DE19962409A1 - DELTA6-Acetylenase und DELTA6-Desaturase aus Ceratodon purpureus - Google Patents
DELTA6-Acetylenase und DELTA6-Desaturase aus Ceratodon purpureusInfo
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Abstract
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung von ungesättigten Fettsäuren sowie ein Verfahren zur Herstellung von Triglyceriden mit einem erhöhten Gehalt an ungesättigten Fettsäuren. Die Erfindung betrifft weiterhin die Verwendung von DNA Sequenzen codierend für DELTA6-Acetylenase/DELTA6-Desaturasen bzw. DELTA6-Desaturasen zur Herstellung eines transgenen Organismus bevorzugt einer transgenen Pflanze oder eines transgenen Mikroorganismus mit erhöhtem Gehalt an Fettsäuren, Ölen oder Lipiden mit DELTA6-Dreifachbindungen und/oder DELTA6-Doppelbindungen. DOLLAR A Außerdem betrifft die Erfindung eine isolierte Nukleinsäuresequenz; eine Expressionskassette, enthaltend eine Nukleinsäuresequenz, einen Vektor und Organismen, enthaltend mindestens eine Nukleinsäuresequenz bzw. eine Expressionskassette. Außerdem betrifft die Erfindung ungesättigte Fettsäuren sowie Triglyceride mit einem erhöhten Gehalt an ungesättigten Fettsäuren und deren Verwendung.
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung
von ungesättigten Fettsäuren sowie ein Verfahren zur Herstellung
von Triglyceriden mit einem erhöhten Gehalt an ungesättigten
Fettsäuren. Die Erfindung betrifft weiterhin die Verwendung von
DNA Sequenzen codierend für Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturasen bzw.
Δ6-Desaturasen zur Herstellung eines transgenen Organismus,
bevorzugt einer transgenen Pflanze oder eines transgenen Mikro
organismus mit erhöhtem Gehalt an Fettsäuren, Ölen oder Lipiden
mit Δ6-Dreifachbindungen und/oder Δ6-Doppelbindungen.
Außerdem betrifft die Erfindung eine isolierte Nukleinsäure
sequenz; eine Expressionskassette enthaltend eine Nukleinesäure
sequenz, einen Vektor und Organismen enthaltend mindestens eine
Nukleinsäuresequenz bzw. eine Expressionskassette. Außerdem be
trifft die Erfindung ungesättigte Fettsäuren sowie Triglyceride
mit einem erhöhten Gehalt an ungesättigten Fettsäuren und deren
Verwendung.
Fettsäuren und Triglyceride haben eine Vielzahl von Anwendungen
in der Lebensmittelindustrie, der Tierernährung, der Kosmetik und
im Pharmabereich. Je nachdem ob es sich um freie gesättigte oder
ungesättigte Fettsäuren oder um Triglyceride mit einem erhöhten
Gehalt an gesättigten oder ungesättigten Fettsäuren handelt, sind
sie für die unterschiedlichsten Anwendungen geeignet, so werden
beispielsweise mehrfach ungesättigte Fettsäuren Babynahrung zur
Erhöhung des Nährwertes zugesetzt. Hauptsächlich werden die ver
schiedenen Fettsäuren und Triglyceride aus Mikroorganismen wie
Mortierella oder aus Öl-produzierenden Pflanzen wie Soja, Raps,
Sonnenblume und weiteren gewonnen, wobei sie in der Regel in Form
ihrer Triacylglyceride anfallen. Sie können aber auch aus Tieren
wie Fischen gewonnen werden. Die freien Fettsäuren werden vor
teilhaft durch Verseifung hergestellt.
Je nach Anwendungszweck sind Öle mit gesättigten oder ungesättig
ten Fettsäuren bevorzugt, so sind z. B. in der humanen Ernährung
Lipide mit ungesättigten Fettsäuren speziell mehrfach ungesättig
ten Fettsäuren bevorzugt, da sie einen positiven Einfluß auf den
Cholesterinspiegel im Blut und damit auf die Möglichkeit einer
Herzerkrankung haben. Sie finden in verschiedenen diätischen
Lebensmitteln oder Medikamenten Anwendung.
Aufgrund ihrer positiven Eigenschaften hat es in der Ver
gangenheit nicht an Ansätzen gefehlt, Gene, die an der Synthese
von Fettsäuren bzw. Triglyceriden beteiligt sind, für die Her
stellung von Ölen in verschiedenen Organismen mit geändertem
Gehalt an ungesättigten Fettsäuren verfügbar zu machen. So
wird in WO 91/13972 und seinem US-Äquivalent eine Δ-9-Desaturase
beschrieben. In WO 93/11245 wird eine Δ-15-Desaturase in
WO 94/11516 wird eine Δ-12-Desaturase beansprucht. Δ-6-Desatura
sen werden in WO 93/06712, US 5,614,393, WO 96/21022 und
WO 99/27111 beschrieben. Weitere Desaturasen werden beispiels
weise in EP-A-0 550 162, WO 94/18337, WO 97/30582, WO 97/21340,
WO 95/18222, EP-A-0 794 250, Stukey et al., J. Biol. Chem., 265,
1990: 20144-20149, Wada et al., Nature 347, 1990: 200-203
oder Huang et al., Lipids 34, 1999: 649-659 beschrieben. In
WO 96/13591 wird eine Δ-6-Palmitoyl-ACP-Desaturase beschrieben
und beansprucht. Die biochemische Charakterisierung der ver
schiedenen Desaturasen ist jedoch bisher nur unzureichend
erfolgt, da die Enzyme als membrangebundene Proteine nur sehr
schwer zu isolieren und charakterisieren sind (McKeon et al.,
Methods in Enzymol. 71, 1981: 12141-12147, Wang et al., Plant
Physiol. Biochem., 26, 1988: 777-792).
In WO 97/37033 wird eine Δ-12-Acetylenase beschrieben. Durch
dieses Enzym lassen sich ungesättigte C18-Fettsäuren mit einer
Dreifachbindung herstellen. Derartige Fettsäuren können neben der
Anwendung in Nahrungsmittel aufgrund ihrer Reaktivität auch zur
Herstellung von Polymeren verwendet werden. Sperling et al. be
richtete auf einer Tagung (South Lake Tahoe, Canada, June 9-13,
1999) über die Klonierung eines Enzyms, das ebenfalls Dreifach
bindungen in Fettsäuren einführt. Wobei sich die Substrate dieses
Enzyms von denen der Δ-12-Acetylenase unterscheiden und die Drei
fachbindung an anderer Position durch das Enzym in die Fettsäuren
eingeführt wird.
In Hefen konnte sowohl eine Verschiebung des Fettsäurespektrums
zu ungesättigten Fettsäuren hin als auch eine Steigerung der
Produktivität nachgewiesen werden (siehe Huang et al., Lipids 34,
1999: 649-659, Napier et al., Biochem. J., Vol. 330, 1998:
611-614). Die Expression der verschiedenen Desaturasen in trans
genen Pflanzen zeigte allerdings nicht den gewünschten Erfolg.
Eine Verschiebung des Fettsäurespektrum zu ungesättigten Fett
säuren hin konnte gezeigt werden, gleichzeitig zeigte sich aber,
daß die Syntheseleistung der transgenen Pflanzen stark nachließ,
das heißt gegenüber den Ausgangspflanzen konnten nur geringere
Mengen an Ölen isoliert werden.
Nach wie vor besteht daher ein großer Bedarf an neuen Genen,
die für Enzyme kodieren, die an der Biosynthese ungesättigter
Fettsäuren beteiligt sind und es ermöglichen, diese in einem
technischen Maßstab herzustellen.
Es bestand daher die Aufgabe weitere Enzyme für die Synthese
ungesättigter konjugierter Fettsäuren zur Verfügung zu stellen.
Diese Aufgabe wurde durch eine isolierte Nukleinsäuresequenz
gelöst, die für ein Polypeptid mit Δ-6-Acetylenase- und/oder
Δ-6-Desaturaseaktivität codiert, ausgewählt aus der Gruppe:
- a) einer Nukleinsäuresequenz mit der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellten Sequenz,
- b) Nukleinsäuresequenzen, die sich als Ergebnis des degenerier ten genetischen Codes von der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellten Nukleinsäuresequenz ab leiten,
- c) Derivate der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellten Nukleinsäuresequenz, die für Polypeptide mit der in SEQ ID NO: 2 dargestellten Aminosäuresequenzen codieren und mindestens 75% Homologie auf Aminosäureebene aufweisen, ohne daß Mess die enzymatische Wirkung der Poly peptide wesentlich reduziert ist.
Unter Derivate(n) sind beispielsweise funktionelle Homologe der
von SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 kodierten
Enzyme oder deren enzymatischer Aktivität, das heißt Enzyme, die
dieselben enzymatischen Reaktionen wie die von SEQ ID NO: 1,
SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 kodierten Enzyme katalysieren,
zu verstehen. Diese Gene ermöglichen ebenfalls eine vorteilhafte
Herstellung von ungesättigten Fettsäuren mit Dreifachbindungen
und/oder Doppelbindungen in Δ6-Position. Unter ungesättigten
Fettsäuren sind im folgenden einfach oder mehrfach ungesättigte
Fettsäuren, die Dreifachbindungen und/oder Doppelbindungen
aufweisen, zu verstehen. Die Dreifach- und/oder Doppel
bindungen können konjugiert oder nicht konjugiert sein. Die
in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 genannten
Sequenzen kodieren für ein neue Enzyme, die eine Acetylenase-
und/oder Δ6-Desaturase-Aktivität aufweisen.
Das erfindungsgemäße Enzym Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase führt vor
teilhaft in Fettsäurereste von Glycerolipiden eine cis-Doppel
bindung in Position C6-C7 ein und/oder konvertiert eine bereits
vorhandene cis-Doppelbindung in Position C6-C7 in eine Dreifach
bindung (siehe SEQ ID NO: 1 oder SEQ ID NO: 3). Das Enzym hat
außerdem eine Δ6-Desaturase-Aktivität, die vorteilhaft in Fett
säurereste von Glycerolipiden ausschließlich eine cis-Doppel
bindung in Postion C6-C7 einführt. Diese Aktivität hat auch das
Enzym mit der in SEQ ID NO: 11 genannten Sequenz. Bei dem es
sich um eine monofunktionelle Δ6-Desaturase handelt.
Die erfindungsgemäße(n) Nukleinsäuresequenz(en) (für die
Anmeldung soll der singular den plural umfassen und umgekehrt)
oder Fragmente davon können vorteilhaft zur Isolierung weiterer
genomischer Sequenzen über Homologiescreening verwendet werden.
Die genannten Derivate lassen sich beispielsweise aus anderen
Organismen eukaryontischen Organismen wie Pflanzen wie speziell
Moosen, Dinoflagellaten oder Pilze isolieren.
Weiterhin sind unter Derivaten bzw. funktionellen Derivaten der
in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 genannten
Sequenzen beispielsweise Allelvarianten zu verstehen, die min
destens 70% Homologie auf der abgeleiteten Aminosäureebene, vor
teilhaft mindestens 75% Homologie, bevorzugt mindestens 80%
Homologie, besonders bevorzugt mindestens 85% Homologie, ganz
besonders bevorzugt 90% Homologie aufweisen. Die Homologie wurde
über den gesamten Aminosäurebereich berechnet. Es wurde das
Programm PileUp, BESTFIT, GAP, TRANSLATE bzw. BACKTRANSLATE
(= Bestandteil des Programmpaketes UWGCG, Wisconsin Package,
Version 10.0-UNIX, January 1999, Genetics Computer Group, Inc.,
Deverux et al., Nucleic. Acid Res., 12, 1984: 387-395) verwendet
(J. Mol. Evolution., 25, 351-360, 1987, Higgins et al., CABIOS, 5
1989: 151-153). Die von den genannten Nukleinsäuren abgeleitete
Aminosäuresequenzen sind Sequenz SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4 und
SEQ ID NO: 12 zu entnehmen. Unter Homologie ist Identität zu ver
stehen, das heißt die Aminosäuresequenzen sind zu mindestens 70%
identisch. Die erfindungsgemäßen Sequenzen sind auf Nukleinsäure
ebene mindestens 65% Homolog, bevorzugt mindestens 70%, be
sonders bevorzugt 75%, ganz besonders bevorzugt mindesten 80%.
Allelvarianten umfassen insbesondere funktionelle Varianten, die
durch Deletion, Insertion oder Substitution von Nukleotiden aus
der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestell
ten Sequenz erhältlich sind, wobei die enzymatische Aktivität der
abgeleiteten synthetisierten Proteine erhalten bleibt.
Solche DNA-Sequenzen lassen sich ausgehend von den in
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 beschriebenen
DNA-Sequenzen oder Teilen dieser Sequenzen, beispielsweise
mit üblichen Hybridisierungsverfahren oder der PCR-Technik
aus anderen Eukaryonten wie beispielsweise den oben genannt
isolieren. Diese DNA-Sequenzen hybridisieren unter Standard
bedingungen mit den genannten Sequenzen. Zur Hybrisierung werden
vorteilhaft kurze Oligonukleotide beispielsweise der konser
vierten Bereiche, die über Vergleiche mit anderen Acetylenase-
und/oder Desaturasegenen in dem Fachmann bekannter Weise
ermittelt werden können, verwendet. Vorteilhaft werden die
Histidin-Box-Sequenzen verwendet. Es können aber auch längere
Fragmente der erfindungsgemäßen Nukleinsäuren oder die voll
ständigen Sequenzen für die Hybridisierung verwendet werden.
Je nach der verwendeten Nukleinsäure: Oligonukleotid, längeres
Fragment oder vollständige Sequenz oder je nachdem welche
Nukleinsäureart DNA oder RNA für die Hybridisierung verwendet
werden, variieren diese Standardbedingungen. So liegen bei
spielsweise die Schmelztemperaturen für DNA : DNA-Hybride ca. 10°C
niedriger als die von DNA : RNA-Hybriden gleicher Länge.
Unter Standardbedingungen sind beispielsweise je nach Nukleinsäu
re Temperaturen zwischen 42 und 58°C in einer wäßrigen Puffer
lösung mit einer Konzentration zwischen 0,1 bis 5 × SSC (1 × SSC
= 0,15 M NaCl, 15 mM Natriumcitrat, pH 7,2) oder zusätzlich in
Gegenwart von 50% Formamid wie beispielsweise 42°C in 5 × SSC,
50% Formamid zu verstehen. Vorteilhafterweise liegen die
Hybridisierungsbedingungen für DNA : DNA-Hybride bei 0,1 × SSC und
Temperaturen zwischen etwa 20°C bis 45°C, bevorzugt zwischen etwa
30°C bis 45°C. Für DNA : RNA-Hybride liegen die Hybridisierungs
bedingungen vorteilhaft bei 0,1 × SSC und Temperaturen zwischen
etwa 30°C bis 55°C, bevorzugt zwischen etwa 45°C bis 55°C. Diese
angegebenen Temperaturen für die Hybridisierung sind beispielhaft
kalkulierte Schmelztemperaturwerte für eine Nukleinsäure mit ein
er Länge von ca. 100 Nukleotiden und einem G + C-Gehalt von 50%
in Abwesenheit von Formamid. Die experimentellen Bedingungen für
die DNA-Hybridisierung sind in einschlägigen Lehrbüchern der
Genetik wie beispielsweise Sambrook et al., "Molecular Cloning",
Cold Spring Harbor Laboratory, 1989, beschrieben und lassen sich
nach dem Fachmann bekannten Formeln beispielsweise abhängig von
der Länge der Nukleinsäuren, der Art der Hybride oder dem G +
C-Gehalt berechnen. Weitere Informationen zur Hybridisierung kann
der Fachmann folgenden Lehrbüchern entnehmen: Ausubel et al.
(eds), 1985, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley &
Sons, New York; Hames and Higgins (eds), 1985, Nucleic Acids
Hybridization: A Practical Approach, IRL Press at Oxford. Uni
versity Press, Oxford; Brown (ed), 1991, Essential Molecular Bio
logy: A Practical Approach, IRL Press at Oxford University Press,
Oxford.
Weiterhin sind unter Derivaten Homologe der Sequenz SEQ ID NO: 1,
SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 beispielsweise eukaryontische
Homologe, verkürzte Sequenzen, Einzelstrang-DNA der codierenden
und nichtcodierenden DNA-Sequenz oder RNA der codierenden und
nichtcodierenden DNA-Sequenz zu verstehen.
Außerdem sind unter Homologen der Sequenzen SEQ ID NO: 1,
SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 Derivate wie beispielsweise
Promotorvarianten zu verstehen. Diese Varianten können durch ein
oder mehrere Nukleotidaustausche, durch Insertion(en) und/oder
Deletion(en) verändert sein, ohne daß aber die Funktionalität
bzw. Wirksamkeit der Promotoren beeinträchtigt sind. Des weiteren
können die Promotoren durch Veränderung ihrer Sequenz in ihrer
Wirksamkeit erhöht oder komplett durch wirksamere Promotoren auch
artfremder Organismen ausgetauscht werden.
Unter Derivaten sind auch vorteilhaft Varianten zu verstehen,
deren Nukleotidsequenz im Bereich -1 bis -2000 vor dem Startkodon
so verändert wurden, daß die Genexpression und/oder die Protein
expression verändert, bevorzugt erhöht wird. Weiterhin sind unter
Derivaten auch Varianten zu verstehen, die am 3'-Ende verändert
wurden.
Unter Derivaten sind auch die Antisense-DNAs zu verstehen, die
zur Hemmung der Proteinbiosynthese der erfindungsgemäßen Proteine
verwendet werden können. Diese Antisense-DNAs gehören zu den
erfindungsgemäßen nichtfunktionellen Derivaten, wie Derivate, die
keine enzymatische Aktivität aufweisen. Weitere dem Fachmann be
kannte Methoden der Herstellung von nichtfunktionellen Derivaten
sind die sogenannte Cosuppression, die Verwendung von Ribozymen
und Introns. Ribozyme sind katalytische RNA-Moleküle mit Ribo
nukleaseaktivität, die Einzelstrang Nukleinsäuren wie mRNA, zu
denen sie eine Komplementarität aufweisen, schneiden können.
Dadurch können mit Hilfe dieser Ribozyme (Haselhoff and Gerlach,
Nature, 334, 1988: 585-591) mRNA-Transkripte katalytisch ges
palten werden und so die Translation dieser mRNA unterdrückt
werden. Derartige Ribozyme können speziell auf ihre Aufgaben hin
zugeschnitten werden (US 4,987,071; US 5,116,742 und Bartel et
al., Science 261, 1993: 1411-1418). Mit Hilfe der Antisense-DNA
können dadurch Fettsäuren, Lipide oder Öle mit einem erhöhten
Anteil an gesättigten Fettsäuren hergestellt werden.
Die erfindungsgemäßen Nukleinsäuresequenzen, die für eine
Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase und/oder Δ6-Desaturase kodieren,
können synthetisch hergestellt oder natürlich gewonnen sein oder
eine Mischung aus synthetischen und natürlichen DNA-Bestandteilen
enthalten, sowie aus verschiedenen heterologen Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase und/oder Δ6-Desaturase-Genabschnitten verschiedener
Organismen bestehen. Im allgemeinen werden synthetische Nukleo
tid-Sequenzen mit Codons erzeugt, die von den entsprechenden
Wirtsorganismen beispielsweise Pflanzen bevorzugt werden. Dies
führt in der Regel zu einer optimalen Expression der heterologen
Gene. Diese von Pflanzen bevorzugten Codons können aus Codons
mit der höchsten Proteinhäufigkeit bestimmt werden, die in den
meisten interessanten Pflanzenspezies exprimiert werden. Ein Bei
spiel für Corynebacterium glutamicum ist gegeben in: Wada et al.
(1992) Nucleic Acids Res. 20: 2111-2118. Die Durchführung solcher
Experimente sind mit Hilfe von Standardmethoden durchführbar und
sind dem Fachmann auf dem Gebiet bekannt.
Funktionell äquivalente Sequenzen, die für das Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gen kodieren, sind solche
Derivate der erfindungsgemäßen Sequenzen, welche trotz abweichen
der Nukleotidsequenz noch die gewünschten Funktionen, das heißt
die enzymatische Aktivität der Proteine besitzen. Funktionelle
Äquivalente umfassen somit natürlich vorkommende Varianten der
hierin beschriebenen Sequenzen sowie künstliche, z. B. durch
chemische Synthese erhaltene, an den Codon-Gebrauch einer Pflanze
angepaßte, künstliche Nukleotid-Sequenzen.
Außerdem sind artifizielle DNA-Sequenzen geeignet, solange sie,
wie oben beschrieben, die gewünschte Eigenschaft beispielsweise
der Erhöhung des Gehaltes von Δ6-Dreifachbindungen oder
Δ6-Doppelbindungen in Fettsäuren, Ölen oder Lipiden in der
Pflanze durch Überexpression des Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase-
und/oder Δ6-Deasaturase-Gens in Kulturpflanzen vermitteln. Solche
artifiziellen DNA-Sequenzen können beispielsweise durch Rücküber
setzung mittels Molecular Modelling konstruierter Proteine, die
Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Aktivität
aufweisen oder durch in vitro-Selektion ermittelt werden. Mög
liche Techniken zur in vitro-Evolution von DNA zur Veränderung
bzw. Verbesserung der DNA-Sequenzen sind beschrieben bei Patten,
P. A. et al., Current Opinion in Biotechnology 8, 724-733 (1997)
oder bei Moore, J. C. et al., Journal of Molecular Biology 272,
336-347 (1997). Besonders geeignet sind codierende DNA-Sequenzen,
die durch Rückübersetzung einer Polypeptidsequenz gemäß der für
die Wirtspflanze spezifischen Kodon-Nutzung erhalten werden.
Die spezifische Kodon-Nutzung kann ein mit pflanzengenetischen
Methoden vertrauter Fachmann durch Computerauswertungen anderer,
bekannter Gene der zu transformierenden Pflanze leicht ermitteln.
Als weitere geeignete äquivalente Nukleinsäure-Sequenzen sind
zu nennen Sequenzen, welche für Fusionsproteine kodieren, wobei
Bestandteil des Fusionsproteins ein Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase-
und/oder Δ6-Desaturase-Polypeptid oder ein funktionell äqui
valenter Teil davon ist. Der zweite Teil des Fusionsproteins
kann z. B. ein weiteres Polypeptid mit enzymatischer Aktivität
sein oder eine antigene Polypeptidsequenz mit deren Hilfe
ein Nachweis auf Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder
Δ6-Desaturase-Expression möglich ist (z. B. myc-tag oder his-tag).
Bevorzugt handelt es sich dabei jedoch um eine regulative
Proteinsequenz, wie z. B. ein Signalsequenz für das ER, das das
Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Protein an
den gewünschten Wirkort leitet.
Vorteilhaft können die Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- bzw.
Δ6-Desaturase-Gene im erfindungsgemäßen Verfahren mit weiteren
Genen der Fettsäurebiosynthese kombiniert werden. Beispiele für
derartige Gene sind die Acetyltransferasen, weitere Desaturasen
oder Elongasen. Für die in-vivo und speziell in-vitro Synthese
ist die Kombination mit z. B. NADH-Cytochrom B5 Reduktasen
vorteilhaft, die Reduktionsäquivalente aufnehmen oder abgeben
können.
Unter den erfindungsgemäßen Aminosäuresequenzen sind Proteine zu
verstehen, die eine in den Sequenzen SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4
oder SEQ ID NO: 12 dargestellte Aminosäuresequenz oder eine
daraus durch Substitution, Inversion, Insertion oder Deletion
von einem oder mehreren Aminosäureresten erhältliche Sequenz ent
halten, wobei die enzymatische Aktivität des in SEQ ID NO: 2,
SEQ ID NO: 4 oder SEQ ID NO: 12 dargestellten Proteins erhalten
bleibt bzw. nicht wesentlich reduziert wird. Unter nicht wesent
lich reduziert sind alle Enzyme zu verstehen, die noch mindestens
10%, bevorzugt 20%, besonders bevorzugt 30% der enzymatischen
Aktivität des Ausgangsenzyms aufweisen. Dabei können beispiels
weise bestimmte Aminosäuren durch solche mit ähnlichen physiko
chemischen Eigenschaften (Raumerfüllung, Basizität, Hydrophobizi
tät etc.) ersetzt werden. Beispielsweise werden Argininreste ge
gen Lysinreste, Valinreste gegen Isoleucinreste oder Asparagin
säurereste gegen Glutaminsäurereste ausgetauscht. Es können aber
auch ein oder mehrere Aminosäuren in ihrer Reihenfolge ver
tauscht, hinzugefügt oder entfernt werden, oder es können mehrere
dieser Maßnahmen miteinander kombiniert werden.
Unter Derivaten sind auch funktionelle Äquivalente zu verstehen,
die insbesondere auch natürliche oder künstliche Mutationen einer
ursprünglich isolierten für eine Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase-
und/oder Δ6-Desaturase codierende Sequenz beinhalten, welche
weiterhin die gewünschte Funktion, das heißt deren enzymatische
Aktivität nicht wesentlich reduziert ist, zeigen. Mutationen
umfassen Substitutionen, Additionen, Deletionen, Vertauschungen
oder Insertionen eines oder mehrerer Nukleotidreste. Somit werden
beispielsweise auch solche Nukleotidsequenzen durch die vor
liegende Erfindung mit umfaßt, welche man durch Modifikation der
D6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase Nukleotid
sequenz erhält. Ziel einer solchen Modifikation kann z. B. die
weitere Eingrenzung der darin enthaltenen codierenden Sequenz
oder z. B. auch die Einfügung weiterer Restriktionsenzym-Schnitt
stellen sein.
Funktionelle Äquivalente sind auch solche Varianten, deren
Funktion, verglichen mit dem Ausgangsgen bzw. Genfragment,
abgeschwächt (= nicht wesentlich reduziert) oder verstärkt ist
(= Enzymaktivität stärker als die Aktivität des Ausgangsenzym,
das heißt Aktivität ist höher als 100%, bevorzugt höher als
110%, besonders bevorzugt höher als 130%).
Die Nukleinsäuresequenz kann dabei vorteilhaft beispielsweise
eine DNA- oder cDNA-Sequenz sein. Zur Insertion in eine er
findungsgemäßen Expressionskassette geeignete codierende Se
quenzen sind beispielsweise solche, die für eine Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase und/oder Δ6-Desaturase mit den oben beschriebenen
Sequenzen kodieren und die dem Wirt die Fähigkeit zur Über
produktion von Fettsäuren, Ölen oder Lipiden mit Dreifach
bindungen und/oder Doppelbindungen in Δ6-Position verleihen.
Diese Sequenzen können homologen oder heterologen Ursprungs sein.
Unter der erfindungsgemäßen Expressionskassette (= Nukleinsäure
konstrukt oder -fragment) sind die in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3
oder SEQ ID NO: 11 genannten Sequenzen, die sich als Ergebnis
des genetischen Codes und/oder deren funktionellen oder nicht
funktionellen Derivate zu verstehen, die mit einem oder mehreren
Regulationssignalen vorteilhafterweise zur Erhöhung der Gen
expression funktionell verknüpft wurden und welche die Expression
der codierenden Sequenz in der Wirtszelle steuern. Diese regu
latorischen Sequenzen sollen die gezielte Expression der Gene und
der Proteinexpression ermöglichen. Dies kann beispielsweise je
nach Wirtsorganismus bedeuten, daß das Gen erst nach Induktion
exprimiert und/oder überexprimiert wird, oder daß es sofort ex
primiert und/oder überexprimiert wird. Beispielsweise handelt es
sich bei diesen regulatorischen Sequenzen um Sequenzen an die
Induktoren oder Repressoren binden und so die Expression der
Nukleinsäure regulieren. Zusätzlich zu diesen neuen Regulations
sequenzen oder anstelle dieser Sequenzen kann die natürliche
Regulation dieser Sequenzen vor den eigentlichen Strukturgenen
noch vorhanden sein und gegebenenfalls genetisch verändert worden
sein, so daß die natürliche Regulation ausgeschaltet und die
Expression der Gene erhöht wurde. Das Genkonstrukt kann aber auch
einfacher aufgebaut sein, das heißt es wurden keine zusätzlichen
Regulationssignale vor die Nukleinsäuresequenz oder dessen Deri
vate inseriert und der natürliche Promotor mit seiner Regulation
wurde nicht entfernt. Stattdessen wurde die natürliche Regu
lationssequenz so mutiert, daß keine Regulation mehr erfolgt und/
oder die Genexpression gesteigert wird. Diese veränderten Promo
toren können in Form von Teilsequenzen (= Promotor mit Teilen
der erfindungsgemäßen Nukleinsäuresequenzen) auch allein vor
das natürliche Gen zur Steigerung der Aktivität gebracht werden.
Das Genkonstrukt kann außerdem vorteilhafterweise auch eine oder
mehrere sogenannte "enhancer Sequenzen" funktionell verknüpft
mit dem Promotor enthalten, die eine erhöhte Expression der
Nukleinsäuresequenz ermöglichen. Auch am 3'-Ende der DNA-
Sequenzen können zusätzliche vorteilhafte Sequenzen inseriert
werden wie weitere regulatorische Elemente oder Terminatoren.
Die Δ6-Acetylenase-/Δ6-Desaturase und/oder Δ6-Desaturase-Gene
können in einer oder mehreren Kopien in der Expressionskassette
(= Genkonstrukt) enthalten sein.
Die regulatorischen Sequenzen bzw. Faktoren können dabei wie
oben beschrieben vorzugsweise die Genexpression der eingeführten
Gene positiv beeinflussen und dadurch erhöhen. So kann eine Ver
stärkung der regulatorischen Elemente vorteilhafterweise auf der
Transkriptionsebene erfolgen, indem starke Transkriptionssignale
wie Promotoren und/oder "Enhancer" verwendet werden. Daneben ist
aber auch eine Verstärkung der Translation möglich, indem bei
spielsweise die Stabilität der mRNA verbessert wird.
Als Promotoren in der Expressionskassette sind grundsätzlich alle
Promotoren geeignet, die die Expression von Fremdgenen in Orga
nismen vorteilhaft in Pflanzen oder Pilzen steuern können. Vor
zugsweise verwendet man insbesondere ein pflanzliche Promotoren
oder Promotoren, die aus einem Pflanzenvirus entstammen. Vor
teilhafte Regulationssequenzen für das erfindungsgemäße Verfahren
sind beispielsweise in Promotoren wie cos-, tac-, trp-, tet-,
trp-tet-, lpp-, lac-, lpp-lac-, lacIq-, T7-, T5-, T3-, gal-, trc-,
ara-, SP6-, λ-PR- oder im λ-PL-Promotor enthalten, die vorteil
hafterweise in gram-negativen Bakterien Anwendung finden. Weitere
vorteilhafte Regulationssequenzen sind beispielsweise in den
gram-positiven Promotoren amy und SPO2, in den Hefe- oder Pilz
promotoren ADC1, MFα, AC, P-60, CYC1, GAPDH, TEF, rp28, ADH
oder in den Pflanzenpromotoren wie CaMV/35S [Franck et al., Cell
21 (1980) 285-294], SSU, OCS, lib4, STLS1, B33, nos (= Nopalin
Synthase Promotor) oder im Ubiquitin-Promotor enthalten. Die
Expressionskassette kann auch einen chemisch induzierbaren
Promotor enthalten, durch den die Expression des exogenen
Δ6-ACETYLENASE/Δ6-DESATURASE- und/oder Δ6-DESATURASE-Gens in den
Organismen vorteilhaft in den Pflanzen zu einem bestimmten Zeit
punkt gesteuert werden kann. Derartige vorteilhafte Pflanzen
promotoren sind beispielsweise deer PRP1-Promotor [Ward et al.,
Plant. Mol. Biol. 22 (1993), 361-366], ein durch Benzensulfonamid-
induzierbarer (EP 388186), ein durch Tetrazyklin-induzierbarer
(Gatz et al., (1992) Plant J. 2, 397-404), ein durch Salizylsäure
induzierbarer Promotor (WO 95/19443), ein durch Abscisinsäure-
induzierbarer (EP 335528) bzw. ein durch Ethanol- oder Cyclo
hexanon-induzierbarer (WO 93/21334) Promotor. Weitere Pflanzen
promotoren sind beispielsweise der Promotor der cytosolischen
FBPase aus Kartoffel, der ST-LSI Promotor aus Kartoffel
(Stockhaus et al., EMBO J. 8 (1989) 2445-245), der Promotor
der Phosphoribosylpyrophosphat Amidotransferase aus Glycine max
(siehe auch Genbank Accession Nummer U87999) oder ein Nodien
spezifischen Promotor wie in EP 249676 können vorteilhaft
verwandt werden. Vorteilhaft sind insbesonders solche pflanz
liche Promotoren, die die Expression in Geweben oder Pflanzen
teilen/-organen sicherstellen, in denen die Fettsäurebiosynthese
bzw. dessen Vorstufen stattfindet wie beispielsweise im Endosperm
oder im sich entwickelnden Embryo. Insbesondere zu nennen sind
vorteilhafte Promotoren, die eine samenspezifische Expression
gewährleisten wie beispielsweise der USP-Promotor oder Derivate
davon, der LEB4-Promotor, der Phaseolin-Promotor oder der Napin-
Promotor. Der besonders vorteilhafte USP-Promotor oder dessen
Derivate vermitteln in der Samenentwicklung eine sehr früh Gen
expression (Baeumlein et al., Mol Gen Genet, 1991, 225 (3): 459-67).
Weitere vorteilhafte samenspezifische Promotoren, die
für monokotyle und dikotyle Pflanzen verwendet werden können,
sind die für Dikotyle geeignete Promotoren wie der Napingen-
Promotor aus Raps (US 5,608,152), der Oleosin-Promotor aus
Arabidopsis (WO 98/45461), der Phaseolin-Promotor aus Phaseolus
vulgaris (US 5,504,200), der Bce4-Promotor aus Brassica
(WO 91/13980) oder der Leguminosen B4-Promotor (LeB4, Baeumlein
et al., Plant J., 2, 2, 1992: 233-239) oder für Monokotyle
geeignete Promotoren wie die Promotoren die Promotoren des lpt2-
oder lpt1-Gens aus Gerste (WO 95/15389 und WO 95/23230) oder die
Promotoren des Gersten Hordein-Gens, des Reis Glutelin-Gens, des
Reis Oryzin-Gens, des Reis Prolamin-Gens, des Weizen Gliadin-
Gens, des Weizen Glutelin-Gens, des Mais Zein-Gens, des Hafer
Glutelin-Gens, des Sorghum Kasirin-Gens oder des Roggen Secalin-
Gens, die in WO 99/16890 beschrieben werden.
Weiterhin sind insbesondere solche Promotoren bevorzugt, die
die Expression in Geweben oder Pflanzenteilen sicherstellen, in
denen beispielsweise die Biosynthese von Fettsäuren, Ölen und
Lipiden bzw. deren Vorstufen stattfindet. Insbesondere zu nennen
sind Promotoren, die eine samenspezifische Expression gewähr
leisten. Zu nennen sind der Promotor des Napin-Gens aus Raps
(US 5,608,152), des USP-Promotor aus Vicia faba (USP = unbekanntes
Samenprotein, Baeumlein et al., Mol Gen Genet, 1991, 225 (3): 459-67),
des Oleosin-Gens aus Arabidopsis (WO 98/45461), des
Phaseolin-Promotors (US 5,504,200) oder der Promotor des Legumin
B4-Gens (LeB4; Baeumlein et al., 1992, Plant Journal, 2 (2): 233-9).
Weiterhin sind zu nennen Promotoren, wie der des lpt2
oder lpt1-Gens aus Gerste (WO 95/15389 und WO 95/23230), die in
monokotylen Pflanzen samenspezifische Expression vermitteln.
In der Expressionskassette (= Genkonstrukt, Nukleinsäure
konstrukt) können wie oben beschrieben noch weitere Gene, die in
die Organismen eingebracht werden sollen, enthalten sein. Diese
Gene können unter getrennter Regulation oder unter der gleichen
Regulationsregion wie die Gene der Δ6-ACETYLENASE/Δ6-DESATURASE-
und/oder Δ6-DESATURASE liegen. Bei diesen Genen handelt es
sich beispielsweise um weitere Biosynthesegene vorteilhaft
der Fettsäurebiosynthese, die eine gesteigerte Synthese ermög
lichen. Beispielsweise seien die Gene für die Δ15-, Δ12-, Δ9-,
Δ6-, Δ5-Desaturase, die verschiedenen Hydroxylasen, die
Δ12-Acetylenase, die Acyl-ACP-Thioesterasen, β-Ketoacyl-ACP-
Synthasen oder β-Ketoacyl-ACP-Reductasen genannt. Vorteilhaft
werden die Desaturasegene im Nukleinsäurekonstrukt verwendet.
Prinzipiell können alle natürlichen Promotoren mit ihren
Regulationssequenzen wie die oben genannten für die erfindungs
gemäße Expressionskassette und das erfindungsgemäße Verfahren,
wie unten beschrieben, verwendet werden. Darüberhinaus können
auch synthetische Promotoren vorteilhaft verwendet werden.
Bei der Präparation einer Expressionskassette können verschiedene
DNA-Fragmente manipuliert werden, um eine Nukleotid-Sequenz zu
erhalten, die zweckmäßigerweise in der korrekten Richtung liest
und die mit einem korrekten Leseraster ausgestattet ist. Für die
Verbindung der DNA-Fragmente (= erfindungsgemäße Nukleinsäuren)
miteinander können an die Fragmente Adaptoren oder Linker ange
setzt werden.
Zweckmäßigerweise können die Promotor- und die Terminator-
Regionen in Transkriptionsrichtung mit einem Linker oder
Polylinker, der eine oder mehrere Restriktionsstellen für die
Insertion dieser Sequenz enthält, versehen werden. In der Regel
hat der Linker 1 bis 10, meistens 1 bis 8, vorzugsweise 2 bis
6 Restriktionsstellen. Im allgemeinen hat der Linker innerhalb
der regulatorischen Bereiche eine Größe von weniger als 100 bp,
häufig weniger als 60 bp, mindestens jedoch 5 bp. Der Promotor
kann sowohl nativ bzw. homolog als auch fremdartig bzw. heterolog
zum Wirtsorganismus beispielsweise zur Wirtspflanze sein. Die Ex
pressionskassette beinhaltet in der 5'-3'-Transkriptionsrichtung
den Promotor, eine DNA-Sequenz, die für ein Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase und/oder Δ6-Desaturase-Gen codiert und eine Region
für die transkriptionale Termination. Verschiedene Terminations
bereiche sind gegeneinander beliebig austauschbar.
Ferner können Manipulationen, die passende Restriktionsschnitt
stellen bereitstellen oder die überflüssige DNA oder Restrik
tionsschnittstellen entfernen, eingesetzt werden. Wo Insertionen,
Deletionen oder Substitutionen wie z. B. Transitionen und Trans
versionen in Frage kommen, können in vitro-Mutagenese, -primer-
repair-, Restriktion oder Ligation verwendet werden. Bei geeig
neten Manipulationen, wie z. B. Restriktion, -chewing-back- oder
Auffüllen von Überhängen für -bluntends-, können komplementäre
Enden der Fragmente für die Ligation zur Verfügung gestellt
werden.
Von Bedeutung für eine vorteilhafte hohe Expression kann u. a.
das Anhängen des spezifischen ER-Retentionssignals SEKDEL sein
(Schouten, A. et al., Plant Mol. Biol. 30 (1996), 781-792), die
durchschnittliche Expressionshöhe wird damit verdreifacht bis
vervierfacht. Es können auch andere Retentionssignale, die natür
licherweise bei im ER lokalisierten pflanzlichen und tierischen
Proteinen vorkommen, für den Aufbau der Kassette eingesetzt
werden.
Bevorzugte Polyadenylierungssignale sind pflanzliche Poly
adenylierungssignale, vorzugsweise solche, die im wesentlichen
T-DNA-Polyadenylierungssignale aus Agrobacterium tumefaciens,
insbesondere des Gens 3 der T-DNA (Octopin Synthase) des
Ti-Plasmids pTiACH5 entsprechen (Gielen et al., EMBO J.3 (1984),
835 ff) oder entsprechende funktionelle Äquivalente.
Die Herstellung einer Expressionskassette erfolgt durch Fusion
eines geeigneten Promotors mit einer geeigneten Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-DNA-Sequenz sowie einem
Polyadenylierungssignal nach gängigen Rekombinations- und
Klonierungstechniken, wie sie beispielsweise in T. Maniatis,
E. F. Fritsch und J. Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY
(1989) sowie in T. J. Silhavy, M. L. Berman und L. W. Enquist,
Experiments with Gene Fusions, Cold Spring Harbor Laboratory,
Cold Spring Harbor, NY (1984) und in Ausubel, F. M. et al.,
Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing Assoc.
and Wiley-Interscience (1987) beschrieben werden.
Bei der Präparation einer Expressionskassette können verschiedene
DNA-Fragmente manipuliert werden, um eine Nukleotid-Sequenz zu
erhalten, die zweckmäßigerweise in der korrekten Richtung liest
und die mit einem korrekten Leseraster ausgestattet ist. Für die
Verbindung der DNA-Fragmente miteinander können an die Fragmente
Adaptoren oder Linker angesetzt werden.
Zweckmäßigerweise können die Promotor- und die Terminator-
Regionen in Transkriptionsrichtung mit einem Linker oder
Polylinker, der eine oder mehrere Restriktionsstellen für die
Insertion dieser Sequenz enthält, versehen werden. In der Regel
hat der Linker 1 bis 10, meistens 1 bis 8, vorzugsweise 2 bis
6 Restriktionsstellen. Im allgemeinen hat der Linker innerhalb
der regulatorischen Bereiche eine Größe von weniger als 100 bp,
häufig weniger als 60 bp, mindestens jedoch 5 bp. Der Promotor
kann sowohl nativ bzw. homolog als auch fremdartig bzw. heterolog
zur Wirtspflanze sein. Die Expressionskassette beinhaltet in der
5'-3'-Transkriptionsrichtung den Promotor, eine DNA-Sequenz die
für ein D6-Acetylenase/Desaturase-Gen codiert und eine Region
für die transkriptionale Termination. Verschiedene Terminations
bereiche sind gegeneinander beliebig austauschbar.
Bei der Präparation einer Expressionskassette können verschiedene
DNA-Fragmente manipuliert werden, um eine Nukleotid-Sequenz zu
erhalten, die zweckmäßigerweise in der korrekten Richtung liest
und die mit einem korrekten Leseraster ausgestattet ist. Für die
Verbindung der DNA-Fragmente miteinander können an die Fragmente
Adaptoren oder Linker angesetzt werden.
Zweckmäßigerweise können die Promotor- und die Terminator-
Regionen in Transkriptionsrichtung mit einem Linker oder
Polylinker, der eine oder mehrere Restriktionsstellen für die
Insertion dieser Sequenz enthält, versehen werden. In der Regel
hat der Linker 1 bis 10, meistens 1 bis 8, vorzugsweise 2 bis
6 Restriktionsstellen. Im allgemeinen hat der Linker innerhalb
der regulatorischen Bereiche eine Größe von weniger als 100 bp,
häufig weniger als 60 bp, mindestens jedoch 5 bp. Der Promotor
kann sowohl nativ bzw. homolog als auch fremdartig bzw. heterolog
zur Wirtspflanze sein. Die Expressionskassette beinhaltet in der
5'-3'-Transkriptionsrichtung den Promotor, eine DNA-Sequenz die
für ein Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- oder Δ6-Desaturase-Gen
codiert und eine Region für die transkriptionale Termination.
Verschiedene Terminationsbereiche sind gegeneinander beliebig
austauschbar.
Die DNA Sequenz codierend für eine Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase-
und/oder Δ6-Desaturase aus Ceratodon purpureus beinhaltet alle
Sequenzmerkmale, die notwendig sind, um eine dem Ort der Fett
säure-, Lipid- oder Ölbiosynthese korrekte Lokalisation zu
erreichen. Daher sind keine weiteren Targetingsequenzen per se
notwendig. Allerdings kann eine solche Lokalisation wünschenswert
und vorteilhaft sein und daher künstlich verändert oder verstärkt
werden, sodaß auch solche Fusionskonstrukte eine bevorzugte vor
teilhafte Ausführungsform der Erfindung sind.
Insbesondere bevorzugt sind Sequenzen, die ein Targeting in
Plastiden gewährleisten. Unter bestimmten Umständen kann auch
ein Targeting in andere Kompartimente (referiert: Kermode, Crit.
Rev. Plant Sci. 15, 4 (1996), 285-423) z. B. in in die Vakuole,
in das Mitochondrium, in das Endoplasmatische Retikulum (ER),
Peroxisomen, Lipidkörper oder durch ein Fehlen entsprechender
operativer Sequenzen ein Verbleib im Kompartiment des Entstehens,
dem Zytosol, wünschenswert sein.
Vorteilhafterweise werden die erfindungsgemäßen Nukleinsäure
sequenzen zusammen mit mindestens einem Reportergen in eine
Expressionskassette kloniert, die in den Organismus über einen
Vektor oder direkt in das Genom eingebracht wird. Dieses
Reportergen sollte eine leichte Detektierbarkeit über einen
wachstums-, Fluoreszenz-, Chemo-, Biolumineszenz- oder Resistenz
assay oder über eine photometrische Messung ermöglichen. Bei
spielhaft seien als Reportergene Antibiotika-oder Herbizi
dresistenzgene, Hydrolasegene, Fluoreszenzproteingene, Bio
lumineszenzgene, Zucker- oder Nukleotidstoffwechselgene oder Bio
synthesegene wie das Ura3-Gen, das Ilv2-Gen, das Luciferasegen,
das β-Galactosidasegen, das gfp-Gen, das 2-Desoxyglucose-6-
phosphat-Phosphatasegen, das β-Glucuronidase-Gen, β-Lactamasegen,
das Neomycinphosphotransferasegen, das Hygromycinphosphotrans
ferasegen oder das BASTA (= Gluphosinatresistenz)-Gen genannt.
Diese Gene ermöglichen eine leichte Meßbarkeit und Quantifizier
barkeit der Transcriptionsaktivität und damit der Expression der
Gene. Damit lassen sich Genomstellen identifizieren, die eine
unterschiedliche Produktivität zeigen.
Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform umfaßt eine Expressions
kassette stromaufwärts, d. h. am 5'-Ende der codierenden Sequenz,
einen Promotor und stromabwärts, d. h. am 3'-Ende, ein Polyadeny
lierungssignal und gegebenenfalls weitere regulatorische Ele
mente, welche mit der dazwischenliegenden codierenden Sequenz für
die Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase und/oder Δ6-Desaturase DNA se
quenz operativ verknüpft sind. Unter einer operativen Verknüpfung
versteht man die sequenzielle Anordnung von Promotor, codierender
Sequenz, Terminator und ggf. weiterer regulativer Elemente der
art, daß jedes der regulativen Elemente seine Funktion bei der
Expression der codierenden Sequenz bestimmungsgemäß erfüllen
kann. Die zur operativen Verknüpfung bevorzugten Sequenzen sind
Targeting-Sequenzen zur Gewährleistung der subzellulären Lokali
sation in Plastiden. Aber auch Targeting-Sequenzen zur Gewähr
leistung der subzellulären Lokalisation im Mitochondrium, im
Endoplasmatischen Retikulum (= ER), im Zellkern, in Ölkörperchen
oder anderen Kompartimenten sind bei Bedarf einsetzbar sowie
Translationsverstärker wie die 5'-Führungssequenz aus dem Tabak-
Mosaik-Virus (Gallie et al., Nucl. Acids Res. 15 (1987),
8693-8711).
Eine Expressionskassette kann beispielsweise einen konstitutiven
Promotor (bevorzugt den USP- oder Napin-Promotor), das zu
exprimierende Gen und das ER-Retentionssignal enthalten. Als
ER-Retentionssignal wird bevorzugt die Aminosäuresequenz KDEL
(Lysin, Asparaginsäure, Glutaminsäure, Leucin) verwendet.
Die Expressionskassette wird zur Expression in einem prokaryon
tischen oder eukaryontischen Wirtsorganismus beispielsweise einem
Mikroorganismus wie einem Pilz oder einer Pflanze vorteilhafter
weise in einen Vektor wie beispielsweise einem Plasmid, einem
Phagen oder sonstiger DNA inseriert, der eine optimale Expression
der Gene im Wirtsorganismus ermöglicht. Geeignete Plasmide sind
beispielsweise in E. coli pLG338, pACYC184, pBR-Serie wie z. B.
pBR322, pUC-Serie wie pUC18 oder pUC19, M113mp-Serie, pKC30,
pRep4, pHS1, pHS2, pPLc236, pMBL24, pLG200, pUR290, pIN-III113-B1,
λgt11 oder pBdCI, in Streptomyces pIJ101, pIJ364, pIJ702 oder
pIJ361, in Bacillus pUB110, pC194 oder pBD214, in Corynebacterium
pSA77 oder pAJ667, in Pilzen pALS1, pIL2 oder pBB116, weitere
vorteilhafte Pilzvektoren werden von Romanos, M. A. et al.,
[(1992) "Foreign gene expression in yeast: a review", Yeast 8: 423-488]
und von von den Hondel, C. A. M. J. J. et al. [(1991)
"Heterologous gene expression in filamentous fungi] sowie in More
Gene Manipulations in Fungi [J. W. Bennet & L. L. Lasure, eds.,
p. 396-428: Academic Press: San Diego] und in "Gene transfer
systems and vector development for filamentous fungi" [von den
Hondel, C. A. M. J. J. & Punt, P. J. (1991) in: Applied Molecular
Genetics of Fungi, Peberdy, J. F. et al., eds., p. 1-28, Cambridge
University Press: Cambridge] beschrieben. Vorteilhafte Hefe
promotoren sind beispielsweise 2 µM, pAG-1, YEp6, YEp13 oder
pEMBLYe23. Beispiele für Algen- oder Pflanzenpromotoren sind
pLGV23, pGHlac+, pBIN19, pAK2004, pVKH oder pDH51 (siehe Schmidt,
R. and Willmitzer, L., 1988). Die oben genannten Vektoren oder
Derivate der vorstehend genannten Vektoren stellen eine kleine
Auswahl der möglichen Plasmide dar. Weitere Plasmide sind dem
Fachmann wohl bekannt und können beispielsweise aus dem Buch
Cloning Vectors (Eds. Pouwels P. H. et al. Elsevier, Amsterdam-
New York-Oxford, 1985, ISBN 0 444 904018) entnommen werden.
Geeignete pflanzliche Vektoren werden unter anderem in "Methods
in Plant Molecular Biology and Biotechnology" (CRC Press),
Kap. 6/7, S. 71-119 beschrieben. Vorteilhafte Vektoren sind sog.
shuttle-Vektoren oder binäre Vektoren, die in E. coli und Agro
bacterium replizieren.
Unter Vektoren sind außer Plasmiden auch alle anderen dem Fach
mann bekannten Vektoren wie beispielsweise Phagen, Viren wie
SV40, CMV, Baculovirus, Adenovirus, Transposons, IS-Elemente,
Phasmide, Phagemide, Cosmide, lineare oder zirkuläre DNA zu
verstehen. Diese Vektoren können autonom im Wirtsorganismus
repliziert oder chromosomal repliziert werden bevorzugt ist
eine chromosomale Replikation.
In einer weiteren Ausgestaltungsform des Vektors kann die
erfindungsgemäße Expressionskassette auch vorteilhafterweise in
Form einer linearen DNA in die Organismen eingeführt werden und
über heterologe oder homologe Rekombination in das Genom des
Wirtsorganismus integriert werden. Diese lineare DNA kann aus
einem linearisierten Plasmid oder nur aus der Expressionskassette
als Vektor oder den erfindungsgemäßen Nukleinsäuresequenzen
bestehen.
In einer weiteren vorteilhaften Ausführungsform kann die
erfindungsgemäße Nukleinsäuresequenz auch alleine in einen
Organismus eingebracht werden.
Sollen neben der erfindungsgemäßen Nukleinsäuresequenz weitere
Gene in den Organismus eingeführt werden, so können alle zusammen
mit einem Reportergen in einem einzigen Vektor oder jedes
einzelne Gen mit einem Reportergen in je einem Vektor in den
Organismus eingebracht werden, wobei die verschiedenen Vektoren
gleichzeitig oder sukzessive eingebracht werden können.
Der Vektor enthält vorteilhaft mindestens eine Kopie der
erfindungsgemäßen Nukleinsäuresequenzen und/oder der erfindungs
gemäßen Expressionskassette.
Beispielhaft kann die pflanzliche Expressionskassette in den
Tabak-Transformationsvektor pBinAR eingebaut werden. Fig. 1 zeigt
die Tabaktransformationsvektoren pBinAR-mit 35S-Promotor (C) bzw.
pBin-USP mit dem USP-Promotor (D). Die Ausgangsvektoren sind in
Fig. 1A) und B) dargestellt.
Alternativ kann ein rekombinanter Vektor (= Expressionsvektor)
auch in-vitro transkribiert und translatiert werden, z. B. durch
Nutzung des T7 Promotors und der T7 RNA Polymerase.
In Prokaryoten verwendete Expressionsvektoren nutzen häufig
induzierbare Systeme mit und ohne Fusionsproteinen bzw. Fusions
oligopeptiden, wobei diese Fusionen sowohl N-terminal als auch
C-terminal oder anderen nutzbaren Domänen eines Proteins erfolgen
können. Solche Fusionsvektoren dienen in der Regel dazu: i.) die
Expressionsrate der RNA zu erhöhen ii.) die erzielbare Protein
syntheserate zu erhöhen, iii.) die Löslichkeit des Proteins zu
erhöhen, iv.) oder die Reinigung durch einen für die Affinitäts
chromatographie nutzbare Bindesequenz zu vereinfachen. Häufig
werden auch proteolytische Spaltstellen über Fusionsproteine
eingeführt, was die Abspaltung eines Teils des Fusionsproteins
auch der Reinigung ermöglicht. Solche Erkennungssequenzen für
Proteasen erkennen sind z. B. Faktor Xa, Thrombin und Entero
kinase.
Typische vorteilhafte Fusions- und Expressionsvektoren sind pGEX
[Pharmacia Biotech Inc. Smith, D. B. and Johnson, K. S. (1988) Gene
67: 31-40], pMAL (New England Biolabs, Beverly, MA) and pRIT5
(Pharmacia, Piscataway, NJ) welches Glutathion S-transferase
beinhaltet (GST), Maltose Bindeprotein, oder Protein A.
Weitere Beispiele für E. coli Expressionsvektoren sind pTrc
[Amann et al., (1988) Gene 69: 301-315] und pET Vektoren [Studier
et al., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185,
Academic Press, San Diego, California (1990) 60-89; Stratagene,
Amsterdam, Niederlande].
Weitere vorteilhafte Vektoren zur Verwendung in Hefe sind
pYepSec1 (Baldari, et al., (1987) Embo J. 6: 229-234), pMFa
(Kurjan and Herskowitz, (1982) Cell 30: 933-943), pJRY88 (Schultz
et al., (1987) Gene 54: 113-123), and pYES-Derivate (Invitrogen
Corporation, San Diego, CA). Vektoren für die Nutzung in fila
mentösen Pilzen sind beschrieben in: von den Hondel, C. A. M. J. J. &
Punt, P. J. (1991) "Gene transfer systems and vector development
for filamentous fungi, in: Applied Molecular Genetics of Fungi,
J. F. Peberdy, et al., eds., p. 1-28, Cambridge University Press:
Cambridge.
Alternativ können auch vorteilhaft Insektenzellexpressions
vektoren genutzt werden z. B. für die Expression in Sf 9 Zellen.
Dies sind z. B. die Vektoren der pAc Serie (Smith et al. (1983)
Mol. Cell Biol. 3: 2156-2165) und der pVL series (Lucklow and
Summers (1989) Virology 170: 31-39).
Des weiteren können zur Genexpression vorteilhaft Pflanzen
zellen oder Algenzellen genutzt werden. Beispiele für Pflanzen
expressionsvektoren finden sich in Becker, D., et al. (1992)
"New plant binary vectors with selectable markers located
proximal to the left border", Plant Mol. Biol. 20: 1195-1197
oder in Bevan, M. W. (1984) "Binary Agrobacterium vectors for
plant transformation", Nucl. Acid. Res. 12: 8711-8721.
Weiterhin können die erfindungsgemäßen Nukleinsäuresequenzen
in Säugerzellen exprimiert werden. Beispiel für entsprechende
Expressionsvektoren sind pCDM8 und pMT2PC genannt in: Seed, B.
(1987) Nature 329: 840 oder Kaufman et al. (1987) EMBO J. 6: 187-195).
Dabei sind vorzugsweise zu nutzende Promotoren viralen
Ursprungs wie z. B. Promotoren des Polyoma, Adenovirus 2, Cyto
megalovirus oder Simian Virus 40. Weitere prokaryotische und
eukaryotische Expressionssysteme sind genannt in Kapitel 16 und
17 in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual.
2nd, ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989.
Das Einbringen der erfindungsgemäßen Nukleinsäuren, der
Expressionskassette oder des Vektors in Organismen beispiels
weise in Pflanzen kann prinzipiell nach allen dem Fachmann
bekannten Methoden erfolgen.
Für Mikroorganismen kann der Fachmann entsprechende Methoden den
Lehrbüchern von Sambrook, J. et al. (1989) Molecular cloning:
A laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, von
F. M. Ausubel et al. (1994) Current protocols in molecular bio
logy, John Wiley and Sons, von D. M. Glover et al., DNA Cloning
Vol. 1, (1995), IRL Press (ISBN 019-963476-9), von Kaiser et al.
(1994) Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Habor Laboratory
Press oder Guthrie et al. Guide to Yeast Genetics and Molecular
Biology, Methods in Enzymology, 1994, Academic Press entnehmen.
Die Übertragung von Fremdgenen in das Genom einer Pflanze wird
als Transformation bezeichnet. Es werden dabei die beschriebenen
Methoden zur Transformation und Regeneration von Pflanzen aus
Pflanzengeweben oder Pflanzenzellen zur transienten oder stabilen
Transformation genutzt. Geeignete Methoden sind die Protoplasten
transformation durch Polyethylenglykol-induzierte DNA-Aufnahme,
das biolistische Verfahren mit der Genkanone - die sogenannte
particle bombardment Methode, die Elektroporation, die Inkubation
trockener Embryonen in DNA-haltiger Lösung, die Mikroinjektion
und der durch Agrobacterium vermittelte Gentransfer. Die genann
ten Verfahren sind beispielsweise in B. Jenes et al., Techniques
for Gene Transfer, in: Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering
and Utilization, herausgegeben von S. D. Kung und R. Wu, Academic
Press (1993) 128-143 sowie in Potrykus Annu. Rev. Plant Physiol.
Plant Molec. Biol. 42 (1991) 205-225) beschrieben. Vorzugsweise
wird das zu exprimierende Konstrukt in einen Vektor kloniert,
der geeignet ist, Agrobacterium tumefaciens zu transformieren,
beispielsweise pBin19 (Bevan et al., Nucl. Acids Res. 12 (1984)
8711). Mit einem solchen Vektor transformierte Agrobakterien
können dann in bekannter Weise zur Transformation von Pflanzen,
insbesondere von Kulturpflanzen, wie z. B. von Tabakpflanzen,
verwendet werden, indem beispielsweise verwundete Blätter oder
Blattstücke in einer Agrobakterienlösung gebadet und anschließend
in geeigneten Medien kultiviert werden. Die Transformation von
Pflanzen mit Agrobacterium tumefaciens wird beispielsweise von
Höfgen und Willmitzer in Nucl. Acid Res. (1988) 16, 9877 be
schrieben oder ist unter anderem bekannt aus F. F. White, Vectors
for Gene Transfer in Higher Plants; in Transgenic Plants, Vol. 1,
Engineering and Utilization, herausgegeben von S. D. Kung und
R. Wu, Academic Press, 1993, S. 15-38.
Mit einem erfindungsgemäßen Expressionsvektor transformierte
Agrobakterien können ebenfalls in bekannter Weise zur Trans
formation von Pflanzen wie Testpflanzen wie Arabidopsis oder
Kulturpflanzen wie Getreide, Mais, Hafer, Roggen, Gerste, Weizen,
Soja, Reis, Baumwolle, Zuckerrübe, Canola, Sonnenblume, Flachs,
Hanf, Kartoffel, Tabak, Tomate, Karotte, Paprika, Raps, Tapioka,
Maniok, Pfeilwurz, Tagetes, Alfalfa, Salat und den verschiedenen
Baum-, Nuß- und Weinspezies, insbesondere von Ölhaltigen Kultur
pflanzen, wie Soja, Erdnuß, Rizinus, Sonnenblume, Mais, Baum
wolle, Flachs, Raps, Kokosnuß, Ölpalme, Färbersaflor (Carthamus
tinctorius) oder Kakaobohne verwendet werden, z. B. indem ver
wundete Blätter oder Blattstücke in einer Agrobakterienlösung
gebadet und anschließend in geeigneten Medien kultiviert werden.
Die genetisch veränderten Pflanzenzellen können über alle dem
Fachmann bekannten Methoden regeneriert werden. Entsprechende
Methoden können den oben genannten Schriften von S. D. Kung und
R. Wu, Potrykus oder Höfgen und Willmitzer entnommen werden.
Als Organismen bzw. Wirtsorganismen für die erfindungsgemäße
Nukleinsäure, die Expressionskassette oder den Vektor eignen sich
prinzipiell vorteilhaft alle Organismen, die in der Lage sind
Fettsäuren speziell ungesättigte Fettsäuren zu synthetisieren
bzw. für die Expression rekombinanter Gene geeignet sind.
Beispielhaft seien Pflanzen wie Arabidopsis, Asteraceae wie
Calendula oder Kulturpflanzen wie Soja, Erdnuß, Rizinus, Sonnen
blume, Mais, Baumwolle, Flachs, Raps, Kokosnuß, Ölpalme, Färber
saflor (Carthamus tinctorius) oder Kakaobohne, Mikroorganismen
wie Pilze beispielsweise die Gattung Mortierella, Saprolegnia
oder Pythium, Bakterien wie die Gattung Escherichia, Hefen wie
die Gattung Saccharomyces, Cyanobakterien, Ciliaten, Algen oder
Protozoen wie Dinoflagellaten wie Crypthecodinium genannt. Bevor
zugt werden Organismen, die natürlicherweise Öle in größeren
Mengen synthetisieren können wie Pilze wie Mortierella alpina,
Pythium insidiosum oder Pflanzen wie Soja, Raps, Kokosnuß, Öl
palme, Färbersaflor, Rizinus, Calendula, Erdnuß, Kakaobohne oder
Sonnenblume oder Hefen wie Saccharomyces cerevisiae, besonders
bevorzugt werden Soja, Raps, Sonnenblume, Calendula oder
Saccharomyces cerevisiae. Prinzipiell sind als Wirtsorganismen
auch transgene Tiere geeignet beispielsweise C. elegans.
Nutzbare Wirtszellen sind weiterhin genannt in: Goeddel, Gene
Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press,
San Diego, CA (1990).
Verwendbare Expressionsstämme z. B. solche, die eine geringere
Proteaseaktivität aufweisen sind beschrieben in: Gottesman, S.,
Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic
Press, San Diego, California (1990) 119-128.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung betrifft die Verwendung
einer Expressionskassette enthaltend DNA-Sequenzen codierend für
ein Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gen oder
mit diesen hybridisierende DNA-Sequenzen zur Transformation von
Pflanzenzellen, -geweben oder Pflanzenteilen. Ziel der Verwendung
ist die Erhöhung des Gehaltes an Fettsäuren, Ölen oder Lipiden
mit erhöhtem Gehalt an Dreifachbindungen und Doppelbindung in
Δ6-Position.
Dabei kann je nach Wahl des Promotors die Expression des
Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gens
spezifisch in den Blättern, in den Samen, den Knollen oder
anderen Teilen der Pflanze erfolgen. Solche Fettsäuren, Öle oder
Lipide mit Δ6-Dreifachbindungen oder Δ6-Doppelbindungen über
produzierenden transgenen Pflanzen, deren Vermehrungsgut, sowie
deren Pflanzenzellen, -gewebe oder -teile, sind ein weiterer
Gegenstand der vorliegenden Erfindung. Ein bevorzugter er
findungsgemäßer Gegenstand sind transgene Pflanze enthaltend
eine erfindungsgemäße funktionelle oder nicht funktionelle
(= Antisense-DNA oder enzymatische inaktives Enzym) Nuklein
säuresequenz oder eine funktionelle oder nicht funktionelle
Expressionskassette.
Die Expressionskassette oder die erfindungsgemäßen Nuklein
säuresequenzen enthaltend eine Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase-
und/oder Δ6-Desaturasegensequenz kann darüber hinaus auch zur
Transformation der oben beispielhaft genannten Organismen wie
Bakterien, Cyanobakterien, Hefen, filamentösen Pilzen, Ciliaten
und Algen mit dem Ziel einer Erhöhung des Gehaltes an Fett
säuren, Ölen oder Lipiden mit Δ6-Dreifachbindungen oder
Δ6-Doppelbindungen eingesetzt werden.
Erhöhung des Gehaltes von Fettsäuren, Ölen oder Lipiden mit
Δ6-Dreifachbindungen oder Δ6-Doppelbindungen bedeutet im Rahmen
der vorliegenden Erfindung beispielsweise die künstlich erworbene
Fähigkeit einer erhöhten Biosyntheseleistung durch funktionelle
tiberexpression des Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder
Δ6-Desaturase-Gens in den erfindungsgemäßen Organismen vor
teilhaft in den erfindungsgemäßen transgenen Pflanzen gegenüber
den nicht gentechnisch modifizierten Ausgangspflanzen zumindest
für die Dauer mindestens einer Pflanzengeneration.
Der Biosyntheseort von Fettsäuren, Ölen oder Lipiden beispiels
weise ist im allgemeinen der Samen oder Zellschichten des Samens,
so daß eine samenspezifische Expression des Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gens sinnvoll ist. Es ist
jedoch naheliegend, daß die Biosynthese von Fettsäuren, Ölen oder
Lipiden nicht auf das Samengewebe beschränkt sein muß, sondern
auch in allen übrigen Teilen der Pflanze - beispielsweise in
Epidermiszellen oder in den Knollen - gewebespezifisch erfolgen
kann.
Darüberhinaus ist eine konstitutive Expression des exogenen
Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gens von
Vorteil. Andererseits kann aber auch eine induzierbare Expression
wünschenswert erscheinen.
Die Wirksamkeit der Expression des Transgens Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gens kann beispielsweise in
vitro durch Sproßmeristemvermehrung ermittelt werden. Zudem kann
eine in Art und Höhe veränderte Expression des Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gens und deren Auswirkung
auf die Fettsäure-, Öl- oder Lipidbiosyntheseleistung an Test
pflanzen in Gewächshausversuchen getestet werden.
Gegenstand der Erfindung sind außerdem transgene Pflanzen,
transformiert mit einer Expressionskassette enthaltend eine
Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gensequenz
oder mit dieser hybridisierende DNA-Sequenzen, sowie transgene
Zellen, Gewebe, Teile und Vermehrungsgut solcher Pflanzen.
Besonders bevorzugt sind dabei transgene Kulturpflanzen, wie
z. B. Gerste, Weizen, Roggen, Hafer, Mais, Soja, Reis, Baum
wolle, Zuckerrübe, Raps und Canola, Sonnenblume, Flachs, Hanf,
Kartoffel, Tabak, Tomate, Raps, Tapioka, Maniok, Pfeilwurz,
Alfalfa, Salat und die verschiedenen Baum-, Nuß- und Weinspezies.
Pflanzen im Sinne der Erfindung sind mono- und dikotyle Pflanzen
oder Algen.
Eine weitere erfindungsgemäße Ausgestaltung sind wie oben
beschriebenen transgene Pflanzen, die eine funktionelle oder
nicht funktionelle erfindungsgemäße Nukleinsäuresequenz oder
eine funktionelle oder nicht funktionelle erfindungsgemäße
Expressionskassette enthalten. Unter nicht funktionell ist
zu verstehen, daß kein enzymatisch aktives Protein mehr syn
thetisiert wird. Außerdem ist unter nicht funktionellen Nuklein
säuren oder Nukleinsäurekonstrukten auch eine sogenannte Anti
sense-DNA zu verstehen, die zu transgenen Pflanzen führt, die
eine Reduktion der enzymatischen Aktivität oder keine enzy
matischen Aktivität aufweisen. Mit Hilfe der Antisense-Technik,
speziell wenn die erfindungsgemäße Nukleinsäuresequenz mit anderen
Fettsäuresynthesegene in der Antisense-DNA kombiniert wird, ist
es möglich Triglyceride mit einem erhöhten Gehalt an gesättigten
Fettsäuren bzw. gesättigte Fettsäuren zu synthetisieren. Unter
transgenen Pflanzen sind einzelne Pflanzenzellen und deren
Kulturen auf Festmedien oder in Flüssigkultur, Pflanzenteile
und ganze Pflanzen zu verstehen.
Weitere Gegenstände der Erfindung sind:
- - Verfahren zur Transformation einer Pflanze dadurch gekenn zeichnet, daß man Expressionskassetten enthaltend eine Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-Gen sequenz oder mit dieser hybridisierende DNA'-Sequenzen in eine Pflanzenzelle, in Kallusgewebe, eine ganze Pflanze oder Protoplasten von Pflanzen einbringt.
- - Verwendung einer Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase- und/oder Δ6-Desaturase-DNA-Gensequenz oder mit dieser hybridisierende DNA-Sequenzen zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhtem Gehalt an Fettsäuren, Ölen oder Lipiden mit Dreifach bindungen oder delta-6-Doppelbindungen durch Expression dieser D6-Acetylenase/Desaturase DNA-Sequenz in Pflanzen.
- - Protein enthaltend die in SEQ ID NO: 8 dargestellte Amino säuresequenz.
- - Protein enthaltend die in SEQ ID NO: 10 dargestellte Amino säuresequenz.
- - Verwendung der Proteine mit den Sequenzen SEQ ID NO: 8 und SEQ ID NO: 10 zur Herstellung von ungesättigten Fettsäuren.
Ein weiterer erfindungsgemäßer Gegenstand ist ein Verfahren zur
Herstellung von ungesättigten Fettsäuren, dadurch gekennzeichnet,
daß man mindestens eine oben beschriebene erfindungsgemäße
Nukleinsäuresequenz oder mindestens ein erfindungsgemäßes
Nukleinsäurekonstrukt in einen bevorzugt Öl produzierenden
Organismus bringt, diesen Organismus anzieht und daß in dem
Organismus enthaltene Öl isoliert und die im Öl enthaltenden
Fettsäuren freisetzt. Diese ungesättigten Fettsäuren enthalten
vorteilhaft Δ6-Dreifach- und/oder Δ6-Doppelbindungen. Die Fett
säuren können aus den Ölen bzw. Lipiden beispielsweise über eine
basische Hydrolyse z. B. mit NaOH oder KOH freigesetzt werden.
Auch ein Verfahren zur Herstellung von Triglyceriden mit einem
erhöhten Gehalt an ungesättigten Fettsäuren, dadurch gekenn
zeichnet, daß man mindestens eine oben beschriebene erfindungs
gemäße Nukleinsäuresequenz oder mindestens eine erfindungsgemäße
Expressionskassette in einen Öl produzierenden Organismus bringt,
diesen Organismus anzieht und daß in dem Organismus enthaltene Öl
isoliert, gehört zu den Erfindungsgegenständen.
Ein weiterer erfindungsgemäßer Gegenstand ist ein Verfahren zur
Herstellung von Triglyceriden mit einem erhöhten Gehalt an unge
sättigten Fettsäuren, indem man Triglyceride mit gesättigten oder
ungesättigten oder gesättigten und ungesättigten Fettsäuren mit
mindestens einem der Protein, das durch eine der Sequenzen
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10 oder
SEQ ID NO: 11 kodiert wird, inkubiert. Vorteilhaft wird das
Verfahren in Gegenwart von Verbindungen durchgeführt, die
Reduktionsäquivalente aufnehmen oder abgeben können. Anschließend
können die Fettsäuren aus den Triglyceriden freigesetzt werden.
Verfahren nach Anspruch 16 oder 17, dadurch gekennzeichnet, daß
die Fettsäuren aus den Triglyceriden freigesetzt werden.
Die oben genannten Verfahren ermöglichen vorteilhaft die Synthese
von Fettsäuren oder Triglyceriden mit einem erhöhten Gehalt an
Fettsäuren mit Δ6-Dreifach- und/oder Δ6-Doppelbindungen.
Mit Hilfe der sogenannten Antisense-Technologie können in einem
Verfahren auch Fettsäuren oder Triglyceride mit einem erhöhten
Gehalt an gesättigten Fettsäuren hergestellt werden.
Als Organismen für die genannten Verfahren seien beispielhaft
Pflanzen wie Arabidopsis, Gerste, Weizen, Roggen, Hafer, Mais,
Soja, Reis, Baumwolle, Zuckerrübe, Raps und Canola, Sonnen
blume, Flachs, Hanf, Kartoffel, Tabak, Tomate, Raps, Tapioka,
Maniok, Pfeilwurz, Alfalfa, Erdnuß, Rizinus, Kokosnuß, Ölpalme,
Färbersaflor (Carthamus tinctorius) oder Kakaobohne, Mikro
organismen wie Pilze Mortierella, Saprolegnia oder Pythium,
Bakterien wie die Gattung Escherichia, Cyanobakterien, Hefen
wie die Gattung Saccharomyces, Algen oder Protozoen wie
Dinoflagellaten wie Crypthecodinium genannt. Bevorzugt werden
Organismen, die natürlicherweise Öle in größeren Mengen syn
thetisieren können wie Mikroorganismen wie Pilze wie Mortierella
alpina, Pythium insidiosum oder Pflanzen wie Soja, Raps, Kokos
nuß, Ölpalme, Färbersaflor, Rizinus, Calendula, Erdnuß, Kakao
bohne oder Sonnenblume oder Hefen wie Saccharomyces cerevisiae,
besonders bevorzugt werden Soja, Raps, Sonnenblume, Carthamus
oder Saccharomyces cerevisiae.
Die in den Verfahren verwendeten Organismen werden je nach Wirts
organismus in dem Fachmann bekannter Weise angezogen bzw. ge
züchtet. Mikroorganismen werden in der Regel in einem flüssigen
Medium, das eine Kohlenstoffquelle meist in Form von Zuckern,
eine Stickstoffquelle meist in Form von organischen Stickstoff
quellen wie Hefeextrakt oder Salzen wie Ammoniumsulfat, Spuren
elemente wie Eisen-, Mangan-, Magnesiumsalze und gegebenenfalls
Vitamine enthält, bei Temperaturen zwischen 0°C und 100°C, bevor
zugt zwischen 10°C bis 60°C unter Sauerstoffbegasung angezogen.
Dabei kann der pH der Nährflüssigkeit auf einen festen Wert
gehalten werden, das heißt während der Anzucht reguliert werden
oder nicht. Die Anzucht kann batch weise, semi batch weise
oder kontinuierlich erfolgen. Nährstoffe können zu beginn der
Fermentation vorgelegt oder semikontinuierlich oder kontinuier
lich nach gefüttert werden.
Pflanzen werden nach Transformation zunächst wie oben beschrieben
regeneriert und anschließend wie üblich angezüchtet bzw. ange
baut.
Aus den Organismen werden nach Anzucht die Lipide in üblicher
weise gewonnen. Hierzu können die Organismen nach Ernte zunächst
aufgeschlossen werden oder direkt verwendet werden. Die Lipide
werden vorteilhaft mit geeigneten Lösungsmitteln wie apolare
Lösungsmittel wie Hexan oder Ethanol, Isopropanol oder Gemischen
wie Hexan/Isopropanol, Phenol/Chloroform/Isoamylalkohol bei
Temperaturen zwischen 0°C bis 80°C, bevorzugt zwischen 20°C bis
50°C extrahiert. Die Biomasse wird in der Regel mit einem Über
schuß an Lösungsmittel extrahiert beispielsweise einem Überschuß
von Lösungsmittel zu Biomasse von 1 : 4. Das Lösungsmittel wird
anschließend beispielsweise über eine Destillation entfernt.
Die Extraktion kann auch mit superkritischem CO2 erfolgen. Nach
Extraktion kann die restliche Biomasse beispielsweise über
Filtration entfernt werden.
Das so gewonnene Rohöl kann anschließend weiter aufgereinigt
werden, beispielsweise in dem Trübungen über das Versetzen
mit polaren Lösungsmittel wie Aceton oder Chloroform und
anschließender Filtration oder Zentrifugation entfernt werden.
Auch eine weitere Reinigung über Säulen ist möglich.
Zur Gewinnung der freien Fettsäuren aus den Triglyceriden werden
diese in üblicherweise verseift.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung sind ungesättigte Fett
säuren sowie Trigylceride mit einem erhöhten Gehalt an unge
sättigten Fettsäuren, die nach den oben genannten Verfahren
hergestellt wurden, sowie deren Verwendung zur Herstellung von
Nahrungsmitteln, Tierfutter, Kosmetika oder Pharmazeutika. Hierzu
werden diese den Nahrungsmitteln, dem Tierfutter, den Kosmetika
oder Pharmazeutika in üblichen Mengen zugesetzt.
Die Erfindung wird durch die folgenden Beispiele näher erläutert:
Die Klonierungsverfahren wie z. B. Restriktionsspaltungen,
Agarose-Gelelektrophorese, Reinigung von DNA-Fragmenten, Transfer
von Nukleinsäuren auf Nitrozellulose und Nylon Membranen, Ver
knüpfen von DNA-Fragmenten, Transformation von Escherichia coli
Zellen, Anzucht von Bakterien und die Sequenzanalyse rekombi
nanter DNA wurden wie bei Sambrook et al. (1989) (Cold Spring
Harbor Laboratory Press: ISBN 0-87969-309-6) beschrieben durch
geführt.
Die Sequenzierung rekombinanter DNA-Moleküle erfolgte mit einem
Laserfluoreszenz-DNA-Sequenzierer der Firma ABI nach der Methode
von Sanger (Sanger et al. (1977) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74,
5463-5467). Fragmente resultierend aus einer Polymerase Ketten
reaktion wurden zur Vermeidung von Polymerasefehlern in zu expri
mierenden Konstrukten sequenziert und überprüft.
Zur Erzeugung transgener Rapspflanzen wurden binäre Vektoren in
Agrobacterium tumefaciens C58C1 : pGV2260 oder Escherichia coli
genutzt (Deblaere et al. 1984, Nucl. Acids. Res. 13, 4777-4788).
Zur Transformation von Rapspflanzen (Var. Drakkar, NPZ Nor
deutsche Pflanzenzucht, Hohenlieth, Deutschland), wurde eine 1 : 50
Verdünnung einer Übernachtkultur einer positiv transformierten
Agrobakterienkolonie in Murashige-Skoog Medium (Murashige und
Skoog 1962 Physiol. Plant. 15, 473) mit 3% Saccharose (3MS-
Medium) benutzt. Petiolen oder Hypokotyledonen frisch gekeimter
steriler Rapspflanzen (zu je ca. 1 cm2) wurden in einer Petri
schale mit einer 1 : 50 Agrobakterienverdünnung für 5-10 Minuten
inkubiert. Es folgt eine 3-tägige Conkubation in Dunkelheit bei
25°C auf 3MS-Medium mit 0,8% Bacto-Agar. Die Kultivierung wurde
nach 3 Tagen mit 16 Stunden Licht / 8 Stunden Dunkelheit weiter
geführt und in wöchentlichem Rhythmus auf MS-Medium mit 500 mg/l
Claforan (Cefotaxime-Natrium), 50 mg/l Kanamycin, 20 mikroM
Benzylaminopurin (BAP) und 1,6 g/l Glukose weitergeführt.
Wachsende Sprosse wurden auf MS-Medium mit 2% Saccharose,
250 mg/l Claforan und 0,8% Bacto-Agar überführt. Bildeten
sich nach drei Wochen keine Wurzeln, so wurde als Wachstums
hormon 2-Indolbuttersäure zum Bewurzeln zum Medium gegeben.
Die Transformation von Arabidopsis thaliana Var. Columbia Col 0
(Lehle Seeds, Round Rock, Texas, USA) erfolgte mittels Blüten
infiltrationsmethode wie beschrieben bei: Bechtold, N., Ellis, J.
and Pelletier, G. in Planta, Agrobacterium mediated gene transfer
by infiltration of adult Arabidopsis thaliana plants, C. R. Acad.
Sci. Paris, Life Sciences 316 (1993), 1194-119 oder mittels
Wurzeltransformationsmethode.
Die Transformation von Maispflanzen erfolgte wie bei Pareddy, D.,
Petolino, J., Skokut, T., Hopkins, N., Miller, M., Welter, M.,
Smith, K., Clayton, D., Pescitelli, S., Gould, A., Maize Trans
formation via Helium Blasting. Maydica. 42 (2): 143-154, 1997,
beschrieben.
Um DNA-Sequenzen aus Ceratodon purpureus zu isolieren, die für
eine Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase und eine Δ6-Desaturase kodieren,
wurden verschiedene degenerierte Oligonukleotidprimer von DNA-
Sequenzen abgeleitet, die für Δ5- (EMBL Accession-Nr. Z81122) und
Δ6-Fettsäure-Desaturasen (U79010, AJ222980, AF031477 kodieren:
Primer A: 5'-TGG TGG AA(A/G) TGG A(A/C)I CA(C/T) AA-3', forward Primer, abgeleitet von der Aminosäuresequenz WWKW(N/T/K)H(N/K)
Primer B: 5'-(T/G)GI TGG AA(A/G) (T/G)(G/A)I (A/C)AI CA(C/T) AA-3', forward Primer, abgeleitet von der Aminosäuresequenz (G/W)WK(E/D/W)(N/Q/K)H(N/K)
Primer C: 5'-AT (A/T/G/C)T(T/G) (A/T/G/C)GG (A/G)AA (A/T/G/C)A(A/G) (A/G)TG (A/G)TG -3', reverse primer, abge leitet von der Aminosäuresequenz (I/M)(H/Q/N)PF(L/F)HH
Primer A: 5'-TGG TGG AA(A/G) TGG A(A/C)I CA(C/T) AA-3', forward Primer, abgeleitet von der Aminosäuresequenz WWKW(N/T/K)H(N/K)
Primer B: 5'-(T/G)GI TGG AA(A/G) (T/G)(G/A)I (A/C)AI CA(C/T) AA-3', forward Primer, abgeleitet von der Aminosäuresequenz (G/W)WK(E/D/W)(N/Q/K)H(N/K)
Primer C: 5'-AT (A/T/G/C)T(T/G) (A/T/G/C)GG (A/G)AA (A/T/G/C)A(A/G) (A/G)TG (A/G)TG -3', reverse primer, abge leitet von der Aminosäuresequenz (I/M)(H/Q/N)PF(L/F)HH
Mittels Polymerasekettenreaction (PCR) mit Einzelstrang-cDNA aus
C. purpureus wurden mit Primer A und Primer C zwei DNA-Fragmente
von 557 bp (Cer3) und 575 bp (Cer16) Länge und mit Primer B und
Primer C ein DNA-Fragment von 560 bp (Cer1) Länge amplifiziert.
Es wurde folgendes Programm für die Amplifizierung benutzt:
10 min bei 94°C, Pause für "hot start" bei 72°C, gefolgt von
32 Zyklen von 20 s bei 94°C, 1 min bei 45°C (Bindungstemperatur,
Tm) und 1 min bei 72°C, 1 Zyklus von 10 min bei 72°C und Stop bei
4°C. Für die Amplifikation wurde die Taq-DNA-Polymerase (Gibco
BRL) verwendet.
Die oben genannten doppelsträngigen DNA-Fragmente aus den zwei
PCR-Amplifikationen wurden in den pGEM-T Vektor (Promega)
legiert, in E. coli XLlblue MRF' Kan (Stratagene) transformiert
und mit dem ABI PRISM Big Dye Terminator Cycle Sequencing Ready
Reaction Kit (Perkin-Elmer, Weiterstadt) sequenziert. Die DNA-
Teilsequenzen von Cer1 und Cer3 zeigten 70% Identität. Die oben
genannten DNA-Teilsequenzen kodierten ohne Primer für offene
Leserahmen bei Cer1 von 173 Aminosäuren (SEQ ID NO: 5 = Partielle
Nukleotidsequenz ohne Primer von Cer1 und SEQ ID NO: 6 =
Partielle deduzierte Aminosäuresequenz von Cer1), bei Cer 3 von
172 Aminosäuren (SEQ ID NO: 7 = Partielle Nukleotidsequenz ohne
Primer von Cer3 und SEQ ID NO: 8 = Partielle deduzierte Amino
säuresequenz von Cer3) und bei Cer16 von 178 Aminosäuren
(SEQ ID NO: 9 = Partielle Nukleotidsequenz ohne Primer von Cer16
und SEQ ID NO: 10 = Partielle deduzierte Aminosäuresequenz von
Cer16). Die abgeleitete Proteinsequenz von Cer1 wies 64% zu Cer3
und 28% identische Aminosäuren zu Cer16 auf; Cer 3 und Cer16
wiesen wiederum 27% identische Aminosäuren auf.
Die höchste Ähnlichkeit der Cer1- und Cer3-Proteine besteht
zu der Δ6-Acyllipid-Desaturase aus Physcomitrella patens
(Girke et al., Plant J., 15, 1998: 39-48), während Cer16 die
höchste Ähnlichkeit zu der Δ6-Acyllipid-Desaturase und der
Δ8-Sphingolipid-Desaturase aus höheren Pflanzen aufweist.
Eine gerichtete λZAP-cDNA-Bank von Ceratodon purpureus wurde
von Fritz Thummler, Botanisches Institut der Universität München,
zur Verfügung gestellt (Pasentsis et al., Plant J., 13, 1,
1998: 51-61). Es wurde ein PCR-Test dieser Ceratodon-Bank durch
geführt, bei dem spezifische Primer von den oben genannten DNA-
Teilsequenzen Cer1, Cer3 und Cer16 abgeleitet wurden:
Spezifische forward und reverse Primer:
Spezifische forward und reverse Primer:
Eine Restriktionsanalyse (Hind III bzw. EcoR V) der aus der cDNA-
Bank mittels PCR amplifizierten Produkte zeigte in allen drei
Fällen das gleiche Restriktionsmuster wie das der PCR-Amplifikate
aus der ss-cDNA, d. h. die Ceratodon-cDNA-Bank enthält die drei
Klone Cer1, Cer3 und Cer16.
DNA-Minipräparationen, der drei aus ss-cDNA amplifizierten PCR-
Fragmente Cer1, Cer3, Cer16 von ~570 bp Länge in pGEM-T (siehe
Beispiel 6) wurden für das weitere Screening der vollständigen
Klone aus einer λ ZAP-cDNA-Bank von Ceratodon purpureus an M. Lee
und S. Stymne abgegeben. Dieses cDNA-Bank-Screening führte bisher
zu zwei vollständigen Klonen von Cer1 und Cer3 mit Inserts von
ca. 2,2 kb, die als EcoR I/Kpn I-Fragmente aus dem λ ZAP-
Vektor in die EcoR I/Kpn I-Schnittstellen des puc19-Vektors
(New England Biolabs) subkloniert und in E. coli JM105 trans
formiert wurden.
Ein weiteres Screening der cDNA-Bank mit Cer1 und Cer3 als
Hybridisierungsproben unter niedriger Stringenz zeigte, daß
mindestens ein weiterer Cer1-homologer Klon existiert, der
evtl. für die Δ5-Desaturase kodieren könnte.
Zwei E. coli-Klone, Cer1-50 und Cer3-50, wurden vollständig
sequenziert. Cer1-50 hat eine Länge von 2003 bp (SEQ ID NO: 1 =
Nukleotidsequenz der Δ6-Acetylenase/Δ6-Desaturase aus Ceratodon
purpureus mit 5'- und 3'-untranslatierten Regionen und polyA)
und kodiert für ein offenes Leseraster von 483 Aminosäuren
(SEQ ID NO: 2 = deduzierte Aminosäuresequenz der Δ6-Acetylenase/Δ6-
Desaturase aus Ceratodon purpureus). Cer3-50 besitzt eine
Länge von 2142 bp (SEQ ID NO: 11 = Nukleotidsequenz [2142 bp]
der Δ6-Desaturase aus Ceratodon purpureus mit 5'- und 3'-untrans
latierten Regionen) mit einen offenen Leserahmen von 520 Amino
säuren (SEQ ID NO: 12 = deduzierte Aminosäuresequenz der
Δ6-Desaturase aus Ceratodon purpureus). Beide Proteinsequenzen
weisen N-terminal das hochkonservierte HPGG-Motiv des Cytochrom b5
auf (Lederer F., Biochimie 76, 1994: 674-692) und C-terminal
die für Desaturasen charakteristischen drei Histidin-Boxen auf
(Shanklin et al., Biochemistry, 33, 1994: 12787-12794). Sie
stellen somit weitere Mitglieder der wachsenden Familie der
Cytochrom b5-Fusionsproteine dar (Napier et al., Trends in PLant
Science, 4, 1, 1999: 2-4). Das erste Histidin der dritten Box
ist gegen Glutamin ausgetauscht, einem weiterem Charakteristikum
von Δ5- und Δ6-Acyllipid-Desaturasen sowie Δ8-Sphingolipid-
Desaturasen.
Es wurde eine cDNA hergestellt, die für Enzyme mit Δ6-Acetylen
ase/Δ6-Desaturase-Aktivität aus Ceratodon purpureus codiert. Ana
log zu dem hier beschriebenen Beispiel wurde die Δ6-Desaturase
kloniert (siehe SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4 bzw. SEQ ID NO: 12).
Hierzu wird zunächst anhand der Cer1-cDNA für die Δ6-Acetylenase/Desaturase
aus Ceratodon purpureus die Oligonukleotide für eine
Polymerase Kettenreakion (PCR) abgeleitet.
Die folgenden Primer wurden abgeleitet von Cer1 für die
Expression in Hefe angepaßt:
In einer PCR Reaktion wird eine Δ6-Acetylenase/Desaturase cDNA
aus Ceratodon purpureus als Matrize verwendet. Mithilfe der
Primer wird eine BamHI-Restriktionsschnittstelle vor dem Start
codon der Δ6-Acetylenase/Desaturase cDNA eingeführt. Für eine
gerichtete Klonierung wird hinter das Stopcodon eine SalI-
Restriktionsschnittstelle eingeführt. Die Reaktionsgemische
enthielten ca. 1 ng/micro l Matrizen DNA, 0,5 microM der Oligo
nukleotide und, 200 microM Desoxy-Nukleotide (Pharmacia), 50 mM
KCl, 10 mM Tris-HCl (pH 8,3 bei 25°C, 1,5 mM MgCl2) und 0,02 U/micro l
Pwo Polymerase (Boehringer Mannheim) und werden in einer
PCR-Maschine der Firma Perkin Elmer mit folgendem Temperatur
programm inkubiert:
| Anlagerungstemperatur: | 50°C, 52 sec |
| Denaturierungstemperatur: | 95°C, 52 sec |
| Elongationstemperatur: | 72°C, 90 sec |
| Anzahl der Zyklen: | 30 |
Das erhaltene Fragment von 1467 Basenpaaren wird in den mit EcoRV
gespaltenen Vektor pBluescript SK- (Stratagene) ligiert. Durch
Kontrollspaltung wird ein Klon identifiziert pBS-Cer1, dessen
Insert durch BamHI/SalI in voller Länge exzisierbar ist (1452
Basenpaare plus 15 Nukleotide Restriktionsschnittstellen) und
folgende Sequenz aufweist (das Start- und Stopcodon ist unter
strichen, die Schnittstellen sind kursiv dargestellt). Analog
kann auch eine cDNA Sequenz des Klones Cer50 genutzt werden.
Dabei handelt es sich um eine monofunktionelle delta-6-Desaturase
(siehe SEQ ID NO: 3). Die abgeleitete Aminosäuresequenz ist
SEQ ID NO: 4 zu entnehmen.
Zur Überprüfung der Funktionalität des codierten Enzyms in einem
Mikroorganismus, wird das 1467 bp BamHI/SalI-Fragment aus pBS-
Cer1 in den BamHI/XhoI geschnittenen Expressionsvector pYES2
(Invitrogen, Groningen, Niederlande) ligiert und Hefe nach
Standardprotokollen mit dem neu entstandenen Plasmid pYES2-Cer1
transformiert (siehe Transformationsprotokoll Invitrogen,
Groningen, Niederlande). Erhaltene Kolonien werden auf Raffinose
haltigen Medium angezogen und mittels Galaktose die Genexpression
der Δ6-Acetylenase/Desaturase induziert (siehe unten).
Hefen können neben den eigenen Fettsäuren (16 : 0, 16 : 1, 18 : 0
und 18 : 1) auch exogene Fettsäuren in ihre Membranlipide in
korporieren. Um die Substratspezifität der jeweils exprimierten
Desaturase zu testen, wird dem CM - 2% Raffinose-Medium zur
Solubilisierung exogener Fettsäuren 1% Tergitol NP-40 (w/v,
Sigma) und 0,003% der entsprechenden Fettsäure (Stammlösung:
0,3% bzw. 3% Fettsäure in 5% Tergitol NP-40, w/v) vor der
Inokulation zugegeben. Die Vorkultur erfolgte durch Inokulation
von 3 ml CM - 2% Raffinose-Medium/1% Tergitol NP-40 mit einer
transgenen Hefekolonie und anschließender Inkubation für 2 d bei
30°C im Roller bis zu einer optischen Dichte bei 600 nm (OD600)
von 4,0 bis 4,3. Für die Hauptkultur werden 10 ml CM - 2%
Raffinose/1% Tergitol NP-40-Medium ± 0,003% Fettsäure mit
einem Aliquot der Vorkultur (200 fache Verdünnung) ad OD600 0,02
angeimpft und 24 h bei 30°C, 250 rpm im Schüttler inkubiert. Die
Induktion der Testkulturen erfolgte in der logarithmischen Wachs
tumsphase (OD600 0,5 bis 0,6) durch Zugabe von Galaktose ad 1,8%.
Die Ernte der induzierten Zellen erfolgte nach weiteren 24 h
aeroben Wachstums bei 30°C bei einer OD600 von 4,0 bis 4,3.
Die induzierten Hefezellen werden durch 10 min Zentrifugation bei
2000 g geerntet, in 3 ml Aqua dest. resuspendiert, 10 min bei
100°C abgekocht und nach dem Abkühlen auf Eis erneut sedimentiert.
Das Zellsediment wird mit 1 N methanolischer Schwefelsäure und
2% Dimethoxypropan 1 h bei 90°C hydrolysiert und die Lipide trans
methyliert. Die resultierenden Fettsäuremethylester (FAME) werden
in Petrolether extrahiert. Die extrahierten FAME werden durch
Gasflüssigkeitschromatographie mit einer Kapillarsäule (Chrom
pack, WCOT Fused Silica, CP-Wax-52 CB, 25 m, 0,32 mm) und einem
Temperaturgradienten von 170°C auf 240°C in 20 min und 5 min bei
240°C analysiert. Die Identität der Mono-, Di-, Tri- und Tetraen
säuremethylester wird durch Vergleich mit entsprechenden FAME-
Standards (Sigma) bestätigt. Für die Tri- und Tetraynsäuren
sind keine Referenzsubstanzen erhältlich. Ihre Identität und
die Position der Dreifachbindung wird durch geeignete chemische
Derivatisierung der FAME-Gemische z. B. zu 4,4-Dimethoxyoxazolin-
Derivaten (Christie, 1998) mittels GC-MS von analysiert. Die GC-
Analysen der Fettsäuremethylester aus den transgenen Hefen, die
mit dem Leervektor pYES2, mit pYES2-Cer1 (Δ6-Acetylenase)
transformiert werden, ist in Tab. 1 dargestellt. Die transgenen
Hefezellen werden ohne exogenen Fettsäuren oder nach Zugabe
von Linolsäure (18 : 2), γ-Linolensäure (γ-18 : 3), α-Linolensäure
(α-18 : 3) oder ω3-Octadecatetraensäure (18 : 4) analysiert.
Tabelle 1 gibt die GC-Analysen der Fettsäuremethylester
aus transgenen Hefen, die mit dem Leervektor pYES2, der
Δ6-Acetylenase (Cer1/pYES2) und der Δ6-Desaturase (Cer3/pYES2)
transformiert wurden, wieder. Die transgenen Hefezellen wurden
ohne exogenen Fettsäuren (-) oder nach Zugabe von Linol
säure (18 : 2), γ-Linolensäure (γ-18 : 3), α-Linolensäure (α-18 : 3)
oder ω3-Octadecatetraensäure (18 : 4) analysiert. Fettsäure
zusammensetzung in [mol %] der Gesamtfettsäuren, wobei die
Inkorporation der gefütterten Fettsäuren (schwarzer Fettdruck),
die Desaturierungsprodukte (in roter Farbe) und die Summe
der Desaturierungsprodukte (letzte Zeile) bei den einzelnen
Fütterungsversuchen angegeben sind.
Für die Transformation von Pflanzen wird ein Transformations
vektor erzeugt, der das BamHI/SalI-Fragment aus pBS-Cer1 in den
mit BamHl/Sall gespaltenen Vektor pBin-USP oder in pBinAR ligiert
wird. pBin-USP und pBinAR sind Derivate des Plasmides pBin19.
pBinAR entstand aus pBin19, indem in pBin19 (Bevan et al. (1980)
Nucl. Acids Res. 12, 8711) ein 35S CaMV Promotor als EcoRI-KpnI-
Fragment (entsprechend den Nukleotiden 6909-7437 des Cauliflower-
Mosaik-Virus (Franck et al. (1980) Cell 21, 285) inseriert wird.
Das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmides
pTiACH5 (Gielen et al., (1984) EMBO J. 3, 835), Nukleotide
11749-11939 wird als PvuII-HindIII-Fragment isoliert und nach
Addition von SphI-Linkern an die PvuII-Schnittstelle zwischen die
SpHI-HindIII Schnittstelle des Vektors kloniert. Es entstand das
Plasmid pBinAR (Höfgen und Willmitzer (1990) Plant Science 66,
221-230), wobei durch Umklonierung aus pBluescript mehrere
Restriktionschnittstellen zwischen Promotor und Terminator zur
Verfügung stehen. Der USP-Promotor entspricht den Nukleotiden
1-684 (Genbank Accession X56240), wobei ein Teil der nicht-
codierenden Region des USP-Gens im Promotor enthalten ist. Das
684 Basenpaar große Promotorfragment wurde mittels käuflichen
T7-Standardprimer (Stratagene) und mit Hilfe eines synthetisier
ten Primers über eine PCR-Reaktion nach Standardmethoden ampli
fiziert. (Primersequenz:
5'-GTCGACCCGCGGACTAGTGGGCCCTCTAGACCCGGGGGATCCGGATCTGCTGGCTATGAA-3'). Das PCR-Fragment wurde mit EcoRI/SalI nachgeschnitten und in den Vektor pBinAR eingesetzt. Es entsteht das Plasmid mit der Bezeichnung pBinUSP.
5'-GTCGACCCGCGGACTAGTGGGCCCTCTAGACCCGGGGGATCCGGATCTGCTGGCTATGAA-3'). Das PCR-Fragment wurde mit EcoRI/SalI nachgeschnitten und in den Vektor pBinAR eingesetzt. Es entsteht das Plasmid mit der Bezeichnung pBinUSP.
Das Konstrukt wird zur Transformation von Arabidopsis thaliana
und Rapspflanzen eingesetzt.
Regenerierte Sprosse werden auf 2MS-Medium mit Kanamycin und
Claforan erhalten, nach Bewurzelung in Erde überführt und nach
Kultivierung für zwei Wochen in einer Klimakammer oder im
Gewächshaus angezogen, zur Blüte gebracht, reife Samen geerntet
und auf D6-Acetylenase/Desaturase-Expression mittels Lipid
analysen untersucht. Linien mit erhöhten Gehalten an Acetylen
fettsäuren oder Doppelbindungen an der delta-6-position werden
identifiziert. Es läßt sich in den stabil transformierten trans
genen Linien, die das Transgen funktionell exprimieren, ein
erhöhter Gehalt von Acetylenfettsäuren und Doppelbindungen an
der delta-6-position im Vergleich zu untransformierten Kontroll
pflanzen feststellen.
Die Analyse von Lipiden aus Pflanzensamen verläuft analog der
Analyse von Hefelipiden. Jedoch wird Pflanzenmaterial zunächst
mechanisch durch Mörsern homogenisiert, um es einer Extraktion
zugänglich zu machen.
Claims (23)
1. Isolierte Nukleinsäuresequenz, die für ein Polypeptid mit
Δ6-Acetylenase- und/oder Δ-6-Desaturaseaktivität codiert,
ausgewählt aus der Gruppe:
- a) einer Nukleinsäuresequenz mit der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellten Sequenz,
- b) Nukleinsäuresequenzen, die sich als Ergebnis des degene rierten genetischen Codes von der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellten Nuklein säuresequenz ableiten,
- c) Derivate der in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellten Nukleinsäuresequenz, die für Polypeptide mit der in SEQ ID NO: 2 dargestellten Amino säuresequenzen codieren und mindestens 75% Homologie auf Aminosäureebene aufweisen, ohne daß die enzymatische Wirkung der Polypeptide wesentlich reduziert ist.
2. Aminosäuresequenz codiert durch eine Nukleinsäuresequenz
gemäß Anspruch 1.
3. Aminosäuresequenz nach Anspruch 2, codiert durch die in
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 oder SEQ ID NO: 11 dargestellte
Sequenz.
4. Expressionskassette enthaltend eine Nukleinsäuresequenz gemäß
Anspruch 1, wobei die Nukleinsäuresequenz mit einem oder
mehreren Regulationssignalen verknüpft ist.
5. Vektor enthaltend eine Nukleinsäuresequenz gemäß Anspruch 1
oder eine Expressionskassette gemäß Anspruch 4.
6. Organismus enthaltend mindestens eine Nukleinsäuresequenz ge
mäß Anspruch 1 oder mindestens ein Expressionskassette gemäß
Anspruch 4 oder mindestens einen Vektor gemäß Anspruch 5.
7. Organismus nach Anspruch 6, wobei es sich bei dem Organismus
um eine Pflanze, einen Mikroorganismus oder ein Tier handelt.
8. Transgene Pflanze enthaltend eine funktionelle oder nicht
funktionelle Nukleinsäuresequenz gemäß Anspruch 1 oder eine
funktionelle oder nicht funktionelle Expressionskassette
gemäß Anspruch 4.
9. Verfahren zur Herstellung von ungesättigten Fettsäuren
dadurch gekennzeichnet, daß man mindestens eine Nukleinsäure
sequenz gemäß Anspruch 1 oder mindestens eine Expressions
kassette gemäß Anspruch 4 in einen Öl produzierenden
Organismus bringt, diesen Organismus anzieht und daß in dem
Organismus enthaltene Öl isoliert und die im Öl enthaltenden
Fettsäuren freisetzt.
10. Verfahren zur Herstellung von Triglyceriden mit einem
erhöhten Gehalt an ungesättigten Fettsäuren, dadurch gekenn
zeichnet, daß man mindestens eine Nukleinsäuresequenz gemäß
Anspruch 1 oder mindestens eine Expressionskassette gemäß
Anspruch 4 in einen Öl produzierenden Organismus bringt,
diesen Organismus anzieht und daß in dem Organismus ent
haltene Öl isoliert.
11. Verfahren nach Anspruch 9 oder 10, dadurch gekennzeichnet,
daß die ungesättigten Fettsäuren einen erhöhten Gehalt an
ungesättigten Fettsäuren mit einer Dreifachbindung oder mit
einer Doppelbindung in Δ-6-Position oder einer Dreifach
bindung und Doppelbindung in Δ-6-Position aufweisen.
12. Verfahren nach den Ansprüchen 9 bis 11, dadurch gekennzeich
net, daß es sich bei dem Organismus um eine Pflanze oder einen
Mikroorganismus handelt.
13. Protein enthaltend die in SEQ ID NO: 8 dargestellte Amino
säuresequenz.
14. Protein enthaltend die in SEQ ID NO: 10 dargestellte Amino
säuresequenz.
15. Verwendung von Proteinen nach Anspruch 13 oder 14 zur Her
stellung von ungesättigten Fettsäuren.
16. Verfahren zur Herstellung von Triglyceriden mit einem
erhöhten Gehalt an ungesättigten Fettsäuren, indem man
Triglyceride mit gesättigten oder ungesättigten oder ge
sättigten und ungesättigten Fettsäuren mit mindestens einem
der Proteine gemäß Anspruch 2, 13 oder 14 inkubiert.
17. Verfahren nach Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet, daß die
Triglyceride in Gegenwart einer Verbindung hergestellt wer
den, die Reduktionsäquivalente aufnehmen oder abgeben können.
18. Verfahren nach Anspruch 16 oder 17, dadurch gekennzeichnet,
daß die Fettsäuren aus den Triglyceriden freigesetzt werden.
19. Ungesättigte Fettsäuren hergestellt nach einem Verfahren
gemäß Anspruch 9 oder 18.
20. Triglyceride mit einem erhöhten Gehalt an ungesättigten Fett
säuren hergestellt nach einem Verfahren gemäß Anspruch 10, 16
oder 17.
21. Verwendung einer Nukleinsäuresequenz gemäß Anspruch 1 oder
eine Expressionskassette gemäß Anspruch 4 zur Herstellung von
transgenen Pflanzen.
22. Verwendung einer Nukleinsäuresequenz gemäß Anspruch 1 oder
eines Fragmentes davon zur Isolierung einer genomischen
Sequenz über Homologiescreening.
23. Verwendung von ungesättigten Fettsäuren gemäß Anspruch 19
oder Triglyceriden mit einem erhöhten Gehalt an ungesättigten
gemäß Anspruch 20 zur Herstellung von Nahrungsmitteln, Tier
futter, Kosmetika oder Pharmazeutika.
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