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ES2199944T3 - Procedimiento para la elaboracion de una cepa mutante geneticamente estable de vibrio cholerae. - Google Patents

Procedimiento para la elaboracion de una cepa mutante geneticamente estable de vibrio cholerae.

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ES2199944T3
ES2199944T3 ES93916907T ES93916907T ES2199944T3 ES 2199944 T3 ES2199944 T3 ES 2199944T3 ES 93916907 T ES93916907 T ES 93916907T ES 93916907 T ES93916907 T ES 93916907T ES 2199944 T3 ES2199944 T3 ES 2199944T3
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ES
Spain
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cholerae
peru
strains
ctx
Prior art date
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Expired - Lifetime
Application number
ES93916907T
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English (en)
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John J. Mekalanos
David Beattie
Kevin Killeen
Yichen Lu
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Celldex Therapeutics Inc
Harvard University
Original Assignee
Harvard University
Avant Immunotherapeutics Inc
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Publication date
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Abstract

LA INVENCION OFRECE ESPECIES MUTANTES ESTABLES GENETICAMENTE NO TOXIGENICOS DE V. CHOLERAE Y UN METODO PARA HACER QUE SEAN UTILES COMO VACUNAS ORALES, VIVAS PARA INDUCIR LA PROTECCION INMUNOLOGICA CONTRA EL COLERA. LAS ESPECIES MUTANTES SON MUTANTES GENETICAMENTE DISEÑADAS, EN LAS CUALES LA CARENCIA DE ADN CODIFICA UNA SUBUNIDAD CTXA FUNCIONAL QUE ES LA RESPONSABLE DE MUCHOS DE LOS SINTOMAS DEL COLERA. A LAS ESPECIES TAMBIEN LES FALTAN SECUENCIAS ATTRS1 FUNCIONALES QUE SE REQUIEREN PARA LA RECOMBINACION Y AMPLIACION DEL ELEMENTO GENETICO CTX. ESTAS ESPECIES SON SEGURAS PORQUE NO PUEDEN RECOMBINARSE CON LOS MEDIOS QUE CONTIENEN ATTRS1 DE TIPO SILVESTRE QUE INCLUYEN EL ADN QUE CODIFICA CTXA.

Description

Procedimiento para la elaboración de una cepa mutante genéticamente estable de Vibrio cholerae.
El campo de la invención son las vacunas de Vibrio cholerae. Tras más de 100 años de investigaciones sobre el cólera existe todavía la necesidad de una vacuna contra el cólera eficaz. Ha habido seis pandémicos de esta enfermedad provocados por tipos de cólera V que pertenecen al biotipo "clásico". Los agentes etiológicos del pandémico actual (el séptimo) pertenecen al biotipo "El Tor" (Finkelstein, Crit. Rev. Microbiol 2:553-623, 1973, Wachsmuth y otros, The Lancet 337:1097-1098, 1991). Recientemente, el séptimo pandémico se ha extendido a un nuevo escenario, el de Sudamérica. A principios de Enero de 1991, una epidemia de cólera provocó más de 250.000 casos y más de 2.000 muertes en Perú, Ecuador, Colombia, y Chile. Antes de esta epidemia se estimó que se producían más de 200.000 casos de cólera por año, principalmente en la India, Bangladesh, África y el Oeste de Asia (Tacket y otros, Cholera Vaccines. En Vaccines: New Approaches to Immunological Problems, Ellis, R. W., editor, Butterworth-Heinemann, Boston, 1992).
En Noviembre de 1992, una forma non-01 de V. cholerae antigénicamente distinta emergió en la India y en Bangladesh y en ocho meses provocó unos 500.000 casos estimados y 6.000 muertes. El potencial pandémico de esta nueva cepa, designada como serogrupo 0139 sinónimo "Bengal", parece asegurado y es un nuevo motivo de preocupación en todo el mundo en desarrollo. Estas recientes experiencias destacan la necesidad de unas vacunas efectivas del cólera contra enfermedades debidas a El Tor 01 y a los serotipos 0139 Bengal del V. cholerae.
Debido a que la infección natural del cólera y la recuperación de la misma de éste induce una inmunidad que dura por lo menos 3 años (Tacket y otros, Supra; Levine y otros, J, Infect. Dis. 143:818-820, 1981; Cash y otros, J. Infect. Dis. 130: 325-333, 1974), se ha realizado un gran esfuerzo para producir vacunas de cólera atenuado de virus vivos que al administrarse por vía oral imitarían la enfermedad en sus propiedades de inmunización pero no producirían los síntomas o reacciones adversos en el individuo inmunizado (es decir, mostrar una baja reactogenicidad). Las vacunas de este tipo suponen la eliminación de mutaciones que inactivan el gen que codifica la subunidad A de la toxina del cólera, una proteína que es responsable de la mayoría de las diarreas que se dan en esta enfermedad (Mekalanos y otros, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79:151-155, 1982; Mekalanos y otros, Nature 306:551-557, 1983; Kaper y otros, Nature 308:655-658, 1984; Kaper y otros, Biotecnología 2:345, 1984; Pierce y otros, Infect. Immun. 55:477-481, 1987; Taylor y otros, Vaccine 6:151-154, 1988; Levine y otros, Infn. Immun. 56; 161-167, 1988; Herrington y otros J. Exper. Med. 168:1487-1492, 1988; Levine y otros, Lancet ii:467-470, 1988; Koper y otros, Res. Microbiol. 141:901-906, 1990; Pearson y otros, Res. Microbiol. 141:893-899, 1990). Véase también Mekalanos, Patentes americanas Nos. 5.098.998 y 4.882.278, y Koper y otros, patente americana No. 4.935.364, que se incorporan aquí por referencia. Aunque se han desarrollado vacunas de virus muertos con células enteras de administración oral y diversas vacunas de virus vivos de cólera atenuado, la más prometedora de éstas proporciona una pequeña protección contra el biotipo El Tor del V. cholerae y probablemente ninguna protección contra el serotipo 0139. La principal cuestión asociada a las vacunas del cólera es la seguridad, la estabilidad y su grado de antigenicidad.
Con relación a los genes de la toxina de V. cholerae, la diversidad genética entre cepas toxicógenas y no toxicógenas ha sido examinada por Chen y otros (1991, Epidemiol. Infect. 107:225). Mekalanos (1983, Cell 35:253) informa acerca de la duplicación y amplificación de los genes de la toxina de V. cholerae, Millar y otros (1984, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:3471) expone la regulación trascripcional de los genes de toxina. Otros genes del V. cholerae, cuyos productos pueden desempeñar un papel en la patogenicidad de este organismo, incluyen los genes "pilus" corregulados por toxina (Shaw y otros, 1990, Infect. Immun. 58:3042; Sharma y otros, 1989, Vaccine, 7:451; Sun y otros, 1990, J. Infect. Dis. 161:1231; Hall y otros, 1991, Infect. Immun. 59:2508; Taylor y otros, 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:2833), y el gen que codifica el factor de colonalización (Taylor y otros, 1988, Vaccine 6:151).
La invención presenta, en un aspecto, cepas mutantes genéticamente estables y no toxicógenas de V. cholerae que resultan útiles como vacunas orales de virus vivos para inducir las cepas mutantes estables inmunológicas del V. cholerae que son útiles como vacunas de administración oral de virus vivos para inducir una protección inmunológica contra el cólera. Las cepas mutantes son mutantes modificados genéticamente que carecen del ADN que codifica una subunidad ctxA funcional y también carecen de cualquier secuencia attRS1 funcional. Se entiende por secuencia attRS1 una secuencia de 17 pares de bases contenida en el elemento genético CTX que se requiere para la recombinación y amplificación del elemento genético CTX, o suficiente de esa secuencia para permitir tal recombinación y amplificación. Mutantes que "carecen de cualquier secuencia attRS1 funcional" son aquellos que substancialmente no pueden experimentar una recombinación en un punto específico con vehículos que contienen attRS1, debido a que las secuencias attRS1 de tipo salvaje están totalmente suprimidas o están lo suficientemente suprimidas o mutadas como para evitar tal recombinación. En consecuencia, dichas cepas de V. cholerae son más seguras debido a que no pueden recombinarse con vehículos que contienen attRS1 de tipo salvaje que incluyen el ADN que codifica ctxA.
La invención también presenta, en otro aspecto de la misma, un procedimiento para la producción de las cepas de V. cholerae descritas anteriormente. El procedimiento implica la introducción de un plásmido en V. cholerae de tipo salvaje que contiene un fragmento de ADN de V. cholerae que incluye una mutación en las secuencias ctxA y attRS1. El fragmento de ADN de V. cholerae es capaz de recombinarse con ADN de V. cholerae de tipo salvaje dentro del organismo para generar la cepa mutante.
\newpage
Aunque puede utilizarse cualquier serotipo de V. cholerae, en realizaciones preferidas, la cepa mutante de V. cholerae pertenece al serotipo El Tor, y más preferiblemente, al serotipo Inaba u Ogawa o el serotipo non-01 de V. cholerae, preferiblemente el serotipo "Bengal" 0139. Preferiblemente, los mutantes carecen de todo el núcleo CTX y secuencias attRS1 y más preferiblemente la cepa mutante es Perú-2, Band-2, Bah-2, o un derivado del serotipo Bengal, tal como Bengal-2 ("Beng-2") o Bengal-3 ("Beng-3") tal como se describe a continuación.
Nuestras cepas mutantes incluyen opcionalmente mutaciones adicionales introducidas para mejorar la seguridad y/o la inmunogenicidad de la vacuna. Dichas mutaciones adicionales incluyen, pero no se limitan a ellas, la inactivación de uno o más genes implicados en la recombinación de ADN, por ejemplo el gen recA codificado por la cepa, y la introducción de genes adicionales que puede introducirse en el cromosoma del V. cholerae, preferiblemente en el gen lacZ V. cholerae. Genes adicionales preferidos incluyen un gen que codifica la subunidad B del V. cholerae o cualquier antígeno heterólogo tal como la subunidad B de toxina de tipo Shiga, o un gen que codifica el antígeno CFA E. coli, o un antígeno de VIH antigénico. Se entiende por antígeno heterólogo cualquier antígeno que no se expresa normalmente por V. cholerae. Por ejemplo, el antígeno heterólogo puede ser antígeno lipopolisacárido Shigella (LPS), toxina Shiga, diversos antígenos CFA de cepas de E. coli enterotoxigénico, toxina de ántrax, endotoxina A pseudomonas, fragmentos antigénicos de cápside de VIH, toxina pertussis, toxina tetánica; antígenos del virus del Herpes, virus de la rubéola, virus de la gripe, virus de las paperas, virus del sarampión, virus de la poliomielitis; y polipéptidos inmunógenos de parásitos eucariotas que provocan la malaria, neumonía Pneumocystis, y toxoplasmosis, pueden expresarse en una vacuna de virus vivos de V cholerae. Preferiblemente, la cepa mutante que presenta mutaciones adicionales es Perú-14, Perú-3, Perú- 4, Perú-5, Bang-3, Bang-5, Bah-3, Bah-4, Bah-5 o un derivado atenuado de Bengal.
Se entiende por subunidad ctxA la subunidad A de la toxina del cólera que es responsable, si es funcional, de muchos de los síntomas del cólera (por ejemplo, náuseas, diarrea, etc). Más preferiblemente, las cepas incluyen la supresión de todo el denominado "elemento genético central", que incluye no solamente la ctxA/B, sino también la zona conocida como ICF (Factor de Colonización Intestinal, probablemente equivalente al CEP "pilin central codificado") y ZOT, que se describe en mayor detalle a continuación.
En otro aspecto, la invención presente una cepa mutante genéticamente estable no toxicógena de V. cholerae que es útil como vacuna de administración oral de virus vivos para inducir una protección inmunológica contra el cólera. La cepa mutante es un mutante modificado genéticamente al que le falta ADN que codifica una subunidad ctxA funcional. La cepa también puede ser deficiente a la penetración de agar blando. Por deficiente a la penetración de agar blando se entiende que no tiene la capacidad de penetrar un medio de alta viscosidad tal como se mide in vitro por aglomeración sobre y en el medio agar que es entre un 0,25 y un 0,4% de agar. La cepa preferible puede ser también filamentosa, es decir, un 25% o más células mayor de 15 nM de longitud bajo condiciones de crecimiento logarítmico. En realizaciones preferidas la cepa es también ATT-.
En realizaciones preferidas, nuestra vacuna comprende por lo menos dos cepas diferentes de V. cholerae que son mutantes genéticamente estables no toxicógenas los cuales carecen del ADN que codifica una subunidad ctxA funcional y son también deficientes a la penetración del agar blando. Una de las dos cepas se deriva preferiblemente de la cepa Perú y la otra se deriva de la cepa Bengal. Cada una de las cepas componente puede ser ctx^{-}, att^{-}, y recA^{-}. Dependiendo de la epidemiología local relevante, las cepas de la vacuna pueden administrarse juntas en una única dosis, o más preferiblemente, de manera separada con un intervalo de 7 a 28 días. Si el único de los serotipos presenta un tratamiento de una enfermedad, puede ser preferible administrar un régimen de vacunas que comprenda solamente una cepa.
La invención presenta también, en otro aspecto de la misma, una vacuna de cólera de administración oral de virus muertos que comprende por lo menos una primera y una segunda cepa V. cholerae en la que por lo menos dos de las cepas son serotipos distintos y todas las cepas de la mezcla carecen de ADN que codifica una subunidad ctxA funcional. La vacuna contiene también una subunidad B de toxina del cólera producida por al menos uno de los serotipos. Preferiblemente, uno de los serotipos de la vacuna es un serotipo Ogawa y otro de los serotipos es un serotipo Inaba. Más preferiblemente, la vacuna de administración oral de virus muertos comprende Bah-3 y Peru-3 o bien Bang-3, o tanto Perú-3 como Bang-3, tal como se define a continuación. Cualquiera de las combinaciones de vacuna de administración oral puede incluir también células del serotipo Bengal, tal como se define a continuación, incluyendo Bengal-2 y Bengal-3. Las cepas pueden administrarse individualmente, juntas, o en dosis consecutivas con un intervalo de 7 a 28 días.
La invención también presenta, en otro aspecto de la misma, un procedimiento para la elaboración de una vacuna V. cholerae de virus muertos. El procedimiento supone el crecimiento de por lo menos una primera y una segunda cepa de V. cholerae, en el que cada cepa de la mezcla carece de ADN que codifica una subunidad ctxA funcional. Las cepas se recogen después del medio de crecimiento y las células se matan. La subunidad B de la toxina del cólera, producida por al menos una de las cepas se obtiene del medio en el cual la cepa se propagó y se añade a las células muertas. La mezcla de bacterias muertas y la subunidad B de la toxina del cólera se suspende entonces en un portador farmacéuticamente aceptable.
Mutantes tales como los descritos anteriormente resultan útiles como vacunas de cólera y se han mejorado sus propiedades genéticas en comparación con vacunas anteriores.
\newpage
Otras características y ventajas de la invención resultarán evidentes a partir de la siguiente descripción de realizaciones preferidas de la misma.
Primero se describirán brevemente los dibujos.
La figura n° 1 es un diagrama esquemático de los elementos genéticos CTX de cepas de V. cholerae toxicógeno P27459-Sm, C6709-Sm y E7946-Sm. Los cuadros llenos representan secuencias RS1. Entre las secuencias RS1 se encuentra una zona mostrada como un cuadro abierto (denominada zona central) que contiene los genes ctxAB y genes que codifican zot, el factor de colonización intestinal (ICF). En los extremos de RS1 las secuencias están rellenas en círculos que representan copias de secuencias que corresponden a 16 de 17 bases con la secuencia de 17 pares de bases attRS1 (CCTAGTGCGCAATTATGT) [SEC. ID. N° 1]. Aunque los elementos CTX de las tres cepas varían en su estructura en base al número de copias de las zonas RS1 y central, debería indicarse que estos elementos se encuentran insertados en el mismo sitio cromosómico en todas las cepas El Tor del V. cholerae.
La figura n° 2 (A) es un mapa de restricción del cromosoma que contiene la zona CTX de la cepa C6709-Sm con el elemento CTX mostrado esquemáticamente como en la figura n° 1. No se muestran los mapas de restricción de la cepa P27459-Sm y E7946-Sm que son las mismas excepto para la variación observada en sitios que se aplican dentro del núcleo del elemento CTX o secuencias RS1 tal como se ha designado esquemáticamente en la figura n° 1. (B) mapa de restricción de la zona cromosómica correspondiente de la cepa Bang-1, Bah-1, y Perú-1.
La figura n° 3 (A) mapa de restricción del plásmido pGP60 que lleva un fragmento de ADN insertado correspondiente al cromosoma que contiene la zona CTX de la cepa P27459-Sm con el elemento CTX mostrado esquemáticamente como en la figura n° 1. Por debajo de éste existe una flecha de dos puntas que designa el ADN que se ha suprimido en el plásmido pAR62. (B) El mapa de restricción de la zona CTX de la cepa P27459-Sm se muestra incluyendo los sitios de restricción que se encuentran fuera de la zona clonada en el plásmido pGP60. (C) Una demostración de los casos de recombinación (líneas a trazos) entre el plásmido pAR62 y el cromosoma que producía la supresión Tipo-2 que dio lugar, en cepas parenterales C6709-Sm, P27459-Sm y E7946-Sm, a la supresión de mutantes Perú-2, Bang-2, y Bah-2, respectivamente. (D) Mapa de restricción del cromosoma de las cepas Perú-2, Bang-2, y Bah-2.
La figura n° 4 es una representación esquemática de la configuración del plásmido pGP52.
La figura n° 5 es una representación esquemática de la generación de pJM84.1 y pJM84.2. Se generó, mediante PCR, un fragmento de 0,6 kb que codifica una subunidad B sin estimulación. Este ADN fue ligado en pCR100 y digerido con SpeI/EcoRI. El fragmento de restricción de 0,6 kb resultante fue ligado en vectores pVC100 y pRT41 digeridos EcoRI/XbaI, produciendo pJM1001 y pJM411, respectivamente. Cada plásmido fue digerido con BamHI/EcoRI, tratado con Klenow, flanqueado con elementos de enlace XbaI, y digerido con XbaI. Los fragmentos purificados fueron ligados a pGP84 digerido XbaI, produciendo pJM84.1 y pJM84.2.
La figura n° 6 es una representación esquemática de la inserción de la ctxB en el cromosoma. Se integró pJM84.1 no replicativo en Perú-2, Bang-2 o Bah-2 por recombinación homóloga. Posteriormente se recubrieron colonias recombinantes resistentes a la ampicilina en un medio que contenía estreptomicina sin ampicilina, reduciendo, de este modo, la presión selectiva para la resistencia a la ampicilina. Las colonias resultantes sensibles a la ampicilina se aislaron y fueron seleccionadas para la extirpación del ADN flanqueado por secuencias de ADN recA homólogo.
Contemplamos el uso de cepas atenuadas de V. cholerae que pueden utilizarse como vacunas de administración oral de virus vivos o bien de virus muertos para proteger a las personas contra el cólera y potencialmente otras enfermedades.
Elaboración de vacunas
En Perú en 1991 se elaboraron derivados atenuados de una cepa de V. cholerae C6709-Sm aislada de un paciente de cólera las cuales pueden utilizarse como vacunas de administración oral del cólera con virus vivos. Los derivados Perú-1 y Perú-2, llevan deleciones pequeñas de tipo-1 (núcleo) y deleciones grandes de tipo-2, respectivamente, que extraen el ADN que codifica la toxina del cólera además del ADN que codifica zot, un factor de colonización intestinal (ICF) que no está relacionado con la toxina del cólera. Debido a que una excesiva colonización intestinal puede ser responsable de efectos secundarios negativos observados en humanos administrados con anteriores vacunas prototipo del cólera de virus vivos, la supresión de genes que codifican tanto la toxina del cólera como el ICF en Perú-1 y Perú-2 hará que estas cepas sean menos reactogénicas en vacunas a la vez que retienen sus propiedades inmunógenas y, por lo tanto, protectoras.
La deleción grande de tipo-2 presente en el Perú-2 también elimina una secuencia de tipo inserción denominada RS1 que está presente en dos o más copias como parte de un segmento de ADN mayor denominado elemento genético CTX. La secuencia RS1 codifica un sistema de recombinación en un punto específico que puede duplicarse a una elevada frecuencia y provocar la inserción del elemento CTX en el cromosoma del V. cholerae en un sitio de destino de 17 pares de bases denominado attRS1. En los extremos de las secuencias RS1 existen unas secuencias casi idénticas a attRS1 (y recombinantemente activas aparentemente). Estas secuencias son como sigue:
Secuencias attRS1 y cromosómicas flanqueadoras
5'- TAAACCTAGAGACAAAATGTTCCTAGTGCGCATTATGTATGTTATGTTAAAT-3' [SEC. ID. N° 2]
Lado izquierdo de RS1 y unión cromosómica
5'-TAAACCTAGAGACAAAATGTTCCTAGTGCGCATTATGTGGCGCGGCAT...RS1... -3' [SEC. ID. N° 3]
Lado derecho de RS1 y unión cromosómica
5'-AAACCCTAGATTCCGCCGCCTTAGTGCGCATTATGTATGTTATGTTAAAT-3' [SEC. ID. N° 4]
Se han subrayado la secuencia attRS1 y una similar presentes en los extremos de la RS1. Nótese que la secuencia cromosómica que flanquea la attRS1 está presente en el lado izquierdo y en el lado derecho de la RS1, encontrándose la única superposición en una secuencia de 17 pares de bases que es idéntica a la attRS1 del extremo izquierdo de la RS1 y una secuencia de 18 pares de bases que coincide con 17/18 pares de bases con la attRS1.
Las vacunas del cólera atenuado de virus vivos modificado genéticamente son teóricamente seguras solamente si no pueden volver, o de otra manera, recuperar la capacidad para producir la toxina del cólera. Las cepas que llevan una única copia de la secuencia attRS1 pueden adquirir eficazmente una nueva copia del elemento CTX a través de una transferencia de ADN a través de la conjugación del factor P o bien por transducción bacteriófaga. De este modo, las deleciones que hacen que el V. cholerae carezca de secuencias RS1 y attRS1 pueden evitar que una cepa para vacunas vuelva a adquirir el elemento genético CTX en naturaleza a través de su propio sistema de recombinación de sitio específico. Dicha deleción se encuentra presente en la cepa Perú-2 y sus derivados.
Se han elaborado seis cepas mutantes de V. cholerae con propiedades similares pero no idénticas. Se elaboraron cuatro cepas que llevan los mismos dos tipos de deleciones (Tipo-1 y Tipo-2) como cepas Perú-1 y Perú-2 en cepas de V. cholerae aislado de pacientes en Bangladesh (P27459-Sm) y Bahrain (E7946-Sm). Estos cuatro derivados, Bang-1, Bang-2, Bah-1 y Bah-2 son también el objeto de la invención ya que varían en colonización y/o otras propiedades (por ejemplo, serotipo) y son, por lo tanto, potencialmente más apropiadas que las cepas Perú correspondientes para la utilización como vacunas en otras zonas del mundo.
Aunque la deleción Tipo-1 más pequeña presente en las tres cepas Peru-1, Bang-1 y Bah-1 no elimina todas las copias de RS1, esta particular deleción afecta a las propiedades de colonización intestinal de algunas de estas cepas de una manera más severa que la deleción mayor presente en Perú-2, Bang-2 y Bah-2.
Elaboración de mutantes de deleción de Tipo-2
Una deleción de Tipo-2 elimina todas las secuencias que corresponden al elemento genético CTX incluyendo las secuencias RS1 y todas las copias de la secuencia attRS1 (figura n° 1). La deleción de Tipo-2 se elaboró a través de la recombinación entre el cromosoma del V. cholerae y las secuencias del plásmido clonado sobre el plásmido pAR62 tal como se muestra en la figura n° 3. El plásmido pAR62 es una derivado del plásmido pGP60 y lleva una deleción de Tipo-2 en la que se suprimió el fragmento mostrado en la figura n° 3. El plásmido pGP60 se elaboró en primer lugar generando una librería de genomas de la cepa P27459 mediante la inserción de fragmentos parcialmente digeridos de 20-30 kb Sau3A en el sitio BamHI del plásmido pLAFR2 (Friedman y otros, 1982, Gene 18:289). Las colonias fueron examinadas mediante hibridación utilizando unas sondas derivadas de la zona ctx (Mekalanos, 1983, Cell 35:253). Se recogió una colonia positiva y el plásmido que se aisló de la misma se denominó pGP60. Un análisis de enzimas de restricción de este plásmido confirmó que contenía todas las secuencias de elementos CTX y ADN de flanqueo adicional. El plásmido pGP60 codifica una resistencia a la tetraciclina. Este plásmido se introdujo en una cepa de V. cholerae por conjugación o electroporación seguido de una selección sobre un medio que contenía 3 \mug/ml de tretraciclina. Dicha cepa que lleva el plásmido fue examinada mediante hibridación de colonias con una sonda L-3 radioactiva preparada tal como se describe en Goldberg y Mekalanos (J. Bacterial. 165:723-731, 1986). Las colonias que llevan la deleción de Tipo-1 insertada en el cromosoma no hibridizada la sonda L-3 y, sorprendentemente, sucedía en una elevada frecuencia (es decir, alrededor de un 1% de las colonias examinadas). Se utilizó un ensayo Southern Blot para confirmar la presencia de las deleciones esperadas en estas cepas.
Elaboración de deleciones centrales (Tipo-1)
Una "deleción central" solamente elimina secuencias que corresponden al núcleo del elemento CTX pero deja detrás una copia del elemento RS1 en el cromosoma (Goldberg y otros, J, Bacteriol. 165:723-731, 1986) (Figura n° 2). Estas deleciones suceden de manera espontánea a través de la recombinación homóloga entre las secuencias RS1 situadas en el lado derecho y en el lado izquierdo de la zona central tal como se muestra en la figura n° 2. Las colonias de V. cholerae que contienen deleciones centrales pueden identificarse de dos maneras. En primer lugar, si la cepa lleva un marcador seleccionable tal como un gen que codifica resistencia a la Kanamicina insertado en la zona central, entonces la deleción central hace que dicha cepa sea sensible a la kanamicina (Goldberg y otros, J. Bacteriol. 165:723-731, 1986). En segundo lugar, las colonias que contienen la deleción central también pueden ser identificadas por hibridación de colonias utilizando una sonda CT-1 radioactiva que no hibridice a las cepas que llevan esta deleción (Golberg y otros, J. Bacteriol. 165:723-731, 1986). A través de cualquier método, las colonias que llevan estas deleciones se produjeron en una frecuencia de alrededor de un 1 por 1000 colonias examinadas. Se utilizó entonces un análisis por hibridación Southern Blot para confirmar las deleciones esperadas en estas cepas.
Un ensayo para las secuencias attRS1 funcionales en base a la integración del plásmido pGP52
El plásmido pGP52 es un plásmido suicida que solamente es capaz de replicarse en cepas de E. coli tales como SM10\lambdapir (Pearson y otros, 1990, Res. Microbiol. 141:893). El plásmido pGP52 se elaboró digiriendo en primer lugar el plásmido pGP7 (Mekalanos, 1983, Cell 35:253) con CLAI y SphI. Este plásmido contiene dos secuencias RS1 (designadas como RS1 y RS2) derivadas de la cepa de V. cholerae E7946-Sm. Se clonó un fragmento de ADN que contenía las secuencias RS1 en pBR322 y el plásmido resultante se denominó pGP20. Este plásmido fue digerido después con EcoRV (que se corta en las secuencias RS1). Cuando este plásmido quedó religado se generó un nuevo plásmido designado como pGP20R que contenía una versión híbrida de RS2 denominada RS2*, en la que las secuencias RS2 híbridas estaban flanqueadas por secuencias centrales. Se subclonó después un fragmento SspI-SphI de RS2 en el plásmido suicida pJM703.1 que había sido digerido con NruI y SphI. El plásmido pJM703.1 se describe en Millar y otros (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:3471). El plásmido resultante se denominó pGP52. En la figura n° 4 se muestra un diagrama que representa la configuración del pGP52.
Cuando el pGP52 es transferido por conjugación a cepas de V. cholerae que contienen secuencias attRS1, se integra en el cromosoma del V. cholerae mediante un evento de recombinación en un sitio específico entre la secuencia attRS1 en el cromosoma y la secuencia attRS1 presente en el plásmido. Los eventos de integración tales como éstos pueden ser cuantificados determinando el número de colonias que mantienen de manera estable (es decir, son no seleccionadas) la resistencia a la ampicilina debido a que la resistencia a la ampicilina se codifica mediante pGP52. La confirmación de la integración puede obtenerse en experimentos de hibridación Southern Blot. Si la cepa del V. cholerae a analizar presenta secuencias attRS1 funcionales entonces la integración se observará en el análisis. Si la cepa no contiene secuencias attRS1 funcionales, la integración no tendrá lugar.
Con el fin de evaluar la capacidad de los distintos candidatos de vacuna para servir como destinatarios para el pGP52, se llevaron a cabo los siguientes experimentos. Se mezcló una cepa E. coli donante SM10\lambdapir pGP52 con la cepa de la vacuna de ensayo del V. cholerae destinatario en 5 ml de un medio Luria broth a una concentración de 10^{7} células de cada cepa por cultivo. La mezcla se incubó a 37°C durante 5 horas en cuyo momento se diluyó 1:100 en un medio fresco Luria broth que contenía 100 \mug/ml de estreptomicina. La finalidad de la estreptomicina es seleccionar contra la cepa donante de E. coli matándola. De esta manera, solamente las cepas destinatarias del V. cholerae resistente a la estreptomicina son capaces de crecer. Este cultivo se incubó hasta que la velocidad de crecimiento de las células alcanzó la saturación. Los cultivos se diluyeron nuevamente y se incubaron también hasta que cada célula se había replicado un total de 20 veces en ausencia de cualquier selección positiva para el pGP52. Este cultivo se diluyó y se cubrió después sobre dos composiciones del medio separadas con el fin de cuantificar el número de colonias viables. Uno de estos medios es medio Luria broth que no contiene ningún antibiótico. El número de colonias que aparecen en estos recubrimientos representa el número total de células en el cultivo. El otro medio es Luria broth que contiene ampicilina. El número de colonias que aparece en estos revestimientos representa el número de eventos de integración que se producen tras la conjugación. Los resultados se expresan como una relación de integración estable de eventos/número total de células viables y se presenta a continuación en la Tabla 1.
TABLA 1 Datos de integración representativos en las cepas de vacuna Perú
Cepa Eventos de integración estable/# total de células viables
Perú-1 \hskip-2.3cm 5,2 x 10^{-5}
Perú-2 No detectable (< 5 x 10^{-8})
Perú-3 No detectable (< 5 x 10^{-8})
Perú-4 No detectable (< 5 x 10^{-8})
Perú-5 No detectable (< 5 x 10^{-8})
En base a estos datos es evidente que la cepa Perú-1, que contiene dos copias de las secuencias attRS1 es capaz de integrar el plásmido pGP52 en su cromosoma en una frecuencia que es por lo menos 1000 pliegues más alta que cualquiera de las otras cepas analizada, todas las cuales carecen de secuencias attRS1.
Caracterización sexológica de las cepas de vacuna
Las cepas de vacuna Perú-2, Bang-2, y Bah-2 se caracterizaban además en términos de sus propiedades sexológicas y de colonización. Los datos presentados en la Tabla 2 demuestran que cada derivado retenía su serotipo esperado (es decir, el serotipo de cada una de su respectiva cepa parental mutante) cuando se analizaron células bacteriales recién cosechadas por aglutinación sobre un portaobjeto utilizando un suero de tipificación Inaba u Ogawa Difco V. cholerae 01. Este resultado indica que estas cepas todavía expresan antígenos LPS. Otras pruebas demostraron que estas cepas mutantes eran móviles, prototróficas, y todavía expresan pili Tcp. De este modo, los mutantes expresan una serie de propiedades que son importantes para su capacidad para ser útiles como cepas de vacuna de virus vivos.
Propiedades de colonización de las cepas de vacuna y mutantes de deleción central
Para analizar las propiedades de colonización de estas cepas de vacuna, se utilizó un ensayo de competencia intestinal de ratones tal como se describe en Taylor y otros (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84:2833-2837, 1987) que se ha mostrado que se relaciona con exactitud con las propiedades de colonización de las cepas mutantes cuando se analizan posteriormente en voluntarios humanos (Herrington y otros, J. Exper. Med. 168:1487-1492, 1988). El ensayo mide diferencias en la colonización de una cepa mutante comparando su capacidad para competir por el crecimiento y supervivencia con otra cepa estrechamente relacionada o isogénica. En este ensayo, las cepas mutantes y competidoras se mezclaron en una proporción de aproximadamente 1:1 y después se introdujeron aproximadamente un millón de células de esta mezcla al estómago de ratones lactantes CD-1 de 3-5 días. Tras 24 horas, los ratones fueron sacrificados, se disecaron, se homogeneizaron, y se recubrieron sobre un medio bacteriológico que contenía estreptomicina que se selecciona para ambas cepas. A las colonias que crecieron tras la incubación durante la noche se analizó entonces los marcadores adicionales que diferencian la cepa mutante de la cepa competidora (es decir, resistencia a la kanamicina o hibridación con sondas de ADN radioactivo apropiadas; véase leyenda de la Tabla 3).
Tal como se muestra en la Tabla 3, el Bang-2 y el Bah-2 mostraron ambos un defecto de suave colonización intestinal que produjo una recuperación mayor de aproximadamente 4-13 pliegues de las cepas competidoras isogénicas que las cepas mutantes tras 24 horas de crecimiento en el intestino del ratón. En la Tabla 3 también se muestran los resultados de los ensayos de competición que implican cepas mutantes de deleción central Perú-1, Bang-1 y Bah-1. Al igual que las cepas de deleción de Tipo-2 Bang-2 y Bah-2, estos mutantes de deleción central fueron deficientes en la colonización respecto a sus cepas competidoras isogénicas. Debido a que las deleciones centrales eliminan las secuencias correspondientes al núcleo del elemento CTX (figuras n° 1 y 3), estos datos sugieren que el núcleo del elemento CTX codifica un "factor de colonización intestinal" o ICF. La toxina del cólera por sí misma no es un ICF. Las cepas SM44 y SM115 que son deficientes en la producción de la toxina del cólera debido a una deleción de los genes ctx y la inserción de un gen que codifica resistencia a la kanamicina tal como se describe en Goldberg y Mekalanos (J. Bacteriol. 165:723-731, 1986) compiten sus respectivas cepas mutantes (Bang-1, Bang-2 y Bah-1, Bah-2) en el ensayo de competencia intestinal. De este modo, resulta evidente que el SM44 y el SM115 generan el ICF si bien no producen la toxina del cólera, mientras que los mutantes no. Además, debido a que la zona central CTX era el único ADN que se suprime en el núcleo así como las deleciones de Tipo-2 y mutantes que llevan ambos tipos de deleciones eran similarmente deficientes en la colonización, puede concluirse también que el ICF se codifica por la zona central del elemento CTX tal como se muestra en la figura n° 1.
Recientemente, se ha encontrado que una nueva toxina denominada ZOT se codificada por la zona central (Baudry y otros, 1992, Infect. Immun. 60:428-434). Hemos demostrado que los mutantes del gen ZOT no producen el defecto de colonización observado en los mutantes de deleción de Tipo-1 y Tipo-2. En consecuencia, el ICF se designa como una propiedad independiente y distinta del ZOT. Las cepas de vacuna que se describen aquí que llevan deleciones de Tipo-1 o Tipo-2 son deficientes en ICT.
En cambio, la cepa Perú-2 no presentó una deficiencia importante en la colonización intestinal respecto a su cepa competidora C6709-Sm (Tabla 2). Sin embargo, la producción total de células de cada cepa C6709-Sm o Perú-2 en los ratones fue típicamente de 10-100 pliegues menor que las cepas SM44 o SM115, lo que sugiere que la cepa Perú C6709-Sm y su derivada Perú-2 ya pueden llevar un defecto de colonización no definido. Debido a que la deleción del núcleo de todo o parte del elemento CTX no provocó un defecto adicional en la colonización o en la cepa Perú-1 o bien Perú-2, puede concluirse que la cepa C6709-Sm ya es parcialmente deficiente en ICF si bien lleva secuencias de ADN que corresponden con la zona central CTX. La deleción de toda la zona CTX tal como se define por las mutaciones de Tipo-2 presentes en las cepas Perú-2, Bang-2 y Bah-3 asegura que los genes para el ICF no pueden reactivarse y llegar a ser funcionales en los derivados de la vacuna. La deleción de Tipo-2 de los genes ICF provoca aparentemente un suave defecto de colonización. Éste puede ser útil como mutación atenuante en el desarrollo de la vacuna del cólera, debido a que el ICF de tipo salvaje puede ser responsable de unos niveles indeseables de toxicidad.
TABLA 2 Propiedades de las cepas mutantes
Cepas Mutantes Cepa parental(*) Serotipo Tipo de deleción
Perú-2 C6709-Sm Inaba Tipo-2
Bang-2 P27459-Sm Ogawa Tipo-2
Bah-2 E7946-Sm Inaba Tipo-2
(*) Nótese que la designación "Sm" detrás del nombre de la cepa se refiere a la resistencia a la estreptomicina. Ésta es una cepa seleccionada de manera espontánea que es resistente a 100 \mug/ml de estreptomicina y fue el resultado de una mutación puntual espontánea en el gen para una proteína ribosómica. Este indicador de resistencia no está asociado a un plásmido o transposón y por consiguiente no es transmisible a la flora entérica. Debido a que todas las cepas mutantes derivan de las cepas parentales indicadas, todas las cepas mutantes también son resistentes a la estreptomicina.
TABLA 3 Ensayos de competición de colonización de ratones lactantes^{B}
Cepa Cepa Relación de entrada Relación de salida
Mutante competidora cepa mutante/competidora cepa mutante/competidora
Bang-2 SM44^{b} 0,61 0,16
Bah-2 SM115^{c} 0,92 0,07
Perú-2 C6709-Sm^{d} 0,74 0,65
Bang-1 SM44^{b} 0,85 0,05
Bah-1 SM115^{c} 0,61 0,04
Perú-1 C6709-Sm^{d} 0,89 0,94
^{a}Los ensayos de colonización de llevaron a cabo de acuerdo con el procedimiento descrito en Taylor y otros (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84:2833-2837, 1987). La relación de cepas se determinó por sensibilidad diferencial a los antibióticos o bien mediante hibridación con sondas apropiadas tal como se describe a continuación en las notas a pie de página adicionales.
^{b}La cepa SM44 se ha descrito en Goldberg y Mekalanos (J. Bacteriol. 165:723-731, 1986) y es un derivado resistente a la kanamicina de la cepa parental P27459-Sm. El gen que codifica la resistencia a la kanamicina en SM44 se insertó en el locus ctx. Debido a que el Bang-1 y el Bang-2 eran derivados del P27459-Sm, la competición con SM44 mide las diferencias de colonización que pueden ser atribuidas al efecto del Tipo-2 en lugar de una pérdida de ctx. Las cepas Bang-1 y Bang-2 eran sensibles a la kanamicina y se diferenciaron del SM44 en estos ensayos de competición por colonias de marcado para la resistencia a 30 \mug/ml de kanamicina.
^{c}La cepa SM115 se ha descrito en Goldberg y Mekalanos (J. Bacteriol. 165:723-731, 1986) y es el derivado resistente a la kanamicina de la cepa parenteral E7946-Sm. El gen que codifica la resistencia a la kanamicina en SM115 se insertó en el locus ctx. Debido a que el Bah-1 y el Bah-2 son derivados del P27459-Sm, la competición con SM115 mide las diferencias de colonización que pueden ser atribuidas al efecto de la deleción Tipo-2 en lugar de una pérdida de ctx. Las cepas Bah-1 y Bah-2 eran sensibles a la kanamicina y se diferenciaron del SM115 en estos ensayos de competición por colonias de marcado para la resistencia a 30 \mug/ml de kanamicina.
^{d}La cepa C6709-Sm es la cepa parenteral de Perú-1 y Perú-2. El Perú-2 lleva una deleción de Tipo-2 mientras que el Perú-1 lleva una deleción central. Ambas deleciones eliminan los genes ctx y, de este modo, tanto Perú-1 como Perú-2 fueron negativos en los ensayos blot de hibridación de colonias cuando se analizaron con la sonda CT-1 descrita en GHoldberg y Mekalanos (J. Bacteriol. 165:723-731, 1986) mientras que la cepa C6709-Sm fue positiva utilizando la misma sonda. De este modo, tanto Perú-1 como Perú-2 se diferenciaban de C6709-Sm en estos ensayos de competencia en unas colonias de marcado para la hibridación con la sonda CT-1.
Las cepas mutantes descritas pueden mejorarse más como candidatos de vacunas creando mutaciones adicionales dentro de cada cepa que servirán para aumentar la seguridad y la inmunogenicidad de la vacuna.
Con relación a la seguridad, puede introducirse una segunda mutación en el gen recA de cualquiera de las cepas descritas anteriormente, cuya mutación está diseñada para inactivar ese gen recA. Dichas cepas mutantes dobles serán, por lo tanto, deficientes en la recombinación y no podrán recombinarse con cepas de tipo salvaje de V. cholerae en el entorno. De este modo, no podrán adquirir genes de toxina de tipo salvaje y expresar el elemento CTX. La inmunogenicidad también puede mejorarse introduciendo mutaciones adicionales en cada cepa que permitirán que esa cepa exprese antígenos asociados a la toxina del cólera (por ejemplo, la subunidad B de la toxina del cólera) u otros antígenos heterólogos, por ejemplo, la unidad B no tóxica de la toxina de tipo Shiga o diversos antígenos de cepas de E. coli enterotoxicógeno, toxina Shiga, toxina del ántrax, endotoxina A pseudomonas, toxina pertussis, toxina tetánica; antígenos del virus del Herpes, virus de la rubéola, virus de la gripe, virus de las paperas, virus del sarampión, virus de la poliomielitis; fragmentos antigénicos de cápside de VIH; y polipéptidos inmunógenos de parásitos eucariotas que provocan la malaria, neumonía Pneumocystis, y toxoplasmosis (karjalainen y otros, 1989, Infect. Immun. 57:1126; Pérez-Casal y otros, 1990, Infect. Immun. 58:3594). De este modo, pueden ser útiles también en la invención una serie de derivados mutados, cada uno incorporando propiedades adicionales que hagan que las cepas sean más seguras, genéticamente más estables y más ampliamente inmunógenas. La elaboración de tales derivados se describe a continuación.
Elaboración de alelos recA/ctxB
Se conoce que la subunidad B de la toxina del cólera es una molécula no tóxica y altamente inmunógena que es capaz de inducir anticuerpos de neutralización de la toxina del cólera. Con el fin de generar más cepas de vacuna inmunónegas se introdujo una nueva copia del gen ctxB en las cepas de vacuna que contenían las deleciones de Tipo-2 descritas anteriormente (debido a que las deleciones de Tipo-2 eliminan toda la secuencia de codificación para la subunidad B de la toxina del cólera). Esto se llevó a cabo en una serie de etapas que se describen a continuación.
En primer lugar, se elaboró una copia del gen ctxB utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Para la reacción PCR, el iniciador curso abajo se diseñó para que la secuencia que codifica el ctxB pudiera sintetizarse de tal manera que eliminara el sitio attRS1 que existe justo curso debajo del codón de terminación del gen ctxB. Este iniciador tenía la siguiente secuencia: 5'-GGGCTAAAGTTAAAAGACAAATATTTTCAGGC-3' [SEC. ID. N°: 5]. El iniciador curso arriba se diseñó de manera que solamente los últimos 24 residuos de aminoácido carboxiterminales de la subunidad A2 pudieran codificarse a través del producto de la reacción. Este iniciador tenía la siguiente secuencia: 5'-GGGTAGAAGTGAAACGGGGTTTACCG-3' [SEC. ID. N°: 6]. Todos los otros nucleótidos del ADN que codifica la subunidad A fueron excluidos de la reacción. El ADN que codifica los aminoácidos carboxiterminales de la CtxA2 fueron retenidos en el producto final para permitir el acoplamiento de traslación de la expresión del gen ctxB. Debido que la actividad tóxica asociada a la toxina del cólera deriva del polipéptido CtxA1, todas las secuencias que codifican el polipéptido A1 fueron excluidas de la reacción PCR.
La reacción PCR se realizó utilizando los iniciadores ctxB tal como se ha descrito anteriormente utilizando ADN del V. cholerae de la cepa peruana, C6709-Sm (figura n° 5), El producto de la reacción, un fragmento de 0,6 kilobase par, fue clonado en plásmido pCR100. Este fragmento fue suprimido del plásmido como un fragmento de SpeI-EcoRI de 0,6 kilobase par y fue clonado en dos plásmidos aceptadores individuales, pRT41 digerido con XbaI-EcoRI y pVC100 digerido con XbaI-EcoRI. Los plásmidos resultantes, pJM411 y pJM1001, codifican cada uno entonces una copia del gen ctxB bajo el control del activador ctx (ctxP) o bien el activador htpG (hptP) del V. cholerae, respectivamente. Estos plásmidos fueron transferidos después a la cepa no toxicógena del V. cholerae 0395-NT (Mekalanos y otros, 1983, Nature 306:551 y patente americana n° 4.935.364), generando dos nuevas cepas denominadas 0395-NT pJM411 y 0395-NT pJM1001. La cantidad de subunidad B del cólera producida por cada cepa se midió a través de GMI ELISA. La cepa 0395-NT pJM411 produjo 30 \mug/ml, mientras que la cepa 0395-NT pJM1001 produjo 100 \mug/ml en fluidos sobrenadantes de cultivo LB. Estos resultados demuestran que el producto de la reacción PCR era un gen ctxB funcional que codifica una subunidad B del cólera antigénica capa de unirse a un gangliósido GMI y por lo tanto similar al segregado por el V. cholerae normal de tipo salvaje.
En la siguiente etapa, fragmentos EcoRI- BamHI de ADN que especifican las configuraciones activador-ctxB fueron subclonados en el plásmido suicida recA pGP84. Este plásmido contiene un inserto de ADN cromosómico de V. cholerae que corresponde al ADN que flanquea el gen recA del V. cholerae (es decir, una deleción interna de recA). El plásmido pGP84 es un derivado del plásmido suicida pJM703.1 (Miller y otros, 1988, J. Bacteriol. 170:2575) y codifica secuencias que corresponden a las zonas flanqueadoras del gen recA del V. cholerae (Goldberg y otros, 1986, J. Bacterial. 165:715) incluyendo un fragmento BglII-PvuII en el lado izquierdo y un fragmento XbaI-EcoRI en el lado derecho. Entre estos dos fragmentos se encuentra situado un fragmento de 1,3 kb que codifica la resistencia a la kanamicina. El plásmido pGP84 también contiene un fragmento NruI-BamHI que codifica la sensibilidad a la estreptomicina. Este último fragmento se deriva del plásmido pNO1523 (Dean, 1981, Gene 15:99). Cuando el pGp84 se digiere con XbaI, el fragmento de 1,3 kb se elimina y pueden insertarse otros fragmentos de XbaI en esta zona recA suprimida. La subclonación se realizó tal como sigue: cada uno de los dos fragmentos EcoRI-BamHI que especifican las configuraciones del ctxB activador se modificó mediante la adición de elementos de enlace XbaI. Fueron unidos de manera individual al pGP84 digerido con XbaI para generar dos nuevos plásmidos pJM84.1 y pJM84.2, cada uno de los cuales contiene ADN que especifica las configuraciones htpP-ctxB y ctxP-ctxB respectivamente (figura n° 6).
Después, los plásmidos pJM84.1 y pJM84.2 fueron transferidos a las cepas del V. cholerae Perú-2, Bang-2 y Bah-2 y se seleccionaron colonias resistentes a la ampicilina. Debido a que estos plásmidos son incapaces de una replicación en el V. cholerae, se integran en el cromosoma de la célula hospedadora por recombinación homóloga generando la estructura mostrada en la figura n° 6. Ambos plásmidos también codifican un gen para la sensibilidad de la estreptomicina que permite una selección positiva contra un caso de integración de plásmidos en cepas que son resistentes a la estreptomicina (es decir, cepas Perú-2, bang-2 y Bah-2). De este modo, cuando las cepas que tienen un plásmido integrado en el ADN cromosómico crecen en un medio que contiene 2 mg/ml de estreptomicina, pueden aislarse las colonias que han vuelto a la sensibilidad a la ampicilina. Las cepas que ahora habían cruzado el plásmido integrado para abandonar detrás de la mutación de la deleción recA junto con la configuración ctxB se seleccionaron entonces de entre estas últimas cepas. Estas cepas fueron identificadas fácilmente como que presentaban las siguientes propiedades.
1. Eran sensibles a la ampicilina.
2. Se eliminaron en presencia de 0,1 ml de metil metano sulfonato por ml de LB, un fenotipo característico de las células recA^{-}.
3. Produjeron la subunidad B del cólera tal como se mide a través de GMI-ELISA.
4. Un análisis Southern Blot utilizando sondas recA y ctxB confirmó que contenían fragmentos de ADN consistentes con la presencia de la configuración ctxB y la deleción de las secuencias recA apropiadas.
Las cepas bacterianas que fueron aisladas siguiendo el procedimiento descrito anteriormente son como sigue:
Cepa Genotipo
Perú-3 deleción attRS1, recA::htpP-ctxB, str
Perú-4 deleción attRS1, recA::ctxP-ctxB, str
Bang-3 deleción attRS1, recA::htpP-ctxB, str
Bah-3 deleción attRS1, recA::htpP-ctxB, str
Bah-4 deleción attRS1, recA::ctxP-ctxB, str
Elaboración de alelos lacZ-ctxB
La mutación recA contenida en las cepas de vacuna descritas anteriormente hace que las cepas sean deficientes en la recombinación homóloga. Con el fin de producir vacunas candidato que todavía sean capaces de una recombinación homóloga, el gen ctxB se insertó en el gen lacZ del V. cholerae tal como se describe a continuación.
El plásmido pCG698 de codificación del gen lacZ del V. cholerae, contiene un lugar HpaI único en el medio de la secuencia que codifica el lacZ. El plásmido pCG698 se elaboró tal como sigue: el gen \beta-galactosidasa del V. cholerae fue clonado a partir de un banco de fragmentos de ADN cromosómico de la cepa E7946 tal como se describe (Mekalanos, 1983, Cell 35:253). Se encontró que expresa la \beta-galactosidasa y la siguiendo una representación de enzimas de restricción se encontró que contenía un inserto de 6 kb que tiene 2 sitios HpaI en el gen lacZ cada uno de los cuales estaba separado por 2,1 kb de ADN. Este plásmido fue linearizado con HpaI y los elementos de enlace XbaI fueron ligados a los extremos. Se eliminó del pJM411 un fragmento de EcoRI-BamHI que contenía la configuración ctxP-ctxB, tal como se ha descrito anteriormente, los extremos fueron modificados mediante la adición de elementos de enlace XbaI y el fragmento fue ligado al pCG698 modificado de manera similar. El plásmido resultante pJM6891 contenía ahora la estructura ctxP-ctxB insertada en el parte central del gen lacZ. Este plásmido fue transferido a las cepas del V. cholerae Perú-2, Bang-2 y Bah-2 y se examinó el crecimiento de cada cepa resultante en presencia de X-gal. Se recogieron y se purificaron colonias blancas que contenían un gen lacZ inactivado. Las cepas que contenían una copia integrada de las secuencias lacZ::ctxP-ctxB en el cromosoma de la célula huésped se obtuvieron mediante el curado de bacterias de pJM6891 por el crecimiento en la ausencia de ampicilina. Se confirmó la presencia de las secuencias apropiadas a través de un análisis Southern Blot y la capacidad de estas bacterias para producir la subunidad B de la toxina del cólera se confirmó a través de GMI-ELISA. Las cepas bacterianas asiladas siguiendo este procedimiento son como sigue:
Cepa Genotipo
Perú-5 deleción attRS1, lacZ::ctxP-ctxB, str
Bang-5 deleción attRS1, lacZ::ctxP-ctxB, str
Bah-5 deleción attRS1, lacZ::ctxP-ctxB, str
Con el fin de caracterizar algunos de estos candidatos portadores de la vacuna del cólera respecto a la colonización de ratones, los ratones fueron infectados con las cepas que se relacionan a continuación. La cepa TCP2, un derivado de la 0395-N1 que contiene una deleción TcpA y no coloniza el intestino de los voluntarios humanos, sirvió como control. Se utilizaron cinco ratones para cada cepa. A las 24 horas post infección, el intestino superior se eliminó de cada ratón, se homogeneizó y se analizó el número de V. cholerae presente utilizando un ensayo de recubrimiento simple. Los resultados se dan en la tabla que sigue a continuación. Esencialmente, no se detectaron bacterias TCP2 en los intestinos de ratones infectados con TCP2 y, por consiguiente, los valores que se dan a continuación representan el número de bacterias de cada cepa que colonizaron el intestino de los ratones por encima de un nivel de fondo de cero.
Cepa UFC por ratón^{a} Genotipo/estructura^{b}
Perú-3 9,4 x 10^{5} deleción attRS1 #2, recA::htpG-ctxB
Perú-2 2,5 x 10^{6} deleción attRS1 #2
Perú-4 6,0 x 10^{6} deleción attRS1 #2, recA::ctx-ctxB
Perú-5 6,6 x 10^{6} deleción attRS1 #2, LacZ::ctx-ctxB
Bang-2 9,9 x 10^{6} deleción attRS1 #2
Bang-3 2,7 x 10^{7} deleción attRS1 #2, recA::htpG-ctxB
^{a}Unidades de formación de colonias recuperadas por ratón (promedio de cinco ratones).
^{b} La estructura deleción att RS1 #2 es una deleción de Tipo-2 elaborada con un plásmido pAR62, descrito en la Figura n° 3.
La estructura recA::htpG-ctxB es una deleción del gen recA y una inserción de la subunidad B de la toxina del cólera bajo el control del estimulador del choque térmico derivado de la htpG del V. cholerae.
La estructura recA::htpG-ctxB es una deleción del gen recA y una inserción de la subunidad B de la toxina del cólera bajo el control del estimulador de la toxina del cólera derivado del gen ctx de una cepa hipertoxicógena 569B del V. cholerae.
La estructura LacZ::ctx-ctxB es una inserción en el gen LacZ del V. cholerae que está compuesto por la subunidad B de la toxina del cólera bajo el control del estimulador de la toxina del cólera derivado del gen ctx de una cepa hipertoxicógena 569B del V. cholerae.
Los resultados sugieren que la presencia del alelo recA::htpP-ctxB sirve para reducir la capacidad de las cepas derivadas del Perú para colonizar el intestino (compárese, por ejemplo, Perú-3 con Perú-4). Sin embargo, el efecto de esta estructura sobre la colonización de la cepa derivada del Bang fue menos notable (compárese Bang-3 con Bang-2). En general, la introducción de las estructuras en las que el ctxB se encuentra bajo el control de su propio estimulador presenta un menor efecto sobre la colonización que la estructura en la que se colocó bajo el control del estimulador de choque térmico. Debería notarse que las cepas Perú-2, Perú-3 y Bang-3 varían en sus propiedades de colonización en un intervalo de 28 pliegues. En la técnica está bien seguir los protocolos descritos anteriormente para aislar los candidatos de vacuna adicionales que varían incluso más ampliamente en sus propiedades de colonización.
En resumen, los datos demuestran la viabilidad de utilizar técnicas de ingeniería genética para generar nuevas cepas de V. cholerae que contienen ctxB en las que la expresión del gen ctxB se coloca bajo el control de cualquiera de los dos estimuladores V. cholerae (ctxP y htpP). Los genes modificados pueden ser recombinados en el cromosoma V. cholerae en genes de destino tales como el recA o el lacZ para generar cepas que expresan de manera estable grandes cantidades de subunidad B de la toxina del cólera (por ejemplo, cepas Perú-3, Perú-4 y Perú-5).
Aislamiento de cepas deficientes en la penetración de agar blando espontáneo de V. cholerae
Los mutantes de V. cholerae que son deficientes en la penetración del agar blando pueden ser útiles en la producción de vacunas. La razón para utilizar estas cantidades es como sigue. Se piensa que la capa mucosa del intestino es viscosa y los mutantes deficientes en la penetración del agar blando podrían ser eficaces en la penetración de esta mucosa. Aunque son deficientes en la penetración a través de la mucosa, estos mutantes pueden presentar todavía un antígeno a las placas de Peyer que no están cubiertas por un denso gel mucoso y que incluyen células de muestra de antígenos específicas para la producción de anticuerpos IgA. En consecuencia, está previsto que los mutantes deficientes a la penetración presenten una baja reactogenicidad que, sin embargo, es altamente antigénica, y estas características son deseables para una vacuna de virus vivos. Aunque los mutantes no móviles son una clase de mutantes deficientes en la penetración del agar blando, otros tipos de mutaciones también pueden producir un fenotipo deficiente en la penetración de agar blando (es decir, un fenotipo de agrupamiento) y pueden resultar útiles para las vacunas. Manteniendo esta línea de razonamientos, los mutantes no totalmente móviles, es decir, aquellos mutantes que no son capaces de agruparse en un medio sin agar, pueden resultar útiles para las vacunas candidato.
Para obtener tales mutantes, el agar blando puede utilizarse para evaluar la capacidad de las bacterias para penetrar un medio de alta viscosidad (un medio de agar blando que es un 0,25 - 0,4% agar), tal como se describe a continuación. Una de dichas vacunas deficientes en la penetración del agar blando con un elevado valor terapéutico es el Perú-14.
El Perú-14 es deficiente en la penetración del agar blando y, además, más de un 50% de las células Perú-14 son filamentosas, con una apariencia a modo de espiral y que presenta una longitud de célula mayor de 5 longitudes celulares normales (25 nM, al contrario que la longitud de las células de tipo salvaje de 5nM).
Se aisló el Perú-14 como derivado deficiente a la penetración del agar blando de la cepa Perú triplemente suprimida (Perú-3) (ctxA^{-}, att^{-}, y recA^{-}) que no presentaba efectos secundarios pero todavía tenía retenida la capacidad para colonizar vacunados tal como se muestra a continuación (Tabla 7).
Aunque el Perú-14 se aisló en base a lo que se ha indicado anteriormente, esta teoría de función puede o no puede explicar de manera precisa y completamente la efectividad del Perú-14 como vacuna. La utilidad del Perú-14 como vacuna eficaz no depende de lo correcta que sea esta teoría.
TABLA 7 Resultado de la inmunización con vacuna del cólera Perú-14 recién cosechado
Dosis (UFC) # voluntario Síntomas Deposición Duración de la excreción
día (días)/máx.
2 x 10^{6} 28 Gas Formada
3/3 29 Retorcijones Formada
14/2 30 Ninguno Formada
- 33 Ninguno Formada
4/4 34 Ninguno 336 g*
4/1 35 Ninguno Formada
3/3 Formada
9 x 10^{8} 25 Ninguno Formada
25/1 26 Gas Formada
3/1 27 Dolor cabeza Formada
2/2 31 Nausea, pérdida apetito Formada
7/4
5/3 32 Ninguno Formada
35/1 36 Retorcijones 63 g+
*El voluntario tuvo deposiciones semisólidas indoloras a 72 horas de la post-inmunización. Las depo-
siciones eran cultivo negativo para el Perú-14.
+El voluntario tuvo dos pequeñas deposiciones a 48 horas de la post-inmunización. Las deposiciones
eran cultivo positivo para el Perú-14.
En particular, la cepa deficiente en la penetración del agar blando se produjo como sigue. El Perú-3 creció durante la noche en un medio LB que contenía 100 \mug de sulfato de estreptomicina a 30°C. El cultivo se diluyó a aproximadamente a 2000 UFC/ml y 0,1 ml recubierto sobre las placas LB que contenían 100 \mug de estreptomicina. Tras incubar las placas durante la noche a 30°C, aproximadamente 1000 colonias se inocularon con unos palillos en unas placas de agar blando (medio LB + un 0,45% de Bacto-agar) y se incubaron durante la noche a 30°C. La inoculación con palillos se inserta solamente 1-2 mm en la superficie de la placa de agar blando. De las 1000 colonias recogidas, 25 parecieron ser no penetrantes. Los aislados no penetrantes aparecen como colonias de aproximadamente 2 mm de diámetro, mientras que los aislados penetrantes se aglutinan en el agar hasta un diámetro mayor de 5 mm. Estas colonias se volvieron a recoger de nuevo en agar blando junto con una cepa de cólera no móvil y no penetrante y la cepa original Perú-3. Una colonia de las 25 fue no penetrante en el agar blando (si se compara con los controles). Esta colonia, designada Perú-14, era todavía Inaba positiva con sueros de aglutinación, y producía el mismo nivel de toxina de subunidad B que el Perú-3 al analizarla en la subunidad B ELISA. Los procedimientos descritos anteriormente pueden utilizarse para aislar mutantes deficientes a la penetración del agar blando de cualquier cepa del V. cholerae. Los mutantes deficientes a la penetración no reversible, tales como las que albergan una deleción genética, pueden producirse utilizando los procedimientos descritos anteriormente.
Cepas Bengal
Recientemente se ha descubierto que una cepa virulenta non-01 muy poco común es la responsable de una epidemia del cólera en el subcontinente indio. Los supervivientes de las epidemias de serogrupo 01 anteriores no están inmunológicamente protegidos contra esta cepa.
Esta cepa se ha depositado con la American Type Culture Collection (ATCC) en Rockville, MD. El Bengal puede atenuarse tal como se ha descrito anteriormente para las otras cepas, por ejemplo, mediante una o más de las siguientes mutaciones: ctx^{-}, att^{-}, o recA^{-}, o un fenotipo deficiente a la penetración del agar blando, Bengal-2 ("Beng-2") y Bengal-3 ("Beng-3"), son genéticamente equivalentes al Perú-2 y Perú-3. Dicha cepa Bengal atenuada puede combinarse con una de las cepas Perú atenuadas descritas anteriormente para proporcionar una vacuna de cepas del cólera múltiple o dual.
Pruebas en humanos del Perú-3 y Perú-5
Se llevaron a cabo estudios en humanos de la eficacia del Perú-3 y Perú-5 tal como sigue.
Se extrajeron muestras de sangre de voluntarios antes de la inmunización y a 7, 14, 21 y 28 días post inmunización. Se midieron los anticuerpos del V. cholerae en su flujo sanguíneo y los niveles se muestran en la Tabla 4. La inmunogenicidad de los prototipos de vacuna Perú-3 y Perú-5 se evaluó en estudios sobre voluntarios humanos. Los voluntarios ingirieron Perú-3 y Perú-5 recién cosechado en 3 dosis diferentes en 100 ml de 10% de bicarbonato sódico. El Perú-3 y el Perú-5 mostraron también que inducían anticuerpos de antitoxinas (Tabla 5). Además, el Perú-3 y el Perú-5 mostraron que protegían a los voluntarios de la agresión con un V. cholerae El Tor de tipo salvaje (cepa N16961, Tabla 6). Concluimos que el Perú-3 en particular provoca una reacción inmunológica (Tablas 4 y 5) y confiere protección del cólera en estudios en humanos (Tabla 6).
TABLA 4 Tituladores vibriocidales tras la inmunización con Perú-3 o Perú (Julio de 1992)
Cepa (UFC) Voluntario Pre 7 14 21 28 máximo
Perú-3 (4x10^{6}) 1 50 1600 6400 6400 6400 6400
2 <100 50 100 50 100 100
5 <100 1600 6400 400 400 6400
Perú-3 (1x10^{8}) 7 <100 400 1600 400 400 1600
12 <100 400 800 50 200 100
13 <100 3200 6400 3200 1600 6400
Perú-3 (2x10^{6}) 11 <100 1600 6400 3200 6400 6400
14 <100 200 6400 3200 1600 6400
15 <100 800 6400 1600 3200 6400
Se diluyeron en serie muestras de suero activado por calor en las cavidades de un microtitulador, se mezclaron con V. cholerae de fase logarítmica (concentración final del 11%) y se incubaron a 37°C durante una hora.
Se añadió entonces un medio de cultivo de infusión corazón y cerebro a las placas y se incubó a 37°C durante 2,75 horas. Los valores de la tabla representan los tituladotes recíprocos en los cuales la eliminación mediada por anticuerpos del V. cholerae fue de un 50% o más.
TABLA 5 Tituladores de la Antitoxina del Cólera tras la inmunización con Perú-3 o Perú-5 (Julio de 1992)
Cepa (UFC) Voluntario 0.2 7 14 21 28 Aumento máximo
(pliegues)
Perú-3 (4x10^{6}) 1 8 8 32 32 32 4
2 <2 <2 <2 <2 <2 Ninguno
5 <2 64 64 2 256 14
Perú-3 (4x10^{8}) 7 2 2 4 4 4 2
12 <2 2 4 4 4 4
13 <2 <2 <2 <2 <2 Ninguno
Perú-3 (2x10^{6}) 11 4 4 4 4 4 Ninguno
14 2 2 2 2 2 Ninguno
15 8 8 8 8 8 Ninguno
Se diluyeron en serie muestras de suero en las cavidades de un microtitulador de 96 cavidades cubiertas con una subunidad B de toxina gangliósida/cólera precalentadas y se incubaron a 37°C durante 30 minutos. Tras 3 lavados con PBS, se dispuso un conjugado de fosfatasa (1/1000) de anticuerpo alcalino de cabra antihumano PBS y se incubó a 37°C durante 30 minutos. Tras 3 lavados con PBS, se añadió 2 mg/ml PNPP a cada cavidad y se incubó durante 15 minutos. La reacción se detuvo con 0,1 M de K_{2}PO_{4}y se leyó en un O. D. de 405 nm. Los valores de la tabla representan los tituladotes recíprocos y el incremento del día 2 en comparación con el titulador máximo.
TABLA 6 Resultado para los voluntarios agredidos con 2x10^{6} UFC de organismos de tipo salvaje (Noviembre de 1992) Vibrio Cholerae (N16961)
Número del Vacunación Dosis Síntomas Diarrea Aparición
sujeto previa inicial (gramos) de síntomas
1 Perú-3 6 logs Ninguno Formada
2 Perú-3^{\bullet} 6 logs Cansado, 534 18-48 horas
sofocado
5 Perú-3 6 logs Ninguno 3
7 Perú-3 8 logs Ninguno 23 36 horas
11 Perú-5 6 logs Ninguno Formada
12 Perú-3 8 logs Ninguno Formada
14 Perú-5 6 logs Ninguno Formada
15 Perú-5 6 logs Ninguno Formada
22 Control T 100.7 1443 24 horas
F, HA, náusea
LOA, sofocado,
retorcijones
23 Control Ninguno 769 24 horas
24 Control T 99.6 F, HA, 904+ 40 horas
malestar,
sofocado,
retorcijones
^{\bullet} No colonizó o seroconvirtió posteriormente tras la vacunación
+Dos deposiciones líquidas no pesadas por motivos de urgencia
Elaboración de vacunas de V. cholerae que expresan antígenos heterólogos
Los procedimientos descritos anteriormente pueden aplicarse por cualquier experto en la materia para la elaboración de derivados del Perú-2, Bang-2, Bah-2, Perú-14, y cepas relacionadas que sean capaces de expresar una amplia variedad de antígenos heterólogos, por ejemplo, antígenos que no se expresan normalmente en el V. cholerae. Si dichos derivados se utilizan como vacunas de virus vivos se esperaría que indujeran una reacción inmunológica tanto contra los antígenos del V. cholerae como contra el antígeno externo que codifica. Es probable que se induzcan tanto la reacción inmunológica sistémica como la local debido a que la vacunación con otras vacunas del V. cholerae prototipo ha provocado la inducción de anticuerpos IgG circulantes y IgA locales que son específicos los antígenos de células enteras (por ejemplo, LPS) y así como proteínas individuales tales como la subunidad B de la toxina del cólera (Herrington y otros, 1988, J. Exp. Med. 168:1487-1492). Se esperaría que un antígeno externo expresado por el V. cholerae provocara una respuesta inmunológica similar a la de las proteínas del cólera individuales.
Los procedimientos útiles para la introducción de antígenos heterólogos en el V. cholerae son similares a los descritos anteriormente para la reintroducción del gen ctxB en las cepas de vacuna Perú-3, Perú-4, Perú-14, Perú-5, Bang-3, Bah-3 y Bah-4. Virtualmente cualquier antígeno heterólogo puede insertarse en el V. cholerae utilizando estos procedimientos.
Puede utilizarse el mismo protocolo empleado para elaborar las cepas que contienen ctxV bajo un nuevo activador para elaborar derivados del Perú-2, Bang-2 y Bah-2 que son capaces de expresión virtualmente cualquier antígeno o antígeno heterólogo normalmente codificado por cualquier bacteria, virus, o parásito. Los procedimientos descritos en la invención señalan por consiguiente la generación de una "cepa portadora" de la vacuna V. cholerae multivalente que puede ser manipulada para codificar y expresar otros antígenos y puede ser administrada a los humanos con el fin de inmunizarlos no solamente contra el cólera, sino también contra otros agentes patógenos.
Vacunas de V. cholerae/E. coli enterotoxicógeno
Se ha demostrado que las vacunas de Vibrio cholerae que provocan los anticuerpos contra la toxina del cólera (TT) confieren una protección cruzada a los humanos vacunados contra las cepas de toxina lábiles al calor (TL) que producen E. coli enterotoxicógeno (ETEC) (Svennerholm, J. Infect. Dis., 149:884-893,1984). Sin embargo, las vacunas eran todavía vulnerables a la toxina estable al calor (TS) produciendo cepas de ETEC. Puede utilizarse una cepa atenuante de Vibrio cholerae, el Perú-3, como un vector de vacuna que alberga genes externos derivados del ETEC que codifican la subunidad principal del fimbriae CFA/IV del antígeno factor de colonización, y un toxoide genético de ST. Dicho vector de vacuna provocará i) anticuerpos antifimbriales, impidiendo la unión de las cepas ETEC patógenas al epitelio intestinal humano, y ii) anticuerpos anti-TS; invalidando los efectos diarreicos del ST. El resultado es una vacuna ETEC de virus vivos dirigida de V. cholerae atenuado administrada por vía oral de dosis única.
La vacuna ETEC dirigida de V. cholerae atenuado puede presentar una o más de las siguientes ventajas: i) puede liofilizarse para almacenamiento a largo plazo, ii) no requiere cadena de frío, iii) se administra por vía oral, iv) solamente requiere una única dosis, v) es económica, y vi) protege contra muchas cepas ETEC.
Una vacuna de virus vivos de administración oral de dosis única contra los agentes patógenos entéricos, V. cholerae y el E. coli enterotoxicógeno (ETEC) se elabora mediante la modificación genética de secuencias que codifican antígenos de las cepas de vacuna E. coli en V. cholerae. En la elaboración de dichas cepa de vacuna es deseable neutralizar tanto la colonización como la producción de toxinas. Esto puede conseguirse modificando una cepa atenuada de V. cholerae, Perú-3 tal como se ha descrito anteriormente.
La cepa Perú-3 ya expresa la subunidad B de la toxina del cólera que es casi idéntica a la subunidad B de la toxina lábil al calor ETEC, y provoca anticuerpos de protección cruzada. La cepa puede modificarse para expresar antígenos fimbriales de ETEC y una proteína quimérica formada por el dominio de oligomerización de la subunidad A de la toxina del cólera y una forma mutante de la toxina estable al calor ETEC. De esta manera puede lograrse la inducción de la inmunidad tanto del V. cholerae como del E. coli.
La generación de la cepa de la vacuna V. cholerae/ETEC se consigue utilizando técnicas comunes en microbiología y biología molecular. La capacidad de la cepa para colonizar animales e inducir una reacción inmunológica puede analizarse en un modelo establecido de infección entérica de conejos.
Clonación y expresión de antígenos fimbriales
La capacidad del ETEC para colonizar el epitelio intestinal de los humanes está mediada por fimbriae serológicamente distintos conocidos como antígenos de factor de colonización (CFA) y factores de colonización putativa (PCFs). El fimbriae CFA/4 es el principal factor de colonización identificado aproximadamente de una cuarta parte a una tercera parte de todos los aislados clínicos ETEC. El gen que codifica la subunidad principal de un miembro prototipo del grupo (CS6) ha sido clonado y secuenciado por otros.
El gen CS6 clonado que va en un plásmido de gran número de copias se introdujo en el Perú-3 por electrotransformación y se mantuvo mediante cultivo en un medio Luria-Bertani que contenía 50 \mug/ml de ampicilina. Se analizó la expresión del antígeno proteína de lisados de células enteras de Perú-3 que contenían las secuencias CS6 por desnaturalización de electroforesis en gel de poliacrilamida e inmunoelectro transferencia utilizando suero de conejo policlonal anti-CS6. Los inmunoblots se desarrollaron utilizando el conjugado anticonejo IgG alcalino fosfatasa y BCIP. La expresión del gen CS6 se detectó como producción de una proteína de 17 kiloDaltons. De este modo, el antígeno de CS6 puede expresarse en el Perú-3 para la formulación de una vacuna.
Sin embargo, para generar la cepa de la vacuna candidata es deseable tener el gen CS6 mantenido de manera estable en ausencia de selección antibiótica y tenerlo expresado a partir de un activador que sea trascrito activamente por el V. cholerae. Con este fin, la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) puede utilizarse para amplificar específicamente el gen CS6 que va en un plásmido y crear sitios de endonucleasa de restricción únicos y sus terminales para la posterior clonación en un vector "suicida" sensible a la estreptomicina y resistente a la ampicilina que permita la integración en el cromosoma del V. Cholerae. En particular, al ADN CS6 generado por PCR flanqueado con un sitio 5' PacI y un sitio 3' NotI puede ligarse con ADN pJM6891 que ha sido digerido con PacI y NotI, colocando el gen CS6 bajo el control del activador de la toxina del cólera. La mezcla de ligadura puede introducirse por electrotransformación en la cepa E. coli SM10pir que proporciona una proteína de trascripción, conocida como pi, requerida por el pJM6891 para la replicación. Sin embargo, cuando el pJM6891 y sus derivados se introducen en el V. cholerae (que carece de la proteína pi), la selección para la resistencia a 50 \mug/ml de ampicilina requiere que el plásmido se integre en el cromosoma. El sitio de integración viene determinado por la presencia de secuencias de ADN lacZ V. cholerae que flanquean la CS6 las cuales son idénticas a las secuencias en el cromosoma V. cholerae y permiten que se produzca una recombinación homóloga. La progenie resultante es resistente a la ampicilina y alberga una copia integrada del plásmido y secuencias CS6 rodeadas de secuencias de ADN repetidas del gen lacZ.
Las repeticiones pueden resolverse para eliminar las secuencias vector (incluyendo el determinante resistente a la ampicilina) dejando el gen CS6 bajo el control del activador de la toxina. Esto se lleva a cabo cultivando la cepa en presencia de 2 mg/ml de estretomicina, seleccionando para el alelo de resistencia a la estreptomicina nativo al Perú y contra el alelo de sensibilidad a la estreptomicina introducido por el plásmido. Tras el crecimiento durante la noche en presencia de estreptomicina, el cultivo se recubre para colonias únicas en agar LB que contiene 100 \mug/ml de estreptomicina, y se marcan para la sensibilidad a 50 \mug/ml de ampicilina. Los aislados que son sensibles a la estreptomicina y resistentes a la ampicilina se analizarán mediante ensayos Southern Blot de ADN cromosómico para determinar si se ha producido la integración esperada y los casos de escisión.
El nivel de producción de antígenos de estos aislados puede analizarse utilizando técnicas de inmunoelectro transferencia. La producción del antígeno fimbrial CS6 puede evaluarse bajo una variedad de condiciones de crecimiento que se sabe que afectan a la trascripción del activador de la toxina del cólera. Puede determinarse el efecto del pH del medio (6,5 contra 8,0), la temperatura (30°C contra 37°C), la concentración de NaCl (50 respecto 500 mM) y la concentración de aminoácidos (0 respecto a 25 mM) sobre el nivel de la expresión de la CS6.
La cepa de la vacuna candidata Perú-3/CS6 puede utilizarse entonces en un conejo modelo para demostrar la seguridad y la inmunogenicidad. Debido que los aislados clínicos humanos de EFEC que producen antígenos CFA son típicamente no patógenos a los animales de laboratorio, puede elaborarse otro derivado Perú-3 que exprese el antígeno fimbrial AF/R1 de la cepa E. coli RDEC-1 para demostrar la seguridad y la inmunogenicidad. Este antígeno media la adherencia al epitelio del intestino, provocando una enfermedad diarreica en los conejos. El gen que codifica el AR/R1, que va en el plásmido pW1, puede amplificarse por PCR, clonarse en pJM6891 e integrarse en el cromosoma de la misma manera que para la CS6. El nivel de expresión de AR/R1 puede evaluarse por inmunoelectro transferencia. Aunque esto no producirá candidatos de vacuna para humanos, puede servir como modelo para demostrar la expresión de un antígeno heterólogo mediante cepas Perú-3 modificadas y la inducción de la protección de agresión por un organismo heterólogo.
El gen AF/R1 que lleva un plásmido de alto número de copias también se introdujo en el Perú-3 por electrotransformación y se mantuvo en cultivo en un medioLuria-Bertani que contenía 50 \mug/ml de ampicilina. Se analizó la expresión del antígeno proteína de lisados de células enteras de Perú-3 que contenían las secuencias AF/R1 mediante desnaturalización de electroforesis en gel de poliacrilamida e inmunoelectro transferencia utilizando suero de conejo policlonal anti-AF/R1. Los inmunoblots se desarrollaron utilizando el conjugado anticonejo IgG alcalino fosfatasa y BCIP. La expresión del gen AF/R1 se detectó como producción de una proteína de aproximadamente 18 kiloDaltons. De este modo, el antígeno de AF/R1 puede expresarse en el Perú-3 para la formulación de una vacuna.
Utilizando estrategias similares, puede prepararse una cepa de vacuna que expresa antígenos protectores de Shigella, tales como el lipopolisacárido (LPS) y la proteína invasora derivada del plásmido, que proteja contra la diarrea infecciosa provocada por especies infecciosas de Shigella, tales como S. sonnei.
En la S. sonnei, solamente existe el serotipo de LPS y es el principal determinante antigénico en la protección contra estas bacterias. La introducción de un clon de plásmido que codifica el operón LPS en E. coli produce la expresión de LPS y es suficiente para conferir sobre el E. coli la capacidad para ser aglutinado mediante anticuerpos LPS anti-S. sonnei. El mismo plásmido introducido en la cepa mutante de deleción del Perú-3 hace que sea aglutinable. Otros análisis del operón indicaron que un fragmento de EcoRI/BamHI de 18 kilobase de este plásmido subclonado en pBR322 todavía confería el fenotipo de aglutinación. Este fragmento puede introducirse entonces al cromosoma en el gen lacZ del V. cholerae tal como se ha descrito anteriormente.
Elaboración y seguridad de fusiones ST-CTA2
El ETEC provoca diarrea mediante la colonización y la producción de dos toxinas distintas. La toxina lábil al calor (TL) es casi idéntica en secuencia, estructura y actuación biológica a la toxina del cólera (TC). Por esta razón la producción de (TC) por los derivados del Perú-3 es suficiente para inducir anticuerpos capaces de neutralizar ambas toxinas. Sin embargo, la inmunización con TC no puede conferir protección de la toxina estable al calor ETEC (TS) que es un polipéptido muy pequeño (19 aminoácidos) producido por muchos aislados clínicos, algunos de los cuales no producen la TL. Por consiguiente, un elemento crítico en la vacuna candidato del cólera/ETEC es la inclusión de secuencias de TS en el Perú-3 con el fin de inducir los anticuerpos a esta toxina.
Se han generado una serie de derivados bien definidos de TS que carecen de actividad de toxina (SToxoides). Estos derivados son típicamente fragmentos de la toxina o mutaciones de sustitución en residuos de cisteína que forman los tres enlaces disulfuro de la proteína. Puede elaborarse un SToxoide compuesto por todo el polipéptido maduro con cisteína a las mutaciones de alanina en los residuos 5 y 10 para minimizar o eliminar la actividad tóxica. El gen que codifica este SToxoide puede prepararse completamente a partir de oligonucleótidos complementarios producidos con un sintetizador de ADN. El gen sintético puede estar flanqueado por sitios de nucleasa de restricción únicos para la posterior subclonación en vectores de plásmidos.
El tamaño de la TS (19 aminoácidos) hace que sea un inmunógeno inherentemente pobre. Si se acoplan químicamente o genéticamente TS intactas o incluso fragmentos péptidos pequeños a otras proteínas mayores (un portador), la TS se convierte en un inmunógeno mucho mejor y puede inducir anticuerpos neutralizadores. El principal portador utilizado fue la subunidad B de TL o TC. Debido a que las proteínas externas fusionadas a la subunidad A2 de la toxina del cólera (el dominio de la subunidad enzimática que permitía que el fragmento A se oligomerizara con el pentámero de la subunidad B) pueden enlazarse al pentámero y formar complejos de tipo holotoxina, estos complejos quiméricos i) son segregados por el V. cholerae, ii) pueden enlazarse al receptor gangliósido, y iii) son inmunoreactivos.
El gen sintético que codifica el SToxoide puede fusionarse, en cuadro, al extremo 5' del gen que codifica la TC A2 creando una quimera de SToxoide-A2. La estructura de la fusión del gen puede integrarse en el cromosoma Perú-3 tal como se ha descrito anteriormente. Si se coexpresa con una subunidad B TC, esta proteína puede formar complejos de tipo holotoxina que carecen de la actividad biológica tanto de la TS como de la TC y son capaces de enlazar los receptores gangliósidos. Las cepas que expresan la proteína quimérica SToxoide-A2 pueden analizarse a través de inmunoblots utilizando antisuero anti-TS para determinar si las mutaciones de substitución se traducen en una proteína antigenéticamente asociada. Los SToxoides también pueden compararse para determinar la toxicidad en el ensayo de ratones lactantes.
El ensayo de ratones lactantes se realiza como sigue. Se inyectan intragástricamente ratones de 2-3 días de vida con extractos de proteínas derivados de estas cepas de vacuna (o TS purificada como control), se sacrifican 2-3 horas tras la inyección y se examina su relación del peso del intestino respecto al peso corporal. Puede analizarse entonces la inmunogenicidad en conejos de las quimeras del SToxoide candidato que muestran la toxicidad más baja.
Seguridad, inmunogenicidad y eficacia del Perú-3/AF/R1
Puede realizarse una prueba inicial del Perú-3 que expresa AF/R1 en conejos. Las bacterias pueden administrarse por vía oral en dosis de 2 x 10^{2}, 2 x 10^{4}, 2 x 10^{6}, y 2 x 10^{8} a conejos blancos de Nueva Zelanda. Pueden recogerse muestras de deposiciones y cultivarlas en placas de agar LB con 100 \mug/ml de estreptomicina para enumerar la colonización y el desprendimiento de las bacterias. Puede extraerse sangre antes de la administración de la vacuna así como 7, 14, 21 y 28 días siguientes a la administración. Pueden prepararse sueros y analizar la presencia de anticuerpos específicos para la proteína AF/R1 mediante un ensayo de inmunoabsorción ligada a enzimas (ELISA) utilizando AF/R1 purificado unido a placas microtituladoras, y la capacidad para aglutinar bacterias RDEC-1.
Los animales que reciben la cepa Perú-3/AF/R1 pueden ser agredidos posteriormente con una cepa patógena de RDEC-1. Puede administrarse por vía oral una dosis agresora de 2 x 10^{6} organismos a conejos inmunizados y que no han recibido tratamiento y observar muestras de deposiciones de diarrea (definida como deposición húmeda y suelta que mancha la zona rectal de diarrea en el fondo de la jaula). La diarrea se produce típicamente en 3-4 días en animales no inmunes. Para analizar la colonización, se cultivan muestras rectales en placas de agar MacConkey de lactosa y las colonias positivas de lactosa se marcan para una reacción positiva con anticuerpos anti-RDEC-1 en una prueba de aglutinación en portaobjetos. La protección puede definirse tanto por inhibición de la diarrea como por colonización bacterial tras el día cuatro.
Seguridad e inmunogenicidad del Perú-3/CS6 y el Perú-3/SToxoide
Puede realizarse una prueba inicial de las cepas de Perú-3 que expresan S6 y SToxoide-A2 tal como se ha descrito anteriormente. Pueden prepararse sueros y analizar la presencia de anticuerpos específicos para la proteína quimérica CS6 o bien la SToxoide-A2 mediante un ensayo de inmunoabsorción ligada a enzimas (ELISA) utilizando CS6 purificado unido a placas microtituladoras. También puede analizarse la presencia de anticuerpos en los sueros anti-CS6 capaces de fijar un complemento y lisar CS6 que produce E. coli. En este análisis, las bacterias que llevan CS6 se mezclan con suero y se añade un medio LB de complemento cobaya y las bacterias se cubren en el agar LB. La actividad bactericida produce una disminución de los cómputos viables recuperados. Finalmente, en los sueros anti-SToxoide-A2 pueden analizarse los anticuerpos capaces de neutralizar la actividad del TS en el análisis de toxicidad de ratones lactantes.
Elaboración de Vibrio cholera atenuado que expresa el antígeno VIH-1 como holotoxoide del cólera recombinante
Puede utilizarse una aproximación similar a la descrita anteriormente para elaborar una cepa de vacuna de V. cholerae que expresa antígenos del Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH).
Se elaboró un plásmido lanzadera del cólera que contenía una unidad de trascripción de bacterial que incluye el activador de la proteína de choque térmico, htp, y el gen CT-B del cólera. La unidad de trascripción está flanqueada por las secuencias de ADN derivadas del locus del recA del cólera de manera que el gen CT-B y su activador pueden integrarse en el cromosoma del cólera por la recombinación homóloga entre la presencia de la secuencia del ADN tanto en el locus del recA del genoma del cólera como en el plásmido. El plásmido lanzadera contiene también un gen que codifica la resistencia a la ampicilina y un gen que codifica la sensibilidad de la estreptomicina como marcadores de selección.
La proteína de envoltura del VIH-1 puede expresarse como parte del holotoxoide del V. cholerae recombinante segregado por las bacterias, en forma de proteína de fusión tipo "sándwich", en la que el antígeno del VIH va precedido de las secuencias de señal del polipéptido TC-A y seguida del dominio TC-A2. Las secuencias de señal del TC-A y su zona no traducida curso arriba son necesarias para la expresión y segregación del antígeno del VIH-1 en las bacterias. El dominio TC-A2 fusionado al antígeno del VIH-1 es requerido por la proteína de fusión para ensamblarse con las proteínas TC-B para formar un holotoxoide del cólera recombinante. El plásmido descrito anteriormente puede modificarse de manera que un fragmento de PCR que contenga las secuencias Shine-Dalgano (SD) y las secuencias de señal del gen TC-A, y un sitio único PmeI de endonucleasa de restricción de VIH para la inserción del antígeno del VIH-1 se inserte en este sitio PacI. El plásmido puede modificarse, además, de manera que un segundo fragmento PCR que contiene tanto el dominio TC-A2 como el gen TC-B sustituya el gen TC-B. La orientación de la inserción de ADN y la unión del fragmento de PCR puede confirmarse por secuenciación de ADN.
El antígeno del VIH-1 utilizado en este estudio forma parte de la glucoproteína de recubrimiento de VIH-1 que contiene el dominio de neutralización principal (PND). Estudios anteriores demuestran que un grupo de péptidos sintéticos derivados del PND pueden provocar la neutralización de anticuerpos en animales. Un fragmento de ADN derivado del gen de recubrimiento del VIH que incluye el PND, pero sin las secuencias de señal y los primeros 120 aminoácidos, se clona en el sitio PmeI del plásmido descrito anteriormente el cual contiene tanto el dominio TC-A2 como el gen TC-B. La fusión en cuadro del antígeno del VIH y el péptido de señal TC-A y el dominio TC-A2 pueden confirmarse mediante secuenciación de ADN.
Para elaborar una cepa de cólera atenuado genéticamente que lleve el antígeno VIH-1, Perú-2 se utiliza la cepa parental. El plásmido que contiene las secuencias de VIH puede introducirse en la cepa Perú-2 a través de enlace. Se produjo una cepa recombinante de V. cholerae que contiene deleciones de locus ctx y recA y expresa una proteína de fusión recombinante no tóxica del antígeno del VIH y se denominó Perú101. Puede utilizarse un análisis Southern Blot para confirmar que el Perú101 contiene el ADN para el antígeno del VIH-1 y puede utilizarse un análisis Southern Blot para demostrar la expresión de la proteína de fusión VIH-A2 por bacterias recombinantes. Un ELISA utilizando tanto anticuerpos anti-TC-B como anti-VIH puede analizar si las bacterias segregan el holotoxoide del cólera recombinante.
Evaluación preclínica en primates de la inmunogenicidad y eficacia protectora de vacunas de VIH-1 de administración oral utilizando el modelo SVIH
Para analizar la inmunogenicidad del Perú101 recombinante de V. cholerae como vacuna profiláctica de VIH-1, a cada uno de seis monos Rhesus hembra adultos (Macaca mulatta) se les puede proporcionar 2 x 10^{6} UFC de bacterias vivas recién preparadas en 30 ml de agua bicarbonadata. Se les puede dar a dos animales adicionales de la misma edad y grupo sexual la misma dosis de Perú 2 como control. Las muestras de deposiciones de los animales pueden analizarse dos días después de la vacunación para detectar la multiplicación de Vibrio cholera en los intestinos mediante la determinación de la unidad de formación de colonias en las placas de estreptomicina LB. Los anticuerpos vaginales, rectales, salivales y de suero, incluyendo IgA y IgG, que son específicos al VIH1 y al TC-B, pueden examinarse bisemanalmente post-vacunación. La proliferación de células T de los animales hospedadoras y las reacciones del CTL que son específicas al antígeno del VIH1 de entrada también pueden examinarse. Pueden ser necesarios uno o varios refuerzos por administración oral o mediante inyección intramuscular o intravenosa de antígeno de VIH1 purificado, dependiendo del nivel de las reacciones inmunológicas iniciales de los animales vacunados.
Si el Perú101 es capaz de estimular los animales para generar anticuerpos anti-VIH o reacciones inmunológicas específicas de VIH mediadas por células, la eficacia del Perú101 como vacuna de VIH1 puede analizarse agrediendo los animales con "stocks" de SVIH-LAI vivos a través de infusión vaginal. Los dos animales Perú 2 (los monos que recibieron la cepa Perú2) y dos de los seis animales Perú101 (los monos que recibieron Perú101) pueden ser agredidos por una dosis de 2x VI-AID_{50}. Dos de los otros animales Perú101 recibirán 10x VI-AID_{50} y el resto de los monos Perú101 recibirán un máximo de 50x VI-AID_{50} de dosis. Las muestras sanguíneas periféricas pueden tomarse cada dos semanas post infección para determinar si el animal se ha llegado a infectar mediante la detección del antígeno vírico en el PBMC cultivado. Si la vacuna presenta un efecto profiláctico sobre los animales contra la agresión por el SVIH que lleva el gen de recubrimiento del VIH1 homólogo, el SVIH-Eli, que contiene un recubrimiento VIH1 heterólogo, puede utilizarse para reagredir a los animales.
Utilización de las cepas de vacuna de virus vivos SVIH
Las cepas mutantes del V. cholerae Perú-1, Perú-2, Bang-1, Bang-2, Bah-1, Bah-2, Bengal- 2, Bengal- 3, Perú-14, y los mutantes adicionales descritos anteriormente resultan útiles como fuentes de protección inmunológica contra el cólera y otras enfermedades toxicógenas relacionadas si se utilizan como vacuna de virus vivos. Otras de dichas enfermedades incluyen, pero no se limitan a éstas, las inducidas por el E. coli enterotoxicógeno y otras bacterias que producen toxinas que son neurológicamente neutralizables de manera cruzada con la subunidad B del cólera.
Si las cepas mutantes del V. cholerae son inoculadas en el intestino de un animal o humano experimental, éstas deberían estimular e inducir una fuerte reacción inmunológica contra todos los componentes bacterianos que son elaborados por estas cepas incluyendo, aunque no limitándose a ellos, los antígenos 01 LPS Ogawa e Inaba, antígenos flagella, los dominios de antígenos de los pili Tcp, y las proteínas de la membrana exterior. En base a estudios publicados con otras vacunas del cólera prototipo, las clases de anticuerpos IgA e IgG dirigidas contra estos componentes bacterianos serán sintetizadas en el animal o humano inoculado y servirán para proteger al animal o al humano contra siguientes agresiones con cepas virulentas de V. cholerae.
Dosaje
La determinación del dosaje y administración apropiados de estas vacunas se lleva a cabo esencialmente tal como se describe en Herrington y otros, (1988, J. Exper. Med. 168:1487-1492). En general, los citados dosajes se encuentran entre 10^{5} a 10^{9} bacterias viables por dosis, aunque no quedan limitados a éstos.
Crecimiento de cepas de vacunas
Las bacterias a utilizar como vacuna pueden crecer en un medio de laboratorio de V. cholerae estándar. Las células pueden cultivarse y después liofilizarse en una formulación que mantenga la viabilidad (por ejemplo, leche descremada estéril o una solución salina que contenga 5 mM de CaCl_{2} y un 10% en peso por volumen de glicerol).
Administración
La administración de la vacuna implica la combinación del contenido de dos sobres o viales, uno que contiene la cepa o combinación de cepas de la vacuna liofilizada, y otro que contiene agua y bicarbonato sódico o un tampón alterno suficiente para neutralizar el ácido del estómago (aproximadamente 2 gramos). La vacuna puede ser tragada por el vacunado. Alternativamente, la vacuna liofilizada puede incorporarse en pastillas que pueden cubrirse con un "revestimiento entérico" resistente al ácido. Dicha forma de vacuna puede administrarse al vacunado en una o más dosis (hasta tres) separadas de pocos días a varias semanas. Si se utiliza como vacuna "de refuerzo", la vacuna también puede administrarse a individuos vacunados previamente en una o más dosis (hasta tres) en un intervalo de pocos días a varias semanas. Cuando se están administrando dos o más cepas, éstas pueden proporcionarse juntas, o en dosis individuales en un intervalo de 28 días.
Vacunas del cólera perfeccionadas de administración oral de virus muertos
Los preparados de vacunas del cólera perfeccionadas de administración oral de virus muertos pueden realizarse a partir de las cepas descritas anteriormente. La vacuna del cólera experimental que se encuentra disponible en la actualidad comprende aproximadamente 10^{11} de formalina y células de V. cholerae de virus muertos por calor mezcladas con la subunidad B de la toxina del cólera purificado (Black y otros, Infect. Immun. 55:1116, 1987). Las cuatro cepas que se utilizan en la preparación del componente bacteriano de esta vacuna producen una toxina del cólera activa que tiene que inactivarse completamente antes de la administración al vacunado. Las nuevas cepas descritas anteriormente proporcionan una vacuna muy mejorada en comparación con la vacuna de Black y otros (Supra) por cada una de las razones que se dan a continuación.
(1) Debido a que las cepas derivadas, e incluyendo Perú-2, Bang-2 y Bah-2, producen solamente la subunidad B no tóxica de la toxina del cólera y no la subunidad A tóxica, los cultivos de estas cepas solamente requieren una suave inactivación antes de la administración a un vacunado, evitando así los tratamientos de desnaturalización más severos tales como formalina o calor. Las ventajas del tratamiento más suave son que los antígenos retendrán un mayor grado de su configuración nativa y por consiguiente serán más inmunógenos. Los procedimientos suaves de inactivación que evitan la inactivación química de las proteínas bacterianas incluyen el calentamiento por microondas de los organismos, el tratamiento con otra fuente de radiación o un disolvente o detergente orgánico suave, o pueden lisarse las células mediante procedimientos mecánicos tales como sonicación o utilización de una French Press.
(2) en las cepas Perú-3, Bang-3 y Bah-3, el gen ctxB se ha dispuesto bajo el control del activador htp. En consecuencia, estas cepas sintetizan grandes cantidades de la subunidad B de la toxina del cólera (mayor de 10 \mug/ml de cultivo) en un medio de laboratorio estándar tal como LB. Esto facilita la purificación de grandes cantidades de la subunidad B del cólera y, de este modo, estas cepas proporcionan una importante ventaja sobre otras cepas que solamente producen la subunidad B en pequeñas cantidades bajo rigurosas condiciones de crecimiento.
(3) En la preparación de vacunas existentes de cólera de virus muertos se utiliza una cepa bacteriana independiente para producir la subunidad de la toxina B a partir de la cepa utilizada como antígeno de células enteras. Durante la preparación de la subunidad B es necesario por consiguiente purificar la subunidad B fuera de la subunidad A tóxica utilizando procedimientos bioquímicos. Dicha purificación tiene el riesgo de que pequeñas cantidades de la subunidad A pueden contaminar la preparación de la subunidad B. Utilizando las cepas descritas anteriormente es posible generar una preparación de antígenos de células enteras a partir del mismo cultivo utilizado para obtener la preparación de la subunidad B. En el primer caso, la purificación de la subunidad B ahora es innecesaria debido a que la cepa no produce la subunidad A reduciéndose, por lo tanto, la cantidad de tiempo y gastos considerables implicados en la producción de la vacuna. En segundo lugar, no existe riesgo de tener cualquier subunidad A contaminante en los preparados debido a que las bacterias simplemente no codifican el gen para esta subunidad y por consiguiente no lo pueden producir. Por esta razón, puede utilizarse el preparado de células enteras como vacuna con un riesgo mínimo para el vacunado.
(4) Algunas de nuestras cepas bacterianas son derivados del V. Cholerae del tipo El Tor y más particularmente, en el caso del Perú-2, Perú-3 y Perú-4, son derivados de un aislado (C6709-Sm) que, de hecho, es el agente causante de la actual epidemia en Latinoamérica. Si existen antígenos que son únicos respecto a esta particular cepa parental, los derivados de la vacuna descritos anteriormente pueden proporcionar generalmente una mejor protección contra la enfermedad El Tor en Latinoamérica y posiblemente otras zonas del mundo.
Preparación de vacunas del Cólera de virus muertos y administración oral mejoradas
Puede prepararse una vacuna del Cólera de virus muertos y administración oral mejorada tal como sigue. Un mínimo de dos cepas, preferiblemente, seleccionadas entre el serotipo Ogawa (por ejemplo, Bah-3) y el serotipo Inaba (por ejemplo, Perú-3, Perú-14, o Bang-3), y el serotipo Bengal (por ejemplo, Bengal-2 o Bengal-3) pueden crecer en cultivos independientes. Un experto en la materia sabrá cómo regular las condiciones, el medio, etc. para maximizar el crecimiento celular a 37°C. Por ejemplo, los cultivos crecen bajo un elevado nivel de aireación en un medio tal como CYE (Mekalanos y otros, 1977, Infect. Immun. 16:789) o puede utilizarse un medio mínimo que contenga glucosa, es decir, AGM4 (van de Walle y otros, 1990, Appl. Microbiol. Biotechnol. 33:389). Cuando el crecimiento de las bacterias ha alcanzado la saturación, las células enteras puede recuperarse del medio por centrifugación, mientras que las proteínas (incluyendo la subunidad B) contenidas en la fracción sobrenadante pueden obtenerse mediante ultracentrifugación o por precipitación. Las células pueden inactivarse utilizando los procedimientos de Black y otros (Infect. Immun. 55:1116, 1987) o a través de procedimientos más suaves (por ejemplo, calentamiento por microondas, irradiación utilizando rayos alfa, beta o gamma), tratamiento con disolventes orgánicos tales como etanol o acetona, o pueden lisarse mediante el tratamiento con detergente o bien a través de procedimientos mecánicos, tales como sonicación o utilizando una French Press. Las células inactivadas pueden combinarse entonces con proteínas bacterianas que contienen sobrenadante concentrado y filtrado (incluyendo la subunidad B) y la mezcla puede dejarse suspender en una solución farmacéuticamente aceptable apropiada para una administración oral (por ejemplo, una solución salina estéril o bicarbonato sódico al 2%).
Administración
La vacuna puede administrarse al vacunado como una solución salina oral que la traga el vacunado varios minutos después de que éste haya ingerido 2 gramos de bicarbonato sódico. Alternativamente, el preparado puede ser liofilizado y comprimido en pastillas que vayan cubiertas con un "recubrimiento entérico" resistente al ácido antes de la administración al vacunado. Las pastillas también pueden microencapsularse con polímeros con el fin de facilitar la absorción del preparado por el tejido mucosal intestinal.
Dosaje
Una dosis única de la vacuna debería contener aproximadamente 10^{11} células y aproximadamente 100-5000 \mug de subunidad B del cólera. Es de esperar que el vacunado requiera aproximadamente dos o más dosis separadas de vacuna administradas aproximadamente en un intervalo de dos o más semanas.
Depósito
Bajo los términos del Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento Internacional del Depósito de Microorganismos para el objetivo de Procedimiento de Patente, se ha realizado el depósito de cepas de V. cholerae C6709-Sm, P27459-Sm, E7946-Sm, Bengal-2, Bengal-3, MO10, y Perú 14 con el American Type Culture Collection (ATCC) de Rockville, Maryland, USA, donde a los depósitos se les otorgaron los números ATCC Accesion Numbers ATCC 55331 (06709-Sm); ATCC 55333 (P27459-Sm); ATCC 55332 (E7946-Sm); ATCC 55436 (0139, Bengal-2); ATCC 55437 (0139, Bengal-3); y ATCC 55438 (0139, MO10). El Perú-14 se depositó con la ATCC el 30 de Junio de 1993.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
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(i)
SOLICITANTE: Mekalanos, John J.
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(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: MUTANTES DE DELECIÓN COMO VACUNAS PARA EL CÓLERA
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(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 6
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(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO: Fish & Richardson
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(B)
CALLE: 225 Franklin Street
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(C)
CIUDAD: Boston
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
ESTADO: Massachusetts
\vskip0.333000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos de América
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(F)
CÓDIGO POSTAL: 02110-2804
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(v)
FORMULARIO ELECTRÓNICO:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disco de 3112, 1,44 Mb
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PS/2 Modelo 50Z o 55SX
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: MS-DOS (Versión 5.0)
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: WordPerfect (Versión 5.1)
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(vi)
DATOS DE SOLICITUD ACTUALES:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD PRIORITARIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Freeman, John W.
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 29.066
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/SUMARIO: 00742/007001
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (617) 542-5070
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
FAX: (617) 542-8906
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TELEX: 200154
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA SECUENCIA NÚMERO: 1:
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(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
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(A)
LONGITUD: 17
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TRENZADO: simple
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
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(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC N°: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskip
CCTAGTGCGC ATTATGT
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA SECUENCIA NÚMERO: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 52
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TRENZADO: simple
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC N°: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskip
TAAACCTAGA GACAAAATGT TCCTAGTGCG CATTATGTAT GTTATGTTAA AT
\hfill
52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA SECUENCIA NÚMERO: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 48
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TRENZADO: simple
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
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(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC N°: 3:
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\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskip
TAAACCTAGA GACAAAATGT TCCTAGTGCG CATTATGTGG CGCGGCAT
\hfill
48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA SECUENCIA NÚMERO: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 50
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TRENZADO: simple
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC N°: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskip
AAACCCTAGA TTCCGCCGCC TTAGTGCGCA TTATGTATGT TATGTTAAAT
\hfill
50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA SECUENCIA NÚMERO: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TRENZADO: simple
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC N°: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskip
GGGCTAAAGT TAAAAGACAA ATATTTTCAG GC
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LA SECUENCIA NÚMERO: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
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(C)
TRENZADO: simple
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC N°: 6:
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\dddseqskip
GGGTAGAAGT GAAACGGGGT TTACCG
\hfill
26

Claims (29)

1. Cepa mutante genéticamente estable no toxicógena de V. cholerae, siendo dicha cepa un mutante de deleción modificado genéticamente que carece de ADN que codifica una subunidad ctxA funcional de manera que dicha cepa no induce los síntomas del cólera de nausea y diarrea, careciendo dicho mutante además de cualquier secuencia attRS1, en el que una secuencia attRS1 funcional es una secuencia de 17 pares de bases contenida en el elemento genético ctx que se requiere para la recombinación y amplificación del elemento genético ctx, o suficiente de esa secuencia para permitir tal recombinación y amplificación, en el que la ausencia de secuencias attRS1 funcionales provoca una recombinación en un punto específico mediada por attRS1 de por lo menos 1000 pliegues menor respecto a una cepa parental que presenta dos secuencias attRS1 funcionales.
2. Cepa de V. cholerae según la reivindicación 1, caracterizada en que dicha cepa deriva de una cepa parental que pertenece al serogrupo El Tor.
3. Cepa de V. cholerae según la reivindicación 2, caracterizada en que dicha cepa deriva de una cepa parental que pertenece al serotipo Inaba u Ogawa.
4. Cepa de V. cholerae según la reivindicación 1, caracterizada en que dicha cepa deriva del serogrupo non-01.
5. Cepa de V. cholerae según la reivindicación 4, caracterizada en que dicha cepa es del serogrupo Bengal.
6. Cepa de V. cholerae según la reivindicación 4 ó 5, caracterizada en que dicha cepa es Bengal-2 (ATCC 55436) o Bengal-3 (ATCC 55437).
7. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, caracterizada en que dicha cepa carece de secuencias centrales ctx y está totalmente suprimida por todas las secuencias attRS1.
8. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, caracterizada en que dicha cepa carece, además, de un gen recA de manera que 0,1 ml metil metano sulfonato por ml de Luria Broth es letal para dicha cepa.
9. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, caracterizada en que dicha cepa codifica adicionalmente una subunidad B de toxina del cólera.
10. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, caracterizada en que dicha cepa codifica adicionalmente un antígeno que no está expresado normalmente en el V. cholerae.
11. Cepa de V. cholerae según la reivindicación 10, caracterizada en que dicho antígeno es una toxina de tipo Shiga, o un antígeno CFA E. coli.
12. Cepa de V. cholerae según las reivindicaciones 10 ó 11, caracterizada en que dicha secuencia de ADN que codifica el citado antígeno se inserta en el gen lacZ del V. cholerae.
13. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 7 a 12, caracterizada en que dicha cepa es Bengal-2 (ATCC 55436) o Bengal-3 (ATCC 55437).
14. Procedimiento para la elaboración de una cepa mutante genéticamente estable de V. cholerae según la reivindicación 1, que comprende la introducción en V. cholerae de tipo salvaje un plásmido que comprende un fragmento de ADN de V. cholerae capaz de recombinarse con ADN de V. cholerae de tipo salvaje, cuyo fragmento ha mutado las secuencias ctxA y attRS1 de manera que, tras la recombinación con ADN de V. cholerae de tipo salvaje, dicho fragmento no induce los síntomas del cólera de nausea y diarrea y no proporciona una secuencia attRS1 funcional tal como se define en la reivindicación 1.
15. Procedimiento según la reivindicación 14, caracterizado en que dicha cepa de V. cholerae es Bengal-2 (ATCC 55436) o Bgengal-3 (ATCC 55437).
16. Procedimiento según las reivindicaciones 14 ó 15, caracterizado en que dicha cepa mutante carece de secuencias centrales ctx y todas las secuencias attRS1.
17. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 14 a 15, caracterizado en que dicha cepa mutante carece adicionalmente de un gen recA de manera que 0,1 ml de metil metano sulfonato por ml de Luria Broth es letal para dicha cepa.
18. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 14 a 17, caracterizado en que dicha cepa mutante codifica adicionalmente un antígeno que no está expresado normalmente en el V. cholerae.
\newpage
19. Procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 14 a 18, caracterizado en que el procedimiento comprende, además, la introducción en el gen lacZ de la citada cepa mutante un fragmento de ADN que codifica un antígeno.
20. Procedimiento según la reivindicación 19, caracterizado en que dicha cepa es Bengal-2 (ATCC 55436) o Bengal-3 (ATCC 55437).
21. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13, siendo dicha cepa un mutante deficiente en la penetración del agar blando.
22. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13 ó 21, caracterizada en que dicha cepa es 2att.
23. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13, 21 ó 22, caracterizada en que por lo menos un 25% de las células de la citada cepa son capaces de formar estructuras filamentosas de 15nM o mayores bajo condiciones de crecimiento de fase estacionaria.
24. Cepa según la reivindicación 10, caracterizado en que el citado antígeno es un antígeno lipopolisacárido Shigella; un antígeno VIH; una toxina de ántrax; una endotoxina A pseudomonas; un fragmento antigénico de cápside de VIH; una toxina pertussis; una toxina tetánica; un antígeno del virus del Herpes, virus de la rubéola, virus de la gripe, virus de las paperas, virus del sarampión, o virus de la poliomielitis; o un polipéptido inmunógeno de un parásito eucariota que provoca la malaria, neumonía pneumocystis, o toxoplasmosis.
25. Vacuna que comprende por lo menos dos cepas diferentes de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13 ó 21 a 24, estando derivada una de dichas cepas de Perú y estando derivada la otra de Bengal.
26. Vacuna según la reivindicación 25, caracterizada en que cada una de dichas cepas es ctx^{-}, att^{-}, y recA^{-}.
27. Vacuna que comprende una cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13 ó 21 a 25.
28. Cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13 ó 21 a 25 para su uso como medicamento.
29. Utilización de una cepa de V. cholerae según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13 ó 21 a 25 en la preparación de una vacuna para el tratamiento del cólera.
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