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CN118725126A - Ckmb抗体及其用途 - Google Patents

Ckmb抗体及其用途 Download PDF

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CN118725126A
CN118725126A CN202410387289.0A CN202410387289A CN118725126A CN 118725126 A CN118725126 A CN 118725126A CN 202410387289 A CN202410387289 A CN 202410387289A CN 118725126 A CN118725126 A CN 118725126A
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CN
China
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antibody
optionally
amino acid
variant
seq
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Application number
CN202410387289.0A
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王磊
张翼
许海燕
钟冬梅
孟媛
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Original Assignee
Fapon Biotech Inc
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Publication date
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Abstract

本发明提出了一种抗CKMB抗体，所述抗体包括：重链可变区和/或轻链可变区；其中，所述重链可变区包括如SEQ ID NO:1或其变体所示的氨基酸序列；所述轻链可变区包括如SEQ ID NO:2或其变体所示的氨基酸序列；与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：第33位、第59位和第61位中的至少之一；与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:2的变体包括第92位的突变的氨基酸序。本发明的抗体可有效结合CKMB，可用于CKMB的定性或定量检测。

Description

CKMB抗体及其用途
相关申请的交叉引用
本申请要求于2023年03月31日提交的中国专利局的申请号为202310344044.5，名称为“CKMB抗体及其用途”的中国专利申请的优先权，其全部内容通过引用结合在本申请中。
技术领域
本发明属于抗体技术领域，具体地，本发明涉及一种CKMB抗体及其用途，更具体地，本发明涉及一种CKMB的抗体、核酸分子、载体、细胞或宿主、抗体的制备方法、偶联物、试剂或试剂盒及其用途、检测CKMB的方法、筛选CKMB抗体的方法和突变文库。
背景技术
肌酸激酶同工酶(creatine kinase isoenzymes)别名为血清肌酸激酶同工酶，根据形式不同可分为：肌肉型(CK-MM)、脑型(CK-BB)、杂化型(CK-MB)和线粒体型(CK-MiMi)四种类型。正常人体组织中通常含CK-BB、CK-MB、CK-MM这3种类型的肌酸激酶同工酶。CK-BB主要存在于脑、肾和子宫组织，CK-MB主要存在于心肌组织，CK-MM主要存在于骨骼肌。
CK-MB在心脏中的含量相对较高，是重要的心肌标志物之一，在急性心肌梗塞(AMI)诊断、不稳定型心绞痛(UAP)的预后判断、缺血性心肌损伤的危险分层或监护溶栓效果上具有重要的用途。一旦心肌细胞发生损伤，血清中的CKMB水平在短时间内迅速升高，其升高时间通常于发病6h内，且在24h左右达到峰值，并于72h后逐渐降低，直至恢复正常水平，这表明CK-MB可于早期反映出心肌受损情况。经过多年的深入研究和临床分析，血清中CKMB升高已成为公认的诊断急性心肌梗死和确认有无心肌坏死的重要指标，具有较高的诊断准确率，可在临床中推广使用。特别是各级医院中对于急性心肌梗死患者的溶栓治疗以及急诊经皮冠状动脉介入治疗的使用越来越广泛，这就要求必须要对急性心肌梗死进行早期诊断。
目前CK-MB测定方法主要有免疫抑制法和酶质量法。酶质量法的原理是采用化学免疫发光技术，以双抗体夹心法为主，使抗人CKMB抗体包被于磁微粒等固相载体，其标记物为酶标抗人CKMB抗体，对CKMB进行定量分析检测，因此，获得抗CKMB的抗体是实现双抗体夹心法检测的关键。因此，本领域对于有效结合CKMB并对其进行检测的抗体存在着强烈需求。
发明内容
本发明旨在提供了一种抗CKMB的抗体、检测CKMB的试剂或试剂盒。
在本发明的第一方面，本发明提出了一种抗CKMB抗体，包括：重链可变区和/或轻链可变区；所述重链可变区包括如SEQ ID NO:1或其变体所示的氨基酸序列，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：第33位、第59位和第61位中的至少之一；所述轻链可变区包括如SEQ ID NO:2或其变体所示的氨基酸序列，与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:2的变体包括第92位的突变。
在本发明的第二方面，本发明提出了一种抗CKMB抗体，包括HCDR1、HCDR2、HCDR3和LCDR1、LCDR2、LCDR3，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3为与第一方面所述的抗体所限定的重链可变区的HCDR1、HCDR2、HCDR3一致的氨基酸序列；所述LCDR1、LCDR2、LCDR3为与第一方面所述的抗体所限定的轻链可变区的LCDR1、LCDR2、LCDR3一致的氨基酸序列。
在本发明的第三方面，本发明提出了一种核酸分子、载体、细胞或宿主或制备上述抗体的方法，所述核酸分子编码第一方面或第二方面所述的抗体；所述载体包括前述核酸分子；所述细胞或宿主包括：前述核酸分子或第载体或表达第一方面或第二方面所述的抗体；所述方法包括前述细胞或宿主。
在本发明的第四方面，本发明提出了一种偶联物，所述偶联物包括：第一方面或第二方面所述的抗体以及与其偶联的偶联部分。
在本发明的第五方面，本发明提出了一种试剂或试剂盒，所述试剂或试剂盒包括：第一方面或第二方面所述的抗体或第四方面所述的偶联物。
在本发明的第六方面，本发明提出了一种第一方面或第二方面所述的抗体、第四方面所述的偶联物或第六方面所述的试剂或试剂盒在检测CKMB、制备用于检测CKMB产品中的用途。
在本发明的第七方面，本发明提出了一种筛选CKMB抗体的方法，所述方法包括：a)设计引物，用于对第一方面所述的抗体中所限定的突变位点或第二方面所述的抗体中所限定的X1、X2、X3、X4中的1、2、3或4个位点进行氨基酸替换；b)以第三方面所述的核酸分子、载体或细胞为模板，用a)所述引物构建的突变文库；c)从所述突变文库中筛选CKMB抗体。
在本发明的第八方面，本发明提出了一种突变文库，所述突变文库包括第一方面或第二方面所述的抗体。
本发明的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出，部分将从下面的描述中变得明显，或通过本发明的实践了解到。
具体实施方式
下面详细描述本发明的实施例。下面描述的实施例是示例性的，仅用于解释本发明，而不能理解为对本发明的限制。
需要说明的是，术语“第一”、“第二”仅用于描述目的，而不能理解为指示或暗示相对重要性或者隐含指明所指示的技术特征的数量。由此，限定有“第一”、“第二”的特征可以明示或者隐含地包括一个或者更多个该特征。进一步地，在本发明的描述中，除非另有说明，“多个”的含义是两个或两个以上。
在本文中所披露的范围的端点和任何值都不限于该精确的范围或值，这些范围或值应当理解为包含接近这些范围或值的值。对于数值范围来说，各个范围的端点值之间、各个范围的端点值和单独的点值之间，以及单独的点值之间可以彼此组合而得到一个或多个新的数值范围，这些数值范围应被视为在本文中具体公开。
为了更容易理解本发明，以下具体定义了某些技术和科学术语。除显而易见在本文件中的它处另有明确定义，否则本文中使用的所有其它技术和科学术语都具有本发明所属领域的一般技术人员通常理解的含义。氨基酸残基的缩写是本领域中所用的指代20个常用L-氨基酸之一的标准3字母和/或1字母代码。
在本文中，术语“包含”或“包括”为开放式表达，即包括本发明所指明的内容，但并不排除其他方面的内容。
在本文中，术语“可选地”、“可选的”、“任选地”、“任选的”或“任选”通常是指随后所述的事件或状况可以但未必发生，并且该描述包括其中发生该事件或状况的情况，以及其中未发生该事件或状况的情况。
在本文中，术语“同一性”、“同源性”或“相似性”均用于描述相对于参考序列的氨基酸序列或核酸序列时，采用通过常规的方法进行确定两个氨基酸序列或核酸序列之间的相同氨基酸或核苷酸的百分比，例如参见，Ausubel等，编著(1995)，Current Protocols inMolecular Biology，第19章(Greene Publishing and Wiley-Interscience，New York)；和ALIGN程序(Dayhoff(1978)，Atlas of Protein Sequence and Structure5：Suppl.3(National Biomedical Research Foundation，Washington，D.C.)。关于比对序列和测定序列同一性有很多算法，包括，Needleman等(1970)J.Mol.Biol.48：443的同源性比对算法；Smith等(1981)Adv.Appl.Math.2：482的局部同源性算法；Pearson等(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.85：2444的相似性搜索方法；Smith-Waterman算法(Meth.Mol.Biol.70：173-187(1997)；和BLASTP，BLASTN，和BLASTX算法(参见Altschul等(1990)J.Mol.Biol.215：403-410)。利用这些算法的计算机程序也是可获得的，并且包括但不限于：ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件，或者WU-BLAST-2(Altschul等，Meth.Enzym.，266：460-480(1996))；或者GAP，BESTFIT，BLAST Altschul等，上文，FASTA，和TFASTA，在Genetics Computing Group(GCG)包，8版，Madison，Wisconsin，USA中可获得；和Intelligenetics，Mountain View，California提供的PC/Gene程序中的CLUSTAL。
在不实质性影响抗体活性(保留至少90％的活性)的前提下，本领域技术人员可以对本发明的序列替换、添加和/或缺失一个或更多个(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个或更多个)氨基酸，以获得所述抗体序列的变体。它们都被视为包括在本发明保护的范围内。如在可变区将具有类似性质的氨基酸进行替换。本发明所述变体序列可以与参比序列具有至少90％、95％、96％、97％、98％或99％的一致性(或同源性)。本发明所述的序列一致性可以使用序列分析软件测量。例如使用缺省参数的计算机程序BLAST，尤其是BLASTP或TBLASTN。本发明述及的氨基酸序列均按照N端至C端的方式示出。
需要说明的是，本发明的说明书和权利要求所限定的突变位点的位置或编号也需根据添加和/或缺失的氨基酸的个数和位置进行调整。例如，SEQ ID NO:1的变体是通过在第33位氨基酸之前(例如第10位、第27位)添加一个氨基酸获得的，本领域技术人员可以理解的是S33V应调整为S34V；或者，SEQ ID NO:1的变体是通过在第33位氨基酸之前(例如第10位、第27位)缺失两个氨基酸获得的，本领域技术人员可以理解的是S33V应调整为S31V。
在本文中，术语“至少80％同源性”指与各参考序列至少为80％，可为80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％的同源性。术语“至少90％同源性”指与各参考序列至少为90％，可为90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％的同源性。
在本文中，术语“变体”或“突变体”可以指包含一个或多个核苷酸或氨基酸突变的任何天然存在的或工程化的分子。
在本文中，术语“载体”通常是指能够插入在合适的宿主中自我复制的核酸分子，其将插入的核酸分子转移到细胞或宿主中和/或细胞或宿主之间。所述载体可包括主要用于将DNA或RNA插入细胞中的载体、主要用于复制DNA或RNA的载体，以及主要用于DNA或RNA的转录和/或翻译的表达的载体。所述载体还包括具有多种上述功能的载体。所述载体可以是当引入合适的细胞或宿主时能够转录并翻译成多肽的多核苷酸。通常，通过培养包含所述载体的合适的细胞或宿主，所述载体可以产生期望的表达产物。
在本文中，术语“细胞”通常是指采用基因工程技术或细胞融合技术对宿主细胞的遗传物质进行修饰改造或重组，获得具有稳定遗传的独特性状的细胞。其中，术语“宿主细胞”是指可导入重组载体的原核细胞或真核细胞。本文所用术语“转化的”或“转染的”是指通过本领域已知的各种技术将核酸(例如载体)引入细胞。合适的宿主细胞可以用本发明的DNA序列转化或转染，并且可以用于靶蛋白的表达和/或分泌。可用于本发明的合适宿主细胞的例子包括永生化杂交瘤细胞、NS/0骨髓瘤细胞、293细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、Cap细胞(人羊水来源的细胞)和CoS细胞。
本发明提出了一种抗体、核酸分子、载体、细胞或宿主、抗体的制备方法、偶联物、试剂或试剂盒及其用途、检测CKMB的方法、筛选CKMB抗体的方法和突变文库，下面将分别对其进行详细描述。
抗体
在本发明的第一方面，本发明提出了一种抗CKMB抗体。根据本发明的实施例，所述抗体包括：重链可变区和/或轻链可变区；所述重链可变区包括/为如SEQ ID NO:1或其变体所示的氨基酸序列，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：第33位、第59位和第61位中的至少之一；所述轻链可变区包括/为如SEQID NO:2或其变体所示的氨基酸序列，与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比，所述SEQ IDNO:2的变体包括第92位的突变。
在本文中，术语“抗体”在最广义上使用，其可以包括全长单克隆抗体、多特异性抗体、以及嵌合抗体或功能性片段，具体结构不受限制，只要它们展示所需的抗原结合活性。
需要说明的是，“功能性片段”是指保持特异性结合CKMB能力的片段，包括但不限于Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、F(ab’)2片段、Fab’片段、Fab片段、F(ab)2片段、scFv片段、scFv-Fc融合蛋白、scFv-Fv融合蛋白、Fv-Fc融合蛋白、由功能性片段形成的多特异性抗体、单结构域抗体、VHH纳米抗体、结构域抗体、二价结构域抗体或最小识别单位的至少之一。
抗体的功能性片段通常具有与其来源抗体相同的结合特异性。本领域技术人员根据本公开记载的内容容易理解到，上述抗体的功能性片段可以通过比如酶消化的方法(包括胃蛋白酶或木瓜蛋白酶)和/或通过化学还原分裂二硫键的方法获得。在本公开中完整抗体的结构基础上，本领域技术人员容易获得上述的功能性片段。
抗体的功能性片段还可以通过也是本领域技术人员所知的重组遗传学技术或通过例如自动肽合成仪，比如Applied BioSystems等销售的自动肽合成仪合成获得。
在本文中，术语“全长抗体”、“全长单抗”或“全长单克隆抗体”均是由至少两条相同的轻链和至少两条相同的重链通过链间二硫键连接而成，如免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白M(IgM)、免疫球蛋白D(IgD)或免疫球蛋白E(IgE)。其通常包括分子量较轻的轻链和分子量较重的重链，重链(H链)和轻链(L链)由二硫键连接形成的抗体分子。其中，肽链的氨基端(N端)氨基酸序列变化很大，称为可变区(V区)；羧基端(C端)相对稳定，变化很小，称为恒定区(C区)。L链和H链的V区分别称为VL和VH。
在本文中，术语“多抗”和“多特异性抗体”同义，均是指可识别多种抗原表位的抗体，例如可识别两种抗原表位的抗体(双特异性抗体，简称双抗)、三种抗原表位的抗体或者四种抗原表位的抗体，其为广义理解，具体结构不受限制，可识别多种抗原表位即可。在本发明中，多种抗原表位的其中至少之一来源于CKMB。
在本文中，术语“功能性片段”是包含抗体的一部分或全部的片段，其缺乏至少一些存在于全长链中的氨基酸但仍能够特异性结合抗原的性能活性，例如，该片段可包含抗体CDR的一部分或全部。此类片段具生物活性，因为其结合至抗原，且可与其他抗原结合分子(包括完整抗体)竞争结合至给定表位。此类片段包括Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、F(ab’)2片段、Fab’片段、Fab片段、F(ab)2片段、scFv片段、scFv-Fc融合蛋白、scFv-Fv融合蛋白、Fv-Fc融合蛋白、由功能性片段形成的多特异性抗体、单结构域抗体、VHH纳米抗体、结构域抗体、二价结构域抗体或最小识别单位的至少之一。此类片段可通过重组核酸技术产生，或可通过抗原结合分子(包括完整抗体)的酶裂解或化学裂解产生。
根据本发明的实施例，上述抗体还可以进一步包括下列附加技术特征中的至少之一：
根据本发明的实施例，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：S33V、I59V/T/Q/R、Y61L/V/I/M中的至少之一。
在本发明的一个可选实施例中，所述第33位的突变为S33V。
在本发明的一个可选实施例中，所述第59位的突变为I59V。
在本发明的一个可选实施例中，所述第59位的突变为I59T。
在本发明的一个可选实施例中，所述第59位的突变为I59Q。
在本发明的一个可选实施例中，所述第59位的突变为I59R。
在本发明的一个可选实施例中，所述第61位的突变为Y61L。
在本发明的一个可选实施例中，所述第61位的突变为Y61V。
在本发明的一个可选实施例中，所述第61位的突变为Y61I。
在本发明的一个可选实施例中，所述第61位的突变为Y61M。
需要说明的是，上述位点的编号是通过将SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列从N端到C端依次按顺序进行编号获得的。例如，第33位是指SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列从N端开始的第33位；所述“S33V”是指SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列编号第33位的丝氨酸被缬氨酸替代；所述“I59V/T/Q/R”是指SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列第59位的异亮氨酸可被缬氨酸、苏氨酸、谷氨酰胺或精氨酸替代。
根据本发明的实施例，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：
根据本发明的实施例，与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:2的变体包括Q92S的突变。
需要说明的是，上述位点的编号是通过将SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列从N端到C端依次按顺序进行编号获得的。例如，第92位是指SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列从N端开始的第92位；所述“Q92S”是指SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列第92位的谷氨酰胺被丝氨酸替代。
根据本发明的实施例，所述重链可变区为如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，和所述轻链可变区为如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列不同时成立。
根据本发明的实施例，所述重链可变区和轻链可变区选自如下组合的任意一种：
本发明第一方面所述突变的抗体相比于未进行第一方面所述突变的抗体而言，具有改善的活性或亲和力。
在本发明的一个可选实施例中，所述突变的抗体的亲和力KD＜10-9M。
在本发明的一个可选实施例中，所述突变的抗体的亲和力KD＜10-10M。
在本发明的一个可选实施例中，所述突变的抗体的亲和力KD＜10-11M。
在本发明的第二方面，本发明提出了一种抗CKMB抗体。根据本发明的实施例，所述抗体包括HCDR1、HCDR2、HCDR3和LCDR1、LCDR2、LCDR3，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3为与第一方面所述的抗体所限定的重链可变区的HCDR1、HCDR2、HCDR3一致的氨基酸序列；所述LCDR1、LCDR2、LCDR3为与第一方面所述的抗体所限定的轻链可变区的LCDR1、LCDR2、LCDR3一致的氨基酸序列。
需要说明的是，HCDR1、HCDR2和HCDR3包括或为与第一方面所述的抗体中所限定的同一条重链可变区的HCDR1、HCDR2、HCDR3一致的氨基酸序列，LCDR1、LCDR2和LCDR3包括或为与第一方面所述的抗体中所限定的同一条轻链可变区的LCDR1、LCDR2、LCDR3一致的氨基酸序列。
例如当第一方面所述的抗体中所限定的重链可变区相比于SEQ ID NO:1仅存在S33V位点的突变时，以Kabat定义该重链可变区的HCDR1、HCDR2、HCDR3分别为HCDR 1:TGVDRWS；HCDR 2:YIYYSGTITYNPSLTS；HCDR 3:ERTYYGYGYFDV；则第二方面所述抗体所含的HCDR1、HCDR2、HCDR3也分别为HCDR 1:TGVDRWS；HCDR 2:YIYYSGTITYNPSLTS；HCDR 3:ERTYYGYGYFDV。
例如当第一方面所述的抗体中所限定的轻链可变区相比于SEQ ID NO:2无突变时，以Kabat定义该轻链可变区的LCDR1、LCDR2、LCDR3分别为LCDR 1:HASQNINVWLS；LCDR 2:KASDLHT；LCDR 3:QQGQSYPWT；则第二方面所述抗体所含的LCDR1、LCDR2、LCDR3也分别为LCDR 1:HASQNINVWLS；LCDR 2:KASDLHT；LCDR 3:QQGQSYPWT。
如本文所用，术语“互补性决定区”、“CDR”或“CDRs”是指免疫球蛋白的重链和轻链的高度可变区，指包含一种或多种或者甚至全部的对抗体与其识别的抗原或表位的结合亲和力起作用的主要氨基酸残基的区域。
在本文中，重链互补决定区(重链可变区CDR)用“HCDRs”或“HCDR”表示，其包括HCDR1、HCDR2和HCDR3；轻链互补决定区(轻链可变区CDR)用“LCDRs”或“LCDR”表示，其包括LCDR1、LCDR2和LCDR3。本领域常用的CDR定义方案包括：Kabat定义、Chothia定义、IMGT定义、Contact定义和AbM定义。如本文所述，“Kabat定义”是指Kabat等，U.S.Dept.of Healthand Human Services，“Sequence of Proteins of Immunological Interest”(1983)所述的定义系统。“Chothia定义”参见Chothia等，J Mol Biol196：901-917(1987)。示例性的定义的CDR列于下表1中，不同文献中的定义略有不同，在给定抗体的可变区氨基酸序列的情况下，本领域技术人员可以常规地确定哪些残基包含特定CDR。需要说明的是，不限于表1中的其他方法定义的CDR也属于本公开的保护范围。
表1：CDR定义1
CDR Kabat AbM2 IMGT Chothia
HCDR1 H31～H353 H26～H353 H26～H33..355 H26～H32..344
HCDR2 H50～H65 H50～H58 H51～H57 H52～H56
HCDR3 H95～H102 H95～H102 H93～H102 H95～H102
LCDR1 L24～L34 L24～L34 L27～L32 L24～L34
LCDR2 L50～L56 L50～L56 L50～L51 L50～L56
LCDR3 L89～L97 L89～L97 L89～L97 L89～L97
1表1中所有CDR定义的编号是依据Kabat编号系统(参见下文)，重链上的氨基酸编号用“H+数字”表示，轻链上的氨基酸编号用“L+数字”表示。
2如表1中使用的“AbM”具有小写“b”，是指通过Oxford Molecular的“AbM”抗体建模软件定义的CDR。
3如果H35A和H35B都不存在时，那么CDR-H1结束在35位；如果只有H35A存在时，那么CDR-H1结束在35A位；如果H35A和H35B同时存在，那么CDR-H1结束在35B位。
4如果H35A和H35B都不存在时，那么CDR-H1结束在32位；如果只有H35A存在时，那么CDR-H1结束在33位；如果H35A和H35B同时存在，那么CDR-H1结束在34位。
5如果H35A和H35B都不存在时，那么CDR-H1结束在33位；如果只有H35A存在时，那么CDR-H1结束在34位；如果H35A和H35B同时存在，那么CDR-H1结束在35位。
Kabat等还定义了适用于任何抗体的可变区序列的编号系统。本领域普通技术人员可以明确地将该Kabat编号系统对应到任何可变区序列，而不依赖于序列本身之外的任何实验数据。如本文所述，“Kabat编号”是指Kabat等，U.S.Dept.of Health andHumanServices，“Sequence of Proteins ofImmunological Interest”(1983)所述的编号系统。需要说明的是，本发明的序列表和表2中的多肽序列未根据Kabat编号系统编号。然而，本领域普通技术人员完全能够将序列表的序列编号转换为Kabat编号。
根据本发明的实施例，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3由Kabat、Chothia、IMGT、AbM或Contact任意一种系统或多种系统组合定义。
在本发明的一些可选实施例中，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3由Kabat系统定义。
在本发明的一些可选实施例中，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3由Chothia系统定义。
在本发明的一些可选实施例中，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3由IMGT系统定义。
在本发明的一些可选实施例中，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3由AbM系统定义。
在本发明的一些可选实施例中，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3由Contact系统定义。
在本发明的一些可选实施例中，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3由Kabat、Chothia、IMGT、AbM或Contact系统组合定义。
根据本发明的实施例，所述Kabat、Chothia、AbM或IMGT系统定义的HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3的氨基酸序列对应的Kabat编号位置如下：
CDR Kabat AbM IMGT Chothia
HCDR1 H31～H35B H26～H35B H26～H35 H26～H34
HCDR2 H50～H65 H50～H58 H51～H57 H52～H56
HCDR3 H95～H102 H95～H102 H93～H102 H95～H102
LCDR1 L24～L34 L24～L34 L27～L32 L24～L34
LCDR2 L50～L56 L50～L56 L50～L51 L50～L56
LCDR3 L89～L97 L89～L97 L89～L97 L89～L97
根据本发明的实施例，所述HCDRs和LCDRs由Kabat系统定义。
根据本发明的实施例，所述HCDRs和LCDRs为下述所示的氨基酸序列：
HCDR 1:TGX1DRWS，其中，X1为S或V；
HCDR 2:YIYYSGTX2TX3NPSLTS，其中，X2为I、V、T、Q或R，X3为Y、L、V、I或M；
HCDR 3:ERTYYGYGYFDV；
LCDR 1:HASQNINVWLS；
LCDR 2:KASDLHT；
LCDR 3:QQGX4SYPWT，其中，X4为Q或S；
根据本发明的实施例，所述X1/X2/X3/X4不同时为S/I/Y/Q组合。
由前述表格的定义原则可知，采用不同的系统进行定义，即使是相同的重链可变区或相同的轻链可变区，其获得的CDR也不同。本申请中的“HCDR 1:TGX1DRWS”是指HCDR 1的氨基酸序列包括或为TGX1DRWS，其还可以根据不同的系统进行调整，得到序列长于TGX1DRWS的HCDR 1。示例性地，HCDR 1由AbM系统定义，HCDR 1为GISITTGX1DRWS，其中，X1为S或V。
根据本发明的实施例，所述X1为S。
根据本发明的实施例，所述X1为V。
根据本发明的实施例，所述X2为I。
根据本发明的实施例，所述X2为V。
根据本发明的实施例，所述X2为T。
根据本发明的实施例，所述X2为Q。
根据本发明的实施例，所述X2为R。
根据本发明的实施例，所述X3为Y。
根据本发明的实施例，所述X3为L。
根据本发明的实施例，所述X3为V。
根据本发明的实施例，所述X3为I。
根据本发明的实施例，所述X3为M。
根据本发明的实施例，所述X4为Q。
根据本发明的实施例，所述X4为S。
根据本发明的实施例，所述X1/X2/X3/X4选自如下组合1-33中的任意一种：
根据本发明的实施例，进一步包括HFR1、HFR2、HFR3、HFR4、LFR1、LFR2、LFR3、LFR4中的至少之一。
其中，所述HFR1、HFR2、HFR3、HFR4、LFR1、LFR2、LFR3和LFR4中的至少之一的至少一部分来自于鼠源抗体、人源抗体、灵长目源抗体、牛源抗体、马源抗体、乳牛源抗体、猪源抗体、绵羊源抗体、山羊源抗体、狗源抗体、猫源抗体、兔源抗体、骆驼源抗体、驴源抗体、鹿源抗体、貂源抗体、鸡源抗体、鸭源抗体、鹅源抗体、火鸡源抗体、斗鸡源抗体或其突变体中的至少之一。
在本文中，“框架区”或“FR”区包括重链框架区和轻链框架区，是指抗体重链可变区(可以表示为VH)和轻链可变区(可以表示为VL)中除CDR之外的区域；其中，重链框架区用“HFR”表示，并且可以被进一步细分成被CDR分隔开的毗邻区域，包含HFR1、HFR2、HFR3和HFR4框架区；轻链框架区用“LFR”表示，并且可以被进一步细分成被CDR分隔开的毗邻区域，包含LFR1、LFR2、LFR3和LFR4框架区。
如本文所用，重链可变区由以下编号的CDR与FR按如下组合排列连接获得：HFR1-HCDR1-HFR2-HCDR2-HFR3-HCDR3-HFR4；轻链可变区由以下编号的CDR与FR按如下组合排列连接获得：LFR1-LCDR1-LFR2-LCDR2-LFR3-LCDR3-LFR4。
根据本发明的实施例，所述HFR1包括如SEQ ID NO:3或11所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述HFR2包括如SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述HFR3包括如SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述HFR4包括如SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述LFR1包括如SEQ ID NO:7或12所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述LFR2包括如SEQ ID NO:8或13所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述LFR3包括如SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
所述LFR4包括如SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列。
在本发明的一个可选实施例中，所述HFR1、HFR2、HFR3、HFR4、LFR1、LFR2、LFR3、LFR4分别依次如SEQ ID NO:3～SEQ ID NO:10所示。
在本发明的一个可选实施例中，所述HFR1如SEQ ID NO:11所示，HFR2如SEQ IDNO:4所示，HFR3如SEQ ID NO:5所示，HFR4如SEQ ID NO:6所示，LFR1如SEQ ID NO:12所示，LFR2如SEQ ID NO:13所示，677LFR3如SEQ ID NO:9所示，LFR4如SEQ ID NO:10所示。
根据本发明的实施例，所述的抗体包括第一方面所述的重链可变区和/或轻链可变区。
根据本发明的实施例，上述第一方面和第二方面所述的抗体还可以进一步包括如下技术特征的至少之一：
根据本发明的实施例，所述抗体进一步包括恒定区；其中，所述恒定区包括重链恒定区和轻链恒定区中的至少之一。
根据本发明的实施例，所述重链恒定区和轻链恒定区的至少之一的至少一部分来自于鼠源抗体、人源抗体、灵长目源抗体、牛源抗体、马源抗体、乳牛源抗体、猪源抗体、绵羊源抗体、山羊源抗体、狗源抗体、猫源抗体、兔源抗体、骆驼源抗体、驴源抗体、鹿源抗体、貂源抗体、鸡源抗体、鸭源抗体、鹅源抗体、火鸡源抗体、斗鸡源抗体或其突变体中的至少之一。
根据本发明的实施例，所述重链恒定区包括选自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE或IgD的重链恒定区；或者，所述轻链恒定区包括选自κ型或λ型轻链恒定区。
在本发明的一个可选实施例中，所述轻链恒定区和重链恒定区均来自于鼠源抗体或其突变体。
在本发明的一个可选实施例中，所述重链恒定区包括或为如SEQ ID NO:14或与其具有至少80％同一性的氨基酸序列所示的重链恒定区；或者
所述轻链恒定区包括或为如SEQ ID NO:15或与其具有至少80％同一性的氨基酸序列所示的轻链恒定区；
根据本发明的实施例，所述重链恒定区的N端与所述重链可变区的C端相连，所述轻链恒定区的N端与所述轻链可变区的C端相连。
在本文中，可变区和恒定区序列的划分参照IMGT划分法，参见Lefranc,M.the international ImMunoGeneTics database.Nucl.Acids Res.,29(1):207-209(2001).DOI:10.1093/nar/29.1.207.PMID:11125093.及Martinez-Jean C.and BoscN.或Ehrenmann,Patrice Duroux,Chantal Ginestoux,Gene table:house mouse(Mus musculus)IGHC,IMGT Repertoire.the international ImMunoGeneticsinformationhttp://www.imgt.org.Created:16/03/2011.Version:17/01/2020.或
Ehrenmann,Patrice Duroux,Chantal Ginestoux,Gene table:housemouse(Mus musculus)IGLC,IMGT Repertoire.the internationalImMunoGenetics informationhttp://www.imgt.org.Created:16/03/2011.Version:17/01/2020.。不同方法划分的可变区与IMGT划分的可变区C端或恒定区N端会有部分氨基酸的差异，本领域公知的其他方法划分的可变区或恒定区也在本发明的保护范围内。
在本发明的一个可选实施例中，所述重链和轻链选自如下组合的任意一种：
在本发明的一个可选实施例中，所述重链和轻链选自如下的任意一种：
本领域技术人员能够理解的是，前面针对第一方面所述的抗体所描述的特征和优点，同样适用于该第二方面所述的抗体，在此不再赘述。
根据本发明的实施例，所述抗体包括选自多抗、全长单抗、Fab抗体、Fab’抗体、F(ab’)2抗体、Fv抗体、单链抗体、单域抗体以及最小识别单位中的至少之一。
在本文中，术语“单域抗体”、“纳米抗体”和“VHH抗体”可互换使用，其最初被描述为“重链抗体”(即“缺乏轻链的抗体”)的抗原结合免疫球蛋白(可变)域(Hamers-CastermanC,AtarhouchT,Muyldermans S,Robinson G,Hamers C,Songa EB,Bendahman N,HamersR.:“Naturallyoccurring antibodies devoid of light chains”；Nature 363,446-448(1993))，包含重链可变区(VH)和常规的CH2与CH3区，其通过重链可变区与抗原蛋白(例如CKMB)特异性结合。
在本文中，术语“Fab抗体”或“Fab片段”通常是指仅含Fab分子的抗体或片段，其由重链的VH和CH1以及完整的轻链构成，轻链和重链之间通过一个二硫键连接。
在本文中，术语“F(ab’)2抗体”或“F(ab’)2片段”具有通过二硫键连接在一起的两个抗原结合F(ab’)部分。
在本文中，术语“Fv抗体”或“Fv片段”通常是指仅由轻链可变区(VL)和重链可变区(VH)通过非共价键连接而成的抗体或片段，是抗体分了保留完整抗原结合部位的最小功能片段。
在本文中，术语“单链抗体”、“scFv片段”是由抗体重链可变区和轻链可变区通过短肽连接而成的抗体或片段。
在本文中，术语“最小识别单位”和“MRU”均是指仅由一个CDR组成的抗体或片段，其分子量十分小仅占完全抗体的1％左右。
核酸分子、载体、细胞或宿主、制备抗体的方法
在制备或者获取第一方面或第二方面所述的抗体的过程中，可以利用表达这些抗体的核酸分子，与不同的载体连接，然后在不同细胞中表达，来获得相应抗体。
在本发明的第三方面，本发明提出了一种核酸分子。根据本发明的实施例，所述核酸分子编码第一方面或第二方面所述的抗体。根据本发明实施例的核酸分子可编码获得上述的抗体。
根据本发明的实施例，所述核酸分子包括DNA或RNA。
需要说明的是，对于本文中所提及的核酸分子，本领域技术人员应当理解，实际包括互补双链的任意一条，或者两条。为了方便，在本文中，虽然多数情况下只给出了一条链，但实际上也公开了与之互补的另一条链。另外，本发明中的分子序列包括DNA形式或RNA形式，公开其中一种，意味着另一种也被公开。
在本发明的第四方面，本发明提出了一种载体。根据本发明的实施例，所述载体包括第三方面所述的核酸分子。在将上述核酸分子连接到载体上时，可以将所述核酸分子与载体上的控制元件直接或者间接相连，只要这些控制元件能够控制所述核酸分子的翻译和表达等即可。当然这些控制元件可以直接来自于载体本身，也可以是外源性的，即并非来自于载体本身。当然，所述核酸分子与控制元件进行可操作地连接即可。本文中“可操作地连接”是指将外源基因连接到载体上，使得载体内的控制元件，例如转录控制序列和翻译控制序列等等，能够发挥其预期的调节外源基因的转录和翻译的功能。常用的载体例如可以为质粒、噬菌体等等。根据本发明的一些具体实施例的载体导入合适的受体细胞后，可在调控系统的介导下，有效实现前述的抗体的表达，进而实现抗体的体外大量获得。
在本发明的一些具体实施例中，所述载体为真核表达载体、原核表达载体、病毒或噬菌体。
在本发明的一个可选实施例中，所述表达载体为质粒表达载体。
在本发明的第五方面，本发明提出了一种细胞或宿主。根据本发明的实施例，所述细胞或宿主包括：第三方面所述的核酸分子或第四方面所述的载体；或者表达第一方面或第二方面所述的抗体。利用该细胞在适合条件下，能够在细胞内有效地表达前述的抗体。
根据本发明的实施例，所述细胞是通过将第四方面所述的载体引入至细胞中而获得的。
需要说明的是，本发明的细胞不受特别限制，可以为原核细胞、真核细胞或噬菌体。所述原核细胞可以为大肠杆菌、枯草杆菌、链霉菌或奇异变形菌等。所述真核细胞包括巴斯德毕赤酵母、酿酒酵母、裂殖酵母、木霉等真菌，草地粘虫等昆虫细胞，烟草等植物细胞，BHK细胞、CHO细胞、COS细胞、骨髓瘤细胞等哺乳动物细胞。
在本发明的一个可选实施例中，所述细胞为哺乳动物细胞，包括BHK细胞、CHO细胞、NSO细胞或COS细胞，且不包括动物生殖细胞、受精卵或胚胎干细胞。
需要说明的是，本发明中所述的“适合条件”，是指适合本发明所述抗体表达的条件。本领域技术人员容易理解的是，适合所述抗体表达的条件包括但不限于合适的转化或转染方式、合适的转化或转染条件、健康的细胞状态、合适的细胞密度、适宜的细胞培养环境、适宜的细胞培养时间。“适合条件”不受特别限制，本领域技术人员可根据实验室的具体环境，优化最适的所述抗体表达的条件。
在本发明的第六方面，本发明提出了一种制备第一方面或第二方面所述的抗体的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括培养第五方面所述的细胞或宿主。根据本发明一些具体实施例的方法能够有效大量获得所述抗体。
在本公开的抗体的氨基酸序列的基础上，本领域技术人员容易想到采用基因工程技术或其他技术(化学合成、重组表达)制备得到该抗体，例如从能够重组表达如上任一项所述的抗体的重组细胞的培养产物中分离纯化得到该抗体，这对本领域技术人员来说是容易实现的，基于此，无论采用何种技术制备本公开的抗体，其均属于本公开的保护范围。
本领域技术人员能够理解的是，前面针对第一方面和第二方面所述的抗体所描述的特征和优点，同样适用于该核酸分子、载体、细胞或宿主、制备抗体的方法，在此不再赘述。
偶联物、试剂或试剂盒及其用途
在本发明的第七方面，本发明提出了一种偶联物。根据本发明的实施例，所述偶联物包括：第一方面或第二方面所述的抗体以及与其偶联的偶联部分。根据本发明实施例的偶联物可特异性结合CKMB，可用于CKMB的定性或定量检测，或者用于诊断CKMB异常相关疾病。
根据本发明的实施例，上述偶联物还可以进一步包括下列附加技术特征中的至少之一：
根据本发明的实施例，所述偶联部分包括纯化标签、亲和性物质、标记物或固相载体；
在本文中，所述亲和性物质可以是例如，生物素、生物素衍生物或链霉亲和素，相互互补的正义链和反义链的核酸中的一者。
在本发明的一个可选实施例中，所述亲和性物质包括选自生物素、生物素衍生物或链霉亲和素中的至少之一。
在本文中，上述标记物是指具有能够被肉眼直接观察或被仪器检测或探测到的特性例如发光、显色、放射性等特性的一类物质，通过该特性可以实现对相应目标物的定性或定量检测。
根据本发明的实施例，所述标记物包括选自荧光染料、酶、放射性同位素、化学发光试剂和纳米颗粒类标记物中的至少之一。
在实际的使用过程中，本领域技术人员可以根据检测条件或实际需要选择合适的标记物，无论使用何种标记物，其均属于本发明的保护范围。
根据本发明的实施例，所述荧光染料包括但不限于荧光素类染料及其衍生物(例如包括但不限于异硫氰酸荧光素(FITC)羟基光素(FAM)、四氯光素(TET)等或其类似物)、罗丹明类染料及其衍生物(例如包括但不限于红色罗丹明(RBITC)、四甲基罗丹明(TAMRA)、罗丹明B(TRITC)等或其类似物)、Cy系列染料及其衍生物(例如包括但不限于Cy2、Cy3、Cy3B、Cy3.5、Cy5、Cy5.5、Cy3等或其类似物)、Alexa系列染料及其衍生物(例如包括但不限于AlexaFluor350、405、430、488、532、546、555、568、594、610、33、647、680、700、750等或其类似物)和蛋白类染料及其衍生物(例如包括但不限于藻红蛋白(PE)、藻蓝蛋白(PC)、别藻蓝蛋白(APC)、多甲藻黄素-叶绿素蛋白(preCP)等)。
根据本发明的实施例，所述酶包括但不限于辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡萄糖氧化酶、碳酸酐酶、乙酰胆碱酯酶以及6-磷酸葡萄糖脱氧酶。
根据本发明的实施例，所述放射性同位素包括但不限于212Bi、131I、111In、90Y、186Re、211At、125I、188Re、153Sm、213Bi、32P、94mTc、99mTc、203Pb、67Ga、68Ga、43Sc、47Sc、110mIn、97Ru、62Cu、64Cu、67Cu、68Cu、86Y、88Y、121Sn、161Tb、166Ho、105Rh、177Lu、172Lu和18F。
根据本发明的实施例，所述化学发光试剂包括但不限于鲁米诺及其衍生物、光泽精、甲壳动物荧光素及其衍生物、联吡啶钌及其衍生物、吖啶酯及其衍生物、二氧环乙烷及其衍生物、洛粉碱及其衍生物和过氧草酸盐及其衍生物。
根据本发明的实施例，所述纳米颗粒类标记物包括但不限于纳米颗粒、胶体、有机纳米颗粒、磁性纳米颗粒、量子点纳米颗粒和稀土络合物纳米颗粒。
根据本发明的实施例，所述胶体包括但不限于胶体金属、分散型染料、染料标记的微球和乳胶。
根据本发明的实施例，所述胶体金属包括但不限于胶体金、胶体银和胶体硒。
在本文中，所述固相载体可以为能够在液相中悬浊或分散的物质(例如，粒子、磁珠等固相载体)，或者为能够收容或搭载液相的固相(例如，板、膜、试管等支持体，以及孔板、微流路、玻璃毛细管、纳米柱、整体柱等的容器)；
根据本发明的实施例，所述固相载体包括选自微球、板和膜中的至少之一。
在本发明的第八方面，本发明提出了一种试剂或试剂盒。根据本发明的实施例，所述试剂或试剂盒包括：第一方面或第二方面所述的抗体或第七方面所述的偶联物。如前所述，本发明一些具体实施方式或实施例中的抗体能够有效与CKMB进行结合，因此，包含所述抗体的试剂或试剂盒能够有效的对CKMB进行定性或定量检测。应用本发明提供的试剂或试剂盒，例如可以用于免疫印迹、免疫沉淀等涉及到利用CKMB和其抗体特异性结合性能的检测。如前所述，本发明的抗体具有与CKMB更高的结合活性或亲和力，因此包含所述抗体的试剂或试剂盒具有更高的检测灵敏度或特异性。
这些试剂盒可包含下列中的任意一种或多种：处理液、抗CKMB抗体、CKMB质控品、抗IgG抗体、说明书或者文献等。抗CKMB抗体可被用于不同类型的诊断测试，例如可以在体外或者体内检测各种各样的疾病或者药物、或者其他蛋白等的存在。例如可以通过对受试者的血清或者血液进行检测，用来测试相关疾病。
在本发明的第九方面，本发明提出了一种第一方面或第二方面所述的抗体、第七方面所述的偶联物或第八方面所述的试剂或试剂盒在检测CKMB或制备用于检测CKMB产品中的用途。
在本发明的第十方面，本发明提出了一种检测CKMB的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：采用第一方面或第二方面所述的抗体、第七方面所述的偶联物或第八方面所述的试剂或试剂盒与待检测样本进行接触，形成免疫复合物。
需要说明的是，上述的“待检测样本”可为患者的待检测样本，例如血清等样本；也可为可能含有CKMB的非患者样本，例如在可科学研究中，采用上述方法仅仅用于检测样本中的CKMB的存在情况或其含量，并不涉及疾病诊断。
根据本发明的实施例，基于所述免疫复合物的信号，确定所述待检测样本中是否含有CKMB或所述CKMB的含量。
根据本发明的实施例，所述免疫复合物还包括第二抗体，所述第二抗体与所述抗体结合。
根据本发明的实施例，所述免疫复合物还包括第二抗体，所述第二抗体与CKMB结合。
根据本发明的实施例，所述信号包括荧光信号。
在本发明的第十一方面，本发明提出了一种筛选CKMB抗体的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：a)设计引物，用于对第一方面所述的抗体中所限定的突变位点或第二方面所述的抗体中所限定的X1、X2、X3、X4中的1、2、3或4个位点进行氨基酸替换；
b)以第三方面所述的核酸分子、第四方面所述的载体或第五方面所述的细胞为模板，用a)所述引物构建的突变文库；
c)从所述突变文库中筛选CKMB抗体。
根据本发明的实施例，所述突变文库为单点饱和突变文库。
根据本发明的实施例，所述CKMB抗体包括或为第一方面或第二方面所述的抗体。
在本发明的第十二方面，本发明提出了一种突变文库，所述突变文库包括第一方面或第二方面所述的抗体。
根据本发明的实施例，所述突变文库是通过第十一方面所述方法得到的。
在本发明的第十三方面，本发明提出了一种第一方面或第二方面所述的抗体、第七方面所述的偶联物或第八方面所述的试剂或试剂盒在诊断CKMB相关疾病或制备用于诊断CKMB相关疾病产品中的用途。
根据本发明的实施例，所述CKMB相关疾病包括但不限于心肌损伤、心肌梗塞、心绞痛或溶栓治疗效果中的至少之一。
根据本发明的实施例，所述CKMB相关疾病包括但不限于缺血性心肌损伤、急性心肌梗塞、不稳定型心绞痛中的至少之一。
在本发明的第十四方面，本发明提出了一种诊断CKMB相关疾病的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：采用第一方面或第二方面所述的抗体、第七方面所述的偶联物或第八方面所述的试剂或试剂盒与来自受试者的待检测样本进行接触，形成免疫复合物。
根据本发明的实施例，基于所述免疫复合物的信号，指示所述受试者CKMB相关疾病的有无、预后或治疗效果。
根据本发明的实施例，所述免疫复合物还包括第二抗体，所述第二抗体与所述抗体结合。
根据本发明的实施例，所述免疫复合物还包括第二抗体，所述第二抗体与CKMB结合。
根据本发明的实施例，所述信号包括荧光信号。
如本文所用，术语“受试者”是指脊椎动物，优选地是哺乳动物，最优选地是人类。哺乳动物包括但不限于鼠类、猿类、人类、家畜、竞技动物和宠物。在体内获得的或在体外培养的生物实体的组织、细胞及其子代也包括在内。
本文中涉及的氨基酸序列如表2所示：
表2：氨基酸序列
下面将结合实施例对本发明的方案进行解释。本领域技术人员将会理解，下面的实施例仅用于说明本发明，而不应视为限定本发明的范围。实施例中未注明具体技术或条件的，按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市购获得的常规产品。
除非另有定义，否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本公开内容所属领域的普通技术人员通常理解的含义相同的含义。尽管与本文描述的那些方法和材料类似或等同的任何方法和材料都可用于本文的制剂或单位剂量的实践或测试，但现在描述一些方法和材料。除非另有说明，否则本文采用或考虑的技术是标准方法。材料、方法和实例仅是说明性而非限制性的。
除非另外指明，否则实践本公开将采用细胞生物学、分子生物学(包含重组技术)、微生物学、生物化学和免疫学的常规技术，所述常规技术在本领域技术人员的能力范围内。文献中充分解释了这种技术，如《分子克隆：实验室手册(Molecular Cloning:ALaboratory Manual)》，第二版(Sambrook等人，1989)；《寡核苷酸合成(OligonucleotideSynthesis)》(M.J.Gait编，1984)；《动物细胞培养(Animal Cell Culture)》(R.I.Freshney编，1987)；《酶学方法(Methods in Enzymology)》(学术出版社有限公司(Academic Press，Inc.)；《实验免疫学手册(Handbook of Experimental Immunology)》(D.M.Weir和C.C.Blackwell编)；《哺乳动物细胞用基因转移载体(Gene Transfer Vectors forMammalian Cells)》(J.M.Miller和M.P.Calos编，1987)；《当代分子生物学方法(CurrentProtocols in Molecular Biology)》(F.M.Ausubel等人编，1987)；《PCR:聚合酶链反应(PCR:The Polymerase Chain Reaction)》(Mullis等人编，1994)；以及《当代免疫学方法(Current Protocols in Immunology)》(J.E.Coligan等人编，2011)，所述文献中的每个文献均通过引用明确并入本文中。
本实施例中限制性内切酶、T4 DNA连接酶、DNA聚合酶购自New England Biolabs公司，Taq DNA聚合酶来购自TaKaRa，凝胶回收试剂盒和质粒提取试剂盒市售，引物合成和基因测序由外包公司完成。CKMB单克隆抗体(以下简称WT抗体)序列来源于小鼠杂交瘤细胞测序。
实施例1：突变文库的构建和筛选
1、野生型(WT)CKMB抗体(简称WT抗体)模板质粒的构建
(1)WT抗体基因合成：
将WT抗体的VH和VL的核苷酸序列进行大肠杆菌密码子优化，然后将抗体基因序列进行基因合成。WT抗体的VH和VL氨基酸序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示，重链和轻链氨基酸序列分别如SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17所示(2)WT抗体基因片段扩增：
将步骤(1)合成好的抗体VH和VL的核苷酸序列，运用DNA聚合酶进行PCR扩增，然后通过琼脂糖凝胶电泳分离抗体条带，接着用凝胶回收试剂盒纯化得到抗体基因片段。
(3)WT抗体基因片段酶切和连接：
将步骤(2)获得的抗体基因片段和V01载体质粒同时用限制性内切酶进行双酶切，然后用凝胶回收试剂盒纯化得到带有粘性末端的抗体基因片段和V01载体，接着用T4 DNA连接酶将抗体基因片段和V01载体在22℃连接4小时后，取连接反应产物进行回收纯化，并测定DNA浓度，最后取100ng的质粒转化到100ul TG1大肠杆菌感受态细胞中，得到菌液。然后将菌液全部涂于含氨苄青霉素抗性的平板上，37℃培养过夜。
(4)WT模板质粒的提取和测序验证
挑选步骤(3)过夜培养的10个单克隆菌落，采用Taq DNA聚合酶进行菌落PCR和凝胶电泳检测，选择正确插入抗体基因序列的菌进行培养扩增，用质粒提取试剂盒等到WT模板质粒，并送测序公司进行基因测序验证。
2、单点突变文库的构建
该部分实验对步骤1获得的WT抗体的VH和VL全CDR区进行单点饱和突变，以构建单点突变文库。
(1)引物设计和合成
利用兼并碱基密码子，设计VH和VL全CDR区(62个氨基酸位点)的单点饱和突变上下游引物62对，并交给外包公司进行引物合成。
(2)单点饱和突变质粒PCR扩增
利用步骤(1)获得的引物，采用PCR方法对单点饱和突变质粒进行PCR扩增。按照表3配置反应体系，然后采用表4的PCR反应条件进行单点饱和突变文库质粒的扩增制备，最后用限制性内切酶在37℃条件下消化步骤1获得的WT模板质粒1小时，得到62个突变文库的质粒。
表3：PCR扩增的反应体系
表4：PCR反应条件
Step1 Step2 Step3 Step4 Step5 Step6
温度 95℃ 95℃ 55-60℃ 72℃ 72℃ 4℃
时间 5min 30s 30s 2min 5min ∞
注：Step2～Step4进行22循环。
(3)单点饱和突变质粒转化：
取步骤(2)获得的62个突变文库的质粒，各取10μl反应产物转化到100μl TG1大肠杆菌感受态细胞中，获得菌液，然后将菌液全部涂于含氨苄青霉素抗性的平板上，37℃培养过夜。
3、单点突变文库的筛选
(1)突变文库抗体表达
在96孔培养板中事先加入500μl的培养基，每个单点突变文库，挑选步骤2-(3)过夜培养的单点饱和突变质粒转化的92个单克隆菌落，并设置WT、阴性对照(即不插入含有VH\VL基因的菌落)、空白对照(即为只有培养基，不含菌落)菌落，在37℃进行培养5-6小时后，将菌液转接到一块新的96孔培养板中，然后，在37℃进行培养1-2小时后，最后加入诱导培养基，37℃过夜培养表达抗体，得到62个突变文库的抗体表达上清。
(2)突变文库筛选和测序
将市售的CKMB蛋白按照0.004μg/ml、100μl/孔的量，加入到62块ELISA板中，4℃过夜反应包被，次日，用1-2％脱脂奶粉进行封闭，将该步骤(1)获得的62个突变文库的抗体表达上清，按照100μl/孔的量加入ELISA板孔中，并设置WT、阴性对照(即不插入含有VH\VL基因的菌落)和空白对照(即为只有培养基，不含菌落)，室温孵育2小时，采用常规ELISA的检测方法，进行后续的洗板、显色、读数；最后，对数据结果进行整理分析，将有提升的克隆送测序，最后对测序结果进行分析，选出10个唯一突变候选克隆的突变位点(见表5)进行组合突变文库构建。(表5中的Ratio值代表了亲和力提升的程度，当Ratio值等于1时，表示突变克隆的亲和力和WT一样；当Ratio值大于1时，表示亲和力有提升)。
表5：候选克隆的筛选结果和突变位点
注：在本文中的WT均代表相对于野生型序列无突变(同表6和表7)；
在本文中的突变氨基酸的位置是通过将WT的VH或VL的氨基酸序列从N端到C端依次按顺序进行编号获得的。
4、组合突变文库的构建
(1)文库引物设计和合成：
根据步骤3-(2)获得的CKMB抗体的VH和VL上的突变位点，设计组合突变文库的扩增引物，并进行引物合成。
(2)片段扩增和连接
根据表3的PCR体系和表4的PCR反应条件，进行抗体突变片段的扩增，然后将抗体突变片段进行胶回收。采用Overlap PCR的方法，将抗体突变片段拼接成完整的抗体片段(重链可变区或轻链可变区)。
最后，采用酶切连接的方法将抗体片段插入V01载体中，形成完整的抗体表达质粒(具体步骤参见步骤1-(3)“WT抗体基因片段酶切和连接”的步骤)。取100ng的质粒转化到100μl TG1大肠杆菌感受态细胞中，将菌液全部涂于含氨苄青霉素抗性的平板上，37℃培养过夜。
5、组合突变文库的筛选
随机挑选23个组合突变抗体进行表达、ELISA筛选检测、阳性克隆测序分析，Ratio值测定如表6所示。
表6：组合突变候选克隆信息
实施例2：突变CKMB抗体表达
本实施例对于实施例1筛选获得的突变CKMB抗体进行表达，具体实验操作如下：
1、真核重组表达质粒构建
pcDNATM3.4vector为构建的重组抗体真核表达载体，该表达载体已经引入HindIII、BamHI、EcoRI等多克隆酶切位点，并命名为pcDNA3.4A表达载体，后续简称3.4A表达载体；根据上述组合突变文库筛选得到的克隆中可变区基因序列，设计相应抗体序列的VL和VH基因特异性扩增引物及恒定区overlap引物，两端引物分别带有HindIII、EcoRI酶切位点和保护碱基，通过PCR扩增方法扩出0.73kb的轻链(Light Chain)基因片段和1.40kb的重链(Heavy Chain)基因片段。
重链和轻链基因片段分别采用HindIII/EcoRI双酶切，3.4A载体采用HindIII/EcoRI双酶切，将酶切后的抗体轻、重链基因片段和载体进行纯化回收，然后将编码抗体轻、重链基因片段和分别连接3.4A表达载体中并转化至DH5α大肠杆菌感受态细胞中，生长出菌落后分别挑取单菌落进行PCR鉴定阳性克隆子，挑取阳性克隆子进行测序，确定序列的正确性。挑选测序正确克隆进行质粒提取备用。
2、重组抗体的样品制备
提前复苏HEK293细胞，传代培养到200ml体系，使细胞密度达到(3～5)×106cells/ml，细胞活力>95％；离心清洗细胞，用培养基复溶，同时将细胞密度调整到2.9×106cells/ml，作为细胞稀释液。用培养基分别配制质粒DNA和转染试剂稀释液。将转染试剂稀释液加入到质粒DNA稀释液中，混匀后室温静置放置15min；将该混合物在1min内缓慢加入细胞稀释液中，混匀后取样计数，记录并观察细胞转染后的活力，并将其放置于35℃恒温培养箱中培养，转速120rmp、CO2含量8％，13天后离心收样。用proteinA亲和层析柱进行亲和纯化得到33个抗体，其中，33个抗体的重链和轻链的氨基酸序列参见表7。
表7：33个抗体的重链和轻链的氨基酸序列
实施例3：亲和力分析
将野生型抗体(WT)、实施例2制备的突变抗体进行亲和力检测分析，具体步骤为：在Biacore8K+设备上测试CKMB与CKMB抗体的结合解离曲线，仪器自动拟合获得亲和力常数、结合速率、解离速率。在亲和力检测结果中，KD表示平衡解离常数，即亲和力常数，KD值越小，亲和力越高；ka表示结合速率；kd表示解离速率。结果显示，突变抗体与CKMB的亲和力优于野生型抗体与CKMB的亲和力。示例性展示抗体的亲和力检测结果如下表8所示：
表8：抗体亲和力检测结果
在本说明书的描述中，参考术语“一个实施例”、“一些实施例”、“示例”、“具体示例”、或“一些示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中，对上述术语的示意性表述不必须针对的是相同的实施例或示例。而且，描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。此外，在不相互矛盾的情况下，本领域的技术人员可以将本说明书中描述的不同实施例或示例以及不同实施例或示例的特征进行结合和组合。
尽管上面已经示出和描述了本发明的实施例，可以理解的是，上述实施例是示例性的，不能理解为对本发明的限制，本领域的普通技术人员在本发明的范围内可以对上述实施例进行变化、修改、替换和变型。

Claims (10)

1.一种抗CKMB抗体，其特征在于，包括：
重链可变区和/或轻链可变区；
所述重链可变区包括如SEQ ID NO:1或其变体所示的氨基酸序列，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：
第33位、第59位和第61位中的至少之一；
所述轻链可变区包括如SEQ ID NO:2或其变体所示的氨基酸序列，与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:2的变体包括第92位的突变。
2.根据权利要求1所述的抗体，其特征在于，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：S33V、I59V/T/Q/R、Y61L/V/I/M中的至少之一；
可选地，所述第33位的突变为S33V；
可选地，所述第59位的突变为I59V；
可选地，所述第59位的突变为I59T；
可选地，所述第59位的突变为I59Q；
可选地，所述第59位的突变为I59R；
可选地，所述第61位的突变为Y61L；
可选地，所述第61位的突变为Y61V；
可选地，所述第61位的突变为Y61I；
可选地，所述第61位的突变为Y61M；
可选地，与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:1的变体包括如下位点的突变：
突变位点 突变位点 VH变体1 S33V VH变体15 S33V,I59Q,Y61L VH变体2 I59V VH变体16 S33V,I59T,Y61L VH变体3 I59T VH变体17 S33V,I59V,Y61L VH变体4 I59Q VH变体18 S33V,I59R,Y61L VH变体5 I59R VH变体19 S33V,I59Q,Y61I VH变体6 Y61L VH变体20 S33V,Y61V VH变体7 Y61V VH变体21 S33V,I59V,Y61V VH变体8 Y61I VH变体22 S33V,I59T,Y61M VH变体9 Y61M VH变体23 S33V,I59V,Y61I VH变体10 S33V,I59R VH变体24 S33V,Y61M VH变体11 S33V,I59T,Y61V VH变体25 S33V,I59T VH变体12 S33V,I59R,Y61I VH变体26 S33V,I59Q,Y61V VH变体13 S33V,I59R,Y61V VH变体27 S33V,I59R,Y61M VH变体14 S33V,I59T,Y61I VH变体28 S33V,I59Q
；
可选地，与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比，所述SEQ ID NO:2的变体包括Q92S的突变；
可选地，所述重链可变区为如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，和所述轻链可变区为如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列不同时成立。
可选地，所述重链可变区和轻链可变区选自如下组合的任意一种：
3.一种抗CKMB抗体，包括HCDR1、HCDR2、HCDR3和LCDR1、LCDR2、LCDR3，其特征在于，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3为与权利要求1～2任一项所述的抗体所限定的重链可变区的HCDR1、HCDR2、HCDR3一致的氨基酸序列；所述LCDR1、LCDR2、LCDR3为与权利要求1～2任一项所述的抗体所限定的轻链可变区的LCDR1、LCDR2、LCDR3一致的氨基酸序列；
可选地，所述HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3由Kabat、Chothia、IMGT、AbM或Contact任意一种系统或多种系统组合定义；
可选地，所述HCDRs和LCDRs为下述所示的氨基酸序列：
HCDR 1:TGX1DRWS，其中，X1为S或V；
HCDR 2:YIYYSGTX2TX3NPSLTS，其中，X2为I、V、T、Q或R，X3为Y、L、V、I或M；
HCDR 3:ERTYYGYGYFDV；
LCDR 1:HASQNINVWLS；
LCDR 2:KASDLHT；
LCDR 3:QQGX4SYPWT，其中，X4为Q或S；
可选地，所述X1/X2/X3/X4不同时为S/I/Y/Q组合；
可选地，所述X1为S；
可选地，所述X1为V；
可选地，所述X2为I；
可选地，所述X2为V；
可选地，所述X2为T；
可选地，所述X2为Q；
可选地，所述X2为R；
可选地，所述X3为Y；
可选地，所述X3为L；
可选地，所述X3为V；
可选地，所述X3为I；
可选地，所述X3为M；
可选地，所述X4为Q；
可选地，所述X4为S；
可选地，所述X1/X2/X3/X4选自如下组合1-33中的任意一种：
可选地，进一步包括HFR1、HFR2、HFR3、HFR4、LFR1、LFR2、LFR3、LFR4中的至少之一；
其中，所述HFR1、HFR2、HFR3、HFR4、LFR1、LFR2、LFR3和LFR4中的至少之一的至少一部分来自于鼠源抗体、灵长目源抗体、牛源抗体、马源抗体、猪源抗体、绵羊源抗体、山羊源抗体、狗源抗体、猫源抗体、兔源抗体、骆驼源抗体、驴源抗体、鹿源抗体、貂源抗体、鸡源抗体、鸭源抗体、鹅源抗体或其突变体中的至少之一；
可选地，所述HFR1包括如SEQ ID NO:3或11所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述HFR2包括如SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述HFR3包括如SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述HFR4包括如SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述LFR1包括如SEQ ID NO:7或12所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述LFR2包括如SEQ ID NO:8或13所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述LFR3包括如SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
所述LFR4包括如SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列或与其具有至少80％同源性的氨基酸序列；
可选地，所述的抗体包括权利要求1～2任一项所述的重链可变区和/或轻链可变区。
4.根据权利要求1～3任一项所述的抗体，其特征在于，所述抗体进一步包括恒定区；
其中，所述恒定区包括重链恒定区和轻链恒定区中的至少之一；
可选地，所述重链恒定区和轻链恒定区的至少之一的至少一部分来自于鼠源抗体、灵长目源抗体、牛源抗体、马源抗体、猪源抗体、绵羊源抗体、山羊源抗体、狗源抗体、猫源抗体、兔源抗体、骆驼源抗体、驴源抗体、鹿源抗体、貂源抗体、鸡源抗体、鸭源抗体、鹅源抗体或其突变体中的至少之一；
可选地，所述重链恒定区包括选自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE或IgD的重链恒定区；或者
所述轻链恒定区包括选自κ型或λ型轻链恒定区；
可选地，所述轻链恒定区和重链恒定区均来自于鼠源抗体或其突变体；
可选地，所述重链恒定区包括或为如SEQ ID NO:14或与其具有至少80％同一性的氨基酸序列所示的重链恒定区；或者
所述轻链恒定区包括或为如SEQ ID NO:15或与其具有至少80％同一性的氨基酸序列所示的轻链恒定区；
可选地，所述重链和轻链选自如下组合的任意一种：
可选地，所述重链和轻链选自如下组合的任意一种：
重链的SEQ ID NO: 轻链的SEQ ID NO: 抗体1 16 46 抗体2 18 17 抗体3 19 17 抗体4 20 17 抗体5 21 17 抗体6 22 17 抗体7 23 17 抗体8 24 17 抗体9 25 17 抗体10 26 17 抗体11 27 46 抗体12 28 46 抗体13 29 17 抗体14 30 46 抗体15 31 46 抗体16 32 46 抗体17 33 46 抗体18 28 17 抗体19 34 46 抗体20 35 46 抗体21 36 17 抗体22 37 46 抗体23 38 46 抗体24 39 17 抗体25 40 46 抗体26 41 46 抗体27 42 46 抗体28 43 17 抗体29 44 46 抗体30 29 46 抗体31 36 46 抗体32 45 46 抗体33 39 46
可选地，所述抗体包括选自多抗、全长单抗、Fab抗体、Fab’抗体、F(ab’)2抗体、Fv抗体、单链抗体、单域抗体以及最小识别单位中的至少之一。
5.一种核酸分子、载体、细胞或宿主或制备权利要求1～4任一项所述抗体的方法，其特征在于，所述核酸分子编码权利要求1～4任一项所述的抗体；所述载体包括所述核酸分子；所述细胞或宿主包括所述的核酸分子或所述的载体或表达权利要求1～4任一项所述的抗体；所述方法包括培养所述的细胞或宿主。
6.一种偶联物，其特征在于，包括：权利要求1～4任一项所述的抗体以及与其偶联的偶联部分；
可选地，所述偶联部分包括纯化标签、亲和性物质、标记物或固相载体；
可选地，所述亲和性物质包括选自生物素、生物素衍生物或链霉亲和素的至少之一；
可选地，所述标记物包括选自荧光染料、酶、放射性同位素、化学发光试剂和纳米颗粒类标记物中的至少之一；
可选地，所述固相载体包括选自微球、板和膜中的至少之一。
7.一种试剂或试剂盒，其特征在于，包括：权利要求1～4任一项所述的抗体或权利要求6所述的偶联物。
8.权利要求1～4任一项所述的抗体、权利要求9所述的偶联物或权利要求10所述的试剂或试剂盒在检测CKMB或制备用于检测CKMB产品中的用途。
9.一种筛选CKMB抗体的方法，其特征在于，包括：
a)设计引物，用于对权利要求1～2任一项所述的抗体中所限定的突变位点、权利要求3所述的抗体中所限定的X1、X2、X3、X4中的1、2、3或4个位点进行氨基酸替换；
b)以权利要求5所述的核酸分子、载体或细胞为模板，用a)所述引物构建的突变文库；
c)从所述突变文库中筛选CKMB抗体；
可选地，所述突变文库为单点饱和突变文库；
可选地，所述CKMB抗体包括或为权利要求1～4任一项所述的抗体。
10.一种突变文库，其特征在于，所述突变文库包括权利要求1～4任一项所述的抗体；
可选地，所述突变文库是通过权利要求9所述方法得到的。
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