DE3751468T2 - METHOD FOR PRODUCING OLIGONUCLEOTIDES AND COMPOUNDS FOR FORMING HIGH-MOLECULAR PROTECTION GROUPS. - Google Patents
METHOD FOR PRODUCING OLIGONUCLEOTIDES AND COMPOUNDS FOR FORMING HIGH-MOLECULAR PROTECTION GROUPS.Info
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Description
Die vorliegende Erfindung bezieht sich auf ein Verfahren zur Synthese eines Oligonucleotides mit einer gemäß der Bindung in Nucleinsäure durch Kondensieren eines Nucleotides oder Oligonucleotides erweiterten Kette. Spezieller bezieht sich die vorliegende Erfindung auf ein Verfahren zur Synthese eines kettenerweiterten Oligonucleotides durch Kondensieren eines Nucleotides oder Oligonucleotides mit einer darin eingebrachten Schutzgruppe mit hohem Molekulargewicht, bei dem die Durchführung der Kondensationsreaktion in dem homogenen System sowie die Trennung und Reinigung in dem heterogenen System möglich ist und bei dem ein Produkt mit hoher Reinheit bei hoher Raum-Zeit-Ausbeute erzielbar ist.The present invention relates to a method for synthesizing an oligonucleotide having a chain extended according to the bond in nucleic acid by condensing a nucleotide or oligonucleotide. More specifically, the present invention relates to a method for synthesizing a chain extended oligonucleotide by condensing a nucleotide or oligonucleotide having a high molecular weight protecting group introduced therein, in which the condensation reaction can be carried out in the homogeneous system and the separation and purification can be carried out in the heterogeneous system and a product of high purity can be obtained at a high space-time yield.
Des weiteren bezieht sich die vorliegende Erfindung auf eine Verbindung zum Bilden einer polymeren Schutzgruppe, die zur Synthese des oben erwähnten Oligonucleotides und zur Synthese von Nucleinsäure, Oligosacchariden und Polysacchariden nützlich ist.Furthermore, the present invention relates to a compound for forming a polymeric protecting group useful for the synthesis of the above-mentioned oligonucleotide and for the synthesis of nucleic acid, oligosaccharides and polysaccharides.
Nucleinsäure besitzt eine Struktur, in der viele Hydroxylgruppen an speziellen Stellen der Saccharidkomponente des Nucleotides über eine Diestergruppe von Phosphorsäure verbunden sind, das heißt eine Struktur, in der alkoholische Hydroxylgruppen von Nucleotid- und Phosphorsäuregruppen sequentiell über Esterbrücken verbunden sind. Demgemäß können die folgenden zwei Verfahren zum Kondensieren von zwei Nucleotiden gemäß der Bindung in Nucleinsäure gewählt werden:Nucleic acid has a structure in which many hydroxyl groups at specific sites of the saccharide component of the nucleotide are bonded via a diester group of phosphoric acid, that is, a structure in which alcoholic hydroxyl groups of nucleotide and phosphoric acid groups are sequentially bonded via ester bridges. Accordingly, the following two methods for condensing two nucleotides can be selected according to the bond in nucleic acid:
(a) das Verfahren. bei dem eine 3'- oder 2'-Phosphorsäuregruppe mit einer 5'-Hydroxylgruppe kondensiert wird;(a) the process in which a 3'- or 2'-phosphoric acid group is condensed with a 5'-hydroxyl group;
(b) das Verfahren, bei dem eine 3'- oder 2'-Hydroxylgruppe mit einer 5'-Phosphorsäuregruppe kondensiert wird.(b) the process in which a 3'- or 2'-hydroxyl group is condensed with a 5'-phosphoric acid group.
Da die Phosphorsäuregruppe voluminös ist und die 5-Hydroxylgruppe aus einem primären Alkohol besteht und einen relativ hohen Freiheitsgrad besitzt und da die 3ro - und 2'-Hydroxylgruppen aus einem sekundären Alkohol bestehen und nahe beieinander liegen, ist das Verfahren (a) das vorteilhafteste der zwei oben erwähnten Verfahren.Since the phosphoric acid group is bulky and the 5-hydroxyl group consists of a primary alcohol and has a relatively high degree of freedom and since the 3ro - and 2'-hydroxyl groups consist of a secondary alcohol and are close to each other, process (a) is the most advantageous of the two processes mentioned above.
Das Verfahren (a) wird ferner nach der Art der Kondensationsreaktion in das Diester- Verfahren, das Triester-Verfahren, das Phosphit-Verfahren und das H-Phosphonat-Verfahren unterteilt. Im Hinblick auf die Reaktionsausbeute, die Stabilität des Zwischenprodukts, die Reaktionsrate und die Leichtigkeit der Reinigung des Produkts werden das Triester-Verfahren und das Phosphit-Verfahren als relativ vorteilhaft angesehen.The process (a) is further divided into the diester process, the triester process, the phosphite process and the H-phosphonate process according to the type of condensation reaction. In view of the reaction yield, the stability of the intermediate, the reaction rate and the ease of purification of the product, the triester process and the phosphite process are considered to be relatively advantageous.
Die Reaktion des Triester-Verfahrens kann durch die folgende Formel (1) ausgedrückt werden: kondensierendes AgensThe reaction of the triester process can be expressed by the following formula (1): condensing agent
In Formel (1) stehen B&sub1; und B&sub2; für eine Basen-Komponente, bei der die Aminogruppe geschützt ist, R&sub1; steht für eine Schutzgruppe für die Hydroxylgruppe, R&sub2; und R&sub4; stehen für Wasserstoff im Fall von Desoxyribonucleotid oder eine geschützte Hydroxylgruppe im Fall von Ribonucleotid, und R&sub3; sowie R&sub5; stehen für eine Schutzgruppe für die Phosphorsäuregruppe.In formula (1), B₁ and B₂ represent a base moiety in which the amino group is protected, R₁ represents a protecting group for the hydroxyl group, R₂ and R₄ represent hydrogen in the case of deoxyribonucleotide or a protected hydroxyl group in the case of ribonucleotide, and R₃ and R₅ represent a protecting group for the phosphoric acid group.
Nach der oben erwähnten Reaktion zur Bildung von Triester werden die Schutzgruppen für die funktionellen Gruppen entfernt, um das angestrebte Produkt zu erhalten. Im allgemeinen besteht kein großer Unterschied in der Löslichkeit oder dergleichen des Reaktionsprodukts, der nicht reagierten Substanz und des Nebenprodukts, und daher ist es nicht immer leicht, sie zu trennen und zu reinigen.After the above-mentioned reaction to form triester, the protective groups for the functional groups are removed to obtain the desired product. In general, there is no great difference in the solubility or the like of the reaction product, unreacted substance and by-product, and therefore it is not always easy to separate and purify them.
Zur Erleichterung dieser Trennung und Reinigung wurden mehrere Verfahren dahingehend vorgeschlagen, daß Unterschiede in den physikalischen Eigenschaften der Reaktionsprodukte durch Verwendung von Verbindungen mit hohem Molekulargewicht als der Verbindung, die eine Schutzgruppe für die funktionelle Gruppe bildet, bewirkt werden. Wenn die Verbindung mit einer polymeren Schutzgruppe unter den Reaktionsbedingungen fest ist oder nach der Reaktion als ein Feststoff erhältlich ist, kann das angestrebte Produkt ohne weiteres durch Filtration und Waschen getrennt und zurückbehalten werden.To facilitate this separation and purification, several methods have been proposed to bring about differences in the physical properties of the reaction products by using high molecular weight compounds as the compound forming a protecting group for the functional group. If the compound having a polymeric protecting group is solid under the reaction conditions or is available as a solid after the reaction, the desired product can be easily separated and retained by filtration and washing.
Die Stelle zur Bildung von R&sub5; in Formel (1) wird als diejenige Stelle angesehen, mit welcher die polymere Schutzgruppe verbunden wird, und es wurde über die Verwendung eines vernetzten Polystyrol- oder Silicagels, dessen funktionelle Gruppe als R&sub5; hiermit verbunden ist, berichtet [V.A. Efimov et al., Nucleic Acid Res. 11, 8369 (1983)]. Das durch Binden einer polymeren Schutzgruppe, wie oben erwähnt, an die endständige Phosphorsäuregruppe gebildete Oligonucleotid ist fest, und eine Reihe von Festphasen- Verfahrenstechniken ist etabliert. Im Gegensatz dazu wird das Verfahren, bei dem die durch Formel (1) dargestellte Kondensationsreaktion in einer homogenen Lösung ausgeführt wird, als das Flüssigphasenverfahren bezeichnet. In Verbindung mit dem Diester-Verfahren wurde die Verwendung von Polyvinylalkohol [H. Scott et al., Makromolekular Chemie, 173, 247 (1973)], Polyethylenglycol [H. Kosler, Tetrahedron Letters, Nr. 16, 1535 (1972)], Polystyrol [H. Hayatsu, H. G. Kohorana, J. Am. Chem. Soc., 88 3182 (1966)] und Vinylalkohol/Polyvinylpyrrolidoncopolymer [H. Seliger, G. Aumamann, Tetrahedron Letters, Nr. 31, 2911(1973)] als der Verbindung zur Bildung einer polymeren Schutzgruppe vorgeschlagen. Wenn diese in Lösungsmittel löslichen Polymere verwendet werden, wird das Verfahren als ein Flüssigphasenverfahren betrachtet, in diesem Fall ist es jedoch nicht leicht, das Reaktionsprodukt zu separieren und zu reinigen.The site for forming R5 in formula (1) is considered to be the site to which the polymeric protecting group is bonded, and the use of a cross-linked polystyrene or silica gel having its functional group bonded thereto as R5 has been reported [V.A. Efimov et al., Nucleic Acid Res. 11, 8369 (1983)]. The oligonucleotide formed by bonding a polymeric protecting group as mentioned above to the terminal phosphoric acid group is solid, and a number of solid-phase processing techniques have been established. In contrast, the method in which the condensation reaction represented by formula (1) is carried out in a homogeneous solution is called the liquid-phase method. In conjunction with the diester method, the use of polyvinyl alcohol [H. Scott et al., Macromolecular Chemistry, 173, 247 (1973)], polyethylene glycol [H. Kosler, Tetrahedron Letters, No. 16, 1535 (1972)], polystyrene [H. Hayatsu, H. G. Kohorana, J. Am. Chem. Soc., 88 3182 (1966)] and vinyl alcohol/polyvinylpyrrolidone copolymer [H. Seliger, G. Aumamann, Tetrahedron Letters, No. 31, 2911(1973)] have been suggested as the compound for forming a polymeric protecting group. When these solvent-soluble polymers are used, the process is considered as a liquid phase process, but in this case it is not easy to separate and purify the reaction product.
Die vorliegende Erfindung beabsichtigt, ein Verfahren zur Synthese eines kettenerweiterten Oligonucleotides gemäß dem Triester-Verfahren oder dem Phosphit-Verfahren bereitzustellen, bei denen eine Trennung und Reinigung des angestrebten Produkts leicht ausgeführt und das angestrebte Produkt mit hoher Reinheit in einer hohen Ausbeute erzielt werden kann.The present invention intends to provide a process for synthesizing a chain-extended oligonucleotide according to the triester method or the phosphite method, in which separation and purification of the desired product can be easily carried out and the desired product with high purity can be obtained in a high yield.
Gemäß der vorliegenden Erfindung wird ein Verfahren zur Synthese eines kettenerweiterten Oligonucleotides bereitgestellt, welches das Kondensieren eines Mononucleotides, eines Oligonucleotides, eines Mononucleotid-Succinates oder eines Oligonucleotid- Succinates in einem homogenen System in einem Lösungsmittel, wobei lediglich die endständige 5'-Hydroxylgruppe nicht blockiert ist und die anderen funktionellen Gruppen durch eine Mehrzahl von Schutzgruppen mit niedrigem Molekulargewicht sowie eine Schutzgruppe, die eine Hydroxylgruppe enthält, blockiert sind, mit einem Mononucleotid oder Oligonucleotid beinhaltet, bei dem die funktionellen Gruppen außer der endständigen Phosphorsäuregruppe durch Schutzgruppen mit niedrigem Molekulargewicht blockiert sind, dadurch gekennzeichnet, daß die Schutzgruppe, welche die Hydroxylgruppe enthält, ein Polysaccharidderivat ist, das in dem Lösungsmittel steuerbar löslich ist, wobei die Verbindung, welche die Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat bildet, durch Anbinden eines Abstandshalters und einer funktionellen Gruppe an ein Polysaccharidderivat gebildet wird.According to the present invention, there is provided a process for synthesizing a chain-extended oligonucleotide, which comprises condensing a mononucleotide, an oligonucleotide, a mononucleotide succinate or an oligonucleotide succinate in a homogeneous system in a solvent, wherein only the terminal 5'-hydroxyl group is not blocked and the other functional groups are blocked by a plurality of low molecular weight protecting groups and a protecting group containing a hydroxyl group, with a mononucleotide or oligonucleotide in which the functional groups other than the terminal phosphoric acid group are blocked by low molecular weight protecting groups, characterized in that the protecting group containing the hydroxyl group is a polysaccharide derivative which is controllably soluble in the solvent, wherein the compound forming the protecting group from the polysaccharide derivative is formed by attaching a spacer and a functional group to a polysaccharide derivative.
Des weiteren wird gemäß der vorliegenden Erfindung eine Verbindung zur Bildung einer Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat bereitgestellt, die durch die folgende allgemeine Formel (I) dargestellt wird: Further, according to the present invention, there is provided a compound for forming a protective group from the polysaccharide derivative, which is represented by the following general formula (I):
wobei C&sub6;H&sub7;O&sub2; für einen wasserfreien Glucoserest steht, R für where C�6H�7O₂ is an anhydrous glucose residue, R is
steht, n eine ganze Zahl zwischen 10 und 2.000, x eine Zahl zwischen 0,4 und 0,8 und y eine Zahl zwischen 1,0 und 2,0 ist.n is an integer between 10 and 2,000, x is a number between 0.4 and 0.8, and y is a number between 1.0 and 2.0.
Fig. 1 ist ein Chromatogramm, das durch eine Umkehrphasen-Hochleistungsflüssigkeitschromatographie eines Oligonucleotides (Undecamer vom RNA- Typ), von dem die Schutzgruppen vollständig entfernt wurden, erzielt wurde, erhalten in einem Beispiel (Beispiel 9) der vorliegenden Erfindung;Fig. 1 is a chromatogram obtained by reverse-phase high performance liquid chromatography of an oligonucleotide (RNA type undecamer) from which the protecting groups were completely removed obtained in an example (Example 9) of the present invention;
Fig. 2 ist ein Chromatogramm, das dadurch erzielt wurde, daß ein gereinigtes Produkt des in Fig. 1 gezeigten Oligonucleotides erneut einer Chromatographie unterzogen wurde;Fig. 2 is a chromatogram obtained by re-chromatographing a purified product of the oligonucleotide shown in Fig. 1;
Fig. 3 ist ein Chromatogramm, das durch Umkehrphasen-Hochleistungsflüssigkeitschromatographie eines Oligonucleotides (Octamer vom DNA-Typ), von dem die Schutzgruppen vollständig entfernt wurden, erzielt wurde, erhalten in einem Beispiel (Beispiel 15) der vorliegenden Erfindung; undFig. 3 is a chromatogram obtained by reverse-phase high performance liquid chromatography of an oligonucleotide (DNA type octamer) from which the protecting groups were completely removed, obtained in an example (Example 15) of the present invention; and
Fig. 4 ist ein Chromatogramm, das dadurch erzielt wurde, daß ein gereinigtes Produkt des in Fig. 3 gezeigten Oligonucleotides erneut einer Chromatographie unterzogen wurde;Fig. 4 is a chromatogram obtained by re-chromatographing a purified product of the oligonucleotide shown in Fig. 3;
Die Verbindung zur Bildung einer Schutzgruppe aus einem Polysaccharidderivat, wie sie in der vorliegenden Erfindung verwendet wird, ist in einem herkömmlichen Lösungsmittel für ein Oligonucleotid und ein durch eine Schutzgruppe mit niedrigem Molekulargewicht blockiertes Oligonucleotid löslich, und wenn in dieses herkömmliche Lösungsmittel ein Nichtlösungsmittel zu einer Lösung hinzugegeben wird, kann die Verbindung teicht ausgefällt und separiert werden. Verbindungen zur Bildung einer Schutzgruppe aus einem Polysaccharidderivat, die zur Erfüllung der Aufgabe der vorliegenden Erfindung geeignet sind, können von Polysacchariden abgeleitet werden. Schutzgruppenbildende Verbindungen, die unter Verwendung von Acetylcellulose mit einem geringen Grad an Acetylierung, eines Mischcelluloseesters, der aus Acetylcellulose und Propionylcellulose zusammengesetzt ist, oder eines Mischcelluloseesters erzeugt werden, der aus Acetylcellulose und Butyrylcellulose zusammengesetzt ist, sind besonders nützlich. Um eine schutzgruppenbildende Verbindung durch Modifizieren eines Polysaccharidderivats, zum Beispiel Acetylcellulose, herzustellen, wird vorzugsweise eine Hydroxyethylsulfonylgruppe als die funktionelle Gruppe eingebracht, welche die Phosphorsäuregruppe blockiert. Die-OH-Gruppe der Hydroxyethylsulfonylgruppe blockiert die Phosphorsäuregruppe durch Bildung eines Phosphatesters.The compound for forming a protective group from a polysaccharide derivative as used in the present invention is soluble in a conventional solvent for an oligonucleotide and an oligonucleotide blocked by a low molecular weight protective group, and when a non-solvent is added to a solution in this conventional solvent, the compound can be easily precipitated and separated. Compounds for forming a protective group from a polysaccharide derivative suitable for achieving the object of the present invention can be derived from polysaccharides. Protective group-forming compounds produced by using acetyl cellulose having a low degree of acetylation, a mixed cellulose ester composed of acetyl cellulose and propionyl cellulose, or a mixed cellulose ester composed of acetyl cellulose and butyryl cellulose are particularly useful. To prepare a protecting group-forming compound by modifying a polysaccharide derivative, for example acetylcellulose, a hydroxyethylsulfonyl group is preferably introduced as the functional group which blocks the phosphoric acid group. The -OH group of the hydroxyethylsulfonyl group blocks the phosphoric acid group by forming a phosphate ester.
Das Gerüst der Verbindung, die eine Schutzgruppe aus einem Polysaccharidderivat erzeugt, bildet durch Reaktion mit einer voluminösen Verbindung wie einem Nucleotid ein räumliches Hindernis, und daher muß, um der Hydroxyethylsulfonylgruppe eine ausreichende Reaktivität zu verleihen, die funktionelle Gruppe von der polymeren Hauptkette durch einen bestimmten Abstand separiert werden. Speziell ist die in dem Verfahren der vorliegenden Erfindung vorzugsweise verwendete Verbindung, die eine Schutzgruppe aus einem Polysacchariddenvat bildet, ein Acetylcellulosede rivat, bei dem zwischen der Hydroxylgruppe der Hauptkette und zum Beispiel einer 4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylgruppe eine Esterbindung ausgebildet ist. Acetylcellulose mit einem Substitutionsgrad von etwa 1,7 bis etwa 1,8, die als Ausgangsmaterial für die schutzgruppenbildende Verbindung bevorzugt ist, ist dadurch charakterisiert, daß die Anzahl von Hydroxylgruppen, die an der esterbildenden Reaktion teilnehmen, groß ist, daß die Löslichkeit gut und daß die Verbindung in vielen polaren Lösungsmitteln löslich ist.The skeleton of the compound that generates a protecting group from a polysaccharide derivative forms a spatial obstacle by reacting with a bulky compound such as a nucleotide, and therefore, in order to impart sufficient reactivity to the hydroxyethylsulfonyl group, the functional group must be removed from the polymeric main chain by a certain distance. Specifically, the compound which forms a protective group from a polysaccharide derivative and is preferably used in the process of the present invention is an acetylcellulose derivative in which an ester bond is formed between the hydroxyl group of the main chain and, for example, a 4-(2-hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoyl group. Acetylcellulose having a degree of substitution of about 1.7 to about 1.8, which is preferred as the starting material for the protective group-forming compound, is characterized in that the number of hydroxyl groups participating in the ester-forming reaction is large, that the solubility is good and that the compound is soluble in many polar solvents.
Die Reaktion für die Synthese des oben erwähnten Acetylcellulosederivats wird durch die folgenden Formeln (2) und (3) dargestellt. The reaction for the synthesis of the above-mentioned acetylcellulose derivative is represented by the following formulas (2) and (3).
In Formel (2) steht MMTr für eine Monomethoxytritylgruppe. Die Reaktionsformel (2) stellt die Synthese von 4-(2-Monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrozimtsäure < 3 > durch die Dehydrochlorierungs-Kondensationsreaktion zwischen einem Monomethoxytritylether < 1 > von Ethylenchlorhydrin und 4-Mercaptodihydrozimtsäure < 2 > dar. < 3 > + Acetylcellulose 1-Meim Pyridin AcetylcelluloseIn formula (2), MMTr represents a monomethoxytrityl group. The reaction formula (2) represents the synthesis of 4-(2-monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrocinnamic acid < 3 > by the dehydrochlorination condensation reaction between a monomethoxytrityl ether < 1 > of ethylene chlorohydrin and 4-mercaptodihydrocinnamic acid < 2 >. < 3 > + Acetylcellulose 1-Meim Pyridine Acetylcellulose
In Formel (3) steht Tps für 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid, und 1-Meim steht für 1-Methylimidazol.In formula (3), Tps stands for 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride and 1-Meim stands for 1-methylimidazole.
Formel (3) stellt den Reaktionsprozeß dar, bei dem 4-(2-Monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrozimt säure < 3 > und Actylcellulose einer Esterkondensation unter Verwendung von 1-Methylimidazol als dem Katalysator und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid als dem Kondensationsagens unterzogen werden, nicht reagierte Hydroxylgruppen in der Acetylcellulose durch Acetanhydrid verestert werden, eine Oxidation durch Verwenden von Wasserstoffperoxid und Natriumwolframat bewirkt wird, um Sulfonylgruppen in das Molekül einzubringen, und eine durch das Polymer getragene Verbindung < 4 > durch die Entfernung der Monomethoxytritylgruppe unter Verwendung von Zinkbromid synthetisiert wird. Die Verbindung < 4 > ist ein Acetylcellulosederivat mit einer 4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylgruppe. Diese Verbindung ist in Pyridin löslich.Formula (3) represents the reaction process in which 4-(2-monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrocinnamic acid <3> and acetyl cellulose are subjected to ester condensation using 1-methylimidazole as the catalyst and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride as the condensing agent, unreacted hydroxyl groups in the acetyl cellulose are esterified by acetic anhydride, oxidation is effected by using hydrogen peroxide and sodium tungstate to introduce sulfonyl groups into the molecule, and a polymer-supported compound <4> is synthesized by removing the monomethoxytrityl group using zinc bromide. The compound <4> is an acetyl cellulose derivative having a 4-(2-hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoyl group. This compound is soluble in pyridine.
Um die Erläuterung zu vereinfachen, wird die vorliegende Erfindung nun unter Bezugnahme auf die Kondensationsreaktion zwischen einem Mononucleotid und einem Mononucleotid beschrieben, die im folgenden beschriebenen Techniken können jedoch auch auf Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung angewendet werden, bei denen einer oder beide der Reaktionspartner Oligonucleotide sind. Kurz gesagt wird gemäß der vorliegenden Erfindung die Verbindung < 4 > mit einem Nucleotid reagiert, bei dem die funktionellen Gruppen mit Ausnahme einer einzigen Phosphorsäuregruppe blockiert sind, zum Beispiel 5'-O-Dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranylribonucleosid-3'-(2- chlorphenyl)phosphat < 5 > , um die Phosphorsäuregruppe zu blockieren, wie durch die folgende Formel (4) gezeigt: 1-Meim Extraktion Pyridin AcetylcelluloseFor ease of explanation, the present invention will now be described with reference to the condensation reaction between a mononucleotide and a mononucleotide, however, the techniques described below can also be applied to embodiments of the present invention in which one or both of the reactants are oligonucleotides. Briefly, according to the present invention, the compound <4> is reacted with a nucleotide in which the functional groups are blocked except for a single phosphoric acid group, for example, 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranylribonucleoside 3'-(2-chlorophenyl)phosphate <5> to block the phosphoric acid group, as shown by the following formula (4) is shown: 1-Meim Extraction Pyridine Acetylcellulose
In Formel (4) steht DMTr für eine Dimethoxytritylgruppe, Thp steht für eine Tetrahydropyranylgruppe, PhCl steht für eine 2-Chlorphenylgruppe und TsOH steht für p-Toluolsulfonsäure.In formula (4), DMTr represents a dimethoxytrityl group, Thp represents a tetrahydropyranyl group, PhCl represents a 2-chlorophenyl group and TsOH represents p-toluenesulfonic acid.
Zwischen < 4 > und < 5 > wird kaltes Wasser zu der Flüssigkeit der Kondensationsreaktion hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, und wenn die Reaktionsflüssigkeit mit Methylenchlorid extrahiert wird, wird das Reaktionsprodukt in die Methylenchloridschicht überführt. Die Hydroxylgruppe der Hydroxyethylgruppe in < 4 > , die an der Reaktion nicht teilgenommen hat, ist durch eine Acetylgruppe blockiert, und p- Toluolsulfonsäure wird hinzugefügt, um die Dimethoxytritylgruppe freizusetzen. Wenn ein Nichtlösungsmittel, das heißt in diesem Fall Ethanol, zu der Reaktionsfiüssigkeit hinzugefügt wird, wird < 6 > als die Ausfällung erhalten. Die Verbindung < 6 > ist ein Mononucleotid, das durch die Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat blockiert ist.Between < 4 > and < 5 >, cold water is added to the condensation reaction liquid to stop the reaction, and when the reaction liquid is extracted with methylene chloride, the reaction product is transferred to the methylene chloride layer. The hydroxyl group of the hydroxyethyl group in < 4 >, which did not participate in the reaction, is blocked by an acetyl group, and p-toluenesulfonic acid is added to release the dimethoxytrityl group. When a non-solvent, that is, ethanol in this case, is added to the reaction liquid, < 6 > is obtained as the precipitate. The compound < 6 > is a mononucleotide blocked by the protective group from the polysaccharide derivative.
Dann werden < 5 > und < 6 > kondensiert, um zwei Nucleotide über einen Triester von Phosphorsäure zu binden und eine Verbindung < 7 > zu erzielen, bei der die endständige Phosphorsäuregruppe durch die polymere Schutzgruppe blockiert ist, wie durch die folgende Formel (5) gezeigt: l-Meim Pyridin Acetylcellulose Et&sub3;N-PyridinThen, < 5 > and < 6 > are condensed to link two nucleotides via a triester of phosphoric acid to obtain a compound < 7 > in which the terminal phosphoric acid group is blocked by the polymeric protecting group, as shown by the following formula (5): l-Meim Pyridine Acetylcellulose Et₃N-Pyridine
Die Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat, welche die endständige Phosphorsäuregruppe von < 7 > blockiert, wird isoliert, und das Produkt wird separiert, wodurch das angestrebte Dinucleotidderivat < 8 > erhalten wird. Diese Isolierungsreaktion ist eine β-Eliminierungsreaktion, und ein Acetylcellulosederivat < 9 > mit einer endständigen Olefingruppe wird gebildet. Das Derivat < 9 > wird durch Hinzufügen von Ethanol zu der Reaktionsfiüssigkeit ausgefällt und kann leicht von < 8 > separiert werden. Die Separierung von < 8 > von dem nicht reagierten Nucleotid und dergleichen wird durch Umkehrphasenchromatographie erzielt.The protective group from the polysaccharide derivative which blocks the terminal phosphoric acid group of <7> is isolated, and the product is separated to obtain the objective dinucleotide derivative <8>. This isolation reaction is a β-elimination reaction, and an acetylcellulose derivative <9> having a terminal olefin group is formed. The derivative <9> is precipitated by adding ethanol to the reaction liquid and can be easily separated from <8>. The separation of <8> from the unreacted nucleotide and the like is achieved by reverse phase chromatography.
Das so synthetisierte Oligonucleotid wird in dem Zustand verwendet, in dem die an dasselbe gebundene Schutzgruppe als das Ausgangsmaterial für die kettenerweiternde Reaktion dient. Andererseits wird, um das Oligonucleotid von dem Oligonucleotid mit der an dasselbe gebundenen Schutzgruppe zu erhalten, die Schutzgruppe in der folgenden Weise entfernt. Als erstes wird eine Behandlung während 16 Stunden in 0,5 M 2-Pyridinaldoximat - 0,5 M 1,1,3,3-Tetramethylguanidin/Pyridin - Wasser (9:1 v/v) bei Raumtemperatur durchgeführt, um die 2-Chlorphenylgruppe als der die Phosphorsäuregruppe schützenden Gruppe zu entfernen, und dann wird eine Behandlung mit wäßrigem Ammoniak (28% bis 30%) bei 50ºC während 5 Stunden ausgeführt, um die Schutzgruppe für die Aminogruppe des Basisteils zu entfernen.The oligonucleotide thus synthesized is used in the state in which the protecting group bonded thereto serves as the starting material for the chain-extending reaction. On the other hand, in order to obtain the oligonucleotide from the oligonucleotide having the protecting group bonded thereto, the protecting group is removed in the following manner. First, treatment is carried out for 16 hours in 0.5 M 2-pyridine aldoximate - 0.5 M 1,1,3,3-tetramethylguanidine/pyridine - water (9:1 v/v) at room temperature to remove the 2-chlorophenyl group as the group protecting the phosphoric acid group, and then treatment is carried out with aqueous ammonia (28% to 30%) at 50°C for 5 hours to remove the protecting group for the amino group of the base portion.
Des weiteren wird eine Behandlung mit einer wäßrigen Salzsäurelösung mit einem pH- Wert von 2 bei Raumtemperatur während eines Tages ausgeführt, um die Dimethoxytritylgruppe als der Schutzgruppe für die 5'-Hydroxylgruppe und die Tetrahydropyranylgruppe als der Schutzgruppe für die 2'-Hydroxylgruppe zu entfernen.Further, treatment with an aqueous hydrochloric acid solution having a pH of 2 at room temperature for one day is carried out to remove the dimethoxytrityl group as the protective group for the 5'-hydroxyl group and the tetrahydropyranyl group as the protective group for the 2'-hydroxyl group.
Ein Oligonucleotid, von dem die Schutzgruppen vollständig entfernt sind, wird gemäß der oben erwähnten Prozeduren erhalten.An oligonucleotide from which the protecting groups are completely removed is obtained according to the above-mentioned procedures.
Gemäß dem Verfahren der vorliegenden Erfindung können optionale Oligonucleotide im Bereich von einem Nucleotiddimer bis zu einem Nucleotidpolymer (zum Beispiel ein Eicosamer) erzielt werden. Speziell wird ein Oligonucleotid von einem Mononucleotid erzielt, ein Oligonucieotid mit hohem Molekulargewicht wird durch Kondensieren dieses Oligonucleotides mit einem Mononucleotid oder Oligonucleotid erzielt, und ein optionales Polymer wird durch Wiederholen dieser Prozeduren erzielt.According to the method of the present invention, optional oligonucleotides ranging from a nucleotide dimer to a nucleotide polymer (for example, an eicosamer) can be obtained. Specifically, an oligonucleotide is obtained from a mononucleotide, a high molecular weight oligonucleotide is obtained by condensing this oligonucleotide with a mononucleotide or oligonucleotide, and an optional polymer is obtained by repeating these procedures.
Die Synthese des kettenerweiterten Oligonucleotides wurde unter Bezugnahme auf das Triester-Verfahren im Detail beschrieben. Nichtsdestoweniger kann das Verfahren der vorliegenden Erfindung in ähnlicher Weise auf das Phosphit-Verfahren angewendet werden.The synthesis of the chain-extended oligonucleotide has been described in detail with reference to the triester method. Nevertheless, the method of the present invention can be similarly applied to the phosphite method.
Polysaccharide, Oligosaccharide und Nucleinsäure, die als physiologisch aktive Substanzen von Bedeutung sind, werden im allgemeinen durch Kondensieren einer kleinen Anzahl von Arten von Monosacchariden oder Mononucleotiden mit einer bestimmten Regelmäßigkeit gebildet, und eine reine Synthese derselben ist chemisch sehr wichtig, enthält jedoch viele ungelöste Probleme. Die meisten der bei der Synthese auftretenden Probleme entstehen, weil es schwierig ist, die Reaktion zum Überführen der Bestandteile mit polyfunktionellen Gruppen in eine gewünschte Bindungsform selektiv durchzuführen. Des weiteren ist es, da es keinen großen Unterschied in den physikalischen Eigenschaften des Ausgangsmaterials, des angestrebten Produktes und des Nebenproduktes gibt, sehr schwierig, das angestrebte Produkt zu separieren und zu reinigen, auch-wenn die angestrebte Reaktion weit entwickelt ist. Aus diesen Gründen stellt die Technik des selektiven Schützens jeder funktionellen Gruppe der Bestandteile und des Isolierens der Schutzgruppe ein wichtiges Mittel für die Synthese oder die Analyse von Polysacchariden, Oligosacchariden und Nucleinsäure bereit.Polysaccharides, oligosaccharides and nucleic acid, which are important as physiologically active substances, are generally formed by condensing a small number of kinds of monosaccharides or mononucleotides with a certain regularity, and pure synthesis of them is chemically very important, but contains many unsolved problems. Most of the problems encountered in the synthesis arise because it is difficult to selectively carry out the reaction for converting the components having polyfunctional groups into a desired bonding form. Furthermore, since there is no great difference in the physical properties of the starting material, the target product and the by-product, it is very difficult to separate and purify the target product even if the target reaction is well developed. For these reasons, the technique of selectively protecting each functional group of the components and isolating the protecting group provides an important tool for the synthesis or analysis of polysaccharides, oligosaccharides and nucleic acid.
Die vorliegende Erfindung ist dadurch gekennzeichnet, daß die Schutzgruppe für die endständige Phosphorsäuregruppe des Nucleotides aus einer polymeren Verbindung gebildet wird, die in Lösungsmitteln löslich ist und leicht durch Ausfällung separiert werden kann, daß die Kondensationsreaktion in einer homogenen Lösungsphase ausgeführt wird und daß das Produkt durch Feststoff-Flüssigkeits-Trennung gewonnen werden kann.The present invention is characterized in that the protective group for the terminal phosphoric acid group of the nucleotide is formed from a polymeric compound which is soluble in solvents and can be easily separated by precipitation, that the condensation reaction is carried out in a homogeneous solution phase and that the product can be recovered by solid-liquid separation.
Die Eigenschaften der vorliegenden Erfindung werden nun durch Vergleichen des Verfahrens der vorliegenden Erfindung mit den herkömmlichen Verfahren beschrieben.The characteristics of the present invention will now be described by comparing the process of the present invention with the conventional processes.
Die Hauptpunkte des herkömmlichen Flüssigphasenverfahrens werden durch die folgenden Formeln (6) und (7) dargestellt. Phosphorylierung Silicagel-Säulenchromatographie Entfernen der Gruppe R&sub1;The main points of the conventional liquid phase process are represented by the following formulas (6) and (7). Phosphorylation Silica gel column chromatography Removal of the group R₁
In Formel (6) steht R&sup6; für -H oder OR&sup7;, und Rg steht für -OR&sup5; oder -NHR&sup9;. Kondensation Silicagel-Säulenchromatographie Entfernen der Gruppe Umkehrphasen-Silicagel-ChromatographieIn formula (6), R6 represents -H or OR7, and Rg represents -OR5 or -NHR9. Condensation Silica gel column chromatography Group removal Reversed phase silica gel chromatography
Im Flüssigphasenverfahren, das heißt dem Verfahren, das lediglich Schutzgruppen mit niedrigem Molekulargewicht verwendet, müssen die in den jeweiligen Schritten erhaltenen Produkte durch Säulenchromatographie gereinigt werden können. Im Gegensatz dazu ist das Verfahren der vorliegenden Erfindung dahingehend von Vorteil, daß das Produkt durch Ausfällen des Produktes in Form eines Polymerderivats durch ein Nichtlösungsmittel leicht und rasch gereinigt werden kann und daß eine überschüssige Menge des nicht an das Polymer gebundenen Ausgangsmaterials verwendet wird und der überschüssige Teil des Ausgangsmaterials mit hoher Reinheit zurückbehalten wird.In the liquid phase process, that is, the process using only low molecular weight protecting groups, the products obtained in the respective steps must be capable of being purified by column chromatography. In contrast, the process of the present invention is advantageous in that the product can be purified by precipitating the product in the form of a polymer derivative by a non-solvent can be easily and rapidly purified and that an excess amount of the starting material not bound to the polymer is used and the excess part of the starting material is retained with high purity.
Bei allen herkömmlichen Festphasenverfahren wird die Reaktion in einem heterogenen System ausgeführt. Demgemäß ist die Menge, die auf dem Festphasenträger getragen wird, das heißt die gebundene Menge des Ausgangsmaterials, klein. Selbst im Fall eines Polystyrolharzes, das mit 1% bis 2% Divinylbenzen vernetzt ist, wobei es sich dabei um einen herkömmlichen Träger handelt, der als einer mit einer hohen getragenen Menge angesehen wird, beträgt die getragene Menge eines Nucleosides oder Nucleotides 0,1 Millimol/g bis 0,4 Millimol/g. Im Gegensatz dazu kann im Fall von Acetylcellulose, die in der vorliegenden Erfindung verwendet wird, eine große Menge des Nucleotides getragen werden, da die Menge des eingebrachten Abstandshalters 1,65 Millimol/g bis 1,97 Millimol/g beträgt und die Kondensationsreaktion zum Einbringen eines Nucleotides quantitativ wesentlich verbessert ist. Des weiteren ist es in dem herkömmlichen Festphasenverfahren, da die Reaktion ein heterogenes System ist, notwendig, das kondensieren de Agens, das Nucleotid- oder Oligonucleotid-3'-phosphodiesterderivat in großem Überschuß zu verwenden, während in dem Verfahren der vorliegenden Erfindung, da die Kondensationsreaktion in einem homogenen System ausgeführt wird, die Mengen der Ausgangsmaterialien reduziert werden können und die Raum-Zeit- Ausbeute erhöht werden kann. In speziellen Beispielen der vorliegenden Erfindung wird Acetylcellulose mit einem geringen Acetylierungsgrad (D.S. = 1,7 bis 1,8) als Ausgangsmaterial der Verbindung verwendet, die eine Schutzgruppe aus einem Polysaccharidderivat bildet, und Acetylcellulose mit einem geringen Acetylierungsgrad wird dahingehend als vorteilhaft angesehen, daß die Acetylcellulose viele Hydroxylgruppen aufweist, die Acetylcellulose in Pyridin, Pyridin/Wasser und dergleichen löslich ist, Hydroxylgruppen, die an der Reaktion nicht teilnehmen, leicht blockiert werden können und die Acdylcellulose geeignete Nichtlösungsmittel besitzt.In all conventional solid phase methods, the reaction is carried out in a heterogeneous system. Accordingly, the amount supported on the solid phase carrier, that is, the amount of the starting material bound, is small. Even in the case of a polystyrene resin crosslinked with 1% to 2% of divinylbenzene, which is a conventional carrier considered to have a high supported amount, the supported amount of a nucleoside or nucleotide is 0.1 millimol/g to 0.4 millimol/g. In contrast, in the case of acetylcellulose used in the present invention, a large amount of the nucleotide can be supported because the amount of the spacer incorporated is 1.65 millimol/g to 1.97 millimol/g and the condensation reaction for introducing a nucleotide is significantly improved in quantity. Furthermore, in the conventional solid phase process, since the reaction is a heterogeneous system, it is necessary to use the condensing agent, the nucleotide or oligonucleotide 3'-phosphodiester derivative, in large excess, while in the process of the present invention, since the condensation reaction is carried out in a homogeneous system, the amounts of the starting materials can be reduced and the space-time yield can be increased. In specific examples of the present invention, acetyl cellulose having a low degree of acetylation (D.S. = 1.7 to 1.8) is used as the starting material of the compound forming a protective group from a polysaccharide derivative, and acetyl cellulose having a low degree of acetylation is considered advantageous in that the acetyl cellulose has many hydroxyl groups, the acetyl cellulose is soluble in pyridine, pyridine/water and the like, hydroxyl groups not participating in the reaction can be easily blocked, and the acetyl cellulose has suitable nonsolvents.
Ein weiteres charakteristisches Merkmal der in speziellen Beispielen der vorliegenden Erfindung verwendeten Verbindung, die eine Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat bildet, besteht darin, daß ein Abstandshalter eingebracht wird, um funktionelle Gruppen an die Acetylcellulose zu binden. In speziellen Beispielen der vorliegenden Erfindung wird in der Reaktion zum Einbringen einer funktionellen Gruppe mit einem Abstandshalter 4-(2-Monomethoxytrityloxyethylthio)dihydroxy zimtsäure < 3 > reagiert. Bei dieser Reaktion handelt es sich um eine Veresterung, und die Reaktionsmenge pro Mengeneinheit des Polymers ist groß, und die Menge des eingebrachten Abstandshalters ist groß. Dies dominiert die gebundene Menge der funktionellen Gruppe zum Blockieren der Phosphorsäuregruppe des Nucleotides, und als Folge wird eine große Menge an gebundenem Nucleotid pro Einheitsmenge des Polymers erhalten. In speziellen Beispielen der vorliegenden Erfindung wird eine 2-Hydroxyethylsulfonylgruppe als funktionelle Gruppe zum Blockieren der Phosphorsäuregruppe verwendet, und da die alkoholische Hydroxylgruppe in dieser funktionellen Gruppe eine primäre Hydroxylgruppe ist, kann die Phosphorsäureveresterung leicht erreicht werden. Des weiteren kann, da die Sulfonylgruppe angrenzend an das Kohlenstoffatom in der β-Position liegt, die funktionelle Gruppe durch β-Eliminierung unter schonenden Bedingungen entfernt werden, die keinen Einfluß auf andere funktionelle Gruppen haben. Diese Sulfonylgruppe wird durch Nachoxidieren des Schwefelatoms von 4-(2-Monomethoxytrityloxyethylthio)dihydroxyzimtsäure < 3 > erzielt. Dieses Schwefelatom kann zur Bestimmung des eingebrachten Abstandshalters verwendet werden.Another characteristic feature of the compound used in specific examples of the present invention which forms a protective group from the polysaccharide derivative is that a spacer is introduced to bond functional groups to the acetyl cellulose. In specific examples of the present invention, in the reaction for introducing a functional group, 4-(2-monomethoxytrityloxyethylthio)dihydroxycinnamic acid <3> is reacted with a spacer. This reaction is an esterification, and the reaction amount per unit amount of the polymer is large, and the amount of the spacer introduced is large. This dominates the bonded amount of the functional group for blocking the phosphoric acid group of the nucleotide, and as a result, a large amount of bonded nucleotide is obtained per unit amount of the polymer. In specific examples of the present invention, a 2-hydroxyethylsulfonyl group is used as the functional group for blocking the phosphoric acid group, and since the alcoholic hydroxyl group in this functional group is a primary hydroxyl group, the phosphoric acid esterification can be easily achieved. Furthermore, since the sulfonyl group is located adjacent to the carbon atom at the β-position, the functional group can be removed by β-elimination under mild conditions that have no influence on other functional groups. This sulfonyl group is obtained by post-oxidation of the sulfur atom of 4-(2-monomethoxytrityloxyethylthio)dihydroxycinnamic acid < 3 >. This sulfur atom can be used to determine the spacer introduced.
Die alkoholische Hydroxylgruppe der 2-Hydroxyethylsulfonylgruppe der in der vorliegenden Erfindung verwendeten Verbindung, welche die Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat bildet, reagiert mit einer Carbonsäure oder Sulfonsäure ebenso wie mit Phosphorsäure, um eine Esterbindung zu bilden und als Schutzgruppe zu wirken. In der vorliegenden Erfindung wird zusätzlich zu der Reaktion mit der Phosphorsäuregruppe eine Reaktion verwendet, bei der Succinsäure an die Hydroxylgruppe der 2-Hydroxyethylsulfonylgruppe des Polysaccharidderivats gebunden wird, und die Verbindung, weldie die Schutzgruppe aus dem Polysaccharidderivat bildet, wird als die Schutzgruppe für das resultierende Mononucleotidsuccinat oder Oligonucleotidsuccinat mit endständiger Carboxylgruppe verwendet.The alcoholic hydroxyl group of the 2-hydroxyethylsulfonyl group of the compound used in the present invention, which forms the protective group of the polysaccharide derivative, reacts with a carboxylic acid or sulfonic acid as well as with phosphoric acid to form an ester bond and act as a protective group. In the present invention, in addition to the reaction with the phosphoric acid group, a reaction in which succinic acid is bonded to the hydroxyl group of the 2-hydroxyethylsulfonyl group of the polysaccharide derivative is used, and the compound which forms the protective group of the polysaccharide derivative is used as the protective group for the resulting carboxyl group-terminated mononucleotide succinate or oligonucleotide succinate.
Die vorliegende Erfindung wird nun unter Bezugnahme auf die folgenden Beispiele im Detail beschrieben, die in keiner Weise den Umfang der Erfindung beschränken.The present invention will now be described in detail with reference to the following examples, which in no way limit the scope of the invention.
Die Synthese einer Verbindung, die eine Schutzgruppe aus einem Polysaccharidderivat bildet, ist in Beispiel 1 dargestellt, die Synthese von Oligonucleotiden vom RNA-Typ ist in den Beispielen 2 bis 9 dargestellt, und die Synthese von Oligonucleotiden vom DNA-Typ ist in den Beispielen 10 bis 15 dargestellt.The synthesis of a compound forming a protecting group from a polysaccharide derivative is shown in Example 1, the synthesis of RNA-type oligonucleotides is shown in Examples 2 to 9, and the synthesis of DNA-type oligonucleotides is shown in Examples 10 to 15.
2-Chlorethanol (4,02 ml, 60 mmol) und Monomethoxytritylchlorid (9,2643 g, 30 mmol) wurden in Pyridin (150 ml) bei Raumtemperatur während 3 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (15 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 30 Minuten gerührt, und das Reaktionsgemisch wurde mit Chloroform (500 ml) extrahiert und mit Wasser (200 ml x 3 Mal) gewaschen. Die organische Schicht wurde mit wasserfreiem Magnesiumsulfat getrocknet. Das Magnesiumsulfat wurde durch Filtration entfernt, und das Filtrat wurde unter einem reduzierten Druck destilliert. n-Hexan (100 ml) wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, um eine Kristallisation zu bewirken, und so wurden 9,6307 g (Ausbeute = 91%) 2- Chlorethylmonomethoxytritylether < 1 > erhalten.2-Chloroethanol (4.02 mL, 60 mmol) and monomethoxytrityl chloride (9.2643 g, 30 mmol) were stirred in pyridine (150 mL) at room temperature for 3 hours. Cold water (15 mL) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred for 30 minutes, and the reaction mixture was extracted with chloroform (500 mL) and washed with water (200 mL x 3 times). The organic layer was dried with anhydrous magnesium sulfate. The magnesium sulfate was removed by filtration, and the filtrate was distilled under a reduced pressure. n-Hexane (100 mL) was added to the residue to cause crystallization, and thus 9.6307 g (yield = 91%) of 2-chloroethyl monomethoxytrityl ether <1> was obtained.
m.p.: 87ºC bis 88ºCm.p.: 87ºC to 88ºC
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3;-TMS): δ3,30-3,50 (4H, m, -C-C &sub2; x 2), 3,60 (3H, s, OC &sub3;), 6,70 (2H, d, J = 9 Hz, Phenylproton x 2), 6,97 - 7,53 (12H, m, Phenylproton x 12)¹H-n.m.r. (CDCl₃-TMS): δ3.30-3.50 (4H, m, -C-C₂ x 2), 3.60 (3H, s, OC₃), 6.70 (2H, d, J = 9 Hz, phenyl proton x 2), 6.97 - 7.53 (12H, m, phenyl proton x 12)
Elementaranalysenwerte als C&sub2;&sub2;H&sub2;&sub1;O&sub2;Cl:Elemental analysis values as C₂₂H₂₁O₂Cl:
Berechnete Werte: C = 74, 89, H = 6,00Calculated values: C = 74, 89, H = 6.00
Gefundene Werte: C = 75,00, H = 5,98Values found: C = 75.00, H = 5.98
4-Mercaptodihydrozimtsäure wurde gemäß dem Verfahren von Gait et al. [M.J. Gait und R.C. Sheppard, Nucleic Acids Res., 4, 1135 bis 1158 (1977)] synthetisiert.4-Mercaptodihydrocinnamic acid was synthesized according to the method of Gait et al. [M.J. Gait and R.C. Sheppard, Nucleic Acids Res., 4, 1135 to 1158 (1977)].
2-Chlorethylmonomethoxytritylether < 1 > (2,1172 g, 6 mmol) und 4-Mercaptodihydrozimtsäure < 2 > (0,9112 g, 5 mmol) wurden in Ethanol (15 ml) gelöst, und Diisopropylethylamin (2,45 ml, 15 mmol) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde erwärmt und während 12 Stunden refluxiert. Das Lösungsmittel wurde durch Destillation unter einem reduzierten Druck entfernt, und der Rückstand wurde durch Silicagel-Säulenchromatographie gereinigt, um 1,9945 g (Ausbeute = 80%) 4- (2-Monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrozimtsäure < 3 > in Form eines Sirups zu erhalten.2-Chloroethylmonomethoxytrityl ether <1> (2.1172 g, 6 mmol) and 4-mercaptodihydrocinnamic acid <2> (0.9112 g, 5 mmol) were dissolved in ethanol (15 mL), and diisopropylethylamine (2.45 mL, 15 mmol) was added to the solution, and the mixture was heated and refluxed for 12 hours. The solvent was removed by distillation under a reduced pressure, and the residue was purified by silica gel column chromatography to obtain 1.9945 g (yield = 80%) of 4- (2-monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrocinnamic acid <3> in the form of a syrup.
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3;-TMS): δ2,56 (2H, t, J = 7,6 Hz, C-C &sub2;), 2,83 (2H, t, J = 7,6 Hz, C-C &sub2;), 3,01(2H, t, J = 6,8 Hz C-C &sub2;), 3,32 (2H, t, J = 6,8 Hz, C-C &sub2;), 3,64 (3H, s, OC &sub3;), 6,75 (2H, d, J = 8,8 Hz, Phenylproton x 2), 6,98 - 7,45 (16H, m, Phenylproton x 16)¹H-n.m.r. (CDCl₃-TMS): δ2.56 (2H, t, J = 7.6 Hz, C-C₂), 2.83 (2H, t, J = 7.6 Hz, C-C₂), 3 ,01(2H, t, J = 6.8 Hz C-C 2 ), 3.32 (2H, t, J = 6.8 Hz, C-C 2 ), 3.64 (3H, s, OC 3 ) , 6.75 (2H, d, J = 8.8 Hz, phenyl proton x 2), 6.98 - 7.45 (16H, m, phenyl proton x 16)
iv) 4-(2-Monomethoxytrityloxyethylthio)diiiydrozimtsäure < 3 > (2,7924 g, 5,6 mmol) und Acetylcellulose (D.S. = 1,77) (1,1794 g) wurden in Pyridin (5 ml) gelöst, und das Pyridin wurde durch Destillation unter einem reduzierten Druck entfernt. Dieser Vorgang wurde dreimal wiederholt. Wasser in dem Gemisch wurde durch azeotrope Dehydratation entfernt, und der Rückstand wurde in Pyridin (28 ml) gelöst, 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (4,0231 g, 14,0 mmol) und 1-Methylimidazol (2,24 ml, 28,0 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt.iv) 4-(2-Monomethoxytrityloxyethylthio)dihydrocinnamic acid <3> (2.7924 g, 5.6 mmol) and acetylcellulose (D.S. = 1.77) (1.1794 g) were dissolved in pyridine (5 mL), and the pyridine was removed by distillation under a reduced pressure. This procedure was repeated three times. Water in the mixture was removed by azeotropic dehydration, and the residue was dissolved in pyridine (28 mL), 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (4.0231 g, 14.0 mmol) and 1-methylimidazole (2.24 mL, 28.0 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours.
Kaltes Wasser (5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 30 Minuten gerührt, mit Chloroform extrahiert und mit Wasser gewaschen. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde einer azeotropen Destillation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen und in Pyridin (14 ml) gelöst, Acetanhydrid (4,7 ml) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Konzentrat hinzugefügt, und eine azeotrope Destillation wurde unter einem reduzierten Druck ausgeführt, bis der Geruch von Pyridin verschwand. Der Rückstand wurde in Dioxan (130 ml) - Essigsäure (9 ml) gelöst, und eine wäßrige Lösung (19 ml) von Na&sub2;WO&sub4; H&sub2;O (0,1869 g) wurde zu der Lösung hinzugefügt. Die Temperatur wurde auf 80ºC erhöht, und 30% wäßriges Wasserstoffperoxid (28 ml) wurde über eine Zeitspanne von 1 Stunde hinweg in das Gemisch hineingetropft, und das Gemisch wurde während 1 Stunde gerührt. Die Reaktionstemperatur wurde auf Raumtemperatur abgesenkt, und das Reaktionsgemisch wurde mit Chloroform (150 ml) - Pyridin (20 ml) extrahiert und mit Wasser gewaschen (100 ml x 2 Mal). Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, der Rückstand wurde in Chloroform (30 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (500 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zuruckbehalten, mit Ethanol (200 ml) gewaschen und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um 2,9753 g eines weißen Pulvers zu erhalten.Cold water (5 ml) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred for 30 minutes, extracted with chloroform and washed with water. The organic layer was concentrated under a reduced pressure. The residue was subjected to azeotropic distillation with pyridine (5 ml x 3 times) and dissolved in pyridine (14 ml), acetic anhydride (4.7 ml) was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and a small amount of toluene was added to the concentrate, and azeotropic distillation was carried out under a reduced pressure until the smell of pyridine disappeared. The residue was dissolved in dioxane (130 ml) - acetic acid (9 ml), and an aqueous solution (19 ml) of Na₂WO₄ H₂O (0.1869 g) was added to the solution. The temperature was raised to 80°C, and 30% aqueous hydrogen peroxide (28 ml) was dropped into the mixture over a period of 1 hour, and the mixture was stirred for 1 hour. The reaction temperature was lowered to room temperature, and the reaction mixture was extracted with chloroform (150 ml) - pyridine (20 ml) and washed with water (100 ml x 2 times). The organic layer was concentrated under a reduced pressure, the residue was dissolved in chloroform (30 ml), and the solution was dropped into ethanol (500 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration, washed with ethanol (200 ml) and dried under a reduced pressure to obtain 2.9753 g of a white powder.
Das so erhaltene weiße Pulver (2,6316 g) wurde in einer 0,7 M Lösung (30 ml) von Zinkbromid in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) gelöst, und die Lösung wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, bis das Volumen auf etwa 1/2 reduziert war, und das Konzentrat wurde unter starkem Rühren in Ethanol (400 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten, mit Ethanol (100 ml) gewaschen und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um 1,8160 g 4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoyl acetyl cellulose < 4 > in Form eines weißen Pulvers zu erhalten. Die Menge des in die Verbindung < 4 > eingebrachten Abstandshalters wurde zu 1,65 mmol/g von dem S-Gehalt (5,30%, 1,65 mmol S pro Gramm) berechnet.The white powder thus obtained (2.6316 g) was dissolved in a 0.7 M solution (30 ml) of zinc bromide in chloroform - methanol (7:3 v/v), and the solution was stirred at room temperature for 2 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure until the volume was reduced to about 1/2, and the concentrate was dropped into ethanol (400 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was retained by filtration, washed with ethanol (100 ml) and dried under a reduced pressure to obtain 1.8160 g of 4-(2-hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoyl acetyl cellulose <4> in the form of a white powder. The amount of spacer incorporated into compound <4> was calculated to be 1.65 mmol/g of the S content (5.30%, 1.65 mmol S per gram).
4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose < 4 > (1,65 mmol/g) (0,2424 g, 0,4 mmol) und Triethylamin-N³-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyluridin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 5 > (0,3170 g, 0,3 mmol) wurden in Pyridin (3 ml) gelöst, und das Pyridin wurde durch Destillation unter einem reduziert en Druck entfernt. Dieser Vorgang wurde dreimal wiederholt, und Wasser in dem Gemisch wurde durch azeotrope Dehydratation entfernt. Der Rückstand wurde in Pyridin (3 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2726 g, 0,9 mmol) und 1-Metliylinudazol (0,14 ml, 1,8 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt. Kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 30 Minuten gerührt, und Methylenchlorid (50 ml) wurde zu dem Gemisch hinzugefügt, und das Gemisch wurde mit Wasser (30 ml) gewaschen. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und der Rückstand wurde einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (3 ml x 3 Mal) unterzogen. Der Rückstand wurde in Pyridin (7,5 ml) gelöst, Acetanhydrid (2,5 ml) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, eine kleine Menge Toluol urde zu dem Konzentrat hinzugefügt, und eine azeotrope Destillation wurde unter einem reduzierten Druck ausgeführt, bis der Pyridingeruch verschwand.4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose <4> (1.65 mmol/g) (0.2424 g, 0.4 mmol) and triethylamine-N3-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyluridine-3'-(2-chlorophenyl)phosphate <5> (0.3170 g, 0.3 mmol) were dissolved in pyridine (3 mL), and the pyridine was removed by distillation under a reduced pressure. This procedure was repeated three times, and water in the mixture was removed by azeotropic dehydration. The residue was dissolved in pyridine (3 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2726 g, 0.9 mmol) and 1-methylinudazole (0.14 mL, 1.8 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Cold water (0.5 mL) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred for 30 minutes, and methylene chloride (50 mL) was added to the mixture, and the mixture was washed with water (30 mL). The organic layer was concentrated under a reduced pressure, and the residue was subjected to azeotropic dehydration with pyridine (3 mL x 3 times). The residue was dissolved in pyridine (7.5 mL), acetic anhydride (2.5 mL) was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, a small amount of toluene was added to the concentrate, and azeotropic distillation was carried out under a reduced pressure until the pyridine odor disappeared.
Der Rückstand, der das Acetylcellulosederivat < 4 > enthielt, in den eine kleine Menge Triethylamin-N³-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyluridin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 5 > eingebracht wurde, wurde in einer kleinen Menge Methylenchlorid gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol getropft, um die Verbindung < 4 > in ein Pulver (3,1 mg) umzuwandeln. Die Dimethoxytritylgruppe wurde von der 5'- Hydroxylgruppe durch eine Behandlung mit einer 2%igen Lösung von p-Toluolsulfonsäure in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) entfernt, und eine Färbung wurde in 60% Perchlorsäure - Ethanol (3:2 v/v) ausgeführt, und die Menge der in das Acetylcellulosederivat < 4 > eingebrachten Verbindung < 5 > wurde durch Messen der dekadischen Extinktion bei 498 nm (ε = 72000) bestimmt. Es wurde festgestellt, daß die Menge der eingebrachten Verbindung < 5 > 0,56 mmol/g betrug und die Kondensationsausbeute 99% war.The residue containing the acetylcellulose derivative < 4 >, in which a small amount Triethylamine N³-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyluridine-3'-(2-chlorophenyl)phosphate <5> incorporated was dissolved in a small amount of methylene chloride, and the solution was dropped into ethanol to convert compound <4> into a powder (3.1 mg). The dimethoxytrityl group was removed from the 5'-hydroxyl group by treatment with a 2% solution of p-toluenesulfonic acid in chloroform-methanol (7:3 v/v), and staining was carried out in 60% perchloric acid-ethanol (3:2 v/v), and the amount of compound <5> incorporated into the acetylcellulose derivative <4> was determined by measuring the absorbance at 498 nm (ε = 72000). It was found that the amount of compound <5> introduced was 0.56 mmol/g and the condensation yield was 99%.
Der Rückstand wurde in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde auf 0ºC abgekühlt, und eine Lösung von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,3954 g) in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (5 ml) wurde zu der obigen Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde während 15 Minuten gerührt, und die Reaktionslösung wurde mit einer gesättigten wäßrigen Lösung aus Natriumhydrogencarbonat neutralisiert und mit Chloroform extrahiert. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, der Rückstand wurde in Chloroform (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten, um 0,3330 g (0,224 mmol, Ausbeute = 75%, 0,674 mmol/g) der pulverigen Verbindung < 6 > zu erhalten [siehe Formel (4)].The residue was dissolved in chloroform-methanol (7:3 v/v) (10 ml), and the solution was cooled to 0 °C, and a solution of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.3954 g) in chloroform-methanol (7:3 v/v) (5 ml) was added to the above solution. The mixture was stirred for 15 minutes, and the reaction solution was neutralized with a saturated aqueous solution of sodium hydrogen carbonate and extracted with chloroform. The organic layer was concentrated under a reduced pressure, the residue was dissolved in chloroform (10 ml), and the solution was added dropwise into ethanol (200 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was retained by filtration to obtain 0.3330 g (0.224 mmol, yield = 75%, 0.674 mmol/g) of the powdery compound < 6 > [see formula (4)].
Die Verbindung < 6 > (0,3330 g) und Triethylamin-N³-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'- O-tetrahydropyranyluridin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 5 > (0,2958 g, 0,28 Millimol) wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (3 ml x 3 Mal) unterzogen. Der Rückstand wurde in Pyridin (2,8 ml) gelöst, 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2544 g, 0,84 mmol) und 1-Methylimidazol (0,13 ml, 0,168 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt. Kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionsflüssigkeit hinzugefügt, und das Gemisch wurde wanrend 30 Minuten gerührt, mit Methylenchlorid extrahiert und mit Wasser gewaschen. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Eine kleine Menge des Rückstandes wurde in Methylenchlorid gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol getropft, uin ein pulveriges Produkt (2,9 mg) zu erhalten. Bei der Bestimmung der Dimethoxytritylgruppe wurde festgestellt, daß der Gehalt der Limethoxytritylgruppe 0,401 mmol/g betrug und die Kondensationsausbeute 97% war.The compound <6> (0.3330 g) and triethylamine-N3-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'- O-tetrahydropyranyluridine-3'-(2-chlorophenyl)phosphate <5> (0.2958 g, 0.28 mmol) were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (3 mL x 3 times). The residue was dissolved in pyridine (2.8 mL), 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2544 g, 0.84 mmol) and 1-methylimidazole (0.13 mL, 0.168 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Cold water (0.5 ml) was added to the reaction liquid, and the mixture was stirred for 30 minutes, extracted with methylene chloride and washed with water. The organic layer was concentrated under a reduced pressure. A small amount of the residue was dissolved in methylene chloride, and the solution was dropped into ethanol to obtain a powdery product (2.9 mg). When the dimethoxytrityl group was determined, the content of the limethoxytrityl group was found to be 0.401 mmol/g and the condensation yield was 97%.
Der Rückstand wurde in Pyridin - Triethylamin (3:1 v/v) (8 ml) gelöst, die Lösung wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Pyridin (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft, die gebildete Ausfällung < 9 > [siehe Formel (5)] wurde durch Filtration entfernt, und das Filtrat wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde durch Umkehrphasen-Säulenchromatographie (Eluent: 40% bis 60% Aceton - 0,05 M wäßrige Lösung von TEAB) separiert, um 0,2926 g eines Dinucleotidderivats < 8 > (0,173 mmol, 58%) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,526 g (0,05 mmol) der Verbindung < 5 > zurückbehalten.The residue was dissolved in pyridine - triethylamine (3:1 v/v) (8 mL), the solution was stirred at room temperature for 2 hours, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in pyridine (10 mL), and the solution was dropped into ethanol (200 mL) under vigorous stirring, the formed precipitate <9> [see formula (5)] was removed by filtration, and the filtrate was concentrated under a reduced pressure. The residue was separated by reverse-phase column chromatography (eluent: 40% to 60% acetone - 0.05 M aqueous solution of TEAB) to obtain 0.2926 g of a dinucleotide derivative <8> (0.173 mmol, 58%). In this step, 0.526 g (0.05 mmol) of compound < 5 > was retained.
Der Rf-Wert von TLC unter Verwendung von Silicagel als dem Träger und die Daten von ¹H-n.m.r. der Verbindung < 8 > befanden sich in Übereinstimmung mit jenen der < 8' > , die durch das Flüssigphasenverfahren synthetisiert wurde, und es wurde bestätigt, daß < 8 > die Struktur von < 8' > aufwies.The Rf value of TLC using silica gel as the support and the data of 1H-n.m.r. of the compound <8> were in agreement with those of <8'> synthesized by the liquid phase method, and it was confirmed that <8> had the structure of <8'>.
Die Werte der physikalischen Eigenschaften der Verbindung < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = N³- Anisoyluracil-1-yl) waren wie folgt (für diese Messung wurde das Diastereomer von 2'-O-Tetrahydropyranyluridin mit einer hohen Polarität verwendet).The values of physical properties of compound <8> (B1 = B2 = N3-anisoyluracil-1-yl) were as follows (for this measurement, the diastereomer of 2'-O-tetrahydropyranyluridine with a high polarity was used).
¹H/n.m.r. (CDCl&sub3;-TMS): δ1,21 (9H, t, J = 7,3 Hz, C &sub2; x 3), 1,27 - 1,75 (12H, m, C-C &sub3; x 6), 2,95 (6H, q, C-C &sub2; x 3), 3,41 - 3,68 (6H, m, 11-5',5' und O-C &sub2; x 2), 3,796, 3,80, 3,83 und 3,85 (12H, s x 4, OC &sub3; x 4), 4,16 - 5,75 (12H, m, H-5 x 2, 2' x 2, 3' x 2, 4' x 2, 5', 5" und -O-C -O x 2), 5,30 (1H, s, -OH), 6,05, 6,11, 6,15 und 6,27 (2H, d x 4, Hl' x 2), 6,83 - 7,92 (31H, m, Phenylproton x 29 und H6 x 2)¹H/n.m.r. (CDCl₃-TMS): δ1.21 (9H, t, J = 7.3 Hz, C₂ x 3), 1.27 - 1.75 (12H, m, C-C₃ x 6), 2.95 (6H, q, C-C₂ x 3), 3.41 - 3.68 (6H, m, 11-5',5' and O-C₂ x 2), 3.796, 3.80, 3.83 and 3.85 (12H, s x 4, OC₃ x 4), 4.16 - 5.75 (12H, m, H-5 x 2, 2' x 2, 3' x 2, 4' x 2, 5', 5" and -O-C -O x 2), 5.30 (1H, s, -OH), 6.05, 6.11, 6.15 and 6.27 (2H, d x 4, Hl' x 2), 6.83 - 7.92 (31H, m, phenyl proton x 29 and H6 x 2)
Rf-Werte: 0,28 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v), 0,65 (Aceton - Wasser, 7:3 v/v)Rf values: 0.28 (acetone - water, 6:4 v/v), 0.65 (acetone - water, 7:3 v/v)
Gemäß den gleichen Prozeduren, wie in Beispiel 2 beschrieben, wurden die Verbindung < 4 > (1,65 mmol/g) (0,2424 g, 0,4 mmol) und Triethylamin-³N-anisoyl-5'- O-dimethoxytrityl-2'-O'-tetrahydropyranyluridin-3,-(2-chlorphenyl)phosphat < 5 > (0,3170 g, 0,3 Millimol) in Pyridin (3 ml) als dem Lösungsmittel mit 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2726 g, 0,9 mmol) und 1-Methylimidazol (0,14ml, 1,8 mmol) reagiert, und das Reaktionsgemisch wurde mit Acetanhydrid (2,5 ml) - Pyridin (7,5 ml) behandelt (die Kondensationsausbeute betrug 99%). Dann wurde das Reaktionsgemisch mit einer 2%igen Lösung von p-Toluolsulfonsäure in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) behandelt, das Reaktionsgemisch wurde in Chloroform gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol getropft, um 0,3680 g der pulverigen Verbindung < 6 > (0,255 mmol 85%, 0,693 mmol/g) zu erhalten.According to the same procedures as described in Example 2, the compound < 4 > (1.65 mmol/g) (0.2424 g, 0.4 mmol) and triethylamine-³N-anisoyl-5'- O-dimethoxytrityl-2'- O'-tetrahydropyranyluridine-3,-(2-chlorophenyl)phosphate < 5 > (0.3170 g, 0.3 millimole) in pyridine (3 mL) as the solvent was reacted with 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2726 g, 0.9 mmol) and 1-methylimidazole (0.14 mL, 1.8 mmol), and the reaction mixture was treated with acetic anhydride (2.5 mL) - pyridine (7.5 mL) (the condensation yield was 99%). Then, the reaction mixture was treated with a 2% solution of p-toluenesulfonic acid in chloroform - methanol (7:3 v/v), the reaction mixture was dissolved in chloroform, and the solution was dropped into ethanol to obtain 0.3680 g of the powdery compound <6> (0.255 mmol 85%, 0.693 mmol/g).
Die Verbindung < 6 > (0,3680 g) und Triethylamin-N&sup6;-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyladenosin-3,-(2-chlorphenyl)phosphat < 5 > (0,3359 g, 0,32 mmol) wurden in Pyridin (3,2 ml) als dem Lösungsmittel mit 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2907 g, 0,96 mmol) und 1-Methylimidazol (0,15 ml, 1,92 mmol) reagiert (die Kondensationsausbeute betrug 96%). Das Reaktionsgemisch wurde mit Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (8 ml) behandelt, und der Acetylcelluloserest wurde durch Ethanol ausgefällt, durch Filtration zurückbehalten und durch Umkehrphasen- Silicagel-Säulenchromatographie separiert, um 0,2978 g des Dinucleotidderivats < 8 > (1,77 mml, 59%) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,0630 g (0,06 mmol) der Verbindung < 5 > (B&sub2; = N&sup6;-Benzoyladenin-9-yl) gewonnen. Es ist zu erwähnen, daß der Rf-Wert von TLC und die Daten von ¹H-n.m.r. der Verbindung < 8 > identisch mit jenen der Verbindung < 8' > waren, die durch das Flüssigphasenverfahren synthetisiert wurde, und es wurde bestätigt, daß die Verbindung < 8 > die Struktur der Verbindung < 8' > aufwies.Compound <6> (0.3680 g) and triethylamine-N6-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyladenosine-3,-(2-chlorophenyl)phosphate <5> (0.3359 g, 0.32 mmol) were reacted with 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2907 g, 0.96 mmol) and 1-methylimidazole (0.15 mL, 1.92 mmol) in pyridine (3.2 mL) as the solvent (the condensation yield was 96%). The reaction mixture was treated with triethylamine-pyridine (1:3 v/v) (8 mL), and the acetylcellulose residue was precipitated by ethanol, retained by filtration and separated by reversed-phase silica gel column chromatography to obtain 0.2978 g of the dinucleotide derivative <8> (1.77 mmol, 59%). In this step, 0.0630 g (0.06 mmol) of the compound <5> (B2 = N6-benzoyladenin-9-yl) was obtained. It is to be noted that the Rf value of TLC and the data of 1H-n.m.r. of the compound <8> were identical with those of the compound <8'> synthesized by the liquid phase method, and it was confirmed that the compound <8> had the structure of the compound <8'>.
Die Werte der physikalischen Eigenschaften der Verbindung < 8 > (B&sub1; = N³-Anisoyluracil-1-yl, B&sub2; = N&sup6;-Benzoyladenin-9-yl) waren wie folgt (für die Messung wurden die Diastereomere von 2'-O-Tetrahydropyranyluridin und 2'-O-Tetrahydropyranyladenosin mit einer hohen Polarität verwendet).The values of physical properties of compound <8> (B1 = N3-anisoyluracil-1-yl, B2 = N6-benzoyladenin-9-yl) were as follows (the diastereomers of 2'-O-tetrahydropyranyluridine and 2'-O-tetrahydropyranyladenosine with a high polarity were used for the measurement).
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3;/TMS): δ1,19 - 1,66 (12H, m, C-C &sub2; x 6), 1,22 (9H, t, J = 7,3 Hz, C &sub3; x 3), 2,96 (6H, q, C-C &sub2; x 3), 3,04 - 3,78 (6H, m, H5', 5" und O-C &sub2; x 2), 3,75 (6H, s, OC &sub3;), 3,83 (3H, s, OC &sub3;), 4,28 - 5,84 (11H, m, H-5, 2' x 2, 3' x 2, 4' x 4, 5', 5" und O-C -O x 2), 5,38 (1H, s, -OH) 6,15, 6,17, 6,34 und 6,39 (2H, d x 4, H-1' x 2), 6,76 - 8,67 (33H, m, Phenylproton x 30, H-2,8 und H-6), 9,28 (1H, br s, NH)¹H-n.m.r. (CDCl₃/TMS): δ1.19 - 1.66 (12H, m, C-C₂ x 6), 1.22 (9H, t, J = 7.3 Hz, C₃ x 3), 2.96 (6H, q, C-C₂ x 3), 3.04 - 3.78 (6H, m, H5', 5" and O-C₂ x 2), 3.75 (6H, s, OC₃), 3.83 (3H, s, OC₃), 4.28 - 5.84 (11H, m, H-5, 2' x 2, 3' x 2, 4' x 4, 5', 5" and O-C-O x 2), 5.38 (1H, s, -OH) 6.15, 6.17, 6.34 and 6.39 (2H, d x 4, H-1' x 2), 6.76 - 8.67 (33H, m, phenyl proton x 30, H-2.8 and H-6), 9.28 (1H, br s, NH)
Rf-Werte. 0,30 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v), 0,6((Aceton Wasser, 7.3 v/v)Rf values: 0.30 (acetone - water, 6:4 v/v), 0.6 (acetone water, 7.3 v/v)
Gemäß den gleichen Prozeduren, wie in Beispiel 2 beschrieben, wurden die Verbindung < 4 > (1,65 mmol/g) (0,6061 g, 1,00 mmol) und Triethylamin-N&sup6;-benzoyl-5'-O- dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyladenosin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat (0,7872 g, 0,75 mmol) in Pyridin (7,5 ml) als dem Lösungsmittel mit 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlond (0,6814 g, 2,25 mmol) und 1-Methylimidazol (0,36 ml, 4,5 mmol) reagiert, und das Reaktionsgemisch wurde mit Acetanhydrid (6,25 ml) - Pyridin (18,25 ml) behandelt (die Kondensatioiisausbeute betrug 96%). Das Reaktionsgemisch wurde mit einer 2%igen Lösung von p-Toluolsulfonsäure in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) behandelt und wurde in Chloroform gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol getropft, um 0,9166 g der pulverigen Verbindung < 6 > (0,638 mmol, Ausbeute von 85%, 0,696 mmol/g) zu erhalten. Die Verbindung < 6 > (0,9166 g) und Triethylamin-N&sup6;- benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyladenosin-3,-(2-chlorphenyl)phosphat < 5 > (0,8370 g, 0,80 mmol) wurden in Pyridin (8 ml) als dem Lösungsmittel mit 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,7269 g, 2,40 mmol) und 1-Methylimidazol (0,38 ml, 4,8 mmol) reagiert (die Umwandlungsausbeute betrug 94%). Das Reaktionsgemisch wurde mit Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (20 ml) behandelt, und die Acetylcellulose < 9 > wurde durch Ethanol ausgefällt, durch Filtration zurückbehalten und durch Umkehrphasen-Silicagel-Säulenchromatographie separiert, um 0,7701 g des Dinudeotidderivats < 8 > (0,459 mmo], Ausbeute von 61%) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,1679 g (0,160 mmol) der Verbindung < 5 > (B&sub2; = N&sup6;-Benzoyladenin-9-yl) gewonnen.According to the same procedures as described in Example 2, the Compound <4> (1.65 mmol/g) (0.6061 g, 1.00 mmol) and triethylamine-N⁶-benzoyl-5'-O- dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyladenosine 3'-(2-chlorophenyl)phosphate (0.7872 g, 0.75 mmol) in pyridine (7.5 mL) as the solvent were reacted with 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.6814 g, 2.25 mmol) and 1-methylimidazole (0.36 mL, 4.5 mmol), and the reaction mixture was treated with acetic anhydride (6.25 mL) - pyridine (18.25 mL) (the condensation yield was 96%). The reaction mixture was treated with a 2% solution of p-toluenesulfonic acid in chloroform - methanol (7:3 v/v) and was dissolved in chloroform, and the solution was dropped into ethanol to obtain 0.9166 g of the powdery compound <6> (0.638 mmol, yield of 85%, 0.696 mmol/g). The compound <6> (0.9166 g) and triethylamine-N6-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tetrahydropyranyladenosine 3,-(2-chlorophenyl)phosphate <5> (0.8370 g, 0.80 mmol) were reacted with 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.7269 g, 2.40 mmol) and 1-methylimidazole (0.38 mL, 4.8 mmol) in pyridine (8 mL) as the solvent (the conversion yield was 94%). The reaction mixture was treated with triethylamine - pyridine (1:3 v/v) (20 mL), and the acetylcellulose <9> was precipitated by ethanol, retained by filtration and separated by reversed-phase silica gel column chromatography to obtain 0.7701 g of the dinucleotide derivative <8> (0.459 mmol], yield of 61%). In this step, 0.1679 g (0.160 mmol) of the compound <5> (B2 = N6-benzoyladenin-9-yl) was recovered.
Die Rf-Werte und die Daten von ¹H n.m.r. der Verbindung < 8 > waren identisch jenen der Verbindung < 8' > , die durch das Flüssigphasenverfahren synthetisiert wurde, und es wurde bestätigt, daß die Verbindung < 8 > die Struktur der Verbindung < 8'> aufwies.The Rf values and 1H n.m.r. data of compound <8> were identical to those of compound <8'> synthesized by the liquid phase method, and it was confirmed that compound <8> had the structure of compound <8'>.
Die Werte der physikalischen Eigenschaften der Verbindung < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = N&sup6;- Benzoyladenin-9-yl) waren wie folgt (für die Messung wurde das Diastereomer von 2'-O-Tetrahydropyranyladenosin mit einer niedrigen B&sub1;-Polarität und einer hohen B&sub2;- Polarität verwendet).The values of physical properties of compound <8> (B1 = B2 = N6-benzoyladenin-9-yl) were as follows (the diastereomer of 2'-O-tetrahydropyranyladenosine with a low B1 polarity and a high B2 polarity was used for the measurement).
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3;/TMS): δ1,22 - 1,62 (12H, m, C-CH&sub2; x 6), 1,25 (9H, t, J = 7,3 Hz, C &sub3; x 3), 2,60 - 3,85 (6H, m, H-5', 5" und -C-C &sub2; x 2), 3,00 (6H, q, -C-C &sub2; x 3), 3,74 und 3,75 (6H, s x 2, OC &sub3; x 2), 4,53 - 5,51 (10H, m, H-2' x 2, 3' x 2, 4' x 2,5',5" und O-C -O x 2), 5,30 (1H, s, -OH), 6,26, 6,31, 6,36 und 6,39 (2H, d x 4, H-1' x 2), 6,74 - 8,79 (35H, m, H-2 x 2, 8 x 2 und Phenylproton x 31), 9,20 - 9,44 (2H, m, -NH x 2)1H-nmr (CDCl₃/TMS): δ1.22 - 1.62 (12H, m, C-CH₂ x 6), 1.25 (9H, t, J = 7.3 Hz, C 3 x 3), 2.60 - 3.85 (6H, m, H-5', 5" and -CC 2; x 2), 3.00 (6H, q, -CC 2; x 3), 3.74 and 3.75 (6H, sx 2, OC 3; x 2), 4.53 - 5.51 (10H, m, H-2' x 2, 3' x 2, 4' x 2,5',5" and OC -O x 2), 5.30 (1H, s, -OH), 6.26, 6.31, 6.36 and 6.39 (2H, dx 4, H-1' x 2), 6.74 - 8.79 (35H, m, H-2 x 2, 8 x 2 and phenyl proton x 31), 9.20 - 9.44 (2H, m, -NH x 2)
Rf-Werte: 0,32, 0,29 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v), 0,69, 0,66 (Aceton - Wasser, 7:3 v/v)Rf values: 0.32, 0.29 (acetone - water, 6:4 v/v), 0.69, 0.66 (acetone - water, 7:3 v/v)
Gemäß den gleichen Prozeduren, wie oben bei der Synthese (i) von < 8 > beschrieben, wurden die Verbindung < 4 > (1,65 mmol/g) (0,3182 g, 0,525 mmol) und eine Verbindung < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = N&sup6;-Benzoyladenin-9-yl) (0,5871 g, 0,35 mmol) in Pyridin (10,5 ml) als dem Lösungsmittel mit 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,3180 g, 1,05 mmol) und 1-Methylimidazol (0,17 ml, 2,10 mmol) reagiert, und das Reaktionsgemisch wurde mit Acetanhydrid (2,5 ml) - Pyridin (7,5 ml) behandelt (die Kondensationsausbeute betrug 100%). Dann wurde das Reaktionsgemisch mit einer 2%igen Lösung voll Toluolsulfonsäure in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) behandelt und in Chloroform gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol getropft, um 0,6248 g eines pulverigen Acetylcellulosederivats zu erhalten, das ein darauf getragenes Dinucleotid mit einer freien Carboxylgruppe am 5'-Ende aufweist (0,288 mmol, Ausbeute von 82%, 0,462 mmol/g).According to the same procedures as described above in the synthesis (i) of <8>, the compound <4> (1.65 mmol/g) (0.3182 g, 0.525 mmol) and a compound <8> (B1 = B2 = N6-benzoyladenin-9-yl) (0.5871 g, 0.35 mmol) in pyridine (10.5 mL) as the solvent were reacted with 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3180 g, 1.05 mmol) and 1-methylimidazole (0.17 mL, 2.10 mmol), and the reaction mixture was treated with acetic anhydride (2.5 mL) - pyridine (7.5 mL) (the condensation yield was 100%). Then, the reaction mixture was treated with a 2% solution of toluenesulfonic acid in chloroform - methanol (7:3 v/v) and dissolved in chloroform, and the solution was dropped into ethanol to obtain 0.6248 g of a powdery acetylcellulose derivative having a dinucleotide supported thereon with a free carboxyl group at the 5'-end (0.288 mmol, yield of 82%, 0.462 mmol/g).
Dieses Pulver (0,6248 g) und eine Verbindung < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = N&sup6;-Benzoyladenin-9-yl) (0,6760 g, 0,403 mmol) wurden in Pyridin (8 ml) als dem Lösungsmittel mit 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,3662 g, 1,21 mmol) und 1-Methylimidazol (0,20 ml, 2,42 mmol) reagiert (die Kondensationsausbeute betrug 90%).This powder (0.6248 g) and a compound <8> (B1 = B2 = N6-benzoyladenin-9-yl) (0.6760 g, 0.403 mmol) were reacted with 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3662 g, 1.21 mmol) and 1-methylimidazole (0.20 mL, 2.42 mmol) in pyridine (8 mL) as the solvent (the condensation yield was 90%).
Darin wurde das Reaktionsgemisch mit Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (10,5 ml) behandelt, und der Acetylcelluloserest wurde durch Ethanol ausgefällt, durch Filtration zurückbehalten und durch Umkehrphasen-Silicagel-Säulenchromatographie separiert, um 0,5095 g (0,174 mmol, Ausbeute,non 50%) eines Tetranucleotidderivats zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,1778 g (0,106 mmol) der Verbindung < 8 > gewonnen.Therein, the reaction mixture was treated with triethylamine - pyridine (1:3 v/v) (10.5 mL), and the acetylcellulose residue was precipitated by ethanol, retained by filtration, and separated by reversed-phase silica gel column chromatography to obtain 0.5095 g (0.174 mmol, yield 50%) of a tetranucleotide derivative. In this step, 0.1778 g (0.106 mmol) of compound < 8 > was obtained.
Die Werte der physikalischen Eigenschaften der Verbindung < 10 > (B&sub1; = B&sub2; = B&sub3; = B&sub4; = N&sup6;-Benzoyladenin-9-yl) waren wie folgt (für die Messung wurde das Diastereomer von 2'-O-Tetrahydropyranyladenosin mit einer hohen Polarität verwendet).The values of physical properties of compound <10> (B1 = B2 = B3 = B4 = N6-benzoyladenin-9-yl) were as follows (the diastereomer of 2'-O-tetrahydropyranyladenosine with a high polarity was used for the measurement).
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3;/TMS): δ1,12 - 1,76 (24H, m, C-C &sub2; x 12), 1,23 (9H, t, J = 7,3 Hz, C &sub3; x 3), 2,90 - 3,56 (8H, m, O-CH&sub2;- x 4), 2,97 (6H, q, C-CH&sub2; x 4), 3,68 - 3,92 (2H, m, H-5' und 5"), 3,72 (6H, s, OC &sub3; x 2), 4,12 - 5,72 (22H, m, H-2' x 4, 3' x 4, 4' x 4, 5' x 3, 5" x 3 und O-CH-O x 4). 5,30 (1H, s, -OH), 6,10 - 6,35 (4H, m, H - 1' x 4), 6,73 - 8,81(57H, m, H -2 x 4, 8 x 4 und Phenylproton x 49), 9,20 - 9,76 (4H, m, NH x 4)¹H-n.m.r. (CDCl₃/TMS): δ1.12 - 1.76 (24H, m, C-C₂ x 12), 1.23 (9H, t, J = 7.3 Hz, C₃ x 3), 2.90 - 3.56 (8H, m, O-CH₂- x 4), 2.97 (6H, q, C-CH₂ x 4), 3.68 - 3.92 (2H, m, H-5' and 5"), 3.72 (6H, s, OC₃ x 2), 4.12 - 5.72 (22H, m, H-2' x 4, 3' x 4, 4' x 4, 5' x 3, 5" x 3 and O-CH-O x 4). 5.30 (1H, s, -OH), 6.10 - 6.35 (4H, m, H - 1' x 4), 6.73 - 8.81(57H, m, H -2 x 4, 8 x 4 and phenyl proton x 49), 9.20 - 9.76 (4H, m, NH x 4)
Rf-Werte: 0,10 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v), 0,45 (Aceton - Wasser, 7:3 v/v)Rf values: 0.10 (acetone - water, 6:4 v/v), 0.45 (acetone - water, 7:3 v/v)
5'-O-Dimethoxytrityl-O&sup6;-diphenylcarbamoyl-N²-isobutyryl-2'-O-(tetrahydropyran-2- yl)guanosin (1, 6670 g, 1,78 mmol) wurde in Methylenchlorid (8,9 ml) gelöst, und Bernsteinsäureanhydrid (0,3568 g, 3,57 mmol) sowie DMAP (0,4362 g, 3,57 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt. Kaltes Wasser (5 ml) wurde zu dem Gemisch hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt und mit Methylenchlorid (50 ml) extrahiert. Die organische Schicht wurde mit 0,1 M TEAB (20 ml x 3 Mal) gewaschen und mit wasserfreiem Magnesiumsulfat getrocknet, und das Magnesiumsulfat wurde durch Filtration entfernt. Das Filtrat wurde einer Destillation unter einem reduzierten Druck unterzogen, und der Rückstand wurde durch Silicagel- Säulenchromatographie [2,5 cm im Durchmesser x 10 cm in der Länge, Methanol - Methylenchlorid] gereinigt, um 1,7370 g (die Ausbeute betrug 94%) glasartiges 5'- O-Dimethoxytrityl-O&sup6;-diphenylcarbamoyl-N²-isobutyryl-2'-O-(tetrahydropyran-2-yl)guanosin-3'-succinat < 11 > zu erhalten.5'-O-Dimethoxytrityl-O⁶-diphenylcarbamoyl-N²-isobutyryl-2'-O-(tetrahydropyran-2-yl)guanosine (1.6670 g, 1.78 mmol) was dissolved in methylene chloride (8.9 mL), and succinic anhydride (0.3568 g, 3.57 mmol) and DMAP (0.4362 g, 3.57 mmol) were was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes. Cold water (5 ml) was added to the mixture, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes and extracted with methylene chloride (50 ml). The organic layer was washed with 0.1 M TEAB (20 ml x 3 times) and dried with anhydrous magnesium sulfate, and the magnesium sulfate was removed by filtration. The filtrate was subjected to distillation under a reduced pressure, and the residue was purified by silica gel column chromatography [2.5 cm in diameter x 10 cm in length, methanol - methylene chloride] to obtain 1.7370 g (the yield was 94%) of glassy 5'-O-dimethoxytrityl-O⁶-diphenylcarbamoyl-N²-isobutyryl-2'-O-(tetrahydropyran-2-yl)guanosine 3'-succinate <11>.
Rf-Wert: 0,42 (CHCl&sub3; - MeOH, 9:1 v/v)Rf value: 0.42 (CHCl₃ - MeOH, 9:1 v/v)
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3; - TMS): δ1,12 - 1,19 (6H, m, C(CH&sub3;)&sub2;), 1,24 - 1,70 (6H, m, C-CH&sub2;-C x 3), 2,51 - 2,84 (3H, m, C (CH&sub3;)&sub2; und -CH&sub2;COOH), 2,96 - 3,23 (2H, m O-C &sub2;), 3,29 - 3,49 (2H, m, CH&sub2;COO-), 3,67 - 3,82 (2H, m, H - 5' und 5"), 3,75, 3,74 und 3,79 (9H, s x 3, OC &sub3;), 4,30 - 4,35 (1H, m, H - 4'), 4,68 - 4,74 (1H, m, O-CH-O), 5,25 (1H, dd, J2'3' = 4,88 Hz, Hz'), 5,50 - 5,56 (1H, m, H-3'), 6,27 (1H, d, J1'2' = 7,81 Hz, H - 1'), 6,77 - 7,76 (23H, m, Phenylproton x 23), 8,18 (1H, s, H - 8), 8,31 (1H, s, N² - H), 8,54 - 8,62 (1H, m, COO )¹H-n.m.r. (CDCl3 - TMS): δ1.12 - 1.19 (6H, m, C(CH3)2), 1.24 - 1.70 (6H, m, C-CH2-C x 3), 2.51 - 2.84 (3H, m, C(CH3)2 and -CH2COOH), 2.96 - 3.23 (2H, m O-C2), 3.29 - 3.49 (2H, m, CH2COO-), 3.67 - 3.82 (2H, m, H - 5' and 5"), 3.75, 3.74 and 3.79 (9H, s x 3, OC3), 4.30 - 4.35 (1H, m, H - 4'), 4.68 - 4.74 (1H, m, O-CH-O), 5.25 (1H, dd, J2'3' = 4.88 Hz, Hz'), 5.50 - 5.56 (1H, m, H-3'), 6.27 (1H, d, J1'2' = 7.81 Hz, H - 1'), 6.77 - 7.76 (23H, m, phenyl proton x 23), 8.18 (1H, s, H - 8), 8.31 (1H, s, N² - H), 8.54 - 8.62 (1H, m, COO )
Elementaranalysenwerte (C&sub5;&sub7;H&sub5;&sub8;N&sub6;O&sub1;&sub3; H&sub2;O):Elemental analysis values (C₅₇H₅₈N₆O₁₃H₂O):
Berechnete Werte: C = 65,01, H = 5 74 N = 7,98Calculated values: C = 65.01, H = 5 74 N = 7.98
Gefundene Werte: C = 64,74, H = 5,62, N = 7,92Values found: C = 64.74, H = 5.62, N = 7.92
4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose < 4 > (1,65 mmol/g) (0,3636 g, 0,6 mmol), das in Beispiel 1 erhalten wurde, und 5'-O-Dimethoxytrityl- O&sup6;-diphenylcarbamoyl-N²isobutyryl-2'-O-(tetrahydropyran-2-yl)guanosin-3'-succinat < 11 > (0,4140 g, 0,4 mmol), das in Beispiel 6 erhalten wurde, wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, und das Reaktionsgemisch wurde in Pyridin (6 ml) gelöst. Dann wurden 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,3634 g, 1,2 mmol) und 1-Methylimidazol (0,20 ml, 2,4 mmol) zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (2 ml) wurde zu dem Reaktionsgemisch hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt. Das Reaktionsgemisch wurde mit Methylenchlorid (60 ml) extrahiert und mit Wasser (20 ml) gewaschen. Die organische Schicht wurde konzentriert und einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, Acetanhydrid - Pyridin (1:3 v/v) (15 ml) wurde zu dem Reaktionsgemisch hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionsflüssigkeit wurde konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde hinzugefügt, und eine azeotrope Destillation wurde wiederholt, bis der Pyridingeruch verschwand. Eine kleine Menge des Rückstandes wurde in Methylenchlorid gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol getropft, und die Dimethoxytritylgruppe wurde durch Verwenden eines weißen Pulvers (4,3 mg) bestimmt, das durch Scheiden der gebildeten Ausfällung erhalten wurde (die darauf getragene Menge war 0,5 mmol/g, und die Kondensationsausbeute betrug 98%).4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose <4> (1.65 mmol/g) (0.3636 g, 0.6 mmol) obtained in Example 1 and 5'-O-dimethoxytrityl-O6-diphenylcarbamoyl-N2isobutyryl-2'-O-(tetrahydropyran-2-yl)guanosine-3'-succinate <11> (0.4140 g, 0.4 mmol) obtained in Example 6 was subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), and the reaction mixture was dissolved in pyridine (6 ml). Then, 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3634 g, 1.2 mmol) and 1-methylimidazole (0.20 ml, 2.4 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Cold water (2 ml) was added to the reaction mixture, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes. The reaction mixture was extracted with methylene chloride (60 ml) and washed with water (20 ml). The organic layer was concentrated and subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), acetic anhydride - pyridine (1:3 v/v) (15 ml) was added to the reaction mixture, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction liquid was concentrated, and a small amount of toluene was added, and azeotropic distillation was repeated until the pyridine odor disappeared. A small amount of the residue was dissolved in methylene chloride, and the solution was dropped into ethanol with vigorous stirring, and the dimethoxytrityl group was determined by using a white powder (4.3 mg) obtained by separating the precipitate formed (the amount carried thereon was 0.5 mmol/g, and the condensation yield was 98%).
Der verbliebene Rückstand wurde in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (5 ml) gelöst, und unter Abkühlung auf 0ºC wurde eine Lösung von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,3954 g) in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (5 ml) zu der obigen Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 15 Minuten gerührt, durch eine 5%ige wäßrige Lösung von Natriumhydrogencarbonat neutralisiert und mit Chloroform (100 ml) extrahiert. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Chloroform (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration gesammelt, um ein Acdylcellulosederivat < 12 > , das ein Guanosin-3'-succinat mit einer freien 5'-Hydroxylgruppe trägt, mit einer Ausbeute von 66% zu erhalten (0,4511 g, 0,589 mmol/g).The remaining residue was dissolved in chloroform-methanol (7:3 v/v) (5 ml), and with cooling to 0°C, a solution of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.3954 g) in chloroform-methanol (7:3 v/v) (5 ml) was added to the above solution, and the mixture was stirred for 15 minutes, neutralized by a 5% aqueous solution of sodium hydrogen carbonate and extracted with chloroform (100 ml). The organic layer was concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in chloroform (10 ml), and the solution was added dropwise into ethanol (200 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration to obtain an acrylcellulose derivative < 12 > bearing a guanosine 3'-succinate with a free 5'-hydroxyl group in a yield of 66% (0.4511 g, 0.589 mmol/g).
4-(2-Hydroxyethylsulfönyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose < 4 > (1,65 mmol/g) (0,2727 g, 0,45 mmol), das in Beispiel 4 erhalten wurde, und ein Dinucleotid-3'-phosphodiesterderivat < 8 > (B&sub1; = UAN, B&sub2; = ABz) (0,5048 g, 0,3 mmol) wurden in Pyridin (4,5 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (TPS) (0,2726 g, 0,9 mmol) sowie 1-Methylimidazol (1-Meim) (0,144 mml, 1,8 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, um eine Kondensation zu bewirken. Das Reaktionsgemisch wurde mit Acetanhydrid (2,5 ml) - Pyridin (7,5 ml) behandelt (die Kondensationsausbeute betrug 94%). Dann wurde das Reaktionsgemisch mit einer 2%igen Lösung von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) behandelt und in Chloroform (10 ml) gelöst. Die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft, um ein pulveriges Acetylcellulosederivat mit einem darin eingebrachten Dinucleotid mit einer freien Hydroxylgruppe am 5'-Ende (n = 2, B&sub1; = UAN, B&sub2; = ABZ) mit einer Ausbeute von 72% zu erhalten (0,5090 g, 0,427 mmol/g).4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose < 4 > (1.65 mmol/g) (0.2727 g, 0.45 mmol) obtained in Example 4 and a dinucleotide 3'-phosphodiester derivative <8> (B₁ = UAN, B₂ = ABz) (0.5048 g, 0.3 mmol) was dissolved in pyridine (4.5 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (TPS) (0.2726 g, 0.9 mmol) and 1-methylimidazole (1-Meim) (0.144 mml, 1.8 mmol) were added to the solution to cause condensation. The reaction mixture was treated with acetic anhydride (2.5 mL) - pyridine (7.5 mL) (condensation yield was 94%). Then, the reaction mixture was treated with a 2% solution of p-toluenesulfonic acid monohydrate in chloroform - methanol (7:3 v/v) and dissolved in chloroform (10 mL). The solution was added dropwise into ethanol (200 mL) under vigorous stirring to obtain a powdery acetylcellulose derivative containing a dinucleotide having a free hydroxyl group at the 5'-end (n = 2, B1 = UAN, B2 = ABZ) in a yield of 72% (0.5090 g, 0.427 mmol/g).
Dann wurden die Verbindung < 14 > (n = 2, B&sub1; = UAN, B&sub2; = ABZ) (0,5090 g) und ein Dinucleotid-3'-phosphodiesterderivat < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = UAN) (0,5526 g, 0,326 mmol) in Pyridin (6,5 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2962 g, 0,978 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,156 ml, 1,96 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, um eine Kondensation zu bewirken (die Kondensationsausbeute betrug 99%). Das Reaktionsgemisch wurde in Methylenchlond (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft, um ein pulveriges Acetylcellulosederivat < 15 > mit einem darauf getragenen Tetramer mit einer Äusbeute,Ton 61% (0,7307 g, 0,252 mmol/g) zu erhalten.Then, compound <14> (n=2, B1=UAN, B2=ABZ) (0.5090 g) and a dinucleotide 3'-phosphodiester derivative <8> (B1=B2=UAN) (0.5526 g, 0.326 mmol) were dissolved in pyridine (6.5 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2962 g, 0.978 mmol) and 1-methylimidazole (0.156 mL, 1.96 mmol) were added to the solution to cause condensation (the condensation yield was 99%). The reaction mixture was dissolved in methylene chloride (10 mL), and the solution was added dropwise into ethanol (200 mL) with vigorous stirring to obtain a powdery acetylcellulose derivative <15> having a tetramer supported thereon with a yield of 61% (0.7307 g, 0.252 mmol/g).
Es ist zu erwähnen, daß das Filtrat konzentriert wurde und der Rückstand durch Umkehrphasen-Silicagel-Säulenchromatographie (2,5 cm im Innendurchmesser x 10 cm in der Länge, 40% bis 60% Aceton - 0,05 M TEAB wäßrige Lösung) gereinigt wurde, um 0,1251 g (0,072 ml) von < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = UAN) zurückzubehalten.It is worth mentioning that the filtrate was concentrated and the residue was purified by reverse phase silica gel column chromatography (2.5 cm i.d. x 10 cm in length, 40% to 60% acetone - 0.05 M TEAB aqueous solution) to retain 0.1251 g (0.072 mL) of <8> (B1 = B2 = UAN).
Das pulverförmige, am Tetramer getragene Acetylcellulosederivat < 15 > (0,7306 g), das durch Wiederholen des oben erwähnten Vorgangs erhalten wurde wurde mit Acetanhydrid (2,5 ml) - Pyridin (7,5 ml) behandelt und dann mit einer 2%igen Lösung von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) behandelt. Das Reaktionsgemisch wurde in Chloroform (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol (200 ml) getropft, um ein pulveriges Acetylcellulosederivat < 16 > mit einem darauf getragenen Tetranucleotid mit einer freien Hydroxylgruppe am 5'-Ende (n = 4, B&sub1; = B&sub3; = B - UAN, B&sub2; = ABZ) mit einer Ausbeute von 47% (0,5173 g, 0,273 mmol/g) zu erhalten.The powdered tetramer-supported acetylcellulose derivative <15> (0.7306 g) obtained by repeating the above-mentioned procedure was treated with acetic anhydride (2.5 ml) - pyridine (7.5 ml) and then treated with a 2% solution of p-toluenesulfonic acid monohydrate in chloroform - methanol (7:3 v/v). The reaction mixture was dissolved in chloroform (10 mL), and the solution was dropped into ethanol (200 mL) to obtain a powdery acetylcellulose derivative <16> supporting thereon a tetranucleotide having a free hydroxyl group at the 5'-end (n = 4, B1 = B3 = B - UAN, B2 = ABZ) in a yield of 47% (0.5173 g, 0.273 mmol/g).
Des weiteren wurden < 16 > (n = 4, B&sub1; = B&sub3; = B&sub4; = UAN, B&sub2; = ABZ) (0,5173 g) und < 8 > (B&sub1; = B&sub2; = ABZ) (0,3523 g, 0,21 mmol) in Pyridin (4,2 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,1908 g, 0,63 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,1 ml, 1,26 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, um eine Kondensation zu bewirken (die Kondensationsausbeute betrug 84%). Dann wurde das Reaktionsgemisch mit einer Lösung aus Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) behandelt, um den in ein Sulfonylalken umgewandelten Rückstandsanteil der Acetylcellulose aus Ethanol auszufällen. Die Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten und durch Umkehrphasen-Silicagel-Säulenchromatographie separiert, um ein Hexanucleotid-3'-phosphodiesterderivat < 13 > (m = 6, B&sub1; = B&sub3; = B&sub4; = UAN, B&sub2; = B&sub5; = B&sub6; = ABZ) mit einer Ausbeute von 21% (0,2527 g) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,1310 g (0,078 mmol) eines Dinucleotid-3'-phosphodiesterderivats < 8 > (B&sub1; = B = ABZ) zurückbehalten.Furthermore, <16> (n=4, B1=B3=B4=UAN, B2=ABZ) (0.5173 g) and <8> (B1=B2=ABZ) (0.3523 g, 0.21 mmol) were dissolved in pyridine (4.2 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.1908 g, 0.63 mmol) and 1-methylimidazole (0.1 mL, 1.26 mmol) were added to the solution to cause condensation (the condensation yield was 84%). Then, the reaction mixture was treated with a solution of triethylamine - pyridine (1:3 v/v) to precipitate the residual portion of acetylcellulose converted to a sulfonylalkene from ethanol. The precipitate was collected by filtration and separated by reverse-phase silica gel column chromatography to obtain a hexanucleotide 3'-phosphodiester derivative <13> (m = 6, B1 = B3 = B4 = UAN, B2 = B5 = B6 = ABZ) in a yield of 21% (0.2527 g). In this step, 0.1310 g (0.078 mmol) of a dinucleotide 3'-phosphodiester derivative <8> (B1 = B = ABZ) was retained.
Die Werte der physikalischen Eigenschaften des Hexanucleotid-3'-phosphodiesterderivats < 13 > (m = 6, B&sub1; = B&sub3; = B&sub4; = UAN, B&sub2; = B&sub5; = B&sub6; = ABZ) waren wie folgt.The values of physical properties of the hexanucleotide 3'-phosphodiester derivative <13> (m = 6, B1 = B3 = B4 = UAN, B2 = B5 = B6 = ABZ) were as follows.
Rf-Werte: 0,05 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v), 0,27 (Aceton - Wasser, 7:3 v/v).Rf values: 0.05 (acetone - water, 6:4 v/v), 0.27 (acetone - water, 7:3 v/v).
Ein Hexanucleotidderivat < 13 > (DMTr[AAUUAU]pOH) (0,4208 g, 0,1 mmol) mit einer funktionellen Phosphodiestergruppe am 5'-Ende und das Acetylcellulosederivat < 12 > (0,4244 g, 0,25 mmol) mit einem darauf getragenen Guanosin-3'-succinat mit einer freien 5'-Hydroxylgruppe, das in Beispiel 7 erhalten wurde, wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, und das Reaktionsgemisch wurde in Pyridin (5 ml) gelöst.A hexanucleotide derivative <13> (DMTr[AAUUAU]pOH) (0.4208 g, 0.1 mmol) having a phosphodiester functional group at the 5'-end and the acetylcellulose derivative <12> (0.4244 g, 0.25 mmol) having a guanosine 3'-succinate having a free 5'-hydroxyl group supported thereon obtained in Example 7 were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), and the reaction mixture was dissolved in pyridine (5 ml).
2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,1211 g, 0,4 mmol) und 1-Methylimidazd (0,065 ml, 0,8 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Dann wurde kaltes Wasser (2 ml) in dem Reaktions gemisch hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt, mit Methylenchlorid (60 ml) extrahiert und mit Wasser (20 ml) gewaschen. Die organische Schicht wurde konzentriert und einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, Acetanhydrid - Pyridin (1:3 v/v) (10 ml) wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und die azeotrope Destillation wurde wiederholt, bis der Pyridingeruch verschwand (die Konzentrationsausbeute betrug 98%, 0,117 mmol/g). Der Rückstand wurde in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (10 ml) gelöst, und unter Abkühlen auf 0ºC wurde eine Lösung von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,3954 g) in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (10 ml) zu der Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde während 15 Minuten gerührt, mit einer 5%igen wäßrigen Lösung von Natriumhydrogencarbonat neutralisiert und mit Chloroform (100 ml) extrahiert, und die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Chloroform (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration gesammelt, um ein Acetylcellulosederivat < 18 > mit einem darauf getragenen Heptamer mit einer Hydroxylgruppe am 5'-Ende mit einer Ausbeute von 87% zu erhalten (0,7210 g, 0,121 mmol/g).2,4,6-Triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.1211 g, 0.4 mmol) and 1-methylimidazole (0.065 ml, 0.8 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Then, cold water (2 ml) was added into the reaction mixture, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes, extracted with methylene chloride (60 ml) and washed with water (20 ml). The organic layer was concentrated and subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), acetic anhydride - pyridine (1:3 v/v) (10 ml) was added to the residue, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated, and a small amount of toluene was added to the residue, and azeotropic distillation was repeated until the pyridine odor disappeared (the concentration yield was 98%, 0.117 mmol/g). The residue was dissolved in chloroform-methanol (7:3 v/v) (10 ml), and with cooling to 0 °C, a solution of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.3954 g) in chloroform-methanol (7:3 v/v) (10 ml) was added to the solution. The mixture was stirred for 15 minutes, neutralized with a 5% aqueous solution of sodium hydrogen carbonate and extracted with chloroform (100 ml), and the organic layer was concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in chloroform (10 mL), and the solution was added dropwise into ethanol (200 mL) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration to obtain an acetylcellulose derivative <18> having a heptamer with a hydroxyl group at the 5'-end supported thereon in a yield of 87% (0.7210 g, 0.121 mmol/g).
Das so erhaltene Cellulosederivat < 18 > (0,7210 g, 0,087 mmol) und das Tetranucleotidderivat < 10 > mit einer funktionellen Phosphodiestergruppe am 3'-Ende (DMTr[AAAA]pOH) (0,6424 g, 0,219 mmol), das in Beispiel 5 erhalten wurde, wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, und der Rückstand wurde in Pyridin (8,7 ml) gelöst. 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,1990 g, 0,657 mmol) und 1-Methylimidazol (0,107 ml, 1,314 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Dann wurde kaltes Wasser (2 ml) zu dem Reaktionsgemlsch hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt, mit Methylenchlorid (100 ml) extrahiert und mit Wasser (30 ml) gewaschen. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung würde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration gesammelt, um ein Acetylcellulosederivat < 19 > mit einem darauf getragenen Undecamer mit einer Gesamtausbeute von 69% (0,7911 g, 0,087 mmol/g) zu erhalten (die Kondensationsausbeute betrug 96%). Es ist zu erwahnen, daß 0,2180 g (0,074 mmol) des Tetranucleotidderivats < 10 > von dem Filtrat durch Entfernen von Ethanol mittels Destillation und Durchführen einer Reinigung durch Umkehrphasen-Silicagel-Säulen chromatographie zurückbehalten wurden.The thus obtained cellulose derivative <18> (0.7210 g, 0.087 mmol) and the tetranucleotide derivative <10> having a phosphodiester functional group at the 3'-end (DMTr[AAAA]pOH) (0.6424 g, 0.219 mmol) obtained in Example 5 were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 mL x 3 times), and the residue was dissolved in pyridine (8.7 mL). 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.1990 g, 0.657 mmol) and 1-methylimidazole (0.107 mL, 1.314 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Then, cold water (2 mL) was added to the reaction mixture, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes, extracted with methylene chloride (100 mL) and washed with water (30 mL). The organic layer was concentrated under a reduced pressure, the residue was dissolved in methylene chloride (10 mL), and the solution was dropped into ethanol (200 mL) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration to obtain an acetylcellulose derivative <19> having an undecamer supported thereon with a total yield of 69% (0.7911 g, 0.087 mmol/g) (the condensation yield was 96%). It is to be noted that 0.2180 g (0.074 mmol) of the tetranucleotide derivative <10> was retained from the filtrate by removing ethanol by distillation and performing purification by reversed-phase silica gel column chromatography.
Das am Undecamer getragene Acetylcellulosederivat < 19 > (44,8 mg, 3,97 mmol) wurde in einer 0,5 M Lösung von 2-Pyridincarboxyaldoxim-1,1,3,3-tetramethylguanidin in Pyridin-Wasser (9:1 v/v) (0,6 ml) gelöst, und man ließ die Lösung bei Raumtemperatur 1 Tag lang stehen. Ethanol (30 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, um den Acetylcellulosederivatrückstand < 9 > , von dem das Undecamer freigesetzt worden war, auszufällen, und es wurde eine Zentrifugaltrennung ausgeführt (3000 U/min, 4ºC, 10 Minuten), und der Flüssigkeitsüberstand wurde konzentriert. Konzentrierter wäßriger Ammoniak (28%) (20 ml) wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und das Gemisch wurde abgedeckt, man ließ es bei 55ºC während 6 Stunden stehen und konzentrierte es unter einem reduzierten Druck. SEP-PAK (C-18) (Waters Co.), das für mehr als 3 Stunden nach Injektion von Acetonitril - Wasser (9:1 v/v) (10 ml) stehengelassen wurde, wurde mit 20 ml 50 mM TEAB (hergestellt durch Verdünnen von 1 M TEAB mit einem pH-Wert von 8,0) gewaschen, und die in 50 mM TEAB (20 ml) gelöste Probe (Rückstand) wurde in das gewaschene SEP-PAK (C-18) (Waters Co.) injiziert.The undecamer-supported acetylcellulose derivative <19> (44.8 mg, 3.97 mmol) was dissolved in a 0.5 M solution of 2-pyridinecarboxyaldoxime-1,1,3,3-tetramethylguanidine in pyridine-water (9:1 v/v) (0.6 mL), and the solution was allowed to stand at room temperature for 1 day. Ethanol (30 mL) was added to the reaction solution to precipitate the acetylcellulose derivative residue <9> from which the undecamer had been released, and centrifugal separation was carried out (3000 rpm, 4°C, 10 minutes), and the supernatant liquid was concentrated. Concentrated aqueous ammonia (28%) (20 mL) was added to the residue, and the mixture was covered, allowed to stand at 55°C for 6 hours, and concentrated under a reduced pressure. SEP-PAK (C-18) (Waters Co.) which was allowed to stand for more than 3 hours after injection of acetonitrile - water (9:1 v/v) (10 mL) was washed with 20 mL of 50 mM TEAB (prepared by diluting 1 M TEAB with pH 8.0), and the sample (residue) dissolved in 50 mM TEAB (20 mL) was injected into the washed SEP-PAK (C-18) (Waters Co.).
2-Pyridincarboxyaldoxim und 1,1,3,3-Tetramethylguanidin wurden durch 15% Acetonitril - 50 mM TEAB (30 ml) und dann durch 18% Acetonitril - 50 mM TEAB (10 ml) eluiert, und das Undecamer wurde durch 35% Acetonitril - 50 mM TEAB (10 ml) eluiert, und das Eluat wurde gefriergetrocknet. Der Rückstand wurde in Wasser (1 ml) gelöst, und die Probe (0,1 ml) wurde durch HPLC (M & S PACK C-18, 4,6 mm im Innendurchmesser x 150 mm in der Länge, 10% bis 50% Acetonitril - 0,1 M TEAA) gereinigt (die erzielten Resultate sind in Fig. 1 gezeigt). Das Eluat wurde durch einen UV-Monitor (280 nm) bestatigt, und der mittlere Teil des Hauptpeaks wurde gesammelt und unter reduziertem Druck konzentriert. Wasser (1 ml) wurde zu dem Konzentrat hinzugefügt, und eine Destillation wurde unter einem reduzierten Druck ausgeführt, bis das Triethylamin verschwand. Der Rückstand,wurde in einer wäßrigen Salzsäurelösung (5 ml) mit einem pH-Wert von 2,0 gelöst, und man ließ die Lösung bei Raumtemperatur 2 Tage lang stehen. Die Lösung wurde mit verdünntem wäßrigem Ammoniak neutralisiert und mit Ethylacetat (10 ml x 3 Mal) gewaschen, und die wäßrige Phase wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Die Probe (Rückstand) wurde in Wasser (200 ul) gelöst, und die Probe (180 ul) wurde durch HPLC (M & S PACK C-18, 4,6 mm im Innendurchmesser x 150 mm in der Länge, 5% bis 19% Acetonitril 0,1 M TEAA) gereinigt (die erzielten Resultate sind in Fig. 2 ge- zeigt). Bei diesem Schritt wurde das Eluat durch einen UV-Monitor bestätigt und der mittlere Teil jedes Peaks wurde gesammelt und gefriergetrocknet, um 1,51 OD eines Undecamers (ApApApApApApUpUpApUpG) zu erhalten, von dem alle Schutzgruppen entfernt worden waren.2-Pyridinecarboxyaldoxime and 1,1,3,3-tetramethylguanidine were eluted by 15% acetonitrile-50 mM TEAB (30 mL) and then by 18% acetonitrile-50 mM TEAB (10 mL), and the undecamer was eluted by 35% acetonitrile-50 mM TEAB (10 mL), and the eluate was freeze-dried. The residue was dissolved in water (1 mL), and the sample (0.1 mL) was purified by HPLC (M&S PACK C-18, 4.6 mm in inner diameter x 150 mm in length, 10% to 50% acetonitrile-0.1 M TEAA) (the results obtained are shown in Fig. 1). The eluate was confirmed by a UV monitor (280 nm), and the central part of the main peak was collected and concentrated under reduced pressure. Water (1 ml) was added to the concentrate, and distillation was carried out under a reduced pressure until the triethylamine disappeared. The residue was dissolved in an aqueous hydrochloric acid solution (5 ml) with a pH of 2.0, and the solution was allowed to stand at room temperature for 2 days. The solution was neutralized with dilute aqueous ammonia and washed with ethyl acetate (10 ml x 3 times), and the aqueous phase was concentrated under a reduced pressure. The sample (residue) was dissolved in water (200 µl) and the sample (180 µl) was purified by HPLC (M & S PACK C-18, 4.6 mm in inner diameter x 150 mm in length, 5% to 19% acetonitrile 0.1 M TEAA) (the results obtained are shown in Fig. 2). At this step, the eluate was confirmed by a UV monitor and the The middle part of each peak was collected and freeze-dried to obtain 1.51 OD of an undecamer (ApApApApApApUpUpApUpG) from which all protecting groups had been removed.
Ein 1 M Ammoniumacetatpuffer (pH 5,3) (10 ul) und Nuclease P1 (Yamasa Shoyu Co., 1 mg/5 ul) (3 ul) wurden zu einer wäßrigen Lösung (86,32 ul) des Undecamers < 17 > (0,1 OD) mit entfernten Schutzgruppen hinzugefügt, und man ließ das Gemisch bei 37ºC während 30 Minuten stehen.A 1 M ammonium acetate buffer (pH 5.3) (10 μl) and nuclease P1 (Yamasa Shoyu Co., 1 mg/5 μl) (3 μl) were added to an aqueous solution (86.32 μl) of the deprotected undecamer <17> (0.1 OD), and the mixture was allowed to stand at 37°C for 30 minutes.
Das Enzymzersetzungsprodukt wurde durch HPLC (M & S PACK C-18, 4,6 mm im Innendurchmesser x 150 mm in der Länge) separiert.The enzyme degradation product was separated by HPLC (M & S PACK C-18, 4.6 mm in inner diameter x 150 mm in length).
Das Undecamer wurde vollständig zersetzt, um ein Zersetzungsprodukt mit Adenosin, Guanosin-5-phosphat, Uridin-5'-phosphat und Adenosin-5'-phosphat mit einem Verhältnis von 1,38:1,31:3,00:5,95 zu erhalten.The undecamer was completely decomposed to obtain a decomposition product containing adenosine, guanosine 5-phosphate, uridine 5'-phosphate and adenosine 5'-phosphate in a ratio of 1.38:1.31:3.00:5.95.
Es wird gesagt, daß Nuclease P1 die Eigenschaft aufweist, Adenosin-5'-phosphat weiter zu Adenosin zu zersetzen. Das im Hinblick auf diese Tatsache bestimmte Verhältnis, das heißt das Verhältnis von (Adenosin + Adenosin-5'-phosphat) zu Uridin-5'-phosphat zu Guanosin-5'-phosphat, beträgt 7,00:2,87:1,25.It is said that nuclease P1 has the property of further decomposing adenosine 5'-phosphate into adenosine. The ratio determined in view of this fact, i.e. the ratio of (adenosine + adenosine 5'-phosphate) to uridine 5'-phosphate to guanosine 5'-phosphate is 7.00:2.87:1.25.
Ein Di-2'-deoxyribonudeotid-3'-phosphodiester < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = TBZ) wurde aus 4-(2-Hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose < 4 > , die in Beispiel 1 erhalten wurde, gemäß der folgenden Reaktionsformel synthetisiert: Acetylcellulose Pyridin l-Meim Acetylcellulose Umkehrphasen-Silicagel-ChromatographieA di-2'-deoxyribonucleotide-3'-phosphodiester <20> (B1 = B2 = TBZ) was synthesized from 4-(2-hydroxyethylsulfonyl)dihydrocinnamoylacetylcellulose <4> obtained in Example 1 according to the following reaction formula: Acetylcellulose Pyridine l-Meim Acetylcellulose reversed phase silica gel chromatography
Das Acetylcellulosederivat < 4 > (1,65 mmol/g) (0,3272 g, 0,53 mmol), das in Beispiel 1 erhalten wurde, und Triethyiammonium-N³-benzoyl-5'-O-dimethoxytritylthymidin- 3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 21 > (0,3766 g, 0,4 mmol) wurden in Pyridin (3 ml) gelöst, und das Pyridin wurde durch Destillation unter einem reduzierten Druck entfernt. Dieser Vorgang wurde 3 Mal wiederholt, um Wasser in dem Gemisch durch azeotrope Destillation zu entfernen. Der Rückstand wurde in Pyridin (4 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensuffonylchlorid (0,3634 g, 1,2 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,19 ml, 2,4 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt. Kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 30 Minuten gerührt, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Pyridin (3 ml x 3 Mal) wurde hinzugefügt und durch Destillation unter einem reduzierten Druck entfernt, um Wasser in dem Gemisch durch azeotrope Dehydratation zu entfernen. Der Rückstand wurde in Pyridin (9 ml) gelöst, und Acetanhydrid (3 ml) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und eine Destillation wurde unter einem reduzierten Druck ausgeführt, bis der Pyridingeruch verschwand. Eine sehr kleine Menge des Acetylcellulosederivats mit darin eingebrachtem < 21 > wurde in einer kleinen Menge Methylenchlorid gelöst, und die Lösung wurde in Ethanol getropft, und die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration gesammelt und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um ein Pulver (4,6 mg) zu erhalten.The acetylcellulose derivative <4> (1.65 mmol/g) (0.3272 g, 0.53 mmol) obtained in Example 1 and triethylammonium N³-benzoyl-5'-O-dimethoxytritylthymidine-3'-(2-chlorophenyl)phosphate <21> (0.3766 g, 0.4 mmol) were dissolved in pyridine (3 ml), and the pyridine was removed by distillation under a reduced pressure. This procedure was repeated 3 times to remove water in the mixture by azeotropic Distillation. The residue was dissolved in pyridine (4 ml), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3634 g, 1.2 mmol) and 1-methylimidazole (0.19 ml, 2.4 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Cold water (0.5 ml) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred for 30 minutes, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure. Pyridine (3 ml x 3 times) was added and removed by distillation under a reduced pressure to remove water in the mixture by azeotropic dehydration. The residue was dissolved in pyridine (9 ml), and acetic anhydride (3 ml) was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure. A small amount of toluene was added to the residue, and distillation was carried out under a reduced pressure until the pyridine odor disappeared. A very small amount of the acetyl cellulose derivative with <21> incorporated therein was dissolved in a small amount of methylene chloride, and the solution was dropped into ethanol, and the precipitate formed was collected by filtration and dried under a reduced pressure to obtain a powder (4.6 mg).
Eine 2%ige Lösung (1 ml) von p-Toluolsulfonsäure in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) wurde zu dem Pulver hinzugefügt, und man ließ das Gemisch bei Raumtemperatur während 15 Minuten stehen, um die Dimethoxytritylgruppe zu entfernen, und eine Färbung wurde durch 60% Perchlorsäure - Methanol (3:2 v/v) bewirkt. Durch Messen der decadischen Extinktion bei 498 nm (ε = 72000) wurde die Menge des in das Acetylcellulosederivat eingebrachten < 21 > bestimmt. Es wurde festgestellt, daß die eingebrachte Menge an < 21 > 0,604 mmol/g betrug und die Kondensationsausbeute 100% war.A 2% solution (1 ml) of p-toluenesulfonic acid in chloroform - methanol (7:3 v/v) was added to the powder and the mixture was allowed to stand at room temperature for 15 minutes to remove the dimethoxytrityl group and coloring was effected by 60% perchloric acid - methanol (3:2 v/v). By measuring the decadic absorbance at 498 nm (ε = 72000), the amount of < 21 > incorporated into the acetylcellulose derivative was determined. It was found that the amount of < 21 > incorporated was 0.604 mmol/g and the condensation yield was 100%.
Das verbliebene Acetylcellulosederivat mit darin eingebrachtem < 21 > wurde in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (8 ml) gelöst, und unter Abkühlen auf 0ºC wurde eine Lösung (4 ml) von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,3164 g) in Chloroform - Methanol (7.3 v/v) zu der obigen Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 15 Minuten gerührt. Dann wurde Pyridin (1 ml) zu dem Gemisch hinzugefügt, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, bis das Volumen auf etwa 1/2 reduziert war. Die restliche Lösung wurde unter starkem Ruhren in Ethanol (200 ml) getropft, und die gebildete Ausfallung wurde durch Filtration zuruckbehalten und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um ein pulveriges Acetylcellulosederivat < 22 > (B&sub1; = TBZ) mit einem darauf getragenen Thymidin-3'-phosphatderivat mit einer freien Hydroxylgruppe an der 5'-Position mit einer Ausbeute von 95% (0,5120 g, 0,378 mmol; 0,739 mmol/g) zu erhalten.The remaining acetyl cellulose derivative having < 21 > incorporated therein was dissolved in chloroform-methanol (7:3 v/v) (8 ml), and with cooling to 0 °C, a solution (4 ml) of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.3164 g) in chloroform-methanol (7.3 v/v) was added to the above solution, and the mixture was stirred for 15 minutes. Then, pyridine (1 ml) was added to the mixture, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure until the volume was reduced to about 1/2. The remaining solution was dropped into ethanol (200 ml) with vigorous stirring, and the precipitate formed was collected by filtration and dried under a reduced pressure to obtain a powdery acetyl cellulose derivative. < 22 > (B₁ = TBZ) with a thymidine-3'-phosphate derivative supported thereon having a free hydroxyl group at the 5'-position in a yield of 95% (0.5120 g, 0.378 mmol; 0.739 mmol/g).
< 22 > (B&sub1; = TBZ) und < 21 > (B&sub2; = TBZ) (0,449 g, 0,473 mmol) wurden zu Pyridin (3 ml x 3 Mal) hinzugefügt, und Wasser in dem Gemisch wurde durch azeotrope Dehydratation entfernt. Das Gemisch wurde in Pyridin (9,5 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,4298 g, 1,42 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,225 ml, 2,84 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt (0,432 mmol/g, Kondensationsausbeute = 99%). Kaltes Wasser (1 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert.<22> (B1 = TBZ) and <21> (B2 = TBZ) (0.449 g, 0.473 mmol) were added to pyridine (3 mL x 3 times), and water in the mixture was removed by azeotropic dehydration. The mixture was dissolved in pyridine (9.5 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.4298 g, 1.42 mmol) and 1-methylimidazole (0.225 mL, 2.84 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour (0.432 mmol/g, condensation yield = 99%). Cold water (1 mL) was added to the reaction solution, the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure.
Dann wurde der Rückstand in Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (16 ml) gelöst, und die Lösung wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Der in das Sulfonylalken umgewandelte Rückstandsanteil < 9 > des Acetylcellulosederivats wurde von Ethanol (100 ml) ausgefällt und durch Filtration entfernt. Das Filtrat wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert und durch Umkehrphasen-Silicagel-Chromatographie (10% bis 40% Aceton - 0,05 M TEAB System) separiert, um < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = TBZ) mit einer Ausbeute von 63% (0,3710 g, 0,254 mmol) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,789 g (0,083 mmol) < 21 > (B = TBZ) gewonnen.Then, the residue was dissolved in triethylamine - pyridine (1:3 v/v) (16 mL), and the solution was stirred at room temperature for 2 hours. The residual portion of the acetylcellulose derivative <9> converted to the sulfonylalkene was precipitated by ethanol (100 mL) and removed by filtration. The filtrate was concentrated under a reduced pressure and separated by reverse phase silica gel chromatography (10% to 40% acetone - 0.05 M TEAB system) to obtain <20> (B1 = B2 = TBZ) with a yield of 63% (0.3710 g, 0.254 mmol). In this step, 0.789 g (0.083 mmol) of <21> (B = TBZ) was recovered.
Die physikalischen Eigenschaften von < 20 > (Bi = B&sub2; = TBZ) waren wie folgt.The physical properties of < 20 > (Bi = B₂ = TBZ) were as follows.
Rf-Wert: 0,29 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v)Rf value: 0.29 (acetone - water, 6:4 v/v)
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3; - TMS): δ1,24 (9H, t, J = 7,3 Hz, [C-C &sub3; in N-C&sub2;H&sub5;- Gruppe] x 3), 1,27 (3H, s, CH&sub3;-5), 1,35 (3H, s, CH&sub3;-5), 2,05 - 2,70 (4H, m, H - 2' x 2 und H - 2" x 2), 2,97 (6H, q, C-C &sub2;-N x 3), 3,78 (6H, s, OCH&sub3; x 2), 3,30 - 4,50 (6H, m, H - 4' x 2, H - 5' x 2 und H - 5" x 2), 4,95 - 5,40 (2H, m, H - 3' x 2), 6,29 - 6,45 (2H, m, H - 1' x 2) und 6,30 - 8,60 (33H, m, Phenylproton x 31 und H - 6 x 2)¹H-n.m.r. (CDCl3 - TMS): δ1.24 (9H, t, J = 7.3 Hz, [C-C3 in N-C2H5 group] x 3), 1.27 (3H, s, CH3-5), 1.35 (3H, s, CH3-5), 2.05 - 2.70 (4H, m, H - 2' x 2 and H - 2" x 2), 2.97 (6H, q, C-C2-N x 3), 3.78 (6H, s, OCH3 x 2), 3.30 - 4.50 (6H, m, H - 4' x 2, H - 5' x 2 and H - 5" x 2), 4.95 - 5.40 (2H, m, H - 3' x 2), 6.29 - 6.45 (2H, m, H - 1' x 2) and 6.30 - 8.60 (33H, m, phenyl proton x 31 and H - 6 x 2)
Gemäß der in Beispiel 10 beschriebenen Reaktionsformel wurde ein Di-2'-deoxyribonucleotid-3-phosphodiesterderivat < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = AACa) aus dem Acetylcellulosederivat < 4 > synthetisiert.According to the reaction formula described in Example 10, a di-2'-deoxyribonucleotide-3-phosphodiester derivative <20> (B1 = B2 = AACa) was synthesized from the acetylcellulose derivative <4>.
Spezieller wurden in der gleichen Weise, wie in Beispiel 10 beschrieben, < 4 > (1,65 mmol/g) (0,3272 g, 0,53 mmol) und Triethylammonium-5'-O-dimethoxytrityl-N&sup6;- (dimethylamino)ethylen-2'-deoxyadenosin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 21 > (0,3882 g, 0,4 mmol) in Pyridin (4 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,3634 g, 1,2 mmol) sowie 1-Methyhmidazol (0,19 ml, 2,4 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt. Kaltes Wasser (1 ml) wurde hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert und mit Acetanhydrid - Pyridin (1:3 v/v) (12 ml) (0,590 mmol/g, Kondensationsausbeute = 99%) behandelt. Dann wurde die Reaktionslösung mit einer Lösung (12 ml) von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,3164 g) in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) behandelt und unter starkem führen in Ethanol (200 ml) getropft, um pulveriges < 22 > (B&sub1; - AAca) mit einer Ausbeute von 89% (0,4970 g, 0,357 mmol; 0,717 mmol/g) zu erhalten.More specifically, in the same manner as described in Example 10, <4> (1.65 mmol/g) (0.3272 g, 0.53 mmol) and triethylammonium 5'-O-dimethoxytrityl-N⁶-(dimethylamino)ethylene-2'-deoxyadenosine 3'-(2-chlorophenyl)phosphate <21> (0.3882 g, 0.4 mmol) were dissolved in pyridine (4 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3634 g, 1.2 mmol) and 1-methylimidazole (0.19 mL, 2.4 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Cold water (1 mL) was added to stop the reaction, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure and treated with acetic anhydride - pyridine (1:3 v/v) (12 mL) (0.590 mmol/g, condensation yield = 99%). Then, the reaction solution was treated with a solution (12 mL) of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.3164 g) in chloroform-methanol (7:3 v/v) and added dropwise into ethanol (200 mL) under vigorous stirring to obtain powdery <22>(B1-AAca) with a yield of 89% (0.4970 g, 0.357 mmol; 0.717 mmol/g).
< 22 > (B&sub1; = AAca) und < 21 > (B&sub2; = AAca) (0,4325 g, 0,446 mmol) wurden in Pyridin (9 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensullonylchlorid (0,3377 g, 1,34 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,21 ml, 2,68 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt. Kaltes Wasser (1 ml) wurde hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, und die Reaktionslösung wurde unter hinein reduzierten Druck konzentriert, so daß das Volumen auf etwa 1/2 reduziert wurde, und das Konzentrat wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft, um ein pulveriges, auf Dinucleotid getragenes Acetylcellulosederivat < 23 > mit einer Ausbeute von 0,6900 g, 0,283 mmol (0,410 mmol/g, Kondensationsausbeute = 97%) zu erhalten.<22> (B₁ = AAca) and <21> (B₂ = AAca) (0.4325 g, 0.446 mmol) were dissolved in pyridine (9 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3377 g, 1.34 mmol) and 1-methylimidazole (0.21 mL, 2.68 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Cold water (1 mL) was added to stop the reaction, and the reaction solution was concentrated under reduced pressure so that the volume was reduced to about 1/2, and the concentrate was dropped into ethanol (200 mL) with vigorous stirring to obtain a powdery dinucleotide-supported acetylcellulose derivative <23> in a yield of 0.6900 g, 0.283 mmol (0.410 mmol/g, condensation yield = 97%).
Der durch die Behandlung mit Triethylamin - Pyridin (1.3 v/v) (16 ml) in ein Sulfonylalken umgewandelte Acetylcellulosederivatrückstand < 9 > wurde von Ethanol (100 ml) ausgefallt, durch Filtration zuruckbehalten und durch Umkehrphasen Silicagel-Chromatographie separiert, um < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = AAca) mit einer Ausbeute von 63% (0,3710 g, 0,254 mmol) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurden 0,0789 g (0,083 mmol) < 21 > (B = AAca) gewonnen.The acetylcellulose derivative residue <9> converted to a sulfonylalkene by treatment with triethylamine-pyridine (1.3 v/v) (16 mL) was precipitated from ethanol (100 mL), retained by filtration and separated by reversed phase silica gel chromatography to obtain <20> (B1 = B2 = AAca) in a yield of 63% (0.3710 g, 0.254 mmol). In this step, 0.0789 g (0.083 mmol) of <21> (B = AAca) was recovered.
Die physikalischen Eigenschaften von < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = AAca) sind wie folgt.The physical properties of < 20 > (B₁ = B₂ = AAca) are as follows.
Rf-Wert: 0,34 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v)Rf value: 0.34 (acetone - water, 6:4 v/v)
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3; - TMS): δ1,27 (9H, t, J = 7,3 Hz, [C-C &sub3; in N-Ethylgruppe] x 3), 2,10 (6H, s, C(C &sub3;) von N(C &sub3;)&sub2; x 2), 2,85 - 2,90 (4H, m, H - 2' x 2 und H - 2" x 2), 2,90 (6H, q, C-C &sub2;-N x 3), 3,13 (12H, m, N(CH&sub3;)&sub2; x 2), 3,34 (4H, m, H - 5' x 2 und H - 5" x 2), 3,72 (6H, s, O-CH&sub3; x 2), 4,40 (2H, m, H - 4' x 2), 5,40 - 5,55 (2H, m, H - 3' x 2), 6,36 - 6,50 (2H, m, H - 1' x 2), 6,70 - 7,50 (21H, m, Phenylproton x 21), 8,00 (2H, s, H - 2 x 2) und 8,55 (2H, s, H - 8 x 2)¹H-n.m.r. (CDCl3 - TMS): δ1.27 (9H, t, J = 7.3 Hz, [C-C3 in N-ethyl group] x 3), 2.10 (6H, s, C(C3) of N(C3)2 x 2), 2.85 - 2.90 (4H, m, H - 2' x 2 and H - 2" x 2), 2.90 (6H, q, C-C2-N x 3), 3.13 (12H, m, N(CH3)2 x 2), 3.34 (4H, m, H - 5' x 2 and H - 5" x 2), 3.72 (6H, s, O-CH3 x 2), 4.40 (2H, m, H - 4' x 2), 5.40 - 5.55 (2H, m, H - 3' x 2), 6.36 - 6.50 (2H, m, H - 1' x 2), 6.70 - 7.50 (21H, m, phenyl proton x 21), 8.00 (2H, s, H - 2 x 2) and 8.55 (2H, s, H - 8 x 2)
Gemäß der in Beispiel 10 beschriebenen Reaktionsformel wurde ein Di-2'-deoxyribonucleotid-3'-phosphodiesterderivat < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = GDpc,iBu) aus der Acetylcellulose < 4 > synthetisiertAccording to the reaction formula described in Example 10, a di-2'-deoxyribonucleotide-3'-phosphodiester derivative < 20 > (B₁ = B₂ = GDpc,iBu) was synthesized from the acetylcellulose < 4 >
Spezieller wurden in der gleichen Weise, wie in Beispiel 10 beschrieben, < 4 > (1,65 mmol/g) (0,2424 g, 0,4 mmol) und Triethylammonium-5'-O-dimethoxytrityl-N&sup6;- diphenylcarbamoyl-N²-isobutyryl-2-deoxyguanosin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 21 > (B&sub1; = GDpc,iBu) (0,3375 g, 0,3 mmol) in Pyridin (3 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2726 g, 0,9 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,144 ml, 1,8 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt. Kaltes Wasser (1 ml) wurde hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert und mit Acetanhydrid - Pyridin (1:3 v/v) (10 ml) (0,533 mmol/g, Kondensationsausbeute = 98%) behandelt. Dann wurde die Reaktionslösung mit p- Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,3164 g) und Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (12 ml) behandelt und unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft, um das Pulver < 22 > (B&sub1; = GDpc,iBu) mit einer Ausbeute von 88% (0,4150 g, 0,264 mmol; 0,635 mmol/g) zu erhalten.More specifically, in the same manner as described in Example 10, <4> (1.65 mmol/g) (0.2424 g, 0.4 mmol) and triethylammonium 5'-O-dimethoxytrityl-N⁶-diphenylcarbamoyl-N²-isobutyryl-2-deoxyguanosine 3'-(2-chlorophenyl)phosphate <21> (B₁ = GDpc,iBu) (0.3375 g, 0.3 mmol) were dissolved in pyridine (3 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2726 g, 0.9 mmol) and 1-methylimidazole (0.144 mL, 1.8 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. Cold water (1 mL) was added to stop the reaction, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure and treated with acetic anhydride - pyridine (1:3 v/v) (10 mL) (0.533 mmol/g, condensation yield = 98%). Then, the reaction solution was treated with p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.3164 g) and chloroform - methanol (7:3 v/v) (12 mL) and added dropwise into ethanol (200 mL) under vigorous stirring to obtain the powder <22> (B1 = GDpc,iBu) with a yield of 88% (0.4150 g, 0.264 mmol; 0.635 mmol/g).
< 22 > (B&sub1; = GDpc,iBu) und < 21 > (B&sub2; = GDpc,iBu) (0,3708 g, 0,33 mmol) wurden in Pyridin (6,6 ml) gelöst, und 2,4,6 Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,2999 g, 0,99 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,16 ml, 1,98 mmol) wurden zu der Lösung hin zugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 1 Stunde gerührt.<22> (B₁ = GDpc,iBu) and <21> (B₂ = GDpc,iBu) (0.3708 g, 0.33 mmol) were dissolved in pyridine (6.6 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.2999 g, 0.99 mmol) and 1-methylimidazole (0.16 mL, 1.98 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour.
Kaltes Wasser (1 ml) wurde hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert (0,356 mmol/g, Kondensationsausbeute = 95%). Das Konzentrat wurde mit Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (8 ml) behandelt, und der in ein Sulfonylalken umgewandelte Acetylcellulosederivatrückstand < 9 > wurde von Ethanol (100 ml) ausgefällt, durch Filtration zurückbehalten und durch Umkehrphasen-Silicagel- Säulenchromatographie separiert, um < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = GDpc,iBu) mit einer Ausbeute von 51% (0,2797 g, 0,153 mmol) zu erhalten. Bei diesem Schritt wurde < 21 > (B = GDpc,iBu) in einer Menge von 0,0496 g (0,0441 mmol) gewonnen.Cold water (1 mL) was added to stop the reaction, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure (0.356 mmol/g, condensation yield = 95%). The concentrate was treated with triethylamine - pyridine (1:3 v/v) (8 mL), and the acetylcellulose derivative residue <9> converted to a sulfonylalkene was precipitated from ethanol (100 mL), retained by filtration and separated by reverse-phase silica gel column chromatography to obtain <20> (B1 = B2 = GDpc,iBu) with a yield of 51% (0.2797 g, 0.153 mmol). In this step, < 21 > (B = GDpc,iBu) was obtained in an amount of 0.0496 g (0.0441 mmol).
Die physikalischen Eigenschaften von < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = GDpc,iBu) sind wie folgt.The physical properties of < 20 > (B₁ = B₂ = GDpc,iBu) are as follows.
Rf-Wert: 0,17 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v)Rf value: 0.17 (acetone - water, 6:4 v/v)
¹H-n.m.r. (CDCl&sub3; - TMS): δ1,05 - 1,25 (21H, m [C-C &sub3; in N-Ethylgruppe] x 3 und CH(C &sub3;)&sub2; x 2), 2,50 - 3,45 (14H, m, C-C &sub2;-N x 3, CH(CH&sub3;)&sub2; x 2, H - 2' x 2, H - 2" x 2, H - 5' x 2 und H - 5" x 2), 3,70 (6H, s, OCH&sub3; x 2), 4,50 - 4,65 (2H, m, H - 4' x 2), 5,30 - 5,55 (2H, m, H - 3' x 2), 6,30 - 6,45 (2H, m, H - 1' x 2), 6,66 - 7,64 (41H, m, Phenylproton x 41), 8.05 und 8,07 (2H, s x 2, H - 8 x 2) sowie 8,55 und 8,80 (2H, s x 2 N CO x 2)¹H-n.m.r. (CDCl3 - TMS): δ1.05 - 1.25 (21H, m [C-C3 in N-ethyl group] x 3 and CH(C3)2 x 2), 2.50 - 3.45 (14H, m, C-C2-N x 3, CH(CH3)2 x 2, H - 2' x 2, H - 2" x 2, H - 5' x 2 and H - 5" x 2), 3.70 (6H, s, OCH3 x 2), 4.50 - 4.65 (2H, m, H - 4' x 2), 5.30 - 5.55 (2H, m, H - 3' x 2), 6.30 - 6.45 (2H, m, H - 1' x 2), 6.66 - 7.64 (41H, m, phenyl proton x 41), 8.05 and 8.07 (2H, s x 2, H - 8 x 2) and 8.55 and 8.80 (2H, s x 2 N CO x 2)
Ein Tri-2'-deoxyribonucleotid-3'-phosphodiesterderivat < 24 > wurde aus dem Acetylcellulosederivat < 4 > gemäß der folgenden Reaktionsformel synthetisiert: Acetylcellulose 1-Meim Et&sub3;N-Pyridin Umkehrphasen-Silicagel-SäulenchromatographieA tri-2'-deoxyribonucleotide-3'-phosphodiester derivative < 24 > was synthesized from the acetylcellulose derivative < 4 > according to the following reaction formula: Acetylcellulose 1-Meim Et₃N-pyridine reversed phase silica gel column chromatography
Das Acetylcellulosederivat < 4 > (1,63 mmol/g) (0,8650 g, 1,39 mmol), das in Beispiel 1 erhalten wurde, und N&sup4;-Anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidin-3'-(2-chlorphenyl)phosphat < 21 > (0,9550 g, 1 mmol) wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3) unterzogen, um Wasser aus dem System zu entfernen, und das Gemisch wurde in Pyridin (10 ml) gelöst. Dann wurden 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,9086 g, 3 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,48 ml, 6 mmol) zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur,während 4 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, und das Reaktionsgemisch wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, Wasser wurde aus dem Reaktionsgemisch durch azeotrope Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) entfernt, der Rückstand wurde in Pyridin (7,5 ml) gelöst, Acetanhydrid (2,5 ml) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Konzentrat hinzugefügt, und eine Destillation wurde unter einem reduzierten Druck ausgeführt, bis der Pyridingeruch nicht mehr wahrgenommen wurde (0,554 mmol/g, Kondensationsausbeute = 82%).The acetylcellulose derivative <4> (1.63 mmol/g) (0.8650 g, 1.39 mmol) obtained in Example 1 and N4-anisoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine-3'-(2-chlorophenyl)phosphate <21> (0.9550 g, 1 mmol) were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3) to remove water from the system, and the mixture was dissolved in pyridine (10 ml). Then, 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.9086 g, 3 mmol) and 1-methylimidazole (0.48 ml, 6 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 4 hours. Cold water (0.5 ml) was added to the reaction solution to stop the reaction, and the reaction mixture was concentrated under a reduced pressure, water was removed from the reaction mixture by azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), the residue was dissolved in pyridine (7.5 ml), Acetic anhydride (2.5 mL) was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and a small amount of toluene was added to the concentrate, and distillation was carried out under a reduced pressure until the pyridine odor was no longer perceived (0.554 mmol/g, condensation yield = 82%).
Dann wurde der Rückstand in einer Lösung (20 ml) von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,5412 g) in Chloroform - Methanol (7:3 vv/v) gelöst, und die Lösung wurde bei 0ºC während 15 Minuten gerührt, mit Pyridin neutralisiert und unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (100 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um pulveriges < 25 > (B&sub1; = CAn) mit einer Ausbeute von 64% (0,9624 g, 0,64 mmol; 0,665 mmol/g) zu erhalten.Then, the residue was dissolved in a solution (20 ml) of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.5412 g) in chloroform - methanol (7:3 vv/v), and the solution was stirred at 0 °C for 15 minutes, neutralized with pyridine and concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in methylene chloride (10 ml), and the solution was added dropwise into ethanol (100 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration and dried under a reduced pressure to obtain powdery <25> (B1 = CAn) with a yield of 64% (0.9624 g, 0.64 mmol; 0.665 mmol/g).
Dann wurden < 25 > (B&sub1; = CAn) und < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = TBZ) (0,7565 g, 0,518 mmol) einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, um Wasser in dem System zu entfernen, und das Gemisch wurde in Pyridin (10 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,4840 g, 1,60 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,26 ml, 3,2 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 4 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösuug hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt und unter einem reduzierten Druck konzentriert, um < 26 > zu erhalten.Then, <25> (B1 = CAn) and <20> (B1 = B2 = TBZ) (0.7565 g, 0.518 mmol) were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 mL x 3 times) to remove water in the system, and the mixture was dissolved in pyridine (10 mL), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.4840 g, 1.60 mmol) and 1-methylimidazole (0.26 mL, 3.2 mmol) were added to the solution. The mixture was stirred at room temperature for 4 hours. Cold water (0.5 mL) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes and concentrated under a reduced pressure to obtain <26>.
Der Rückstand wurde in Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (20 ml) gelöst, und die Lösung wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt und unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (100 ml) getropft, um den in ein Sulfonylalken umgewandelten Acetylcellulosederivatrückstand < 9 > auszufällen. Die Ausfällung wurde durch Filtration entfernt, und das Filtrat wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert und durch die Umkehrphasen-Silicagel-Säulenchromatographie (10% bis 40% Aceton - 0,05 M TEAB System) separiert, um < 24 > (B&sub1; = (CAn, B&sub2; = B&sub3; = TBZ) mit einer Ausbeute non 47% (0,5180 g, 0,25 mmol) zu erhalten.The residue was dissolved in triethylamine-pyridine (1:3 v/v) (20 mL), and the solution was stirred at room temperature for 2 hours and concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in methylene chloride (10 mL), and the solution was added dropwise into ethanol (100 mL) with vigorous stirring to precipitate the acetylcellulose derivative residue <9> converted into a sulfonylalkene. The precipitate was removed by filtration, and the filtrate was concentrated under reduced pressure and separated by reverse-phase silica gel column chromatography (10% to 40% acetone - 0.05 M TEAB system) to obtain <24> (B1 = (CAn, B2 = B3 = TBZ) in 47% yield (0.5180 g, 0.25 mmol).
Die physikalischen Eigenschaften non < 24 > (B&sub1; = CAn, B&sub2; = B&sub3; = TBZ) sind wie folgt.The physical properties of non < 24 > (B₁ = CAn, B₂ = B₃ = TBZ) are as follows.
Rf-Werte: 0,19 (Aceton - Wasser, 6:4 v/v), 0,43 (Aceton - Wasser, 7:3 v/v)Rf values: 0.19 (acetone - water, 6:4 v/v), 0.43 (acetone - water, 7:3 v/v)
Ein Tetra-2'-deoxyribonucleotid-3'-phosphodiesterderivat < 27 > (B&sub1; = B&sub2; = AAca, B&sub3; = B&sub4; = GDpc,iBu) wurde von dem Acetylcellulosederivat gemäß der folgenden Reaktionsformel synthetisiert: 1-Meim Pyridin Acetylcellulose Et&sub3;N-Pyridin Umkehrphasen-Silicagel-SäulenchromatographieA tetra-2'-deoxyribonucleotide-3'-phosphodiester derivative <27> (B1 = B2 = AAca, B3 = B4 = GDpc,iBu) was synthesized from the acetylcellulose derivative according to the following reaction formula: 1-Meim Pyridine Acetylcellulose Et₃N-pyridine Reversed phase silica gel column chromatography
Das Acetylcellulosederivat < 4 > (1,63 mmol/g) (0,3750 g, 0,604 mmol), das in Beispiel 1 erhalten wurde, und < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = AAca) (0,6140 g, 0,405 mmol), das in Beispiel 11 erhalten wurde, wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, um Wasser in dem Gemisch zu entfernen, und das Gemisch wurde in Pyridin (10 ml) gelöst. Dann wurden 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,3660 g, 1,21 mmol) und 1-Methylimidazol (0,20 ml, 2,48 mmol) zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 4 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (0,5ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, um die Reaktion zu stoppen, die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und der Rückstand wurde einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, um Wasser in dem Gemisch zu entfernen. Der Rückstand wurde in Pyridin (7,5 ml) gelöst, und Acetanhydrid (2,5 ml) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Konzentrat hinzugefügt, und eine Destillation wurde unter einem reduzierten Druck wiederholt, bis der Pyridingeruch verschwand (0,345 mmol/g, Kondensationsausbeute = 94%).The acetylcellulose derivative <4> (1.63 mmol/g) (0.3750 g, 0.604 mmol) obtained in Example 1 and <20> (B1 = B2 = AAca) (0.6140 g, 0.405 mmol) obtained in Example 11 were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times) to remove water in the mixture, and the mixture was dissolved in pyridine (10 ml). Then, 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3660 g, 1.21 mmol) and 1-methylimidazole (0.20 ml, 2.48 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 4 hours. Cold water (0.5 mL) was added to the reaction solution to stop the reaction, the reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and the residue was subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 mL x 3 times) to remove water in the mixture. The residue was dissolved in pyridine (7.5 mL), and acetic anhydride (2.5 mL) was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and a small amount of toluene was added to the concentrate, and distillation was repeated under a reduced pressure until the pyridine odor disappeared (0.345 mmol/g, condensation yield = 94%).
Der Rückstand wurde in einer Lösung (20 ml) von p-Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,5412 g) in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) gelöst, und die Lösung wurde bei 0ºC während 15 Minuten gerührt, mit Pyridin neutralisiert und unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (100 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um pulveriges < 28 > (B&sub1; = B&sub2; = AACa) mit einer Ausbeute von 76% (0,7720 g, 0,306 mmol; 0,397 mmol/g) zu erhalten.The residue was dissolved in a solution (20 ml) of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.5412 g) in chloroform - methanol (7:3 v/v), and the solution was stirred at 0 °C for 15 minutes, neutralized with pyridine and concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in methylene chloride (10 ml), and the solution was added dropwise into ethanol (100 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration and dried under a reduced pressure to obtain powdery <28> (B₁=B₂=AACa) with a yield of 76% (0.7720 g, 0.306 mmol; 0.397 mmol/g).
Dann wurden < 28 > (B&sub1; = B&sub2; = AACa) und < 20 > (B&sub1; = B&sub2; = GDpc,iBu) (0,6710 g, 0,36 mmol), das in Beispiel 12 erhalten wurde, einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, um Wasser in dem Gemisch zu entfernen, und das Gemisch wurde in Pyridin (10 ml) gelöst, und 2,4,5-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,3336 g, 1,1 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,15 ml, 2,21 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 4 Stunden gerührt, und kalt es Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt und unter einem reduzierten Druck konzentriert.Then, <28> (B1 = B2 = AACa) and <20> (B1 = B2 = GDpc,iBu) (0.6710 g, 0.36 mmol) obtained in Example 12 were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times) to remove water in the mixture, and the mixture was dissolved in pyridine (10 ml), and 2,4,5-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.3336 g, 1.1 mmol) and 1-methylimidazole (0.15 ml, 2.21 mmol) were added to the solution. The mixture was stirred at room temperature for 4 hours, and cold water (0.5 ml) was added to the reaction solution. The mixture was stirred at room temperature for 30 minutes and concentrated under a reduced pressure.
Der Rückstand wurde in Triethylamin - Pyridin (1:3 v/v) (20 ml) gelöst, die Lösung wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt und unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (100 ml) getropft, um den in ein Sulfonylalken umgewandelten Acetylcellulosederivatrückstand < 9 > auszufällen, das durch Filtration entfernt wurde. Das Filtrat wurde unter reduziertem Druck konzentriert und durch Umkehrphasen-Silicagel-Säulenchromatographie (10% bis 40% Aceton - 0,05 M TEAB System) separiert, um < 27 > (B&sub1; = B&sub2; = AACa, B&sub3; = B&sub4; = GDpc,iBu) mit einer Ausbeute von 69% (0,6000 g, 0,21 mmol) zu erhalten.The residue was dissolved in triethylamine - pyridine (1:3 v/v) (20 mL), the solution was stirred at room temperature for 2 hours and concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in methylene chloride (10 mL), and the solution was added dropwise into ethanol (100 mL) with vigorous stirring to precipitate the residue of acetylcellulose derivative <9> converted into a sulfonylalkene, which was removed by filtration. The filtrate was concentrated under reduced pressure and separated by reversed-phase silica gel column chromatography (10% to 40% acetone - 0.05 M TEAB system) to afford <27> (B1 = B2 = AACa, B3 = B4 = GDpc,iBu) in 69% yield (0.6000 g, 0.21 mmol).
Der Wert der physikalischen Eigenschaften von < 27 > (B&sub1; = B&sub2; = AAca, B&sub3; = B&sub4; = GDpc,iBu) ist wie folgt.The value of physical properties of <27> (B1 = B2 = AAca, B3 = B4 = GDpc,iBu) is as follows.
Rf-Wert: 0,17 (Aceton - Wasser, 7:3 v/v)Rf value: 0.17 (acetone - water, 7:3 v/v)
Gemäß der folgenden Reaktionsformel wurde aus der Acetylcellulose < 4 > ein Acetylcellulosederivat < 30 > mit darauf getragenem 2'-Deoxycytidin-3'-succinat synthetisiert, ein Acetylcellulosederivat < 31 > mit darauf getragenem Octa-2'-deoxyribojiucleotid wird aus < 30 > synthetisiert, und die Schutzgruppen wurden von < 31 > entfernt, und eine Reinigung wurde ausgeführt, um Octa-2'-deoxyribonucleotid < 29 > (GpGpApApTpTpCpC) zu erhalten: 1-Meim Pyridin Acetylcellulose Acetylcellulose Umkehrphasen-HPLCAccording to the following reaction formula, an acetylcellulose derivative <30> having 2'-deoxycytidine-3'-succinate supported thereon was synthesized from acetylcellulose <4>, an acetylcellulose derivative <31> having octa-2'-deoxyribojinucleotide supported thereon is synthesized from <30>, and the protecting groups were removed from <31>, and purification was carried out to obtain octa-2'-deoxyribonucleotide <29> (GpGpApApTpTpCpC): 1-Meim Pyridine Acetylcellulose Acetylcellulose reversed phase HPLC
Das Acetylcellulosederivat < 4 > (1,63 mmol/g) (0,9663 g, 1,58 mmol) und N&sup4;-Anisoyl- 3'-O-(3-carboxy)propionyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidin < 32 > (0,802 g, 1,05 mmol) wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, und das Gemisch wurde in Pyridin (10,5 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,9450 g, 3,15 mmol) sowie 1-Methyhmidazol (0,53 ml, 6,3 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (1 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde während 30 Minuten gerührt, Methylenchlorid (100 ml) wurde hinzugefügt, und das Gemisch wurde mit Wasser (40 ml) gewaschen. Die organische Schicht wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und das Konzentrat wurde einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen. Acetanhydrid - Pyridin (1:3 v/v) (20 ml) wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und eine azeotrope Destillation wurde ausgeführt, bis der Pyridingeruch verschwand (0,5 mmol/g, Kondensationsausbeute = 98%). Der Rückstand wurde in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde auf 0ºC abgekühlt, und eine Lösung (10 ml) von p-Toluolsulfonsäuremoriohydrat (0,5412 g) in Chloroform - Methanol (7:3 v/v) wurde zu der obigen Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde während 15 Minuten gerührt und mit Pyridin neutralisiert, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (20 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (200 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um pulverlges < 30 > mit einer Ausbeute von 84% (1,3190 g, 0,877 mmol; 0,665 mmol/g) zu erhalten.The acetylcellulose derivative <4> (1.63 mmol/g) (0.9663 g, 1.58 mmol) and N4-anisoyl-3'-O-(3-carboxy)propionyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine <32> (0.802 g, 1.05 mmol) were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), and the mixture was dissolved in pyridine (10.5 ml), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.9450 g, 3.15 mmol) and 1-methylimidazole (0.53 ml, 6.3 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Cold water (1 ml) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred for 30 minutes, methylene chloride (100 ml) was added, and the mixture was washed with water (40 ml). The organic layer was concentrated under a reduced pressure, and the concentrate was subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times). Acetic anhydride - pyridine (1:3 v/v) (20 ml) was added to the residue, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and a small amount of toluene was added to the residue, and azeotropic distillation was carried out until the pyridine odor disappeared (0.5 mmol/g, condensation yield = 98%). The residue was dissolved in chloroform-methanol (7:3 v/v) (10 ml), and the solution was cooled to 0 °C, and a solution (10 ml) of p-toluenesulfonic acid moiety hydrate (0.5412 g) in chloroform-methanol (7:3 v/v) was added to the above solution. The mixture was stirred for 15 minutes and neutralized with pyridine, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in methylene chloride (20 ml), and the solution was added dropwise into ethanol (200 ml) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration and dried under reduced pressure to obtain powdered <30> in 84% yield (1.3190 g, 0.877 mmol; 0.665 mmol/g).
< 24 > (B&sub1; = CAn, B&sub2; = B&sub3; = TBZ) (0,2735 g, 0,132 mmol), das in Beispiel 13 erhalten wurde, und < 30 > (0,4910 g, 0,33 mmol), das in i) oben erhalten wurde, wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, um Wasser aus dem Gemisch zu entfernen, und das Gemisch wurde in Pyridin (3,3 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropyibenzensulfonylchlorid (0,1599 g, 0,528 mmol) sowie 1-Methylimidazol (0,09 ml, 1,06 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt, und kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt und unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, um Wasser aus dem Gemisch zu entfernen. Der Rückstand wurde in Pyridin (15 ml) gelöst, und Acetanhydrid (5 ml) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 5 Stunden gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und eine kleine Menge Toluol wurde zu dem Konzentrat hinzugefügt, und eine Destillation unter einem reduzierten Druck wurde ausgeführt, bis der Pyridingeruch verschwand (0,163 mmol/g, Kondensationsausbeute = 93%). Dann wurde der Rückstand in Chloroform - Methanol (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde auf 0ºC abgekühlt, und eine Lösung (10 ml) von p Toluolsulfonsäuremonohydrat (0,5412 g) in Chloroform - Methanol (7.3 v/v) wurde zu der obigen Lösung hinzugefügt. Das Gemisch wurde während 15 Minuten gerührt und mit Pyridin neutralisiert, und die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalteil und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um pulveriges < 33 > mit einer Ausbeute von 86% (0,6685 g, 0,115 mmol; 0,171 mmol/g) zu erhalten.<24> (B1 = CAn, B2 = B3 = TBZ) (0.2735 g, 0.132 mmol) obtained in Example 13 and <30> (0.4910 g, 0.33 mmol) obtained in i) above were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times) to remove water from the mixture, and the mixture was dissolved in pyridine (3.3 ml), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.1599 g, 0.528 mmol) and 1-methylimidazole (0.09 ml, 1.06 mmol) were added to the solution. The mixture was stirred at room temperature for 2 hours, and cold water (0.5 ml) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes and concentrated under a reduced pressure. The residue was subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times) to remove water from the mixture. The residue was dissolved in pyridine (15 ml), and acetic anhydride (5 ml) was added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 5 hours. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and a small amount of toluene was added to the concentrate, and distillation under a reduced pressure was carried out until the pyridine odor disappeared (0.163 mmol/g, condensation yield = 93%). Then the residue was dissolved in chloroform-methanol (10 ml), and the solution was cooled to 0ºC, and a solution (10 ml) of p-toluenesulfonic acid monohydrate (0.5412 g) in chloroform-methanol (7.3 v/v) was added to the above solution was added. The mixture was stirred for 15 minutes and neutralized with pyridine, and the reaction solution was concentrated under a reduced pressure. The residue was dissolved in methylene chloride (10 ml), and the solution was added dropwise into ethanol with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration and dried under a reduced pressure to obtain powdery < 33 > in a yield of 86% (0.6685 g, 0.115 mmol; 0.171 mmol/g).
< 33 > (0,445 g, 0,076 mmol) und < 27 > (B&sub5; = B&sub6; = AAca, B&sub7; = B&sub8; = GDpc,iBu) (0,4343 g, 0,152 mmol), das in Beispiel 14 erhalten wurde, wurden einer azeotropen Dehydratation mit Pyridin (5 ml x 3 Mal) unterzogen, und das Gemisch wurde in Pyridin (3,4 ml) gelöst, und 2,4,6-Triisopropylbenzensulfonylchlorid (0,1726 g, 0,57 mmol) sowie 1-Methyiimidazol (0,09 ml, 1,14 mmol) wurden zu der Lösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 2 Stunden gerührt. Kaltes Wasser (0,5 ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt und unter einem reduzierten Druck konzentriert (Kondensationsausbeute = 80,43%). Der Rückstand wurde in Methylenchlorid (10 ml) gelöst, und die Lösung wurde unter starkem Rühren in Ethanol (100 ml) getropft. Die gebildete Ausfällung wurde durch Filtration zurückbehalten und unter einem reduzierten Druck getrocknet, um pulveriges < 31 > mit einer Ausbeute von 91% (0,6120 g, 0,069 mmol; 0,113 mmol/g) zu erhalten.<33> (0.445 g, 0.076 mmol) and <27> (B5 = B6 = AAca, B7 = B8 = GDpc,iBu) (0.4343 g, 0.152 mmol) obtained in Example 14 were subjected to azeotropic dehydration with pyridine (5 ml x 3 times), and the mixture was dissolved in pyridine (3.4 ml), and 2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl chloride (0.1726 g, 0.57 mmol) and 1-methylimidazole (0.09 ml, 1.14 mmol) were added to the solution, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Cold water (0.5 mL) was added to the reaction solution, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes and concentrated under a reduced pressure (condensation yield = 80.43%). The residue was dissolved in methylene chloride (10 mL), and the solution was added dropwise into ethanol (100 mL) with vigorous stirring. The precipitate formed was collected by filtration and dried under a reduced pressure to obtain powdery <31> with a yield of 91% (0.6120 g, 0.069 mmol; 0.113 mmol/g).
Das Octamer < 31 > (30 mg, 3,39 mnol), das in ii) oben erhalten wurde, wurde in einer 0,5 M Lösung von N¹,N¹,N³,N³-Tetramethylguanidin-(E)-2-pyridinald oximat in Pyridin - Wasser (9:1 v/v) (0,6 ml) gelöst, und man ließ die Lösung bei Raumtemperatur einen Tag lang stehen. Ethanol (30ml) wurde zu der Reaktionslösung hinzugefügt, um den Rückstandsanteil (9) des Acetylcellulosederivats auszufällen, der durch Filtraion entfernt wurde. Das Filtrat wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert. Konzentrierter wäßriger Ammoniak (28%) (20 ml) wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und das Gemisch wurde abgedeckt, und man ließ es bei 55ºC 6 Stunden lang stehen, gefolgt von einer Konzentration unter einem reduzierten Druck. Der in einer 50 mM wäßrigen Lösung von TEAB (20 ml) gelöste Octamerrückstand wurde in SEP- PAK (C-18) (vertrieben von Waters Co.) injiziert, das man mehr als 3 Stunden lang nach einer Injektion von Acetonitril-Wasser (9:1 v/v) (10 ml) stehengelassen hatte, und dann mit einer 50 mM wäßrigen Lösung von TEAB (20 ml) gewaschen. Dann wurde N¹.N¹,N³,N³-Tetramethylguanidin-(E)-2-pyridinald oximat mit 5% Acetonitril - 0,05 mM TEAB wäßriger Lösung (20 ml) eluiert, und das Octamer wurde dann mit 10% Acetonitril - 0,05 mM TEAB wäßriger Lösung (20 ml) oder 15% Acetonitril - 0,05 M TEAB wäßriger Lösung (10 ml) eluiert. Das Eluat wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und der Rückstand wurde in Wasser (1 ml) gelöst, und die Probe (0,63 ml) wurde gesammelt, und das Octamer < 34 > mit einer Dimethoxytritylgruppe an der 5'-Position wurde durch HPLC gereinigt. Der mittlere Anteil des Hauptpeaks wurde gesammelt und unter einem reduzierten Druck konzentriert. Wasser (1 ml) wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und es wurde eine Destillation unter einem reduzierten Druck durchgeführt, bis der Triethylamingeruch verschwand. Dann wurde eine 80% wäßrige Lösung von Essigsäure (1,31 ml) zu 1/2 der gesammelten Probe hinzugefügt, und das Gemisch wurde bei Raumtemperatur während 30 Minuten gerührt. Die Reaktionslösung wurde unter einem reduzierten Druck konzentriert, und eine kleine Nienge Wasser wurde zu dem Rückstand hinzugefügt, und die Essigsäure wurde durch azeotrope Destillation entfernt. Der Rückstand wurde in Wasser (1 ml) gelöst, und die Probe (0,46 ml) wurde durch HPLC [LiChrosorb RP-18, 4 mm im Innendurchmesser x 250 mm in der Länge, 10% Acetonitril - 0,1 M TEAA wäßrige Lösung) gereinigt (die erzielten Ergenisse sind in Fig. 3 gezeigt). Der mittlere Anteil des Hauptpeaks wurde gesammelt, und das Eluat wurde unter einem reduzierten Druck auf 1,95 OD des Octamers < 29 > konzentriert, von dem alle Schutzgruppen entfernt worden waren (die Ergebnisse sind in Fig. 4 gezeigt).The octamer <31> (30 mg, 3.39 mmol) obtained in ii) above was dissolved in a 0.5 M solution of N¹,N¹,N³,N³-tetramethylguanidine-(E)-2-pyridinealdeoximate in pyridine-water (9:1 v/v) (0.6 ml), and the solution was allowed to stand at room temperature for one day. Ethanol (30 ml) was added to the reaction solution to precipitate the residual portion (9) of the acetylcellulose derivative, which was removed by filtration. The filtrate was concentrated under a reduced pressure. Concentrated aqueous ammonia (28%) (20 ml) was added to the residue, and the mixture was covered and allowed to stand at 55 °C for 6 hours, followed by concentration under a reduced pressure. The octamer residue dissolved in a 50 mM aqueous solution of TEAB (20 mL) was injected into SEP-PAK (C-18) (sold by Waters Co.) which had been allowed to stand for more than 3 hours after an injection of acetonitrile-water (9:1 v/v) (10 mL) and then washed with a 50 mM aqueous solution of TEAB (20 mL). Then, N¹,N¹,N³,N³-tetramethylguanidine-(E)-2-pyridine alde oximate was added at 5% Acetonitrile-0.05 mM TEAB aqueous solution (20 mL), and the octamer was then eluted with 10% acetonitrile-0.05 mM TEAB aqueous solution (20 mL) or 15% acetonitrile-0.05 M TEAB aqueous solution (10 mL). The eluate was concentrated under a reduced pressure, and the residue was dissolved in water (1 mL), and the sample (0.63 mL) was collected, and the octamer <34> having a dimethoxytrityl group at the 5'-position was purified by HPLC. The middle portion of the main peak was collected and concentrated under a reduced pressure. Water (1 mL) was added to the residue, and distillation was carried out under a reduced pressure until the triethylamine odor disappeared. Then, an 80% aqueous solution of acetic acid (1.31 mL) was added to 1/2 of the collected sample, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes. The reaction solution was concentrated under a reduced pressure, and a small amount of water was added to the residue, and the acetic acid was removed by azeotropic distillation. The residue was dissolved in water (1 mL), and the sample (0.46 mL) was purified by HPLC [LiChrosorb RP-18, 4 mm in inner diameter x 250 mm in length, 10% acetonitrile - 0.1 M TEAA aqueous solution] (the results obtained are shown in Fig. 3). The middle portion of the main peak was collected, and the eluate was concentrated under a reduced pressure to 1.95 OD of the octamer <29> from which all the protecting groups had been removed (the results are shown in Fig. 4).
Das Octamer < 29 > (0,6 OD) wurde in 0,05 M Trispuffer (pH 8,48) (200 ul) gelöst, und Schlangengift-Phosphodiesterase (20 ug) wurde zu der Lösung hinzugefügt, und man ließ das Gemisch bei 37ºC 2 Stunden lang stehen. Dann wurde alkalische Phosphatase (50 ug) zu dem Gemisch hinzugefügt, und man ließ das Gemisch bei 25ºC 1 Stunde lang stehen. Das Enzym-Zersetzungsprodukt wurde durch HPLC [Lichrosorb RP-18, 4 mm im Innendurchmesser x 250 mm in der Länge, 10% Acetonitril - 0,1 M Natriumphosphat wäßrige Lösung (pH 4,2)] separiert, und es wurde bestätigt, daß < 29 > vollständig in die jeweiligen 2'-Deoxynucleotide zersetzt worden war.The octamer <29> (0.6 OD) was dissolved in 0.05 M Tris buffer (pH 8.48) (200 µl), and snake venom phosphodiesterase (20 µg) was added to the solution, and the mixture was allowed to stand at 37°C for 2 hours. Then, alkaline phosphatase (50 µg) was added to the mixture, and the mixture was allowed to stand at 25°C for 1 hour. The enzyme decomposition product was separated by HPLC [Lichrosorb RP-18, 4 mm in inner diameter x 250 mm in length, 10% acetonitrile - 0.1 M sodium phosphate aqueous solution (pH 4.2)], and it was confirmed that <29> was completely decomposed into the respective 2'-deoxynucleotides.
Mit dem raschen Fortschritt in der Biochemie oder Gentechnik, insbesondere mit der Entwicklung der Rekombinations-DNA-Technik, nahm der Bedarf an synthetischen Oligonucleotiden zu, und die vorliegende Erfindung ist dafür nutzbar, diesen Bedarf zu decken.With the rapid progress in biochemistry or genetic engineering, especially with the development of recombinant DNA technology, the need for synthetic oligonucleotides has increased, and the present invention is useful for meeting this need.
Synthetische DNA wird zur Synthese von strukturellen Genen, wie menschlichen Interferonen und menschlichen Wachstumshormonen verwendet, und des weiteren hat die Verwendung synthetischer DNA-Decamere über Eicosamere zur Herstellung von Primeren für eine Bestimmung von Sequenzen, von Linkern zum Klonen, von Sonden für eine Auswahl und Bestätigung angestrebter Gene, von Agenzien für eine direkte Diagnose (genetische Diagnose) von durch Mikroorganismen übertragbaren Krankheiten und von Arzneimitteln, wie Anti-Virus-Agenzien, auf den medizinischen und therapeutischen Gebieten und dergleichen beträchtlich zugenommen. Primere, Linker und Sonden weiben spezielle Sequenzen auf, und große Mengen von hochreinen DNA-Oligomeren sind für deren Herstellung notwendig. Das Verfahren der vorliegenden Erfindung, das einfach und für diese Synthese in großen Mengen geeignet ist, stellt einen großen Beitrag zu deren Herstellung dar.Synthetic DNA is used for the synthesis of structural genes such as human interferons and human growth hormones, and further, the use of synthetic DNA decamers via eicosamers for the preparation of primers for determination of sequences, linkers for cloning, probes for selection and confirmation of target genes, agents for direct diagnosis (genetic diagnosis) of diseases transmitted by microorganisms, and drugs such as anti-virus agents has considerably increased in the medical and therapeutic fields and the like. Primers, linkers and probes have specific sequences, and large amounts of highly pure DNA oligomers are necessary for their preparation. The process of the present invention, which is simple and suitable for this synthesis in large quantities, makes a great contribution to their preparation.
In dem Protein-Biosynthesesystem befindet sich RNA an einer Zwischenposition zwischen DNA und einem Protein und spielt eine wichtige Rolle. Es gibt jedoch viele unbekannte Punkte, und, um die Funktionen zu klären, ist es wüiischenswert, RNA mit einer optionalen Sequenz in großen Mengen zu erzielen. Gemäß dem Verfahren, das Enzyme verwendet, wird RNA lediglich in einer kleinen Menge erhalten, und die angestrebte Sequenz ist eingeschränkt. Demgemäß ist das chemische Syntheseverfahren sehr vorteilhaft. Gemäß dem herkömmlichen Flüssigphasen-Phosphotriester-Verfahren ist es jedoch sehr schwierig, hochreine RNA-Oligomere, wie Decamere, in großen Mengell zu erhalten. Des weiteren wurde bei dem Festphasen-Phosphotriester-Verfahren bislang noch keine allgemeine Vorgehensweise zur Synthese von RNA-Oligomeren, wie sie bei der Synthese von DNA-Oligomeren besteht, bereitgestellt.In the protein biosynthesis system, RNA is located at an intermediate position between DNA and a protein and plays an important role. However, there are many unknown points, and in order to clarify the functions, it is desirable to obtain RNA with an optional sequence in large quantities. According to the method using enzymes, RNA is obtained only in a small amount, and the desired sequence is limited. Accordingly, the chemical synthesis method is very advantageous. However, according to the conventional liquid-phase phosphotriester method, it is very difficult to obtain high-purity RNA oligomers such as decamers in large quantities. Furthermore, in the solid-phase phosphotriester method, a general procedure for synthesizing RNA oligomers as in the synthesis of DNA oligomers has not yet been provided.
Das Verfahren der vorliegenden Erfindung ist sehr wertvoll als dasjenige Verfahren, DNA-Oligomere und RNA-Oligomere leicht und in großen Mengen herzustellen, deren Synthese äußerst arbeitsintensiv und beschwerlich ist.The process of the present invention is very valuable as the process for easily and in large quantities producing DNA oligomers and RNA oligomers, the synthesis of which is extremely laborious and cumbersome.
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