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CN111684286A - 核酸分析装置及核酸提取装置 - Google Patents

核酸分析装置及核酸提取装置 Download PDF

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CN111684286A
CN111684286A CN201880087598.9A CN201880087598A CN111684286A CN 111684286 A CN111684286 A CN 111684286A CN 201880087598 A CN201880087598 A CN 201880087598A CN 111684286 A CN111684286 A CN 111684286A
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nucleic acid
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二松史哉
酒井康裕
田野岛英司
小泽利行
铃木健一郎
村田知嘉子
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Sysmex Corp
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Abstract

本发明提供一种能将容器正确设置于装置的核酸分析装置及核酸提取装置。核酸分析装置100包括:复数个放大容器设置部120,其设置放大容器20,所述放大容器20被注入含有核酸的提取液,并收放有用于放大提取液中的核酸的试剂;显示部402;控制部401,在显示部402显示使复数个放大容器设置部120的各自的配置位置与放大容器20设置于放大容器设置部120相关的关联信息相对应的界面500。

Description

核酸分析装置及核酸提取装置
技术领域
本发明涉及核酸分析装置及核酸提取装置。
背景技术
近年来,随着基因检测的普及而需要一种自动进行从核酸提取到检测的装置。
专利文献1记载了一种使试样中所含目标核酸放大并分析的核酸分析装置。在该核酸分析装置中,为提取和检测目标核酸,而使用图26(a)所示的核酸提纯盒910和图26(b)所示的核酸分析吸头920。核酸提纯盒910用于从样本分离核酸并提纯核酸溶液。核酸分析吸头920用于从使用核酸提纯盒910提取的核酸放大目标核酸并进行检测。
现有技术文献
专利文献
专利文献1 : 专利第5003845号。
发明内容
发明要解决的技术问题
核酸分析装置可用于大肠癌、白血病等各种诊断。此时,每次诊断时成为分析对象的核酸部位均不同,因此每次诊断要使用收放与该诊断相应的试剂的容器。因此,操作者需要在分析核酸时将与诊断相应的容器正确设置于核酸分析装置。但是,对于不熟悉装置的操作者来说,在选择与诊断相应的容器后将容器切实设置于核酸分析装置内的正确位置等作业特别困难。因此,需要一种能使操作者正确设置容器的核酸分析装置。
解决技术问题的技术手段
本发明第1技术形态涉及一种核酸分析装置。本技术形态涉及的核酸分析装置(100)包括:复数个放大容器设置部(120),其设置放大容器(20),所述放大容器(20)被注入含有核酸的提取液,并收放有用于放大提取液中的核酸的试剂;显示部(402);控制部(401),在显示部(402)显示使复数个放大容器设置部(120)的各自的配置位置与放大容器(20)设置于放大容器设置部(120)相关的关联信息相对应的界面。
关联信息指的是如下信息等:用于确定放大容器设置部中设置的放大容器内的试剂所处理的样本的信息;表示放大容器设置部中是否设置了放大容器的信息;放大容器设置部中应设置的放大容器的类别的信息;表示放大容器设置部中设置的放大容器的类别错误的信息。
根据本技术形态涉及的核酸分析装置,关联信息发挥在操作者将放大容器设置于放大容器设置部时的向导作用。因此,操作者能通过参照显示部中显示的关联信息将放大容器正确设置于各放大容器设置部。另外,关联信息显示后,即使是不熟悉核酸分析装置的操作者也能正确且顺畅地设置放大容器。
在本技术形态涉及的核酸分析装置(100)中,可设计为,控制部(401)在显示部(402)显示如下信息作为关联信息:将复数个样本的每一个与收放用于处理各样本的试剂的放大容器(20)所设置到的放大容器设置部(120)的配置位置互相关联的信息。这样一来,操作者能通过参照显示部中显示的界面轻松地掌握处理对象样本与放大容器设置部的对应关系。因此,操作者能轻松掌握应该将用于注入从各样本提取的含核酸的提取液的放大容器设置于哪一放大容器设置部。因此,操作者能将适用于各样本的放大容器正确设置于容器设置部。
在本技术形态涉及的核酸分析装置(100)中,可设计为,控制部(401)在显示部(402)显示如下信息作为关联信息:将复数个样本各自的识别信息与收放用于处理各样本的试剂的放大容器(20)所设置到的放大容器设置部(120)的配置位置互相关联的信息。
另外,“关联的信息”是指颜色、数字、文字、图形等。比如,对样本的识别信息的显示区域和与该样本对应的容器设置部的图像所赋予的相同颜色是互相关联的信息。
在本技术形态涉及的核酸分析装置(100)中,可设计为,控制部(401)在显示部(402)显示各放大容器设置部(120)中应设置的放大容器(20)的类别的相关信息作为关联信息。
放大容器的类别指以该放大容器中收放的试剂为对象的测定项目等。测定项目比如是All-Ras、EGFR、ESR1、BRAF、白血病等。放大容器的类别的相关信息指能识别放大容器的类别的信息,比如表示放大容器的类别的字符串或图形、用于识别放大容器的用途的字符串或图形等。试剂容器名是表示放大容器的类别的字符串。
此时,操作者能通过参照显示部中显示的关联信息掌握放大容器设置部中应设置的放大容器的类别。因此,操作者能轻松掌握哪一类别的放大容器应设置于哪一放大容器设置部,并能将正确类别的放大容器设置于各放大容器设置部。
在本技术形态涉及的核酸分析装置(100)中,可设计为,当放大容器设置部(120)中未设置有处理对象样本所对应的类别的放大容器(20)时,控制部(401)在显示部(402)显示表示放大容器(20)的类别不正确的信息作为关联信息。
操作者能通过参照表示放大容器的类别不正确的信息来防止使用不正确的类别的容器进行样本处理。因此,能在之后设置正确类别的容器来对样本进行正确处理。另外,操作者能将错误设置的容器顺畅地交换为正确类别的容器。
此时,可设计为:放大容器(20)持有能确定该容器(20)的类别的信息;本技术形态涉及的核酸分析装置(100)包括用于从放大容器设置部(120)中设置的放大容器(20)读取放大容器(20)的类别的相关信息的读取部(142);当处理对象样本所对应的放大容器(20)的类别与读取部(142)读取的信息不对应时,控制部(401)在显示部(402)显示表示放大容器设置部(120)中设置的放大容器(20)的类别不正确的信息作为关联信息。
此外,可设计为,当处理对象样本所对应的类别的放大容器(20)未设置于放大容器设置部时,控制部(401)中断针对样本的处理。这样一来,能更加切实地防止使用不正确的类别的容器进行样本处理。因此,能在之后设置正确类别的容器来对样本进行正确处理。此外,能防止容器浪费。
可设计为,本技术形态涉及的核酸分析装置(100)包括用于检测放大容器设置部(120)中是否设置了放大容器(20)的传感器(122),控制部(401)基于传感器(122)的检测结果在显示部(402)显示放大容器设置部(120)中是否设置了放大容器(20)的相关信息作为关联信息。
这样一来,操作者能通过参照显示部中显示的是否设置有放大容器的相关信息来掌握放大容器设置部中是否设置了放大容器。因此,当设置有放大容器时,操作者能够理解无需在放大容器设置部中设置放大容器,当未设置有放大容器时,操作者能够理解需要在放大容器设置部中设置放大容器。因此,操作者能正确且顺畅地设置容器。
在本技术形态涉及的核酸分析装置(100)中,可设计为,控制部(401)在显示部(402)显示对放大容器设置部(120)中设置的容器(20)的类别是否与处理对象样本相对应且正确能进行评价的信息作为关联信息。“能进行评价的信息”指的是界面上的“样本ID”、“应设置的容器信息”、“实际设置的容器信息”等。操作者能通过参照显示部中显示的关联信息,来确认放大容器设置部中设置的容器是否为正确类别的容器。因此,操作者能将正确类别的容器正确设置于各放大容器设置部。
在本技术形态涉及的核酸分析装置(100)中,可设计为,当针对放大容器设置部的配置位置所对应的图像(520、820)进行了一定操作时,控制部(401)在显示部(402)显示用于受理处理对象样本的测定项目的操作部(511、521)。一定操作比如是指当显示部和输入部由触摸屏一体构成时而针对触摸屏中显示的图像持续触摸一定时间的操作等。另外,一定操作是指当显示部和输入部单独设置时而针对显示部中显示的图像介由输入部进行的点击操作等。这样一来,即使在未预先设定测定项目时也能在之后轻松设定测定项目。
本发明第2技术形态涉及一种核酸提取装置。本技术形态涉及的核酸提取装置(900)包括:复数个提取容器设置部(110),其设置提取容器(10),所述提取容器(10)收放用于从样本提取核酸的试剂并用于使用试剂对含核酸的提取液进行提纯;显示部(402);控制部(401),在显示部(402)显示使复数个提取容器设置部(110)的各自的配置位置与提取容器(10)设置于提取容器设置部(110)相关的关联信息相对应的界面。
根据本技术形态涉及的核酸提取装置,关联信息会发挥在操作者将提取容器设置于提取容器设置部时的向导作用。因此,操作者能通过参照显示部中显示的关联信息将提取容器正确设置于各提取容器设置部。另外,关联信息显示后,即使是不熟悉核酸提取装置的操作者也能正确且顺畅地设置提取容器。
在本技术形态涉及的核酸提取装置(900)中,可设计为,控制部(401)在显示部(402)显示提取容器设置部(110)中应设置的提取容器(10)的类别的相关信息作为关联信息。提取容器的类别指以该提取容器中收放的试剂为对象的样本的类别、核酸的类别等。样本的类别比如是福尔马林固定石蜡包埋组织切片、血浆、全血等。核酸的类别比如是DNA、RNA等。
本发明第3技术形态涉及一种核酸分析装置。本技术形态涉及的核酸分析装置(100)包括:提取容器设置部(110),其设置提取容器(10),所述提取容器(10)收放用于从样本提取核酸的试剂并用于使用试剂对含核酸的提取液进行提纯;放大容器设置部(120),其设置放大容器(20),所述放大容器(20)被注入在提取容器(10)中提纯的提取液,并收放有用于放大提取液中的核酸的试剂;显示部(402);控制部(401),在显示部(402)显示使提取容器设置部(110)的配置位置与提取容器(10)设置于提取容器设置部(110)相关的第1关联信息相对应、使放大容器设置部(120)的配置位置与放大容器(20)设置于放大容器设置部(120)相关的第2关联信息相对应的界面。
根据本技术形态涉及的核酸分析装置,第1关联信息和第2关联信息会发挥在操作者将提取容器和放大容器分别设置于提取容器设置部和放大容器设置部时的向导作用。因此,操作者能通过参照显示部中显示的第1关联信息和第2关联信息将提取容器正确设置于提取容器设置部,并能将放大容器正确设置于放大容器设置部。此外,第1关联信息和第2关联信息显示后,即使是不熟悉核酸分析装置的操作者也能正确且顺畅地设置提取容器和放大容器。
发明效果
根据本发明能将容器正确设置于装置。
附图说明
图1(a)是从上侧看实施方式1涉及的核酸分析装置的内部时的概要结构的示意图;图1(b)是实施方式1涉及的显示部中显示的界面的示图;
图2(a)是实施方式1涉及的核酸分析装置的外观的示图;图2(b)是实施方式1涉及的盖打开状态的核酸分析装置的外观的示图;
图3是从上侧看实施方式1涉及的核酸分析装置的内部时的结构的示意图;
图4是实施方式1涉及的第1~第3道中分别设置的提取容器设置部和放大容器设置部的结构的示意图;
图5(a)是实施方式1涉及的提取容器的结构的斜视示意图;图5(b)是实施方式1涉及的放大容器的结构的斜视示意图;
图6(a)、(b)是实施方式1涉及的喷嘴的结构的侧视示意图;图6(c)是实施方式1涉及的分装单元的结构的示意图;
图7(a)是实施方式1涉及的配置于提取容器设置部下方的温度调节部的结构的截面示意图;图7(b)、(c)是实施方式1涉及的磁力施加部的结构的示意图;
图8是实施方式1涉及的检测部的结构的示意图;
图9是实施方式1涉及的核酸分析装置的结构的框图;
图10是实施方式1涉及的核酸分析装置的处理中的测定处理开始为止的处理的流程图;
图11是实施方式1涉及的核酸分析装置的处理中的测定处理开始为止的处理的流程图;
图12(a)是实施方式1涉及的样本ID输入前的状态的界面的示图;图12(b)是实施方式1涉及的用于输入样本ID的界面的示图;
图13(a)是实施方式1涉及的输入1个样本ID后的状态的界面的示图;图13(b)是实施方式1涉及的测定指令表的结构的示意图;
图14(a)是实施方式1涉及的试剂表的结构的示意图;图14(b)是实施方式1涉及的试剂表的变更例的结构的示意图;
图15(a)是实施方式1涉及的用于输入测定指令的第1操作部和第2操作部的示图;图15(b)是实施方式1涉及的与输入的1个样本ID相应设置提取容器和放大容器时的界面的示图;
图16(a)是实施方式1涉及的输入3个样本ID并与3个样本ID相应设置提取容器和放大容器时的界面的示图;图16(b)是实施方式1涉及的显示部中显示的进度界面的示图;
图17(a)是实施方式1涉及的容器设置发生错误时的界面的示图;图17(b)是实施方式1涉及的容器设置发生错误之后去掉不正确的容器时的界面的示图;
图18是实施方式1涉及的核酸分析装置的处理中的测定处理的流程图;
图19(a)是实施方式1的变更例1涉及的显示部中显示的界面的示图;图19(b)是实施方式1的变更例2涉及的显示部中显示的界面的示图;
图20是实施方式1的变更例3涉及的显示部中显示的纵长的界面的示图;
图21是实施方式2涉及的核酸分析装置的处理中的测定处理开始为止的处理的流程图;
图22(a)是实施方式2涉及的显示部中显示的界面的示图;图22(b)是实施方式2的变更例1涉及的显示部中显示的界面的示图;
图23是实施方式2的变更例2涉及的显示部中显示的界面的示图;
图24(a)是从上侧看实施方式3涉及的核酸提取装置的内部时的概要结构的示意图;图24(b)是实施方式3涉及的显示部中显示的界面的示图;
图25(a)是从上侧看实施方式4涉及的核酸分析装置的内部时的概要结构的示意图;图25(b)是实施方式4涉及的显示部中显示的界面的示图;
图26(a)、(b)是为说明相关技术的结构的示意图。
具体实施方式
<实施方式1>
实施方式1将本发明适用于自动进行从核酸提取、实时PCR、核酸放大反应的检测到核酸分析的装置。
参照图1(a)、(b)对核酸分析装置100的概要进行说明。关于核酸分析装置100的具体结构将在之后参照图2(a)及以后的附图进行说明。
如图1(a)、(b)所示,核酸分析装置100包括3个提取容器设置部110、3个放大容器设置部120、检测部240、控制部401、显示部402。在图1(a)中,XYZ轴互相正交。X轴正方向表示后方,Y轴正方向表示左方,Z轴正方向表示铅直下方。以下附图中XYZ轴也与图1(a)所示的XYZ轴相同。
在核酸分析装置100中,在Y轴方向上设有3列沿X轴排列的1个提取容器设置部110和1个放大容器设置部120的列。以下将左端的列、中央的列、右端的列分别称作“第1道”、“第2道”、“第3道”。给围住各道的提取容器设置部110和放大容器设置部120的矩形区域内分别赋予不同颜色。具体来说,第1道涂成蓝色,第2道涂成绿色,第3道涂成橘色。
提取容器设置部110是用于设置提取容器10的设置部。提取容器10如后所述具有复数个试剂收放部。提取容器10的复数个试剂收放部预先收放有用于从样本提取核酸的试剂。提取容器10是用于从样本提取核酸的能交换的容器。另外,提取容器10如后所述具有反应部11。反应部11中收放处理对象样本。使用提取容器10的试剂收放部中收放的试剂从反应部11中收放的样本提取核酸。以下将含有在提取容器10中提取的核酸的液体称作“提取液”。
放大容器设置部120是用于设置放大容器20的设置部。放大容器20如后所述具有复数个收放部。放大容器20的复数个收放部中预先收放有用于放大在提取容器10中提纯的提取液中的核酸的试剂。放大容器20是用于放大提取液中的核酸的能交换的容器。在提取容器10中提纯的提取液会从设于放大容器20的注入口注入放大容器20内。然后,注入有提取液的放大容器20向检测部240移送。在检测部240的位置上,使用放大容器20的收放部中收放的试剂放大提取液所含核酸。
检测部240在放大容器20内检测放大的检测靶核酸。控制部401控制核酸分析装置100的各部,并使用由检测部240获取的测定数据进行核酸分析。显示部402显示图像并受理来自操作者的输入。
图1(b)是显示部402中显示的界面500的示图。界面500包括3个第1图像510、3个第2图像520、3个显示区域530、开始按钮540。操作者在开始样本处理时,使界面500在显示部402中显示。以下在界面500中,将上下方向称作“纵向”,左右方向称作“横向”。
在界面500中横向设有3列1个第1图像510和1个第2图像520沿纵向排列的列。左端的列、中央的列和右端的列分别与图1(a)所示的核酸分析装置100内的第1道、第2道和第3道相对应。给纵向排列的第1图像510和第2图像520赋予与核酸分析装置100内的相对应的道相同的颜色。具体来说,对第1道相对应的第1图像510和第2图像520赋予蓝色,对第2道相对应的第1图像510和第2图像520赋予绿色,对第3道相对应的第1图像510和第2图像520赋予橘色。
纵向排列的1个第1图像510和1个第2图像520被矩形区域围住以清楚其互相关联,在该区域的上部附有表示第1~第3道中的其中一个道的编号。像这样,第1图像510与提取容器设置部110的配置相对应,第2图像520与放大容器设置部120的配置相对应。
显示区域530是用于显示样本的识别信息的区域。在实施方式1中,样本的识别信息是能单独识别样本的信息,是由数字、字母等字符串构成的样本ID。显示区域530具有横向延伸的矩形形状,3个显示区域530相对于第1图像510和第2图像520在横向的位置上纵向排列配置。在显示区域530内,样本ID横向记载。由操作者输入样本ID后,输入的样本ID在显示区域530显示。另外,给3个显示区域530从上往下分别赋予与第1~第3道相对应的第1图像510和第2图像520相同的颜色。具体来说,给上侧的显示区域530赋予蓝色,给中央的显示区域530赋予绿色,给下侧的显示区域530赋予橘色。
控制部401使第1图像510与提取容器10设置于提取容器设置部110的相关的第1关联信息相对应,并在界面500显示第1图像510和第1关联信息。具体来说,控制部401在显示部402显示如下信息等作为第1关联信息:表示提取容器设置部110中是否设置了提取容器10的信息、应设置于提取容器设置部110的提取容器10的类别、当提取容器设置部110中设置了错误类别的提取容器10时表示提取容器10的类别错误的信息。此外,控制部401对第1图像510赋予和相对应的显示区域530相同的颜色作为第1关联信息,并在显示部402显示第1图像510。
同样地,控制部401使第2图像520与放大容器20设置于放大容器设置部120相关的第2关联信息相对应,并在界面500中显示第2图像520和第2关联信息。具体来说,控制部401在显示部402显示如下信息等作为第2关联信息:表示放大容器设置部120中是否设置了放大容器20的信息、应设置于放大容器设置部120的放大容器20的类别、当放大容器设置部120中设置了错误类别的放大容器20时表示放大容器20的类别错误的信息。此外,控制部401对第2图像520赋予和相对应的显示区域530相同的颜色作为第2关联信息,并在显示部402显示第2图像520。
在图1(b)的示例中,在第1道相对应的显示区域530中显示样本ID。另外,在第1道相对应的第1图像510显示字符串“DNA、FFPE”作为第1关联信息,在第1道相对应的第2图像520显示字符串“All-Ras”作为第2关联信息。“DNA、FFPE”表示应设置于提取容器设置部110的提取容器10的类别,“All-Ras”表示应设置于放大容器设置部120的放大容器20的类别。
如图1(b)所示,显示应设置的提取容器10的类别的话,操作者就能掌握应该在第1道的提取容器设置部110设置收放有用于从福尔马林固定石蜡包埋组织切片提取DNA的试剂的提取容器10。另外,如图1(b)所示,显示应设置的放大容器20的类别的话,操作者能掌握应该在第1道的放大容器设置部120设置收放有使用于测定项目“All-Ras”的试剂的放大容器20。
另外,在图1(b)的示例中,在第1道相对应的第1图像510和第2图像520中显示“Empty”。“Empty”表示未在相对应的容器设置部中设置容器的状态。显示“Empty”的话,操作者就能掌握未在相对应的容器设置部中设有容器。此外,在图1(b)的示例中,在第2和第3道相对应的显示区域530中未显示样本ID。因此,在第2和第3道相对应的第1图像510和第2图像520中显示“NoUse”。显示“NoUse”的话,操作者就能掌握相对应的容器设置部不被使用。
操作者在正确的提取容器10的反应部11收放样本,并将该提取容器10设置于提取容器设置部110,并将正确的放大容器20设置于放大容器设置部120。然后,操作者操作开始按钮540开始针对样本的处理。针对样本的处理开始后,在提取容器10中提纯提取液,提纯的提取液注入放大容器20。之后,在检测部240中检测在放大容器20内放大的检测靶核酸。
如上所述,提取容器10设置于提取容器设置部110相关的第1关联信息、放大容器20设置于放大容器设置部120相关的第2关联信息在操作者将提取容器10和放大容器20分别设置于提取容器设置部110和放大容器设置部120时会发挥向导作用。因此,操作者能通过参照第1关联信息和第2关联信息,将提取容器10正确设置于提取容器设置部110,并将放大容器20正确设置于放大容器设置部120。另外,第1关联信息和第2关联信息显示后,即使是不熟悉核酸分析装置100的操作者也能正确且顺畅地设置提取容器10和放大容器20。
另外,在显示区域530内样本ID横向记载,各道所对应的显示区域530相对于第1图像510和第2图像520在横向的位置上纵向排列配置。由此,能在有限大小的界面500中高效放入第1图像510、第2图像520和显示区域530。另外,在实施方式1中,第1图像510、第2图像520和显示区域530在不排成一列的情况下显示。但是如图1(b)所示,使各道的第1图像510和第2图像520与该道所对应的显示区域530通过颜色、道编号等互相关联,由此操作者能轻松掌握第1图像510和第2图像520与样本ID的对应关系。
另外,在实施方式1中,给提取容器设置部110、放大容器设置部120、第1图像510、第2图像520以及显示区域530根据道而赋予了蓝色、绿色、橘色,但只要是操作者能掌握对应关系,其颜色种类就无限制。而且,也不限于赋予颜色,比如,也可以在上述赋予颜色的各部位赋予能识别道的记号等,也可设计为每个上述赋予颜色的各部位都具有其特征形状。另外,若显示字符串作为第1关联信息和第2关联信息,则不限于如图1(b)所示地字符串显示于第1图像510和第2图像520中。比如,第1关联信息的字符串可以显示于第1图像510的周边,第2关联信息的字符串可以显示于第2图像520的周边。
<实施方式1的具体结构>
以下对实施方式1的具体结构进行说明。
如图2(a)、(b)所示,核酸分析装置100包括壳体100a、盖100b、显示部402、读取部403、极限式的传感器404。壳体100a覆盖核酸分析装置100的内部。盖100b设于壳体100a用来将核酸分析装置100的内部向外部开放。另外可设计为,盖100b省略,并预先使核酸分析装置100的内部向外部开放。
显示部402由触摸屏式的显示器构成。核酸分析装置100也可以单独具有用于显示图像的显示部和用于受理来自操作者的输入的输入部来代替显示部402。读取部403从贴于无图示的样本容器的条形码标签读取样本ID。读取部403由条形码读取器构成。另外,当样本容器具有RFID标签时,读取部403由用于读取RFID的天线构成。
如图2(b)所示,盖100b向上方旋转移动,核酸分析装置100的内部向外部开放。在核酸分析装置100的内部设有图1(a)示出的提取容器设置部110和放大容器设置部120。操作者打开盖100b,由此能针对提取容器设置部110和放大容器设置部120设置及拿取容器。盖100b关闭后,盖100b按压传感器404,盖100b打开后,盖100b对传感器404的按压解除。由此,控制部401检测盖100b的开闭状态。
接下来,参照图3~图8对核酸分析装置100的内部结构进行详细说明。
如图3所示,核酸分析装置100包括板构件101、分装单元140、温度调节部150、160、磁力施加部170、移送单元180、容器设置部210、旋转驱动部220、温度调节部230、检测部240。板构件101与XY平面平行。在板构件101设有3个提取容器设置部110和3个放大容器设置部120。
提取容器设置部110是由如下构成的凹部:形成于板构件101的开口111;板构件101的铅直下侧的支撑板112;设于支撑板112的左向、右向及后方的与Z轴方向垂直的无图示的板构件。在俯视图中,开口111和支撑板112具有比提取容器10的外形稍微大的轮廓,支撑板112设于开口111的后方侧。图5(a)所示的提取容器10的下端部10b被支撑板112在铅直上方向上支撑,提取容器10的侧面被开口111和设于支撑板112的左方、右方及后方的板构件支撑,由此提取容器10设置于提取容器设置部110。
另外,在支撑板112设有第1传感器112a。第1传感器112a由极限式的传感器构成。提取容器10设置于提取容器设置部110后,提取容器10的下端部10b向铅直下方向按压第1传感器112a。由此,控制部401检测提取容器设置部110中是否设置有提取容器10。
放大容器设置部120由板构件101的上侧面和设置于板构件101的上侧面的3个销121构成。图5(b)所示的被啮合部27a啮合于3个销121,由此放大容器20设置于放大容器设置部120。另外,在放大容器20所设置到的板构件101的上侧面设有开口,在该开口的位置中,在板构件101的上侧面的铅直下侧设置有第2传感器122。第2传感器122由反射型的传感器构成。放大容器20设置于放大容器设置部120后,从第2传感器122射出的光被放大容器20的下侧面反射。由此,控制部401检测放大容器设置部120中是否设置有放大容器20。
如图4所示,在Y轴方向上设3列1个提取容器设置部110和1个放大容器设置部120沿X轴排列的列。图4中也与图1(a)相同,左端的列、中央的列、右端的列分别是第1~第3道。在各道中,在围住提取容器设置部110和放大容器设置部120的矩形区域内与图1(a)相同,分别被涂上不同的颜色。图4中也与图1(a)相同,第1~第3道分别被涂成蓝色、绿色、橘色。另外,在第1~第3道的板构件101的上侧面设置有表示道编号的标签101a,使操作者能从视觉上掌握道编号。第1~第3道内的各部的结构除了道的颜色和标签101a上所附的数字外,其余互相相同。
如图3和图5(a)所示,提取容器10包括反应部11、试剂收放部12、试剂收放部13a~13h、混合部14a~14d、试剂收放部15、废液收放部16、条形码标签17、标签18、孔19a、19b。反应部11、试剂收放部12、试剂收放部13a~13h、混合部14a~14d、试剂收放部15、废液收放部16设于提取容器10且上方开放,是能收放液体的孔。在条形码标签17上印刷有含有该提取容器10的识别信息的二维条形码。提取容器10的识别信息包括能确定该提取容器10的类别的文字信息,比如“DNA、FFPE”等文字信息。另外,贴在提取容器10的外侧面的标签18中记载有能确定该提取容器10的类别的字符串,比如“DNA、FFPE”。孔19a用来安放吸移管吸头32,孔19b用来安放穿刺用吸头31。
另外,提取容器10可以具有存储了该提取容器10的识别信息的RFIDtag来代替条形码标签17。另外,也可以通过形成于该提取容器10的切口、孔等特殊结构来确定提取容器10的类别。
试剂收放部12、13a~13h预先收放有核酸提取用试剂。提取容器10中收放的试剂是与该提取容器10的类别相对应的试剂。提取容器10的类别根据在该提取容器10中提取的核酸的类别和设置于该提取容器10的样本的类别而决定。所提取的核酸的类别比如是DNA、RNA等。样本的类别比如是福尔马林固定石蜡包埋组织切片、血浆、全血等。另外,样本的类别不限于此。以下将福尔马林固定石蜡包埋组织切片称作“FFPE切片”。
比如,当提取容器10的类别为“DNA、FFPE”时,该提取容器10用于从FFPE切片提取DNA。此时,试剂收放部12预先收放有含有磁性粒子和磁性粒子保存液的试剂,试剂收放部13a~13h分别预先收放有增溶液、蛋白酶K、油、洗提液、提取用试剂的原液、第2清洗液的原液、稀释液的原液以及第1清洗液的原液。当提取容器10的类别为“DNA、血浆”时,该提取容器10用于从血浆提取DNA。此时,各试剂收放部收放有与类别为“DNA、FFPE”时相同的试剂。当提取容器10的类别为“RNA、全血”时,该提取容器10用于从全血提取RNA。此时,因为不需要蛋白酶K,所以试剂收放部13b不收放试剂,其他各试剂收放部中收放有与类别为“DNA、FFPE”时相同的试剂。
另外,在实施方式1中,类别为“DNA、FFPE”时和类别为“DNA、血浆”时收放的试剂相同,但也可以不同。另外,提取容器10的类别由核酸的类别和样本的类别而决定,但也可以由核酸的类别、样本的类别以及测定项目而决定。
试剂收放部12、试剂收放部13a~13h、废液收放部16的上方被铝封条10a关闭。操作者在将提取容器10设置于提取容器设置部110时,将样本收放于反应部11,并将乙醇收放于试剂收放部15。
如图3和图5(b)所示,放大容器20包括注入口21、23个收放部22、连接注入口21和23个收放部22的23个流路23。放大容器20是中心位置配置有注入口21,且从中心位置在固定直径的外周侧的位置上在圆周方向上以固定间隔配置有23个收放部22的圆盘状的容器。另外,放大容器20不一定必须是圆盘状的容器。
更具体来说,放大容器20包括上侧面部24、突部25、下侧面部26、凸边部27、条形码标签28。突部25配置于放大容器20的中心位置。注入口21是设于突部25的与铅直方向平行的孔。上侧面部24由具有透光性的构件构成。上侧面部24的上侧面是与水平面平行的面,在上侧面部24的下侧面形成有用于分别形成收放部22和流路23的凹部和槽。在上侧面部24的下侧面贴有薄膜状的ABS树脂,由此形成收放部22和流路23。下侧面部26由导热性高的薄膜状的铝构成。下侧面部26从下侧贴于上侧面部24的下侧面所贴的ABS树脂。
凸边部27是形成于上侧面部24的外侧的与水平面平行的平板。在凸边部27形成3处被啮合部27a。被啮合部27a为切口。被啮合部27a啮合于放大容器设置部120的销121。向注入口21注入在相同道的提取容器10中提纯的提取液。
各收放部22预先收放有用于放大提取液中的核酸的试剂。具体来说,各收放部22预先收放有放大在核酸的检测靶部位产生了变异的检测靶核酸的试剂、包括与检测靶核酸结合的荧光探针的试剂。荧光探针包括荧光物质。各收放部22中对象检测靶部位互相不同。放大容器20中收放的试剂是与该放大容器20的类别相对应的试剂。放大容器20的类别由使用该放大容器20进行的测定项目而决定。测定项目比如是All-Ras、EGFR、ESR1、BRAF、白血病等。另外,测定项目不限于此。
比如,放大容器20的类别为“All-Ras”时,该放大容器20用于进行大肠癌相关测定。此时,各收放部22收放有用于放大及检测大肠癌相关的检测靶核酸的试剂。放大容器20的类别为“EGFR”时,该放大容器20用于进行肺癌相关测定。此时,各收放部22收放有用于放大及检测肺癌相关的检测靶核酸的试剂。放大容器20的类别为“ESR1”时,该放大容器20用于进行乳腺癌相关测定。此时,各收放部22收放有用于放大及检测乳腺癌相关的检测靶核酸的试剂。放大容器20的类别为“BRAF”时,该放大容器20用于进行皮肤癌相关测定。此时,各收放部22收放有用于放大及检测皮肤癌相关的检测靶核酸的试剂。放大容器20的类别为“白血病”时,该放大容器20用于进行白血病相关测定。此时,各收放部22收放有用于放大及检测白血病相关的检测靶核酸的试剂。
另外,在实施方式1中,放大容器20的类别由测定项目而决定,但也可以由核酸的类别、样本的类别以及测定项目而决定。
从注入口21注入的提取液通过放大容器20旋转而产生离心力被大致均等移送到23个收放部22。由此,能在23个收放部22中并列进行核酸相关分析,因此能提高分析效率。
条形码标签28上印刷有包括该放大容器20的识别信息的二维条形码。放大容器20的识别信息包括能确定该放大容器20的类别的文字信息,比如“EGFR”等文字信息。另外,放大容器20可以具有存储了该放大容器20的识别信息的RFIDtag来代替条形码标签28。另外,也可以通过形成于该放大容器20的切口、孔等特殊结构来确定放大容器20的类别。另外,可以在放大容器20的包装上记载能确定该放大容器20的类别的字符串,比如“EGFR”。
如图3和图6(a)所示,提取容器10安放有1个穿刺用吸头31和7个吸移管吸头32。穿刺用吸头31是用于刺穿提取容器10的铝封条10a,并使位于铝封条10a的下侧的收放部的上方开放的吸头。吸移管吸头32具有在铅直方向上贯穿的孔。如图6(a)、(b)所示,分装单元140的喷嘴141从吸移管吸头32的正上方下降后,吸移管吸头32安装于喷嘴141的下端。然后,喷嘴141上升,由此吸移管吸头32从提取容器10拔出。穿刺用吸头31也同样地安装于喷嘴141的下端。在喷嘴141形成有孔141a使得能从喷嘴141的下端吸移和排放液体。
如图3和图6(c)所示,分装单元140包括喷嘴141、读取部142、泵143、上下移送部144、前后移送部145、左右移送部146。
喷嘴141能安装、拆下穿刺用吸头31和吸移管吸头32。读取部142从提取容器设置部110中设置的提取容器10的条形码标签17读取识别信息,并从放大容器设置部120中设置的放大容器20的条形码标签28读取识别信息。读取部142由条形码读取器构成。另外,当提取容器10和放大容器20具有RFIDtag时,读取部142由用于读取RFID的天线构成。另外,当通过形成于提取容器10和放大容器20的特殊结构而持有类别信息时,读取部142由用于判别特殊结构的形状的开关、相机等构成。
泵143与喷嘴141的孔141a连接。泵143对喷嘴141施加正压和负压,并介由安装于喷嘴141的下端的吸移管吸头32吸移和排放液体。
上下移送部144具有沿Z轴延伸的导轨144a和无图示的步进电机。上下移送部144驱动步进电机使喷嘴141沿导轨144a向Z轴方向移送。读取部142固定于上下移送部144。前后移送部145具有沿X轴延伸的导轨145a和无图示的步进电机。前后移送部145驱动步进电机,使上下移送部144沿导轨145a向X轴方向移送。左右移送部146具有沿Y轴延伸的导轨146a和无图示的步进电机。左右移送部146驱动步进电机使前后移送部145沿导轨146a向Y轴方向移送。
这样一来,喷嘴141能通过上下移送部144、前后移送部145、左右移送部146在核酸分析装置100的内部沿XYZ轴移动。另外,读取部142能通过前后移送部145和左右移送部146在核酸分析装置100的内部沿XY轴移动。
分装单元140介由安装于喷嘴141的吸移管吸头32进行分装动作,由此在提取容器10中移送样本和试剂。分装单元140介由安装于喷嘴141的吸移管吸头32进行分装动作,由此能将在提取容器10中提纯的提取液向放大容器20移送。
如图3所示,温度调节部150、160在俯视图中配置于提取容器设置部110的开口111内的前方位置。如图7(a)所示,温度调节部150具有加热块151和加热器152,加热设置于提取容器设置部110的提取容器10的反应部11。在加热块151形成有与反应部11的形状大致相同形状的孔151a。加热反应部11时,温度调节部150向上方移动,孔151a中收放反应部11。在该状态下,加热器152的热介由加热块151传递至反应部11。反应部11的加热结束后,温度调节部150向下方移动。
同样地,温度调节部160具有加热块161和加热器162,加热设置于提取容器设置部110的提取容器10的试剂收放部12。加热试剂收放部12时,温度调节部160向上方移动,在孔161a中收放试剂收放部12。在此状态下,加热器162的热会介由加热块161传递至试剂收放部12。试剂收放部12的加热结束后,温度调节部160向下方移动。
如图3所示,磁力施加部170配置于板构件101的铅直下侧,并能向Y轴方向移动。如图7(b)、(c)所示,磁力施加部170包括支撑部171和2个磁铁172。当使用磁力施加部170时,如图7(a)所示,温度调节部160向铅直下方向退避。然后,如图7(c)所示,磁力施加部170接近提取容器设置部110中设置的提取容器10的试剂收放部12。由此,如图7(b)所示,试剂收放部12内所含的磁性粒子如图7(c)所示被磁铁172吸引,吸附在试剂收放部12的X轴负侧的壁面和Y轴负侧的壁面。
如图3所示,移送单元180包括手部181、用于使手部181沿Y轴方向移动的机构。移送单元180在放大容器设置部120与容器设置部210之前夹持并移送放大容器20。移送单元180也可以通过吸附部吸附并移送放大容器20的上侧面部24的上侧面,来代替通过手部181夹持并移送放大容器20。
容器设置部210具有筒型的形状,容器设置部210的内部能设置放大容器20。旋转驱动部220为了通过离心力将提取液送至收放部22,而使容器设置部210中设置的放大容器20旋转。具体来说,旋转驱动部220对容器设置部210的外侧面赋予驱动力来使容器设置部210旋转。由此,容器设置部210中设置的放大容器20旋转,从注入口21注入的提取液介由流路23通过离心力送至收放部22。这样一来,在容器设置部210中设置的放大容器20的收放部22中,提取液所含核酸会和预先收放在收放部22中的试剂混合。
如上所述,收放部22预先收放有放大在核酸的检测靶部位产生了变异的检测靶核酸的试剂、含有与检测靶核酸结合的荧光探针的试剂。荧光探针与检测靶核酸结合后,检测靶核酸被荧光物质标记。当荧光探针已与检测靶核酸结合时,对荧光探针的荧光物质照射激发光的话,会从荧光物质产生荧光。另一方面,当荧光探针未与检测靶核酸结合时,即使对荧光探针的荧光物质照射激发光也不会从荧光物质产生荧光。
温度调节部230调节容器设置部210中设置的放大容器20的温度,以使在收放部22中产生核酸放大反应。当核酸中含有检测靶核酸时,在收放部22中放大检测靶核酸,当核酸中不含检测靶核酸时,在收放部22中不放大检测靶核酸。因此,在检测靶核酸已放大时,放大的检测靶核酸会被荧光探针的荧光物质标记,因此对收放部22照射激发光后,会与放大量相应地产生荧光。
旋转驱动部220通过旋转容器设置部210来旋转放大容器20,使已经温度调节过的各收放部22依次位于检测部240的检测位置。
如图3和图8所示,检测部240包括检测头241、光学单元242、光纤243。检测部240对位于检测位置的放大容器20的收放部22照射光,并检测在收放部22产生的核酸放大反应。具体来说,检测部240检测表示核酸放大反应的放大产物的量的荧光信号的强度。检测头241对收放部22照射光,并与放大容器20的收放部22相对。光学单元242包括光源242a、分色镜242b、聚光镜242c、光检测器242d。
光源242a射出一定波长的激发光。当荧光探针已与检测对象物质结合时,从光源242a射出的激发光激发荧光探针的荧光物质产生荧光。分色镜242b反射从光源242a射出的激发光,透射从荧光探针的荧光物质产生的荧光。聚光镜242c聚集被分色镜242b反射的激发光并向光纤243传导。此外,聚光镜242c聚集从光纤243向聚光镜242c射出的荧光并向分色镜242b引导。光检测器242d接收透射分色镜242b的荧光,并测定接收的荧光的强度,输出与荧光的强度相应的电信号。
控制部401从由检测部240的光检测器242d检测的荧光的电信号生成表示在各收放部22产生的核酸放大反应的复数个时间序列数据。然后,控制部401基于时间序列数据判定各收放部22中是否含有检测对象物质,并在显示部402显示判定结果等。这样核酸分析结束。
如图9所示,核酸分析装置100如上所述包括分装单元140、移送单元180、旋转驱动部220、检测部240、控制部401、显示部402、读取部403。此外,核酸分析装置100包括存储部405、温度调节部406、驱动部407、传感器部408。
控制部401由CPU或微机构成。控制部401也可以由CPU和微机构成。控制部401控制核酸分析装置100的各部,接受来自核酸分析装置100的各部的信号。控制部401介由显示部402从操作者受理开始指示后,开始样本的处理、即核酸分析处理。控制部401基于由检测部240检测的荧光的电信号,生成表示在放大容器20的各收放部22产生的核酸放大反应的复数个时间序列数据。控制部401基于生成的时间序列数据,针对核酸的检测靶部位已变异的检测靶核酸判定阳性或阴性。
控制部401与主机40连接并能通信。主机40具备存储部41。存储部41中存储有录入了针对各个样本的测定指令的测定指令表。关于测定指令表将在之后参照图13(b)进行说明。
存储部405由RAM、ROM、硬盘等构成。存储部405预先存储有用于执行核酸的分析的程序405a。存储部405中存储有试剂表,所述试剂表用于将测定项目、核酸的类别、样本的类别与提取容器10的类别、放大容器20的类别关联。关于试剂表将之后参照图14(a)进行说明。此外,存储部405存储核酸的分析结果。
温度调节部406包括温度调节部150、160、230。驱动部407包括配置于核酸分析装置100内的各种驱动部。传感器部408包括传感器404、第1传感器112a、第2传感器122以及配置于核酸分析装置100内的各种传感器。
接下来,参照图10、11对核酸分析装置100的处理中,到测定处理开始为止的处理进行说明。控制部401通过执行程序405a来进行图10、11所示的处理。在以下说明中将适当参照图12(a)~图17(b)进行说明。
如图10所示,在步骤S101中,控制部401基于操作者已进行显示界面500的操作,而在显示部402显示图12(a)所示的界面500。接下来,控制部401使处理待机直到在步骤S102中操作者输入样本ID为止或步骤S108中操作者触摸开始按钮540为止。
如图12(a)所示,界面500具有与图1(a)所示的界面500相同的结构。在未进行样本ID的输入时,如图12(a)所示,显示区域530为空栏,并在第1图像510和第2图像520中显示“NoUse”。操作者在输入样本ID时,在界面500中触摸设置样本的道所对应的第1图像510或显示区域530。由此,如图12(b)所示,在显示部402显示输入界面600来代替界面500。
另外,操作者触摸由触摸屏构成的显示部402的表面部来针对显示部402中显示的界面的各部进行触摸操作。当用于显示界面的显示部和用于进行输入的输入部为单独设置时,操作者一边参照显示部中显示的界面一边操作输入部对界面的各部进行点击等操作。
如图12(b)所示,输入界面600包括输入区域610、条形码读取按钮620、输入按钮区域630、OK按钮641、取消按钮642。通过条形码读取按钮620或输入按钮区域630内的按钮来向输入区域610输入样本ID。若使用条形码读取按钮620,则操作者触摸条形码读取按钮620并使读取部403接近收放了样本的样本容器,通过读取部403从样本容器的条形码标签读取样本ID。读取部403读取的样本ID在输入区域610显示。若使用输入按钮区域630内的按钮,则操作者触摸输入按钮区域630内的按钮输入样本ID。通过输入按钮区域630内的按钮输入的样本ID也在输入区域610显示。
操作者按压OK按钮641后,控制部401判定为步骤S102中输入了样本ID,将处理向步骤S103前进。此时,控制部401关闭输入界面600,再次在显示部402显示界面500。然后,如图13(a)所示,控制部401在显示区域530显示介由输入界面600输入的样本ID。在图13(a)的示例中,在第1道所对应的显示区域530显示“Sample1”作为样本ID。另一方面,操作者按压取消按钮642后,控制部401判定为步骤S102中没有输入样本ID,将处理向步骤S108前进。此时,控制部401废弃介由输入界面600输入的样本ID并关闭输入界面600,并再次在显示部402显示界面500。
在步骤S103中,控制部401基于介由输入界面600输入的样本ID向主机40询问测定指令。
如图13(b)所示,测定指令表针对各个测定指令具有样本ID、测定项目、样本的类别来作为项目。各测定指令在核酸分析装置100中进行核酸分析之前已预先录入至测定指令表中。
主机40从核酸分析装置100接受测定指令的询问后,参照存储部41中存储的测定指令表,基于询问内容中含有的样本ID进行提取测定指令的处理。主机40在存储有所询问的样本ID的测定指令时,将该样本ID的测定指令发送至控制部401,在没有所询问的样本ID的测定指令时,将没有该样本ID的测定指令的消息发送至控制部401。控制部401从主机40接受在步骤S103询问的结果后,将处理向步骤S104前进。
在步骤S104中,控制部401基于来自主机40的接受结果判定有无测定指令。若接受结果中含有测定指令,则控制部401将处理从步骤S104向步骤S105前进。
另外,测定指令表可以不存储于主机40的存储部41,而是存储于核酸分析装置100的存储部405。此时,在步骤S103中,控制部401参照存储部405中存储的测定指令表获取样本ID的测定指令。
在步骤S105中,控制部401基于测定指令参照试剂表,获取应设置于第1图像510和第2图像520的容器的类别。
如图14(a)所示,试剂表包括测定项目、提取容器10中提取的核酸的类别、提取容器10中设置的样本的类别、提取容器10的类别、放大容器20的类别作为项目。实施方式1的试剂表分别针对各个测定项目、核酸的类别、样本的类别的组合而存储有提取容器10的类别和放大容器20的类别。
更详细来说,核酸的类别由测定项目而决定。比如,当测定项目为“All-Ras”、“EGFR”时,核酸的类别为“DNA”,当测定项目为“白血病”时,核酸的类别为“RNA”。提取容器10的类别是根据核酸的类别和样本的类别而识别的信息。即,提取容器10的类别由核酸的类别和样本的类别而决定。比如,当核酸的类别为“DNA”、样本的类别为“FFPE”时,提取容器10的类别为“DNA、FFPE”。而放大容器20的类别是根据测定项目而识别的信息。即,放大容器20的类别由测定项目而决定。比如,当测定项目为“All-Ras”时,放大容器20的类别为“All-Ras”。
比如,控制部401在获取了图13(b)的第1行测定指令时,基于该测定指令中含有的测定项目“All-Ras”和样本的类别“FFPE”从图14(a)的试剂表获取“DNA、FFPE”作为提取容器10的类别,并获取“All-Ras”作为放大容器20的类别。另外,控制部401在获取了图13(b)的第6行测定指令时,基于该测定指令中含有的测定项目“白血病”和样本的类别“全血”,从图14(a)的试剂表获取“RNA、全血”作为提取容器10的类别,并获取“白血病”作为放大容器20的类别。
另外,图14(a)所示的试剂表可以分为将测定项目与核酸的类别相对应的表、将核酸的类别和样本的类别的组合与提取容器10的类别相对应的表、将测定项目与放大容器20相对应的表。另外,提取容器10的类别可以不是由表示核酸的类别的字符串和表示样本的类别的字符串构成的字符串,放大容器20的类别可以不是表示测定项目的字符串。比如,如图14(b)所示,提取容器10的类别和放大容器20的类别可以分别为能识别提取容器10的类别的试剂容器名、能识别放大容器20的类别的试剂容器名。另外,提取容器10的类别可以是用于识别提取容器10的用途的字符串,放大容器20的类别可以是用于识别放大容器20的用途的字符串。
另外,提取容器10的类别至少是根据核酸的类别和样本的类别而识别的信息即可,比如,可以是根据核酸的类别、样本的类别和测定项目而识别的信息。放大容器20的类别至少是根据测定项目而识别的信息即可,比如可以是根据核酸的类别、样本的类别和测定项目而识别的信息。
此外,试剂表可以不存储于核酸分析装置100的存储部405,而是存储于主机40的存储部41。此时,在步骤S105中,控制部401从主机40获取基于测定指令的容器的类别。
在步骤S106中,控制部401在第1图像510和第2图像520中显示在步骤S105中获取的容器的类别。比如,当针对第1道输入样本ID并基于该样本ID获取了容器的类别时,如图13(a)所示,在第1道的第1图像510和第2图像520显示容器的类别。在图13(a)的示例中,显示“DNA、FFPE”作为应设置于第1道的提取容器设置部110的提取容器10的类别,显示“All-Ras”作为应设置于第1道的放大容器设置部120的放大容器20的类别。
另外,在步骤S106中,不限于在第1图像510和第2图像520显示图13(a)所示的表示容器的类别的字符串,只要显示能识别容器的类别的信息即可。比如,可以显示图14(b)所示的试剂容器名作为表示容器的类别的字符串。另外,可以显示表示容器的类别的图形、用于识别容器的用途的字符串或图形等。
显示在第1图像510和第2图像520中应设置的容器的类别后,操作者能掌握应设置于提取容器设置部110的提取容器10的类别和应设置于放大容器设置部120的放大容器20的类别。因此,操作者能将正确类别的容器设置于各容器设置部。
另外,如图13(a)的第1道所例示,在样本ID已输入而所对应的提取容器设置部110和放大容器设置部120中未设置容器时,在第1图像510和第2图像520显示“Empty”。控制部401基于第1传感器112a的检测结果检测出提取容器设置部110中未设置提取容器10,并基于第2传感器122的检测结果检测出放大容器设置部120中未设置放大容器20。显示“Empty”的话,第1图像510和第2图像520的边框的颜色变为与“NoUse”的边框的颜色不同的颜色。在图13(a)中,为便于说明,第1图像510和第2图像520的边框为实线以清楚边框颜色已变化。
另一方面,控制部401在步骤S103中询问了测定指令后,如果接受了没有测定指令的消息,则将处理从步骤S104向步骤S107前进。在步骤S107中,控制部401介由显示部402受理测定指令。
图15(a)是针对第1道设定测定指令时的第1操作部511和第2操作部521的示图。第1操作部511和第2操作部521由选择清单构成。
操作者持续触摸第2图像520一定时间,由此使第2操作部521显示。然后,操作者触摸第2操作部521内的任意项目来针对第1道设定测定项目。然后,操作者持续触摸第1图像510一定时间来使第1操作部511显示。由于在第2操作部521中选择了“All-Ras”,由此图15(a)所示的第1操作部511示出了能选择的项目锁定为2个的状态。然后,操作者触摸第1操作部511内的任意项目,由此针对第1道设定样本的类别。控制部401介由第1操作部511和第2操作部521受理处理对象样本的测定指令。由此,即使在未预先设定测定指令时也能在之后轻松设定测定指令。
另外,第1操作部511和第2操作部521不限于选择清单,只要是能受理处理对象样本的测定指令的操作部即可。比如,第1操作部511和第2操作部521可以是用于分别受理测定项目和样本的类别的界面。另外,也可以是第1操作部511受理测定项目,第2操作部521受理样本的类别。
此时在后续的步骤S105中,控制部401也基于在步骤S107设定的测定指令参照试剂表获取容器的类别。然后,在步骤S106中,控制部401在第1图像510和第2图像520显示获取的容器的类别。比如,介由第1操作部511和第2操作部521设定“All-Ras”作为测定项目,设定“FFPE”作为样本的类别后,如图13(a)所例示,在第1道的第1图像510和第2图像520显示容器的类别。
另外,如果是不预先录入测定指令的技术形态的话,则省略步骤S103、S104的处理。此时,进行样本ID的输入之后,在步骤S107中,参照图15(a)所说明的输入测定指令。
控制部401在执行步骤S106的处理后将处理返回至步骤S102。然后,控制部401使处理待机直到输入样本ID为止或触摸开始按钮540为止。
如图13(a)所示,显示在第1图像510和第2图像520中应设置的容器的类别后,操作者确认第1图像510和第2图像520的显示内容,打开盖100b,并将容器设置于提取容器设置部110和放大容器设置部120。在图13(a)的示例中,在第1道的第1图像510中显示“DNA、FFPE”,因此操作者将类别为“DNA、FFPE”的提取容器10设置于第1道的提取容器设置部110。另外,在图13(a)的示例中,在第1道的第2图像520显示“All-Ras”,因此操作者将类别为“All-Ras”的放大容器20设置于第1道的放大容器设置部120。
另外,如上所述,操作者在将提取容器10设置于提取容器设置部110时,在反应部11收放与测定指令对应的类别的样本,在试剂收放部15收放乙醇。
容器设置于提取容器设置部110和放大容器设置部120中使得曾显示“Empty”的第1图像510和第2图像520如图15(b)所示显示“Ready”。控制部401基于第1传感器112a的检测结果检测出提取容器设置部110中设置有提取容器10,基于第2传感器122的检测结果检测出放大容器设置部120中设置有放大容器20。显示“Ready”后,第1图像510和第2图像520的边框的颜色变为与“NoUse”和“Empty”的边框的颜色不同的颜色。在图15(b)中,为便于说明,第1图像510和第2图像520的边框为双实线以清楚边框颜色已变化。
第1图像510和第2图像520中显示的“Empty”以及“Ready”、以及第1图像510和第2图像520的边框颜色是容器设置部中是否设置有容器相关的信息。操作者能通过参照这些信息来掌握容器设置部中是否设置有容器。因此,操作者能在设有容器时理解无需对容器设置部设置容器,能在未设置有容器时理解需要对容器设置部设置容器。因此,操作者能正确且顺畅地设置提取容器10和放大容器20。
设置第1道的提取容器10和放大容器20,并关闭盖100b,由此成为能够开始处理的状态后,界面500成为图15(b)所示的状态。控制部401基于传感器404的检测结果检测出盖100b已关闭。成为能在第1~第3道中的至少一个道中开始处理的状态后,开始按钮540有效。在图15(b)中,为便于说明,开始按钮540的边框为实线以清楚开始按钮540有效。
此外,不仅在第1道,在第2、第3道中也输入样本ID和设置提取容器10及放大容器20,并关闭盖100b后,界面500比如为图16(a)所示的状态。在图16(a)的示例中,基于针对第2和第3道输入的样本ID分别获取了图13(b)的第2行和第3行的测定指令。由此,在第2道的第1图像510和第2图像520分别显示“DNA、血浆”和“All-Ras”,在第3道的第1图像510和第2图像520分别显示“DNA、FFPE”和“EGFR”。操作者在第2和第3道中也与第1图像510和第2图像520中示出的容器的种类相应地设置提取容器10和放大容器20。这样一来,界面500成为图16(a)所示的状态。
在实施方式1中,各道的第1图像510和第2图像520与和该道相对应的显示区域530相对应。因此,操作者能轻松地掌握第1图像510和第2图像520与样本ID的对应关系。因此,操作者比如能轻松地掌握在各样本ID所示的样本的处理中应使用的类别的提取容器10和放大容器20应设置于哪一道的容器设置部。因此,操作者能将适用于各样本ID所示的样本的类别的提取容器10和放大容器20正确设置于与该样本ID相对应的提取容器设置部110和放大容器设置部120。
另外,一个道的第1图像510和第2图像520与和该道相对应的显示区域530通过相同颜色和相同道编号而对应。由此,操作者能通过参照第1图像510和第2图像520的颜色或第1图像510和第2图像520的周围所显示的道编号,更直观地掌握各道的第1图像510和第2图像520与样本ID的对应关系。因此,能更加顺畅且正确地将容器设置于各容器设置部。另外,一个道的第1图像510和第2图像520与和该道相对应的显示区域530可以通过文字、图形互相关联。
另外,一个道的提取容器设置部110和放大容器设置部120与和该道相对应的第1图像510和第2图像520赋予相同颜色。由此,操作者能通过颜色直观地将相同道的提取容器设置部110、放大容器设置部120、第1图像510和第2图像520相对应。因此,能参照显示部402中显示的图像,更加顺畅且正确地将容器设置于各容器设置部。
另外,相同道的提取容器设置部110和放大容器设置部120在装置主体的纵深方向即X轴方向上排列配置,不同道的提取容器设置部110和放大容器设置部120在装置主体的宽度方向即Y轴方向上排列。由此,能减小装置主体的宽度,将核酸分析装置100顺畅地设置于桌子、设置台等。
此外,除了像如上构成提取容器设置部110和放大容器设置部120之外,显示部402还配置于装置主体的前侧面,并且相同道所对应的第1图像510和第2图像520纵向排列、且不同道的第1图像510和第2图像520横向排列。由此,在从装置主体前侧的视角中,显示部402中显示的第1图像510和第2图像520的布局、以及装置主体中的提取容器设置部110和放大容器设置部120的布局统合。由此,操作者能在将容器设置于装置主体的操作中将第1图像510和第2图像520与各容器设置部更直观地对应。由此,操作者能一边参照第1图像510和第2图像520一边轻松地将容器设置于各容器设置部。
开始按钮540有效后,操作者按压开始按钮540的话,控制部401从图10的步骤S108向图11的步骤S111推进处理,由此开始针对处理对象样本的处理。
如图11所示,在步骤S111中,控制部401在显示部402显示图16(b)所示的进度界面700。如图16(b)所示,进度界面700具有进度清单710和中止按钮720。进度清单710表示在第1~第3道中进行的样本的处理的进度情况。进度清单710在第1~第3道的显示行中各自具有样本ID、测定项目、进度情况作为项目。另外,操作者能通过触摸中止按钮720来中止在核酸分析装置100进行的全部处理。
接下来,在步骤S112中,控制部401从各道中设置的提取容器10的条形码标签17和放大容器20的条形码标签28读取条形码。具体来说,控制部401驱动分装单元140使读取部142移动至条形码标签17、28的正上方,并驱动读取部142从条形码标签17、28读取条形码。在步骤S113中,控制部401从条形码所含信息获取各道的提取容器设置部110中设置的提取容器10的类别和各道的放大容器设置部120中设置的放大容器20的类别。
在步骤S114中,控制部401基于处理对象样本的测定指令和读取部142读取的容器的类别判定提取容器设置部110中设置的提取容器10和放大容器设置部120中设置的放大容器20是否正确。
具体来说,控制部401判定从各道中设置的提取容器10的条形码获取的提取容器10的类别是否与所对应的道的第1图像510中示出的提取容器设置部110中应设置的提取容器10的类别一致。此外,控制部401判定从各道中设置的放大容器20的条形码获取的放大容器20的类别是否与所对应的道的第2图像520中示出的放大容器设置部120中应设置的放大容器20的类别是否一致。当从条形码获取的容器的类别与应设置的容器的类别一致时,控制部401判定为对象容器设置部中设置了正确的容器。
控制部401对所有提取容器10和放大容器20进行从条形码获取的提取容器10的类别与第1图像510中示出的提取容器10的类别是否一致、以及从条形码获取的放大容器20的类别与第2图像520中示出的放大容器20的类别是否一致的判定。
所有提取容器10和放大容器20中只要有一个未正确设置的容器,控制部401就将处理从步骤S114向步骤S115前进。在步骤S115中,控制部401中止由于按压开始按钮540而开始的针对样本的处理,并关闭进度界面700。然后,在步骤S116中,控制部401再次在显示部402中显示界面500,并在步骤S114中判定为未正确设置的容器所对应的第1图像510或第2图像520中显示容器的设置不正确的消息。
图17(a)是设置的容器不正确时的界面500的示例图。图17(a)表示第2道中设置的提取容器10和放大容器20不正确时的情况。此时,在第2道的第1图像510和第2图像520中显示错误。具体来说,因为从第2道的提取容器设置部110中设置的提取容器10的条形码获取的提取容器10的类别为“DNA、FFPE”,所以在第2道的第1图像510中显示“Error:DNA、FFPE
Figure DEST_PATH_IMAGE001
”。另外,因为从第2道的放大容器设置部120中设置的放大容器20的条形码获取的放大容器20的类别为“ESR1”,所以在第2道的第2图像520中显示“Error:ESR1
Figure 681469DEST_PATH_IMAGE001
”。
并且,在图17(a)的示例中,在第2道的第1图像510和第2图像520中分别显示“DNA、血浆”和“All-Ras”作为正确的容器的类别。
并且,此时,第2道中的第1图像510和第2图像520的边框的颜色为红色。在图17(a)中,为便于说明,第1图像510和第2图像520的边框为粗实线以清楚边框的颜色为红色。此外,在界面500显示表示设置了不正确的类别的容器的错误标签501。错误标签501中比如显示“容器的类别不正确”等字符串。另外,也可以在错误标签501中显示哪个道的哪个容器不正确。
像这样,操作者能通过参照第1图像510和第2图像520内的显示、第1图像510和第2图像520的边框的颜色、错误标签501等来从视觉上掌握设置的容器不正确。由此,能防止操作者使用不正确的类别的容器进行样本处理。因此,能在之后设置正确的容器来对样本进行正确处理。另外,操作者能将错误设置的容器顺畅地交换为正确类别的容器。
若显示如上所述的错误,则针对样本的处理中止,因此能切实防止使用不正确的类别的容器进行样本处理。因此,能在之后设置正确的容器来对样本进行正确处理。并且能防止错误的提取容器10中铝封条10a开放提取容器10浪费、对错误的放大容器20中注入提取液容器20浪费。
另外,像这样在设置了不正确的容器时,如图17(a)所示,开始按钮540无效化无法触摸。在图17(a)中,为便于说明,开始按钮540的边框为虚线以清楚其无效。由此,能切实防止在设置了不正确的容器的情况下进行处理。
另外,若省略用于将显示区域530与第1图像510和第2图像520相对应的显示,则可以在界面500上用线连接显示区域530与第1图像510和第2图像520以清楚针对哪个样本ID设置了不正确的容器。
在执行了图11的步骤S116之后,控制部401将处理返回图10的步骤S102。此时,操作者打开盖100b,从发生了错误的提取容器设置部110和放大容器设置部120中去掉容器。若显示了图17(a)所示的错误,则操作者去掉第2道的提取容器10和放大容器20。由此,如图17(b)所示,错误标签501的显示消失,并在第2道的第1图像510和第2图像520显示“Empty”。在去掉不正确的容器之后,也如图17(b)所示,曾设置有不正确的容器的第1图像510和第2图像520的边框的颜色维持红色。由此,操作者能掌握仍未设置有正确容器。
然后,操作者将正确的容器设置于去掉了容器的容器设置部。此时,控制部401检测出不正确的容器已去掉,并在之后设置了容器。由此,如图16(a)所示,第1图像510和第2图像520的边框为双重线,在第1图像510和第2图像520显示“Ready”。然后,如图16(a)所示,在错误显示消失的状态下操作者关闭盖100b的话,开始按钮540再次有效。
之后,操作者触摸开始按钮540再次开始处理。由此,控制部401将处理从图10的步骤S108向图11的步骤S111前进,再次开始针对处理对象样本的处理。
处理再次开始时,控制部401也在步骤S111中显示进度界面700,在步骤S112中从所有提取容器10和放大容器20读取条形码,在步骤S113中获取各道中设置的提取容器10和放大容器20的类别。然后,在步骤S114中,控制部401基于获取的提取容器10和放大容器20的类别再次判定容器的设置是否正确。
在步骤S114中判定为容器设置正确的话,控制部401将处理从步骤S114向步骤S117前进。在步骤S117中,控制部401针对进行了样本ID的输入以及提取容器10和放大容器20的设置的道开始测定处理。由此,针对各个处理对象样本进行图18所示的处理。
接下来参照图18对核酸分析装置100的处理中的测定处理进行说明。控制部401通过执行程序405a来进行图18所示的处理。控制部401并列进行在图10的步骤S117中开始的复数个测定处理。以下就针对1个道开始的测定处理进行说明。
测定处理开始后,控制部401驱动分装单元140在喷嘴141的下端安装穿刺用吸头31。控制部401驱动分装单元140使穿刺用吸头31刺穿铝封条10a,由此开放提取容器10的试剂收放部12、试剂收放部13a~13h、废液收放部16的上部。在步骤S201中,控制部401驱动分装单元140在提取容器10中提纯提取液。在提取液的提纯中,针对喷嘴141适当安装和交换吸移管吸头32,并介由吸移管吸头32通过喷嘴141吸移和排放液体。
在步骤S201中,具体来说,控制部401进行如下控制。以下以样本种类为FFPE切片、要提取的核酸种类为DNA为例,对步骤S201的控制进行说明。
控制部401将试剂收放部13a的增溶液向反应部11分装。由此浸渍FFPE切片。控制部401使温度调节部150向上方移动,通过加热器152加热反应部11。由此,石蜡溶解。
接下来,控制部401将试剂收放部13b的蛋白酶K向反应部11分装,将试剂收放部13c的油向反应部11分装。试剂收放部13c的油是矿物油。接下来,控制部401通过温度调节部150调节反应部11的温度。由此,反应部11内的蛋白分解,从细胞提取核酸。
接下来,控制部401使磁力施加部170接近试剂收放部12。由此,试剂收放部12内的磁性粒子聚集在试剂收放部12的壁面。然后,控制部401驱动分装单元140,将试剂收放部12内的磁性粒子保存液移至废液收放部16。然后,控制部401使磁力施加部170远离试剂收放部12。接着,控制部401驱动分装单元140,使试剂收放部15的乙醇和试剂收放部13e的提取用试剂向混合部14c分装,并使混合部14c中收放的乙醇和提取用试剂的混合液向试剂收放部12分装。
接下来,控制部401驱动分装单元140使反应部11的试样溶液向试剂收放部12移动,并在试剂收放部12内重复吸移和排放,来搅拌试剂收放部12内的试样溶液。然后,控制部401驱动温度调节部160调节试剂收放部12的温度。由此核酸被磁性粒子捕捉。接着,控制部401使磁力施加部170接近试剂收放部12。由此,试剂收放部12内的磁性粒子聚集在试剂收放部12的壁面。然后,控制部401驱动分装单元140吸移试剂收放部12的上清液,并将吸移的液体移至废液收放部16。然后,控制部401使磁力施加部170远离试剂收放部12。
然后,控制部401驱动分装单元140使试剂收放部15的乙醇和试剂收放部13h的第1清洗液的原液向混合部14b分装,并使混合部14b中收放的乙醇和第1清洗液的混合液向试剂收放部12分装。接着,控制部401驱动分装单元140搅拌试剂收放部12内的试样溶液。接着,控制部401使磁力施加部170接近试剂收放部12。然后,控制部401控制分装单元140吸移试剂收放部12的上清液,并将吸移的液体移至废液收放部16。然后,控制部401使磁力施加部170远离试剂收放部12。
同样地,控制部401驱动分装单元140使试剂收放部15的乙醇和试剂收放部13f的第2清洗液的原液向混合部14d分装,并使混合部14d中收放的乙醇和第2清洗液的混合液向试剂收放部12分装。接着,控制部401驱动分装单元140搅拌试剂收放部12内的试样溶液。接着,控制部401使磁力施加部170接近试剂收放部12。然后,控制部401驱动分装单元140吸移试剂收放部12的上清液,并将吸移的液体移至废液收放部16。然后,控制部401使磁力施加部170远离试剂收放部12。这样一来试剂收放部12内的杂质被清洗。
然后,控制部401驱动分装单元140使试剂收放部13d的洗提液向试剂收放部12分装,并搅拌试剂收放部12内的试样溶液。然后,控制部401驱动温度调节部160调节试剂收放部12的温度。由此,试剂收放部12内的核酸从磁性粒子洗提出来。
接下来,控制部401使磁力施加部170接近试剂收放部12。由此,试剂收放部12内的磁性粒子聚集在试剂收放部12的壁面。接着,控制部401驱动分装单元140将试剂收放部12的试样溶液移至混合部14a。然后,控制部401使磁力施加部170远离试剂收放部12。然后,控制部401使试剂收放部13g的稀释液的原液向混合部14a分装,并搅拌混合部14a的试样溶液。由此,混合部14a的试样浓度得以调整,在混合部14a内完成提取液。
另外,当样本的种类为血浆、所提取的核酸的种类为DNA时,与上述处理相比,省略热处理进行的去除石蜡的工序。另外,当样本的种类为全血、所提取的核酸的种类为RNA时,与上述处理相比,省略热处理进行的去除石蜡的工序以及蛋白酶K的反应工序。像这样,与样本的种类和核酸的种类相应地进行步骤S201的提纯提取液的工序。
在步骤S202中,控制部401驱动分装单元140,将混合部14a的提取液注入放大容器设置部120中设置的放大容器20的注入口21。在步骤S203中,控制部401驱动移送单元180,使放大容器设置部120中设置的放大容器20向容器设置部210移送。在步骤S204中,控制部401驱动旋转驱动部220,使放大容器20高速旋转,对放大容器20赋予离心力。由此,注入至注入口21的提取液通过流路23送向收放部22。
在步骤S205中,控制部401驱动移送单元180,将通过旋转驱动部220旋转的放大容器20移送至放大容器设置部120。在步骤S206中,控制部401驱动分装单元140,向通过旋转驱动部220旋转且移送至放大容器设置部120的放大容器20的注入口21注入试剂收放部13c的油。另外,在步骤S206中使用的油可以预先收放于核酸分析装置100内的一定收放部。
接下来,在步骤S207中,控制部401驱动移送单元180,使注入有油的放大容器20向容器设置部210移送。在步骤S208中,控制部401驱动旋转驱动部220,使放大容器20高速旋转,对放大容器20赋予离心力。由此,放大容器20的流路23的空气与从注入口21注入的油置换。
接下来,在步骤S209~S215中,控制部401进行核酸放大反应的检测和核酸分析。在实施方式1中,控制部401基于BNA clamp PCR的原理,进行检测与分析。另外,检测与分析的原理不限于BNA clamp PCR,比如也可以是PCR+Invader。
在步骤S209中,控制部401将放大容器20的内部的气泡从注入口21排出。具体来说,控制部401驱动温度调节部230加热放大容器20,驱动旋转驱动部220使放大容器20高速旋转。由此,对放大容器20赋予离心力,放大容器20内的气泡从注入口21排出。
在步骤S210中,控制部401驱动温度调节部230执行放大容器20的温度调节。接下来,在步骤S211中,控制部401驱动旋转驱动部220旋转放大容器20使收放部22位于检测部240的检测位置。在步骤S212中,控制部401驱动检测部240,检测在收放部22产生的核酸放大反应。具体来说,检测部240对收放部22照射激发光,并通过光检测器242d接收从收放部22产生的荧光。控制部401基于光检测器242d输出的电信号获取荧光强度,并将获取的荧光强度存储于存储部405。
在步骤S213中,控制部401判定全部收放部22的检测是否已完成。若全部收放部22的检测未完成,则控制部401将处理返回至步骤S211。此时,在步骤S211中,控制部401驱动旋转驱动部220使放大容器20旋转收放部22的圆周方向的间距,使得仍未检测完成的邻近的收放部22位于检测位置。然后,如上所述,在步骤S212中进行核酸放大反应的检测。像这样,重复进行旋转驱动部220使放大容器20旋转收放部22的圆周方向的间距的动作以及检测部240针对收放部22检测核酸放大反应的动作。然后,从在圆周方向上排列的所有收放部22依次检测核酸放大反应。
全收放部22的检测完成后,在步骤S214中,控制部401判定周期数是否到达了一定周期数。这里,周期指的是由步骤S210~S213构成的处理。一定周期数比如是55周期。即,在步骤S214中判定由步骤S210~S213构成的1个周期是否总计进行了一定周期数。若周期数未到达一定周期数,则控制部401将处理返回至步骤S210。然后,控制部401再次执行由步骤S210~S213构成的周期。
周期数到达一定周期数的话,在步骤S215中,控制部401判定各收放部22中是否有检测靶核酸,并在显示部402显示判定结果等。这样一来,针对1个样本的核酸分析的处理结束。另外,针对1个样本的核酸分析的处理结束后,控制部401驱动移送单元180使容器设置部210中设置的放大容器20移送至放大容器设置部120。移送的放大容器20将在之后废弃。
<实施方式1的变更例1>
在实施方式1的变更例1中,与实施方式1相比,界面500内被赋予颜色的区域改变。如图19(a)所示,在实施方式1的变更例1中,在围住第1图像510与第2图像520的矩形区域内,对第1图像510和第2图像520的外侧的区域赋予颜色。各道所对应的第1图像510和第2图像520的外侧区域所赋予的颜色与实施方式1相同。另外,在围住显示区域530的矩形区域内,对显示区域530的外侧的区域赋予颜色。各道所对应的显示区域530的外侧区域所赋予的颜色与实施方式1相同。实施方式1的变更例1的其他结构与实施方式1相同。
在实施方式1的变更例1中,一个道的第1图像510和第2图像520也通过相同颜色与该道所对应的显示区域530相对应。由此,与实施方式1相同,操作者能通过参照颜色直观掌握各道的第1图像510和第2图像520与样本ID的对应关系。
另外,也可以给第1图像510、第2图像520以及显示区域530的外周的边框赋予颜色来代替给围住第1图像510、第2图像520以及显示区域530的矩形区域赋予颜色。
<实施方式1的变更例2>
在实施方式1的变更例2中,与实施方式1相比,界面500内被赋予颜色的区域改变。如图19(b)所示,在实施方式1的变更例2中,仅对第1图像510和第2图像520内的下半部分的区域赋予颜色。各道所对应的第1图像510和第2图像520内的下半部分的区域所赋予的颜色与实施方式1相同。另外,仅对显示区域530的下半部分的区域赋予颜色。各道所对应的显示区域530的下半部分的区域所赋予的颜色与实施方式1相同。实施方式1的变更例2的其他结构与实施方式1相同。实施方式1的变更例2也发挥与实施方式1的变更例1相同的技术效果。
<实施方式1的变更例3>
在实施方式1的变更例3中,与实施方式1相比,界面500为纵长形状。如图20所示,在实施方式1的变更例3中,第1道所对应的显示区域530位于第1道所对应的第1图像510和第2图像520上。同样地,第2道所对应的显示区域530位于第2道所对应的第1图像510和第2图像520上,第3道所对应的显示区域530位于第3道所对应的第1图像510和第2图像520上。另外,在实施方式1的变更例3中,不对第1图像510、第2图像520和显示区域530赋予颜色。实施方式1的变更例3的其他结构与实施方式1相同。
根据实施方式1的变更例3,相同道所对应的第1图像510、第2图像520和显示区域530纵向排列,因此即使不像实施方式1一样赋予颜色,操作者也能直观掌握对应关系。另外,在实施方式1的变更例3中可以与实施方式1一样赋予颜色。这样一来,操作者能更加直观地掌握对应关系。
<实施方式2>
在实施方式2中,与实施方式1相比,图11所示的流程图与显示部402中显示的界面不同。在实施方式2中,如图21所示,从图11所示的流程图中,在步骤S113的后边追加步骤S121,并追加步骤S122、S123代替步骤S114、S115,步骤S116省略,在步骤S117的前边追加步骤S124。实施方式2中的其他结构与实施方式1相同。
以下就与图11所示的流程图不同的步骤、确认界面进行说明。
如图21所示,在步骤S121中,控制部401在显示部402的显示区域内与进度界面700一并显示图22(a)所示的确认界面800。如图22(a)所示,确认界面800包括各道所对应的3个第1图像810、各道所对应的3个第2图像820、区域811、821、830、消息区域840、OK按钮851、取消按钮852。
第1图像810与界面500的第1图像510相同被赋予与道相对应的颜色,并显示基于测定指令得到的提取容器10的类别。第2图像820与界面500的第2图像520相同被赋予与道相对应的颜色,并显示基于测定指令得到的放大容器20的类别。第1图像810和第2图像820与界面500的第1图像510和第2图像520同样地配置。区域811显示基于各道中设置的提取容器10的条形码而获取的提取容器10的类别。区域821显示基于各道中实际设置的放大容器20的条形码而获取的放大容器20的类别。区域830显示各道所对应的样本ID。消息区域840显示促进消费者确认确认界面800的显示内容的消息。消息区域840比如显示“请确认样本ID、测定项目、容器等”。
像这样,在第1图像810和区域811、830显示能评价提取容器设置部110中设置的提取容器10的类别相对于测定指令是否正确的信息。在第2图像820和区域821、830显示能评价放大容器设置部120中设置的放大容器20的类别相对于测定指令是否正确的信息。
接下来,在步骤S122中,控制部401判定是否触摸了OK按钮851。在判断为未设置正确的容器时,操作者触摸取消按钮852。由此,控制部401将处理从步骤S122向步骤S123前进,在步骤S123中,中止样本处理,关闭确认界面800和进度界面700。另一方面,操作者确认确认界面800的显示内容,当判断为已设置正确的容器时,触摸OK按钮851。由此,控制部401将处理从步骤S122向S124前进,在步骤S124中关闭确认界面800。
根据实施方式2,操作者能通过参照确认界面800的显示内容,来确认提取容器设置部110中是否设置了正确类别的提取容器10以及放大容器设置部120中是否设置了正确类别的放大容器20。由此,操作者能在提取容器设置部110和放大容器设置部120中设置正确类别的提取容器10和放大容器20。因此,能基于正确的容器进行正确地核酸的分析。
另外,在确认界面800中,若第1图像810的显示内容和区域811的显示内容不一致,以及第2图像820的显示内容和区域821的显示内容不一致,则可以在确认界面800显示容器的类别不一致即设置了错误类别的容器。比如通过第1图像810和第2图像820的边框的颜色、用于引起注意的图标等显示设置了错误类别的容器。
<实施方式2的变更例1>
如图22(b)所示,实施方式2的变更例1的确认界面800与图22(a)的确认界面800相比,省略区域811、821。在实施方式2的变更例1中,区域811、821省略,所以不需要从所设置的容器的条形码获取容器的类别。因此,在实施方式2的变更例1中,从图21所示的流程图中省略步骤S112、S113的处理。实施方式2的变更例1的其他结构与实施方式2相同。
在实施方式2的变更例1中,操作者能确认应设置的提取容器10和放大容器20的类别,因此能在提取容器设置部110和放大容器设置部120设置正确类别的提取容器10和放大容器20。因此,能基于正确的容器进行正确地核酸的分析。
<实施方式2的变更例2>
如图23所示,实施方式2的变更例2的确认界面800与图22(a)的确认界面800相比,具有清单区域860来代替第1图像810、第2图像820、区域811、821、830。清单区域860针对各个道具有样本ID、测定项目、样本的类别、应设置的提取容器10的类别、应设置的放大容器20的类别来作为项目。清单区域860将提取容器设置部110中应设置的提取容器10的类别和放大容器设置部120中应设置的放大容器20的类别与样本ID相对应显示。实施方式2的变更例2的其他结构与实施方式2相同。
根据实施方式2的变更例2,操作者能通过参照确认界面800的显示内容来确认所设置的容器的类别与样本ID所示的样本是否处于正确的对应关系。因此,操作者能将正确类别的容器设置于各容器设置部。
另外,可以在清单区域860中进一步显示从实际设置的提取容器10的条形码得到的提取容器10的类别以及从实际设置的放大容器20的条形码得到的放大容器20的类别。这样一来,操作者能进一步顺畅判断容器设置部中设置的容器是否正确。
<实施方式3>
实施方式3的核酸提取装置900是用于使用提取容器10从样本提纯提取液的装置。如图24(a)所示,在实施方式3的核酸提取装置900中,与图1(a)所示的实施方式1的结构相比,省略了放大容器设置部120和检测部240。另外,如图24(b)所示,在实施方式3的界面500中,与图1(b)所示的实施方式1的结构相比,省略了第2图像520。关于实施方式3的其他结构,与图1(a)所示的实施方式1的结构相同。
在实施方式3中,与实施方式1相同,将样本收放于提取容器10的反应部11并开始处理,与实施方式1相同在提取容器10中提纯提取液。在实施方式3中,在提取容器10中提纯了提取液的时间点结束核酸提取装置900的处理。
具体来说,在图10所示的处理中,与实施方式1相同,在输入样本ID后,基于测定指令获取提取容器设置部110中应设置的提取容器10的类别。然后,在步骤S106中,如图24(b)所示,在第1图像510显示应设置的提取容器10的类别。在图11所示的处理中,读取条形码,并获取实际设置于提取容器设置部110的提取容器10的类别后,在步骤S114中,判定提取容器设置部110中设置的提取容器10的类别是否正确。之后,测定处理开始后,在图18所示的处理中只执行步骤S201。这样一来,结束从样本提纯提取液的处理。
在实施方式3中,界面500的显示也与实施方式1同样进行,因此提取容器10设置于提取容器设置部110相关的第1关联信息会发挥在操作者将提取容器10设置于提取容器设置部110时的向导的作用。因此,操作者能通过参照第1关联信息将提取容器10正确设置于提取容器设置部110。另外,显示第1关联信息后,即使是不熟悉核酸提取装置900的操作者也能正确且顺畅地设置提取容器10。
另外,实施方式1的核酸分析装置100可以只进行使用提取容器10从样本提纯提取液的处理。此时,操作者介由显示部402中显示的菜单等输入只进行提纯提取液的处理的指示。然后,操作者将提取容器10设置于提取容器设置部110,并触摸界面500的开始按钮540,开始处理。
<实施方式4>
实施方式4的核酸分析装置100是用于使用放大容器20来放大和检测提取液中的核酸的装置。如图25(a)所示,在实施方式4的核酸分析装置100中,与图1(a)所示的实施方式1的结构相比,设有提取液容器设置部190来代替提取容器设置部110,并在提取液容器设置部190中设置提取液容器50。在提取液容器50中形成有用于收放提取液的收放部51。此外,如图25(b)所示,在实施方式3的界面500中,与图1(b)所示的实施方式1的结构相比,在显示区域530的上方的区域显示“提取液ID”,来表示显示区域530显示提取液ID。关于实施方式4的其他结构,与图1(a)所示的实施方式1的结构相同。
在实施方式4中,将提取液收放于提取液容器50的收放部51并开始处理,进行提取液中的核酸的放大和检测。在实施方式4中,省略如实施方式1所示的提纯提取液的处理。提取液中的核酸的放大、检测及分析结束后,结束核酸分析装置100的处理。
具体来说,在图10所示的处理中,输入提取液ID来代替样本ID,之后基于测定指令获取放大容器设置部120中应设置的放大容器20的类别。此时的测定指令中录入了提取液ID、测定项目、核酸的类别。然后,在步骤S106中,如图25(b)所示,在第2图像520显示应设置的放大容器20的类别。另外,此时,在第1图像510显示基于测定指令得到的提取液中的核酸的类别。在图11所示的处理中,读取条形码,并获取实际设置于放大容器设置部120的放大容器20的类别后,在步骤S114中判定放大容器设置部120中设置的放大容器20的类别是否正确。之后,测定处理开始后,在图18所示的处理中,执行步骤S202及以后的处理。这样一来,提取液中的核酸的放大、检测以及分析结束。
在实施方式4中,界面500的显示也与实施方式1同样进行,因此放大容器20设置于放大容器设置部120相关的第2关联信息会发挥在操作者将放大容器20设置于放大容器设置部120时的向导作用。因此,操作者能通过参照第2关联信息将放大容器20正确设置于放大容器设置部120。另外,第2关联信息显示后,即使是不熟悉核酸分析装置100的操作者也能正确且顺畅地设置放大容器20。
另外,实施方式1的核酸分析装置100可以只进行使用放大容器20针对提取液中的核酸的放大、检测以及分析处理。此时,操作者介由显示部402中显示的菜单等输入只进行针对提取液中的核酸的放大、检测以及分析处理的指示。然后,操作者将放大容器20设置于放大容器设置部120,将只收放了提取液的提取容器10设置于提取容器设置部110,并触摸界面500的开始按钮540,开始处理。
编号说明
10 提取容器
20 放大容器
100 核酸分析装置
110 提取容器设置部
112a 第1传感器
120 放大容器设置部
122 第2传感器
142 读取部
401 控制部
402 显示部
510 第1图像
511 第1操作部
520 第2图像
521 第2操作部
530 显示区域
810 第1图像
820 第2图像
900 核酸提取装置

Claims (23)

1.一种核酸分析装置,其特征在于包括:
复数个放大容器设置部,其设置放大容器,所述放大容器被注入含有核酸的提取液,并收放有用于放大所述提取液中的核酸的试剂;
显示部;
控制部,在所述显示部显示使所述复数个放大容器设置部的各自的配置位置与放大容器设置于放大容器设置部相关的关联信息相对应的界面。
2.根据权利要求1所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述关联信息包括将复数个样本的每一个与收放用于处理各样本的试剂的放大容器所设置到的放大容器设置部的配置位置相关联的信息。
3.根据权利要求2所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述关联信息包括将复数个样本的各自的识别信息与收放用于处理各样本的试剂的放大容器所设置到的放大容器设置部的配置位置相关联的信息。
4.根据权利要求3所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述关联信息包括对各样本的识别信息的显示以及各样本所对应的放大容器设置部的配置位置赋予的颜色。
5.根据权利要求1至4的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述关联信息包括各放大容器设置部中应设置的放大容器的类别的相关信息。
6.根据权利要求5所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述放大容器的类别的相关信息包括处理对象样本的测定项目的相关信息。
7.根据权利要求1至6的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
当放大容器设置部中未设置有处理对象样本所对应的类别的放大容器时,所述控制部在所述显示部显示表示放大容器的类别不正确的信息作为所述关联信息。
8.根据权利要求7所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述放大容器包括持有能确定该放大容器的类别的信息;
所述核酸分析装置包括用于从放大容器设置部中设置的所述放大容器读取所述放大容器的类别的相关信息的读取部;
当处理对象样本所对应的放大容器的类别与所述读取部读取的信息不对应时,所述控制部在所述显示部显示表示放大容器设置部中设置的放大容器的类别不正确的信息作为所述关联信息。
9.根据权利要求7或8所述的核酸分析装置,其特征在于:
当所述处理对象样本所对应的类别的放大容器未设置于放大容器设置部时,所述控制部中断针对所述样本的处理。
10.根据权利要求1至9的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述核酸分析装置包括用于检测放大容器设置部中是否设置有放大容器的传感器;
其中,所述控制部基于所述传感器的检测结果在所述显示部显示放大容器设置部中是否设置有放大容器的相关信息作为所述关联信息。
11.根据权利要求1至10的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述关联信息包括对放大容器设置部中设置的放大容器的类别是否与处理对象样本相对应且正确能进行评价的信息。
12.根据权利要求1至11的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述控制部在所述显示部显示所述界面,所述界面将所述复数个放大容器设置部的各自的配置位置所对应的图像与所述关联信息相对应。
13.根据权利要求12所述的核酸分析装置,其特征在于:
在针对所述图像进行了一定操作时,所述控制部在所述显示部显示用于受理处理对象样本的测定项目的操作部。
14.根据权利要求1至13的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于
所述核酸分析装置还包括复数个提取容器设置部,其设置提取容器,所述提取容器收放用于从样本提取核酸的试剂并用于使用所述试剂对含有核酸的提取液进行提纯;
其中,所述控制部在所述显示部显示所述界面,所述界面使所述复数个提取容器设置部的各自的配置位置与提取容器设置于提取容器设置部相关的关联信息相对应。
15.根据权利要求14所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述关联信息包括所述提取容器设置部中应设置的提取容器的类别的相关信息。
16.根据权利要求15所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述提取容器的类别的相关信息包括处理对象样本的类别的相关信息。
17.根据权利要求14至16的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述控制部在所述显示部显示所述界面,所述界面使所述复数个提取容器设置部的各自的配置位置所对应的图像与所述关联信息相对应。
18.根据权利要求17所述的核酸分析装置,其特征在于:
当针对所述图像进行了一定的操作时,所述控制部在所述显示部显示用于受理处理对象样本的类别的操作部。
19.根据权利要求14至18的任意一项所述的核酸分析装置,其特征在于:
相同组的放大容器设置部和提取容器设置部在装置主体的纵深方向上排列配置;
相同组的放大容器设置部和提取容器设置部的纵长方向与装置主体的纵深方向平行;
互相不同组的放大容器设置部和提取容器设置部在装置主体的宽度方向上排列配置。
20.根据权利要求19所述的核酸分析装置,其特征在于:
提取容器设置部和放大容器设置部开放使得能从所述装置主体的前侧设置提取容器和放大容器;
所述显示部配置于所述装置主体的前侧面;
所述控制部在所述显示部显示所述界面,所述界面中一组的提取容器设置部和放大容器设置部所分别对应的图像纵向排列,且其他组的提取容器设置部和放大容器设置部所分别对应的图像相对于所述一组的图像在横向排列。
21.根据权利要求19或20所述的核酸分析装置,其特征在于:
所述控制部在所述显示部显示所述界面,所述界面中所述提取容器设置部所对应的图像和所述放大容器设置部所对应的图像纵向排列,显示各组的提取容器设置部和放大容器设置部所对应的样本的识别信息的区域横向延伸。
22.一种核酸提取装置,其特征在于包括:
复数个提取容器设置部,其设置提取容器,所述提取容器收放用于从样本提取核酸的试剂并用于使用所述试剂对含有核酸的提取液进行提纯;
显示部;
控制部,在所述显示部显示使所述复数个提取容器设置部的各自的配置位置和提取容器设置于提取容器设置部相关的关联信息相对应的界面。
23.一种核酸分析装置,其特征在于包括:
提取容器设置部,其设置提取容器,所述提取容器收放用于从样本提取核酸的试剂并且用于使用所述试剂对含有核酸的提取液进行提纯;
放大容器设置部,其设置放大容器,所述放大容器被注入在所述提取容器中提纯的所述提取液,并收放有用于放大所述提取液中的核酸的试剂;
显示部;
控制部,在所述显示部显示使所述提取容器设置部的配置位置与提取容器设置于所述提取容器设置部相关的第1关联信息相对应、并使所述放大容器设置部的配置位置与放大容器设置于所述放大容器设置部相关的第2关联信息相对应的界面。
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