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JP7572977B2 - 所定の構成の複数の発現カセットの標的化組込みによって多価の多重特異性抗体発現細胞を作製するための方法 - Google Patents

所定の構成の複数の発現カセットの標的化組込みによって多価の多重特異性抗体発現細胞を作製するための方法 Download PDF

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Description

本発明は、細胞株作製およびポリペプチド産生の分野に関する。より正確には、哺乳動物細胞のゲノムへの特定の発現カセット配列の組込みをもたらす二重リコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって得られた組換え哺乳動物細胞が、本明細書において報告される。前記細胞は、多価の多重特異性抗体を製造する方法において使用することができる。
発明の背景
例えば抗体等の、分泌されグリコシル化されるポリペプチドは、通常、安定発現または一過性発現のいずれかとして真核細胞において組換え発現されることにより産生される。
目的の外因性ポリペプチドを発現する組換え細胞を作製するための１つの戦略は、目的のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のランダムな組込みとそれに続く選択工程および単離工程を含む。しかしながら、この手法にはいくつかの欠点がある。第１に、細胞それ自体のゲノム中へのヌクレオチド配列の機能的組込みは、珍しい事象であるだけでなく、ヌクレオチド配列が組み込まれる場所についてのランダム性を考慮に入れると、これらの珍しい事象の結果、遺伝子発現および細胞増殖に様々な表現型が生じる。「位置効果変異」として公知のこのような変異は、真核細胞ゲノムに存在する複雑な遺伝子制御ネットワークならびに組込みおよび遺伝子発現のための特定のゲノム遺伝子座に対する接近容易性に、少なくともある程度は起因する。第２に、一般的に、ランダムな組込み戦略は、細胞のゲノム中に組み込まれるヌクレオチド配列コピーの数を制御するものではない。実際に、高産生細胞を得るために遺伝子増幅法がしばしば使用される。しかし、このような遺伝子増幅は、例えば不安定な細胞増殖および／または生産物発現等の望ましくない細胞表現型を招く可能性もある。第３に、ランダムな組込みプロセスにつきものの組込み遺伝子座不均一性が原因となって、目的のポリペプチドについて望ましい発現レベルを示している組換え細胞を単離するためにトランスフェクション後に何千個もの細胞をスクリーニングすることには、時間がかかり、大きな労働力を要する。そのような細胞を単離した後でさえ、目的のポリペプチドの安定な発現は保証されておらず、安定な市販の産生細胞を得るには、さらなるスクリーニングが必要とされる場合がある。第４に、ランダムな組込みによって得られた細胞から産生されるポリペプチドは、高度の配列差異を示し、これは、高レベルのポリペプチド発現を選択するために使用される選択剤の変異原性にいくらか起因する可能性がある。最後に、産生しようとするポリペプチドの複雑性が高いほど、すなわち、目的のポリペプチドを細胞内で形成するのに必要とされる種々のポリペプチドまたはポリペプチド鎖の数が多いほど、互いに異なるポリペプチドまたはポリペプチド鎖の発現比率を制御することが、より重要になる。発現比率の制御は、目的のポリペプチドの効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での分泌の成功を可能にするために必要とされる。
リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）による標的化組込みは、真核生物宿主ゲノムのあらかじめ定められた部位に特異的かつ効率的に外来ＤＮＡを導くための方法である（Ｔｕｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４０７（２０１１）１９３－２２１（非特許文献１））。
国際公開第２００６／００７８５０号（特許文献１）では、抗ＲｈＤ組換えポリクローナル抗体および個々の宿主細胞のゲノム中への部位特異的組込みを用いる製造方法が開示されている。
Ｃｒａｗｆｏｒｄ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ．（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．２９（２０１３）１３０７－１３１５（非特許文献２））は、ｐｈｉＣ３１インテグラーゼ技術とＣＲＥ－Ｌｏｘ技術を組み合わせて用いて、標的化細胞株開発のために信頼のおける宿主を限定的なゲノムスクリーニングによって迅速に同定したことを報告した。
国際公開第２０１３／００６１４２号（特許文献２）では、そのゲノム中にドナーカセットを安定に組み入れた、遺伝的に変更された真核細胞のほぼ均質な集団を開示しており、ドナーカセットは、ターゲティング核酸部位および選択可能マーカータンパク質コード配列を含む単離された核酸フラグメントに作動可能に連結された強力なポリアデニル化部位を含み、単離された核酸フラグメントは、第１の組換え部位および第２の異なる組換え部位に挟まれている。
国際公開第２０１８／１６２５１７号（特許文献３）では、ｉ）発現カセット配列およびｉｉ）様々な発現ベクター間での発現カセットの分布に応じて、発現収率および生産物の質に大きな差異が認められたことが開示されている。
Ｔａｄａｕｃｈｉ，Ｔ．，ｅｔ ａｌ．は、何が抗体の発現を困難にするかを体系的に検討するために、制御された標的化組込み細胞株の開発アプローチを利用することを開示している（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３５（２０１９）Ｎｏ．２，１－１１（非特許文献３））。
国際公開第２０１６／０７９０７６号（特許文献４）は、ＦｏｌＲ１およびＣＤ３に対するＴ細胞活性化二重特異性抗原結合分子を開示している。実施例２９では、二重特異性ＦｏｌＲ１／ＣＤ３－カッパ－ラムダ抗体の作製を、一過性トランスフェクションを使用して記載しており、３つの発現ベクターのプラスミド比は１：１：１であった。実施例３６において、ＤＰ４７ ＧＳ ＴＣＢの調製を、ＨＥＫ２９３－ＥＢＮＡ細胞を対応する発現ベクターと１：２：１：１の比（「ベクター重鎖Ｆｃ（ホール）」：「ベクター軽鎖」：「ベクター軽鎖ＣｒｏｓｓＦａｂ」：「ベクター重鎖Ｆｃ（ノブ）－ＦａｂＣｒｏｓｓＦａｂ」）で同時トランスフェクトすることによって記載している。
国際公開第２０１４／０３３０７４号（特許文献５）は、血液脳関門シャトルを開示している。実施例２において、三価のＭＡｂ３１－ｓｃＦａｂ（８Ｄ３）の一過性産生を、トランスフェクション時に等モルのプラスミド比で３つの発現プラスミドを使用して開示している。
国際公開第２０１７／１８４８３１号（特許文献６）は、真核細胞における組換えタンパク質の部位特異的な組込みおよび発現、特に、発現増強遺伝子座を使用することによる、真核細胞、特にチャイニーズハムスター（Ｃｒｉｃｅｔｕｌｕｓ ｇｒｉｓｅｕｓ）細胞株における二重特異性抗体を含む抗体の発現を改善するための方法を開示しているとされている。この文書のデータは、匿名化された方法で提示され、したがって、実際に何が行われたかについての結論を許容しない。Ｃｒｅリコンビナーゼを使用した場合、それを追加のプラスミド上で同時トランスフェクトしたが、このプラスミドはその組成または起源に関して記載されていない。
Ｒａｊｅｎｄｒａ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ．は、単一のクワッドベクターが安定なＣＨＯ細胞株の生成のための単純であるが効果的な代替アプローチであり、臨床ヘテロｍＡｂ治療のための細胞株生成を加速し得ることを開示している（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３３（２０１７）４６９－４７７（非特許文献４））。
Ｇｕｒｕｍｕｒｔｈｙ，Ｃ．Ｂ．およびＫｅｎｔ Ｌｌｏｙｄ，Ｋ．Ｃ．は、生物医学研究のためのマウスモデルを開示した（Ｄｉｓ．Ｍｏｄ．Ｍｅｃｈ．１２（２０１９）（非特許文献５））。本発明者らは、胚性幹細胞における相同組換えによる従来の遺伝子標的化が、どのようにして、接合子における対立遺伝子特異的操作を可能にするより洗練された方法にとってかわられたかを論じている。
Ｂａｈｒ，Ｓ．，ｅｔ ａｌ．は、チャイニーズハムスター卵巣細胞における標的化組込みを使用するプラットフォーム発現系の開発を開示した（Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ＸＶＩ，２０１８の議事録（非特許文献６））。
国際公開第２０１７／０６０１４４号（特許文献７）は、共刺激ＴＮＦ受容体について四価を有する二重特異性抗体を開示している。国際公開第２０１９／０８６４９７号（特許文献８）は、標的化されたＯｘ４０アゴニストとの併用療法を開示している。
国際公開第２００６／００７８５０号 国際公開第２０１３／００６１４２号 国際公開第２０１８／１６２５１７号 国際公開第２０１６／０７９０７６号 国際公開第２０１４／０３３０７４号 国際公開第２０１７／１８４８３１号 国際公開第２０１７／０６０１４４号 国際公開第２０１９／０８６４９７号
Ｔｕｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４０７（２０１１）１９３－２２１ Ｃｒａｗｆｏｒｄ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ．（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．２９（２０１３）１３０７－１３１５） Ｔａｄａｕｃｈｉ，Ｔ．，ｅｔ ａｌ．（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３５（２０１９）Ｎｏ．２，１－１１） Ｒａｊｅｎｄｒａ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ．（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３３（２０１７）４６９－４７７） Ｇｕｒｕｍｕｒｔｈｙ，Ｃ．Ｂ．およびＫｅｎｔ Ｌｌｏｙｄ，Ｋ．Ｃ．（Ｄｉｓ．Ｍｏｄ．Ｍｅｃｈ．１２（２０１９）） Ｂａｈｒ，Ｓ．，ｅｔ ａｌ．（Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ＸＶＩ，２０１８の議事録）
三価の二重特異性抗体：
本明細書では、三価の二重特異性抗体、特にその重鎖の１つのＣ末端に追加のｓｃＦｖまたはＦａｂフラグメントを含む二価の単一特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を報告している。三価の二重特異性抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、三価の二重特異性抗体は、４つのポリペプチド、完全長軽鎖である１つの軽鎖、ドメイン交換軽鎖であるさらなる軽鎖、完全長重鎖である１つの重鎖、およびＣ末端に追加のドメイン交換重鎖または軽鎖Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である、さらなる重鎖からなるヘテロ多量体タンパク質である。三価の二重特異性抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
特に、本発明による方法は、脳シャトル抗体の作製に使用することができる。これらは、例えば国際公開第２０１４／０３３０７４号に記載されているようなフォーマットを有していてもよい。それらの分子は、血液脳関門の細胞上のヒトトランスフェリン受容体（第１の特異性）および標的治療抗原（第２の特異性）に同時に結合し、それによって輸送および治療効果を誘導することができる。
三価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて三価の二重特異性抗体を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
好ましい一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む第１の軽鎖、ならびに
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第２の軽鎖
を含み、
第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成し、
第１の結合部位はヒトトランスフェリン受容体に特異的に結合する。
好ましい一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第１の重鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む第１の軽鎖、ならびに
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第２の軽鎖
を含み、
第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成し、
第１の結合部位はヒトトランスフェリン受容体に特異的に結合する。
好ましい一実施形態において、三価の二重特異性抗体の第１の軽鎖および第２の軽鎖のいずれも共通軽鎖またはユニバーサル軽鎖ではない。
本発明は、ヘテロ多量体三価の二重特異性抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、三価の二重特異性抗体（例えば、脳シャトル抗体）の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、特定の発現カセット構成を有する、ヘテロ多量体の三価の二重特異性抗体をコードする核酸を、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込むことによって、三価の二重特異性抗体（例えば、脳シャトル抗体）の効率的な組換え発現および生産を達成できるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
二重リコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって、所定の発現カセット配列を哺乳動物細胞のゲノム中に有利に組み込めることが、見出されている。
本発明による１つの態様は、三価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、以下：
ａ）任意で三価の二重特異性抗体の発現に適した条件下で、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から三価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット
のいずれかを含む。
１つの実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット
のいずれかを含む、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット
のいずれかを含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の二重特異性抗体の発現のための使用である。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれる。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の一態様は、組換え哺乳動物細胞であって、細胞のゲノムに組み込まれた三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット
のいずれかを含む。
一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
全ての前述の態様の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、
－第１の（最も５’の）発現カセットに対して５’に位置する第１の組換え認識配列、
－第７または第８の（最も３’）に対して３’に位置する第２の組換え認識配列、および
－第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間、かつ
－発現カセットのうちの２つの間
に位置する第３の組換え認識配列
をさらに含み、
かつ
組換え認識配列は全て異なっている。
一実施形態において、第３の組換え認識配列は、第４の発現カセットと第５の発現カセットとの間に位置する。
一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の１つの態様は、３つの異なる組換え認識配列および７つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列、
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
を含み、
かつ、
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（３）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含む。
全ての前述の態様の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードする他の発現カセットをさらに含む。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の、
ｉ）５’、または
ｉｉ）３’、または
ｉｉｉ）部分的に５’および部分的に３’
のいずれかに位置している。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置し、前記発現カセットの５’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの３’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第４の発現カセットに隣接し（すなわち、第４の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）；かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第５の発現カセットに隣接している。
一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の一態様は、組換え哺乳動物細胞であって、細胞のゲノムに組み込まれた三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、次のエレメント、
第１、第２および第３の組換え認識配列、
第１の選択マーカーおよび第２の選択マーカー、ならびに
第１～第８の発現カセット、
を含み、前記エレメントの配列は、５’から３’の方向に、
ＲＲＳ１－第１のＥＣ－第２のＥＣ－第３のＥＣ－第４のＥＣ－ＲＲＳ３－ＳＭ１－第５のＥＣ－第６のＥＣ－第７のＥＣ－第８のＥＣ－ＲＲＳ２
または
ＲＲＳ１－第１のＥＣ－第２のＥＣ－第３のＥＣ－第４のＥＣ－ＲＲＳ３－ＳＭ１－第５のＥＣ－第６のＥＣ－第７のＥＣ－ＲＲＳ２
であり、
ＲＲＳ＝組換え認識配列、
ＥＣ＝発現カセット、
ＳＭ＝選択マーカーである。
本発明の１つの態様は、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および７つまたは８つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
を含み、
かつ、
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列、
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列、
または
（３）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列は、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識する（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、三価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
全ての態様および実施形態の好ましい一実施形態において、第１の結合部位はヒトトランスフェリン受容体に特異的に結合する。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、抗ＴｆＲ／ＣＤ２０二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５５４２号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、抗ＴｆＲ／Ａβ二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５５４０号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
二重特異性三価の抗体：
本明細書では、三価の抗体、特にＴ細胞二重特異性抗体（ＴＣＢ）等の二重特異性三価の抗体を発現する組換え哺乳動物細胞が報告されている。三価の抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、三価の抗体は、４つのポリペプチドまたはポリペプチド鎖、完全長軽鎖である１つの軽鎖、ドメイン交換軽鎖であるさらなる軽鎖、完全長重鎖である１つの重鎖、および追加のドメイン交換重鎖または軽鎖Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である、さらなる重鎖からなるヘテロ多量体タンパク質である。三価の抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
特に、本発明による方法は、Ｔ細胞二重特異性抗体（ＴＣＢ）の作製に使用することができる。これらは、例えば国際公開第２０１３／０２６８３１号に記載されているようなフォーマットを有していてもよい。それらの分子は、Ｔ細胞上のＣＤ３（第１の特異性）および標的（例えば、腫瘍）細胞上の抗原（第２の特異性）に同時に結合し、それによって標的細胞の死滅を誘導することができる。
本明細書ではまた、三価の抗体、特に三価の二重特異性抗体、より具体的にはＴＣＢを発現する組換え哺乳動物細胞を作製する方法、および前記組換え哺乳動物細胞を使用して三価の抗体、特に三価の二重特異性抗体、より具体的にはＴＣＢを作製する方法が報告されている。
好ましい一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、
ａ）第１の抗原にそれぞれ特異的に結合する第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメント、
ｂ）第２の抗原に特異的に結合し、ＣＨ１ドメインとＣＬドメインが互いに置換されている、１つのドメイン交換Ｆａｂフラグメント、
ｃ）第１の重鎖Ｆｃ領域のポリペプチドと第２の重鎖Ｆｃ領域ポリペプチドを含む、１つのＦｃ領域
を含み、
第１のＦａｂフラグメントのＣＨ１ドメインのＣ末端は、重鎖Ｆｃ領域ポリペプチドの１つのＮ末端に接続しており、ドメイン交換ＦａｂフラグメントのＣＬドメインのＣ末端は、他の重鎖Ｆｃ領域ポリペプチドのＮ末端に接続しており、かつ、
第２のＦａｂフラグメントのＣＨ１ドメインのＣ末端は、第１のＦａｂフラグメントのＶＨドメインのＮ末端またはドメイン交換ＦａｂフラグメントのＶＨドメインのＮ末端に接続されており、
第１の抗原または第２の抗原は、ヒトＣＤ３である。
好ましい一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、
ａ）第１の抗原にそれぞれ特異的に結合する第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメント、
ｂ）第２の抗原に特異的に結合し、ＶＨドメインとＶＬドメインが互いに置換されている、１つのドメイン交換Ｆａｂフラグメント、
ｃ）第１の重鎖Ｆｃ領域のポリペプチドと第２の重鎖Ｆｃ領域ポリペプチドを含む、１つのＦｃ領域
を含み、
第１のＦａｂフラグメントのＣＨ１ドメインのＣ末端は、重鎖Ｆｃ領域ポリペプチドの１つのＮ末端に接続しており、ドメイン交換ＦａｂフラグメントのＣＨ１ドメインのＣ末端は、他の重鎖Ｆｃ領域ポリペプチドのＮ末端に接続しており、かつ、
第２のＦａｂフラグメントのＣＨ１ドメインのＣ末端は、第１のＦａｂフラグメントのＶＨドメインのＮ末端またはドメイン交換ＦａｂフラグメントのＶＬドメインのＮ末端に接続されており、
第１の抗原または第２の抗原は、ヒトＣＤ３である。
好ましい一実施形態において、三価の二重特異性抗体の第１の軽鎖および第２の軽鎖のいずれも共通軽鎖またはユニバーサル軽鎖ではない。
本発明は、ヘテロ多量体三価の抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、特定の発現カセット構成を有する、ヘテロ多量体三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードする核酸を、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込むことによって、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の効率的な組換え発現および生産を達成できるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
二重リコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって、所定の発現カセット配列を哺乳動物細胞のゲノム中に有利に組み込めることが、判明している。
本発明による１つの態様は、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を製造するための方法であって、以下：
ａ）任意で三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現に適した条件下で、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を回収する工程
を含み、
三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
次のいずれか、
１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－任意に、第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセットを含み、
第１～第３の発現カセットは一方向に配列されており、第４～第６の発現カセットは、第１～第３の発現カセットとは一方向および逆方向に配列されているか、
または
３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含む。
好ましい一実施形態において、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。一実施形態において、第１の軽鎖はドメイン交換軽鎖である。
一実施形態において、デオキシリボ核酸は、第２の重鎖をコードする第１の発現カセットと第２の発現カセットとの間にさらなる発現カセットを含む。
一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
次のいずれか、
１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－任意に、第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセットを含み、
第１～第３の発現カセットは一方向に配列されており、第４～第６の発現カセットは、第１～第３の発現カセットとは一方向および逆方向に配列されているか、
または
３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含む、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸である。
好ましい一実施形態において、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。一実施形態において、第１の軽鎖はドメイン交換軽鎖である。
一実施形態において、デオキシリボ核酸は、第２の重鎖をコードする第１の発現カセットと第２の発現カセットとの間にさらなる発現カセットを含む。
一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
次のいずれか、
１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－任意に、第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセットを含み、
第１～第３の発現カセットは一方向に配列されており、第４～第６の発現カセットは、第１～第３の発現カセットとは一方向および逆方向に配列されているか、
または
３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含む、デオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現のための使用である。
好ましい一実施形態において、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。一実施形態において、第１の軽鎖はドメイン交換軽鎖である。
一実施形態において、デオキシリボ核酸は、第２の重鎖をコードする第１の発現カセットと第２の発現カセットとの間にさらなる発現カセットを含む。
一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれる。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の一態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
次のいずれか、
１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－任意に、第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセットを含む、
第１～第３の発現カセットは一方向に配列されており、第４～第６の発現カセットは、第１～第３の発現カセットとは一方向および逆方向に配列されているか、
または
３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含む。
好ましい一実施形態において、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。一実施形態において、第１の軽鎖はドメイン交換軽鎖である。
一実施形態において、デオキシリボ核酸は、第２の重鎖をコードする第１の発現カセットと第２の発現カセットとの間にさらなる発現カセットを含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
１つの実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸は、
－第１の（最も５’の）発現カセットに対して５’に位置する第１の組換え認識配列、
－第６の（最も３’）発現カセットに対して３’に位置する第２の組換え認識配列、および
－第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間、かつ
－発現カセットのうちの２つの間
に位置する第３の組換え認識配列をさらに含み、
ならびに
組換え認識配列は全て異なっている。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、第３の組換え認識配列は、第３の発現カセットと第４の発現カセットの間に位置する。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の１つの態様は、３つの異なる組換え認識配列および６つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
を含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
を含む。
好ましい一実施形態において、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。一実施形態において、第１の軽鎖はドメイン交換軽鎖である。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードする他の発現カセットをさらに含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の、
ｉ）５’、または
ｉｉ）３’、または
ｉｉｉ）部分的に５’および部分的に３’
のいずれかに位置している。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第３の発現カセットに隣接し（すなわち、第３の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第４の発現カセットに隣接している。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の一態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸は、次のエレメント、
第１、第２および第３の組換え認識配列、
第１の選択マーカーおよび第２の選択マーカー、ならびに
第１～第６の発現カセット、
を含み、５’から３’の方向に、前記エレメントの配列は、
ＲＲＳ１－第１のＥＣ－第２のＥＣ－第３のＥＣ－ＲＲＳ３－ＳＭ１－第４のＥＣ－第５のＥＣ－第６のＥＣ－ＲＲＳ２
であり、
ＲＲＳ＝組換え認識配列、
ＥＣ＝発現カセット、
ＳＭ＝選択マーカーである。
本発明の１つの態様は、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸を含み三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および６つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
を含み、
ならびに
第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの３’末端部分、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
を含み、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）をコードするデオキシリボ核酸を含み、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
全ての前述の態様および実施形態の好ましい一実施形態において、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、第１の軽鎖はドメイン交換軽鎖である。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのない１つの第２の選択マーカーのコード配列およびポリＡシグナルを含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、プロモータ配列は、上流で発現カセットに隣接し（すなわち、発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）；かつ、１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの３’末端部分は、開始コドンを欠く１つの第２の選択マーカーのコード配列を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で発現カセットに隣接している。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
ｉ）第１の発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、第１の重鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
ｉｉ）第２の発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、第１の軽鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
ｉｉｉ）第３の発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、第１の軽鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
ｉｖ）第４の発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、第２の重鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
ｖ）第５の発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、第２の軽鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
ｖｉ）第６の発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、第２の軽鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、かつ、
（ｖｉｉ）選択マーカーをコードする発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含む。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体（ＴＣＢ）は、
－第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントであって、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントの各結合部位が第２の抗原に特異的に結合する、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメント、
－第３のＦａｂフラグメントであって、第３のＦａｂフラグメントの結合部位が第１の抗原に特異的に結合し、可変軽鎖ドメイン（ＶＬ）と可変重鎖ドメイン（ＶＨ）とが互いに入れ替えられるようにドメインクロスオーバーを含む、第３のＦａｂフラグメント、および
－Ｆｃ領域であって、第１のＦｃ領域のポリペプチドと第２のＦｃ領域のポリペプチドとを含む、Ｆｃ領域
を含み、
第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントがそれぞれ、重鎖フラグメントおよび完全長軽鎖を含み、
第１のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端は、第１のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されており、
第２のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端が、第３のＦａｂフラグメントの可変軽鎖ドメインのＮ末端に融合されており、第３のＦａｂフラグメントの重鎖定常ドメイン１のＣ末端が、第２のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されている。
本明細書における全ての態様および実施形態の一実施形態において、少なくとも１つの選択マーカー発現カセットは、抗体の重鎖発現カセットおよび軽鎖発現カセットとは反対の方向に方向付けられている。
本明細書における全ての態様および実施形態の一実施形態において、抗体重鎖発現カセットおよび抗体軽鎖発現カセットは、互いに一方向性（すなわち、３’から５’の方向に同じ方向を有する）に配置され、選択マーカー発現カセットの少なくとも１つは、抗体重鎖発現カセットおよび抗体軽鎖発現カセットに対して双方向に配置されている。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体は、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体である。一実施形態において、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体はＴＣＢであり、ＣＤ２０は第２の抗原である。一実施形態において、二重特異性抗ＣＤ３／ＣＤ２０抗体は、ＲＧ６０２６である。そのような抗体は、国際公開第２０１６／０２０３０９号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体は、抗ＣＤ３／ＣＥＡ二重特異性抗体である。一実施形態において、抗ＣＤ３／ＣＥＡ二重特異性抗体はＴＣＢであり、ＣＥＡは第２の抗原である。一実施形態において、二重特異性抗ＣＤ３／ＣＥＡ抗体は、ＲＯ６９５８６８８またはＲＧ７８０２またはシビサタマブである。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５３８９号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
全ての態様および実施形態の好ましい一実施形態において、第１の結合部位はヒトＣＤ３に特異的に結合する。
全ての態様および実施形態の好ましい一実施形態において、第２の結合部位はヒトＣＤ３に特異的に結合する。
ドメイン交換を伴う二価の二重特異性抗体：
本明細書において、二価の二重特異性抗体、特にドメイン交換を伴う二価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞が報告されている。二価の二重特異性抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、二価の二重特異性抗体は、４つのポリペプチドまたはポリペプチド鎖、完全長軽鎖である１つの軽鎖、ドメイン交換軽鎖であるさらなる軽鎖、完全長重鎖である１つの重鎖、およびドメイン交換重鎖である、さらなる重鎖からなるヘテロ多量体タンパク質である。二価の二重特異性抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
二価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて二価の二重特異性抗体を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
好ましい一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第２の軽鎖
を含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
好ましい一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む第１の軽鎖、ならびに
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第２の軽鎖
を含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明は、ヘテロ多量体二価の二重特異性抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、二価の二重特異性抗体の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、特定の発現カセット構成を有する、ヘテロ多量体二価の二重特異性抗体をコードする核酸を、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込むことによって、二価の二重特異性抗体の効率的な組換え発現および生産を達成できるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
二重リコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって、所定の発現カセット配列を哺乳動物細胞のゲノム中に有利に組み込めることが、判明している。
本発明による１つの態様は、二価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、以下：
ａ）任意で二価の二重特異性抗体の発現に適した条件下で、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から二価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
を含む。
一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
のいずれかを含む、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
のいずれかを含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における二価の二重特異性抗体の発現のための使用である。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれる。
一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の一態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
のいずれかを含む、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
全ての前述の態様の一実施形態において、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、
－第１の（最も５’の）発現カセットに対して５’に位置する第１の組換え認識配列、
－第４の（最も３’）発現カセットに対して３’に位置する第２の組換え認識配列、および
－第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間、かつ
－発現カセットのうちの２つの間
に位置する第３の組換え認識配列
をさらに含み、
ならびに
組換え認識配列は全て異なっている。
一実施形態において、第３の組換え認識配列は、第２の発現カセットと第３の発現カセットの間に位置する。
一実施形態において、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の１つの態様は、３つの異なる組換え認識配列および８つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー、
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列、
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含む。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
全ての前述の態様の一実施形態において、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードする他の発現カセットをさらに含む。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の、
ｉ）５’、または
ｉｉ）３’、または
ｉｉｉ）部分的に５’および部分的に３’
のいずれかに位置している。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置し、前記発現カセットの５’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの３’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第２の発現カセットに隣接し（すなわち、第２の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第３の発現カセットに隣接している。
一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の一態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、次のエレメント、
第１、第２および第３の組換え認識配列、
第１の選択マーカーおよび第２の選択マーカー、ならびに
第１～第４の発現カセット
を含み、５’から３’の方向に、前記エレメントの配列は、
ＲＲＳ１－第１のＥＣ－第２のＥＣ－ＲＲＳ３－ＳＭ１－第３のＥＣ－第４のＥＣ－ＲＲＳ２
であり、
ＲＲＳ＝組換え認識配列、
ＥＣ＝発現カセット、
ＳＭ＝選択マーカーである。
本発明の１つの態様は、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み二価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および４つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、二価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、二価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ二重特異性抗体である。一実施形態において、二重特異性抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ抗体は、ＲＧ７２２１またはバヌシズマブである。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ二重特異性抗体である。一実施形態において、二重特異性抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ抗体は、ＲＧ７７１６またはファリシマブである。
そのようなＡＮＧ２／ＶＥＧＦ二重特異性抗体は、国際公開第２０１０／０４０５０８号、国際公開第２０１１／１１７３２９号、国際公開第２０１４／００９４６５号に報告されており、これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＰＤ１／ＴＩＭ３二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５４０４号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＰＤ１／Ｌａｇ３二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１８／１８５０４３号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
多価の二重特異性抗体：
多価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞が、本明細書において報告されている。多価の二重特異性抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、多価の二重特異性抗体は、３つのポリペプチドまたはポリペプチド鎖、完全長軽鎖である１つの軽鎖、Ｎ末端に付加的な重鎖ＦａｂフラグメントおよびＣ末端に付加的な軽鎖可変ドメインを含む伸長重鎖である１つの重鎖、Ｎ末端に付加的な重鎖ＦａｂフラグメントおよびＣ末端に付加的な重鎖可変ドメインを含む伸長重鎖であるさらなる重鎖からなるヘテロ多量体タンパク質である。多価の二重特異性抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。多価の二重特異性抗体は、好ましい一実施形態において、少なくとも四価である。多価の二重特異性抗体は、好ましい一実施形態において、最大で１０価、より好ましくは最大で８価である。
多価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて多価の二重特異性抗体を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
好ましい一実施形態において、多価の二重特異性抗体は、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメインの第２のコピー、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第１の軽鎖可変ドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメインの第２のコピー、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第２の重鎖可変ドメインを含む第２の重鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第１の軽鎖
を含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
好ましい一実施形態において、多価の二重特異性抗体の第１の軽鎖および第２の軽鎖のいずれも共通軽鎖またはユニバーサル軽鎖ではない。
本発明は、ヘテロ多量体多価の二重特異性抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、多価の二重特異性抗体の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、特定の発現カセット構成を有する、ヘテロ多量体多価の二重特異性抗体をコードする核酸を、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込むことによって、多価の二重特異性抗体の効率的な組換え発現および生産を達成できるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
二重リコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって、所定の発現カセット配列を哺乳動物細胞のゲノム中に有利に組み込めることが見出されている。
本発明による１つの態様は、多価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、以下：
ａ）任意で多価の二重特異性抗体の発現に適した条件下で、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から多価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含む。
一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含む、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
本発明の１つの態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における多価の二重特異性抗体の発現のための使用である。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれる。
使用の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の一態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含む、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
全ての前述の態様の一実施形態において、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、
－第１の（最も５’の）発現カセットに対して５’に位置する第１の組換え認識配列、
－第６または第８の（最も３’）発現カセットに対して３’に位置する第２の組換え認識配列、および
－第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間、かつ
－発現カセットのうちの２つの間
に位置する第３の組換え認識配列
をさらに含み、
かつ
全ての組換え認識配列は異なる。
一実施形態において、第３の組換え認識配列は、第３の発現カセットと第４の発現カセットの間、または第４の発現カセットと第５の発現カセットとの間に位置する。
一実施形態において、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の１つの態様は、３つの異なる組換え認識配列および８つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含む。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
全ての前述の態様の一実施形態において、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードする他の発現カセットをさらに含む。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の、
ｉ）５’、または
ｉｉ）３’、または
ｉｉｉ）部分的に５’および部分的に３’
のいずれかに位置している。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置し、前記発現カセットの５’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの３’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流でそれぞれ第３または第４の発現カセットに隣接し（すなわち、第３または第４の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流でそれぞれ第４または第５の発現カセットに隣接している。
一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の一態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、次のエレメント、
第１、第２および第３の組換え認識配列、
第１の選択マーカーおよび第２の選択マーカー、ならびに
第１～第６または第１～第８の発現カセット
を含み、５’から３’の方向に、前記エレメントの配列は、
ＲＲＳ１－第１のＥＣ－第２のＥＣ－第３のＥＣ－ＲＲＳ３－ＳＭ１－第４のＥＣ－第５のＥＣ－第６のＥＣ－ＲＲＳ２
または
ＲＲＳ１－第１のＥＣ－第２のＥＣ－第３のＥＣ－第４のＥＣ－ＲＲＳ３－ＳＭ１－第５のＥＣ－第６のＥＣ－第７のＥＣ－第８のＥＣ－ＲＲＳ２
であり、
ＲＲＳ＝組換え認識配列、
ＥＣ＝発現カセット、
ＳＭ＝選択マーカーである。
本発明の１つの態様は、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み多価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および６つまたは８つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第３の組換え認識配列の第１のコピー、
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列、
または（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、多価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、多価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第１の軽鎖可変ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第２の重鎖可変ドメインを含み、かつ
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての前述の態様および実施形態のうちの一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、全ての発現カセットが一方向に配列されている。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、多価の二重特異性抗体は、抗ＦＡＰ／Ｏｘ４０二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０６０１４４号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
Ｃｒｅ ｍＲＮＡを用いた標的化組込み：
異種性ポリペプチドを発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて異種性ポリペプチドを製造するための方法も、本明細書において報告されている。
本発明は、少なくとも部分的には、例えばＣｒｅリコンビナーゼＤＮＡ（Ｃｒｅ ＤＮＡ）の代わりにＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡ（Ｃｒｅ ｍＲＮＡ）を使用すると、標的化インテグレーションによって得られるクローンの数を改善できるという知見に基づいている。より詳細には、選択期間後、Ｃｒｅ ｍＲＮＡ生成組換え細胞プールにおけるクローンの絶対数は、ＣＲＥプラスミド生成組換え細胞プールよりも多いことが見出された。したがって、例えばＣｒｅリコンビナーゼをコードするプラスミド（Ｃｒｅプラスミド）の代わりにＣｒｅ ｍＲＮＡを使用することによって、クローン数および不均一性が増加した組換え細胞プールを得ることができる。この理論に束縛されるものではないが、それにより、高力価および良好な生成物品質を有する組換え細胞クローンを見出す確率が増加すると想定される。さらに、Ｃｒｅ ｍＲＮＡ生成プールからの組換え細胞クローンの数の増加は、Ｃｒｅプラスミド生成細胞プールと比較して安定であることが見出された。
リコンビナーゼ反応のために導入されたＣｒｅ ｍＲＮＡは、単離されたＣｒｅ ｍＲＮＡであり、ならびに本発明による方法におけるＣｒｅリコンビナーゼの唯一の供給源であることを指摘しなければならない。
本発明の１つの独立した態様は、ポリペプチドを製造するための方法であって、以下：
ａ）任意でポリペプチドの発現に適した条件下で、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地からポリペプチドを回収する工程
を含み、
ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸が、Ｃｒｅ ｍＲＮＡを使用するＣｒｅリコンビナーゼ媒介カセット交換によって哺乳動物細胞のゲノムに安定に組み込まれている、方法である。
本発明の別の独立した態様は、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含み、ポリペプチドを分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および１～８つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－１つまたは複数の発現カセット、
－１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの３’末端部分、
－１つまたは複数の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡを導入する工程であって、
Ｃｒｅリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、任意で、リコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、ポリペプチドを分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含み、ポリペプチドを分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
本発明の別の態様は、組換え哺乳動物細胞のゲノムの単一部位に、標的化組込みによって安定に組み込まれた、目的の（異種性）ポリペプチドをコードする（異種性および／またはトランスジェニック）デオキシリボ核酸（の厳密に１つのコピー）を含む前記組換え哺乳動物細胞の数を増加させるためのＣｒｅ－リコンビナーゼｍＲＮＡの使用であり、一実施形態において、組換え細胞はまた、その中での培養時に目的のポリペプチドを培養培地に分泌する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞および／または導入されたＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡは、Ｃｒｅリコンビナーゼをコードするデオキシリボ核酸を含まない。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡは、単離されたＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡである。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２０のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、そのＮ末端もしくはＣ末端または両方に核局在化配列をさらに含むポリペプチドをコードする。一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２０のアミノ酸配列を有し、そのＮ末端もしくはＣ末端に、または両方に、互いに独立して、１～５つの核局在化配列をさらに含むポリペプチドをコードする。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２１のアミノ酸配列またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含む。全ての態様の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２１のヌクレオチド配列、またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含み、その５’末端もしくは３’末端または両方に、核局在化配列をコードするさらなる核酸をさらに含む。全ての態様の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２１のヌクレオチド配列、またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含み、その５’末端もしくは３’末端または両方に互いに独立して、１～５個の、核局在化配列をコードする核酸をさらに含む。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、１～８つの発現カセットを含む。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、少なくとも４つの発現カセットを含み、
－第１の組換え認識配列は、最も５’の（すなわち、第１の）発現カセットに対して５’に位置し、
－第２の組換え認識配列は、最も３’の発現カセット（すなわち最後の発現カセット）に対して３’に位置し、かつ、
－第３の組換え認識配列は、
－第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間、かつ
－発現カセットのうちの２つの間
に位置し、
かつ
全ての組換え認識配列は異なる。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、第３の組換え認識配列は、第２の発現カセットと第３の発現カセット、または第３の発現カセットと第４の発現カセット、または第４の発現カセットと第５の発現カセットとの間に位置する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードする発現カセットをさらに含む。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の、
ｉ）５’、または
ｉｉ）３’、または
ｉｉｉ）部分的に５’および部分的に３’
のいずれかに位置している。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、二価単一特異性抗体、二価の二重特異性抗体、少なくとも１つのドメイン交換を含む二価の二重特異性抗体、および少なくとも１つのドメイン交換を含む三価の二重特異性抗体からなるポリペプチドの群から選択される。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ多量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第１の軽鎖可変ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第２の重鎖可変ドメインを含む、第２の重鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第１の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、治療用抗体である。好ましい一実施形態において、治療用抗体は、二重特異性（治療用）抗体である。一実施形態において、二重特異性（治療用）抗体はＴＣＢである。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、二重特異性（治療用）抗体（ＴＣＢ）であって、
－第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントであって、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントの各結合部位が第２の抗原に特異的に結合する、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメント、
－第３のＦａｂフラグメントであって、第３のＦａｂフラグメントの結合部位が第１の抗原に特異的に結合し、可変軽鎖ドメイン（ＶＬ）と可変重鎖ドメイン（ＶＨ）とが互いに置換されるようにドメインクロスオーバーを含む、第３のＦａｂフラグメント、
－Ｆｃ領域であって、第１のＦｃ領域のポリペプチドと第２のＦｃ領域のポリペプチドとを含む、Ｆｃ領域
を含み、
第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントがそれぞれ、重鎖フラグメントおよび完全長軽鎖を含み、
第１のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端は、第１のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されており、
第２のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端が、第３のＦａｂフラグメントの可変軽鎖ドメインのＮ末端に融合されており、第３のＦａｂフラグメントの重鎖定常ドメイン１のＣ末端が、第２のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されている、二重特異性（治療用）抗体（ＴＣＢ）である。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体である。一実施形態において、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体はＴＣＢであり、ＣＤ２０は第２の抗原である。一実施形態において、二重特異性抗ＣＤ３／ＣＤ２０抗体は、ＲＧ６０２６である。
全ての前述の態様および実施形態の実施形態：
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのない１つの第２の選択マーカーのコード配列およびポリＡシグナルを含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、プロモータ配列は、上流で発現カセットに隣接し（すなわち、発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）；かつ、１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの３’末端部分は、開始コドンを欠く１つの第２の選択マーカーのコード配列を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で発現カセットに隣接している。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
これまでの全ての態様および実施形態のうちの１つの実施形態において、第１のデオキシリボ核酸は第１のベクターに組み込まれ、第２のデオキシリボ核酸は第２のベクターに組み込まれる。
全ての前述の態様および実施形態のうちの一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、
抗体鎖についての発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
かつ
選択マーカーをコードする各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含む。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むか、または含まないヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
ターミネータ配列は、ＲＮＡポリメラーゼＩＩによる非常に長いＲＮＡ転写物の生成、すなわち、本発明によるデオキシリボ核酸中の次の発現カセットへのリードスルーを防止し、本発明による方法で使用される。すなわち、目的の１つの構造遺伝子の発現は、それ自体のプロモータによって制御される。
したがって、ポリアデニル化シグナルとターミネータ配列との組合せによって、効率的な転写終結が達成される。すなわち、ＲＮＡポリメラーゼＩＩのリードスルーは、二重終結シグナルの存在によって妨げられる。ターミネータ配列は、複合体分解を開始し、ＤＮＡ鋳型からのＲＮＡポリメラーゼの解離を促進する。
全ての前述の態様および実施形態のうちの一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、選択マーカーの発現カセットを除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
全ての前述の態様および実施形態のうちの一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態において、ＣＨＯ細胞はＣＨＯ－Ｋ１細胞である。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、抗体は、治療用抗体である。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体の第１の軽鎖および第２の軽鎖のいずれも共通軽鎖またはユニバーサル軽鎖ではない。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
全ての態様および実施形態の好ましい一実施形態において、厳密に２つのデオキシリボ核酸が含まれるか、または導入される。
本発明によるデオキシリボ核酸中の個々の発現カセットは、連続して配置される。１つの発現カセットの末端とその後に続く発現カセットの開始部との間の距離は、クローニング手順に必要とされた、すなわちクローニング手順から生じるわずか数ヌクレオチドである。
全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、２つの直後の発現カセットは、最大で１００ｂｐ離れている（すなわち、ポリＡシグナル配列またはターミネータ配列のそれぞれの末端から、以下のプロモータエレメントの開始部までは最大１００塩基対（ｂｐ）である）。一実施形態において、２つの直後の発現カセットは、最大で５０ｂｐ離間している。好ましい一実施形態において、２つの直後の発現カセットは、最大で３０ｂｐ離間している。
[本発明1001]
三価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、
ａ）前記三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）前記細胞または培養培地から前記三価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
前記三価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、前記哺乳動物細胞のゲノム中に安定的に組み込まれ、かつ5’から3’の方向に、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖または前記第2の重鎖または第2の軽鎖のいずれかをコードする第6の発現カセット、および
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット
を含む、方法。
[本発明1002]
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸であって、5’から3’の方向に、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖または前記第2の重鎖または第2の軽鎖のいずれかをコードする第6の発現カセット、および
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット
を含む、デオキシリボ核酸。
[本発明1003]
5’から3’の方向に、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖または前記第2の重鎖または第2の軽鎖のいずれかをコードする第6の発現カセット、および
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の二重特異性抗体の発現のための使用。
[本発明1004]
組換え哺乳動物細胞であって、前記細胞のゲノムに組み込まれた三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、前記三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖または前記第2の重鎖または第2の軽鎖のいずれかをコードする第6の発現カセット、および
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット
を含む、組換え哺乳動物細胞。
[本発明1005]
3つの異なる組換え認識配列および4つの発現カセットを順に含む、2つのデオキシリボ核酸を含む組成物であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
を含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖または前記第2の重鎖または第2の軽鎖のいずれかをコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
を含む、組成物。
[本発明1006]
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下の工程：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む前記哺乳動物細胞を提供する工程であって、前記外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも1つの第1の選択マーカーに隣接する第1の組換え認識配列および第2の組換え認識配列、ならびに前記第1の組換え認識配列と前記第2の組換え認識配列との間に位置する第3の組換え認識配列を含み、かつ前記組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された前記細胞に、3つの異なる組換え認識配列および少なくとも7つの発現カセットを含む2つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
を含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－前記第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖または前記第2の重鎖または第2の軽鎖のいずれかをコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
を含み、
前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列は、組み込まれた前記外因性ヌクレオチド配列の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列と一致しており、
1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの5’末端部分および3’末端部分が、一緒になる場合、前記1つの第2の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、1つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記組換え認識配列を認識する（かつ任意で、前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、2リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程
ならびに
ｄ）前記第2の選択マーカーを発現しかつ前記三価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程
を含み、それにより、前記三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法。
[本発明1007]
前記デオキシリボ核酸が、前記第7の発現カセットの後に、前記第2の軽鎖をコードする第8の発現カセットを含む、本発明1001～1006のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1008]
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメイン中に変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメイン中に変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、本発明1001～1007のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1009]
前記重鎖の一方が変異Ｓ354Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ349Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、本発明1008の三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1010]
前記第1の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ1－ＣＬを含む伸長重鎖である、本発明1001～1009のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1011]
前記第1の軽鎖が、ドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ1－ＣＬである、本発明1001～1010のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1012]
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、ＣＨ3ドメイン、ペプチドリンカー、第2の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ1ドメインを含み、かつ、
－前記第2の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1001～1011のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1013]
前記デオキシリボ核酸の厳密に1コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、本発明1001、1003、1004および1006～1012のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1014]
前記三価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、
前記選択マーカーをコードする前記発現カセットが、前記第3の組換え認識配列に対して部分的に5’および部分的に3’に位置し、前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されており、
前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、それにより、前記プロモータ配列が、上流で前記第4の発現カセットに隣接し、前記開始コドンが、下流で前記第3の組換え認識配列に隣接し、かつ前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で前記第3の組換え認識配列に隣接し、下流で前記第5の発現カセットに隣接し、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されている、
本発明1001～1005および1007～1013のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1015]
抗体鎖についての各発現カセットが、5’から3’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、かつ
前記選択マーカーをコードする各発現カセットが、5’から3’の方向に、プロモータ、前記選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、
前記プロモータが、ＳＶ40プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ40ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
本発明1001～1014のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1016]
前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、本発明1001、1003、1004および1006～1015のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1017]
全てのカセットが一方向に配列されている、本発明1001～1016のいずれかの、三価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1018]
三価の抗体を製造するための方法であって、
ａ）前記三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）前記細胞または培養培地から前記三価の抗体を回収する工程
を含み、
前記三価の抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、前記哺乳動物細胞のゲノム中に安定的に組み込まれ、かつ5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（3）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（4）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（5）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、
または
（6）
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット
のいずれかを含む、方法。
[本発明1019]
三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸であって、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（3）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（4）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（5）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、
または
（6）
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット
のいずれかを含む、デオキシリボ核酸。
[本発明1020]
5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（3）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（4）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（5）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、
または
（6）
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット
のいずれかを含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の抗体の発現のための使用。
[本発明1021]
組換え哺乳動物細胞であって、前記細胞のゲノムに組み込まれた三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、前記三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（3）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
または
（4）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（5）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、
または
（6）
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット
のいずれかを含む、組換え哺乳動物細胞。
[本発明1022]
3つの異なる組換え認識配列および5～7つの発現カセットを順に含む、2つのデオキシリボ核酸を含む組成物であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（2）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（3）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（4）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（5）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（6）
－第1の組換え認識配列、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
のいずれかを含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（2）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（3）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（4）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第1の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（5）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（6）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
のいずれかを含む、組成物。
[本発明1023]
三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記三価の抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下の工程：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む前記哺乳動物細胞を提供する工程であって、前記外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも1つの第1の選択マーカーに隣接する第1の組換え認識配列および第2の組換え認識配列、ならびに前記第1の組換え認識配列と前記第2の組換え認識配列との間に位置する第3の組換え認識配列を含み、かつ前記組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された前記細胞に、3つの異なる組換え認識配列および5～7つの発現カセットを含む2つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（2）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（3）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（4）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（5）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（6）
－第1の組換え認識配列、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
のいずれかを含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（2）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（3）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（4）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第1の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（5）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（6）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
のいずれかを含み、
前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列が、組み込まれた前記外因性ヌクレオチド配列の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列と一致しており、
1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの5’末端部分および3’末端部分が、一緒になる場合、前記1つの第2の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、1つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記組換え認識配列を認識する（かつ任意で、前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、2リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程
ならびに
ｄ）前記第2の選択マーカーを発現しかつ前記三価の抗体を分泌する細胞を選択する工程
を含み、それにより、前記三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記三価の抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法。
[本発明1024]
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメイン中に変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメイン中に変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含むか、またはその逆である、本発明1018～1023のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1025]
前記重鎖の一方が変異Ｓ354Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ349Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、本発明1024の、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1026]
前記第1の重鎖が、さらなるドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である、本発明1018～1025のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1027]
前記第1の軽鎖が、ドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ1－ＣＬである、本発明1018～1026のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1028]
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、第1の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－前記第2の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1018～1027のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1029]
前記デオキシリボ核酸が、単一の部位または遺伝子座で、前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、本発明1018、1020、1021および1023～1028のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1030]
前記三価の抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、前記選択マーカーをコードする前記発現カセットが、前記第3の組換え認識配列に対して部分的に5’および部分的に3’に位置し、前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されている、本発明1018～1022および1024～1029のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1031]
前記プロモータが、ＳＶ40プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ40ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
本発明1018～1022および1024～1030のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1032]
前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、本発明1018、1020、1021および1023～1031のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1033]
5’から3’方向の構成が第1の発現カセットとして前記第1の重鎖をコードする発現カセットを有する場合、全てのカセットが一方向に配列されている、本発明1018～1032のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1034]
5’から3’方向の構成が、前記第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、前記第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、前記第1の重鎖をコードする第3の発現カセット、前記第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、前記第2の軽鎖をコードする第5の発現カセット、前記第2の軽鎖をコードする第6の発現カセットである場合、前記第1の発現カセット～前記第3の発現カセットが一方向に配置され、前記第4の発現カセット～前記第6の発現カセットが一方向に配置され、それにより、前記第1の発現カセット～前記第3の発現カセットが前記第4の発現カセット～前記第6の発現カセットの反対方向に配置される、本発明1017から1032のいずれかの、三価の抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1035]
二価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、
ａ）前記二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）前記細胞または培養培地から前記二価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
前記二価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、前記哺乳動物細胞のゲノム中に安定的に組み込まれ、かつ5’から3’の方向に、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット
を含み、
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、方法。
[本発明1036]
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸であって、5’から3’の方向に、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット
を含み、
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、デオキシリボ核酸。
[本発明1037]
5’から3’の方向に、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における二価の二重特異性抗体の発現のための使用であって、
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、使用。
[本発明1038]
組換え哺乳動物細胞であって、前記細胞のゲノムに組み込まれた二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、前記二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、
－第2の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット
を含み、
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、組換え哺乳動物細胞。
[本発明1039]
3つの異なる組換え認識配列および4つの発現カセットを順に含む、2つのデオキシリボ核酸を含む組成物であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の組換え認識配列、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
を含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
を含み、
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、組成物
[本発明1040]
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記二価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下の工程：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む前記哺乳動物細胞を提供する工程であって、前記外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも1つの第1の選択マーカーに隣接する第1の組換え認識配列および第2の組換え認識配列、ならびに前記第1の組換え認識配列と前記第2の組換え認識配列との間に位置する第3の組換え認識配列を含み、かつ前記組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された前記細胞に、3つの異なる組換え認識配列および4つの発現カセットを含む2つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の組換え認識配列、
－第1の軽鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の重鎖をコードする第2の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
を含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
を含み、
前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列は、組み込まれた前記外因性ヌクレオチド配列の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列と一致しており、
1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの5’末端部分および3’末端部分が、一緒になる場合、前記1つの第2の選択マーカーの機能的発現カセットを形成し、
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメインに変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、1つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記組換え認識配列を認識する（かつ任意で、前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、2リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程
ならびに
ｄ）前記第2の選択マーカーを発現しかつ前記二価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程
を含み、それにより、前記二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記二価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法。
[本発明1041]
前記重鎖の一方が変異Ｓ354Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ349Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、本発明1035～1040のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1042]
前記第2の軽鎖が、ＶＨ－ＶＬ交換後のドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＣＨ1、またはＣＨ1－ＣＬ交換後のドメイン交換軽鎖ＶＬ－ＣＨ1である、本発明1035～1041のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1043]
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第1の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－前記第2の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1035～1042のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1044]
前記デオキシリボ核酸の厳密に1コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、本発明1035、1037、1038および1040～1043のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1045]
前記二価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、前記選択マーカーをコードする前記発現カセットが、前記第3の組換え認識配列に対して部分的に5’および部分的に3’に位置し、前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されており、前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、それにより、前記プロモータ配列が、上流で前記第2の発現カセットに隣接し、前記開始コドンが、下流で前記第3の組換え認識配列に隣接し、かつ前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で前記第3の組換え認識配列に隣接し、下流で前記第3の発現カセットに隣接し、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されている、本発明1035～1039および1040～1044のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1046]
抗体鎖についての各発現カセットが、5’から3’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、ポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、かつ
前記選択マーカーをコードする各発現カセットが、5’から3’の方向に、プロモータ、前記選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、
前記プロモータが、ＳＶ40プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ40ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
本発明1035～1045のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1047]
前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、本発明1035、1037、1038および1040～1046のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1048]
全てのカセットが一方向に配列されている、本発明1035～1047のいずれかの、二価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1049]
多価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、
ａ）前記多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）前記細胞または培養培地から多価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
前記多価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、前記哺乳動物細胞のゲノム中に安定的に組み込まれ、かつ5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第8の発現カセット
のいずれかを含む、方法。
[本発明1050]
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸であって、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第8の発現カセット
のいずれかを含む、デオキシリボ核酸。
[本発明1051]
5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第8の発現カセット
のいずれかを含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における多価の二重特異性抗体の発現のための使用。
[本発明1052]
組換え哺乳動物細胞であって、前記細胞のゲノムに組み込まれた多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、前記多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第5の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
または
（2）
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第7の発現カセット、および
－前記第1の軽鎖をコードする第8の発現カセット
のいずれかを含む、組換え哺乳動物細胞。
[本発明1053]
3つの異なる組換え認識配列および6または8つの発現カセットを順に含む、2つのデオキシリボ核酸を含む組成物であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（2）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
のいずれかを含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（2）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第7の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第8の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
のいずれかを含む、組成物。
[本発明1054]
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記多価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下の工程：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む前記哺乳動物細胞を提供する工程であって、前記外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも1つの第1の選択マーカーに隣接する第1の組換え認識配列および第2の組換え認識配列、ならびに前記第1の組換え認識配列と前記第2の組換え認識配列との間に位置する第3の組換え認識配列を含み、かつ前記組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された前記細胞に、3つの異なる組換え認識配列および6または8つの発現カセットを含む2つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
－第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー、
または
（2）
－第1の組換え認識配列、
－第1の重鎖をコードする第1の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第2の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第3の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第4の発現カセット、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
のいずれかを含み、
かつ、
－第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
（1）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第4の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第5の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列、
または
（2）
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－第2の重鎖をコードする第5の発現カセット、
－第1の軽鎖をコードする第6の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第7の発現カセット、
－前記第1の軽鎖をコードする第8の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
のいずれかを含み、
前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列が、組み込まれた前記外因性ヌクレオチド配列の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列と一致しており、
1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの5’末端部分および3’末端部分が、一緒になる場合、前記1つの第2の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、1つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記組換え認識配列を認識する（かつ任意で、前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、2リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程
ならびに
ｄ）前記第2の選択マーカーを発現しかつ前記多価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程
を含み、それにより、前記多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記多価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法。
[本発明1055]
前記第1の重鎖が、ＣＨ3ドメイン中に変異Ｔ366Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第2の重鎖が、ＣＨ3ドメイン中に変異Ｔ366Ｓ、Ｌ368Ａ、およびＹ407Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含むか、またはその逆である、本発明1049～1054のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1056]
前記重鎖の一方が変異Ｓ354Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ349Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、本発明1055の、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1057]
前記第1の軽鎖がドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ1－ＣＬである、本発明1049～1056のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1058]
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、ＣＨ3ドメイン、および第1の軽鎖可変ドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、ＣＨ3ドメイン、および第2の重鎖可変ドメインを含み、かつ
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1049～1057のいずれかの多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1059]
前記デオキシリボ核酸の厳密に1コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、本発明1049、1051、1052および1054～1058のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1060]
前記多価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、前記選択マーカーをコードする前記発現カセットが、前記第3の組換え認識配列に対して部分的に5’および部分的に3’に位置し、前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されており、前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、それにより、前記プロモータ配列が、上流で前記第3の発現カセットまたは前記第4の発現カセットにそれぞれ隣接し、前記開始コドンが、下流で前記第3の組換え認識配列に隣接し、かつ前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で前記第3の組換え認識配列に隣接し、下流で前記第4の発現カセットまたは前記第5の発現カセットにそれぞれ隣接し、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されている、本発明1049～1053および1055～1059のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1061]
抗体鎖についての各発現カセットが、5’から3’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、かつ
前記選択マーカーをコードする各発現カセットが、5’から3’の方向に、プロモータ、前記選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、
前記プロモータが、ＳＶ40プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ40ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
本発明1049～1060のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1062]
前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、本発明1049、1051、1052および1054～1061のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1063]
全ての発現カセットが一方向に配列されている、本発明1049～1062のいずれかの、多価の二重特異性抗体を製造するための方法、またはデオキシリボ核酸、または使用、または組換え哺乳動物細胞、または組成物、または組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
[本発明1064]
ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記ポリペプチドを分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下の工程：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む前記哺乳動物細胞を提供する工程であって、前記外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも1つの第1の選択マーカーに隣接する第1の組換え認識配列および第2の組換え認識配列、ならびに前記第1の組換え認識配列と前記第2の組換え認識配列との間に位置する第3の組換え認識配列を含み、かつ前記組換え認識配列が全て異なっており、前記哺乳動物細胞が、ＣｒｅリコンビナーゼをコードするＤＮＡを含まない、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された前記細胞に、3つの異なる組換え認識配列および1～8つの発現カセットを含む2つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
第1のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第1の組換え認識配列、
－1つまたは複数の発現カセット、
－1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの5’末端部分、および
－第3の組換え認識配列の第1のコピー
を含み、
かつ、
第2のデオキシリボ核酸が、5’から3’の方向に、
－第3の組換え認識配列の第2のコピー、
－前記1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの3’末端部分、
－1つまたは複数の発現カセット、および
－第2の組換え認識配列
を含み
前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列は、組み込まれた前記外因性ヌクレオチド配列の前記第1の組換え認識配列～前記第3の組換え認識配列と一致しており、
前記1つの第2の選択マーカーをコードする発現カセットの5’末端部分および3’末端部分が、一緒になる場合、前記1つの第2の選択マーカーの機能的発現カセットを形成し、
前記デオキシリボ核酸が、ＣｒｅリコンビナーゼをコードするＤＮＡを含まない、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡを、Ｃｒｅリコンビナーゼの唯一の供給源として導入する工程であって、
前記Ｃｒｅリコンビナーゼが、前記第1のデオキシリボ核酸および前記第2のデオキシリボ核酸の前記組換え認識配列を認識する（かつ任意で、前記1つまたは複数のリコンビナーゼが、2リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）前記第2の選択マーカーを発現しかつ前記ポリペプチドを分泌する細胞を選択する工程
を含み、それにより、前記ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記ポリペプチドを分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法。
[本発明1065]
前記Ｃｒｅ ｍＲＮＡが、配列番号20のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、本発明1064の方法。
[本発明1066]
前記Ｃｒｅ ｍＲＮＡが、配列番号21のヌクレオチド配列またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含む、本発明1064の方法。
[本発明1067]
前記デオキシリボ核酸の厳密に1コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、本発明1064～1066のいずれかの方法。
[本発明1068]
前記ポリペプチドをコードする前記デオキシリボ核酸が少なくとも4つの発現カセットを含み、
－第1の組換え認識配列が、最も5’の（すなわち、第1の）発現カセットに対して5’に位置し、
－第2の組換え認識配列が、最も3’の発現カセットに対して3’に位置し、
－第3の組換え認識配列が、
－前記第1の組換え認識配列と前記第2の組換え認識配列との間、かつ
－前記発現カセットのうちの2つの間
に位置し、
かつ
組換え認識配列が全て異なっている、
本発明1064～1067のいずれかの方法。
[本発明1069]
前記ポリペプチドをコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含む、本発明1064～1068のいずれかの方法。
[本発明1070]
前記ポリペプチドをコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、前記選択マーカーをコードする前記発現カセットが、前記第3の組換え認識配列に対して部分的に5’および部分的に3’に位置し、前記発現カセットの前記5’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの前記3’に位置する部分が、開始コドンを含まないコード配列およびポリＡシグナルを含み、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されている、本発明1064～1069のいずれかの方法。
[本発明1071]
Ｃｒｅ ｍＲＮＡと第1のベクターおよび第2のベクターの混合物との重量比が、1：3～2：1の範囲内である、本発明1064～1070のいずれかの方法。
[本発明1072]
Ｃｒｅ ｍＲＮＡと第1のベクターおよび第2のベクターの混合物との重量比が約1：5である、本発明1064～1071のいずれかの方法。
[本発明1073]
前記発現カセットのそれぞれが、5’から3’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含み、
前記プロモータが、ＳＶ40プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ40ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
本発明1064～1072のいずれかの方法。
[本発明1074]
前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、本発明1064～1073のいずれかの方法。
[本発明1075]
前記ポリペプチドが、第1の抗体重鎖、第2の抗体重鎖、第1の抗体軽鎖、および第2の抗体軽鎖を含むヘテロ四量体であり、前記デオキシリボ核酸が4つの発現カセットを含み、
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、第1の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、かつ
－前記第2の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1064～1074のいずれかの方法。
[本発明1076]
前記ポリペプチドが、第1の抗体重鎖、第2の抗体重鎖、第1の抗体軽鎖、および第2の抗体軽鎖を含むヘテロ四量体であり、前記デオキシリボ核酸が4つの発現カセットを含み、かつ
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、かつ
－前記第2の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1064～1074のいずれかの方法。
[本発明1077]
前記ポリペプチドが、第1の抗体重鎖、第2の抗体重鎖、第1の抗体軽鎖、および第2の抗体軽鎖を含むヘテロ四量体であり、前記デオキシリボ核酸が4つの発現カセットを含み、
－前記第1の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、ＣＨ3ドメイン、ペプチドリンカー、第2の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
－前記第2の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の重鎖可変ドメイン、ＣＨ1ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ2ドメイン、およびＣＨ3ドメインを含み、
－前記第1の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第1の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ1ドメインを含み、かつ、
－前記第2の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第2の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
前記第2の重鎖可変ドメインおよび前記第1の軽鎖可変ドメインが第1の結合部位を形成し、前記第1の重鎖可変ドメインおよび前記第2の軽鎖可変ドメインが第2の結合部位を形成する、
本発明1064～1074のいずれかの方法。
[本発明1078]
前記第1のリコンビナーゼ認識配列がＬ3であり、前記第2のリコンビナーゼ認識配列が2Ｌであり、前記第3のリコンビナーゼ認識配列がＬｏｘＦａｓである、本発明1064～1077のいずれかの方法。
[本発明1079]
標的化組込みによって組換え哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位に安定的に組み込まれる目的のポリペプチドまたはタンパク質をコードするデオキシリボ核酸を含む、前記組換え哺乳動物細胞の数を増加させるための、Ｃｒｅ－リコンビナーゼｍＲＮＡの使用。
[本発明1080]
前記組換え細胞が、培養培地中での培養時に前記目的のポリペプチドを前記培養培地中にさらに分泌する、本発明1079の使用。
発明の態様の詳細な説明
本発明は、異なるポリペプチドを含む複合分子、すなわちヘテロ多量体である、三価の二重特異性抗体の発現のために、所定かつ特定の発現カセット構成を使用すると、ＣＨＯ細胞等の哺乳動物細胞において三価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、三価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体三価の二重特異性抗体の異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた三価の二重特異性抗体の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
本発明は、異なるポリペプチドを含む複合分子、すなわちヘテロ多量体である、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現のために、所定かつ特定の発現カセット構成を使用すると、ＣＨＯ細胞等の哺乳動物細胞において三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
本発明は、異なるポリペプチドを含む複合分子、すなわちヘテロ多量体である、二価の二重特異性抗体の発現のために、所定かつ特定の発現カセット構成を使用すると、ＣＨＯ細胞等の哺乳動物細胞において二価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、二価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体二価の二重特異性抗体の異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた二価の二重特異性抗体の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
本発明は、少なくとも部分的には、例えばＣｒｅ ＤＮＡ（Ｃｒｅプラスミド）と比較して、Ｃｒｅリコンビナーゼの単一の供給源として、Ｃｒｅ ｍＲＮＡを使用すると、標的化組込みによって得られるクローンの数を改善できるという知見に基づいている。より詳細には、選択期間後、ＣＲＥ ｍＲＮＡ生成組換え細胞プールにおけるクローンの絶対数は、ＣＲＥプラスミド生成組換え細胞プールよりも多いことが見出された（実施例１０ならびに図２、図３および図４を参照）。したがって、ＣＲＥプラスミドの代わりにＣＲＥ ｍＲＮＡを使用することによって、より大きなサイズおよび不均一性を有する組換え細胞プールが製造される。この理論に束縛されるものではないが、それにより、高力価および良好な生成物品質を有する組換え細胞クローンを特定する確率が増加すると想定される。さらに、ＣＲＥ ｍＲＮＡ生成プールからの組換え細胞クローンの数の増加は、ＣＲＥプラスミド生成細胞プールと比較して安定である。
Ｉ．定義
本発明を実施するための有用な方法および技術は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（ｅｄ．），Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅｓ Ｉ ｔｏ ＩＩＩ（１９９７）；Ｇｌｏｖｅｒ，Ｎ．Ｄ．，ａｎｄ Ｈａｍｅｓ，Ｂ．Ｄ．，ｅｄ．，ＤＮＡ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｖｏｌｕｍｅｓ Ｉ ａｎｄ ＩＩ（１９８５），Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ；Ｆｒｅｓｈｎｅｙ，Ｒ．Ｉ．（ｅｄ．），Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ－ａ ｐｒａｃｔｉｃａｌ ａｐｐｒｏａｃｈ，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ Ｌｉｍｉｔｅｄ（１９８６）；Ｗａｔｓｏｎ，Ｊ．Ｄ．，ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ＤＮＡ，Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，ＣＨＳＬ Ｐｒｅｓｓ（１９９２）；Ｗｉｎｎａｃｋｅｒ，Ｅ．Ｌ．，Ｆｒｏｍ Ｇｅｎｅｓ ｔｏ Ｃｌｏｎｅｓ；Ｎ．Ｙ．，ＶＣＨ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ（１９８７）；Ｃｅｌｉｓ，Ｊ．，ｅｄ．，Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ（１９９８）；Ｆｒｅｓｈｎｅｙ，Ｒ．Ｉ．，Ｃｕｌｔｕｒｅ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌｓ：Ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｂａｓｉｃ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ，ｓｅｃｏｎｄ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，Ｎ．Ｙ．（１９８７）に記載されている。
組換えＤＮＡ技術の使用は、核酸の誘導体生成を可能にする。このような誘導体は、例えば、置換、変更、交換、欠失または挿入によって、個々のまたはいくつかのヌクレオチド位置で修飾することができる。修飾または誘導体化は、例えば、部位特異的突然変異誘発によって行うことができる。そのような改変は、当業者によって容易に実施され得る（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．，ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｍａｎｕａｌ（１９９９）Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＵＳＡ；Ｈａｍｅｓ，Ｂ．Ｄ．，ａｎｄ Ｈｉｇｇｉｎｓ，Ｓ．Ｇ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ－ａ ｐｒａｃｔｉｃａｌ ａｐｐｒｏａｃｈ（１９８５）ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ，Ｅｎｇｌａｎｄ参照）。
本明細書および添付の特許請求の範囲において使用する場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、文脈がそうでないことを明確に示さない限り、複数形を含む。したがって、例えば、「細胞」への言及は、複数のこのような細胞および当業者に公知のその均等物などを含む。同様に、「ａ」（または「ａｎ」）、「１つまたは複数」および「少なくとも１つ」という用語は、本明細書では相互交換可能に使用することができる。また、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、および「有する」という用語は、相互交換可能に使用することができることにも留意されたい。
「約」という用語は、その後に続く数値の±２０％の範囲を表す。一実施形態において、約という用語は、その後に続く数値の±１０％の範囲を表す。一実施形態において、約という用語は、その後に続く数値の±５％の範囲を表す。
用語「Ｃｒｅ－リコンビナーゼ」は、ＬｏｘＰ部位間でトポイソメラーゼＩ様機構を使用して部位特異的リコンビナーゼを触媒するチロシンリコンビナーゼを意味する。酵素の分子量は約３８ｋＤａであり、３４３アミノ酸残基からなる。これはインテグラーゼファミリーのメンバーである。Ｃｒｅリコンビナーゼは、以下のアミノ酸配列：
Figure 0007572977000001
を有し、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、以下の配列：
Figure 0007572977000002
またはそのコドン最適化バリアントを含む。
「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ）」という用語も包含する。
本明細書で使用される「ＣＤ２０－ＴＣＢ」という用語は、ＣＤ２０標的化ＴＣＢ（ＣＤ２０－ＴＣＢ；ＲＧ６０２６；ＴＣＢフォーマットの抗ＣＤ３／ＣＤ２０抗体）を意味し、これは、以前に特徴付けられた２：１ＴＣＢ分子フォーマットにおいて、ＣＤ２０への高結合活性二価結合ならびにＢおよびＴ細胞結合ドメインの頭尾配向によって可能にされる長い半減期および高い効力を有する（例えば、Ｂａｃａｃ，Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．２２（２０１６）３２８６－３２９７；Ｂａｃａｃ，Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｏｎｃｏｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ５（２０１６）ｅ１２０３４９８参照）。
用語「外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞」は、そのような細胞の子孫を含めて、１つまたは複数の外因性核酸が導入され、かつその後の遺伝子修飾のための開始点になることが目的とされる細胞を、包含する。したがって、用語「外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞」は、哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む細胞を包含し、この外因性ヌクレオチド配列は、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する、少なくとも１つの第１の組換え認識配列および少なくとも１つの第２の組換え認識配列（これらのリコンビナーゼ認識配列は異なる）を含む。一実施形態において、外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞は、宿主細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む細胞であり、この外因性ヌクレオチド配列は、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列は全て異なっている。
本明細書で使用される用語「核局在化配列」は、正に荷電したアミノ酸残基のアルギニンまたは／およびリジンの複数のコピーを含むアミノ酸配列を表す。前記配列を含むポリペプチドは、細胞核に導入するために細胞によって同定される。例示的な核局在化配列は、ＰＫＫＫＲＫＶ（配列番号３３；ＳＶ４０ラージＴ抗原）、ＫＲ［ＰＡＡＴＫＫＡＧＱＡ］ＫＫＫＫ（配列番号３４、ＳＶ４０ヌクレオプラスミン）、ＭＳＲＲＲＫＡＮＰＴＫＬＳＥＮＡＫＫＬＡＫＥＶＥＮ（配列番号３５；線虫（Ｃａｅｎｏｒｈａｂｄｉｔｉｓ ｅｌｅｇａｎｓ）ＥＧＬ－１３）、ＰＡＡＫＲＶＫＬＤ（配列番号３６、ヒトｃ－ｍｙｃ）、ＫＬＫＩＫＲＰＶＫ（配列番号３７、大腸菌末端利用物質タンパク質）である。他の核局在化配列は、当業者によって容易に同定され得る。
本明細書において使用される場合、用語「組換え細胞」は、最終的な遺伝子修飾後の細胞、例えば、目的のポリペプチドを発現し、前記目的のポリペプチドの任意の規模での生産のために使用できる細胞を意味する。例えば、リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）に供され、それによって目的のポリペプチドのコード配列が宿主細胞のゲノム中に導入された「外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞」は、「組換え細胞」である。この細胞は、さらにＲＭＣＥ反応を行うことが依然としてできるが、そうすることは目的ではない。
用語「ＬｏｘＰ部位」は、末端にある２つのパリンドロームの１３ｂｐ配列（それぞれ、ＡＴＡＡＣＴＴＣＧＴＡＴＡ（配列番号２２）およびＴＡＴＡＣＧＡＡＧＴＴＡＴ（配列番号２３））および中央の８ｂｐコア（対称ではない）スペーサー配列からなる長さ３４ｂｐのヌクレオチド配列を表す。コアスペーサー配列は、ＬｏｘＰ部位の配向を決定する。互いに対するＬｏｘＰ部位の相対的な配向および位置に応じて、介在するＤＮＡは、切り取られる（同じ方向に配向されたＬｏｘＰ部位）か、または反転される（反対方向に配向されたＬｏｘＰ部位）。用語「ｌｏｘＰが導入された（ｆｌｏｘｅｄ）」は、２つのＬｏｘＰ部位の間に位置するＤＮＡ配列を意味する。２つのｌｏｘＰが導入された配列、すなわちゲノム中に標的のｌｏｘＰが導入された配列およびドナー核酸中にｌｏｘＰが導入された配列が存在する場合、両方の配列を互いに交換することができる。これは「リコンビナーゼ媒介カセット交換」と呼ばれる。
例示的なＬｏｘＰ部位を以下の表に示す：
Figure 0007572977000003
「外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞」および「組換え細胞」はどちらも、「形質転換細胞」である。この用語は、継代の回数に関わらず、初代形質転換細胞も、それに由来する子孫も含む。子孫は、例えば、親細胞と完全に同一の核酸含量でない場合があるが、変異を含んでもよい。最初に形質転換された細胞においてスクリーニングまたは選択されたのと同じ機能または生物活性を有している変異子孫が包含される。
「単離された」組成物は、自然環境の構成成分から分離されたものである。いくつかの実施形態において、組成物は、例えば、電気泳動（例えば、ＳＤＳ－ＰＡＧＥ、等電点電気泳動（ＩＥＦ）、キャピラリー電気泳動、ＣＥ－ＳＤＳ）またはクロマトグラフィー（例えば、サイズ排除クロマトグラフィー、またはイオン交換もしくは逆相ＨＰＬＣ）によって、９５％または９９％超の純度と決定されるまで精製される。抗体の純度を評価するための方法の概説については、例えば、Ｆｌａｔｍａｎ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｈｒｏｍ．Ｂ ８４８（２００７）７９－８７を参照されたい。
「単離された」核酸は、その天然環境の構成要素から分離された核酸分子を指す。単離された核酸には、通常核酸分子を含む細胞内に含まれる核酸分子が含まれるが、核酸分子は、染色体外、または天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在する。
「単離された」ポリペプチドまたは抗体は、自然環境の構成成分から分離された、ポリペプチド分子または抗体分子を指す。
用語「組込み部位」は、外因性ヌクレオチド配列が挿入される、細胞ゲノム内の核酸配列を意味する。特定の実施形態において、組込み部位は、細胞ゲノム中の隣り合う２つのヌクレオチドの間にある。特定の実施形態において、組込み部位は、ヌクレオチド配列の伸長部を含む。特定の実施形態において、組込み部位は、哺乳動物細胞のゲノムの特定の遺伝子座内に位置している。特定の実施形態において、組込み部位は、哺乳動物細胞の内在性遺伝子内にある。
相互交換可能に使用することができる「ベクター」または「プラスミド」という用語は、本明細書で使用される場合、連結された別の核酸を伝播することができる核酸分子を指す。この用語は、自己複製する核酸構造としてのベクターならびに、ベクターが導入された宿主細胞のゲノムに組み込まれたベクターも含む。特定のベクターは、作動可能に連結された核酸の発現を指示することができる。そのようなベクターを、本明細書では「発現ベクター」と呼ぶ。
用語「結合する」は、その標的への結合部位の結合を表す。例えば、それぞれの抗原への、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む抗体結合部位の結合である。この結合は、例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）アッセイ（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、Ｕｐｐｓａｌａ、Ｓｗｅｄｅｎ）を使用して測定することができる。すなわち、用語「（抗原への）結合」は、インビトロアッセイにおける、抗原（複数可）への抗体の結合を表す。一実施形態において、結合は、抗体が表面に結合しており、かつ抗体への抗原の結合が表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）により測定される結合アッセイにおいて決定される。結合とは、例えば、１０－８Ｍ以下、いくつかの実施形態において１０－１３～１０－８Ｍ、いくつかの実施形態において１０－１３～１０－９Ｍの結合親和性（ＫＤ）を意味する。用語「結合する」は、用語「特異的に結合する」も含む。
例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）アッセイの１つの可能な実施形態では、抗原を表面に結合させ、抗体の結合、すなわちその結合部位（複数可）が、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定される。結合の親和性は、用語ｋａ（会合定数：複合体を形成するための会合の速度定数）、ｋｄ（解離定数、複合体の解離のための速度定数）、およびＫＤ（ｋｄ／ｋａ）によって定義される。あるいは、ＳＰＲセンサーグラムの結合シグナルを、共鳴シグナルの高さおよび解離挙動に関して、参照の応答シグナルと直接比較することができる。
用語「結合部位」という用語は、標的への結合特異性を示す任意のタンパク質性実体を表す。これは、例えば、受容体、受容体リガンド、アンチカリン、アフィボディ、抗体等であり得る。したがって、本明細書で使用される用語「結合部位」は、第２のポリペプチドに特異的に結合することができるか、またはそれによって特異的に結合されることができるポリペプチドを表す。
本明細書で使用される場合、用語「選択マーカー」は、対応する選択剤の存在下で、ある遺伝子を保持する細胞が特異的に選択されるか、または特異的に排除されることを可能にする遺伝子を表す。例えば、限定するものではないが、選択マーカーは、選択マーカー遺伝子で形質転換された宿主細胞が、それぞれの選択剤の存在下で積極的に選択されることを可能にすることができ（選択的培養条件）、形質転換されていない宿主細胞は、選択的培養条件下で増殖または生存することができない。選択マーカーは、陽性、陰性、または二機能性であり得る。陽性選択マーカーは、マーカーを保持する細胞の選択を可能にすることができるのに対し、陰性選択マーカーは、マーカーを保持する細胞を選択的に排除することを可能にし得る。選択マーカーは、薬剤耐性を付与し、または宿主細胞の代謝的もしくは異化的欠陥を補い得る。原核細胞では、とりわけ、アンピシリン、テトラサイクリン、カナマイシン、またはクロラムフェニコールに対する耐性を付与する遺伝子が使用され得る。真核細胞の選択マーカーとして有用な耐性遺伝子としては、アミノグリコシドホスホトランスフェラーゼ（ＡＰＨ）（例えば、ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ（ＨＹＧ）、ネオマイシンおよびＧ４１８ ＡＰＨ）、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）、チミジンキナーゼ（ＴＫ）、グルタミンシンテターゼ（ＧＳ）、アスパラギンシンテターゼ、トリプトファンシンテターゼ（インドール）、ヒスチジノールデヒドロゲナーゼ（ヒスチジノールＤ）の遺伝子、ならびにピューロマイシン、ブラストサイジン、ブレオマイシン、フレオマイシン、クロラムフェニコール、ゼオシン、およびマイコフェノール酸に対する耐性をコードする遺伝子が含まれるが、これらに限定されない。さらなるマーカー遺伝子は、国際公開第９２／０８７９６号および国際公開第９４／２８１４３号に記載されている。
対応する選択剤の存在下での選択を容易にすることを超えて、選択マーカーは、別法として、普通は細胞に存在しない分子、例えば、緑色蛍光性タンパク質（ＧＦＰ）、高感度ＧＦＰ（ｅＧＦＰ）、合成ＧＦＰ、黄色蛍光性タンパク質（ＹＦＰ）、高感度ＹＦＰ（ｅＹＦＰ）、シアン蛍光性タンパク質（ＣＦＰ）、ｍＰｌｕｍ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、Ｊ－ｒｅｄ、ＤｓＲｅｄ単量体、ｍＯｒａｎｇｅ、ｍＫＯ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、Ｖｅｎｕｓ、ＹＰｅｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ、ＣｙＰｅｔ、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、およびＴ－Ｓａｐｐｈｉｒｅであってよい。例えば、コードされるポリペプチドが発する蛍光の検出または不在にそれぞれ基づいて、そのような分子を発現する細胞を、この遺伝子を内部に持たない細胞と区別することができる。
本明細書で使用される場合、「作動可能に連結される」という用語は、２つ以上の構成要素の並置を指し、構成要素は、意図される様式で機能することを可能する関係にある。例えば、プロモータおよび／またはエンハンサーがコード配列の転写を調節するように作用する場合、プロモータおよび／またはエンハンサーは、コード配列に作動可能に連結されている。特定の実施形態において、「作動可能に連結された」ＤＮＡ配列は、単一の染色体上で近接し、隣接している。特定の実施形態において、例えば、分泌リーダーおよびポリペプチドなどの２つのタンパク質をコードする領域を結合する必要がある場合、配列は、連続して隣接し、同じリーディングフレーム内に存在する。特定の実施形態において、作動可能に連結されたプロモータは、コード配列の上流に位置し、それに隣接し得る。特定の実施形態において、例えば、コード配列の発現を調節するエンハンサー配列に関して、２つの構成要素は隣接していなくても、作動可能に連結され得る。エンハンサーは、コード配列の転写を増加させる場合、エンハンサーは、コード配列に作動可能に連結されている。作動可能に連結されエンハンサーは、コード配列の上流、その中、または下流に位置し得、またコード配列のプロモータから相当な距離を置いて位置し得る。作動可能な連結は、当技術分野で公知の組換え法によって、例えば、ＰＣＲ法を使用して、および／または都合の良い制限部位でのライゲーションによって達成され得る。都合の良い制限部位が存在しない場合、合成オリゴヌクレオチドアダプターまたはリンカーを、従来の方法に従って使用し得る。内部リボソーム侵入部位（ＩＲＥＳ）が、５’末端に非依存的な方法により内部位置でＯＲＦの翻訳を開始できる場合、ＩＲＥＳは、オープン・リーディング・フレーム（ＯＲＦ）に作動可能に連結されている。
本明細書において使用される場合、用語「隣接する」は、第１のヌクレオチド配列が第２のヌクレオチド配列の５’末端もしくは３’末端のいずれか、または両末端に位置していることを意味する。隣接するヌクレオチド配列は、第２のヌクレオチド配列に隣接するか、または第２のヌクレオチド配列から規定の距離にあり得る。隣接するヌクレオチド配列の長さに、具体的な制限はない。例えば、隣接配列は、数塩基対または数千塩基対であり得る。
本明細書において使用される場合、用語「外因性」は、あるヌクレオチド配列が特定の細胞に由来せず、ＤＮＡ送達法、例えば、トランスフェクション法、エレクトロポレーション法、または形質転換法によって前記細胞に導入されることを示す。したがって、外因性ヌクレオチド配列は人工配列であり、この人工物は、例えば、起源が異なる部分配列の組合せ（例えば、ＳＶ４０プロモータを有するリコンビナーゼ認識配列と緑色蛍光性タンパク質のコード配列との組合せは、人工核酸である）から、または配列（例えば、膜結合型受容体の細胞外ドメインのみをコードする配列もしくはｃＤＮＡ）の部分的な欠失もしくは核酸塩基の突然変異から、生じ得る。用語「内在性」は、細胞に由来するヌクレオチド配列を意味する。「外因性」ヌクレオチド配列は、塩基組成が同一である「内在性」対応物を有し得るが、「外因性」配列は、例えば組換えＤＮＡ技術によって細胞に導入されている。
抗体
ヒト免疫グロブリンの軽鎖および重鎖のヌクレオチド配列に関連する一般的な情報は、Ｋａｂａｔ，Ｅ．Ａ．，ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ ｅｄ．，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１）に示されている。
用語「重鎖」は、本明細書においてその元の意味で使用される、すなわち、抗体を形成する４つのポリペプチド鎖の２つのより大きなポリペプチド鎖を表す（例えば、Ｅｄｅｌｍａｎ，Ｇ．Ｍ．ａｎｄ Ｇａｌｌｙ Ｊ．Ａ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１１６（１９６２）２０７－２２７参照）。この文脈における、用語「より大きい」は、分子量、長さおよびアミノ酸数のいずれかを指していてもよい。用語「重鎖」は、その中に存在する個々の抗体ドメインの配列および数から独立している。それは、それぞれのポリペプチドの分子量に基づいてのみ割り当てられる。
用語「軽鎖」は、本明細書においてその元の意味で使用される、すなわち、抗体を形成する４つのポリペプチド鎖の２つのより小さいポリペプチド鎖を表す（例えば、Ｅｄｅｌｍａｎ，Ｇ．Ｍ．ａｎｄ Ｇａｌｌｙ Ｊ．Ａ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１１６（１９６２）２０７－２２７参照）。この文脈における、用語「より小さい」は、分子量、長さおよびアミノ酸数のいずれかを指していてもよい。用語「軽鎖」は、その中に存在する個々の抗体ドメインの配列および数から独立している。それは、それぞれのポリペプチドの分子量に基づいてのみ割り当てられる。
本明細書において使用される場合、重鎖および軽鎖の全ての定常領域およびドメインのアミノ酸位置は、Ｋａｂａｔ，ら，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ ｅｄ．，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１）において説明されるＫａｂａｔナンバリングシステムによりナンバリングされ、本明細書では「Ｋａｂａｔによるナンバリング」と称される。具体的には、Ｋａｂａｔ，ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ ｅｄ．，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１）のＫａｂａｔナンバリングシステム（６４７～６６０ページを参照されたい）は、カッパアイソタイプおよびラムダアイソタイプの軽鎖定常ドメインＣＬに使用し、Ｋａｂａｔ，ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ ｅｄ．，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１）のＫａｂａｔ ＥＵインデックスナンバリングシステム（６６１～７２３ページを参照されたい）は、重鎖定常ドメイン（ＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３であって、本明細書では、この場合には、「Ｋａｂａｔ ＥＵインデックスによるナンバリング」を参照することによってさらに明確にしている）に使用される。
本明細書において、用語「抗体」は、最も広義に使用され、全長抗体、モノクローナル抗体、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、および抗体－抗体フラグメント－融合体を含む様々な抗体構造を包含するが、これらに限定されない。
用語「ネイティブ抗体」は、種々の構造を有する天然に生じる免疫グロブリン分子を指す。例えば、ネイティブＩｇＧ抗体は、２本の同一の軽鎖と２本の同一の重鎖がジスルフィド結合したものを含む、約１５０，０００ダルトンのヘテロテトラメリック糖タンパク質である。各重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に向かって、重鎖可変領域（ＶＨ）と、それに続く３つの重鎖定常ドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３）を有し、これによって、第１の重鎖定常ドメインと第２の重鎖定常ドメインとの間にヒンジ領域が位置する。同様に、Ｎ末端からＣ末端に向かって、各軽鎖は、軽鎖可変領域（ＶＬ）と、それに続く軽鎖定常ドメイン（ＣＬ）とを有する。抗体の軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、κ（カッパ）、λ（ラムダ）と呼ばれる２種類のいずれかに割り当てられてもよい。
「全長抗体」という用語は、ネイティブ抗体に実質的に類似した構造を有する抗体を表す。完全長抗体は、Ｎ末端からＣ末端の方向に、可変領域および定常ドメインをそれぞれ含む２つ以上の完全長抗体軽鎖、ならびにＮ末端からＣ末端方向に、可変領域、第１の定常ドメイン、ヒンジ領域、第２の定常ドメイン、および第３の定常ドメインをそれぞれ含む２つの完全長抗体重鎖を含む。ネイティブ抗体とは対照的に、完全長抗体は、さらなる免疫グロブリンドメイン、例えば１つまたは複数のさらなるｓｃＦｖ、または重鎖もしくは軽鎖Ｆａｂフラグメント、または完全長抗体の異なる鎖の末端の１つまたは複数にコンジュゲートされたｓｃＦａｂを含み得るが、各末端には単一のフラグメントのみを含み得る。これらのコンジュゲートもまた、全長抗体という用語により包含される。
用語「抗体結合部位」は、重鎖可変ドメインと軽鎖可変ドメインの対を表す。抗原への適切な結合を確実にするために、これらの可変ドメインは同族可変ドメインであり、すなわち共に属する。抗体、結合部位は、少なくとも３つのＨＶＲ（例えば、ＶＨＨの場合）または３～６つのＨＶＲ（例えば、天然に存在する、すなわち、ＶＨ／ＶＬ対を有する従来の抗体の場合）を含む。一般的に、抗原結合に関与する抗体のアミノ酸残基が、結合部位を形成している。これらの残基は通常、抗体重鎖可変ドメインに対応する抗体軽鎖可変ドメインの対に含まれる。抗体の抗原結合部位は、「超可変領域」または「ＨＶＲ」からのアミノ酸残基を含む。「フレームワーク」または「ＦＲ」領域は、本明細書で定義される超可変領域残基以外の可変ドメイン領域である。したがって、抗体の軽鎖および重鎖可変ドメインは、Ｎ末端からＣ末端に向けて、領域ＦＲ１、ＨＶＲ１、ＦＲ２、ＨＶＲ２、ＦＲ３、ＨＶＲ３、およびＦＲ４を含む。特に、重鎖可変ドメインのＨＶＲ３領域は、抗原結合に最も寄与し、抗体の結合特異性を定義する領域である。「機能的結合部位」は、その標的に特異的に結合することができる。用語「特異的に結合する」は、インビトロアッセイにおいて、標的への結合部位の結合を表し、一実施形態では、結合アッセイにおいてである。そのような結合アッセイは、結合イベントが検出され得る限り、任意のアッセイであり得る。例えば、抗体を表面に結合させ、抗体への抗原（複数可）の結合が表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定される、結合アッセイである。あるいは、ブリッジングＥＬＩＳＡを使用することができる。
「超可変領域」または「ＨＶＲ」という用語は、本明細書で使用される場合、超可変的な配列（「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」）であり、および／または構造的に定義されるループ（「超可変ループ」）を形成し、および／または抗原に接触する残基（「抗原接触」）を含有するアミノ酸残基ストレッチを含む、抗体可変ドメインのそれぞれの領域を指す。一般的に、抗体は、６つのＨＶＲを含み、重鎖可変ドメインＶＨに３つ（Ｈ１、Ｈ２、Ｈ３）、軽鎖可変ドメインＶＬに３つ（Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３）である。
ＨＶＲには、次のものが含まれる：
（ａ）アミノ酸残基２６～３２（Ｌ１）、５０～５２（Ｌ２）、９１～９６（Ｌ３）、２６～３２（Ｈ１）、５３～５５（Ｈ２）、および９６～１０１（Ｈ３）に生じる超可変ループ（Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．ａｎｄ Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｍ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６（１９８７）９０１－９１７）、
（ｂ）アミノ酸残基２４～３４（Ｌ１）、５０～５６（Ｌ２）、８９～９７（Ｌ３）、３１～３５ｂ（Ｈ１）、５０～６５（Ｈ２）、および９５～１０２（Ｈ３）に生じるＣＤＲ（Ｋａｂａｔ，Ｅ．Ａ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１），ＮＩＨ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ ９１－３２４２）、
（ｃ）アミノ酸残基２７ｃ～３６（Ｌ１）、４６～５５（Ｌ２）、８９～９６（Ｌ３）、３０～３５ｂ（Ｈ１）、４７～５８（Ｈ２）、および９３～１０１（Ｈ３）に生じる抗原接触（ＭａｃＣａｌｌｕｍ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２６２：７３２－７４５（１９９６））、ならびに
（ｄ）アミノ酸残基４６～５６（Ｌ２）、４７～５６（Ｌ２）、４８～５６（Ｌ２）、４９～５６（Ｌ２）、２６～３５（Ｈ１）、２６～３５ｂ（Ｈ１）、４９～６５（Ｈ２）、９３～１０２（Ｈ３）、および９４～１０２（Ｈ３）を含む、（ａ）、（ｂ）、および／または（ｃ）の組合せ。
別段の指示がない限り、ＨＶＲ残基および可変ドメイン内の他の残基（例えば、ＦＲ残基）は、本明細書において、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．に従ってナンバリングされている。
抗体の「クラス」は、定常ドメインまたは定常領域、好ましくは重鎖が持つＦｃ領域の種類を指す。抗体の５つの主要なクラスがあり、すなわち、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭが存在し、これらのうちのいくつかは、サブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２にさらに分ける場合がある。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、およびμと呼ばれる。
用語「重鎖定常領域」は、定常ドメインを含む免疫グロブリン重鎖の領域、すなわちネイティブ免疫グロブリンの場合はＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメイン、または完全長免疫グロブリンの場合は第１の定常ドメイン、ヒンジ領域、第２の定常ドメインおよび第３の定常ドメインを示す。一実施形態において、ヒトＩｇＧ重鎖定常領域は、Ａｌａ１１８から重鎖のカルボキシル末端Ａｌａ１１８（ナンバリングはＫａｂａｔ ＥＵインデックスに従う）に及ぶ。しかしながら、定常領域のＣ末端リジン（Ｌｙｓ４４７）は、存在していても、または存在していなくてもよい（ナンバリングはＫａｂａｔ ＥＵインデックスに従う）。用語「定常領域」は、鎖間ジスルフィド結合を形成するヒンジ領域システイン残基を介して互いに共有結合することができる２つの重鎖定常領域を含む二量体を示す。
用語「重鎖Ｆｃ領域」は、ヒンジ領域（中間および下部ヒンジ領域）、第２の定常ドメイン、例えばＣＨ２ドメイン、および第３の定常ドメイン、例えばＣＨ３ドメインの少なくとも一部を含む免疫グロブリン重鎖のＣ末端領域を示す。一実施形態において、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、Ａｓｐ２２１またはＣｙｓ２２６またはＰｒｏ２３０から重鎖のカルボキシル末端に及ぶ（ナンバリングはＫａｂａｔ ＥＵインデックスに従う）。このため、Ｆｃ領域は、定常領域よりも小さいが、同一のＣ末端部にある。しかしながら、重鎖領域のＣ末端リジン（Ｌｙｓ４４７）は、存在していても、または存在していなくてもよい（ナンバリングはＫａｂａｔ ＥＵインデックスに従う）。用語「Ｆｃ領域」は、鎖間ジスルフィド結合を形成するヒンジ領域システイン残基を介して互いに共有結合することができる２つの重鎖Ｆｃ領域を含む二量体を示す。
抗体の定常領域、より正確にはＦｃ領域（および同様の定常領域）は、補体活性化、Ｃ１ｑ結合、Ｃ３活性化およびＦｃ受容体結合に直接関与する。補体系に対する抗体の影響は、特定の条件に依存するが、Ｃ１ｑへの結合は、Ｆｃ領域における規定の結合部位によって引き起こされる。このような結合部位は、先行技術で公知であり、例えば、Ｌｕｋａｓ，Ｔ．Ｊ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１２７（１９８１）２５５５－２５６０；Ｂｒｕｎｈｏｕｓｅ，Ｒ．，ａｎｄ Ｃｅｂｒａ，Ｊ．Ｊ．，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６（１９７９）９０７－９１７；Ｂｕｒｔｏｎ，Ｄ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ２８８（１９８０）３３８－３４４；Ｔｈｏｍｍｅｓｅｎ，Ｊ．Ｅ．，ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．３７（２０００）９９５－１００４；Ｉｄｕｓｏｇｉｅ，Ｅ．Ｅ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６４（２０００）４１７８－４１８４；Ｈｅｚａｒｅｈ，Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７５（２００１）１２１６１－１２１６８；Ｍｏｒｇａｎ，Ａ．，ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ８６（１９９５）３１９－３２４、および欧州特許第０ ３０７ ４３４号に記載されている。このような結合部位は、例えば、Ｌ２３４、Ｌ２３５、Ｄ２７０、Ｎ２９７、Ｅ３１８、Ｋ３２０、Ｋ３２２、Ｐ３３１およびＰ３２９（ナンバリングはＫａｂａｔのＥＵインデックスに従う）である。サブクラスＩｇＧ１、ＩｇＧ２、およびＩｇＧ３の抗体は通常、補体活性化、Ｃ１ｑ結合、およびＣ３活性化を示すのに対し、ＩｇＧ４は、補体系を活性化せず、Ｃ１ｑと結合せず、Ｃ３を活性化しない。「抗体のＦｃ領域」は、当業者に周知の用語であり、抗体のパパイン切断に基づいて規定される。
本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に同種の抗体の集団から得られた抗体を指し、すなわち、その集団を構成する個々の抗体は、同一であり、および／または同じエピトープに結合するが、例えば、自然発生突然変異を含有するか、またはモノクローナル抗体調製物の産生中に生じる、起こり得る変異型抗体は例外であり、かかる変異型は一般的に少量で存在する。典型的には異なる決定基（エピトープ）に対して指向する異なる抗体を含むポリクローナル抗体製剤とは対照的に、モノクローナル抗体製剤のそれぞれのモノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対して指向する。したがって、修飾語「モノクローナル」は、抗体の実質的に均一な集合から得られる抗体の特徴を示し、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とするように解釈すべきではない。例えば、モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ法、組換えＤＮＡ法、ファージディスプレイ法、およびヒト免疫グロブリン遺伝子座の全部または一部を含むトランスジェニック動物を利用する方法を含むがこれらに限定されない種々の技術によって作製されてもよい。
用語「価数」は、本出願で使用される場合、抗体内の特定数の結合部位の存在を示す。したがって、用語「二価」、「四価」および「六価」は、抗体中に、それぞれ２つの結合部位、４つの結合部位、および６つの結合部位の存在を表す。
「単一特異性抗体」は、すなわち、１つの抗原に対して得意的に結合する、単一の結合特異性を有する抗体を示す。単一特異性抗体を、完全長抗体もしくは抗体フラグメント（例えば、Ｆ（ａｂ’）２）またはそれらの組合せ（例えば、完全長抗体と追加のｓｃＦｖまたはＦａｂフラグメント）として調製することができる。単一特異性抗体は、一価である必要はない。すなわち、単一特異性抗体は、１つの抗原に特異的に結合する２つ以上の結合部位を含んでもよい。例えば、天然型の抗体は、単一特異性であるが二価である。
「多重特異性抗体」は、同じ抗原または２つの異なる抗原上の少なくとも２つの異なるエピトープに対して結合特異性を有する抗体を表す。多重特異性抗体を、完全長抗体もしくは抗体フラグメント（例えば、Ｆ（ａｂ’）２二重特異性抗体）またはそれらの組合せ（例えば、完全長抗体と追加のｓｃＦｖまたはＦａｂフラグメント）として調製することができる。多重特異性抗体は、少なくとも二価である。すなわち、２つの抗原結合部位を含む。また、多重特異性抗体は、少なくとも二重特異性である。したがって、三価の二重特異性抗体は、多重特異性抗体の最も単純な形態である。２つ、３つまたはより多く（例えば、４つ）の機能的な抗原結合部位を有する操作された抗体が報告されている（例えば、米国特許出願公開第２００２／０００４５８７号を参照）。
特定の実施形態において、抗体は、多重特異性抗体、例えば、少なくとも二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも２つの異なる抗原またはエピトープに対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。特定の実施形態において、結合特異性の一方は、第１の抗原に対するものであり、他方は、異なる第２の抗原に対するものである。特定の実施形態において、多重特異性抗体は、同じ抗原の２つの異なるエピトープに結合し得る。多重特異性抗体を使用して、抗原を発現する細胞に細胞毒性剤を局在化させることもできる。
多重特異性抗体を作製するための技術には、異なる特異性を有する２つの免疫グロブリン重鎖－軽鎖対の組換え共発現（Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｃ．ａｎｄ Ｃｕｅｌｌｏ，Ａ．Ｃ．，Ｎａｔｕｒｅ ３０５（１９８３）５３７－５４０、国際公開第９３／０８８２９号およびＴｒａｕｎｅｃｋｅｒ，Ａ．，ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．１０（１９９１）３６５５－３６５９参照）および「ノブインホール」操作（例えば、米国特許第５，７３１，１６８号明細書を参照）が含まれるが、これらに限定されない。多重特異性抗体はまた、抗体Ｆｃ－ヘテロ二量体分子を作製するための静電的ステアリング効果の操作（国際公開第２００９／０８９００４号）、２つ以上の抗体またはフラグメントを架橋すること（例えば、米国特許第４，６７６，９８０号、およびＢｒｅｎｎａｎ，Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ、２２９（１９８５）８１－８３を参照）、ロイシンジッパーを使用して二重特異性抗体を製造すること（例えば、Ｋｏｓｔｅｌｎｙ，Ｓ．Ａ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８（１９９２）１５４７－１５５３を参照；二重特異性抗体フラグメントを作製するための特定の技術を使用すること（例えば、Ｈｏｌｌｉｇｅｒ，Ｐ．，ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０（１９９３）６４４４－６４４８を参照）、および一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）二量体を使用すること（例えば、Ｇｒｕｂｅｒ，Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５２（１９９４）５３６８－５３７４を参照、および、例えば、Ｔｕｔｔ，Ａ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７（１９９１）６０－６９）に記載されるような三重特異性抗体を調製することによっても作製され得る。
抗体またはフラグメントはまた、国際公開第２００９／０８０２５１号、国際公開第２００９／０８０２５２号、国際公開第２００９／０８０２５３号、国際公開第２００９／０８０２５４号、国際公開第２０１０／１１２１９３号、国際公開第２０１０／１１５５８９号、国際公開第２０１０／１３６１７２号、国際公開第２０１０／１４５７９２号または国際公開第２０１０／１４５７９３号に記載されている多重特異性抗体であり得る。
抗体またはそのフラグメントは、国際公開第２０１２／１６３５２０号に開示されている多重特異性抗体でもあり得る。
二重特異性抗体は、一般に、同じ抗原上の２つの異なる重複しないエピトープまたは異なる抗原上の２つのエピトープに特異的に結合する抗体分子である。
この文脈における、用語「非重複」は、二重特異性Ｆａｂの第１のパラトープ内に含まれるアミノ酸残基が第２のパラトープ内に含まれず、二重特異性Ｆａｂの第２のパラトープ内に含まれるアミノ酸が第１のパラトープ内に含まれないことを示す。
「ノブ・イントゥー・ホール」二量体化モジュールおよび抗体操作におけるその使用は、Ｃａｒｔｅｒ Ｐ．；Ｒｉｄｇｗａｙ Ｊ．Ｂ．Ｂ．；Ｐｒｅｓｔａ Ｌ．Ｇ．：Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅ ２，Ｎｕｍｂｅｒ １，Ｆｅｂｒｕａｒｙ １９９６，ｐｐ．７３－７３（１）に記載されている。
抗体の重鎖のＣＨ３ドメインを、「ノブ・イントゥー・ホール」技術によって改変することができる。例えば、国際公開第９６／０２７０１１号、Ｒｉｄｇｗａｙ，Ｊ．Ｂ．，ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．９（１９９６）６１７－６２１、およびＭｅｒｃｈａｎｔ，Ａ．Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１６（１９９８）６７７－６８１に、いくつかの例を伴って詳細に記載されている。この方法では、２つのＣＨ３ドメインの相互作用表面を改変して、これら２つのＣＨ３ドメインのヘテロ二量体化を増加させ、それによってそれらを含むポリペプチドのヘテロ二量体化を増加させる。（２つの重鎖の）２つのＣＨ３ドメインのそれぞれは「ノブ」であることができ、他方は「ホール」である。ジスルフィドブリッジの導入はさらに、ヘテロ二量体を安定化させ（Ｍｅｒｃｈａｎｔ，Ａ．Ｍ．，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．１６（１９９８）６７７－６８１；Ａｔｗｅｌｌ，Ｓ．，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２７０（１９９７）２６－３５）、収率を増加させる。
（抗体重鎖の）ＣＨ３ドメインの変異Ｔ３６６Ｗは、「ノブ変異」または「変異ノブ」として表され、（抗体重鎖の）ＣＨ３ドメインの変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、Ｙ４０７Ｖは、「ホール変異」または「変異ホール」として表される（ナンバリングはＫａｂａｔのＥＵインデックスに従う）。ＣＨ３ドメイン間の追加の鎖間ジスルフィド架橋（Ｍｅｒｃｈａｎｔ，Ａ．Ｍ．ら、Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．１６（１９９８）６７７－６８１）も、例えば、「ノブ変異」を有する重鎖のＣＨ３ドメインにＳ３５４Ｃ変異を導入（「ノブ－ｃｙｓ－変異」または「変異ノブ－ｃｙｓ」と表記）すること、および「ホール変異」を有する重鎖のＣＨ３ドメインにＹ３４９Ｃ変異を導入（「ホール－ｃｙｓ－変異」または「変異ホール－ｃｙｓ」と表記）することにより、使用できる（ナンバリングはＫａｂａｔのＥＵインデックスに従う）。
「ドメインクロスオーバー」という用語は、本明細書で使用される場合、抗体重鎖ＶＨ－ＣＨ１フラグメントとその対応する同族の抗体軽鎖との対において、すなわち抗体Ｆａｂ（フラグメント－抗原結合）において、少なくとも１つの重鎖ドメインが、対応する軽鎖ドメインによって置換されている、もしくはその逆、という点について、ドメイン配列がネイティブ抗体の配列から逸脱していることを表す。ドメインクロスオーバーは、一般的に３種類あり、（ｉ）ＣＨ１ドメインおよびＣＬドメインのクロスオーバーであって、軽鎖中のドメインクロスオーバーによってＶＬ－ＣＨ１ドメイン配列がもたらされ、重鎖フラグメント中のドメインクロスオーバーによってＶＨ－ＣＬドメイン配列（またはＶＨ－ＣＬ－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３ドメイン配列を有する完全長抗体重鎖）がもたらされるもの、（ｉｉ）ＶＨドメインおよびＶＬドメインのドメインクロスオーバーであって、軽鎖中のドメインクロスオーバーによってＶＨ－ＣＬドメイン配列がもたらされ、重鎖フラグメント中のドメインクロスオーバーによってＶＬ－ＣＨ１ドメイン配列がもたらされるもの、ならびに（ｉｉｉ）完全な軽鎖（ＶＬ－ＣＬ）および完全なＶＨ－ＣＨ１重鎖フラグメントのドメインクロスオーバー（「Ｆａｂクロスオーバー」）であって、ドメインクロスオーバーによってＶＨ－ＣＨ１ドメイン配列を有する軽鎖がもたらされ、ドメインクロスオーバーによってＶＬ－ＣＬドメイン配列を有する重鎖フラグメントがもたらされるもの（上述の全てのドメイン配列は、Ｎ末端からＣ末端への方向で示されている）がある。
本明細書で使用される場合、対応する重鎖ドメインおよび軽鎖ドメインに関して「互いに置き換えられた」という用語は、上述のドメインクロスオーバーを指す。そのため、ＣＨ１ドメインおよびＣＬドメインが「互いに置き換えられた」場合、用語は、項目（ｉ）の下で言及されたドメインクロスオーバー、ならびに結果として生じる重鎖および軽鎖ドメイン配列を指す。したがって、ＶＨおよびＶＬが「互いに置換された」場合、用語は、項目（ｉｉ）の下で言及されたドメインクロスオーバーを指し、またＣＨ１ドメインおよびＣＬドメインが「互いに置換され」、かつＶＨドメインおよびＶＬドメインが「互いに置換された」場合、用語は、項目（ｉｉｉ）の下で言及されたドメインクロスオーバーを指す。ドメインクロスオーバーを含む二重特異性抗体は、例えば、国際公開第２００９／０８０２５１号、国際公開第２００９／０８０２５２号、国際公開第２００９／０８０２５３号、国際公開第２００９／０８０２５４号、およびＳｃｈａｅｆｅｒ，Ｗ．，ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ １０８（２０１１）１１１８７－１１１９２において報告されている。このような抗体は、一般的にＣｒｏｓｓＭａｂと呼ばれる。
多重特異性抗体はまた、一実施形態において、上記の項目（ｉ）で述べたＣＨ１ドメインおよびＣＬドメインのドメインクロスオーバー、または上記の項目（ｉｉ）で述べたＶＨおよびＶＬドメインのドメインクロスオーバー、または上記の項目（ｉｉｉ）で述べたＶＨ－ＣＨ１およびＶＬ－ＶＬドメインのドメインクロスオーバーのいずれかを含む、少なくとも１つのＦａｂフラグメントを含む。ドメインクロスオーバーを伴う多重特異性抗体の場合、同じ抗原（複数可）に特異的に結合するＦａｂは、同じドメイン配列であるように構築される。そのため、ドメインクロスオーバーを伴う２つ以上のＦａｂが、多重特異性抗体に含まれる場合、前記Ｆａｂ（複数可）は、同じ抗原に特異的に結合する。
「ヒト化」抗体は、非ヒトＨＶＲからのアミノ酸残基、およびヒトＦＲからのアミノ酸残基を含む抗体を指す。特定の実施形態において、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的に全てを含むものであり、それにおいて、ＨＶＲ（例えば、ＣＤＲ）の全てまたは実質的に全てが非ヒト抗体のものに相当し、ＦＲの全てまたは実質的に全てがヒト抗体のものに相当する。ヒト化抗体は、必要に応じて、ヒト抗体に由来する抗体定常領域の少なくとも一部を含んでいてもよい。抗体、例えば、非ヒト抗体の「ヒト化形態」は、ヒト化を受けた抗体を指す。
用語「組換え抗体」は、本明細書において使用される場合、組換え手段、例えば組換え細胞により調製、発現、作製または単離された全ての抗体（キメラ、ヒト化およびヒト）を表す。これには、例えば、ＮＳ０、ＨＥＫ、ＢＨＫまたはＣＨＯ細胞等の組換え細胞から単離された抗体が含まれる。
本明細書で使用される場合、用語「抗体フラグメント」は、インタクトな抗体が結合する抗原に結合するインタクトな抗体の一部を含む、インタクトな抗体以外の分子を指し、すなわちそれは、機能的なフラグメントである。抗体フラグメントの例としては、以下に限定されないが、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’－ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、二重特異性Ｆａｂ、ダイアボディ、直鎖状抗体、一本鎖抗体分子（例えば、ｓｃＦｖまたはｓｃＦａｂ）が挙げられる。
本明細書で使用される場合、用語「抗体フラグメント」は、インタクトな抗体が結合する抗原に結合するインタクトな抗体の一部を含む、インタクトな抗体以外の分子を指し、すなわちそれは、機能的なフラグメントである。抗体フラグメントの例としては、以下に限定されないが、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’－ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、二重特異性Ｆａｂ、ダイアボディ、直鎖状抗体、一本鎖抗体分子（例えば、ｓｃＦｖまたはｓｃＦａｂ）が挙げられる。
ＩＩ．組成物および方法
通常、例えば治療用ポリペプチドのような目的のポリペプチドの組換え大量生産のためには、前記ポリペプチドを安定に発現し分泌する細胞が必要とされる。この細胞は、「組換え細胞」または「組換え生産細胞」と呼ばれ、このような細胞を作製するために使用される方法は「細胞株開発」と呼ばれる。細胞株開発方法の第１の工程において、例えばＣＨＯ細胞などの適切な宿主細胞に、前記目的のポリペプチドの発現に適した核酸配列をトランスフェクトする。第２の工程において、目的のポリペプチドを安定に発現する細胞を、目的のポリペプチドをコードする核酸と共にコトランスフェクトしておいた選択マーカーの共発現に基づいて選択する。
ポリペプチドをコードする核酸、すなわちコード配列は、構造遺伝子と呼ばれる。このような構造遺伝子は単純な情報であり、その発現には追加の制御エレメントが必要とされる。したがって、普通は、構造遺伝子は発現カセットに組み込まれる。発現カセットが哺乳動物細胞において機能的となるために必要とされる最小限の制御エレメントは、構造遺伝子の上流、すなわち５’に位置する、前記哺乳動物細胞において機能的なプロモータ、および構造遺伝子の下流、すなわち３’に位置する、前記哺乳動物細胞において機能的なポリアデニル化シグナル配列である。プロモータ配列、構造遺伝子配列、およびポリアデニル化シグナル配列は、作動可能に連結された形態で並べられる。
目的のポリペプチドが、互いに異なる（単量体）ポリペプチドから構成されるヘテロ多量体ポリペプチドであるならば、１つの発現カセットだけでなく、含まれる構造遺伝子が異なる多数の発現カセット、すなわち、ヘテロ多量体ポリペプチドの異なる（単量体）ポリペプチドのそれぞれについて少なくとも１つの発現カセットが必要とされる。例えば、完全長抗体は、軽鎖の２個のコピーおよび重鎖の２個のコピーを含むヘテロ多量体ポリペプチドである。したがって、完全長抗体は、２つの異なるポリペプチドから構成される。したがって、完全長抗体の発現のためには２つの発現カセット、すなわち軽鎖のための１個および重鎖のための１個が必要とされる。例えば、完全長抗体が二重特異性抗体である、すなわち抗体が、２つの異なる抗原に特異的に結合する２つの異なる結合部位を含む場合、軽鎖同士も互いに異なり、重鎖同士も互いに異なる。したがって、このような二重特異性完全長抗体は、４つの異なるポリペプチドから構成され、４つの発現カセットが必要とされる。
目的のポリペプチドのための発現カセット（複数可）は、いわゆる「発現ベクター」に順に組み込まれる。「発現ベクター」は、細菌細胞中で前記ベクターを増幅し、かつ含まれる構造遺伝子（複数可）を哺乳動物細胞中で発現させるのに必要とされる全てのエレメントを提供する核酸である。典型的には、発現ベクターは、例えば大腸菌の場合、複製開始点および原核生物選択マーカー、さらには真核生物選択マーカー、ならびに目的の構造遺伝子（複数可）の発現に必要とされる発現カセットを含む、原核生物プラスミド増殖単位を含む。「発現ベクター」は、哺乳動物細胞に発現カセットを導入するための輸送運搬体である。
前述の段落で概説したように、発現しようとするポリペプチドが複雑であるほど、必要とされる異なる発現カセットの数もまた多くなる。本質的に、発現カセットの数と共に、宿主細胞のゲノム中に組み込まれる核酸のサイズも大きくなる。同時に、発現ベクターのサイズも大きくなる。しかし、ベクターのサイズの実用的な上限は約１５ｋｂｐの範囲にあり、それを上回ると、操作および処理の効率が著しく落ちる。この問題は、２つ以上の発現ベクターを用いることによって対処することができる。それによって、発現カセットを、発現カセットの一部のみをそれぞれ含む異なる発現ベクター間で分け合うことができる。
従来の細胞株開発（ＣＬＤ）は、目的のポリペプチド（ＳＯＩ）のための発現カセットを有するベクターのランダムな組込み（ＲＩ）に依拠している。一般的に、ランダムな手法によってベクターがトランスフェクトされる場合、いくつかのベクターまたはそのフラグメントが細胞ゲノム中に組み込まれる。したがって、ＲＩに基づくトランスフェクションプロセスは、予測不可能である。
このようにして、異なる発現ベクター間で発現カセットを分け合うことでサイズの問題に対処することにより、新たな問題（組み込まれる発現カセットのランダムな数およびその空間的分布）が生じる。
通常、構造遺伝子の発現用の発現カセットが細胞ゲノム中により多く組み込まれるほど、発現される各ポリペプチドの量は多くなる。組み込まれる発現カセットの数の他に、組込みの部位および遺伝子座も発現収率に影響を与える。例えば、発現カセットが、細胞ゲノム中の転写活性が低い部位に組み込まれる場合、コードされたポリペプチドはごく少量しか発現されない。しかし、同じ発現カセットが、細胞ゲノム中の転写活性が高い部位に組み込まれる場合、コードされたポリペプチドは多量に発現される。
ヘテロ多量体ポリペプチドの互いに異なるポリペプチドのための発現カセットが、同じ頻度で、かつ同程度の転写活性を有する遺伝子座に全て組み込まれる限り、この発現の違いが問題を引き起こしてはいない。このような状況下では、多量体ポリペプチドに含まれる全てのポリペプチドが同量で発現され、多量体ポリペプチドが正確に組み立てられる。
しかし、このシナリオが起こる可能性は非常に低く、２つより多いポリペプチドで構成される分子に対してこのシナリオを保証することはできない。例えば、国際公開第２０１８／１６２５１７号では、ｉ）発現カセット配列およびｉｉ）異なる発現ベクター間での発現カセットの分布に応じて、発現収率および生産物の質の大きな差異がＲＩによって観察されたことが開示されている。この理論に縛られるわけではないが、この観察結果は、異なる発現ベクターに由来する異なる発現カセットが、細胞中で異なる頻度で異なる遺伝子座に組み込まれ、その結果、ヘテロ多量体ポリペプチドに含まれる様々なポリペプチドが差次的に、すなわち適切ではない様々な比率で発現されるという事実に起因する。その結果、単量体ポリペプチドの一部が、相対的に多い量で存在し、それ以外が相対的に少ない量で存在する。ヘテロ多量体ポリペプチドに含まれる単量体がこのように不均衡であることが原因で、不完全な組立て、間違った組立て、および分泌速度の低下が起こる。前述のどれも、正確に折り畳まれたヘテロ多量体ポリペプチドの発現収率の低下、および生産物に関係する副産物の割合の上昇を招く。
従来のＲＩ ＣＬＤとは違って、標的化組込み（ＴＩ）ＣＬＤは、細胞ゲノム中のあらかじめ定められた「ホットスポット」に、様々な発現カセットを含む導入遺伝子を導入する。また、この導入は、所定の比率の発現カセットを用いる。その結果、この理論に縛られるわけではないが、ヘテロ多量体ポリペプチドに含まれる様々なポリペプチドの全てが、同じ（または少なくとも同程度であり、少ししか違わない）速度かつ適切な比率で発現される。その結果、正確に組み立てられたヘテロ多量体ポリペプチドの量は増加するはずであり、生産物に関係する副産物の割合は低下するはずである。
また、所定のコピー数および所定の組込み部位が与えられたとすると、ＴＩによって得られる組換え細胞は、ＲＩによって得られる細胞と比べて、優れた安定性を有しているはずである。さらに、選択マーカーは、適切なＴＩを有する細胞を選択するためだけに使用され、高レベルの導入遺伝子発現を示す細胞を選択するためには使用されないことから、メトトレキサート（ＭＴＸ）またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）のような選択剤の突然変異誘発性が原因の一部である配列変異体（ＳＶ）が生じる可能性を最小限にするために、突然変異誘発性の低いマーカーを適用してよい。
ＩＩ．ａ 本発明による導入遺伝子および方法
三価の二重特異性抗体：
しかし、ＴＩで使用される導入遺伝子中の発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、三価の二重特異性抗体発現に強い影響を持っていることが、現在では判明している。
本発明は、個々の発現カセットを所定の数および配列で有する特定の発現カセット構成を使用する。これにより、哺乳動物細胞において発現される三価の二重特異性抗体の発現収率が高くなり、生成物の質が良好になる。
本発明による発現カセット配列を有する導入遺伝子の所定の組込みのために、ＴＩ方法が使用される。本発明は、２プラスミドリコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）反応を用いて、三価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製する新規の方法を提供する。改善点は、特に、所定の配列中の同じ遺伝子座における所定の組込み、ならびにそれによる三価の二重特異性抗体の高発現および生産物に関係する副産物の形成の減少にある。
本発明で開示される主題は、三価の二重特異性抗体の安定な大規模生産のために組換え哺乳動物細胞を製造するための方法だけでなく、有利な副産物プロファイルを有する三価の二重特異性抗体の生産力が高い組換え哺乳動物細胞もまた、提供する。
本明細書において使用される２プラスミドＲＭＣＥ戦略は、同じＴＩ遺伝子座に複数の発現カセットを挿入することを可能にする。
三価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞が、本明細書において報告されている。三価の二重特異性抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、三価の二重特異性抗体は、４つのポリペプチド：２つの異なる重鎖および２つの異なる軽鎖からなるヘテロ二量体タンパク質である。三価の二重特異性抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
三価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて三価の二重特異性抗体を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
本発明は、ヘテロ多量体三価の二重特異性抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、三価の二重特異性抗体の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、三価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体抗体の異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた三価の二重特異性抗体の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
三価の二重特異性抗体はヘテロ四量体であるため、その発現のために少なくとも４つの異なる発現カセット、第１の重鎖の発現のための第１の発現カセット、第２の重鎖の発現のための第２の発現カセット、第１の軽鎖の発現のための第３の発現カセット、および第２の軽鎖の発現のための第４の発現カセットが必要とされる。さらに、陽性選択マーカーのためのさらなる発現カセットも含まれてよい。
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥプールを、ドメインクロスオーバー／交換を伴うさらなるＦａｂフラグメントを有する三価の二重特異性抗体の個々の鎖に対する異なる数および編成の発現カセットを含有する２つのプラスミド（フロントおよびバックベクター）をトランスフェクトすることによって作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間の流加産生アッセイで評価した。
ドメイン交換を伴うさらなるＦａｂフラグメントを有する異なる三価の二重特異性抗体の発現に対する抗体鎖発現カセット構成の効果を評価した。全てが異なる標的特異性を有していた。
一般的に、当技術分野では、一過性タンパク質発現プロファイルが安定な発現プロファイルを予測すると想定されている（例えば、Ｄｉｅｐｅｎｂｒｕｃｋ，Ｃ．，ｅｔ ａｌ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．５４（２０１３）４９７－５０３；Ｒａｊｅｎｄｒａ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３３（２０１７）４６９－４７７参照）。
１つのＢＳ抗体（ＢＳ－１）について、一過性トランスフェクションから以下の結果が得られた（ベクターは、示された発現カセットのみを含んでおり、ベクター比：ｌ＝軽鎖発現カセットを１つ含むベクター；ｌ＋ｈ＝１つの軽鎖発現カセットおよびホール変異を有する重鎖のための１つの発現カセットを含むベクター；ｘｌ＋ｋ＝ドメイン交換を伴う軽鎖のための１つの発現カセットおよびノブ変異を伴う重鎖のための１つの発現カセットを含むベクター；ｘｌ＝ドメイン交換を伴う軽鎖のための１つの発現カセットを含むベクター）：
Figure 0007572977000004
ｌ＝軽鎖；ｈ＝ホール変異を有する重鎖；ｘｌ＝ドメイン交換を有する軽鎖；ｋ＝ノブ変異を有する重鎖
第１のＢＳ抗体および３つのさらなるＢＳ抗体について、安定な標的化された組込みについて以下の結果が得られた：
Figure 0007572977000005
ＭＰ＝主生成物、ｅｆｆ．力価＝有効力価＝主生成物の％を乗算した力価
分かるように、一過性トランスフェクションで得られた結果は、一過性のランダムな組込みから安定な標的化された組込みへの変化について、現在の場合には予測できない。これは、ｋ：ｈ：ｌ：ｘｌ＝２：１：２：３の組合せで見ることができ、これは安定なトランスフェクションに最適であり、一過性トランスフェクションでは３番目に優れているに過ぎない。
抗体ＢＳ－１は、抗ヒトＡβ／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体（配列番号１２～１５）である。抗体ＢＳ－３は、抗ヒトＣＤ２０／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体（配列番号１６～１９）である。
本発明のこの部分を以下に要約する。
本発明の１つの独立した態様は、三価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、以下：
ａ）三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から三価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖または第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
を含む、方法である。
三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の哺乳動物細胞のゲノムへの安定な組込みは、発現カセットの特定の配列が維持される限り、当技術分野の当業者に公知の任意の方法によって行うことができる。
本発明の１つの独立した態様は、５’から３’の方向に、
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖または第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸である。
本発明の１つの独立した態様は、５’から３’の方向に、
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖または第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の二重特異性抗体の使用である。
本発明の１つの独立した態様は、細胞のゲノムに組み込まれた三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む組換え哺乳動物細胞であり、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖または第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
を含む。
本発明の１つの独立した態様は、３つの異なる組換え認識配列および４つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
を含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖または第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
を含む。
本発明の１つの独立した態様は、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および少なくとも７つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
を含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖または第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
を含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、三価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、単一または二重のリコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、デオキシリボ核酸は、７つの発現カセットの後に、第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の軽鎖は、ドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は配列番号１２のアミノ酸配列を含み、第２の重鎖は、配列番号１３のアミノ酸配列を含み、第１の軽鎖は配列番号１４のアミノ酸配列を含み、第２の軽鎖は配列番号１５のアミノ酸配列を含み、第１の結合部位はヒトトランスフェリン受容体に特異的に結合し、第２の結合部位はヒトＡβポリペプチドに特異的に結合する。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は配列番号１６のアミノ酸配列を含み、第２の重鎖は、配列番号１７のアミノ酸配列を含み、第１の軽鎖は配列番号１８のアミノ酸配列を含み、第２の軽鎖は配列番号１９のアミノ酸配列を含み、第１の結合部位はヒトトランスフェリン受容体に特異的に結合し、第２の結合部位はヒトＣＤ２０ポリペプチドに特異的に結合する。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第４の発現カセットに隣接し、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第５の発現カセットに隣接しており、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
抗体鎖についての各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
かつ
選択マーカーをコードする各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、選択マーカーの発現カセットを除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
ターミネータ配列は、ＲＮＡポリメラーゼＩＩによる非常に長いＲＮＡ転写物の生成、すなわち、本発明によるデオキシリボ核酸中の次の発現カセットへのリードスルーを防止し、本発明による方法で使用される。すなわち、目的の１つの構造遺伝子の発現は、それ自体のプロモータによって制御される。
したがって、ポリアデニル化シグナルとターミネータ配列との組合せによって、効率的な転写終結が達成される。すなわち、ＲＮＡポリメラーゼＩＩのリードスルーは、二重終結シグナルの存在によって妨げられる。ターミネータ配列は、複合体分解を開始し、ＤＮＡ鋳型からのＲＮＡポリメラーゼの解離を促進する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、全てのカセットが一方向に配置される。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第４の発現カセットに隣接し（すなわち、第４の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列の上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、ポリアデニル化配列に作動可能に連結した開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第５の発現カセットに隣接している。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸は第１のベクターに組み込まれ、第２のデオキシリボ核酸は第２のベクターに組み込まれる。
全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含み、これらは全て互いに作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態において、ＣＨＯ細胞はＣＨＯ－Ｋ１細胞である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、リコンビナーゼ認識配列は、Ｌ３、２ＬおよびＬｏｘＦａｓである、一実施形態において、Ｌ３は配列番号０１の配列を有し、２Ｌは配列番号０２の配列を有し、ＬｏｘＦａｓは配列番号０３の配列を有する。一実施形態において、第１のリコンビナーゼ認識配列はＬ３であり、第２のリコンビナーゼ認識配列は２Ｌであり、第３のリコンビナーゼ認識配列はＬｏｘＦａｓである。
全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリＡ部位であり、ターミネータ配列が存在しない、選択マーカー（複数可）の発現カセット（複数可）を除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、かつターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０４の配列を有する。一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０６の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列は配列番号０８である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ｈＧＴターミネータは、配列番号０９の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０プロモータは配列番号１０の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列は配列番号０７である。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、抗ＴｆＲ／ＣＤ２０二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５５４２号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体は、抗ＴｆＲ／Ａβ二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５５４０号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
二重特異性三価の抗体：
しかし、ＴＩで使用される導入遺伝子中の発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）発現に強い影響を持っていることが、現在では見出されている。
本発明は、個々の発現カセットを所定の数および配列で有する特定の発現カセット構成を使用する。これにより、哺乳動物細胞において発現される三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現収率が高くなり、生成物の質が良好になる。
本発明による発現カセット配列を有する導入遺伝子の所定の組込みのために、ＴＩ方法が使用される。本発明は、２プラスミドリコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）反応を用いて、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を発現する組換え哺乳動物細胞を作製する新規の方法を提供する。改善点は、特に、所定の配列中の同じ遺伝子座における所定の組込み、ならびにそれによる三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の高発現および生産物に関係する副産物の形成の減少にある。
本発明で開示される主題は、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の安定な大規模生産のために組換え哺乳動物細胞を製造するための方法だけでなく、有利な副産物プロファイルを有する三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の生産力が高い組換え哺乳動物細胞もまた、提供する。
本明細書において使用される２プラスミドＲＭＣＥ戦略は、同じＴＩ遺伝子座に複数の発現カセットを挿入することを可能にする。
三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を発現する組換え哺乳動物細胞が、本明細書において報告されている。三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）は、４つのポリペプチド、第１の軽鎖および第２の軽鎖ならびに第１の重鎖および第２の重鎖からなるヘテロ二量体タンパク質である。三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
本発明は、ヘテロ多量体三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくともある程度は基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体ポリペプチドの異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
三価の抗体（例えば、ＴＣＢ）はヘテロ四量体であるため、その発現のために少なくとも４つの異なる発現カセット、第１の軽鎖の発現のための第１の発現カセット、第２の軽鎖の発現のための第２の発現カセット、第１の重鎖の発現のための第３の発現カセット、および第２の重鎖の発現のための第４の発現カセットが必要とされる。さらに、陽性選択マーカー（複数可）のための１つまたは複数のさらなる発現カセットも含まれてよい。
例えば、ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥプールを、ＴＣＢフォーマットの三価の抗体の異なる数および構成の個々の鎖を含む、２つのプラスミド（前方および後方ベクター）をトランスフェクトすることによって、作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間の流加産生アッセイで評価した。特定のベクター構成について、参照プールと比較して力価の増加が観察された。
５つの異なるＴＣＢの発現に対する抗体鎖発現カセット構成の影響を評価した。ＴＣＢ１～５は全て異なる標的特異性を有していた。ＴＣＢ３を４つの異なる抗ＣＤ３結合部位で試験した。
ＴＣＢ－１については、以下の結果が得られ、参照構成は灰色で陰影が付けられており、ｋ＝ノブ変異を有する重鎖であり、ｈ＝ホール変異を有する重鎖であり、ｌ＝軽鎖、ｘｌ＝ドメイン交換を有する軽鎖である。
Figure 0007572977000006
ＭＰ＝主生成物、ｅｆｆ．力価＝有効力価＝主生成物の％を乗算した力価
本発明のこの部分を以下に要約する。
本発明による１つの独立した態様は、三価の抗体を製造するための方法であって、以下：
ａ）三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から三価の抗体を回収する工程
を含み、
三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（４）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（５）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
または
（６）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含む。
三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸の哺乳動物細胞のゲノムへの安定な組込みは、発現カセットの特定の配列が維持される限り、当技術分野の当業者に公知の任意の方法によって行うことができる。
本発明による１つの独立した態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（４）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第５の発現カセット
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（５）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
または
（６）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸である。
本発明による１つの独立した態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（４）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（５）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
または
（６）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の抗体の発現のための使用である。
本発明による１つの独立した態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（３）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット
または
（４）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（５）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
または
（６）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸である。
本発明による１つの独立した態様は、３つの異なる組換え認識配列および５～７つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（３）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（４）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（５）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（６）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（３）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（４）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第１の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（５）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（６）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含む。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成を含むか、または、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（３）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（４）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（５）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（６）による構成を含む。
本発明による１つの独立した態様は、三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、三価の抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および５～７つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（３）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（４）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（５）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（６）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（３）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（４）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第１の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（５）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット
－第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（６）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、三価の抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、三価の抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成を含むか、または、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（３）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（４）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（５）による構成を含むか、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（６）による構成を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、単一または二重のリコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明による各々独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆もまた同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
本発明による各々独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属した一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の各々独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。
本発明による各々独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の軽鎖は、ドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬである。
本発明の各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、デオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の各々の独立した態様および全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、三価の抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含む。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第３の発現カセットに隣接し、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第４の発現カセットに隣接しており、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、
抗体鎖についての各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
かつ
選択マーカーをコードする各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含む。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、選択マーカーの発現カセットを除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
本発明の各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、５’から３’の方向の構成が、第１の発現カセットとして第１の重鎖をコードする発現カセットを有する場合、全てのカセットは一方向に配置される。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、５’から３’の方向の構成が、第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、第１の重鎖をコードする第３の発現カセット、第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、第２の軽鎖をコードする第５の発現カセット、第２の軽鎖をコードする第６の発現カセットである場合、第１～第３の発現カセットは一方向に配置され、第４～第６の発現カセットは一方向に配置され、それによって第１～第３の発現カセットは第４～第６の発現カセットの反対方向に配置される。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての実施形態の従属する一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第２の発現カセットに隣接し（すなわち、第２の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列の上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、ポリアデニル化配列に作動可能に連結した開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第３の発現カセットに隣接している。
本発明の各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸は第１のベクターに組み込まれ、第２のデオキシリボ核酸は第２のベクターに組み込まれる。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含み、これらは全て互いに作動可能に連結されている。
本発明の各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態において、ＣＨＯ細胞はＣＨＯ－Ｋ１細胞である。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、リコンビナーゼ認識配列は、Ｌ３、２ＬおよびＬｏｘＦａｓである、一実施形態において、Ｌ３は配列番号０１の配列を有し、２Ｌは配列番号０２の配列を有し、ＬｏｘＦａｓは配列番号０３の配列を有する。一実施形態において、第１のリコンビナーゼ認識配列はＬ３であり、第２のリコンビナーゼ認識配列は２Ｌであり、第３のリコンビナーゼ認識配列はＬｏｘＦａｓである。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する「一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータでありポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリＡ部位であり、ターミネータ配列が存在しない、選択マーカー（複数可）の発現カセット（複数可）を除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、かつターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０４の配列を有する。一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０６の配列を有する。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列は配列番号０８である。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、ｈＧＴターミネータは、配列番号０９の配列を有する。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、ＳＶ４０プロモータは、配列番号１０の配列を有する。
本発明による各々の独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の従属する一実施形態において、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列は配列番号０７である。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体は、治療用抗体である。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の二重特異性（治療用）抗体（ＴＣＢ）は、
－第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントであって、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントの各結合部位が第２の抗原に特異的に結合する、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメント、
－第３のＦａｂフラグメントであって、第３のＦａｂフラグメントの結合部位が第１の抗原に特異的に結合し、可変軽鎖ドメイン（ＶＬ）と可変重鎖ドメイン（ＶＨ）とが互いに置換されるようにドメインクロスオーバーを含む、第３のＦａｂフラグメント、
－Ｆｃ領域であって、第１のＦｃ領域のポリペプチドと第２のＦｃ領域のポリペプチドとを含む、Ｆｃ領域
を含み、
第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントは、それぞれ、重鎖フラグメントおよび完全長軽鎖を含み、
第１のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端は、第１のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されており、
第２のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端は、第３のＦａｂフラグメントの可変軽鎖ドメインのＮ末端に融合されており、第３のＦａｂフラグメントの重鎖定常ドメイン１のＣ末端は、第２のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されている。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体は、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体である。一実施形態において、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体はＴＣＢであり、ＣＤ２０は第２の抗原である。一実施形態において、二重特異性抗ＣＤ３／ＣＤ２０抗体は、ＲＧ６０２６である。そのような抗体は、国際公開第２０１６／０２０３０９号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、三価の抗体は、抗ＣＤ３／ＣＥＡ二重特異性抗体である。一実施形態において、抗ＣＤ３／ＣＥＡ二重特異性抗体はＴＣＢであり、ＣＥＡは第２の抗原である。一実施形態において、二重特異性抗ＣＤ３／ＣＥＡ抗体は、ＲＯ６９５８６８８またはＲＧ７８０２またはシビサタマブである。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５３８９号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ドメイン交換を伴う二価の二重特異性抗体：
しかし、ＴＩで使用される導入遺伝子中の発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、二価の二重特異性抗体発現に強い影響を持っていることが、現在では判明している。
本発明は、個々の発現カセットを所定の数および配列で有する特定の発現カセット構成を使用する。これにより、哺乳動物細胞において発現される二価の二重特異性抗体の発現収率が高くなり、生成物の質が良好になる。
本発明による発現カセット配列を有する導入遺伝子の所定の組込みのために、ＴＩ方法が使用される。本発明は、２プラスミドリコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）反応を用いて、二価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製する新規の方法を提供する。改善点は、特に、所定の配列中の同じ遺伝子座における所定の組込み、ならびにそれによる二価の二重特異性抗体の高発現および生産物に関係する副産物の形成の減少にある。
本発明で開示される主題は、二価の二重特異性抗体の安定な大規模生産のために組換え哺乳動物細胞を製造するための方法だけでなく、有利な副産物プロファイルを有する二価の二重特異性抗体の生産力が高い組換え哺乳動物細胞もまた、提供する。
本明細書において使用される２プラスミドＲＭＣＥ戦略は、同じＴＩ遺伝子座に複数の発現カセットを挿入することを可能にする。
二価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞が、本明細書において報告されている。二価の二重特異性抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、二価の二重特異性抗体は、４つのポリペプチド、第１の抗体重鎖、第２の抗体重鎖、第１の抗体軽鎖および第２の抗体軽鎖からなるヘテロ多量体タンパク質である。二価の二重特異性抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
二価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて二価の二重特異性抗体を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
本発明は、ヘテロ多量体二価の二重特異性抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、二価の二重特異性抗体の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、二価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体抗体の異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた二価の二重特異性抗体の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
二価の二重特異性抗体はヘテロ四量体であるため、その発現のために少なくとも４つの異なる発現カセット、第１の抗体重鎖の発現のための第１の発現カセット、第２の抗体重鎖の発現のための第２の発現カセット、第１の抗体軽鎖の発現のための第３の発現カセット、および第２の抗体軽鎖の発現のための第４の発現カセットが必要とされる。さらに、陽性選択マーカー（複数可）のための１つまたは複数のさらなる発現カセットも含まれてよい。
ドメインクロスオーバー／交換を伴う１つの二価の二重特異性抗体について、一過性トランスフェクションから以下の結果が得られた（ベクターは、示された発現カセットのみを含んでおり、ｌ＋ｈ＝１つの軽鎖発現カセットおよびホール変異を有する重鎖のための１つの発現カセットを含むベクター；ｘｌ＋ｋ＝ドメイン交換を伴う軽鎖のための１つの発現カセットおよびノブ変異を伴う重鎖のための１つの発現カセットを含むベクター；ｘｌ＋ｈ＝ドメイン交換を伴う軽鎖のための１つの軽鎖発現カセットおよびホール変異を伴う重鎖のための１つの発現カセットを含むベクター、ｌ＋ｋ＝軽鎖のための発現カセット、およびノブ変異を伴う重鎖のための１つの発現カセット）：
Figure 0007572977000007
ｌ＝軽鎖；ｈ＝ホール変異を有する重鎖；ｘｌ＝ドメイン交換を有する軽鎖；ｋ＝ノブ変異を有する重鎖
見られるように、一過性トランスフェクションで得られた結果、配列および４つの発現カセットの組合せは、異なる発現収率および生成物品質をもたらす。
一般的に、当技術分野では、一過性タンパク質発現プロファイルが安定な発現プロファイルを予測することが知られている（例えば、Ｄｉｅｐｅｎｂｒｕｃｋ，Ｃ．，ｅｔ ａｌ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．５４（２０１３）４９７－５０３；Ｒａｊｅｎｄｒａ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３３（２０１７）４６９－４７７参照）。
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥの安定したプールを、ドメインクロスオーバー／交換を伴う二価の二重特異性抗体の個々の鎖に対する異なる数および編成の発現カセットを含有する２つのプラスミド（前方および後方ベクター）をトランスフェクトすることによって作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間の流加産生アッセイで評価した。
ドメイン交換を伴う６つの異なる二価の二重特異性抗体について、安定なトランスへクション細胞における発現収率および生成物品質に対する抗体鎖発現カセット構成の効果を評価した。全てが異なる標的特異性を有していた。いくつかについては、異なるＶＨ／ＶＬ対の効果も分析した。これらの１０の異なる抗体について、以下の結果が得られた。
Figure 0007572977000008
Figure 0007572977000009
ｋ＝ノブ変異を有する重鎖、ｈ＝ホール変異を有する重鎖；ｌ＝軽鎖、ｘｌ＝ドメイン交換を有する軽鎖、ｖａｒ＝異なる結合部位配列
本発明のこの部分を以下に要約する。
本発明の独立した態様は、二価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、以下：
ａ）二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から二価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
を含み、
任意で、第１の軽鎖または第２の軽鎖が、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖または第２の重鎖が、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
任意で、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）、方法である。
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の安定な組込みは、哺乳動物細胞のゲノムへ安定に組み込まれ、発現カセットの特定の配列が維持される限り、当技術分野の当業者に公知の任意の方法によって行うことができる。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖である。
好ましい一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
かつ
第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の独立した態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸であり、
任意で、第１の軽鎖または第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖または第２の重鎖が、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
任意で、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖である。
好ましい一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
かつ
第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の独立した態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
を含み、
任意で、第１の軽鎖または第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖または第２の重鎖が、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
任意で、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）、
哺乳動物細胞における二価の二重特異性抗体の発現のための使用である。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖である。
好ましい一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
かつ
第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含む（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
本発明の独立した態様は、細胞のゲノム中に組み込まれた、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む、組換え哺乳動物細胞であり、
二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット
または
（２）
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、および
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット
のいずれかを含み、
任意で、第１の軽鎖または第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖または第２の重鎖が、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
任意で、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖である。
好ましい一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
かつ
第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の独立した態様は、３つの異なる組換え認識配列および４つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
任意で、第１の軽鎖または第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖または第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
任意で、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖である。
好ましい一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
かつ
第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の独立した態様は、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み二価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および４つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の軽鎖をコードする第１の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第２の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の重鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
任意で、第１の軽鎖または第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖または第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
任意で、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖が、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様であり（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、二価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、二価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖である。
好ましい一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
好ましい一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含む対応するドメイン交換重鎖であり、
かつ
第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、単一または二重のリコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様ならびに従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換重鎖である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換重鎖である。
本発明の全ての独立した態様ならびに従属する実施形態の一実施形態において、（１）の場合、または（１）および（２）の場合、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第１の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換重鎖であり、（１）の場合または（１）および（２）の場合、第２の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（Ｋａｂａｔによるナンバリング）を含み、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（Ｋａｂａｔによるナンバリング）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第２の軽鎖は、ＶＨ－ＣＬ（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＬ－ＣＨ１（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換軽鎖であり、それぞれの第２の重鎖は、ＶＬ－ＣＨ１－ＣＨ２－ＣＨ３（ＶＨ－ＶＬ－ドメイン交換）またはＶＨ－ＣＬ－ＣＨ２－ＣＨ３（ＣＨ１－ＣＬドメイン交換）を含むドメイン交換重鎖であり、（１）の場合または（１）および（２）の場合、第１の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（Ｋａｂａｔによるナンバリング）を含み、第２の重鎖はＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖ（Ｋａｂａｔによるナンバリング）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含み、
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
－第２の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第２の発現カセットに隣接し、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第３の発現カセットに隣接しており、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
抗体鎖についての各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
かつ
選択マーカーをコードする各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、選択マーカーの発現カセットを除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、全てのカセットが一方向に配置される。
１つの実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流で第２の発現カセットに隣接し（すなわち、第２の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列の上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、ポリアデニル化配列に作動可能に連結した開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流で第３の発現カセットに隣接している。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸は第１のベクターに組み込まれ、第２のデオキシリボ核酸は第２のベクターに組み込まれる。
全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含み、これらは全て互いに作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態において、ＣＨＯ細胞はＣＨＯ－Ｋ１細胞である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、リコンビナーゼ認識配列は、Ｌ３、２ＬおよびＬｏｘＦａｓである、一実施形態において、Ｌ３は配列番号０１の配列を有し、２Ｌは配列番号０２の配列を有し、ＬｏｘＦａｓは配列番号０３の配列を有する。一実施形態において、第１のリコンビナーゼ認識配列はＬ３であり、第２のリコンビナーゼ認識配列は２Ｌであり、第３のリコンビナーゼ認識配列はＬｏｘＦａｓである。
全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリＡ部位であり、ターミネータ配列が存在しない、選択マーカー（複数可）の発現カセット（複数可）を除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、かつターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０４の配列を有する。一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０６の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列は配列番号０８である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ｈＧＴターミネータは、配列番号０９の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０プロモータは配列番号１０の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列は配列番号０７である。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ二重特異性抗体である。一実施形態において、二重特異性抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ抗体は、ＲＧ７２２１またはバヌシズマブである。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ二重特異性抗体である。一実施形態において、二重特異性抗ＡＮＧ２／ＶＥＧＦ抗体は、ＲＧ７７１６またはファリシマブである。
そのようなＡＮＧ２／ＶＥＧＦ二重特異性抗体は、国際公開第２０１０／０４０５０８号、国際公開第２０１１／１１７３２９号、国際公開第２０１４／００９４６５号に報告されており、これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＰＤ１／ＴＩＭ３二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０５５４０４号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、二価の二重特異性抗体は、抗ＰＤ１／Ｌａｇ３二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１８／１８５０４３号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
多価の二重特異性抗体：
しかし、ＴＩで使用される導入遺伝子中の発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、多価の二重特異性抗体発現に強い影響を持っていることが、現在では判明している。
本発明は、個々の発現カセットを所定の数および配列で有する特定の発現カセット構成を使用する。これにより、哺乳動物細胞において発現される多価の二重特異性抗体の発現収率が高くなり、生成物の質が良好になる。
本発明による発現カセット配列を有する導入遺伝子の所定の組込みのために、ＴＩ方法が使用される。本発明は、２プラスミドリコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）反応を用いて、多価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製する新規の方法を提供する。改善点は、特に、所定の配列中の同じ遺伝子座における所定の組込み、ならびにそれによる多価の二重特異性抗体の高発現および生産物に関係する副産物の形成の減少にある。
本発明で開示される主題は、多価の二重特異性抗体の安定な大規模生産のために組換え哺乳動物細胞を製造するための方法だけでなく、有利な副産物プロファイルを有する多価の二重特異性抗体の生産力が高い組換え哺乳動物細胞もまた、提供する。
本明細書において使用される２プラスミドＲＭＣＥ戦略は、同じＴＩ遺伝子座に複数の発現カセットを挿入することを可能にする。
多価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞が、本明細書において報告されている。多価の二重特異性抗体は、前記哺乳動物細胞によって天然には発現されないヘテロ多量体ポリペプチドである。より具体的には、多価の二重特異性抗体は、３つのポリペプチド、抗体軽鎖ならびに第１の抗体重鎖および第２の抗体重鎖からなるヘテロ二量体タンパク質である。多価の二重特異性抗体の発現を達成するために、特定かつ所定の配列中に複数の異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれている。
多価の二重特異性抗体を発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて多価の二重特異性抗体を製造するための方法も、本明細書において報告されている。
本発明は、ヘテロ多量体多価の二重特異性抗体の発現に必要とされる異なる発現カセットの配列、すなわち発現カセット構成が、哺乳動物細胞のゲノム中に組み込まれた際に、多価の二重特異性抗体の発現収率に影響を与えるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、多価の二重特異性抗体の効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくとも部分的に基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。それによって、ヘテロ多量体抗体の異なるポリペプチドの、互いに対する発現比率を制御することが可能である。その結果として、正確に折り畳まれ組み立てられた多価の二重特異性抗体の効率的な発現、正確な組立て、および高い発現収率での成功裡な分泌が実現される。
多価の二重特異性抗体はヘテロ三量体であるため、その発現のために少なくとも３つの異なる発現カセット、抗体軽鎖の発現のための第１の発現カセット、第１の抗体重鎖の発現のための第２の発現カセット、および第２の抗体重鎖の発現のための第３の発現カセットが必要とされる。さらに、陽性選択マーカーのためのさらなる発現カセットも含まれてよい。
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥプールを、多価の二重特異性抗体の異なる数および構成の個々の鎖を含む、２つのプラスミド（前方および後方ベクター）をトランスフェクトすることによって、作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間の流加産生アッセイで評価した。
多価の二重特異性抗体の発現に対する抗体鎖発現カセット構成の影響を評価した。
多価の二重特異性抗体について、以下の結果が得られた：
Figure 0007572977000010
本発明のこの部分を以下に要約する。
本発明による１つの独立した態様は、多価の二重特異性抗体を製造するための方法であり、
ａ）多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地から多価の二重特異性抗体を回収する工程
を含み、
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、哺乳動物細胞のゲノム中に安定に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含む、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の安定な組込みは、哺乳動物細胞のゲノムへ安定に組み込まれ、発現カセットの特定の配列が維持される限り、当技術分野の当業者に公知の任意の方法によって行うことができる。
本発明によるデオキシリボ核酸中の個々の発現カセットは、連続して配置される。１つの発現カセットの末端とその後に続く発現カセットの開始部との間の距離は、クローニング手順に必要とされた、すなわちクローニング手順から生じるわずか数ヌクレオチドである。
本発明による１つの独立した態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含む、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
本発明による１つの独立した態様は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
を含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における多価の二重特異性抗体の発現のための使用である。
本発明による１つの独立した態様は、細胞のゲノムに組み込まれた多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む組換え哺乳動物細胞であり、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、５’から３’の方向に、
（１）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット
または
（２）
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット
のいずれかを含む、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸である。
本発明による１つの独立した態様は、３つの異なる組換え認識配列および６つまたは８つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であり、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含む。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
本発明による１つの独立した態様は、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、多価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および６つまたは８つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
－第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
（１）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
または
（２）
－第１の組換え認識配列
－第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第２の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
－第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
（１）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第４の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第５の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
または
（２）
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第６の発現カセット、
－第１の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
－第１の軽鎖をコードする第８の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
１つまたは複数のリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、多価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程を含み、
多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、多価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（１）による構成、または第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸は共に、（２）による構成を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、単一または二重のリコンビナーゼ媒介カセット交換反応によって哺乳動物細胞のゲノム中の単一遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様ならびに従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、第２の重鎖は、ＣＨ３ドメインに変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８ＡおよびＹ４０７Ｖを含み、またはその逆も同様である（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、重鎖の１つは、変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他の重鎖は変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の重鎖は、追加のドメイン交換Ｆａｂフラグメントを含む伸長重鎖である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１の軽鎖は、ドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
－第１の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第１の軽鎖可変ドメインを含み、
－第２の重鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第２の重鎖可変ドメインを含み、かつ
－第１の軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、多価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含む。
本発明の全ての独立した態様および全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流でそれぞれ第３または第４の発現カセットに隣接し、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流でそれぞれ第４または第５の発現カセットに隣接しており、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、
抗体鎖についての各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含み、
かつ
選択マーカーをコードする各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、ならびに任意に、ターミネータ配列を含む。
ターミネータ配列は、ＲＮＡポリメラーゼＩＩによる非常に長いＲＮＡ転写物の生成、すなわち、本発明によるデオキシリボ核酸中の次の発現カセットへのリードスルーを防止し、本発明による方法で使用される。すなわち、目的の１つの構造遺伝子の発現は、それ自体のプロモータによって制御される。
したがって、ポリアデニル化シグナルとターミネータ配列との組合せによって、効率的な転写終結が達成される。すなわち、ＲＮＡポリメラーゼＩＩのリードスルーは、二重終結シグナルの存在によって妨げられる。ターミネータ配列は、複合体分解を開始し、ＤＮＡ鋳型からのＲＮＡポリメラーゼの解離を促進する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、選択マーカーの発現カセットを除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、全ての発現カセットが一方向に配置される。
１つの実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の５’に一部が、３’に一部が位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流でそれぞれ第３または第４の発現カセットに隣接し（すなわち、第３または第４の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列の上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、ポリアデニル化配列に作動可能に連結した開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流でそれぞれ第４または第５の発現カセットに隣接している。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、開始コドンは翻訳開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸は第１のベクターに組み込まれ、第２のデオキシリボ核酸は第２のベクターに組み込まれる。
全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含み、これらは全て互いに作動可能に連結されている。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態において、ＣＨＯ細胞はＣＨＯ－Ｋ１細胞である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、リコンビナーゼ認識配列は、Ｌ３、２ＬおよびＬｏｘＦａｓである、一実施形態において、Ｌ３は配列番号０１の配列を有し、２Ｌは配列番号０２の配列を有し、ＬｏｘＦａｓは配列番号０３の配列を有する。一実施形態において、第１のリコンビナーゼ認識配列はＬ３であり、第２のリコンビナーゼ認識配列は２Ｌであり、第３のリコンビナーゼ認識配列はＬｏｘＦａｓである。
全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリＡ部位であり、ターミネータ配列が存在しない、選択マーカー（複数可）の発現カセット（複数可）を除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、かつターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０４の配列を有する。一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０６の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列は配列番号０８である。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ｈＧＴターミネータは、配列番号０９の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０プロモータは配列番号１０の配列を有する。
本発明の全ての独立した態様ならびに全ての従属する実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列は配列番号０７である。
全ての態様および実施形態の一実施形態において、多価の二重特異性抗体は、抗ＦＡＰ／Ｏｘ４０二重特異性抗体である。そのような抗体は、国際公開第２０１７／０６０１４４号に報告されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
Ｃｒｅ ｍＲＮＡを用いた標的化組込み：
しかし、例えばＣｒｅ ＤＮＡの代わりにＣｒｅ ｍＲＮＡを使用すると、標的化組込みによって得られるクローンの数を改善できることが見出された。より詳細には、選択期間後、Ｃｒｅ ｍＲＮＡ生成組換え細胞プールにおけるクローンの絶対数は、Ｃｒｅプラスミド生成組換え細胞プールよりも多いことが見出された。したがって、Ｃｒｅ ＤＮＡ（プラスミド）の代わりにＣｒｅ ｍＲＮＡを使用することによって、より大きなサイズおよび不均一性を有する組換え細胞プールが製造される。この理論に束縛されるものではないが、それにより、高力価および良好な生成物品質を有する組換え細胞クローンを見出す確率が増加すると想定される。さらに、Ｃｒｅ ｍＲＮＡ生成プールからの組換え細胞クローンの数の増加は、Ｃｒｅ ＤＮＡ（プラスミド）生成細胞プールと比較して安定である。
導入遺伝子の所定の組込みのために、ＴＩ法が使用される。本発明は、２プラスミドリコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）反応を用いて、ポリペプチドを発現する組換え哺乳動物細胞を作製する新規の方法を提供する。改善点は、特に、所定の配列中の同じ遺伝子座における所定の組込み、ならびにそれによるポリペプチドの高発現および生産物に関係する副産物の形成の減少にある。
本発明で開示される主題は、ポリペプチドの安定な大量生産のために組換え哺乳動物細胞を製造するための方法だけでなく、ポリペプチドの生産力が高い組換え哺乳動物細胞もまた、提供する。
本明細書において使用される２プラスミドＲＭＣＥ戦略は、同じＴＩ遺伝子座に複数の発現カセットを挿入することを可能にする。
本発明の１つの態様は、異種性ポリペプチドを発現する組換え哺乳動物細胞を作製するための方法および前記組換え哺乳動物細胞を用いて異種性ポリペプチドを製造するための方法である。
本発明は、少なくとも部分的には、標的化組込みによって得られた組換え哺乳動物細胞クローンの数、すなわち、目的のタンパク質をコードする異種性核酸でトランスフェクトされ、前記異種性核酸をそれらのゲノムに安定に組み込んだした哺乳動物細胞の数が、例えばＣｒｅ ＤＮＡの代わりにＣｒｅ ｍＲＮＡが使用される場合、改善され得る、すなわち増加され得るという知見に基づく。より詳細には、選択期間後、リコンビナーゼの供給源としてＣｒｅ ｍＲＮＡのみを使用して作製された組換え細胞プール中のクローンの絶対数は、リコンビナーゼの供給源としてＣｒｅプラスミドを使用した組換え細胞プール中よりも多いことが見出された。したがって、Ｃｒｅ ＤＮＡ（Ｃｒｅプラスミド）の代わりにＣｒｅ ｍＲＮＡを使用することによって、より大きなサイズおよび不均一性を有する組換え細胞プールが製造される。これは、実施例１０ならびに図２、図３および図４に示されている。この理論に束縛されるものではないが、それにより、高力価および良好な生成物品質を有する組換え細胞クローンを見出す確率が増加すると想定される。さらに、本発明は、少なくとも部分的に、Ｃｒｅ ｍＲＮＡ生成プールからの組換え細胞クローンの数の増加は、Ｃｒｅプラスミド生成細胞プールと比較して安定であることに基づいている。
本発明の１つの態様は、異種性ポリペプチドを発現する組換え哺乳動物細胞である。異種性ポリペプチドの発現を実現するために、特定かつ所定の配列中に異なる発現カセットを含む組換え核酸が、哺乳動物細胞のゲノムに組み込まれた。
本発明の１つの態様は、組換え哺乳動物細胞のゲノムの単一部位に、標的化組込みによって安定に組み込まれた、目的の（異種性）ポリペプチドをコードする（異種性および／またはトランスジェニック）デオキシリボ核酸（の厳密に１つのコピー）を含む前記組換え哺乳動物細胞の数を増加させるためのＣｒｅ－リコンビナーゼｍＲＮＡの使用であり、一実施形態において、組換え細胞はまた、その中での培養時に目的のポリペプチドを培養培地に分泌する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞および／または導入されたＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡは、Ｃｒｅリコンビナーゼをコードするデオキシリボ核酸を含まない。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡは、単離されたＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡである。
本発明は、組換えＣＨＯ細胞などの組換え哺乳動物細胞を製造するために二重リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）を使用することができ、その際、所定かつ特定の発現カセット配列がゲノム中に組み込まれ、その結果として、異種性ポリペプチドの効率的な発現および生産がもたらされるという知見に、少なくともある程度は基づいている。この組込みは、標的化組込みによって哺乳動物細胞のゲノムの特定の部位に引き起こされる。
標的化組込みにおいて、部位特異的組換えは、ＴＩ宿主細胞のゲノム中の特定の遺伝子座へのドナー核酸の導入に使用される。これは、ゲノム中の組込み部位の配列がドナー核酸と交換される酵素プロセスである。そのような核酸交換を行うために使用される１つの系はＣｒｅ－ｌｏｘ系である。交換を触媒する酵素はＣｒｅリコンビナーゼである。交換される配列は、ゲノム中ならびにドナー核酸中の２つのｌｏｘ部位の位置によって決定される。これらのｌｏｘ部位はＣｒｅリコンビナーゼによって認識される。それ以上は必要ない、すなわちＡＴＰ等は不要である。元々、Ｃｒｅ－ｌｏｘ系はバクテリオファージＰ１において見出されている。
Ｃｒｅ－ｌｏｘ系は、哺乳動物、植物、細菌および酵母等の異なる細胞型で作動する。
ＲＭＣＥの効率は、他の要因の中でも、ｌｏｘＰが導入されたＤＮＡの長さによって決定される。ｌｏｘＰが導入された配列の長さを増加させると、ＲＭＣＥ効率が低下する。
さらに、ＲＭＣＥの効率は、Ｃｒｅリコンビナーゼの起源の選択に依存する。Ｃｒｅリコンビナーゼの不十分な発現は、非並行組換えをもたらし、ＲＭＣＥを抗体産生核酸の導入に使用する場合に有害であることが報告されている。
交換反応は酵素反応であるため、交換後にｌｏｘ部位がそれらの機能性を保持するので、酵素が依然として存在する／活性である限り、第１の交換反応が行われた後にさらなる交換反応が可能である。したがって、ゲノム中に活性ＣｒｅリコンビナーゼおよびｌｏｘＰ部位を含む細胞は、意図された組換え事象が発生する傾向があるが、非意図的な組換え事象も発生する傾向がある。
したがって、Ｃｒｅ－ｌｏｘ系の活性を適時に制御して、最初に意図した交換反応が起こった後の二次的な意図しないさらなる交換反応を防止する必要がある。
これは、Ｃｒｅ ｍＲＮＡをリコンビナーゼの唯一の供給源として使用する本発明による方法によって達成された。
Ｃｒｅリコンビナーゼの唯一の供給源としてＣｒｅ ＤＮＡをＣｒｅ ｍＲＮＡで置き換えることによって、Ｃｒｅリコンビナーゼのランダムな組込みおよびそれによる持続的な活性の可能性が排除された。これはまた、Ｃｒｅ ＤＮＡも組み込んだクローンのスクリーニングを実施する必要がないため、作業負荷の低減をもたらす。
Ｃｒｅ ＤＮＡをＣｒｅ ｍＲＮＡで置き換えることにより、プールの増加ならびに力価についての単一クローンの品質の上昇を得ることができる。
Ｃｒｅ ＤＮＡをＣｒｅ ｍＲＮＡで置き換えることにより、プールの増加ならびに導入遺伝子発現についての単一クローンの安定性の上昇を得ることができる。
例えば、ＴＩ後の生存率回復に関しては、常に欠点はないが、Ｃｒｅ ｍＲＮＡを使用した場合に改善が見られることがあることがわかっている（図２参照）。交換効率／プール品質に関しては、常に欠点はないが、Ｃｒｅ ｍＲＮＡを使用した場合に改善が見られることがある（図３および図４参照）。
複雑な抗体フォーマットを作製するためのＣＨＯプールを、リコンビナーゼの唯一の供給源としてＣＲＥプラスミドまたはＣＲＥ ｍＲＮＡのいずれかを用いて作製した。選択期間の前後、すなわち選択剤の存在下での培養の前後に、ＣＨＯプール中のクローンをＦＡＣＳによって分析した。
選択期間後、ＣＲＥ ｍＲＮＡ作製ＣＨＯプールにおけるクローンの交換効率／プール品質は、ＣＲＥプラスミド作製ＣＨＯプールよりも高いことが分かる（図３および図４参照）。したがって、ＣＲＥ ＤＮＡの代わりにＣＲＥ ｍＲＮＡを使用することによって、より大きなサイズおよび不均一性を有するＣＨＯプールが製造される。それにより、高い力価および良好な生成物品質を有するＣＨＯクローンを見出す確率が増加する。
さらに、Ｃｒｅ ｍＲＮＡを使用して得られたクローンにおける生存率回復が改善される（図２参照）。
さらに、ＣＲＥ ｍＲＮＡ生成ＣＨＯプール由来のクローンは、ＣＲＥプラスミド生成ＣＨＯプール由来のクローンと比較してより安定であると予想される。
本発明のこの部分を以下に要約する。
本発明の１つの独立した態様は、ポリペプチドを製造するための方法であり、
ａ）任意でポリペプチドの発現に適した条件下で、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
ｂ）細胞または培養培地からポリペプチドを回収する工程
を含み、
ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、Ｃｒｅ ｍＲＮＡを使用するＣｒｅリコンビナーゼ媒介カセット交換によって哺乳動物細胞のゲノムに安定に組み込まれている。
本発明の別の独立した態様は、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含み、ポリペプチドを分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下：
ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞を提供する工程であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
ｂ）ａ）で提供された細胞に、３つの異なる組換え認識配列および１～８つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸を含む組成物を導入する工程であって、
第１のデオキシリボ核酸が５’から３’の方向に、
－第１の組換え認識配列
－１つまたは複数の発現カセット、
－１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分、および
－第３の組換え認識配列の第１のコピー
のいずれかを含み、
かつ
第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
－第３の組換え認識配列の第２のコピー、
－１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの３’末端部分、
－１つまたは複数の発現カセット、および
－第２の組換え認識配列
のいずれかを含み、
第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列が、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列の第１の組換え認識配列～第３の組換え認識配列と一致しており、
１つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になるとき、１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
ｃ）
ｉ）ｂ）の第１のデオキシリボ核酸および第２のデオキシリボ核酸と同時に；または
ｉｉ）その後に逐次的に
のいずれかで、ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡを導入する工程であって、
Ｃｒｅリコンビナーゼが、第１および第２のデオキシリボ核酸の組換え認識配列を認識し、（かつ、場合によっては、１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程、
ならびに
ｄ）第２の選択マーカーを発現し、ポリペプチドを分泌する細胞を選択する工程を含み、
それにより、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸を含み、ポリペプチドを分泌する組換え哺乳動物細胞を製造する、方法である。
ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸の安定な組込みは、哺乳動物細胞のゲノムへ安定に組み込まれ、発現カセットの特定の配列が維持される限り、当技術分野の当業者に公知の任意の方法によって行うことができる。
本発明の１つの態様は、組換え哺乳動物細胞のゲノムの単一部位に、標的化組込みによって安定に組み込まれた、目的の（異種性）ポリペプチドをコードする（異種性および／またはトランスジェニック）デオキシリボ核酸（の厳密に１つのコピー）を含む前記組換え哺乳動物細胞の数を増加させるためのＣｒｅ－リコンビナーゼｍＲＮＡの使用であり、一実施形態において、組換え細胞はまた、その中での培養時に目的のポリペプチドを培養培地に分泌する。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、哺乳動物細胞および／または導入されたＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡは、Ｃｒｅリコンビナーゼをコードするデオキシリボ核酸を含まない。
本発明による全ての態様および実施形態の一実施形態において、ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡは、単離されたＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡである。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２０のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２０のアミノ酸配列を含み、そのＮ末端もしくはＣ末端または両方に核局在化配列をさらに含むポリペプチドをコードする。一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２０のアミノ酸配列を有し、そのＮ末端もしくはＣ末端に、または両方に、互いに独立して、１～５つの核局在化配列をさらに含むポリペプチドをコードする。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２１のアミノ酸配列またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含む。全ての態様の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２１のヌクレオチド配列、またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含み、その５’末端もしくは３’末端または両方に、核局在化配列をコードするさらなる核酸をさらに含む。全ての態様の一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡは、配列番号２１のヌクレオチド配列、またはそのコドン使用頻度最適化バリアントを含み、その５’末端もしくは３’末端または両方に互いに独立して、１～５個の、核局在化配列をコードする核酸をさらに含む。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、デオキシリボ核酸の厳密に１つのコピーが、哺乳動物細胞のゲノムの単一の部位または遺伝子座に安定に組み込まれる。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、１～８つの発現カセットを含む。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、少なくとも４つの発現カセットを含み、
－第１の組換え認識配列は、最も５’の（すなわち、第１の）発現カセットに対して５’に位置し、
－第２の組換え認識配列は、最も３’の発現カセットに対して３’に位置し、
－第３の組換え認識配列は、
－第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間、かつ
－発現カセットのうちの２つの間
に位置し、
かつ
全ての組換え認識配列は異なる。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、第３の組換え認識配列は、第４の発現カセットと第５の発現カセットの間に位置する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードする発現カセットをさらに含む。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドをコードするデオキシリボ核酸は、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、開始コドンはコード配列に作動可能に連結されている。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列の、
ｉ）５’、または
ｉｉ）３’、または
ｉｉｉ）部分的に５’および部分的に３’
のいずれかに位置している。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットは、第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置しており、前記発現カセットの、５’に位置する部分は、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの、３’に位置する部分は、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含む。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、選択マーカーをコードする発現カセットの、５’に位置する部分は、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、これにより、プロモータ配列は、上流でそれぞれ第２、第３または第４の発現カセットに隣接し（すなわち、第２、第３または第４の発現カセットに対して下流の位置にあり）、開始コドンは、下流で第３の組換え認識配列に隣接し（すなわち、第３の組換え認識配列に対して上流の位置にあり）、かつ、選択マーカーをコードする発現カセットの３’に位置する部分は、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で第３の組換え認識配列に隣接し、下流でそれぞれ第３、第４または第５の発現カセットに隣接している。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、開始コドンは転写開始コドンである。一実施形態において、開始コドンはＡＴＧである。
本発明の全ての態様および実施形態のうちの一実施形態において、第１のデオキシリボ核酸は第１のベクターに組み込まれ、第２のデオキシリボ核酸は第２のベクターに組み込まれる。
本発明の全ての態様および実施形態の好ましい一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡと、第１のベクターおよび第２のベクターの混合物との重量比は、１：３～２：１の範囲である。好ましい一実施形態において、Ｃｒｅ ｍＲＮＡと第１のベクターおよび第２のベクターの混合物との重量比は約１：５である。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、各発現カセットは、５’から３’の方向に、プロモータ、コード配列、およびポリアデニル化シグナル配列、任意でそれに続くターミネータ配列を含む。
ターミネータ配列は、ＲＮＡポリメラーゼＩＩによる非常に長いＲＮＡ転写物の生成、すなわち、本発明によるデオキシリボ核酸中の次の発現カセットへのリードスルーを防止し、本発明による方法で使用される。すなわち、目的の１つの構造遺伝子の発現は、それ自体のプロモータによって制御される。
したがって、ポリアデニル化シグナルとターミネータ配列との組合せによって、効率的な転写終結が達成される。すなわち、ＲＮＡポリメラーゼＩＩのリードスルーは、二重終結シグナルの存在によって妨げられる。ターミネータ配列は、複合体分解を開始し、ＤＮＡ鋳型からのＲＮＡポリメラーゼの解離を促進する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むか、または含まないヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての態様および実施形態のうちの一実施形態において、プロモータは、ＳＶ４０プロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、選択マーカーの発現カセットを除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータは、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての態様および実施形態のうちの一実施形態において、哺乳動物細胞はＣＨＯ細胞である。一実施形態において、ＣＨＯ細胞はＣＨＯ－Ｋ１細胞である。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、二価単一特異性抗体、少なくとも１つのドメイン交換を含む二価の二重特異性抗体、および少なくとも１つのドメイン交換を含む三価の二重特異性抗体からなるポリペプチドの群から選択される。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＬドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ多量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第１の軽鎖可変ドメインを含む、第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、および第２の重鎖可変ドメインを含む、第２の重鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第１の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、ヘテロ四量体ポリペプチドであって、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む第１の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメインおよびＣＨ３ドメインを含む、第２の重鎖、
－Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含む、第１の軽鎖、および
－Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含む、第２の軽鎖
を含むポリペプチドであり、
第２の重鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖可変ドメインは第１の結合部位を形成し、第１の重鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖可変ドメインは第２の結合部位を形成する。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、治療用抗体である。好ましい一実施形態において、治療用抗体は、二重特異性（治療用）抗体である。一実施形態において、二重特異性（治療用）抗体はＴＣＢである。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、二重特異性（治療用）抗体（ＴＣＢ）であって、
－第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントであって、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントの各結合部位が第２の抗原に特異的に結合する、第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメント、
－第３のＦａｂフラグメントであって、第３のＦａｂフラグメントの結合部位が第１の抗原に特異的に結合し、可変軽鎖ドメイン（ＶＬ）と可変重鎖ドメイン（ＶＨ）とが互いに置換されるようにドメインクロスオーバーを含む、第３のＦａｂフラグメント、
－Ｆｃ領域であって、第１のＦｃ領域のポリペプチドと第２のＦｃ領域のポリペプチドとを含む、Ｆｃ領域
を含み、
第１のＦａｂフラグメントおよび第２のＦａｂフラグメントは、それぞれ、重鎖フラグメントおよび完全長軽鎖を含み、
第１のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端は、第１のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されており、
第２のＦａｂフラグメントの重鎖フラグメントのＣ末端は、第３のＦａｂフラグメントの可変軽鎖ドメインのＮ末端に融合されており、第３のＦａｂフラグメントの重鎖定常ドメイン１のＣ末端は、第２のＦｃ領域ポリペプチドのＮ末端に融合されている。
本発明の全ての態様および実施形態の一実施形態において、ポリペプチドは、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体である。一実施形態において、抗ＣＤ３／ＣＤ２０二重特異性抗体はＴＣＢであり、ＣＤ２０は第２の抗原である。一実施形態において、二重特異性抗ＣＤ３／ＣＤ２０抗体は、ＲＧ６０２６である。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、リコンビナーゼ認識配列は、Ｌ３、２Ｌ、およびＬｏｘＦａｓである。一実施形態において、Ｌ３は配列番号０１の配列を有し、２Ｌは配列番号０２の配列を有し、ＬｏｘＦａｓは配列番号０３の配列を有する。一実施形態において、第１のリコンビナーゼ認識配列はＬ３であり、第２のリコンビナーゼ認識配列は２Ｌであり、第３のリコンビナーゼ認識配列はＬｏｘＦａｓである。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、プロモータがＳＶ４０プロモータでありポリアデニル化シグナル配列がＳＶ４０ポリＡ部位でありターミネータ配列が存在しない、選択マーカー（複数可）の発現カセット（複数可）を除いて、プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリＡ部位であり、ターミネータ配列は、ｈＧＴターミネータである。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０４の配列を有する。一実施形態において、ヒトＣＭＶプロモータは、配列番号０６の配列を有する。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列は、配列番号０８である。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、ｈＧＴターミネータは、配列番号０９の配列を有する。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０プロモータは配列番号１０の配列を有する。
本発明の全ての前述の態様および実施形態の一実施形態において、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列は配列番号０７である。
ＩＩ．ｂ リコンビナーゼ媒介カセット交換（ＲＭＣＥ）
標的化組込みにより、哺乳動物細胞ゲノムのあらかじめ定められた部位に外因性ヌクレオチド配列が組み込まれることが可能になる。特定の実施形態では、標的化組込みは、１つまたは複数の組換え認識配列（ＲＲＳ）を認識するリコンビナーゼによって媒介される。特定の実施形態では、標的化組込みは、相同組換えによって媒介される。
「組換え認識配列」（ＲＲＳ）は、リコンビナーゼによって認識されるヌクレオチド配列であり、リコンビナーゼ媒介性組換え事象に必要かつ十分である。ＲＲＳは、組換え事象がヌクレオチド配列内で発生する位置を定義するために使用され得る。
特定の実施形態では、ＲＲＳは、ＬｏｘＰ配列、ＬｏｘＰ Ｌ３配列、ＬｏｘＰ ２Ｌ配列、ＬｏｘＦａｓ配列、Ｌｏｘ５１１配列、Ｌｏｘ２２７２配列、Ｌｏｘ２３７２配列、Ｌｏｘ５１７１配列、Ｌｏｘｍ２配列、Ｌｏｘ７１配列、Ｌｏｘ６６配列、ＦＲＴ配列、Ｂｘｂ１ ａｔｔＰ配列、Ｂｘｂ１ ａｔｔＢ配列、φＣ３１ ａｔｔＰ配列、およびφＣ３１ ａｔｔＢ配列からなる群から選択される。複数のＲＲＳが存在しなければならない場合、同一でないＲＲＳが選択される限りにおいて、各配列の選択は他方に依存する。
特定の実施形態では、ＲＲＳは、Ｃｒｅリコンビナーゼによって認識され得る。特定の実施形態では、ＲＲＳは、ＦＬＰリコンビナーゼによって認識され得る。特定の実施形態では、ＲＲＳは、Ｂｘｂ１インテグラーゼによって認識され得る。特定の実施形態では、ＲＲＳは、φＣ３１インテグラーゼによって認識され得る。
ＲＲＳがＬｏｘＰ部位である特定の実施形態において、細胞は、組換えを行うためにＣｒｅリコンビナーゼを必要とする。ＲＲＳがＦＲＴ部位である特定の実施形態において、細胞は、組換えを行うためにＦＬＰリコンビナーゼを必要とする。ＲＲＳがＢｘｂ１ ａｔｔＰ部位またはＢｘｂ１ ａｔｔＢ部位である特定の実施形態において、細胞は、組換えを行うためにＢｘｂ１インテグラーゼを必要とする。ＲＲＳがφＣ３１ ａｔｔＰ部位またはφＣ３１ａｔｔＢ部位である特定の実施形態において、細胞は、組換えを行うためにφＣ３１インテグラーゼを必要とする。これらのリコンビナーゼは、これらの酵素のコード配列を含む発現ベクターを用いて細胞中に導入することができる。
Ｃｒｅ－ＬｏｘＰ部位特異的組換え系は、多くの生物学的実験系で広く使用されている。Ｃｒｅは、３４ｂｐのＬｏｘＰ配列を認識する３８ｋＤａの部位特異的ＤＮＡリコンビナーゼである。ＣｒｅはバクテリオファージＰ１に由来し、チロシンファミリーの部位特異的リコンビナーゼに属する。Ｃｒｅリコンビナーゼは、ＬｏｘＰ配列間の分子内および分子間組換えの両方を媒介できる。ＬｏｘＰ配列は、２つの１３ｂｐの逆方向反復に挟まれた８ｂｐの非パリンドロームコア領域で構成されている。Ｃｒｅリコンビナーゼは１３ｂｐの反復に結合し、それによって８ｂｐのコア領域内の組換えを媒介する。Ｃｒｅ－ＬｏｘＰ媒介性組換えは高効率で起こり、他の宿主因子を必要としない。２つのＬｏｘＰ配列が同じヌクレオチド配列上で同じ方向に配置されている場合、Ｃｒｅ媒介性組換えにより、２つのＬｏｘＰ配列の間に位置するＤＮＡ配列が共有結合で閉じた円として切り出される。２つのＬｏｘＰ配列が同じヌクレオチド配列上で逆方向の位置に配置されている場合、Ｃｒｅ媒介性組換えにより、２つの配列の間に位置するＤＮＡ配列の方向が反転する。２つのＬｏｘＰ配列が２つの異なるＤＮＡ分子上にあり、１つのＤＮＡ分子が環状である場合、Ｃｒｅ媒介性組換えにより、環状ＤＮＡ配列の組込みをもたらす。
特定の実施形態では、ＬｏｘＰ配列は、野生型ＬｏｘＰ配列である。特定の実施形態では、ＬｏｘＰ配列は、変異体ＬｏｘＰ配列である。変異体ＬｏｘＰ配列は、Ｃｒｅ媒介性組込みまたは置換の効率を高めるために開発された。特定の実施形態では、変異体ＬｏｘＰ配列は、ＬｏｘＰ Ｌ３配列、ＬｏｘＰ ２Ｌ配列、ＬｏｘＦａｓ配列、Ｌｏｘ５１１配列、Ｌｏｘ２２７２配列、Ｌｏｘ２３７２配列、Ｌｏｘ５１７１配列、Ｌｏｘｍ２配列、Ｌｏｘ７１配列、およびＬｏｘ６６配列からなる群から選択される。例えば、Ｌｏｘ７１配列では、左側の１３ｂｐの反復で５ｂｐが変異している。Ｌｏｘ６６配列では、右側の１３ｂｐの反復で５ｂｐが変異している。野生型と変異体の両方のＬｏｘＰ配列は、Ｃｒｅ依存性組換えを媒介し得る。
「一致するＲＲＳ」という用語は、２つのＲＲＳ間で組換えが起こることを示す。特定の実施形態では、２つの一致ＲＲＳは同一である。特定の実施形態では、両方のＲＲＳは野生型ＬｏｘＰ配列である。特定の実施形態では、両方のＲＲＳは変異体ＬｏｘＰ配列である。特定の実施形態では、両方のＲＲＳは野生型ＦＲＴ配列である。特定の実施形態では、両方のＲＲＳは変異体ＦＲＴ配列である。特定の実施形態では、２つの一致するＲＲＳは異なる配列であるが、同じリコンビナーゼによって認識され得る。特定の実施形態では、第１の一致するＲＲＳは、Ｂｘｂ１ ａｔｔＰ配列であり、第２の一致するＲＲＳは、Ｂｘｂ１ ａｔｔＢ配列である。特定の実施形態では、第１の一致するＲＲＳは、φＣ３１ ａｔｔＢ配列であり、第２の一致するＲＲＳは、φＣ３１ ａｔｔＢ配列である。
ＩＩ．ｃ ＴＩに適した例示的哺乳動物細胞
前述したような、外因性核酸（「ランディング部位」）を含む、ＴＩに適した任意の公知または今後得られる哺乳動物細胞を、本発明において使用することができる。
これまでのセクションに基づく、外因性核酸（ランディング部位）を含むＣＨＯ細胞を用いて、本発明を例示する。これは、本発明を例示するためにのみ提示されており、いかなる方法であっても限定として解釈されるべきではない。本発明の真の範囲は、特許請求の範囲で設定される。
好ましい一実施形態において、哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞は、ＣＨＯ細胞である。
本発明において使用するために適している、そのゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む例示的哺乳動物細胞は、Ｃｒｅリコンビナーゼの媒介によるＤＮＡ組換えのための３つの異種特異的ｌｏｘＰ部位を含むランディング部位（＝哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列）を内部に持つ、ＣＨＯ細胞である。これらの異種特異的ｌｏｘＰ部位は、Ｌ３、ＬｏｘＦａｓ、および２Ｌであり（例えば、Ｌａｎｚａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｊ．７（２０１２）８９８－９０８；Ｗｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．３３（２００５）ｅ１４７を参照されたい）、その際、Ｌ３および２Ｌはランディング部位の５’末端および３’末端にそれぞれ隣接しており、ＬｏｘＦａｓはＬ３部位と２Ｌ部位の間に位置している。ランディング部位は、ＩＲＥＳを介した選択マーカーの発現を蛍光性ＧＦＰタンパク質の発現に結び付けて、ポジティブ選択によってランディング部位を安定化することならびにトランスフェクションおよびＣｒｅ組換え後に部位が存在しないものを選択すること（ネガティブ選択）を可能にする、バイシストロン性単位をさらに含む。緑色蛍光性タンパク質（ＧＦＰ）は、ＲＭＣＥ反応をモニターするのに役立つ。例示的なＧＦＰは、配列番号１１の配列を有する。
先のパラグラフで概説したようにランディング部位がこのように編成されていることによって、２つのベクター、いわゆる、Ｌ３部位およびＬｏｘＦａｓ部位を有するフロントベクターならびにＬｏｘＦａｓ部位および２Ｌ部位を内部に持つバックベクターを同時に組み込むことが可能になる。ランディング部位に存在するものとは異なる、選択マーカー遺伝子の機能的エレメントは、両方のベクター間に分配されている：プロモータおよび開始コドンはフロントベクター上に位置しているのに対し、コード化領域およびポリＡシグナルはバックベクター上に位置している。両方のベクターに由来する前記核酸がＣｒｅを媒介として正確に組み込まれた場合にのみ、各選択剤に対する耐性が誘導される。
通常、ＴＩに適した哺乳動物細胞は、哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞であって、外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに第１の組換え認識配列と第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ組換え認識配列が全て異なっている、外因性ヌクレオチド配列を含む哺乳動物細胞である。前記外因性ヌクレオチド配列は、「ランディング部位」と呼ばれる。
本発明で開示される主題では、外因性ヌクレオチド配列のＴＩに適した哺乳動物細胞を使用する。特定の実施形態において、ＴＩに適した哺乳動物細胞は、哺乳動物細胞のゲノム中の組込み部位に組み込まれる外因性ヌクレオチド配列を含む。ＴＩに適したこのような哺乳動物細胞は、ＴＩ宿主細胞と表記することもできる。
特定の実施形態において、ＴＩに適した哺乳動物細胞は、ランディング部位を含む、ハムスター細胞、ヒト細胞、ラット細胞、またはマウス細胞である。特定の実施形態において、ＴＩに適した哺乳動物細胞は、ランディング部位を含む、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ＣＨＯ Ｋ１細胞、ＣＨＯ Ｋ１ＳＶ細胞、ＣＨＯ ＤＧ４４細胞、ＣＨＯ ＤＵＫＸＢ－１１細胞、ＣＨＯ Ｋ１Ｓ細胞、またはＣＨＯ Ｋ１Ｍ細胞である。
特定の実施形態において、ＴＩに適した哺乳動物細胞は、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含み、外因性ヌクレオチド配列は、１つまたは複数の組換え認識配列（ＲＲＳ）を含む。特定の実施形態では、外因性ヌクレオチド配列は、少なくとも２つのＲＲＳを含む。ＲＲＳは、リコンビナーゼ、例えば、Ｃｒｅリコンビナーゼ、ＦＬＰリコンビナーゼ、Ｂｘｂ１インテグラーゼ、またはφＣ３１インテグラーゼによって認識され得る。ＲＲＳは、ＬｏｘＰ配列、ＬｏｘＰ Ｌ３配列、ＬｏｘＰ ２Ｌ配列、ＬｏｘＦａｓ配列、Ｌｏｘ５１１配列、Ｌｏｘ２２７２配列、Ｌｏｘ２３７２配列、Ｌｏｘ５１７１配列、Ｌｏｘｍ２配列、Ｌｏｘ７１配列、Ｌｏｘ６６配列、ＦＲＴ配列、Ｂｘｂ１ ａｔｔＰ配列、Ｂｘｂ１ ａｔｔＢ配列、φＣ３１ ａｔｔＰ配列、およびφＣ３１ ａｔｔＢ配列からなる群から選択され得る。
特定の実施形態において、外因性ヌクレオチド配列は、第１のＲＲＳ、第２のＲＲＳ、および第３のＲＲＳ、ならびに第１のＲＲＳと第２のＲＲＳの間に位置する少なくとも１つの選択マーカーを含み、かつ第３のＲＲＳは、第１のＲＲＳおよび／または第２のＲＲＳとは異なる。特定の実施形態では、外因性ヌクレオチド配列は、第２の選択マーカーをさらに含み、第１および第２の選択マーカーは異なる。特定の実施形態において、外因性ヌクレオチド配列は、第３の選択マーカーおよび配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）もさらに含み、ＩＲＥＳは第３の選択マーカーに作動可能に連結されている。第３の選択マーカーは、第１または第２の選択マーカーとは異なり得る。
選択マーカー（複数可）は、アミノグリコシド系ホスホトランスフェラーゼ（ＡＰＨ）（例えば、ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ（ＨＹＧ）、ネオマイシン、およびＧ４１８ ＡＰＨ）、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）、チミジンキナーゼ（ＴＫ）、グルタミン合成酵素（ＧＳ）、アスパラギン合成酵素、トリプトファン合成酵素（インドール）、ヒスチジノールデヒドロゲナーゼ（ヒスチジノールＤ）、ならびにピューロマイシン、ブラスチシジン、ブレオマイシン、フレオマイシン、クロラムフェニコール、ゼオシン、およびミコフェノール酸に対する耐性をコードする遺伝子からなる群から選択され得る。また、選択マーカー（複数可）は、緑色蛍光性タンパク質（ＧＦＰ）、高感度ＧＦＰ（ｅＧＦＰ）、合成ＧＦＰ、黄色蛍光性タンパク質（ＹＦＰ）、高感度ＹＦＰ（ｅＹＦＰ）、シアン蛍光性タンパク質（ＣＦＰ）、ｍＰｌｕｍ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、Ｊ－ｒｅｄ、ＤｓＲｅｄ単量体、ｍＯｒａｎｇｅ、ｍＫＯ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、Ｖｅｎｕｓ、ＹＰｅｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ６、ＣｙＰｅｔ、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、およびＴ－Ｓａｐｐｈｉｒｅからなる群から選択される蛍光性タンパク質であってもよい。
特定の実施形態において、外因性ヌクレオチド配列は、第１のＲＲＳ、第２のＲＲＳ、および第３のＲＲＳ、ならびに第１のＲＲＳと第３のＲＲＳの間に位置する少なくとも１つの選択マーカーを含む。
外因性ヌクレオチド配列は、特定の細胞に由来しないが、ＤＮＡ送達法、例えば、トランスフェクション法、エレクトロポレーション法、または形質転換法などによって前記細胞に導入することができるヌクレオチド配列である。特定の実施形態において、ＴＩに適した哺乳動物細胞は、哺乳動物細胞のゲノム中の１つまたは複数の組込み部位に組み込まれた少なくとも１つの外因性ヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態において、外因性ヌクレオチド配列は、哺乳動物細胞のゲノムの特定の遺伝子座内の１つまたは複数の組込み部位に組み込まれる。
特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、１つまたは複数の組換え認識配列（ＲＲＳ）を含み、ＲＲＳは、リコンビナーゼによって認識され得る。特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、少なくとも２つのＲＲＳを含む。特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、３つのＲＲＳを含み、第３のＲＲＳは、第１のＲＲＳと第２のＲＲＳとの間に位置する。特定の実施形態では、第１のＲＲＳと第２のＲＲＳとは同一であり、第３のＲＲＳは、第１のＲＲＳまたは第２のＲＲＳとは異なる。特定の好ましい実施形態において、３つのＲＳＳは全て、互いに異なる。特定の実施形態において、ＲＲＳは、ＬｏｘＰ配列、ＬｏｘＰ Ｌ３配列、ＬｏｘＰ ２Ｌ配列、ＬｏｘＦａｓ配列、Ｌｏｘ５１１配列、Ｌｏｘ２２７２配列、Ｌｏｘ２３７２配列、Ｌｏｘ５１７１配列、Ｌｏｘｍ２配列、Ｌｏｘ７１配列、Ｌｏｘ６６配列、ＦＲＴ配列、Ｂｘｂ１ ａｔｔＰ配列、Ｂｘｂ１ ａｔｔＢ配列、φＣ３１ ａｔｔＰ配列、およびφＣ３１ ａｔｔＢ配列からなる群から、相互に独立して、選択される。
特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、少なくとも１つの選択マーカーを含む。特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、第１、第２および第３のＲＲＳ、ならびに少なくとも１つの選択マーカーを含む。特定の実施形態では、選択マーカーは、第１のＲＲＳと第２のＲＲＳとの間に位置する。特定の実施形態において、２つのＲＲＳは、少なくとも１つの選択マーカーに隣接する。すなわち、第１のＲＲＳが選択マーカーの５’（上流）に位置し、第２のＲＲＳが選択マーカーの３’（下流）に位置している。特定の実施形態において、第１のＲＲＳは、選択マーカーの５’末端の隣に存在し、かつ第２のＲＲＳは、選択マーカーの３’末端の隣に存在する。
特定の実施形態では、選択マーカーは、第１のＲＲＳと第２のＲＲＳとの間に位置し、２つの隣接するＲＲＳは異なる。特定の好ましい実施形態において、第１の隣接ＲＲＳはＬｏｘＰ Ｌ３配列であり、第２の隣接ＲＲＳはＬｏｘＰ ２Ｌ配列である。特定の実施形態では、ＬｏｘＰ Ｌ３配列は、選択マーカーの５’に位置し、ＬｏｘＰ ２Ｌ配列は、選択マーカーの３’に位置する。特定の実施形態では、第１の隣接するＲＲＳは、野生型ＦＲＴ配列であり、第２の隣接するＲＲＳは、変異体ＦＲＴ配列である。特定の実施形態では、第１の隣接するＲＲＳは、Ｂｘｂ１ ａｔｔＰ配列であり、第２の隣接するＲＲＳは、Ｂｘｂ１ ａｔｔＢ配列である。特定の実施形態では、第１の隣接するＲＲＳは、φＣ３１ ａｔｔＰ配列であり、第２の隣接するＲＲＳは、φＣ３１ ａｔｔＢ配列である。特定の実施形態では、２つのＲＲＳは同じ方向に配置される。特定の実施形態では、２つのＲＲＳはいずれもフォワードまたはリバース方向に存在する。特定の実施形態では、２つのＲＲＳは反対方向に配置される。
特定の実施形態において、組み込まれる外因性ヌクレオチド配列は、２つのＲＳＳが隣接する、第１の選択マーカーおよび第２の選択マーカーを含み、第１の選択マーカーは第２の選択マーカーとは異なる。特定の実施形態において、２つの選択マーカーのどちらも、相互に独立して、グルタミン合成酵素選択マーカー、チミジンキナーゼ選択マーカー、ＨＹＧ選択マーカー、およびピューロマイシン耐性選択マーカーからなる群から選択される。特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、チミジンキナーゼ選択マーカーおよびＨＹＧ選択マーカーを含む。特定の実施形態において、第１の選択マーカーは、アミノグリコシド系ホスホトランスフェラーゼ（ＡＰＨ）（例えば、ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ（ＨＹＧ）、ネオマイシン、およびＧ４１８ ＡＰＨ）、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）、チミジンキナーゼ（ＴＫ）、グルタミン合成酵素（ＧＳ）、アスパラギン合成酵素、トリプトファン合成酵素（インドール）、ヒスチジノールデヒドロゲナーゼ（ヒスチジノールＤ）、ならびにピューロマイシン、ブラスチシジン、ブレオマイシン、フレオマイシン、クロラムフェニコール、ゼオシン、およびミコフェノール酸に対する耐性をコードする遺伝子からなる群から選択され、第２の選択マーカーは、ＧＦＰ、ｅＧＦＰ、合成ＧＦＰ、ＹＦＰ、ｅＹＦＰ、ＣＦＰ、ｍＰｌｕｍ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、Ｊ－ｒｅｄ、ＤｓＲｅｄ単量体、ｍＯｒａｎｇｅ、ｍＫＯ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、Ｖｅｎｕｓ、ＹＰｅｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ、ＣｙＰｅｔ、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、およびＴ－Ｓａｐｐｈｉｒｅ蛍光性タンパク質からなる群から選択される。特定の実施形態において、第１の選択マーカーはグルタミン合成酵素選択マーカーであり、第２の選択マーカーはＧＦＰ蛍光性タンパク質である。特定の実施形態では、両方の選択マーカーに隣接する２つのＲＲＳは異なる。
特定の実施形態では、選択マーカーは、プロモータ配列に作動可能に連結されている。特定の実施形態では、選択マーカーは、ＳＶ４０プロモータに作動可能に連結されている。特定の実施形態において、選択マーカーは、ヒトサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモータに作動可能に連結されている。
特定の実施形態では、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は、３つのＲＲＳを含む。特定の実施形態では、第３のＲＲＳは、第１のＲＲＳと第２のＲＲＳとの間に位置する。特定の実施形態では、第１のＲＲＳと第２のＲＲＳとは同一であり、第３のＲＲＳは、第１のＲＲＳまたは第２のＲＲＳとは異なる。特定の好ましい実施形態において、３つのＲＳＳは全て、互いに異なる。
ＩＩ．ｄ 本発明を実施するために適した例示的ベクター
上記に概説した「単一ベクターＲＭＣＥ」のほかに、２つの核酸を同時に標的化組込みするために、新規な「２ベクターＲＭＣＥ」を実施することができる。
「２ベクターＲＭＣＥ」戦略は、本発明によるベクター組合せを用いる本発明による方法において実施される。例えば、限定ではないが、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列は３つのＲＲＳを含み、例えば、第３のＲＲＳ（「ＲＲＳ３」）が第１のＲＲＳ（「ＲＲＳ１」）と第２のＲＲＳ（「ＲＲＳ２」）の間に存在し、一方で、第１のベクターは、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列上の第１のＲＲＳおよび第３のＲＲＳに一致する２つのＲＲＳを含み、第２のベクターは、組み込まれた外因性ヌクレオチド配列上の第３のＲＲＳおよび第２のＲＲＳに一致する２つのＲＲＳを含む場合の配置であり得る。２ベクターＲＭＣＥ戦略の例を図１に示す。このような２ベクターＲＭＣＥ戦略により、ＴＩに適した哺乳動物細胞のゲノムにおけるＴＩ後に本発明による発現カセット構成が得られるように、各配列の各ＲＲＳ対の間に適切な数のＳＯＩを組み入れることによって複数のＳＯＩを導入することが可能になる。
２プラスミドＲＭＣＥ戦略では、３つのＲＲＳ部位を使用して、２つの独立したＲＭＣＥを同時に実行することを含む（図１）。したがって、２プラスミドＲＭＣＥ戦略を用いるＴＩに適した哺乳動物細胞のランディング部位は、第１のＲＲＳ部位（ＲＲＳ１）に対しても第２のＲＲＳ部位（ＲＲＳ２）に対しても交差活性を有していない第３のＲＲＳ部位（ＲＲＳ３）を含む。標的化する２つの発現プラスミドは、効率的標的化のために同じ隣接ＲＲＳ部位を必要とし、一方の発現プラスミド（前方）はＲＲＳ１およびＲＲＳ３に隣接し、他方（後方）はＲＲＳ３およびＲＲＳ２に隣接する。また、２プラスミドＲＭＣＥでは、２つの選択マーカーも必要とされる。１つの選択マーカー発現カセットは、２つの部分に分割された。前方プラスミドは、プロモータと、それに続く開始コドンおよびＲＲＳ３配列を含む。後方プラスミドは、開始コドン（ＡＴＧ）を欠き、選択マーカーコード化領域のＮ末端に融合されたＲＲＳ３配列を有する。融合タンパク質のインフレーム翻訳、すなわち作動可能な連結を確実にするために、ＲＲＳ３部位と選択マーカー配列との間に付加的なヌクレオチドを挿入する必要がある場合がある。両方のプラスミドが正確に挿入された場合にのみ、選択マーカーの完全な発現カセットが組み立てられ、したがって、各選択剤に対する耐性が細胞に与えられる。図１は、２プラスミドＲＭＣＥ戦略を示す模式図である。
単一ベクターＲＭＣＥと２ベクターＲＭＣＥのどちらも、ドナーＤＮＡ上に存在するＤＮＡ配列と組込み部位が存在する哺乳動物細胞ゲノム中のＤＮＡ配列とを正確に交換することにより、哺乳動物細胞ゲノムのあらかじめ定められた部位に１つまたは複数のドナーＤＮＡ分子を一方向性に組み込むことを可能にする。これらのＤＮＡ配列は、ｉ）少なくとも１つの選択マーカー、もしくはある種の２ベクターＲＭＣＥの場合のような「分割された選択マーカー」、および／またはｉｉ）少なくとも１つの外因性ＳＯＩ、に隣接する２つの異種特異的ＲＲＳを特徴とする。
ＲＭＣＥは、リコンビナーゼによって触媒される、標的ゲノム遺伝子座内の２つの異種特異的ＲＲＳとドナーＤＮＡ分子の間の二重組換えクロスオーバーイベントを伴う。ＲＭＣＥは、フロントベクターおよびバックベクターに由来する組み合わせられたＤＮＡ配列のコピーを、哺乳動物細胞ゲノムのあらかじめ定められた遺伝子座に導入するように設計されている。ただ１回の乗換え事象を伴う組換えとは違って、ＲＭＣＥは、原核生物ベクターの配列が哺乳動物細胞ゲノム中に導入されず、したがって、宿主の免疫または防御機構の望まれない誘発を減らし、かつ／または防ぐように、実行することができる。ＲＭＣＥ手順は、複数のＤＮＡ配列を用いて繰り返すことができる。
特定の実施形態において、標的化組込みは、２回のＲＭＣＥによって実現され、その際、２つの異なるＤＮＡ配列が両方とも、ＴＩに適した哺乳動物細胞のゲノムのあらかじめ定められた部位に組み込まれ、各ＤＮＡ配列は、ヘテロ多量体ポリペプチドの一部分および／または２つの異種特異的ＲＲＳが隣接する少なくとも１つの選択マーカーもしくはその一部分をコードする、少なくとも１つの発現カセットを含む。特定の実施形態において、標的化組込みは、複数回のＲＭＣＥによって実現され、その際、複数のベクターに由来するＤＮＡ配列が全て、ＴＩに適した哺乳動物細胞のゲノムのあらかじめ定められた部位に組み込まれ、各ＤＮＡ配列は、ヘテロ多量体ポリペプチドの一部分および／または２つの異種特異的ＲＲＳが隣接する少なくとも１つの選択マーカーもしくはその一部分をコードする、少なくとも１つの発現カセットを含む。特定の実施形態において、選択マーカーは、一部が第１のベクターにおいてコードされ、一部が第２のベクターにおいてコードされてよく、その結果、二重ＲＭＣＥによって両方が正確に組み込まれた場合にのみ、その選択マーカーの発現が可能になる。このようなシステムの例を図１に示す。
特定の実施形態において、リコンビナーゼに媒介された組換えによる標的化組込みにより、原核生物ベクターに由来する配列を含まずに、宿主細胞ゲノムの１つまたは複数のあらかじめ定められた組込み部位に、選択マーカーおよび／または多量体ポリペプチドの様々な発現カセットが組み込まれる。
記載され、かつ特許請求される様々な実施形態に加えて、本開示の主題は、本明細書に開示され、特許請求される特徴の他の組合せを有する他の実施形態も対象とする。したがって、本明細書に提示される特定の特徴は、本開示の主題が本明細書に開示される特徴の任意の好適な組合せを含むように、本開示の主題の範囲内において他の様式で互いに組み合わせられ得る。本開示の主題の特定の実施形態の前述の上記説明は、例示および説明目的のために提示されている。網羅的であるように、または本開示の主題を開示される実施形態に限定することを意図するものではない。
本開示の主題の趣旨または範囲から逸脱することなく、本開示の主題の組成物および方法に様々な修正および変形を加えることができることは、当業者には明らかである。したがって、本開示の主題が添付の特許請求の範囲およびそれらの等価物の範囲内の修正および変形を含むことを意図する。
様々な刊行物、特許、および特許出願が本明細書に引用されており、それらの内容は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
以下の実施例、図面および配列は、本発明の理解を助けるために提供されており、その真の範囲は、添付の特許請求の範囲に記載されている。
２つの独立したＲＭＣＥを同時に実行するために、３つのＲＲＳ部位の使用を伴う２プラスミドＲＭＣＥ戦略のスキーム。 Ｃｒｅ ＤＮＡおよびＣｒｅ ｍＲＮＡを用いたＴＩ後の生存率回復。 Ｃｒｅ ＤＮＡ／プラスミドを用いたＴＩ後の交換効率／プール品質、サイズ外側領域：６８７ ＡＵ、サイズ中央領域：１３２ＡＵ、サイズ内領域：２７ＡＵ。 Ｃｒｅ ｍＲＮＡを用いたＴＩ後の交換効率およびプール品質、サイズ外側領域：８１２ ＡＵ；サイズ中央領域：１１４ＡＵ；サイズ内領域：３２ＡＵ。
配列の説明
配列番号０１ Ｌ３リコンビナーゼ認識配列の例示的配列
配列番号０２ ２Ｌリコンビナーゼ認識配列の例示的配列
配列番号０３：ＬｏｘＦａｓリコンビナーゼ認識配列の例示的配列
配列番号０４～０６：ヒトＣＭＶプロモータの例示的バリアント
配列番号０７：例示的なＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列
配列番号０８：例示的なｂＧＨポリアデニル化シグナル配列
配列番号０９：例示的なｈＧＴターミネータ配列
配列番号１０：例示的なＳＶ４０プロモータ配列
配列番号１１：例示的なＧＦＰ核酸配列
配列番号１２：抗ヒトＡβ／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第１の重鎖
配列番号１３：抗ヒトＡβ／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第２の重鎖
配列番号１４：抗ヒトＡβ／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第１の軽鎖
配列番号１５：抗ヒトＡβ／ヒトトランスフェリン三価の二重特異性抗体第２の軽鎖
配列番号１６：抗ヒトＣＤ２０／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第１の重鎖
配列番号１７：抗ヒトＣＤ２０／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第２の重鎖
配列番号１８：抗ヒトＣＤ２０／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第１の軽鎖
配列番号１９：抗ヒトＣＤ２０／ヒトトランスフェリン受容体三価の二重特異性抗体第２の軽鎖
配列番号２０：Ｃｒｅリコンビナーゼアミノ酸配列
配列番号２１：最小ＣｒｅリコンビナーゼｍＲＮＡ
配列番号２２：ｌｏｘ部位パリンドローム配列１
配列番号２３：ｌｏｘ部位パリンドローム配列２
配列番号２４：コア配列ｌｏｘ部位野生型
配列番号２５：コア配列ｌｏｘ部位変異体Ｌ３
配列番号２６：コア配列ｌｏｘ部位変異体２Ｌ
配列番号２７：コア配列ｌｏｘ部位変異体ＬｏｘＦａｓ
配列番号２８：コア配列ｌｏｘ部位変異体Ｌｏｘ５１１
配列番号２９：コア配列ｌｏｘ部位変異体Ｌｏｘ５１７１
配列番号３０：コア配列ｌｏｘ部位変異体Ｌｏｘ２２７２
配列番号３１：コア配列ｌｏｘ部位変異体Ｍ２
配列番号３２：コア配列ｌｏｘ部位変異体Ｍ３
配列番号３３：例示的な核局在化配列
配列番号３４：例示的な核局在化配列
配列番号３５：例示的な核局在化配列
配列番号３６：例示的な核局在化配列
配列番号３７：例示的な核局在化配列
実施例１
一般的技術
１）組換えＤＮＡ技術
Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ，（１９８９）に記載されているように、標準的な方法を用いてＤＮＡを操作した。分子生物学的試薬は、製造元の説明書に従って使用した。
２）ＤＮＡ配列決定
ＤＮＡ配列決定は、ＳｅｑｕｉＳｅｒｖｅ ＧｍｂＨ（Ｖａｔｅｒｓｔｅｔｔｅｎ、Ｇｅｒｍａｎｙ）で実施した。
３）ＤＮＡおよびタンパク質の配列分析および配列データ管理
ＥＭＢＯＳＳ（欧州分子生物学オープンソフトウェアスイート）ソフトウェアパッケージおよびＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎのＶｅｃｔｏｒ ＮＴＩバージョン１１．５またはＧｅｎｅｉｏｕｓ ｐｒｉｍｅを、配列の作成、マッピング、解析、アノテーション、および図示のために使用した。
４）遺伝子およびオリゴヌクレオチド合成
所望の遺伝子セグメントを、Ｇｅｎｅａｒｔ ＧｍｂＨ（レーゲンスブルク、ドイツ）での化学合成によって調製した。合成した遺伝子フラグメントを増殖／増幅のために大腸菌プラスミドにクローニングした。サブクローン化された遺伝子フラグメントのＤＮＡ配列は、ＤＮＡシークエンシングによって確認された。あるいは、化学的に合成されたオリゴヌクレオチドをアニーリングすることによって、またはＰＣＲによって短い合成ＤＮＡフラグメントを組立てた。それぞれのオリゴヌクレオチドを、Ｍｅｔａｂｉｏｎ ＧｍｂＨ（Ｐｌａｎｅｇｇ－Ｍａｒｔｉｎｓｒｉｅｄ、ドイツ）によって調製した。
５）試薬
特に明記しない限り、全ての市販の化学物質、抗体およびキットを製造業者のプロトコルに従って提供されるように使用した。
６）ＴＩ宿主細胞株の培養
ＴＩ ＣＨＯ宿主細胞を、湿度８５％および５％ＣＯ２の加湿インキュベータ内で３７℃で培養した。それらを、３００μｇ／ｍｌハイグロマイシンＢおよび４μｇ／ｍｌの第２の選択マーカーを含有する専売のＤＭＥＭ／Ｆ１２ベースの培地で培養した。細胞を、総体積３０ｍｌで０．３×１０Ｅ６細胞／ｍｌの濃度で３または４日ごとに分割した。培養のために、１２５ｍｌの非バッフル三角三角振盪フラスコを使用した。細胞を５ｃｍの振盪振幅で１５０ｒｐｍで振盪した。Ｃｅｄｅｘ ＨｉＲｅｓ Ｃｅｌｌ Ｃｏｕｎｔｅｒ（Ｒｏｃｈｅ）を用いて細胞数を決定した。細胞を６０日齢に達するまで培養した。
７）クローニング
一般
Ｒ部位を用いたクローニングは、以下のフラグメントにある配列に等しい目的の遺伝子（ＧＯＩ）の隣のＤＮＡ配列に依存する。同様に、フラグメントの構築は、等しい配列の重複およびその後のＤＮＡリガーゼによる構築されたＤＮＡ中のニックの密封によって可能である。したがって、単一遺伝子、特に正しいＲ部位を含む予備ベクターのクローニングが必要である。これらの予備ベクターのクローニングに成功した後、Ｒ部位に隣接する目的の遺伝子を、Ｒ部位のすぐ隣で切断する酵素による制限消化によって切り出す。最後のステップは、１つのステップにおける全てのＤＮＡフラグメントの組立てである。より詳細には、５’－エキソヌクレアーゼは、重複領域（Ｒ部位）の５’末端を除去する。その後、Ｒ部位のアニーリングを行うことができ、ＤＮＡポリメラーゼが３’末端を伸長させて配列中のギャップを埋める。最後に、ＤＮＡリガーゼはヌクレオチド間にニックを密封する。エキソヌクレアーゼ、ＤＮＡポリメラーゼおよびリガーゼのような異なる酵素を含有するアセンブリマスターミックスの添加、およびその後の反応混合物の５０°Ｃでのインキュベーションは、単一フラグメントの単一プラスミドへのアセンブリをもたらす。その後、コンピテント大腸菌細胞をプラスミドで形質転換する。
いくつかのベクターについては、制限酵素によるクローニング戦略を使用した。適切な制限酵素を選択することによって、所望の目的の遺伝子を切り出し、その後、ライゲーションによって異なるベクターに挿入することができる。したがって、マルチクローニングサイト（ＭＣＳ）で切断する酵素を使用し、スマートな方法で選択することが好ましく、正しいアレイでフラグメントのライゲーションを行うことができる。ベクターおよびフラグメントが同じ制限酵素で予め切断されている場合、フラグメントおよびベクターの粘着末端は完全に一緒に嵌合し、続いてＤＮＡリガーゼによって連結することができる。ライゲーション後、コンピテント大腸菌細胞をプラスミドで形質転換する。
制限消化によるクローニング
制限酵素によるプラスミドの消化のために、以下の成分を氷上で一緒にピペッティングした：
（表）制限消化反応混合物
Figure 0007572977000011
より多くの酵素を１回の消化に使用する場合、１μｌの各酵素を使用し、より多いまたはより少ないＰＣＲグレードの水の添加によって体積を調整した。全ての酵素は、それらがｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ製のＣｕｔＳｍａｒｔ緩衝液（１００％活性）での使用に適格であり、同じインキュベーション温度（全て３７°Ｃ）を有するという前提条件で選択された。
インキュベーションは、サーモミキサーまたはサーマルサイクラーを使用して行い、試料を一定温度（３７℃）でインキュベートした。インキュベーション中、試料を撹拌しなかった。インキュベーション時間を６０分に設定した。その後、試料をローディング色素と直接混合し、アガロース電気泳動ゲルにローディングするか、またはさらなる使用のために氷上で４℃で保存した。
ゲル電気泳動のために１％アガロースゲルを調製した。そのために、１．５ｇの多目的アガロースを１２５エルレンマイヤー振盪フラスコに秤量し、１５０ｍｌのＴＡＥ緩衝液で満たした。アガロースが完全に溶解するまで、混合物を電子レンジで加熱した。０．５μｇ／ｍｌの臭化エチジウムをアガロース溶液に添加した。その後、ゲルを鋳型にキャストした。アガロースをセットした後、鋳型を電気泳動チャンバに入れ、チャンバをＴＡＥ緩衝液で満たした。その後、サンプルをロードした。第１のポケット（左から）に適切なＤＮＡ分子量マーカーをロードし、続いてサンプルをロードした。ゲルを＜１３０Ｖで約６０分間泳動した。電気泳動後、ゲルをチャンバから取り出し、ＵＶイメージャで分析した。
標的バンドを切断し、１．５ｍｌエッペンドルフチューブに移した。ゲルの精製のために、Ｑｉａｇｅｎ製のＱＩＡｑｕｉｃｋ Ｇｅｌ Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ Ｋｉｔを製造者の説明書に従って使用した。さらなる使用のためにＤＮＡフラグメントを－２０℃で保存した。
ライゲーションのためのフラグメントを、挿入物およびベクターフラグメントの長さおよびそれらの互いの相関に応じて、１：２、１：３または１：５のモル比で一緒にピペットで分注して挿入した。ベクターに挿入されるべきフラグメントが短い場合、１：５の比を使用した。インサートがより長い場合、より少量のインサートをベクターと相関させて使用した。５０ｎｇの量のベクターを各ライゲーションに使用し、特定の量のインサートをＮＥＢｉｏＣａｌｃｕｌａｔｏｒで計算した。ライゲーションには、ＮＥＢ製のＴ４ ＤＮＡライゲーションキットを使用した。ライゲーション混合物の一例を以下の表に示す。
（表）ライゲーション反応混合物
Figure 0007572977000012
全ての成分を氷上で共にピペッティングし、ＤＮＡと水の混合で開始し、緩衝液を添加し、最後に酵素を添加した。反応物を上下にピペッティングすることによって穏やかに混合し、短時間微小遠心し、次いで室温で１０分間インキュベートした。インキュベーション後、Ｔ４リガーゼを６５℃で１０分間熱不活性化した。試料を氷上で冷却した。最終ステップにおいて、１０個のベータコンピテント大腸菌細胞を、２μｌの連結プラスミドで形質転換した（下記参照）。
Ｒサイトアセンブリを介したクローニング
アセンブリのために、各末端にＲ部位を有する全てのＤＮＡフラグメントを氷上で一緒にピペットで移した。４つを超えるフラグメントがアセンブリされているとき、製造業者によって推奨されるように、全てのフラグメントの等モル比（０．０５ｎｇ）を使用した。反応混合物の半分は、ＮＥＢｕｉｌｄｅｒ ＨｉＦｉ ＤＮＡ Ａｓｓｅｍｂｌｙ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘによって具現化された。全反応体積は４０μｌであり、ＰＣＲ清浄水での充填によって到達した。以下の表に、例示的なピペッティング方式を示す。
（表）アセンブリ反応混合物
Figure 0007572977000013
反応混合物をセットアップした後、チューブをサーモサイクラー内で常に５０℃で６０分間インキュベートした。アセンブリが成功した後、１０個のベータコンピテント大腸菌を２μｌの構築されたプラスミドＤＮＡで形質転換した（以下を参照）。
形質転換１０ベータコンピテント大腸菌細胞
形質転換のために、１０個のベータコンピテント大腸菌細胞を氷上で解凍した。その後、２μｌのプラスミドＤＮＡを細胞懸濁液中に直接ピペッティングした。チューブを弾き、氷上に３０分間置いた。その後、細胞を４２℃の温かいサーマルブロックに入れ、正確に３０秒間ヒートショックを与えた。その後すぐに、細胞を氷上で２分間冷却した。９５０μｌのＮＥＢ１０ベータ増殖培地を細胞懸濁液に添加した。細胞を振盪下、３７℃で１時間インキュベートした。次いで、５０～１００μｌを予熱した（３７℃）ＬＢ－Ａｍｐ寒天プレート上にピペットで取り、使い捨てスパチュラで広げた。混合物を、３７℃で一晩撹拌した。アンピシリンに対する耐性遺伝子を有するプラスミドの組込みに成功した細菌のみが、このプレート上で増殖することができる。翌日、単一コロニーを採取し、その後のプラスミド調製のためにＬＢ－Ａｍｐ培地で培養した。
細菌培養
大腸菌の培養は、１ｍｌ／Ｌの１００ｍｇ／ｍｌアンピシリンを添加したルリア・ベルターニ（Ｌｕｒｉａ Ｂｅｒｔａｎｉ）を略したＬＢ培地で行い、０．１ｍｇ／ｍｌのアンピシリン濃度を得た。異なるプラスミド調製量について、以下の量を単一細菌コロニーで接種した。
（表）大腸菌培養体積
Figure 0007572977000014
ミニプレップの場合、９６ウェルの２ｍｌ深ウェルプレートに、ウェルあたり１．５ｍｌのＬＢ－Ａｍｐ培地を充填した。コロニーを採取し、爪楊枝を培地に入れた。全てのコロニーを採取すると、プレートは粘着性の空気多孔質膜で閉じた。プレートを３７℃のインキュベータ内で２００ｒｐｍの振盪速度で２３時間インキュベートした。
ミニプレップの場合、１５ｍｌチューブ（換気蓋付き）を３．６ｍｌ ＬＢ－Ａｍｐ培地で満たし、細菌コロニーを等しく接種した。インキュベーション中に、爪楊枝を除去せずにチューブ内に残した。９６ウェルプレートと同様に、チューブを３７℃、２００ｒｐｍで２３時間インキュベートした。
マキシプレップの場合、２００ｍｌのＬＢ－Ａｍｐ培地をオートクレーブしたガラス製の１Ｌの三角フラスコに充填し、約５時間経過した１ｍｌの細菌の日培養物を接種した。三角フラスコを紙栓で閉じ、３７℃、２００ｒｐｍで１６時間インキュベートした。
プラスミドの調製
ミニプレップの場合、５０μｌの細菌懸濁液を１ｍｌ深ウェルプレートに移した。その後、細菌細胞をプレート内で３０００ｒｐｍ、４℃で５分間遠心分離した。上清を除去し、細菌ペレットを含むプレートをＥｐＭｏｔｉｏｎに入れた。約９０分間実行し、溶出したプラスミドＤＮＡをさらなる使用のためにＥｐＭｏｔｉｏｎから除去することができた。
ミニプレップの場合、１５ｍｌチューブをインキュベータから取り出し、３．６ｍｌ細菌培養物を２つの２ｍｌエッペンドルフチューブに分割した。チューブを、卓上微量遠心機において室温で３分間、６，８００ｘｇで遠心分離した。その後、製造業者の指示に従ってＱｉａｇｅｎ ＱＩＡｐｒｅｐ Ｓｐｉｎ Ｍｉｎｉｐｒｅｐキットを用いてミニプレップを行った。プラスミドＤＮＡ濃度をＮａｎｏｄｒｏｐで測定した。
マキシプレップは、Ｍａｃｈｅｒｅｙ－Ｎａｇｅｌ ＮｕｃｌｅｏＢｏｎｄ（登録商標）Ｘｔｒａ Ｍａｘｉ ＥＦキットを製造者の説明書に従って使用して実施した。プラスミドＤＮＡ濃度をＮａｎｏｄｒｏｐで測定した。
エタノール沈殿
ＤＮＡ溶液の体積を２．５倍体積のエタノール１００％と混合した。混合物を、－２０℃で１０分間撹拌した。次いで、ＤＮＡを１４，０００ｒｐｍ、４℃で３０分間遠心分離した。上清を慎重に除去し、ペレットを７０％エタノールで洗浄した。次いで、チューブを１４，０００ｒｐｍ、４℃で５分間遠心分離した。上清をピペッティングすることによって慎重に除去し、ペレットを乾燥させた。エタノールを蒸発させた際に、適切な量のエンドトキシンを含まない水を添加した。ＤＮＡを４℃で一晩水に再溶解する時間を与えた。少量のアリコートを取り、Ｎａｎｏｄｒｏｐ装置を用いてＤＮＡ濃度を測定した。
実施例２
プラスミド作製
発現カセット比率
上記の前駆体ポリペプチドの発現には、以下の機能的要素を含む転写ユニットを使用した：
－イントロンＡを含む、ヒトサイトメガロウイルス由来の前初期エンハンサーおよびプロモータ、
－ヒト重鎖免疫グロブリン５’非翻訳領域（５’ＵＴＲ）、
－マウス免疫グロブリン重鎖シグナル配列、
－それぞれの前駆体ポリペプチドをコードする核酸、
－ウシ成長ホルモンポリアデニル化配列（ＢＧＨ ｐＡ）、および
－任意で、ヒトガストリン終結因子（ｈＧＴ）。
発現される所望の遺伝子を含む発現ユニット／カセットの他に、基本的な／標準の哺乳動物発現プラスミドは、
－大腸菌におけるこのプラスミドの複製を可能にするベクターｐＵＣ１８からの複製起点、および
－大腸菌にアンピシリン耐性を付与するベータラクタマーゼ遺伝子を含む。
前方ベクタークローニングおよび後方ベクタークローニング
２プラスミド抗体構築物を構築するために、抗体ＨＣおよびＬＣフラグメントを、Ｌ３およびＬｏｘＦＡＳ配列を含む前方ベクター骨格、ならびにＬｏｘＦＡＳおよび２Ｌ配列ならびにｐａｃ選択可能マーカーを含む後方ベクターにクローニングした。ＣｒｅリコンビナーゼプラスミドｐＯＧ２３１（Ｗｏｎｇ，Ｅ．Ｔ．，ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．３３（２００５）ｅ１４７；Ｏ’Ｇｏｒｍａｎ，Ｓ．，ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９４（１９９７）１４６０２－１４６０７）を全てのＲＭＣＥプロセスに使用した。
それぞれの抗体鎖をコードするｃＤＮＡを遺伝子合成（Ｇｅｎｅａｒｔ，Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｉｎｃ．）によって生成した。３７℃で１時間、遺伝子合成物およびバックボーンベクターをＨｉｎｄＩＩＩ－ＨＦおよびＥｃｏＲＩ－ＨＦ（ＮＥＢ）で消化し、アガロースゲル電気泳動によって分離した。挿入フラグメントおよびバックボーンのＤＮＡフラグメントをアガロースゲルから切り取り、ＱＩＡｑｕｉｃｋゲル抽出キット（Ｑｉａｇｅｎ）を用いて抽出した。製造業者のプロトコルに従って迅速ライゲーションキット（Ｒｏｃｈｅ）を用いて、３：１の挿入フラグメント／バックボーン比で、精製した挿入フラグメントおよびバックボーンフラグメントをライゲーションした。次いで、４２℃で３０秒間のヒートショックによってライゲーションアプローチをコンピテント大腸菌ＤＨ５αに形質転換し、３７℃で１時間インキュベートした後、選択用のアンピシリンを含む寒天プレートに播種した。プレートを３７℃で一晩インキュベートした。
翌日、クローンを採取し、ミニプレップまたはマキシプレップのために振盪しながら３７℃で一晩インキュベートした。これは、ＥｐＭｏｔｉｏｎ（登録商標）５０７５（Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆ）を用いて、またはそれぞれＱＩＡｐｒｅｐスピンミニプレップキット（Ｑｉａｇｅｎ）／ＮｕｃｌｅｏＢｏｎｄ ＸｔｒａマキシＥＦキット（Ｍａｃｈｅｒｅｙ＆Ｎａｇｅｌ）を用いて、実施した。全てのコンストラクトを配列決定して、いかなる不適切な突然変異も存在しないように徹底した（ＳｅｑｕｉＳｅｒｖｅ ＧｍｂＨ）。
第２のクローニング工程において、第１のクローニングの場合と同じ条件を用いて、あらかじめクローニングしたベクターをＫｐｎＩ－ＨＦ／ＳａｌＩ－ＨＦおよびＳａｌＩ－ＨＦ／ＭｆｅＩ－ＨＦで消化した。ＴＩバックボーンベクターをＫｐｎＩ－ＨＦおよびＭｆｅＩ－ＨＦで消化した。分離および抽出を、前述したようにして実施した。製造業者のプロトコルに従ってＴ４ ＤＮＡリガーゼ（ＮＥＢ）を用いて、１：１：１の挿入フラグメント／挿入フラグメント／バックボーン比で、精製した挿入フラグメントおよびバックボーンのライゲーションを４℃で一晩実施し、６５℃で１０分間、不活性化した。前述したようにして、下記のクローニング工程を実施した。以下のクローニング工程を上記のように行った。
クローニングされたプラスミドを、ＴＩトランスフェクションおよびプール作製のために使用した。
実施例３
培養、トランスフェクション、選択、プール生成および単一細胞クローニング
ＴＩ宿主細胞を、独自のＤＭＥＭ／Ｆ１２系培地中、１５０ｒｐｍの一定の撹拌速度で、標準的な加湿条件下（９５％ｒＨ、３７°Ｃ、５％ＣＯ２）で使い捨ての１２５ｍｌ通気振盪フラスコ中で増殖させた。３～４日ごとに、細胞を、３×１０Ｅ５細胞／ｍｌの濃度の有効濃度の選択マーカー１および選択マーカー２を含有する化学的に定義された培地に播種した。培養物の密度と生存率を、Ｃｅｄｅｘ ＨｉＲｅｓ細胞カウンタ（Ｆ．Ｈｏｆｆｍａｎｎ－Ｌａ Ｒｏｃｈｅ Ｌｔｄ、Ｂａｓｅｌ、Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）で測定した。
安定なトランスフェクションのために、等モル量のフロントおよびバックベクターを混合した。１μｇのＣｒｅ発現プラスミドまたはＣｒｅ ｍＲＮＡを５μｇの混合物に添加した、すなわち５μｇのＣｒｅ発現プラスミドまたはＣｒｅ ｍＲＮＡを２５μｇのフロントベクター混合物およびバックベクター混合物に添加した。
トランスフェクションの２日前に、ＴＩ宿主細胞を、４ｘ１０Ｅ５細胞／ｍｌの密度で、新鮮な培地に播種した。トランスフェクションは、ＮｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒキットＶ（Ｌｏｎｚａ、Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）を使用して、製造元のプロトコルに従ってＮｕｃｌｅｏｆｅｃｔｏｒデバイスで実施した。３ｘ１０Ｅ７個の細胞を、３０μｇのプラスミドでトランスフェクトした。トランスフェクション後、細胞を、選択剤を含まない３０ｍｌの培地に播種した。
播種後５日目に、細胞を遠心分離し、ピューロマイシン（選択剤１）および１－（２’－デオキシ－２’－フルオロ－１－β－Ｄ－アラビノフラノシル－５－ヨード）ウラシル（ＦＩＡＵ；選択剤２）を含む８０ｍｌの化学的に定義された培地に、組換え細胞の選択のために６×１０Ｅ５細胞／ｍｌの有効濃度で移した。細胞を３７℃、１５０ｒｐｍでインキュベートした。５％のＣＯ２および８５％の湿度であり、この日以降分割しなかった。培養物の細胞密度および生存率を定期的にモニターした。培養物の生存率が再び増加し始めたとき、選択剤１および２の濃度を、以前に使用した量の約半分に減少させた。細胞の回収を促進するために、生存率が４０％より高く、かつ生細胞濃度（ＶＣＤ）が０．５×１０Ｅ６細胞／ｍＬより高い場合は選択圧を下げた。したがって、４×１０Ｅ５細胞／ｍｌを遠心分離し、選択培地ＩＩ（化学限定培地、１／２選択マーカー１および２）４０ｍｌに再懸濁した。これらの細胞を以前と同じ条件で、かつこの場合も分割せずに、インキュベートした。
選択を開始してから１０日後、細胞内ＧＦＰおよび細胞表面に結合した細胞外三価の二重特異性抗体の発現を測定するフローサイトメトリーによって、Ｃｒｅ媒介性カセット交換の成功を確認した。ヒト抗体の軽鎖および重鎖に対するＡＰＣ抗体（アロフィコシアニン標識Ｆ（ａｂ’）２フラグメントヤギ抗ヒトＩｇＧ）を、ＦＡＣＳ染色用に使用した。フローサイトメトリーは、ＢＤ ＦＡＣＳ Ｃａｎｔｏ ＩＩフローサイトメータ（ＢＤ、Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用して実施した。試料あたり１０，０００イベントを測定した。生細胞を、側方散乱（ＳＳＣ）に対する前方散乱（ＦＳＣ）のプロットでゲートした。生細胞ゲートは、トランスフェクトされていないＴＩ宿主細胞で定義され、ＦｌｏｗＪｏ７．６．５ＥＮソフトウェア（ＴｒｅｅＳｔａｒ、Ｏｌｔｅｎ、Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）を用いて、全ての試料に適用された。ＧＦＰの蛍光をＦＩＴＣチャネルで定量し（４８８ｎｍで励起、５３０ｎｍで検出）、ＡＰＣチャネル（６４５ｎｍで励起、６６０ｎｍで検出）において、三価の二重特異性抗体を測定した。ＣＨＯ親細胞、すなわちＴＩ宿主細胞の作製に使用された細胞を、ＧＦＰおよび三価の二重特異性抗体発現に対する陰性対照として使用した。選択開始から１４日後、生存率は９０％を超え、選択は完了したと見なされた。
ＣｒｅプラスミドおよびＣｒｅ ｍＲＮＡを比較に使用した場合、選択後、安定にトランスフェクトされた細胞のプールを限界希釈による単一細胞クローニングに供した。この目的のために、細胞をＣｅｌｌ Ｔｒａｃｋｅｒ Ｇｒｅｅｎ（商標）（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）で染色し、３８４ウェルプレートに０．６細胞／ウェルで播種した。単一細胞クローニングおよびその後の全ての培養工程では、選択剤２を培地から除外した。１つの細胞のみを含むウェルを、明視野および蛍光ベースのプレートイメージングによって同定した。１つの細胞を含むウェルのみを、さらに検討した。プレーティング後約３週間で、コンフルエントなウェルからコロニーを採取し、９６ウェルプレートでさらに培養した。９６ウェルプレートで４日後、培養培地中の抗体力価を、抗ヒトＩｇＧサンドイッチＥＬＩＳＡで測定した。簡単に説明すると、抗体を、ＭａｘｉＳｏｒｐマイクロタイタープレート（Ｎｕｎｃ（商標）、Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）に結合した抗ヒトＦｃ抗体で細胞培養液から捕捉し、捕捉抗体とは異なるエピトープに結合する抗ヒトＦｃ ＰＯＤコンジュゲートで検出した。二次抗体を、ＢＭ化学発光ＥＬＩＳＡ基質（ＰＯＤ）（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）を用いた化学発光によって定量した。
実施例４
ＦＡＣＳスクリーニング
ＦＡＣＳ解析を実施して、トランスフェクション効率およびトランスフェクションのＲＭＣＥ効率を調べた。トランスフェクトされたアプローチの４×１０Ｅ５細胞を遠心分離し（１２００ｒｐｍ、４分）、１ｍＬ ＰＢＳで２回洗浄した。ＰＢＳを用いる洗浄工程の後、沈殿物を４００μＬのＰＢＳに再懸濁し、ＦＡＣＳチューブ（セルストレーナーキャップ付きのＦａｌｃｏｎ（登録商標）丸底チューブ、Ｃｏｒｎｉｎｇ）に移した。ＦＡＣＳ Ｃａｎｔｏ ＩＩを用いて測定を実施し、ソフトウェアＦｌｏｗＪｏを用いてデータを解析した。
実施例５
フィードバッチ培養
フィードバッチ産生培養は、独自の化学限定培地を含む振盪フラスコまたはＡｍｂｒ１５容器（Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ Ｓｔｅｄｉｍ）で実施した。細胞を０日目に１×１０Ｅ６細胞／ｍＬで播種し、３日目に温度を変化させた。３、７、および１０日目に、培養物に独自のフィード培地を加えた。Ｖｉ－Ｃｅｌｌ（商標）ＸＲ装置（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ）を使用して、０、３、７、１０、および１４日目に、培養物中の細胞の生存細胞数（ＶＣＣ）および生存率割合を測定した。Ｂｉｏｐｒｏｆｉｌｅ ４００ Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｎｏｖａ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ）を使用して、７、１０および１４日目にグルコース濃度および乳酸濃度を測定した。フィードバッチ開始後１４日目に、遠心分離（１０分、１０００ｒｐｍおよび１０分、４０００ｒｐｍ）によって上清を採取し、濾過（０．２２μｍ）によって清澄化した。ＵＶ検出を伴うタンパク質Ａ親和性クロマトグラフィーを使用して、１４日目の力価を測定した。
製品の品質は、ＣａｌｉｐｅｒのＬａｂＣｈｉｐ（Ｃａｌｉｐｅｒ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）によって決定した。
実施例６
三価の二重特異性抗体の発現に対するベクター設計の効果
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥプールを、ドメインクロスオーバー／交換を伴うさらなるＦａｂフラグメントを有する三価の二重特異性抗体の個々の鎖に対する異なる数および編成の発現カセットを含有する２つのプラスミド（フロントおよびバックベクター）をトランスフェクトすることによって作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間のフィードバッチ産生アッセイで評価した。
ドメイン交換を伴うさらなるＦａｂフラグメントを有する異なる三価の二重特異性抗体の発現に対する抗体鎖発現カセット構成の効果を評価した。全てが異なる標的特異性を有していた。
４つのＢＳ抗体について、以下の結果が得られた：
Figure 0007572977000015
ＭＰ＝主生成物、ｅｆｆ．力価＝有効力価＝主生成物の％を乗算した力価
実施例７
二重特異性三価の抗体の発現に対するベクター設計の効果
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥプールを、ＴＣＢフォーマットの三価の抗体の異なる数および構成の個々の鎖を含む、２つのプラスミド（前方および後方ベクター）をトランスフェクトすることによって、作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間のフィードバッチ産生アッセイで評価した。特定のベクター構成について、参照プールと比較して力価の増加が観察された。
５つの異なるＴＣＢの発現に対する抗体鎖発現カセット構成の影響を評価した。ＴＣＢ１～５は全て異なる標的特異性を有していた。ＴＣＢ３を４つの異なる抗ＣＤ３結合部位で試験した。
ＴＣＢ－１については、以下の結果が得られた。参照構成は灰色で陰影が付けられている。
Figure 0007572977000016
ＴＣＢ－３については、以下の結果が得られた：
Figure 0007572977000017
ＴＣＢ－２、－４および－５については、以下の結果が得られた：
Figure 0007572977000018
ＭＰ＝主生成物、ｅｆｆ．力価＝有効力価＝主生成物の％を乗算した力価
実施例８
ドメイン交換を伴う二価の二重特異性抗体の発現に対するベクター設計の効果
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥのプールを、ドメインクロスオーバー／交換を伴う二価の二重特異性抗体の個々の鎖に対する異なる数および編成の発現カセットを含有する２つのプラスミド（前方および後方ベクター）をトランスフェクトすることによって作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間のフィードバッチ産生アッセイで評価した。
ドメイン交換を伴う６つの異なる二価の二重特異性抗体について、安定なトランスフェクション細胞における発現収率および生成物品質に対する抗体鎖発現カセット構成の効果を評価した。全てが異なる標的特異性を有していた。いくつかについては、異なるＶＨ／ＶＬ対の効果も分析した。これらの１０の異なる抗体について、以下の結果が得られた。
Figure 0007572977000019
Figure 0007572977000020
ｋ＝ノブ変異を有する重鎖、ｈ＝ホール変異を有する重鎖；ｌ＝軽鎖、ｘｌ＝ドメイン交換を有する軽鎖、ｖａｒ＝異なる結合部位配列
実施例９
多価の二重特異性抗体の発現に対するベクター設計の効果
ＴＩ宿主における生産性に対する発現カセット構成の影響を調べるために、ＲＭＣＥプールを、多価の二重特異性抗体の異なる数および構成の個々の鎖を含む、２つのプラスミド（前方および後方ベクター）をトランスフェクトすることによって、作製した。フローサイトメトリーによるＲＭＣＥの選択、回収および検証の後、プールの生産性を１４日間のフィードバッチ産生アッセイで評価した。
多価の二重特異性抗体の発現に対する抗体鎖発現カセット構成の影響を評価した。
多価の二重特異性抗体について、以下の結果が得られた：
Figure 0007572977000021
実施例１０
ＣＲＥ ｍＲＮＡ標的化組込みは、ＣＨＯプールにおいて陽性クローンの数の増加をもたらす
複雑な抗体フォーマットを生成するためのＣＨＯプールは、ＣＲＥプラスミドまたはＣＲＥ ｍＲＮＡのいずれかを用いて作製される。選択期間の前後に、ＣＨＯプール中のクローンの絶対数を、クローン特異的タグを用いて測定する。このクローン特異的タグは、標的化組込み技術の一部であり、プールサイズおよび不均一性の識別を可能にするディープシーケンシングを使用して読み出される。選択期間後、ＣＲＥ ｍＲＮＡ作製ＣＨＯプール中のクローンの絶対数は、ＣＲＥプラスミド作製ＣＨＯプール中よりも有意に高い。したがって、ＣＲＥプラスミドの代わりにＣＲＥ ｍＲＮＡを使用することによって、より大きなサイズおよび不均一性を有するＣＨＯプールが製造され、それによって高力価および生成物品質を有するＣＨＯクローンを見出す確率が高まる。さらに、ＣＲＥ ｍＲＮＡ作製ＣＨＯプール由来のクローンの増加は、ＣＲＥプラスミド作製ＣＨＯプール由来のクローンと比較してより安定である。

Claims (35)

  1. 三価の二重特異性抗体を製造するための方法であって、
    ａ）前記三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含む哺乳動物細胞を培養する工程、および
    ｂ）前記細胞または培養培地から前記三価の二重特異性抗体を回収する工程
    を含み、
    前記三価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、前記哺乳動物細胞のゲノム中に安定的に組み込まれ、かつ５’から３’の方向に、
    －第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
    －前記第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
    －第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
    －第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖または前記第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
    －前記第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
    を含み、
    前記デオキシリボ核酸が、前記第７の発現カセットの後に、前記第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含み、
    前記第１の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖であり、かつ前記第１の軽鎖が、対応するドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬであり、かつ
    前記第１の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第２の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、
    前記方法。
  2. 三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸であって、５’から３’の方向に、
    －第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
    －前記第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
    －第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
    －第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖または前記第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
    －前記第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
    を含み、
    前記デオキシリボ核酸が、前記第７の発現カセットの後に、前記第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含み、
    前記第１の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖であり、かつ前記第１の軽鎖が、対応するドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬであり、かつ
    前記第１の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第２の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、
    前記デオキシリボ核酸。
  3. ５’から３’の方向に、
    －第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
    －前記第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
    －第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
    －第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖または前記第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
    －前記第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
    を含むデオキシリボ核酸の、哺乳動物細胞における三価の二重特異性抗体の発現のための使用であって、
    前記デオキシリボ核酸が、前記第７の発現カセットの後に、前記第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含み、
    前記第１の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖であり、かつ前記第１の軽鎖が、対応するドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬであり、かつ
    前記第１の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第２の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、
    前記使用。
  4. 組換え哺乳動物細胞であって、前記細胞のゲノムに組み込まれた三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含み、前記三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
    －第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
    －前記第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
    －第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、
    －第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖または前記第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、および
    －前記第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット
    を含み、
    前記デオキシリボ核酸が、前記第７の発現カセットの後に、前記第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含み、
    前記第１の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖であり、かつ前記第１の軽鎖が、対応するドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬであり、かつ
    前記第１の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第２の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、
    前記組換え哺乳動物細胞。
  5. ３つの異なる組換え認識配列および４つの発現カセットを順に含む、２つのデオキシリボ核酸を含む組成物であって、
    －第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
    －第１の組換え認識配列、
    －第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
    －前記第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
    －第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
    －第３の組換え認識配列の第１のコピー
    を含み、
    かつ、
    －第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
    －第３の組換え認識配列の第２のコピー、
    －第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖または前記第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、
    －前記第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
    －第２の組換え認識配列
    を含み、
    前記デオキシリボ核酸が、前記第７の発現カセットの後に、前記第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含み、
    前記第１の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖であり、かつ前記第１の軽鎖が、対応するドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬであり、かつ
    前記第１の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第２の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、
    前記組成物。
  6. 三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造するための方法であって、以下の工程：
    ａ）哺乳動物細胞のゲノムの遺伝子座内の単一の部位に組み込まれた外因性ヌクレオチド配列を含む前記哺乳動物細胞を提供する工程であって、前記外因性ヌクレオチド配列が、少なくとも１つの第１の選択マーカーに隣接する第１の組換え認識配列および第２の組換え認識配列、ならびに前記第１の組換え認識配列と前記第２の組換え認識配列との間に位置する第３の組換え認識配列を含み、かつ前記組換え認識配列が全て異なっている、提供する工程、
    ｂ）ａ）で提供された前記細胞に、３つの異なる組換え認識配列および少なくとも７つの発現カセットを含む２つのデオキシリボ核酸の組成物を導入する工程であって、
    －第１のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
    －第１の組換え認識配列、
    －第１の重鎖をコードする第１の発現カセット、
    －前記第１の重鎖をコードする第２の発現カセット、
    －第１の軽鎖をコードする第３の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖をコードする第４の発現カセット、および
    －第３の組換え認識配列の第１のコピー
    を含み、
    かつ、
    －第２のデオキシリボ核酸が、５’から３’の方向に、
    －前記第３の組換え認識配列の第２のコピー、
    －第２の重鎖をコードする第５の発現カセット、
    －前記第１の軽鎖または前記第２の重鎖または第２の軽鎖のいずれかをコードする第６の発現カセット、
    －前記第２の軽鎖をコードする第７の発現カセット、および
    －第２の組換え認識配列
    を含み、
    前記第１のデオキシリボ核酸および前記第２のデオキシリボ核酸の前記第１の組換え認識配列～前記第３の組換え認識配列は、組み込まれた前記外因性ヌクレオチド配列の前記第１の組換え認識配列～前記第３の組換え認識配列と一致しており、
    １つの第２の選択マーカーをコードする発現カセットの５’末端部分および３’末端部分が、一緒になる場合、前記１つの第２の選択マーカーの機能的発現カセットを形成する、導入する工程、
    ｃ）
    ｉ）ｂ）の前記第１のデオキシリボ核酸および前記第２のデオキシリボ核酸と同時に、または
    ｉｉ）その後に逐次的に
    のいずれかで、１つまたは複数のリコンビナーゼを導入する工程であって、
    前記１つまたは複数のリコンビナーゼが、前記第１のデオキシリボ核酸および前記第２のデオキシリボ核酸の前記組換え認識配列を認識する（かつ任意で、前記１つまたは複数のリコンビナーゼが、２リコンビナーゼ媒介カセット交換を行う）、導入する工程
    ならびに
    ｄ）前記第２の選択マーカーを発現しかつ前記三価の二重特異性抗体を分泌する細胞を選択する工程
    を含み、それにより、前記三価の二重特異性抗体をコードするデオキシリボ核酸を含みかつ前記三価の二重特異性抗体を分泌する組換え哺乳動物細胞を製造し、
    前記デオキシリボ核酸が、前記第７の発現カセットの後に、前記第２の軽鎖をコードする第８の発現カセットを含み、
    前記第１の重鎖が、さらなるドメイン交換ＦａｂフラグメントＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬを含む伸長重鎖であり、かつ前記第１の軽鎖が、対応するドメイン交換軽鎖ＶＨ－ＶＬまたはＣＨ１－ＣＬであり、かつ
    前記第１の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｗ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含み、前記第２の重鎖が、ＣＨ３ドメイン中に変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、
    前記方法。
  7. 前記重鎖の一方が変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、請求項１に記載の三価の二重特異性抗体を製造するための方法。
  8. －前記第１の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
    －前記第２の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含み、
    －前記第１の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
    －前記第２の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
    前記第２の重鎖可変ドメインおよび前記第１の軽鎖可変ドメインが第１の結合部位を形成し、前記第１の重鎖可変ドメインおよび前記第２の軽鎖可変ドメインが第２の結合部位を形成する、
    請求項１および７のいずれか一項に記載の三価の二重特異性抗体を製造するための方法。
  9. 前記デオキシリボ核酸の厳密に１コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、請求項１、７および８のいずれか一項に記載の三価の二重特異性抗体を製造するための方法。
  10. 前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、請求項１および７～９のいずれか一項に記載の三価の二重特異性抗体を製造するための方法。
  11. 全てのカセットが一方向に配列されている、請求項１および７～１０のいずれか一項に記載の三価の二重特異性抗体を製造するための方法。
  12. 前記重鎖の一方が変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、請求項２に記載のデオキシリボ核酸。
  13. －前記第１の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
    －前記第２の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含み、
    －前記第１の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
    －前記第２の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
    前記第２の重鎖可変ドメインおよび前記第１の軽鎖可変ドメインが第１の結合部位を形成し、前記第１の重鎖可変ドメインおよび前記第２の軽鎖可変ドメインが第２の結合部位を形成する、
    請求項２および１２のいずれか一項に記載のデオキシリボ核酸。
  14. 全てのカセットが一方向に配列されている、請求項２、１２および１３のいずれか一項に記載のデオキシリボ核酸。
  15. 前記重鎖の一方が変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、請求項３に記載の使用。
  16. －前記第１の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
    －前記第２の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含み、
    －前記第１の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
    －前記第２の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
    前記第２の重鎖可変ドメインおよび前記第１の軽鎖可変ドメインが第１の結合部位を形成し、前記第１の重鎖可変ドメインおよび前記第２の軽鎖可変ドメインが第２の結合部位を形成する、
    請求項３および１５のいずれか一項に記載の使用。
  17. 前記デオキシリボ核酸の厳密に１コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、請求項３、１５および１６のいずれか一項に記載の使用。
  18. 前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、請求項３および１５～１７のいずれか一項に記載の使用。
  19. 全てのカセットが一方向に配列されている、請求項３および１５～１８のいずれか一項に記載の使用。
  20. 前記重鎖の一方が変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、請求項４に記載の組換え哺乳動物細胞。
  21. －前記第１の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
    －前記第２の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含み、
    －前記第１の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
    －前記第２の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
    前記第２の重鎖可変ドメインおよび前記第１の軽鎖可変ドメインが第１の結合部位を形成し、前記第１の重鎖可変ドメインおよび前記第２の軽鎖可変ドメインが第２の結合部位を形成する、
    請求項４および２０のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞。
  22. 前記デオキシリボ核酸の厳密に１コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、請求項４、２０および２１のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞。
  23. 前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、請求項４および２０～２２のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞。
  24. 全てのカセットが一方向に配列されている、請求項４および２０～２３のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞。
  25. 前記重鎖の一方が変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、請求項５に記載の組成物。
  26. －前記第１の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
    －前記第２の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含み、
    －前記第１の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
    －前記第２の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
    前記第２の重鎖可変ドメインおよび前記第１の軽鎖可変ドメインが第１の結合部位を形成し、前記第１の重鎖可変ドメインおよび前記第２の軽鎖可変ドメインが第２の結合部位を形成する、
    請求項５および２５のいずれか一項に記載の組成物。
  27. 前記三価の二重特異性抗体をコードする前記デオキシリボ核酸が、選択マーカーをコードするさらなる発現カセットを含み、
    前記選択マーカーをコードする前記発現カセットが、前記第３の組換え認識配列に対して部分的に５’および部分的に３’に位置し、前記発現カセットの前記５’に位置する部分が、プロモータおよび開始コドンを含み、前記発現カセットの前記３’に位置する部分が、開始コドンのないコード配列およびポリＡシグナルを含み、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されており、
    前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記５’に位置する部分が、開始コドンに作動可能に連結されたプロモータ配列を含み、それにより、前記プロモータ配列が、上流で前記第４の発現カセットに隣接し、前記開始コドンが、下流で前記第３の組換え認識配列に隣接し、かつ前記選択マーカーをコードする前記発現カセットの前記３’に位置する部分が、開始コドンを欠く選択マーカーをコードする核酸を含み、上流で前記第３の組換え認識配列に隣接し、下流で前記第５の発現カセットに隣接し、前記開始コドンが、前記コード配列に作動可能に連結されている、
    請求項５、２５および２６のいずれか一項に記載の組成物。
  28. 抗体鎖についての各発現カセットが、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、かつ
    前記選択マーカーをコードする各発現カセットが、５’から３’の方向に、プロモータ、前記選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、
    前記プロモータが、ＳＶ４０プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
    前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
    請求項２７に記載の組成物。
  29. 全てのカセットが一方向に配列されている、請求項５および２５～２８のいずれか一項に記載の組成物。
  30. 前記重鎖の一方が変異Ｓ３５４Ｃをさらに含み、それぞれの他方の重鎖が変異Ｙ３４９Ｃ（ナンバリングはＫａｂａｔに従う）を含む、請求項６に記載の組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
  31. －前記第１の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ペプチドリンカー、第２の重鎖可変ドメイン、およびＣＬドメインを含み、
    －前記第２の重鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、前記第１の重鎖可変ドメイン、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ領域、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含み、
    －前記第１の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第１の軽鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、かつ、
    －前記第２の軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端に、第２の軽鎖可変ドメインおよびＣＬドメインを含み、
    前記第２の重鎖可変ドメインおよび前記第１の軽鎖可変ドメインが第１の結合部位を形成し、前記第１の重鎖可変ドメインおよび前記第２の軽鎖可変ドメインが第２の結合部位を形成する、
    請求項６および３０のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
  32. 前記デオキシリボ核酸の厳密に１コピーが単一の部位または遺伝子座で前記哺乳動物細胞のゲノムに安定的に組み込まれている、請求項６、３０および３１のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
  33. 抗体鎖についての各発現カセットが、５’から３’の方向に、プロモータ、抗体鎖をコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、かつ
    前記選択マーカーをコードする各発現カセットが、５’から３’の方向に、プロモータ、前記選択マーカーをコードする核酸、およびポリアデニル化シグナル配列、および任意でターミネータ配列を含み、
    前記プロモータが、ＳＶ４０プロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列が、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナル配列であり、ターミネータが存在しない、前記選択マーカーの前記発現カセットを除いて、
    前記プロモータは、イントロンＡを含むヒトＣＭＶプロモータであり、前記ポリアデニル化シグナル配列は、ｂＧＨポリアデニル化シグナル配列であり、前記ターミネータは、ｈＧＴターミネータである、
    請求項６および３０～３２のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
  34. 前記哺乳動物細胞がＣＨＯ細胞である、請求項６および３０～３３のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
  35. 全てのカセットが一方向に配列されている、請求項６および３０～３４のいずれか一項に記載の組換え哺乳動物細胞を製造するための方法。
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