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DE10115507A1 - Verfahren zur Kodierung von Information in Nukleinsäuren eines genetisch veränderten Organismus - Google Patents

Verfahren zur Kodierung von Information in Nukleinsäuren eines genetisch veränderten Organismus

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Publication number
DE10115507A1
DE10115507A1 DE10115507A DE10115507A DE10115507A1 DE 10115507 A1 DE10115507 A1 DE 10115507A1 DE 10115507 A DE10115507 A DE 10115507A DE 10115507 A DE10115507 A DE 10115507A DE 10115507 A1 DE10115507 A1 DE 10115507A1
Authority
DE
Germany
Prior art keywords
dna sequence
functional
sequence
organism
functional dna
Prior art date
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Withdrawn
Application number
DE10115507A
Other languages
English (en)
Inventor
Yuri Gleba
Victor Klimyuk
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Icon Genetics AG
Original Assignee
Icon Genetics AG
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Publication date
Application filed by Icon Genetics AG filed Critical Icon Genetics AG
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Priority to CA2442022A priority patent/CA2442022C/en
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Priority to MXPA03008669A priority patent/MXPA03008669A/es
Priority to ES01986901T priority patent/ES2429360T3/es
Priority to EP01986901.5A priority patent/EP1373531B1/de
Priority to AU2002238453A priority patent/AU2002238453B2/en
Priority to US10/471,960 priority patent/US7667091B2/en
Priority to JP2002578483A priority patent/JP2004532631A/ja
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Abstract

Diese Erfindung beschreibt ein Verfahren zum Kodieren einer Informationsnachricht in der DNA eines genetisch veränderten Organismus mit dem Zweck, den Organismus mit technischer Information zu markieren, was eine verlässlichere Umwelt-, Technik- und wirtschaftliche Kontrolle sowie die Verfolgung des genetisch veränderten Organismus erlaubt. Das Verfahren beruht auf der Anwendung eines vorbestimmten Kodierschemas auf eine Informationsnachricht, wobei das vorbestimmte Codierschema eine Abbildung von einer Vielzahl von möglichen Informationsnachrichten auf eine Vielzahl von DNA Sequenzen vorsieht. Ferner wird ein Verfahren zum Kodieren einer Informationsnachricht in einem DNA Molekül und ein Verfahren zum Markieren eines DNA Moleküls mit einer Marke beschrieben.

Description

ALLGEMEINES GEBIET DER ERFINDUNG
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Erzeugung eines genetisch veränderten Organismus, der eine kodierte Informationsnachricht enthält. Sie bezieht sich ferner auf ein Verfahren zur Kodierung einer Informationsnachricht in einem DNA-Molekül und auf ein Verfahren zur Markierung eines DNA Moleküls mit einer Marke. Verfahren zur Analyse eines solchen genetisch veränderten Organismus oder DNA-Moleküls werden ebenfalls zur Verfügung gestellt.
HINTERGRUND DER ERFINDUNG
Das genetische Verändern ist ein technisches Verfahren und unterliegt als solches bestimmten Vorschriften und Regulierungen, die entworfen wurden, um geeignete technische, ökologische und ökonomische Bedingungen für dieses Verfahren und für die sich daraus ergebenden Produkte sicherzustellen. Solche Vorschriften sind in anderen Technologiefeldern gut etabliert und sind unter anderem zur Sicherstellung einer hohen Qualität und Reproduzierbarkeit des Verfahrens und der sich daraus ergebenden Produkte eingeführt worden. Weiterhin dienen sie dazu, die Allgemeinheit, die Verbraucher, die Hersteller wie auch die Umwelt zu schützen. Genetisch modifizierte (GM) Organismen sind spezielle vom Menschen geschaffene Produkte, weil sie sich selbst replizieren können. Deswegen hat jedes transgenes Material, das in die Umwelt freigesetzt wird, das Potential, lange Zeit zu überdauern. Die wissenschaftliche Gemeinschaft wird oftmals beschuldigt, allzu sehr fasziniert von wissenschaftlichen Entdeckungen zu sein und sorglos die öffentliche Gesundheit und die Umwelt durch die Befürwortung der frühen Freisetzung von genetisch veränderten Organismen wie GM-Pflanzen zu gefährden. Seit 1994 sind ungefähr 3.5 Billionen transgene Pflanzen in Amerika angebaut worden, und keine Hinweise auf schädliche Wirkungen wurden gefunden. Nach wie vor sind "gute technologische Verfahrensweisen" in Bezug auf das Verfahren der genetischen Manipulation und der transgenen Organismen als Produkte noch nicht bis zur Reife entwickelt worden. Weitere Anstrengungen werden diesbezüglich unternommen. Ein Element dieser weiter fortgeschrittenen, biotechnologischen Verfahren ist die Bereitstellung geeigneter technischer Informationen, was die Kennzeichnung und die Registrierung der Produkte umfasst. Mehrere Gruppen befürworten die Kennzeichnung von Nahrungsmitteln, die gentechnisch veränderte Organismen (GMOs) enthalten. Die neueste Entscheidung der Europäischen Union, das Moratorium bezüglich auf transgener Pflanzen aufzugeben, ist eine positive Entwicklung in die richtige Richtung (Schiermeier, Q., 2001, Nature, 409, 967-968). Die Staaten, die de facto hinter dem Moratorium stehen, fordern jedoch zusätzliche Regelungen zur Verfolgbarkeit und zur Kennzeichnung von GM-Produkten.
Es ist deswegen die Aufgabe dieser Erfindung, ein Verfahren zur Kennzeichnung von GM-Organismen zur Verfügung zu stellen.
Es ist eine weitere Aufgabe der Erfindung, Verfahren zur Verfügung zu stellen, welche es erlauben, in die Umwelt freigesetzte GM-Organismen und von diesen abstammende Produkte zu verfolgen.
Es ist eine weitere Aufgabe, ein Verfahren zur Kodierung einer Informationsnachricht in einem DNA Molekül zur Verfügung zu stellen.
ZUSAMMENFASSUNG DER ERFINDUNG
Es wird ein Verfahren zur Herstellung eines genetisch veränderten Organismus bereitgestellt, umfassend
  • a) das Einführen einer funktionellen DNA Sequenz in den Organismus und
  • b) das Einführen einer nichtfunktionellen DNA Sequenz in den Organismus,
wobei die nichtfunktionelle DNA Sequenz dem Ergebnis der Anwendung eines vorbestimmten Kodierschemas auf eine Informationsnachricht entspricht, wobei die Informationsnachricht sich auf die funktionelle DNA Sequenz bezieht, und wobei das vorbestimmte Kodierschema eine Abbildung von einer Vielzahl von möglichen Informationsnachrichten auf eine Vielzahl von DNA Sequenzen vorsieht.
Dies Erfindung stellt weiterhin einen transgenen Organsimus zur Verfügung, der gemäß diesem Verfahren erhalten wird oder erhältlich ist.
Weiterhin werden die Vektoren zum Einführen von DNA in einen Organismus gemäß diesem Verfahren zur Verfügung gestellt.
Ferner wird ein Verfahren zur Analyse eines genetisch veränderten Organismus, der gemäß dem Verfahren dieser Erfindung hergestellt wurde, bereitgestellt, wobei das Verfahren mindestens einen der folgenden Schritte umfasst:
  • a) Benutzen der PCR Methode zum Amplifizieren der nichtfunktionellen DNA Sequenz,
  • b) Benutzen einer Sonde mit einer Sequenz, die komplementär zur nichtfunktionellen DNA Sequenz ist,
  • c) Benutzen eines Antikörpers zur immunologischen Detektion eines Polypeptids, das von der nichtfunktionellen DNA Sequenz abgelesen wird,
  • d) Sequenzieren der nichtfunktionellen DNA Sequenz,
  • e) Lesen der Informationsnachricht mit Hilfe des vorbestimmten Codierschemas.
Gemäß dem Verfahren dieser Erfindung werden wenigstens zwei Sequenzen in einen Organismus eingeführt: eine funktionelle und eine nicht funktionelle DNA-Sequenz.
Die funktionelle DNA-Sequenz enthält ein gewünschtes Gen oder Genfragment, das zum Beispiel dem Organismus ein nützliches Merkmal verleiht. Die Funktionalität der funktionellen Sequenz entspricht im Wesentlichen dem Grund für die genetische Veränderung des Organismus.
Die nicht funktionelle DNA-Sequenz wird nicht für die Funktion des Organismus oder für die Funktion der funktionellen DNA-Sequenz benötigt, obwohl sie teilweise mit der funktionellen Sequenz überlappen kann. Die Informationsnachricht steht insofern mit der funktionellen DNA- Sequenz in Bezug, als sie Information über die funktionelle Sequenz enthält. Die Information hinsichtlich der funktionellen Sequenz kann ein Datum, einen Ort, einen Hersteller, einen Firmennamen, eine Registrier- oder eine Seriennummer, eine Referenz auf eine Datenbank oder einen Datenbankeintrag, der weitere Informationen bezüglich der funktionellen Sequenz enthält, eine Marke u. s. w. enthalten. Ein wichtiger Zweck der nicht funktionellen Sequenz besteht darin, einen in der Umwelt oder auf dem Markt gefunden GMO zu seinem Hersteller, zu seinem Herstellungsdatum und -ort oder seiner Freisetzung etc. zurückverfolgen zu können.
Das vordefinierte Kodierschema sieht eine Abbildung von einer Vielzahl von möglichen Informationsnachrichten auf eine Vielzahl von möglichen DNA-Sequenzen vor. Jede mögliche Informationsnachricht kann auf eine DNA-Sequenz durch die Anwendung des vordefinierten Kodierschemas abgebildet werden. Das Kodierschema kann eine eindeutige oder eine nicht eindeutige Abbildung erlauben. Vorzugsweise ist die Abbildung von einer DNA-Sequenz auf eine Informationsnachricht eindeutig und die Abbildung von einer Informationsnachricht auf eine DNA-Sequenz nicht eindeutig. Im weitesten Sinne kann diese Abbildung irgendeine binäre Beziehung zwischen dem Satz oder der Vielzahl von zulässigen Informationsnachrichten und dem Satz oder der Vielzahl von DNA-Sequenzen oder einer Teilmenge oder Teilmengen davon sein.
Es sind viele mögliche Kodierschemas für den Zweck dieser Erfindung denkbar. Eine besonders einfache Möglichkeit wäre ein Kodierschema, das mit Hilfe eines Verschlüsselungsbuches definiert ist und das jede mögliche Informationsnachricht (z. B. Firmenname) mit einer oder mehreren entsprechenden DNA-Sequenzen assoziiert. Dieses Verschlüsselungsbuch kann irgendeine inhärente Struktur haben, braucht dies jedoch nicht. In anderen Ausführungsformen dieser Erfindung wird ein vordefiniertes Kodierschema an Stelle eines vordefinierten Verschlüsselungsbuches, das für jede individuelle Informationsnachricht gesondert verwendet wird, eingesetzt. In jedem Fall ist die Anzahl der möglichen Informationsnachrichten, die kodiert werden kann, bevorzugt eher groß und kann in einigen Ausführungsformen größer als 10 oder größer als 1000 oder größer als 100.000 sein.
In einer bevorzugten Ausführungsform besteht die Informationsnachricht aus einer Sequenz aus alphanumerischen Zeichen. Diese können einzelnen Basen oder Multimeren von Basen zugeordnet sein. Vorzugsweise werden Multimere von Basen wie Dubletts, Tripletts, Quartetts oder Quintetts verwendet. Ab bevorzugtesten sind Basentripletts. Von Vorteil ist ebenfalls, wenn das Multimer der Basen eine höhere Kodierungskapazität als die Anzahl der Zeichen oder Buchstaben hat, die kodiert werden. Die Redundanz des Kodierschemas, das so erhalten wird, sorgt für eine höhere Stabilität der kodierten Information z. B. während des Sequenzierens oder der Reproduktion des Organismus. Weiterhin sorgt es für eine größere Vielseitigkeit und einer Anpassung der Nukleotidsequenz an andere Umstände wie zum Beispiel an alle Umstände, die mit der genetischen Veränderung eines Organismus zusammenhängen (z. B. Restriktionsstellen). Zusätzlich zu der Redundanz des Kodierschemas gibt es weitere Mittel, die Fehlersicherheit des Verfahrens der Erfindung zu verbessern, indem bis zu einer gegebenen Anzahl von Fehlern diese detektiert und korrigiert werden können. Dazu gehört z. B. der Gebrauch von Blockcodes wie binäre Codes und zyklische Codes, von verschachtelten Codes (interleaving codes), zyklischen Hamming Codes und von convolutional codes (siehe z. B. Informatikhandbuch, Hrg.: Pechenberger und Pomberger, zweite Auflage, München, Wien, Hanser Verlag, 1999). Die kodierte Information sollte über eine Zeitperiode, die praktisch relevant ist, stabil sein.
Wenn Multimere der Basen verwendet werden, um Zeichen der Informationsnachricht zu kodieren, stehen multiple Leseraster zur Verfügung. In diesem Fall kann mehr als ein Leseraster für die Kodierung der Informationsnachricht verwendet werden.
Um das Verfahren dieser Erfindung möglichst einer breiten Anwendung zuzuführen, sollte das Kodierschema allgemein anerkannt und somit vordefiniert sein. Bevorzugt sollte das Kodierschema national anerkannt sein. Eine internationale Anerkennung ist jedoch vorzuziehen. Die Inkorporierung einer nicht funktionellen DNA-Sequenz gemäß der Erfindung kann dann ein internationaler Standard werden, der zu der Sicherheit von GMOs beiträgt.
Die funktionelle und die nicht funktionelle DNA-Sequenz der genetisch modifizierten Organismen gemäß dieser Erfindung sollten mit dem Prozess der Reproduktion des Organismus verbunden sein und dies bleiben. Dieses kann mit der physikalischen Nähe der besagten Sequenzen erreicht werden. Sie sollten auf dem gleichem Chromosom lokalisiert sein. Bevorzugt sollten sie eng genug zueinander angeordnet sein, um die Wahrscheinlichkeit der Trennung während der Reproduktion über eine Zeitperiode, die praktisch relevant ist, zu minimieren. Eine praktisch relevante Zeitperiode kann annähernd mit 200, vorzugsweise mit 100 und mindestens mit 50 Generationen des Organismus definiert werden. Es kann von praktischem Nutzen sein, die funktionelle und die nicht funktionelle Sequenz direkt hintereinander in dem Organismus zu haben, optional durch eine Spacer-Sequenz getrennt. Diese Sequenzen können teilweise überlappen.
Durch gleichzeitiges Einführen der funktionellen und der nicht funktionellen Sequenz in den Organismus kann die Nähe dieser Sequenzen am einfachsten erreicht werden. Diese Erfindung umfasst jedoch auch den Fall, dass die nicht funktionelle Sequenz in einem Organismus inkorporiert wird, der schon gentechnisch durch die funktionellen Sequenz modifiziert ist oder umgekehrt.
Die nicht funktionelle DNA-Sequenz wird vorzugsweise mit mindestens einer vordefinierten Erkennungssequenz ausgestattet. Die Erkennungssequenz oder -sequenzen können innerhalb der nicht funktionellen Sequenz lokalisiert sein. Bevorzugt wird die nicht funktionelle Sequenz wenigstens auf einer Seite von einer vordefinierten Erkennungssequenz bzw. -sequenzen flankiert. Diese vordefinierte Erkennungssequenz bzw. -sequenzen erlauben die Identifizierung der nicht funktionellen DNA-Sequenz. Bevorzugt ist dabei die Situation, dass die nicht funktionelle DNA-Sequenz auf beiden Seiten von Erkennungssequenzen flankiert wird. Sie kann dann mit Hilfe der PCR-Amplifikation analysiert werden, wobei Primer, die komplementär zu den vordefinierten Erkennungssequenzen sind, verwendet werden. Anschließend wird die nicht funktionelle Sequenz sequenziert. Flankierende Erkennungssequenzen können auch zur Bestimmung der Initiation und/oder der Termination der nicht funktionellen Sequenz verwendet werden. Weiterhin können die vordefinierten Erkennungssequenzen derart gestaltet sein, dass mehrere nicht funktionelle DNA-Sequenzen getrennt oder gemeinsam in einem lebenden Organismus erkannt werden können. Dies ist wichtig, wenn mehrfach genetisch veränderte oder markierte Organismen alltäglich werden.
Die Erkennungssequenz(en) oder die flankierenden Sequenzen sind vorzugsweise vordefiniert, d. h. sie sind im Allgemeinen in der gleichen Weise wie das Kodierschema anerkannt. Die nicht funktionelle Sequenz kann dann detektiert, und die Informationsnachricht kann von der Basensequenz der nicht funktionellen DNA-Sequenz durch die Anwendung des Kodierschema gelesen werden. Dies kann von allen Personen mit einer durchschnittlichen molekularbiologischen Ausbildung durchgeführt werden. Alternativ kann die Anwesenheit der nicht funktionellen DNA-Sequenz zum Beispiel mit Hilfe einer DNA-Sonde detektiert werden, welche die ganze Erkennungssequenz, die nicht funktionelle Sequenz oder Teile derselben erkennt.
Weitere Möglichkeiten für die Analyse der nicht funktionellen DNA-Sequenz sind u. a. der Gebrauch eines Antikörpers gegen ein Polypeptid, das von der nicht funktionellen Sequenz exprimiert wird. In diesem Fall kann die nicht funktionelle Sequenz eine komplette Expressionskassette enthalten. Alternativ kann das besagte Polypeptid mit Hilfe eines IRES- Elementes (internal ribosome entry site), das in dem besagten Organismus funktionell ist, translatiert werden. Mit Hilfe dieser Methoden kann die nicht funktionelle Sequenz in Organismen oder in Produkten, die von diesen abstammen, detektiert werden, wie z. B. in (prozessierten) Nahrungsmitteln.
Die Analyse der nicht funktionellen Sequenz kann sich zum einen nur auf die Detektion der Anwesenheit einer nicht funktionellen Sequenz in einem Organismus beschränken (z. B. mittels einer DNA Sonde) oder sie kann die Bestimmung der Basensequenz der nicht funktionellen Sequenz und die Anwendung des Kodierschemas beinhalten, um die Informationsnachricht zu dekodieren.
Die Erkennungssequenz kann der nicht funktionellen DNA-Sequenz nach der Anwendung des Kodierschemas auf die Informationsnachricht hinzugefügt werden. Alternativ kann das Kodierschema derart gestaltet werden, dass eine Sequenz, die die Funktion einer Erkennungssequenz hat, der nicht funktionellen Sequenz bei der Anwendung des Kodierschemas hinzugefügt oder direkt in die nicht funktionelle Sequenz inkorporiert wird. In dieser Ausführungsform umfasst der Ausdruck "nicht funktionelle DNA-Sequenz" sowohl die Funktion der nicht funktionellen DNA-Sequenz als auch die Funktion der Erkennungssequenz.
Das Verfahren dieser Erfindung kann auf sämtliche GMOs angewendet werden. Es ist jedoch bevorzugt, es auf höhere Organismen wie Pflanzen oder Tiere anzuwenden. In der Gruppe der Tiere sind Säugetiere bevorzugt, wobei der Mensch ausgeschlossen ist. Am meisten bevorzugt sind allerdings höhere Nutzpflanzen.
Diese Erfindung stellt ferner ein Verfahren zur Kodierung einer Informationsnachricht in einem DNA-Molekül zur Verfügung, umfassend das Einführen einer nicht funktionellen DNA Sequenz in das DNA-Molekül, wobei die nichtfunktionelle DNA Sequenz dem Ergebnis der Anwendung eines vorbestimmten Kodierschemas auf eine Informationsnachricht entspricht, und wobei das vorbestimmte Kodierschema eine Abbildung von einer Vielzahl von möglichen Informationsnachrichten auf eine Vielzahl von DNA Sequenzen vorsieht.
Die zuvor dargestellten Prinzipien des Verfahrens zur Herstellung von gentechnisch veränderten Organismen gelten, sofern anwendbar, auch für das Verfahren zur Kodierung einer Informationsnachricht in einem DNA-Molekül.
Das DNA-Molekül kann ein Plasmid oder chromosomale DNA sein. Es kann isoliert oder in einem Organismus enthalten sein. Vorzugsweise wird es in einem Organismus gehalten. Am bevorzugtesten, ist die Informationsnachricht oder die nicht-funktionelle DNA- Sequenz eine Marke (trademark).
Schließlich stellt diese Erfindung ein Verfahren zum Markieren eines DNA Moleküls mit einer Marke bereit, umfassend
  • a) Auswahl einer Nukleotidsequenz, die geeignet ist, als Marke zu fungieren,
  • b) Einführen der Nukleotidsequenz in das DNA Molekül, so das sie detektiert werden und als Hinweis auf die Herkunft des DNA Moleküls erkannt werden kann.
Das Verfahren zur Kennzeichnung des DNA-Moleküls mit einer Marke ist eine spezielle Anwendung des Verfahrens der vorliegenden Erfindung, wobei das vordefinierte Kodierschema die Nukleotidsequenz, die als Markenzeichen wirken kann, auf den Inhaber des Markenzeichens abbildet.
Vektoren zum Einführen von DNA in einen Organismus gemäß dem Verfahren zur Erzeugung eines genetisch veränderten Organismus können nach allgemein in der Molekularbiologie bekannten Prinzipien entworfen werden. Diese Vektoren sollten dazu geeignet sein, eine gewünschte DNA Sequenz in das Genom eines Organismus einzuführen. Solche Vektoren können z. B. viralen Ursprungs sein. Im Falle von Pflanzen kann z. B. die Agrobakterium-vermittelte Einführung einer Ziel-DNA in die Pflanze verwendet werden.
Mehrere weitere Transformationsmethoden sind bekannt wie z. B. ballistische Methoden oder solche unter Verwendung von Teilchenkanonen (particle gun).
KURZE BESCHREIBUNG DER ABBILDUNGEN
Fig. 1 stellt den Vektor zur Kodierung und Aktualisierung der nicht biologischen Information dar.
A - Allgemeines Schema des Vektors; die ausgefüllten Bereiche entsprechen den konservierten Regionen, die für die Amplifizierung der kodierenden Region (nicht ausgefüllte Bereiche) mit dem PrimerA und B vorgesehen sind. Die Primer C und D sind für die Aktualisierung bzw. den Austausch der Information innerhalb der kodierenden Regionen vorhergesehen.
B - Ein Beispiel für die Kodierung der nicht biologischen Information.
DETAILIERTE BESCHREIBUNG DER ERFINDUNG
Hier wird vorgeschlagen, gentechnisch modifizierte Organismen (GMOs) selbst zu kennzeichnen, indem eine DNA kodierte (technische) Informationsnachricht in das Genom des GMO eingeführt wird, vorzugsweise neben eine funktionelle DNA-Sequenz (Transgen). Eine solche Informationsnachricht kann auf einem nicht genetischen Code oder einem Kodierschema basieren, sie kann leicht wiedergefunden und gelesen werden und sie kann verschiedene Informationsmengen enthalten. In einer bevorzugten Anwendungsform kann diese Kennzeichnung als ein universeller Kodierstandard von GMOs eingeführt werden, so dass auf diese Weise rechtlich geschützte Rahmenbedingungen für das gentechnische Verändern von Organismen geschaffen werden, welche die Allgemeinheit, die Umwelt und den Hersteller schützen.
Kodierschema/Sprachen
Die vorgeschlagene technische Information der Informationsnachricht wird in DNA verschlüsselt, so dass eine Sprache benutzt wird, die auf den vier Buchstaben der DNA beruht. Um die Sprache der Informationsnachricht möglichst anwendungsfreundlich zu machen, kann die englische Sprache gewählt werden. In diesem Fall ergibt sich ein Kodierschema, das die vier Buchstaben der DNA (A, T, C, G) in eine Sprache translatiert, die 26 lateinische Buchstaben, 10 arabische Ziffern und ein oder zwei Leer- bzw. Stopzeichen hat, also 37-38 (alphanumerische) Zeichen. Es ist offensichtlich, dass wir am besten mit einem Kodierschema bedient sind, das Tripletts der Nukleotide vergleichbar mit dem natürlichen genetischen Kode translatiert. Dieser Code hat eine Kodierungskapazität von 43 = 64 Zeichen, was mehr als ausreichend für unsere Anwendung ist. Der vorgeschlagene Code wird auf diese Weise auch bis zu einem gewissen Grad redundant sein, wodurch Lesefehler minimiert werden. Dies garantiert eine höhere Stabilität während der Reproduktion der Organismen. Die Redundanz ermöglicht es ebenfalls, unerwünschte Eigenschaften der nicht funktionellen Sequenzen zu vermeiden wie z. B. Restriktionsschnittstellen, die den Prozess der gentechnischen Veränderung komplizieren. Ein Beispiel eines Kodierschemas, das diese Aspekte berücksichtigt, ist in der Tabelle 1 vorgestellt. Fig. 1B zeigt ein Beispiel, welches unseren vorgeschlagenen nicht biologischen Code für die englische Sprache benutzt und bedeutet: ICON GENETICS HALLE.
Die Informationsnachricht
Um eine nützliche Botschaft in Bezug auf Inhalt und Länge zu definieren, können Analogien zu anderen bereits existierenden Produkten auf dem Markt herangezogen werden. Auf der Rückseite einer Maschine z. B. eines Computers findet man normalerweise Daten wie den Namen der Herstellerfirma, das Produktionsdatum, den Produktionsort, das Produktmodell und die Seriennummer. Unter der Annahme einer vergleichbaren Situation beim Genetic Engineering mag eine ausreichende Länge der Botschaft für die nähere Zukunft im Bereich von 3-10 Wörtern liegen. Jedes Wort hat dabei eine ausreichende Kodierungskapazität, welche die Komplexität einer industriellen Welt wiederspiegelt. Es mag z. B. der Name eines registrierten Produktbesitzers, der gleichzeitig der Hersteller sein kann oder nicht, und eine zusätzliche Sektion für eine Nachricht, die für die nähere Zukunft reserviert ist, enthalten sein. Wesentlich längere Botschaften sind jedoch ebenfalls möglich. Die DNA kodierte Information würde eine ausreichend, jedermann zugänglich allgemeine Informationen geben, sowie Informationen, die in anderen Medien wie in vollständigen Datenbanken des Herstellers oder in speziellen Datenbanken von Behörden gespeichert sind. Wenn man die durchschnittliche Länge der Wörter der zur Zeit verwendeten Kennzeichen von technischen Produkte voraussetzt, erreichen wir eine Gesamtlänge der Nachricht von ungefähr 100 alphanumerischen Zeichen, was 300 Nukleotiden entspricht, wenn man Basentripletts zu Grunde legt.
Initiation/Termination des Lesens
Um eine DNA kodierte Informationsnachricht technisch einfach und verlässlich lesen zu können, braucht man geeignete, universelle Initiations- und Terminationssignale. Wenn man den derzeitigen Status der DNA-Manipulation bedenkt, ist man am besten mit einem eindeutigen Satz von kurzen (18-30 Nukleotide), vordefinierten Erkennungssequenzen bedient, die eine einfache Amplifikation der DNA-Nachricht (nicht funktionelle DNA Sequenz) erlauben und die möglichst weit anerkannt sind und als Standard erklärt worden sind. Solche Primer für die Amplifiaktion würden es auf diese Weise erlauben, den Anfang und das Ende der DNA-Region, welche die Informationsnachricht kodiert, zu bestimmen.
Multiple Botschaften
Organismen können mehr als einmal genetisch verändert werden, wodurch mehrere Kennzeichnungen oder nicht funktionelle DNA Sequenzen nötig werden können. Das Problem von multiplen Kennzeichnungen wird mittels verschiedener Sätze von Initiationssequenzen der Nachrichten gelöst, einer degenerierten Sequenz, die alle möglichen Anfangssequenzen detektiert, und eine Serie von anderen Sequenzen, die weniger degeneriert oder einzigartig sind. Eine Dekodierung mittels PCR würde dann zunächst mit den degenerierten Sequenzen beginnen. Wenn mehrfach modifizierte und gekennzeichnete Organismen eingeführt werden, würde man multiple, weniger degenerierte Primer einschließen.
Technische Erwägungen
Technisch gesehen kann die Synthese eines kodierenden Bereiches einer DNA (nicht funktionelle DNA) graduell durch den Gebrauch von überlappenden Primern durchgeführt werden. Dieses bedingt nicht die Synthese von sehr langen Primern und kann in jedem Standard-molekularbiologischen Laboratorium durchgeführt werden. Das finale PCR-Produkt, das vorzugsweise von zwei seltenen Restriktionsschnittstellen flankiert wird (z. B. Not I) kann in einen kleinen high-copy Plasmidvektor (z. B. pUC oder pBS-Familie) wie in Fig. 1 gezeigt subkloniert werden. In diesem Vektor kann die Informationsnachricht, die in dem Bereich der DNA kodiert ist, leicht mit Hilfe von zwei phosphorylierten, kundenspezifischen Primern, die nicht überlappen aber von der gleichen Position in entgegengesetzter Orientierung (Primer C und D, Abb. 1) starten, aktualisiert werden. Diese Primer können alle notwendigen Veränderungen in den kodierenden Bereich einführen. Das PCR-Produkt, das solche Veränderungen trägt, kann mit dem Klenow Fragment der DNA-Polymerase I behandelt, religiert und in E. coli transformiert werden. Der kodierende Bereich kann leicht weiter in irgendeinen gewünschten Vektor mit Hilfe von standardmolekularbiologischen Techniken kloniert werden. Der Bereich der DNA, der die nicht biologische Information kodiert, kann in einem genetisch veränderten Oragnismus (oder sogar in Produkten von diesen, da immer noch Spuren von DNA vorhanden sind) detektiert werden, indem zu den konservierten Erkennungssequenzen der nicht funktionellen DNA komplementäre Primer verwendet werden (Primer A und B Abb. 1). Wenn man in Betracht zieht, dass durch eine falsche Basenpaarung des Primers mit dem Template am 3'-Ende des Primers die Synthese verhindert wird, erlaubt die Verlängerung der Primer A und B in die variable, kodierende Zentralregion die Detektierung von zwei oder mehreren verschiedenen Kennzeichnungen in demselben GMO oder seinen Derivaten. Die PCR-Produkte können subkloniert oder direkt sequenziert werden, und die nichtbiologische Information kann dekodiert werden, wodurch somit ein genetisch modifizierter Organismus und seine abgeleiteten Produkte identifiziert werden können.
Hinzufügen eines Nachrichtenfragments, das in ein Polypeptid translatiert werden kann
Um die Detektierung eines GMO weiter zu vereinfachen, kann die für die Informationsnachricht kodierende Region auch ein Segment kodieren, das eine Information enthält, die durch die genetische Maschinerie des lebenden Organismus exprimiert werden kann. Diese Information kann nach der Transkription und Translation ein kleines universelles Polypeptid erzeugen, das leicht mit schnellen und sensitiven immunologischen Techniken detektiert werden kann. Somit wird auf diese Weise die transgene Natur des fraglichen Organismus angezeigt.
TABELLE 1
BEISPIEL 1
Der nichtbiologische Code, der in Tabelle 1 vorgeschlagen wird, kann zur Kodierung von Information mit nichtbiologischer Art verwendet werden. Wenn man bedenkt, dass wenigstens 37 alphanumerische Buchstaben verschlüsselt werden müssen (26 Buchstaben des Alphabets im Fall der englischen Sprache, ein Leerzeichen und 10 Ziffern) und nur 64 Triplett-Kodes zur Verfügung stehen, basiert die Wahl der Bezeichnung von einem Buchstaben mit einem oder zwei Kodes auf der erwarteten Häufigkeit des Gebrauchs eines bestimmten Buchstabens. Hieraus resultiert, dass einige Buchstaben nur einen Triplett-Kode haben. Das Leerzeichen hat zwei Kodons, weil es das am häufigsten benutzte Zeichen ist. Wir empfehlen jedoch, das erste Kodon des Leerzeichens (ATG) am Anfang der verschlüsselten Information und das zweite Kodon (TTC) an das Ende der verschlüsselten Information zu stellen. Die Wahl des Leerzeichens in der Mitte der verschlüsselten Information sollte frei gewählt und nur dann verwendet werden, falls es notwendig ist, die Bildung einer Restriktionsschnittstelle zu vermeiden.

Claims (25)

1. Verfahren zur Herstellung eines genetisch veränderten Organismus, umfassend
  • a) das Einführen einer funktionellen DNA Sequenz in den Organismus und
  • b) das Einführen einer nicht funktionellen DNA Sequenz in den Organismus,
wobei die nicht funktionelle DNA Sequenz dem Ergebnis der Anwendung eines vorbestimmten Kodierschemas auf eine Informationsnachricht entspricht, wobei die Informationsnachricht sich auf die funktionelle DNA Sequenz bezieht, und wobei das vorbestimmte Kodierschema eine Abbildung von einer Vielzahl von möglichen Informationsnachrichten auf eine Vielzahl von DNA Sequenzen vorsieht.
2. Verfahren nach Anspruch 1, wobei die funktionelle DNA Sequenz vor der nicht funktionellen DNA Sequenz in den Organismus eingeführt wird.
3. Verfahren nach Anspruch 1, wobei die nicht funktionelle DNA Sequenz vor der funktionellen DNA Sequenz in den Organismus eingeführt wird.
4. Verfahren nach Anspruch 1, wobei die nicht funktionelle und die funktionelle DNA Sequenz gleichzeitig in den Organismus eingeführt werden.
5. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 4, wobei die nicht funktionelle und die funktionelle DNA Sequenz bei der Reproduktion des Organismus gekoppelt bleiben.
6. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 5, wobei die Abbildung DNA Bereichen auf alphanumerische Zeichen abbildet.
7. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 6, wobei die nicht funktionelle DNA Sequenz mit mindestens einer vorbestimmten Erkennungssequenz ausgestattet wird, die eine Identifizierung und/oder Analyse der nicht funktionellen DNA Sequenz erlaubt.
8. Verfahren nach Anspruch 7, wobei die Erkennungssequenz(en) die nicht funktionelle DNA Sequenz mindestens auf einer Seite flankiert (flankieren).
9. Verfahren nach Anspruch 7 oder 8, wobei die vorbestimmte(n) Erkennungssequenz(en) so entworfen ist (sind), dass sie die gemeinsame und getrennte Erkennung von mehreren nicht funktionellen DNA Sequenzen erlauben.
10. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 9, wobei das Kodierschema redundant ist, so dass die Kodierte Information über einen praktisch relevanten Zeitraum stabil ist.
11. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 10, wobei die nicht funktionelle DNA Sequenz eine weitere DNA Sequenz enthält, die für ein Polypeptid zur schnellen Erkennung Kodiert.
12. Transgener Organismus, der gemäß dem Verfahren eines der Ansprüche 1 bis 11 erhalten wird oder erhältlich ist.
13. Vektor zum Einführen von DNA in einen Organismus gemäß dem Verfahren eines der Ansprüche 1 bis 11.
14. Verfahren zur Analyse eines genetisch veränderten Organismus, der gemäß dem Verfahren eines der Ansprüche 1 bis 11 hergestellt wurde, mindestens einen der folgenden Schritte umfassend:
  • a) Verwenden der PCR Methode zum Amplifizieren der nichtfunktionellen DNA Sequenz,
  • b) Verwenden einer Sonde mit einer Sequenz, die komplementär zur nicht funktionellen DNA Sequenz ist,
  • c) Verwenden eines Antikörpers zur immunologischen Detektion eines Polypeptids, das von der nicht funktionellen DNA Sequenz abgelesen wird,
  • d) Sequenzieren der nicht funktionellen DNA Sequenz,
  • e) Lesen der Informationsnachricht mit Hilfe des vorbestimmten Kodierschemas.
15. Verfahren zur Codierung einer Informationsnachricht in einem DNA Molekül, umfassend das Einführen einer nicht funktionellen DNA Sequenz in das DNA Molekül, wobei die nicht funktionelle DNA Sequenz dem Ergebnis einer Anwendung eines vorbestimmten Kodierschemas auf eine Informationsnachricht entspricht und wobei das vorbestimmte Kodierschema eine Abbildung von einer Vielzahl von möglichen Informationsnachrichten auf eine Vielzahl von DNA Sequenzen vorsieht.
16. Verfahren gemäß Anspruch 15, wobei das DNA Molekül in einem Organismus vorliegt oder in einem solchen gehalten werden kann.
17. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 15 oder 16, wobei die nicht funktionelle DNA Sequenz mindestens auf einer Seite von vorbestimmten Erkennungssequenzen, die die Identifizierung der nicht funktionellen DNA Sequenzen erlauben, flankiert wird.
18. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 15 bis 17, wobei die Informationsnachricht Produktinformation enthält.
19. Verfahren gemäß Anspruch 18, wobei die Produktinformation eine Marke umfasst.
20. Verfahren gemäß Anspruch 18, wobei die Produktinformation eine Referenz auf eine Datenbank enthält.
21. Verfahren gemäß Anspruch 18, wobei die Produktinformation ein Datum, einen Ort und/oder einen Herstellernamen oder einen Besitzer enthält.
22. Verfahren zur Analyse einer Informationsnachricht, die gemäß dem Verfahren eines der Ansprüche 15 bis 21 in einem DNA Molekül codiert wurde, wobei das Verfahren mindestens einen der folgenden Schritte umfasst:
  • a) Benutzen der PCR Methode zum Amplifizieren der nichtfunktionellen DNA Sequenz,
  • b) Benutzen einer Sonde mit einer Sequenz, die komplementär zur nichtfunktionellen DNA Sequenz ist,
  • c) Benutzen eines Antikörpers zur immunologischen Detektion eines Polypeptids, das von der nichtfunktionellen DNA Sequenz abgelesen wird,
  • d) Sequenzieren der nichtfunktionellen DNA Sequenz,
  • e) Lesen der Informationsnachricht mit Hilfe des vorbestimmten Codierschemas.
23. DNA Molekül mit einer darin codierten Informationsnachricht hergestellt gemäß dem Verfahren eines der Ansprüche 15 bis 22.
24. Verfahren zum Markieren eines DNA Moleküls mit einer Marke umfassend
  • a) Auswahl einer Nukleotidsequenz, die geeignet ist, als Marke zu fungieren,
  • b) Einführen der Nukleotidsequenz in das DNA Molekül, so dass sie detektiert werden und als Hinweis auf die Herkunft des DNA Moleküls erkannt werden kann.
25. Verfahren gemäß Anspruch 24, wobei das DNA Molekül in einem Organismus vorliegt oder in einem solchen gehalten werden kann.
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ES01986901T ES2429360T3 (es) 2001-03-29 2001-12-19 Método de codificar información en ácidos nucleicos de un organismo tratado por ingeniería genética
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US10/471,960 US7667091B2 (en) 2001-03-29 2001-12-19 Method of encoding information in nucleic acids of a genetically engineered organism
JP2002578483A JP2004532631A (ja) 2001-03-29 2001-12-19 遺伝子組換え生物の核酸中の情報をコードする方法

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Families Citing this family (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE10049587A1 (de) * 2000-10-06 2002-05-02 Icon Genetics Ag Vektorsystem für Pflanzen
DE10061150A1 (de) 2000-12-08 2002-06-13 Icon Genetics Ag Verfahren und Vektoren zur Erzeugung von transgenen Pflanzen
DE10102389A1 (de) 2001-01-19 2002-08-01 Icon Genetics Ag Verfahren und Vektoren zur Plastidentransformation höherer Pflanzen
DE10114209A1 (de) * 2001-03-23 2002-12-05 Icon Genetics Ag Ortsgerichtete Transformation durch Verwendung von Amplifikationsvektoren
DE10115507A1 (de) 2001-03-29 2002-10-10 Icon Genetics Ag Verfahren zur Kodierung von Information in Nukleinsäuren eines genetisch veränderten Organismus
DE10121283B4 (de) 2001-04-30 2011-08-11 Icon Genetics GmbH, 80333 Verfahren und Vektoren zur Amplifikation oder Expression von gewünschten Nucleinsäuresequenzen in Pflanzen
DE10132780A1 (de) * 2001-07-06 2003-01-16 Icon Genetics Ag Plastidäre Genexpression über autonom replizierende Vektoren
DE10143205A1 (de) * 2001-09-04 2003-03-20 Icon Genetics Ag Verfahren zur Proteinproduktion in Pflanzen
DE10143238A1 (de) * 2001-09-04 2003-03-20 Icon Genetics Ag Identifizierung eukaryotischer interner Ribosomen-Eingangsstellen (IRES)-Elemente
DE10143237A1 (de) * 2001-09-04 2003-03-20 Icon Genetics Ag Herstellung künstlicher interner ribosomaler Eingangsstellenelemente (Ires-Elemente)
JP2005080523A (ja) * 2003-09-05 2005-03-31 Sony Corp 生体遺伝子に導入するｄｎａ、遺伝子導入ベクター、細胞、生体遺伝子への情報導入方法、情報処理装置および方法、記録媒体、並びにプログラム
ES2273531B1 (es) * 2003-10-24 2008-04-16 Newbiotechnic, S.A. Polinucleotidos como biotrazadores de productos alimenticios.
DE102007057802B3 (de) * 2007-11-30 2009-06-10 Geneart Ag Steganographische Einbettung von Informationen in kodierenden Genen
CA2779495C (en) * 2009-10-30 2019-04-30 Synthetic Genomics, Inc. Encoding text into nucleic acid sequences
US20110269119A1 (en) 2009-10-30 2011-11-03 Synthetic Genomics, Inc. Encoding text into nucleic acid sequences
US8937564B2 (en) 2013-01-10 2015-01-20 Infinidat Ltd. System, method and non-transitory computer readable medium for compressing genetic information
US20140236897A1 (en) * 2013-01-10 2014-08-21 Jacob Brodio System, method and non-transitory computer readable medium for compressing genetic information
WO2014145824A2 (en) * 2013-03-15 2014-09-18 Medicomp Systems, Inc. Electronic medical records system utilizing genetic information
US20150312212A1 (en) * 2014-04-24 2015-10-29 David Holmes Holistic embodiment of dna and ipv6
US10586239B2 (en) * 2016-08-05 2020-03-10 Intertrust Technologies Corporation Provenance tracking using genetic material
US11345963B2 (en) 2018-05-07 2022-05-31 Ebay Inc. Nucleic acid taggants
US12474994B2 (en) 2022-12-05 2025-11-18 Western Digital Technologies, Inc. Preprocessing for correcting insertions and deletions in DNA data storage

Family Cites Families (53)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0229174A1 (de) 1985-07-16 1987-07-22 The Salk Institute For Biological Studies Genetische modifikation von pflanzen mittels retroviren
US6147278A (en) * 1985-10-25 2000-11-14 Monsanto Company Plant vectors
GB8626878D0 (en) 1986-11-11 1986-12-10 Ici Plc Dna
US5922602A (en) 1988-02-26 1999-07-13 Biosource Technologies, Inc. Cytoplasmic inhibition of gene expression
US6174700B1 (en) * 1988-07-08 2001-01-16 University Of British Columbia Purification of a polypeptide compound having a polysaccharide binding domain by affinity phase separation
FR2649518B1 (fr) * 1989-07-07 1991-10-18 Bioprobe Systems Sa Procede et dispositif de marquage crypte de haute securite pour la protection d'objets de valeur
US5464764A (en) * 1989-08-22 1995-11-07 University Of Utah Research Foundation Positive-negative selection methods and vectors
US5877402A (en) * 1990-05-01 1999-03-02 Rutgers, The State University Of New Jersey DNA constructs and methods for stably transforming plastids of multicellular plants and expressing recombinant proteins therein
NZ241310A (en) 1991-01-17 1995-03-28 Gen Hospital Corp Trans-splicing ribozymes
US5474925A (en) * 1991-12-19 1995-12-12 Agracetus, Inc. Immobilized proteins in cotton fiber
AU694102B2 (en) 1992-12-30 1998-07-16 Kentucky Bioprocessing, Llc Viral amplification of recombinant messenger RNA in transgenic plants
US5496934A (en) * 1993-04-14 1996-03-05 Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Nucleic acids encoding a cellulose binding domain
US5576198A (en) * 1993-12-14 1996-11-19 Calgene, Inc. Controlled expression of transgenic constructs in plant plastids
US5723765A (en) * 1994-08-01 1998-03-03 Delta And Pine Land Co. Control of plant gene expression
AU701932B2 (en) * 1994-12-08 1999-02-11 Pabio Chemical labelling of objects
US6010904A (en) 1995-06-07 2000-01-04 The General Hospital Corporation Cell ablation using trans-splicing ribozymes
US6037525A (en) * 1996-08-01 2000-03-14 North Carolina State University Method for reducing expression variability of transgenes in plant cells
JP2001500009A (ja) 1996-09-09 2001-01-09 ロヨラ ユニバーシティ オブ シカゴ 植物レトロウイルスポリヌクレオチドおよびその使用のための方法
US5939541A (en) 1997-03-28 1999-08-17 University Of South Carolina Method for enhancing expression of a foreign or endogenous gene product in plants
FI972293A7 (fi) 1997-05-30 1998-12-01 Timo Korpela Useamman kuin yhden geenin yhteisekspressiomenetelmät
ATE454459T1 (de) 1997-11-18 2010-01-15 Pioneer Hi Bred Int Mobilisierung eines viralen genoms aus t-dna durch ortsspezifische rekombinationssysteme
CA2306184C (en) * 1997-11-18 2007-05-15 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods for genetic modification of plants
AU761367B2 (en) 1998-01-16 2003-06-05 Large Scale Biology Corporation Method of determining the function of nucleotide sequences and the proteins they encode by transfecting the same into a host
EP1073730A1 (de) 1998-04-17 2001-02-07 Whitehead For Biomedical Research Verwendung von ribozym zum verbinden von nukleinsäuren mit polypeptiden
HUP0104697A3 (en) 1998-09-23 2003-12-29 Du Pont Binary viral expression system in plants
GB9821303D0 (en) 1998-10-01 1998-11-25 Novartis Ag Organic compounds
WO2000068391A1 (en) 1998-10-23 2000-11-16 University Of British Columbia Expression of a mannan binding domain to alter plant morphology
CA2352464A1 (en) 1998-11-25 2000-06-08 Calgene Llc Methods for transforming plastids
EP1045037A1 (de) * 1999-04-12 2000-10-18 Discovery Biotech., Inc. System zu Identifizierung von Planzenzellen
EP1242618B1 (de) * 1999-05-06 2006-12-06 Mount Sinai School of Medicine of New York University Steganographie auf DNA basis
AU762214B2 (en) 1999-05-17 2003-06-19 Icon Genetics, Inc. Process of rapid variety-independent plant transformation
US6331416B1 (en) * 1999-06-10 2001-12-18 Cbd Technologies Ltd. Process of expressing and isolating recombinant proteins and recombinant protein products from plants, plant derived tissues or cultured plant cells
JP2003503033A (ja) 1999-06-24 2003-01-28 メタボリックス，インコーポレイテッド 植物多重遺伝子発現構築物
EP1200557B1 (de) 1999-08-05 2006-04-26 Icon Genetics, Inc. Verfahren zur herstellung künstlicher pflanzenchromosomen
AU2001242360A1 (en) 2000-02-10 2001-08-20 Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Vzw Plant internal ribosome entry segment
EP1276884A2 (de) * 2000-04-20 2003-01-22 Btg International Limited Transgene pflanzen
US6781033B2 (en) * 2000-04-26 2004-08-24 Monsanto Technology Llc Method for the transformation of plant cell plastids
GB0019745D0 (en) 2000-08-10 2000-09-27 Univ Surrey Gene expression element
DE10049587A1 (de) 2000-10-06 2002-05-02 Icon Genetics Ag Vektorsystem für Pflanzen
DE10061150A1 (de) * 2000-12-08 2002-06-13 Icon Genetics Ag Verfahren und Vektoren zur Erzeugung von transgenen Pflanzen
DE10101276A1 (de) * 2001-01-12 2002-07-18 Icon Genetics Ag Verfahren und Vektoren zur Transformation von Plastiden
DE10102389A1 (de) * 2001-01-19 2002-08-01 Icon Genetics Ag Verfahren und Vektoren zur Plastidentransformation höherer Pflanzen
DE10109354A1 (de) * 2001-02-27 2002-09-05 Icon Genetics Ag Rekombinante virale Schaltersysteme
DE10114209A1 (de) * 2001-03-23 2002-12-05 Icon Genetics Ag Ortsgerichtete Transformation durch Verwendung von Amplifikationsvektoren
DE10115507A1 (de) 2001-03-29 2002-10-10 Icon Genetics Ag Verfahren zur Kodierung von Information in Nukleinsäuren eines genetisch veränderten Organismus
DE10121283B4 (de) 2001-04-30 2011-08-11 Icon Genetics GmbH, 80333 Verfahren und Vektoren zur Amplifikation oder Expression von gewünschten Nucleinsäuresequenzen in Pflanzen
DE10129010A1 (de) * 2001-06-13 2002-12-19 Icon Genetics Ag Verfahren und Vektoren zur Erzeugung von transgenen Pflanzen
DE10131680A1 (de) * 2001-06-29 2003-01-23 Voith Paper Patent Gmbh Auftragsvorrichtung
DE10131690A1 (de) 2001-06-29 2003-01-16 Icon Genetics Ag Verfahren zum kontrollierten Umordnen von Chromosomenfragmenten für die Pflanzenzucht
DE10132780A1 (de) 2001-07-06 2003-01-16 Icon Genetics Ag Plastidäre Genexpression über autonom replizierende Vektoren
DE10143238A1 (de) * 2001-09-04 2003-03-20 Icon Genetics Ag Identifizierung eukaryotischer interner Ribosomen-Eingangsstellen (IRES)-Elemente
DE10143237A1 (de) * 2001-09-04 2003-03-20 Icon Genetics Ag Herstellung künstlicher interner ribosomaler Eingangsstellenelemente (Ires-Elemente)
DE10143205A1 (de) 2001-09-04 2003-03-20 Icon Genetics Ag Verfahren zur Proteinproduktion in Pflanzen

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AU2002238453B2 (en) 2008-04-10

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