JP7411970B2 - 乳汁中のIgA抗体含有量の増加剤 - Google Patents
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Description
〔1〕配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有し、かつ、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する作用を有するバクテロイデス属細菌株;並びに
配列番号2に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有し、かつ、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する作用を有するプレボテラ属細菌株;
から選択される細菌株を、1又は2種以上含むことを特徴とする乳汁中のIgA抗体含有量の増加剤。
〔2〕細菌株が、パイエル板における免疫機能を活性化し、IgA抗体産生形質細胞数を増加させる作用を有することを特徴とする上記〔1〕に記載の増加剤。
〔3〕腸内細菌叢に占める、配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有するバクテロイデス属細菌株、及び配列番号2に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有するプレボテラ属細菌株の割合が低下した哺乳動物母体に接種することを特徴とする上記〔1〕又は〔2〕に記載の増加剤。
〔4〕経口接種することを特徴とする上記〔1〕~〔3〕のいずれかに記載の増強剤。
配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有し、かつ、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する作用を有するバクテロイデス属細菌株(以下、「本件バクテロイデス属細菌株」ということがある);並びに、配列番号2に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有し、かつ、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する作用を有するプレボテラ属細菌株(以下、「本件プレボテラ属細菌株」ということがある);から選択される細菌株(以下、これらを総称して「本件細菌株」ということがある)の1又は2種以上を、乳汁中のIgA抗体含有量の増加を必要とする哺乳動物母体に接種するステップを含む、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する方法;や、
乳汁中のIgA抗体含有量の増加における使用のための、1又は2種以上の本件細菌株;や、
乳汁中のIgA抗体含有量の増加剤を製造するための、1又は2種以上の本件細菌株の使用;
を挙げることができる。
[細菌株]
理研バイオリソース研究センターの微生物材料開発室から、3種類の細菌株(Parabacteroides goldsteinii[JCM13446]、Bacteroides acidifaciens[JCM10556]、及びPrevotella buccalis[JCM12246])を入手した。これらの細菌を細菌培養ガス濃度調節剤(アネロパック[登録商標])(スギヤマゲン社製)を用いた嫌気性条件下で、GAM液体培地中に一晩培養した後、細菌数をカウントした。
6種類のマウス(BALB/c[BALB/cCrSlc]マウス;C57BL/6[C57BL/6NCrSlc]マウス;ICR[C.B-17/Icr-+/+Jcl]マウス;重症複合免疫不全症[C.B-17/Icr-scid/scidJcl]を有するICRマウス(すなわち、免疫不全マウス);及びB6N.Cg-Tg[Vil-cre]997Gum/Jマウス)は、日本エスエルシー社、日本クレア社、The Jackson Laboratory、又は三協ラボサービス社から購入し、東北大学大学院農学研究科又は東京大学医科学研究所の動物施設で飼育した。また、B6-Tg(CAG-FLPe)36マウスは、理研バイオリソース研究から分与された。図2及び図23~26の実験に用いたPP欠損マウスは、胎生14日目のBALB/cマウスに、1mgの抗IL-7Rα抗体(A7R34)を子宮内投与することにより作製した(文献「Yoshida et al., International Immunology, 11, 643-655. 1999」参照)。また、図2の実験に用いたILN欠損マウスは、鼠径リンパ節を外科的に除去することにより作製した。また、図3の実験に用いたマウスは、免疫不全マウスの交配開始時に、以下の[細胞の単離]の項目に記載の方法に従って得られたPP由来単核細胞及びILN由来単核細胞を、野生型(Icr+/+)マウスへ尾静脈内投与することにより調製した。また、図5~7の実験に用いたマウスは、交配前から出産14日後までの間、抗生物質(1g/Lのアンピシリン、1g/Lのネオマイシン、500mg/Lのバンコマイシン、又はこれらの混合物)を含む水を、BALB/c母マウスに自由飲水させることにより調製した。また、図8~10及び16~18の実験に用いたマウスは、交配前から出産7日後までの間、抗生物質混合物を含む水を、BALB/c母マウスに自由飲水させた後、健常BALB/cマウスから採取した糞便(図8~10及び16~18)や、免疫不全マウスから採取した糞便(図16~18)を、出産8~14日の間、1日1回、計7回FMTを行うことにより調製した。また、図12~15の実験に用いたマウスにおいて、骨髄移植(BMT)は、免疫不全マウスにおける交配開始時に、野生型(Icr+/+)マウスから得た106の骨髄単核球を用いて行った。また、図20~22の実験に用いたマウスは、交配前から出産7日後までの間、抗生物質混合物を含む水を、BALB/c母マウスに自由飲水させた後、約1010cfuの3種類の細菌株(Parabacteroides goldsteinii、Bacteroides acidifaciens、及びPrevotella buccalis)を含むPBS500μLを経口投与することにより調製した。すべての動物実験は、東北大学及び東京大学の両方の所内動物実験委員会により承認されたプロトコルにしたがって設計された。
Spib遺伝子のエクソン2~5をloxP部位で両側をはさみ、エクソン5及び6の間のイントロンにFrt-flanked neo耐性カセットを挿入するようにターゲティングベクターを設計した。ターゲティングベクター30μgを線状化した後、JM8A1.N3胚性幹細胞(KOMP Repositoryより入手)へ形質転換した。ネオマイシン耐性及びガンシクロビル耐性胚性幹細胞のコロニーを選択した後、以下の表1に示すプライマーセットを用いたPCR法や、以下の表1に示すプローブを用いたサザンブロット解析により、Spib遺伝子ターゲティングされた相同組換え体をスクリーニングした。スクリーニングした相同組換え体をC57BL/6マウスの胚盤胞にマイクロインジェクションし、キメラマウスを作製した。Neo耐性カセットを欠失させてfloxed Spibマウスを得るため、ヘテロ型のF1マウスをB6-Tg(CAG-FLPe)36マウスと交配した。次に、得られたfloxed SpibマウスをB6N.Cg-Tg(Vil-cre)997Gum/Jマウスと交配し、Spibflox/floxマウスを作製した。作製したSpibflox/floxマウスと、腸管上皮細胞特異的にCreリコンビナーゼを発現するマウス(Villin-Creトランスジェニックマウス)とを交配することにより、SpiBコンディショナルノックアウトマウス(すなわち、SpiB cKOマウス)を作製した。
各種マウスの乳腺、PP、及びILNから単核細胞を単離した。具体的には、乳腺及びPPを、0.5mg/mLのコラゲナーゼで60分間、37℃で消化し、乳腺由来単核細胞及びPP由来単核細胞を単離した。また、ILN由来単核細胞については、ILNを物理的に処理することにより調製した。得られた単核細胞の一部を、チュルク液(Turk's solution)で染色し、細胞数カウントした後、フローサイトメトリーや尾静脈内投与に用いた。
各々の組織から単離した単核細胞を、10μg/mLの抗マウスCD16/32(2.4G2)により15分間4℃でブロックし、蛍光物質で標識した5種類の細胞表面マーカー(B220、Ly6C、CD93、I-Ad、及びCD11b)に対する5種類の抗体(2μg/mLのBV421標識抗CD45R[B220]抗体[RA3-6B2、BD Bioscience社製]、2μg/mLのPE標識抗Ly6C抗体[HK1.4、Biolegend社製]、2μg/mLのPE-Cy7標識抗CD93抗体[AA4.1、Biolegend社製]、5μg/mLのAlexa647標識抗I-Ad抗体[39-10-8、Biolegend社製]、及び2μg/mLのBV510標識抗CD11b抗体[M1/70、BD Bioscience社製])の存在下で、30分間4℃で抗原抗体反応処理を行った。なお、アイソタイプ・コントロール抗体として、4種類の抗体(5μg/mLのAlexa647標識マウスIgG3抗体[MG3-35、Biolegend社製]、2μg/mLのBV421標識ラットIgG2a[R35-95、BD Bioscience社製]、2μg/mLのPE-Cy7標識ラットIgG2b[RTK4530、Biolegend社製]、及び2μg/mLのPE標識ラットIgG2c[RTK4174、Biolegend社製])を用いた。また、フローサイトメトリー解析における死細胞を除去するために、10μg/テストの細胞生存溶液(Cell Viability Solution)(BD Bioscience社製)を添加した。また、細胞内におけるIgA抗体を検出するために、各々の組織から単離した単核細胞を、4%(w/v)パラホルムアルデヒド溶液中に20分間室温で固定化処理し、界面活性剤(0.1%[w/v]サポニン)により15分間室温で処理した後、5μg/mLのFITC標識抗IgA抗体(C10-3、BD Bioscience社製)の存在下で、30分間室温で抗原・抗体反応処理を行った。なお、アイソタイプ・コントロール抗体として、2種類の抗体(5μg/mLのFITCラットIgG1[R3-34、BD Bioscience社製]、及び2μg/mLのBV421ラットIgG1[R3-34、BD Bioscience社製])を用いた。Attune NxT Acoustic Focusing Cytometer(Thermo Fisher Science社製)又はAccuri C6 flow cytometer(BD Bioscience社製)を用いてフローサイトメトリーを行った。
母マウスにおける乳汁中のIgA抗体の濃度を測定するために、乳汁を摂取した仔マウスから採取した胃内容物におけるIgA抗体(以下、「乳汁由来IgA抗体」ということがある)の濃度を、ELISA法を用いて測定した。具体的には、乳汁を摂取した仔マウスの胃内容物を、1mg当たり10μLのPBSに懸濁し、遠心分離により上清(以下、「乳汁由来試料」という)を回収した。次に、96ウェルELISAプレートの各ウェルに、100μg/mLの抗IgA抗体(Bethyl Laboratries社製)を添加し、4℃で一晩インキュベートすることにより固相化処理を行った。1%(w/v)BSAの存在下で、1時間室温でブロッキング処理を行った後、2階段希釈した乳汁由来試料を各ウェルに添加し、2時間室温でインキュベートした。PBSで洗浄後、各ウェルに、100ng/mLのHRP標識IgA抗体(上記固相化した抗IgA抗体とはエピトープが異なる抗IgA抗体)(Bethyl Laboratries社製)を添加し、1時間室温でインキュベートし、TMB(Tetramethylbenzidine)マイクロウェルペルオキシダーゼ基質システム(SeraCare Life Sciences社製)を用いて、HRP由来のシグナルを生成させた。IgA抗体の検量線を、既知の濃度のIgA抗体を含むマウス血清を用いて作成し、かかる検量線を基に、乳汁を摂取した仔マウスの胃内容物中のIgA抗体濃度を測定した。
乳汁中のIgA抗体が結合する腸内細菌種を同定するために、文献「Palmet al., Cell 158, 1000-1010. 2014」に記載のIgA-Seqを一部修正した方法を行った。具体的には、健常BALB/cマウスから採取した糞便を含むPBS(100μg/μL)を、40μm孔のセルストレーナーを用いてデブリを除去することにより、腸内微生物を含む糞便懸濁液を調製した。500μg/mLの抗IgA抗体、20%(v/v)の正常ラット血清、及び1%(w/v)BSAの存在下で、30分間、4℃でブロッキング処理を行った後、乳汁由来試料と1:1の比率で混合し、30分間、4℃でインキュベートした。洗浄後、懸濁液を2μg/mLのPE標識抗IgA抗体(mA-6E1、Invitrogen社製)及び500nMの細胞核染色試薬(SYTO 9)の存在下で30分間、4℃でインキュベートした後、30μL/テストのAnti-PE MicroBeads UltraPure(Miltenyi Biotec社製)の存在下で30分間、4℃でインキュベートした。IgA抗体が結合した細菌を、磁気細胞ソーターAutoMACS(Miltenyi Biotec社製)を用いて回収し、糞便DNA単離キット(Stool DNA Isolation Kit)(チヨダサイエンス社製)を用いて、細菌由来のゲノムDNAを抽出した。かかるゲノムDNAを鋳型とし、以下の[メタゲノム解析]の項目に記載の方法に従って、乳汁中のIgA抗体が結合する腸内細菌種を同定した。
各種マウスの糞便から、QIAamp DNA Stool Mini Kit(Qiagen社製)を用いて細菌由来のゲノムDNAを抽出し、メタゲノム解析を行った。具体的には、抽出した細菌由来のゲノムDNAを鋳型とし、PrimeSTAR HS DNAポリメラーゼ(タカラバイオ社製)及び以下の表2に示すプライマーを用いたPCR法を行い、各種細菌の16S rRNA遺伝子のV3及びV4領域を増幅した。
上記[IgA-Seq]や[メタゲノム解析]の項目に記載の方法に従って抽出した細菌由来のゲノムDNAを鋳型とし、TB Green Premix Ex Taq II(タカラバイオ社製)を用いた定量PCRを行い、細菌特異的tuf遺伝子のコピー数を定量した。プライマーはすべて、Perfect Real-timeサポートシステム(タカラバイオ社製)により設計した。
BMTを行ったマウスから定法に従って小腸組織を単離し、4%(w/v)パラホルムアルデヒド液中に固定した後、パラフィンに包埋した。組織切片(5μm)をTNB溶液中で、室温で30分間ブロッキング処理した後、PE標識抗CD45R(B220)抗体(RA3-6B2)と、マウスCD3と交差反応する抗ヒトCD3(SP2)抗体の存在下で、一晩4℃で抗原抗体反応処理を行った。洗浄後、組織切片を、HRP標識IgG抗体の存在下で、1時間室温でインキュベートし、10分間室温でTSA Plus fluorescein System(PerkinElmer社製)を用いて、CD3由来のシグナルを増幅した。また、1μg/mLのDAPIを用いて細胞核を染色した。また、組織病理学的分析のため、組織切片を、ヘマトキシリン・エオシン染色し、BZ-9000(Keyence社製)又はBX63(Olympus社製)のいずれかで画像を取得した。
[IgA抗体産生形質細胞における細胞表面マーカーの発現解析]
乳腺においてIgAが産生されるためには、IgA抗体産生形質細胞が、乳腺へ遊走することが不可欠であることが報告されている(文献「Halsey et al., Ann N Y Acad Sci 409, 452-460. 1983」及び「Niimi et al., Mucosal Immunol 11, 643-653. 2018」参照)。そこで、母マウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞を同定するために、6種類の形質細胞関連マーカー(IgA抗体、及び5種類の細胞表面マーカー[B220、Ly6C、I-Ad、CD11b、及びCD93])を用いたフローサイトメトリーを行った。その結果、IgA抗体を高レベルで産生する形質細胞は、3種類の細胞表面マーカー(Ly6C、I-Ad、及びCD93)が陽性でかつ、2種類の細胞表面マーカー(B220及びCD11b)が陰性であることが示された(図1参照)。このため、以降の実験においては、B220陰性でかつIgA陽性の形質細胞をIgA産生形質細胞の指標とした。
鼠径リンパ節(ILN)は、乳腺の所属リンパ節(draining lymph node)としての役割を果たしていることが知られている(文献「Leonhardt,Gene 94, 121-124. 1990」参照)また、パイエル板(PP)は、特にIgA抗体が最も豊富に産生される胃腸管で、粘膜免疫系において極めて重要な役割を果たしていることが知られている(文献「Lindner et al., Nat Immunol 16, 880-888. 2015」及び「Moro-Sibilot et al., Gastroenterology 151, 311-323. 2016」参照)。そこで、2種類のモデル母マウス(ILN欠損マウス及びPP欠損マウス)を用いて、乳腺中の母体IgA抗体産生に与える影響を解析した。その結果、ILN欠損マウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数は、非欠損マウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数と比べ、ほとんど変わらなかったのに対して、PP欠損マウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数値は、非欠損マウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数値と比べ、有意に低いことが示された(図2A及びB参照)。また、ILN欠損マウスにおける乳汁由来IgA抗体の濃度は、非欠損マウスにおける乳汁由来IgA抗体の濃度とほとんど変わらなかったのに対して、PP欠損マウスにおける乳汁由来IgA抗体の濃度は、非欠損マウスにおける乳汁由来IgA抗体の濃度と比べ、有意に低いことが示された(図2C参照)。
Spibは、濾胞関連上皮(follicle-associated epithelium:FAE)を含む腸管上皮において、FAE中に存在する抗原を取り込むM細胞から、IgA抗体を産生する成熟B細胞への分化に関与する転写因子であることが知られている(文献「Kanayaet al., Nat Immunol 13, 729-736. 2012」及び「Satoet al., Mucosal Immunol 6, 838-846. 2013」参照)。一方、Spib遺伝子のコンディショナルノックアウトモデルマウス(すなわち、SpiB cKOマウス)は、パイエル板(PP)におけるM細胞を欠損したマウスである。そこで、Spibと、乳腺におけるIgA産生との関連性を、SpiB cKOマウスを用いて解析した。その結果、SpiB cKOマウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数値は、Spibflox/floxマウス(すなわち、SpiB遺伝子が欠損していないマウス)の乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数値と比べ、有意に低いことが示された(図4A及びB参照)。また、SpiB cKOマウスにおける乳汁由来IgA抗体の濃度は、Spibflox/floxマウスにおける乳汁由来IgA抗体の濃度と比べ、有意に低いことが示された(図4C参照)。
腸内細菌叢が、PPを含む胃腸管における宿主の免疫細胞とともに、ホメオスタシスを確立していることを考慮し、様々な種類の抗生物質、具体的には、アンピシリン、ネオマイシン、若しくはバンコマイシン、又はこれらの混合物を、妊娠期間~授乳期間中のBALB/c母マウスに投与することにより腸内細菌叢を乱し、母体IgA抗体産生に与える影響を調べた。初めに、各種抗生物質処理が腸内細菌叢に与える影響を調べるために、メタゲノム解析を行った。その結果、腸内細菌の総数は、各種抗生物質処理と未処理の間でほとんど変化は認められなかったものの(図5A参照)、腸内細菌叢の構成は、両者間で大幅に変動し(図5B及び5C参照)、特に、4種類の細菌株(Parabacteroides goldsteinii、Bacteroides acidifaciens、Prevotella buccalis、及びEscherichia albertii)の腸内細菌叢に対する割合が、大きく変動した(図6参照)。具体的には、バンコマイシンや、3種類の抗生物質(アンピシリン、ネオマイシン、及びバンコマイシン)からなる混合物を母マウスに自由飲水により投与すると、抗生物質未投与の母マウスと比べ、腸内細菌叢に占める3種類の細菌株(Parabacteroides goldsteinii[図6A]、Bacteroides acidifaciens[図6B]、及びPrevotella buccalis[図6C])の割合は、大幅に低下したのに対して、1種類の細菌株(Escherichia albertii[図6D])の割合は高かった。また、バンコマイシンや、上記3種類の抗生物質からなる混合物を母マウスに自由飲水により投与すると、抗生物質未投与の母マウスと比べ、母マウスの乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合や数値が有意に低くなるとともに(図7A及びB参照)、乳汁由来IgA抗体の濃度も有意に低いことが示された(図7C参照)。
次に、2種類の細菌株(Bacteroides acidifaciens及びPrevotella buccalis)に対する乳汁中のIgA抗体の特異性を解析するために、健常BALB/cマウスから採取した糞便と、BALB/c母マウスの乳汁を摂取した仔マウスの胃内容物とを用いて、IgA-Seqを行った。その結果、上記2種類の細菌株は、乳汁中のIgA抗体に結合しないものの割合よりも、乳汁中のIgA抗体に結合するものの割合の方が多いことが示された(図19参照)。
抗生物質混合物を投与したBALB/c母マウスに、上記2種類の細菌株(Bacteroides acidifaciens及びPrevotella buccalis)を接種し、乳汁中のIgA抗体産生が増加するかどうか検証した。なお、コントロールとしてParabacteroides goldsteiniiを用いた。その結果、これら細菌株の接種を行った場合、細菌株未接種の場合と比べ、腸内細菌の総数はほとんど変わらず(図20A参照)、腸内細菌叢の構成に変動が認められたものの(図20B及び20C参照)、2種類の細菌株(Bacteroides acidifaciens及びPrevotella buccalis)の接種を行った場合、細菌株未接種の場合と比べ、乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数や、乳汁由来IgA抗体濃度は、有意に増加した(図21参照)。一方、コントロールのParabacteroides goldsteiniiの接種を行った場合、細菌株未接種の場合と比べ、乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数や、乳汁由来IgA抗体濃度は、ほとんど変わらなかった(図21参照)。また、2種類の細菌株(Bacteroides acidifaciens及びPrevotella buccalis)の接種を行った場合、これら細菌株特異的な乳汁由来IgA抗体量が有意に増加することが示された(図22参照)。
腸内細菌叢が乱され、乳腺におけるIgA抗体産生量が低下した状態の哺乳動物母体に、2種類の細菌株(Bacteroides acidifaciens及びPrevotella buccalis)を接種したときに認められた、乳腺におけるIgA抗体産生量の増加には、PPが必須かどうかを、PP欠損マウスを用いて検証した。なお、コントロールとしてParabacteroides goldsteiniiを用いた。その結果、これら細菌株の接種により、PP非欠損マウス(BALB/c母マウス)及びPP欠損マウスのそれぞれに、上記2種類の細菌株(Bacteroides acidifaciens及びPrevotella buccalis)を接種すると、両者ともに、腸内細菌の総数はほとんど変わらなかったものの(図23A参照)、B. acidifaciensを接種した場合、両マウスともに、腸内細菌叢に占めるB. acidifaciensの割合が有意に増加した(図23B及びC、並びに図24参照)。また、PP非欠損マウスに、上記2種類の細菌株を接種すると、細菌株未接種の場合と比べ、乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数や、乳汁由来IgA抗体濃度は、有意に増加したのに対して、PP欠損マウスに、上記2種類の細菌株を接種しても、乳腺におけるIgA産生形質細胞の割合及び数の増加や、乳汁由来IgA抗体濃度の増加は認められず、PP非欠損マウスに、コントロールのParabacteroides goldsteiniiを接種した場合と同レベルであった(図25参照)。また、PP非欠損マウスに、上記2種類の細菌株を接種すると、これら細菌株特異的な乳汁由来IgA抗体量が有意に増加したのに対して、PP欠損マウスに、上記2種類の細菌株を接種しても、これら細菌株特異的な乳汁由来IgA抗体量の増加は認められなかった(図26参照)。
Claims (4)
- 配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有し、かつ、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する作用を有するバクテロイデス属細菌株;並びに
配列番号2に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有し、かつ、乳汁中のIgA抗体含有量を増加する作用を有するプレボテラ属細菌株;
から選択される細菌株を、1又は2種以上含むことを特徴とする乳汁中のIgA抗体含有量の増加剤。 - 細菌株が、パイエル板における免疫機能を活性化し、IgA抗体産生形質細胞数を増加させる作用を有することを特徴とする請求項1に記載の増加剤。
- 腸内細菌叢に占める、配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有するバクテロイデス属細菌株、及び配列番号2に示されるヌクレオチド配列と少なくとも90%の同一性を有する16S rRNA遺伝子を有するプレボテラ属細菌株の割合が低下した哺乳動物母体に接種することを特徴とする請求項1又は2に記載の増加剤。
- 経口接種することを特徴とする請求項1~3のいずれかに記載の増加剤。
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