、mAb4、mAb5、mAb6、mAb8、mAb9、及びmAb10)に結合することが見出され、8種の抗BTN2A mAbは、BTN2A2アイソフォーム(mAb16、mAb17、mAb18、mAb19、mAb20、mAb21、mAb22、及びmAb23)に結合することが見出され、7種のmAbは、両方のアイソフォーム(mAb1、mAb7、mAb11、mAb12、mAb13、mAb14、及びmAb15)に結合することが見出された。
本発明者らは、抗BTN2A mAbが、末梢血の非Vγ9Vδ2 T細胞コンパートメント、すなわち、単球及びNK細胞を、治療目的でターゲティングしうるのかどうかを決定しようと試みた。このため、本発明者らは、本発明者らのオクテットアッセイにおいて、BTN2A1又はBTN2A2だけに結合することが見出された、mAb5及びmAb17のそれぞれを、末梢血に由来する、単球及びNK細胞の表現型解析に使用した。図4に示される通り、抗BTN2A1 mAb5だけが、単球及びNK細胞の両方の細胞膜を染色したが、単球において、より強いシグナルが観察された。よって、単球及びNK細胞の細胞膜では、BTN2A1は検出されたが、BTN2A2は検出されなかったことから、BTN2A1を認識するmAbを、これらの免疫細胞コンパートメントの免疫機能をモジュレートする、それらの能力についてスクリーニングすることに対する根拠が与えられる。
それらの微小環境からのシグナルに応答して、単球は、M1マクロファージ又はM2マクロファージへと分極させられうる。M1マクロファージが、炎症促進性及び抗腫瘍性特性を伴って存在するのに対し、M2マクロファージは、抗炎症性特性を有し、腫瘍の発症と関連する。単球の細胞膜では、BTN2A1アイソフォームだけが見出されることを踏まえ、BTN2A1アイソフォームだけ、又はBTN2A1/BTN2A2アイソフォームの両方を認識する抗BTN2A mAbを、in vitroの、M-CSFの存在下で、単球の、M2マクロファージへの分極に干渉する、それらの能力について査定した。いずれも、mAbを伴わずに、GM-CSF(CD14+/- CD163-)の存在下で発生するM1マクロファージ、及びM-CSFの存在下で発生するM2(CD14+ CD163+)マクロファージを、マクロファージ分極についての対照として使用した。in vitroにおける、5日間にわたる分極の後、抗BTN2A mAb又はそれらの対照IgG1の存在下で分極させられた、M1マクロファージ、M2マクロファージ、及びM-CSF誘導性マクロファージの細胞膜における、CD14及びCD163の発現を、フローサイトメトリーにより評価した(表4)。予測される通り、M1細胞が、低CD14発現及び検出不能なCD163発現を呈した(表5及び図4)のに対し、M2マクロファージは、両方のマーカーの高発現を呈した。興味深いことに、後出では101G5と呼ばれる、抗BTN2A mAb1は、M-CSFの存在下で、CD14及びCD163の発現の、最も強力な低減を誘導し、M-CSF誘導性マクロファージ分極を、M1様表現型へと偏らせた(表4及び図4B)。M-CSF誘導性M2マクロファージ分極の、第2の最良の阻害剤は、107G3である、mAb2であった(表5及び図4B)。これは、M-CSF及び対照IgG1の存在下で得られるマクロファージの、非処理M2マクロファージと類似する表現型と対照的である。
M2分極マクロファージを、M1表現型へと復帰させる、参照mAbである、101G5 mAb及び107G3 mAbの潜在的可能性について評価した。この目的で、M-CSFの存在下で、5日間にわたり分極させられた、前出のM2マクロファージを、101G5 mAb及び107G3 mAbでコーティングされた、前出のウェルに播種し、2又は4日間にわたり、さらに培養した。M2マクロファージの、IFNγによる処理を、M2→M1復帰についての陽性対照として用いた。図8に示される通り、101G5及び107G3の存在下で培養されたM2マクロファージは、IFNγ処理と同様の、M1様表現型を獲得した。実際、M2マクロファージの、参照mAbである、101G5 mAb及び107G3 mAbによる処理は、CD14発現(図8A)及びCD163発現(図8B)の減少、並びにCD86発現の増大(図8C)を結果としてもたらした。101G5又は107G3のそれぞれによる処理の後、PDL1の、微弱な上方調節~上方調節の非存在が観察された(図8D)。さらに、101G5及び107G3による、M2マクロファージの処理は、IL-10の分泌を阻害し(図8E)、TNFαの分泌を増強した(図8F)ことから、M1の表現型を指し示す。
M2マクロファージの機能、すなわち、T細胞増殖に対する、M2媒介性阻害に影響を及ぼす、参照mAbである、101G5 mAb及び107G3 mAbの能力について、探索した。この目的で、あらかじめ活性化させた同種CD3+ T細胞を、M1、M2、又はmAbの存在下で発生したM2と共に共培養した。予測される通り、従来のM2マクロファージとの共培養は、M1マクロファージと比較した、CD3+ T細胞数の減少のほか、T細胞増殖の減少(CTVの希釈率により評価される)、及びIFNγの産生を結果としてもたらした(図9A、9C、9G、9E、及び9I)。これに対し、対照IgG1の存在下で発生したM2マクロファージの培養物と比較した、CD3+ T細胞の高百分率及び高絶対数により示される通り、101G5及び107G3の存在下で発生したM2マクロファージは、T細胞増殖を阻害しないと考えられた(図9B、9H、及び9J)。さらに、IFNγ産生T細胞の百分率及び数もまた、対照IgG1と比較した、101G5及び107G3の存在下で発生したマクロファージを含有する共培養物において高値であった(図9D及び9F)。
BTN2A1は、NK細胞の細胞膜において見出されたので、101G5及び107G3が、NK細胞の活性化をモジュレートする潜在的能力について探索した。健常ドナーに由来する精製NK細胞を、さらなる活性化(それぞれ、IL-2及びIL-15、又はIL-2だけ)を伴うか、又は伴わない、101G5又は107G3の存在下で、5日間にわたり培養した。図10に示される通り、101G5及び107G3のいずれも、全ての被験条件下のNK細胞の細胞膜において、CD69の発現を増強した(図10A)。加えて、101G5及び107G3はまた、NK細胞の、IL-2及びIL-15による処理により誘導される、CD25の発現も増強した(図10B)。101G5及び107G3は、精製NK細胞を活性化させることが可能であったので、本発明者らは、これらのmAbがまた、NK細胞による細胞傷害作用も増強しうるのかどうかについて探索した。よって、がん細胞株である、HL-60(骨髄性白血病)、HT-29(結腸癌)、MDA-MB-231(乳腺腺癌)、及びA549(肺腺癌)に対する、NK細胞の脱顆粒(CD107+細胞の%)を、IL-2及びIL-15による刺激を伴うか、又は伴わない、101G5又は107G3の存在下で評価した。予測される通り、対照IgG1の存在下で、HL-60細胞だけが、NK細胞の脱顆粒を誘発し(図10C)、これは、IL-2及びIL-15を伴う刺激により増強された(図10D)。充実性腫瘍細胞株である、HT-29、MDA-MB-231、及びA549に対する、適度なNK細胞の脱顆粒はまた、対照IgG1及びIL2+IL-15の存在下でも観察された。表8は、これらの被験がん細胞株及び他の被験がん細胞株(Raji、HCT116、DU-145)に対する、NK細胞の脱顆粒についてまとめる。興味深いことに、参照mAbである、101G5及び107G3は、IL-2+IL-15による刺激を伴わずに、充実性腫瘍細胞株である、MDA-MB-231及びA549に対する、NK細胞の脱顆粒を増強し、HT-29に対しては低度に増強した。IL-2及びIL-15の添加は、MDA-MB-231細胞、A549細胞、及びDU145細胞における、101G5及び107G3の効果を強調した(表8)。HL-60血液がん細胞株及びRaji血液がん細胞株について、参照101G5 mAb又は参照107G3 mAbの添加により、このような増強が観察されることはなかった(表8及び図10C及び10D)。加えて、参照mAbである、101G5及び107G3は、mAbを、共培養物へと、さらに添加せずに、共培養の前に、NK細胞と共にプレインキュベートされた場合に、A549細胞に対して、NK細胞の脱顆粒を誘発することが可能であった(図10E)。これは、がん細胞に対する細胞傷害作用を誘発するNK細胞への直接的な結合による、参照mAbである、107G3 mAb及び101G5 mAbの直接的な効果を示唆する。さらに、前立腺腺癌DU-145細胞株に対する、NK細胞の脱顆粒の増強における、101G5及び107G3の用量依存性について評価した。実際、101G5及び107G3は、DU-145細胞に対する、NK細胞の脱顆粒を、用量依存的に増強した(101G5及び107G3について、それぞれ、EC50(no stim)=0.14及び0.54nM;EC50(IL-2+IL-15)=0.08及び0.2nM)。
101G5及び107G3のいずれも、BTN2A1に結合し、M2マクロファージ分極を阻害し、NK細胞の活性化及び細胞傷害作用を増強する能力を共有する。よって、本発明者らは、これらのmAbが、BTN2A1タンパク質における、同じエピトープ領域を認識したのかどうかについて探索した。そこで、「インダンテム」状況を使用して、101G5と107G3とが、BTN2A1への結合について競合する、オクテットベースのビニング実験を実施した。図12に示される通り、101G5と、107G3とは、互いのBTN2A1への結合を遮断しなかったことから、これらの2つのmAbは、BTN2A1における、同じエピトープ領域に結合しないことを指し示す。
BTN2A1を特徴づけるために、本発明者らは、試料を、トリプシン、キモトリプシン、Asp-N、エラスターゼ、及びテルモリシンによるタンパク質分解に続く、nLC-LTQ-Orbitrap MS/MS解析にかけた。トリプシンによるタンパク質分解の後、BTN2A1の配列に、配列のうちの79.84%をカバーする、32のペプチドを同定し;キモトリプシンによるタンパク質分解の後、BTN2A1配列のうちの94.76%をカバーする、27のペプチドを同定し;ASP-Nによるタンパク質分解の後、BTN2A1配列のうちの12.50%をカバーする、2つのペプチドを同定し;エラスターゼによるタンパク質分解の後、BTN2A1配列のうちの89.11%をカバーする、33のペプチドを同定し;テルモリシンによるタンパク質分解の後、BTN2A1配列のうちの78.23%をカバーする、29のペプチドを同定した。得られた結果に基づき、トリプシン、キモトリプシン、ASP-N、エラスターゼ、及びテルモリシンによるペプチドについての重複マッピングをデザインした(図13)。トリプシン、キモトリプシン、Asp-N、エラスターゼ、及びテルモリシンによるタンパク質分解ペプチドを組み合わせて、BTN2A1配列のうちの96.37%をカバーした。BTN2A1/107G3複合体及びBTN2A1/101G5複合体のエピトープを、高分解能で決定するために、タンパク質複合体を、重水素化架橋剤と共にインキュベートしてから、多酵素切断にかけた。タンパク質複合体である、BTN2A1/107G3に対する、トリプシン、キモトリプシン、ASP-N、エラスターゼ、及びテルモリシンによるタンパク質分解の後、nLC-orbitrap MS/MS解析は、BTN2A1と、抗体である107G3との間に、17の架橋ペプチドを検出した。
BTN2A1オーソログは、カニクイザル(cynomolgus)(カニクイザル(Macaca fascicularis))を含む、大半の非ヒト霊長動物において存在する。参照mAbである、101G5及び107G3の、カニクイザルBTN2A1オーソログ(cynoBTN2A1;NCBI参照番号:XM_015448906.1、ヒトBTN2A1に対する、93.31%の同一性)との交差反応性を決定するために、本発明者らは、cynoBTN2A1の細胞外ドメインを含有する組換えFc融合タンパク質(cynoBTN2A1-Fc)を作出し、本発明者らは、参照mAbの、このタンパク質への結合について評価するためのELISAアッセイを実施した。本発明者らはまた、参照mAbのアフィニティーを、ヒトBTN2A1オーソログと、カニクイザルBTN2A1オーソログとの間で比較するために、組換えヒトBTN2A1-Fcタンパク質を使用するELISAも実施した。図13に示される通り、101G5及び107G3のいずれも、cynoBTN2A1の細胞外ドメインに、huBTN2A1(それぞれ、0.82及び0.56nM)において得られる、対応するEC50と同等である、それぞれ、0.60及び0.57nMのEC50で結合することが可能であった。
本出願を通して、多様な参考文献は、本発明が関係する技術分野の最新技術について記載する。これらの参考文献の開示は、参照により本開示へと組み込まれる。
さらなる実施形態は以下のとおりである。
[実施形態1]
以下の機能:
i.単球の、M2マクロファージへの分極を阻害する機能、
ii.M2マクロファージの、抗腫瘍性M1マクロファージへの復帰を誘導する機能、
iii.NK細胞の活性化を、直接誘発する機能、
iv.NK細胞媒介性細胞傷害作用を増強する機能
のうちの少なくとも1つを有することにおいて特徴づけられる抗ブチロフィリン2A(BTN2A)抗体。
[実施形態2]
BTN2A1への結合について、
(i)配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む参照抗体である、mAb 107G3、又は
(i)配列番号19のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、(ii)配列番号20のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む参照抗体である、mAb 101G5
と競合する、実施形態1に記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態3]
配列番号17の65、68、69、72、78、84、85、95、97、及び100位に位置する残基を含むエピトープに結合する、実施形態1又は2に記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態4]
配列番号17の212、213、218、220、224、及び229位に位置する残基を含むエピトープに結合する、実施形態1又は2に記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態5]
ヒトBTN3アイソフォームと交差反応しない、及び/又はカニクイザルBTN2A1オーソログと交差反応する、実施形態1~4のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態6]
配列番号3を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号4を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号5を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号6を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号7を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号8を含む、軽鎖可変領域であるCDR3、又は
配列番号21を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号22を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号23を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号24を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号25を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号26を含む、軽鎖可変領域であるCDR3
を含む、実施形態1~5のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態7]
配列番号1のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域、又は
配列番号19のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号20のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含む、実施形態1~6のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態8]
以下の機能:
i.Vγ9Vδ2 T細胞による、細胞溶解性分子の分泌を活性化させる機能、
ii.Vγ9Vδ2 T細胞の細胞溶解機能を活性化させる機能、及び/又は
iii.Vγ9Vδ2 T細胞の増殖を活性化させる機能
のうちの少なくとも1つをさらに有する、実施形態1~7のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態9]
BTN2A1への結合について、(i)配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む参照マウス抗体である、mAb 107G3と競合する、実施形態8に記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態10]
配列番号3を含む、重鎖可変領域であるCDR1、配列番号4を含む、重鎖可変領域であるCDR2、配列番号5を含む、重鎖可変領域であるCDR3、配列番号6を含む、軽鎖可変領域であるCDR1、配列番号7を含む、軽鎖可変領域であるCDR2、及び配列番号8を含む、軽鎖可変領域であるCDR3、又は
配列番号1のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域、又は
配列番号1のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との、少なくとも90%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含む、実施形態8又は9に記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態11]
ヒトBTN2A1アイソフォームに対する特異性をさらに有する、実施形態8~10のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態12]
ヒト抗体、キメラ抗体、又はヒト化抗体である、実施形態1~11のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態13]
実施形態1~10のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体の重鎖及び/又は軽鎖をコードする核酸分子。
[実施形態14]
実施形態13に記載の核酸を含む宿主細胞。
[実施形態15]
治療における使用のための、実施形態1~12のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態16]
がん又は感染性疾患の処置における使用のための、実施形態1~12のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体。
[実施形態17]
実施形態1~12のいずれか1つに記載の抗BTN2A抗体と、少なくとも1つの薬学的に許容できる担体とを含む医薬組成物。
Claims (9)
- ブチロフィリン2A1(BTN2A1)に特異的に結合する抗BTN2A1抗体であって、
配列番号21を含む重鎖可変領域のCDR1、配列番号22を含む重鎖可変領域のCDR2、配列番号23を含む重鎖可変領域のCDR3、配列番号24を含む軽鎖可変領域のCDR1、配列番号25を含む軽鎖可変領域のCDR2、及び配列番号26を含む軽鎖可変領域のCDR3、又は
配列番号3を含む重鎖可変領域のCDR1、配列番号4を含む重鎖可変領域のCDR2、配列番号5を含む重鎖可変領域のCDR3、配列番号6を含む軽鎖可変領域のCDR1、配列番号7を含む軽鎖可変領域のCDR2、及び配列番号8を含む軽鎖可変領域のCDR3
を含む、抗BTN2A1抗体。 - 配列番号19のアミノ酸配列との少なくとも95%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号20のアミノ酸配列との少なくとも95%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域、又は
配列番号1のアミノ酸配列との少なくとも95%の同一性を有する配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号2のアミノ酸配列との少なくとも95%の同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含む、請求項1に記載の抗BTN2A1抗体。 - キメラ抗体、又はヒト化抗体である、請求項1又は2に記載の抗BTN2A1抗体。
- 請求項1~3のいずれか一項に記載の抗BTN2A1抗体の重鎖及び/又は軽鎖をコードする核酸分子。
- 請求項4に記載の核酸分子を含む宿主細胞。
- 治療における使用のための、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗BTN2A1抗体。
- がん又は感染性疾患の処置における使用のための、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗BTN2A1抗体。
- 請求項1~3のいずれか一項に記載の抗BTN2A1抗体と、少なくとも1つの薬学的に許容できる担体とを含む医薬組成物。
- 単球の、M2マクロファージへの分極を阻害することによって、がん又は感染性疾患を処置する用の、請求項8に記載の医薬組成物。
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