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CN1350590A - 利用qtl和分子标记预测纤维长度的方法 - Google Patents

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CN1350590A
CN1350590A CN00804594A CN00804594A CN1350590A CN 1350590 A CN1350590 A CN 1350590A CN 00804594 A CN00804594 A CN 00804594A CN 00804594 A CN00804594 A CN 00804594A CN 1350590 A CN1350590 A CN 1350590A
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genetic marker
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CN00804594A
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S·波特
P·A·沃森
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Pulp and Paper Research Institute of Canada
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Abstract

本发明涉及一种利用基因标记座预测纤维长度和选择良种树的新方法。该方法包含将基因型鉴定数据与从同一棵树上收集而来的表型数据进行比照,该树是用来实施基因型鉴定和识别与纤维长度关联的特定基因标记座或数量性状基因座(QTL)的。该方法可从人工培育和天然生长的树中识别并通过按识别的基因标记座划定基因型的方法为树木优育工程选出良种树。

Description

利用QTL和分子标记预测纤维长度的方法
本发明的背景
1.本发明的领域
本发明属于树木培育和分子生物学领域,并涉及木浆和纸张性能的评判方法。本发明可提高从人工培育和天然生长的树木中基于纤维长度挑选良种树的效率。
2.现有技术描述
树木的许多重要商业特性,比如木质密度、体积生长率和纤维性能,无论是天然的还是培育的已知都显示出连续性的差异水平[J.E.Eckenwalder,“Systematics and Evolution of Populus”in Biologyof Populus(Stettler,R.F.Bradshaw,H.D.Heilman,P.E.&Hinckley,T.M.Ed.)NRC Research Council Press,Ottawa ON,pp.7-32(1996)]。在数量性状选择上取得进步的最大障碍是不同环境下的表型性状缺乏重复性。因此,识别出基因型最为适宜的个体是树木培育上一个最困难且具挑战性的问题之一。数量性状千差万别的根源在于,这些性状不是由一个而是由多个基因组份协同控制的。尽管很复杂,但是基因标记研究工作中所取得的成果是可以识别出在控制连续可变的性能中起一定作用的基因区域的。这些区被称为数量性状基因座或QTL[E.S.Lander & D.Botstein,Genetics121,185-199(1989)]。基因标记是任何数量遗传表型,它可用来监控按基因关系连锁在标记上的等位基因的离散情况。有可能识别和监控紧密连锁在QTL上的基因标记。为了将QTL识别或绘制成特定的染色体位置,首先必须证明的是目标数量性状与基因标记之间有很强的关联性。
按此方式已绘制出许多性状包括体积生长率、木质密度和盛芽期的QTL。虽然如此,还没有绘制过与木浆和造纸工业直接有关的性能的QTL。
长久以来,针对树木中的强势木材和纤维性能所作的培育和挑选工作已经复杂得不能再复杂了。树木的传统改良方法碰到许多问题。首先,各代之间的间隔太长-即使是速生品种(比如杨树)也需要生长4-8年才行。再者,在只基于一或两个物理特性时,由于杂交时涉及大量的基因物质以及发生基因互混时所造成的复杂性,选择树木的能力就很受限制。
同样在天然森林中,不进行深入的表征性研究就很难识别出工业用良种树。本发明有助于界定哪些是需要测试的并加快良种树组的选择进度。
本发明的简要说明
本发明的一个目的是提供方法,用以界定哪些是需要测试的并加快良种树组的选择进度。
本发明提供了一种识别出树族系中与主导强势纤维长度性能的基因座关联的基因标记的方法,包含这些步骤:
a)得到一个显现强势纤维长度性能的成年母树;
b)经由自花或异花传粉而得到所述母树的多个子代树;
c)评判多个子代树其多个基因标记中的每一个;
d)识别按近似孟德尔(Mendelian)比离散且与至少一部分所述其它的多个基因标记存在连锁关系的基因标记;
e)测定多个子代树中的纤维长度;并且
f)将是否存在强势纤维长度性能与步骤d)中所识别的至少一个按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它标记存在连锁关系的标记进行关联,强势纤维长度性能的存在与否与标记之间关联的现象表明所述的标记与主导强势纤维长度的基因座是有关系的;其中所述的树族系包含一个母树及其子代。
本发明一个实施方案提供了一种大量制造具强势纤维长度性能的克隆树的方法,包含这些步骤:
a)得到一个显现强势纤维长度性能的成年母树;
b)经由自花或异花传粉而得到所述母树的多个子代树;
c)评判多个子代树其多个基因标记中的每一个;
d)识别按近似孟德尔比离散且与至少一部分所述其它的多个基因标记存在连锁关系的基因标记;
e)测定多个子代树中的纤维长度;
f)将是否存在强势纤维长度与步骤d)中所识别的至少一个按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它标记存在连锁关系的标记进行关联;
g)选择含有步骤f)中识别的、与主导强势纤维长度的基因座关联的标记的子代树;并且
h)无性繁殖步骤g)所选的所述子代树,以制造多个克隆树,几乎所有的克隆树都显现出强势的纤维长度。
本发明的一个实施方案提供了一种制造树族系的方法,其中至少有约一半显现出强势的纤维长度性能,包含这些步骤:
a)得到一个显现强势纤维长度性能的成年母树;
b)经由自花或异花传粉而得到所述母树的多个子代树;
c)评判多个子代树其多个基因标记中的每一个;
d)识别按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它的多个基因标记存在连锁关系的基因标记;
e)测定多个子代树中的纤维长度;
f)将是否存在强势纤维长度与步骤d)中所识别的至少一个按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它标记存在连锁关系的标记进行关联;
g)选择含有步骤f)中识别的、与主导强势纤维长度的基因座关联的标记的子代树;并且
h)有性繁殖步骤g)所选的所述子代树,以制造一个树族系,至少有约一半的所述树族系含有主导强势纤维长度的基因座而且所述的树族系显现出强势的纤维长度。
根据本发明的一个实施方案,该方法可进一步包含利用所述的多个基因标记来组构所述母树的QTL图。
基因标记座可以是再与数量性状基因座(QTL)关联的限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)。
母树可以是每个所述子代树的育种母树,评判所述子代树的叶片或形成层组织中是否存在步骤c)的基因标记。
母树是杨科,并且更优选populus trichocarpa、三角杨(populusdeltoides)、山杨科或其杂交品种。
本发明一个实施方案提供了一个如图8所示的杨科树木的与纤维长度相关联的QTL基因图谱。
本发明一个实施方案提供了一种包含800bp增倍产物的树纤维长度基因标记,其中如果在所述树的增倍DNA样品中存在所述产物就意味着≤0.92mm的短纤维长度,而如果所述产物不存在则表明>0.92mm的长纤维长度。
基于本发明的目的,对以下术语进行了定义。
“强势纤维长度性能”一语词指的是长度大于0.92mm的纤维。
“短纤维长度”一语词指的是≤0.92mm的纤维。
“长纤维长度”一语词指的是>0.92mm的纤维。
“800bp增倍产物”一语词指的是800倍基对其RAPD标记G03的PCR产物。
附图的简要说明
图1表示的是母本克隆样本14-129(D)和93-968(T)其纤维长度与树龄的函数关系;
图2表示的是F1代克隆样本53-242和53-246其纤维长度与树龄的函数关系;
图3表示的是F2代克隆样本331-1059、1061、1062和1065其纤维长度与树龄的函数关系;
图4表示的是全部57个克隆样本的纤维长度分布情况;
图5表示的是母本和F1代克隆样本其纤维长度数据的等级集群分析结果;
图6表示的是全部57个克隆样本其纤维长度数据的等级集群分析结果;
图7表示的是按纤维长度大小顺序排列全部57个克隆样本;
图8表示的是标有所检出的QTL位置的杨科基因图谱;而
图9表示的是可预测族系331中纤维长度的800bp G03 RAPD产物。
本发明的具体描述
大量的前人工作[H.D.Bradshaw & R.F.Stettler,Genetics 139,963-973(1995);R.W.Allard,Principles of Plant Breeding. JohnWiley & Sons,New York(1960)]已表明,生长状况、适应能力和木材质量性状并不是由数目庞大的弱效基因所控制而是由少数几个强效基因所决定,其影响作用还掺杂了周围环境因素的干扰。本发明所述的方法表明,对决定纤维性能的各个因素而言,情况也是如此。已发现两个对所观察到纤维长度变化情况各自起66.5%和28.3%影响作用的显性QTL。因此,这些QTL加在一起解释了在同一个为试验所选的取样点处纤维长度94.8%的变化情况。
这些QTL对标记辅助培育技术或快速评判技术的进步有着潜在的应用价值,通过有目的的培植质量已知的纤维,可为木浆和造纸工业在筛选和开发新且好的产品时节省大量的时间和金钱。QTL可用来加强并指导树木培育试验以改良木材质量性状以及根据其纤维性能对天然林进行快速评判。材料和方法取样地点
在Puyllup,Washington其Washington State University Farm的5个种植点进行取样。该取样用族谱通过Populus trichocarpa(克隆样本93-968)与Populus deltoides(克隆样本ILL-129)种间杂交的方法于1981年建立的。杂交第一代(53族系的F1代)的两个同胞,53-246和53-242,于1988年杂交,生成了用于基因图谱研究的杂交第二代族系(331族系的F2代)。将P、F1和55 F2克隆样本的非连根枝条于1991年春天按改良型随机划整块的方式相隔2×2m栽种在5号Farm中。树取样
从族谱中所有存活下来的137棵树上在约齐胸的高度取一个直径为10mm的增量芯。经由木髓逐棵树取出全部的木芯。采用Bio101 FastPrep仪的标准步骤从新鲜叶片组织中取得DNA样品。按已有方法[H.D.Bradshaw & R.F. Stettler,Genetics 139,963-973(1995)]针对RAPD分析而优化PCR反应。纤维性能
10mm增量芯分剥成两个年轮组并徒手切片。利用乙酸/过氧化氢浸渍法[L.F. Burkart,For. Prod. J.,16,52(1966)]得到分析用纤维,做法是将0D质量已知的样片先放在试管中,浸透水然后喷以浸渍溶液[冰醋酸:过氧化氢(贮瓶30%溶液)的1∶1混合物]。样品接着在干燥的热砧板上于60℃熟化48h。以蒸馏水从样片上完全冲掉浸渍溶液并在小型Hamilton Beech混合机中打碎木浆。然后把一系列的稀释样品制成10-20,000纤维(约等于5mg浸渍木浆)的特征样品,利用Kajaani FS-200设备和/或Optest Fiber QualityAnalyzer分析其长度和颗粒度值。基因图谱组构和QTL绘图
本研究工作中所用的杨树基因图谱,是前人利用同一331族系谱而组构的,由342个RFLP、STS和RAPD标记构成,并且以前已被描述过[H.D.Bradshaw,M.Villar,B.D.Watson,K.G.Otto & S.Stewart,Theor.Appl.Genet. 89,551-558(1994)]。对与杨树19个染色体很接近的19个大连锁组进行扫描,采用程序MAPMAKER-QTL1.1[A.H.Patterson,S.Damon,J.D.Hewitt,D.Zamir & H.D.Rabinowich,Nature 335,721-726(1988)]得到其表型数据。根据扫描到的基因组长度以及基因标记之间的距离,选定2.9为对数机率(LOD)显著性阙限值(这能确保检测到的正性QTL其出错的几率最大为5%)。有关QTL绘图程序更详细的信息可参见[H.D.Bradshaw& R.F.Stettler,Genetics 139,963-973(1995)]。结果和讨论纤维性能
为了便于纤维性能的分析,对由以下8个克隆样本,母本种(93-968,ILL-129)、杂交F1代(53-242、53-246)和四个第二杂交F2代(331-1059、1061、1062、1065)构成的初步小样进行全面的表征。每个克隆样本其长度加权的纤维长度值汇总于表I,并对树龄作图,见图1、2和3。通过这些研究最终确定剩下的克隆样本只分析其第七生长年轮的纤维性能。
                     表I
        年增量的长度加权平均纤维长度,mm克隆样本号    0-2年             3-4年             5-7年ILL-129       0.60(±0.06)      0.72(±0.00)      0.80(±0.06)93-968        0.65(±0.04)      0.83(±0.01)      0.98(±0.01)53-242        0.59(±0.03)      0.75(±0.02)      0.82(±0.03)53-246        0.52(±0.01)      0.69(±0.01)      0.84(±0.01)331-1059      0.58(±0.05)      0.68(±0.06)      0.79(±0.05)331-1061      0.60(±0.08)      0.79(±0.03)      0.93(±0.04)331-1062      0.64(±0.04)      0.84(±0.03)      0.99(±0.02)331-1065      0.55(±0.01)      0.69(±0.01)      0.80(±0.02)
这些数据清楚地表明,该族系中龄期为7的纤维其长度仍然随时间而增加。数据也表明,用以制造该族系(D母本ILL-129、T母本93-968)的两个母本组在龄期为7时有着在统计学上完全不同的纤维长度。F1子代(53-242和53-246)显示出与D母本类似的长度加权纤维长度。这些结果表明该性能在子代中发生了离散,特别是在第二杂交代中,而且该族系中的纤维长度至少是部分受基因控制的。
每个F2克隆样本其纤维长度的分布情况见图4。可以看到,确有迹象表明这些杂交代中存在着纤维长度双模型分布现象,纤维长度值集中在母本类型的附近。
然后将所有克隆样本得到的纤维长度利用SYSTAT 7.0进行等级集群分析。母本和F1代集群见图5。所有57个克隆样本的集群树见图6。图7表示的是不同克隆样本集群彼此是如何在纤维长度方面发生关联的。各个样本组从集群分析测试结果来看,在统计学上彼此完全不同(组内变化<组间变化)。纤维长度决定因素的QTL绘图
含多个影响同一物理性状的基因的DNA区域被称为数量性状基因座(QTL)。通过基因标记技术可检测出这些区域,并且其存在与否可从统计学角度与树族群中特定生理性状比如纤维长度的量度进行关联。进行统计关联时基于的是性状数据与基因标记存在与否的数据经计算机软件进行多重同步线性回归的方法。按此方式,可为基因图谱“扫描”出可能与目标性状有关联的标记组-然后对该标记组进行分类,界定出部分控制该性状的QTL(换句话说,标记并不是参与性状控制的那个基因,而是在该标记界定的DNA区域内存在的那些基因-该方法称为区间映像法)。标记与性状之间关联的程度可用来估计QTL的“长度”,即性状变化情况受控于特定QTL的百分数。
利用从331族系谱得到的纤维长度数据,以MAPMAKER-QTL1.1[H.D.Bradshaw & R.F.Stettler,Genetics 139,963-973(1995)]对杂交杨树基因图谱[H.D.Bradshaw & R.F.Stettler,Genetics 139,963-973(1995)]进行扫描。每个检测到的QTL其详细信息汇总于表II中,而其在杨树基因图谱上的位置见图8。方条A-Y表示的是功能上相当于杨树19个染色体的连锁组。图谱上为每个基因标记所分配的特征(比如P1277)和位置标在方条上。
                          表II
                       纤维长度QTL
                 6年生PMGC克隆样本的纤维长度性状      标记/连锁组    LOD    Phen  平均   TD     DD     Dom.
                               %    TT纤维长度FL-2      E18_15-CO1_16/M  3.09   66.5  0.828  0.925  0.759  0.1313FL-3      G12_09-G03_14/O  3.22* 28.3  0.935  0.849  0.795  -0.0160*与前人测定的其它龄期和形式的QTL位置接近的图谱[R.W.Allard,Principles of Plant Breeding. John Wiley & Sons,NewYork(1960)]。LOD=对数机率值(反映QTL的几率)Phen.=%由QTL所造成的表型变化。Dom.=D等位基因的显性影响。
两个纤维长度QTL均大于2.9的LOD阙限值,表明这些QTL要高于95%的几率阙限值。因此,现在就可以挑选出关联基因标记以作进一步研究之用,有可能作为快速评判和分子培育试验的指标。该族系与杨科其它族员之间的关系很近,因此这些标记和关联QTL也可能适用于山杨等物种。纤维性能的基因控制
用以制造本研究工作所用杂交族系的两个母本物种,其纤维长度在统计学上是完全不同的。发现这些母本其纤维类型在子代中发生了离散,纤维长度在整个F2代内表现为双模型分布。F1代都显现出D母本的纤维长度。如果族谱中所有的树都生长在相同的环境下,那么这些观察结果就清楚地说明纤维性能至少在中等程度上受着基因的控制。遗传度(H2)是基因对性状控制度的度量。如果H2值为0.50,则表明目标性状50%受基因的控制。性状变化情况的另一半受环境因素控制。利用SYSTAT 7.0以内的一般线性模型法得出纤维长度的遗传度(H2)估算值。根据式(H2)(克隆样本的MS-重复克隆样本的MS)/克隆样本的MS,(其中MS=III型均方根)进行计算,从而估算出该族系中纤维长度的广义遗传度为0.47。桉树的纤维长度H2估算值变化范围是0.12[G.O.Otegbeye & R.C.Kellison,SylvaeGenetica 29,27(1980)]~0.59[C.R.E.Clarke,Msc.Thesis,University of Natal,Pietermaritzburg,South Africa(1990)]。
参照以下说明性而非限定性的实施例对本发明进行更为详细的说明。
实施例1树纤维长度的测定
利用在筛分一系列未知样品的纤维长度性能的预测能力方面与QTL有关联的基因标记进行初步试验,以显示该方法在快速评判方法的开发中的潜在价值。从来自British Columbia中部D、F和K三个不同地点的一系列山杨样品中分离出基因DNA。然后利用与QTL关联的基因标记G03经由聚合酶链式反应(PCR)对这些DNA样板进行选择性的增倍处理,并通过评判图谱来确定是否存在~800bp PCR产物。基于之前对331族系杂交杨树克隆样本所作的研究发现,该产物随着纤维长度的变化而在数量上也会发生改变。331族系某个克隆样本的增倍DNA中存在该产物对应的就是短纤维;不存在则是长纤维克隆样本。然后基于这些判定准则对每个山杨克隆样本进行纤维长度的预测(长或短)。随后利用常规方法测定受测山杨克隆样本的实际纤维长度性能并与DNA法预测的结果进行对比。图9给出的是表明331族系克隆样本中纤维相对长度的800bp产物。968克隆样本(trichocarpa)的纤维较长(0.99mm);129克隆样本(deltoides)的纤维较短(0.85mm)。
表III给出的是未知山杨系列样本其DNA测试的预测结果以及这些树经由常规打浆法测得的实际纤维性能。可以看到,根据800bp PCR产物所作的预测无论在任何情况下都是准确的。
                         表III
         未知山杨克隆样本的PCR预测纤维长度分析结果克隆样本号    800bp G03片段  预测的长/短*  FS-200纤维长度(mm)K3-3            -                长                1.06K3-4            -                长                1.10K6-1            +                短                0.82K6-2            +                短                0.83K7-2            -                长                1.06K7-3            -                长                1.02F2-1            -                长                1.04F2-2            -                长                1.08F4-1            +                短                0.84F4-2            +                短                0.86F5-1            +                短                0.82F5-4            +                短                0.80F7-1            -                长                0.99F7-3            +                短                0.81F7-4            +                短                0.88F8              +                短                0.73D1-14           -                长                1.01D1-19           -                长                1.00D3-5            +                短                0.85*对受测山杨克隆样本预测其纤维长或短是相对而言的,并且是基于天然山杨族群中发现的两个在统计学上完全不同的纤维长度组(1.05mm和0.85mm-见PPR一书)的。
表IV给出了每个受试克隆样本其7年龄荚片纤维长度的全套数据。按族系和各自的基因型号来识别各个克隆样本(也给出了特定的重复实验)。
            表IV绘图族群其克隆样本个体的全部数据克隆样本号    重复实验    纤维长度(mm)14-129        A            0.8414-129        C            0.7693-968        A            0.9993-968        B            0.9793-968        C            0.9853-242        A            0.8553-242        B            0.8353-242        C            0.7953-246        C            0.8353-246        D            0.84331-1059      A            0.83331-1059      B            0.74331-1059      C            0.8331-1061      A            0.96331-1061      B            0.89331-1061      C            0.93331-1062      A            1.01331-1062      B            1331-1062      C            0.97331-1065      A            0.78331-1065      B            0.82331-1065      C            0.81331-1060      A            0.85331-1060      C            0.81331-1064      A            0.98331-1064      C            0.96331-1067      A            0.82
          表IV(续)绘图族群其克隆样本个体的全部数据克隆样本号     重复实验    纤维长度(mm)331-1067        B            0.87331-1067        C            0.87331-1069        A            0.89331-1069        B            0.99331-1072        C            0.84331-1073        B            0.69331-1075        A            0.91331-1075        B            0.88331-1075        C            0.91331-1076        A            0.74331-1076        C            0.76331-1077        C            0.77331-1078        A            0.87331-1078        B            0.85331-1079        A            0.98331-1079        B            0.89331-1079        C            0.95331-1084        A            0.91331-1084        C            0.85331-1086        A            0.82331-1086        B            0.87331-1087        A            0.86331-1087        B            0.85331-1087        C            0.84331-1090        A            0.95331-1093        A            0.91331-1093        B            0.75331-1093        C            0.81
               表IV(续)
  绘图族群其克隆样本个体的全部数据克隆样本号        重复实验        纤维长度(mm)331-1095            B                0.91331-1095            C                0.77331-1101            A                0.93331-1101            B                0.96331-1101            C                0.92331-1102            A                0.73331-1102            B                0.82331-1103            A                0.81331-1103            B                0.92331-1103            C                0.95331-1104            A                0.81331-1104            B                0.82331-1106            A                0.68331-1106            B                0.79331-1112            A                0.6331-1112            B                0.75331-1112            C                0.76331-1114            A                0.87331-1114            B                0.98331-1114            C                0.99331-1118            A                0.81331-1118            B                0.99331-1120            C                0.83331-1121            B                0.54331-1122            A                0.84331-1122            B                0.78331-1122            C                0.77331-1126            A                1.03
         表IV(续)
 绘图族群其克隆样本个体的全部数据克隆样本号     重复实验     纤维长度(mm)331-1126        B             0.98331-1126        C             0.93331-1127        A             0.87331-1127        B             1.01331-1127        C             1.02331-1128        A             0.9331-1128        B             0.85331-1128        C             0.85331-1130        A             0.85331-1130        B             0.92331-1130        C             0.93331-1131        A             0.99331-1131        C             0.96331-1133        A             0.76331-1133        B             0.69331-1136        A             0.64331-1136        B             0.69331-1140        A             0.8331-1140        B             0.78331-1149        A             0.91331-1149        B             0.94331-1149        C             0.94331-1151        A             0.77331-1151        B             0.94331-1151        C             0.91331-1158        A             0.75331-1158        B             0.7331-1158        C             0.77
           表IV(续)绘图族群其克隆样本个体的全部数据克隆样本号    重复实验    纤维长度(mm)331-1162        A            0.81331-1162        B            0.89331-1162        C            0.94331-1163        B            0.62331-1163        C            0.65331-1169        A            0.71331-1169        B            0.78331-1169        C            0.8331-1173        A            0.96331-1173        B            0.81331-1173        C            0.91331-1174        B            0.85331-1174        C            0.88331-1182        B            0.88331-1186        A            0.91331-1186        B            0.95331-1186        C            0.99331-1580        A            0.67331-1580        B            0.72331-1580        C            0.79331-1582        A            0.86331-1582        B            1.01331-1582        C            0.94331-1587        B            0.85331-1587        C            0.91克隆样本号=族系号-基因型号重复实验=Puyallop某地;纤维长度=长度加权的纤维长度(三次FQA测试结果的平均值);DBM=齐胸高度处的直径。
虽然本发明参照特定的实施方案进行了说明,但要明白进一步的改变是可能的,而且本发明旨在函盖本发明的任何其它形式、用途或修改版本,其在总体上遵照本发明的原理并且包括在本发明所适用的现有技术领域内熟知或按常规做法就可得到并符合前述主要特征且处于附录权利要求书范围之内的一些与本公开书有所不同的情况。

Claims (24)

1.一种在一个树族系中识别与主导强势纤维长度性能的基因座关联的基因标记的方法,包含这些步骤:
a)得到一个显现强势纤维长度性能的成年母树;
b)经由自花或异花传粉而得到所述母树的多个子代树;
c)评判多个子代树其多个基因标记中的每一个;
d)识别按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它的多个基因标记存在连锁关系的基因标记;
e)测定多个子代树中的纤维长度;并且
f)将是否存在强势纤维长度性能与步骤d)中所识别的至少一个按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它标记存在连锁关系的标记进行关联,强势纤维长度性能的存在与否与标记之间关联的现象表明所述的标记与主导强势纤维长度的基因座是有关系的;其中所述的树族系包含一个母树及其子代。
2.权利要求1的方法,进一步包含利用所述的多个基因标记来组构所述母树的QTL图。
3.权利要求1的方法,其中所述的基因标记座是限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)。
4.权利要求3的方法,其中所述的限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)再与数量性状基因座(QTL)进行关联。
5.权利要求1的方法,其中所述的母树是每个所述子代树的育种母树,并评判所述子代树的叶片或形成层组织中是否存在步骤c)的基因标记。
6.权利要求7的方法,其中所述的母树是杨科。
7.权利要求1的方法,其中所述的母树是populus trichocarpa、populus deltoides、山杨科或其杂交品种。
8.一种大量制造具强势纤维长度性能的克隆树的方法,包含这些步骤:
a)得到一个显现强势纤维长度性能的成年母树;
b)经由自花或异花传粉而得到所述母树的多个子代树;
c)评判多个子代树其多个基因标记中的每一个;
d)识别按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它的多个基因标记存在连锁关系的基因标记;
e)测定多个子代树中的纤维长度;
f)将是否存在强势纤维长度与步骤d)中所识别的至少一个按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它标记存在连锁关系的标记进行关联;
g)选择含有步骤f)中识别的、与主导强势纤维长度的基因座关联的标记的子代树;并且
h)无性繁殖步骤g)所选的所述子代树,以制造多个克隆树,几乎所有的克隆树都显现出强势的纤维长度。
9.权利要求8的方法,进一步包含利用所述的多个基因标记来组构所述母树的QTL图。
10.权利要求8的方法,其中所述的基因标记座是限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)。
11.权利要求10的方法,其中所述的限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)与数量性状基因座(QTL)进行关联。
12.权利要求8的方法,其中所述的母树是每个所述子代树的育种母树,并评判所述子代树的叶片或形成层组织中是否存在步骤c)的基因标记。
13.权利要求8的方法,其中所述的母树是杨科。
14.权利要求8的方法,其中所述的母树是populus trichocarpa、populus deltoides、山杨科或其杂交品种。
15.权利要求8方法制造的一批强势纤维长度克隆树,所述树的基因组含有相同的与所述强势纤维长度关联的基因标记。
16.一种制造树族系的方法,其中至少有约一半显现出强势的纤维长度性能,包含这些步骤:
a)得到一个显现强势纤维长度性能的成年母树;
b)经由自花或异花传粉而得到所述母树的多个子代树;
c)评判多个子代树其多个基因标记中的每一个;
d)识别按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它的多个基因标记存在连锁关系的基因标记;
e)测定多个子代树中的纤维长度;
f)将是否存在强势纤维长度与步骤d)中所识别的至少一个按近似孟德尔比离散且显示与至少一部分所述其它标记存在连锁关系的标记进行关联;
g)选择含有步骤f)中识别的、与主导强势纤维长度的基因座关联的标记的子代树;并且
h)有性繁殖步骤g)所选的所述子代树,以制造一个树族系,至少有约一半的所述树族系含有主导强势纤维长度的基因座而且所述的树族系显现出强势的纤维长度。
17.权利要求16的方法,进一步包含利用所述的多个基因标记来组构所述母树的QTL图。
18.权利要求16的方法,其中所述的基因标记座是限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)。
19.权利要求18的方法,其中所述的限制片长多态性(RFLP)或随机增倍多态性DNA(RAPD)与数量性状基因座(QTL)进行关联。
20.权利要求16的方法,其中所述的母树是每个所述子代树的育种母树,并评判所述子代树的叶片或形成层组织中是否存在步骤c)的基因标记。
21.权利要求16的方法,其中所述的母树是杨科。
22.权利要求20的方法,其中所述的母树是populustrichocarpa、populus deltoides、山杨科或其杂交品种。
23.一种如图8所示的树木其纤维长度与QTL相关联的基因图谱。
24.一种包含800bp增倍产物的树纤维长度基因标记,其中如果在所述树的增倍DNA样品中存在所述产物就意味着≤0.92mm的短纤维长度,而如果所述产物不存在则表明>0.92mm的长纤维。
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