JP5713251B2 - 細胞判別方法、細胞判別用の参照データ生成方法、および細胞判別装置 - Google Patents
細胞判別方法、細胞判別用の参照データ生成方法、および細胞判別装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5713251B2 JP5713251B2 JP2010012125A JP2010012125A JP5713251B2 JP 5713251 B2 JP5713251 B2 JP 5713251B2 JP 2010012125 A JP2010012125 A JP 2010012125A JP 2010012125 A JP2010012125 A JP 2010012125A JP 5713251 B2 JP5713251 B2 JP 5713251B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- cell
- scatter diagram
- vibration
- frequency analysis
- measurement
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M47/00—Means for after-treatment of the produced biomass or of the fermentation or metabolic products, e.g. storage of biomass
- C12M47/04—Cell isolation or sorting
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
(細胞判別装置1の構成)
まず、本発明の第1実施形態に係る細胞判別装置1の構成について説明する。図1は細胞判別装置1の構成概要図であり、図2は細胞判別装置1のハードウェア構成図である。
次に、図1に示した振動計測部110を構成し、細胞の振動を計測する際に用いられる定量位相顕微鏡について説明する。振動計測部110は定量位相顕微鏡そのものであっても良く、定量位相顕微鏡を備えた測定モジュールであっても良い。なお、定量位相顕微鏡に関する以下の説明は、下記の参考文献1および参考文献2を更に参考にすることで、より容易に理解できる。
<参考文献1> 特開2009−122033号公報
<参考文献2> Toyohiko Yamauchi,"Low-coherent quantitative phase microscope for nanometer-scalemeasurement of living cells morphology", Opt. Exp.、16, 12227, 2008
A=I1−3*I3+3*I5−I7…(1)
B=−2*I2+4*I4−2*I6…(2)
を求め、更には、
φ=tan−1(A/B)…(3)
を求める(位相抽出)。
次に、以上で説明した定量位相顕微鏡を用いて細胞の振動に対する時間変動を計測した一例について、図7〜図13を参照しながら説明する。細胞膜にフォーカスを合わせて得られた位相画像(図7)では、なだらかに連続する細胞膜の形状を反映して、細胞膜の高さに応じて干渉縞が空間的に連続して表示される。一方、細胞膜が、定量位相顕微鏡の測定領域に存在していない領域は連続した位相が得られず、干渉縞は見られない。干渉縞が空間的に連続する領域と位相がランダムになる領域との境界を検出することは容易であり、境界に対して位相が空間的に連続する側の領域を細胞膜の存在領域として特定する(図8において白線で囲まれた領域)。
続いて、細胞判別装置1により行われる動作(特許請求の範囲における「細胞判別用の参照データ生成方法」および「細胞判別方法」に対応)の一例として、被検体の細胞の種類を判別する方法について説明する。被検体の細胞の種類を判別する手順は、被検体である細胞の振動を定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測し、且つ当該計測結果に対して周波数解析を行うことにより、細胞を判別するための参照データを生成する参照データ生成手順(特許請求の範囲における「参照データ生成ステップ」に対応)と、細胞の振動を定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測し且つ当該計測結果に対して周波数解析を行った結果を、参照データ生成手順にて生成された参照データと照らし合わせることにより、被検体の細胞を判別する細胞判別手順(特許請求の範囲における「細胞判別ステップ」に対応)に大別される。以下、各手順の詳細について説明する。
図14は、参照データ生成手順を示すフローチャートである。参照データ生成手順では、予め細胞の種類が判別されている細胞集団を用意し、当該細胞集団の細胞を計測した結果から参照データを作成する。
上記の数式(4)および(5)において、Nは時間軸上でのサンプリング点数である。Δtはサンプリングの時間間隔である。Δh(m)は、t=Δt*mの時点での計測開始時からの細胞膜の変位量である。なお、m=0、1、2、3、…(N−1)である。
PSDfit(f)=A*fs…(6)
引き続き、細胞判別手順について説明する。細胞判別手順は、被検体となる未知の細胞の細胞膜の振動を一定時間計測し、細胞膜の振動の周波数解析を行い、既に格納されているリファレンスデータの2成分散布図に当てはめることによって行う。弁別したい被検体の細胞は、リファレンスデータとして既に取得済みである種類と同種類の細胞である。以下、図19を参照しながら細胞判別手順の詳細について説明する。図19は、細胞判別手順を示すフローチャートである。
以上、参照データ生成手順および細胞判別手順を説明した。以上の説明を簡単にまとめると次のようである。(1)細胞一個一個の細胞膜の変動の周波数パワースペクトルを計算し、それぞれを式(6)に基づきフィッティングし、フィッティング直線の傾きsとフィッティング直線の複数のf=f0におけるパワースペクトルの値を求め、各細胞の細胞膜振動の周波数パラメータとする。(2)リファレンスとなる2種類以上の細胞集団についてフィッティング直線の傾きsを横軸、フィッティング直線のf=f0における値を縦軸にして、各細胞のパワースペクトルの特性を2変数の散布図にプロットする。(3)異なるf0を用いて複数の2変数散布図を作成する。(4)2変数散布図の中で、プロットされた点の決定係数の大きいものを除外し、決定係数の値が所定の値以下のものを選択する。上記の例においては決定係数が例えば0.6以下のものを選択した。(5)2変数散布図を、細胞集団ごとに別のシンボルや色を用いてプロットし、細胞集団同士の弁別が単純な区画線を用いて可能となるようなf0を採用し、2変数散布図と区画線を決定し、2種類の細胞集団を弁別するためのリファレンスデータとする。(6)被検体である未知細胞について細胞膜の変動を計測し、得られた周波数パラメータをリファレンスデータの2変数散布図と区画線に当てはめて細胞を弁別する。このような手続きを経ることで、細胞膜の変動の周波数解析をもとにして細胞を弁別する方法および装置を提供することができる。
引き続き、本発明の第2実施形態について説明する。第2実施形態では、複数作成した散布図の選択方法が、第1実施形態と主に相違している。つまり、第1実施形態における図14のステップS107において相違点がある。以下ではこの相違点を中心に説明する。
本実施形態によれば、細胞の振動を定量位相顕微鏡を用いて計測する。定量位相顕微鏡を用いた計測方法によれば、光を使った非侵襲で、更にナノメータスケールの高精度で、細胞の振動を計測することができる。また、AFMの場合と異なり、多点計測ができるため、細胞の特徴的な変動を示す部位を知らなくても、細胞全体としての特徴を捉えることができる。更に、計測時間面において、AFMの場合でのような長時間はかからないというメリットがある。そして、以上のような定量位相顕微鏡による計測方法を用いて、参照データを生成し、また当該参照データを用いて被検体の細胞を判別するため、結果的に、非侵襲、高精度、更に高速で細胞判別を行うことができる。
Claims (9)
- 予め細胞の種類が判別されている細胞である参照細胞の振動を定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測し、且つ当該計測結果に対して周波数解析を行うことにより、細胞判別用の参照データを生成する参照データ生成ステップと、
被検体である細胞の前記振動を前記定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測し、且つ当該計測結果に対して前記周波数解析を行うことにより、解析結果データを生成し、当該解析結果データを前記参照データと照らし合わせることにより、前記被検体である細胞を判別する細胞判別ステップと、
を備えることを特徴とする細胞判別方法。 - 前記参照データ生成ステップは、
前記参照細胞の前記振動を前記定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測する振動計測ステップと、
前記振動計測ステップにおける当該計測結果に対して前記周波数解析を行う周波数解析ステップと、
前記周波数解析ステップにおける当該周波数解析結果を近似することにより、前記振動の特性を数値化する数値化ステップと、
前記数値化ステップにおける当該数値化の結果を元に散布図を作成する散布図作成ステップと、
前記散布図作成ステップにて作成された前記散布図における所定領域を前記被検体である細胞を判別するための判別領域として区画する領域区画ステップと、
を備え、
前記参照データは、前記領域区画ステップにて当該領域区画された当該散布図である、
ことを特徴とする請求項1に記載の細胞判別方法。 - 前記振動計測ステップでは、前記参照細胞に設けられた複数の計測領域に対してそれぞれ当該計測を行い、
前記周波数解析ステップでは、それぞれの前記計測領域の当該計測結果に対して前記周波数解析を行い、且つ当該周波数解析結果を平均化することにより前記参照細胞全体としての周波数解析結果を得る、
ことを特徴とする請求項2に記載の細胞判別方法。 - 前記周波数解析ステップでは、周波数およびパワースペクトルにより前記周波数解析が行われ、
前記数値化ステップでは、前記周波数に対する前記パワースペクトルの値を近似化した近似線、および前記近似線における傾きを求め、
前記散布図作成ステップでは、前記傾きを一の軸とし且つ所定の周波数における前記パワースペクトルの値を他の軸とする2次元上に、前記傾きに対して前記パワースペクトルの値を前記参照細胞ごとにプロットした図を、前記散布図として作成する、
ことを特徴とする請求項2または3に記載の細胞判別方法。 - 前記散布図作成ステップでは、複数の前記所定の周波数に応じて複数の前記散布図が作成され、
当該複数の前記散布図のうち、プロットされた前記パワースペクトルの値における決定係数の値が所定の値以下である前記散布図を、前記領域区画ステップにて当該領域区画される前記散布図として選択する散布図選択ステップを更に備える、
ことを特徴とする請求項4に記載の細胞判別方法。 - 前記領域区画ステップにおける当該領域区画は、前記散布図上で区画線を設定することにより行われる、
ことを特徴とする請求項2〜5の何れか1項に記載の細胞判別方法。 - 予め細胞の種類が判別されている細胞である参照細胞の振動を定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測する振動計測ステップと、
前記振動計測ステップにおける当該計測結果に対して周波数解析を行う周波数解析ステップと、
前記周波数解析ステップにおける当該周波数解析結果を近似することにより、前記振動の特性を数値化する数値化ステップと、
前記数値化ステップにおける当該数値化の結果を元に散布図を作成する散布図作成ステップと、
前記散布図作成ステップにて作成された前記散布図における所定領域を被検体である細胞を判別するための判別領域として区画する領域区画ステップと、
を備えることを特徴とする細胞判別用の参照データ生成方法。 - 予め細胞の種類が判別されている細胞である参照細胞の振動を定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測し、且つ当該計測結果に対して周波数解析を行うことにより、細胞判別用の参照データを生成する参照データ生成手段と、
被検体である細胞の前記振動を前記定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測し、且つ当該計測結果に対して前記周波数解析を行うことにより、解析結果データを生成し、当該解析結果データを前記参照データと照らし合わせることにより、前記被検体である細胞を判別する細胞判別手段と、
を備えることを特徴とする細胞判別装置。 - 前記参照データ生成手段は、
前記参照細胞の前記振動を前記定量位相顕微鏡を用いて一定時間計測する振動計測手段と、
前記振動計測手段による当該計測結果に対して前記周波数解析を行う周波数解析手段と、
前記周波数解析手段による当該周波数解析結果を近似することにより、前記振動の特性を数値化する数値化手段と、
前記数値化手段による当該数値化の結果を元に散布図を作成する散布図作成手段と、
前記散布図作成手段が作成した前記散布図における所定領域を前記被検体である細胞を判別するための判別領域として区画する領域区画手段と、
を備え、
前記参照データは、前記領域区画手段が当該領域区画した当該散布図である、
ことを特徴とする請求項8に記載の細胞判別装置。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2010012125A JP5713251B2 (ja) | 2010-01-22 | 2010-01-22 | 細胞判別方法、細胞判別用の参照データ生成方法、および細胞判別装置 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2010012125A JP5713251B2 (ja) | 2010-01-22 | 2010-01-22 | 細胞判別方法、細胞判別用の参照データ生成方法、および細胞判別装置 |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2015036729A Division JP5969640B2 (ja) | 2015-02-26 | 2015-02-26 | 細胞判別方法および細胞判別装置 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2011147400A JP2011147400A (ja) | 2011-08-04 |
| JP5713251B2 true JP5713251B2 (ja) | 2015-05-07 |
Family
ID=44535010
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2010012125A Expired - Fee Related JP5713251B2 (ja) | 2010-01-22 | 2010-01-22 | 細胞判別方法、細胞判別用の参照データ生成方法、および細胞判別装置 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP5713251B2 (ja) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB2520899B (en) * | 2012-09-13 | 2020-01-01 | Hamamatsu Photonics Kk | Method for discriminating differentiation degree of pluripotent stem cell |
| JP6562059B2 (ja) * | 2013-02-14 | 2019-08-21 | ソニー株式会社 | 神経細胞評価装置、神経細胞評価プログラム及び神経細胞評価方法 |
| JP6494903B2 (ja) | 2013-02-14 | 2019-04-03 | ソニー株式会社 | 分析システム、分析プログラム及び分析方法 |
| CN112014429B (zh) * | 2019-05-30 | 2024-01-30 | 华东理工大学 | 一种基于超微电渗流调控的细胞膜振动检测方法 |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2644476A1 (fr) * | 1989-03-15 | 1990-09-21 | Sainte Agathe Nicolas De | Procede de detection et/ou d'identification de micro-organismes vivants par vibrometrie |
| CN1457430A (zh) * | 1999-06-21 | 2003-11-19 | 松下电器产业株式会社 | 利用神经元样本中重复性电活动的分析进行精神活性物质的体外检测和表征的方法和装置 |
| JP2004000046A (ja) * | 2002-05-31 | 2004-01-08 | Osaka Gas Co Ltd | 細胞が発信する音波の周波数測定方法 |
| JP5160878B2 (ja) * | 2007-12-21 | 2013-03-13 | 浜松ホトニクス株式会社 | 試料同定装置および試料同定方法 |
-
2010
- 2010-01-22 JP JP2010012125A patent/JP5713251B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2011147400A (ja) | 2011-08-04 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP5214455B2 (ja) | 空間変調光学力顕微鏡検査を使用して細胞の変形能を検出するための装置および方法 | |
| Nawaz et al. | Cell visco-elasticity measured with AFM and optical trapping at sub-micrometer deformations | |
| Kronenberg et al. | Long-term imaging of cellular forces with high precision by elastic resonator interference stress microscopy | |
| Yousafzai et al. | Substrate-dependent cell elasticity measured by optical tweezers indentation | |
| Ragan et al. | 3D particle tracking on a two-photon microscope | |
| US10717962B2 (en) | Cell culture device and image analysis device | |
| JP6283104B2 (ja) | 光学分析装置 | |
| Bishitz et al. | Optical‐mechanical signatures of cancer cells based on fluctuation profiles measured by interferometry | |
| WO2004001402A1 (ja) | 生体分子解析装置 | |
| JP2015504177A (ja) | 成形されたビームを用いた定量用非線形光学顕微鏡 | |
| JP5713251B2 (ja) | 細胞判別方法、細胞判別用の参照データ生成方法、および細胞判別装置 | |
| CN111812095B (zh) | 光子晶体显微镜和细胞力学测量方法 | |
| WO2013093732A1 (en) | Optical and atomic force microscopy integrated system for multi-probe spectroscopy measurements applied in a wide spatial region with an extended range of force sensitivity. | |
| JP2020086204A (ja) | 光画像計測装置、光画像計測方法 | |
| WO2017075519A1 (en) | Combined optical micromanipulation and interferometric topography | |
| Brodovitch et al. | Use of TIRF to monitor T-lymphocyte membrane dynamics with submicrometer and subsecond resolution | |
| JP5969640B2 (ja) | 細胞判別方法および細胞判別装置 | |
| JP2004361087A (ja) | 生体分子解析装置 | |
| CN118103705A (zh) | 细胞机械力的检测系统、方法、装置及其制备方法 | |
| Franco et al. | Optical discrimination of live single cancer cells using reflection-based nanohole array sensor | |
| Eldridge | Development of optical tools for the assessment of cellular biomechanics | |
| JP2025031695A (ja) | 細胞の状態の推論装置、細胞の表現型の推論装置、細胞の分化状態の推論装置、細胞の状態の推論方法、細胞の表現型の推論方法および細胞の分化状態の推論方法 | |
| US10393653B2 (en) | Method and device for optically detecting a movement in a biological sample | |
| US9448393B2 (en) | Method and apparatus for automated scanning probe microscopy | |
| Varol et al. | Holographic Cell Stiffness Mapping Using Acoustic Stimulation |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20130121 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20130201 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20140624 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20140822 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20150203 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20150227 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5713251 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313117 |
|
| R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |