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CN120041455A - 构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建方法和应用 - Google Patents

构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建方法和应用 Download PDF

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CN120041455A
CN120041455A CN202510510389.2A CN202510510389A CN120041455A CN 120041455 A CN120041455 A CN 120041455A CN 202510510389 A CN202510510389 A CN 202510510389A CN 120041455 A CN120041455 A CN 120041455A
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CN
China
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tbx19
mice
thr187ala
grna
kit
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柳延虎
张亚平
谢海兵
黄翠萍
王雪冰
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Kunming Institute of Zoology of CAS
Original Assignee
Kunming Institute of Zoology of CAS
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Abstract

本发明涉及基因工程技术领域,特别是涉及构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建方法和应用。本发明提供的试剂盒包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的gRNA和核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的单链Oligo donor DNA。本发明提供的试剂盒可以构建得到TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型,该小鼠模型可作为研究下丘脑‑垂体‑肾上腺轴功能减弱和促肾上腺皮质激素(ACTH)缺乏症模型发生发展病程的动物模型,以研究TBX19基因影响动物(小鼠)行为的分子和细胞机制,还可作为促肾上腺皮质激素缺乏症药物研发的动物模型。

Description

构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建 方法和应用
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,特别是涉及构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建方法和应用。
背景技术
T-box transcription factor 19(TBX19)基因定位于人的1q24.2,编码一个具有T-box结构域的转录因子。TBX19是调节下丘脑-垂体-肾上腺轴(HPA轴)的重要基因,通过与Pitx1的结合,启动POMC的表达,进而引起HPA轴相关激素水平改变。HPA轴是动物的压力应激中心,调控生物的生长发育、神经活动、应激反应等重要的生物活动。小鼠的TBX19基因在1号染色,全长22,919个碱基,NCBI ID:83993。该基因在小鼠基因组中有4个转录本。
rs80951600是位于家猪(Sscrofa11.1)第4号染色体TBX19基因上的突变位点,位于chr4:82,684,374,由T突变为C,属于错义突变,导致TBX19翻译的蛋白质第189位点的苏氨酸(Thr或T)转变为丙氨酸(Ala或A),根据蛋白质同源性,该位点在小鼠中的同源位点为第187位氨基酸,即小鼠TBX19Thr187Ala。基因组的研究发现该突变可能与家猪的HPA轴功能减弱相关,进而促使野猪驯化为温顺的家猪。目前关于TBX19基因的T187A影响小鼠行为的作用机制研究知之甚少,且也没有该位点被编辑的小鼠模型。
发明内容
为了解决上述问题,本发明提供了构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建方法和应用。本发明提供的试剂盒可以构建得到TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型,该小鼠模型可作为研究下丘脑-垂体-肾上腺轴功能减弱和促肾上腺皮质激素(ACTH)缺乏症模型发生发展病程的动物模型。
为了实现上述目的,本发明提供如下技术方案:
本发明提供了一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒,包括gRNA和单链Oligo donor DNA;所述gRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述单链Oligodonor DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
优选的,所述试剂盒还包括Cas9 mRNA和Cas9反应缓冲液。
本发明提供了上述技术方案所述的试剂盒在构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型中的应用。
本发明提供了一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的方法,包括以下步骤:
将Cas9 mRNA、gRNA、单链Oligo donor DNA和Cas9反应缓冲液混合,得到反应混合液;所述gRNA和单链Oligo donor DNA为上述技术方案所述的试剂盒中的所述gRNA和单链Oligo donor DNA;
将所述反应混合液注射到小鼠受精卵中后,将注射后存活的受精卵移植到受体母鼠体内,产出F0代小鼠;
测定所述F0代小鼠的TBX19基因的基因型,得到突变的阳性F0代小鼠;
将所述突变的阳性F0代小鼠与野生型小鼠交配获得F1代小鼠;
测定所述F1代小鼠的TBX19基因的基因型,得到阳性F1代小鼠;
将所述阳性F1代小鼠杂交,获得含有纯合TBX19 p.Thr187Ala点突变的F2代小鼠。
优选的,所述反应混合液中Cas9 mRNA的浓度为5ng/μl,gRNA的浓度为2ng/μl,单链Oligo donor DNA的浓度为100ng/μl。
优选的,所述测定使用的引物包括:TBX19基因的扩增引物和测序引物。
优选的,所述TBX19基因的扩增引物由上游引物和下游引物组成;所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
优选的,所述测序引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
本发明提供了上述技术方案所述方法构建得到的TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型在1)~3)任一项中的应用:
1)作为观察下丘脑-垂体-肾上腺轴功能减弱的动物模型;
2)作为促肾上腺皮质激素缺乏症的动物模型;
3)作为促肾上腺皮质激素缺乏症药物研发的动物模型。
优选的,2)所述的动物模型为促肾上腺皮质激素缺乏症发生和/或发展病程的动物模型。
有益效果:
本发明提供了一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒,包括gRNA和单链Oligo donor DNA;所述gRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述单链Oligodonor DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明提供的试剂盒可以构建得到TBX19p.Thr187Ala点突变小鼠模型,该小鼠模型可作为研究下丘脑-垂体-肾上腺轴功能减弱和促肾上腺皮质激素(ACTH)缺乏症模型发生发展病程的动物模型,以研究TBX19基因影响动物(小鼠)行为的分子和细胞机制,还可作为促肾上腺皮质激素缺乏症药物研发的动物模型。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍。
图1为本发明的流程示意图;
图2为TBX19基因点突变设计策略示意图;
图3为体外转录Cas9和gRNA电泳结果;
图4为F0代小鼠鉴定策略示意图;
图5为F0代小鼠PCR的凝胶电泳图;
图6为野生型小鼠突变位点附近峰形图;
图7为杂合突变型小鼠突变位点附近峰形图;
图8为纯合突变型小鼠突变位点附近峰形图。
具体实施方式
本发明提供了一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒,包括gRNA和单链Oligo donor DNA;所述gRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述单链Oligodonor DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,具体如下:
5'-CTGCATAAATATGAACCTCAGGTTCATATAGTCCGTGTTGGAGGCGCCCATCGAATGGTCATGAACTGCTCATTTCCTGAAGCTCAGTTCATCGCTGTGACTGCCTATCAGAATGAGGAG-3'。
本发明所述单链Oligo donor DNA中第82位碱基G是目标突变位点,第75位碱基T是防止Cas9二次切割引入的同义突变,可以防止单链Oligo donor DNA插入基因组前后被Cas9-sgRNA识别并切割。
作为一种实施方式,所述试剂盒还包括Cas9 mRNA和Cas9反应缓冲液。
作为一种实施方式,所述试剂盒中的Cas9 mRNA和gRNA是通过体外转录的方式得到有活性的gRNA和Cas9 mRNA,所述单链Oligo donor DNA是通过合成的方式得到。
本发明提供的试剂盒可以构建得到TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型,该小鼠模型可作为研究下丘脑-垂体-肾上腺轴功能减弱和促肾上腺皮质激素(ACTH)缺乏症模型发生发展病程的动物模型,以研究TBX19基因影响动物(小鼠)行为的分子和细胞机制,还可作为促肾上腺皮质激素缺乏症药物研发的动物模型。
基于上述优势,本发明提供了上述技术方案所述的试剂盒在构建TBX19p.Thr187Ala点突变小鼠模型中的应用。
本发明提供了一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的方法,包括以下步骤:
将Cas9 mRNA、gRNA、单链Oligo donor DNA和Cas9反应缓冲液混合,得到反应混合液;所述gRNA和单链Oligo donor DNA为上述技术方案所述的试剂盒中的所述gRNA和单链Oligo donor DNA;
将所述反应混合液注射到小鼠受精卵中后,将注射后存活的受精卵移植到受体母鼠体内,产出F0代小鼠;
测定所述F0代小鼠的TBX19基因的基因型,得到突变的阳性F0代小鼠;
将所述突变的阳性F0代小鼠与野生型小鼠交配获得F1代小鼠;
测定所述F1代小鼠的TBX19基因的基因型,得到阳性F1代小鼠;
将所述阳性F1代小鼠杂交,获得含有纯合TBX19 p.Thr187Ala点突变的F2代小鼠。
作为一种实施方式,所述反应混合液中Cas9 mRNA的浓度为5ng/μl,gRNA的浓度为2ng/μl,单链Oligo donor DNA的浓度为100ng/μl。
作为一种实施方式,所述小鼠受精卵是通过小鼠促排卵并经过体外受精培育获得的。
作为一种实施方式,所述测定使用的引物包括:TBX19基因的扩增引物和测序引物。
作为一种实施方式,所述TBX19基因的扩增引物由上游引物和下游引物组成;所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
作为一种实施方式,所述测序引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
本发明基于上述技术方案所述的gRNA设计了Txb19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的构建方法,将Cas9 mRNA、gRNA、单链Oligo donor DNA和Cas9反应混合液显微注射到小鼠受精卵中,通过两步筛选和一次杂交,获得Thr187Ala点突变小鼠模型,运用CRISPR/Cas9系统,构建出点突变小鼠后可与不同的工具鼠灵活搭配运用,研究目的基因在不同组织器官,甚至不同细胞类型中的作用机制,为国内外提供有效的模型动物。
本发明提供了上述技术方案所述方法构建得到的TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型在1)~3)任一项中的应用:
1)作为观察下丘脑-垂体-肾上腺轴功能减弱的动物模型;
2)作为促肾上腺皮质激素缺乏症的动物模型;
3)作为促肾上腺皮质激素缺乏症药物研发的动物模型。
作为一种实施方式,2)所述的动物模型为促肾上腺皮质激素缺乏症发生和/或发展病程的动物模型。
为了进一步说明本发明,下面结合附图和实施例对本发明提供的构建TBX19p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒及其构建方法和应用进行详细地描述,但不能将它们理解为对本发明保护范围的限定。
实施例1
一种基于CRISPR/Cas9基因编辑技术建立TBX19 Thr187Ala点突变小鼠模型的方法,流程示意图见图1,具体步骤如下:
一、TBX19基因的基本信息如下:
1)点突变基因名称(Gene ID号):TBX19(83993);
2)点突变基因名称(Ensemble):TBX19(ENSMUSG00000026572);
3)点突变针对的转录本(Ensemble号):Tbx19-201(ENSMUST00000027859.12);
4)点突变针对的外显子:3号外显子。
二、Cas9/gRNA的设计与构建:
TBX19基因点突变设计策略示意图,如图2所示,gRNAs设计在TBX19基因的外显子3目标突变附近。
1、打靶具体策略为:根据序列信息在TBX19基因的3号外显子序列中设计了1条gRNA,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,具体如下:
5'-CAGCGATGAACTGAGTTTCAGGG-3'。
2、以突变区域为中心(5'-TCCTGAAGCTCAGTTCATCGCTG-3',SEQ ID NO.2),向上游外延74个碱基,向下游外延23个碱基,合成单链Oligo donor DNA(oligo donor DNA),总长120个碱基,核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,具体如下:
5'-CTGCATAAATATGAACCTCAGGTTCATATAGTCCGTGTTGGAGGCGCCCATCGAATGGTCATGAACTGCTCATTTCCTGAAGCTCAGTTCATCGCTGTGACTGCCTATCAGAATGAGGAG-3'。
3、将gRNA、Cas9质粒(px330-T7-cas9质粒,上海南方模式生物科技股份有限公司自主构建)通过MEGAshortscript T7 kit(LifeTechnologies)体外转录试剂盒进行体外转录,得到进行显微注射的Cas9 mRNA、有活性的gRNA,并通过MEGAclear kit试剂盒进行纯化回收。
Cas9 mRNA合成过程:
1)酶切实验:将px330-T7-cas9质粒进行单酶切。酶切体系如下:px330-T7-cas9质粒5μg,10×Buffer 10μl,限制性内切酶XbaI 5μl,ddH2O补足至100μl。酶反应:37℃金属浴或恒温水浴2h;酶失活:65℃金属浴或恒温水浴20min。
2)纯化实验:
(1)酶切反应结束后,取2μl进行凝胶电泳实验,确认酶切是否完全。拿环状质粒进行对照。
(2)DNA纯化回收实验:
①加入200μl的无水乙醇,缓慢颠倒30s,直到出现絮状悬浮物;
②将加入乙醇的EP管在13000rpm转速下离心5min;
③离心完毕后,倒掉液体,加入75%乙醇清洗(不要洗掉管底沉淀物),清洗完倒掉乙醇,此步重复2次;
④烘干管中残留的乙醇,加入50μl ddH2O,在56℃溶解DNA,待充分溶解后测定浓度。
3)转录实验:按照ThermoFisher mMESSAGE mMACHINE™ T7 ULTRA 转录试剂盒(购自Thermo Fisher,货号为AM1345)使用说明进行实验。
4)RNA纯化回收实验:按照ThermoFisher MEGAclear™ 转录纯化试剂盒(购自TherThermo Fisher,货号为AM1908)使用说明进行实验。
最终的到转录好的Cas9 mRNA,进行凝胶电泳实验观察转录质量并测定浓度。电泳结果如图3所示。
三、TBX19 Thr187Ala的小鼠动物模型构建过程:
1)将上述体外转录的有活性的将Cas9 mRNA、gRNA和单链Oligo donor DNA按照本领域常规注入剂量显微注射入小鼠受精卵中,注射体系如下:Cas9 mRNA 0.5μg,gRNA 0.2μg,单链Oligo donor DNA 10μg,缓冲液补足至100ml;所述缓冲液由20μL 0.5mol/L的EDTA(pH=8.0)和1000uL 1mol/L的Tris-HCL组成(pH=7.5)。
按照《小鼠胚胎操作实验手册(第三版)》中的方法进行胚胎的显微注射,取注射后存活的受精卵移植到受体母鼠(ICR小鼠)体内,产出小鼠,即为F0代小鼠。
2)提取F0代小鼠尾部基因组DNA,PCR扩增并将产物进行测序鉴定,获得阳性F0代小鼠或疑似阳性F0代小鼠;由于胚胎早期卵裂速度很快,因此得到的F0小鼠为嵌合体。故以F0小鼠鼠尾DNA进行鉴定得到的F0基因型仅供参考,不能代表其一定为可遗传的基因突变型,可遗传的基因型需待F1小鼠基因型鉴定后确定。F0代小鼠基因型鉴定具体过程如下:
①鉴定引物设计:
引物设计原则如图4所示,两条引物(引物Ⅰ和引物Ⅱ)的前端和后端分别设计在TBX19基因的内含子2和内含子3中,通过扩增可以获取编辑后的完整序列。
②引物的核苷酸序列如下所示:
TBX19-F(引物Ⅰ):5'-CTGAACGTAGATGAATCCAGAA-3'(SEQ ID NO.4);
TBX19-R(引物Ⅱ):5'-TCCTCAAAACTCTAAATTCCGT-3'(SEQ ID NO.5);
③PCR扩增条件如下所示:
反应体系:ddH2O 13.2µl、PrimeStar GXL PCR Buffer(R050A,Takara)2µl、2.5mM的dNTP 2µl、TBX19-F(10pmol/µl)0.5µl、TBX19-R(10pmol/µl)0.5µl、PrimeStar GXLDNA Polymerase*(TaKaRa,R050A)0.8µl和基因组DNA 1µl。
反应条件:94预变性3 min;98变性15s,58退火15s,68延伸20s,共35个循环;68终延伸5min。
④F0代小鼠鼠尾基因型鉴定,首先对PCR扩增产物进行凝胶电泳,结果如图5所示,结果可知,通过PCR扩展可以特异地获得目标片段。对PCR产物进行Sanger测序获得目标片段的核苷酸序列。
测序引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
通过PCR鉴定和测序结果,确定突变的阳性F0代小鼠。共注射了16只小鼠,F0代得到11只野生型小鼠和5只点突变阳性小鼠。
3)将上述阳性F0代阳性小鼠与野生型异性小鼠交配获得F1代小鼠;提取F1代小鼠尾部DNA,PCR扩增并将产物进行测序鉴定,获得具有稳定基因型的阳性F1代小鼠。将阳性F1代小鼠杂交获得F2代小鼠,对F2代小鼠进行纯合子基因型的鉴定,获得F2代纯合子基因型的小鼠,即为TBX19基因Thr187Ala点突变小鼠动物模型。
F2代小鼠的基因型鉴定结果包括:纯合野生型小鼠如图6所述,杂合突变型小鼠如图7所述,纯合突变型小鼠如图8所述。
尽管上述实施例对本发明做出了详尽的描述,但它仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部实施例,人们还可以根据本实施例在不经创造性前提下获得其他实施例,这些实施例都属于本发明保护范围。

Claims (10)

1.一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的试剂盒,其特征在于,包括gRNA和单链Oligo donor DNA;所述gRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述单链Oligo donorDNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Cas9 mRNA和Cas9反应缓冲液。
3.权利要求1或2所述的试剂盒在构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型中的应用。
4.一种构建TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型的方法,其特征在于,包括以下步骤:
将Cas9 mRNA、gRNA、单链Oligo donor DNA和Cas9反应缓冲液混合,得到反应混合液;所述gRNA和单链Oligo donor DNA为权利要求1或2所述的试剂盒中的所述gRNA和单链Oligo donor DNA;
将所述反应混合液注射到小鼠受精卵中后,将注射后存活的受精卵移植到受体母鼠体内,产出F0代小鼠;
测定所述F0代小鼠的TBX19基因的基因型,得到突变的阳性F0代小鼠;
将所述突变的阳性F0代小鼠与野生型小鼠交配获得F1代小鼠;
测定所述F1代小鼠的TBX19基因的基因型,得到阳性F1代小鼠;
将所述阳性F1代小鼠杂交,获得含有纯合TBX19 p.Thr187Ala点突变的F2代小鼠。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述反应混合液中Cas9 mRNA的浓度为5ng/μl,gRNA的浓度为2ng/μl,单链Oligo donor DNA的浓度为100ng/μl。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述测定使用的引物包括:TBX19基因的扩增引物和测序引物。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述TBX19基因的扩增引物由上游引物和下游引物组成;所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,所述测序引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.4所示。
9.权利要求4~8任一项所述方法构建得到的TBX19 p.Thr187Ala点突变小鼠模型在1)~3)任一项中的应用:
1)作为观察下丘脑-垂体-肾上腺轴功能减弱的动物模型;
2)作为促肾上腺皮质激素缺乏症的动物模型;
3)作为促肾上腺皮质激素缺乏症药物研发的动物模型。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,2)所述的动物模型为促肾上腺皮质激素缺乏症发生和/或发展病程的动物模型。
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