JP6996709B2 - 画像処理方法、画像判定方法、プログラムおよび記録媒体 - Google Patents
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Description
Ax2+By2+Cz2+Dxy+Exz+Fyz+Gx+Hy+Iz+J=0
から、例えば最小二乗法によって各定数A~Jを求めることにより、当該領域を近似する楕円体を特定することができる。図9(a)に点線で示すように、細胞C1に対応する近似楕円体E1は、実線で示される細胞C1の露出表面の形状を近似したものであり、点線で示される、領域分割によって作成された境界とは必ずしも一致しない。すなわち、近似楕円体E1は、他の細胞との接触による細胞C1の変形による影響を受けない。細胞C2に対応する近似楕円体E2についても同様である。
x=r・sinθ・cosφ
y=r・sinθ・sinφ
z=r・cosθ
の関係がある。
10 保持部
20 撮像ユニット
21 光源
22 ビームスプリッタ
24 基準ミラー
26 光検出器
30 制御ユニット
33 信号処理部
34 3D復元部
352 表示部
Sp 試料
Claims (12)
- 培養された胚を光干渉断層撮像して求められた、前記胚の三次元像に対応する原画像データを取得する工程と、
前記原画像データに基づき、前記三次元像を複数の領域に領域分割する工程と
を備え、
前記領域分割する工程では、
前記三次元像に対しLocal Thickness演算を実行して前記三次元像に含まれるオブジェクトの大きさを指標する指標値を求め、該指標値が所定の第1閾値より大きい領域と小さい領域とに前記三次元像を分割し、
分割された領域の各々を、Watershedアルゴリズムにより分割する、
画像処理方法。 - 前記Local Thickness演算により前記三次元像内の各点に与えられる階調値を前記指標値とする請求項1に記載の画像処理方法。
- 前記領域分割する工程では、前記複数の領域の間における境界を画定し、前記原画像データが表す前記三次元像を画定された境界で複数に分割する請求項1または2に記載の画像処理方法。
- 分割された前記領域について、当該領域の表面のうち他の領域と接していない露出表面を楕円体近似する請求項1ないし3のいずれかに記載の画像処理方法。
- 前記楕円体近似により求められた近似楕円体の表面と前記露出表面との乖離度を指標する指標値を算出する請求項4に記載の画像処理方法。
- 前記露出表面および前記近似楕円体の表面の各位置の座標を前記近似楕円体の重心を原点とする極座標によって表し、同一動径上にある前記露出表面上の点と前記近似楕円体の表面上の点との距離に基づき前記指標値を求める請求項5に記載の画像処理方法。
- 分割された前記領域内の画素各々の画素値のヒストグラムを算出する請求項1ないし6のいずれかに記載の画像処理方法。
- 請求項1ないし7のいずれかに記載の画像処理方法により、前記胚の三次元像を複数の領域に分割し、前記複数の領域のうち前記指標値が前記第1閾値より大きい第1領域を割球の集合体と判定する画像判定方法。
- 前記第1領域から分割された1つの領域を1つの細胞と判定する請求項8に記載の画像判定方法。
- 前記指標値が前記第1閾値より小さい第2領域から分割された領域のうち、球形度が第2閾値より大きい領域をフラグメントと判定する請求項8または9に記載の画像判定方法。
- コンピュータに、
培養された胚を光干渉断層撮像して求められた、前記胚の三次元像に対応する原画像データを取得する工程と、
前記原画像データに基づき、前記三次元像を複数の領域に領域分割する工程と
を備え、
前記領域分割する工程では、
前記三次元像に対しLocal Thickness演算を実行して前記三次元像に含まれるオブジェクトの大きさを指標する指標値を求め、該指標値が所定の第1閾値より大きい領域と小さい領域とに前記三次元像を分割し、
分割された領域の各々を、Watershedアルゴリズムにより分割する、
画像処理を実行させるためのプログラム。 - 請求項11に記載のプログラムを記録した、コンピュータ読み取り可能な記録媒体。
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