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JP2019532017A - がんを治療するための異なるエピトープ結合を示す複数の二重特異性結合ドメイン構築物 - Google Patents

がんを治療するための異なるエピトープ結合を示す複数の二重特異性結合ドメイン構築物 Download PDF

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Abstract

がんを治療するための二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループを記載する。グループにおける各BS−BDCは、該グループにおける別のBS−BDCにより標的化されるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープとは異なるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープを標的化する。前記の異なるがん抗原エピトープは同一がん抗原上に存在しうる。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2016年7月14日付け出願の第62/362,397号及び2017年3月31日付け出願の第62/480,230号(それらのそれぞれの全体を、本明細書に完全に記載されているものとして、参照により本明細書に組み入れることとする)に基づく優先権を主張するものである。
本開示は、がんを治療するための複数の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を提供する。グループ内の各BS−BDCは、該グループ内の別のBS−BDCにより標的化されるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープとは異なる、がん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープを標的化する。前記の異なるがん抗原エピトープは、同一がん抗原上に存在しうる。
がん治療の進歩にもかかわらず、該疾患に関連した死亡率は依然として極めて高い。例えば、多数の小児患者の臨床成績の改善にもかかわらず、米国においては、がんは依然として、乳児期を過ぎた小児における主要死亡原因である。したがって、小児がんを含むがんに対する有効な新規治療方法の必要性に疑問の余地はない。
抗体を使用してがん細胞を標的化することは、非特異的毒性を制限した、腫瘍細胞を排除する有力な手段として、高い期待を集めた。しかし、多数の患者にとって、単一抗体の使用は有効ではない。
二重特異性T細胞結合抗体は、T細胞をがん細胞に引き寄せてがん細胞を破壊することを目的として、腫瘍細胞上のがん抗原とT細胞活性化エピトープとの両方に結合する。例えば、US 2008/0145362を参照されたい。現在の二重特異性T細胞結合抗体治療薬は単一特異性の抗体由来結合ドメインのペアを含む。該ペアの一方のメンバーはがん抗原エピトープを標的化し、該ペアの他方のメンバーはT細胞活性化エピトープを標的化する。2つの異なるT細胞活性化エピトープ(例えば、CD3及びCD28)を標的化するそのような抗体を組合せて使用することを検討した研究者もいる。残念ながら、このアプローチも同様に、期待された治療効果を達成していない。したがって、当技術分野においては、特に、より難治性の又は治療困難ながん型を有する患者のための、より有効ながん治療方法が依然として緊急に必要とされている。
がん細胞のような望ましくない細胞型を標的化し殺傷するために免疫系のT細胞を遺伝的に操作することにおいて、進歩が達成されている。例えば、特定の標的抗原に結合する細胞外成分と、細胞外成分が標的抗原に結合した際にT細胞の作用を導く細胞内成分とを有する分子を発現するように、T細胞が遺伝的に操作されている。一例としては、細胞外成分は、がん細胞上で見出される標的抗原に結合するように設計されることが可能であり、結合したら、結合したがん細胞を破壊するように、細胞内成分がT細胞に指令する。そのような分子の例には、遺伝的に操作されたT細胞受容体(TCR)及びキメラ抗原受容体(CAR)が含まれる。
TCR及び/又はCAR修飾T細胞は、経時的に出現する再発性又は進行性のがん細胞を攻撃しうる、がん細胞に対する免疫記憶を該T細胞が生成しうるという点で、大きな利点をもたらすが、該T細胞が正常組織上の標的を異常又は外来性と認識すると、この免疫記憶は自己免疫毒性を招く可能性がある。
米国特許出願公開第2008/0145362号明細書
開示の概要
本開示は、がんを治療するための複数の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を提供する。あるグループ内の各BS−BDCは、該グループ内の別のBS−BDCによって結合されるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープとは異なるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープに結合する。前記の異なるがん抗原エピトープは、同一がん抗原上に存在することが可能であり、特定の実施形態においては、同一がん抗原上の非重複性の異なるがん抗原エピトープである。この進歩は、幾つかの利点をもたらす。第1に、あるグループ内のBS−BDCは、異なるがん抗原エピトープに結合するため、結合に関する競合がより少なく、立体障害が減少する。第2に、異なる免疫細胞活性化エピトープに結合することにより、免疫細胞同時刺激シグナルが得られる。免疫細胞活性化エピトープ(例えば、T細胞受容体及び同時刺激受容体)を認識する結合ドメインは、あるグループ内の異なるBS−BDC上に位置するため、該グループは、がん細胞の存在下でのみ、T細胞活性化を誘導する。このアプローチは、多種多様ながんを標的化するために利用されうる汎用プラットフォームを提供する。
少なくとも2つのがん抗原エピトープ及び少なくとも2つの免疫細胞活性化エピトープを標的化するBS−BDCの記載されているグループの使用は、がん細胞のT細胞媒介性殺傷に対する予想外の相乗効果をもたらした。更に、BS−BDCの記載されているグループの使用は、意外にも、単一の二重特異性T細胞結合抗体構築物に対するがん細胞耐性を克服した。
多数の現在利用可能な治療法と比較した場合の、開示されているアプローチの追加的な利点は、開示されているBS−BDCが、自己免疫毒性を招きうるCAR修飾T細胞療法のような個別化遺伝子治療を要することなく、特定のがんを有する患者に普遍的に投与されうる「既製(off−the−shelf)」療法として提供されうることを含む。更に、治療に対する個々の患者の応答がモニター可能であり、それに応じて投与量を調節して、治療の悪影響、例えばサイトカインストームを、回避することが可能である。注入された前活性化細胞の腫瘍ホーミングに基づく、活性化T細胞を患者の体内に注入することとは対照的に、該治療はまた、がんの部位において特異的にT細胞を活性化する。
開示されているBS−BDCはまた、個々の患者の疾患の経過を経時的に追跡する組合せとしても使用されうる。例えば、CD28は、T細胞上で発現される免疫細胞活性化エピトープを与える。しかし、継続的なT細胞活性化の後、(腫瘍微小環境の場合と同様に)T細胞はCD28の発現を経時的にダウンレギュレーションして、このエピトープを介したT細胞活性化の機会を減少させうる。したがって、CD28に結合するBS−BDCから治療が有益に開始されうるが、時間の経過と共に、このBS−BDCは、抑制性T細胞エピトープの活性化を逆転させ又は遮断するエピトープに結合するもの(例えば、4−1BB(CD137)、PD−1、TIM−3、LAG3、VISTA)で置換されうる。BS−BDCグループのそのような多数の有益で発展的な組合せが本明細書に記載されている。
前記理由の全てにより、BS−BDCの記載されているグループは、がんに対する進行中の闘いにおいて重要かつ顕著な進歩をもたらす。
図1A。T細胞及びがん細胞に結合したT細胞結合性BS−BDCの同時多重相互作用の図示。この図示されている実施形態においては、グループ内の1つのBS−BDCがCD3及びROR1上のエピトープに結合する。このグループ内の第2のBS−BDCは、同じT細胞上のCD28及びROR1上の異なるエピトープに結合する。 図1B。例示的なBS−BDCフォーマット。 図2。T細胞同時刺激の際のがん細胞/T細胞BS−BDCの細胞傷害性。 図3A及び3B。CD28指向性BS−BDCによるT細胞同時活性化は標的抗原陽性がん細胞の存在に厳密に依存している。 図3A及び3B。CD28指向性BS−BDCによるT細胞同時活性化は標的抗原陽性がん細胞の存在に厳密に依存している。 図4A〜4D。CD28指向性BS−BDCによるT細胞同時活性化はROR1/CD3抗体誘導性細胞傷害性を増強する。 図4A〜4D。CD28指向性BS−BDCによるT細胞同時活性化はROR1/CD3抗体誘導性細胞傷害性を増強する。 図4A〜4D。CD28指向性BS−BDCによるT細胞同時活性化はROR1/CD3抗体誘導性細胞傷害性を増強する。 図4A〜4D。CD28指向性BS−BDCによるT細胞同時活性化はROR1/CD3抗体誘導性細胞傷害性を増強する。 図5。第2のがん細胞抗原を標的化するCD28指向性BS−BDCでのT細胞同時活性化は治療用二重特異性T細胞結合抗体の抗がん活性を増強する。 図6A〜図6C。PD−L1/CD28抗体は二重特異性抗体に対するPD−L1媒介性耐性を克服しうる。 図6A〜図6C。PD−L1/CD28抗体は二重特異性抗体に対するPD−L1媒介性耐性を克服しうる。 図6A〜図6C。PD−L1/CD28抗体は二重特異性抗体に対するPD−L1媒介性耐性を克服しうる。 図7。NFκBレポーターJurkat(ジャーカット)系を使用して測定した場合、R11及び2A2は、異なるが重複するROR1エピトープに結合し、一方、R12は、異なり非重複性のROR1エピトープに結合する。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。 図8。裏づける配列。
詳細な説明
がん治療の進歩にもかかわらず、該疾患に関連した死亡率は依然として極めて高い。例えば、多数の小児患者の臨床成績の改善にもかかわらず、米国においては、がんは依然として、乳児期を過ぎた小児における主要死亡原因である。したがって、小児がんを含むがんに対する有効な新規治療方法の必要性に疑問の余地はない。
抗体を使用してがん細胞を標的化することは、限られた非特異的毒性を有する、腫瘍細胞を排除する有力な手段として、高い期待を集めた。しかし、多数の患者にとって、単一抗体の使用は有効ではない。
二重特異性T細胞結合抗体は、T細胞をがん細胞に引き寄せてがん細胞を破壊することを目的として、腫瘍細胞上のがん抗原とT細胞活性化エピトープとの両方に結合する。例えば、US 2008/0145362を参照されたい。現在の二重特異性T細胞結合抗体治療薬は単一特異性の抗体由来結合ドメインのペアを含む。該ペアの一方のメンバーはがん抗原エピトープを標的化し、該ペアの他方のメンバーはT細胞活性化エピトープを標的化する。2つの異なるT細胞活性化エピトープ(例えば、CD3及びCD28)を標的化するそのような抗体を組合せて使用することを検討した研究者もいる。残念ながら、このアプローチも同様に、期待された治療効果を達成していない。したがって、当技術分野においては、特に、より難治性の又は治療困難ながん型を有する患者のための、より有効ながん治療方法が依然として緊急に必要とされている。
本開示は、がんを治療するための複数の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC;例えば、二重特異性抗体)を提供する。グループ内の各BS−BDCは、該グループ内の別のBS−BDCによって結合されるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープとは異なるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープに結合する。前記の異なるがん抗原エピトープは同一がん抗原上に存在することが可能であり、特定の実施形態においては、同一がん抗原上の非反復性の異なるがん抗原エピトープである。この進歩は幾つかの利点をもたらす。第1に、グループ内のBS−BDCは、異なるがん抗原エピトープに結合するため、結合に関する競合がより少なく、立体障害が減少する。第2に、異なる免疫細胞活性化エピトープに結合することにより、同時刺激シグナリングが達成される。T細胞受容体及び同時刺激受容体を認識する結合ドメインは、異なるBS−BDC上に位置するため、該BS−BDCグループは、がん細胞の存在下でのみ、T細胞活性化を誘導する。このアプローチは、多種多様ながんを標的化するために利用されうる汎用プラットフォームを提供する。
少なくとも2つのがん抗原エピトープ及び少なくとも2つの免疫細胞活性化エピトープを標的化するBS−BDCの記載されているグループの使用は、がん細胞のT細胞媒介性殺傷に対する予想外の相乗効果をもたらした。更に、BS−BDCの記載されているグループの使用は、意外にも、単一の二重特異性T細胞結合抗体構築物に対するがん細胞耐性を克服した。
多数の現在利用可能な治療法と比較した場合の、開示されているアプローチの追加的な利点は、開示されているBS−BDCが、CAR修飾T細胞療法のような個別化遺伝子治療を要することなく、特定のがんを有する患者に普遍的に投与されうる「既製(off−the−shelf)」療法として提供されうることを含む。更に、治療に対する個々の患者の応答がモニター可能であり、それに応じて投与量を調節して、治療の悪影響、例えばサイトカインストームを回避することが可能である。注入された前活性化細胞の腫瘍ホーミングに基づく、活性化T細胞を患者の体内に注入することとは対照的に、該治療はまた、がんの部位において特異的にT細胞を活性化する。
開示されているBS−BDCはまた、個々の患者の疾患の経過を経時的に追跡する組合せとしても使用されうる。特定の実施形態においては、投与されたBS−BDCは、免疫系の状態(例えば、活性化の段階)、治療に対する応答の段階及び/又はがん細胞により発現されるがん抗原の変化に基づいて、治療レジメンの経過にわたって変化しうる。BS−BDC間の変化は、最初のBS−BDCの投与の少なくとも1時間後、又は最初のBS−BDCの投与の数日後、数週間後若しくは数ヵ月後まで、生じうる。特定の実施形態においては、投与されたBS−BDCの変化は、例えば、対象サンプルからのフィードバック(例えば、血液検査)による継続的な対象のモニターに基づく。特定の実施形態においては、投与されたBS−BDCの変化は、免疫状態及び/若しくはがん周期における予測可能な変化又は治療に対する予想される応答に基づいて、予めプログラム(計画)されうる。特定の実施形態においては、投与されたBS−BDCの変化は、例えばプログラム可能なポンプの使用に基づいて、予めプログラムされ、自動的に生成されうる。投与されたBS−BDCの変化は急性的に生じる可能性があり、又は徐々に変化しうる。
特定の実施形態においては、患者は免疫活性化の変化に関してモニターされることが可能であり、投与されたBS−BDCは、異なる免疫活性化エピトープを標的化するBS−BDCへと変化されうる。一例としては、CD28は、T細胞上で発現される免疫細胞活性化エピトープを与える。しかし、継続的なT細胞活性化の後、(腫瘍微小環境の場合と同様に)T細胞はCD28の発現を経時的にダウンレギュレーションして、このエピトープを介したT細胞活性化の機会を減少させうる。したがって、CD28に結合するBS−BDCから治療が有益に開始されうるが、時間の経過と共に、このBS−BDCは、抑制性T細胞エピトープの活性化を逆転させ又は遮断するエピトープに結合するもの(例えば、4−1BB(CD137)、PD−1、TIM−3、LAG3、VISTA)で置換されうる。BS−BDCグループのそのような多数の有益で発展的な組合せが本明細書に記載されている。
特定の実施形態においては、患者はがん抗原の発現の変化に関してモニターされることが可能であり、投与されたBS−BDCは、異なるがん抗原を標的化するBS−BDCへと交換されうる。がん抗原の発現は、しばしば、がんの経過中に変化する。一例としては、抗がん薬であるトラスツズマブの分子標的であるHer−2は治療中にダウンレギュレーションされて、治療耐性を招きうる(Shiら,Breast Cancer Research 2014 16:R33)。特定の実施形態においては、Her−2を標的化するBS−BDCで治療されている患者はHer−2のダウンレギュレーションに関してモニターされることが可能であり、それらのがんがHer−2発現を喪失又は低減した場合には、該患者は、異なるがん抗原を標的化するBS−BDCで治療されうる。EGFRは、治療の経過中にダウンレギュレーションされるがん抗原のもう1つの例である。
治療の経過中、投与されたBS−BDCグループは、標的化がん抗原、標的化免疫活性化エピトープ又はその両方を変化させるように進化しうる。変化は、標的化がん抗原及び/若しくは免疫細胞活性化エピトープの付加;標的化がん抗原及び/若しくは免疫細胞活性化エピトープの除去;並びに/又は標的化がん抗原及び/若しくは免疫細胞活性化エピトープの置換を反映しうる。
前記理由の全てにより、BS−BDCの記載されているグループは、がんに対する進行中の闘いにおいて重要かつ顕著な進歩をもたらす。
示されている「とは異なる」は、標的化エピトープが配列及び/又は構造において互いに異なることを意味する。特定の実施形態においては、異なることに加えて、標的化エピトープは非重複性でもある。「非重複性」は、あるグループにおける1つのBS−BDCの、エピトープへの結合が、該グループにおける少なくとも1つの他のBS−BDCの存在により、競合結合アッセイにおいて統計的に有意な度合では低減しないことを意味する。非重複性エピトープは、異なる分子上のエピトープであることが可能であり(例えば、ROR1及びCD33;CD3及びCD28)、あるいは、同一分子上に位置する非重複性エピトープであることが可能である(例えば、非重複性ROR1エピトープ;非重複性CD3エピトープ)。同一抗原上の、異なる非反復性エピトープは、空間的には互いに物理的に異なるが配列においては互いに反復性であるエピトープを除外する。例えば、MUC1は反復配列を有し、本明細書において定義されているとおり、該配列内の反復は非反復性ではなく、異なっている。
T細胞の「同時刺激」は、BS−BDCグループの複数メンバーの存在下では、BS−BDCグループの単一メンバーのみの存在下よりも頑強なT細胞応答が観察されることを意味する。
特定の実施形態においては、本明細書に開示されているBS−BDCグループは、SMITEグループと称されうる。SMITEは、「同時多重相互作用T細胞エンゲージ」結合ドメイン構築物(例えば、抗体、scFv)を表す。この用語は、開示されているBS−BDCグループが、2つの異なるがん抗原エピトープに結合した場合に、2つの異なる免疫細胞活性化エピトープにエンゲージ(結合)することを表す。免疫細胞活性化エピトープの結合は時間的に重複して、がん細胞の部位における頑強なT細胞活性化を引き起こす。
BS−BDCのグループは2つ、3つ又は4つのBS−BDCを含みうる。グループが2つのBS−BDC(ペア)を含む場合、該ペアの各メンバーは、異なるがん抗原エピトープ及び異なる免疫細胞活性化エピトープに結合する。グループが3つのBS−BDCを含む場合、該グループの各メンバーは、異なるがん抗原エピトープ及び異なる免疫細胞活性化エピトープに結合することが可能であり(3つのがん抗原エピトープ及び3つの免疫細胞活性化エピトープを標的化する)、あるいは、3メンバーグループ(すなわち、3つのメンバーからなるグループ)の2つのメンバーは同一がん抗原エピトープを標的化することが可能であり、該3メンバーグループの2つのメンバーは同一免疫細胞活性化エピトープを標的化することが可能である。同じ原理が4メンバーグループにも当てはまる。すなわち、あるグループが4つのBS−BDCを含む場合、該グループの各メンバーは、異なるがん抗原エピトープ及び異なる免疫細胞活性化エピトープに結合しうる(4つのがん抗原エピトープ及び4つの免疫細胞活性化エピトープを標的化する)。あるいは、該グループのメンバーのサブセットは共通のがん抗原エピトープ及び/又は免疫細胞活性化エピトープを標的化しうる。メンバーの数にかかわらず、各グループは少なくとも2つの異なるがん抗原エピトープを標的化し、特定の実施形態においては、少なくとも2つの異なる免疫細胞活性化エピトープを標的化する。特定の実施形態においては、各グルーピングは少なくとも2つの異なるがん抗原エピトープ及び共通の免疫細胞活性化エピトープ(例えば、CD3又はCD28)を標的化する。
BS−BDCの開示されているグループは、多種多様ながん、例えば副腎がん、膀胱がん、血液がん、骨がん、脳腫瘍、乳がん、がん腫、子宮頸がん、結腸がん、結腸直腸がん、子宮体がん、耳鼻咽喉(ENT)がん、子宮内膜がん、食道がん、胃腸がん、頭頸部がん、ホジキン病、腸がん、腎臓がん、喉頭がん、白血病、肝臓がん、リンパ節がん、リンパ腫、肺がん、メラノーマ、中皮腫、骨髄腫、鼻咽頭がん、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、口腔がん、卵巣がん、膵臓がん、陰茎がん、咽頭がん、前立腺がん、直腸がん、肉腫、精上皮腫、皮膚がん、胃がん、奇形腫、精巣がん、甲状腺がん、子宮がん、膣がん、血管腫瘍及びそれらの転移を標的化するために使用されうる、汎用プラットフォームを提供する。
本開示の態様を以下に更に詳細に記載する。
BS−BDCフォーマット。BS−BDCフォーマットは、がん抗原エピトープに結合する第1結合ドメインと免疫細胞活性化エピトープに結合する第2結合ドメインとを含有するタンパク質を含む。例示的な二重特異性抗体フォーマットは、例えば、WO2009/080251、WO2009/080252、WO2009/080253、WO2009/080254、WO2010/112193、WO2010/115589、WO2010/136172、WO2010/145793及びWO2010/145793に記載されている。
種々の結合ドメインは、抗体、フィブロネクチン、アフィボディ、天然リガンド(例えば、CD28に関するCD80及びCD86)などのような複数の起源に由来しうる。特定の実施形態において、結合ドメインは、がん抗原エピトープ又は免疫細胞活性化エピトープ(例えば、T細胞受容体)に特異的に結合する全抗体又はその結合フラグメント、例えば、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)、Fc及び一本鎖Fvフラグメント(scFv)、若しくは免疫グロブリンの任意の生物学的に有効なフラグメントに由来しうる。抗体又は抗原結合性フラグメントには、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、合成抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ミニボディ及び直鎖状抗体の全部又は一部が含まれる。
ヒト化抗体又はヒト由来の結合ドメインを含むBS−BDCは、非ヒト抗体と比較して、ヒトにおいて低下した免疫原性を有し、少数の非免疫原性エピトープを有する。結合ドメインは、一般に、ヒト対象において低下した抗原性を示すように選択される。結合ドメインは、特に、選択されたがん抗原エピトープ又は免疫細胞活性化エピトープに特異的に結合する任意のペプチドを含みうる。結合ドメインの起源には、種々の種からの抗体可変領域(これは、抗体、sFv、scFv、Fab、scFvに基づくグラバボディ(grababody)、又は可溶性VHドメイン若しくはドメイン抗体の形態でありうる)が含まれる。これらの抗体は、重鎖可変領域のみを用いて抗原結合領域を形成しうる。すなわち、これらの機能的抗体は重鎖のみのホモ二量体である(「重鎖抗体」と称される)(Jespersら,Nat.Biotechnol.22:1161,2004;Cortez−Retamozoら,Cancer Res.64:2853,2004;Baralら,Nature Med.12:580,2006;及びBarthelemyら,J.Biol.Chem.283:3639,2008)。
部分的又は完全合成抗体のファージディスプレイライブラリーが利用可能であり、選択されたエピトープに結合しうる抗体又はそのフラグメントに関してスクリーニングされうる。例えば、結合ドメインは、関心標的に特異的に結合するFabフラグメントに関してFabファージライブラリーをスクリーニングすることにより特定されうる(Hoetら,Nat.Biotechnol.23:344,2005を参照されたい)。ヒト抗体のファージディスプレイライブラリーも利用可能である。また、簡便な系(例えば、マウス、HuMAbマウス(登録商標)、TCマウス(商標)、KMマウス(登録商標)、ラマ、ニワトリ、ラット、ハムスター、ウサギなど)において免疫原として関心標的を使用するハイブリドーマ開発の伝統的な方法が、結合ドメインを開発するために使用されうる。特定の実施形態においては、結合ドメインは、標的化がん細胞及び/又はT細胞により発現される選択されたエピトープに特異的に結合し、非特異的成分又は無関係な標的とは交差反応しない。結合ドメイン内のCDRをコードするアミノ酸配列又はポリヌクレオチド配列は、一旦特定されると、単離及び/又は決定されうる。
結合ドメインの代替的起源には、ランダムペプチドライブラリーをコードする配列、又は代替的非抗体スカフォールドのループ領域における操作された多様性のアミノ酸をコードする配列、例えば、scTCR(Lakeら,Int.Immunol.11:745,1999;Maynardら,J.Immunol.Methods 306:51,2005;米国特許第8,361,794号)、mAb又はFcab(商標)(例えば、PCT特許出願公開番号WO 2007/098934;WO 2006/072620)、アフィボディ(affibody)、アビマー(avimer)、フィノマー(fynomer)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質−4(Weidleら,Cancer Gen.Proteo.10:155,2013)及びその他(Nordら,Protein Eng.8:601,1995;Nordら,Nat.Biotechnol.15:772,1997;Nordら,Euro.J.Biochem.268:4269,2001;Binzら,Nat.Biotechnol.23:1257,2005;Boersma及びPluckthun,Curr.Opin.Biotechnol.22:849,2011)が含まれる。
特定の実施形態においては、抗体フラグメントは、BS−BDCにおける1以上の結合ドメインとして使用される。「抗体フラグメント」は、エピトープに結合する能力を保有する、完全又は全長抗体の一部を意味する。抗体フラグメントの例には、Fv、scFv、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)、ダイアボディ及び直鎖状抗体が含まれる。
一本鎖可変フラグメント(scFv)は、短いリンカーペプチドに連結された免疫グロブリンの重鎖及び軽鎖の可変領域の融合タンパク質である。Fvフラグメントは抗体の単一アームのVLドメイン及びVHドメインを含む。Fvフラグメントの2つのドメインであるVL及びVHは別々の遺伝子によりコードされているが、それらは連結されることが可能であり、例えば、VL領域とVH領域がペアになって1価分子(一本鎖Fv(scFv))を形成している単一タンパク質としてそれらが生成されることを可能にする合成リンカーにより、組換え法を用いて、それらは連結されうる。Fv及びscFvに関する更なる情報に関しては、例えば、Birdら,Science 242(1988)423−426;Hustonら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85(1988)5879−5883;Plueckthun,in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg及びMoore(編),Springer−Verlag,New York),(1994)269−315;WO1993/16185;米国特許第5,571,894号;ならびに米国特許第5,587,458号を参照されたい。
Fabフラグメントは、VL、VH、CL及びCH1ドメインを含む1価抗体フラグメントである。F(ab’)フラグメントは、ヒンジ領域におけるジスルフィド架橋により連結された2つのFabフラグメントを含む2価フラグメントである。インビボ半減期が増加したFab及びF(ab’)フラグメントの考察に関しては、米国特許第5,869,046号を参照されたい。ダイアボディは、2価でありうる2つのエピトープ結合部位を含む。例えば、EP 0404097;WO1993/01161;及びHolligerら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90(1993)6444−6448を参照されたい。二重アフィニティ再標的化抗体(DART(商標);ダイアボディ形態に基づくが、更なる安定化のためのC末端ジスルフィド架橋を特徴とする(Mooreら,Blood 117,4542−51(2011)))も使用されうる。抗体フラグメントは、単離されたCDRをも含みうる。抗体フラグメントの総説は、Hudsonら,Nat.Med.9(2003)129−134を参照されたい。
抗体フラグメントは、本明細書に記載されているとおり、無傷抗体のタンパク質分解消化及び組換え宿主細胞(例えば、ヒト懸濁細胞株、大腸菌(E.coli)又はファージ)による製造を含む種々の技術により製造されうる。抗体フラグメントは、無傷抗体の場合と同様にして、それらの結合特性に関してスクリーニングされうる。
特定の実施形態においては、BS−BDCは結合ドメインとしてのエピトープに対する天然受容体又はリガンドをも含みうる。例えば、結合標的がPD−L1を含む場合、結合ドメインはPD−1(例えば、PD−1/抗CD3融合体を含む)を含みうる。結合のための受容体融合体の一例は、Enbrel(登録商標)(Amgen)である。天然受容体又はリガンドはまた、結合を増強するために修飾されうる。例えば、ベータラセプト(betalacept)はアバタセプト(abatacept)の修飾形態である。特定の実施形態においては、BS−BDCは、食作用を誘導する天然受容体又はリガンドを含みうる。カルレティキュリン(calreticulin)(UniProt ID No.P27797)は、健常細胞の小胞体に局在するタンパク質であるが、瀕死細胞においては、それは細胞表面に移動し、マクロファージのような免疫細胞による食作用を誘導する。特定の実施形態においては、結合ドメインは、カルレティキュリン、又は食作用を誘導しうるカルレティキュリンの一部を含みうる。
結合は、結合ドメインの多量体化から生じるアビディティの増強によっても増強されうる。当技術分野で公知の任意のスクリーニング方法が、抗原エピトープに対するアビディティの増強を特定するために使用されうる。
特定の実施形態においては、BS−BDC形態は、特に標的化されるがん抗原及び免疫細胞活性化エピトープに関して選択された結合ドメインを含有するブリナツモマブ(blinatumomab)に基づくものでありうる。特定の実施形態においては、BS−BDC形態は、特に標的化されるがん抗原及び免疫細胞活性化エピトープに関して選択された結合ドメインを含有するAMG330に基づくものでありうる。
特定の実施形態において、BS−BDC形態は、軽鎖のC末端に結合した一本鎖抗体を含みうる(例えば、Oncoimmunology.2017;6(3):e1267891を参照されたい)。Fc領域の存在は、タンパク質半減期の維持に役立ちうるため、この形態は有用でありうる。Fcは幾つかの受容体と相互作用し、そして免疫応答に寄与しうるため、Fc領域の存在も有用でありうる。抗体−scFv融合体もまた、有用でありうる。なぜなら、該抗体部分はそのエピトープに二量体様態で結合し(これはアビディティを増強する)、そして該scFv部分はそのエピトープに単量体様態で結合する(これは、例えば、T細胞エピトープへの結合に有用でありかつ標的(例えば、がん細胞)の存在下でのみ多量体化を可能にするのに有用である)からである。これらの実施形態は、「三重特異性」でありうる。
使用されうる追加的なBS−BDC形態の総説としては、Brinkmann & Kontermann,mAbs,2017.9:2,182−212,DOI:10.1080/19420862.2016.1268307を参照されたい。
「エピトープ」は、抗原結合性タンパク質、例えば抗体又はT細胞受容体より結合されうる任意の決定基を含む。エピトープは、その抗原を標的化する抗原結合性タンパク質により結合される抗原の領域であり、その抗原がタンパク質である場合には、該抗原結合性タンパク質と直接接触する特定の残基を含む。特定の実施形態においては、「エピトープ」は、対応する結合ドメインにより結合されるタンパク質標的上の結合部位を意味する。結合ドメインは、直鎖状エピトープ(例えば、5〜12個の連続的アミノ酸の伸長を含むエピトープ)に結合するか、又は結合ドメインは、タンパク質標的の短い伸長の幾つかの空間的配置により形成される三次元構造に結合する。結合ドメインにより、例えば、抗体又は抗体フラグメントのエピトープ認識部位又はパラトープにより認識される三次元エピトープは、エピトープ分子の三次元の表面の特徴と考えられうる。これらの特徴は、結合ドメインの対応結合部位に厳密に嵌合し、それにより、結合ドメインとその標的タンパク質との結合が促進される。特定の実施形態においては、エピトープは以下の2つのレベルを有するとみなされうる:(i)抗体又は結合ドメインが投じる暗影と考えられうる「被覆パッチ(covered patch)」、及び(ii)個々の関与側鎖及びバックボーン(骨格)残基。したがって、結合はイオン相互作用、水素結合及び疎水性相互作用の集合体によるものである。
「結合する」は、10−8M以下、特定の実施形態においては10−5M〜10−13M、特定の実施形態においては10−5M〜10−10M、特定の実施形態においては10−5M〜10−7M、特定の実施形態においては10−8M〜10−13M、又は特定の実施形態においては10−9M〜10−13Mの解離定数(1(D))で、結合ドメインがその標的エピトープと会合することを意味する。この語は更に、結合ドメインが、存在する他の生体分子に結合しないこと(例えば、それが、10−4M以上、特定の実施形態においては10−4M〜1Mの解離定数(KD)で、他の生体分子に結合すること)を示すために用いられうる。標的化エピトープは、適切なインビトロ条件下及び本明細書に記載されているインビボ条件下でその対応BS−BDC結合ドメインにより結合されるエピトープである。特定の実施形態においては、結合のための適切なインビトロ条件は、室温又は37℃でほぼ生理的pH(7.4)の緩衝化塩溶液を含みうる。
標的化がん抗原エピトープ。がん細胞抗原はがん細胞により発現される。本開示の重要な特徴の1つは、がん抗原ががん細胞によって優先的に発現される必要がないことである。これは、有意なSMITE誘発性免疫細胞活性化ががん細胞の存在下でのみ生じるからである。一例として、PD−L1はがん細胞及び非がん細胞により発現される。
特定の実施形態においては、がん細胞抗原はがん細胞によって優先的に発現される。「優先的に発現される」は、がん細胞抗原が、他の細胞型と比較して、がん細胞上で、より高いレベルで見出されることを意味する。幾つかの例においては、がん抗原は標的化がん細胞型によってのみ発現される。他の例においては、がん抗原は、標的化がん細胞型上で、非標的細胞上よりも少なくとも25%、35%、45%、55%、65%、75%、85%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%多く発現される。
以下の表は、BS−BDCで標的化されうる特定のがん及びがん抗原の例を示す。
Figure 2019532017
より詳細な例においては、がん細胞抗原には以下のものが含まれる。
Figure 2019532017
Figure 2019532017
Figure 2019532017
当業者に理解されるとおり、標的化抗原は、シグナルペプチド、例えば、配列番号6〜8における代表的なCD33抗原の下線付き断片を欠いている可能性がある。更に、理解されるとおり、「同一(同じ)がん抗原」は、両方の標的化エピトープが同一がん抗原分子上に存在することを可能にし、必ずしもそれを必要としない。すなわち、例えば、ROR1の2つの異なるエピトープが標的化される場合、グループにおける1つのBS−BDCは第1 ROR1分子上の第1エピトープに結合することが可能であり、該グループにおける第2 BS−BDCは、異なるROR1分子上の第2エピトープに結合することが可能である。同様に、第1及び第2エピトープは同一ROR1分子上の第1及び第2 BS−BDCにより結合されうる。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるRORIエピトープ(例えば、ROR1−A及びROR1−B)を標的化する。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、ASGFDFSAYYM(配列番号12)を含むCDRL1配列、TIYPSSG(配列番号13)を含むCDRL2配列及びADRATYFCA(配列番号14)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、DTIDWY(配列番号15)を含むCDRH1配列、VQSDGSYTKRPGVPDR(配列番号16)を含むCDRH2配列及びYIGGYVFG(配列番号17)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、QASQSIDSNLA(配列番号18)を含むCDRL1配列、RASNLAS(配列番号19)を含むCDRL2配列及びLGGVGNVSYRTS(配列番号20)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、DYPIS(配列番号21)を含むCDRH1配列、FINSGGSTWYASWVKG(配列番号22)を含むCDRH2配列及びGYSTYYCDFNI(配列番号23)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらはR11抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、TLSSAHKTDTID(配列番号24)を含むCDRL1配列、GSYTKRP(配列番号25)を含むCDRL2配列及びGADYIGGYV(配列番号26)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、AYYMS(配列番号27)を含むCDRH1配列、TIYPSSGKTYYATWVNG(配列番号28)を含むCDRH2配列及びDSYADDGALFNI(配列番号29)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらはR12抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、KASQNVDAAVA(配列番号30)を含むCDRL1配列、SASNRYT(配列番号31)を含むCDRL2配列及びQQYDIYPYT(配列番号32)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、DYEMH(配列番号33)を含むCDRH1配列、AIDPETGGTAYNQKFKG(配列番号34)を含むCDRH2配列及びYYDYDSFTY(配列番号35)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは2A2抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、QASQSIGSYLA(配列番号36)を含むCDRL1配列、YASNLAS(配列番号37)を含むCDRL2配列及びLGSLSNSDNV(配列番号38)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、SHWMS(配列番号39)を含むCDRH1配列、IIAASGSTYYANWAKG(配列番号40)を含むCDRH2配列及びDYGDYRLVTFNI(配列番号41)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらはY31抗体のCDR配列を表す。
RORIに特異的な多数の追加的な抗体が当業者に公知であり、配列、エピトープ結合及びアフィニティに関して容易に特徴づけられうる。例えば、WO2008076868、WO/2008103849、WO201008069、WO2010124188、WO2011079902、WO2011054007、WO2011159847、WO2012076066、WO2012076727、WO 2012045085及びWO2012097313を参照されたい。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるCD19エピトープを標的化する。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、CD19に特異的なVH及びVL領域を含む結合ドメイン(例えば、scFv)を含む。特定の実施形態においては、V及びV領域はヒト体である。例示的なV及びV領域は抗CD19特異的モノクローナル抗体FMC63のセグメントを含む。特定の実施形態においては、結合ドメイン(例えば、scFv)はヒト体又はヒト化体であり、RASQDISKYLN(配列番号42)を含むCDRL1配列、SRLHSGV(配列番号43)を含むCDRL2配列及びGNTLPYTFG(配列番号44)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。結合ドメイン(例えば、scFv)はヒト体又はヒト化体であり、DYGVS(配列番号45)を含むCDRH1配列、VTWGSETTYYNSALKS(配列番号46)を含むCDRH2配列及びYAMDYWG(配列番号47)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。SJ25C1及びHD37のような他のCD19標的化抗体が公知である(SJ25C1:Bejcekら,Cancer Res 2005,PMID 7538901;HD37:Pezuttoら,JI 1987,PMID 2437199)。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるPSMAエピトープを標的化する。PSMAに特異的な多数の抗体が当業者に公知であり、配列、エピトープ結合及びアフィニティに関して容易に特徴づけられうる。結合ドメインは抗メソテリンリガンド(卵巣がん、膵臓がん及び中皮腫の治療に関連している)をも含みうる。当業者に理解されるとおり、異なるがん抗原エピトープ結合ドメインは、(とりわけ)本明細書に開示されているがん抗原上の多数の異なるエピトープに結合しうる。既に示されているとおり、特定の実施形態においては、異なるエピトープが同一がん抗原上に存在する。特定の実施形態においては、異なるエピトープが、異なるがん抗原上に存在する。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるCD20エピトープを標的化する。リツキサン(Rituxan)(リツキシマブ(Rituximab),Genentech)はCD20陽性非ホジキンリンパ腫のCD20を標的化し、アルゼラ(Arzerra)(オファツムマブ(Ofatumumab),Novartis)は、CD20の異なるエピトープを標的化する。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、RASSSVSYIH(配列番号48)を含むCDRL1配列、ATSNLAS(配列番号49)を含むCDRL2配列及びQQWTSNPPT(配列番号50)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、SYNMH(配列番号51)を含むCDRH1配列、AIYPGNGDTSYNQKFKG(配列番号52)を含むCDRH2配列及びSTYYGGDWYFNV(配列番号53)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは2B8抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、RASQDVNTAVAW(配列番号54)を含むCDRL1配列、YSASFLES(配列番号55)を含むCDRL2配列及びQQHYTTPT(配列番号56)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、SGFNTKDTYIHW(配列番号57)を含むCDRH1配列、RIYPTNGYTRYADSVKGR(配列番号58)を含むCDRH2配列及びWGGDGFYAMDV(配列番号59)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは4D5抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるCD33エピトープを標的化する。
特定の実施形態においては、BS−BDCは全長CD33(CD33FL)のみに、又はエクソン2を欠くCD33のスプライス変異体(CD33ΔE2)のみに、又は(iii)それがCD33FLであるかCD33ΔE2であるかにかかわらず、CD33に結合する。異なるCD33アイソフォームを標的化するBS−BDCのグループは、より高い比率のCD33発現細胞を標的化しうる。なぜなら、それらは、CD33FL及びCD33ΔE2を発現する細胞を標的化しうるからである。更に、CD33ΔE2に結合するBS−BDCは、CD33ΔE2変異体を発現するがCD33FLタンパク質を発現しない細胞に対する治療標的化をもたらす。
図8においては、以下の特異性を有するBS−BDCに関して、以下の可変軽鎖(V)及び可変重鎖(V)が示されている。
Figure 2019532017
CDRの明確な描写及び抗体の結合部位を含む残基の特定は、抗体の構造を解明すること及び/又は抗体−エピトープ複合体の構造を解明することにより達成されうる。特定の実施形態においては、これはX線結晶学のような方法により達成されうる。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、RASEVDNYGISFMN(配列番号76)を含むCDRL1配列、AASNQGS(配列番号77)を含むCDRL2配列及びQQSKEVPW(配列番号78)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化CD33結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、DYNMH(配列番号79)を含むCDRH1配列、YIYPYNGGTGYNQKFKS(配列番号80)を含むCDRH2配列及びGRPAMDY(配列番号81)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化CD33結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらはM195又はHuM195抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、CD33結合ドメインは、配列番号253を含むCDRL1配列、配列番号254を含むCDRL2配列及び配列番号255を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CD33結合ドメインは、配列番号256を含むCDRH1配列、配列番号257を含むCDRH2配列及び配列番号258を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。これらは1H7抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるPD−L1エピトープを標的化する。特定の実施形態においては、PD−L1結合ドメインは、RASQDVSTAVA(配列番号267)を含むCDRL1配列、SASFLYS(配列番号268)を含むCDRL2配列及びQQYLYHPAT(配列番号269)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、PD−L1結合ドメインは、SGFTFSDSWIH(配列番号270)を含むCDRH1配列、WISPYGGSTYYADSVKG(配列番号271)を含むCDRH2配列及びRHWPGGFDY(配列番号272)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、PD−L1結合ドメインは、TGTSSDVGGYNYVS(配列番号273)を含むCDRL1配列、DVSNRPS(配列番号274)を含むCDRL2配列及びSSYTSSSTRV(配列番号275)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、PD−L1結合ドメインは、SGFTFSSYIMM(配列番号276)を含むCDRH1配列、SIYPSGGITFYADTVKG(配列番号277)を含むCDRH2配列及びIKLGTVTTVDY(配列番号259)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのPD−L1結合ドメインは、RASQSVSSYL(配列番号82)を含むCDRL1配列、DASNRAT(配列番号83)を含むCDRL2配列及びQQRSNWPRT(配列番号84)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、DYGFS(配列番号85)を含むCDRH1配列、WITAYNGNTNYAQKLQG(配列番号86)を含むCDRH2配列及びDYFYGMDY(配列番号87)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは3G10抗体のCDR配列を表す。PD−L1に結合する多数の追加的な配列は、例えば、US 2016/0222117に記載されている。
特定の実施形態においては、BS−BDCグループ内に存在するがん抗原エピトープ結合ドメインはそれぞれ、異なるCD123エピトープを標的化する。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、抗CD123 7G3抗体のCDRを含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、RASESVDNYGNTFMH(配列番号88)を含むCDRL1配列、RASNLES(配列番号89)を含むCDRL2配列及びQQSNEDPPT(配列番号90)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、NYGMN(配列番号91)を含むCDRH1配列、WINTYTGESTYSADFKG(配列番号92)を含むCDRH2配列及びSGGYDPMDY(配列番号93)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは、米国特許第8,163,279号に記載されている抗体32716のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、RSNKSLLHSNGNTYLY(配列番号94)を含むCDRL1配列、RMSNLAS(配列番号95)を含むCDRL2配列及びMQHLEYPYT(配列番号96)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのがん抗原エピトープ結合ドメインは、NYWMN(配列番号97)を含むCDRH1配列、RIDPSDSESHYNQKFKD(配列番号98)を含むCDRH2配列及びYDYDDTMDY(配列番号99)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは、米国特許第8,163,279号に記載されている抗体32703のCDR配列を表す。
免疫細胞活性化エピトープ。本開示のSMITEによる局所的活性化のために標的化されうる免疫細胞には、例えば、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞及びマクロファージが含まれる。
T細胞活性化は2つの異なるシグナル[すなわち、抗原依存性一次活性化を開始させ、T細胞受容体様シグナルを与えるもの(一次細胞質シグナリング配列)、及び抗原非依存的に作用して、二次又は同時刺激シグナルを与えるもの(二次細胞質シグナリング配列)]によりもたらされうる。本明細書に開示されているBS−BDCグループは、結合時にT細胞活性化を誘導するT細胞活性化エピトープの任意の組合せを標的化しうる。そのようなT細胞活性化エピトープの例は、CD2、CD3、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CD83、4−1BB(CD137)、OX40、リンパ球機能関連抗原−1(LFA−1)、LIGHT、NKG2C及びB7−H3を含むT細胞マーカー上に存在する。遮断されうるT細胞抑制受容体には、4−1BB、PD−1、LAG3、TIM−3、BTLA、CTLA−4及びCD200が含まれる。
CD3はT細胞受容体の一次シグナル伝達要素である。CD3は、ガンマ(γ)、デルタ(Δ)、イプシロン(ε)、ゼータ(Ζ)及びエータ(Η)鎖と称されるインバリアントタンパク質の一群から構成される。γ鎖、Δ及びε鎖は構造的に関連しており、それぞれは、Ig様細胞外定常ドメイン及びそれに続く膜貫通領域及び40個を超えるアミノ酸の細胞質ドメインを含有する。Ζ鎖及びΗ鎖は、明らかに異なる構造を有し、両方は僅か9アミノ酸の非常に短い細胞外領域、膜貫通領域並びにΖ及びΗ鎖にそれぞれ113アミノ酸及び115アミノ酸を含む長い細胞質テールを有する。CD3複合体におけるインバリアントタンパク質鎖は会合して、ε鎖とγ鎖との非共有結合性ヘテロ二量体(εγ)、又はε鎖とΔ鎖との非共有結合性ヘテロ二量体(εΔ)、又はΖ鎖とΗ鎖との非共有結合性ヘテロ二量体(ΖΗ)、あるいは2つのΖ鎖のジスルフィド結合ホモ二量体(ΖΖ)を形成する。CD33複合体の90%はΖΖホモ二量体を含む。
CD3鎖の細胞質領域は、免疫受容体チロシンに基づく活性化モチーフ(ITAM)と称されるモチーフを含む。このモチーフは、IgE及びIgGに対するFc受容体並びにB細胞受容体複合体のIg−α/Ig−βヘテロ二量体を含む多数の他の受容体において見出される。ITAM部位は細胞質チロシンキナーゼと会合し、TCR媒介誘発後のシグナル伝達に関与する。CD3においては、γ鎖、Δ鎖及びε鎖はそれぞれ、ITAMの単一コピーを含有し、一方、Ζ鎖及びΗ鎖はそれらの長い細胞質領域内に3つのITAMを含有する。実際、Ζ鎖及びΗ鎖はT細胞活性化シグナル伝達経路における主要な役割を担っている。
CD3は全ての成熟T細胞上で発現される。特定の実施形態においては、CD3結合ドメイン(例えば、scFv)はOKT3抗体(ブリナツモマブにおいて使用されているものと同じ)に由来する。OKT3抗体は米国特許第5,929,212号に詳細に記載されている。それは、、SASSSVSYMN(配列番号100)を含むCDRL1配列、RWIYDTSKLAS(配列番号101)を含むCDRL2配列及びQQWSSNPFT(配列番号102)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、KASGYTFTRYTMH(配列番号103)を含むCDRH1配列、INPSRGYTNYNQKFKD(配列番号104)を含むCDRH2配列及びYYDDHYCLDY(配列番号105)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。
以下の配列は、CD3に結合する能力を保有するOKT3に由来するscFvである。
Figure 2019532017
それはまた、CD3結合ドメインとして使用されうる。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、QSLVHNNGNTY(配列番号107)を含むCDRL1配列、KVSを含むCDRL2配列及びGQGTQYPFT(配列番号109)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、GFTFTKAW(配列番号110)を含むCDRH1配列、IKDKSNSYAT(配列番号111)を含むCDRH2配列及びRGVYYALSPFDY(配列番号112)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは20G6−F3抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、QSLVHDNGNTY(配列番号113)を含むCDRL1配列、KVSを含むCDRL2配列及びGQGTQYPFT(配列番号115)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、GFTFSNAW(配列番号116)を含むCDRH1配列、IKARSNNYAT(配列番号117)を含むCDRH2配列及びRGTYYASKPFDY(配列番号118)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは4B4−D7抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、QSLEHNNGNTY(配列番号119)を含むCDRL1配列、KVSを含むCDRL2配列及びGQGTQYPFT(配列番号121)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、GFTFSNAW(配列番号122)を含むCDRH1配列、IKDKSNNYAT(配列番号123)を含むCDRH2配列及びRYVHYGIGYAMDA(配列番号124)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは4E7−C9抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、QSLVHTNGNTY(配列番号125)を含むCDRL1配列、KVSを含むCDRL2配列及びGQGTHYPFT(配列番号127)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD3 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、GFTFTNAW(配列番号128)を含むCDRH1配列、KDKSNNYAT(配列番号129)を含むCDRH2配列及びRYVHYRFAYALDA(配列番号130)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらは18F5−H10抗体のCDR配列を表す。
抗CD3抗体、結合ドメイン及びCDRの追加的な例はWO2016/116626において見出されうる。TR66も使用されうる。
CD28は、ヒトにおける末梢T細胞の80%に存在する表面糖タンパク質であり、休止T細胞及び活性化T細胞の両方に存在する。CD28はB7−1(CD80)及びB7−2(CD86)に結合し、公知の同時刺激分子の中で最も強力である(Juneら,Immunol.Today 15:321(1994);Linsleyら,Ann.Rev.Immunol.11:191(1993))。特定の実施形態においては、CD28結合ドメイン(例えば、scFv)はCD80、CD86又は9D7抗体に由来する。CD28に結合する追加的な抗体には、9.3、KOLT−2、15E8、248.23.2及びEX5.3D10が含まれる。更に、1YJDは、分裂促進性抗体(5.11A1)のFabフラグメントと複合体を形成したヒトCD28の結晶構造を与える。特定の実施形態においては、9D7と競合しない抗体が選択される。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはCD28のエピトープに結合する。特定の実施形態においては、CD28結合ドメインはTGN1412抗体のCDRを含む。特定の実施形態においては、CD28結合ドメインは、HASQNIYVWLN(配列番号131)を含むCDRL1配列、KASNLHT(配列番号132)を含むCDRL2配列及びQQGQTYPYT(配列番号133)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CD28結合ドメインは、SYYIH(配列番号134)を含むCDRH1配列、CIYPGNVNTNYNEKFKD(配列番号135)を含むCDRH2配列及びSHYGLDWNFDV(配列番号136)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはCD80/CD86のエピトープに結合する。CD80(B7−1、UniProt ID No.P33681、配列番号137とも称される)及びCD86(B7−2、UniProt ID No.P42081、配列番号138とも称される)は共に、T細胞活性化及び生存のための同時刺激シグナルを与える。特定の実施形態においては、CD80/CD86結合ドメイン(例えば、scFV)は、米国特許第7,531,175号に記載されている1以上のモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、CD80/CD86結合ドメインは、SVSSSISSSNLH(配列番号139)を含むCDRL1配列、GTSNLAS(配列番号140)を含むCDRL2配列及びQQWSSYPLT(配列番号141)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CD80/CD86結合ドメインは、DYYMH(配列番号142)を含むCDRH1配列、WIDPENGNTLYDPKFQG(配列番号143)を含むCDRH2配列及びEGLFFAY(配列番号144)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
活性化T細胞は4−1BB(CD137)を発現する。T細胞は更に、ヘルパー細胞(CD4+ T細胞)及び細胞傷害性T細胞(CTL、CD8+ T細胞)(これは細胞溶解性T細胞を含む)に分類されうる。Tヘルパー細胞は、とりわけ、形質細胞へのB細胞の成熟並びに細胞傷害性T細胞及びマクロファージの活性化を含む免疫学的過程において他の白血球を補助する。これらの細胞は、それらの表面上でCD4タンパク質を発現するため、CD4+ T細胞としても公知である。ヘルパーT細胞は、それが、抗原提示細胞(APC)の表面上で発現されるMHCクラスII分子によりペプチド抗原と共に提示されると、活性化される。それは、一旦活性化されると、急速に分裂し、活性免疫応答を調節又は補助するサイトカインと称される小さなタンパク質を分泌する。
特定の実施形態は、CD3、TLR2若しくはCD28に結合することにより、並びに/又は4−1BB、PD−1、LAG3、TIM−3、BTLA、CTLA−4、CD200及び/若しくはVISTAに結合してCD4 T細胞の抑制を遮断することにより、CD4 T細胞を活性化することを含みうる。
TLR2(UniProt ID No.O60603、配列番号145)は細菌性リポタンパク質及び他の微生物細胞壁成分に対する自然免疫応答に関与する。特定の実施形態においては、TLR2結合ドメインは抗TLR2抗体に由来する。商業的に入手可能な抗TLR2抗体には、抗hTLR2−IgA及びmAb−hTLR2(共にInvivogenから入手可能)が含まれる。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCは同時刺激受容体4−1BBのエピトープに結合する。4−1BBはCD137又はTNFSF9(UniProt ID No.Q07011、配列番号146)とも称され、T細胞同時刺激受容体である。特定の実施形態においては、4−1BB結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許第9,382,328B2号に記載されているモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、4−1BB結合ドメインは、RASQSVS(配列番号147)を含むCDRL1配列、ASNRAT(配列番号148)を含むCDRL2配列及びQRSNWPPALT(配列番号149)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、4−1BB結合ドメインは、YYWS(配列番号150)を含むCDRH1配列、INHを含むCDRH2配列及びをYGPGNYDWYFDL(配列番号152)含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、4−1BB結合ドメインは、SGDNIGDQYAH(配列番号261)を含むCDRL1配列、QDKNRPS(配列番号262)を含むCDRL2配列及びATYTGFGSLAV(配列番号263)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、4−1BB結合ドメインは、GYSFSTYWIS(配列番号264)を含むCDRH1配列、KIYPGDSYTNYSPS(配列番号265)を含むCDRH2配列及びGYGIFDY(配列番号266)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはプログラム細胞死タンパク質1(PD−1)のエピトープに結合する。PD−1はCD279(UniProt ID No.Q15116、配列番号153)とも称され、T細胞免疫応答の調節に関与する抑制性細胞表面受容体である。特定の実施形態においては、PD−1結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許公開第2011/0271358号に記載されているモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、PD−1結合ドメインは、RASQSVSTSGYSYMH(配列番号154)を含むCDRL1配列、FGSNLES(配列番号155)を含むCDRL2配列及びQHSWEIPYT(配列番号156)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、PD−1結合ドメインは、SSWIH(配列番号157)を含むCDRH1配列、YIYPSTGFTEYNQKFKD(配列番号158)を含むCDRH2配列及びWRDSSGYHAMDY(配列番号159)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、PD−1結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許出願第20090217401A1号に記載されているモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態では、PD−1結合ドメインは、RASQSVSSYLA(配列番号160)を含むCDRL1配列、DASNRAT(配列番号161)を含むCDRL2配列及びQQSSNWPRT(配列番号162)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、PD−1結合ドメインは、NSGMH(配列番号163)を含むCDRH1配列、VLWYDGSKRYYADSVKG(配列番号164)を含むCDRH2配列及びNDDY(配列番号165)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはリンパ球活性化遺伝子3タンパク質(LAG3)のエピトープに結合する。LAG3はCD223(UniProt ID No.P18627、配列番号166)とも称され、HLAクラスII抗原に結合し、リンパ球の活性化に関与する。特定の実施形態においては、LAG3結合ドメイン(例えば、scFv)は、PCT特許公開WO/2014/008218に記載されているモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、LAG3結合ドメインは、RASQSISSYLA(配列番号167)を含むCDRL1配列、DASNRAT(配列番号168)を含むCDRL2配列及びQQRSNWPLT(配列番号169)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、LAG3結合ドメインは、DYYWN(配列番号170)を含むCDRH1配列、EINHRGSTNSNPSLKS(配列番号171)を含むCDRH2配列及びGYSDYEYNWFDP(配列番号172)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはT細胞免疫グロブリンムチン受容体3(TIM−3)のエピトープに結合する。TIM−3はHAVcr−2又はTIMD−3(UniProt ID No.Q9TDQ0;配列番号173)としても公知であり、自然免疫応答及び適応免疫応答において抑制的な役割を果たす細胞表面受容体である。特定の実施形態においては、TIM−3結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許公開第2015/0218274号に記載されているモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、TIM−3結合ドメインは、SESVEYYGTSL(配列番号174)を含むCDRL1配列、AASを含むCDRL2配列及びSRKDPS(配列番号176)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、TIM−3結合ドメインは、GYTFTSY(配列番号177)を含むCDRH1配列、YPGNGD(配列番号178)を含むCDRH2配列及びVGGAFPMDY(配列番号179)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはB及びTリンパ球アテニュエーター(BTLA)のエピトープに結合する。BTLAはCD272(UniProt ID No.Q7Z6A9、配列番号180)としても公知であり、リンパ球の免疫応答を抑制する抑制性受容体である。特定の実施形態においては、BTLA結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許公開第2012/0288500号に記載されている1以上のモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、BTLA結合ドメインは、RASQSVSSSYLA(配列番号181)を含むCDRL1配列、GASSRAT(配列番号182)を含むCDRL2配列及びQQYGSSIT(配列番号183)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、BTLA結合ドメインは、TIGVGVN(配列番号184)を含むCDRH1配列、LIYWDDDKRYSPSLKR(配列番号185)を含むCDRH2配列及びSGITEVRGVIIHYYGMDV(配列番号186)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、BTLA結合ドメインは、RASQSVSSSYLA(配列番号187)を含むCDRL1配列、GASSRAT(配列番号188)を含むCDRL2配列及びQQYGSSPPIT(配列番号189)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、BTLA結合ドメインは、TSGMCVS(配列番号190)を含むCDRH1配列、LIDWDDVKYYSSSLKT(配列番号191)を含むCDRH2配列及びIRFTMFRGVYYYYYGLDV(配列番号192)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCは細胞傷害性Tリンパ球タンパク質5(CTLA−4)のエピトープに結合する。CTLA−4はCD152(UniProt ID No.P16410、配列番号193)としても公知であり、T細胞応答の主要な負の調節因子である抑制性受容体である。特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許第6,984,720号に記載されているモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインはHu26B抗体のCDRを含む。特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインは、RASQSVGSSYLA(配列番号194)を含むCDRL1配列、GAFSRAT(配列番号195)を含むCDRL2配列及びQQYGSSPWT(配列番号196)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインは、SYTMH(配列番号197)を含むCDRH1配列、FISYDGNNKYYADSVKG(配列番号198)を含むCDRH2配列及びTGWLGPFDY(配列番号199)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインは、RASQGISSWLA(配列番号200)を含むCDRL1配列、AASSLQS(配列番号201)を含むCDRL2配列及びQQYNSYPPT(配列番号202)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインは、SYGMH(配列番号203)を含むCDRH1配列、VIWYDGSNKYYADSVKG(配列番号204)を含むCDRH2配列及びAPNYIGAFDV(配列番号205)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインは、SATSSITYMS(配列番号206)を含むCDRL1配列、DTSNLAS(配列番号207)を含むCDRL2配列及びQQWSSYPLT(配列番号208)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CTLA−4結合ドメインは、SYGVY(配列番号209)を含むCDRH1配列、VIWAGGTTNYNSALMS(配列番号210)を含むCDRH2配列及びGPPHAMMKRGYAMDY(配列番号211)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。これらは、米国特許出願US20020039581A1に記載されているCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはCD200のエピトープに結合する。CD200(ox−2膜糖タンパク質としても公知である;UniProt ID No.P41217、配列番号212)は、免疫細胞に抑制性シグナルを送達しうるタンパク質である。特定の実施形態においては、CD200結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許公開第2013/0189258号に記載されている1以上のモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、CD200結合ドメインは、RASESVDSYGNSFMH(配列番号213)を含むCDRL1配列、RASNLES(配列番号214)を含むCDRL2配列及びQQSNEDPRT(配列番号215)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、CD200結合ドメインは、GFTFSGFAMS(配列番号216)を含むCDRH1配列、SISSGGTTYYLDSVKG(配列番号217)を含むCDRH2配列及びGNYYSGTSYDY(配列番号218)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCは、T細胞活性化前駆体のV型免疫グロブリンドメイン含有抑制因子(VISTA;NP 071436.1;配列番号219)のエピトープに結合する。VISTAに対する結合ドメインは、例えば、R&D Systems,LifeSpan Biosciences,Invitrogen,BioLegend,BD Biosciences及びAbcamから入手可能な抗体に由来しうる。特定の実施形態においては、VISTA結合ドメイン(例えば、scFv)は、米国特許出願第2017/0051061号又は国際特許公開WO2015097536A2に記載されている1以上のモノクローナル抗体に由来する。特定の実施形態においては、VISTA結合ドメイン(例えば、scFv)は、VISTAに結合しVISTAシグナリングを抑制する抗体JNJ−61610588に由来する。特定の実施形態においては、VISTA結合ドメインは、GGTFSSY(配列番号220)を含むCDRL1配列、IIPIFGT(配列番号221)を含むCDRL2配列及びARSSYGW(配列番号222)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含む。特定の実施形態においては、VISTA結合ドメインは、QSIDTR(配列番号223)を含むCDRH1配列、SASを含むCDRH2配列及びQQSAYNP(配列番号225)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含む。
細胞傷害性T細胞は腫瘍細胞を破壊する。これらの細胞は、それらの表面にCD8糖タンパク質を発現するため、CD8+ T細胞としても公知である。これらの細胞は、身体のほぼ全ての細胞の表面上に存在するMHCクラスIに関連する抗原に結合することにより、それらの標的を認識する。特定の実施形態は、CD3、CD28若しくは4−1BBに結合することにより、及び/又はPD−1、LAG3、TIM−3若しくはVISTAに結合してCD8 T細胞の抑制を遮断することにより、CD8 T細胞を活性化することを含みうる。
CD8上のエピトープに結合する結合ドメインを含む、本明細書に開示されている特定の実施形態。特定の実施形態においては、CD8結合ドメイン(例えばscFv)はOKT8抗体に由来する。例えば、特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD8 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、RTSRSISQYLA(配列番号226)を含むCDRL1配列、SGSTLQS(配列番号227)を含むCDRL2配列及びQQHNENPLT(配列番号228)を含むCDRL3配列を含む可変軽鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。特定の実施形態においては、グループにおける少なくとも1つのBS−BDCのCD8 T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、GFNIKD(配列番号229)を含むCDRH1配列、RIDPANDNT(配列番号230)を含むCDRH2配列及びGYGYYVFDH(配列番号231)を含むCDRH3配列を含む可変重鎖を含むヒト又はヒト化結合ドメイン(例えば、scFv)である。これらはOKT抗体のCDR配列を表す。
特定の実施形態においては、結合ドメインは、関心のある標的エピトープに特異的なVα−Cα、Vβ−Cβ、Vα−Vβペアを含む、又はVα/β及びCα/β鎖(例えば、Vα−Cα、Vβ−Cβ、Vα−Vβ)を含む一本鎖T細胞受容体(scTCR)である。特定の実施形態においては、T細胞活性化エピトープ結合ドメインは公知TCR(例えば、高アフィニティTCR)のVα、Vβ、Cα又はCβに由来する又は基づくことが可能である。
特定の実施形態においては、T細胞活性化エピトープ結合ドメインは、公知TCRのVα、Vβ、Cα又はCβと比較した場合の1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)の挿入、1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)の欠失、1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)のアミノ酸置換(例えば、保存的アミノ酸置換又は非保存的アミノ酸置換)又は前記変化の組合せを含む。挿入、欠失又は置換はVα、Vβ、Cα又はCβ領域(これらの領域のアミノ若しくはカルボキシ末端又は両端を含む)のどこに存在していてもよいが、ただし、各CDRは変化を含まないか、又は多くとも1つ、2つ若しくは3つの変化を含み、Vα、Vβ、Cα又はCβ領域を含む結合ドメインは、野生型に類似したアフィニティでその標的に尚も特異的に結合しうる。
特定の実施形態においては、ナチュラルキラー細胞(NK細胞、K細胞及びキラー細胞としても公知である)はSMITEによる局所的活性化のために標的化される。NK細胞は、細胞膜を破壊する顆粒を放出することによりアポトーシス又は細胞溶解を誘導することが可能であり、サイトカインを分泌して他の免疫細胞をリクルートしうる。
NK細胞の表面上で発現される活性化タンパク質の例には、NKG2D、CD8、CD16、KIR2DL4、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR3DS1、NKG2C、NKG2E、NKG2D及び天然細胞傷害性受容体(NCR)ファミリーの幾つかのメンバーが含まれる。リガンド結合の際にNK細胞を活性化するNCRの例には、NKp30、NKp44、NKp46、NKp80及びDNAM−1が含まれる。
NK細胞受容体に結合し、NK細胞の活性化を誘導及び/又は増強する商業的に入手可能な抗体の例には、NCG2Dに結合しそれを活性化する5C6及び1D11(BioLegend(登録商標)San Diego,CAから入手可能)、KIR2DL4に結合しそれを活性化するmAb 33(BioLegend(登録商標)から入手可能)、NKp44に結合しそれを活性化するP44−8(BioLegend(登録商標)から入手可能)、CD8に結合しそれを活性化するSK1、並びにCD16に結合しそれを活性化する3G8が含まれる。
特定の実施形態においては、BS−BDCはNK細胞抑制性受容体に結合し、それを遮断して、NK細胞活性化を増強しうる。結合及び遮断されうるNK細胞抑制性受容体の例には、KIR2DL1、KIR2DL2/3、KIR3DL1、NKG2A及びKLRG1が含まれる。特定の実施形態においては、NK細胞抑制性受容体KIR2DL1及びKIR2DL2/3に結合し、それらを遮断する結合ドメインは、配列
Figure 2019532017
の可変軽鎖領域、及び配列
Figure 2019532017
の可変重鎖領域を含む。
追加的なNK細胞活性化抗体はWO/2005/0003172及び米国特許第9,415,104号に記載されている。
特定の実施形態においては、マクロファージはSMITEによる局所的活性化のために標的化される。マクロファージは、食作用として公知の過程で細胞、細胞片及び/又は異物を飲み込み消化しうる一種の白血球(又は白血球細胞)である。
BS−BDCグループは、マクロファージの表面上で発現されるタンパク質に結合するように設計されうる。マクロファージ(及びそれらの前駆体、単球)の表面上で発現される活性化タンパク質の例には、CD11b、CD11c、CD64、CD68、CD119、CD163、CD206、CD209、F4/80、IFGR2 Toll様受容体(TLR)1〜9、IL−4Rα及びMARCOが含まれる。マクロファージの表面上で発現されるタンパク質に結合する商業的に入手可能な抗体には、CD11bに結合しそれを活性化するM1/70(BioLegend(登録商標)から入手可能)、CD68に結合しそれを活性化するKP1(ABCAM(登録商標),Cambridge,United Kingdomから入手可能)、及びCD163に結合しそれを活性化するab87099(ABCAM(登録商標)から入手可能)が含まれる。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはCD40のエピトープに結合する。CD40(又は腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー5、UniProt ID No.P25942、配列番号234)は、マクロファージにおいて活性化シグナルを伝達しうる受容体である。特定の実施形態においては、CD40結合ドメインはCD40活性化抗体CP−870,893に由来する。
特定の実施形態においては、マクロファージ(及びそれらの前駆体、単球)により発現される抑制性タンパク質の例には、プログラム細胞死リガンド1及び2(PD−L1及びPD−L2)及びガレクチン9(Gal−9)が含まれる。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはPD−L1に結合し、それを抑制する。PD−L1(CD274又はB7−H1としても公知;UniProt ID No.Q9NZQ7、配列番号235)はT細胞増殖及びサイトカイン産生を抑制しうる。特定の実施形態においては、PD−L1結合ドメインは抗PD−L1抗体に由来しうる。PD−L1を遮断する商業的に入手可能な抗体の一例はニボルマブ(Nivolumab)である。PD−L1に結合し、それを中和する中和抗体の一例はモノクローナル抗体71213(BPS Bioscienceから入手可能)である。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはPD−L2のエピトープに結合する。PD−L2(CD273としても公知;UniProt ID No.Q9WUL5、配列番号236)はTIM−3と相互作用し、調節性T細胞の増殖を誘導し、細胞傷害性T細胞のアポトーシスを誘導しうる。特定の実施形態においては、PD−L2結合ドメインは抗PD−L2抗体に由来する。商業的に入手可能なPD−L2抗体の一例には、TY25(Abcamから入手可能なab21107)が含まれる。
特定の実施形態においては、グループ内の少なくとも1つのBS−BDCはGal−9(UniProt ID No.O00182、配列番号237)のエピトープに結合する。特定の実施形態においては、Gal−9結合ドメインは、TIM−3への結合を遮断する抗Gal−9抗体に由来しうる。TIM−3結合を遮断する商業的に入手可能な抗Gal−9抗体の一例は9M1−3(Biolegendから入手可能)である。
特定の実施形態においては、SMITEは病原体認識受容体(PRR)を標的化しうる。PRRは、危険なシグナルを認識し、自然免疫応答を活性化及び/又は増強するタンパク質又はタンパク質複合体である。PRRの例には、グラム陰性菌を認識するTLR4/MD−2複合体、真菌及び他の病原体上のマンノース部分を認識するデクチン(Dectin)−1及びデクチン−2、グラム陽性菌を認識するTLR2/TLR6又はTLR2/TLR1ヘテロ二量体、フラジェリンを認識するTLR5、ならびにDNAにおけるCpGモチーフを認識するTLR9(CD289)が含まれる。特定の実施形態においては、BS−BDCはTLR4/MD−2、デクチン−1、デクチン−2、TRL2/TLR6、TLR2/TLR1、TLR5及び/又はTLR9に結合し、活性化しうる。
特定の実施形態においては、SMITEは補体系を標的化しうる。補体系は、抗原結合抗体により誘導され補体タンパク質のシグナル伝達に関与して免疫認識及び抗体被覆抗原の排除をもたらす免疫経路を意味する。特定の実施形態においては、BS−BDCは補体活性化抗体に結合しうる。
示されているとおり、特定の実施形態においては、本開示の結合ドメインV領域は、公知モノクローナル抗体のVに由来又は基づくことが可能であり、公知モノクローナル抗体のVと比較した場合の1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)の挿入、1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)の欠失、1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)のアミノ酸置換(例えば、保存的アミノ酸置換又は非保存的アミノ酸置換)又は前記変化の組合せを含みうる。挿入、欠失又は置換はV領域(この領域のアミノ若しくはカルボキシ末端又は両端を含む)のどこに存在していてもよいが、ただし、各CDRは変化を含まないか、又は多くとも1つ、2つ若しくは3つの変化を含み、修飾V領域を含む結合ドメインは、野生型結合ドメインに類似したアフィニティでその標的に尚も特異的に結合しうる。
特定の実施形態においては、本開示の結合ドメインにおけるV領域は、公知モノクローナル抗体のVに由来又は基づくことが可能であり、公知モノクローナル抗体のVと比較した場合の1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)の挿入、1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)の欠失、1以上(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10個)のアミノ酸置換(例えば、保存的アミノ酸置換又は非保存的アミノ酸置換)又は前記変化の組合せを含む。挿入、欠失又は置換はV領域(この領域のアミノ若しくはカルボキシ末端又は両端を含む)のどこに存在していてもよいが、ただし、各CDRは変化を含まないか、又は多くとも1つ、2つ若しくは3つの変化を含み、修飾V領域を含む結合ドメインは、野生型結合ドメインに類似したアフィニティでその標的に尚も特異的に結合しうる。
特定の実施形態においては、結合ドメインは、軽鎖可変領域(V)又は重鎖可変領域(V)又は両方の既知アミノ酸配列に対して少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.5%又は100%同一である配列を含む又は該配列であり、ここで、各CDRは、関心のある標的に特異的に結合するモノクローナル抗体又はそのフラグメント若しくは誘導体からの変化を含まないか、又は多くとも1つ、2つ若しくは3つの変化を含む。
特定の実施形態は、2つの異なるがん抗原エピトープ並びにCD3及びCD28に結合するBS−BDCグループを含む。特定の実施形態は、異なるがん抗原エピトープ並びにCD3、CD28及びCD137(4−1BB)に結合するBS−BDCグループを含む。特定の実施形態は、異なるがん抗原エピトープ、並びに(i)CD3上の2つの異なるエピトープ及び(ii)CD28に結合するBS−BDC基を含む。特定の実施形態は、異なるがん抗原エピトープ、並びに(i)CD28上の2つの異なるエピトープ及び(ii)CD3に結合するBS−BDCグループを含む。
特定の実施形態は、ROR1/CD3、ROR1/CD28、CD33/CD3、CD19/CD3、CD123/CD3、CD33/CTLA−4、CD33/CD28、CD123/CD28、及びPD−L1/CD28に結合するBS−BDCを含む。特定の実施形態は、以下の表1に示されているとおり、T細胞活性化エピトープと組合されたがん抗原エピトープを使用しうる。
Figure 2019532017
この表及び本明細書の他の部分においては、ROR1−AはR11と同義に解釈されることが可能であり、ROR1−Bは2A2と同義に解釈されることが可能であり、ROR1−aはR12と同義に解釈されることが可能である。R12抗体は、R11及び2A2により結合されるエピトープとは異なる非重複性であるエピトープを標的化する。R11及び2A2は、異なる非競合性であるエピトープを標的化し、したがって、これらの2つはROR−1に同時に結合しうる。
前記表におけるROR1エピトープは、本明細書に開示されている他のがん抗原(例えば、CD19、CD33、PSMA、メソテリン、CD123、PD−L1)由来のエピトープで置換されうる。特定の実施形態はBS−BDCグループ内にROR1/CD3及びROR1/CD28 BS−BDCを含む。特定の実施形態はBS−BDCグループ内にROR1/CD28及びCD33/CD3 BS−BDCを含む。特定の実施形態はBS−BDCグループ内にCD33/CD3及びPD−L1/CD28 BS−BDCを含む。特定の実施形態はBS−BDCグループ内にCD19/CD3及びPD−L1/CD28 BS−BDCを含む。特定の実施形態はBS−BDCグループ内にCD123/CD28及びCD123/CD3 BS−BDCを含む。特定の実施形態はBS−BDCグループ内にCD33/CD3及びCD123/CD28 BS−BDCを含む。
特定の実施形態においては、BS−BDCの各グループは同一がん抗原上の少なくとも2つの異なるエピトープを標的化する。追加的なエピトープが標的化される場合、該追加的エピトープは同一がん抗原上に存在することが可能であり、又は異なるがん抗原上に存在することが可能である。
本明細書に記載されているBS−BDCグループ内で使用されうる二重特異性T細胞結合抗体の特定の例には、とりわけ、MDT000098(配列番号238;bAb_2A2−CD28−His)、MDT000099(配列番号239;bAb_2A2−CD8−His)、MDT000100(配列番号240;bAb_R11−CD3−Myc−His)、MDT000327(配列番号241;bAb_R11−CD3−His(MDT000100の形態2))、MDT000346(配列番号242;bAb_R11−CD28−His)、MDT000320(配列番号243;bAb_R12−CD3−His)、MDT000347(配列番号244;_bAb_R12−CD28−His)、MDT000319(配列番号245;_bAb_2A2−CD3−His)、MDT000359(配列番号246;_bAb_PDL1−CD28−His)、MDT000479(配列番号247;_scFv_CD28_TGN1412−His)、MDT000480(配列番号248;_scFv_PDL1_Tecentriq−His)、MDT000244(配列番号249;_bAb_Blincyto−His)、MDT000245(配列番号250;bAb_AMG330−His)、MDT000470(配列番号251;_bAb_Blincyto−CD28−His)、ROR1及び4−1BBを標的化するBS−BDC(配列番号252;bAb_R12−CD137−His)、WO2014/167022に記載されているROR1/CD3二重特異性抗体、CD19/CD3抗体(ブリナツモマブ)、US 2016/0208001に記載されているCD19/CD3抗体、並びに/又はUS 2014/0302037及びUS 2014/0308285に記載されているHer2/CD3抗体が含まれる。
示されているとおり、BS−BDCの結合ドメインはリンカーを介して連結されうる。リンカーは、BS−BDCの結合ドメイン間のコンホメーション移動のための柔軟性及び空間を提供しうるアミノ酸配列である。任意の適切なリンカーが、使用されうる。リンカーの例は、Chenら,Adv Drug Deliv Rev.2013 Oct 15;65(10):1357−1369において見出されうる。リンカーは、標的に対する所望の機能ドメイン提示に応じて、柔軟性、剛性又は半剛性でありうる。一般的に使用される柔軟性(可動性)リンカーには、Gly−Serリンカー、例えば、GGSGGGSGGSG(配列番号120)、GGSGGGSGSG(配列番号151)及びGGSGGGSG(配列番号175)が含まれる。追加的な例には、GGGGSGGGGS(配列番号224)、GGGSGGGS(配列番号108)及びGGSGGS(配列番号114)が含まれる。1以上の抗体ヒンジ領域及び/又は免疫グロブリン重鎖定常領域、例えばCH3のみ又はCH2CH3配列を含むリンカーも使用されうる。
幾つかの場合には、柔軟性リンカーは、個々の用途に必要な結合ドメインの距離又は配置を維持し得ない可能性がある。これらの場合には、剛性又は半剛性リンカーが有用でありうる。剛性又は半剛性リンカーの例には、プロリンに富むリンカーが含まれる。特定の実施形態においては、プロリンに富むリンカーは、偶然のみに基づいて予想されるものより多数のプロリン残基を有するペプチド配列である。特定の実施形態においては、プロリンに富むリンカーは、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも36%、少なくとも39%、少なくとも40%、少なくとも48%、少なくとも50%又は少なくとも51%のプロリン残基を有するものである。プロリンに富むリンカーの特定の例には、プロリンに富む唾液タンパク質(唾液Pr蛋白)(PRP)の断片が含まれる。
特定の実施形態においては、本明細書に開示されているBS−BDCは、Pechmanら,Am J Physiol 294:R1234−R1239,2008に記載されているようなダイダロス(Daedalus)発現系を使用して形成される。ダイダロス系は、ゲノムサイレンシングを低減又は予防し、デシグラムレベルの発現の安定性を維持するのを助けるために、導入ベクターにおける最小化遍在性クロマチンオープニングエレメントの含有を利用する。この系は、293 Freestyleのような無血清適応ヒト懸濁細胞株の分泌経路を使用することによる他のタンパク質製造方法の、面倒で時間のかかる工程を回避しうる。最適化レンチウイルスベクターを使用して、70kDaまでのサイズの適切にフォールディングした翻訳後修飾エンドトキシン非含有タンパク質が、20〜100mg/lの収量で、通常の小規模(100ml)の培養において得られうる。これらの収量においては、ほとんどのタンパク質は、構造的、生物物理学的又は治療的用途での使用に直接的に適した単一のサイズ排除クロマトグラフィー工程を用いて精製されうる。Bandaranayakeら,Nucleic Acids Res.,2011(Nov);39(21)。幾つかの場合には、本明細書に記載されている方法による製造の純度ゆえに、クロマトグラフィーによる精製は不要かもしれない。
特定の実施形態は、適切な調節配列に機能的に連結された1以上の目的タンパク質をコードする核酸配列を含むDNA構築物(例えば、キメラ遺伝子、発現カセット、発現ベクター、組換えベクターなど)を使用する。そのようなDNA構築物は、天然に存在するDNA分子ではなく、目的の選択されたタンパク質を発現させるためにDNAを宿主細胞内に導入するのに有用である。
機能的に連結(された)は、コードされたタンパク質が発現されるようにDNA配列を連結すること(配列の順序、配列の配向及び種々の配列の相対的間隔を含む)を意味する。発現制御配列をコード配列に機能的に連結する方法は当技術分野においてよく知られている。例えば、Maniatisら,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,N.Y.,1982;及びSambrookら,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,N.Y.,1989を参照されたい。
発現制御配列は、転写又は翻訳の制御に何らかの形で関与するDNA配列である。適切な発現制御配列並びにそれらを製造及び使用する方法は当技術分野においてよく知られている。発現制御配列は一般にプロモーターを含む。プロモーターは誘導性又は構成的でありうる。それは、天然に存在するものであることが可能であり、天然に存在する種々のプロモーターの一部分から構成されることが可能であり、又は部分的若しくは全体的に合成物であることが可能である。プロモーター設計のための指針は、プロモーター構造の研究、例えば、Harley及びReynolds,Nucleic Acids Res.,15,2343−2361,1987の研究により示されている。また、転写開始位置に対するプロモーターの位置が最適化されうる。例えば、Robertsら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,76:760−764,1979を参照されたい。
プロモーターは1以上のエンハンサーエレメントを含むことが可能であり、又は1以上のエンハンサーエレメントを含むように修飾されうる。特定の実施形態においては、プロモーターは複数のエンハンサーエレメントを含む。エンハンサーエレメントを含むプロモーターは、それらを含まないプロモーターと比較して高いレベルの転写をもたらしうる。
効率的な発現のためには、コード配列は3’非翻訳配列に機能的に連結されうる。特定の実施形態においては、3’非翻訳配列は転写終結配列及びポリアデニル化配列を含みうる。3’非翻訳領域は、例えば、遺伝子の隣接領域から得られうる。
特定の実施形態では、5’非翻訳リーダー配列も使用されうる。5’非翻訳リーダー配列は、5’CAP部位から翻訳開始コドンまで伸長するmRNAの一部である。
特定の実施形態においては、Avitag(アビタグ)アミノ酸配列“GLNDIFEAQKIEWHE”(配列番号126)をコードするヌクレオチド、及び6×ヒスチジンタグコード配列“HHHHHH(配列番号260)”を付加することにより、「hisavi」タグが遺伝子のN末端又はC末端に付加されうる。Avitagアビディティータグは、タンパク質精製のためのビオチン−アビジン又はビオチン−ストレプトアビジンに基づく相互作用、ならびに抗ビオチン抗体を使用する免疫生物学的方法(例えば、免疫ブロット法又は免疫蛍光法)を可能にするためにビオチンリガーゼによりビオチン化されうる。6×ヒスチジンタグは、Ni−2+アフィニティークロマトグラフィーを用いるタンパク質精製を可能にする。
本明細書に開示されているタンパク質をコードする核酸配列は、当業者により誘導されうる。核酸配列はまた、種々の配列多型、突然変異及び/又は配列変異体の1以上を含みる。特定の実施形態においては、配列多型、突然変異及び/又は配列変異体は、コードされたタンパク質の機能に影響を及ぼさない。配列はまた、天然配列の縮重コドン、又はコドン優先性を付与するために導入されうる配列を含みうる。
幾つかの態様においては、DNA構築物は、真核細胞の核内に外来DNAを導入することを含む技術であるトランスフェクションにより導入されうる。幾つかの態様においては、タンパク質は一過性トランスフェクションにより合成されうる(DNAは真核細胞のゲノムに組込まれないが、遺伝子は24〜96時間発現される)。外来DNAを宿主細胞内に導入するためには種々の方法が使用可能であり、リン酸カルシウムによる方法、デンドリマーによる方法、リポソームによる方法及びカチオン性ポリマーの使用による方法を含む化学的手段により、トランスフェクションが達成されうる。トランスフェクションの非化学的方法には、エレクトロポレーション、ソノポレーション、光学的トランスフェクション、プロトプラスト融合、インパレフェクション(impalefection)及び流体力学的運搬が含まれる。幾つかの実施形態においては、トランスフェクションは、遺伝子銃を含む、粒子に基づく方法により達成可能であり、この場合、DNA構築物を不活性固体のナノ粒子に結合させ、ついでこれを標的細胞の核内に直接的に「射撃(shot)」する。粒子に基づく他のトランスフェクション方法には、磁石を利用するトランスフェクション及びインパレフェクションが含まれる。
特定の実施形態においては、BS−BDCは、投与の利益をもたらすために修飾されうる。特定の実施形態においては、修飾BS−BDCは、1以上のアミノ酸が非アミノ酸成分で置換されているもの、又はアミノ酸が官能基にコンジュゲート化されている又は他の様態で官能基がアミノ酸に結合しているものを含む。修飾アミノ酸は、例えば、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、脂質部分にコンジュゲート化されたアミノ酸、又は有機誘導体化物質にコンジュゲート化されたアミノ酸でありうる。アミノ酸は、例えば、組換え製造中に翻訳と同時に若しくは翻訳後に修飾されることが可能であり(例えば、哺乳類細胞における発現中のN−X−S/TモチーフにおけるN結合グリコシル化)、又は合成手段により修飾されうる。修飾アミノ酸は配列の内部又は配列の末端に存在しうる。修飾は亜硝酸化構築物をも含む。
PEG化は、特に、ポリエチレングリコール(PEG)ポリマー鎖がタンパク質のような他の分子に共有結合されるプロセスである。タンパク質をPEG化する幾つかの方法が文献に報告されている。例えば、タンパク質のN末端及びリシン残基の遊離アミン基をPEG化するために、N−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)−PEGが使用された。還元剤の存在下でタンパク質のアミノ末端をPEG化するために、アルデヒド基を含有するPEGが使用されている。タンパク質中のシステイン残基の遊離チオール基を選択的にPEG化するために、マレイミド官能基を有するPEGが使用されている。アセチル−フェニルアラニン残基の部位特異的PEG化が行われうる。
PEGへのタンパク質の共有結合は、体内のタンパク質の半減期を延ばすための有用な方法であることが証明されている(Abuchowski,A.ら,Cancer Biochem.Biophys.,1984,7:175−186;Hershfield,M.S.ら,N.Engl.J.Medicine,1987,316:589−596;及びMeyers,F.J.ら,Clin.Pharmacol.Ther.,1991,49:307−313)。タンパク質へのPEGの結合は、該分子を酵素分解から保護するだけでなく、身体からのそれらのクリアランス速度をも低下させる。タンパク質に結合したPEGのサイズは、タンパク質の半減期に大きな影響を及ぼしている。クリアランスを減少させるPEG化の能力は、一般に、タンパク質に結合しているPEG基の数の関数ではなく、改変タンパク質の全分子量の関数である。通常、PEGが大きいほど、結合タンパク質のインビボ半減期は長くなる。また、PEG化はタンパク質凝集を低減し(Suzukiら,Biochem.Bioph.Acta vol.788,pg.248(1984))、タンパク質の免疫原性を改変し(Abuchowskiら;J.Biol.Chem.vol.252 pg.3582(1977))、例えばPCT公開番号WO92/16221に記載されているとおり、タンパク質溶解度を増加させうる。
幾つかのサイズのPEGが商業的に入手可能であり(Nektar Advanced PEGylation Catalog 2005−2006;及びNOF DDS Catalogue Ver 7.1)、それらは、目標循環半減期を有するタンパク質を製造するのに適している。種々の活性PEGが使用されており、それらには、mPEGスクシンイミジルスクシナート、mPEGスクシンイミジルカルボナート、及びPEGアルデヒド、例えばmPEG−プロピオンアルデヒドが含まれる。
公開データベースにより提供される配列情報を用いて、本明細書に開示されているシステム及び方法と共に使用されうる追加的な遺伝子及びタンパク質配列を特定することが可能である。
結合ドメイン配列及びコード遺伝子配列の考察に関して既に示されているとおり、本明細書に開示され及び参照されている配列の変異体も含まれる。タンパク質の変異体には、例えば、図4〜6に記載されている尺度においてタンパク質の機能に悪影響を及ぼさない1以上の保存的アミノ酸置換又は1以上の非保存的置換を有するものが含まれうる。「保存的置換」は、以下の保存的置換群のうちの1つに見出される置換を含む:群1:アラニン(Ala)、グリシン(Gly)、セリン(Ser)、トレオニン(Thr);群2:アスパラギン酸(Asp)、グルタミン酸(Glu);群3:アスパラギン(Asn)、グルタミン(Gln);群4:アルギニン(Arg)、リジン(Lys)、ヒスチジン(His);群5:イソロイシン(Ile)、ロイシン(Leu)、メチオニン(Met)、バリン(Val);及び群6:フェニルアラニン(Phe)、チロシン(Tyr)、トリプトファン(Trp)。
また、アミノ酸は、類似した機能又は化学構造若しくは組成(例えば、酸性、塩基性、脂肪族、芳香族、硫黄含有)により、保存的置換基に分類されうる。例えば、脂肪族群は、置換の目的では、Gly、Ala、Val、Leu及びIleを含みうる。互いに保存的置換と見なされるアミノ酸を含有する他の群は以下のものを含む:硫黄含有:Met及びシステイン(Cys);酸性:Asp、Glu、Asn及びGln;小さな脂肪族、非極性又はわずかに極性の残基:Ala、Ser、Thr、Pro、及びGly;極性負荷電残基及びそれらのアミド:Asp、Asn、Glu及びGln;極性正電荷残基:His、Arg及びLys;大きな脂肪族非極性残基:Met、Leu、Ile、Val及びCys;並びに大きな芳香族残基:Phe、Tyr及びTrp。追加的な情報はCreighton(1984)Proteins,W.H.Freeman and Companyに見出される。
他の箇所に記載されているとおり、遺伝子配列の変異体は、統計的に有意な程度にはコード産物の機能に影響を及ぼさないコドン最適化変異体、配列多型、スプライス変異体及び/又は突然変異を含みうる。
本明細書に開示されているタンパク質及び核酸配列の変異体は、本明細書に記載又は開示されているタンパク質及び核酸配列に対して少なくとも70%の配列同一性、80%の配列同一性、85%の配列、90%の配列同一性、95%の配列同一性、96%の配列同一性、97%の配列同一性、98%の配列同一性又は99%の配列同一性を有する配列をも含む。
「%の配列同一性(配列同一性の百分率)」は、配列を比較することにより決定される、2以上の配列間の関係を意味する。当技術分野においては、「同一性」は、一連の配列間のマッチ(一致)により決定される、タンパク質及び核酸配列間の配列関連性の度合をも意味する。「同一性」(「類似性」と称されることも多い)は、以下のものに記載されている方法(それらに限定されるものではない)を含む公知方法によって容易に計算されうる:Computational Molecular Biology(Lesk,A.M.編)Oxford University Press,NY(1988);Biocomputing:Informatics and Genome Projects(Smith,D.W.編)Academic Press,NY(1994);Computer Analysis of Sequence Data,Part I(Griffin,A.M.及びGriffin,H.G.編)Humana Press,NJ(1994);Sequence Analysis in Molecular Biology(Von Heijne,G.編)Academic Press(1987);及びSequence Analysis Primer(Gribskov,M.及びDevereux,J.編)Oxford University Press,NY(1992)。同一性を決定するための好ましい方法は、試験される配列の間で最良のマッチを与えるように設計される。同一性及び類似性を決定するための方法は、公的に利用可能なコンピュータープログラムにおいて体系化されている。配列アラインメント及び同一性の割合の計算は、LASERGENEバイオインフォマティクスコンピューティングスイート(DNASTAR,Inc.,Madison,Wisconsin)のMegalignプログラムを使用して行われうる。また、配列の多重アラインメントは、デフォルトパラメーター(GAP PENALTY=10,GAP LENGTH PENALTY=10)でClustalアラインメント法(Higgins及びSharp CABIOS,5,151−153(1989))を使用して行われうる。関連プログラムには、GCGプログラム一式(Wisconsin Package Version 9.0,Genetics Computer Group(GCG),Madison,Wisconsin);BLASTP、BLASTN、BLASTX(Altschulら,J.Mol.Biol.215:403−410(1990);DNASTAR(DNASTAR,Inc.,Madison,Wisconsin);及びSmith−Watermanアルゴリズムを組み込んだFASTAプログラム(Pearson,Comput.Methods Genome Res.,[Proc.Int.Symp.](1994),Meeting Date 1992,111−20.編者:Suhai,Sandor.出版社:Plenum,New York,N.Y.)も含まれる。本開示の文脈においては、配列分析ソフトウェアが分析に使用される場合、分析の結果は、参照されるプログラムの「デフォルト値」に基づくと理解されるであろう。「デフォルト値」は、最初の初期化時にソフトウェアに最初にロードされた値又はパラメーターの任意の組合せを意味する。
BS−BDCは対象への投与のために単独で又は組合せて組成物へと製剤化(処方)されうる。特定の実施形態においては、組成物は、薬学的に許容される担体と共に製剤化された、本明細書に開示されている少なくとも2つのBS−BDCを含む。
BS−BDCの塩及び/又はプロドラッグも使用されうる。
薬学的に許容される塩には、BS−BDCの活性を保持し、薬学的使用に許容される任意の塩が含まれる。薬学的に許容される塩は、酸、他の塩、又は酸若しくは塩に変換されるプロドラッグの投与の結果としてインビボで形成されうる任意の塩をも意味する。
適切な薬学的に許容される酸付加塩は無機酸又は有機酸から製造されうる。そのような無機酸の例としては、塩酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、硝酸、炭酸、硫酸及びリン酸が挙げられる。適切な有機酸は、脂肪族、脂環式、芳香族、アリール脂肪族、複素環式、カルボン酸及びスルホン酸クラスの有機酸から選択されうる。
適切な薬学的に許容される塩基付加塩には、アルミニウム、カルシウム、リチウム、マグネシウム、カリウム、ナトリウム及び亜鉛から製造される金属塩、又はN,N’−ジベンジルエチレンジアミン、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、エチレンジアミン、N−メチルグルカミン、リジン、アルギニン及びプロカインから製造される有機塩が含まれる。
プロドラッグは、投与後に、例えばBS−BDCの開裂により又は生物学的に不安定な基の加水分解によって治療的に活性な化合物に変換される活性成分を含む。
特定の実施形態においては、組成物は、組成物の少なくとも0.1% w/v又はw/w、組成物の少なくとも1% w/v又はw/w、組成物の少なくとも10% w/v又はw/w、組成物の少なくとも20% w/v又はw/w、組成物の少なくとも30% w/v又はw/w、組成物の少なくとも40% w/v又はw/w、組成物の少なくとも50% w/v又はw/w、組成物の少なくとも60% w/v又はw/w、組成物の少なくとも70% w/v又はw/w、組成物の少なくとも80% w/v又はw/w、組成物の少なくとも90% w/v又はw/w、組成物の少なくとも95% w/v又はw/w、あるいは組成物の少なくとも99% w/v又はw/wのBS−BDCを含む。
例示的な一般に使用される薬学的に許容される担体には、あらゆる吸収遅延剤、抗酸化剤、結合剤、緩衝剤、増量剤若しくは充填剤、キレート剤、コーティング、崩壊剤、分散媒体、ゲル、等張剤、潤滑剤、保存剤、塩、溶媒若しくは共溶媒、安定剤、界面活性剤、及び/又は運搬ビヒクルが含まれる。
例示的な抗酸化剤には、アスコルビン酸、メチオニン及びビタミンEが含まれる。
例示的な緩衝剤には、シトラートバッファー、スクシナートバッファー、タルトラートバッファー、フマラートバッファー、グルコナートバッファー、オキサラートバッファー、ラクタートバッファー、アセタートバッファー、ホスファートバッファー、ヒスチジンバッファー及び/又はトリメチルアミン塩が含まれる。
例示的なキレート剤としては、EDTAが挙げられる。
例示的な等張剤には、多価糖アルコール、例えば三価以上の糖アルコール、例えばグリセリン、エリトリトール、アラビトール、キシリトール、ソルビトール又はマンニトールが含まれる。
例示的な保存剤には、フェノール、ベンジルアルコール、メタクレゾール、メチルパラベン、プロピルパラベン、塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム、ハロゲン化ベンザルコニウム、塩化ヘキサメトニウム、アルキルパラベン、例えばメチル又はプロピルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール及び3−ペンタノールが含まれる。
安定剤は、増量剤から、BS−BDCを可溶化する又は変性若しくは容器壁への付着を防止するのを助ける添加剤までの機能を含みうる広範な範疇の賦形剤を意味する。典型的な安定剤には、多価糖アルコール;アミノ酸、例えばアルギニン、リジン、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アラニン、オルニチン、L−ロイシン、2−フェニルアラニン、グルタミン酸及びトレオニン;有機糖又は糖アルコール、例えばラクトース、トレハロース、スタキオース、マンニトール、ソルビトール、キシリトール、リビトール、ミオイニシトール、ガラクチトール、グリセロール及びシクリトール、例えばイノシトール;PEG;アミノ酸ポリマー;硫黄含有還元剤、例えば尿素、グルタチオン、チオクト酸、チオグリコール酸ナトリウム、チオグリセロール、アルファ−モノチオグリセロール及びチオ硫酸ナトリウム;低分子量ポリペプチド(すなわち、10残基未満);タンパク質、例えばヒト血清アルブミン、ウシ血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドン;単糖類、例えばキシロース、マンノース、フルクトース及びグルコース;二糖類、例えばラクトース、マルトース及びスクロース;三糖類、例えばラフィノース;並びに多糖類、例えばデキストランが含まれうる。安定剤は、典型的には、治療剤の重量に対して0.1〜10,000重量部の範囲で存在する。
本明細書に開示されている組成物は、例えば注射、吸入、注入、灌流、洗浄又は摂取による投与用に製剤化されうる。本明細書に開示されている組成物は更に、静脈内、皮内、動脈内、結節内、リンパ内、腹腔内、病巣内、前立腺内、膣内、直腸内、局所、髄腔内、腫瘍内、筋肉内、小胞内、経口及び/又は皮下投与用に、より詳細には、静脈内、皮内、動脈内、結節内、リンパ内、腹腔内、病巣内、前立腺内、膣内、直腸内、髄腔内、腫瘍内、筋肉内、小胞内及び/又は皮下注射による投与用に製剤化されうる。
注射用には、組成物は、水溶液として、例えば、ハンクス液、リンガー液又は生理食塩水を含むバッファー緩衝液中で製剤化されうる。水溶液は、製剤化剤、例えば懸濁化剤、安定剤及び/又は分散剤を含みうる。あるいは、製剤は、適切なビヒクル、例えば発熱物質非含有無菌水で使用前に還元するための凍結乾燥形態及び/又は粉末形態でありうる。
経口投与には、組成物は錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤などとして製剤化されうる。経口固形製剤、例えば散剤、カプセル剤及び錠剤の場合、適切な賦形剤には、結合剤(トラガカントガム、アラビアゴム、コーンスターチ、ゼラチン)、増量剤、例えば糖類、例えばラクトース、スクロース、マンニトール及びソルビトール;リン酸二カルシウム、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム;セルロース調製物、例えばトウモロコシデンプン、コムギデンプン、コメデンプン、ジャガイモデンプン、ゼラチン、トラガカントガム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム及び/又はポリビニルピロリドン(PVP);顆粒化剤;並びに結合剤が含まれる。所望により、崩壊剤、例えばコーンスターチ、ジャガイモデンプン、アルギン酸、架橋ポリビニルピロリドン、寒天又はアルギン酸若しくはその塩、例えばアルギン酸ナトリウムが添加されうる。所望により、固形剤形は、標準的な技術を用いて、糖衣又は腸溶コーティングされうる。香味料、例えばペパーミント、ウィンターグリーンオイル、チェリーフレーバー、オレンジフレーバーなども使用されうる。
組成物はエアロゾルとして製剤化されうる。特定の実施形態においては、エアロゾルは、無水、液体又は乾燥粉末吸入器の一部として提供される。加圧パック又はネブライザーからのエアロゾルスプレーも、適切な噴射剤、例えばジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素又は他の適切なガスと共に使用されうる。加圧エアロゾルの場合、投与単位は、定量を送達するための弁を設けることにより決定されうる。BS−BDCと適切な粉末基剤(例えば、ラクトース又はデンプン)との粉末混合物を含む、吸入器又は吹送器における使用のためのゼラチンのカプセル剤及びカートリッジも処方(製剤化)されうる。
組成物はデポー製剤としても製剤化されうる。デポー製剤は、適切なポリマー材料若しくは疎水性材料(例えば、許容される油中のエマルジョンとして)又はイオン交換樹脂を使用して、あるいは難溶性誘導体、例えば難溶性塩として製剤化されうる。
また、組成物は、少なくとも1つのBS−BDCグループを含む固体ポリマーの半透性マトリックスを利用する徐放系として製剤化されうる。種々の徐放性材料が確立されており、当業者によく知られている。徐放系は、それらの化学的性質に応じて、投与後に数週間から100日以上にわたってBS−BDCを放出しうる。デポー製剤は、注射;非経口注射;点眼;又は細い針を介した注射による軟組織、体腔若しくは時には血管内への移植により投与されうる。
デポー製剤は、所望のラクチド:グリコリド比、平均分子量、多分散性及び末端基化学のポリ(ラクチド)、ポリ(グリコリド)、ポリ(カプロラクトン)及びポリ(ラクチド)−コ(グリコリド)(PLG)を含む種々の生分解性ポリマーを含みうる。種々のグレードを使用して種々のポリマータイプを種々の比率で混合することにより、寄与するポリマーのそれぞれから取り入れられる特性が得られうる。
異なる溶媒(例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、酢酸エチル、トリアセチン、N−メチルピロリドン、テトラヒドロフラン、フェノール又はそれらの組合せ)の使用は微粒子のサイズ及び構造を改変して、放出特性を調節しうる。他の有用な溶媒には、水、エタノール、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N−メチル−2−ピロリドン(NMP)、アセトン、メタノール、イソプロピルアルコール(IPA)、安息香酸エチル及び安息香酸ベンジルが含まれる。
例示的な放出修飾剤には、界面活性剤、洗剤、内相増粘剤、錯化剤、界面活性分子、共溶媒、キレート剤、安定剤、セルロースの誘導体、(ヒドロキシプロピル)メチルセルロース(HPMC)、HPMCアセタート、セルロースアセタート、プルロニック(例えば、F68/F127)、ポリソルベート、Span(登録商標)(Croda Americas,Wilmington,Delaware)、ポリ(ビニルアルコール)(PVA)、Brij(登録商標)(Croda Americas,Wilmington,Delaware)、スクロースアセタートイソブチラート(SAIB)、塩及びバッファーが含まれうる。
ポリソルベート、ジオクチルスルホスクシナート、ポロキサマー、PVAを含む界面活性剤のような微粒子の外部相境界に分配する賦形剤はまた、粒子安定性及び侵食速度、水和及びチャネル構造、界面輸送並びに動力学を含む特性を、好ましい様態で改変しうる。
開示されている徐放性デポー製剤の追加的な加工は、トリス、シトラート又はヒスチジンのようなバッファー中、マンニトール、スクロース、トレハロース及びグリシンを含む安定化賦形剤を、ポリソルベート、PVA及びジオクチルスルホスクシナートのような他の成分と共に利用しうる。元の懸濁液の類似サイズ及び性能特性に還元(再構成)される非常に低い水分の散剤(粉末)を製造するために、凍結乾燥サイクルも用いられうる。
本明細書に開示されている任意の組成物は、投与の利益を越える有意に有害なアレルギー性の又は他の有害な反応を引き起こさないものを含む任意の他の薬学的に許容される担体を有利に含みうる。例示的な薬学的に許容される担体及び製剤は、Remington’s Pharmaceutical Sciences,18th Ed.Mack Printing Company,1990に開示されている。更に、製剤は、米国FDA生物学的標準局(U.S.FDA Office of Biological Standards)及び/又は他の関連する外国の規制当局により要求される無菌性、発熱性、一般的安全性及び純度基準を満たすように製造されうる。
特定の実施形態においては、BS−BDC組成物には、免疫原性組成物が含まれる。免疫原性組成物は、対象において免疫応答を刺激する組成物を意味する。免疫応答は、例えばT細胞応答でありうる。T細胞応答は、例えば、IL−2のようなサイトカインの産生を測定することにより検出されうる。
特定の実施形態においては、BS−BDC組成物には、治療用組成物が含まれる。治療用組成物は、対象を治療する組成物を意味する。治療は、本明細書の他の箇所に記載されているとおり、対象の疾患又は症状の軽減により検出されうる。
キット。本明細書は、本明細書に記載されているBS−BDC及び/又は組成物の1以上を含む1以上の容器を含むキットをも開示する。そのような容器には、医薬品又は生物学的製品の製造、使用又は販売を規制する政府機関により規定された形式の注意書きが付随していてもよく、この注意書きは、ヒトへの投与のための製造、使用又は販売の、当局による承認を表す。特定の実施形態においては、キット内のBS−BDCグループは、個々の対象の予想される疾患経過の評価に基づいて選択される。特定の実施形態においては、キット内のBS−BDCは、対象の現在の病態の継続的な評価に基づいて個々の対象に関して更新される。
本明細書に開示されている方法は、対象(ヒト、獣医動物(イヌ、ネコ、爬虫類、鳥類など))、家畜(ウマ、ウシ、ヤギ、ブタ、ニワトリなど)及び研究動物(サル、ラット、マウス、魚類など)を、本明細書に開示されている組成物で治療することを含む。対象の治療は、治療的有効量を送達することを含む。治療的有効量には、有効量、予防的処置及び/又は治療的処置をもたらす量が含まれる。
「有効量」は、対象において所望の生理学的変化をもたらすのに必要な組成物の量である。例えば、有効量は免疫原性効果をもたらしうる。有効量は、しばしば、研究目的で投与される。本明細書に開示されている有効量は、がんの発生又は進行の評価に関連した動物モデル又はインビトロアッセイにおける統計的に有意な効果をもたらしうる。免疫原性組成物は有効量で提供されることが可能であり、この場合、有効量は免疫応答を刺激する。
「予防的処置」は、がんの徴候若しくは症状を示さず、又はがんの初期の徴候若しくは症状のみを示す対象に施される処置を含み、この場合、治療は、がんを更に進展させるリスクを低減又は減少させる目的で施される。したがって、予防的処置は、がんを予め防ぐ治療(処置)として機能する。特定の実施形態においては、予防的処置は、原発性がん腫瘍部位からの転移が生じるのを低減し、遅延させ、又は予防する。
「治療的処置」は、がんの症状又は徴候を示す対象に施される処置を含み、がんのそれらの徴候又は症状を軽減又は排除する目的で対象に施される。治療的処置は、がんの存在若しくは活性を低減、制御若しくは除去し、及び/又はがんの副作用を低減、制御若しくは除去しうる。
有効量としての機能、予防的処置又は治療的処置は相互に排他的ではなく、特定の実施形態においては、投与される用量は2以上の処置タイプを達成しうる。
特定の実施形態においては、治療的有効量は抗がん効果をもたらす。抗がん効果は、がん細胞数の減少、転移数の減少、腫瘍体積の減少、余命の延長、がん細胞における化学療法若しくは放射線感受性の誘発、がん細胞近傍の血管新生の抑制、がん細胞増殖の抑制、腫瘍成長の抑制、転移の予防若しくは低減、対象の寿命の延長、がん関連疼痛の軽減、及び/又は治療後のがんの再燃若しくは再発の低減を含む。
「腫瘍」は、細胞(新生細胞又は腫瘍細胞と称される)の異常増殖により形成される腫脹又は病変である。「腫瘍細胞」は、急速な無制御細胞増殖により増殖する異常細胞であって、新たな増殖を開始した刺激が停止した後も増殖し続ける異常細胞である。腫瘍は、正常組織との機能的協調及び構造的組織化の部分的又は完全な欠如を示し、通常、良性、前悪性又は悪性でありうる明瞭な組織塊を形成する。
投与の場合には、インビトロアッセイ及び/又は動物モデル研究からの結果に基づいて、治療的有効量(本明細書においては用量とも称される)が最初に推定されうる。そのような情報は、関心のある対象における有用な用量をより正確に決定するために用いられうる。特定の対象に投与される実際の投与量は、標的、体重、状態の重症度、がんの種類、がんの病期、過去の又は併用される治療的介入、対象の特発性及び投与経路を含む身体的及び生理学的要因のようなパラメータを考慮して、医師、獣医又は研究者により決定されうる。
有用な用量は、0.1〜5μg/kg又は0.5〜1μg/kgの範囲でありうる。他の非限定的な例においては、用量は、1μg/kg、15μg/kg、30μg/kg、50μg/kg、55μg/kg、70μg/kg、90μg/kg、150μg/kg、350μg/kg、500μg/kg、750μg/kg、1000μg/kg、0.1〜5mg/kg、又は0.5〜1mg/kgを含みうる。他の非限定的な例においては、用量は、1mg/kg、10mg/kg、30mg/kg、50mg/kg、70mg/kg、100mg/kg、300mg/kg、500mg/kg、700mg/kg、1000mg/kg又はそれ以上を含みうる。
治療的有効量は、治療レジメンの過程で単一又は複数の用量を(例えば、毎日、隔日、3日ごと、4日ごと、5日ごと、6日ごと、毎週、2週間ごと、3週間ごと、毎月、2か月ごと、3か月ごと、4か月ごと、5か月ごと、6か月ごと、7か月ごと、8か月ごと、9か月ごと、10か月ごと、11か月ごと又は毎年)投与することにより達成されうる。
特定の実施形態においては、BS−BDCは、プログラム可能なポンプ(例えば、インスリンポンプ)のようなポンプにより投与されうる。特定の実施形態においては、例えばプログラムされたポンプを使用して、異なるBS−BDCの段階的投与が達成されうる。
特定の実施形態においては、BS−BDCは短い半減期(例えば、短いインビボ半減期)を有していて、該BS−BDCは、ポンプによる連続的注入を用いて投与される。特定の実施形態においては、5時間未満のインビボ半減期を有する任意のBS−BDCが連続的注入により投与されうる。これとは対照的に、抗体は、それらのより大きなサイズ及びFc部分ゆえに、数週間のインビボ半減期を有することが可能であり、Fc部分を含有する二重特異性形態も同様に、延長したインビボ半減期を有しうる。
特定の実施形態においては、自己免疫毒性を引き起こすことなくがんの再発を低減又は排除するために或る時間間隔で治療的有効量が投与される。
本明細書に記載されている医薬組成物は、注射、吸入、注入、灌流、洗浄又は摂取(これらに限定されるものではない)により投与されうる。投与経路には、静脈内、皮内、動脈内、非経口、鼻腔内、結節内、リンパ内、腹腔内、病巣内、前立腺内、膣内、直腸内、局所、髄腔内、腫瘍内、筋肉内、小胞内、経口、皮下及び/又は舌下投与、より詳細には、静脈内、皮内、動脈内、非経口、鼻腔内、結節内、リンパ内、腹腔内、病巣内、前立腺内、膣内、直腸内、局所、髄腔内、腫瘍内、筋肉内、小胞内、経口、皮下及び/又は舌下注射が含まれうる。
示されているとおり、特定の実施形態においては、BS−BDCの投与は対象の治療レジメンの経過中に経時的に進展する。BS−BDCのグループは、組合わされて多種多様なタイプのがんに対処可能であり、個々の対象に対して個別化されうる(例えば、A+B;A+C;A+F;B+F;など)。同様に、BS−BDCグループの投与の非常に個別化された態様が存在しうる。その場合、新興(emerging)クローンを特定するために、及びBS−BDCのペアを選択して新興クローンを特異的に処理するために、例えばポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、ディープシーケンシング、フローサイトメトリー又は免疫組織化学(IHC)を用いて、対象サンプル(例えば、液体生検、標準生検)を評価する。この「カセット」アプローチは、耐性クローンの出現(新興出現)をモニターすること、及びBS−BDCの新たな組合せによりそれらを迅速に処理することを含みうる。「新興クローン」は、クローンが由来するがん細胞の集団の優性遺伝子型とは異なる、1以上の対立遺伝子を有するがん細胞又はがん細胞のクローン集団を意味しうる。「薬物耐性クローン」は、1以上の抗がん薬に対する耐性を付与する新たな対立遺伝子を獲得したがん細胞又はがん細胞のクローン集団を意味しうる。患者のがんは、新たながんクローン及び/又は治療耐性クローンの出現に関して、例えば、患者由来のがんサンプルからのDNAを配列決定することによりモニターされうる。
特定の実施形態においては、患者は腫瘍微小環境における免疫抑制及び/又はT細胞抑制に関してモニターされうる。微小環境における免疫抑制及び/又はT細胞抑制は、例えば、患者由来のサンプルにおけるサイトカインレベル及び/又はT細胞数を測定することによりモニターされうる。
特定の実施形態においては、本明細書に開示されている方法は腫瘍微小環境における免疫細胞を活性化することを含む。特定の実施形態においては、腫瘍微小環境における免疫細胞の活性化は腫瘍微小環境におけるT細胞抑制を低減又は逆転させることを含む。T細胞抑制は、例えば調節性T細胞により引き起こされうる、T細胞活性化の遮断又は低減を意味しうる。T細胞抑制を測定するための方法は、例えば、McMurchy & Levings,European Journal of Immunology 42(1):27−34において見出されうる。腫瘍微小環境におけるT細胞抑制の低減又は逆転は、CD28結合性BS−BDCを、免疫細胞抑制因子の活性を低下させるBS−BDCで置換することを含みうる。このアプローチは、腫瘍微小環境におけるT細胞が、継続的な活性化の後でCD28の発現を低減する場合に有益である。
例示的な実施形態
1.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ(群)であって、該グループにおける各BS−BDCが、該グループにおける別のBS−BDCにより標的化されるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープとは異なるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープを標的化し、ただし、少なくとも2つの標的化がん抗原エピトープが同一がん抗原上に存在する、グループ。
2.前記の異なるがん抗原エピトープが非重複性及び/又は非反復性である、実施形態1記載のグループ。
3.前記の異なる標的化がん抗原エピトープの全てが同一がん抗原上に存在する、実施形態1又は2記載のグループ。
4.該同一がん抗原がBCMA、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD33、CD133、ERBB2、葉酸受容体、HER2、ルイスY、L1−CAM、メソテリン、MUC−CD、PSCA、PSMA、ROR1、SV40 T、WT−1、PD−L1又はCD123である、実施形態3記載のグループ。
5.該同一がん抗原がROR1であり、前記の異なる非重複性エピトープがROR1−A及びROR1−Bにより標的化され、又はROR1−a及びROR1−Bにより標的化される、実施形態3記載のグループ。
6.BS−BDCグループが更に、異なるがん抗原上の異なるがん抗原エピトープを標的化する、実施形態1又は2記載のグループ。
7.前記の異なるがん抗原エピトープが
(i)ROR1及びCD33;
(ii)CD33及びPD−L1;
(iii)CD19及びPD−L1;
(iv)CD123及びCD33;
(v)CD19、CD20、CD22、ROR1、CD33、CD123及びWT−1の2以上;
(vi)PSMA、WT1、PSCA及びSV40 Tの2以上;
(vii)HER2、ERBB2及びROR1の2以上;
(viii)L1−CAM、MUC−CD、葉酸受容体、ルイスY、ROR1、メソテリン及びWT−1の2以上;又は
(ix)メソテリン、CEA、CD24及びROR1の2以上
に存在する、実施形態6記載のグループ。
8.前記の異なるがん抗原エピトープがROR1、CD33、CD19、CD123及び/又はPD−L1上に存在する、実施形態6記載のグループ。
9.グループにおけるBS−BDCがR11、R12、2A2及び/又はY31のCDR配列を含む、実施形態1〜8のいずれか1項記載のグループ。
10.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16及び配列番号17から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜9のいずれか1項記載のグループ。
11.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22及び配列番号23から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜10のいずれか1項記載のグループ。
12.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28及び配列番号29から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜11のいずれか1項記載のグループ。
13.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34及び配列番号35から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜12のいずれか1項記載のグループ。
14.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40及び配列番号41から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜13のいずれか1項記載のグループ。
15.該グループにおけるBS−BDCがFMC63、SJ25C1及び/又はHD37のCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜14のいずれか1項記載のグループ。
16.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46及び配列番号47から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜15のいずれか1項記載のグループ。
17.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52及び配列番号53から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜16のいずれか1項記載のグループ。
18.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58及び配列番号59から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜17のいずれか1項記載のグループ。
19.該グループにおけるBS−BDCがリツキシマブ(Rituximab)、オファツムマブ(Ofatumumab)及び/又はハーセプチン(Herceptin)のCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜18のいずれか1項記載のグループ。
20.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80及び配列番号81から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜19のいずれか1項記載のグループ。
21.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号253、配列番号254、配列番号255、配列番号256、配列番号257及び配列番号258から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜20のいずれか1項記載のグループ。
22.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86及び配列番号87から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜21のいずれか1項記載のグループ。
23.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92及び配列番号93から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜22のいずれか1項記載のグループ。
24.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98及び配列番号99から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜23のいずれか1項記載のグループ。
25.該グループにおけるBS−BDCが、(i)配列番号267、配列番号268、配列番号269、配列番号270、配列番号271及び配列番号272、又は(ii)配列番号273、配列番号274、配列番号275、配列番号276、配列番号277及び配列番号259から選択されるCDR配列を含む、実施形態1〜4又は6〜24のいずれか1項記載のグループ。
26.該グループにおけるBS−BDCが全長CD33(CD33FL)を標的化する、又はエキソン2を欠くCD33のスプライス変異体(CD33ΔE2)のみを標的化する、又は(iii)CD33FLであるかCD33ΔE2であるかにかかわらずCD33を標的化する、実施形態1〜4又は6〜25のいずれか1項記載のグループ。
27.該グループにおけるBS−BDCが5D12、85F、12B12、4H10、11D5、13E11、1H7又は11D11のV及びV鎖を含む、実施形態26記載のグループ。
28.該グループにおけるBS−BDCが5D12、85F、12B12、4H10、11D5、13E11、1H7、11D11又はM195のVおよびV鎖からのCDR配列を含む、実施形態25又は26記載のグループ。
29.免疫細胞がT細胞、ナチュラルキラー細胞又はマクロファージである、実施形態1〜28のいずれか1項記載のグループ。
30.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが同一免疫細胞活性化因子上に存在する、実施形態1〜29のいずれか1項記載のグループ。
31.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、異なる免疫細胞活性化因子上に存在する、実施形態1〜29のいずれか1項記載のグループ。
32.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが同一免疫細胞活性化因子上及び異なる免疫細胞活性化因子上に存在する、実施形態1〜29のいずれか1項記載のグループ。
33.免疫細胞活性化エピトープがT細胞上に存在する、実施形態1〜32のいずれか1項記載のグループ。
34.該同一免疫細胞活性化因子がCD3であり、前記の異なるエピトープが、T細胞CD3二量体を含む異なるインバリアントタンパク質上に存在する、実施形態32記載のグループ。
35.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープがCD3及びCD28、CD3及びCD8、又はCD8及びCD28上に存在する、実施形態31又は32記載のグループ。
36.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープがCD3、CD8及びCD28上に存在する、実施形態31又は32記載のグループ。
37.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープがCD3、CD28及びCD137上に存在する、実施形態31又は32記載のグループ。
38.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、(i)CD3、(ii)CD3、及び(iii)CD28上に存在する、実施形態31又は32記載のグループ。
39.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、(i)CD28、(ii)CD28、及び(iii)CD3上に存在する、実施形態31又は32記載のグループ。
40.前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、CD2、CD3、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CD83、CD137、OX40、LFA−1、LIGHT、NKG2C及びB7−H3の1以上に存在する、実施形態1〜39のいずれか1項記載のグループ。
41.該グループにおけるBS−BDCがOKT3、OKT8又は9D7のCDR配列を含む、実施形態1〜40のいずれか1項記載のグループ。
42.該グループにおけるBS−BDCがOKT3、20G6−F3、4B4−D7、4E7−C9及び/又は18F5−H10のCDR配列を含む、実施形態1〜41のいずれか1項記載のグループ。
43.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号100、配列番号101、配列番号102、配列番号103、配列番号104及び配列番号105から選択されるCDR配列を含む、実施形態42記載のグループ。
44.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号107、KVS、配列番号109、配列番号110、配列番号111及び配列番号112から選択されるCDR配列を含む、実施形態42又は43記載のグループ。
45.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号113、KVS、配列番号115、配列番号116、配列番号117及び配列番号118から選択されるCDR配列を含む、実施形態42〜44のいずれか1項記載のグループ。
46.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号119、KVS、配列番号121、配列番号122、配列番号123及び配列番号124から選択されるCDR配列を含む、実施形態42〜45のいずれか1項記載のグループ。
47.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号125、KVS、配列番号127、配列番号128、配列番号129及び配列番号130から選択されるCDR配列を含む、実施形態42〜46のいずれか1項記載のグループ。
48.該グループにおけるBS−BDCが9D7、9.3、KOLT−2、15E8、248.23.2、EX5.3D10、5.11A1及び/又はTGN1412のCDR配列を含む、実施形態1〜47のいずれか1項記載のグループ。
49.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号131、配列番号132、配列番号133、配列番号134、配列番号135及び配列番号136から選択されるCDR配列を含む、実施形態50記載のグループ。
50.該グループにおけるBS−BDCがOKT8を含む、実施形態1〜49のいずれか1項記載のグループ。
51.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号226、配列番号227、配列番号228、配列番号229、配列番号230及び配列番号231から選択されるCDR配列を含む、実施形態50記載のグループ。
52.免疫細胞活性化エピトープがナチュラルキラー細胞上に存在する、実施形態1〜51のいずれか1項記載のグループ。
53.該グループにおけるBS−BDCが配列番号232の可変軽鎖領域及び配列番号233の可変重鎖領域を含む、実施形態52記載のグループ。
54.該グループにおけるBS−BDCが5C6、1D11、mAb 33、P44−8、SK1及び/又は3G8のCDR配列を含む、実施形態1〜53のいずれか1項記載のグループ。
55.免疫細胞活性化エピトープがマクロファージ上に存在する、実施形態1〜54のいずれか1項記載のグループ。
56.該グループにおけるのBS−BDCがM1/70、KP1及び/又はab87099のCDR配列を含む、実施形態55記載のグループ。
57.免疫細胞活性化エピトープの少なくとも1つが免疫細胞抑制因子上に存在する、実施形態1〜56のいずれか1項記載のグループ。
58.免疫細胞抑制因子が4−1BB、PD−1、LAG3、TIM−3、BTLA、CTLA−4、CD200及びVISTAの1以上を含む、実施形態57記載のグループ。
59.該グループにおけるBS−BDCが、CDR配列(i)配列番号147、配列番号148、配列番号149、配列番号150、INH及び配列番号152、又は(ii)配列番号261、配列番号262、配列番号263、配列番号264、配列番号265及び配列番号266を含む、実施形態57又は58記載のグループ。
60.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号154、配列番号155、配列番号156、配列番号157、配列番号158及び配列番号159から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜59のいずれか1項記載のグループ。
61.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号160、配列番号161、配列番号162、配列番号163、配列番号164及び配列番号165から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜60のいずれか1項記載のグループ。
62.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号167、配列番号168、配列番号169、配列番号170、配列番号171及び配列番号172から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜61のいずれか1項記載のグループ。
63.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号174、AAS、配列番号176、配列番号177、配列番号178及び配列番号179から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜62のいずれか1項記載のグループ。
64.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号181、配列番号182、配列番号183、配列番号184、配列番号185及び配列番号186から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜63のいずれか1項記載のグループ。
65.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号187、配列番号188、配列番号189、配列番号190、配列番号191及び配列番号192から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜64のいずれか1項記載のグループ。
66.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号194、配列番号195、配列番号196、配列番号197、配列番号198及び配列番号199から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜65のいずれか1項記載のグループ。
67.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号200、配列番号201、配列番号202、配列番号203、配列番号204及び配列番号205から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜66のいずれか1項記載のグループ。
68.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号206、配列番号207、配列番号208、配列番号209、配列番号210及び配列番号211から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜67のいずれか1項記載のグループ。
69.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号213、配列番号214、配列番号215、配列番号216、配列番号217及び配列番号218から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜68のいずれか1項記載のグループ。
70.該グループにおけるBS−BDCが、配列番号220、配列番号221、配列番号222、配列番号223、SAS及び配列番号225から選択されるCDR配列を含む、実施形態57〜69のいずれか1項記載のグループ。
71.該グループが2、3又は4個のBS−BDCを含む、実施形態1〜70のいずれか1項記載のグループ。
72.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCが第1 ROR1エピトープ及びCD3を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCが第2 ROR1エピトープ及びCD28を標的化する、グループ。
73.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがROR1エピトープ及びCD28を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがCD33エピトープ及びCD3を標的化する、グループ。
74.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがROR1エピトープ及びCD3を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがCD33エピトープ及びCD28を標的化する、グループ。
75.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがCD33エピトープ及びCD3を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがPD−L1エピトープ及びCD28を標的化する、グループ。
76.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがCD33エピトープ及びCD28を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがPD−L1エピトープ及びCD3を標的化する、グループ。
77.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがCD19エピトープ及びCD3を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがPD−L1エピトープ及びCD28を標的化する、グループ。
78.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがCD19エピトープ及びCD28を標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがPD−L1エピトープ及びCD3を標的化する、グループ。
79.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがCD123エピトープ及びCD3エピトープを標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがCD123エピトープ及びCD28エピトープを標的化する、グループ。
80.二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおけるBS−BDCがCD33エピトープ及びCD3エピトープを標的化し、該グループにおける第2 BS−BDCがCD123エピトープ及びCD28エピトープを標的化する、グループ。
81.CD28を標的化するBS−BDCが、免疫細胞抑制因子エピトープを抑制するBS−BDCで置換されている、実施形態71〜80のいずれか1項記載のグループ。
82.免疫細胞抑制因子エピトープが4−1BB、PD−1、LAG3、TIM−3、BTLA、CTLA−4、CD200及び/又はVISTA上に位置する、実施形態81記載のグループ。
83.該グループの投与が、腫瘍微小環境における免疫細胞抑制を低減又は逆転させる、実施形態81記載のグループ。
84.該グループの投与が、腫瘍微小環境におけるT細胞抑制を低減又は逆転させる、実施形態81記載のグループ。
85.配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号244、配列番号245、配列番号246、配列番号247、配列番号248、配列番号249、配列番号250、配列番号251及び配列番号252から選択される少なくとも2つの二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を含む、二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ。
86.配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号244、配列番号245、配列番号246、配列番号247、配列番号248、配列番号249、配列番号250、配列番号251及び配列番号252から選択される3個の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を含む、二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ。
87.配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号244、配列番号245、配列番号246、配列番号247、配列番号248、配列番号249、配列番号250、配列番号251及び配列番号252から選択される4個の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を含む、二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ。
88.BS−BDCグループがscFvを含む、実施形態1〜87のいずれか1項記載のグループ。
89.BS−BDCグループが二重特異性抗体を含む、実施形態1〜88のいずれか1項記載のグループ。
90.実施形態1〜89のいずれか1項記載のグループを含む組成物。
91.実施形態90記載の組成物の治療量を対象に投与し、それにより、がんの治療を要する対象においてがんを治療することを含む、がんの治療を要する対象におけるがんの治療方法。
92.該治療が治療に対するがん細胞の耐性を克服する、実施形態91記載の方法。
93.対象のがんの変化に関して対象をモニターすることを含む、実施形態91又は92記載の方法。
94.異なるグループのBS−BDCと共に組成物を投与することを含む、実施形態91〜93のいずれか1項記載の方法。
95.異なるグループのBS−BDCと共に該組成物を投与することが該モニターの結果に基づく、実施形態94記載の方法。
96.該モニターの結果がクローンの出現を示す、実施形態95記載の方法。
97.該モニターの結果が治療耐性クローンの出現を示す、実施形態95又は96記載の方法。
98.該モニターの結果が腫瘍微小環境における免疫抑制を示す、実施形態95〜97のいずれか1項記載の方法。
99.該モニターの結果が腫瘍微小環境におけるT細胞抑制を示す、実施形態95〜98のいずれか1項記載の方法。
100.治療に対するがん細胞の耐性を克服するための、実施形態1〜99のいずれか1項記載のグループ、組成物又は方法の使用。
101.耐性を克服することが、腫瘍微小環境における免疫抑制を低減又は逆転させることに基づく、実施形態100記載の使用。
102.耐性を克服することが、腫瘍微小環境におけるT細胞抑制を低減又は逆転させることに基づく、実施形態100又は101記載の使用。
103.対象において免疫応答を刺激するための、前記実施形態のいずれか1項記載のグループ又は組成物の使用。
104.免疫応答の刺激を要する対象において免疫応答を刺激する方法であって、それを要する対象に実施形態90記載の組成物の治療量を投与し、それにより、それを要する対象において免疫応答を刺激することを含む方法。
[実施例1]
新規「クリニック対応(clinic ready)」SMITE抗体治療薬の開発及びヒト化のための合理的な計算タンパク質設計アプローチを可能にするために、フレッドハッチンソンがん研究センター(Fred Hutchinson Cancer Research Center)(FHCRC)抗体開発施設及び分子設計治療コア(Antibody Development Facility and the Molecular Design Therapeutics Core)を用いる。この研究で使用するヒト材料の説明を以下に示す。
健常ドナーT細胞: 過去の二重特異性抗体研究において用いたのと同様にして、IRBにより承認された研究プロトコルに基づくFHCRC造血細胞処理コア(Hematopoietic Cell Processing Core)により、白血球アフェレーシスにより、健常成人ボランティアから、刺激されていない単核細胞を集める。T細胞を磁気細胞選別により富化させ、ついでアリコートとして非識別様態で凍結し、使用するまで液体窒素中で保存する。解凍した細胞アリコートを、がん細胞からの分離が可能となるようCellBue Burgundyで標識する。
二重特異性T細胞結合抗体の最大活性にはT細胞同時刺激が必要である: 急性白血病細胞系及び遺伝子操作された亜系を使用して、CD33/CD3及びCD19/CD3抗体、AMG330並びにブリナツモマブのインビトロ活性に対する抑制性(PD−L1及びPD−L2)及び活性化(CD80及びCD86)T細胞リガンドの影響を試験した。つぎに、これらの実験を、急性白血病患者から得たサンプルを使用して繰返した。結果は、PD−L1又はPD−L2の発現は二重特異性T細胞結合抗体の細胞溶解活性を低下させるが、CD80又はCD86の発現はそれらの活性を増強することを示した。これに一致して、同時刺激性T細胞受容体CD28に対する活性化抗体との同時処理は急性白血病細胞株における二重特異性T細胞結合抗体誘導性細胞傷害性を有意に増強した。12個のAML患者検体において、CD28の同時活性化はまた、初代白血病細胞におけるAMG330の活性を増強した(P=0.023)。総合すると、これらの知見は、二重特異性T細胞結合抗体の最大活性にはT細胞補助受容体活性化が必要であることを示しており、T細胞への同時刺激シグナルの供与がこれらの物質に対する耐性を克服しうることを示唆している。他の研究者による過去の研究は、CD3×CD28交差反応性二重特異性抗体が大きな治療ウィンドウをもたらしうることを示しており、この場合、腫瘍細胞依存性T細胞活性化のみが誘導され、全身性腫瘍細胞非依存性T細胞活性化は回避される。
特定の実施形態においては、SMITE抗体アプローチは2つの二重特異性T細胞結合抗体(すなわち、一方はCD3(又はCD8)に対するものであり、他方はCD28に対するものである)の併用を要する。最大活性化シグナルをT細胞に伝達するためには、両方の抗体が時間重複様態でROR1に結合する必要がある。これらの研究のためには、3つのROR1抗体からの十分に確認された公的に利用可能な配列が使用されうる。関心のある初期抗体セットにおいては、ROR1−A抗体(クローン:R11)及びROR1−α抗体(クローン:2A2)は同一エピトープに結合し、ROR1への結合に関して互いに競合する。ROR1−B抗体(クローン:R12)は非重複性近位エピトープに結合し、その他の2つの抗体のうちのいずれか一方と同時にROR1に結合しうる。これら3つのROR1抗体のscFv、並びにCD3(クローン:OKT3)、CD8(クローン:OKT8)及びCD28(クローン:9D7)を認識する公的に入手可能な抗体のscFvを使用して、柔軟性ROR1指向性SMITE抗体プラットフォームを形成する交換可能な結合モジュールを含有するビルディングブロックとして、二重特異性T細胞結合抗体を作製する(例えば、表1を参照されたい)。精製用の6×ヒスチジンタグとBir−Aリガーゼによる特異的ビオチン化のためのavitagとを含む「hisavi」構築物として、全ての抗体を作製する。
ROR1−A、ROR1−a及びROR1−B抗体由来のROR1を標的化する一本鎖構築物が、発現されるとおりに設計されている。Biacoreチップを使用する表面プラズモン共鳴(SPR)分析により実証されるとおり、これらの一本鎖構築物はROR1抗原に対する頑強なアフィニティを保有する。ついで、サイズ排除クロマトグラフィーを用いて、ROR1−A及びROR1−Bに由来する一本鎖構築物はROR1に同時に結合することが実証された。ついで、2つの二重特異性T細胞結合抗体分子を設計し、成功裏に発現させた。2リットルの調製物を使用して、aROR1−a/aCD28及びaROR1−B/aCD3構築物に関して、それぞれ、22.4mg及び14.4mgの収量を得た。どちらの製造においても、凝集、分解又はミスフォールディングはほとんど観察されず、aROR1−B/aCD3構築物はROR1に結合することが確認され、これは抗体配列から高品質二重特異性T細胞結合抗体への変換の成功を示している。
実験的アプローチ: 抗体産生: 既に記載されている特製ダイダロス(Daedalus)レンチウイルス導入系を使用して、全ての抗体を作製する。簡潔に説明すると、各構築物を、切断可能なC末端6×His−Aviタグと共に親発現プラスミド(IRES−GFPを含む)内にクローニングし、ポリエチレンイミン(PEI)を使用して、BirAビオチンリガーゼを安定に発現する293T細胞内に(psPAX2及びpMD2Gと共に)コトランスフェクトする。得られたレンチウイルスを使用して、懸濁適応293F細胞への導入を行い、GFPを使用してタンパク質発現をモニターする。分泌された抗体を導入の2週間後に回収し、ついで、通常のアフィニティクロマトグラフィーを使用して馴化培地から精製する。ついで、サイズ排除クロマトグラフィー及びSDS−PAGEを使用して、個々の分子の安定性及び凝集傾向を判定する。
SPRバイオセンサー上に捕捉されたROR1への個々の二重特異性T細胞結合抗体の結合を、既に記載されているとおりにBiacore T100装置(GE Healthcare)で定量し(例えば、Fintonら,Autoreactivity and exceptional CDR plasticity(but not unusual polyspecificity)hinder elicitation of the anti−HIV antibody 4E10.PLoS Pathog.2013;9(9):e1003639、及びFintonら,Ontogeny of recognition specificity and functionality for the broadly neutralizing anti−HIV antibody 4E10.PLoS Pathog.2014;10(9):e1004403を参照されたい)、前記で要約されているとおりに、初期ROR1 scFvに関して成功裏に行う。二重特異性T細胞結合抗体とCD3、CD8又はCD28との間のSPR相互作用分析を可能にするための試薬は現在入手可能でないため、抗His抗体と共に適切な標的抗原陽性/陰性細胞株を使用して、フローサイトメトリーに基づくアッセイを用いてT細胞への抗体分子の結合を測定する。
全ての二重特異性T細胞結合抗体の細胞溶解特性を、他の二重特異性T細胞結合抗体を特徴づけるために成功裏に用いられている比較インビトロアッセイにおいて決定する。ROR1+ 初代腫瘍細胞(JeKo)及びトランスフェクト化細胞(K562/ROR1)がこれらの研究に利用可能であり、必要に応じて、追加的な細胞株の作製を可能にするROR1発現構築物も利用可能である。適切なROR1−細胞(例えば、親K562細胞又はMKN45細胞)は陰性対照として有用である。ROR1+又はROR1− 細胞株を、種々のE:T細胞比で添加された健常ドナーTの存在下又は非存在下、種々の濃度の個々の二重特異性T細胞結合抗体を含む225μLの適切な培地において、5〜10,000細胞/ウェルで96ウェル丸底プレート内でインキュベートする。48時間後、非生存可能細胞を検出するために4’,6−ジアミジノ−2−フェニルインドール(DAPI)を使用して、細胞数及び薬物誘発細胞傷害性を、LSRIIサイトメーターを使用して決定する。健常ドナーT細胞を添加する実験においては、前方/側方散乱特性及びCellVueブルゴーニュ色素に関する陰性度により、がん細胞を特定する。
得られたBS−BDCグループ、特に、CD3に対するものは、単独で使用された場合に強力な細胞溶解特性を有する。しかし、予備的な知見に基づけば、それらがT細胞同時刺激シグナル伝達をも活性化するようにそれらをグループとして使用する場合に、二重特異性T細胞結合抗体の有効性が増強されうると予想される。CD3及びCD28指向性抗体の組合せが最良の応答をもたらすと予想されるが、このモジュラー系は、先験的に決定された分子セットに探索を限定することなく、最良の抗体の組合せを経験的に決定することを可能にする。これらの二重特異性T細胞結合抗体グループは、(1つ又は2つのT細胞抗原を標的化すると同時に)2つの非重複性ROR1エピトープを同時に標的化することが、単一ROR1エピトープを標的化することと比較した場合の利点をもたらすことを示すのにも有用である。最も好ましい生物物理学的及び細胞溶解的特性を有する抗体グループを特定する。次に、選択した抗体グループをヒト化する。現在の臨床におけるほとんどの抗体はマウス抗体のヒト化形態である。二重特異性T細胞結合分子のマウス形態は有用性を有しうるが、免疫原性が臨床開発における欠点となりうる。ヒト化は、中和抗体の生成を最小限にするための一般に認められている技術であるため、この工程はそれらの臨床開発に必須であると考えられており、したがって、候補分子開発の可能な限り早い段階に組み込まれるであろう。
実験的アプローチ: 二重特異性T細胞結合抗体のグループを、T細胞抗原(例えば、CD3及びCD28又はCD8及びCD28)に対する特異性及び非重複性ROR1エピトープ認識(例えば、ROR1−A及びROR1−B又はROR1−a及びROR1−B)に基づいて合理的に選択した。潜在的に関心が持たれるこれらのグループに加えて、SMITE抗体としてはそれほど適していないと予想される少数のグループ(例えば、ROR1−A及びROR1−a、又はCD3及びCD8)も試験する。次に、これらの抗体グループを標的抗原結合の分析及び薬物誘発性細胞傷害性の決定に付す。単独で使用される個々の抗体は比較分析に役立つ。また、ROR1発現細胞の存在下でSMITE細胞抗体構築物がT細胞サイトカイン放出を誘発する能力をELISA及び細胞内フローサイトメトリーによる共培養実験において評価する。ついで、抗体グループを生物物理学的特性及び細胞溶解特性に基づいてランク付けし、最も高い関心が持たれるグループを、FHCRCコア施設において常套的に利用可能な労働集約的な標準的な方法を用いて抗体ヒト化に付す。このアプローチは主に、多数のマウス・バーニアゾーン(vernier zone)残基が必要だと判断された場合に、表面残基に焦点を絞って、結合を保持させるために必要に応じてマウスに戻されるバーニアゾーン残基の突然変異での相補性決定領域(CDR)グラフティングに基づくものである。分子治療コア(Molecular Therapeutic Core)は、多数の候補分子の作製に適した24ウェルのロボットトランスダクション及び発現系を有する。
個別に使用した場合より良好な細胞溶解特性を併用時に示すBS−BDCのグループを特定する。しかし、2つの二重特異性T細胞結合抗体の同時結合は少なくとも1つのBS−BDCのリンカー長の調節を要すると考えられうる。ロボット発現施設の使用は、必要に応じて、リンカー設計の数回の反復を可能にする。
ヒト化ROR1指向性抗体のグループを作製して、リード分子を特定し、ついで、それを(例えば、大型動物における毒性に関して)より広範な前臨床試験において試験し、最終的に臨床に移すことが可能である。
関心のある構築物を、血液腫瘍細胞モデル(JeKo)及び固形腫瘍細胞モデル(MDA−MB231)に相当するヒトT細胞及びホタルルシフェラーゼ発現ROR1+ 腫瘍細胞(JeKo及びMDA−MB231)を移植したNSGマウスにおいて抗腫瘍活性をもたらすそれらの能力に関して試験する。関心のある抗体の血清半減期を決定するための研究のために、NSGマウスも使用する。これらの研究においては、血液を安楽死時の心臓穿刺により採取し、質量分析又はシンチレーション計数により分析する。これらの研究は、更なる試験に使用されうるリード候補ヒト化抗体二重特異性T細胞結合分子を特定する。
[実施例2]
図3A及び3Bは、CD28指向性二重特異性抗体でのT細胞同時活性化が標的抗原陽性がん細胞の存在に厳密に依存することを示している。これらの実験では、ROR1陰性親K562細胞又はROR1発現K562細胞を、示されているとおりにモノクローナルCD28又はROR1/CD28抗体の存在下又は非存在下、1:1のE:T比で、健常ドナーT細胞と共にCD3抗体(クローンOKT3)でコートされたウェル内でインキュベートした。48時間後、CD69及びCD25の細胞表面発現の測定によるフローサイトメトリーによりT細胞活性化を定量化した。T細胞活性化は、活性化CD3抗体が存在する場合に、ほぼ独占的に見られた。ROR1陰性がん細胞の存在下では、T細胞同時活性化は活性化CD28モノクローナル抗体では可能であったが、ROR1/CD28抗体ではそうではなかった。一方、ROR1陽性がん細胞の存在下では、T細胞共活性化はモノクローナルCD28抗体及びROR1/CD28抗体の両方で可能であった。総合すると、これらのデータは、モノクローナルCD28抗体を使用した場合のがん細胞標的(「非特異的」)T細胞活性化の見解に一致しており、一方、CD28指向性二重特異性T細胞結合抗体でのT細胞同時活性化は、モノクローナルCD28抗体で見られるものと同等に効率的であったが、標的抗原陽性がん細胞の存在に厳密に依存していた。
図4A〜4Dは、CD28指向性二重特異性抗体でのT細胞同時活性化がROR1/CD3抗体誘導性細胞傷害性を増強することを示している。ROR1を発現するように強制されたK562細胞(K562/ROR1)を、示されているとおりの種々の濃度のROR1/CD28抗体MDT347(ROR1抗体クローンR12からの可変ドメインを含む)又はモノクローナルCD28抗体(クローンCD28.2)(4B、4D)を伴って又は伴わずに、ROR1/CD3抗体MDT319(ROR1抗体クローン2A2からの可変ドメインを含む)(4A、4B)又はROR1/CD3抗体MDT340(非交差反応性ROR1抗体クローンR12からの可変ドメインを含む)(4C、4D)の存在下、1:1のE:T比で健常ドナーT細胞と共にインキュベートした。48時間後、細胞数及び薬物誘発性細胞傷害性を決定した。ROR1/CD3抗体は共に、ROR1導入K562細胞において用量依存的な細胞傷害性を引き起こす。この細胞傷害性は、モノクローナルCD28抗体又はROR1/CD28抗体のいずれかでの同時処理によって有意に増強されうる。この増強効果の大きさはモノクローナルCD28抗体とROR1/CD28抗体とにおいて同等である。
図5は、第2のがん細胞抗原を標的化するCD28指向性二重特異性抗体でのT細胞同時活性化が治療用二重特異性T細胞結合抗体の抗がん活性を増強することを示している。ROR1を発現することを強制されたCD33dim+ K562細胞(K562/ROR1)を、示されているとおりに種々の濃度のROR1/CD28抗体(MDT347)を伴って又は伴わずに、CD33/CD3抗体の存在下、1:1のE:T比で健常ドナーT細胞と共にインキュベートした。48時間後、細胞数及び薬物誘発性細胞傷害性を決定した。低レベルのCD33のみを発現するこれらのK562細胞において、CD33/CD3抗体は、限られた単剤活性を有する。ROR1を標的化しCD28を同時活性化する第2抗体との組合せはCD33/CD3抗体と用量依存的に相乗作用をもたらし、薬物誘発性細胞傷害性を実質的に増強する。
図6A〜6Cは、PD−L1/CD28抗体が二重特異性抗体に対するPD−L1媒介耐性を克服しうることを示している。親CD33+ TF−1細胞(6A)、CD19+ RCV−ACV細胞(6B)又はCD19+ REH細胞(6C)、及びPD−L1を過剰発現する対応亜系を、示されているとおりにPD−L1/CD28抗体(MDT359)を伴って又は伴わずに、適切な場合にはCD33/CD3又はCD19/CD3抗体の存在下、健常ドナーT細胞と共にE:Tの比でインキュベートした。48時間後、細胞数及び薬物誘発性細胞傷害性を決定した。既に示されているとおり(Laszloら,Blood Cancer J 2015)、PD−L1の過剰発現は二重特異性抗体誘導性細胞傷害性に対する白血病細胞の耐性の類縁事象を招く。PD−L1/CD28抗体はこの耐性を完全に克服しうる。
リード候補抗体が特定されたら、前臨床安全性及び初期ヒト臨床試験のための臨床等級の抗体の大規模製造を開始する。現在のグッド・マニュファクチャリング・プロセシーズ(Good Manufacturing Processes)(cGMP)研究施設としてのFHCRCの生物製剤製造施設(Biologics Production Facility)はフェーズ1/2試験用の検証済みの生物製剤を製造可能であることに注目することが重要である。例えば、OKT3抗体に由来するCD3に対するscFvは、ブリナツモマブにおいて使用されているものと同じであり、一方、scFv配列から誘導されているCD28抗体はインビボでT細胞を活性化することが実証されている。
統計的な考慮: 主として、ペア分析に関する標準的な記述統計量を用い、これは生物統計学者と協議して行われる。
当業者に理解されるとおり、本明細書に開示されている各実施形態は、その特定の記載されている要素、工程、成分又は構成部分を含む、それらから本質的になる、又はそれらからなることが可能である。したがって、「含む」又は「含み」なる語は、「含む、からなる、又はから本質的になる」を表すと解釈されるべきである。「含む」なる移行句は、限定的なものではなく包含することを意味し、特定されていない要素、工程、成分又は構成部分を、たとえ大量であっても、包含することを可能にする。「からなる」なる移行句は、特定されていない任意の要素、工程、成分又は構成部分を除外する。「から本質的になる」なる移行句は、実施形態の範囲を、特定されている要素、工程、成分又は構成部分、及び該実施形態に実質的に影響を及ぼさないものに限定する。実質的効果はがん細胞へのBS−BDCグループの結合の後でT細胞活性化における統計的に有意な減少を引き起こすであろう。
特に示されていない限り、本明細書及び特許請求の範囲において用いられている成分の量、特性、例えば分子量、反応条件などを表す全ての数は、全ての場合において、「約」なる語により修飾されていると理解されるべきである。したがって、特に断られていない限り、本明細書及び特許請求の範囲に記載されている数的パラメーターは、本発明により得られることが求められる所望の特性に応じて変動しうる近似値である。少なくとも、そして均等論の適用を特許請求の範囲に限定する試みとしてではなく、各数的パラメーターは、少なくとも、示されている有効桁数を考慮して、そして通常の丸め技法を適用することにより解釈されるべきである。更なる明確さが要求される場合、「約」なる語は、表示されている数値又は範囲と共に用いられる場合に当業者によって合理的にそれに帰される意味を有し、すなわち、表示値又は範囲より幾分多い又は幾分少ないことを示し、表示値の±20%、表示値の±19%、表示値の±18%、表示値の±17%、表示値の±16%、表示値の±15%、表示値の±14%、表示値の±13%、表示値の±12%、表示値の±11%、表示値の±10%、表示値の±9%、表示値の±8%、表示値の±7%、表示値の±6%、表示値の±5%、表示値の±4%、表示値の±3%、表示値の±2%、又は表示値の±1%以内を示す。
本発明の広範な範囲を記載する数的範囲及びパラメータは近似値であるにもかかわらず、特定の実施例に記載されている数値は可能な限り正確に示されている。しかし、いずれの数値も、それらのそれぞれの試験測定値において見出される標準偏差から必然的に生じる或る誤差を本質的に含む。
本発明を説明する文脈において(特に、以下の特許請求の範囲の文脈において)用いられる単数形は、本明細書に特に示されていない限り又は文脈に明らかに矛盾しない限り、単数形及び複数形の両方を含むと解釈されるべきである。本明細書における値の範囲の列挙は、該範囲内に含まれるそれぞれの別々の値を個々に指す簡潔な方法として機能することを単に意図している。本明細書に特に示されていない限り、各個の値は、本明細書において個別に列挙されている場合と同様に、本明細書に組み入れられる。本明細書に記載されている全ての方法は、本明細書に特に示されていない限り又は文脈に明らかに矛盾しない限り、任意の適切な順序で実施されうる。本明細書に記載されている全ての例又は例示的な用語(例えば、「のような」)の使用は、単に本発明をより明瞭にすることを意図しており、別に特許請求されている本発明の範囲を限定しない。本明細書におけるいかなる語も、本発明の実施に必須の任意の特許請求されていない要素を示すと解釈されるべきではない。
本明細書に開示されている本発明の代替的要素又は実施形態のグループ分けは、限定的なものとして解釈されるべきではない。各グループメンバーは、個々に、又は該グループの他のメンバー若しくは本明細書に見出される他の要素との任意の組合せで言及され及び特許請求されうる。簡便性及び/又は特許性の理由により、グループのメンバーの1以上がグループに含まれうる又はグループから除外されうると予想される。いずれかのそのような包含又は除外が生じる場合、本明細書は、修正されたものとしてグループを含み、したがって、特許請求の範囲で用いられる全てのマーカッシュグループの、書面による記載を満たすと見なされる。
本発明を実施するための本発明者らに知られている最良の形態を含む、本発明の特定の実施形態が本明細書に記載されている。もちろん、これらの記載されている実施形態に対する変形は、前記の記載を読めば当業者に明らかになるであろう。本発明者は、当業者がそのような変形形態を適宜使用することを想定しており、本発明者らは、本明細書に具体的に記載されている以外の様態で本発明が実施されることを意図している。したがって、本発明は、適用可能な法律によって許容されているとおり、本出願における特許請求の範囲に列挙されている内容の全ての修飾及び均等物を含む。更に、本明細書に特に示されていない限り又は文脈に明らかに矛盾しない限り、前記要素の、その全ての可能な変形における任意の組合せが本発明に包含される。
更に、本明細書全体にわたって、特許、印刷刊行物、学術論文及び他の文書によるテキスト(本明細書において参照されている資料)に対する多数の参照がなされている。参照されている資料のそれぞれの全体を、それらの参照されている教示のために、本明細書に個々に組み入れることとする。
最後に、本明細書に開示されている本発明の実施形態は本発明の原理の例示であると理解されるべきである。用いられうる他の修飾も本発明の範囲内である。したがって、限定的ではない例示として、本明細書の教示に従い、本発明の代替構成が用いられうる。したがって、本発明は、示され記載されている厳密にそのとおりのものには限定されない。
本明細書に示されている詳細は例示としてのものであり、本発明の好ましい実施形態の例示的説明を目的としたものであるに過ぎず、本発明の種々の実施形態の原理及び概念的態様の最も有用で容易に理解される説明であると考えられるものを提供するために示されている。この点において、本発明の基本的理解に必要なものより詳細に本発明の構造的詳細を示すための試みはなされておらず、図面及び/又は実施例と共になされている説明は、本発明の幾つかの形態がどのように実際に具体化されうるかを当業者に明らかにしている。
本開示において用いられている定義及び説明は、以下の実施例において明確かつ明白に修正されない限り、又はその意味の適用がいかなる構成をも無意味又は本質的に無意味にする場合を除き、将来のいかなる構成にも優先することを意味し及びそのように意図される。用語の構成がそれを無意味又は本質的に無意味にする場合、定義は、Webster’s Dictionary, 3rd Edition、又はOxford Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology(Anthony Smith編,Oxford University Press,Oxford,2004)のような当業者に公知の辞書から採用されるべきである。

Claims (116)

  1. 二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおける各BS−BDCが、
    (i)該グループ内の別のBS−BDCにより標的化されるがん抗原エピトープとは非重複性及び非反復性であるがん抗原エピトープ、並びに
    (ii)該グループ内の別のBS−BDCにより標的化される免疫細胞活性化エピトープとは非重複性及び非反復性である免疫細胞活性化エピトープ
    を標的化し、
    ここで、該非重複性及び非反復性がん抗原エピトープの2つがROR1上に位置し、該非重複性及び非反復性免疫細胞活性化エピトープの1つがCD3上に位置し、該非重複性及び非反復性免疫細胞活性化エピトープの1つがCD28上に位置する、グループ。
  2. 少なくとも1つのBS−BDCが、R11抗体のCDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及びCDRH3配列を含むscFVを含む、請求項1記載のグループ。
  3. 少なくとも1つのBS−BDCが、R12抗体のCDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及びCDRH3配列を含むscFVを含む、請求項1記載のグループ。
  4. 少なくとも1つのBS−BDCが、2A2抗体のCDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及びCDRH3配列を含むscFVを含む、請求項1記載のグループ。
  5. 少なくとも1つのBS−BDCが、OKT3抗体のCDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及びCDRH3配列を含むscFVを含む、請求項1記載のグループ。
  6. 少なくとも1つのBS−BDCが、9D7抗体のCDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及びCDRH3配列を含むscFVを含む、請求項1記載のグループ。
  7. 少なくとも1つのBS−BDCが、TGN1412抗体のCDRL1、CDRL2、CDRL3、CDRH1、CDRH2及びCDRH3配列を含むscFVを含む、請求項1記載のグループ。
  8. 配列番号238を含む、請求項1記載のグループ。
  9. 配列番号239を含む、請求項1記載のグループ。
  10. 配列番号240を含む、請求項1記載のグループ。
  11. 配列番号241を含む、請求項1記載のグループ。
  12. 配列番号242を含む、請求項1記載のグループ。
  13. 配列番号243を含む、請求項1記載のグループ。
  14. 配列番号244を含む、請求項1記載のグループ。
  15. 二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおける各BS−BDCが、該グループにおける別のBS−BDCにより標的化されるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープとは異なるがん抗原エピトープ及び免疫細胞活性化エピトープを標的化し、ただし、該がん抗原エピトープの少なくとも2つが同一がん抗原上に存在する、グループ。
  16. 前記の異なるがん抗原エピトープが非重複性及び/又は非反復性である、請求項15記載のグループ。
  17. 前記の異なるがん抗原エピトープの全てが同一がん抗原上に存在する、請求項15記載のグループ。
  18. 前記同一がん抗原がROR1であり、前記の異なるエピトープがROR1−A及びROR1−Bにより標的化され、又はROR1−a及びROR1−Bにより標的化される、請求項15記載のグループ。
  19. 前記の異なるがん抗原エピトープの全てが同一がん抗原上に存在しない、請求項15記載のグループ。
  20. 前記BS−BDCグループが更に、異なるがん抗原上の異なるがん抗原エピトープを標的化する、請求項15記載のグループ。
  21. 前記の異なるがん抗原エピトープが、前記の少なくとも2つの標的化エピトープを含有するがん抗原とは異なるがん抗原上のがん抗原エピトープを含む、請求項20記載のグループ。
  22. (i)少なくとも2つの標的化エピトープを含有するがん抗原がROR1であり、前記の異なるがん抗原がCD33である;
    (ii)少なくとも2つの標的化エピトープを含有するがん抗原がCD33であり、前記の異なるがん抗原がPD−L1である;
    (iii)少なくとも2つの標的化エピトープを含有するがん抗原がCD19であり、前記の異なるがん抗原がPD−L1である;又は
    (iv)少なくとも2つの標的化エピトープを含有するがん抗原がCD123であり、前記の異なるがん抗原がCD33である、
    請求項20記載のグループ。
  23. 前記の異なるがん抗原エピトープが、
    (i)ROR1及びCD33;
    (ii)CD33及びPD−L1;
    (iii)CD19及びPD−L1;
    (iv)CD123及びCD33;
    (v)CD19、CD20、CD22、ROR1、CD33、CD123及びWT−1の2以上;
    (vi)PSMA、WT1、PSCA及びSV40 Tの2以上;
    (vii)HER2、ERBB2及びROR1の2以上;
    (viii)L1−CAM、MUC−CD、葉酸受容体、ルイスY、ROR1、メソテリン及びWT−1の2以上;又は
    (ix)メソテリン、CEA、CD24及びROR1の2以上
    に存在する、請求項20記載のグループ。
  24. 前記同一がん抗原がBCMA、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD33、CD123,CD133、ERBB2、葉酸受容体、HER2、ルイスY、L1−CAM、メソテリン、MUC−CD、PD−L1、PSCA、PSMA、ROR1、SV40 T又はWT−1である、請求項15記載のグループ。
  25. 前記グループにおけるBS−BDCがR11、R12、2A2又はY31のVH、VL及び/又はCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  26. 前記グループにおけるBS−BDCが8F5、12B12、4H10、11D5、13E11、1H7、11D11又はM195のVH、VL及び/又はCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  27. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、異なるT細胞活性化因子上に存在する、請求項15記載のグループ。
  28. 前記の異なるT細胞活性化因子がCD3及びCD28;CD3及びCD8;又はCD8及びCD28である、請求項27記載のグループ。
  29. 前記グループにおけるBS−BDCがOKT3、OKT8又は9D7のCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  30. 前記グループが4個以下のBS−BDCを含む、請求項15記載のグループ。
  31. 前記グループが、第1 ROR1エピトープ及びCD3を標的化するBS−BDCと、第2 ROR1エピトープ及びCD28を標的化するBS−BDCとを含む、請求項15記載のグループ。
  32. 前記グループが、ROR1及びCD28を標的化するBS−BDCと、CD33及びCD3を標的化するBS−BDCとを含む、請求項15記載のグループ。
  33. 前記グループが、CD33及びCD3を標的化するBS−BDCと、PD−L1及びCD28を標的化するBS−BDCとを含む、請求項15記載のグループ。
  34. 前記グループが、CD19及びCD3を標的化するBS−BDCと、PD−L1及びCD28を標的化するBS−BDCとを含む、請求項15記載のグループ。
  35. 前記グループが、CD123及びCD3の第1エピトープを標的化するBS−BDCと、CD123及びCD28の第2エピトープを標的化するBS−BDCとを含む、請求項15記載のグループ。
  36. 前記グループが、CD33及びCD3を標的化するBS−BDCと、CD123及びCD28を標的化するBS−BDCとを含む、請求項15記載のグループ。
  37. 前記の異なるがん抗原エピトープがROR1、CD33、CD19、PD−L1及び/又はCD123上に存在する、請求項15記載のグループ。
  38. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16及び配列番号17から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  39. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22及び配列番号23から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  40. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28及び配列番号29から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  41. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34及び配列番号35から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  42. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40及び配列番号41から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  43. 前記グループにおけるBS−BDCがFMC63、SJ25C1及び/又はHD37のCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  44. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46及び配列番号47から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  45. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52及び配列番号53から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  46. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58及び配列番号59から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  47. 前記グループにおけるBS−BDCがリツキシマブ、オファツムマブ及び/又はハーセプチンのCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  48. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86及び配列番号87から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  49. 前記グループにおけるBS−BDCが、CDR配列(i)配列番号267、配列番号268、配列番号269、配列番号270、配列番号271及び配列番号272、又は(ii)配列番号273、配列番号274、配列番号275、配列番号276、配列番号277及び配列番号259を含む、請求項15記載のグループ。
  50. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92及び配列番号93から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  51. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98及び配列番号99から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  52. 前記グループにおけるBS−BDCがCD33を標的化し、ここで、CD33が、(i)全長CD33(CD33FL)、(ii)エキソン2を欠くCD33のスプライス変異体(CD33ΔE2)のみ、又は(iii)それがCD33FLであるかCD33ΔE2であるかにかかわらず、CD33である、請求項15記載のグループ。
  53. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80及び配列番号81から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  54. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号253、配列番号254、配列番号255、配列番号256、配列番号257及び配列番号258から選択されるCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  55. 前記グループにおけるBS−BDCが5D12、85F、12B12、4H10、11D5、13E11、1H7、11D11又はM195のV及びV鎖を含む、請求項15記載のグループ。
  56. 前記グループにおけるBS−BDCが5D12、85F、12B12、4H10、11D5、13E11、1H7、11D11又はM195のVおよびV鎖からのCDR配列を含む、請求項15記載のグループ。
  57. 二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループであって、該グループにおける各BS−BDCが、
    (i)該グループ内の別のBS−BDCにより標的化されるがん抗原エピトープとは非重複性及び非反復性であるがん抗原エピトープ、並びに
    (ii)該グループ内の別のBS−BDCにより標的化される免疫細胞活性化エピトープとは非重複性及び非反復性である免疫細胞活性化エピトープ
    を標的化し、
    ここで、該非重複性及び非反復性がん抗原エピトープの2つがCD33上に位置し、該非重複性及び非反復性免疫細胞活性化エピトープの2つがCD3上と4−1BB、PD−1、LAG3、TIM−3、BTLA、CTLA−4、CD200又はVISTAの1以上の上とに位置する、グループ。
  58. 免疫細胞がT細胞、ナチュラルキラー細胞又はマクロファージである、請求項57記載のグループ。
  59. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが同一免疫細胞活性化因子上に存在する、請求項57記載のグループ。
  60. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、異なる免疫細胞活性化因子上に存在する、請求項57記載のグループ。
  61. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、同一免疫細胞活性化因子上及び異なる免疫細胞活性化因子上に存在する、請求項57記載のグループ。
  62. 免疫細胞活性化エピトープの少なくとも1つがT細胞上に存在する、請求項57記載のグループ。
  63. 前記同一免疫細胞活性化因子がCD3であり、前記の異なるエピトープが、T細胞CD3二量体を含む異なるインバリアントタンパク質上に存在する、請求項61記載のグループ。
  64. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープがCD3及びCD28、CD3及びCD8、又はCD8及びCD28上に存在する、請求項57記載のグループ。
  65. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープがCD3、CD8及びCD28上に存在する、請求項57記載のグループ。
  66. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープがCD3、CD28及びCD137上に存在する、請求項57記載のグループ。
  67. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、(i)CD3、(ii)CD3、及び(iii)CD28上に存在する、請求項57記載のグループ。
  68. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、(i)CD28、(ii)CD28、及び(iii)CD3上に存在する、請求項57記載のグループ。
  69. 前記の異なる免疫細胞活性化エピトープが、CD2、CD3、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CD83、CD137、OX40、LFA−1、LIGHT、NKG2C及びB7−H3の1以上に存在する、請求項57記載のグループ。
  70. 前記グループにおけるBS−BDCがOKT3、OKT8、9D7又はHu26BのCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  71. 前記グループにおけるBS−BDCがOKT3、20G6−F3、4B4−D7、4E7−C9及び/又は18F5−H10のCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  72. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号100、配列番号101、配列番号102、配列番号103、配列番号104及び配列番号105から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  73. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号107、KVS、配列番号109、配列番号110、配列番号111及び配列番号112から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  74. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号113、KVS、配列番号115、配列番号116、配列番号117及び配列番号118から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  75. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号119、KVS、配列番号121、配列番号122、配列番号123及び配列番号124から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  76. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号125、KVS、配列番号127、配列番号128、配列番号129及び配列番号130から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  77. 前記グループにおけるBS−BDCが9D7、9.3、KOLT−2、15E8、248.23.2、EX5.3D10及び/又は5.11A1のCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  78. 前記グループにおけるBS−BDCがOKT8を含む、請求項57記載のグループ。
  79. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号226、配列番号227、配列番号228、配列番号229、配列番号230及び配列番号231から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  80. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号261、配列番号262、配列番号263、配列番号264、配列番号265及び配列番号266から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  81. 免疫細胞活性化エピトープの少なくとも1つがナチュラルキラー細胞上に存在する、請求項57記載のグループ。
  82. 前記グループにおけるBS−BDCが5C6、1D11、mAb 33、P44−8、SK1及び/又は3G8のCDR配列を含む、請求項81記載のグループ。
  83. 前記グループにおけるBS−BDCが配列番号232の可変軽鎖領域及び配列番号233の可変重鎖領域を含む、請求項81記載のグループ。
  84. 免疫細胞活性化エピトープがマクロファージ上に存在する、請求項57記載のグループ。
  85. 前記グループにおけるBS−BDCがM1/70、KP1及び/又はab87099のCDR配列を含む、請求項84記載のグループ。
  86. 免疫細胞活性化エピトープの少なくとも1つが免疫細胞抑制因子上に存在する、請求項15又は57記載のグループ。
  87. 免疫細胞抑制因子が4−1BB、PD−1、LAG3、TIM−3、BTLA、CTLA−4、CD200及びVISTAの1以上を含む、請求項85記載のグループ。
  88. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号261、配列番号262、配列番号263、配列番号264、配列番号265及び配列番号266から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  89. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号147、配列番号148、配列番号149、配列番号150、INH及び配列番号152から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  90. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号154、配列番号155、配列番号156、配列番号157、配列番号158及び配列番号159から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  91. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号160、配列番号161、配列番号162、配列番号163、配列番号164及び配列番号165から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  92. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号167、配列番号168、配列番号169、配列番号170、配列番号171及び配列番号172から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  93. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号174、AAS、配列番号176、配列番号177、配列番号178及び配列番号179から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  94. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号181、配列番号182、配列番号183、配列番号184、配列番号185及び配列番号186から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  95. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号187、配列番号188、配列番号189、配列番号190、配列番号191及び配列番号192から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  96. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号194、配列番号195、配列番号196、配列番号197、配列番号198及び配列番号199から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  97. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号200、配列番号201、配列番号202、配列番号203、配列番号204及び配列番号205から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  98. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号206、配列番号207、配列番号208、配列番号209、配列番号210及び配列番号211から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  99. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号213、配列番号214、配列番号215、配列番号216、配列番号217及び配列番号218から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  100. 前記グループにおけるBS−BDCが、配列番号220、配列番号221、配列番号222、配列番号223、SAS及び配列番号225から選択されるCDR配列を含む、請求項15又は57記載のグループ。
  101. 前記グループが2、3又は4個のBS−BDCを含む、請求項15又は57記載のグループ。
  102. 配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号244、配列番号245、配列番号246、配列番号247、配列番号248、配列番号249、配列番号250、配列番号251及び配列番号252から選択される少なくとも2つの二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を含む、二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ。
  103. 配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号244、配列番号245、配列番号246、配列番号247、配列番号248、配列番号249、配列番号250、配列番号251及び配列番号252から選択される3個の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を含む、二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ。
  104. 配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号244、配列番号245、配列番号246、配列番号247、配列番号248、配列番号249、配列番号250、配列番号251及び配列番号252から選択される4個の二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)を含む、二重特異性結合ドメイン構築物(BS−BDC)のグループ。
  105. BS−BDCがscFvである、請求項15、57又は102記載のグループ。
  106. 請求項15、57又は102記載のグループを含む組成物。
  107. 請求項106記載の組成物の治療量を投与することにより、がんの治療を要する対象においてがんを治療することを含む、がんの治療を要する対象におけるがんの治療方法。
  108. 前記治療が治療に対するがん細胞の耐性を克服する、請求項107記載の方法。
  109. 対象のがんの変化に関して対象をモニターすることを含む、請求項107記載の方法。
  110. 異なるグループのBS−BDCと共に組成物を投与することを含む、請求項107記載の方法。
  111. 異なるグループのBS−BDCと共に組成物を投与することが、前記モニターの結果に基づく、請求項110記載の異なるグループのBS−BDCと共に組成物を投与することを含む方法。
  112. 前記モニターの結果がクローンの出現を示す、請求項111記載の方法。
  113. 前記モニターの結果が治療耐性クローンの出現を示す、請求項111記載の方法。
  114. 前記モニターの結果が腫瘍微小環境における免疫抑制を示す、請求項111記載の方法。
  115. 前記モニターの結果が腫瘍微小環境におけるT細胞抑制を示す、請求項111記載の方法。
  116. 免疫応答の刺激を要する対象において免疫応答を刺激する方法であって、免疫応答の刺激を要する対象に請求項106記載の組成物の治療量を投与し、それにより、免疫応答の刺激を要する対象において免疫応答を刺激することを含む方法。
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