JP7531250B2 - 5’-ヌクレオチダーゼ変形タンパク質を暗号化するがん治療のためのポリヌクレオチド - Google Patents
5’-ヌクレオチダーゼ変形タンパク質を暗号化するがん治療のためのポリヌクレオチド Download PDFInfo
- Publication number
- JP7531250B2 JP7531250B2 JP2023517328A JP2023517328A JP7531250B2 JP 7531250 B2 JP7531250 B2 JP 7531250B2 JP 2023517328 A JP2023517328 A JP 2023517328A JP 2023517328 A JP2023517328 A JP 2023517328A JP 7531250 B2 JP7531250 B2 JP 7531250B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- cells
- mrna
- cancer
- cell
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/78—Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
- A61K31/7105—Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/03—Phosphoric monoester hydrolases (3.1.3)
- C12Y301/03035—Thymidylate 5'-phosphatase (3.1.3.35)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
Description
脂質ナノ粒子(lipid nanoparticle)に基づく薬物伝達システムは、相当な長所を有するため普遍的に使用されてきた。資質ナノ粒子は、高い薬容量(drug capacity)、高い安定性(stability)、高い特異性(specificity)を有しており、放出時点(release point)を制御することができる。薬物として使用される遺伝物質のため、正イオン性リポソームは標的がんに薬物を伝達するのに使用されていた。正電荷に荷電されたリポソームは、遺伝的薬物(genetic drug)を引き寄せて薬物が標的に遇うまで保護するために薬物を覆う球状コンプレックス(spherical complex)を形成する。
自然界に存在するSirpαの配列を変形してCD47との結合力が向上されたSV1を突然変異によって選定し、それに対してリポソーム剤形を製作する際に正しい方向に挿入されて反応し得るSV4を突然変異によって確保した(図1を参照)。SV4突然変異の製作は以下のような方法で行われた。前記確保されたSV1配列において、CD47との正しい方向結合のために11番目と104番目のリシンをロイシン(leucine)に置換した。置換のためにSV1遺伝子をpET28aベクトルに挿入したプラスミドを利用して、11番目と104番目に当たる配列で点突然変異(point-mutation)されるようにプライマ(下記表2を参照)を製作し、Quickchange II site-directed mutagenesis kit(Agilent)の方法に従ってそれぞれ或いは同時に置換させた突然変異遺伝子を製作した。
以下、上述したバインダ(SV4)-コンジュゲートリポソームに捕集される薬物の具現例について説明する。
T001の最終薬物の形態はmRNAの形態であって、発現に必要な各構成要素を最適化してUTR(untranslated region)及びKozak配列を最適化した。そのために、レポータ(reporter)遺伝子としてGFP(Green Fluorescent Protein)を使用し、図5のような候補構造を選定して発現効率を決定した。各使用したUTRの配列情報は下記表5のようである。
TS(Thymidylate synthase)は、DNA合成及び復旧のためのチミジレート(dTMP)の唯一のデノボ(de novo)源泉(source)である。TSタンパク質をターゲットとする薬物はがん治療の主軸をなしているが、標的外効果と毒性のため使用が制限されている。TK1(cytosolic thymidine kinase)とTK2(mitochondrial thymidine kinase)は腫瘍環境からチミジンを回復させることで代替dTMPの生成経路に寄与し、TSターゲッティング薬物に対する抵抗を調節する。siRNAを有するTKsの下向き調節(downregulation)で腫瘍細胞を感知するTS siRNAの容量を従来のTSタンパク質ターゲッティング薬物(5FUdR及びpemetrexed)に比べ増加させたという報告があったため、本発明ではdTTP生合成代謝に焦点を合わせた。
まず、各T001 mRNAをトランスフェクションした後、腫瘍細胞の成長を評価するために各グループの細胞数を推定し、生存検査で培養細胞の成長を分析した(図10を参照)。生存検査は以下のように行われた。
細胞生存能を定量化するためにMTT分析を行った。MTT分析方法は以下のようである。
前記実験結果によって、Annexin V染色後フローサイトメトリ分析(Flow cytometric analysis)を行って、T001がアポトーシスを誘導して細胞数の減少または細胞増殖の抑制を誘発するのかを調べた。具体的な分析方法は以下のようである。
T001はMT5Mとは異なる構造的差のため核酸Tにより特異的である。よって、全般的な核酸の損失よりdTTPの損失による核酸の不均衡はがん細胞の代謝に大きな影響を及ぼし、そのためがん細胞の成長を阻害することができる。それを照明するために、ヒトNT5Mの成熟型(mature form)とイントロン(intron)が含まれた非成熟型(non-mature form)を細胞質T001(CT)と細胞生存能及び細胞成長抑制効果を比較し、各酵素間の基質特異性によって細胞にいかなる影響を及ぼすのかを調べた。各mRNAを大腸がん細胞株HCT-116にトランスフェクションし、24時間後にトリパンブルー分析(Trypan blue assay)を行ってHCT-116細胞生存能と細胞成長抑制結果を図13に示した。具体的な実験方法は以下のようである。
sense(配列番号33):CGAGAAGAAGUCAGAUUACAUCAAG
antisense(配列番号34):CUUGAUGUAAUCUGACUUCUUCUCG
sense(配列番号35):CGCAAAUUCAUUGAAACCUUCCUGA
antisense(配列番号36):UCAGGAAGGUUUCAAUGAAUUUGCG
T001の作用メカニズム上、大腸がん以外のがん種でもがん細胞のアポトーシスを誘発することができると考えられ、トリプルネガティブ乳がん(TNBC)に対して同じ試験を行ってアポトーシス誘発能を確認した。具体的な試験方法は以下のようである。
以下、SV4バインダ及びT001薬物を利用した抗がん剤の具現例について説明する。
(1)CD47バインダ(SV4)
Sirpα由来のタンパク質をを変形した高親和性CD47結合体とそれにDSPEとのコンジュゲーションの際に正しい方向にリポソームの外部に位置するように変形したSV4をCD47バインダ(binder)として使用したが、SV4の推定構造を図1Aに示した。DSPEと結合した資料、それをリポソームに挿入した資料それぞれのKD値を比較した結果、配列変位によってリポソーム形態から改善されたことが分かった(前記表1を参照)。
リポソームは正電荷に荷電して標的まで円滑な薬物伝達を行うために使用された物質として、正イオン性リン脂質(DSPE-PEG1000)、DOTAP、及びコレステロールの構造をそれぞれ下記化学式1乃至3に示した。
上述したように、核内、細胞質内、及びミトコンドリア内で発現可能なmRNAとして、図21にT001 mRNAの構成を概略的に示した。
位置信号がよく作動したのかを確認するために、mRNAを核及びミトコンドリア位置信号でMCF7にトランスフェクションした。mStrrawberry蛍光を検出し、各mRNAの成功的なトランスフェクションと位置を確認した(図22を参照)。具体的な実験方法は以下のようである。
薬物の伝達がCD47を媒介に引き起こされるのかを確認するために、MCF-7細胞にエピルビシン(epirubicin)薬物が捕集されたSV4が結合されたiLPを処理した。この際、CD47の媒介可否を確認するために、CD47抗体(polyclonal)を処理した実験群と処理していない実験群を比較した。具体的なCD47 masking assay方法は以下のようである。
Claims (8)
- 配列番号3で表されるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドを含む抗がん剤。
- 前記ポリヌクレオチドはmRNAであることを特徴とする請求項1に記載の抗がん剤。
- 前記mRNAはがん細胞に進入して核酸代謝を阻害することを特徴とする請求項2に記載の抗がん剤。
- 前記核酸代謝はdTTP生合成代謝であることを特徴とする請求項3に記載の抗がん剤。
- 前記ポリヌクレオチドは、配列番号19で表される5’-UTRと、配列番号20で表される3’-UTRとを更に含むことを特徴とする請求項1に記載の抗がん剤。
- 前記ポリヌクレオチドは、配列番号23で表される核位置信号(NLS)をコードする核酸配列を更に含むことを特徴とする請求項1に記載の抗がん剤。
- 前記ポリヌクレオチドは、配列番号24で表されるミトコンドリア位置信号(MLS)をコードする核酸配列を更に含むことを特徴とする請求項1に記載の抗がん剤。
- 前記がんは大腸がんまたは乳がんであることを特徴とする請求項1に記載の抗がん剤。
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR10-2020-0122164 | 2020-09-22 | ||
| KR1020200122164A KR102398032B1 (ko) | 2020-09-22 | 2020-09-22 | 암 치료를 위한 5''-뉴클레오티다아제 변이체 |
| PCT/KR2021/011702 WO2022065725A1 (ko) | 2020-09-22 | 2021-08-31 | 5'-뉴클레오티다아제 변형 단백질을 암호화하는 암 치료를 위한 폴리뉴클레오티드 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2023542142A JP2023542142A (ja) | 2023-10-05 |
| JP7531250B2 true JP7531250B2 (ja) | 2024-08-09 |
Family
ID=80846768
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2023517328A Active JP7531250B2 (ja) | 2020-09-22 | 2021-08-31 | 5’-ヌクレオチダーゼ変形タンパク質を暗号化するがん治療のためのポリヌクレオチド |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20230293571A1 (ja) |
| EP (1) | EP4183877A4 (ja) |
| JP (1) | JP7531250B2 (ja) |
| KR (1) | KR102398032B1 (ja) |
| CN (1) | CN116194117A (ja) |
| WO (1) | WO2022065725A1 (ja) |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2008500396A (ja) | 2004-05-21 | 2008-01-10 | ブリガム ヤング ユニバーシティ | 抗チミジンキナーゼモノクローナル抗体の抗癌活性 |
| JP2010246406A (ja) | 2009-04-10 | 2010-11-04 | International Frontier Technology Laboratory Inc | 抗腫瘍効果増強活性測定法 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA2545166A1 (en) | 2003-11-11 | 2005-05-19 | Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha | Humanized anti-cd47 antibody |
| GB0602339D0 (en) * | 2006-02-06 | 2006-03-15 | Glaxo Group Ltd | Novel process |
| CA2761438C (en) * | 2009-05-15 | 2017-12-12 | University Health Network | Compositions and methods for treating hematologic cancers targeting the sirp.alpha.-cd47 interaction |
| GB201417712D0 (en) * | 2014-10-07 | 2014-11-19 | Oxford Nanopore Tech Ltd | Method |
| CN106754602B (zh) * | 2017-01-04 | 2021-08-20 | 苏州华赛生物工程技术有限公司 | 一种生产胞苷的重组微生物及生产胞苷的方法 |
| CN110386984B (zh) * | 2018-04-17 | 2022-04-22 | 杭州尚健生物技术有限公司 | 结合cd47蛋白的融合蛋白及其应用 |
| KR102579284B1 (ko) * | 2020-09-22 | 2023-09-18 | 비피진 주식회사 | 신규의 cd47 바인더와 폴리뉴클레오티드를 포함하는 암 치료를 위한 리포좀 복합체 |
-
2020
- 2020-09-22 KR KR1020200122164A patent/KR102398032B1/ko active Active
-
2021
- 2021-08-31 EP EP21872755.0A patent/EP4183877A4/en not_active Withdrawn
- 2021-08-31 US US18/021,092 patent/US20230293571A1/en active Pending
- 2021-08-31 JP JP2023517328A patent/JP7531250B2/ja active Active
- 2021-08-31 CN CN202180054385.8A patent/CN116194117A/zh active Pending
- 2021-08-31 WO PCT/KR2021/011702 patent/WO2022065725A1/ko not_active Ceased
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2008500396A (ja) | 2004-05-21 | 2008-01-10 | ブリガム ヤング ユニバーシティ | 抗チミジンキナーゼモノクローナル抗体の抗癌活性 |
| JP2010246406A (ja) | 2009-04-10 | 2010-11-04 | International Frontier Technology Laboratory Inc | 抗腫瘍効果増強活性測定法 |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| Hyeon Cheol LEE et al.,Biotechnology Letters,2004年,Vol. 26,pp. 265-268 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR102398032B1 (ko) | 2022-05-19 |
| EP4183877A1 (en) | 2023-05-24 |
| JP2023542142A (ja) | 2023-10-05 |
| US20230293571A1 (en) | 2023-09-21 |
| CN116194117A (zh) | 2023-05-30 |
| KR20220039256A (ko) | 2022-03-29 |
| EP4183877A4 (en) | 2024-08-07 |
| WO2022065725A1 (ko) | 2022-03-31 |
| KR102398032B9 (ko) | 2022-09-30 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Dohmen et al. | Nanosized multifunctional polyplexes for receptor-mediated siRNA delivery | |
| TR201906295T4 (tr) | IL-4 R alfaya bağlanan gözyaşı lipokalini muteinleri. | |
| JP2005511761A (ja) | ナノ粒子送達ビヒクル | |
| WO2002013873A2 (en) | P97-active agent conjugates and their methods of use | |
| EP4183387A1 (en) | Liposome complex for cancer treatment, comprising novel cd47 binder and polynucleotide | |
| WO2016186445A1 (ko) | 암 세포 표적용 펩타이드 및 이의 용도 | |
| Vita et al. | Serum albumin and nucleic acids biodistribution: From molecular aspects to biotechnological applications | |
| Hayashi et al. | Crotamine cell-penetrating nanocarriers: cancer-targeting and potential biotechnological and/or medical applications | |
| US11618901B2 (en) | Anti-miRNA carrier conjugated with a peptide binding to a cancer cell surface protein and use thereof | |
| van Rossenberg et al. | Stable polyplexes based on arginine-containing oligopeptides for in vivo gene delivery | |
| KR102710779B1 (ko) | 5'-뉴클레오티다아제 변형 단백질을 암호화하는 암 치료를 위한 폴리뉴클레오티드 | |
| JP7531250B2 (ja) | 5’-ヌクレオチダーゼ変形タンパク質を暗号化するがん治療のためのポリヌクレオチド | |
| EP3476402B1 (en) | Capsule for drug delivery systems of target tissue-specific delivery type using carbosilane dendrimer | |
| KR102557016B1 (ko) | 암 치료를 위한 cd47 바인더 및 리포좀 복합체 | |
| JP3748561B2 (ja) | 超高効率タンパク分子・ペプチドトランスポーター及びそれを用いた目的物質細胞内導入方法およびそのキット。 | |
| KR101956450B1 (ko) | Rna 특이적 전달용 나노입자 복합체 및 이의 제조방법 | |
| CN113214353B (zh) | 两亲性寡肽结构物质 | |
| EP4600356A1 (en) | Method for introducing nucleic acid into mitochondrion | |
| Zhang et al. | Crispr Cas9 fluorine-containing PEI nanomedicine inhibits the growth of hepatocellular carcinoma cells by knocking out NEDD8-E2 conjugase UBC12 (UBE2M) | |
| WO2025245094A2 (en) | Peptide sequences for improved delivery of proteins into nucleus | |
| CN120966832A (zh) | 一种缺氧响应治疗性VEGFA mRNA及其应用和稳定性验证方法 | |
| Iwata | MALDI-TOF MS: m/z calcd for CgH3ClNNaOgS [M-Na]": 749.13 Found: 749.12. | |
| Hayashi et al. | Crotamine Cell Crotamine Cell-Penetrating Nanocarriers: Penetrating Nanocarriers: Cancer-Targeting and Potential Targeting and Potential Targeting and Potential Targeting and Potential Biotechnological and/or Medical Applications Biotechnological and/or Medical Applications | |
| HK1107275A (en) | Highly branched hk peptides as effective carriers of sirna |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20230313 |
|
| A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20240222 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20240227 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20240501 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20240625 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20240723 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7531250 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |