JP6268129B2 - 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 - Google Patents
癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6268129B2 JP6268129B2 JP2015151065A JP2015151065A JP6268129B2 JP 6268129 B2 JP6268129 B2 JP 6268129B2 JP 2015151065 A JP2015151065 A JP 2015151065A JP 2015151065 A JP2015151065 A JP 2015151065A JP 6268129 B2 JP6268129 B2 JP 6268129B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- indicates
- seq
- cdr3
- peptide
- ctl
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims description 137
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title claims description 83
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 title claims description 81
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 title description 6
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 title description 5
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title description 4
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title description 4
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title description 4
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 380
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 245
- 108700020467 WT1 Proteins 0.000 claims description 235
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 136
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 136
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 claims description 135
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 claims description 134
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 98
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 98
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 98
- 102100028972 HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain Human genes 0.000 claims description 94
- 108010075704 HLA-A Antigens Proteins 0.000 claims description 94
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 84
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 claims description 65
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 53
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 24
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 23
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 22
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 17
- 108020004394 Complementary RNA Proteins 0.000 claims description 14
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 claims description 14
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims description 13
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims description 11
- 230000004043 responsiveness Effects 0.000 claims description 5
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 claims description 3
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 3
- 102100022748 Wilms tumor protein Human genes 0.000 claims 48
- 101100112922 Candida albicans CDR3 gene Proteins 0.000 claims 43
- 102000040856 WT1 Human genes 0.000 description 187
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 158
- 208000033776 Myeloid Acute Leukemia Diseases 0.000 description 158
- 201000003793 Myelodysplastic syndrome Diseases 0.000 description 151
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 150
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 72
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 47
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 47
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 39
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 35
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 22
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 6
- 210000005105 peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 description 6
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 6
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 6
- 101000719121 Arabidopsis thaliana Protein MEI2-like 1 Proteins 0.000 description 5
- 101000857677 Homo sapiens Runt-related transcription factor 1 Proteins 0.000 description 5
- 102100025373 Runt-related transcription factor 1 Human genes 0.000 description 5
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 5
- 101000797612 Arabidopsis thaliana Protein MEI2-like 3 Proteins 0.000 description 4
- 101000797615 Arabidopsis thaliana Protein MEI2-like 4 Proteins 0.000 description 4
- 108010079362 Core Binding Factor Alpha 3 Subunit Proteins 0.000 description 4
- 101000857682 Homo sapiens Runt-related transcription factor 2 Proteins 0.000 description 4
- 102100024952 Protein CBFA2T1 Human genes 0.000 description 4
- 102100025368 Runt-related transcription factor 2 Human genes 0.000 description 4
- 102100025369 Runt-related transcription factor 3 Human genes 0.000 description 4
- 108700042075 T-Cell Receptor Genes Proteins 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 4
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 3
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 3
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 description 2
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 2
- 208000002250 Hematologic Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 102100039121 Histone-lysine N-methyltransferase MECOM Human genes 0.000 description 2
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 description 2
- 101001033728 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase MECOM Proteins 0.000 description 2
- 101000917858 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Proteins 0.000 description 2
- 101000917839 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Proteins 0.000 description 2
- 101000946889 Homo sapiens Monocyte differentiation antigen CD14 Proteins 0.000 description 2
- 101000581981 Homo sapiens Neural cell adhesion molecule 1 Proteins 0.000 description 2
- 102100029185 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Human genes 0.000 description 2
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 102100035877 Monocyte differentiation antigen CD14 Human genes 0.000 description 2
- 102100027347 Neural cell adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 2
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 2
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 2
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 230000000235 effect on cancer Effects 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 2
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 2
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 208000024893 Acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000014697 Acute lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 1
- 206010004593 Bile duct cancer Diseases 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 208000001976 Endocrine Gland Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 208000006168 Ewing Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 206010017993 Gastrointestinal neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 208000000527 Germinoma Diseases 0.000 description 1
- 206010067807 Gingival cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010023825 Laryngeal cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 208000000172 Medulloblastoma Diseases 0.000 description 1
- 208000034578 Multiple myelomas Diseases 0.000 description 1
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 1
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000009565 Pharyngeal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010034811 Pharyngeal cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 208000006664 Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000004337 Salivary Gland Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010061934 Salivary gland cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 208000000453 Skin Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108700042077 T-Cell Receptor beta Genes Proteins 0.000 description 1
- 208000000728 Thymus Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000024770 Thyroid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 206010062129 Tongue neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 208000008385 Urogenital Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000008383 Wilms tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011394 anticancer treatment Methods 0.000 description 1
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 1
- 208000026900 bile duct neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 1
- 206010006007 bone sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 208000002458 carcinoid tumor Diseases 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 210000004671 cell-free system Anatomy 0.000 description 1
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 208000006990 cholangiocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 238000000432 density-gradient centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 201000011523 endocrine gland cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 201000003115 germ cell cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 1
- 238000011134 hematopoietic stem cell transplantation Methods 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 206010023841 laryngeal neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 1
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000003387 muscular Effects 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 201000008026 nephroblastoma Diseases 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108010091748 peptide A Proteins 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical compound [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 description 1
- 208000029340 primitive neuroectodermal tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 239000003161 ribonuclease inhibitor Substances 0.000 description 1
- 201000002314 small intestine cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 229940126585 therapeutic drug Drugs 0.000 description 1
- 201000002510 thyroid cancer Diseases 0.000 description 1
- 201000006134 tongue cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 206010044412 transitional cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 208000037964 urogenital cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000037965 uterine sarcoma Diseases 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0635—B lymphocytes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0636—T lymphocytes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0646—Natural killers cells [NK], NKT cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/10—Cells modified by introduction of foreign genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56966—Animal cells
- G01N33/56977—HLA or MHC typing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
- G01N33/57492—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites involving compounds localized on the membrane of tumor or cancer cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Hematology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
Description
Valmori D. et al., J. Immunol. 168:4231-4240, 2002 Dietrich PY. et al., Cancer Res. 61:2047-2054, 2001 Coulie PG. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98:10290-10295, 2001 Godelaine D. et al. J. Immunol. 171:4893-4897, 2003 Mandruzzato S. et al., J. Immunol. 169:4017-4024, 2002
すなわち、本発明は以下のものを提供する。
(1)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:1〜1695に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチド;
(2)配列番号:1〜1695に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(1)記載のポリヌクレオチド;
(3)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1696〜3389に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド;
(4)配列番号:1696〜3389に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(3)記載のペプチド;
(5)(1)または(2)記載のポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のペプチドの、癌マーカーとしての使用;
(6)治療前にHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の、(1)または(2)記載のいずれかのポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のいずれかのペプチドを有するWT1特異的CTLのクロナリティーを調べることを特徴とする、癌の診断方法であって、該クロナリティーが複数のWT1特異的CTLが存在する場合に、該患者が癌にかかっている可能性があると判定する方法;
(7)治療前の患者におけるいずれかのCDR3ポリヌクレオチドまたはいずれかのCDR3ペプチドを有する3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLのクロナリティーが大きいほど、あるいは3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLの種類が多いほど、該患者が癌にかかっている可能性が高いと判定する(6)記載の方法;
(8)治療前においてHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の、(1)または(2)記載のいずれかのポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のいずれかのペプチドを有するWT1特異的CTLの種類およびクロナリティーを調べることを特徴とする、WT1ペプチド免疫療法に対する患者の感受性を調べる方法であって、該患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLの種類が、WT1ペプチド免疫療法に対する無応答者のそれよりも多い場合に、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性があると判定する方法;
(9)治療前の患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLクローンの種類が多いほど、あるいはクロナリティーが大きいほど、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性が高いと判定する(8)記載の方法;
(10)WT1ペプチド免疫療法の前後において、HLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の、(1)または(2)記載のいずれかのポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のいずれかのペプチドを有するWT1特異的CTLクローンのクロナリティーを調べることを特徴とする、該患者におけるWT1ペプチド免疫療法のモニタリング方法であって、いずれかのクローンに関してWT1ペプチド免疫療法前よりもWT1ペプチド免疫療法後において該WT1特異的CTLのクロナリティーが増加した場合に、該患者がWT1ペプチド免疫療法に応答したと判定する方法;
(11)WT1ペプチド免疫療法後において、クロナリティーの増加の割合が大きいほど、あるいはクロナリティーが増加したクローンの種類が多いほど、WT1ペプチド免疫療法に対する応答性が高いと判定する(10)記載の方法;
(12)(3)または(4)記載のペプチドに対する抗体;
(13)(1)または(2)記載のポリヌクレオチド、(3)または(4)記載のペプチド、あるいは(12)記載の抗体を含むチップ;
(14)配列番号:3391〜3418に示す配列から選択される配列を有するCDR3ポリペプチド増幅用プライマー;
(15)(1)または(2)記載のポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断キット、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるためのキット、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用キット;
(16)(1)または(2)記載のポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断装置、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるための装置、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用装置;
(17)(13)記載のチップまたは(14)記載のプライマーを含む(15)記載のキット;
(18)(13)記載のチップまたは(14)記載のプライマーが用いられる(16)記載の装置;
(19)(1)または(2)記載のポリヌクレオチド配列を含むT細胞レセプター遺伝子を導入したHLA−A*2402陽性癌患者のリンパ球。
(1)細胞
5人の健康ボランティア(HV1〜HV5)ならびに4人のHLA−A*2402陽性AML患者(AML1〜AML4)から末梢血試料を得た。5人のHLA−A*2402陽性MDS患者(MDS1〜MDS5)から骨髄試料または末梢血試料を得た。すなわち、AML1からは、治療前、治療開始から4、8、12、42週目に末梢血を得た。AML2からは、治療前、治療開始から4週目、8週目、12週目および42週目に末梢血を得た。AML3からは、治療前、治療開始から4週目、8週目に末梢血を得た。AML4からは、治療前、治療開始から4週目に末梢血を得た。MDS1からは、治療前の骨髄、治療前の末梢血、治療開始から4週目、8週目および12週目に末梢血を得た。MDS2〜5からは、治療前の末梢血および治療前の骨髄を得た。得られた末梢血試料をFicoll-Hypaque(Pharmacia, Uppsala, Sweden)を用いる密度勾配遠心分離に供して末梢血単核細胞(PBMCs)を分離し、使用するまで−170℃にて冷凍した。上記患者に対する治療は、WT1ペプチド免疫療法にて行った。治療に使用したWT1ペプチドのアミノ酸配列はCys−Tyr−Thr−Trp−Asn−Gln−Met−Asn−Leu(配列番号:3390)であり、2週間間隔で皮内注射により投与した。
先ず、1試料あたり2x106個のPBMCsを、FACSバッファー(2%ウシ胎児血清含有PBS)中にて37℃で30分、PE抱合HLA−A*2402−WT1 235−243テトラマー(MBL, Tokyo, Japan)にて染色した。次いで、下記の5色の蛍光標識モノクローナル抗体にて、暗所かつ氷上で25分染色した:FITC−標識抗−CD4、CD14、CD16、CD19およびCD56、抗−CD3−PerCP、抗−CD8−APC−Cy7(BD Bioscience, San Jose, CA)、抗−CD45RA−APCおよび抗−CCR7−PE−Cy7(BD Pharmingen, San Diego, CA)。染色された細胞をFACSバッファーにて2回洗浄した。FACSAria装置(BD Biosciences)を用いてソーティングを行い、FACSDivaソフトウェア(BD Biosciences)にてデータ解析を行って、CD4−CD14−CD16−CD19−CD56−細胞フラクション中の単一のHLA−A*2402−WT1 235−243テトラマー+CD3+CD8+細胞を得て、WT1−Tet+細胞と定義した。
DNAのコンタミネーションをなくし、十分な単一細胞のRT−PCRを行うために、cDNA合成を行い、すべてのPCR工程を別個のクリーンベンチ内で行った。単一WT1−Tet+細胞を、15μlのcDNA反応ミックスを入れたPCRチューブ中に直接ソーティングした。このcDNA反応ミックスは、下記のものを溶解バッファー(0.5% Triton X-100を含有する1XcDNAバッファー)中に含むものであった:逆転写酵素(SuperScript III, Invitrogen, Carlsbad, CA)、0.5mM dNTPs(Invitrogen)、20ユニット(U)のRnaseインヒビター(Invitrogen)、100μg/mlのゼラチン(Roche, Indianapolis, IN)、100μg/mlのtRNA(Roche)および200nMのTCR−β鎖不変領域特異的プライマー(5’-CACCAGTGTGGCCTTTTG-3’(配列番号:3391))。ソーティング後、cDNA合成のために試料を50℃で90分インキュベーションし、次いで、反応を停止させるために95℃で5分インキュベーションした。
上記手順により得た10μlの合成cDNA生成物を、40μlの反応ミックス中に添加した。この反応ミッックスは、1XPCRバッファー、2mM MgCl2、0.25mM dNTPs、1.25U DNAポリメラーゼ(Platinum Taq DNA Polymerase, Invitrogen)、5nMの24種のVβファミリー特異的フォワードプライマーの混合物(表1に示す)および5nMの3’Cβリバースプライマー(5’−GCTTCTGATGGCTCAAACACAGC−3’(配列番号:3392))を含んでいた。PCR手順は以下のとおりであった:プレ−PCR加熱工程を95℃で2分、次いで、95℃で45秒の変性工程、57℃で45秒のアニーリング工程および72℃で50秒の伸長工程からなるサイクルを40サイクル。
増幅されたTCR−β遺伝子フラグメントを、PCR Purification Kit(Qiagen, Valencia, CA)により精製した。対応するTCR Vβ特異的フォワードプライマーを用いて配列決定を行った。配列決定にはABI PRIAM BigDye Terminator v 3.1 Cycle Sequencing kit(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)を用い、ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer(Applied Biosystems)にて分析を行った。IMGTヒトTCR遺伝子データベースのサイト(http://imgt.cines.fr)と比較することによりCDR3の配列データを分析した。
健常人および癌患者(AML1〜4、MDS1〜5)由来のWT1特異的CTLのVβ鎖遺伝子の配列、J領域の配列、D領域の配列、N領域の配列、CDR3ヌクレオチド配列およびCDR3アミノ酸配列を図1−1〜図1−36に示す。個々のWT1特異的CTLのクロナリティーを図2−1〜図2−36に示す。また、CDR3ヌクレオチド配列を配列番号:1〜1695に示し(クローン#24.29と#28.92のCDR3ヌクレオチド配列は同じものとなるのでクローン#24.29のほうを配列表に記載)、CDR3アミノ酸配列を配列番号:1696〜3389に示した(クローン#2.53と#28.58のCDR3アミノ酸配列は同じものであり、クローン#24.29と#28.92のCDR3アミノ酸配列も同じものであるので、クローン#2.53、クローン#24.19を配列表に記載)。なお、AML患者のうち、AML1およびAML2は治療に対して応答し、AML3およびAML4は応答しなかった。MDS患者については治療に対する応答を判定していない。
ティーが複数である細胞の種類の増加は、患者において癌細胞に対する防御・攻撃が既に開始されている可能性を示すものであり、既に癌細胞が患者に存在する可能性があると考えられる。
Claims (12)
- 治療前にHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLのクロナリティーを調べることを特徴とし、該クロナリティーが複数のWT1特異的CTLが存在する場合に、該患者が癌にかかっている可能性があると判定する方法あって、
ポリヌクレオチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは(ii)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(i)記載のポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは(ii)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(i)記載のペプチドである方法。 - 治療前の患者におけるいずれかのCDR3ポリヌクレオチドまたはいずれかのCDR3ペプチドを有する3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLのクロナリティーが大きいほど、あるいは3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLの種類が多いほど、該患者が癌にかかっている可能性が高いと判定する請求項1記載の方法。
- 治療前においてHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLの種類およびクロナリティーを調べることを特徴とし、該患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLの種類が、WT1ペプチド免疫療法に対する無応答者のそれよりも多い場合に、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性があると判定するWT1ペプチド免疫療法に対する
患者の感受性を調べる方法であって、
ポリヌクレオチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは(ii)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(i)記載のポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは(ii)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(i)記載のペプチド
である方法。 - 治療前の患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLクローンの種類が多いほど、あるいはクロナリティーが大きいほど、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性が高いと判定する請求項3記載の方法。
- WT1ペプチド免疫療法の前後において、あるいはWT1ペプチド免疫療法の期間中において、HLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLクローンのクロナリティーを調べることを特徴とし、いずれかのクローンに関してWT1ペプチド免疫療法前よりもWT1ペプチド免疫療法後において該WT1特異的CTLのクロナリティーが増加した場合に、あるいはWT1ペプチド免疫療法期間中にクロナリティーが増加した場合に、該患者がWT1ペプチド免疫療法に応答したと判定する該患者におけるWT1ペプチド免疫療法のモニタリング方法であって、
ポリヌクレオチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは(ii)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(i)記載のポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは(ii)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(i)記載のペプチド
である方法。 - WT1ペプチド免疫療法後において、あるいはWT1ペプチド免疫療法期間中に、クロナリティーの増加の割合が大きいほど、あるいはクロナリティーが増加したクローンの種類が多いほど、WT1ペプチド免疫療法に対する応答性が高いと判定する請求項5記載の方法。
- 下記ペプチド:
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
に対する抗体。 - 下記ポリヌクレオチド、下記ペプチド、あるいは請求項7記載の抗体を含むチップであって、
ポリヌクレオチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなるポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
であるチップ。 - 下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断キット、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるためのキット、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用キットであって、
ポリヌクレオチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなるポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
であるキット。 - 下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断装置、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるための装置、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用装置であって、
ポリヌクレオチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなるポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
である装置。 - 請求項8記載のチップを含む、請求項9記載のキット。
- 請求項8記載のチップが用いられる、請求項10記載の装置。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2015151065A JP6268129B2 (ja) | 2007-03-05 | 2015-07-30 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2007054215 | 2007-03-05 | ||
| JP2007054215 | 2007-03-05 | ||
| JP2015151065A JP6268129B2 (ja) | 2007-03-05 | 2015-07-30 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
Related Parent Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2014058621A Division JP5832572B2 (ja) | 2007-03-05 | 2014-03-20 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2016005466A JP2016005466A (ja) | 2016-01-14 |
| JP6268129B2 true JP6268129B2 (ja) | 2018-01-24 |
Family
ID=39738141
Family Applications (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2009502541A Expired - Fee Related JP5808079B2 (ja) | 2007-03-05 | 2008-02-28 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
| JP2014058621A Expired - Fee Related JP5832572B2 (ja) | 2007-03-05 | 2014-03-20 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
| JP2015151065A Expired - Fee Related JP6268129B2 (ja) | 2007-03-05 | 2015-07-30 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
Family Applications Before (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2009502541A Expired - Fee Related JP5808079B2 (ja) | 2007-03-05 | 2008-02-28 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
| JP2014058621A Expired - Fee Related JP5832572B2 (ja) | 2007-03-05 | 2014-03-20 | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US10093977B2 (ja) |
| EP (4) | EP2116596A4 (ja) |
| JP (3) | JP5808079B2 (ja) |
| KR (3) | KR101773690B1 (ja) |
| CN (2) | CN101668853B (ja) |
| AU (1) | AU2008222061B2 (ja) |
| BR (1) | BRPI0808341A2 (ja) |
| CA (1) | CA2679045A1 (ja) |
| MX (2) | MX2009009589A (ja) |
| TW (2) | TWI615470B (ja) |
| WO (1) | WO2008108257A1 (ja) |
Families Citing this family (45)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2343083B1 (en) | 2003-06-27 | 2014-01-15 | International Institute of Cancer Immunology, Inc. | Method of diagnosing cancer comprising the measurement of WT1-specific CTL precursor cells |
| PL2071028T3 (pl) | 2003-11-05 | 2012-06-29 | Int Inst Cancer Immunology Inc | Pochodzący z WT1 peptyd antygenowy wiążący się z HLA-DR |
| MY158219A (en) | 2007-02-27 | 2016-09-15 | Int Inst Cancer Immunology Inc | Method for activation of helper t cell and composition for use in the method |
| HUE027057T2 (en) * | 2007-07-27 | 2016-08-29 | Immatics Biotechnologies Gmbh | New immunogenic epitope for immunotherapy |
| GB0721686D0 (en) * | 2007-11-05 | 2007-12-12 | Medinnova As | Polypeptides |
| MX361299B (es) | 2010-10-05 | 2018-11-30 | Otsuka Pharmaceutical Co Ltd Star | Metodo para activar celulas auxiliares. |
| CN107238706A (zh) * | 2011-06-28 | 2017-10-10 | 株式会社癌免疫研究所 | 肽癌抗原‑特异性t细胞的受体基因 |
| US9539299B2 (en) | 2011-10-27 | 2017-01-10 | International Institute Of Cancer Immunology, Inc. | Combination therapy with WT1 peptide vaccine and temozolomide |
| US10391126B2 (en) | 2011-11-18 | 2019-08-27 | Board Of Regents, The University Of Texas System | CAR+ T cells genetically modified to eliminate expression of T-cell receptor and/or HLA |
| WO2013166343A2 (en) * | 2012-05-04 | 2013-11-07 | Nuclea Biotechnologies, Inc. | Mrm-ms signature assay |
| EP2868325B1 (en) * | 2012-07-02 | 2017-11-01 | Sumitomo Dainippon Pharma Co., Ltd. | Transdermal cancer antigen peptide preparation |
| JP6535463B2 (ja) * | 2012-09-12 | 2019-06-26 | 株式会社癌免疫研究所 | 抗原特異的ヘルパーt細胞レセプター遺伝子 |
| GB2508414A (en) * | 2012-11-30 | 2014-06-04 | Max Delbrueck Centrum | Tumour specific T cell receptors (TCRs) |
| BR112015013697A2 (pt) | 2012-12-17 | 2017-11-14 | Univ Osaka | método para ativar célula t auxiliar |
| JP6250288B2 (ja) * | 2013-01-30 | 2017-12-20 | 株式会社医学生物学研究所 | T細胞レセプターおよびその利用 |
| US9663563B2 (en) | 2013-03-12 | 2017-05-30 | Sumitomo Dainippon Pharma Co., Ltd. | Aqueous liquid composition |
| CN106170297A (zh) * | 2013-09-20 | 2016-11-30 | 纪念斯隆-凯特琳癌症中心 | 用于wt‑1‑阳性疾病的组合/辅助疗法 |
| US11390921B2 (en) | 2014-04-01 | 2022-07-19 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Determining WT-1 specific T cells and WT-1 specific T cell receptors (TCRs) |
| WO2015164740A1 (en) * | 2014-04-24 | 2015-10-29 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Application of induced pluripotent stem cells to generate adoptive cell therapy products |
| EP3067366A1 (en) * | 2015-03-13 | 2016-09-14 | Max-Delbrück-Centrum Für Molekulare Medizin | Combined T cell receptor gene therapy of cancer against MHC I and MHC II-restricted epitopes of the tumor antigen NY-ESO-1 |
| TWI726920B (zh) * | 2015-10-14 | 2021-05-11 | 耶魯大學 | 基因體規模的t細胞活性陣列、其製造方法、其用於辨識免疫調節因子的方法及其用途 |
| CA3042890A1 (en) | 2016-11-14 | 2018-05-17 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | High affinity merkel cell polyomavirus t antigen-specific tcrs and uses thereof |
| MX2019010972A (es) * | 2017-03-15 | 2019-12-02 | Hutchinson Fred Cancer Res | Receptores de linfocito t (tcr) específicos del antígeno asociado a melanoma 1 (mage-a1) de alta afinidad y usos de estos. |
| WO2018231958A1 (en) * | 2017-06-13 | 2018-12-20 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Determining wt-1 specific t cells and wt-1 specific t cell receptors (tcrs) |
| DE102017114737A1 (de) * | 2017-06-30 | 2019-01-03 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Neue T-Zellrezeptoren und deren Verwendung in Immuntherapie |
| WO2019139972A1 (en) * | 2018-01-09 | 2019-07-18 | Board Of Regents, The University Of Texas System | T cell receptors for immunotherapy |
| WO2019204338A1 (en) * | 2018-04-16 | 2019-10-24 | The Regents Of The University Of California | Compositions and methods for cytotoxic cd4+t cells |
| EP3793577A4 (en) * | 2018-05-16 | 2022-03-02 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | MERKEL CELL POLYOMAVIRUS T ANTIGEN SPECIFIC TCRS AND USES THEREOF |
| US12134637B2 (en) * | 2018-07-12 | 2024-11-05 | Bgi Shenzhen | MART-1(27-35) epitope-specific T cell receptor |
| CN111116754A (zh) * | 2018-10-30 | 2020-05-08 | 天津亨佳生物科技发展有限公司 | 一种针对egfr l858r基因突变的特异性tcr及其应用 |
| GB201817821D0 (en) * | 2018-10-31 | 2018-12-19 | Ospedale San Raffaele Srl | TCR and peptides |
| MX2021005308A (es) * | 2018-11-09 | 2021-09-08 | Fred Hutchinson Cancer Center Star | Receptores de celulas t especificos para mesotelina y su uso en inmunoterapia. |
| EP3670530A1 (en) * | 2018-12-18 | 2020-06-24 | Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin in der Helmholtz-Gemeinschaft | Cd22-specific t cell receptors and adoptive t cell therapy for treatment of b cell malignancies |
| US20220251167A1 (en) * | 2019-06-21 | 2022-08-11 | St. Jude Children's Research Hospital, Inc. | T-Cell Receptor for Treating Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma |
| WO2021016109A1 (en) * | 2019-07-19 | 2021-01-28 | The Regents Of The University Of California | T-cell receptors and methods of use thereof |
| WO2021060343A1 (ja) * | 2019-09-24 | 2021-04-01 | オンコセラピー・サイエンス株式会社 | Urlc10由来ペプチドまたはdepdc1由来ペプチドを認識するヒトt細胞が発現するt細胞受容体 |
| WO2021217077A1 (en) * | 2020-04-24 | 2021-10-28 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Novel t-cell specificities and uses thereof |
| CA3183663A1 (en) * | 2020-05-18 | 2021-11-25 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Engineered t cell receptors and methods of use |
| CN111665359A (zh) * | 2020-07-11 | 2020-09-15 | 成都益安博生物技术有限公司 | 一种肺癌的外周血tcr标志物及其检测试剂盒和应用 |
| CN113109564A (zh) * | 2021-03-15 | 2021-07-13 | 成都益安博生物技术有限公司 | 一种急性髓细胞性白血病的外周血tcr标志物及其检测试剂盒和应用 |
| CN113092761A (zh) * | 2021-03-15 | 2021-07-09 | 成都益安博生物技术有限公司 | 一种弥漫大b细胞淋巴瘤的外周血tcr标志物及其检测试剂盒和应用 |
| BR112023022765A2 (pt) | 2021-05-05 | 2024-01-02 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Proteínas de ligação ao antígeno que ligam especificamente o prame |
| WO2024092265A2 (en) * | 2022-10-28 | 2024-05-02 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | T cell receptors targeting ewsr1-wt1 fusion protein and uses thereof |
| EP4633665A2 (en) * | 2022-12-13 | 2025-10-22 | BioNTech US Inc. | T cell receptor constructs and uses thereof |
| WO2025096983A1 (en) * | 2023-11-02 | 2025-05-08 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Peptides and engineered t cell receptors targeting tpx2 antigen and methods of use |
Family Cites Families (43)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4923799A (en) | 1984-02-06 | 1990-05-08 | The Ontario Cancer Institute | T cell specific cDNA clone |
| US6582908B2 (en) * | 1990-12-06 | 2003-06-24 | Affymetrix, Inc. | Oligonucleotides |
| CA2116526A1 (en) | 1991-08-28 | 1993-03-18 | William V. Williams | T cell receptor-based therapy for rheumatoid arthritis |
| US5364787A (en) | 1992-03-23 | 1994-11-15 | Idaho Research Foundation | Genes and enzymes involved in the microbial degradation of pentachlorophenol |
| US20060134641A1 (en) * | 1992-05-22 | 2006-06-22 | Franklin Richard L | Treating viral infections with krill enzymes |
| US5494794A (en) * | 1992-10-20 | 1996-02-27 | Emory University | Detection of mitochondrial DNA mutations associated with Alzheimer's disease and Parkinson's disease |
| US5672509A (en) * | 1993-08-25 | 1997-09-30 | Pfizer Inc. | hPDE IV-C: a human phosphodiesterase IV isozyme |
| ES2242221T3 (es) | 1996-04-16 | 2005-11-01 | Kishimoto, Tadamitsu | Procedimiento para la deteccion de celulas de cancer solido y de heterotipia histologica y procedimiento para el examen de tejidos destinados a trasplantes de medula osea y al trasplante de celulas madre sanguineas perifericas. |
| US5942422A (en) * | 1996-11-14 | 1999-08-24 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Method for generating a directed, recombinant fusion nucleic acid |
| GB9710820D0 (en) | 1997-05-27 | 1997-07-23 | Univ Dundee | Immunological method |
| US6013444A (en) * | 1997-09-18 | 2000-01-11 | Oligotrail, Llc | DNA bracketing locus compatible standards for electrophoresis |
| WO1999027957A1 (en) * | 1997-12-03 | 1999-06-10 | The Immune Response Corporation | Vaccination and methods against multiple sclerosis using specific tcr vbeta peptides |
| US6090593A (en) * | 1998-05-13 | 2000-07-18 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Air Force | Isolation of expressed genes in microorganisms |
| WO1999060120A2 (en) | 1998-05-19 | 1999-11-25 | Avidex Limited | Soluble t cell receptor |
| CA2337743C (en) | 1998-07-31 | 2015-07-07 | Yoshihiro Oka | Tumor antigen based on products of the tumor suppressor gene wt1 |
| US20030072767A1 (en) | 1998-09-30 | 2003-04-17 | Alexander Gaiger | Compositions and methods for WT1 specific immunotherapy |
| BR9914116A (pt) | 1998-09-30 | 2002-01-15 | Corixa Corp | Composições e métodos para imunoterapia especìfica de wt1 |
| US20030235557A1 (en) | 1998-09-30 | 2003-12-25 | Corixa Corporation | Compositions and methods for WT1 specific immunotherapy |
| GB9823897D0 (en) | 1998-11-02 | 1998-12-30 | Imp College Innovations Ltd | Immunotherapeutic methods and molecules |
| KR100479648B1 (ko) | 1999-02-23 | 2005-03-30 | 베일러 칼리지 오브 메디신 | T 세포 수용체 Vβ-Dβ-Jβ서열 및 그 검출방법 |
| WO2001094944A2 (en) | 2000-06-02 | 2001-12-13 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | Artificial antigen presenting cells and methods of use thereof |
| CN1281625C (zh) | 2001-03-22 | 2006-10-25 | 株式会社癌免疫研究所 | 经修饰的wt1肽 |
| CN1320923C (zh) | 2001-06-29 | 2007-06-13 | 中外制药株式会社 | 含有基于癌抑制基因wt1的产物的癌抗原和阳离子脂质体的癌疫苗 |
| US20060035291A1 (en) | 2001-09-18 | 2006-02-16 | Kyogo Itoh | Method of detecting cellular immunity and application thereof to drugs |
| EP1447092A4 (en) | 2001-09-28 | 2007-07-11 | Haruo Sugiyama | METHODS OF INDUCING ANTIGEN-SPECIFIC T CELLS |
| US8735357B2 (en) | 2001-09-28 | 2014-05-27 | International Institute Of Cancer Immunology, Inc. | Method of inducing antigen-specific T cells |
| WO2003059155A2 (en) | 2002-01-09 | 2003-07-24 | Maxx Genetech Co. Ltd | Method of detecting t-cell proliferation for diagnosis of diseases by gene array |
| US7214492B1 (en) * | 2002-04-24 | 2007-05-08 | The University Of North Carolina At Greensboro | Nucleic acid arrays to monitor water and other ecosystems |
| JP4365784B2 (ja) | 2002-06-12 | 2009-11-18 | 株式会社癌免疫研究所 | Hla−a24拘束性癌抗原ペプチド |
| ES2538486T3 (es) | 2002-09-12 | 2015-06-22 | International Institute Of Cancer Immunology, Inc. | Preparación de péptidos antigénicos contra el cáncer |
| WO2004063706A2 (en) * | 2003-01-08 | 2004-07-29 | Maxx Genetech Co., Ltd. | Method of detecting over-expression of t-cell receptor genes by real-time pcr |
| EP2343083B1 (en) * | 2003-06-27 | 2014-01-15 | International Institute of Cancer Immunology, Inc. | Method of diagnosing cancer comprising the measurement of WT1-specific CTL precursor cells |
| WO2005037868A2 (en) * | 2003-10-16 | 2005-04-28 | Case Western Reserve University | Methods of treating nfat-related disorders |
| PL2071028T3 (pl) | 2003-11-05 | 2012-06-29 | Int Inst Cancer Immunology Inc | Pochodzący z WT1 peptyd antygenowy wiążący się z HLA-DR |
| WO2005053603A2 (en) | 2003-12-08 | 2005-06-16 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Antigen receptor variable region typing |
| US7576183B2 (en) * | 2003-12-24 | 2009-08-18 | Los Alamos National Security, Llc | Structure-based receptor MIMICS targeted against bacterial superantigen toxins |
| DK2186896T3 (en) | 2004-03-31 | 2015-12-21 | Int Inst Cancer Immunology Inc | Cancer antigen peptides derived from WT1 |
| GB0411771D0 (en) | 2004-05-26 | 2004-06-30 | Avidex Ltd | Nucleoproteins displaying native T cell receptor libraries |
| US7674456B2 (en) * | 2004-06-14 | 2010-03-09 | Charles Wiseman | Breast cancer cell lines and uses thereof |
| GB0427585D0 (en) | 2004-12-16 | 2005-01-19 | Avidex Ltd | Assay |
| WO2008026927A2 (en) | 2006-08-30 | 2008-03-06 | Academisch Medisch Centrum | Process for displaying t- and b-cell receptor repertoires |
| JP2009278927A (ja) | 2008-05-23 | 2009-12-03 | Tohoku Univ | T細胞受容体を模倣する抗体断片及びその製造方法 |
| CN107238706A (zh) | 2011-06-28 | 2017-10-10 | 株式会社癌免疫研究所 | 肽癌抗原‑特异性t细胞的受体基因 |
-
2008
- 2008-02-28 EP EP08720964A patent/EP2116596A4/en not_active Withdrawn
- 2008-02-28 KR KR1020157023123A patent/KR101773690B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2008-02-28 CN CN2008800134367A patent/CN101668853B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2008-02-28 KR KR1020177023678A patent/KR101900639B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2008-02-28 EP EP16198218.6A patent/EP3173480A3/en not_active Withdrawn
- 2008-02-28 EP EP14192034.8A patent/EP2857508A3/en not_active Withdrawn
- 2008-02-28 MX MX2009009589A patent/MX2009009589A/es active IP Right Grant
- 2008-02-28 CN CN2013102585890A patent/CN103374576A/zh active Pending
- 2008-02-28 BR BRPI0808341-0A2A patent/BRPI0808341A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2008-02-28 JP JP2009502541A patent/JP5808079B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2008-02-28 AU AU2008222061A patent/AU2008222061B2/en not_active Ceased
- 2008-02-28 US US12/529,701 patent/US10093977B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2008-02-28 KR KR1020097018554A patent/KR101669279B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2008-02-28 WO PCT/JP2008/053469 patent/WO2008108257A1/ja not_active Ceased
- 2008-02-28 CA CA002679045A patent/CA2679045A1/en not_active Abandoned
- 2008-02-28 MX MX2014010820A patent/MX343633B/es unknown
- 2008-02-28 EP EP19150097.4A patent/EP3492590A3/en not_active Withdrawn
- 2008-03-04 TW TW103145693A patent/TWI615470B/zh not_active IP Right Cessation
- 2008-03-04 TW TW097107430A patent/TWI615469B/zh not_active IP Right Cessation
-
2014
- 2014-02-20 US US14/184,816 patent/US20140315758A1/en not_active Abandoned
- 2014-02-20 US US14/184,979 patent/US10669584B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2014-03-20 JP JP2014058621A patent/JP5832572B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2015
- 2015-07-30 JP JP2015151065A patent/JP6268129B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2020
- 2020-04-23 US US16/857,005 patent/US20210017599A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP6268129B2 (ja) | 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 | |
| JP6483071B2 (ja) | ペプチド癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子 | |
| AU2013270605B2 (en) | Cancer antigen-specific T-cell receptor gene, peptide encoded by the gene and use of them | |
| HK1198049A (en) | Receptor gene for peptide cancer antigen-specific t cell |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160712 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160815 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160825 |
|
| A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20170110 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170407 |
|
| A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20170515 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170718 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170822 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20171128 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6268129 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |