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JP2008136421A - Nucleic acid amplification method and nucleic acid amplification kit - Google Patents

Nucleic acid amplification method and nucleic acid amplification kit Download PDF

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JP2008136421A
JP2008136421A JP2006325986A JP2006325986A JP2008136421A JP 2008136421 A JP2008136421 A JP 2008136421A JP 2006325986 A JP2006325986 A JP 2006325986A JP 2006325986 A JP2006325986 A JP 2006325986A JP 2008136421 A JP2008136421 A JP 2008136421A
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nucleic acid
amplification
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JP2006325986A
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Japanese (ja)
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Koji Nozato
宏治 野里
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Canon Inc
Original Assignee
Canon Inc
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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a nucleic acid amplification method, by which a PCR reaction-inhibiting factor is excluded without affecting a normal PCR reaction system and a post process to enhance the efficiency of the amplification, even when an initial amount of a target nucleic acid is rare. <P>SOLUTION: This nucleic acid amplification method for amplifying the target nucleic acid is characterized in that the PCR reaction using the target nucleic acid as a template is performed in the presence of an auxiliary nucleic acid, and the auxiliary nucleic acid does not have complementarity and homology with the target nucleic acid and a primer. <P>COPYRIGHT: (C)2008,JPO&INPIT

Description

本発明は、PCR(Polymerase Chain Reaction)法による核酸増幅法に関する。より詳細には、検査試料中の微量核酸の安定的で高効率な増幅方法に関する。   The present invention relates to a nucleic acid amplification method using a PCR (Polymerase Chain Reaction) method. More specifically, the present invention relates to a stable and highly efficient amplification method for a small amount of nucleic acid in a test sample.

ゲノムシーケンスプロジェクトの進展に伴って、ゲノム上の特定遺伝子の検出、SNPS解析、発現解析等がポストゲノムの課題として注目されている。そういった中で、最近の医療、分子生物学の分野では、収集した検体から微量な標的核酸を増幅、検出する必要性が大きくなってきている。   With the progress of the genome sequencing project, detection of specific genes on the genome, SNPS analysis, expression analysis, etc. are attracting attention as post-genome issues. Under such circumstances, in recent medical and molecular biology fields, there is an increasing need to amplify and detect a small amount of target nucleic acid from collected specimens.

また、実際の臨床医療の現場においても核酸検出の重要度が増している。従来、ウイルスや細菌による感染症の臨床検査方法としては、血清抗体の検出や患者からの病原体分離培養などの方法が取られてきた。しかし、血清抗体の検出法においては、感染から抗体生産までの時間が長期間かかることや、抗体生産が安定していない等の理由により、検出できない場合がある。また、病原体分離培養の場合にも、病原体を判定するために3日程度にわたる長時間培養が必要であるという問題があった。このような問題から、患者から採取した検体中に含まれる病原体の核酸を増幅し、病原体由来の特定配列を直接検出する方法が提案されている。   Also, the importance of nucleic acid detection is increasing in actual clinical practice. Conventionally, methods such as detection of serum antibodies and pathogen isolation culture from patients have been used as clinical inspection methods for infections caused by viruses and bacteria. However, in the detection method of serum antibodies, detection may not be possible due to the long time from infection to antibody production or because antibody production is not stable. Further, in the case of pathogen isolation culture, there is a problem that long-term culture for about 3 days is required to determine the pathogen. From such a problem, a method has been proposed in which a nucleic acid of a pathogen contained in a specimen collected from a patient is amplified and a specific sequence derived from the pathogen is directly detected.

核酸の増幅方法としては、PCR(Polymerase Chain Reaction)法が一般的に用いられている。PCR法とは、増幅させたいDNA領域を挟む2種類のプライマーを用いてDNAポリメラーゼによるDNA合成反応を繰り返すことによって、目的とするDNA断片を短時間で数10万から100万倍以上に増幅させる方法である。より詳しくは、標的核酸、プライマ−、DNAポリメラーゼ、各種バッファ、塩類等を含んだ反応液を、95℃程度にすることによってDNAの2本鎖を1本鎖に乖離させる。その後65℃程度にすることにより標的配列とプライマ−を結合させ、70℃程度にすることでDNAポリメラーゼによってプライマ−から標的核酸を鋳型としたDNA合成反応が進む。この温度サイクルを20〜40回繰り返すことによって、30分〜数時間で数百万倍にまで増幅する。従ってPCR法は、原理的には、DNAが1コピーあれば、これを増幅させて極めて多数個になし得る方法である。   As a nucleic acid amplification method, a PCR (Polymerase Chain Reaction) method is generally used. The PCR method is to amplify the desired DNA fragment from several hundred thousand to over one million times in a short time by repeating the DNA synthesis reaction by DNA polymerase using two kinds of primers sandwiching the DNA region to be amplified. Is the method. More specifically, the DNA double strand is separated into a single strand by bringing the reaction solution containing the target nucleic acid, primer, DNA polymerase, various buffers, salts and the like to about 95 ° C. Thereafter, the target sequence and the primer are bound by setting the temperature to about 65 ° C., and the DNA synthesis reaction using the target nucleic acid as a template is promoted from the primer by the DNA polymerase by setting the temperature to about 70 ° C. By repeating this temperature cycle 20 to 40 times, it is amplified to million times in 30 minutes to several hours. Therefore, in principle, the PCR method is a method in which if there is one copy of DNA, it can be amplified to a very large number.

核酸の検出、定量するための方法としては、アガロースゲル電気泳動にかけて染色する方法が一般的である。また、標的核酸を固体担体上に固定し標識プローブをハイブリダイゼーションさせる方法(特許文献1参照)や、固体担体上にプローブを固定して標識した標的核酸をハイブリダイゼーションさせる方法(特許文献2参照)等が提案されている。これらの方法は微小な標的配列も検出可能な感度を有しているが、一般的には検体そのままの標的核酸の濃度では検出不可能であり、PCR等の核酸増幅処理が前段階として必要である。   As a method for detecting and quantifying nucleic acid, a method of staining by agarose gel electrophoresis is common. Also, a method of immobilizing a target nucleic acid on a solid support and hybridizing a labeled probe (see Patent Document 1), or a method of immobilizing a probe on a solid support and hybridizing a labeled target nucleic acid (see Patent Document 2) Etc. have been proposed. These methods are sensitive enough to detect minute target sequences, but generally cannot be detected at the target nucleic acid concentration of the sample as it is, and nucleic acid amplification treatment such as PCR is necessary as a previous step. is there.

今後、遺伝子解析が進むに従って、解析対象がより詳細で微量な標的となることが予想される。また、感染症の病原体の検出においては、検体中には非常に稀少な数の病原体しか含まれていない。そのような検体を上述のアガロース電気泳動法やハイブリダイゼーション法で検出可能な量まで増幅する必要がある。   In the future, as genetic analysis progresses, it is expected that the analysis target will become a more detailed and minute target. Further, in the detection of infectious pathogens, the sample contains only a very rare number of pathogens. It is necessary to amplify such a specimen to an amount detectable by the above-described agarose electrophoresis method or hybridization method.

原理的にPCR法では、1コピーの標的核酸があればそれを数百万倍まで増幅できることになっているが、一般的には初期標的核酸として数百〜数千コピーが必要である。初期の標的核酸がこれ以上少ないと、全く増幅されなかったり、増幅産物量が一定しなかったりという現象が見られる。   In principle, in the PCR method, if there is one copy of the target nucleic acid, it can be amplified up to several million times, but generally several hundred to several thousand copies are required as the initial target nucleic acid. If the initial target nucleic acid is less than this, there will be a phenomenon that amplification is not performed at all or the amount of amplification product is not constant.

このような現象の原因としては、様々なものが想定される。一例としては、プライマー同士が結合をおこしてプライマーダイマーを形成することや、検体中の標的類似配列とプライマーが反応を起こし、正常なプライマーの結合を阻害することによる増幅効率の低下が考えられる。また、検体中の成分やPCR試薬、反応器具等が標的核酸やDNAポリメラーゼに作用することによって、PCR反応が阻害されてしまうことも原因と考えられている。前者の例の阻害要因に対しては反応溶液を定温で調整するような方法(特許文献3参照)等が提案されている。また、後者の例の要因に対しては熱工程を加える方法や、pHの調整、フィルタレーション等をすることによって回避する方法が提案されている(特許文献4参照)。
米国特許第4358535号明細書 米国特許第5688642号明細書 特開平05−24495号公報 特開平11−113573号公報
Various causes are assumed for such a phenomenon. As an example, it can be considered that the amplification efficiency is lowered by binding of primers to each other to form a primer dimer, or by causing a target similar sequence in a sample to react with the primer and inhibiting the binding of normal primers. In addition, it is considered that the PCR reaction is inhibited by the components in the specimen, PCR reagents, reaction instruments, etc. acting on the target nucleic acid or DNA polymerase. For the inhibition factor of the former example, a method of adjusting the reaction solution at a constant temperature (see Patent Document 3) has been proposed. In addition, a method of adding a thermal process, a method of avoiding the factor of the latter example by adjusting pH, filtering, or the like has been proposed (see Patent Document 4).
U.S. Pat. No. 4,358,535 US Pat. No. 5,688,642 JP 05-24495 A Japanese Patent Laid-Open No. 11-113573

しかし、これらの方法を行っても阻害要因の排除は不完全であり、初期標的核酸量が稀少な場合には、残った阻害要因の影響を強く受けてしまい、増幅効率が低くなってしまう場合がある。   However, even if these methods are used, the inhibition factor is not completely eliminated, and if the initial target nucleic acid amount is scarce, it will be strongly influenced by the remaining inhibition factor, resulting in low amplification efficiency. There is.

また、各種薬品の添加やフィルタレーションを行う場合には、それらがPCR反応の新たな阻害要因になる可能性や、PCR条件が変わってしまうことによる増幅産物の組成の変化、PCR後の核酸精製工程に影響を与えてしまう可能性があった。   In addition, when various chemicals are added or filtered, they may become new inhibitors of PCR reactions, changes in the composition of amplification products due to changes in PCR conditions, nucleic acid purification after PCR There was a possibility of affecting the process.

本発明の目的は、これらの課題を克服し、正常なPCR反応系や後工程へ影響を与えることなくPCR反応の阻害要因を排除し、安定的で高効率な核酸増幅方法を提供することにある。   An object of the present invention is to overcome these problems and to provide a stable and highly efficient nucleic acid amplification method by eliminating factors that inhibit PCR reactions without affecting normal PCR reaction systems and subsequent processes. is there.

上記の目的を達成するため本発明は、第一に、標的核酸を増幅するためのPCR方法であって、
前記標的核酸を鋳型とするPCR反応を補助核酸の存在下で行い、
前記補助核酸が、前記標的核酸及びプライマーと相補性及び相同性を有さないことを特徴とする標的核酸増幅方法である。
To achieve the above object, the present invention firstly provides a PCR method for amplifying a target nucleic acid,
Performing a PCR reaction using the target nucleic acid as a template in the presence of an auxiliary nucleic acid,
The method for amplifying a target nucleic acid, wherein the auxiliary nucleic acid does not have complementarity and homology with the target nucleic acid and a primer.

本発明の第二は、標的核酸を増幅するためのPCR試薬キットであって、
a)標的核酸の増幅に必要とされるPCR試薬
b)前記標的核酸の配列と相補性および相同性を有さない補助核酸
を少なくとも含むことを特徴とする核酸増幅キットである。
The second of the present invention is a PCR reagent kit for amplifying a target nucleic acid,
a) a PCR reagent required for amplification of the target nucleic acid b) a nucleic acid amplification kit comprising at least an auxiliary nucleic acid having no complementarity and homology with the sequence of the target nucleic acid.

本発明の核酸増幅方法により、正常なPCR反応系および後工程に影響を与えることなく、増幅効率を向上させることが可能となる。よって、ごく微量な初期標的核酸であっても効率良く安定的に増幅させることが可能となる。   The nucleic acid amplification method of the present invention makes it possible to improve amplification efficiency without affecting the normal PCR reaction system and subsequent processes. Therefore, even a very small amount of the initial target nucleic acid can be efficiently and stably amplified.

以下、本発明に係わる核酸増幅方法の具体的な実施の形態を説明する。ただし、本発明はこれらに限定されるものではない。   Hereinafter, specific embodiments of the nucleic acid amplification method according to the present invention will be described. However, the present invention is not limited to these.

本発明において、標的核酸とは、PCR反応により増幅される標的配列を有する核酸を指す。標的核酸としては、ゲノムDNA、プラスミドDNA、その他の二本鎖DNAもしくは一本鎖DNAなどが挙げられる。核酸検体とは、標的核酸を含む検体としてPCR反応液に加えられる検体を指す。核酸検体が生体由来である場合は、抽出および精製方法の条件により、標的核酸およびその他の生体由来DNA以外にRNAおよびその他の夾雑物成分を含むこともある。   In the present invention, the target nucleic acid refers to a nucleic acid having a target sequence amplified by a PCR reaction. Examples of the target nucleic acid include genomic DNA, plasmid DNA, other double-stranded DNA or single-stranded DNA. A nucleic acid sample refers to a sample added to a PCR reaction solution as a sample containing a target nucleic acid. When the nucleic acid specimen is derived from a living body, RNA and other contaminant components may be contained in addition to the target nucleic acid and other living body-derived DNA depending on the conditions of the extraction and purification methods.

一般的に本発明が利用される分野としては、生体由来物質から抽出したDNA等を標的核酸とする増幅処理であるが、これに限定されるものではなく、人工合成核酸の増幅であっても利用可能である。生体由来物質とは、例えば動植物組織、体液、排泄物等をいい、細胞、細菌、ウィルス等であっても良い。体液には血液、唾液、髄液、尿、乳等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。また、これらの生体由来物質に含まれる検体核酸としては、特に限定されないが、例えば、特定の遺伝子の増幅に用いられる。   In general, the field in which the present invention is used is amplification treatment using DNA extracted from a biological material as a target nucleic acid, but is not limited thereto, and may be amplification of artificially synthesized nucleic acid. Is available. The biological material refers to, for example, animal and plant tissues, body fluids, excrement, etc., and may be cells, bacteria, viruses, and the like. Body fluids include, but are not limited to blood, saliva, spinal fluid, urine, milk and the like. Moreover, although it does not specifically limit as a sample nucleic acid contained in these biological origin substances, For example, it uses for amplification of a specific gene.

本発明に係るPCR反応は、通常用いられる方法であればどのようなPCR法でも用いることができる。一般的なPCR法を下記に示すが、本発明のPCR反応は、これらの反応試薬組成および反応条件に限定されるものではない。   Any PCR method can be used for the PCR reaction according to the present invention as long as it is a commonly used method. A general PCR method is shown below, but the PCR reaction of the present invention is not limited to these reaction reagent compositions and reaction conditions.

PCR法では、PCR反応液に対して加熱冷却を行って温度サイクルをかけることが基本となる。一般的なPCR反応液は、増幅対象となる標的配列を有する標的核酸(鋳型DNA)、pH緩衝用バッファー、塩類、プライマー、dNTP等の基質及びDNAポリメラーゼを含むものである。さらに、界面活性剤やゼラチン等を含む場合もある。pH緩衝用バッファーとしては、Tris−HCl等の10mMから100mM程度の濃度のものが好適に使用される。pHは8〜9付近に調整することが多い。DNAポリメラーゼは、Taq DNA PolimeraseやT4 DNA Polymerase等様々なものが使用可能であるが、増幅対象や増幅反応を勘案して適宜選択する。さらに、DNAポリメラーゼに各種抗体を付加して不活性化しておき、PCRの1回目の加熱工程で抗体を乖離させてDNAポリメラーゼを活性化する方法等もあるので、適宜反応条件も含めて選択する。通常1反応に0.5〜2.5単位を加える。塩ではMgCl2が好適に用いられ、通常1.5mM程度の濃度で添加されるが、増幅対象等によって最適化して使用する場合が多い。プライマーは標的核酸に応じて設計する。増幅したい領域の両側に数十〜数百塩基の長さで設計する。プライマー同士で結合するような配列や、高次構造をとるような配列は一般的に使用しない。また、標的核酸との結合しやすさの目安となるtm(溶解温度)も考慮して設計する必要がある。 In the PCR method, the temperature reaction cycle is basically performed by heating and cooling the PCR reaction solution. A general PCR reaction solution contains a target nucleic acid (template DNA) having a target sequence to be amplified, a buffer for pH buffer, salts, primers, a substrate such as dNTP, and a DNA polymerase. Further, it may contain a surfactant, gelatin and the like. As the buffer for pH buffer, a buffer having a concentration of about 10 mM to 100 mM such as Tris-HCl is preferably used. The pH is often adjusted to around 8-9. Various DNA polymerases such as Taq DNA Polymerase and T4 DNA Polymerase can be used, and are selected appropriately in consideration of the amplification target and the amplification reaction. In addition, there are methods such as adding various antibodies to DNA polymerase to inactivate them, then detaching the antibodies in the first heating step of PCR and activating DNA polymerase, so select appropriately including reaction conditions . Usually 0.5 to 2.5 units are added to one reaction. As the salt, MgCl 2 is preferably used, and is usually added at a concentration of about 1.5 mM. Primers are designed according to the target nucleic acid. Design with a length of several tens to several hundred bases on both sides of the region to be amplified. Generally, a sequence that binds to each other or a sequence that has a higher order structure is not used. In addition, it is necessary to design in consideration of tm (dissolution temperature) which is a measure of ease of binding to the target nucleic acid.

上述のような組成に調整したPCR反応液に対して、市販のサーマルサイクラー等を用いて温度サイクルを繰り返すことによって核酸増幅を行う。温度サイクルは、標的核酸である2本鎖DNAを1本鎖に乖離する工程(熱変性)、前記1本鎖とプライマーを結合させる工程(アニーリング)、プライマーからDNAを合成させる工程(伸長)の繰り返しである。熱変性工程は、95℃程度で行い、20〜60秒程度行うことができる。アニーリング工程はプライマーの構成によって異なるが、通常は50〜65℃程度で、10〜90秒程度で行うことができる。伸長工程は選択したDNAポリメラーゼによって異なるが、概ね72℃程度であり、10〜60秒程度が一般的である。このようなサイクル以外にも、アニール工程と伸長工程を同一温度で行うサイクルであってもよい。また、上記温度サイクルの前後に補助的な温度条件を与える場合も多い。   Nucleic acid amplification is performed on the PCR reaction solution adjusted to the above composition by repeating the temperature cycle using a commercially available thermal cycler or the like. The temperature cycle includes a step of separating a double-stranded DNA, which is a target nucleic acid, into a single strand (thermal denaturation), a step of binding the single strand to a primer (annealing), and a step of synthesizing DNA from the primer (extension). It is repetition. The heat denaturation step can be performed at about 95 ° C. for about 20 to 60 seconds. Although an annealing process changes with composition of a primer, it is about 50-65 degreeC normally and can be performed in about 10-90 second. The extension step varies depending on the selected DNA polymerase, but is generally about 72 ° C. and generally about 10 to 60 seconds. In addition to such a cycle, a cycle in which the annealing step and the extension step are performed at the same temperature may be used. Also, auxiliary temperature conditions are often given before and after the temperature cycle.

本発明の特徴は、上述のPCR反応の反応溶液に、標的配列およびプライマー配列に対して相補性も相同性も有さない配列からなる補助核酸を含むことである。補助核酸は生体由来物質から抽出したものであっても良いし、人工的に合成したものでも良い。補助核酸を人工的に合成して得る場合は、標的核酸およびプライマー配列に対して相補性および相同性を有さないように設計する。補助核酸を生体から抽出して調製する場合は、さまざまな公的機関が公開する各種ゲノムデータベースを利用して、塩基配列のホモロジーおよび相補性を検証することができる。標的配列に対して相補性があるとアニーリング工程で標的配列と結合してしまい、本来のプライマーとのアニーリングを阻害してしまうことになるので、避ける必要がある。また、標的配列に対して相同性があると、プライマーと結合してしまったり、後の検出工程で本来の増幅産物と区別できなくなるので避ける必要がある。さらに、プライマーに対しても相補性あるいは相同性があると、プライマーと結合したり、標的核酸とプライマーとの結合を阻害してしまったりするので避ける必要がある。以上のとおり、本発明における補助核酸の相同性および相補性は、好ましくは、検出に用いる標的核酸あるいはプライマーとPCR反応のアニーリング工程温度域においてハイブリダイゼーションしない程度であればよい。   A feature of the present invention is that the reaction solution for the PCR reaction described above includes an auxiliary nucleic acid having a sequence that is neither complementary nor homologous to the target sequence and the primer sequence. The auxiliary nucleic acid may be extracted from a biological substance or may be artificially synthesized. When the auxiliary nucleic acid is artificially synthesized, it is designed so as not to have complementarity and homology with the target nucleic acid and the primer sequence. When preparing and preparing an auxiliary nucleic acid from a living body, the homology and complementarity of base sequences can be verified using various genome databases published by various public institutions. If there is complementarity to the target sequence, it will be bound to the target sequence in the annealing step, which will inhibit the annealing with the original primer, and should be avoided. In addition, if there is homology to the target sequence, it must be avoided because it binds to the primer or cannot be distinguished from the original amplification product in the subsequent detection step. Furthermore, if the primer is complementary or homologous to the primer, it must be avoided because it binds to the primer or inhibits binding between the target nucleic acid and the primer. As described above, the homology and complementarity of the auxiliary nucleic acid in the present invention is preferably such that it does not hybridize with the target nucleic acid or primer used for detection in the annealing process temperature range.

補助核酸として生体由来の核酸を用いる場合、補助核酸は検体が由来する生物と分類属性上の異なる種類から選択することが好ましい。ここで、分類属性上の種類が異なるとは、生物学的特性に基づいて分類した場合に、互いに異なる種類に属することをいい、たとえば分類学的な観点では、界、門、網、目、科、属、種から選択されるいずれかの階層(分類属性)に着目して、検体由来生物が属する種類と異なることである。たとえば、界に着目すれば、検体由来の生物は動物界、植物界、菌界のいずれかに分類され、補助核酸は、検体由来生物の属する界と異なる界の生物のゲノムDNAあるいはその一部を補助核酸として用いることが好ましい。前記の分類学的な階層は、表記した順に上位から下位への階層構造を有する。補助核酸を選択する基準としてどの分類属性を採用するかは、検出しようとする標的遺伝子の配列の特異性の特性を考慮して選択される。例えば、種特異的な遺伝子配列を標的とする場合、異なる種に属する生物のゲノムDNAまたはその一部を補助核酸に選択すれば、標的遺伝子およびPCRプライマーの配列に相補性および相同性を有さず、ハイブリダイゼーションを防止することができ好ましい。具体的には、標的核酸の配列がある種の菌に特異的な配列を有する遺伝子配列である場合、補助核酸は、異なる種の菌のゲノムDNAあるいはその一部を選択する。さらに種特異的な遺伝子を標的とする場合でも、種よりも上位の階層(たとえば属、界)において、標的核酸が由来する生物と分類属性上の異なる種類の生物のゲノムDNAまたはその一部から選択されることがより好ましい。たとえば、標的遺伝子がある種の菌に特異的な配列である場合、菌と異なる界である、動物または植物の界に属する生物のゲノムDNAあるいはその一部を選択することがより好ましく、ヒトゲノムDNAを好適に用いることができる。ヒトゲノムDNAを補助核酸として好適に利用できる検出には実施例に挙げるもの以外にも白血病等で白血球の減少が著しい血液や微生物検査に供する食品での微生物の検出を挙げることができる。また分類学的な属性に限定されず、真核生物と原核生物との違いによる分類や近年明らかになっているゲノム解析に基づいた分類を用いてもよい。   When a nucleic acid derived from a living body is used as the auxiliary nucleic acid, it is preferable to select the auxiliary nucleic acid from a kind different from the organism from which the specimen is derived in terms of classification attributes. Here, different types of classification attributes means that they belong to different types when classified based on biological characteristics. For example, from a taxonomic point of view, fields, gates, nets, eyes, Focusing on any hierarchy (classification attribute) selected from the family, genus, and species, it is different from the type to which the specimen-derived organism belongs. For example, when focusing on the world, specimen-derived organisms are classified as animal kingdom, plant kingdom, or fungal kingdom, and auxiliary nucleic acid is genomic DNA of organisms in a world different from the world to which specimen-derived organisms belong or a part thereof. Is preferably used as an auxiliary nucleic acid. The taxonomic hierarchy has a hierarchical structure from the upper order to the lower order in the order described. Which classification attribute is adopted as a criterion for selecting an auxiliary nucleic acid is selected in consideration of the characteristic of the sequence specificity of the target gene to be detected. For example, when targeting a species-specific gene sequence, if the genomic DNA of an organism belonging to a different species or a part thereof is selected as an auxiliary nucleic acid, the target gene and PCR primer sequences have complementarity and homology. Therefore, it is preferable because hybridization can be prevented. Specifically, when the sequence of the target nucleic acid is a gene sequence having a specific sequence for a certain type of fungus, the auxiliary nucleic acid selects genomic DNA of a different type of fungus or a part thereof. Furthermore, even when species-specific genes are targeted, in the higher hierarchy (eg, genus, world) than the species, the target nucleic acid is derived from the genome DNA of a different kind of organism and the classification attribute or a part thereof. More preferably, it is selected. For example, when the target gene is a sequence specific to a certain fungus, it is more preferable to select genomic DNA of an organism belonging to the animal or plant kingdom, or a part thereof, which is different from the fungus. Can be suitably used. Examples of detection that can suitably use human genomic DNA as an auxiliary nucleic acid include detection of microorganisms in blood that is markedly depleted of leukocytes due to leukemia and the like and foods that are subjected to microbial tests, in addition to those described in the examples. Moreover, it is not limited to taxonomic attribute, You may use the classification based on the difference between a eukaryote and a prokaryote, and the genome analysis revealed in recent years.

このような生体由来の補助核酸の選択方法は、プライマー配列と相補的な配列以外の配列が不明である標的核酸に対しても、補助核酸の配列が標的核酸配列と相補性および相同性を有しないことの信頼性を確保することができる。また、これらの補助核酸の選択方法が好適に利用できる本発明の増幅方法の例として、生物種の検出を目的として、当該生物種に特異的な標的配列について行うPCR増幅が挙げられる。   In such a method for selecting an auxiliary nucleic acid derived from a living body, the auxiliary nucleic acid sequence has complementarity and homology with the target nucleic acid sequence even for a target nucleic acid whose sequence other than the sequence complementary to the primer sequence is unknown. The reliability of not doing can be ensured. Moreover, as an example of the amplification method of the present invention in which these auxiliary nucleic acid selection methods can be suitably used, PCR amplification performed on a target sequence specific to the biological species for the purpose of detecting the biological species can be mentioned.

PCR法で増幅する標的配列は通常数百〜数千塩基長である。後工程で増幅産物と区別することを考慮すると、補助核酸は標的配列と異なる核酸配列長を有することが望ましい。十分異なる長さにしておくことによって、アガロースゲル電気泳動等によって分別可能である。実際には、補助核酸は標的配列よりも長い核酸配列長を有することによって配列特異性が高まり、プライマーや標的配列との結合防止に優利である。標的核酸配列に対して短い核酸配列長を有する補助核酸を用いることも考えられるが、それだけ配列特異性が下がってしまうために、プライマーや標的配列との結合に注意する必要がある。よって、補助核酸の核酸配列長は、標的配列の配列長の5倍以上もしくは1/5倍以下であることが好ましい。より好ましくは、補助核酸の核酸配列長は標的配列の配列長の10倍以上であることが望ましい。   The target sequence amplified by the PCR method is usually several hundred to several thousand bases long. In consideration of distinguishing from the amplification product in a later step, it is desirable that the auxiliary nucleic acid has a nucleic acid sequence length different from the target sequence. By making the lengths sufficiently different, they can be separated by agarose gel electrophoresis or the like. Actually, the auxiliary nucleic acid has a nucleic acid sequence length longer than that of the target sequence, so that the sequence specificity is increased, which is advantageous for preventing binding with a primer or a target sequence. Although it is possible to use an auxiliary nucleic acid having a short nucleic acid sequence length relative to the target nucleic acid sequence, it is necessary to pay attention to the binding with the primer and the target sequence because the sequence specificity is reduced accordingly. Therefore, the nucleic acid sequence length of the auxiliary nucleic acid is preferably 5 times or more or 1/5 time or less of the sequence length of the target sequence. More preferably, the nucleic acid sequence length of the auxiliary nucleic acid is 10 times or longer than the sequence length of the target sequence.

PCR反応液に補助核酸を含有することにより、様々な阻害要因を補助核酸が吸収し、その反面、標的核酸やプライマー等への阻害要因の影響が軽減される。よって、標的核酸と比較して補助核酸を大量に添加したほうが、阻害要因をより多く吸収できる。補助核酸は20ng/ml以上8μg/ml以下の範囲でPCR反応液に添加することが望ましい。補助核酸も標的核酸と同じ核酸で構成されているので、PCR法に本来不要な薬品を添加する方法等とは異なり、新たな阻害や後工程での問題を起こすことがない。よって、後工程に影響を与えることなくPCR反応における阻害要因の影響を排除することが可能となり、高効率で安定した増幅反応が可能となる。   By containing the auxiliary nucleic acid in the PCR reaction solution, the auxiliary nucleic acid absorbs various inhibitory factors. On the other hand, the influence of the inhibitory factor on the target nucleic acid, the primer and the like is reduced. Therefore, more inhibitory factors can be absorbed by adding a large amount of auxiliary nucleic acid compared to the target nucleic acid. It is desirable to add the auxiliary nucleic acid to the PCR reaction solution in the range of 20 ng / ml to 8 μg / ml. Since the auxiliary nucleic acid is also composed of the same nucleic acid as the target nucleic acid, unlike the method of adding an originally unnecessary chemical to the PCR method, no new inhibition or problems in the subsequent steps are caused. Therefore, it is possible to eliminate the influence of the inhibition factor in the PCR reaction without affecting the subsequent process, and a highly efficient and stable amplification reaction is possible.

通常のPCR反応液中の補助核酸は検体核酸に含まれる標的核酸以外の核酸に対しても大幅に多く含まれるが、PCR反応液中に含まれる全核酸量が20ng/ml以上20μg/ml以下の範囲にあるように補助核酸を添加することが反応効率の点から望ましい。   Auxiliary nucleic acid in a normal PCR reaction solution is contained in a significantly larger amount than the target nucleic acid contained in the sample nucleic acid, but the total amount of nucleic acid contained in the PCR reaction solution is 20 ng / ml or more and 20 μg / ml or less. From the viewpoint of reaction efficiency, it is desirable to add an auxiliary nucleic acid so that it is in the range of.

また本発明の補助核酸にはDNAだけでなくRNAを用いることも可能である。   Moreover, it is possible to use not only DNA but also RNA as the auxiliary nucleic acid of the present invention.

また、本発明は、標的核酸の増幅に必要とされるPCR試薬と、本発明に係る補助核酸と、を有する核酸増幅キットにも関する。PCR試薬に含まれる試薬としては、pH緩衝用バッファー、塩類、基質であるdNTPを少なくとも含むものである。さらに、PCRプライマー、またはDNAポリメラーゼを含んでもよい。   The present invention also relates to a nucleic acid amplification kit having a PCR reagent required for amplification of a target nucleic acid and the auxiliary nucleic acid according to the present invention. The reagent contained in the PCR reagent includes at least a pH buffering buffer, salts, and dNTP as a substrate. In addition, PCR primers or DNA polymerase may be included.

以下に本発明の核酸増幅方法の実施例を示すが、以下の実施例で本発明の内容が限定されるものではない。
(実施例1)
本実施例では、人の喀痰から肺炎の病原菌であるStreptococcus pneumoniae(以降S.p.と記載する)の遺伝子を検出する例を示す。本実施例で検出対象となるrRNA配列はタンパク合成の主要な機能を担っていることもあり、その塩基配列は種内において非常によく保存されている。しかし、分類属性上の種類が異なれば異なる程に配列の相同性は少なくなることから、種の同定や系統解析によく利用されている。本実施例において補助核酸として用いるヒトゲノム中にも28s、18s、5.8s、5sのrRNA配列が含まれているが、原核生物である細菌の16srRNAの配列と比較すると相同性はほとんどなく、10塩基以上相同している配列はほとんどない。
Although the Example of the nucleic acid amplification method of this invention is shown below, the content of this invention is not limited by a following example.
(Example 1)
In this example, an example is shown in which a gene of Streptococcus pneumoniae (hereinafter referred to as Sp) is detected from a human sputum. In this example, the rRNA sequence to be detected may be responsible for the main function of protein synthesis, and its base sequence is very well preserved in the species. However, since the homology of the sequence decreases as the types of classification attributes differ, it is often used for species identification and phylogenetic analysis. The human genome used as an auxiliary nucleic acid in this example also contains 28 s, 18 s, 5.8 s, and 5 s rRNA sequences, but there is little homology compared to the 16 s rRNA sequences of prokaryotic bacteria. Few sequences are homologous over bases.

まず、S.p.に存在する特異的な配列として、16srRNA中に存在する1500塩基配列を選択し、この配列をコードする領域のDNAを特異的に増幅するための両端2種類のプライマーを設計した。プライマー配列を表1に示す。   First, S.M. p. A 1500 base sequence present in 16 srRNA was selected as a specific sequence present in 2 and two types of primers at both ends for specifically amplifying the DNA of the region encoding this sequence were designed. The primer sequences are shown in Table 1.

人の喀痰2mlを採取し、そのうち200μlをDneasy Tissue Kit(QIAGEN社製)を用いて核酸を抽出した。抽出液量は50μlであった。この時点では、ごく微量な核酸しか含まれていないものと思われ、アガロースゲル電気泳動や吸光を測定しても核酸の存在を確認できなかった。同じ喀痰を培地で3日間培養したところS.p.のコロニーが形成され、コロニー数から初期菌数が喀痰1mlあたり約50菌と判明した。よって、核酸抽出液50μl中には10菌分に相当するゲノムDNAが上限として含まれ得る。   2 ml of human sputum was collected, and 200 μl of the nucleic acid was extracted using Dneasy Tissue Kit (manufactured by QIAGEN). The extract volume was 50 μl. At this point, it seems that only a very small amount of nucleic acid was contained, and the presence of the nucleic acid could not be confirmed even by measuring agarose gel electrophoresis or absorbance. The same sputum was cultured in a medium for 3 days. p. From the number of colonies, the initial number of bacteria was found to be about 50 / ml. Therefore, 50 μl of nucleic acid extract may contain as an upper limit genomic DNA corresponding to 10 bacteria.

上述の方法で抽出した核酸を本発明の核酸増幅法によって増幅した。反応液の組成としては、PCRバッファー(Applied Biosystems社製)、4mM MgCl2、10mM dNTP(dATP、dCTP、dUTP、dGTP混合物)、2単位AmpliTaq Gold(Applied Biosystems社製)、前記プライマーを各5μMとし、前記抽出物10μlを含め、全体量を48μlとした。そして、この反応液に補助核酸として、市販の100ng/μl Human Genomic DNA(タカラバイオ社製)を2μl添加し、全量を50μlとした。反応液中に含まれる補助核酸200ngに対して標的核酸の量は上限でも2菌分のゲノムDNAに相当するため、反応液中の核酸量の大半は補助核酸であった。また、rRNA配列のコピー数から標的遺伝子の増幅生成量を考慮しても、補助核酸は反応を通して全核酸量の大半を占めていた。 The nucleic acid extracted by the above method was amplified by the nucleic acid amplification method of the present invention. The composition of the reaction solution was as follows: PCR buffer (Applied Biosystems), 4 mM MgCl 2 , 10 mM dNTP (dATP, dCTP, dUTP, dGTP mixture), 2 units AmpliTaq Gold (Applied Biosystems), and 5 μM each of the above primers. The total volume was 48 μl including 10 μl of the extract. Then, 2 μl of commercially available 100 ng / μl Human Genomic DNA (manufactured by Takara Bio Inc.) was added as an auxiliary nucleic acid to the reaction solution to make the total volume 50 μl. Since the amount of target nucleic acid corresponds to genomic DNA for two bacteria at the upper limit with respect to 200 ng of auxiliary nucleic acid contained in the reaction solution, most of the amount of nucleic acid in the reaction solution was auxiliary nucleic acid. In addition, even when the amount of amplification of the target gene was taken into account from the copy number of the rRNA sequence, the auxiliary nucleic acid occupied the majority of the total amount of nucleic acid throughout the reaction.

前記PCR溶液をT3000サーモサイクラー(Biometra社製)にセットし、PCR反応を行った。サーマルサイクルとしては、一次加熱95℃ 10分とし、変性95℃ 45秒、アニール65℃ 45秒、伸長72℃ 45秒を40回繰り返し、その後72℃で10分間最終伸長を行った。同検体を用いた同様の増幅反応を計10回行った。また、S.p.が含まれていないことを培養法によって確認した喀痰検体に関しても、同様の操作を行った。   The PCR solution was set in a T3000 thermocycler (manufactured by Biometra), and PCR reaction was performed. As the thermal cycle, primary heating was 95 ° C. for 10 minutes, denaturation 95 ° C. for 45 seconds, annealing 65 ° C. for 45 seconds, and extension 72 ° C. for 45 seconds were repeated 40 times, and then final extension was performed at 72 ° C. for 10 minutes. A similar amplification reaction using the same sample was performed 10 times in total. S. p. The same operation was performed for sputum specimens that were confirmed to be free of sucrose by a culture method.

反応後、BioAnalyzer(Agilent社製)を用いて、電気泳動法による核酸の存在確認を行った。電気泳動の結果を図1に示す。図中、(a)〜(j)がS.p.が含まれていた喀痰から抽出したDNAを増幅した結果であり、(k)はS.p.が含まれていない喀痰から抽出したDNAを増幅した結果である。図から明らかなように、本発明の10回の増幅では全て1500塩基長の増幅産物が生成されていることが分かる。核酸が含まれていない検体からの増幅反応では増幅産物が出来ていないことから、S.p.由来の核酸から所望の標的配列が増幅されていることが確認できる。このように、ごく微量の病原菌であっても安定して遺伝子検査を行えることが分かった。
(比較例1)
増幅反応の反応液に、Human Genomic DNAを加える代わりに2μlの純水を添加して一般的なPCR反応組成にした以外は、全て実施例1と同様に抽出、増幅反応を行った。
After the reaction, the presence of the nucleic acid was confirmed by electrophoresis using BioAnalyzer (manufactured by Agilent). The result of electrophoresis is shown in FIG. In the figure, (a) to (j) are S.P. p. (K) is the result of amplifying the DNA extracted from the cocoon containing the S. p. It is the result of amplifying the DNA extracted from the straw that does not contain. As can be seen from the figure, amplification products having a length of 1500 bases are generated in all 10 amplifications of the present invention. In the amplification reaction from the sample not containing nucleic acid, no amplification product was produced. p. It can be confirmed that the desired target sequence is amplified from the nucleic acid derived therefrom. As described above, it was found that even a very small amount of pathogenic bacteria can be stably subjected to genetic testing.
(Comparative Example 1)
Extraction and amplification reactions were carried out in the same manner as in Example 1 except that 2 μl of pure water was added to the reaction solution of the amplification reaction instead of adding Human Genomic DNA to obtain a general PCR reaction composition.

実施例1と同量のS.p.が含まれる喀痰検体に対して、10回の増幅反応を行った。また、S.p.が含まれていない検体に対しても同様の反応をおこなった。反応後、BioAnalyzer(Agilent社製)を用いて、電気泳動法による核酸の存在の確認を行った。   The same amount of S.I. p. Ten times of amplification reaction was performed on sputum specimens containing. S. p. The same reaction was carried out for specimens that did not contain. After the reaction, the presence of the nucleic acid was confirmed by electrophoresis using BioAnalyzer (manufactured by Agilent).

電気泳動の結果を図2に示す。図中、(a)〜(j)がS.p.が含まれていた喀痰から抽出したDNAを増幅した結果であり、(k)はS.p.が含まれていない喀痰から抽出したDNAを増幅した結果である。図から明らかなように、同様の検体を用いたにも関わらず10反応で増幅産物の量に差異があり、半数では全く増幅が行われていない。   The result of electrophoresis is shown in FIG. In the figure, (a) to (j) are S.P. p. (K) is the result of amplifying the DNA extracted from the cocoon containing the S. p. It is the result of amplifying the DNA extracted from the straw that does not contain. As is apparent from the figure, there is a difference in the amount of amplification product in 10 reactions despite the use of the same specimen, and no amplification is performed in half.

このように、本発明の核酸増幅方法を用いると、従来の増幅方法では増幅できないもしくは増幅量が不安定であった検体であっても、安定して効率良く増幅できる。
(実施例2)
本実施例では、人の髄液から髄膜炎の病原菌であるHaemophilus influenzae(以降H.i.と記載する)の遺伝子を検出する例を示す。
As described above, when the nucleic acid amplification method of the present invention is used, even a sample that cannot be amplified by the conventional amplification method or whose amplification amount is unstable can be stably and efficiently amplified.
(Example 2)
In this example, an example is shown in which a gene of Haemophilus influenzae (hereinafter referred to as Hi) is detected from human cerebrospinal fluid.

まず、H.i.に存在する特異的な配列として、16srRNA中に存在する1000塩基配列を選択し、この配列をコードする領域のDNAを特異的に増幅するための両端2種類のプライマーを設計した。プライマー配列は表2に示す。   First, H. i. A 1000 base sequence present in 16srRNA was selected as a specific sequence present in 2 and two primers at both ends for specifically amplifying the DNA encoding the sequence were designed. Primer sequences are shown in Table 2.

人の髄液2mlを採取し、そのうち1mlをMORA−EXTRACT(極東製薬社製)を用いてDNA抽出を行った。抽出産物は50μlであった。この時点では、ごく微量な核酸しか含まれておらず、アガロースゲル電気泳動や吸光を測定しても核酸の存在を確認できなかった。同じ髄液を培地で3日間培養し、初期菌数が髄液1mlあたり約10菌と判明した。   2 ml of human cerebrospinal fluid was collected, and 1 ml was extracted with MORA-EXTRACT (manufactured by Kyokuto Pharmaceutical). The extract was 50 μl. At this point, only a very small amount of nucleic acid was contained, and the presence of the nucleic acid could not be confirmed even by measuring agarose gel electrophoresis or absorbance. The same cerebrospinal fluid was cultured in a medium for 3 days, and the initial number of bacteria was found to be about 10 per ml of cerebrospinal fluid.

上述の方法で抽出した核酸を本発明の核酸増幅法によって増幅した。反応液の組成としては、PCRバッファー(Applied Biosystems社製)、4mM MgCl2、10mM dNTP(dATP、dCTP、dUTP、dGTP混合物)、2単位AmpliTaq Gold(Applied Biosystems社製)、及び前記プライマーを各5μMとし、前記抽出物20μlを含め、全体量を48μlとした。そして、この反応液に市販の100ng/μl Human Genomic DNA(タカラバイオ社製)を2μl添加し、全量を50μlとした。 The nucleic acid extracted by the above method was amplified by the nucleic acid amplification method of the present invention. The composition of the reaction solution was PCR buffer (manufactured by Applied Biosystems), 4 mM MgCl 2 , 10 mM dNTP (mixture of dATP, dCTP, dUTP, dGTP), 2 units of AmpliTaq Gold (manufactured by Applied Biosystems), and 5 μM each of the above primers. The total volume was 48 μl including 20 μl of the extract. Then, 2 μl of commercially available 100 ng / μl Human Genomic DNA (manufactured by Takara Bio Inc.) was added to the reaction solution to make the total volume 50 μl.

前記PCR溶液をT3000サーモサイクラー(Biometra社製)にセットし、PCR反応を行った。サーマルサイクルとしては、一次加熱95℃ 10分とし、変性95℃ 45秒、アニール65℃ 45秒、伸長72℃ 45秒を40回繰り返し、その後72℃で10分間最終伸長を行った。同様の増幅反応を10回行った。また、H.i.が含まれていないことを培養法によって確認した髄液検体に関しても、同様の操作を行った。   The PCR solution was set in a T3000 thermocycler (manufactured by Biometra), and PCR reaction was performed. As the thermal cycle, primary heating was 95 ° C. for 10 minutes, denaturation 95 ° C. for 45 seconds, annealing 65 ° C. for 45 seconds, and extension 72 ° C. for 45 seconds were repeated 40 times, and then final extension was performed at 72 ° C. for 10 minutes. The same amplification reaction was performed 10 times. H. i. The same operation was performed on the cerebrospinal fluid specimen that was confirmed by the culture method to be free of.

反応後、BioAnalyzer(Agilent社製)を用いて、電気泳動法による核酸の存在の確認を行った。電気泳動の結果を図3に示す。図中、(a)〜(j)がH.i.が含まれていた髄液から抽出したDNAを増幅した結果であり、(k)はH.i.が含まれていない髄液から抽出したDNAを増幅した結果である。図から明らかなように、本発明の10回の増幅では全て1000塩基長の増幅産物が生成されていることが分かる。核酸が含まれていない検体からの増幅反応では増幅産物が出来ていないことから、H.i.由来の核酸から所望の標的配列が増幅されていることが確認できる。このように、ごく微量の病原菌であっても安定して遺伝子検査を行えることが分かった。
(比較例2)
増幅反応の反応液に、Human Genomic DNAを加える代わりに2μlの純水を添加して一般的なPCR反応組成にした以外は、全て実施例2と同様に抽出、増幅反応を行った。
After the reaction, the presence of the nucleic acid was confirmed by electrophoresis using BioAnalyzer (manufactured by Agilent). The result of electrophoresis is shown in FIG. In the figure, (a) to (j) are H.264. i. (K) is the result of amplifying the DNA extracted from the cerebrospinal fluid containing H. i. It is the result of amplifying DNA extracted from cerebrospinal fluid that does not contain. As can be seen from the figure, amplification products of 1000 base length are generated in all 10 amplifications of the present invention. In the amplification reaction from the sample not containing nucleic acid, no amplification product is produced. i. It can be confirmed that the desired target sequence is amplified from the nucleic acid derived therefrom. As described above, it was found that even a very small amount of pathogenic bacteria can be stably subjected to genetic testing.
(Comparative Example 2)
Extraction and amplification reactions were carried out in the same manner as in Example 2 except that 2 μl of pure water was added to the reaction solution of the amplification reaction instead of adding Human Genomic DNA to obtain a general PCR reaction composition.

実施例2と同量のH.i.が含まれる喀痰検体に対して、10回の増幅反応を行った。また、H.i.が含まれていない検体に対しても同様の反応をおこなった。反応後、BioAnalyzer(Agilent社製)を用いて、電気泳動法による核酸の存在の確認を行った。   H. of the same amount as in Example 2. i. Ten times of amplification reaction was performed on sputum specimens containing. H. i. The same reaction was carried out for specimens that did not contain. After the reaction, the presence of the nucleic acid was confirmed by electrophoresis using BioAnalyzer (manufactured by Agilent).

電気泳動の結果を図4に示す。図中、(a)〜(j)がH.i.が含まれていた髄液から抽出したDNAを増幅した結果であり、(k)はH.i.が含まれていない髄液から抽出したDNAを増幅した結果である。図から明らかなように、同様の検体を用いたにも関わらず10反応で増幅産物の量に差異がある。(a)、(e)のみかろうじて増幅されており、あとの8反応では全く増幅が行われていない。   The result of electrophoresis is shown in FIG. In the figure, (a) to (j) are H.264. i. (K) is the result of amplifying the DNA extracted from the cerebrospinal fluid containing H. i. It is the result of amplifying DNA extracted from cerebrospinal fluid that does not contain. As is apparent from the figure, there are differences in the amount of amplification product in 10 reactions despite using the same specimen. Only (a) and (e) are barely amplified, and amplification is not performed at all in the subsequent 8 reactions.

このように、本発明の核酸増幅方法を用いると、従来の増幅方法では増幅できない、もしくは増幅量が不安定であった検体であっても、安定して効率良く増幅できる。   Thus, when the nucleic acid amplification method of the present invention is used, even a sample that cannot be amplified by the conventional amplification method or whose amplification amount is unstable can be stably and efficiently amplified.

本発明の好適な実施例の結果を示す電気泳動結果の写真である。It is the photograph of the electrophoresis result which shows the result of the preferable Example of this invention. 従来の核酸増幅法による増幅結果を示す電気泳動結果の写真である。It is the photograph of the electrophoresis result which shows the amplification result by the conventional nucleic acid amplification method. 本発明の好適な実施例の結果を示す電気泳動結果の写真である。It is the photograph of the electrophoresis result which shows the result of the preferable Example of this invention. 従来の核酸増幅法による増幅結果を示す電気泳動結果の写真である。It is the photograph of the electrophoresis result which shows the amplification result by the conventional nucleic acid amplification method.

Claims (8)

標的核酸を増幅するためのPCR方法であって、
前記標的核酸を鋳型とするPCR反応を補助核酸の存在下で行い、
前記補助核酸が、前記標的核酸及びプライマーと相補性及び相同性を有さないことを特徴とする標的核酸増幅方法。
A PCR method for amplifying a target nucleic acid comprising:
Performing a PCR reaction using the target nucleic acid as a template in the presence of an auxiliary nucleic acid,
The target nucleic acid amplification method, wherein the auxiliary nucleic acid does not have complementarity and homology with the target nucleic acid and the primer.
前記PCR反応の反応溶液に含まれる前記補助核酸の量が、前記標的核酸の量よりも多いことを特徴とする請求項1に記載の核酸増幅方法。   The nucleic acid amplification method according to claim 1, wherein the amount of the auxiliary nucleic acid contained in the reaction solution of the PCR reaction is larger than the amount of the target nucleic acid. 前記補助核酸の核酸配列長が、前記PCR反応によって生成された増幅産物の核酸配列長と異
なることを特徴とする請求項1もしくは2に記載の核酸増幅方法。
The nucleic acid amplification method according to claim 1 or 2, wherein the nucleic acid sequence length of the auxiliary nucleic acid is different from the nucleic acid sequence length of the amplification product generated by the PCR reaction.
前記補助核酸がヒトゲノムDNAである請求項1乃至3の何れかに記載の核酸増幅方法。   The nucleic acid amplification method according to any one of claims 1 to 3, wherein the auxiliary nucleic acid is human genomic DNA. 前記補助核酸が合成DNAである請求項1乃至3の何れかに記載の核酸増幅方法。   The nucleic acid amplification method according to any one of claims 1 to 3, wherein the auxiliary nucleic acid is a synthetic DNA. 標的核酸を増幅するためのPCR試薬キットであって、
a)標的核酸の増幅に必要とされるPCR試薬
b)前記標的核酸の配列と相補性および相同性を有さない補助核酸
を少なくとも含むことを特徴とする核酸増幅キット。
A PCR reagent kit for amplifying a target nucleic acid,
a) a PCR reagent required for amplification of the target nucleic acid b) a nucleic acid amplification kit comprising at least an auxiliary nucleic acid having no complementarity and homology with the sequence of the target nucleic acid.
前記補助核酸がヒトゲノムDNAである請求項6に記載の核酸増幅キット。   The nucleic acid amplification kit according to claim 6, wherein the auxiliary nucleic acid is human genomic DNA. 前記補助核酸が合成DNAである請求項6に記載の核酸増幅キット。   The nucleic acid amplification kit according to claim 6, wherein the auxiliary nucleic acid is a synthetic DNA.
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