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JP2002512599A - 富グアニジンオリゴアプタマー及び免疫応答の調節方法 - Google Patents

富グアニジンオリゴアプタマー及び免疫応答の調節方法

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JP2002512599A
JP2002512599A JP53023398A JP53023398A JP2002512599A JP 2002512599 A JP2002512599 A JP 2002512599A JP 53023398 A JP53023398 A JP 53023398A JP 53023398 A JP53023398 A JP 53023398A JP 2002512599 A JP2002512599 A JP 2002512599A
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JP53023398A
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タム,ロバート
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アイ・シー・エヌ・フアーマシユーテイカルズ・インコーポレイテツド
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Abstract

(57)【要約】 アプタマーオリゴヌクレオチドは、CD28のような補助刺激因子並びにIL−2及びGMCSFのようなサイトカインをコードする遺伝子を調節するSp1タンパク質及びSp1関連タンパク質のDNA結合部位に特異的に結合する。このオリゴヌクレオチドは、T細胞活性化を調節する分子を特異的に調節する調節タンパク質とDNA結合部位において競合する。これは、遺伝子の転写を阻止することによって遺伝子発現を有効に調節する。アプタマーは、乾癬、I型(インスリン依存性)真性糖尿病、多発性硬化症、自己免疫ブドウ膜炎、リウマチ様関節炎、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患(クローン病及び潰瘍性大腸炎)、敗血症性ショックのようなT細胞の異常な活性化が関与する疾病の治療効果を与えるために、また、同種移植片拒絶のようなT細胞の正常な活性化を調節するために投与される。

Description

【発明の詳細な説明】 富グアニジンオリゴアプタマー及び免疫応答の調節方法 発明の分野 本発明の分野は免疫学である。 発明の背景 多くの主要T細胞仲介疾患の発病及び悪化の原因は、T細胞の異常な活性化に よって誘発される不適正な免疫応答にある。I型(インスリン依存性)真性糖尿 病、甲状腺炎、サルコイド症、多発性硬化症、自己免疫性ブドウ膜炎、リウマチ 様関節炎、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患(クローン病及び潰瘍性大腸 炎)、および再生不能性貧血のような他の多くの疾病の原因もT細胞の異常な活 性化にあると考えられている。更に、敗血症性ショック及び腫瘍誘発性悪液質の ような種々の症候群にもT細胞の活性化及び毒性になり得るレベルのリンホカイ ンの産生増進が関与すると考えられる。また、T細胞の正常な活性化は、“外来 ”ドナー組織の有効な破壊に必要なシグナルを供給することによって移植細胞及 び移植器官の拒絶を仲介する。 T細胞の増殖並びに特定の免疫調節サイトカインの遺伝子発 現及び分泌に導くTリンパ球の活性化には独立した2つのシグナルが必要である 。第一のシグナルは、特異的T細胞レセプター/CD3複合体によって、抗原提 示細胞(APC)表面の主要組織適合複合体分子によって提示される抗原が認識 されることによって生じる。T細胞とAPCとの抗原非特異的細胞内相互作用に よって第二のシグナルが生じ、このシグナルは抗原に対するT細胞応答を調節す る。これらの二次シグナルまたは共刺激シグナルは抗原に対するT細胞応答の大 きさを決定する。共刺激された細胞は、特定のサイトカイン遺伝子の転写レベル を上昇させ、選択されたmRNAを安定させることによって反応する。共刺激の 非存在下のT細胞活性化は、不全性または無力性のT細胞応答を生じる。1つの 重要な共刺激シグナルは、T細胞表面レセプタ−CD28とAPC上のB7関連 分子との相互作用によって提供される(Linsley and Ledbet ter(1993)Annu Rev Immunol 11:191−212 )。CD28は、95%のCD4+T細胞(B細胞抗体産生のヘルパー機能を果 たす)及び50%のCD8+T細胞(細胞障害性機能を有する)上で構成的に発 現されている(Yamadaら(1985)Eur J Immunol 15:1164−1168)。抗原刺激またはin vitroのマイトジェン 刺激の後、高レベルの表面CD28の誘発及びいくつかの免疫調節サイトカイン の産生が生じる。これらの免疫調節サイトカインとしては、T細胞の細胞周期の 進行に必要なインターロイキン−2(IL−2)、多様な抗ウイルス効果及び抗 腫瘍効果を示すインターフェロン−ガンマ(IFNγ)、好中球及びリンパ球の 強力な走化性因子として知られたインターロイキン−8(IL−8)がある。こ れらのサイトカインがT細胞活性化のCD28経路によって調節されることが証 明された(Fraserら(1991)Science 251:313−31 6、Sederら(1994)J Exp Med 179:299−304、 Wechslerら(1994)J Immunol 153:2515−25 23)。IL−2、IFNγ及びIL−8は、広範囲の免疫応答の促進に必須で あり、多くのT細胞仲介疾患の状態で超発現していることが判明している。 乾癬の場合には、活性化した病変性T細胞がIL−2及びIFNγのようなT h1サイトカインを主として放出する(Schlaakら(1994)J In vest Derm 102:145−149)。分泌されたこれらのサイトカインは正常な角化細胞 を誘発し、乾癬病変で見られる表現型(HLADR+/ICAM−1+)と同じ表 現型を正常な角化細胞に発現させる(Baadsgaardら(1990)J Invest Derm 95:275−282)。またIL−8は、in v itro及びin vivoのプロ炎症特性を有しており、且つ、活性化T細胞 と乾癬病巣の角化細胞との双方によって大量に分泌されるので、角化細胞の過増 殖のような乾癬皮膚に見られる病理変化の主要な原因になると考えられている。 更に、B7ファミリーレセプター(活性化APCで見出されるCD28の天然リ ガンド)の1つであるBB1は、乾癬に罹った皮膚の角化細胞中で発現している が健康な皮膚の角化細胞中では検出されないことが判明した(Nickolof fら(1993)Am J Pathology 142:1029−1040 )。このことは、疾病の発生病理にT細胞活性化が重要であることを裏付ける。 アレルギー性接触皮膚炎及び肥厚性扁平苔癬のような他のT細胞仲介皮膚疾患 では、大多数の皮膚及び上皮のCD3+T細胞中でCD28が高レベルで発現し ているが、健康な皮膚及び基 底細胞腫(非T細胞性皮膚疾患)中ではCD28は血管周囲のT細胞中でのみ発 現している。アレルギー性接触皮膚炎及び肥厚性扁平苔癬の双方ではまた、B7 発現が皮膚の樹状細胞、皮膚のAPC及び角化細胞で観察されるが、健康な皮膚 及び基底細胞腫では観察されない(Simonら(1994)J Invest Derm 103:539−543)。従って、これは、CD28/B7経路 がT細胞仲介皮膚疾患の重要なメディエーターであることを示唆する。 自己寛容の喪失を原因とするいくつかの自己免疫疾患を伴うT細胞の異常な活 性化の主な特徴は、CD28+T細胞の存在とそのリガンドB7の活性化された 免疫担当APC(単球、マクロファージまたは樹状細胞)上の発現である。この ような疾患の例は、自己免疫性グレイブ甲状腺炎(Garcia−Cozarら (1993)Immunologia 12 32)、サルコイド症(Vand enbergheら(1993)Int Immunol 5:317−321 )、リウマチ様関節炎(Verwilghenら(1994)J Immuno l 153:1378−1385)及び全身性エリテマトーデス(Sfikak isら(1994)Clin Exp Immunol 96:8−14) である。移植された細胞及び器官の拒絶がT細胞の正常な活性化によって仲介さ れる場合には、T細胞レセプター結合が生じているときに、例えばドナー組織上 の外来抗原に対して適正なアロジェネイック応答を生じさせるCD28と適正B 7リガンドとの結合が生じていなければならない(Azumaら(1992)J Exp Med 175:353−360、Turkaら(1992)Pro c Nat Acad Sci USA 89:11102−11105)。 自己免疫疾患の伝統的な治療方法では、T細胞活性化、即ち、自己抗原に対す る自己反応性免疫応答のエフェクター段階を阻止しない。現状では、ステロイド 及び非ステロイド系の抗炎症薬(NSAIDS)のような薬剤が症状を軽減する ために使用されているが、これらの薬剤は病気の進行を阻止できない。更に、ス テロイドは、骨粗鬆症、器官毒性及び糖尿病の誘発などの副作用を生じ、また、 軟骨変性プロセスを促進したり2〜8時間程度のいわゆる注射後フレアを生じた りする。NSAIDSは、胃腸にも副作用があり、また、顆粒球減少症及び医原 性肝炎の危険も増す。 特に病気の進行した時期には、別の形態の治療方法として免 疫抑制剤も使用される。しかしながらこれらの薬剤は、免疫系全体を抑制し、高 血圧及び腎毒性のような重大な副作用をしばしば生じる。また、シクロスポリン 及びFK506のような確定された免疫抑制剤はCD28依存性T細胞活性化経 路を阻害することができない(Juneら(1987)Mol Cell Bi ol 7:4472−4481)。 現在使用されているT細胞活性化に影響を及ぼす物質は、合成ペプチド、モノ クローナル抗体及び可溶化形態のT細胞活性化分子である。CD28、CD40 L及びCAMファミリーの接着分子のようなT細胞活性化分子に競合的な合成ペ プチドが今日まで同定されたことはない。モノクローナル抗体(mAb)は、乾 癬のようなT細胞仲介疾患に対する治療効果(抗CD4(Prinzら(199 4)Lancet 338:320−321))、及び、同種移植片中の正常な T細胞活性化に対する免疫抑制効果(抗VCAM−1及びVLA−4(Isob eら(1994)J Immunol 153:5810−5818))を発揮 し得ることを示した。しかしながら、治療の長期化に伴って、宿主動物体内でモ ノクローナル抗体に対する抗体が産生され、モノクローナル抗体の有効性が低下 する。これらのモノ クローナル抗体に対する誘発免疫応答の危険性を見掛けの上で低減する“ヒト化 ”モノクローナル抗体が開発されている。しかしながら、これらのモノクローナ ル抗体はいまだ開発途上であり、更に、これらの新しいモノクローナル抗体は依 然として大きいタンパク質であり、そのためターゲット部位に到着するのが難し い。ヒトIg Cγ鎖に融合したヒトCTLA−4遺伝子(配列的にCD28に 近縁)の細胞外ドメインを含むCTLA−4IgのようなT細胞活性化分子の可 溶化形態が開発されている。CTLA−4Igは、ラットのゼノジェネイック( Lenschowら(1992)Science 257789−792)及び アロジェネイック(Turkaら(1992)Proc Nat Acad S ci USA 89:11102−11105)な心臓同種移植片の拒絶を防止 することによってT細胞の正常な活性化を特異的にブロックすることを示し、ま た、ラットの自己免疫性糸球体腎炎中で見出されるようなT細胞の異常な活性化 に治療効果を有することを示した(Nishikawaら(1994)Eur J Immunol 24:1249−1254)。しかしながら、可溶性CT LA−4Igはモノクローナル抗体と同様の制約を有しており、更 に、製造コストも高い。また、このCD28様分子の真の機能は未知であり、治 療効果が評価可能になるためにはその機能を完全に決定する必要がある。 CD28の細胞表面発現の阻害は、活性化T細胞の長期の非反応性及び欠失を 導く。不活性化により、T細胞の増殖は阻止され、インターロイキン−2、イン ターフェロン−ガンマ及びインターロイキン−8のような特異的免疫調節サイト カインのT細胞特異的産生が阻害される。 CD28遺伝子の発現の調節は、アンチセンス及び三重鎖形成オリゴヌクレオ チドを使用し、オリゴデオキシ−リボヌクレオチドまたはオリゴリボヌクレオチ ドをCD28遺伝子またはプロモーター領域の内部のDNAまたはRNA配列に ハイブリダイズさせることによって得られる(CD28 Tam特許)。オリゴ ヌクレオチドは、T細胞の正常及び異常な活性化の効果をブロックするために使 用される常用の物質の多くの欠点を防止する。しかしながら、アンチセンス戦略 用に設計されたこれらのオリゴは、細胞内ヌクレアーゼまたは細胞外媒質に存在 するヌクレアーゼによって分解され易い。 タンパク質に対するDNA(またはRNA)の結合は、遺伝 子の転写を調節する基本的経路であることがこれまでに判明していた。これらの 調節タンパク質または転写因子は、特異的二次構造をもつDNA配列を認識し、 その後の相互作用によって遺伝子発現の正または負の調節を導く。アプタマーは 、特定のタンパク質に特異的に結合し得る短いオリゴヌクレオチド配列である。 異なるアプタマー配列は異なるタンパク質に特異的に結合し得ることが証明され た。例えば配列GGNNGG〔N=グアノシン(G)、シトシン(C)、アデノ シン(A)またはチミジン(T)を表す〕はトロンビンに特異的に結合する(B ockら(1992)Nature 355:564−566、及び、Tool eらの特許第5582981号(1996))。 しかしながら、上のDNA結合部位における転写因子として知られた調節タン パク質との競合的阻害物質として機能し得るアプタマー配列が記載されたことは ない。転写因子は、遺伝子の5’上流プロモーター領域の特異的調節配列に一次 的に結合することによって遺伝子を調節するタンパク質のクラスである。この相 互作用が転写の開始を導く。Sp1、AP2、AP−1、EGR−1及びNFκ Bのようないくつかの転写因子が、Tリンパ球及びBリンパ球の活性化に必須で ある(Skerkaら, J Biol Chem 270:22500−22506,Jungら(19 95)Ann N Y Acad Sci 766:245−252)。いくつ かの場合には、共刺激により開始されるシグナルによってこれらの転写因子が誘 発される(Jungら(1995)Ann N Y Sci 766:245−2 52)。従って、特異的DNA結合部位とタンパク質との相互作用を妨害しその 結果として補助刺激経路を含むいくつかの免疫経路を抑制し得る物質及び方法の 開発が依然として要望されている。発明の概要 本発明によれば、CD28のような補助刺激分子並びにIL−2及びGMCS Fのようなサイトカインをコードする遺伝子を調節するSp1タンパク質及びS p1近縁タンパク質のようなタンパク質のDNA結合部位に特異的に結合するよ うに設計されたアプタマーオリゴヌクレオチドが提供される。 好ましい実施態様においては、オリゴヌクレオチドは、Sp1タンパク質及び Sp1近縁タンパク質のような特異的調節タンパク質に結合するように設計され 、調節下にある遺伝子のプロモーター領域にこれらの転写因子と競合的に結合す るように設計されている。これは、遺伝子の転写を阻止することによっ て遺伝子発現を調節する機能を果たす。従って、アプタマーオリゴヌクレオチド はまた、RNAまたはDNAの機能、即ち、そのタンパク質への翻訳、その細胞 質へのトランスロケーションまたはその総合的生物機能に必要な他の何らかの活 性を阻害することができる。RNAまたはDNAがその機能の全部または一部を 発揮できないとき、その結果としてT細胞活性化を調節するゲノムの一部分の適 正な発現に欠陥が生じ、上記のような代謝の調節が生じる。 T細胞活性化を調節できる分子を特異的に調節する調節タンパク質とDNA結 合部位において競合するように、囮であるアプタマー核酸をターゲッティングさ せるのが好ましい。CD28タンパク質はこの方法に特に有用であることが知見 された。CD28遺伝子及びCD28関連遺伝子の発現を阻害することは、乾癬 及び他の皮膚病、T細胞の異常な活性化に伴う症候群、自己免疫疾患及び同種移 植片拒絶の治療に有用であると期待される。 T細胞活性化を調節することが判っている調節下のタンパク質の発現を阻害す るなどのように、調節タンパク質とDNA結合部位において競合するオリゴヌク レオチドを患者に接触させ ることから成るT細胞活性化の調節方法が提供される。CD28遺伝子及びCD 28関連遺伝子の転写を調節するSp1タンパク質及びSp1関連タンパク質の ようなタンパク質に結合するオリゴヌクレオチドが好ましい。 本発明の別の特徴によれば、アプタマーは、乾癬、AIDSによって悪化した 乾癬及び他の皮膚病、I型(インスリン依存性)真性糖尿病、甲状腺炎、サルコ イド症、多発性硬化症、自己免疫性ブドウ膜炎、リウマチ様関節炎、全身性エリ テマトーデス、炎症性腸疾患(クローン病及び潰瘍性大腸炎)、敗血症性ショッ ク、腫瘍誘発性悪液質及び再生不能性貧血のようなT細胞の異常な活性化が関与 する疾病を治療するため、及び、同種移植片拒絶のような場合にT細胞の正常な 活性化を調節するために投与される。これは、CD28分子及びCD28関連分 子などのT細胞活性化分子の合成及び発現を撹乱することによって達成できる。 本発明の更に別の特徴によれば、Sp1タンパク質及びSp1関連タンパク質 のような特異的調節タンパク質に結合でき、従って、(a)これらのタンパク質 によって正常に調節され及び(b)T細胞応答を調節するCD28タンパク質及 びCD28 関連タンパク質のような遺伝子の転写を阻害できるアプタマーが提供される。図面の簡単な説明 図1A及び図1Bは、それぞれ細胞外流体中及びジャーカット細胞中の32P標 識ホスホロチオエート、ICN16064(配列4)のin vitro安定性 を表すグラフである。図1C及び図1Dは、それぞれ細胞外流本中及びジャーカ ット細胞中の32P標識ホスホロチオエート、ICN16214(配列21)のi n vitro安定性を表すグラフである。 図1E及び図1Fは、20%ポリアクリルアミド変性ゲルで電気泳動させ次い でPhosphorImagerを用いて可視化することによって評価したオリ ゴヌクレオチド、ICN16064(配列4)及びICN16214(配列21 )(2,000cpm)の各々の時間依存性(0−96時間)分解を表すグラフで ある。Nickspinカラム(Pharmacia)を使用し、10,000 cpmの細胞外(図1E)及び細胞(1F)の溶出液中に各時点で残存していた 無傷の全長32P−RT03S(○)及び32P−RTCO6S(●)を時点t=0 に対するパーセンテージとして測定した。分子量標準(Std)、32P− dNTP(N)及び遊離32P−オルトホスフェート(P)を同時に分析した。 図2は、ゲルシフト分析を表すグラフであり、G(グアニジン)富化12量体 配列モチーフを含むオリゴヌクレオチド(レーン5及び11)が、HeLa核抽 出物とのインキュベーション後に、他のホスホロチオエートオリゴヌクレオチド で観察されたバンドBとは異なる電気泳動シフトをもつバンドAを生じることを 示す。 図3は、CD28プロモーター領域(残基−197〜+28)に由来する22 6bpのインサート(28b)または残基−51〜−22が表1の配列3で置換 された突然変異体(28h−1)をCATリポーター遺伝子の上流に含むプラス ミドベクターをジャーカット細胞にトランスフェクションし、次いでホスホロチ オエートオリゴヌクレオチド、ICN16064及びICN16481、で処理 するかまたは処理しないときのクロラムフェニコールアセチルトランスフェラー ゼ(CAT)の発現を表すグラフである。 図4は、28b、即ちCD28遺伝子の上流領域−197〜+28に対するS p1の結合が特異的であることを示すゲルス ーパーシフトアッセイを表すグラフである。 図5は、32P標識二重鎖オリゴ28b(親28b、表1の配列1に由来)に 対するSp1の結合と、コールド二重鎖オリゴ28bと図1A及び16481の アプタマーオリゴとの競合的結合とを表すグラフである。特定実施態様の詳細な説明 Sp1タンパク質及びSp1関連タンパク質のような調節タンパク質のDNA 結合部位に特異的に結合するアプタマーオリゴヌクレオチドは、対象遺伝子のプ ロモーター領域の特異的二重鎖DNA領域に調節タンパク質が結合することを阻 止するであろう。アプタマーによる競合的結合は、遺伝子の転写を妨害し、従っ て遺伝情報がDNAからタンパク質に伝達されることを阻止するであろう。オリ ゴヌクレオチドはターゲット特異的という特性を有しており、この特性によって 多目的性になり得る。オリゴヌクレオチドは4つのモノマー単位から成る長い鎖 であるため、任意のターゲットRNA配列に応じて容易に合成できる。 オリゴヌクレオチドに仲介される遺伝子発現の阻害は、多くのモデル及びin vitro系において証明されており、ヒ トの多くの疾病の新しい治療戦略としてその治療能力が期待されている(Uhl mann and Peyman(1990)Chem Rev 90:544 −584;Zon and Stec(1991)Oligonucleoti des and analogues−A Practical Approa ch:87−108;Millerら(1981)Biochem 20:18 74−1880;Orsonら(1991)Nucleic Acid Res 19:3435−3441,Helene and Toulme(1990 )Biochem Biophys Acta 1049:99−125;Th ierry and Dritschilo(1992)Nucleic Ac id Res 20:5691−5698)。最近では、細胞内摂取の増進を示 すホスホロチオエート(Zon and Stec(1991)Oligonu cleotides and analogues−A Practical Approach:87−108)及びホスホロチオエート−3’ヒドロキシプ ロピルアミン(Tamら(1994)Nucleic Acid Res 22 :977−986)のようなヌクレアーゼ耐性オリゴヌクレオチドの合成が進歩 したので、オリゴヌクレオチド を新しい形態の治療薬として使用することが考察されている。調節タンパク質結 合部位をターゲッティングするアプタマーオリゴヌクレオチドは、核酸を主体と する化合物の代替クラスを表し、従来技術の方法で遭遇した問題に理想的な解決 を与える。アプタマーオリゴヌクレオチドは、特異的遺伝子発現の調節に直接関 与し、その結果としてターゲットタンパク質発現をスイッチオフするが、レセプ ター−リガンド相互作用の結合メカニズム及び親和性の完全な理解を必要とする ようなターゲットタンパク質に対する可溶性レセプターの競合的阻害には関与し ない。オリゴヌクレオチドは小さい分子であり、従って、大きい分子から成る阻 害物質で生じるような立体上の問題は生じない。ターゲットの説明 本文中で考察されるターゲットは、免疫応答の開始または維持において重要な 役割を果たす転写因子によって調節され得る分子である。これらの分子としては 、CD28のような共刺激分子並びにIL−2、GM−CSF及びIFNγのよ うなサイトカインがある。 治療薬については、CD28分子またはCD28関連分子のような共刺激分子 の発現を低下させることによって治療できる 疾病に罹患している疑いのある動物が本発明のオリゴヌクレオチドの投与によっ て治療できる。オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドに加えて、担体、増 粘剤、希釈剤、バッファ、防腐剤、界面活性剤、リポソームまたは脂質成分など を含有する医薬組成物の形態に製剤化できる。医薬組成物はまた、オリゴヌクレ オチドに加えて、抗菌薬、抗炎症薬、麻酔薬などの1種または複数の有効成分を 含有し得る。 医薬組成物は、局部的治療もしくは全身的治療のいずれが望ましいかに従って 、また、治療すべき領域に依存して、種々の方法で投与され得る。外用投与(眼 内、膣内、直腸内、鼻孔内など)、吸入による経口投与、または、静脈内点滴、 皮下、腹腔内もしくは筋肉内注射のような非経口投与が可能である。 外用投与に好適な製剤形態は、軟膏剤、ローション剤、クリーム剤、ゲル剤、 液滴剤、坐薬剤、スプレー剤、液剤及び散剤などである。慣用の医薬用担体、水 性、粉末状または油状の基剤、増粘剤なども所要または所望であろう。坐薬剤を 塗布したコンドームまたはグローブも有用であろう。 経口投与に好適な組成物としては粉末または顆粒、水または非水性媒体中の懸 濁液または溶液、カプセル、小袋または錠剤 がある。増粘剤、香味剤、希釈剤、乳化剤、分散助剤または結合剤の使用が望ま しい。 非経口投与に好適な製剤の形態としては、バッファ、リポソーム希釈剤及び他 の適当な添加剤を含有し得る無菌水溶液の形態がある。 投与用量は、治療すべき障害の重篤度及び反応性に依存するが、通常は数日か ら数カ月の治療計画に従ってまたは治癒に成功するかもしくは病状の軽減が得ら れるまで毎日1回から数回の投与を行う。最適投与用量、投与方法及び反復投与 の程度は当業者が容易に決定できよう。 好ましい全身投与では、アプタマーを5mg/kgの用量で1日1回静脈内投 与する。好ましい外用投与では、アプタマーを1〜5%溶液として1日1回投与 する。肺に投与する場合には好ましくは、アプタマーを5mgのエアゾールとし て1日1回投与する。 本発明は、T細胞活性化を調節し得るタンパク質に対応するRNA及びDNA の機能を阻害するためにアプタマーオリゴヌクレオチドを使用する。本文中に使 用した“オリゴヌクレオチド”なる用語は、リボ核酸またはデオキシリボ核酸の オリゴマ ーまたはポリマーを意味する。この用語は、天然に産生する塩基、糖及び糖間( 主鎖)結合から成るオリゴマー、並びに、同様に機能する天然に産生しない部分 をもつオリゴマー、などのオリゴマーを包含する。このような修飾または置換さ れたオリゴヌクレオチドはしばしば、細胞内摂取の増進及びヌクレアーセの存在 下の安定性強化などの特性を有するので天然型形態よりも好ましい。 本発明のオリゴヌクレオチドは好ましくは、約3〜約50個の核酸塩基ユニッ トを含む。より好ましくはこのようなオリゴヌクレオチドは約8〜約30個の核 酸塩基ユニットを含み、更に好ましくは約12〜約22個の核酸塩基ユニットを 含む。核酸塩基ユニットは、ホスホジエステル結合または他の結合を介して隣接 核酸塩基ユニットに適正に結合された塩基−糖の組合せであることは理解されよ う。 本発明に従って使用されるオリゴヌクレオチドは、公知の固相合成技術によっ て常套的な手段で好都合に作製し得る。このような合成のための装置は、App lied Biosystemsのような複数の販売業者が販している。このよ うに他の任意の手段も合成に使用できるが、オリゴヌクレオチドの実際の合成は 当業者の通常の知識の範囲内である。また、ホスホロチオエート及び3’アミン −ホスホロチオエートのような他のオリゴヌクレオチドを調製するために同様の 技術を使用することもよく知られている。 本発明によれば、転写を開始させるDNAの読み取り枠(ORF)によって特 定されたメッセンジャーRNAが、DNAのORFからの情報だけでなく、5’ 非翻訳領域、3’非翻訳領域及び介在配列のリボヌクレオチドのような当業者に 公知の領域を形成する結合リボヌクレオチドを含むことは、通常の知識をもつ当 業者には理解されよう。従って、これらの結合リボヌクレオチド及び情報性リボ ヌクレオチドに全面的にまたは部分的にターゲットされるオリゴヌクレオチドを 本発明によって作製し得る。好ましい実施態様では、アプタマーオリゴヌクレオ チドは、Sp1タンパク質及びSp1関連タンパク質のような調節タンパク質と DNA結合部位において相互作用し、この相互作用によって、T細胞活性化に関 与するタンパク質をコードする遺伝子の発現を遮断する。好ましい実施態様では 、これらの調節されるべきタンパク質は、CD28及びCD28分子の相同タン パク質をすべて包含する。GGGG、GNGG、GGNG〔N =A、C、G、UまたはT]のような少なくとも3個のグアノシン(G)残基を 含む4つのヌクレオチドから成る領域として定義される富G領域を少なくとも2 つ含む配列から成るオリゴヌクレオチドが好ましい。このような2つの富G領域 が最大で6個の残基、好ましくは4個またはそれ以下の残基によって隔てられた オリゴヌクレオチドが本発明に有用である。全体としてまたは部分として使用し 得る好ましい配列セグメントを以下に示す: 正しい配列であると考えて上記の配列を示したが、もしも誤りがある場合には 、正しい配列が本発明の目的であることを理解されたい。本発明に有用なオリゴ ヌクレオチドは、これらの配列の1つまたはその一部から成る。従って、上記の オリゴヌクレオチドのいずれか、または、CD28分子及びCD28関 連分子を含むT細胞活性化分子の合成を調節するための好ましいオリゴヌクレオ チドターゲットに関する知識から平均的な当業者が容易に作製できる同様のオリ ゴヌクレオチドのいずれかを使用するのが好ましい。CD28及び/またはCD 28相同タンパク質の産生の阻害または調節は疾病の治療において有意な治療効 果を発揮すると期待されている。組成物の有効性を評価するために、1つのアッ セイまたは一連のアッセイが必要である。実施例 オリゴヌクレオチド 標準ホスホラミジット化学法を用い、全自動DNAシンセサイザー(Appl ied Biosystems model 394)でオリゴデオキシヌクレ オチドを合成した。β−シアノエチルホスホラミジット、合成試薬及びCPGポ リスチレンカラムは、Applied Biosystems(ABI,Fos ter City,CA)から購入した。3’−アミノ−修飾因子C3、CPG カラムはGlen Research(Sterling,VA)から購入した 。ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドの場合は、標準酸化ボトルをテトラエ チ ルチウラムジスルフィド/アセトニトリルで置換し、ホスホロチオエート結合の 段階的付加のために標準ABIホスホロチオエートプログラムを使用した。規制 ポアガラスカラムから開裂後、オリゴヌクレオチドを濃縮水酸化アンモニウムで 55℃で8時間処理することによって保護基を除去した。逆相セミプレップC8 カラム(ABI)を用いたHPLCによってオリゴヌクレオチドを精製した。D MT保護基を開裂し、80%酢酸で処理し、エタノール沈殿させた後、分析用C 18カラム(Beckman,Fullerton,CA)を用いたHPLCに よって生成物の純度を評価した。90%を上回る純度のオリゴヌクレオチド全部 を凍結乾固した。オリゴヌクレオチドを無菌脱イオン水(ICN,Costa Mesa)で復元し、OD260nmの評価後に400μMに調節し、アリコー トに分け、実験に使用するまで−20℃で保存した。全ての場合について、表1 に示した各オリゴヌクレオチドの少なくとも3つのバッチを使用した。In vitroオリゴヌクレオチド安定性試験 従来技術に記載の手順(Tamら(1994)Nucleic Acid R es 22:977−986)でオリゴヌクレオ チドの時間的安定性分析を行った。オリゴヌクレオチドの分解プロフィルを電気 泳動によって評価し、Nickspinカラムを用いて定量した。細胞系及びT細胞精製 健康なドナーの60mlの血液をフィコール−Hypaque密度勾配遠心し て得られたバッフィコートから末梢血単核細胞(PBMC)を単離した。次に、 LymphokwikのT細胞特異的リンパ球単離試薬(LK−25T,One Lambda,Canoga Park,CA)を用いてPBMCからT細胞 を精製した。平均収量40〜60×106のT細胞を次に、20〜30mlのR PMI−AP5(20mMのHEPESバッファpH7.4、5%の自己血漿、 1%のL−グルタミン、1%のペニシリン/ストレプトマイシン及び0.05% の2−メルカプトエタノールを含むRPMI−1640培地(ICN,Cost a Mesa,CA))中で37℃で一夜インキュベートして、夾雑付着細胞を 完全に除去した。全部の実験で、T細胞をRPMI−AP5で洗浄し、次いで9 6ウェルのマイクロタイタープレートに細胞濃度2〜3×106細胞/mlで平 板培養した。 T細胞リンパ腫細胞系、ジャーカットE6−1(CD28+/CD4+)細胞( 152−TIB)をRPMI−10(20mMのHEPESバッファpH7.4 、10%のウシ胎仔血清(FCS)(Hyclone,Logan,UT)、1 %のL−グルタミン及び1%のペニシリン/ストレプトマイシンを含むRPMI −1640培地)中に維持した。マイトジェン誘発T細胞活性化及びオリゴヌクレオチド処理 ヒト末梢T細胞またはT細胞リンパ腫細胞系(0.2〜0.3×106)の添 加に先立って、重複96ウェルのマイクロタイタープレートを、精製した抗CD 3モノクローナル抗体(mAb)(6.25〜200ng/ウェル)(クローン HIT 3a,Pharmingen,SanDiego,CA)でプレコート し、低温の燐酸塩緩衝生理食塩水pH7.4(PBS)で2回洗浄した。抗CD 3 mAbで処理したT細胞を更に、2ngのホルボール12−ミリステート1 3−アセテート(PMA)(Calbiochem,La Jolla,CA) の添加によって活性化し、37℃で48時間インキュベートした。抗−CD3/ PMAで活性化したT細胞を、活性化直後に1〜20μMのCD28特異的オリ ゴヌクレオチド及び対照オリゴヌクレオチ ドで処理し、24時間後に再処理した。重複する一方のマイクロプレートのT細 胞を免疫蛍光分析に使用し、1Aをサイトカイン試験に使用し、第二のプレート をT細胞増殖分析に使用した。免疫蛍光試験 活性化の後、重複する第一のマイクロプレートから得られた150μlの細胞 上清を、細胞由来のサイトカイン産生を分析するために別のマイクロプレートに 移した。残りの細胞を等張生理食塩水溶液pH7.4(Becton Dick inson,Mansfie1d,MA)で2回洗浄し、50μlの等張生理食 塩水溶液に再浮遊させ、2つのサンプルに分割した。1つのサンプルアリコート をPE−CD28/FITC−CD4mAbで同時染色し、第二のアリコートを PE/FITC標識したアイソタイプ適合の対照モノクローナル抗本で染色する ことによって非特異的蛍光を評価した。蛍光標識モノクローナル抗体はいずれも Becton Dickinson(SanJose,CA)から入手した。飽 和濃度のmAbを用いて、暗中、4℃でインキュベーションを45分間行った。 取込まれなかったラベルをPBS洗浄によって除去した後、FACScan フローサイトメーター(Becton Dickinson)で分析した。ゲー トされた(gated)生存細胞中で抗原密度を間接測定し、平均蛍光チャンネ ル(MCF)として表した。CD28 mAbで染色した細胞のCD4+サブセ ットの表面発現は、CD28-CD4-細胞のMCFからCD28+CD4+のMC Fを減算することによって決定した。多数ドナーにおける全部のオリゴヌクレオ チドの各バッチ中の非処理対照細胞及びオリゴヌクレオチド処理細胞の生存率を 、生体色素ヨウ化プロピジウム(5μg/mlの最終濃度)で染色することによ って測定した。ヨウ化プロピジウムを排除した生存細胞のパーセンテージをフロ ーサイトメトリーによって測定すると、全てのオリゴヌクレオチドについて1〜 20μMの範囲の用量でオリゴヌクレオチドを使用した全部のバッチで、処理後 に90%を上回る値(90〜99%の範囲)が得られた。サイトカイン分析 細胞由来のヒトのサイトカインの濃度を重複する第一のマイクロプレートの細 胞上清中で測定した。マイトジェン誘発によるインターロイキン−2(IL−2 )のレベル変化を、市販のELISAキット(R & DシステムQuanti kine キット、Minneapolis,MN)を用いて測定した。全部のELISA の結果をpg/mlで表した。電気泳動移動度シフト分析(EMSA) T4ポリヌクレオチドキナーゼを製造業者のプロトコル(Gibco BRL ,Gaithersburg,MD)通りに用い、試験オリゴヌクレオチドの5 ’端を〔γ−32P〕−ATP(ICN,Costa Mesa,CA)で標識し た。10μgのHeLa細胞核抽出物(Promega)を約80,000cp mの標識オリゴヌクレオチドと共に室温で20分間インキュベートした。結合反 応混合物は、10mMのトリス−HCl(pH7.5)、50mMのNaCl、 0.5mMのDTT、0.5mMのEDTA、1mMのMgCl2、4%のグリ セロール及び0.5μgのポリ(dI.dC)を含んでいた。DNA−タンパク 質複合体を、0.5×TBEバッファ(50mMのトリス、45mMのホウ酸、 0.5mMのEDTA)を含む4%のポリアクリルアミドゲルで100Vで約3 時間電気泳動させた。ゲルを乾燥し、Phosphorlmager(Bior ad,Richmond,CA)を使用してオートラジオグラフィー処理した。DNアーゼのフットプリントアッセイ及びゲルシフトアッセイのためのcDNA の調製 DNアーゼのフットプリントアッセイ及びゲルシフトアッセイにおいてタンパ ク質−DNA結合に使用したcDNA(約300塩基対)は、プラスミドpCA T3e 28b、pCAT3e28hまたはpCAT3e 28h−1から単離 した。60μgの各プラスミドをBglIIで消化し、先ず、一部の量を直鎖性 を検査するためにアガロースゲルに載せ、次に、残りの量をフェノール/sev ag抽出し、エタノール沈殿させ、次いで水に再浮遊させてSacIで消化した 。少量を再度ゲルに載せ、切断された否かを検査した。(4kbのバンド及び3 00b.p.のバンドの2つのバンドが出現する筈である)。残りの量をフェノ ール/sevag抽出し、エタノール沈殿させた。次に脱リン酸化するために、 DNAペレットを少量の水(62μl)に再懸濁させ、1μlの20U/μlの アルカリホスファターゼ(Boehringer Mannheim,Indi anapolis,IN)及び7μlの10×反応バッファを添加した。反応混 合物を37℃で1時間インキュベートした後、7μlのpH8.0の0.2Mの EGTAを添加し、管全体を65℃で10分間加 熱した。総量77μlの脱リン酸化したDNAを1%アガロースゲルに載せ、Q iagen(Santa Clarita,CA)社製のQiaquickゲル 抽出キットを用いて300b.p.のバンドを精製した。精製した300b.p .バンドの最終容量は70μlであり、その濃度を以下のごとく計算した。60 μg×(300b.p./4300b.p.)=4.2μg。これらの全部の操 作後の回収率を50%と仮定して2.1μg/70μl=30ng/μl。32P 末端標識反応(キナーゼ処理)の各々には、5μl〜7μlの精製300b.p .DNAを使用した。ゲルシフトアッセイ用ポリアクリルアミドゲルの調製 0.5×TBE中の4%非変性ポリアクリルアミドゲル溶液をPromega Gel Shift Assay Systemsの技術報告に従って調製し た(4%アクリルアミド、0.05%ビスアクリルアミド、2.5%グリセロー ル、0.5×TBE)。250mlの上記ゲル溶液から成る予製液を調製し、濾 過し、4℃で保存した。毎回の使用では、毎回25mlの4%ゲル予製液に12 .5μlのTEMEDと187.5μlの10%過硫酸アンモニウムとを添加し 、16.5cm×16.5cm× 0.75mmのガラスプレートに注いだ。最適結果を得るたにどの場合にもゲル を一夜重合させた。サンプルを充填する前に、0.5×TBEバッファ中でゲル を30分間前処理した。二重鎖オリゴヌクレオチドの形成及び精製 ここで使用した方法は、“逆平行ポリプリンホスホロチオエートオリゴヌクレ オチドは、ラットα1(I)コラーゲン遺伝子プロモーターと共に安定な三重鎖 を形成し培養ラット線維芽細胞中の転写を阻害する(Antiparallel polypurine phosphorothioate oligonu cleotides form stable triplexes with the rat α1(I) collagen genepromoter and inhibit transcription in cultur ed rat fibroblasts)”,Jacob Josephら,N ucleic Acids Research,1997,Vol.25,No .11,2182−2188,に記載の方法である。互いに相補的な同量の一本 鎖を、0.25MのNaCl中で80℃で5分間加熱し、次いで室温までゆっく りと冷却した。アニールした二重鎖オリゴヌクレオチドを、6%非変性(29: 1)ポ リアクリルアミドゲルで電気泳動させて精製し、切り出し、“粉砕し浸漬させ” 、“Molecular cloning、a laboratory man ual”Sambrook,Fritsch & Maniatisに記載の方 法を用いてエタノール沈殿させた。各標識反応に約20ngの二重鎖オリゴを使 用した。DNAの末端32P標識 150〜200ngの300b.p.のcDNAまたは20ngの二重鎖オリ ゴを、10μCiの〔γ−32P〕ATP(4,500Ci/ミリモル,ICN, Irvine,CA)及び10Uのキナーゼと1×キナーゼバッファ(双方とも Promega社製)と共に10μl容量で37℃で1時間インキュベートし、 Centri Spin−10カラム(Princeton Separati on,Adelphia,NJ)で精製した。約80,000〜100,000 cpmのキナーゼ化DNAを各ゲルシフト反応に使用した。ゲルシフトアッセイ タンパク質(核抽出物または精製転写因子)を、1×ゲルシフトバッファ(P romega,Madison,WI)と共 に室温で5〜10分間インキュベートした後、キナーゼ化したDNAを添加し、 室温で更に20〜30分間インキュベートした。次に、前処理した4%非変性ゲ ルにサンプルを充填した。0.5×TBE中で100Vで約3〜4時間処理した 後、ゲルを2枚のWhatmanペーパーで乾燥し、蛍リン光体映像装置(ph osphor−imager)で一夜露光した。抗体ゲルスーパーシフトアッセイ Sp1に対する抗体(クローン1C6,Santa CruzBiotech nologies,Santa Cruz,CA)を精製Sp1(Promeg a)と共に1時間プレインキュベートした後、32P標識したcDNAまたはオリ ゴを添加した。競合的ゲルシフトアッセイ 約70〜100モル過剰の非標識オリゴヌクレオチド(一本鎖または二重鎖) をタンパク質と共に室温で約30分間プレインキュベートした後、32P標識した DNAを添加した。pCAT3e 28b、pCAT3e 28h、pCAT3e28h−1の構築 ジャーカット全RNAを鋳型として用いたRT PCRによってCD28の上流 のcDNA(−197〜+28)を作製し た。このcDNAピースを先ず、TAクローニングベクターPCR2.1(In vitrogen,Carlsbad,CA)にクローニングした。次に、同じ cDNAをpCAT3e(Promega)のXhoI−SacI部位に挿入す ることによってサブクローニングした。pCAT3e 28h及びpCAT3e 28h−1は、pCAT3e 28b中の−51〜−22の配列が欠失し別の 15のヌクレオチドで置換されたpCAT3e 28bの突然変異体である。トランスフェクション(一過性発現) トランスフェクションの1日前に、2つまたは3つのT150中でジャーカッ ト細胞を80〜90%の集密細胞から1:4または1:5希釈物として調製した 。トランスフェクションの直前に、全部の細胞を1つのフラスコにプールしてカ ウントした(約40×104/mlの濃度が必要)。10個のトランスフェクシ ョン反応物を得るために11×4×106の細胞を50mlの円錐管中で遠心し た。細胞を初期容量の半量のPBSで1回洗浄し、次いで44mlの予め加温し た新しいジャーカット培地(90%のRPMI1640、10%のFBS、1% のL−グルタメート、1%のペニシリン/ストレプトマイシン) に再浮遊させ、最終濃度1×106/mlとした。4mlの細胞を6ウェルプレ ートの各ウェルにピペット注入した。2.5μlの2mg/mlのプラスミド( pCAT3eシリーズ)を1.5mlの管にピペット注入し、147.5μlの RPMI1640培地(無血清、抗生物質非含有)を添加し、次いで20μlの Qiagen社製のSuperfact試薬をプラスミド/培地溶液に添加し、 ピペットで5回上下させて混合し、室温で5〜10分間静置した。トランスフェ クション複合体を各ウェルの細胞に滴下し、プレートに穏やかな渦流を与えて混 合した。細胞を37℃、5%CO2インキュベーターでインキュベートし、24 時間後にCATアッセイ用に採取した。トランスフェクション後にオリゴを添加 する場合には、400μMのオリゴを含む50μlの予製液を指定された時点( トランスフェクションの1時間後)に細胞に添加し、細胞をインキユベーターに 戻した。CATアッセイ 24時間のインキュベーション後、細胞が残らないように細胞培地で十分にす すぎながら、ピペットによって各ウェルから15mlの円錐管に細胞を採集した 。細胞を2,000rpm で室温で5分間遠心した。培地をピペットで除去した。各細胞ペレットを2ml のPBSで3回洗浄した(PBSを添加し、渦流させ、遠心し、培地をピペット で除去した)。ピペット先端でPBSの最終洗浄液をできるだけ完全に除去した 。400μlの1×リポーター溶解バッファ(Promega CAT酵素アッ セイシステム)を各細胞ピペットに添加し、1.5mlの管に移した。細胞ペレ ットを溶解バッファ中で室温で30分間インキュベートし、場合によっては渦流 させた。30分間のインキュベーション後、これらの管を60℃で10分間加熱 し、次いで室温で12,000rpmで2分間遠心し、上清(溶解液)を新しい 1.5mlの管にピペットで注入した。各CATアッセイ反応に、100μlの 溶解液を使用し、残量を−80℃で凍結した。CATアッセイの各々を以下のよ うに設定した。18.5μlの水と、100μlの溶解液、5μlの5mg/m lのn−ブチリルCoA(Promega)及び1.5μlの0.1μCi/μ lのクロラムフェニコール−14C(ICN)とを、1.5mlの管で混合し( 総量125μl)、37℃で1時間インキュベートした。1時間後、300μl のキシレン(ICN)を各管に添加し、5秒間激しく渦流させ、室温で3 分間全速で遠心し、280μlの上相(キシレン相)をピペットで新しい管に移 した。100μlの0.25MのトリスpH8.0を280μlのキシレン相に 添加し、渦流させ、上記同様に遠心した。200μlの上相をシンチレーション バイアルにピペットで移し、5mlのシンチレーション流体を添加し、転倒によ って混合し、サンプルをシンチレーションカウンターでカウントした。in vitroオリゴヌクレオチド安定性はホスホロチオエートオリゴヌクレ オチドの生物活性を延長させる 。 ホスホロチオエートのヌクレオチド間結合によるオリゴの修飾はヌクレアーゼ 耐性を与え、従って、in vitro生物活性を1〜2時間から24時間まで 延長させる(Stein,(1993)Science 261:1004−1 012)。ここでは、図1Aの富Gオリゴ(配列4)が図1Bの非富Gホスホロ チオエート(配列21)よりも大きいin vitro安定性を有していたこと を証明する。図1Aの電気泳動図は、細胞外1A(S)及び細胞1B(L)の双 方がジァーカット細胞との96時間のインキュベーション後に図1B(配列21 )よりもかなり多くの完全形32P−標識1A(配列4)を残存させて いることをはっきりと示す。この観察はNickspinカラムのデータ(図1 B)に一致する。96時間後に図1A(配列4)から回収された完全形のオリゴ は54%(S)及び59%(L)であり、図1B(配列21)では10%(S) 及び34%(L)であった。これらのデータは、図1A(配列4)中の富G領域 が存在するだけでより大きいヌクレアーゼ耐性が与えられたことを示唆し、これ はこの特定オリゴが折畳まれた二次構造を形成する能力をもつことに関連すると 推測される。活性化ヒトT細胞中の機能性CD28発現及びCD28特異的IL−2産生のア プタマーオリゴヌクレオチドによる阻害は特異的富Gモチーフに依存する 。 表1のホスホロチオエートオリゴヌクレオチド配列4〜21(5μM)による CD28の発現及びCD28特異的IL−2産生の相対的阻害を表2に示す。こ こでは、これらのアプタマーオリゴヌクレオチドの生物活性に対する正確な配列 要件を検討した。表2は、阻害活性が配列依存性であること、特に4つの塩基( 配列5〜8)によって隔てられた2つのGカルテットを含むモチーフの存在に依 存することを示す。これらのデータは、図1A(配列4)のようなオリゴとその 推定ターゲットと の相互作用が、(アンセンス及び抑制遺伝子モデルについて見出されるような) 核酸:核酸ハイブリダイゼーション要件よりもオリゴ−タンパク質相互作用中で 見られるような正確なコンホメーション要件に依存することを示唆する。特異的12量体配列モチーフを含むオリゴヌクレオチドは特異的タンパク質オリ ゴ複合体を形成する 。 図2は、HeLa細胞抽出物と共にプレインキュベートした32P標識オリゴヌ クレオチドの電気泳動移動度シフト分析を示す。表3に挙げたオリゴは、4つの ヌクレオチドによって隔てられた2組のGテトラッドを含む12量体のモチーフ を含有する2つのオリゴ〔図1A(配列4)及びICN16481(配列5)〕 を含む。試験オリゴのうちで、このようなモチーフを含むオリゴ(レーン5及び 11)だけが、他のホスホロチオエートオリゴとは異なるオリゴ−タンパク質シ フト(バンドA)を生じた。これらのデータは、特異的タンパク質−オリゴ相互 作用が12量体のモチーフを含有するオリゴによって生じることを示唆する。活性化ヒトT細胞中の機能性CD28発現のアプタマーオリゴヌクレオチドによ る阻害は特異的オリゴ−タンパク質複合体の 存在に相関関係を有している 。 表4は、濃度5μMで使用されたいくつかのホスホロチオエートオリゴヌクレ オチドが、マイトジェンに誘発されるCD28発現及びIL−2産生の双方に対 して与える阻害効果と、これらのオリゴヌクレオチドが転写因子の富化ソースで あるHeLa核抽出物と共にインキュベートされたときに特異的オリゴ−タンパ ク質複合体を形成するこれらのオリゴヌクレオチドのアプタマー能力とを比較す る。これらのデータは、CD28発現及びIL−2分泌に対するモチーフ含有オ リゴの阻害活性と特異的ゲルシフトバンドの形成との相関関係をはっきりと示す 。2つのGテトラッド内部で生じた置換は機能を喪失させ、オリゴ−タンパク質 複合体を消滅させる。CD28上流プロモーター領域−197〜+28(28b)はSp1に結合する 28bとも呼ばれる32P標識CD28プロモーター領域−197〜+28をS p1タンパク質と共にインキュベートし、0.5μgから開始してSp1抗体の 3回の系列希釈物を調製した。ゲルスーパーシフトアッセイを実施し、DNA− タンパク質−抗体複合体を電気泳動後に分解し、データを図4に示す。 データは、Sp1がCD28プロモーターの28b領域に結合することを示す。 特異的Sp1抗体の0.00617μgまでの系列希釈後に、Sp1/32P−2 8b/Sp1抗体バンド(バンドB)が消滅して28b/Sp1バンド(バンド A)が残るのでこの相互作用が特異的であることが判明する。これは、28bが Sp1に特異的に結合することを示す。遊離32P標識28bはバンドCである。CD28上流プロモーター領域−197〜+28(28b)に由来し12量体の 富Gモチーフを含有するオリゴ−51〜−22もSp1に結合し得る。 CD28プロモーター領域−197〜+28中の富Gモチーフに対する28b 中の正しいSp1結合領域を制限するために、28bオリゴ(配列1、表1)と 呼ぶ30量体の二重鎖(ds)オリゴを合成した。このオリゴはその配列中に1 2量体GGGGAGGAGGGGを含んでいた。我々はこれをCD28プロモー ター領域中のSp1結合部位であると仮定した。32P標識の後、28bオリゴ をSp1抽出物と共にインキュベートすると、これらは実際に互いに結合した( 図5、バンドA、レーン2及び3)。コールドの二重鎖28bオリゴと競合させ ると、 バンドが消滅した。これは、結合がSp1特異的であることを示す(レーン4) 。意外にも、一本鎖ホスホロチオエート富Gオリゴ、図1A(レーン5)及び1 6481(レーン6)(双方とも富Gモチーフを含む)はSp1結合で競合した が対照オリゴICN16476(レーン7)は競合しなかった。このデータは、 ホスホロチオエート富Gオリゴ、即ち、図1A及びICN16481がSp1の DNA結合部位に対する結合のアプタマーとして作用し得ることを示す。この相 互作用の結果、プロモーター領域の−51〜−22のSp1部位に対するSp1 結合が阻止され、従ってCD28遺伝子のSp1仲介転写が阻害され、成熟CD 28タンパク質の発現が低下する。 アプタマー及びこのようなアプタマーを利用する免疫応答の調節方法を以上に 開示した。特定実施態様に基づいて本発明を説明したが、発明の範囲は請求の範 囲のみによって限定される。
【手続補正書】 【提出日】平成12年11月17日(2000.11.17) 【補正内容】 (1) 請求の範囲を別紙に記載のとおりとする。 (2) 明細書第9頁、第13行の「CD28 Tam特許」を「(1996年 8月30日出願PCT/US96/01507参照)」とする。 (3) 明細書第11頁、第10ないし14行の、「本発明によれば、CD28 のような補助刺激分子並びにIL−2及びGMCSFのようなサイトカインをコ ードする遺伝子を調節するSp1タンパク質及びSp1近縁タンパク質のような タンパク質のDNA結合部位に特異的に結合するように設計されたアプタマーオ リゴヌクレオチドが提供される。」を「本発明は、核酸単位約12から約22の 間の長さ(両端値を含む)を有し、GGnG、GGGG、GnGG、nGGG及 びGGGn[Gはグアニジンであり、nは任意のヌクレオチドである]からなる グループから選択された少くとも2つの富G領域を含む配列を有するアプタマー を提供する。」とする。 (4) 明細書第17ないし18行の「のような」を「を含む」とする。請求の範囲 1.核酸単位約12から約22の間の長さを有し(両端値を含む)、GGnG、 GGGG、GnGG、nGGG及びGGGn〔Gはグアニジン及びnは任意のヌ クレオチドを表す〕のグループから選択された少なくとも2つの富グアニジン領 域を含む配列を有しているアプタマー。 2.上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが2〜7個(両端値を含む )未満のヌクレオチドによって隔てられていることを特徴とする請求項1に記載 のアプタマー。 3.上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが3〜6個(両端値を含む )のヌクレオチドによって隔てられていることを特徴とする請求項1に記載のア プタマー。 4.上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが4個のヌクレオチドによ って隔てられていることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 5.免疫調節タンパク質の核酸結合部位について競合することを特徴とする請求 項1に記載のアプタマー。 6.免疫調節タンパク質がSp1、NFκB、EGR1及び AP2のグループから選択されることを特徴とする請求項2に記載のアプタマー 。 7.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGGnGか ら成り、上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが2〜7個のヌクレオ チドによって隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部 位について競合する請求項1に記載のアプタマー。 8.2つ以上の富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGGGGから成り、 2つ以上の領域のうちの少なくとも2つが2〜7個(両端値を含む)のヌクレオ チドによって隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部 位に競合する請求項1に記載のアプタマー。 9.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGnGGか ら成り、上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが2〜7個(両端値を 含む)のヌクレオチドによって隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパ ク質の核酸結合部位について競合する請求項1に記載のアプタマー。 10.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがnGGG またはGGGnから成り、上記少くとも2つ の領域のうちの少なくとも2つが2〜7個(両端値を含む)ヌクレオチドによっ て隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部位について 競合する請求項1に記載のアプタマー。 11.配列5’TTG GAG GGG GTG CTG GGG3’(配列4 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 12.配列5’GGG GAG GAG GGG CTG GAA3’(配列5 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 13.配列5’GGG GTG GTG GGG3’(配列13)から成ること を特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 14.配列5’TTG GAG GGG GAG CAG GGG3’(配列7 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 15.配列5’TTG GAG GGG GAG GTG GGG3’(配列8 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 16.配列5’GGG TTG GAG GGG GTG GTG GGG3’ (配列6)から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 17.請求項1から16のいずれか一項に記載のアプタマーを患者に投与するこ とから成る患者の免疫系応答の調節方法。 18.請求項1から16のいずれか一項に記載のアプタマーを患者に投与するこ とから成る不適正な免疫系応答によって特徴づけられる障害を有する患者の治療 方法。 19.障害が移植片対宿主応答であることを特徴とする請求項18に記載の方法 。 20.障害が自己免疫疾患であることを特徴とする請求項18に記載の方法。 21.障害がリウマチ様関節炎であることを特徴とする請求項20に記載の方法 。 22.障害が多発性硬化症であることを特徴とする請求項20に記載の方法。 23.障害がエリテマトーデスであることを特徴とする請求項20に記載の方法 。 24.障害がインスリン依存性真性糖尿病であることを特徴とする請求項20に 記載の方法。 25.障害が乾癬であることを特徴とする請求項20に記載の方法。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 25/00 A61P 25/00 29/00 101 29/00 101 37/02 37/02 37/06 37/06 43/00 111 43/00 111 // C12N 15/09 ZNA C12N 15/00 ZNAA (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,LS,M W,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY ,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AL,AM ,AT,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY, CA,CH,CN,CU,CZ,DE,DK,EE,E S,FI,GB,GE,GH,HU,IL,IS,JP ,KE,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR, LS,LT,LU,LV,MD,MG,MK,MN,M W,MX,NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD ,SE,SG,SI,SK,SL,TJ,TM,TR, TT,UA,UG,US,UZ,VN,YU,ZW

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.GGnG、GGGG、GnGG及びGGG〔Gはグアニジン及びnは任意の ヌクレオチドを表す]のグループから選択された少なくとも2つの富グアニジン 領域を含む配列を有しているアプタマー。 2.上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが7個未満のヌクレオチド によって隔てられていることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 3.上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが3〜6個(両端値を含む )のヌクレオチドによって隔てられていることを特徴とする請求項1に記載のア プタマー。 4.上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが4個のヌクレオチドによ って隔てられていることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 5.免疫調節タンパク質の核酸結合部位について競合することを特徴とする請求 項1に記載のアプタマー。 6.免疫調節タンパク質がSp1、NFκB、EGR1及びAP2のグループか ら選択されることを特徴とする請求項2に 記載のアプタマー。 7.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGGnGか ら成り、2つ以上の領域のうちの少なくとも2つが7個未満のヌクレオチドによ って隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部位につい て競合する請求項1に記載のアプタマー。 8.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGGGGか ら成り、上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが7個未満のヌクレオ チドによって隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部 位について競合する請求項1に記載のアプタマー。 9.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGnGGか ら成り、上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが7個未満のヌクレオ チドによって隔てられていることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部 位について競合する請求項1に記載のアプタマー。 10.上記少くとも2つの富グアニジン領域のうちの少なくとも1つがGGGか ら成り、上記少くとも2つの領域のうちの少なくとも2つが7個未満のヌクレオ チドによって隔てられてい ることを特徴とする免疫調節タンパク質の核酸結合部位について競合する詰求項 1に記載のアプタマー。 11.配列5’TTG GAG GGG GTG CTG GGG3’(配列4 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 12.配列5’GGG GAG GAG GGG CTG GAA3’(配列5 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 13.配列5’GGG GTG GTG GGG3’(配列13)から成ること を特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 14.配列5’TTG GAG GGG GAG CAG GGG3’(配列7 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 15.配列5’TTG GAG GGG GAG GTG GGG3’(配列8 )から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 16.配列5’GGG TTG GAG GGG GTG GTG GGG3’ (配列6)から成ることを特徴とする請求項1に記載のアプタマー。 17.請求項1から16のいずれか一項に記載のアプタマーを患者に投与するこ とから成る患者の免疫系応答の調節方法。 18.請求項1から16のいずれか一項に記載のアプタマーを患者に投与するこ とから成る不適正な免疫系応答によって特徴づけられる障害を有する患者の治療 方法。 19.障害が移植片対宿主応答であることを特徴とする請求項18に記載の方法 。 20.障害が自己免疫疾患であることを特徴とする請求項18に記載の方法。 21.障害がリウマチ様関節炎であることを特徴とする請求項20に記載の方法 。 22.障害が多発性硬化症であることを特徴とする請求項20に記載の方法。 23.障害がエリテマトーデスであることを特徴とする請求項20に記載の方法 。 24.障害がインスリン依存性真性糖尿病であることを特徴とする請求項20に 記載の方法。 25.障害が乾癬であることを特徴とする請求項20に記載の方法。
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