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FR2941948A1 - Derives d'azaindoles en tant qu'inhibiteur des proteines kinases abl et src - Google Patents

Derives d'azaindoles en tant qu'inhibiteur des proteines kinases abl et src Download PDF

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FR2941948A1
FR2941948A1 FR0900631A FR0900631A FR2941948A1 FR 2941948 A1 FR2941948 A1 FR 2941948A1 FR 0900631 A FR0900631 A FR 0900631A FR 0900631 A FR0900631 A FR 0900631A FR 2941948 A1 FR2941948 A1 FR 2941948A1
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Abstract

La présente invention concerne des composés de formule générale I et leur utilisation comme inhibiteurs des protéines kinases Abl et Src et leur procédé d'obtention. La présente invention concerne également les compositions pharmaceutiques et médicaments comprenant ces composés.

Description

DERIVES D'AZAINDOLES EN TANT QU'INHIBITEUR DES PROTEINES KINASES ABL ET SRC
La présente invention concerne des composés de type inhibiteurs des protéines kinases, leur procédé de préparation et leur application thérapeutique.
Le dysfonctionnement des protéines kinases (PK) est à l'origine d'un grand nombre de pathologies. En effet, une large proportion des oncogènes et protooncogènes impliqués dans les cancers humains code pour des PK.
Il a été également découvert qu'une activité accrue des PK est impliquée dans de nombreuses maladies non malignes telles que l'hyperplasie de la prostate bénigne, l'adénomatose familiale, la polypose, la neuro-fibromatose, le psoriasis, la prolifération des cellules lisses des vaisseaux sanguins associée à l'athérosclérose, la fibrose pulmonaire, la glomérulonéphrite et les sténoses et resténoses post-opératoires.
Les PK sont impliquées dans la réponse inflammatoire et la multiplication des virus et parasites. Les PK sont également connues pour leur rôle majeur dans 20 la pathogénèse et le développement de désordres neurodégénératifs.
La leucémie myéloïde chronique (LMC) est due à la transformation maligne d'une cellule souche hématopoïétique caractérisée par une anomalie génétique acquise : l'oncogène BCR-ABL, produit du chromosome Philadelphie (Ph) 22q 25 (Deininger et al., Blood, 2000, 96, 3343-3356). Ce gène de fusion code pour une protéine Bcr-Abl chimérique présentant une activité tyrosine kinase Abl constitutivement activée. L'expression d'une protéine de fusion Bcr-Abl provenant d'une translocation différente du gène BCR est également à l'origine de la leucémie 30 lymphoblastique aigüe à Ph positive (ALL Ph+), pour Philadelphia-chromosome positive (Chan et al., Nature, 1987, 325, 635-637 ; Melo et al., Leukemia, 1994, 8, 208-211 ; Ravandi et al., Br. J. Haematol., 1999, 107, 581-586).
La LMC représente environ 15 % à 20 % des leucémies chez les personnes adultes. Cette pathologie, caractérisée par une prolifération excessive des cellules de la lignée myéloïde, est considérée par de nombreux spécialistes comme un modèle de référence pour la compréhension des mécanismes de prolifération des cellules souches hématopoïétiques, ainsi que pour le développement de nouveaux médicaments contre les cancers.
L'un des premiers inhibiteurs actif découvert contre la kinase Abl est l'Imatinib (Gleevec/Glivec, STI-571 ; Novartis Pharma AG), molécule de type phénilamino-pyrimidine. L'Imatinib a été développé pour le traitement thérapeutique des cancers (Druker et al., Nat.Med., 1996, 2, 561-566). Druker mettait alors en évidence une inhibition sélective de la kinase Abl par l'Imatinib avec une IC50 comprise entre 0.038 et 0.025 NM.
Il a été démontré que cette molécule n'inhibe pas seulement la kinase Abl, mais joue également le rôle d'inhibiteur de c-KIT, du PDGFR (platelet-derived growth factor receptor) ou encore d'autres protéines (Bantscheff et al., Nat.Biotechnol., 2007, 25, 1035-1044 ; Okuda et al., Blood, 2001, 97, 2440-2448 ; Dewar et al., Blood, 2005, 105, 3127-3332).
Des tests cliniques ont montré que l'Imatinib induit une rapide rémission chez les patients en phase chronique, exprimant la protéine de fusion Bcr-Abl, tout en présentant une toxicité négligeable (O'Brien et al, N.EngI.J.Med, 2003, 384, 994-1004 ; Apperley et al., N.EngI.J.Med, 2002, 347, 471-487). L'Imatinib a également été testé avec succès en essais cliniques de phase Il sur des tumeurs stromales gastro-intestinales (GIST) exprimant KIT et PDGFRa et a montré une efficacité prometteuse sur un certain nombre de pathologie dont la dérégulation de l'activité kinase du PDGFR a été mise en évidence incluant un dermatofibrosarcome, un syndrome hyperéosinophilique et la leucémie myélomonocytaire chronique; (Rubin et al., J.CIin.Oncol, 2002, 20, 3586-3591 ; Maki et al., Int.J.Cancer, 2002, 100, 623-6262 ; Apperley et al., N.Eng1.J.Med, 2002, 347, 471-487 ; Gotlib et al., Blood, 2004, 103, 2879-2891).
Cependant, certains patients atteints de LMC ou d'ALL Ph+ en phase avancée développent une résistance à l'Imatinib se traduisant généralement par l'apparition de mutations dans le site catalytique ou dans les régions à proximité de Bcr-Abl ou encore par une amplification du gène BCR-ABL (Gorre et al., Science, 2001, 293, 876-80; Le Coutre et al., Blood, 2000, 95, 1758-66 ; Weisberg et al., Blood , 2000, 95, 3498-505 ; Mahon et al., 2000, Blood, 96, 1070-9 ; Campbell et al., Cancer Genet Cytogenet, 2002, 139, 30-3 ; Hochhaus et al., Leukemia, 2002, 16, 2190-6).
Les protéines kinases de la famille Src sont impliquées dans les leucémies médiées par Bcr-Abl et ont été impliquées dans plusieurs cas de résistance à l'Imatinib. Dans ce sens, plusieurs inhibiteurs Src/Abl ont été développés, de type 4-anilo-3-quinolinecarbonitrile, des analogues de purine 2,6,9 trisubstituées, et des pyrido[2,3-d]pyrimidine, pour proposer des alternatives de traitement au patient atteints de Leucémie Myéloïde Chronique ou de Leucémie Lymphoblastique Aigüe (Martinelli et al., Leukemia, 2005, 19, 1872-1879). Les kinases de la famille Src régulent également des voies clés de la progression métastasique des tumeurs malignes incluant l'adhésion, l'invasion, la motilité cellulaire et l'angiogénèse (Brunton et al., Curr Opin Pharmacol. , 2008, 8, 427-432). La surexpression de la protéine c-Src ainsi que l'augmentation de son activité ont été observées dans plusieurs types de cancers incluant le cancer colorectal, différents cancers gastrointestinaux (hépatique, pancréatique, gastrique et oesophagique) ainsi que les cancers du sein, ovarien et pulmonaire (Yeatman et al., Nat Rev Cancer, 2004, 4, 470-80).
Par ailleurs, les études de cristallographie ont révélé que l'Imatinib se lie au domaine kinase d'Abl seulement lorsque celui-ci adopte une conformation inactive (Nagar et al., Cancer Res, 2002, 62, 4236-43 ; Schindler et al., Science, 2000, 289, 1938-42). Ces résultats ont été à l'origine du développement de thérapies alternatives afin d'outrepasser la résistance à l'Imatinib mais également à l'origine de la conception de nouvelles molécules capables de se lier spécifiquement sur le domaine kinase d'Abl en conformation active (Cowan-Jacob et al., Acta Crystallogr D Biot Crystallogr, 2007, 63, 80-93 ; Weisberg et al., Nat Rev Cancer, 2007, 7, 345-56). Les classes de nouveaux inhibiteurs développées incluent des inhibiteurs sélectifs d'Abl, des inhibiteurs des kinases Abl et des kinases de la famille Src, des inhibiteurs de kinases Aurora et des inhibiteurs de Bcr-Abl non compétitifs de l'ATP.
Parmi les nouvelles classes d'inhibiteurs on peut citer (Weisberg et al., Nat Rev Cancer, 2007, 7, 345-56) : le Nilotinib qui inhibe principalement Abl et également KIT et PDGFR(3, le Dasatinib qui inhibe les kinases de la famille Src et également KIT, Bcr-Abl, PDGFR, le Bosutinib qui inhibe les kinases de la famille Src et Bcr-Abl et le Dasatinib qui se fixe, contrairement aux autres inhibiteurs, sur la conformation active du domaine Abl kinase. On constate néanmoins des effets secondaires avec le Dasatinib, de rétention de fluides (incluant une effusion pleurale), de diarrhée, etc.
Cependant, comme le suggèrent Weisberg et al (Weisberg et al., Nat Rev Cancer, 2007, 7, 345-56), on peut supposer, tout comme pour l'Imatinib, le Nilotinib ou encore d'autres inhibiteurs de kinases, que certains patients pourront développer une résistance aux nouvelles classes d'inhibiteurs.
II faut donc trouver de nouvelles molécules inhibitrices des protéines kinases.
La présente invention a pour objectif de proposer des nouveaux inhibiteurs de kinases, ayant un squelette original, qui peuvent être utilisés en thérapie dans le traitement de pathologies associées à une dérégulation de protéines kinases.
Les inhibiteurs de la présente invention peuvent être utilisés pour le traitement de nombreux cancers et plus particulièrement dans le cas de désordres myéloprolifératifs chroniques ou aigus comme certaines leucémies et dans le cas de cancer colorectal, de différents cancers gastro-intestinaux (hépatique, pancréatique, gastrique et oesophagique), ainsi que des cancers du sein, ovarien et pulmonaire.
Un autre objectif de l'invention est de proposer des nouveaux inhibiteurs sélectifs des kinases Abl et Src.
Un autre objectif encore de l'invention est de proposer un procédé de 5 préparation desdits inhibiteurs.
La présente invention concerne des composés de formule générale I : 15 Formule I dans laquelle, R représente : - un groupe NHCOR1, ou - un groupe NR3R4 25 avec,
R' représente : - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou polysubstitué par : 30 - un atome d'halogène, de préférence le brome, le fluor ou le chlore, - un groupe nitro, - un groupe cyano, - un groupe méthylthiazyle, - un groupe alkoxy, de préférence methoxy, 35 - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un groupe aryloxy, de préférence phényloxy, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluorométhyle, - un groupe sulfonamide substitué ou non, de préférence N-methylsulfonamide, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazyle éventuellement mono ou poly substitué par un atome d'halogène, de préférence le chlore, - ou un groupe choisi parmi les groupes A, B, C ou D tels que définis ci-dessous: NJ 10 20 25 30 35 F A B
O i---- S, N Q O H C D - un groupe hétéroaryle de préférence - un groupe pyridyle éventuellement mono ou poly substitué par un groupe sulfanyle de préférence propylsulfanyle, - un groupe thiophènyle, - un groupe thiazyle, - un groupe imidazyle, - un groupe pyrazyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkyle, de préférence méthyle, - un groupe quinoxaline, N H - un groupe dihydrobenzofurannyle, ou - un groupe indyle, - un groupe cycloalkyle de préférence cyclopropyle, - un groupe alkyle, de Cl à C6, linéaire ou ramifié, de préférence éthyle, isopropyle, ou - un groupe arylalkyle, de Cl à C6, de préférence phénylalkyle, de préférence phénylméthyle, éventuellement mono ou poly substitué par un groupe alkoxy de préférence méthoxy, et/ou un atome d'halogène de préférence le brome.
R2 représente : - un groupe ester COOR14 , - un groupe alkyle CH2R9, CH2OCOR10, CH2NR11R12, - un groupe amide CONR7R8, ou - un groupe COR13.
R7 et R8, identiques ou différents représentent : - un atome d'hydrogène, - un groupe aminoalkyle de Cl à C6 de préférence N,N- diméthylaminopropyle, ou - un groupe morpholinoalkyle en Cl à C6 de préférence N-morpholinoéthyle,
R9 représente : - un groupe hétéroaryle de préférence imidazyle ou pyrryle, - un groupe hétérocyclique, de préférence N-morpholinyle ou tetrahydrofurannyle, - un groupe alkoxy de préférence méthoxy, ou - un groupe hydroxy,
R10 représente : - un groupe hétéroaryle de préférence quinoxaline, R11 et R12 identiques ou différents représentent : - un atome d'hydrogène, - un groupe alkyle, en Cl à C6, linéaire ou ramifié de préférence terbutyle, - un groupe arylalkyle, de préférence phénylalkyle, de préférence phénylméthyle, - un groupe alkoxyalkyle, en Cl à C6 de préférence méthoxyéthyle, - un groupe cycloalkyle de préférence cyclohexyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou polysubstitué par: - un atome d'halogène, de préférence brome, - un groupe cyano, - un groupe sulfonamide, - un groupe nitro, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, ou - un groupe hydroxy, - ou un groupe hétéroaryle de préférence un groupe pyridyle , R13 représente un groupe hétérocycle de préférence N-morpholyle,
R14 représente : - un groupe alkyle en Cl à C6 linéaire ou ramifié, de préférence méthyle, ou - un groupe aryle, de préférence phényle éventuellement substitué par un 25 groupe alkoxy, de préférence méthoxy,
R3, R4 identiques ou différents représentent : - un atome d'hydrogène, - un groupe CH2R15, 30 - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridyle, indyle, benzoimidazyle, ou pyrazyle éventuellement substitué par un groupe alkyle, en Cl à C6, de préférence méthyle, ou 10 15 20 25 30 9 - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou polysubstitué par: - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un atome d'halogène, de préférence le brome, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluorométhyle, - un groupe CONHalkyle, de préférence CONHméthyle, - un groupe NHCOalkyle de préférence NHCOméthyle, - un groupe sulfonamide, ou - un groupe méthanesulfonamide,
R15 représente : - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou poly substitué par : - un atome d'halogène de préférence brome, chlore, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe trifluoro alkyle en Cl à C6, de préférence trifluorométhyle, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazinyle éventuellement mono ou poly substitué par un atome d'halogène, de préférence chlore, - un groupe sulfonamide, ou - un groupe méthanesulfonamide, ou un groupe hétéroaryle de préférence : - un groupe thiophènyle, - un groupe thiazyle, - un groupe imidazyle, - un groupe indyle, - un groupe pyrazyle, - un groupe pyridyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, ou - un groupe choisi parmi les groupes A, B, C et D tels que définis ci-dessus.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule Il : Formule II dans laquelle R' et R2 représentent les groupes tels que précédemment définis.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont 25 représentés par les composés de formule III : 15 i R3 N, R4 R2 H Formule III dans laquelle, R2, R3 et R4 représentent les groupes tels que précédemment 30 définis. 11 Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule IV : Formule IV dans laquelle, Ra représente : - un groupe cycloalkyle de préférence cyclopropyle, 10 - un groupe alkyle Cl à C6, linéaire ou ramifié, de préférence éthyle, isopropyle, - un groupe aryle, de préférence phényle éventuellement mono ou polysubstitué par: - un groupe cyano, - un atome d'halogène, de préférence fluor, brome ou chlore, - un groupe méthylthiazyle, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un groupe aryloxy, de préférence phényloxy, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazinyle éventuellement mono ou polysubstitué par un atome d'halogène, de préférence le chlore, - un groupe alkyle de préférence en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluorométhyle, - un groupe sulfonamide substitué ou non, de préférence N-méthylsulfonamide, ou - un groupe choisi parmi les groupes A, B, C et D tels que définis ci-dessus, 15 20 25 - un groupe hétéroaryle, de préférence : - un groupe pyridyle éventuellement substituée par un groupe sulfanyle, de préférence un propylsulfanyle, - un groupe thiophènyle, - un groupe thiazyle, - un groupe imidazyle, - un groupe pyrazyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkyle, de préférence méthyle, - un groupe dihydrobenzofurannyle, ou - un groupe indyle, - ou un groupe CH2-phényle, éventuellement substitué par un groupe alkoxy, de préférence méthoxy ; un atome d'halogène, de préférence brome, Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont 15 représentés par les composés de formule V : O Formule V dans laquelle, Rb représente : 20 - un groupe ester, de préférence ester méthylique, - un groupe CH2E, - un groupe CH2OCOG, ou - un groupe amide CONHI, E représente : 25 - un groupe hydroxy, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe amine secondaire substitué par : - un groupe alkyle en Cl à C6 linéaire ou ramifié, de préférence terbutyle, 10 - un groupe cycloalkyle de préférence cyclohexyle substitué ou non par un groupe alkyle en Cl à C6, un méthyle, - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement substitué mono ou polysubstitué par : - un atome d'halogène, de préférence fluor ou brome, - un groupe cyano, - un groupe nitro, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe hydroxy, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe amine tertiaire diméthylamine, ou - un groupe sulfonamide, - un groupe hétéroaryle de préférence pyridyle, et/ou - un groupe arylaikyle, de préférence phénylalkyle, de préférence phénylméthyle, - un groupe amine tertiaire bisubstitué par un groupe alkoxyalkyle, de préférence méthoxypropyle, - un groupe hétérocycle, de préférence morpholyle, tétrahydrofurannyle, - ou un groupe hétéroaryle, de préférence pyrryle, imidazyle, G représente un groupe hétéroaryle de préférence quinoxaline,
I représente un groupe aminoalkyle, de préférence N-diméthylaminopropyle.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule VI : O Formule VI dans laquelle Rd et Rc, identiques ou différents représentent : - un atome d'hydrogène, - un groupe nitro, - un groupe cyano, - un atome d'halogène, de préférence le fluor, le brome ou le chlore, - un groupe méthylthiazyle, - un groupe alkyle en Cl à C6, linéaire ou ramifié, de préférence méthyle ou isopropyle, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluorométhyle, - un groupe sulfonamide substitué ou non, de préférence N-méthylsulfonamide, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazinyle éventuellement mono ou polysubstitué par un atome d'halogène, de préférence le chlore, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un groupe choisi parmi les groupes A, B, C ou D tels que définis ci-dessus, ou - un groupe aryloxy de préférence phényloxy, ou Rd et Rc forment avec le phényle un cycle dihydrobenzofuranne ou indole.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule VII :
O N Formule VII dans laquelle Re représente : - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, ou - un atome d'halogène, de préférence le brome.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule VIII : O Rf Formule VIII Dans laquelle Rf représente : - un atome d'hydrogène, ou - un groupe sulfényle, de préférence propylsulfényle.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule IX : O Formule IX Dans laquelle Rg représente : - un atome d'halogène, de préférence le brome, - un groupe nitro, - un groupe cyano, - un groupe sulfonamide, - un atome d'hydrogène, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe hydroxy, ou - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule X : O Rg N Rh Dans laquelle Ri et Rj identiques ou différents représentent : - un atome d'halogène, de préférence brome, fluor ou chlore, - un groupe nitro, - un groupe méthylthiazyle, - un atome d'hydrogène, - un groupe aryloxy, de préférence phényloxy, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un goupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluoro-méthyle, - un groupe sulfonamide substitué ou non, de préférence N-méthylsulfonamide, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazinyle éventuellement mono ou polysubstitué par un atome d'halogène, de préférence le chlore, - un groupe choisi parmi les groupes A, B, C ou D tels que définis ci-dessus, ou 10 - un groupe cyano, Ou Ri et Rj forment avec le phényle un cycle dihydrobenzofuranne, indole ou quinoxaline.
Rh représente : 15 - un groupe N-morpholyle, - un groupe amine primaire, - un groupe amine secondaire NHJ, ou - OK, J représente : 20 - un groupe aminoalkyle, de préférence N,N-diméthylaminopropyl, ou - un groupe N-morpholinoalkyle, de préférence N-morpholinoéthyle,
K représente : - un groupe aryle, de préférence phényle éventuellement substitué par un 25 alkoxy, de préférence méthoxy, ou - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle.
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule XI : O Formule XI Dans laquelle Rm représente : - un groupe hydroxy, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyrryle ou imidazyle, - un groupe hétérocycle, de préférence trihydrofurannyle ou N-morpholyle, - un groupe alkoxy de préférence méthoxy, - un groupe amine secondaire substituée par : - un groupe alkyle linéaire ou ramifié en Cl à C6, de préférence terbutyle, - un groupe cycloalkyle, de préférence cyclohexyle, éventuellement substitué, par un groupe alkyle, de préférence méthyle, - un groupe aryle, de préférence phényle, éventuellement substitué par : - un atome d'halogène, de préférence le brome, - un groupe cyano, - un groupe sulfonamide, - un groupe nitro, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe hydroxy, ou - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe hétéroaryle de préférence pyridyle, ou - un groupe phénylalkyle, de préférence phénylméthyle, - un groupe amine tertiaire N,N,di-méthoxypropylamine, ou - un groupe OCOL L représente un groupe hétéroaryle, de préférence quinoxaline,
Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule XII : H N Formule XII Dans laquelle RI et Rk identiques ou différents représentent : - un groupe alkoxyalkyle, de préférence métoxypropyle, 10 - un atome d'hydrogène, - un groupe cycloalkyle, de préférence cyclohexyle éventuellement substitué par un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe aryle, de préférence phényle éventuellement substitué par : un atome d'halogène, de préférence le brome, 15 - un groupe cyano, - un groupe nitro, - un groupe sulfonamide, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, un groupe hydroxy, ou 20 un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridyle, - un groupe arylalkyle, de préférence un phénylméthyle, ou - un groupe alkyle linéaire ou ramifié, en Cl à C6 de préférence terbutyle ; ou RI et Rk forment avec N un groupe morpholyle. 25 Selon un mode de réalisation, les composés de la présente invention sont représentés par les composés de formule XIII : H Formule XIII Dans laquelle Rn représente : - un groupe alkoxy, de préférence methoxy , ou - un groupe amine secondaire, de préférence N,N-diméthylpropylamine.
De façon générale on entend par : groupe alkyle : un groupe aliphatique saturé linéaire ou ramifié de 1 à 6 atomes de carbone. A titre d'exemple on peut citer méthyle, éthyle, propyle, butyle, terbutyle, isopropyle, etc.. groupe cycloalkyle : un groupe alkyle cyclique de 3 à 10 atomes de carbone. A titre d'exemple on peut citer cyclopropyle, cyclobutyle, cyclopentyle, cyclohexyle, méthylcyclohexyle, etc. groupe aryle : un groupe aromatique cyclique (mono ou polycyclique) comprenant entre 5 et 10 atomes de carbone. A titre d'exemple on peut citer phényle, naphtyle, etc. - groupe hétéroaryle : un groupe aromatique cyclique (mono ou poly cyclique) comprenant entre 5 et 10 atomes de carbone et entre 1 et 3 hétéroatomes, tels que l'azote, l'oxygène ou le soufre. A titre d'exemple on peut citer : pyridine, thiophène, thiazole, imidazole, pyrazole, pyrrole, quinoléine, indole, pyridazine, quinoxaline, dihydrobenzofuranne etc. groupe hétérocycle : un groupe cyclique saturé comprenant entre 5 et 10 atomes de carbone et entre 1 et 3 hétéroatomes, tels que l'azote, l'oxygène et le soufre. A titre d'exemple on peut citer : morpholine, tétrahydrofuranne, etc. - atome d'halogène : le fluor, le chlore, le brome ou l'iode. - groupe alkoxy : un groupe alkyle lié à un oxygène. A titre d'exemple on peut citer méthoxy, éthoxy etc. - groupe aryloxy : un groupe aryle lié à un oxygène. A titre d'exemple on 5 peut citer phényloxy, etc. - groupe sulfonamide : 0 I I Sù N I I 0 II ,CH3 Sù N I I - groupe méthanesulfonamide : 25 30 alkyleùaryle 35 - groupe aminoalkyle : un groupe alkyle substitué par un groupe amine alkyleùamine - groupe hydroxy : OH - groupe alkoxyalkyle : un groupe alkyle substitué par un groupe alkoxy alkyleùalkoxy 0 - groupe N-methylsulfonamide : 15 0 0 I I Nù Sù C H3 0
- groupe arylalkyle : un groupe alkyle substitué par un groupe aryle 45 15 20 25 30 22 - groupe sulfanyle : Sùalkyle phényle substitué : un phényle mono ou poly substitué par : - un atome d'halogène, - un groupe nitro -(NO2), - un groupe cyano (CN), - un groupe méthylthiazyle, S~ N - un groupe alkoxy, - un groupe aryloxy, - un groupe alkyle, - un groupe sulfonamide, - un groupe N-méthylsulfonamide, - un groupe methanesulfonamide, - un groupe hétéroaryle, - un groupe hydroxy, - un groupe amine tertiaire, - un groupe -CONHalkyle, - un groupe -NHCOalkyle, ou - un groupe choisi parmi les groupes A, B, C et D tels que définis ci-dessus, pyridyle : radical issu de la pyridine thiophényle : radical issu du thiophène 23 - thiazyle : radical issu du thiazole z• ~N\ s - imidazyle : radical issu de l'imidazole H - pyrazyle : radical issu du pyrazole H N - quinoxaline : - dihydrobenzofurannyle : radical issu du dihydrobenzofurranne O - pyrryle : radical issu du pyrrole H - indyle : radical issu de l'indole N H
pyridazinyle : radical issu de la pyridazine N - N-morpholyle : radical issu de la morpholine O~
N Dans un mode de réalisation, l'invention concerne des composés, caractérisé en ce qu'il est choisi dans le groupe constitué par le 5-(2-bromobenzamido)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle, le 5-(2-fluoro-6-methoxybenzamido)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle, le N- (2-((4-hydroxyphenylamino)methyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-2-bromobenzamide, le N-(2-((1 H-pyrrol-2-yl)methyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-2-bromobenzamide, le 2-bromo-N-(2-(methoxymethyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide, ou le 5-(2-bromobenzamido)-N-(3-(dimethylamino) propyl)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxamide.
Lorsque les composés selon l'invention comprennent un ou des carbones asymétriques les composés selon l'invention peuvent être obtenus sous forme d'isomères et l'invention concerne les composés sous toutes leurs formes, à savoir les formes énantiomères, diastéréosimères, racémiques ou les mélanges. Lorsque les composés comprennent des liaisons susceptibles de donner des isomères géométriques, la présente invention concerne tous les isomères géométriques isolés ou en mélange des composés selon l'invention.
Les composés selon l'invention peuvent exister sous forme solvatée et sous forme non solvatée. - benzoimidazyle : radical issu du benzoimidazole H N Selon l'invention, tous les sels pharmaceuticalement acceptables des composés selon l'invention sont compris dans la portée de l'invention en particulier les sels d'acides faibles et de bases faibles.
La présente invention concerne également l'utilisation des composés selon l'invention comme inhibiteurs des protéines kinases. Dans un mode de réalisation, les composés selon l'invention sont utilisés comme inhibiteur de la protéine kinase AbI. Dans un autre mode de réalisation, les composés selon l'invention sont utilisés comme inhibiteur des protéines kinases Src.
Les composés de l'invention peuvent être utilisés dans le traitement de pathologies associées à une dérégularisation de protéines kinases : dans le cas de désordres myéloprolifératifs chroniques ou aigus comme certaines leucémies, dans le cas de cancers gastro-intestinaux hépatique, pancréatique, gastrique, oesophagique et colorectaux, dans le cas de cancer du seins et cancer ovarien, - dans le cas de cancer pulmonaire.
Selon un autre aspect, l'invention a pour objet un médicament comprenant comme principe actif un composé selon l'invention. Ainsi, les composés selon l'invention peuvent être utilisés comme médicament dans le traitement de pathologies associées à une dérégularisation de protéines kinases : dans le cas de désordres myéloprolifératifs chroniques ou aigus comme certaines leucémies, dans le cas de cancers gastro-intestinaux hépatique, pancréatique, gastrique, oesophagique et colorectaux, dans le cas de cancer du seins et cancer ovarien, - dans le cas de cancer pulmonaire.
La présente invention concerne également des compositions pharmaceutiques comprenant, en tant que principe actif, un composé de l'invention et un excipient pharmaceutiquement acceptable.
On entend par composition pharmaceutique toute composition comprenant une dose efficace d'un composé de l'invention et au moins un excipient pharmaceutiquement acceptable. Lesdits excipients sont choisis, selon la forme pharmaceutique et le mode d'administration souhaité, parmi les excipients habituels connus de l'homme du métier.
Les compositions selon l'invention peuvent être utilisées dans le traitement de pathologies associées à une dérégularisation de protéines kinases : - dans le cas de désordres myéloprolifératifs chroniques ou aigus comme certaines leucémies, dans le cas de cancers gastro-intestinaux hépatique, pancréatique, gastrique, oesophagique et colorectaux, - dans le cas de cancer du seins et cancer ovarien, dans le cas de cancer pulmonaire. L'invention concerne également le procédé de préparation des composés à 20 partir de 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle (commercial auprès de la Société Azasynth). Dans un premier mode de réalisation, le procédé selon l'invention est représenté par le schéma 1. McO,C-- C NO, NH2 NELä • ' Hä Pd/C 10% R M.O,C DCM, t.a., 18h 15-74% MeOH, t.a., 18h McO,C 95% 25 Schéma 1 Le procédé comprend au moins les étapes de : a) hydrogénation catalytique du 5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle, en présence de palladium sur charbon et sous atmosphère d'hydrogène (Seela, F., Gumbiowski, R. Heterocycles, 1989, 29 (4), 795-805) b) réaction de l'amine formée avec différents chlorures d'acyles pour conduire aux amides correspondants avec des rendements allant de 15 à 74% après purification sur gel de silice (Mouaddib, A., Joseph, B. et al., Synthesis, 2000, (4), 549-556) et c) obtention et caractérisation du composé. Dans un second mode de réalisation, le procédé est représenté par le schéma 2. LiAIH, THF, t.a., 2h 89% McOH, t.a., 18h 17% Me02C B HO Br Br Schéma 2 Le procédé comprend au moins les étapes de : a) réduction sélective de la fonction ester du 5-(2-bromobenzamido)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle par l'hydrure de lithium aluminium à température ambiante (Karrer, P., Boettcher, Augusta., Helvetica Chimica Acta, 1953, 36, 570-2) , b) transformation de l'alcool en bromure d'alcane par PBr3, à température ambiante pendant 18h dans le THF (rendement brut de 81%) (Ku, Jin-Mo; J. et al., Journal of Organic Chemistry, 2007, 72 (21), 8115-8118) cette réaction est suivie des étapes c) ou d) suivantes c) mise en solution dans le méthanol, pour conduire au méthoxyazaindole obtenu par réaction du solvant sur la fonction halogénée, à température ambiante d) réaction du bromure d'alcane avec une amine primaire ou secondaire dans le dimethylformamide anhydre, à température ambiante pendant 18h, pour conduire aux 7-azaindoles correspondants avec des rendements allant de 9 à 96% après purification sur gel de silice (Nagarathnam, D., Journal of Heterocyclic Chemistry, 1992, 29 (6), 1371-3) et e) obtention et caractérisation du composé. DMF, t.a., 18h 39% Dans un troisième mode de réalisation de l'invention, le procédé est représenté par le schéma 3. NO2 LiOH NO2 ,NO2 EDCI, 0,,, McO2C H2OIEtOH, reflux, 30 min 52% HO2C NH2 DMF, ta., 4h 37-53% Schéma 3
Le procédé comprend au moins les étapes de : a) saponification de l'ester du 5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2- carboxylate de méthyle par l'hydroxyde de lithium (Kanth, Sribhashyam R. et al., Heterocycles 2005, 65 (6), 1415-1423), b) couplage peptidique à l'aide de chlorhydrate de N-(3- dimethylaminopropyl)-N'-ethylcarbodiimide (EDCI) et de morpholine, c) hydrogénation de l'amide obtenu par du palladium catalytique, d) réaction du composé obtenue avec différents chlorures d'acyles, en présence de triéthylamine dans le dimethylformamide, pour mener aux 7-azaindoles souhaités, et e) obtention et caractérisation du composé.
Dans un quatrième mode de réalisation le procédé de l'invention est représenté par le schéma 4. NH4OH 28% MeOH, t.a., 24h 10% NO2 NO2 McO2C H2N H2, Pd/C 10% MeOH, La., 24h H2N 100% DMF, t.a., 2.5h 33% NH2 H2N ci NEt3, Schéma 4 Le procédé comprend au moins les étapes de : a) réaction du 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de 10 méthyle avec l'ammoniac aqueux à température ambiante pendant 24 heures pour obtenir l'amide primaire d'azaindole, b) hydrogénation du composé obtenu sur Pd/C, c) réaction avec 3-fluorobenzoyle pour donner le composé souhaité, et d) obtention et caractérisation du composé. 15 Dans un cinquième mode de réalisation, le procédé de l'invention est représenté par le schéma 5. EDCI, HOBt, NEt3, R1R2NH KOH ~_~ _ •i DMF, ta., 18h
H2OIMeOH, reflux, 2h reflux, 30 mIn 2) R1R2NH, NEt3 DMF, ta., 18h HO2C DCM, t.a., 18h McO2C NH2 McO2C C NEt3, DCC, DMAP, R3OH DMF, t.a., 18h RIO Schéma 5 5 Le procédé comprend au moins les étapes de : a) réaction du 5-amino-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle avec différents chlorures d'acyles, 10 b) saponification des composés obtenus par action de l'hydroxyde de potassium à reflux dans un mélange eau-méthanol, c) réaction du composé obtenu sur différents alcools ou amines, et d) obtention et caractérisation du composé. 15 L'invention sera mieux comprise à la lecture des exemples suivants. Les composés de l'invention ont été obtenus à partir du 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle (commercial auprès de la Société Azasynth) en synthèse multi-étapes pouvant faire intervenir au besoin un 20 appareil de synthèse parallèle ( Synthesis 1 , Heidolph). Les différents protocoles de synthèse sont détaillés ci-dessous ainsi que les caractéristiques physico-chimiques des composés de type 7-azaindoles obtenus.
Les synthèses et analyses ont été réalisées dans les conditions suivantes :
- Résonance Magnétique Nucléaire 1H et 13C : Appareil : Bruker Avance 300 (300 MHz) ; Bruker DPX 200 (200MHz) Conditions d'utilisation : Température ambiante, déplacements chimiques exprimés en partie par millions (ppm), référence interne trimethylsilane (TMS), multiplicité des signaux indiquée par lettres minuscules (singulet s, doublet d, triplet t, quadruplet q, multiplet m), dimethylsulfoxyde d6, méthanol d4, chloroforme d1 comme solvants deutériés. - Chromatographie Liquide Haute Pression (HPLC) : Appareil : Système chromatographique Waters Alliance 2790, détecteur UV 996 Conditions d'utilisation : Colonne Thermo Hypersil C18 (50x2.1mm), gradient d'élution Eau/Acétonitrile/Acide trifluoroacétique (99.9°/0/0%/0.1°/o à 19.9%/80%/0.1%)
- Spectrométrie de Masse (MS) : Appareil : Micromass Q-Tof Conditions d'utilisation : ElectroSpray (ESI) en mode positif. - Pesées : Appareil : Denver Instrument TP214 (précision 0.1 mg) Conditions d'utilisation : Pesées effectuées au milligramme près.
25 - Synthèse parallèle : Appareil : Heidolph Synthesis 1 (16 réacteurs) Conditions d'utilisation : 16 réactions en parallèle, température ambiante, évaporation multiple.
30 - Réactions sous pression : Appareil : Autoclave Parr 300 mL. Conditions d'utilisation : Hydrogénation sous 20 bars d'hydrogène.20 Exemple A : Synthèse d'inhibiteurs en 2 étapes à partir du réactif commercial de la société Azasynth.
Le schéma 6 représente un procédé général de synthèse d'inhibiteurs de protéines kinases. H2, PdIC 10% MeOH, t.a., 18h McO2C 95% DCM, t.a., 18h 15-74% NO2 NH2 McO2C McO2C C N Et,, Schéma 6 - Schéma de synthèse général de l'exemple A La première étape est une hydrogénation catalytique du 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle, en présence de palladium sur charbon et sous atmosphère d'hydrogène (Seela, F.; Gumbiowski, R., Heterocycles 1989, 29 (4), 795-805). Le produit est obtenu avec un rendement brut de 95%. La seconde étape a été réalisée par synthèse parallèle. L'amine formée lors de la première étape est mise en réaction avec différents chlorures d'acyles pour conduire aux amides correspondants avec des rendements allant de 15 à 74% après purification sur gel de silice (Mouaddib, A.; Joseph, B. et al., Synthesis 2000, (4), 549-556). lève étape : Préparation du 5-amino-IH-pyrrolo(2,3-blpyridine-2- carboxylate de méthyle(schéma 7) Schéma 7 On introduit dans une autoclave 2.9 g (13.12 mmol) de 5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (Azasynth), 290 mg de palladium sur charbon 10% et 200 mL de méthanol. Le mélange réactionnel est placé sous 20 bars d'hydrogène, et laissé sous agitation pendant 18h à température ambiante. La solution est ensuite filtrée sur célite, et la célite est rincée par 3 fois 100 mL NH2 McOZC de méthanol chaud. Le filtrat est évaporé sous pression réduite. 2,38 g d'un solide jaune sont obtenus avec un rendement de 95%. 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.98 (br s, 1H), 7.95 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 6.90 (s, 1H), 3.84 (s, 3H). 2ème étape : Préparation de l'inhibiteur à partir du 5-amino-1H-pyrrolo%2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle
On introduit dans un réacteur 50 mg de 5-amino-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2- 10 carboxylate de méthyle (0.26 mmol), le réactif et 5 mL de dichlorométhane. On ajoute au mélange réactionnel 56 pL (0.39 mmol) de triéthylamine et on laisse agiter à température ambiante pendant 18 heures. On ajoute ensuite au mélange réactionnel 60 mL d'une solution saturée en hydrogénocarbonate de sodium. Le précipité qui se forme est filtré et rincé avec un peu d'eau. Le filtrat 15 est extrait par 3 fois 50 ml de dichlorométhane. Les phases organiques sont réunies, séchée sur sulfate de sodium et évaporée sous pression réduite. On obtient un précipité qui est réuni avec le précipité filtré, puis purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/éther de pétrole).5 Le tableau 1 représente les différents inhibiteurs synthétisés selon le schéma de synthèse ci-dessus décrit. N° exemple Réactifs utilisés Inhibiteurs synthétisés (masse et données analytique) 5-(cyclopropanecarboxamido)-1 H-pyrrolo [2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle H 31 mg d'un solide beige (46%); 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.43 (br s, 1H), 10.41 (br s, 1H), 8.48 (d, 1H), 8.41 (d, 1H), 7.14 (s, 1H), 3.87 (s, 3H), 1.81 (m, 1H), 0.87 (m, 4H); HPLC: 97% ; MS (ESI): 260.0 (M+1) 5-(isobutyramido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle McO2C H 22 mg de solide blanc (54%). HPLC: 83%. MS (ESI): 247.2 (M+1) Exemple 1 N D0044 chlorure de cyclopropanecarb- -onyle 26 pl (0,028mmol) McO2C Exemple 2 30 pL de chlorure ND0045 d'isobutyryle McO2C~ ~N H 38 mg de solide beige (54%). HPLC: 97%. MS (ESI): 262.2(M+1) 5-(propionamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle Exemple 3 N D0046 25 pL de chlorure de propionyle -(3-cyanobenzamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle McO2C~~NiùN " CN H 18 mg de solide jaune (22%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.54 (br s, 1H), 10.67 (br s, 1H), 8.68 (d, 1H), 8.56 (d, 1H), 8.46 (s, 1H), 8.30 (m, 1H), 8.10 (m, 1H), 7.78 (m, 1H), 7.22 (s, 1H), 3.89 (s, 3H). HPLC: 96%. MS (ESI): 321.2 (M+1) 5-(3-fluorobenzamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle Exemple 4 ND0051 48 mg de chlorure de 3-cyanobenzoyle Exemple 5 45 mg de chlorure de ND0053 3-fluorobenzoyle McO2C H 19 mg de solide jaune (23%). HPLC: 100%. MS (ESI): 314.2(M+1) 5-(2-bromobenzamido)-1 H- pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle McO2C H 33 mg de solide beige (74%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.52 (br s, 1H), 10.65 (br s, 1H), 8.58 (s, 2H), 7.74 (m, 1H), 7.62-7.41 (m, 3H), 7.22 (s, 1H), 3.89 (s, 3H).HPLC: 95%. MS (ESI): 373.8 ; 375.8 (M+1)338.2(M+1) Exemple 6 ND0020 63 mg de chlorure de 2-bromobenzoyle -(2, 3-difluorobenzamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle McO2C H 26 mg de solide beige (59%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.61 (br s, 1H), 10.76 (br s, 1H), 8.65 (d, 1H), 8.62 (d, 1H), 7.75-7.58 (m, 2H), 7.48-7.35 (m, 1H), 7.28 (s, 1H), 3.95 (s, 3H). HPLC: 100%. MS (ESI): 332.2(M+1) 5-(4-(2-meth ylthiazol-4-yl)benzamido)- 1 H-pyrrolo[2, 3-bjpyridine-2- carboxylate de methyle 68 mg de chlorure de 4-(2-methylthiazol-4- Meo2c yl)benzoyle Exemple 7 ND0061 utilisant 51 mg de chlorure de 2,3-difluorobenzoyle Exemple 8 ND0054 26 mg de solide beige (25%). HPLC: 75%. MS (ESI): 393.2 (M+1) 5-(2, 3-dihydrobenzofuran-7-carboxamido)-1 H-pyrroloj2, 3-bjpyridine-2-carboxylate de methyle 52 mg de chlorure de Exemple 9 2,3- ND0062 dihydrobenzofuran-7- carbonyleMcO2C H 24 mg de solide marron (15%). HPLC: 100%. MS (ESI): 338.2(M+1) -(2-fluoro-6-methoxybenzamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle Exemple 10 ND0047 Exemple 11 ND0059 Exemple 12 ND0050 54 mg de chlorure de 2-fluoro-6- methoxybenzoyle 67 mg de chlorure de 2-phenoxybenzoyle 51 mg de chlorhydrate de chlorure de nicotinoyle McO2C H 30 mg de solide blanc (33%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.50 (br s, 1H), 10.67 (br s, 1H), 8.60 (d, 1H), 8.53 (d, 1H), 7.47 (m, 1H), 7.21 (s, 1H), 7.00-6.90 (m, 2H), 3.39 (s, 3H), 3.84 (s, 3H). HPLC: 99%. MS (ESI): 344.2 (M+1) 5-(2-phenoxybenzamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle McO2C~ N H 28 mg de solide marron (28%). HPLC: 91%. MS (ESI): 388.2 (M+1) 5-(nicotinamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle H O N McO2C H 15 mg de solide marron (20%). HPLC: 100%. MS (ESI): 297.2(M+1) -(2-(propylthio) pyridine-3-carboxamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-bJpyridine-2-carboxylate de methyle H O N McO2C~ ~N H 60 mg de solide beige (28%). HPLC: 98%. MS (ESI): 373.1 (M+1) 5-(2-(3-methoxyphenyl)acetamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine-2- carboxylate de methyle McO2C~ "N H 22 mg de solide beige (27%). HPLC: 100%. MS (ESI): 340.2(M+1) 5-(2-(2-bromophenyl)acetamido)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle McO2C H B 19 mg de solide marron (24%). HPLC: 93%. MS (ESI): 388.1 ; 390.1 (M+1) Exemple 13 N D0060 62 mg de chlorure de 2- (propylthio)pyridine- 3-carbonyle Exemple 15 ND0064 Exemple 14 N D0063 45 pL de chlorure de 2-(3-methoxyphenyl)-acetyle 43 iiL de chlorure de 2-(2-bromophenyl)- acetyle Tableau 1 - Inhibiteurs obtenus par l'exemple A Exemple B : Synthèse d'inhibiteurs en 3 étapes à partir de l'inhibiteur de l'exemple 6.
Le schéma 8 représente le schéma réactionnel de l'exemple B.
La première étape est une réduction sélective de la fonction ester par l'hydrure de lithium aluminium à température ambiante pour conduire à l'alcool correspondant avec un rendement de 89% (Karrer, P., Boettcher, Augusta., Helvetica Chimica Acta, 1953, 36, 570-2). L'alcool formé est alors transformé en bromure d'alcane par PBr3, à température ambiante pendant 18h dans le THF (rendement brut de 81%) (Ku, Jin-Mo., J. et al., Journal of Organic Chemistry, 2007, 72 (21), 8115-8118). Le bromure d'alcane intermédiaire est très réactif et ne peut pas être purifié sans se dégrader. Mis en solution dans le méthanol, il conduit au méthoxyazaindole obtenu par réaction du solvant sur la fonction halogénée, à température ambiante (rendement de 17%). Pour obtenir les amines souhaitées, le bromure d'alcane est donc mis en réaction directement sans purification lors de la troisième et dernière étape. Celle-ci est réalisée par synthèse parallèle à l'aide du synthesis 1 d'Heidolph. Deux équivalents d'amine primaire ou secondaire sont ajoutés au bromure d'alcane dans le dimethylformamide anhydre, à température ambiante pendant 18h, pour conduire aux 7-azaindoles correspondants avec des rendements allant de 9 à 96% après purification sur gel de silice (Nagarathnam D., Journal of Heterocyclic Chemistry, 1992, 29 (6), 1371-3).
PBr3 THF, t.a., 18h 81% McO2C LiAIH4 THF, ta., 2h HO 89% R'^,H,R' B H DMF, t.a., 18h 9-96% Br B MeOH, ta., 18h 17% B H Schéma 8 - Schéma de synthèse général de l'exemple B
Exemple 16 : Préparation du 2-bromo-N-(2-(hydroxymethyl)-1H-pyrrolof2,3-5 blpyridin-5-yl)benzamide(ND0019) HO On introduit dans un ballon 4.6 g (12.3 mmol) de 5-(2-bromobenzamido)-1H- 10 pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (exemple 6) dans 180 mL de tetrahydrofurane anhydre sous atmosphère d'argon. Le mélange réactionnel est placé à 0°C à l'aide d'un bain d'éthanol froid et on ajoute avec précaution, en plusieurs fois, 0.7 g (18.5 mmol) d'hydrure de lithium aluminium en poudre. On laisse agiter à 0°C, sous argon, pendant 15 minutes et on enlève le bain froid. 15 La réaction est laissée sous agitation pendant encore 2h, à température ambiante. On ajoute ensuite très lentement 3 mL d'une solution d'eau saturée en chlorure d'ammonium, et on laisse agiter pendant 15 min. Le précipité formé est alors filtré sur célite, et la célite est rincée par 3 fois 50 mL de tetrahydrofurane chaud. Le filtrat est évaporé sous pression réduite et on 20 obtient 2.38 g de solide jaune (rendement brut 95%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.50 (br s, 1H), 10.46 (br s, 1H), 8.34 (d, 1H), 8.28 (d, 1H), 7.80-7.37 (m, 5H), 6.32 (s, 1H), 5.30 (m, 1H), 4.60 (m, 2H). HPLC: 95%. MS (ESI): 345.8; 347.8 (M+1). 1' étape : Préparation du 2-bromo-N-(2-(bromomethyl)-1 H-pyrrolo[2, 3-blpyridin-5-yl)benzamide (schéma 9) Schéma 9 On introduit dans un ballon successivement 1 g (2.89 mmol) de 2-bromo-N-(2-(hydroxymethyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide (Exemple 16), 100 mL 10 de tetrahydrofurane et 408 pL (4.34 mmol) de bromure de phosphore (PBr3) sous atmosphère d'argon. On laisse agiter à température ambiante pendant 18 heures. Le solvant est alors évaporé sous pression réduite, et le résidu est repris dans 150 mL d'acétate d'éthyle. La phase organique est lavée par 3 fois 50 mL d'eau, séchée sur sulfate de sodium et évaporée sous pression réduite. 15 Le précipité obtenu est séché sous vide pendant 1h, et on obtient finalement 957 mg d'un solide marron (rendement brut 81%). MS (ESI): 408.0; 410.0; 412.0 (M+1).
2ème étape : Préparation de l'inhibiteur à partir du 2-bromo-N-(2-20 (bromomethyl)-1 H-pyrrolo(2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide
On introduit dans un réacteur 50 mg (0.12 mmol) de 2-bromo-N-(2-(bromomethyl)-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide formé lors de l'étape précédente, 0.5 mL de dimethylformamide (distillé sur hydrure de calcium) et le 25 réactif, sous atmosphère d'argon. La solution est agitée à température ambiante pendant 18 heures puis diluée dans 30 mL d'acétate d'éthyle, lavée par 4 fois 10 mL d'eau, séchée sur sulfate de sodium et évaporée sous pression réduite. Le produit brut est alors purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/méthanol). Le tableau 2 présente les différents 30 inhibiteurs synthétisés suite à la deuxième étape.5 Réactifs utilisés Inhibiteurs synthétisés (masse et données analytique) N-(2-((tert-butylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2, 3-b]pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide H 19 mg d'un solide beige (49%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.44 (br s, 1H), 10.45 (br s, 1H), 8.32 (d, 1H), 8.24 (d, 1H), 7.74-7.40 (m, 4H), 6.30 (s, 1H), 3.82 (s, 2H), 1.11 (s, 9H). HPLC: 97%. MS (ESI): 401.1; 403.1 (M+1). 2-bromo-N-(2-(morpholinomethyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide H O N B N H 15 mg de solide blanc (57%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.56 (br s, 1H), 10.46 (br s, 1H), 8.35 (d, 1H), 8.27 (d, 1H), 7.75-7.40 (m, 4H), 6.33 (s, 1H), 3.62 (s, 2H), 3.61-3.58 (m, 4H), 2.44-2.42 (m, 4H). HPLC: 95%. MS (ESI): 415.1 ; 417.1 (M+1). Exemple 17 N D0030 26 pL (0.24 mmol) de tertio-butylamine Exemple 18 N D0023 22 pL de morpholine N° exemple N-(2-((bis(2- methoxyethyl)amino)methyl)-1H- pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-2- bromobenzamide H O N Br Exemple 36 pL de bis(2- H N 19 methoxyethyl)amine 22 mg de solide blanc (55%). ND0024 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.42 (br s, 1H), 10.45 (br s, 1H), 8.34 (d, 1H), 8.25 (d, 1H), 7.75-7.40 (m, 4H), 6.32 (s, 1H), 3.81 (s, 2H), 3.44 (t, 4H), 3.23 (s, 6H), 2.70 (t, 4H). HPLC: 97%. MS (ESI): 461.2; 463.2 (M+1). N-(2-((2- Exemple 32 pL de 2- methylcyclohexylamino)methyl)-1H- methylcyclohexylami pyrrolo[2, 3-b]pyrid i n-5-yl)-2- bromobenzamide H O Br H N 11 mg de solide beige (33%). 20 ne (mélange ' H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.42 ND0026 cis+trans) (br s, 1H), 10.44 (br s, 1H), 8.32 (d, 1H), 8.23 (d, 1H), 7.75-7.40 (m, 4H), 6.30 (s, 1H), 3.89-3.83 (m, 2H),. 3.29-3.16 (m, 1H), 1.70-1.08 (m, 9H), 0.94-0.86 (m, 3H). HPLC: 93%. MS (ESI): 441.2; 443.2 (M+1).
N-(2-((4-cyanophenylamino)methyl)-1H-pyrro lo[2, 3-b] pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide N-(2-((3-bromophenylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl) -2-bromobenzamide Br H 27 pL de 3- 28 mg de solide beige (33%). bromoaniline 'H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.59 (br s, 1H), 10.46 (br s, 1H), 8.35 (d, 1H), 8.24 (d, 1H), 7.75-7.40 (m, 4H), 7.02 (br s, 1H), 6.82 (s, 1H), 6.70-6.63 (m, 2H), 6.46 (t, 1H), 6.34 (s, 1H), 4.40 (d, 2H). HPLC: 96%. MS (ESI): 499.0; 501.0; 503.0 (M+1). Exemple 21 ND0027 B NC 26 mg de solide blanc (49%). 'H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.64 (br s, 1H), 10.46 (br s, 1H), 8.36 (d, 1H), 8.25 (d, 1H), 7.74-7.39 (m, 6H), 7.17 (br s, 1H), 6.73 (d, 2H), 6.34 (s, 1H), 4.48 (d, 2H). HPLC: 95%. MS (ESI): 446.0; 448.1 (M+1). Exemple 22 ND0032 29 mg de 4- aminobenzonitrile N-(2-((2-cyanophenylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl) -2-bromobenzamide H 20 mg de solide blanc (44%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.56 (br s, 1H), 10.45 (br s, 1H), 8.35 (d, 1H), 8.23 1 (d, 1H), 7.74-7.33 (m, 6H), 6.80 (m, 1H), 6.69-6.59 (m, 2H), 6.34 (s, 1H), 4.58 (d, 2H). HPLC: 95%. MS (ESI): 446.1; 448.1 (M+1). N-(2-((3-sulfamidophenylamino)methyl)-1 H-pyrro lo[2, 3-b] pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide Br Exemple 23 ND0036 29 mg de 2- aminobenzonitrile Exemple 24 ND0033 H 42 mg de 3- 34 mg de solide b lanc (66%). aminobenzenesulfo 'H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.66 (br namide s, 1H), 10.52 (br s, 1H), 8.41 (d, 1H), 8.30 (d, 1H), 7.81-7.46 (m, 4H), 7.33-7.19 (m, 4H), 7.06 (d, 1H), 6.88 (m, 1H), 6.67 (br s, 1H), 6.40 (s, 1H), 4.51 (d, 2H). HPLC: 95%. MS (ESI): 500.1; 502.1 (M+1).
N-(2-((3-nitrophenylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2, 3-b]pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide Br 02N N H 34 mg de solide jaune (69%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.64 (br s, 1H), 10.46 (br s, 1H), 8.35 (d, 1H), 8.25 (d, 1H), 7.74-7.31 (m, 7H), 7.08 (m, 1H), 6.92 (br s, 1H), 6.36 (s, 1H), 4.50 (d, 2H). HPLC: 96%. MS (ESI): 466.1; 468.1 (M+1). N-(2-((phenylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2, 3-b]pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide B H 41 mg de solide blanc (87%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.56 (br s, 1H), 10.44 (br s, 1H), 8.34 (d, 1H), 8.23 (d, 1H), 7.74-7.40 (m, 4H), 7.07 (t, 2H), 6.66 (d, 2H), 6.55 (t, 1H), 6.33 (s, 1H), 6.07 (br s, 1H), 4.39 (d, 2H). HPLC: 97%. MS (ESI): 421.1; 423.1 (M+1). Exemple 25 ND0034 34 mg de 3-nitroaniline Exemple 26 23 pL d'aniline N D0035 N-(2-((m-toluidino)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyrid in-5-yl)-2-bromobenzamide Br H 37 mg de solide jaune (79%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.60 (br s, 1H), 10.50 (br s, 1H), 8.39 (d, 1H), 8.28 (d, 1H), 7.80-7.46 (m, 4H), 7.00 (t, 1H), 6.54-6.42 (m, 3H), 6.38 (s, 1H), 6.03 (br s, 1H), 4.44 (d, 2H), 2.23 (s, 3H). HPLC: 90%. MS (ESI): 435.1; 437.1 (M+1). Exemple 27 ND0040 26 pL de m- toluidine N-(2-((4-hydroxyphenylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2, 3-b]pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide B HO H 24 mg de solide marron (41%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.51 (br s, 1H), 10.44 (br s, 1H), 8.44 (s, 1H), 8.33 (d, 1H), 8.22 (d, 1H), 7.74-7.40 (m, 4H), 6.53 (s, 4H), 6.32 (s, 1H), 5.43 (br s, 1H), 4.30 (d, 2H). HPLC: 81%. MS (ESI): 437.1; 439.1 (M+1). Exemple 28 ND0038 27 mg de 4-aminophenol N-(2-((3-methoxyphenylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl) -2-bromobenzamide B H 34 mg de solide beige (71%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.55 (br s, 1H), 10.45 (br s, 1H), 8.34 (d, 1H), 8.23 (d, 1H), 7.74-7.40 (m, 4H), 6.97 (t, 1H), 6.33 (s, 1H), 6.28-6.08 (m, 4H), 4.38 (d, 2H), 3.65 (s, 3H). HPLC: 95%. MS (ESI): 451.1; 453.1 (M+1) N-(2-((pyridin-4-ylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl) -2-bromobenzamide Exemple 29 ND0041 27 pL de m- anisidine Exemple 30 ND0029 23 mg de 4-aminopyridine B H 30 mg de solide marron (67%). HPLC: 100%. MS (ESI): 422.0; 424.1 (M+1) N-(2-((1H-pyrrol-2-yl)methyl)-1H-pyrrolo[2, 3-b]pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamide B H 28 mg de solide noir (66%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.50 (br s, 1H), 10.66 (br s, 1H), 10.43 (br s, 1H), 8.32 (d, 1H), 8.20 (d, 1H), 7.74-7.40 (m, 4H), 6.64 (m, 1H), 6.11 (s, 1H), 5.93 (m, 1H), 5.85 (m, 1H), 4.02 (s, 2H). HPLC: 84%. MS (ESI): 395.1; 397.1 (M+1). Exemple 31 17 pL de pyrrole ND0037 N-(2-((1H-imidazol-1-yl)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl) -2-bromobenzamide H 17 mg d'imidazole 15 mg de solide jaune (42%). 'H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.84 (br s, 1H), 10.50 (br s, 1H), 8.40 (d, 1H), 8.32 (d, 1H), 7.77-7.40 (m, 6H), 7.26 (s, 1H), 6.36 (s, 1H), 5.34 (s, 2H). HPLC: 80%. MS (ESI): 396.0; 398.1 (M+1). N-(2-((R)-tetrahyd rofuran-2-yl)methyl)-1 H-pyrrolo [2, 3-b] pyrid i n-5-yl)-2-bromobenzamid H N N H 12 mg de solide jaune (32%). 'H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.47 (br s, 1H), 10.46 (br s, 1H), 8.33 (d, 1H), 8.25 (d, 1H), 7.74-7.40 (m, 4H), 6.30 (s, 1H), 3.87 (m, 1H), 3.76-3.69 (m, 1H), 3.64-3.56 (m, 1H), 2.55 (d, 2H), 1.95-1.73 (m, 3H), 1.57-1.44 (m, 1H). HPLC: 93%. MS (ESI): 429.1; 431.1 (M+1). Exemple 32 ND0031 --N B Exemple 25 pL de (R)- 33 tetrahydrofurfuryla ND0025 mine Tableau 2 ù Inhibiteurs obtenus selon le schéma de synthèse décrit à l'exemple B Exemple 35 : Préparation du 2-bromo-N-(2-(methoxymethyl)-1H-pyrrolo/2,3-bIp yridin-5-yl) benzamide(ND0021) N-(2-(benzylamino)methyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-2-bromobenzamide H 30 mg de solide blanc (57%). 'H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.52 (br s, 1H), 10.51 (br s, 1H), 8.39 (d, 1H), 8.32 (d, 1H), 7.81-7.27 (m, 9H), 6.39 (s, 1H), 3.88 (s, 2H), 3.77 (s, 2H). HPLC: 98%. MS (ESI): 435.1; 437.1 (M+1) Br Exemple 34 N D0028 27 pL de benzylamine B On introduit dans un ballon 200 mg (0.49 mmol) de 2-bromo-N-(2-(bromomethyl)-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide (étape 1) et 5 mL de méthanol. La solution est agitée à température ambiante pendant 18 heures puis diluée dans 100 mL d'acétate d'éthyle, lavée par 3 fois 30 mL d'eau, séchée sur sulfate de sodium et évaporée sous pression réduite. Le produit brut est alors purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/éther de pétrole). On obtient 30 mg d'un solide jaune (17%). ' H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.75 (br s, 1H), 10.54 (br s, 1H), 8.43 (d, 1H), 8.38 (d, 1H), 7.80-7.45 (m, 4H), 6.47 (s, 1H), 4.58 (s, 2H), 3.36 (s, 3H). HPLC: 96%. MS (ESI): 360.1; 362.1 (M+1).20 Exemple 36 : Préparation du quinoxaline-6-carboxylate de (5-(2-bromobenzamido)-1 H-pyrroloj2,3-b]pyridin-2-yl)methyle (ND0022) B On introduit dans un ballon respectivement 50 mg (0.14 mmol) de 2-bromo-N-(2-(hydroxymethyl)-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide AT2-2BF2 (exemple 16), 5 mL de dichlorométhane, 30 mg (0.15 mmol) de chlorure de 6-quinoxalinecarbonyle et 30 pL (0.22 mmol) de triéthylamine. La solution est agitée à température ambiante pendant 18 heures puis diluée dans 60 mL d'acétate d'éthyle, lavée par 10 mL d'une solution saturée en bicarbonate de sodium, 10 mL d'eau, et 10 mL d'une solution saturée en chlorure de sodium. La phase organique est ensuite séchée sur sulfate de sodium et évaporée sous pression réduite. Le produit brut est alors purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/éther de pétrole). On obtient 14 mg d'un solide jaune (24%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.00 (br s, 1H), 10.53 (br s, 1H), 9.10 (s, 2H), 8.77 (s, 1H), 8.45-8.24 (m, 4H), 7.76-7.41 (m, 4H), 6.66 (s, 1H), 5.59 (s, 2H). HPLC: 97%. MS (ESI): 502.1; 504.1 (M+1).
Exemple C : Synthèse d'inhibiteurs en 5 étapes à partir du 5-nitro-IH-pyrrolof2,3-blpyridine-2-carboxylate de méthyle (Schéma 10). Lors de la première étape, l'ester est saponifié par l'hydroxyde de lithium pour conduire à l'acide carboxylique correspondant avec un rendement brut de 52% (Kanth, Sribhashyam R. et al., Heterocycles, 2005, 65 (6), 1415-1423). Cet acide carboxylique est alors transformé en amide par un couplage peptidique à l'aide de chlorhydrate de N-(3-dimethylaminopropyl)-N'-ethylcarbodiimide (EDCI) et de morpholine. L'amide obtenu est alors hydrogéné par du palladium catalytique, pour conduire quantitativement à l'aminoazaindole correspondant.
Ce dernier est alors mis en réaction avec différents chlorures d'acyles, en présence de triéthylamine dans le dimethylformamide, pour mener aux 7-azaindoles souhaités. H2, Pd/C 10% McOH, ta., 18h 100% McO2C LiOH H20/EtOH, reflux, 30 min 52% HO2C N O2 NO2 EDCI, 0,H ^^ ,NO2 DMF, ta., 18h 39% H DMF, t.a., 4h 37-53% ci NH2 NEtä Schéma 10 Etape 1 : Préparation de l'acide 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylique NO2 HO2C On introduit dans un ballon successivement 5 g (22.62 mmol) de 5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (Azasynth), 50 mL d'éthanol à 95%, 50 mL d'eau et 1.63 g (67.92 mmol) d'hydroxyde de lithium. On porte à reflux le mélange réactionnel pendant 30 minutes puis on le laisse revenir à température ambiante. La solution est concentrée sous pression réduite puis diluée dans 200 mL d'eau. La phase aqueuse est extraite par 3 fois 60 mL d'acétate d'éthyle, puis acidifiée à l'aide d'acide chlorhydrique à 32% jusqu'à obtenir un pH compris entre 2 et 3. Le précipité formé est filtré, rincé avec 50 mL d'acétate d'éthyle puis séché sous vide pendant 6h. On obtient 2.45 g d'un solide blanc (52%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 13.60 (br s, 1H), 13.20 (br s, 1H), 9.25 (d, 1H), 9.26 (d, 1H), 7.38 (s, 1H).
Etape 2: Préparation de la morpholino(5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-blpyridin-2-yl)methanone On introduit dans un ballon successivement 600 mg (2.90 mmol) d'acide 5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylique formé lors de l'étape précédente, 10 mL de dimethylformamide (distillé sur hydrure de calcium), 0.5 mL (5.80 mmol) de morpholine et 1.11 g (5.80 mmol) chlorhydrate de N-(3- dimethylaminopropyl)-N'-ethylcarbodiimide (EDCI) sous atmosphère d'argon. La solution est agitée à température ambiante pendant 18 heures. Le solvant est ensuite évaporé sous pression réduite et le produit brut est purifié directement par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/méthanol). On récupère 313 mg d'un solide blanc (39%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 13.04 (br s, 1H), 9.20 (d, 1H), 8.97 (d, 1H), 7.05 (s, 1H), 3.70 (m, 8H).
Etape 3 : Préparation de la (5-amino-1 H-pyrrolo/2, 3-blpyridin-2-yl) (morpholino)methanone On introduit dans une autoclave 313 mg (1.13 mmol) de morpholino(5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridin-2-yl)methanone formée lors de l'étape précédente, 100 mL de méthanol et 31 mg de palladium sur charbon à 10%. On place l'autoclave 25 sous 20 bars d'hydrogène et la solution est agitée à température ambiante pendant 18 heures. La solution est ensuite filtrée sur célite, la célite est rincé par 50 mL de méthanol et le filtrat est évaporé sous pression réduite. On récupère 280 mg d'un solide blanc qui est utilisé dans l'étape suivante sans purification ultérieure (rendement brut quantitatif). NO2 NHZ 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 11.60 (br s, 1H), 7.86 (d, 1H), 7.13 (d, 1H), 6.52 (s, 1H), 4.84 (br s, 2H), 3.68 (m, 8H). Etape 4 : Préparation de la 5-(2-fluoro-5-nitrobenzamido)-2-5 morpholinocarbonyl-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyridine (exemple 37, ND0010) On introduit dans un ballon successivement 100 mg (0.40 mmol) de (5-amino- 10 1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-2-yl)(morpholino)methanone formée lors de l'étape précédente, 5 mL de dimethylformamide (distillé sur hydrure de calcium), 90 mg (0.44 mmol) de chlorure de 2-fluoro-5-nitrobenzoyle et 85 pL (0.60 mmol) de triethylamine sous atmosphère d'argon. La solution est agitée à température ambiante pendant 4 heures. Le solvant est évaporé sous pression réduite et le 15 résidu est repris dans 100 mL d'acétate d'éthyle. La phase organique est rincée par 30 mL d'une solution saturée en bicarbonate de sodium, 30 mL d'eau et 30 mL d'une solution saturée en chlorure de sodium. La phase organique est séchée sur sulfate de sodium et évaporée sous pression réduite. Le produit brut obtenu est purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acetate 20 d'ethyle/methanol) et on obtient 90 mg de solide jaune (53%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.12 (br s, 1H), 10.30 (br s, 1H), 8.51-8.43 (m, 2H), 8.41 (d, 1H), 8.36 (d, 1H), 7.85 (m, 1H), 6.81 (s, 1H), 3.673 (m, 8H). HPLC: 74%. MS (ESI): 414.3 (M+1). 25 Exemple D : Synthèse de l'inhibiteur exemple 38 (ND0005) Le 5-(3-fluorobenzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxamide (Schéma 12) a été obtenu en 3 étapes (Schéma général 11) à partir du 5-nitro-IH- 30 pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (Azasynth). L'ester méthylique de l'azaindole est transformé directement en amide primaire par réaction de l'ammoniaque aqueux sur la fonction ester (Ramasamy, K. et al., Tetrahedron, 1986, 42 (21), 5869-78). La réaction est menée à température ambiante pendant 24h et on obtient le produit attendu avec un rendement de 10% après purification. Le nitroazaindole ainsi obtenu est hydrogéné pour obtenir quantitativement l'aminoazaindole correspondant. Ce dernier conduit au composé exemple 38 (ND0005) par réaction de la fonction amine sur le chlorure de 3-fluorobenzoyle, dans le dimethylformamide en présence de triéthylamine. NH4OH 28% MeOH, t.a., 24h 10% NO2 NO2 Me02C H2N H2, Pd/C 10% MeOH, t.a., 24h H2N 100% DMF, ta., 2.5h 33% NH2 H2N a NEt3, Schéma 11 Ô H Schéma 12 On introduit dans un ballon 300 mg (1.36 mmol) de 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (Azasynth), 7.5 mL de methanol et 15 mL d'une solution d'ammoniaque à 28%. On laisse le mélange réactionnel sous agitation à température ambiante pendant 24 heures. La solution est concentrée sous pression réduite puis diluée avec 100 mL d'une solution saturée de chlorure de sodium. La phase aqueuse est extraite par 3 fois 30 mL d'acétate d'éthyle. Les phases organiques sont réunies, séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. Le produit brut obtenu est purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acetate d'ethyle/ether de petrole). On obtient 30 mg d'un solide jaune (10%).
On introduit dans une autoclave 30 mg (0.14 mmol) de 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxamide formé précédemment, 100 mL de méthanol et 10 mg de palladium sur charbon à 10%. On place l'autoclave sous 20 bars d'hydrogène et la solution est agitée à température ambiante pendant 2 heures. La solution est ensuite filtrée sur célite. La célite est rincé par 50 mL de méthanol et le filtrat est évaporé sous pression réduite. On récupère 25 mg d'un solide jaune qui est utilisé dans l'étape suivante sans purification ultérieure (rendement brut quantitatif).
On introduit dans un ballon successivement 25 mg (0.14 mmol) de 5-amino-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxamide formé précédemment, 3 mL de dimethylformamide (distillé sur hydrure de calcium), 19 pL (0.16 mmol) de chlorure de 3-fluorobenzoyle et 30 pL (0.21 mmol) de triethylamine sous atmosphère d'argon. La solution est agitée à température ambiante pendant 2.5 heures. Le solvant est évaporé sous pression réduite et le résidu est repris dans 100 mL d'une solution saturée en bicarbonate de sodium. La phase aqueuse est extraite par 3 fois 30 mL d'acétate d'éthyle. Les phases organiques sont réunies, séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. Le produit brut obtenu est purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle) et on obtient 14 mg de solide beige (33%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.04 (br s, 1H), 10.44 (br s, 1H), 8.57 (d, 1H), 8.45 (d, 1H), 7.98 (br s, 2H), 7.89-7.43 (m, 4H), 7.12 (s, 1H). HPLC: 56%. MS (ESI): 299.2 (M+1).
Exemple E : Synthèse de d'inhibiteurs à partir du 5-amino-1H-pyrrolo[2,3-blpyridine-2-carboxylate de méthyle Le schéma 13 montre le schéma général de synthèse. L'aminoazaindole est transformé en amides en faisant réagir différents chlorures d'acyles sur la fonction amine. Les amides ainsi obtenus sont saponifiés par action de l'hydroxyde de potassium à reflux dans un mélange eau-méthanol, et conduisent aux composés décrits dans les exemples 39 à 43 en faisant réagir la fonction acide sur différents alcools et amines.
NH2 KOH H2aMeOH, reflux, 2h HO2C DCM, ta., 18h ou 1) SOCl2, reflux, 30 min 2) R'R2NH, NEt3 DMF, t.a., 18h DCC, DMAP, R3OH R'--O DMF, ta., 18h
Schéma 13
Exemple 39 : Préparation du 5-(2-bromobenzamido)-N-(3-(dimethylamino) 5 propyl)-1 H-pyrroloj2, 3-b]pyridine-2-carboxamide (ND0009) On introduit dans un ballon successivement 425 mg (1.14 mmol) de 5-(2- 10 bromobenzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (exemple 6), 20 mL de méthanol, 20 mL d'eau et 127 mg d'hydroxyde de potassium. On porte à reflux le mélange réactionnel pendant 2 heures puis on le laisse revenir à température ambiante. La solution est concentrée sous pression réduite puis diluée dans 200 mL d'eau. La phase aqueuse est extraite par 3 fois 60 mL 15 d'acétate d'éthyle, et acidifiée à l'aide d'acide chlorhydrique à 32%, jusqu'à obtenir un pH compris entre 2 et 3. La phase aqueuse est extraite à nouveau par 3 fois 60 mL d'acétate d'éthyle. Les phases organiques sont réunies, séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. On obtient 250 mg d'un solide beige qui est utilisé directement sans purification. 20 On place dans un ballon successivement 250 mg (0.70 mmol) du solide formé précédemment, 25 mL de dimethylformamide (distillé sur hydrure de calcium), 96 pL (0.76 mmol) de 3-(dimethylamino)-1-propylamine, 3.28 mL (23.05 mmol) de triethylamine et 94 mg (0.70 mmol) d'hydroxybenzotriazole. On laisse agiter 15 minutes à température ambiante puis on ajoute 160 mg (0.83 mmol) de chlohydrate de N-(3-dimethylaminopropyl)-N'-ethylcarbodiimide (EDCI). La réaction est laissée sous agitation pendant encore 18h. Le solvant est alors évaporé sous pression réduite et le résidu est repris dans 100 mL d'eau. On extrait la phase aqueuse par 6 fois 50 mL de dichloromethane, on réunit les phases organiques qui sont ensuite séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. Le produit brut est purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/méthanol). On obtient 98 mg de solide beige (20% à partir du 5-(2-bromobenzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle). 1H NMR (300 MHz, CD3OD): 8.40 (s, 2H), 7.62-7.27 (m, 4H), 6.97 (s, 1H), 3.34 (t, 2H), 2.33 (t, 2H), 2.17 (s, 6H), 1.74 (m, 2H).
HPLC: 95%. MS (ESI): 442.2; 446.2 (M+1).
Exemple 40 : Préparation du 5-(3-(2-methylthiazol-4-yl)benzamido)-N-(3-(dimethylamino)propyl)-1 H-pyrrolol.2,3-b]pyridine-2-carboxamide (ND0011) Le composé est préparé selon le protocole décrit dans l'exemple 39 en utilisant 150 mg de 5-(4-(2-methylthiazol-4-yl)benzamido)-IH-pyrrolo[2,3-b] pyridine-2-carboxylate de methyle (exemple 8) à la place du 5-(2-bromobenzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle AT10-3A. Après traitement, on obtient 73 mg de solide beige (22% sur 2 étapes). 1H NMR (300 MHz, CD3OD): 8.50-8.39 (m, 2H), 7.97 (m, 4H), 7.74 (s, 1H), 7.01 (s, 1H), 3.40 (t, 2H), 2.69 (s, 3H), 2.60 (t, 2H), 2.06 (s, 6H), 1.85 (m, 2H). HPLC: 80%. MS (ESI): 463.3 (M+1).
Exemple 41 : Préparation du N-(2-(3-(dimethylamino)propylcarbamoyl)-1H-pyrroloÎ2, 3-bipyridin-5-yl)quinoxaline-6-carboxamide (ND0012) Etape 1 : Préparation du 5-(quinoxaline-6-carboxamido)-1 H-pyrroloï2, 3-5 bipyridine-2-carboxylate de methyle McOZC Le composé est préparé selon le protocole décrit dans l'exemple 1 (étape 2) en utilisant 55 mg de chlorure de quinoxaline-6-carbonyle à la place du chlorure de cyclopropanecarbonyle. Après traitement, on obtient 42 mg de solide beige 10 (60%).
Etape 2: Préparation du N-(2-(3-(dimethylamino)propylcarbamoyl)-1H-pyrrolo%2, 3-bipyridin-5-yl) quinoxaline-6-carboxamide Le composé est préparé selon le protocole décrit dans l'exemple 39 en utilisant 42 mg de 5-(quinoxaline-6-carboxamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle décrit précédemment à la place du 5-(2- 20 bromobenzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle. Après traitement, on obtient 7 mg de solide beige (15% sur 2 étapes). 1H NMR (300 MHz, CD3OD): 8.89 (m, 2H), 8.65 (s, 1H), 8.52 (m, 1H), 8.45 (m, 1H), 8.30 (d, 1H), 8.14 (d, 1H), 6.99 (s, 1H), 3.36 (t, 2H), 2.40 (t, 2H), 2.22 (s, 6H), 1.74 (m, 2H). 25 HPLC: 83%. MS (ESI): 418.3 (M+1). 15 Exemple 42 : Préparation du 5-(benzamido)-1H-pyrroloj2,3-b]pyridine-2-carboxylate de 4-methoxyphenyle (ND0004) Etape 1: Préparation du 5-(benzamido)-1 H-pyrrolo[2, 3-b]pyndine-2-5 carboxylate de methyle McOZC Le composé est préparé selon le protocole décrit dans l'exemple A (étape 2) en utilisant 200 mg (1.04 mmol) de 5-amino-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle et 121 pL (1.04 mmol) de chlorure de benzoyle à la 10 place du chlorure de cyclopropanecarbonyle. Après traitement, on obtient 170 mg de solide beige (55%).
Etape 2: Préparation du 5-(benzamido)-1 H-pyrrolo(2,3-blpyridine-2-carboxylate de 4-methoxyphenyle On introduit dans un ballon 100 mg (0.34 mmol) de 5-(benzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle décrit précédemment, 20 mL de 20 methanol, 20 mL d'eau et 200 mg (3.40 mmol) d'hydroxyde de potassium. On porte le mélange réactionnel à 60°C pendant 30 minutes puis on le laisse revenir à température ambiante. La solution est concentrée sous pression réduite puis diluée dans 100 mL d'eau. La phase aqueuse est extraite par 3 fois 30 mL d'acétate d'éthyle, puis acidifiée à l'aide d'acide chlorhydrique à 32% 25 jusqu'à obtenir un pH compris entre 2 et 3. La phase aqueuse est extraite à nouveau par 3 fois 30 mL d'acétate d'éthyle. Les phases organiques sont réunies, séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. On obtient 85 mg de solide blanc qui est utilisé directement sans purification. 15 On place dans un ballon successivement 85 mg (0.30 mmol) du solide formé précédemment, 20 mL de tetrahydrofurane, 68 mg (0.38 mmol) de pmethoxyphenol, 90 mg (0.30 mmol) de N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (DCC) et 27 mg (0.15 mmol) de 4-dimethylaminopyridine (DMAP). On laisse agiter pendant 18 heures. Le solvant est évaporé sous pression réduite et le résidu est repris dans 100 mL d'eau. On extrait la phase aqueuse par 3 fois 30 mL d'acétate d'éthyle, on réunit les phases organiques qui sont séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. Le produit brut est purifié par chromatographie sur gel de silice (éluant acétate d'éthyle/éther de pétrole). On obtient 17 mg de solide beige (10% à partir du 5-(benzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.40 (br s, 1H), 10.52 (br s, 1H), 8.77 (d, 1H), 8.67 (d, 1H), 8.08 (d, 2H), 7.68-7.60 (m, 3H), 7.49 (s, 1H), 7.32 (d, 2H), 7.08 (d, 2H).
Exemple 43 : Préparation du 5-(3-fluorobenzamido)-N-(2-morpholinoethvi)-1 H-pyrrolof2, 3-bjpyridine-2-carboxamide (ND0006) On introduit dans un ballon 865 mg (2.76 mmol) de 5-(3-fluorobenzamido)-9H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle (exemple 5), 20 mL d'ethanol, 20 mL d'eau et 464 mg (8.30 mmol) d'hydroxyde de potassium. On porte le mélange réactionnel à 60°C pendant 30 minutes puis on le laisse revenir à 25 température ambiante. La solution est concentrée sous pression réduite puis diluée dans 200 mL d'eau. La phase aqueuse est extraite par 3 fois 60 mL d'acétate d'éthyle et acidifiée à l'aide d'acide chlorhydrique à 32% jusqu'à obtenir un pH compris entre 2 et 3. La phase aqueuse est extraite à nouveau par 5 fois 50 mL d'acétate d'éthyle. Les phases organiques sont réunies, 30 séchées sur sulfate de sodium et évaporées sous pression réduite. On obtient20 590 mg de solide blanc qui est utilisé directement sans purification (rendement brut de 71%).
On place dans un ballon 280 mg (0.93 mmol) du solide formé précédemment avec 5 mL de chlorure de thionyle sous atmosphère d'argon. La réaction est portée à reflux pendant 1 heure puis on laisse revenir à température ambiante. Le solvant est alors évaporé sous pression réduite et on ajoute au mélange 10 mL de dimethylformamide (distillé sur hydrure de calcium), 0.2 mL (1.40 mmol) de triethylamine et 135 pL (1.03 mmol) de 4-(2-aminoethyl)morpholine. On agite à température ambiante pendant 2 heures et on évapore le solvant sous pression réduite. Le résidu est repris dans 100 mL d'acétate d'éthyle. La phase organique est rincée par 30 mL d'une solution saturée en bicarbonate de sodium, puis par 3 fois 30 mL d'eau. On sèche la phase organique sur sulfate de sodium et on évapore sous pression réduite le solvant. On obtient 48 mg de solide jaune (13%). 1H NMR (300 MHz, DMSO d6): 12.09 (br s, 1H), 10.43 (br s, 1H), 8.55 (d, 1H), 8.46 (d, 1H), 8.44 (br s, 1H), 7.87-7.78 (m, 2H), 7.65-7.58 (m, 1H), 7.50-7.43 (m, 1H), 7.09 (s, 1H), 3.58 (t, 4H), 3.42 (m, 2H), 3.31 (m, 2H), 2.42 (t, 4H). HPLC: 85%. MS (ESI): 412.2 (M+1).
Exemple F : Essais in vitro d'inhibition des kinases
Les figures 1 à 10 représentent les courbes d'inhibition de l'activité kinase Abl pour les composés. La figure 1 représente les effets du composé ND0006 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 2 représente les effets du composé ND0009 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 3 représente les effets du composé ND0019 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 4 représente les effets du composé ND0020 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 5 représente les effets du composé ND0021 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 6 représente les effets du composé ND0029 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 7 représente les effets du composé ND0031 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 8 représente les effets du composé ND0037 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 9 représente les effets du composé ND0038 sur l'activité de la kinase humaine Abl. La figure 10 représente les effets du composé ND0047 sur l'activité de la kinase humaine AbI. La figure 11 représente les effets du composé ND0009 sur l'activité de la kinase humaine Src. Les résultats sont exprimés en pourcentage de l'activité spécifique du contrôle obtenu en présence du composé testé. Les IC50 et coefficient de Hill (nH) obtenus sont mentionnés au-dessus de chaque courbe. La figure 12 représente la courbe d'inhibition de la prolifération cellulaire sur les cellules K562 exprimant la kinase Bcr-Abl. Les résultats sont exprimés en pourcentage de cellules viables (analyse MTT) après 72 h de traitement avec le composé ND0009 à différentes concentrations exprimées en Mol/L. L'activité inhibitrice des composés de la série chimique sur différentes protéines kinases a été évaluée par Cerep (Cerep Kinase Profiling Service ; www.cerep.com). Les kinases utilisées dans les tests in vitro sont des protéines recombinantes humaines exprimées en cellules humaines, cellules d'insecte ou en bactéries. Les références des kinases testées sont indiquées dans le tableau suivant. Essai Origine Composé de Bibliographie référence AbI kinase Recombinante humaine Staurosporine 1 (h) (cellules d'insecte) AurA/Aur2 Recombinante humaine Staurosporine 2 kinase (h) (cellules Sf21) c-kit Recombinante humaine Staurosporine 3 kinase (h) (cellules d'insecte) PDGFRa Recombinante humaine Staurosporine 4 kinase (h) (cellules d'insecte) Src kinase Recombinante humaine Staurosporine 5 (h) (cellules d'insecte) (1. Park, Y.W. et al., Homogeneous proximity tyrosine kinase assays: scintillation proximity assay versus homogeneous time-resolved fluorescence. Anal Biochem, 269, 94-104(1999), 2. Sun, C. et al., High-throughput screening assay for identification of small molecule inhibitors of Aurora2/STK15 kinase. J Biomol Screen 9, 391-7(2004), 3. Blume-Jensen, P. et al., Identification of the major phosphorylation sites for protein kinase C in kit/stem cell factor receptor in vitro and in intact cells. J Biot Chem 270, 14192-200(1995); 4. Songyang, Z. et al., Catalytic specificity of protein-tyrosine kinases is critical for selective signalling. Nature 373, 536-9(1995); 5. Cheng, H.C. et al., A synthetic peptide derived from p34cdc2 is a specific and efficient substrate of src-family tyrosine kinases. J Biot Chem 267, 9248-56(1992)).
Chaque protéine kinase recombinante a été incubée avec son substrat approprié biotinylé en présence de 0.05-20 pM d'ATP (0.3 à 3 fois le Km de la kinase individuelle) à 22 °C pendant 15 à 90 minutes selon la kinase testée. L'activité de la kinase a alors été détectée par un essai HTRF.
L'essai HTRF (CisBio International) est basé sur le transfert de fluorescence, utilisant l'Europium (Eu3+) cryptate et XL665 respectivement comme donneur et accepteur. Lorsque le substrat biotinylé ou taggé est phosphorylé par la kinase, il réagit avec un anticorps phosphospécifique marqué au cryptate. L'ajout de Streptavidine-XL665, SA-XL665, (ou anticorps anti-tag XL665) entraine la juxtaposition du cryptate et du fluorophore XL665 ceci se traduit par un transfert d'énergie de fluorescence par résonance (FRET). L'intensité du FRET dépend de la quantité d'anticorps marqué au cryptate liée au substrat, qui est proportionnelle à la quantité de substrat phosphorylé (Mathis, G. Probing molecular interactions with homogeneous techniques based on rare earth cryptates and fluorescence energy transfer. Clin Chem 41, 1391-7(1995)).
Afin de déterminer la capacité d'inhibition d'un composé sur une kinase, le composé a été incubé à la concentration de 10 pM avec l'activité kinase à évaluer. Les résultats obtenus (tableau 3 et 4) présentent donc le pouvoir d'inhibition d'un composé, à 10 pM sur la kinase, exprimé en pourcentage d'inhibition.
Ensuite, la détermination des IC50 (concentration du composé inhibant 50 % de l'activité kinase) a été effectuée en utilisant le même test (Cerep) et en incubant 5 concentrations croissantes comprises entre 10"10 M et 10"4 M du composé. Les résultats sont présentés dans le tableau 5 et sur les figures 1 à 11.
• Essais kinases in vitro sur Abl mutées : Des IC50 ont été déterminées par la société Reaction Biology Corp. (USA) en duplicate pour certains composés sur des mutants de la kinase AbI (Q252H, Y253F et T3151). 5 concentrations croissantes comprises entre 10-8 M et 104 M de chaque composé ont été incubées avec une des kinases en présence d'ATP à 10 pM selon le protocole de la société Reaction Biology Corp. Les résultats sont présentés dans le tableau 6.
• Tests in vitro d'inhibition de la prolifération cellulaire Les tests cellulaires ont été effectués au sein de l'institut de recherche en cancérologie de Montpellier. L'inhibition de la prolifération par nos composés a été analysée sur 2 lignées cellulaires (U937 et K562) par calcul de l'IC50 en testant 6 concentrations en triplicate pour chacun des composés et pour chaque lignée.
L'Imatinib, dont l'activité connue est décrite dans le tableau suivant, a été utilisé comme contrôle positif des tests.30 Lignée Caractéristiques Origine cellules Action Imatinib cellulaire U937 BCR-Abl" Précurseurs Pas d'effet myéloïdes K562 BCR-Abl+ Patient atteint de Sensibles LMC Les composés (Imatinib et composé(s) de la présente invention) ont été dilués à 10 mm en DMSO. Les cellules en phase exponentielles ont été ensemencées en plaques 96 puits à la concentration de 104 cellules / 100 pL / puits. Les concentrations finales de composé dans le puits en contact avec les cellules ont été de 0.1 ; 0.3 ; 0.9 ; 3.3 ; 10 ; 30 ; 90 pM. Les contrôles négatifs et positifs ont été respectivement le DMSO (dont la concentration finale ne doit pas dépasser 5 % du volume final du puits) et l'Imatinib. Les cellules ont été traitées avec le composé pendant 72 h (les cellules sont traitées 3 fois, une fois toutes les 24 h) avant d'être lavées et analysées à l'aide d'un kit MU (3-[4,5-dimethylthiazol-2-yl]-2,5-diphenyl tetrazolium bromide) permettant de déterminer la prolifération cellulaire.
• Résultats biologiques Pourcentages d'inhibition de la kinase Abl par différents composés de la classe chimique inventée Les résultats, présentés dans le tableau 3, exposent le pourcentage d'inhibition de l'activité kinase d'Abl en fonction du composé incubé. 25 Identifiant % d'inhibition de la Identifiant du % d'inhibition de du composé kinase Abl composé la kinase Abl ND0004 31 ND0033 53 ND0005 10 ND0034 17 ND0006 33 ND0035 16 ND0009 100 ND0036 47 ND0037 97 ND0010 1 ND0038 94 ND0011 6 ND0040 21 ND0012 8 ND0041 14 N D0019 82 N D0044 6 ND0045 58 ND0020 85 ND0046 49 ND0021 94 ND0047 94 ND0022 5 ND0050 27 ND0023 36 ND0051 20 ND0024 18 ND0053 33 ND0025 39 ND0054 15 ND0026 8 ND0059 5 ND0027 29 ND0060 16 ND0028 14 ND0061 46 ND0029 77 ND0062 6 ND0030 26 ND0063 8 ND0031 86 ND0064 12 ND0032 27 35 Tableau 3 - Essais kinases in vitro. Chaque composé a été incubé à 10 NM. Le pourcentage d'inhibition de l'activité kinase est indiqué.
Les tests d'inhibition kinase in vitro mettent en évidence plusieurs structures moléculaires inhibitrices de kinases : 11 composés inhibent l'activité kinase 40 d'Abl à hauteur d'au moins 50%. II faut noter que 11 composés présentent 10 15 20 25 30 également une activité inhibitrice de la kinase comprise entre 25 et 50 % à la concentration de 10 NM. Le produit de référence pour le traitement de la LMC, de l'ALE et des GIST, l'imatininib, est capable d'inhiber, outre Bcr-Abl, les kinases c-kit et PDGFRa. Les composés de seconde et de troisième génération (Dasatinib, Nilotinib, Bosutinib) sont quant à eux capables d'inhiber, outre Bcr-Abl, les kinases Aurora-A et/ou c-Src. Une analyse a été réalisée pour plusieurs des composés de l'invention concernant leur capacité à inhiber une ou plusieurs de ces kinases. Les résultats sont présentés dans le tableau 4 suivant. % d'inhibition de la kinase Abl c-kit c-Src Aurora-A PDGFR-a ND0009 100 44 90 5 11 N D0020 85 10 50 5 0 ^ ND0021 94 ND 59 ND ND ND0037 97 ND 72 ND ND ND0038 94 ND 71 ND ND ND0047 94 ND 74 ND ND Tableau 4 - Essais kinases in vitro. Chaque composé a été incubé à 10 NM. Le pourcentage d'inhibition de l'activité kinase est indiqué en fonction de la kinase 15 testée. ND = Non déterminé.
Ces tests montrent une forte activité de quelques composés envers les kinases Abl et c-Src.
20 Détermination des IC50 des composés d'intérêt en tests kinase in vitro
L'évaluation de l'IC50 a été effectuée pour chaque composé présentant une structure moléculaire ainsi qu'une activité inhibitrice d'intérêt. Les résultats 69 obtenus sont présentés sous la forme d'un tableau (tableau 5) et de courbes exposées sur les figures 1 à 11. Abl c-Src IC50 en M ND-0006 > 1.104 NT ND-0009 3,9.10-" 2,2.10-6 ND-0010 > 1.10-4 NT ND-0011 > 1.104 NT ND-0019 6,2.10 NT ND-0020 4,6.10"7 NT ND-0021 2,3.10-6 NT ND-0029 1,1.10"5 NT ND-0031 4.10-6 NT ND-0037 1,4.10-6 NT N D-0038 2,6.10-6 NT N D-0047 4.10-' NT Tableau 5 - IC50 obtenues en M (tests in vitro) sur la kinase Abl. (NT = non testé).
Ces résultats confirment les résultats précédemment obtenus et mettent à jour le potentiel inhibiteur de plusieurs composés de la classe chimique. Essais kinases in vitro sur Abl mutées Les 4 composés présentant la meilleure IC50 sur la kinase Abl WT ont été testés pour leur capacité inhibitrice de différentes kinases Abl mutées (Société Américaine, Reaction Biology Corp.).
IC50 en nM Abl WT Abl Q252H Abl Abl T315I Y253F ND-0009 709.2 21.81 28.01 > 100 000 ND-0020 44.56 < 10 < 10 > 100 000 ND-0037 654.5 68.13 84.96 63330 ND-0047 381.7 18.28 18.43 > 100 000 Tableau 6 - IC50 obtenues en nM (tests in vitro) sur la kinase Abl sauvage (WT) ou mutées (Q252H, Y253F et T3151). Détermination des IC50 des composés d'intérêt en test de prolifération cellulaire
La capacité du composé ND0009 à inhiber la prolifération des cellules malignes 10 exprimant (K562) ou non (U937) la kinase Bcr-Abl a été analysée en déterminant l'IC50 correspondant à la concentration de composé inhibant la croissance cellulaire à hauteur de 50%. Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau 7 suivant et figure 12. IC50 (pM) K562 U937 ND0009 6 > 100 Imatinib 0,1 9 15 Tableau 7 - IC50 obtenues en pM (tests cellulaires) sur les lignées cellulaires K562 et U937. Le composé ND0009 est actif sur les cellules Bcr-Abl+ (K562) et non sur les cellules Bcr-Abl- (U937), il présente une spécificité cellulaire similaire à celle de 20 l'Imatinib.5

Claims (16)

  1. REVENDICATIONS1. Composés de formule générale I : R2 Formule I dans laquelle, R représente : - un groupe NHCOR1, ou 20 - un groupe NR3R4 avec, R' représente : - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou 25 polysubstitué par : - un atome d'halogène, de préférence le brome, le fluor ou le chlore, - un groupe nitro, - un groupe cyano, - un groupe méthylthiazyle, 30 - un groupe alkoxy, de préférence methoxy, un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un groupe aryloxy, de préférence phényloxy, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluorométhyle, - un groupe sulfonamide substitué ou non, de préférence N- 35 methylsulfonamide, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazyle éventuellement mono ou poly substitué par un atome d'halogène, de préférence le chlore, - ou un groupe choisi parmi les groupes A, B, C ou D tels que définis ci-dessous: 10 15F A B O S, N7\0 O H C 20 25 30 D - un groupe hétéroaryle de préférence - un groupe pyridyle éventuellement mono ou poly substitué par un groupe sulfanyle de préférence propylsulfanyle, - un groupe thiophènyle, - un groupe thiazyle, - un groupe imidazyle, - un groupe pyrazyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkyle, de préférence méthyle, - un groupe quinoxaline, - un groupe dihydrobenzofurannyle, ou - un groupe indyle, - un groupe cycloalkyle de préférence cyclopropyle,- un groupe alkyle, de Cl à C6, linéaire ou ramifié, de préférence éthyle, isopropyle, ou - un groupe arylalkyle, de Cl à C6, de préférence phénylalkyle, de préférence phénylméthyle, éventuellement mono ou poly substitué par un groupe alkoxy 5 de préférence méthoxy, et/ou un atome d'halogène de préférence le brome. R2 représente : - un groupe ester COOR14 - un groupe alkyle CH2R9, CH2OCOR10, CH2NR11R12, 10 - un groupe amide CONR7R8, ou - un groupe COR13. R7 et R8, identiques ou différents représentent : - un atome d'hydrogène, 15 - un groupe aminoalkyle de Cl à C6 de préférence N,N- diméthylaminopropyle, ou - un groupe morpholinoalkyle en Cl à C6 de préférence N-morpholinoéthyle, R9 représente : 20 - un groupe hétéroaryle de préférence imidazyle ou pyrryle, - un groupe hétérocyclique, de préférence N-morpholinyle ou tetrahydrofurannyle, - un groupe alkoxy de préférence méthoxy, ou - un groupe hydroxy, 25 R10 représente : - un groupe hétéroaryle de préférence quinoxaline, R11 et R12 identiques ou différents représentent : 30 - un atome d'hydrogène, - un groupe alkyle, en Cl à C6, linéaire ou ramifié de préférence terbutyle,- un groupe arylalkyle, de préférence phénylalkyle, de préférence phénylméthyle, - un groupe alkoxyalkyle, en Cl à C6 de préférence méthoxyéthyle, - un groupe cycloalkyle de préférence cyclohexyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou polysubstitué par: - un atome d'halogène, de préférence brome, - un groupe cyano, - un groupe sulfonamide, - un groupe nitro, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, ou - un groupe hydroxy, ou un groupe hétéroaryle de préférence un groupe pyridyle , R13 représente un groupe hétérocycle de préférence N-morpholyle, R14 représente : - un groupe alkyle en Cl à C6 linéaire ou ramifié, de préférence méthyle, ou - un groupe aryle, de préférence phényle éventuellement substitué par un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, R3, R4 identiques ou différents représentent : - un atome d'hydrogène, - un groupe CH2R15, - un groupe hétéroaryle pyridyle, indyle, benzoimidazyle, pyrazyle éventuellement substitué par un groupe alkyle, en Cl à C6, de préférence méthyle, ou - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou polysubstitué par: - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy,- un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un atome d'halogène, de préférence le brome, - un groupe trifluoroalkyle, de préférence trifluorométhyle, - un groupe CONHalkyle, de préférence CONHméthyle, - un groupe NHCOalkyle de préférence NHCOméthyle, - un groupe sulfonamide, ou - un groupe méthanesulfonamide, R15 représente : - un groupe aryle de préférence phényle éventuellement mono ou poly substitué par: - un atome d'halogène de préférence brome, chlore, - un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, - un groupe trifluoroalkoxy, de préférence trifluorométhoxy, - un groupe alkyle en Cl à C6, de préférence méthyle, - un groupe trifluoro alkyle en Cl à C6, de préférence trifluorométhyle, - un groupe hétéroaryle, de préférence pyridazinyle éventuellement mono ou poly substitué par un atome d'halogène, de préférence chlore, - un groupe sulfonamide, ou - un groupe méthanesulfonamide, - un groupe hétéroaryle de préférence : - un groupe thiophènyle, - un groupe thiazyle, - un groupe imidazyle, - un groupe indyle, - un groupe pyrazyle, - un groupe pyridyle éventuellement mono ou polysubstitué par un groupe alkoxy, de préférence méthoxy, ou - un groupe choisi parmi les groupes A, B, C et D tels que définis ci-dessus. 20 25 30
  2. 2. Composé selon la revendication 1 de formule générale Il O NH-' R1 R2 N H Formule Il R1 et R2 tels que précédemment définis. 15
  3. 3. Composé selon la revendication 1 de formule générale III i R3 N, R4 R2 N N H Formule III R2, R3 et R4 tels que précédemment définis. 20
  4. 4. Composé selon l'une quelconque des revendications précédentes utilisés en tant qu'ihnibiteur de protéines kinases dans les maladies choisies dans le groupe constitué par les désordres myéloprolifératifs chroniques ou aigus, le cancer colorectal, les cancers gastro intestinaux, le cancer du sein, le 25 cancer ovarien, le cancer du poumon.
  5. 5. Composé selon la revendication 4, caractérisé en ce que la protéine kinase est la kinase Abl. 30
  6. 6. Composé selon la revendication 4, caractérisé en ce que la protéine kinase est la kinase c-Src.
  7. 7. Composé selon l'une quelconque la revendication 1, caractérisé en ce qu'il est choisi dans le groupe constitué par le 5-(2-bromobenzamido)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle, le 5-(2-fluoro-6-methoxybenzamido)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de methyle, le N-(2-((4-hydroxyphenylamino)methyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-2-bromobenzamide, le N-(2-((1 H-pyrrol-2-yl)methyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin- 5-yl)-2-bromobenzamide, le 2-bromo-N-(2-(methoxymethyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)benzamide, ou le 5-(2-bromobenzamido)-N-(3-(dimethylamino) propyl)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxamide.
  8. 8. Médicament caractérisé en ce qu'il comprend comme principe actif un 10 composé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3.
  9. 9. Médicament selon la revendication 8 caractérisé en ce qu'il est utilisé dans le cas de dérégularisation de protéines kinases dans les maladies choisies dans le groupe constitué par les désordres myéloprolifératifs chroniques ou 15 aigus, le cancer colorectal, les cancers gastro intestinaux, le cancer du sein, le cancer ovarien, le cancer du poumon.
  10. 10. Composition pharmaceutique caractérisée en ce qu'elle comprend comme principe actif un composé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3 20 et un excipient pharmaceutiquement acceptable.
  11. 11. Composition selon la revendication 10 caractérisée en ce qu'elle est utilisée dans le cas de dérégularisation de protéines kinases dans les maladies choisies dans le groupe constitué par les désordres myéloprolifératifs 25 chroniques ou aigus, le cancer colorectal, les cancers gastro intestinaux, le cancer du sein, le cancer ovarien, le cancer du poumon.
  12. 12. Procédé de préparation des composés selon la revendication 1 caractérisé en ce qu'il comprend au moins les étapes de : 30 a) hydrogénation catalytique du 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle, en présence de palladium sur charbon et sous atmosphère d'hydrogèneb) réaction de l'amine formée avec différents chlorures d'acyles pour conduire aux amides correspondants avec des rendements allant de 15 à 74% après purification sur gel de silice et c) obtention et caractérisation du composé.
  13. 13. Procédé de préparation des composés selon la revendication 1 caractérisé en ce qu'il comprend au moins les étapes de : a) réduction sélective de la fonction ester du 5-(2-bromobenzamido)-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyrid ine-2-carboxylate de methyle par l'hydrure de 10 lithium aluminium à température ambiante, b) transformation de l'alcool en bromure d'alcane par PBr3, à température ambiante pendant 18h dans le THF (rendement brut de 81 %) cette réaction est suivie des étapes c) ou d) suivantes c) mise en solution dans le méthanol, pour conduire au 15 méthoxyazaindole obtenu par réaction du solvant sur la fonction halogénée, à température ambiante d) réaction du bromure d'alcane avec une amine primaire ou secondaire dans le dimethylformamide anhydre, à température ambiante pendant 18h, pour conduire aux 7-azaindoles 20 correspondants avec des rendements allant de 9 à 96% après purification sur gel de silice et e) obtention et caractérisation du composé.
  14. 14. Procédé de préparation des composés selon l'une des revendications 1 25 caractérisé en ce qu'il comprend au moins les étapes de : a) saponification de l'ester du 5-nitro-IH-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle par l'hydroxyde de lithium, b) couplage peptidique à l'aide de chlorhydrate de N-(3-dimethylaminopropyl)-N'-ethylcarbodiimide (EDCI) et de morpholine, 30 c) hydrogénation de l'amide obtenu par du palladium catalytique,d) réaction du composé obtenue avec différents chlorures d'acyles, en présence de triéthylamine dans le dimethylformamide, pour mener aux 7-azaindoles souhaités, et e) obtention et caractérisation du composé.
  15. 15. Procédé de préparation de composé selon l'une des revendications 1 caractérisé en ce qu'il comprend au moins les étapes de : a) réaction du 5-nitro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle avec l'ammoniac aqueux à température ambiante pendant 24 heures 10 pour obtenir l'amide primaire d'azaindole, b) hydrogénation du composé obtenu sur Pd/C, c) réaction avec 3-fluorobenzoyle pour donner le composé souhaité, et d) obtention et caractérisation du composé. 15
  16. 16. Procédé de préparation de composé selon l'une des revendications 1 caractérisé en ce qu'il comprend au moins les étapes de : a) réaction du 5-amino-1 H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylate de méthyle avec différents chlorures d'acyles, b) saponification des composés obtenus par action de l'hydroxyde de 20 potassium à reflux dans un mélange eau-méthanol, c) réaction du composé obtenu sur différents alcools ou amines, et d) obtention et caractérisation du composé.
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