ES2636980T3

ES2636980T3 - Un dominio de unión de ATP sintasa bacteriana

Info

Publication number: ES2636980T3
Application number: ES05794520.6T
Authority: ES
Inventors: K.J.L.M. Andries; Hinrich W.H. GÖHLMANN; J.-M.E.F.M. Neefs; Peter K.M. Verhasselt; Johann Winkler; Marc René DE JONGE; Lucien Maria Henricus Koymans
Original assignee: Janssen Pharmaceutica NV
Current assignee: Janssen Pharmaceutica NV
Priority date: 2004-09-28
Filing date: 2005-09-28
Publication date: 2017-10-10
Anticipated expiration: 2025-09-28
Also published as: JP2012210210A; NO20072237L; JP2008515395A; DK1797115T3; IL182185A; RU2007116144A; AU2005288848A1; US20120219964A1; EP1797115A1; US20090298874A1; ME02935B; PL1797115T3; NZ553693A; CN101065397A; KR20070073823A; US8378085B2; CN101065397B; RU2418001C2; PT1797115T; LT1797115T

Abstract

Una proteína atpE mutante aislada que comprende una secuencia polipeptídica seleccionada de SEQ ID Nº 01 que comprende al menos una mutación puntual situada en uno cualquiera de los sitios de unión de ATPasa situados entre los aminoácidos 14 a 34 o entre los aminoácidos 54 a 69, y la SEQ ID Nº 03 que comprende al menos una mutación puntual situada en uno cualquiera de los aminoácidos 20 a 40, o de los aminoácidos 60 a 75, en donde dicha proteína induce resistencia al compuesto antimicrobiano DARQ J de la Figura 1.

Description

imagen1

imagen2

imagen3

imagen4

imagen5

imagen6

imagen7

5

15

25

35

45

55

tienen para la subunidad A los códigos Ser 206 -Leu 207 -Leu 209 y Arg 210 en las Tablas 3, 4 y 5), en donde dichos aminoácidos tienen las coordenadas atómicas de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5 o coordenadas estructurales homólogas que comprenden una desviación media cuadrática de átomos distintos de hidrógeno de menos de aproximadamente 1,5 Å, preferiblemente no más de 0,75 Å, cuando están superpuestos a las posiciones de los átomos de que no son hidrógeno de las correspondientes coordenadas atómicas de las Tablas 3, 4 o 5. En una realización particular, el sitio de unión comprende los aminoácidos Ala21, Gly25 de una primera subunidad C; los aminoácidos Ala24, Gly27, Phe53, Phe54, Val57, Gly58, Glu61, Tyr64, Phe65 de una segunda subunidad C; los aminoácidos Met17, Gly19, Gly20, Ala21, Ile22, Gly23, Ala24, Gly25, Ile26, Gly27, Asp28, Gly29, Ala31, Phe53, Thr56, Val57, Gly58, Leu59, Val60, Glu61, Ala62, Ala63/Pro63, Tyr64, Phe65 de una tercera subunidad C y los aminoácidos Leu183, Leu185 y Arg186 de una subunidad A; en donde dichos aminoácidos tienen las coordenadas atómicas de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5 o las coordenadas estructurales homólogas que comprenden una desviación media cuadrática de átomos distintos de hidrógeno de menos de aproximadamente 1,5 Å, preferiblemente no más de 0,75 Å, cuando están superpuestos a las posiciones de los átomos de que no son hidrógeno de las correspondientes coordenadas atómicas de las Tablas 3, 4 o 5. En una realización aún más particular, el sitio de unión consiste en los aminoácidos Ala21, Gly25 de una primera subunidad C; los aminoácidos Ala24, Gly27, Phe53, Phe54, Val57, Gly58, Glu61, Tyr64, Phe65 de una segunda subunidad C; los aminoácidos Met17, Gly19, Gly20, Ala21, Ile22, Gly23, Ala24, Gly25, Ile26, Gly27, Asp28, Gly29, Ala31, Phe53, Thr56, Val57, Gly58, Leu59, Val60, Glu61, Ala62, Ala63/Pro63, Tyr64, Phe65 de una tercera subunidad C y los aminoácidos Leu183, Leu185 y Arg186 de una subunidad A; en donde dichos aminoácidos tienen las coordenadas atómicas de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5. En la realización más particular, el sitio de unión consiste en los aminoácidos Ala21, Gly25 de una primera subunidad C; los aminoácidos Ala24, Gly27, Phe53, Phe54, Val57, Gly58, Glu61, Tyr64, Phe65 de una segunda subunidad C; los aminoácidos Met17, Gly19, Gly20, Ala21, Ile22, Gly23, Ala24, Gly25, Ile26, Gly27, Asp28, Gly29, Ala31, Phe53, Thr56, Val57, Gly58, Leu59, Val60, Glu61, Ala62, Ala63/Pro63, Tyr64, Phe65 de una tercera subunidad C y los aminoácidos Leu183, Leu185 y Arg186 de una subunidad A; en donde dichos aminoácidos tienen las coordenadas atómicas de la Tabla 3.

Según esto, un objetivo de la presente invención es evaluar el potencial de un compuesto de ensayo para interactuar con una proteína atpE usando las coordenadas atómicas que se esbozan anteriormente, en programas de cribado informatizados. En una realización, la presente invención proporciona un método para evaluar el potencial de un compuesto de ensayo para interactuar con una proteína atpE, comprendiendo dicho método; -técnicas de modelado molecular para generar la estructura tridimensional de un sitio de unión de una parte F0 de una ATPasa; -emplear medios informáticos para realizar una operación de ajuste entre el compuesto de ensayo y la estructura tridimensional del sitio de unión; y – analizar los resultados de dicha operación de ajuste para cuantificar la asociación del compuesto de ensayo con la estructura tridimensional del sitio de unión. En una realización adicional de la presente invención, la estructura tridimensional del sitio de unión se genera usando las coordenadas atómicas de las Tablas 3, 4 o 5 o las coordenadas estructurales homólogas que comprenden una desviación media cuadrática de átomos distintos de hidrógeno de menos de aproximadamente 1,5 Å, preferiblemente no más de 0,75 Å, cuando están superpuestos a las posiciones de los átomos de que no son hidrógeno de las correspondientes coordenadas atómicas de las Tablas 3, 4 o 5. En una realización particular, la estructura tridimensional se genera usando las coordenadas atómicas de los aminoácidos Ala21, Gly25 de la cadena A de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5; los aminoácidos Ala24, Gly27, Phe53, Phe54, Val57, Gly58, Glu61, Tyr64, Phe65 de la cadena K de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5; los aminoácidos Met17, Gly19 Gly20, Ala21, Ile22, Gly23, Ala24, Gly25, Ile26, Gly27, Asp28, Gly29, Ala31, Phe53, Thr56, Val57, Gly58, Leu59, Val60, Glu61, Ala62, Ala63/pro63, Tyr64, Phe65 de la cadena L de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5; y los aminoácidos Ser206, Leu207, Leu207 y Arg210 de la cadena M de cualquiera de las Tablas 3, 4 o 5.

En este cribado, la calidad de ajuste de estos compuestos al sitio de unión se puede juzgar bien mediante complementariedad de conformación o bien mediante la energía de interacción estimada (Meng, E.C. y cols., J. Coma.Chem 13:505-524 (1992)).

Uso del sitio de unión

El diseño de compuestos que se unen a, promueven o inhiben la actividad funcional de atpE según esta invención implica generalmente la consideración de dos factores. En primer lugar, el compuesto debe ser capaz de asociarse físicamente y estructuralmente con atpE. Interacciones moleculares no covalentes importantes en la asociación de atpE con el compuesto incluyen enlace de hidrógeno, interacciones de van der Waals e hidrófobas. En segundo lugar, el compuesto debe ser capaz de asumir una conformación que le permita asociarse con atpE. Aunque ciertas porciones del compuesto pueden no participar directamente en la asociación con atpE, esas porciones pueden influir sin embargo en la conformación global de la molécula. Esto, a su vez, puede tener un impacto significativo sobre las afinidades de unión, la eficacia terapéutica, las cualidades farmacológicas y la potencia. Estos requisitos de conformación incluyen la estructura tridimensional global y la orientación de la entidad química o compuesto en relación con la totalidad o una porción del sitio activo u otra región de atpE o la separación entre grupos funcionales de un compuesto que comprende varias entidades químicas que interactúan directamente con atpE.

El efecto agonista, antagonista o de unión inhibidor potencial predicho de un ligando u otro compuesto sobre atpE se puede analizar antes de su síntesis real y probar el uso de técnicas de modelado informatizadas. Si la estructura teórica del compuesto dado sugiere una interacción y asociación insuficientes entre él y atpE, la síntesis y la prueba

9 5

15

25

35

45

55

65

del compuesto se pueden obviar. Sin embargo, si el modelado informatizado indica una fuerte interacción, entonces la molécula se puede sintetizar y probar con respecto a su capacidad para interactuar con atpE. De este modo, se puede evitar la síntesis de compuestos no operativos. En algunos casos, se sintetizan compuestos inactivos predichos durante el modelado y a continuación se prueban para desarrollar una SAR (relación estructura-actividad) para compuestos que interactúan con una región específica de atpE.

Un experto en la técnica puede usar uno de los varios métodos para cribar entidades químicas fragmentos, compuestos o agentes con respecto a su capacidad para asociarse con atpE y más particularmente con los bolsillos de unión individuales o los sitios activos de atpE. Este procedimiento puede comenzar mediante la inspección visual, por ejemplo, del sitio activo en el cribado informático basado en las coordenadas atómicas de atpE o atpE complejada con un ligando. Las entidades químicas, los compuestos o los agentes seleccionados se pueden situar a continuación en una variedad de orientaciones, o acoplarse dentro de un bolsillo de unión individual de atpE. El acoplamiento se puede efectuar usando un software tal como Quanta y Sybyl, seguido por minimización energética y dinámica molecular con campos de fuerza de la mecánica molecular estándar, tales como CHARMM y AMBER.

Programas informáticos especializados también pueden ayudar en el procedimiento de selección de entidades químicas. Estos incluyen, pero no se limitan a: GRID (Goodford, P. J., "A Computational Procedure for Determining Energetically Favorable Binding Sites on Biologically Important Macromolecules," J. Med. Chem. 28:849-857 (1985), disponible de Oxford University, Oxford, RU); MCSS (Miranker, A. y M. Karplus, "Functionality Maps of Binding Sites: A Multiple Copy Simultaneous Search Method." Proteins: Structure, Function and Genetics 11: 29-34 (1991), disponible de Molecular Simulations, Burlington, Mass.); AUTODOCK (Goodsell, D. S. y A. J. Olsen, "Automated Docking of Substrates to Proteins by Simulated Annealing" Proteins: Structure. Function, and Genetics 8:195-202 (1990), disponible de Scripps Research Institute, La Jolla, Calif.); y DOCK (Kuntz, I. D. y cols., "A Geometric Approach to Macromolecule-Ligand Interactions," J.-Mol. Biol. 161:269-288 (1982), disponible de University of California, San Francisco, Calif.).

El uso de una software tal como GRID, un programa que determina probables sitios de interacción entre sondas con diversas características de los grupos funcionales y la superficie macromolecular, se usa para analizar los sitios superficiales para determinar estructuras de proteínas o compuestos inhibidores similares. Los cálculos de GRID, con grupos inhibidores adecuados en moléculas (p. ej., aminas primarias protonadas) como la sonda se usan para identificar puntos calientes potenciales alrededor de posiciones accesibles a niveles de contorno energético adecuados. El programa DOCK se puede usar para analizar un sitio activo o sitio de unión al ligando y sugiere ligandos con propiedades estéricas complementarias.

Una vez que se han seleccionado las entidades químicas, los compuestos o los agentes adecuados, se pueden ensamblar en un solo ligando o compuesto o inhibidor o activador. En ensamblaje puede proceder mediante inspección visual de la relación de los fragmentos entre sí sobre la imagen tridimensional. Esto puede estar seguido por construcción de modelos manuales usando un software tal como Quanta o Sybyl.

Programas útiles para ayudar a conectar las entidades químicas, los compuestos o los agentes individuales incluyen, pero no se limitan a: CAVEAT (Bartlett, P. A. y cols., "CAVEAT: A Program to Facilitate the Structure-Derived Design of Biologically Active Molecules." En Molecular Recognition in Chemical and Biological Problems, Special Pub., Royal Chem. Soc., 78, pp. 82-196 (1989)); sistemas de bases de datos 3D tales como MACCS-3D (MDL Information Systems, San Leandro, Calif. y Martin, Y.C., "3D Database Searching in Drug Design", J. Med. Chem. 35: 2145-2154 (1992); y HOOK (disponible de Molecular Simulations, Burlington, Mass.).

Están disponibles varias metodologías para buscar bases de datos tridimensionales para probar hipótesis de farmacóforos y seleccionar compuestos para el cribado. Estas incluyen el programa CAVEAT (Bacon y cols., J. Mol. Biol. 225:849-858 (1992)). A modo de ejemplo, CAVEAT usa bases de datos de compuestos cíclicos que pueden actuar como "espaciadores" para conectar cualquier número de fragmentos químicos ya situados en el sitio activo. Esto permite a un experto en la técnica generar rápidamente cientos de posibles modos de conectar los fragmentos que ya se sabe o se sospecha que son necesarios para una unión fuerte.

En lugar de proceder a construir un activador, agonista o antagonista inhibidor de atpE en un modo por etapas una entidad química en un momento que se describe anteriormente, estos compuestos se pueden diseñar como un todo

o "de novo" usando bien un sitio activo vacío o que incluye opcionalmente alguna porción o porciones de moléculas conocidas. Estos métodos incluyen: LUDI (Bohm, H.-J., "The Computer Program LUDI: A New Method for the De Novo Design of Enzyme Inhibitors", J. ComR. Aid. Molec. Design, 6, pp. 61-78 (1992), disponible de Biosym Technologies, San Diego, Calif.); LEGEND (Nishibata, Y. y A. Itai, Tetrahedron 47:8985 (1991), disponible de Molecular Simulations, Burlington, Mass.); y LeapFrog (disponible de Tripos Associates, St. Louis, Mo.).

A modo de ejemplo, el programa LUDI puede determinar una lista de sitios de interacción en los que situar tanto un enlace de hidrógeno como fragmentos hidrófobos. LUDI usa a continuación una biblioteca de enlazadores para conectar hasta cuatro sitios de interacción diferentes en los fragmentos. A continuación, se usan grupos "de puenteo" menores tales como --CH2-y --COO--para conectar estos fragmentos. Por ejemplo, para la enzima

10 5

15

25

35

45

55

65

DHFR, las colocaciones de grupos funcionales clave en el bien conocidos inhibidor metotrexato fueron reproducidas por LUDI. Véase además Rotstein y Murcko, J. Med. Chem. 36: 1700-1710 (1992).

Según esta invención, también se pueden emplear otras técnicas de modelado molecular. Véase, p. ej., Cohen, N.

C. y cols., "Molecular Modeling Software and Methods for Medicinal Chemistry, J. Med. Chem. 33:883-894 (1990). Véase además Navia, M. A. y M. A. Murcko, "The Use of Structural Information in Drug Design," Current Opinions in Structural Biology, 2, pp. 202-210 (1992).

Una vez que un compuesto se ha diseñado o seleccionado mediante los métodos anteriores, la afinidad con la que ese compuesto se puede unir o asociar con atpE se puede probar y optimizar mediante evaluación informatizada y/o al probar la actividad biológica después de sintetizar el compuesto. Los inhibidores o los compuestos pueden interactuar con la atpE en más de una conformación que sea similar en la energía de unión global. En esos casos, la energía de deformación de la unión se toma como la diferencia entre la energía del compuesto libre y la energía media de las conformaciones observadas cuando el compuesto se une a atpE.

Un compuesto diseñado o seleccionado por unirse o asociarse con atpE se puede optimizar informáticamente de forma adicional de modo que en su estado unido preferiblemente carezca de interacción electrostática repulsiva con atpE. Estas interacciones no complementarias (p. ej., electrostáticas) incluyen interacciones repulsivas carga-carga, dipolo-dipolo y carga-dipolo. Específicamente, la suma de todas las interacciones electrostáticas entre el inhibidor y atpE cuando el inhibidor está unido preferiblemente realiza una contribución neutra o favorable a la entalpía de unión. También se diseñarán mediante estos métodos compuestos que se unen débilmente, a fin de determinar SAR. Véanse, por ejemplo, las Solicitudes de EE. UU. Nº 60/275.629, 60/331.235, 60/379.617 y 10/097.249.

Está disponible en la técnica un software informático específico para evaluar la energía de deformación y la interacción electrostática de los compuestos. Ejemplos de programas diseñados para estos usos incluyen: Gaussian 92, revisión C (M. J. Frisch, Gaussian, Inc., Pittsburgh, Pa., COPYRGT 1992); AMBER, versión 4.0 (P. A. Kollman, University of California at San Francisco, COPYRGT 1994); QUANTA/CHARMM (Molecular Simulations, Inc., Burlington, Mass. COPYRGT 1994); e Insight II/Discover (Biosysm Technologies Inc., San Diego, Calif. COPYRGT 1994). Otros sistemas de hardware y paquetes de software serán conocidos por los expertos en la técnica.

Una vez que un compuesto que se asocia con atpE se ha seleccionado o diseñado óptimamente, según se describe anteriormente, se pueden hacer entonces sustituciones en algunos de sus átomos o grupos laterales a fin de mejorar o modificar sus propiedades de unión. Generalmente, las sustituciones iniciales son conservativas, es decir, el grupo de sustitución tendrá aproximadamente iguales tamaño, conformación, hidrofobia y carga que el grupo original. Por supuesto, se debe entender que se pueden evitar componentes conocidos en la técnica por alterar la conformación. Estos compuestos químicos sustituidos se pueden analizar a continuación con respecto a la eficacia de ajuste a atpE mediante los mismos métodos informáticos descritos con detalle, anteriormente.

La presente invención proporciona además sistemas, particularmente sistemas informáticos, que contienen las coordenadas de secuencia y/o estructura descritas en la presente. Estos sistemas están diseñados para realizar la determinación estructural y el diseño racional de fármacos para atpE o para el sitio de unión en la parte F0 de la ATPasa. Los sistemas informáticos se refieren a los medios de hardware, los medios de software y los medios de almacenamiento de datos usados para analizar las coordenadas de secuencia y/o estructura de la presente invención en cualquiera de los métodos informáticos descritos con detalle, anteriormente. Los medios de hardware mínimos del sistema informático de la presente invención comprenden una unidad de procesamiento central (CPU), medios de entrada, medios de salida y medios de almacenamiento de datos. Un experto en la técnica puede apreciar fácilmente cuáles de los sistemas informáticos actualmente disponibles son adecuados para el uso en la presente invención.

Según esto, un objetivo de la presente invención es proporcionar un medio de almacenamiento de datos legible informáticamente que contenga las coordenadas estructurales descritas en la presente. Según se usa en la presente, "medio de almacenamiento de datos legible informáticamente" se refiere a cualquier medio que pueda ser leído a al que se pueda acceder directamente mediante un ordenador. Estos medios incluyen, pero no se limitan a: medios de almacenamiento magnéticos, tales como discos flexibles, medios de almacenamiento en disco duro y cinta magnética; medios de almacenamiento ópticos tales como discos ópticos o CD-ROM; medios de almacenamiento eléctricos tales como RAM y ROM; e híbridos de estas categorías tales como medios de almacenamiento magnéticos/ópticos.

Métodos de tratamiento

Como ya se mencionó anteriormente, también es un objetivo de la presente invención proporcionar el uso de compuestos identificados usando cualquiera de los susodichos métodos de cribado en un método para tratar a un sujeto con una infección microbiana. En general, los patógenos bacterianos se pueden clasificar como patógenos grampositivos o gramnegativos. Se considera generalmente que los compuestos antimicrobianos con actividad contra patógenos tanto grampositivos como gramnegativos tienen un amplio espectro de actividad. Los compuestos de la presente invención se consideran activos contra patógenos bacterianos grampositivos y/o gramnegativos. En

11

imagen8

imagen9

imagen10

5

15

25

35

45

55

estreptomicina, amikacina, etambutol y moxifloxacina. Un análisis adicional de mutantes de M. tuberculosis y M. smegmatis con una sensibilidad reducida a J mostraba que no había mutaciones en las regiones de ADN girasa gyrA y gyrB, secuencias en las que típicamente se desarrolla resistencia a quinolonas. Esto confirma que el objetivo molecular para J es diferente del de las fluoroquinolonas.

Un enfoque para determinar el objetivo molecular para J e inferir un mecanismo de acción es identificar y comparar mutaciones que confieren resistencia en cepas de M. tuberculosis y M. smegmatis sensibles y resistentes. Los genomas de la cepa de M. tuberculosis BK12 resistente y las dos cepas de M. smegmatis R09 y R10 resistentes, así como la M. smegmatis parental, se secuenciaron casi hasta la terminación. Se identificaron mutaciones que confieren resistencia mediante el análisis comparativo de las secuencias genómicas de cepas de M. tuberculosis y

M. smegmatis sensibles y resistentes (Fig. 2). Se mostró que el único gen afectado en los tres mutantes independientes frente al tipo silvestre parental correspondiente codifica atpE, una parte de la subunidad F0 de ATP sintasa. Esto sugiere que atpE es responsable de la resistencia a J en las cepas mutantes, indicando que J inhibe un nuevo objetivo de M. tuberculosis, la bomba de protones de ATP sintasa.

Se realizaron estudios complementarios para mostrar que el gen de atpE mutante es responsable de la resistencia a J y mediante inferencia directa que el producto del gen de atpE es el objetivo de J en las micobacterias. Dado el hecho de que se sabe que todos los genes del operón de ATP sintasa tienen que ser expresados de un modo coordinado, es decir todos los genes que codifican la parte F0 tienen que ser expresados desde la misma localización, se amplificó la parte F0 del operón a partir de la cepa de M. smegmatis resistente (D32V) y se seleccionaron clones que no adquirieran mutaciones adicionales a través del procedimiento de PCR. Se transformó

M. smegmatis silvestre con un plásmido que contenía el fragmento F0 mutante así seleccionado. Esto volvía las células resistentes a J con una MIC prácticamente idéntica a la de la cepa resistente M. smegmatis R09 (D32V),. Además, cuando el plásmido se reaislaba de estos transformantes y el gen de atpE se secuenciaba, se mostró que había permanecido el alelo mutante (D32V).

El efecto real de DARQ J sobre la producción de ATP en M. tuberculosis se demostró adicionalmente al medir el efecto de J sobre el ATP celular total presente en las micobacterias usando el ATP Bioluminescence Luciferase Assay Kit HS II de Roche. Este ensayo se basa en la conversión conducida por ATP de D-luciferina en oxiluciferina que se puede medir a 526 nm.

imagen11

Brevemente, se probó el efecto de DARQ J sobre el ATP total en M. tuberculosis tanto silvestre como en la cepa mutante. Se usó DCCD, que es un inhibidor muy conocido de ATP sintasa, como un control positivo y se usó isoniazida, que es un inhibidor para la biosíntesis de ciertos componentes de la pared celular, pero no tiene efecto sobre la producción de ATP, como un control negativo.

Como se puede observar en la Fig. 3, el tratamiento de la M. tuberculosis silvestre con DARQ J conduce a una disminución dependiente de la dosis en la producción de ATP en estas bacterias. En contraste, la isoniazida no tiene efecto sobre la producción de ATP. Como ya se describió anteriormente en la presente, exponer estas bacterias a una alta concentración de la DARQ J elevaba los mutantes de M. tuberculosis resistentes a diarilquinolinas. Cuando estas M. tuberculosis resistentes se trataban con DARQ J, estas bacterias no mostraban ninguna disminución en la producción de ATP incluso con 100 veces la concentración inhibidora mínima (MIC) de este compuesto. En contraste DCCD era capaz de bloquear la producción de ATP en estos bacilos, sugiriendo que DARQ J y DCCD tienen diferentes bolsillos de unión en ATP sintasas.

Modelado e identificación informáticos de la región de unión de DARQ J

Para investigar adicionalmente el diferente modo de acción de DCCD y DARQ J, se generó un modelo 3D generado informáticamente de la ATP sintasa para la M. tuberculosis tanto silvestre como mutante DARQ J. Las coordenadas atómicas proporcionadas en las Tablas 4 y 5 se computaron al preparar un modelo de la estructura 3D de las secuencias de aminoácidos publicadas P63691 y AJ865377. Se encontró que el sitio de unión real de DARQ J estaba situado en la zona de contacto de las subunidades A y C, más en particular alrededor del aminoácido 'Arg 210' de la subunidad A y 'Glu 61' de la subunidad C, como se indica en las tablas 3, 4 o 5. Esto se ajusta bien a los resultados observados para el cribado de mutaciones que confieren resistencia en cepas de M. tuberculosis y M. smegmatis sensibles y resistentes, descritas anteriormente.

El modelo se basa en la optimización de la colocación relativa de las hélices A y C de la estructura de ATPasa y la orientación del esqueleto y la cadena lateral de aminoácidos hacia una deformación interna calculada mínima. La

15 5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

55

60

geometría se obtuvo por medio de un número de ciclos de estimulación dinámica molecular y relajaciones mecánicas moleculares partiendo de la geometría helicoidal general previamente publicada de un organismo diferente [E-Coli PDB código de entrada 1C17 -V.K. Rastogi y M.E. Girvin, Nature, 402, 263-268 (1999)]. La dinámica molecular y la relajación realizaron ambas con una parametrización de campo forzado basada en MMFF94s [Halgren, T.A. (1996), J. Comput. Chem., 17, 490-519], pero se podría emplear cualquier estado del software de dinámica molecular de la técnica [Berendsen, H.J.C., van der Spoel, D. y van Drunen, R., Comp. Phys. Comm. 91 (1995), 43-56; Lindahl, E., Hess, B. y van der Spoel, D., J. Mol. Mod. 7 (2001) 306-317.] seguido por una optimización geométrica adecuada [J. W. Ponder y F. M. Richards, J. Comput. Chem., 8, 1016-1024 (1987).].

Las coordenadas calculada en las tablas 3, 4 y 5 comprenden la parte (con un volumen de radio de 30 angstroms) de la estructura predicha de la región considerada pertinente para la inhibición de la actividad de ATPasa de MTB en estas enzimas, basándose en el modo de inhibición propuesto y en la presencia de mutaciones puntuales inductoras de resistencia en ensayos biológicos.

Análisis

La DARQ J es un miembro de una nueva clase química de agentes anti-TB con una MIC igual a o menor que la de compuestos de referencia. Su espectro es único en su especificidad para micobacterias, incluyendo especies atípicas importantes en seres humanos; MAC, M. kansasii y las M. fortuitum y M. abscessus de desarrollo rápido. Este espectro antimicobacterianamente específico difiere del de la isoniazida, que no tiene actividad contra MAC. El uso clínico de J se dirigirá en gran parte al tratamiento de TB e infecciones micobacterianas. La incapacidad de J para inhibir no micobacterias se debe traducir en que se desarrollen menos presión menos y menor riesgo de resistencia en otras especies bacterianas, en comparación con anticuerpos con espectros más amplios (9).

El objetivo y el mecanismo de acción de J es diferente del de otros agentes anti-TB. Una comparación de las secuencias de ATP sintasas de diferentes bacterias y de ATP sintasa eucariótica, y en particular de la cadena C de la subunidad F0 del complejo de ATPasa, junto con el modelado 3D de las ATP sintasas de la M. tuberculosis silvestre y mutante, proporciona una razón fundamental para la especificidad del espectro antibacteriano y, en un grado menor, el perfil de seguridad.

El estudio dinámico realizado sobre los modelos de ATPasas de Mycobacterium construidos muestran que en estas estructuras existe una cavidad (el sitio de unión según las coordenadas atómicas de la Tabla 3) en la zona de contacto de las subunidades A y C (alrededor del aminoácido 'Arg 210' de la subunidad A y 'Glu 61' de la subunidad C). Las tablas 4 y 5 proporcionan las coordenadas de dos variantes estudiadas de los átomos alrededor de este sitio, y su posición media. El inhibidor DARQ J es capaz de interferir con la etapa de transferencia protónica normal que implica a estos dos aminoácidos al prohibir que estos dos aminoácidos interactúen. La estereoespecificidad de DARQ J se puede entender por la asimetría del sitio de unión predicho; el enantiómero quiral activo se ajusta a esta cavidad óptimamente, otras formas del compuesto y variantes de ATPasa coinciden peor.

El sitio de unión que los presentes inventores han derivado está sobre una parte totalmente diferente del sistema de ATPasa que DCCD (las DARQs están en la parte de la membrana de la enzima, la unión a DCCD se produce aproximadamente 90 angstroms más allá dentro de la célula; basándose en la estructura de PDB de una cristal de ATPasa bovina "1E79" – publicado en C.Gibbons, M.G.Montgomery, A.G.W. Leslie, J.E.Walker, Nat.Struct.Biol.,7,1055 (2000). Por lo tanto, los átomos que podrían estar implicados potencialmente con la inhibición tipo DCCD de ATPasa de MTB no están en la región listada en las tablas de coordenadas del sitio de unión (que solo abarca junto la porción de membrana de la enzima) y, recíprocamente, esta parte de la enzima implicada en el modo de inhibición de DARQ J no está presente en la estructura de "1E79" publicada (que sólo muestra la parte intracelular). Esta diferencia en el sitio de unión puede explicar la diferente respuesta de M. tuberculosis observada en el ensayo de producción de ATP in vitro.

A pesar de lo anterior, estudios más antiguos con DCCD sobre ATPasas mitocondriales sugieren otro sitio de unión situado alrededor de un aminoácido ácido en un ambiente lipófilo de la región F0 de la enzima, p. ej. por Sebald W, Machleidt W, Wachter E., Proc Natl Acad Sci U S A. 1980 Feb;77(2):785-789. Esta posición de unión en ATPasas mitocondriales se puede considerar análoga a la descrita para la especie Mycobacterium en la presente.

Al mismo tiempo, la elección como objetivo de un nuevo mecanismo asegura que las capas de TB actualmente en circulación con mutaciones de resistencia a tratamientos disponibles no sean resistentes cruzadamente a J. Es obvio a partir de los presentes estudios in vitro que J tiene un efecto antibacteriano al menos tan alto contra aislados de MDR-TB, incluso contra aquellos con una resistencia amplia a cuatro fármacos, como contra cepas de M. tuberculosis pansensibles silvestres normales. Esta observación es importante ya que demuestra claramente que no hay resistencia cruzada con fármacos anti-TB existentes. Dada la identificación adicional del bolsillo de unión de la parte de membrana de la ATPasa, los resultados de este estudio permitirán un desarrollo adicional de nuevos compuestos antibacterianos, en particular compuestos antimicobacterianos que eligen como objetivo la síntesis de ATP en estos organismos.

16

REFERENCIAS

5 1. Global Alliance for TB Drug Development, Developing a faster TB cure (2004; http://www.tballiance.org).

2. E. L. Corbett y cols., Arch. Intern. Med. 163, 1009 (2003).

3. UNAIDS, AIDS epidemic update 2003 (2003; www.unaids.org/Unaids/EN/Resources).

4. World Health Organization, Tuberculosis (2004; http://www.who.int/health topics/tuberculosis/en/).

5. R. J. O'Brien, P. P. Nunn, Am. J. Respir. Crit. Care Med. 163, 1055 (2001).

10 6. World Health Organization, Tuberculosis Fact Sheet No 104 (2004; http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs104/en/).

7. A. J. Claxton, J. Cramer, C. Pierce, Clin. Ther. 23, 1296 (2001).

8. N. Lounis y cols., Antimicrob. Agents Chemother. 45, 3482 (2001).

9. A. S. Ginsburg, J. H. Grosset, W. R. Bishai, Lancet Infect. Dis. 3, 432 (2003). 15 10. C. K. Stover y cols., Nature 405, 962 (2000).

11. Guillemont J, Emile G, Patente (Publicación Internacional Número WO 2004/011436. Fecha de Publicación Internacional 5 de febrero de 2004).

12. Barbachyn MR, Brickner SJ, Patente (Publicación Internacional Número: WO 93/09103, Fecha de Publicación Internacional: 13 de mayo de 1993, Solicitud Internacional Número: PCT/US92/08267, Fecha de Presentación 20 Internacional: 1992).

13. R. Jain, B. Vaitilingam, A. Nayyar, P. B. Palde, Bioorg. Med. Chem. Lett. 13, 1051 (2003).

14. C. M. Kunin, W. Y. Ellis, Antimicrob. Agents Chemother. 44, 848 (2000).

15. L. Savini, L. Chiasserini, A. Gaeta, C. Pellerano, Bioorg. Med Chem 10, 2193 (2002).

16. S. Vangapandu, M. Jain, R. Jain, S. Kaur, P. P. Singh, Bioorg. Med. Chem. 12, 2501 (2004). 25 17. K. Andries y cols., Science 307, 223 (2005).

17

imagen12

imagen13

imagen14

Tabla 3 (continuación)

ÁTOMO: 90 SD MET L 17 10,846 -13,177 10,983 1,00 0,00 S

ÁTOMO: 91 CE MET L 17 11,507 -14,142 9,610 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 92 N GLY L 19 7,665 -8,503 5,731 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 93 CA GLY L 19 6,955 -8,955 4,577 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 94 C GLY L 19 6,222 -10,215 4,817 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 95 O GLY L 19 5,027 -10,326 4,589 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 96 N GLY L 20 7,028 -11,189 5,274 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 97 CA GLY L 20 6,545 -12,472 5,462 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 98 C GLY L 20 5,400 -12,516 6,352 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 99 O GLY L 20 4,328 -12,921 5,962 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 100 N ALA L 21 5,696 -12,094 7,607 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 101 CA ALA L 21 4,773 -12,247 8,668 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 102 C ALA L 21 3,441 -11,568 8,418 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 103 O ALA L 21 2,401 -12,101 8,724 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 104 CB ALA L 21 5,365 -11,795 9,953 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 105 N ILE L 22 3,503 -10,313 7,908 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 106 CA ILE L 22 2,293 -9,551 7,618 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 107 C ILE L 22 1,551 -10,212 6,464 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 108 O ILE L 22 0,349 -10,406 6,550 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 109 CB ILE L 22 2,557 -8,055 7,417 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 110 CG1 ILE L 22 2,757 -7,350 8,740 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 111 CG2 ILE L 22 1,424 -7,339 6,679 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 112 CD1 ILE L 22 3,979 -7,733 9,410 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 113 N GLY L 23 2,307 -10,532 5,345 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 114 CA GLY L 23 1,730 -11,131 4,153 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 115 C GLY L 23 0,953 -12,395 4,473 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 116 O GLY L 23 -0,212 -12,517 4,150 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 117 N ALA L 24 1,683 -13,360 5,127 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 118 CA ALA L 24 1,102 -14,632 5,548 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 119 C ALA L 24 -0,076 -14,444 6,468 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 120 O ALA L 24 -1,054 -15,158 6,348 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 121 CB ALA L 24 2,105 -15,541 6'. 198 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 122 N GLY L 25 0,067 -13,469 7,438 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 123 CA GLY L 25 -0,962 -13,170 8,392 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 124 C GLY L 25 -2,268 -12,811 7,747 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 125 O GLY L 25 -3,300 -13,370 8,064 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 126 N ILE L 26 -2,180 -11,796 6,833 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 127 CA ILE L 26 -3,331 -11,306 6,108 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 128 C ILE L 26 -3,969 -12,476 5,367 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 129 O ILE L 26 -5,165 -12,691 5,457 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 130 CB ILE L 26 -2,991 -10,132 5,190 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 131 CG1 ILE L 26 -2,576 -8,894 5,997 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 132 CG2 ILE L 26 -4,165 -9,810 4,293 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 133 CD1 ILE L 26 -1,882 -7,842 5,205 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 134 N GLY L 27 -3,109 -13,215 4,602 1,00 0,00 N

21

imagen15

imagen16

imagen17

imagen18

Tabla 4

ÁTOMO: 1 N ALA A 21 6,345 -14,031 -0,384 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 2 CA ALA A 21 5,507 -14,175 0,805 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 3 C ALA A 21 4,183 -13,425 0,676 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 4 O ALA A 21 3,126 -14,005 0,893 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 5 CB ALA A 21 6,228 -13,751 2,081 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 6 N ILE A 22 4,282 -12,074 0,350 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 7 CA ILE A 22 3,090 -11,221 0,235 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 8 C ILE A 22 2,159 -11,728 -0,869 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 9 O ILE A 22 0,946 -11,670 -0,719 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 10 CB ILE A 22 3,362 -9,687 0,133 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 11 CG1 ILE A 22 4,114 -9,223 -1,134 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 12 CG2 ILE A 22 4,108 -9,189 1,374 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 13 CD1 ILE A 22 3,187 -8,776 -2,254 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 14 N GLY A 23 2,782 -12,213 -2,016 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 15 CA GLY A 23 2,049 -12,734 -3,156 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 16 C GLY A 23 1,095 -13,831 -2,732 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 17 O GLY A 23 -0,107 -13,720 -2,928 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 18 N ALA A 24 1,708 -14,925 -2,131 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 19 CA ALA A 24 0,944 -16,088 -1,682 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 20 C ALA A 24 -0,144 -15,660 -0,712 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 21 O ALA A 24 -1,298 -16,015 -0,897 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 22 CB ALA A 24 1,797 -17,177 -1,039 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 23 N GLY A 25 0,280 -14,904 0,373 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 24 CA GLY A 25 -0,589 -14,587 1,491 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 25 C GLY A 25 -1,877 -13,947 1,018 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 26 O GLY A 25 -2,953 -14,520 1,129 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 27 N ILE A 26 -1,699 -12,685 0,473 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 28 CA ILE A 26 -2,827 -11,831 0,104 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 29 C ILE A 26 -3,654 -12,542 -0,969 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 30 O ILE A 26 -4,871 -12,600 -0,857 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 31 CB ILE A 26 -2,401 -10,397 -0,323 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 32 CG1 ILE A 26 -1,597 -9,649 0,770 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 33 CG2 ILE A 26 -3,603 -9,553 -0,763 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 34 CD1 ILE A 26 -2,318 -9,454 2,099 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 35 N GLY A 27 -2,942 -13,062 -2,046 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 36 CA GLY A 27 -3,584 -13,678 -3,199 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 37 C GLY A 27 -4,550 -14,779 -2,803 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 38 O GLY A 27 -5,716 -14,754 -3,175 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 39 N ASP A 28 -3,985 -15,780 -2,024 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 40 CA ASP A 28 -4,732 -16,946 -1,539 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 41 C ASP A 28 -5,998 -16,489 -0,825 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 42 O ASP A 28 -7,077 -17,007 -1,083 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 43 CB ASP A 28 -3,917 -17,846 -0,588 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 44 CG ASP A 28 -2,860 -18,655 -1,307 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 45 OD1 ASP A 28 -2,422 -18,431 -2,426 1,00 0,00 O

26

imagen19

imagen20

Tabla 4 (continuación)

ÁTOMO: 135 O ALA K 31 -12,931 -11,178 10,696 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 136 CB ALA K 31 -9,624 -11,033 10,283 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 137 N GLY K 32 -11,816 -9,610 11,974 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 138 CA GLY K 32 -12,719 -9,669 13,109 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 139 C GLY K 32 -14,138 -9,365 12,675 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 140 O GLY K 32 -15,039 -10,185 12,801 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 141 N PHE K 53 -10,783 -14,377 18,969 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 142 CA PHE K 53 -9,482 -14,955 18,629 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 143 C PHE K 53 -8,723 -14,019 17,685 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 144 O PHE K 53 -7,574 -13,689 17,947 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 145 CB PHE K 53 -9,600 -16,376 18,045 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 146 CG PHE K 53 -8,257 -17,051 17,883 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 147 CD1 PHE K 53 -7,577 -17,020 16,639 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 148 CD2 PHE K 53 -7,660 -17,740 18,968 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 149 CE1 PHE K 53 -6,333 -17,661 16,487 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 150 CE2 PHE K 53 -6,416 -18,382 18,810 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 151 CZ PHE K 53 -5,753 -18,344 17,571 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 152 N PHE K 54 -9,409 -13,608 16,543 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 153 CA PHE K 54 -8,767 -12,782 15,516 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 154 C PHE K 54 -8,164 -11,541 16,176 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 155 O PHE K 54 -6,978 -11,270 16,042 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 156 CB PHE K 54 -9,706 -12,321 14,380 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 157 CG PHE K 54 -10,176 -13,399 13,433 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 158 CD1 PHE K 54 -9,257 -14,099 12,611 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 159 CD2 PHE K 54 -11,561 -13,654 13,273 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 160 CE1 PHE K 54 -9,716 -15,014 11,644 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 161 CE2 PHE K 54 -12,014 -14,563 12,300 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 162 CZ PHE K 54 -11,094 -15,240 11,482 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 163 N ILE K 55 -9,075 -10,749 16,863 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 164 CA ILE K 55 -8,727 -9,405 17,324 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 165 C ILE K 55 -7,693 -9,410 18,450 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 166 O ILE K 55 -6,827 -8,544 18,477 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 167 CB ILE K 55 -9,943 -8,495 17,647 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 168 CG1 ILE K 55 -10,898 -9,081 18,707 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 169 CG2 ILE K 55 -10,688 -8,166 16,349 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 170 CD1 ILE K 55 -12,005 -8,127 19,121 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 171 N THR K 56 -7,833 -10,391 19,426 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 172 CA THR K 56 -6,922 -10,464 20,567 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 173 C THR K 56 -5,505 -10,773 20,080 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 174 O THR K 56 -4,555 -10,147 20,530 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 175 CB THR K 56 -7,422 -11,383 21,713 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 176 OG1 THR K 56 -6,750 -11,036 22,925 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 177 CG2 THR K 56 -7,216 -12,880 21,504 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 178 N VAL K 57 -5,382 -11,788 19,134 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 179 CA VAL K 57 -4,079 -12,161 18,578 1,00 0,00 C

29

imagen21

Tabla 4 (continuación)

ÁTOMO: 225 C TYR K 64 6,472 -8,042 19,015 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 226 O TYR K 64 7,665 -8,258 19,180 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 227 CB TYR K 64 5,069 -10,062 19,359 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 228 CG TYR K 64 4,322 -11,015 20,266 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 229 CD1 TYR K 64 4,486 -11,028 21,679 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 230 CD2 TYR K 64 3,483 -11,993 19,678 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 231 CE1 TYR K 64 3,829 -11,984 22,471 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 232 CE2 TYR K 64 2,857 -12,979 20,459 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 233 CZ TYR K 64 3,033 -12,965 21,859 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 234 OH TYR K 64 2,416 -13,902 22,671 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 235 N PHE K 65 5,971 -7,269 17,972 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 236 CA PHE K 65 6,881 -6,566 17,058 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 237 C PHE K 65 7,823 -5,649 17,839 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 238 O PHE K 65 9,014 -5,614 17,560 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 239 CB PHE K 65 6,180 -5,739 15,966 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 240 CG PHE K 65 5,527 -6,570 14,890 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 241 CD1 PHE K 65 4,136 -6,471 14,655 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 242 CE1 PHE K 65 3,536 -7,174 13,596 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 243 CZ PHE K 65 4,312 -8,000 12,767 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 244 CE2 PHE K 65 5,693 -8,121 12,994 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 245 CD2 PHE K 65 6,298 -7,409 14,046 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 246 N ASN K 67 8,600 -5,837 21,135 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 247 CA ASN K 67 9,499 -6,640 21,975 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 248 C ASN K 67 10,712 -7,094 21,170 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 249 O ASN K 67 11,841 -6,910 21,603 1,00. 0,00 O

ÁTOMO: 250 CB ASN K 67 8,840 -7,875 22,619 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 251 CG ASN K 67 7,877 -7,498 23,726 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 252 OD1 ASN K 67 6,675 -7,388 23,534 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 253 ND2 ASN K 67 8,480 -7,263 24,941 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 254 N LEU K 68 10,429 -7,744 19,975 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 255 CA LEU K 68 11,456 -8,357 19,131 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 256 C LEU K 68 12,495 -7,303 18,752 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 257 O LEU K 68 13,684 -7,496 18,968 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 258 CB LEU K 68 10,830 -9,066 17,909 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 259 CG LEU K 68 11,796 -9,975 17,120 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 260 CD1 LEU K 68 11,014 -11,105 16,449 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 261 CD2 LEU K 68 12,577 -9,208 16,051 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 262 N GLY L 14 14,989 -7,715 8,662 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 263 CA GLY L 14 13,793 -6,924 8,905 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 264 C GLY L 14 12,803 -7,025 7,757 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 265 O GLY L 14 11,628 -7,291 7,964 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 266 N ILE L 16 12,496 -9,152 5,091 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 267 CA ILE L 16 11,861 -10,451 4,837 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 268 C ILE L 16 10,744 -10,700 5,848 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 269 O ILE L 16 9,660 -11,122 5,468 1,00 0,00 O

31

imagen22

imagen23

Tabla 4 (continuación)

ÁTOMO: 360 O GLY L 32 -12,428 -18,788 7,620 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 361 N THR L 51 -11,764 -26,332 14,771 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 362 CA THR L 51 -10,467 -26,987 14,935 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 363 C THR L 51 -9,452 -26,599 13,848 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 364 O THR L 51 -8,351 -26,190 14,199 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 365 CB THR L 51 -10,589 -28,519 15,109 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 366 OG1 THR L 51 -11,578 -28,792 16,105 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 367 CG2 THR L 51 -9,288 -29,157 15,580 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 368 N PRO L 52 -9,797 -26,799 12,499 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 369 CA PRO L 52 -8,818 -26,678 11,427 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 370 C PRO L 52 -8,028 -25,377 11,428 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 371 O PRO L 52 -6,825 -25,388 11,203 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 372 CB PRO L 52 -9,592 -26,833 10,125 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 373 CG PRO L 52 -10,863 -27,542 10,527 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 374 CD PRO L 52 -11,104 -27,123 11,962 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 375 N PHE L 53 -8,777 -24,222 11,638 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 376 CA PHE L 53 -8,158 -22,904 11,575 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 377 C PHE L 53 -7,070 -22,835 12,640 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 378 O PHE L 53 -5,919 -22,563 12,328 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 379 CB PHE L 53 -9,165 -21,749 11,710 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 380 CG PHE L 53 -8,486 -20,406 11,576 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 381 CD1 PHE L 53 -8,068 -19,938 10,308 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 382 CD2 PHE L 53 -8,232 -19,601 12,715 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 383 CE1 PHE L 53 -7,415 -18,699 10,186 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 384 CE2 PHE L 53 -7,598 -18,352 12,585 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 385 CZ PHE L 53 -7,185 -17,903 11,320 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 386 N PHE L 54 -7,493 -23,069 13,942 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 387 CA PHE L 54 -6,624 -22,780 15,082 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 388 C PHE L 54 -5,283 -23,500 14,934 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 389 O PHE L 54 -4,238 -22,899 15,149 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 390 CB PHE L 54 -7,258 -23,112 16,446 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 391 CG PHE L 54 -8,520 -22,346 16,780 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 392 CD1 PHE L 54 -8,627 -20,946 16,577 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 393 CD2 PHE L 54 -9,626 -23,027 17,347 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 394 CE1 PHE L 54 -9,810 -20,260 16,905 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 395 CE2 PHE L 54 -10,796 -22,330 17,701 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 396 CZ PHE L 54 -10,892 -20,948 17,473 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 397 N ILE L 55 -5,352 -24,850 14,595 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 398 CA ILE L 55 -4,139 -25,666 14,492 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 399 C ILE L 55 -3,201 -25,129 13,402 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 400 O ILE L 55 -2,003 -25,002 13,627 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 401 CB ILE L 55 -4,402 -27,198 14,419 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 402 CG1 ILE L 55 -3,088 -27,977 14,635 0,00 C

ÁTOMO: 403 CG2 ILE L 55 -5,106 -27,651 13,136 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 404 CD1 ILE L 55 -3,303 -29,446 14,966 1,00 0,00 C

34

imagen24

Tabla 4 (continuación)

ÁTOMO: 450 O ALA L 62 8,733 -21,152 11,454 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 451 CB ALA L 62 6,351 -22,844 12,734 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 452 N ALA L 63 7,235 -21,777 9,810 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 453 CA ALA L 63 8,205 -21,820 8,714 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 454 C ALA L 63 9,043 -20,543 8,636 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 455 O ALA L 63 10,257 -20,607 8,499 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 456 CB ALA L 63 7,547 -22,083 7,362 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 457 N TYR L 64 8,333 -19,349 8,701 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 458 CA TYR L 64 9,006 -18,049 8,621 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 459 C TYR L 64 10,000 -17,881 9,768 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 460 O TYR L 64 11,097 -17,379 9,562 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 461 CB TYR L 64 8,042 -16,849 8,590 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 462 CG TYR L 64 7,194 -16,820 7,341 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 463 CD1 TYR L 64 7,770 -16,499 6,085 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 464 CD2 TYR L 64 5,811 -17,118 7,404 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 465 CE1 TYR L 64 6,990 -16,502 4,914 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 466 CE2 TYR L 64 5,024 -17,125 6,238 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 467 CZ TYR L 64 5,615 -16,821 4,997 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 468 OH TYR L 64 4,807 -16,847 3,870 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 469 N PHE L 65 9,571 -18,285 11,026 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 470 CA PHE L 65 10,456 -18,198 12,188 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 471 C PHE L 65 11,751 -19,001 11,982 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 472 O PHE L 65 12,807 -18,572 12,428 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 473 CB PHE L 65 9,751 -18,584 13,503 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 474 CG PHE L 65 10,605 -18,264 14,707 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 475 CD1 PHE L 65 10,790 -16,921 15,123 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 476 CE1 PHE L 65 11,649 -16,616 16,194 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 477 CZ PHE L 65 12,328 -17,647 16,867 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 478 CE2 PHE L 65 12,135 -18,985 16,481 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 479 CD2 PHE L 65 11,277 -19,295 15,410 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 480 ILE L 66 11,648 -20,219 11,314 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 481 CA ILE L 66 12,834 -21,039 11,020 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 482 C ILE L 66 13,831 -20,203 10,207 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 483 O ILE L 66 -20,185 10,527 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 484 CB ILE L 66 12,536 -22,402 10,326 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 485 CG1 ILE L 66 11,537 -23,293 11,099 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 486 CG2 ILE L 66 13,824 -23,190 10,054 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 487 CD1 ILE L 66 11,915 -23,605 12,541 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 488 N ASN L 67 13,319 -19,523 9,103 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 489 CA ASN L 67 14,170 -18,671 8,257 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 490 C ASN L 67 14,893 -17,621 9,100 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 491 O ASN L 67 16,086 -17,414 8,918 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 492 CB ASN L 67 13,433 -17,956 7,109 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 493 CG ASN L 67 12,966 -18,928 6,045 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 494 OD1 ASN L 67 11,854 -19,433 6,070 1,00 0,00 O

36

imagen25

imagen26

Tabla 4 (continuación)

ÁTOMO: 585 C LEU M 211 8,744 -21,017 22,457 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 586 O LEU M 211 9,830 -20,675 22,903 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 587 CB LEU M 211 6,921 -19,556 23,477 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 588 CG LEU M 211 6,253 -20,691 24,283 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 589 CD1 LEU M 211 7,071 -21,031 25,529 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 590 CD2 LEU M 211 4,828 -20,304 24,668 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 591 N PHE M 212 8,395 -22,335 22,194 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 592 CA PHE M 212 9,343 -23,437 22,323 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 593 C PHE M 212 10,537 -23,177 21,400 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 594 O PHE M 212 11,684 -23,308 21,810 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 595 CB PHE M 212 8,657 -24,790 22,053 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 596 CG PHE M 212 9,531 -26,001 22,266 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 597 CD1 PHE M 212 9,585 -27,015 21,279 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 598 CD2 PHE M 212 10,273 -26,176 23,463 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 599 CE1 PHE M 212 10,360 -28,171 21,483 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 600 CE2 PHE M 212 11,054 -27,328 23,659 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 601 CZ PHE M 212 11,095 -28,324 22,671 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 602 N GLY M 213 10,213 -22,782 20,106 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 603 CA GLY M 213 11,222 -22,358 19,149 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 604 C GLY M 213 12,077 -21,244 19,726 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 605 O GLY M 213 13,296 -21,353 19,773 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 606 N ASN M 214 11,360 -20,130 20,149 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 607 CA ASN M 214 12,007 -18,898 20,604 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 608 C ASN M 214 13,063 -19,144 21,674 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 609 O ASN M 214 14,176 -18,654 21,546 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 610 CB ASN M 214 11,001 -17,841 21,083 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 611 CG ASN M 214 11,704 -16,606 21,615 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 612 OD1 ASN M 214 11,859 -16,419 22,813 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 613 ND2 ASN M 214 12,177 -15,754 20,643 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 614 N GLN M 252 6,092 -15,258 27,574 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 615 CA GLN M 252 5,399 -15,988 26,508 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 616 C GLN M 252 4,487 -17,062 27,109 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 617 O GLN M 252 3,343 -17,209 26,701 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 618 CB GLN M 252 6,348 -16,641 25,488 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 619 CG GLN M 252 7,165 -15,662 24,639 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 620 CD GLN M 252 6,294 -14,812 23,745 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 621 OE1 GLN M 252 5,949 -13,685 24,069 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 622 NE2 GLN M 252 5,911 -15,431 22,578 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 623 N ILE M 255 1,315 -15,654 28,673 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 624 CA ILE M 255 0,314 -15,323 27,648 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 625 C ILE M 255 -0,456 -16,594 27,270 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 626 O ILE M 255 -1,677 -16,562 27,206 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 627 CB ILE M 255 0,899 -14,600 26,397 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 628 CG1 ILE M 255 1,511 -13,217 26,721 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 629 CG2 ILE M 255 -0,132 -14,462 25,269 1,00 0,00 C

39

imagen27

Tabla 5

ÁTOMO: 1 N ALA A 21 5,881 -12,842 -1,403 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 2 CA ALA A 21 5,032 -12,962 -0,219 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 3 C ALA A 21 3,724 -12,190 -0,393 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 4 O ALA A 21 2,644 -12,753 -0,261 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 5 CB ALA A 21 5,743 -12,524 1,061 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 6 N ILE A 22 3,865 -10,830 -0,654 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 7 CA ILE A 22 2,696 -9,942 -0,707 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 8 C ILE A 22 1,780 -10,304 -1,877 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 9 O ILE A 22 0,564 -10,249 -1,742 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 10 CB ILE A 22 3,012 -8,420 -0,634 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 11 CG1 ILE A 22 3,808 -7,845 -1,829 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 12 CG2 ILE A 22 3,732 -8,094 0,679 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 13 CD1 ILE A 22 2,917 -7,216 -2,890 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 14 N ALA A 24 1,317 -13,263 -3,458 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 15 CA ALA A 24 0,563 -14,470 -3,134 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 16 C ALA A 24 -0,656 -14,135 -2,280 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 17 O ALA A 24 -1,754 -14,581 -2,580 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 18 CB ALA A 24 1,423 -15,525 -2,443 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 19 N GLY A 25 -0,414 -13,331 -1,171 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 20 CA GLY A 25 -1,450 -12,972 -0,212 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 21 C GLY A 25 -2,689 -12,390 -0,872 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 22 O GLY A 25 -3,799 -12,857 -0,647 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 23 N LEU A 59 -1,069 -19,335 -3,710 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 24 CA LEU A 59 -0,138 -19,537 -2,599 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 25 C LEU A 59 1,257 -19,890 -3,118 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 26 O LEU A 59 2,236 -19,287 -2,700 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 27 CB LEU A 59 -0,654 -20,593 -1,599 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 28 CG LEU A 59 0,253 -20,834 -0,375 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 29 CD1 LEU A 59 0,412 -19,583 0,489 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 30 CD2 LEU A 59 -0,317 -21,972 0,469 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 31 N ILE K 16 10,647 -2,985 11,484 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 32 CA ILE K 16 9,949 -4,131 12,078 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 33 C ILE K 16 8,633 -3,639 12,688 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 34 O ILE K 16 7,578 -4,192 12,405 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 35 CB ILE K 16 10,839 -4,911 13,092 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 36 CG1 ILE K 16 11,982 -5,650 12,360 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 37 CG2 ILE K 16 10,028 -5,918 13,915 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 38 CD1 ILE K 16 13,158 -5,961 13,274 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 39 N GLY K 19 5,970 -2,022 10,048 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 40 CA GLY K 19 5,412 -3,072 9,210 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 41 C GLY K 19 4,400 -3,910 9,967 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 42 O GLY K 19 3,291 -4,135 9,498 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 43 N GLY K 20 4,855 -4,394 11,185 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 44 CA GLY K 20 4,029 -5,189 12,076 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 45 C GLY K 20 2,705 -4,513 12,381 1,00 0,00 C

41

imagen28

imagen29

Tabla 5 (continuación)

ÁTOMO: 135 CA GLY K 58 -4,665 -10,040 14,902 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 136 C GLY K 58 -3,915 -8,999 15,716 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 137 O GLY K 58 -2,837 -8,566 15,338 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 138 N LEU K 59 -4,569 -8,588 16,866 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 139 CA LEU K 59 -4,102 -7,488 17,709 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 140 C LEU K 59 -2,696 -7,785 18,219 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 141 O LEU K 59 -1,786 -6,994 18,011 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 142 CB LEU K 59 -5,084 -7,200 18,866 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 143 CG LEU K 59 -4,667 -6,055 19,810 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 144 CD1 LEU K 59 -4,617 -4,705 19,094 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 145 CD2 LEU K 59 -5,640 -5,983 20,985 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 146 N VAL K 60 -2,575 -8,958 18,956 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 147 CA VAL K 60 -1,376 -9,313 19,723 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 148 C VAL K 60 -0,172 -9,621 18,808 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 149 O VAL K 60 0,965 -9,587 19,262 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 150 CB VAL K 60 -1,666 -10,425 20,774 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 151 CG1 VAL K 60 -0,436 -10,797 21,603 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 152 CG2 VAL K 60 -2,756 -9,980 21,761 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 153 N GLU K 61 -0,439 -9,875 17,464 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 154 CA GLU K 61 0,617 -9,928 16,448 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 155 C GLU K 61 1,600 -8,765 16,629 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 156 O GLU K 61 2,806 -8,976 16,643 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 157 CB GLU K 61 0,048 -9,957 15,018 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 158 CG GLU K 61 1,116 -10,204 13,955 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 159 CD GLU K 61 0,480 -10,239 12,589 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 160 OE1 GLU K 61 0,270 -9,258 11,891 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 161 OE2 GLU K 61 0,106 -11,500 12,255 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 162 N ALA K 62 1,026 -7,499 16,735 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 163 CA ALA K 62 1,838 -6,288 16,832 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 164 C ALA K 62 2,817 -6,381 18,011 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 165 O ALA K 62 4,014 -6,325 17,766 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 166 CB ALA K 62 1,026 -4,994 16,802 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 167 N TYR K 64 4,143 -8,947 19,533 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 168 CA TYR K 64 5,238 -9,901 19,299 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 169 C TYR K 64 6,411 -9,187 18,617 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 170 O TYR K 64 7,549 -9,293 19,057 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 171 CB TYR K 64 4,859 -11,158 18,485 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 172 CG TYR K 64 3,743 -12,009 19,045 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 173 CD1 TYR K 64 3,591 -12,248 20,436 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 174 CD2 TYR K 64 2,826 -12,617 18,151 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 175 CE1 TYR K 64 2,524 -13,026 20,919 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 176 CE2 TYR K 64 1,754 -13,394 18,625 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 177 CZ TYR K 64 1,603 -13,582 20,014 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 178 OH TYR K 64 0,533 -14,296 20,528 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 179 N PHE K 65 6,092 -8,473 17,468 1,00 0,00 N

44

imagen30

Tabla 5 (continuación)

ÁTOMO: 225 CD1 ILE L 16 11,458 -13,971 4,775 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 226 N MET L 17 11,163 -10,818 8,193 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 227 CA MET L 17 10,196 -10,952 9,281 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 228 C MET L 17 8,956 -10,129 8,951 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 229 O MET L 17 7,865 -10,675 8,862 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 230 CB MET L 17 10,759 -10,564 10,663 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 231 CG MET L 17 11,766 -11,566 11,230 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 232 SD MET L 17 10,949 -13,111 11,753 1,00 0,00 S

ÁTOMO: 233 CE MET L 17 11,549 -14,216 10,448 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 234 N ALA L 18 9,158 -8,765 8,795 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 235 CA ALA L 18 8,046 -7,822 8,702 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 236 C ALA L 18 7,152 -8,180 7,521 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 237 O ALA L 18 5,979 -8,477 7,692 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 238 CB ALA L 18 8,510 -6,370 8,625 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 239 N GLY L 19 7,766 -8,127 6,279 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 240 CA GLY L 19 7,039 -8,324 5,037 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 241 C GLY L 19 6,426 -9,707 4,980 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 242 O GLY L 19 5,227 -9,857 4,788 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 243 N GLY L 20 7,342 -10,737 5,121 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 244 CA GLY L 20 7,000 -12,131 4,906 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 245 C GLY L 20 5,877 -12,608 5,802 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 246 O GLY L 20 4,881 -13,136 5,327 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 247 N ALA L 21 6,105 -12,439 7,161 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 248 CA ALA L 21 5,177 -12,957 8,167 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 249 C ALA L 21 3,795 -12,317 8,072 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 250 O ALA L 21 2,795 -12,996 8,255 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 251 CB ALA L 21 5,700 -12,806 9,589 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 252 N ILE L 22 3,756 -10,947 7,836 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 253 CA ILE L 22 2,476 -10,243 7,663 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 254 C ILE L 22 1,766 -10,786 6,419 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 255 O ILE L 22 0,554 -10,946 6,440 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 256 CB ILE L 22 2,626 -8,694 7,709 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 257 CG1 ILE L 22 2,574 -8,158 9,161 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 258 CG2 ILE L 22 1,550 -7,959 6,902 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 259 CD1 ILE L 22 3,547 -8,791 10,144 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 260 N GLY L 23 2,556 -11,065 5,313 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 261 CA GLY L 23 2,039 -11,727 4,122 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 262 C GLY L 23 1,274 -12,998 4,463 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 263 O GLY L 23 0,151 -13,189 4,016 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 264 N ALA L 24 1,957 -13,889 5,281 1,00 0,00 N

ÁTOMO: 265 CA ALA L 24 1,364 -15,139 5,762 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 266 C ALA L 24 0,049 -14,890 6,499 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 267 O ALA L 24 -0,925 -15,594 6,275 1,00 0,00 O

ÁTOMO: 268 CB ALA L 24 2,317 -15,935 6,650 1,00 0,00 C

ÁTOMO: 269 N GLY L 25 0,070 -13,864 7,434 1,00 0,00 N

46

imagen31

imagen32

imagen33

imagen34

imagen35

imagen36

imagen37

imagen38

imagen39

imagen40

imagen41

imagen42

imagen43

imagen44

imagen45

imagen46

imagen47

imagen48

imagen49

imagen50

imagen51

imagen52

imagen53

imagen54

imagen55

imagen56

imagen57

imagen58

imagen59

imagen60

imagen61

Claims

imagen1

imagen2