JP7030343B2 - 疾患iPS細胞を用いた神経毒性評価モデル系及びその使用 - Google Patents
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Description
そこで近年では、開発の早い段階で、iPS細胞から作製したヒト細胞を用いて候補薬を調べることにより毒性を予測し、創薬開発をより効率的かつ低コストで行えるようにしようとする研究が注目されており、これまでに、iPS細胞由来の心筋細胞や肝細胞を用いた毒性評価系が報告されている。
神経毒性は心毒性や肝毒性と並び、創薬において評価すべき重要な項目である。例えば、薬剤誘導性の神経毒性において主要な型である軸索変性症は、ある種の抗がん剤によって引き起こされるが、in vitroモデルを用いて抗がん剤誘導性の神経毒性を試験したことが報告されている(非特許文献1)。しかしながら、iPS細胞由来の神経細胞を用いたどのような評価系が実際の臨床的副作用を反映した評価系なのかは未だ明らかになっていない。数多ある細胞アッセイ系と表現型の中から、臨床症状をよく反映する神経細胞の表現型を、ヒトiPS細胞由来神経細胞を用いた細胞アッセイにより同定することが、神経毒性評価モデル系を確立するために切望されている。
本発明者らは、これらの知見に基づいて、本細胞モデルが新規な神経毒性評価系として有用であると結論し、本発明を完成するに至った。
[1] 以下の(1)~(3)の工程を含む、化合物のヒトに対する神経毒性の評価方法。
(1)CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞と試験化合物とを接触させる工程
(2)当該神経細胞における、以下の(a)~(c):
(a)神経突起中のミトコンドリアの状態
(b)神経突起中のATPレベル
(c)MFN2タンパク質レベル
からなる群より選択される1以上の表現型を検定する工程
(3)試験化合物と接触させなかった対照と比較して、(2)の表現型を増悪させた試験化合物を、ヒトに対して神経毒性を引き起こす可能性がある化合物として選択する工程
[2] 工程(2)において検定される表現型が、(a)及び/又は(b)の表現型である、[1]記載の方法。
[3] 神経突起中のミトコンドリアの状態が、ミトコンドリア長、ミトコンドリアの形態、ミトコンドリアの凝集、ミトコンドリアの移動性、ミトコンドリア数から選択される、[1]又は[2]記載の方法。
[4] 神経細胞が、神経突起を伸長させた付着性ニューロスフェアである、[1]~[3]のいずれかに記載の方法。
[5] CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞の代わりに、健常人のiPS細胞から分化誘導された対照神経細胞を用いて、(1)及び(2)の工程をさらに行い、該対照神経細胞に比べて、CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞において、(2)の表現型が増悪傾向を示した試験化合物を、ヒトに対して神経毒性を引き起こす可能性がより高い化合物として選択することを含む、[1]~[4]のいずれかに記載の方法。
[6] CMTがMFN2遺伝子に変異を有するものである、[1]~[5]のいずれかに記載の方法。
[7] MFN2遺伝子の変異がH128Y又はR94Qである、[6]記載の方法。
[8] 神経毒性が軸索変性症である、[1]~[7]のいずれかに記載の方法。
尚、本明細書において「CMTのヒトiPS細胞」とは、CMT患者由来の体細胞から樹立されたiPS細胞だけでなく、当該疾患と相関する遺伝子変異を有するCMT未発症のヒト由来の体細胞から樹立されたiPS細胞をも包含する意味で用いられる。
iPS細胞は、特定の初期化因子を、DNA又はタンパク質の形態で体細胞に導入することによって作製することができる、ES細胞とほぼ同等の特性、例えば分化多能性と自己複製による増殖能、を有する体細胞由来の人工の幹細胞である(K. Takahashi and S. Yamanaka (2006) Cell, 126:663-676; K. Takahashi et al. (2007), Cell, 131:861-872; J. Yu et al. (2007), Science, 318:1917-1920; Nakagawa, M. et al., Nat. Biotechnol. 26:101-106 (2008);国際公開WO 2007/069666)。初期化因子は、ES細胞に特異的に発現している遺伝子、その遺伝子産物もしくはnon-coding RNA、またはES細胞の未分化維持に重要な役割を果たす遺伝子、その遺伝子産物もしくはnon-coding RNA、あるいは低分子化合物によって構成されてもよい。初期化因子に含まれる遺伝子として、例えば、Oct3/4、Sox2、Sox1、Sox3、Sox15、Sox17、Klf4、Klf2、c-Myc、N-Myc、L-Myc、Nanog、Lin28、Fbx15、ERas、ECAT15-2、Tcl1、beta-catenin、Lin28b、Sall1、Sall4、Esrrb、Nr5a2、Tbx3またはGlis1等が例示され、これらの初期化因子は、単独で用いても良く、組み合わせて用いても良い。初期化因子の組み合わせとしては、WO2007/069666、WO2008/118820、WO2009/007852、WO2009/032194、WO2009/058413、WO2009/057831、WO2009/075119、WO2009/079007、WO2009/091659、WO2009/101084、WO2009/101407、WO2009/102983、WO2009/114949、WO2009/117439、WO2009/126250、WO2009/126251、WO2009/126655、WO2009/157593、WO2010/009015、WO2010/033906、WO2010/033920、WO2010/042800、WO2010/050626、WO 2010/056831、WO2010/068955、WO2010/098419、WO2010/102267、WO 2010/111409、WO 2010/111422、WO2010/115050、WO2010/124290、WO2010/147395、WO2010/147612、Huangfu D, et al. (2008), Nat. Biotechnol., 26: 795-797、Shi Y, et al. (2008), Cell Stem Cell, 2: 525-528、Eminli S, et al. (2008), Stem Cells. 26:2467-2474、Huangfu D, et al. (2008), Nat Biotechnol. 26:1269-1275、Shi Y, et al. (2008), Cell Stem Cell, 3, 568-574、Zhao Y, et al. (2008), Cell Stem Cell, 3:475-479、Marson A, (2008), Cell Stem Cell, 3, 132-135、Feng B, et al. (2009), Nat Cell Biol. 11:197-203、R.L. Judson et al., (2009), Nat. Biotech., 27:459-461、Lyssiotis CA, et al. (2009), Proc Natl Acad Sci U S A. 106:8912-8917、Kim JB, et al. (2009), Nature. 461:649-643、Ichida JK, et al. (2009), Cell Stem Cell. 5:491-503、Heng JC, et al. (2010), Cell Stem Cell. 6:167-74、Han J, et al. (2010), Nature. 463:1096-100、Mali P, et al. (2010), Stem Cells. 28:713-720、Maekawa M, et al. (2011), Nature. 474:225-9.に記載の組み合わせが例示される。
本発明において、神経細胞とは、少なくともβIII-チューブリン及び/又はMAP2の神経細胞マーカーを発現している細胞を言い、好ましくはさらにSMI-32及び/又はIsl1を発現する運動神経細胞である。
ここで、BMP阻害剤として、Noggin、chordin、follistatinおよびDorsomorphin LDN-193189などが例示される。また、TGFβファミリー阻害剤として、SB431542、SB202190、SB505124、NPC30345、SD093、SD908、SD208、LY2109761、LY364947、LY580276およびA-83-01などが例示される。これらの添加剤は、適宜組み合わせて用いることができる。好まし添加剤の組み合わせとしては、(1)NoginおよびSB431542、(2)Nogin、B27-サプリメントおよびN2-サプリメント、(3)レチノイン酸、Sonic Hedgehog、B27-サプリメントおよびN2-サプリメントまたは(4)BDNF、GDNF、NT-3、B27-サプリメントおよびN2-サプリメントが挙げられる。これらの組み合わせを、さらに組み合わせて用いることもできる。
本発明は、前述の方法によって得られたCMTのヒトiPS細胞由来の神経細胞と試験化合物とを接触させ、各指標を用いることで該試験化合物の神経毒性を評価する方法(本発明の評価方法)を提供する。
(1)CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞(CMT-N)と試験化合物とを接触させる工程
(2)当該神経細胞における、以下の(a)~(c):
(a)神経突起中のミトコンドリアの状態
(b)神経突起中のATPレベル
(c)MFN2タンパク質レベル
からなる群より選択される1以上の表現型を検定する工程
(3)試験化合物と接触させなかった対照と比較して、(2)の表現型を増悪させた試験化合物を、ヒトに対して神経毒性を引き起こす可能性がある化合物として選択する工程
試験化合物としては、例えば、細胞抽出物、細胞培養上清、微生物発酵産物、海洋生物由来の抽出物、植物抽出物、精製タンパク質又は粗タンパク質、ペプチド、非ペプチド化合物、合成低分子化合物、天然化合物等が挙げられる。好ましくは、医薬品候補化合物である。
この意味において、本発明の評価方法の好ましい一実施態様においては、健常人iPS細胞由来神経細胞(対照)について、同様に前記工程(1)及び(2)を行い、CMT-Nにおいて、対照に比べて、神経毒性を示す表現型がより顕著である場合か否かを神経毒性のさらなる評価指標とすることができる。
ここで「神経突起中のミトコンドリアの状態」としては、例えば、ミトコンドリア長、ミトコンドリアの形態、ミトコンドリアの凝集、ミトコンドリアの移動性、ミトコンドリア数が挙げられる。ミトコンドリアの長さや形態は、電子顕微鏡観察により検定することができる。また、ミトコンドリアの凝集、ミトコンドリアの移動性は、例えば、運動神経細胞特異的プロモーター(例:HB9プロモーター)の制御下にある蛍光タンパク質遺伝子にミトコンドリア移行シグナル配列を連結したコンストラクトを、神経細胞に導入し、ミトコンドリアを可視化して観察することにより実施することができる。ミトコンドリア数は、Mitotracker等でミトコンドリアを染色して計数することができる。
神経突起中のATPレベルの測定や神経細胞中のMFN2タンパク質レベルの測定は、常法により行うことができる。
iPS細胞の作製と細胞培養
既報の方法に従って、OCT3/4、Sox2、Klf4、L-Myc、Lin28、ドミナントネガティブp53、又はOCT3/4、Sox2、Klf4、L-Myc、Lin28、p53-shRNAを有するエピソーマルベクターを用いて、MFN2遺伝子変異を有するCMT患者(CMT1及びCMT2)及びMFN2に変異を有しない健常人(control 1及びcontrol 2)由来の末梢血単核細胞(PBMC)またはTリンパ球からヒトiPS細胞を作製した(表1)。4ng/mlのベーシック線維芽細胞増殖因子(FGF;Wako Chemicals、Osaka、Japan)およびペニシリン/ストレプトマイシンを含んだヒトiPS細胞培地(霊長類胚性幹細胞培地;ReproCELL、Yokohama、Japan)を用いて、SNLフィーダー層上で細胞を培養した。
ゲノムDNAのPCR増幅およびダイレクトシーケンシング(3500xL Genetic Analyzer、Applied Biosystems、Waltham、MA)によってMFN2遺伝子における一塩基変異のジェノタイピングを行った。
ヒトiPS細胞を単細胞に解離し、100%エタノールで2%濃度に調整したPluronic(シグマ・アルドリッチ、St. Louis、MO)で予め被覆した再懸濁培養用のU底96穴プレート(Greiner Bio-One、Frickenhausen、Germany)で、急速に再凝集させた。胚様体の凝集塊は、5%DFK培地(Dulbecco's改変Eagle's培地/Ham's F12;サーモフィッシャーサイエンティフィック、Pittsburgh、PA)、5%KSR(サーモフィッシャーサイエンティフィック)、NEAA(サーモフィッシャーサイエンティフィック)、L-グルタミン(シグマアルドリッチ)、0.1Mの2-ME(サーモフィッシャーサイエンティフィック)、2mMのドルソモルフィンと共に、神経細胞誘導段階(P1)で12日間培養した。ビタミンAを含まない2%B27(サーモフィッシャーサイエンティフィック)、1mMレチノイン酸、Smoothenedアゴニスト(Sonic Hedgehogシグナル活性化剤)(100ng/ml)、およびFGF 2(12.5ng/ml)(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を添加したニューロベーサル培地(サーモフィッシャーサイエンティフィック)でパターニングを行った後、凝集塊を22日目にMatrigel(コーニング、Tewksbury、MA)でコーティングした培養容器に付着させた。
iPS細胞由来神経細胞に関して、分化した細胞をシトシン・アラビノシド(Ara C)(シグマアルドリッチ)で処理した。Ara Cを除去して3日後、細胞を回収し、溶解した。
細胞(iPS細胞由来神経細胞)を、1%トライトンX-100を含む、TS緩衝液(50mM Tris-HCl, pH7.5、0.15M NaCl、5mMエチレンジアミンテトラ酢酸、5mMエチレングリコール・ビス(β-アミノエチルエーテル)-N,N,N,N-テトラ酢酸、およびプロテアーゼ阻害剤カクテル(ロシュ、Basel、Switzerland))中で、10分間氷上で溶解した。試料を4℃で10,000×gで15分間遠心分離し、上清を保存した。上清のタンパク質濃度は、ビシンコニン酸タンパク質アッセイキット(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて測定した。それぞれの等量のタンパク質を各レーンにロードし、SDS-PAGE(10-20%ポリアクリルアミドゲル、BIO CRAFT、Tokyo、Japan)で電気泳動し、ポリビニリデン・ジフルオライド(PVDF)膜(ミリポア、Billerica、MA)に転写した。当該膜を室温で1時間、5%BSAでブロックし、一次抗体を添加して一晩インキュベートした後、適切な二次抗体を加えた。ECL Prime試薬(GEヘルスケア、Chicago、IL)を検出に使用した。画像はLAS 4000(GEヘルスケア)で取得した。このアッセイで使用した一次抗体は、MFN2(Abcam、Cambridge、UK、1:1,000)およびβ-アクチン(シグマアルドリッチ、1:5,000)であった。
50日目に生細胞の画像を取得した。HB9::Turbo RFP-mito陽性神経細胞を選択し、低速度撮影によって神経突起におけるミトコンドリアの移動性を観察した。生細胞は、x60レンズとインキュベーションチャンバーを備えたCarl Zeiss LSM710顕微鏡を用いて撮影した。撮影の間、細胞を37℃、5%CO2に保った。核酸導入された細胞を選択し、低速度撮影よって神経突起におけるミトコンドリアの移動性を観察した。5分間3秒毎に画像を撮り、キモグラフ分析を行った。キモグラフは、Meta Morph Software(Molecular Device、Sunnyvale、CA)を用いて作成した。移動しているミトコンドリアを、2μmの移動があったかどうかに基づいて、移動または静止のいずれかとして分類した。各キモグラフにおいて、移動しているミトコンドリアを計数した。
既報の方法に従って、フローサイトメトリーにより運動神経細胞を精製した。全ての選別手順は、FACS AriaII(BD Biosciences、Franklin Lakes、NJ)を用いて行った。HB9::GFPレンチウイルスで感染させた後、50日目に、分化した細胞を細胞選別のためにアキュターゼ(Innovative Cell Technologies)により単一細胞に解離させた。HB9::GFP陽性細胞(全選別細胞の約2%)を選別し、マトリゲルでコートした96穴プレート上に、1穴当たり20,000~30,000細胞となるように播種した。翌日、精製された運動神経細胞を室温でPBSで4%に調整したパラホルマリン(PFA)および2%グルタルアルデヒドで固定し、4℃で一晩インキュベートした。超薄切片解析は、透過型電子顕微鏡(日立、東京、日本、H7650)で80kVで行った。神経突起中のミトコンドリア長は、ImageJを用いて7枚のランダムな画像で測定した。
神経体のミトコンドリアを除外して、神経突起中のミトコンドリアを効率的に評価するために、ニューロスフェア・アッセイを導入した。60日目の神経細胞をアキュターゼを用いて解離させ、U底96穴プレートに1穴当たり25,000細胞を集め、10ng/mlのBDNF、10ng/mlのGDNF、および10ng/mlのNT-3を含むニューロベーサル培地で培養した。ニューロスフェアは24時間後に形成され、7日間培養した。形成されたニューロスフェアをラミニンでコートした培養容器上に播種し、付着性ニューロスフェアに由来する神経突起を3日間伸長
させた。ミトコンドリアを染色するために、細胞を37℃で500nMのMitotrackerと共に30分間インキュベートした。PBSで洗浄した後、細胞を4%PFAで固定し、抗βIIIチューブリン抗体で免疫染色した。IN Cell Analyzer 6000(GEヘルスケア)を使用して、細胞画像を撮影した。IN Cell Developerツールボックス・ソフトウェア1.92(GEヘルスケア)を用いて、ニューロスフェア領域を除いた後に、βIIIチューブリン染色された神経突起と共に局在するMitotracker染色された斑点を計数することによって、ミトコンドリア数を評価した。非凝集ミトコンドリアの評価においては、10μm2以下の小さい斑点数をプログラムされたプロトコールによって自動計数し、神経突起の面積で補正した。神経毒性試験の分析では、10μm2よりも大きい斑点数を凝集ミトコンドリアとしてプログラムされたプロトコールによって自動計数し、神経突起の面積で補正した。
1穴あたり10個のニューロスフェアとなるように24穴プレートに播種し、7日間培養した。ピペットで吸引することによってニューロスフェアのコアを除去した後、培地をウェルから除き、神経突起におけるATPレベルをCellTitier-Glo蛍光細胞生存アッセイ(Promega、Fitchburg、WI)を用いて測定した。ATP測定に用いた細胞溶解物中のタンパク質濃度をBCAアッセイによって測定し、それによってATPレベルを補正した。
全てのデータは平均±標準誤差で示している。群の比較は、一元配置又は二元配置のANOVAを用いて行い、続いてScheffeの多重比較検定によって、事後検定を行った。p<0.05を統計的に有意とみなした。
CMT患者から作製したiPS細胞
MFN2遺伝子にH128Y又はR94Qの変異を有する2人のCMT患者、及び2人の健常者からiPS細胞を作製した(図1a、表1)。次にiPS細胞から運動神経細胞を作製した。CMT患者由来のiPS細胞及びそれから作製した運動神経細胞は、MFN2遺伝子に変異を有していた(図1b)。
CMT患者のiPS細胞に由来する運動神経細胞を含む神経細胞群において、MFN2の生化学的特性を、ウェスタンブロット分析によって調べた。CMT患者のiPS細胞に由来する神経細胞群においては、MFN2の増加が見られた(図2a,b)。このことは、MFN2をコードする遺伝子の変異によって、MFN2タンパク質の生化学的性質が変化していることを示す。
CMT患者は、抗癌剤の投与後、深刻な薬剤性の神経障害を起こす。抗癌剤ビンクリスチンがCMT神経細胞に及ぼす影響を調べた。ニューロスフェアに由来する神経突起を、1μMのビンクリスチンに曝し、ミトコンドリアを染色することでその影響を評価した。長時間ビンクリスチンに曝露した場合、CMT神経細胞と対照神経細胞の両方において、神経突起中のミトコンドリア凝集体が見られた。しかし、短時間の曝露においては、CMT神経細胞は対照神経細胞に比べて、その毒性に対する、より高い感受性を示した(図4a、b)。1μMのパクリタキセルも、対照神経細胞に比べて、CMT神経細胞においてミトコンドリア凝集体を増加させた(図5a、5b)。多機能分析システムによって、興味の対象を認識することができ、自動でそれらの大きさを分析することができる。そのシステムを凝集ミトコンドリアの評価にも用いた。
本出願は、2017年5月9日付で日本国に出願された特願2017-93450を基礎としており、ここで言及することによりそれらの内容は全て本明細書に包含される。
Claims (8)
- 以下の(1)~(3)の工程を含む、化合物のヒトに対する神経毒性の評価方法。
(1)CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞と試験化合物とを接触させる工程
(2)当該神経細胞における、以下の(a)~(c):
(a)神経突起中のミトコンドリアの状態
(b)神経突起中のATPレベル
(c)MFN2タンパク質レベル
からなる群より選択される1以上の表現型を検定する工程
(3)試験化合物と接触させなかった対照と比較して、(2)の表現型を増悪させた試験化合物を、ヒトに対して神経毒性を引き起こす可能性がある化合物として選択する工程 - 工程(2)において検定される表現型が、(a)及び/又は(b)の表現型である、請求項1記載の方法。
- 神経突起中のミトコンドリアの状態が、ミトコンドリア長、ミトコンドリアの形態、ミトコンドリアの凝集、ミトコンドリアの移動性、ミトコンドリア数から選択される、請求項1又は2記載の方法。
- 神経細胞が、神経突起を伸長させた付着性ニューロスフェアである、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞の代わりに、健常人のiPS細胞から分化誘導された対照神経細胞を用いて、(1)及び(2)の工程をさらに行い、該対照神経細胞に比べて、CMTのヒトiPS細胞から分化誘導された神経細胞において、(2)の表現型が増悪傾向を示した試験化合物を、ヒトに対して神経毒性を引き起こす可能性がより高い化合物として選択することを含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の方法。
- CMTがMFN2遺伝子に変異を有するものである、請求項1~5のいずれか1項に記載の方法。
- MFN2遺伝子の変異がH128Y又はR94Qである、請求項6記載の方法。
- 神経毒性が軸索変性症である、請求項1~7のいずれか1項に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
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| 今村恵子,iPS細胞を用いた認知症モデルの可能性:iPS細胞モデルとマウスモデルについて,Dementia Japan,2016年10月15日,Vol.30 No.4,Page.525 シンポジウム26 |
| 今村恵子,薬剤副作用検出のためのiPS細胞を用いた神経系毒性評価モデルについて,日本薬学会年会要旨集,2017年03月,Vol.137th,Page.ROMBUNNO.S15-3 |
| 大原亮,患者iPS細胞を用いたCharcot-Marie-Tooth病モデルの確立,末梢神経,2015年12月01日,Vol.26 No.2,Page.289 |
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