JP7437815B2 - 抗SIRPαモノクローナル抗体およびその使用 - Google Patents
抗SIRPαモノクローナル抗体およびその使用 Download PDFInfo
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Description
シグナル調節タンパク質アルファ(SIRPα)は、シグナル調節タンパク質(SIRP)ファミリーのメンバーであり、また、免疫グロブリンスーパーファミリーにも属している。SIRPファミリーメンバーは、受容体チロシンキナーゼ結合シグナル伝達プロセスの負の調節に関与することが知られている受容体型膜貫通糖タンパク質である。SIRPαは、チロシンキナーゼによってリン酸化され得る。このPTPのホスホチロシン残基は、SH2ドメインを含むチロシンホスファターゼ(PTP)をリクルートすることが示されており、かつ、PTPの基質として働く。SIRPαは、種々の成長因子受容体によって媒介されるシグナル伝達に関与することが見いだされた。CD47は、リガンドであることが実証されている。SIRPαは、SIRPファミリーのいくつかの他のメンバーと非常に高い類似性を共有している。SIRPαは、主に骨髄性細胞によって発現され、また、幹細胞またはニューロンによっても発現される。
バリアントv1とv2の両方に対して高い親和性を有する抗SIRPα抗体が、本明細書において見いだされ、SIRPαとCD47の間の相互作用を用量依存的かつ効率的にブロックすることができ、かつCD47を発現している細胞のマクロファージ媒介ファゴサイトーシスを効率的に誘導することができる。対照的に、既知の抗SIRPα抗体は、バリアント1を認識できるだけである。
定義
用語「a(1つの、ある)」または「an(1つの、ある)」実体は、1つまたはそれを超えるその実体を指す。例えば、「1つの抗体(an antibody)」は、1つまたはそれを超える抗体を表すものと理解すべきである。従って、用語「a」(または「an」)、「1つまたはそれを超える(one or more)」、および「少なくとも1つの(at least one)」は、本明細書において、互換的に使用され得る。
抗SIRPα抗体
表A.アミノ酸類似性マトリックス
二官能性分子および併用治療
抗体をコードするポリヌクレオチド、および抗体の調製方法
処置方法
診断方法
組成物
ヒトSIRPαタンパク質(human SIRPa protein)を、異なる系統のマウスを免役するために使用し、それによってハイブリドーマを生成させた。十分な数のハイブリドーマクローンを生成させるために、8つの融合体を作製した。SIRPα v1/v2陽性バインダー(SIRPa v1/v2 positive binders)を選択し、サブクローニングした。その後、約30の精製抗体を使用して、in vitro結合および機能的スクリーニングを行い、最も高い結合親和性および最も強い機能的能力を有するリード抗体を同定した。リード抗体は、ヒト化した。
表1.リードマウス抗体のVH/VL配列
実施例4.マクロファージ媒介ファゴサイトーシスの誘導
実施例5.マウスmAbのヒト化
ヒト化配列
A.248G3F6
表2A.248G3F6のヒト化-VH
表3A.300A6A6のヒト化-VH
表4A.102A10F2のヒト化-VH
表5A.62D2H6のヒト化-VH
表6A.211F8E11のヒト化-VH
表7A.217D11E5のヒト化-VH
表7E.ヒト化抗体
表8A.234B7D5のヒト化-VH
表9.ヒト化抗体の、SIRPαとCD47の相互作用をブロックする活性
実施例8.SIRPα v1とv2に対する結合親和性
表10A.SIRPα v1に対する結合親和性
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
野生型ヒトシグナル調節タンパク質アルファ(SIRPα)タンパク質に対して結合特異性を有する抗体またはそのフラグメントであって、前記抗体またはそのフラグメントが、重鎖相補性決定領域CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含む重鎖可変領域、ならびに相補性決定領域CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む軽鎖可変領域軽鎖を含み、ここで
(a)前記CDRH1が、配列番号15のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号16、21、または22のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号17のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号18のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号19のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号20のアミノ酸配列を含み;
(b)前記CDRH1が、配列番号30のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号31、36、37、または38のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号32のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号33のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号34のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号35のアミノ酸配列を含み;
(c)前記CDRH1が、配列番号47のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号48、53、または54のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号49のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号50のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号51のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号52のアミノ酸配列を含み;
(d)前記CDRH1が、配列番号63のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号64のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号65のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号66のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号67のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号68のアミノ酸配列を含み;
(e)前記CDRH1が、配列番号77のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号78のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号79のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号80のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号81のアミノ酸配列を含み、前記CDRL3が、配列番号82のアミノ酸配列を含み;
(f)前記CDRH1が、配列番号91のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号92のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号93のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号94のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号95のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号96のアミノ酸配列を含み;または
(g)前記CDRH1が、配列番号103のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号104のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号105のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号106のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号107のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号108のアミノ酸配列を含む、
抗体またはそのフラグメント。
(項目2)
野生型ヒトシグナル調節タンパク質アルファ(SIRPα)タンパク質に対して結合特異性を有する抗体またはそのフラグメントであって、前記抗体またはそのフラグメントが、重鎖相補性決定領域CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含む重鎖可変領域、ならびに相補性決定領域CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む軽鎖可変領域軽鎖を含み、ここで前記CDRH1が、配列番号15のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号16、21、または22のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号17のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号18のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号19のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号20のアミノ酸配列を含む、
抗体またはそのフラグメント。
(項目3)
前記重鎖可変領域が、配列番号1および23~27からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号1および23~27からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するペプチドを含む、項目2に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目4)
前記軽鎖可変領域が、配列番号2および28~29からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号2および28~29からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するペプチドを含む、項目2または3に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目5)
前記重鎖可変領域が、配列番号27のアミノ酸配列を含み、および前記軽鎖可変領域が、配列番号29のアミノ酸配列を含む、項目2に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目6)
野生型ヒトシグナル調節タンパク質アルファ(SIRPα)タンパク質に対して結合特異性を有する抗体またはそのフラグメントであって、前記抗体またはそのフラグメントが、重鎖相補性決定領域CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含む重鎖可変領域、ならびに相補性決定領域CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む軽鎖可変領域軽鎖を含み、ここで前記CDRH1が、配列番号30のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号31、36、37、または38のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号32のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号33のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号34のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号35のアミノ酸配列を含む、
抗体またはそのフラグメント。
(項目7)
前記重鎖可変領域が、配列番号3および39~44からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号3および39~44からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するペプチドを含む、項目6に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目8)
前記軽鎖可変領域が、配列番号4および45~46からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号4および45~46からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するペプチドを含む、項目6または7に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目9)
前記重鎖可変領域が、配列番号43のアミノ酸配列を含み、および前記軽鎖可変領域が、配列番号45のアミノ酸配列を含む、項目6に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目10)
野生型ヒトシグナル調節タンパク質アルファ(SIRPα)タンパク質に対して結合特異性を有する抗体またはそのフラグメントであって、前記抗体またはそのフラグメントが、重鎖相補性決定領域CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含む重鎖可変領域、ならびに相補性決定領域CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む軽鎖可変領域軽鎖を含み、ここで前記CDRH1が、配列番号47のアミノ酸配列を含み、前記CDRH2が、配列番号48、53、または54のアミノ酸配列を含み、前記CDRH3が、配列番号49のアミノ酸配列を含み、前記CDRL1が、配列番号50のアミノ酸配列を含み、前記CDRL2が、配列番号51のアミノ酸配列を含み、および前記CDRL3が、配列番号52のアミノ酸配列を含む、
抗体またはそのフラグメント。
(項目11)
前記重鎖可変領域が、配列番号5および55~60からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号5および55~60からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するペプチドを含む、項目10に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目12)
前記軽鎖可変領域が、配列番号6および61~62からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号6および61~62からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するペプチドを含む、項目10または11に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目13)
SIRPαバリアント1およびバリアント2に結合することができる、項目1~12のいずれか一項に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目14)
ヒト化されている、項目1~13のいずれか一項に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目15)
第2の標的タンパク質に対する結合特異性をさらに有する、項目1~24のいずれか一項に記載の抗体またはそのフラグメント。
(項目16)
項目1~15のいずれか一項に記載の抗体またはそのフラグメント、および医薬的に許容され得るキャリアを含む、組成物。
(項目17)
腫瘍抗原に対する特異性を有する二次抗体をさらに含む、項目16に記載の組成物。
(項目18)
前記二次抗体が、腫瘍オプソニン化抗体である、項目17に記載の組成物。
(項目19)
がんを処置することを必要とする患者においてがんを処置する方法であって、項目1~15のいずれか一項に記載の抗体またはそのフラグメントを前記患者に投与することを含む、方法。
(項目20)
前記がんが、膀胱がん、肝臓がん、結腸がん、直腸がん、子宮内膜がん、白血病、リンパ腫、膵臓がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、乳がん、尿道がん、頭頸部がん、胃腸がん、胃がん、食道がん、卵巣がん、腎臓がん、メラノーマ、前立腺がん、および甲状腺がんからなる群から選択される、項目19に記載の方法。
(項目21)
腫瘍オプソニン化を誘発するタンパク質を標的とする二次抗体を前記患者に投与することをさらに含む、項目19に記載の方法。
(項目22)
前記タンパク質が、CD19、CD20、EGFR、HER2、CD3、CD16、PD1、PD-L1、LAG3、TIM3、CTLA4、VISTA、CSFR1、A2AR、CD73、CD39、CD40、CEA、HER2、VEGFR、TIGIT、クローディン18.2、CD24、GPC3、Il13RA2、4-1BB、CCR8、およびCMETからなる群から選択される、項目21に記載の方法。
Claims (16)
- 野生型ヒトシグナル調節タンパク質アルファ(SIRPα)タンパク質に対して結合特異性を有する抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、それぞれ、配列番号43のVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3のアミノ酸配列を有する重鎖相補性決定領域CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびにそれぞれ、配列番号45のVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3のアミノ酸配列を有する相補性決定領域CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記配列番号43のVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3および前記配列番号45のVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、Kabatシステムに従って定義されるものである、請求項1に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記配列番号43のVH CDR1、VH CDR2およびVH CDR3および前記配列番号45のVL CDR1、VL CDR2およびVL CDR3は、Chothiaシステムに従って定義されるものである、請求項1に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記重鎖可変領域が配列番号43のアミノ酸配列を有し、前記軽鎖可変領域が配列番号45のアミノ酸配列を有する、請求項1に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 第2の標的タンパク質への結合特異性をさらに有する、請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 請求項1~5のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメント、および医薬的に許容され得るキャリアを含む、組成物。
- 腫瘍抗原に対する特異性を有する二次抗体をさらに含む、請求項6に記載の組成物。
- 前記二次抗体が、腫瘍オプソニン化抗体である、請求項7に記載の組成物。
- 必要とする患者においてがんを処置するための医薬の製造における、請求項1~5のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントの使用。
- 前記がんが、膀胱がん、肝臓がん、結腸がん、直腸がん、子宮内膜がん、白血病、リンパ腫、膵臓がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、乳がん、尿道がん、頭頸部がん、胃腸がん、胃がん、食道がん、卵巣がん、腎臓がん、メラノーマ、前立腺がん、および甲状腺がんからなる群から選択される、請求項9に記載の使用。
- 前記患者は、腫瘍オプソニン化を誘発するタンパク質を標的とする二次抗体を投与されることを特徴とする、請求項9に記載の使用。
- 前記タンパク質が、CD19、CD20、EGFR、HER2、CD3、CD16、PD1、PD-L1、LAG3、TIM3、CTLA4、VISTA、CSFR1、A2AR、CD73、CD39、CD40、CEA、HER2、VEGFR、TIGIT、クローディン18.2、CD24、GPC3、Il13RA2、4-1BB、CCR8、およびCMETからなる群から選択される、請求項11に記載の使用。
- 必要とする患者においてがんを処置するための組成物であって、請求項1~5のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントを含む、組成物。
- 前記がんが、膀胱がん、肝臓がん、結腸がん、直腸がん、子宮内膜がん、白血病、リンパ腫、膵臓がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、乳がん、尿道がん、頭頸部がん、胃腸がん、胃がん、食道がん、卵巣がん、腎臓がん、メラノーマ、前立腺がん、および甲状腺がんからなる群から選択される、請求項13に記載の組成物。
- 前記組成物は、前記患者に、腫瘍オプソニン化を誘発するタンパク質を標的とする二次抗体と組み合わせて投与されることを特徴とする、請求項13に記載の組成物。
- 前記タンパク質が、CD19、CD20、EGFR、HER2、CD3、CD16、PD1、PD-L1、LAG3、TIM3、CTLA4、VISTA、CSFR1、A2AR、CD73、CD39、CD40、CEA、HER2、VEGFR、TIGIT、クローディン18.2、CD24、GPC3、Il13RA2、4-1BB、CCR8、およびCMETからなる群から選択される、請求項15に記載の組成物。
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