JP2003061677A

JP2003061677A - 全身性エリテマトーデスの感受性遺伝子およびその使用

Info

Publication number: JP2003061677A
Application number: JP2001258494A
Authority: JP
Inventors: Katsushi Tokunaga; 勝士徳永; Naoyuki Tsuchiya; 尚之土屋
Original assignee: Olympus Optical Co Ltd
Current assignee: Olympus Corp
Priority date: 2001-08-28
Filing date: 2001-08-28
Publication date: 2003-03-04

Abstract

(57)【要約】【課題】全身性エリテマトーデスの感受性遺伝子、こ
の感受性遺伝子を用いて全身性エリテマトーデスの発症
危険率を予測する方法および装置を提供する。【解決手段】以下の群より選択される新規多型遺伝
子：（１）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞Ｔ；（２）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ
＞Ｔ；（３）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）_{１２−１８}；および（４）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５Ｔ＞Ｃ。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【発明の属する技術分野】本発明は、リウマチ性疾患の
感受性遺伝子に関する。特に、日本人における全身性エ
リテマトーデス（以下、ＳＬＥと称す）の発症に関連す
る感受性遺伝子に関する。また、当該感受性遺伝子を用
いてＳＬＥの発症危険率を予測する方法に関する。

【０００２】

【従来の技術】慢性関節リウマチ（以下、ＲＡと称す）
や全身性エリテマトーデス（以下、ＳＬＥと称す）に代
表されるリウマチ性疾患は、全身の主要臓器に難治性の
慢性炎症をきたす自己免疫疾患である。

【０００３】ＲＡは、全身の関節の破綻をきたす頻度の
高い疾患である。その病態の特徴は、関節包を裏打ち
し、関節腔を覆う数層の細胞からなる滑膜の異常増殖と
慢性炎症、それに伴う骨および／または軟骨吸収であ
る。また、全人口における有病率は０．５から１．０％
である(文献1参照)。３０から４０歳代の女性に初発す
ることが多く、罹患の男女比はおおよそ１：４である。
第一度近親にリウマチの患者がいる場合には、その人が
将来罹患する確率は、そうでない人に比べ４から８倍高
いと言われる(文献2参照)。更に、双生児における発症
の一致率は一卵性で１２％、二卵性で４％(文献3-5参
照)と差があることから、遺伝的要素の関与が強く示唆
される。

【０００４】ＳＬＥは、ＲＡに比べると頻度が低く、そ
の有病率は０．０１から０．１０％程度である。１０か
ら３０歳代の女性に初発することが多い疾患であり、男
女比は１：９である。自己の細胞中の核や細胞質成分に
対する自己抗体の出現を伴う全身性の免疫反応により、
全身の各臓器や血球形が侵される。これまでに、ＳＬＥ
の患者同胞の罹患率が一般に比べ約２０から４００倍と
高いことや、双生児研究によって一卵性双生児が二卵性
のものに比べておよそ１２倍リスクが高いことが報告さ
れているおり(文献6参照)、ＳＬＥはＲＡよりも更に強
い遺伝的な影響が疑われる。

【０００５】以上のように、リウマチ性疾患の発症に何
らかの遺伝要因が関与することには疑問の余地はない
が、一卵性双生児における発症一致率が１００％よりか
なり低いことや、家族集積例におけるメンデル遺伝様式
も見られないことから、リウマチ性疾患の発症には、複
数の遺伝要因と環境要因、更には遺伝子再編成などの免
疫学的な後天的要因の相互作用が関与することが示唆さ
れる。即ち、リウマチ性疾患は多因子疾患であると考え
られる。しかしながら、その発症に関与する遺伝要因は
未だに十分には解明されていない。

【０００６】一方、ＣＤ１９は、Ｂ細胞の分化、活性化
および増殖を調節する分子である。ＣＤ１９の欠損およ
び過剰発現は、夫々、低ガンマグロブリン血症および自
己抗体産生の原因となることがマウスにおいて証明され
ている。ヒトＣＤ１９遺伝子は、１６ｐ１１．２の遺伝
子座に位置し、慢性関節リウマチ（以下、ＲＡと称す）
とクローン病（以下、ＣＤと称す）の候補遺伝子座の１
つであると示唆されている。

【０００７】ＣＤ１９遺伝子は、Ｂリンパ球に特異的な
９５ｋＤａの遺伝子であり、Ｈ鎖再編成時からプラズマ
細胞分化までの早期のプレＢ細胞により発現される免疫
グロブリン遺伝子スーパーファミリーに属する(文献7-9
参照)。また、ＣＤ１９分子は、Ｂ細胞表面のＣＤ２
１、ＣＤ１８およびＬｅｕ１３と結合して、Ｂ細胞共受
容体複合体を形成し、Ｂ細胞受容体(BCR)のシグナルを
調節する。

【０００８】現在、ＣＤ１９分子のリガンドは同定され
てはいないが、ＣＤ１９のシグナルは、活性化された該
補体成分の断片Ｃ３ｄのＣＤ２１に対する結合の結果と
して、ＣＤ１９のシグナルが生じ得ると考えられる。こ
れは、ＣＤ２１が補体第３成分（以下、Ｃ３と記す）切
断フラグメントの受容体であり、抗原−Ｃ３ｄ複合体は
ＣＤ２１を介してＢ細胞に結合することに起因すると考
えられる。

【０００９】また、ＣＤ１９は、ＣＤ４０(文献10参
照)、ＣＤ３８(文献11参照)、ＣＤ７２(文献10参照)、
ＶＬＡ４(文献12参照)およびＦｃγＲＩＩＢ(文献13,14
参照)を含む他の幾つかの細胞表面受容体のシグナル伝
達のパートナーとして影響を与える。遺伝子ターゲティ
ングマウスまたはトランスジェニックマウスにおいて細
胞表面でのＣＤ１９の密度を変化させると、Ｂ細胞の機
能に顕著な影響が生じることが示されている。ＣＤ１９
欠失(CD19^-/-)マウスからのＢ細胞は、膜貫通シグナル
に対して低反応性であり、分化、活性化の異常を示す
(文献15-21参照)。これに対して、トランスジェニック
マウスにおけるＣＤ１９の過剰発現は、膜貫通シグナル
に対して過反応性であり、且つ体液性の免疫反応の上昇
したＢ細胞を生じる。また、そのようなマウスは、おそ
らく骨髄における高い負の選択により生じると考えられ
る末梢プールにおけるＢ細胞数の減少を示す。加えて、
抗二本鎖（ｄｓ）ＤＮＡ抗体およびリウマトイド因子を
含む自己抗体の産生も観察される（文献15、17-20、22、23
参照）。このように、ＣＤ１９は、末梢のＢ細胞プール
の増殖のための重要なシグナル閾値を調節するための、
いわば分子として機能するようである(文献24参照)。

【００１０】ＣＤ１９の２４０アミノ酸の細胞質領域
は、９つの保存されたチロシン残基を含み(文献8参
照)、ＢＣＲおよび／またはＣＤ１９のライゲーション
に続くそのリン酸化は、当該細胞表面に対して調節分子
を供給するＳｒｃホモロジー(SH2)認識モチーフを提供
する。Ｌｙｎ、ＦｙｎおよびＬｃｋタンパクチロシンキ
ナーゼ(PTKs)、並びにプロトオンコジーンＶａｖは、Ｃ
Ｄ１９と相互作用する。また、ＣＤ１９は、ホスファチ
ジルイノシトール３−キナーゼ(PI3-キナーゼ)とも相互
作用する(文献25参照)。ＰＩ３−キナーゼは、シグナル
下流の多くのエフェクター分子の膜局在化および活性化
を調節する。

【００１１】現在、自己免疫疾患の発症は多くの遺伝的
要因を含むという仮説に従って、ゲノムワイドなスクリ
ーニングから示唆された感受性候補遺伝子座が多くの染
色体領域においてマッピングされている。特に、ＲＡま
たはクローン病の候補領域は１６ｐ１１．２を含み、そ
こにはＣＤ１９をコードする遺伝子も含まれる(文献26,
27参照)。加えて、ＳＬＥ患者におけるＢ細胞は、活性
化されていると考えられる(文献28参照)。興味深いこと
に、Ｂ細胞におけるＣＤ１９発現のレベルは、抗核抗体
に関連する全身性自己免疫疾患の１つである、全身硬化
を伴う患者において約２０％高いことが示されている
(文献29参照)。

【００１２】一方、ゲノムワイドな連鎖解析により、染
色体領域１ｑ２３がヒトＳＬＥの候補領域(文献30,31参
照)、およびマウスループスエリテマトーデスにおける
そのシンテニー領域(文献32参照)であることが示唆され
た。３つのＦｃγＲＩＩ遺伝子(即ち、FCGR2A,2Bおよび
2C)と２つのＦＣγＲＩＩＩ遺伝子(即ち、FCGR3Aおよび
3B)は１ｑ２３における約２００ｋｂの領域にマッピン
グされており(文献33-36参照)、ＳＬＥの感受性遺伝子
候補と見なされている。種々の集団におけるＦｃγＲｓ
多型とＳＬＥとの関連性は、広範に研究されており、Ｆ
ｃγＲＩＩＡ−１３１Ｈ／Ｒ、ＦｃγＲＩＩＩＡ−１７
６Ｆ／ＶおよびＦｃγＲＩＩＩＢ−ＮＡ１／２多型が一
部の人類集団でＳＬＥと関連していることが示された
(文献38,40参照)。しかしながら、その結果は、異なる
遺伝子背景を有する集団においては矛盾するものであ
り、この染色体領域における他の遺伝子がＳＬＥと主に
関連する可能性を示唆している。

【００１３】ＦＣγＲ２Ｂは、ＦｃγＲファミリーの中
で唯一、免疫レセプターチロシン基抑制性モチーフ（IT
IMとも記す）をコードする遺伝子であり、Ｂ細胞および
骨髄単球細胞における抑制性シグナルを伝達する能力を
有している(文献39参照)。マウスにおけるＦｃγＲＩＩ
Ｂの欠失は、コラーゲン誘導関節炎およびグットパスチ
ャー症候群等の自己免疫疾患と関連性があることが最近
になって示されている(文献41,42参照)。更にその上、
抗核抗体と糸球体腎炎の自然発生的な進展が、Ｃ５７Ｂ
Ｌ／６マウスの背景にＦｃγＲＩＩＢ欠失を導入した場
合に報告されている(文献43参照)。（ＮＺＢ × ＮＺ
Ｗ）Ｆ１マウス(文献44参照)および他の自己免疫傾向マ
ウス(文献45参照)の脾臓胚中心のＢ細胞におけるＦｃγ
ＲＩＩＢ発現レベルの低下と関連し、ＩｇＧ抗体産生の
異常な亢進を誘導することが報告された。加えて、互い
に連鎖不平衡にある翻訳領域内の４つのＳＮＰｓがｌｕ
ｐｕｓ−ｐｒｏｎｅマウス系ではＦｃγＲＩＩＢの感受
性の対立遺伝子を形成することも示された。これらの発
見は、ＦＣＧＲ２Ｂが、染色体領域１ｑ２３におけるヒ
トＳＬＥに対する主な感受性遺伝子であり得ることを提
起するものである。

【００１４】これまでのところ、以上のようなＳＬＥお
よび免疫機能に関連する種々の分子に関する部分的な知
見が報告されるのみであって、ＳＬＥに感受性のある遺
伝子的な要因に関する具体的な報告はなされてはいな
い。

【００１５】

【発明の解決しようとする課題】このような状況に鑑
み、本発明は、全身性エリテマトーデスの感受性遺伝子
を提供することと、当該感受性遺伝子を用いて全身性エ
リテマトーデスの発症危険率を予測する方法を提供する
ことである。

【００１６】

【課題を解決するための手段】本発明者らは、代表的リ
ウマチ性疾患、特に、全身性エリテマトーデス（ＳＬ
Ｅ）の病因および病態を解明するために、病態上の重要
性、正常組織と病変組織のｍＲＮＡ発現プロファイリン
グ、連鎖解析の成果、動物モデルからの情報などに基づ
いて、設定した多数の候補遺伝子の変異解析を系統的に
行い、疾患との関連性を解析した。このような鋭意研究
の結果、以下のような解決手段を見出した。

【００１７】即ち、本願発明は、１．以下の群より選択される少なくとも１の新規多型
遺伝子：（１）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞Ｔ；（２）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ
＞Ｔ；（３）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）_{１２−１８}；および（４）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５Ｔ＞Ｃ。

【００１８】２．以下を具備する対象における全身性
エリテマトーデスの発症危険率を予測する方法；（１）対象からのゲノムＤＮＡサンプルを準備するこ
と；（２）得られたゲノムＤＮＡサンプルについて以下の少
なくとも１の多型の遺伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；並びに（３）前記（２）で選択された多型が前記（ｄ）の多型
であり、且つ該遺伝子型がコドン２３２Ｔ／Ｔを生じる
ような多型である場合には、更に（ｅ）ヒト白血球ＨＬ
Ａ−ＤＲＢ１^＊１５０１の有無を決定すること；（４）前記（２）および（３）において決定された遺伝
子型を基にＳＬＥの発症危険率を判定することにより対
象における全身性エリテマトーデスの発症危険率を予測
すること。

【００１９】３．コンピュータを利用した対象におけ
る全身性エリテマトーデスの発症危険率を予測する装置
であって、以下を具備する装置；（１）ゲノムＤＮＡを精製するための装置；（２）前記（１）で精製されたゲノムＤＮＡについて、
以下からなる群より選択される少なくとも１の多型の遺
伝子型を決定するための装置（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；および（３）上記（２）に記載の多型の遺伝子型に対して所定
のスコアが対応させられているスコアテーブルを記憶す
る記憶手段；並びに（４）（２）で決定された遺伝子型を基に前記（３）の
記憶手段に記憶される前記スコアテーブルを検索して、
対応する得点データを抽出し、抽出された前記スコアデ
ータの全て、および前記スコアの合計得点を出力する手
段。

【００２０】４．コンピュータを利用した対象におけ
る全身性エリテマトーデスの発症危険率を予測する装置
であって、以下を具備する装置；（１）以下からなる群より少なくとも１で選択された全
身性エリテマトーデス感受性多型遺伝子；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞Ｔ；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ
＞Ｔ；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）_{１２−１８}；および（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５Ｔ＞Ｃの遺伝子型に対して所定のスコアが対応させられている
スコアテーブルを記憶する記憶手段；並びに（２）選択された多型について決定された遺伝子型を基
に前記（１）の記憶手段に記憶されたスコアテーブルを
検索して、対応する得点データを抽出し、抽出された前
記スコアデータの全て、および前記スコアの合計得点を
出力する手段。

【００２１】５．コンピュータに、（１）得られたゲノムＤＮＡサンプルについて以下の少
なくとも１の多型の遺伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；並びに（２）前記（１）で選択された多型が前記（ｄ）の多型
であり、且つ該遺伝子型がコドン２３２Ｔ／Ｔを生じる
ような多型である場合には、更に（ｅ）ヒト白血球ＨＬ
Ａ−ＤＲＢ１^＊１５０１の有無を決定すること；（３）前記（１）および（２）において決定された遺伝
子型を基にＳＬＥの発症危険率を判定することにより対
象における全身性エリテマトーデスの発症危険率を予測
すること；を実行させるためのプログラム。

【００２２】６．コンピュータに（１）ゲノムＤＮＡを精製すること；（２）前記（１）で精製されたゲノムＤＮＡについて、
以下からなる群より選択される少なくとも１の多型の遺
伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；および（４）（２）で決定された遺伝子型を基に、上記（２）
に記載の多型の遺伝子型に対して所定のスコアが対応さ
せられているスコアテーブルを記憶する記憶手段に記憶
される該スコアテーブルを検索して、対応する得点デー
タを抽出し、抽出された前記スコアデータの全て、およ
び前記スコアの合計得点を出力すること；（５）（４）で得られた合計得点から対象における全身
性エリテマトーデスの発症危険率を予測すること；を実
行させるためのプログラム。

【００２３】７．対象における全身性エリテマトーデ
スの発症危険率を予測する方法であって、以下を具備す
る方法。

【００２４】（１）ゲノムＤＮＡを精製すること；（２）前記（１）で精製されたゲノムＤＮＡについて、
以下からなる群より選択される少なくとも１の多型の遺
伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；および（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；（４）（２）で決定された遺伝子型を基に、上記（２）
に記載の多型の遺伝子型に対して所定のスコアが対応さ
せられているスコアテーブルを検索して、対応する得点
データを抽出し、抽出された前記スコアデータの全て、
および前記スコアの合計得点を出力すること；並びに（５）（４）で得られた合計得点から対象における全身
性エリテマトーデスの発症危険率を予測することであ
る。

【００２５】

【発明の実施の形態】本発明は、本発明者らが、Ｂ細胞
においてＢ細胞の活性化を制御する分子であるＣＤ１９
とＦｃγＲ２Ｂ受容体がＳＬＥ発症に関連する可能性が
あるというこれまでの知見を基に、ＣＤ１９およびＦｃ
γＲ２Ｂ受容体の遺伝子における変異を検出し、検出さ
れた変異とＳＬＥ発症との関連を解析し、それによりＳ
ＬＥ感受性遺伝子を初めて同定したことによって達成さ
れた。

【００２６】１．用語の説明ここで使用される「感受性遺伝子」(susceptibility ge
ne)とは、ＳＬＥの発症危険率を左右する発症関連遺伝
子をいう。ここで使用される「ＳＬＥの発症危険率」と
は、ＳＬＥの発症の危険性の相対的な度合いを示す。

【００２７】ここにおいて「多型遺伝子」とは、１つの
遺伝子座を占める複数種の対立遺伝子群、又はこのよう
な対立遺伝子群に属する個々の対立遺伝子を指称するも
のとする。また、多型部位の中で１塩基のみが異なるも
のは、特に「単塩基多型」（Single Nucleotide Polymo
rphism、以後、SNPと称する）と指称する。また、ここ
で使用する「遺伝子型」の語は、注目している遺伝子座
の対立遺伝子の存在状態を示す。

【００２８】ここで使用される「ポリヌクレオチド」の
語は、便宜的にポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオ
チド等を総括した意味で用いる｛ここで「オリゴヌクレ
オチド」とは、数個から数十個のヌクレオシドのリン酸
エステル(即ち、ヌクレオチド)がホスホジエステル結合
で重合した物質を意味し、オリゴリボヌクレオチドとオ
リゴデオキシリボヌクレオチドとが含まれるが、これに
限定されるものではない。また、ここで「ポリヌクレオ
チド」とは、２以上のヌクレオシドがリン酸エステル結
合によって結合されてなる物質を意味する｝。ヌクレオ
シドには、デオキシリボヌクレオシドおよびリボヌクレ
オシドが含まれるが、これに限定されない。更に、本発
明において「ポリヌクレオチド」とは、ペプチド核酸、
モルホリノ核酸、メチルフォスフォネート核酸、Ｓ-オ
リゴ核酸などの人工合成核酸も指称するものとする。

【００２９】２．多型とＳＬＥ発症との関連（１）ＣＤ１９遺伝子ＣＤ１９遺伝子における多型のスクリーニングは、１本
鎖ＤＮＡ高次構造多型ＰＣＲ（ＰＣＲ−ｓｉｎｇｌｅ
ｓｔｒａｎｄｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｐｏｌｙｍ
ｏｒｐｈｉｓｍ；以下ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法と略す）と直
接シーケンス法を用いて行った。更に、検出された多型
の疾患に対する関連性を、日本人集団におけるケースコ
ントロール関連解析法（ｃａｓｅ−ｃｏｎｔｒｏｌａ
ｓｓｏｃｉａｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓ）によって解
析した。

【００３０】その結果、本発明者らはＣＤ１９遺伝子に
おける６つの新規多型を同定し、更に、同定された多型
のうちの３つの多型にＳＬＥ発症との関連性が存在する
ことを明らかにした。以下、発明者により新たに同定さ
れ、且つＳＬＥ発症との関連が明かとなった３つの多
型、即ち、ｃ．７０５Ｇ＞Ｔ(P235P)、ＩＶＳ１４−３
０Ｃ＞Ｔ、およびｃ．^＊１３２（ＧＴ）_{１２−１８}につ
いて説明する。

【００３１】ここで使用される「ｃ．７０５Ｇ＞Ｔ」の
語は、ＣＤ１９遺伝子の翻訳領域の７０５位に存在する
ＳＮＰにおいて存在し得る遺伝子型、即ち、チミン（Ｔ
と略す）およびグアニン（Ｇと略す）のうちの遺伝子型
Ｔの遺伝子を示す。また、これらの遺伝子型のうち、従
来から一般的に知られている配列における当該位置の塩
基はＧである。ｃ．７０５の遺伝子型がＴである場合
に、ホモ接合体であってもヘテロ接合体であっても、Ｓ
ＬＥを発症する危険性が低い（即ち、低危険率遺伝子型
である）。また、本多型においては、Ｇの場合であって
もＴの場合であっても、相当するコドンの２３５位のア
ミノ酸はプロリン（Ｐと略す）であり、同義置換であ
る。ここで使用される「ｃ．７０５Ｔ」は該遺伝子の対
立遺伝子ｃ．７０５が遺伝子型Ｔであることを示す。

【００３２】ここで使用される「ＩＶＳ１４−３０Ｃ＞
Ｔ」の語は、ＣＤ１９遺伝子の転写開始部位から数えて
１４番目のイントロン領域の３０位に存在するＳＮＰに
おいて存在しうる遺伝子型、即ち、シトシン（Ｃと略
す）とチミン（Ｔと略す）のうちの遺伝子型Ｔの遺伝子
を示す。また、これらの遺伝子型のうち、従来から一般
的に知られている配列における当該位置の塩基はＣであ
る。ＩＶＳ１４−３０の遺伝子型がＴである場合に、ホ
モ接合体であってもヘテロ接合体であっても、ＳＬＥを
発症する危険率が低い。ここで使用される「ＩＶＳ１４
−３０Ｔ」は該遺伝子の対立遺伝子ＩＶＳ１４−３０が
遺伝子型Ｔであることを示す。

【００３３】また、対立遺伝子ｃ．７０５およびＩＶＳ
１４−３０は、連鎖不平衡で結ばれるハプロタイプの関
係にある。従って、どちらか一方が存在すれば残る他方
も存在する可能性は非常に高い。従って、何れかを検出
することにより、患者におけるＳＬＥ発症の危険率を予
測することが可能である。

【００３４】ここで使用される「ｃ．^＊１３２（ＧＴ）
_{１２−１８}」の語は、ＣＤ１９の非翻訳領域（即ち、
３’ＵＴＲ）の１３２位に対応するゲノムＤＮＡにおけ
る１２回から１８回のＧＴ反復の多型を示す。この反復
回数が１５回以上に伸長されている個体の場合、ＳＬＥ
発症の危険率は高い。このような関連は、ＲＡおよびク
ローン病においては観察されなかった。「ｃ．^＊１３２
（ＧＴ）_１５−」は該遺伝子座のマイクロサテライト多
型の反復回数が１５以上である遺伝子を示す。

【００３５】これらの多型は平成１２年１２月１９日に
ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ／ＤＤＢＪに登録番号ＡＢ０
５７９９、ＡＢ０５２８１４、ＡＢ０５２８１５、ＡＢ
０５２８１６、ＡＢ０５２８１７およびＡＢ０５２８１
８として発明者らにより登録された。

【００３６】（２）Ｆｃγ受容体ＩＩＢ（ＦＣＧＲ２Ｂ
遺伝子）ヒト低親和性Ｆｃγ受容体遺伝子群は、ＦｃγＲＩＩ
Ａ、ＩＩＢ、ＩＩＣ、ＩＩＩＡおよびＩＩＩＢからなる
遺伝子ファミリーを構成し、染色体１ｑ２３領域に位置
する。それらは、リガンド親和性、細胞の分布およびエ
フェクター機能(文献37,38参照)において互いに異な
る。特に、ＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインにお
ける免疫レセプターチロシン基抑制性モチーフ（ＩＴＩ
Ｍ）を介しての抑制性シグナルを伝達する能力において
ユニークである。

【００３７】今回、発明者らは、ヒトＦＣＧＲ２Ｂ遺伝
子における新規のＳＮＰ、即ち、ｃ．６９５Ｔ＞Ｃを同
定し、その多型の遺伝子型とＳＬＥとの関連性を明らか
にした。ｃ．６９５Ｔ＞Ｃはエクソン５に位置する多型
である。

【００３８】ここで使用される「ｃ．６９５Ｔ＞Ｃ」の
語は、ヒトＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子の翻訳領域の６９５位に
存在するＳＮＰにおいて存在し得る遺伝子型、即ち、Ｔ
およびＣのうちの遺伝子型Ｃの遺伝子を示す。また、こ
れらの遺伝子型のうち、従来から一般的に知られている
配列における当該位置の塩基はＴであることを示す。こ
こで使用される「ｃ．６９５Ｃ」は該遺伝子の対立遺伝
子ｃ．６９５が遺伝子型Ｃであることを示す。

【００３９】また、この多型は、Ｆｃγ受容体ＩＩＢの
膜貫通ドメインにおけるコドン２３２の位置に２つの対
立遺伝子を与える。即ち、遺伝子型がＣの場合には、コ
ドン２３２はトレオニン（ＴｈｒまたはＴと略す）、即
ち、２３２Ｔ、がコードされる。一方、遺伝子型がＴの
場合には、コドン２３２はイソロイシン（Ｉｌｅまたは
Ｉと略す）、即ち、２３２Ｉ、がコードされる。

【００４０】ＳＬＥ患者における２３２Ｔ／Ｔ遺伝子型
を有する個体は、健常者と比較して顕著に多い。即ち、
２つの対立遺伝子の該多型の遺伝子型が共にＣのホモ接
合体である場合にＳＬＥの発症危険率が高い。

【００４１】また、強い連鎖不平衡が、ＦｃγＲＩＩＢ
−２３２Ｉ／ＴとＦｃγＲＩＩＩＢ−ＮＡ１／２多型の
間において検出されたが、その関連性の強さの比較によ
り、ＳＬＥとの関連においては、上記のＦＣＧＲ２Ｂの
多型が第一義の感受性遺伝子であると考えられた。また
更に、相乗作用効果がＦＣＧＲ２Ｂ２３２Ｔ／Ｔ遺伝
子型と、ＨＬＡ−ＤＲＢ１^＊１５０１との間に存在する
ようである。自己免疫の調節におけるＦｃγＲＩＩＢの
役割を証明する最近の動物実験の結果を考え合わせる
と、本研究は、ヒトＳＬＥに対する遺伝子感受性におけ
るＦｃγＲＩＩＢの役割を強力に示唆するものである。

【００４２】本発明者らが決定したＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子
における多型は、登録番号ＡＢ０５０９３４およびＡＢ
０５１３８７で平成１２年１１月８日および同年１１月
２０日にＧｅｎＢａｎｋに発明者らによって登録され
た。また、ここで使用した公知のＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子配
列は、ＡＨ００５４２２およびＮＭ００４００１、ＦＣ
ＧＲ２ＡはＡＨ００３０９５、ＦＣＧＲ２ＣはＡＨ００
２８３２である。

【００４３】３．多型本発明の１つの側面に従うと、以下の群より選択される
新規多型遺伝子：（１）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞Ｔ；（２）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ
＞Ｔ；（３）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）_{１２−１８}；および（４）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５Ｔ＞Ｃ；が提供される。

【００４４】上述の通り、これらはＳＬＥに感受性のあ
るまたは低危険率の多型、特に、日本人におけるＳＬＥ
に感受性または抵抗性のある多型である。従って、これ
らの遺伝子型の少なくとも１を決定すれば、対象におけ
る相対的なＳＬＥ発症危険率を予想することが可能であ
る。

【００４５】４．予測方法本発明の１つの側面に従うと、ＳＬＥの発症危険率を予
測する方法が提供される。即ち、以下を具備するＳＬＥ
の発症危険率を予測する方法；（１）対象からゲノムＤＮＡサンプルを準備すること；（２）得られたゲノムＤＮＡサンプルについて以下の少
なくとも１の遺伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；および（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；並びに（３）決定された遺伝子型を基にＳＬＥの発症危険率を
判定することにより対象における全身性エリテマトーデ
スの発症危険率を予測すること；が提供される。

【００４６】本方法の適用が好ましい個体は、ヒトであ
り、特に、日本人が好ましい。

【００４７】対象からゲノムＤＮＡサンプルを準備する
手段は、対象から得た末梢血中の白血球、単球、リンパ
球および顆粒球等の血球細胞からフェノールクロロホル
ム法、塩析法または市販のキット等を用いて抽出する方
法等、一般的に使用される何れの手段を用いてもよい。

【００４８】遺伝子型を決定する手段は、直接シークエ
ンス法、ＳＳＣＰ法、オリゴヌクレオチドハイブリダイ
ゼーション法および特異的プライマー法等の一般的に使
用される何れの手段を用いて行ってもよい。

【００４９】遺伝子型とＳＬＥ発症危険率の判定は以下
の通りである。予測対象において、上記（１）の多型の
遺伝子型がＴであることを第１の個体において検出した
場合、当該多型の遺伝子型がＧである第２の個体と比較
してＳＬＥ発症危険率は低い。上記（２）の多型の遺伝
子型がＴである場合、ＳＬＥ発症危険率は低い。また、
上述した通り（１）と（２）の多型は互いにハプロタイ
プを形成する。従って、何れか一方を検出しても、両方
の遺伝子型を決定して判断してもよい。

【００５０】予測対象において、上記（３）の多型にお
いてＧＴの反復回数が１５回以上である場合には、それ
以下の回数の対象と比較してＳＬＥ発症の危険率が高
い。

【００５１】また、予測対象において、その２つの対立
遺伝子における上記（４）の多型の遺伝子型が２つとも
にＣである場合、即ち、前記対象の２つの対立遺伝子が
２３２Ｔ／Ｔのホモ接合体である場合には、そうでない
場合、即ち、該対立遺伝子が２３２Ｉ／Ｔのヘテロ接合
体または２３２Ｉ／Ｉのホモ接合体である場合、に比較
してＳＬＥ発症の危険率は高い。更にまた、予測対象の
対立遺伝子が２３２Ｔ／Ｔのホモ接合体であり、それに
加えて遺伝子座ＨＬＡ−ＤＲＢ１^＊１５０１も存在する
場合には、２３２Ｔ／Ｔ遺伝子型が単独で存在する場合
に比べてＳＬＥ発症の危険率は更に高い。

【００５２】ここで、「ＨＬＡ−ＤＲＢ１^＊１５０１」
は、ヒト白血球抗原（ＨＬＡと略す）遺伝子のクラスＩ
Ｉに含まれるＤＲＢ１遺伝子座の対立遺伝子を示す。

【００５３】ＳＬＥの発症危険率の予測には、上記の
（１）から（４）までの多型の遺伝子型を全て決定して
行っても、何れか１のみを行っても、これらを組み合わ
せて大なってもよい。例えば、ハプロタイプである上記
（１）および（２）のうちの何れか１の多型と、上記
（３）および（４）の多型の３の多型の遺伝子型を決定
して行ってもよい。或いは、上記（１）から（４）の何
れかを任意に組み合わせて決定することにより行っても
よい。更に、（４）の遺伝子型に応じてＨＬＡの多型を
決定し、これを更に考慮して予測を行ってもよい。

【００５４】５．ＳＬＥの発症危険率を予測する装置本発明の１つの側面に従うと、ＳＬＥの発症危険率を予
測する装置が提供される。即ち、コンピュータを利用し
たＳＬＥの発症危険率を予測する装置であって、以下を
具備する装置；（１）ゲノムＤＮＡを精製するための装置；（２）上記（１）で得られたゲノムＤＮＡについて、以
下からなる群より選択された多型の遺伝子型を決定する
ための装置（１）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（２）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（３）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（４）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；および（５）ヒト白血球ＨＬＡ−ＤＲＢ１^＊１５０１の有無；（３）上記（２）に記載の多型の遺伝子型に対して所定
のスコアが対応させられているスコアテーブルを記憶す
る記憶手段；並びに（４）（２）で決定された遺伝子型を基に前記スコアテ
ーブルを検索して、対応する得点データを抽出し、抽出
された前記スコアデータの全て、および前記スコアの合
計得点を出力する手段；が提供される。

【００５５】図１は、本発明のＳＬＥ発症危険率予測装
置の１態様の構成図である。全ての構成要素はバス線１
１を介したバス接続により接続されている。図１に示す
通り、対象からの試料からゲノムＤＮＡサンプルを精製
するための手段１と、手段１により得られた核酸から所
望の多型における遺伝子型を決定するための手段２、表
示装置３、およびキーボードやマウス等の入力手段４
が、バス線１１に接続されている。

【００５６】ＣＰＵ５は、精製プログラム１２を実行し
て、ゲノムＤＮＡサンプル精製装置１を制御して、試料
からのゲノムＤＮＡの精製を行う。精製されたゲノムＤ
ＮＡは精製装置１に接続された遺伝子型決定装置２に輸
送され、そこにおいて遺伝子型決定がなされる。この遺
伝子型決定は、ＣＰＵ５が、遺伝子型決定プログラム１
３を実行し、遺伝子型決定装置２を制御することにより
達成される。

【００５７】遺伝子型決定装置２の遺伝子型に関する情
報は、コンピュータによって扱うことが可能な情報形態
に変換される。例えば、そのような情報は、一般的に、
蛍光強度、放射能レベルおよび吸光度等により得られる
ので、そのような光信号等の情報を一般的な手段により
電気信号に変換すればよい。また、この工程は、手動に
より行った電気泳動の結果またはハイブリダイゼーショ
ンの結果をオペレーターが見て、その結果から陽性また
は陰性を判断することによって行ってもよい。

【００５８】得られた遺伝子型に関する情報を基に、Ｃ
ＰＵ５は、予測プログラムを実行して、表示すべき画像
データの指示、遺伝子型およびその組合せからスコアの
検索等を行う。ＲＡＭ６は、表示用の画像データを一旦
格納するものであり、画像処理部７は、ＣＰＵ５からの
指示に従って必要な画像データを生成して表示装置３に
画像を表示する。

【００５９】本ＳＬＥ発症危険率予測装置内のメモリに
は、大きくわけて３つのファイルが格納される。

【００６０】第１のファイル８内には、精製プログラム
１２、遺伝子型決定プログラム１３および精製および遺
伝子型決定に関連する画像データが記憶されている。第
２のファイル９内には、予測プログラム１５と予測に関
連する画像データが記憶されている。更に第３のファイ
ル１０内にはスコアテーブルが記憶されている。

【００６１】図２（ａ）は、スコアテーブルの例を示
す。図２（ｂ）は、表示画面の例の一部分を示す図であ
る。本表示は、図２（ａ）のスコアテーブルの右側に、
遺伝子型決定装置２により得たデータと、該スコアテー
ブルを検索して読み出したスコアと、これを集計したス
コア合計「３」が表示されている。

【００６２】図３のフローチャートに従って、本ＳＬＥ
発症危険率予測装置による動作を説明する。（Ｓ１）予
測開始の指示が出されると、精製プログラムに従って精
製が実行される。（Ｓ２）該精製が完了すると、遺伝子
型決定プログラムに従ってＮｏ．１からＮｏ．４までの
多型について遺伝子型の決定が実行される。（Ｓ３）Ｎ
ｏ．４の多型がコドン２３２Ｔ／Ｔを与えるような遺伝
子であった場合、（Ｓ４）に進み、そうでない場合には
（Ｓ５）に進む。（Ｓ４）Ｎｏ．５の遺伝子型の検出が
行われる。（Ｓ５）スコアテーブルを検索して、決定さ
れた遺伝子型に対応するスコアを読み出し、合計のスコ
アを集計する。（Ｓ６）決定された遺伝子型、取得スコ
アおよびスコアの合計を表示装置３に表示する。

【００６３】対象からの試料は、血球を含む血液および
リンパ液等の液体試料であっても、何れの組織試料であ
ってもよく、或いは、予めそれらの試料から予め所望の
程度にまでゲノムＤＮＡを精製したものであってもよ
い。

【００６４】前記試料からゲノムＤＮＡサンプルを精製
するための装置は、ＤＮＡ自動抽出装置（例えば、ＡＢ
Ｉまたは東洋紡等により入手可能である）の一般的に使
用される何れの装置を用いてもよい。当然ながら、この
工程は、抽出キット等を使用する、それ自身公知の一般
的な手段によりオペレーターが手動で行ってもよい。

【００６５】遺伝子型を決定するための装置は、自動シ
ークエンサーおよびＦＲＥＴ法を用いるリアルタイムＰ
ＣＲ装置（例えば、ＡＢＩ７７００，LghyCyclex等）等
の一般的に使用される何れの装置を用いて行ってもよ
い。また当然ながら、この工程も、抽出キット等を使用
する、それ自身公知の一般的な手段によりオペレーター
が手動で行ってもよい。

【００６６】また、ここでは、ゲノムＤＮＡサンプルの
精製と遺伝子型決定を、夫々、ゲノムＤＮＡサンプル精
製装置１および遺伝子型決定装置２により自動で行う装
置の例を示したが、ゲノムＤＮＡサンプル精製装置１お
よび遺伝子型決定装置２は、両方共にまたはどちらか一
方のみが具備されていない装置も本発明の範囲内に含ま
れる。以下に、該装置が両方共に具備されない例を示
す。

【００６７】本発明の１つの側面に従うと、ＳＬＥ感受
性の新規多型の遺伝子型からＳＬＥの発症危険率を予測
する装置が提供される。即ち、コンピュータを利用した
ＳＬＥの発症危険率を予測する装置であって、以下を具
備する装置；（１）ＳＬＥ感受性多型の遺伝子型の組合せに対して所
定のスコアが対応させられているスコアテーブルを記憶
する記憶手段；並びに（２）選択された多型について決
定された遺伝子型を基に前記スコアテーブルを検索し
て、対応する得点データを抽出し、抽出された前記スコ
アデータの全て、および前記スコアの合計得点を出力す
る手段；が提供される。本態様の構成を図４に示す。Ｓ
ＬＥ感受性多型における遺伝子型を手動により決定し、
そのデータを入力手段から入力し、そのデータを基に、
ＳＬＥ発症危険率予測を行う。

【００６８】詳述した装置は、本発明の新規多型、即
ち、（１）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞
Ｔ、（２）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３
０Ｃ＞Ｔ、（３）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１
３２（ＧＴ）_{１２−１８}、（４）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにお
けるｃ．６９５Ｔ＞Ｃの他に、他の疾患関連遺伝子およ
び／または多型、並びに血液型に関する多型等の他の解
析を同時に行うようにプログラムしてもよい。

【００６９】このような装置により、ＳＬＥ発症危険率
の予測が簡便に行うことが可能である。

【００７０】また、本発明の１つの側面に従うと、以下
のポリヌクレオチドが提供される。即ち、（ａ）配列番号１から８に記載の塩基配列からなる群
より選択された１の塩基配列により示されるポリヌクレ
オチド；（ｂ）上記（ａ）に記載されたポリヌクレオチドにお
いて、前記配列における多型遺伝子の存在する以外の部
位において、１若しくは数個のヌクレオチドが欠失、置
換または付加された修飾ポリヌクレオチド；（ｃ）配列番号１の２５５３位または８５１８位に存
在する１ヌクレオチドを含む配列番号１に含まれる連続
する１０から３０塩基の塩基配列によりポリヌクレオチ
ドからなる断片；（ｄ）配列番号５の１９４位から２２３位までに存在
する１５ヌクレオチドを含む配列番号５に含まれる連続
する１５から３０塩基の塩基配列によりポリヌクレオチ
ドからなる断片；（ｅ）配列番号６は１９４位から２２９位までに存在
する１８ヌクレオチドを含む配列番号６に含まれる連続
する１８から３０塩基の塩基配列によりポリヌクレオチ
ドからなる断片；（ｆ）配列番号７の３０４位に存在する１ヌクレオチ
ドを含む配列番号７に含まれる連続する１５から３０塩
基の塩基配列によりポリヌクレオチドからなる断片；（ｇ）配列番号８の３８６位に存在する１ヌクレオチ
ドを含む配列番号８に含まれる連続する１５から３０塩
基の塩基配列によりポリヌクレオチドからなる断片；お
よび（ｈ）配列番号９に記載の塩基配列により示されるポ
リヌクレオチド；である。

【００７１】配列番号１に示される前記ポリヌクレオチ
ドはｃ．７０５およびＩＶＳ１４−３０を含むヒトＣＤ
１９遺伝子の一部である。この塩基配列のうち、ＳＬＥ
の発症に関与しているのは当該配列のＳＮＰ部位、即
ち、２５５３位および８５１８位である。従って、本発
明のポリヌクレオチドが配列番号１の断片である場合に
は、当該部位に存在する少なくとも１個のヌクレオチド
を含むＳＮＰ部位を含む配列番号１の断片がより好まし
い。

【００７２】配列番号２から６に示される前記ポリヌク
レオチドは、ｃ．^＊１３２（ＧＴ）の反復回数を含むヒ
トＣＤ遺伝子である。特に、配列番号５および６は、反
復回数が１５以上であり、ＳＬＥ発症の危険率を求める
上で有用性が高い。

【００７３】配列番号７は、ｃ．６９５を含むヒトＦＣ
ＧＲ２Ｂ遺伝子である。この塩基配列のうち、ＳＬＥの
発症に関与しているのは当該配列のＳＮＰ部位、即ち、
２２１位および３０４位である。従って、本発明のポリ
ヌクレオチドが配列番号７の断片である場合には、当該
部位に存在する少なくとも１個のヌクレオチドを含むＳ
ＮＰ部位を含む断片であることが好ましい。

【００７４】配列番号８も配列番号７と同様に、ｃ．６
９５を含むヒトＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子である。この塩基配
列のうち、ＳＬＥの発症に関与しているのは当該配列の
ＳＮＰ部位、即ち、３８６位である。従って、本発明の
ポリヌクレオチドが配列番号８の断片である場合には、
当該部位に存在する１個のヌクレオチドを含むＳＮＰ部
位を含む断片であることが好ましい。

【００７５】これらのポリヌクレオチドは、例えば、対
象の遺伝子型を決定するための各種ＰＣＲ増幅のための
プライマーとして、またはＤＮＡチップにおいて使用す
るプローブとして使用してよい。この場合、本ポリヌク
レオチドは、１０ヌクレオチド以上３０ヌクレオチド以
下であることが望ましい。ポリヌクレオチド断片の長さ
が過度に長いと、１個のヌクレオチドの相違を識別する
ことが困難になる。また、基本的にポリヌクレオチドの
長さが過度に短いと試料中に含まれるポリヌクレオチド
の塩基配列の決定が困難になる。

【００７６】特に、配列番号９に示すポリヌクレオチド
は、ＦＣＧＲ２Ｂに特異的なプライマーとして有用な配
列である。特に、このポリヌクレオチドは、ＰＣＲの下
流用のプライマーとして使用するのに有用である。

【００７７】

【実施例】例１．日本における全身性エリテマトーデス
への感受性とＣＤ１９多型の関連性例１では、ＣＤ１９の多型配列をスクリーニングして多
型を検出し、検出された多型とＳＬＥとの関連を調べ
た。

【００７８】１．材料および方法（１）患者および健常者先ず初めに、ＲＡ患者１２７例、ＳＬＥ患者（第１のＳ
ＬＥ群：以下、ＳＬＥ１群と称す）８７例、クローン病
患者１５６例、および健常者２４７例について、ケース
コントロール関連分析(case-control association stud
y)を行った。更に、ＳＬＥ１群において検出された関連
性を追試するために、９９例のＳＬＥ患者からなる独立
した第２のＳＬＥ群(以下、ＳＬＥ２群と称す)を構成し
た。従って、ＳＬＥ患者の総症例数は１８６例である。

【００７９】対照群である健常者は、東京大学および日
本赤十字中央血液センターの研究者、研究室職員および
学生から構成される男性１４５例と女性１０２例(平均
年齢：３６．６歳)である。ＲＡ患者、男性１８例と女
性１６８例(平均年齢：５７．８歳)を、米国リウマチ学
会の分類基準に従って分類した(文献46参照)。ＳＬＥ１
およびＳＬＥ２は、それぞれ、男性１２例と女性７５例
(平均年齢：４０．３歳)、男性６例と女性９３例(平均
年齢：４０．０歳)から構成された。ＳＬＥ患者は、米
国リウマチ学会の分類基準に従って分類した(文献47参
照)。クローン患者、男性１２４例と女性３２例(平均３
１．１歳)は、臨床学的に、Ｘ線撮影、内視鏡的検査お
よび生検標本の組織学的試験により診断された。ＣＶＩ
Ｄ患者は、男性３例と女性１例であった。ＣＶＩＤ患者
からの末梢血単核細胞中のＣＤ１９陽性Ｂ細胞の割合
は、それぞれ１０％、３．３％、３．０％および０％で
あった。

【００８０】ケースコントロールスタディに使用された
全健常者および患者は、互いに血縁関係にない関東在住
の日本人である。日本の中心部は、遺伝的背景に関して
比較的均質であることは既に示されているため(文献48
参照)、本研究で使用されるケースコントロールスタデ
ィによる試験が可能となる。

【００８１】当該患者の臨床学的特徴は、各患者の診察
記録から得た。そこから十分な情報が得られない場合に
は、その患者は詳細な分析対象から除外した。ここでの
腎炎は、持続性蛋白尿が0.5g/day若しくは３＋以上であ
るか、細胞円柱の所見のあるものをいい、中枢神経系疾
患は、痙攣または精神病をいうが、これらはＡＣＲ診断
基準(文献47参照)に従って定義した。

【００８２】なお、本研究は、東京大学、順天堂大学お
よびＵＣＬＡのヒト対象保護委員会の研究倫理審査委員
会によって承認された。

【００８３】（２）ゲノムＤＮＡゲノムＤＮＡは、患者および健常者の末梢血白血球か
ら、ＱＩＡａｍｐ・ブラッド・キット(QIAamp Blood ki
t, Qiagen,Hilden,Germany)を使用して精製した。

【００８４】（３）ＰＣＲ一本鎖構造多型(PCR-single
strand conformation polymorphism;以下、PCR-SSCPと
称す) ＰＣＲに使用したプライマーとアニーリング温度を表１
に示す。

【００８５】

【表１】

【００８６】これらは、ヒトＣＤ１９のゲノムＤＮＡ配
列に従って設計された(GenBank 受付番号M84371)。夫々
のエクソンは、隣接するイントロン配列に特異的なプラ
イマーを設定して増幅した。また、これまでの研究か
ら、当該方法に最適な断片サイズは２００−４００ｂｐ
であることが示唆されていることから(文献49,50参
照)、エクソン２および４は２つの断片に分割し、エク
ソン１１と１２および１３と１４は、夫々１つの断片と
して増幅した。一段階のＰＣＲでは増幅効率が低いの
で、プロモーター領域は二段階のＰＣＲ法を用いて分析
した。第１のプライマーセットは、ロングＰＣＲを用い
て−１３５１から１３６を増幅するために設計した。最
初の変性（９６℃、１０分）の後、変性（９６℃、１分
間）、アニーリング（５８℃、３０秒）および伸長反応
（７２℃、３分）を３５サイクルで行う条件により、サ
ーマルサイクラー（Thermal cycler MP;Takara,Kyoto,J
apan）を用いてＰＣＲ増幅を行った。ＰＣＲ−ＳＳＣＰ
のために、得られた長い断片を重複する３つの断片（３
００−４５０ｂｐ）に分割した。ＰＣＲ増幅は、最初の
変性（９６℃、１０分）の後、変性（９６℃、３０
秒）、アニーリング（６０℃、３０秒）および伸長反応
（７２℃、３０秒）を３５サイクルで行う条件により、
サーマルサイクラー(Thermal cycler MP;Takara または
GeneAmp PCR system 9600;Perkin-Elmer Applied Biosy
stems;Foster City,CA)を用いてＰＣＲ増幅を行った。
このような方法により−１０５０ｂｐまでのプロモータ
ー領域が分析された。

【００８７】この増幅されたＤＮＡをＰＣＲ−ＳＳＣＰ
法を用いて分析した。ＰＣＲ産物を含有する１μＬの溶
液を、７μＬの変性溶液(95%のホルムアミド、20mMのＥ
ＤＴＡ、0.05%のブロモフェノールブルー、0.05%のキシ
レンシアノールFF)と混合した。この混合物を９６℃で
５分間変性し、直ちに氷上で冷却した。１μＬの該混合
物を７．５％のポリアクリルアミドゲル(アクリルアミ
ド：ビスアクリルアミド＝４９：１)を用いてエクソン
１５を分析し、１０％のポリアクリルアミドゲル(アク
リルアミド：ビスアクリルアミド＝４９：１)を用いて
その他の部分を分析した。より良好な分離のために、エ
クソン２Ｂと４Ａを分析するためのゲルには、１０％の
グリセロールを添加した。電気泳動は０．５×ＴＢＥ(4
5mM トリスボレート[pH8.0]、1mM のEDTA)中において、
２０ｍＡ／ゲルの定電流下で、一定温度調節系を具備す
るミニゲル電気泳動装置(90×80×1mm、AE-6410およびA
E-6370;ATTO、東京)を用いて行った。最適温度および電
気泳動時間は、予備実験により決定した。当該ゲルにお
ける一本鎖ＤＮＡ断片を銀染色(第一純薬、東京)により
可視化した。

【００８８】（４）ＰＣＲ制限断片長多型(以下、PCR-R
FLPと称す) イントロン１４におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ＞Ｔ多型の
遺伝子型の決定は、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ法を用いて行っ
た。特異的プライマーセット(CD19-3'UTRF:5'-AGAGGGAA
CAGGGTTCCTAG-3'、CD19ex15R:5'-AGGAATACAAAGGGGACTGG
-3')を使用して多型部位を含むＣＤ１９遺伝子からの２
５６塩基対断片を増幅した。また、この増幅は前述した
ＰＣＲ−ＳＳＣＰと同じ条件を用いた。ＰＣＲ反応後
に、増幅産物を、２時間、ＢａｍＨＩにより消化し、更
に、ＳＹＢＲゴールド(商品名サイバーゴールド、Molec
ular probes,Inc.,Engene,OR)染色による１０％のポリ
アクリルアミドゲル上での分析を行った。

【００８９】（５）直接シーケンス法ＰＣＲ産物を増幅し、上述のＰＣＲ−ＳＳＣＰと同様の
プライマーを使用して、センス鎖およびアンチセンス鎖
の両方について直接シーケンスを行った。ＡＢＩ３１０
またはＡＢＩ３７７シーケンサー(ABI PRISM,PE Biosys
tems)を使用し、製造者の指示に従って、ダイターミネ
ーター法を用いて（ABI PRISMTM dRhodamine Terminato
r Cycle Sequencing-Ready Reaction Kit）ＰＣＲ産物
の蛍光を基にした自動サイクルシーケンシングを行っ
た。

【００９０】（６）ジヌクレオチド反復多型の遺伝子型
決定３’ＵＴＲに含まれるジヌクレオチド反復多型の遺伝子
型の決定は、ＰＣＲ増幅後、シーケンサーとＧＥＮＳＣ
ＡＮ^ＴＭソフトウェアを用いて行った。多型部位を含む
２５６塩基対断片をＦａｍまたはＨｅｘ標識ＣＤ１９−
３’ＵＴＲＦプライマーおよびＣＤ１９ｅｘ１５Ｒプラ
イマーを使用して増幅した。また、該増幅は上述のＰＣ
Ｒ−ＳＳＣＰと同じ条件で行った。その増幅産物を、４
％のポリアクリルアミドゲル(アクリルアミド：ビスア
クリルアミド＝１９：１)上でＡＢＩ３７７シーケンサ
ー(ABI-PRISM,PE Biosystems)を使用して泳動した。Ｐ
ＣＲ産物を含有する１．５μＬの溶液を、２．５μＬの
９９．５％のホルムアミド、０．５μＬのロード用緩衝
液(50mg/mLのブルーデキストラン、25mMのEDTA)および
１．０μＬのジーン・スキャン(Gene Scan;登録商標）-
500[ROX]サイズ・スタンダード(ABI-PRISM,PE Biosyste
ms)の１．０μLと混合した。当該混合物を９６℃で２分
間変性し、直ちに氷上で冷却した。その混合物の２μＬ
を、４％のポリアクリルアミドゲルに添加した。データ
はＡＢＩ３７７コレクションソフトウェアで回収し、サ
イズ分析はジーン・スキャン−５００ＲＯＸ(Genescan-
500ROX)をサイズスタンダード(ABI-PRISM)として使用し
て行った。

【００９１】（７）統計学的解析日本人患者と健常者は、ケースコントロール関連解析に
より比較した。陽性率は、個体総数における対立遺伝子
（ホモ接合体およびヘテロ接合体）を有した個体の割合
として定義した。カイ２乗検定とフィッシャーの直接確
率計算法を使用して、ＣＤ１９多型と夫々の疾患に対す
る感受性との関連性、またはＣＤ１９多型と日本人集団
における臨床学的特徴との関連性を解析した。個々の対
立遺伝子の有無を比較するためのＰ値は、１３を乗じる
ことによって対立遺伝子数で補正を行った（補正後のＰ
値はＰ_corrと記す）。即ち、９種のＳＮＰｓと５個の対
立遺伝子を持つ１０種類の反復配列多型が解析された
（即ち、９＋５−１）。

【００９２】コーカソイドＳＬＥ家系は、伝達不平衡試
験（以後、ＴＤＴと略す）を使用して通常と同様に解析
した(文献51参照)。２または３人の罹患した子供を持つ
家系では、第１子のみを解析のために選択した。ＴＤＴ
の有意性は、ＮｃＮｅｍａｒ’ｓ検定を使用して検定し
た。χ^２値は以下の式により計算した： χ^２＝（Ｔ−ＮＴ）^２／（Ｔ＋ＮＴ）ここで、Ｔは遺伝された対立遺伝子の数であり、ＮＴは
遺伝されなかった対立遺伝子の数である。ハプロタイプ
頻度および連鎖不平衡パラメータはＥＨプログラムを使
用したタイピング結果から評価した(文献52参照)。相対
的連鎖不平衡(以後、ＲＬＤと略す)値は、連鎖不平衡
（以下、ＬＤと略す）の可能な限りの最大値（ＬＤ＞０
の場合）または可能な限りの最小値（ＬＤ＜０の場合）
の絶対値に対するＬＤの割合として定義される。その結
果として、ＲＬＤは−１から１までの範囲で変化する。

【００９３】２．結果（１）ＣＤ１９多型性の同定ＤＣ１９翻訳領域の全長、プロモーター領域（即ち、〜
―１０５０ｂｐ）および３’非翻訳領域（即ち、３’−
ＵＴＲ）の系統的な変位スクリーニングを、日本人健常
者３２例と患者３６例(即ち、ＳＬＥ患者１６例、ＲＡ
患者１６例およびＣＶＩＤ患者４例)からのゲノムＤＮ
Ａサンプルについて、ＰＣＲ−ＳＳＣＰを使用して行っ
た。検出された変異のヌクレオチド配列は、直接シーケ
ンス法を用いて決定した。スクリーニングを通して、翻
訳領域における３つのＳＮＰｓと、エクソン−イントロ
ン接合部に挟まれたイントロンにおける２つのＳＮＰｓ
と、プロモーター領域内の４つのＳＮＰｓと、更に３’
ＵＴＲにおけるＧＴ反復多型が同定された（図５）。図
５に、ヒトＣＤ１９遺伝子のゲノム配置および日本人に
おいて検出された変異を示す。図５においてボックスは
エクソンを示す。当該変異の名称は文献に基づいた(文
献53,54参照)。共通の変異以外の突然変異は、ＣＶＩＤ
患者においては検出されなかった。

【００９４】（２）日本人におけるＳＬＥとＣＤ１９変
異との関連性次に発明者らは、（１）で検出されたＣＤ１９の多型の
うちのどれが日本人集団におけるＲＡ、ＳＬＥおよびク
ローン病の感受性に関連しているのかを分析するため
に、ケースコントロール解析を行った。ＲＡ患者１２７
例、ＳＬＥ患者８７例、クローン病患者１５６例および
日本人健常者２４７例について、これらの多型の遺伝子
型を決定した。

【００９５】表２は、プロモーターおよび翻訳領域にお
いて検出されたＣＤ１９のＳＮＰｓの陽性率を示す。

【００９６】

【表２】

【００９７】エクソン４におけるｃ．７０５Ｔ（Ｐ２３
５Ｐ）（Ｐ＝０．００９６、Ｐｃｏｒｒ＝０．１２、オ
ッズ値［ＯＲ］＝０．４９、９５％信頼区間［ＣＩ］：
０．２９−０．８４）と、イントロン１４におけるＩＶ
Ｓ１４−３０Ｔ（Ｐ＝０．０２８、Ｐcorr＝０．３６、
ＯＲ＝０．５６、９５％ＣＩ：０．３３−０．９４）
は、ＳＬＥとのネガティブな関連性が示された。その他
の有意な関連性は、他のＳＮＰｓの何れかとＳＬＥとの
間でも、他のＳＮＰｓの何れかとＲＡおよびクローン病
との間にも観察されなかった。

【００９８】表３は、３’ＵＴＲの２塩基反復多型の頻
度を示す。

【００９９】

【表３】

【０１００】ｃ．^＊１３２（ＧＴ）_１８(即ち、ｃＤＮ
Ａ配列における終止コドンの３’塩基から数えて１３２
番目の塩基から始まる１８回のＧＴ反復をコードする対
立遺伝子)の陽性率は、健常者(17/247、6.9%)と比較し
て、ＳＬＥ(15/87、17.2%)の方が有意に高かった(Ｐ＝
０．００５，Ｐｃｏｒｒ＝０．０６５、ＯＲ＝２．８
２、９５％ＣＩ：１．３７−５．７９)。また、ＳＬＥ
１と対照群との間の有意差が、ｃ．^＊１３２（ＧＴ）
_１８の対立遺伝子頻度(χ^２＝７．６、ｄｆ＝１、Ｐ＝
０．００６、Ｐ_ｃｏｒｒ＝０．０７８）、遺伝子型の分
布（χ^２＝１９．０、ｄｆ＝１０、Ｐ＝０．０４、Ｐ
_ｃｏｒｒ＝０．３６）および対立遺伝子頻度（χ^２＝
９．８、ｄｆ＝４、Ｐ＝０．０４、Ｐ_ｃｏｒｒ＝０．３
６）において得られた。この関連性が追試できるか否か
を試験するために、ＧＴ反復多型性について独立したＳ
ＬＥ患者群（即ち、ＳＬＥ２）を解析にした。ＳＬＥ２
におけるｃ．^＊１３２（ＧＴ）_１８の陽性率はＳＬＥ１
よりも低いものであったが、ｃ．^＊１３２（ＧＴ）_１５
の陽性率は有意な増加が得られた（χ^２＝４．８、ｄｆ
＝１、ｐ＝０．０３、Ｐ_ｃｏｒｒ＝０．３９）。

【０１０１】これらの結果から、発明者らは、そのＧＴ
反復数が１５以上である場合に、３’ＵＴＲにおけるＧ
Ｔ反復がＳＬＥに関連すると考えた。従って、ｃ．^＊１
３２（ＧＴ）_{１５−１８}の陽性率および頻度を、ＳＬＥ
１、ＳＬＥ２および対照において比較した（表４）。
ｃ．^＊１３２（ＧＴ）_{１５−１８}の陽性率は、ＳＬＥ１
（Ｐ＝０．０１６）およびＳＬＥ２（Ｐ＝０．０４９）
の両群において有意に増加した。２つの群を合わせた場
合には、更に顕著な相違が対照群との間で観察された
（Ｐ＝０．００９６）。また、ｃ．^＊１３２（ＧＴ）
_{１５−１８}対立遺伝子の頻度は、ＳＬＥにおいて有意に
高かった（Ｐ＝０．０１２）。

【０１０２】

【表４】

【０１０３】ＲＡおよびクローン病については、該ＧＴ
反復多型との有意な関連性は観察されなかった。

【０１０４】（３）多型部位間の連鎖不平衡ＳＬＥとの有意な関連を示した多型部位ｃ．７０５、Ｉ
ＶＳ１４−３０およびｃ．＊１３２の間の関係を検討す
るために、健康な日本人個体の遺伝子型決定の結果に基
づいて解析した。有意な連鎖不平衡がＣＤ１９ｃ．７０
５ＴとＩＶＳ１４−３０Ｔの間で観察された(相対的連
鎖不平衡値［ＲＬＤ］＝０．８３、χ^２＝９３．８、Ｐ
＜１０^−１０)。加えて、強い関連性が、ｃ．７０５Ｇ
とｃ．^＊１３２（ＧＴ）_１８の間（ＲＬＤ＝１．０、χ
^２＝８．２、Ｐ＝０．００４）、およびｃ．７０５Ｇと
ｃ．^＊１３２（ＧＴ）_１５の間（ＲＬＤ＝０．８４，χ
^２＝１．１２、Ｐ＝ＮＳ）に観察されたが、この対立遺
伝子を有する個体数が少ないために、後者に統計学的な
有意差は得られなかった。

【０１０５】（４）臨床的特徴との関連性次に、発明者らは、ＧＴ反復多型がＳＬＥの臨床学的特
徴と関連するか否かを解析した。興味深いことに、ｃ．
^＊１３２（ＧＴ）_{１５−１８}対立遺伝子を持たない患者
に比較して、ｃ．^＊１３２（ＧＴ）_１５またはｃ．^＊１
３２（ＧＴ）_１ _８を持つ患者の方が抗Ｓｍ抗体を有する
可能性は低かった（Ｐ＝０．０２）。発症年齢、ネフロ
パシーの有無、神経学的異常（発作または精神病）、漿
膜炎、低補体血症または抗ｄｓＤＮＡ抗体等のパラメー
タについては関連は観察されなかった（表５）。

【０１０６】

【表５】

【０１０７】３．考察本研究において、発明者らは、ヒトＣＤ１９の多くのヌ
クレオチド配列変異を同定し、その中の３つが、ＳＬＥ
と有意に関連性のあることを示した。２つはＳＬＥと負
の関連性を示し、残りは、有意な正の関連性を示した。
先の２つは後者と負の連鎖不平衡にあった。更に、イン
トロンにおける同義置換および１塩基置換をコードする
ＳＮＰｓは、何らかの機能的変化に関連している可能性
は小さいと考えられるので、３’ＵＴＲのＧＴ反復多型
が、主に機能的に重要である可能性が高いと考えられ
る。

【０１０８】これまでの研究では、ＣＤ１９の遺伝子多
型がＳＬＥに関連しているという報告はない。例えば、
イタリアのケースコントロールスタディにおいて解析さ
れた多型は、本発明者らが今回報告した多型と同じもの
である可能性があるが、その研究では、ＳＬＥとの関連
は認められなかった。このようなことは、ＣＤ１９の
３’ＵＴＲのＳＬＥとの関連は日本人や近隣の集団に固
有の特徴である可能性を示唆している。従って、日本人
以外のアジア系集団におけるこの関連性の有無を解析す
ることも興味深いことであろう。

【０１０９】現時点では、伸長されたＧＴ反復対立遺伝
子がどのようにＳＬＥと関連しているのかは推論でしか
ない。仮に、そのような対立遺伝子が末梢におけるＣＤ
１９のより高い発現レベルに関連するのであれば、自己
抗原に対する低親和性自己抗体の産生を導くようなＢ細
胞活性化の閾値の低下が生じるかもしれない。ＣＤ１９
の過剰発現したマウスからのＢ細胞の表現型は、ＳＨＰ
−１タンパクチロシンホスファターゼ(文献55,56参照)
やＬｙｎ(文献57参照)に欠陥のあるＢ細胞に類似する。
これら２つの分子はＢ細胞の反応における負の調節因子
であるため、そのシグナル閾値の低下が自己免疫の誘導
を引き起こしているのかもしれない。或いは、仮に、
ｃ．^＊１３２（ＧＴ）_{１５−１８}対立遺伝子が、未熟Ｂ
細胞における低い表面ＣＤ１９発現に関与しているなら
ば、骨髄における自己抗原に対する寛容誘導の欠陥を引
き起こすかもしれない(文献19参照)。末梢Ｂ細胞におけ
るＣＤ１９の発現レベルは、少数のＳＬＥ患者において
は僅かに減少したと報告されている(文献29参照)。実際
に、ＣＤ１９欠失マウスの大部分は抗核抗体を示す(Sat
o S.,personal communication)。従って、おそらく未熟
Ｂ細胞におけるＢＣＲシグナリング減少のために、欠陥
のあるＣＤ１９が自己抗原に対する寛容誘導の不足を導
くという機序も一つの可能性として考えられる(文献58
参照)。例えば、負の調節因子の遺伝子多型が不十分な
負のシグナルをもたらす場合や、他の遺伝的および／ま
たは環境的状態が提供される場合と組合わさって、ＳＬ
Ｅ患者では、低いレベルのＣＤ１９発現をもたらす多型
が自己反応性Ｂ細胞の存続と活性化を引き起こす可能性
も考えられる。

【０１１０】本研究において、ｃ．^＊１３２（ＧＴ）
_{１５−１８}対立遺伝子を有するＳＬＥ患者が抗Ｓｍ抗体
を有している可能性が顕著に低いことが観察された。特
に興味深いことには、ＣＤ１９の発現レベルが、抗Ｓｍ
重鎖導入遺伝子を発現しているマウスにおいて、Ｂ−１
およびＢ−２細胞群の分化や自己抗体産生を調節するこ
とが最近報告された(文献59参照)。従って、ＣＤ１９発
現レベルが、核自己抗原に特異的なＢ細胞の分化および
活性化の調節に関連している可能性がある。

【０１１１】多くの多型部位が検出され、且つ検出され
た全対立遺伝子の夫々について統計学的解析が行われた
ので、Ｐ値は、多重比較のための補正の後で統計学的な
有意性には到達しなかった。しかしながら、ＧＴ反復多
型の有意な関連が、ＲＡおよびクローン病においてでは
なく、ＳＬＥの２つの独立群においてともに観察されて
いることから、この関連が偽陽性のものとは考えられな
い。

【０１１２】例２．ＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子における多型と
ヒト全身性エリテマトーデスとの関連性ＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子における多型とヒト全身性エリテマ
トーデスとの関連性を解析するために、ＦＣＧＲ２Ｂの
変異スクリーニングをＰＣＲ一本鎖構造多型(PCR-singl
e strand conformation polymorphism;SSCP)を使用して
行った。

【０１１３】図６に示すように、ＦｃγＲＩＩＢタンパ
クは、シグナルペプチド（ＳＰ）、２つのＩｇ様細胞外
ドメイン（図６では、夫々、ＥＣ１およびＥＣ２と記
す）、膜貫通領域（図６ではＴＭと記す）および細胞質
末端（図６では、夫々、Ｃ１、Ｃ２およびＣ３と記す）
からなる（図６）。エクソン特異的プライマーセットと
ゲノムＤＮＡ鋳型を使用しての翻訳領域全長の初期変異
スクリーニングを経て、４つの可能な変異部位がエクソ
ン４とエクソン５において検出された（データには示さ
ず）。しかしながら、エクソン１から５を通して、Ｆｃ
γＲＩＩＢのアミノ酸およびヌクレオチド配列は、Ｆｃ
γＲＩＩＡとＩＩＣとも高い相同性を有しており(文献6
1,62参照)、従って、変異の幾つかは実際にはＦＣＧＲ
２Ａまたは２Ｃ多型に由来する可能性もあった。

【０１１４】以上の状況を考慮して、ＦＣＧＲ２Ｂ遺伝
子のみを増幅するために、末梢血単核細胞から抽出した
ＲＮＡを鋳型として調製したｃＤＮＡを鋳型として使用
して二段階のＰＣＲを行った。従来報告されている通
り、大きさの異なる２つの断片が最初のＰＣＲで観察さ
れ、これはスプライシングによる変異体ＦｃγＲＩＩＢ
１およびＦｃγＲＩＩＢ２であると考えられた(文献63
参照)。

【０１１５】１．方法（１）患者および健常者非血縁日本人であるＳＬＥ患者７５例と健常者９４例に
ついて解析した。ＳＬＥ患者は、年齢１６歳から７８歳
まで（平均年齢４０．０±１３．７歳）の男性１２例お
よび女性６３例である。また、これらのＳＬＥ患者は、
東京大学医学部附属病院および順天堂大学病院に通院中
の患者である。健常者は、年齢２２歳から５０歳まで
（平均年齢３１．３±８．３歳）の４９例の男性および
４５例の女性であり、東京大学および日本赤十字中央血
液センターの研究者、研究室職員および学生からなる。
日本の関東地域の住民は、遺伝的背景に関して比較的均
質であることが示されているので(文献48参照)、本研究
で採用するケースコントロールスタディが可能となる。
また、本研究は、東京大学および順天堂大学の研究倫理
審査委員会により承認された。

【０１１６】（２）ＲＮＡおよびゲノムＤＡＮＲＮＡは、ＲＮｅａｓｙ・ミニ・キット（Qiagen,Hilde
n,Germany）を使用し、ＳＬＥ患者と健常者の末梢血単
核細胞から精製し、ｃＤＮＡに逆転写した。また、ゲノ
ムＤＮＡは、患者および健常者の末梢血白血球から、Ｑ
ＩＡａｍｐ・ブラッド・キット(QIAamp Blood kit, Qia
gen,Hilden,Germany)を使用して精製した。

【０１１７】（３）ＦＣＦＲ２Ｂ遺伝子型の決定ＦＣＧＲ２Ｂエクソン４、エクソン５およびエクソン６
の遺伝子型の決定は二段階のＰＣＲとＳＳＣＰ法を使用
して行った。最初のＰＣＲのためのプライマーは、５’
ＵＴＲ（２Ｂ５’ＵＴＲ−Ｆ：5’−GAGAAGGCTGTGACTGC
TGT-3'）およびエクソン８のＩＴＩＭ領域（２ＢＩＴＩ
Ｍ−Ｒ：5'-CGGGTGCATGAGAAGTGAAT-3'）に設計し、ＦＣ
ＧＲ２Ｂの９４４ｂｐのｃＤＮＡ断片を増幅した（図
６）。ＰＣＲ条件は以下の通りであった：０．２μＬの
ｃＤＮＡ、０．２μＭの各プライマー、０．４ｍＭのｄ
ＮＴＰｓ、２ｍＭのＭｇＣｌ_２、２．５ＵのＬＡＴａ
ｑＤＮＡポリメラーゼ（タカラ社）を含有する５０μＬ
反応液。最初の変性（９６℃で３分）の後、変性（９６
℃で３０秒）、アニーリング（６０℃で３０秒）、伸長
（７２℃で９０秒）のＰＣＲ反応を３５サイクル行い、
更に最後の伸長反応（７２℃で５分）行った。最初のＰ
ＣＲ産物は、直接シーケンス法によりＦＣＧＲ２Ｂであ
ることを確認した。

【０１１８】続いて、増幅された断片を第２のＰＣＲ反
応のための鋳型として使用し、２つのプライマーセット
を用いて、即ち、その１つは（2Bエクソン3-F:5'-GCATC
TGACTGTGCTTTCTG-3'、2Bエクソン4-R：5’-CTTGGACAGTG
ATGGTCACA-3'）を用いてエクソン４全長である２７５ｂ
ｐ断片を増幅し、もう１つは（2Bエクソン４．５−F:5'
-TCCAAGCTCCCAGCTCTTCA-3'、2Bエクソン6-R:5'-TGGTTTC
TCAGGGAGGGTCT-3'）を用いてエクソン５およびエクソン
６を包含する１７６ｂｐ断片を増幅した（図６）。ＰＣ
Ｒ条件は以下の通りである：０．５μＬの最初のＰＣＲ
産物、０．４μＭの各プライマー、０．２ｍＭのｄＮＴ
Ｐｓ、１．５ｍＭのＭｇＣｌ_２、１ＵのＡｍｐｌｉＴａ
ｑＧｏｌｄＤＮＡポリメラーゼ（パーキン−エルマ
ー・アプライド・バイオシステムズ、Ｎｏｒｗａｌｋ、
ＣＴ、ＵＳＡ）を含有する２５μＬの反応液。９６℃で
１０分間の変性の後で、変性（９６℃、３０秒）、アニ
ーリング［６０℃（２７５ｂｐ断片の増幅の場合）また
は６２℃（１７５ｂｐ断片の増幅の場合）、３０秒］、
伸長反応（７２℃、３０秒）のＰＣＲ反応を２５サイク
ル行い、更に最後の伸長反応（７２℃、１分）を行っ
た。

【０１１９】増幅された２７５ｂｐと１７６ｂｐのＤＮ
Ａ断片は、ＳＳＣＰ法を用いて、我々の既報に記載され
ている通りに分析した(文献40,69参照)。１０％のポリ
アクリルアミドゲル(アクリルアミド：ビス＝４９：１)
を使用しての電気泳動を２１℃で９０分間、および１０
℃で７５分間で夫々行った。分離された断片を銀染色で
可視化した。

【０１２０】（４）ＦＣＧＲ２Ａ、３Ａおよび３Ｂの遺
伝子型の決定ＦＣＧＲ２Ａ−１３１Ｈ／Ｒ、ＦＣＧＲ３Ａ−１７６Ｆ
／ＶおよびＦＣＧＲ３Ｂ−ＮＡ１／２を、７５例のＳＬ
Ｅ患者と９４例の健常者からのゲノムＤＮＡを用いて決
定した。ＦＣＧＲ２Ａ―１３１Ｈ／Ｒの遺伝子の決定
は、ミスマッチプライマーを用いたＰＣＲ―ＲＦＬＰを
使用して行い(文献40参照)、ＦＣＧＲ３Ａ−１７６／Ｖ
の遺伝子の決定はＰＣＲ−ＳＳＣＰを使用して行い(文
献40参照)、ＦＣＧＲ３Ｂ−ＮＡ１／２の遺伝子の決定
はＰＣＲ−ＰＨＦＡ法(文献64参照)とＰＣＲ−ＳＳＰ法
(文献65参照)を用いて行った。

【０１２１】（５）直接シーケンス法ＦＣＧＲ２Ｂの直接シーケンスをＡＢＩＰＲＩＳＭ
^ＴＭ３１０遺伝子アナライザー（パーキン−エルマー・
アプライド・バイオシステムズ）とダイ−ターミネータ
ー法を用いて行った。

【０１２２】（６）統計学的解析関連解析のための計算はマッキントッシュ用のＳｔａｔ
Ｖｉｅｗ−Ｊ４．１１（Abacus Concepts Inc.,Berkele
y,CA,USA）を使用して行った。４つのＦｃγＲ遺伝子郡
の多型とＳＬＥ感受性の関連性についてχ^２検定を用い
て解析した。サンプルの数が少ない場合には、フィッシ
ャーの直接確率計算法を使用した。ハプロタイプの頻度
および連鎖不平衡パラメータの推定には、ＥＨプログラ
ムを使用した。

【０１２３】２．結果２つのプライマーセットにより増幅された第２のＰＣＲ
産物は（図６）、２つの変異部位、エクソン４における
ｃ．６１２Ｇ＞Ａ（同義置換）およびエクソン６におけ
るｃ．７７２Ｔ＞Ｇ（Ｙ２５８Ｄ）を含み、これらは、
ヒトＢリンパ芽球細胞株Ｒａｊｉ(文献66参照)（変異部
位の名称は文献53に基づく）を用いた予備実験において
検出された変異部位として報告されている。２対立遺伝
子多型（ＳＮＰ）がＰＣＲ−ＳＳＣＰ法によりエクソン
５において検出され（図７）、更に、直接シーケンス法
により、ＦｃγＲＩＩＢの膜貫通領域内のコドン２３２
での非保存的なアミノ酸置換（Ｉ２３２Ｔ）を引き起こ
す新規のＳＮＰｃ．６９５Ｔ＞Ｃ（エクソン５）である
ことを明らかにした。

【０１２４】表６は、７５例のＳＬＥ患者および９４例
の健常者のＦＣＧＲ２Ｂ−２３２Ｉ／Ｔ遺伝子型の頻度
を示す。当該遺伝子型の頻度は、ＳＬＥと健常者の間で
有意に異なる（χ^２＝６．４、Ｐ＝０．０４）。ＳＬＥ
の進展に関するＴ／ＴとＩ／Ｔ遺伝子型のオッズ値（Ｏ
Ｒ）は、Ｉ／Ｉ遺伝子型に対して、夫々、３．９（χ ^２
＝６．３、Ｐ＝０．０２、９５％信頼区間[ＣＩ]：１．
４−１１．２）および１．１（χ^２＝０．１、Ｐ＝０．
７３、９５％ＣＩ：０．６−２．２）であり、２３２Ｔ
／Ｔ遺伝子型とＳＬＥとの有意な関連が示された。反対
に、２３２Ｉ対立遺伝子の陽性率は、当該患者において
有意に減少した（χ^２＝６．３、Ｐ＝０．０２、０Ｒ：
０．３、９５％ＣＩ：０．１−０．７）。更に、２３２
Ｉと２３２Ｔの対立遺伝子頻度も、ＳＬＥと健常者の間
で有意に異った（χ^２＝５．１、Ｐ＝０．０２）。健常
者の遺伝子型頻度は、ハーディ−ワインバーグ平衡に適
合した。

【０１２５】

【表６】

【０１２６】発明者らは、次に、ＦｃγＲＩＩＢ−２３
２Ｉ／Ｔ多型と、ＳＬＥ患者における発症年齢、ループ
ス腎炎の有無、抗ｄｓＤＮＡおよび抗Ｓｍ等の疾患表現
型との関係を分析した。これらの臨床的および免疫学的
特徴が陽性または陰性の患者の間に遺伝子型頻度の有意
差は観察されなかった（データには示さず）。

【０１２７】ＦｃγＲファミリーの遺伝子が、第一義的
にＳＬＥと関連していることを確認するために、ＦＣＧ
Ｒ２Ａ−１３１Ｈ／Ｒ、ＦＣＧＲ３Ａ−１７６Ｆ／Ｖお
よびＦＣＧＲ３Ｂ−ＮＡ１／２の遺伝子型を、ＦＣＧＲ
２Ｂについて分析した患者と健常者の同セットにおいて
比較した。ＦＣＧＲ２Ｂ遺伝子型の決定には、ｃＤＮＡ
サンプルが必要であり、且つｃＤＮＡサンプルは大多数
の患者においては入手可能であったが、健常者では約半
数で入手可能であったことから、分析された個体の数
は、発明者らの以前の報告よりも少ない(文献40参照)。
表７に示す通り、ＦＣＧＲ２Ｂを除いて、サンプルのこ
れらのセットにおいて有意な関連は検出されず、４つの
ＦｃγＲ遺伝子群の中ではＦｃγＲＩＩＢが最もＳＬＥ
と強く関連することが示された。

【０１２８】

【表７】

【０１２９】これらの４つのＦｃγＲ遺伝子群の多型の
間の連鎖不平衡を、健常者からのデータを用いて解析し
たところ、ＦＣＧＲ２ＢおよびＦＣＧＲ３Ｂ（χ^２＝７
９．７、Ｐ＜１０^−６）の間、ＦＣＧＲ２ＡおよびＦＣ
ＧＲ３Ａ（χ^２＝６．４、Ｐ＝０．０１）の間で強い連
鎖不平衡が検出されたが、他の組み合わせでは検出され
なかった（表８）。

【０１３０】

【表８】

【０１３１】これらの結果は、ＦＣＧＲ２Ｂが３Ｂに隣
接して位置し、ＦＣＧＲ２Ａが３Ａに隣接して位置する
ことを示す報告されている物理的地図に一致する。ま
た、該ＳＬＥ患者において、強い関連が、ＦＣＧＲ２Ｂ
−２３２Ｔ対立遺伝子と３Ｂ−ＮＡ２対立遺伝子との間
で観察され（χ^２＝５８．８、Ｐ＜１０^−６）、このこ
とは、より多数のサンプルを用いて、発明者らが以前に
報告したＦＣＧＲ３Ｂ−ＮＡ２対立遺伝子とＳＬＥの関
連と合致する。

【０１３２】以前に検出されたＦＣＧＲ３Ｂ−ＮＡ２対
立遺伝子との関連性は、ＦＣＧＲ２Ｂ−２３２Ｔ対立遺
伝子との連鎖不平衡から生じることが説明されたとはい
え、ＦＣＧＲ３Ｂ−ＮＡ２が免疫複合体のクリアランス
の低さによって独立した寄与を有する可能性もある。そ
のような可能性を評価するために、ＦＣＧＲ２Ｂと３Ｂ
の２遺伝子座解析を行った。オッズ値(ＯＲ)の有意な増
加が２Ｂ−２３２Ｔ／Ｔと３Ｂ−ＮＡ２／２遺伝子型を
有する固体においてのみに検出されたが（ＯＲ：３．４
１、９５％ＣＩ：１．１−１０．９、Ｐ＝０．０５）、
２Ｂ−２３２Ｉ／Ｔ、３Ｂ−ＮＡ２／２群を含む他の組
合せにおいては検出されなかった（図８）。この結果に
より、ＦＣＧＲ２Ｂ多型が一義的であり、ＦＣＧＲ３Ｂ
の関連は二次的なものであることが支持された。

【０１３３】ＳＳＣＰにより検出されなかった他の変異
の存在を除外するために、ＦＣＧＲ２Ｂの翻訳領域全長
の配列を、ＦＣＧＲ２Ｂ−２３２Ｉ／Ｉ遺伝子型を有す
る１０例の個体、２３２Ｉ／Ｔを有する１０例の個体、
および２３２Ｔ／Ｔを有する２０例の個体からのｃＤＮ
Ａｓを用いて決定した。２つの同義置換、即ち、エクソ
ン３内のｃ．２１６Ｇ＞Ｔ（Ｒ７２Ｒ）およびエクソン
４内のｃ．６１２Ｇ＞Ａ（Ｌ２０４Ｌ）が、２３２−Ｉ
／Ｉと２３２−Ｉ／Ｔの遺伝子型の１個体ずつのみ検出
された。一方、以前に報告されたエクソン６における
ｃ．７７２Ｔ＞Ｇ（Ｙ２５８Ｄ）は、その機能が代わる
可能性のあるヒトＦＣＧＲ２Ｂの変異であるが(文献67
参照)、発明者らの対象においては検出されず、また、
コーカソイドおよびアフリカ系アメリカ人集団において
も希であることが示された。加えて、過去に登録された
配列（夫々、ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＨ００５４２２
とＮＭ＿００４００１）の間にｃ．６１４ＴとＡ（Ｆ２
０５Ｙ）の２種が存在するが、発明者らが解析した全サ
ンプルはｃ．６１４Ａ（２０５Ｙ）のホモ接合体であっ
たことにより、少なくとも日本人においては２０５Ｙが
高頻度であることが明かとなった。

【０１３４】更に、発明者らは、ＨＬＡ−ＤＲＢ１^＊１
５０１(文献68参照)およびＴＮＦＲ２−１９６Ｒ(文献6
9参照)とＦＣＧＲ２Ｂ多型の相互作用の可能性について
解析した。これらは、以前に、日本人ＳＬＥとの関連性
が示されている遺伝子である。表９に示す通り、ＦＣＧ
Ｒ２Ｂ−２３２Ｔ／Ｔ遺伝子型と、少なくとも１のＨＬ
Ａ−ＤＲＢ１^＊１５０１対立遺伝子をともに有する個体
のオッズ値（即ち、発症危険率）は、各遺伝子座の独立
した影響から予測されたものと比較して非常に高いもの
であった（ＯＲ：２０．９，９５％ＣＩ：２．９−１５
２．７，Ｐ＝０．００４）。これはこれらの遺伝子の間
の相乗効果を示唆する大変興味深い結果である。そのよ
うな効果は、ＦＣＧＲ２ＢとＴＮＦＲ２との間では観察
されなかった（データは示さず）。

【０１３５】

【表９】

【０１３６】以上により、発明者らの今回の発見は、Ｆ
ｃγＲファミリーの中でもＦＣＧＲ２Ｂが、日本人集団
におけるＳＬＥに対する主要な感受性遺伝子であること
を強く示唆する。Ｂ細胞の負の調節因子としてのＦｃγ
ＲＩＩＢの役割を明確に証明するインビトロおよび動物
実験を考え合わせると、ＦｃγＲＩＩＢ−２３２Ｔ多型
がＦｃγＲＩＩＢの機能低下と関連し、それによってＳ
ＬＥに特有の自己抗体が産生されるという機序が推定さ
れる。膜貫通領域におけるＦＣＧＲ２Ｂ−２３２Ｉ／Ｔ
置換に関連する機能的な相違はまだ推測の域を超えない
が、最近、Ｂ細胞のアポトーシスの惹起におけるＦｃγ
ＲＩＩＢの膜貫通ドメインの役割が証明されている。従
って、ＦｃγＲＩＩＢ−２３２Ｉ／Ｔ多型がアポトーシ
スのシグナル伝達に影響し、自己抗体を産生するＢ細胞
の存続を可能にし、該自己免疫疾患を引き起こすこと
が、１つの可能性として考えられる。今後、この仮説を
実験によって検証することは興味深い課題である。

【０１３７】

【発明の効果】本発明者らは、新たなＳＬＥ感受性多型
遺伝子を初めて決定した。この決定によって、対象にお
けるＳＬＥ発症の危険率をより詳細に予測することが可
能となった。

【０１３８】また、このような多型遺伝子を含むポリヌ
クレオチドにより、当該多型遺伝子型を容易に決定する
ことが可能である。また、ＳＬＥ発症危険率予測方法お
よびこの方法を行うための装置を使用することにより、
ＳＬＥ発症の危険率を容易に予測することが可能であ
る。

【０１３９】参照文献

【表１０】

【０１４０】

【表１１】

【０１４１】

【表１２】

【０１４２】

【表１３】

【０１４３】

【表１４】

【０１４４】

【表１５】

【０１４５】

【表１６】

【０１４６】

【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> OLYMPUS OPTICAL CO., LTD. <120> Susceptive gene to systemic lupus erythematosus and use thereof <130> A000101594 <140> <141> <160> 9 <170> PatentIn Ver. 2.0 <210> 1 <211> 8743 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for CD19 <220> <221> source <222> (1)..(8743) <223> /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" <220> <221> variation <222> (541) <223> /replace="g" <220> <221> variation <222> (908) <223> /replace="t" <220> <221> variation <222> (1104) <223> /replace="t" <220> <221> variation <222> (1391) <223> /replace="a" <220> <221> variation <222> (2367) <223> /gene="CD19" /replace="t" <220> <221> variation <222> (2481) <223> /gene="CD19" /replace="c" <220> <221> variation <222> (2553) <223> /gene="CD19" /replace="t" <220> <221> variation <222> (2785) <223> /gene="CD19" /replace="g" <220> <221> variation <222> (7248) <223> /gene="CD19" /replace="g" <220> <221> variation <222> (8518) <223> /replace="t" <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB052799 <400> 1 ggatcctctc gcctcggcct cctaaagtat tgggattaca ggcatgagcc tctgtgcctg 60 gctgtaactg acatgtttta agcaggggaa tgacatgctc tagtgaaagc cagtctgggc 120 agctgggtag ctaatgaggg gattagagag attttgttga atgaaaggca gattgagtcc 180 tgctactcgc ccccttcatt ccccttcatt catgcctcat tcttccgcct cccagccgcc 240 tcaactggcc aaagggaagt ggaggccctg ccacctgtag ggagggtccc ctggggcttg 300 cccacagcaa acaggaagtc acagcctggt gagatgggcc tgggaatcag ccactgagaa 360 agtgggtctc ttgggtccct gaattctttt tctgagtccc tgcagcagtg aaaaagacac 420 agaggcacat agagagtgac agagaaagag agagacagag aggagaggca tggggcagaa 480 taagaacaga tttaggagtt agaactcctg ggttctttta aaacaatttt tcttttagag 540 acagggtctt gttgtgttgc ccggactgga gcacagtggc tattcccagg cataatcatg 600 gtgcactgca gccttgaact cctgggctca agcgatcctt ctacctcagc ctcccaagga 660 cctgggacca taggcgtgta ccactgtgcc tggcttttgc ctggttttaa actgaggcag 720 tatgacttga gctcttaggc attaattgaa gctgtatctc attaactgag ggcttatgat 780 gtgctggaca ctgggctaat agtgctgaac atattgtcat ttttaatctt cacaaacaat 840 atttgtatag gactgttttc ttttcttttt tttttttgaa acagagtctc actctggtgc 900 ccaggctgga gtgcagtggt gtgatctcgg ctcactgcaa cctccgcctc ctggtttcca 960 gtgattctcc tgcctcagcc tcctaagtag ctgggattac aggtgtgcgc caccatgccc 1020 ggctaatttt tttttttttt tttgagaagg agtctatgtg cccagcattg ttctagagca 1080 cttgcaatta gtggtgaaca acacggtctc tactccaagg ggctcacatt cttgtgcaga 1140 aaacagaaat gaacaaataa acacacaaga tcatttcccg tggtagtgag agctgggatg 1200 aaaataaaac agcgtggcag ggaggaggca agtgttgtga gtctggaggg ttcctggaga 1260 atggggcctg aggcgtgacc accgccttcc tctctggggg gactgcctgc cgcccccgca 1320 gacacccatg gttgagtgcc ctccaggccc ctgcctgccc cagcatcccc tgcgcgaagc 1380 tgggtgcccc ggagagtctg accaccatgc cacctcctcg cctcctcttc ttcctcctct 1440 tcctcacccc catggaagtc aggcccgagg aacctctagt ggtgaaggtg gaaggtatgt 1500 ccaaagggca gaaagggaag ggattgaggc tggaaacttg agttgtggct gggtgtcctt 1560 ggctgagtaa cttaccctct ctgagcctcc attttcttat ttgtaaaatt caggaaaggg 1620 ttggaaggac tctgccggct cctccactcc cagcttttgg agtcctctgc tctataacct 1680 ggtgtgagga gtcggggggc ttggaggtcc cccccaccca tgcccacacc tctctccctc 1740 tctctccaca gagggagata acgctgtgct gcagtgcctc aaggggacct cagatggccc 1800 cactcagcag ctgacctggt ctcgggagtc cccgcttaaa cccttcttaa aactcagcct 1860 ggggctgcca ggcctgggaa tccacatgag gcccctggca tcctggcttt tcatcttcaa 1920 cgtctctcaa cagatggggg gcttctacct gtgccagccg gggcccccct ctgagaaggc 1980 ctggcagcct ggctggacag tcaatgtgga gggcagcggt gagggccggg ctggggcagg 2040 ggcaggagga gagaagggag gccaccatgg acagaagagg tccgcggcca caatggagct 2100 ggagagaggg gctggaggga ttgagggcga aactcggagc taggtgggca gactcctggg 2160 gcttcgtggc ttcagtatga gctgcttcct gtccctctac ctctcactgt cttctctctc 2220 tctgcgggtc tttgtctcta tttatctctg tctttgagtc tctatctctc tccctctcct 2280 gggtgtctct gcatttggtt ctgggtctct tcccagggga gctgttccgg tggaatgttt 2340 cggacctagg tggcctgggc tgtggcctga agaacaggtc ctcagagggc cccagctccc 2400 cttccgggaa gctcatgagc cccaagctgt atgtgtgggc caaagaccgc cctgagatct 2460 gggagggaga gcctccgtgt gtcccaccga gggacagcct gaaccagagc ctcagccagg 2520 gtatggtgat gactggggag atgccgggaa gctggggtcc agagacagag gggaggggaa 2580 actgaagagg tgaaaccctg aggatcaggc tttccttgtc ttatctctcc ctgtcccaga 2640 cctcaccatg gcccctggct ccacactctg gctgtcctgt ggggtacccc ctgactctgt 2700 gtccaggggc cccctctcct ggacccatgt gcaccccaag gggcctaagt cattgctgag 2760 cctagagctg aaggacgatc gcccggccag agatatgtgg gtaatggaga cgggtctgtt 2820 gttgccccgg gccacagctc aagacgctgg aaagtattat tgtcaccgtg gcaacctgac 2880 catgtcattc cacctggaga tcactgctcg gccaggtaga gtttctctca actgggaggc 2940 atctgtgtgg gggtactggg aagaagtgga agccagtcaa tcttagattc ccccaacccg 3000 agggctactc ccagcctcac cccaaacccc aacttccaca cagaacactg actccaagtc 3060 tttctttttt ttgacagagt ctcgctctgt tgcctaggct ggagtgcagt ggtgccatct 3120 tgtcttggct cactgcaacc tccgcctccc aggttcaagt gattcccctg cctcagcctc 3180 ctgagtagct gggattacag gtgcccacca ccacgcctgg ctaatttttt tttttttttt 3240 gagacggagt cttgcactgt cacccaggct ggagtgcagt ggcacgatct cagctcactg 3300 caacctccac cttccaggtt caagtgattc tcctgcctca gcctcccgag tagctgggat 3360 taaagcctgg ctaatttttt ttgtattttt agtagagatg gggtttcatt atgttggcca 3420 ggctggtctc aaactcctga cctcgtgatc cacccgcctc ggcctcccaa agtgctggga 3480 ttacagacat gagccacagg gccgggccaa gcctaatttt gtatttttag tagagatggg 3540 gtttctccct gttggaccag gctggtcttg aactcctgac ttcaggtgat ctgcctgcct 3600 tggcctccca aagtactggg attacaggca taagccaccg cacctggcct agacttcaag 3660 tctttcttcc ctcgcttcca agacactact tttctgggtc ttcacctacc attgcttgcg 3720 cctgcccacc agcttgggtg gagtcttcct tcctccccaa ctcctcactc ttggagccct 3780 gggccctctt cttatccctg tctgcacact ttcctatttg aacttgactc tcaatggctt 3840 cttgggtcac catgccttgg tgactctatt ccaggctcca tactcagcca tctcctgtgc 3900 catttgatat cccatggaca cctcaggctc aacagataca aaatcaaact caatgtcttc 3960 cccaagtata gtcttcttgg tggcccagtg taagcagagg gcaccaccac ctgctccctc 4020 gcccaggcta agaacctggg catccttctt tttcctcacc ccgtccaaca aactggtcac 4080 agtgttctgc caattctctc tccatgcaat cctatcatgc tatcctaact gcaattcaca 4140 aacccaaccc caactttcac tccaaacttg atccaagcaa tgtgctggat cccaactgta 4200 accttgcaaa ctcaactctg cccttcactt tgaccgtgac tatccttaat tgcagcagga 4260 aactgatcat tatgctcccc tcaatccaca cattgcctct gagtacagcc atggtttgtc 4320 cacgatttgc tcaaagacac tgcccatgtc ctgtgccagg gtctgtgaca atccctgacc 4380 tcctgggaca tggctcctta gagagaggag agcctttctc acagcttggg actttgagtc 4440 tgtgtctttt tttttttctt gagacggagt tttgctgtgg ttgcccaggc tggagtgcag 4500 tgatctcggc tcactgaaac ctccgcctcc cgggttcaaa cgattctcct gcctcagcct 4560 cccaagtagc tgggattaca ggcacccacc accatgccca gctaattttt ttgtattttt 4620 agtagagatg gggtttcacc atgttggcca ggctggtctc gaactcctga cctcaggtga 4680 tccacccgcc tttgcctccc aaagtgctgg gattacaggc gtcaaccacc gcgcccggcc 4740 gagtctgtgt cttgcctctg tgcctcagac ttgcggttcc ttgagatctc aggattggga 4800 cgtaagatgc cagcctgggg tcctcgtctc atagcccctt ccccctagta ctatggcact 4860 ggctgctgag gactggtggc tggaaggtct cagctgtgac tttggcttat ctgatcttct 4920 gcctgtgttc ccttgtgggc attcttcatc ttcaaagagg tgagtcatgt ccccagtggg 4980 tctgtccaaa ccctactcca tcttccccag gataagccgg ctctggccag tctgacaacc 5040 atctttcttt cctcccatcc ctcccttcaa gaccccagaa tcctgttctc cccagtcttc 5100 ctctagcctc cctcaaactt cccaagcctc ttgcaatttt tttttttttt ttgagacagg 5160 gtctcattct gtcaccccag ctggagtgca gtggcacaat ctgagctcac tgtaacctct 5220 gcctcccagg cttaagtgat tcttgtgctt cagcctcccg agtacctggg actacaagtg 5280 tatgccacca cacccggcca attttttata tttttagtag agacgaggtt tcaccatgtt 5340 ggccagactg gtctcgaact cttgacctca aatgatccgc ccacctcggc ctcccaaagt 5400 gctgggatta caggcacgag ccaccgcgcc cgtccgcctc gcaatttgaa ctcctgtctc 5460 ctttgttgaa ccaagtgacc tccccagcac ctggccccac aaatcctcac cctgccaagc 5520 agcccctcct ctgatcacgc cctttaactc ccaccagccc tggtcctgag gaggaaaaga 5580 aagcgaatga ctgaccccac caggaggtaa tgcaaccagt gcaccccgcg gtaacaccct 5640 ccaccttcac tttatgcctt gcacttactg tttcctctgc ccaggggttc tttgctccgt 5700 ctctactgtt tcaaatactg cccaacctca aagcccagct ccaaagctac ctcctctgtg 5760 aagaactcct tggaaatgat catctcagac tcctctattg gctgtcccag cacaagtgat 5820 cacgtttaac ttctgaaggc ctggacagaa tcttgagtgg gtccgccatt ccattccaag 5880 tcggccctca ccgtgcactt cctcttctcc cgccagattc ttcaaagtga cgcctccccc 5940 aggaagcggg ccccagaacc agtacgggaa cgtgctgtct ctccccacac ccacctcagg 6000 cctcggtaag aggcaccgcc cctccagcct atagctccgc cccagatccg gggctccacc 6060 cccactctcc tcatccctcc aatccgctgt gcgccaagcc ttctggagct cggaactccg 6120 cccccggggc ggggagtccc gcccagctat gagccccgcc tctagaacca gaccccgcct 6180 ccagggctca gagccacgcc cccaggaccc agagcctgaa gtcgtaatca agagcagaac 6240 ttcgccccag aactgaaggc ctcggcccta gatttagatt ccgccccagg gttcaaggcc 6300 gggttcctag acccagagtc cattcgcaga gcccaaaaca tcctcttccc gtgccccgcc 6360 gcgcggaccc ttagccttga ccgcccccat ctcttctgac cccgtcttac aatgcccctc 6420 tcaccaggac gcgcccagcg ttgggccgca ggcctggggg gcactgcccc gtcttatgga 6480 aacccgagca gcgacgtcca ggcggatgga gccttggggt cccggagccc gccgggagtg 6540 ggtgaatgac tgggagaggg aagggtcgtt ccccacatgg agggggttgg agcggtctgt 6600 ggcccgaata gtggactggg ccctggagga gagggggcat gactcggttc cccatcccca 6660 tccccaaacc cccaggccca gaagaagagg aaggggaggg ctatgaggaa cctgacagtg 6720 aggaggactc cgagttctat gagaacgact ccaaccttgg gcaggaccag ctctcccagg 6780 gtaaggctgc cctcccccgt ggccccccac ctctgcggtg gcctgtggac tcccatggac 6840 acccctcctt ctacaccaga tggcagcggc tacgagaacc ctgaggatga gcccctgggt 6900 cctgaggatg aagactcctt ctccaacggt aacttggggc ctttgtggga cctcagagac 6960 ttaggtgtaa ttgcagcgct gtgacactcc tagaagggga tccctggagt tctctctctt 7020 ctgccacagc tgagtcttat gagaacgagg atgaagagct gacccagccg gtcgccagga 7080 caatgggtgt gtgtgaggat ggcaacagtc caggggggag gcggaggaca cctggaggcc 7140 aggaggaata gtaacctccc tcttcccttt ccagacttcc tgagccctca tgggtcagcc 7200 tgggacccca gccgggaagc aacctccctg ggtgagagat gctttcaatc agactgcctt 7260 gcccagcttg ggtgacctgg cctcagctct gacaccagat ccaactttga cctgaccctg 7320 accccaaacc cgaacccaat cctgtgactc ctctcacctc aacactgagc cccatccccc 7380 atcctgagcc ccatccccca tcctgacccc caatatttac cccctcccta actgtgaata 7440 tcaacaccga tcccaatgca gtatcagcct ggacttgatc tccacctcac ctcagcccca 7500 gtgcagacct caacttggac cccagcttac tctgcagctt cttcatgact ctgactccga 7560 ctccctccag tttcttcttt ttctttttct tttttttgag acggagtctc cctctgttgc 7620 ccaggctgga gtgcagttgc cacctctgcc tcctaggttc aagcgattct catgcctcag 7680 cctcctgagt agctgggatt atagacgttt gccaccacac ctggctaatt tttgtatttt 7740 cagtagagac agggtttcgc catgttggcc agactggtct ccaactcctg gcctctagtg 7800 atctgcccgc ctttggcttc ccaaagtgct gggattacag gcatgagcca ccacgcccag 7860 cccagttctg ttcttgaccc cttccttagc cataatctaa cccatatcta accctgaccc 7920 tacagctaac tggggcccca aactcaatgc taaccaaatc accccttccc agcacagcat 7980 gggtaatgct cctcaccttc ctctgcccct cagtcttcct ccttaccgta ggctgtactt 8040 cccatgccct agcctccaat tctccatccc ccgcccaagc agggtcccag tcctatgagg 8100 atatgagagg aatcctgtat gcagcccccc agctccgctc cattcggggc cagcctggac 8160 ccaatcatga ggaaggtggg tgcttctgcc gctgtcccct gctgtcccct gggctgactt 8220 tgccttccag cctacttcca gtgccaccca tgttctcctc ctccctggtc ctatccagat 8280 gcagactctt atgagaacat ggataatccc gatgggccag acccagcctg gggaggaggg 8340 ggccgcatgg gcacctggag caccaggtga tcctcaggtg gccaggtgag ctgggactgc 8400 ccctagggaa agcggggagg gagggagata ggcacggatg gcagtggctg ctggctttca 8460 gggagggaga gggaacaggg ttcctagggc ctggtgggca gggggaggac tgctggatcc 8520 ctccccatca ccgtttcttc tgcatagcct ggatctcctc aagtccccaa gattcacacc 8580 tgactctgaa atctgaagac ctcgagcaga tgatgccaac ctctggagca atgttgctta 8640 ggatgtgtgc atgtgtgtaa gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt gtgtatacat gccagtgaca 8700 cttccagtcc cctttgtatt ccttaaataa actcaatgag ctc 8743 <210> 2 <211> 252 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for CD19 <220> <221> source <222> (1)..(252) <223> /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="16" /map="16p11.2" <220> <221> satellite <222> (194)..(213) <223> /note="microsatellite GT repeat variation 5" /rpt_type=tandem /rpt_unit=gt <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB052818 <400> 2 agagggaaca gggttcctag ggcctggtgg gcagggggag gactgctgga cccctcccca 60 tcaccgtttc ttctgcatag cctggatctc ctcaagtccc caagattcac acctgactct 120 gaaatctgaa gacctcgagc agatgatgcc aacctctgga gcaatgttgc ttaggatgtg 180 tgcatgtgtg taagtgtgtg tgtgtgtgtg tgtatacatg ccagtgacac ttccagtccc 240 ctttgtattc ct 252 <210> 3 <211> 258 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for CD19 <220> <221> source <222> (1)..(258) <223> /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="16" /map="16p11.2" <220> <221> gene <222> (194)..(219) <223> gene="CD19" <220> <221> satellite <222> (194)..(219) <223> /gene="CD19" /note="microsatellite GT repeat variation 1" /rpt_type=tandem /rpt_unit=gt <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB052814 <400> 3 agagggaaca gggttcctag ggcctggtgg gcagggggag gactgctgga cccctcccca 60 tcaccgtttc ttctgcatag cctggatctc ctcaagtccc caagattcac acctgactct 120 gaaatctgaa gacctcgagc agatgatgcc aacctctgga gcaatgttgc ttaggatgtg 180 tgcatgtgtg taagtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgta tacatgccag tgacacttcc 240 agtccccttt gtattcct 258 <210> 4 <211> 260 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for CD19 <220> <221> source <222> (1)..(260) <223> /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="16" /map="16p11.2" <220> <221> satellite <222> (194)..(221) <223> /note="microsatellite GT repeat variation 2" /rpt_type=tandem /rpt_unit=gt <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB052815 <400> 4 agagggaaca gggttcctag ggcctggtgg gcagggggag gactgctgga cccctcccca 60 tcaccgtttc ttctgcatag cctggatctc ctcaagtccc caagattcac acctgactct 120 gaaatctgaa gacctcgagc agatgatgcc aacctctgga gcaatgttgc ttaggatgtg 180 tgcatgtgtg taagtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tatacatgcc agtgacactt 240 ccagtcccct ttgtattcct 260 <210> 5 <211> 262 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for CD19 <220> <221> source <222> (1)..(262) <223> /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="16" /map="16p11.2" <220> <221> gene <222> (194)..(223) <223> /gene="CD19" <220> <221> satellite <222> (194)..(223) <223> /gene="CD19" /note="microsatellite GT repeat variation 3" /rpt_type=tandem /rpt_unit=gt <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB052816 <400> 5 agagggaaca gggttcctag ggcctggtgg gcagggggag gactgctgga cccctcccca 60 tcaccgtttc ttctgcatag cctggatctc ctcaagtccc caagattcac acctgactct 120 gaaatctgaa gacctcgagc agatgatgcc aacctctgga gcaatgttgc ttaggatgtg 180 tgcatgtgtg taagtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtatacatg ccagtgacac 240 ttccagtccc ctttgtattc ct 262 <210> 6 <211> 268 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for CD19 <220> <221> source <222> (1)..(268) <223> /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="16" /map="16p11.2" <220> <221> gene <222> (194)..(229) <223> /gene="CD19" <220> <221> satellite <222> (194)..(229) <223> /gene="CD19" /note="microsatellite GT repeat variation 4" /rpt_type=tandem /rpt_unit=gt <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB052817 <400> 6 agagggaaca gggttcctag ggcctggtgg gcagggggag gactgctgga cccctcccca 60 tcaccgtttc ttctgcatag cctggatctc ctcaagtccc caagattcac acctgactct 120 gaaatctgaa gacctcgagc agatgatgcc aacctctgga gcaatgttgc ttaggatgtg 180 tgcatgtgtg taagtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgta tacatgccag 240 tgacacttcc agtccccttt gtattcct 268 <210> 7 <211> 369 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for FCGR2B exon4,5 <220> <221> variation <222> (221) <223> /replace="a" <220> <221> variation <222> (304) <223> /replace="c" <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB050934 <400> 7 agtggctggt gctccagacc cctcacctgg agttccagga gggagaaacc atcgtgctga 60 ggtgccacag ctggaaggac aagcctctgg tcaaggtcac attcttccag aatggaaaat 120 ccaagaaatt ttcccgttcg gatcccaact tctccatccc acaagcaaac cacagtcaca 180 gtggtgatta ccactgcaca ggaaacatag gctacacgct atactcatcc aagcctgtga 240 ccatcactgt ccaagctccc agctcttcac cgatggggat cattgtggct gtggtcactg 300 ggactgctgt agcggccatt gttgctgctg tagtggcctt gatctactgc aggaaaaagc 360 ggatttcag 369 <210> 8 <211> 567 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for FCGR2B exon5 & flanking intron <220> <221> variation <222> (95) <223> /replace="t" <220> <221> variation <222> (100) <223> /replace="c" <220> <221> variation <222> (134) <223> /replace="t" <220> <221> variation <222> (148) <223> /replace="t" <220> <221> variation <222> (153) <223> /replace="g" <220> <221> variation <222> (251) <223> /replace="t" <220> <221> variation <222> (328) <223> /replace="c" <220> <221> variation <222> (386) <223> /replace="c" <220> <221> variation <222> (468) <223> /replace="a" <220> <221> variation <222> (477) <223> /replace="g" <300> <303> GenBank/EMBL/DDBJ <308> AB062416 <400> 8 aaggctgtgc tccatagagt aatgatgcct ccagctatgc gaggctttgg gcccaccctt 60 cccactgccc ctgagggcta aggggagccc ttccttctgc tcctgcctgc tcaccagtgt 120 gcctttatta gtttggtgga gaaaccttgg taggcaggag gcataagtcc agccacagaa 180 accctgtgca gatgaggctg gggatgtagt gagtgctgca gaagtgagtg actcagacac 240 agaagagctt tgggtgacaa gcactaggac atagcattgg atggggggga ggtgggacaa 300 ggagagtact gcctgtcctg atgtctgcct tccctagctc ccagctcttc accgatgggg 360 atcattgtgg ctgtggtcac tgggactgct gtagcggcca ttgttgctgc tgtagtggcc 420 ttgatctact gcaggaaaaa gcggatttca ggtttgtagc tcctcccagt ccctttggtt 480 atcagtttcc acttggccca ggccctaacc ccagacattg ccagaatccc tctctttggg 540 ctagatacac attcagatct aggcccg 567 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Homo sapiens gene for FCGR2B exon7 <400> 9 cccaactttg tcagcctcat 20

【図面の簡単な説明】

【図１】本発明の１態様であるＳＬＥ発症危険率予測装
置の構成図。

【図２】本発明において用いるスコアテーブルの例を示
す図。

【図３】本発明の１態様において使用する処理フローを
示す図。

【図４】本発明の１態様であるＳＬＥ発症危険率予測装
置の構成図。

【図５】ヒトＣＤ１９遺伝子のゲノム配置および日本人
において検出された変異を示す図。

【図６】ＦＣＦＲ２Ｂ遺伝子のｃＤＮＡ構造とネステッ
トＰＣＲ戦略を示す図。

【図７】ＦＣＧＲ２Ｂ−２３２Ｉ／Ｔ多型の代表的なＳ
ＳＣＰパターンを示す電気泳動写真。

【図８】２遺伝子座解析により得られたＦＣＧＲ２Ｂの
主な役割を示す図。

【符号の説明】

１．ゲノムＤＮＡサンプル精製装置２．遺伝子型決
定手段３．入力手段４．表示装置５．ＣＰＵ６．ＲＡＭ７．画
像処理部８．フィル１１．バス線

フロントページの続きＦターム(参考） 4B024 AA11 AA19 CA01 CA04 CA06 CA12 CA20 HA11 4B029 AA07 AA23 BB20 FA15 4B063 QA13 QA17 QA19 QQ02 QQ42 QQ53 QR08 QR14 QR32 QR35 QR40 QR42 QR62 QS16 QS25 QS36 QS39 QX01 QX10

Claims

【特許請求の範囲】

【請求項１】以下の群より選択される少なくとも１の
新規多型遺伝子：（１）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞Ｔ；（２）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ
＞Ｔ；（３）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）_{１２−１８}；および（４）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけ
るｃ．６９５Ｔ＞Ｃ。
【請求項２】以下を具備する対象における全身性エリ
テマトーデスの発症危険率を予測する方法；（１）対象からのゲノムＤＮＡサンプルを準備するこ
と；（２）得られたゲノムＤＮＡサンプルについて以下の少
なくとも１の多型の遺伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；並びに（３）前記（２）で選択された多型が前記（ｄ）の多型
であり、且つ該遺伝子型がコドン２３２Ｔ／Ｔを生じる
ような多型である場合には、更に（ｅ）ヒト白血球ＨＬ
Ａ−ＤＲＢ１^＊１５０１の有無を決定すること；（４）前記（２）および（３）において決定された遺伝
子型を基にＳＬＥの発症危険率を判定することにより対
象における全身性エリテマトーデスの発症危険率を予測
すること。
【請求項３】コンピュータを利用した対象における全
身性エリテマトーデスの発症危険率を予測する装置であ
って、以下を具備する装置；（１）ゲノムＤＮＡを精製するための装置；（２）前記（１）で精製されたゲノムＤＮＡについて、
以下からなる群より選択される少なくとも１の多型の遺
伝子型を決定するための装置（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；および（３）上記（２）に記載の多型の遺伝子型に対して所定
のスコアが対応させられているスコアテーブルを記憶す
る記憶手段；並びに（４）（２）で決定された遺伝子型を基に前記（３）の
記憶手段に記憶される前記スコアテーブルを検索して、
対応する得点データを抽出し、抽出された前記スコアデ
ータの全て、および前記スコアの合計得点を出力する手
段。
【請求項４】コンピュータを利用した対象における全
身性エリテマトーデスの発症危険率を予測する装置であ
って、以下を具備する装置；（１）以下からなる群より少なくとも１で選択された全
身性エリテマトーデス感受性多型遺伝子；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５Ｇ＞Ｔ；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０Ｃ
＞Ｔ；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）_{１２−１８}；および（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５Ｔ＞Ｃの遺伝子型に対して所定のスコアが対応させられている
スコアテーブルを記憶する記憶手段；並びに（２）選択
された多型について決定された遺伝子型を基に前記
（１）の記憶手段に記憶されたスコアテーブルを検索し
て、対応する得点データを抽出し、抽出された前記スコ
アデータの全て、および前記スコアの合計得点を出力す
る手段。
【請求項５】コンピュータに、（１）得られたゲノムＤＮＡサンプルについて以下の少
なくとも１の多型の遺伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；並びに（２）前記（１）で選択された多型が前記（ｄ）の多型
であり、且つ該遺伝子型がコドン２３２Ｔ／Ｔを生じる
ような多型である場合には、更に（ｅ）ヒト白血球ＨＬ
Ａ−ＤＲＢ１^＊１５０１の有無を決定すること；（３）前記（１）および（２）において決定された遺伝
子型を基にＳＬＥの発症危険率を判定することにより対
象における全身性エリテマトーデスの発症危険率を予測
すること；を実行させるためのプログラム。
【請求項６】コンピュータに（１）ゲノムＤＮＡを精製すること；（２）前記（１）で精製されたゲノムＤＮＡについて、
以下からなる群より選択される少なくとも１の多型の遺
伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；および（４）（２）で決定された遺伝子型を基に、上記（２）
に記載の多型の遺伝子型に対して所定のスコアが対応さ
せられているスコアテーブルを記憶する記憶手段に記憶
される該スコアテーブルを検索して、対応する得点デー
タを抽出し、抽出された前記スコアデータの全て、およ
び前記スコアの合計得点を出力すること；（５）（４）で得られた合計得点から対象における全身
性エリテマトーデスの発症危険率を予測すること；を実
行させるためのプログラム。
【請求項７】対象における全身性エリテマトーデスの
発症危険率を予測する方法であって、以下を具備する方
法。（１）ゲノムＤＮＡを精製すること；（２）前記（１）で精製されたゲノムＤＮＡについて、
以下からなる群より選択される少なくとも１の多型の遺
伝子型を決定すること；（ａ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．７０５の遺伝子
型；（ｂ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるＩＶＳ１４−３０の
遺伝子型；（ｃ）ヒトＣＤ１９遺伝子におけるｃ．^＊１３２（Ｇ
Ｔ）の反復回数；および（ｄ）ヒトＦＣＧＲ２Ｂにおけるｃ．６９５の遺伝子
型；（４）（２）で決定された遺伝子型を基に、上記（２）
に記載の多型の遺伝子型に対して所定のスコアが対応さ
せられているスコアテーブルを検索して、対応する得点
データを抽出し、抽出された前記スコアデータの全て、
および前記スコアの合計得点を出力すること；並びに（５）（４）で得られた合計得点から対象における全身
性エリテマトーデスの発症危険率を予測すること。
【請求項８】配列番号１から８に記載の塩基配列から
なる群より選択された１の塩基配列により示されるポリ
ヌクレオチド。
【請求項９】請求項８に記載されたポリヌクレオチド
において、前記配列における多型遺伝子の存在する以外
の部位において、１若しくは数個のヌクレオチドが欠
失、置換または付加された修飾ポリヌクレオチド。
【請求項１０】配列番号１の２５５３位または８５１
８位に存在する１ヌクレオチドを含む配列番号１に含ま
れる連続する１０から３０塩基の塩基配列によりポリヌ
クレオチドからなる断片。
【請求項１１】配列番号５の１９４位から２２３位ま
でに存在する１５ヌクレオチドを含む配列番号５に含ま
れる連続する１５から３０塩基の塩基配列によりポリヌ
クレオチドからなる断片。
【請求項１２】配列番号６は１９４位から２２９位ま
でに存在する１８ヌクレオチドを含む配列番号６に含ま
れる連続する１８から３０塩基の塩基配列によりポリヌ
クレオチドからなる断片。
【請求項１３】配列番号７の３０４位に存在する１ヌ
クレオチドを含む配列番号７に含まれる連続する１５か
ら３０塩基の塩基配列によりポリヌクレオチドからなる
断片。
【請求項１４】配列番号８の３８６位に存在する１ヌ
クレオチドを含む配列番号８に含まれる連続する１５か
ら３０塩基の塩基配列によりポリヌクレオチドからなる
断片。
【請求項１５】配列番号９に記載の塩基配列により示
されるポリヌクレオチド。