ES2297889T3 - Derivados de hormona de crecimiento y proteinas relacionadas. - Google Patents
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Abstract
Una variante con cisteína de la hormona de crecimiento (ID. SEC. NO: 1), en la que dicha variante comprende las cuatro cisteínas nativas C53, C165, C182 y C189, y en la que dicha variante comprende un residuo de cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo que consta de: un aminoácido localizado en el extremo del terminal N del lazo A-B, que corresponde a los aminoácidos 34-52 de la ID. SEC. NO: 1, un aminoácido localizado en el lazo B-C, un aminoácido localizado en el lazo C-D, un aminoácido localizado en los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice A, un aminoácido localizado en los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice B, un aminoácido localizado en los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice C, un aminoácido localizado en los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice D, un aminoácido localizado en los aminoácidos que preceden a la hélice A, y un aminoácido localizado en los aminoácidos que siguen a la hélice D; en la que dicha variante posee la capacidad de provocar in vitro la proliferación de una línea celular que prolifera en respuesta a la hormona del crecimiento.
Description
Derivados de la hormona de crecimiento y
proteínas relacionadas.
La presente invención se refiere a proteínas
terapéuticas producidas mediante ingeniería genética. De modo más
específico, las proteínas producidas mediante ingeniería genética
incluyen la hormona de crecimiento y proteínas relacionadas.
Las siguientes proteínas son codificadas por
genes que pertenecen a la superfamilia génica de la hormona de
crecimiento (GH por sus siglas en inglés) (Bazan (1990); Mott y
Campbell (1995); Silvennoinen y Ihle (1996)): hormona de
crecimiento, prolactina, lactógeno placentario, eritropoyetina
(EPO), trombopoyetina (TPO), interleucina-2
(IL-2), IL-3, IL-4,
IL-5, IL-6, IL-7,
IL-9, IL-10, IL-11,
IL-12 (subunidad p53), IL-13,
IL-15, oncostatina M, factor neurotrófico ciliar,
factor inhibitorio de leucemia, interferón alfa, interferón beta,
interferón gamma, interferón omega, interferón tau, factor
estimulador de colonias de granulocitos (G-CSF),
factor estimulador de colonias de granulocitos macrófagos
(GM-CSF), factor estimulador de colonias de
macrófagos (M-CSF), y
cardiotrofina-1 (CT-1) ("la
superfamilia génica de la GH"). Se anticipa que se identificarán
miembros adicionales de esta familia génica en el futuro, mediante
la clonación y la secuenciación de genes. Los miembros de la
superfamilia génica de la GH poseen estructuras secundarias y
terciarias similares, a pesar del hecho de que, por lo general,
poseen limitada identidad de secuencia aminoacídica o de ADN. Las
características estructurales compartidas permiten que los nuevos
miembros de la familia génica puedan identificarse fácilmente.
Existe considerable interés de parte de los
pacientes y los proveedores de servicios de salud por el desarrollo
de terapéuticas proteicas "amigables para el usuario" de acción
a largo plazo. Las proteínas son costosas de fabricar y, a
diferencia de los fármacos convencionales de moléculas pequeñas, el
organismo no las absorbe fácilmente. Además, se digieren al ser
tomadas por vía oral. Por tanto, las proteínas naturales deben
administrarse por vía inyectable. Luego de la inyección, la mayoría
de las proteínas se eliminan rápidamente del organismo, con la
necesidad de inyecciones frecuentes, muchas veces, diarias. A los
pacientes les desagradan las inyecciones, lo que tiene como
consecuencia una reducida eficacia de la droga y una reducida
satisfacción. Algunas proteínas, tales como la eritropoyetina
(EPO), son efectivas cuando se administran con menos frecuencia
(tres veces por semana para la EPO) porque se encuentran
glicosiladas. Sin embargo, las proteínas glicosiladas se producen
empleando sistemas de expresión de células de mamíferos que resultan
costosos.
El lapso de tiempo que una proteína inyectada
permanece en el organismo es finito y se encuentra determinado
mediante, p. e., el tamaño de la proteína y si la proteína contiene
o no modificaciones covalentes, tales como glicosilación. Las
concentraciones circulantes de las proteínas inyectadas cambian
constantemente, frecuentemente, en varios órdenes de magnitud, en
el transcurso de un período de 24 horas. Concentraciones de
agonistas proteicos con cambios constantes pueden tener
consecuencias dramáticas en puntos más adelantados de la cadena, a
veces pueden disminuir la estimulación y otras incrementar la
estimulación de las células blanco. Los antagonistas proteicos
poseen problemas similares. Estas fluctuaciones pueden conducir a
una disminución de la eficacia y un incremento de la frecuencia de
los efectos colaterales adversos de las terapéuticas proteicas. La
remoción rápida de las proteínas recombinantes del organismo
incrementa de modo significativo la cantidad de proteínas
requeridas por paciente e incrementa de manera dramática el costo
del tratamiento. Se espera que el costo de los fármacos proteicos
humanos se incremente de manera dramática en los próximos años, a
medida que se aprueben fármacos nuevos y existentes para más
prescripciones a enfermedades.
Por tanto, existe la necesidad de desarrollar
tecnologías de liberación de proteínas que disminuyan los costos de
la terapéutica proteica para los pacientes y los proveedores de
servicios de salud. La presente invención proporciona una solución
a este problema, al proporcionar métodos que prolongan los tiempos
de vida media de circulación en el organismo de la terapéutica
proteica, de manera que las proteínas no deban ser inyectadas
frecuentemente. Esta solución también satisface las necesidades y
deseos de los pacientes de que la terapéutica proteica sea
"amigable para el usuario" o sea, una terapéutica proteica que
no requiera inyecciones frecuentes. La presente invención soluciona
éstos y otros problemas, al proporcionar variantes de miembros de la
superfamilia génica de la hormona de crecimiento que poseen una
cisteína añadida y que son biológicamente activos. La invención
también proporciona la modificación química de estas variantes con
polímeros reactivos a cisteína u otros tipos de restos reactivos a
cisteína, para producir derivados de las mismas, y las moléculas así
producidas.
El primer aspecto de la invención proporciona
variantes con cisteína de la hormona de crecimiento (ID. SEC. NO:1)
que posee la capacidad de provocar la proliferación in vitro
de una línea celular que prolifera en respuesta a la hormona de
crecimiento. Las variantes constan de las cuatro cisteínas nativas
C53, C165, C182 y C189 y consta también de un residuo de cisteína
que sustituye a un aminoácido que se selecciona a partir del grupo
que consta de: un aminoácido localizado en el extremo del terminal N
del lazo A-B que corresponde a los aminoácidos
34-52 de la ID. SEC. NO:1, un aminoácido localizado
en el lazo B-C, un aminoácido localizado en el lazo
C-D, un aminoácido localizado entre los primeros
tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice A, un aminoácido
localizado entre los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de
la hélice B, un aminoácido localizado entre los primeros tres o los
últimos tres aminoácidos de la hélice C, un aminoácido localizado
entre los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice
D, un aminoácido localizado entre los aminoácidos que anteceden a
la hélice A, y un aminoácido localizado entre los aminoácidos que
siguen a la hélice D.
De preferencia, la variante de cisteína consta
de un residuo de cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado
del grupo que consta de: F1, T3, P5, E33, A34, K38, E39, Q40, S43,
Q46, N47, P48, Q49, T50, S51, A98, N99, S100, G104, A105, S106,
E129, D130, G131, S132, P133, T135, G136, Q137, K140, Q141, T142,
S144, K145, D147, T148, N149, S150, H151, N152, D153, S184, E186,
G187, S188, y G190.
La variante de cisteína puede ser una en que la
cisteína sustituida se modifica con un resto reactivo a la
cisteína. La variante de cisteína puede modificarse mediante
polietilenglicol (PEG), por ejemplo, mediante la modificación del
residuo de cisteína sustituido con PEG.
Un segundo aspecto de la invención proporciona
una variante de cisteína del primer aspecto de la invención para su
empleo en la medicina.
Un tercer aspecto de la invención proporciona el
empleo de la variante de cisteína del primer aspecto de la
invención en la fabricación de un medicamento para la estimulación
del metabolismo del hueso, el cartílago o el músculo, la
estimulación del crecimiento somático durante la infancia, el
tratamiento de la estatura pequeña que es resultado de una
inadecuación de la hormona de crecimiento y el fallo renal en niños,
o el tratamiento de la caquexia en pacientes de SIDA o la caquexia
asociada a otras enfermedades.
De manera similar, la presente solicitud muestra
variantes de cisteína de miembros de la superfamilia génica. Las
variantes constan de un residuo de cisteína que remplaza a un
aminoácido no esencial de las proteínas. De preferencia, las
variantes constan de un residuo de cisteína que sustituye a un
aminoácido seleccionado a partir de los aminoácidos en las regiones
de los lazos, el final de las hélices alfa, en posición próxima a
la primera hélice anfipática, y en posición distal a la última
hélice anfipática, o donde el residuo de cisteína se añade hacia el
Terminal N o el Terminal C de las proteínas. Los sitios preferidos
para la sustitución son los sitios de glicosilación N- y O-
ligados.
También se presentan variantes de cisteína en
las que el aminoácido que se sustituye se encuentra en los lazos
A-B, B-C, el lazo
C-D o el lazo D-E de los miembros de
tipo interferón/similares al interferón 10 de la superfamilia
génica de la GH.
También se presentan variantes de cisteína de
miembros de la superfamilia génica de la GH, en los que el residuo
de cisteína se introduce entre dos aminoácidos en la proteína
natural. En particular, el residuo de cisteína se introduce en las
regiones de lazo, los extremos de las hélices alfa, próxima con
respecto a la primera hélice anfipática o distal con respecto a la
última hélice anfipática. Incluso con mayor particularidad, la
variante de cisteína se introduce entre dos aminoácidos en un sitio
de glicosilación N-O-, o adyacente a un aminoácido
en un sitio de glicosilación N- u O-.
Con mayor particularidad, se presentan variantes
de cisteínas en las que la región de lazo en la que se introduce la
cisteína es el lazo A-B, el lazo
B-C, el lazo C-D o el lazo
D-E de los miembros de tipo interferón/similares al
interferón 10 de la superfamilia génica de la GH.
Dichas sustituciones de cisteínas o mutaciones
de inserción pueden incluir también la inserción de uno o más
aminoácidos adicionales en los extremos amino terminal o carboxilo
terminal de la sustitución o inserción de cisteína.
Otros ejemplos de variantes de cisteína incluyen
las variantes de la eritropoyetina. Las variantes de la
eritropoyetina incluyen aquellas en las que el aminoácido
sustituido se encuentra en el lazo A-B, el lazo
B-C, el lazo C-D, los aminoácidos
próximos a la hélice A y distal a la hélice D y los extremos N- o
Terminal C. Con mayor especificidad aún, las variantes de cisteína
de la EPO incluyen moléculas en las que los aminoácidos indicados a
continuación poseen una cisteína que los sustituye:
serina-126, N24, I25, T26, N38, I39, T40, N83, S84,
A1, P2, P3, R4, D8, S9, T27, G28, A30, E31, H32, S34, N36, D43,
T44, K45, N47, A50, K52, E55, G57, Q58, G77, Q78, A79, Q86, W88,
E89, T107, R110, A111, G113, A114, Q115, K116, E117, A118, S120,
P121, P122, D123, A124, A125, A127, A128, T132, K154, T157, G158,
E159, A160, T163, G164, D165, R166 y S85.
Los miembros de la superfamilia génica de la GH
incluyen la hormona de crecimiento, la prolactina, el lactógeno
placentario, la eritropoyetina, la trombopoyetina, la
interleucina-2, la interleucina-3,
la interleucina-4, la
interleucina-5, la interleucina-6,
la interleucina-7, la
interleucina-9, la interleucina-10,
la interleucina-11, la
interleucina-12 (subunidad p53), la
interleucina-13, la interleucina-15,
la oncostatina M, el factor neurotrófico ciliar, el factor
inhibidor de leucemia, el interferón alfa, el interferón beta, el
interferón gamma, el interferón omega, el interferón tau, el factor
estimulador de colonias de granulocitos, el factor estimulador de
colonias de granulocitos macrófagos, el factor estimulador de
colonias de macrófagos, la cardiotrofina-1 y otras
proteínas identificadas y clasificadas como miembros de la familia.
Las proteínas pueden obtenerse a partir de cualquier especie
animal, incluyendo humanos, animales de compañía y animales de
granjas.
\newpage
Otras variaciones y modificaciones a la
invención resultarán obvias a los expertos en la técnica, sobre la
base de la especificación y las "reglas" presentadas más
adelante en el presente documento. Todas éstas se consideran como
parte de la invención.
La presente invención se refiere a variantes de
cisteína y, entre otras cosas, la conjugación específica al sitio
de dichas proteínas con polietilenglicol (PEG) u otras unidades de
este tipo. El PEG es un polímero no antigénico, inerte que prolonga
de manera significativa el período de tiempo que una proteína se
encuentra circulando en el organismo. Esto permite que la proteína
sea efectiva por un período de tiempo más prolongado. La
modificación covalente de proteínas con PEG ha demostrado ser un
método útil para extender la vida media en circulación de las
proteínas en el organismo (Abuchowski et al., 1984;
Hershfield, 1987; Meyers et al., 1991). La unión covalente
del PEG a una proteína incrementa el tamaño efectivo de la proteína
y reduce su velocidad de aclaración del organismo. Los PEGs se
encuentran disponibles de forma comercial en diferentes tamaños, lo
que permite ajustar a la medida la vida media circulante de las
proteínas modificadas con PEG para prescripciones individuales
mediante el uso de PEGs de diferentes tamaños. Otros beneficios de
la modificación con PEG incluyen un incremento de la solubilidad de
la proteína, un incremento de la estabilidad de la proteína in
vivo y una disminución de la inmunogenicidad de la proteína
(Katre et al., 1987; Katre, 1990).
El método preferido para la
PEG-ilación de las proteínas es la unión covalente
de PEG a residuos de cisteína, empleando PEGs reactivos a cisteína.
Una variedad de PEGs reactivos a cisteína de elevada especificidad
con diferentes grupos reactivos (p.e., maleímida, vinilsulfonato) y
PEGs de distintos tamaños (2-20 kDa) se encuentran
disponibles comercialmente (p.e., por parte de Shearwater, Polymers,
Inc., Hunstville, AL). A pH neutro, estos reactivos de PEG se unen
de manera selectiva a residuos de cisteína "libres", o sea,
residuos de cisteína que no se encuentran involucrados en enlaces
disulfuro. Los conjugados son estables a la hidrólisis. El empleo
de PEGs reactivos a cisteína permite el desarrollo de conjugados
homogéneos PEG-proteína, de estructura definida.
Se ha producido un progreso considerable en años
recientes en la determinación de las estructuras de proteínas
terapéuticas de importancia comercial y en la comprensión de cómo
interactúan con sus blancos proteicos, p.e., receptores de la
superficie celular, proteasas, etc. Esta información estructural
puede emplearse para diseñar conjugados
PEG-proteína empleando PEGs reactivos a cisteína.
Los residuos de cisteína en la mayoría de las proteínas participan
en enlaces disulfuro y no se encuentran disponibles para la
PEG-ilación empleando PEGs reactivos a cisteína.
Mediante mutagénesis in vitro empleando técnicas de ADN
recombinante, se pueden introducir residuos adicionales de cisteína
en cualquier lugar de la proteína. Las cisteínas añadidas pueden
introducirse al inicio de la proteína, al final de la proteína,
entre dos aminoácidos de la secuencia proteica o, de preferencia,
sustituir a un aminoácido existente en la secuencia proteica. Las
cisteínas "libres" recién añadidas pueden servir como sitios
para la unión específica de una molécula de PEG empleando PEGs
reactivos a cisteína. La cisteína añadida debe exponerse en la
superficie de la proteína y ser accesible para la
PEG-ilación para que este método resulte exitoso.
Si el sitio empleado para introducir un sitio de cisteína añadido no
es esencial para la actividad biológica, entonces la proteína
PEG-ilada mostrará una bioactividad in vitro
que será esencialmente la del tipo salvaje (normal). El mayor reto
técnico en la PEG-ilación de las proteínas con PEGs
reactivos a cisteína es la identificación de regiones expuestas a la
superficie, no esenciales, en la proteína blanco, a donde puedan
añadirse los residuos de cisteína, o remplazar aminoácidos
existentes, sin pérdida de bioactividad.
Se han descrito variantes con cisteínas añadidas
de unas pocas proteínas humanas, y conjugados
polímero-PEG de estas proteínas. La patente US
5.206.344 describe variantes de IL-2 con cisteína
añadida. Estas variantes de cisteínas añadidas se localizan dentro
de los primeros 20 aminoácidos a partir del amino terminal de la
cadena polipeptídica de la IL-2 madura. La variante
de cisteína preferida se encuentra en la posición 3 de la cadena
polipeptídica madura, que corresponde a un residuo de treonina que
se encuentra glicosilado por O en la proteína natural. El reemplazo
de la treonina por una cisteína en la posición 3 produce una
variante de IL-2 que puede ser
PEG-ilada con un PEG reactivo a cisteína, y mantener
bioactividad in vitro total (Goodson y Katre, 1990). Por el
contrario, la IL-2 PEG-ilada con
PEGs reactivos a lisina muestra una bioactividad in vitro
reducida (Goodson y Katre, 1990). Los efectos de las sustituciones
de cisteína en otras posiciones de la IL-2 no se
han reportado.
La patente US 5.166.322 muestra variantes de
IL-3 con cisteína añadida. Estas variantes se
localizan dentro de los primeros 14 aminoácidos a partir del
Terminal N de la secuencia proteica madura. La patente muestra la
expresión de las proteínas en bacterias y la modificación covalente
de las proteínas con los PEGs reactivos a cisteína. No se
proporciona información acerca de si las variantes de
IL-3 con cisteína añadida y conjugados de PEG son
biológicamente activos. No se han reportado variantes con cisteína
añadida en otras posiciones de la cadena polipeptídica.
La solicitud de patente mundial WO9412219 y la
solicitud PCT US95/06540 muestran variantes con cisteína añadida
del factor de crecimiento semejante a la insulina I
(IGF-I). El IGF-I posee una
estructura muy diferente a la de la GH y no es miembro de la
superfamilia génica de la GH (Mott y Campbell, 1995). Se han
descrito sustituciones de cisteína en muchas posiciones de la
proteína IGF-I. Solo algunas de las variantes con
cisteína añadida poseen actividad biológica. El sitio preferido
para la variante con cisteína añadida es el aminoácido en la
posición 69 en la cadena proteica madura. Las sustituciones de
cisteína en posiciones cercanas al Terminal N de la proteína
(residuos 1-3) producen variantes de
IGF-I con actividades biológicas reducidas y enlaces
disulfuro inadecuados.
La solicitud de patente WO9422466 muestra dos
variantes con cisteína añadida de la proteína 1 de unión al factor
de crecimiento semejante a la insulina (IGF), que posee una
estructura muy diferente a la de la GH y no es miembro de la
superfamilia génica de la GH. Las dos variantes mostradas con
cisteína añadida de la proteína 1 de unión a IGF se localizan en
las posiciones 98 a 101 en la cadena de la proteína madura y se
corresponden con residuos de serina que se fosforilan en la proteína
natural.
La solicitud de patente US 07/822296 muestra
variantes con cisteína añadida de la proteína de unión al factor de
necrosis tumoral, que es una forma soluble, truncada del receptor
celular del factor de necrosis tumoral. La proteína de unión al
factor de necrosis tumoral posee una estructura muy diferente a la
de la GH y no es miembro de la superfamilia génica de la GH.
El IGF-I, la proteína de unión 1
al IGF, y la proteína de unión al factor de necrosis tumoral poseen
estructuras secundaria y terciaria que son muy diferentes a las de
la GH y dichas proteínas no son miembros de la superfamilia génica
de la GH. Debido a esto, resulta difícil utilizar la información
obtenida a partir de estudios del IGF-I, la
proteína 1 de unión al IGF y la proteína de unión al factor de
necrosis tumoral para crear variantes con cisteína añadida de
miembros de la superfamilia génica de la GH. Los estudios con
IL-2 e IL-3 se llevaron a cabo
antes de que se conocieran las estructuras de la
IL-2 y la IL-3 (McKay, 1992; Bazan,
1992) y antes de que se conociera que dichas proteínas son miembros
de la superfamilia génica de la GH. Los experimentos previos
encaminados a la identificación de sitios preferidos para la adición
de residuos de cisteína a la IL-2 y la
IL-3 fueron en gran medida empíricos y se llevaron a
cabo con anterioridad a los experimentos que indicaban que los
miembros de la superfamilia génica de la GH poseían estructuras
secundaria y terciaria similares.
Sobre la base de la información estructural que
se encuentra disponible en la actualidad acerca de miembros de la
superfamilia génica de la GH, la presente invención proporciona
"reglas" para la determinación a priori de cuáles regiones y
residuos de aminoácidos de los miembros de la superfamilia génica de
la GH pueden emplearse para introducir o sustituir residuos de
cisteína sin provocar una pérdida significativa de actividad
biológica. Por el contrario de lo que sucede con proteínas
naturales, estas variantes con cisteína añadida de miembros de la
superfamilia génica de la GH poseerán propiedades novedosas, tales
como la capacidad de ser covalentemente modificadas en sitios
definidos dentro de la cadena polipeptídica con polímeros reactivos
a cisteína, u otros tipos de restos reactivos a cisteína. Las
proteínas modificadas covalentemente serán biológicamente
activas.
La GH es el miembro mejor estudiado de la
superfamilia génica de la GH. La GH es una proteína de 22 kDa,
secretada por la glándula pituitaria. La GH estimula el metabolismo
del hueso, el cartílago y el músculo, y es la hormona más
importante para la estimulación del crecimiento somático durante la
infancia. La GH humana recombinante (rhGH) se emplea para el
tratamiento de la estatura pequeña que se da como consecuencia de la
inadecuación de la GH y el fallo renal en niños. La GH no está
glicosilada, y puede producirse en forma totalmente activa en
bacterias. La proteína posee una vida media corta in vivo y
debe administrarse por medio de inyecciones subcutáneas diarias
para una máxima efectividad (MacGillivray et al., 1996). La
GH humana recombinante (rhGH) se aprobó recientemente para el
tratamiento de la caquexia en pacientes de SIDA y se encuentra bajo
estudio para el tratamiento de la caquexia asociada a otras
enfermedades.
La secuencia de la GH humana es bien conocida
(ver, p.e., Martial et al. 1979; Goeddel et al. 1979
que se incorporan como referencia en el presente documento; ID. SEC.
NO: 1). La GH está muy relacionada, en secuencia, con la prolactina
y el lactógeno placentario y estas tres proteínas se consideraron,
originalmente, como miembros de una pequeña familia génica. La
secuencia primaria de la GH se encuentra altamente conservada entre
especies animales (Abdel-Meguid et al.,
1987), lo que es consistente con la amplia reactividad cruzada
entre especies de la proteína. El patrón de plegamiento
tridimensional de la GH porcina se ha resuelto mediante
cristalografía de rayos X (Abdel-Meguid et
al., 1987). La proteína posee una estructura globular compacta,
que comprende cuatro tramos de hélices alfa anfipáticas unidas por
lazos. La GH humana posee una estructura similar (de Vos et
al., 1992). Las cuatro regiones de hélice alfa se denominan
A-D, comenzando a partir del Terminal N de la
proteína. Las regiones de lazos se denominan según las regiones de
hélice alfa que unen, p.e., el lazo A-B une los
tramos de hélice alfa A y B. Los lazos A-B y
C-D son largos, mientras que el B-C
es corto. La GH comprende cuatro residuos de cisteína, todos los
cuales participan en enlaces disulfuro. Las asignaciones de los
enlaces disulfuro son la cisteína 53 unida a la cisteína 165 y la
cisteína 182 unida a la cisteína 189.
La estructura cristalina de la GH unida a su
receptor revela que la GH posee dos sitios de unión al receptor y
se une a dos moléculas receptoras (Cunningham et al., 1991;
de Vos et al., 1992). Los dos sitios de unión al receptor se
denominan sitio I y sitio II. El sitio I contiene el extremo
carboxilo (C)-terminal de la hélice D y partes de
la hélice A y del lazo A-B, mientras que el sitio II
contiene la región amino (N)-terminal de la hélice
A y una porción de la hélice C. La unión de la GH a su receptor
ocurre de manear secuencial, con el sitio I uniéndose primero
siempre. Luego el sitio II se une a un segundo receptor de GH, lo
que provoca la dimerización y activación de las vías de
señalización intracelulares que conducen a las respuestas celulares
a la GH. Una muteína de GH en la que se ha mutado el sitio II (una
mutación de glicina a arginina en el aminoácido 120) es capaz de
unir un único receptor de GH, pero es incapaz de dimerizar los
receptores de GH; esta muteína actúa como un antagonista de la GH
in vitro, presumiblemente mediante la ocupación de los sitios
del receptor de la GH sin la activación de las vías de señalización
intracelulares (Fuh et al., 1992).
\newpage
También se han estudiado los roles de las
regiones y aminoácidos específicos involucrados en la unión al
receptor de la GH y la señalización intracelular, empleando
técnicas tales como la mutagénesis, los anticuerpos monoclonales y
la digestión proteolítica. Los primeros experimentos de mutagénesis
involucraron el reemplazo de dominios enteros de la GH por regiones
similares de la proteína muy similar prolactina (Cunningham et
al., 1989). Un hallazgo fue que el reemplazo del lazo
B-C de la GH por el de la prolactina no afectaba la
unión de la proteína GH híbrida a una forma soluble del receptor de
la GH, lo que implicaba que el lazo B-C no era
esencial para la unión al receptor. La mutagénesis de barrido de
alanita (reemplazo de aminoácidos individuales por alanina)
identificó 14 aminoácidos que eran esenciales para la bioactividad
de la GH (Cunningham y Wells, 1989). Estos aminoácidos se
encuentran localizados en las hélices A, B, C y D, y en el lazo
A-B y corresponden a los sitios I y II
identificados a partir de estudios estructurales. Se determinó que
dos residuos de lisina, en las posiciones aminoácidicas 41 y 172,
K41 y K172, eran componentes esenciales del sitios I de unión al
receptor, lo que explica la disminución de la bioactividad que se
observa cuando se acetila K172 (Teh y Chapman, 1988). La
modificación de K168 también disminuyó de manera significativa la
unión del receptor de la GH y la bioactividad (de la Llosa et
al., 1985; Martal et al., 1985; Teh y Chapman, 1988). Las
regiones de la GH responsables de la unión al receptor de la GH
también se han estudiado empleando anticuerpos monoclonales
(Cunningham et al., 1989). Se generó una serie de ocho
anticuerpos monoclonales contra la GH humana y se analizó su
capacidad de neutralizar la actividad de la GH e impedir la unión de
la GH a su receptor recombinante soluble. Los últimos estudios
permitieron la localización del supuesto sitio de unión de cada
anticuerpo monoclonal dentro de la estructura tridimensional de la
GH. De interés resultó que los anticuerpos monoclonales 1 y 8
resultaron incapaces de desplazar a la GH de la unión a su receptor.
Los sitios de unión de estos anticuerpos monoclonales se
localizaban en el lazo B-C (monoclonal número 1) y
el extremo del terminal N del lazo A-B (monoclonal
número 8). No se estudiaron monoclonales que se unieran
específicamente al lazo C-D. Los estudios de
anticuerpos monoclonales sugieren que el lazo B-C y
el extremo del terminal N del lazo A-B no son
esenciales para la unión al receptor. Finalmente, se encontró que
la digestión limitada de la GH con tripsina producía un derivado de
dos cadenas que mantenía inalterada su actividad (Mills et
al., 1980; Li, 1982). Los estudios de mapeo indicaron que la
tripsina cortaba y/o eliminaba aminoácidos entre las posiciones 134
y 149, lo que corresponde al lazo C-D. Estos
estudios sugieren que el lazo C-D no está
involucrado en la unión al receptor o la bioactividad de la GH.
Se ha determinado la estructura de cierto número
de citoquinas, incluyendo G-CSF (Hill et al.,
1993), GM-CSF (Diederichs et al., 1991;
Walter et al., 1992), IL-2 (Bazan, 1992;
McKay, 1992), IL-4 (Redfield et al., 1991;
Powers et al., 1992), e IL-5 (Milburn et
al., 1993) mediante difracción de rayos-X y
estudios de RMN, y muestran una conservación asombrosa con la
estructura de la GH, a pesar de una carencia de homología
significativa en la secuencia primaria. La EPO se considera un
miembro de esta familia, sobre la base de estudios de modelación y
mutagénesis (Boissel et al., 1993; Wen et al., 1994).
A esta familia pertenecen una gran cantidad de otras citoquinas y
factores de crecimiento, incluyendo el factor ciliar neurotrófico
(CNTF), el factor inhibidor de leucemia (LIF), la trombopoyetina
(TPO), la oncostatina M, el factor estimulador de colonias de
macrófagos (M-CSF), la IL-3, la
IL-6, la IL-7, la
IL-9, la IL-12, la
IL-13, la IL-15, y el interferón
alfa, beta, omega, tau y gamma (revisado por Mott y Campbell, 1995;
Silvennoinen y Ihle 1996). Todas las citoquinas y factores de
crecimiento anteriores se considera que constituyen una única gran
familia, de la cual la GH es el prototipo.
Además de compartir estructuras secundaria y
terciaria similares, los miembros de esta familia comparten la
propiedad de que deben oligomerizar los receptores de la superficie
celular para activar las vías de señalización intracelulares.
Algunos miembros de la familia de la GH, p.e., la GH y la EPO se
unen a un único tipo de receptor y provocan la formación de
homodímeros. Otros miembros de la familia, p.e., la
IL-2, la IL-4, y la
IL-6, se unen a más de un tipo de receptor y
provocan que estos receptores formen heterodímeros o agregados de
orden superior (Davis et al., 1993; Paonessa et al.,
1995; Mott y Campbell, 1995).
Los estudios de mutagénesis han mostrado que, al
igual que la GH, estas otras citoquinas y factores de crecimiento
contienen múltiples sitios de unión al receptor, por lo regular dos,
y se unen a sus receptores de manera secuencial (Mott y Campbell,
1995; Matthews et al., 1996). Al igual que la GH, los sitios
primarios de unión al receptor para estos otros miembros de la
familia, se encuentran de manera primaria en las cuatro hélices
alfa y el lazo A-B (revisado en Mott y Campbell,
1995). Los aminoácidos específicos en los tramos de hélices que
participan en la unión al receptor son diferentes entre los miembros
de la familia (Mott y Campbell, 1995). La mayoría de los receptores
de la superficie celular que interactúan con miembros de la
superfamilia génica de la GH están relacionados estructuralmente y
contienen una segunda gran familia multigénica (Bazan, 1990; Mott y
Campbell, 1995; Silvennoinen y Ihle 1996).
Una conclusión general alcanzada a partir de
estudios de mutación de varios miembros de la superfamilia génica
de la GH es que los lazos que unen las hélices alfa tienden a no
estar involucrados en la unión al receptor. En particular, el lazo
corto B-C aparentemente no resulta esencial para la
unión al receptor en la mayoría, si no todos, los miembros de la
familia. Por esta razón, el lazo B-C es una región
preferencial para la introducción de sustituciones de cisteínas en
miembros de la superfamilia génica de la GH. El lazo
A-B, el lazo B-C, el lazo
C-D (y el lazo D-E de los miembros
de la superfamila génica de la GH de tipo interferón/similares a la
IL-10) también son sitios preferenciales para la
introducción de mutaciones de cisteína. Los aminoácidos situados
cerca de la hélice A y distal a la hélice final también tienden a no
estar involucrados en la unión al receptor y también son sitios
preferenciales para la introducción de las mutaciones de cisteína.
Ciertos miembros de la familia de la GH, p.e., EPO,
IL-2, IL-3, IL-4,
IL-6, G-CSF, GM-CSF,
TPO, IL-10, IL-12 p35,
IL-13, IL-15 y el interferón beta
contienen azúcares Ligados por N u Ligados por O. Los sitios de
glicosilación en la proteína se encuentran casi exclusivamente en
las regiones de los lazos y no en los tramos de hélices alfa. Dado
que las regiones de los lazos en general no están involucradas en
la unión al receptor y dado que son sitios para la unión covalente
de grupos azúcares, son sitios preferidos para la introducción de
sustituciones de cisteína en las proteínas. Los aminoácidos que
contienen los sitios de glicosilación Ligados por N y Ligados por O
en las proteínas son sitios preferenciales para la sustitución con
cisteínas, porque estos aminoácidos se encuentran expuestos a la
superficie, la proteína natural puede tolerar grupos azúcares
voluminosos unidos a las proteínas en estos sitios y los sitios de
glicosilación tienden a estar alejados de los sitios de unión al
receptor.
Es muy probable que se descubran muchos otros
miembros de la familia génica de la GH en el futuro. Los nuevos
miembros de la superfamilia génica de la GH pueden identificarse por
medio de análisis de estructura secundaria y terciaria asistidos
por computadora, a partir de las secuencias proteicas predichas. Los
miembros de la superfamilia génica de la GH poseerán cuatro o cinco
hélices anfipáticas unidas por aminoácidos no helicoidales (las
regiones de lazos). Las proteínas pueden contener una secuencia
señal hidrófoba en su terminal N, que promueva la secreción de la
célula.
En este documento se presentan "reglas"
para la creación de variantes biológicamente activas, con cisteínas
añadidas, de miembros de la superfamilia génica de la GH. Estas
"reglas" pueden aplicarse a cualquier miembro existente o
futuro de la superfamilia génica de la GH. Las variantes con
cisteínas añadidas poseerán propiedades novedosas que no comparten
las proteínas naturales. Lo más importante: las variantes con
cisteínas añadidas poseerán la propiedad de que pueden ser
covalentemente modificadas con polímeros reactivos a cisteína u
otros tipos de restos reactivos a cisteína para generar proteínas
biológicamente activas con propiedades mejoradas, tales como vida
media in vivo incrementada, solubilidad incrementada y
eficacia mejorada in vivo.
Las variantes biológicamente activas, con
cisteínas añadidas de miembros de la superfamilia génica de la GH
pueden prepararse mediante la sustitución de residuos de aminoácidos
no esenciales de las proteínas por residuos de cisteína. De
preferencia, los residuos de cisteína sustituyen a aminoácidos
comprendidos dentro de las regiones de los lazos, a aminoácidos
cercanos a los extremos de las hélices alfa y a los aminoácidos
próximos a la primera hélice anfipática o distal a la hélice
anfipática final de estas proteínas. Otros sitios preferenciales
para la adición de residuos de cisteína son los extremos terminal N
y terminal C de las proteínas. Los residuos de cisteína también
pueden introducirse entre dos aminoácidos en las regiones expuestas
de la cadena polipeptídica. Se muestra en este documento que los
sitios de glicosilación ligados por N y ligados por O en las
proteínas constituyen sitios preferenciales para la introducción de
sustituciones de cisteína, ya sea mediante la sustitución de
aminoácidos que formen los sitios o, en el caso de sitios ligados
por N, mediante la introducción de cisteínas en los mismos. Los
sitios de glicosilación pueden ser residuos de serina o treonina que
se encuentran glicosilados por O, o residuos de asparagina que se
encuentran glicosilados por N. Los sitios de glicosilación ligados
por N poseen la estructura general
asparagina-X-serina o treonina
(N-X-S/T), donde X puede ser
cualquier aminoácido. El residuo de asparagina, el aminoácido en la
posición X y el residuo de serina/treonina del sitio de
glicosilación ligado por N son sitios preferenciales para la
creación de variantes de estas proteínas biológicamente activas con
sustituciones de cisteína. Los aminoácidos que rodean
inmediatamente, o que se encuentran adyacentes a, los sitios de
glicosilación ligados por O y ligados por N (en el intervalo de
aproximadamente 10 residuos a cada lado del sitios de
glicosilación) son sitios preferidos para la introducción de
sustituciones de cisteína.
Con mayor generalidad, algunas de las
"reglas" para la identificación de sitios preferenciales para
la creación de variantes proteicas biológicamente activas con
cisteínas añadidas, pueden aplicarse a cualquier proteína, no solo
a proteínas que sean miembros de la superfamilia génica de la GH.
Específicamente, los sitios preferenciales para la creación de
variantes de cisteína biológicamente activas de las proteínas
(diferentes a la IL-2) son los sitios de
glicosilación ligados por O. Los aminoácidos que rodean
inmediatamente al sitio de glicosilación ligado por O (dentro de
alrededor de 10 residuos a cada lado del sitio de glicosilación)
también son sitios preferidos. Los sitios de glicosilación ligados
por N, y los residuos de aminoácidos que se encuentran
inmediatamente adyacentes a cada lado del sitio de glicosilación
(dentro de aproximadamente 10 residuos del sitio
N-X-S/T) también son sitios
preferenciales para la creación de variantes proteicas con cisteínas
añadidas. Dichos aminoácidos no esenciales pueden identificarse por
medio de mutagénesis de barrido de cisteína sobre la proteína blanco
y la medición de los efectos sobre la actividad biológica. La
mutagénesis de barrido de cisteína involucra la adición o
sustitución de aminoácidos individuales de la cadena polipeptídica
por residuos de cisteína y la determinación de los efectos de la
sustitución de cisteína sobre la actividad biológica. La mutagénesis
de barrido de cisteína es similar a la mutagénesis de barrido de
alanina (Cunningham et al., 1992), excepto por el hecho de
que los aminoácidos individuales se sustituyen por residuos de
cisteína, en lugar de alanina.
La aplicación de las "reglas" para la
creación de variantes con cisteínas añadidas y conjugados de
antagonistas de proteínas también se contempla. La producción en
exceso de citoquinas y factores de crecimiento se ha implicado en
la patología de muchas dolencias inflamatorias, tales como la
artritis reumatoide, el asma, las alergias y la formación de
cicatrices en las heridas. La producción excesiva de GH se ha
implicado como una causa de acromegalia. Determinados factores de
crecimiento y citoquinas, p.e., la GH y la IL-6, se
han implicado en la proliferación de cánceres particulares. Muchos
de los factores de crecimiento y citoquinas involucrados en la
inflamación y el cáncer son miembros de la superfamilia génica de la
GH. Existe un interés considerable en el desarrollo de antagonistas
proteicos de estas moléculas, para el tratamiento de estas
enfermedades. Una estrategia involucra la modificación de las
citoquinas y los factores de crecimiento, de manera que puedan
unirse a los receptores, pero no oligomerizarlos. Esto se logra
mediante mutagénesis del segundo sitio de unión al receptor (sitio
II) de las moléculas. Las luteínas resultantes son capaces de unirse
al receptor y ocupar sus sitios, pero son incapaces de activar las
vías de señalización intracelulares. Esta estrategia se ha aplicado
con éxito para la GH, para construir un antagonista de la GH
(Cunningham et al., 1992). Se han desarrollado estrategias
similares para el desarrollo de antagonistas de otros miembros de la
superfamilia génica de la GH, tales como la IL-2
(Zurawski et al., 1990; Zurawski y Zurawski, 1992), la
IL-4 (Kruse et al., 1992), la
IL-5 (Tavernier et al., 1995), el GMCSF
(Hercus et al., 1994) y la EPO (Matthews et al.,
1996). Dado que los sitios preferenciales para la adición de
residuos de cisteína a los miembros de la superfamilia génica de la
GH descritos aquí se encuentran situados fuera de los sitios de
unión al receptor de estas proteínas y, por tanto, fuera de
cualquier sitio empleado para la creación de antagonistas proteicos,
las variantes de cisteínas añadidas descritas en este documento
pueden emplearse para generar versiones de acción a largo plazo de
antagonistas proteicos. Como ejemplo, Cunningham et al.
(1992) desarrollaron un antagonista in vitro de la GH
mediante la mutación de un residuo de glicina (aminoácido 120) a una
arginina. Este residuo de lisina es un componente esencial del
segundo sitio de unión al receptor en la GH; al remplazársele por
arginina, la GH no puede dimerizar los receptores. La mutación de
glicina a arginina en la posición 120 puede introducirse en las
secuencias de ADN que codifican para las variantes con cisteína
añadida de la GH, que se contemplan en este documento, para crear
un antagonista de la GH con cisteína añadida que puede conjugarse
con PEGs reactivos a cisteína, u otros tipos de restos reactivos a
cisteína. De manera similar, cambios en aminoácidos en otras
proteínas que convierten las proteínas de agonistas a antagonistas
pueden incorporarse a las secuencias de ADN que codifican las
variantes proteicas con cisteínas añadidas que se describen en este
documento. Se está dedicando un esfuerzo considerable a la
identificación de cambios de aminoácidos que conviertan las
proteínas de agonistas a antagonistas. Hercus et al. (1994)
reportaron que la sustitución del ácido glutámico en la posición 21
de la proteína GM-CSF madura por arginina o lisina
convierte a la GM-CSF de agonista a antagonista.
Tavernier et al. (1995) reportó que la sustitución del ácido
glutámico en la posición 13 de la IL-5 madura por
glutamina crea un antagonista de la IL-5.
Estrategias experimentales similares a las
descritas con anterioridad pueden emplearse para crear variantes
con cisteínas añadidas (tanto agonistas como antagonistas) de
miembros de la superfamilia génica de la GH obtenidos a partir de
varios animales. Esto es posible porque la secuencia aminoácidica
primaria y las estructuras de las citoquinas y los factores de
crecimiento se encuentran extremadamente bien conservadas entre los
humanos y especies animales. Por esta razón, las "reglas"
presentadas en este documento para la creación de variantes
biológicamente activas, con cisteínas añadidas, de miembros de la
superfamila génica de la GH serán útiles para la creación de
variantes biológicamente activas, con cisteínas añadidas, de
miembros de la superfamila génica de la GH de especies de animales
de compañía (p.e., perros, gatos, caballos) y animales comerciales
(p.e., vacas, ovejas, cerdos). La conjugación de estas variantes con
cisteínas añadidas a PEGs reactivos a cisteína creará versiones de
acción larga de estas proteínas que beneficiarán al animal de
compañía y los mercados de animales comerciales de granjas.
Las proteínas que son miembros de la
superfamilia génica de la GH (citoquinas hematopoyéticas) son
proporcionadas por Silvennoimem e Ihle (1996). Silvennoimem e Ihle
(1996) también proporcionan información acerca de la estructura y
la expresión de estas proteínas. Las secuencias de ADN, los
aminoácidos codificados y los ensayos biológicos llevados a cabo
in vivo e in vitro para las proteínas descritas en
este documento se describen en Aggarwal y Gurterman (1992; 1996),
Aggarwal (1998), y Silvennoimem e Ihle (1996). Los ensayos
biológicos para las proteínas también son proporcionados por
catálogos de varios suministradores comerciales de dichas proteínas,
tales como R&D Systems, Inc. y Endogen, Inc.
El siguiente ejemplo se proporciona para
demostrar de qué modo estas "reglas" pueden emplearse para la
creación de variantes de la GH con cisteínas añadidas. El ejemplo
no pretende ser limitante, sino solamente ejemplificar
realizaciones específicas de la invención.
Este ejemplo expone ciertos aminoácidos en la GH
que no son esenciales para la actividad biológica y que, mutados a
residuos de cisteína, no alterarán el patrón normal de enlace
disulfuro y la conformación general de la molécula. Estos
aminoácidos están situados en el extremo del terminal N del lazo
A-B (aminoácidos 34-52 de la
secuencia de la proteína madura; SEC ID No: 1; Martial et al
1979; Goeddel et al 1979), el lazo B-C
(aminoácidos 97-105 en la secuencia de la proteína
madura) y el lazo C-D (aminoácidos
130-153 en la secuencia de la proteína madura).
Los tres primeros o tres últimos aminoácidos en las hélices A, B, C
y D y los aminoácidos próximos a la hélice A y distales a la hélice
D también se identifican como sitios preferidos para la introducción
de residuos de cisteína.
Las secuencias de ADN que codifican para la GH
salvaje pueden amplificarse utilizando la técnica de reacción en
cadena de la polimerasa a partir de ADNc de simple cadena disponible
comercialmente preparado a partir de pituitarias humanas (ClonTech,
San Diego, CA) o ensamblados utilizando oligonucleótidos
superpuestos. Las mutaciones específicas pueden introducirse en la
secuencia de la GH utilizando una variedad de procedimientos tales
como técnicas de fagos (Kunkel et al 1987), técnicas de
mutagénesis PCR (Innis et al 1990; White 1993), paquetes de
mutagénesis tales como los vendidos por Stratagene
("Quick-Change Mutagenesis" kit, San Diego,
CA) o Promega (Gene Editor Kit, Madison WI).
Las sustituciones de cisteína pueden
introducirse en cualquiera de los aminoácidos que forman el lazo
B-C, el lazo C-D y el extremo del
terminal N del lazo A-B o en los tres primeros
aminoácidos de las regiones alfa helicoidales que colindan con
estas regiones o en la región próxima a la hélice A o distal a la
hélice D. Los sitios preferidos para la introducción de residuos de
cisteína son: F1, T3, P5, E33, A34, K38, E39, Q40, S43, Q46, N47,
P48, Q49, T50, S51, S55, T60, A98, N99, S100, G104, A105, S106,
E129, D130, G131, 5132, P133, T135, G136, Q137, K140, Q141, T142,
S144, K145, D147, T148, N149, S150, H151, N152, D153, S184, E186,
G187, S188, y G190. Los residuos de cisteína también pueden
introducirse al comienzo de la proteína madura, i.e., próximos al
aminoácido F1, o luego del último aminoácido en la proteína madura,
i.e., después del F191. Si se desea, pueden combinarse fácilmente
dos o más mutaciones en la misma proteína, ya sea por recombinación
in vitro de ADN de genes mutantes clonados y/o construcción
secuencial de mutaciones individuales deseadas.
El gen de la GH humana se amplificó a partir de
ADNc de simple cadena de pituitaria humana (disponible
comercialmente en CLONTECH, Inc., Palo Alto, CA) utilizando la
técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y los
cebadores BB1 y BB2. La secuencia de BB1 es
5'-GGGGGTCGACCATATGTTCCCAACCATTCCCT
TATCCAG-3' (SEC ID NO: 24). La secuencia de BB2 es 5'-GGGGGATCCTCACTAGAAGCCACAGCTGCCCTC-3' (SEC ID NO: 25). El cebador BB1 se diseñó para codificar una metionina iniciadora precediendo al primer aminoácido de la GH madura, fenilalanina, y sitios Sall y Ndel con propósitos de clonación. El cebador inverso BB2 contiene un sitio BamHl con objetivos de clonación. Las reacciones de PCR de 100 microlitros contenían 20 pmoles de cada cebador oligonucleotídico, tampón de PCR 1X (tampón Perkin-Elmer que contenía MgCl_{2}), concentración micromolar 200 de cada uno de los cuatro nucleótidos dA, dC, dG y dT, 2 ng de ADNc de cadena simple, 2,5 unidades de Taq polimerasa (Perkin-Elmer) y 2,5 unidades de polimerasa Pfu (Stratagene, Inc.). Las condiciones de la reacción de PCR fueron de 96ºC durante 3 minutos, 35 ciclos de (95ºC, 1 minuto; 63ºC, 30 segundos; 72ºC, un minuto), seguidos de 10 minutos a 72ºC. El equipo para el ciclado térmico empleado fue el Amplitron II Termal Cycler (Thermolyne). El producto de PCR de aproximadamente 600 p.b. fue digerido con Sall y BamHI, purificado con gel y clonado en el plásmido pUC19 digerido de manera similar (disponible comercialmente en New England BioLabs, Beverly, MA). La mezcla ligada se transformó en una cepa de E. coli DH5alfa y los transformantes se seleccionaron en placas LB que contenían ampicillina. Se desarrollaron varias colonias en el transcurso de la noche en medio LB y ADN plasmídico aislado utilizando paquetes de aislamiento de ADN miniplasmídico comprados a Qiagen, Inc (Valencia, CA). Se determinó que el clon LB6 tenía la secuencia de ADN correcta.
TATCCAG-3' (SEC ID NO: 24). La secuencia de BB2 es 5'-GGGGGATCCTCACTAGAAGCCACAGCTGCCCTC-3' (SEC ID NO: 25). El cebador BB1 se diseñó para codificar una metionina iniciadora precediendo al primer aminoácido de la GH madura, fenilalanina, y sitios Sall y Ndel con propósitos de clonación. El cebador inverso BB2 contiene un sitio BamHl con objetivos de clonación. Las reacciones de PCR de 100 microlitros contenían 20 pmoles de cada cebador oligonucleotídico, tampón de PCR 1X (tampón Perkin-Elmer que contenía MgCl_{2}), concentración micromolar 200 de cada uno de los cuatro nucleótidos dA, dC, dG y dT, 2 ng de ADNc de cadena simple, 2,5 unidades de Taq polimerasa (Perkin-Elmer) y 2,5 unidades de polimerasa Pfu (Stratagene, Inc.). Las condiciones de la reacción de PCR fueron de 96ºC durante 3 minutos, 35 ciclos de (95ºC, 1 minuto; 63ºC, 30 segundos; 72ºC, un minuto), seguidos de 10 minutos a 72ºC. El equipo para el ciclado térmico empleado fue el Amplitron II Termal Cycler (Thermolyne). El producto de PCR de aproximadamente 600 p.b. fue digerido con Sall y BamHI, purificado con gel y clonado en el plásmido pUC19 digerido de manera similar (disponible comercialmente en New England BioLabs, Beverly, MA). La mezcla ligada se transformó en una cepa de E. coli DH5alfa y los transformantes se seleccionaron en placas LB que contenían ampicillina. Se desarrollaron varias colonias en el transcurso de la noche en medio LB y ADN plasmídico aislado utilizando paquetes de aislamiento de ADN miniplasmídico comprados a Qiagen, Inc (Valencia, CA). Se determinó que el clon LB6 tenía la secuencia de ADN correcta.
Para la expresión en E. coli, se digirió
el clon LB6 con NdeI y EcoRI, se purificó en gel el
fragmento de aproximadamente 600 p.b. y se clonó en el plásmido
pCYB1 (disponible comercialmente a partir de New England BioLabs,
Beverly, MA) que había sido digerido con la misma enzima, y
desfosfatado. La reacción de ligación se transformó en E.
coli DH5alfa y se seleccionaron los transformantes en placas de
LB con ampicillina. El ADN plasmídico se aisló a partir de varios
transformantes, y se muestreó mediante digestión con NdeI y
EcoRI. Se identificó un clon correcto, y se le dio el nombre
pCYB1: GHts (pBBT120). Este plásmido se transformó en cepas de
E. coli JM109 o W3110 (disponible comercialmente a partir de
New England BioLabs y la American Type Culture Collection).
El clon LB6 de GH de tipo salvaje (pUC19: GH
tipo salvaje) se empleó como molde para construir un clon de GH
contentivo de la secuencia señalizadora STII E. coli (Picken
et. al. 1983). Debido a su extensión, la secuencia STII se
añadió en dos reacciones PCR secuenciales. La primera reacción
utilizó el cebador directo BB12 y el cebador inverso BB10. El BB10
tenia la secuencia: 5'CGCGGATCCGATTAGAATCCACAGCTCCCCTC3' (SEC ID NO:
28). El BB 112 tenía la secuencia:
5'ATCTATGTTCGTTTTCTCTATCGCTACCAACGCTTACGCATTCCCAAC
CATTCCCTTATCCAG-3' (SEC ID NO: 30).
CATTCCCTTATCCAG-3' (SEC ID NO: 30).
Las reacciones de PCR fueron tal como se
describió para amplificar la GH de tipo salvaje, excepto en que se
utilizaron aproximadamente 4 ng de plásmido LB6 como molde en lugar
de ADNc de simple cadena y las condiciones del PCR fueron 96ºC
durante 3 minutos, 30 ciclos de (95ºC durante 1 minuto; 63ºC durante
30 segundos; 72ºC durante 1 minuto) seguido de 72ºC durante 10
minutos. El producto de PCR de aproximadamente 630 p.b. se purificó
en gel utilizando el paquete Qiaex II Gel Extraction Kit (Qiagen,
Inc), diluido en agua en proporción de 50 veces y 2 microlitros
utilizados como molde para la segunda reacción de PCR. La segunda
reacción de PCR utilizó el cebador inverso BB10 y el cebador
directo BB11. El BB11 tiene la secuencia:
5'CCCCCTCTAGACATATGAAGAAGAACATCG
CATTCCTGCTGGCATCTATGTTCGTTTTCTCTATCG-3' (SEC ID NO: 29).
CATTCCTGCTGGCATCTATGTTCGTTTTCTCTATCG-3' (SEC ID NO: 29).
El cebador BB11 contiene sitios Xbal y
Ndel con objetivos de clonación. Las condiciones de PCR
fueron tal como se describieron en la primera reacción. El producto
de PCR de aproximadamente 660 p.b. se digirió con Xbal y
BamHl, se purificó en gel y se clonó en el plásmido
pADNC3.1(+) cortado de manera similar (Invitrogen, Inc. Carlsbad,
CA). El clon pADNc3.1(+)::stII-GH(5C) o
"5C" se determinó que tenía la secuencia de ADN correcta.
El clon "5C" fue escindido con Ndel
y BamHl y clonado a pBBT108 con corte similar (un derivado de
pUC19 que carece de un sitio Pst I, este plásmido se
describe más adelante). Se identificó un clon con el inserto
correcto siguiendo la digestión con estas enzimas. Este clon,
designado pBBT111, se digirió con Ndel y Sall, el
fragmento de 660 p.b. contentivo del gen de fusión
stII-GH, se purificó en gel y se clonó al vector
plasmídico de expresión pCYB (New England BioLabs) que había sido
digerido con las mismas enzimas y fosfatado. Se identificó un
plásmido recombinante contentivo de la inserción
stII-GH mediante digestiones de restricción de
endonucleasas. Se eligió un aislamiento del mismo para estudios
posteriores y se le designó como pBBT114. Este plásmido se
transformó en cepas E. coli JM109 o W3110 (disponibles en New
England BioLabs y la American Type Culture Collection).
El clon LB6 de la GH de tipo salvaje (pUC19: GH
de tipo salvaje) se utilizó como molde para construir un clon de GH
contentivo de la secuencia señalizadora de E. coli ompA (Mowa
et al. 1980). Debido a su extensión, la secuencia ompA se
añadió en dos reacciones PCR secuenciales. La primera reacción
utilizó el cebador directo BB7:
5'GCAGTGGCACTGGCTGGTTTCGCTACCGTAGCGCAGGCCTTCCCAACCATTCCC TTATCCAG 3'
(SEC ID NO: 31), y el cebador inverso BB10: 5'
CGCGGATCCGATTAGAATCCACAGCTCCCCTC 3' (SEC ID NO: 28).
Las reacciones de PCR fueron tal como se
describió para la amplificación de la GH de tipo salvaje excepto
que aproximadamente 4 ng del plásmido LB6 se utilizaron como molde
en lugar del ADNc de simple cadena y las condiciones del PCR fueron
96ºC durante 3 minutos, 30 ciclos de (95ºC durante 1 minuto; 63ºC
durante 30 segundos; 72ºC durante 1 minuto) seguido de 72ºC durante
10 minutos. El producto de PCR de aproximadamente 630 p.b. se
purificó en gel utilizando el paquete Qiaex II Gel Extraction Kit
(Qiagen, Inc), se diluyó en proporción 50 veces en agua y se
emplearon 2 microlitros como patrón para la segunda reacción de PCR.
La segunda reacción de PCR utilizó el cebador inverso BB10 y el
cebador directo BB6:
5'CCCCGTCGACACATATGAAGAAGACAGCTATCGCGATTG
CAGTGGCACTGGCTGGTTTC 3' (SEC ID NO: 32).
CAGTGGCACTGGCTGGTTTC 3' (SEC ID NO: 32).
Las condiciones del PCR fueron tal como se
describió en la primera reacción. El producto de PCR de
aproximadamente 660 p.b. se purificó con gel, se digirió con
Sal I y Bam H1 y se clonó en pUC19 (New England
BioLabs) que se cortó con Sal I y BamH 1 o
pADNC3.1(+) (Invitrogen) que había sido cortado con Xho I y
Bam H1 (Sal I y Xho I producen salientes
compatibles de simple cadena). Cuando se secuenciaron varios
clones, se descubrió que todos los clones pUC19 (8/8) contenían
errores en la región de la secuencia ompA. Sólo se secuenció un
clon pCADN3.1(+) y contenía una ambigüedad secuencial en la región
ompA. Para generar una fusión correcta ompA-GH se
recombinaron y clonaron al derivado pUC19 que carece del sitio
Pst I (véase pBBT108 descrito más adelante) segmentos de
genes de dos clones secuenciados que contenían diferentes errores
separados mediante una restricción conveniente. El plásmido
resultante, denominado pBBT112, porta el gen fusionado
ompA-GH, clonado como un fragmento Nde I -
Bam H1 en estos mismos sitios en pBBT108. Este plásmido se
designó como pBBT112 y se utiliza en la mutagénesis específica al
sitio de la GH, basada en PCR, tal como se describe más
adelante.
Para facilitar la mutagénesis del gen de GH
clonado para la construcción de la sustitución de la cisteína
elegida y de las mutaciones de inserción se construyó, como sigue,
un derivado del plásmido pUC19 (New England BioLabs) carente de un
sitio Pst I. Se digirió el ADN del plásmido pUC19 con
Pst I y a continuación se trató a 75ºC con ADN Polimerasa
PFU (Stratagene) utilizando el tampón de reacción suministrado por
el vendedor, suplementado con 200uM dNTPs. Bajo estas condiciones,
la polimerasa digerirá el saliente de 3' de simple cadena creado
por la digestión de Pst I, pero no digerirá la región de
doble cadena. El resultado neto será la eliminación de las cuatro
bases de simple cadena que comprenden las cuatro bases del medio del
sitio de reconocimiento de Pst I. La molécula resultante
tiene extremos de doble cadena, o sea, "romos". A continuación
de estas reacciones enzimáticas, el monómero lineal se purificó en
gel utilizando el paquete Qiaex II Gel Extraction Kit (Qiagen,
Inc.) Este ADN purificado se trató con ADN Ligasa T4 (New England
BioLabs) en correspondencia con los protocolos del vendedor, se
digirió con Pst I y se utilizó para transformar E.
coli DH5alfa. Los transformantes se eligieron y analizaron
mediante digestión de restricción con Pst I y Bam H1.
Uno de los transformantes que no estaba escindido por Pst I
pero sí lo estaba en el sitio cercano de Bam H1, se eligió y
designó como pBBT108.
Las muteínas de GH se construyeron generalmente
utilizando la mutagénesis dirigida basada en PCR tal como se
describe en los protocolos de PCR: Current Methods y Applications
editados por B. A. White, 1993 Humana Press, Inc., Totowa, NJ y los
Protocolos de PCR: A Guide to Methods y Applications editados por
Innis, M. A. et al. 1990 Academic Press Inc San Diego, CA.
Por lo regular, se diseñan oligonucleótidos cebadores de PCR para
incorporar cambios nucleótidos a la secuencia de codificación de la
GH que resultan en la sustitución de un aminoácido por un residuo
de cisteína en una posición específica dentro de la proteína. Dichos
oligonucleótidos cebadores mutagénicos pueden también diseñarse
para incorporar un residuo de cisteína adicional en el extremo
carboxi terminal o en el extremo amino terminal de la secuencia
codificadora de la GH. En este último caso uno o más residuos
adicionales de aminoácidos pudieran incorporarse también en el amino
terminal y/o carboxi terminal al residuo añadido de cisteína si
fuera deseable. Es más, los oligonucleótidos pueden ser diseñados
para incorporar residuos de cisteína como mutaciones de inserción
en posiciones específicas dentro de la secuencia de codificación de
la GH si fuera deseable. De nuevo, uno o más aminoácidos adicionales
pueden ser insertados conjuntamente con el residuo de cisteína y
estos aminoácidos pudieran estar ubicados hacia el amino terminal
y/o carboxi terminal al residuo de cisteína.
La mutación de sustitución de cisteína T135C se
construyó como sigue. El oligonucleótido inverso mutagénico BB28:
5'CTGCTTGAAGATCTGCCCACACCGGGGGCTGCCATC3' (SEC ID NO: 33) se diseñó
para cambiar el codón ACT para treonina en el residuo aminoácido
135 a un codón TGT que codifica para cisteína y para extenderse
sobre el sitio cercano Bgl II. Este oligonucleótido se
utilizó en el PCR conjuntamente con el oligonucleótido directo BB34:
5'GTAGCGCAGGCCTTCCCAACCATT3' (SEC ID NO: 34) que hibridiza en la
región de unión de la fusión ompA-GH y no es
mutagénico. El PCR se llevó a cabo en una reacción de 50ul en
tampón de PCR 1X (tampón Perkin-Elmer contentivo de
1,5 mM MgCl_{2}), concentración 200 micromolar de cada uno de los
cuatro nucleótidos dA, dC, dG y dT, con cada cebador
oligonucleotídico presente a 0,5 \muM, 5 pg de pBBT112 (antes
descrito) como molde y 1,25 unidades de Polimerasa de ADN Amplitac
(Perkin-Elmer) y 0,125 unidades de Polimerasa de ADN
PFU (Stratagene). Las reacciones se llevaron a cabo en un equipo
para el ciclado térmico Robocycler Gradient 96 (Stratagene). El
programa utilizado incluía: 95ºC durante 3 minutos seguido de 25
ciclos de 95ºC durante 60 segundos, 45ºC o 50ºC o 55ºC durante 75
segundos, 72ºC durante 60 segundos seguido de una espera a 6ºC. Las
reacciones de PCR se analizaron mediante electroforesis en gel de
agarosa para identificar temperaturas de unión que aportaran
suficiente producto del tamaño esperado; aproximadamente 430 pb. La
reacción 45ºC fue "limpiada" utilizando el paquete QlAquick PCR
Purification Kit (Qiagen), y digerida con Bgl II y
Pst I. El fragmento de 278 p.b. Bgl II-Pst I
resultante, que incluye la mutación T135C putativa, se purificó en
gel y ligó a pBBT111 el derivativo pUC19 portando el gen de fusión
stII-GH (antes descrito) que había sido digerido con
Bgl II y Pst I y purificado con gel. Los
transformantes de esta ligación se seleccionaron inicialmente por
digestión con Bgl II y Pst I y seguidamente se
secuenció un clon para confirmar la presencia de la mutación T135C y
la ausencia de cualquier mutación adicional que pudiera
introducirse potencialmente por la reacción de PCR o por los
oligonucleótidos sintéticos. Se verificó que el clon secuenciado
tenía la secuencia correcta.
La mutación de sustitución S132C se construyó
utilizando el protocolo descrito anteriormente para T135C con las
siguientes diferencias: se utilizó el oligonucleótido mutagénico
inverso BB29 5'CTGCTTGAAGATCTGCCCAGTCC
GGGGGCAGCCATCTTC3' (SEC ID NO: 35) en lugar del BB28 y la reacción de PCR con temperatura de unión de 50ºC se utilizó para la clonación. Se encontró que uno de los dos clones secuenciados tenía la secuencia correcta.
GGGGGCAGCCATCTTC3' (SEC ID NO: 35) en lugar del BB28 y la reacción de PCR con temperatura de unión de 50ºC se utilizó para la clonación. Se encontró que uno de los dos clones secuenciados tenía la secuencia correcta.
La mutación de sustitución T148C se construyó
utilizando un protocolo análogo pero empleando una estrategia de
clonación diferente. El oligonucleótido mutagénico directo BB30
5'GGGCAGATCTTCAAGCAGACCTACAG
CAAGTTCGACTGCAACTCACACAAC3' (SEC ID NO: 36) se utilizó en el PCR con el cebador inverso no mutagénico BB33 5'CGCGGTACCCGGGATCCGATTAGAATCCACAGCT3' (SEC ID NO: 37) que hibridiza con el extremo 3' de la secuencia codificante de la GH y expande el sitio Bam H1 inmediatamente en dirección hacia abajo. Se llevó a cabo el PCR como se describió anteriormente con la excepción de que las temperaturas de unión utilizadas fueron de 46,51 y 56ºC. Luego de los análisis de PCR y de gel tal como se describiera anteriormente las reacciones de 46 y 51ºC se tomaron alícuotas para la clonación. Estas se digirieron con Bam H1 y Bgl II, se purificaron en gel y se clonaron en pBBT111 que se había digerido con Bam H1 y Bgl II tratado con fosfatasa alcalina intestinal vacuna (Promega) en correspondencia con los protocolos del vendedor, y se purificaron en gel. Los transformantes de esta ligación se analizaron mediante digestión con Bam H1 y Bgl II para identificar clones en los cuales el fragmento mutagénico de PCR de 188 p.b. Bam H1-Bgl II se clonara en la orientación apropiada. Debido a que Bam H1 y BgI II generan extremos compatibles, este paso de clonación no tiene especificidad de orientación. Se mostró que cinco o seis clones puestos a prueba estaban orientados correctamente. Uno de estos se secuenció y se mostró que contenía la mutación T148C deseada. La secuencia del resto del fragmento mutagénico de PCR de 188 p.b. Bam H1-BgI II en este clon se confirmó como correcta.
CAAGTTCGACTGCAACTCACACAAC3' (SEC ID NO: 36) se utilizó en el PCR con el cebador inverso no mutagénico BB33 5'CGCGGTACCCGGGATCCGATTAGAATCCACAGCT3' (SEC ID NO: 37) que hibridiza con el extremo 3' de la secuencia codificante de la GH y expande el sitio Bam H1 inmediatamente en dirección hacia abajo. Se llevó a cabo el PCR como se describió anteriormente con la excepción de que las temperaturas de unión utilizadas fueron de 46,51 y 56ºC. Luego de los análisis de PCR y de gel tal como se describiera anteriormente las reacciones de 46 y 51ºC se tomaron alícuotas para la clonación. Estas se digirieron con Bam H1 y Bgl II, se purificaron en gel y se clonaron en pBBT111 que se había digerido con Bam H1 y Bgl II tratado con fosfatasa alcalina intestinal vacuna (Promega) en correspondencia con los protocolos del vendedor, y se purificaron en gel. Los transformantes de esta ligación se analizaron mediante digestión con Bam H1 y Bgl II para identificar clones en los cuales el fragmento mutagénico de PCR de 188 p.b. Bam H1-Bgl II se clonara en la orientación apropiada. Debido a que Bam H1 y BgI II generan extremos compatibles, este paso de clonación no tiene especificidad de orientación. Se mostró que cinco o seis clones puestos a prueba estaban orientados correctamente. Uno de estos se secuenció y se mostró que contenía la mutación T148C deseada. La secuencia del resto del fragmento mutagénico de PCR de 188 p.b. Bam H1-BgI II en este clon se confirmó como correcta.
La construcción de la mutación de sustitución
S144C fue idéntica a la construcción de la T148C con las siguientes
excepciones. El oligonucleótido directo mutagénico BB31
5'GGGCAGATCTTCAAGCAGACCTACTGCAAGTTC
GAC3' (SEC ID NO: 38) se utilizó en lugar del BB30. Dos de los seis clones puestos a prueba se mostró que tenían orientación correcta. Uno de estos se secuenció y se mostró que contenía la mutación S144C deseada. La secuencia del resto del fragmento mutagénico de PCR de 188 p.b. Bam H1-BgI II en este clon se confirmó como correcta.
GAC3' (SEC ID NO: 38) se utilizó en lugar del BB30. Dos de los seis clones puestos a prueba se mostró que tenían orientación correcta. Uno de estos se secuenció y se mostró que contenía la mutación S144C deseada. La secuencia del resto del fragmento mutagénico de PCR de 188 p.b. Bam H1-BgI II en este clon se confirmó como correcta.
También se construyó una mutación que añadía un
residuo de cisteína al carboxilo terminal natural de la GH. La
construcción de esta mutación, designada stp192C, fue similar a la
del T148C, pero empleaba cebadores oligonucleotídicos diferentes.
El oligonucleótido mutagénico inverso BB32
5'CGCGGTACCGGATCCTTAGCAGAAGC
CACAGCTGCCCTCCAC3' (SEC ID NO: 39) que inserta un codón TGC para cisteína entre el codón para el residuo phe del carboxilo terminal de la GH y el codón transduccional de parada TAA y expande el sitio cercano Bam H1, se utilizó conjuntamente con el BB34 5'GTAGCGCAGGCCTTCCCAACCATT3' (SEC ID NO: 40) que se describió anteriormente. Luego del PCR y de los análisis de gel descritos anteriormente, la reacción a 46ºC se utilizó para la clonación. Tres de los seis clones puestos a prueba se mostró que estaban orientados correctamente. Uno de estos se secuenció y se mostró que contenía la mutación stp192C deseada. La secuencia del resto del fragmento de PCR mutagénico de 188 p.b. Bam H1-BgI II en este clon se confirmó como correcta.
CACAGCTGCCCTCCAC3' (SEC ID NO: 39) que inserta un codón TGC para cisteína entre el codón para el residuo phe del carboxilo terminal de la GH y el codón transduccional de parada TAA y expande el sitio cercano Bam H1, se utilizó conjuntamente con el BB34 5'GTAGCGCAGGCCTTCCCAACCATT3' (SEC ID NO: 40) que se describió anteriormente. Luego del PCR y de los análisis de gel descritos anteriormente, la reacción a 46ºC se utilizó para la clonación. Tres de los seis clones puestos a prueba se mostró que estaban orientados correctamente. Uno de estos se secuenció y se mostró que contenía la mutación stp192C deseada. La secuencia del resto del fragmento de PCR mutagénico de 188 p.b. Bam H1-BgI II en este clon se confirmó como correcta.
Pueden utilizarse procedimientos análogos de PCR
de mutagénesis para generar otras mutaciones de cisteína. La
elección de las secuencias de los oligonucleótidos mutagénicos será
dictada por la posición donde deba colocarse el residuo de cisteína
deseado y la predilección de los sitios útiles de endonucleasas de
restricción. Generalmente, se desea colocar la mutación, o sea, el
segmento que no hibridiza, cerca del centro del oligonucleótido,
para favorecer la unión del oligonucleótido al molde. Las
temperaturas apropiadas de hibridización para cualquier
oligonucleótido pueden determinarse empíricamente. También es
deseable que el oligonucleótido mutagénico expanda un sitio único
de restricción de manera que el producto de PCR pueda ser escindido
para generar un fragmento que pueda clonarse fácilmente en un
vector apropiado, o sea, un vector que pueda utilizarse para
expresar la muteína o brindar sitios de restricción convenientes
para extraer el gen mutado y clonarlo fácilmente en dicho vector de
expresión. En ocasiones, los sitios de mutación y de restricción se
separan mediante distancias mayores que lo deseable para la
síntesis de oligonucleótidos sintéticos: generalmente se desea
mantener tales oligonucleótidos por debajo de 80 bases de
distancia, y las extensiones de 30-40 bases son las
de mayor preferencia.
\newpage
En los casos en que esto no sea posible, los
genes escogidos para la mutagénesis pudieran ser recompuestos o
resintetizados para incorporar sitios de restricción en posiciones
apropiadas. Alternativamente, las variaciones de los protocolos de
mutagénesis por PCR empleados anteriormente, tales como los
denominados "Método Megaprimer" (Barik, S., pp.
277-286 en Methods in Molecular Biology, Vol. 15:
PCR Protocols: Current Methods y Applications editado por B. A.
White, 1993, Humana Press, Inc., Totowa,NJ) o "Gene Splicing by
Overlap Extension" (Horton, R. M., pp. 251-261,
in Methods in Molecular Biology, Vol. 15: PCR Protocols: Current
Methods y Applications, editado por B. A. White, 1993, Humana
Press, Inc. , Totowa,NJ) pueden emplearse también para construir
dichas mutaciones.
Para expresar la GH en E. coli, el
pBBT120 (gen de la GH sin secuencia líder clonado en el vector de
expresión tac pCYB1) y el pBBT114 (gen de la GH con
secuencia líder stII clonada al vector de expresión tac
pCYB1) fueron transformados en las cepas de E. coli JM109 y
W3110. El vector parental pCYB1 también fue transformado en JM109 y
W3110. A estas cepas se les otorgaron las siguientes
designaciones:
\vskip1.000000\baselineskip
- BOB119:
- JM109 (pCYB1)
- BOB130:
- W3110 (pCYB1)
- BOB129:
- JM109 (pBBT120)
- BOB133:
- W3110 (pBBT120)
- BOB121:
- JM109 (pBBT114)
- BOB132:
- W3110 (pBBT114)
\vskip1.000000\baselineskip
Para la expresión, las cepas se cultivaron
durante la noche a 37ºC en medio Luria (LB) (Sambrook et al
1989) conteniendo 100 \mug/ml de ampicillina. Estos cultivos
saturados durante la noche se diluyeron a aproximadamente 0,03 OD a
A_{600} en LB contentivo de 100 \mug/ml de ampicillina e
incubados a 37ºC en frascos de agitación en un agitador rotatorio,
por lo regular, a 250-300 r.p.m. Las ODs se
monitorearon y se añadió IPTG a una concentración final de 0,5 mM
cuando las ODs del cultivo alcanzaron aproximadamente de 0,25 a 0,5,
por lo regular, entre 0,3 y 0,4. Los cultivos se muestrearon
generalmente a 1, 3, 5 y \sim16 horas después de la inducción.
Los puntos de tiempo "aproximadamente 16 horas" representaban
la incubación nocturna de los cultivos y los tiempos exactos
variaron aproximadamente entre 15 y 20 horas. Las muestras de los
cultivos inducidos y no inducidos se sedimentaron mediante
centrifugación, se resuspendieron en tampón de muestra 1x (50 mM
Tris-HCl (pH 6,8), 2% lauril sulfato de sodio, 10%
glicerol, 0,1% de bromofenol azul) con la adición de 1%
\beta-mercaptoetanol cuando fuese deseable. Las
muestras se hirvieron durante \sim10 minutos o se calentaron a
95ºC durante \sim10 minutos. Las muestras se enfriaron a
temperatura ambiente antes de cargarse en geles de poliacrilamida
con SDS o se almacenaron a -20ºC si no se ensayaron inmediatamente.
Las muestras se ensayaron en poliacrilamida prefundida al 15%
"Ready Gels" (Bio-Rad, Hercules CA) utilizando
un aparato de electroforesis Ready Gel Cell
(Bio-Rad) en correspondencia con los protocolos del
vendedor. Por lo regular, los geles se ensayaron a 200 voltios
durante \sim35-45 minutos. Los geles se tiñeron
con Azul Coomassie o se analizaron mediante
electro-marcado Western Blot. La tinción con
Coomassie de lisados de células enteras de las cepas BOB 129, BOB
133, BOB 121 y BOB 132 mostró una banda de unos 22 kD que comigraba
con la GC purificada recombinante humana estándar comprada a
Research Diagnostics Inc (Flanders, NJ). Esa banda era más notable
en cultivos inducidos luego de su inducción durante la noche. Sin
embargo, también se observó una banda de ese peso molecular en
cultivos no inducidos de estas mismas cepas y también pudo
observarse con y sin inducción en las cepas control BOB 119 y BOB
130 que portaban el vector de expresión pCYB1 carente del gen de la
GH. Para clarificar esta observación, se llevaron a cabo análisis
de Western Blot en lisados de células enteras de cultivos inducidos
de las cepas BOB119, BOB130, BOB129, BOB133, BOB121 y BOB132. Las
Western blots se llevaron a cabo con antisuero policlonal de conejo
levantado contra la GH humana comprada a United States Biological;
catálogo # G 9000-11 (Swampscott, MA). Este
anticuerpo primario se utilizó a una dilución de 1:5000 y su unión
se detectó mediante el fragmento Fc de anti-IgG de
conejo levantado en cabra, conjugado a fosfatasa alcalina (producto
# 31341), comprado a Pierce (Rockford, IL). Este anticuerpo
secundario se utilizó a una dilución de 1:10.000. La actividad de la
fosfatasa alcalina se detectó utilizando el paquete ImmunoPure®
Fast Red TR/AS-MX Substrate Kit (Pierce, Rockford
IL), en correspondencia con los protocolos del vendedor. Los
Western Blots demostraron claramente la presencia de la GH en los
lisados de los cultivos inducidos de BOB129, BOB133, BOB121 y
BOB132, en la post inducción, tanto al cabo de 3 horas, como al
cabo de 16 horas. En el cultivo inducido de las cepas de control,
BOB119 y BOB130, no se detectó la GH mediante Western blot en los
puntos de tiempo post inducción de 3 ó 16 horas.
En estos experimentos preliminares, los
rendimientos mayores de la GH se obtuvieron a partir de BOB132 W3110
(pBBT114), en el cual el gen de la GH se funde hacia abajo de la
secuencia señal para la secreción stII. Esta cepa se probó aún más
para determinar si la proteína de la GH se segregaba al periplasma
como era de esperar. Se preparó un cultivo inducido de BOB132 tal
como se describió y se sometió a choque osmótico en correspondencia
con el procedimiento de Koshland y Botstein (Cell 20 (1980) pp.
749-760). Este procedimiento rompe la membrana
exterior y libera los contenidos del periplasma hacia el medio
circundante. La centrifugación subsiguiente separa los contenidos
periplasmáticos, presentes en el material flotante del resto de los
componentes asociados a la célula. En este experimento, el grueso
de la GH sintetizada por BOB132 se encontró localizado en el
periplasma. Este resultado es consistente con el hallazgo de que la
mayor parte del total de la GH también resulta indistinguible, en
tamaño, del estándar de la GH purificada, lo que indicaba que la
secuencia señal stII había sido eliminada. Esto es indicativo de
secreción. Un cultivo a mayor escala (500 ml) de BOB132 se indujo
también, se cultivó durante la noche y se sometió a choque osmótico
en correspondencia con el procedimiento descrito por Hsiung et
al., 1986 (Bio/Technology 4, pp. 991-995). El
análisis de gel demostró nuevamente que el grueso de la GH
producida era soluble, periplasmática y no distinguible, en tamaño,
del estándar de la GH. Este material podía también ser unido de
manera cuantitativa y eluído de, una columna de
Q-Sefarosa utilizando condiciones muy similares a
las descritas para la GH recombinante humana por Becker y Hsiung,
1986 (FEBS Lett 204 pp145-150).
El receptor de la GH humana se clonó mediante
PCR utilizando el cebador directo BB3 y el cebador inverso BB4. BB3
tiene la secuencia:
5'-CCCCGGATCCGCCACCATGGATCTCTGGCAGCTGCTGTT-3'
(SECID NO: 26). BB4 tiene la secuencia:
5'CCCCGTCGACTCTAGAGCTATTAAATACGTAGCTCTTGGG-3' (SEC
ID NO: 27).
El molde fue un ADNc de simple cadena, preparado
a partir de hígado humano (disponible comercialmente en los
Laboratorios CLONTECH). Los cebadores BB3 y BB4 contienen sitios de
restricción BamHI y SaII, respectivamente, con
propósitos de clonación. Las reacciones de 100 \mul de PCR
contenían 2,5 ng del ADNc de simple cadena y 20 picomoles de cada
cebador en tampón de PCR 1 x (tampón Perkin-Elmer
contentivo de MgCl_{2}), concentración 200 micromolar de cada uno
de los cuatro nucleótidos dA, dC, dG y dT, 2,5 unidades de Taq
polimerasa (Perkin-Elmer) y 2,5 unidades de PFU
polimerasa (Stratagene Inc.). Las condiciones de la reacción de PCR
fueron: 96ºC durante 3 minutos, 35 ciclos de (95ºC, 1 minuto; 58ºC
durante 30 segundos; 72ºC durante 2 minutos), seguidos de 10
minutos a 72ºC. El equipo para el ciclado térmico empleado fue el
Amplitron II Termal Cycler (Thermolyne). El producto de PCR de
aproximadamente 1,9 kb fue digerido con BamH1 y SaII,
y ligado en el plásmido pUC19 de corte similar (New England
BioLabs). Sin embargo, ninguno de los transformantes obtenidos de
esta reacción de ligación contenía un fragmento de PCR de 1,9 kb.
Leung et al. (Nature 1987, 330 pp. 537-543)
tampoco consiguió obtener clones de ADNc con la longitud total del
receptor de GH en pUC19. A continuación, el fragmento de PCR se
clonó en una vector de poca cantidad de copias, pACYC184 (New
England BioLabs) en los sitios BamH1 y SaII de este
vector. Dichos clones se obtuvieron a frecuencias razonables, pero
las cepas de E. coli portadoras del fragmento de PCR clonado
crecieron pobremente, formando pequeñas colonias de aspecto
heterogéneo en presencia de cloranfenicol, que se utiliza para
seleccionar las que mantienen el pACYC184.
El fragmento de PCR se clonó, simultáneamente,
en pCADN3.1(+) (Invitrogen). El producto de PCR de aproximadamente
1,9 kb fue digerido con BamHI y SaII y ligado a sitios
de clonación BamHI y Xhol de pCADN3.1(+). Sólo los
transformantes no frecuentes de esta ligación contenían el ADNc del
receptor de GH clonado, y se encontró que todos ellos contenían
pérdidas de segmentos de la secuencia codificante del receptor. Uno
de estos clones se secuenció y se encontró que contenía una pérdida
de 135 bp dentro de la secuencia de codificación del receptor de
GH: la secuencia del resto del gen estaba según la reportada por
Leung et al (1987).
El receptor de GH de conejo se clonó mediante
PCR utilizando el cebador directo BB3 (antes descrito) y el cebador
inverso BB36. El BB36 tiene la secuencia
5'CCCCGTCGACTCTAGAGCCATTAGATACAAAGCTCTTGGG3' (SEC ID NO: 41) y
contiene sitios de restricción Xbal y SalI con
objetivo de clonación. El hígado de conejo
poli(A)^{+}
mARN se compró a CLONTECH Inc. y se utilizó como sustrato en la síntesis de la primera cadena de ADNc de simple cadena para producir moldes para amplificación por PCR. La síntesis de la primera cadena del ADNc de simple cadena se llevó a cabo utilizando un paquete 1st Strand cDNA Synthesis Kit for RT-PCR (AMV) de Boehringer Mannheim Corp (Indianápolis, IN), en correspondencia con los protocolos del vendedor. Se llevaron a cabo síntesis paralelas de la primera cadena del ADNc utilizando hexámeros aleatorios de BB36 como cebadores. Las reacciones de PCR subsiguientes con los productos de la síntesis de la primera cadena como moldes, se llevaron a cabo con cebadores BB3 y BB36, en correspondencia con el protocolo del paquete 1st Strand cDNA Synthesis Kit for RT-PCR (AMV) y utilizando 2,5 unidades de polimerasa Amplitac de ADN (Perkin-Elmer) y 0,625 unidades de polimerasa Pfu de ADN (Stratagene). Las condiciones de la reacción de PCR fueron: 96ºC durante 3 minutos, 35 ciclos de (95ºC, 1 minuto; 58ºC durante 30 segundos; 72ºC durante 2 minutos), seguido de 10 minutos a 72ºC. El equipo para el ciclado térmico empleado fue el Amplitron II Thermal Cycler (Thermolyne). El producto de PCR de aproximadamente 1,9 kb se observó en las reacciones de PCR utilizando como molde ADNc cebado mediante hexámero aleatorio o ADNc cebado con BB36. El ADNc cebado con hexámero aleatorio se utilizó en experimentos subsiguientes de clonación. Se digirió con Bam H1 y Xbal y se corrió sobre gel de agarosa al 1,2%. Esta digestión genera dos fragmentos (aproximadamente 365 p.b. y 1600 pb) debido a que el gen del receptor de GH de conejo contiene un sitio interno Bam H1. Ambos fragmentos se purificaron en gel. Inicialmente el fragmento Bam H1-Xbal de aproximadamente 1600 p.b. se clonó en pCADN3.1(+), que había sido digerido con estas mismas enzimas. Estos clones se obtuvieron fácilmente a frecuencias razonables y no mostraron evidencia de pérdidas determinadas mediante digestiones de restricción y secuenciación subsiguiente. Para generar un clon de longitud total, uno de los plásmidos contentivos del fragmento Bam H1-XbaI de 1600 p.b. (pCADN3.1(+):: rab-ghr-2A) se digirió con Bam H1, se trató con Fosfatasa Alcalina Intestinal vacuna (Promega) en correspondencia con los protocolos del vendedor, se purificó en gel y se ligó con el fragmento Bam H1 de aproximadamente 365 p.b. purificado en gel, que contiene la porción 5' del gen del receptor de GH de conejo. Los transformantes de esta ligación se escogieron y analizaron mediante digestión de restricción y PCR para confirmar la presencia del fragmento de aproximadamente 365 p.b. y para determinar su orientación relativa al segmento distal del gen del receptor de GH de conejo. Tres de los cuatro clones analizados contenían el fragmento de aproximadamente 365 p.b. clonado en la orientación correcta para la reconstitución del gen del receptor de GH de conejo. La ausencia de complicaciones en la clonación en E. coli del gen de conejo, en contraste con el gen humano, es consistente con los resultados de Leung et al. (1987), que también obtuvo fácilmente clones de ADNc de longitud total para el gen receptor de GH de conejo, pero fue incapaz de clonar un ADNc de longitud total del gen humano en E. coli. El receptor de GH de conejo puede emplearse en ensayos que utilizan GH humana como ligando, ya que se ha demostrado que la GH humana se une al receptor de conejo con alta afinidad (Leung et al. 1987). Los plásmidos que contienen el receptor de GH de conejo clonado debían secuenciarse para identificar el ADNc del receptor de GH de conejo con la secuencia correcta antes de su uso.
mARN se compró a CLONTECH Inc. y se utilizó como sustrato en la síntesis de la primera cadena de ADNc de simple cadena para producir moldes para amplificación por PCR. La síntesis de la primera cadena del ADNc de simple cadena se llevó a cabo utilizando un paquete 1st Strand cDNA Synthesis Kit for RT-PCR (AMV) de Boehringer Mannheim Corp (Indianápolis, IN), en correspondencia con los protocolos del vendedor. Se llevaron a cabo síntesis paralelas de la primera cadena del ADNc utilizando hexámeros aleatorios de BB36 como cebadores. Las reacciones de PCR subsiguientes con los productos de la síntesis de la primera cadena como moldes, se llevaron a cabo con cebadores BB3 y BB36, en correspondencia con el protocolo del paquete 1st Strand cDNA Synthesis Kit for RT-PCR (AMV) y utilizando 2,5 unidades de polimerasa Amplitac de ADN (Perkin-Elmer) y 0,625 unidades de polimerasa Pfu de ADN (Stratagene). Las condiciones de la reacción de PCR fueron: 96ºC durante 3 minutos, 35 ciclos de (95ºC, 1 minuto; 58ºC durante 30 segundos; 72ºC durante 2 minutos), seguido de 10 minutos a 72ºC. El equipo para el ciclado térmico empleado fue el Amplitron II Thermal Cycler (Thermolyne). El producto de PCR de aproximadamente 1,9 kb se observó en las reacciones de PCR utilizando como molde ADNc cebado mediante hexámero aleatorio o ADNc cebado con BB36. El ADNc cebado con hexámero aleatorio se utilizó en experimentos subsiguientes de clonación. Se digirió con Bam H1 y Xbal y se corrió sobre gel de agarosa al 1,2%. Esta digestión genera dos fragmentos (aproximadamente 365 p.b. y 1600 pb) debido a que el gen del receptor de GH de conejo contiene un sitio interno Bam H1. Ambos fragmentos se purificaron en gel. Inicialmente el fragmento Bam H1-Xbal de aproximadamente 1600 p.b. se clonó en pCADN3.1(+), que había sido digerido con estas mismas enzimas. Estos clones se obtuvieron fácilmente a frecuencias razonables y no mostraron evidencia de pérdidas determinadas mediante digestiones de restricción y secuenciación subsiguiente. Para generar un clon de longitud total, uno de los plásmidos contentivos del fragmento Bam H1-XbaI de 1600 p.b. (pCADN3.1(+):: rab-ghr-2A) se digirió con Bam H1, se trató con Fosfatasa Alcalina Intestinal vacuna (Promega) en correspondencia con los protocolos del vendedor, se purificó en gel y se ligó con el fragmento Bam H1 de aproximadamente 365 p.b. purificado en gel, que contiene la porción 5' del gen del receptor de GH de conejo. Los transformantes de esta ligación se escogieron y analizaron mediante digestión de restricción y PCR para confirmar la presencia del fragmento de aproximadamente 365 p.b. y para determinar su orientación relativa al segmento distal del gen del receptor de GH de conejo. Tres de los cuatro clones analizados contenían el fragmento de aproximadamente 365 p.b. clonado en la orientación correcta para la reconstitución del gen del receptor de GH de conejo. La ausencia de complicaciones en la clonación en E. coli del gen de conejo, en contraste con el gen humano, es consistente con los resultados de Leung et al. (1987), que también obtuvo fácilmente clones de ADNc de longitud total para el gen receptor de GH de conejo, pero fue incapaz de clonar un ADNc de longitud total del gen humano en E. coli. El receptor de GH de conejo puede emplearse en ensayos que utilizan GH humana como ligando, ya que se ha demostrado que la GH humana se une al receptor de conejo con alta afinidad (Leung et al. 1987). Los plásmidos que contienen el receptor de GH de conejo clonado debían secuenciarse para identificar el ADNc del receptor de GH de conejo con la secuencia correcta antes de su uso.
Como alternativa al receptor de conejo, pudiera
construirse un receptor quimérico que combine el dominio
extracelular del receptor humano con los dominios transmembrana y
citoplasmáticos del receptor de conejo. Dicho receptor quimérico
podría construirse recombinando los genes humanos y de conejo en el
sitio único Nco I presente en cada uno de ellos (Leung et
al. 1987). Dicho recombinante, contentivo del segmento del gen
humano ubicado a 5' o "hacia arriba" del sitio Nco I y
el segmento del gen de conejo 3', o "hacia abajo" respecto al
sitio Nco I codificaría exactamente un receptor quimérico del
tipo deseado, teniendo el dominio extracelular del receptor humano
con los dominios de transmembrana y citoplasmático del receptor de
conejo. Esto permitiría el análisis de la interacción de la GH, las
luteínas de GH, y las muteínas de GH PEG-iladas con
el sitio de enlace del receptor natural pero podría evitar la
necesidad de clonar el receptor de GH humano de longitud total en
E. coli.
Las muteínas de GH pueden expresarse en una
diversidad de sistemas de expresión tales como bacterias, levadura
o células de insectos. Los vectores para la expresión de las
muteínas de GH en estos sistemas están disponibles comercialmente a
partir de un número de proveedores como Novagen Inc. (pET15b para
expresión en E. coli), New England BioLabs (pC4B1 para
expresión en E. coli) Invitrogen (pVL1392, pVL1393 y pMELBAC
para expresión en células de insectos utilizando Baculovirus como
vectores, vectores Pichia para expresión en células de levadura, y
pcADN3 para expresión en células de mamíferos). La GH se ha
producido con éxito en E. coli como proteína citoplásmica y
como proteína de secreción, periplasmática, utilizando las
secuencias señal OmpA o StII en E. coli, para lograr la
secreción de la proteína al espacio periplasmático (Chang et
al., 1987; Hsiung et al., 1986). Es preferible que las
muteínas de GH se expresen como proteínas secretadas, de manera que
no contengan un residuo de Terminal N de metionina, que no está
presente en la proteína humana natural. Para la expresión en E.
coli, las secuencias de ADN que codifican para GH o las muteínas
de GH pueden clonarse en vectores de expresión de E. coli,
tales como el pET15b que utiliza el promotor fuerte T7 o el pCYB1
que utiliza el promotor TAC. La adición de IPTG
(isopropiltiogalactopiranósido, disponible en Sigma Chemical
Company) al medio de crecimiento, puede inducir la expresión de la
proteína. La GH recombinante se segregará al espacio
periplasmático del cual puede ser liberada y luego purificada, luego
de choque osmótico (Becker y Hsiung, 1986). La proteína puede
purificarse aún más utilizando otros métodos cromatográficos, tales
como intercambio iónico, interacción hidrófoba, exclusión por talla
y cromatografía de fase reversa, todos los cuales son bien
conocidos en la técnica (e.g. véase Becker y Hsiung, 1986). Las
concentraciones de proteína pueden determinarse utilizando paquetes
de ensayo comercialmente disponibles tales como los vendidos por los
Laboratorios BioRad (Richmond, CA). Si las proteínas GH son
insolubles cuando se expresen en E. coli, pueden ser
recubiertas utilizando procedimientos bien conocidos por los
expertos en la técnica (véase Cox et al., 1999 y las
solicitudes de patentes WO9422466 y WO9412219).
De manera alternativa, las proteínas pueden
expresarse en células de insectos como proteínas secretadas. El
plásmido de expresión puede modificarse para contener la secuencia
señal de GH para provocar la secreción de la proteína al medio. El
ADNc puede clonarse en vectores comercialmente disponibles, p.e.,
pVL1392 de Invitrogen Inc., y utilizarse para infectar las células
de insectos. La GH y las muteínas de GH pueden purificarse a partir
del medio condicionado, utilizando procedimientos convencionales de
cromatografía. Pueden utilizarse anticuerpos contra rhGH de
conjunto con Western blots para localizar fracciones contentivas de
las proteínas GH durante la cromatografía. Alternativamente, las
fracciones contentivas de GH pueden identificarse utilizando
ensayos ELISA.
Las variantes de GH con adición de cisteína
pueden expresarse también como proteínas intracelulares o secretadas
en células eucariotas tales como la levadura, células de insectos,
o células de mamíferos. Los vectores para la expresión de las
proteínas y los métodos para la realización de tales experimentos se
describen en catálogos de diversas compañías suministradoras tales
como Invitrogen, Inc. y ClonTech, Inc. La GH y las muteínas de GH
pueden purificarse utilizando procedimientos convencionales de
cromatografía.
La actividad biológica de las muteínas de GH
puede medirse utilizando una línea de células que prolifere en
respuesta a la GH. Fuh et al. (1992) crearon una línea
celular que responde a la GH, mediante la transformación estable de
una línea celular de leucemia mieloide, FDC-P1, con
un receptor quimérico contentivo del dominio extracelular del
receptor de GH de conejo fusionado al receptor G-CSF
de ratón. Esta línea celular prolifera en respuesta a la GH con una
concentración máxima efectiva media (EC_{50}) de 20 picomolar.
Puede construirse una línea de células similar utilizando las
secuencias publicadas de estos receptores y técnicas estándar de
biología molecular (Fuh et al., 1992). De modo alternativo,
el dominio extracelular del receptor de la GH humana puede
fusionarse al receptor de la G-CSF de ratón
utilizando las secuencias publicadas de estos receptores y técnicas
estándar de biología molecular. Las células transformadas que
expresan el receptor quimérico pueden identificarse mediante
citometría de flujo utilizando GH marcada, debido a la capacidad de
las células transformadas para unir GH radiomarcada, o debido a la
capacidad de las células transformadas de proliferar en respuesta a
la GH añadida. La GH purificada y las muteínas de GH pueden
someterse a prueba en ensayos de proliferación celular utilizando
células que expresen el receptor quimérico para medir actividades
específicas de las proteínas. Las células pueden colocarse en
placas de 96 pocillos con diversas concentraciones de GH o muteínas
de GH. Después de 18 horas, las células se tratan durante 4 horas
con timidina tritiada y se cultivan para determinar la
radioactividad incorporada. La EC_{50} puede determinarse para
cada muteína. Los ensayos deben realizarse al menos tres veces para
cada muteína utilizando pocillos triplicados para cada punto de
datos. Se prefieren las muteínas de GH que despliegan niveles
óptimos similares de estimulación y valores EC_{50} comparables a
o mayores que los de la GH de tipo salvaje.
Las muteínas de GH que retienen actividad in
vitro pueden ser PEG-iladas utilizando un
PEG-maleímida de 8 kDa reactivo a la cisteína (o
PEG-vinilsulfona) disponible comercialmente en
Shearwater, Inc. Por lo general, los métodos para
PEG-ilar las proteínas con estos reactivos serán
similares a los descritos en las solicitudes de patentes WO9412219
y WO9422466 y la solicitud PCT US95/06540, con modificaciones
menores. Las proteínas recombinantes pueden reducirse parcialmente
con ditiotreitol (DTT) para alcanzar una PEG-ilación
óptima de la cisteína libre. Aunque la cisteína libre no está
involucrada en un enlace disulfuro, es relativamente no reactiva a
los PEGs reactivos a la cisteína a menos que se realice este paso de
reducción parcial. La cantidad de DTT requerida para reducir
parcialmente cada muteína puede determinarse empíricamente
utilizando un intervalo de concentraciones de DTT. Típicamente, un
exceso molar de 5 a 10 veces de DTT durante 30 minutos a
temperatura ambiente es suficiente. La reducción parcial puede
detectarse mediante un ligero cambio en el perfil de la dilución de
la proteína a partir de una columna de fase reversa. Debe tenerse
cuidado de no reducir en exceso la proteína y exponer residuos
adicionales de cisteína. La reducción excesiva puede detectarse
mediante HPLC de fase reversa (la proteína tendría un tiempo de
retención similar a la proteína reducida totalmente y
desnaturalizada) y mediante la aparición de moléculas de GH
contentivas de dos PEGs (detectables mediante un cambio en el peso
molecular en el SDS-PAGE). La GH de tipo salvaje
puede servir como control, ya que no debe PEG-ilarse
bajo condiciones similares. El exceso de DTT puede eliminarse
mediante cromatografía de exclusión por tamaños utilizando columnas
de fase reversa. La proteína parcialmente reducida puede hacerse
reaccionar con diversas concentraciones de
PEG-maleímida (PEG: proporciones molares de la
proteína de 1:1, 5:1, 10:1 y 50:1) para determinar la proporción
óptima de los dos reactivos. La PEG-ilación de la
proteína puede monitorearse mediante cambio del peso molecular
utilizando electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecil
sulfato de sodio (SDS-PAGE). La cantidad más baja
de PEG que arroja cantidades significativas de producto
mono-PEG-ilado sin aportar producto
di-PEG-ilado se considerará óptima
(80% de conversión a producto
mono-PEG-ilado es considerada como
buena). Generalmente la proteína
mono-PEG-ilada puede purificarse a
partir de proteína no PEG-ilada y PEG no reaccionado
mediante exclusión por talla o cromatografía de intercambio iónico.
La proteína PEG-ilada purificada puede someterse a
prueba mediante el ensayo de proliferación celular antes descrito
para determinar su actividad específica.
Los experimentos anteriores permitirán la
identificación de aminoácidos en el lazo B-C, lazo
C-D o extremo del terminal N del lazo
A-B en GH que pueden ser modificados a residuos de
cisteína, PEG-ilados, y retener la actividad
biológica in vitro. Estas muteínas pueden ser sometidas a
prueba en modelos de enfermedad animal bien conocidos en la
técnica.
Pueden llevarse a cabo experimentos para
confirmar que la molécula de PEG se ha enlazado a la proteína en el
sitio apropiado. Esto puede lograrse mediante digestión proteolítica
de la proteína, purificación del péptido PEG (que tendrá un alto
peso molecular) mediante exclusión por tamaño, intercambio iónico o
cromatografía de fase reversa, seguido por secuenciación del
aminoácido o espectroscopía de masas. El aminoácido unido a PEG
aparecerá como una ausencia en el ensayo de secuenciación
aminoácidica.
Las propiedades farmacocinéticas de las
proteínas PEG-GH pueden determinarse como sigue, o
como las describe la solicitud de patente WO9422466. Los pares de
ratas o de ratones pueden recibir una inyección intravenosa de bolo
de las proteínas que se prueban. Los niveles de circulación de las
proteínas se miden en el curso de 24 horas retirando una pequeña
muestra de sangre de los animales en los puntos de tiempo deseados.
Los niveles de circulación de las proteínas que se prueban pueden
cuantificarse utilizando ensayos ELISA. Pueden llevarse a cabo
experimentos adicionales utilizando la vía subcutánea para
administrar las proteínas. Experimentos similares deben llevarse a
cabo con la proteína no PEG-ilada para servir como
control. Estos experimentos revelarán si la inserción de un
reactivo de tipo PEG incrementará la vida media circulante de la
proteína con relación a la proteína no PEG-ilada.
Las moléculas de PEG mayores y/o la inserción de múltiples moléculas
PEG deben extender la vida media en circulación más que las
moléculas de PEG de menor tamaño.
Las proteínas PEG-GH pueden
someterse a prueba en modelos de deficiencia en la hormona de
crecimiento en roedores (Cox et al., 1994) y de caquexia
(Tomas et al., 1992; Read et al., 1992), para
determinar esquemas óptimos de dosificación y demostrar eficacia.
Estos estudios pueden explorar moléculas de PEG de diferentes
tamaños, e. g., 8 y 20 kDa y esquemas de dosificación para
determinar el tamaño de PEG óptimo y el esquema de dosificación. Se
espera que las moléculas de PEG mayores extiendan la media vida
circulante más que las moléculas de PEG menores y que requieran
dosis menos frecuentes. Sin embargo, las proteínas más grandes
pueden tener potencialmente volúmenes de distribución reducidos
in vivo; por tanto, es posible que un PEG de 20 kDa unido a
la GH limitará la biodisponibilidad, reduciendo su eficacia. Los
modelos en roedores permitirán determinar si éste es el caso. Una
vez que se hayan determinado los esquemas de dosificación óptima y
de tamaños de PEG, la eficacia de la PEG-GH o GH
puede compararse en los modelos animales. Aunque las proteínas PEG
GH que tienen actividad GH se incluyen en la presente invención, las
proteínas PEG-GH preferidas son las que estimulan
un crecimiento igual o superior al de la GH, pero que pueden ser
administradas con menor frecuencia. Las PEG-GH
deben ser más eficaces que la GH cuando ambos se administran
utilizando los esquemas de dosificación menos frecuentes.
Un modelo de deficiencia de la GH que puede
utilizarse es una rata hipofisectomizada. La GH estimula la ganancia
en peso corporal y el crecimiento de huesos y cartílagos en este
modelo (Cox et al., 1994). Las ratas hipofisectomizadas
pueden comprarse a Charles River. Las ratas pueden inyectarse con
GH, PEG-GH o placebo y la ganancia en peso puede
medirse diariamente en un período de 10 a 14 días. Al momento del
sacrificio, puede determinarse el ancho de la epífisis de la tibia
como medida del crecimiento óseo. Los métodos experimentales para
llevar a cabo estos estudios se describen en Cox et al.,
(1994).
La eficacia de la PEG-GH en
modelos de caquexia en roedores puede ser probada de manera similar.
La administración diaria de dexametasona, mediante bombas osmóticas
o la inyección subcutánea puede utilizarse para inducir la pérdida
de peso (Tomas et al., 1992; Read et al., 1992,
solicitud de patente PCT de US95/06540).
Todos los documentos citados en la presente
solicitud se incorporan aquí como referencia.
Los análogos de proteínas presentados aquí
pueden utilizarse para los usos terapéuticos conocidos de las
proteínas nativas esencialmente en las mismas formas y dosis todas
bien conocidas en la técnica.
Aunque las realizaciones preferidas de la
presente invención, presentadas a manera de ejemplo, se describen
en la presente solicitud con particularidad, los expertos en la
técnica reconocerán cambios, modificaciones, adiciones y
aplicaciones diferentes de las específicamente descritas aquí y
podrán adaptar las realizaciones preferidas y los métodos sin
apartarse del espíritu de esta invención.
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<170> PatentIn Ver. 2.0
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Cebador de PCR
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<400> 41
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\hskip-.1em\dddseqskipccccgtcgac tctagagcca ttagatacaa agctcttggg
\hfill40
Claims (28)
1. Una variante con cisteína de la hormona de
crecimiento (ID. SEC. NO: 1), en la que dicha variante comprende
las cuatro cisteínas nativas C53, C165, C182 y C189, y en la que
dicha variante comprende un residuo de cisteína que sustituye a un
aminoácido seleccionado entre el grupo que consta de: un aminoácido
localizado en el extremo del terminal N del lazo
A-B, que corresponde a los aminoácidos
34-52 de la ID. SEC. NO: 1, un aminoácido localizado
en el lazo B-C, un aminoácido localizado en el lazo
C-D, un aminoácido localizado en los primeros tres o
los últimos tres aminoácidos de la hélice A, un aminoácido
localizado en los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de
la hélice B, un aminoácido localizado en los primeros tres o los
últimos tres aminoácidos de la hélice C, un aminoácido localizado
en los primeros tres o los últimos tres aminoácidos de la hélice D,
un aminoácido localizado en los aminoácidos que preceden a la hélice
A, y un aminoácido localizado en los aminoácidos que siguen a la
hélice D;
en la que dicha variante posee la capacidad de
provocar in vitro la proliferación de una línea celular que
prolifera en respuesta a la hormona del crecimiento.
2. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo
que consta de: F1, T3, P5, E33, A34, K38, E39, Q40, S43, Q46, N47,
P48, Q49, T50, S51, A98, N99, S100, G104, A105, S106, E129, D130,
G131, S132, P133, T135, G136, Q137, K140, Q141, T142, S144, K145,
D147, T148, N149, S150, H151, N152, D153, S184, E186, G187, S188 y
G190.
3. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en la región de
la hormona del crecimiento que precede a la hélice A.
4. La variante con cisteína según la
reivindicación 3, en la que un residuo de cisteína sustituye a
F1.
5. La variante con cisteína según la
reivindicación 3, en la que un residuo de cisteína sustituye a
T3.
6. La variante con cisteína según la
reivindicación 3, en la que un residuo de cisteína sustituye a
P5.
7. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en la región de
la hormona del crecimiento que sigue a la hélice D.
8. La variante con cisteína según la
reivindicación 7, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo
constituido por S184, E186, G187, S188, y G190.
9. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en el extremo del
terminal N del lazo A-B de la hormona de
crecimiento, correspondiente a los aminoácidos
34-52 de la ID. SEC. NO: 1.
10. La variante con cisteína según la
reivindicación 9, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo
constituido por A34, K38, E39, Q40, S43, Q46, N47, P48, Q49, T50 y
S51.
11. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en el lazo
C-D de la hormona de crecimiento.
12. La variante con cisteína según la
reivindicación 11, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo
constituido por D130, G131, S132, P133, T135, G136, Q137, K140,
Q141, T142, S144, K145, D147, T148, N149, S150, H151, N152 y
D153.
13. La variante con cisteína según la
reivindicación 11, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo
constituido por S132, P133, Q137, K140, S144 y T148.
14. La variante con cisteína según la
reivindicación 11, en la que un residuo de cisteína sustituye a
P133.
15. La variante con cisteína según la
reivindicación 11, en la que un residuo de cisteína sustituye a
S132.
16. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en el lazo
B-C de la hormona de crecimiento.
17. La variante con cisteína según la
reivindicación 16, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido seleccionado entre el grupo
constituido por A98, N99, S100, G104, y A105.
18. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en la región de la
hormona de crecimiento, seleccionado entre el grupo que consta de
los primeros tres aminoácidos de la hélice A o los últimos tres
aminoácidos de la hélice A.
19. La variante con cisteína según la
reivindicación 18, en la que un residuo de cisteína sustituye a
E33.
20. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en la región de la
hormona de crecimiento, seleccionado entre el grupo que consta de
los primeros tres aminoácidos en la hélice B o los últimos tres
aminoácidos en la hélice B.
21. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en la región de la
hormona de crecimiento, seleccionado entre el grupo que consta de
los primeros tres aminoácidos de la hélice C o los últimos tres
aminoácidos de la hélice C.
22. La variante con cisteína según la
reivindicación 21, en la que un residuo de cisteína sustituye a un
aminoácido seleccionado entre el grupo constituido por S106 y
E129.
23. La variante con cisteína según la
reivindicación 1, en la que dicha variante comprende un residuo de
cisteína que sustituye a un aminoácido localizado en la región de la
hormona de crecimiento, seleccionado entre el grupo que consta de
los primeros tres aminoácidos de la hélice D o los últimos tres
aminoácidos de la hélice D.
24. La variante con cisteína según una
cualquiera de las reivindicaciones 1-23, en la que
el residuo de cisteína que sustituye se modifica con un resto
reactivo a cisteína.
25. La variante con cisteína según una
cualquiera de las reivindicaciones 1-23 en la que la
variante de cisteína se modifica con polietilenglicol (PEG).
26. La variante con cisteína según una
cualquiera de las reivindicaciones 1-23 en la que el
residuo de cisteína que sustituye se modifica con polietilenglicol
(PEG).
27. Una variante con cisteína de la hormona de
crecimiento según una cualquiera reivindicación precedente para su
empleo en medicina.
28. Uso de una variante con cisteína de la
hormona de crecimiento, como se define en una cualquiera de las
Reivindicaciones 1-26, en la preparación de un
medicamento para la estimulación del metabolismo del hueso,
cartílago o músculo, la estimulación del crecimiento somático
durante la infancia, para el tratamiento de la baja estatura que
sea resultado de una inadecuación de la hormona de crecimiento y
fallo renal en niños, o el tratamiento de la caquexia en pacientes
con SIDA o la caquexia asociada a otras enfermedades.
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