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JP2004511254A - ヒト樹状細胞免疫受容体の調節 - Google Patents

ヒト樹状細胞免疫受容体の調節 Download PDF

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JP2004511254A JP2002536339A JP2002536339A JP2004511254A JP 2004511254 A JP2004511254 A JP 2004511254A JP 2002536339 A JP2002536339 A JP 2002536339A JP 2002536339 A JP2002536339 A JP 2002536339A JP 2004511254 A JP2004511254 A JP 2004511254A
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Abstract

ヒト樹状細胞免疫受容体を調節する試薬およびヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子産物と結合する試薬は、癌、喘息、肥満症、糖尿病、CNS障害、および心臓血管障害を含むがこれに限られない、機能不全または疾患の阻止、改善、修正において役割を担うことができる。

Description

【0001】
発明の属する技術分野
本発明は、受容体調節の分野に関する。より具体的には、本発明はヒト樹状細胞免疫受容体の調節に関する。
【0002】
発明の背景
樹状細胞(DC)は、免疫学的にナイーブなT細胞(Steinman、1991年)を活性化するそれらの強力な能力によって、抗原提示細胞 (APC)に独特である。米国特許第6,046,158; Banchereau & Steinman, Nature 1998 Mar 19;392(6673):245−52。DCの本質的にあるいは成熟の後に、物理的な相互作用を解決させるいくつかの分子、またT細胞に応答することによって活性化信号を配達する。これらはクラスIおよびクラスII MHC分子;CDSO (B7−1)およびCD86 (B7−2). CD40, CD11a/CD18 (LFA−1),およびCD54 (ICAM−1)を含む(Steinman, 1991; Steinman et al., 1995)。CD40、CD11a/CD18(LFA−1)およびCD54(ICAM−1)(Steinman(1991年)。DC、さらにIL1β(IL−6)を含むいくつかのT細胞刺激的なサイトカイニンを分泌する。IL−8およびマクロファージ炎症性の蛋白質1α (MIP1α)およびMIP−1δ。Matsue et al., 1992; Kitajima et al., 1995; Ariizumi et al., 1995; Caux et al., 1994; Heufler et al., 1992; Schreiber et al., 1992; Enk et al., 1992; Mohamadzadeh et al., 1996。これらの特性、接着分子発現およびサイトカイニン生産は両方とも、他のAPC(例えば活性化されたマクロファージおよびB細胞)(それは名―ブT細胞の活性化で本質的にそれほど能力がない)によって共有される。
【0003】
T細胞活性化は環境中の病原性の微生物(例えばウィルス、バクテリアおよび寄生動物)、外来蛋白質および有害な化学物質に対する保護免疫の重要なステップである。T細胞は、抗原提示細胞の表面で抗原が示したことを認識する、それらの表面(つまりT細胞受容体)上の受容体を発現する。正常な免疫反応中に、T細胞受容体にこれらの抗原を結合することによって、T細胞活性化に結びつく細胞内の変更を開始する。DCの発現、T細胞を備えたそれらの相互作用を解決させるいくつかの異なる付着また共刺激分子。DC上の受容体、およびこの役割を果たすと知られているT細胞上の反受容体の組合せは、次のものを含む:a)クラスIMHC、b)クラスII MHC、c)CD54、d)ICAM−3およびCD11a/CD18、e)LFA−3、f CD80(B7−1)およびCD28(またCTLA4)およびCD2(ICAM−1)およびCD11a/CD18(LFA−1)およびCD4およびCD8、g)CD86(B7−2)およびCD28(またCTLA4)、およびh)CD40およびCD40L(Steinman、1995年ら)。重要なことには、これらの分子の結合だけでなく、DCとT細胞の間の物理的な結合を促進する、さらに、それは活性化信号を変換する。
【0004】
C−型レクチンはそれらの炭水化物認識領域(CRD)にアミノ酸配列類似性を提示し、Ca2+ファミリー依存的に選択された炭水化物に結合する糖タンパク質である。C型レクチンは、4つのカテゴリー(Vastaら、1994年; Spiess 1990)の中の第1のグループは、アシアロ糖タンパク質受容体、マクロファージ・ガラクトースおよびN−アセチルグルコサミン(GlcNac)のようなタイプのIIの薄膜を統合された蛋白質を含む。レクチンおよびCD23(FcRII)またはガラクトース/フコースに特異的なこのグループ中の多くのメンバーが、ガラクトサミン/GalNac用特異性を示する。第2のグループは繊維芽細胞のプロテオグリカン中核蛋白質あるいはGlcNac残留物軟骨を含む。第3のグループは、血清のようないわゆる「コレクションズ(collectins)」をマンノースを結合力のある蛋白質、肺の界面活性剤蛋白質SP−Aおよびコングルチニンを含む、。第4のグループは、LEC−CAM(例えばメル−14、GMP−140およびELAM−1)として知られているある付着分子を含む。
【0005】
C型レクチンは、凝集素、オプソニン、補足活性剤および細胞を関連する認識分子(Vastaら、1994年; Spiess 1990; Kery、1991年)として機能に知られている。例えば、マクロファージ・マンノース受容体はスカベンジャー機能 (Shepherd、1990年ら)に役立ち、Pneumocystis carinii(Ezekowitz、1991年ら)、Candida albicans(Ezekowitz、1990年ら)を含む病原性の有機体の取りこみを媒介する。血清、マンノースを結合蛋白質は、慣用的な方法で活性化するその能力によってClqを模倣する。重要なことには、このレクチン中の遺伝子突然変異は回帰性の感染、厳しい再現する伝染病、下痢(リード、1994年ら)に供する。したがって、C型レクチンは、生物学の重要性を備えた種々の機能を示す。
【0006】
重要なことには、炭水化物部分は、必ずしも、C型レクチン用の「自然な」リガンドとして供しない。例えば、CD23(FCRII)(Gal−Gal−Nac (Kijimoto−落合、1994年ら)のその結合により、およびそのCRD配列により確認されるようなC型レクチンファミリーが共有している)は炭水化物独立的な方法で免疫グロブリンEを認識することが知られている。大腸菌の中で生産された再結合物(糖鎖形成しなかった)免疫グロブリンEと同様に免疫グロブリンEの酵素で脱グリコシル化された形式も両方とも、CD23(ヴェルチェリ、1989年ら)に結合する。したがって、いくつかのC型レクチンは、それらの自然なリガンド中のポリペプチド・配列を認識する。さらに極端、任意のポリペプチドから同定によって示唆されるように、レクチンの主な生物学の機能が炭水化物の代わりに、ポリペプチドの認識であるというのが最近の仮説である。反対に、植物レクチン(オルデンバーグ、1992年ら)のためのいくつかのポリペプチドリガンドのペプチドライブラリーがある。
【0007】
最近、2つのCタイプレクチンがDCの表面上で同定された。最初に、蒋らは、NLDC−145 mAb、ネズミ科のDC(蒋、1995年ら)に対する最も広く用いられているmAbのうちの1つによって認識された蛋白質のクローンを作成した。このDEC−205と名付けられた蛋白質は、10の別個のCRDを含む1つであるC型レクチン・ファミリーの新しいメンバーであると分かった。次に、Sallustoらは複合のCRD(Sallusto、1995年ら)を含むヒトDCを発現したマクロファージ・マンノース受容体(MMR))を報告した。両方の受容体はDCによって糖鎖形成した分子のエンドシトーシスを解決させるために提案された、観察では: a)DCの表面上のDEC−205にDEC−205に対するポリクローナルウサギ抗体、b)ウサギ免疫グロブリンGに反応するT細胞系の有効な活性化; DCによるFITCデキストランの吸収、c)、マンナン、マンノース受容体アンタゴニスト(Jiang et al., 1995年; Sallustoら、1995年)で有効にブロックされれた。細胞タイプ特異性に関して、より低いレベルでは、胸腺中のB細胞および上皮の細胞によって、腸および肺(Witmer−Pack et al、1995年; Inabaら、1995年)およびMMRも、マクロファージ(Stahl 1992)によってさらに十分に発現されるとはいえ、DEC−205は発現されると知られている。したがって、C型レクチンはDCに特有の方式で発現する。
【0008】
Fournierらは、ヒト樹状細胞と脊髄細胞によって発現されるFDF03(免疫グロブリン上の抑制する受容体)を同定した。Immunol. 165(3), 1197−209, 2000。ベイツらは、免疫受容体のチロシンに基づいた抑制するモチーフを含んでいる斬新なC型レクチン表面受容体である樹木細胞免疫受容体 (DCIR)を同定しました。Journal of Immunology 163, 1973−1983, 1999。
【0009】
免疫学的にナイーブなT細胞を活性化することは知られているので、それらの能力中の他のAPCよりはるかに有力である、DCが蛋白質を発現することは可能性が高い機能を活性化し、T細胞、そしてそれは他のAPCによって発現されない。そのような蛋白質の構造についての知識は、多くのエリアにおいて全く価値があると分かるであろう。例えば、T細胞によって発現されたそのあるいはそれらリガンドを同定するために精製された蛋白質を使用することができる。さらに、精製された蛋白質に対して抗体を惹起し、DCを媒介としたT細胞活性化を抑制するために使用することができる。
【0010】
発明の要旨
本発明の課題は、ヒト樹状細胞免疫受容体を調節する試薬および方法を提供することである。本発明のこの課題および他の課題は、以下に記載の1またはそれ以上の態様によって提供される。
【0011】
本発明の一態様は、以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む樹状細胞免疫受容体ポリペプチドである:
配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;
配列番号2に示すアミノ酸配列;
配列番号15に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;および
配列番号15に示すアミノ酸配列。
【0012】
本発明のさらに別の態様は、細胞外基質分解を減少させる物質のスクリーニング方法である。試験(被験)化合物を、以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと接触させる:
配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;
配列番号2に示すアミノ酸配列;
配列番号15に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;および
配列番号15に示すアミノ酸配列。
【0013】
試験化合物および樹状細胞免疫受容体ポリペプチド間の結合を検出する。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと結合する試験化合物は、これにより、細胞外基質分解を減少させるのに有望な物質として同定される。この物質は樹状細胞免疫受容体の活性を減少させることによって機能し得る。
【0014】
本発明の別の態様は、細胞外基質分解を減少させる物質のスクリーニング方法である。試験化合物を、以下からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと接触させる:
配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも約50%の同一性を有するヌクレオチド配列;ならびに、
配列番号1に示されるヌクレオチド配列;
配列番号14に示されるヌクレオチド配列と少なくとも約50%の同一性を有するヌクレオチド配列;ならびに、
配列番号14に示されるヌクレオチド配列。
【0015】
このポリヌクレオチドに対する試験化合物の結合を検出する。このポリヌクレオチドと結合する試験化合物は、細胞外基質分解を減少させるのに有望な物質として同定される。この物質は樹状細胞免疫受容体mRNAと相互作用することを介し、樹状細胞免疫受容体の量を減少させることによって機能し得る。
【0016】
本発明の別の態様は、細胞外基質分解を調節する物質をスクリーニングする方法である。試験化合物を、以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと接触させる:
配列番号2に示されるアミノ酸配列と少なくとも約30%の同一性を有するアミノ酸配列;ならびに、
配列番号2に示されるアミノ酸配列;
配列番号15に示されるアミノ酸配列と少なくとも約30%の同一性を有するアミノ酸配列;ならびに、
配列番号2に示されるアミノ酸配列。
【0017】
ポリペプチドの樹状細胞免疫受容体活性を検出する。このポリペプチドの樹状細胞免疫受容体活性を、試験化合物の不存在下における樹状細胞免疫受容体活性と比較して増大させる試験化合物は、これにより、細胞外基質分解の増大に関して有望な物質として同定される。
【0018】
本発明のさらに別の態様は、細胞外基質分解を減少させる物質のスクリーニング方法である。試験化合物を、以下からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドの樹状細胞免疫受容体産物と接触させる:
配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも約50%の同一性を有するヌクレオチド配列;ならびに、
配列番号1に示されるヌクレオチド配列。
配列番号14に示されるヌクレオチド配列と少なくとも約50%の同一性を有するヌクレオチド配列;ならびに、
配列番号14に示されるヌクレオチド配列。
【0019】
樹状細胞免疫受容体産物に対する試験化合物の結合を検出する。樹状細胞免疫受容体産物と結合する試験化合物は、これにより、細胞外基質分解の減少に関して有望な物質として同定される。
【0020】
本発明のさらに別の態様は、細胞外基質分解を減少させる方法である。細胞を、以下からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたはこのポリヌクレオチドによってコードされる産物と特異的に結合する試薬と接触させる:
配列番号1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも約50%の同一性を有するヌクレオチド配列;ならびに、
配列番号1に示されるヌクレオチド配列。
配列番号14に示されるヌクレオチド配列と少なくとも約50%の同一性を有するヌクレオチド配列;ならびに、
配列番号14に示されるヌクレオチド配列。
【0021】
細胞内の樹状細胞免疫受容体活性はこれにより減少する。
【0022】
したがって本発明は、例えばこの酵素の活性部位におけるアゴニストまたはアンタゴニストとして作用し得る試験化合物を同定するのに使用可能なヒト樹状細胞免疫受容体を提供する。ヒト樹状細胞免疫受容体およびその断片はまた、この酵素をブロックし、効率的にその活性を減少させることができる特異的抗体を生じさせるのに有用である。

【0023】
本発明の詳しい説明
本発明は、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドであって、
a)配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;
配列番号2に示すアミノ酸配列;
配列番号15に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;および
配列番号15に示すアミノ酸配列
から成る群より選択されるアミノ酸配列を含む樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
b)配列番号1または14に記載の配列を含むポリヌクレオチド;
c)(a)および(b)に明記するポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド;
d)遺伝コードの縮重のため、その配列が(a)〜(c)に明記するポリヌクレオチド配列から逸脱しているポリヌクレオチド;並びに
e)(a)〜(d)に明記するポリヌクレオチド配列の断片、誘導体またはアレル変異体を表すポリヌクレオチド、
から成る群より選択されるポリヌクレオチドに関する。
【0024】
さらに、新規の樹状細胞、(特にヒト樹状細胞免疫受容体)が、本発明の発見であることが本願出願によって発見された。ヒト樹状細胞免疫受容体は、配列番号2および15に示されるアミノ酸配列を含む。樹状細胞免疫受容体をコードする配列は、配列番号1および14に示される。関連するEST(配列番号4〜13)は、肺と肝臓中で表現する。
【0025】
ヒト樹状細胞免疫受容体は、“pdb|1DV8|1DV8−A”(図17)と注釈されるタンパク質と132アミノ酸にわたって28%の同一性を有する。ヒト樹状細胞免疫受容体はさらに、C型レクチンドメイン(図18)を含む。
【0026】
ヒト樹状細胞免疫受容体は、癌、喘息、肥満、糖尿病、CNS障害あるいは心臓血管障害の処置および診断に有用であることが予想される。また、ヒト樹状細胞免疫受容体および遺伝子は、ヒト樹状細胞免疫受容体および遺伝子アゴニストおよびアンタゴニストをスクリーニングするのに用いることもできる。
【0027】
ポリペプチド
本発明に係る樹状細胞免疫受容体ポリペプチドには、配列番号2に示すアミノ酸配列、または以下定義による生物学的に活性なその変異体より選択される、少なくとも6、10、15、20、25、50、75、100、125または134個の連続アミノ酸が含まれる。したがって、本発明の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドは、樹状細胞免疫受容体タンパク質の一部、完全長の樹状細胞免疫受容体タンパク質、又は樹状細胞免疫受容体タンパク質の全部または一部を含む融合タンパク質であり得る。さらに、本発明に係る樹状細胞免疫受容体ポリペプチドには、配列番号2に示すアミノ酸配列、または以下定義による生物学的に活性なその変異体より選択される、少なくとも6、10、15、20、25、50、75、100、125または148個の連続アミノ酸が含まれる。したがって、本発明の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドは、樹状細胞免疫受容体タンパク質の一部、完全長の樹状細胞免疫受容体タンパク質、又は樹状細胞免疫受容体タンパク質の全部または一部を含む融合タンパク質であり得る。
【0028】
生物学的に活性な変異体
生物学的活性がある、即ちセリンプロテアーゼ、および、好ましくはトリプシンセリンプロテアーゼ活性を保持している樹状細胞免疫受容体ポリペプチド変異体もまた、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドである。天然または非天然樹状細胞免疫受容体ポリペプチド変異体は、配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも約30、35、40、45、50、55、60、65または70%、好ましくは、約75、80、85、90、96、97または98%一致するアミノ酸配列またはその断片を有することが好ましい。推定される樹状細胞免疫受容体ポリペプチド変異体と配列番号2に記載のアミノ酸配列との間の一致(同一性)パーセントは、Blast2整列(アライメント)プログラム(Blosum62, Expect 10, standard genetic codes)を用いて決定される。
【0029】
一致パーセントの変異は、例えばアミノ酸置換、挿入または欠失に起因し得る。アミノ酸置換は1対1のアミノ酸の置き換えとして定義される。置換されたアミノ酸が類似の構造的および/または化学的性質を有する場合、置換は事実上保存的である。保存的置換の例は、イソロイシンまたはバリンによるロイシンの置換、グルタメートによるアスパルテートの置換、またはセリンによるスレオニンの置換である。
【0030】
アミノ酸挿入または欠失はアミノ酸配列への、またはその内部での変化である。これらは典型的には約1〜5アミノ酸の範囲で起こる。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの生物学的または免疫学的活性を破壊することなく、どのアミノ酸残基が置換、挿入または欠失できるかを決定する際の指針は、当分野で周知のコンピュータープログラム、例えばDNASTARソフトウェアを用いて見出すことができる。あるアミノ酸変化が生物学的に活性な樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに影響するか否かは、例えば以下の実施例に記載のように、セリンプロテアーゼ活性を検定することにより容易に決定できる。
【0031】
融合タンパク質
融合タンパク質は、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドアミノ酸配列に対する抗体の作製に、そして様々な検定系での使用に有用である。例えば、融合タンパク質は、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの一部と相互作用するタンパク質の同定に使用できる。タンパク質親和クロマトグラフィーまたはタンパク質−タンパク質相互作用のためのライブラリーに基づく検定、例えば酵母2−ハイブリッドまたはファージディスプレイ系をこの目的のために使用できる。このような方法は当分野で周知であり、薬物スクリーニングとしても使用できる。
【0032】
樹状細胞免疫受容体ポリペプチド融合タンパク質は、ペプチド結合により互いに融合した二つのポリペプチドセグメントを含んでいる。第一のポリペプチドセグメントは、配列番号2または上記のような生物学的に活性な変異体の少なくとも6、10、15、20、25、50、75、100、125または134個の連続アミノ酸を含む。第一のポリペプチドセグメントはまた、完全長樹状細胞免疫受容体タンパク質を含み得る。
樹状細胞免疫受容体ポリペプチド融合タンパク質は、ペプチド結合により互いに融合した二つのポリペプチドセグメントを含んでいる。さらに第一のポリペプチドセグメントは、配列番号15または上記のような生物学的に活性な変異体の少なくとも6、10、15、20、25、50、75、100、125または134個の連続アミノ酸を含む。第一のポリペプチドセグメントはまた、完全長樹状細胞免疫受容体タンパク質を含み得る。
【0033】
第二のポリペプチドセグメントは完全長タンパク質またはタンパク質断片であってよい。融合タンパク質の構築に一般的に使用するタンパク質は、β−ガラクトシダーゼ、β−グルクロニダーゼ、緑色蛍光タンパク質(GFP)、自己蛍光タンパク質(青色蛍光タンパク質(BFP)を包含する)、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)、ルシフェラーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)、およびクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)を包含する。さらに、融合タンパク質の構築には、ヒスチジン(His)標識、FLAG標識、インフルエンザへマグルチニン(HA)標識、Myc標識、VSV−G標識、およびチオレドキシン(Trx)標識を包含するエピトープ標識を使用する。その他の融合構築は、マルトース結合タンパク質(MBP)、S−標識、Lex a DNA結合ドメイン(DBD)融合物、GAL4 DNA結合ドメイン融合物、および単純ヘルペスウイルス(HSV)BP16タンパク質融合物を包含する。また、融合タンパク質はさらに、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドコード配列と非相同タンパク質配列の間に位置する開裂部位を含むよう組み立てることができ、その結果、この樹状細胞免疫受容体ポリペプチドは、開裂され、非相同部分を無くすように精製できる。
【0034】
融合タンパク質は当分野で周知のように化学合成できる。好ましくは、融合タンパク質は二つのポリペプチドセグメントを共有結合で連結することにより、または分子生物学分野で標準的な方法により調製する。例えば、当分野で知られているように、第二のポリペプチドセグメントをコードしているヌクレオチドを有する適切なリーディングフレームに配列番号1または14より選ばれるコード配列を含むDNA構築物を作製し、このDNA構築物を宿主細胞で発現させることによる組換えDNA法を用いて、融合タンパク質を調製できる。融合タンパク質構築用の多くのキットが、Promega Corporation(Madison, WI)、Stratagene(La Jolla, CA)、CLONTECH(Mountain View, CA)、Santa Cruz Biotechnology(Santa Cruz, CA)、MBL International Corporation(MIC; Watertown, MA)、およびQuantum Biotechnologies(Montreal, Canada; 1−888−DNA−KITS)といった企業から入手できる。
【0035】
種相同体の同定
樹状細胞免疫受容体ポリペプチドのポリヌクレオチド(下記)を使用して他の種、例えばマウス、サル、または酵母由来のcDNA発現ライブラリーをスクリーニングするために好適なプローブまたはプライマーを作製し、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの相同体をコードしているcDNAを同定し、そして当分野で周知のようにこのcDNAを発現させて、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの種相同体を得ることができる。
【0036】
ポリヌクレオチド
樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドは、一本鎖又は二本鎖であってよく、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドのコード配列又はその相補物を含んでいてもよい。ヒト樹状細胞免疫受容体のコード配列を、配列番号1または14に示す。
【0037】
ヒト樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードしている縮重ヌクレオチド配列、および、配列番号1に示すヌクレオチド配列と少なくとも約50、好ましくは約75、90、96または98%一致するホモローガスなヌクレオチド配列もまた、樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドである。二つのポリヌクレオチド配列間の配列一致パーセントは、ALIGNのようなコンピュータープログラムを用いて決定するが、これは、ギャップオープンペナルティー−12およびギャップエクステンションペナルティー−2によるアフィンギャップ検索を用いるFASTAアルゴリズムを使用するものである。相補的DNA(cDNA)分子、種相同体および生物学的に活性な樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードしている樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドの変異体もやはり樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドである。
【0038】
ポリヌクレオチド変異体および相同体の同定
上記の樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチド変異体および相同体もまた樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドである。典型的には、相同樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチド配列は、当分野で周知のように、ストリンジェントな条件下で候補ポリヌクレオチドを既知の樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドにハイブリダイズさせることにより同定できる。例えば、以下の洗浄条件 −− 2X SSC(0.3M NaCl、0.03Mクエン酸ナトリウム、pH7.0)、0.1%SDS、室温 2回、各々30分間;次いで2× SSC、0.1%SDS、50℃ 1回、30分間;次いで2× SSC、室温 2回、各々10分間 −− を使用して、最大約25−30%の塩基対ミスマッチ(不対合)を含む相同配列を同定できる。より好ましくは、相同核酸鎖は15−25%の塩基対ミスマッチを、さらに好ましくは5−15%の塩基対ミスマッチを含む。
【0039】
本明細書に開示する樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドの種相同体はさらに、適当なプローブまたはプライマーを作製し、他の種、例えばマウス、サル、または酵母由来のcDNA発現ライブラリーをスクリーニングすることによって同定できる。樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドのヒト変異体は、例えばヒトcDNA発現ライブラリーをスクリーニングすることにより同定できる。二本鎖DNAのTは相同性が1%低下する毎に1−1.5℃低下することがよく知られている(Bonnerら、J.Mol.Biol. 81,123(1973))。故にヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドの変異体または他の種の樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドは、推定の相同樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを、配列番号1に記載のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドまたはその相補物とハイブリダイズさせて被験ハイブリッドを作製することによって同定できる。被験ハイブリッドの融解温度を完全に相補的なヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含むハイブリッドの融解温度と比較し、被験ハイブリッド中の塩基対ミスマッチの数またはパーセントを算出する。
【0040】
ストリンジェントなハイブリダイゼーションおよび/または洗浄条件に従い樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドまたはその相補物とハイブリダイズするヌクレオチド配列もまた樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドである。ストリンジェントな洗浄条件は当分野で周知且つ理解されており、例えばSambrookら、MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, 2d ed., 1989, 9.50−9.51頁に開示されている。
【0041】
典型的には、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件のためには、温度と塩濃度の組み合わせを、検討中のハイブリッドの理論的Tよりおよそ12−20℃低くなるよう選択すべきである。配列番号1または6に示すヌクレオチド配列を有する樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドまたはその相同体と、それらのヌクレオチド配列のいずれか1つと少なくとも約50、55、60、65、70、好ましくは約75、90、96、または98%一致するポリヌクレオチド配列とのハイブリッドのTは、例えばBoltonおよびMcCarthy, Proc.Natl.Acad.Sci. U.S.A. 48,1390(1962)の式:
=81.5℃−16.6(log10[Na])+0.41(%G+C)−0.63(%ホルムアミド)−600/l)、
[式中、l=塩基対で表したハイブリッドの長さ]
を用いて算出できる。
ストリンジェントな洗浄条件としては例えば、4× SSC(65℃)、または50%ホルムアミド、4× SSC(42℃)、または0.5× SSC、0.1%SDS(65℃)が挙げられる。高度ストリンジェントな洗浄条件は、例えば0.2× SSC(65℃)などである。
【0042】
ポリヌクレオチドの調製
天然に存在する樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドは、膜構成成分、タンパク質および脂質といった他の細胞成分を含まないよう単離できる。ポリヌクレオチドは細胞から調製でき、標準的核酸精製技術を用いて単離、またはポリメラーゼ連鎖反応(PCR)のような増幅技術を用いて合成、若しくは自動合成機を用いることによって調製できる。ポリヌクレオチドを単離する方法は機械的であり、当分野で知られている。ポリヌクレオチドを取得するためこのような任意の技術を用いて、単離された樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを得ることができる。例えば、制限酵素およびプローブを用いて樹状細胞免疫受容体ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド断片を単離できる。単離したポリヌクレオチドは他の分子を含まないか、あるいは少なくとも70、80、または90%含まない調製物である。
【0043】
樹状細胞免疫受容体cDNA分子は、樹状細胞免疫受容体mRNAを鋳型に用いて標準的分子生物学技術にて調製できる。その後樹状細胞免疫受容体cDNA分子は、当分野で周知でありSambrookら.(1989)のようなマニュアルに開示される分子生物学技術を用いて複製できる。ヒトゲノムDNAまたはcDNAのいずれかを鋳型として使用して本発明に係るポリヌクレオチドのさらなるコピーを得るため、PCRのような増幅技術を用いることができる。
【0044】
別法として、合成化学技術を用いて樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを合成することもできる。遺伝コードの縮重により、例えば配列番号2に示すアミノ酸配列を有する樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはその生物学的に活性な変異体をコードする別のヌクレオチド配列の合成を可能にする。
【0045】
ポリヌクレオチド伸長
PCRに基づく様々な方法を用いて、配列番号1および9に開示した核酸配列を伸長させ、プロモーターおよび調節要素といった上流配列を検出することができる。例えば制限部位PCRは、既知の座に隣接する未知配列を検索するため、ユニバーサルプライマーを使用する(BASIC METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY, Davis et al., eds., Elsevier Press, N. Y., 1986)。まず、ゲノムDNAを、リンカー配列に対するプライマーと既知領域に特異的なプライマーの存在下で増幅する。次に、増幅させた配列を、同じリンカープライマーと最初のものの内部にある別の特異的プライマーを用いて、第二回目のPCRを行なう。各回のPCR産物を適当なRNAポリメラーゼで転写し(Stratagene Cloning Systems, La Jolla, Calif. 92037)逆転写酵素を行いて配列決定する(Sambrook et al., 1989, pg. 1.20)。
【0046】
既知領域に基づく異なるプライマーを用いて配列を増幅または伸長するために、逆PCRを使用することもできる(Davis et al., 1986)。市販ソフトウェアを用いて、標的配列とアニーリングするプライマーを設計できる。この方法は、幾つかの制限酵素を用いて、遺伝子の既知領域に適当な断片を作り出細胞。次いでこの断片を分子内ライゲーションにより環化し、PCR鋳型として使用する。生じる放射能画像のプレートを複写するために比較する。各スポットは、ポジティブなコロニーかプラークに相当する。コロニーあるいはプラークは選択され拡張される。また、DNAは詳しい分析および配列用のコロニーから分離する。
【0047】
ポジティブななcDNAクローンはそれらが、部分的な配列からの1つのプライマーおよびベクターからの別のプライマーを備えたPCRを使用して含んでいる、補足配列の量を決定すると分析される。クローンで、1つの、より大きな、オリジナルの部分的な配列よりPCR産物をベクター挿入する、mRNAサイズがノーザンブロッティング分析から決定するともに、それらが同じ大きさのインサートを含むかどうか決めるために順番に並べる、制限消化およびDNAによって分析されるか類似している。
【0048】
使用できるもう一つの方法は、ヒトおよび酵母人工染色体DNA中の既知配列に隣接するDNA断片のPCR増幅を含む、エキソヌクレアーゼIIIである(McCombie et al., Methods 3,33−40,1991)。この方法では、作製した二本鎖配列を、PCRの実施前に当該DNA分子の未知断片中に入れるため、さらに複数の制限酵素消化とライゲーションを行うことができる。
【0049】
様々なPCRに基づいた方法はプロモーターおよび規定する要素のように上流に検知するキナーゼ様蛋白質が順番に並べる、ヒトスフィンゴシンの示された部分をコード化する核酸配列を拡張するために使用することができた。例えば、制限部位PCRは、既知の軌跡(SarkarおよびPCR方法Applic。 2,318−322、1993年)に隣接している未知の配列を検索するために普遍的なプライマーを使用する。ゲノムのDNAは、結合物配列へのプライマーおよび既知の領域への効薬がある状態で最初に増幅される。その後、増幅された配列は、同じ結合物プライマー、および第1のものに内部別の特定のプライマーを備えたPCRの第2ラウンドにさらされる。PCRの各丸の産物は適切なRNAポリメラーゼで転写され、逆転写酵素を使用して順番に並べられる。
【0050】
さらに逆PCRは、既知の領域(Triglia et al., Nucleic Acids Res. 16, 8186, 1988)に基づいた分岐するプライマーを使用して、配列を増幅するか拡張するために使用することができた。プライマーはOLIGO 4.06のように、商業的に利用可能なソフトウェアを使用して、設計することができた、分析ソフトウェア(National Biosciences Inc., Plymouth, Minn)、50%以上のGCの内容を持っており、かつ緩冷するために長さで22−30のヌクレオチドであるために、約68−72℃の温度で目標配列をアニ−ルする。方法は、遺伝子の既知の領域の適切な破片を生成するためにいくつかの制限酵素を使用する。その後、分子内の酵素によって破片に切断される。また、その破片はPCRテンプレートとして使用される。
【0051】
未知配列を回収するために使用できるもう一つの方法はPCR(それはヒトとイーストの中の既知の配列に隣接しているDNA破片のPCR増幅を含んでいる)を捕らえる、人工染色体DNA(Lagerstromら、Applic PCR法。 1、111−119、1991年)である。この方法では、多数の制限酵素消化がPCRを実行する前に、DNA分子の未知の破片に巧みに計画された二重らせん構造の配列を入れるために使用される。
【0052】
未知配列を回収するために使用できるもう一つの方法はParkerら、Nucleic Acids Res. 19,3055−3060,1991の方法である。さらに、PCR、ネスティド(nested)プライマー、およびPROMOTERFINDERライブラリー(CLONTECH, Palo Alto, Calif.)を用いてゲノムDNA歩行を行なうことができる(CLONTECH, Palo Alto, Calif.)。このプロセスはライブラリーをスクリーニングする必要性を排除し、イントロン/エクソン接合点の発見に有用である。
【0053】
スクリーニングで完全長cDNAを求める場合、より大きなcDNAを含むようサイズ選択したライブラリーを使用するのが望ましい。遺伝子の5’領域を含む配列をより多く含んでいるという点で、無作為プライミングしたライブラリーが好ましい。無作為プライミングしたライブラリーの使用は、オリゴd(T)ライブラリーが完全長cDNAを産生しない状況で特に好ましいであろう。ゲノムライブラリーは、配列を5’非転写調節領域へと伸長させるのに有用な場合がある。
【0054】
市販品が入手可能な毛細管電気泳動系を用いて、PCRまたは配列決定産物のサイズを分析、またはヌクレオチド配列を確認することができる。例えば、毛細管配列決定は、電気泳動分離用の流動性ポリマー、レーザー励起する4種の異なる蛍光色素(各ヌクレオチドにつき1種ずつ)、および電荷結合素子カメラによる放射された波長の検出を利用することができる。出力/光強度は適当なソフトウェア(例えばGENOTYPERおよびSequence NAVIGATOR、Perkin Elmer)を用いて電気シグナルに変換でき、試料のロードからコンピューター分析および電子的データ表示に至る全プロセスをコンピューター管理することができる。毛細管電気泳動は、特定の試料中に限られた量で存在するかも知れないDNAの小片を配列決定するのに特に好ましい。
【0055】
ポリペプチドの取得
ヒト樹状細胞免疫受容体は、例えばヒト細胞からの精製によって、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドの発現によって、または直接的化学合成によって取得できる。
【0056】
タンパク質精製
ヒト樹状細胞免疫受容体を、その酵素を発現する任意の細胞(HCT116, DLD1, HT29, Caco2, SW837, SW480,およびRKO, 乳癌細胞系 21−PT, 21−MT, MDA−468, SK−BR3, およびBT−474,A549を含む)から精製することができる。ヒト正常上皮細胞および初期癌細胞は、セリンプロテアーゼDESC1ヒト樹状細胞免疫受容体の特に有用なソースを提供する。精製ヒト樹状細胞免疫受容体は、当分野で周知の方法を用いて、細胞内でヒト樹状細胞免疫受容体と通常会合している他の化合物、例えば特定のタンパク質、炭水化物または脂質から分離される。そのような方法には、サイズ排除クロマトフラフィー、硫酸アンモニウム分画、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーおよび調製用ゲル電気泳動が挙げられるが、これらに制限されない。精製ヒト樹状細胞免疫受容体の調製は、少なくとも80%純粋;90%、95%または99%純粋な調製であることが好ましい。調製物の純度は当分野で周知の任意の方法、例えばLin etal., Biol. Chem. 274, 18231−36,1999に記載のSDSポリキャピラリーゲル電気泳動によって評価できる。
【0057】
ポリヌクレオチドの発現
ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを発現させるため、挿入されたコード配列の転写と翻訳に必要な要素を含む発現ベクター中にそのポリヌクレオチドを挿入することができる。当業者に周知の方法を利用して、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列および適当な転写および翻訳調節要素を含む発現ベクターを構築できる。これらの方法には、インビトロ組換えDNA技術、合成技術、およびインビボ遺伝子組換えがある。このような技術は、例えばSambrookら、(1989)およびAusubelら、CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley & Sons, New York., 1989に記載されている。
【0058】
ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列を含み、そして発現する様々な発現ベクター/宿主系が利用できる。これらには、微生物、例えば組換えバクテリオファージ、プラスミド、またはコスミドDNA発現ベクターにより形質転換された細菌;酵母発現ベクターにより形質転換された酵母、ウイルス発現ベクター(例えばバキュロウイルス)により感染を受けた昆虫細胞系、ウイルス発現ベクター(例えばカリフラワーモザイクウイルス、CaMV;タバコモザイクウイルス、TMV)、若しくは細菌発現ベクター(例えばTiまたはpBR322プラスミド)により形質転換された植物細胞系、または動物細胞系が包含されるがこれらに限定される訳ではない。
【0059】
調節要素または調節配列は、宿主細胞タンパク質と相互作用して転写と翻訳を実行するベクターの非翻訳領域−エンハンサー、プロモーター、5’および3’非翻訳領域−である。かかる要素はその強さと特異性において異なっている。利用するベクター系および宿主に応じて、構成的および誘導的プロモーターを包含する、多数の好適な転写および翻訳要素を使用できる。例えば、細菌系でクローニングを行う場合、BLUESCRI.P.Tファージミド(Stratagene, LaJolla,Calif.)またはpSPORT1プラスミド(Life Technologies)等のハイブリッドlacZプロモーターのような誘導的プロモーターを使用できる。バキュロウイルスのポリヘドリンプロモーターは昆虫細胞に使用できる。植物細胞のゲノムから誘導したプロモーターまたはエンハンサー(例えば熱ショック、RUBISCO、および貯蔵タンパク質遺伝子)、または植物ウイルスから誘導したプロモーターまたはエンハンサー(例えば、ウイルスプロモーターまたはリーダー配列)を該ベクター中にクローニングすることができる。哺乳動物細胞系では、哺乳動物遺伝子由来の、または哺乳動物ウイルス由来のプロモーターが好ましい。ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしているヌクレオチド配列を複数コピー含む細胞系を作製する必要がある場合は、SV40またはEBVに基づくベクターを適当な選択マーカーと共に使用することができる。
【0060】
細菌および酵母発現系
細菌系では、ヒト樹状細胞免疫受容体に対して意図する用途に応じて幾つかの発現ベクターを選択できる。例えば、抗体の誘導のため、大量のヒト樹状細胞免疫受容体が必要である場合は、容易に精製できる融合タンパク質の高レベル発現を指令するベクターが使用できる。このようなベクターは、BLUESCRI.P.T(Stratagene)のような多機能E.coliクローニングおよび発現ベクターを包含するが、これに限定される訳ではない。BLUESCRI.P.Tベクターにおいては、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列を、β−ガラクトシダーゼのアミノ末端Metとこれに続く7残基の配列と共にフレーム内で該ベクター中にライゲーションすることができ、その結果ハイブリッドタンパク質が産生される。pINベクター(Van Heeke & Schuster, J.Biol.Chem. 264,5503−5509,1989)またはpGEXベクター(Promega, Madison, Wis.)もまた、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)を伴う融合タンパク質として外来ポリペプチドを発現させるのに使用できる。一般に、このような融合タンパク質は可溶性であり、グルタチオン−アガロースビーズに吸着させ、その後遊離グルタチオンの存在下で溶離することにより、溶菌させた細胞から容易に精製できる。このような系で調製したタンパク質は、ヘパリン、トロンビン、または第Xa因子プロテアーゼ開裂部位を含むよう設計でき、その結果、目的とするクローンポリペプチドをGST部分から随意に解放することができる。
【0061】
酵母Saccharomyces cerevisiaeにおいては、α因子、アルコールオキシダーゼ、およびPGHのような構成的または誘導的プロモーターを含む幾つかのベクターが使用できる。総説としてAusubelら、(1989)およびGrantら、Methods Enzymol. 153,516−544,1987を参照されたい。
【0062】
植物および昆虫発現系
植物発現ベクターを使用する場合、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列の発現は、幾つかのプロモーターのうち任意のものにより駆動できる。例えば、CaMVの35Sおよび19Sプロモーターのようなウイルスプロモーターを、単独で、またはTMV由来のオメガリーダー配列と組み合わせて使用できる(Takamatsu, EMBO J. 6,307−311,1987)。別法として、RUBISCOの小サブユニットのような植物プロモーターまたは熱ショックプロモーターを使用することもできる(Coruzziら、EMBO J. 3,1671−1680,1984;Broglieら、Science 224,838−843,1984;Winterら、Results Probl.Cell Differ. 17,85−105,1991)。これらの構築物は、直接DNA形質転換または病原体媒介トランスフェクションにより植物細胞中に導入できる。このような技術は、幾つかの一般に入手可能な総説に記載されている(例えば、HobbsまたはMurray、MCGRAW HILL YEARBOOK OF SCIENCE AND TECHNOLOGY, McGraw Hill, New York, N.Y., pp191−196,1992)。
【0063】
昆虫系もまたヒト樹状細胞免疫受容体の発現に使用できる。例えば、かかる系の1つAutographa californica核多角体病ウイルス(AcNPV)は、Spodoptera frugi.p.erda細胞またはTrichoplusiaの幼虫で外来遺伝子を発現させるベクターとして使用する。ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列を、ポリヘドリン遺伝子のような該ウイルスの非必須領域中にクローニングし、ポリヘドリンプロモーターの調節下に置くことができる。ヒト樹状細胞免疫受容体をうまく挿入すると、ポリヘドリン遺伝子は不活性化し、コートタンパク質を欠く組換えウイルスが生成する。次いでこの組換えウイルスをS.frugi.p.erda細胞またはTrichoplusiaの幼虫への感染に使用し、そこでヒト樹状細胞免疫受容体を発現させることができる(Engelhardら、Proc.Nat.Acad.Sci. 91,3224−3227,1994)。
【0064】
哺乳動物発現系
ウイルスに基づく多くの発現系を用いて哺乳動物宿主細胞でヒト樹状細胞免疫受容体を発現させることができる。例えば、発現ベクターとしてアデノウイルスを使用する場合、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列は、後期プロモーターおよび3部に分かれたリーダー配列を含むアデノウイルス転写/翻訳複合体中にライゲーションできる。該ウイルスゲノムの非必須E1またはE3領域における挿入を用いて、感染宿主細胞においてヒト樹状細胞免疫受容体を発現できる生存ウイルスを取得できる(Logan & Shenk, Proc.Natl.Acad.Sci. 81,3655−3659,1984)。所望によりラウス肉腫ウイルス(RSV)エンハンサーのような転写エンハンサーを用いて、哺乳動物宿主細胞での発現を増大させることができる。
【0065】
ヒト人工染色体(HAC)もまた、プラスミドが内包し発現するDNA断片よりも大きなDNA断片の運搬に使用できる。6Mから10MのHACを組み立て、常套的送達法により細胞に到達させる(例えば、リポソーム、ポリカチオンアミノポリマー、または小胞)。
【0066】
さらに、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列のより効率的な翻訳を達成するために、特異的開始シグナルを使用できる。かかるシグナルはATG開始コドンおよび連続配列を包含する。ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列、その開始コドン、および上流配列を適当な発現ベクター中に挿入した場合、さらなる転写または翻訳調節シグナルは必要ないであろう。しかしながら、コード配列またはその断片のみを挿入した場合は、外因性の翻訳調節シグナル(ATG開始コドンを包含する)を供給すべきである。開始コドンは挿入物全体を確実に翻訳させるために、正しいリーディングフレームになければならない。外因性翻訳要素および開始コドンは天然および合成両者の様々な起源であってよい。発現の効率は、使用する特定の細胞系に対し適切なエンハンサーを存在させることにより増強できる(Scharfら、Results Probl.Cell Differ. 20,125−162,1994)。
【0067】
宿主細胞
宿主細胞菌株は、挿入した配列の発現を調節する能力または発現されたヒト樹状細胞免疫受容体を所望の方法で処理できる能力を目的として選択できる。該ポリペプチドのこのような修飾には、アセチル化、カルボキシ化、グリコシル化、燐酸化、脂質化、およびアシル化が包含されるがこれらに限定されない。該ポリペプチドの「プレプロ」型を開裂する翻訳後プロセシングもまた、正しい挿入、折り畳み、および/または機能を促進するために使用できる。翻訳後活性のための特異的な細胞機構および特徴的メカニズムを持つ異なる宿主細胞(例えばCHO、HeLa、MDCK、HEK293およびWI38)が、American Type Culture Collection(ATCC;10801 Uni.v.ersity Boulevard, Manassas, VA 20110−2209)から入手でき、外来タンパク質の正しい修飾およびプロセシングを確実とするために選択できる。
【0068】
組換えタンパク質の長期高収量産生のために、安定な発現が好ましい。例えば、ヒト樹状細胞免疫受容体を安定に発現する細胞系を、ウイルス複製起点および/または内因性発現要素、および同じまたは別のベクター上にある選択マーカー遺伝子を含む発現ベクターを用いて形質転換することができる。該ベクターの導入に続いて、細胞を強化培地で1−2日間生育させた後、培地を選択培地に交換することができる。選択マーカーの目的は選択に対する抵抗性を付与することであり、その存在が、導入されたヒト樹状細胞免疫受容体配列をうまく発現する細胞の生育と回収を可能にする。安定に形質転換された細胞の耐性クローンは、その細胞型にとって適当な組織培養技術を用いて増殖させることができる。例えば、ANIMAL CELL CULTURE, R.I.Freshney,ed.,1986を参照されたい。
【0069】
幾つかの選択系を用いて、形質転換された細胞系を回収できる。
【0070】
これらには、それぞれtkまたはaprt細胞で使用できる単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(Wiglerら、Cell 11,223−32,1977)およびアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Lowyら、Cell 22,817−23,1980)遺伝子が包含されるが、これらに限定される訳ではない。さらに、代謝拮抗物質、抗生物質、または除草剤耐性を選択の基準に用いることができる。例えば、dhfrはメソトレキサートに対する耐性を付与し(Wiglerら、Proc.Natl.Acad.Sci. 77,3567−70,1980)nptはアミノグリコシド、ネオマイシンおよびG−418に対する耐性を付与し(Colbere−Garapinら、J.Mol. Biol. 150,1014,1981)、そしてalsおよびpatはそれぞれクロルスルフロンおよびホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼに対する耐性を付与する(Murray, 1992,上記)。さらなる選択遺伝子が記載されている。例えば、trpBは細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用するようにさせ、hisDは細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノールを利用するようにさせる(Hartman & Mulligan, Proc.Natl.Acad.Sci. 85,8047−51,1988)。アントシアニンのような可視マーカー、β−グルクロニダーゼとその基質GUS、およびルシフェラーゼとその基質ルシフェリンは、形質転換体を同定し、特異的ベクター系に帰すことのできる一過性または安定なタンパク質発現の量を定量するために使用できる(Rhodesら、Methods Mol.Biol. 55,121−131,1995)。
【0071】
発現の検出
マーカー遺伝子発現の存在はヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドが存在することも示唆しているが、ヒト樹状細胞免疫受容体の存在と発現は確認する必要がある。例えば、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列がマーカー遺伝子配列内部に挿入されている場合、誘導または選択に応答して、通常、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドの発現を示す。
【0072】
これとは別に、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを含み、PI−ヒト樹状細胞免疫受容体を発現する宿主細胞は、当業者に知られる様々な方法によって同定できる。これらの方法には、DNA−DNAまたはDNA−RNAハイブリダイゼーションおよびタンパク質生検またはイムノアッセイ技術(核酸またはタンパク質の検出および/または定量のための膜、溶液、またはチップに基づく技術を包含する)が包含されるがこれらに限定されない。例えば、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしているポリヌクレオチド配列の存在は、プローブまたは断片またはヒト樹状細胞免疫受容体をコードしているポリヌクレオチドの断片を使用するDNA−DNAまたはDNA−RNAハイブリダイゼーションまたは増幅によって検出できる。核酸増幅に基づく検定は、ヒト樹状細胞免疫受容体を含む形質転換体を検出するための、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドをコードしている配列から選択されるオリゴヌクレオチドの使用を含む。
【0073】
ヒト樹状細胞免疫受容体に対し特異的なポリクローナルまたはモノクローナル抗体のいずれかを使用して該ポリペプチドの発現を検出および測定するための様々なプロトコルが当分野で知られている。例として、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、および蛍光活性化細胞ソーティング(FACS)がある。ヒト樹状細胞免疫受容体上の2個の非干渉性エピトープに反応するモノクローナル抗体を用いる、2部位のモノクローナルに基づくイムノアッセイが使用でき、または、競合的結合検定を使用することができる。これらのおよびその他の検定はHamptomら、SEROLOGICAL METHODS: A LABORATORY MANUAL, APS Press, St.Paul, Minn., 1990およびMaddoxら、J.Exp.Med. 158,1211−1216,1983に記載されている。
【0074】
多岐にわたる標識およびコンジュゲーション技術が当業者に知られており、様々な核酸およびアミノ酸検定に使用できる。ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしているポリヌクレオチドに関連する配列を検出するための標識化ハイブリダイゼーションまたはPCRプローブを調製する手段は、標識したヌクレオチドを使用する、オリゴ標識化、ニック翻訳、末端標識化、またはPCR増幅を包含する。これとは別に、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列を、mRNAプローブの産生のためのベクター中にクローニングすることもできる。このようなベクターは当分野で既知であり、市販品が入手でき、標識化ヌクレオチドおよび適当なRNAポリメラーゼ、例えばT7、T3、またはSP6を添加することによりインビトロでのRNAプローブの合成に使用することができる。これらの方法は、市販の様々なキットを用いて実施できる(Amersham Pharmacia Biotech、 Promega、およびUS Biochemical)。検出を容易にするために使用できる適当なリポーター分子または標識には、放射性核種、酵素、および蛍光、化学ルミネセント、または色素生成物質、ならびに基質、補助因子、インヒビター、磁性粒子などが包含される。
【0075】
ポリペプチドの発現および精製
ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしているヌクレオチド配列で形質転換させた宿主細胞は、発現と、細胞培養からのタンパク質の回収に適した条件下で培養できる。形質転換細胞により産生されたポリペプチドは、その配列および/または使用したベクターに応じて分泌されまたは細胞内に貯留され得る。当業者には理解できるであろうが、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしているポリヌクレオチドを含む発現ベクターは、原核または真核細胞膜を通った可溶性ヒト樹状細胞免疫受容体の分泌を指令する、または膜結合ヒト樹状細胞免疫受容体の膜挿入を指令する、シグナル配列を含むよう設計できる。
【0076】
上に論じたように、他の構築物を用いて、ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列を、可溶性タンパク質の精製を促進するポリペプチドドメインをコードしているヌクレオチド配列と結合させることができる。このような精製促進ドメインは、金属キレート化ペプチド、例えば固定化金属上での精製を可能にするヒスチジン−トリプトファンモジュール、固定化免疫グロブリン上での精製を可能にするタンパク質Aドメイン、およびFLAGS伸長/親和精製系で利用するドメインが包含されるが、これらに限定されない(Immunex Corp., Seattle, Wash.)。精製ドメインとヒト樹状細胞免疫受容体との間に開裂可能リンカー配列、例えば第Xa因子またはエンテロキナーゼに特異的なリンカー配列を入れること(Invitrogen, San Diego, CA)もまた、精製を促進するために利用できる。このような発現ベクターの1つは、ヒト樹状細胞免疫受容体と、チオレドキシンまたはエンテロキナーゼ開裂部位に先立つ6個のヒスチジン残基とを含む融合タンパク質の発現を提供する。このヒスチジン残基はIMAC(Porathら、Prot.Exp.Purif. 3,263−281,1992に記載の固定化金属イオン親和クロマトグラフィー)による精製を促進し、一方エンテロキナーゼ開裂部位は融合タンパク質からのヒト樹状細胞免疫受容体の精製手段を提供する。融合タンパク質を含むベクターはKrollら、DNA Cell Biol. 12,441−453,1993に開示されている。
【0077】
化学合成
ヒト樹状細胞免疫受容体をコードしている配列は、その全体または一部を、当分野で周知の化学的方法を用いて合成できる(Caruthersら、Nucl.Acids Res.Symp.Ser. 215−223,1980;Hornら、Nucl.Acids Res.Symp.Ser. 225−232,1980)。これとは別に、ヒト樹状細胞免疫受容体自身を、そのアミノ酸配列を合成するための化学的方法、例えば固相技術を用いる直接ペプチド合成を用いて調製できる(Merrifield, J.Am.Chem.Soc. 85,2149−2154,1963;Robergeら、Science 269,202−204,1995)。タンパク質合成は手動技術またはオートメーションを用いて実施できる。自動化合成は、例えばApplied Biosystems 431Aペプチド合成機(Perkin Elmer)を用いて達成できる。所望により、ヒト樹状細胞免疫受容体の断片を別々に合成し、化学的方法を用いて合して完全長の分子を調製することもできる。
【0078】
新たに合成したペプチドは、調製用高速液体クロマトグラフイー(例えばCreighton, PROTEINS: STRUCTURES AND MOLECULAR PRINCI.P.LES, WH Freeman and Co., New York, N.Y., 1983)により実質的に精製できる。合成ヒト樹状細胞免疫受容体の組成はアミノ酸分析または配列決定により確認できる(例えばエドマン分解法;Creighton、上記を参照されたい)。さらに、直接合成中にヒト樹状細胞免疫受容体のアミノ酸配列の任意の部分を改変させ、そして/または化学的方法を用いて他のタンパク質由来の配列と合して、変異体ポリペプチドまたは融合タンパク質を調製することができる。
【0079】
改変ポリペプチドの調製
当業者には理解できるであろうが、天然に存在しないコドンを有するヒト樹状細胞免疫受容体コード化ヌクレオチドを調製することは有利であり得る。例えば、特定の原核または真核宿主が好むコドンを選択して、タンパク質発現の速度を増大させ、または所望の性質、例えば天然に存在する配列から産み出される転写物の半減期より長い半減期を持つRNA転写物を調製することができる。
【0080】
本明細書に開示するヌクレオチド配列は、当分野で一般的に知られる方法を用いて、ヒト樹状細胞免疫受容体またはmRNA産物のクローニング、プロセシング、および/または発現を修飾する改変を包含する(但しこれらに限定される訳ではない)様々な理由で、該ポリペプチドコード配列を改変させるように設計できる。無作為断片化によるDNAシャフリングと遺伝子断片および合成オリゴヌクレオチドのPCR再集合を用いてヌクレオチド配列を設計できる。例えば、位置指定突然変異誘発を用いて、新たな制限部位を挿入し、グリコシル化パターンを変え、コドンの優先性を変え、スプライス変異体を調製し、突然変異を導入する等を実施できる。
【0081】
抗体
当分野で知られているいかなる型の抗体も、ヒト樹状細胞免疫受容体のエピトープに特異的に結合するよう作製できる。本明細書で使用する「抗体」とは、無傷の免疫グロブリン分子、およびその断片、例えばFab、F(ab’)、およびFvを包含し、これらはヒト樹状細胞免疫受容体のエピトープに結合できる。典型的には、エピトープを形成するためには少なくとも6、8、10、または12の連続するアミノ酸が必要である。しかしながら、非連続アミノ酸を含むエピトープはより多くの、例えば少なくとも15、25、または50のアミノ酸を必要とするかも知れない。
【0082】
ヒト樹状細胞免疫受容体のエピトープに特異的に結合する抗体は治療に使用でき、そして免疫化学検定、例えばウェスタンブロット、ELISA、ラジオイムノアッセイ、免疫組織化学検定、免疫沈降、またはその他の当分野で既知の免疫化学的検定に使用できる。所望の特異性を有する抗体の同定のため、様々なイムノアッセイが使用できる。競合的結合または免疫放射検定のための多数のプロトコルが当分野でよく知られている。このようなイムノアッセイは典型的には、免疫原と、その免疫原に特異結合する抗体との間の複合体形成の測定を含んでいる。
【0083】
典型的には、ヒト樹状細胞免疫受容体に特異的に結合する抗体は、免疫化学検定に使用する時、他のタンパク質が提供する検出シグナルより少なくとも5、10、または20倍高い検出シグナルを提供する。好ましくは、ヒト樹状細胞免疫受容体に特異結合する抗体は、免疫化学検定で他のタンパク質を検出せず、ヒト樹状細胞免疫受容体を溶液から免疫沈降させることができる。
【0084】
ヒト樹状細胞免疫受容体は、哺乳動物、例えばマウス、ラット、ウサギ、モルモット、サル、またはヒトを免疫してポリクローナル抗体を産生させるのに使用できる。所望により、ヒト樹状細胞免疫受容体は、担体タンパク質、例えば牛血清アルブミン、チログロブリン、およびスカシガイヘモシアニンとコンジュゲートさせることができる。宿主の種に応じて、免疫学的反応を増大させるために種々のアジュバントを使用できる。このようなアジュバントは、フロイントアジュバント、鉱物性ゲル(例えば水酸化アルミニウム)、および界面活性物質(例えばリゾレシチン、プルロニックポリオール、ポリアニオン、ペプチド、油性エマルジョン、スカシガイヘモシアニン、およびジニトロフェノール)を包含するがこれらに限定されない。ヒトに使用するアジュバントの中ではBCG(bacilli Calmette−Guerin)およびCorynebacterium parvumが特に有用である。
【0085】
ヒト樹状細胞免疫受容体に特異的に結合するモノクローナル抗体は、培養中の連続的細胞系により抗体分子の産生を提供する任意の技術を用いて調製できる。これらの技術には、ハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術、およびEBV−ハイブリドーマ技術があるがこれらに限定されない(Kohlerら、Nature 256,495−497,1985; Kozborら、J.Immunol.Methods 81,31−42,1985; Coteら、Proc.Natl.Acad.Sci. 80,2026−2030,1983; Coleら、Mol.Cell Biol. 62,109−120,1984)。
【0086】
さらに、マウス抗体遺伝子をヒト抗体遺伝子にスプライシングして適当な抗原特異性と生物活性を持つ分子を得る、「キメラ抗体」の産生のために開発された技術が利用できる(Morrisonら、Proc.Natl.Acad.Sci. 81,6851−6855,1984; Neubergerら、Nature 312,604−608,1984; Takedaら、Nature 314,452−454,1985)。モノクローナルおよびその他の抗体はまた、これを治療に使用した場合に患者が該抗体に対する免疫反応を起こすのを防ぐため、「ヒト化」することができる。このような抗体は、治療に直接使用できるほど配列が充分ヒトに類似しているかも知れず、または幾つかの重要残基の変更を必要とするかも知れない。齧歯類の抗体とヒト配列の間の配列相違は、個々の残基の位置指定突然変異誘発により、または相補性決定領域全体の格子により、ヒト配列内の残基と相違する残基を置き換えることによって最小化することができる。別法として、ヒト化抗体はGB2188638Bに記載のように組換え法を用いて調製できる。ヒト樹状細胞免疫受容体に特異的に結合する抗体は、U.S.5565332に開示のように、部分的または完全にヒト化した抗原結合部位を含むことができる。
【0087】
これに代わり、当分野で既知の方法を用いて、一本鎖抗体の調製のために記載した技術を適合させ、ヒト樹状細胞免疫受容体に特異結合する一本鎖抗体を調製することができる。関連する特異性を持つが別個のイディオタイプ組成を有する抗体を、無作為組み合わせ免疫グロブリンライブラリーから鎖シャフリングによって調製することができる(Burton, Proc.Natl.Acad.Sci. 88,11120−23,1991)。
【0088】
一本鎖抗体はまた、ハイブリドーマcDNAを鋳型に用いて、PCRのようなDNA増幅法を用いて組み立てることができる(Thirionら、1996, Eur.J.Cancer Prev. 5,507−11)。一本鎖抗体は単一または二重特異性であり得、また、二価または四価であり得る。四価二重特異性一本鎖抗体の組み立ては例えばColoma & Morrison, 1997, Nat.Biotechnol. 15,159−63に教示されている。二価二重特異性一本鎖抗体の組み立てはMallender & Voss, 1994, J.Biol.Chem. 269,199−206に教示されている。
【0089】
下記のように、一本鎖抗体をコードしているヌクレオチド配列を手動または自動ヌクレオチド合成を用いて組み立て、標準的組換えDNA法を用いて発現構築物中にクローニングし、そして細胞中に導入してコード配列を発現させることができる。別法として、一本鎖抗体を、例えば糸状ファージ技術を用いて直接調製することもできる(Verhaarら、1995, Int.J.Cancer 61,497−501; Nichollaら、1993, J.Immunol.Meth. 165,81−91)。
【0090】
ヒト樹状細胞免疫受容体に特異結合する抗体はまた、リンパ球集団においてインビボ産生を誘導することによって、または、文献に開示されている極めて特異的な結合試薬のパネルまたは免疫グロブリンライブラリーをスクリーニングすることによって調製することもできる(Orlandiら、Proc.Natl.Acad.Sci. 86,3833−3837,1989; Winterら、Nature 349,293−299,1991)。
【0091】
その他の型の抗体を、本発明方法において組み立て、治療に使用することができる。例えば、WO93/03151に開示のように、キメラ抗体を組み立てることができる。免疫グロブリンから誘導され多価且つ多重特異的である結合タンパク質、例えばWO94/13804に記載の「diabodies」もまた調製できる。
【0092】
本発明に係る抗体は当分野で周知の方法により精製できる。例えば、抗体は、ヒト樹状細胞免疫受容体が結合しているカラムを通過させることにより親和精製できる。次いで、結合した抗体を、高い塩濃度の緩衝液を用いてカラムから溶出することができる。
【0093】
アンチセンスオリゴヌクレオチド
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、特定のDNAまたはRNA配列に対し相補的なヌクレオチド配列である。いったん細胞中に導入されるとこの相補的ヌクレオチドは、該細胞が産生した天然配列と結合して複合体を形成し、転写または翻訳のいずれかを遮断する。好ましくはアンチセンスオリゴヌクレオチドは少なくとも11ヌクレオチド長であるが、少なくとも12、15、20、25、30、35、40、45、若しくは50またはそれ以上のヌクレオチド長であってもよい。より長い配列もまた使用できる。アンチセンスオリゴヌクレオチド分子をDNA構築物に提供し、上記のように細胞中に導入して、その細胞におけるヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子産物のレベルを低下させることができる。
【0094】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、またはこの両者の組み合わせであってよい。オリゴヌクレオチドは、1つのヌクレオチドの5’末端を、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、アルキルホスホネート、ホスホロアミデート、燐酸エステル、カルバメート、アセトアミデート、カルボキシメチルエステル、カルボネート、および燐酸トリエステルといった非ホスホジエステルヌクレオチド間結合を有する別のヌクレオチドの3’末端と共有結合させることにより、手動で、または自動合成機によって合成できる。Brown, Meth.Mol. Biol. 20,1−8,1994; Sonveaux, Meth.Mol.Biol. 26,1−72,1994; Uhlmannら、Chem.Rev. 90,543−583,1990を参照されたい。
【0095】
ヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子の制御、5’、または調節領域と二本鎖を形成するアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計することにより、ヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子発現の修飾が得られる。転写開始部位、例えば開始部位から−10および+10位の間から誘導されるオリゴヌクレオチドが好ましい。同様に、「三重らせん」塩基対合法を用いて阻害を達成できる。三重らせん対合は、二重らせんがポリメラーゼ、転写因子またはシャペロンの結合に対して十分に開くという能力の阻害を引き起こすため、有用である。三本鎖DNAを用いる治療上の進歩が文献に記載されている(例えばGeeら、Huber & Carr, MOLECULAR AND IMMUNOLOGIC APPROACHES, Futura Publishing Co., Mt.Kisco, N.Y., 1994)。転写物がリボソームに結合するのを防ぐことによりmRNAの翻訳を遮断するアンチセンスオリゴヌクレオチドもまた設計できる。
【0096】
アンチセンスオリゴヌクレオチドとヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドの相補配列との間に好結果の複合体を形成させるためには、正確な相補性は必要ない。例えばヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドに対し正確に相補的である2、3、4、若しくは5またはそれ以上の長さの連続するヌクレオチドを含み、その各々が、隣接するヒト樹状細胞免疫受容体ヌクレオチドとは相補的ではない連続するある長さのヌクレオチドによって隔てられているアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒト樹状細胞免疫受容体mRNAに対して充分な標的化特異性を提供できる。好ましくは、相補的な連続ヌクレオチドの長さはそれぞれ少なくとも4、5、6、7若しくは8またはそれ以上のヌクレオチド長である。非相補的な介在配列は、好ましくは1、2、3、または4ヌクレオチド長である。当業者は、アンチセンス−センスの対の算出融点を容易に使用して、特定のアンチセンスオリゴヌクレオチドと特定のヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチド配列間で寛容されるミスマッチの程度を決定できるであろう。
【0097】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドとハイブリダイズする能力に影響を及ぼすことなく修飾できる。これらの修飾は該アンチセンス分子の内部、または一端若しくは両端である。例えば、ヌクレオシド間の燐酸結合は、アミノ基と末端リボースの間にいろいろな数の炭素残基を有するコレステリルまたはジアミン部分を加えることによって修飾できる。修飾された塩基および/または糖、例えばリボースの代わりのアラビノース、または3’ヒドロキシ基または5’燐酸基が置換されている3’,5’−置換オリゴヌクレオチドもまた修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドに使用できる。これらの修飾オリゴヌクレオチドは当分野で周知の方法により調製できる。例えば、Agrawalら、Trends Biotechnol. 10,152−158,1992; Uhlmannら、Chem.Rev. 90,543−584,1990; Uhlmannら、Tetrahedron.Lett. 215,3539−3542,1987を参照されたい。
【0098】
リボザイム
リボザイムは触媒活性を有するRNA分子である。例えば、Cech, Science 236,1532−1539; 1987; Cech, Ann.Rev.Biochem. 59,543−568; 1990, Cech, Curr.Opin.Struct.Biol. 2,605−609; 1992, Couture & Stinchcomb, Trends Genet. 12,510−515, 1996を参照されたい。当分野で知られるように、リボザイムは、RNA配列を開裂することにより遺伝子機能を阻害するのに使用できる(例えば、Haseloffら、米国特許5641673)。リボザイムの作用機構は、相補的標的RNAに対するリボザイム分子の配列特異的ハイブリダイゼーションと、その後のエンドヌクレオ分解的な(endonucleolytic)開裂を含む。例には、特異的ヌクレオチド配列のエンドヌクレオ分解的な開裂を特異的且つ効果的に触媒できる、設計されたハンマーヘッドモチーフリボザイム分子がある。
【0099】
ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドのコード配列を用いて、ヒト樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドから転写されたmRNAに特異結合するリボザイムを作製できる。他のトランスのRNA分子を極めて配列特異的に開裂できるリボザイムを設計し組み立てる方法が開発され、当分野で記載されている(Haseloffら、Nature 334,585−591,1988)。例えば、リボザイムの開裂活性は、別個の「ハイブリダイゼーション」領域を該リボザイム中に組み入れることによって、特定のRNAを標的とさせることができる。このハイブリダイゼーション領域は標的RNAに対し相補的な配列を含んでおり、したがってその標的と特異的にハイブリダイズする(例えばGerlachら、EP321201を参照されたい)。
【0100】
ヒト樹状細胞免疫受容体RNA標的内部の特異的リボザイム開裂部位は、この標的分子を、以下の配列:GUA、GUU、およびGUCを包含するリボザイム開裂部位についてスキャンすることにより同定できる。同定できたならば、該開裂部位を含む標的RNAの領域に対応する、15および20の間のリボヌクレオチドを有する短いRNA配列を、標的を非機能的にし得る二次構造の特徴について評価できる。さらに、候補のヒト樹状細胞免疫受容体RNA標的の適合性を、リボヌクレアーゼ防護検定を用いて相補的オリゴヌクレオチドとのハイブリダイゼーションに対する利用可能性を試験することによって評価できる。より長い相補配列を用いて、標的に対するハイブリダイゼーション配列の親和性を増大させることができる。リボザイムのハイブリダイズおよび開裂する領域は、相補領域を介して標的RNAにハイブリダイズする時、リボザイムの触媒領域が標的を開裂し得るといったように、完全に相関している。
【0101】
リボザイムはDNA構築物の一部として細胞内に導入できる。マイクロ注入、リポソーム媒介トランスフェクション、電気穿孔、または燐酸カルシウム沈殿といった機械的方法を用いて、ヒト樹状細胞免疫受容体発現の低下が望まれる細胞中にリボザイム含有DNA構築物を導入することができる。これとは別に、細胞がDNA構築物を安定的に保持することが望まれる場合は、該構築物をプラスミド上で供給し、当分野で知られるように、別個の要素として維持するか、または細胞のゲノム中に組み込むことができる。リボザイムコード化DNA構築物は、細胞中のリボザイムの転写を調節するために、プロモーター要素、エンハンサーまたはUAS要素、および転写ターミネーターシグナルといった転写調節要素を含み得る。
【0102】
リボザイムはDNAの構築物するとともに細胞へ導入することができた。顕微鏡下注射、リポソームを媒介としたトランスフェクション、エレクトロポレーションあるいはリン酸カルシウム沈殿のような機械的方法はリボザイムを含んでいるDNAを導入するために使用することができた。構築物を、それがスフィンゴシンを減少させると望まれる細胞へ、キナーゼ様蛋白質を発現させる。二者択一で、細胞が安定してDNAを保持することが望まれる場合、構築する、それはプラスミド上で供給することができ、個別の要素として維持する。あるいは当分野で知られている細胞のゲノムへ統合される。DNA、構築する、細胞のリボザイムの転写のコントロールのためにプロモーター要素、エンハンーか、UAS要素、およびターミネーターシグナルのような規定する要素を含むことができた。
【0103】
Haseloffら、米国特許5641673に教示のように、リボザイムは、標的遺伝子の発現を誘導する因子に応答してリボザイムの発現が起こるように設計することができる。リボザイムはまた、追加レベルの調節を提供するよう設計でき、その結果、mRNAの破壊はリボザイムと標的遺伝子の両者が細胞に誘導された時にのみ起こる。
【0104】
示差的に発現した遺伝子
産物が蛋白質キナーゼのようなヒトスフィンゴシンと対する遺伝子の同定用方法はここに記述される。そのような遺伝子は、含んでいる障害で示差的に発現されるが、制限されない遺伝子を発現し得る、癌、アレルギーを含んでいるが喘息、中枢障害および末梢神経系障害また自己免疫疾患に制限されていなかった。さらに、そのような遺伝子は、そのような疾病の進行か治療に適切な操作に応じて差別的に調節される遺伝子を発現し得る。さらに、そのような遺伝子は増加し、一時的に調節された発現を行っているかもしれないか、あるいは組織か有機物の異なる段階で減少する。示差的に発現された遺伝子は、さらにコントロール対実験の条件の下でその発現を調節し得る。さらに、ヒトスフィンゴシン、キナーゼ様遺伝子あるいは遺伝生成物それ自体差異の発現に関して試験する。
【0105】
病気の状態において発現が異なる程度は、差異のディスプレイ技術のような標準の特性を記述する技術によって視覚化されるように単に十分に大きい必要がある。発現差が視覚化されるかもしれないような他の標準の特性記述技術としては量的RT、PCR(逆転写酵素)、またノーザン分析が含まれるがこれに制限されない。
【0106】
示差的発現した遺伝子の同定
示差的発現した遺伝子の同定示差的に発現された遺伝子を同定するために、RNAあるいは総rmRNAを目的組織から分離する。例えば、RNAサンプルは、実験の組織およびコントロールの対応組織から得られる。mRNA分離に対して選択しないどんなRNA隔離技術もそのようなRNAサンプルの精製のために利用し得る(例えばAusubel et al., ed.”CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley & Sons, Inc.New York, 1987−1993)。多くの組織サンプルは、例えばChomczynski、U.S.特許4,843,155の単一のステップのRNA隔離プロセスのように、当業者に周知の技術を使用して、容易に処理される。
【0107】
示差的に発現された遺伝子によって酸性されたRNAを集めたRNAサンプル内の記録は、当業者に周知の方法によって同定される。それらは例えば、差異ふるい分け(Tedder et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. SA. 85, 208−12,1988)をがふくまれる。Sci。U.SA。85、208−12、1988年、ハイブリダイゼーション(Hedrick et al., Nature 308, 149−53; Lee et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 88, 2825,1984)および示差的ディスプレイ(Liang & Pardee, Science 257, 967−71,1992; U. S. Patent 5,262,311)特許5,262,311が含まれる。
【0108】
それ自体、ヒトスフィンゴシンを含む病気の治療用の適切な方法を示唆する、キナーゼ様蛋白質。例えば、処理は、示差的に発現された遺伝子および(または)蛋白質キナーゼのようなヒトスフィンゴシンをコード化する遺伝子の発現の調節を含んでいるかもしれない。示差的発現の情報は示すかもしれない、かどうか、発現か活性、その、示差的に発現された遺伝子か遺伝生成物、あるいは遺伝子か遺伝生成物キナーゼのようなヒトスフィンゴシンは上の調節されるか下方調節される。
【0109】
スクリーニング方法
本発明は、調節物質、即ち、それはスフィンゴシンにキナーゼ様蛋白質ポリペプチドあるいはポリヌクレオチドを結合、または、例えばスフィンゴシンの発現あるいは活性に刺激的か抑制する効果があるする候補または試験化合物を同定する方法を提供する。被験化合物は樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドに結合する。より好ましくは、被験化合物は、樹状細胞免疫受容体活性を、被験化合物の不在時に比較して少なくとも約10、好ましくは約50、より好ましくは約75、90、または100%低下または増大させる。
【0110】
被験化合物
被験化合物は当分野で既知の薬理学的物質であってよく、または薬理活性を持っていることが前もって分かっていない化合物であってよい。この化合物は天然に存在する、または実験室で設計されたものであってよい。これらは、微生物、動物、または植物から単離されたものであってよく、そして組換え的に調製され、または当分野で既知の化学的方法により合成されたものであってよい。所望により被験化合物は、生物学的ライブラリー、空間的アドレス特定可能な並行固相または液相ライブラリー、デコンボルーションを要する合成ライブラリー法、「一ビーズ一化合物」ライブラリー法、および親和クロマトグラフィー選択を用いる合成ライブラリー法を包含する(但しこれらに限定される訳ではない)当分野で既知の数多くの組み合わせライブラリー法のいずれかを用いて取得できる。生物学的ライブラリーアプローチはポリペプチドライブラリーに限定されているが、他の4種のアプローチはポリペプチド、非ペプチドオリゴマー、または化合物の小分子ライブラリーに適用できる。Lam, Anticancer Drug Des. 12,145,1997を参照されたい。
【0111】
分子ライブラリーの合成法は当分野でよく知られている(例えば、DeWittら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 90,6909,1993; Erbら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 91,11422,1994; Zuckermannら、J.Med.Chem. 37,2678,1994; Choら、Science 261,1303,1993; Carellら、Angew.Chem.Int.Ed.Engl. 33,2059,1994; Carellら、Angew.Chem.Int.Ed.Engl. 33,2061; Gallopら、J.Med.Chem. 37,1233,1994を参照されたい)。化合物のライブラリーは溶液で(例えば、Houghten, Biotechniques 13,412−421,1992)、またはビーズ(Lam, Nature 354,82−84,1991)、チップ(Fodor, Nature 364,555−556,1993)、細菌または胞子(Ladner、米国特許5223409)プラスミド(Cullら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 89,1865−1869,1992)、またはファージ(Scott & Smith, Science 249,386−390, 1990; Devlin, Science 249,404−406,1990);Cwirlaら、Proc.Natl.Acad.Sci.97,6378−6382,1990; Felici, J.Mol.Biol. 222,301−310,1991; およびLadner、米国特許5223409)上に提供できる。
【0112】
ハイスループットスクリーニング
被験化合物は、高(ハイ)スループットスクリーニングを用いて、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドに結合する能力、または樹状細胞免疫受容体活性若しくは樹状細胞免疫受容体遺伝子発現に影響を及ぼす能力についてスクリーニングできる。ハイスループットスクリーニングを使用して、多くの個別的化合物を並行して試験でき、その結果多数の被験化合物を迅速にスクリーニングできる。最も広範に確立されている技術は96ウェル微量定量プレートを利用するものである。この微量定量プレートのウェルは、典型的には50から500μlの範囲の検定容量を必要とする。このプレートに加えて、96ウェルフォーマットに適合させた多くの機器、材料、ピペット、ロボット、プレート洗浄機、およびプレート読み取り機が市販されている。
【0113】
別法として、「自由フォーマット検定」、または試料間に物理的障壁を持たない検定が使用できる。例えば、組み合わせペプチドライブラリーのための、単純な均質検定で色素細胞(メラノサイト)を用いる検定が、Jayawickremeら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 19,1614−18(1994)に記載されている。ペトリ皿中のアガロースの下にこの細胞を入れ、次いで組み合わせ化合物を伴っているビーズをアガロースの表面に載せる。組み合わせ化合物はこのビーズから化合物を部分的に放出する。化合物がゲルマトリックス中へと局所的に拡散するにつれて活性化合物が細胞の色の変化を惹起するため、活性化合物を暗色色素領域として視覚化することができる。
【0114】
自由フォーマット検定のもう一つの例は、生体分子スクリーニング学会第1回年次総会(Philadelphia,Pa.、1995年11月7−10日)で報告されたChelsky、「組み合わせライブラリーのスクリーニングのための戦略:新規な、そして伝統的なアプローチ」により記載されている。Chelskyは、カルボニックアンヒドラーゼのための単純な均質酵素検定をアガロースゲルの内部に入れ、その結果ゲル中の酵素がゲル全体に色の変化を惹起するようにさせた。その後、光リンカーを介して組み合わせ化合物を持つビーズをゲル内部に入れ、すると該化合物はUV光により部分的に放出された。酵素を阻害する化合物は、色の変化がより少ない局所阻害領域として観察された。
【0115】
さらに別の例がSalmonら、Molecular Diversity 2,57−63(1996)に記載されている。この例では、組み合わせライブラリーを、寒天中で生育する癌細胞への細胞毒性効果を有する化合物についてスクリーニングした。
【0116】
もう一つのハイスループットスクリーニング法がBeutelら、米国特許5976813に記載されている。この方法では、被験試料を多孔性マトリックスに入れる。次に1またはそれ以上の検定成分を、マトリックス、例えばゲル、プラスチックシート、フィルター、またはその他の形の容易に操作できる固体担体の内部、上、または底に入れる。試料がこの多孔性マトリックスに導入されるとこれらは充分ゆっくりと拡散し、その結果、被験試料が混ざらずに検定が遂行できる。
【0117】
結合検定
結合検定について、被験化合物は、例えば本酵素のATP/GTP結合部位または樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの活性部位に結合してこれを占有する結果、正常な生物活性を妨げるような、小分子であることが好ましい。このような小分子の例は、小ペプチドまたはペプチド様分子を包含するが、これらに限定される訳ではない。
【0118】
結合検定では、被験化合物または樹状細胞免疫受容体ポリペプチドのいずれかが検出可能な標識、例えば蛍光、放射性同位元素、化学ルミネセント、または酵素標識(例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはルシフェラーゼ)を含むことができる。そこで、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに結合している被験化合物の検出は、例えば放射能の放出を直接計数することにより、またはシンチレーション計数により、または検出可能産物への適当な基質の変換を測定することにより、達成できる。
【0119】
別法として、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドへの被験化合物の結合を、反応体のいずれをも標識せずに測定することができる。例えば、マイクロフィジオメーターを用いて、被験化合物と樹状細胞免疫受容体ポリペプチドとの結合を検出できる。マイクロフィジオメーター(例えばサイトセンサーTM)とは、細胞がその環境を酸性化する速度を光アドレッサブル電位差センサー(LAPS)を用いて測定する分析機器である。この酸性化速度の変化は、被験化合物と樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの相互作用の指標として使用できる(McConnellら、Science 257,1906−1912,1992)。
【0120】
被験化合物が樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに結合する能力の測定はまた、実時間Bimolecular Interaction Analysis(BIA)のような技術を用いて達成できる(Sjolander & Urbaniczky, Anal.Chem. 63,2338−2345,1991、およびSzaboら、Curr.Opin.Struct.Biol. 5,699−705,1995)。BIAは、いかなる反応体をも標識せずに、生体特異的相互作用を実時間で研究するための技術である(例えばBIAcore(登録商標))。光学的現象表面プラズモン共鳴(SPR)の変化を、生体分子間の実時間反応の指標に使用できる。
【0121】
本発明のさらに別の態様では、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを二ハイブリッド検定または三ハイブリッド検定(例えば、米国特許5283317; Zervosら、Cell 72,223−232,1993; Maduraら、J.Biol.Chem. 268,12046−12054,1993; Bartelら、Biotechniques 14,920−924,1993; Iwabuchiら、Oncogene 8,1693−1696,1993; およびBrent WO94/10300)における「おとりタンパク質」として使用し、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに結合またはこれと相互作用してその活性を調節する他のタンパク質を同定することができる。
【0122】
二ハイブリッド系は殆どの転写因子のモジュール的性格に基づくものであり、それは、分離可能なDNA結合および活性化ドメインから成っている。簡潔に述べると、この検定は二種の異なるDNA構築物を利用する。例えば、一方の構築物においては、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードしているポリヌクレオチドが、既知の転写因子のDNA結合ドメインをコードしているポリヌクレオチドに融合できる(例えばGAL−4)。別の構築物においては、未同定タンパク質(「餌」または「試料」)をコードしているDNA配列が、既知の転写因子の活性化ドメインをコードしているポリヌクレオチドに融合できる。もし「おとり」および「餌」タンパク質がインビボで相互作用してタンパク質依存複合体を形成できたならば、該転写因子のDNA結合および活性化ドメインは極めて近位に招来される。この近位性が、転写因子に応答する転写調節部位と機能的に結合しているリポーター遺伝子(例えばLacZ)の転写を可能にする。リポーター遺伝子の発現が検出でき、機能的転写因子を含む細胞コロニーを単離し、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと相互作用するタンパク質をコードしているDNA配列取得に使用することができる。
【0123】
反応体の一方または両方の非結合型からの結合型の分離を促進するため、そして検定の自動化の便宜を図るため、樹状細胞免疫受容体ポリペプチド(またはポリヌクレオチド)または被験化合物のいずれかを固定化することが望ましいかも知れない。したがって、樹状細胞免疫受容体ポリペプチド(またはポリヌクレオチド)または被験化合物のいずれかを固体支持体に結合させることができる。好適な固体支持体は、ガラスまたはプラスチックスライド、組織培養プレート、微量定量ウェル、管、シリコンチップ、またはビーズ(ラテックス、ポリスチレン、またはガラスビーズを包含するがこれらに限定されない)のような粒子を包含するがこれらに限定されない。共有および非共有結合、受動吸収、またはそれぞれポリペプチド(またはポリヌクレオチド)または被験化合物に付着させた結合部分と固体支持体の対、の使用を包含する、当分野で既知の任意の方法を用いて樹状細胞免疫受容体ポリペプチド(またはポリヌクレオチド)または被験化合物を固体支持体に付着させることができる。被験化合物は好ましくは整列して固体支持体に結合させ、その結果個々の被験化合物の位置を追跡することができる。樹状細胞免疫受容体ポリペプチド(またはポリヌクレオチド)への被験化合物の結合は、反応体を入れるのに適した任意の容器で達成できる。かかる容器の例には微量定量プレート、試験管、および微量遠沈管がある。
【0124】
一つの態様において、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドは、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを固体支持体に結合させるドメインを含む融合タンパク質である。例えば、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ融合タンパク質をグルタチオンセファロースビーズ(Sigma Chemical, St.Louis, Mo.)上またはグルタチオン誘導体化微量定量プレート上に吸着させ、次いでこれを被験化合物または被験化合物および非吸着樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに合し;次にこの混合物を複合体形成が行われる条件下でインキュベートする(例えば、塩およびpHに関して生理的条件)。インキュベーションの後、ビーズまたは微量定量プレートのウェルを洗浄して未結合成分を除去する。反応体の結合は上記のように直接的または間接的に測定できる。別法として、複合体を固体支持体から解離させた後に結合を測定することもできる。本発明に係るスクリーニング検定には、タンパク質またはポリヌクレオチドを固体支持体上に固定化するためのその他の技術を使用することもできる。例えば、樹状細胞免疫受容体ポリペプチド(またはポリヌクレオチド)または被験化合物のいずれかを、ビオチンとストレプトアビジンのコンジュゲーションを利用して固定化できる。当分野で周知の技術(例えばビオチニル化キット、Pierce Chemicals, Rockford,Ill.)を用いて、ビオチニル化した樹状細胞免疫受容体ポリペプチド(またはポリヌクレオチド)または被験化合物をビオチン−NHS(N−ヒドロキシスクシンイミド)から調製し、ストレプトアビジン被覆した96ウェルプレート(Pierce Chemical)のウェルに固定化できる。別法として、樹状細胞免疫受容体ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または被験化合物に特異的に結合するが、所望の結合部位、例えばATP/GTP結合部位または樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの活性部位に干渉しない抗体をプレートのウェルに誘導体化することができる。未結合の標的またはタンパク質が抗体コンジュゲーションによりウェル中に捕捉できる。
【0125】
GST−固定化複合体について上に記載した方法に加え、このような複合体を検出する方法には、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたは被験化合物に特異結合する抗体を用いる、複合体の免疫検出、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの活性検出へと引き継がれる酵素結合検定、および非還元条件下でのSDSゲル電気泳動がある。
【0126】
樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドに結合する被験化合物を求めるスクリーニングは、無傷の細胞で実施することもできる。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを含む任意の細胞が、細胞に基づく検定系で使用できる。樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドは細胞中に天然に存在し、または上記のような技術を用いて導入できる。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対する被験化合物の結合は、上記のように測定する。
【0127】
酵素検定
ヒト樹状細胞免疫受容体ポリペプチドのセリンプロテアーゼ活性を増大または低下させる能力について、被験化合物を試験できる。酵素検定は、精製樹状細胞免疫受容体ポリペプチド、細胞膜調製物または無傷の細胞と、被験化合物とを接触させた後に実施できる。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドのトランスケトラーゼ活性を少なくとも約10、好ましくは約50、より好ましくは約75、90または100%低下させる被験化合物を、樹状細胞免疫受容体活性を低下させる可能性のある治療物質として同定する。ヒト樹状細胞免疫受容体ポリペプチドのセリンプロテアーゼ、好ましくはセリンプロテアーゼトリプシン活性を少なくとも約10、好ましくは約50、より好ましくは約75、90または100%増大させる被験化合物を、ヒト樹状細胞免疫受容体活性を増大させる可能性のある治療物質として同定する。
【0128】
遺伝子発現
別の態様では、樹状細胞免疫受容体遺伝子の発現を増大または減少させる被験化合物を同定する。樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを被験化合物と接触させ、RNAまたは樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドのポリペプチド産物の発現を測定する。被験化合物存在下での適当なmRNAまたはポリペプチドの発現レベルを、該被験化合物不在下でのmRNAまたはポリペプチドの発現レベルと比較する。すると被験化合物が、この比較に基づく発現のモジュレーターとして同定できる。例えば、mRNAまたはポリペプチドの発現が、被験化合物の不在時よりも存在時により大きい場合は、この被験化合物を、該mRNAまたはポリペプチド発現の刺激物質または増強物質と同定する。そうではなく、mRNAまたはポリペプチドの発現が、被験化合物の不在時よりも存在時により小さい場合は、この被験化合物を、該mRNAまたはポリペプチド発現のインヒビターと同定する。
【0129】
細胞における樹状細胞免疫受容体mRNAまたはポリペプチド発現のレベルは、mRNAまたはポリペプチドを検出するための当分野で周知の方法により決定できる。定性または定量的方法のいずれかが使用できる。樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドのポリペプチド産物の存在は、例えばラジオイムノアッセイのような免疫化学的方法、ウエスタンブロッティング、および免疫組織化学を包含する、当分野で周知の様々な技術を用いて決定できる。別法として、ポリペプチド合成は、樹状細胞免疫受容体ポリペプチド内への標識アミノ酸の取り込みを検出することにより、インビボで、細胞培養で、またはインビトロ翻訳系で決定できる。
【0130】
このようなスクリーニングは、無細胞検定系または無傷の細胞のいずれかで実施できる。樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドを発現するいかなる細胞も細胞に基づく検定系で使用できる。樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチドは細胞内に天然に存在するか、または上記のような技術を用いて導入することができる。一次培養または確立された細胞系、例えばCHOまたはヒト胚性腎293細胞のいずれかを使用できる。
【0131】
医薬組成物
本発明はさらに、治療効果を達成するために患者に投与できる医薬組成物を提供する。本発明に係る医薬組成物は、例えば樹状細胞免疫受容体ポリペプチド、樹状細胞免疫受容体ポリヌクレオチド、リボザイムまたはアンチセンスオリゴヌクレオチド、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに特異的に結合する抗体、または類似体、樹状細胞免疫受容体ポリペプチド活性のアゴニスト、アンタゴニスト、又はインヒビターを含み得る。この組成物は単独で、または少なくとも1種類の他の物質、例えば安定化化合物と組み合わせて投与でき、これは、食塩水、緩衝化食塩水、デキストロース、および水を包含する(但しこれらに限定されない)任意の無菌で生物学的適合性のある製薬的担体中で投与できる。この組成物は単独で、または他の物質、薬物またはホルモンと組み合わせて患者に投与できる。
【0132】
活性成分に加えて、これらの医薬組成物は、賦形剤および補助物質を含む適当な製薬的に許容し得る担体を含有でき、これらは、製薬的に使用できる調製物への活性化合物の処理を促進する。本発明に係る医薬組成物は、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、髄内、髄腔内、心室内、経皮、皮下、腹腔内、鼻腔内、非経口、局所、舌下、または直腸手段を包含する(但しこれらに限定されない)多くの経路により投与できる。経口投与用医薬組成物は、当分野で既知の製薬的に許容し得る担体を用いて経口投与に適した用量に調合できる。このような担体により、該医薬組成物を、患者が内服するための錠剤、丸剤、糖衣剤、カプ細胞剤、液体、ゲル、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤などに調合できる。
【0133】
経口使用のための医薬製剤は、活性化合物を、固体賦形剤と合し、得られた混合物を所望により粉砕し、そしてこの顆粒混合物を、所望ならば適当な補助物質を加えた後に処理して錠剤または糖衣剤核を得る。好適な賦形剤は炭水化物またはタンパク質増量剤、例えば乳糖、シュクロース、マンニトール、またはソルビトールを包含する糖;トウモロコシ、小麦、米、馬鈴薯、またはその他の植物由来の澱粉;細胞ロース、例えばメチル細胞ロース、ヒドロキシプロピルメチル細胞ロース、またはカルボキシメチル細胞ロースナトリウム;アラビアゴムおよびトラガカントゴムを包含するゴム;ならびにゼラチンおよびコラーゲンのようなタンパク質である。所望により崩壊剤または可溶化剤、例えば架橋ポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸、またはその塩、例えばアルギン酸ナトリウムを添加できる。
【0134】
糖衣剤核は、濃縮糖溶液のような適当な被覆剤と共に使用でき、これはさらに、アラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、carbopolゲル、ポリエチレングリコール、および/または二酸化チタン、ラッカー溶液、および適当な有機溶媒または溶媒混合物を含むことができる。製品の同定のためまたは活性化合物の量、即ち用量をあらわすために染料または色素を錠剤または糖衣被覆剤に添加できる。
【0135】
経口的に使用できる医薬調合物は、ゼラチン製の押してはめ込むカプ細胞剤、ならびに、ゼラチンおよび被覆剤、例えばグリセロールまたはソルビトールでできた軟封入カプ細胞剤を包含する。押してはめ込むカプ細胞剤は、活性成分を、乳糖または澱粉のような増量剤または結合剤、タルクまたはステアリン酸マグネシウムのような潤滑剤、および所望により安定剤と混合して含有できる。軟カプ細胞剤では、活性化合物を、安定剤を加えたまたは加えない適当な液体、例えば脂肪油、液体、または液体ポリエチレングリコールに溶解または懸濁できる。
【0136】
非経口投与に好適な医薬製剤は、水溶液、好ましくは生理学的適合性の緩衝液、例えばハンクス溶液、リンゲル溶液、または生理学的に緩衝化した食塩水中で調合できる。水性注射用懸濁剤は、該懸濁液の粘度を増加させる物質、例えばカルボキシメチル細胞ロースナトリウム、ソルビトール、またはデキストランを含有できる。さらに、活性化合物の懸濁剤は適当な油性注射用懸濁剤として調製できる。好適な親油性溶媒または媒質は、胡麻油のような脂肪油、またはオレイン酸エチルまたはトリグリセリドのような合成脂肪酸エステル、またはリポソームを包含する。非脂質ポリカチオンアミノポリマーもまた送達に使用できる。所望により懸濁剤は、化合物の溶解性を増し高濃縮溶液の調製を可能にするような適当な安定剤または物質を含むことができる。局所または鼻腔投与のためには、透過すべき特定の障壁に対し適当な浸透剤を製剤に使用する。このような浸透剤は当分野で一般に知られている。
【0137】
本発明に係る医薬組成物は当分野で既知の方法で、例えば常套的混合、溶解、顆粒化、糖衣剤製造、すりつぶし、乳化、カプ細胞化、捕捉、または凍結乾燥プロセスによって製造できる。この医薬組成物は塩として提供でき、塩酸、硫酸、酢酸、乳酸、クエン酸、リンゴ酸、琥珀酸などを包含する(但しこれらに限定されない)多くの酸を用いて調製できる。塩は、水性または他のプロトン性溶媒において、対応する遊離塩基型よりもより可溶性の傾向がある。別の場合には、好ましい調製物は、pH範囲4.5から5.5において以下のもの:1−50mMヒスチジン、0.1%−2%シュクロース、および2−7%マンニトール、の全てまたは任意のものを含有できる凍結乾燥粉末であってよく、これを使用前に緩衝液と合する。
【0138】
調合と投与のための技術のさらなる詳細は、REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCES(Maack Publishing Co., Easton, Pa)の最新版に見出すことができる。医薬組成物を製造した後、これらを適当な容器に入れ、適応状態の治療のためにラベルを貼る。このようなラベル表示は、投与の量、頻度、および投与方法を包含する。
【0139】
治療上の適応および方法
ヒト樹状細胞免疫受容体を調節して、ガン、喘息、肥満症、糖尿病、CNS障害、および心臓血管障害を処置することができる。
癌は、基本的に発癌性細胞形質転換によって発症する疾患である。形質転換細胞をそれらの正常な対応物から区別し、かつ癌の病態生理に基づく形質転換細胞の特徴は幾つかある。それらには、非制御型細胞性増殖、通常の死誘導シグナルに対する不応答(不死化)、増大した細胞運動性及び侵襲性、新たな血管新生の誘導を通じた血液供給を補充するための増大した能力(血管新生)、遺伝子の不安定性、並びに調節不全遺伝子発現が挙げられる。薬剤耐性の獲得とともに、これらの異常な生理機能の種々の組み合わせににより、最終的に臓器不全および患者の死となる難治性疾患状態に頻繁に陥る。
【0140】
最も一般的な癌治療は、細胞増殖を標的とし、形質転換細胞と正常細胞との間の効率に関するその特異な増殖能に基づいている。このアプローチは、幾つかの重要な正常細胞タイプもまた高増殖であり、かつ癌細胞が高頻度にこれらの物質に対して耐性となるという現実により妨げられている。従って、従来の抗癌治療についての治療指数は珍しく2.0を超えている。
【0141】
ゲノミクス誘導性分子の標的同定は、癌患者に安全で、かつより効率的な処置を提供できる治療介入のための新たな癌特異的標的を同定する可能性を開いた。従って、新たに発見される腫瘍関連遺伝子及びその産物を疾患におけるそれらの機能(群)について試験でき、そして革新的な治療を発見し、かつ開発するために道具として用いることができる。以上に概説した生理学的プロセスの多くに重要な働きがある遺伝子は、癌標的として特徴付けることができる。
【0142】
ゲノミクスによって同定された遺伝子あるいは遺伝子破片は機能的な組換え蛋白質を生産するために1つ以上の異種起源の発現系で容易に発現させることができる。これらの蛋白質は、それらの生化学的特性のために生体外で特徴づけられ、次に、それらの生化学的活性の化学的モジュレーターを同定するためのハイスループット分子スクリーニングプログラムにおけるツールとして使用する。標的タンパク質活性のアゴニストおよび/またはアンタゴニストは、この方法で同定し、そして細胞およびin vivo 疾患モデルにおいて抗癌活性に関して試験することができる。生物学的モデルおよび詳細な薬物動力学的および毒物学的分析は、医薬の開発およびさらにヒトにおける試験のための基礎を形成する。
【0143】
アレルギー、アナフィラキシー、喘息および炎症 アレルギーは、アレルゲンに応じて免疫グロブリンE(免疫グロブリンE)抗体の生産である。アレルゲンへの接触に際して、反応する個人のB細胞はアレルゲンに特有の免疫グロブリンE分子を分泌する。免疫グロブリンE分子は、マスト細胞と好塩基性細胞上で存在する高い類似免疫グロブリンE受容体(FcRI)に結合する。
免疫グロブリンE結合は、アレルギーと炎症性のレスポンスを促進する様々な血管に作用するメディエーターの放出を活性化する。アレルゲン分子をには形成する境界免疫グロブリンE分子によって2つ以上のFcRIsが架橋される場合は常に、活性化が生じる。そのような集合体は、細胞質の小粒および鉛板からプロスタグランジン、ロイコトリエン、サイトカイニンおよび過敏反応の他のエフェクターの合成にヒスタミンとプロテアーゼを放出する、生化学のカスケードを開始する。
【0144】
喘息および他の炎症性の疾病の病因において重要であり得る。洗浄流体中のSPPレベルの著しい高台は分節の抗原投与に続く喘息において観察された。SPP(それ自体あるいはPDGFを備えた共同作用の中で)もIL−6生産を調節するために報告された。さらに、スフィンゴシンとSI.P.の間のバランスがマスト細胞の活性化には決定的であることが実証されました、細胞系、スフィンゴシンキナーゼIがそれらの刺激用の任意のスイッチの役割をするところで、多くの喘息の徴候の開始物質として関係している。スフィンゴシン・キナーゼ様蛋白質はジアシルグリセロールキナーゼのある点で2つの既知のスフィンゴシン・キナーゼと類似している、スフィンゴシン・キナーゼにD−トレオスフィンゴシンを燐酸化する能力を与えるために推定される、触媒現象の領域。しかしながら、それは、そのN−末端でさらに相同(PH)領域を持っている点で、他の2つのスフィンゴシン・キナーゼと異なる(下記の図を参照)。PHは蛋白質を示すことで見つかった領域で、イノシトール・リン酸塩、G蛋白質のベータ/ガンマサブユニット、蛋白質の燐酸化されたSer/Thr残留物および薄膜を結合する能力を含む多数の機能がある。キナーゼ様3つのヒトスフィンゴシン・キナーゼ、SPHK1、SPHK 2およびスフィンゴシン、384、618のおよび537アミノ酸の蛋白質をそれぞれコード化する。長さの差に加えて、スフィンゴシン・キナーゼは、さらに組織分配の差を示する。3つの、スフィンゴシン、キナーゼ状、ほぼすべての組織で発現し、最も広い分配を持つように見える。しかしながら、顕著に、それが微小血管の内皮の細胞の中で最も高く発現される、ということを細胞系が身体の全体にわたって分かった。これはそのスフィンゴシンをキナーゼ様およびより多くの、したがって、他のスフィンゴシン・キナーゼより、それらの付着分子発現、細胞から細胞の接触、サイトカイニンおよび成長因子分泌、増殖および血管形成を調節して、内皮の細胞の活性化に重要な役割を果たしてもよい。
【0145】
自己免疫疾患の確立している治療は、炎症の最終の共通のあるいは免疫学のメディエーターのいずれかを阻止することを目的とする。両方のアプローチは非特異性で、したがって、筋骨の副作用、同化作用の副作用、神経学と結合組織副作用、免疫抑制、骨髄および胃腸の毒性、肝臓障害、肺疾病、過敏反応、聴覚障害、腎臓部の毒性(皮膚と粘膜の毒性)のような厳しい副作用に関係する。R. Million et al., Lancet 1: 812 (1984), J. A. Engelbrecht et al., Arthritis and Rheumatism 26: 1275 (1983), G. W. Cannon et al., Arthritis and. Rheumatism 26: 1269 (1983), Simon and Mills,”Nonsteroidal 抗inflammatory Drugs,”N. Eng. J. Med. 302: 1179. (1980), Katz et al., Ann. Int. Med. 101: 176 (1984), W. F. Kean et al., Arthritis and Rheumatism 23: 158 (1980).したがって、自己免疫疾患用の現在の治療は、重大な副作用の高い発生率に関係する。更に、いくつかの薬物治療は徴候的な救済を行うかもしれないが、多くの場合では、それらは著しく共同の破壊のような徴候の進行を修正しない。必要なものはより低い毒性を備えた、治療がよりよくであるそのようなもの、許容された、そして自己免疫疾患の治療に、より適切な有効な治療法である。SPPはFasを媒介とした細胞死道を阻止すると示された。O. Cuvillier et al.,”Suppression of ceramide−mediated Programmed Cell Death By Sphingosine−l−phosphate,”Nature 381: 800 (1996)を参照。したがって、蛋白質活性キナーゼのようなスフィンゴシンの阻止は、SPPの構成を防ぐことによりFas介在のアポトーシスの阻止を逆にすることへの実行可能な方法である。SPPはスフィンゴシン・キナーゼの活性によってスフィンゴシンから生産される。SPPの正味の影響はセラミドを媒介とした細胞死の阻止である。したがって、スフィンゴシンの調節、キナーゼ様蛋白質は、例えば慢性関節リウマチ、全身エリテマトーである、墓の疾病、多発性硬化症(MS)およびタイプのような自己免疫疾患を治療するか防ぐ方法を提供し得る。マスト細胞と好塩基性細胞は炎症の部位で蓄積し、活性化に際して、顆粒細胞/マクロファージコロニー刺激因子、インターロイキン−3およびインターロイキン−6のような血液生成成長因子を分泌する。これらの要因は、好中球、マクロファージおよびエオシン好性の細胞のような炎症性の細胞を補充し、活性化することにより、炎症性の反応が広まる。活性化された細胞は、進行中の炎症、腫瘍侵入、血管形成、繊維症および血栓症の領域で蓄積する。FcRIによる細胞の免疫グロブリンE依存の活性化は局所的な組織防御、組織維持および改変へ指図された、炎症性の反応および免疫調節 (Gagari, E. et al (1997) Blood 89: 2654−2663)に帰着する。
【0146】
糖尿病 糖尿病は心臓血管系で、血糖中の異常な高台、脂質および異常(併発症)の変更、目、腎臓および神経系によって特徴づけられた共通の代謝異常である。糖尿病は2つの別個の疾病に分類される:タイプ1糖尿病(若年性の発症)(それは、インシュリンを作り分泌する細胞の損失に起因する)およびタイプ2糖尿病(成人性の発症) (インシュリン分泌の欠陥およびインシュリン反応の欠陥によって引き起こされる)。
【0147】
タイプ1糖尿病は、膵臓の小島で細胞(β細胞)を分泌するインシュリンを攻撃する、自己免疫の反応によって開始する。β細胞の破壊が始まるS前にこの反応が生じるのを防ぐか、反応を止める試薬は、この疾病用の潜在的な治療である。ベータ細胞増殖および再生を引き起こす他の試薬はさらに潜在的な治療である。
【0148】
タイプII糖尿病は2つの糖尿病の条件(人口の6%)に共通する。インシュリン分泌の欠陥は糖尿病の条件の重要な原因で、適切に、インシュリン放出を備えた血糖レベルの上昇に検知して応答するβ細胞の無力化に起因する。β細胞による反応をグルコースに増加させる治療は、この疾病の重要な新しい治療法を提示するであろう。
【0149】
タイプII糖尿病患者主題のインシュリン応答の欠陥は治療の介在の別の目標である。筋肉、肝臓および脂肪中のインシュリン受容体の活動を増加させる試薬は、血糖の減少および血しょう脂質の正常化を引き起こすでしょう。直接受容体を刺激するか、受容体からの細胞内の信号を増加させる試薬は受容体活動を増加させることができる。他の治療は、インシュリン状の結果を生成するために細胞の終了プロセス(つまりグルコース輸送、様々な酵素システム)を直接活性化することができる、したがって、1つの、有益な結果を重量超過の主題がタイプII糖尿病に対してより大きな感受性を有する体重を減少させるどんな試薬も可能な治療である。
【0150】
Iおよびタイプ糖尿病が扱うことができる両方の型のインシュリン応答を模倣する試薬あるいは血糖レベルの縮小により糖尿病の併発症を扱う。同様に、試薬、それは新しい血容器成長を縮小する、両方の疾病の中で発展する目併発症を扱うために使用することができる。
【0151】
治療されるかもしれないCNS病気は脳傷、脳血管性の疾病およびそれらの結果を含む、パーキンソン病、corticobasalな退化、運動ニューロン疾病、ALSを含む痴呆、多発性硬化症、精神的外傷の脳傷、ストローク、ポストストローク、精神的外傷で、記入する、脳傷、また小さな容器の脳血管性の疾病。痴呆、アルツハイマー病のように、管の痴呆、Lewy身体を備えた痴呆、frontotemporalな痴呆およびパーキンソン症候群、染色体17にリンクされた、frontotemporalな痴呆、ピックの疾病を含んでいること、進歩的な核の震え、corticobasalな退化、ハンチントン舞踏病、視床の退化、Creutzfeld−ジェイコブ痴呆、HIV痴呆、痴呆を備えた精神分裂病、またKorsakoffの精神病、さらに、扱うことができる。同様に、ヒト樹状細胞免疫受容体の活動の規制により学習障害を持った子供の中の穏やかな認識の悪化、年齢を関連するメモリ悪化、年齢に関連する認識の衰退、管の認識の悪化、注意力欠如障害、attentiondeficit活動過多病気およびメモリ妨害のような認識のことに関連する病気を治療することは可能かもしれない。
【0152】
慢性の肺の(あるいは気道)疾病(COPD)は慢性の気管支炎(シニア&シャピロ、肺の疾病および障害、3d ed、ニューヨーク、マグロウヒル、1998年、pp.、1998年659−681;バーンズ、胸、10S−14S、2000年117)により肺気腫および周辺の気道妨害の混合物に一般に起因する気流妨害として生理学上条件である。肺気腫は、肺の領空の異常な拡大に結びつく歯槽の壁の破壊によって特徴づけられる。慢性の気管支炎は、各々の連続の2年に3か月の間慢性の生産的な咳の存在として臨床的に定義される。COPDでは、気流妨害が通常進歩的で、単に部分的に可逆的である。非常に、疾病は非喫煙者に生じるが、COPDの開発のた?゜の最も重要な危険要因はたばこ喫煙である。
【0153】
気管の慢性の炎症はCOPD(シニア&シャピロ、1998年)の重要な病理学の特徴である。炎症性の細胞人口は、マクロファージ、好中球およびCD8+リンパ細胞の増加した数を含む。たばこ煙のような吸入された刺激物は、ケモキネス(例えばインターロイキン−8)およびに走化性のある要因をリリースするためにリードする上皮の細胞と同様に呼吸器官において駐在のマクロファージを活性化する。これらの走化性のある要因はincrに作用する。肺組織および気道へ血液から売買する好中球/単球を緩和してください。気道へ補充された好中球および単球は、蛋白質分解を生ずる酵素および反応的な酸素種のような様々な潜在的に有害な仲裁人を解放することができる。マトリックス低下および肺気腫、気道と共に、厚くなる界面活性剤機能障害および粘液分泌過多を囲む、すべては害された気流およびガス交換に結びつく、この炎症性の反応の潜在的な結果である。
【0154】
肥満、そして体重超過のけ傾向に相対的な身体の脂肪の過剰として定義される。カロリーの摂取の増加あるいはエネルギー消費あるいは両方の減少は、脂肪として格納されている余分のエネルギーに結びつくこのインバランスを引き起こすことができる。肥満は重要な医学の病的な状態および死の増加に関係している。肥満の原因よく分かっていないが、陽性のエネルギー・バランスを引き起こすために遺伝要因、環境要因あるいは2つの組合せによってもよい。対照的に、拒食症と悪液質は、否定のエネルギーバランスおよび減量に結びつくエネルギー摂取対エネルギー消費での不均衡によって特徴づけられる。一方の増加エネルギー消費、エネルギー摂取の減少、吸収あるいは記憶が有用な試薬、肥満の治療、重量超過、また共同な状態を関連させた。エネルギー摂取および/またはエネルギー消費の減少を増加させるか、引き締まっている組織の量を増加させる試薬は、悪液質、拒食症および浪費する病気を扱うのによく役立ちました。
【0155】
遺伝子は処置として使用できる。また、ゲノミクスを通じて同定される遺伝子又は遺伝子断片は、すぐに1つ又はそれ以上の非相同(ヘテローガス)発現系において発現させ、機能性組換えタンパク質を産生させることができる。このタンパク質は、その生物学的機能についてインビトロで特徴付けられ、その後その生化学活性の化学修飾因子(モジュレーター)を同定するため、ハイスループット分子スクリーニングプログラムにおける道具として用いられる。標的タンパク質活性のアゴニスト及び/又はアンタゴニストをこの様式で同定し、次いで、細胞およびインビボ疾患モデルにて抗癌活性について試験する。生物学的モデルにおける反復試験や、詳細な薬物動態力学的分析及び中毒学的分析を用いたリード化合物の最適化により、薬物開発及び次のヒトでの試験についての基礎を形成する。
【0156】
本発明は、上に記述された、分析によって同定された新規な試薬の使用にさらに関する。従って、それは適切な動物モデルにここに記述されるように同定された試験化合物を使用することも本発明の範囲内である。例えば、そのような試薬と処理の効能、毒性あるいは副作用を決定するために、ここに(例えば調整する試薬、アンチセンスの核酸分子、特定の抗体、リボザイムあるいは分子を結合する樹状細胞免疫受容体ポリペプチド。記述されるように同定された試薬は、動物モデルの中で使用することができる。別法として、そのような試薬の反応のメカニズムを測定するために、ここに記述されるように同定された試薬は、動物モデルにおいて使用することができる。更に、この発明は、ここに記述されるような処理のための上記の記述された分析によって同定された新規な試薬の用途に関する。
【0157】
樹状細胞免疫受容体遺伝子、酵素、またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストは、心血管症状に対する治療効果を有し得る。心血管疾患には、以下の心臓および血管系の障害が含まれる:うっ血性心不全、心筋梗塞、虚血性心疾患、すべての種類の心房性および心室性不整脈、高血圧血管疾患および末梢血管疾患。
【0158】
心不全とは、心機能の異常性のせいで、心臓が、代謝中の組織の必要に見合う割合で血液をポンプすることができない病態生理学的状態として定義される。これには、ハイアウトプットおよびローアウトプット、急性および慢性、右側または左側、収縮性または弛緩性のようなすべての型のポンプ不全が、原因に関係なく含まれる。
【0159】
心筋梗塞(MI)は一般に、冠血流の突然の減少、その後の、動脈硬化症によってあらかじめ狭小化した冠動脈の血栓性閉塞によって生じる。MI予防(初期および二次的予防)は、MIの急性処置および合併症の予防と同様に包含される。
【0160】
虚血性疾患は、冠流が制限され、酸素に関して心筋の必要量に見合わない灌流を生じる症状である。この群の疾患には、安定狭心症、不安定狭心症および無症候性虚血が含まれる。
【0161】
不整脈には、すべての型の心房性および心室性頻脈性不整脈(心房性頻脈、心房粗動、心房細動、房室リエントラント頻脈、興奮前症候群、心室頻脈、心室粗動、心室細動)、ならびに徐脈性型不整脈が含まれる。
【0162】
高血圧血管疾患には、初期ならびにすべての種類の二次的動脈高血圧(腎、内分泌、神経原性、その他)が含まれる。遺伝子は、高血圧の処置、ならびにすべての合併症の予防に関する薬物標的として用いることができる。末梢血管疾患とは、動脈および/または静脈流が減少し、血液供給と組織酸素要求の間の不均衡が生じる血管疾患として定義される。これには、慢性末梢動脈閉塞疾患(PAOD)、急性動脈血栓症および塞栓症、炎症性血管障害、レイノー現象および静脈障害が含まれる。CNS障害、例えばパーキンソン疾患、皮質基底変性(corticobasal degeneration)、運動ニューロン疾患、痴呆、ALS、多発性硬化症、外傷性脳傷害、外傷後脳傷害、小血管脳血管疾患、脳卒中および脳卒中後後遺症もまた、ヒト樹状細胞免疫受容体の調節によって処置できる。
【0163】
本発明は、上記のスクリーニング検定によって同定される新規物質の使用にさらに関する。従って、本明細書に記載するように同定される被験化合物を適当な動物モデルに使用することは、本発明の範囲内にある。例えば、本明細書に記載するように同定される物質(例えば、調整物質、アンチセンス核酸分子、特異的な抗体、リボザイム又は樹状細胞免疫受容体ポリペプチド結合分子)を、そのような物質を用いた処置の効果、毒性又は副作用を決定するために、動物モデルに用いることがある。あるいは、本明細書に記載するように同定された物質を、該物質の作用機構を決定するために、動物モデルに使用する場合がある。さらに、本発明は、本明細書に記載の処置に対する上記スクリーニング検定によって同定される新規物質の使用に関する。樹状細胞免疫受容体活性に影響を及ぼす試薬を、樹状細胞免疫受容体活性を低下させるために、インビトロ又はインビボのいずれかにおいてヒト細胞に投与することができる。試薬は、ヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子の発現産物と結合することが好ましい。その発現産物がタンパク質である場合、試薬は抗体であることが好ましい。エックスビボにおけるヒト細胞の処置については、抗体を、人体から取り出しておいた幹細胞の調製物に添加することができる。その後、その細胞を、当分野で周知のように、クローン増殖させるか、又はさせずに同じ又は別の人体に移すことができる。
【0164】
1つの態様においては、試薬を、リポソームを用いて送達する。リポソームは、投与した動物中にて、少なくとも約30分間、より好ましくは少なくとも約1時間、さらにより好ましくは少なくとも約24時間安定であることが好ましい。リポソームは、試薬、特にポリヌクレオチドを、動物(例えばヒト)の特定の部位に標的化することができる脂質組成物を含む。リポソームの脂質組成物は、動物の特有の器官、例えば肺、肝臓、脾臓、心臓、脳、リンパ節及び皮膚を標的化できることが好ましい。
【0165】
本発明に有用なリポソームは、標的化した細胞の原形質膜と融合でき、その内容物を細胞に送達できる脂質組成物を含む。好ましくは、リポソームのトランスフェクション効率は約10細胞に送達されるリポソーム16nmol当たりDNA約0.5μgであり、より好ましくは約10細胞に送達されるリポソーム16nmol当たりDNA約1.0μgであり、さらにより好ましくは約10細胞に送達されるリポソーム16nmol当たりDNA約2.0μgである。好ましくは、リポソームは直径が、約100〜500nmであり、より好ましくは約150〜450nmであり、さらにより好ましくは約200〜400nmである。
【0166】
本発明に用いるに適したリポソームは、例えば当業者に知られる遺伝子送達法に標準的に用いられるリポソームを含む。より好ましいリポソームは、ポリカチオン脂質組成物を有するリポソームおよび/またはポリエチレングリコールと連結されたコレステロールバックボーン(骨格鎖)を有するリポソームを含む。あるいは、リポソームは特定の細胞タイプを標的化できる化合物、例えばリポソームの外側表面に曝される細胞特異的リガンドを包含する。
【0167】
リポソームを、試薬、例えばアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはリボザイムと複合化させることは、当分野で標準的な方法 (例えば、米国特許5,705,151を参照のこと) を用いて達成することができる。好ましくは、ポリヌクレオチド約0.1μg〜約10μgをリポソーム約8nmolと複合化する、より好ましくはポリヌクレオチド約0.5μg〜約5μgをリポソーム約8nmolと複合化する、さらにより好ましくはポリヌクレオチド約10μgをリポソーム約8nmolと複合化する。
【0168】
別の態様においては、抗体を、受容体媒介性標的化送達を用いて、インビボにて特定の組織に送達することができる。受容体媒介性DNA送達技術は、例えばFindeisら、Trends in Biotechnol. 11, 202−05 (1993); Chiouら、GENE THERAPEUTICS: METHODS AND APPLICATIONS OF DIRECT GENE TRANSFER (J. A. Wolffら、) (1994); Wu & Wu, J. Biol. Chem. 263, 621−24 (1988); Wuら、J. Biol. Chem. 269, 542−46 (1994); Zenkeら、Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 3655−59 (1990); Wuら、J. Biol. Chem. 266, 338−42 (1991) にて教示されている。
【0169】
治療的有効量の決定
治療的有効量の決定は、充分当業者の能力の範囲内にある。治療的有効量とは、治療的有効量の不在下で起こる樹状細胞免疫受容体活性に比較して樹状細胞免疫受容体活性を増大させまたは低下させる活性成分の量を指す。
【0170】
いかなる化合物に関しても、治療的有効量は最初に細胞培養検定で、または動物モデル、通常マウス、ウサギ、イヌ、またはブタで見積もることができる。動物モデルは適当な濃度範囲および投与経路の決定にも使用できる。次にこのような情報を用いてヒトでの有用な用量と投与経路を決定できる。
【0171】
治療的有効性および毒性、例えばED50(集団の50%で治療的に有効な用量)およびLD50(集団の50%で致死的な用量)は、細胞培養または実験動物における標準的薬学的方法により決定できる。治療効果に対する毒性効果の用量比が治療指数であり、比LD50/ED50で表すことができる。
【0172】
大きな治療指数を示す医薬組成物が好ましい。細胞培養検定および動物研究から得られるデータを、ヒトへの使用のための用量範囲を処方する際に使用する。かかる組成物に含まれる用量は、好ましくは殆どまたは全く毒性を持たないED50を包含する循環濃度の範囲内である。この用量は、使用する用量型、患者の感受性、および投与経路に応じてこの範囲内で変わる。
【0173】
正確な用量は、治療を必要とする対象に関連する因子に照らして医師が決定する。用量および投与は、充分なレベルの活性成分を提供するよう、または所望の効果を維持するよう、調節する。考慮できる因子は、疾病状態の重篤度、対象の全身健康状態、年齢、体重、および対象の性別、食餌、投与の時間および頻度、薬物の組み合わせ、反応の感受性、および療法に対する寛容/応答を包含する。長時間作用性医薬組成物は、その製剤の半減期およびクリアランス率に応じて3から4日毎、毎週、または2週間に1回投与することができる。
【0174】
標準的な用量は投与経路に応じて0.1から100000マイクログラムまで変えることができ、約1gまでの総用量とすることができる。特定の用量および送達方法についての指針は文献に提供されており、一般に当分野の医師が入手できる。当業者は、ヌクレオチド用にはタンパク質またはそれらのインヒビター用のものとは異なる製剤を使用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの送達は特定の細胞、状態、場所などに特異的である。
【0175】
この試薬が一本鎖抗体である場合、この抗体をコードしているポリヌクレオチドを組み立て、トランスフェリン−ポリカチオン−媒介DNA転移、裸のまたはカプ細胞内核酸を用いるトランスフェクション、リポソームの媒介する細胞融合、DNA被覆ラテックスビーズの細胞内輸送、プロトプラスト融合、ウイルス感染、電気穿孔、「遺伝子銃」、およびDEAE−または燐酸カルシウム−媒介トランスフェクションを包含する(但しこれらに限定される訳ではない)充分確立した技術を用いて、ex vivoまたはインビボで細胞内に導入できる。
【0176】
抗体の有効なインビボ用量は、約5μgから約50μg/kg、約50μgから約5mg/kg、約100μgから約500μg/kg(患者の体重)、および約200から約250μg/kg(患者の体重)の範囲である。一本鎖抗体をコードしているポリヌクレオチドの投与のためには、有効なインビボ用量は、約100ngから約200ng、500ngから約50mg、約1μgから約2mg、約5μgから約500μg、および約20μgから約100μgのDNAの範囲である。
【0177】
発現産物がmRNAである場合、試薬は好ましくはアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはリボザイムである。アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはリボザイムを発現するポリヌクレオチドは、上記のように多岐にわたる方法によって細胞中に導入できる。
【0178】
好ましくは、試薬は、樹状細胞免疫受容体遺伝子の発現または樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの活性を、該試薬の不在時と比較して少なくとも約10、好ましくは約50、より好ましくは約75、90、または100%低下させる。樹状細胞免疫受容体遺伝子の発現レベルまたは樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの活性を低下させるよう選択した機構の有効性は、当分野で周知の方法、例えば樹状細胞免疫受容体特異的mRNAへのヌクレオチドプローブのハイブリダイゼーション、定量的RT−PCR、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの免疫学的検出、または樹状細胞免疫受容体活性の測定を用いて評価できる。
【0179】
上記のいずれの態様においても、本発明に係る任意の医薬組成物は他の適当な治療薬と組み合わせて投与できる。併用療法に使用するための適当な物質の選択は、常套的製薬原理に従い、当業者により実施することができる。治療薬の組み合わせは、相乗的に働いて、上記の様々な疾患の治療または予防を奏効させる。このアプローチを用いて、より低い各物質の用量で治療効果を達成することができ、したがって有害な副作用の可能性を低減することができる。
【0180】
上記の治療方法のいずれも、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル、および最も好ましくはヒトといった哺乳動物を包含する、このような治療を必要とする任意の対象に適用することができる。
【0181】
診断方法
ヒト樹状細胞免疫受容体はさらに、この酵素をコードしている核酸配列における突然変異の存在に関連する疾病および異常、または疾病および異常に対する感受性を検出する診断検定に使用できる。例えば、疾患に罹患している個体と正常な個体とにおける樹状細胞免疫受容体をコードするcDNAまたはゲノム配列の間の差異を決定できる。もし、罹患している個体の幾つかまたは全てに突然変異が観察され、正常な個体で観察されないならば、その突然変異がその疾患の原因物質である可能性がある。
【0182】
参照遺伝子および突然変異を有する遺伝子の間の配列相違は、直接DNA配列決定法によって明らかにできる。加えて、クローニングしたDNAセグメントを、特定のDNAセグメントを検出するためのプローブとして使用できる。この方法の感受性はPCRと組み合わせる時極めて増強される。例えば、二本鎖PCR産物または修飾PCRにより調製された一本鎖テンプレート分子と共に、配列決定プライマーを使用することができる。配列決定は、放射標識したヌクレオチドを用いる常套的方法によって、または蛍光標識を使用する自動配列決定法によって実施する。
【0183】
DNA配列相違に基づく遺伝子試験は、変性させる物質を含むまたは含まないゲル中のDNA断片の電気泳動移動度の変化を検出することにより実施できる。小配列の欠失および挿入は、例えば高分解能ゲル電気泳動によって視覚化できる。異なる配列のDNA断片は変性させるホルムアミド勾配ゲル上で同定でき、ここでは、異なるDNA断片の移動度が、それらの特異的融解温度または部分的融解温度に従って、ゲル中の異なる位置で遅延する(例えば、Myersら、Science 230,1242,1985を参照されたい)。特定の位置での配列改変もまたヌクレアーゼ保護検定、例えばRNアーゼおよびS1保護または化学的開裂法によって明らかにすることができる(例えば、Cottonら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85,4397−4401,1985)。即ち特異的DNA配列の検出は、ハイブリダイゼーション、RNアーゼ保護、化学的開裂、直接DNA配列決定といった方法によって、または制限酵素とゲノムDNAのサザンブロッティングを使用することによって実施できる。ゲル電気泳動およびDNA配列決定のような直接法に加えて、突然変異はin situ分析により検出することもできる。
【0184】
樹状細胞免疫受容体レベルの変化もまた種々の組織で検出できる。血液または組織生検のように、宿主から誘導した身体試料中のタンパク質ポリペプチドのレベルを検出するために用いる検定は、当業者に周知であり、ラジオイムノアッセイ、競合的結合検定、ウェスタンブロット分析、およびELISA検定を包含する。
【0185】
本明細書に引用する全ての特許および特許出願は、引用により特に本明細書の一部とする。上記の内容は本発明を一般的に記載するものである。より完全な理解は以下の具体的実施例を参照することによって得られ、それらの実施例は例示のみの目的で提供するものであり、本発明の範囲を限定する意図は無い。
【0186】
実施例1
樹状細胞免疫受容体活性の検出
配列番号1のポリヌクレオチドを発現ベクターpCEV4に挿入し、得られた発現ベクターpCEV4−樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをヒト胎児腎293細胞にトランスフェクトする。チオベンジルエステル基質を用いて、米国特許第5,500,344号に記載のように、トランスフェクト細胞の細胞抽出物のプロテアーゼ活性を測定する。顆粒およびカラムフラクション由来の酵素活性をモニターするため、室温で、0.5mM 5,5’−ジチオビス−(2−ニトロ安息香酸)(DTNB)(Sigma)を用いて検定を行い、HSBzl脱離基を検出(410=13600M−1cm−1)する。さらに、ミクロタイター検定(Green and Shaw, Anal. Biochem. 93, 223−226, 1979)を用いてBLT−エラスターゼ活性を見積もる。簡単には、サンプル50μLを、10mM HEPES、1mM CaCl、1mM MgClからなる1mM DTNB100μL、pH7.2に加える。BLT(Sigma)50μLを加えて、最終濃度500μMにすることによって反応を開始させる。メターゼ(Metase)測定では、0.1M HEPES、0.05M CaCl、pH7.5中のサンプル希釈物50μLを、1mM DTNB100μLに加え、Boc−Ala−Ala−Met−S ベンジル(Bzl)50μLを加え、最終濃度250μMにすることによって反応を開始させる。検定の時間は呈色度合いに応じ、その割合(rate)は Dynatech MR 5000 マイクロプレートリーダーで測定(O.D.410)する。サンプルおよびDTNBのみまたはDTNBおよび基質のみのコントロールを実行する。
【0187】
トランスフェクトしていない同じタイプの細胞培養を、被験化合物を加えず、同じ時間インキュベートし、ネガティブコントロールとする。RNAを、Chirgwinら、Biochem. 18, 5294−99,1979に記載のように2つの培養物から単離する。ノーザンブロットを全RNA20〜30μgを用いて調製し、エクスプレスハイブ(Expresshyb)(CLONTECH)中65℃にて、32I−標識化ヒト樹状細胞免疫受容体特異的プローブを用いてハイブリダイズさせる。このプローブは配列番号1または9の相補物より選ばれる少なくとも11個の連続ヌクレオチドを包含する。
【0188】
被験化合物を、ヒト樹状細胞免疫受容体発現構築物でトランスフェクトしたヒト細胞培養に投与し、30℃で1時間インキュベートする。トランスフェクトしていない同じタイプの細胞培養を、GF/Bフィルターを用いて、0.5%ポリエチレンジアミンを用いて同じ時間インキュベートし、ネガティブコントロールとする。RNAを、Chirgwinら、Biochem. 18, 5294−99,1979に記載のように2つの培養物から単離する。
【0189】
非特異的結合は、被験化合物の非存在下にて得られるシグナルと比較して、ヒト樹状細胞免疫受容体特異的シグナルを低下させる被験化合物を、ヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子発現のインヒビターとして同定する。
【0190】
実施例2
組換えヒト樹状細胞免疫受容体の発現
ピキア パストリス(Pichia pastoris)発現ベクターpPICZB(Invitrogen, San Diego, CA) を用いて、大量の組換えヒトセリンプロテアーゼDESC1セリンプロテアーゼDESC1ポリペプチドを酵母中に生産させる。樹状細胞免疫受容体コード化DNA配列は配列番号1または14から誘導する。ベクターpPICZB中に挿入する前に、DNA配列を、その5’端に開始コドン、及び3’端にエンテロキナーゼ開列部位、His6レポータータグや終止コドンを含ませるといった周知の方法によって修飾する。さらに、その両末端に制限エンドヌクレアーゼの認識配列を加え、対応する制限酵素を用いてpPICZBのマルチクローニングサイトを消化した後に、修飾DNA配列をpPICZB中にライゲートする。この発現ベクターは、ピキア パストリスにて酵母プロモーターにより誘導される誘導性発現用に設計する。得られたpPICZ/md−His6ベクターを用いて、酵母を形質転換する。
【0191】
この酵母を、5リッター攪拌フラスコ中で通常の条件下にて培養し、組換え産物タンパク質を、8Mウレアの存在下で親和性クロマトグラフィー(Ni−NTA−樹脂)により培養物から単離する。結合したポリペプチドを、pH3.5の緩衝液を用いて溶出し、中性化する。His6レポータータグからのポリペプチドの分離は、製造元の指示に従い、エンテロキナーゼ(Invitrogen, San Diego, CA)を用いる部位特異的タンパク質分解により行なう。精製ヒト樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを得る。
【0192】
実施例3
樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと結合する被験化合物の同定
グルタチオン−S−トランスフェラーゼタンパク質を含み96ウェル マイクロタイタープレートのグルタチオン誘導化ウェルに吸着させた精製樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを、生理緩衝溶液pH7.0の小分子ライブラリー由来の被験化合物と接触させる。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドは、配列番号2に示すアミノ酸配列を含む。被験化合物は蛍光標識を含む。この試料を5分間〜1時間インキュベートする。コントロール試料は、被験化合物の非存在下にてインキュベートする。
【0193】
被験化合物を含む緩衝液を、ウェルから洗い出す。樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに対する被験化合物の結合を、ウェル内容物の蛍光測定により検出する。被験化合物をインキュベートしていないウェルの蛍光と比較して少なくとも15%ウェルの蛍光を増大させる被験化合物を、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと結合する化合物と同定する。
【0194】
実施例4
樹状細胞免疫受容体遺伝子発現を低下させる被験化合物の同定
被験化合物を、樹状細胞免疫受容体発現構築物でトランスフェクトしたヒト細胞培養に投与し、37℃で10〜45分間、インキュベートする。トランスフェクトしていない同じタイプの細胞培養を、被験化合物を加えず、同じ時間インキュベートし、ネガティブコントロールとする。
【0195】
RNAを、Chirgwinら、Biochem. 18, 5294−99,1979に記載のように2つの培養物から単離する。ノーザンブロットを全RNA20〜30μgを用いて調製し、エクスプレスハイブ(Expresshyb)(CLONTECH)中65℃にて、32P−標識化樹状細胞免疫受容体特異的プローブを用いてハイブリダイズさせる。このプローブは配列番号1または14の相補物より選ばれる少なくとも11個の連続ヌクレオチドを包含する。被験化合物の非存在下にて得られるシグナルと比較して、樹状細胞免疫受容体特異的シグナルを低下させる被験化合物を、樹状細胞免疫受容体遺伝子発現のインヒビターとして同定する。
【0196】
実施例5
ヒト樹状細胞免疫受容体のリガンドの同定
発現クローニング。被験化合物を、樹状細胞免疫受容体発現構築物でトランスフェクトしたヒト細胞培養に投与し、インキュベートする。トランスフェクトしていない同じタイプの細胞培養を、被験化合物を加えず、同じ時間インキュベートし、ネガティブコントロールとする。樹状細胞免疫受容体特異的プローブを用いてFACSまたはパンニングする。このプローブは非存在下にて得られるシグナルと比較して、樹状細胞免疫受容体特異的シグナルを低下させる被験化合物を、樹状細胞免疫受容体遺伝子発現のインヒビターとして同定する。
【0197】
ランダムペプチドディスプレイライブラリーの使用。ヒト樹状細胞免疫受容体cDNAで感染させた哺乳類の細胞はヒト樹状細胞免疫受容体に結合するペプチドを同定するために使用される。特に、ランダムペプチド・ディスプレイライブラリ(例えばFliTrx™)を発現する大腸菌は、トランスフェクタントへの結合のためにスクリーニングする。ふるい分けのいくつかのラウンドの後に、陽性のクローンは順番に並べらる。縮重していないポリペプチドはオリゴヌクレオチドを使用して、T細胞cDNAライブラリの植民地ハイブリダイゼーションによって同定される。あるいは、PCRプライマーはペプチド・配列に基づいて合成する。
【0198】
生化学的方法。T細胞系全細胞抽出液から調製した細胞膜画分を可溶のヒト樹状細胞免疫受容体に結合したアフィニティーカラムに適用する。カラム(つまり推定上のリガンド)に結合した分子は、pHを変更するかEDTAまたは炭水化物で洗浄することにより溶出する。溶出液を慣用のカラム・クロマトグラフィーおよびHPLCによって精製した後、アミノ酸配列決定で検査する。これらのリガンドをコード化するcDNAは、オリゴヌクレオチドを使用して、T細胞cDNAライブラリーの植民地ハイブリダイゼーションによってクローンを作成する。あるいは、PCRプライマーを明らかにされたアミノ酸配列に基づいて合成する。
【0199】
実施例6
ヒト樹状細胞免疫受容体活性を低下させる細胞被験化合物の同定
被験化合物を、ヒト樹状細胞免疫受容体発現構築物でトランスフェクトしたヒト細胞培養に投与し、37℃で10〜45分間、インキュベートする。トランスフェクトしていない同じタイプの細胞培養を、被験化合物を加えず、同じ時間インキュベートし、ネガティブコントロールとする。
【0200】
被験化合物の非存在下にて得られるシグナルと比較して、ヒト樹状細胞免疫受容体特異的シグナルを低下させる被験化合物を、ヒト樹状細胞免疫受容体遺伝子発現のインヒビターとして同定する。
【0201】
実施例7
樹状細胞免疫受容体遺伝子産物と特異的に結合する試薬を用いた喘息の処置
配列番号1または15の相補物より選択される少なくとも11個の連続ヌクレオチドを含むアンチセンスヒトスフィンゴシンキナーゼ様タンパク質オリゴヌクレオチドの合成は、ホスホラミダイト手順を用いて、ファルマシア ジーン アセンブリー シリーズ シンセサイザー(Pharmacia Gene Assembler series synthesizer)にて実施する(Uhlmannら、Chem. Rev. 90, 534−83, 1990を参照のこと)。アセンブリーおよび脱保護に続き、オリゴヌクレオチドを2度エタノール沈殿させ、乾燥させ、そしてリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中に所望の濃度に懸濁する。これらのオリゴヌクレオチドの純度は、キャピラリーゲルゲル電気泳動及びイオン交換HPLCにより試験する。オリゴヌクレオチド調製のエンドトキシンレベルは、リムルスアメーバ様検定(Limulus Amebocyte Assay)(Bang, Biol. Bull. (Woods Hole, Mass.) 105, 361−362, 1953) を用いて決定する。
【0202】
アンチセンスのオリゴヌクレオチドを含んでいる水性製剤は、吸入によって患者に処置した。
【0203】
喘息の重篤度は徴候の変化に注意する、肺機能を測定する、あるいは洗浄によって肺からサンプリングされた流体の中で多くの炎症性の細胞あるいは炎症性のメディエーターの濃度のような肺炎症のマーカーの変化を測定することにより、数日または数週の期間の間モニターした。喘息の重篤度は樹状細胞免疫受容体の活性により低減した。
【0204】
実施例8
新規化合物の生体内の確認
1. T細胞の活性に対する試験は共刺激分子サイトカイニン、サイトカイニン受容体、シグナル伝達分子あるいはT細胞活性化に関与する他の分子の発現か活性を調節する試薬を評価するために使用した。
【0205】
マウスはサイトカイニン産生モデルを反−CD3−誘導した:
BALB/cマウスは、145の2C11(精製ハムスター抗マウスCD3モノクローナル抗体, PHARMINGEN)の10のAgの単一の静脈注射を注入した。化合物は、抗CD3 mAb注入に先立って腹腔内で60分処理した。血液は、抗体注入の後に90分集めた。血清を3000 rで遠心分離によって得た。
【0206】
IL−2およびIL−4のようなサイトカイニンあるいは他の分泌された分子の血清レベルは、ELISAによって決定した。CD3の下流のシグナリングを調節する蛋白質はこのモデル中で評価することができた。
【0207】
2. B細胞の活性に対する試験は、B細胞受容体の発現か活性を調節する試薬、あるいは、B細胞活性化/免疫グロブリンクラス・スイッチングに含まれる他の分子を評価するために使用した。マウス反免疫グロブリンDは免疫グロブリンE産生モデルを引き起こした。
マウス抗IgDはIgE産生モデルを誘導した:
BALB/cマウスは、精製されたヤギ抗マウス免疫グロブリンD抗体あるいはPBS(日0として定義された)の0.8mgを静脈内で注入した。化合物は、日0〜日6まで腹腔内で処理した。日に、7つの血液を集めた。また、血清は3000 rで遠心分離によって得られた。免疫グロブリンEの合計の血清レベルはYAMASAのELISAキットによって決定した。また、他のIgサブタイプはIg ELISA KIT(Rougier Bio−tech’s, Montreal, Canada)によって測定した。免疫グロブリンDの下流のシグナリングおよびIgクラス・スイッチングを調節する蛋白質は評価することができた。
【0208】
3. 単球/マクロファージの活性に対する試験は分子(転写要因)を示す発現か活性を調節する試薬を評価するために使用した。
【0209】
マウスはTNFa産生モデルをLPS−引き起こした:
化合物は腹腔内の注入によってBALB/cマウスに処理した、そして1時間後に、腹腔内の注入によってLPS(200およびug/マウス)を与えられたマウス。LPS注入およびプラズマが得られた90分後、血液が集めた。サンプル中のTNFa濃度はELISAキットを使用して決定した。NF−KB活性化のようなLPS刺激の影響を下流に調節する蛋白質は評価することができた。
【0210】
4. エオシン好性の細胞の活性に対する試験は分子、細胞骨格の分子あるいは付着分子を示して、エオトキシン受容体の発現か活性を調節する試薬を評価するために使用した。
【0211】
マウスは好酸球増加モデルをエオトキシン誘導した:
BALB/cマウスは、皮内に注入した、6および3日目に2.5mlのエアポーチを準備するために日0において、化合物を腹腔内処理した。また、30分後に、IL−5(300ナノグラム/マウス)は静脈内投与した。さらに30分の後に、エオタキシンは注入した(3 pg/マウス、i d)。エオタキシン注入の4時間後に、airpouch浸出物中の白血球を集めた。また、細胞の合計の数が数えられた。浸出物中の差異の細胞数はGrunwald Gimsaにより実行した。エオタキシン受容体によってシグナリングを調節するか、エオシン好性の売買を調節する蛋白質は評価することができた。
【0212】
5. ラットにおける受動皮膚アナフィラキシー(PCA)
6週齢、のオスのWistarラットに皮下投与し (i d)感作し、軽い麻酔下で0.1のug/mlマウス反DNP免疫グロブリンE単クローン抗体(SPE−7)の50 glで処理した。24時間の後に、ラットは、0.6mgのDNP−BSA(30)(LSL CO。LTD)を含有する食塩水の1mlおよびエヴァンスの0.005gで静脈内で投与した。化合物は、腹腔内で(i.p.)注入した。増感、抗原投与および合成の処理のないラットはコントロールとして使用した。また、感作、抗原投与をしたラットは阻止を決定するために使用した。抗原投与の30分後に、ラットを屠殺した。また、後部の皮膚を切除した。皮膚中のエヴァンスの青い染料は、63℃にて620nmの吸光度でフォルムアミドの中で一晩抽出した、その後、漏らされた染料の光学の密度を得るために測定した。
【0213】
化合物によるPCAの阻害パーセントは以下のように計算した:
%阻害={(平均媒質容量−試料容量)/(平均媒質値−平均対照値)}×100
ヒスタミン受容体、セロトニン受容体あるいはシステイニルロイコトリエン受容体に対する、マスト細胞顆粒減少、管の浸透性あるいは受容体敵を調節する100の蛋白質を評価することができた。
【0214】
6. ラットにおけるアナフィラキシー性気管支収縮
6週齢の雄性WistarラットにSPE−7で静脈内(i.v.)感作し、1日後に、ラットは、ウレタン(1000mg/kg、i.p.)およびガラニン(50mg/kg、i.v.)を添加した麻酔下の1.5mgのDNP−BSA(30)を含んでいる食塩水の0.3mlで静脈内で抗原投与した。カニューレは、人工呼吸(2ml/ストローク、70のストローク/分)のために気管に挿入した。肺の圧力(PI.P.)はカニューレの側面の腕を圧力変換器に接続し、記録した。PI.P.の変化は、抵抗および肺の従順の両方の変化を反映した。化合物を評価するために、化合物を抗原投与の5分前に投与した。
【0215】
ヒスタミン受容体、セロトニン受容体あるいはシステイニルロイコトリエン受容体に対する、マスト細胞顆粒減少、管の浸透性あるいは受容体敵を調節する蛋白質は評価することができた。平滑筋の短縮を調節する蛋白質も評価することができた。
【0216】
7. 平滑筋細胞あるいは内皮細胞へのT細胞吸着
T細胞の精製した集団は、羊赤血球で惹起し、抗体で覆われた磁気ビーズを使用して、ナイロンウールカラム上で分離した後ficoll密度遠心分離によって製造した。T細胞は36〜42時間有系分裂促進物質で活性化した。また、標識を活性化の最後の16時間間で3Hチミジンで付した。気道平滑筋細胞あるいは気管支の微小血管の内皮の細胞は、肺移植組織、癌患者からの気管支切除、死体、あるいは商業的な供給元からの細胞系として得た。新鮮な組織が細胞の源として使用される場合、1.7 mMをエチレングリコールで2度30−60分間消化した後、解剖によって平滑筋細胞および内皮の細胞を組織から分離したエチレングリコール−ビス−(ベータ−アミノエチルエーテル)−N、N’,N’−四酢酸、640のU/mLコラゲナーゼ、10mg/mlのダイズ豆トリプシン抑制剤および10のU/mLエラスターゼ。平滑筋細胞か内皮の細胞はコンフルエントまで24ウェル組織培養皿において培養した後、24時間TNFaのような試験化合物および炎症性のメディエーターで処理した。付着を測定するために、6つの×10 T細胞を加えらた。37個のC.Nonadherent細胞で1時間付着することが認められ、培地でで6回静かに洗うことにより除去した。最後に、残る付着細胞を、PBS中の300μLの1%トリトン−X 100を加えることにより溶解し、シンチレーション計数器で放射能の量を計った。付着細胞/合計から回収された計数値×100%として結合の百分率を計算した。
【0217】
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【図面の簡単な説明】
【図1】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号1)を示す。
【図2】図1のDNA配列から推定されるアミノ酸配列(配列番号2)を示すを示す。
【図3】受託番号AJ13532によって同定されるタンパク質のアミノ酸配列(配列番号3)を示す。
【図4】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号4)を示す。
【図5】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号5)を示す。
【図6】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号6)を示す。
【図7】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号7)を示す。
【図8】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号8)を示す。
【図9】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号9)を示す。
【図10】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号10)を示す。
【図11】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号11)を示す。
【図12】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号12)を示す。
【図13】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号13)を示す。
【図14】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするアミノ酸配列(配列番号14)を示す。
【図15】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号14)を示す。
【図16】樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするDNA配列(配列番号15)を示す。
【図17】273_genwisedbおよびpdb|1DV8|1DV8−A間のBLASTPアライメントを示す。
【図18】273_genwisedbおよびhmm|lectin_c間のHMMPFAMアライメントを示す。

Claims (71)

  1. 樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドであって、
    a)配列番号2に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;
    配列番号2に示すアミノ酸配列;
    配列番号15に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列;および
    配列番号15に示すアミノ酸配列
    から成る群より選択されるアミノ酸配列を含む樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
    b)配列番号1または14に記載の配列を含むポリヌクレオチド;
    c)(a)および(b)に明記するポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド;
    d)遺伝コードの縮重のため、その配列が(a)〜(c)に明記するポリヌクレオチド配列から逸脱しているポリヌクレオチド;並びに
    e)(a)〜(d)に明記するポリヌクレオチド配列の断片、誘導体またはアレル変異体を表すポリヌクレオチド、
    から成る群より選択されるポリヌクレオチド。
  2. 請求項1に記載の任意のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
  3. 請求項2に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
  4. 請求項1に記載のポリヌクレオチドによってコードされている、実質上精製された樹状細胞免疫受容体ポリペプチド。
  5. a)請求項3に記載の宿主細胞を、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドの発現に好適な条件下で培養する工程;および、
    b)該宿主細胞培養から樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを回収する工程、
    を含む、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを産生する方法。
  6. a)請求項1に記載の任意のポリヌクレオチドを生物試料の核酸材料とハイブリダイズさせ、それによりハイブリダイゼーション複合体を形成させる工程;および、
    b)該ハイブリダイゼーション複合体を検出する工程、
    を含む、生物試料中の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを検出するための方法。
  7. ハイブリダイゼーション前に、生物試料の核酸材料を増幅させる、請求項6に記載の方法。
  8. 生物試料を、請求項1に記載のポリヌクレオチドまたは請求項4に記載の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと特異的に相互作用する試薬と接触させる工程を含む、請求項1に記載のポリヌクレオチドまたは請求項4に記載の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドを検出するための方法。
  9. 請求項6〜8のいずれかに記載の方法を実施するための診断キット。
  10. 被験化合物を、請求項1に記載の任意のポリヌクレオチドによってコードされている任意の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと接触させる工程;
    該樹状細胞免疫受容体ポリペプチドに対する被験化合物の結合を検出する工程、
    を含む樹状細胞免疫受容体の活性を低下させる物質をスクリーニングする方法であって、該ポリペプチドと結合する被験化合物を、樹状細胞免疫受容体の活性を低下させる可能性のある治療物質として同定する方法。
  11. 被験化合物を、請求項1に記載の任意のポリヌクレオチドによってコードされる樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと接触させる工程;および、
    該ポリペプチドの樹状細胞免疫受容体活性を検出する工程、
    を含む樹状細胞免疫受容体の活性を調節する物質をスクリーニングする方法であって、樹状細胞免疫受容体活性を増大させる被験化合物を樹状細胞免疫受容体の活性を増大させる可能性のある治療物質として同定し、そして該ポリペプチドの樹状細胞免疫受容体活性を減少させる被験化合物を樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる可能性のある治療物質として同定する方法。
  12. 被験化合物を、請求項1に記載の任意のポリヌクレオチドと接触させ、該ポリヌクレオチドに対する被験化合物の結合を検出する工程を含む、樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる物質をスクリーニングする方法であって、該ポリヌクレオチドに結合する被験化合物を樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる可能性のある治療物質として同定する方法。
  13. 細胞を、請求項1に記載の任意のポリヌクレオチドまたは請求項4に記載の任意の樹状細胞免疫受容体ポリペプチドと特異的に結合する試薬と接触させ、それにより樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる工程を含む、樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる方法。
  14. 請求項10〜12のいずれかに記載の方法によって同定される、樹状細胞免疫受容体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドの活性を調整する試薬。
  15. 請求項2に記載の発現ベクターまたは請求項14に記載の試薬および製薬的に許容し得る担体、を含む医薬組成物。
  16. 疾患において樹状細胞免疫受容体の活性を調整する医薬の製造のための、請求項2に記載の発現ベクターまたは請求項14に記載の試薬能使用。
  17. 該疾患が、癌、喘息、肥満、糖尿病、CNS障害あるいは心臓血管障害である、請求項16に記載の使用。
  18. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするcDNA。
  19. 配列番号1または14を含む、請求項18に記載のcDNA。
  20. 配列番号1または14から成る、請求項18に記載のcDNA。
  21. 配列番号2に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
  22. 該ポリヌクレオチドが配列番号1または14から成る、請求項21に記載の発現ベクター。
  23. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする発現ベクターを含む宿主細胞。
  24. 該ポリヌクレオチドが配列番号1または14から成る、請求項23に記載の宿主細胞。
  25. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含む精製されたポリペプチド。
  26. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列から成る、請求項25に記載の精製されたポリペプチド。
  27. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む融合タンパク質。
  28. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする発現ベクターを含む宿主細胞を、該ポリペプチドが発現される条件下で培養し;そして該ポリペプチドを単離する工程を含む、該ポリペプチドを産生する方法。
  29. 該発現ベクターが配列番号1または14を含む、請求項28に記載の方法。
  30. 配列番号1または14に記載の11個の連続ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドを、生物試料の核酸材料とハイブリダイズさせ、それによりハイブリダイゼーション複合体を形成させ;そして、該ハイブリダイゼーション複合体を検出する工程を含む、配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドのコード配列を検出する方法。
  31. ハイブリダイズさせる工程の前に、該核酸材料を増幅させる工程をさらに含む、請求項30に記載の方法。
  32. 配列番号1または14に記載の11個の連続するヌクレオチドを含むポリヌクレオチド;および、
    請求項30に記載の方法についての説明書、
    を含む、配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドのコード配列を検出するためのキット。
  33. 生物試料を、配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドと特異的に結合する試薬と接触させて、試薬−ポリペプチド複合体を形成させる工程;および、
    該試薬−ポリペプチド複合体を検出する工程、
    を含む、該ポリペプチドを検出する方法。
  34. 該試薬が抗体である、請求項33に記載の方法。
  35. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドと特異的に結合する抗体;および
    請求項33に記載の方法についての説明書、
    を含む、該ポリペプチドを検出するためのキット。
  36. 被験化合物を、(1)配列番号2または15に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列、および(2)配列番号2または15に示すアミノ酸配列、から成る群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドと接触させる工程;および
    該ポリペプチドに対する被験化合物の結合を検出する工程、
    を含むヒト樹状細胞免疫受容体の活性を調整することができる物質をスクリーニングする方法であって、該ポリペプチドに結合する被験化合物をヒト樹状細胞免疫受容体の活性を調節する可能性のある物質として同定する方法。
  37. 接触させる工程が細胞においてである、請求項36に記載の方法。
  38. 細胞がインビトロである、請求項36に記載の方法。
  39. 接触させる工程が無細胞系においてである、請求項36に記載の方法。
  40. 該ポリペプチドが検出可能な標識を含む、請求項36に記載の方法。
  41. 被験化合物が検出可能な標識を含む、請求項36に記載の方法。
  42. 被験化合物が該ポリペプチドと結合している標識化リガンドに取って代わる、請求項36に記載の方法。
  43. 該ポリペプチドが固体支持体と結合している、請求項36に記載の方法。
  44. 被験化合物が固体支持体と結合している、請求項36に記載の方法。
  45. 被験化合物を、(1)配列番号2または15に示すアミノ酸配列と少なくとも約30%一致するアミノ酸配列、および、(2)配列番号2または15に示すアミノ酸配列、から成る群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドと接触させる工程;および
    該ポリペプチドの活性を検出する工程、
    を含むヒト樹状細胞免疫受容体の活性を調整する物質をスクリーニングする方法であって、該ポリペプチドの活性を増大させる被験化合物をヒト樹状細胞免疫受容体の活性を増大させる可能性のある物質として同定し、該ポリペプチドの活性を減少させる被験化合物をヒト樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる可能性のある物質として同定する方法。
  46. 接触させる工程が細胞においてである、請求項45に記載の方法。
  47. 細胞がインビトロである、請求項45に記載の方法。
  48. 接触させる工程が無細胞系においてである、請求項45に記載の方法。
  49. 被験化合物を、配列番号1または14に示すヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドによってコードされる産物と接触させる工程;および
    該産物に対する被験化合物の結合を検出する工程、
    を含むヒト樹状細胞免疫受容体の活性を調整する物質をスクリーニングする方法であって、該産物に結合する被験化合物をヒト樹状細胞免疫受容体の活性を調節する可能性のある物質として同定する方法。
  50. 該産物がポリペプチドである、請求項49に記載の方法。
  51. 該産物がRNAである、請求項49に記載の方法。
  52. 細胞を、配列番号1または14に示すヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドによってコードされる産物と特異的に結合する試薬と接触させ、それによりヒト樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる工程を含む、ヒト樹状細胞免疫受容体の活性を減少させる方法。
  53. 該産物がポリペプチドである、請求項52に記載の方法。
  54. 該産物が抗体である、請求項53に記載の方法。
  55. 該産物がRNAである、請求項52に記載の方法。
  56. 該試薬がアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項55に記載の方法。
  57. 該試薬がリボザイムである、請求項56に記載の方法。
  58. 細胞がインビトロである、請求項52に記載の方法。
  59. 細胞がインビボである、請求項52に記載の方法。
  60. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドと特異的に結合する試薬;および製薬的に許容し得る担体、を含む医薬組成物。
  61. 該試薬が抗体である、請求項60に記載の医薬組成物。
  62. 配列番号1または14に示すヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドの産物と特異的に結合する試薬;および製薬的に許容し得る担体、を含む医薬組成物。
  63. 該試薬がリボザイムである、請求項62に記載の医薬組成物。
  64. 該試薬がアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項62に記載の医薬組成物。
  65. 該試薬が抗体である、請求項62に記載の医薬組成物。
  66. 配列番号2または15に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする発現ベクター;および製薬的に許容し得る担体、を含む医薬組成物。
  67. 該発現ベクターが配列番号1または14を含む、請求項66に記載の医薬組成物。
  68. 癌、喘息、肥満、糖尿病、CNS障害あるいは心臓血管障害より選択される樹状細胞免疫受容体機能障害関連疾患を処置する方法であって、それを必要とする患者に、ヒト樹状細胞免疫受容体の機能を調整する試薬の治療的有効量を投与し、それにより樹状細胞免疫受容体機能障害関連疾患の症状を回復させる工程を含む方法。
  69. 該試薬が請求項36に記載の方法によって同定される、請求項68に記載の方法。
  70. 該試薬が請求項45に記載の方法によって同定される、請求項68に記載の方法。
  71. 該試薬が請求項49に記載の方法によって同定される、請求項68に記載の方法。
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