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CN110818802A - 一种嵌合t细胞受体star及其应用 - Google Patents

一种嵌合t细胞受体star及其应用 Download PDF

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CN110818802A CN201810898720.2A CN201810898720A CN110818802A CN 110818802 A CN110818802 A CN 110818802A CN 201810898720 A CN201810898720 A CN 201810898720A CN 110818802 A CN110818802 A CN 110818802A
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赵学强
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Sino-American iCELL (Shanghai) Biotechnology Co Ltd
Huaxia Yingtai (beijing) Biotechnology Co Ltd
Tsinghua University
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Abstract

本发明公开了一种嵌合T细胞受体(Synthetic T Cell Receptor and Antigen Receptor,STAR),以及相关制剂、药物、或其在制备细胞药物中的用途,还涉及所述制剂或药物组合物用于治疗相应的疾病,例如肿瘤或感染性疾病等。

Description

一种嵌合T细胞受体STAR及其应用
技术领域
本发明涉及生物医药领域,具体地涉及一种抗体-T细胞受体嵌合受体,构建方法及其用途,包括治疗及诊断疾病。
背景技术
嵌合抗原受体T细胞疗法(CAR-T)和T细胞受体疗法(TCR-T)都是利用患者自身的T淋巴细胞治疗癌症的两类前沿基因疗法。它们能够表达特异性受体,靶向识别特异性的细胞如肿瘤细胞,受到广泛的关注和研究,从最开始的基础免疫研究转变为临床应用。基于合成生物学、免疫学和遗传改造技术的最新进展,使得合成改造的特异性功能加强的T细胞成为可能。
CAR-T是利用能够与特定抗原结合的抗体片段来识别肿瘤细胞表面的抗原。近年来,CD19抗原特异性CAR-T细胞用于治疗B细胞白血病和淋巴瘤临床试验中,显示出持续的疾病缓解效果。嵌合抗原受体(CAR)赋予T细胞HLA非依赖的方式识别肿瘤抗原的能力,这使得经过CAR改造的T细胞相对于天然T细胞表面受体TCR能够识别更广泛的目标。目前,CAR-T技术在急性白血病和非霍奇金淋巴瘤的治疗上有着显著的疗效,被认为是最有前景的肿瘤治疗方式之一。
与CAR-T不同,TCR(T cell receptor)是T细胞表面特异性识别抗原和介导免疫应答的分子。TCR主要识别由组织相容复合物分子提呈的抗原分子多肽。近几年,由于CAR-T细胞疗法在临床上取得巨大的成功,TCR疗法的研究相对不那么引人关注。然而,在治疗实体瘤方面,TCR-T与CAR-T相比有着明显的优势,这是因为CAR-T细胞治疗的靶点抗原为细胞表面蛋白,而TCR-T识别MHC分子,MHC分子能够呈递从细胞表面和细胞内蛋白中获得的肽链,因此TCR-T能够靶向更多种抗原。
众所周知,大多数肿瘤相关抗原(TAA)是自身抗原,由于胸腺的选择机制和耐受机制,机体针对这些抗原产生的T淋巴细胞的大多数T细胞受体(TCR)的亲和力都比较低,从而限制了其肿瘤识别及杀伤效果。将克隆的高亲和力识别TAA的TCR(或嵌合受体)通过转基因技术转给T淋巴细胞,可以使重定向的原来无肿瘤识别能力的T细胞在体外和体内有效地识别并杀伤肿瘤细胞。TCR为所有T细胞表面的特征性标志,以非共价键与CD3(ε,δ,γ,ζ)结合,形成TCR-CD3复合体。
TCR是由两条不同肽链构成的异二聚体,由α、β两条肽链组成,每条肽链又可分为可变区(V区)和恒定区(C区)两部分,其中恒定区又包括胞外区、跨膜区和胞内末端三部分;其特点是胞内区很短。TCR分子属于免疫球蛋白超家族,其抗原特异性存在于V区。TCR分为两类:TCR1和TCR2;TCR1由γ和δ两条链组成,TCR2由α和β两条链组成。外周血中,90%-95%的T细胞表达TCR2;而且任一T细胞只表达TCR2或TCR1之一。
天然存在的TCR是一种膜蛋白,通过其跨膜区得以稳定,因此对于在细菌中表达可溶性TCR而言,获得保持与其原配体(即pMHC)特异性结合能力的高稳定性TCR是一件非常困难的事情,如专利文献WO99/18129中所述。有些文献描述了截短形式的TCR,它仅仅包含胞外区或者仅仅包含胞外和胞质区,尽管这样的TCR可以被TCR特异性的抗体识别,但是产率很低,并且低浓度时不能识别主组织相容性复合体-肽复合体,说明其很容易变性,不够稳定。
TCR-T技术优势在于:传统的免疫过继治疗,只是增加了效应细胞的数量,对于效应细胞的特异性并没有提高,而且效应细胞即使能和肿瘤细胞结合,其亲和力也比较低。TCR-T技术,直接改造T细胞的结合肿瘤抗原的“探头”-TCR,加强了T细胞针对肿瘤细胞的特异性识别过程,而且提高了T淋巴细胞对于肿瘤细胞的亲和力,使得原来无肿瘤识别能力的T细胞在体外和体内有效地识别并杀伤肿瘤细胞。总之,TCR-T细胞疗法,一边增加了T淋巴细胞的数量,一边提高了T淋巴细胞对于肿瘤细胞的杀伤性,从而达到了很好的肿瘤治疗效果。
现有TCR-T疗法中,一般需要分离出内源的TCR,并加以工程化改造,将其引入全新的T细胞,并输注回人体,带有靶向癌细胞能力的T细胞数量将大增,有望对多种实体肿瘤与血液肿瘤进行识别与攻击。然而外源性的TCRα和β链与内源性的α和β链之间会相互识别配对形成杂合TCR。这种TCR错配现象被认为广泛存在于TCR-T疗法中,可能引发细胞表面的TCR表达量下降、细胞活性降低。错配TCR还可能形成一种能产生未知特异性的新的TCR,这种新的TCR会在TCR-T中带来自身免疫性(on-target)或交叉反应(off-target)毒性。虽然目前TCR错配引起的自身反应疾病还没有临床证据,但是由杂合TCR所带来的自身免疫风险却不容忽视。因此,TCR在T细胞的表达和配对组装以及与pMHC的亲和力都是影响TCR基因治疗充分发挥抗肿瘤能力的关键因素。
可见,如何改造修饰TCR基因使得TCRα链和β链能在T细胞表面正确配对,并且其表达效率和亲和力都增强,同时避免产生副作用、提高安全性成为近年来TCR基因治疗的一个热点之一。主要的策略包括提高TCR在T细胞中的亲和力、优化TCR链的配对以及增强其表面表达效率。比如有研究者采用以下方法来减少TCR的错配:在TCR链中引入二硫键;采用鼠源性保守C区替换人TCR分子的C区;将TCRα链和β链链接口处保守结构域的氨基酸残基翻转;构建单链TCR(scTCR)嵌合体;将TCR链的C区与CD3分子融合;将aβTCR基因转入γδT细胞中等,但上述效果均不尽如人意。可见,目前虽然提出了对TCR-T进行修饰以优化外源TCR分子的配对策略,但仍然有很多需要改进的地方。
发明内容
本发明解决现有技术中存在的上述技术问题,提供一种特异性结合至靶抗原的嵌合T细胞受体(Synthetic T Cell Receptor and Antigen Receptor,STAR),所述嵌合T细胞受体包含:
a)抗体重链可变区与T细胞受体(TCR)第一亚基恒定区融合得到的第一肽链;和,
b)抗体轻链可变区与T细胞受体第二亚基恒定区融合得到的第二肽链;
其中,所述抗体重链可变区与抗体轻链可变区特异性结合至所述靶抗原的抗原表位。
在一些实施方案中,根据前述的嵌合T细胞受体,(1)当所述T细胞受体第一亚基为α链时,所述T细胞受体第二亚基为β链;或,(2)当所述T细胞受体第一亚基为β链时,所述T细胞受体第二亚基为α链;或,(3)当所述T细胞受体第一亚基为γ链时,所述T细胞受体第二亚基为δ链;或,(4)当所述T细胞受体第一亚基为δ链时,所述T细胞受体第二亚基为γ链。
具体的,所述第一肽链和第二肽链在T细胞中表达后通过二硫键结合。
在一些实施方案中,嵌合T细胞受体第一亚基恒定区和T细胞受体第二亚基恒定区,其种属来源为人源或鼠源,包括不同的蛋白亚型。
在一些实施方案中,对所述的嵌合T细胞受体可进行任何氨基酸序列改造,包括但不限于氨基酸点突变修饰、多肽片段替换修饰,以降低与内源表达的T细胞受体错配。例如:TCRα链,其恒定区第48位氨基酸突变为半胱氨酸,且,其恒定区第57位氨基酸突变为半胱氨酸,使得所述第一多肽和第二多肽之间通过二硫键连接;再例如:TCRα链,其恒定区第85位氨基酸突变为丙氨酸,且,其恒定区第88位氨基酸突变为甘氨酸;
具体的,(1)所述T细胞受体第一亚基是TCRα链,其恒定区第48位氨基酸突变为半胱氨酸,和/或,所述T细胞受体第二亚基是TCRβ链,其恒定区第57位氨基酸突变为半胱氨酸;或(2)所述T细胞受体第一亚基是TCRα链,其恒定区第85位氨基酸突变为丙氨酸,和/或,所述T细胞受体第二亚基是TCRβ链,恒定区第88位氨基酸突变为甘氨酸。
在一些实施方案中,所述的靶抗原为肿瘤特异性抗原或病毒特异性抗原。具体的所述靶抗原选自CD19,CD20,EGFR,Her2,PSCA,CD123,CEA(癌胚抗原),FAP,CD133,EGFRVIII,BCMA,PSMA,CA125,EphA2,C-met,L1CAM,VEGFR,CS1,ROR1,EC,NY-ESO-1,MUC1,MUC16,mesothelin,LewisY,GPC3,GD2,EPG,DLL3,CD99,5T4,CD22,CD30,CD33,CD138,CD171。优选的,所述抗原可以为CD19、CD20,EGFR,Her2。
具体的,在一些实施方案中,所述的抗体、抗体重链可变区或抗体轻链可变区来自IMCC225(西妥昔单抗、Cetuximab/Cetux)、利妥昔单抗(美罗华)、Ofatumumab(OFA,奥法木单抗)、CD19单克隆抗体(FMC63)、Avastin(贝伐单抗)、BEC2(阿妥莫单抗)、Bexxar(托西莫单抗)、Campath(阿仑单抗)、Herceptin(曲妥单抗)、LymphoCide(依帕珠单抗)、MDX-210、Mylotarg(吉姆单抗奥佐米星)、单抗17-1A(依决洛单抗)、Theragyn(pemtumomab)、Zamyl、Zevalin(替伊莫单抗)或筛选获得的高亲和力抗体。优选的,其所述抗体包括选自Fab、F(ab’)2、Fab’、scFv、Fv、VH、VL的抗原结合片段。
在一些实施方案中,所述靶抗原相关疾病为癌症或病毒感染相关疾病。具体的,所述癌症选自下组:肾上腺皮质癌、膀胱癌、乳腺癌、子宫颈癌、胆管癌、结肠直肠癌、食道癌、神经胶母细胞瘤、神经胶质瘤、肝细胞癌、头颈癌、肾癌、白血病、淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、间皮瘤、多发性骨髓瘤、胰脏癌、嗜铬细胞瘤、浆细胞瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宫癌及甲状腺癌;或,所述病毒感染是由选自以下病毒引起:巨细胞病毒(CMV)、埃-巴二氏病毒(Epstein-BarrVirus;EBV)、B型肝炎病毒(HBV)、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)、人类乳头状瘤病毒(HPV)、传染性软疣病毒(MCV)、人类T细胞白血病病毒1(HTLV-1)、HIV(人类免疫缺陷病毒)及C型肝炎病毒(HCV)。
本发明的嵌合T细胞受体,所述第一多肽和第二多肽与T细胞内源的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体。
在一些实施方案中,所述抗体重链可变区和轻链可变区来源于IMCC225(西妥昔单抗、Cetuximab/Cetux)、利妥昔单抗(美罗华)、Ofatumumab(奥法木单抗)、CD19单克隆抗体FMC63的VH和VL。
优选的,所述Cetux VH的核苷酸序列为SEQ ID NO:3,氨基酸序列为SEQ ID NO:13所述Cetux VL的核苷酸序列为SEQ ID NO:4,氨基酸序列为SEQ ID NO:14。
优选的,所述FMC63-VH的核苷酸序列为SEQ ID NO:5,氨基酸序列为SEQ ID NO:15,所述FMC63-VL的核苷酸序列为SEQ ID NO:6,氨基酸序列为SEQ ID NO:16;。
优选的,所述OFA-VH的核苷酸序列为SEQ ID NO:9,氨基酸序列为SEQ ID NO:19,所述OFA-VL的核苷酸序列为SEQ ID NO:10,氨基酸序列为SEQ ID NO:20。
在一些实施方案中,所述来源于西妥昔单抗、曲妥昔单抗、利妥昔单抗的VH和VL分别与所述TCRα链或β链融合获得VH-TCRα链融合体或VL-TCRβ链融合体。
进一步优选的,所述来源于IMCC225(西妥昔单抗、Cetuximab/Cetux)、利妥昔单抗(美罗华)、Ofatumumab(奥法木单抗)、CD19单克隆抗体FMC63的VH和VL分别与所述TCRα链恒定区或β链恒定区融合获得VH-TCRα链恒定区融合体或VL-TCRβ链恒定区融合体。
优选的,所述两个不同的融合体通过furin-p2A段肽序列相连;优选的,所述两个不同的融合体在T细胞中表达后通过二硫键共价结合。更进一步的,所述两个不同的融合体与T细胞内源的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体。
另外,本发明还提供了一种特异性结合至靶抗原的由嵌合T细胞受体形成的复合体,由前述任一的嵌合T细胞受体与T细胞内源表达的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体,且被靶抗原激活后可介导T细胞相关信号转导通路。
在一些实施方案中,本发明还提供了一种核酸,其编码前述任一项的嵌合T细胞受体或所述第一多肽及所述第二多肽。
具体的,所述核酸的结构如下:
(1)依次为抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(2)依次为抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(3)依次为抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(4)依次为抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(5)将(1)-(4)中的T细胞受体(TCR)α链替换为T细胞受体(TCR)γ链,T细胞受体(TCR)β链替换为T细胞受体(TCR)δ链对应的核酸。
在一些具体实施方案中,所述T细胞受体(TCR)α链或β链恒定区来源于人TCRα链或β链恒定区,还可以来源于鼠TCRα链或β链恒定区。
在一些具体实施方案中,TCR的α链和/或β链可进行氨基酸点突变修饰、多肽片段替换修饰,以降低与内源表达的T细胞受体错配。优选的,TCR的α链和/或β链进行半胱氨酸点突变。具体的,TCRα链恒定区第48位氨基酸突变为半胱氨酸,TCRβ链恒定区第57位氨基酸突变为半胱氨酸,使得所述第一肽链和第二肽链之间通过增加一个二硫键的方式连接。
更优选的,人源TCRα链恒定区半胱氨酸突变体核苷酸序列为SEQ ID NO:1,氨基酸序列为SEQ ID NO:11;人源TCRβ链恒定区半胱氨酸突变体核苷酸序列为SEQ ID NO:2,氨基酸序列为SEQ ID NO:12。
在另一个实施方案中,人源TCRγ链恒定区的氨基酸序列为SEQ ID NO:21,人源TCRδ链恒定区的氨基酸序列为SEQ ID NO:22,鼠源TCRγ链恒定区的氨基酸序列为SEQ IDNO:23,鼠源TCRδ链恒定区的氨基酸序列为SEQ ID NO:24。
进一步的,天然人源TCRα链恒定区首位氨基酸存在四种形式;首位氨基酸为Asp,即SEQ ID NO:11所示的多肽,以及首位氨基酸为Asn、His或Tyr的多肽,因此人源TCRα链恒定区半胱氨酸突变体还可以选自以下序列表示的多肽:
①氨基酸序列为SEQ ID NO:31,对应的核苷酸序列为SEQ ID NO:25;
②氨基酸序列为SEQ ID NO:32,对应的核苷酸序列为SEQ ID NO:26;
③氨基酸序列为SEQ ID NO:33,对应的核苷酸序列为SEQ ID NO:27。
更优选的,鼠源TCRα链恒定区半胱氨酸突变体核苷酸序列为SEQ ID NO:7,氨基酸序列为SEQ ID NO:17;鼠源TCRβ恒定区半胱氨酸突变体核苷酸序列为SEQ ID NO:8,氨基酸序列为SEQ ID NO:18。
进一步的,天然鼠源TCRα链恒定区首位氨基酸存在四种形式;首位氨基酸为Asn,即SEQ ID NO:17所示的多肽,以及首位氨基酸为Asp、His或Tyr的多肽,因此鼠源TCRα链恒定区半胱氨酸突变体还可以选自以下序列表示的多肽:
①氨基酸序列为SEQ ID NO:34,对应的核苷酸序列为SEQ ID NO:28;
②氨基酸序列为SEQ ID NO:35,对应的核苷酸序列为SEQ ID NO:29;
③氨基酸序列为SEQ ID NO:36,对应的核苷酸序列为SEQ ID NO:30。
在一些实施方式中,T细胞受体(TCR)α链可替换为T细胞受体(TCR)γ链;T细胞受体(TCR)β链可替换为T细胞受体(TCR)δ链。优选的,T细胞受体(TCR)γ链和T细胞受体(TCR)δ链可来源于人TCRγ链或δ链恒定区,还可以来源于鼠TCRγ链或δ链恒定区。
在一些实施方案中,本发明还提供了一种载体,其包含编码前述任一项的嵌合T细胞受体或所述第一多肽及所述第二多肽的核酸。优选的,所述载体是质粒。更优选的,所述载体选自逆转录病毒载体、慢病毒载体、腺病毒载体和腺相关病毒载体。
在一些实施方案中,根据以上所述嵌合T细胞受体中的任一者,提供一种效应细胞,其表达前述任一的嵌合T细胞受体或前述复合体于其细胞表面上。在一些实施方案中,效应细胞包含编码所述嵌合T细胞受体的核酸。在一些实施方案中,T细胞选自下组:细胞毒性T细胞、辅助T细胞、自然杀伤T细胞及抑制T细胞。
在一些实施方案中,提供一种药物组合物,其包含根据以上所述嵌合T细胞受体中的任一者的嵌合T细胞受体及药物上可接受的载剂。在一些实施方案中,提供一种药物组合物,其包含编码根据以上所述实施方案中的任一者的所述嵌合T细胞受体的核酸及药物上可接受的载剂。在一些实施方案中,提供一种药物组合物,其包含表达根据以上所述嵌合T细胞受体的任一者的效应细胞及药物上可接受的载剂。
本发明的嵌合T细胞受体和本发明嵌合T细胞受体转染的细胞可与药学上可接受的载体一起在药物组合物中提供。本发明的嵌合T细胞受体、嵌合T细胞受体的复合体和细胞通常作为无菌药物组合物的一部分提供,所述组合物通常包括药学上可接受的载体。该药物组合物可以是任何合适的形式(取决于给予患者的所需方法)。其可采用单位剂型提供,通常在密封的容器中提供,可作为试剂盒的一部分提供。此类试剂盒(但非必需)包括使用说明书。其可包括多个所述单位剂型。
本发明的嵌合T细胞受体可以单独使用,也可与偶联物结合或偶联。所述偶联物包括可检测标记物、治疗剂、PK(蛋白激酶)修饰部分或任何以上这些物质的组合。
用于诊断目的的可检测标记物包括但不限于:荧光或发光标记物、放射性标记物、MIR(磁共振成像)或CT(电子计算机X射线断层扫描技术)造影剂、或能够产生可检测产物的酶。
药物组合物还可含有药学上可接受的载体。术语“药学上可接受的载体”指用于治疗剂给药的载体。该术语指这样一些药剂载体:它们本身不诱导产生对接受该组合物的个体有害的抗体,且给药后没有过分的毒性。这些载体是本领域普通技术人员所熟知的。这类载体包括但并不限于:盐水、缓冲液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、佐剂及其组合。治疗性组合物中药学上可接受的载体可含有液体,如水、盐水、甘油和乙醇。另外,这些载体中还可能存在辅助性的物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲物质等。通常,可将治疗性组合物制成可注射剂,例如液体溶液或悬液;还可制成在注射前适合配入溶液或悬液中、液体载体的固体形式。
一旦配成本发明的组合物,可将其通过常规途径进行给药,其中包括(但并不限于):眼内、肌内、静脉内、皮下、皮内或局部给药。待预防或治疗的对象可以是动物,尤其是人。
当本发明的药物组合物被用于实际治疗时,可根据使用情况而采用各种不同剂型的药物组合物。较佳地,可以例举的有针剂、口服剂等。这些药物组合物可根据常规方法通过混合、稀释或溶解而进行配制,并且偶尔添加合适的药物添加剂,如赋形剂、崩解剂、粘合剂、润滑剂、稀释剂、缓冲剂、等渗剂、防腐剂、润湿剂、乳化剂、分散剂、稳定剂和助溶剂,而且该配制过程可根据剂型用惯常方式进行。
本发明的药物组合物还可以缓释剂形式给药。例如,本发明多肽可被掺入以缓释聚合物为载体的药丸或微囊中,然后将该药丸或微囊通过手术植入待治疗的组织。
当本发明的药物组合物被用于实际治疗时,作为活性成分的本发明多肤或其药学上可接受的盐的剂量,可根据待治疗的每个病人的体重、年龄、性别、症状程度而合理地加以确定。
本发明的嵌合T细胞受体可用作药物或诊断试剂。可通过修饰或其他改进以使其获得更适于作为药物或诊断试剂使用的特征。
在一些实施方案中,提供一种核酸文库,其包含编码多个根据以上所述嵌合T细胞受体任一者的嵌合T细胞受体的序列。
在一些实施方案中,提供一种筛选根据以上所述实施方案中的任一者的核酸文库中编码对靶抗原具有特异性的嵌合T细胞受体的序列的方法,其包含:a)将核酸文库引入至多个细胞中,使得嵌合T细胞受体表达于多个细胞的表面上;b)将多个细胞与包含靶抗原或其中所含的一或多个表位的配体一起温育;c)收集结合至配体的细胞;及d)自步骤c)中所收集的细胞中分离编码嵌合T细胞受体的序列,从而鉴别对靶抗原具有特异性的嵌合T细胞受体。
还提供本文所述构建体中的任一者的制造方法、制品及适合于本文所述方法的试剂盒。
在一些实施方案中,还提供一种以上所述嵌合T细胞受体中的任一者的嵌合T细胞受体在制备治疗或诊断有需要个体的靶抗原相关疾病的试剂盒中的用途。
在一些实施方案中,提供一种杀伤递呈靶抗原的靶细胞的方法,其包含使靶细胞与表达根据以上所述嵌合T细胞受体中的任一者的嵌合T细胞受体的效应细胞接触,其中嵌合T细胞受体特异性结合至靶抗原。
在一些实施方案中,提供一种杀伤递呈靶抗原的靶细胞的方法,其中所述的嵌合T细胞受体特异性结合至靶抗原。其中,所述抗体重链可变区和轻链可变区特异性结合至所述靶抗原的抗原结合模块。
在一些实施方案中,根据以上所述的靶细胞杀伤方法中的任一者,该接触为体内的。在一些实施方案中,该接触为体外的。
在一些实施方案中,提供一种治疗有需要个体的靶抗原相关疾病的方法,其包含向个体施用有效量的药物组合物,该药物组合物包含表达根据以上所述嵌合T细胞受体或所述效应细胞。
在一些实施方案中,提供一种治疗有需要个体的靶抗原相关疾病的方法,其包含向个体施用有效量的组合物,该组合物包含效应T细胞,该效应T细胞包含特异性结合至靶抗原的嵌合T细胞受体,其包含:a)抗体重链可变区融合的第一多肽;b)抗体轻链可变区融合的第二多肽;其中,所述抗体重链可变区和轻链可变区特异性结合至所述靶抗原的抗原结合模块。优选的,所述嵌合T细胞受体为前述任一嵌合T细胞受体。
在一些实施方案中,提供一种在有需要的受试者中治疗由于细胞、组织、机体部分或器官移植发生的T细胞介导的病症的方法,其包括步骤:将细胞、组织、机体部分或器官移植入所述受试者;并施用两次或多次剂量的药物上可接受量的前述任意一个嵌合T细胞受体至所述受试者。
在一些实施方案中,根据以上的方法中的任一者,所述疾病为癌症。在一些实施方案中,癌症选自下组:肾上腺皮质癌、膀胱癌、乳腺癌、子宫颈癌、胆管癌、结肠直肠癌、食道癌、神经胶母细胞瘤、神经胶质瘤、肝细胞癌、头颈癌、肾癌、淋巴瘤、白血病、肺癌、黑素瘤、间皮瘤、多发性骨髓瘤、胰脏癌、嗜铬细胞瘤、浆细胞瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宫癌及甲状腺癌。在一些实施方案中,靶抗原相关疾病为病毒感染。在一些实施方案中,病毒感染是由选自以下的病毒引起:巨细胞病毒(CMV)、埃-巴二氏病毒(Epstein-Barr Virus;EBV)、B型肝炎病毒(HBV)、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi'sSarcoma associated herpes virus;KSHV)、人类乳头状瘤病毒(HPV)、传染性软疣病毒(MCV)、人类T细胞白血病病毒1(HTLV-1)、HIV(人类免疫缺陷病毒)及C型肝炎病毒(HCV)。
更优选的,所述疾病为肾上腺皮质癌、膀胱癌、乳腺癌、子宫颈癌、胆管癌、结肠直肠癌、食道癌、神经胶母细胞瘤、神经胶质瘤、肝细胞癌、头颈癌、肾癌、白血病、淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、间皮瘤、多发性骨髓瘤、胰脏癌、嗜铬细胞瘤、浆细胞瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宫癌及甲状腺癌等。
在一些实施方案中,提供一种治疗有需要个体的靶抗原相关疾病的方法,其包含向个体施用有效量的药物组合物,该药物组合物包含编码根据以上所述嵌合T细胞受体中的任一者的嵌合T细胞受体的核酸。
通过常规的重组DNA技术,可利用本发明的多核苷酸来表达或生产重组的本发明多肽。一般来说有以下步骤:(1)用编码本发明嵌合T细胞受体多肽的多核苷酸(或变异体),或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;(2)在合适的培养基中培养宿主细胞;(3)从培养基或细胞中分离、纯化出本发明的嵌合T细胞受体多肽。
在一些实施方案中,本发明提供前述任一的嵌合T细胞受体、所述复合体、核酸、载体或效应细胞在制备治疗或诊断有需要个体的靶抗原相关疾病的试剂盒、制剂或药物组合物中的用途。
在一些实施方案中,本发明提供一种治疗有需要个体的靶抗原相关疾病或癌症或病毒感染相关疾病的方法,其包含向个体施用有效量的药物组合物,该药物组合物包含前述任一的嵌合T细胞受体、所述复合体、核酸、载体或效应细胞。
具体的,所述癌症选自下组:肾上腺皮质癌、膀胱癌、乳腺癌、子宫颈癌、胆管癌、结肠直肠癌、食道癌、神经胶母细胞瘤、神经胶质瘤、肝细胞癌、头颈癌、肾癌、淋巴瘤、白血病、肺癌、黑素瘤、间皮瘤、多发性骨髓瘤、胰脏癌、嗜铬细胞瘤、浆细胞瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宫癌及甲状腺癌;或者,所述病毒感染是由选自以下的病毒引起:巨细胞病毒(CMV)、埃-巴二氏病毒(Epstein-Barr Virus;EBV)、B型肝炎病毒(HBV)、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)、人类乳头状瘤病毒(HPV)、传染性软疣病毒(MCV)、人类T细胞白血病病毒1(HTLV-1)、HIV(人类免疫缺陷病毒)及C型肝炎病毒(HCV)。
经典的CAR分子由单链抗体区、铰链区、跨膜区以及胞内信号区组成,可被呈递在T细胞表面。其中,单链抗体区包含抗体的重链可变区和轻链可变区(在某些情况下还会包括IgG CH1区域,起到结构上的作用),两者通过柔性连接肽相连。胞内信号区由共刺激信号分子(4-1BB、CD28等)以及信号分子CD3ζ相互串联组成。
而本申请所构建的嵌合T细胞受体在细胞中表达后由两条多肽链经由二硫键共价键连接在一起,其中第一多肽是由抗体重链可变区(VH)与TCRα恒定区(Cα)融合而成,第二多肽是由抗体轻链可变区(VL)与TCRβ恒定区(Cβ)融合而成;嵌合T细胞受体可与T细胞内源表达的CD3亚基(ε、δ、λ、ζ)形成复合体发挥功能。嵌合T细胞受体的基因序列通过furin和p2A蛋白酶切位点多肽段相连,两条多肽链将一同被转录并翻译表达成蛋白质,之后再被furin和p2A对应的蛋白酶切割成独立的两个蛋白质。嵌合T细胞受体可以有多种组合:抗体重链可变区(VH)与TCRα恒定区(Cα)融合、抗体轻链可变区(VL)与TCRβ恒定区(Cβ)融合,或者抗体轻链可变区(VL)与TCRα恒定区(Cα)融合、抗体重链可变区(VH)与TCRβ恒定区(Cβ)融合;以及两者交换相对furin和P2A的前后顺序。抗体的轻链和重链可变区可替换成多种特异性的抗体可变区,如抗EGFR、CD19、CD20等。TCRα和β恒定区也可存在多种变体,包括野生型TCRα和β恒定区、半胱氨酸单点突变型TCRα和β恒定区、人鼠嵌合型TCRα和β恒定区,以及含半胱氨酸单点突变的人鼠嵌合型TCRα和β恒定区。
本发明获得了高稳定性、高特异性的T细胞受体,可用于疾病的诊断和治疗。在TCR设计过程中,发明人创造性地采用了多个策略。本申请通过在TCR分子的恒定区引入二硫键的改造。理论上在TCR中能够形成人工链间二硫键的位点非常多,但找到在TCR中形成人工链间二硫键的合适位点使得含有人工链间二硫键的TCR都能够被成功复性、重折叠来得到高产量、高稳定的,并且具有与其原配体特异性结合活性的TCR是非常困难的。本领域技术人员致力于开发含有人工链间二硫键的,能够被很好地复性、重折叠、纯化且具有高稳定性、复性收率高同时能够与其原配体特异性结合的TCR。本发明在特定位点进行二硫键的改造能够减少TCR-T细胞的新反应性,降低错配。
CAR-T疗法虽然捷报频频,但安全性问题是业界以及FDA重点关注的问题,避免自激活降低副反应是目前亟待解决的问题。本发明引入抗体抗原结合片段与原始TCR进行融合,形成抗体-T细胞受体结合的嵌合T细胞受体(STAR),更进一步提高了α链和β链的配对,且提高了TCR的结合活性,更重要的是,对体内的原始TCR改造相对CAR-T要少,减少了外源氨基酸的引入,降低了副作用的发生风险,并提高了安全性。经多个靶点的嵌合T细胞受体的验证,结果表明嵌合T细胞受体可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,且与制备获得的相应抗体-嵌合抗原受体(CAR)相比,抗原激活的程度相当,更重要的是在无抗原刺激的静息状态下,嵌合T细胞受体无自激活现象,而CAR有很高的自激活现象。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。下面结合实施例进一步详述本发明。
附图说明
本发明的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解,其中:
图1 STAR与CAR分子的结构示意图。STAR在细胞中表达后由两条多肽链经由二硫键共价键连接在一起,其中第一多肽链是由抗体重链可变区(VH)与TCRα恒定区(Cα)融合而成,第二多肽链是由抗体轻链可变区(VL)与TCRβ恒定区(Cβ)融合而成;STAR可与T细胞内源表达的CD3亚基(ε、δ、λ、ζ)形成复合体发挥功能。
图2 STAR与CAR分子基因结构序列示意图。STAR基因序列通过furin和P2A蛋白酶切位点多肽段相连,两条多肽链将一同被转录并翻译表达成蛋白质,之后再被furin和p2A对应的蛋白酶切割成独立的两个蛋白质。STAR可以有多种组合:抗体重链可变区(VH)与TCRα恒定区(Cα)融合、抗体轻链可变区(VL)与TCRβ恒定区(Cβ)融合,或者抗体轻链可变区(VL)与TCRα恒定区(Cα)融合、抗体重链可变区(VH)与TCRβ恒定区(Cβ)融合;以及两者交换相对furin和P2A的前后顺序。
图3靶向EGFR的STAR在人类T细胞中的上膜情况。利用慢病毒载体将STAR基因导入人类T细胞系Jurkat Clone 5(内源性TCR缺失的Jurkat亚克隆)中。取感染3天后的细胞,用anti-human TCR-α/β的流式抗体染色,之后进行流式检测。可发现,与未转基因的阴性对照细胞相比,STAR可以被抗TCR-α/β的抗体染色,并且染色水平与天然的E1-TCR相当。这一结果表明STAR分子可以上膜,并且其α链和β链可以配对。
图4靶向EGFR的STAR在人类T细胞膜表面时结合抗原的能力。上述STAR基因导入3天后的Jurkat Clone 5细胞,用抗原蛋白EGFR-His以及anti-His-APC的流式抗体染色,之后进行流式检测。可发现,与天然的E1-TCR(特异性不针对于EGFR)的阴性对照细胞相比,STAR显示较强的染色,并且染色水平与anti-EGFR的CAR相当。
图5靶向EGFR的STAR介导T细胞激活的能力。上述STAR基因导入3天后的JurkatClone 5细胞,分别在EGFR抗原包被的细胞培养板中培养、以及与肿瘤细胞A549(EGFR阳性的人肺癌细胞系)共孵育。24小时后,收集细胞,并用anti-human CD69-FITC的流式抗体染色,之后进行流式检测。横坐标CD69阳性的为表达T细胞激活标志物CD69分子的细胞。可发现STAR在抗原刺激下可以使得T细胞表达CD69的激活标志物,即STAR可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,并且激活程度与CAR相当。同时可以发现,在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有较高的自激活水平。
图6靶向EGFR的STAR在人原代T细胞中的功能。取得人外周血细胞,使用pan T细胞分离试剂盒将其中CD4+和CD8+T细胞纯化出来。然后将T细胞用抗CD3/CD28的抗体刺激激活72小时后,用慢病毒载体将STAR基因转入T细胞。病毒感染后,在含20%血清和200IU/mLIL-2的RPMI 1640培养基中培养至足够数量。将T细胞与A431细胞(一种EGFR高阳性的人皮肤癌细胞)共培养,检测T细胞激活和靶细胞死亡情况。共培养8小时后,取T细胞进行染色,可发现STAR和CAR都可以介导T细胞激活。从T细胞标志物CD69(图6a)和T细胞细胞因子IFN-γ(图6b)水平看,STAR可引起的显著的T细胞激活。共培养24小时后,取细胞上清检测乳酸盐脱氢酶(LDH)的水平(图6c),可反映靶细胞死亡情况。结果表明,STAR-T与CAR-T细胞对靶细胞都有明显的杀伤作用。
图7靶向CD19的STAR介导T细胞激活的能力。利用慢病毒载体将靶向CD19的STAR基因导入人类T细胞系Jurkat Clone 5中。取感染3天后的T细胞,分别在肿瘤细胞Raji、Mino、LY-1(CD19和CD20阳性的人淋巴瘤细胞系)共孵育。24小时后,收集细胞,并用anti-humanCD69-FITC的流式抗体染色,之后进行流式检测。纵坐标CD69阳性的为表达T细胞激活标志物CD69分子的细胞。可发现STAR在抗原刺激下可以使得T细胞表达CD69的激活标志物,即STAR可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,并且激活程度与CAR相当。同时可以发现,在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有较高的自激活水平。
图8靶向CD19的STAR在人原代T细胞中的功能。取得人外周血细胞,使用pan T细胞分离试剂盒将其中CD4+和CD8+T细胞纯化出来。然后将T细胞用抗CD3/CD28的抗体刺激激活72小时后,用慢病毒载体将靶向CD19的STAR基因转入T细胞。病毒感染后,在含20%血清和200IU/mL IL-2的RPMI 1640培养基中培养至足够数量。将T细胞与Raji和LY-1细胞共培养,检测靶细胞死亡情况。共培养8小时后,取T细胞进行染色,可发现STAR和CAR都可以介导T细胞激活。从T细胞细胞因子IFN-γ(图4)水平看,STAR可引起的显著的T细胞激活(其水平高于CAR的水平)。T细胞内IFN-γ表达水平结果表明,靶细胞对STAR-T细胞有明显的激活作用。
图9靶向CD20的STAR介导T细胞激活的能力。利用慢病毒载体将靶向CD20的STAR基因导入人类T细胞系Jurkat Clone 5中。取感染3天后的T细胞,分别在肿瘤细胞Raji、Mino、LY-1(CD19和CD20阳性的人淋巴瘤细胞系)共孵育。24小时后,收集细胞,并用anti-humanCD69-FITC的流式抗体染色,之后进行流式检测。纵坐标CD69阳性的为表达T细胞激活标志物CD69分子的细胞。可发现STAR在抗原刺激下可以使得T细胞表达CD69的激活标志物,即STAR可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,并且激活程度与CAR相当。同时可以发现,在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有较高的自激活水平。
图10靶向CD20的STAR在人原代T细胞中的功能。取得人外周血细胞,使用pan T细胞分离试剂盒将其中CD4+和CD8+T细胞纯化出来。然后将T细胞用抗CD3/CD28的抗体刺激激活72小时后,用慢病毒载体将靶向CD20的STAR基因转入T细胞。病毒感染后,在含20%血清和200IU/mL IL-2的RPMI 1640培养基中培养至足够数量。将T细胞与Raji和LY-1细胞共培养,检测靶细胞死亡情况。共培养8小时后,取T细胞进行染色,可发现STAR和CAR都可以介导T细胞激活。从T细胞细胞因子IFN-γ(图4)水平看,STAR可引起的显著的T细胞激活(其水平高于CAR的水平)。T细胞内IFN-γ表达水平结果表明,靶细胞对STAR-T细胞有明显的激活作用。
具体实施方式
除非另有说明,本发明的实施采用分子生物学、微生物学、细胞生物学、生物化学和免疫学的常规技术,其均在本领域技术人员知晓的范围内。
下面详细描述本发明的实施例,以便为本领域普通技术人员提供如何进行和利用本发明的试验、筛选和治疗方法的充分公开和说明,需要说明的是,这些实施例仅是说明性的,而不能理解为对本发明的限制。
实施例1、靶向EGFR的STAR的构建
具体构建方法如下:
1、TCR恒定区序列确定
STAR中的TCR的α链和β链的恒定区(C区)均来源于人外周血T细胞的cDNA经PCR分子克隆而得;在原始TCR序列的基础上,分别把α链和β链的恒定区的第48和57个氨基酸位点突变为半胱氨酸,以帮助α链和β链之间形成额外的一个二硫键,增加其相互配对效率,并命名为E1-TCR。
2、靶向EGFR的抗体序列确定
抗体重链可变区(VH)和抗体轻链可变区(VL)选择西妥昔单抗(Cetuximab,简称Cetux),仅作为实例解释本发明的内容,其他已知抗体均可进行替换。
3、靶向EGFR的STAR构建
STAR含有两条多肽链,将Cetux-VL与TCRβ链融合为第一多肽链,将Cetux-VH与α链融合为第二多肽链。STAR的基因序列通过furin和p2A蛋白酶切位点多肽段相连,两条多肽链将一同被转录并翻译成一条融合多肽,之后再被furin和p2A对应的蛋白酶切割成为两个独立的蛋白亚基,这两个亚基间通过二硫键共价结合,并与T细胞内源的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体(如图1和图2所示)。
整个基因通过限制性内切酶切位点NheI和NotI插入进慢病毒表达载体pHAGE中。该载体携带氨苄抗性、EF1α启动子以及IRES-RFP荧光报告基因。
4、基因片段的克隆与组装
获得的四个片段“Cetux VL”,“TCRβ-C”,“Cetux-VH”,“TCRα-C”分别从pHAGE-Cetux-28zCAR载体以及pHAGE-E1-TCR载体上克隆获得。每对引物上都带有与前后同源的25bp碱基,四个片段通过Gibson Assembly的方法一步重组连接到慢病毒载体中。从而获得STAR。
所述E1 TCRα链恒定区半胱氨酸突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO:1;
所述E1 TCRβ链恒定区半胱氨酸突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO:2;
所述Cetux VH的核苷酸序列为SEQ ID NO:3;
所述Cetux VL的核苷酸序列为SEQ ID NO:4;
5.载体转化和测序
Gibson Assembly的产物被转化入了DH5α菌株,使其在含氨苄的LB平板上过夜生长。挑单克隆隆菌进测序,测序引物选用pHAGE载体上的引物seq-pHAGE-F和seq-pHAGE-R。
6.质粒提取
将测序结果正确的菌接种在LB液体培养基中,过夜培养。使用具有去内毒素功能的试剂盒提取质粒。质粒浓度用Nanodrop测量,质粒终浓度在1000ng/ul左右,A260/A280值大于1.8。
实施例2、靶向EGFR的STAR功能验证
1.慢病毒包装
将携带目标基因的pHAGE载体与包装质粒pMD2.G与psPAX2按比例转染进293T细胞(使用PEI转染)。收集48小时和72小时的细胞培养基上清,并将上清与PEG8000混合,静置过夜后离心,可得病毒沉淀。用小体积的培养基重悬,起到病毒浓缩的效果。
2.慢病毒感染人类T细胞系
将携带目标基因的慢病毒感染Jurkat clone 5细胞(内源性TCR缺失的Jurkat亚克隆)。将浓缩后的慢病毒和助转剂Polybrene一同加入到T细胞培养基中,在32℃下1500rpm离心感染2小时。感染3天后,可观察荧光报告基因,并可以检测目标蛋白表达。
3.靶向EGFR的STAR上膜情况及抗原结合能力检测
取感染3天后的T细胞,用anti-human TCRα/β-BV421的流式抗体染色,之后进行流式检测。可发现(图3),与未转基因的阴性对照细胞相比,STAR可以被抗TCRα/β的抗体染色,并且染色水平与天然的E1-TCR相当。这一结果表明STAR分子可以上膜,并且其α链和β链可以配对。
取感染3天后的T细胞,用抗原蛋白EGFR-His以及anti-His-APC的流式抗体染色,之后进行流式检测。可发现(图4),与天然的E1-TCR(特异性不针对于EGFR)的阴性对照细胞相比,STAR显示较强的染色,并且染色水平与anti-EGFR的CAR相当。这一结果表明,STAR具有和CAR分子相当的抗原识别和结合能力。
4.靶向EGFR的STAR-T细胞与靶细胞共孵育及其介导T细胞激活能力检测
取感染3天后的T细胞,分别在EGFR抗原包被的细胞培养板中培养、以及与肿瘤细胞A549(EGFR阳性的人肺癌细胞系)共孵育。24小时后,收集细胞,并用anti-human CD69-FITC的流式抗体染色,之后进行流式检测(图5)。横坐标CD69阳性的为表达T细胞激活标志物CD69分子的细胞。可发现STAR在抗原刺激下可以使得T细胞表达CD69的激活标志物,即STAR可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,并且激活程度与CAR相当。同时可以发现,在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有较高的自激活水平。
5.人类原代T细胞的分离、培养和慢病毒感染
取得人外周血细胞,使用全T细胞磁珠分离试剂盒将其中CD4和CD8T细胞纯化出来。然后将T细胞在用抗CD3/CD28的抗体包被的培养皿中刺激激活48-72小时后,可观察到T细胞体积变大、聚团生长以及形状发生极化等现象。此时,用慢病毒病载体将目标基因转入T细胞,感染方法为32℃下1500rpm离心感染2小时。病毒感染后,在含20%血清和200IU IL-2的RPMI 1640培养基中培养至足够数量。
6.靶向EGFR的STAR在人原代T细胞中的功能验证
将T细胞与A431细胞(一种EGFR高阳性的人皮肤癌细胞)按照1:1至5:1的数量比例进行共培养,检测T细胞激活和靶细胞死亡情况。共培养8小时后,取T细胞进行染色,可发现STAR和CAR都可以介导T细胞激活。从T细胞标志物CD69(图6a)和T细胞细胞因子IFN-γ(图6b)水平看,STAR可引起的显著的T细胞激活。共培养24小时后,取细胞上清检测乳酸盐脱氢酶(LDH)的水平(图6c),可反映靶细胞死亡情况。结果表明,STAR-T细胞对靶细胞有明显的杀伤作用。
实施例3、靶向CD19的STAR的构建
具体构建方法如下:
1、TCR恒定区序列确定
来源于人外周血T细胞或小鼠脾脏T细胞的cDNA经PCR分子克隆而得;在原始TCR序列的基础上,分别把α链和β链的恒定区的第48和57个氨基酸位点突变为半胱氨酸,以帮助α链和β链之间形成额外的一个二硫键,增加其相互配对效率,并分别命名为E1-TCR(人源)或E11-TCR(鼠源)。
2、靶向CD19的抗体序列确定
抗体重链可变区(VH)和抗体轻链可变区(VL)选择CD19特异性鼠单克隆抗体(克隆号FMC63)的scFv片段,仅作为实例解释本发明的内容,其他已知抗体均可进行替换。
3、靶向CD19的STAR构建
STAR含有两条多肽链,将FMC63-VL与TCRβ链融合为第一多肽链,将FMC63-VH与α链融合为第二多肽链。STAR的基因序列通过furin和p2A蛋白酶切位点多肽段相连,两条多肽链将一同被转录并翻译成一条融合多肽,之后再被furin和p2A对应的蛋白酶切割成为两个独立的蛋白亚基,这两个亚基间通过二硫键共价结合,并与T细胞内源的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体。
整个基因通过限制性内切酶切位点NheI和NotI插入进慢病毒表达载体pHAGE中。该载体携带氨苄抗性、EF1α启动子以及IRES-RFP荧光报告基因。
4、基因片段的克隆与组装
获得的四个片段“FMC63-VL”,“TCRβ-C”,“FMC63-VH”,“TCRα-C”分别从pHAGE-FMC63-41BBzCAR载体以及pHAGE-E1-TCR载体上克隆获得。每对引物上都带有与前后同源的25bp碱基,四个片段通过Gibson Assembly的方法一步重组连接到慢病毒载体中。从而获得STAR。
所述E1 TCRα链恒定区半胱氨酸突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO:1;
所述E1 TCRβ链恒定区半胱氨酸突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO:2;
所述FMC63-VH的核苷酸序列为SEQ ID NO:5;
所述FMC63-VL的核苷酸序列为SEQ ID NO:6;
5.载体转化和测序
Gibson Assembly的产物被转化入了DH5α菌株,使其在含氨苄的LB平板上过夜生长。挑单克隆隆菌进测序,测序引物选用pHAGE载体上的引物seq-pHAGE-F和seq-pHAGE-R。
6.质粒提取
将测序结果正确的菌接种在LB液体培养基中,过夜培养。使用具有去内毒素功能的试剂盒提取质粒。质粒浓度用Nanodrop测量,质粒终浓度在1000ng/ul左右,A260/A280值大于1.8。
实施例4、靶向CD19的STAR的功能验证
1.慢病毒包装
将携带目标基因的pHAGE载体与包装质粒pMD2.G与psPAX2按比例转染进293T细胞(使用PEI转染)。收集48小时和72小时的细胞培养基上清,并将上清与PEG8000混合,静置过夜后离心,可得病毒沉淀。用小体积的培养基重悬,起到病毒浓缩的效果。
2.慢病毒感染人类T细胞系
将携带目标基因的慢病毒感染Jurkat clone 5细胞(内源性TCR缺失的Jurkat亚克隆)。将浓缩后的慢病毒和助转剂Polybrene一同加入到T细胞培养基中,在32℃下1500rpm离心感染2小时。感染3天后,可观察荧光报告基因,并可以检测目标蛋白表达。
3.FMC63-STAR-T细胞与靶细胞共孵育及其介导T细胞激活能力检测
取感染3天后的T细胞,分别在肿瘤细胞Raji、Mino、LY-1(CD19和CD20阳性的人淋巴瘤细胞系)共孵育。24小时后,收集细胞,并用anti-human CD69-FITC的流式抗体染色,之后进行流式检测(图7)。纵坐标CD69阳性的为表达T细胞激活标志物CD69分子的细胞。可发现STAR在抗原刺激下可以使得T细胞表达CD69的激活标志物,即STAR可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,并且激活程度与CAR相当。同时可以发现,在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有较高的自激活水平。
4.人类原代T细胞的分离、培养和慢病毒感染
取得人外周血细胞,使用全T细胞磁珠分离试剂盒将其中CD3+T细胞纯化出来。然后将T细胞在用抗CD3/CD28的抗体包被的培养皿中刺激激活48-72小时后,可观察到T细胞体积变大、聚团生长以及形状发生极化等现象。此时,用慢病毒病载体将目标基因转入T细胞,感染方法为32℃下1500rpm离心感染2小时。病毒感染后,在含20%血清和200IU/mL IL-2的RPMI 1640培养基中培养至足够数量。
5.靶向CD19的STAR在人原代T细胞中的功能验证
将T细胞与Raji和LY-1细胞按照1:1至5:1的数量比例进行共培养,检测T细胞激活和靶细胞死亡情况。共培养8小时后,取T细胞进行染色,可发现STAR和CAR都可以介导T细胞激活。从T细胞细胞因子IFN-γ(图8)水平看,STAR可引起的显著的T细胞激活。T细胞内IFN-γ表达水平结果表明,靶细胞对STAR-T细胞有明显的激活作用。
实施例5、靶向CD20的STAR的构建
具体构建方法如下:
1、靶向CD20的抗体序列确定
抗体重链可变区(VH)和抗体轻链可变区(VL)选择CD20特异性抗体Ofatumumab(奥法木单抗,OFA)的scFv片段,仅作为实例解释本发明的内容,其他已知抗体均可进行替换。
2、靶向CD20的STAR构建
STAR含有两条多肽链,将OFA-VL与TCRβ链融合为第一多肽段,将OFA-VH与α链融合为第二多肽段。STAR的基因序列通过furin和p2A蛋白酶切位点多肽段相连,两条多肽链将一同被转录并翻译成一条融合多肽,之后再被furin和p2A对应的蛋白酶切割成为两个独立的蛋白亚基,这两个亚基间通过二硫键共价结合,并与T细胞内源的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体。
整个基因通过限制性内切酶切位点NheI和NotI插入进慢病毒表达载体pHAGE中。该载体携带氨苄抗性、EF1α启动子以及IRES-RFP荧光报告基因。
3、基因片段的克隆与组装
获得的四个片段“OFA-VL”,“TCRβ-C”,“OFA-VH”,“TCRα-C”分别从pHAGE-OFA-41BBzCAR载体以及pHAGE-E11-TCR载体上克隆获得。每对引物上都带有与前后同源的25bp碱基,四个片段通过Gibson Assembly的方法一步重组连接到慢病毒载体中。从而获得STAR。
所述E11 TCRα链恒定区半胱氨酸突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO:7;
所述E11 TCRβ链恒定区半胱氨酸突变体的核苷酸序列为SEQ ID NO:8;
所述OFA-VH的核苷酸序列为SEQ ID NO:9;
所述OFA-VL的核苷酸序列为SEQ ID NO:10;
4.载体转化和测序
Gibson Assembly的产物被转化入了DH5α菌株,使其在含氨苄的LB平板上过夜生长。挑单克隆隆菌进测序,测序引物选用pHAGE载体上的引物seq-pHAGE-F和seq-pHAGE-R。
5.质粒提取
将测序结果正确的菌接种在LB液体培养基中,过夜培养。使用具有去内毒素功能的试剂盒提取质粒。质粒浓度用Nanodrop测量,质粒终浓度在1000ng/ul左右,A260/A280值大于1.8。
实施例6、靶向CD20的STAR的功能验证
1.慢病毒包装
将携带目标基因的pHAGE载体与包装质粒pMD2.G与psPAX2按比例转染进293T细胞(使用PEI转染)。收集48小时和72小时的细胞培养基上清,并将上清与PEG8000混合,静置过夜后离心,可得病毒沉淀。用小体积的培养基重悬,起到病毒浓缩的效果。
2.慢病毒感染人类T细胞系
将携带目标基因的慢病毒感染Jurkat clone 5细胞(内源性TCR缺失的Jurkat亚克隆)。将浓缩后的慢病毒和助转剂Polybrene一同加入到T细胞培养基中,在32℃下1500rpm离心感染2小时。感染3天后,可观察荧光报告基因,并可以检测目标蛋白表达。
3.OFA-STAR-T细胞与靶细胞共孵育及其介导T细胞激活能力检测
取感染3天后的T细胞,分别在肿瘤细胞Raji、Mino、LY-1(CD19和CD20阳性的人淋巴瘤细胞系)共孵育。24小时后,收集细胞,并用anti-human CD69-FITC的流式抗体染色,之后进行流式检测(图9)。纵坐标CD69阳性的为表达T细胞激活标志物CD69分子的细胞。可发现STAR在抗原刺激下可以使得T细胞表达CD69的激活标志物,即STAR可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,并且激活程度与CAR相当。同时可以发现,在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有较高的自激活水平。
4.人类原代T细胞的分离、培养和慢病毒感染
取得人外周血细胞,使用全T细胞磁珠分离试剂盒将其中CD3+T细胞纯化出来。然后将T细胞在用抗CD3/CD28的抗体包被的培养皿中刺激激活48-72小时后,可观察到T细胞体积变大、聚团生长以及形状发生极化等现象。此时,用慢病毒病载体将目标基因转入T细胞,感染方法为32℃下1500rpm离心感染2小时。病毒感染后,在含20%血清和200IU/mL IL-2的RPMI 1640培养基中培养至足够数量。
5.靶向CD20的STAR在人原代T细胞中的功能验证
将T细胞与Raji和LY-1细胞按照1:1至5:1的数量比例进行共培养,检测T细胞激活和靶细胞死亡情况。共培养8小时后,取T细胞进行染色,可发现STAR和CAR都可以介导T细胞激活。从T细胞细胞因子IFN-γ(图10)水平看,STAR可引起的显著的T细胞激活。T细胞内IFN-γ表达水平结果表明,靶细胞对STAR-T细胞有明显的激活作用。
由此可见,本发明已经成功构建了多个靶点的STAR,成功验证了本申请所涉及的抗体-T细胞嵌合受体能够与T细胞内源表达的CD3亚基(ε、δ、λ、ζ)形成复合体发挥功能,可以介导T细胞在抗原刺激后的激活,且与制备获得的相应抗体-嵌合抗原受体(CAR)相比,抗原激活的程度相当,更重要的是在无抗原刺激的静息状态下,STAR无自激活现象,而CAR有很高的自激活现象。限于篇幅,本发明列出了示例性的STAR,已经足够支持本发明的STAR的成功构建和突出的技术效果。
在本说明书的描述中,参考术语“一个实施例”、“一些实施例”、“示例”、“具体示例”、或“一些示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中,对上述术语的示意性表述不一定指的是相同的实施例或示例。而且,描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任何的一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。
尽管已经示出和描述了本发明的实施例,本领域的普通技术人员可以理解:在不脱离本发明的原理和宗旨的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型,本发明的范围由权利要求及其等同物限定。
Figure BDA0001758849110000151
Figure BDA0001758849110000161
Figure BDA0001758849110000181
Figure BDA0001758849110000191
Figure BDA0001758849110000201
Figure BDA0001758849110000211
Figure BDA0001758849110000221
Figure BDA0001758849110000231
Figure BDA0001758849110000241
Figure BDA0001758849110000251
Figure BDA0001758849110000261
Figure BDA0001758849110000271
Figure BDA0001758849110000281
Figure BDA0001758849110000291
Figure BDA0001758849110000301

Claims (25)

1.一种特异性结合至靶抗原的嵌合T细胞受体(STAR),所述嵌合T细胞受体包含:
a)抗体重链可变区与T细胞受体(TCR)第一亚基恒定区融合得到的第一肽链;和,
b)抗体轻链可变区与T细胞受体第二亚基恒定区融合得到的第二肽链;
其中,所述抗体重链可变区与抗体轻链可变区特异性结合至所述靶抗原的抗原表位。
2.根据权利要求1所述的嵌合T细胞受体,其特征在于:
(1)当所述T细胞受体第一亚基为α链时,所述T细胞受体第二亚基为β链;或,
(2)当所述T细胞受体第一亚基为β链时,所述T细胞受体第二亚基为α链;或,
(3)当所述T细胞受体第一亚基为γ链时,所述T细胞受体第二亚基为δ链;或,
(4)当所述T细胞受体第一亚基为δ链时,所述T细胞受体第二亚基为γ链。
3.根据权利要求1-2任一项所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,所述第一肽链和第二肽链在T细胞中表达后通过二硫键结合。
4.根据权利要求1-3任一项所述的嵌合T细胞受体,其特征在于:所述T细胞受体第一亚基恒定区和T细胞受体第二亚基恒定区的种属来源为人源或鼠源,包括不同的蛋白亚型。
5.根据权利要求1-4任一项所述的嵌合T细胞受体,其特征在于:对所述的嵌合T细胞受体进行氨基酸序列改造以降低与内源表达的T细胞受体错配,所述修改包括但不限于氨基酸点突变修饰、多肽片段替换修饰。
6.根据权利要求1-5任一项所述的嵌合T细胞受体,其特征在于:
(1)所述T细胞受体第一亚基是TCRα链,其恒定区第48位氨基酸突变为半胱氨酸,且,所述T细胞受体第二亚基是TCRβ链,其恒定区第57位氨基酸突变为半胱氨酸;或
(2)所述T细胞受体第一亚基是TCRα链,其恒定区第85位氨基酸突变为丙氨酸,且,所述T细胞受体第二亚基是TCRβ链,恒定区第88位氨基酸突变为甘氨酸。
7.根据前述任一权利要求所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,所述的靶抗原为肿瘤特异性抗原或病毒特异性抗原。
8.根据权利要求1-7任一项所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,所述靶抗原选自CD19,CD20,EGFR,Her2,PSCA,CD123,CEA(癌胚抗原),FAP,CD133,EGFRVIII,BCMA,PSMA,CA125,EphA2,C-met,L1CAM,VEGFR,CS1,ROR1,EC,NY-ESO-1,MUC1,MUC16,mesothelin,LewisY,GPC3,GD2,EPG,DLL3,CD99,5T4,CD22,CD30,CD33,CD138,CD171。
9.根据前述任一权利要求所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,所述抗体、抗体重链可变区或抗体轻链可变区来自IMCC225(西妥昔单抗、Cetuximab/Cetux)、Ofatumumab(奥法木单抗)、CD19单克隆抗体FMC63、利妥昔单抗(美罗华)、Avastin(贝伐单抗)、BEC2(阿妥莫单抗)、Bexxar(托西莫单抗)、Campath(阿仑单抗)、Herceptin(曲妥单抗)、LymphoCide(依帕珠单抗)、MDX-210、Mylotarg(吉姆单抗奥佐米星)、单抗17-1A(依决洛单抗)、Theragyn(pemtumomab)、Zamyl、Zevalin(替伊莫单抗)或筛选获得的高亲和力抗体。
10.根据前述任一权利要求所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,所述靶抗原相关疾病为癌症或病毒感染相关疾病。
11.根据权利要求10所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,其中所述癌症选自下组:肾上腺皮质癌、膀胱癌、乳腺癌、子宫颈癌、胆管癌、结肠直肠癌、食道癌、神经胶母细胞瘤、神经胶质瘤、肝细胞癌、头颈癌、肾癌、白血病、淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、间皮瘤、多发性骨髓瘤、胰脏癌、嗜铬细胞瘤、浆细胞瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宫癌及甲状腺癌;或,所述病毒感染是由选自以下病毒引起:巨细胞病毒(CMV)、埃-巴二氏病毒(Epstein-BarrVirus;EBV)、B型肝炎病毒(HBV)、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)、人类乳头状瘤病毒(HPV)、传染性软疣病毒(MCV)、人类T细胞白血病病毒1(HTLV-1)、HIV(人类免疫缺陷病毒)及C型肝炎病毒(HCV)。
12.根据前述任一权利要求所述的嵌合T细胞受体,其特征在于,所述第一肽链和第二肽链与T细胞内源的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体。
13.一种特异性结合至靶抗原的由嵌合T细胞受体形成的复合体,其特征在于,由前述任一权利要求所述的嵌合T细胞受体与T细胞内源表达的CD3亚基(ε,δ,γ,ζ)形成复合体,且被靶抗原激活后可介导T细胞相关信号转导通路。
14.一种核酸,其特征在于,其编码权利要求1-12任一项的嵌合T细胞受体或权利要求13所述复合体中的所述第一肽链和所述第二肽链。
15.一种核酸,其特征在于,包括:
(1)依次为抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(2)依次为抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(3)依次为抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(4)依次为抗体轻链可变区,T细胞受体(TCR)β链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端,链接子(linker),抗体重链可变区,T细胞受体(TCR)α链恒定区胞外段、跨膜区和胞内末端;或,
(5)将(1)-(4)中的T细胞受体(TCR)α链替换为T细胞受体(TCR)γ链,T细胞受体(TCR)β链替换为T细胞受体(TCR)δ链对应的核酸。
16.一种载体,其特征在于,其包含编码权利要求1-12任一项的嵌合T细胞受体或权利要求13所述复合体中的所述第一肽链和所述第二肽链的核酸序列,或,包含权利要求14-15所述的核酸。
17.根据权利要求16所述的载体,其特征在于,所述载体选自逆转录病毒载体、慢病毒载体、腺病毒载体和腺相关病毒载体。
18.一种效应细胞,其特征在于,其表达权利要求1-12任一项的嵌合T细胞受体或权利要求13所述复合体于其细胞表面上。
19.根据权利要求18所述的效应细胞,其特征在于,效应细胞为T细胞,优选的,所述效应细胞为细胞毒性T细胞、辅助T细胞、自然杀伤T细胞及抑制T细胞。
20.一种药物组合物,其包含权利要求1-12任一项所述的嵌合T细胞受体、权利要求13所述的复合体、权利要求任一项14-15所述的核酸、权利要求16-17任一项所述的载体或权利要求18-19任一项所述的效应细胞,以及药物上可接受的载剂。
21.一种包含权利要求1-12任一项所述的嵌合T细胞受体、权利要求13所述的复合体、权利要求14-15任一项所述的核酸、权利要求16-17任一项所述的载体或权利要求18-19任一项所述的效应细胞、权利要求20所述的药物组合物的试剂盒。
22.一种包含权利要求1-12任一项所述的嵌合T细胞受体、权利要求13所述的复合体、权利要求14-15任一项所述的核酸、权利要求16-17任一项所述的载体或权利要求18-19任一项所述的效应细胞在制备治疗或诊断有需要个体的靶抗原相关疾病的试剂盒、制剂或药物组合物中的用途。
23.一种杀伤递呈靶抗原的靶细胞的方法,其包含使靶细胞与权利要求18-19任一项所述的效应细胞相接触,其中所述的嵌合T细胞受体特异性结合至靶抗原。
24.一种治疗有需要个体的靶抗原相关疾病或癌症或病毒感染相关疾病的方法,其包含向个体施用有效量的药物组合物,该药物组合物包含权利要求1-12任一项所述的嵌合T细胞受体、权利要求13所述的复合体、权利要求14-15任一项所述的核酸、权利要求16-17任一项所述的载体或权利要求18-19任一项所述效应细胞、权利要求20所述的药物组合物。
25.根据权利要求24所述的方法,其特征在于,所述癌症选自下组:肾上腺皮质癌、膀胱癌、乳腺癌、子宫颈癌、胆管癌、结肠直肠癌、食道癌、神经胶母细胞瘤、神经胶质瘤、肝细胞癌、头颈癌、肾癌、淋巴瘤、白血病、肺癌、黑素瘤、间皮瘤、多发性骨髓瘤、胰脏癌、嗜铬细胞瘤、浆细胞瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宫癌及甲状腺癌;或者,所述病毒感染是由选自以下的病毒引起:巨细胞病毒(CMV)、埃-巴二氏病毒(Epstein-BarrVirus;EBV)、B型肝炎病毒(HBV)、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)、人类乳头状瘤病毒(HPV)、传染性软疣病毒(MCV)、人类T细胞白血病病毒1(HTLV-1)、HIV(人类免疫缺陷病毒)及C型肝炎病毒(HCV)。
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