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JP2000166578A - D―パントテン酸の製造方法及びE.coli属の微生物 - Google Patents

D―パントテン酸の製造方法及びE.coli属の微生物

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Publication number
JP2000166578A
JP2000166578A JP11340841A JP34084199A JP2000166578A JP 2000166578 A JP2000166578 A JP 2000166578A JP 11340841 A JP11340841 A JP 11340841A JP 34084199 A JP34084199 A JP 34084199A JP 2000166578 A JP2000166578 A JP 2000166578A
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JP
Japan
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microorganism
gene
pantothenic acid
sequence
pand
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JP11340841A
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English (en)
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Mechthild Dr Rieping
リーピング メヒトヒルト
Georg Thierbach
ティールバッハ ゲオルク
Walter Dr Pfefferle
プフェッファーレ ヴァルター
Dusch Nicole
ドゥッシュ ニコーレ
Joern Kalinowski
カリノヴスキー イェルン
Alfred Puehler
ピューラー アルフレート
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Evonik Operations GmbH
Original Assignee
Degussa GmbH
Degussa Huels AG
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Publication date
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
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    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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Abstract

(57)【要約】 【課題】 腸内細菌科のパントテン酸−形成−株をさら
に改善すること 【解決手段】 腸内細菌類のD−パントテン酸を産生す
る微生物の発酵によりD−パントテン酸を製造する方法
において、 a) プラスミドpFV31及び/又はpFV202を
含有する株を使用し、この微生物中で、 b) panD−遺伝子及び場合によりさらにアスパル
テート−1−デカルボキシラーゼをコードするヌクレオ
チド配列を強化、特に過剰発現し、 c) パントテン酸を培地中又は微生物の細胞中に富化
させ、及び d) 生じたパントテン酸を分離する、 ことを特徴とする、D−パントテン酸の製造方法。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】パントテン酸は化粧品、医薬
品、栄養食品及び動物飼料中に使用される商業的に重要
なビタミンである。
【0002】
【従来の技術】パントテン酸は化学合成又は適当な培養
液中での適当な微生物の発酵により生物工学的に製造す
ることができる。化学合成の場合にはDL−パントラク
トンが重要な中間体である。これはホルムアルデヒド、
イソブチルアルデヒド及びシアニドから多工程法で製造
される。他の方法工程においてラセミ混合物を分離し、
D−パントラクトンをβ−アラニンで縮合し、D−パン
トテン酸が得られる。
【0003】微生物による発酵製造の利点は、L−パン
トテン酸不含のパントテン酸の所望のD−形の直接形成
にある。
【0004】バクテリア、例えばEscherichi
a coli、Arthrobacter ureaf
aciens、Corynebacterium er
ythrogenes、Brevibacterium
ammoniagenes及び酵母、例えばDeba
romyces castelliiの多様な種類は、
欧州特許出願公開第0493060号明細書に示された
ように、グルコース、DL−パントイン酸及びβ−アラ
ニンを含有する培養液中でD−パントテン酸を産生する
ことができる。欧州特許出願公開第0493060号明
細書は、さらに、Escherichia coliに
おいて、プラスミドpFV3及びpFV5上に含まれる
パントテン酸−生合成遺伝子の増幅により、グルコー
ス、DL−パントイン酸及びβ−アラニンを含有する培
養液中で、D−パントテン酸の生成が改善されることが
示されている。
【0005】欧州特許出願公開第0590857号明細
書及び米国特許5518906号明細書は、Esche
richia coli株IFO3547から誘導され
た突然変異種、例えばFV5714、FV525、FV
814、FV521、FV221、FV6051及びF
V5069を記載しており、これらは多様な代謝拮抗
物、例えばサリチル酸、α−ケト酪酸、β−ヒドロキシ
アスパラギン酸、O−メチルトレオニン及びα−ケトイ
ソ吉草酸に対して耐性を有し、グルコース含有培養液中
でパントイン酸を及びグルコース及びβ−アラニンを含
有する培養液中でD−パントテン酸を産生する。
【0006】欧州特許出願公開0590857号明細書
中では、さらに、プラスミドpFV31上に含まれる正
確には特定されていないパントテン酸−生合成遺伝子の
増幅により、上記の株中で、グルコース含有培養液中で
D−パントイン酸の産生が、及びグルコース及びβ−ア
ラニンを含有する培養液中でD−パントテン酸の産生が
改善されることが示されている。
【0007】WO97/10340中では、さらに、プ
ラスミドpFV202を用いた、バリン生合成の酵素、
ilvGM−遺伝子の増幅による酵素アセトヒドロキシ
酸−シンターゼIIの活性の向上により、グルコース含
有培養液中でD−パントテン酸の産生を、及びグルコー
ス及びβ−アラニンを含有する培養液中でD−パントテ
ン酸の産生を改善する。
【0008】前記の文献からは、前記の株が単にグルコ
ース又は単にサッカロースを基質として含有する培養液
中でパントテン酸をどの程度まで産生するかは推知でき
ない。
【0009】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、腸内細菌科
の、特にEscherichia属のパントテン酸−形
成−株をさらに改善するという課題が生じた。
【0010】
【課題を解決するための手段】ビタミンのパントテン酸
は、化粧品、医薬品、栄養食品及び動物飼料中に使用さ
れる商業的に重要な生成物である。従って、パントテン
酸の改善された製造方法を提供するという一般的興味が
生じる。
【0011】以後、D−パントテン酸又はパントテン酸
又はパントテネートに言及する場合、遊離酸だけでなく
D−パントテン酸の塩、例えばカルシウム塩、ナトリウ
ム塩、アンモニウム塩又はカリウム塩を意味するものと
する。
【0012】本発明の対象は、腸内細菌科、特にEsc
herichia属のD−パントテン酸産生微生物の発
酵によりD−パントテン酸を製造する方法において、こ
の微生物が a) プラスミド、pFV31及び/又はpFV20
2、特にpFV31を含有し、その微生物中で、 b) panD−遺伝子及び場合によりさらにアスパル
テート−1−デカルボキシラーゼ(E.C. 4.1.
1.11)をコードするヌクレオチド配列を強化、有利
に過剰発現させることを特徴とする。
【0013】ヌクレオチド配列が、特にコリネ型バクテ
リアのE.coliから由来するpanDをコードする
DNAを有する微生物を使用するのが有利である。有利
に複製可能なDNAは、(i) 配列番号1で示され
た、panDをコードするヌクレオチド配列、又は(i
i) 遺伝子コードの同義性(Degeneration)の範囲内
で配列(i)に相当する配列、又は(iii) 配列
(i)又は(ii)に対する相補的配列とハイブリダイ
ズする配列、及び場合により(iiii) (i)にお
いて機能的に中立なセンス突然変異(sense mutations;
Sinnmutationen)により特徴付けられる。
【0014】この発酵は、有利にもっぱらグルコース又
はサッカロースを基質として含有し、かつβ−アラニン
及びパントイン酸は含有しない培養液中で行われる。
【0015】パントテン酸の産生は本発明により改善さ
れる。アスパルテート、β−アラニン、ケトイソバレレ
ート、ケトパントイン酸又はパントイン酸及び/又はこ
れらの塩の添加は場合により望ましい。
【0016】「強化」の概念は、本願明細書において、
例えば遺伝子のコピー数を高めるか、強いプロモータを
使用するか又は高い活性を有する相当する酵素をコード
する遺伝子を使用することにより、及び場合によりこれ
らの手法を組み合わせることにより、微生物中で相当す
るDNAによりコードされる1種以上の酵素の細胞内活
性を高めることを意味する。
【0017】本発明の対象である微生物は、グルコー
ス、サッカロース、ラクトース、フルクトース、マルト
ース、糖蜜、デンプン、セルロースから又はグリセリン
とエタノールとからパントテン酸を製造できる。有利に
グルコース又はサッカロースが使用される。特にこれは
グラム陰性バクテリア、例えば腸内細菌科である。腸内
細菌科において、特にEscherichia col
iの種類のEscherichia属が挙げられる。こ
の種のEscherichia coliの中で、いわ
ゆるK−12株、例えばMG1655又はW3110
(Neidhard et al.:Escherichia coli and Salmonella.
Cellular and Molecular Biology (ASM Press, Washin
gton D.C.))又はEscherichia coli野
生型IFO3547(Institut fuer Fermentation, Os
aka, Japan)及びこれらから誘導された突然変異種が挙
げられ、これらはパントテン酸を産生する能力を有す
る。この場合、特に株3547/pFV31、5714
/pFV31、525/pFV31、814/pFV3
1、521/pFV31、FV221/pFV31、F
V6051/pFV31、FV5069/pFV31、
FV5069/pFV202及び通常の突然変異誘発、
例えば代謝拮抗物質耐性、例えばアジドチミジン耐性、
チアイソロイシン耐性による選択、及びスクリーニング
により得られたものが挙げられる。特に、株FV506
9/pFV31及びFV5069/pFV202が適し
ており、これらはブタペスト条約によりFERM BP
4395及びFERM BP 5227として寄託さ
れている(EP−A−0590857及び97/103
40参照)。
【0018】強化、特に過剰発現の達成のために、例え
ば相応する遺伝子のコピー数を高めるか、又は構造遺伝
子の上流に存在するプロモーター部位及びレギュレーシ
ョン部位を突然変異させる。同様に、構造遺伝子の上流
に組み込まれた発現カセットが作用する。誘導可能なプ
ロモーターにより、付加的に発酵によるD−パントテネ
ート形成の過程において発現を向上させることができ
る。m−RNAの寿命を延長させる手段によっても同様
に発現を改善できる。さらに酵素タンパク質の分解を阻
害することによっても同様に酵素活性が強化される。遺
伝子又は遺伝子構造体は異なるコピー数を有するプラス
ミド中に存在するか又は染色体中に組み込まれ、増幅さ
せることができる。また、さらに該当する遺伝子の過剰
発現は、培地組成の変更及び培養操作の変更により達成
することができる。
【0019】これについての手引は、当業者には特にCh
ang and Cohen (Journal of Bacteriology 134:1141-11
56 (1978)), Hartley and Gregori (Gene 13:347-353
(1981)), Amann and Brosius (Gene 40:183-190 (198
5)), Broer et al. (Proceedings of the National of
Sciences of the United States of America 80:21-25
(1983)), LaVallie et al. (BIO/TECHNOLOGY 11, 187-1
93 (1993)), PCT/US97/13359, Llosa et al. (Plasmid
26:222-224 (1991)), Quandt and Klipp (Gene 80:161-
169 (1989)), Hamilton (Journal of Bacteriology 17
1:4617-4622 (1989), Jensen and Hammer (Biotechnolo
gy and Bioengineering 58, 191-195 (1998)及び遺伝学
及び分子生物学の公知の教書に見ることができる。
【0020】E.coliのpanD−遺伝子は公知で
ある。このヌクレオチド配列は Merkels and Nichols
(FEMS Microbiology Letters 143, 247-252 (1996))に
公開されている。E.coliのpanD−遺伝子の単
離もしくは製造のために、一般的に公知のPCR(ポリ
メラーゼ連結反応)法又は以下に記載する方法を使用す
ることができる。
【0021】C.glutamicumのpanD−遺
伝子の単離のために、まずE.coli中の微生物の遺
伝子ライブラリーを作成する。遺伝子ライブラリーの作
成は一般に公知の教書及びハンドブックにおいて記載さ
れている。例として、Winnackerの教書:Gene und Klon
e, Eine Einfuehrung in die Gentechnologie (Verlag
Chemie, Weinheim, Deutschland, 1990)又はSambrook e
t al.の教書:Molecular Cloning, A Laboratory Manua
l (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)が挙
げられる。公知の遺伝子ライブラリーは、Kohara et a
l. (Cell 50, 495-508 (1987))によるλ−ベクター中に
作成されたE.coli K−12株W3110の遺伝
子ライブラリーである。Bathe et al. (Molecular and
General Genetics, 252:255-265, 1996)はC.glut
amicum ATCC13032の遺伝子ライブラリ
を記載しており、この遺伝子ライブラリーはコスミドベ
クターSuperCos I(Wahl et al., 1987, 84:2
160-2164)を用いてE.coli株K−12 NM55
4(Raleigh et al., 1988, Nucleic Acids Research1
6:1563-1575)中で作成された。E.coli中のC.
glutamicumの遺伝子ライブラリーの製造は、
pBR322(Bolivar, Life Sciences, 25,807-818
(1979))又はpUC9(Vieria et al., 1982, Gene, 1
9:259-268)のようなプラスミドも使用することができ
る。宿主として特に制限欠失(restriktionsdefekt)及
び組換え欠失(rekombinationsdefekt)であるような
E.coli株が適している。これについての例は、Gr
ant et al. (Proceedings of the National Academy of
Sciences USA, 87 (1990) 4645-4649)に記載されてた
株DH5αMCRである。この遺伝子ライブラリーは引
き続き指示株中へ形質転換(Hanahan, Journal of Mole
cular Biology 166, 577-580, 1983)又はエレクトロポ
レーション(Tauch et. al., 1994, FEMS Microbiologi
cal Letters, 123:343-347)によって導入することがで
きる。この指示株は、検出可能な表現型、例えば栄養要
求性を生じさせる重要な遺伝子中に突然変異を有するこ
とにおいて優れている。本発明の範囲内で、panD遺
伝子中に突然変異を有するE.coli突然変異体DV
9(Vallari and Rock, Journal of Bacteriology 198
5, 164:136-142)が特に重要である。指示株、例えばp
anD−突然変異体DV9を、重要な遺伝子、例えばp
anD−遺伝子を有する組換えプラスミドで形質転換
し、それを発現させた後で、この指示株は相応する特
性、例えばパントテン酸−要求性に関して原栄養体とな
る。
【0022】このように単離された遺伝子もしくはDN
A−フラグメントは、例えばSangeret al. (Proceeding
s of the National of Sciences of the United States
ofAmerica USA, 74:5463-5467, 1977)に記載されたよ
うに配列決定により特性決定されることができる。
【0023】このようにC.glutamicumの遺
伝子panDをコードする新規のDNA−配列が得ら
れ、この配列は配列番号1として本発明の構成要素であ
る。さらに、本発明のDNA−配列から上記記載の方法
を用いて相応する酵素のアミノ酸配列が誘導された。配
列番号2中ではpanD−遺伝子産物の得られたアミノ
酸配列、つまりL−アスパルテート−1−デカルボキシ
ラーゼが示されている。
【0024】配列番号1から遺伝子コードの同義性(De
generiertheit)により生じたコードするDNA−配列
も同様に本発明の構成要素である。同様に、配列番号1
とハイブリダイズするDNA−配列も本発明の構成要素
である。この専門分野において、さらにタンパク質中で
の同類アミノ酸置換(konservative Aminosaeureaustau
sch)、例えばグリシンのアラニンによる置換又はアス
パラギン酸のグルタミン酸による置換は「センス突然変
異」(sense mutations; Sinnmutationen)として公知
であり、このセンス突然変異はタンパク質の活性の根本
的な変更を引き起こさない、つまり機能的に中立であ
る。さらに、タンパク質のN−及び/又はC−末端での
変更はその機能に本質的に影響を及ぼさないか、それど
ころか安定化することもできることは公知である。
【0025】これについての情報は、当業者は特にBen-
Bassat et al. (Journal of Bacteriology 169:751-757
(1987)), O'Regan et al. (Gene 77:237-251 (1989)),
Sahin-Toth et al. (Protein Sciences 3:240-247 (19
88)) 及び遺伝学及び分子生物学の公知の教書に見るこ
とができる。
【0026】このように単離されかつ特性決定された遺
伝子は、引き続き個々に又は場合により他のものと組み
合わせてEscherichia coliの適当な株
中で発現させることができる。遺伝子を発現させるも特
は過剰発現させる公知の方法は、さらに発現シグナルを
設置することができるプラスミドベクターを用いて増幅
することである。プラスミドベクターとして、相応する
微生物中で増幅可能なものが挙げられる。E.coli
用に例えばベクターpSC101(Vocke andBastia, P
roceedings of the National Academy of Sciences USA
80 (21), 6557-6561 (1983))又はpKK223−3
(Brosius and Holy, Proceedings of the National Ac
ademy of Sciences USA 81, 6929 (1984))又はCor
ynebacterium glutamicum/E
scherichia coliシャトルベクターpZ
8−1(欧州特許第0375889号明細書)が本発明
のために挙げられる。E.coliのこの種の株の例
は、FV5069/pFV31/pND−D1及びFV
5069/pFV31/pND−D2であり、これらは
プラスミドpND−D1及びpND−D2を含有する。
プラスミドpND−D1はプラスミドpZ8−1ベース
のE.coli−C.glutamicumシャトルベ
クターであり、このシャトルベクターはE.coliの
panD−遺伝子を有する。プラスミドpND−D2は
プラスミドpZ8−1ベースのE.coli−C.gl
utamicumシャトルベクターであり、このシャト
ルベクターはC.glutamicumのpanD−遺
伝子を有する。
【0027】染色体突然変異、代謝物質及び代謝拮抗物
質に対する耐性を引き起こすか又はパントテン酸の前駆
体の流出を阻止する染色体突然変異は、個々に又は一緒
に、本発明の対象である手段を用いて有利に組み合わせ
ることができることは当業者には明らかである。
【0028】本発明により製造された微生物は、連続的
に又は不連続的に、バッチ法(Satzkultivierung)又は
フィードバッチ法(fed batch; Zulaufverfahren)又は
繰り返しフィードバッチ法(repeated fed batch;repet
itives Zulaufverfahren)でパントテン酸−産生の目的
で培養することができる。公知の培養法に関する概要は
Chmiel (Bioprozesstechnik 1. Einfuehrung in die Bi
overfahrenstechnik (Gustav Fischer Verlag, Stuttga
rt, 1991))の教書又はStorhas (Bioreaktorenund perip
here Einrichtungen (Vieweg Verlag, Braunschweig/Wi
esbaden, 1994))の教書に記載されている。
【0029】使用すべき培養基は適当な手法でそれぞれ
の微生物の要求を満たさなければならない。多様な微生
物の培養基の記載は、ハンドブック"Manual of Methods
forGeneral Bacteriology", American Society for Ba
cteriology (Washington D.C., USA, 1981)になされて
いる。炭素源として、糖及び炭水化物、例えばグルコー
ス、サッカロース、ラクトース、フルクトース、マルト
ース、糖蜜、デンプン及びセルロース、油及び脂肪、例
えば大豆油、ヒマワリ油、落花生油及びココナッツ脂
肪、脂肪酸、例えばパルミチン酸、ステアリン酸及びリ
ノール酸、アルコール、例えばグリセリン及びエタノー
ル及び有機酸、例えば酢酸が使用される。この材料は単
独で又は混合物として使用することができる。窒素源と
して、有機窒素含有化合物、例えばペプトン、酵母抽出
物、肉抽出物、麦芽抽出物、トウモロコシ膨潤水、ダイ
ズ粉及び尿素又は無機化合物、硫酸アンモニウム、塩化
アンモニウム、リン酸アンモニウム、炭酸アンモニウム
及び硝酸アンモニウムが使用される。この窒素源は個々
に又は混合物として使用することができる。リン源とし
て、リン酸、リン酸二水素カリウム又はリン酸水素二カ
リウム又は相応するナトリウム含有塩を使用することが
できる。この培養基は、さらに成長に必要な金属塩、例
えば硫酸マグネシウム又は硫酸鉄を含有しなければなら
ない。最後に、必須の成長物質、例えばアミノ酸及びビ
タミンを前記の物質に対して付加的に使用することがで
きる。この培養基に所望の場合にさらにパントテン酸の
前駆体、例えばアスパルテート、β−アラニン、ケトイ
ソバレレート又はケトパントイン酸又はパントイン酸及
び場合によりこれらの塩を添加することができる。前記
の添加物質は培養へ1回のバッチの形で添加するか、又
は適当な手法で培養の間に供給することができる。
【0030】培地のpH−コントロールのために、塩基
性化合物、例えば水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、
アンモニア、又は酸性化合物、例えばリン酸又は硫酸が
適当な手法で使用される。泡形成を制御するために、消
泡剤、例えば脂肪酸ポリグリコールエステルを使用する
ことができる。プラスミドの安定を維持するために、培
地に適当な選択作用する物質、例えば抗生物質を添加す
ることができる。好気性条件を維持するために、酸素又
は酸素含有ガス混合物、例えば空気を培地中へ導入す
る。培地の温度は通常25℃〜45℃、有利に30℃〜
37℃である。パントテン酸の最大量が生成されるまで
培養は継続される。この目的は通常10時間〜160時
間の間に達成される。
【0031】酵素L−アスパルテート 1−デカルボキ
シラーゼの高い活性を有する株は、L−アスパルテート
からβ−アラニンを製造するために使用できることは当
業者には明らかである。このため、公知の発酵による方
法、酵素による変換反応又はこの両方の組合せが使用さ
れる。
【0032】生成されたパントテン酸の濃度は、公知の
方法(Velisek; Chromatographic Science 60, 515-560
(1992))で測定することができる。
【0033】次の微生物をブタペスト条約に従ってDeut
sche Sammlung fuer Mikrorganismen und Zellkulturen
(DSMZ, Braunschweig, Deutschland)に寄託した:Co
rynebacterium glutamicum
ATCC13032/pND−D2をDSM12438
として。
【0034】
【実施例】本発明を次に実施例につき詳説する。
【0035】例1 C.glutamicumのpanD−遺伝子のクロー
ニング及び配列決定 1. panD−遺伝子のクローニング C.glutamicum ATCC 13032から
の染色体DNAを、Tauch et al. (1995, Plasmid, 33:
168-179)に記載されたように単離し、制限酵素Sau3
A(Pharmacia Biotech (Freiburg, Deutschland),製品
表示Sau3A、Code no. 27-0913-02)を用いて部分
的に分解した。7〜9kbのサイズ領域のDNA−フラ
グメントを"Nucleotrap Extraction Kit for Nucleic A
cids" (Machery und Nagel, Duersen, Deutschland; Ca
t. No. 740584)を用いて単離し、MBI Fermentas社(Vil
nius, Litauen)のベクターpUC19(Norrander et
al., 1982, Gene, 26:101-106)の脱リン酸化されたB
amHI−切断部位へ連結した。この連結はSambrook e
t al. (1989, Molecular Cloning: A laboratory Manua
l, Cold Spring Harbor)に記載されたように実施し、そ
の際、DNA−混合物はT4−リガーゼ(Pharmacia Bi
otech, Freiburg, Deutschland)と一緒に一晩中インキ
ュベートした。この連結混合物を引き続きE.coli
株DH5αMCR(Grant, 1990, Proceedings of the
National Acadimies of Sciences USA, 87:4645-4649)
中へエレクトロポレーション(Tauch, 1994, FEMS Micr
obiological Letters, 123:343-347)し、LB−寒天
(Lennox, 1955, Virology, 1:190)+アンピシリン1
00μg/ml上で平板培養した。37℃で24時間の
インキュベーションの後に、C.glutamicum
遺伝子ライブラリーを、"Alkalischen-Lyse-Methode" B
irnboim and Doly (Nucleic Acids Research, 7:1513-1
523, 1997)によるプラスミド−DNAの再単離によって
形質転換体から得た。この遺伝子ライブラリーを用い
て、panD−遺伝子中に突然変異を有するE.col
i株DV9(Vallari and Rock, 1985, Journal of Bac
teriology, 164:136-142)のコンピテント細胞をエレク
トロポレーションした。このエレクトロポレーション処
理物を再生期間(Tauch et al., 1994, FEMS Microbiol
ogical Letters, 123: 343-347)に引き続き培地E(Vo
gel and Bonner, 1956, Journalof Biological Chemist
ry, 218:97-106)を用いて2回培養した。培地Eの組成
を表1に示した。この細胞を250mlのエルレンマイ
ヤーフラスコ中に装入した培地E 50ml+アンピシ
リン100μg/mlに接種し、エアシェーカー中で2
50rpmで39℃でインキュベーションした。2日間
のインキュベーションの後に、バクテリア懸濁液を希釈
し、アンピシリン100μg/mlを補充したLB−寒
天(Lennox, 1955, Virology, 1:190)上に塗り付け
た。
【0036】
【表1】
【0037】DV9−形質転換体のプラスミド−DNA
を単離し、これをpNIC−1.3とし、アガロースゲ
ル電気泳動(Sambrook et al., Molecular cloning. A
laboratory manual (1989) Cold Spring Harbour Labor
atory Press)及び公知の長さの標準−DNA−フラグ
メントとの比較により特性決定した。プラスミドpNI
C−1.3は7kbpの長さの挿入物を有する。pNI
C−1.3の相補能力をpanD突然変異体DV9の新
たな形質転換により調査した。得られた形質転換体は再
び、β−アラニン不含培地E中で上記の条件下で成長す
ることができた。
【0038】7kbのインサートのサブクローニング
は、プラスミドpNIC−1.3を制限酵素BamHI
(Pharmacia Biotech (Freiburg, Deutschland),製品表
示BamHI、Code no. 27-0868-03)、EcoRI(P
harmacia Biotech (Freiburg,Deutschland),製品表示E
coRI、Code no. 27-0884-03)及びBglII(Pha
rmacia Biotech (Freiburg, Deutschland),製品表示B
glII、Code no. 27-0946-02)を用いて分解し及び
引き続き相応して制限消化したベクターpK18mob
(Schaefer, 1994, Gene, 145:69-73)中へ連結した。
得られた連結物をE.coli panD突然変異体D
V9中へエレクトロポレーションし;相補的形質転換体
に関して上記のように選択を行った(この場合、寒天プ
レートはカナマイシン50μg/mlを含有)。相補的
な単一クローンのプラスミドを単離し、制限分析により
特性決定した。約3kbのサイズのDNA−インサート
を有するEcoRI−サブクローン(以後pNIC−1
0とする)を次の配列分析のために選択した。
【0039】2. panD−遺伝子の配列決定 pNIC−10の3kb断片の二本鎖の配列決定のため
に、この断片を多様な制限酵素で分解し、この断片をプ
ラスミドpUC19又はpK18mob中へサブクロー
ニングした。配列決定のために使用したプラスミド−D
NAは、"QIAGEN Plasmid Mini kit" (Qiagen, Inc., C
hatsworth, Ca., USA)を用いて製造元の指示により単離
し、プラスミドサイズの決定をアガロースゲル電気泳動
を用いて実施した。
【0040】配列決定は、Zimmermann et al. (Nucleic
Acids Research, 18:1067, 1990)により改良したSange
r et al. (Proceedings of the National Academies of
Sciences USA, 74:5463-5467, 1977)のジデオキシ−鎖
中断−法により行った。Pharmacia (Product No. 27-26
90-02, Freiburg, Germany)の"Cy5-AutoRead Sequencin
g kit"を使用した。ゲル電気泳動による分離及び配列反
応の分析を、Amersham Pharmacia Biotech (Uppsala, S
chweden)社の"automatischen Laser-Fluoreszenz (A.L.
F.) Express DNA Sequenziergeraet"を備えた"Long Ran
ger Gel Solution"-Polyacrylamidgel (FMC BioProduct
s, Rockland, Me., USA)中で行った。得られた粗−配列
データを引き続きStaden-Programpakets(Nucleic Acid
s Research, 14:217-231, 1986)Version 97-0を使用し
て処理した。pNIC−10サブクローンの全体の単一
配列は関連する3060bpの長さのContigに組
み立て、これをContig13とした。全体のDNA
−フラグメントのプログラム XNIP (Staden, 1986, Nuc
leic Acids Research, 14:217-231)を用いたコンピュー
タによるコード領域分析は5つのオープンリードフレー
ム(ORFs)の同定が明らかになった。図1におい
て、Conting13の制限マップ及びorf−1〜
orf−5として示されるORFsの長さが示されてい
る。相同性分析は、"National Library of Medicine"
(Bethesda, MD, USA)のNCBI−サービスのオンライ
ンサービスを介して供給された"BLAST search program
s" (Gishand States, 1993, Nature of Genetics, 3:26
6-272; Altschul et al., 1990,Journal of Molecular
Biology, 215:403-410)を用いて実施した。Conti
g13の分析によりorf−3がpanD−遺伝子であ
ることを明らかになった。以後、orf−3をpanD
とした。panD−遺伝子を有するDNA−フラグメン
トのヌクレオチド配列を配列番号1として記載した。上
記方法で生じたpanD−遺伝子産物のアミノ酸配列を
配列番号2として記載した。
【0041】例2 panD−遺伝子の発現のためのベクターの構成 パントテネート生合成−遺伝子であるC.glutam
icumからのpanD及びE.coliからのpan
Dをポリメラーゼ連結反応(PCR)並びに合成オリゴ
ヌクレオチドの適用下に増幅した。PCR−実験はGibc
o-BRL (Eggestein, Deutschland社)のTaq DNA
ポリメラーゼを用いて"PCT-100 Thermocycler" (MJ Res
earch Inc., Watertown, Mass., USA)中で実施した。9
4℃で2分間の1回の変性工程に続き94℃で90秒の
変性工程、T=(2AT+4GC)−5℃(Suggs, et
al., 1981, p. 638-693, In: D.D. Brown, and C.F. Fo
x(eds.), Developmental biology using purified gene
s. Academic Press, NewYork, USA)のプライマー依存
性温度で90秒のアニーリング工程並びに72℃で90
秒間の延長工程を続けた。後の3工程を35回のサイク
ルで繰り返し、この反応は72℃で10分の最後の延長
工程で完了した。こうして増幅した産物を、アガロース
ゲル中で電気泳動により試験した後、製造元の指示に応
じて、ベクターpCR(R) 2.1(Original TA Cloni
ng Kit, Invitrogene (Leek, Niederlande),製品表示Or
iginal TA Cloning (R) Kit, Cat. no. KNM2030-01)中
に連結し、引き続きE.coli株TOP10F′中へ
形質転換した。形質転換体に関する選択は、アンピシリ
ン100μg/ml及びX−Gal(5−ブロモ−4−
クロロ−3−インドリル−β−D−ガラクトシド)40
μg/mlを有するLB−寒天プレート上で24時間3
7℃でインキュベーションすることによって行った。
【0042】このパントテネート生合成−遺伝子のC.
glutamicum ATCC13032(図2)の
panD及びE.coli K12(W.K. Merkel and
B.P. Nichols, 1993, GenBank: L17086)のpanDの
ヌクレオチド配列から出発し、PCR−プライマーを合
成した(MWG Biotech, Ebersberg, Deutschland)。こ
のプライマーは、増幅されたフラグメントが前記遺伝子
並びにそのネガティブなリボソーム−結合部位を有する
が、可能なプロモータ−部位は有していないように選択
された。さらに、目的ベクター中へのクローニングを可
能にするように適当な制限切断部位を挿入した。PCR
−プライマーの配列、挿入された切断部位(下線の配
列)並びに増幅された遺伝子(フラグメントのサイズを
括弧中にbpで記載)を次の表2に記載した。
【0043】
【表2】
【0044】C.glutamicum並びにE.co
li中での発現のための基本ベクターは、図2に示した
E.coli−C.glutamicumシャトル−発
現ベクターpZ8−1(欧州特許第0375889号明
細書)を使用した。予めベクターpCR(R)2.1中に
クローニングされたpanDC.g.増幅物を、プライマー
が挿入された制限切断部位を用いて同様に処理された発
現ベクターpZ8−1中へ連結し、それによりこのプラ
スミド上に含まれるtac−プロモータの制御下におか
れる。この増幅物のpanDE.c.はEcoRI−Bgl
II−フラグメントとしてベクターpZ8−1の適合す
るEcoRI−BamHI−制限末端中へクローニング
された。こうして構成された発現プラスミドについての
それぞれプラスミドの表示を表2に記載した。遺伝子p
anDE.c.及びpanDC.g.についてのクローニングス
トラテジーを図2に示した。発現プラスミドの正確なク
ローニングはそれぞれのインサートの配列決定により調
査された。
【0045】このプラスミドpND−D1及びpND−
D2はE.coli株FV5069/pFV31中に形
質転換され、形質転換体はLB−寒天(Lennox, 1955,
Virology, 1:190)+カナマイシン50μg/ml上で選
択した。得られた株をFV5069/pFV31/pN
D−D1及びFV5069/pFV31/pND−D2
とした。
【0046】例3 E.coli FV5069/pFV31から誘導され
た多様な株によるパントテネートの形成 D−パントテネートの定量的測定は、Lactobac
illus plantarumパントテネート−アッ
セイ(試験株:Lactobacillusplant
arum ATCC 8014,Cat. No. 3211-30-3;
培養基:Bacto Pantotenate Assay Medium (DIFCO Labo
ratories, Michigan, USA), Cat. No.0604-15-3)を用
いて行った。この指示株はパントテネートの存在の場合
にだけ前記の培養基中で成長し、この成長は、測光によ
り測定可能に、培養基のパントテネート濃度に直線的に
依存することが示された。校正のためにパントテネート
のヘミカルシウム塩を使用した(Sigma,製品表示 P
2250)。光学密度はLKB Biochrom Photometer, Pha
rmacia Biotech社(Freiburg, Deutschland)で、580
nmの測定波長(o.D.580)で決定した。
【0047】基質としてグルコース又はサッカロースを
用いたE.coli株FV5069/pFV31/pZ
8−1、FV5069/pFV31/pND−D1及び
FV5069/pFV31/pNDーD2のパントテネ
ート−産生を測定した。グルコース4g/l又はサッカ
ロース4g/lが基質として補充され、株FV5069
/pFV31/pND−D1及びFV5069/pFV
31/pND−D2の場合にカナマイシン50μg/m
lを有する培地Eを試験培地として使用した。500m
lのエルレンマイヤーフラスコ中に装入した試験培地5
0mlを同じ培地の16時間後の培養から出発して、
o.D.580が0.1になる程度に増幅した。この培養
を37℃で250rpmで72時間インキュベーション
した後、この細胞を5000×gで10分間遠心分離す
ることでペレット化した。得られた細胞不含の上澄液を
滅菌濾過し、パントテネート−定量化のために4℃で貯
蔵した。
【0048】培養上澄液のD−パントテネートの定量化
は、L. plantarum ATCC 8014を
用いてDIFCO (DIFCO Manual, 10th Edition, p. 1100-1
102;Michigan, USA)社のハンドブックの記載により行っ
た。この測定結果を表3及び表4に記載した。
【0049】表3 基質としてグルコースを用いたパントテネート−蓄積
【0050】
【表3】
【0051】表4 基質としてサッカロースを用いたパントテネート−蓄積
【0052】
【表4】
【0053】 配列表 (1) 書誌的事項 (i) 出願人 (A)名称:Degussa Aktiengesellschaft (B)番地:Weissfrauenstr. 9 (C)都市:Frankfurt am Main (D)州:Hessen (E)国:Deutschland (F)郵便番号:D-60311 (ii) 発明の名称:D−パントテン酸の製造方法及びE.coli属の微生 物 (iii) 配列の数:2 (iv) コンピュータ記録方式: (A)記録媒体:フロッピーディスク (B)コンピュータ:IBM PC互換 (C)オペレーションシステム:PC-DOS/MS-DOS (D)ソフトウェアー:PatentIn Release #1.0, Version #1.30 (EPA) (2) 配列番号1に関する情報: (i) 配列の特徴 (A)長さ:540塩基対 (B)配列の型:ヌクレオチド (C)鎖の数:二本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii) 配列の種類:ゲノム−DNA (iii) ハイポセティカル:なし (iv) アンチセンス:なし (vi) 起源 (A)生物名:Corynebacterium glutamicum (B)株名:ATCC13032 (ix) 配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:77..484 (D)他の情報:/codon_start=77 /EC_number=4.1.1.11 /product="L−アスパルテート−1−デカルボキシラーゼ" /gene="panD" (xi) 配列番号1:
【0054】
【外1】
【0055】(2) 配列番号2に関する情報: (i) 配列の特徴: (A)長さ:136アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii) 配列の種類:タンパク質 (xi) 配列番号2:
【0056】
【外2】
【図面の簡単な説明】
【図1】orf1〜orf5を有するContig13
のマップを示す図。
【図2】プラスミドpZ8−1のプラスミドマップ及び
プラスミドpND−D1及びpND−D2のクローニン
グストラテジーを示す図。
【符号の説明】
TIT2 rrnB−遺伝子のトランスクリプション−
ターミネータ Ptac tacプロモータ panD panD遺伝子のコード領域 rep−C.g. C.glutamicum中の複製
のためのDNA−領域 oriV−E.c. E.coli中の栄養成長のトラ
ンスファー用の起源 kan カナマイシン耐性 EcoRI 制限酵素EcoRIの切断部位 E 制限酵素EcoRIの切断部位 BamHI 制限酵素BamHIの切断部位 B 制限酵素BamHIの切断部位 BglII 制限酵素BglIIの切断部位 ClaI 制限酵素ClaIの切断部位 H 制限酵素HindIIIの切断部位 P 制限酵素PstIの切断部位 PstI 制限酵素PstIの切断部位 SalI 制限酵素SalIの切断部位 ScaI 制限酵素ScaIの切断部位 SphI 制限酵素SphIの切断部位 X 制限酵素XbaIの切断部位 XhoI 制限酵素XhoIの切断部位
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ゲオルク ティールバッハ ドイツ連邦共和国 ビーレフェルト グン ストシュトラーセ 21 (72)発明者 ヴァルター プフェッファーレ ドイツ連邦共和国 ハレ ヤーンシュトラ ーセ 33 (72)発明者 ニコーレ ドゥッシュ ドイツ連邦共和国 ビーレフェルト アム ポッゲンポール 38 (72)発明者 イェルン カリノヴスキー ドイツ連邦共和国 ビーレフェルト レン バッハシュトラーセ 19 (72)発明者 アルフレート ピューラー ドイツ連邦共和国 ビーレフェルト アム ヴァルトシュレスヒェン 2

Claims (19)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 腸内細菌類のD−パントテン酸を産生す
    る微生物の発酵によりD−パントテン酸を製造する方法
    において、 a) プラスミドpFV31及び/又はpFV202を
    含有する株を使用し、この微生物中で、 b) panD−遺伝子及び場合によりさらにアスパル
    テート−1−デカルボキシラーゼをコードするヌクレオ
    チド配列を強化し、特に過剰発現させ、 c) パントテン酸を培地中又は微生物の細胞中に富化
    させ、及び d) 生じたパントテン酸を分離する、 ことを特徴とする、D−パントテン酸の製造方法。
  2. 【請求項2】 複製可能なDNAを有する微生物を使用
    し、このヌクレオチド配列はコリネバクテリウム由来の
    panDをコードする、請求項1記載の方法。
  3. 【請求項3】 複製可能なDNAが、(i) 配列番号
    1で示された、panDをコードするヌクレオチド配
    列、又は(ii) 遺伝子コードの同義性の範囲内で配
    列(i)に相当する配列、又は(iii) 配列(i)
    又は(ii)に対する相補的配列とハイブリダイズする
    配列、及び場合により(iiii) (i)において機
    能的に中立なセンス突然変異により特徴付けられる、請
    求項2記載の方法。
  4. 【請求項4】 微生物を使用し、前記微生物中で、遺伝
    子もしくはヌクレオチド配列の強化(過剰発現)の達成
    のためにそのコピー数を遺伝子もしくはヌクレオチド配
    列を有するプラスミドベクターを用いて高める、請求項
    1記載の方法。
  5. 【請求項5】 微生物を使用し、前記微生物中で、過剰
    発現の達成のために、構造遺伝子の上流に存在するプロ
    モータ部位及びレギュレーション部位を突然変異させ
    る、請求項1記載の方法。
  6. 【請求項6】 微生物を使用し、前記微生物中で、過剰
    発現の達成のために、構造遺伝子の上流に発現カセット
    を組み込む、請求項1記載の方法。
  7. 【請求項7】 強化の達成のために、上記の配列からマ
    トリックスとして読み取られるmRNAの寿命を延長す
    る及び/又は相応する酵素タンパク質の分解を阻害す
    る、請求項1記載の方法。
  8. 【請求項8】 さらに、代謝物質−もしくは代謝拮抗物
    質−耐性突然変異を個々に又は一緒に有する微生物を使
    用する、請求項1から7までのいずれか1項記載の方
    法。
  9. 【請求項9】 過剰発現の達成のために、微生物を相応
    する変更した培養基中で発酵させるか又は発酵操作を変
    更する、請求項1から8までのいずれか1項記載の方
    法。
  10. 【請求項10】 パントテネート−(パントテン酸)−
    形成を低下させる物質代謝経路が少なくとも一部遮断さ
    れている微生物を使用する、請求項1から9までのいず
    れか1項記載の方法。
  11. 【請求項11】 微生物を使用し、前記微生物中で、p
    anD−遺伝子に対して付加的に、パントテン酸形成の
    物質代謝経路の残りの、特にコリネバクテリウム由来の
    遺伝子を個々に又は一緒に過剰発現させる、請求項1か
    ら10までのいずれか1項記載の方法。
  12. 【請求項12】 ケトパントエート−ヒドロキシメチル
    トランスフェラーゼ(EC 4.1.2.12)及びパ
    ントテネート−シンテターゼ(EC 6.3.2.1)
    の酵素をコードする1種以上の遺伝子を、特にコリネバ
    クテリウム由来のpanD−遺伝子に対して付加的に過
    剰発現させる、請求項11記載の方法。
  13. 【請求項13】 前記の遺伝子を個々に含有する多様な
    適合性のプラスミドベクターを用いて形質転換した微生
    物を使用する、請求項11及び12記載の方法。
  14. 【請求項14】 プラスミドベクターを用いて形質転換
    したE.coli種の微生物を使用し、前記プラスミド
    ベクターはpanD−遺伝子を含んだ前記遺伝子の1種
    以上を有し、前記ベクター中で前記遺伝子は連続して配
    置されておりかつ共通のプロモータの制御下にあるか、
    又は相互に別々に配置されており、異なるプロモータの
    制御下にある、請求項11及び12記載の方法。
  15. 【請求項15】 コリネバクテリウム・グルタミクムA
    TCC 13032/pND−D2としてDSM124
    38の名称で寄託された、図2に記載された制限マップ
    により特徴付けられるプラスミドベクターpND−D2
    を含有する微生物を使用する、請求項1から14までの
    いずれか1項記載の方法。
  16. 【請求項16】 次の工程: a) 少なくともpanD−遺伝子が強化(過剰発現)
    され、場合によりpanB−遺伝子及び/又はpanC
    −遺伝子と組み合わせた、E.coli種の微生物の発
    酵、 b) 培地中又は微生物の細胞中でのパントテン酸の富
    化、 c) パントテン酸の単離 を実施する、請求項1から15までのいずれか1項記載
    のパントテン酸の製造方法。
  17. 【請求項17】 過剰発現された遺伝子がコリネバクテ
    リウム属の微生物から由来する、請求項16記載の方
    法。
  18. 【請求項18】 工程a)において、アスパルテート、
    β−アラニン、ケトパントエート、ケトイソバレレート
    又はパントエートのグループから選択されるパントテン
    酸の前駆体を添加する、請求項16又は17記載の方
    法。
  19. 【請求項19】 プラスミドpFV31及び/又はpF
    V202を含有し、(i) panDをコードする、配
    列番号1で示されるヌクレオチド配列、又は(ii)
    遺伝子コードの同義性の範囲内で配列(i)に相当する
    配列、又は(iii) 配列(i)又は(ii)に対す
    る相補的配列とハイブリダイズする配列、及び場合によ
    り(iiii) (i)において機能的に中立なセンス
    突然変異により特徴付けられる複製可能なDNAの導入
    により形質転換されたE.coli属の微生物。
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