ES2425413T3 - Método para preparar carboxipeptidasa activada - Google Patents
Método para preparar carboxipeptidasa activada Download PDFInfo
- Publication number
- ES2425413T3 ES2425413T3 ES07847255T ES07847255T ES2425413T3 ES 2425413 T3 ES2425413 T3 ES 2425413T3 ES 07847255 T ES07847255 T ES 07847255T ES 07847255 T ES07847255 T ES 07847255T ES 2425413 T3 ES2425413 T3 ES 2425413T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- carboxypeptidase
- amino acid
- insulin
- chain
- human insulin
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 102000005367 Carboxypeptidases Human genes 0.000 title claims abstract description 119
- 108010006303 Carboxypeptidases Proteins 0.000 title claims abstract description 119
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 54
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 84
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims abstract description 50
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims abstract description 50
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 claims abstract description 31
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 21
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 19
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 80
- PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N insulin (human) Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H]2C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3NC=NC=3)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC1=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=O)CSSC[C@@H](C(N2)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C1=CN=CN1 PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N 0.000 claims description 70
- 101000976075 Homo sapiens Insulin Proteins 0.000 claims description 67
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 66
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 58
- 108010075254 C-Peptide Proteins 0.000 claims description 19
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 18
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 18
- VOUAQYXWVJDEQY-QENPJCQMSA-N 33017-11-7 Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)CCC1 VOUAQYXWVJDEQY-QENPJCQMSA-N 0.000 claims description 16
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 16
- 101001091368 Rattus norvegicus Glandular kallikrein-7, submandibular/renal Proteins 0.000 claims description 8
- 101000898773 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Saccharopepsin Proteins 0.000 claims description 8
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 5
- 101500025353 Homo sapiens Insulin A chain Proteins 0.000 claims description 4
- 101150029183 PEP4 gene Proteins 0.000 claims description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims description 4
- HSQGMTRYSIHDAC-BQBZGAKWSA-N Leu-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HSQGMTRYSIHDAC-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims description 3
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 claims description 3
- AZLASBBHHSLQDB-GUBZILKMSA-N Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C AZLASBBHHSLQDB-GUBZILKMSA-N 0.000 claims description 3
- LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims description 3
- NTISAKGPIGTIJJ-IUCAKERBSA-N Leu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C NTISAKGPIGTIJJ-IUCAKERBSA-N 0.000 claims description 3
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 claims description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 3
- 108010071185 leucyl-alanine Proteins 0.000 claims description 3
- 108010091798 leucylleucine Proteins 0.000 claims description 3
- 108010091871 leucylmethionine Proteins 0.000 claims description 3
- RFCVXVPWSPOMFJ-STQMWFEESA-N Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RFCVXVPWSPOMFJ-STQMWFEESA-N 0.000 claims description 2
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 claims description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 187
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 93
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 93
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 84
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 75
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 45
- 108010059081 Cathepsin A Proteins 0.000 description 43
- 102000005572 Cathepsin A Human genes 0.000 description 43
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 33
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 30
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 27
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 20
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 19
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 18
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 18
- 239000004026 insulin derivative Substances 0.000 description 14
- 239000000047 product Substances 0.000 description 14
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 11
- 102000002273 Polycomb Repressive Complex 1 Human genes 0.000 description 10
- 108010000598 Polycomb Repressive Complex 1 Proteins 0.000 description 10
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 10
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 10
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 9
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 9
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 9
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 8
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 8
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 8
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 8
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 8
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 8
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 8
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 8
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 7
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 7
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 7
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 7
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 6
- 101150045458 KEX2 gene Proteins 0.000 description 6
- 101150033985 TPI gene Proteins 0.000 description 6
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 6
- 230000008569 process Effects 0.000 description 6
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 6
- 102000004400 Aminopeptidases Human genes 0.000 description 5
- 108090000915 Aminopeptidases Proteins 0.000 description 5
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 5
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 5
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 5
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 5
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 5
- 101100277613 Aspergillus desertorum desB gene Proteins 0.000 description 4
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 4
- 101001030243 Homo sapiens Myosin-7 Proteins 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Chemical group NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 4
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 4
- 108010076181 Proinsulin Proteins 0.000 description 4
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 description 4
- 102100033598 Triosephosphate isomerase Human genes 0.000 description 4
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 4
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 4
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 4
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 4
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 4
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 4
- 108010005636 polypeptide C Proteins 0.000 description 4
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 4
- GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4,6-dichloropyrimidine-5-carbaldehyde Chemical group NC1=NC(Cl)=C(C=O)C(Cl)=N1 GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 3
- 102100032378 Carboxypeptidase E Human genes 0.000 description 3
- 101100246753 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) pyrF gene Proteins 0.000 description 3
- 101500025354 Homo sapiens Insulin B chain Proteins 0.000 description 3
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 241000235346 Schizosaccharomyces Species 0.000 description 3
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 3
- 101150050575 URA3 gene Proteins 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 238000011210 chromatographic step Methods 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 3
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 3
- -1 human insulin ester Chemical class 0.000 description 3
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 241000024188 Andala Species 0.000 description 2
- 101100288313 Arabidopsis thaliana KTI4 gene Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100030614 Carboxypeptidase A2 Human genes 0.000 description 2
- 108090000087 Carboxypeptidase B Proteins 0.000 description 2
- 102100035024 Carboxypeptidase B Human genes 0.000 description 2
- 108090000201 Carboxypeptidase B2 Proteins 0.000 description 2
- 108090000007 Carboxypeptidase M Proteins 0.000 description 2
- 102100032936 Carboxypeptidase M Human genes 0.000 description 2
- 108090000012 Carboxypeptidase T Proteins 0.000 description 2
- 108010080937 Carboxypeptidases A Proteins 0.000 description 2
- ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L EDTA disodium salt (anhydrous) Chemical compound [Na+].[Na+].OC(=O)CN(CC([O-])=O)CCN(CC(O)=O)CC([O-])=O ZGTMUACCHSMWAC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 102000005593 Endopeptidases Human genes 0.000 description 2
- 108010059378 Endopeptidases Proteins 0.000 description 2
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 2
- 101000801742 Homo sapiens Triosephosphate isomerase Proteins 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- 102100038934 Myosin-7 Human genes 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 2
- 241000235347 Schizosaccharomyces pombe Species 0.000 description 2
- 101150032817 TPI1 gene Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 2
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 2
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 238000001641 gel filtration chromatography Methods 0.000 description 2
- 125000000291 glutamic acid group Chemical group N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Chemical class 0.000 description 2
- 238000012409 standard PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000003934 vacuole Anatomy 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 101710163881 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Proteins 0.000 description 1
- HMPUHXCGUHDVBI-UHFFFAOYSA-N 5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-amine Chemical compound CC1=NN=C(N)S1 HMPUHXCGUHDVBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 1
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 1
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000235349 Ascomycota Species 0.000 description 1
- 101710082738 Aspartic protease 3 Proteins 0.000 description 1
- 101150071434 BAR1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010023063 Bacto-peptone Proteins 0.000 description 1
- 241000221198 Basidiomycota Species 0.000 description 1
- 102100030981 Beta-alanine-activating enzyme Human genes 0.000 description 1
- 241000235172 Bullera Species 0.000 description 1
- 241000219357 Cactaceae Species 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 102000003847 Carboxypeptidase B2 Human genes 0.000 description 1
- 102100035023 Carboxypeptidase B2 Human genes 0.000 description 1
- 101710093142 Carboxypeptidase E Proteins 0.000 description 1
- 108010058255 Carboxypeptidase H Proteins 0.000 description 1
- 102000000496 Carboxypeptidases A Human genes 0.000 description 1
- 241000233652 Chytridiomycota Species 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 241000490729 Cryptococcaceae Species 0.000 description 1
- 241000221199 Cryptococcus <basidiomycete yeast> Species 0.000 description 1
- LXJXRIRHZLFYRP-VKHMYHEASA-N D-glyceraldehyde 3-phosphate Chemical compound O=C[C@H](O)COP(O)(O)=O LXJXRIRHZLFYRP-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 108700033740 EC 3.4.17.1 Proteins 0.000 description 1
- 108700034208 EC 3.4.17.10 Proteins 0.000 description 1
- 108700034209 EC 3.4.17.15 Proteins 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 241000221207 Filobasidium Species 0.000 description 1
- 102000004961 Furin Human genes 0.000 description 1
- 108090001126 Furin Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 241000178290 Geotrichum fermentans Species 0.000 description 1
- 101150009006 HIS3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150069554 HIS4 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000773364 Homo sapiens Beta-alanine-activating enzyme Proteins 0.000 description 1
- 101000741885 Homo sapiens Protection of telomeres protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001046426 Homo sapiens cGMP-dependent protein kinase 1 Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical class C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 1
- 241000235649 Kluyveromyces Species 0.000 description 1
- 235000014663 Kluyveromyces fragilis Nutrition 0.000 description 1
- 241000235650 Kluyveromyces marxianus Species 0.000 description 1
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 1
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- 241000235087 Lachancea kluyveri Species 0.000 description 1
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M Lactate Chemical compound CC(O)C([O-])=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 101150068888 MET3 gene Proteins 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical class [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 102100030612 Mast cell carboxypeptidase A Human genes 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 101100022915 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) cys-11 gene Proteins 0.000 description 1
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical class [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000320412 Ogataea angusta Species 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 241000233654 Oomycetes Species 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 101100378536 Ovis aries ADRB1 gene Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 101150000922 PRC1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 101800005149 Peptide B Proteins 0.000 description 1
- 102000015731 Peptide Hormones Human genes 0.000 description 1
- 108010038988 Peptide Hormones Proteins 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical class [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004614 Process Aid Substances 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 description 1
- 102100038745 Protection of telomeres protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101100394989 Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) hisI gene Proteins 0.000 description 1
- 241000223252 Rhodotorula Species 0.000 description 1
- 235000003534 Saccharomyces carlsbergensis Nutrition 0.000 description 1
- 235000001006 Saccharomyces cerevisiae var diastaticus Nutrition 0.000 description 1
- 244000206963 Saccharomyces cerevisiae var. diastaticus Species 0.000 description 1
- 241000204893 Saccharomyces douglasii Species 0.000 description 1
- 241001407717 Saccharomyces norbensis Species 0.000 description 1
- 241001123227 Saccharomyces pastorianus Species 0.000 description 1
- 241000235344 Saccharomycetaceae Species 0.000 description 1
- 241000235343 Saccharomycetales Species 0.000 description 1
- 101001000154 Schistosoma mansoni Phosphoglycerate kinase Proteins 0.000 description 1
- 101100022918 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) sua1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101900104102 Schizosaccharomyces pombe Triosephosphate isomerase Proteins 0.000 description 1
- 241000228389 Sporidiobolus Species 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical class [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 description 1
- 241000235013 Yarrowia Species 0.000 description 1
- 241000235015 Yarrowia lipolytica Species 0.000 description 1
- 241000758405 Zoopagomycotina Species 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 125000003647 acryloyl group Chemical group O=C([*])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 1
- 229940127095 analogue insulin Drugs 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000002518 antifoaming agent Substances 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 description 1
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000000227 basophil cell of anterior lobe of hypophysis Anatomy 0.000 description 1
- 108010051210 beta-Fructofuranosidase Proteins 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 235000003869 genetically modified organism Nutrition 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 239000001573 invertase Substances 0.000 description 1
- 235000011073 invertase Nutrition 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 210000004153 islets of langerhan Anatomy 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 230000005923 long-lasting effect Effects 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Chemical class 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000012092 media component Substances 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 150000002739 metals Chemical class 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 235000008935 nutritious Nutrition 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 108010091748 peptide A Proteins 0.000 description 1
- 239000000813 peptide hormone Substances 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N phenylalanine group Chemical group N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Chemical class 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical class [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 239000007261 sc medium Substances 0.000 description 1
- 210000004739 secretory vesicle Anatomy 0.000 description 1
- 108010059841 serine carboxypeptidase Proteins 0.000 description 1
- 230000037432 silent mutation Effects 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 108010078692 yeast proteinase B Proteins 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
- C07K14/62—Insulins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/50—Fusion polypeptide containing protease site
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Método para preparar una carboxipeptidasa activada en una célula fúngica, donde una secuencia de ADN quecodifica una proforma modificada de la carboxipeptidasa, que incluye un sitio de escisión Kex2 insertado en unaposición de 0 a aproximadamente 30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en lacarboxipeptidasa de tipo salvaje, se expresa bajo condiciones adecuadas para la expresión de la proforma modificadade la carboxipeptidasa, a partir de lo cual la prosecuencia se escinde en la célula para liberar la forma activa libre de lacarboxipeptidasa.
Description
Método para preparar carboxipeptidasa activada
Campo de la invención
[0001] La presente invención se refiere a un método para preparar carboxipeptidasas activadas y a un método para usar las carboxipeptidasas activadas para la producción de insulina humana madura o análogos de insulina humana en células fúngicas.
Antecedentes de la invención
[0002] La insulina es una hormona polipeptídica producida en las células beta de los islotes de Langerhans. La molécula de insulina activa es una molécula bicatenaria que consiste en una cadena B y una cadena A conectadas por dos puentes de disulfuro. La insulina se sintetiza como una proinsulina de molécula precursora con la estructura B-C-A, donde la cadena del péptido C conecta el residuo de aminoácidos C-terminal en la cadena B con el residuo de aminoácidos N-terminal en la cadena A. La insulina bicatenaria madura se forma por escisión in vivo del péptido C en el par de residuos de aminoácidos básicos situados en la unión con la cadena A y B. La cadena A y B están sujetas entre sí por dos puentes de disulfuro entre los residuos Cys A7 y B7 y A20 y B19, respectivamente. Además, la molécula de insulina biológicamente activa tiene un puente de disulfuro interno entre los residuos Cys en la posición A6 y A11.
[0003] Tras el desarrollo de la tecnología del ADN recombinante, se han descrito numerosos métodos para producir insulina y precursores de la misma en células huésped genéticamente modificadas. Dado que E. coli no tiene la maquinaria celular para plegar el polipéptido expresado y establecer los puentes de disulfuro que conectan la cadena A y B en la insulina madura, esta estrategia incluye varios pasos de tratamiento in vitro, tal como el establecimiento in vitro de los puentes de disulfuro durante el replegado y la escisión posterior del péptido C.
[0004] A diferencia de E. coli, las eucariotas contienen la maquinaria necesaria para el plegado y el establecimiento de los puentes de disulfuro y así parece que serían buenos candidatos para la producción de insulina madura en organismos genéticamente modificados. Thim et al, en FEBS Letters, volumen 212, número 2,307-312, divulgan la expresión de proinsulina humana y varios precursores de insulina con determinados péptidos C modificados. La patente estadounidense 4 914 026 divulga un proceso para preparar insulina madura en la levadura por inserción del gen de proinsulina humana enlazado a la secuencia líder del a-factor de levadura en una célula huésped de levadura y cultivando la célula de levadura transformada en un medio nutritivo bajo condiciones donde la proinsulina se expresa y secreta en forma madura.
[0005] La WO 97/03089 divulga la expresión de precursores de insulina con la fórmula BZA, donde B y A son las cadenas peptídicas A y B de insulina humana enlazadas por al menos un enlace de disulfuro y Z es un polipéptido que comprende al menos un sitio de escisión proteolítica. La WO 90/10075 revela procesos para preparar insulina y análogos de insulina basados en la expresión de un precursor de insulina o análogo de insulina en la levadura, que después de la recuperación inicial del caldo de fermentación se convierten enzimáticamente en insulina madura o análogo de insulina. Las moléculas precursoras comprenden determinados péptidos C modificados y pueden comprender además una extensión N-terminal de la cadena B de insulina. El péptido C modificado y la posible extensión N-terminal del péptido B están diseñados para no ser divididos en la célula de levadura y así los precursores se segregan como péptidos monocatenarios, donde la cadena A y B siguen conectadas por el péptido C modificado pero con puentes de disulfuro correctamente situados. El producto de insulina madura o de análogo de insulina se obtienen entonces por una serie de pasos enzimáticos in vitro posteriores para disociar el péptido C y posiblemente la extensión N-terminal. Estos pasos enzimáticos llevan mucho tiempo, son frecuentemente costosos e introducen impurezas adicionales que posteriormente se deben eliminar en pasos posteriores de proceso hacia abajo, como costosos pasos de cromatografía y similares.
[0006] Un proceso para preparar insulina madura en células animales creadas genéticamente que no son capaces de formar naturalmente gránulos secretores se describe en la patente estadounidense nº: 6 348 327.
[0007] La WO2008/037735 divulga un método para preparar insulina humana por cultivo de una células fúngica que comprende una secuencia de ADN que codifica un precursor que comprende al menos un sitio de escisión Kex2.
[0008] La WO2007/080256 divulga un método para preparar polipéptidos de insulina madurada mediante la reacción del precursor de insulina con una carboxipeptidasa.
[0009] El propósito de la presente invención es desarrollar una cepa de hongos capaz de producir carboxipeptidasas que se activen intracelularmente independientemente de la proteinasa A y B y, además, desarrollar un proceso para preparar insulina madura o análogos de insulina completamente procesados mediante tal carboxipeptidasa alternativamente activada, de modo que se eviten los pasos de proceso de purificación hacia abajo costosos y de larga duración.
Resumen de la invención
[0010] En un aspecto, la presente invención se refiere a un método para preparar una carboxipeptidasa activada en una célula fúngica, donde una secuencia de ADN que codifica una proforma modificada de la carboxipeptidasa, que incluye un sitio de escisión Kex2 insertado en una posición de 0 a aproximadamente 30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácidos N-terminal natural en la carboxipeptidasa de tipo salvaje, se expresa bajo condiciones adecuadas para la expresión de la proforma modificada de la carboxipeptidasa, a partir de lo cual la prosecuencia se escinde en la célula para liberar la forma activa libre de la carboxipeptidasa.
[0011] En un aspecto, la presente invención se refiere a un método para preparar una carboxipeptidasa activada que comprende la expresión en una célula fúngica de una secuencia de ADN que codifica una proforma modificada de la carboxipeptidasa, que incluye un sitio de escisión Kex2 insertado, a partir de lo cual la proforma de la carboxipeptidasa se escinde en la célula para liberar la forma activa libre de la carboxipeptidasa.
[0012] En una forma de realización de la invención, el método comprende además un paso de aislamiento de la forma activa de la carboxipeptidasa de la célula fúngica.
[0013] En otra forma de realización de la invención, la célula fúngica tiene un gen PEP4 no funcional (el gen que codifica la proteinasa A).
[0014] En una forma de realización de la invención, la célula fúngica tiene un gen PEP4 eliminado.
[0015] El sitio Kex2 insertado en la proforma de la carboxipeptidasa en una posición asegura la escisión eficaz de la proforma de la carboxipeptidasa para formar la forma madura activada de la carboxipeptidasa.
[0016] En una forma de realización de la presente invención, el sitio Kex2 se une directamente al residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa de tipo salvaje.
[0017] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce en una posición relativamente próxima al residuo de aminoácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa. No obstante, el sitio Kex2 preferiblemente no debería ser de más de aproximadamente 30 residuos de aminoácidos abajo o arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0018] En una forma de realización de la invención, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 1 a aproximadamente 30 residuos de aminoácidos abajo o arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa.
[0019] En una forma de realización de la invención, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 1 a aproximadamente 30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa.
[0020] En otra forma de realización de la invención, el sitio de escisión Kex2 se introduce a una distancia de 2-30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa.
[0021] En otra forma de realización de la invención, el sitio de escisión Kex2 se introduce a una distancia de 5-30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa.
[0022] En otra forma de realización de la invención, el sitio de escisión Kex2 se introduce a una distancia de 5-20 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa.
[0023] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 2-30, de 2-29, de 2-28, de 2- 27, de 226, de 2-25, de 2-24, de 2-23, de 2-22, de 2-21 o de 2-20 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0024] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 3-30, de 3-29, de 3-28, de 3- 27, de 326, de 3-25, de 3-24, de 3-23, de 3-22, de 3-21 o de 3-20 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0025] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 4-30, de 4-29, de 4-28, de 4- 27, de 426, de 4-25, de 4-24, de 4-23, de 4-22, de 4-21 o de 4-20 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0026] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 5-30, de 5-29, de 5-28, de 5- 27, de 526, de 5-25, de 5-24, de 5-23, de 5-22, de 5-21 o de 5-20 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0027] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 1 residuo de aminoácido arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0028] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 2 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0029] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce en una distancia de 3 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido de N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0030] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 4 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0031] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 5 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0032] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 6 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0033] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 7 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0034] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 8 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0035] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 9 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0036] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 10 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0037] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 12 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0038] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 13 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0039] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 14 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0040] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 15 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0041] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 16 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0042] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 17 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0043] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 18 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0044] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 19 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0045] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 20 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0046] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 21 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0047] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 22 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0048] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 23 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0049] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 24 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0050] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 25 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
5 [0051] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 26 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0052] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 27 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
10 [0053] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 28 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0054] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 29 residuos de aminoácidos arriba o 15 abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
[0055] En otra forma de realización, el sitio Kex2 se introduce a una distancia de 30 residuos de aminoácidos arriba o abajo del residuo de ácido N-terminal natural de la carboxipeptidasa.
20 [0056] En otro aspecto, la invención se refiere a un método para preparar insulina humana madura o un análogo de la misma mediante la reacción de un precursor para insulina humana o un análogo de la misma que comprende una extensión C-terminal de la cadena B con una carboxipeptidasa producida por un método según cualquiera de las formas de realización anteriores, por lo cual la extensión C-terminal se escinde para dar insulina humana madura o un análogo de la misma.
25 [0057] En un aspecto, la invención se refiere a un método para preparar insulina humana madura o un análogo de la misma que comprende la coexpresión en una célula fúngica de:
i) una secuencia de ADN que codifica un precursor de insulina humana o un análogo de la misma que incluye 30 una extensión C-terminal de la cadena B y
ii) una secuencia de ADN que codifica una proforma de una carboxipeptidasa que incluye un sitio de escisión Kex2,
35 por lo cual la extensión C-terminal de la cadena B en la molécula precursora de insulina es escindida por la carboxipeptidasa coexpresada y activada en la célula fúngica, a partir de lo cual la insulina humana madura o un análogo de la misma es aislado del medio de cultivo.
[0058] La carboxipeptidasa puede ser cualquier carboxipeptidasa adecuada. No obstante, en una forma de realización
40 de la invención, la carboxipeptidasa es endógena de la célula fúngica huésped. En otra forma de realización, la carboxipeptidasa es CPY.
[0059] En una forma de realización del método, el precursor de insulina humana o un derivado análogo comprende la cadena B de insulina humana o un derivado análogo, la cadena A de insulina humana o un derivado análogo y un
45 péptido C que conecta la cadena B y la cadena A entre sí, donde el péptido C comprende al menos un sitio de escisión Kex2 y donde la cadena B comprende una extensión C-terminal que facilita una escisión Kex2 más eficaz del péptido C en la célula fúngica y que además es capaz de ser escindida con una carboxipeptidasa.
[0060] La secuencia de aminoácidos fijada al residuo de aminoácido C-terminal de la cadena B será relativamente corta
50 y tendrá típicamente de 1-4 o 1-3 residuos de aminoácidos o, en particular, 2 residuos de aminoácidos. Los residuos de aminoácidos en esta secuencia serán residuos de aminoácidos hidrofóbicos y se seleccionarán típicamente del grupo que consiste en Phe, Leu, Ile, Tyr, Trp, Val, Met y Ala.
[0061] Ejemplos no limitativos de la extensión C-terminal para la cadena B son Leu-Gly; Leu-Ala; Leu-Leu; Leu-Met y 55 Leu-Ile.
[0062] En una forma de realización de la invención, el péptido C en el precursor de insulina comprenderá un único sitio Kex2 unido directamente al residuo de aminoácido N-terminal en la cadena A para asegurar la escisión en esta posición.
60 [0063] En otra forma de realización de la invención, el péptido C comprenderá dos sitios de escisión Kex2 con una secuencia peptídica interpuesta entre los dos sitios Kex2. La longitud y la composición de aminoácidos de la secuencia peptídica entre los dos sitios Kex2 puede variar en tanto en cuanto ésta permita el pliegue del precursor de insulina monocatenario expresado y el establecimiento de los puentes disulfuro situados correctamente en la molécula precursora de insulina.
65 [0064] El tamaño del péptido C natural es de 35 residuos de aminoácidos. Así, en un aspecto de la presente invención, la secuencia peptídica entre los dos sitios Kex2 será de aproximadamente la misma longitud que el péptido C natural.
[0065] En una forma de realización, la secuencia peptídica entre los dos sitios Kex2 será 1-35, 1-34, 1-33, 1-31, 1-30, 15 29, 1-28, 1-27, 1-26, 1-25, 1-24, 1-23, 1-22, 1-21, 1-20, 1-19, 1-18, 1-17, 1-16, 1-15, 1-14, 1-13, 1-12, 1-11,1-10,1-9,1- 8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3 o 1-2 residuos de aminoácidos de largo.
[0066] En una forma de realización de la invención, el precursor de insulina humana tiene la secuencia de aminoácidos
donde B(1-30) es la cadena B de insulina humana o un derivado análogo, A(1-21) es la cadena A de insulina humana o un derivado análogo, X1 es una secuencia peptídica de 1-5 residuos de aminoácidos que facilitará una escisión de Kex2 más eficaz en la célula fúngica, X2 es un sitio de escisión Kex2, Z es una secuencia peptídica con de 1 a
15 aproximadamente 35 residuos de aminoácidos o un enlace peptídico, X3 es un sitio de escisión Kex2 o un enlace peptídico y X4 es un sitio de escisión de aminopeptidasa o un enlace peptídico.
[0067] En una forma de realización de la invención, X3 es un sitio de escisión Kex2, Z es una secuencia peptídica y X4 es una enlace peptídico.
20 [0068] En otra forma de realización de la invención, X3 y Z son enlaces peptídicos y X4 es un sitio de escisión de aminopeptidasa.
[0069] X1 es típicamente de 1-4 o de 1-3 residuos de aminoácidos de largo y en una forma de realización, X1 es una
25 secuencia peptídica de 2 residuos de aminoácidos. Los residuos de aminoácidos en X1 serán preferiblemente residuos de aminoácidos hidrofóbicos y se seleccionarán típicamente del grupo que consiste en Phe, Leu, Ile, Tyr, Trp, Val, Met y Ala.
[0070] En otra forma de realización, los residuos de aminoácidos en X1 se seleccionan del grupo que consiste en Phe, 30 Leu, Ile, Tyr, Trp, Val, Met, Ala, Asp y Gly.
[0071] En una forma de realización de la invención, X1 es Leu-Ala.
[0072] En otra forma de realización de la invención, X1 es Phe-Leu. 35 [0073] En otra forma de realización de la invención, X1 es Leu-Gly.
[0074] En otra forma de realización de la invención, X1 es Leu-Leu.
40 [0075] En otra forma de realización de la invención, X1 es Leu-Met.
[0076] En otra forma de realización de la invención X1 es Leu-Ile.
Breve descripción de los dibujos 45 [0077]
La figura 1 muestra el plásmido ESI42-33.
50 La figura 2 muestra el plásmido pRC1.
La figura 3 muestra el plásmido pSA160.
La figura 4 muestra un espectro de masa deconvolucionada de un sobrenadante de cultivo de 24 horas de una 55 cepa que alberga pSA160.
La masa 5763 corresponde a insulina completamente procesada A14E, B25H.
La figura 5 muestra un análisis esquemático de la escisión de un precursor de insulina con un sitio Kex2. 60 La figura 6 muestra la escisión de un precursor de insulina con un sitio Kex2 y un sitio de aminopeptidasa.
Y la figura 7 muestra la escisión de un precursor de insulina con dos sitios Kex2.
65 Descripción detallada de la invención
[0078] La carboxipeptidasa Y (CPY) se sintetiza en la levadura Saccharomyces cerevisiae como una proforma inactiva
(proCPY). Después de la translocación de la proteína en retículo endoplasmático (ER), se transporta a la vacuola. A su
llegada, se activa por eliminación del propéptido, un evento proteolítico iniciado por la proteinasa A. Dos situaciones
evitan la conversión eficaz de proCPY en CPY: 1) si el gen PEP4 (el gen que codifica la proteinasa A) se elimina o
inactiva, todas las CPY estarán en la proforma inactiva, 2) si PRC1 (el gen que codifica CPY) se sobreexpresa, se
segregará una cantidad significativa de proCPY al caldo de fermentación. Permanecerá en la proforma dado que la
proteinasa A está localizada en la vacuola y por lo tanto separada de la proCPY segregada. Para permitir la activación
eficaz de proCPY en estas situaciones, es necesaria una ruta de activación alternativa.
[0079] En la interfaz entre el propéptido y la CPY madura se encuentran motivos de secuencia que pueden ser
reconocidos por la proteinasa A, dando lugar así a la escisión específica. Tras la escisión, el propéptido se separa de la
CPY madura. En la presente invención, se han hecho varios mutantes en los que los residuos cercanos a la interfaz
entre el propéptido y la CPY madura se han mutado de manera que se ha insertado un sitio de escisión dibásico
reconocido por Kex2p. Esto garantiza la conversión de proCPY en CPY en el aparato de Golgi, donde está localizado
Kex2p. Esto elimina la necesidad de proteinasa A en la activación de CPY. Además, los genes mutados se han
sobreexpresado para permitir la secreción de cantidades significativas de CPY activa.
[0080] A continuación se muestra la secuencia de aminoácidos de la prosecuencia de la carboxipeptidasa CPY de tipo
salvaje, desde la posición 31 arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural de la enzima de tipo salvaje, y los
primeros 9 residuos de aminoácidos del extremo N-terminal de la enzima de tipo salvaje y las secuencias
correspondientes de los mutantes A-G, donde se ha insertado un sitio Kex2 (KR) en diferentes posiciones abajo o arriba
con respecto al residuo de aminoácido N-terminal. El sitio de escisión para escindir la prosecuencia se indica con una
flecha.
Tipo salvaje: KPKFPEAIKTKKDWDFVVKNDAIENYQLRVNtKIKDPKILG (SEC ID Nº: 1).
Mutante A: KPKFPEAIKTKKDWDFVVKNDAIENYQLRVNKIKRtDPKILG (SEC ID Nº: 2).
Mutante B: KPKFPEAIKTKKDWDFVVKNDAIENYQLRVLGKRtDPKILG (SEC ID Nº: 3).
Mutante C: LGKRIEFPEAIKTKKDWDFVVKNDAIENYQLRVNKIKDPKILG (SEC ID Nº: 4).
Mutante D: KPKFPEAIKTKRtDWDFVVKNDAIENYQLRVNKIKDPKILG (SEC ID Nº: 5).
Mutante e: KPKFPEAIKTKKDWDFVKRtNDAIENYQLRVNKIKDPKILG (SEC ID Nº: 6).
Mutante F: KPKFPEAIKTKKDWDFVVKLDKRtAIENYQLRVNKIKDPKILG (SEC ID Nº: 7).
Mutante G: KPKFPEAIKTKKDWDFVVKNDAIENYQLRVNKIKDPKRtGGILG (SEC ID Nº: 8).
[0081] El término "propéptido" o "prosecuencia", como se utiliza en este caso, se refiere a una secuencia polipeptídica
cuya función es facilitar el pliegue y el transporte del polipéptido expresado desde el retículo endoplasmático hasta su
destino final en la ruta secretora o extracelularmente. El propéptido además inhibe la actividad enzimática de la
carboxipeptidasa.
[0082] El término "proforma" se refiere al producto de fusión de la prosecuencia y la secuencia polipeptídica activa.
[0083] La carboxipeptidasa puede ser cualquier carboxipeptidasa que se pueda expresar en una célula fúngica y que
pueda ser activada por una enzima Kex2p endógena expresada por la célula fúngica.
[0084] Ejemplos representativos de carboxipeptidasas son la carboxipeptidasa A (EC 3.4.17.1), la carboxipeptidasa A2
(EC 3.4.17.15), la carboxipeptidasa B (EC 3.4.17.2), la carboxipeptidasa E (EC 3.4.17.10), la carboxipeptidasa M (EC
3.4.17.12), la carboxipeptidasa T (EC 3.4.17.18), la carboxipeptidasa U (EC 3.4.17.20) y la carboxipeptidasa Y (EC
3.4.16.5).
[0085] En una forma de realización de la invención, la carboxipeptidasa es CPY.
[0086] Si el sitio Kex2 introducido se une directamente al residuo de aminoácido N-terminal en la carboxipeptidasa, la
forma activada será la forma nativa de la carboxipeptidasa.
[0087] Si el sitio Kex2 no se une directamente al aminoácido N-terminal natural, la carboxipeptidasa liberada contendrá
una extensión N-terminal de longitud variable o carecerá de uno o más de los residuos de aminoácidos naturales en el
extremo N-terminal dependiendo de la posición del sitio Kex2.
[0088] La carboxipeptidasa activada puede utilizarse para procesar proteínas de fusión de cualquier tipo.
[0089] La carboxipeptidasa se puede expresar a partir de cualquier promotor adecuado, incluyendo su propio promotor.
No obstante, ha resultado que los niveles de carboxipeptidasa pueden ser demasiado altos, lo que lleva a
procesamiento aberrante del precursor de insulina. Para encontrar una proporción adecuada entre el precursor de
insulina y la carboxipeptidasa activa, el nivel de expresión de la carboxipeptidasa mutante se puede modular por
substitución del promotor propio de la carboxipeptidasa con promotores alternativos.
[0090] Si la carboxipeptidasa es la enzima de CPY, entonces los promotores alternativos adecuados son regiones
promotoras de los genes de CYC1, KEX2, MF(alfa)1 y MPD1.
[0091] Alternativamente, la cantidad de la proforma de la carboxipeptidasa se puede regular por modulación de su expresión desde su promotor mediante el cambio de la cantidad de factores de transcripción para el promotor en cuestión.
[0092] En una forma de realización de la invención, el promotor para la carboxipeptidasa es el promotor Kex2.
[0093] La coexpresión de la proforma modificada de la carboxipeptidasa y un precursor de insulina humana en una célula fúngica permitirá la secreción de insulina humana completamente procesada al caldo de fermentación, sin necesidad de más pasos de procesamiento costosos hacia abajo. El precursor de insulina humana expresado será, como el primer paso, procesado intracelularmente por las proteasas de Golgi Kex1p y Kex2p. El precursor de insulina humana comprende un péptido C que ha sido modificado por la adición de residuos de aminoácidos extra (X) al residuo de aminoácido C-terminal en la cadena B de insulina. Estos residuos de aminoácidos extra están diseñados para facilitar una escisión eficaz del péptido C de la cadena A y B de la molécula de insulina en la célula fúngica. El procesamiento completo por Kex1p y Kex2p produce una molécula precursora de insulina humana bicatenaria con la extensión X del extremo C-terminal de la cadena B. Los precursores tendrán la forma B-(X)n.....A, donde B es la cadena B de insulina humana, A es la cadena A de insulina humana y X son los residuos de aminoácidos extra y donde las cadenas A y B están enlazadas por dos puentes de disulfuro como en la insulina humana.
[0094] Esta insulina humana bicatenaria, C-terminalmente extendida, se convertirá luego en insulina humana madura o un derivado análogo por escisión mediante la carboxipeptidasa coexpresada y activada, que escindirá la extensión Cterminal de la cadena B para dar insulina humana madura bicatenaria o un derivado análogo, según el caso.
[0095] Dependiendo del residuo de aminoácido en la posición B30, la carboxipeptidasa también puede quitar el residuo de aminoácido B30, dando como resultado un análogo de insulina humana desB30. La carboxipeptidasa puede además quitar hasta 5 residuos de aminoácidos del extremo C-terminal de la cadena B, dando como resultado un análogo de insulina humana desB(29-30), desB(28-30), desB(27-30) o desB(26- 30).
[0096] Los diferentes modelos de procesamiento del precursor de insulina se ilustran esquemáticamente en las figura 5
7.
[0097] En la figura 5, el constructo del precursor de insulina tiene un sitio Kex2 único, KR, y una extensión C-terminal de la cadena B ilustrada por la secuencia XX en el péptido de conexión. El primer paso de procesamiento es la escisión en el sitio Kex2 por Kex2, que convierte la estructura monocatenaria en una estructura bicatenaria que tiene la secuencia XXKR fijada a la cadena B. Posteriormente, la enzima Kex1 escindirá la secuencia KR y finalmente la carboxipeptidasa escinde la extensión XX de la cadena B para dar un producto de insulina bicatenaria madura.
[0098] En la figura 6, se ilustra una forma de realización alternativa, donde el precursor de insulina tiene un sitio Kex2 único y un sitio de escisión de aminopeptidasa, YY, en el péptido de conexión. Como en la figura 5, Kex2p, Kex1p y la carboxipeptidasa eliminarán la secuencia XX-KR. No obstante, en esta forma de realización, una escisión de aminopeptidasa final elimina la secuencia YY para dar el producto de insulina bicatenaria madura.
[0099] En la forma de realización ilustrada en la figura 7, el precursor de insulina tiene dos sitios de escisión Kex2 conectados por una cadena peptídica Z. La primera escisión con Kex2 elimina la secuencia Z-KR, el Kex1 elimina la secuencia KR y finalmente la carboxipeptidasa elimina la secuencia XX.
[0100] La producción de altas cantidades de insulina humana madura o análogo de insulina desde la célula fúngica reducirá significativamente el número de pasos de purificación hacia abajo necesarios para producir un producto de insulina de una pureza suficientemente alta para fines farmacéuticos. Así, en el método para preparar insulina en la levadura descrito en la patente estadounidense nº: 4916212, un precursor de insulina se convierte en insulina humana en dos pasos, es decir, una transpeptidación para convertir el precursor de insulina de cadena única B(1-29)-Alal-AlaLys-A(1-21) en un éster de insulina humana y luego una hidrólisis del éster de insulina en insulina humana. Cada paso de conversión requerirá un paso de separación inicial y al menos un paso de purificación posterior. Así, al menos seis pasos adicionales son necesarios para producir la insulina madura, incluyendo al menos una conversión enzimática.
[0101] La solicitud de patente europea 0163529A, solicitudes de patente PCT nº: WO 95/02059 y WO 90/10075 revelan procesos para preparar insulina y análogos de insulina basados en la expresión de un precursor de la insulina o análogo de insulina en la levadura, que después de la recuperación inicial del caldo de fermentación son enzimáticamente convertidos en la insulina madura o análogo de insulina. Las moléculas precursoras comprenden determinados péptidos C modificados y pueden comprender además una extensión N-terminal de la cadena B de insulina. El péptido C modificado y la posible extensión N-terminal del péptido B están diseñados para no ser divididos en la célula de levadura y así los precursores se segregan como péptidos monocatenarios donde la cadena A y B están aún conectadas por el péptido C modificado pero con puentes de disulfuro correctamente situados. La insulina madura o producto análogo de insulina se obtiene luego por varios pasos enzimáticos in vitro posteriores para escindir el péptido C y posiblemente la extensión de N-terminal. Estos pasos enzimáticos duran mucho tiempo, son frecuentemente
costosos e introducen impurezas adicionales que posteriormente se deben eliminar en más pasos de proceso hacia abajo, tales como costosos pasos de cromatografía y similares.
[0102] Se sabe bien que ninguna escisión enzimática se produce hasta un 100% de escisión, dejando impurezas de impurezas no escindidas o parcialmente escindidas que tienen ser eficazmente eliminadas en el caso de los productos farmacéuticos. Así, cada paso de escisión estará seguido de al menos un paso de aislamiento o de purificación, típicamente una purificación cromatográfica por medios de cromatografía de intercambio, cromatografía de filtración en gel, cromatografía de afinidad o similares.
[0103] El material de columna cromatográfica para su uso a escala comercial es muy caro y, por lo tanto, la reducción del número de tales pasos cromatográficos tiene un impacto significativo en la economía de la producción. Una reducción de la conversión hacia abajo y un paso de purificación reducirán además la cantidad de trabajo y horas de mano de obra utilizadas en el proceso y así además mejora la economía de la producción.
[0104] En el presente proceso, donde la insulina madura o un derivado análogo se puede aislar directamente del caldo de cultivo, son necesarios muchos menos pasos de proceso hacia abajo para producir un producto de pureza suficiente para uso farmacéutico.
[0105] La molécula de insulina se puede modificar en la cadena A y/o B en tanto en cuanto tal modificación no tenga un efecto adverso en la actividad insulínica del análogo de insulina resultante.
[0106] Así, por "análogo de insulina", como se utiliza en este caso, se entiende un polipéptido que tiene una estructura molecular que formalmente se puede derivar de la estructura de una insulina de origen natural, por ejemplo la de insulina humana, por borrado y/o substitución en al menos un residuo de aminoácido que se produce en la insulina natural y/o por adición de al menos un residuo de aminoácido. Los residuos de aminoácidos añadidos y/o substituidos pueden ser bien residuos de aminoácidos codificables u otros residuos de aminoácidos de origen natural o residuos de aminoácidos puramente sintéticos.
[0107] Los análogos de insulina no comprenderán típicamente más de aproximadamente 7 mutaciones, más típicamente no más de 5 e incluso más típicamente como mucho 3 mutaciones, en comparación con la insulina humana.
[0108] A lo largo de los años, se ha descrito un número bastante importante de modificaciones de la cadena A y B de insulina. Así, la posición 28 de la cadena B se puede modificar a partir del residuo Pro natural a Asp, Lys, o Ile y Lys en la posición B29 también se puede modificar a Pro.
[0109] También, Asn en la posición A21 se puede modificar a Ala, Gln, Glu, Gly, His, Ile, Leu, Met, Ser, Thr, Trp, Tyr o Val, en particular a Gly, Ala, Ser o Thr y en particular a Gly. Además, Asn en la posición B3 se puede modificar a Lys o Asp. Otros ejemplos de análogos de insulina son insulina humana des(B30), análogos de insulina donde uno o ambos B1 y B2 se han eliminado; análogos de insulina donde la cadena A y/o la cadena B tienen una extensión N-terminal y análogos de insulina donde la cadena A y/o la cadena B tienen una extensión C-terminal. También, el residuo de aminoácido natural en la posición A18 se puede cambiar a un residuo de Gln o uno o más de los residuos de aminoácido en las posiciones B26-B30 se han eliminado.
[0110] Ejemplos de análogos de insulina que se pueden producir por el presente método son insulina humana GlyA21 , insulina humana GlyA21 des(B30), insulina humana desB1, insulina humana desB30, insulina humana AspB28 e insulina humana LysB28ProB29 .
[0111] Otros ejemplos de análogos de insulina son los análogos de insulina humana que contienen mutaciones en una o más de las posiciones A21, B10, A8, A14, B25, B27 y B1.
[0112] La célula fúngica puede ser cualquier célula fúngica puesto que todos los hongos tienen la actividad proteolítica necesaria para escindir moléculas precursoras de insulina del presente tipo para escindir el péptido de conexión y liberar una molécula bicatenaria. No obstante, a lo largo de los años, la levadura ha demostrado ser un tipo de célula eficaz para la expresión y secreción de péptidos pequeños del tamaño de la insulina. En particular, la levadura Saccharomyces cerevisiae ha demostrado ser útil.
[0113] Así, en una forma de realización de la invención, la célula fúngica es una célula de levadura y en otra forma de realización, la célula de levadura es Saccharomyces cerevisiae.
[0114] La secuencia de ADN usada en la presente invención puede ser de origen genómico o de ADNc, por ejemplo, se puede obtener mediante la preparación de una biblioteca genómica o de ADNc y seleccionar secuencias de ADN que codifiquen para todo o parte del polipéptido por hibridación, usando sondas de oligonucleótidos sintéticas conforme a técnicas estándar (véase, por ejemplo, Sambrook, J, Fritsch, EF and Maniatis, T, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 1989). La secuencia de ADN que codifica el precursor de insulina también se puede preparar sintéticamente por métodos estándar establecidos, por ejemplo, el método de fosfoamidita descrito por Beaucage y Caruthers, Tetrahedron Letters 22 (1981), 1859 - 1869, o el método descrito por
Matthes et al., EMBO Journal 3 (1984), 801 - 805. La secuencia de ADN también se puede preparar por reacción en cadena de polimerasa usando cebadores específicos, por ejemplo, tal y como se describe en la US 4 683 202 o Saiki et al., Science 239 (1988), 487 - 491.
[0115] La secuencia de ADN se puede insertar en cualquier vector que se pueda someter a procedimientos de ADN recombinante, y la elección del vector dependerá frecuentemente de la célula huésped en que se tiene que introducir. Así, el vector puede ser un vector de replicación autónoma, es decir, un vector que existe como una entidad extracromosómica, cuya replicación es independiente de la replicación cromosómica, por ejemplo, un plásmido. Alternativamente, el vector puede ser uno que, cuando se introduce en una célula huésped, se integre en el genoma de la célula huésped y se replique junto con el cromosoma o cromosomas en los que se ha integrado.
[0116] El vector es preferiblemente un vector de expresión en el que la secuencia de ADN que codifica el precursor de insulina está operativamente enlazado a segmentos adicionales necesarios para la transcripción del ADN, tal como un promotor. El promotor puede ser cualquier secuencia de ADN que muestre actividad transcripcional en la célula huésped de elección y se puede derivar a partir de genes que codifiquen proteínas, bien homólogas, bien heterólogas, de la célula huésped.
[0117] Ejemplos de promotores adecuados para su uso en las células huésped de levadura incluyen promotores de genes glicolíticos de levadura (Hitzeman et al., J. Biol. Chem. 255 (1980), 12073 - 12080; Alber and Kawasaki, J. Mol. Appl. Gen. 1 (1982), 419 - 434) o genes de alcohol deshidrogenasa (Young et al., en Genetic Engineering of Microorganisms for Chemicals (Hollaender et al, eds.), Plenum Press, New York, 1982) o los promotores TPI1 (US 4,599,311) o ADH2-4c (Russell et al., Nature 304 (1983), 652 - 654).
[0118] La secuencia de ADN que codifica el producto deseado también puede estar, si es necesario, operativamente conectado con un terminador adecuado, señales de poliadenilación, secuencias potenciadoras transcripcionales y secuencias potenciadoras traduccionales. El vector recombinante de la invención puede comprender además una secuencia de ADN que permita que el vector se replique en la célula huésped en cuestión.
[0119] Para dirigir la insulina en la ruta secretora de las células huésped, puede estar provista una secuencia señal secretora (también conocida como una secuencia líder, preprosecuencia o presecuencia) en el vector recombinante. La secuencia señal secretora se une a la secuencia de ADN que codifica el precursor de insulina en el marco de lectura correcto. Las secuencias señal secretoras están comúnmente situadas 5' para la secuencia de ADN que codifica el péptido. El péptido señal puede ser un péptido señal producido de forma natural, o una parte funcional del mismo, o puede ser un péptido sintético.
[0120] Para la secreción eficaz en la levadura, una secuencia que codifica un péptido líder también se puede insertar abajo de la secuencia de señal y arriba de la secuencia de ADN que codifica el producto deseado.
[0121] Métodos para transformar células de levadura con ADN heterólogo y producir polipéptidos heterólogos a partir de ellas se describen, por ejemplo, en la US 4 599 311, US 4 931 373, US 4 870 008, 5 037 743 y US 4 845 075. Las células transformadas son seleccionadas por un fenotipo determinado por un marcador seleccionable, comúnmente la resistencia al medicamento o la capacidad para crecer en ausencia de un nutriente particular, por ejemplo, leucina. Un vector preferido para su uso en la levadura es el vector POT1 descrito en la US 4 931 373.
[0122] El medio usado para cultivar las células en el proceso de fermentación puede ser cualquier medio convencional adecuado para el crecimiento de las células huésped, tal como medios mínimos o complejos que contienen suplementos apropiados. Los medios adecuados están disponibles de proveedores comerciales o se pueden preparar según las recetas publicadas (p. ej., en catálogos de la American Type Culture Collection). Así, el medio contendrá al menos una fuente de carbono, una o más fuentes de nitrógeno, sales esenciales, incluyendo sales de potasio, sodio, magnesio, fosfato, nitrato y sulfato, metales traza, vitaminas solubles en agua, ayudas de proceso, incluyendo, pero no limitado a, inhibidores de proteasa, estabilizadores, ligandos, agentes antiespumantes e inductores. El medio puede contener componentes que se precipiten o se dispersen parcialmente en el medio líquido en algunas condiciones de operación, incluyendo esterilización por calor. El medio se puede crear mediante la mezcla de diferentes líquidos y soluciones gaseosas. Estas soluciones se pueden mezclar antes de entrar en el tanque de fermentación o se suministran al tanque de fermentación como corrientes de líquido separadas, adicionadas en una proporción predefinida. La proporción entre diferentes soluciones de líquido de componentes de medio puede variar durante los diferentes estadios del proceso de fermentación, lo que significa que la composición total del medio puede variar durante el curso de la fermentación.
[0123] El péptido producido por las células se puede recuperar luego del medio de cultivo por procedimientos convencionales que incluyen la separación de las células huésped del medio por centrifugado o filtración, la precipitación de los componentes proteináceos del sobrenadante o filtrado mediante una sal, por ejemplo sulfato de amonio, purificación por una variedad de procedimientos cromatográficos, por ejemplo cromatografía de intercambio de iones, cromatografía de filtración en gel, cromatografía de afinidad, o similar, dependiendo del tipo de péptido en cuestión.
[0124] Después del aislamiento del caldo de cultivo, la insulina madura o el análogo de insulina se puede convertir en, por ejemplo, formas aciladas por acilación, en particular, del grupo £-amino del residuo B29Lys. Los métodos para la acilación de insulinas son bien conocidos en la técnica y se describen, por ejemplo, en las patentes EP 792 290 y 894 095 y en las patentes US 5 693 609, 5 646 242, 5 922 675, 5 750 497 y 6 011 007.
5 [0125] Ejemplos de insulinas aciladas son N£B29-tetradecanoil insulina humana des(B30), N£B29-litocoloil-y-glutamil
N£B29 £B29
insulina humana des(B30),-(Na-(HOOC(CH2)14CO)-y-Glu) insulina humana des(B30) o N-(Na(HOOC(CH2)16CO)-y-Glu) insulina humana des(B30).
10 [0126] Con "desB30" o "B(1-29)" se entiende una cadena B de insulina natural o un derivado análogo que carece del residuo de aminoácido B30.
[0127] B(1-30) se refiere a la cadena B natural de insulina humana y "A(1-21)" se refiere a la cadena A de insulina natural. Insulina humana A18Q es un análogo de insulina con un Gln en la posición A18 de la cadena A de insulina
15 humana. B10E, A8H, A14E es un análogo de insulina con un Glu en la posición B10, un His en la posición A8 y un Glu en la posición A14, respectivamente.
[0128] Con "B1", "A1", etc., se hace referencia al residuo de aminoácido en la posición 1 en la cadena B de insulina (contado desde el extremo N-terminal) y el residuo de aminoácido en la posición 1 en la cadena A de insulina (contado
20 desde el extremo N-terminal), respectivamente. El residuo de aminoácido en una posición específica también se puede denominar, por ejemplo, PheB1, que significa que el residuo de aminoácido en la posición B1 es un residuo de fenilalanina.
[0129] Con "péptido C" se hace referencia a la secuencia peptídica que conecta las cadenas de péptido B y A de la 25 molécula de insulina entre sí.
[0130] Con "insulina madura" se entiende una insulina bicatenaria con la composición de residuo de aminoácido correcta y la misma conformación estructural que la molécula de insulina humana natural, es decir, con puentes disulfuro entre CysA7 y CysB7y entre CysA20 y CysB19 y un puente disulfuro interno entre CysA6 y CysA11 y con actividad de
30 insulina. Así, una insulina madura según la presente invención sería la insulina humana. Un análogo de insulina humana madura puede ser insulina humana B28Asp, insulina humana desB30, insulina humana A14Glu, B25His e insulina humana B31Leu, B32Ala.
[0131] Por "derivado de insulina", como se utiliza en este caso, se entiende una insulina de origen natural o un análogo
35 de insulina que se ha modificado químicamente, por ejemplo por introducción de una cadena lateral en una o más posiciones de la estructura de insulina o por oxidación o reducción de los grupos de los residuos de aminoácidos en la insulina o por acilación de un grupo amino libre o un grupo hidroxi.
[0132] Con "Kex2" o "Kex2p" se entiende una endoproteasa tipo subtilisina que cataliza preferentemente la escisión
40 después de una secuencia de dos residuos básicos (lisina o arginina) (Rockwell, NC, Krysan, DJ, Komiyama, T & Fuller, RS 2002 Precursor Processing by Kex2/Furin Proteases. Chem. Rev. 102: 4525-4548).
[0133] Con "Kex1" o "Kex1p" se entiende una carboxipeptidasa de serina que cataliza preferentemente la eliminación de los residuos de lisilo y/o arginilo C-terminales (Shilton BH, Thomas DY, Cygler M 1997 Crystal structure of Kex1deltap, a
45 prohormone-processing carboxypeptidase from Saccharomyces cerevisiae. Biochemistry 36: 9002-9012).
Con CPY se entiende una carboxipeptidasa Y, una carboxipeptidasa que preferentemente cataliza la eliminación de residuos de aminoácidos C-terminales pesados o hidrofóbicos, tal como Phe y Leu (Remington, S.J. & Breddam, K. (1994) Carboxypeptidases C and D. Methods Enzymol. 244, 231-248). La secuencia de aminoácidos de CPY se
50 describe en "Valls et al., 1987, Cell, 48(5): 887-897".
[0134] Con "correctamente procesado" se hace referencia a una escisión enzimática en el punto de escisión deseado que da el producto deseado con la secuencia de residuos de aminoácidos correcta.
55 [0135] "Escisión eficaz" hace referencia a una escisión de al menos 80%, preferiblemente al menos 85% y más preferiblemente al menos 95%.
[0136] "POT" es el gen de triosa fosfato isomerasa de Schizosaccharomyces pombe y "TPI1" es el gen de triosa fosfato isomerasa de S. cerevisiae.
60 [0137] Por una "líder" se entiende una secuencia de aminoácidos que consiste en un prepéptido (el péptido señal) y un propéptido.
[0138] El término "péptido señal" se refiere a un prepéptido que está presente como una secuencia N-terminal en la 65 forma precursora de una proteína. La función del péptido señal es permitir que la proteína heteróloga facilite la
translocación en el retículo endoplasmático. El péptido señal normalmente se escinde en el curso de este proceso. El péptido señal puede ser heterólogo u homólogo del organismo huésped que produce la proteína.
[0139] Los péptidos señal útiles para las células huésped de levadura se obtienen a partir de los genes para a-factor de Saccharomyces cerevisiae e invertasa de Saccharomyces cerevisiae. Varios péptidos señal que se pueden usar con el constructo de ADN de la invención incluyen el péptido señal de proteasa aspártica 3 de levadura (Yps1) o cualquier análogo funcional (Egel- Mitani et al. (1990) YEAST 6:127-137 y US 5 726 038) y el a-factor señal del gen MFa1 (Thorner (1981) en The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces cerevisiae, Strathern et al., eds., pp 143-180, Cold Spring Harbor Laboratory, NY y US 4 870 008), el péptido señal de amilasa salival de ratón (véase O. Hagenbuchle et al., Nature 289, 1981, págs. 643-646), un péptido señal de carboxipeptidasa modificada (véase L.A. Valls et al., Cell 48, 1987, págs. 887-897) y el péptido señal BAR1 de levadura (véase la WO 87/02670).
[0140] La invención abarca un vector que es capaz de replicar en el microorganismo seleccionado o célula huésped y que lleva una secuencia polinucleótida que codifica los precursores de insulina de la invención. El vector recombinante puede ser un vector de replicación autónoma, es decir, un vector que existe como una entidad extracromosómica, cuya replicación es independiente de la replicación cromosómica, por ejemplo, un plásmido, un elemento extracromosómico, un minicromosoma o un cromosoma artificial. El vector puede contener cualquier medio para asegurar la autorreplicación. Alternativamente, el vector puede ser un vector que, cuando se introduce en la célula huésped, se integre en el genoma y se replique con el cromosoma o cromosomas en que los que se ha integrado. Además, se pueden utilizar un único vector o plásmido o dos o más vectores o plásmidos que juntos contienen el ADN total que se ha de introducir en el genoma de la célula huésped o un transposón. El vector puede ser plásmidos lineales o cerrados circulares y contendrá preferiblemente un elemento o elementos que permitan la integración estable del vector en el genoma de la célula huésped o la replicación autónoma del vector en la célula independiente del genoma.
[0141] En una forma de realización, el vector de expresión recombinante es capaz de replicar en levadura. Ejemplos de secuencias que permiten que el vector replique en la levadura son los genes de replicación REP 1-3 del plásmido de levadura 2 Im y el origen de replicación.
[0142] El vector también puede comprender un marcador seleccionable, por ejemplo, un gen cuyo producto complemente un defecto en la célula huésped o uno que confiera resistencia a un medicamento, por ejemplo, ampicilina, canamicina, tetraciclina, cloranfenicol, neomicina, higromicina o metotrexato.
[0143] Los marcadores adecuados para células huésped de levadura son ADE2, HIS3, LEU2, LYS2, MET3, TRP1 y URA3. Un marcador seleccionable preferido para levadura es el gen TPI de Schizosaccharomyces pompe (Russell (1985) Gene 40:125-130).
[0144] En un huésped de levadura, los promotores útiles son los promotores MFa1, TPI, ADH o PGK de Saccharomyces cerevisiae.
[0145] El constructo polinucleótido de la invención estará también típicamente conectado operativamente con un terminador adecuado. En la levadura, un terminador adecuado es el terminador TPI (Alber et al. (1982) J. Mol. Appl. Genet. 1:419-434).
[0146] Los procedimientos usados para enlazar las secuencias de ADN que codifican para el precursor de insulina, el promotor y opcionalmente el terminador y/o la secuencia señal secretora, respectivamente, y para insertarlas en vectores adecuados que contienen la información necesaria para la replicación, son bien conocidos por las personas expertas en la técnica (véase, por ejemplo, Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, New York, 1989).
[0147] Se entenderá que el vector se puede construir preparando primero un constructo de ADN que contiene la secuencia de ADN entera que codifica los precursores de insulina de la invención, y posteriormente insertando este fragmento en un vector de expresión adecuado, o insertando consecutivamente los fragmentos de ADN que contienen información genética para los elementos individuales seguido de ligamiento.
[0148] La célula huésped usada en la presente invención es una célula fúngica. "Hongos", como se utiliza en este caso, incluye los filos Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota y Zygomycota (como definen Hawkswort et al., en Ainsworth and Bisby's Dictionary of The Fungi, 8th edition, 1995, CAB International, University Press, Cambridge, Reino Unido) al igual que Oomycota (como se cita en Hawkswort et al., 1995, supra, página 171) y todos los hongos mitospóricos (Hawkswort et al., 1995, supra).
[0149] En una forma de realización, la célula huésped fúngica es una célula de levadura. "Levadura", como se utiliza en este caso, incluye levadura ascoesporógena (Endomycetales), levadura basidioesporogénea y la levadura perteneciente a los Fungi Imperfecti (Blastomicetos). Los levaduras ascoesporógenas se dividen en las familias Spermophthoraceae y Saccharomycetaceae. La última está compuesta por cuatro subfamilias, Schizosaccharomycoideae (p. ej., género Schizosaccharomyces), Nadsonioideae, Lipomycoideae y Saccharomycoideae (p. ej., los géneros Pichia, Kluyveromices y Saccharomyces). Las levaduras basidioesporogéneas incluyen los géneros Leucosporidim, Rhodosporidium,
Sporidiobolus, Filobasidium y Filobasidiella. Las levaduras de los Fungi Imperfecti se dividen en dos familias, Sporobolomycetaceae (p. ej., los géneros Sorobolomyces y Bullera) y Cryptococcaceae (p. ej., el género Candida). Dado que la clasificación de levadura puede cambiar en el futuro, para los fines de esta invención, la levadura debe definirse como se describe en Biology and Activities of Yeast (Skinner, F.A., Passmore, S.M., and Davenport, R.R., eds, Soc. App. Bacteriol. Symposium Series No. 9, 1980). La biología de la levadura y la manipulación de la genética de la levadura son bien conocidas en la técnica (véase, por ejemplo, Biochemistry and Genetics of Yeast, Bacil, M., Horecker, B.J., and Stopani, A.O.M., editors, 2nd edition, 1987; The Yeasts, Rose, A.H., and Harrison, J.S., editors, 2nd edition, 1987; and The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces, Strathern et al., editors, 1981).
[0150] La célula huésped de levadura se puede seleccionar de una célula de una de las especies de Candida, Kluyveromices, Saccharomyces, Schizosaccharomyces, Pichia, Hansenula, Yarrowia. En una forma de realización, la célula huésped de levadura es una Saccharomyces carlsbergensis, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces diastaticus, Saccharomyces douglasii, Saccharomyces kluyveri, Saccharomyces norbensis, Saccharomyces oviformis, Schizosaccharomyces pombe, Sacchoromyces uvarum, Pichia kluyveri, Yarrowia lipolytica, Candida utilis, Candida cacaoi y Geotrichum fermentans. Otras células huésped de levadura útiles son una Kluyveromyce lactis, Kluyveromyces fragilis, Hansenula polymorpha, Pichia pastoris, Yarrowia lipolytica, Schizosaccharomyces pombe, Ustilgo maylis, Candida maltose, Pichia guillermondii y Pichia methanoliol (véase, Gleeson et al., J. Gen. Microbiol. 132, 1986, págs. 3459-3465; US 4,882,279 y US 4,879,231).
[0151] La expresión "un aminoácido codificable" o "un residuo de aminoácido codificable" se utiliza para referirse a un aminoácido o un residuo de aminoácido que se puede codificar por un triplete ("codón") de nucleótidos.
[0152] En el presente contexto, las indicaciones de tres letras o de una sola letra de los aminoácidos se han usado en sus significado convencional. A menos que se indique explícitamente, los aminoácidos mencionados en la presente son L-aminoácidos. Además, los extremos izquierdo y derecho de una secuencia de aminoácidos de un péptido son, respectivamente, el N- y C-términos, a menos que se especifique de otro modo.
[0153] Todos los encabezados y subencabezados se usan en este caso sólo por conveniencia y no deberían interpretarse como limitativos de la invención de manera alguna.
[0154] El uso de cualquiera y de todos los ejemplos, o el lenguaje a modo de ejemplo (p. ej., "tal como") que se proporcionan en la presente, se destina meramente a iluminar mejor la invención y no plantea una limitación del ámbito de la invención, a menos que se reivindique de otro modo. Ningún lenguaje de la especificación debería interpretarse como indicador de cualquier elemento no reivindicado como esencial para la práctica de la invención.
[0155] La mención y la incorporación de documentos de patente se hace en la presente sólo por conveniencia y no refleja ningún enfoque de la validez, patentabilidad y/o ejecutabilidad de tales documentos de patente.
[0156] Esta invención incluye todas las modificaciones y equivalentes de la materia objeto nombrada en las reivindicaciones anexas, según lo permitido por la ley aplicable.
Ejemplos
Procedimientos generales
[0157] Todos los plásmidos de expresiones son del tipo C-POT, similares a los descritos en la EP 171 142. Son vectores de expresión basados en 2I, caracterizados por el hecho de que contienen el gen de triosa fosfato isomerasa de Schizosaccharomyces pombe (POT) para el propósito de la selección y estabilización del plásmido en S. cerevisiae. Los plásmidos también contienen el promotor y el terminador de triosa fosfato isomerasa de S. cerevisiae (Figura 1). Estas secuencias son similares a las secuencias correspondientes en el plásmido pKFN1003 (descrito en la WO 9010075) como son todas las secuencias excepto las siguientes: 1) la secuencia del fragmento EcoRI -Xbal que codifica la proteína de fusión de la líder y el producto de insulina y 2) una mutación silenciosa se ha introducido dando como resultado la eliminación de un sitio Ncol en la región 2I en el vector de expresión. Para facilitar la clonación de diferentes proteínas de fusión, la secuencia de ADN que codifica la pre-pro líder MFa1 se ha cambiado para incorporar un sitio Ncol (véase la figura 2) y se llama la pre-pro líder MFa1*. Así, el fragmento Ncol -Xbal se substituye simplemente por un fragmento Ncol -Xbal que codifica el constructo de insulina de interés. Tales fragmentos Ncol -Xbal se pueden sintetizar usando oligonucleótidos sintéticos y PCR según técnicas estándar. Además del líder alfa, se pueden usar otros líderes.
[0158] Se prepararon transformantes de levadura por transformación de la cepa de S. cerevisiae MT663 o ME1719 de cepas huéspedes. La cepa de levadura MT663 (MATa/MATD pep4-3/pep4-3 HIS4/his4 Ltpi::LEU2/Ltpi::LEU2 Cir') fue depositada en el Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen en conexión con el depósito de la WO 92I11378 y se le asignó el número de depósito DSM 6278. La cepa de S. cerevisiae ME1719 (MATa/D leu2/leu2 pep43/pep4-3 Ltpi::LEU2/Ltpi::LEU2 Lura3/Lura3 Lyps1::URA3 / Lyps1::ura3 Cir+) se describe en la WO 98/01535.
[0159] MT663 o ME1719 se cultivaron en YPGaL (1% de extracto de bacto-levadura, 2% de bacto-peptona, 2% de galactosa, 1% de lactato) para un O.D. en 600 nm de 0,6. Se cosecharon 100 ml de cultivo por centrifugado, se lavó con 10 ml de agua, se recentrifugó y se resuspendió en 10 ml de una solución que contenía 1,2 M de sorbitol, 25 mM de Na2EDTA pH = 8,0 y 6,7 mglml de ditiotreitol. La suspensión se incubó a 30°C durante 15 minutos, se centrifugó y las células se resuspendieron en 10 ml de una solución que contenía 1,2 M de sorbitol, 10 mM de Na2EDTA, 0,1 M de citrato sódico, pH 0 5,8, y 2 mg de NovozymC3234. La suspensión se incubó a 30°C durante 30 minutos, las células se recogieron por centrifugado, se lavaron en 10 ml de 1,2 M de sorbitol y 10 ml de CAS (1,2 M de sorbitol, 10 mM de CaCl2,10 mM de Tris HCl (Tris = Tris(hidroximeti1)-aminometano) pH = 7,5) y se resuspendieron en 2 ml de CAS. Para la transformación, 1 ml de células suspendidas en CAS se mezclaron con aprox. 0,1 mg de ADN plásmido y se dejaron a temperatura ambiente durante 15 minutos. 1 ml de (20% de polietilenglicol 4000,10 mM de CaCl2, 10 mM de Tris HCl, pH = 7,5) se añadió y se dejó la mezcla durante otros 30 minutos a temperatura ambiente. La mezcla se centrifugó y el granulado se resuspendió en 0,1 ml de SOS (1,2 M de sorbitol, 33% v/v de YPD, 6,7 mM de CaCl2) y se incubó a 30°C durante 2 horas. La suspensión se centrifugó después y el granulado se resuspendió en 0,5 ml de 1,2 M de sorbitol. Luego, se añadió 6 ml de agar superior (el medio SC de Sherman et al. (1982) Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory) que contenía 1,2 M de sorbitol más 2,5% de agar) a 52°C y la suspensión se vertió sobre las placas que contenían el mismo sorbitol solidificado en agar que contenía el medio.
Ejemplo 1
[0160] Construcción de un sistema de expresión de levadura para el precursor de insulina humana B(1-30)-LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)-(A1-21), insulina humana (A14E, B25H).
[0161] La figura 1 muestra un plásmido de levadura llamado pESI42-33. El plásmido contiene un cassette de expresión que incluye un fragmento EcoRI -XbaI insertado en el plásmido entre el promotor de transcripción y el terminador de transcripción del gen TPI de S. cerevisiae. En el plásmido pESI42-33, el fragmento EcoRI -XbaI codifica un producto de fusión compuesto por el pre-pro líder MFa1*, un sitio de escisión Lys-Arg para la endopeptidasa Kex2 de procesamiento dibásico y el precursor de insulina B(1-30)-LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)-(A1-21), insulina humana (A14E, B25H).
[0162] Un fragmento de ADN que contiene secuencias que codifican el precursor de insulina B(1-30)-LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)- (A1-21), insulina humana (A14E, B25H) se construyó usando oligonucleótidos sintéticos y amplificaciones de PCR estándar. El fragmento de PCR resultante se purificó, digirió con NcoI y XbaI y se ligó al fragmento de vector NcoI -XbaI del vector de expresión de tipo cPOT modificado (Figura 1).
[0163] El plásmido de expresión se propagó en E. coli, se cultivó en presencia de ampicilina y se aisló usando técnicas estándar (Sambrook et al., 1989). El ADN plásmido se controló para inserto por nucleasas de restricción apropiadas (p. ej., EcoRI, NcoI, XbaI) y mostró por el análisis de secuencias que contenía la secuencia apropiada del precursor de insulina humana B(1-30)-LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)-(A1-21), insulina humana (A14E, B25H).
[0164] El plásmido se transformó en la cepa MT663 de S. cerevisiae. Los transformantes de levadura que albergaban el plásmido se seleccionaron utilizando glucosa como fuente de carbono en placas de agar (2%) YPD (1% de extracto de levadura, 2% de peptona, 2% de glucosa).
Ejemplo 2
[0165] Construcción de un sistema de expresión de levadura para los mutantes de activación de CPY.
[0166] La figura 2 muestra un plásmido de levadura llamado pPRC1. El plásmido contiene un cassette de expresión que incluye un fragmento ClaI -NheI insertado en el plásmido entre el promotor de transcripción y el terminador de transcripción del gen TPI de S. cerevisiae. En el plásmido pPRC1, el fragmento ClaI-NheI codifica pre-pro-CPY de tipo salvaje. Todos los plásmidos mutantes de CPY son idénticos a pPRC1s salvo las mutaciones puntuales pertinentes hechas para introducción de motivos de escisión de Kex2 dibásicos.
[0167] Los fragmentos de ADN que contienen secuencias que codifican PRC1 mutado para inserción de sitios de escisión Kex2 se construyeron usando oligonucleótidos sintéticos, ADN de levadura genómico como modelo y amplificaciones de PCR estándar. Los fragmentos de PCR resultantes se purificaron, se digirieron con ClaI y NheI y se ligaron al fragmento de vector ClaI-NheI del vector de expresión de tipo cPOT modificado.
[0168] El plásmido de expresión se propagó en E. coli, se cultivó en presencia de ampicilina y se aisló usando técnicas estándar (Sambrook et al., 1989). El ADN plásmido se comprobó para inserto por nucleasas de restricción apropiadas y mediante el análisis de secuencias mostró que contenía la secuencia apropiada del PRC1.
[0169] El plásmido se transformó en la cepa MT663 de S. cerevisiae. Los transformantes de levadura que albergaban el plásmido se seleccionaron utilizando glucosa como fuente de carbono en placas de agar (2%) YPD (1% de extracto de levadura, 2% de peptona, 2% de glucosa).
Ejemplo 3
[0170] Construcción de un sistema de levadura para coexpresión del precursor de insulina B(1-30)-LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)-(A1-21), insulina humana (A14E, B25H) y unos mutantes de activación de CPY.
5 [0171] La figura 3 muestra un plásmido de levadura llamado pSA160. El plásmido contiene un cassette de expresión que incluye un fragmento EcoRI-XbaI insertado en el plásmido entre el promotor de transcripción y el terminador de transcripción del gen TPI de S. cerevisiae. En el plásmido pSA160, el fragmento EcoRI -XbaI codifica un producto de fusión compuesto por el pre-pro líder MFa1*, un sitio de escisión Lys-Arg para la endopeptidasa de procesamiento dibásico Kex2 y el precursor de insulina B(1-30)- LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)-(A1-21), insulina humana (A14E, B25H).
10 El plásmido también contiene un cassette de expresión que codifica el mutante de CPY "F", que comprende un fragmento KpnI -SacI insertado en el plásmido entre después del promotor de transcripción del gen PRC1 de S. cerevisiae.
[0172] El cassette de insulina se subclonó en un vector de expresión de tipo cPOT adecuado. Posteriormente, el
15 promotor PRC1 se amplificó por PCR utilizando ADN de levadura genómico como modelo y se clonó en el plásmido anterior como un fragmento SalI -KpnI. Finalmente, el ADN que codifica el mutante de CPY más el terminador se amplificó usando PCR y se clonó en el plásmido.
[0173] El plásmido de expresión se propagó en E. coli, se cultivó en presencia de ampicilina y se aisló usando técnicas
20 estándar (Sambrook et al., 1989). El ADN plásmido se comprobó para inserto por nucleasas de restricción apropiadas y mediante análisis de secuencias mostró que contenía la secuencia apropiada del marco de lectura abierto PRC1.
[0174] El plásmido se transformó en la cepa MT663 de S. cerevisiae. Los transformantes de levadura que albergaban el plásmido se seleccionaron utilizando glucosa como fuente de carbono en placas de agar (2%) YPD (1% de extracto de
25 levadura, 2% de peptona, 2% de glucosa).
Ejemplo 4
[0175] Se construyeron varios mutantes de CPY. Los plásmidos se transformaron en la levadura y se llevaron a cabo
30 fermentaciones de lote a escala de laboratorio por cultivo en unos medios definidos durante 72 horas a 30°C. El caldo de fermentación se evaluó para actividad de CPY usando el sustrato sintético N-(3-[2-Furil]acriloil)-Phe-Phe. Usando este sustrato, la actividad de CPY se puede seguir espectrofotométricamente como un cambio en la absorbancia a 337nm. Mediante la correlación de la actividad con la actividad de una CPY estándar con concentración conocida, se puede estimar la concentración en el sobrenadante. Basado en estos ensayos, se estimó que los 9 mutantes están
35 presentes en una concentración de 0-2,3 mg/L.
- Mutante
- Concentración de CPY activa (mg/L)
- A
- 0,21
- B
- 0,41
- C
- 0.30
- D
- 0,13
- E
- 0,85
- F
- 2,25
- G
- 0,02
[0176] Para examinar el grado de procesamiento, los sobrenadantes de fermentación fueron sometidos a análisis de transferencia Western, evaluando con anticuerpos de CPY. La proporción entre CPY no procesada (proCPY) y CPY 40 procesada se estimó a partir de la transferencia. Ésta mostró hasta 080 % de conversión en CPY madura en el mejor de los mutantes.
Ejemplo 5
45 [0177] El plásmido pSA160 para coexpresión del precursor de insulina humana (B(1-30)-LARRDLGKR(SEC ID Nº: 9)(A1-21), insulina humana (A14E, B25H) y el mutante de activación de CPY "F" se transformó en la levadura y se llevaron a cabo fermentaciones de lote a escala de laboratorio por cultivo en unos medios definidos a 30°C. El caldo de fermentación se analizó por LC-MS después de 24 horas de cultivo de especies de insulina. Esto mostró que >90% de las especies de insulina segregadas eran análogos de insulina humana A14E, B25H completamente procesados. La
50 figura 4 demuestra la eliminación exitosa de la extensión LA del C-terminal de la cadena B de insulina por la CPY activa segregada.
Ejemplo 6
55 [0178] La fermentación continua de una cepa de levadura que alberga el plásmido de coexpresión descrito en el ejemplo 3 mostró que los niveles de CPY fueron demasiado altos, lo que llevó a procesamiento aberrante del precursor de insulina humana. Para encontrar una proporción adecuada entre el precursor de insulina humana y la CPY activa, el nivel de expresión del mutante de CPY se moduló por substitución del promotor PRC1 con promotores alternativos.
[0179] Las regiones promotoras de los genes de CYC1, KEX2, MF(alfa)1 y MPD1 se amplificaron por PCR y se clonaron
5 en los sitios SalI -KpnI del plásmido de coexpresión descrito en ejemplo 3, dando como resultado un intercambio de la secuencia promotora PRC1 por las secuencias promotoras alternativas CYC1, KEX2, MF(alfa)1 y MPD1, respectivamente. Los plásmidos resultantes se transformaron en la cepa MT663 de S. cerevisiae. Los transformantes de levadura que albergaban el plásmido se seleccionaron utilizando glucosa como fuente de carbono en placas de agar(2%) YPD (1% de extracto de levadura, 2% de peptona, 2% de glucosa).
Ejemplo 7
[0180] Se llevaron a cabo fermentaciones de lote a escala de laboratorio con las muevas cepas de levadura que albergaban los plásmidos descritos en el ejemplo 6. Las cepas se cultivaron en medios definidos a 30°C. Después de 72
15 horas, la concentración de CPY activa en el caldo de fermentación se determinó por medición de la actividad usando un sustrato cromogénico, FA-Phe-Phe. Los resultados muestran un amplio rango de niveles de expresión.
- Promotor
- Concentración de CPY con respect al promotor PRC1 (%)
- CYC1
- 0,3
- KEX2
- 0,9
- MF(alfa)1
- 0,07
- MPD1
- 4,3
- PRC1
- 100
Ejemplo 8
20 [0181] Las fermentaciones continuas se realizaron con las cepas de levadura que albergaban los plásmidos de coexpresión para la coexpresión del precursor de insulina humana B(1-30)-LARRDLGKR (SEC ID Nº: 9)-(A1-21), insulina humana (A14E, B25H) y unos mutantes de activación de CPY descritos en el ejemplo 6. El promotor KEX2 dio niveles de expresión de CPY que dieron lugar a un porcentaje muy bajo de insulina humana A14, B25 procesada de
25 forma aberrante.
- Promotor
- % de insulin correctamente procesda
- PRC1
- 80
- KEX2
- 95
Listado de secuencias 30 [0182]
<110> Novo Nordisk A/S Nørgaard, Per
<120> Método para preparar carboxipeptidasas activadas 35
<130> 7493.204-WO
<160> 9 40 <170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 40
<212> PRT 45 <213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 1
<210> 2
<211> 41
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 2
- 10
- <210> 3
- <211> 40
- <212> PRT
- <213> Saccharomyces cerevisiae
- 15
- <400> 3
- <210>
- 4 20 <211> 42
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<210> 5
<211> 40
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 5
- <210>
- 6 10 <211> 40
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 6
- <210>
- 8 25 <211> 43
- 15
- <210> 7
- <211> 42
- <212> PRT
- <213> Saccharomyces cerevisiae
- 20
- <400> 7
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 8
<210> 9
<211> 9
5 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> Péptido C 10
<400> 9
Claims (12)
- REIVINDICACIONES1. Método para preparar una carboxipeptidasa activada en una célula fúngica, donde una secuencia de ADN que codifica una proforma modificada de la carboxipeptidasa, que incluye un sitio de escisión Kex2 insertado en una5 posición de 0 a aproximadamente 30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la carboxipeptidasa de tipo salvaje, se expresa bajo condiciones adecuadas para la expresión de la proforma modificada de la carboxipeptidasa, a partir de lo cual la prosecuencia se escinde en la célula para liberar la forma activa libre de la carboxipeptidasa.10 2. Método según la reivindicación 1, que comprende además un paso de aislamiento de la forma activa de la carboxipeptidasa de la célula fúngica.
- 3. Método según la reivindicación 1 o 2, donde la célula fúngica tiene un gen PEP4 no funcional (el gen que codifica laproteinasa A). 15
-
- 4.
- Método según la reivindicación 1-3, donde la carboxipeptidasa es endógena de la célula fúngica huésped.
-
- 5.
- Método según la reivindicación 1, donde el sitio de escisión Kex2 se inserta en la prosecuencia a una distancia de 1 a
aproximadamente 30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la forma de tipo 20 salvaje de la carboxipeptidasa. - 6. Método según la reivindicación 1, donde el sitio de escisión Kex2 se inserta en la prosecuencia a una distancia de 520, 5-15 o 5-10 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal natural en la forma de tipo salvaje de la carboxipeptidasa.
- 7. Método según la reivindicación 1, donde el sitio de escisión Kex2 se inserta en una posición de 2-20, 2-15 o 2-10 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido N-terminal de la enzima de carboxipeptidasa de tipo salvaje.
- 8. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1-7, donde la carboxipeptidasa es CPY. 30
- 9. Método para preparar insulina humana madura o un derivado análogo, dicho método comprende la coexpresión en una célula fúngica de:i) una secuencia de ADN que codifica un precursor de insulina humana o un derivado análogo que comprende35 una extensión C-terminal de la cadena B y ii) un ADN que codifica una proforma de una carboxipeptidasa que incluye un sitio de escisión Kex2 insertado en una posición de 1 a aproximadamente 30 residuos de aminoácidos arriba del residuo de aminoácido Nterminal natural en la carboxipeptidasa de tipo salvaje,40 por lo cual, la extensión C-terminal de la cadena B de la molécula del precursor de insulina humana se escinde en la célula fúngica mediante la carboxipeptidasa coexpresada y activada y, a partir de lo cual, la insulina humana madura o un derivado análogo se aísla del medio de cultivo.
- 10. Método según la reivindicación 9, donde la molécula del precursor de insulina humana comprende la cadena B de45 insulina humana o un derivado análogo, la cadena A de insulina humana o un derivado análogo y un péptido C que enlaza la cadena B y la cadena A entre sí, donde el péptido C comprende al menos un sitio de escisión Kex2 y la cadena B comprende una extensión C-terminal que facilita una escisión Kex2 más eficaz del péptido C en la célula fúngica.50 11. Método según la reivindicación 9-10, donde la extensión C-terminal de la cadena B tiene hasta 4 residuos de aminoácidos.
- 12. Método según la reivindicación 11, donde la extensión C-terminal de la cadena B se selecciona del grupo queconsiste en Leu-Ala, Phe-Leu, Leu-Gly, Leu-Leu, Leu-Met y Leu-Ile. 55
- 13. Método según la reivindicación 9-12, donde la proforma de la carboxipeptidasa se expresa bajo regulación de un promotor diferente de su propio promotor.
- 14. Método según la reivindicación 13, donde la carboxipeptidasa es la enzima CPY de la levadura y el promotor es el 60 promotor Kex2.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP06124576 | 2006-11-22 | ||
| EP06124576 | 2006-11-22 | ||
| PCT/EP2007/062629 WO2008062010A2 (en) | 2006-11-22 | 2007-11-21 | Method for making activated carboxypeptidases |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2425413T3 true ES2425413T3 (es) | 2013-10-15 |
Family
ID=39322494
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES07847255T Active ES2425413T3 (es) | 2006-11-22 | 2007-11-21 | Método para preparar carboxipeptidasa activada |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8153395B2 (es) |
| EP (1) | EP2084179B1 (es) |
| JP (2) | JP5404411B2 (es) |
| ES (1) | ES2425413T3 (es) |
| WO (1) | WO2008062010A2 (es) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1917363B1 (en) * | 2005-08-16 | 2011-06-22 | Novo Nordisk A/S | Method for making mature insulin polypeptides |
| ES2464282T3 (es) * | 2006-09-27 | 2014-06-02 | Novo Nordisk A/S | Método para preparar polipéptidos de insulina madura |
| CA2788074C (en) * | 2010-01-25 | 2016-07-12 | Allergan, Inc. | Methods of intracellular conversion of single-chain proteins into their di-chain form |
| CA3071419A1 (en) | 2017-07-28 | 2019-01-31 | The Trustees Of Princeton University | Fusion tags for recombinant protein expression |
| CN112680371A (zh) * | 2019-10-18 | 2021-04-20 | 广东利世康低碳科技有限公司 | 一种水解餐厨垃圾中蛋白成分的产朊假丝酵母双基因共表达菌株及其构建方法 |
| WO2022094146A1 (en) * | 2020-10-28 | 2022-05-05 | The Trustees Of Princeton University | Methods of converting precursor proteins to mature proteins using kex2 proteases |
| CN117363641B (zh) * | 2023-10-11 | 2024-06-25 | 广东省卓肽医药有限公司 | 一种重组双碱性内肽酶和羧肽酶b的融合表达方法 |
Family Cites Families (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4914026A (en) | 1983-04-07 | 1990-04-03 | Chiron Corporation | Alpha factor leader sequence directed secretion of insulin |
| DK58285D0 (da) | 1984-05-30 | 1985-02-08 | Novo Industri As | Peptider samt fremstilling og anvendelse deraf |
| DK105489D0 (da) | 1989-03-03 | 1989-03-03 | Novo Nordisk As | Polypeptid |
| US6348327B1 (en) | 1991-12-06 | 2002-02-19 | Genentech, Inc. | Non-endocrine animal host cells capable of expressing variant proinsulin and processing the same to form active, mature insulin and methods of culturing such cells |
| DK82893D0 (da) | 1993-07-08 | 1993-07-08 | Novo Nordisk As | Peptid |
| ZA954983B (en) | 1994-06-17 | 1996-02-14 | Novo Nordisk As | N-terminally extended proteins expressed in yeast |
| GB9513967D0 (en) | 1995-07-08 | 1995-09-06 | Univ Leicester | Insulin |
| DE19915938A1 (de) * | 1999-04-09 | 2000-10-19 | Aventis Pharma Gmbh | Herstellung von pankreatischer Procarboxypeptidase B, Isoformen und Muteinen davon und ihre Verwendung |
| EP1917363B1 (en) | 2005-08-16 | 2011-06-22 | Novo Nordisk A/S | Method for making mature insulin polypeptides |
| FR2894987B1 (fr) | 2005-12-15 | 2008-03-14 | Ascometal Sa | Acier a ressorts, et procede de fabrication d'un ressort utilisant cet acier, et ressort realise en un tel acier |
| ES2464282T3 (es) | 2006-09-27 | 2014-06-02 | Novo Nordisk A/S | Método para preparar polipéptidos de insulina madura |
-
2007
- 2007-11-21 WO PCT/EP2007/062629 patent/WO2008062010A2/en not_active Ceased
- 2007-11-21 US US12/312,663 patent/US8153395B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-11-21 JP JP2009537629A patent/JP5404411B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-11-21 EP EP07847255.2A patent/EP2084179B1/en not_active Not-in-force
- 2007-11-21 ES ES07847255T patent/ES2425413T3/es active Active
-
2013
- 2013-08-21 JP JP2013171068A patent/JP2013255513A/ja not_active Withdrawn
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2010509929A (ja) | 2010-04-02 |
| JP2013255513A (ja) | 2013-12-26 |
| EP2084179B1 (en) | 2013-05-22 |
| EP2084179A2 (en) | 2009-08-05 |
| WO2008062010A3 (en) | 2008-07-31 |
| WO2008062010A2 (en) | 2008-05-29 |
| US8153395B2 (en) | 2012-04-10 |
| US20100173357A1 (en) | 2010-07-08 |
| JP5404411B2 (ja) | 2014-01-29 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| ES2464282T3 (es) | Método para preparar polipéptidos de insulina madura | |
| ES2425413T3 (es) | Método para preparar carboxipeptidasa activada | |
| US20060264606A1 (en) | Processes for making acylated insulin | |
| US20160115216A1 (en) | Method for Making Mature Insulin Polypeptides | |
| JP2013208119A (ja) | 成熟インスリンポリペプチドの作製方法 | |
| ES2700547T3 (es) | Variantes del pro-péptido del factor de apareamiento alfa | |
| US6861237B2 (en) | Production of heterologous polypeptides in yeast | |
| US6337194B1 (en) | Method for the preparation of insulin by cleavage of a fusion protein and fusion proteins containing insulin A and B chains | |
| US7572884B2 (en) | Method for making acylated polypeptides | |
| ES2260917T3 (es) | Metodo de fabricacion de proteinas en celulas de levadura transformadas. | |
| WO2003010185A2 (en) | Method for making acylated polypeptides | |
| CZ20015A3 (cs) | Rekombinantní exprimovaný kvasinkový vektor, způsob jeho získávání a transformovaná kvasinková buňka |