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CN111836636A - 用于细胞免疫疗法的表观遗传修饰剂 - Google Patents

用于细胞免疫疗法的表观遗传修饰剂 Download PDF

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CN111836636A
CN111836636A CN201980018619.6A CN201980018619A CN111836636A CN 111836636 A CN111836636 A CN 111836636A CN 201980018619 A CN201980018619 A CN 201980018619A CN 111836636 A CN111836636 A CN 111836636A
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CN
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hdaci
cells
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population
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CN201980018619.6A
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马谢乐·沃伦
普雷斯顿·丹尼尔斯
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Viracta Therapeutics Inc
Original Assignee
Viracta Therapeutics Inc
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Abstract

本文描述了可用于增强基于细胞的免疫疗法的方法和组合物。增强的基于细胞的免疫疗法可用于治疗患有癌症和慢性病毒感染的个体。

Description

用于细胞免疫疗法的表观遗传修饰剂
相关申请的交叉引用
本申请要求于2018年1月12日提交的美国临时申请序列号62/616,791和于2018年1月17日提交的美国临时申请序列号62/618,455的权益，其全部内容通过引用并于本文。
发明背景
免疫疗法是一种用于治疗癌症和慢性病毒性疾病的新兴方法。免疫疗法基于使用免疫系统的分子或细胞成分。分子疗法包括重组细胞因子、趋化因子、抗体和其他免疫调节多肽、蛋白质或小分子。基于细胞的疗法包括施用淋巴细胞群体(例如抗原呈递细胞、NK细胞或T细胞)来调节患者的免疫反应，并指导其消除慢性病毒感染、恶性肿瘤或肿瘤。
发明内容
衰竭是许多基于细胞的免疫疗法的标志，也是其阻碍。衰竭是指免疫效应细胞对特定抗原产生应答的功能和有效性下降。在患有癌症或慢性病毒感染的个体中，通常会存在抗原特异性T细胞，然而当其衰竭时，会缺乏增殖、分泌辅助细胞因子/趋化因子或杀死显示抗原的靶细胞的能力。衰竭同时影响CD4+和CD8+T细胞。在基于细胞的疗法中采用的其他细胞(例如NK细胞)可能表现出衰竭迹象，其特征在于细胞因子分泌减少和靶细胞杀伤降低。通常，与未衰竭的细胞相比，衰竭的免疫效应细胞表现出表观遗传学差异。因此，使用适当的HDAC抑制剂(HDACi)处理衰竭的T细胞或NK细胞将逆转T细胞的衰竭并增强基于细胞的免疫疗法。本文描述了采用HDACi nanatinostat结合基于细胞的免疫疗法的方法，因此增强了该疗法及其在治疗与免疫细胞衰竭有关的疾病中的用途。
本文描述了使用HDACi增强基于细胞的免疫疗法的方法。与其他HDAC抑制剂相比，用于增强本文所述的免疫疗法的HDAC抑制剂显示出乎意料的优异结果和效力。在某些实施方案中，HDACi抑制组蛋白H3的脱乙酰化(例如，提高组蛋白H3的稳态乙酰化)。在各种实施方案中，可以在体外采用这些HDACi来处理用于过继性细胞疗法的淋巴细胞群体(例如，T细胞、NK细胞)。在某些情况下，可以在体外处理患者自己的细胞，之后再次施用于该患者。在其他实施方案中，可以从体外处理未从待治疗患者中分离的原代细胞群体或细胞系。在某些实施方案中，可以用HDACi处理来自HLA匹配供体的细胞。在某些实施方案中，可以用HDACi处理来自HLA错配的供体或细胞系的细胞。在某些特定的实施方案中，HDACi是nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。
在某些方面，本文描述了一种用于增强基于细胞的免疫疗法的方法，其包括使基于细胞的免疫疗法与HDAC抑制剂(HDACi)进行体外接触，其中HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。在某些实施方案中，该方法逆转T细胞衰竭。在某些实施方案中，HDACi的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。在某些实施方案中，HDACi的浓度小于约1微摩尔。在某些实施方案中，HDACi的浓度大于约400纳摩尔。在某些实施方案中，使HDACi与基于细胞的免疫疗法接触至少2小时。在某些实施方案中，使HDACi与基于细胞的免疫疗法接触至少16小时。在某些实施方案中，该方法包括使基于细胞的免疫疗法与白介素-15接触。在某些实施方案中，白介素-15以约1至约100ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，白介素-15以约5至约25ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，白介素-15以约10ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，该方法包括使基于细胞的免疫疗法与检查点抑制物接触。在某些实施方案中，检查点抑制物是靶向PDL-1或PD-1的抗体。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自健康个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体进一步包含嵌合抗原受体(CAR)。在某些实施方案中，该方法进一步包括用肿瘤相关抗原刺激T细胞群体。在某些实施方案中，该方法进一步包括用促炎细胞因子刺激T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体富含CD4阳性T细胞。在某些实施方案中，T细胞群体富含CD8阳性T细胞。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞群体中FoxP3的表达降低。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞群体中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞群体中CXCR3的细胞表面表达增加。在某些实施方案中，基于细胞的疗法包括T细胞系。在某些实施方案中，T细胞系包含嵌合抗原受体。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞系中FoxP3的表达降低。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞系中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞系中CXCR3的细胞表面表达增加。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括原代天然杀伤细胞群体。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括天然杀伤细胞系。在某些实施方案中，天然杀伤细胞系或群体包含嵌合抗原受体。在某些实施方案中，天然杀伤细胞系或群体包含高亲和力Fc受体。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，天然杀伤细胞系或群体中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，该方法进一步包括对患有疾病的个体施用基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法对于患有疾病的个体是自体的。在某些实施方案中，该疾病是癌症。在某些实施方案中，癌症是乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、肝癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌或前列腺癌。在某些实施方案中，癌症是白血病或淋巴瘤。在某些实施方案中，该疾病是慢性病毒性疾病。在某些实施方案中，慢性病毒性疾病由人类免疫缺陷病毒、人巨细胞病毒、爱泼斯坦-巴尔(Epstein-Barr)病毒、丙型肝炎病毒、乙型肝炎病毒或人乳头瘤病毒(HPV)引起。
在另一方面，本文描述了一种过继性细胞免疫疗法，其包括：a)使基于细胞的免疫疗法与HDAC抑制剂(HDACi)接触，其中HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；和b)对患有疾病的个体施用基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，使基于细胞的免疫疗法与HDACi进行体外接触。在某些实施方案中，HDACi的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。在某些实施方案中，HDACi的浓度小于约1微摩尔。在某些实施方案中，使HDACi与基于细胞的免疫疗法接触至少2小时。在某些实施方案中，使HDACi与基于细胞的免疫疗法接触至少16小时。在某些实施方案中，该方法包括使基于细胞的免疫疗法与白介素-15接触。在某些实施方案中，白介素-15以约1至约100ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，白介素-15以约5至约25ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，白介素-15以约10ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，该方法包括使基于细胞的免疫疗法与检查点抑制物接触。在某些实施方案中，检查点抑制物是靶向PDL-1或PD-1的抗体。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自健康个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体进一步包含嵌合抗原受体(CAR)。在某些实施方案中，该方法进一步包括用肿瘤相关抗原刺激T细胞群体。在某些实施方案中，该方法进一步包括用促炎细胞因子刺激T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体富含CD4阳性T细胞。在某些实施方案中，T细胞群体富含CD8阳性T细胞。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞群体中FoxP3的表达降低。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞群体中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞群体中CXCR3的细胞表面表达增加。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括T细胞系。在某些实施方案中，T细胞系包含嵌合抗原受体。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞系中FoxP3的表达降低。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞系中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，T细胞系中CXCR3的细胞表面表达增加。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括原代天然杀伤细胞群体。在一些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括天然杀伤细胞系。在某些实施方案中，天然杀伤细胞系或群体包含嵌合抗原受体。在某些实施方案中，天然杀伤细胞系或群体包含高亲和力Fc受体。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，天然杀伤细胞系或群体中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，该疾病是癌症。在某些实施方案中，癌症是乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、肝癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌或前列腺癌。在某些实施方案中，癌症是白血病或淋巴瘤。在某些实施方案中，该疾病是慢性病毒性疾病。在某些实施方案中，慢性病毒性疾病是由人类免疫缺陷病毒、人巨细胞病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、丙型肝炎病毒或乙型肝炎病毒或人乳头瘤病毒(HPV)引起。
在另一个方面，本文描述了包含HDAC抑制剂(HDACi)的细胞培养基，其中HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。在某些实施方案中，细胞培养基不包含非人类来源的血清。在某些实施方案中，细胞培养基不包含血清。在某些实施方案中，细胞培养基包括使基于细胞的免疫疗法与白介素-15接触。在某些实施方案中，白介素-15以约1至约100ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，白介素-15以约5至约25ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，白介素-15以约10ng/mL的浓度与基于细胞的免疫疗法接触。在某些实施方案中，细胞培养基包括使基于细胞的免疫疗法与检查点抑制物接触。在某些实施方案中，检查点抑制物是靶向PDL-1或PD-1的抗体。在某些实施方案中，细胞培养基进一步包括基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自健康个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体进一步包含嵌合抗原受体(CAR)。在某些实施方案中，细胞培养基进一步包含肿瘤相关抗原。在某些实施方案中，细胞培养基进一步包含促炎细胞因子。在某些实施方案中，T细胞群体富含CD4阳性T细胞。在某些实施方案中，T细胞群体富含CD8阳性T细胞。在一些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞群体中FoxP3的表达降低。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞群体中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞群体中CXCR3的细胞表面表达增加。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括T细胞系。在某些实施方案中，T细胞系包含嵌合抗原受体。在某些实施方案中，使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞系中FoxP3的表达降低。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞系中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞系中CXCR3的细胞表面表达增加。在某些实施方案中，基于细胞的疗法包括天然杀伤细胞系或原代天然杀伤细胞群体。在某些实施方案中，天然杀伤细胞系或群体包含嵌合抗原受体。在某些实施方案中，天然杀伤细胞系或群体包含高亲和力Fc受体。在某些实施方案中，在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，天然杀伤细胞系中干扰素γ的分泌增加。在某些实施方案中，该培养基用于抑制或逆转T细胞衰竭的方法中。在某些实施方案中，该培养基用于治疗患有疾病的个体的方法中。在某些实施方案中，该疾病是癌症。在某些实施方案中，癌症是乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、肝癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌或前列腺癌。在某些实施方案中，癌症是白血病或淋巴瘤。在某些实施方案中，该疾病是慢性病毒性疾病。在某些实施方案中，慢性病毒性疾病由人类免疫缺陷病毒、人巨细胞病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、丙型肝炎病毒或乙型肝炎病毒或人乳头瘤病毒(HPV)引起。
另一方面，本文描述了一种在个体中治疗人类免疫缺陷(HIV)感染的方法，其包括：向患有HIV感染的个体施用有效量的nanatinostat，其中患有HIV感染的个体的HIV病毒载量为每毫升血液少于1000个HIV RNA拷贝。在某些实施方案中，个体的HIV病毒载量为每毫升少于100个HIV RNA拷贝。在某些实施方案中，nanatinostat以小于80mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，nanatinostat以小于40mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，nanatinostat以小于20mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，该方法进一步包括对患有HIV感染的个体施用抗HIV治疗。在某些实施方案中，该方法进一步包括对患有HIV感染的个体施用抗HIV治疗。在某些实施方案中，抗HIV治疗包括抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐选自阿巴卡韦(Abacavir)、阿扎那韦(Atazanavir)、达芦那韦(Darunavir)、度鲁特韦(Dolutegravir)、依法韦伦(Efavirenz)、埃替拉韦(Elvitegravir)、恩曲他滨(Emtricitabine)、依曲韦林(Etravirine)、呋山那韦(Fosamprenavir)、拉米夫定(Lamivudine)、洛匹那韦(Lopinavir)、马拉韦罗(Maraviroc)、奈韦拉平(Nevirapine)、雷特格韦(Raltegravir)、利匹韦林(Rilpivirine)、利托那韦(Ritonavir)、替诺福韦(Tenofovir)、齐多夫定(Zidovudine)及其组合。在某些实施方案中，抗HIV治疗包括免疫疗法。在某些实施方案中，免疫疗法包含与HIV衍生的多肽结合的抗体。在某些实施方案中，免疫疗法包括T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。在某些实施方案中，T细胞群体是特异性地裂解HIV感染的细胞的细胞毒性T细胞群体。在某些实施方案中，免疫疗法包括天然杀伤细胞群体。在某些实施方案中，天然杀伤细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。在某些实施方案中，在向患有HIV感染的个体施用之前，使免疫疗法与组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)进行体外接触。在某些实施方案中，HDACi包括nanatinostat、quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他(Belinostat)/PXD101、曲古抑菌素(trichostatin)A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他(Givinostat)/ITF2357、罗米地新(romidepsin)、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他(Entinostat)/MS-275/SNDX-275、莫西司他(mocetinostat)/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯(aroyl pyrrolyl hydroxamides)或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺(chidamide)或4SC-202。在某些实施方案中，HDACi包括nanatinostat。在某些实施方案中，HDACI的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。在某些实施方案中，HDACi的浓度小于约1微摩尔。在某些实施方案中，使HDACi与免疫疗法接触至少2小时。在某些实施方案中，使HDACi与免疫疗法接触至少16小时。在某些实施方案中，患有HIV感染的个体先前已接受抗HIV治疗。在某些实施方案中，抗HIV治疗是抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。
在另一方面，本文描述了一种治疗个体的人类免疫缺陷(HIV)感染的方法，其包括：向患有HIV感染的个体施用有效量的组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)，其中HDACi包括nanatinostat、quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202，其中感染HIV的个体的HIV病毒载量为每毫升血液少于1000个HIV RNA拷贝。在某些实施方案中，个体的HIV病毒载量为每毫升少于100个HIV RNA拷贝。在某些实施方案中，HDACi以小于80mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，HDACi以小于40mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，HDACi以小于20mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，该方法进一步包括对患有HIV感染的个体施用抗HIV治疗。在某些实施方案中，抗HIV治疗包括抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐选自阿巴卡韦、阿扎那韦、达芦那韦、度鲁特韦、依法韦伦、埃替拉韦、恩曲他滨、依曲韦林、呋山那韦、拉米夫定、洛匹那韦、马拉韦罗、奈韦拉平、雷特格韦、利匹韦林、利托那韦、替诺福韦、齐多夫定及其组合。在某些实施方案中，抗HIV治疗包括免疫疗法。在某些实施方案中，免疫疗法包括与HIV衍生的多肽结合的抗体。在某些实施方案中，免疫疗法包括T细胞群体。在某些实施方案中，T细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。在某些实施方案中，T细胞群体是特异性地裂解HIV感染的细胞的细胞毒性T细胞群体。在某些实施方案中，免疫疗法包括天然杀伤细胞群体。在某些实施方案中，天然杀伤细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。在某些实施方案中，在向患有HIV感染的个体施用之前，使免疫疗法与nanatinostat进行体外接触。在某些实施方案中，nanatinostat的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。在某些实施方案中，nanatinostat的浓度小于约1微摩尔。在某些实施方案中，使nanatinostat与免疫疗法接触至少2小时。在某些实施方案中，使nanatinostat与免疫疗法接触至少16小时。在某些实施方案中，患有HIV感染的个体先前已接受抗HIV治疗。在某些实施方案中，抗HIV治疗是抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。
另一方面，本文描述了一种用于治疗患有潜伏病毒感染的个体的方法，其包括：a)向患有潜伏病毒感染的个体施用第一组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)；b)使基于细胞的免疫疗法与第二HDACi进行体外接触，其中第二HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；以及c)对患有潜伏病毒感染的个体施用基于细胞的免疫疗法。
另一个方面，本文描述了一种用于治疗患有潜伏病毒感染的个体的方法，其包括：a)向患有潜伏病毒感染的个体施用第一组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)，其中第一HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；b)使基于细胞的免疫疗法与第二HDACi进行体外接触；以及c)对患有潜伏病毒感染的个体施用基于细胞的免疫疗法。
援引并入
本说明书中所提到的所有出版物、专利和专利申请均通过引用并入本文，其程度如同特别地且单独地指出每个单独的出版物、专利或专利申请通过引用而并入。
附图说明
本文所述的新特征在随附的权利要求书中具体阐述。通过参考以下对在其中利用到本文所述特征的原理的说明性实例加以阐述的详细描述和附图，将会获得对本文所述特征和优点的更好的理解，在附图中：
图1A示出了来自用恩替司他(1μM)或nanatinostat(1nM、500nM、100nM、1nM)处理的BALB/c脾细胞的定量FAC数据(CD4+、CD25+、FoxP3+百分比)。
图1B示出了来自用1μM、500nM或100nM的nanatinostat处理的BALB/c脾细胞的定量FAC数据。
图2示出了接种CT26肿瘤细胞系并用抗PD-1和nanatinostat组合处理的小鼠的平均肿瘤体积。
图3A和图3B示出了接种4T1肿瘤细胞系并用抗PD-1和nanatinostat组合处理的小鼠的平均肿瘤体积。
图3A示出了用10mg/kg的nanatinostat和10mg/kg的抗PD-1(填充图形)处理的小鼠。
图3B示出了用25mg/kg的nanatinostat和10mg/kg的抗PD-1(填充图形)处理的小鼠。
图4示出了如所示处理的小鼠的肿瘤中CD8+T细胞的百分比。
图5A示出了如所示处理的小鼠的肿瘤中CD4+/CXCR3+T细胞的百分比。
图5B示出了如所示处理的小鼠的肿瘤中CD8+/CXCR3+T细胞的百分比。
图6A示出了在如所示处理的小鼠的肿瘤中TGFβ的基因表达。
图6B示出了在如所示处理的小鼠的肿瘤中Stat6的基因表达。
图7A示出了在如所示处理的小鼠的肿瘤中IFN-γ的基因表达。
图7B示出了在如所示处理的小鼠的肿瘤中Tbet的基因表达。
图8示出了在如所示处理的小鼠的肿瘤中Klrc2的基因表达。
图9A、9B和9C示出了抗PD-1和nanatinostat处理对细胞增殖的影响。
图9A示出了用CEFT肽刺激10天的分离的PBMC。在此期间，使用3H-胸苷监测增殖直至细胞衰竭。
图9B示出了在对照和经恩替司他处理的细胞中增殖的CD8+细胞的百分比。
图9C示出了联合和未联合αPD-1疗法的nanatinostat对增殖的CD8+细胞百分比的影响。黑色实线表示CEFT对照，虚线代表抗PD-1处理的对照。
图10A和10B示出了抗PD-1和nanatinostat处理对细胞生存力的影响。
图10A示出了对照和恩替司他处理的细胞中活细胞的百分比。
图10B示出了联合和未联合抗PD-1疗法的nanatinostat对活细胞的百分比的影响。黑色实线表示CEFT对照，虚线表示抗PD-1处理的对照。
图11A和11B示出了抗PD-1和nanatinostat处理对CD8+T细胞释放IFN-γ的影响。
图11A示出了在对照和恩替司他处理的细胞中分泌IFNγ的CD8+细胞的百分比。
图11B示出了联合和未联合抗PD-1疗法的nanatinostat对分泌IFNγ的CD8+细胞的百分比的影响。黑色实线表示CEFT对照，虚线表示抗PD-1处理的对照。
图12A、12B和12C示出了抗PD-1和nanatinostat处理对IFN-γ、TNFα和TGFβ的影响。分离的PBMC用CEFT刺激衰竭10天，然后再用moDC和CEFT肽再刺激，使用化合物处理4天。进行Luminex分析并测定IFN-γ(图12A)、TNFα(图12B)和TGFβ(图12C)的水平。虚线表示所示的抗PD-1对照处理和媒介物对照处理。
具体实施方式
在某些方面，本文描述了一种增强基于细胞的免疫疗法的方法，其包括使基于细胞的免疫疗法与HDAC抑制剂(HDACi)进行体外接触，其中HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。
在另一方面，本文描述了一种过继性细胞免疫疗法，其包括：a)使基于细胞的免疫疗法与HDAC抑制剂(HDACi)接触，其中HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；和b)对患有疾病的个体施用基于细胞的免疫疗法。
在另一方面，本文描述了包含HDAC抑制剂(HDACi)的细胞培养基，其中HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。
本文提供用于治疗和/或预防有需要的个体的疾病的方法。在某些实施方案中，该疾病是癌症。在某些实施方案中，治疗可以包括使基于细胞的免疫疗法与有效量的HDACi进行体外接触的步骤。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法包括T细胞(CD4+或CD8+)。在某些实施方案中，该方法进一步包括向患有癌症的患者施用已经进行体外接触的基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。
本文还提供了用于治疗和/或预防有需要的个体的疾病的组合物和细胞培养基。在某些实施方案中，该疾病是癌症。在某些实施方案中，该疾病与癌症有关。在某些实施方案中，该组合物包含悬浮在细胞培养基中的HDAC抑制剂。在某些实施方案中，HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。在某些实施方案中，细胞培养基包括基于细胞的免疫疗法。
在另一方面，本文描述了一种在个体中治疗人类免疫缺陷(HIV)感染的方法，其包括：向患有HIV感染的个体施用有效量的nanatinostat，其中患有HIV感染的个体的HIV病毒载量为每毫升血液少于1000个HIV RNA拷贝。
在另一方面，本文描述了一种用于治疗患有潜伏病毒感染的个体的方法，其包括：a)向患有潜伏病毒感染的个体施用第一组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)；b)使基于细胞的免疫疗法与第二HDACi进行体外接触，其中第二HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；以及c)对患有潜伏病毒感染的个体施用基于细胞的免疫疗法。
在另一方面，本文描述了一种用于治疗患有潜伏病毒感染的个体的方法，其包括：a)向患有潜伏病毒感染的个体施用第一组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)，其中第一种HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；b)使基于细胞的免疫疗法与第二HDACi进行体外接触；以及c)对患有潜伏病毒感染的个体施用基于细胞的免疫疗法。
如本文所用的术语“约”是指在所述量的10％以内的数值。
术语“包括”、“包含”旨在赋予它们广泛的含义，并且可以意指“包含”、“包括”等。
术语“受试者”、“患者”或“个体”在本文中可互换使用，并且是指被诊断患有本文所述病症、患有本文所述病症、存在患上本文所述病症的风险、怀疑患有本文所述病症的人类个体，包括可能无症状或有前驱症状的个体。在某些实施方案中，个体是指基于细胞的治疗剂的供体或来源。
如本文所用的术语“治疗”或“处理”以及其他语法等同词包括缓解、抑制或减轻症状，降低或抑制疾病或病况的严重性，降低疾病或病况的发病率，对疾病或病况的预防性治疗，减少或抑制疾病或病况的复发，延迟疾病或病况的发作，延迟疾病或病况的复发，缓和或改善疾病或病况症状，改善症状的潜伏代谢病因，抑制疾病或病况例如阻止疾病或病况的发展，减轻疾病或病况，导致疾病或病况消退，减轻由疾病或病况引起的病况，或停止疾病或病况的症状。该术语还包括实现治疗益处。治疗益处是指根除或改善所治疗的潜伏病症，和/或根除或改善与潜伏病症相关的一种或多种生理症状，使得在患者中观察到改善。
如本文所用的术语“预防”或“防止”以及其他语法等同词包括预防其他症状、预防症状的潜伏代谢病因、抑制疾病或病况例如阻止疾病或病况的发展，并且旨在包括预防。该术语还包括实现防治益处。为了防治益处，任选地将组合物施用于处于发展特定疾病风险下的患者、报告了疾病的一种或多种生理学症状的患者或处于疾病复发风险下的患者。
如本文所用的术语“有效量””或“治疗有效量”是指达到所期望的结果，例如在一定程度上减轻所治疗的疾病或病况的一种或多种症状的足量的至少一种所施用的药剂。在某些情况下，该结果为减轻和/或缓解疾病的体征、症状或病因，或生物系统的任何其他所期望的改变。在某些情况下，用于治疗用途的“有效量”是提供疾病的临床上显著的降低所需的包含如本文所述的药剂的组合物的量。使用任何合适的技术如剂量递增研究来确定任何个别情况下适当的“有效”量。
如本文所用的术语“施用”、“给药”等是指用于使药剂或组合物能够递送至所需的生物作用部位的方法。这些方法包括但不限于口服途径、十二指肠内途径、肠胃外注射(包括静脉内、皮下、腹膜内、肌肉内、血管内或输注)。在一些情况下与本文所述的药剂和方法一起使用的施用技术包括例如在Goodman和Gilman,The Pharmacological Basis ofTherapeutics(当前版本),Pergamon；和Remington’s,Pharmaceutical Sciences(当前版本)，Mack Publishing Co.,Easton，Pa中所讨论的。在某些实施方案中，本文所述的药剂和组合物口服施用。在一些实施方案中，本文所述的组合物肠胃外施用。
在一些实施方案中，本文的组合物和方法将“基本上”由所列举的步骤或组分组成。这意味着基本上由……组成是指所述步骤或组分有助于功能或治疗效果，并且不包括有助于该功能或治疗效果的其他组分或步骤。基本上由……组成的方法可以包括对于基于细胞的免疫疗法的功能或治疗效果不是必需的步骤；非限制性实例包括纯化/分离步骤、细胞扩增步骤、细胞维持步骤、化学品、添加用于达到一定张力的化学品、维生素补充剂、pH缓冲剂或调节剂、能源、脂肪酸、糖、多肽、蛋白质、生长因子、添加用于维持/扩增培养中的细胞的饲养细胞。基本上由……组成的组合物可以包含对于基于细胞的免疫疗法的功能或治疗效果不是必需的组分；非限制性实例包括化学品，添加用于达到一定张力的化学品、维生素补充剂、pH缓冲剂或调节剂、能源、脂肪酸、糖、多肽、蛋白质、生长因子和添加用于维持/扩增培养中的细胞的饲养细胞。
HDAC抑制剂
提供的本发明的方法包括使用本文提供的包含HDAC抑制剂(HDACi)的一种或多种组合物或方法。使HDAC抑制剂与基于细胞的免疫疗法接触，以逆转衰竭现象或增强疗法。HDACi可以与基于细胞的免疫疗法共培养，或者可将HDACi施用给个体，然后再从该个体分离出淋巴细胞、T细胞或NK细胞。可将随后分离的淋巴细胞、T细胞或NK细胞从外周血单核细胞(PBMC)或直接从肿瘤(肿瘤浸润淋巴细胞)分离。
对于体外应用(例如施用于细胞培养基中)，可以用有效量的HDACi处理或接触基于细胞的免疫疗法。有效量是导致组蛋白乙酰化增加的量。在某个实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3。在某些实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3，并且增加的乙酰化在赖氨酸9处。在某些实施方案中，用浓度小于约10μM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约5μM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约2μM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约1μM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约900nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约800nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用小于约700nM的HDACi浓度处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约600nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约500nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约400nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约300nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约200nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约100nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约50nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约1nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约2nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约5nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约10nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约100nM的HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，施用的HDACi在约1nM至约5μM之间、约1nM至约2μM之间、约1nM至约1μM之间、约1nM至约900nM之间、约1nM至约800nM之间、约1nM至约700nM之间、约1nM至约600nM之间、约1nM至约500nM之间、约1nM至约400nM之间、约1nM至约300nM之间、约1nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约1nM至约50nM之间、约1nM至约25nM之间、约10nM至约5μM之间、约10nM至约2μM之间、约10nM至约1μM之间、约10nM至约900nM之间、约10nM至约800nM之间、约10nM至约700nM之间、约10nM至约600nM之间、约10nM至约500nM之间、约10nM至约400nM之间、约10nM至约300nM之间、约10nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约10nM至约50nM之间、约10nM至约25nM之间。HDACi可以与基于细胞的免疫疗法一起温育约1、2、4、8、16、24或48小时。HDACi可以与基于细胞的免疫疗法一起温育至少约1、2、4、8、16、24或48小时。HDACi可以与基于细胞的免疫疗法一起温育不超过约1、2、4、8、16、24或48小时。
在某些实施方案中，HDACi包括组蛋白脱乙酰酶复合物抑制剂(HDACi)，其中HDACi包括quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202。
对于体内应用，在从患者体内分离细胞之前，可以用有效量的HDACi治疗患者。在某些实施方案中，HDAC抑制剂以小于400mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，HDAC抑制剂以约1mg/天、约2mg/天、约5mg/天、约10mg/天、约15mg/天、约20mg/天、约25mg/天、约30mg/天、约35mg/天、约40mg/天、约45mg/天、约50mg/天、约60mg/天、约70mg/天、约80mg/天、约90mg/天、约100mg/天、约120mg/天、约125mg/天、约140mg/天、约150mg/天、约160mg/天、约175mg/天、约180mg/天、约190mg/天、约200mg/天、约225mg/天、约250mg/天、约275mg/天、约300mg/天、约325mg/天、约350mg/天、约375mg/天、约400mg/天、约425mg/天、约450mg/天、约475mg/天或约500mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，HDAC抑制剂以小于1mg/天、小于2mg/天、小于5mg/天、小于10mg/天、小于15mg/天、小于20mg/天、小于25mg/天、小于30mg/天、小于35mg/天、小于40mg/天、小于45mg/天、小于50mg/天、小于60mg/天、小于70mg/天、小于80mg/天、小于90mg/天、小于100mg/天、小于120mg/天、小于125mg/天、小于140mg/天、小于150mg/天、小于160mg/天、小于175mg/天、小于180mg/天、小于190mg/天、小于200mg/天、小于225mg/天、小于250mg/天、小于275mg/天、小于300mg/天、小于325mg/天、小于350mg/天、小于375mg/天、小于400mg/天、小于425mg/天、小于450mg/天、小于475mg/天或小于500mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，HDAC抑制剂以大于1mg/天、大于2mg/天、大于5mg/天、大于10mg/天、大于15mg/天、大于20mg/天、大于25mg/天、大于30mg/天、大于35mg/天、大于40mg/天、大于45mg/天、大于50mg/天、大于60mg/天、大于70mg/天、大于80mg/天、大于90mg/天、大于100mg/天、大于120mg/天、大于125mg/天、大于140mg/天、大于150mg/天、大于160mg/天、大于175mg/天、大于180mg/天、大于190mg/天、大于200mg/天、大于225mg/天、大于250mg/天、大于275mg/天、大于300mg/天、大于325mg/天、大于350mg/天、大于375mg/天、大于400mg/天、大于425mg/天、大于450mg/天、大于475mg/天或大于500mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，HDAC抑制剂以大于1mg/天且小于500mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，HDAC抑制剂以大于20mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，HDAC抑制剂每天一次(q.d.)、每天两次(b.i.d.)或每天三次(t.i.d.)施用。在一些实施方案中，HDAC抑制剂每天一次、每周一次、每周两次、每周三次、每周四次或每周五次施用。
在某些实施方案中，HDACi包括组蛋白脱乙酰酶复合物抑制剂(HDACi)，其中HDACi包括quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202。
对于体外应用(例如施用于细胞培养基中)，可以用有效量的I类HDACi处理或接触基于细胞的免疫疗法。在一些实施方案中，I类HDACi是Nanatinostat(也称为Nstat、tractinostat、VRx-3996或CHR-3996)。Nanatinostat的化学式为(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。Nanatinostat为选择性I类HDAC抑制剂，且在美国专利号7,932,246中公开，该专利的全文通过引用并入本文。有效量是在基于细胞的免疫治疗剂中导致组蛋白乙酰化增加的量。在某个实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3。在某些实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3，并且增加的乙酰化在赖氨酸9处。在某些实施方案中，用浓度小于约10μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约5μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约2μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约1μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约900nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约800nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约700nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约600nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约500nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约400nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约300nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约200nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约100nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约50nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约1nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约2nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约5nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约10nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约100nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，施用的nanatinostat在约1nM至约5μM之间、约1nM至约2μM之间、约1nM至约1μM之间、约1nM至约900nM之间、约1nM至约800nM之间、约1nM至约700nM之间、约1nM至约600nM之间、约1nM至约500nM之间、约1nM至约400nM之间、约1nM至约300nM之间、约1nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约1nM至约50nM之间、约1nM至约25nM之间、约10nM至约5μM之间、约10nM至约2μM之间、约10nM至约1μM之间、约10nM至约900nM之间、约10nM至约800nM之间、约10nM至约700nM之间、约10nM至约600nM之间、约10nM至约500nM之间、约10nM至约400nM之间、约10nM至约300nM之间、约10nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约10nM至约50nM之间、约10nM至约25nM之间。在某些实施方案中，用浓度为约1μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约900nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约800nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约700nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约600nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约500nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约400nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约300nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约200nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度为约100nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。
在某些实施方案中，用浓度为约100nM至约1,000nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用以下浓度的nanatinostat来处理基于细胞的免疫疗法：约100nM至约200nM、约100nM至约300nM、约100nM至约400nM、约100nM至约500nM、约100nM至约600nM、约100nM至约700nM、约100nM至约800nM、约100nM至约900nM、约100nM至约1,000nM、约200nM至约300nM、约200nM至约400nM、约200nM至约500nM、约200nM至约600nM、约200nM至约700nM、约200nM至约800nM、约200nM至约900nM、约200nM至约1,000nM、约300nM至约400nM、约300nM至约500nM、约300nM至约600nM、约300nM至约700nM、约300nM至约800nM、约300nM至约900nM、约300nM至约1,000nM、约400nM至约500nM、约400nM至约600nM、约400nM至约700nM、约400nM至约800nM、约400nM至约900nM、约400nM至约1,000nM、约500nM至约600nM、约500nM至约700nM、约500nM至约800nM、约500nM至约900nM、约500nM至约1,000nM、约600nM至约700nM、约600nM至约800nM、约600nM至约900nM、约600nM至约1,000nM、约700nM至约800nM、约700nM至约900nM、约700nM至约1,000nM、约800nM至约900nM、约800nM至约1,000nM或约900nM至约1,000nM。在某些实施方案中，用以下浓度的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法：约100nM、约200nM、约300nM、约400nM、约500nM、约600nM、约700nM、约800nM、约900nM或约1,000nM。在某些实施方案中，用以下浓度的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法：至少约100nM、约200nM、约300nM、约400nM、约500nM、约600nM、约700nM、约800nM或约900nM。在某些实施方案中，用以下浓度的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法：不超过约200nM、约300nM、约400nM、约500nM、约600nM、约700nM、约800nM、约900nM或约1,000nM。
Nanatinostat可以与基于细胞的免疫疗法一起温育约1、2、4、8、16、24或48小时。Nanatinostat可以与基于细胞的免疫疗法一起温育至少约1、2、4、8、16、24或48小时。Nanatinostat可以与基于细胞的细胞一起温育不超过约1、2、4、8、16、24或48小时。
对于体内应用，可以用有效量的I类HDAC抑制剂治疗患者。在一些实施方案中，I类HDACi是nanatinostat。在某些实施方案中，nanatinostat以40mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以约1mg/天、约2mg/天、约5mg/天、约10mg/天、约15mg/天、约20mg/天、约25mg/天、约30mg/天、约35mg/天、约40mg/天、约45mg/天、约50mg/天、约60mg/天、约70mg/天、约80mg/天、约90mg/天或约100mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，nanatinostat以小于1mg/天、小于2mg/天、小于5mg/天、小于10mg/天、小于15mg/天、小于20mg/天、小于25mg/天、小于30mg/天、小于35mg/天、小于40mg/天、小于45mg/天、小于50mg/天、小于60mg/天、小于70mg/天、小于80mg/天、小于90mg/天或小于100mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以大于1mg/天、大于2mg/天、大于5mg/天、大于10mg/天、大于15mg/天、大于20mg/天、大于25mg/天、大于30mg/天、大于35mg/天、大于40mg/天、大于45mg/天、大于50mg/天、大于60mg/天、大于70mg/天、大于80mg/天、大于90mg/天或大于100mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，nanatinostat以大于30mg/天且小于50mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以大于5mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以大于10mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以大于20mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以约1mg/天、约2mg/天、约5mg/天、约6mg/天、约7mg/天、约8mg/天、约9mg/天、约10mg/天、约11mg/天、约12mg/天、约13mg/天、约14mg/天、约15mg/天、约16mg/天、约17mg/天、约18mg/天、约19mg/天、约20mg/天、约22mg/天、约23mg/天、约25mg/天、约27mg/天、约28mg/天、约30mg/天、约32mg/天、约33mg/天、约35mg/天、约40mg/天、约45mg/天、约50mg/天、约60mg/天、约70mg/天、约80mg/天、约90mg/天或约100mg/天的剂量施用。在某些实施方案中，nanatinostat每天一次(q.d.)、每天两次(b.i.d.)或每天三次(t.i.d.)施用。在一些实施方案中，nanatinostat每天一次、每周一次、每周两次、每周三次、每周四次或每周五次施用。
基于细胞的免疫疗法
本文所述的HDACi用于增强基于细胞的疗法的方法中。HDACi可以在体外应用于培养中的基于细胞的免疫疗法。这些基于细胞的免疫疗法可以由从待治疗的患者或与HLA匹配的供体分离的细胞群体制备。HDACi可用于处理来自非HLA匹配供体的细胞系或原代细胞群体。可替代地，在分离用于制造基于细胞的免疫疗法的细胞群体之前，可将HDACi用于治疗患者或健康的供体。
在某些实施方案中，本文所述的方法是增强基于T细胞的免疫疗法的方法。在某些实施方案中，本文所述的方法是在基于细胞的免疫疗法中增加IFN-γ表达或分泌的方法。在某些实施方案中，本文所述的方法是在基于细胞的免疫疗法中增加TNFα表达或分泌的方法。在某些实施方案中，本文所述的方法是在基于细胞的免疫疗法中减少TGFβ表达或分泌的方法。
基于细胞的免疫疗法通常包括免疫效应细胞，例如T细胞和NK细胞，以及抗原呈递细胞(例如巨噬细胞、树突细胞和B细胞)。本文公开的HDACi可用于增强这些基于细胞的免疫疗法。基于细胞的免疫疗法可以是包含T细胞、T细胞群体或T细胞系的一种或多种过继转移的淋巴细胞群体。可替代地，基于细胞的免疫疗法可以是NK细胞、NK细胞群体或NK细胞系。在某些实施方案中，增强的基于细胞的免疫疗法是经历过抗原并已被变得在功能上无反应性、功能缺陷或衰竭的细胞群体。可以通过针对靶细胞群体的细胞毒性、至肿瘤/感染部位的转运、IFN-γ表达/分泌、CXCR3表达或T-bet的水平降低来证明T细胞的衰竭(或功能缺陷)。还可以通过以FoxP3转录因子表达为标志的高水平的调节性T细胞(TREG)来证明T细胞或T细胞应答的功能缺陷。可以通过针对靶细胞群体的细胞毒性以及IFN-γ或GMCSF、穿孔素或粒酶B的表达分泌的水平降低；或FasL或TRAIL的表达降低来证明NK细胞的衰竭(或功能缺陷)。在某些实施方案中，基于细胞的免疫疗法可以是治疗性疫苗。
基于T细胞的疗法
在某些实施方案中，本文中将要用HDACi处理的基于细胞的免疫疗法是淋巴细胞群体。在某些实施方案中，淋巴细胞群体衍生自从个体循环中分离的外周血单核细胞(PBMC)。在某些实施方案中，淋巴细胞群体衍生自从个体的肿瘤(肿瘤浸润淋巴细胞)分离的淋巴细胞。在某些实施方案中，淋巴细胞群体包括T淋巴细胞(T细胞)。这些细胞群体可以是异质性的，包含多种淋巴细胞，或者它们也可以使用密度离心(例如Percoll)、荧光激活细胞分选(FACS)、白细胞去除术或基于抗体的选择方法(阳性或阴性)进一步分离/纯化。T细胞通常可以通过CD3的表达来标记，并进一步细分为细胞毒性(CD8+)或辅助(CD4+)群体。当分离/纯化时，细胞群体可以包含纯度至少为80％、90％或95％的CD3+细胞。在某些实施方案中，该群体包含纯度至少为80％、90％或95％的CD3+、CD4+T细胞。在某些实施方案中，该群体包含纯度至少为80％、90％或95％的CD3+、CD8+T细胞。可以进一步分离和选择T细胞群体以用于低表达的检查点抑制物，例如CTLA4、LAG-3或PD-1。
分离和纯化的细胞群体可以使用标准方法进一步扩增，例如与抗CD3或CD28抗体一起温育和/或与细胞因子(如IL-2、IL-7和/或IL-15)共培养。在某些实施方案中，将分离和纯化的细胞群体与经辐照的饲养细胞和肽抗原一起温育以扩增具有一定抗原特异性的一种或多种T细胞。在某些实施方案中，肽抗原包括肿瘤相关抗原。
异质细胞群体可以使用标准方法进一步扩增，例如与抗CD3或CD28抗体一起温育和/或与细胞因子(如IL-2、IL-7和/或IL-15)共培养。在某些实施方案中，将分离和纯化的细胞群体与经辐照的饲养细胞和肽抗原一起温育以扩增具有一定抗原特异性的一种或多种T细胞。在某些实施方案中，肽抗原包括肿瘤相关抗原。在细胞扩增后，细胞可以包含大于60％、70％、80％、90％或95％的CD3+细胞、CD3+CD4+细胞或CD3+CD8+细胞。在某些实施方案中，可以在扩增后测试细胞的等分试样的功效。
存在许多可用于分离或扩增从个体获得的T细胞或T细胞群体的方法。扩增和/或分离T细胞群体的某些非限制性方法在美国专利和公开的申请5,827,642；6,316,257；6,399,054；7,745,140；8,383,099；US2003/0134341；US 2004/0241162中公开；所有这些通过引用整体并入本文。
T细胞群体也可以使用本领域已知的方法衍生自造血干细胞(HSC)或诱导多能干细胞(iPSC)。在某些实施方案中，T细胞群体是从iPSC衍生/分化的。iPSC的来源可以是自体的，也可以是异源的。在某些实施方案中，T细胞群体是从(HSC)细胞衍生/分化的。HSC的来源可以是自体的，也可以是异源的。
本文中将由HDACi处理的T细胞群体可衍生自最终将被基于细胞的免疫治疗剂治疗的个体(例如自体群体)或不同的个体(例如异源群体)。在某些实施方案中，当使用自体细胞群体时，已经用HDACi在体外处理了该细胞群体。在某些实施方案中，当使用自体细胞群体时，在分离该细胞群体之前，已经对该人进行了一次或多次HDACi施用。在某些实施方案中，当使用异源细胞群体时，其来自HLA匹配的个体(例如，同基因的)或HLA错配的个体(例如，异基因的)。在某些实施方案中，当使用异源细胞群体时，其来自HLA错配的供体。在某些实施方案中，当使用异源细胞群体时，其是可以从自体或异源来源建立的T细胞系。
当在本文所述的方法中使用T细胞群体(异质或纯化；自体或异源)或T细胞系时，可以在用HDACi处理之前或之后由特定的肿瘤相关抗原刺激或激活该群体。肿瘤相关抗原(TAA)是与相同来源的正常细胞相比，由肿瘤细胞专门表达或高度表达的一种抗原。已知的肿瘤相关抗原包括，例如，神经胶质瘤相关抗原、癌胚抗原(CEA)、β-人绒毛膜促性腺激素、甲胎蛋白(AFP)、凝集素反应性AFP、甲状腺球蛋白、RAGE-1、MN-CA IX、人端粒酶逆转录酶、RU1、RU2(AS)、肠羧基酯酶、mut hsp70-2、M-CSF、前列腺酶、前列腺特异性抗原(PSA)、PAP、NY-ESO-1、LAGE-1a、p53、前列腺素、PSMA、Her2/neu、存活素和端粒酶、前列腺癌肿瘤抗原-1(PCTA-1)、MAGE、ELF2M、中性粒细胞弹性蛋白酶、ephrinB2、CD22、胰岛素生长因子(IGF)-I、IGF-II、IGF-I受体和间皮素、MART-1、路易斯Y抗原(LeY)、酪氨酸酶和GP100、前列腺酸性磷酸酶(PAP)前列腺特异性抗原(PSA)、ROR1、MUC16、CD171(LICAM)、B细胞成熟抗原(BCMA)、WT1、HER-2/Neu/ErbB-2、CD19、CD20、CD37或患者特有的独特型。在某些实施方案中，大于50％、60％、70％、80％、90％或95％的T细胞群体可以对肿瘤相关抗原具有特异性(例如，通过四聚体染色所定义的)。在某些实施方案中，T细胞群体可以不被TAA刺激，但是可以具有对TAA的特异性，如通过四聚体染色所指示的。在某些实施方案中，T细胞群体可以不被病毒抗原刺激，但是可以具有对病毒抗原的特异性，如通过四聚体染色所指示的。
当在本文所述的方法中使用T细胞群体(异质或纯化；自体或异源)或T细胞系时，可以通过源自人巨细胞病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、人类免疫缺陷病毒、丙型肝炎病毒或乙型肝炎病毒的病毒抗原来刺激或激活该群体。在某些实施方案中，该群体被源自爱泼斯坦-巴尔病毒的抗原刺激。在某些实施方案中，该群体被源自人巨细胞病毒的抗原刺激。
CD4+调节性T细胞对免疫应答进行负调节。减少CD4+Treg是增加对基于细胞的免疫疗法的治疗响应的重要策略。FoxP3是调节性T细胞表型的转录调节物。在某些实施方案中，本文所述的HDAC抑制剂在体外减少FoxP3+、CD4+调节性T细胞群体。在某些实施方案中，本文所述的HDAC抑制剂将FoxP3+、CD4+调节性T细胞群体减少至少10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％或更多。在HDAC抑制剂给药之后但在分离用于基于细胞的免疫疗法的细胞之前，这些T细胞群体可在个体中减少。在某些实施方案中，与用安慰剂治疗的个体相比，本文所述的HDAC抑制剂在用HDAC抑制剂治疗的个体中将FoxP3+、CD4+调节性T细胞群体减少至少10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％、95％或更多。在某些实施方案中，与用媒介物对照处理或未予处理的PBMC相比，本文所述的HDAC抑制剂使离体培养的外周血单核细胞中的FoxP3+，CD4+调节性T细胞群体减少至少10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％或更多。
在本文所述的方法中使用的T细胞群体和T细胞系显示出增强的功能。该功能可以是生理功能，例如与未经HDACi处理的T细胞群体相比，循环中的半衰期延长、向肿瘤部位的转运更高、细胞毒素活性增加或细胞因子/趋化因子分泌增加。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出的半衰期比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系长10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出的半衰期比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系的半衰期长2倍、3倍、4倍或5倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系多10％、25％、50％或75％的向肿瘤部位的转运。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系多2倍、3倍、4倍或5倍的向肿瘤部位的转运。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％的细胞毒素活性。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍的细胞毒素活性。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％的水平释放IFN-γ。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍的水平释放IFN-γ。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％的水平释放IL-2。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍的水平释放IL-2。未经HDACi处理的细胞群体或细胞系可以例如是处理前后的比较，或是与除HDACi处理以外的类似处理的细胞群体的比较。
可替代地，在T细胞群体或T细胞系中看到的增加的功能可以是细胞或分子功能，例如与未经HDACi处理的T细胞群体相比，激活的细胞标志物的表达增加、抑制性细胞标志物的表达减少、激活的细胞标志物的细胞表面表达的增加或抑制性细胞标记物的表达降低。CXCR3是优先在激活的Th1细胞上表达的趋化因子受体。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系在细胞表面表达CXCR3的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系在细胞表面表达CXCR3的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍。FoxP3是与调节性T细胞(TREG)相关的转录因子。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达FoxP3的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系低10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达FoxP3的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系低2倍、3倍、4倍或5倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达IFN-γmRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达IFN-γmRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达TNFαmRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达TNFαmRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达IL-2mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达IL-2mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达T-bet mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达T-bet mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。未经HDACi处理的细胞群体或细胞系可以例如是处理前后的比较，或是与除HDACi处理之外的类似处理的细胞群体的比较。
HDACi可以增强T细胞活性的一种方法是通过增加T细胞群体或使T细胞群体分化为记忆T细胞。记忆T细胞对表达或展示同源抗原的靶标具有高活性。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达CCR7的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达CCR7的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达CD62L的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达CD62L的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达TGFβ的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系低10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达TGFβ的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系低2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。未经HDACi处理的细胞群体或细胞系可以例如是处理前后的比较，或是与除HDACi处理外的类似处理的细胞群体的比较。
T细胞还与嵌合抗原受体(CAR)(所谓的“CAR T细胞”)一起用作基于细胞的治疗剂。CAR T细胞是这样的T细胞系或群体，其经过基因工程改造后可以表达与跨膜域融合的靶向域(例如抗体Fab或单链可变片段)，和在靶向域与其靶标相互作用时诱导T细胞活化的细胞内域(例如，CD3ζ信号传导域、CD28细胞内域、4-1BB细胞内域)。可以使用例如逆转录病毒载体、腺病毒载体或AAV载体，通过将核酸CAR构建体病毒转导至原代T细胞群体中；或通过基于脂质的试剂或电穿孔进行转染而使T细胞转基因。在某些实施方案中，本文所述的方法包括在用HDACi处理之前使T细胞群体转基因。在某些实施方案中，本文所述的方法包括在用HDACi处理后使T细胞群体转基因。当从原代淋巴细胞群体产生CAR T细胞时，这些细胞通常对所治疗的患者而言是自体的。分离细胞并使用常规方法如CD3/CD28抗体在培养基中扩增，以产生足够的细胞用于转导和随后的施用。另外，还可以使用CAR建立稳定的细胞系并施用。当前，FDA批准的CAR T细胞疗法包括axicabtagene ciloleucelaxicabtageneciloleucel(YescartaTM)和tisagenlecleucel(KymriahTM)。举非限制性实例而言，US20130287748A1；US 2014/0234348A1；或US 2014/0050708描述了CAR构建体及其使用方法，其通过引用整体并入本文。
在某些实施方案中，基于细胞的治疗剂是用CAR转基因的T细胞系或T细胞群体。用CAR转基因的T细胞群体可以表达对TAA具有特异性的靶向域，该TAA是例如神经胶质瘤相关抗原、癌胚抗原(CEA)、β-人绒毛膜促性腺激素、甲胎蛋白(AFP)、凝集素反应性AFP、甲状腺球蛋白、RAGE-1、MN-CA IX、人端粒酶逆转录酶、RU1、RU2(AS)、肠羧基酯酶、mut hsp70-2、M-CSF、前列腺酶、前列腺特异性抗原(PSA)、PAP、NY-ESO-1、LAGE-1a、p53、前列腺素、PSMA、Her2/neu、存活素和端粒酶、前列腺癌肿瘤抗原-1(PCTA-1)、MAGE、ELF2M、中性粒细胞弹性蛋白酶、ephrinB2、CD22、胰岛素生长因子(IGF)-I、IGF-II、IGF-I受体和间皮素、MART-1、路易斯Y抗原(LeY)、酪氨酸酶和GP100、前列腺酸性磷酸酶(PAP)前列腺特异性抗原(PSA)、ROR1、MUC16、CD171(LICAM)、B细胞成熟抗原(BCMA)、WT1、HER-2/Neu/ErbB-2、CD19、CD20或CD37。
当通过CAR使T细胞系或T细胞群体(异质或纯化；自体或异源)转基因时，CAR可以对源自人巨细胞病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、人类免疫缺陷病毒、丙型肝炎病毒或乙型肝炎病毒的病毒抗原具有特异性。在某些实施方案中，该群体被源自爱泼斯坦-巴尔病毒的抗原刺激。在某些实施方案中，该群体被源自人巨细胞病毒的抗原刺激。
在某些实施方案中，CAR T细胞通过静脉内输注施用。在某些实施方案中，施用约1x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 107个细胞/m2。
在某些实施方案中，CAR T细胞每天施用一次。在某些实施方案中，CAR T细胞每周施用一次。在某些实施方案中，CAR T细胞每个月施用一次。在某些实施方案中，CAR T细胞每周施用两次。在某些实施方案中，CAR T细胞每个月施用两次。在某些实施方案中，CAR T细胞每周施用三次。在某些实施方案中，CAR T细胞每个月施用三次。在某些实施方案中，CAR T细胞每个月施用四次。在某些实施方案中，CAR T细胞以单剂量施用。
在基于细胞的治疗剂中采用的另一种策略是使T细胞群体转基因有TAA特异性的重组T细胞受体(TCR)。与基于CAR的疗法非常相似，已在培养中扩增的T细胞可以通过TAA特异性TCR转染并转导。在大多数情况下是患者自体细胞已在培养中扩增。在某些实施方案中，基于细胞的疗法是表达重组TCR的T细胞或T细胞群体。TCR可以是TAA特异性的，TAA是例如神经胶质瘤相关抗原、癌胚抗原(CEA)、β-人绒毛膜促性腺激素、甲胎蛋白(AFP)、凝集素反应性AFP、甲状腺球蛋白、RAGE-1、MN-CA IX、人端粒酶逆转录酶、RU1、RU2(AS)、肠羧基酯酶、mut hsp70-2、M-CSF、前列腺酶、前列腺特异性抗原(PSA)、PAP、NY-ESO-1、LAGE-1a、p53、前列腺素、PSMA、Her2/neu、存活素和端粒酶、前列腺癌肿瘤抗原-1(PCTA-1)、MAGE、ELF2M、中性粒细胞弹性蛋白酶、ephrinB2、CD22、胰岛素生长因子(IGF)-I、IGF-II、IGF-I受体和间皮素、MART-1、路易斯Y抗原(LeY)、酪氨酸酶和GP100、前列腺酸性磷酸酶(PAP)前列腺特异性抗原(PSA)、ROR1、MUC16、CD171(LICAM)、B细胞成熟抗原(BCMA)、WT1、HER-2/Neu/ErbB-2、CD19、CD20或CD37。
在某些实施方案中，重组TCR T细胞通过静脉内输注施用。在某些实施方案中，施用约1x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 107个细胞/m2。
在某些实施方案中，重组TCR T细胞每天施用一次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每周施用一次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每个月施用一次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每周施用两次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每个月施用两次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每周施用三次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每个月施用三次。在某些实施方案中，重组TCR T细胞每个月施用四次。
用HDACi对T细胞或T细胞系的体外处理可以与其他试剂(例如增殖或促维持(pro-maintenance)因子，例如细胞因子IL-15、IL-7或其组合)相结合。在某些实施方案中，用nanatinostat对T细胞或T细胞系的体外处理可以与其他试剂(例如增殖或促维持因子，例如细胞因子IL-15、IL-7或其组合)相结合。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括约1ng/mL至约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括约1ng/mL至约5ng/mL、约1ng/mL至约10ng/mL、约1ng/mL至约20ng/mL、约1ng/mL至约30ng/mL、约1ng/mL至约40ng/mL、约1ng/mL至约50ng/mL、约1ng/mL至约60ng/mL、约1ng/mL至约70ng/mL、约1ng/mL至约80ng/mL、约1ng/mL至约90ng/mL、约1ng/mL至约100ng/mL、约5ng/mL至约10ng/mL、约5ng/mL至约20ng/mL、约5ng/mL至约30ng/mL、约5ng/mL至约40ng/mL、约5ng/mL至约50ng/mL、约5ng/mL至约60ng/mL、约5ng/mL至约70ng/mL、约5ng/mL至约80ng/mL、约5ng/mL至约90ng/mL、约5ng/mL至约100ng/mL、约10ng/mL至约20ng/mL、约10ng/mL至约30ng/mL、约10ng/mL至约40ng/mL、约10ng/mL至约50ng/mL、约10ng/mL至约60ng/mL、约10ng/mL至约70ng/mL、约10ng/mL至约80ng/mL、约10ng/mL至约90ng/mL、约10ng/mL至约100ng/mL、约20ng/mL至约30ng/mL、约20ng/mL至约40ng/mL、约20ng/mL至约50ng/mL、约20ng/mL至约60ng/mL、约20ng/mL至约70ng/mL、约20ng/mL至约80ng/mL、约20ng/mL至约90ng/mL、约20ng/mL至约100ng/mL、约30ng/mL至约40ng/mL、约30ng/mL至约50ng/mL、约30ng/mL至约60ng/mL、约30ng/mL至约70ng/mL、约30ng/mL至约80ng/mL、约30ng/mL至约90ng/mL、约30ng/mL至约100ng/mL、约40ng/mL至约50ng/mL、约40ng/mL至约60ng/mL、约40ng/mL至约70ng/mL、约40ng/mL至约80ng/mL、约40ng/mL至约90ng/mL、约40ng/mL至约100ng/mL、约50ng/mL至约60ng/mL、约50ng/mL至约70ng/mL、约50ng/mL至约80ng/mL、约50ng/mL至约90ng/mL、约50ng/mL至约100ng/mL、约60ng/mL至约70ng/mL、约60ng/ml至约80ng/mL、约60ng/mL至约90ng/mL、约60ng/mL至约100ng/mL、约70ng/mL至约80ng/mL、约70ng/mL至约90ng/mL、约70ng/mL至约100ng/mL、约80ng/mL至约90ng/mL、约80ng/mL至约100ng/mL或约90ng/mL至约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括约1ng/mL、约5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL、约90ng/mL或约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括至少约1ng/mL、约5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL或约90ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括至多约5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL、约90ng/mL或约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15以约1ng/mL、5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL、约90ng/mL或约100ng/mL的浓度与IL-7组合。
用HDACi对T细胞或T细胞系的体外处理可以与作为检查点抑制物的其他免疫治疗剂相结合，该检查点抑制物例如为针对PD-1、PD-L1或PD-L2的拮抗抗体及其组合。在某些实施方案中，检查点抑制物抗体包括伊匹木单抗(Ipilimumab)、派姆单抗(Pembrolizumab)、纳武单抗(Nivolumab)、斯巴达珠单抗(Spartalizumab)、阿特珠单抗(Atezolizumab)、阿维鲁单抗(Avelumab)或度夫芦单抗(Durvalumab)。在相同或不同的接触步骤中，检查点抑制物抗体可任选包含一定量的IL-15或IL-7。在某些实施方案中，在该方法中与基于T细胞的免疫疗法接触的检查点抑制物抗体的浓度为约10微克/mL至约100微克/mL。在某些实施方案中，在该方法中与基于T细胞的免疫疗法接触的检查点抑制物抗体的浓度为约10微克/mL至约20微克/mL、约10微克/mL至约30微克/mL、约10微克/mL至约40微克/mL、约10微克/mL至约50微克/mL、约10微克/mL至约60微克/mL、约10微克/mL至约70微克/mL、约10微克/mL至约80微克/mL、约10微克/mL至约90微克/mL、约10微克/mL至约100微克/mL、约20微克/mL至约30微克/mL、约20微克/mL至约40微克/mL、约20微克/mL至约50微克/mL、约20微克/mL至约60微克/mL、约20微克/mL至约70微克/mL、约20微克/mL至约80微克/mL、约20微克/mL至约90微克/mL、约20微克/mL至约100微克/mL、约30微克/mL至约40微克/mL、约30微克/mL至约50微克/mL、约30微克/mL至约60微克/mL、约30微克/mL至约70微克/mL、约30微克/mL至约80微克/mL、约30微克/mL至约90微克/mL、约30微克/mL至约100微克/mL、约40微克/mL至约50微克/mL、约40微克/mL至约60微克/mL、约40微克/mL至约70微克/mL、约40微克/mL至约80微克/mL、约40微克/mL至约90微克/mL、约40微克/mL至约100微克/mL、约50微克/mL至约60微克/mL、约50微克/mL至约70微克/mL、约50微克/mL至约80微克/mL、约50微克/mL至约90微克/mL、约50微克/mL至约100微克/mL、约60微克/mL至约70微克/mL、约60微克/mL至约80微克/mL、约60微克/mL至约90微克/mL、约60微克/mL至约100微克/mL、约70微克/mL至约80微克/mL、约70微克/mL至约90微克/mL、约70微克/mL至约100微克/mL、约80微克/mL至约90微克/mL、约80微克/mL至约100微克/mL、或约90微克/mL至约100微克/mL。在某些实施方案中，在该方法中与基于T细胞的免疫疗法接触的检查点抑制物抗体的浓度为约10微克/mL、约20微克/mL、约30微克/mL、约40微克/mL、约50微克/mL、约60微克/mL、约70微克/mL、约80微克/mL、约90微克/mL或约100微克/mL。在某些实施方案中，在该方法中与基于T细胞的免疫疗法接触的检查点抑制物抗体的浓度为至少约10微克/mL、约20微克/mL、约30微克/mL、约40微克/mL、约50微克/mL、约60微克/mL、约70微克/mL、约80微克/mL或约90微克/mL。在某些实施方案中，在该方法中与基于T细胞的免疫疗法接触的检查点抑制物抗体的浓度为至多约20微克/mL、约30微克/mL、约40微克/mL、约50微克/mL、约60微克/mL、约70微克/mL、约80微克/mL、约90微克/mL或约100微克/mL。
基于NK细胞的疗法
天然杀伤(NK)细胞也可用于基于细胞的疗法。NK细胞是表现细胞毒素活性的先天淋巴免疫细胞。与T细胞一样，NK细胞可以用CAR进行转导(生成CAR NK细胞)，或者不经转导就用作原代群体。可以从原代自体群体或使用NK细胞系建立CAR NK细胞。可以使用的常见NK细胞系是NK-92细胞系(可得自ATCC；CRL-2497)或KHYG-1细胞系。在某些实施方案中，工程化NK细胞系由KHYG-1细胞系制成。参见Yagita等人,“A novel natural killer cellline(KHYG-1)from a patient with aggressive natural killer cell leukemiacarrying a p53 point mutation.”Leukemia 14(5):922-30。与本公开内容的HDACi一起使用的NK细胞可以由包括原代细胞或已建立的细胞系的任何NK细胞群体制成。在某些实施方案中，NK细胞是人NK细胞。人类的原代天然杀伤细胞表达细胞表面标志物CD56，并且在某些实施方案中，工程化的天然杀伤细胞可从CD56阳性细胞产生，作为非限制性实例，如通过流式细胞术所确定的。在某些实施方案中，天然杀伤细胞可来自自体来源，或者来自异源来源。可以使用诸如细胞分选或磁珠等方法从供体或待治疗个体的外周血中分离NK细胞。从供体中分离的NK细胞可以通过在白介素-2和白介素-15的存在下培养超过7天而离体扩增。NK细胞群体也可以使用本领域已知的方法衍生自造血干细胞(HSC)或诱导性多能干细胞(iPSC)。在某些实施方案中，T细胞群体是从iPSC衍生/分化的。iPSC的来源可以是自体的，也可以是异源的。在某些实施方案中，T细胞群体是从(HSC)细胞衍生/分化的。HSC的来源可以是自体的，也可以是异源的。NK细胞群体可以通过CD56表达来标记。在某些实施方案中，通过FACS染色，可用于本文所述的培养基和方法的NK细胞群体对CD56至少60％、70％、80％、90％或95％呈阳性。
表达CAR的NK细胞或NK细胞群体可以表达TAA特异性的CAR，TAA是例如神经胶质瘤相关抗原、癌胚抗原(CEA)、β-人绒毛膜促性腺激素、甲胎蛋白(AFP)、凝集素反应性AFP、甲状腺球蛋白、RAGE-1、MN-CA IX、人端粒酶逆转录酶、RU1、RU2(AS)、肠羧基酯酶、mut hsp70-2、M-CSF、前列腺酶、前列腺特异性抗原(PSA)、PAP、NY-ESO-1、LAGE-1a、p53、前列腺素、PSMA、Her2/neu、存活素和端粒酶、前列腺癌肿瘤抗原-1(PCTA-1)、MAGE、ELF2M、中性粒细胞弹性蛋白酶、ephrinB2、CD22、胰岛素生长因子(IGF)-I、IGF-II、IGF-I受体和间皮素、MART-1、路易斯Y抗原(LeY)、酪氨酸酶和GP100、前列腺酸性磷酸酶(PAP)前列腺特异性抗原(PSA)、ROR1、MUC16、CD171(LICAM)、B细胞成熟抗原(BCMA)、WT1、HER-2/Neu/ErbB-2、CD19、CD20或CD37。
在某些实施方案中，CAR NK细胞通过静脉内输注施用。在某些实施方案中，施用约1x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 107个细胞/m2。
在某些实施方案中，CAR NK细胞每天施用一次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每周施用一次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每个月施用一次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每周施用两次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每个月施用两次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每周施用三次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每个月施用三次。在某些实施方案中，CAR NK细胞每个月施用四次。在某些实施方案中，CAR NK细胞以单剂量施用。
另外，可以将NK细胞工程化以表达高亲和力Fc受体(HaNK)，并与肿瘤靶向抗体相结合以在体内靶向杀死肿瘤细胞。例如，CD16是高亲和力的Fc受体，其将通过其Fc部分结合抗体，从而允许Fab部分自由地与肿瘤细胞相互作用，从而将细胞毒性NK细胞募集到肿瘤部位。用高亲和力Fc受体修饰的NK细胞描述于例如美国专利7,618,817和8,313,943中，其全部内容并入本文。可以将表达高亲和力Fc受体的NK细胞与TAA特异性抗体相结合，例如单克隆抗体为兰罗利珠单抗(Lambrolizumab)、度丕卢单抗(Dupilumab)、它布鲁单抗(Tabalumab)、加利昔单抗(Galiximab)、普立木单抗(Pritumumab)、曲妥珠单抗(Trastuzumab)、阿麦妥昔单抗(Amatuximab)、Coltuximab ravtansine、恩司昔单抗(Ensituximab)、拉-英达西单抗(Indatuximab ravtansine)、Isatuximab、Mirvetuximabsoravtansine、司妥昔单抗(Siltuxima)、Ublituximab、Zatuximab、欧特西珠单抗(Ontuxizumab)、帕束妥昔珠单抗(Pasotuxizumab)、安妥单抗(Anetumab ravtansine)、阿斯万卡单抗(Ascrinvacumab)、可那木单抗(Conatumumab)、达雷木单抗(Daratumumab)、度夫芦单抗、度司荼单抗(Dusigitumab)、依格珠单抗(Elgemtumab)、Ganitumab、尹马鲁单抗(Imalumab)、英杜斯妥单抗(Indusatumab vedotin)、来沙木单抗(Lexatumumab)、马帕木单抗(Mapatumumab)、纳鲁特单抗(Narnatumab)、奈弗库单抗(Nesvacumab)、纳武单抗、Olaratum、Parsatuzumab、帕曲土单抗(Patritumab)、Radretumab、Robatumuma、色瑞班妥单抗(Seribantumab)、它瑞妥单抗(Tarextumab)、替西木单抗(Ticilimumab)(曲美木单抗(tremelimumab))、Tovetumab、曲美木单抗(Tremelimumab)、Vantictumab、阿比特珠单抗(Abituzumab)、培化阿珠单抗(Alacizumab pegol)、阿特珠单抗、cBR96-多柔比星免疫缀合物、克锥特珠单抗(Codrituzumab)、德姆茨单抗(Demcizumab)、地宁图珠单抗(Denintuzumab mafodotin)、依麻特珠单抗(Emactuzumab)、依米特珠单抗(Emibetuzumab)、Enoblituzumab、尹戈妥珠单抗(Imgatuzumab)、伊珠单抗奥加米星(Inotuzumab ozogamicin)、利伐特珠单抗(Lifastuzumab vedotin)、林妥珠单抗(Lintuzuma)、莫-洛伏珠单抗(Lorvotuzumab mertansin)、Lumretuzumab、Margetuximab、莫加珠单抗(Mogamulizumab)、Ocaratuzumab、奥纳珠单抗(Onartuzumab)、莫奥珠单抗(Oportuzumab monatox)、奥特托珠单抗(Otlertuzumab)、帕妥珠单抗(Pertuzumab)、匹伐珠单抗(Pinatuzumab vedotin)、波拉妥珠单抗(Polatuzumab vedotin)、沙斯妥珠单抗(Sacituzumab govitecan)、Samalizumab、西罗珠单抗(Sibrotuzumab)、Tacatuzumabtetraxetan、替加珠单抗(Tigatuzumab)、西莫白介素单抗(Tucotuzumab celmoleukin)、Vandortuzumab vedotin、凡诺西珠单抗(Vanucizumab)、Vorsetuzumab mafodotin、匹狄立珠单抗(Pidilizumab)、Drozitumab、伊库克单抗(Icrucumab)、乌瑞鲁单抗(Urelumab)、达洛珠单抗(Dalotuzumab)、恩凡珠单抗(Enavatuzumab)、Ficlatuzumab、派姆单抗、恩夫图单抗(Enfortumab vedotin)、巴维昔单抗(Bavituximab)、依帕珠单抗(Epratuzumab)、莫坎妥珠单抗(Cantuzumab ravtansine)、森纳西珠单抗(Sonepcizumab)、妥韦单抗(Tuvirumab)、鲁昔单抗(Lumiliximab)、奥法木单抗(Ofatumumab)、TGN1412、吉瑞昔单抗(Girentuximab)、帕尼单抗(Panitumumab)、拉贝珠单抗(Labetuzumab)、美妥珠单抗(Cantuzumab mertansine)、伏妥莫单抗(Votumumab)、马妥珠单抗(Matuzumab)、瑞加韦单抗(Regavirumab)、司韦单抗(Sevirumab)、奥昔珠单抗(Otelixizumab)、IMAB362、贝伦妥单抗-维多汀(Brentuximab vedotin)、达西珠单抗(Dacetuzumab)、乌克普鲁单抗(Ulocuplumab)、替妥木单抗(Teprotumumab)、阿泊珠单抗(Apolizumab)、阿托木单抗(Atorolimumab)、伊妥木单抗(Iratumumab)、TNX-650、阿托珠单抗(Afutuzumab)、利妥昔单抗(Rituximab)、依美昔单抗(Ecromeximab)、TRBS07、Flanvotumab、伊匹木单抗、格莱木单抗-维多汀(Glembatumumab vedotin)、埃达珠单抗(Etaracizumab)、贝伐珠单抗(Bevacizumab)、西妥昔单抗(Cetuximab)、依洛珠单抗(Elotuzumab)、米拉珠单抗(Milatuzumab)、鲁卡木单抗(Lucatumumab)、定妥昔单抗(Dinutuximab)、贝利木单抗(Belimumab)、维妥珠单抗(Veltuzumab)、奈昔木单抗(Necitumumab)、卡鲁单抗(Carlumab)、罗姆珠单抗(Romosozumab)、地舒单抗(Denosumab)、法利珠单抗(Farletuzumab)、Pankomab、Sofituzumab vedotin、泊西他珠单抗(Citatuzumabbogatox)、Clivatuzumab tetraxetan、阿昔单抗(Abciximab)、达克珠单抗(Daclizumab)、巴利昔单抗(Basiliximab)、阿德木单抗(Adecatumumab)、Derlotuximab biotin、芦利珠单抗(Ruplizumab)、克立昔单抗(Clenoliximab)、卡那奴单抗(Canakinumab)、弗乐提单抗(Fletikumab)、Mavrilimumab、希鲁库单抗(Sirukumab)、ALD518、阿利珠单抗(Atlizumab)(托珠单抗(tocilizumab))、Clazakizumab、英利昔单抗(Infliximab)、奥瑞珠单抗(Ocrelizumab)、扎木单抗(Zanolimumab)、戈利木单抗(Golimumab)、萨里单抗(Sarilumab)、阿达木单抗(Adalimumab)、非扎奴单抗(Fezakinumab)、伏洛昔单抗(Volociximab)、西妥木单抗(Cixutumumab)、雷莫芦单抗(Ramucirumab)、利妥木单抗(Rilotumumab)、英妥木单抗(Intetumumab)、莫-比伐珠单抗(Bivatuzumab mertansine)、扎芦木单抗(Zalutumumab)、尼妥珠单抗(Nimotuzumab)、安弗露单抗(Anifrolumab)、罗利珠单抗(Rontalizumab)、美替木单抗(Metelimumab)、阿仑单抗(Alemtuzumab)或帕特利珠单抗(Pateclizumab)。在某些实施方案中，所述单克隆抗体为BS-936559、MSB0010718C或MEDI4736。
在某些实施方案中，HaNK细胞通过静脉内输注施用。HaNK细胞可以在施用前(HDACi处理之前、期间或之后)与抗体复合，或在TAA特异性抗体后施用。在某些实施方案中，施用约1x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 105个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 106个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约1x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约2x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约3x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约4x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约5x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约6x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约7x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约8x 107个细胞/m2。在某些实施方案中，施用约9x 107个细胞/m2。
在某些实施方案中，HaNK细胞每天施用一次。在某些实施方案中，HaNK细胞每周施用一次。在某些实施方案中，HaNK细胞每个月施用一次。在某些实施方案中，HaNK细胞每周施用两次。在某些实施方案中，HaNK细胞每个月施用两次。在某些实施方案中，HaNK细胞每周施用三次。在某些实施方案中，HaNK细胞每个月施用三次。在某些实施方案中，HaNK细胞每个月施用四次。在某些实施方案中，HaNK细胞以单剂量施用。
本文所述方法中使用的NK细胞群体和NK细胞系(包括CAR NK和HaNK细胞)表现出增强的功能。该功能可以是生理功能，例如与未经HDACi处理的NK细胞群体相比，循环中的半衰期延长、向肿瘤部位的转运更高、细胞毒素活性增加或细胞因子/趋化因子分泌增加。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系的半衰期比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系长10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系的半衰期比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系的半衰期长2倍、3倍、4倍或5倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系多10％、25％、50％或75％的向肿瘤部位的转运。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系多2倍、3倍、4倍或5倍的向肿瘤部位的转运。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％的细胞毒素活性。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表现出比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍的细胞毒素活性。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％的水平释放IFN-γ。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍的水平释放IFN-γ。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％的水平释放TRAIL。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系以比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍的水平释放TRAIL。
可替代地，在NK细胞群体或NK细胞系中看到的增加的功能可以是细胞或分子功能，例如与未经HDACi处理的NK细胞群体相比，激活的细胞标志物的表达增加、抑制性细胞标志物的表达减少、激活的细胞标志物的细胞表面表达增加或抑制性细胞标记物的表达降低。FasL是在NK细胞上表达并有助于细胞毒性的细胞表面受体。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系在细胞表面表达FasL的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系在细胞表面表达FasL的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍。KLRC2是与NK细胞的细胞毒性相关的转录因子。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达KLRC2的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达KLRC2的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍或5倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达IFN-γmRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达IFN-γmRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达穿孔素mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达穿孔素mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达粒酶B mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高10％、25％、50％或75％。在某些实施方案中，经HDACi处理的细胞群体或细胞系表达粒酶B mRNA的水平比未经HDACi处理的细胞群体或细胞系高2倍、3倍、4倍、5倍或10倍。未经HDACi处理的细胞群体或细胞系可以例如是处理前后的比较，或是与除HDACi处理之外的类似处理的细胞群体的比较。
用HDACi对NK细胞的体外处理可以与其他试剂(例如增殖或促维持因子，例如细胞因子IL-15、IL-7或其组合)相结合。在某些实施方案中，用nanatinostat对NK细胞的体外处理可以与其他试剂(例如增殖或促维持因子，例如细胞因子IL-15、IL-7或其组合)相结合。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括约1ng/mL至约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括约1ng/mL至约5ng/mL、约1ng/mL至约10ng/mL、约1ng/mL至约20ng/mL、约1ng/mL至约30ng/mL、约1ng/mL至约40ng/mL、约1ng/mL至约50ng/mL、约1ng/mL至约60ng/mL、约1ng/mL至约70ng/mL、约1ng/mL至约80ng/mL、约1ng/mL至约90ng/mL、约1ng/mL至约100ng/mL、约5ng/mL至约10ng/mL、约5ng/mL至约20ng/mL、约5ng/mL至约30ng/mL、约5ng/mL至约40ng/mL、约5ng/mL至约50ng/mL、约5ng/mL至约60ng/mL、约5ng/mL至约70ng/mL、约5ng/mL至约80ng/mL、约5ng/mL至约90ng/mL、约5ng/mL至约100ng/mL、约10ng/mL至约20ng/mL、约10ng/mL至约30ng/mL、约10ng/mL至约40ng/mL、约10ng/mL至约50ng/mL、约10ng/mL至约60ng/mL、约10ng/mL至约70ng/mL、约10ng/mL至约80ng/mL、约10ng/mL至约90ng/mL、约10ng/mL至约100ng/mL、约20ng/mL至约30ng/mL、约20ng/mL至约40ng/mL、约20ng/mL至约50ng/mL、约20ng/mL至约60ng/mL、约20ng/mL至约70ng/mL、约20ng/mL至约80ng/mL、约20ng/mL至约90ng/mL、约20ng/mL至约100ng/mL、约30ng/mL至约40ng/mL、约30ng/mL至约50ng/mL、约30ng/mL至约60ng/mL、约30ng/mL至约70ng/mL、约30ng/mL至约80ng/mL、约30ng/mL至约90ng/mL、约30ng/mL至约100ng/mL、约40ng/mL至约50ng/mL、约40ng/mL至约60ng/mL、约40ng/mL至约70ng/mL、约40ng/mL至约80ng/mL、约40ng/mL至约90ng/mL、约40ng/mL至约100ng/mL、约50ng/mL至约60ng/mL、约50ng/mL至约70ng/mL、约50ng/mL至约80ng/mL、约50ng/mL至约90ng/mL、约50ng/mL至约100ng/mL、约60ng/mL至约70ng/mL、约60ng/ml至约80ng/mL、约60ng/mL至约90ng/mL、约60ng/mL至约100ng/mL、约70ng/mL至约80ng/mL、约70ng/mL至约90ng/mL、约70ng/mL至约100ng/mL、约80ng/mL至约90ng/mL、约80ng/mL至约100ng/mL或约90ng/mL至约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括约1ng/mL、约5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL、约90ng/mL或约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括至少约1ng/mL、约5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL或约90ng/mL。在某些实施方案中，IL-15的浓度包括至多约5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL、约90ng/mL或约100ng/mL。在某些实施方案中，IL-15以约1ng/mL、5ng/mL、约10ng/mL、约20ng/mL、约30ng/mL、约40ng/mL、约50ng/mL、约60ng/mL、约70ng/mL、约80ng/mL、约90ng/mL或约100ng/mL的浓度与IL-7组合。
培养基
本文还公开了可用于增强基于细胞的免疫疗法的细胞培养基。在某些实施方案中，培养基缺乏人或动物来源的血清。在某些实施方案中，培养基包含I类HDACi。在一些实施方案中，I类HDACi是nanatinostat。在某些实施方案中，HDAC在基于细胞的免疫治疗剂中以增加组蛋白乙酰化的浓度存在。在某个实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3。在某些实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3，并且增加的乙酰化在赖氨酸9处。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约10μM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约5μM的nanatinostat。在一些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约2μM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约1μM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约900nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约800nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约700nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约600nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约500nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约400nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约300nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约200nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约100nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度小于约50nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度大于约1nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度大于约2nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度大于约5nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度大于约10nM的nanatinostat。在某些实施方案中，细胞培养基包含浓度大于约100nM的nanatinostat。在某些实施方案中，nanatinostat以以下量存在于细胞培养基中：约1nM至约5μM之间、约1nM至约2μM之间、约1nM至约1μM之间、约1nM至约900nM之间、约1nM至约800nM之间、约1nM至约700nM之间、约1nM至约600nM之间、约1nM至约500nM之间、约1nM至约400nM之间、约1nM至约300nM之间、约1nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约1nM至约50nM之间、约1nM至约25nM之间、约10nM至约5μM之间、约10nM至约2μM之间、约10nM至约1μM之间、约10nM至约900nM之间、约10nM至约800nM之间、约10nM至约700nM之间、约10nM至约600nM之间、约10nM至约500nM之间、约10nM至约400nM之间、约10nM至约300nM之间、约10nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约10nM至约50nM之间、约10nM至约25nM之间。本文的培养基可以基本上由所包含的HDACi和培养基组成，而没有其他有助于增强基于细胞的疗法的细胞因子、趋化因子或生长因子。
可以提供冻干的细胞培养物以便用无菌蒸馏水在合适的容器中以浓缩溶液(例如10x或100x)或未稀释的形式进行重构。培养基可以作为试剂盒提供，其中具有用于T细胞或NK细胞分离或扩增的合适试剂。培养基可以作为试剂盒提供，其中HDACi和培养基在单独的容器中。培养基可以作为试剂盒提供，其中nanatinostat和培养基在单独的容器中。
现在描述细胞培养基的具体实施方案。
1.一种细胞培养基，其包含HDAC抑制剂(HDACi)，其中该HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。
2.实施方案1的细胞培养基，其不包含非人类来源的血清。
3.实施方案1的细胞培养基，其不包含血清。
4.实施方案1-3中任一项的细胞培养基，其进一步包含基于细胞的免疫疗法。
5.实施方案4的细胞培养基，其中所述基于细胞的免疫疗法包括T细胞群体。
6.实施方案5的细胞培养基，其中所述T细胞群体包含源自健康个体的原代T细胞群体。
7.实施方案5的细胞培养基，其中所述T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。
8.实施方案5的细胞培养基，其中所述T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。
9.实施方案5至8中任一项的细胞培养基，其中所述T细胞群体进一步包含嵌合抗原受体(CAR)。
10.实施方案5至9中任一项的细胞培养基，其中所述细胞培养基进一步包含肿瘤相关抗原。
11.实施方案5至9中任一项的细胞培养基，其中所述细胞培养基进一步包含促炎细胞因子。
12.实施方案5至9中任一项的细胞培养基，其中所述T细胞群体富含CD4阳性T细胞。
13.实施方案5至9中任一项的细胞培养基，其中所述T细胞群体富含CD8阳性T细胞。
14.实施方案5至13中任一项的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞群体中FoxP3的表达降低。
15.实施方案5至13中任一项的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞群体中干扰素γ的分泌增加。
16.实施方案5至13中任一项的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞群体中CXCR3的细胞表面表达增加。
17.实施方案4的细胞培养基，其中所述基于细胞的免疫疗法包括T细胞系。
18.实施方案17的细胞培养基，其中所述T细胞系包含嵌合抗原受体。
19.实施方案17或18的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞系中FoxP3的表达降低。
20.实施方案17或18的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞系中干扰素γ的分泌增加。
21.实施方案17或18的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，T细胞系中CXCR3的细胞表面表达增加。
22.实施方案4的细胞培养基，其中所述基于细胞的疗法包括天然杀伤细胞系或原代天然杀伤细胞群体。
23.实施方案22的细胞培养基，其中所述天然杀伤细胞系或群体包含嵌合抗原受体。
24.实施方案22的细胞培养基，其中所述天然杀伤细胞系或群体包含高亲和力Fc受体。
25.实施方案22至24中任一项的细胞培养基，其中在使基于细胞的免疫疗法与细胞培养基接触后，天然杀伤细胞系或群体中干扰素γ的分泌增加。
26.实施方案22至24中任一项的细胞培养基，其用于抑制或逆转T细胞衰竭的方法。
27.实施方案22至24中任一项的细胞培养基，其用于治疗患有疾病的个体的方法。
28.实施方案27的细胞培养基，其中所述疾病是癌症。
29.实施方案28的细胞培养基，其中所述癌症是乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、肝癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌或前列腺癌。
30.实施方案29的细胞培养基，其中所述癌症是白血病或淋巴瘤。
其他试剂
HDACi可以与其他试剂一起在培养基中结合以增强基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，免疫治疗剂是细胞因子或趋化因子。在某些实施方案中，该细胞因子为干扰素。在某些实施方案中，该细胞因子为干扰素α。在某些实施方案中，该细胞因子为干扰素β。在某些实施方案中，该细胞因子为干扰素γ。在某些实施方案中，该细胞因子为白介素。在某些实施方案中，该细胞因子为白介素1。在某些实施方案中，该细胞因子为白介素2。在某些实施方案中，该细胞因子是白介素7。在某些实施方案中，该细胞因子是白介素15。在某些实施方案中，该细胞因子为造血生长因子。
癌症
在某些实施方案中，本公开内容的方法用于治疗癌症或制造用于治疗癌症或肿瘤的药物。在某些实施方案中，本公开内容的方法用于增强癌症或肿瘤的治疗。在某些实施方案中，癌症或肿瘤为急性淋巴母细胞性白血病，成人；急性淋巴母细胞性白血病，儿童；急性髓样白血病，成人；急性髓样白血病，儿童；肾上腺皮质癌；肾上腺皮质癌，儿童；青春期癌症；AIDS相关癌症；AIDS相关淋巴瘤；肛门癌；阑尾癌；星形细胞瘤，儿童；非典型畸胎样/横纹肌样瘤，儿童，中枢神经系统；基底细胞癌；胆管癌，肝外；膀胱癌；膀胱癌，儿童；骨癌，骨肉瘤和恶性纤维组织细胞瘤；脑干胶质瘤，儿童；脑瘤，成人；脑瘤，脑干胶质瘤，儿童；脑瘤，中枢神经系统非典型畸胎样/横纹肌样瘤，儿童；脑瘤，中枢神经系统胚胎瘤，儿童；脑瘤，星形细胞瘤，儿童；脑瘤，颅咽管瘤，儿童；脑瘤，室管膜母细胞瘤，儿童；脑瘤，室管膜瘤，儿童；脑瘤，髓母细胞瘤，儿童；脑瘤，髓上皮瘤，儿童；脑瘤，中度分化的松果体实质瘤，儿童；脑瘤，幕上原始神经外胚层瘤和松果体母细胞瘤，儿童；脑和脊髓瘤，儿童(其他)；乳腺癌；乳腺癌和妊娠；乳腺癌，儿童；乳腺癌，男性；支气管瘤，儿童；伯基特淋巴瘤；类癌瘤，儿童；类癌瘤，胃肠；原发部位不明癌；中枢神经系统非典型畸胎样/横纹肌样瘤，儿童；中枢神经系统胚胎瘤，儿童；中枢神经系统(CNS)淋巴瘤，原发性；宫颈癌；宫颈癌，儿童；儿童癌症；脊索瘤，儿童；慢性淋巴细胞白血病；慢性髓性白血病；慢性脊髓增生性病症；结肠癌；结直肠癌，儿童；颅咽管瘤，儿童；皮肤T细胞淋巴瘤；胚胎瘤，中枢神经系统，儿童；子宫内膜癌；室管膜母细胞瘤，儿童；室管膜瘤，儿童；食管癌；食管癌，儿童；鼻腔神经胶质瘤，儿童；尤因肉瘤肿瘤家族；颅外生殖细胞瘤，儿童；性腺外生殖细胞瘤；肝外胆管癌；眼癌，眼内黑色素瘤；眼癌，视网膜母细胞瘤；胆囊癌；胃癌；胃癌，儿童；胃肠道类癌瘤；胃肠道间质瘤(GIST)；胃肠道间质细胞瘤，儿童；生殖细胞瘤，颅外，儿童；生殖细胞瘤，性腺外；生殖细胞瘤，卵巢；妊娠滋养细胞瘤；胶质瘤，成人；胶质瘤，儿童脑干；毛细胞白血病；头颈癌；心脏癌，儿童；肝细胞(肝)癌，成人(原发性)；肝细胞(肝)癌，儿童(原发性)；组织细胞增多症，朗格汉斯细胞；霍奇金淋巴瘤，成人；霍奇金淋巴瘤，儿童；下咽癌；眼内黑色素瘤；胰岛细胞瘤(内分泌胰腺)；卡波西肉瘤；肾(肾细胞)癌；肾癌，儿童；朗格汉斯细胞增生症；喉癌；喉癌，儿童；急性淋巴母细胞性白血病，成人；急性淋巴母细胞性白血病，儿童；急性髓样白血病，成人；急性髓样白血病，儿童；慢性淋巴细胞白血病；慢性髓性白血病；白血病，毛细胞；唇和口腔癌；肝癌，成人(原发性)；肝癌，儿童(原发性)；肺癌，非小细胞；肺癌，小细胞；淋巴瘤，AIDS相关；淋巴瘤，伯基特；淋巴瘤，皮肤T细胞；淋巴瘤，霍奇金，成人；淋巴瘤，霍奇金，儿童；淋巴瘤，非霍奇金，成人；淋巴瘤，非霍奇金，儿童；淋巴瘤，原发性中枢神经系统(CNS)；巨球蛋白血症，瓦尔登斯特伦；骨恶性纤维组织细胞瘤和骨肉瘤；髓母细胞瘤，儿童；髓上皮瘤，儿童；黑色素瘤；黑色素瘤，眼内(眼)；梅克尔细胞癌；间皮瘤，成人恶性；间皮瘤，儿童；原发隐匿性转移鳞状颈癌；口癌；多发性内分泌瘤综合征，儿童；多发性骨髓瘤/浆细胞瘤；蕈样肉芽肿病；骨髓增生异常综合征；骨髓增生异常/骨髓增生性肿瘤；髓性白血病，慢性；髓样白血病，成人急性；髓样白血病，儿童急性；骨髓瘤，多发性；骨髓增生性病症，慢性；鼻腔和鼻窦癌；鼻咽癌；鼻咽癌，儿童；神经母细胞瘤；非霍奇金淋巴瘤，成人；非霍奇金淋巴瘤，儿童；非小细胞肺癌；口癌，儿童；口腔和唇癌；口咽癌；骨肉瘤和骨恶性纤维组织细胞瘤；卵巢癌，儿童；卵巢上皮癌；卵巢生殖细胞瘤；卵巢低恶性潜伏肿瘤；胰腺癌；胰腺癌，儿童；胰腺癌，胰岛细胞瘤；乳头状瘤病，儿童；鼻窦和鼻腔癌；甲状旁腺癌；阴茎癌；咽癌；中度分化的松果体实质瘤，儿童；松果体细胞瘤和幕上原始神经外胚层瘤，儿童；垂体瘤；浆细胞瘤/多发性骨髓瘤；胸膜肺母细胞瘤，儿童；妊娠和乳腺癌；原发性中枢神经系统(CNS)淋巴瘤；前列腺癌；直肠癌；肾细胞(肾)癌；肾盂和输尿管癌，移行细胞癌；具有染色体15改变的呼吸道癌；视网膜母细胞瘤；横纹肌肉瘤，儿童；涎腺癌；涎腺癌，儿童；肉瘤，尤因肉瘤肿瘤家族；肉瘤，卡波西；肉瘤，软组织，成人；肉瘤，软组织，儿童；肉瘤，子宫；塞扎里综合征；皮肤癌(非黑色素瘤)；皮肤癌，儿童；皮肤癌(黑色素瘤)；皮肤癌，梅克尔细胞；小细胞肺癌；小肠癌；软组织肉瘤，成人；软组织肉瘤，儿童；鳞状细胞癌；原发隐匿性鳞状颈瘤，转移性；胃癌；幕上原始神经外胚层瘤，儿童；T细胞淋巴瘤，皮肤；睾丸癌；喉癌；胸腺瘤和胸腺癌；甲状腺癌；甲状腺癌，儿童；肾盂和输尿管的移行细胞癌；滋养细胞瘤，妊娠期；原发部位不明癌，成人；原发部位不明癌，儿童；儿童不寻常癌症；输尿管和肾盂癌，移行细胞癌；尿道癌；尿道癌，子宫内膜；子宫肉瘤；阴道癌；外阴癌；瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症；或维尔姆斯瘤。
病毒适应症
增强的基于细胞的疗法也可用作慢性病毒感染的治疗。在某些实施方案中，使用本文所述的方法治疗患有慢性病毒感染的个体。在某些实施方案中，慢性病毒感染包括人类免疫缺陷病毒(HIV)、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、单纯疱疹I型病毒、单纯疱疹II型病毒、人乳头瘤病毒(HPV)或人巨细胞病毒(hCMV)。
治疗潜伏的病毒性疾病的方法
本文公开的HDACi可用于治疗潜伏的病毒性疾病的方法。尽管许多潜伏的病毒性疾病(例如HIV或疱疹)可以得到有效治疗，但在“治愈”这些疾病(例如，完全清除病毒体或使得个体停止接受抗病毒治疗)方面仍然存在重大障碍。使用I类HDACi(如Nanatinostat)进行治疗可以使潜伏病毒库中的潜伏病毒重新激活，并允许使用适当的基于细胞的疗法或抗病毒药物进行治疗。这种方法可以称为“清除”或“踢除杀灭(kick and kill)”。在某些实施方案中，通过本文的方法“清除”的慢性病毒感染包括人类免疫缺陷病毒(HIV)、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、单纯疱疹I型病毒、单纯疱疹II型病毒或人巨细胞病毒(hCMV)。
本文公开的方法和HDACi可以用于治疗人类免疫缺陷病毒(HIV)的方法。在某些实施方案中，该方法和HDACi可用于重新激活潜伏的病毒库以消除病毒。在某些实施方案中，将HDACi施用于个体以重新激活潜伏病毒，然后用一种或多种HIV抗逆转录病毒药物、免疫疗法、基于细胞的免疫疗法、治疗性疫苗或其组合进行治疗。在某些实施方案中，HDACi包括nanatinostat、基本上由nanatinostat组成或由nanatinostat组成。
艾滋病毒呈阳性的个体可以使用HDACi(例如nanatinostat)治疗，以重新激活潜伏的艾滋病毒感染，以供通过随后的抗病毒治疗“清除”。可以事先用抗病毒方案治疗该个体。在某些实施方案中，通过标准实验室测试例如聚合酶链反应(PCR)检测不到个体的病毒载量。在某些实施方案中，个体的病毒载量低于1000个拷贝/mL。在某些实施方案中，个体的病毒载量低于500个拷贝/mL。在某些实施方案中，个体的病毒载量低于200个拷贝/mL。在某些实施方案中，个体的病毒载量低于100个拷贝/mL。在某些实施方案中，个体的病毒载量低于50个拷贝/mL。在某些实施方案中，在用潜伏期逆转剂例如HDACi治疗之前的至少3个月、6个月或一年，个体的病毒载量低于1000、500、200、100或50个拷贝/mL。
对于病毒“清除”应用，可以在患者被施用旨在消除潜伏病毒的治疗之前，先用有效量的I类HDAC抑制剂进行预处理。在一些实施方案中，I类HDACi是nanatinostat。在某些实施方案中，nanatinostat以40mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以以下剂量施用：约1mg/天、约2mg/天、约5mg/天、约10mg/天、约15mg/天、约20mg/天、约25mg/天、约30mg/天、约35mg/天、约40mg/天、约45mg/天、约50mg/天、约60mg/天、约70mg/天、约80mg/天、约90mg/天或约100mg/天。在某些实施方案中，nanatinostat以以下剂量施用：小于1mg/天、小于2mg/天、小于5mg/天、小于10mg/天、小于15mg/天、小于20mg/天、小于25mg/天、小于30mg/天、小于35mg/天、小于40mg/天、小于45mg/天、小于50mg/天、小于60mg/天、小于70mg/天、小于80mg/天、小于90mg/天或小于100mg/天。在一些实施方案中，nanatinostat以以下剂量施用：大于1mg/天、大于2mg/天、大于5mg/天、大于10mg/天、大于15mg/天、大于20mg/天、大于25mg/天、大于30mg/天、大于35mg/天、大于40mg/天、大于45mg/天、大于50mg/天、大于60mg/天、大于70mg/天、大于80mg/天、大于90mg/天或大于100mg/天。在某些实施方案中，nanatinostat的剂量大于30mg/天且小于50mg/天。在一些实施方案中，nanatinostat以大于5mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以大于10mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以大于20mg/天且小于80mg/天的剂量施用。在一些实施方案中，nanatinostat以以下剂量施用：约1mg/天、约2mg/天、约5mg/天、约6mg/天、约7mg/天、约8mg/天、约9mg/天、约10mg/天、约11mg/天、约12mg/天、约13mg/天、约14mg/天、约15mg/天、约16mg/天、约17mg/天、约18mg/天、约19mg/天、约20mg/天、约22mg/天、约23mg/天、约25mg/天、约27mg/天、约28mg/天、约30mg/天、约32mg/天、约33mg/天、约35mg/天、约40mg/天、约45mg/天、约50mg/天、约60mg/天、约70mg/天、约80mg/天、约90mg/天或约100mg/天。在某些实施方案中，nanatinostat每天一次(q.d.)、每天两次(b.i.d.)或每天三次(t.i.d.)施用。在一些实施方案中，nanatinostat每天一次、每周一次、每周两次、每周三次、每周四次或每周五次施用。nanatinostat可以在施用旨在消除潜伏病毒的治疗之前至少施用1、2、3或4周。nanatinostat可以在施用旨在消除潜伏病毒的治疗之前至少施用1、2、3或4个月。
在某些实施方案中，施用nanatinostat后施用抗逆转录病毒药物，或nanatinostat与抗逆转录病毒药物同时施用。在某些实施方案中，抗逆转录病毒药物包含或由以下组成：阿巴卡韦(Ziagen)、阿扎那韦(Reyataz)、达芦那韦(Prezista)、度鲁特韦(Tivicay)、依法韦伦(Sustiva)、埃替拉韦、恩曲他滨(Emtriva)、依曲韦林(Intelence)、呋山那韦(Telzir、Lexiva)、拉米夫定(Epivir)、洛匹那韦/利托纳韦(Kaletra)、马拉韦罗(Celsentri)、奈韦拉平(Viramune)、雷特格韦(Isentress)、利匹韦林(Edurant)、利托那韦(Norvir)、替诺福韦(Viread)、齐多夫定(AZT、Retrovir)及其组合。在某些实施方案中，抗逆转录病毒药物是联合治疗，其包含或由以下组成：例如依法韦伦/恩曲他滨/富马酸替诺福韦二吡呋酯(Atripla)，阿扎那韦/可比司他(Cobicistat)(Evotaz)、恩曲他滨/替诺福韦(Descovy)、达鲁那韦/可比司他(Rezol)、埃替拉韦/可比司他/恩曲他滨/替诺福韦(Stribild)、阿巴卡韦/度鲁特韦/拉米夫定(Triumeq)、恩曲他滨/利比韦林/替诺福韦(Odefsey)、利匹韦林/恩曲他滨/替诺福韦(Eviplera)、阿巴卡韦/拉米夫定(Kivexa)和埃替拉韦/可比司他/恩曲他滨/替诺福韦(Genvoya)。这些抗逆转录病毒药物中的任何一种均可按给予抗逆转录病毒药物的剂量和次数的标准进行给药。
在某些实施方案中，用nanatinostat治疗以重新激活潜伏病毒，然后施用免疫疗法治疗，或二者同时施用。在某些实施方案中，免疫疗法是结合HIV多肽的抗体或抗体混合物。在某些实施方案中，免疫疗法是基于细胞的疗法，其包括被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的CAR的CAR T细胞或其群体，被转基因有对结合至MHC I类或MHC II类分子的HIV多肽具有特异性的T细胞受体的T细胞或其群体，或特异性地裂解HIV感染细胞的细胞毒性T细胞群体(CD8+)。在某些实施方案中，基于细胞的疗法可以是用HDACi处理以逆转衰竭或以其他方式增强功能的自体T细胞群体。在某些实施方案中，基于细胞的疗法已经在体外用HDACi处理以如上所述增强基于细胞的疗法。在某些实施方案中，用于增强基于细胞的免疫疗法的HDACi是nanatinostat，并且被应用于基于细胞的疗法，之后施用于用HDACi处理以重新激活潜伏病毒的患者。
对于体外应用(例如施用于细胞培养基中)，可以用有效量的I类HDACi处理基于细胞的免疫疗法。在一些实施方案中，I类HDACi是Nanatinostat(也称为VRx-3996或CHR-3996)。Nanatinostat的化学式为(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。Nanatinostat为选择性I类HDAC抑制剂，且在美国专利号7,932,246中公开，该专利的全文通过引用并入本文。有效量是在基于细胞的免疫治疗剂中导致组蛋白乙酰化增加的量。在某个实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3。在某些实施方案中，乙酰化增加的组蛋白包括组蛋白H3，并且增加的乙酰化在赖氨酸9处。在某些实施方案中，用浓度小于约10μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约5μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约2μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约1μM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约900nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约800nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约700nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约600nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约500nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约400nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约300nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约200nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约100nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度小于约50nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约1nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约2nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约5nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约10nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，用浓度大于约100nM的nanatinostat处理基于细胞的免疫疗法。在某些实施方案中，施用的nanatinostat为约1nM至约5μM之间、约1nM至约2μM之间、约1nM至约1μM之间、约1nM至约900nM之间、约1nM至约800nM之间、约1nM至约700nM之间、约1nM至约600nM之间、约1nM至约500nM之间、约1nM至约400nM之间、约1nM至约300nM之间、约1nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约1nM至约50nM之间、约1nM至约25nM之间、约10nM至约5μM之间、约10nM至约2μM之间、约10nM至约1μM之间、约10nM至约900nM之间、约10nM至约800nM之间、约10nM至约700nM之间、约10nM至约600nM之间、约10nM至约500nM之间、约10nM至约400nM之间、约10nM至约300nM之间、约10nM至约200nM之间、约1nM至约100nM之间、约10nM至约50nM之间、约10nM至约25nM之间。Nanatinostat可以与基于细胞的免疫疗法一起温育约1、2、4、8、16、24或48小时。Nanatinostat可以与基于细胞的免疫疗法一起温育至少约1、2、4、8、16、24或48小时。Nanatinostat可以与基于细胞的免疫疗法温育不超过约1、2、4、8、16、24或48小时。
在某些实施方案中，可以在清除潜伏病毒库的方法中将不是nanatinostat的HDACi与nanatinostat进行组合。在某些实施方案中，不是nanatinostat的HDACi被用于重新激活潜伏病毒，而nanatinostat被用于增强靶向该病毒的基于细胞的免疫治疗剂。在某些实施方案中，nanatinostat被用于重新激活潜伏病毒，而不是nanatinostat的HDACi被用来增强靶向该病毒的基于细胞的免疫治疗剂。在某些实施方案中，该病毒是HIV。在某些实施方案中，不是nanatinostat的HDACi包括quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202。
本文在以下述特定编号实施方案中描述：
1.一种在个体中治疗人类免疫缺陷(HIV)感染的方法，其包括：向患有HIV感染的个体施用有效量的组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)，其中HDACi包括nanatinostat、quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202，其中患有HIV感染的个体的HIV病毒载量为每毫升血液小于1000个HIV RNA拷贝。
2.实施方案1的方法，其中所述个体的HIV病毒载量为每毫升少于100个HIV RNA拷贝。
3.实施方案1或2的方法，其中所述HDACi以小于80mg/天的剂量施用。
4.实施方案1或2的方法，其中所述HDACi以小于40mg/天的剂量施用。
5.实施方案1或2的方法，其中所述HDACi以小于20mg/天的剂量施用。
6.实施方案1至5中任一项的方法，其进一步包括对患有HIV感染的个体施用抗HIV治疗。
7.实施方案6的方法，其中所述抗HIV治疗包括抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。
8.实施方案7的方法，其中所述抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐选自阿巴卡韦、阿扎那韦、达芦那韦、度鲁特韦、依法韦伦、埃替拉韦、恩曲他滨、依曲韦林、呋山那韦、拉米夫定、洛匹那韦、马拉韦罗、奈韦拉平、雷特格韦、利匹韦林、利托那韦、替诺福韦、齐多夫定及其组合。
9.实施方案6的方法，其中所述抗HIV治疗包括免疫疗法。
10.实施方案9的方法，其中所述免疫疗法包含与HIV衍生的多肽结合的抗体。
11.实施方案9的方法，其中所述免疫疗法包括T细胞群体。
12.实施方案11的方法，其中所述T细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。
13.实施方案11的方法，其中所述T细胞群体是特异性地裂解HIV感染细胞的细胞毒性T细胞群体。
14.实施方案9的方法，其中所述免疫疗法包括天然杀伤细胞群体。
15.实施方案14的方法，其中所述天然杀伤细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。
16.实施方案9至15中任一项的方法，其中在向患有HIV感染的个体施用之前，使免疫疗法与nanatinostat进行体外接触。
17.实施方案16的方法，其中nanatinostat的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。
18.实施方案17的方法，其中nanatinostat的浓度小于约1微摩尔。
19.实施方案17的方法，其中使nanatinostat与免疫疗法接触至少2小时。
20.实施方案17的方法，其中使nanatinostat与免疫疗法接触至少16小时。
21.实施方案1至20中任一项的方法，其中所述患有HIV感染的个体先前已接受抗HIV治疗。
22.实施方案1至20中任一项的方法，其中所述抗HIV治疗是抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。
非HDACi潜伏期逆转剂
另外，非-HDACi病毒潜伏期逆转剂可以与HDACi组合使用，用于在用免疫治疗剂或抗病毒药物治疗之前或期间重新激活潜伏病毒的步骤。在某些实施方案中，非HDACi病毒潜伏期逆转剂包括蛋白激酶C(PKC)调节剂如苔藓抑制素-1或类似物，或基本上由其组成。在某些实施方案中，非-HDACi病毒潜伏期逆转剂包括白介素7(IL-7)、IL-7激动剂，例如雷特格韦(raltegravir)或马拉罗韦(maraviroc)，或基本上由其组成。在某些实施方案中，非HDACi病毒潜伏期逆转剂包括白介素15(IL-15)或IL-15激动剂，或基本上由其组成。在某些实施方案中，非HDACi病毒潜伏期逆转剂包括二硫仑或基本上由其组成。在某些实施方案中，非HDACi病毒潜伏期逆转剂包括Toll样受体激动剂如MGN1703，或基本上由其组成。在某些实施方案中，非HDACi病毒潜伏期逆转剂包括Ingenol-B，或基本由其组成。在某些实施方案中，非HDACi病毒潜伏时间逆转剂包括溴结构域和末端外结构域抑制剂(Bromodomainand Extraterminal inhibitor，BETi)，例如JQ1、1-BET或1-BET151，或基本由其组成。
疫苗佐剂
如本文所示，由于HDACi可以改善细胞免疫系统的组分(例如T细胞和NK细胞)的功能方面，因此HDACi可以用作疫苗佐剂。在某些实施方案中，HDACi可以用作佐剂，被包括在包含HDACi和预防性疫苗(例如在感染某种细菌或病毒之前施用以预防感染或症状的疫苗)的制剂中。HDACi可作为佐剂被包括经皮下、肌肉内、口服或静脉内施用的预防性疫苗中。HDACi可与其他常见的佐剂(如明矾或角鲨烯油)，或任何其他适合在注射部位引起局部炎症的佐剂一起包含在内。在某些实施方案中，HDACi包括或基本上由以下组成：quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202。在某些实施方案中，HDACi包括nanatinostat或基本上由其组成。
在某些实施方案中，制剂中包含的HDACi的浓度为至少约1mg/mL、约2mg/mL、约5mg/mL、约10mg/mL、约15mg/mL、约20mg/mL、约25mg/mL、约30mg/mL、约35mg/mL、约40mg/mL、约45mg/mL、约50mg/mL、约60mg/mL、约70mg/mL约80mg/mL、约90mg/mL、约100mg/mL、约150mg/mL、200mg/mL、300mg/mL、400mg/mL或约500mg/mL。在某些实施方案中，疫苗组合物中包含的HDACi的浓度为约1mg/mL、约2mg/mL、约5mg/mL、约10mg/mL、约15mg/mL、约20mg/mL、约25mg/mL、约30mg/mL、约35mg/mL、约40mg/mL、约45mg/mL、约50mg/mL、约60mg/mL、约70mg/mL约80mg/mL、约90mg/mL、约100mg/mL、约150mg/mL、200mg/mL、300mg/mL、400mg/mL或约500mg/mL。在某些实施方案中，疫苗组合物中包含的HDACi的浓度不超过约1mg/mL、约2mg/mL、约5mg/mL、约10mg/mL、约15mg/mL、约20mg/mL、约25mg/mL、约30mg/mL、约35mg/mL、约40mg/mL、约45mg/mL、约50mg/mL、约60mg/mL、约70mg/mL、约80mg/mL、约90mg/mL、约100mg/mL、约150mg/mL、200mg/mL、300mg/mL、400mg/mL或约500mg/mL。
在某些实施方案中，制剂中包含的nanatinostat浓度为至少约1mg/mL、约2mg/mL、约5mg/mL、约10mg/mL、约15mg/mL、约20mg/mL、约25mg/mL、约30mg/mL、约35mg/mL、约40mg/mL、约45mg/mL、约50mg/mL、约60mg/mL、约70mg/mL约80mg/mL、约90mg/mL、约100mg/mL、约150mg/mL、200mg/mL、300mg/mL、400mg/mL或约500mg/mL。在某些实施方案中，疫苗组合物中包含的nanatinostat的浓度为约1mg/mL、约2mg/mL、约5mg/mL、约10mg/mL、约15mg/mL、约20mg/mL、约25mg/mL、约30mg/mL、约35mg/mL、约40mg/mL、约45mg/mL、约50mg/mL、约60mg/mL、约70mg/mL、约80mg/mL、约90mg/mL、约100mg/mL、约150mg/mL、200mg/mL、300mg/mL、400mg/mL或约500mg/mL。在某些实施方案中，疫苗组合物中包含的nanatinostat的浓度不超过约1mg/mL、约2mg/mL、约5mg/mL、约10mg/mL、约15mg/mL、约20mg/mL、约25mg/mL、约30mg/mL、约35mg/mL、约40mg/mL、约45mg/mL、约50mg/mL、约60mg/mL、约70mg/mL、约80mg/mL、约90mg/mL、约100mg/mL、约150mg/mL、200mg/mL、300mg/mL、400mg/mL或约500mg/mL。
实施例
实施例1-用nanatinostat处理脾细胞减少FoxP3+调节性T细胞
nanatinostat特异性地减少CD4+、CD25+和FoxP3+调节性细胞。与另一种HDAC抑制剂恩替司他相比，这种减少尤为显著。
对于该实验，建立7个处理组(未经处理、经DMSO处理、1μM的恩替司他、1μM的nanatinostat、500nM的nanatinostat、100nM的nanatinostat和1nM的nanatinostat)。对从5只幼稚BALB/c小鼠(每个处理组n＝5)分离的脾细胞进行各个处理。使用MiltenyiGentlemacs将脾加工成单细胞悬浮液。使用RBC裂解缓冲液来裂解红细胞。对细胞进行计数并将其重悬于含有10％FBS的RΜMI培养基中。根据下表将来自每个脾的细胞以3x 106个细胞/孔接种在12孔板中。将测试试剂以下表中所示的浓度添加到每个板中，并在FACS分析之前温育24小时。FACS分析由以下标志物组成：活/死、CD45、CD3、CD4、CD25和FoxP3。结果在以下表1中示出。与1μM恩替司他相比，nanatinostat导致FoxP3，CD25+T细胞减少近47倍(表1的最后一列和图1A)。至少在低至100nM观察到这种抑制效果(表1的最后一列和图1B)
Figure BDA0002677076960000641
实施例2：Nanatinostat增强免疫疗法在小鼠异种移植模型中的功效
在调节性T细胞上观察到的nanatinostat(CHR-3996)的作用可以导致免疫治疗剂(如靶向PD-1/PD-L1轴的免疫治疗剂)的功效增强。在该实施例中，在两种不同的肿瘤异种移植模型4T1和CT26中将nanatinostat治疗与抗PD-1抗体治疗进行组合。每个模型在6个不同的治疗组中进行测试(媒介物、10mg/kg抗PD-1、25mg/kg nanatinostat、10mg/kgnanatinostat、10mg/kg抗PD-1和25mg/kg nanatinostat、10mg/kg抗PD-1和10mg/kgnanatinostat)，每组由8只动物组成。在动物的右后胁部接种4T1或CT26，当肿瘤为65-90mm3时开始给药并持续21天。每天向动物给予nanatinostat，并且每周给予抗PD-1两次。图2显示，与单独给予PD-1或nanatinostat相比，经抗PD-1和nanatinostat(填充图形)组合治疗，接受CT26肿瘤的小鼠在肿瘤生长方面展示出更大的减少。对于两种浓度的nanatinostat(10mg/kg/天，以及25mg/kg/天)均观察到这种情况。图3A和图3B显示4T1肿瘤细胞系对该作用具有抗性。实际上，该肿瘤对单独抗PD-1治疗具有抗性，从而表明用nanatinostat进行的HDAC治疗可以与免疫疗法(如抗PD-1和可能的所有检查点抑制物)特异性地协同作用。
实施例3-Nanatinostat增加在小鼠异种移植模型中的T细胞肿瘤浸润
在Balb/c小鼠的CT26皮下肿瘤模型中评估了单独的Nanatinostat以及与抗mPD-1联合使用的情况。每日向动物口服给药25mg/kg的nanatinostat，并每两周一次在腹膜内给药10mg/kg的抗mPD-1。每组选择8只动物，并在第9天，在给药后12-13小时收集肿瘤用于FACS和qPCR分析。其余动物继续接受各自的治疗，直到第21天。Nanatinostat的耐受性良好。如表2所示，在第9天，联合治疗组(nanatinostat和抗PD-1)诱导最高的肿瘤生长抑制(57％)，而单独抗PD-1和单独nanatinostat的组分别诱导36％和33％的部分的肿瘤生长抑制。
Figure BDA0002677076960000651
Figure BDA0002677076960000661
如图4所示，与媒介物或抗PD-1组相比，在Natatinostat治疗组中T细胞浸润显著增加(两者的p值均为0.007)。具体而言，与媒介物组相比，nanatinostat治疗组中的CD8+T细胞群体更高，而各组之间CD4+群体和调节性T细胞群体没有显著差异(未示出)。如图5A和5B所示，用nanatinostat+抗PD-1治疗的组与仅用抗PD-1治疗的组相比，在CD4+T细胞(图5A；相对于媒介物的p-值为0.015，相对于抗PD-1的p-值为0.07)和CD8+T细胞(图5B；相对于抗PD-1的p-值为0.0.21)中表达CXCR3的细胞群体显著更高，而仅用nanatinostat治疗与媒介物组相比，未观察到显著差异。
如图6A(TGFβ1)和6B(Stat6)所示，与对照组相比，治疗组中免疫抑制性标志物TGFB1和Stat6的基因表达(相对于媒介物对照组)的倍数变化趋于降低。反之，图7A(IFN-γ)、图7B(Tbet)显示在联合组中基因表达的倍数变化最高。
有趣的是，如图8所示，Nanatinostat和PD-1分别增加NK细胞上KLRC2的表达，但是二者组合却阻止了这种增加。
方法
动物：将从Jackson实验室购买的144只雌性Balb/c小鼠(出生日期：2017年8月1日)进行接种以供研究。接种前将动物饲养为期5天的稳定期。将动物饲养在单独的HEPA通风笼(
Figure BDA0002677076960000662
IVC，Innovive USA)中。提供12小时循环的荧光灯照明。温度和湿度每天监控和记录，并分别保持在68-74°F(20-23℃)和30-70％湿度的最大范围内。提供2920X.1018％经辐照的大豆啮齿动物饲料(Envigo)和高压灭菌的酸化水(pH 2.5-3)供随意取用。
肿瘤细胞的制备：按照ATCC推荐的培养方案培养CT26细胞。为了进行接种，将细胞在PBS中洗涤、计数，并以250,000个活细胞/100μl的浓度重悬于冷PBS中。在将细胞悬浮液转移到饲养室期间，将其保持在冰上。通过将细胞抽入装有26G7/8(0.5mm X 22mm)针的冷却的1ml注射器中来使细胞准备用于注射。
肿瘤植入：使用经批准的标准麻醉根据需要使动物准备用于注射，并在注射前将小鼠剃毛。一次固定一只小鼠，并用酒精棉签对注射部位进行消毒。将100μl的细胞悬浮液皮下注射到小鼠的后胁腹。通过耳标标记小鼠。
肿瘤测量：每天监测动物的可触及的肿瘤或任何外观或行为的变化。一旦可触及肿瘤，就用卡尺测量。使用下式计算肿瘤体积(最大直径×最短直径2)/2。
FACS分析：在第9天，在最后一次给药后12-13小时，采集N＝8只/组的肿瘤用于PD评估。将每个肿瘤的一半置于转移缓冲液中用于FACS分析。
QPCR分析：在第9天，采集N＝8只/组的肿瘤用于PD评估。快速冷冻每个肿瘤的一半用于随后的qPCR分析。将快速冷冻的肿瘤的碎片转移到RLT PLUS缓冲液(Qiagen)中，并装入标记的和预装微珠的管中，并以最大速度匀化60秒。根据制造商的方案，使用从Qiagen购买的AllPrep DNA/RNA Mini试剂盒提取RNA。根据Biotec方案，通过Synergy 2多模式读取仪评估RNA的数量和纯度。来自每个样品的总计750ng RNA用于在20μl反应中生成cDNA。通过使用Eppendorf Mastercycler Pro，按照ThermoFisher的Superscript III第一链合成方案的标准进行反应。在逆转录后，根据制造商的说明，使用大肠杆菌RNA酶H消化模板RNA。将每个样品的37.5ng cDNA用于在10μl反应总体积中的基因表达PCR。每个样品分析三次，并使用384孔平台ABI-ViiA7快速实时PCR系统，通过制造商建议的标准参数进行qRT-PCR。这项研究使用了从Thermo Fisher购买的特定TaqMan基因表达分析。使用ABI 2.1软件在ViiA7系统上分析基因表达数据，以生成原始数据。小鼠β-肌动蛋白用作管家基因。
实施例4-在自体过继性T细胞免疫疗法中使用nanatinostat体外处理肿瘤浸润淋巴细胞
被诊断患有或怀疑患有乳腺癌的患者的肿瘤浸润淋巴细胞从活检组织分离。在IL-2、抗CD3和经辐照的饲养细胞的存在下，将细胞在X-VIVO培养基(Lonza)中扩增。一旦产生足够数量的细胞(至少1×109)，就将细胞与100nM的nanatinostat温育24小时。处理后，采集T细胞并施用于患者(至少1×109)。
实施例5-在已经用nanatinostat预处理的患者的自体过继性T细胞免疫疗法中用nanatinostat体外处理肿瘤浸润淋巴细胞
按照实施例4进行该实施例，除了在分离肿瘤浸润淋巴细胞之前，患者每周口服2mg的nanatinostat进行处理持续4周。
实施例6-通过nanatinostat逆转T细胞衰竭
为了测试nanatinostat单独或与PD-1组合是否可用于逆转T细胞衰竭，采用标准的T细胞衰竭试验。通过密度梯度从3个人类供体血沉棕黄层中分离外周血单核细胞(PBMC)。用合并的病原体特异性I类肽(CEFT)刺激PBMC，以产生衰竭的T细胞群体。然后再用CEFT和自体单核细胞衍生的树突细胞将细胞再刺激一段时间，然后在最终的再刺激试验中使用补充的DC和CEFT进行测试，以监测衰竭的逆转。刺激试验是在单独存在HDAC抑制剂nanatinostat(Nstat)或其与抗PD-1组合的情况下，或在存在另一I类HDACi恩替司他的情况下进行的。测试了HDAC抑制剂的一个剂量，并使用单个剂量的抗PD-1。还铺板了未刺激的对照和参考HDAC抑制剂。用3H-胸苷脉冲培养物并评估增殖。还采集上清液以通过多重分析进行细胞因子分析。使用针对CD4、CD8、PD-1、IL-15R、TIGIT、CD45RO、CCR7、IFNγ和CD25的抗体组对细胞样品进行染色，并使用流式细胞仪进行表征，以确认其衰竭的表型以及确认在暴露于联合疗法后表达水平是否发生了变化。在第0天也使用上述组对PBMC进行表型分析，以确定细胞群体的初始频率。
数据表明T细胞衰竭方案是有效的。图9A示出了PBMC增殖在第6天达到峰值，然后迅速下降，直到在第10天用(CEFT)再刺激T细胞。图9B和9C示出了与单独的CEFT相比，抗PD-1加CEFT恢复了CD8+T细胞的增殖。单独的Nanatinostat对CEFT CD8+T细胞增殖具有不利影响，但是当与抗PD-1(派姆单抗)治疗联合使用时，在10nM和100nM下，增殖可以得到恢复。响应于PD-1的这种增殖下降不是细胞活力降低的结果，如图10所示。总体来说，与I类HDAC1和HDAC3抑制剂恩替司他相比，细胞对nanatinostat的耐受性好(比较图10A和10B)。如图11所示，与单独的PD-1抑制剂或单独的nanatinostat相比，用nanatinostat加PD-1抑制剂抗体处理的再刺激的CD8+T细胞分泌更多的IFN-γ(图11B)，而不论是单独的恩替司他还是恩替司他与抗PD-1组合，恩替司他实际上减少了释放的IFN-γ的量(图11A)。单独的Nanatinostat对由再刺激的CD8+T细胞释放的IFN-γ几乎没有影响(图11B)。
图12示出，对来自再刺激的CD8+T细胞的上清液的细胞因子的分析表明，抗PD1和nanatinostat的组合增加了免疫刺激性的IFN-γ(图12A)和TNFα(图12B)的释放，同时降低了免疫抑制性的TGFβ(图12C)的释放。
尽管本文已经示出并描述了本发明的优选实施方案，但对于本领域技术人员而言显而易见的是，这些实施方案仅以示例的方式提供。本领域技术人员在不脱离本发明的情况下现将想到多种变化、改变和替代。应当理解，本文中所述的本发明实施方案的各种替代方案可用于实施本发明。旨在用以下权利要求限定本发明的范围，并且由此涵盖这些权利要求范围内的方法和结构及其等同物。

Claims (101)

1.一种用于增强基于细胞的免疫疗法的方法，其包括使基于细胞的免疫疗法与HDAC抑制剂(HDACi)进行体外接触，其中所述HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法逆转T细胞衰竭。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述HDACi的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述HDACi的浓度小于约1微摩尔。
5.根据权利要求3所述的方法，其中所述HDACi的浓度为至少约400纳摩尔。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中使所述HDACi与所述基于细胞的免疫疗法接触至少2小时。
7.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中使所述HDACi与所述基于细胞的免疫疗法接触至少16小时。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述基于细胞的免疫疗法与白介素-15接触。
9.根据权利要求8所述的方法，其中将白介素15以约1至约100ng/mL的浓度与所述基于细胞的免疫疗法接触。
10.根据权利要求8所述的方法，其中将白介素15以约5至约25ng/mL的浓度与所述基于细胞的免疫疗法接触。
11.根据权利要求8所述的方法，其中将白介素15以约10ng/mL的浓度与所述基于细胞的免疫疗法接触。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述基于细胞的免疫疗法与检查点抑制物接触。
13.根据权利要求12所述的方法，其中所述检查点抑制物是靶向PDL-1或PD-1的抗体。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述基于细胞的免疫疗法包括T细胞群体。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述T细胞群体包括源自健康个体的原代T细胞群体。
16.根据权利要求14所述的方法，其中所述T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。
17.根据权利要求14至16中任一项所述的方法，其中所述T细胞群体进一步包含嵌合抗原受体(CAR)。
18.根据权利要求14至16中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括用肿瘤相关抗原刺激所述T细胞群体。
19.根据权利要求14至16中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括用促炎细胞因子刺激所述T细胞群体。
20.根据权利要求14至19中任一项所述的方法，其中所述T细胞群体富含CD4阳性T细胞。
21.根据权利要求14至19中任一项所述的方法，其中所述T细胞群体富含CD8阳性T细胞。
22.根据权利要求14至21中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞群体中FoxP3的表达降低。
23.根据权利要求14至21中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞群体中干扰素γ的分泌增加。
24.根据权利要求14至21中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞群体中CXCR3的细胞表面表达增加。
25.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述基于细胞的疗法包括T细胞系。
26.根据权利要求25所述的方法，其中所述T细胞系包含嵌合抗原受体。
27.根据权利要求25或26所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞系中FoxP3的表达降低。
28.根据权利要求25或26所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞系中干扰素γ的分泌增加。
29.根据权利要求25或26所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞系中CXCR3的细胞表面表达增加。
30.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述基于细胞的免疫疗法包括天然杀伤细胞系或原代天然杀伤细胞群体。
31.根据权利要求30所述的方法，其中所述天然杀伤细胞系或群体包含嵌合抗原受体。
32.根据权利要求30所述的方法，其中所述天然杀伤细胞系或群体包含高亲和力Fc受体。
33.根据权利要求30至32中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述天然杀伤细胞系或群体中干扰素γ的分泌增加。
34.根据权利要求1至33中任一项所述的方法，其进一步包括对患有疾病的个体施用所述基于细胞的免疫疗法。
35.根据权利要求34所述的方法，其中所述基于细胞的免疫疗法对于所述患有疾病的个体是自体的。
36.根据权利要求34所述的方法，其中所述疾病是癌症。
37.根据权利要求36所述的方法，其中所述癌症是乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、肝癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌或前列腺癌。
38.根据权利要求36所述的方法，其中所述癌症是白血病或淋巴瘤。
39.一种过继性细胞免疫疗法，其包括：
a)使基于细胞的免疫疗法与HDAC抑制剂(HDACi)接触，其中所述HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；以及
b)对患有疾病的个体施用所述基于细胞的免疫疗法。
40.根据权利要求39所述的方法，其中使所述基于细胞的免疫疗法与所述HDACi进行体外接触。
41.根据权利要求39所述的方法，其中所述HDACi的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。
42.根据权利要求41所述的方法，其中所述HDACi的浓度小于约1微摩尔。
43.根据权利要求41所述的方法，为至少约400纳摩尔。
44.根据权利要求39至43中任一项所述的方法，其中使所述HDACi与所述基于细胞的免疫疗法接触至少2小时。
45.根据权利要求39至43中任一项所述的方法，其中使所述HDACi与所述基于细胞的免疫疗法接触至少16小时。
46.根据权利要求39至45中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述基于细胞的免疫疗法与白介素-15接触。
47.根据权利要求46所述的方法，其中将白介素15以约1至约100ng/mL的浓度与所述基于细胞的免疫疗法接触。
48.根据权利要求46所述的方法，其中将白介素15以约5至约25ng/mL的浓度与所述基于细胞的免疫疗法接触。
49.根据权利要求46所述的方法，其中将白介素15以约10ng/mL的浓度与所述基于细胞的免疫疗法接触。
50.根据权利要求39至49中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述基于细胞的免疫疗法与检查点抑制物接触。
51.根据权利要求50所述的方法，其中所述检查点抑制物是靶向PDL-1或PD-1的抗体。
52.根据权利要求39至51中任一项所述的方法，其中所述基于细胞的免疫疗法包括T细胞群体。
53.根据权利要求52所述的方法，其中所述T细胞群体包括源自健康个体的原代T细胞群体。
54.根据权利要求52所述的方法，其中所述T细胞群体包括源自患有疾病的个体的原代T细胞群体。
55.根据权利要求52所述的方法，其中所述T细胞群体包括源自患有所述疾病的所述个体的原代T细胞群体。
56.根据权利要求52至55中任一项所述的方法，其中所述T细胞群体进一步包含嵌合抗原受体(CAR)。
57.根据权利要求52至55中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括用肿瘤相关抗原刺激所述T细胞群体。
58.根据权利要求52至55中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括用促炎细胞因子刺激所述T细胞群体。
59.根据权利要求52至58中任一项所述的方法，其中所述T细胞群体富含CD4阳性T细胞。
60.根据权利要求52至58中任一项所述的方法，其中所述T细胞群体富含CD8阳性T细胞。
61.根据权利要求52至60中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞群体中FoxP3的表达降低。
62.根据权利要求52至60中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞群体中干扰素γ的分泌增加。
63.根据权利要求52至60中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞群体中CXCR3的细胞表面表达增加。
64.根据权利要求39至51中任一项所述的方法，其中所述基于细胞的免疫疗法包括T细胞系。
65.根据权利要求64所述的方法，其中所述T细胞系包含嵌合抗原受体。
66.根据权利要求64或65所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞系中FoxP3的表达降低。
67.根据权利要求64或65所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞系中干扰素γ的分泌增加。
68.根据权利要求64或65所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述T细胞系中CXCR3的细胞表面表达增加。
69.根据权利要求39至51中任一项所述的方法，其中所述基于细胞的免疫疗法包括天然杀伤细胞系或原代天然杀伤细胞群体。
70.根据权利要求69所述的方法，其中所述天然杀伤细胞系或群体包含嵌合抗原受体。
71.根据权利要求69所述的方法，其中所述天然杀伤细胞系或群体包含高亲和力Fc受体。
72.根据权利要求69至71中任一项所述的方法，其中在使所述基于细胞的免疫疗法与HDACi接触后，所述天然杀伤细胞系或群体中干扰素γ的分泌增加。
73.根据权利要求39至72中任一项所述的方法，其中所述疾病是癌症。
74.根据权利要求73所述的方法，其中所述癌症是乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、肝癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌或前列腺癌。
75.根据权利要求73所述的方法，其中所述癌症是白血病或淋巴瘤。
76.一种在个体中治疗人类免疫缺陷病毒(HIV)感染的方法，其包括：向患有HIV感染的个体施用有效量的nanatinostat，其中所述患有HIV感染的个体的HIV病毒载量为每毫升血液小于1000个HIV RNA拷贝。
77.根据权利要求76所述的方法，其中所述个体的HIV病毒载量为每毫升小于100个HIVRNA拷贝。
78.根据权利要求76或77所述的方法，其中nanatinostat以小于80mg/天的剂量施用。
79.根据权利要求76或77所述的方法，其中nanatinostat以小于40mg/天的剂量施用。
80.根据权利要求76或77所述的方法，其中nanatinostat以小于20mg/天的剂量施用。
81.根据权利要求76至80中任一项所述的方法，其进一步包括对所述患有HIV感染的个体施用抗HIV治疗。
82.根据权利要求81所述的方法，其中所述抗HIV治疗包括抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。
83.根据权利要求82所述的方法，其中所述抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐选自阿巴卡韦、阿扎那韦、达芦那韦、度鲁特韦、依法韦伦、埃替拉韦、恩曲他滨、依曲韦林、呋山那韦、拉米夫定、洛匹那韦、马拉韦罗、奈韦拉平、雷特格韦、利匹韦林、利托那韦、替诺福韦、齐多夫定及其组合。
84.根据权利要求81所述的方法，其中所述抗HIV治疗包括免疫疗法。
85.根据权利要求84所述的方法，其中所述免疫疗法包含与HIV多肽结合的抗体。
86.根据权利要求84所述的方法，其中所述免疫疗法包括T细胞群体。
87.根据权利要求86所述的方法，其中所述T细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。
88.根据权利要求86所述的方法，其中所述T细胞群体是特异性地裂解HIV感染的细胞的细胞毒性T细胞群体。
89.根据权利要求84所述的方法，其中所述免疫疗法包括天然杀伤细胞群体。
90.根据权利要求89所述的方法，其中所述天然杀伤细胞群体被转基因有对HIV衍生的多肽具有特异性的嵌合抗原受体。
91.根据权利要求84至90中任一项所述的方法，其中在向所述患有HIV感染的个体施用之前，使所述免疫疗法与组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)进行体外接触。
92.根据权利要求91所述的方法，其中所述HDACi包括nanatinostat、quisinostat(JNJ-26481585(N-羟基-2-(4-((((1-甲基-1H-吲哚-3-基)甲基)氨基)甲基)哌啶-1-基)嘧啶-5-甲酰胺)、R306465/JNJ-16241199(N-羟基-5-(4-(萘-2-基磺酰基)哌嗪-1-基)嘧啶-2-甲酰胺)、贝林司他/PXD101、曲古抑菌素A/TSA(7-[4-(二甲基氨基)苯基]-N-羟基-4,6-二甲基-7-氧代庚-2,4-二烯酰胺)、ITF2357、CBHA、吉维司他/ITF2357、罗米地新、PCI-24781、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、丁酸盐、丁酸苯酯、丙戊酸、AN-9、CI-994、恩替司他/MS-275/SNDX-275、莫西司他/MGCD0103(N-(2-氨基苯基)-4-((4-吡啶-3-基嘧啶-2-基氨基)甲基)苯甲酰胺)、间羧基肉桂酸、双异羟肟酸、辛二酸双异羟肟酸、oxamflatin、ABHA、SB-55629、pyroxamide、丙烯酰胺、芳酰基吡咯基羟肟酸酯或LAQ824(((E)-N-羟基-3-[4-[[2-羟乙基-[2-(1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙-2-烯酰胺)、panobinostat/LBH-589、vorinsotat/SAHA、西达本胺或4SC-202。
93.根据权利要求92所述的方法，其中所述HDACi包括nanatinostat。
94.根据权利要求91至93中任一项所述的方法，其中所述HDACi的浓度为足以增加组蛋白H3的乙酰化的量。
95.根据权利要求91至93中任一项所述的方法，其中所述HDACi的浓度小于约1微摩尔。
96.根据权利要求91至93中任一项所述的方法，其中使所述HDACi与所述免疫疗法接触至少2小时。
97.根据权利要求91至93中任一项所述的方法，其中使所述HDACi与所述免疫疗法接触至少16小时。
98.根据权利要求76至97中任一项所述的方法，其中所述患有HIV感染的个体先前已接受抗HIV治疗。
99.根据权利要求81至98中任一项所述的方法，其中所述抗HIV治疗是抗逆转录病毒药物或其药学上可接受的盐。
100.一种用于治疗患有潜伏病毒感染的个体的方法，其包括：
a)向患有所述潜伏病毒感染的个体施用第一组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)；
b)使基于细胞的免疫疗法与第二HDACi进行体外接触，其中所述第二HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；以及
c)对患有所述潜伏病毒感染的所述个体施用所述基于细胞的免疫疗法。
101.一种用于治疗患有潜伏病毒感染的个体的方法，其包括：
a)向患有所述潜伏病毒感染的个体施用第一组蛋白脱乙酰酶抑制剂(HDACi)，其中所述第一HDACi包括nanatinostat(2-(6-{[(6-氟喹啉-2-基)甲基]氨基}-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-羟基嘧啶-5-甲酰胺)；
b)使基于细胞的免疫疗法与第二HDACi进行体外接触；以及
c)对患有所述潜伏病毒感染的所述个体施用所述基于细胞的免疫疗法。
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Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB2567093A (en) 2016-07-15 2019-04-03 Viracta Therapeutics Inc Histone deacetylase inhibitors for use in immunotherapy
CN115052600A (zh) 2019-12-05 2022-09-13 维拉克塔附属公司 Hdac抑制剂固态形式
CA3196385A1 (en) 2020-10-28 2022-05-05 Xiaohu Deng Hdac inhibitor solid state forms
CN114699395A (zh) * 2021-04-25 2022-07-05 华为云计算技术有限公司 贝利司他或其药学上可接受的盐在制备治疗感染的药物中的用途
CN113502265B (zh) * 2021-05-25 2024-05-28 昭泰英基生物医药（香港）有限公司 将t细胞重编程为类nk细胞的诱导剂及其应用

Citations (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1146136A (zh) * 1994-02-14 1997-03-26 杰纳勒尔医疗公司 由携带嵌合cd4受体的细胞针对hiv感染细胞的细胞溶解作用
CN101856348A (zh) * 2003-08-29 2010-10-13 斯隆-凯特林癌症研究所 联合治疗癌症的方法
US20110245154A1 (en) * 2010-03-11 2011-10-06 Hemaquest Pharmaceuticals, Inc. Methods and Compositions for Treating Viral or Virally-Induced Conditions
US20150023937A1 (en) * 2013-07-18 2015-01-22 Baylor College Of Medicine Histone deacetylase (hdac) inhibitor up-regulates car expression and targeted antigen intensity, increasing antitumor efficacy
US20150099012A1 (en) * 2012-03-02 2015-04-09 Erasmus University Medical Center Rotterdam Methods for activating retrovirus in latent infected cells, and compounds for use therein
WO2017132536A1 (en) * 2016-01-28 2017-08-03 Indiana University Research & Technology Corporation Use of histone deacetylase inhibitors for enhancing immunotherapies
WO2017134116A1 (en) * 2016-02-02 2017-08-10 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for enhancing cd8+ t cell-dependent immune responses in subjects suffering from cancer
WO2017197140A1 (en) * 2016-05-11 2017-11-16 Huya Bioscience International, Llc Combination therapies of hdac inhibitors and pd-l1 inhibitors
WO2017202949A1 (en) * 2016-05-25 2017-11-30 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and compositions for treating cancers

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3400009A2 (en) * 2016-01-05 2018-11-14 The U.S.A. As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Combination of histone deacetylase inhibitor and immunotherapy
GB2567093A (en) * 2016-07-15 2019-04-03 Viracta Therapeutics Inc Histone deacetylase inhibitors for use in immunotherapy
TW201922282A (zh) * 2017-10-13 2019-06-16 大陸商江蘇恆瑞醫藥股份有限公司 Ｐｄ-１抗體和表觀遺傳調節劑聯合在製備治療腫瘤的藥物中的用途

Patent Citations (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1146136A (zh) * 1994-02-14 1997-03-26 杰纳勒尔医疗公司 由携带嵌合cd4受体的细胞针对hiv感染细胞的细胞溶解作用
CN101856348A (zh) * 2003-08-29 2010-10-13 斯隆-凯特林癌症研究所 联合治疗癌症的方法
US20110245154A1 (en) * 2010-03-11 2011-10-06 Hemaquest Pharmaceuticals, Inc. Methods and Compositions for Treating Viral or Virally-Induced Conditions
US20150099012A1 (en) * 2012-03-02 2015-04-09 Erasmus University Medical Center Rotterdam Methods for activating retrovirus in latent infected cells, and compounds for use therein
US20150023937A1 (en) * 2013-07-18 2015-01-22 Baylor College Of Medicine Histone deacetylase (hdac) inhibitor up-regulates car expression and targeted antigen intensity, increasing antitumor efficacy
WO2017132536A1 (en) * 2016-01-28 2017-08-03 Indiana University Research & Technology Corporation Use of histone deacetylase inhibitors for enhancing immunotherapies
WO2017134116A1 (en) * 2016-02-02 2017-08-10 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for enhancing cd8+ t cell-dependent immune responses in subjects suffering from cancer
WO2017197140A1 (en) * 2016-05-11 2017-11-16 Huya Bioscience International, Llc Combination therapies of hdac inhibitors and pd-l1 inhibitors
WO2017202949A1 (en) * 2016-05-25 2017-11-30 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and compositions for treating cancers

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ECKSCHLAGER, T., ET AL: "Histone Deacetvlase Inhibitors as Anticancer Drugs", INT. J. MOL. SCI., vol. 18, no. 7, pages 3 *
LI SHEN ET AL: "Class I histone deacetylase inhibition is a novel mechanism to target regulatory T cells in immunotheragy", ONCOIMMUNOLOGY, vol. 1, no. 6, pages 948 *
UDAI BANERJI ET AL.: "A Phase I Pharmacokinetic and Pharmacodvnamic Study of CHR-3996, an Oral Class I selective Histone Deacetylase Inhibitor in Refractory Solid Tumors", CLIN CANCER RES ., vol. 18, no. 9, pages 2687 - 2694, XP055834998, DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-11-3165 *

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Publication number Publication date
EP3737405A4 (en) 2021-10-06
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