EA008007B1 - Новые липазы и их применение - Google Patents
Новые липазы и их применение Download PDFInfo
- Publication number
- EA008007B1 EA008007B1 EA200500391A EA200500391A EA008007B1 EA 008007 B1 EA008007 B1 EA 008007B1 EA 200500391 A EA200500391 A EA 200500391A EA 200500391 A EA200500391 A EA 200500391A EA 008007 B1 EA008007 B1 EA 008007B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- bie
- tht
- zeg
- azp
- rgo
- Prior art date
Links
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 title claims description 14
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 title claims description 7
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 title claims description 6
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 title description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 230
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract description 205
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract description 202
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 180
- 230000002366 lipolytic effect Effects 0.000 claims abstract description 164
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 96
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 64
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 64
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 64
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 52
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 51
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 23
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 188
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 171
- 235000013305 food Nutrition 0.000 claims description 160
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 126
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 48
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 37
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 31
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 26
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 26
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 10
- 241000233866 Fungi Species 0.000 claims description 8
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 3
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 241000272525 Anas platyrhynchos Species 0.000 claims 60
- 241000282994 Cervidae Species 0.000 claims 38
- 101100167365 Caenorhabditis elegans cha-1 gene Proteins 0.000 claims 15
- 239000003518 caustics Substances 0.000 claims 13
- XHPWRTXYJFNZAW-OWOJBTEDSA-N 5-azido-2-[(e)-2-(4-azido-2-sulfophenyl)ethenyl]benzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC(N=[N+]=[N-])=CC=C1\C=C\C1=CC=C(N=[N+]=[N-])C=C1S(O)(=O)=O XHPWRTXYJFNZAW-OWOJBTEDSA-N 0.000 claims 4
- OBATZBGFDSVCJD-LALPQLPRSA-N deslanoside Chemical compound O([C@H]1[C@@H](O)C[C@@H](O[C@@H]1C)O[C@H]1[C@@H](O)C[C@@H](O[C@@H]1C)O[C@H]1[C@@H](O)C[C@@H](O[C@@H]1C)O[C@@H]1C[C@@H]2[C@]([C@@H]3[C@H]([C@]4(CC[C@@H]([C@@]4(C)[C@H](O)C3)C=3COC(=O)C=3)O)CC2)(C)CC1)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O OBATZBGFDSVCJD-LALPQLPRSA-N 0.000 claims 3
- 229960001324 deslanoside Drugs 0.000 claims 3
- 239000002957 persistent organic pollutant Substances 0.000 claims 3
- 241000287531 Psittacidae Species 0.000 claims 2
- 240000005499 Sasa Species 0.000 claims 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims 2
- TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 3-(trimethylsilyl)propane-1-sulfonic acid Chemical compound C[Si](C)(C)CCCS(O)(=O)=O TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000238017 Astacoidea Species 0.000 claims 1
- 206010012335 Dependence Diseases 0.000 claims 1
- BEZXPSZCIDIMAS-KQYNXXCUSA-N [(2r,3s,4r,5r)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-2-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] phosphono hydrogen phosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@H]1O BEZXPSZCIDIMAS-KQYNXXCUSA-N 0.000 claims 1
- ARYLBQOVLQRPOG-UHFFFAOYSA-L disodium;4-[4-[4-(3-carboxylatopropanoylamino)phenyl]sulfonylanilino]-4-oxobutanoate Chemical compound [Na+].[Na+].C1=CC(NC(=O)CCC(=O)[O-])=CC=C1S(=O)(=O)C1=CC=C(NC(=O)CCC([O-])=O)C=C1 ARYLBQOVLQRPOG-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 abstract description 71
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 abstract description 36
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 26
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 abstract description 17
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 abstract description 2
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 abstract description 2
- 241000228245 Aspergillus niger Species 0.000 abstract 1
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 184
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 165
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 92
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 74
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 74
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 73
- 239000000047 product Substances 0.000 description 55
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 46
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 44
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 41
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 39
- 235000008429 bread Nutrition 0.000 description 37
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 36
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 30
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 29
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 29
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 26
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 26
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 22
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 22
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 21
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 21
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 20
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 19
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 17
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 17
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 17
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 14
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 14
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 14
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 14
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 13
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 13
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 13
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 12
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 12
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 12
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 12
- 235000012813 breadcrumbs Nutrition 0.000 description 11
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 11
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 10
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 10
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 10
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 10
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 10
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 10
- 235000015173 baked goods and baking mixes Nutrition 0.000 description 10
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 10
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 9
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 9
- 102000015439 Phospholipases Human genes 0.000 description 9
- 108010064785 Phospholipases Proteins 0.000 description 9
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 9
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 9
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 9
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 9
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 9
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 8
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 8
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 description 8
- 229940024171 alpha-amylase Drugs 0.000 description 8
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 8
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 8
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 8
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 8
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 8
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 8
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 7
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 7
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 7
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 7
- 102220517972 Humanin_C8Y_mutation Human genes 0.000 description 7
- 102100033357 Pancreatic lipase-related protein 2 Human genes 0.000 description 7
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 7
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 7
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 7
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 7
- 230000008569 process Effects 0.000 description 7
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 7
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 7
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 7
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 7
- ZIIUUSVHCHPIQD-UHFFFAOYSA-N 2,4,6-trimethyl-N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzenesulfonamide Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1S(=O)(=O)NC1=CC=CC(C(F)(F)F)=C1 ZIIUUSVHCHPIQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 6
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 6
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 6
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 6
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 6
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 6
- 230000000593 degrading effect Effects 0.000 description 6
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 6
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 6
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 6
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 6
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 6
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 6
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 5
- 102100031415 Hepatic triacylglycerol lipase Human genes 0.000 description 5
- 108020002496 Lysophospholipase Proteins 0.000 description 5
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 5
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 5
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 5
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 5
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 5
- 230000006870 function Effects 0.000 description 5
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 5
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 5
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 5
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 5
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 5
- -1 pentosanases Proteins 0.000 description 5
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 5
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 5
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 5
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 5
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 4
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 4
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 4
- 108010015776 Glucose oxidase Proteins 0.000 description 4
- 239000004366 Glucose oxidase Substances 0.000 description 4
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 4
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 4
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 4
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 4
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008351 acetate buffer Substances 0.000 description 4
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 4
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 4
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 4
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 4
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 4
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 4
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 4
- 229940116332 glucose oxidase Drugs 0.000 description 4
- 235000019420 glucose oxidase Nutrition 0.000 description 4
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N glycerol group Chemical group OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 4
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 4
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 4
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 4
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 4
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 4
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 4
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 3
- 108010091443 Exopeptidases Proteins 0.000 description 3
- 102000018389 Exopeptidases Human genes 0.000 description 3
- 229920002488 Hemicellulose Polymers 0.000 description 3
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 3
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 3
- 239000006057 Non-nutritive feed additive Substances 0.000 description 3
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 3
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 3
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 3
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 3
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 3
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 3
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 3
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 3
- 108010002430 hemicellulase Proteins 0.000 description 3
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 3
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 3
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000000465 moulding Methods 0.000 description 3
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 3
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 3
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 3
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 3
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- FROLUYNBHPUZQU-IIZJPUEISA-N (2R,3R,4S,5R)-2-(hydroxymethyl)-6-[3-[3-[(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxypropoxy]propoxy]oxane-3,4,5-triol Chemical compound OC[C@H]1OC(OCCCOCCCOC2O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O FROLUYNBHPUZQU-IIZJPUEISA-N 0.000 description 2
- RYCNUMLMNKHWPZ-SNVBAGLBSA-N 1-acetyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CC(=O)OC[C@@H](O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C RYCNUMLMNKHWPZ-SNVBAGLBSA-N 0.000 description 2
- VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 1-monostearoylglycerol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)CO VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHLSSLVZXJBVHE-UHFFFAOYSA-N 3-sulfanylpropan-1-ol Chemical compound OCCCS SHLSSLVZXJBVHE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 2
- 241000394761 Blumea lacera Species 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108010059892 Cellulase Proteins 0.000 description 2
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 2
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710121765 Endo-1,4-beta-xylanase Proteins 0.000 description 2
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 2
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 description 2
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 2
- 108010093488 His-His-His-His-His-His Proteins 0.000 description 2
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 2
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 2
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 108010029541 Laccase Proteins 0.000 description 2
- 102000003820 Lipoxygenases Human genes 0.000 description 2
- 108090000128 Lipoxygenases Proteins 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 102000000571 Phospholipases A Human genes 0.000 description 2
- 108010002176 Phospholipases A Proteins 0.000 description 2
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 2
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 description 2
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N Styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1 PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 108060008539 Transglutaminase Proteins 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UGXQOOQUZRUVSS-ZZXKWVIFSA-N [5-[3,5-dihydroxy-2-(1,3,4-trihydroxy-5-oxopentan-2-yl)oxyoxan-4-yl]oxy-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (e)-3-(4-hydroxyphenyl)prop-2-enoate Chemical compound OC1C(OC(CO)C(O)C(O)C=O)OCC(O)C1OC1C(O)C(O)C(COC(=O)\C=C\C=2C=CC(O)=CC=2)O1 UGXQOOQUZRUVSS-ZZXKWVIFSA-N 0.000 description 2
- 102000005840 alpha-Galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 108010030291 alpha-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 2
- 239000002518 antifoaming agent Substances 0.000 description 2
- 229920000617 arabinoxylan Polymers 0.000 description 2
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 2
- 125000000613 asparagine group Chemical class N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- 108010019077 beta-Amylase Proteins 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 235000012970 cakes Nutrition 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 229940106157 cellulase Drugs 0.000 description 2
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 2
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 2
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 2
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 2
- UHZZMRAGKVHANO-UHFFFAOYSA-M chlormequat chloride Chemical compound [Cl-].C[N+](C)(C)CCCl UHZZMRAGKVHANO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 239000003797 essential amino acid Substances 0.000 description 2
- 235000020776 essential amino acid Nutrition 0.000 description 2
- 238000005187 foaming Methods 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 2
- 229940059442 hemicellulase Drugs 0.000 description 2
- 108060003552 hemocyanin Proteins 0.000 description 2
- 108010018734 hexose oxidase Proteins 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 2
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 2
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 description 2
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 2
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052745 lead Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 238000003754 machining Methods 0.000 description 2
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 241000264288 mixed libraries Species 0.000 description 2
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 2
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 2
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 2
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 2
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 2
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 2
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 2
- 239000000941 radioactive substance Substances 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000007493 shaping process Methods 0.000 description 2
- ODFAPIRLUPAQCQ-UHFFFAOYSA-M sodium stearoyl lactylate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC(C)C(=O)OC(C)C([O-])=O ODFAPIRLUPAQCQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000003153 stable transfection Methods 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 150000005846 sugar alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 2
- 102000003601 transglutaminase Human genes 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 2
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 2
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ASWBNKHCZGQVJV-UHFFFAOYSA-N (3-hexadecanoyloxy-2-hydroxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C ASWBNKHCZGQVJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006701 (C1-C7) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 2,4-dinitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1[N+]([O-])=O UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QRYXYRQPMWQIDM-UHFFFAOYSA-N 3-benzoyl-3-(2,5-dioxopyrrol-1-yl)-1-hydroxypyrrolidine-2,5-dione Chemical compound O=C1N(O)C(=O)CC1(C(=O)C=1C=CC=CC=1)N1C(=O)C=CC1=O QRYXYRQPMWQIDM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004679 31P NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- UHBAPGWWRFVTFS-UHFFFAOYSA-N 4,4'-dipyridyl disulfide Chemical compound C=1C=NC=CC=1SSC1=CC=NC=C1 UHBAPGWWRFVTFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DTRIDVOOPAQEEL-UHFFFAOYSA-M 4-sulfanylbutanoate Chemical compound [O-]C(=O)CCCS DTRIDVOOPAQEEL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 7-hydroxycoumarin Natural products O1C(=O)C=CC2=CC(O)=CC=C21 CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010022752 Acetylcholinesterase Proteins 0.000 description 1
- 102000012440 Acetylcholinesterase Human genes 0.000 description 1
- 102100024321 Alkaline phosphatase, placental type Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 102000004400 Aminopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108090000915 Aminopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 108010032595 Antibody Binding Sites Proteins 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 102000004580 Aspartic Acid Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010017640 Aspartic Acid Proteases Proteins 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 231100000699 Bacterial toxin Toxicity 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical class OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010006303 Carboxypeptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000005367 Carboxypeptidases Human genes 0.000 description 1
- 102000011632 Caseins Human genes 0.000 description 1
- 108010076119 Caseins Proteins 0.000 description 1
- 108010031396 Catechol oxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000030523 Catechol oxidase Human genes 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 108010008885 Cellulose 1,4-beta-Cellobiosidase Proteins 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241001137251 Corvidae Species 0.000 description 1
- 108010025880 Cyclomaltodextrin glucanotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 1
- 108010008286 DNA nucleotidylexotransferase Proteins 0.000 description 1
- 102100029764 DNA-directed DNA/RNA polymerase mu Human genes 0.000 description 1
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 1
- 241000168022 Elaphurus davidianus Species 0.000 description 1
- 108010013369 Enteropeptidase Proteins 0.000 description 1
- 102100029727 Enteropeptidase Human genes 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001422 FEMA 4092 Substances 0.000 description 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 description 1
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 1
- 102100022624 Glucoamylase Human genes 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 102000051366 Glycosyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 241001530812 Goupia glabra Species 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N HA peptide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N 0.000 description 1
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- 101001122938 Homo sapiens Lysosomal protective protein Proteins 0.000 description 1
- 101000674732 Homo sapiens TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 101710203526 Integrase Proteins 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N L-arginine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 229930064664 L-arginine Natural products 0.000 description 1
- 235000014852 L-arginine Nutrition 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 239000004201 L-cysteine Substances 0.000 description 1
- 235000013878 L-cysteine Nutrition 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 102100028524 Lysosomal protective protein Human genes 0.000 description 1
- 229920002774 Maltodextrin Polymers 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 108010036176 Melitten Proteins 0.000 description 1
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 description 1
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 description 1
- 229920001410 Microfiber Polymers 0.000 description 1
- 102000014171 Milk Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010011756 Milk Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101100378170 Mus musculus Actl7a gene Proteins 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Chemical group 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 241000566145 Otus Species 0.000 description 1
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 1
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 1
- 101150101057 PBA1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 108010067902 Peptide Library Proteins 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 1
- 102220558805 Platelet-activating factor acetylhydrolase_E18A_mutation Human genes 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 101900083372 Rabies virus Glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 1
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 1
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 241000701093 Suid alphaherpesvirus 1 Species 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100021229 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- 101710097834 Thiol protease Proteins 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 1
- 241000209140 Triticum Species 0.000 description 1
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 1
- 235000007264 Triticum durum Nutrition 0.000 description 1
- 241000209143 Triticum turgidum subsp. durum Species 0.000 description 1
- YZCKVEUIGOORGS-NJFSPNSNSA-N Tritium Chemical compound [3H] YZCKVEUIGOORGS-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 1
- 102000014384 Type C Phospholipases Human genes 0.000 description 1
- 108010079194 Type C Phospholipases Proteins 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 229940022698 acetylcholinesterase Drugs 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000000688 bacterial toxin Substances 0.000 description 1
- 235000012791 bagels Nutrition 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 108010047754 beta-Glucosidase Proteins 0.000 description 1
- 102000006995 beta-Glucosidase Human genes 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 235000015895 biscuits Nutrition 0.000 description 1
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 1
- 239000001045 blue dye Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 235000012180 bread and bread product Nutrition 0.000 description 1
- 235000012787 bread loaves Nutrition 0.000 description 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- SXDBWCPKPHAZSM-UHFFFAOYSA-M bromate Chemical class [O-]Br(=O)=O SXDBWCPKPHAZSM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N casein, tech. Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CC(C)C)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(C(C)O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(COP(O)(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 1
- 229940021722 caseins Drugs 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 230000007248 cellular mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000012707 chemical precursor Substances 0.000 description 1
- 238000012993 chemical processing Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000002987 choroid plexus Anatomy 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000012411 cloning technique Methods 0.000 description 1
- 238000002742 combinatorial mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000005336 cracking Methods 0.000 description 1
- 235000012777 crisp bread Nutrition 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000003405 delayed action preparation Substances 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- UHMKISIRZFDJRU-UHFFFAOYSA-L diethyl-methyl-[2-(1,1,6-trimethylpiperidin-1-ium-2-carbonyl)oxyethyl]azanium;diiodide Chemical compound [I-].[I-].CC[N+](C)(CC)CCOC(=O)C1CCCC(C)[N+]1(C)C UHMKISIRZFDJRU-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229940079919 digestives enzyme preparation Drugs 0.000 description 1
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 description 1
- 235000012489 doughnuts Nutrition 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 229940088679 drug related substance Drugs 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- YERABYSOHUZTPQ-UHFFFAOYSA-P endo-1,4-beta-Xylanase Chemical compound C=1C=CC=CC=1C[N+](CC)(CC)CCCNC(C(C=1)=O)=CC(=O)C=1NCCC[N+](CC)(CC)CC1=CC=CC=C1 YERABYSOHUZTPQ-UHFFFAOYSA-P 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000010429 evolutionary process Effects 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 235000012470 frozen dough Nutrition 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 102000018146 globin Human genes 0.000 description 1
- 108060003196 globin Proteins 0.000 description 1
- 108010061330 glucan 1,4-alpha-maltohydrolase Proteins 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 235000021312 gluten Nutrition 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- YQEMORVAKMFKLG-UHFFFAOYSA-N glycerine monostearate Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC(CO)CO YQEMORVAKMFKLG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SVUQHVRAGMNPLW-UHFFFAOYSA-N glycerol monostearate Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)CO SVUQHVRAGMNPLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 1
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical class O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052588 hydroxylapatite Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 239000012133 immunoprecipitate Substances 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 229910052738 indium Inorganic materials 0.000 description 1
- APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N indium atom Chemical compound [In] APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- 238000012417 linear regression Methods 0.000 description 1
- 235000019626 lipase activity Nutrition 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 239000006194 liquid suspension Substances 0.000 description 1
- 239000013541 low molecular weight contaminant Substances 0.000 description 1
- HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N luminol Chemical compound O=C1NNC(=O)C2=C1C(N)=CC=C2 HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 239000002075 main ingredient Substances 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- VDXZNPDIRNWWCW-JFTDCZMZSA-N melittin Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(N)=O)CC1=CNC2=CC=CC=C12 VDXZNPDIRNWWCW-JFTDCZMZSA-N 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 1
- 239000003658 microfiber Substances 0.000 description 1
- 235000021239 milk protein Nutrition 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- ZTLGJPIZUOVDMT-UHFFFAOYSA-N n,n-dichlorotriazin-4-amine Chemical compound ClN(Cl)C1=CC=NN=N1 ZTLGJPIZUOVDMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000011330 nucleic acid test Methods 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000012771 pancakes Nutrition 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 235000015927 pasta Nutrition 0.000 description 1
- XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D pentacalcium;hydroxide;triphosphate Chemical compound [OH-].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 229940080469 phosphocellulose Drugs 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 235000015108 pies Nutrition 0.000 description 1
- 235000012796 pita bread Nutrition 0.000 description 1
- 108010031345 placental alkaline phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920000447 polyanionic polymer Polymers 0.000 description 1
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- GTNNCNWLWZLCGV-UHFFFAOYSA-M potassium;2-(2-octadecanoyloxypropanoyloxy)propanoate Chemical compound [K+].CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC(C)C(=O)OC(C)C([O-])=O GTNNCNWLWZLCGV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 108010001816 pyranose oxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 229940100486 rice starch Drugs 0.000 description 1
- 238000012106 screening analysis Methods 0.000 description 1
- 230000037432 silent mutation Effects 0.000 description 1
- 230000005783 single-strand break Effects 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000010802 sludge Substances 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000012064 sodium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 229940080352 sodium stearoyl lactylate Drugs 0.000 description 1
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000005507 spraying Methods 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000012409 standard PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 238000012289 standard assay Methods 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 108010001535 sulfhydryl oxidase Proteins 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 1
- 239000012730 sustained-release form Substances 0.000 description 1
- 229910052713 technetium Inorganic materials 0.000 description 1
- GKLVYJBZJHMRIY-UHFFFAOYSA-N technetium atom Chemical compound [Tc] GKLVYJBZJHMRIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012956 testing procedure Methods 0.000 description 1
- 229960000814 tetanus toxoid Drugs 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 235000012184 tortilla Nutrition 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000005820 transferase reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 229910052722 tritium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Chemical compound C1=CC(=O)OC2=CC(O)=CC=C21 ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Natural products Cc1cc2C=CC(=O)Oc2cc1OCC=CC(C)(C)O HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 1
- 235000012794 white bread Nutrition 0.000 description 1
- 235000011845 white flour Nutrition 0.000 description 1
- 201000008552 xeroderma pigmentosum group A Diseases 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/18—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
- C12N9/20—Triglyceride splitting, e.g. by means of lipase
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
Abstract
Изобретение относится к новой идентифицированной полинуклеотидной последовательности, содержащей ген, который кодирует новый липолитический фермент из Aspergillus niger. Отличительными особенностями настоящего изобретения являются нуклеотидная последовательность полной длины нового гена, последовательность кДНК, содержащая последовательность полной длины, кодирующую новый липолитический фермент, а также аминокислотная последовательность функционального белка полной длины и их функциональные эквиваленты. Настоящее изобретение также относится к способам применения таких ферментов в промышленных процессах и способах диагностирования грибковых инфекций. Также в настоящее изобретение включены клетки, трансформированные полинуклеотидом согласно настоящему изобретению и клетки, в которых липолитический фермент согласно настоящему изобретению генетически модифицирован для усиления своей активности и/или уровня экспрессии.
Description
Изобретение относится к недавно идентифицированной полинуклеотидной последовательности, содержащей ген, кодирующий новый липолитический фермент из АкретдШик шдет. Признаками настоящего изобретения являются нуклеотидная последовательность нового гена полной длины, кДНК последовательность, содержащая полную длину последовательности, кодирующей новый липолитический фермент, а также аминокислотная последовательность липолитического фермента полной длины и его функциональные эквиваленты. Настоящее изобретение также относится к способам использования этих ферментов в промышленных процессах и способах диагностики грибковых инфекций. В настоящее изобретение также включены клетки, трансформированные полинуклеотидом согласно настоящему изобретению, и клетки, в которых липолитический фермент согласно настоящему изобретению является генетически модифицированным для усиления активности и/или уровня экспрессии.
Сущность изобретения
Печеные изделия, такие как хлеб, готовят из теста, которое обычно изготавливают из основных ингредиентов (пшеничной) муки, воды и необязательно соли. В зависимости от печеных изделий другими добавленными ингредиентами могут быть сахар и прочие вкусовые добавки. Для продуктов с применением разрыхлителей, в основном используют хлебопекарные дрожжи наряду с химическими разрыхляющими системами, такими как комбинация кислот (генерирующее соединение) и бикарбонатов.
Для улучшения свойств разделки теста и/или конечных свойств печеных изделий осуществляют непрерывные попытки развития вспомогательных веществ обработки с улучшенными свойствами. Вспомогательные вещества обработки в настоящем описании определены как соединения, которые улучшают свойства разделки теста и/или конечные свойства печеных изделий. Свойства теста, которые могут быть улучшены, включают способность механической обработки, способность аккумулировать газ, уменьшенную липкость, эластичность, растяжимость, пластичность и т.д. Свойства печеных изделий, которые могут быть улучшены, включают объем батона, жесткость корочки, текстуру и мягкость хлебного мякиша, привкус, связанный с несвежестью и сроком хранения. Такие вспомогательные вещества, улучшающие обработку теста и/или печеных изделий, можно подразделить на две группы: химические добавки и ферменты (также упоминаемые как хлебопекарные ферменты).
Дрожжи, ферменты и химические добавки обычно добавляют в тесто отдельно. Дрожжи могут быть добавлены в виде жидкой суспензии, в прессованном виде или в виде сухих активных (ΑΌΥ) или сухих неактивных дрожжей (ΙΌΥ). Различием между такими составами дрожжей является содержание воды и сухого вещества дрожжей. Жидкие дрожжи имеют содержание сухого вещества дрожжей менее чем 25% (веса к объему). Дрожжи в виде пасты имеют содержание сухого вещества дрожжей от 17 до 23% (веса к объему). Прессованные дрожжи имеют содержание сухого вещества дрожжей между 25-35% (веса к объему), в то время как составы сухих дрожжей имеют содержание сухого вещества дрожжей между 92-98% (веса к объему).
Ферменты могут быть добавлены в сухом, например гранулированном, виде или в жидком виде. Химические добавки в большинстве случаев добавляют в виде порошка. Также композиции вспомогательных веществ, которые разработаны для специфических применений выпечки, могут быть составлены из специально предназначенных смесей химических добавок и ферментов.
Приготовление теста из ингредиентов и вспомогательных веществ, описанных выше, хорошо известно специалистам в данной области техники и содержит смешивание упомянутых ингредиентов и вспомогательных веществ и один или несколько этапов формования и ферментации.
Приготовление печеных изделий из такого теста также хорошо известно специалистам в данной области техники и может содержать формование и придание формы и дополнительное брожение теста, с последующей выпечкой при необходимых температурах и времени выпечки.
Химические добавки с улучшенными свойствами содержат окисляющие агенты, такие как аскорбиновую кислоту, броматы и азодикарбонаты, восстанавливающие агенты, такие как Ь-цистеин и глутатион, эмульгаторы, действующие как улучшители свойств теста, такие как эфиры моно- и диглицеридов диацетилвинной кислоты (ΌΑΤΕΜ), стеароиллактилат натрия (88Ь) или стеароиллактилат калия (С8Ь), или действующие как размягчители хлебного мякиша, такие как моностеарат глицерина (ΟΜ8) и т.д., жирные вещества, такие как триглицериды (жир) или лецитин и др.
В результате из-за диктуемой потребителем необходимости замещения химических добавок более натуральными продуктами, разработаны некоторые хлебопекарные ферменты со свойствами, улучшающими тесто и/или печеные изделия, и, которые могут быть использованы во всевозможных комбинациях, в зависимости от специфических условий применения выпечки. Подходящие ферменты включают ферменты, разрушающие крахмал, ферменты, разрушающие арабиноксилан и другую гемицеллюлозу, ферменты, разрушающие целлюлозу, ферменты окисления, ферменты, расщепляющие жирные вещества, ферменты, разрушающие, модифицирующие или сшивающие белки.
Ферментами, разрушающими крахмал, являются, например, ферменты, действующие внутри, такие как альфа-амилаза, мальтогенная амилаза, пуллуланаза, или другие ферменты расщепления разветвленной структуры, и ферменты, действующие снаружи, которые расщепляют до глюкозы (амилоглюкозидаза), мальтозы (бета-амилаза), мальтотриозы, мальтотетрозы и более высокие олигосахариды.
- 1 008007
Ферментами, разрушающими арабиноксилан- и другую гемицеллюлозу, являются, например, ксиланазы, пентозаназы, гемицеллюлаза, арабинофуранозидаза, глюконаза и др.
Ферментами, разрушающими целлюлозу, являются, например, целлюлаза, целлобиогидролаза и бета-глюкозидаза.
Ферментами окисления являются, например, глюкозооксидаза, гексозооксидаза, пиранозоксидаза, сульфгидрил-оксидаза, липоксигеназа, лакказа, полифенолоксидаза и др.
Ферментами, расщепляющими жирные вещества, являются, например, липолитические ферменты, такие как триацилглицероллипазы, фосфолипазы (такие как Аь А2, В, С и Ό) и галактолипазы.
Ферментами, разрушающими, модифицирующими или сшивающими белки, являются, например, эндопротеазы (серинпротеазы, металлопротеазы, аспартилпротеазы, тиолпротеазы), экзопептидазы, которые расщепляют до одной аминокислоты или дипептида, трипептида и т.д. с Ν-терминального (аминопептидазы) или С-терминального (карбоксипептидазы) концов полипептидной цепи, ферменты, разрушающие глутамин или аспарагины, такие как деамидаза и пептидоглутаминаза, или сшивающие ферменты, такие как трансглютаминаза.
Хлебопекарные ферменты как правило могут производиться микроорганизмами. Микробные хлебопекарные ферменты являются доступными из различных источников; ВасШик крес. являются обычным источником ферментов бактерий, несмотря на то, что ферменты грибов обычно производят АкретдШик крес.
Хлебопекарные ферменты могут быть использованы в многообразии хлебопекарных изделий. Термин хлебопекарные изделия в настоящем описании определен как содержащий хлебные изделия, такие как хлеб, батоны хлеба, французский батон, а также булочки, пирожные, пирожки, горячая сдоба, пончики из дрожжевого и недрожжевого теста и т. п.
В процессах, упомянутых выше, существует преимущество использования хлебопекарных ферментов, которые получены при помощи ДНК-рекомбинантных технологий. Такие рекомбинантные ферменты имеют некоторые преимущества перед традиционно очищенными аналогами. Рекомбинантные ферменты могут быть созданы по низкой себестоимости, с высоким выходом, свободными от загрязняющих агентов, подобных бактериям или вирусам, а также свободными от бактериальных токсинов или других загрязняющих ферментативных активностей.
Задача изобретения
Задачей настоящего изобретения является предоставление новых полинуклеотидов, кодирующих новые липолитические ферменты с улучшенными свойствами. Дополнительной задачей является предоставление липолитических ферментов, продуцируемых естественным путем и рекомбинантным способом, а также рекомбинантных штаммов, их продуцирующих. Также частью настоящего изобретения являются слитые полипептиды, а также способы создания и использования полинуклеотидов и полипептидов согласно настоящему изобретению.
Задачей настоящего изобретения также является предоставление новых липолитических ферментов, которые решают по меньшей мере одну из вышеупомянутых проблем или предоставляют новые липолитические ферменты, которые имеют одно или несколько улучшенных свойств при использовании в тесте и/или печеных изделиях, выбранных из группы увеличенной прочности теста, увеличенной эластичности теста, увеличенной стабильности теста, уменьшенной черствости теста, улучшенной растяжимости теста, улучшенной способности теста к механической обработке, увеличенного объема печеного изделия, улучшенной структуры хлебного мякиша печеного изделия, улучшенной мягкости печеного изделия, улучшенного вкуса печеного изделия, улучшенной устойчивости к черствлению печеного изделия, улучшенного цвета печеного изделия, улучшенной корки печеного изделия или которые имеют особенность хлебного субстрата.
Сущность изобретения
Настоящее изобретение предоставляет новые полинуклеотиды, кодирующие новые липолитические ферменты. Более конкретно, настоящее изобретение предоставляет полинуклеотиды, имеющие нуклеотидную последовательность, которая гибридизируется предпочтительно при условиях высокой жесткости с последовательностью, выбранной из группы, состоящую из БЕЦ ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38. Следовательно, изобретение предоставляет нуклеиновые кислоты, которые являются более чем на 40%, такие как примерно 60%, предпочтительно 65%, более предпочтительно 70%, даже более предпочтительно 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% гомологичными последовательностям, выбранным из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38.
В более предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет такие выделенные полинуклеотиды, получаемые из мицельных грибов, в частности АкретдШик шдет является предпочтительным.
В одном из вариантов осуществления настоящее изобретение предоставляет выделенный полинуклеотид, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов.
- 2 008007
В дополнительном варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет выделенный полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один функциональный домен полинуклеотида, выбранного из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов.
В предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет ген липолитического фермента, выбранный из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25, 28, 31, 34 и 37. В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет полинуклеотид, предпочтительно кДНК, кодирующую липолитический фермент АкретдШик шдет, чью аминокислотную последовательность выбирают из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или варианты или фрагменты такого полипептида. В предпочтительном варианте осуществления кДНК имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 2, 5, 8, 11, 14, 17, 20, 23, 26, 29, 32, 35 и 38 или их функциональных эквивалентов.
В еще одном предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет полинуклеотид, содержащий кодирующую последовательность полинуклеотидов согласно настоящему изобретению, причем предпочтительной является полинуклеотидная последовательность, выбранная из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 2, 5, 8, 11, 14, 17, 20, 23, 26, 29, 32, 35 и 38.
Настоящее изобретение также относится к векторам, содержащим полинуклеотидную последовательность согласно настоящему изобретению, и праймерам, зондам и фрагментам, которые могут быть использованы для амплификации или обнаружения ДНК согласно настоящему изобретению.
В дополнительном предпочтительном варианте осуществления предоставляют вектор, в котором полинуклеотидная последовательность согласно настоящему изобретению является функционально связанной с регуляторными последовательностями, подходящими для экспрессии кодируемой аминокислотной последовательности в подходящей клетке хозяина, такой как ЛкретдШик шдет или ЛкретдШик огухае. Настоящее изобретение также предоставляет способы приготовления полинуклеотидов и векторов согласно настоящему изобретению.
Настоящее изобретение также относится к рекомбинантно продуцируемым клеткам хозяина, которые содержат гетерологичные или гомологичные полинуклеотиды согласно настоящему изобретению.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет рекомбинантные клетки хозяина, в которых экспрессия липолитического фермента согласно настоящему изобретению существенно увеличена или в которых увеличена активность липолитического фермента.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет клетку хозяина продуцируемую рекомбинантным способом, которая содержит гетерологичный или гомологичный полинуклеотид согласно настоящему изобретению и, где клетка способна продуцировать функциональный липолитический фермент согласно настоящему изобретению, предпочтительно клетка способна к чрезмерной экспрессии липолитического фермента согласно настоящему изобретению, например штамм АкретдШик, содержащий увеличенное количество копий гена или кДНК в настоящем изобретении.
В еще одном аспекте настоящего изобретения предоставлен очищенный полипептид. Полипептиды согласно настоящему изобретению включают полипептиды, кодируемые полинуклеотидами согласно настоящему изобретению. Особенно предпочтительным является полипептид, выбранный из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов.
Следовательно, в одном из аспектов настоящее изобретение предоставляет композицию липолитического фермента, содержащую в качестве активного ингредиента фермент, выбранный из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет способ получения печеных изделий, в котором в тесто включены используемые для изготовления печеных изделий один или несколько ферментов, выбранных из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов.
Слитые белки, содержащие полипепти, согласно настоящему изобретению также находятся в объеме настоящего изобретения. Настоящее изобретение также предоставляет способы получения полипептидов согласно настоящему изобретению.
Настоящее изобретение также относится к использованию липолитического фермента согласно настоящему изобретению в любом промышленном процессе как изложено в настоящем описании.
Осуществление изобретения
Липолитический фермент определен в настоящем описании как фермент, проявляющий себя, по меньшей мере, как один, а предпочтительно два, или три, или четыре, или более из следующих липолитических активностей: триацилглицерол липазы, фосфолипазы А1, фосфолипазы А2, фосфолипазы В, фосфолипазы С, фосфолипазы Ό, лизофосфолипазы и галактолипазы.
Полинуклеотиды
Настоящее изобретение представляет нуклеотиды, кодирующие липолитические ферменты, имеющие аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12,
- 3 008007
15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов. Последовательности семи генов, кодирующих липолитические ферменты ΝΒΕ028, ΝΒΕ029, ΝΒΕ030, ΝΒΕ031, ΝΒΕ032, ΝΒΕ033, ΝΒΕ034, ΝΒΕ036, ΝΒΕ038, ΝΒΕ039, ΝΒΕ043, ΝΒΕ045 и ΝΒΕ042 соответственно были определены путем секвенирования геномных клонов, полученных из ЛзрегдШиз шдег. Настоящее изобретение представляет полинуклеотидные последовательности, содержащие гены, кодирующие липолитические ферменты ΝΒΕ028, ΝΒΕ029, ΝΒΕ030, ΝΒΕ031, ΝΒΕ032, ΝΒΕ033, ΝΒΕ034, ΝΒΕ036, ΝΒΕ038, ΝΒΕ039, ΝΒΕ043, ΝΒΕ045 и ΝΒΕ042, а также их полные последовательности кДНК и их кодирующие последовательности (табл. 1). Следовательно, настоящее изобретение относится к выделенным полинуклеотидам, содержащим нуклеотидные последовательности, выбранные из группы, состоящей из 8Ε0 ΙΟ ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 или их функциональных эквивалентов.
Таблица 1
| Липолитический фермент | Последовательность (ЗЕО Ю N0) | ||
| ΝΒΕχχχ | геномная | кДНК | аминокислотная |
| ΝΒΕ028 | 1 | 2 | 3 |
| ΝΒΕ029 | 4 | 5 | 6 |
| ΝΒΕ030 | 7 | 8 | 9 |
| ΝΒΕ031 | 10 | 11 | 12 |
| ΝΒΕ032 | 13 | 14 | 15 |
| ΝΒΕ033 | 16 | 17 | 18 |
| ΝΒΕ034 | 19 | 20 | 21 |
| ΝΒΕ036 | 22 | 23 | 24 |
| ΝΒΕ038 | 25 | 26 | 27 |
| ΝΒΕ039 | 28 | 29 | 30 |
| ΝΒΕ043 | 31 | 32 | 33 |
| ΝΒΕ045 | 34 | 35 | 36 |
| ΝΒΕ042 | 37 | 38 | 39 |
Более конкретно, настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, гибридизуемому в жестких условиях, предпочтительно в условиях высокой жесткости, в полинуклеотиды, выбранные из группы, состоящей из 8Ш Ш ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38. Преимущественно, такие полинуклеотиды могут быть получены из мицельных грибов, в частности из ЛзрегдШиз шдег. Более конкретно, настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, имеющему нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ΕΌ Ю ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38.
Настоящее изобретение также относится к выделенному полинуклеотиду, кодирующему по меньшей мере один функциональный домен полинуклеотида, имеющего аминокислотные последовательности, выбранные из группы, состоящей из 8ЕО ΙΟ ΝΟ: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или их функциональных эквивалентов.
Как используется в настоящем описании, термины ген и рекомбинантный ген относятся к молекулам нуклеиновой кислоты, которые могут быть выделены из хромосомной ДНК, которая включает открытую рамку считывания, кодирующую белок, например, липолитический фермент ЛзрегдШиз шдег. Ген может включать в себя кодирующие последовательности, некодирующие последовательности, интроны и регуляторные последовательности. Более того, ген относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, как определено в настоящем описании.
Молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения, такая как молекула нуклеиновой кислоты, имеющая нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8Ε0 ΙΟ ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 или их функциональных эквивалентов, может быть выделена с использованием стандартных техник молекулярной биологии и информации последовательностей, предоставленной настоящим описанием. Например, используя всю или часть последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8Ε0 ΙΟ ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 в качестве гибридизационного зонда, молекулы нуклеиновых кислот согласно настоящему изобретению могут быть выделены
- 4 008007 с использованием стандартных техник гибридизации и клонирования (например, как описано у 8атЬгоок, ί.. ЕтйкЬ, Е.Е. и МапаШ, Т. Мо1еси1аг С1ошид: А ЬаЬога1огу Мапиа1. 2'1. еб., Со1б 8ртшд НагЬог ЬаЬога1огу, Со1б 8ртшд НагЬог ЬаЬота1огу Рге55. Со1б 8ртшд НагЬог, ΝΥ, 1989).
Более того, молекула нуклеиновой кислоты, охватывающая всю или часть последовательности нуклеиновой кислоты из группы, состоящей из 8Ер ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38, может быть выделена полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с использованием синтетических олигонуклеотидных праймеров, разработанных на основании информации о последовательности, содержащейся в последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8ЕР ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38.
Нуклеиновая кислота настоящего изобретения может быть амплифицирована с использованием кДНК, мРНК или, в качестве альтернативы, геномной ДНК, в качестве матрицы и подходящих олигонуклеотидных праймеров согласно стандартным техникам ПЦР амплификации. Нуклеиновая кислота, амплифицированная таким образом, может быть клонирована в подходящий вектор и охарактеризована при помощи анализа последовательности ДНК.
Более того, олигонуклеотиды, соответствующие или гибридизуемые с нуклеотидными последовательностями согласно настоящему изобретению, могут быть приготовлены при помощи стандартных техник синтеза, например, используя автоматизированный ДНК синтезатор.
В одном из предпочтительных вариантов осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8ЕР ГО N0:2. Последовательность 8ЕР ГО N0:2 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, представленного в 8ЕР ГО N0:1. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ028 АкретдШик шдет, как показано в 8ЕР ГО N0:3.
Во втором предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8 Ер ГО N0:5. Последовательность 8ЕР ГО N0:5 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8ЕР ГО N0:4. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ029 АкретдШик шдет, как показано в 8ЕР ГО N0:6.
В третьем предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:8. Последовательность 8Ер ГО N0:8 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8Ер ГО N0:7. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ030 АкретдШик шдет, как показано в 8Ер ГО N0:9.
В четвертом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:11. Последовательность 8Ер ГО N0:11 соответствует области кодирования гена АкретдШик пре г, предоставленного в 8Ер ГО N0:10. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ031 АкретдШик шдет, как показано в 8Ер ГО N0:12.
В пятом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:14. Последовательность 8Ер ГО N0:14 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8Ер ГО N0:13. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ032 АкретдШик шдет, как показано в 8Ер ГО N0:15.
В шестом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:17. Последовательность 8Ер ГО N0:17 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8Ер ГО N0:16. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ033, АкретдШик шдет, как показано в 8Ер ГО N0:18.
В седьмом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:20. Последовательность 8Ер ГО N0:20 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8Ер ГО N0:19. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ034 АкретдШик шдет, как показано в 8Ер ГО N0:21.
В восьмом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:23. Последовательность 8Ер ГО N0:23 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8Ер ГО N0:22. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ034 АкретдШик шдет, как показано в 8Ер ГО N0:24.
В девятом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов, представленную в 8Ер ГО N0:265. Последовательность 8Ер ГО N0:26 соответствует области кодирования гена АкретдШик шдет, предоставленного в 8Ер ГО N0:25. Такая кДНК содержит последовательность, кодирующую полипептид NΒЕ034
- 5 008007
ЛзрегдШиз шдег. как показано в 8ЕЦ Ш N0:27.
В десятом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов. представленную в 8ЕО Ш N0:29. Последовательность 8Е0 Ш N0:29 соответствует области кодирования гена ЛзрегдШиз шдег. предоставленного в 8Е0 Ш N0:28. Такая кДНК содержит последовательность. кодирующую полипептид ΝΒΕ034 ЛзрегдШиз шдег. как показано в 8ЕЦ Ш N0:30.
В одиннадцатом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов. представленную в 8Е0 Ш N0:32. Последовательность 8Е0 Ш N0:32 соответствует области кодирования гена ЛзрегдШиз шдег. предоставленного в 8Е0 Ш N0:31. Такая кДНК содержит последовательность. кодирующую полипептид ПВЕ034 ЛзрегдШиз шдег. как показано в 8ЕЦ Ш N0:33.
В двенадцатом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов. представленную в 8Е0 Ш N0:35. Последовательность 8Е0 Ш N0:35 соответствует области кодирования гена ЛзрегдШиз шдег. предоставленного в 8Е0 Ш N0:34. Такая кДНК содержит последовательность. кодирующую полипептид NΒЕ034 ЛзрегдШиз шдег. как показано в 8ЕЦ Ш N0:36.
В тринадцатом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит последовательность нуклеотидов. представленную в 8Е0 Ш N0:38. Последовательность 8Е0 Ш N0:38 соответствует области кодирования гена ЛзрегдШиз шдег. предоставленного в 8Е0 Ш N0:37. Такая кДНК содержит последовательность. кодирующую полипептид NΒЕ034 ЛзрегдШиз шдег. как показано в 8ЕЦ Ш N0:39.
В другом предпочтительном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты настоящего изобретения содержит молекулу нуклеиновой кислоты. которая комплементарна нуклеотидной последовательности. выбранной из группы. состоящей из 8Е0 Ш N0: 1. 2. 4. 5. 7. 8. 10. 11. 13. 14. 16. 17. 19. 20. 22. 23. 25. 26. 28. 29. 31. 32. 34. 35. 37 и 38 или функциональных эквивалентов таких нуклеотидных последовательностей. Молекула нуклеиновой кислоты. которая комплементарна другой нуклеотидной последовательности. является молекулой. которая достаточно комплементарна другой нуклеотидной последовательности так. что она может гибридизоваться с другой нуклеотидной последовательностью. таким образом. образуя стабильный дуплекс.
Один из аспектов настоящего изобретения имеет отношение к выделенным молекулам нуклеиновых кислот. которые кодируют полипептид настоящего изобретения или его функциональный эквивалент. такой как биологически активный фрагмент или домен. а также к молекулам нуклеиновых кислот. достаточным для использования в качестве гибридизационных зондов для идентификации молекул нуклеиновых кислот. кодирующих полипептид настоящего изобретения. и к фрагментам таких молекул нуклеиновых кислот. подходящих для использования в качестве праймеров ПЦР для амплификации или мутации молекул нуклеиновых кислот. Выделенный полинуклеотид или выделенная нуклеиновая кислота представляет собой ДНК или РНК. которая не является непосредственно граничащей с обеими кодирующими последовательностями. с которыми она непосредственно граничит (одна на 5' и одна на 3' концах) в природном геноме организма. из которого получена. Таким образом. в одном из вариантов осуществления выделенная нуклеиновая кислота включает в себя несколько или все 5' некодирующие (например. промотор) последовательности. которые непосредственно примыкают к кодирующей последовательности. Следовательно. термин включает в себя. например. рекомбинантную ДНК. которая включена в вектор. в автономно реплицирующуюся плазмиду или вирус. или в геномную ДНК прокариота или эукариота. или которая существует как отдельная молекула (например. кДНК или фрагмент геномной ДНК. полученной при помощи ПЦР или обработкой рестрикционными эндонуклеазами) независимо от других последовательностей. Она также включает в себя рекомбинантную ДНК. которая является частью гибридного гена. кодирующего дополнительный полипептид. который является по существу свободным от клеточного вещества. вирусного вещества или культуральной среды (при продуцировании ДНК при помощи ДНК-рекомбинантных техник). или химических предшественников. или других химических веществ (при химическом синтезе). Более того. выделенный фрагмент нуклеиновой кислоты является фрагментом нуклеиновой кислоты. который не является природным. как фрагмент. и не может быть найден в природном состоянии.
Как используются в настоящем описании. термины полинуклеотид или молекула нуклеиновой кислоты включают в себя молекулы ДНК (например. кДНК или геномной ДНК) и молекулы РНК (например. мРНК) и аналоги ДНК или РНК. созданные с использованием нуклеотидных аналогов. Молекула нуклеиновой кислоты может быть одноцепочечной или двухцепочечной. но предпочтительно. является двухцепочечной ДНК. Нуклеиновая кислота может быть синтезирована с использованием аналогов олигонуклеотидов или производных (например. нуклеотидов инозина или фосфоротиоата). Такие олигонуклеотиды могут быть использованы. например. для приготовления нуклеиновых кислот. которые имеют измененные способности спаривания оснований. или увеличенную устойчивость к нуклеазам.
Другой вариант осуществления настоящего изобретения предоставляет выделенную молекулу нуклеиновой кислоты. которая является антисмысловой к молекуле нуклеиновой кислоты согласно настоя
- 6 008007 щему изобретению. Также включенными в объем настоящего изобретения являются комплементарные нити молекул нуклеиновых кислот, изложенные в настоящем описании.
Ошибки секвенирования
Информацию о последовательности, представленную в настоящем описании, не следует толковать настолько узко, чтобы не требовать включения ошибочно идентифицированных оснований. Определенные последовательности, раскрытые в настоящем описании, могут быть легко использованы для выделения полного гена из мицельных грибов, в частности ЛкретдШик гиде г, который, в свою очередь, может быть легко подвергнут дополнительному анализу последовательности, таким образом, идентифицируя ошибки секвенирования.
Если не оговорено иное, все нуклеотидные последовательности, определенные путем секвенирования молекулы ДНК, в настоящем описании определены с использованием автоматизированного ДНК секвенатора, и все аминокислотные последовательности полипептидов, кодированные молекулами ДНК, определенными в настоящем описании, были предсказаны при помощи трансляции последовательности ДНК, определенной как упомянуто выше. Следовательно, как известно в данной области техники, для любой последовательности ДНК, определенной при помощи такого автоматизированного способа, любая нуклеотидная последовательность, определенная в настоящем описании, может содержать некоторые ошибки. Нуклеотидные последовательности, определенные при помощи автоматов, обычно являются по меньшей мере на примерно 90% идентичными, более обычно по меньшей мере от примерно 95% до по меньшей мере примерно 99,9% идентичными реальной нуклеотидной последовательности молекулы секвенированной ДНК. Реальная последовательность может быть более точно определена при помощи других способов, включающих в себя способы секвенирования ДНК вручную, хорошо известные в данной области техники. Как известно в данной области техники, единичная вставка или делеция в определенной нуклеотидной последовательности по сравнению с реальной последовательностью может вызвать сдвиг рамки при трансляции нуклеотидной последовательности таким образом, что предсказанная аминокислотная последовательность, кодированная определенной нуклеотидной последовательностью, может полностью отличаться от аминокислотной последовательности, действительно кодируемой молекулой секвенированной ДНК, начиная с точки такой вставки или делеции.
Специалист в данной области техники способен идентифицировать такие ошибочно идентифицированные основания и знает, как откорректировать такие ошибки.
Фрагменты нуклеиновых кислот, зонды и праймеры
Молекула нуклеиновой кислоты согласно настоящему изобретению может содержать только часть или фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38, например фрагмент, который может быть использован в качестве зонда или праймера, или фрагмент, кодирующий часть белка, согласно настоящему изобретению. Нуклеотидная последовательность, определенная из клонирования гена липолитического фермента и кДНК, позволяет создавать зонды и праймеры, разработанные для использования при идентификации и/или клонировании других членов семейства липолитических ферментов, а также гомологов липолитического фермента из других видов. Зонд/праймер обычно содержит по существу очищенный олигонуклеотид, который обычно содержит область нуклеотидной последовательности, которая гибридизуется предпочтительно в условиях высокой жесткости до, по меньшей мере, примерно 12 или 15, предпочтительно примерно 18 или 20, предпочтительно примерно 22 или 25, более предпочтительно примерно 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65 или 75, или более следующих друг за другом нуклеотидов нуклеиновой последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 или их функциональных эквивалентов.
Зонды, основанные на нуклеотидных последовательностях, предоставленных в настоящем описании, могут быть использованы для обнаружения транскриптов или геномных последовательностей, кодирующих одни и те же или гомологичные белки, например, в других организмах. В предпочтительных вариантах осуществления зонд дополнительно содержит группу-метку, прикрепленную к нему, например, группа-метка может быть радиоизотопом, флуоресцентным соединением, ферментом или кофактором фермента. Такие зонды также могут быть использованы в качестве части набора диагностического теста для идентификации клеток, которые экспрессируют липолитический ферментативный белок.
Идентичность и гомология
Термины гомология или процент идентичности в настоящем описании используются взаимозаменяемо. Для цели настоящего изобретения в настоящем описании определено, что для определения процента идентичности двух аминокислотных последовательностей или двух последовательностей нуклеиновых кислот, последовательности совмещают с целью оптимального сравнения (например, могут быть введены пробелы в последовательность первой аминокислоты или последовательность нуклеиновой кислоты для оптимального совмещения со второй последовательностью амино- или нуклеиновой кислоты). Затем сравнивают остатки аминокислоты или нуклеотиды в соответствующих позициях аминокислоты или позициях нуклеотидов. Если позиция в первой последовательности занята таким же остатком аминокислоты или нуклеотида, как соответствующая позиция второй последовательности, то мо
- 7 008007 лекулы являются идентичными в этой позиции. Процент идентичности между двумя последовательностями является функцией количества идентичных позиций, присутствующих в двух последовательностях (т.е. % идентичности=количество идентичных позиций/общее количество позиций (т.е. перекрывающихся позиций) х100). Предпочтительно, две последовательности имеют одинаковую длину.
Специалисту в данной области техники известен факт, что некоторые различные компьютерные программы являются пригодными для определения гомологии между двумя последовательностями. Например, сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя последовательностями может сопровождаться использованием математического алгоритма. В предпочтительном варианте осуществления процент идентичности между двумя аминокислотными последовательностями определяют, используя алгоритм №еб1етап апб ХУипксй (1. Μοί. ΒίοΙ. (48): 444-453 (1970)), который встроен в программу САР в пакете программного обеспечения ССС (доступного на 1Шр://\\л\л\7дсд.со1п). используя либо матрикс В1о8§от 62, либо матрикс РАМ250, и вес пробела 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4 и вес длины 1, 2, 3, 4, 5 или 6. Специалисту в данной области техники очевидно, что все указанные различные параметры могут приводить к незначительно различающимся результатам, но что общий процент идентичности двух последовательностей значимо не изменяется при использовании разных алгоритмов.
В другом варианте осуществления процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями определяют с использованием САР программы в пакете программного обеспечения ССС (доступного на 1Шр://\\л\л\7дсд.со1п) , используя матрикс Ы^8дарбпа.СМР и вес пробела 40, 50, 60, 70 или 80 и вес длины 1, 2, 3, 4, 5 или 6. В другом варианте осуществления процент идентичности двух аминокислотных последовательностей или последовательностей нуклеотидов определяют с использованием алгоритма Е. Меуега апб ХУ.МШег (САВЮ8, 4: 11-17 (1989)), который встроен в АЫСЫ программу (версия 2,0) (доступный на: Ьбр://уедаддб.спгк.1г/Ь1п/а11дп-диекк.сд1), используя таблицу весов остатков РАМ120, штраф длины пробела 12 и штраф пробела 4.
Последовательности нуклеиновых кислот и белков настоящего изобретения дополнительно могут быть использованы в качестве последовательности-запроса для выполнения поиска в общедоступных базах данных, например, для идентификации других членов семейства или родственных последовательностей. Такие типы поиска могут быть выполнены с использованием программ Β6Α8ΤΝ и ВЬА8ТХ (версия 2,0) АбксЬи1 и др. (1990) I. Μοί. Βίοί. 215: 403-10. ВЬА8Т поиски нуклеотидов могут быть выполнены программой ΒΕ-Λ8ΤΝ, объем=100, длина слова=12 для получения нуклеотидных последовательностей, гомологичных молекулам РЬР03 нуклеиновых кислот настоящего изобретения. ВЬА8Т поиски белков могут быть выполнены ВЬА8ТХ программой, объем=50, длина слова=3 для получения аминокислотных последовательностей, гомологичных белковым молекулам РЬР03 настоящего изобретения. Для получения совмещений, содержащих пробелы, с целью сравнения, может быть использована Сарреб ВЬА8Т, описанная АЙксби1 и др. (1997) №с1ею АДбк Век. 25(17):3389-3402. При использовании программ ВЬА8Т и Сарреб ВЬА8Т могут быть применены параметры по умолчанию соответствующих программ (например, Β^Λ8ΤN и ВЬА8ТХ). См. Ьбр://^^^.ηсЬ^.η^т.η^Ь.дον.
Гибридизация
Как используется в настоящем описании, термин гибридизация предназначен для описания условий гибридизации и промывки, при которых нуклеотидные последовательности по меньшей мере примерно на 50%, по меньшей мере примерно на 60%, по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, даже более предпочтительно по меньшей мере примерно от 85 до 90%, более предпочтительно по меньшей мере на 95% гомологичные друг другу обычно остаются гибридизованными друг с другом.
Предпочтительным, не ограничивающим примером таких условий гибридизации является гибридизация в 6х растворе хлорида натрия/цитрата натрия (88С) при примерно 45°С, с последующей одной или двумя промывками в 1-кратном 88С, 0,1% 8Ό8 при 50°С, предпочтительно при 55°С, предпочтительно при 60°С, даже более предпочтительно при 65°С.
Условия высокой жесткости включают в себя, например, гибридизацию при 68°С в 5-кратном 88С/5-кратном растворе Денхарда/1,0% 8Ό8 и промывкой в 0,2-кратном 88С/0,1% 8Ό8 при комнатной температуре. В качестве альтернативы промывка может быть выполнена при 42°С.
Специалисту в данной области техники известно, какие условия применяются в жестких и условиях высокой жесткости гибридизации. Дополнительным руководством относительно таких условий является легко доступное в данной области техники, например, в ЗатЬгсюк и др., 1989, ΜοΕαιΕίΓ Οοηίη§, А ΕηόοгаЮгу Мапиа1, Со1б 8рппд ΗπιΓογ Ргекк, Ν.Υ.; и АикиЬе1 и др. (ебк.), 1995, Ситтеп! Р^οΐοсο1κ ίη ΜοΕαιΕίΓ ВюЕду, (.^кп \УПеу & δο^, Ν.Υ.).
Конечно, полинуклеотид, который гибридизуется только с поли(А) последовательностью (такой как 3' терминальный поли(А) участок мРНК), или с комплементарным фрагментом Т (И) остатков, не может быть включен в полинуклеотид настоящего изобретения, используемый для специфической гибридизации с частью нуклеиновой кислоты настоящего изобретения, поскольку такой нуклеотид будет гибридизоваться с любой молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей фрагмент поли(А) или комплементарный ему (например, практически любой клон двухцепочечной ДНК).
- 8 008007
Получение ДНК полной длины из других организмов
В обычном подходе кДНК библиотеки конструируют из других организмов, например, мицельных грибов, в частности может быть проведен скрининг из видов АкрегдШик.
Например, штаммы АкретдШик могут быть скринированы для гомологичных полинуклеотидов Нозерн-блот анализом. При обнаружении транскриптов, гомологичных полинуклеотидам согласно настоящему изобретению, кДНК библиотеки могут быть сконструированы из РНК, выделенной из подходящего штамма с использованием стандартных техник, хорошо известных специалистам в данной области техники. В качестве альтернативы может быть скринирована полная библиотека геномной ДНК с использованием зонда, гибридизуемого с полинуклеотидом согласно настоящему изобретению.
Гомологичные последовательности генов могут быть выделены, например, путем выполнения ПЦР с использованием двух пулов праймеров вырожденных олигонуклеотидов, разработанных на основе нуклеотидных последовательностей в качестве примера настоящего описания.
Матрицей для реакции может быть кДНК, полученная при помощи обратной транскрипции мРНК, приготовленной из штаммов известных или предполагаемых как экспрессирующие полинуклеотид согласно настоящему изобретению. Продукт ПЦР может быть субклонирован и секвенирован для гарантии, что амплифицированные последовательности представляют собой последовательности новой РЬР03 последовательности нуклеиновой кислоты или ее функциональный эквивалент.
Затем может быть использован ПЦР фрагмент для выделения кДНК клона полной длины при помощи множества известных способов. Например, амплифицированный фрагмент может быть помечен и использован для скрининга бактериофага или космидной кДНК библиотеки. В качестве альтернативы, может быть использован меченый фрагмент для скрининга геномной библиотеки.
Технология ПЦР может быть использована для выделения последовательностей кДНК полной длины из других организмов. Например, РНК может быть выделена следующими ниже стандартными процедурами из подходящего клеточного или тканевого источника. Реакция обратной транскрипции может быть выполнена на РНК с использованием олигонуклеотидного праймера, специфичного для наибольшего 5' конца амплифицированного фрагмента для праймирования первого стандартного синтеза.
Полученный в результате гибрид РНК/ДНК затем может быть терминирован (например, гуанинами) с использованием стандартной реакции терминальной трансферазы, гибрид может быть расщеплен РНКазой Н, и затем может быть праймирован вторым стандартным синтезом (например, поли-С праймером). Таким образом, последовательности кДНК выше амплифицированного фрагмента могут быть легко выделены. Для обзора пригодных стратегий клонирования см., например, 8ашЬтоок и др., указаного выше; и Лн5нЬе1 и др., указанного выше.
Векторы
Другой аспект настоящего изобретения имеет отношение к векторам, предпочтительно векторам экспрессии, содержащим нуклеиновую кислоту, кодирующую белок согласно настоящему изобретению или его функциональный эквивалент. Как используется в настоящем описании, термин вектор относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной транспортировать другую нуклеиновую кислоту, к которой она присоединена. Один тип вектора является плазмидой, которая относится к петле кольцевой двухцепочечной ДНК, в которую могут быть вшиты дополнительные ДНК сегменты. Другой тип вектора является вирусным вектором, в котором дополнительные сегменты ДНК могут быть вшиты в вирусный геном. Некоторые векторы способны автономно реплицироваться в клетке хозяина, в которую они введены (например, бактериальные векторы, имеющие бактериальный источник репликации и эписомальные векторы млекопитающих). Другие векторы (например, неэписомальные векторы млекопитающих) интегрируют в геном клетки хозяина при введении в клетку хозяина, и таким образом, реплицируют в направлении генома хозяина. Более того, некоторые векторы способны к направленной экспрессии генов, к которым они оперативно присоединены. Такие векторы относятся в настоящем описании к векторам экспрессии. В общем случае, векторы экспрессии, полезные в рекомбинантных техниках ДНК, часто находятся в виде плазмид. Термины плазмида и вектор могут быть использованы взаимозаменяемо в настоящем описании, поскольку плазмида является наиболее обычно используемой формой вектора. Однако настоящее изобретение включает в себя другие формы векторов экспрессии, такие как вирусные векторы (например, ретровирусы с поврежденной репликацией, аденовирусы и аденоассоциированные вирусы), которые служат эквивалентным функциям.
Рекомбинантные векторы экспрессии настоящего изобретения содержат нуклеиновую кислоту настоящего изобретения в форме, подходящей для экспрессии нуклеиновой кислоты в клетке хозяина, что означает, что рекомбинантный вектор экспрессии включает в себя одну или несколько регуляторных последовательностей, выбранных из оснований клеток хозяина, предназначенных для экспрессии, которые оперативно связываются с нуклеиновой последовательностью, предназначенной для экспрессии. В пределах рекомбинантного вектора экспрессии эффективно связанный предназначен для обозначения, что интересующая нуклеотидная последовательность связана с регуляторной последовательностью(последовательностями) способом, который позволяет экспрессию нуклеотидной последовательности (например, в ίη νίίτο системе транскрипции/трансляции или в клетке хозяина, если вектор введен в клетку хозяина). Термин регуляторная последовательность включает в себя промоторы, энхансеры и
- 9 008007 другие элементы управления экспрессией (например, сигнал полиаденилирования). Такие регуляторные последовательности описаны, например, в Соеббе1; Сепе Ехргекк1оп ТесЬпокду: МеШобк ίη Епхутокду 185, Асабетк Ргекк, 8аи О|едо. СА (1990). Регуляторные последовательности включают в себя такие, которые управляют конститутивной или индуцируемой экспрессией нуклеотидной последовательности во многих типах клеток хозяина, и такими, которые управляют экспрессией нуклеотидной последовательности только в некоторых клетках хозяина (например, тканеспецифические регуляторные последовательности).
Специалистам в данной области техники будет очевидно, что разработка вектора экспрессии может зависеть от таких факторов, как выбор клетки хозяина, предназначенной для трансформации, уровня экспрессии желаемого белка и т.п. Векторы экспрессии настоящего изобретения могут быть введены в клетку хозяина, таким образом, для продуцирования белков или пептидов, кодируемых нуклеиновыми кислотами, как изложено в настоящем описании (например, липолитических ферментов, мутированных липолитических ферментов, их фрагментов, вариантов или их функциональных эквивалентов, слитых белков и т.п.).
Рекомбинантные векторы экспрессии настоящего изобретения могут быть разработаны для экспрессии липолитических ферментов в прокариотических или эукариотических клетках. Например, белок согласно настоящему изобретению может быть экспрессирован в бактериальных клетках, таких как Е. сой и ВасШик крескк, клетках насекомых (с использованием векторов экспрессии бакуловируса), дрожжевых клетках или клетках млекопитающих. Соответствующие клетки хозяина дополнительно обсуждены в Соеббе1, Сепе Ехргекккп Тес1по1оду: Мебюбк ίη Епхуто1оду 185, Асабетк Ргекк, 8ап Экдо, СА (1990). В качестве альтернативы рекомбинантный вектор экспрессии может быть транскрибирован и транслирован ίη νίϋΌ, например, с использованием Т7 регуляторных последовательностей промотора и Т7 полимеразы.
Векторы экспрессии, пригодные в настоящем изобретении, включают хромосомные, эписомные и вирусные векторы, например, векторы, полученные из бактериальных плазмид, бактериофага, эписомы дрожжей, хромосомных элементов дрожжей, вирусов, таких как бакуловирусы, паповавирусы, вирусы коровьей оспы, аденовирусы, вирусы оспы птиц, вирусы псевдобешенства и ретровирусы, и векторы, полученные из их комбинаций, таких как полученные из плазмиды и генетических элементов бактериофага, таких как космиды и фагемиды.
Вставка ДНК должна быть оперативно связана с подходящим промотором, таким как РЬ промотор лямбда фага, 1ас Е.сой, промоторы 1гр и 1ас, 8У40 ранний и поздний промоторы и промоторы ЬТК ретровируса, что приведено в качестве некоторых примеров. Специалисту в данной области техники хорошо известны другие подходящие промоторы. В определенном варианте осуществления промоторы предпочтительно являются такими, которые способны управлять высоким уровнем экспрессии липолитических ферментов в мицельных грибах. Такие промоторы известны в данной области техники. Конструкции экспрессии могут содержать сайты инициации транскрипции, терминации, а в транскрибируемых областях - сайт связывания с рибосомой для трансляции. Часть кодирования зрелых транскриптов, экспрессируемых при помощи конструкции, включает в себя АИС, инициирующий трансляцию, в начале и кодон терминации, расположенный соответственно в конце полипептида, предназначенного для трансляции.
Вектор ДНК может быть введен в прокариотические или эукариотические клетки посредством обычных техник трансформации или трансфекции. Как использовано в настоящем описании, термины трансформация и трансфекция предназначены для обозначения различных техник, известных в данной области техники, для введения чужой нуклеиновой кислоты (например, ДНК) в клетку хозяина, включающую в себя преципитацию фосфатом кальция или хлоридом кальция, ЭЕАЕ-декстранопосредованную трансфекцию, трансдукцию, инфекцию, липофекцию, трансфекцию с катионными липидами, или электропорацию. Подходящие способы для трансформации или трансфекции клеток хозяина могут быть найдены в 8атЬгоок и др. (Мо1еси1аг С1ошпд: А ЬаЬогаГогу Мапиа1, 2пб, еб. Со1б 8рппд НагЬог ЬаЬогакгу, Со1б 8ргшд НагЬог ЬаЬогакгу Ргекк, Со1б 8рппд НагЬог, ΝΥ, 1989), ΟπνΕ и др., Вакк Мебюбк ίη Мо1еси1аг Вю1оду (1986) и в других лабораторных руководствах.
Для стабильной трансфекции клеток млекопитающих известно, что в зависимости от используемых вектора экспрессии и техники трансфекции, только небольшая фракция клеток может интегрировать чужую ДНК в свой геном. Для идентификации и отбора таких интегрантов, обычно в клетки хозяина вместе с интересующим геном вводят ген, кодирующий селектируемый маркер (например, устойчивый к антибиотикам). Предпочтительные селектируемые маркеры включают такие, которые предоставляют устойчивость к лекарственным веществам, таким как С418, гигромицин и метатриксат. Нуклеиновую кислоту, кодирующую селектируемый маркер, предпочтительно вводят в клетку хозяина на тот же самый вектор, который кодирует белок согласно настоящему изобретению или могут ввести на отдельный вектор. Клетки, стабильно трансфецируемые введенной нуклеиновой кислотой, могут быть идентифицированы при помощи отбора лекарственным препаратом (например, клетки, которые имеют встроенный ген селектируемого маркера, будут выживать, в то время как другие клетки вымрут).
Экспрессию белков в прокариотах часто осуществляют в векторах Е. сой, содержащих конститутивные или индуцируемые промоторы, управляющие экспрессией либо слитых, либо неслитых белков.
- 10 008007
Слитые векторы добавляют некоторое количество аминокислот в белок, кодируемый ими, например, к амино концу рекомбинантного белка. Такие слитые векторы обычно служат для трех целей: 1) для увеличения экспрессии рекомбинантного белка; 2) для увеличения растворимости рекомбинантного белка; и 3) с целью очистки рекомбинантного белка путем воздействия в качестве лиганда при аффинной очистке. Часто, в слитых векторах экспрессии сайт протеолитического расщепления вводят в место соединения слитой группы и рекомбинантного белка для возможного отделения рекомбинантного белка от слитой группы после очистки слитого белка. Такие ферменты, и их родственные узнаваемые последовательности, включают в себя фактор Ха, тромбин и энтерокиназу.
Как указано, векторы экспрессии предпочтительно могут содержать селектируемые маркеры. Такие маркеры включают дигидрофолат редуктазу или устойчивость к неомицину для культуры эукариотических клеток и устойчивость к тетрацилину или ампициллину для культивирования в Е. сой и других бактериях. Представленные примеры подходящих хозяев включают в себя бактериальные клетки, такие как Е. сой, 8!гер!отусек и 8а1топе11а !урй1тигшт; клетки грибов, таких как дрожжи; клетки насекомых, таких как Эгокорййа 82 и 8робор!ега 8Г9; клетки животных, такие как СНО, С08 и меланомы Вотек; и клетки растений. Подходящие культуральные среды и условия для выше описанных клеток хозяина известны специалистам в данной области техники.
Среди векторов предпочтительными для использования в бактериях являются рЦЕ70, рЦЕ60 и РОЕ-9, доступные от Ц1адеп; рВ8 векторы, Рйадекспр! векторы, В1иекспр! векторы, рNΗ8А, рNΗ16А, рNΗ18А, рNΗ46А, доступные от 8!га!адепе; и р!гс99а рКК223-3, рКК233-3, рЭЯ540, рЯГГ5, доступные от РНагтааа. Среди предпочтительных эукариотических векторов - Р\\'ЪКР0 р8У2САТ р0044 р2Т1 и р8О, доступные от 8!га!адепе; и р8УК3, рВРУ, рМ8О и р8УЪ, доступные от Рйагташа. Другие подходящие векторы могут быть легко очевидными для специалистов в данной области техники.
Известные бактериальные промоторы для использования в настоящем изобретения включают в себя 1ас1 и 1ас2 промоторы Е.сой, Т3 и Т7 промоторы, др! промотор, лямбда РЯ, РЬ промоторы и !рг промотор, промотор тимидин киназы Η8ν, 8У40 ранние и поздние промоторы, ЬТЯ промоторы ретровируса, такого как вируса саркомы Рауса ('Έ8ν), промоторы металлотионина, такие как промотор металлотионина-Ι мыши.
Вставка энхансерной последовательности в вектор может увеличить транскрипцию ДНК, кодирующую полипептиды настоящего изобретения у высших эукариот. Энхансеры являются цисдействующими элементами ДНК, обычно примерно от 10 до 300 п.н., которые действуют для увеличения транскрипционной активности промотора в данном типе клетки хозяина. Примеры энхансеров включают 8ν40 энхансер, который расположен на дальней по отношению к началу репликации стороне на от п. н. 100 до 270, энхансер раннего промотора цитомегаловируса, энхансер полиомы на дальней по отношению к началу репликации стороне и энхансеры аденовирусов.
Для секреции транслированного белка в просвет эндоплазматического ретикулума, в пространство периплазмы или в окружающую среду вне клетки, в эспрессируемый полипептид может быть вставлен подходящий сигнал секреции. Сигналы могут быть эндогенными для полипептида или они могут быть гетерологичными сигналами.
Полипептид может быть экспрессирован в модифицированном виде, таком как слитый белок, и может включать в себя не только сигналы секреции, а также дополнительные гетерологичные функциональные области. Таким образом, например, область дополнительных аминокислот, частично измененных аминокислот, может быть добавлена к Ν-концу полипептида для улучшения стабильности и персистенции в клетке хозяина, во время очистки или во время последующей обработки и хранения. Также для облегчения очистки к полипептиду могут быть добавлены пептидные группы.
Полипептиды согласно настоящему изобретению
Настоящее изобретение представляет выделенные полипептиды, имеющие аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, аминокислотную последовательность, получаемую путем экспрессии полинуклеотида, выбранного из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 34, 35, 37 и 38 в подходящем хозяине. Также пептид или полипептид, содержащий функциональный эквивалент выше указанных полипептидо, включен в настоящее изобретение. Выше указанные полипептиды совместно включены в термин полипептиды согласно настоящему изобретению.
Термины пептид и олигопептид считаются синонимами (что является общепризнанным) и каждый термин может быть использован взаимозаменяемо, как требуется по контексту, для указания цепи, по меньшей мере, из двух аминокислот, связанных пептидными связями. Слово полипептид используется в настоящем описании для цепей, содержащих более семи аминокислотных остатков. Все формулы или последовательности олигопептидов и пептидов в настоящем описании написаны слева направо и в направлении от аминоконца к карбоксильному концу. Однобуквенный код аминокислот, используемый в настоящем описании, обычно известен специалистам в данной области техники и может быть найден в 8атЬгоок и др. (Мо1еси1аг С1ошпд: А ЬаЬога!огу Мапиа1, 2пб, еб. Со1б 8ргшд НагЬог ЬаЬога!огу, Со1б 8ргшд НагЬог ЬаЬога!огу Ргекк, Со1б 8ргшд НагЬог, NΥ, 1989).
Под выделенным полипептидом или белком подразумевается полипептид или белок, удаленный
- 11 008007 из его естественного окружения. Например, рекомбинантно продуцируемые полипептиды и белки, экспрессируемые в клетках хозяина, считаются выделенными для цели настоящего изобретения, поскольку являются природными или рекомбинантными полипептидами, которые были по существу очищены любым подходящим способом, таким как, например, способ одноэтапной очистки, описанный в διηίΐΐι и 1ойп8оп, Сепе 67:31-40 (1988) .
Липолитический фермент согласно настоящему изобретению может быть восстановлен и очищен из рекомбинантных клеточных культур при помощи хорошо известных способов, включающих в себя преципитацию сульфатом аммония или спиртом, экстракцию кислотой, анион- или катион-обменную хроматографию, хроматографию на фосфоцеллюлозе, хроматографию гидрофобных взаимодействий, афинную хроматографию, хроматографию с гидроксиапатитом и хроматографию на лектине. Наиболее предпочтительно для очистки используют метод высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
Полипептиды настоящего изобретения включают очищенные естественным путем продукты, продукты способов химического синтеза и продукты, полученные рекомбинантными техниками от прокариотического или эукариотического хозяина, включающего, например, бактериальные дрожжевые клетки, клетки высших растений, насекомых и млекопитающих. В зависимости от используемого хозяина в способе получения рекомбинанта полипептиды настоящего изобретения могут быть гликозилированными или могут быть негликозилированными. Дополнительно, полипептиды настоящего изобретения могут также включать исходно модифицированный остаток метионина, в некоторых случаях, как результат процессов опосредованных хозяином.
Липолитический фермент согласно настоящему изобретению может быть преимущественно использован в хлебопекарных процессах. Количество фермента, которое должно быть добавлено в тесто, определяют эмпирически. Это может зависеть от качества используемой муки, степени улучшения, которая требуется, вида хлеба или печеных изделий, способа приготовления теста, пропорции других ингредиентов и т. д.
Фрагменты белков
Отличительными особенностями настоящего изобретения являются биологически активные фрагменты полипептидов согласно настоящему изобретению.
Биологически активные фрагменты полипептида согласно настоящему изобретению включают полипептиды, содержащие аминокислотные последовательности, в достаточной степени идентичные или полученные из аминокислотной последовательности липолитического фермента (например, аминокислотная последовательность, выбранная из группы, состоящей из 8ЕО ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39), которая включает в себя меньше аминокислот, чем белок полной длины, и проявляет по меньшей мере одну биологическую активность соответствующего белка полной длины. Обычно биологически активные фрагменты содержат домен или основу по меньшей мере одной с активностью соответствующего белка полной длины.
Биологически активный фрагмент белка согласно настоящему изобретению может быть полипептидом, который, например, представляет собой в длину 10, 25, 50, 100 или более аминокислот. Более того, другие биологически активные части, в которых удалены другие области белка, могут быть приготовлены при помощи рекомбинантных техник и оценены для одной или более биологических активностей природной формы полипептида настоящего изобретения.
Отличительными особенностями настоящего изобретения также являются фрагменты нуклеиновых кислот, которые кодируют выше описанные биологически активные фрагменты липолетического ферментативного белка.
Слитые белки
Белки настоящего изобретения или их функциональные эквиваленты, например, их биологически активные части, могут быть эффективно присоединены к нелиполитическому ферментативному полипептиду (например, гетерологичные аминокислотные последовательности) для образования слитых белков. Как используется в настоящем описании, химерный белок или слитый белок липолитического фермента содержит липолитический ферментативный белок, оперативно связанный с нелиполитическим ферментативным белком. Липолитический ферментативный полипептид относится к полипептиду, имеющему аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕО ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, тогда как нелиполитический ферментативный полипептид относится к полипептиду, имеющему аминокислотную последовательность, соответствующую белку, который не является по существу гомологичным липолитическому ферменту, например, белку, который отличается от липолитического фермента и который получен из того же самого или другого организма. В липолитическом ферментативном слитом белке липолитический ферментативный полипептид может соответствовать всему или части липолитического ферментативного белка. В предпочтительном варианте осуществления липолитический ферментативный слитый белок содержит по меньшей мере один биологически активный фрагмент липолитического ферментативного белка. В другом предпочтительном варианте осуществления липолитический ферментативный слитый белок содержит по меньшей мере две биологически активные части липолитического ферментативного белка. В слитом белке термин эффек
- 12 008007 тивно связанный предназначен для обозначения того, что липолитический ферментативный полипептид и нелиполитический ферментативный полипептид соединены друг с другом с сохранением рамки считывания. Нелиполитический ферментативный полипептид может быть присоединен к Ν-концу или С-концу липолитического ферментативного полипептида.
Например, в одном из вариантов осуществления слитый белок является С8Т липолитическим ферментативным слитым белком, в котором липолитическая ферментативная последовательность присоединена к С-концу С8Т последовательности. Такие слитые белки могут облегчить очистку рекомбинантного липолитического фермента(ферментов). В другом варианте осуществления слитый белок является липолитическим ферментативным белком, содержащим гетерологичную сигнальную последовательность на Ν-конце. В некоторых клетках хозяина (например, клетках хозяина млекопитающих и дрожжей) экспрессия и/или секреция липолитического фермента может быть увеличена путем использования гетерологичной сигнальной последовательности.
В другом примере др67 секреторная последовательность белка оболочки бакуловируса может быть использована в качестве гетерологичной сигнальной последовательности (Ситгеи! Рто1оео18 ίη Мо1еси1аг Βίοίοβν. Ли8иЬе1 и др., 1о1ш \Убеу & 8оп5. 1992). Другие примеры гетерологичной сигнальной последовательности эукариот включают в себя секреторные последовательности мелиттина и плацентарной алкалин фосфатазы человека (81та1адепе; Ьа 1о11а, Калифорния). В еще одном примере пригодные гетерологичные сигнальные последовательности прокариот включают в себя р1юА секреторный сигнал (8ашЬтоок и др., указанный выше) и секреторный сигнал протеина А (Рйатшаша Вю1ес11; Р18са1а^ау, Νο\ν 1ет§еу).
Сигнальная последовательность может быть использована для облегчения секреции и выделения белка или полипептида настоящего изобретения. Сигнальная последовательность обычно характеризуется кором гидрофобных аминокислот, которые обычно отрезаются от белка во время секреции за одно или несколько отрезаний. Такие сигнальные пептиды содержат сайты процессинга, которые позволяют отрезать сигнальную последовательность от созревших белков, пока они проходят путь секреции. Сигнальная последовательность управляет секрецией белка, такого как из эукариотической клетки хозяина, в которую трансформируют вектор экспрессии, и сигнальная последовательность последовательно или одновременно отрезается. Затем белок может быть быстро очищен от внеклеточной среды при помощи известных в данной области техники способов. В качестве альтернативы, сигнальная последовательность может быть присоединена к интересующему белку с использованием последовательности, которая легко очищается, к такой как с С8Т доменом. Таким образом, например, последовательность, кодирующая полипептид, может быть слита с последовательностью маркера, такой как последовательность, кодирующая пептид, который облегчает очистку слитого полипептида. В некоторых вариантах осуществления такого аспекта настоящего изобретения последовательность маркера является пептидом гексагистидина, таким как 1ад, предоставляемый в рЦЕ векторе (Ц1адеп, 1пс), который является одним из многих, которые коммерчески доступны. Как описано в Сеп1х и др., Ргос. №И. Асаб. 8с1 И8А 86:821-824 (1989), например, гексагистидин предоставлен для обычной очистки слитого белка. Например, НА метка является другим пептидом, пригодным для очистки, который соответствует эпитопу полученного белка гриппа гемаглютинина, который описан ^йкоп и др., Се11 37:767 (1984).
Предпочтительно химерный или слитый белок настоящего изобретения получают при помощи стандартных ДНК-рекомбинантных техник. Например, ДНК фрагменты, кодирующие различные полипептидные последовательности, соединены вместе с сохранением рамки считывания согласно обычным техникам, например, путем использования тупых или выступающих концов для сшивки, расщепления рестриктазами для обеспечения подходящих концов, соответственно заполнения липких концов, обработки алкалин фосфатазой для исключения нежелательных соединений и ферментативной сшивки. В другом варианте осуществления слитый белок может быть синтезирован обычными способами, включающими в себя автоматизированные ДНК синтезаторы. В качестве альтернативы, ПЦР амплификация генных фрагментов может быть осуществлена с использованием праймеров якорей, которые повышают комплементарность выступов между двумя последовательными генными фрагментами, которые затем могут быть гибридизованы и снова амплифицированы для создания химерной генной последовательности (см., например, Сштеп! РтоФсок ίη Мо1еси1аг Вю1оду, еб§. Аи8иЬе1 и др. 1о1ш \Убеу & 8оп§: 1992). Более того, многие векторы экспрессии являются коммерчески доступными, которые уже кодируют слитые компоненты (например, С8Т полипептид). Липолитические нуклеиновые кислоты, кодирующие фермент, могут быть клонированы в такие векторы экспрессии из условия, чтобы слитый компонент являлся связанным с сохранением рамки считывания с липолитическим ферментативным белком.
Функциональные эквиваленты
Термины функциональные эквиваленты и функциональные варианты используются в настоящем описании взаимозаменяемо. Функциональные эквиваленты ДНК, кодирующей липолитический фермент, являются выделенными фрагментами ДНК, которые кодируют полипептид, проявляющий конкретную функцию липолитического фермента АхрегдШих шдет, как изложено в настоящем описании. Функциональный эквивалент липолитического ферментативного полипептида согласно настоящему изобретению является полипептидом, который проявляет по меньшей мере одну функцию липолитического фермента АкретщПик шдет, как изложено в настоящем описании. Следовательно, функциональные экви
- 13 008007 валенты также охватывают активные фрагменты.
Функциональные эквиваленты белка или полипептида могут содержать только консервативные замены одной или нескольких аминокислот в аминокислотных последовательностях, выбранных из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 или замен, вставок или делеций несущественных аминокислот. Следовательно, несущественная аминокислота является остатком, который может быть замещен в аминокислотных последовательностях, выбранных из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 без существенных изменений биологической функции. Например, считается, что аминокислотные остатки, которые сохранены среди липолитических ферментативных белков настоящего изобретения, являются особенно устойчивыми к изменениям. Помимо этого, аминокислоты, сохраненные среди липолитических ферментативных белков согласно настоящему изобретению и других липолитических ферментов, не являются легко подверженными изменению.
Термин защитная замена предназначен для обозначения такой замены, при которой аминокислотный остаток замещается аминокислотным остатком, имеющим такую же боковую цепь. Такие семейства известны в данной области техники и включают в себя аминокислоты с основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин и гистидин), кислыми боковыми цепями (например, аспартановая кислота, глутаминовая кислота), боковыми цепями с неизмененной полярностью (например, глицин, аспарагины, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин), неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин, триптофан), бета-ответвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин).
Функциональные эквиваленты нуклеиновых кислот обычно могут содержать молчащие мутации или мутации, которые не изменяют биологическую функцию кодируемого полипептида. Следовательно, настоящее изобретение предоставляет молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие липолитические ферментативные белки, которые содержат изменения в аминокислотных остатках, которые не являются существенными для конкретной биологической активности. Такие липолитические ферментативные белки различаются в аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 все еще сохраняя по меньшей мере одну биологическую активность. В одном варианте осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, причем белок содержит по существу гомологичную аминокислотную последовательность по меньшей мере на 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39.
Например, руководство, относительно того, как создавать фенотипически молчащие аминокислотные замены, предоставлено в Всшае, ТИ. и др., 8с1епсе 247:1306-1310 (1990), в котором авторы указывают, что существует два основных подхода для изучения толерантности аминокислотной последовательности к изменению. Первый способ относится к процессу эволюции, в котором мутации являются либо допускаемыми, либо отбракованными естественным отбором. Второй подход использует генетическую инженерию для введения аминокислотных изменений в определенных позициях клонированного гена и отбирает или проводит скрининг для идентификации последовательностей, которые поддерживают функциональность. Как утверждают авторы, такие исследования установили, что белки являются удивительно толерантными аминокислотными веществами. Дополнительно авторы указали, какие изменения являются возможными, чтобы быть разрешенными в некоторых позициях белка. Например, для большинства внутренних аминокислотных остатков требуются неполярные боковые цепи, тогда как некоторые признаки поверхностных боковых цепей, как правило, сохраняются. Другие такие фенотипически молчащие замены описаны в Во\\зе и др., указанный выше, и ссылках упомянутых в настоящем описании.
Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок, гомологичный белку, выбранному из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39 может быть создана путем введения одной или более нуклеотидных замен, вставок или делеций в соответствующие кодирующие нуклеотидные последовательности (табл. 1) таким образом, что одну или несколько аминокислотных замен, делеций или вставок вводят в кодируемый белок. Такие мутации могут быть введены стандартными техниками, такими как сайт-направленный мутагенез и мутагенез при помощи ПЦР.
Термин функциональные эквиваленты также охватывает ортологи липолитических ферментов АкрегдШик шдег, предоставленных в настоящем описании. Ортологи липолитических ферментов АкрегдШик шдег являются белками, которые могут быть выделены из других штаммов или видов и обладают похожей или идентичной биологической активностью. Такие ортологи могут быть легко идентифицированы, как содержащие аминокислотную последовательность, которая по существу гомологична аминокислотным последовательностям, выбранным из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39.
Как определено в настоящем описании, термин по существу гомологичный относится к первой аминокислотной или нуклеотидной последовательности, которая содержит достаточное или минималь
- 14 008007 ное количество идентичных или эквивалентных (например, с такой же боковой цепью) аминокислот или нуклеотидов второй аминокислотной или нуклеотидной последовательности таким образом, что первая и вторая аминокислотная или нуклеотидная последовательности имеют общий домен. Например, аминокислотные или нуклеотидные последовательности, которые содержат общий домен, имеющий примерно 60%, предпочтительно 65%, более предпочтительно 70, даже более предпочтительно 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичность или более, определены в настоящем описании как достаточно идентичные.
Также, нуклеиновые кислоты, кодирующие другие члены семейства липолитических ферментов, которые, таким образом, имеют нуклеотидную последовательность, отличающуюся от нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 находятся в объеме настоящего изобретения. Более того, нуклеиновые кислоты, кодирующие липолитические ферментативные белки из других видов, которые, таким образом, имеют нуклеотидную последовательность, которая отличается от нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 находятся в объеме настоящего изобретения.
Молекулы нуклеиновых кислот, соответствующие вариантам (например, природные аллельные варианты), и гомология полинуклеотидов настоящего изобретения могут быть выделены, основываясь на их гомологии с нуклеиновыми кислотами, раскрытыми в настоящем описании, с использованием кДНК, раскрытой в настоящем описании, или ее подходящего фрагмента, в качестве гибридизационного зонда согласно стандартным гибридизационным техникам предпочтительно в условиях высокой жесткости гибридизации.
Дополнительно к природным аллельным вариантам последовательностей АкрегдШик шдет, предоставленным в настоящем описании, специалистам в данной области техники будет очевидно, что изменения могут быть введены при помощи мутации в нуклеотидных последовательностях, выбранных из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38, таким образом, приводя к изменениям в аминокислотной последовательности липолитического ферментативного белка без существенных изменений функции этого белка.
В другом аспекте настоящего изобретения представляют улучшенные липолитические ферменты. Улучшенные липолитичекие ферменты являются белками, в которых по меньшей мере одна биологическая активность является улучшенной. Такие белки могут быть получены путем случайного введения мутаций во всей или части последовательности, кодирующей липолитический фермент, таким как мутагенез, и полученные в результате мутации могут быть рекомбинантно экспрессированы, и скринированы для биологической активности. Например, в существующем уровне техники имеются способы стандартного анализа для измерения ферментативной активности биологических ферментов и, таким образом, с легкостью могут быть выбраны улучшенные белки.
В предпочтительном варианте осуществления липолитический фермент имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39. В другом варианте осуществления липолитический фермент является по существу гомологичным аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, и сохраняет по меньшей мере одну биологическую активность полипептида, выбранного из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, еще отличается аминокислотной последовательностью вследствие естественного изменения или мутагенеза, как описано выше.
В дополнительном варианте осуществления липолитический фермент имеет аминокислотную последовательность, кодируемую при помощи выделенного фрагмента нуклеиновой кислоты, способного к гибридизации с нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38 предпочтительно при условиях высокой жесткости гибридизации.
Следовательно, липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере, примерно на 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, и сохраняет по меньшей мере одну функциональную активность полипептида, выбранного из группы, состоящей из 8ЕС ГО N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39.
Более конкретно, липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере, примерно на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕС ГО N0: 3, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере, примерно на 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕС ГО N0: 6, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере, примерно на 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕС
- 15 008007
ΙΌ N0: 9, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 12, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 15, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 18, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 21, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 24, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 27, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 30, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 33, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 36, или липолитический фермент является белком, который содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичную аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ГО N0: 39.
Функциональные эквиваленты белка согласно настоящему изобретению также могут быть идентифицированы, например, при помощи комбинаторных библиотек скрининга мутантов, например мутантов процессинга, белка настоящего изобретения для активности липолитического фермента. В одном из вариантов настоящего изобретения создают смешанную библиотеку вариантов путем комбинаторного мутагенеза на уровне нуклеиновых кислот. Смешанная библиотека вариантов может быть получена, например, ферментативной сшивкой смеси синтетических олигонуклеотидов в последовательностях генов таким образом, что вырожденный набор потенциальных белковых последовательностей экспрессируют как отдельные полипептиды, или в качестве альтернативы, как набор больших слитых белков (например, для обнаружения фага). Существуют различные способы, которые могут быть использованы для получения библиотек потенциальных вариантов полипептидов настоящего изобретения из вырожденной олигонуклеотидной последовательности. Способы синтеза вырожденных олигонуклеотидов известны специалистам в данной области техники (см., например, №1гап§ (1983) Тейайебгои 39:3; Йакига и др. (1984) Апп. Неу. Вюсйега. 53:323; Йакига и др. (1984) 8с1еисе 198:1056; П<е и др. (1983) №.1с1е1с АсИ Нез. 11:477).
Дополнительно, библиотеки фрагментов кодирующих последовательностей полипептидов настоящего изобретения могут быть использованы для создания смешанной популяции полипептидов для скрининга последовательностей вариантов. Например, библиотека фрагментов кодирующих последовательностей может быть создана путем обработки двухнитевого ПЦР фрагмента интересующей кодирующей последовательности нуклеазой в условиях, при которых происходит однонитевой разрыв только примерно один раз на молекулу, денатурируя двухнитевую ДНК, ренатурируя ДНК для образования двунитевой ДНК, которая может включать в себя смысловые/антисмысловые пары из различных продуктов с однонитевым разрывом, удаляя однонитевые части из снова образованных дуплексов путем обработки 81 нуклеазой, и сшивая полученную в результате библиотеку фрагментов в вектор экспрессии. При помощи такого способа может быть получена библиотека экспрессии, которая кодирует №концевые и внутренние фрагменты разных размеров белка настоящего изобретения.
В данной области техники известны некоторые способы для скрининга генных продуктов комбинаторных библиотек, созданных при помощи точечных мутаций процессинга, и для скрининга кДНК библиотек для генных продуктов, имеющих выбранное свойство. Наиболее широко используемые способы, которые обеспечивают высокую производительность анализа, для скрининга больших генных библиотек обычно включают в себя клонирование генной библиотеки в реплицируемые векторы экспрессии, трансформацию подходящих клеток полученной в результате библиотекой векторов и экспрессию комбинаторных генов в условиях, при которых обнаружение желаемой активности облегчает выделение вектора, кодирующего ген, продукт которого был обнаружен. Мутагенез рекурентного множества (НЕМ), техника, которая усиливает частоту функциональных мутаций в библиотеках, может быть использован в сочетании с анализом скрининга для идентификации разновидностей белка настоящего изобретения
- 16 008007 (Аткт и Уоигуап (1992) Ргос. №11. Асаб. 8с1. И8А 89:7811-7815; Эе1дгауе и др. (1993) Рго1еш Бпдшеегтд 6(3):327-331).
Специалистам в данной области техники очевидно, что полиморфизм последовательности ДНК, который может приводить к изменениям в аминокислотной последовательности липолитического фермента, может существовать внутри данной популяции. Такой генетический полиморфизм может существовать в клетках из разных популяций или внутри популяции вследствие природного аллельного варианта. Аллельные варианты также могут включать функциональные эквиваленты.
Фрагменты полинуклеотидов согласно настоящему изобретению также могут содержать полинуклеотиды, не кодирующие функциональные полипептиды. Такие полинуклеотиды могут работать как зонды или праймеры для ПЦР реакции.
Нуклеиновые кислоты согласно настоящему изобретению безотносительно, кодируют ли они функциональные или нефункциональные полипептиды, могут быть использованы в качестве гибридизационных зондов или праймеров полимеразной цепной реакции (ПЦР). Применение молекул нуклеиновых кислот настоящего изобретения, которые не кодируют полипептиды, имеющие липолитическую ферментативную активность, включают, между прочим, (1) выделение гена, кодирующего липолитический ферментативный белок, или его аллельные варианты из библиотеки кДНК, например, из других организмов, а не из АкрегдШш шдег; (2) гибридизацию ίη Ши (например, ΕΙ8Η) для митофазных хромосомных препаратов для обеспечения точного хромосомного положения гена липолитического фермента, как описано в Уегта и др., Нитап Сйтотокотек: а Мапиа1 οί Ба51с Тес11пк.|ие5. Регдатоп Рге§8, Нью Йорк (1988); (3) Нозерн-блот анализ для обнаружения экспрессии мРНК липолитического фермента в определенных тканях и/или клетках и (4) зонды или праймеры, которые могут быть использованы в качестве диагностического инструмента для анализа наличия нуклеиновой последовательности, гибридизуемой с зондом липолитического фермента в данном биологическом (например, ткани) образце.
Также охваченным настоящим изобретением является способ получения функционального эквивалента гена или кДНК, кодирующих липолитический фермент. Такой способ определяет порядок получения меченного зонда, который включает в себя выделенную нуклеиновую кислоту, которая кодирует всю или часть последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ΕΟ ΙΌ ΝΟ: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, или их варианты; проведение скрининга библиотеки фрагментов нуклеиновой кислоты меченным зондом в условиях, которые позволяют гибридизацию настоящего зонда с фрагментами нуклеиновой кислоты в библиотеке, таким образом образуя дуплексы нуклеиновых кислот, и приготовление последовательности гена полной длины из фрагментов нуклеиновой кислоты в любом меченном дуплексе для получения гена, имеющего отношение к липолитическому ферменту.
В одном из вариантов настоящего изобретения нуклеиновая кислота настоящего изобретения является, по меньшей мере, на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичной последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8ΕΟ ΙΌ ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11,13, 14,16, 17, 19, 20, 22, 23, 25, 26, 28, 29, 31, 32, 34, 35, 37 и 38, или их дополнения.
В другом предпочтительном варианте настоящего изобретения полипептид настоящего изобретения является по меньшей мере на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичным аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ΕΟ ΙΌ ΝΟ: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39.
Клетки хозяина
Отличительной особенностью в другом варианте настоящего изобретения являются клетки, например, трансформированные клетки хозяина или рекомбинантные клетки хозяина, которые содержат нуклеиновые кислоты, охваченные настоящим изобретением. Трансформированная клетка или рекомбинантная клетка является клеткой, в которую (или в предшественника которой) введена, при помощи ДНК-рекомбинантных техник, нуклеиновая кислота настоящего изобретения. Включены как прокариотические, так и эукариотические клетки, например бактериальные, грибные, дрожжевые и т. п., особенно предпочтительными являются клетки из мицельных грибов, более конкретно АкрегдШик шдег.
Клетка хозяина может быть выбрана таким образом, чтобы модулировать экспрессию интересующих последовательностей, или модификации и процессы генного продукта в определенной, желаемой форме. Такие модификации (например, гликозилирование) и процессинг (например, разрезание) белковых продуктов можно облегчить оптимальным функционированием белка.
Различные клетки хозяина имеют характерные и определенные механизмы для посттрансляционного процессинга и модификации белков и генных продуктов. Подходящие клеточные линии или системы хозяина, хорошо знакомые специалистам в данной области молекулярной биологиии/или микробиологии, могут быть выбраны с гарантией желательной и правильной модификации и процессинга экспрессии чужеродного белка. С этой целью могут быть использованы эукариотические клетки хозяина, которые обладают клеточным механизмом подходящего процессинга первичной транскрипции, гликолизирования и фосфорилирования генного продукта. Такие клетки хозяина хорошо известны в данной области техники.
Клетки хозяина также включают, но не ограничивают, линии клеток млекопитающих, такие как СНО, ΥΕΡΌ, ΒΗΚ, НеЬа, ОД8, МОСК, 293, 3Т3, ^138 и линии клеток хориоидного сплетения.
- 17 008007
При желании полипептиды согласно настоящему изобретению могут быть продуцированы при помощи стабильно трансфецируемой клеточной линии. Некоторые векторы, подходящие для стабильной трансфекции клеток млекопитающих, являются доступными, способы для конструирования клеточных линий также являются хорошо известными, например в Ли8иЬе1 и др. (указанный выше).
Антитела
Дополнительной особенностью настоящего изобретения являются антитела, такие как моноклональные или поликлональные антитела, которые специфически связывают липолитические ферментативные белки согласно настоящему изобретению.
Как используется в настоящем описании, термин антитело (АЬ) или моноклональное антитело (МаЬ) включает в себя интактные молекулы, а также фрагменты антител (таких как, например, фрагменты ЕаЬ и Е(аЬ')2), которые способны специфически связываться с липолитическим ферментативным белком. Фрагменты ЕаЬ и Е(аЬ')2 не имеют Ес фрагмента интактного антитела, более быстро выводятся из кровообращения и могут иметь меньшее неспецифично-тканевое связывание интактного антитела (\Уа111 и др., 1. Ыис1. Мед., 24:316-325 (1983)). Таким образом, такие фрагменты являются предпочтительными.
Антитела настоящего изобретения могут быть приготовлены любым из множества способов. Например, клетки, экспрессирующие липолитический ферментативный белок или его антигенный фрагмент, могут быть введены в животное, чтобы вызвать продуцирование сыворотки, содержащей поликлональные антитела. В предпочтительном способе препарат липолитического ферментативного белка готовят и очищают, чтобы предоставить его по существу свободным от природных загрязнений. Такой препарат затем вводят в животное для продуцирования поликлональных антисывороток более высокой специфичной активности.
В наиболее предпочтительном способе антитела настоящего изобретения являются моноклональными антителами настоящего изобретения (или их фрагментами, связывающимися с липолитическим ферментативным белком). Такие моноклональные антитела могут быть приготовлены с использованием технологии гибридомы (КоЫег и др., Ыа1иге 256:495 (1975); КоЫег и др., Еиг. 1. 1ттипо1. 6: 511 (1976); Наттег1шд и др., в: Мопос1опа1 АпдЬоФек апд Т-Се11 НуЬпдотак, ЕЫеуег.НУ.. стр. 563-681 (1981)). В общем случае, такие процедуры включают в себя иммунизацию животного (предпочтительно мышь) антигеном липолитического ферментативного белка или клеткой, экспрессирующей липолитический ферментативный белок. Спленоциты таких мышей экстрагируют и сливают с подходящей клеточной линией миеломы. Может быть использована любая подходящая линия клеток миеломы согласно настоящему изобретению; однако предпочтительна для использования родительская линия клеток миеломы (8Р2О), доступная из американской коллекции типов культур, ВоскуШе, Мэрилэнд. После слияния полученные в результате клетки гибридомы избирательно поддерживают в среде НАТ и затем клонируют путем предельного разбавления, как описано \Уапд5 и др. (6а81то-еп1его1оду 80: 225-232 (1981)). Клетки гибридомы, полученные путем такого отбора, затем анализируют для идентификации клонов, которые секретируют антитела, способные к связыванию антигена липолитического ферментативного белка. В общем случае, полипептиды могут быть соединены с белком носителем, таким как КЕН, как описано в Аи8иЬе1 и др., указанный выше, смешены с адъювантом и инъецированы в млекопитающее хозяина.
Более конкретно, различные животные хозяева могут быть иммунизированы путем инъекции интересующего полипептида. Примеры подходящих животных хозяев включают кроликов, мышей, морских свинок и крыс. Могут быть использованы различные адьюванты для увеличения иммунологического ответа, в зависимости от вида хозяина включающие в себя, без ограничений, адъювант Фрейнда (полный и неполный), адьювантные минеральные гели, такие как гидроксид алюминия, поверхностно-активные вещества, такие как лизолецитин, поверхностно-активные полиолы, полианионы, пептиды, масляные имульсии, гемоцианин лимфы улитки, динитрофенол, ВСС (бацилла Калметта-Герена) и СотупеЬас1етшт ратуит.
Поликлональные антитела являются гетерогенными популяциями молекул антител, полученных из сывороток иммунизированных животных.
Такие антитела могут быть любым классом иммуноглобулина, включая 1дС, 1дМ, 1дЕ, 1дА, 1дЭ и любым его подклассом. Гибридомы, продуцирующие тАЬ§ настоящего изобретения, могут быть культивированы 1п У11то или 1п У1Уо.
После продуцирования поликлональные или моноклональные антитела тестируют для специфического определения белка согласно настоящему изобретению или его функционального эквивалента иммуноанализом, таким как Вестерн-блот или анализ иммунопреципитации с использованием стандартных техник, например, как описано в Аи8иЬе1 и др., указанный выше. Антитела, которые специфически связываются с белком согласно настоящему изобретению или его функциональным эквивалентом, являются пригодными в настоящем изобретении. Например, такие антитела могут быть использованы в иммуноанализе для обнаружения белка согласно настоящему изобретению в патогенных или непатогенных штаммах АкретдШик (например, в АкретдШик ех1тас18).
Предпочтительно, антитела настоящего изобретения продуцируют, используя фрагменты белка согласно настоящему изобретению, который проявляет себя как антигенный, при помощи критерия, такого как высокая частота измененных остатков. Например, такие фрагменты могут быть созданы при помощи
- 18 008007 стандартных техник ПЦР и затем клонированы в рСЕХ вектор экспрессии (АикиЬе1 и др., указанный выше). Затем слитые белки могут быть экспрессированы в Е. сой и очищены с использованием матрикса сродства с глутатион агарозой, как описано в ЛикиЬе1 и др., указанный выше. При желании некоторые (например, два или три) слияния могут быть созданы для каждого белка, и каждое слияние может быть инъецировано по меньшей мере в двух крыс. Антисыворотка может быть увеличена путем серий инъекций, обычно включающих в себя по меньшей мере три бустер-инъекции. Обычно антисыворотки исследуют на их способность к иммунопреципитации белка согласно настоящему изобретению или его функциональных эквивалентов, тогда как неродственные белки могут быть полезными в качестве контроля на специфичность иммунной реакции.
В качестве альтернативы, техники, описанные для продуцирования одноцепочечных антител (патенты США 4946778 и 4704692), могут быть адаптированы для продуцирования одноцепочечных антител к белку согласно настоящему изобретению или его функциональных эквивалентов. Наборы для создания и скрининга библиотек обнаружения фага являются коммерчески доступными, например, от Рйатшае1а.
Дополнительно, примеры способов и реагентов, особенно пригодных для использования при создании и скрининге библиотеки обнаружения антител, могут быть найдены, например, в патенте США 5223409; заявке РСТ №092/18619; заявке РСТ №091/17271, заявке РСТ №020791; заявке РСТ №092/20791; заявке РСТ №092/15679; заявке РСТ №093/01288; заявке РСТ №092/01047; заявке РСТ №092/09690; заявке РСТ №090/02809; Еиейк и др. (1991) Вю/Теейпо1оду 9:370-1372; Нау и др. (1992) Нит. ЛпИЬоб. НуЬпботак 3:81-85; Нике и др. (1989) 8е1епее 246: 1275-1281; Οτίίϊϊΐκ и др. (1993) ЕМВ0 1. 12: 725-734.
Поликлональные и моноклональные антитела, которые специфично связываются с белком настоящего изобретения или его функциональными эквивалентами, например, могут быть использованы для обнаружения экспрессии гена, кодирующего белок согласно настоящему изобретению или его функциональные эквиваленты, например, в другом штамме АкретдШик. Например, белок согласно настоящему изобретению может быть быстро обнаружен при обычном иммуноанализе клеток АкретдШик или экстрактах. Примеры подходящего анализа включают в себя, без ограничений, Вестерн-блоттинг, ЕЙ18А, радиоиммунный анализ и т. п.
Под специфически связывает имеется в виду, что антитело узнает и связывает конкретный антиген, например, белок согласно настоящему изобретению, но не предназначен по существу для узнавания и связывания других неродственных молекул в образце.
Антитела могут быть очищены, например, при помощи способов аффинной хроматографии, в которых антиген полипептида иммобилизуют на смоле.
Антитело, направленное против полипептида настоящего изобретения (например, моноклональное антитело), может быть использовано для выделения полипептида стандартными техниками, такими как аффинная хроматография или иммунопреципитация. Помимо этого, такое антитело может быть использовано для обнаружения белка (например, в клеточном лизате или супернатанте клеток) для оценки большого количества и образца экспрессии полипептида. Антитела также могут быть использованы диагностически для контролирования уровней белка в клетках или ткани в качестве части процедуры клинического тестирования, например, для, к примеру, определения эффективности данного режима обработки или при диагностике АкретдШоДк.
Обнаружение может быть облегчено путем присоединения антитела к обнаружимому веществу. Примеры обнаружимых веществ включают в себя различные ферменты, простетические группы, флуоресцентные вещества, люминесцентные вещества, биолюминесцентные вещества и радиоактивные вещества. Примеры подходящих ферментов включают в себя пероксидазу хрена, алкалин фосфатазу, βгалактозидазу или ацетилхолинэстеразу; примеры подходящих флуоресцентных веществ включают в себя умбеллиферон, флуоресцеин, изотиоционат флуоресцеина, родамин, дихлортриазиниламин флуоресцеин, хлорид дансила или фикоэритрин; пример подходящего люминесцентного вещества включает в себя люминол; примеры подходящих биолюминесцентных веществ включают в себя луциферазу, луциферин и акворин, примеры подходящих радиоактивных веществ включают в себя 1251, 1311, 358 или 3Н.
Предпочтительные эпитопы, охваченные антигенными пептидами, являются областями, которые размещены на поверхности белка, например, гидрофильные области. Точки гидрофобности белка настоящего изобретения могут быть использованы для идентификации гидрофильных областей.
Антигенный пептид белка настоящего изобретения содержит 7 (предпочтительно 10, 15, 20 или 30) следующих друг за другом аминокислотных остатков аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8Е0 Ш N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39, и охватывает эпитоп белка таким образом, что антитело против белка образовывало специфический иммунный комплекс с белком.
Предпочтительные эпитопы, охваченные антигенным белком, являются областями белка настоящего изобретения, которые расположены на поверхности белка, например, гидрофильные области, гидрофобные области, альфа области, бета области, кольцевые области, измененные области и гибкие области.
- 19 008007
Иммуноанализ
Качественное или количественное определение полипептида согласно настоящему изобретению в биологическом образце можно проводить с использованием любого хорошо известного в данной области техники способа. Техники, основанные на антителах, обеспечивают ряд преимуществ для анализа уровней определенного полипептида в биологическом образце.
В связи с этим, специфическое узнавание обеспечивают при помощи первичного антитела (поликлонального или моноклонального), но система вторичного обнаружения может использовать флуоресцентные, ферментативные или другие связанные вторичные антитела. В результате получают иммунокомплекс.
Следовательно, изобретение представляет способ для диагностирования, инфицирован ли определенный организм ЛкрегдШик, содержащий этапы, на которых выделяют биологический образец из упомянутого организма, подозреваемого в том, что он инфецирован ЛкрегдШш;
проводят реакцию упомянутого образца с антителом согласно настоящему изобретению; определяют, образовался ли иммунокомплекс.
Ткани также могут быть экстрагированы, например мочевиной и нейтральным детергентом, для выделения белка для Вестерн-блоттинга или дот/слот блотов. Такая техника также может быть применима для жидкостей тела.
Другие способы, основанные на антителах, пригодные для определения белка согласно настоящему изобретению, включают в себя иммуноанализ, такой как связанный с ферментом иммуносорбент (ЕЬ18Л) и радиоиммуноанализ (ИЛ). Например, моноклональные антитела к белку согласно настоящему изобретению могут быть использованы как в качестве иммуносорбента, так и в качестве зонда, меченного ферментом, для обнаружения и качественного определения белка согласно настоящему изобретению. Количество белка, присутствующего в образце, может быть вычислено по количеству, присутствующему в стандартном препарате, используя компьютерный алгоритм линейной регрессии. В другом анализе ЕЫ8Л могут быть использованы два вида разных специфических моноклональных антител для обнаружения в биологической жидкости белка согласно настоящему изобретению. В таком анализе одно из антител используют в качестве иммуно-абсорбента, а другое в качестве зонда, меченого ферментом.
Выше описанные техники могут быть проведены как одноэтапное или двухэтапное исследование. Одноэтапное исследование включает контактирование белка согласно настоящему изобретению с иммобилизованным антителом и, без промывки, контактирование смеси с меченым антителом. Двухэтапное исследование включает промывку перед контактированием смеси с меченым антителом. Другие обычные способы могут быть использованы, соответственно. Обычно желательно иммобилизовать один компонент системы анализа на подложке, таким образом, позволяя другим компонентам системы войти в контакт с компонентом и быть легко извлеченными из образца.
Подходящие ферментативные метки включают, например, метки из группы оксидаз, которые катализируют продуцирование перекиси водорода путем реакции с субстратом. Активность оксидазной метки может быть проанализирована путем измерения концентрации перекиси водорода, образованного реакцией антитело, меченное ферментом/субстрат.
По сравнению с ферментами, другие подходящие метки включают в себя радиоизотопы, такие как йод (126Ι, 125Ι), углерод (14С), серу (358), тритий (3Н), индий (112Ιη) и технеций (99тТс) и флуоресцентные метки, такие как флуоресцин, родамин и биотин.
Специфическое связывание вещества теста с белком согласно настоящему изобретению может быть обнаружено, например, ίη νίίτο путем обратимой и необратимой иммобилизации белка согласно настоящему изобретению на субстрате, например, поверхности лунки 96-луночного микротитровального планшета из полистирола. Способы иммобилизации полипептидов и других небольших молекул хорошо известны в данной области техники. Например, микротитровальные планшеты могут быть покрыты белком согласно настоящему изобретению путем добавления белка в раствор (обычно, концентрацией от 0,05 до 1 мг/мл в объеме 1-100 мкл) в каждую лунку, и инкубирования планшетов при комнатной температуре до 37°С в течение от 0,1 до 36 ч. Белки, которые не связались с планшетом при комнатной температуре, могут быть удалены путем встряхивания избытка раствора из планшета, и затем промывкой планшета (один раз или неоднократно) водой или буфером. Обычно белок содержат в воде или буфере. Затем планшет промывают буфером, который не имеет связанного белка. Для блокирования на планшете свободных участков, связывающих белок, планшеты блокируют белком, который не является родственным связанному белку. Например, являются подходящими 300 мкл альбумина бычьей сыворотки (В8А) при концентрации 2 мг/мл в Трис-НС1. Подходящие субстраты включают такие субстраты, которые содержат определенные химические соединения с поперечными сшивками (например, пластиковые субстраты, такие как полистироловые, стироловые или полипропиленовые субстраты из Сотшпд СоЧаг Согр. (СашЬпбде. МА), например). При желании в качестве субстрата могут быть использованы частицы в виде шариков, например шарообразная агароза или шарообразная сефароза.
Связывание вещества теста с полипептидами согласно настоящему изобретению может быть обнаружено любым из множества способов, известных в данной области техники. Например, в иммуноанали
- 20 008007 зе может быть использовано специфическое антитело. При желании, антитело может быть меченым (например, флуоресцентно или радиоизотопом) и сразу обнаружено (см., например, \Уе51 и МсМакоп, 1. Се11 Βίο1. 74:264, 1977). В качестве альтернативы, для обнаружения может быть использовано второе антитело (например, меченое антитело, которое связывает Ес часть анти-А№97 антитела). При альтернативном способе обнаружения метят белок согласно настоящему изобретению, и обнаруживают метку (например, при помощи мечения белка согласно настоящему изобретению радиоизотопом, флуорофором, хромофором или т.п.). В еще одном способе белок согласно настоящему изобретению продуцируют как слитый белок с белком, который может быть визуально обнаружен, например, зеленым флуоресцентным белком (который может быть обнаружен под УФ светом). В альтернативном способе белок согласно настоящему изобретению может быть ковалентно связан с ферментом, имеющим обнаружимую ферментативную активность, или слит с ним, таким как пероксидаза хрена, алкалин фосфатаза, альфа-галактозидаза или глюкозооксидаза. Гены, кодирующие все эти ферменты, клонированы и легко доступны для использования специалистами в данной области техники. При желании, слитый белок может включать в себя антиген, и такой антиген может быть обнаружен и измерен поликлональным или моноклональным антителом, используя обычные способы. Подходящие антигены включают в себя ферменты (например, пероксидазу хрена, алкалин фосфатазу и альфа-галактозидазу) и неферментативные полипептиды (например, белки сыворотки, такие как В8А и глобины, и молочные белки, такие как казеины).
Эпитопы, антигены и иммуногены
В другом аспекте настоящее изобретение представляет пептид или полипептид, содержащий часть, несущую эпитоп, полипептида настоящего изобретения. Эпитоп такой части полипептида является иммуногенным или антигенным эпитопом полипептида настоящего изобретения. Иммуногенный эпитоп определен как часть белка, которая вызывает ответ антитела, если весь белок является иммуногеном. Предполагается, что такие иммуногенные эпитопы должны быть ограничены некоторыми локусами на молекуле. С другой стороны, область белковой молекулы, к которой может присоединиться антитело, определен как антигенный эпитоп. Количество иммуногенных эпитопов белка обычно меньше, чем количество антигенных эпитопов. См., например, Сеуъеп. Н.М. и др. Ргос. №111. Асаб. 8с1. США 81:39984002 (1984).
В отношении выбора пептидов или полипептидов, несущих антигенный эпитоп (т.е. такое содержание области молекулы белка, с которой может связаться антитело), специалистам в данной области техники хорошо известно, что относительно короткие синтетические пептиды, которые имитируют часть последовательности белка, способны обычным способом активировать антисыворотку, которая реагирует с частично имитированным белком. См., например, 8и1с11ГГе, 1.6. и др. 8с1епсе 219:660-666 (1984). Пептиды, способные активировать сыворотки, реагирующие с белком, зачастую представлены в первичной последовательности белка, могут быть охарактеризованы при помощи набора правил химических образцов, и не ограничены ни иммунодоминантными областями интактных белков (т.е. иммуногенными эпитопами), ни аминными или карбоксильными концами. Пептиды, которые являются чрезвычайно гидрофобными, и пептиды шести или менее остатков обычно являются неэффективными при индуцировании антител, которые связываются с имитированным белком; более длинные растворимые пептиды, особенно такие, которые содержат остатки пролина, обычно являются эффективными. 8н1с11ГГе и др., указанный выше, на 661. Например, 18 из 20 пептидов, разработанных согласно таким рекомендациям, содержащие 8-39 остатков, покрывающих 75% цепи полипептида гемагглютинина НА1 вируса гриппа, стимулировали антитела, которые прореагировали с НА1 белком или интактным вирусом; и 12/12 пептидов из МиЬУ полимеразы и 18/18 из гликопротеина вируса бешенства стимулировали антитела, которые преципитировали соответствующие белки.
Следовательно, пептиды и полипептиды, несущие антигенный эпитоп, настоящего изобретения пригодны для индуцирования антител, включающих в себя моноклональные антитела, которые связываются специфически с полипептидом настоящего изобретения. Таким образом, высокое соотношение гибридов, полученных слиянием клеток селезенки от донора, иммунизированного пептидом, несущим эпитоп антигена, как правило, секретируют антитело, реагирующее с природным белком. 8и1с11ГГе и др., указанный выше, на 663. Антитела, индуцированные пептидами, несущими антигенный эпитоп, или полипептиды являются пригодными для обнаружения имитированного белка, а антитела к различным пептидам могут быть использованы для отслеживания судьбы различных областей предшественника белка, который подвергнут процессингу после трансляции. Пептиды и антитела к пептидам могут быть использованы во множестве количественных или качественных исследований имитированного белка, например, в сравнительном анализе, так как показано, что даже короткие пептиды (например, около 9 аминокислот) могут связываться и замещать большие пептиды в анализе иммунопреципитации. См., например, ^Шоп, 1.А. и др. Се11 37:767-778 на 777 (1984). Антитела к пептидам настоящего изобретения также являются пригодными для очистки имитированного белка, например, путем адсорбционной хроматографии, используя способы, хорошо известные в данной области техники.
Пептиды и полипептиды, несущие антигенный эпитоп, настоящего изобретения, разработанные согласно выше описанным рекомендациям, предпочтительно содержат последовательность по меньшей мере семь, более предпочтительно по меньшей мере девять и наиболее предпочтительно по меньшей
- 21 008007 мере от примерно 15 до примерно 30 аминокислот, находящихся внутри аминокислотной последовательности полипептида настоящего изобретения. Однако пептиды или полипептиды, содержащие большую часть аминокислотной последовательности полипептида настоящего изобретения, содержащие от примерно 30 до примерно 50 аминокислот, или любую длину до, включая всю аминокислотную последовательность полипептида настоящего изобретения, также считаются пептидами или полипептидами настоящего изобретения, несущими эпитоп, и также являются пригодными для стимулирования антител, которые реагируют с имитированным белком. Предпочтительно аминокислотную последовательность пептида, несущего эпитоп, выбирают для обеспечения существенной растворимости в водных растворителях (т.е. последовательность включает в себя относительно гидрофильные остатки, а высоко гидрофобные последовательности предпочтительно устраняют); и последовательности, содержащие остатки пролина, являются особенно предпочтительными.
Пептиды и полипептиды настоящего изобретения, несущие эпитоп, могут быть продуцированы при помощи любого обычного способа создания пептидов или полипептидов, включая рекомбинантные способы, использующие молекулы нуклеиновых кислот настоящего изобретения. Например, короткая аминокислотная последовательность, несущая эпитоп, может быть слита с более большим полипептидом, который действует в качестве носителя во время продуцирования и очистки рекомбинанта, а также во время иммунизации для продуцирования антител к пептиду.
Пептиды, несущие эпитоп, также могут быть синтезированы с использованием известных способов химического синтеза. Например, НоидЫеп описал простой способ синтеза большого количества пептидов, таких как 10-20 мг 248 различных пептидов из 13 остатков, представляющих собой единичные варианты аминокислот сегмента НА1 полипептида, который приготовили и охарактеризовали (при помощи исследований, связывающих ЕЫ8А тип) менее чем за четыре недели. НоидЫеп. К.А., Ргос. №111. Асаб. 8с1. США 82:5131-5135 (1985). Такой процесс одновременного синтеза множества пептидов (8МР8) дополнительно описан в патенте США 4631211 НоидЫеп и др. (1986). В этой процедуре отдельные смолы для синтеза в твердой фазе различных пептидов содержат в отдельных пакетах, проницаемых для растворителя, способствующих оптимальному использованию многих идентичных повторяющихся этапов, включенных в твердофазные способы.
Полностью ручная процедура позволяет проводить одновременно 500-1000 или более синтезов. НоидЫеп и др., указанный выше, на 5134.
Пептиды и полипептиды настоящего изобретения, несущие эпитоп, используют для индуцирования антител согласно способам, хорошо известным в данной области техники. См., например, 8и1с11йе и др., указанный выше; ^бкоп и др., указанный выше; Сйоте, М. и др., Ргос. №111. Асаб. США 82:910-914; и ВИПе, Р.1. и др. 1. Сеп. У1го1. 66:2347-2354 (1985).
Обычно животные могут быть иммунизированы свободными пептидами; однако может быть усилен титр антител к белку путем присоединения пептида к носителю-макромолекуле, такому как гемоцианин лимфы улитки (КЬН) или столбнячный анатоксин. Например, пептиды, содержащие цистеин, могут быть соединены с носителем с использованием линкера, такого как малеимидобензоил-№гидроксисукцинимидовый эфир (МВ8), в то время как другие пептиды могут быть соединены с носителем с использованием более обычного связывающего агента, такого как глутаральдегид.
Животных, таких как кролики, крысы и мыши, иммунизируют либо свободными, либо связанными с носителем пептидами, например при помощи интраперитонеального и/или интрадермального введения инъекции эмульсии, содержащей примерно 100 мкг пептида или белка-носителя и адъюванта Фрейнда. Для некоторых инъекций может потребоваться повторная иммунизация, например, с интервалом в две недели, для обеспечения пригодного титра антитела к белку, который может быть обнаружен, например, при помощи ЕЫ8А анализа с использованием свободного белка, адсорбированного на твердой поверхности. Титр антител к белку в сыворотке из иммунизированного животного может быть увеличен путем отбора антител к пептиду, например, путем адсорбции пептида на твердой подложке и элюции отобранных антител согласно способам, хорошо известным в данной области техники.
Иммуногенные пептиды настоящего изобретения, несущие эпитоп, т.е. такие части белка, которые вызывают ответ антитела, когда весь белок является иммуногеном, идентифицируют согласно способам, хорошо известным в данной области техники. Например, у Сеукеп и др., 1984, указанный выше, раскрыта процедура быстрого конкурентного синтеза на твердых подложках сотен пептидов достаточной очистки для реакции в исследовании иммуносорбента, подобного ферменту. Взаимодействие синтезированных пептидов с антителами затем легко обнаруживают без удаления их с подложки. В таком способе пептиды, несущие иммуногенный эпитоп желаемого белка, могут быть просто идентифицированы специалистом в данной области техники. Например, иммунологически важный эпитоп в белке оболочки вируса ящура был локализован Сеукеп и др. анализом нескольких аминокислот при помощи синтеза покрывающего набора всех 208 возможных гексапептидов, покрывающих полностью 213 аминокислотную последовательность белка. Затем был синтезирован полный набор замещений пептидов, в котором все 20 аминокислот были заменены, в свою очередь, в каждой позиции эпитопа и были определены конкретные аминокислоты, представляющие специфичность для реакции с антителом. Таким образом, пептиды, аналоги пептидов, несущих эпитоп, настоящего изобретения могут быть без затруднения созданы таким
- 22 008007 способом. Патент США 4708781 Сеукеп (1987) дополнительно раскрывает способ идентификации пептида, несущего иммунологический эпитоп желаемого белка.
Более того, патент США 5194392 Сеукеп (1990) раскрыл обычный способ обнаружения или определения последовательности мономеров (аминокислот или других соединений), которая является топологическим эквивалентом пептида (т.е. имитирующим эпитопом), который комплементарен конкретному паратопу (сайту, связывающему антиген) интересующего антитела. В более общих выражениях, патент США 4433092 Сеукеп (1989) раскрыл способ обнаружения или определения последовательности мономеров, которая является топографическим эквивалентом лиганда, который является комплементарным лиганду, связывающему сайт конкретного интересующего рецептора. Подобным способом, патент США 5480971 НоидЫеп и др. (1996) на смесях пералкилированных аминопептидов раскрыл линию С1-С7алкил пералкилированных олигопептидов и наборы, и библиотеки таких пептидов, а также способы для использования таких наборов и библиотек пептидов для определения последовательности пералкилированного олигопептида, который предпочтительно связывается с интересующей молекулой акцептора. Таким образом, непептиды, аналоги пептидов, несущих эпитоп, настоящего изобретения также могут быть без затруднения изготовлены такими способами.
Использование липолитических ферментов в промышленных процессах
Настоящее изобретение также относится к использованию липолитического фермента согласно настоящему изобретению в определенных промышленных процессах. Несмотря на длительный опыт, приобретенный в таких процессах, липолитический фермент согласно настоящему изобретению имеет несколько отличительных существенных преимуществ по сравнению с ныне используемыми ферментами. В зависимости от конкретного применения такие преимущества могут включать в себя аспекты, подобно более низкой цене производства, более высокой специфичности в отношении субстрата, меньшей аллергенности, меньшего количества нежелательных побочных активностей, более высокое получение при продуцировании в подходящем микроорганизме, более подходящий рН и температурные режимы, улучшенный вкус и конечное изделие, а также аспекты качества пищи и чистоты продукта.
Настоящее изобретение также относится к способам приготовления теста или печеного изделия, содержащего включенное в тесто эффективное количество липолитического фермента настоящего изобретения, которое улучшает одно или несколько свойств теста или печеного изделия, полученного из этого теста относительно теста или печеного изделия, в которые не включен полипептид.
Фраза включен в тесто определена в настоящем описании как добавка липолитического фермента согласно настоящему изобретению в тесто, любой ингредиент, из которого может быть сделано тесто, и/или любую смесь ингредиентов теста, из которых может быть сделано тесто. Другими словами, липолитический фермент согласно настоящему изобретению может быть добавлен на любом этапе приготовления теста и может быть добавлен в один, два или несколько этапов. Липолитический фермент согласно настоящему изобретению добавляют в ингредиенты теста, которые замешивают и пекут для изготовления печеного изделия с использованием способов, хорошо известных в данной области техники. См., например, патент США 4567046, ЕР-А-426,211, ДР-А-60-78529, ХР-А-62-111629 и ДР-А-63-258528.
Термин эффективное количество определен в настоящем описании как количество липолитического фермента согласно настоящему изобретению, которое достаточно для обеспечения измеряемого эффекта, по меньшей мере, интересующего свойства теста и/или печеного изделия.
Термин улучшенное свойство определен в настоящем описании как любое свойство теста и/или изделия, полученного из теста, особенно печеного изделия, которое улучшено действием липолитического фермента согласно настоящему изобретению относительно теста или продукта, в которые не включен липолитический фермент согласно настоящему изобретению. Улучшенное свойство может включать, без ограничений, увеличенную прочность теста, увеличенную эластичность теста, увеличенную стабильность теста, уменьшенную липкость теста, улучшенную растяжимость теста, улучшенный вкус печеного изделия, улучшенное античерствление печеного изделия.
Улучшенное свойство может быть определено путем сравнения теста и/или печеного изделия, приготовленного с добавлением полипептида настоящего изобретения согласно способам настоящего изобретения, описанным ниже в примерах, или без добавления. Органолептические качества могут быть оценены с использованием процедур, хорошо отработанных в хлебопекарной промышленности, и могут включать, например, использование группы квалифицированных экспертов-дегустаторов.
Термин увеличенная прочность теста определен в настоящем описании как свойство теста, которое обычно имеет эластичные свойства и/или требует большего вклада работы в формование и придание формы.
Термин увеличенная эластичность теста определен в настоящем описании как свойство теста, которое обычно имеет большую тенденцию к восстановлению своей первоначальной формы после того, как оно было подвергнуто некоторому физическому растяжению.
Термин увеличенная стабильность теста определен в настоящем описании как свойство теста, которое менее восприимчиво к механическим воздействиям, таким образом, лучше поддерживающее свою форму и объем.
Термин уменьшенная липкость теста определен в настоящем описании как свойство теста, кото
- 23 008007 рое имеет уменьшенную тенденцию прилипания к поверхности, например, при механическом производстве теста, и является легко оцениваемым эмпирически пекарем-лаборантом или измеряемым с использованием анализатора текстуры (например, ТАХТ2), известными в данной области техники.
Термин улучшенная растяжимость теста определен в настоящем описании как свойство теста, которое может быть подвергнуто увеличенному натяжению или растяжению без разрыва.
Термин улучшенная способность теста к механической обработке определен в настоящем описании как свойство теста, которое является обычно менее тягучим, и/или более плотным, и/или более эластичным.
Термин увеличенный объем печеного изделия измеряется как определенный объем данного батона хлеба (объем/вес), обычно определяемый традиционным способом определения с использованием рапсового семени.
Термин улучшенная структура хлебного мякиша печеного изделия определен в настоящем описании как свойство печеного изделия с более удлиненными и/или тонкими стенками ячеек в хлебном мякише и/или более однородным и/или гомогенным распределением ячеек в хлебном мякише и обычно оценивается эмпирически пекарем-лаборантом.
Термин улучшенная мягкость печеного изделия противопоставлен твердости и определен в настоящем описании как свойство печеного изделия, которое является более легко сжимаемым и легко оценивается эмпирически пекарем-лаборантом или измеряется с использованием анализатора (например, ТАХТ2), известным в данной области техники.
Термин улучшенный вкус печеного изделия оценивают при помощи группы квалифицированных дегустаторов.
Термин улучшенное античерствление печеного изделия определен в настоящем описании как свойства печеного изделия, которые имеют уменьшенную скорость ухудшения параметров качества, например, мягкости и/или эластичности, во время хранения.
Термин тесто определен в настоящем описании как смесь муки и других ингредиентов, достаточно плотных для замешивания или раскатывания. Тесто может быть свежим, замороженным, предварительно раскатанным или подвергнутым предварительной термообработке. Приготовление замороженного теста описано Ки1р и йогеп/ в Егохеп апб РеГпдеШеб ЭоидН апб Вайегк.
Термин печеное изделие определен в настоящем описании как любой продукт, приготовленный из теста, либо мягкого, либо хрустящего типа. Примеры печеных изделий, любых белого, серого или черного типа, которые могут быть преимущественно изготовлены при помощи настоящего изобретения, являются хлебом (более конкретно белым хлебом, хлебом из ржаной муки или ржаного шрота) обычно в виде батонов или бубликов, длинного французского хлеба, макаронных изделий, лаваша, тортильи, тако, тортов, блинов, бисквитов, булочек, хлебной крошки, парового хлеба и хрустящего хлеба или т.п.
Липолитический фермент настоящего изобретения и/или дополнительные ферменты, предназначенные для использования в способах настоящего изобретения, могут быть в любом виде, подходящем для рассматриваемого использования, например, в виде сухого порошка, быстрорастворимого порошка, или гранулята, более конкретно, непорошкообразного гранулята, жидкости, более конкретно, стабилизированной жидкости или защищенного фермента, такого как описано в А001/11974 и А002/26044. Гранулы и быстрорастворимые порошки могут быть приготовлены обычными способами, например путем распыления липолитического фермента согласно настоящему изобретению на носитель в гранулятор с псевдоожиженным слоем. Носитель может состоять из отдельных ядер, имеющих подходящие размеры частиц. Носитель может быть растворимым и нерастворимым, например солью (такой как №С1 или сульфат натрия), сахаром (таким как сахароза или лактоза), сахарным спиртом (таким как сорбитол), крахмалом, рисом, измельченным зерном или соей. Липолитический фермент согласно настоящему изобретению и/или дополнительные ферменты могут содержаться в препаратах замедленного освобождения. Способы приготовления препаратов замедленного освобождения хорошо известны в данной области техники. Добавление пригодных для пищи стабилизаторов, таких как сахар, сахарный спирт или других полиолей и/или молочной кислоты или другой органической кислоты согласно установленным способам могут, например, стабилизировать жидкие ферментативные препараты.
Липолитический фермент согласно настоящему изобретению также может быть включен в дрожжи, содержащие композиции, такие как раскрытые в ЕР-А-0619947, ЕР-А-0659344 и А002/49441.
Преимуществом является то, что для добавления в заранее приготовленные смеси муки полипептиды согласно настоящему изобретению находятся в виде сухого продукта, например непорошкообразно гранулированного, в то время как для добавления вместе с жидкостью он находится преимущественно в жидком виде.
Один или несколько дополнительных ферментов также могут быть добавлены в тесто. Дополнительный фермент может быть любого происхождения, включая животное или растительное, и предпочтительно микробное (бактериальное, дрожжевое или грибковое) происхождение и может быть получен при помощи техник, обычно используемых в данной области техники.
В предпочтительном варианте осуществления дополнительный фермент может быть амилазой, такой как альфа-амилаза (пригодная для обеспечения сахара, способного к брожению при помощи дрож
- 24 008007 жей и замедляющая черствление) или бета-амилаза. циклодекстрин глюканотрансфераза. пептидаза. более конкретно. экзопептидаза (пригодная для усиления вкуса). трансглутаминаза. липаза (пригодная для модификации липидов. присутствующих в тесте или компонентах теста для размягчения теста). фосфолипаза. целлюлаза. гемицеллюлаза. более конкретно. пентозаназа. такая как ксиланаза (пригодная для частичного гидролиза пентозанов. которые увеличивают растяжимость теста). протеаза (пригодная для ослабления клейковины. более конкретно. при использовании муки из твердой пшеницы). изомераза дисульфидных белков. например. изомераза дисульфидных белков. как раскрыто в \У095/00636. гликозилтрансфераза. пероксидаза (пригодная для улучшения консистенции теста). лакказа или оксидаза. например глюкозооксидаза. гексозооксидаза. альдозооксидаза. пиранозооксидаза. липоксигеназа или оксидаза Ь-аминокислот (пригодная для улучшения консистенции теста).
Если одна или несколько активностей дополнительных ферментов добавлены по способам настоящего изобретения. такие активности могут быть добавлены отдельно или вместе с полипептидом согласно настоящему изобретению. необязательно в качестве компонента(компонентов) композиции. улучшающей хлеб и/или улучшающей муку. Другие ферментативные активности могут быть любыми ферментами. описанными выше и могут быть дозированы согласно установленной практике хлебопечения.
Настоящее изобретение также относится к способам приготовления печеных изделий. включающих выпекание теста. полученного способом настоящего изобретения для производства печеного изделия. Выпекание теста для производства печеного изделия может быть выполнено с использованием способов. хорошо известных в данной области техники.
Настоящее изобретение также относится к тесту и печеным изделиям. соответственно. произведенным способами настоящего изобретения.
Настоящее изобретение дополнительно относится к предварительной смеси. например. в виде композиции муки. для теста и/или печеных изделий. приготовленных из теста. причем предварительная смесь содержит полипептид настоящего изобретения. Термин предварительная смесь определен в настоящем описании для понимания ее в обычном значении. т.е. как смесь агентов печения. обычно включающих в себя муку. которая может быть использована не только в установках/оборудовании промышленного хлебопечения. но также в пекарнях розничной продажи. Предварительная смесь может быть приготовлена путем смешивания полипептида или композиции. улучшающей хлеб и/или улучшающей тесто настоящего изобретения. содержащей полипептид. с подходящим носителем. таким как мука. крахмал. сахар или соль. Предварительная смесь может содержать другие добавки. улучшающие тесто и/или улучшающие хлеб. например. любые добавки. включающие ферменты. упомянутые выше.
Настоящее изобретение дополнительно относится к хлебопекарным добавкам в виде гранулированного или быстрорастворимого порошка. который содержит полипептид настоящего изобретения. Дополнительная хлебопекарная добавка предпочтительно имеет узкое распределение размера частиц с более чем 95% (по весу) частиц в области от 25 до 500 мкм.
Для теста и хлеба производство настоящего изобретения может быть использовано в комбинации со вспомогательными веществами обработки. определенными ранее в настоящем описании. такими как вспомогательные вещества химической обработки. таким как оксиданты (например аскорбиновая кислота). восстанавливающие агенты (например Ь-цистеин). оксидоредуктазы (например. глюкозооксидаза) и/или другие ферменты. такие как ферменты. модифицирующие полисахариды (например. α-амилаза. гемицеллюлаза. ферменты для печения и т.д.). и/или ферменты. модифицирующие белки (эндопротеаза. экзопротеаза. ферменты для печения и т.д.).
Пример 1. Ферментация АзретдШиз шдет
Липолитические ферменты. кодируемые нуклеотидной последовательностью. как предусмотрено в настоящем описании. получили путем конструирования плазмид экспрессии. содержащих последовательности ДНК. трансформации штамма А. шдет такой плазмидой и культивирования штаммов А. шдет следующим ниже способом.
Свежие споры (106-107) штаммов А. шдет инокулировали в 20 мл С8Ь среды (100 мл флакон. перегородка) и культивировали в течение 20-24 ч при 34°С и 170 об./мин. После инокуляции 5-10 мл С8Ь перед культивированием в 100 мл С8М среде (500 мл флакон. перегородка) штаммы ферментировали при 34°С и 170 об./мин в течение 3-5 дней.
Бесклеточные супернатанты получили центрифугированием в 50 мл флаконах Стешет (30 мин. 5000 об./мин). Супернатанты предварительно отфильтровали микроволокнистым фильтром СЕ/А \УНа1тап С1азз (150 мм Е) для удаления более больших частиц. до рН 5 доводили 4 н КОН (по необходимости) и стерильно отфильтровали 0.2 мкм (с бутылочным верхом) фильтром со всасыванием для удаления грибкового материала. Супернатанты хранили при 4°С (или -20°С).
Среда С8Ь состояла из (в количестве на 1 л): 100 г Сот 81еер 8о11бз (ИоциеПе). 1 г NаΗ2Ρ04Ή20. 0.5 г Мд804-7Н20. 10 г глюкоза-Н20 и 0.25 г Вазйбоп (пеногаситель). Ингредиенты растворили в половине объема воды и рН довели до рН 5.8 при помощи №10Н или Н2804; 100 мл флакон с перегородкой и шариком для вспенивания заполнили 20 мл бульона ферментации и стерилизовали в течение 20 мин при 120°С. после чего 200 мкл раствора. содержащего 5000 ΐυ/мл пенициллина и 5 мг/мл стрептомицина. добавили в каждый флакон после охлаждения до комнатной температуры.
- 25 008007
С8М среда состояла из (в количестве на литр): 150 г мальтоза-Н20, 60 г 8оу1опе (пептон), 1 г №Н2Р04-Н20, 15 г Мд804-7Н20, 0,08 Твин 80, 0,02 г Вазййоп (пеногаситель), 20 г МЕ8, 1 г Ь-аргинина. Ингредиенты растворили в половине объема воды и рН довели до рН 6,2 при помощи №0Н или Н2804; 100 мл флакон с перегородкой и шариком для вспенивания заполнили 100 мл бульона ферментации и стерилизовали в течение 120 мин при 120°С, после чего 1 мл раствора, содержащего 5000 ГО/мл пенициллина и 5 мг/мл стрептомицина, добавили в каждый флакон после охлаждения до комнатной температуры.
Пример 2. Очистка липолитических ферментов настоящего изобретения
Этап 1 - Приготовление ультрафильтратов
Выполнили ультрафильтрацию супернатантов культур, которые получены в примере 1, для удаления низкомолекулярных загрязнений, которые могут мешать при определении ферментативной активности и тестах при выпечке. Ультрафильтрацию 30 мл супернатанта проводили системой МйНроге ЕаЬзса1е ТЕЕ, оборудованной фильтром с 10 кОа границей пропускания.
В зависимости от цвета образцы промывали 3-5 раз 40 мл объемами 100 мМ холодного фосфатного буфера рН 6,0, включающего в себя 0,5 мМ СаС12. Конечный объем раствора фермента составил 30 мл и далее он упоминается как ультрафильтрат.
Этап 2 - Определение концентрации липолитических ферментов при помощи А280 и НР8ЕС.
Концентрацию липолитических ферментов в ультрафильтрате вычислили из экстинкции при 280 нм (А280), свойственной липолитическим ферментам, и вычислили коэффициент молекулярной экстинкции липолитических ферментов. Измерение А280 выполнили спектрометром Иу1коп ХБ 8есошаш (Веип 4е Копйе, АЬсоийе, Нидерланды).
Коэффициент молекулярной экстинкции фермента может быть вычислен из количества остатков тирозина, триптофана и цистеина на молекулу (8.С. С111 Р.Н. уоп Н1рре1, Апа1.Вюсйеш. 182, 319-326 (1989)). Коэффициент молекулярной экстинкции этих аминокислот составляет 1280, 5690 и 120 М1-см-1, соответственно. Количество остатков тирозина, триптофана и цистеина в липолитических ферментах настоящего изобретения может быть выведено из последовательностей 8ЕЦ ΙΏ N0: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36 и 39. Вычисленные коэффициенты ослабления липолитических ферментов настоящего изобретения суммированы в табл. 2.
Таблица 2
| Липолитиче ский фермент | ЗЕ<2 10 ΝΟ: | # аминокислоты | Вычисленное М.И. (Оа) | Вычисленный коэффициент экстинкции при 280 нм | |||
| Тгр | Туг | Суз | мУсм 1 | 1 (мг/мл1 γ· | см 1 | ||
| ΝΒΕ028 | 3 | 13 | 26 | 6 | 64141 | 107970 | 1,7 |
| ΝΒΕ029 | 6 | 14 | 27 | 6 | 63250 | 114940 | 1,8 |
| ΝΒΕ030 | 9 | 17 | 26 | 6 | 59952 | 130730 | 2,2 |
| ΝΒΕ031 | 12 | 9 | 27 | 4 | 61173 | 86250 | 1,4 |
| ΝΒΕ032 | 15 | 3 | 13 | 6 | 29683 | 34430 | 1,2 |
| ΝΒΕ033 | 18 | 7 | 24 | 2 | 44890 | 70790 | 1,6 |
| ΝΒΕ034 | 21 | 11 | 19 | 7 | 53796 | 87750 | 1,6 |
| ΝΒΕ036 | 24 | 10 | 23 | 7 | 64945 | 87180 | 1,3 |
| ΝΒΕ038 | 27 | 13 | 29 | 4 | 55161 | 111570 | 2,2 |
| ΝΒΕ039 | 30 | 11 | 26 | 6 | 59298 | 96590 | 1,6 |
| ΝΒΕ043 | 33 | 16 | 35 | 8 | 62564 | 136800 | 2,2 |
| ΝΒΕ045 | 36 | 0 | 6 | 6 | 26688 | 8400 | 0,31 |
| ΝΒΕ042 | 39 | 14 | 30 | 7 | 61593 | 118900 | 1,9 |
Экстинкция ультрафильтрата при 280 нм (А280), которая является свойством липолитических ферментов, зависит от чистоты образца фермента. Чистота, определенная с использованием НР8ЕС (высокоразрешающей хроматографией по размеру молекул) с Т8К 8\¥-Х1. колонкой (300-7,8 мм; область М^ 10-300 кОа). Буфер для элюции состоял из 25 мМ натрий фосфатного буфера рН 6,0 и был использован поток 1 мл/мин. Инъецировали 5-100 мкл образцы. Измерили поглощение при 280 нм.
А280 в ультрафильтратах, свойственное липолитическому ферменту настоящего изобретения, получили из отношения поверхности пика к пику соответствующего липолитического фермента в хроматограмме и общей поверхности пиков поглощения при 280 нм. Затем для каждого липолитического фермента вычислили концентрацию липолитического фермента в ультрафильтрате путем умножения А280 ультрафильтрата на отношение, описанное выше, и разделили на вычисленный коэффициент экстинкции
- 26 008007 (1 мг/мл раствора - табл. 2 - самая большая правая колонка). Пример 3. Измерения активностей
Бесклеточные супернатанты, полученные в примере 1, исследовали при помощи липазы, фосфолипазы и галактолипазы, что показано в табл. 3.
Таблица 3. Активности липолитических ферментов в бесклеточных супернатантах, как приготовлено в примере 1
| Липолитический фермент | липаза | фосфолипаза А | лизофосфолипаза | галактолипаза |
| ΝΒΕ028 | + | + | + | 0 |
| ΝΒΕ029 | + | + | + | 0 |
| ΝΒΕ031 | +++ | + | + | + |
| ΝΒΕ032 | ++ | + | + | 0 |
| ΝΒΕ033 | + | ++ | + | + |
| ΝΒΕ034 | 0 | + | 0 | 0 |
| ΝΒΕ036 | 0 | + | 4- | 0 |
| ΝΒΕ038 | 0 | + | 0 | 0 |
| ΝΒΕ039 | + | 0 | 0 | 0 |
| ΝΒΕ043 | + | 0 | 0 | 0 |
= нет отличия от контроля;
+/++/+++ =выше, чем контроль.
Активность липазы определили спектрофотометрически с использованием 2,3-меркапто-1пропанолтрибутирата (ТВОИ?) в качестве субстрата. Липаза гидролизует сульфидные связи ТВОИР, таким образом, освобождая тиобутановую кислоту, которая в последующей реакции с 4,4дитиодипиридином (ЭТЭР) образует 4-тиопиридон. Последний находится в таутомерном равновесии с 4-меркаптопиридином, который поглощается при 334 нм. Реакция протекает в 0,1М ацетатном буфере рН 5,0, содержащем 0,2% Тритон Х-100, 0,65 мМ ТВО1ЛР и 0,2 мМ ЭТЭР, при 37°С. Одна единица липазы определена, как количество фермента, которое высвобождает 1 мкмоль 4 тиобутановой кислоты в 1 мин в установившихся условиях реакции.
Фосфолипазу А определили спектрофотометрически с использованием 1,2-дитиодиоктаноилфосфатдихолина в качестве субстрата. Фосфолипаза А гидролизует сульфидную связь в 1 положении (РЬА1) или 2 положении (РЬА2), таким образом освобождая 4 тиооктановую кислоту, которая в последующей реакции реагирует с 4,4' -дитиопиридином для образования 4-тиопиридона. Последний находится в таутомерном равновесии с 4-меркаптопиридином, который поглощается при 334 нм. Реакция протекает в 0,1 М ацетатном буфере рН 4,0, содержащем 0,2% Тритон Х-100, 0,65 мМ субстрата и 0,2 мМ □ТОР, при 37°С. Одна единица фосфолипазы А (РЬА) определена как количество фермента, которое высвобождает 1 мкмоль 4 тиооктановой кислоты в 1 мин в установившихся условиях реакции.
Активность лизофосфолипазы определили 31Р-ЯМР спектроскопией с использованием лизофосфатидилхолина в качестве субстрата. Лизофосфолипаза гидролизует эфирную связь, таким образом освобождая жирную кислоту из группы глицерина. Образованный таким образом глицеринфосфохолин количественно определили, используя ЯМР. Реакция протекала в 50 мМ ацетатном буфере рН 4,5, дополнительно содержащем 1 мг/мл лизофосфатидилхолин и 5мМ СаС12, в течение 30 мин при 55°С. Одна единица лизофосфолипазы (ЬРС) определена как количество фермента, которое образует 1 мкмоль 4 глицеринфосфохолина кислоты в 1 мин в установившихся условиях реакции.
Активность галактолипазы определили ЯМР спектроскопией с использованием дигалактозилдиглицерида в качестве субстрата согласно способу, описанному ИЛауата и Μаί8иба (1972) Ацпс. Вю1. С1ет. 36, 1831. Галактолипаза гидролизует эфирную связь между жирными кислотами и глицериновой основой, таким образом, освобождая одну или две жирные кислоты. Реакция протекает в 50 мМ ацетатном буфере рН 4,5, дополнительно содержащем 5мМ СаС12, 0,2% Тритон Х-100 и 1 мг/мл дигалактозилдиглицерида (липидные продукты), в течение 30 мин при 30°С. Одна единица галактолипазы определена как количество фермента, которое образует 1 мкмоль жирной кислоты в 1 мин в установившихся условиях реакции.
Ультрафильтраты, полученные в примере 2, подвергли РАИ измерению активности фермента. Активность грибковой альфа-амилазы измерили с использованием тестовых таблеток Р1абеЬак Ату1аке (РБагтаыа). Таблетки РБабеЬаз содержат субстрат водонерастворимого крахмала и голубой краситель, связанный поперечными связями с субстратом. Субстрат гидролизовали грибковой амилазой, освобождая окрашенные растворимые мальтодекстрины, которые перешли в раствор. Кривую калибровки приго
- 27 008007 товили при помощи раствора, содержащего упомянутую активность грибковой альфа-амилазы. Из стандарта и неизвестных образцов в 50 мМ буфере малеиновой кислоты рН 5,5 приготовили соответствующие разбавления. Образцы по 5 мл инкубировали при 30°С в течение 5 мин, добавили РйабеЬак таблетку и после 15 мин реакцию остановили путем добавления 1,0 мл 0,5 н гидроксида натрия. Смеси оставили остывать до комнатной температуры в течение 5 мин, после чего добавили 4,0 мл воды, после встряхивания руками в течение 15 мин образцы центрифугировали при 4700 об./мин в течение 10 мин. Экстинкцию верхних слоев измерили при 620 нм. ΟΏ 620 нм является единицей измерения для активности грибковой альфа-амилазы. Одна единица грибковой альфа-амилазы (РАИ) определена в настоящем описании как количество фермента, которое превращает 1 г крахмала (100% сухого вещества) за 1 ч в продукт, обладающий прозрачностью при 620 нм после реакции с йодным раствором известной концентрации в установившихся условиях реакции.
Таблица 4. Аи и белок в ультрафильтратах, приготовленных в примере 2
| Липолитический фермент | Белок (мг/мл) из анализа 280 нм | Грибковая амилаза (ΕΑϋ/мл) |
| ΝΒΕ028 | 2,3 | 4,5 |
| ΝΒΕ029 | 1,3 | 3,0 |
| ΝΒΕ030 | 0,4 | 2,6 |
| ΝΒΕ031 | 0,1 | 2,5 |
| ΝΒΕ032 | 1,0 | 0,3 |
| ΝΒΕ033 | Νϋ | 0,3 |
| ΝΒΕ034 | Νϋ | 2,7 |
| ΝΒΕ036 | Νϋ | 3,4 |
| ΝΒΕ038 | 2,0 | 3,7 |
| ΝΒΕ039 | 2,2 | 0,6 |
| ΝΒΕ043 | 0,1 | 0,2 |
| ΝΒΕ045 | Νϋ | 4,0 |
| ΝΒΕ042 | 1,6 | 1,5 |
Дополнительно к активностям, приведенным в табл. 4, также присутствуют незначительные активности глюкоамилазы, однако в таких низких количествах, что эти ферменты не мешают в экспериментах хлебопечения, описанных в примере 4.
Пример 4. Эксперименты 1 хлебопечения - батоны хлеба
Батоны хлеба выпекли из 150-граммовых кусков теста, полученного путем смешивания 200 г муки (Ко11Ьп™/1Ык™ в соотношении 80/20), 1,4 г сухих хлебопекарных дрожжей (Регт1рап®), 4 г соли, 3 г сахара, 10 мг аскорбиновой кислоты, 116 г воды и 2 г жира. После перемешивания в течение 6 мин и 15 с в стержневом миксере, тесто разделили на куски по 150 г и поставили для брожения в течение 45 мин при 30°С, обмяли и поставили для брожения в течение еще 25 мин, отформовали и приготовили. Брожение проводили при относительной влажности 90-100%. После финального брожения в течение 70 мин при 30°С тесто пекли в течение 20 мин при 225°С.
Различное воздействие (табл. 5 и 6) липолитических ферментов в экспериментах хлебопечения сравнили с контролем, содержащим такое же количество грибковой амилазы, которую добавили иным способом при помощи дозировки ультрафильтрата (для активности грибковой амилазы в ультрафильтратах см. табл. 4). Это было необходимо, так как количество грибковой амилазы, добавленной с липолитическими ферментами, особенно повлияло на объем хлеба, а не на другие параметры. Объем батонов хлеба с добавленным контрольным количеством грибковой амилазы приняли за 100%.
- 28 008007
Таблица 5
| Эффект | Оценка | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | ||
| липкость | очень | липкое | Контрольный | Значите- | Прекрасно | |
| теста | липкое | хлеб | льно | сухое | ||
| естс | лучше | |||||
| Ен | Растворимость | Очень | Меньше, чем | Контрольный | хорошо | Очень |
| теста | короткая | контроль | хлеб | длинная | ||
| Структура | плохая | неоднород- | Контрольный | хорошая | отличная | |
| хлебного | ная | хлеб | ||||
| ю | мякиша | |||||
| е И | ТТтаогп т/’/'Угэтгтл· | ГТгчтдъ АО ТА ХД ΧΧ^^Αν^ΙΧΟ | Очень | троль. НЬМ | о т личный | Очень |
| белый | светлый | хлеб | темный | |||
| О) Р1 | Цвет хлебного | Слишком | Очень | Контрольный | отличный | Абсолютно |
| ф с | мякиша | желтая | желтый | хлеб | белый | |
| черствение | Слишком | Очень | Контрольный | мягче | отличный | |
| твердый | твердый | хлеб |
Объем батона определили при помощи измерителя объема хлеба БУМ-3 (ΚΙ Сагдз 1п81гитеп18 АБ, У1кеп, 8\\'е4еп). Принцип такого измерения основан на отражении ультразвука, измеренного при помощи датчика вокруг вращающегося хлеба. Время измерения составляло 45 с.
Липкость теста и растяжимость оценили при помощи квалифицированного пекаря, используя шкалу, изображенную в табл. 5. Измеряли среднее значение 2 батонов на один объект.
После таких тестов куски теста округлили и первое брожение проводили в течение 45 мин при 30°С и после этого тесто обмяли, отформовали, приготовили и поставили для брожения в течение 75 мин при 30°С. Относительная влажность во время брожения составляла 85%.
Затем оценили стабильность теста после брожения при помощи наличия пузырьков, корочки с оборванными краями и нерегулярных кривых поверхностей корочки. Куски теста выпекали в течение 20 мин при 225°С. Объемы батонов определили способом ΒνΜ-3: в таблице представлены средние значения 2 хлебов, которые выпекали как один объект.
Структуру хлебного мякиша оценили при помощи профессионального пекаря, используя шкалу, изображенную в табл. 5. После хранения батонов в течение 3 дней в полиэтиленовых сумках при комнатной температуре измерили твердость хлебного мякиша, используя 81еуепз анализатор текстуры. Два ломтика толщиной 2 см из центра каждого батона проанализировали анализатором текстуры, используя пробу диаметром 1,5 дюйма, глубиной давления 5 мм (25%) и скоростью давления 0,5 мм/с. В таблице показано среднее значение двух измерений.
Цвет корочки оценивали при помощи профессионального пекаря согласно шкале, изображенной в табл. 5. В качестве контроля использовали стандартный рецепт хлеба с датской формой для выпечки.
Цвет хлебного мякиша оценивали при помощи профессионального пекаря согласно оценке, изображенной в табл. 5. Цвет хлебного мякиша контрольного хлеба оценили как норму (3). В качестве положительного контроля батоны 2 объектов использовали с одной и той же композицией как контроль плюс 0,5% соевая мука. Процедуры брожения и выпечки такие же как и для контроля без соевой муки. Последний оценили как отличный.
Нависающую верхушку хлеба оценивали путем нависания верхушки относительно формы для выпечки, более нижние кромки верхушки - более низкая оценка. Меньше нависания, более лучшая оценка.
Черствление хлеба оценили путем ощущения твердости хлебного мякиша ломтиков хлеба. Перед нарезкой ломтиков хлеб хранили в пластиковой сумке при комнатной температуре в течение 4 дней. Более мягкий хлебный мякиш ломтиков имеет более лучшую оценку.
- 29 008007
Таблица 6
| Липолитический | Параметр |
| фермент | Объем (%) | Липкость теста | Растяжимость теста | Устойчивость теста | Структура хлебного мякиша | Цвет корочки | Цвет хлебного мякиша | Нависание верхушки | черствление |
| ΝΒΕ028 | 100 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 3 | 4 |
| ΝΒΕ029 | 104 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ030 | 107 | 3 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ031 | 102 | 3 | 2 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | 4 |
| ΝΒΕ032 | 98 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ033 | 105 | 3 | 2 | 4 | 2 | 4 | 3 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ034 | 104 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ036 | 100 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ038 | 109 | 3 | 3 | 4 | 5 | 4 | 4 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ039 | 109 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 4 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ043 | 106 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ045 | 110 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 |
| ΝΒΕ042 | 110 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 3 | 3 |
Пример 5. Эксперименты 2 хлебопечения - батард
Хлебопекарные качества липолитических ферментов согласно настоящему изобретению протестировали с французским типом хлеба, называемым батард. Приготовление батардов в стандартном процессе хлебопечения было осуществлено путем смешивания 3000 г белой муки при примерно 20°С. 70 г прессованных дрожжей, 60 г соли, 68 ч./млн аскорбиновой кислоты, 30 ч./млн Ваке7уте® Н82000 (грибковая гемицеллюлоза), 7 ч./млн Ваке7уте® Р500 (грибковая α-амилаза) и 1680 мл воды (8-10°С) в спиральном миксере (Оюкпа:2 мин со скоростью 1; 100 Вт-ч подавали при скорости 2). Температура теста составляла 27°С. Механически обработанное тесто проанализировали вручную при помощи профессионального пекаря. Тесто подвергли 15-минутной проверке на увеличение объема в герметичном шкафу при 32°С и 90% влажности. Позже тесто разделили на 6 кусков по 350 г, раскатали и поставили для брожения в течение 15 мин при 32°С и 90% влажности. В конце этого периода куски теста отформовали, придали форму и последний раз поставили тесто для брожения на 90 мин при 32°С и 90% влажности. Полностью подошедшее тесто разрезали по длине кусков теста и выпекали в печи при 240°С в течение 30 мин в присутствии пара. После остывания до комнатной температуры объемы батонов определили ВVМ способом (см. пример 4).
Разламывание, разрезание и форму батонов проанализировали сразу после остывания до комнатной температуры при помощи профессионального пекаря, используя оценку в табл. 7. После 16 ч (всю ночь) хранения в закрытом ящике при комнатной температуре проанализировали качество хлебного мякиша при помощи профессионального пекаря. Оценку батонов (табл. 8) получали от 1 объекта.
- 30 008007
Таблица 7
| Эффект | Оценка | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | ||
| Разламывание, разрезание | Очень рыхлый и мягкий | Рыхлый и мягкий | Контрольный хлеб | Тонкая и хрустящая корочка Устойчиво идущий разрез | Корочка слишком тонкая, слишком твердая | |
| Структура хлебного мякиша | бедная | Не однородная | Контрольный хлеб | хорошая | отличная | |
| форма | высота | плоская | средняя | Контрольный хлеб | Выше, чем (3) | Гораздо выше, чем (3) |
| бороздка | бороздка закрыта | бороздка закрыта | Контрольный хлеб | Полностью открыта | Полностью открыта; рваная |
Таблица 8. Выполнение хлебопечения липолитическими ферментами настоящего изобретения
| Липолитиче ский | Параметр |
| фермент | Дозирование* | Объем батона (%) | Разламывание& разрезание | Форма | Структура хлебного мякиша |
| нет | 0 | 100 | 3 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ028 | 0,75 | 3 | 4 | 4 | 4 |
| ΝΒΕ030 | 3 | 103 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ031 | 2,5 | 95 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ036 | Νϋ | 88 | 3 | 3 | 3 |
| ΝΒΕ038 | 30 | 100 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ039 | 64 | 126 | 3 | 4 ' | 3 |
| ΝΒΕ045 | Νϋ | 89 | 4 | 4 | 3 |
| ΝΒΕ042 | 12 | 98 | 3 | 4 | 4 |
* в ч./млн, основанном на весе муки и весе фермента, определенном А280 способом.
Claims (24)
1. Выделенный полинуклеотид, гибридизуемый с полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из 8Е0 ГО N0:10, 11.
2. Выделенный полинуклеотид по п.1, гибридизуемый в жестких условиях с полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из 8Е0 ГО N0:10, 11.
3. Выделенный полинуклеотид по п.1 или 2, получаемый из мицельного гриба.
4. Выделенный полинуклеотид по п.3, получаемый из АзрегдШиз шдег.
5. Выделенный полинуклеотид, кодирующий полипептид, содержащий аминокислотную последовательность 8Е0 ГО N0: 12 или ее функциональный эквивалент.
6. Выделенный полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один функциональный домен полипептида 8Е0 ГО N0:12 или его функционального эквивалента.
7. Выделенный полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8Е0 ГО N0:10, 11 или их функциональных эквивалентов.
- 31 008007
8. Выделенный полинуклеотид, выбранный из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0:10, 11.
9. Вектор, содержащий полинуклеотидную последовательность по пп.1-8.
10. Вектор по п.9, в котором упомянутая полинуклеотидная последовательность по пп.1-8 оперативно связана с регуляторными последовательностями, подходящими для экспрессии упомянутой полинуклеотидной последовательности в подходящей клетке-хозяине.
11. Вектор по п.10, в котором упомянутая подходящая клетка-хозяин является мицельным грибом.
12. Способ получения полинуклеотида по пп.1-8 или вектора по пп.9-11, включающий этапы культивирования клетки-хозяина, трансформированной указанным полинуклеотидом или упомянутым вектором, выделения указанного полинуклеотида или указанного вектора из клетки-хозяина.
13. Выделенный липолитический фермент с последовательностью 8Е0 ΙΌ N0:12 или ее функциональный эквивалент.
14. Выделенный липолитический фермент по п.13, полученный из АкрегдШик шдег.
15. Выделенный липолитический фермент, полученный путем экспрессии полинуклеотида по пп.18 или вектора по пп.9-11 в подходящей клетке-хозяине, например АкрегдШик шдег.
16. Рекомбинантный липолитический фермент, содержащий функциональный домен любого из липолитических ферментов по пп.13-15.
17. Способ получения липолитического фермента по пп.13-16, включающий этапы трансформации подходящей клетки-хозяина выделенным полинуклеотидом по пп.1-8 или вектором по пп.9-11, культивирования указанной клетки в условиях, позволяющих экспрессию указанного полинуклеотида, и необязательно очищения кодируемого полипептида из упомянутой клетки или культуральной среды.
18. Рекомбинантная клетка-хозяин, содержащая полинуклеотид по пп.1-8 или вектор по пп.9-11.
19. Рекомбинантная клетка-хозяин, экспрессирующая липолитический фермент по пп.13-16.
20. Очищенные антитела, реагирующие с липолитическим ферментом по пп.13-16.
21. Слитый белок, содержащий последовательность липолитического фермента по пп.13-16.
22. Способ получения теста, содержащего добавление липолитического фермента по любому из пп.13-16.
23. Способ получения печеного изделия из теста, приготовленного способом по п.22.
24. Применение липолитического фермента по любому из пп.13-16 для получения теста и/или печеного изделия из этого теста.
- 32 008007
Список последовательностей <110> ϋ3Μ ΙΡ АззеЪз Β.ν.
<120> НОВЫЕ ЛИПАЗЫ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ <130> 2Ю78ИО <160> 39 <170> РаЕепЫп уегзхоп 3.1 <210> 1 <211> 3728 <212> ДНК <213> АзрегдШив птдег <400> 1
- 33 008007
- 34 008007 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пхдег <220>
<221> СДЗ <222> (1)..(1749) <400> 2
- 35 008007
180 185 190
405 410 415
- 36 008007
580 <210> 3 <211> 582 <212> БЕЛОК <213> АзрегдШиз пЬдег <400> 3
Мек А1а Бег А1а Ьеи Ьеи Тгр Ьеи Зег Ьеи Ьеи С1у 61у Зег ТЬг Ьеи
15 10 15
37 008007
- 38 008007
Не Азп ТЬг 11е Уа1 Агд
580 <210> 4 <211> 3853 <212> ДНК <213> АзрегдШиз п!дег
- 39 008007
- 40 008007
<210> 5 <211> 1743 <212> ДНК <213> Азрегд±11из пхдег <220>
<221> СДЗ <222> (1)..(1743) <400> 5
- 41 008007
- 42 008007
- 43 008007
530 535 540
1680
1728
1743
<400> 6
- 44 008007
530 535 540
- 45 008007
565 570 575
А1а Ηί3 Тгр Тгр
580 <210> 7 <211> 2769 <212> ДНК <213> АзрегдШиз птдег <400> 7
- 46 008007
<210> 8
Ο Ί 1 ч. 1 СОО + 4.11+ ± υζ. -э <212> ДНК <213> АзрегдШиз птдег <220>
<221> СДЗ <222> (1)..(1623) <400> 8
- 47 008007
- 48 008007
290 295 300
- 49 008007
<210> 9 <211> 540 <212> БЕЛОК <213> АзрегдШиз пидег
50 008007
530 535 540 <210> 10 <211> 3235 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пЬдег
- 51 008007 <400> 10
- 52 008007
<220>
<221> СЬЗ <222> (1)..(1689) <400> 11
- 53 008007
- 54 008007
325 330 335
- 55 008007 сас аЬс Еда
Нхз 11е
1689 <210> 12 <211> 562 <212> БЕЛОК <213> АзрегдхНиз пхдег <400> 12
- 56 008007
ΗΪ3 Не <210> 13 <211> 2097 <212> ДНК
- 57 008007 <213> АзрегдШиз пБдег <400> 13
<210> 14 <211> 834 <212> ДНК
- 58 008007 <213> АзрегдШиз пЬдег <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(834) <400> 14
- 59 008007
275 <210> 15 <211> 277 <212> БЕЛОК <213> АзрегдШиз пддег <400> 15
- 60 008007
С1у Зег Рго 61у Агд
275 <210> 16 <211> 1881 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пгдег <400> 16
- 61 008007
<220>
<221> СР5 <222> (1) . . (1257) <400> 17
- 62 008007
- 63 008007
1257 дЬЬ ЬаЬ Гад
Уа1 Туг <210> 18 <211> 418 <212> БЕЛОК <213> АзрегдШиз пЬдег <400> 18
- 64 008007
Уа1 Туг <210> 19
- 65 008007 <211> 2809 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пЬдег <400> 19
- 66 008007
<210> 20 <211> 1413 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <220>
<221> СЬЗ <222> (1)..(1413) <400> 20
- 67 008007
- 68 008007
<400> 21
69 008007
- 70 008007
<210> 22 <211> 3328 <212> ДНК <213> АзрегдЬНиз пЬдег <400> 22
- 71 008007
<210> 23 <211> 1779 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пхдег <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(1779) <400> 23
- 72 008007
- 73 008007
- 74 008007
465 470 475 480
580 5В5 590 кда
1779 <210> 24 <211> 592 <212> БЕЛОК <213> АзрегдШиз птдег <400> 24
- 75 008007
- 76 008007
580 585 590 <210> 25 <211> 3932 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <400> 25
- 77 008007
- 78 008007
<210> 26 <211> 1518 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пхдег <220>
<221> СЭЗ <222> (1)..(1518) <400> 26
- 79 008007
- 80 008007
355 360 365
500 505 <210> 27 <211> 505 <212> БЕЛОК <213> АзрегдШиз пЬдег <400> 27
81 008007
50 55 60
- 82 008007
<210> 28 <211> 3091 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <400> 28
- 83 008007
<210> 29 <211> 1617 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <220>
<221> СОЗ <222> (1) . . (1617) <400> 29
- 84 008007
- 85 008007
- 86 008007
<400> 30
- 87 008007
145 150 155 160
- 88 008007
<210> 31 <211> 4575 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <400> 31
- 89 008007
- 90 008007
<210> 32 <211> 1695 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <220>
<221> СЬЗ <222> (1)..(1695) <400> 32
- 91 008007
130 135 140
- 92 008007
А1а Туг С1п Агд <210> 33 <211> 564 <212> БЕЛОК
- 93 008007 <213> АзрегдШиз пидег <400> 33
- 94 008007
А1а Туг ΘΙη Агд <210> 34 <211> 2371 <212> ДНК <213> АзрегдШиз птдег <400> 34 дсссРдаса! ддасдд!д!с адаРададас сдррддаадд сРдаассаса дддсасасдд60 сасдррдадд асссРдсаРд ссддРдРаРс сддаРааРдд садаРааРсс сддсРааРРд120 ддддсдасдд садсРасддс РсасаааРРд РдаРддааРа дасасддса! даРдРРРсаа180
РдаадсРсса аас!!!асад РдсРаддсРд РааасдРда! РаРааРсасд аРдРааРРда240
- 95 008007
<210> 35 <211> 789 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег
- 96 008007 <220>
<221> СБЗ <222> (1)..(789) <400> 35
97 008007
195 200 205
260
<400> 36
- 98 008007
5ег РЬе РЬе С1у С1у Ьеи
260 <210> 37 <211> 2981 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пидег <400> 37
- 99 008007
<210> 38 <211> 1686 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пЛдег <220>
<221> СЬЗ <222> (1)..(1686) <400> 38
- 100 008007
- 101 008007
245 250 255
- 102 008007
<400> 39
- 103 008007
- 104 008007
Агд
Applications Claiming Priority (13)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP02102170 | 2002-08-19 | ||
| EP02102169 | 2002-08-19 | ||
| EP02102168 | 2002-08-19 | ||
| EP02102179 | 2002-08-19 | ||
| EP02102171 | 2002-08-19 | ||
| EP02102183 | 2002-08-19 | ||
| EP02102178 | 2002-08-19 | ||
| EP02102174 | 2002-08-19 | ||
| EP02102173 | 2002-08-19 | ||
| EP02102181 | 2002-08-19 | ||
| EP02102176 | 2002-08-19 | ||
| EP02102172 | 2002-08-19 | ||
| PCT/EP2003/009145 WO2004018660A2 (en) | 2002-08-19 | 2003-08-15 | Novel lipases and uses thereof |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EA200500391A1 EA200500391A1 (ru) | 2005-08-25 |
| EA008007B1 true EA008007B1 (ru) | 2007-02-27 |
Family
ID=31951005
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| EA200601823A EA200601823A1 (ru) | 2002-08-19 | 2003-08-15 | Новые липазы и их применение |
| EA200500391A EA008007B1 (ru) | 2002-08-19 | 2003-08-15 | Новые липазы и их применение |
Family Applications Before (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| EA200601823A EA200601823A1 (ru) | 2002-08-19 | 2003-08-15 | Новые липазы и их применение |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US7550280B2 (ru) |
| EP (2) | EP1530630A2 (ru) |
| JP (1) | JP2005535352A (ru) |
| CN (1) | CN1675355A (ru) |
| AR (1) | AR042417A1 (ru) |
| AU (1) | AU2003270088A1 (ru) |
| CA (1) | CA2495198C (ru) |
| DK (1) | DK2338986T3 (ru) |
| EA (2) | EA200601823A1 (ru) |
| ES (1) | ES2527924T3 (ru) |
| MX (1) | MXPA05001978A (ru) |
| PL (2) | PL375355A1 (ru) |
| WO (1) | WO2004018660A2 (ru) |
Families Citing this family (26)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6936289B2 (en) | 1995-06-07 | 2005-08-30 | Danisco A/S | Method of improving the properties of a flour dough, a flour dough improving composition and improved food products |
| ATE331793T1 (de) | 1997-04-09 | 2006-07-15 | Danisco | Verwendung von lipase zur verbesserung von teigen und backwaren |
| WO2000005396A1 (en) | 1998-07-21 | 2000-02-03 | Danisco A/S | Foodstuff |
| WO2002094123A2 (en) | 2001-05-18 | 2002-11-28 | Danisco A/S | Method of preparing a dought with an enzime |
| PL375355A1 (en) * | 2002-08-19 | 2005-11-28 | Dsm Ip Assets B.V. | Novel lipases and uses thereof |
| US20050196766A1 (en) | 2003-12-24 | 2005-09-08 | Soe Jorn B. | Proteins |
| US7955814B2 (en) | 2003-01-17 | 2011-06-07 | Danisco A/S | Method |
| MXPA05007654A (es) | 2003-01-17 | 2005-09-30 | Danisco | Metodo. |
| US7906307B2 (en) | 2003-12-24 | 2011-03-15 | Danisco A/S | Variant lipid acyltransferases and methods of making |
| US7718408B2 (en) | 2003-12-24 | 2010-05-18 | Danisco A/S | Method |
| GB0716126D0 (en) | 2007-08-17 | 2007-09-26 | Danisco | Process |
| GB0405637D0 (en) | 2004-03-12 | 2004-04-21 | Danisco | Protein |
| CN101818177A (zh) | 2004-07-16 | 2010-09-01 | 丹尼斯科公司 | 脂肪分解酶及其在食品工业中的应用 |
| WO2006047469A2 (en) | 2004-10-21 | 2006-05-04 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having lipase activity and polynucleotides encoding same |
| CN101389644B (zh) * | 2006-02-23 | 2015-06-17 | 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 | 脂肪酶及其用途 |
| EP2405007B1 (en) | 2007-01-25 | 2013-12-04 | DuPont Nutrition Biosciences ApS | Production of a lipid acyltransferase from transformed Bacillus licheniformis cells |
| WO2008093720A1 (ja) | 2007-01-30 | 2008-08-07 | Mitsubishi-Kagaku Foods Corporation | グリセロ糖脂質リパーゼ |
| CN101960008B (zh) * | 2008-02-29 | 2016-04-13 | 诺维信公司 | 具有脂肪酶活性的多肽和编码该多肽的多核苷酸 |
| DK2387330T3 (en) | 2009-01-16 | 2018-02-05 | Dupont Nutrition Biosci Aps | ENZYMATIC GENERATION OF FUNCTIONAL LIPIDS OUT OF CORN CHLIDE EXTRACT |
| WO2010130622A1 (en) * | 2009-05-11 | 2010-11-18 | Dsm Ip Assets B.V. | Enzyme composition for the treatment of prancreatic insufficiency |
| KR101724614B1 (ko) * | 2014-05-27 | 2017-04-19 | 주식회사 제노포커스 | 신규 카탈라아제 신호서열 및 이를 이용한 카탈라아제 발현방법 |
| WO2018099965A1 (en) * | 2016-11-30 | 2018-06-07 | Novozymes A/S | Method of baking |
| AU2019360247A1 (en) * | 2018-10-17 | 2021-06-03 | Perfect Day, Inc. | Recombinant components and compositions for use in food products |
| CN119013412A (zh) | 2022-04-20 | 2024-11-22 | 诺维信公司 | 用于生产游离脂肪酸的方法 |
| EP4420520A1 (en) * | 2023-02-24 | 2024-08-28 | Green Spot Technologies | Panification with b-glucans, and laccase or peroxidase |
| CN117925570B (zh) * | 2023-12-18 | 2025-04-22 | 蚌埠学院 | 从羊胎盘中提取生物活性物质的方法 |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0687734A1 (fr) * | 1994-06-17 | 1995-12-20 | SOLVAY (Société Anonyme) | Système d'expression pour aspergillus foetidus |
| WO2000056762A2 (en) * | 1999-03-22 | 2000-09-28 | Novozymes Biotech, Inc. | Methods for monitoring multiple gene expression |
| WO2001027251A1 (en) * | 1999-10-14 | 2001-04-19 | Novozymes A/S | Lysophospholipase from aspergillus |
Family Cites Families (29)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4433092A (en) | 1981-03-09 | 1984-02-21 | Champion Spark Plug Company | Green ceramic of lead-free glass, conductive carbon, silicone resin and AlPO4, useful, after firing, as an electrical resistor |
| JPS6030488B2 (ja) | 1982-11-10 | 1985-07-17 | 協和醗酵工業株式会社 | 生地の改良剤およびそれを含有してなる生地 |
| JPS6078529A (ja) | 1983-10-07 | 1985-05-04 | 協和醗酵工業株式会社 | 生地 |
| EP0190205B1 (en) | 1984-07-24 | 1992-10-21 | Coselco Mimotopes Pty. Ltd. | Method for determining mimotopes |
| US4631211A (en) | 1985-03-25 | 1986-12-23 | Scripps Clinic & Research Foundation | Means for sequential solid phase organic synthesis and methods using the same |
| LU86128A1 (fr) | 1985-10-18 | 1987-06-02 | Vander Poorten Henri | Procede permettant l'impression ou le revetement de ceramique simultanement a son electroformage et conduisant en monocuisson a des produits decoratifs ou techniques |
| JPS62111629A (ja) | 1985-11-09 | 1987-05-22 | キユーピー株式会社 | ケ−キの製造方法 |
| US4704692A (en) | 1986-09-02 | 1987-11-03 | Ladner Robert C | Computer based system and method for determining and displaying possible chemical structures for converting double- or multiple-chain polypeptides to single-chain polypeptides |
| US4946778A (en) | 1987-09-21 | 1990-08-07 | Genex Corporation | Single polypeptide chain binding molecules |
| JPS63258528A (ja) | 1987-04-15 | 1988-10-26 | キユーピー株式会社 | スポンジケ−キの製造方法 |
| DE68927933T2 (de) | 1988-09-02 | 1997-08-14 | Dyax Corp | Herstellung und auswahl von rekombinantproteinen mit verschiedenen bindestellen |
| US5223409A (en) | 1988-09-02 | 1993-06-29 | Protein Engineering Corp. | Directed evolution of novel binding proteins |
| EP0426211B1 (en) | 1989-09-29 | 1993-11-24 | Unilever N.V. | Food product containing dried lyso-phospholipoprotein |
| US5427908A (en) | 1990-05-01 | 1995-06-27 | Affymax Technologies N.V. | Recombinant library screening methods |
| GB9015198D0 (en) | 1990-07-10 | 1990-08-29 | Brien Caroline J O | Binding substance |
| AU665190B2 (en) | 1990-07-10 | 1995-12-21 | Cambridge Antibody Technology Limited | Methods for producing members of specific binding pairs |
| DK0564531T3 (da) | 1990-12-03 | 1998-09-28 | Genentech Inc | Berigelsesfremgangsmåde for variantproteiner med ændrede bindingsegenskaber |
| DK1279731T3 (da) | 1991-03-01 | 2007-09-24 | Dyax Corp | Fremgangsmåde til udvikling af bindende miniproteiner |
| DK1471142T3 (da) | 1991-04-10 | 2009-03-09 | Scripps Research Inst | Heterodimere receptor-biblioteker under anvendelse af fagemider |
| DE4122599C2 (de) | 1991-07-08 | 1993-11-11 | Deutsches Krebsforsch | Phagemid zum Screenen von Antikörpern |
| ES2103538T3 (es) | 1993-03-31 | 1997-09-16 | Gist Brocades Nv | Formulacion de levadura para la preparacion de productos horneados. |
| US5480971A (en) | 1993-06-17 | 1996-01-02 | Houghten Pharmaceuticals, Inc. | Peralkylated oligopeptide mixtures |
| DK76893D0 (ru) | 1993-06-28 | 1993-06-28 | Novo Nordisk As | |
| DE69427632T2 (de) | 1993-12-24 | 2002-05-16 | Dsm N.V., Heerlen | Trockenhefe Zusammensetzungen |
| BE1008737A3 (fr) * | 1994-01-28 | 1996-07-02 | Solvay | Systeme d'expression, vecteur d'integration et cellule transformee par ce vecteur d'integration. |
| AR025320A1 (es) | 1999-08-17 | 2002-11-20 | Dsm Nv | Composicion liquida para mejorar el pan |
| ES2278800T3 (es) | 2000-09-28 | 2007-08-16 | Dsm Ip Assets B.V. | Composiciones liquidas mejoradoras del pan. |
| HUP0302513A3 (en) | 2000-12-20 | 2007-09-28 | Dsm Ip Assets Bv | Liquid yeast compositions |
| PL375355A1 (en) | 2002-08-19 | 2005-11-28 | Dsm Ip Assets B.V. | Novel lipases and uses thereof |
-
2003
- 2003-08-15 PL PL03375355A patent/PL375355A1/xx not_active Application Discontinuation
- 2003-08-15 CA CA2495198A patent/CA2495198C/en not_active Expired - Fee Related
- 2003-08-15 JP JP2004530194A patent/JP2005535352A/ja active Pending
- 2003-08-15 PL PL392183A patent/PL214792B1/pl not_active IP Right Cessation
- 2003-08-15 WO PCT/EP2003/009145 patent/WO2004018660A2/en not_active Ceased
- 2003-08-15 US US10/524,983 patent/US7550280B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2003-08-15 CN CNA038197421A patent/CN1675355A/zh active Pending
- 2003-08-15 MX MXPA05001978A patent/MXPA05001978A/es unknown
- 2003-08-15 EP EP03750417A patent/EP1530630A2/en not_active Withdrawn
- 2003-08-15 AU AU2003270088A patent/AU2003270088A1/en not_active Abandoned
- 2003-08-15 EP EP10174801.0A patent/EP2338986B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2003-08-15 AR ARP030102985A patent/AR042417A1/es not_active Application Discontinuation
- 2003-08-15 ES ES10174801.0T patent/ES2527924T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2003-08-15 EA EA200601823A patent/EA200601823A1/ru unknown
- 2003-08-15 DK DK10174801.0T patent/DK2338986T3/en active
- 2003-08-15 EA EA200500391A patent/EA008007B1/ru not_active IP Right Cessation
-
2009
- 2009-05-06 US US12/453,292 patent/US8216586B2/en not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0687734A1 (fr) * | 1994-06-17 | 1995-12-20 | SOLVAY (Société Anonyme) | Système d'expression pour aspergillus foetidus |
| WO2000056762A2 (en) * | 1999-03-22 | 2000-09-28 | Novozymes Biotech, Inc. | Methods for monitoring multiple gene expression |
| WO2001027251A1 (en) * | 1999-10-14 | 2001-04-19 | Novozymes A/S | Lysophospholipase from aspergillus |
Non-Patent Citations (9)
| Title |
|---|
| DATABASE EMBL 'Online! A. nidulans lipA gene 30 November 2000 (2000-11-30), BRITO A.G. ET AL.: "Aspergillus nidulans lipase (lipA) gene, where mutation confers resistance to undecanoic acid", XP002278120, retrieved from EBI accession no. AF315651, abstract * |
| DATABASE EMBL 'Online! Aspergillus niger EST. 20 September 2000 (2000-09-20), TSANG A. AND STORMS R.: "Aspergillus niger Expressed Sequence Tags", XP002278119, retrieved from EBI accession no. BE760259, abstract * |
| DATABASE GENESEQ 'Online! XP002280788, retrieved from EBI accession no. AAF11551, abstract & WO 0056762 A2 (NOVONORDISK AS; NOVONORDISK BIOTECH INC (US)), 28 September 2000 (2000-09-28), page 1793, claim 87 * |
| DATABASE UNIPROT 'Online! 1 June 2003 (2003-06-01), BRITO A.G. ET AL.: "Apergillus nidulans triacylglycerol lipase (lipA) gene, wild type allele", XP002278118, retrieved from EBI accession no. Q876R3, abstract * |
| DATABASE UNIPROT 'Online! Lipase 2 precursor (EC 3.1.1.3), Candida rugosa, 1 October 1993 (1993-10-01), XP002278121, retrieved from EBI accession no. P32946, abstract * |
| DATABASE UNIPROT 'Online! Lipase 5 precursor (EC 3.1.1.3), Candida rugosa, 1 October 1993 (1993-10-01), XP002278122, retrieved from EBI accession no. P32949 abstract * |
| NAMBOODIRI V. M. ET AL.: "Purification and biochemical characterization of a novel thermostable lipase from Aspergillus niger", LIPIDS. UNITED STATES, MAY 2000, vol. 35, no. 5, May 2000 (2000-05), pages 495-502, XP009029850, ISSN: 0024-4201, abstract, page 495, page 498, right-hand column, line 5-line 10 * |
| SUGIHARA A. ET AL.: "PURIFICATION AND CHARACTERIZATION OF ASPERGILLUS-NIGER LIPASE", AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, vol. 52, no. 6, 1988, pages 1591-1592, XP009029849, ISSN: 0002-1369, page 1591, left-hand column, line 1-line 10, page 1592, left-hand column, line 3-line 4, page 1592, left-hand column, line 11-line 12 * |
| TOROSSIAN K. ET AL.: "PURIFICATION AND CHARACTERIZATION OF AN ACID-RESISTANT TRIACYLGLYCEROL LIPASE FROM ASPERGILLUS-NIGER", BIOTECHNOLOGY AND APPLIED BIOCHEMISTRY, vol. 13, no. 2, 1991, pages 205-211, XP009029851, ISSN: 0885-4513, abstract, page 207, line 1-line 3, page 210, line 20-line 21 * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CA2495198A1 (en) | 2004-03-04 |
| MXPA05001978A (es) | 2005-04-28 |
| US20090232936A1 (en) | 2009-09-17 |
| US8216586B2 (en) | 2012-07-10 |
| CN1675355A (zh) | 2005-09-28 |
| EP2338986A1 (en) | 2011-06-29 |
| EP2338986B1 (en) | 2014-10-29 |
| JP2005535352A (ja) | 2005-11-24 |
| WO2004018660A2 (en) | 2004-03-04 |
| DK2338986T3 (en) | 2015-01-19 |
| EA200601823A1 (ru) | 2007-02-27 |
| PL214792B1 (pl) | 2013-09-30 |
| EA200500391A1 (ru) | 2005-08-25 |
| ES2527924T3 (es) | 2015-02-02 |
| AU2003270088A1 (en) | 2004-03-11 |
| PL375355A1 (en) | 2005-11-28 |
| CA2495198C (en) | 2014-03-11 |
| US20060281080A1 (en) | 2006-12-14 |
| AR042417A1 (es) | 2005-06-22 |
| US7550280B2 (en) | 2009-06-23 |
| WO2004018660A3 (en) | 2004-10-28 |
| EP1530630A2 (en) | 2005-05-18 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EA008007B1 (ru) | Новые липазы и их применение | |
| US7838274B2 (en) | Phospholipases and uses thereof | |
| AU753578B2 (en) | Carbohydrate oxidase and use thereof in baking | |
| CN106929494B (zh) | 产生gh8木聚糖酶变体的方法 | |
| JP2012527230A (ja) | 使用 | |
| EA015172B1 (ru) | Новые липазы и их применение | |
| WO2004018662A2 (en) | Cellulases and hemicellulases and uses thereof | |
| WO2011009747A1 (en) | Carbohydrate oxidases | |
| US7060474B1 (en) | Carbohydrate oxidase and use thereof in baking | |
| RU2380414C2 (ru) | Белок | |
| ZA200500794B (en) | Novel lipases and uses thereof |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s) |
Designated state(s): RU |