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JP3002735B2 - 大豆のホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ遺伝子 - Google Patents

大豆のホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ遺伝子

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JP3002735B2
JP3002735B2 JP3274950A JP27495091A JP3002735B2 JP 3002735 B2 JP3002735 B2 JP 3002735B2 JP 3274950 A JP3274950 A JP 3274950A JP 27495091 A JP27495091 A JP 27495091A JP 3002735 B2 JP3002735 B2 JP 3002735B2
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JP
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pepc
soybean
gene
cdna
phage
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幸雄 河村
敏男 杉本
大輔 柴田
エフ ウイッティア ロバート
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Mitsui Chemicals Inc
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Mitsui Chemicals Inc
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8251Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis

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Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、植物の種子、特に大豆
に含まれるホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ
遺伝子に関するものである。該遺伝子は、タンパク質の
生産増大に関するものであるので、この遺伝子を発現さ
せればタンパク質含量の高い大豆その他の植物を生産す
ることができ、一方遺伝子の発現を抑制すれば大豆その
他の植物での脂肪の生産増大が図られ、本発明を利用す
れば、所望する性質を有する大豆その他各種の植物の育
種が極めて効率的に行われる。
【0002】
【従来の技術】ホスホエノールピルビン酸カルボキシラ
ーゼ(以下、PEPCと略す)は植物の各種の組織に見
いだされる酵素であり、ホスホエノールピルビン酸と炭
酸イオンからオキザロ酢酸とオルトリン酸を生成する反
応を触媒する。
【0003】Sugimotoら(Agric.Bio
l.Chem.53,885,1989)によれば大豆
種子に含まれるPEPCとタンパク質含量、脂肪含量と
の間にはそれぞれ正、および負の相関性があることが報
告されている。すなわちPEPCの発現量を制御すれ
ば、これらの生産量をコントロールできることを示して
いる。従来の研究においてはC4植物であるトウモロコ
シのPEPC遺伝子が単離されているが(Izuiら、
Nucl.Acids Res.14,1615,19
86)、C3植物の種子からの遺伝子の単離は報告され
ていない。
【0004】
【発明が解決しようとする課題】人口の増大に伴ない、
食糧の増産は世界的な急務であるが、作付面積の拡大は
森林等自然破壊につながり好ましくない。このような条
件下で食糧増産を図るためには、個々の植物自体を増大
ないし肥大化する方法のほか、植物における特定成分濃
度を特に高める方法が考えられる。
【0005】本発明は、後者の考え方にたち、しかもこ
れを遺伝子工学の手法を利用して解決しようとするもの
であって、特にタンパク質と脂肪の増産という観点か
ら、それに関与する遺伝子をクローニングすることを目
的とし、もって所望する植物を育種することを究極の目
的とするものである。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明は、上記目的を達
成するために行われたものであって、本発明者らは植物
種子・葉・培養細胞におけるタンパク質含量の増大ある
いは脂肪生産の増大を図る手段として、大豆からPEP
C遺伝子のクローニングを計画し、大豆登熟期種子より
2種のcDNAをクローニングするのに成功し、更に各
方面から研究の結果、大豆PEPC遺伝子の構造を決定
するのに成功し、遂に本発明の完成に至ったものであ
る。以下、本発明について詳細に説明する。
【0007】本発明を実施するには、先ず、大豆種子か
らPEPCを分離精製する必要があるが、それには酵素
の精製に用いられる常法が適宜利用され、例えば、大豆
種子を破砕した後、緩衝液に懸濁し、その上清の硫安画
分について、カラムクロマトグラフィー等既知の方法に
したがって精製する。
【0008】このようにして、大豆種子からPEPCを
均一にまで精製した後、それを用いてウサギに対する抗
体を作製した。次に、大豆の登熟期の種子からポリ
(A)RNAを調製して、それを鋳型としてcDNAを
合成した。このcDNAをラムダファージベクターλg
t11に組み込みcDNAライブラリーを得た。このラ
イブラリーをさらに大腸菌Y1088株を用いて増幅さ
せてからスクリーニングを行った。スクリーニングは先
に作製したウサギ抗体を用いて行ったところ、この抗体
に特異的に結合するタンパク質を生産するλファージが
6つ得られた。これらがPEPC遺伝子を有するもので
あることを確認するために、これらのλファージが生産
するタンパク質に結合する抗体を精製して、それを用い
てウエスタン分析を行った。その結果、いずれの抗体も
SDS電気泳動で分離した大豆種子タンパク質の中から
PEPCのみを特異的に選択したことからPEPC遺伝
子を含むことを確認した。そこでこれらのλファージか
らλDNAを調製して、制限酵素EcoRIで切断して
からcDNA部分を回収して、プラスミドベクターpK
S+にサブクローニングした。これらの制限酵素地図を
作製したところ、4つは1kbp以下のインサートcD
NAしか含まなかったが、2つは3kbpのインサート
DNAを含んでいた。これら2つのクローンをSPC1
およびSPC16と名付けた。この両者は制限酵素の位
置が異なっており、異なる遺伝子に由来するPEPC遺
伝子であることが判明した。これらの塩基配列を決定し
て2種のPEPC遺伝子のcDNAの塩基配列を得るの
に成功した(配列表、配列番号1及び配列番号2)。
【0009】この2種のPEPC遺伝子の配列は既にト
ウモロコシ、マツバギク、ラン藻、大腸菌から単離され
ているPEPC遺伝子と相同性がみとめられるが同一で
はなかった。
【0010】以下に本発明を実施例に基づいて詳細に説
明する。
【0011】
【実施例1】
【0012】(1)大豆PEPCの精製 大豆種子(500g)を粉砕して、2リットルの0.1
Mリン酸緩衝液(pH6.8、25mM塩化マグネシウ
ムを含む)を加えてよく混合し、その上清を遠心分離に
よって回収した。この上清から30%から50%の硫安
画分を得た。この硫安沈澱を0.1Mトリス緩衝液(p
H7.5、30%硫安を含む)に溶解したのち、同じ緩
衝液を用いてブチルトヨパールカラム(5×50cm)
に供して、PEPC活性を溶出した。この画分を透析し
た後、DEAEトヨパールカラム(5×50cm)に供
した。このカラムよりPEPC活性を塩化ナトリウムの
濃度勾配により溶出した。この画分を硫安沈澱させたの
ちセファロースCL6Bカラム(2×90cm)を用い
てゲル濾過を行った。この画分をハイドロキシアパタイ
トカラム(1×20cm)に供し、5mMから100m
Mのリン酸緩衝液(pH6.8)にて溶出した。この様
にして均一に精製されたPEPCを得た。
【0013】(2)大豆PEPCに対する抗体の作製 以上の方法で得た大豆PEPCの1mgを2.5mlの
アジュバントとよく混合したのち、ウサギの表皮に注射
した。60日間の後に再度、同じウサギに同様にして大
豆PEPCを注射して抗体価を高めた。この後、60日
間たってからこのウサギから血液を採取し、等量の50
mMクエン酸ナトリウムを加えて、その上清を抗体とし
て用いた。
【0014】(3)大豆登熟期種子からのポリ(A)R
NAの調製 登熟期の大豆種子をすぐさま液体窒素に投入して、凍結
して、使用までは−135℃で保存した。この大豆種子
(50g)を液体窒素の存在下で乳鉢を用いて、粉末状
になるまで破砕した。これに200mlの抽出緩衝液
(20mMのバナジルコンプレックス、2%SDS、ト
リス塩酸、pH8.0)を加えて、すぐさま500×g
で遠心してその上清を回収した。この上清に等量のフェ
ノール・トリス(pH8.0)を加えて、約10分間攪
拌してから2000×gで遠心して、その上清を回収し
た。この上清に10分の1量の3M酢酸ナトリウム(p
H5.2)および2倍量のエタノールを加えて、−20
℃で30分間おいた。これを2000×gで遠心して核
酸の沈澱を得た。これを5mlのトリス緩衝液に溶解
後、等量のフェノール・トリスを加えて、10分間攪拌
した。この上清を遠心で回収して、このフェノール抽出
をさらに5回繰り返した。得られた上清をエタノールで
沈澱させ、このRNAを蒸留水に溶解し、RNA濃度が
1mg/ml、塩化リチウム濃度が2Mとなるようにし
たのち、氷上で8時間静置した。これを2000×gで
遠心してから、沈澱を回収した。このRNA沈澱を蒸留
水に溶解した。ポリ(A)RNAの調製は、オリゴdT
スピンカラム(ファルマシア社製)を用いて、このカラ
ムの使用説明書に従って行った。100μgのポリ
(A)RNAを得ることができた。
【0015】(4)cDNAライブラリーの作製 上記の方法で得たポリ(A)RNAを5μg用い、cD
NA合成キット(ファルマシア社製)を用い、このキッ
トの説明書に従ってcDNAを合成した。このキットに
よるcDNA合成では合成されたcDNAの両末端にE
coRIアダプターをライゲーションキット(宝酒造社
製)を用いて、その説明書に従って、連結反応を行わせ
た。このようにして得られたλDNAをパッケージング
キット(ストラタジーン社製)を用いて、そのキットの
説明書に従ってファージ粒子を再構成させ、cDNAラ
イブラリーとした。このライブラリーには約100万の
組換体が含まれていた。このライブラリーをスクリーニ
ングする前に、このライブラリーに含まれる全てのファ
ージを大腸菌Y1088株に感染させ、これを42℃で
寒天培地上で培養して、6時間後に出現したファージプ
ラークからファージをSM溶液を用いて回収した。この
回収液にクロロフォルムを少量くわえて4℃で保存し
た。以下のスクリーニングではこのファージ液をcDN
Aライブラリーとして用いた。
【0016】(5)cDNAのスクリーニング 以上のようにして得られたcDNAライブラリーに含ま
れるファージ液の一部を大腸菌(Y1090株)と混合
して37℃で15分間培養することによって、ファージ
を大腸菌に感染させた。これを50℃で溶解した10m
lの軟寒天と混合してから、LB寒天培地(直径15c
mのシャーレ)に重層させ、軟寒天を固化させた。この
際、一枚のシャーレあたり10万個のプラークが生じる
ように大腸菌とファージ液の量を調節した。このように
して調製した10枚のシャーレを3時間、42℃で培養
後、10mMのIPTG溶液をしみこませてから乾燥し
ておいたニトロセルロースフィルターを寒天培地上にか
ぶせ、さらに3時間、37℃で培養を行った。その後、
これらのフィルターを注意深く寒天培地から剥し、1%
のBSA溶液に16時間浸した。PEPCのウサギ抗体
(0.1ml)を100mlのBSA溶液に加えて混合
したのち、この溶液に先のフィルターを浸して、緩く揺
すりながら室温で1時間抗体と反応させた。発色反応は
アルカリフォスファターゼをもちいる2次抗体法のキッ
ト(プロメガ社、ピコブルー)をその説明書に従って行
った。フィルター上に現れた6個の紫色のスポットの位
置をそのフィルターが由来した寒天培地と照らし合わせ
て、対応する位置のファージを1mlのSM溶液に回収
した。これら6種のファージ液には目的以外のファージ
が多数混在しているので、今度はシャーレ1枚当り約1
00のファージのプラークが生じるように寒天培地にま
いて、同様にしてそれぞれのファージ液から紫色のスポ
ットを与えるファージのプラークを回収した(2次スク
リーニング)。さらに同様にして3次スクリーニングを
行い、最終的に6種のファージ液を得た。
【0017】(6)塩基配列の決定 このようにして得られた6種のファージからGross
bergerの方法(Nuc.Acids Res.
,6737,1987)に従って、λDNAをそれぞ
れ調製した。このλDNAを制限酵素EcoRIで消化
してから、すでにEcoRIで消化しCIP処理を施し
たプラスミドベクターpKS+(ストラタジーン社)と
ライゲーションキット(宝酒造社製)の説明書に従っ
て、連結した。これを用いて大腸菌(XL1−Blue
株)を形質転換した。得られたコロニーからプラスミド
を調製して、各種の制限酵素で消化して、それぞれの制
限酵素地図を作製した。これらを比較して、2種の全長
と考えられるcDNAを見いだした。これらをSPC1
およびSPC16と名付けた。これらは類似した制限酵
素地図を示すが、いくつかの点で異なっており、異なる
PEPC遺伝子から由来していることが判明した。そこ
でこれらの塩基配列を決定するため、SPC1に関して
はインサートcDNAを別のプラスミドベクターpUC
118にサブクローニングした。これらをプロメガ社の
イレース・ア・ベース・キットを用い、その説明書に従
って、デリーションクローンを作製した。これらのクロ
ーンから一本鎖DNAを調製して、ジデオキシ法により
塩基配列を決定した。その結果、2つのPEPCクロー
ンはいずれも翻訳開始部位を含む全長のcDNAインサ
ートを有することが明らかとなった。
【0018】すなわち、本発明は、下記の表1〜16に
示される配列表の配列番号1、2に示す大豆のPEPC
をコードする遺伝子に関するものである。
【0019】
【表1】
【0020】
【表2】
【0021】
【表3】
【0022】
【表4】
【0023】
【表5】
【0024】
【表6】
【0025】
【表7】
【0026】
【表8】
【0027】
【表9】
【0028】
【表10】
【0029】
【表11】
【0030】
【表12】
【0031】
【表13】
【0032】
【表14】
【0033】
【表15】
【0034】
【表16】
【0035】
【発明の効果】PEPC活性が高い植物細胞では脂肪の
合成に較べてタンパク質の生産量が増加するという観点
から、PEPCを利用してタンパク質の生産の増大、あ
るいは逆にPEPCの発現を抑えることにより脂肪の生
産増大に用いることができる。本発明により大豆種子で
のタンパク質生産増大に係わるPEPCの遺伝子が単離
されたことにより、遺伝子組換え技術を用いて植物種
子、葉・培養細胞などにおいてタンパク質含量を増大さ
せた植物の作製や、逆に脂肪含量を増大させた植物の作
製が期待できる。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ロバート エフ ウイッティア 茨城県土浦市桜ケ丘31−14 (56)参考文献 特開 平3−172187(JP,A) (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12N 15/09 GenBank/EMBL/DDBJ

Claims (1)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列表の配列番号1又は配列番号2に記
    載の塩基配列で示されるホスホエノールピルビン酸カル
    ボキシラーゼの遺伝子のcDNA。
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