JP6117812B2 - ナノダイヤモンド粒子およびその製造方法ならびに蛍光分子プローブおよびタンパク質の構造解析方法 - Google Patents
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Description
上記の減少ピーク(ODMRシグナル)は静的な外部磁場に置かれたNVセンターでは分裂し、ピークの分裂幅はNVセンターの回転運動とともに変化するため、NVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を蛍光分子プローブとして使用し、該蛍光分子プローブによって標的タンパク質を標識するとともにODMRスペクトルを計測することにより、上記した既存の方法では実現できなかった生体内におけるタンパク質の精細かつリアルタイムの構造解析が実現できる可能性がある。
以下、本発明の実施形態(以下「本実施形態」とも記す)についてさらに詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
以下、本実施形態のナノダイヤモンド粒子について説明する。本実施形態のナノダイヤモンド粒子はヘテロ原子を含む官能基で表面が修飾されており、ODMR強度が高められたNVセンターを含んでいる。
原料となるナノダイヤモンド粉末の製造方法は特に制限されず、いかなる方法で製造されてもよい。ナノダイヤモンド粉末の製造方法としては、たとえばCVD法(化学蒸着法)、爆発法(爆轟法)、高温高圧法(HPHT法)等を挙げることができる。
本実施形態のナノダイヤモンド粒子は、ODMR強度が高められたNVセンターを含んでいる。ここで、NVセンターとは図1に示すように、ダイヤモンド結晶中の炭素原子1を置換した窒素原子2と窒素原子2と隣接する空孔3とからなる複合欠陥を示す。
一般的に、上記のような方法でナノダイヤモンド粉末を製造した場合、ダイヤモンド結晶中には不純物として窒素原子が混入しており、同時に炭素原子が欠落した空孔も存在している。しかし、このままでは、たとえば図2に示すように窒素原子2と空孔3とが隣接した一対をなしておらずNVセンターとはなっていない。
そこで、ナノダイヤモンド粉末を真空中700℃〜1000℃の高温で熱処理することによって、窒素原子2と空孔3とを結合させることができる。これによりダイヤモンド結晶中に図1に示されるNVセンターが生成される。
しかし、上記のように高温で真空熱処理した場合、粒子表面のダイヤモンド構造の一部がグラファイト化してしまう。このように、表面がグラファイトで覆われてしまうと、結晶内部にNVセンターを有していても、ナノダイヤモンド粒子は良好な蛍光発光を示さない。
上記のようにして、ダイヤモンド結晶内部にNVセンターが生成されたナノダイヤモンド粒子は励起光を照射すると蛍光発光する。そして、励起光および高周波磁場を該ダイヤモンド粒子に同時照射して、電子スピン磁気共鳴〔以下「ESR(Electron Spin Resonance)」とも記す〕を発生させると、蛍光発光量が減少する場合がある。
本明細書において、ヘテロ原子とは、炭素(C)、水素(H)以外の原子であり、かつ官能基中において該原子上に非共有電子対を有する原子を示す。このようなヘテロ原子としては、たとえば、酸素(O)、窒素(N)、硫黄(S)等を挙げることができる。そして、ヘテロ原子を含む官能基としては、たとえば、ヒドロキシル基(−OH)、ヒドロキシアルキル基(−CH2OH、−ROH:Rはアルキル基を示す。)、カルボキシル基(−COOH)、アミノ基(−NH2)、アルキルアミノ基(−NHR、−NR2:Rはアルキル基を示す。)、チオール基(−SH)等を挙げることができる。
上記のヘテロ原子を含む官能基は電子供与性官能基であることが好ましい。ここで、本明細書において「電子供与性」とは、該ヘテロ原子上の非共有電子対によって引き起こされる共鳴効果による電子供与性を示す。
一般に、ナノダイヤモンド粒子の表面には多種多様な官能基が存在している。そのような官能基としては、たとえば、アルキル基、カルボキシル基、ケトン基、ヒドロキシル基、ビニル基、ラクトン基等の存在が知られている。
上記のように、表面修飾処理を行なった後に、ナノダイヤモンド粒子の表面に存在する官能基の定性を行なうことが好ましい。官能基の定性は、たとえば赤外分光スペクトル(以下「IRスペクトル」とも記す)を測定することによって行なうことができる。たとえば、ナノダイヤモンド粒子を従来公知の錠剤法によって錠剤に成形して、IRスペクトルを測定することができる。
ODMR強度の評価は、ナノダイヤモンド粒子に励起光を照射しながらESRを発生する高周波磁場を照射して蛍光発光量を計測するとともに、上記式(I)によってODMR強度を算出して行なうことができる。
NV(−)の存在率の評価は、同条件で処理された一定数のナノダイヤモンド粒子について、個々の粒子について上記したODMR強度を求め、それらの相加平均を算出することによって行なうこともできる。ここで、信頼性の高い結果を得るためには、上記一定数は、たとえば50〜200個程度とすることが好ましい。
上記のように本実施形態のナノダイヤモンド粒子は高いODMR強度を有する。ここでODMR強度をさらに高めるとの観点から、ナノダイヤモンド粒子は結晶内部に希土類金属(たとえば、イッテルビウム(Yb)、エルビウム(Er)、ツリウム(Tm)等)を含まないことが好ましい。結晶中に希土類金属が導入されるとダイヤモンド結晶格子に歪みが生じ、ODMR強度が減退することがあるからである。またダイヤモンド結晶中に磁性元素(たとえば、マンガン(Mn)、鉄(Fe)、ニッケル(Ni)、コバルト(Co)、銅(Cu)等)も含まないことが好ましい。これらの磁性元素が生起する磁場がODMR強度の測定に悪影響を及ぼすことがあるからである。
このような本実施形態のナノダイヤモンド粒子は、以下のような製造方法によって製造される。換言すれば、以下のような製造方法によって製造されるナノダイヤモンド粒子は上記のような特性を示す。したがって、本実施形態のナノダイヤモンド粒子は極めて高いODMR強度を示すという優れた効果を有する。以下、本実施形態のナノダイヤモンド粒子の製造方法について説明する。
図12に本実施形態のナノダイヤモンド粒子の製造方法のフローチャートを示す。当該製造方法は、ナノダイヤモンド粒子を準備する工程S1と、ナノダイヤモンド粒子の表面に存在する官能基のうち1種以上のヘテロ原子を含む官能基の修飾率を選択的に高める処理を行なう工程S2と、を含む。以下、各工程について説明する。
まず、工程S1では、ナノダイヤモンド粉末を分級する工程S11と、ナノダイヤモンド粒子を真空中で熱処理する工程S12と、ナノダイヤモンド粒子を空気中で熱処理する工程S13と、を実施する。工程S11を実施することによって、ナノダイヤモンド粒子は生体内での使用に好適な粒度分布に調整され、工程S12を実施することによってナノダイヤモンド粒子の内部にNVセンターが生成される。さらに、工程S13を実施することによって、ナノダイヤモンド粒子表面のグラファイト層を酸化し、蛍光性を示すNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を製造することができる。なお、前述のように爆轟法によって得られたダイヤモンド粉末を用いる場合は、分級する工程を省略することができる。
次いで、工程S2では、上記工程S1で得られたナノダイヤモンド粒子に、粒子の表面に存在する官能基のうち1種以上のヘテロ原子を含む官能基の修飾率を選択的に高める処理を行なう工程として、還元処理を行なう工程S21および/または酸化処理を行なう工程S22を実施することによって、ODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を製造することができる。
以下、上記に説明した本実施形態のナノダイヤモンド粒子の生体計測への具体的な適用例である蛍光分子プローブについて説明する。
本実施形態の蛍光分子プローブは、ODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を化学修飾することによって得られる。
ここで、化学修飾とは、標的タンパク質と特異的に結合する分子鎖をナノダイヤモンドに化学結合させることを示す。該分子鎖は、ダイヤモンド結晶をなす炭素原子と直接結合されていてもよく、ナノダイヤモンド粒子表面上の官能基と結合していてもよい。また該分子鎖は、標的タンパク質(目的タンパク質ともいう)に合わせて適宜選択することが好ましい。たとえば、後述する代謝型グルタミン酸受容体を標的とする場合、アンピシリン(Ampicillin、以下「Amp」と略記することもある)等を用いることができる。
上記の化学修飾は、標的タンパク質以外の生体高分子への非特異的な吸着を阻害する分子鎖を含むことが好ましい。そのような分子鎖の一例としては、たとえば高分岐ポリグリセロール(HPG:Hyper branched Poly-Glycerol)を挙げることができる。化学修飾が非特異的な吸着を阻害する分子鎖を含むことにより、高選択的に標的タンパク質を標識することができる。
ここで非特異的な吸着の阻害に成功した具体例を、実験例を用いて説明する。まず(i)ナノダイヤモンド粒子をヒドロキシル基によって修飾しODMR強度の増強を行なった。次いで(ii)このナノダイヤモンド粒子に次の[a]〜[c]に示す分子鎖を結合させ(すなわち該分子鎖で表面修飾して)、表面修飾ナノダイヤモンド粒子を得た。
[b]ポリエチレングリコール(PEG:polyethylene glycol)
[c]HPG
以下のこの実験例での説明においては、上記符号[a]〜[c]に従い、カルボキシル基で表面修飾されたナノダイヤモンド粒子を「ND[a]」と記し、PEGで表面修飾されたナノダイヤモンド粒子を「ND[b]」と記し、HPGで表面修飾されたナノダイヤモンド粒子を「ND[c]」と記す。
実験例1ではナノダイヤモンド粒子の細胞表面への非特異的な吸着を評価した。
実験例2ではタンパク質のナノダイヤモンド粒子への非特異的な吸着を評価した。
本実施形態において観測対象となる標的タンパク質としては、たとえば代謝型グルタミン酸受容体(以下「mGluR」とも記す)等を挙げることができる。これまでの構造生物学における知見から、mGluRは細胞内においてシグナルを伝達する際、2量体のコンフォメーションを変化させていると予想されている。しかしこれまでに、この構造変化を実際に観測した例は報告されていない。本実施形態の蛍光分子プローブおよび後述する本実施形態のタンパク質の構造解析方法によれば、上記の構造変化を初めて観測できる可能性が高い。
以下、上記の蛍光分子プローブを用いた本実施形態のタンパク質の構造解析方法について説明する。
図21は本実施形態のタンパク質の構造解析方法の概略を示すフローチャートである。図21に示すように、本実施形態のタンパク質の構造解析方法は、本実施形態の蛍光分子プローブで標識した標的タンパク質に励起光および1〜5GHzの高周波磁場を照射して、蛍光スペクトルが減少するピーク磁場周波数を検知することによって標的タンパク質の構造変化を検知するタンパク質の構造解析方法である。すなわち、本実施形態のタンパク質の構造解析方法は、蛍光分子プローブで標的タンパク質を標識する工程S101と、標識された標的タンパク質に励起光および1〜5GHzの高周波磁場を照射して、蛍光発光量が減少するピーク磁場周波数を検知することによって標的タンパク質の構造変化を検知する工程S102と、を備える。
蛍光分子プローブによって、標的タンパク質を標識するためには、まず標的タンパク質とタグとなるタンパク質(以下、「タグ−タンパク質」とも記す)を融合する。たとえば、上記に例示したmGluRを標的とする場合、バクテリア由来β−ラクタマーゼの変異体(以下「BLタグ」とも記す)をタグ−タンパク質として採用することができる。
上記のようにして、標識された標的タンパク質の構造解析は、ODMR計測によって、蛍光分子プローブに含まれるダイヤモンド結晶内のN−V軸の回転運動を検出することにより行なうことができる。
ここで、N−V軸とは、ダイヤモンド結晶内のNVセンターにおいて、窒素原子(N)と隣接する空孔(V)とを結ぶ直線軸を示す。NVセンターは、該N−V軸上に磁気モーメントμNVを有している。
図9に示すODMRスペクトルのように、ナノダイヤモンド粒子に含まれるNV(−)のODMRシグナルはゼーマン効果により静的な外部磁場の下で2つに分裂している。分裂した2つのODMRシグナルは約2.87GHzを中心として対称となる。これは、縮退していたMz=±1のエネルギー準位がゼーマン効果によりMz=+1とMz=−1の2つのエネルギー準位に分裂していることを示している。このとき、ODMRシグナルの分裂幅をΔωとすると、ΔωはN−V軸と静磁場とのなす角θに対応して変化する。
式(II)は、N−V軸ベクトルと静磁場ベクトルとの内積を示し、式(II)中、θはN−V軸と静磁場とのなす角を示し、hは換算プランク定数を示し、ΔωはODMRスペクトルのピークの分裂幅を示し、μNVはNVセンターの磁気モーメントを示し、B0は静磁場強度を示す。
上記に説明したタンパク質の構造解析は次のような解析装置によって行なうことができる。図13は本実施形態のタンパク質の構造解析方法に係わる解析装置の一例を示す概略概念図である。この解析装置を機能毎に大別すると、光検出部と、磁気共鳴部と、コンソール部とに分けることができる。
以下に示す実施例1、実施例2および比較例1ではHPHT法によって得られたナノダイヤモンド粉末を用いてODMR強度の評価を行なった。
≪ナノダイヤモンド粒子を準備する工程S1≫
まず、出発原料として、HPHT法によって得られたナノダイヤモンド粉末(製品名「Micron+MDA、0−0.10μm」、エレメントシックス社製)を準備した。
このナノダイヤモンド粉末を水中に分散させ、15000rpmで20分間遠心してダイヤモンド粒子の分級を行なった。このようにして得られたナノダイヤモンド粒子の平均粒径を、レーザー回折・散乱式粒度分布計(製品名「Microtrac II」、日機装株式会社製)を用いて動的光散乱法によって求めた。このとき平均粒径は27.3nmであり、粒度分布の標準偏差は7.3nmであった。
次いで、分級処理によって得たナノダイヤモンド粒子を真空中800℃で熱処理してダイヤモンド結晶内にNVセンターを生成した。
次いで、空気中550℃で熱処理して表面を酸化した。
(還元処理を行なう工程S21)
上記のようにして得たナノダイヤモンド粒子10mgと、ボラン−テトラヒドロフランコンプレックス(製品名、ALDRICH社製)300μlとを、ガラス製反応器に入れ、さらにテトラヒドロフラン5mlを加え、アルゴン雰囲気下で、70℃で還流して、24時間攪拌した。次いで、上澄み液を除去し、アセトン、超純水で洗浄した後、乾燥してODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を得た。
実施例1のNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子の製造において、還元処理を実施せず、以下の酸化処理を実施した以外は、実施例1と同様にして、ODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を得た。
空気熱処理を経たナノダイヤモンド粉末11mgと、濃硫酸と濃硝酸を体積比9:1で混合した溶液5mlとを、ガラス製反応器に入れ75℃で72時間攪拌した。次いで、上澄み液を除去し超純水で洗浄した後、乾燥してナノダイヤモンド粒子を得た。
実施例1のNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子の製造において、還元処理を実施しなかった以外は、実施例1と同様にしてNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を得た。
≪修飾官能基の定性≫
上記のようにして得られた実施例1、実施例2および比較例1のナノダイヤモンド粒子の表面に存在する官能基の定性(IRスペクトルの測定)を以下のようにして行なった。ここで、実施例1または実施例2については、還元処理後または酸化処理後のナノダイヤモンド粒子を試料とした。一方、比較例1のナノダイヤモンド粒子については、真空熱処理後、空気熱処理前のナノダイヤモンド粒子を試料とした。これは、空気熱処理後にIR測定を行なうと、グラファイトの酸化によって生じた夾雑物質により測定の精度が低下するためである。
次に、実施例1、実施例2および比較例1のODMR強度を以下のようにして評価した。
以下に示す実施例3および比較例2では、爆轟法によって得られたナノダイヤモンド粉末を用いてODMR強度の評価を行なった。
上記の爆轟法によって得られたナノダイヤモンド粉末を真空中800℃で熱処理し、続いて空気中550℃で熱処理することにより比較例2に係るナノダイヤモンド粒子を得た。すなわち、比較例2に係るナノダイヤモンド粒子は還元処理を行なわない以外は実施例3と同様にして得られたものである。
以上のようにして得られた実施例3および比較例2に係るナノダイヤモンド粒子のODMR強度を前述した蛍光顕微鏡(図11参照)を用いて評価した。結果を図19および図20ならびに表2に示す。
Claims (11)
- 電子供与性官能基で表面が修飾されている、ODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子であり、
前記ODMR強度は、1〜5GHzの高周波磁場を照射したときの、励起光による蛍光発光量の減少率であり、
前記蛍光発光量の減少率は、0.01以上である、ODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子。 - 前記電子供与性官能基は、ヒドロキシル基およびヒドロキシアルキル基の少なくともいずれかである、請求項1に記載のODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子。
- 前記ナノダイヤモンド粒子は、平均粒径が1nm以上50nm以下である、請求項1または2に記載のODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子。
- 請求項1〜請求項3のいずれか1項に記載のODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子からなる粉末状試薬、または前記ナノダイヤモンド粒子を液体に分散させた試薬。
- ナノダイヤモンド粒子を準備する工程と、
前記ナノダイヤモンド粒子の表面に存在する官能基のうち1種以上の電子供与性官能基の修飾率を選択的に高める処理を行なう工程と、を含む、ODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子の製造方法。 - 前記電子供与性官能基はヒドロキシル基およびヒドロキシアルキル基の少なくともいずれかであり、かつ前記処理を行なう工程は還元処理を行なう工程である、請求項5に記載のODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子の製造方法。
- 請求項1〜請求項3のいずれか1項に記載のODMR強度が高められたNVセンターを含むナノダイヤモンド粒子を化学修飾した、蛍光分子プローブ。
- 高分岐ポリグリセロールで化学修飾されている、請求項7に記載の蛍光分子プローブ。
- 請求項7または8に記載の蛍光分子プローブからなる粉末試薬、または前記蛍光分子プローブを液体に分散させた試薬。
- 請求項7または8に記載の蛍光分子プローブで標的タンパク質を標識する工程と、
標識された前記標的タンパク質に励起光および1〜5GHzの高周波磁場を照射して、蛍光発光量が減少するピーク磁場周波数を検知することによって前記標的タンパク質の構造変化を検知する工程と、を備える、タンパク質の構造解析方法。 - 前記検知する工程において、前記ピーク磁場周波数は静的な外部磁場の下で分裂しており、
前記検知する工程は、前記ピーク磁場周波数の分裂幅の大きさから、前記蛍光分子プローブに含まれるNVセンターの回転運動を検知する工程を含む、請求項10に記載のタンパク質の構造解析方法。
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