JP7011241B2 - Wt1ワクチン - Google Patents
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Description
本願は、2012年12月13日出願の米国仮特許出願第61/737,094号に対する優先権を主張するものである。この出願の全教示内容は、参照することで本明細書に組み込まれる。
1.定義
抗原、その断片、その変異体、またはそれらの組み合わせを含むワクチンが本明細書において提供される。ワクチンは、抗原に対する免疫反応を哺乳類内で生成することができる。ワクチンは、以下により詳細に記載されるように、プラスミドまたは複数のプラスミドを含み得る。ワクチンは、治療的または予防的免疫反応を誘導することができる。
上述のように、ワクチンは、抗原を含み得る。抗原は、ウィルムス腫瘍抑制遺伝子1(WT1)、その断片、その変異体、またはその組み合わせであってもよい。WT1は、プロリン/グルタミンリッチDNA-結合領域をN-末端に、かつ、4つの亜鉛フィンガーモチーフをC-末端に含む転写因子である。WT1は、泌尿生殖器系の正常な発達に関与しており、多くの因子、例えば、腫瘍抑制因子として知られるp53、および細胞毒性薬による治療後に多数の部位でWT1を切断するセリンプロテアーゼHtrA2と相互作用する。
ワクチンは、抗原をコードする異種核酸を含む1つ以上のベクターを含み得る。1つ以上のベクターは、哺乳類内において免疫反応を誘発するのに有効な量の抗原を発現することができる。ベクターは、抗原をコードする異種核酸を含み得る。ベクターは、複製起点を含む核酸配列を有し得る。ベクターは、プラスミド、バクテリオファージ、細菌人工染色体、または酵母人工染色体であり得る。ベクターは、自己複製染色体外ベクターまたは宿主ゲノムに組み込まれるベクターのいずれかであり得る。
ベクターは、環状プラスミドまたは線状核酸であり得る。環状プラスミドおよび線状核酸は、適切な対象細胞内において特定のヌクレオチド配列の発現をもたらすことができる。ベクターは、抗原コードヌクレオチド配列に機能的に連結しているプロモーターを有してもよく、これは、終止シグナルに機能的に連結し得る。ベクターは、ヌクレオチド配列の適切な翻訳に必要な配列も含み得る。対象のヌクレオチド配列を含むベクターは、キメラであってもよく、これは、その成分の少なくとも1つが、その他の成分の少なくとも1つに対して異種であることを意味する。発現カセットにおけるヌクレオチド配列の発現は、構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターの制御下であってもよく、宿主細胞がいくつかの特定の外部刺激に晒された場合にのみ転写を開始する。多細胞生物の場合、プロモーターは、特定の組織または臓器もしくは発生の段階に特異的であり得る。
ベクターは、プラスミドであり得る。プラスミドは、抗原をコードする核酸で細胞をトランスフェクトするのに有用であり得、形質転換された宿主細胞を、抗原の発現が起こる条件下で培養し、維持する。
ベクターは、環状プラスミドであってもよく、これは、標的細胞を統合によって細胞性ゲノムに形質転換してもよく、あるいは、染色体外に存在してもよい(例えば、複製起点をもつ自律複製プラスミド)。
ベクターは、プロモーターを有し得る。プロモーターは、遺伝子発現を駆動し、単離核酸の発現を調節することができる任意のプロモーターであり得る。かかるプロモーターは、DNA依存RNAポリメラーゼ経由の転写に要するシス作用配列要素であり、本明細書に記載の抗原配列を転写する。異種核酸の発現の指示に用いられるプロモーターは、特定の用途に依って選択される。プロモーターは、ベクターの転写開始部位から、これがその天然の設定における転写開始部位からの距離であるのとほぼ同じ距離に配置され得る。しかしながら、この距離の変動は、プロモーター機能の喪失を伴うことなく対応し得る。
本明細書で提供されるのは、本明細書に開示されているDNAワクチンを含むベクターを調製する方法である。ベクターを、哺乳類発現プラスミドにサブクローニング最終的なステップの後、当該技術分野で公知の方法を用いて、大規模発酵タンクで細胞培養物に接種するのに用いることができる。
ワクチンは、薬学的に許容しうる賦形剤をさらに含んでいてもよい。薬学的に許容しうる賦形剤は、ビヒクル、担体、または希釈剤としての機能的分子であり得る。薬学的に許容しうる賦形剤は、界面活性剤を含みうるトランスフェクション促進剤、例えば免疫刺激複合体(ISCOMS)、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリル脂質AをはじめとするLPS類似体、ムラミルペプチド、キノン類似体、スクアレンおよびスクアレンなどの小胞、ヒアルロン酸、脂質、リポソーム、カルシウムイオン、ウイルスタンパク質、ポリアニオン、ポリカチオン、もしくはナノ粒子、または他の公知のトランスフェクション促進剤であり得る。
免疫反応を誘導することができる標的免疫原に対して特に有効となるエピトープを含む遺伝的構築物および抗原を供給するためのワクチンを送達する方法が本明細書において提供される。治療的免疫反応および予防的免疫反応を誘導するためのワクチンを送達する方法またはワクチン投与の方法が提供され得る。ワクチン投与過程は、哺乳類内で抗原に対する免疫反応を生成し得る。ワクチンは、哺乳類の免疫系の活性を調節し、免疫反応を高めるために、個体にワクチンを送達し得る。ワクチンの送達は、細胞内で発現し、その上で免疫系が認識し、細胞性反応、体液性反応、または細胞性反応と体液性反応を誘導する細胞表面に送達される核酸分子としての抗原のトランスフェクションであり得る。哺乳類に先に考察したようなワクチンを投与することにより、抗原に対する免疫反応を哺乳類内で誘導または誘発するために、ワクチンの送達を用いることができる。
他のタンパク質および/またはCCL20、α-インターフェロン、γ-インターフェロン、血小板由来増殖因子(PDGF)、TNFα、TNFβ、GM-CSF、上皮成長因子(EGF)、皮膚T細胞誘因性ケモカイン(CTACK)、上皮胸腺発現ケモカイン(TECK)、粘膜関連上皮ケモカイン(MEC)、IL-12、欠失され、かつ、IgEのシグナルペプチドなどの異なるシグナルペプチドを任意に含むシグナル配列を有するIL-15を含むIL-15、MHC、CD80、CD86、IL-28、IL-l、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-10、IL-18、MCP-1、MIP-lα、MIP-1β、IL-8、RANTES、L-セレクチン、P-セレクチン、E-セレクチン、CD34、GlyCAM-1、MadCAM-1、LFA-1、VLA-1、Mac-1、pl50.95、PECAM、ICAM-1、ICAM-2、ICAM-3、CD2、LFA-3、M-CSF、G-CSF、変異体型IL-18、CD40、CD40L、血管増殖因子、線維芽細胞増殖因子、IL-7、神経成長因子、血管内皮細胞増殖因子、Fas、TNF受容体、Flt、Apo-1、p55、WSL-1、DR3、TRAMP、Apo-3、AIR、LARD、NGRF、DR4、DRS、KILLER、TRAIL-R2、TRICK2、DR6、カスパーゼICE、Fos、c-jun、Sp-1、Ap-1、Ap-2、p38、p65Rel、MyD88、IRAK、TRAF6、IkB、不活性NIK、SAP K、SAP-I、JNK、インターフェロン応答遺伝子、NFkB、Bax、TRAIL、TRAILrec、TRAILrecDRC5、TRAIL-R3、TRAIL-R4、RANK、RANK LIGAND、Ox40、Ox40 LIGAND、NKG2D、MICA、MICB、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2E、NKG2F、TAPI、TAP2、およびそれらの機能的断片またはそれらの組み合わせをコードする遺伝子と組み合わせてワクチンを投与することができる。いくつかの実施形態において、以下の核酸分子および/またはタンパク質の1つ以上と組み合わせてワクチンを投与する:CCL20、IL-12、IL-15、IL-28、CTACK、TECK、MEC、およびRANTES、またはそれらの機能的断片の1つ以上をコードするコード配列を含む核酸分子からなる群から選択される核酸分子、ならびに、CCL20、IL-12タンパク質、IL-15タンパク質、IL-28タンパク質、CTACKタンパク質、TECKタンパク質、MECタンパク質、RANTESタンパク質、またはそれらの機能的断片からなる群から選択されるタンパク質。
ワクチンを、薬学技術分野の当業者に周知の標準的な技術に従って調製することができる。かかる組成物を、特定の対象の年齢、性別、体重、および状態、ならびに投与経路などの要因を考慮して、医学分野の当業者に周知の用量および技術によって投与することができる。対象は、ヒト、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ネコ、イヌ、ネズミ、またはマウスなどの哺乳類であり得る。
また、本明細書で提供されるのは、ワクチンをそれを必要とする対象において投与す方法である。疾患は、癌、例えば、ウィルムス腫瘍、ウィルムス腫瘍から生じる転移性癌、およびWT1を発現する癌または腫瘍であり得る。ワクチンは、上述の送達方法で対象に投与することができる。ワクチンを対象に投与することにより、対象において免疫反応を誘導するかまたは誘発することができる。特に、ワクチンを対象に投与することにより、対象において体液性および/または細胞性の免疫反応を誘導または誘発することができる。
以下に実施例を用いて本発明をさらに説明する。これらの実施例は本発明の好ましい実施形態を示すものであるが、説明のためだけに記載されるものと理解されるべきである。上記の説明及びこれらの実施例から、当業者であれば、本発明の必須の特徴を確認することができ、本発明の精神及び範囲から逸脱することなく、種々の用途及び条件に適合させるために本発明の種々の変更例及び改変例を作ることができる。したがって、本明細書中に示され説明されているものに加え、本発明の種々の改変例が上記の説明から当業者には明らかであろう。そのような改変例も特許請求の範囲に含まれることが意図される。
最適化WT-1
WT1免疫原を生成するための段階的アプローチを開発した。まず、単一の全長転写産物のみが産生されるようにRNA構造の変化を設計することで、格段に制御された表現型を持つ免疫原を作成した。配列は、改変されたコドン使用選択も含み、RNA構造を5’末端で変化させて、in vivo発現を高めた。従って、WT1免疫原は、発現用に最適化された。この改良型免疫原用の発現カセットをコードしたプラスミドを生成し、潜在的な免疫性およびT細胞ならびにB細胞応答を生成する能力について動物で試験した。エレクトロポレーションによるin vivo送達を高めるようにこのプラスミドワクチンを製剤化した。in vivo送達には特定の条件を用いた。
コンセンサスWT1
上述のように、最適化WT1免疫原(すなわち、実施例1に記載のようにWT1遺伝子を最適化した)は、体液性および細胞性免疫反応を誘導した。WT1免疫原配列をさらに標的にし、改変するため、コンセンサスWT1免疫原を生成した。
ジンクフィンガー改変および除去
上記実施例2に記載のコンセンサスWT1免疫原をさらに改変し、WT1免疫原の免疫原性を改善した。特に、WT1免疫原のカルボキシ末端(C末端)に位置するジンクフィンガーを破壊するようにコンセンサスWT1免疫原を改変した。これらの改変には、2つのアミノ末端(N末端)ジンクフィンガーにおける亜鉛イオン(すなわち、CCHHモチーフ)に配位している残基を置換して、改変ジンクフィンガーを持つコンセンサスWT1免疫原(本明細書では、改変ジンクフィンガーを有するCON WT1またはConWT1-Lとも呼ばれる)を生成することを含んだ(図4および図5)。CCHHモチーフのCおよびH残基をグリシン(G)と置き換えた。免疫グロブリンE(IgE)リーダー配列をConWT1-LペプチドのN末端上に配置した。ConWT1-Lは、配列番号1によりコードされ、配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する(それぞれ、図6Aおよび図6B)。
ConWT1-LおよびConWT1-Sをコードする構築物の発現分析
ConWT1-LおよびConWT1-Sをコードする核酸配列をpVAX1ベクターに別々に配置した(ライフテクノロジーズ社、カリフォルニア州カールズバッド)。得られたベクターは、それぞれ、WT1-pVAX-LおよびWT1-pVAX-Sと名づけられた。WT1-pVAX-LおよびWT1-pVAX-Sは、pVAX1と共に、細胞内でトランスフェクトし、これらのベクターからConWT1-LおよびConWT1-Sの発現を確認した。pVAX1は陰性対照として使用した。
ConWT1-LおよびConWT1-Sをコードする構築物により誘導された免疫反応
ConWT1-LおよびConWT1-Sをコードする構築物が免疫反応を誘導したかどうか判定するため、C57BL/6マウスを25μgのWT1-pVAX-LまたはWT1-pVAX-Sでそれぞれ免疫化した。C57BL/6マウスを25μgのWT1-pVAX(実施例1に記載のWT1をコードする最適化構築物)または25μgのWT1-pCDNA(WT1をコードする非最適化構築物)でも免疫化した。未感作マウスを対照として使用した。
Claims (33)
- リーダー配列を有しない配列番号2によって表されるタンパク質をコードする核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号2によって表されるタンパク質の断片をコードする核酸配列であって、当該断片はリーダー配列を有しない配列番号2によって表されるタンパク質の全長の少なくとも90%を含む断片を含む核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号2の全長にわたってリーダー配列を有しない配列番号2によって表されるタンパク質と少なくとも98%同一であるタンパク質をコードする核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号2によって表されるタンパク質と少なくとも98%同一であるタンパク質の断片をコードする核酸配列であって、当該断片の長さは、リーダー配列を有しない配列番号2によって表されるタンパク質の全長の少なくとも90%である、核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号4によって表されるタンパク質をコードする核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号4によって表されるタンパク質の断片をコードする核酸配列であって、当該断片がリーダー配列を有しない配列番号4によって表されるタンパク質の全長の少なくとも90%を含む、核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号4の全長にわたってリーダー配列を有しない配列番号4によって表されるタンパク質と少なくとも98%同一であるタンパク質をコードする核酸配列、および
リーダー配列を有しない配列番号4によって表されるタンパク質と少なくとも98%同一であるタンパク質の断片をコードする核酸配列であって、当該断片の長さはリーダー配列を有しない配列番号4によって表されるタンパク質の全長の少なくとも90%である、核酸配列
からなる群から選択される1つ以上の核酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドをコードする単離核酸分子。 - リーダー配列を有しない配列番号1の核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号1の断片であって、当該断片がリーダー配列を有しない配列番号1の全長の少なくとも90%を含む、断片、
リーダー配列を有しない配列番号1の全長にわたってリーダー配列を有しない配列番号1と少なくとも98%同一である核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号1と少なくとも98%同一である核酸配列の断片であって、当該断片の長さがリーダー配列を有しない配列番号1の全長の少なくとも90%である、断片、
リーダー配列を有しない配列番号3の核酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号3の断片であって、当該断片がリーダー配列を有しない配列番号3の全長の少なくとも90%を含む、断片、
リーダー配列を有しない配列番号3の全長にわたってリーダー配列を有しない配列番号3と少なくとも98%同一である核酸配列、および
リーダー配列を有しない配列番号3と少なくとも98%同一である核酸配列の断片であって、当該断片の長さはリーダー配列を有しない配列番号3の全長の少なくとも90%である、断片
からなる群から選択される1つ以上の核酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドをコードする単離核酸分子。 - 前記分子が、プラスミドまたはウイルスベクターに組み込まれる請求項1または2に記載の核酸分子。
- 請求項1に記載の1つ以上の核酸分子を含む組成物。
- 請求項2に記載の1つ以上の核酸分子を含む組成物。
- 請求項1に記載の1つ以上の核酸分子を含むワクチン。
- 請求項2に記載の1つ以上の核酸分子を含むワクチン。
- WT1発現腫瘍を有する個体を治療するための医薬組成物であって、
WT1発現腫瘍の増殖を遅らせる、WT1発現腫瘍を縮小させるかもしくは取り除くのに有効な量の請求項6または7に記載のワクチンを含む、医薬組成物。 - 個体内のWT1発現腫瘍を予防するための医薬組成物であって、
WT1発現腫瘍の形成または増殖を阻害するのに有効な量の請求項6または7に記載のワクチンを含む、医薬組成物。 - リーダー配列を有しない配列番号2のアミノ酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号2の断片であって、当該断片がリーダー配列を有しない配列番号2の全長の少なくとも90%を含む、断片、
リーダー配列を有しない配列番号2の全長にわたってリーダー配列を有しない配列番号2と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号2と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列の断片であって、当該断片の長さはリーダー配列を有しない配列番号2の全長の少なくとも90%である、断片、
リーダー配列を有しない配列番号4のアミノ酸配列、
リーダー配列を有しない配列番号4の断片であって、当該断片がリーダー配列を有しない配列番号4の全長の少なくとも90%を含む、断片、
リーダー配列を有しない配列番号4の全長にわたってリーダー配列を有しない配列番号4と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列、および
リーダー配列を有しない配列番号4と少なくとも98%同一であるアミノ酸配列の断片であって、当該断片の長さはリーダー配列を有しない配列番号4の全長の少なくとも90%である、断片
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するタンパク質。 - ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドをコードする核酸分子を含むワクチンであって、
(a)前記核酸分子が、リーダー配列を有しない配列番号1に記載の核酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有する核酸配列を含む;または、
(b)前記核酸分子が、リーダー配列を有しない配列番号3に記載の核酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有する核酸配列を含むワクチン。 - (a)リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチド;または、
(b)リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチド
をさらに含む請求項11に記載のワクチン。 - 前記核酸分子が、発現ベクターを含む請求項11に記載のワクチン。
- 薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含む請求項11に記載のワクチン。
- アジュバントをさらに含む請求項11に記載のワクチン。
- ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドをコードする核酸分子を含むワクチンであって、
(a)前記核酸分子が、リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチドをコードし;または、
(b)前記核酸分子が、リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチドをコードするワクチン。 - (a)リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチド;または、
(b)リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチド
をさらに含む請求項16に記載のワクチン。 - 前記核酸分子が、発現ベクターを含む請求項16に記載のワクチン。
- 薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含む請求項16に記載のワクチン。
- アジュバントをさらに含む請求項16に記載のワクチン。
- リーダー配列を有しない配列番号1に記載の核酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドをコードする核酸分子。
- リーダー配列を有しない配列番号3に記載の核酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドをコードする核酸分子。
- リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチド。
- リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列を含む、ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチド。
- 抗原を含むワクチンであって、前記抗原が、リーダー配列を有しない配列番号1またはリーダー配列を有しない配列番号3によりコードされるワクチン。
- 前記抗原が、リーダー配列を有しない配列番号1によりコードされる請求項25に記載のワクチン。
- 前記抗原が、リーダー配列を有しない配列番号3によりコードされる請求項25に記載のワクチン。
- 前記抗原が、リーダー配列を有しない配列番号2またはリーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列を含む請求項25に記載のワクチン。
- 前記抗原が、リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列を含む請求項28に記載のワクチン。
- 前記抗原が、リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列を含む請求項28に記載のワクチン。
- ウィルムス腫瘍免疫原としての機能を有するペプチドを含むワクチンであって、
(a)前記ペプチドが、リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含み;または、
(b)前記ペプチドが、リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列の全長にわたって少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むワクチン。 - 前記ペプチドが、リーダー配列を有しない配列番号2に記載のアミノ酸配列を含む請求項31に記載のワクチン。
- 前記ペプチドが、リーダー配列を有しない配列番号4に記載のアミノ酸配列を含む請求項31に記載のワクチン。
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