CN1952663B - 端粒酶结合蛋白p23的应用 - Google Patents
端粒酶结合蛋白p23的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN1952663B CN1952663B CN2006101158855A CN200610115885A CN1952663B CN 1952663 B CN1952663 B CN 1952663B CN 2006101158855 A CN2006101158855 A CN 2006101158855A CN 200610115885 A CN200610115885 A CN 200610115885A CN 1952663 B CN1952663 B CN 1952663B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- male
- binding protein
- telomerase
- protein
- unknown
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 102000029724 enzyme binding proteins Human genes 0.000 title 1
- 108091009282 enzyme binding proteins Proteins 0.000 title 1
- 102000055501 telomere Human genes 0.000 title 1
- 108091035539 telomere Proteins 0.000 title 1
- 210000003411 telomere Anatomy 0.000 title 1
- 102100028642 Prostaglandin E synthase 3 Human genes 0.000 claims abstract description 50
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 50
- 101710103638 Prostaglandin E synthase 3 Proteins 0.000 claims abstract description 49
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 43
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 19
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 claims description 45
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 claims description 45
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 9
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 2
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 abstract description 38
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 abstract description 33
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 abstract description 22
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 abstract description 19
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 abstract description 8
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 abstract description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 abstract description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 49
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 20
- 238000000034 method Methods 0.000 description 13
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 7
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 6
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 6
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 6
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 5
- 102000013529 alpha-Fetoproteins Human genes 0.000 description 5
- 108010026331 alpha-Fetoproteins Proteins 0.000 description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 5
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 5
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 4
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 4
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 4
- ROOXNKNUYICQNP-UHFFFAOYSA-N ammonium persulfate Chemical compound [NH4+].[NH4+].[O-]S(=O)(=O)OOS([O-])(=O)=O ROOXNKNUYICQNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 4
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 description 3
- 102100022900 Actin, cytoplasmic 1 Human genes 0.000 description 3
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 3
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- DAJSVUQLFFJUSX-UHFFFAOYSA-M sodium;dodecane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCS([O-])(=O)=O DAJSVUQLFFJUSX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 2
- 102100031680 Beta-catenin-interacting protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 101000993469 Homo sapiens Beta-catenin-interacting protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 2
- 102000005431 Molecular Chaperones Human genes 0.000 description 2
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000006180 TBST buffer Substances 0.000 description 2
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 229910001870 ammonium persulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 238000001294 liquid chromatography-tandem mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 210000005228 liver tissue Anatomy 0.000 description 2
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 102000003998 progesterone receptors Human genes 0.000 description 2
- 108090000468 progesterone receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YRHZCEZKEHFPEL-UHFFFAOYSA-N (2,3,4,5,6-pentabromophenyl) hypobromite Chemical compound BrOC1=C(Br)C(Br)=C(Br)C(Br)=C1Br YRHZCEZKEHFPEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KTZQTRPPVKQPFO-UHFFFAOYSA-N 1,2-benzoxazole Chemical compound C1=CC=C2C=NOC2=C1 KTZQTRPPVKQPFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- APKFDSVGJQXUKY-KKGHZKTASA-N Amphotericin-B Natural products O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1C=CC=CC=CC=CC=CC=CC=C[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-KKGHZKTASA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 238000009010 Bradford assay Methods 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- KWYHDKDOAIKMQN-UHFFFAOYSA-N N,N,N',N'-tetramethylethylenediamine Chemical compound CN(C)CCN(C)C KWYHDKDOAIKMQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011837 N,N-methylenebisacrylamide Substances 0.000 description 1
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 108091027981 Response element Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N amphotericin B Chemical compound O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N 0.000 description 1
- 229960003942 amphotericin b Drugs 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 238000004043 dyeing Methods 0.000 description 1
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007071 enzymatic hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006047 enzymatic hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N n,n'-methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960000988 nystatin Drugs 0.000 description 1
- VQOXZBDYSJBXMA-NQTDYLQESA-N nystatin A1 Chemical compound O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/CC/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 VQOXZBDYSJBXMA-NQTDYLQESA-N 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- STCOOQWBFONSKY-UHFFFAOYSA-N tributyl phosphate Chemical compound CCCCOP(=O)(OCCCC)OCCCC STCOOQWBFONSKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
本发明通过筛选在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白,找到了一种在肝细胞癌的癌组织中高表达的蛋白,免疫印迹实验进一步证实了端粒酶结合蛋白p23的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。鉴于端粒酶结合蛋白p23与肝细胞癌的这种相关性,该蛋白可以用作检测肝细胞癌的蛋白质分子标记。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明涉及一种端粒酶结合蛋白p23用作检测肝癌的蛋白质分子标记的应用。
背景技术
肝癌是一种严重危害人类的疾病。西方发达国家肝癌的发病率较低,国际上对肝癌的基础研究仍较为薄弱,而我国是肝癌高发国家,发病率和死亡率呈现上升趋势,且发病年龄构成年轻化,每年用于肝癌治疗的医疗支出大为增加,肝癌成了严重危害我国人民生命财产安全的头号敌人,并且是影响社会经济发展的一个重要因素,加大力度进行我国肝癌的基础研究具有战略意义,而分离和鉴定新的肝癌相关基因是目前肝癌基础研究中的前沿课题。
到目前为止,已有不下20种的基因异常表达被确定与肝癌的发生发展有关,但已确定的肝癌相关基因在肝癌中的异常表达率并不高,肝癌的发病机制至今仍未阐明,肝癌的早期诊断率仍有待提高。此外,传统的肝癌手术加化疗以及近年来配合使用的多种基因治疗方法仍没有明显提高肝癌患者的生存率,因而寻找新的肝癌相关基因尤其是肝癌高表达基因对于探讨肝癌的发病机制具有重要意义。
因此,为治疗和诊断目的研究和开发在肝癌中高表达的基因和/或蛋白具有重要意义。本领域迫切需要新的在肝癌中高表达的基因和/或蛋白。
端粒酶结合蛋白p23(Telomerase-binding protein p23;Hsp90 co-chaperone;Progesteronereceptor complex p23)的Genebank登录号为gi|8928247,NCBI的登录号为NP_006592,Swissprot登录号为Q15185,IPI号为:IPI00015029.1。它是端粒酶(telomerase)和孕酮受体(progesterone receptor)的结合蛋白,具有分子伴侣活性(chaperone activity),体内的端粒酶结合蛋白p23在激素依赖的情况下跟整个转录相关,通过解散转录体复合物打断受体介导的转录活性。2002年发表在Science上的一篇文献就报道了,p23在激素依赖的基因组反应元件中其作用,他通过打断激素受体,从而终止信号的转导,起到调控转录活性的作用(Disassembly of transcriptional regulatory complexes by molecular chaperones.Science,2002.Jun 21;296(5576):2232-5)。
很少有文献报道端粒酶结合蛋白p23的结构与功能,截止目前,还没有端粒酶结合蛋白p23与肝细胞癌的相关报道。
发明内容
通过筛选在肝细胞癌癌组织以及肝细胞癌癌旁组织中差异表达的蛋白质,本申请的发明人找到了一种在肝细胞癌的癌组织和癌旁组织中存在差异表达的蛋白质(在癌组织中上调表达),经质谱鉴定为端粒酶结合蛋白p23。进一步的免疫印迹实验证实,端粒酶结合蛋白p23的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达(在癌组织中上调表达)。
基于端粒酶结合蛋白p23与肝细胞癌的这种相关性,以该蛋白作为一个蛋白质分子标记对其表达量进行检测可以用于检测肝癌。
因此,本发明的首要目的即在于提供一种端粒酶结合蛋白p23用作检测肝癌的蛋白质分子标记的应用。
本发明的另一个目的在于提供一种抗端粒酶结合蛋白p23的抗体,包括单克隆抗体和多克隆抗体,用于制备检测肝癌的制剂的应用。
本发明的再一个目的还在于提供一种抗端粒酶结合蛋白p23的抗体,包括单克隆抗体和多克隆抗体,用于制备检测肝癌的试剂盒的应用。
本发明的又一个目的在于提供一种体外检测肝细胞组织中端粒酶结合蛋白p23的表达是否异常的方法,该方法包括以下步骤:
A、用特异性抗端粒酶结合蛋白p23的抗体检测待测肝细胞中端粒酶结合蛋白p23的数量;
B、将步骤A测得的端粒酶结合蛋白p23的数量与正常肝组织中的端粒酶结合蛋白p23的数量进行比较,如测得的蛋白数量高于正常值,则表示被检测肝组织中端粒酶结合蛋白p23的表达异常。
现有技术中很少有关于端粒酶结合蛋白p23结构与功能的报道,到目前为止,还没有端粒酶结合蛋白p23与肝细胞癌的相关性的报道,因此,本发明的这一发现将为肝细胞癌的诊断和/或治疗提供一条全新的途径。
附图说明
图1为端粒酶结合蛋白p23的免疫印迹分析结果示意图,Beta-actin为对照。
图2显示了对随机抽取的36例肝癌患者血清样品、24例乙肝而非肝癌患者的血清样品以及36例正常人血清样品中端粒酶结合蛋白p23的免疫印迹分析结果,transferrin为对照;其中N代表正常人血清,I代表乙肝而非肝癌患者血清,C代表肝癌患者血清。
图3为采用R数据分析软件对图2的免疫印迹图谱进行数据分析得出的蛋白质表达量相对分布图。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。
下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
本申请的发明人用非酶解样品制备法(nonenzymatic sample preparation,NESP)制备了肝细胞癌的癌组织与癌旁组织蛋白质样品,以同位素亲和标签与凝胶增强的液质联用技术(gel-enhanced liquid chromatography-mass spectrometry coupled with isotope-coded affinitytag,GeLC-MS-ICAT)对其中的蛋白进行鉴定并比较其表达量,结果发现端粒酶结合蛋白p23在肝细胞癌癌组织中高表达。免疫印迹实验进一步证实端粒酶结合蛋白p23的确在肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中存在差异表达。
因此,以端粒酶结合蛋白p23作为一个蛋白质分子标记对其表达量进行检测可以用于检测肝癌,即端粒酶结合蛋白p23可以用作检测肝癌的蛋白质分子标记。
实施例1、肝细胞癌癌组织及癌旁组织蛋白质样品的制备
本实施例中所使用的尿素、3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙铵]-1-丙磺酸(CHAPS)、苯甲基磺酰氟(PMSF)、二硫苏糖醇(DTT)均购自Sigma公司。
本实施例以非酶解样品制备法(nonenzymatic sample preparation,NESP)制备肝细胞癌的癌组织及癌旁组织蛋白质样品,具体如下:
手术切除的新鲜组织块迅速置于冰上,快速切成几个肉眼可见、无坏死区域的小块。用预冷的不含谷氨酰胺的RPMI1640培养基(5%胎牛血清,0.2mM PMSF,1mM EDTA,苯甲异噁唑青霉素25mg/mL,庆大霉素50mg/mL,青霉素100U/mL,链霉素100mg/mL,两性霉素B 0.25mg/mL,制霉菌素50U/mL)洗涤组织小块数次后,在液氮中快速研磨成细胞沉淀,细胞沉淀分别溶于适量裂解液(8mol/L尿素、4%CHAPS、40mmol/L Tris和65mmmol/L DTT)中,超声细胞破碎仪(Soniprep 150,英国,MSE)冰浴间歇超声2min,15000r/min、4℃离心1h。取上清,以改良的Bradford法(见Bio-Rad公司产品说明书)进行总蛋白质定量,制备好的肝细胞癌癌组织及相应癌旁组织的蛋白质样品分装,-80℃保存备用。
以上述方法制备11对肝细胞癌癌组织及癌旁组织蛋白质样品。11例肝细胞癌标本均来自东方肝胆外科医院,由2个病理科医生明确为肝细胞癌。均为男性,平均年龄48.5岁(31~65岁),血清检测hepatitis B病毒感染阳性,11例(100%)属临床分级(TNM分级)III级。其中,甲胎蛋白(AFP)高于25μg/L的10例(90.9%);9例肿瘤大于5cm。11例肝细胞癌标本的病理资料详见表1。
表1、11例肝细胞癌标本的病理资料
| No. | 性别 | 年龄 | HBV | HCV | 等级 | AFP | 尺寸 |
| 327 | 男性 | 44 | + | - | III | >1000 | 8×8×7 |
| 415 | 男性 | 40 | + | - | III | >1000 | 10×8×6 |
| 418 | 男性 | 31 | + | - | III | 3.7 | 8×5×8 |
| 422 | 男性 | 57 | + | - | III | >1000 | 3.5×4 |
| 429 | 男性 | 44 | + | - | III | >1000 | 7.2×6 |
| 317 | 男性 | 58 | + | - | III | >1000 | 5.2×6.4 |
| 42 | 男性 | 45 | + | - | III | >1000 | 7.7×5.4 |
| 45 | 男性 | 51 | + | - | III | >1000 | 5.5×4.0 |
| 48 | 男性 | 55 | + | - | III | >1000 | 4×3 |
| 49 | 男性 | 43 | + | - | III | >1000 | 12×12 |
| 424 | 男性 | 65 | + | - | III | >1000 | 11.5×6.5 |
本实施例所用癌组织及癌旁组织样品均为取自同一肝细胞癌患者的成对样品,所有11例肝细胞癌病例有极相似的病例诊断指标:均为男性,平均年龄48.5岁(31~65岁),血清检测hepatitis B病毒感染阳性,11例(100%)属TNM分级III级。其中,AFP高于25μg/L的10例(93.75%);9例肿瘤大于5cm。这种取样方法有利于降低个体间差别对实验分析工作的影响。
实施例2、差异表达蛋白的筛选
本实施例中使用的尿素、3-[(3-胆酰胺丙基)-二乙铵]-1-丙磺酸(CHAPS)、十二烷基磺酸钠(SDS)、二硫苏糖醇(DTT)购自Sigma公司;碘乙酰胺(IAA)、丙烯酰胺、N,N-甲叉双丙烯酰胺等购自Fluka公司;cleavable ICAT试剂购自Applied BiosystemsFramingham,MA公司。
过硫酸胺(AP)、TEMED、Tri-n-butylphosphat(TBP)、PDQuest软件等为Bio-Rad产品。
Avidin亲和柱购自Applied Biosystems,Framingham,MA公司。
LCQTM Deca XP system和ProteomeXTM Workstation购自Thermo Finnigan公司。
所使用的上样缓冲液的组成为:1mol/L Tris-HCl(pH6.8)0.6ml,50%甘油5ml,10%SDS 2ml,巯基乙醇0.5ml,蒸馏水1.9ml,少量六溴酚蓝。
首先采用同位素亲和标签与凝胶增强的液质联用技术(gel-enhanced liquidchromatography-mass spectrometry coupled with isotope-coded affinity tag,GeLC-MS-ICAT)对实施例1得到的11对蛋白质样品中的其中一对(病例编号为429)肝细胞癌的癌组织及癌旁组织中的差异表达蛋白进行筛选鉴定,方法参照2003年Steven P.Gygi发表在MCP上的文献(Jiaxu Li.et al.Mol Cell Proteomics.2003 Nov;2(11):1198-204.Epub.2003 Sep.23),具体过程如下:
NESP法制备的一对肝细胞癌癌组织与相应癌旁组织蛋白质样品(病例编号为429),分别取100μg,先用TBP还原蛋白质,而后分别用cleavable ICAT试剂(C12和C13)标记(其中C12与C13分别对应癌组织与相应癌旁组织,标记方法参照产品说明书)。混合后加入适量上样缓冲液,跑5%浓缩胶(上层胶)和7.5%~17.5%分离胶(下层胶),电泳条件为15mA/胶30min,然后30mA/胶,保持至溴酚蓝前沿入浓缩胶8cm左右。
考染染出条带后,将整个上样条带平均切为8份,每份再分别切成1mm3的小块,在100mMNH4HCO3、30%ACN中脱色,真空冷冻干燥,100μl 50mmol/LNH4HCO3(pH8.3,蛋白质∶胰蛋白酶=1∶5,w/w)中4℃放置2hr,加入50μl 50mmol/L NH4HCO3(pH8.3),37℃酶解过夜。
抽提蛋白(60%ACN、0.1%TFA),真空冷冻干燥。酶解后的每份肽段混合物经Avidin亲和柱纯化出已标记肽段后,再用LCQTM ProteomeXTM Workstation进行液相串联(LC-MS/MS)质谱鉴定,Bioworks软件(Thermo finnigan公司)进行数据库搜索并用relex软件(Scripps Research Institute,USA)进行数值计算。
运用NESP法和GeLC-MS-ICAT技术,我们共鉴定到426种有定量关系的蛋白质。其中两倍以上量变的蛋白质共201种,肝细胞癌癌组织高表达的有155种蛋白质;肝细胞癌癌旁组织高表达的有46种蛋白质。
用LC-MS/MS质谱鉴定、数据库搜索及比值计算得3个含Cys的肽段被总共鉴定到8次,与端粒酶结合蛋白p23(Telomerase-binding protein p23)相符,氨基酸覆盖率为20.00%。relex软件计算结果显示端粒酶结合蛋白p23在肝细胞癌癌组织中高表达,癌组织/癌旁组织的比值为3.74(SD=1.665),详细的鉴定情况及肽段打分结果见表格2(表格中C*代表C13标记的Cys)。
表2、GeLC-MS-ICAT中3个含Cys的肽段的详细鉴定结果
| 鉴定到的肽段(3段共8次) | 质量数(MH+) | 电荷数 | X corr值 | DeltaCn值 |
| K.HLNEIDLFHCIDPNDSK.H | 2238.47 | 2 | 4.4548 | 0.556 |
| K.HLNEIDLFHCIDPNDSK.H | 2238.47 | 2 | 4.611 | 0.6361 |
| K.LTFSC*LGGSDNFK.H | 1625.82 | 2 | 2.423 | 0.3779 |
| K.LTFSC*LGGSDNFK.H | 1625.82 | 2 | 2.5575 | 0.4092 |
| K.LTFSCLGGSDNFK.H | 1616.82 | 2 | 3.6558 | 0.4347 |
| K.LTFSCLGGSDNFK.H | 1616.82 | 2 | 3.8515 | 0.477 |
| K.SKLTFSCLGGSDNFK.H | 1832.07 | 2 | 4.6517 | 0.4542 |
| K.SKLTFSCLGGSDNFK.H | 1832.07 | 2 | 4.6433 | 0.4594 |
实施例3、端粒酶结合蛋白p23差异表达的免疫印迹验证
为确认端粒酶结合蛋白p23的差异表达,取10位肝细胞癌患者的癌组织及相应癌旁组织蛋白质样品(NESP法制备,表1中除429例以外的其它10例),用购买的抗端粒酶结合蛋白p23抗体进行免疫印迹分析,具体过程简述如下:
每个样品取20μg蛋白质样品用12%SDS-PAGE分离,转移至PVDF膜(购自Amersham Biosciences公司)上,一抗使用鼠抗人端粒酶结合蛋白p23单抗(购自ABRAffinity BioEeagentsTM公司,1∶1000稀释),室温孵育2小时,用TBST(每升含Tris 2.42g,氯化钠8g,Tween 20ml,用HCl调节pH到7.6)洗涤三次,每次5分钟,二抗为抗鼠抗体(购自Santa Cruz公司,1∶10000稀释)室温孵育1小时,再用TBST洗涤三次,每次10分钟,最后用ECL plus试剂(Amersham Biosciences)反应5分钟后,以X-光片曝光检测,检测结果如图1所示。同时我们采用beta-actin作为等量上样的对照(beta-actin单抗购自abcam公司,1∶1000稀释,二抗为小鼠),结果如图1所示。
图1的免疫印迹结果显示,10对癌组织与癌旁组织基本上是等量上样,并且10对癌组织与癌旁组织中除三对(317,49,418)不甚明显外,其余各对均呈现癌组织中端粒酶结合蛋白p23的杂交条带的浓度都明显高于相应的癌旁组织的现象;可见端粒酶结合蛋白p23在肝细胞癌的癌组织中存在高表达,该结果与质谱检测结果一致。
为了能够体现更好的应用价值,我们随机挑取了36例肝癌患者的血清(样品资料见表3),24例乙肝而非肝癌患者的血清(样品资料见表4),36例正常人血清(样品资料见表5),随机进行分组(每一组包含一例正常人血清、一例乙肝而非肝癌患者血清,一例肝癌患者血清),每例样品取10ug蛋白质样品,同样运用上述的免疫印迹方法进行检测,同时采用transferrin作为等量上样的对照(transferrin单抗购自abcam公司,1∶1000稀释,二抗为小鼠),结果如图2所示。
同时,我们采用R数据分析软件(免费从http://www.r-project.org/下载)对图2的免疫印迹图谱进行数据分析,得出蛋白质表达量的相对分布图,结果如图3所示。
从图2和图3我们可以看出,所有样品的上样量基本相同(从图3的transferrin中可以得出此结论),但是端粒酶结合蛋白p23在肝癌患者血清中的表达量明显的高于正常人血清中的量,可见端粒酶结合蛋白p23在肝细胞癌患者的血清中高表达,该结果与质谱检测结果一致。
综上所述,端粒酶结合蛋白p23在肝细胞癌的癌组织及癌旁组织中存在差异表达,显然与肝细胞癌的发生发展有着密切的相关性,因此,以端粒酶结合蛋白p23作为一个蛋白质分子标记对其表达量进行检测可以用于检测肝细胞癌。相应的,特异性抗端粒酶结合蛋白p23的抗体,包括各种抗端粒酶结合蛋白p23的单克隆抗体和多克隆抗体,由于其能够用于检测端粒酶结合蛋白p23的表达量,因而可以用于检测肝癌和/或肝癌易感性,或者用于制备检测肝癌肝癌易感性的制剂,这对于本领域的技术人员来说是显而易见的。
虽然有关端粒酶结合蛋白p23动态的生物学功能及肿瘤相关机制还有待进一步研究,但是将其作为检测肝癌或肝癌易感性的标记物却是肯定的。端粒酶结合蛋白p23可作为肝细胞癌的潜在标志,而其在胞内的生物学功能提示端粒酶结合蛋白p23可能作为肝癌的预后分子标记和临床治疗的靶分子。
表3、肝癌血清样品资料
| No. | 性别 | 年龄 | HBV | 等级 | AFP(ug/L) |
| C1 | 男性 | 32 | + | III | 不详 |
| C2 | 女性 | 51 | + | IV | 不详 |
| C3 | 不详 | 不详 | 不详 | 不详 | 不详 |
| C4 | 男性 | 34 | + | 不详 | 不详 |
| C5 | 女性 | 50 | - | 不详 | 不详 |
| C6 | 女性 | 63 | + | 不详 | 不详 |
| C7 | 男性 | 76 | + | 不详 | 不详 |
| C8 | 男性 | 70 | - | 不详 | 不详 |
| C9 | 男性 | 47 | + | 不详 | 不详 |
| C10 | 男性 | 55 | - | 不详 | 不详 |
| C11 | 男性 | 76 | + | 不详 | 不详 |
| C12 | 男性 | 63 | + | 不详 | 不详 |
| C13 | 男性 | 52 | + | III | 不详 |
| C14 | 女性 | 44 | 不详 | III | 不详 |
| C15 | 不详 | 不详 | 不详 | 不详 | 不详 |
| C16 | 女性 | 42 | - | 不详 | 4.8 |
| C17 | 男性 | 34 | + | III | 58.9 |
| C18 | 女性 | 71 | - | 不详 | 3.3 |
| C19 | 男性 | 61 | + | 不详 | 不详 |
| C20 | 女性 | 49 | 不详 | 不详 | 不详 |
| C21 | 女性 | 76 | - | 不详 | 22.3 |
| C22 | 男性 | 73 | - | 不详 | 17.7 |
| C23 | 男性 | 81 | + | 不详 | - |
| C24 | 男性 | 61 | + | 不详 | 1000 |
| C25 | 男性 | 68 | - | 不详 | 1.3 |
| C26 | 男性 | 67 | + | 不详 | 不详 |
| C27 | 男性 | 49 | + | 不详 | 146.5 |
| C28 | 男性 | 55 | + | III | 837 |
| C29 | 男性 | 50 | + | II | 27.3 |
| C30 | 男性 | 29 | + | III | 1000 |
| C31 | 男性 | 42 | + | III | 不详 |
| C32 | 男性 | 68 | + | III | 不详 |
| C33 | 男性 | 69 | + | 不详 | - |
| C34 | 男性 | 29 | + | 不详 | 1000 |
| C35 | 男性 | 42 | + | 不详 | 297.6 |
| C36 | 女性 | 65 | + | 不详 | 59.3ug/L |
表4、乙肝血清样品资料
| No. | 性别 | 年龄 | HBV |
| I1 | 男性 | 39 | + |
| I2 | 男性 | 35 | + |
| I3 | 男性 | 46 | + |
| I4 | 男性 | 54 | + |
| I5 | 男性 | 24 | + |
| I6 | 男性 | 41 | + |
| I7 | 男性 | 22 | + |
| I8 | 男性 | 46 | + |
| I9 | 男性 | 33 | + |
| I10 | 男性 | 45 | + |
| I11 | 男性 | 37 | + |
| I12 | 男性 | 48 | + |
| I13 | 男性 | 34 | + |
| I14 | 男性 | 40 | + |
| I15 | 男性 | 44 | + |
| I16 | 男性 | 13 | + |
| I17 | 男性 | 44 | + |
| I18 | 男性 | 45 | + |
| I19 | 男性 | 28 | + |
| I20 | 男性 | 30 | + |
| I21 | 女性 | 33 | + |
| I22 | 男性 | 38 | + |
| I23 | 男性 | 55 | + |
| I24 | 男性 | 29 | + |
表5、正常血清样品资料
| No. | 性别 | 年龄 |
| N1 | 男性 | 22 |
| N2 | 男性 | 25 |
| N3 | 男性 | 26 |
| N4 | 男性 | 26 |
| N5 | 男性 | 25 |
| N6 | 男性 | 27 |
| N7 | 男性 | 28 |
| N8 | 男性 | 24 |
| N9 | 男性 | 29 |
| N10 | 女性 | 20 |
| N11 | 女性 | 26 |
| N12 | 女性 | 25 |
| N13 | 女性 | 23 |
| N14 | 女性 | 26 |
| N15 | 女性 | 24 |
| N16 | 女性 | 22 |
| N17 | 女性 | 25 |
| N18 | 女性 | 23 |
| N19 | 女性 | 25 |
| N20 | 女性 | 31 |
| N21 | 女性 | 26 |
| N22 | 女性 | 23 |
| N23 | 女性 | 27 |
| N24 | 女性 | 23 |
| N25 | 女性 | 22 |
| N26 | 女性 | 28 |
| N27 | 女性 | 22 |
| N28 | 女性 | 23 |
| N29 | 女性 | 23 |
| N30 | 女性 | 24 |
| N31 | 女性 | 22 |
| N32 | 女性 | 23 |
| N33 | 女性 | 25 |
| N34 | 女性 | 25 |
| N35 | 女性 | 26 |
| N36 | 女性 | 28 |
Claims (7)
1.一种端粒酶结合蛋白p23的应用,其特征在于,用于制备检测肝癌的蛋白质分子标记。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测是检测该蛋白在肝细胞组织中的表达量。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测该蛋白在肝细胞组织中的表达量是检测该蛋白在肝细胞组织中是否存在上调表达。
4.一种抗端粒酶结合蛋白p23的抗体的应用,其特征在于,用于制备检测肝癌的制剂。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述抗端粒酶结合蛋白p23的抗体包括单克隆抗体和多克隆抗体。
6.一种抗端粒酶结合蛋白p23的抗体的应用,其特征在于,用于制备检测肝癌的试剂盒。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,所述抗端粒酶结合蛋白p23的抗体包括单克隆抗体和多克隆抗体。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN2006101158855A CN1952663B (zh) | 2005-08-26 | 2006-08-16 | 端粒酶结合蛋白p23的应用 |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN200510029163 | 2005-08-26 | ||
| CN200510029163.3 | 2005-08-26 | ||
| CN2006101158855A CN1952663B (zh) | 2005-08-26 | 2006-08-16 | 端粒酶结合蛋白p23的应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN1952663A CN1952663A (zh) | 2007-04-25 |
| CN1952663B true CN1952663B (zh) | 2011-05-18 |
Family
ID=38059106
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN2006101158855A Expired - Fee Related CN1952663B (zh) | 2005-08-26 | 2006-08-16 | 端粒酶结合蛋白p23的应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN1952663B (zh) |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2000008135A1 (en) * | 1998-08-09 | 2000-02-17 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for inhibiting or stimulating telomerase assembly |
| CN1493703A (zh) * | 2002-09-30 | 2004-05-05 | 财团法人奇美医院 | 作为膀胱癌的分子标记的肝癌上升-调节蛋白质基因 |
-
2006
- 2006-08-16 CN CN2006101158855A patent/CN1952663B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2000008135A1 (en) * | 1998-08-09 | 2000-02-17 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for inhibiting or stimulating telomerase assembly |
| CN1493703A (zh) * | 2002-09-30 | 2004-05-05 | 财团法人奇美医院 | 作为膀胱癌的分子标记的肝癌上升-调节蛋白质基因 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN1952663A (zh) | 2007-04-25 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EA013927B1 (ru) | Неинвазивный способ выявления переходно-клеточной карциномы мочевого пузыря in vitro | |
| Fan et al. | Identification of the up-regulation of TP-alpha, collagen alpha-1 (VI) chain, and S100A9 in esophageal squamous cell carcinoma by a proteomic method | |
| Wang et al. | Occurrence of newly discovered human polyomaviruses in skin of liver transplant recipients and their relation with squamous cell carcinoma in situ and actinic keratosis–a single‐center cohort study | |
| Sepiashvili et al. | Integrated omic analysis of oropharyngeal carcinomas reveals human papillomavirus (HPV)–dependent regulation of the activator protein 1 (AP-1) pathway | |
| Fietz et al. | Proteomic biomarkers in seminal plasma as predictors of reproductive potential in azoospermic men | |
| JP2018136122A (ja) | 膵がんを診断するための血漿バイオマーカーパネル | |
| Li et al. | Proteomics-based approach identified differentially expressed proteins with potential roles in endometrial carcinoma | |
| Hadziselimovic et al. | Decreased expression of FGFR1, SOS1, RAF1 genes in cryptorchidism | |
| CN1952664B (zh) | 表面脂肪酸结合蛋白e-fabp的应用 | |
| CN1952663B (zh) | 端粒酶结合蛋白p23的应用 | |
| Mhatre et al. | Development of an ELISA for sPSP94 and utility of the sPSP94/sPSA ratio as a diagnostic indicator to differentiate between benign prostatic hyperplasia and prostate cancer | |
| Huang et al. | Retracted Paper-Bioinformatics Analysis and Screening of Potential Target Genes Related to the Lung Cancer Prognosis | |
| Xu et al. | Rta-IgG as a biomarker for diagnosis and post treatment prognostic of nasopharyngeal carcinoma | |
| EP2570813B1 (en) | Method for the diagnosis/prognosis of colorectal cancer | |
| CN1920569B (zh) | 26s蛋白酶体调节亚基1非atp酶的应用 | |
| CN1952662A (zh) | 星形胶质细胞磷酸化蛋白pea-15的应用 | |
| CN1952661A (zh) | RhoC三磷酸鸟苷酶的应用 | |
| CN113189345B (zh) | Pdlim4用作胃癌标志物的应用 | |
| CN114990218A (zh) | 一种预测肺癌脑转移的试剂盒 | |
| CN107807243A (zh) | 一种食管癌的生物标志物及其应用 | |
| CN101008647A (zh) | G蛋白β2亚基的应用 | |
| CN1920570B (zh) | 硫氧还蛋白样蛋白2的应用 | |
| JP2007215412A (ja) | 悪性転移性胃癌の判定方法 | |
| KR100873629B1 (ko) | 신규한 폐암 진단용 마커 | |
| CN101004418A (zh) | 玻连蛋白的应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| C06 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| C10 | Entry into substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| C14 | Grant of patent or utility model | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| C17 | Cessation of patent right | ||
| CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20110518 Termination date: 20130816 |