JP6422961B2 - 改善された高効率ナノ粒子型オリゴヌクレオチド構造体およびその製造方法 - Google Patents
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Description
Q−(Am−J)n−X−R−Y−B 構造式(1)
Q−(J−Am)n−X−R−Y−B 構造式(2)
Qは(Li−Zj)またはP−J1−J2であり、
Lは受容体媒介内包作用(receptor−mediated endocytosis,RME)を介してターゲット細胞内在化(internalization)を増進させる受容体と特異的に結合する特性を持つリガンド(ligand)、
Zは単純共有結合または親水性物質ブロック内の親水性物質単量体とリガンドの結合を媒介するリンカーで、
iは0〜5の整数、好ましくは0〜3の整数、jは0または1を意味して、但しiが0である場合、jも必ず0であり、
Pは、アミン基またはポリヒスチジン基を意味して、
J1とJ2は、独立して単純共有結合、またはアミン基またはポリヒスチジン基と親水性物質との間の結合を媒介するリンカーである。
(Li−Zj)−(Am−J)n−X−R−Y−B 構造式(3)
(Li−Zj)−(J−Am)n−X−R−Y−B 構造式(4)
P−J1−J2−(Am−J)n−X−R−Y−B 構造式(5)
P−J1−J2−(J−Am)n−X−R−Y−B 構造式(6)
前記構造式(5)および構造式(6)でJ1とJ2はリンカーであり、J1およびJ2は独立して単純共有結合、C2−12のアルキル、アルケニル、アルキニル、PO3 −、SO3およびCO2で構成された群から選択されることが好ましいが、これに限定されず、使用される親水性物質によって本発明の目的に合致するJ1とJ2はいかなるリンカーでも使用できることは当業者には自明である。
(1)前記構造式(20)の固形支持体に親水性物質ブロックをn回繰り返し共有結合させる段階;
(2)前記親水性物質ブロックが結合された固形支持体をベースにオリゴヌクレオチド一本鎖を合成する段階;
(3)前記親水性物質ブロックが結合されたオリゴヌクレオチド5’末端に疎水性物質を共有結合させる段階;および
(4)固形支持体からオリゴヌクレオチド構造体を分離する段階;
を含む。
(1)前記構造式(20)の固形支持体に親水性物質ブロックを結合する段階をn回繰り返す段階;
(2)前記親水性物質ブロックが結合された固形支持体をベースにRNA一本鎖を合成する段階;
(3)前記親水性物質ブロックが結合されたRNA5’末端に疎水性物質を共有結合させる段階;
(4)固形支持体からRNA−高分子構造体および相補的配列のRNA一本鎖を分離する段階;および
(5)前記RNA−高分子構造体と相補的配列のRNA一本鎖をアニーリングして二本鎖を形成する段階;
を含む。
より好ましくは
(1)前記構造式(20)の固形支持体をベースに親水性物質ブロックを結合させる段階;
(2)(1)段階をn−1回繰り返す段階;
(3)前記親水性物質ブロックが結合された固形支持体をベースにRNA一本鎖を合成する段階;
(4)前記RNA一本鎖5’末端に疎水性物質を結合させる段階;
(5)合成が完了すると、固形支持体からRNA−高分子構造体および相補的な配列のRNA一本鎖を分離精製する段階;および
(6)製造されたRNA−高分子構造体と相補的な配列のRNA一本鎖をアニーリング(annealing)を介して二重らせんオリゴRNA構造体を製造する段階;
を含む。
(1)構造式(20)の固形支持体をベースに親水性物質ブロックをn回繰り返し共有結合させる段階;
(2)段階(1)で合成されたリガンド−親水性物質ブロックが結合された固形支持体をベースにRNA一本鎖を合成する段階;
(3)段階(2)で収得された物質に5’末端に疎水性物質を共有結合させる段階;
(4)合成が完了すると、固形支持体(CPG)からリガンドが付着されたRNA−高分子構造体一本鎖および相補的な配列のRNA一本鎖を分離精製する段階;および
(5)前記リガンドが結合されたRNA−高分子構造体と相補的配列のRNA一本鎖をアニーリングして二本鎖を形成する段階;
を含む。
(1)官能基が結合されている固形支持体、好ましくはCPGを利用してオリゴヌクレオチド一本鎖を合成する段階;
(2)前記オリゴヌクレオチドが結合された固形支持体をベースに親水性物質単量体を結合する段階をn回繰り返す段階;
(3)前記親水性物質が結合されたオリゴヌクレオチド5’末端に構造式(21)に係る物質を共有結合させる段階;
(4)固形支持体からオリゴヌクレオチド高分子構造体を分離する段階;および
(5)前記段階(4)で収得されたオリゴヌクレオチド構造体3’末端に結合された官能基を介して疎水性物質を共有結合させる段階;
を含む。
(1)官能基が結合されている固形支持体、好ましくはCPGを利用してオリゴヌクレオチド一本鎖を合成する段階;
(2)前記オリゴヌクレオチドが結合された固形支持体をベースに親水性物質単量体を結合する段階をn回繰り返す段階;
(3)前記親水性物質が結合されたオリゴヌクレオチド5’末端に構造式(21)に係る物質を共有結合させる段階;
(4)固形支持体からRNA−高分子構造体および相補的配列のRNA一本鎖を分離する段階;
(5)前記段階(4)で収得されたオリゴヌクレオチド構造体3’末端に結合された官能基を介して疎水性物質を共有結合させる段階;および
(6)前記RNA−高分子構造体と相補的配列のRNA一本鎖をアニーリングして二本鎖を形成する段階;
を含む。
本発明に係るオリゴヌクレオチド構造体は、いずれも同じ親水性物質の部分を持つことができて、オリゴヌクレオチドに結合される親水性物質が合成ポリマーである時発生する多分散的特性による品質管理(Quality Control)等の問題を画期的に改善することができ、多分散性親水性物質を利用した既存精製工程に比べて簡単かつ合成費用を節減することができて、オリゴヌクレオチド構造体の物質分析が容易である長所がある。また、親水性物質ブロックの繰り返し回数および各親水性物質ブロック内の親水性物質単量体の繰り返し回数調節を介してナノ粒子の大きさ調節が可能である。
リガンドが結合された二重らせんオリゴRNA構造体を製造するために二重らせんオリゴRNA構造体に結合が可能なリガンド物質であるN−アセチルガラクトサミンCPGを製造した。
N−アセチルガラクトサミン(N−Acetyl Galactosamine,NAG)を二重らせんオリゴRNA構造体に結合するために、図2に示した通り1−ヘキサ(エチレングリコール)−N−アセチルガラクトサミン−CPG(1−Hexa(Ethylene Glycol)−N−Acetyl Galactosamine−CPG(Controlled Pore Glass))を製造した。
出発物質塩酸ガラクトサミン(Galactosamine hydrochloride,Sigma Aldrich,米国)(10g,46.37mmol)、アセトニトリル(150mL)、トリエチルアミン(556.48mL)を混合して1時間還流する。ゆっくり常温で冷却して、氷水を利用して0℃に冷却した後、無水酢酸(43.83mL、463.70mmol)を滴加した。滴加が終わった後、氷水を除去して、24時間常温で撹はんした。反応が完了すると、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液でpHが中性になる時までゆっくり投入した。pHが中性になった後2時間常温で撹はんして生成された固体をろ過して、ろ過物をエチルアセテート、蒸溜水、エチルアセテートの順に洗浄した。固体を真空乾燥して1,3,4,6−テトラアセチル−N−アセチルガラクトサミン(9.792g,56%)を得た(図2参照)。
前記実施例1−1−1で得られた1,3,4,6−テトラアセチル−N−アセチルガラクトサミン(6.77g、18.04mmol)、塩化鉄III(3.80g、23.45mmol)、メチレンクロライド(200mL)を混合して常温で撹はんした。10分間撹はんした後、ヘキサ(エチレングリコール)(5.90mL、4.82mmol)を投入して2時間還流した。反応が完了すると、セライトを使用してろ過し、ろ過物をメチレンクロライドで洗浄した。ろ過液を減圧濃縮して、エチルアセテートと蒸溜水を入れて水層を抽出した。獲得された水層をメチレンクロライドで抽出して有機層を集めて無水硫酸マグネシウムで乾燥してろ過した。ろ過液を減圧濃縮して、真空乾燥して3,4,6−トリアセチル−1−ヘキサ(エチレングリコール)−N−アセチルガラクトサミン(2.24g、74.9%)を得た(図3参照)。
前記実施例1−1−2で得られた3,4,6−トリアセチル−1−ヘキサ(エチレングリコール)−N−アセチルガラクトサミン(13.66g、22.33mmol)をアセトニトリル(220mL)に投入して撹はんする。N,N’−ジサクシミジルカルボネート(9.15g、35.73mmol)、トリエチルアミン(9.90mL、71.46mmol)を投入して、24時間撹はんする。3−アミノ−1,2−プロパンジオール(3.26g、35.73mmol)をN,N’−ジメチルホルムアミド60mLに希釈して、トリエチルアミン(4.95mL、35.73mmol)を投入した後、反応溶液に入れて24時間撹はんする。減圧濃縮して、真空乾燥する。カラムで分離して、溶液を減圧濃縮する。真空乾燥して3,4,6−トリアセチル−1−[ヘキサ(エチレングリコール)−N’−1’,2’−プロパンジオール]−N−アセチルガラクトサミン(9.23g、56.7%)を得る(図4参照)。
前記実施例1−1−3で得られた3,4,6−トリアセチル−1−[ヘキサ(エチレングリコール)−N’−1’,2’−プロパンジオール]−N−アセチルガラクトサミン(9.23g(12.67mmol、1eq)をメチレンクロライド(120mL)に投入して撹はんする。トリエチルアミン5.27mL(38.00mmol、3eq)を投入する。ディエムティクロライド(4.72g、13.93mmol)をメチレンクロライド(20mL)に希釈して投入して、24時間の間撹はんする。減圧濃縮する。エチルアセテートで抽出する。無水硫酸ナトリウムで乾燥して、ろ過する。ろ過液を減圧濃縮する。カラムで分離して、溶液を減圧濃縮する。真空乾燥して望む3,4,6−トリアセチル−1−[ヘキサ(エチレングリコール)−N’−1’−メトキシ−ジメトキシトリチル−2’−プロパノール]−N−アセチルガラクトサミン(7.77g、59.5%)を得る。
前記実施例1−1−4で得られた3,4,6−トリアセチル−1−[ヘキサ(エチレングリコール)−N’−1’−メトキシ(ジメトキシトリチル)−2’−プロパノール]−N−アセチルガラクトサミン(7.72g、7.487mmol)、ピリジン(70mL)を投入して撹はんする。無水酢酸(3.75g、37.486mmol)、DMAP(0.46g、3.745mmol)を投入して、60〜70℃で24時間撹はんする。減圧濃縮して、真空乾燥する。エチルアセテートで抽出する。無水硫酸ナトリウムで乾燥して、ろ過する。ろ過液を減圧濃縮する。カラムで分離して、溶液を減圧濃縮する。真空乾燥して望む3,4,6−トリアセチル−1−[ヘキサ(エチレングリコール)−N’−1’−メトキシ(ジメトキシトリチル)−2’−プロポキシ(サクシニックアシッド]−N−アセチルガラクトサミン(7.61g、89.9%)を得る。
前記実施例1−1−5で得られた3,4,6−トリアセチル−1−[ヘキサ(エチレングリコール)−N’−1’−メトキシ(ジメトキシトリチル)−2’−プロポキシ(サクシニックアシッド)]−N−アセチルガラクトサミン(0.34g、0.30mmol)、LCAA−CPG(1000Å)(5g)、ビス−2−ヨウ素−3−オキサゾリジニルホスホリッククロライド(0.2g、0.45mmol)、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(0.06g、0.45mmol)、メチレンクロライド(50mL)を投入する。トリエチルアミン(0.03mL、2.25mmol)を投入する。24時間反応させる。ろ過してメタノールで洗浄する。乾燥して望む3,4,6−トリアセチル−1−ヘキサ(エチレングリコール)−N−アセチルガラクトサミン−CPGのCapping前CPG化合物(4.91g)を得る。
前記実施例1−1−6で得られた3,4,6−トリアセチル−1−ヘキサ(エチレングリコール)−N−アセチルガラクトサミン−CPGのCapping前CPG化合物(4.86g)、ピリジン(30mL)、無水酢酸(6.02mL、63.70mmol)、1−メチルイミダゾール(5.08mL、63.70mmol)を投入した後、24時間反応する。ろ過して、メタノールで洗浄する。ろ過物を真空乾燥して望む化合物3,4,6−トリアセチル−1−ヘキサ(エチレングリコール)−N−アセチルガラクトサミン−CPG(1−Hexa(Ethylene Glycol)−N−Acetyl Galactosamine−CPG(Controlled Pore Glass)(2.8g)を得る。
以下、実施例ではサバイビンを抑制するために、サバイビンに対する二重らせんオリゴRNAを使った。サバイビンは今までテストされた多くの新生腫瘍や形質転換された細胞株で共通して発現するタンパク質であり、抗癌治療において重要なターゲットになると予測されている(Survivin: a new target for anti-cancer therapy. Cancer Treat Rev. 2009 Nov; 35(7):553-62)。
(配列番号1)5’−AAG GAG AUC AAC AUU UUC A−3’
(配列番号2)5’−CUU ACG CUG AGU ACU UCG A−3’
前記実施例2で製造されたmonoSAMiRNA二重らせんオリゴRNAの末端に結合された疎水性物質の間の疎水性相互作用によってナノ粒子、すなわちミセル(micelle)を形成するようになる(図1参照)。
単一分子に疎水性基と親水性基が共に入っている両親媒性物質(amphiphile)は、界面活性剤になれるが、界面活性剤は、水溶液に溶解すると、疎水性基は水との接触を避けるために中心に集まって、親水性基は外側へ向かってミセルを形成するようになる。この時、最初にミセルを形成するようになる濃度を臨界ミセル濃度(critical micelle concentration,CMC)という。蛍光染料を利用してCMCを測定する方法は、ミセルが形成される前/後に蛍光染料の蛍光値(intensity)グラフ曲線の傾きが急激に変わる特性に基づいたものである。monoSAMiRNAで構成されたナノ粒子の臨界ミセル濃度測定のために、蛍光染料である0.04mM DPH(1,6−Diphenyl−1,3,5−hexatriene,SIGMA,USA)を準備する。monoSAMiRNA(n=1)1nmole/μLを0.0977μg/mLで最高50μg/mLの濃度でDPBSで段階別に希釈して、合計180μLのmonoSAMiRNA(n=1)試料を準備する。準備された試料に0.04mM DPHと対照群として使用されるDPHの溶媒であるメタノールをそれぞれ20μLずつ添加してよく混合した後、超音波分散器(Wiseclean,DAIHAN,韓国)を介してナノ粒子の大きさを均質化(700W;振幅20%)した。均質化された試料は、光を遮断した常温条件で約24時間反応させた後、蛍光値(excitation:355nm,emission:428nm,top read)を測定した。測定された蛍光値は、相対的な蛍光値を確認するものであるため、同じ濃度でDPH含まれた試料の蛍光値−メタノールだけ含まれた試料の蛍光値を求めて(Y軸)処理したmonoSAMiRNA(n=1)濃度のlog値(X軸)に対するグラフで図示した。前記monoSAMiRNA(n=2)、monoSAMiRNA(n=3)も同じ方法で測定した。
均質なナノ粒子の製造のために、前記monoSAMiRNA(n=1)を1.5mL DPBS(Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline)に50μg/mLの濃度で溶解した後、−75℃、5mTorr条件で48時間凍結乾燥した。前記monoSAMiRNA(n=2)、monoSAMiRNA(n=3)、monoSAMiRNA(n=4)も同じ方法で製造された。
ゼータ−電位測定器(zeta−potential measurement)を介して前記ナノ粒子の大きさを測定した。具体的に実施例3−2で製造された均質化されたナノ粒子は、ゼータ−電位測定器(Nano−ZS,MALVERN,イギリス)で大きさを測定したが、物質に対する屈折率(Refractive index)は、1.459、吸収率(Absorption index)は0.001として、溶媒であるDPBSの温度25℃およびそれによる粘度(viscosity)は1.0200、および屈折率は1.335の値を入力して測定した。1回の測定は、15回反復構成された大きさ測定からなり、これを6回繰り返した。前記monoSAMiRNA(n=1)、monoSAMiRNA(n=2)、monoSAMiRNA(n=3)、monoSAMiRNA(n=4)も同じ方法で測定した。
monoSAMiRNAからなるナノ粒子が形成された形態を確認するために、透過電子顕微鏡(Transmission Electron Microscope,TEM)を介して観察した。具体的にS−SAMiRNAをDPBSに最終100μg/mLの濃度で溶解した後、超音波分散器(Wiseclean,DAIHAN,韓国)でナノ粒子の大きさを均質化(700W;振幅(amplitude)20%)した。S−SAMiRNAからなるナノ粒子は、電子密度が高い物質でネガティブ染色(negative staining)法を介して観察された。TEMを介して観察されたナノ粒子は、実施例3−2で測定されたナノ粒子の大きさと類似する程度でナノ粒子が良好に形成されたことが確認された。
前記実施例3−2で製造したmonoSAMiRNAからなるナノ粒子を利用して、形質注入(transfection)された腫瘍細胞株のサバイビン(survivin)遺伝子の発現様子を分析した。
米国種菌協会(American type Culture Collection,ATCC)から取得したヒト子宮癌細胞(HeLa)はEMEM培養培地(ATCC−formulated Eagle’s Minimum Essential Medium,米国)に10%(v/v)牛胎児血清、ペニシリン100units/mL、ストレプトマイシン100μg/mLを添加して、37℃で5%(v/v)CO2の条件下に培養した。
前記実施例4−1で培養された1×105繊維母細胞細胞株を37℃で5%(v/v)CO2の条件下に12−ウェルプレートで18時間EMEMで培養した後、培地を除去した後、各ウェル当たり同量のOpti−MEM培地(GIBCO、米国)を分株した。Opti−MEM培地100μLと前記実施例3−2で製造したSAMiRNAおよびmonoSAMiRNAを50μg/mLの濃度でDPBSに添加して、実施例3−1と同じ方法で−75℃、5mTorr条件で48時間凍結乾燥して均一なナノ粒子を製造した。その後、Opti−MEMが分株された腫瘍細胞株の各ウェルに形質注入(transfection)用溶液を200nMの濃度で処理して、37℃で5%(v/v)CO2の条件下で合計48時間培養した。
前記実施例4−2で形質注入(transfection)された細胞株から全体RNAを抽出してcDNAを合成した後、リアルタイム重合酵素連鎖反応(real−time PCR)を介してサバイビン(Survivin)mRNA発現量を大韓民国公開特許公報第2009−0042297号の方法に従って相対定量した(図17)。Sur584は、SAMiRNAの構造別にターゲット遺伝子であるサバイビンに特異的な二重らせんオリゴRNA配列(配列番号1)を持つSAMiRNAを意味して、CONTは、ターゲット遺伝子の発現に影響を及ぼすことができない対照群配列(配列番号2)を含むSAMiRNAを意味する。ターゲット遺伝子のmRNA発現阻害程度は、CONを処理した試料のターゲット遺伝子発現量に対するSur584を処理した試料のターゲット遺伝子発現量で相対的な定量法(Comparative Quantitation)を介して計算された。サバイビン特異的二重らせんオリゴRNAが含まれたmonoSAMiRNA(n=1〜4)は、いずれも目標遺伝子の発現阻害効果を示したが、親水性物質ブロックが二つ以上であるmonoSAMiRNA(n=2)から目標遺伝子の高い発現阻害効果(約75%以上発現阻害)が維持されることが観察された。
5.1:エチレングリコールを親水性物質単量体として含むSAMiRNAの製造
本発明でのエチレングリコール、特にヘキサエチレングリコール(hexa ethylene glycol)を親水性物質単量体として含み、疎水性物質としてC24テトラドコサン(tetradocosane)を含む場合の二重らせんオリゴ構造体は、次のような構造体(22)の構造で示すことができる。
本実施例ではnが4である下記の構造式(23)のような二重らせんオリゴRNA構造体([hexa ethylene glycol]4−SAMiRNA)を製造した。
親水性物質にアミン基が導入された下記の構造式(25)のような二重らせんオリゴ構造体を製造した。
親水性物質にペプチドが導入された下記の構造式(27)のような二重らせんオリゴ構造体を製造した。
前記構造式(27)をさらに具体的に示すと、次の構造式(28)の通りである。
サバイビン(Survivin)発現量を減らすことができるsiRNA配列を含むHexa ethylene glycol−SAMiRNAからなるナノ粒子を利用して子宮頸部癌細胞(HeLa)を形質転換させて、このように形質転換した子宮頸部癌細胞(HeLa)細胞株で目標遺伝子の発現様子をRNAレベルで分析した。
米合衆国種菌協会(American Type Culture Collection,ATCC)から入手したヒト子宮頸部癌細胞(HeLa)細胞株は、実施例5−1と同じ条件で培養した。
前記実施例6−1で培養された0.8×105子宮頸部癌細胞(HeLa)細胞株を37℃で5%(v/v)CO2の条件下12−wellプレートで18時間EMEMで培養した後、培地を除去した後、各well当たり同量のOpti−MEM培地(GIBCO,USA)を分株した。ナノ粒子の製造は、実施例5−1と同じ方法で−75℃、5mTorr条件で48時間凍結乾燥して均一に製造した。前記実施例3−2で製造したHexa ethylene glycol−SAMiRNAを50μg/mLの濃度でDPBSに添加して溶解した後、Opti−MEM培地1mL中に50、100、200nMに合わせて処理する。Hexa ethylene glycol−SAMiRNAが含まれたOpti−MEMを分株後、腫瘍細胞株の各wellに濃度に合わせて処理して、37℃で5%(v/v)CO2の条件下、合計24時間と48時間培養した。
前記実施例6−2で形質注入された細胞株から前記実施例4−3と同じ方法で全体RNAを抽出してcDNAを製造した後、リアルタイムPCR(real−time PCR)を利用してターゲット遺伝子のmRNA発現量を相対定量した。アミン基が導入されたHexa ethylene glycol−SAMiRNAの処理に応じたターゲット遺伝子発現阻害量観察を介して対照群であるHexa ethylene glycol−SAMiRNAに対してアミン基が導入されたHexa ethylene glycol−SAMiRNAの効能を明確に確認した(図18)。
Claims (30)
- 下記の構造式(1)または構造式(2)の構造を持つ新しい形態のオリゴヌクレオチド構造体:
Q−(Am−J)n−X−R−Y−B 構造式(1)
Q−(J−Am)n−X−R−Y−B 構造式(2)
(前記構造式(1)および構造式(2)で、Aは親水性物質単量体、Bは疎水性物質、XとYはそれぞれ独立して単純共有結合またはリンカー媒介された共有結合で、Rは一本鎖または二重らせんオリゴヌクレオチド、mは1〜15の整数、nは1〜10の整数で、
Qは(Li−Zj)またはP−J1−J2であり、
Lは受容体媒介内包作用(RME)を介してターゲット細胞内在化を増進させる受容体と特異的に結合する特性を持つリガンド、
Zは単純共有結合または親水性物質ブロック内の親水性物質単量体とリガンドの結合を媒介するリンカーで、
iは0〜5の整数、jは0または1を意味して、但しiが0である場合、jも必ず0であり、
Pは、アミン基またはポリヒスチジン基を意味して、
J1とJ2は、独立して単純共有結合、またはアミン基またはポリヒスチジン基と親水性物質との間の結合を媒介するリンカーであり、
前記構造式(1)におけるJは、nが1である場合、AmとXとの間を連結するリンカーであり、nが2〜10の整数である場合、AmとAmとの間、またはAmとXとの間を連結するリンカーであり、
前記構造式(2)におけるJは、nが1である場合、QとAmとの間を連結するリンカーであり、nが2〜10の整数である場合、AmとAmとの間、またはQとAmとの間を連結するリンカーである)。 - Rは二本鎖オリゴヌクレオチドであり、センス鎖またはアンチセンス鎖は、19〜31個のヌクレオチドで構成されることを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記二本鎖オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖の5’末端にリン酸基が結合されたことを特徴とする請求項2に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記アンチセンス鎖の5’末端に結合されたリン酸基は一つ〜三つであることを特徴とする請求項3に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記疎水性物質の分子量は、250〜1,000であることを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記疎水性物質は、ステロイド誘導体、グリセリド誘導体、グリセロールエーテル、ポリプロピレングリコール、C12〜C50の不飽和または飽和炭化水素、ジアシルホスファチジルコリン、脂肪酸、リン脂質、及びリポポリアミンで構成された群から選択されることを特徴とする請求項5に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記ステロイド誘導体は、コレステロール、コレスタノール、コール酸、コレステリルホルマート、コレスタニルホルマートおよびコレステリルアミンで構成された群から選択されることを特徴とする請求項6に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記グリセリド誘導体は、モノ−、ジ−およびトリ−グリセリドから選択されることを特徴とする請求項6に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記親水性物質単量体は、下記化合物(1)の構造を持つことを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体:
(前記化合物(1)でGは、O、SおよびNHで構成された群から選択される)。 - 前記リンカー(J)は、PO3 −、SO3およびCO2で構成された群から選択されることを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記共有結合は、X、YおよびZで表される非分解性結合または分解性結合であることを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記非分解性結合は、アミド結合またはリン酸結合であることを特徴とする請求項11に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記分解性結合は、ジスルフィド結合、酸分解性結合、エステル結合、アンハイドライド結合、生分解性結合または酵素分解性結合であることを特徴とする請求項11に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- Qは(Li−Zj)であり、Zは単純共有結合または親水性物質ブロック内の親水性物質単量体とリガンドの結合を媒介するリンカーであり、前記リンカーZは、ヘキサエチレングリコールを含むことを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記リンカーZは、下記化合物(4)の構造を持つことを特徴とする請求項14に記載のオリゴヌクレオチド構造体:
(前記化合物(4)で、Tは下記化合物(1)が1〜15個繰り返された化合物を示し、Gは、CH2、O、SおよびNHで構成された群から選択される)。
- Qは(Li−Zj)であり、下記化合物(19)の構造を持つことを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体:
(前記構造式(19)で、A、B、R、m、n、ZおよびLは、請求項1に記載の構造式(2)での定義と同様である)。 - Qは(Li−Zj)であり、前記リガンドLは、炭水化物、ペプチドおよび抗体で構成された群から選択されることを特徴とする請求項1に記載のリガンドが結合されたオリゴヌクレオチド構造体。
- 前記炭水化物は、ヘキソアミン、単糖類、二糖類および多糖類で構成された群から選択されることを特徴とする請求項17に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- QはP−J1−J2であり、Pは第一級〜第三級アミン基から選択されたいずれか一つまたは5〜8個のヒスチジンを含むポリヒスチジン基であることを特徴とする請求項1に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- J1およびJ2は独立して単純共有結合、C2−12のアルキル、アルケニル、アルキニル、PO3 −、SO3およびCO2で構成された群から選択されることを特徴とする請求項19に記載のオリゴヌクレオチド構造体。
- 下記の構造式(20)の構造を持つ固形支持体:
(前記構造式(20)で、Lは受容体媒介内包作用(RME)を介してターゲット細胞内在化を増進させる受容体と特異的に結合する特性を持つリガンドであり、Tは下記化合物(1)が1〜15個繰り返された化合物を示し(化合物(1)で、Gは、CH2、O、SおよびNHで構成された群から選択される)、
CとDのうち一方は固形支持体で、他方はジメトキシトリチルであり;iは0〜3の整数;EとFはそれぞれ独立して1〜10の整数である)
を使用して請求項1に記載の一本鎖または二本鎖オリゴヌクレオチド構造体を製造する方法。 - (1)構造式(20)の固形支持体に親水性物質単量体を結合する段階をn回繰り返し行う段階;
(2)前記親水性物質が結合された固形支持体をベースにオリゴヌクレオチド一本鎖を合成する段階;
(3)前記親水性物質が結合されたオリゴヌクレオチド5’末端に疎水性物質を共有結合させる段階;および
(4)固形支持体からオリゴヌクレオチド構造体を分離する段階;
を含むことを特徴とする請求項21に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド構造体の製造方法。 - (1)構造式(20)の固形支持体に親水性物質単量体を結合する段階をn回繰り返し行う段階;
(2)前記親水性物質が結合された固形支持体をベースにRNA一本鎖を合成する段階;(3)前記親水性物質が結合されたRNA5’末端に疎水性物質を共有結合させる段階;(4)固形支持体からRNA−高分子構造体および相補的配列のRNA一本鎖を分離する段階;および
(5)前記RNA−高分子構造体と相補的配列のRNA一本鎖をアニーリングして二本鎖を形成する段階;
を含むことを特徴とする請求項21に記載の二本鎖オリゴヌクレオチド構造体の製造方法。 - 段階(2)のRNA一本鎖の配列と相補的な配列を持つRNA一本鎖は、5’末端にリン酸基が結合されたことを特徴とする請求項22に記載の製造方法。
- 請求項1から請求項20のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド構造体を含むナノ粒子。
- 前記ナノ粒子は、凍結乾燥された形態であることを特徴とする請求項25に記載のナノ粒子。
- 請求項1から請求項20のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド構造体を含む薬剤学的組成物。
- 請求項25または請求項26に記載のナノ粒子を含む薬剤学的組成物。
- 請求項1から請求項20のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド構造体を利用した生体外での遺伝子発現調節方法。
- 請求項25または請求項26に記載のナノ粒子を利用した生体外での遺伝子発現調節方法。
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