JP2002017352A - 核酸試料検出用具及び電気化学的検出方法 - Google Patents
核酸試料検出用具及び電気化学的検出方法Info
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Landscapes
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
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Abstract
(57)【要約】
【課題】 電極表面に、ペプチド核酸が結合固定されて
なる、特定の塩基配列部分を有するDNA断片などで代
表される核酸試料の検出用具を提供する。 【解決手段】 電極表面に共有結合によりペプチド核酸
を固定する。この共有結合によるペプチド核酸の固定
は、ペプチド核酸に導入された活性水素含有基と電極表
面に導入されたビニルスルホニル基もしくはその反応性
前駆体基を含む反応性基との反応により形成するか、電
極に導入された活性水素含有基とペプチド核酸に導入さ
れたビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆体基を
含む反応性基との反応により形成することが望ましい。
なる、特定の塩基配列部分を有するDNA断片などで代
表される核酸試料の検出用具を提供する。 【解決手段】 電極表面に共有結合によりペプチド核酸
を固定する。この共有結合によるペプチド核酸の固定
は、ペプチド核酸に導入された活性水素含有基と電極表
面に導入されたビニルスルホニル基もしくはその反応性
前駆体基を含む反応性基との反応により形成するか、電
極に導入された活性水素含有基とペプチド核酸に導入さ
れたビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆体基を
含む反応性基との反応により形成することが望ましい。
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、生体高分子物質の
構造の解析に有用な検出用具に関し、特に遺伝子の発
現、変異、多型等の効率的な解析に有用な、電気化学的
検出方法に有利に利用される核酸試料の検出用具に関す
る。本発明は特に、核酸試料の塩基配列の解析に有用
な、該核酸試料に相補性を有する化合物を電極表面に高
密度に整列固定させた高密度アレイ型検出用具、そして
該高密度アレイ型検出用具を用いた電気化学的検出方法
に関する。
構造の解析に有用な検出用具に関し、特に遺伝子の発
現、変異、多型等の効率的な解析に有用な、電気化学的
検出方法に有利に利用される核酸試料の検出用具に関す
る。本発明は特に、核酸試料の塩基配列の解析に有用
な、該核酸試料に相補性を有する化合物を電極表面に高
密度に整列固定させた高密度アレイ型検出用具、そして
該高密度アレイ型検出用具を用いた電気化学的検出方法
に関する。
【0002】
【従来の技術】多彩な生物の遺伝子機能を効率的に解析
するための技術開発が進んでおり、それらのDNAもし
くはDNA断片の塩基配列の解析のために、DNAチッ
プとよばれる、多数のDNA断片あるいは合成オリゴヌ
クレオチドなどのヌクレオチド誘導体を固相担体の表面
に固定した検出用具が用いられている。このような固相
担体の表面に結合固定されたヌクレオチド誘導体など
の、DNAもしくはその断片あるいは合成オリゴヌクレ
オチドのような検出用分子はプローブ分子とも呼ばれ
る。代表的なDNAチップは、スライドガラス等の固相
担体に多数のプローブ分子を整列固定させたマイクロア
レイである。このDNAチップの製造、そしてその使用
に関するDNAチップ関連技術は、DNA以外の生体分
子の検出にも利用可能であると考えられ、従って、創薬
研究、疾病の診断や予防法の開発等に新しい手段を提供
するものとして期待されている。
するための技術開発が進んでおり、それらのDNAもし
くはDNA断片の塩基配列の解析のために、DNAチッ
プとよばれる、多数のDNA断片あるいは合成オリゴヌ
クレオチドなどのヌクレオチド誘導体を固相担体の表面
に固定した検出用具が用いられている。このような固相
担体の表面に結合固定されたヌクレオチド誘導体など
の、DNAもしくはその断片あるいは合成オリゴヌクレ
オチドのような検出用分子はプローブ分子とも呼ばれ
る。代表的なDNAチップは、スライドガラス等の固相
担体に多数のプローブ分子を整列固定させたマイクロア
レイである。このDNAチップの製造、そしてその使用
に関するDNAチップ関連技術は、DNA以外の生体分
子の検出にも利用可能であると考えられ、従って、創薬
研究、疾病の診断や予防法の開発等に新しい手段を提供
するものとして期待されている。
【0003】DNAチップ関連技術が具体化してきたの
は、DNAの塩基配列をオリゴヌクレオチドとのハイブ
リダイゼーションによって決定する方法が考案されたこ
とに始まる。この方法は、ゲル電気泳動を用いる塩基配
列決定法の限界を克服できる方法ではあったが、当初は
実用化には至らなかった。
は、DNAの塩基配列をオリゴヌクレオチドとのハイブ
リダイゼーションによって決定する方法が考案されたこ
とに始まる。この方法は、ゲル電気泳動を用いる塩基配
列決定法の限界を克服できる方法ではあったが、当初は
実用化には至らなかった。
【0004】その後、上記の構成のDNAチップと、そ
の作製技術が開発され、遺伝子の発現、変異、多型等を
短時間で効率よく調べることが可能となった。すなわ
ち、作製されたDNAチップ上のDNA断片もしくはオ
リゴヌクレオチドに相補性を示すDNA断片試料(標的
DNA断片ともいわれる)は、一般的には、DNAチッ
プ上のDNA断片もしくはオリゴヌクレオチドと、標識
したDNA断片試料とのハイブリダイゼーションを利用
して検出される。
の作製技術が開発され、遺伝子の発現、変異、多型等を
短時間で効率よく調べることが可能となった。すなわ
ち、作製されたDNAチップ上のDNA断片もしくはオ
リゴヌクレオチドに相補性を示すDNA断片試料(標的
DNA断片ともいわれる)は、一般的には、DNAチッ
プ上のDNA断片もしくはオリゴヌクレオチドと、標識
したDNA断片試料とのハイブリダイゼーションを利用
して検出される。
【0005】DNAチップ作製技術を実用化するために
は、多数のDNA断片やオリゴヌクレオチドを固相担体
表面に高密度に、かつ安定に整列させるための技術が必
要とされる。
は、多数のDNA断片やオリゴヌクレオチドを固相担体
表面に高密度に、かつ安定に整列させるための技術が必
要とされる。
【0006】DNAチップの作製方法としては、固相担
体表面で直接オリゴヌクレオチドを合成する方法(「オ
ン・チップ法」という。)と、予め調製用意したDNA
断片あるいはオリゴヌクレオチドを固相担体表面に結合
固定する方法とが知られている。オン・チップ法として
は、光照射で選択的に除去される保護基の使用と、半導
体製造に利用されるフォトリソグラフィー技術および固
相合成技術とを組み合わせ、所定の微少なマトリックス
領域でのオリゴヌクレオチドの選択的な合成を行なう方
法(「マスキング技術」という)が代表的である。
体表面で直接オリゴヌクレオチドを合成する方法(「オ
ン・チップ法」という。)と、予め調製用意したDNA
断片あるいはオリゴヌクレオチドを固相担体表面に結合
固定する方法とが知られている。オン・チップ法として
は、光照射で選択的に除去される保護基の使用と、半導
体製造に利用されるフォトリソグラフィー技術および固
相合成技術とを組み合わせ、所定の微少なマトリックス
領域でのオリゴヌクレオチドの選択的な合成を行なう方
法(「マスキング技術」という)が代表的である。
【0007】予め調製用意したDNA断片やオリゴヌク
レオチドを固相担体表面に結合固定する方法としては、
DNA断片の種類や固相担体の種類に応じて下記の方法
が知られている。
レオチドを固相担体表面に結合固定する方法としては、
DNA断片の種類や固相担体の種類に応じて下記の方法
が知られている。
【0008】(1)固定するDNA断片がcDNA(m
RNAを鋳型にして合成した相補的DNA)やPCR産
物(cDNAをPCR法によって増幅させたDNA断
片)である場合には、cDNAあるいはPCR産物を、
DNAチップ作製装置に備えられたスポッタ装置によ
り、ポリ陽イオン化合物(ポリリシン、ポリエチレンイ
ミン等)で表面処理した固相担体の表面に点着し、DN
A断片の持つ電荷を利用して固相担体に静電結合させ
る。なお、固相担体表面の処理方法としては、アミノ
基、アルデヒド基、あるいはエポキシ基等を有するシラ
ンカップリング剤を用いる方法も利用されている。この
シランカップリング剤を用いた表面処理では、アミノ
基、アルデヒド基等は、共有結合により固相担体表面に
固定されるため、ポリ陽イオン化合物による表面処理の
場合と比較して、安定に固相担体表面に固定される。
RNAを鋳型にして合成した相補的DNA)やPCR産
物(cDNAをPCR法によって増幅させたDNA断
片)である場合には、cDNAあるいはPCR産物を、
DNAチップ作製装置に備えられたスポッタ装置によ
り、ポリ陽イオン化合物(ポリリシン、ポリエチレンイ
ミン等)で表面処理した固相担体の表面に点着し、DN
A断片の持つ電荷を利用して固相担体に静電結合させ
る。なお、固相担体表面の処理方法としては、アミノ
基、アルデヒド基、あるいはエポキシ基等を有するシラ
ンカップリング剤を用いる方法も利用されている。この
シランカップリング剤を用いた表面処理では、アミノ
基、アルデヒド基等は、共有結合により固相担体表面に
固定されるため、ポリ陽イオン化合物による表面処理の
場合と比較して、安定に固相担体表面に固定される。
【0009】上記のDNA断片の電荷を利用する方法の
変法として、アミノ基で修飾したPCR産物をSSC
(標準食塩−クエン酸緩衝液)に懸濁させ、これをシリ
ル化したスライドガラス表面に点着し、インキュベート
した後、水素化ホウ素ナトリウムによる処理および加熱
処理を順に行なう方法が報告されている。しかし、この
固定方法では必ずしも充分なDNA断片の固定安定度が
得られ難いという問題がある。DNAチップ技術では、
検出限界が重要となる。すなわち、固相担体表面に充分
な量で(すなわち、高密度に)、かつ安定にDNA断片
が結合固定することは、DNA断片プローブと標識した
試料核酸断片とのハイブリダイゼーションの検出限界の
向上に直接影響する。
変法として、アミノ基で修飾したPCR産物をSSC
(標準食塩−クエン酸緩衝液)に懸濁させ、これをシリ
ル化したスライドガラス表面に点着し、インキュベート
した後、水素化ホウ素ナトリウムによる処理および加熱
処理を順に行なう方法が報告されている。しかし、この
固定方法では必ずしも充分なDNA断片の固定安定度が
得られ難いという問題がある。DNAチップ技術では、
検出限界が重要となる。すなわち、固相担体表面に充分
な量で(すなわち、高密度に)、かつ安定にDNA断片
が結合固定することは、DNA断片プローブと標識した
試料核酸断片とのハイブリダイゼーションの検出限界の
向上に直接影響する。
【0010】(2)固定するオリゴヌクレオチド(プロ
ーブ分子)が合成オリゴヌクレオチドである場合には、
まず反応性基を導入したオリゴヌクレオチドを合成し、
予め反応性基を形成させるように表面処理した固相担体
に該オリゴヌクレオチドを点着して、該オリゴヌクレオ
チドを固相担体表面に共有結合により結合固定させる方
法も知られている。例えば、表面にアミノ基を導入した
スライドガラスに、PDC(p−フェニレンジイソチオ
シアネート)の存在下、アミノ基導入オリゴヌクレオチ
ドを反応させる方法、および該スライドガラスに、アル
デヒド基導入オリゴヌクレオチドを反応させる方法が知
られている。これらの二つの方法は、前記(1)のDN
A断片の電荷を利用した静電結合による固定方法と比べ
ると、オリゴヌクレオチドが固相担体表面に安定に結合
固定されるという利点がある。しかし、PDCを存在さ
せる方法は、PDCとアミノ基導入オリゴヌクレオチド
との反応が遅く、またアルデヒド基導入オリゴヌクレオ
チドを用いる方法では、反応生成物であるシッフ塩基の
安定性が低い(従って、加水分解が起こり易い)という
問題点がある。
ーブ分子)が合成オリゴヌクレオチドである場合には、
まず反応性基を導入したオリゴヌクレオチドを合成し、
予め反応性基を形成させるように表面処理した固相担体
に該オリゴヌクレオチドを点着して、該オリゴヌクレオ
チドを固相担体表面に共有結合により結合固定させる方
法も知られている。例えば、表面にアミノ基を導入した
スライドガラスに、PDC(p−フェニレンジイソチオ
シアネート)の存在下、アミノ基導入オリゴヌクレオチ
ドを反応させる方法、および該スライドガラスに、アル
デヒド基導入オリゴヌクレオチドを反応させる方法が知
られている。これらの二つの方法は、前記(1)のDN
A断片の電荷を利用した静電結合による固定方法と比べ
ると、オリゴヌクレオチドが固相担体表面に安定に結合
固定されるという利点がある。しかし、PDCを存在さ
せる方法は、PDCとアミノ基導入オリゴヌクレオチド
との反応が遅く、またアルデヒド基導入オリゴヌクレオ
チドを用いる方法では、反応生成物であるシッフ塩基の
安定性が低い(従って、加水分解が起こり易い)という
問題点がある。
【0011】なお、近年、DNAチップのプローブ分子
として、オリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド
(合成されたオリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオ
チド及びDNA分子やDNA断片、そしてRNA分子や
RNA断片をも包含する)の代りに、PNA(ペプチド
核酸)と呼ばれるオリゴヌクレオチド類縁体を用いる技
術も提唱されている。このPNAを固相担体に共有結合
により固定する方法として、アビジンとビオチンとを組
み合わせて用いる方法も知られている(特開平11−3
32595号公報)。この公開公報には、固相基板とし
て、表面プラズモン共鳴(SPR)バイオセンサを利用
することが記載されている。表面プラズモン共鳴バイオ
センサ上にプローブ分子が固定されたDNAチップを用
いて、その表面にハイブリダイゼーションを介して結合
固定されたDNA断片は、表面プラズモン共鳴現象を利
用して検出することができる。
として、オリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド
(合成されたオリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオ
チド及びDNA分子やDNA断片、そしてRNA分子や
RNA断片をも包含する)の代りに、PNA(ペプチド
核酸)と呼ばれるオリゴヌクレオチド類縁体を用いる技
術も提唱されている。このPNAを固相担体に共有結合
により固定する方法として、アビジンとビオチンとを組
み合わせて用いる方法も知られている(特開平11−3
32595号公報)。この公開公報には、固相基板とし
て、表面プラズモン共鳴(SPR)バイオセンサを利用
することが記載されている。表面プラズモン共鳴バイオ
センサ上にプローブ分子が固定されたDNAチップを用
いて、その表面にハイブリダイゼーションを介して結合
固定されたDNA断片は、表面プラズモン共鳴現象を利
用して検出することができる。
【0012】特開平4−228076号公報(米国特許
第5387505号明細書に対応)には、ビオチン分子
を付けた標的DNAを、アビジン分子を表面に固定した
基体に結合させて、標的DNAを分離する技術が記載さ
れている。
第5387505号明細書に対応)には、ビオチン分子
を付けた標的DNAを、アビジン分子を表面に固定した
基体に結合させて、標的DNAを分離する技術が記載さ
れている。
【0013】特公平7−43380号公報(米国特許第
5094962号明細書に対応)には、リガンド−受容
体アッセイに用いる検出用具であって、表面に反応活性
基を有する微孔質ポリマー粒子の表面に受容体分子を結
合させた分析用具が記載されている。
5094962号明細書に対応)には、リガンド−受容
体アッセイに用いる検出用具であって、表面に反応活性
基を有する微孔質ポリマー粒子の表面に受容体分子を結
合させた分析用具が記載されている。
【0014】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、新規な反応
性電極、そして、ペプチド核酸をプローブ分子として固
定した核酸試料検出用具を提供することを、その課題と
する。
性電極、そして、ペプチド核酸をプローブ分子として固
定した核酸試料検出用具を提供することを、その課題と
する。
【0015】
【課題を解決するための手段】本発明は、電極と該電極
表面に共有結合により固定された一群のペプチド核酸と
からなる核酸試料検出用具にある。
表面に共有結合により固定された一群のペプチド核酸と
からなる核酸試料検出用具にある。
【0016】本発明におけるペプチド核酸と電極との共
有結合は、ペプチド核酸に導入された活性水素含有基と
電極表面に導入されたビニルスルホニル基もしくはその
反応性前駆体基を含む反応性基との反応により形成され
ていることが望ましい。あるいは、ペプチド核酸と電極
との共有結合を、電極に導入された活性水素含有基とペ
プチド核酸に導入されたビニルスルホニル基もしくはそ
の反応性前駆体基を含む反応性基との反応により形成す
ることもできる。
有結合は、ペプチド核酸に導入された活性水素含有基と
電極表面に導入されたビニルスルホニル基もしくはその
反応性前駆体基を含む反応性基との反応により形成され
ていることが望ましい。あるいは、ペプチド核酸と電極
との共有結合を、電極に導入された活性水素含有基とペ
プチド核酸に導入されたビニルスルホニル基もしくはそ
の反応性前駆体基を含む反応性基との反応により形成す
ることもできる。
【0017】本発明の核酸試料検出用具はまた、電極、
該電極表面に共有結合により固定された一群のペプチド
核酸、そして該一群のペプチド核酸のそれぞれを互いに
電極表面と平行な平面に沿って空間的に分離する配置に
て電極表面に固定された一群のスペーサ基からなる構成
を有していていもよい。
該電極表面に共有結合により固定された一群のペプチド
核酸、そして該一群のペプチド核酸のそれぞれを互いに
電極表面と平行な平面に沿って空間的に分離する配置に
て電極表面に固定された一群のスペーサ基からなる構成
を有していていもよい。
【0018】スペーサ基は、電荷を有していないことが
好ましく、またスペーサ基の電極に固定されている側と
は反対側の末端が疎水性基であることが好ましい。そし
て、電極表面に固定された一群のペプチド核酸と一群の
スペーサ基とのモル比が1:1乃至1:200の範囲に
あることが望ましく、特に1:2乃至1:100、さら
には1:5乃至1:50の範囲に有ることが望ましい。
好ましく、またスペーサ基の電極に固定されている側と
は反対側の末端が疎水性基であることが好ましい。そし
て、電極表面に固定された一群のペプチド核酸と一群の
スペーサ基とのモル比が1:1乃至1:200の範囲に
あることが望ましく、特に1:2乃至1:100、さら
には1:5乃至1:50の範囲に有ることが望ましい。
【0019】本発明はまた、導電性基を有する縫い込み
型インターカレータ及び水性媒体の存在下、核酸試料を
上記のペプチド核酸が固定された核酸試料検出用具に接
触させることにより、該インターカレータが挿入された
核酸試料とペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成
させ、次いで、核酸試料検出用具の電極に電位を印加
し、該検出用具の電極と外部電極との間をインターカレ
ータの導電性基を介して流れる電流を測定することを特
徴とするペプチド核酸に相補性を有する核酸試料の検出
方法にもある。
型インターカレータ及び水性媒体の存在下、核酸試料を
上記のペプチド核酸が固定された核酸試料検出用具に接
触させることにより、該インターカレータが挿入された
核酸試料とペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成
させ、次いで、核酸試料検出用具の電極に電位を印加
し、該検出用具の電極と外部電極との間をインターカレ
ータの導電性基を介して流れる電流を測定することを特
徴とするペプチド核酸に相補性を有する核酸試料の検出
方法にもある。
【0020】本発明はまた、導電性基を有するカチオン
性分子及び水性媒体の存在下、核酸試料を上記のペプチ
ド核酸が固定された核酸試料検出用具に接触させること
により、該カチオン性分子がイオン結合した核酸試料と
ペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成させ、次い
で、核酸試料検出用具の電極に電位を印加し、該検出用
具の電極と外部電極との間をカチオン性分子の導電性基
を介して流れる電流を測定することを特徴とするペプチ
ド核酸に相補性を有する核酸試料の検出方法にもある。
性分子及び水性媒体の存在下、核酸試料を上記のペプチ
ド核酸が固定された核酸試料検出用具に接触させること
により、該カチオン性分子がイオン結合した核酸試料と
ペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成させ、次い
で、核酸試料検出用具の電極に電位を印加し、該検出用
具の電極と外部電極との間をカチオン性分子の導電性基
を介して流れる電流を測定することを特徴とするペプチ
ド核酸に相補性を有する核酸試料の検出方法にもある。
【0021】上記の検出方法において、基質およびその
基質との反応によって還元型に変化する酸化酵素をハイ
ブリッド複合体生成の反応系に存在させることによっ
て、PNA固定電極と導電性基との間を流れる電流を、
還元型に変化した酸化酵素と電極との間の電子移動によ
って増幅させて測定することもできる。以下、この測定
法を増感型測定法という。
基質との反応によって還元型に変化する酸化酵素をハイ
ブリッド複合体生成の反応系に存在させることによっ
て、PNA固定電極と導電性基との間を流れる電流を、
還元型に変化した酸化酵素と電極との間の電子移動によ
って増幅させて測定することもできる。以下、この測定
法を増感型測定法という。
【0022】本発明はまた、電極の表面に、一群のビニ
ルスルホニル基もしくはその反応性前駆体基がそれぞれ
連結基を介して共有結合により固定されてなる反応性電
極にもある。
ルスルホニル基もしくはその反応性前駆体基がそれぞれ
連結基を介して共有結合により固定されてなる反応性電
極にもある。
【0023】本発明の反応性電極は、その電極の表面に
一群のビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆体基
がそれぞれ連結基を介して共有結合により固定され、さ
らに該一群のビニルスルホニル基もしくはその反応性前
駆体基を互いに電極表面と平行な平面に沿って空間的に
分離する配置にて電極表面に固定された一群のスペーサ
基からなるものであることが好ましい。
一群のビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆体基
がそれぞれ連結基を介して共有結合により固定され、さ
らに該一群のビニルスルホニル基もしくはその反応性前
駆体基を互いに電極表面と平行な平面に沿って空間的に
分離する配置にて電極表面に固定された一群のスペーサ
基からなるものであることが好ましい。
【0024】本発明で用いるビニルスルホニル基もしく
はその反応性前駆体基と連結基との連結体が下記の式
(1)により表わされるものであることが望ましい。
はその反応性前駆体基と連結基との連結体が下記の式
(1)により表わされるものであることが望ましい。
【0025】
【化6】−L−SO2−X …(1)
【0026】[上記の式において、Xは、−CR1=C
R2R3または−CHR1−CR2R3Yを表わし;R1、R
2及びR3は、互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1
乃至6のアルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリー
ル基、及び炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する
合計炭素原子数が7乃至26のアラルキル基からなる群
より選ばれる原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン
原子、−OSO2R11、−OCOR12、−OSO3M、及
び四級ピリジニウム基からなる群より選ばれる原子もし
くは基を表わし;R11は、炭素原子数が1乃至6のアル
キル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ばれる
基を表わし;R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル
基および炭素原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基
からなる群より選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、
アルカリ金属原子およびアンモニウム基からなる群より
選ばれる原子もしくは基を表わし;そして、Lは連結基
を表わす]。
R2R3または−CHR1−CR2R3Yを表わし;R1、R
2及びR3は、互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1
乃至6のアルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリー
ル基、及び炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する
合計炭素原子数が7乃至26のアラルキル基からなる群
より選ばれる原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン
原子、−OSO2R11、−OCOR12、−OSO3M、及
び四級ピリジニウム基からなる群より選ばれる原子もし
くは基を表わし;R11は、炭素原子数が1乃至6のアル
キル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ばれる
基を表わし;R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル
基および炭素原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基
からなる群より選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、
アルカリ金属原子およびアンモニウム基からなる群より
選ばれる原子もしくは基を表わし;そして、Lは連結基
を表わす]。
【0027】上記式(1)において、Xは、−CH=C
H2で表わされるビニル基であることが望ましい。そし
てLは、−NH−、−S−、および−O−からなる群か
ら選ばれる連結部位を有する連結基であることが望まし
く、特に−(L1)n−NHCH2CH2−[但し、L1は
連結基を表わし、そしてnは0もしくは1である]で表
わされる連結基であることが望ましい。
H2で表わされるビニル基であることが望ましい。そし
てLは、−NH−、−S−、および−O−からなる群か
ら選ばれる連結部位を有する連結基であることが望まし
く、特に−(L1)n−NHCH2CH2−[但し、L1は
連結基を表わし、そしてnは0もしくは1である]で表
わされる連結基であることが望ましい。
【0028】本発明の反応性電極は、表面に反応性基が
導入された電極に、下記式(2):
導入された電極に、下記式(2):
【0029】
【化7】 X1−SO2−L2−SO2−X2 …(2)
【0030】[上記の式において、X1およびX2は互い
に独立に、−CR1=CR2R3、または−CHR1−CR
2R3Yを表わし;R1、R2及びR3は、互いに独立に、
水素原子、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原
子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数が1乃
至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至26
のアラルキル基からなる群より選ばれる原子もしくは基
を表わし;Yは、ハロゲン原子、−OSO2R11、−O
COR12、−OSO3M、及び四級ピリジニウム基から
なる群より選ばれる原子もしくは基を表わし;R11は、
炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が6乃
至20のアリール基、及び炭素原子数が1乃至6のアル
キル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至26のアラルキ
ル基からなる群より選ばれる基を表わし;R12は、炭素
原子数が1乃至6のアルキル基および炭素原子数が1乃
至6のハロゲン化アルキル基からなる群より選ばれる基
を表わし;Mは、水素原子、アルカリ金属原子およびア
ンモニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を
表わし;そして、L2は連結基を表わす]で表わされる
ジスルホン化合物を接触させることにより有利に製造す
ることができる。
に独立に、−CR1=CR2R3、または−CHR1−CR
2R3Yを表わし;R1、R2及びR3は、互いに独立に、
水素原子、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原
子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数が1乃
至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至26
のアラルキル基からなる群より選ばれる原子もしくは基
を表わし;Yは、ハロゲン原子、−OSO2R11、−O
COR12、−OSO3M、及び四級ピリジニウム基から
なる群より選ばれる原子もしくは基を表わし;R11は、
炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が6乃
至20のアリール基、及び炭素原子数が1乃至6のアル
キル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至26のアラルキ
ル基からなる群より選ばれる基を表わし;R12は、炭素
原子数が1乃至6のアルキル基および炭素原子数が1乃
至6のハロゲン化アルキル基からなる群より選ばれる基
を表わし;Mは、水素原子、アルカリ金属原子およびア
ンモニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を
表わし;そして、L2は連結基を表わす]で表わされる
ジスルホン化合物を接触させることにより有利に製造す
ることができる。
【0031】また、本発明のスペーサ基付きの反応性電
極は、電極表面にビニルスルホニル基もしくはその反応
性前駆体基と反応する基を導入する際に、一方の端部に
電極表面に反応する基を備え、他方の端部にビニルスル
ホニル基もしくはその反応性前駆体基と反応しない(或
は、反応しにくい)基を備えたスペーサ化合物(例、1
−ヘキサンチオール、6−ヒドロキシ−1−ヘキサンチ
オール)を存在させることによって製造することができ
る。そして、このようにして製造したスペーサ基付きの
反応性電極に、一端に反応性基を備えたPNAを接触さ
せることによって、電極表面にスペーサ基により互いに
空間的に隔離された状態でPNAが共有結合により固定
されたPNA固定電極を得ることができる。
極は、電極表面にビニルスルホニル基もしくはその反応
性前駆体基と反応する基を導入する際に、一方の端部に
電極表面に反応する基を備え、他方の端部にビニルスル
ホニル基もしくはその反応性前駆体基と反応しない(或
は、反応しにくい)基を備えたスペーサ化合物(例、1
−ヘキサンチオール、6−ヒドロキシ−1−ヘキサンチ
オール)を存在させることによって製造することができ
る。そして、このようにして製造したスペーサ基付きの
反応性電極に、一端に反応性基を備えたPNAを接触さ
せることによって、電極表面にスペーサ基により互いに
空間的に隔離された状態でPNAが共有結合により固定
されたPNA固定電極を得ることができる。
【0032】あるいは、本発明のスペーサ基付きの反応
性電極は、電極表面に、まず多数の反応性基を導入し、
次いで、この表面に反応性基を持つ電極に、一方の端部
に該反応性基と反応する基を備え、他方の端部にはPN
Aの反応性基と反応する基を備えた、ジビニルスルホン
化合物などのジスルホン化合物、そして、一方の端部に
電極の反応性基と反応する基を備え、他方の端部にPN
Aの反応性基と反応しない(或は、反応しにくい)基を
備えたスペーサ化合物を同時に接触させることによって
も作成することができる。そして、このようにして製造
したスペーサ基付きの反応性電極に、一端に反応性基を
備えたPNAを接触させることにより、電極表面にスペ
ーサ基により互いに空間的に隔離された状態でPNAが
共有結合により固定されたPNA固定電極を得ることが
できる。
性電極は、電極表面に、まず多数の反応性基を導入し、
次いで、この表面に反応性基を持つ電極に、一方の端部
に該反応性基と反応する基を備え、他方の端部にはPN
Aの反応性基と反応する基を備えた、ジビニルスルホン
化合物などのジスルホン化合物、そして、一方の端部に
電極の反応性基と反応する基を備え、他方の端部にPN
Aの反応性基と反応しない(或は、反応しにくい)基を
備えたスペーサ化合物を同時に接触させることによって
も作成することができる。そして、このようにして製造
したスペーサ基付きの反応性電極に、一端に反応性基を
備えたPNAを接触させることにより、電極表面にスペ
ーサ基により互いに空間的に隔離された状態でPNAが
共有結合により固定されたPNA固定電極を得ることが
できる。
【0033】上記のようにして作製されたスペーサ基を
介して複数個のPNAが互いに隔離された状態で電極表
面に固定された核酸試料検出用電極は、特に優れた感度
を示す。
介して複数個のPNAが互いに隔離された状態で電極表
面に固定された核酸試料検出用電極は、特に優れた感度
を示す。
【0034】上記の式(2)で表わされるジスルホン化
合物の代表的な例としては、1,2−ビス(ビニルスル
ホニルアセトアミド)エタンを挙げることができる。
合物の代表的な例としては、1,2−ビス(ビニルスル
ホニルアセトアミド)エタンを挙げることができる。
【0035】上記の電極表面に導入される反応性基は、
アミノ基、メルカプト基もしくはヒドロキシル基である
ことが望ましい。
アミノ基、メルカプト基もしくはヒドロキシル基である
ことが望ましい。
【0036】
【発明の実施の形態】本発明の反応性電極は、好ましく
は、電極の表面に、一群のビニルスルホニル基もしくは
その反応性前駆体基がそれぞれ連結基を介して共有結合
により結合固定された構成を有している。このような電
極は、予め表面に反応性基を導入した電極を用意し、こ
の電極と、この電極表面に備えられた反応性基と反応し
て共有結合を形成する反応性基を一方の端部もしくは端
部附近に有し、かつ他方の端部もしくは端部附近にビニ
ルスルホニル基もしくはビニルスルホニル基の反応性前
駆体基を有する化合物とを接触させることにより製造す
ることができる。
は、電極の表面に、一群のビニルスルホニル基もしくは
その反応性前駆体基がそれぞれ連結基を介して共有結合
により結合固定された構成を有している。このような電
極は、予め表面に反応性基を導入した電極を用意し、こ
の電極と、この電極表面に備えられた反応性基と反応し
て共有結合を形成する反応性基を一方の端部もしくは端
部附近に有し、かつ他方の端部もしくは端部附近にビニ
ルスルホニル基もしくはビニルスルホニル基の反応性前
駆体基を有する化合物とを接触させることにより製造す
ることができる。
【0037】[電極]本発明の反応性電極の製造に用い
る電極としては、従来より電気化学的検出方法に利用さ
れるDNA断片検出用電極の製造に一般的に用いられて
いる金電極、あるいはDNA断片検出用電極の製造用と
して提案されている各種の電極が好ましく利用すること
ができる。
る電極としては、従来より電気化学的検出方法に利用さ
れるDNA断片検出用電極の製造に一般的に用いられて
いる金電極、あるいはDNA断片検出用電極の製造用と
して提案されている各種の電極が好ましく利用すること
ができる。
【0038】電極は通常、外部に出力する端子を備えて
いるものを用いる。電極の材料としては、金以外にも、
グラファイト、グラシーカーボン等の炭素電極、白金、
パラジウム、ロジウム等の貴金属電極、酸化チタン、酸
化スズ、酸化マンガン、酸化鉛等の酸化物電極、Si、
Ge、ZnO、CdS等の半導体電極、チタンなどの電
子伝導体を挙げることができるが、金もしくはグラシー
カーボンを用いることが特に好ましい。これらの電子伝
導体は、導電性高分子によって被覆されていても、単分
子膜によって被覆されていてもよい。電極は、例えば、
電極がグラシーカーボンである場合には、電極を過マン
ガン酸カリウムで処理するなどの方法で表面処理してお
くことが好ましい。電極が導電性を持たない基板上に配
置された複数の電極である場合には、電極表面のそれぞ
れに、互いに異なる種類のPNAを固定することが好ま
しい。
いるものを用いる。電極の材料としては、金以外にも、
グラファイト、グラシーカーボン等の炭素電極、白金、
パラジウム、ロジウム等の貴金属電極、酸化チタン、酸
化スズ、酸化マンガン、酸化鉛等の酸化物電極、Si、
Ge、ZnO、CdS等の半導体電極、チタンなどの電
子伝導体を挙げることができるが、金もしくはグラシー
カーボンを用いることが特に好ましい。これらの電子伝
導体は、導電性高分子によって被覆されていても、単分
子膜によって被覆されていてもよい。電極は、例えば、
電極がグラシーカーボンである場合には、電極を過マン
ガン酸カリウムで処理するなどの方法で表面処理してお
くことが好ましい。電極が導電性を持たない基板上に配
置された複数の電極である場合には、電極表面のそれぞ
れに、互いに異なる種類のPNAを固定することが好ま
しい。
【0039】本発明で用いられる電極は、導電性を持た
ない基板上に複数の電極が配置されたものであることが
好ましい。その場合、電極は、導電性を持たない基板上
に、互いに接しないように、かつ規則的に配置されてい
ることが好ましい。
ない基板上に複数の電極が配置されたものであることが
好ましい。その場合、電極は、導電性を持たない基板上
に、互いに接しないように、かつ規則的に配置されてい
ることが好ましい。
【0040】導電性を持たない基板としては、電気絶縁
性の疎水性担体、あるいは電気絶縁性の低親水性の担体
であることが好ましい。また、その表面が凹凸を有する
平面性の低いものであっても好ましく用いることができ
る。基板の材質としては、ガラス、セメント、陶磁器等
のセラミックスもしくはニューセラミックス、ポリエチ
レンテレフタレート、酢酸セルロース、ビスフェノール
Aのポリカーボネート、ポリスチレン、ポリメチルメタ
クリレート等のポリマー、シリコン、活性炭、多孔質ガ
ラス、多孔質セラミックス、多孔質シリコン、多孔質活
性炭、織編物、不織布、濾紙、短繊維、メンブレンフィ
ルター等の多孔質物質などを挙げることができるが、各
種ポリマー、ガラスもしくはシリコンであることが特に
好ましい。これは、表面処理の容易さや電気化学的方法
による解析の容易さによるものである。基板の厚さは、
特に限定されないが、板状である場合には、100乃至
10000μmの範囲にあることが好ましい。
性の疎水性担体、あるいは電気絶縁性の低親水性の担体
であることが好ましい。また、その表面が凹凸を有する
平面性の低いものであっても好ましく用いることができ
る。基板の材質としては、ガラス、セメント、陶磁器等
のセラミックスもしくはニューセラミックス、ポリエチ
レンテレフタレート、酢酸セルロース、ビスフェノール
Aのポリカーボネート、ポリスチレン、ポリメチルメタ
クリレート等のポリマー、シリコン、活性炭、多孔質ガ
ラス、多孔質セラミックス、多孔質シリコン、多孔質活
性炭、織編物、不織布、濾紙、短繊維、メンブレンフィ
ルター等の多孔質物質などを挙げることができるが、各
種ポリマー、ガラスもしくはシリコンであることが特に
好ましい。これは、表面処理の容易さや電気化学的方法
による解析の容易さによるものである。基板の厚さは、
特に限定されないが、板状である場合には、100乃至
10000μmの範囲にあることが好ましい。
【0041】導電性を持たない基板上に複数の電極が配
置されたものとしては、導電性を持たない基板の表面を
上記の電子伝導体で処理したものを用いることが好まし
く、金を蒸着したものを用いることが特に好ましい。基
板は、電子伝導体で表面処理をする前に、基板上に電荷
を有する親水性の高分子物質からなる層や架橋剤からな
る層を設けてもよい。このような層を設けることによっ
て基板の凹凸を軽減することができる。また、基板によ
っては、その基板中に電荷を有する親水性の高分子物質
を含ませることも可能であり、このような処理を施した
基板も好ましく用いることができる。
置されたものとしては、導電性を持たない基板の表面を
上記の電子伝導体で処理したものを用いることが好まし
く、金を蒸着したものを用いることが特に好ましい。基
板は、電子伝導体で表面処理をする前に、基板上に電荷
を有する親水性の高分子物質からなる層や架橋剤からな
る層を設けてもよい。このような層を設けることによっ
て基板の凹凸を軽減することができる。また、基板によ
っては、その基板中に電荷を有する親水性の高分子物質
を含ませることも可能であり、このような処理を施した
基板も好ましく用いることができる。
【0042】導電性を持たない基板上に複数の電極が配
置されたものとしては、文献(Sosnowski,R.G. et al.,
Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 94, 1119-1123(1997))に記
載の、核酸が未固定のシリコンチップも好ましく用いる
ことができる。また、プリント配線基板のように、が基
板上に印刷されてなるものであってもよい。
置されたものとしては、文献(Sosnowski,R.G. et al.,
Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 94, 1119-1123(1997))に記
載の、核酸が未固定のシリコンチップも好ましく用いる
ことができる。また、プリント配線基板のように、が基
板上に印刷されてなるものであってもよい。
【0043】電極の表面には、予め区画あるいは想定さ
れた多数の領域が設定されており、各領域毎に、ジビニ
ルスルホン化合物などの二官能性反応性化合物と反応す
ることができる反応性基、例、アミノ基(−NH2)、
メルカプト基(−SH)、あるいはヒドロキシル基(−
OH)、を導入する。
れた多数の領域が設定されており、各領域毎に、ジビニ
ルスルホン化合物などの二官能性反応性化合物と反応す
ることができる反応性基、例、アミノ基(−NH2)、
メルカプト基(−SH)、あるいはヒドロキシル基(−
OH)、を導入する。
【0044】反応性基を備えた電極は、ジビニルスルホ
ン化合物などの二官能性反応性化合物と接触することに
よって、その反応性基と二官能性反応性化合物とが反応
し、共有結合が形成され、電極の反応性基部分が延長さ
れ、その先端もしくは先端附近にビニルスルホニル基も
しくはその反応性前駆体基を持つ反応性鎖が形成され
て、本発明の反応性電極が生成する。
ン化合物などの二官能性反応性化合物と接触することに
よって、その反応性基と二官能性反応性化合物とが反応
し、共有結合が形成され、電極の反応性基部分が延長さ
れ、その先端もしくは先端附近にビニルスルホニル基も
しくはその反応性前駆体基を持つ反応性鎖が形成され
て、本発明の反応性電極が生成する。
【0045】本発明の反応性電極において、電極表面に
導入されるビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆
体基と連結基との連結体は、下記の式(1)により表わ
されるものであることが望ましい。
導入されるビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆
体基と連結基との連結体は、下記の式(1)により表わ
されるものであることが望ましい。
【0046】
【化8】 −L−SO2−X −−− (1)
【0047】上記の式(1)において、Xは、−CR1
=CR2R3または−CHR1−CR2R3Y(反応性前駆
体基)を表わす。R1、R2およびR3は、それぞれ互い
に独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6のアルキル
基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、あるいは炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
が7乃至26のアラルキル基を表わす。炭素原子数が1
乃至6のアルキル基の例としては、メチル基、エチル
基、n−プロピル基、n−ブチル基、及びn−ヘキシル
基を挙げることができ、メチル基であることが特に好ま
しい。アリール基としては、フェニル基及びナフチル基
を挙げることができる。R1、R2及びR3は共に水素原
子であることが好ましい。
=CR2R3または−CHR1−CR2R3Y(反応性前駆
体基)を表わす。R1、R2およびR3は、それぞれ互い
に独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6のアルキル
基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、あるいは炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
が7乃至26のアラルキル基を表わす。炭素原子数が1
乃至6のアルキル基の例としては、メチル基、エチル
基、n−プロピル基、n−ブチル基、及びn−ヘキシル
基を挙げることができ、メチル基であることが特に好ま
しい。アリール基としては、フェニル基及びナフチル基
を挙げることができる。R1、R2及びR3は共に水素原
子であることが好ましい。
【0048】Yは、−OH、−OR0、−SH、NH3、
NH2R0(但し、R0は、水素原子を除く、アルキル基
などの基である)などの求核試薬によって置換される
基、あるいは塩基によって「HY」として脱離する基を
表わし、その例としては、ハロゲン原子、−OSO2R
11、−OCOR12、−OSO3M、あるいは四級ピリジ
ニウム基を表わす(R11は、炭素原子数が1乃至6のア
ルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、ある
いは炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭
素原子数が7乃至26のアラルキル基を表わし;R
12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基あるいは炭素
原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基を表わし;M
は、水素原子、アルカリ金属原子あるいはアンモニウム
基を表わす)を挙げることができる。
NH2R0(但し、R0は、水素原子を除く、アルキル基
などの基である)などの求核試薬によって置換される
基、あるいは塩基によって「HY」として脱離する基を
表わし、その例としては、ハロゲン原子、−OSO2R
11、−OCOR12、−OSO3M、あるいは四級ピリジ
ニウム基を表わす(R11は、炭素原子数が1乃至6のア
ルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、ある
いは炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭
素原子数が7乃至26のアラルキル基を表わし;R
12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基あるいは炭素
原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基を表わし;M
は、水素原子、アルカリ金属原子あるいはアンモニウム
基を表わす)を挙げることができる。
【0049】Lは、電極もしくは電極に結合している連
結基と、上記−SO2−X基とを連結している二価もし
くはそれ以上の連結基を表わす。ただし、Lは単結合で
あってもよい。二価の連結基としては、炭素原子数が1
乃至6のアルキレン基、炭素原子数が3乃至16の脂肪
族環基、炭素原子数が6乃至20のアリーレン基、N、
SおよびPからなる群より選ばれるヘテロ原子を1乃至
3個含む炭素原子数が2乃至20の複素環基、−O−、
−S−、−SO−、−SO2−、−SO3−、−NR
11−、−CO−およびこれらの組み合わせから群より選
ばれる基を一つあるいは複数個組み合わせてなる基であ
ることが好ましい。R11は、水素原子、炭素原子数が1
乃至15のアルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリ
ール基、あるいは炭素原子数が1乃至6のアルキル基を
有する炭素原子が7乃至21のアラルキル基であること
が好ましく、水素原子もしくは炭素原子数が1乃至6の
アルキル基であることがさらに好ましく、水素原子、メ
チル基もしくはエチル基であることが特に好ましい。
結基と、上記−SO2−X基とを連結している二価もし
くはそれ以上の連結基を表わす。ただし、Lは単結合で
あってもよい。二価の連結基としては、炭素原子数が1
乃至6のアルキレン基、炭素原子数が3乃至16の脂肪
族環基、炭素原子数が6乃至20のアリーレン基、N、
SおよびPからなる群より選ばれるヘテロ原子を1乃至
3個含む炭素原子数が2乃至20の複素環基、−O−、
−S−、−SO−、−SO2−、−SO3−、−NR
11−、−CO−およびこれらの組み合わせから群より選
ばれる基を一つあるいは複数個組み合わせてなる基であ
ることが好ましい。R11は、水素原子、炭素原子数が1
乃至15のアルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリ
ール基、あるいは炭素原子数が1乃至6のアルキル基を
有する炭素原子が7乃至21のアラルキル基であること
が好ましく、水素原子もしくは炭素原子数が1乃至6の
アルキル基であることがさらに好ましく、水素原子、メ
チル基もしくはエチル基であることが特に好ましい。
【0050】Lが−NR11−、−SONR11−、−CO
NR11−、−NR11COO−、および−NR11CONR
11−からなる群より選ばれる基を二個以上組み合わせて
なる基である場合には、それらのR11同士が結合して環
を形成していてもよい。
NR11−、−NR11COO−、および−NR11CONR
11−からなる群より選ばれる基を二個以上組み合わせて
なる基である場合には、それらのR11同士が結合して環
を形成していてもよい。
【0051】R11のアルキル基、R11のアリール基、お
よびR11のアラルキル基は、置換基を持っていてもよ
い。このような置換基としては、水酸基、炭素原子数が
1乃至6のアルコキシ基、炭素原子数が1乃至6のアル
ケニル基、炭素原子数が2乃至7のカルバモイル基、炭
素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が2乃至
7のアラルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリール
基、スルファモイル基(もしくはそのNa塩、K塩
等)、スルホ基(もしくはそのNa塩、K塩等)、カル
ボン酸基(もしくはそのNa塩、K塩等)、ハロゲン原
子、炭素原子数が1乃至6のアルケニレン基、炭素原子
数が6乃至20のアリーレン基、スルホニル基、および
これらの組み合わせからなる群より選ばれる原子もしく
は基を挙げることができる。
よびR11のアラルキル基は、置換基を持っていてもよ
い。このような置換基としては、水酸基、炭素原子数が
1乃至6のアルコキシ基、炭素原子数が1乃至6のアル
ケニル基、炭素原子数が2乃至7のカルバモイル基、炭
素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が2乃至
7のアラルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリール
基、スルファモイル基(もしくはそのNa塩、K塩
等)、スルホ基(もしくはそのNa塩、K塩等)、カル
ボン酸基(もしくはそのNa塩、K塩等)、ハロゲン原
子、炭素原子数が1乃至6のアルケニレン基、炭素原子
数が6乃至20のアリーレン基、スルホニル基、および
これらの組み合わせからなる群より選ばれる原子もしく
は基を挙げることができる。
【0052】上記「−X」基の好ましい具体例を以下に
示す。また、「−L−SO2−X」として使用できる基
の例についても、その後に示す。
示す。また、「−L−SO2−X」として使用できる基
の例についても、その後に示す。
【0053】
【化9】
【0054】
【化10】
【0055】「−X」は、上記具体例中、(X1)、
(X2)、(X3)、(X4)、(X7)、(X8)、
(X13)、あるいは(X14)であることが好まし
く、(X1)あるいは(X2)であることがさらに好ま
しい。特に好ましいのは(X1)で表わされるビニル基
である。
(X2)、(X3)、(X4)、(X7)、(X8)、
(X13)、あるいは(X14)であることが好まし
く、(X1)あるいは(X2)であることがさらに好ま
しい。特に好ましいのは(X1)で表わされるビニル基
である。
【0056】Lの好ましい具体例を以下に示す。但し、
aは、1乃至6の整数であり、1もしくは2であること
が好ましく、1であることが特に好ましい。bは、0乃
至6の整数であり、2もしくは3であることが好まし
い。
aは、1乃至6の整数であり、1もしくは2であること
が好ましく、1であることが特に好ましい。bは、0乃
至6の整数であり、2もしくは3であることが好まし
い。
【0057】
【化11】
【0058】Lとしては、上記記載の二価の連結基の他
に、上記式のアルキレン基の水素原子が−SO2CH=
CH2基によって置換されてなる基も好ましい。
に、上記式のアルキレン基の水素原子が−SO2CH=
CH2基によって置換されてなる基も好ましい。
【0059】前記の式(1)で表わされるビニルスルホ
ニル基もしくは反応性前駆体基が共有結合により固定さ
れた電極を得るために利用される二官能反応性化合物と
しては、下記の式(2)で表わされるジスルホン化合物
が有利に利用できる。
ニル基もしくは反応性前駆体基が共有結合により固定さ
れた電極を得るために利用される二官能反応性化合物と
しては、下記の式(2)で表わされるジスルホン化合物
が有利に利用できる。
【0060】
【化12】 X1−SO2−L2−SO2−X2 −−− (2)
【0061】[上記の式において、X1およびX2は互い
に独立に、−CR1=CR2R3、または−CHR1−CR
2R3Y(反応性前駆体基)を表わし;R1、R2及びR3
は、互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6の
アルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及
び炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素
原子数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ば
れる原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン原子、−
OSO2R11、−OCOR12、−OSO3M、及び四級ピ
リジニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を
表わし;R11は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、
炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数
が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃
至26のアラルキル基からなる群より選ばれる基を表わ
し;R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基および
炭素原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基からなる
群より選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、アルカリ
金属原子およびアンモニウム基からなる群より選ばれる
原子もしくは基を表わし;そして、L2は連結基を表わ
す]。
に独立に、−CR1=CR2R3、または−CHR1−CR
2R3Y(反応性前駆体基)を表わし;R1、R2及びR3
は、互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6の
アルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及
び炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素
原子数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ば
れる原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン原子、−
OSO2R11、−OCOR12、−OSO3M、及び四級ピ
リジニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を
表わし;R11は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、
炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数
が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃
至26のアラルキル基からなる群より選ばれる基を表わ
し;R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基および
炭素原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基からなる
群より選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、アルカリ
金属原子およびアンモニウム基からなる群より選ばれる
原子もしくは基を表わし;そして、L2は連結基を表わ
す]。
【0062】すなわち、上記の式(2)で表わされるジ
スルホン化合物を、前記の反応性基を備えた電極と、例
えば水性雰囲気にて接触させることによって、本発明の
反応性電極を容易に製造することができる。
スルホン化合物を、前記の反応性基を備えた電極と、例
えば水性雰囲気にて接触させることによって、本発明の
反応性電極を容易に製造することができる。
【0063】本発明で好ましく用いるジスルホン化合物
の代表例を下記に示す。なお、ジスルホン化合物は、二
種類以上を混合して用いてもよい。
の代表例を下記に示す。なお、ジスルホン化合物は、二
種類以上を混合して用いてもよい。
【0064】
【化13】
【0065】
【化14】
【0066】上記の式(2)で表わされるジスルホン化
合物の代表的な例としては、1,2−ビス(ビニルスル
ホニルアセトアミド)エタン[上記のS1に相当する]
を挙げることができる。
合物の代表的な例としては、1,2−ビス(ビニルスル
ホニルアセトアミド)エタン[上記のS1に相当する]
を挙げることができる。
【0067】本発明で用いるジスルホン化合物の合成法
については、たとえば、特公昭47−2429号、同5
0−35807号、特開昭49−24435号、同53
−41551号、同59−18944号等の各種公報に
詳細が記載されている。
については、たとえば、特公昭47−2429号、同5
0−35807号、特開昭49−24435号、同53
−41551号、同59−18944号等の各種公報に
詳細が記載されている。
【0068】上記のようにして得られた反応性電極を利
用して、DNA、RNA、DNA断片、あるいはRNA
断片などの天然起源のポリヌクレオチドあるいはオリゴ
ヌクレオチドなどの核酸試料の検出固定のための本発明
のペプチド核酸固定検出具を作製するためには、上記の
反応性電極を、その担体表面上のビニルスルホニル基も
しくはその反応性前駆体基と反応して共有結合を形成す
るアミノ基などの反応性基を備えたペプチド核酸と接触
させる方法が利用される。そして、このようにして所望
のペプチド核酸からなるプローブ分子を備えた検出具を
作製することができる。
用して、DNA、RNA、DNA断片、あるいはRNA
断片などの天然起源のポリヌクレオチドあるいはオリゴ
ヌクレオチドなどの核酸試料の検出固定のための本発明
のペプチド核酸固定検出具を作製するためには、上記の
反応性電極を、その担体表面上のビニルスルホニル基も
しくはその反応性前駆体基と反応して共有結合を形成す
るアミノ基などの反応性基を備えたペプチド核酸と接触
させる方法が利用される。そして、このようにして所望
のペプチド核酸からなるプローブ分子を備えた検出具を
作製することができる。
【0069】本発明の電極表面にビニルスルホニル基も
しくはその反応性前駆体基は、加水分解に対して高い抵
抗性を有しているため、容易に安定に保存することがで
き、また、アミノ基を予め備えているか、あるいはアミ
ノ基などの反応性基が導入されているかペプチド核酸
(PNA)の反応性基と迅速に反応して、安定な共有結
合を形成することができる。
しくはその反応性前駆体基は、加水分解に対して高い抵
抗性を有しているため、容易に安定に保存することがで
き、また、アミノ基を予め備えているか、あるいはアミ
ノ基などの反応性基が導入されているかペプチド核酸
(PNA)の反応性基と迅速に反応して、安定な共有結
合を形成することができる。
【0070】[PNA]本発明で好ましく用いられるP
NAは、下記一般式(3)で表される化合物である。
NAは、下記一般式(3)で表される化合物である。
【0071】
【化15】(3)
【0072】式中、B11は、リガンドであって、天然の
核酸塩基(A、T、C、G、I、もしくはU)あるいは
塩基類似体を表す。B11は、天然に見出される位置、即
ち、アデニン、グアニンもしくはイノシンを含むプリン
については、9位において、チミン、ウラシルもしくは
シトシンを含むピリミジンについては、1位において結
合している。塩基類似体とは、天然に存在しない核酸塩
基に類似の有機塩基をいい、プリン環やピリミジン環の
一部がCからNへ、もしくはNからCへ置換された化合
物、またはプリン環やピリミジン環の一部に新たな修飾
を施された化合物(スルフヒドリル基やハロゲン原子が
導入された化合物)をいう。また、B11は、核酸塩基を
含まない芳香族部分、炭素原子数が1乃至4のアルカノ
イル基、水酸基あるいは水素原子であってもよい。塩基
類似体としては、7−デアザアデニン、6−アザウラシ
ルおよび5−アザシトシンを挙げることができる。
核酸塩基(A、T、C、G、I、もしくはU)あるいは
塩基類似体を表す。B11は、天然に見出される位置、即
ち、アデニン、グアニンもしくはイノシンを含むプリン
については、9位において、チミン、ウラシルもしくは
シトシンを含むピリミジンについては、1位において結
合している。塩基類似体とは、天然に存在しない核酸塩
基に類似の有機塩基をいい、プリン環やピリミジン環の
一部がCからNへ、もしくはNからCへ置換された化合
物、またはプリン環やピリミジン環の一部に新たな修飾
を施された化合物(スルフヒドリル基やハロゲン原子が
導入された化合物)をいう。また、B11は、核酸塩基を
含まない芳香族部分、炭素原子数が1乃至4のアルカノ
イル基、水酸基あるいは水素原子であってもよい。塩基
類似体としては、7−デアザアデニン、6−アザウラシ
ルおよび5−アザシトシンを挙げることができる。
【0073】典型的な核酸塩基リガンド及び例示的合成
リガンドについては、WO92/20702に図示され
ており、5−プロピルチミンおよび3−デアザウラシル
は、DNA断片への結合親和性を増加させることが知ら
れている(特開平11−236396号公報)。他の有
用な天然にない核酸塩基としては、6−チオグアニンや
ピラゾロ[4,3d]−ピリミジンが有用である(国際
出願PCT/US92/04795)。
リガンドについては、WO92/20702に図示され
ており、5−プロピルチミンおよび3−デアザウラシル
は、DNA断片への結合親和性を増加させることが知ら
れている(特開平11−236396号公報)。他の有
用な天然にない核酸塩基としては、6−チオグアニンや
ピラゾロ[4,3d]−ピリミジンが有用である(国際
出願PCT/US92/04795)。
【0074】さらに、B11は、DNAインターカレー
タ、レポーターリガンド(例えば、フルオロフォア)、
ハプテンやビオチンのタンパク質標識、スピン標識、あ
るいは放射性標識であってもよい。B11は、核酸塩基
(A、T、C、GもしくはU)であることが特に好まし
い。
タ、レポーターリガンド(例えば、フルオロフォア)、
ハプテンやビオチンのタンパク質標識、スピン標識、あ
るいは放射性標識であってもよい。B11は、核酸塩基
(A、T、C、GもしくはU)であることが特に好まし
い。
【0075】R11は、水素原子、もしくは天然のα−ア
ミノ酸の側鎖を表す基を表す。天然のα−アミノ酸の側
鎖を表す基としては、炭素原子数が1乃至6のアルキル
基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、炭素原子数
が1乃至6のアルキル基を含む炭素原子数が7乃至26
のアラルキル基、炭素原子数が6乃至20のヘテロアリ
ール基、水酸基、炭素原子数が1乃至6のアルコキシ
基、炭素原子数が1乃至6のアルキルチオ基、−NR13
R14基、−SH基、および炭素原子数が1乃至6のアル
キル基からなる群より選ばれる基であることが好まし
い。炭素原子数が1乃至6のアルキル基は、さらに、水
酸基、炭素原子数が1乃至6のアルコキシ基もしくは炭
素原子数が1乃至6のアルキルチオ基で置換されていて
もよい。R13およびR14は、互いに独立に、水素原子、
炭素原子数が1乃至3のアルキル基、炭素原子数が1乃
至3のアルコキシ基、炭素原子数が1乃至3のアルキル
チオ基および水酸基からなる群より選ばれる原子もしく
は水酸基を表す。天然のα−アミノ酸の側鎖を表す基
は、R11が結合している炭素原子の水素原子と一緒にな
って脂環あるいは複素環を形成していてもよい。
ミノ酸の側鎖を表す基を表す。天然のα−アミノ酸の側
鎖を表す基としては、炭素原子数が1乃至6のアルキル
基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、炭素原子数
が1乃至6のアルキル基を含む炭素原子数が7乃至26
のアラルキル基、炭素原子数が6乃至20のヘテロアリ
ール基、水酸基、炭素原子数が1乃至6のアルコキシ
基、炭素原子数が1乃至6のアルキルチオ基、−NR13
R14基、−SH基、および炭素原子数が1乃至6のアル
キル基からなる群より選ばれる基であることが好まし
い。炭素原子数が1乃至6のアルキル基は、さらに、水
酸基、炭素原子数が1乃至6のアルコキシ基もしくは炭
素原子数が1乃至6のアルキルチオ基で置換されていて
もよい。R13およびR14は、互いに独立に、水素原子、
炭素原子数が1乃至3のアルキル基、炭素原子数が1乃
至3のアルコキシ基、炭素原子数が1乃至3のアルキル
チオ基および水酸基からなる群より選ばれる原子もしく
は水酸基を表す。天然のα−アミノ酸の側鎖を表す基
は、R11が結合している炭素原子の水素原子と一緒にな
って脂環あるいは複素環を形成していてもよい。
【0076】L11は、連結基を表し、−CO−基もしく
は−CO−NR12−基であることが好ましく、−CO−
基であることが特に好ましい。R12は、水素原子、炭素
原子数が1乃至4のアルキレン基、水酸基、炭素原子数
が1乃至4のアルコキシ基およびアミノ基からなる群よ
り選ばれる原子もしくは基を表す。炭素原子数が1乃至
4のアルキレン基、炭素原子数が1乃至4のアルコキシ
基およびアミノ基は、何れも炭素原子数が1乃至4のア
ルキル基、炭素原子数が1乃至4のアルコキシ基もしく
は水酸基で置換されていてもよい。
は−CO−NR12−基であることが好ましく、−CO−
基であることが特に好ましい。R12は、水素原子、炭素
原子数が1乃至4のアルキレン基、水酸基、炭素原子数
が1乃至4のアルコキシ基およびアミノ基からなる群よ
り選ばれる原子もしくは基を表す。炭素原子数が1乃至
4のアルキレン基、炭素原子数が1乃至4のアルコキシ
基およびアミノ基は、何れも炭素原子数が1乃至4のア
ルキル基、炭素原子数が1乃至4のアルコキシ基もしく
は水酸基で置換されていてもよい。
【0077】dは、1乃至60の整数を表す。dは、1
乃至40の整数であることが好ましい。a、bおよびc
は、それぞれ独立に0乃至5の整数を表す。a、bおよ
びcは、何れも1であることが好ましい。
乃至40の整数であることが好ましい。a、bおよびc
は、それぞれ独立に0乃至5の整数を表す。a、bおよ
びcは、何れも1であることが好ましい。
【0078】本発明で用いるPNAは、下記一般式(4)
で表される化合物であることが特に好ましい。式中、B
11およびdは、それぞれ、上記式(3)のB11とdとを
表わす。
で表される化合物であることが特に好ましい。式中、B
11およびdは、それぞれ、上記式(3)のB11とdとを
表わす。
【0079】
【化16】(4)
【0080】なお、ペプチド核酸(PNA)はアミノ基
を有しているため、通常は、改めて別に反応性基を導入
する必要はない。ただし、必要に応じて、ペプチド核酸
の一方の末端には、前記のビニルスルホニル基もしくは
その反応性前駆体基と反応して共有結合を形成する反応
性基を導入する。反応性基は、アミノ基、イミノ基、ヒ
ドラジノ基、カルバモイル基、ヒドラジノカルボニル
基、もしくはカルボキシイミド基であることが好まし
く、アミノ基であることが特に好ましい。ペプチド核酸
には、必要により、クロスリンカを介してこれらの反応
性基が結合される。クロスリンカとしては、たとえば、
アルキレン基あるいはN−アルキルアミノ−アルキレン
基が利用されるが、ヘキシレン基あるいはN−メチルア
ミノ−ヘキシレン基であることが好ましく、ヘキシレン
基であることが特に好ましい。
を有しているため、通常は、改めて別に反応性基を導入
する必要はない。ただし、必要に応じて、ペプチド核酸
の一方の末端には、前記のビニルスルホニル基もしくは
その反応性前駆体基と反応して共有結合を形成する反応
性基を導入する。反応性基は、アミノ基、イミノ基、ヒ
ドラジノ基、カルバモイル基、ヒドラジノカルボニル
基、もしくはカルボキシイミド基であることが好まし
く、アミノ基であることが特に好ましい。ペプチド核酸
には、必要により、クロスリンカを介してこれらの反応
性基が結合される。クロスリンカとしては、たとえば、
アルキレン基あるいはN−アルキルアミノ−アルキレン
基が利用されるが、ヘキシレン基あるいはN−メチルア
ミノ−ヘキシレン基であることが好ましく、ヘキシレン
基であることが特に好ましい。
【0081】PNAの電極表面への固定は通常、PNA
を含む水性液を、前記の反応性電極上に点着して行な
う。具体的には、反応性基を備えたペプチド核酸を水性
媒体に溶解あるいは分散して水性液としたのち、その水
性液を、96穴もしくは384穴プラスチックプレート
に分注し、分注した水性液をスポッター装置等を用いて
電極表面上に滴下して行なうことが好ましい。
を含む水性液を、前記の反応性電極上に点着して行な
う。具体的には、反応性基を備えたペプチド核酸を水性
媒体に溶解あるいは分散して水性液としたのち、その水
性液を、96穴もしくは384穴プラスチックプレート
に分注し、分注した水性液をスポッター装置等を用いて
電極表面上に滴下して行なうことが好ましい。
【0082】点着後、所定の温度でそのまま数時間放置
すると、電極表面にて共有結合反応が進行し、PNAの
一端が電極表面にて固定される。点着の条件は、使用す
る電極の種類、電極の大きさなどによって異なる。点着
は、マニュアル操作によっても行うことができるが、汎
用されているDNAチップ作製装置に装備されたスポッ
タを用いて行うことも好ましい。点着後は、インキュベ
ーションを行うことも好ましい。インキュベート後、固
定されていないPNAを洗浄して除去することが好まし
い。
すると、電極表面にて共有結合反応が進行し、PNAの
一端が電極表面にて固定される。点着の条件は、使用す
る電極の種類、電極の大きさなどによって異なる。点着
は、マニュアル操作によっても行うことができるが、汎
用されているDNAチップ作製装置に装備されたスポッ
タを用いて行うことも好ましい。点着後は、インキュベ
ーションを行うことも好ましい。インキュベート後、固
定されていないPNAを洗浄して除去することが好まし
い。
【0083】点着後のペプチド核酸の乾燥を防ぐため
に、ペプチド核酸が溶解あるいは分散してなる水性液中
に、高沸点の物質を添加してもよい。高沸点の物質とし
ては、点着後のペプチド核酸が溶解あるいは分散してな
る水性液に溶解し得るものであって、検出対象の核酸断
片試料(標的核酸断片)などの試料とのハイブリダイゼ
ーションを妨げることがなく、かつ粘性があまり大きく
ない物質であることが好ましい。このような物質として
は、グリセリン、エチレングリコール、ジメチルスルホ
キシドおよび低分子の親水性ポリマーを挙げることがで
きる。親水性ポリマーとしては、ポリアクリルアミド、
ポリエチレングリコール、そしてポリアクリル酸ナトリ
ウム等を挙げることができる。このポリマーの分子量
は、103乃至106の範囲にあることが好ましい。高沸
点の物質としては、グリセリンあるいはエチレングリコ
ールを用いることがさらに好ましく、グリセリンを用い
ることが特に好ましい。高沸点の物質の濃度は、ペプチ
ド核酸の水性液中、0.1乃至2容量%の範囲にあるこ
とが好ましく、0.5乃至1容量%の範囲にあることが
特に好ましい。
に、ペプチド核酸が溶解あるいは分散してなる水性液中
に、高沸点の物質を添加してもよい。高沸点の物質とし
ては、点着後のペプチド核酸が溶解あるいは分散してな
る水性液に溶解し得るものであって、検出対象の核酸断
片試料(標的核酸断片)などの試料とのハイブリダイゼ
ーションを妨げることがなく、かつ粘性があまり大きく
ない物質であることが好ましい。このような物質として
は、グリセリン、エチレングリコール、ジメチルスルホ
キシドおよび低分子の親水性ポリマーを挙げることがで
きる。親水性ポリマーとしては、ポリアクリルアミド、
ポリエチレングリコール、そしてポリアクリル酸ナトリ
ウム等を挙げることができる。このポリマーの分子量
は、103乃至106の範囲にあることが好ましい。高沸
点の物質としては、グリセリンあるいはエチレングリコ
ールを用いることがさらに好ましく、グリセリンを用い
ることが特に好ましい。高沸点の物質の濃度は、ペプチ
ド核酸の水性液中、0.1乃至2容量%の範囲にあるこ
とが好ましく、0.5乃至1容量%の範囲にあることが
特に好ましい。
【0084】また、同じ目的のために、ペプチド核酸を
点着した後の電極を、90%以上の湿度および25乃至
50℃の温度範囲の環境に置くことも好ましい。
点着した後の電極を、90%以上の湿度および25乃至
50℃の温度範囲の環境に置くことも好ましい。
【0085】反応性基を有するペプチド核酸を点着後、
紫外線、水素化ホウ素ナトリウムあるいはシッフ試薬に
よる後処理を施してもよい。これらの後処理は、複数の
種類を組み合わせて行ってもよく、特に加熱処理と紫外
線処理を組み合わせて行うことが好ましい。点着後は、
インキュベーションを行うことも好ましい。インキュベ
ート後は、未反応のペプチド核酸を洗浄して除去するこ
とが好ましい。
紫外線、水素化ホウ素ナトリウムあるいはシッフ試薬に
よる後処理を施してもよい。これらの後処理は、複数の
種類を組み合わせて行ってもよく、特に加熱処理と紫外
線処理を組み合わせて行うことが好ましい。点着後は、
インキュベーションを行うことも好ましい。インキュベ
ート後は、未反応のペプチド核酸を洗浄して除去するこ
とが好ましい。
【0086】ペプチド核酸の固定量(数)は、電極表面
に対して、102乃至105種類/cm2の範囲にあるこ
とが好ましい。ペプチド核酸の量は、1乃至10-15モ
ルの範囲にあり、重量としては数ng以下であることが
好ましい。点着によって、ペプチド核酸の水性液は、電
極表面にドットの形状で固定される。ドットの形状は、
ほとんど円形である。形状に変動がないことは、遺伝子
発現の定量的解析や一塩基変異を解析するために重要で
ある。それぞれのドット間の距離は、0乃至1.5mm
の範囲にあることが好ましく、100乃至300μmの
範囲にあることが特に好ましい。一つのドットの大きさ
は、直径が50乃至300μmの範囲にあることが好ま
しい。電極表面に点着するペプチド核酸の量は、100
pL乃至1μLの範囲にあることが好ましく、1乃至1
00nLの範囲にあることが特に好ましい。
に対して、102乃至105種類/cm2の範囲にあるこ
とが好ましい。ペプチド核酸の量は、1乃至10-15モ
ルの範囲にあり、重量としては数ng以下であることが
好ましい。点着によって、ペプチド核酸の水性液は、電
極表面にドットの形状で固定される。ドットの形状は、
ほとんど円形である。形状に変動がないことは、遺伝子
発現の定量的解析や一塩基変異を解析するために重要で
ある。それぞれのドット間の距離は、0乃至1.5mm
の範囲にあることが好ましく、100乃至300μmの
範囲にあることが特に好ましい。一つのドットの大きさ
は、直径が50乃至300μmの範囲にあることが好ま
しい。電極表面に点着するペプチド核酸の量は、100
pL乃至1μLの範囲にあることが好ましく、1乃至1
00nLの範囲にあることが特に好ましい。
【0087】図1と図2に、本発明の代表的な態様であ
る反応性電極の製造方法、および代表的なペプチド核酸
(PNA)固定電極の製造方法と構成を模式的に示す。
る反応性電極の製造方法、および代表的なペプチド核酸
(PNA)固定電極の製造方法と構成を模式的に示す。
【0088】図1は、アミノ基が表面に導入された電極
に、1,2−ビス(ビニルスルホニルアセトアミド)エ
タンに代表される、両端部のそれぞれにビニルスルホニ
ル基を備えた反応性化合物(CH2=CH−SO2−L−
SO2−CH=CH2)を接触させて、先端に反応性のL
−SO2−CH=CH2を備えた反応性電極を製造したの
ち、次いでこの反応性電極にアミノ基を備えたPNA
(ペプチド核酸)を接触させて、PNAを共有結合によ
り電極に固定させる工程を示している。
に、1,2−ビス(ビニルスルホニルアセトアミド)エ
タンに代表される、両端部のそれぞれにビニルスルホニ
ル基を備えた反応性化合物(CH2=CH−SO2−L−
SO2−CH=CH2)を接触させて、先端に反応性のL
−SO2−CH=CH2を備えた反応性電極を製造したの
ち、次いでこの反応性電極にアミノ基を備えたPNA
(ペプチド核酸)を接触させて、PNAを共有結合によ
り電極に固定させる工程を示している。
【0089】図2は、電極表面に、複数個のPNAのそ
れぞれを複数個のスペーサ基により隔離して固定するた
めの工程を模式的に示している。すなわち、たとえば、
予め表面に反応性基(X)を備えた電極に、一方の端部
に反応性基Xと反応する反応性基Yを有し、他方の端部
に該反応性基と反応しない(或は、反応しにくい)不活
性基Zとを備えたスペーサ導入化合物と、両方の端部に
反応性基Yを備えた化合物とを一緒に接触させることに
より、表面に不活性基Zと反応性基Yの双方が固定され
た反応性電極を得て、次いでこれに一方の端部に反応性
基Xを備えたPNAを接触させることによって、スペー
サ基を介して互いに隔離された状態で電極表面に固定さ
れたPNA(ペプチド核酸)固定電極を得ることができ
る。
れぞれを複数個のスペーサ基により隔離して固定するた
めの工程を模式的に示している。すなわち、たとえば、
予め表面に反応性基(X)を備えた電極に、一方の端部
に反応性基Xと反応する反応性基Yを有し、他方の端部
に該反応性基と反応しない(或は、反応しにくい)不活
性基Zとを備えたスペーサ導入化合物と、両方の端部に
反応性基Yを備えた化合物とを一緒に接触させることに
より、表面に不活性基Zと反応性基Yの双方が固定され
た反応性電極を得て、次いでこれに一方の端部に反応性
基Xを備えたPNAを接触させることによって、スペー
サ基を介して互いに隔離された状態で電極表面に固定さ
れたPNA(ペプチド核酸)固定電極を得ることができ
る。
【0090】本発明の検出用電極の検出対象となる核酸
試料としては、通常、その配列や機能が未知であるDN
A断片試料あるいはRNA断片試料などの核酸試料が用
いられる。
試料としては、通常、その配列や機能が未知であるDN
A断片試料あるいはRNA断片試料などの核酸試料が用
いられる。
【0091】核酸試料は、遺伝子発現を調べる目的で
は、真核生物の細胞や組織サンプルから単離することが
好ましい。試料がゲノムならば、赤血球を除く任意の組
織サンプルから単離することが好ましい。赤血球を除く
任意の組織は、抹消血液リンパ球、皮膚、毛髪、精液等
であることが好ましい。試料がmRNAならば、mRN
Aが発現される組織サンプルから抽出することが好まし
い。mRNAは、逆転写反応により標識dNTP(「d
NTP」は、塩基がアデニン(A)、シトシン(C)、
グアニン(G)もしくはチミン(T)であるデオキシリ
ボヌクレオチドを意味する。)を取り込ませて標識cD
NAとすることが好ましい。dNTPとしては、化学的
な安定性のため、dCTPを用いることが好ましい。一
回のハイブリダイゼーションに必要なmRNA量は、点
着する液量や標識方法によって異なるが、数μg以下で
ある。なお、ペプチド核酸固定電極上のPNAが低分子
のものである場合には、核酸断片試料は低分子化してお
くことが望ましい。原核生物の細胞では、mRNAの選
択的な抽出が困難なため、全RNAを標識することが好
ましい。
は、真核生物の細胞や組織サンプルから単離することが
好ましい。試料がゲノムならば、赤血球を除く任意の組
織サンプルから単離することが好ましい。赤血球を除く
任意の組織は、抹消血液リンパ球、皮膚、毛髪、精液等
であることが好ましい。試料がmRNAならば、mRN
Aが発現される組織サンプルから抽出することが好まし
い。mRNAは、逆転写反応により標識dNTP(「d
NTP」は、塩基がアデニン(A)、シトシン(C)、
グアニン(G)もしくはチミン(T)であるデオキシリ
ボヌクレオチドを意味する。)を取り込ませて標識cD
NAとすることが好ましい。dNTPとしては、化学的
な安定性のため、dCTPを用いることが好ましい。一
回のハイブリダイゼーションに必要なmRNA量は、点
着する液量や標識方法によって異なるが、数μg以下で
ある。なお、ペプチド核酸固定電極上のPNAが低分子
のものである場合には、核酸断片試料は低分子化してお
くことが望ましい。原核生物の細胞では、mRNAの選
択的な抽出が困難なため、全RNAを標識することが好
ましい。
【0092】核酸試料は、遺伝子の変異や多型を調べる
目的では、標識プライマーもしくは標識dNTPを含む
反応系において標的領域のPCRを行なって得ることが
好ましい。
目的では、標識プライマーもしくは標識dNTPを含む
反応系において標的領域のPCRを行なって得ることが
好ましい。
【0093】ハイブリダイゼーションは、96穴もしく
は384穴プラスチックプレートに分注しておいた、標
識した核酸試料が溶解あるいは分散してなる水性液を、
本発明のペプチド核酸固定電極上に点着することによっ
て実施することが好ましい。点着の量は、1乃至100
nLの範囲にあることが好ましい。ハイブリダイゼーシ
ョンは、室温乃至70℃の温度範囲で、そして6乃至2
0時間の範囲で実施することが好ましい。ハイブリダイ
ゼーションの終了後に、界面活性剤と緩衝液との混合溶
液を用いて洗浄を行い、未反応の核酸断片試料を除去す
ることが好ましい。界面活性剤としては、ドデシル硫酸
ナトリウム(SDS)を用いることが好ましい。緩衝液
としては、クエン酸緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝
液、トリス緩衝液、グッド緩衝液等を用いることができ
るが、クエン酸緩衝液を用いることが特に好ましい。
は384穴プラスチックプレートに分注しておいた、標
識した核酸試料が溶解あるいは分散してなる水性液を、
本発明のペプチド核酸固定電極上に点着することによっ
て実施することが好ましい。点着の量は、1乃至100
nLの範囲にあることが好ましい。ハイブリダイゼーシ
ョンは、室温乃至70℃の温度範囲で、そして6乃至2
0時間の範囲で実施することが好ましい。ハイブリダイ
ゼーションの終了後に、界面活性剤と緩衝液との混合溶
液を用いて洗浄を行い、未反応の核酸断片試料を除去す
ることが好ましい。界面活性剤としては、ドデシル硫酸
ナトリウム(SDS)を用いることが好ましい。緩衝液
としては、クエン酸緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝
液、トリス緩衝液、グッド緩衝液等を用いることができ
るが、クエン酸緩衝液を用いることが特に好ましい。
【0094】ペプチド核酸を固定した電極を用いるハイ
ブリダイゼーションの特徴は、標識した核酸断片試料の
使用量を非常に少なくできることである。そのため、電
極に固定するペプチド核酸の鎖長や標識した核酸試料の
種類により、ハイブリダイゼーションの最適条件を設定
する必要がある。遺伝子発現の解析には、低発現の遺伝
子も十分に検出できるように、長時間のハイブリダイゼ
ーションを行うことが好ましい。一塩基変異の検出に
は、短時間のハイブリダイゼーションを行うことが好ま
しい。
ブリダイゼーションの特徴は、標識した核酸断片試料の
使用量を非常に少なくできることである。そのため、電
極に固定するペプチド核酸の鎖長や標識した核酸試料の
種類により、ハイブリダイゼーションの最適条件を設定
する必要がある。遺伝子発現の解析には、低発現の遺伝
子も十分に検出できるように、長時間のハイブリダイゼ
ーションを行うことが好ましい。一塩基変異の検出に
は、短時間のハイブリダイゼーションを行うことが好ま
しい。
【0095】[導電性基で標識された縫い込み型インタ
ーカレータ]ハイブリダイゼーション操作の実施に際し
て用いられる、導電性基を有する縫い込み型インターカ
レータとしては、特開平9−288080号公報および
文献(J.Chem.Soc.Commun.,1111(1998))に記載のイン
ターカレータを用いることが特に好ましい。
ーカレータ]ハイブリダイゼーション操作の実施に際し
て用いられる、導電性基を有する縫い込み型インターカ
レータとしては、特開平9−288080号公報および
文献(J.Chem.Soc.Commun.,1111(1998))に記載のイン
ターカレータを用いることが特に好ましい。
【0096】さらに、該インターカレータとしては、下
記式(5)で表されるものも好ましく用いることができ
る。下記の式(5)で表されるインターカレータは、印
加電圧が400乃至600mVの範囲にピーク電流値を
有する特徴を持つ。
記式(5)で表されるものも好ましく用いることができ
る。下記の式(5)で表されるインターカレータは、印
加電圧が400乃至600mVの範囲にピーク電流値を
有する特徴を持つ。
【0097】
【化17】(5)
【0098】上記の式(5)において、N−置換−イミ
ノ基は、縫い込み型インターカレータに可溶性を付与す
る基であり、RおよびR1は、互いに独立に、水素原
子、そして、置換基を有していてもよい炭素原子数が1
乃至3のアルキル基、炭素原子数が2乃至4のアシル
基、炭素原子数が6乃至20のアリール基および炭素原
子数が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数が7乃
至23のアラルキル基からなる群より選ばれる原子もし
くは基を表す。炭素原子数が1乃至3のアルキル基とし
ては、メチル基もしくはエチル基であることが好まし
く、メチル基であることが特に好ましい。炭素原子数が
2乃至4のアシル基としては、アセチル基であることが
好ましい。炭素原子数が6乃至20のアリール基として
は、フェニル基もしくはナフチル基であることが好まし
く、フェニル基であることが特に好ましい。炭素原子数
が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数が7乃至2
3のアラルキル基としては、ベンジル基であることが好
ましい。RおよびR1は、同一の原子もしくは基である
ことが好ましく、メチル基であることが特に好ましい。
ノ基は、縫い込み型インターカレータに可溶性を付与す
る基であり、RおよびR1は、互いに独立に、水素原
子、そして、置換基を有していてもよい炭素原子数が1
乃至3のアルキル基、炭素原子数が2乃至4のアシル
基、炭素原子数が6乃至20のアリール基および炭素原
子数が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数が7乃
至23のアラルキル基からなる群より選ばれる原子もし
くは基を表す。炭素原子数が1乃至3のアルキル基とし
ては、メチル基もしくはエチル基であることが好まし
く、メチル基であることが特に好ましい。炭素原子数が
2乃至4のアシル基としては、アセチル基であることが
好ましい。炭素原子数が6乃至20のアリール基として
は、フェニル基もしくはナフチル基であることが好まし
く、フェニル基であることが特に好ましい。炭素原子数
が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数が7乃至2
3のアラルキル基としては、ベンジル基であることが好
ましい。RおよびR1は、同一の原子もしくは基である
ことが好ましく、メチル基であることが特に好ましい。
【0099】置換基としては、ヒドロキシル基、ハロゲ
ン原子(F、Cl、Br等)、カルボキシル基、炭素原
子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が1乃至6の
アルキルアミノ基、炭素原子数が1乃至6のハロゲン化
アルキル基、炭素原子数が6乃至12のアリール基、お
よび炭素原子数が1乃至6のアルコキシ基からなる群よ
り選ばれる原子もしくは基を挙げることができる。置換
基の数は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原
子数が1乃至6のアルキルアミノ基、炭素原子数が1乃
至6のハロゲン化アルキル基、あるいは炭素原子数が1
乃至6のアルコキシ基については、1乃至12個である
ことが好ましく、1乃至3個であることさらに好まし
く、1個であることが特に好ましい。炭素原子数が6乃
至12のアリール基については、その数は1乃至7個で
あることが好ましく、1乃至3個であることがさらに好
ましく、1個であることが特に好ましい。
ン原子(F、Cl、Br等)、カルボキシル基、炭素原
子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が1乃至6の
アルキルアミノ基、炭素原子数が1乃至6のハロゲン化
アルキル基、炭素原子数が6乃至12のアリール基、お
よび炭素原子数が1乃至6のアルコキシ基からなる群よ
り選ばれる原子もしくは基を挙げることができる。置換
基の数は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原
子数が1乃至6のアルキルアミノ基、炭素原子数が1乃
至6のハロゲン化アルキル基、あるいは炭素原子数が1
乃至6のアルコキシ基については、1乃至12個である
ことが好ましく、1乃至3個であることさらに好まし
く、1個であることが特に好ましい。炭素原子数が6乃
至12のアリール基については、その数は1乃至7個で
あることが好ましく、1乃至3個であることがさらに好
ましく、1個であることが特に好ましい。
【0100】YおよびY1は、互いに独立に、−NH−
CO−基もしくは−CO−NH−基を表し、−NH−C
O−基であることが好ましい。これらの基のカルボニル
基もしくはイミノ基が、それぞれ、EおよびE1と結合
する。
CO−基もしくは−CO−NH−基を表し、−NH−C
O−基であることが好ましい。これらの基のカルボニル
基もしくはイミノ基が、それぞれ、EおよびE1と結合
する。
【0101】EおよびE1は、互いに独立に、一つの結
合手を有するフェロセンを表す。当該フェロセンは、置
換基を有していても有していなくてもよい。置換基を有
している場合には、同一であることが好ましい。以下
に、置換基を有するフェロセンの具体例を示す。置換基
の位置は、シクロペンタジエニル基の何れの位置であっ
てもよい。
合手を有するフェロセンを表す。当該フェロセンは、置
換基を有していても有していなくてもよい。置換基を有
している場合には、同一であることが好ましい。以下
に、置換基を有するフェロセンの具体例を示す。置換基
の位置は、シクロペンタジエニル基の何れの位置であっ
てもよい。
【0102】
【化18】
【0103】XおよびZは、互いに独立に、水素原子、
ハロゲン原子、あるいは炭素原子数1乃至6のアルキル
基を表すが、水素原子であることが好ましい。炭素原子
数1乃至6のアルキル基の好ましい例としては、前記記
載のR(もしくはR1)と同様である。
ハロゲン原子、あるいは炭素原子数1乃至6のアルキル
基を表すが、水素原子であることが好ましい。炭素原子
数1乃至6のアルキル基の好ましい例としては、前記記
載のR(もしくはR1)と同様である。
【0104】m、n、kおよびpは、縫い込み型インタ
ーカレータのリンカー部分の長さを決定するものであ
り、各々、1乃至6の整数を表す。但し、mとnとの
和、およびkとpとの和は、各々、4乃至8である。m
とk、およびnとpとは、それぞれ、同一の数であるこ
とが好ましく、m、n、kおよびpは、何れも3である
ことが特に好ましい。
ーカレータのリンカー部分の長さを決定するものであ
り、各々、1乃至6の整数を表す。但し、mとnとの
和、およびkとpとの和は、各々、4乃至8である。m
とk、およびnとpとは、それぞれ、同一の数であるこ
とが好ましく、m、n、kおよびpは、何れも3である
ことが特に好ましい。
【0105】上述の導電性基で標識された縫い込み型イ
ンターカレータは、例えば、特開平9−288080号
公報に記載の方法によって簡便に収率良く製造すること
ができる。
ンターカレータは、例えば、特開平9−288080号
公報に記載の方法によって簡便に収率良く製造すること
ができる。
【0106】本発明のPNA固定電極を用いる核酸試料
の検出に際しては、下記の式(6)で表わされる導電性
基で標識された縫い込み型インターカレータを用いるこ
とが特に好ましい。下記の式(6)で表されるインター
カレータは、印加電圧100乃至400mVの範囲にピ
ーク電流値を有する性質を持つ。
の検出に際しては、下記の式(6)で表わされる導電性
基で標識された縫い込み型インターカレータを用いるこ
とが特に好ましい。下記の式(6)で表されるインター
カレータは、印加電圧100乃至400mVの範囲にピ
ーク電流値を有する性質を持つ。
【0107】
【化19】Ea−La−X−Lb−Eb −− (6)
【0108】[ただし、EaおよびEbは、互いに独立
に、酸化還元活性を示し、かつ共役系を含む基を表わ
し、Xは二価の環状基を表わし、そしてLaおよびL
bは、互いに独立に、それぞれがEaおよびEbの共役系
が延長される共役系を形成することのない連結基であっ
て、少なくとも一方の連結基が、本化合物に水溶性を付
与する部位を有する連結基もしくは水溶性を付与する部
位に変換し得る部位を有する連結基である。]
に、酸化還元活性を示し、かつ共役系を含む基を表わ
し、Xは二価の環状基を表わし、そしてLaおよびL
bは、互いに独立に、それぞれがEaおよびEbの共役系
が延長される共役系を形成することのない連結基であっ
て、少なくとも一方の連結基が、本化合物に水溶性を付
与する部位を有する連結基もしくは水溶性を付与する部
位に変換し得る部位を有する連結基である。]
【0109】上記式(6)において、EaとEb、そして
LaとLbとが、それぞれ、互いに同一の基であることが
好ましい。また、La−X−Lbで表わされる連結部の主
鎖の最短の結合路を構成する原子の数が10乃至100
の間、なかでも15乃至70の間、特に20乃至50の
間にあることが好ましい。なお、この連結部の主鎖の最
短の結合路を構成する原子の数の計算を、前記のフェロ
センカルボン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル
に適用すると、その原子の数は32となる。
LaとLbとが、それぞれ、互いに同一の基であることが
好ましい。また、La−X−Lbで表わされる連結部の主
鎖の最短の結合路を構成する原子の数が10乃至100
の間、なかでも15乃至70の間、特に20乃至50の
間にあることが好ましい。なお、この連結部の主鎖の最
短の結合路を構成する原子の数の計算を、前記のフェロ
センカルボン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル
に適用すると、その原子の数は32となる。
【0110】また、EaおよびEbは、互いに独立に、そ
れぞれ置換基を有していてもよい、一もしくは二以上の
結合手を持つメタロセン、2,2’−ビピリジン錯体、
シクロブタジエン錯体、シクロペンタジエニル錯体、
1,10−フェナントロリン錯体、トリフェニルホスフ
ィン錯体、カテコールアミンおよびビオローゲンからな
る群より選ばれる酸化還元活性基であることが好まし
い。
れぞれ置換基を有していてもよい、一もしくは二以上の
結合手を持つメタロセン、2,2’−ビピリジン錯体、
シクロブタジエン錯体、シクロペンタジエニル錯体、
1,10−フェナントロリン錯体、トリフェニルホスフ
ィン錯体、カテコールアミンおよびビオローゲンからな
る群より選ばれる酸化還元活性基であることが好まし
い。
【0111】上記式(6)の化合物は、特に下記式
(7)で表わされる化合物であることが好ましい。
(7)で表わされる化合物であることが好ましい。
【0112】
【化20】 Ea−L1a−L2a−X−L2b−L1b−Eb −− (7)
【0113】[但し、EaおよびEbは、互いに独立に、
酸化還元活性を有し、かつ共役系を含む基を表わし、L
1aおよびL1bは、互いに独立に、それぞれがEaおよび
Ebの共役系が延長される共役系を形成しない基を表わ
し、L2aおよびL2bは、互いに独立に、水溶性を付与す
る部位を有する連結基もしくは水溶性を付与する部位に
変換し得る部位を有する連結基を表わし、そしてXは二
価の環状基を表わす。]
酸化還元活性を有し、かつ共役系を含む基を表わし、L
1aおよびL1bは、互いに独立に、それぞれがEaおよび
Ebの共役系が延長される共役系を形成しない基を表わ
し、L2aおよびL2bは、互いに独立に、水溶性を付与す
る部位を有する連結基もしくは水溶性を付与する部位に
変換し得る部位を有する連結基を表わし、そしてXは二
価の環状基を表わす。]
【0114】L1aおよびL1bは、互いに独立に、置換基
を有していてもよい炭化水素基、特に、置換基を有して
いてもよい炭素原子数が1乃至6のアルキレン基あるい
は置換基を有していてもよい炭素原子数が1乃至6のア
ルケニレン基であることが好ましい。
を有していてもよい炭化水素基、特に、置換基を有して
いてもよい炭素原子数が1乃至6のアルキレン基あるい
は置換基を有していてもよい炭素原子数が1乃至6のア
ルケニレン基であることが好ましい。
【0115】L2aおよびL2bは、互いに独立に、炭素元
素以外の元素(例、N、O、もしくはS)を含む連結基
であることが好ましく、特に、置換基を有していてもよ
い、アミド結合基、エステル結合基、エーテル結合基、
チオエーテル結合基、ジイミド結合基、チオジイミド結
合基、チオアミド結合基、イミノ結合基、カルボニル結
合基、チオカルボニル結合基および1,4−ピペラジニ
ル基からなる群より選ばれる基を含む連結基であること
が好ましい。最も好ましいのは、−NHCO−基、もし
くは−CONH−基である。なお、EaとEb、L1aとL
1b、そしてL2aとL2bとが、それぞれ、互いに同一の基
であることが有利である。
素以外の元素(例、N、O、もしくはS)を含む連結基
であることが好ましく、特に、置換基を有していてもよ
い、アミド結合基、エステル結合基、エーテル結合基、
チオエーテル結合基、ジイミド結合基、チオジイミド結
合基、チオアミド結合基、イミノ結合基、カルボニル結
合基、チオカルボニル結合基および1,4−ピペラジニ
ル基からなる群より選ばれる基を含む連結基であること
が好ましい。最も好ましいのは、−NHCO−基、もし
くは−CONH−基である。なお、EaとEb、L1aとL
1b、そしてL2aとL2bとが、それぞれ、互いに同一の基
であることが有利である。
【0116】上記式(6)および(7)の縫い込み型イ
ンターカレータを用いると、核酸断片の検出操作におい
て電極基板付与する電位として、100乃至400mV
の範囲内の相対的に低い電位が利用できる。
ンターカレータを用いると、核酸断片の検出操作におい
て電極基板付与する電位として、100乃至400mV
の範囲内の相対的に低い電位が利用できる。
【0117】式(6)および式(7)において、Xは、
置換基を有していてもよい二価の環状基を表す。二価の
環状基としては、平面性を有する環状基であることが好
ましく、二つの窒素原子に結合手を有するナフタレンジ
イミド基、2位と6位、もしくは1位と5位(好ましく
は2位と6位)とに結合手を有するアントラセン基、ア
ントラセン基と同じ位置に結合手を有するアントラキノ
ン基、2位と6位とに結合手を有するフルオレン基、2
位と6位とに結合手を有するビフェニレン基、2位と7
位とに結合手を有するフェナントレン基、および2位と
7位とに結合手を有するピレン基からなる群より選ばれ
る環状基であることが好ましく、二つの窒素原子に結合
手を有するナフタレンジイミド基であることが特に好ま
しい。置換基としては、水素原子、ハロゲン原子(F、
Cl、Br等)、あるいは炭素原子数1乃至6のアルキ
ル基であることが好ましいが、水素原子であることが好
ましい。炭素原子数1乃至6のアルキル基としては、メ
チル基、エチル基、もしくはn−プロピル基であること
が好ましい。
置換基を有していてもよい二価の環状基を表す。二価の
環状基としては、平面性を有する環状基であることが好
ましく、二つの窒素原子に結合手を有するナフタレンジ
イミド基、2位と6位、もしくは1位と5位(好ましく
は2位と6位)とに結合手を有するアントラセン基、ア
ントラセン基と同じ位置に結合手を有するアントラキノ
ン基、2位と6位とに結合手を有するフルオレン基、2
位と6位とに結合手を有するビフェニレン基、2位と7
位とに結合手を有するフェナントレン基、および2位と
7位とに結合手を有するピレン基からなる群より選ばれ
る環状基であることが好ましく、二つの窒素原子に結合
手を有するナフタレンジイミド基であることが特に好ま
しい。置換基としては、水素原子、ハロゲン原子(F、
Cl、Br等)、あるいは炭素原子数1乃至6のアルキ
ル基であることが好ましいが、水素原子であることが好
ましい。炭素原子数1乃至6のアルキル基としては、メ
チル基、エチル基、もしくはn−プロピル基であること
が好ましい。
【0118】前記式(6)において、LaおよびLbは、
互いに独立に、それぞれがEaおよびEbの共役系が延長
される共役系を形成することのない連結基であって、少
なくとも一方の連結基が、本化合物に水溶性を付与する
部位を有する連結基もしくは水溶性を付与する部位に変
換し得る部位を有する連結基である。ここで、「水溶性
を付与する部位に変換し得る部位」とは、たとえば、メ
チル基を置換基として有するイミノ基のように、硫酸な
どの酸と接触した場合に、硫酸塩部位に変換され、水溶
性を示すように変化する部位を有する。勿論、「本化合
物に水溶性を付与する部位」に塩部分のような荷電部分
を持っていてもよい。
互いに独立に、それぞれがEaおよびEbの共役系が延長
される共役系を形成することのない連結基であって、少
なくとも一方の連結基が、本化合物に水溶性を付与する
部位を有する連結基もしくは水溶性を付与する部位に変
換し得る部位を有する連結基である。ここで、「水溶性
を付与する部位に変換し得る部位」とは、たとえば、メ
チル基を置換基として有するイミノ基のように、硫酸な
どの酸と接触した場合に、硫酸塩部位に変換され、水溶
性を示すように変化する部位を有する。勿論、「本化合
物に水溶性を付与する部位」に塩部分のような荷電部分
を持っていてもよい。
【0119】LaおよびLbは、互いに独立に、Eaおよ
びEbに隣接する側に、置換基を有していてもよい炭化
水素基(前記式(7)のL1aとL1bに相当する基)を有
し、一方、Xに隣接する側に炭素元素以外の元素を含む
連結基(前記式(7)のL2aとL2bに相当する基)とか
らなる連結基であることが好ましい。従って、Laおよ
びLbは、それぞれ、前記式(7)の−L1a−L2a−、
そして−L2b−L1b−に該当する連結基であることが望
ましい。ここで、L1aとL1bは、互いに独立に、置換基
を有していてもよい炭素原子数が1乃至6のアルキレン
基あるいは置換基を有していてもよい炭素原子数が2乃
至6のアルケニレン基であることが好ましく、一方、L
2aとL2bとは、互いに独立に、N、O、もしくはSを含
む連結基であることが望ましい。
びEbに隣接する側に、置換基を有していてもよい炭化
水素基(前記式(7)のL1aとL1bに相当する基)を有
し、一方、Xに隣接する側に炭素元素以外の元素を含む
連結基(前記式(7)のL2aとL2bに相当する基)とか
らなる連結基であることが好ましい。従って、Laおよ
びLbは、それぞれ、前記式(7)の−L1a−L2a−、
そして−L2b−L1b−に該当する連結基であることが望
ましい。ここで、L1aとL1bは、互いに独立に、置換基
を有していてもよい炭素原子数が1乃至6のアルキレン
基あるいは置換基を有していてもよい炭素原子数が2乃
至6のアルケニレン基であることが好ましく、一方、L
2aとL2bとは、互いに独立に、N、O、もしくはSを含
む連結基であることが望ましい。
【0120】L1aおよびL1bの置換基としては、ヒドロ
キシル基、ハロゲン原子、カルボキシル基、アミノ基、
シアノ基、ニトロ基、ホルミル基、ホルミルアミノ基、
炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が1乃
至6のアルキルアミノ基、炭素原子数が1乃至6のハロ
ゲン化アルキル基、炭素原子数が5乃至7のシクロアル
キルアミノ基、炭素原子数が2乃至12のジアルキルア
ミノ基、炭素原子数が6乃至12のアリール基、炭素原
子数が1乃至6のアルキル基を有する炭素原子数が7乃
至18のアラルキル基、1乃至6のアルキル基を有する
炭素原子数が7乃至18のアラルキルアミノ基、炭素原
子数が2乃至7のアルカノイル基、炭素原子数が2乃至
7のアルカノイルアミノ基、炭素原子数が3乃至10の
N−アルカノイル−N−アルキルアミノ基、アミノカル
ボニル基、炭素原子数が2乃至7のアルコキシカルボニ
ル基、S、NおよびOからなる群より選ばれるヘテロ原
子を1乃至4個含む炭素原子数2乃至10の複素環基、
並びに置換基として炭素原子数1乃至6のアルキル基、
炭素原子数1乃至6のアルコキシ基、もしくはハロゲン
原子を1乃至5個有していてもよい環構成炭素原子数の
数が6乃至12のアリール基からなる群より選ばれる原
子もしくは基である。置換基の数は、炭素原子数が1乃
至6のアルキレン基では、1乃至12個であることが好
ましく、1乃至3個であることが特に好ましい。炭素原
子数が1乃至6のアルケニレン基については、その数は
1乃至10個であることが好ましく、1乃至3個である
ことが特に好ましい。
キシル基、ハロゲン原子、カルボキシル基、アミノ基、
シアノ基、ニトロ基、ホルミル基、ホルミルアミノ基、
炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が1乃
至6のアルキルアミノ基、炭素原子数が1乃至6のハロ
ゲン化アルキル基、炭素原子数が5乃至7のシクロアル
キルアミノ基、炭素原子数が2乃至12のジアルキルア
ミノ基、炭素原子数が6乃至12のアリール基、炭素原
子数が1乃至6のアルキル基を有する炭素原子数が7乃
至18のアラルキル基、1乃至6のアルキル基を有する
炭素原子数が7乃至18のアラルキルアミノ基、炭素原
子数が2乃至7のアルカノイル基、炭素原子数が2乃至
7のアルカノイルアミノ基、炭素原子数が3乃至10の
N−アルカノイル−N−アルキルアミノ基、アミノカル
ボニル基、炭素原子数が2乃至7のアルコキシカルボニ
ル基、S、NおよびOからなる群より選ばれるヘテロ原
子を1乃至4個含む炭素原子数2乃至10の複素環基、
並びに置換基として炭素原子数1乃至6のアルキル基、
炭素原子数1乃至6のアルコキシ基、もしくはハロゲン
原子を1乃至5個有していてもよい環構成炭素原子数の
数が6乃至12のアリール基からなる群より選ばれる原
子もしくは基である。置換基の数は、炭素原子数が1乃
至6のアルキレン基では、1乃至12個であることが好
ましく、1乃至3個であることが特に好ましい。炭素原
子数が1乃至6のアルケニレン基については、その数は
1乃至10個であることが好ましく、1乃至3個である
ことが特に好ましい。
【0121】L2aとL2bとは、互いに独立に、それぞ
れ、置換基を有していてもよい、アミド結合基、エステ
ル結合基、エーテル結合基、チオエーテル結合基、ジイ
ミド結合基、チオジイミド結合基、チオアミド結合基、
イミノ結合基、カルボニル結合基、チオカルボニル結合
基および1,4−ピペラジニル基からなる群より選ばれ
る基を一個もしくは複数個含む連結基であることが好ま
しく、特に好ましいのはアミド基(−NHCO−基、も
しくは−CONH−基)である。
れ、置換基を有していてもよい、アミド結合基、エステ
ル結合基、エーテル結合基、チオエーテル結合基、ジイ
ミド結合基、チオジイミド結合基、チオアミド結合基、
イミノ結合基、カルボニル結合基、チオカルボニル結合
基および1,4−ピペラジニル基からなる群より選ばれ
る基を一個もしくは複数個含む連結基であることが好ま
しく、特に好ましいのはアミド基(−NHCO−基、も
しくは−CONH−基)である。
【0122】L2aとL2bの置換基の例としては、炭素原
子数が1乃至3のアルキル基、炭素原子数が2乃至4の
アシル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基および
炭素原子数が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数
が7乃至23のアラルキル基からなる群より選ばれる基
で置換されていてもよい。炭素原子数が1乃至3のアル
キル基としては、メチル基もしくはエチル基であること
が好ましく、メチル基であることが特に好ましい。炭素
原子数が2乃至4のアシル基としては、アセチル基であ
ることが好ましい。炭素原子数が6乃至20のアリール
基としては、フェニル基もしくはナフチル基であること
が好ましく、フェニル基であることが特に好ましい。炭
素原子数が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数が
7乃至23のアラルキル基としては、ベンジル基である
ことが好ましい。
子数が1乃至3のアルキル基、炭素原子数が2乃至4の
アシル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基および
炭素原子数が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数
が7乃至23のアラルキル基からなる群より選ばれる基
で置換されていてもよい。炭素原子数が1乃至3のアル
キル基としては、メチル基もしくはエチル基であること
が好ましく、メチル基であることが特に好ましい。炭素
原子数が2乃至4のアシル基としては、アセチル基であ
ることが好ましい。炭素原子数が6乃至20のアリール
基としては、フェニル基もしくはナフチル基であること
が好ましく、フェニル基であることが特に好ましい。炭
素原子数が1乃至3のアルキル基を有する炭素原子数が
7乃至23のアラルキル基としては、ベンジル基である
ことが好ましい。
【0123】L2aとL2bがイミノ結合基である場合、そ
の置換基としては、メチル基であることが特に好まし
い。従って、L2aとL2bは、それぞれ独立に、N−メチ
ル−ジ(n−プロピレニル)イミノ基、1,4−ジ(n
−プロピレニル)−ピペラジニル基であることがさらに
好ましく、N−メチル−ジ(n−プロピレニル)イミノ
基であることが特に好ましい。
の置換基としては、メチル基であることが特に好まし
い。従って、L2aとL2bは、それぞれ独立に、N−メチ
ル−ジ(n−プロピレニル)イミノ基、1,4−ジ(n
−プロピレニル)−ピペラジニル基であることがさらに
好ましく、N−メチル−ジ(n−プロピレニル)イミノ
基であることが特に好ましい。
【0124】EaおよびEbは、酸化還元活性を有し、こ
れによって導電性を付与する基であり、互いに独立に、
置換基を有していてもよい、一つ以上の結合手を持つメ
タロセン、2,2’−ビピリジン錯体、シクロブタジエ
ン錯体、シクロペンタジエニル錯体、1,10−フェナ
ントロリン錯体、トリフェニルホスフィン錯体、カテコ
ールアミン、あるいはビオローゲンなどであることが好
ましい。置換基を有していてもよい一つの結合手を持つ
フェロセンであることが特に好ましい。EaおよびEbは
互いに同一の基であることが好ましい。次に、置換基を
有するフェロセンの具体例を示す。置換基の位置は、シ
クロペンタジエニル基の何れの位置であってもよい。
れによって導電性を付与する基であり、互いに独立に、
置換基を有していてもよい、一つ以上の結合手を持つメ
タロセン、2,2’−ビピリジン錯体、シクロブタジエ
ン錯体、シクロペンタジエニル錯体、1,10−フェナ
ントロリン錯体、トリフェニルホスフィン錯体、カテコ
ールアミン、あるいはビオローゲンなどであることが好
ましい。置換基を有していてもよい一つの結合手を持つ
フェロセンであることが特に好ましい。EaおよびEbは
互いに同一の基であることが好ましい。次に、置換基を
有するフェロセンの具体例を示す。置換基の位置は、シ
クロペンタジエニル基の何れの位置であってもよい。
【0125】
【化21】
【0126】上記の式(6)および(7)の縫い込み型
インターカレータとして有利に用いることのできる化合
物は、例えば、公知のジアミン化合物を原料として、公
知の方法(特開平9−288080号公報)に準じる製
造方法によって簡便に製造することができる。
インターカレータとして有利に用いることのできる化合
物は、例えば、公知のジアミン化合物を原料として、公
知の方法(特開平9−288080号公報)に準じる製
造方法によって簡便に製造することができる。
【0127】また式(6)および(7)の化合物は、公
知のジアミン化合物を出発物質とする下記の式で代表さ
れる合成ルートによっても安価に、かつ収率良く製造す
ることができる。
知のジアミン化合物を出発物質とする下記の式で代表さ
れる合成ルートによっても安価に、かつ収率良く製造す
ることができる。
【0128】
【化22】
【0129】[導電性基で標識されたカチオン性分子]
ハイブリダイゼーション操作の実施に際しては、上記の
縫い込み型インターカレータの代わりに、導電性基を持
つカチオン性分子を用いてもよい。このカチオン性分子
は、核酸試料の負電荷を持ったリン酸エステル基との静
電気的な相互作用によって、核酸試料とイオン複合体を
形成する。本発明で用いるカチオン性分子は、正電荷を
有しているものであれば、高分子化合物であっても、あ
るいは低分子化合物であってもよい。ハイブリダイゼー
ションで用いる核酸試料の負電荷を中和するため、核酸
試料が有するすべての負電荷に対応するべく、核酸塩基
の数以上の正電荷を有する分子であることが好ましい。
従って、導電性基で標識されたカチオン性分子は、導電
性基を有し、かつカチオン性基を有するポリマーである
ことが好ましい。
ハイブリダイゼーション操作の実施に際しては、上記の
縫い込み型インターカレータの代わりに、導電性基を持
つカチオン性分子を用いてもよい。このカチオン性分子
は、核酸試料の負電荷を持ったリン酸エステル基との静
電気的な相互作用によって、核酸試料とイオン複合体を
形成する。本発明で用いるカチオン性分子は、正電荷を
有しているものであれば、高分子化合物であっても、あ
るいは低分子化合物であってもよい。ハイブリダイゼー
ションで用いる核酸試料の負電荷を中和するため、核酸
試料が有するすべての負電荷に対応するべく、核酸塩基
の数以上の正電荷を有する分子であることが好ましい。
従って、導電性基で標識されたカチオン性分子は、導電
性基を有し、かつカチオン性基を有するポリマーである
ことが好ましい。
【0130】導電性基を有し、かつカチオン性基を有す
るポリマーは、カチオン性基と導電性基を有するモノマ
ーのポリマー(MP)であっても、カチオン性基を有す
るモノマーと導電性基を有するモノマーとのコポリマー
(CP)であってもよい。モノマーのポリマー(MP)
およびコポリマー(CP)は、それぞれ、カチオン性基
や導電性基を持たないモノマー(NM)とのコポリマー
をさらに形成してもよい。この場合、コポリマー中のM
Pの割合およびコポリマー中のCPの割合は、それぞ
れ、1乃至99質量%の範囲にあることが好ましく、5
乃至95質量%の範囲にあることが特に好ましい。
るポリマーは、カチオン性基と導電性基を有するモノマ
ーのポリマー(MP)であっても、カチオン性基を有す
るモノマーと導電性基を有するモノマーとのコポリマー
(CP)であってもよい。モノマーのポリマー(MP)
およびコポリマー(CP)は、それぞれ、カチオン性基
や導電性基を持たないモノマー(NM)とのコポリマー
をさらに形成してもよい。この場合、コポリマー中のM
Pの割合およびコポリマー中のCPの割合は、それぞ
れ、1乃至99質量%の範囲にあることが好ましく、5
乃至95質量%の範囲にあることが特に好ましい。
【0131】導電性基を有し、かつカチオン性基を有す
るポリマーは、公知の方法によって製造することができ
る。例えば、エチレン系不飽和結合を有する化合物を用
いてラジカル重合によって製造することができる。導電
性基およびカチオン性基は、モノマーの段階で導入して
も、重合後にポリマーに導入してもよく、あるいは、導
電性基やカチオン性基に誘導される反応性基の前駆体を
モノマーに導入しておき、重合後に、対応する導電性基
や対応するカチオン性基に変換したものであってもよ
い。導電性基やカチオン性基を重合後に導入する場合に
は、デンプン、セルロース、デキストラン、アガロー
ス、ゼラチン、プルラン等の天然高分子を用いてもよ
い。
るポリマーは、公知の方法によって製造することができ
る。例えば、エチレン系不飽和結合を有する化合物を用
いてラジカル重合によって製造することができる。導電
性基およびカチオン性基は、モノマーの段階で導入して
も、重合後にポリマーに導入してもよく、あるいは、導
電性基やカチオン性基に誘導される反応性基の前駆体を
モノマーに導入しておき、重合後に、対応する導電性基
や対応するカチオン性基に変換したものであってもよ
い。導電性基やカチオン性基を重合後に導入する場合に
は、デンプン、セルロース、デキストラン、アガロー
ス、ゼラチン、プルラン等の天然高分子を用いてもよ
い。
【0132】好ましいモノマーの具体例を以下に示す。
アクリル酸、メタクリル酸およびそのエステル類として
は、例えば、アクリル酸、メチルアクリレート、ブチル
アクリレート、ベンジルアクリレート、ヒドロキシエチ
ルアクリレート、−CH2=CHCOO(CH2CH
2O)nR22(R22は、水素原子もしくは炭素原子数が1
乃至6のアルキル基を表し;nは、1以上の整数を表
す)、メタクリル酸、メチルメタクリレート、エチルメ
タクリレート、ベンジルメタクリレート、ヒドロキシエ
チルメタクリレート、2−エチルヘキシルメタクリレー
ト、2−メトキシエチルメタクリレート、N,N−ジメ
チルアミノエチルメタクリレート、2−スルホエチルメ
タクリレート等を挙げることができる。
アクリル酸、メタクリル酸およびそのエステル類として
は、例えば、アクリル酸、メチルアクリレート、ブチル
アクリレート、ベンジルアクリレート、ヒドロキシエチ
ルアクリレート、−CH2=CHCOO(CH2CH
2O)nR22(R22は、水素原子もしくは炭素原子数が1
乃至6のアルキル基を表し;nは、1以上の整数を表
す)、メタクリル酸、メチルメタクリレート、エチルメ
タクリレート、ベンジルメタクリレート、ヒドロキシエ
チルメタクリレート、2−エチルヘキシルメタクリレー
ト、2−メトキシエチルメタクリレート、N,N−ジメ
チルアミノエチルメタクリレート、2−スルホエチルメ
タクリレート等を挙げることができる。
【0133】エチレン系不飽和カルボン酸のアミド類と
しては、アクリルアミド、メタクリルアミド、N−アク
リロイルモルホリン、N,N−ジメチルアクリルアミ
ド、2−アクリルアミド−2−メチルプロパンスルホン
酸(もしくはその塩)等を挙げることができる。アミン
類としては、アリルアミン、エチルイミン、ビニルアミ
ン等を挙げることができる。ポリオルニチン、ポリリジ
ンなどのポリアミノ酸も好ましい。芳香族類としては、
スチレン、ビニルトルエン、p−t−ブチルスチレン、
p−ビニル安息香酸、ビニルナフタレン等を挙げること
ができる。また、他のビニル系モノマーとして、エチレ
ン、プロピレン、塩化ビニル、塩化ビニリデン、トリフ
ロロエチレン、トリフロロクロロエチレン、酢酸ビニ
ル、プロピオン酸ビニル、ビニルアルコール、N−ビニ
ルピロリドン、N−ビニルアセトアミド、アクリロニト
リル、メタクリロニトリル等を用いることもできる。
しては、アクリルアミド、メタクリルアミド、N−アク
リロイルモルホリン、N,N−ジメチルアクリルアミ
ド、2−アクリルアミド−2−メチルプロパンスルホン
酸(もしくはその塩)等を挙げることができる。アミン
類としては、アリルアミン、エチルイミン、ビニルアミ
ン等を挙げることができる。ポリオルニチン、ポリリジ
ンなどのポリアミノ酸も好ましい。芳香族類としては、
スチレン、ビニルトルエン、p−t−ブチルスチレン、
p−ビニル安息香酸、ビニルナフタレン等を挙げること
ができる。また、他のビニル系モノマーとして、エチレ
ン、プロピレン、塩化ビニル、塩化ビニリデン、トリフ
ロロエチレン、トリフロロクロロエチレン、酢酸ビニ
ル、プロピオン酸ビニル、ビニルアルコール、N−ビニ
ルピロリドン、N−ビニルアセトアミド、アクリロニト
リル、メタクリロニトリル等を用いることもできる。
【0134】カチオン性基は、ポリマーの側鎖に存在す
ることが好ましく、側鎖の末端に存在することが特に好
ましい。好ましいカチオン性基としては、アンモニウム
カチオン性基(−N+R31H2、−N+R31R32H、−N+
R31R32R33)、オキソニウムカチオン性基(−O+R
31H、−O+R31R32)、スルホニウムカチオン性基
(−S+R31H、−S+R31R32)、セレノニウムカチオ
ン性基(−Se+R31H、−Se+R31R32)、(−P+
R31H2、−P+R31R32H、−P+R31R32R33)、ア
ルソニウムカチオン性基(−As+R31H、−As+R31
R32)、スチボニウムカチオン性基(−Sb+R31H、
−Sb+R31R32)、クロロニウムカチオン性基(−C
l+R31)、ブロモニウムカチオン性基(−Br+R31)
およびヨードニウムカチオン性基(−I+R11)を挙げ
ることができるが、アンモニウムカチオン性基、オキソ
ニウムカチオン性基、ホスホニウムカチオン性基もしく
はスルホニウムカチオン性基であることがより好まし
く、アンモニウムカチオンであることが特に好ましい。
ることが好ましく、側鎖の末端に存在することが特に好
ましい。好ましいカチオン性基としては、アンモニウム
カチオン性基(−N+R31H2、−N+R31R32H、−N+
R31R32R33)、オキソニウムカチオン性基(−O+R
31H、−O+R31R32)、スルホニウムカチオン性基
(−S+R31H、−S+R31R32)、セレノニウムカチオ
ン性基(−Se+R31H、−Se+R31R32)、(−P+
R31H2、−P+R31R32H、−P+R31R32R33)、ア
ルソニウムカチオン性基(−As+R31H、−As+R31
R32)、スチボニウムカチオン性基(−Sb+R31H、
−Sb+R31R32)、クロロニウムカチオン性基(−C
l+R31)、ブロモニウムカチオン性基(−Br+R31)
およびヨードニウムカチオン性基(−I+R11)を挙げ
ることができるが、アンモニウムカチオン性基、オキソ
ニウムカチオン性基、ホスホニウムカチオン性基もしく
はスルホニウムカチオン性基であることがより好まし
く、アンモニウムカチオンであることが特に好ましい。
【0135】R31、R32およびR33は、互いに独立に、
水素原子、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原
子数が1乃至6のアルコキシ基、炭素原子数が6乃至2
0のアリール基、および炭素原子数が1乃至6のアルキ
ル基を有する炭素原子数が7乃至26のアラルキル基か
らなる群より選ばれる原子もしくは基であることが好ま
しく、炭素原子数が1乃至6のアルキル基であることが
特に好ましい。これらの基は、さらに置換されていても
よい。R31、R32およびR33は、共同してそれらが付い
ているヘテロ原子等と一緒に環を形成する原子群であっ
てもよい。例えば、モルホリニウム基、ピリジニウム
基、ピロリウム基、イミダゾリウム基、ピラゾリウム
基、2−ピロリニウム基、ピロリジウム基、2−イミダ
ゾリジニウム基、ピペリジニウム基およびインドリニウ
ム基を挙げることができる。
水素原子、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原
子数が1乃至6のアルコキシ基、炭素原子数が6乃至2
0のアリール基、および炭素原子数が1乃至6のアルキ
ル基を有する炭素原子数が7乃至26のアラルキル基か
らなる群より選ばれる原子もしくは基であることが好ま
しく、炭素原子数が1乃至6のアルキル基であることが
特に好ましい。これらの基は、さらに置換されていても
よい。R31、R32およびR33は、共同してそれらが付い
ているヘテロ原子等と一緒に環を形成する原子群であっ
てもよい。例えば、モルホリニウム基、ピリジニウム
基、ピロリウム基、イミダゾリウム基、ピラゾリウム
基、2−ピロリニウム基、ピロリジウム基、2−イミダ
ゾリジニウム基、ピペリジニウム基およびインドリニウ
ム基を挙げることができる。
【0136】炭素原子数が1乃至6のアルキル基として
は、メチル基、エチル基、n−プロピル基、n−ブチル
基、n−ペンチル基、シクロペンチル基、n−ヘキシル
基もしくはシクロヘキシル基であることが好ましく、メ
チルであることが特に好ましい。
は、メチル基、エチル基、n−プロピル基、n−ブチル
基、n−ペンチル基、シクロペンチル基、n−ヘキシル
基もしくはシクロヘキシル基であることが好ましく、メ
チルであることが特に好ましい。
【0137】標識は、ピーク電流値が印加する電位に依
存するような互いに異なる二種類以上の導電性基を用い
て行なってもよい。導電性基としては、結合手を有す
る、下記に記載の有機金属化合物と、金属原子を含まな
いが導電性を有する物質とを挙げることができる。尚、
下記には、結合手を持たない構造を示す。
存するような互いに異なる二種類以上の導電性基を用い
て行なってもよい。導電性基としては、結合手を有す
る、下記に記載の有機金属化合物と、金属原子を含まな
いが導電性を有する物質とを挙げることができる。尚、
下記には、結合手を持たない構造を示す。
【0138】有機金属化合物としては、配位子から中心
金属原子の電子供与に加えて、中心金属原子の軌道から
配位子の原子の空軌道へ電子がπ結合を通じて供与され
るタイプのπ錯体を用いることが好ましい。また、有機
金属化合物としては、繰り返し単位同士が配位結合によ
って互いに結合している配位高分子も好ましく用いるこ
とができる。π錯体は、金属原子に対する配位が、単座
配位、二座配位、多座配位もしくは架橋配位の何れの配
位によるものであってもよい。π錯体の具体例として
は、下記式に示すメタロセン錯体をあげることができ
る。Mは、金属原子を表す。
金属原子の電子供与に加えて、中心金属原子の軌道から
配位子の原子の空軌道へ電子がπ結合を通じて供与され
るタイプのπ錯体を用いることが好ましい。また、有機
金属化合物としては、繰り返し単位同士が配位結合によ
って互いに結合している配位高分子も好ましく用いるこ
とができる。π錯体は、金属原子に対する配位が、単座
配位、二座配位、多座配位もしくは架橋配位の何れの配
位によるものであってもよい。π錯体の具体例として
は、下記式に示すメタロセン錯体をあげることができ
る。Mは、金属原子を表す。
【0139】
【化23】
【0140】メタロセン錯体の金属原子は、Fe、N
i、Co、Mo、Zn、Cr、Tl、Ta、Ti、C
u、Mn、W、V、RuもしくはOsであることが好ま
しく、Fe、Co、Ni、Ru、Os、VもしくはCr
であることがさらに好ましく、Fe(このとき、メタロ
セン錯体は、フェロセンである)であることが特に好ま
しい。
i、Co、Mo、Zn、Cr、Tl、Ta、Ti、C
u、Mn、W、V、RuもしくはOsであることが好ま
しく、Fe、Co、Ni、Ru、Os、VもしくはCr
であることがさらに好ましく、Fe(このとき、メタロ
セン錯体は、フェロセンである)であることが特に好ま
しい。
【0141】π錯体としては、下記の式で表されるシク
ロブタジエン錯体、シクロペンタジエニル錯体、フェナ
ントロリン錯体、ビピリジル錯体もしくはトリフェニル
ホスフィン錯体も好ましく用いることができる。フェナ
ントロリン錯体としては、トリス(フェナントロリン)
亜鉛錯体、トリス(フェナントロリン)ルテニウム錯
体、トリス(フェナントロリン)コバルト錯体、ジ(フ
ェナントロリン)亜鉛錯体、ジ(フェナントロリン)ル
テニウム錯体、ジ(フェナントロリン)コバルト錯体お
よびフェナントロリンプラチナ錯体を挙げることができ
る。ビピリジル錯体としては、ビピリジルプラチナ錯
体、トリス(ビピリジル)亜鉛錯体、トリス(ビピリジ
ル)ルテニウム錯体、トリス(ビピリジル)コバルト錯
体、ジ(ビピリジル)亜鉛錯体、ジ(ビピリジル)ルテ
ニウム錯体、およびジ(ビピリジル)コバルト錯体を挙
げることができる。
ロブタジエン錯体、シクロペンタジエニル錯体、フェナ
ントロリン錯体、ビピリジル錯体もしくはトリフェニル
ホスフィン錯体も好ましく用いることができる。フェナ
ントロリン錯体としては、トリス(フェナントロリン)
亜鉛錯体、トリス(フェナントロリン)ルテニウム錯
体、トリス(フェナントロリン)コバルト錯体、ジ(フ
ェナントロリン)亜鉛錯体、ジ(フェナントロリン)ル
テニウム錯体、ジ(フェナントロリン)コバルト錯体お
よびフェナントロリンプラチナ錯体を挙げることができ
る。ビピリジル錯体としては、ビピリジルプラチナ錯
体、トリス(ビピリジル)亜鉛錯体、トリス(ビピリジ
ル)ルテニウム錯体、トリス(ビピリジル)コバルト錯
体、ジ(ビピリジル)亜鉛錯体、ジ(ビピリジル)ルテ
ニウム錯体、およびジ(ビピリジル)コバルト錯体を挙
げることができる。
【0142】導電性化合物として、クロロフルオロヘ
ム、クロロフィリド、クロロフィル、ヘム、ビタミンB
12等のポルフィリン系錯体も好ましく用いることができ
る。
ム、クロロフィリド、クロロフィル、ヘム、ビタミンB
12等のポルフィリン系錯体も好ましく用いることができ
る。
【0143】金属原子を含まない導電性化合物として
は、下記の式で表されるビオロゲン、2,2’−ビピリ
ジン、1,10−フェナントロリン、カテコールアミン
等を挙げることができる。但し、RA、RBは、互いに独
立に、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数
が1乃至6のアルコキシ基、炭素原子数が6乃至12の
アリール基、並びにN、OおよびSからなる群より選ば
れるヘテロ原子を1乃至4個含む炭素原子数が2乃至1
2の複素環基からなる群より選ばれる基であることが好
ましい。上記のアルキル基、アルコキシ基、アリール基
及び複素環基は、何れも炭素原子数が1乃至6のアルキ
ル基、炭素原子数が1乃至6のアルコキシ基および炭素
原子数が6乃至10のアリール基からなる群より選ばれ
る基で置換されていてもよい。RA、RBは、何れも、炭
素原子数が1乃至6のアルキル基もしくは炭素原子数が
6乃至12のアリール基であることがさらに好ましく、
フェニル基であることが特に好ましい。
は、下記の式で表されるビオロゲン、2,2’−ビピリ
ジン、1,10−フェナントロリン、カテコールアミン
等を挙げることができる。但し、RA、RBは、互いに独
立に、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数
が1乃至6のアルコキシ基、炭素原子数が6乃至12の
アリール基、並びにN、OおよびSからなる群より選ば
れるヘテロ原子を1乃至4個含む炭素原子数が2乃至1
2の複素環基からなる群より選ばれる基であることが好
ましい。上記のアルキル基、アルコキシ基、アリール基
及び複素環基は、何れも炭素原子数が1乃至6のアルキ
ル基、炭素原子数が1乃至6のアルコキシ基および炭素
原子数が6乃至10のアリール基からなる群より選ばれ
る基で置換されていてもよい。RA、RBは、何れも、炭
素原子数が1乃至6のアルキル基もしくは炭素原子数が
6乃至12のアリール基であることがさらに好ましく、
フェニル基であることが特に好ましい。
【0144】
【化24】
【0145】導電性基で標識されたカチオン性分子は、
公知の方法、例えば、カチオン性分子が有するアミノ基
と導電性物質が有するカルボン酸との脱水縮合によって
容易に合成することができる。
公知の方法、例えば、カチオン性分子が有するアミノ基
と導電性物質が有するカルボン酸との脱水縮合によって
容易に合成することができる。
【0146】[酸化酵素および基質]本発明の増感型測
定法において酸化酵素として用いる酵素は、酸素から過
酸化水素を生じる二電子還元を行なう酵素であれば特に
制限されない。グルコースオキシダーゼ、コレステロー
ルオキシダーゼ、ウリカーゼ、アミンオキシダーゼ等を
好ましく使用することができる。グルコースオキシダー
ゼによって過酸化水素を発生する基質としては、グルコ
ースを使用する。コレステロールオキシダーゼの場合に
は、基質としてコレステロールを使用する。
定法において酸化酵素として用いる酵素は、酸素から過
酸化水素を生じる二電子還元を行なう酵素であれば特に
制限されない。グルコースオキシダーゼ、コレステロー
ルオキシダーゼ、ウリカーゼ、アミンオキシダーゼ等を
好ましく使用することができる。グルコースオキシダー
ゼによって過酸化水素を発生する基質としては、グルコ
ースを使用する。コレステロールオキシダーゼの場合に
は、基質としてコレステロールを使用する。
【0147】グルコースオキシダーゼは、Asperg
illus nigerもしくはPenicilliu
m notatum由来のものを用いることが好まし
い。コレステロールオキシダーゼは、Nocardia
erythroporis、Brevibacter
ium、Pseudomonas、Mycobacte
rium、スエヒロタケ等から得られたものを用いるこ
とが好ましい
illus nigerもしくはPenicilliu
m notatum由来のものを用いることが好まし
い。コレステロールオキシダーゼは、Nocardia
erythroporis、Brevibacter
ium、Pseudomonas、Mycobacte
rium、スエヒロタケ等から得られたものを用いるこ
とが好ましい
【0148】[標識量の検出]電流量の測定は、電極上
のPNA断片と試料核酸との二本鎖が固定された電極と
導電性基との間を流れる電流量が測定できる方法であれ
ば如何なる方法であってもよい。サイクリックボルタモ
グラフィー(CV)、デファレンシャルパルスボルタモ
グラフィー(DPV)、リニアスィープボルタモグラフ
ィー、ポテンショスタット等を用いることが好ましい。
カウンター電極と二本鎖固定電極とを電解質溶液に浸漬
し、一対の電解系を形成させ、デファレンシャルパルス
ボルタモグラフィーを測定することが特に好ましい。
のPNA断片と試料核酸との二本鎖が固定された電極と
導電性基との間を流れる電流量が測定できる方法であれ
ば如何なる方法であってもよい。サイクリックボルタモ
グラフィー(CV)、デファレンシャルパルスボルタモ
グラフィー(DPV)、リニアスィープボルタモグラフ
ィー、ポテンショスタット等を用いることが好ましい。
カウンター電極と二本鎖固定電極とを電解質溶液に浸漬
し、一対の電解系を形成させ、デファレンシャルパルス
ボルタモグラフィーを測定することが特に好ましい。
【0149】
【実施例】[実施例1]導電性基で標識した縫い込み型
インターカレータを用いる相補性DNA断片の検出
〈1〉 (1)PNA断片の合成 下記式で表されるPNA−H2N−Lys−T10−H
(以下「PNA−T10」という。Tは、チミンを表わ
す。)を、文献(P.E.Nielsen et al., Journal ofAmer
ican Chemical Society,114,1895-1897(1992)および11
4,9677-9678(1992))に記載の方法に従って合成した。
インターカレータを用いる相補性DNA断片の検出
〈1〉 (1)PNA断片の合成 下記式で表されるPNA−H2N−Lys−T10−H
(以下「PNA−T10」という。Tは、チミンを表わ
す。)を、文献(P.E.Nielsen et al., Journal ofAmer
ican Chemical Society,114,1895-1897(1992)および11
4,9677-9678(1992))に記載の方法に従って合成した。
【0150】
【化25】
【0151】(2)PNA固定金電極の作製 表面に一群のメルカプト基を有する面積が2.25mm
2の金電極に、1,2−ビス(ビニルスルホニルアセト
アミド)エタンのリン酸緩衝液を滴下して、該金電極の
表面に1,2−ビス(ビニルスルホニルアセトアミド)
エタンを共有結合により固定させ、自由端部にビニルス
ルホニル基を持つ反応性金電極を作成した。次いで、こ
の反応性金電極表面に、100ピコモル/1μLのPN
A−T10の水溶液(2μL)を滴下し、室温にて1時間
放置してPNA固定金電極を作製した。
2の金電極に、1,2−ビス(ビニルスルホニルアセト
アミド)エタンのリン酸緩衝液を滴下して、該金電極の
表面に1,2−ビス(ビニルスルホニルアセトアミド)
エタンを共有結合により固定させ、自由端部にビニルス
ルホニル基を持つ反応性金電極を作成した。次いで、こ
の反応性金電極表面に、100ピコモル/1μLのPN
A−T10の水溶液(2μL)を滴下し、室温にて1時間
放置してPNA固定金電極を作製した。
【0152】(3)試料DNA断片の調製 試料DNA断片として、アデニンの10量体(DNA−
A10)を特開平9−288080号公報に記載の方法に
従って調製した。
A10)を特開平9−288080号公報に記載の方法に
従って調製した。
【0153】(4)相補性DNA断片の検出 〈バックグラウンド値の測定〉下記の式で表されるフェ
ロセン標識電気化学活性縫い込み型インターカレータ
(50μMを含む0.1M塩化カリウム−0.1M酢酸
緩衝液(pH5.6))溶液に、38℃にて、前記
(2)で作製したPNA固定電極を浸漬し、100乃至
700mVの範囲で電圧を印加し、デファレンシャル・
パルス・ボルタンメトリー(DPV)を実施した。次い
で、印加電圧260mVでの応答電流値(バックグラウ
ンド値)測定したところ、−1.2μAであった。この
測定は、パルス振幅50mV、パルス幅50mSおよび
スキャン速度100mV/秒にて行なった。
ロセン標識電気化学活性縫い込み型インターカレータ
(50μMを含む0.1M塩化カリウム−0.1M酢酸
緩衝液(pH5.6))溶液に、38℃にて、前記
(2)で作製したPNA固定電極を浸漬し、100乃至
700mVの範囲で電圧を印加し、デファレンシャル・
パルス・ボルタンメトリー(DPV)を実施した。次い
で、印加電圧260mVでの応答電流値(バックグラウ
ンド値)測定したところ、−1.2μAであった。この
測定は、パルス振幅50mV、パルス幅50mSおよび
スキャン速度100mV/秒にて行なった。
【0154】
【化26】
【0155】〈相補性DNA断片の検出〉前記(2)で
作製したPNA固定電極の上に、前記(3)で得たDN
A−A10(70ピコモル)を含む10mMトリス緩衝液
(pH7.5)溶液2μLを滴下し、25℃にて30分
間インキュベートした。次いで、インキュベート後のP
NA固定電極の表面を0.1Mリン酸二水素ナトリウム
−リン酸水素二ナトリウム水溶液(pH7.0)にて洗
浄し、未反応のDNA−A10を除去した。そして、上記
のバックグラウンド値の測定と同様の操作を行って、応
答電流値(PNAと試料DNA断片との複合体形成後の
電流値)を測定したところ、−2.8μAであった。ま
た、バックグランド値に対する応答電流値の変化の割合
は、133%であった。
作製したPNA固定電極の上に、前記(3)で得たDN
A−A10(70ピコモル)を含む10mMトリス緩衝液
(pH7.5)溶液2μLを滴下し、25℃にて30分
間インキュベートした。次いで、インキュベート後のP
NA固定電極の表面を0.1Mリン酸二水素ナトリウム
−リン酸水素二ナトリウム水溶液(pH7.0)にて洗
浄し、未反応のDNA−A10を除去した。そして、上記
のバックグラウンド値の測定と同様の操作を行って、応
答電流値(PNAと試料DNA断片との複合体形成後の
電流値)を測定したところ、−2.8μAであった。ま
た、バックグランド値に対する応答電流値の変化の割合
は、133%であった。
【0156】実施例1の結果より、PNAプローブが固
定されたPNA固定電極は、低いバックグラウンド値を
示すことが分かる。また、バックグラウンド値が低いた
め、感度よく相補性DNA断片を検出できることが分か
る。
定されたPNA固定電極は、低いバックグラウンド値を
示すことが分かる。また、バックグラウンド値が低いた
め、感度よく相補性DNA断片を検出できることが分か
る。
【0157】[実施例2]導電性基で標識したカチオン
性基を有する縫い込み型インターカレータを用いる相補
性DNA断片の検出〈2〉 実施例1で用いたフェロセン標識縫い込み型インターカ
レータの代わりに、下記式で表されるカチオン性のフェ
ロセン標識縫い込み型インターカレータを用いる以外は
実施例1と同様にして、バックグラウンド値、複合体の
電流値および変化の割合を求めたところ、それぞれ−
1.5μA、−5.2μA、247%であった。
性基を有する縫い込み型インターカレータを用いる相補
性DNA断片の検出〈2〉 実施例1で用いたフェロセン標識縫い込み型インターカ
レータの代わりに、下記式で表されるカチオン性のフェ
ロセン標識縫い込み型インターカレータを用いる以外は
実施例1と同様にして、バックグラウンド値、複合体の
電流値および変化の割合を求めたところ、それぞれ−
1.5μA、−5.2μA、247%であった。
【0158】
【化27】
【0159】[実施例3]導電性基で標識したカチオン
性ポリマーを用いる相補性DNA断片の検出〈3〉 〈バックグラウンド値の測定〉実施例1で作製したPN
A固定電極の上に、下記式で表されるフェロセン標識ポ
リアリルアミン(約1ナノモル)を含む水溶液2μLを
滴下し、25℃にて30分間放置し、PNA固定電極の
表面を蒸留水で洗浄した。次いで、0.1M塩化カリウ
ム−0.1M酢酸緩衝液(pH5.6)溶液に、38℃
にて、洗浄後のPNA固定電極を浸漬し、100乃至7
00mVの範囲で電圧を印加し、デファレンシャル・パ
ルス・ボルタンメトリー(DPV)を実施した。次い
で、印加電圧460mVでの応答電流値(バックグラウ
ンド値)測定したところ、−0.9μAであった。測定
は、パルス振幅50mV、パルス幅50mSおよびスキ
ャン速度100mV/秒にて行った。
性ポリマーを用いる相補性DNA断片の検出〈3〉 〈バックグラウンド値の測定〉実施例1で作製したPN
A固定電極の上に、下記式で表されるフェロセン標識ポ
リアリルアミン(約1ナノモル)を含む水溶液2μLを
滴下し、25℃にて30分間放置し、PNA固定電極の
表面を蒸留水で洗浄した。次いで、0.1M塩化カリウ
ム−0.1M酢酸緩衝液(pH5.6)溶液に、38℃
にて、洗浄後のPNA固定電極を浸漬し、100乃至7
00mVの範囲で電圧を印加し、デファレンシャル・パ
ルス・ボルタンメトリー(DPV)を実施した。次い
で、印加電圧460mVでの応答電流値(バックグラウ
ンド値)測定したところ、−0.9μAであった。測定
は、パルス振幅50mV、パルス幅50mSおよびスキ
ャン速度100mV/秒にて行った。
【0160】
【化28】
【0161】上記のフェロセンで標識したポリアリルア
ミンは、WSCD(1−エチル−3−(3−ジメチルア
ミノプロピル)カルボジイミド)の塩酸塩の存在下で、
ポリアリルアミン(日東紡績(株)製、分子量:約10
000)とフェロセンカルボン酸とを反応させることに
よって合成した。フェロセン標識ポリアリルアミンの分
子量は、約12000であった。
ミンは、WSCD(1−エチル−3−(3−ジメチルア
ミノプロピル)カルボジイミド)の塩酸塩の存在下で、
ポリアリルアミン(日東紡績(株)製、分子量:約10
000)とフェロセンカルボン酸とを反応させることに
よって合成した。フェロセン標識ポリアリルアミンの分
子量は、約12000であった。
【0162】〈相補性DNA断片の検出〉実施例1で作
製したPNA固定電極に、試料DNA断片としてアデニ
ンの10量体(DNA−A10)(70ピコモル)を含む
10mMトリス緩衝液(pH7.5)溶液2μLを滴下
し、25℃にて30分間インキュベートした。次いで、
インキュベート後のPNA固定電極の表面を0.1Mリ
ン酸二水素ナトリウム−リン酸水素二ナトリウム水溶液
(pH7.0)で洗浄し、未反応のDNA−A10を除去
した。そして、上記のバックグラウンド値の測定と同様
の操作を行って、応答電流値(PNAと試料DNA断片
との複合体形成時の電流値)を測定したところ、−2.
0μAであった。また、バックグランド値に対する応答
電流値の変化の割合は、122%であった。
製したPNA固定電極に、試料DNA断片としてアデニ
ンの10量体(DNA−A10)(70ピコモル)を含む
10mMトリス緩衝液(pH7.5)溶液2μLを滴下
し、25℃にて30分間インキュベートした。次いで、
インキュベート後のPNA固定電極の表面を0.1Mリ
ン酸二水素ナトリウム−リン酸水素二ナトリウム水溶液
(pH7.0)で洗浄し、未反応のDNA−A10を除去
した。そして、上記のバックグラウンド値の測定と同様
の操作を行って、応答電流値(PNAと試料DNA断片
との複合体形成時の電流値)を測定したところ、−2.
0μAであった。また、バックグランド値に対する応答
電流値の変化の割合は、122%であった。
【0163】実施例3の結果より、PNAプローブが固
定されたPNA修飾電極では、バックグラウンド値が低
いことが分かる。また、バックグラウンド値が低いた
め、感度よくDNA断片を検出できることが分かる。
定されたPNA修飾電極では、バックグラウンド値が低
いことが分かる。また、バックグラウンド値が低いた
め、感度よくDNA断片を検出できることが分かる。
【0164】[実施例4]導電性基で標識した縫い込み
型インターカレータを用いる相補性DNA断片の検出
(増感型検出) 試料DNA断片(DNA−A10、286ピコモル)、下
記の式で表されるフェロセン標識縫い込み型インターカ
レータ(50μM)、グルコース(10mM)およびグ
ルコースオキシダーゼ(Aspergillus ni
ger由来、和光(株)製、200U)とを含む0.1
M酢酸−酢酸カリウム水溶液(pH5.6)と0.1M
塩化カリウム水溶液との混合液に、実施例1の(2)で
作製したPNA修飾電極、白金電極および銀/塩化銀参
照電極を浸積して三電極を形成させ、100乃至700
mVの範囲で電圧を印加し、掃引速度10mV/sにお
いて測定を行ない、PNA固定電極のサイクリックボル
タモグラムを得た。印加電圧514mVにおける電流値
は−3.2μAであった。また、グルコースおよびグル
コースオキシダーゼを存在させなかった以外は上記と同
様にして、印加電圧514mVでの電流値を測定したと
ころ、−0.2μAであった。
型インターカレータを用いる相補性DNA断片の検出
(増感型検出) 試料DNA断片(DNA−A10、286ピコモル)、下
記の式で表されるフェロセン標識縫い込み型インターカ
レータ(50μM)、グルコース(10mM)およびグ
ルコースオキシダーゼ(Aspergillus ni
ger由来、和光(株)製、200U)とを含む0.1
M酢酸−酢酸カリウム水溶液(pH5.6)と0.1M
塩化カリウム水溶液との混合液に、実施例1の(2)で
作製したPNA修飾電極、白金電極および銀/塩化銀参
照電極を浸積して三電極を形成させ、100乃至700
mVの範囲で電圧を印加し、掃引速度10mV/sにお
いて測定を行ない、PNA固定電極のサイクリックボル
タモグラムを得た。印加電圧514mVにおける電流値
は−3.2μAであった。また、グルコースおよびグル
コースオキシダーゼを存在させなかった以外は上記と同
様にして、印加電圧514mVでの電流値を測定したと
ころ、−0.2μAであった。
【0165】
【化29】
【0166】従って、グルコースおよびグルコースオキ
シダーゼを存在させると、これらを存在させない場合に
比べると、約16倍に電流値が増幅されることが分か
る。
シダーゼを存在させると、これらを存在させない場合に
比べると、約16倍に電流値が増幅されることが分か
る。
【0167】[実施例5]スペーサ基付きPNA固定電
極を用いる相補性DNA断片の検出 (1)スペーサ基付きPNA固定金電極の作製 表面積が2.25mm2の金電極に、6−アミノ−1−
ヘキサンチオール(0.1mM)と6−ヒドロキシ−1
−ヘキサンチオール(1mM)の混合水溶液(2μL)
を滴下し、混合水溶液が急速に乾燥しないように、45
℃で2時間放置して、該金電極の表面に、アミノ基を自
由末端部に有する反応性基とヒドロキシル基を自由末端
部に有するスペーサ基とを固定させた。このように処理
した電極の表面に、1,2−ビス(ビニルスルホニルア
セトアミド)エタンの3%リン酸緩衝液(pH8.5)
を滴下して、室温で放置して、表面にスペーサ基を介し
て、1,2−ビス(ビニルスルホニルアセトアミド)エ
タンを共有結合により固定されたスペーサ基付き反応性
金電極を作成した。
極を用いる相補性DNA断片の検出 (1)スペーサ基付きPNA固定金電極の作製 表面積が2.25mm2の金電極に、6−アミノ−1−
ヘキサンチオール(0.1mM)と6−ヒドロキシ−1
−ヘキサンチオール(1mM)の混合水溶液(2μL)
を滴下し、混合水溶液が急速に乾燥しないように、45
℃で2時間放置して、該金電極の表面に、アミノ基を自
由末端部に有する反応性基とヒドロキシル基を自由末端
部に有するスペーサ基とを固定させた。このように処理
した電極の表面に、1,2−ビス(ビニルスルホニルア
セトアミド)エタンの3%リン酸緩衝液(pH8.5)
を滴下して、室温で放置して、表面にスペーサ基を介し
て、1,2−ビス(ビニルスルホニルアセトアミド)エ
タンを共有結合により固定されたスペーサ基付き反応性
金電極を作成した。
【0168】次いで、このスペーサ基付き反応性金電極
表面に、100ピコモル/1μLのPNA−T10の水溶
液(実施例1で調製したもの)を2μL滴下し、室温に
て1時間放置し、超純水で洗浄し、次いで乾燥すること
のより、スペーサ基付きPNA固定金電極を作製した。
表面に、100ピコモル/1μLのPNA−T10の水溶
液(実施例1で調製したもの)を2μL滴下し、室温に
て1時間放置し、超純水で洗浄し、次いで乾燥すること
のより、スペーサ基付きPNA固定金電極を作製した。
【0169】(2)バックグラウンド値測定、および相
補性DNA断片の検出 上記のスペーサ基付きPNA固定金電極を用いる以外
は、実施例1に記載の方法に従って、バックグラウンド
値、ハイブリッド複合体の電流値および変化の割合を求
めたところ、それぞれ、−1.3μA、−3.9μA、
そして200%であった。
補性DNA断片の検出 上記のスペーサ基付きPNA固定金電極を用いる以外
は、実施例1に記載の方法に従って、バックグラウンド
値、ハイブリッド複合体の電流値および変化の割合を求
めたところ、それぞれ、−1.3μA、−3.9μA、
そして200%であった。
【0170】(3)測定再現性の評価 上記のスペーサ基付きPNA固定金電極を同一の方法で
10個製造し、それぞれのスペーサ基付きPNA固定金
電極を用いて、上記と同じ方法で、バックグラウンド値
の測定と相補性DNA断片の検出操作を実施したとこ
ろ、変動係数(CV、N=10)は6.5%であり、測
定値の再現性が非常に高いことが確認された。
10個製造し、それぞれのスペーサ基付きPNA固定金
電極を用いて、上記と同じ方法で、バックグラウンド値
の測定と相補性DNA断片の検出操作を実施したとこ
ろ、変動係数(CV、N=10)は6.5%であり、測
定値の再現性が非常に高いことが確認された。
【0171】
【発明の効果】本発明のPNA固定電極を用いるDNA
断片などのようなアニオン性基を有する核酸試料の検出
方法では、プローブ分子のPNA断片と核酸試料との間
の電気的な反発が発生しないため、効率のよいハイブリ
ダイゼーションが可能となる。また、本発明の検出方法
は、ハイブリッドを形成していないPNA断片と縫い込
み型インターカレータとの結合も回避できるために、よ
り感度のよい検出を実現できる。さらに、カチオン性の
縫い込み型インターカレータおよびカチオン性分子は、
核酸試料の負電荷の中和によって、ノニオン性の縫い込
み型インターカレータよりもさらに、効率のよいハイブ
リダイゼーションや、より高い感度を達成することがで
きる。
断片などのようなアニオン性基を有する核酸試料の検出
方法では、プローブ分子のPNA断片と核酸試料との間
の電気的な反発が発生しないため、効率のよいハイブリ
ダイゼーションが可能となる。また、本発明の検出方法
は、ハイブリッドを形成していないPNA断片と縫い込
み型インターカレータとの結合も回避できるために、よ
り感度のよい検出を実現できる。さらに、カチオン性の
縫い込み型インターカレータおよびカチオン性分子は、
核酸試料の負電荷の中和によって、ノニオン性の縫い込
み型インターカレータよりもさらに、効率のよいハイブ
リダイゼーションや、より高い感度を達成することがで
きる。
【0172】また、本発明の核酸使用の検出方法に増感
型の検出工程を組み合わせることによって、増感工程を
利用しない検出(非増感型検出)の場合と比較すると、
約20倍〜100倍の範囲(条件の設定によっては、1
00倍以上)の高い検出感度を達成することができる。
従って、検出目的の核酸試料の濃度が数10-18乃至数
10-12モルの範囲の量であっても、充分に検出・定量
が可能となる。
型の検出工程を組み合わせることによって、増感工程を
利用しない検出(非増感型検出)の場合と比較すると、
約20倍〜100倍の範囲(条件の設定によっては、1
00倍以上)の高い検出感度を達成することができる。
従って、検出目的の核酸試料の濃度が数10-18乃至数
10-12モルの範囲の量であっても、充分に検出・定量
が可能となる。
【図1】本発明の反応性電極の製造方法および代表的な
ペプチド核酸(PNA)固定電極の製造方法と構成を模
式的に示す。
ペプチド核酸(PNA)固定電極の製造方法と構成を模
式的に示す。
【図2】本発明のスペーサ基が固定された反応性電極の
製造方法、および該スペーサ基で互いに隔離された状態
でペプチド核酸(PNA)が固定された電極の製造方法
と構成を模式的に示す。
製造方法、および該スペーサ基で互いに隔離された状態
でペプチド核酸(PNA)が固定された電極の製造方法
と構成を模式的に示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 27/416 C12N 15/00 F 37/00 102 G01N 27/46 336G (72)発明者 小川 雅司 東京都港区西麻布2丁目26番30号 富士写 真フイルム株式会社内 Fターム(参考) 2G045 AA35 DA12 DA13 DA14 FB05 4B024 AA11 AA19 CA01 CA09 CA11 CA20 HA11 HA12 4B029 AA07 AA23 BB20 CC01 CC03 CC08 FA12 FA15 4B063 QA01 QA13 QA17 QQ41 QR31 QR38 QR55 QR84 QR90 QS34 QX04
Claims (33)
- 【請求項1】 電極と該電極表面に共有結合により固定
された一群のペプチド核酸とからなる核酸試料検出用
具。 - 【請求項2】 ペプチド核酸と電極との共有結合が、ペ
プチド核酸に導入された活性水素含有基と電極表面に導
入されたビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆体
基を含む反応性基との反応により形成されている、請求
項1に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項3】 電極表面に導入された反応性基が、下記
の式により表わされるものである、請求項2に記載の核
酸試料検出用具: 【化1】−L−SO2−X [上記の式において、Xは、−CR1=CR2R3または
−CHR1−CR2R3Yを表わし;R1、R2及びR3は、
互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6のアル
キル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ばれる
原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン原子、−OS
O2R11、−OCOR12、−OSO3M、及び四級ピリジ
ニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を表わ
し;R11は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素
原子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数が1
乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至2
6のアラルキル基からなる群より選ばれる基を表わし;
R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基および炭素
原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基からなる群よ
り選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、アルカリ金属
原子およびアンモニウム基からなる群より選ばれる原子
もしくは基を表わし;そして、Lは連結基を表わす]。 - 【請求項4】 Xが、−CH=CH2で表わされるビニ
ル基である、請求項3に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項5】 Lが、−NH−、−S−、および−O−
からなる群から選ばれる連結部位を有する連結基であ
る、請求項3に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項6】 Lが、−(L1)n−NHCH2CH2−
[但し、L1は連結基を表わし、そしてnは0もしくは
1である]で表わされる連結基である、請求項3に記載
の核酸試料検出用具。 - 【請求項7】 電極が金から形成されている、請求項1
に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項8】 ペプチド核酸と電極との共有結合が、ペ
プチド核酸に導入されたビニルスルホニル基もしくはそ
の反応性前駆体基を含む反応性基と電極表面に導入され
た活性水素含有基との反応により形成されている、請求
項1に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項9】 導電性基を有する縫い込み型インターカ
レータ及び水性媒体の存在下、核酸試料を請求項1に記
載のペプチド核酸が固定された核酸試料検出用具に接触
させることにより、該インターカレータが挿入された核
酸試料とペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成さ
せ、次いで、核酸試料検出用具の電極に電位を印加し、
該検出用具の電極と外部電極との間をインターカレータ
の導電性基を介して流れる電流を測定することを特徴と
するペプチド核酸に相補性を有する核酸試料の検出方
法。 - 【請求項10】 導電性基を有するカチオン性分子及び
水性媒体の存在下、核酸試料を請求項1に記載のペプチ
ド核酸が固定された核酸試料検出用具に接触させること
により、該カチオン性分子がイオン結合した核酸試料と
ペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成させ、次い
で、核酸試料検出用具の電極に電位を印加し、該検出用
具の電極と外部電極との間をカチオン性分子の導電性基
を介して流れる電流を測定することを特徴とするペプチ
ド核酸に相補性を有する核酸試料の検出方法。 - 【請求項11】 電極、該電極表面に共有結合により固
定された一群のペプチド核酸、そして該一群のペプチド
核酸のそれぞれを互いに電極表面と平行な平面に沿って
空間的に分離する配置にて電極表面に固定された一群の
スペーサ基からなる核酸試料検出用具。 - 【請求項12】 ペプチド核酸と電極との共有結合が、
ペプチド核酸に導入された活性水素含有基と電極表面に
導入されたビニルスルホニル基もしくはその反応性前駆
体基を含む反応性基との反応により形成されている、請
求項11に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項13】 電極表面に導入された反応性基が、下
記の式により表わされるものである、請求項12に記載
の核酸試料検出用具: 【化2】−L−SO2−X [上記の式において、Xは、−CR1=CR2R3または
−CHR1−CR2R3Yを表わし;R1、R2及びR3は、
互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6のアル
キル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ばれる
原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン原子、−OS
O2R11、−OCOR12、−OSO3M、及び四級ピリジ
ニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を表わ
し;R11は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素
原子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数が1
乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至2
6のアラルキル基からなる群より選ばれる基を表わし;
R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基および炭素
原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基からなる群よ
り選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、アルカリ金属
原子およびアンモニウム基からなる群より選ばれる原子
もしくは基を表わし;そして、Lは連結基を表わす]。 - 【請求項14】 Xが、−CH=CH2で表わされるビ
ニル基である、請求項13に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項15】 スペーサ基が電荷を有していない、請
求項11に記載の核酸試料検出用具。 - 【請求項16】 スペーサ基の電極に固定されている側
とは反対側の末端が疎水性基である、請求項11に記載
の核酸試料検出用具。 - 【請求項17】 電極表面に固定された一群のペプチド
核酸と一群のスペーサ基とのモル比が1:1乃至1:2
00の範囲にある、請求項11に記載の核酸試料検出用
具。 - 【請求項18】 導電性基を有する縫い込み型インター
カレータ及び水性媒体の存在下、核酸試料を請求項11
に記載のペプチド核酸が固定された核酸試料検出用具に
接触させることにより、該インターカレータが挿入され
た核酸試料とペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形
成させ、次いで、核酸試料検出用具の電極に電位を印加
し、該検出用具の電極と外部電極との間をインターカレ
ータの導電性基を介して流れる電流を測定することを特
徴とするペプチド核酸に相補性を有する核酸試料の検出
方法。 - 【請求項19】 導電性基を有するカチオン性分子及び
水性媒体の存在下、核酸試料を請求項11に記載のペプ
チド核酸が固定された核酸試料検出用具に接触させるこ
とにより、該カチオン性分子がイオン結合した核酸試料
とペプチド核酸とのハイブリッド複合体を形成させ、次
いで、核酸試料検出用具の電極に電位を印加し、該検出
用具の電極と外部電極との間をカチオン性分子の導電性
基を介して流れる電流を測定することを特徴とするペプ
チド核酸に相補性を有する核酸試料の検出方法。 - 【請求項20】 電極の表面に、一群のビニルスルホニ
ル基もしくはその反応性前駆体基がそれぞれ連結基を介
して共有結合により固定されてなる反応性電極。 - 【請求項21】 ビニルスルホニル基もしくはその反応
性前駆体基と連結基との連結体が下記の式により表わさ
れるものである請求項20に記載の反応性電極: 【化3】−L−SO2−X [上記の式において、Xは、−CR1=CR2R3または
−CHR1−CR2R3Yを表わし;R1、R2及びR3は、
互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6のアル
キル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ばれる
原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン原子、−OS
O2R11、−OCOR12、−OSO3M、及び四級ピリジ
ニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を表わ
し;R11は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素
原子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数が1
乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至2
6のアラルキル基からなる群より選ばれる基を表わし;
R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基および炭素
原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基からなる群よ
り選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、アルカリ金属
原子およびアンモニウム基からなる群より選ばれる原子
もしくは基を表わし;そして、Lは連結基を表わす]。 - 【請求項22】 Xが、−CH=CH2で表わされるビ
ニル基である請求項21に記載の反応性電極。 - 【請求項23】 Lが、−NH−、−S−、および−O
−からなる群から選ばれる連結部位を有する連結基であ
る請求項21に記載の反応性電極。 - 【請求項24】 Lが、−(L1)n−NHCH2CH2−
[但し、L1は連結基を表わし、そしてnは0もしくは
1である]で表わされる連結基である請求項21に記載
の反応性電極。 - 【請求項25】 電極が金から形成されている、請求項
20に記載の反応性電極。 - 【請求項26】 電極の表面に一群のビニルスルホニル
基もしくはその反応性前駆体基がそれぞれ連結基を介し
て共有結合により固定され、さらに該一群のビニルスル
ホニル基もしくはその反応性前駆体基を互いに電極表面
と平行な平面に沿って空間的に分離する配置にて電極表
面に固定された一群のスペーサ基からなる反応性電極。 - 【請求項27】 ビニルスルホニル基もしくはその反応
性前駆体基と連結基との連結体が下記の式により表わさ
れるものである請求項26に記載の反応性電極: 【化4】−L−SO2−X [上記の式において、Xは、−CR1=CR2R3または
−CHR1−CR2R3Yを表わし;R1、R2及びR3は、
互いに独立に、水素原子、炭素原子数が1乃至6のアル
キル基、炭素原子数が6乃至20のアリール基、及び炭
素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子
数が7乃至26のアラルキル基からなる群より選ばれる
原子もしくは基を表わし;Yは、ハロゲン原子、−OS
O2R11、−OCOR12、−OSO3M、及び四級ピリジ
ニウム基からなる群より選ばれる原子もしくは基を表わ
し;R11は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素
原子数が6乃至20のアリール基、及び炭素原子数が1
乃至6のアルキル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至2
6のアラルキル基からなる群より選ばれる基を表わし;
R12は、炭素原子数が1乃至6のアルキル基および炭素
原子数が1乃至6のハロゲン化アルキル基からなる群よ
り選ばれる基を表わし;Mは、水素原子、アルカリ金属
原子およびアンモニウム基からなる群より選ばれる原子
もしくは基を表わし;そして、Lは連結基を表わす]。 - 【請求項28】 Xが、−CH=CH2で表わされるビ
ニル基である請求項27に記載の反応性電極。 - 【請求項29】 スペーサ基が電荷を有していない、請
求項26に記載の反応性電極。 - 【請求項30】 スペーサ基の電極に固定されている側
とは反対側の末端が疎水性基である、請求項26に記載
の反応性電極。 - 【請求項31】 電極表面に固定された一群のペプチド
核酸と一群のスペーサ基とのモル比が1:1乃至1:2
00の範囲にある、請求項26に記載の反応性。 - 【請求項32】 電極が金から形成されている、請求項
26に記載の反応性電極。 - 【請求項33】 表面に反応性基が導入された電極に、
下記式: 【化5】X1−SO2−L2−SO2−X2 [上記の式において、X1およびX2は互いに独立に、−
CR1=CR2R3、または−CHR1−CR2R3Yを表わ
し;R1、R2及びR3は、互いに独立に、水素原子、炭
素原子数が1乃至6のアルキル基、炭素原子数が6乃至
20のアリール基、及び炭素原子数が1乃至6のアルキ
ル鎖を有する合計炭素原子数が7乃至26のアラルキル
基からなる群より選ばれる原子もしくは基を表わし;Y
は、ハロゲン原子、−OSO2R11、−OCOR12、−
OSO3M、及び四級ピリジニウム基からなる群より選
ばれる原子もしくは基を表わし;R11は、炭素原子数が
1乃至6のアルキル基、炭素原子数が6乃至20のアリ
ール基、及び炭素原子数が1乃至6のアルキル鎖を有す
る合計炭素原子数が7乃至26のアラルキル基からなる
群より選ばれる基を表わし;R12は、炭素原子数が1乃
至6のアルキル基および炭素原子数が1乃至6のハロゲ
ン化アルキル基からなる群より選ばれる基を表わし;M
は、水素原子、アルカリ金属原子およびアンモニウム基
からなる群より選ばれる原子もしくは基を表わし;そし
て、L2は連結基を表わす]で表わされるジスルホン化
合物を接触させることを特徴とする反応性電極の製造方
法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2001134685A JP2002017352A (ja) | 2000-04-28 | 2001-05-01 | 核酸試料検出用具及び電気化学的検出方法 |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2000-130090 | 2000-04-28 | ||
| JP2000130090 | 2000-04-28 | ||
| JP2001134685A JP2002017352A (ja) | 2000-04-28 | 2001-05-01 | 核酸試料検出用具及び電気化学的検出方法 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2002017352A true JP2002017352A (ja) | 2002-01-22 |
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|---|---|---|---|
| JP2001134685A Withdrawn JP2002017352A (ja) | 2000-04-28 | 2001-05-01 | 核酸試料検出用具及び電気化学的検出方法 |
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|---|---|
| JP (1) | JP2002017352A (ja) |
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-
2001
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