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ES2857998T3 - Receptores de antígenos quiméricos - Google Patents

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ES2857998T3
ES2857998T3 ES16748518T ES16748518T ES2857998T3 ES 2857998 T3 ES2857998 T3 ES 2857998T3 ES 16748518 T ES16748518 T ES 16748518T ES 16748518 T ES16748518 T ES 16748518T ES 2857998 T3 ES2857998 T3 ES 2857998T3
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Naoto Hirano
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University Health Network
Takara Bio Inc
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Abstract

Un receptor de antígenos quiméricos (CAR) que comprende: i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado; ii) un dominio transmembrana; y iii) un segmento intracelular que comprende a) un dominio citoplasmático truncado de la cadena beta del receptor de interleucina-2 que corresponde a la SEQ ID NO: 5 y b) un dominio intracelular de CD3ζ caracterizado por tener un motivo de asociación a STAT3 exógeno que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en las posiciones 104-107 de la SEQ ID NO: 7.

Description

DESCRIPCIÓN
Receptores de antígenos quiméricos
Solicitud relacionada
Esta es una solicitud de Tratado de Cooperación de Patentes que reivindica el beneficio de 35 USC § 119 en base a la prioridad de la solicitud provisional de Estados Unidos núm. 62/115,527 presentada el 12 de febrero de 2015. Incorporación del listado de secuencias
Una forma legible por ordenador del Listado de Secuencias "P47312PC00_ST25.txt" (45,782 bytes) creado el 11 de febrero de 2016 se incorpora aquí como referencia.
Campo técnico
La presente descripción se refiere a receptores de antígenos quiméricos (CAR) mejorados y, en particular, a CAR que comprenden un segmento intracelular que comprende un dominio citoplasmático truncado de la cadena beta del receptor de interleucina-2 que corresponde a la SEQ ID NO: 5 y un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en las posiciones 104-107 de la SEQ ID NO: 7. También se proporcionan ácidos nucleicos que codifican dichos CAR, una célula que expresa dichos CAR, así como también métodos de fabricación y usos terapéuticos de estos.
Introducción
Una estrategia terapéutica para el tratamiento de tumores puede implicar la introducción de un receptor de células T (TCR) que puede unirse a un antígeno específico en una célula T para preparar una célula T que se dirija al antígeno de interés. Sobre la base de esta estrategia, se han intentado terapias génicas de inmunidad adoptiva que usan genes de TCR que se dirigen a muchos antígenos tumorales, por ejemplo, antígenos WT1, MART1, gp100, CEA, CD19 y mHAG HA-2.
Otra terapia con células T genéticamente modificadas implica el uso de un receptor de antígenos quiméricos (CAR). Los CAR combinan la especificidad del antígeno y las propiedades de activación de células T en una sola molécula de fusión. El CAR tiene especificidad por un antígeno de superficie de una célula tumoral y la capacidad de activar el crecimiento de células T ex vivo. Esta terapia puede tener un efecto antitumoral más fuerte y de mayor duración que un anticuerpo terapéutico que se dirige al antígeno de la superficie tumoral y, por lo tanto, su efecto clínico también puede ser mayor.
Una estructura representativa de CAR comprende un fragmento variable de cadena única (scFv) que reconoce un antígeno de superficie de una célula tumoral, un dominio transmembrana y un dominio de señalización intracelular de un complejo TCR - tal como CD3Z - que activa una célula T. Un CAR que tiene tal constitución se denomina CAR de primera generación. Una secuencia de ácido nucleico que codifica una porción de fragmento variable de cadena única puede aislarse de, por ejemplo, un hibridoma que produce un anticuerpo monoclonal que reconoce un antígeno diana, tal como un antígeno tumoral diana. Un cAr se produce y expresa en una célula tal como una célula T. Una célula T que expresa un CAR reconoce directamente un antígeno de superficie de una célula tumoral independientemente de la expresión del antígeno mayor de histocompatibilidad clase I en la célula tumoral y, al mismo tiempo, activa la célula T y, por lo tanto, la célula T que expresa CAR puede matar la célula tumoral.
Con el fin de intentar mejorar la capacidad de los CAR de primera generación para activar las células T, se ha desarrollado un CAR de segunda generación, en donde un dominio de señalización intracelular de CD28, que es una molécula coestimuladora de una célula T, se une a un primer CAR de primera generación. Como una versión mejorada adicional, también se ha desarrollado un CAR de tercera generación, en donde un dominio de señalización intracelular derivado de CD137 (4-1BB) o CD134 (OX40), ambos que son miembros de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral (TNF), se une en tándem a un CAR de segunda generación. Por lo tanto, se han informado muchas moléculas CAR que se dirigen a una variedad de antígenos tumorales (ver, por ejemplo, Sadelain y otros, 2009). Sin embargo, son limitadas las proteínas transductoras de señales usadas como el dominio de señalización intracelular coestimulador para los cAr de segunda y tercera generación que se informan actualmente. Se sabe que cuando se unen a un CAR, no todos los dominios de señalización intracelular derivados de cada proteína transductora de señales de células T estimularán suficientemente una célula T para dañar y/o matar una célula tumoral diana. Por lo tanto, es convenientemente encontrar dominios de señalización intracelular de proteínas transductoras de señales que sean eficaces cuando se unan a un CAR.
Resumen
Un aspecto de la presente descripción es un CAR que se une específicamente a un antígeno diana e imparte una actividad citotóxica contra una célula diana que expresa el antígeno diana.
Un aspecto adicional es una célula que expresa el CAR que puede usarse para dirigirse a una célula que expresa el antígeno diana de interés.
En la presente descripción se describe un CAR que comprende i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado, ii) un dominio transmembrana y iii) un segmento intracelular que comprende a) uno o más dominios de señalización intracelular seleccionados de un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina y/o un dominio coestimulador citoplasmático y b) un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno, en donde el segmento intracelular comprende un motivo de unión a JAK endógeno o exógeno y un motivo de asociación a STAT5.
En la presente descripción se proporciona un receptor de antígenos quiméricos (CAR) que comprende:
i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado;
ii) un dominio transmembrana; y
iii) un segmento intracelular que comprende a) un dominio citoplasmático truncado de la cadena beta del receptor de interleucina-2 que corresponde a la SEQ ID NO: 5 y b) un dominio intracelular de CD3Z caracterizado por tener un motivo de asociación a STAT3 exógeno que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en las posiciones 104-107 de SEQ ID NO: 7.
Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT3 exógeno es YXXQ (SEQ ID NO: 13). El motivo de asociación a STAT3 exógeno corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en las posiciones 104-107 de la SEQ IQ NO:7.
El motivo de asociación a STAT3 exógeno puede tener menos de 100 residuos de aminoácidos del extremo C terminal del CAR.
El motivo de asociación a STAT3 exógeno reemplaza los aminoácidos 156-158 de CD3Z.
Como se describe en la presente descripción, el uno o más dominios de señalización intracelular son o comprenden un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina.
El dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina puede ser un fragmento truncado que comprende mínimamente un motivo de unión a JAK y un motivo de asociación a STAT5.
En una modalidad, el segmento intracelular comprende además un dominio coestimulador citoplasmático.
En otra modalidad, el dominio coestimulador citoplasmático es un dominio citoplasmático de CD28, CD2, CD4, CD5, CD8a, CD8p, CD134 o CD137.
En la presente descripción se describe un CAR que comprende i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado, ii) un dominio transmembrana y iii) un segmento intracelular que comprende uno o más dominios de señalización intracelular que incluyen un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina y opcionalmente al menos un dominio citoplasmático suplementario.
El dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina puede ser un fragmento truncado que comprende un motivo de asociación de tirosina quinasa y un motivo de asociación a STAT.
Como se describe en la presente descripción, el al menos un dominio citoplasmático suplementario es i) un dominio de señalización intracelular de CD3Z, en donde opcionalmente el dominio de señalización intracelular de CD3Z comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno ii) y/o un dominio coestimulador citoplasmático de CD28. La cadena del receptor de interleucina puede seleccionarse del grupo que consiste en la cadena p del receptor de interleucina 2 (IL-2R) y la cadena a del receptor de interleucina 21 (IL-21R).
Aún en otra modalidad, el dominio extracelular es y/o comprende una región de unión al antígeno de un anticuerpo que puede unirse al antígeno predeterminado.
En otra modalidad, la región de unión al antígeno del anticuerpo es o comprende un fragmento variable de cadena única de dicho anticuerpo.
En otra modalidad, el dominio transmembrana se selecciona del grupo que consiste en el dominio transmembrana de CD28 y el dominio transmembrana de CD8.
En otra modalidad, el CAR comprende además un péptido señal, opcionalmente en el extremo N terminal.
Otro aspecto incluye un ácido nucleico que codifica un CAR descrito en la presente descripción.
En una modalidad, el ácido nucleico codifica un CAR conjugado a un péptido señal opcionalmente en donde el péptido señal está en el extremo N terminal del CAR.
Un aspecto adicional incluye un vector que comprende un ácido nucleico descrito en la presente descripción.
Aun un aspecto adicional incluye una célula que expresa el CAR descrito en la presente descripción y/o se transfecta o transduce con el ácido nucleico o el vector descrito en la presente descripción.
Aun un aspecto adicional incluye una composición que comprende un ácido nucleico o vector de CAR descrito en la presente descripción, opcionalmente una preparación microsomal que comprende un CAR descrito en la presente descripción.
La composición comprende un diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable.
De acuerdo con la presente descripción, se proporcionan receptores de antígenos quiméricos, ácidos nucleicos que codifican dichos receptores de antígenos quiméricos, células que expresan dichos receptores de antígenos quiméricos y composiciones que comprenden cualquiera de los anteriores. En una modalidad, uno o más de los anteriores pueden usarse en el campo de la terapia génica de inmunidad adoptiva que se dirige a un antígeno tal como un antígeno tumoral y/o en el tamizaje u otros ensayos in vitro. El receptor de antígenos quiméricos de la presente descripción puede introducirse en una célula, lo que da como resultado, por ejemplo, un aumento o elevación de la cantidad de expresión del receptor de antígenos quiméricos en la célula. Tal célula puede exhibir actividad citotóxica contra células que expresan el antígeno diana.
En un aspecto, se proporciona un método para preparar la célula que exprese un CAR descrito en la presente descripción, el método comprende:
a) aislar células inmunitarias de un mamífero, opcionalmente en donde las células inmunitarias son células T; b) transfectar o transducir las células inmunitarias aisladas, opcionalmente células T, con un ácido nucleico que codifica un CAR descrito en la presente descripción; y
c) opcionalmente aislar y/o expandir las células que expresan CAR, opcionalmente células T que expresan CAR después de la transfección o transducción.
Otro aspecto es un CAR, un ácido nucleico, un vector, una célula o un uso en la composición descrita en la presente descripción, por ejemplo, para su uso en la reducción del número de células que expresan un antígeno predeterminado, tratar una enfermedad, prevenir una enfermedad y/o proporcionar inmunidad antitumoral en un mamífero.
Otro aspecto incluye el CAR, ácido nucleico, vector o célula para su uso en un método para disminuir en un sujeto el número de células que expresan un antígeno predeterminado, el método comprende administrar al sujeto que lo necesita una cantidad eficaz de células que expresan un CAR descrito en la presente descripción, en donde el CAR se une específicamente al antígeno predeterminado.
Otro aspecto es el CAR, ácido nucleico, vector, célula o composición para su uso en un método de tratamiento o prevención de una enfermedad en un mamífero, el método comprende administrar al mamífero que lo necesite una cantidad eficaz de células que expresan un CAR descrito en la presente descripción o una composición descrita en la presente descripción.
Un aspecto adicional es el CAR, ácido nucleico, vector, célula o composición para su uso en un método para proporcionar una inmunidad antitumoral en un mamífero, el método comprende administrar al mamífero que lo necesite una cantidad eficaz de células que expresan un CAR descrito en la presente descripción o una composición descrita en la presente descripción.
Otras características y ventajas de la presente descripción resultarán evidentes a partir de la siguiente descripción detallada. Debe entenderse, sin embargo, que la descripción detallada y los ejemplos específicos, aunque indican modalidades preferidas de la descripción, se dan únicamente a modo de ilustración, ya que varios cambios y modificaciones resultarán evidentes para los expertos en la técnica a partir de esta descripción detallada.
Breve descripción de los dibujos
La presente descripción se describirá ahora en relación con los dibujos en los que:
La Figura 1 es un diagrama esquemático de constructos del receptor de antígenos quiméricos (CAR) anti-CD19.
La Figura 2 es una serie de gráficos de un análisis de citometría de flujo que muestra la eficiencia de transducción de células T primarias con constructos de CAR anti-CD19.
La Figura 3 es una serie de gráficos que muestran la expresión superficial de CAR anti-CD19 de varios constructos. La Figura 4 es una serie de gráficos que muestran la fosforilación de STAT3 y STAT5 en las células T transducidas con CAR anti-CD1928-IL2RB-z(YXXQ).
La Figura 5 es una comparación gráfica de la actividad de la vía JAK-STAT en células T transducidas con CAR. La Figura 6 es un esquema que ilustra un protocolo para la transducción y expansión de células T con constructo de CAR anti-CD19.
La Figura 7 es una serie de gráficos que muestran la expansión de células T transducidas con CAR después de la transducción.
La Figura 8 es una serie de gráficos que muestran la expansión de células T transducidas con CAR después de la estimulación específica con CD19 con células K562-CD19.
La Figura 9 es una serie de gráficos que muestran la expansión de células T transducidas con CAR después del cocultivo con células K562 (control). La Figura 10 es una serie de gráficos que muestran la expansión de las células T transducidas con CAR después de la reestimulación específica con antígeno con células K562-CD19.
La Figura 11 es una serie de gráficos que muestran la tasa de división celular en células T transducidas con CAR. La Figura 12 es un gráfico que muestra la viabilidad de las células T transducidas con CAR.
La Figura 13 es una serie de gráficos de análisis de citometría de flujo que muestran el fenotipo de superficie y los niveles de expresión de CD4+ y CD8+ de células T transducidas con Ca R.
La Figura 14 es una serie de gráficos que muestran la frecuencia de las células T transducidas con CAR con un fenotipo marcador de células T de memoria similares a una célula madre (CD45RA+ CD62L+ CD95+).
La Figura 15 es una serie de gráficos que comparan la expresión de CD62L en células T transducidas con CAR. La Figura 16 es una serie de gráficos que muestran la secreción de IL-2 e IFN-y por células T transducidas con CAR.
La Figura 17 es un gráfico que muestra la lisis de células diana in vitro por células T transducidas con CAR.
La Figura 18 es un esquema que ilustra un protocolo para la inyección de ratones inmunodeficientes con la línea celular NALM-6 de leucemia linfoblástica aguda positiva para c D19 que expresa EGFP-luciferasa, seguida de una inyección con células T transducidas con CAR.
La Figura 19 es una serie de imágenes bioluminiscentes de la actividad luciferasa en los puntos de tiempo indicados después de la infusión de las células T transducidas con CAR anti-CD19.
La Figura 20 es un gráfico que muestra la curva de Kaplan-Meier para la supervivencia general de los ratones tratados con células T transducidas con CAR anti-CD19 (n=5 cada una).
La Figura 21 muestra la estructura de los CAR NFMC63-28Z, NFMC63-28-d2RbZ, NFMC63-28-21RaZ o NFMC63-28Z-21Ra usados en los Ejemplos.
La Figura 22 muestra células con fosforilación de STAT transducidas con los CAR de la Figura 21.
Descripción detallada
Como se usa en la presente descripción, un "receptor de antígenos quiméricos (CAR)" significa una proteína fusionada que comprende un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado, un segmento intracelular que comprende uno o más dominios citoplasmáticos derivados de proteínas transductoras de señales diferentes del polipéptido del cual se deriva un dominio extracelular y un dominio transmembrana. El "receptor de antígenos quiméricos (CAR)" a veces se denomina un "receptor quimérico", un "cuerpo T" o "receptor inmunitario quimérico (ClR)". La frase "dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado" significa cualquier molécula proteica o parte de esta que puede unirse específicamente al antígeno predeterminado. El "dominio de señalización intracelular" significa cualquier oligopéptido o dominio polipeptídico conocido porque funciona para transmitir una señal que provoca la activación o inhibición de un proceso biológico en una célula, por ejemplo, la activación de una célula inmunitaria tal como una célula T o una célula NK. Los ejemplos incluyen la cadena ILR, CD28 y/o CD3Z.
Como se usa en la presente descripción, "STAT3" o "Transductor de señal y activador de la transcripción 3" se refiere a un factor de transcripción que pertenece a la familia de proteínas STAT. STAT3 también se conoce como "factor de respuesta de fase aguda", "APRF", "factor de transcripción APRF", proteína de unión al ADN APRF ", FLJ20882", proteína hipotética MGC16063", "factor de respuesta a IL-6", "Factor de respuesta a LIF (factor inhibidor de la leucemia)" o "STAT3JHUMAN". La proteína STAT3 participa en la regulación de genes que están implicados en el crecimiento y la división celular, el movimiento celular y la apoptosis celular. En el sistema inmunológico, STAT3 es un transductor de señales para la maduración de las células del sistema inmunológico tales como las células T y la célula B. Siegel y otros, han demostrado que STAT3 juega un papel importante en el desarrollo y mantenimiento de la memoria de las células T humanas (Siegel y otros, 2011).
Como se usa en la presente descripción, un "motivo de asociación a transductor de señal y activador de la transcripción 3' o un "motivo de asociación a STAT3' se refiere a una secuencia de aminoácidos (o un polinucleótido que codifica dicha secuencia de aminoácidos de acuerdo con el contexto) YXXQ (SEQ ID NO: 13) y que se une a STAT3 (por ejemplo, en el contexto de un polipéptido más largo/proteína). El motivo de asociación a STAT3 está presente en proteínas de señalización, por ejemplo, IL-6 e IL-10. El motivo de asociación a STAT3 también puede introducirse en dominios de señalización que no comprenden endógenamente el motivo de asociación a STAT3 (es decir, motivo de asociación a STAT3 exógeno). El término "motivo de asociación a STAT3 exógeno" significa un motivo de asociación a STAT3 que se introduce de forma recombinante en un dominio, por ejemplo, un dominio de señalización intracelular de CD3Z, pero que no existe de forma nativa en dicho dominio o en la ubicación introducida en el dominio. Por ejemplo, un motivo de asociación a STAT3 exógeno YXXQ (SEQ ID NO: 13) puede introducirse en CD3Z. El motivo de asociación a STAT3 exógeno puede ser, por ejemplo, YRHQ (SEQ ID NO: 22). Un experto en la técnica apreciará que el motivo de asociación a STAT3 exógeno puede introducirse en CD3Z con el uso de diversas técnicas conocidas en la técnica.
Como se usa en la presente descripción, un "motivo de asociación a transductor de señal y activador de la transcripción 5" o un "motivo de asociación a STAT5" se refiere a una secuencia de aminoácidos (o un polinucleótido que codifica dicha secuencia de aminoácidos de acuerdo con el contexto) que comprende un residuo de tirosina y que se une a STAT5. Por ejemplo, el motivo de asociación a STAT5 de la cadena p de IL-2R comprende el residuo de tirosina 510 (residuo de tirosina 510 que es el aminoácido número 536 de NCBI Ref-Seq:NP_000869.1, por ejemplo, 271 de la SEQ ID NO: 11). Por ejemplo, el motivo de asociación a STAT5 comprende los residuos de aminoácidos YXXL (SEQ ID NO: 41). Por ejemplo, el motivo de asociación a STAT5 comprende los residuos de aminoácidos YLSL (SEQ ID NO: 43).
La expresión "motivo de asociación exógeno" significa cualquier motivo de asociación que se introduce de forma recombinante en un dominio, por ejemplo, un dominio de señalización intracelular tal como un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina, un dominio coestimulador citoplasmático o un dominio de señalización intracelular de CD3Z, pero que no existe de forma nativa en dicho dominio o en la ubicación introducida en el dominio. Por ejemplo, un motivo de unión a JAK exógeno puede insertarse en un dominio de señalización intracelular, por ejemplo, un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina.
El "motivo de unión a JAK" usado en la presente descripción se refiere a un motivo BOX-1 que permite la asociación de tirosina quinasa a JAK, por ejemplo, JAK1. El motivo de unión a JAK puede ser, por ejemplo, los aminoácidos números 278 a 286 de NCb I Ref-Seq:NP_000869.1 (aminoácidos 13 a 21 de la SEQ ID NO: 11).
Como se usa en la presente descripción, un "dominio" significa una región en un polipéptido, por ejemplo, que está plegada en una estructura particular independientemente de otras regiones y/o tiene una función particular. El dominio puede ser, por ejemplo, la porción citoplasmática de una molécula o una parte de esta. Como se usa en la presente descripción, el "dominio citoplasmático" de una molécula puede referirse al dominio citoplasmático completo o una parte de este que induce una señal intracelular cuando se activa.
El término "variante" significa una molécula que comprende la sustitución, deleción o adición de uno o unos pocos a una pluralidad de aminoácidos, e incluye moléculas particularmente sustituidas de forma conservadora, siempre que la variante conserve sustancialmente la misma función que la secuencia original. Por ejemplo, las variantes del receptor de IL pueden comprender sustituciones, deleciones o adiciones fuera del motivo de unión a JAK y del motivo de asociación a STAT. Por ejemplo, una variante de la cadena del receptor de IL puede comprender deleciones y/o sustituciones conservadoras de hasta 50, hasta 40, hasta 30, hasta 20 o hasta 10 aminoácidos, en una región fuera de los motivos de unión a JAK y de asociación a STAT. De manera similar, las variantes de otras moléculas pueden comprender deleciones y/o sustituciones conservadoras de hasta 50, hasta 40, hasta 30, hasta 20 o hasta 10 aminoácidos, en una región fuera de una región identificada específicamente en la presente descripción.
Como se usa en la presente descripción, la frase "en donde el segmento intracelular comprende un motivo de unión a JAK y un motivo de asociación a STAT5 endógeno o exógeno" significa, en el caso en donde el segmento intracelular comprende más de un dominio citoplasmático, que el motivo de unión a JAK y el motivo de asociación a STAT5 puede estar en el mismo dominio citoplasmático o puede estar en dominios citoplasmáticos separados. La expresión "dominio citoplasmático suplementario" como se usa en la presente descripción en el contexto de un CAR que comprende un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina (ILR) es un dominio citoplasmático de una proteína transductora de señales que no está comprendida en la cadena de ILR.
Como se usa en la presente descripción, un "antígeno tumoral" significa una molécula biológica que tiene antigenicidad, cuya expresión llega a reconocerse en asociación con la alteración maligna de una célula. El antígeno tumoral en la presente descripción incluye un antígeno específico del tumor (un antígeno que está presente solo en las células tumorales y no se encuentra en otras células normales) y un antígeno asociado al tumor (un antígeno que también está presente en otros órganos y tejidos o células normales heterogéneas y alogénicas, o un antígeno que se expresa durante el desarrollo y/o diferenciación).
Como se usa en la presente descripción, un "receptor de interleucina (IL)" significa un receptor de citocina para una interleucina. Existen dos familias principales de receptores de IL, los receptores de citocinas de tipo 1 y de tipo 2. Los receptores de interleucina de tipo 1 incluyen el receptor de IL-2, receptor de IL-3, receptor de IL-4, receptor de IL-5, receptor de IL-6, receptor de IL-7, receptor de IL-9, receptor de IL-11, receptor de IL-12, receptor de IL-13, receptor de IL-15, receptor de IL-21, receptor de IL-23 y receptor de IL-27. Los receptores de IL de tipo 2 incluyen el receptor de IL-10, receptor de IL-20, receptor de IL-22 y receptor de IL-28. El receptor de IL está compuesto por múltiples cadenas polipeptídicas. En la presente descripción, por ejemplo, la cadena p del receptor de IL-2 se abrevia a veces como IL2Rb o IL-2Rb.
El término "anticuerpo" como se usa en la presente descripción pretende incluir anticuerpos monoclonales, anticuerpos policlonales y anticuerpos quiméricos de ratón-humano, anticuerpos humanizados, así como también anticuerpos murinos, bovinos, de conejo, de rata, de cabra, humanos y otros anticuerpos derivados de organismos. El anticuerpo puede provenir de fuentes recombinantes y/o producirse en animales transgénicos. El anticuerpo también puede ser sintético. El término "fragmento de anticuerpo" como se usa en la presente descripción, pretende incluir sin limitaciones Fab, Fab', F(ab')2, scFv, dsFv, ds-scFv, dímeros, heterodímeros, minicuerpos, diacuerpos y multímeros de estos, fragmentos de anticuerpos multiespecíficos y anticuerpos de dominio. Los anticuerpos pueden fragmentarse con el uso de técnicas convencionales. Por ejemplo, pueden generarse fragmentos F(ab')2 mediante el tratamiento del anticuerpo con pepsina. El fragmento F(ab')2 resultante puede tratarse para reducir los puentes disulfuro para producir fragmentos Fab'. La digestión con papaína puede conducir a la formación de fragmentos Fab. Fab, Fab' y F(ab')2, scFv, dsFv, ds-scFv, dímeros, minicuerpos, diacuerpos, fragmentos de anticuerpos biespecíficos y otros fragmentos también pueden sintetizarse mediante técnicas recombinantes.
Se conocen en la técnica métodos para producir anticuerpos. Para producir anticuerpos monoclonales humanos y/o fragmentos de unión de estos, pueden cosecharse células productoras de anticuerpos (linfocitos) de un ser humano que tiene cáncer y fusionarse con células de mieloma mediante procedimientos estándar de fusión de células somáticas inmortalizando de este modo estas células y produciendo células de hibridoma. Tales técnicas son bien conocidas en la técnica (por ejemplo, la técnica de hibridoma desarrollada originalmente por Kohler y Milstein (Nature 256:495-497 (1975)) así como también otras técnicas tales como la técnica de hibridoma de células B humanas (Kozbor y otros, Immunol. Today 4:72 (1983)), la técnica de hibridoma de EBV para producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole y otros, Methods Enzymol, 121:140-67 (1986)), y el tamizaje de bibliotecas de anticuerpos combinatorios (Huse y otros, Science 246:1275 (1989)). Las células de hibridoma pueden tamizarse inmunoquímicamente para la producción de anticuerpos específicamente reactivos con células cancerosas y los anticuerpos monoclonales pueden aislarse.
Como se usa en la presente descripción, un "fragmento variable de cadena única (scFv)" significa un polipéptido de cadena única derivado de un anticuerpo que mantiene la capacidad de unirse a un antígeno. Un ejemplo de scFv incluye un polipéptido de anticuerpo que se forma mediante una técnica de ADN recombinante y en el que las regiones Fv de los fragmentos de cadena pesada (cadena H) y cadena ligera (cadena L) de inmunoglobulina están unidas mediante una secuencia separadora. Se conocen varios métodos para preparar un scFv, e incluyen los métodos descritos en la patente de Estados Unidos núm. 4694778, Science, vol. 242, págs. 423-442 (1988), Nature, vol. 334, pág. 54454 (1989) y Science, vol. 242, págs. 1038-1041 (1988).
El término "CD3Z", como se usa en la presente descripción, se refiere a todas las especies de mamíferos, preferentemente seres humanos, de la agrupación del correceptor de células T de diferenciación 3 (CD3). En los mamíferos, CD3 comprende una cadena Z de CD3, una cadena delta de CD3 y dos cadenas épsilon de CD3. La cadena CD3Z (por ejemplo, NCBI RefSeq:NP_932170.1) comprende un dominio de señalización intracelular (por ejemplo, SEQ ID NO: 7) que puede usarse para diseñar el CAR de la presente descripción.
El término "28-z", como se usa en la presente descripción, se refiere a un constructo de CAR generado al unir un fragmento variable de cadena única (scFv) derivado de FMC63 a un dominio transmembrana de CD28 y un dominio intracelular de CD3Z.
El término "28-BB-z", como se usa en la presente descripción, se refiere a un constructo de CAR generado al unir un fragmento variable de cadena única derivado de FMC63 (scFv) a un dominio transmembrana de CD28 y además a un dominio de señalización intracelular de 4-1BB y un dominio de señalización intracelular de CD3Z.
El término "28-IL2RB-z(YXXQ)", como se usa en la presente descripción, se refiere a un constructo de CAR generado al unir un fragmento variable de cadena única (scFv) derivado de FMC63 a un dominio transmembrana de CD28, a un dominio citoplasmático de IL-2Rp que comprende un motivo BOX 1 implicado en la señalización de JAK (por ejemplo, comprende un motivo de unión a JAK) y un residuo de tirosina en la posición 510 para la asociación a STAT5, y además de un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo YXXQ exógeno (SEQ ID NO: 13) implicado en la asociación a STAT3.
La expresión "secuencia de ácido nucleico", como se usa en la presente descripción, se refiere a una secuencia de monómeros de nucleósidos o nucleótidos que consiste en bases, azúcares y enlaces entre azúcares (cadena principal) de origen natural. La expresión también incluye secuencias modificadas o sustituidas que comprenden monómeros de origen no natural o porciones de estos. Las secuencias de ácido nucleico de la presente solicitud pueden ser secuencias de ácido desoxirribonucleico (ADN) o secuencias de ácido ribonucleico (ARN) y pueden incluir bases de origen natural que incluyen adenina, guanina, citosina, timidina y uracilo. Las secuencias también pueden contener bases modificadas. Los ejemplos de tales bases modificadas incluyen aza y deaza adenina, guanina, citosina, timidina y uracilo; y xantina e hipoxantina.
La expresión "ácido nucleico aislado" como se usa en la presente descripción se refiere a un ácido nucleico sustancialmente libre de material celular o medio de cultivo cuando se produce mediante técnicas de ADN recombinante, o precursores químicos, u otros productos químicos cuando se sintetizan químicamente. Un ácido nucleico aislado también está sustancialmente libre de secuencias que flanquean naturalmente el ácido nucleico (es decir, secuencias ubicadas en los extremos 5' y 3' del ácido nucleico) del que se deriva el ácido nucleico. La expresión "ácido nucleico" pretende incluir ADN y ARN y puede ser bicatenario o monocatenario, y representa la cadena sentido o antisentido. Además, la expresión "ácido nucleico" incluye las secuencias de ácido nucleico complementarias, por ejemplo, ADNc.
La expresión "polipéptido aislado", también denominado "proteína aislada", se refiere a un polipéptido sustancialmente libre de material celular o medio de cultivo cuando se produce mediante técnicas de ADN recombinante, o precursores químicos u otros productos químicos cuando se sintetizan químicamente.
El término "aminoácido" incluye todos los aminoácidos de origen natural, así como también los aminoácidos modificados.
Una "variación conservadora de aminoácidos", como se usa en la presente descripción, es una en la que un residuo de aminoácido se reemplaza por otro residuo de aminoácido sin eliminar las propiedades deseadas de la proteína. El término "sujeto", como se usa en la presente descripción incluye todos los miembros del reino animal incluido un ser humano.
Como se usa en la presente descripción, y como se entiende bien en la técnica, "tratamiento" o "tratar" es un enfoque para obtener resultados beneficiosos o deseados, incluidos los resultados clínicos. Los resultados clínicos beneficiosos o deseados pueden incluir, pero no se limitan a, alivio o mejora de uno o más síntomas o afecciones, disminución de la extensión de la enfermedad, estado estabilizado (es decir, sin empeoramiento) de la enfermedad, prevención de la propagación de la enfermedad, retardo o desaceleración de la progresión de la enfermedad, mejoría o paliación del estado de la enfermedad y remisión (ya sea parcial o total), ya sea detectable o indetectable. "Tratamiento" o "tratar" también puede significar prolongar la supervivencia en comparación con la supervivencia esperada si no se recibe tratamiento. Paliar una enfermedad o trastorno significa que la extensión y/o las manifestaciones clínicas indeseables de un trastorno o estado de enfermedad se reducen y/o el curso temporal de la progresión se ralentiza o alarga, en comparación con no tratar el trastorno.
Como se usa en la presente descripción, la frase "tratar o prevenir el cáncer" se refiere a inhibir la replicación de las células cancerosas, proporcionar inmunidad antitumoral, inhibir la propagación del cáncer (metástasis), inhibir el crecimiento tumoral, reducir el número de células cancerosas o el crecimiento tumoral, o mejorar los síntomas relacionados con el cáncer.
El término "administrado" como se usa en la presente descripción significa la administración de una cantidad terapéuticamente eficaz, por ejemplo, de células que expresan un CAR para reducir y/o inhibir la propagación de células que expresan el antígeno predeterminado o una composición de la solicitud a un paciente.
Para comprender el alcance de la presente descripción, el término "que comprende" y sus derivados, como se usa en la presente descripción, pretenden ser términos abiertos que especifiquen la presencia de las características, elementos, componentes, grupos, números enteros y/o etapas indicados, pero no excluya la presencia de otras características, elementos, componentes, grupos, números enteros y/o etapas no indicados. Lo anterior también se aplica a palabras que tienen significados similares, tales como los términos "que incluye", "que tiene" y sus derivados. Finalmente, términos de grado tales como "sustancialmente", "alrededor de" y "aproximadamente" como se usan en la presente descripción significan una cantidad razonable de desviación del término modificado de manera que el resultado final no cambia significativamente. Estos términos de grado deben interpretarse como que incluyen una desviación de al menos ± 5 % del término modificado si esta desviación no niega el significado de la palabra que modifica.
Como se usa en esta descripción y las reivindicaciones adjuntas, las formas singulares "un", "una" y "el/la" incluyen referencias en plural a menos que el contenido indique claramente lo contrario. También debe tenerse en cuenta que el término "o" se emplea generalmente en su sentido que incluye "y/o" a menos que el contenido indique claramente lo contrario.
Se pretende que las definiciones y modalidades descritas en secciones particulares sean aplicables a otras modalidades descritas en la presente descripción para las que son adecuadas, tal como lo entendería un experto en la técnica.
La enumeración de intervalos numéricos por puntos finales en la presente descripción incluye todos los números y fracciones subsumidos dentro de ese intervalo (por ejemplo, 1 a 5 incluye 1, 1,5, 2, 2,75, 3, 3,90, 4 y 5). También debe entenderse que se supone que todos los números y fracciones de estos están modificados por el término "alrededor de".
Además, se pretende que las definiciones y modalidades descritas en secciones particulares sean aplicables a otras modalidades descritas en la presente descripción para las que son adecuadas, como entendería un experto en la técnica. Por ejemplo, en los siguientes pasajes, se definen con más detalle diferentes aspectos de la invención. Cada aspecto así definido puede combinarse con cualquier otro aspecto o aspectos a menos que se indique claramente lo contrario. En particular, cualquier característica indicada como preferida o ventajosa puede combinarse con cualquier otra característica o características indicadas como preferidas o ventajosas.
(1) CAR de la presente descripción
En la presente descripción se proporciona un CAR que comprende i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado, ii) un dominio transmembrana y iii) un segmento intracelular que comprende un dominio citoplasmático truncado de la cadena beta del receptor de interleucina-2 que corresponde a la SEQ ID NO: 5, y un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno, que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en las posiciones 104-107 de SEQ ID NO: 7. En una modalidad, los dominios se fusionan directamente o indirectamente, opcionalmente, en el orden anterior comenzando desde el extremo N-terminal. En una modalidad, los dominios en el segmento intracelular se fusionan en orden inverso.
También se describe en la presente descripción un CAR que comprende i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado, ii) un dominio transmembrana y iii) un segmento intracelular que comprende uno o más dominios de señalización intracelular que incluyen un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de IL y opcionalmente en al menos un dominio citoplasmático suplementario. Como se describe en la presente descripción, los dominios se fusionan directamente o indirectamente, opcionalmente, en el orden anterior comenzando desde el extremo N-terminal. Como se describe en la presente descripción, los dominios en el segmento intracelular se fusionan en un orden inverso.
En algunas modalidades, la cadena del receptor de IL está próxima al dominio transmembrana y/o está hacia o forma el extremo N-terminal del segmento intracelular de CAR. En otras modalidades, la cadena del receptor de IL está hacia o forma el extremo C-terminal del segmento intracelular en el CAR. En algunas modalidades, la cadena del receptor de IL está corriente arriba o N-terminal del dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende el motivo de asociación a STAT3 exógeno en el CAR.
Como se describe en la presente descripción, cuando el segmento intracelular de CAR comprende solo dominios de señalización de la cadena del receptor de IL, las células que expresan el CAR pueden ser activadas por un antígeno predeterminado presentado en un complejo MHC a través de TCR endógenos y/o por moléculas CD80/86 a través de CD28 endógeno, por ejemplo, por células B.
También se proporciona una célula que expresa un CAR de la presente descripción. Una célula de este tipo puede tener, por ejemplo, una tasa de proliferación aumentada y/o una capacidad de supervivencia aumentada, puede producir cantidades aumentadas de citocinas y/o puede tener una actividad citotóxica aumentada contra una célula que tiene, en la superficie, el antígeno predeterminado/preseleccionado al que se une en relación con una célula progenitora que no expresa el CAR. Por ejemplo, como se muestra en los Ejemplos, las células T transducidas con CAR de acuerdo con la invención tienen un aumento de la división, proliferación y viabilidad celular, proporcionan efectos antitumorales y mejoran la supervivencia general en ratones que reciben dichas células como tratamiento. (a) Dominio extracelular
El "dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado" usado para el CAR de la presente descripción es un dominio que comprende una molécula proteica o parte de esta que puede unirse a un antígeno diana e incluye, por ejemplo, un dominio de unión al antígeno de un anticuerpo y un dominio de unión al ligando de un receptor. Este dominio se une e interactúa con un antígeno presente en la superficie celular y, por lo tanto, imparte especificidad a una célula que expresa un CAR. Por ejemplo, el dominio extracelular usado para el CAR de la presente descripción comprende y/o se deriva de regiones variables de un anticuerpo (por ejemplo, cadena H y cadena L), cadenas únicas y fragmentos de unión de estas o un TCR (TCRa, TCRp, TCRy, TCR8), o se deriva del ectodominio de CD4, CD8a, CD8p, CD11A, CD11B, CD11C, CD18, CD29, CD49A, CD49B, CD49D, CD49E, CD49F, CD61, CD41 y/o CD51. Puede usarse toda la región de estas proteínas. Por otro lado, puede usarse un dominio que puede unirse a un antígeno o un ligando, por ejemplo, un fragmento Fab de anticuerpo, una región variable de anticuerpo [región V de la cadena H (VH) y región V de la cadena L (VL)] o un dominio de unión a ligando extracelular de un receptor. Particularmente, en una modalidad, puede usarse un fragmento variable de cadena única (scFv). Por ejemplo, el ectodominio de CD4 puede reconocer células infectadas por VIH.
El dominio extracelular para el CAR de la presente descripción puede unirse a un solo antígeno o ligando, o unirse a dos o más antígenos o ligandos. Además, la presente descripción incluye tanto un CAR que comprende un dominio extracelular como un CAR que comprende dos o más dominios extracelulares.
El dominio extracelular para el CAR de la presente descripción puede seleccionarse de anticuerpos que reconocen un antígeno diana, opcionalmente un antígeno de superficie celular o un antígeno soluble, o moléculas que interactúan con el antígeno. Los ejemplos del antígeno incluyen un antígeno viral, un antígeno bacteriano (particularmente, bacterias infecciosas), un antígeno de parásito, un marcador de superficie celular en una célula diana relacionada con una determinada afección (por ejemplo, un antígeno tumoral) y una molécula de superficie de un inmunocito.
La presente descripción en un aspecto proporciona un CAR que puede unirse a un antígeno derivado de Retroviridae (por ejemplo, virus de inmunodeficiencia humana tales como VIH-1 y VIH-LP), Picornaviridae (por ejemplo, poliovirus, virus de la hepatitis A, enterovirus, coxsackievirus humano, rinovirus, y echovirus), virus de la rubéola, coronavirus, virus de la estomatitis vesicular, virus de la rabia, virus del ébola, virus de la parainfluenza, virus de las paperas, virus del sarampión, virus sincitial respiratorio, virus de la influenza, virus de la hepatitis B, parvovirus, Adenoviridae, Herpesviridae [por ejemplo, virus del herpes simple (HSV) tipo 1 y tipo 2, virus varicelazoster, citomegalovirus (CMV) y virus del herpes], Poxviridae (por ejemplo, virus de la viruela, virus vaccinia y virus de la viruela) o virus de la hepatitis C.
En otro aspecto la presente descripción proporciona un CAR que puede unirse a un antígeno derivado de una cepa bacteriana de Staphylococci, Streptococcus, Escherichia coli, Pseudomonas o Salmonella. En particular, la presente descripción proporciona un CAR que puede unirse a un antígeno derivado de una bacteria infecciosa, por ejemplo, Helicobacter pyloris, Legionella pneumophilia, una cepa bacteriana de Mycobacteria sps. (por ejemplo, M. tuberculosis, M. avium, M. intracellulare, M. kansaii o M. gordonea), Staphylococcus aureus, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitides, Listeria monocytogenes, Streptococcus pyogenes, Streptococcus del grupo A, Streptococcus del grupo B (Streptococcus agalactiae), Streptococcus pneumoniae o Clostridium tetani.
La presente descripción en otro aspecto proporciona un CAR que puede unirse a un antígeno tumoral tal como 5T4, a 5p1 -integrina, 707-AP, AFP, ART-4, B7H4, BAGE, p-catenina/m, Bcr-abl, Anticuerpo MN/C IX, CA125, CAMEL, CAP-1, CASP-8, CD4, CD19, CD20, CD22, CD25, CDC27/m, CD30, CD33, CD52, CD56, CD80, CDK4/m, CEA, CT, Cyp-B, DAM, EGFR, ErbB3, ELF2M, EMMPRIN, EpCam, ETV6-AML1, G250, GAGE, GnT-V, Gp100, HAGE, HER-2/new, HLA-A*0201-R170I, HPV-E7, HSP70-2M, HST-2, hTERT (o hTRT), iCE, IGF-1R, IL-2R, IL-5, KIAA0205, LAGE, LDLR/FUT, MAGE, MART-1/melan-A, MART-2/Ski, MC1R, miosina/m, MUC1, MUM-1, MUM-2, MUM-3, NA88-A, PAP, proteinasa-3, p190 minor bcr-abl, Pml/RARa, PRAME, PSA, PSM, PSMA, RAGE, RU1 o RU2, SAGE, SART-1 o SART-3, survivina, TEL/AML1, TGFp, TPI/m, TRP-1, TRP-2, TRP-2/INT2, VEGF, WT1, NY-Eso-1 o NY-Eso-B. La presente descripción también proporciona un CAR que puede unirse a una molécula de adhesión a la superficie celular, una molécula de superficie de una célula inflamatoria que aparece en una enfermedad autoinmunitaria, o un TCR que provoca autoinmunidad.
(b) Segmento intracelular
El segmento intracelular del CAR de acuerdo con la presente descripción es una molécula proteica que comprende los dominios de señalización intracelular y que puede transducir una señal en una célula cuando el dominio extracelular presente dentro de la misma molécula se une a (interactúa con) su antígeno/ligando afín.
El segmento intracelular de CAR comprende un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO:22) en la posición 104-107 de la SEQ ID NO: 7. Además, el segmento intracelular de CAR comprende un dominio citoplasmático truncado de la cadena beta del receptor de interleucina-2 que corresponde a la SEQ ID NO: 5. El segmento intracelular puede comprender un motivo de unión a JAK endógeno o exógeno y un motivo de asociación a STAT5.
Una secuencia de señalización citoplasmática primaria puede regular la activación primaria de un complejo de TCR. Por ejemplo, el dominio de señalización intracelular de CD3Z proporciona una señal citoplasmática primaria. La secuencia de señalización citoplasmática primaria puede comprender un motivo de transducción de señales conocido como un motivo de activación de inmunorreceptor basado en tirosina (ITAM) [Nature, vol. 338, págs. 383­ 384 (1989)]. Por otro lado, una secuencia de señalización citoplasmática primaria que actúa de forma inhibidora comprende un motivo de transducción de señales conocido como un motivo de inhibición de inmunorreceptor basado en tirosina (ITIM) [J Immunol., vol. 162, núm. 2, págs. 897-902 (1999)]. En la presente descripción, puede usarse un dominio de señalización intracelular que tiene un ITAM y/o un ITIM.
Los ejemplos de dominios de señalización intracelular que tienen un ITAM que pueden usarse, por ejemplo, en lugar de o para reemplazar CD3Z, incluyen dominios de señalización intracelular que tienen ITAM derivado de CD3Z, FcRy, FcRp, CD3y, CD38, CD3e, CD5, CD22, CD79a, CD79b y CD66d. Específicamente, los ejemplos de dominios intracelulares que comprenden uno o más ITAM incluyen péptidos que tienen secuencias de aminoácidos números 52 a 164 (SEQ ID NO.: 7) de CD3Z (NCBI RefSeq: NP_932170.1), aminoácidos números 45 a 86 de FceRIy (NCBI RefSeq: Np_004097.1), aminoácidos números 201 a 244 de FcsRIp (NCBI RefSeq: NP_000130.1), aminoácidos números 139 a 182 de CD3y (NCBI RefSeq: NP_000064.1), aminoácidos números 128 a 171 de CD38 (NCBI RefSeq: NP_000723.1), aminoácidos números 153 a 207 de CD3e (NCBI RefSeq: NP_000724.1), aminoácidos números 402 a 495 de CD5 (NCBI RefSeq: NP_055022.2), aminoácidos números 707 a 847 de CD22 (NCBI RefSeq: NP_001762.2), aminoácidos números 166 a 226 de CD79a (NCBI RefSeq: NP_001774.1), aminoácidos números 182 a 229 de CD79b (NCBI RefSeq: NP_000617.1) y aminoácidos números 177 a 252 de CD66d (NCBI RefSeq: NP_001806.2) y sus variantes tienen la misma función que estos péptidos. La numeración de aminoácidos basada en la información de la secuencia de aminoácidos de NCBI RefSeq ID o GenBank descrita en la presente descripción se numera en base a la longitud completa del precursor (que comprende una secuencia de péptido señal, etc.) de cada proteína.
Como se describe en la presente descripción, cuando CD3Z se reemplaza con uno de los anteriores, el motivo de asociación a STAT3 exógeno se introduce en el reemplazo de CD3Z.
La señalización del factor de transcripción STAT3 juega un papel importante en el desarrollo y mantenimiento de la memoria de las células T humanas (Siegel y otros, 2011). La señalización de STAT3 también puede potenciar en las células T los efectos antitumorales in vivo (Blood. 2010 y J Exp Med. 2005).
Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT3 exógeno es YXXQ (SEQ ID NO: 13). Como se demostró, el motivo de asociación a STAT3 exógeno YXXQ (SEQ ID NO: 13) comprendido en el dominio de señalización intracelular de un péptido transductor de señal CD3Z puede unirse a STAT3. El dominio intracelular de CD3Z es la secuencia en la SeQ ID NO: 7.
Como se describe en la presente descripción, los residuos de aminoácidos representados por "X" en el motivo de asociación a STAT3 YXXQ (SEQ ID NO: 13) pueden ser cualquier aminoácido de origen natural, incluido cualquier aminoácido de origen natural modificado que mantiene la unión a STAT3. Como se describe en la presente descripción, el aminoácido X se elige independientemente de leucina, arginina, histidina, fenilalanina, lisina, prolina, metionina, valina, glutamina, treonina y aspartato. Por ejemplo, el aminoácido X es arginina. Por ejemplo, el aminoácido X es histidina.
Los dos residuos de aminoácidos que flanquean el residuo de tirosina son arginina-histidina. El motivo de asociación a STAT3 exógeno es YRHQ (SEQ ID NO: 22).
Aunque el motivo de asociación a STAT3 exógeno YXXQ (SEQ ID NO: 13) puede introducirse en cualquier porción del dominio intracelular de CD3Z, el motivo de asociación a YXXQ descrito en la presente descripción se inserta cerca de la región del extremo C-terminal. Sin desear estar unido a la teoría, muchos motivos YXXQ endógenos están ubicados cerca o dentro de los 100 aa del extremo C-terminal. También se ha demostrado que un motivo YXXQ ubicado cerca de la región del extremo C-terminal es más funcional que el de un sitio más próximo en los estudios de GP130 y LIFR (Schmitz J y otros, J Immunol. 2000; 164:848-54; Tomida M y otros, Sangre. 1999; 93:1934-41).
Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT3 exógeno YXXQ (SEQ ID NO: 13) se introduce en cualquier porción del dominio intracelular de CD3Z que se ubica dentro de 200 residuos de aminoácidos desde el extremo C terminal del CAR. Por ejemplo, el motivo de asociación a STAT3 puede introducirse menos de 200, menos de 150, menos de 100, menos de 90, menos de 80, menos de 70, menos de 60, menos de 50, menos de 40, menos de 30, menos de 20 o menos de 10 residuos de aminoácidos del extremo C del CAR.
Como se describe en la presente descripción, el dominio intracelular de CD3Z comprende, como se describe en la presente descripción, los motivos de activación de inmunorreceptores basados en tirosina (ITAM). Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT3 exógeno se introduce en otro lugar que en un ITAM. Los ITAM son funcionalmente redundantes; sin embargo, tienen efectos aditivos con respecto a la fuerza de las respuestas de señalización. Por ejemplo, el dominio intracelular de CD3Z comprende tres ITAM para la señalización intracelular. Pueden mantenerse los motivos ITAM en el dominio intracelular de CD3Z del CAR descrito en la presente descripción.
En una modalidad, el dominio intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno comprende al menos un motivo ITAM. En una modalidad, el dominio intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno comprende dos motivos ITAM. Como se describe en la presente descripción, el dominio intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno comprende tres motivos ITAM.
El experto en la técnica apreciará que pueden usarse varios métodos para introducir un motivo de asociación a STAT3 en el dominio de señalización intracelular de CD3Z. Por ejemplo, como se muestra en la Figura 1, puede introducirse un motivo de asociación a STAT3 exógeno al sustituir los residuos de aminoácidos Leu-His-Met en la posición 104-106 con una tirosina en el residuo 104 y cualesquiera otros dos residuos de aminoácidos que flanquean el residuo de tirosina en las posiciones 105 y 106, lo que forma de este modo el motivo de asociación YXXQ (SEQ ID NO: 13). Los residuos de aminoácidos 104-105-106 del dominio de señalización intracelular de CD3Z corresponden a los residuos de aminoácidos 156-157-158 de la CD3Z de longitud completa (por ejemplo, NCBI RefSeq: NP_932170.1). La secuencia de 28-IL2RB-z(YXXQ) que comprende un motivo YXXQ en los residuos 104­ 107 del dominio intracelular de CD3Z se proporciona en la SeQ ID NO: 24. La secuencia de 28-IL2RB-z(YRHQ) que comprende un motivo YRHQ (SEQ ID nO: 22) en los residuos 104-107 del dominio intracelular de CD3Z (se muestra un dominio intracelular de CD3Z en los residuos 475-586 de la SEQ ID NO: 25).
Por ejemplo, el motivo STAT3 puede introducirse mediante mutagénesis dirigida a sitio con el uso, por ejemplo, del método de ensamblaje de Gibson. Pueden usarse los siguientes cebadores para el ensamblaje de Gibson: directo, ACGCCTATCGCCATCAGGCCCTGC (SEQ ID NO: 26); e inverso, CTGATGGCGATAGGCGTCGTAGGTGT (SEQ ID NO: 27). Otros métodos que pueden usarse incluyen, por ejemplo, tecnologías basadas en PCR, por ejemplo, clonación con extensión incompleta de cebadores por polimerasa (PIPE), clonación independiente de secuencia y ligación (SLIC) y clonación con extensión de superposición (OEC) (Klock y otros, 2008; Li y otros, 2007; Bryskin y otros, 2010; Unger y otros, 2010).
Como se describe en la presente descripción, el CAR comprende un segmento intracelular que comprende uno o más dominios de señalización intracelular seleccionados de un dominio citoplasmático de una cadena de ILR y un dominio coestimulador citoplasmático.
El dominio citoplasmático de una cadena del receptor de IL puede seleccionarse de cualquier cadena del receptor de IL, por ejemplo, puede usarse el dominio citoplasmático que comprende los aminoácidos números 266 a 551 de la cadena p del receptor de IL-2 (NCBI REFSEQ: NP_000869.1) (SEQ ID NO: 11, aminoácidos números 256 a 538 de la cadena a del receptor de IL-21 (NCBI REFSEQ: NP_068570.1; SEQ ID NO: 6) aminoácidos números 284 a 369 de la cadena y del receptor de IL-2 común (NCBI REFSEQ: NP_000197.1), aminoácidos números 265 a 459 de IL-7Ra (NCBI REFSEQ: NP_002176.2), aminoácidos números 292 a 521 de IL-9Ra (NCBI REFSEQ: NP_002177.2) o aminoácidos números 257 a 825 de IL-4Ra (NCBI REFSEQ: NP_000409.1). Puede usarse toda la región del dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL (por ejemplo, las secuencias proporcionadas en la presente descripción).
Alternativamente, también puede usarse un fragmento truncado de dicho dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL. Por ejemplo, el fragmento truncado comprende hasta 250 aminoácidos, o tiene de 50 a 200 aminoácidos o de 80 a 150 aminoácidos del dominio citoplasmático de ILR.
Como se describe en la presente descripción, el dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL, opcionalmente un fragmento truncado de dicho dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL comprende al menos un motivo de asociación a STAT, opcionalmente un motivo de asociación a STAT5 y un motivo de unión a JAK (también conocido como motivo box-1). Como se describe en la presente descripción el dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL o su fragmento truncado comprende un motivo de asociación a STAT5 y un motivo de unión a JAK.
Como se describe en la presente descripción, el dominio citoplasmático y/o los fragmentos truncados de la cadena del receptor de IL incluyen variantes que tienen la misma función, por ejemplo, variantes que inducen la señalización de STAT, opcionalmente la señalización de STAT5 y/o la señalización de jAk.
En un aspecto de la presente descripción, puede usarse el dominio citoplasmático de la cadena p del receptor de IL-2 (IL-2R). Un ejemplo de un dominio citoplasmático de la cadena p de IL-2R que puede usarse en la presente descripción incluye los aminoácidos números 266 a 551 de la cadena p de IL-2R (NcBI RefSeq: NP_000869.1, SEQ ID NO: 11). En todos los aspectos de la invención, se usa un fragmento truncado del dominio citoplasmático de la cadena p de IL-2R que corresponde a la SEQ ID NO: 5. Como se describe en la presente descripción, un fragmento truncado puede comprender i) un motivo de unión a JAK (por ejemplo, aminoácidos números 278 a 286 de NCBI Ref-Seq: NP_000869.1), también denominado motivo BOX-1, que permite la asociación con la tirosina quinasa JAK1, y ii) un motivo de asociación a STAT, opcionalmente un motivo de asociación a STAT5 o a STAT3. Pueden variarse otras porciones de la cadena del receptor de IL, por ejemplo, con variaciones conservadoras de aminoácidos.
El segmento intracelular puede comprender un motivo de unión a JAK exógeno o una molécula de señalización que comprende un motivo de unión a JAK. Por ejemplo, el motivo de unión a JAK proviene de IL2Rgamma (IL2RG), receptor de eritropoyetina (EpoR), receptor de trombopoyetina (TpoR), receptor del factor estimulante de colonias de macrófagos de granulocitos (GM-CSFR) y receptor de la hormona del crecimiento (GHR).
La cadena p de IL-2R comprende tres motivos de unión a STAT5 funcionales, YFFF (SEQ ID NO: 28), YCTF (SEQ ID NO: 29) y YLSL (SEQ ID NO: 43), usados para la asociación a STAT5. Las mutaciones de estos residuos de tirosina pueden eliminar la respuesta a IL-2 de la cadena p de IL-2R (Friedmann y otros, 1996). Se ha descrito que el receptor de eritropoyetina (EpoR) comprende dos residuos de tirosina que median la activación de STAT5, a saber, Y343 e Y401 y ambos tienen motivos YXXL (SEQ ID NO: 41) (Klingmuller y otros, 1996). Por lo tanto, YXXL (SEQ ID NO: 41) puede ser un motivo preferido para el reclutamiento de STAT5. Otros residuos de aminoácidos también son funcionales, como se muestra, por ejemplo, con los motivos de unión a STAT5 de la cadena p de IL-2R. Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT5 es el motivo de asociación a STAT5 de la cadena p de IL-2R y comprende el residuo 510 de tirosina (el residuo 510 de tirosina es el aminoácido número 536 de NCBI RefSeq: NP_000869.1).
Como se describe en la presente descripción, un motivo de asociación a STAT5 puede derivarse de IL2Rgamma, EpoR, TpoR, GM-CSFR y GHR.
Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT5 de la cadena p de IL-2R comprende los residuos de aminoácidos YXXL (SEQ ID NO: 41). Como se describe en la presente descripción, los residuos de aminoácidos representados por "X" en el motivo de asociación a STAT5 pueden ser cualquier aminoácido de origen natural, incluido cualquier aminoácido de origen natural modificado que mantiene la unión a STAT5.
El motivo de asociación a STAT5 comprende el residuo 510 de tirosina y los 4 residuos flanqueantes en el lado C-terminal del residuo 510 de tirosina, es decir, YLSLQ (SEQ ID NO:12).
El motivo de asociación a STAT5 puede existir de forma endógena en un dominio citoplasmático. Por ejemplo, el dominio citoplasmático de la cadena beta de IL-2R comprende un motivo de asociación a STAT5. El motivo de asociación a STAT5 también puede introducirse en un dominio citoplasmático que no expresa naturalmente este motivo. Por ejemplo, la asociación a STAT5 puede introducirse, por ejemplo, mediante sustitución o inserción de residuos de aminoácidos, con el uso de métodos conocidos que incluyen los descritos en la presente descripción. También se conocen otros motivos de asociación a STAT3 e incluyen, por ejemplo, YLRQ (SEQ ID NO: 30) para IL21R; YRHQ (SEQ ID NO: 22), YFKQ (SEQ ID NO: 31), YLPQ (SEQ ID NO: 32) y YMPQ (SEQ ID NO: 33) para IL6ST; YVLQ (SEQ ID NO: 34) para GCSFR, YQPQ (SEQ ID NO: 35), YKPQ (SEQ ID NO: 36) e YRPQ (SEQ ID NO: 37) para LIFR; YTHQ (SEQ ID NO: 38) para FGFR1; YLRQ (SEQ ID NO: 30) y YLKQ (SEQ ID NO: 39) para IL10RA y YHNQ (SEQ ID NO: 40) para EGFR (Shao y otros, 2004).
Como se describe en la presente descripción, el segmento intracelular comprende motivos de asociación a STAT3 y STAT5, que incluyen múltiples motivos de asociación a STAT3 y/o a STAT5.
Los motivos de asociación a STAT3 y STAT5 pueden, por ejemplo, localizarse o introducirse en cualquiera de los dominios de señalización intracelular.
De manera similar, el segmento intracelular descrito en la presente descripción puede comprender uno o más motivos de unión a JAK, que pueden localizarse o introducirse en cualquiera de los dominios de señalización intracelular.
También se muestra un motivo BOX-1 en los aminoácidos 13-21 de la SEQ ID NO: 5 y el residuo de tirosina 510 también se muestra como el aminoácido número 79 de la SEQ ID NO: 5 (y el motivo que flanquea el residuo de tirosina es los aminoácidos 80-83). En una modalidad, el fragmento del dominio citoplasmático del receptor de interleucina comprende los aminoácidos 22-78 de la SEQ ID NO: 5. Los ejemplos del fragmento truncado del dominio citoplasmático de la cadena p de IL-2R (SEQ ID No.: 5) incluyen péptidos que tienen secuencias de aminoácidos números 266 a 337 y 530 a 551 de Nc Bi RefSeq: NP_000869.1.
En un aspecto de la presente descripción, puede usarse el dominio citoplasmático de la cadena a del receptor de IL-21 (IL-21R). Un ejemplo del dominio citoplasmático de la cadena a de IL-21R usado en la presente descripción incluye un dominio de señalización intracelular que comprende los aminoácidos números 256 a 538 de la cadena a de IL-21R (NCBI RefSeq: NP_068570.1, SEQ ID No.: 6). En un aspecto de la presente descripción, puede usarse un fragmento truncado del dominio citoplasmático de la cadena a de IL-21R. El fragmento truncado incluye un motivo box-1 (aminoácidos números 266 a 274 de NCBI RefSeq: NP_068570.1) requerido para la asociación con la tirosina quinasa JAK1 e incluye un motivo de asociación a STAT. Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT comprende el residuo de tirosina 500 (aminoácido número 519 de NCBI RefSeq: NP_000869.1) y 3 residuos flanqueantes en el lado C-terminal del residuo de tirosina 500, es decir, YLRQ (SEQ ID NO: 30), requerido para la asociación a STAT1/3.
Otros ejemplos de dominios de señalización intracelular incluyen regiones citoplasmáticas de un complejo TCR y/o una molécula coestimuladora, y cualquier variante que tenga la misma función que esas secuencias. Otros ejemplos incluyen los dominios de señalización citoplasmática enumerados en la Tabla 2 de Sadelain y otros, 2009.
La activación natural de las células T es transducida por dos tipos diferentes de dominios de señalización intracelular, es decir, un dominio para iniciar la activación primaria dependiente de antígeno a través de un complejo de TCR (señal citoplasmática primaria, por ejemplo, proporcionada por CD3Z) y un dominio para el antígeno de acción independiente para proporcionar una señal secundaria o coestimuladora (señal citoplasmática secundaria). El segmento intracelular de CAR de la presente descripción comprende un dominio de señalización citoplasmático intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno y opcionalmente una secuencia de señalización citoplasmática secundaria.
Como se usa en la presente descripción, los términos "señalización citoplasmática secundaria" y "coestimulador" se usan indistintamente.
Los ejemplos de dominios intracelulares que comprenden un dominio de señalización citoplasmático secundario o coestimulador que puede usarse en la presente descripción incluyen secuencias de CD2, CD4, CD5, CD8a, CD8p, CD28, CD134, CD137 (4-1BB), ICOS y CD154 tales como fragmentos truncados de estos que comprenden motivos de señalización. Los ejemplos específicos de los mismos incluyen péptidos que tienen las secuencias de aminoácidos números 236 a 351 de CD2 (NCBI RefSeq: NP_001758.2), aminoácidos números 421 a 458 de CD4 (NCBI RefSeq: NP_000607.1), aminoácidos números 402 a 495 de CD5 (NCBI RefSeq: NP_055022.2), aminoácidos números 207 a 235 de CD8a (NCBI RefSeq: NP_001759.3), aminoácidos números l96 a 210 de CD8p (GenBank: AAA35664.1), aminoácidos números 180 a 220 (SEQ ID No.: 8) de CD28 (NCBI RefSeq: NP_006130.1), aminoácidos números 214 a 255 de CD137 (4-1BB, NcBI RefSeq: NP_001552.2), aminoácidos números 241 a 277 de CD134 OX40, NCBI RefSeq: NP_003318.1), y aminoácidos números 166 a 199 de ICOS (NCBI RefSeq: NP_036224.1), y sus variantes que tienen la misma función que tienen estos péptidos.
En una modalidad, el segmento intracelular de CAR descrito en la presente descripción comprende además un dominio coestimulador citoplasmático seleccionado de CD28, CD2, CD4, CD5, CD8a, CD8p, CD134 y CD137. La presente descripción incluye en un aspecto un CAR que comprende un segmento intracelular con uno o más, por ejemplo, 2 o 3 dominios de señalización intracelular además del dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno.
La presente descripción también incluye un CAR que comprende un segmento intracelular con dos o más dominios de señalización intracelular iguales que están unidos en tándem. En un aspecto, la presente descripción proporciona un CAR en el que un dominio citoplasmático del receptor de IL está en un lado N-terminal en relación con un dominio de señalización intracelular de CD3Z, es decir, un CAR que comprende un dominio citoplasmático del receptor de IL y un dominio de señalización intracelular de CD3Z que se unen en este orden desde el lado N-terminal. La presente descripción también incluye los CAR obtenidos mediante la adición adicional de un dominio intracelular de CD28 (por ejemplo, dominio coestimulador citoplasmático de CD28) al CAR mencionado anteriormente, es decir, un cAr que comprende un dominio de señalización intracelular de CD28, un dominio citoplasmático del receptor de IL, y un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo STAT3 exógeno que se unen en este orden desde el lado N-terminal.
Como se describe en la presente descripción, el CAR comprende un segmento intracelular que comprende un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno y dominios de señalización intracelular seleccionados de un dominio citoplasmático de la cadena del receptor de interleucina y un dominio coestimulador citoplasmático, en donde al menos uno de los dominios de señalización comprende un motivo de unión a JAK endógeno o exógeno y un motivo de asociación a STAT5.
Como se describe en la presente descripción, el CAR comprende un dominio de señalización intracelular de CD3Z con un motivo de asociación a STAT3 exógeno, un dominio citoplasmático del fragmento de la cadena del receptor de IL que comprende un motivo de unión a JAK endógeno o exógeno y un motivo de asociación a STAT5, y un dominio coestimulador citoplasmático de CD28.
En un CAR de la presente descripción, puede insertarse un enlazador oligopeptídico o un enlazador polipeptídico entre los dominios del segmento intracelular para unir los dominios en el mismo y/o unirlos a otros dominios. Por ejemplo, puede usarse un enlazador que tenga una longitud de 2 a 10 aminoácidos. En particular, puede usarse un enlazador que tenga una secuencia continua de glicina-serina. Por ejemplo, el enlazador IDGGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 42) puede introducirse entre el dominio citoplasmático de CD28 y el dominio beta del receptor de IL-2 citoplasmático parcial. Por ejemplo, el enlazador KLGGSGP (SEQ ID NO: 19) puede introducirse entre el dominio beta del receptor de IL-2 citoplasmático parcial y el dominio intracelular de la cadena de CD3Z.
En una modalidad específica, el CAR comprende un péptido señal, un dominio extracelular de un fragmento variable de cadena única de FMC63, un CD28 transmembrana, un dominio citoplasmático de CD28, un dominio beta del receptor de IL-2 citoplasmático parcial que corresponde a la SEQ ID NO: 5, corresponde a la SEQ ID NO: 5, que comprende un motivo de unión a JAK y un motivo de asociación a STAT5 endógeno, y un dominio de señalización intracelular de CD3Z que comprende un motivo de asociación a STAT3 exógeno que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en la posición 104-107 de la SEQ ID NO: 7, que se unen en este orden desde el lado N-terminal, como se muestra, por ejemplo, en la SEQ ID NO: 24.
En la presente descripción se describe un CAR que comprende i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado, ii) un dominio transmembrana y iii) un segmento intracelular que comprende uno o más dominios de señalización intracelular que incluyen un dominio citoplasmático de una cadena del receptor de interleucina y, opcionalmente, un dominio citoplasmático suplementario.
El dominio citoplasmático de una cadena del receptor de IL puede seleccionarse de cualquier cadena del receptor de IL descrita en la presente descripción. Puede usarse toda la región del dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL. Alternativamente, también puede usarse un fragmento truncado de dicho dominio citoplasmático de la cadena del receptor de IL. En la presente descripción se proporcionan ejemplos de fragmentos truncados y de longitud completa de estos.
El fragmento truncado puede comprender al menos un motivo de asociación de tirosina quinasa (también conocido como motivo box-1) y un motivo de asociación a STAT (Transductor de señal y activador de la transcripción) descrito en la presente descripción. Por ejemplo, el fragmento truncado comprende hasta 250 aminoácidos, o tiene de 50 a 200 aminoácidos o de 80 a 150 aminoácidos del dominio citoplasmático de ILR.
Como se describe en la presente descripción, el motivo de asociación a STAT de la cadena p de IL-2R comprende el residuo de tirosina 510 (el residuo de tirosina 510 es el aminoácido número 536 de NCBI RefSeq: NP_000869.1). El motivo de asociación a STAT comprende el residuo 510 de tirosina y los 4 residuos flanqueantes en el lado C-terminal del residuo de tirosina 510, es decir, YLSLQ (SEQ ID NO:12).
También se conocen otros motivos de asociación a STAT e incluyen YXXQ (SEQ ID NO:13), opcionalmente YXPQ, para IL-6, YXXQ (SEQ ID NO:13) para IL-10, YLPSNID (SEQ ID NO:14) para IL- 12, YLSLQ (SEQ ID NO:12), YCTFP (SEQ ID NO:15), YFFFH (SEQ ID NO:16) para IL-2, YVTMS (SEQ ID NO:17) para IL-7, YLPQE (SEQ ID NO:18) para IL-9 y YKAFS (SEQ ID NO:20) y YKPFQ (SEQ ID NO:21) para IL-4 como se indica, por ejemplo, en la Tabla 2 de Kisseleva y otros, 2002. Puede usarse y/o introducirse cualquier dominio de señalización de STAT en la cadena de ILR.
Como se describe en la presente descripción, además del dominio citoplasmático del receptor de IL, el segmento intracelular de CAR comprende al menos un dominio de señalización suplementario que está presente en el receptor de IL. Los ejemplos de dominios de señalización intracelular incluyen regiones citoplasmáticas de un complejo de TCR y/o una molécula coestimuladora, y cualquier variante que tenga la misma función que esas secuencias. Otros ejemplos incluyen los dominios de señalización citoplasmática enumerados en la Tabla 2 de Sadelain y otros, 2009. Como se describe en la presente descripción, el segmento intracelular de CAR comprende una secuencia de señalización citoplasmática primaria y/o una secuencia de señalización citoplasmática secundaria (por ejemplo, coestimuladora) descrita en la presente descripción como los dominios de señalización intracelular.
Como se describe en la presente descripción, el segmento intracelular comprende un dominio de señalización intracelular que tiene un ITAm y/o un ITIM descrito en la presente descripción.
La presente descripción incluye un CAR que comprende un segmento intracelular que comprende uno o más, por ejemplo, 2 o 3 dominios de señalización intracelular además del dominio citoplasmático del receptor de IL. Por ejemplo, el CAR comprende un dominio citoplasmático del receptor de IL y un dominio de señalización intracelular de CD3Z. Por ejemplo, el CAR comprende un dominio citoplasmático del receptor de IL, un dominio de señalización intracelular de CD3Z y un dominio coestimulador citoplasmático de CD28.
La presente descripción también incluye un CAR que comprende un segmento intracelular que comprende dos o más dominios de señalización intracelular que se unen en tándem. Por ejemplo, el CAR comprende un dominio citoplasmático del receptor de IL en un lado N-terminal en relación con un dominio de señalización intracelular de CD3Z, es decir, comprende un dominio citoplasmático del receptor de IL y un dominio de señalización intracelular de CD3Z que se unen en este orden desde el lado N-terminal.
La presente descripción también incluye los CAR que comprenden además un dominio intracelular de CD28 introducido en el CAR mencionado anteriormente, es decir, un CAR que comprende un dominio coestimulador citoplasmático de CD28, un dominio citoplasmático del receptor de IL y un dominio de señalización intracelular de CD3Z están opcionalmente unidos en este orden desde el lado N-terminal. Por ejemplo, el segmento intracelular de CAR puede comprender un dominio citoplasmático del receptor de IL en un lado C-terminal en relación con un dominio de señalización intracelular de c D3Z, es decir, comprende un dominio de señalización intracelular de CD3Z y un dominio citoplasmático del receptor de iL que se unen en este orden desde el lado N-terminal.
Como se describe en la presente descripción, el CAR comprende un segmento intracelular que comprende un dominio de señalización intracelular de CD3Z, uno o más dominios coestimuladores citoplasmáticos, en donde el segmento intracelular comprende un motivo de unión a JAK, motivos de asociación a STAT5 y/o a STAT3.
(c) Dominio transmembrana y dominio separador
El CAR de la presente descripción comprende un dominio transmembrana. El dominio transmembrana puede derivarse de un polipéptido natural o puede diseñarse artificialmente. El dominio transmembrana derivado de un polipéptido natural puede obtenerse de cualquier proteína transmembrana o de unión a membrana. Por ejemplo, puede usarse un dominio transmembrana de una cadena a o p del receptor de células T, una cadena de CD3Z, CD28, CD3£, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137, ICOS, CD154 o un GITR. El dominio transmembrana diseñado artificialmente es un polipéptido que comprende principalmente residuos hidrófobos tales como leucina y valina. Por ejemplo, puede encontrarse un triplete de fenilalanina, triptófano y valina en cada extremo del dominio transmembrana sintético. Opcionalmente, puede disponerse un enlazador oligopeptídico corto o un enlazador polipeptídico, por ejemplo, un enlazador que tiene una longitud de 2 a 10 aminoácidos entre el dominio transmembrana y el segmento intracelular como se describe en la presente descripción. En particular, puede usarse una secuencia enlazadora que tenga una secuencia continua de glicina-serina.
Por ejemplo, puede usarse un dominio transmembrana que tiene una secuencia de aminoácidos números 153 a 179 (SEQ ID NO.: 9) de CD28 (NCBI RefSeq: NP_006130.1) como el dominio transmembrana.
En el CAR de la presente descripción, puede disponerse un dominio separador entre el dominio extracelular y el dominio transmembrana, o entre el segmento intracelular y el dominio transmembrana. El dominio separador significa cualquier oligopéptido o polipéptido que sirve para unir el dominio transmembrana con el dominio extracelular y/o el dominio transmembrana con el segmento intracelular. El dominio separador comprende hasta 300 aminoácidos, por ejemplo, alrededor de 10 a 100 aminoácidos, o alrededor de 25 a 50 aminoácidos.
El dominio separador tiene preferentemente una secuencia que promueve la unión de un CAR con un antígeno y mejora la señalización en una célula. Los ejemplos de un aminoácido que se espera que promueva la unión incluyen cisteína, un aminoácido cargado y serina y treonina en un sitio de glicosilación potencial, y estos aminoácidos pueden usarse como un aminoácido que constituye el dominio separador.
En una modalidad, el dominio separador es un polipéptido que comprende o consiste en los aminoácidos números 118 a 178 de CD8a (NCBI RefSeq: NP_001759.3) que es una región bisagra de CD8a, aminoácidos números 135 a 195 de CD8p (GenBank: AAA35664.1), aminoácidos números 315 a 396 de CD4 (NCBI RefSeq: NP_000607.1), aminoácidos números 114 a 152 (SeQ ID No.: 10) de CD28 (NCBI RefSeq: NP_006130.1), o una parte de este. Además, el dominio separador puede ser una secuencia sintetizada de manera artificial.
El CAR de la presente descripción puede diseñarse para formar un polímero, en particular, un dímero. Por ejemplo, la cisteína se inserta en el dominio separador y/o el dominio transmembrana para polimerizar (dimerizar) el CAR, por ejemplo, a través de un puente disulfuro.
Además, en el CAR de la presente descripción, una secuencia de péptida señal puede unirse al extremo N-terminal. Existe una secuencia de péptido señal en el extremo N-terminal de muchas proteínas secretoras y proteínas de membrana, y tiene una longitud de 15 a 30 aminoácidos. Muchas de las moléculas de proteína que tienen un dominio intracelular mencionadas en la presente descripción son proteínas de membrana y tienen secuencias de péptidos señal. Los péptidos señal derivados de tales proteínas secretoras y proteínas de membrana pueden usarse como un péptido señal para el CAR de la presente descripción. Puede usarse cualquier péptido señal. Por ejemplo, el péptido señal puede ser un péptido señal de Oncostatina M. Los péptidos señal pueden ser de humanos y también pueden derivarse de no humanos, por ejemplo, de células de insectos o de virus. En una modalidad, el péptido señal es un péptido señal humano.
(2) Ácido nucleico que codifica los CAR
La presente descripción proporciona un ácido nucleico que codifica el CAR descrito en la presente descripción. El ácido nucleico que codifica el CAR puede prepararse fácilmente a partir de una secuencia de aminoácidos del CAR especificado mediante un método convencional. Puede obtenerse una secuencia de nucleótidos que codifica una secuencia de aminoácidos a partir de los NCBI RefSeq ID mencionados anteriormente o los números de acceso de GenBank para una secuencia de aminoácidos de cada dominio, y el ácido nucleico de la presente descripción puede prepararse con el uso de un estándar biológico molecular y/o procedimiento químico. Por ejemplo, basándose en la secuencia de nucleótidos, puede sintetizarse un ácido nucleico y el ácido nucleico de la presente descripción puede prepararse al combinar fragmentos de ADN que se obtienen de una biblioteca de ADNc con el uso de una reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
El ácido nucleico de la presente descripción puede unirse a otro ácido nucleico para expresarse bajo el control de un promotor adecuado. Los ejemplos del promotor incluyen un promotor que promueve constitutivamente la expresión de un gen o constructo unido operativamente, un promotor que induce la expresión de un gen o constructo unido operativamente por la acción de un fármaco o similar (por ejemplo, tetraciclina o doxorrubicina). Para lograr una transcripción eficiente del ácido nucleico, el ácido nucleico de la presente descripción también puede unirse a otros elementos reguladores que cooperan con un promotor o un sitio de inicio de la transcripción, por ejemplo, un ácido nucleico que comprende una secuencia potenciadora o una secuencia terminadora. Además del ácido nucleico de la presente descripción, puede incorporarse un gen que puede ser un marcador para confirmar la expresión del ácido nucleico (por ejemplo, un gen de resistencia a fármacos, un gen que codifica una enzima indicadora o un gen que codifica una proteína fluorescente).
En una modalidad, el ácido nucleico es un ácido nucleico con optimización de codones para la expresión en un huésped particular.
La presente descripción proporciona una composición que comprende el ácido nucleico de la presente descripción como un ingrediente activo, junto con un excipiente farmacéuticamente aceptable. Los excipientes farmacéuticamente aceptables adecuados son bien conocidos por un experto en la técnica. Los ejemplos de excipientes farmacéuticamente aceptables incluyen solución salina tamponada con fosfato (por ejemplo, fosfato 0,01 M, NaCl 0,138 M, KCl 0,0027 M, pH 7,4), una solución acuosa que contiene una sal de ácido mineral tal como un hidrocloruro, un hidrobromuro, un fosfato o un sulfato, solución salina, una solución de glicol o etanol, y una sal de un ácido orgánico tal como un acetato, un propionato, un malonato o un benzoato. También pueden usarse un adyuvante, tal como un agente humectante o un emulsionante, y un agente tamponador del pH. Como los excipientes farmacéuticamente aceptables, pueden usarse apropiadamente los excipientes descritos en Remington's Pharmaceutical Sciences (Mack Pub. Co., N.J. 1991). La composición de la presente descripción puede formularse en una forma conocida adecuada para la administración parenteral, por ejemplo, inyección o infusión. Además, la composición de la presente descripción puede comprender aditivos de formulación tales como un agente de suspensión, un conservante, un estabilizador y/o un dispersante, y un agente de conservación para extender un período de validez durante el almacenamiento. La composición puede estar en forma seca para su reconstitución con un líquido estéril apropiado antes de su uso. Para la administración mediada por partículas finas, una partícula tal como una partícula de oro de tamaño microscópico puede recubrirse con un ADN.
Cuando el ácido nucleico de la presente descripción se introduce en una célula ex vivo, el ácido nucleico de la presente descripción puede combinarse con una sustancia que promueva la transferencia de un ácido nucleico en una célula, por ejemplo, un reactivo para introducir un ácido nucleico tal como un liposoma o un lípido catiónico, además de los excipientes mencionados anteriormente. Alternativamente, un vector que porta el ácido nucleico de la presente descripción también es útil como se describe más adelante. En particular, una composición en una forma adecuada para la administración a un organismo vivo que contiene el ácido nucleico de la presente descripción portado por un vector adecuado es adecuada para la terapia génica in vivo.
Una composición que comprende el ácido nucleico de la presente descripción como un ingrediente activo puede administrarse para el tratamiento de, por ejemplo, un cáncer [cáncer de sangre (leucemia), tumor sólido, etc.], una enfermedad inflamatoria/enfermedad autoinmunitaria (asma, eccema), hepatitis y una enfermedad infecciosa cuya causa es un virus tal como la influenza y el VIH, una bacteria o un hongo, por ejemplo, una enfermedad como la tuberculosis, MRSA, VRE o micosis profunda, dependiendo del antígeno al cual se une un CAR codificado por el ácido nucleico. Una composición que comprende el ácido nucleico de la presente descripción como un ingrediente activo puede administrarse o formularse adecuadamente para la administración por vía intradérmica, intramuscular, subcutánea, intraperitoneal, intranasal, intraarterial, intravenosa, intratumoral o en un vaso linfático aferente, por administración parenteral, por ejemplo, mediante inyección o infusión, aunque la vía de administración no está particularmente limitada.
(3) Proceso para producir células que expresan CAR
Un proceso de producción de una célula que expresa el CAR de la presente descripción incluye una etapa de introducir el ácido nucleico que codifica un CAR descrito en la presente descripción en una célula. La etapa se realiza ex vivo. Por ejemplo, una célula puede transformarse ex vivo con un vector viral o un vector no viral que porta el ácido nucleico de la presente descripción para producir una célula que expresa el CAR de la presente descripción. En el proceso de la presente descripción, puede usarse una célula derivada de un mamífero, por ejemplo, una célula humana, o una célula derivada de un mamífero no humano tal como un mono, un ratón, una rata, un cerdo, un caballo o un perro.
En una modalidad, el mamífero es un ser humano.
La célula usada en el proceso de la presente descripción no está particularmente limitada y puede usarse cualquier célula. Por ejemplo, puede usarse una célula recolectada, aislada o purificada de un fluido corporal, un tejido o un órgano tal como sangre (sangre periférica, sangre del cordón umbilical, etc.) o médula ósea o una célula obtenida mediante la diferenciación o reprogramación de la célula antes mencionada para producir una célula madre pluripotente inductora (iPSC) (ver, por ejemplo, Themeli y otros, 2013). Puede usarse una célula mononuclear de sangre periférica (PBMC), una célula inmunitaria [que incluye, por ejemplo, una célula T, una célula dendrítica, una célula B, una célula madre hematopoyética, un macrófago, un monocito, una célula NK o una célula hematopoyética (un neutrófilo, un basófilo)], una célula mononuclear de sangre de cordón umbilical, un fibroblasto, un adipocito precursor, un hepatocito, un queratinocito de piel, una célula madre mesenquimatosa, una célula madre adiposa, varias cepas de células cancerosas o una célula madre neuronal. Por ejemplo, puede usarse una célula NK o una célula T, una célula precursora de una célula T (una célula madre hematopoyética, una célula precursora de linfocitos, etc.) o una población celular que las contenga. Los ejemplos de la célula T incluyen una célula T positiva para CD8, una célula T positiva para CD4, una célula T reguladora, una célula T citotóxica y un linfocito infiltrante de tumor. La población celular que contiene una célula T y una célula precursora de una célula T incluye una PBMC. Las células mencionadas anteriormente pueden recolectarse de un cuerpo vivo, obtenerse por cultivo de expansión de una célula recolectada de un cuerpo vivo o establecerse como una cepa celular. Cuando se desea el trasplante de la célula que expresa CAR producida o una célula diferenciada de la célula que expresa CAR producida en un cuerpo vivo, el ácido nucleico puede introducirse en una célula recolectada del propio cuerpo vivo o de un cuerpo vivo conespecífico de este.
El ácido nucleico que codifica el CAR de la presente descripción puede insertarse en un vector y el vector puede introducirse en una célula. Por ejemplo, puede usarse un vector de virus como un vector de retrovirus (que incluye un vector de oncorretrovirus, un vector de lentivirus y un vector de pseudotipado), un vector de adenovirus, un vector de virus adenoasociado (AAV), un vector de virus de simio, un vector de virus vaccinia o un vector de virus sendai, un vector de virus de Epstein-Barr (EBV) y un vector de HSV. Por ejemplo, puede usarse un vector de virus que carece de la capacidad de replicación para no autorreplicarse en una célula infectada.
Además, también puede usarse un vector no de virus en la presente descripción en combinación con un liposoma o un agente de condensación tal como un lípido catiónico como se describe en los documentos WO 96/10038, WO 97/18185, WO 97/25329, WO 97/30170 y Wo 97/31934. El ácido nucleico de la presente descripción también puede introducirse en una célula mediante transducción de fosfato cálcico, DEAE-dextrano, electroporación o bombardeo de partículas.
Por ejemplo, cuando se usa un vector de retrovirus, el proceso de la presente descripción puede llevarse a cabo al seleccionar una célula de empaquetamiento adecuada basada en una secuencia de LTR y una secuencia señal de empaquetamiento que posee el vector y al preparar una partícula de retrovirus con el uso de la célula de empaquetamiento. Los ejemplos de la célula de empaquetamiento incluyen PG13 (ATCC CRL-10686), PA317 (ATCC CRL-9078), GP+E-86 y GP+envAm-12 (patente de Estados Unidos núm. 5,278,056) y Psi-Crip [Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 85, págs. 6460-6464 (1988)]. También puede prepararse una partícula de retrovirus con el uso de una célula 293 o una célula 293T que tiene una alta eficacia de transfección. Muchos tipos de vectores de retrovirus producidos en base a retrovirus y células de empaquetamiento que pueden usarse para empacar los vectores de retrovirus están ampliamente disponibles comercialmente en muchas compañías.
Un aspecto es un método de fabricación de una célula descrito en la presente descripción, que comprende transfectar o transducir una célula con un ácido nucleico o un vector descrito en la presente descripción.
Otro aspecto es un método de fabricación de una célula descrita en la presente descripción, que comprende: a) aislar células inmunitarias de un mamífero;
b) transfectar o transducir las células inmunitarias aisladas, células T opcionalmente aisladas, con un ácido nucleico que codifica un CAR descrito en la presente descripción o un vector que comprende dicho ácido nucleico; y
c) opcionalmente aislar y/o expandir células que expresan CAR, opcionalmente células T que expresan CAR. En una modalidad, las células inmunitarias aisladas son células T aisladas.
En una modalidad, las células aisladas son CD3+ y opcionalmente estimuladas con un anticuerpo anti-CD3, opcionalmente en una forma soluble o unida a la membrana, por ejemplo, OKT3 o mOKT3, y/o APC antes de la transducción o transfección. En una modalidad, las APC son APC artificiales (aAPC). En otra modalidad, la aAPC expresa una forma membranosa de anticuerpo monoclonal anti-CD3.
En una modalidad, se repite la etapa de transfección o transducción. Por ejemplo, la etapa de transfección o transducción puede llevarse a cabo dos o tres veces, o cuatro veces o hasta que, por ejemplo, se logre un nivel adecuado de expresión. Por ejemplo, la etapa de transfección o transducción puede llevarse a cabo cinco veces. En una modalidad, las células se transfectan o transducen en más de un día consecutivo. Por ejemplo, las células se transfectan o transducen durante dos días consecutivos, tres días consecutivos o cuatro días consecutivos.
En una modalidad, las células transducidas con CAR se estimulan con células irradiadas que expresan un antígeno predeterminado. Por ejemplo, las células T transducidas con CAR se estimulan con células irradiadas en una relación de efector con respecto a diana de 100:1, 75:1, 50:1, 25:1, 20:1, 15:1, 10:1, 9:1, 8:1, 7:1, 6:1, 5:1, 4:1, 3:1, 2:1, 1:1, 1:2, 1:3, 1:4, 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 1:10, 1:15, 1:20, 1:25, 1:50 o 1:100.
(4) Célula que expresa CAR y usos de esta
La célula que expresa el CAR de la presente descripción es una célula en la que el ácido nucleico que codifica un CAR descrito en la presente descripción se introduce y expresa mediante el proceso de producción descrito en la presente descripción.
La célula de la presente descripción se une a un antígeno específico a través del CAR, por lo que se transmite una señal a la célula y, como resultado, la célula se activa. La activación de la célula que expresa el CAR varía en función del tipo de célula huésped y los dominios intracelulares del CAR, y puede confirmarse basándose, por ejemplo, en la liberación de una citocina, la mejora de la tasa de proliferación celular, el cambio en una molécula de superficie celular, o similar como un índice. Por ejemplo, la liberación de una citocina citotóxica (un factor de necrosis tumoral, linfotoxina, etc.) de la célula activada provoca la destrucción de una célula diana que expresa un antígeno. Además, la liberación de una citocina o el cambio en una molécula de la superficie celular estimula otras células inmunitarias, por ejemplo, una célula B, una célula dendrítica, una célula NK y un macrófago.
En la presente descripción se demuestra que las células T modificadas con CAR de acuerdo con la invención tienen una proliferación superior a través de una tasa de división celular más alta y una apoptosis reducida en comparación con las células T que comprenden CARS de primera (28-z) y segunda (28-BB-z) generación (ver la Figura 12). Además, las células T con CAR genéticamente modificado también mantienen fenotipos de memoria similares a las de las células madre después de la estimulación repetida del antígeno (Figura 14).
En consecuencia, la célula que expresa el CAR puede usarse como un agente terapéutico para una enfermedad. Como se muestra en el Ejemplo 4 así como también en las Figuras 18-20, los ratones inyectados con células leucémicas y tratados con el CAR anti-CD19 mostraron una actividad tumoral disminuida, así como también una supervivencia general aumentada en comparación con los ratones no tratados y los ratones tratados con CAR de generaciones anteriores.
En un aspecto, se proporciona el CAR, ácido nucleico, vector, célula o composición descritos en la presente descripción para su uso en el tratamiento de una enfermedad.
Otro aspecto es un método para tratar o prevenir una enfermedad en un mamífero, el método comprende administrar al mamífero que lo necesite una cantidad eficaz de células o una composición descrita en la presente descripción.
Un aspecto adicional es un método para proporcionar una inmunidad antitumoral en un mamífero, el método comprende administrar al mamífero que lo necesite una cantidad eficaz de una célula o una composición descrita en la presente descripción.
El agente terapéutico comprende la célula que expresa el CAR como ingrediente activo y puede comprender además un excipiente adecuado. Los ejemplos del excipiente incluyen los excipientes farmacéuticamente aceptables mencionados anteriormente para la composición que comprende el ácido nucleico de la presente descripción como un ingrediente activo, diversos medios de cultivo celular y cloruro de sodio isotónico.
La enfermedad contra la que se administra la célula que expresa el CAR no está particularmente limitada siempre que la enfermedad muestre sensibilidad a la célula. En una forma de modalidad, la enfermedad es un cáncer.
Por ejemplo, el cáncer es un cáncer de sangre o un tumor sólido. Por ejemplo, el cáncer de sangre es una leucemia, linfoma o mieloma. Por ejemplo, el tumor sólido es cáncer de mama, cáncer de ovario, glioblastoma, osteosarcoma o meduloblastoma.
En una modalidad, la enfermedad es una enfermedad inflamatoria/enfermedad autoinmunitaria (asma, eccema), hepatitis y una enfermedad infecciosa, cuya causa es un virus tal como la influenza y el VIH, una bacteria o un hongo, por ejemplo, tuberculosis, MRSA, VRE y micosis profunda.
La célula que expresa el CAR de la presente descripción que se une a un antígeno poseído por una célula que se desea disminuir o eliminar para el tratamiento de las enfermedades mencionadas anteriormente, es decir, un antígeno tumoral, un antígeno viral, un antígeno bacteriano o similares se administra para el tratamiento de estas enfermedades.
En consecuencia, un aspecto incluye un método para disminuir en un sujeto el número de células que expresan un antígeno predeterminado, el método comprende administrar al sujeto que lo necesita una cantidad eficaz de células que expresan un CAR como se describe en la presente descripción, en donde el CAR se une específicamente al antígeno predeterminado.
La célula de la presente descripción también puede utilizarse para la prevención de una enfermedad infecciosa después de un trasplante de médula ósea o exposición a radiación, transfusión de linfocitos de donante con el fin de remisión de leucemia recurrente y similares.
El agente terapéutico que comprende la célula que expresa el CAR como un ingrediente activo puede administrarse por vía intradérmica, intramuscular, subcutánea, intraperitoneal, intranasal, intraarterial, intravenosa, intratumoral o en un vaso linfático aferente, mediante administración parenteral, por ejemplo, mediante inyección o infusión, aunque la vía de administración no está limitada.
En una modalidad, el sujeto es sospechoso de tener o tiene cáncer. En una modalidad, el sujeto es sospechoso de tener o tiene una enfermedad inflamatoria.
Además, se pretende que las definiciones y modalidades descritas en secciones particulares sean aplicables a otras modalidades descritas en la presente descripción para las que son adecuadas, como entendería un experto en la técnica. Por ejemplo, en los siguientes pasajes, se definen con más detalle diferentes aspectos de la invención. Cada aspecto así definido puede combinarse con cualquier otro aspecto o aspectos a menos que se indique claramente lo contrario. En particular, cualquier característica indicada como preferida o ventajosa puede combinarse con cualquier otra característica o características indicadas como preferidas o ventajosas.
La descripción anterior describe en general la presente solicitud. Puede obtenerse una comprensión más completa haciendo referencia a los siguientes ejemplos específicos. Estos ejemplos se describen únicamente con fines ilustrativos y no pretenden limitar el alcance de la solicitud. Se contemplan cambios de forma y sustitución de equivalentes según las circunstancias lo sugieran o lo hagan oportuno. Aunque en la presente descripción se han empleado términos específicos, dichos términos están pensados en un sentido descriptivo y no con fines de limitación.
Los siguientes ejemplos no limitantes son ilustrativos de la presente descripción:
Ejemplos
La presente descripción se explicará con más detalle a modo de Ejemplos, a los que no se limita la presente descripción.
Ejemplo 1
Constructos de receptores de antígenos quiméricos (CAR) anti-CD19
Un fragmento variable de cadena única derivado de FMC63 (scFv) (Nicholson y otros, 1997) se ha unido a la cadena de CD28 y CD3Z (28-z, 2a generación), CD28, 4-1BB y cadena de Cd 3Z (28-BB -z, 3' generación), o CD28, dominio citoplasmático de la cadena p del receptor de IL-2 con deleción interna, y se ha introducido la cadena de CD3Z con un motivo YXXQ exógeno (SeQ ID NO: 13) para la unión a STAT3 (28-IL2RB- z(YXXQ)), como se muestra en la Figura 1. El motivo YXXQ (SEQ ID NO: 13) se generó mediante la sustitución del residuo Leu-His-Met en la posición 156-158 codificado por la cadena de CD3Z por Tyr-Arg-His. FMC63 es un anticuerpo monoclonal de ratón IgG2a que pertenece a la agrupación de CD19. Se usó oncostatina M como un péptido señal. El método de ensamblaje de Gibson se usó para la mutagénesis dirigida a sitio. Se usaron los siguientes cebadores: ACGCCTATCGCCATCAGGCCCTGC (SEQ ID NO: 26) y CTGATGGCGATAGGCGTCGTAGGTGT (SEQ ID NO: 27).
Eficiencia de transducción de células T primarias con constructos de CAR anti-CD19
Para determinar la eficiencia de transducción de células T primarias con constructos de CAR anti-CD19, se estimularon células T CD3+ de sangre periférica con células presentadoras de antígeno artificiales que expresan una forma membranosa de AcM anti-CD3 (clon OKT3), Cd8o y CD83 (mOKT3/aAPC) (Butler y otros, 2012), y posteriormente se transdujeron con constructos de CAR individuales que demanda retrovirus. La transducción se repitió durante tres días consecutivos. Siete días después de la estimulación inicial con mOKT3/aAPC, las células T transducidas con CAR se tiñeron con proteína L marcada con biotina seguida de estreptavidina-APC. Las células T teñidas se analizaron mediante citometría de flujo, como se muestra en la Figura 2. La eficiencia de la transducción fue comparable en las células T transducidas con varios constructos de CAR. Se muestran datos representativos de cuatro experimentos independientes.
Expresión superficial de CAR anti-CD19
Se comparó la expresión superficial de CAR anti-CD19 al medir la intensidad de fluorescencia media (MFI) de los constructos de CAR expresados en células T primarias (n=4) (Figura 3). La expresión de la superficie de CAR fue ligeramente inferior en las células T CAR 28-BB-z y 28-IL2RB-z(YXXQ) en comparación con las células T CAR 28-z. La significancia estadística se evaluó con la prueba t pareada. Las barras de error indican S.D.
Fosforilación de STAT3 y STAT5 en las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z (YXXQ)
Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) se dejaron reposar en un medio libre de citocinas durante un día y se estimularon con células K562-CD19 en una relación de efector con respecto a diana (E: T) de 2:1. Se fijaron/permeabilizaron células T CD8+ STAT3 y STAT5 fosforiladas, se tiñeron con AcM específicos y se analizaron mediante análisis de citometría de flujo intracelular, como se muestra en la Figura 4. Las células T modificadas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron un aumento gradual en la fosforilación de STAT3 y STAT5. Se muestran datos representativos de tres experimentos.
Comparación de la actividad de la vía JAK-STAT en células T transducidas con CAR
Se estimularon células T transducidas con CAR con células K562 o células K562 que expresan de forma estable CD19 (K562-CD19) en las mismas condiciones que en la Figura 4, y se midió la expresión de STAT3 y STAT5 fosforilada 18 horas después de la estimulación. Se calculó la intensidad de fluorescencia media relativa (MFI) al dividir cada MFI por el valor medio de MFI de las células T transducidas con CAR 28-z cocultivadas con células K562 (n=4). Como se muestra en la Figura 5, las células T CAR+ 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron una fosforilación significativamente mayor de STAT3 (P<0,01) y STAT5 (P<0,05; prueba t pareada) cuando se cocultivaron con células K562-CD19, lo que indica que el CAR indujo la activación de la vía JAK-STAT específica de CD19.
Ejemplo 2
Protocolo para la transducción y expansión de células T con constructos de CAR anti-CD19
Se estimularon células T CD3+ periféricas con mOKT3/aAPC y se transdujeron retroviralmente con CAR CD19 individuales durante tres días consecutivos. Las células T transducidas con CAR se estimularon con células K562-CD19 o células K562 irradiadas en presencia de 100 UI/ml de IL-2 y 10 ng/ml de IL-15 en una relación de E: T de 2:1 de manera semanal donde se indica (ver la Figura 6). Pueden preverse variaciones de la relación de E: T y la duración de la transducción. Por ejemplo, las células T CD3+ estimuladas con mOKT3/aAPC pueden transducirse durante tres días consecutivos en una relación de E: T de 10:1.
Expansión de células T transducidas con CAR después de la transducción
En la Figura 7 se muestra la expansión en veces de células T transducidas con CAR (n=4). Se obtuvo una expansión superior a 100 veces de las células T CD8+ en 2 semanas en todas las células T transducidas con CAR. Las células T transducidas con CAR 28-BB-z mostraron una proliferación significativamente superior en comparación con las células T transducidas con CAR 28-z después de la transducción (P<0,05 por la prueba t pareada), mientras que no hubo diferencia entre las células T transducidas con CAR 28-z y 28-IL2RB-z(YXXQ). Expansión de células T transducidas con CAR después de la estimulación específica con CD19 con células K562-CD19
Las células T transducidas con CAR se estimularon de una manera específica con CD19 con el uso de células K562-CD19 irradiadas. Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron una proliferación superior tanto en las células T CD4+ como en las CD8+ independientemente de la suplementación con citocinas. En la Figura 8 se muestra la expansión en veces de las células T CAR+ (n=4; la significancia estadística se evaluó con la prueba t pareada).
Expansión de células T CAR+ después del cocultivo con células K562
Las células T transducidas con CAR se estimularon con células K562 irradiadas (control). En la Figura 9 se muestra la expansión en veces de las células T transducidas con CAR (n=4). Como se mostró anteriormente, las células T transducidas con 28-BB-z promovieron la proliferación independiente del antígeno en comparación con las células T transducidas con CAR 28-z (Milone y otros, 2009) (P<0,05 para las células T CD8+ por la prueba t pareada). Por el contrario, las células T CAR+ 28-IL2RB-z(YXXQ) no conferían una ventaja proliferativa sobre las células T CAR 28-z en ausencia de estimulación con CD19 específica de antígeno.
Expansión de las células T CAR+ después de la reestimulación específica de antígeno con células K562-CD19 Las células T transducidas con CAR se estimularon semanalmente dos veces con células K562-CD19 irradiadas, como se muestra en la Figura 10. Se muestra la expansión en veces de las células T CAR+ (n=4). Las células T modificadas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron una proliferación mejorada en comparación con las otras células T transducidas con CAR (P<0,05 para las células T CD8+; prueba t pareada).
Tasa de división celular en células T transducidas con CAR
Las células T modificadas con CAR se marcaron con éster succinimidílico de carboxifluoresceína (CFSE) y se estimularon con células K562-CD19 en una relación de 2:1. La MFI promedio de CFSE en las células T CD4+ o CD8+ transducidas con CAR 3 días después de la estimulación en relación con la de las células T transducidas con CAR 28-z se muestra en la Figura 11 (n=4). La intensidad de CFSE en las células T transducidas con CAR 28-z se estableció en uno en cada donante. Las barras de error indican la S.D. La significancia estadística se evaluó con la prueba t pareada. Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron una división celular significativamente mejorada.
Ejemplo 3
Viabilidad de las células T transducidas con CA
Se estimularon células T transducidas con CAR con células K562-CD19 en una relación de 2:1. La frecuencia de células muertas se evaluó mediante citometría de flujo 3 días después de la estimulación (n=4) (Figura 12). Las barras de error representan la S.D. Las células T transducidas con el constructo CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron una disminución de la apoptosis tras la estimulación del antígeno. La significancia de la diferencia se evaluó mediante la prueba t pareada. Los datos presentados en las Figuras 11 y 12 demuestran que la ventaja proliferativa de las células T CAR+ 28-IL2RB-z(YXXQ) tras la estimulación con CD19 resultó tanto de una división celular mejorada como de una apoptosis disminuida.
Fenotipo de superficie de células T transducidas con CAR
Las células T transducidas con CAR se estimularon con K562-CD19 en una relación de 2:1. Se tiñeron CD45RA y CD62L de superficie en células T CD4+ y CD8+ con AcM específicos y se sometieron a análisis de citometría de flujo 7 días después de la estimulación (Figura 13). Se muestran datos representativos de 4 experimentos independientes. Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mantuvieron el subconjunto de células T CD45RA+ CD62L+ en comparación con las células T CAR+ 28-z o 28-BB-z.
La frecuencia de las células T CAR con un fenotipo de marcador de células T de memoria similar a células madre (CD45RA+ CD62L+ CD95+)
Las células T transducidas con CAR se estimularon con K562-CD19 en una relación de 2:1. Se analizó la expresión superficial de CD45RA, CD62L y CD95 7 días después de la estimulación (n=4) (Figura 14). Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) poseían una frecuencia significativamente más alta de un subconjunto de células T de memoria similares a células madre CD45RA+ CD62L+ CD95+. La significancia estadística se evaluó con la prueba t pareada.
Comparación de la expresión de CD62L en células T transducidas con CAR
La expresión de CD62L en células T transducidas con CAR se analizó como se describe para las Figuras 13 y 14. Se calculó la MFI relativa de la expresión de CD62L en las células T CD4+ y CD8+ transducidas con CAR al dividir cada MFI por el valor promedio de MFI de las células T transducidas con CAR 28-z (n=4). Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) mostraron un nivel de expresión significativamente mayor de CD62L en comparación con las otras células T CAR+ (P<0,05 mediante la prueba t pareada).
Secreción de IL-2 por células T transducidas con CAR
Las células T transducidas con CAR se estimularon con K562-CD19 en una relación de 1:1. Una semana después de la estimulación, las células T se reestimularon con mOKT3/aAPC y se midió la secreción de citocinas con citometría de flujo intracelular después de la tinción con AcM específicos. Las células T CAR+ 28-IL2RB-z(YXXQ) secretaron más IL-2 en comparación con las células T transducidas con CAR 28-z y 28-BB-z. La significancia se evaluó mediante la prueba t pareada. Estos resultados son consistentes con los datos mostrados en la Figura 15; las células T CAR+ 28-IL2RB-z (YXXQ) mantuvieron preferentemente un subconjunto de células T de memoria similares a células madre CD45RA+ CD62L+ CD95+ en comparación con las otras células T CAR.
Lisis in vitro de células diana por células T transducidas con CAR
Se cultivaron células T transducidas con CAR con células diana irradiadas (células K562-CD19 y CD19+ Nalm-6) marcadas con éster succinimidílico de carboxifluoresceína (CFSE) en una relación de E: T de 3:1 durante 6 horas. El porcentaje de células vivas positivas para CFSE residuales en el cultivo se determinó mediante análisis de citometría de flujo (n=3). Se usaron células K562 progenitoras como un control. Las barras de error representan la S.D. La significancia estadística se evaluó con ANOVA de mediciones repetidas. Las células T transducidas con CAR 28-IL2RB-z(YXXQ) demostraron una actividad lítica contra las células CD19+ comparable a las otras células T transducidas con CAR.
Ejemplo 4
Constructo vectorial
CAR NFMC63-28Z, también denominado CAR 28-z, es un receptor de antígenos quiméricos anti-CD19 creado mediante el reemplazo de la secuencia señal de CAR FMC63-28Z, que fue originalmente construido por Kochenderfer y otros, (J Immunother. 2009 Sep; 32(7):689-702), con la secuencia señal de Oncostatina M (NCBI RefSeq:NP_065391.1, aminoácidos números 1 a 25 de la SEQ ID No.: 1). El constructo de CAR NFMC63-28Z con optimización de codones fue sintetizado por Geneart® y se clonó en el vector retroviral pMX (Int J Hematol. 1998, 67:351-9). Una secuencia de aminoácidos de CAR NFMC63-28Z se muestra en la SEQ ID NO: 1. CAR NFMC63-28-d2RbZ es un receptor de antígenos quiméricos que tiene un fragmento truncado del dominio citoplasmático de la cadena p del receptor de IL-2 humana que incluye el motivo box-1 y el residuo de tirosina flanqueante 510 (por ejemplo, los aminoácidos números 266 a 337 y 530 a 551 de NCBI RefSeq: NP_000869.1, SEQ ID No.: 5), entre el dominio de CD28 y el dominio de CD3Z de Ca R NFMC63-28Z. Una secuencia de aminoácidos de CAR NfMc63-28-d2RbZ se muestra en la SEQ ID NO: 2. CAR NFMC63-28-21RaZ es un receptor de antígenos quiméricos que tiene un dominio citoplasmático de longitud completa de la cadena a del receptor de IL-21 humano (aminoácidos números 256 a 538 de NCBI RefSeq:NP_068570.1, SEQ ID No.: 6) entre el dominio de CD28 y el dominio de CD3Z de CAR NFMC63-28Z. Una secuencia de aminoácidos de CAR NFMC63-28-21RaZ se muestra en la SEQ ID NO: 3. CAR NFMC63-28Z-21Ra es un receptor de antígenos quiméricos que tiene un dominio citoplasmático de longitud completa de la cadena a del receptor de IL-21 humano con el extremo N-terminal de CAR NFMC63-28Z. Una secuencia de aminoácidos de CAR NFMC63-28Z-21Ra se muestra en la SEQ ID NO: 4. Las estructuras de los CAR se muestran en la Figura 21. Los ácidos nucleicos que codifican CAR NFMC63-28-d2RbZ, CAR NFMC63-28-21RaZ y CAR NFMC63-28Z-21Ra se construyeron mediante la inserción de los ADN que codificaban los respectivos dominios citoplasmáticos en el constructo CAR NFMC63-28Z en el vector retroviral pMX.
Los vectores retrovirales ecotrópicos se obtuvieron por transfección transitoria de plásmidos retrovirales de constructo de CAR con TransIT293 (Mirus Bio) a la línea celular phoenix-eco; posteriormente, se transdujeron líneas celulares PG13 con los vectores retrovirales ecotrópicos obtenidos de la línea celular phoenix-eco transducida. Se obtuvieron vectores retrovirales pseudotipados con GaLV a partir de la masa de líneas celulares PG13 transducidas y se usaron para la transducción de genes en células Jurkat.
Células
La línea celular PG13 y la línea celular phoenix-eco se cultivaron en medio DMEM suplementado con suero de ternera fetal al 10 % (FCS) y 50 pg/ml de gentamicina (Gibco).
Las células K562 o las células K562 transducidas con constructos de expresión de CD80 y CD83 humanos se transdujeron adicionalmente con un constructo de expresión de CD19 humano y se usaron como células presentadoras de antígenos artificiales (células aAPC, Clin Cancer Res., 2007, 13:1857-67, Immunol Rev., 2014, 257:191-209). Las células derivadas de K562 y K562 y las células derivadas de Jurkat y Jurkat se cultivaron en medio RPMI 1640 suplementado con FCS al 10 % y 50 pg/ml de gentamicina.
Transferencia de constructos de CAR y clasificación celular
Las células se transdujeron con el uso del método de infección por virus unido a RetroNectin (J Biochem. 2001 Sep; 130(3):331-4), en el que se precargaron soluciones retrovirales en placas recubiertas con RetroNectin (marca registrada, Takara Bio), se centrifugaron a 2000 g durante 2 horas a 32 °C y después se enjuagaron con solución salina tamponada con fosfato que incluye albúmina sérica bovina. Se aplicaron células Jurkat a la placa precargada con virus. Esta transferencia de genes se realizó dos veces.
Después de la transferencia de genes de los constructos de CAR, las células se clasificaron con Biotina-Proteína L (GenScript) y Microesferas anti-biotina (Miltenyi Biotec). Después se confirmaron la clasificación de más del 95 % de positividad y el mismo nivel de intensidad fluorescente media de los constructos de CAR transferidas.
Fosforilación de STAT
Las células Jurkat transducidas con CAR y las aAPC se contaron y se mezclaron en hielo. Después de centrifugar a 4 °C, las células se incubaron en un baño de agua a 37 °C. Después de la incubación, las células se fijaron en paraformaldehído al 1,5 % y se permeabilizaron con metanol al 100 %. Posteriormente, las células se tiñeron con los siguientes anticuerpos; Phospho-p44/42 MAP quinasa (Cell signaling technology, clon E10), Phospho-STAT3 (pY705) (BD Phosflow, clon 4/P-STAT3) y Phospho-STAT5 (pY694) (BD Phosflow, clon 47/P-STAT5). La adquisición de citometría de flujo se realizó con un BD FacsCanto II (BD Biosciences) y el análisis se realizó con FlowJo (Treestar).
Los resultados se muestran en la Figura 22. Como se muestra en las figuras superiores de la Figura 2, NFMC63-28Z solo muestra la fosforilación de MAP quinasa, que es un marcador de la señalización de CD3Z, mientras que NFMC63-28-d2R5 muestra la fosforilación de STAT5 en una fracción positiva de fosfo-MAP quinasa. Además, como se muestra en las figuras inferiores de la Figura 2, tanto NFMC63-28-21RaZ como NFMC63-28Z-21Ra muestran fosforilación de STAT3 en una fracción positiva de fosfo-MAP quinasa. Estos resultados indican que estos CAR pueden activar la señalización de STAT5 o STAT3, que son las principales dianas de la señalización de IL-2 e IL-21, respectivamente, además de la señalización de MAP quinasa tras la estimulación con el antígeno.
Ejemplo 5
Efectos antileucémicos in vivo en ratones
Se trataron ratones NSG inmunodeficientes que albergaban células leucémicas CD19+ NALME B humanas con el CAR anti-CD1928-IL2RB-z(YXXQ) o con células T CAR de la generación anterior.
Las células T CD3+ se transdujeron por vía retroviral con CAR anti-CD1928-z, 28-BB-z o 28-IL2RB-z(YXXQ), y se estimularon con células K562 transducidas con CD19, como se muestra en la Figura 18. Se inyectaron por vía intravenosa ratones NSG inmunodeficientes con la línea celular de leucemia linfoblástica aguda positiva para CD19 NALM-6, que expresa EGFP-luciferasa (NALM6-GL), y después se les inyectaron células T transducidas con CAR 14 días después de la inyección del tumor.
Las imágenes bioluminiscentes in vivo de la actividad luciferasa se muestran en la Figura 19 en los días 0, 7, 28 para los grupos sin tratamiento y CAR anti-CD1928-z, así como también los días 0, 7, 28, 42 y 63 para los grupos de CAR anti-CD1928-BB-z y 28-IL2RB-z(YXXQ) después de la infusión de las células T transducidas con CAR anti-CD19. Los ratones tratados con los CAR anti-CD19 28-IL2RB-z(YXXQ) muestran una mayor disminución de la actividad tumoral en comparación con los otros grupos.
La curva de Kaplan-Meier para la supervivencia general de los ratones tratados con células T transducidas con CAR anti-CD19 (n=5 cada una) indica que los ratones tratados con CAR anti-CD1928-IL2RB-z(YXXQ) tuvieron una mejor tasa de supervivencia general en comparación con el grupo no tratado, así como también con los CAR anti-CD19 28-z y 28-BB-z de la generación anterior.
Aunque la presente solicitud se ha descrito con referencia a los que actualmente se consideran los ejemplos preferidos, debe entenderse que la solicitud no se limita a los ejemplos descritos. Por el contrario, la solicitud está destinada a cubrir diversas modificaciones y disposiciones equivalentes.
Las secuencias asociadas con cada número de acceso proporcionado en la presente descripción incluyen, por ejemplo, números de acceso y/o secuencias de biomarcadores (por ejemplo, proteína y/o ácido nucleico) proporcionados en las Tablas o en otra parte.
Tabla de secuencias:
SEQ ID NO: 1: NFMC63-28Z
MGVLLTQRTLLSLVLALLFPSMASMDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQ
QKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFG
GGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGV
SWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCA
KHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFP
GPSKPFVWLVWGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQP
YAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGG
KPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHM
QALPPR
-25: PÉPTIDO SEÑAL
6-270: SCFV DE FMC63
74-312: DOMINIO EXTRACELULAR PARCIAL DE CD28
13-339: DOMINIO TRANSMEMBRANA DE CD28
40-380: DOMINIO CITOPLASMÁTICO DE CD28
81-492: DOMINIO INTRACELULAR DE CD3Z
SEQ ID NO: 2: NFMC63-28-d2RbZ
MGVLLTQRTLLSLVLALLFPSMASMDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQ
QKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFG
GGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGV
SWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCA
KHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFP
GPSKPFVWLVWGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQP
YAPPRDFAAYRSIDGGGGSGGGGSGGGGSNCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSE
HGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLPLNTDAYLSLQELQGQDPT
HLVKLGGSGPRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKP
RRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQA
LPPR
-25: PÉPTIDO SEÑAL
6-270: SCFV DE FMC63
74-312: DOMINIO EXTRACELULAR PARCIAL DE CD28
13-339: DOMINIO TRANSMEMBRANA DE CD28
40-380: DOMINIO CITOPLASMÁTICO DE CD28
98-491: DOMINIO BETA DEL RECEPTOR DE IL-2 CITOPLASMÁTICO PARCIAL
99-610: DOMINIO INTRACELULAR DE CD3Z
SEQ ID NO: 3: NFMC63-28-21RaZ
MGVLLTQRTLLSLVLALLFPSMASMDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQ
QKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFG
GGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGV
SWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCA
KHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFP
GPSKPFWVLVWGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQP
YAPPRDFAAYRSKTHPLWRLWKKIWAVPSPERFFMPLYKGCSGDFKKWVGAPFTGSSLEL
GPWSPEVPSTLEVYSCHPPRSPAKRLQLTELQEPAELVESDGVPKPSFWPTAQNSGGSAY
SEERDRPYGLVSIDTVTVLDAEGPCTWPCSCEDDGYPALDLDAGLEPSPGLEDPLLDAGTT
VLSCGCVSAGSPGLGGPLGSLLDRLKPPLADGEDWAGGLPWGGRSPGGVSESEAGSPLA
GLDMDTFDSGFVGSDCSSPVECDFTSPGDEGPPRSYLRQWWIPPPLSSPGPQASKLGGS
GPRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQE
GLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
-25: PÉPTIDO SEÑAL
6-270: SCFV DE FMC63
74-312: DOMINIO EXTRACELULAR PARCIAL DE CD28
13-339: DOMINIO TRANSMEMBRANA DE CD28
40-380: DOMINIO CITOPLASMÁTICO DE CD28
81-663: DOMINIO ALFA DEL RECEPTOR DE IL-21 CITOPLASMÁTICO DE LONGITUD COMPLETA 71-782: DOMINIO INTRACELULAR DE CD3Z
SEQ ID NO: 4: NFMC63-28Z-21Ra
MGVLLTQRTLLSLVLALLFPSMASMDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQ
QKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFG
GGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGV
SWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCA
KHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFP
GPSKPFWVLVWGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQP
YAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGG
KPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHM
QALPPRGGGGSGGGGSGGGGSKTHPLWRLWKKIWAVPSPERFFMPLYKGCSGDFKKWV
GAPFTGSSLELGPWSPEVPSTLEVYSCHPPRSPAKRLQLTELQEPAELVESDGVPKPSFW
PTAQNSGGSAYSEERDRPYGLVSIDTVTVLDAEGPCTWPCSCEDDGYPALDLDAGLEPSP
GLEDPLLDAGTTVLSCGCVSAGSPGLGGPLGSLLDRLKPPLADGEDWAGGLPWGGRSPG
GVSESEAGSPLAGLDMDTFDSGFVGSDCSSPVECDFTSPGDEGPPRSYLRQWWIPPPLS
SPGPQAS
-25: PÉPTIDO SEÑAL
6-270: SCFV DE FMC63
74-312: DOMINIO EXTRACELULAR PARCIAL DE CD28
13-339: DOMINIO TRANSMEMBRANA DE CD28
40-380: DOMINIO CITOPLASMÁTICO DE CD28
81-492: DOMINIO INTRACELULAR DE CD3Z
08-790: DOMINIO ALFA DEL RECEPTOR DE IL-21 CITOPLASMÁTICO DE LONGITUD COMPLETA SEQ ID NO: 5: Fragmento truncado del dominio citoplasmático de la cadena p de IL-2R
NCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPL
EVLERDKVTQLLPLNTDAYLSLQELQGQDPTHLV
SEQ ID NO: 6' donrinio c'toplasnáticci de la cadena a de IL-21 humano
KTH PLWR LWKKIWAVPSPERFF MPLYKGCSG DFKK WVG APF TGSSLE LGPWSPEVPSTLE
VY SCH PPRSPAK RLQ LTE LQ EPAELVE5 DG VPKPSF WFT AQ NSGG SAY5 EERDRPYG L VS
IDTVT VLDAEG PCT WPCSC E D DG YPALDL D AG LEPSPG LEDPL LDAG TTVLSCGCVSAG SP
G LO GPLG SLLDR LKP PLADG EDWAGG LPWG G RSPGGVSES EAG SPLAGLDMDTFDSGFV
G SDCSSPVECDFTSPGDE G PPR S YLRQ WWIPPPLSSPGPQ AS
1-19: MOTIVO BOX 1
64: RESIDUO DE TIROSINA QUE PUEDE FOSFORILARSE
65-267 - residuos flanqueantes de tirosina
SEO ID NO' 7: dorrinio intracelular de
Figure imgf000028_0001
R VKFSR sao APAYO QGQNQ LYNELNLGRREEYDVLDKRRQRDFEMGGKFRRKNFQEGL Y NELQ KDKM AE A YS EtGM KGER RRG KG H DGL YQGLSTATKDTY D ALH MQALPPR
SEQ ID NO: 8: dominio intracelular de CD28 RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS SEQ ID NO: 9: dominio transmembrana de CD28
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV SEQ ID NO: 10: dominio extracelular parcial de CD28 IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP SEQ ID NO: 11
NP_000869.1, 266-551:
NCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPL
EVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFTNQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPY
SEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCTFPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGG
SGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVPDLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPR
EGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQELQGQDPTHLV SEQ ID NO: 12 - YLSLQ
SEQ ID NO: 13 - YXXQ
SEQ ID NO: 14 - YLPSNID
SEQ ID NO: 15 - YCTFP
SEQ ID NO: 16 - YFFFH
SEQ ID NO: 17 - YVTMS
SEQ ID NO: 18 - YLPQE
SEQ ID NO: 19 - KLGGSGP
SEQ ID NO: 20 - YKAFS
SEQ ID NO: 21 - YKPFQ
SEQ ID NO: 22 - YRHQ
SEQ ID NO: 23 -YXPQ
SEQ ID NO: 24: 3S-IL2R0-i(YXXQ}WnTH CON MOTIVO DE ASOCIACIÓN A STAT3 EN LAS POSICIONES 104-107 104-107 D EL DO MI NIO INTRAC E LU LAR D E COSÍ
MG VLLTQRT LLSLVLALLFPSMASM DlQ M TQ TTSS LSASLGDR VTISC RASQ DI SKY LN WYQ
Q K PDGTVK LLIY HTSRLHSGVPSRFSG SG SGTDYSLTISÑLEQ EDIATYFCQQG NTLPYTF G
G GTKLEITGSTSGSG K PG SG EGSTKG EVK LQ ESG PG LVAPSQSLSVTQTVSG V5LPDYG V
SWI RC¡ PP RKGLEWLG VIWGSETTYYN SALKSR LTl IKDN SKSQ VFL,KMÑSLQT DDTAIYYCA
KH Y Y YGGS YAM D Y WGQ GTS VTVSSAAAl EVMY P P PYLDN E KS NGTIIHVKGK HLCPSPLF P
GPSKPFVWLWVGGVÜACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQP
Y APPR DFAAYRS NC RNTGP WlKKVLKC NTP DPSKFFSQ LSSE HGG DV QK WLSS P F PSSSF
SPG G LAPE ISPLEVLER DKVTQ LLP LNTDAYLSLQ E LOGO DPTHLVRVKFSR S ADAPAYQ O
GQNQLYNELNLGRR EEYDVLDKRRG R□ PEM GGKP H RKN PQ EG LY NELQKDKM AEAYSEI
G MKG ERR RG K GHDG LYQG LSTATKDTY DAYXXQAL PPR
1-25: PÉPTIDO SEÑAL
26-270: SCFV DE FMC63
274-312: DOMINIO EXTRACELULAR PARCIAL DE CD28
313-339: DOMINIO TRANSMEMBRANA DE CD28
340-380: DOMINIO CITOPLASMÁTICO DE CD28
381-474: DOMINIO BETA DEL RECEPTOR DE IL-2 CITOPLASMÁTICO PARCIAL
475-586: DOMINIO INTRACELULAR DE CD3Z QUE COMPRENDE EL MOTIVO DE ASOCIACIÓN A STAT3 EXÓGENO YXXQ SEQ ID NO: 25: £6-IL2RE-l(YRHQ) CON MOTIVO DE ASOCIACIÓN ASTAT3YRHQ (SEQ ID
ÑO: 22) EN LAS POSICIONES 104-107 DEL DOMINIO INTRACELULAR DE CDSi;
MG VLLTQRT LLSLVLALLFPSMASM DlQ MTQ TTSS LSASLGDRVTISC RASQ DI SKY LN WY Q
Q K PDGTVK LL IY HTSRL HSGVPSRFSG SG SGTDYSLT ISÑLEQ EDIATYFCQ QGNTLPYTFG
G GTKLEITGSTSGSG K PG SG EG STKG E VK LQ ESG PG LV APSQSLSVTCTVSG VSLPD YG V
SWI RQ PP RKGLE WLG VIWGSETTYYN SALKSR LTI IKON SKSQVFLKMN SLQTDDT AIYYCA
KHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAAIEVMYPPPYLDNEKSÑGTIIHVKGKHLCPSPLFP
G PSK PFWVL WVGGVLACYSLL VTVAF11FWVRSKRSR LLHS DYM NMTp RR PGPTRKHYQ P
Y APPR DFAAYRSHCRNTGFWLKKVLKCNTFOFSKFFSQLSSEHGGOVQKWLSSFFFSSSF
SPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLPLNTDAYLSLQELQGQDPTh L VRVKFSR SADAPAYQQ
G Q NQ L YNELN LG RR E E YD VLDKRRGF DPEM GGKP RRKN PQ EG L Y NELQKDKM AEA YSEI
GMKGERRRGKGHDGLYQGL STATK DTYDAY RHQALPPR
1-25: PÉPTIDO SEÑAL
26-270: SCFV DE FMC63
274-312: DOMINIO EXTRACELULAR PARCIAL DE CD28
313-339: DOMINIO TRANSMEMBRANA DE CD28
340-380: DOMINIO CITOPLASMÁTICO DE CD28
381-474: DOMINIO BETA DEL RECEPTOR DE IL-2 CITOPLASMÁTICO PARCIAL
475-586: DOMINIO INTRACELULAR DE CD3Z QUE COMPRENDE EL MOTIVO DE ASOCIACIÓN A STAT3 EXÓGENO YRHQ SEQ ID NO: 26 - ACGCCTATCGCCATCAGGCCCTGC
SEQ ID NO: 27 - CTGATGGCGATAGGCGTCGTAGGTGT
SEQ ID NO: 28 - YFFF
SEQ ID NO: 29 - YCTF
SEQ ID NO: 30 - YLRQ
SEQ ID NO: 31 - YFKQ
SEQ ID NO: 32 - YLPQ
SEQ ID NO: 33 - YMPQ
SEQ ID NO: 34 - YVLQ
SEQ ID NO: 35 - YQPQ
SEQ ID NO: 36 - YKPQ
SEQ ID NO: 37 - YRPQ
SEQ ID NO: 38 - YTHQ
SEQ ID NO: 39 - YLKQ
SEQ ID NO: 40 - YHNQ
SEQ ID NO: 41 - YXXL
SEQ ID NO: 42 - IDGGGGSGGGGSGGGGS
SEQ ID NO: 43 - YLSL
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Claims (10)

REIVINDICACIONES
1. Un receptor de antígenos quiméricos (CAR) que comprende:
i) un dominio extracelular que puede unirse a un antígeno predeterminado;
ii) un dominio transmembrana; y
iii) un segmento intracelular que comprende a) un dominio citoplasmático truncado de la cadena beta del receptor de interleucina-2 que corresponde a la SEQ ID NO: 5 y b) un dominio intracelular de CD3Z caracterizado por tener un motivo de asociación a STAT3 exógeno que corresponde a YRHQ (SEQ ID NO: 22) en las posiciones 104-107 de la SEQ ID NO: 7.
2. El CAR de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el segmento intracelular comprende además un dominio coestimulador citoplasmático, preferentemente un dominio citoplasmático de CD28, CD2, CD4, CD5, CD8a, CD8p, CD134 o CD137.
3. El CAR de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en donde el dominio extracelular es una región de unión al antígeno de un anticuerpo, preferentemente en donde la región de unión al antígeno es un fragmento variable de cadena única.
4. El CAR de acuerdo cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en donde el dominio transmembrana se selecciona del grupo que consiste en el dominio transmembrana de CD28 y el dominio transmembrana de CD8.
5. Un ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica un CAR de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, preferentemente en donde el ácido nucleico codifica el CAR y además codifica un péptido señal en el extremo N terminal.
6. Un vector que comprende el ácido nucleico de la reivindicación 5.
7. Una célula que expresa el CAR de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, y/o se transfecta o transduce con el ácido nucleico de la reivindicación 5 o el vector de la reivindicación 6.
8. Una composición que comprende el CAR, ácido nucleico, vector o célula de cualquiera de las reivindicaciones 1a 7, y preferentemente un excipiente farmacéuticamente aceptable.
9. Un método para preparar la célula de la reivindicación 7, que comprende
A. transducir una célula con el ácido nucleico de la reivindicación 5 o el vector de la reivindicación 6, B.
a) aislar células inmunitarias de un mamífero, preferentemente en donde las células inmunitarias son células T; y
b) transfectar o transducir las células inmunitarias aisladas, preferentemente células T, con un ácido nucleico que codifica un CAR de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4; o
C.
a) aislar células inmunitarias de un mamífero, preferentemente en donde las células inmunitarias son células T;
b) transfectar o transducir las células inmunitarias aisladas, preferentemente células T, con un ácido nucleico que codifica un CAR de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4; y
c) aislar y/o expandir las células que expresan CAR, preferentemente células T que expresan CAR después de la transfección o transducción.
10. El CAR, ácido nucleico, vector, célula o composición de cualquiera de las reivindicaciones 1-8, para uso en el tratamiento o prevención de una enfermedad, para disminuir en un sujeto el número de células que expresan un antígeno predeterminado y/o para proporcionar una inmunidad antitumoral en un mamífero.
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