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CN116063565A - 靶向Fc受体样5的嵌合抗原受体及其用途 - Google Patents

靶向Fc受体样5的嵌合抗原受体及其用途 Download PDF

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CN116063565A
CN116063565A CN202211233565.5A CN202211233565A CN116063565A CN 116063565 A CN116063565 A CN 116063565A CN 202211233565 A CN202211233565 A CN 202211233565A CN 116063565 A CN116063565 A CN 116063565A
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CN
China
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seq
chain variable
variable region
amino acid
acid sequence
Prior art date
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Pending
Application number
CN202211233565.5A
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English (en)
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R·J·布伦特延斯
E·L·史密斯
C·刘
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Memorial Sloan Kettering Cancer Center
Eureka Therapeutics Inc
Original Assignee
Memorial Sloan Kettering Cancer Center
Eureka Therapeutics Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
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Abstract

本发明公开的主题提供用于治疗瘤形成(例如多发性骨髓瘤)的方法和组合物。其涉及特异性地靶向Fc受体样5(FcRL5)例如FcRL5的结构域9的嵌合抗原受体(CAR),以及包含这样的CAR的免疫应答细胞。本发明公开的FcRL5靶向的CAR具有增强的免疫活化特性,包括抗肿瘤活性。

Description

靶向Fc受体样5的嵌合抗原受体及其用途
本申请是申请日为2015年12月4日、申请号为201580075562.5、 发明名称为“靶向Fc受体样5的嵌合抗原受体及其用途”的专利申 请的分案申请。
相关申请的交叉引用
本申请要求2014年12月5日提交的美国临时专利申请第 62/088,164号的优先权,将其全部内容引入以供参考,且要求其优先 权。
技术领域
本发明公开的主题提供用于治疗癌症的方法和组合物。其涉及特 异性地靶向Fc受体样5(FcRL5)例如FcRL5的结构域9的嵌合抗 原受体(CAR)、包含这样的CAR的免疫应答细胞,以及使用这样的 细胞用于治疗癌症(例如多发性骨髓瘤)的方法。
背景技术
基于细胞的免疫疗法是对治疗癌症具有治愈潜力的疗法。T细胞 和其它免疫细胞可以通过引入编码针对抗原的人工或合成受体的遗 传物质而被修饰为靶向肿瘤抗原,该受体称为嵌合抗原受体(CAR), 其对所选择的抗原具有特异性。使用CAR的靶向T细胞疗法已经显 示最近在治疗血液恶性肿瘤中获得临床成功。
多发性骨髓瘤(MM)是第二常见的血液恶性肿瘤死亡率(Siegel 等,CA:a cancerjournal for clinicians 63,11-30(2013))。约25%的患者 具有高危细胞遗传学,这预示小于2年的中值存活(Boyd等,Genes, chromosomes&cancer 50,765-774(2011);Shaughnessy等,Blood 109, 2276-2284(2007))。尽管最近已经取得了进展,但不管细胞遗传学如 何,在同种异体移植物的免疫治疗性移植对抗骨髓瘤(GvM)效果之 外,该疾病仍被认为是不能治愈的。然而,同种异体移植物因不合资 格(ineligibility)和高比例的移植相关的发病率和死亡率而受到限制 (Gahrton等,The New England journal of medicine325,1267-1273 (1991))。与GvM效果相似,可以通过自体过继性T细胞疗法以最小 的毒性实现潜在有疗效的T细胞效果。
骨髓瘤被认为是测试过继性T细胞疗法最理想的疾病。首先,同 种异体移植证明,T细胞可以是有疗效的治疗,即使比如在非清髓性 移植或移植后供体淋巴细胞输注之后同时伴随最小限度的化疗或不 伴随化疗。第二,条件化疗(conditioning chemotherapy)可能通过耗 竭调节性T细胞(Treg)的机制同样增强过继性T细胞疗法的效力 (Brentjens等,Blood 118,4817-4828(2011)和Pegram等,Blood 119, 4133-4141(2012)),即时的自体移植后期间可以是施用T细胞的最佳 时间,且骨髓瘤是其中自体干细胞移植是护理标准的少数疾病之一。 第三,免疫调节药物来那度胺可改善基于CAR的疗法,如已经在小 鼠中所显示的((Bertilaccio等,Blood 122,4171(2013)),且来那度胺 通常用于治疗MM。第四,当与实体瘤或髓外CLL(Brentjens等 (2011))相比时,过继性T细胞疗法在骨髓主导疾病比如ALL (Brentjens等,Science translational medicine 5,177ra138(2013); Davila等,Science translational medicine 6,224ra225(2014))中作用最 好,而与ALL类似,骨髓瘤是骨髓疾病。
尽管存在各种理由期望过继性T细胞疗法在MM中可能作用良 好,但将过继性T细胞疗法扩展到骨髓瘤引起了独特的挑战。与其它 B细胞恶性肿瘤不同,仅在2%的骨髓瘤患者中观察到CD19表达 (Bataille等,Haematologica 91,1234-1240(2006))。而且,与CD19不同,骨髓瘤中常见的细胞外免疫表型标志物(CD138、CD38和 CD56)均共表达于其它基本细胞类型上,而针对任意这些靶标的CAR 可导致不可接受的“脱靶效应(off tumor,ontarget)”毒性(Brentjens 等(2013)),这即使在抗体耐受较好的靶标中也可能是致命的,正如 HER2靶向的CAR的情况(Morgan等,Molecular therapy:the journal of theAmerican Society of Gene Therapy 18,843-851(2010))。因此,需 要新的治疗策略以设计靶向在MM细胞中高度表达而在正常组织中 限制性表达的抗原的CAR来治疗多发性骨髓瘤,该策略能够以最小 的毒性和免疫原性诱导有效的肿瘤根除。
发明内容
本发明公开的主题总体提供特异性靶向Fc受体样5(FcRL5)的 嵌合抗原受体(CAR)、包含这样的CAR的免疫应答细胞、以及这样 CAR和免疫应答细胞用于治疗多发性骨髓瘤的用途。
本发明公开的主题提供CAR。在一个非限制性实例中,CAR包 含细胞外抗原结合结构域、跨膜结构域和细胞内结构域,其中细胞外 抗原结合结构域与FcRL5特异性地结合。在某些实施方式中,细胞 外抗原结合结构域与FcRL5的结构域9结合。
在某些非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域是单链可变 片段(scFv)。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域是鼠scFv。 在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域是人scFv。在某些非限制 性实施方式中,细胞外抗原结合结构域是任选交联的Fab。在某些非 限制性实施方式中,细胞外结合结构域是F(ab)2。在某些非限制性实 施方式中,任意前述分子可以包含在具有异源序列的融合蛋白中以形 成细胞外抗原结合结构域。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构 域以约1x10-11M至约3x10-6M、1x10-10M至约3x10-6M或1x10-9 M至约3x10-6M的结合亲和力(Kd)与FcRL5特异性地结合。在某 些实施方式中,细胞外抗原结合结构域以约1x10-9M至约3x10-6M 的Kd与FcRL5的结构域8或9特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该 轻链可变区包含与选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、 SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ IDNO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917和SEQ ID NO:921的氨基酸序列至少80%、 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、 92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列, 其中细胞外抗原结合结构域结合FcRL5。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含重链可变区,该 重链可变区包含与选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:12、 SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ IDNO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ IDNO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ IDNO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915和SEQ ID NO:919的氨基酸序列至少80%、 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、 92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列, 其中细胞外抗原结合结构域结合FcRL5。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)包含与选 自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:71、SEQ IDNO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:95、SEQ IDNO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:139、SEQ IDNO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:183、SEQ IDNO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ ID NO:227、SEQ IDNO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:271、SEQ IDNO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917和SEQ ID NO:921的氨基酸序列至少80%、81%、82%、83%、 84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、 95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列的轻链可变区;和 (b)包含与选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:72、SEQ IDNO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:96、SEQ IDNO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:140、SEQ IDNO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:184、SEQ IDNO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:228、SEQ IDNO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:272、SEQ IDNO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915和SEQ ID NO:919的氨基酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、 92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列 的重链可变区,其中细胞外抗原结合结构域结合FcRL5。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该 轻链可变区包含选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、 SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ IDNO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917、SEQ ID NO:921及其保守性修饰的氨基酸 序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含重链可变区,该 重链可变区包含选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:12、 SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ IDNO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ IDNO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ IDNO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915、SEQ ID NO:919及其保守性修饰的氨基酸 序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含重链可变区,该 重链可变区包含具有SEQ ID NO:915所示序列的氨基酸。在某些实施 方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该轻链可变区具有 SEQ ID NO:917所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原 结合结构域包含重链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:919 所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含 轻链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:921所示序列的氨基 酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含重链可变区,该 重链可变区包含具有SEQ ID NO:144所示序列的氨基酸。在某些实施 方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该轻链可变区包含 具有SEQ ID NO:143所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域包含重链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:216所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:215所示序 列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含重链可 变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:220所示序列的氨基酸。在 某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该轻链可 变区包含具有SEQ ID NO:219所示序列的氨基酸。在某些实施方式 中,细胞外抗原结合结构域包含重链可变区,该重链可变区包含具有 SEQ ID NO:236所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原 结合结构域包含轻链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ IDNO:235 所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含 重链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:268所示序列的氨基 酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可变区,该 轻链可变区包含具有SEQ ID NO:267所示序列的氨基酸。在某些实施 方式中,细胞外抗原结合结构域包含重链可变区,该重链可变区包含 具有SEQ ID NO:116所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域包含轻链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:115所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结 构域包含重链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:172所示序 列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含轻链可 变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:171所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)轻链可变 区,其包含选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ IDNO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917、SEQ ID NO:921及其保守性修饰的氨基酸 序列;和(b)重链可变区,其包含选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、 SEQ IDNO:12、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ IDNO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ IDNO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ IDNO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915、SEQ ID NO:919及其保 守性修饰的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区,其包含具有SEQ ID NO:915所示序列的氨基酸;和(b)轻链可 变区,其包含具有SEQ ID NO:917所示序列的氨基酸。在某些实施方 式中,细胞外抗原结合结构域包含细胞外抗原结合结构域包含:(a) 重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:919所示序列的氨基酸;和(b) 轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:921所示序列的氨基酸。在某些 实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含 具有SEQ ID NO:144所示序列的氨基酸;和(b)轻链可变区,其包 含具有SEQ ID NO:143所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞 外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:216 所示序列的氨基酸;和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:215 所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含: (a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:220所示序列的氨基酸; 和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:219所示序列的氨基酸。 在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区, 其包含具有SEQ ID NO:236所示序列的氨基酸;和(b)轻链可变区, 其包含具有SEQ ID NO:235所示序列的氨基酸。在某些实施方式中, 细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:268所示序列的氨基酸;和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:267所示序列的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结 构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:116所示序列的 氨基酸;和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:115所示序列 的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重 链可变区,其包含具有SEQ ID NO:172所示序列的氨基酸;和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:171所示序列的氨基酸。
在某些非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域同时包含所 述重链和轻链,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有接头序列, 例如接头肽。例如,在某些非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结 构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:915所示序列的 氨基酸,和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:917所示序列 的氨基酸,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(c)接头序列, 例如接头肽。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a) 重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:919所示序列的氨基酸,和(b) 轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:92所示序列的氨基酸,任选在 重链可变区与轻链可变区之间具有(c)接头序列,例如接头肽。在 某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其 包含具有SEQ ID NO:144所示序列的氨基酸,和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:143所示序列的氨基酸,任选在重链可变区与 轻链可变区之间具有(c)接头序列,例如接头肽。在某些实施方式 中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:216所示序列的氨基酸,和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ IDNO:215所示序列的氨基酸,任选在重链可变区与轻链可变区之间 具有(c)接头序列,例如接头肽。在某些实施方式中,细胞外抗原 结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQID NO:220所示 序列的氨基酸,和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:219所 示序列的氨基酸,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(c)接 头序列,例如接头肽。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包 含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:236所示序列的氨基酸, 和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:235所示序列的氨基酸, 任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(c)接头序列,例如接头 肽。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区,其包含具有SEQ ID NO:268所示序列的氨基酸,和(b)轻链可 变区,其包含具有SEQ ID NO:267所示序列的氨基酸,任选在重链可 变区与轻链可变区之间具有(c)接头序列,例如接头肽。在某些实 施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含具 有SEQ ID NO:116所示序列的氨基酸,和(b)轻链可变区,其包含 具有SEQ ID NO:115所示序列的氨基酸,任选在重链可变区与轻链可 变区之间具有(c)接头序列,例如接头肽。在某些实施方式中,细 胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:172所示序列的氨基酸,和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ IDNO:171所示序列的氨基酸,任选在重链可变区与轻链可变区之间具 有(c)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR3,其包含选自SEQ ID NO:311、317、323、328、334、337、 342、347、351、356、362、368、374、376、380、384、389、394、 396、400、405、408、412、415、422、427、432、437、442、446、451、453、456、458、459、463、464、467、473、476、482、486、 489、492、494、497、502、507、512、517、522、527、529、532、536、539、543、546、550、553、555、561、567、570、574、577、 578、579、584、578、587、591、925和931的氨基酸序列;和(b) 轻链可变区CDR3,其包含选自SEQ ID NO:314、320、325、331、339、345、350、353、359、365、371、377、383、386、392、395、 399、402、407、410、414、418、419、424、430、435、439、443、 449、452、455、457、462、465、470、479、485、488、491、493、 495、499、505、509、514、519、524、528、530、531、535、541、 542、545、549、554、558、564、569、573、576、581、592、928 和934的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含选自SEQ ID NO:309、315、321、326、332、335、 340、346、354、360、366、372、378、387、393、403、411、420、 425、436、440、444、471、480、500、510、515、520、525、537、 551、559、565、582、589、923和929的氨基酸序列;(b)重链可 变区CDR2,其包含选自SEQ ID NO:310、316、322、327、333、336、 341、355、361、367、373、379、388、404、412、421、426、431、 441、445、450、466、472、475、481、496、501、506、511、516、 521、526、538、552、560、566、583、590、924和930的氨基酸序 列;(c)重链可变区CDR3,其包含选自SEQ ID NO:311、317、323、 328、334、337、342、347、351、356、362、368、374、376、380、 384、389、394、396、400、405、408、412、415、422、427、432、 437、442、446、451、453、456、458、459、463、464、467、473、 476、482、486、489、492、494、497、502、507、512、517、522、 527、529、532、536、539、543、546、550、553、555、561、567、 570、574、577、578、579、584、578、587、591、925和931的氨 基酸序列;(d)轻链可变区CDR1,其包含选自SEQ ID NO:312、318、 324、329、338、343、348、352、357、363、369、381、390、397、 401、406、416、423、428、433、447、460、468、474、477、483、490、498、503、508、518、533、540、544、547、556、562、568、 571、580、585、588、926和932的氨基酸序列;(e)轻链可变区CDR2, 其包含选自SEQ ID NO:313、319、330、344、349、358、364、370、 382、385、391、398、409、417、429、434、438、448、454、461、 469、478、484、487、504、513、523、534、429、448、548、557、 563、572、575、586、927和933的氨基酸序列;以及(f)轻链可变 区CDR3,其包含选自SEQ ID NO:314、320、325、331、339、345、 350、353、359、365、371、377、383、386、392、395、399、402、 407、410、414、418、419、424、430、435、439、443、449、452、 455、457、462、465、470、479、485、488、491、493、495、499、 505、509、514、519、524、528、530、531、535、541、542、545、 549、554、558、564、569、573、576、581、592、928和934的氨 基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:923所示序列或其保守性修饰的氨 基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:924所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;和(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:925所示序列或其保守性修饰的氨基酸。在某些实施方式 中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含具 有SEQ ID NO:926所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(b)轻链可变 区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:927所示序列或其保守性修饰的氨基酸;和(c)轻链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:928所示 序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:929所示序列或其保守性修饰的氨 基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:930所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;和(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:931所示序列或其保守性修饰的氨基酸。在某些实施方式 中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含具 有SEQ ID NO:932所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(b)轻链可变 区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:933所示序列或其保守性修饰的氨基酸;和(c)轻链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:934所示 序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:923所示序列或其保守性修饰的氨 基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:924所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQID NO:925所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(d)轻链可变区 CDR1,其包含具有SEQ IDNO:926所示序列或其保守性修饰的氨基 酸;(e)轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:927所示序列或 其保守性修饰的氨基酸;以及(f)轻链可变区CDR3,其包含具有 SEQ IDNO:928所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:929所示序列或其保守性修饰的氨 基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:930所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQID NO:931所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(d)轻链可变区 CDR1,其包含具有SEQ IDNO:932所示序列或其保守性修饰的氨基 酸;(e)轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:933所示序列或 其保守性修饰的氨基酸;和(f)轻链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:934所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:463的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:318的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:515的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:516的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:517的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:318的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合包含:(a)重链可变区CDR1, 其包含SEQ IDNO:403的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)重链可变 区CDR2,其包含SEQ ID NO:404的氨基酸序列或其保守性修饰;(c) 重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:532的氨基酸序列或其保守性 修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:533的氨基酸序列 或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:534的 氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3,其包含 SEQ ID NO:535的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:543的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:544的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:448的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:545的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:372的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:475的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:570的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:571的 氨基酸序列;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:572的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:573的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:440的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:441的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:442的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:329的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:330的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:443的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:309的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:310的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:489的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:490的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:313的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含具有 SEQ ID NO:664所示序列或其保守性修饰的氨基酸。在某些实施方式 中,细胞外抗原结合结构域包含具有SEQ ID NO:700所示序列或其保 守性修饰的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含 具有SEQ ID NO:702所示序列或其保守性修饰的氨基酸。在某些实施 方式中,细胞外抗原结合结构域包含具有SEQ ID NO:710所示序列或 其保守性修饰的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域 包含具有SEQ ID NO:726所示序列或其保守性修饰的氨基酸。在某些 实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含具有SEQ ID NO:650所示序 列或其保守性修饰的氨基酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结 构域包含具有SEQ IDNO:678所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a) 重链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:923所示序列或其保守性 修饰的氨基酸;重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:924所示 序列或其保守性修饰的氨基酸;和重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:925所示序列或其保守性修饰的氨基酸;以及(ii)轻链 可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:926所示序列或其保守性修饰 的氨基酸;轻链可变区CDR2,其包含具有SEQID NO:927所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;和轻链可变区CDR3,其包含具有SEQ IDNO:928所示序列或其保守性修饰的氨基酸,任选在重链可变区与轻 链可变区之间具有(iii)接头序列,例如接头肽。
在另一个非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(i) 重链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:929所示序列或其保守性 修饰的氨基酸;重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:930所示 序列或其保守性修饰的氨基酸;和重链可变区CDR3,其包含具有 SEQ ID NO:931所示序列或其保守性修饰的氨基酸;以及(ii)轻链 可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:932所示序列或其保守性修饰 的氨基酸;轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:933所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;和轻链可变区CDR3,其包含具有SEQID NO:934所示序列或其保守性修饰的氨基酸,任选在重链可变区与轻 链可变区之间具有(iii)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:463的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:318的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列或其保守性修饰,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:515的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:516的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:517的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:318的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列或其保守性修饰,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合包含:(a)重链可变区CDR1, 其包含SEQ IDNO:403的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)重链可变 区CDR2,其包含SEQ ID NO:404的氨基酸序列或其保守性修饰;(c) 重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:532的氨基酸序列或其保守性 修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:533的氨基酸序列 或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:534的 氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3,其包含 SEQ ID NO:535的氨基酸序列,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:543的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:544的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:448的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:545的氨基酸序列或其保守性修饰,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:372的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:475的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:570的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:571的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:572的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:573的氨基酸序列或其保守性修饰,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:440的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:441的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:442的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:329的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:330的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:443的氨基酸序列或其保守性修饰,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)重链可变 区CDR1,其包含SEQ ID NO:309的氨基酸序列或其保守性修饰;(b) 重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:310的氨基酸序列或其保守性 修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:489的氨基酸序列 或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:490的 氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:313的氨基酸序列或其保守性修饰;以及(f)轻链可变区CDR3, 其包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列或其保守性修饰,任选在重链可变区与轻链可变区之间具有(g)接头序列,例如接头肽。
在某些实施方式中,接头肽包含选自SEQ ID NO:307和SEQ ID NO:897的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域与包含SEQ ID NO:899所示的氨基酸序列的FcRL5结合。在某些实施方式中,细胞 外抗原结合结构域与包含SEQ ID NO:964所示的氨基酸序列的表位 结合。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域与包含SEQ ID NO:965所示的氨基酸序列的表位结合。
根据本发明公开的主题,细胞外抗原结合结构域与跨膜结构域共 价接合。细胞外抗原结合结构域可以包含与细胞外抗原结合结构域的5’端共价接合的信号肽。某些实施方式中,CAR的跨膜结构域包含 CD8多肽、CD28多肽、CD3ζ多肽、CD4多肽、4-1BB多肽、OX40 多肽、ICOS多肽、CTLA-4多肽、PD-1多肽、LAG-3多肽、2B4多 肽、BTLA多肽、合成肽(不基于与免疫应答相关的蛋白)、或其组 合。在非限制性实施方式中,跨膜结构域包含CD8多肽。在某些实 施方式中,跨膜结构域包含CD28多肽。
根据本发明公开的主题,在某些实施方式中,细胞内结构域包含 CD3ζ多肽。在某些实施方式中,细胞内结构域还包含至少一个信号 传导区。在某些实施方式中,该至少一个信号传导区包含CD28多肽、 4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、DAP-10多肽、PD-1多肽、CTLA-4多肽、LAG-3多肽、2B4多肽、BTLA多肽、合成肽(不基 于与免疫应答相关的蛋白)、或其组合。在某些实施方式中,信号传 导区是共刺激信号传导区。在某些实施方式中,共刺激信号传导区包 含CD28多肽、4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、DAP-10多肽、 或其组合。在某些实施方式中,至少一个共刺激信号传导区包含CD28 多肽。在某些非限制性实施方式中,跨膜结构域包含CD28多肽,细 胞内结构域包含CD3ζ多肽,且共刺激信号传导结构域包含CD28多 肽。在某些非限制性实施方式中,跨膜结构域包含CD8多肽,细胞 内结构域包含CD3ζ多肽,且共刺激信号传导结构域包含4-1BB多肽。
在某些实施方式中,CAR是重组表达的。CAR可以由载体表达。 在某些实施方式中,载体是γ-逆转录病毒载体。
本发明公开的主题还提供分离的免疫应答细胞,其包含上述 CAR。在某些实施方式中,分离的免疫应答细胞转导有CAR,例如, CAR组成型表达于免疫应答细胞的表面。在某些实施方式中,分离 的免疫应答细胞还转导有至少一种共刺激配体,使得免疫应答细胞表达该至少一种共刺激配体。在某些实施方式中,该至少一种共刺激配 体选自4-1BBL、CD80、CD86、CD70、OX40L、CD48、TNFRSF14、 及其组合。在某些实施方式中,分离的免疫应答细胞还转导有至少一 种细胞因子,使得免疫应答细胞分泌该至少一种细胞因子。在某些实 施方式中,该至少一种细胞因子选自IL-2、IL-3、IL-6、IL-7、IL-11、IL-12、IL-15、IL-17、IL-21、及其组合。在某些实施方式中,分离的 免疫应答细胞选自T细胞、自然杀伤(NK)细胞、细胞毒性T淋巴 细胞(CTL)、调节性T细胞、人胚胎干细胞、淋巴样祖细胞、T细 胞-前体细胞和可分化成淋巴样细胞的多能干细胞。在某些实施方式 中,免疫应答细胞是T细胞。
本发明公开的主题还提供编码本发明公开的CAR的核酸分子、 包含核酸分子的载体、以及表达这样的核酸分子的宿主细胞。在某些 实施方式中,核酸分子包含具有SEQ IDNO:951所示序列的核酸。在 某些实施方式中,核酸分子包含具有SEQ ID NO:952所示序列的核 酸。在某些实施方式中,载体是γ-逆转录病毒载体。在某些实施方式 中,宿主细胞是T细胞。
另外,本发明公开的主题提供使用上述免疫应答细胞用于减少受 试者中的肿瘤负荷的方法。例如,本发明公开的主题提供减少受试者 中的肿瘤负荷的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的本发明 公开的免疫应答细胞,从而诱导受试者中的肿瘤细胞死亡。在某些实 施方式中,该方法减少肿瘤细胞的数量。在另一实施方式中,该方法 减小肿瘤尺寸。在又一实施方式中,该方法根除受试者中的肿瘤。在 某些实施方式中,肿瘤选自多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤(尤其是 套细胞)、霍奇金淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴细 胞白血病(ALL)、毛细胞白血病、伯基特淋巴瘤(Burketts Lymphoma)和瓦氏巨球蛋白血症(Waldenstrom’s Macroglobulinemia)。在某些实 施方式中,肿瘤是多发性骨髓瘤。在某些实施方式中,受试者是人。 在某些实施方式中,免疫应答细胞是T细胞。
另外,本发明公开的主题提供使用上述免疫应答细胞用于增加或 延长患有瘤形成的受试者的存活的方法。例如,本发明公开的主题提 供增加或延长患有瘤形成的受试者的存活的方法,其中该方法包括向 受试者施用有效量的本发明公开的免疫应答细胞,从而增加或延长受 试者的存活。在某些实施方式中,瘤形成选自多发性骨髓瘤、非霍奇 金淋巴瘤(尤其是套细胞)、霍奇金淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病 (CLL)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、毛细胞白血病、伯基特淋巴 瘤和瓦氏巨球蛋白血症。在某些实施方式中,瘤形成是多发性骨髓瘤。 在某些实施方式中,该方法减少或根除受试者中的肿瘤负荷。
本发明公开的主题还提供用于产生与Fc受体样5(FcRL5)例如 FcRL5的结构域9结合的免疫应答细胞的方法。在一个非限制性实例 中,该方法包括向免疫应答细胞中引入编码嵌合抗原受体(CAR)的 核酸序列,该嵌合抗原受体(CAR)包含细胞外抗原结合结构域、跨膜结构域和细胞内结构域,其中细胞外抗原结合结构域与Fc受体样 5(FcRL5)特异性地结合。在特定的非限制性实施方式中,细胞外 抗原结合结构域是scFv。
本发明公开的主题还提供药物组合物,其包含有效量的本发明公 开的免疫应答细胞和药学上可接受的赋形剂。在某些实施方式中,药 物组合物用于治疗瘤形成。在某些实施方式中,瘤形成选自多发性骨 髓瘤、非霍奇金淋巴瘤(尤其是套细胞)、霍奇金淋巴瘤、慢性淋巴 细胞白血病(CLL)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、毛细胞白血病、 伯基特淋巴瘤和瓦氏巨球蛋白血症。在某些实施方式中,瘤形成是多 发性骨髓瘤。
本发明公开的主题还提供用于治疗瘤形成的试剂盒,其包含本发 明公开的免疫应答细胞。在某些实施方式中,试剂盒还包含使用免疫 应答细胞治疗瘤形成的书面说明书。在某些实施方式中,瘤形成选自 多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤(尤其是套细胞)、霍奇金淋巴瘤、 慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、毛细胞 白血病、伯基特淋巴瘤和瓦氏巨球蛋白血症。在某些实施方式中,瘤 形成是多发性骨髓瘤。
附图说明
可以结合附图理解以下以实例方式给出的具体实施方式,但并不 意在将本发明局限于所描述的具体的实施方式。
图1示出各种正常组织和人癌细胞系中的FcRL5表达。
图2示出使用表达FcRL5或FcRL1、2、3、4或6的3T3细胞进 行抗-FcRL5 scFv的筛选。
图3A-D:(A)表示FcRL5的结构域和FcRL5的可溶形式、糖 基磷脂酰肌醇(GPI)锚定形式和跨膜形式。(B)表示用于表达FcRL5 的缺少结构域9的突变形式(在本文中也称作FcRL5Δdom9)的载体。 (C)全长FcRL5和缺少结构域9的FcRL5形式的核苷酸序列。(D) 表示全长FcRL5和FcRL5的缺失结构域9的突变形式(在本文中也 称作“FcRL5Δdom9”)的核苷酸序列中的差异。
图4示出在表达FcRL5Δdom9的3T3细胞上进行的抗-FcRL5 scFv ET200-39筛选。
图5示出在表达FcRL5Δdom9的3T3细胞上进行的抗-FcRL5 scFv ET200-104筛选。
图6示出在表达FcRL5Δdom9的3T3细胞上进行的抗-FcRL5 scFv ET200-105筛选。
图7示出在表达FcRL5Δdom9的3T3细胞上进行的抗-FcRL5 scFv ET200-109筛选。
图8示出在表达FcRL5Δdom9的3T3细胞上进行的抗-FcRL5 scFv ET200-117筛选。
图9A-B:根据本发明公开的主题的非限制性实施方式的靶向 FcRL5的嵌合抗原受体的图示。(A)具有CD28共刺激结构域和CD3ζ 的FcRL5靶向的CAR的图示。(B)具有4-1BB共刺激结构域和CD3ζ 的FcRL5靶向的CAR的图示。
图10示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-31靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图11示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-39靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图12示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-69靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图13示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-104靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图14示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-105靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图15示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-109靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图16示出根据本发明公开的主题的一个非限制性实施方式的使 用scFV ET200-117靶向FcRL5的嵌合抗原受体的载体图。
图17示出FcRL5靶向的嵌合抗原受体在经转导T细胞表面上的 表达。
图18示出FcRL5靶向的嵌合抗原受体T细胞对表达FcRL5的细 胞的细胞毒性。
图19示出对FcRL5靶向的嵌合抗原受体T细胞的细胞因子分泌 的诱导。
图20示出在抗原刺激时FcRL5靶向的嵌合抗原受体T细胞的增 殖。
图21示出CLIPS技术。CLIPS反应发生在CLIPS骨架的溴基团 和半胱氨酸的巯基侧链之间。反应在温和条件下快速且特异性进行。 使用此精妙化学,将天然蛋白质序列转化成具有一系列结构的CLIPS 构建体。从左至右:两个不同的单T2环、T3双环、共轭T2+T3环、稳定的β片层和稳定的α螺旋(Timmerman等,J.Mol.Recognit.2007; 20:283-29)。
图22示出组合CLIPS文库筛选。含有不连续构象表位的靶蛋白 (左)转化为矩阵文库(中间)。组合肽在专用小卡上合成并化学作 用转化成空间限定的CLIPS构建体(右)。
图23示出带T3环的CLIPSTM构建体。
图24A-D示出热度图技术。示出热度图技术。(A)组合肽的表 格,有两个表示为“环1”和“环2”的子序列。(B)展示为矩阵的 A的数据。(C)热度图表示法的彩条指示。(D)来自A的数据的热 度图可视化。
图25示出针对赫塞汀记录的数据的热度图分析。
图26示出对于ET200-104记录的数据的热度图分析。
图27示出具有突出显示的肽段657SRPILTFRAPR667的FcRL55的 氨基酸残基380-731的3D模型。
具体实施方式
本发明公开的主题总体提供FcRL5靶向的嵌合抗原受体(CAR)。 在一个非限制性实例中,CAR包含细胞外抗原结合结构域、跨膜结 构域和细胞内结构域,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5特异性 地结合。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域与FcRL5的结构域7、8或9特异性地结合。本发明公开的主题还提供表达FcRL5 靶向的CAR的免疫应答细胞(例如T细胞、自然杀伤(NK)细胞、 细胞毒性T淋巴细胞(CTL)、调节性T细胞、人胚胎干细胞、淋巴 样祖细胞、T细胞-前体细胞和可分化成淋巴样细胞的多能干细胞)、 以及使用这样的免疫应答细胞用于治疗肿瘤例如多发性骨髓瘤的方 法。
一.定义
除非另有定义,本文使用的所有技术和科学术语具有本发明所属 领域的技术人员通常理解的含义。以下参考文献为本领域技术人员提 供本发明中使用的许多术语的一般定义:Singleton等,Dictionary of Microbiology and Molecular Biology(第二版,1994);The Cambridge Dictionary of Science and Technology(Walker编,1988);TheGlossary of Genetics,第五版,R.Rieger等(编),Springer Verlag(1991);和 Hale&Marham,The Harper Collins Dictionary of Biology(1991)。除 非另有说明,本文使用的以下术语具有下文给出的含义。
本文使用的术语“约”或“大约”是指在由本领域普通技术人员 确定的特定值的可接受误差范围内,这将部分地取决于如何测量或确 定该值,即测量系统的局限性。例如,根据本领域的惯例,“约”可 以指在3个或多于3个标准偏差内。或者,“约”可以表示给定值的至多20%、优选至多10%、更优选至多5%、再更优选至多1%的范 围。或者,特别是关于生物系统或过程,该术语可以表示在数值的一 个数量级内、优选在5倍以内、更优选在2倍以内。
本文使用的术语“细胞群体”是指表达相似或不同表型的至少两 种细胞的组。在非限制性实例中,细胞群体可以包括至少约10个、 至少约100个、至少约200个、至少约300个、至少约400个、至少 约500个、至少约600个、至少约700个、至少约800个、至少约 900个、至少约1000个表达相似或不同表型的细胞。
本文使用的术语“抗体”不仅指完整的抗体分子,而且指保留免 疫原结合能力的抗体分子片段。这样的片段在本领域中也是众所周知 的,并且在体外和体内常规使用。因此,本文使用的术语“抗体”不 仅指完整的免疫球蛋白分子,而且指众所周知的活性片段F(ab’)2和 Fab。缺少完整抗体的Fc片段的F(ab’)2和Fab片段,更快地从循环 中清除,并且可能具有更少的完整抗体的非特异性组织结合(Wahl 等,J.Nucl.Med.24:316-325(1983))。本发明的抗体包括完整天然 抗体、双特异性抗体;嵌合抗体;Fab、Fab’、单链V区片段(scFv)、 融合多肽和非常规抗体。
本文使用的术语“单链可变片段”或“scFv”是免疫球蛋白(例 如小鼠或人)的重链(VH)和轻链(VL)的可变区的融合蛋白,其 共价连接形成VH::VL异源二聚体。重链(VH)和轻链(VL)直接连 接或通过肽编码接头(例如,10、15、20、25个氨基酸)连接,其 将VH的N末端与VL的C-末端连接或将VH的C末端与VL的N末端 连接。接头通常出于柔性而富含甘氨酸,以及出于溶解性而富含丝氨 酸或苏氨酸。接头可以连接细胞外抗原结合结构域的重链可变区和轻 链可变区。接头的非限制性实例公开于Shen等,Anal.Chem. 80(6):1910-1917(2008)和WO 2014/087010,其全部内容并入本文以供 参考。在某些实施方式中,接头是G4S接头。
在一个非限制性实例中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:897所示序列的氨基酸。
GGGGSGGGGSGGGGS[SEQ ID NO:897]。在某些实施方式中, 编码SEQ ID NO:897的氨基酸序列的核酸序列在如下所提供的SEQ ID NO:898中示出:
Figure BDA0003882604390000271
在另一个非限制性实例中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:307所示序列的氨基酸:
SRGGGGSGGGGSGGGGSLEMA[SEQ ID NO:307]。在某些实施方 式中,编码SEQ ID NO:307的氨基酸序列的核酸序列在如下所提供的 SEQ ID NO:305中示出:
Figure BDA0003882604390000281
尽管去除了恒定区并引入了接头,scFv蛋白保留了原始免疫球蛋 白的特异性。单链Fv多肽抗体可以由包含VH和VL编码序列的核酸 表达,如Huston等所述(Proc.Nat.Acad.Sci.USA,85:5879-5883, 1988)。还可参见美国专利号5,091,513、5,132,405和4,956,778;以 及美国专利公开号20050196754和20050196754。具有抑制活性的拮抗性scFv已有描述(参见,例如,Zhao等,Hyrbidoma(Larchmt)2008 27(6):455-51;Peter等,J Cachexia Sarcopenia Muscle 2012年8月 12日;Shieh等,J Imunol 2009 183(4):2277-85;Giomarelli等,Thromb Haemost 2007 97(6):955-63;Fife等,J Clin Invst2006 116(8):2252-61; Brocks等,Immunotechnology 1997 3(3):173-84;Moosmayer等,Ther Immunol 1995 2(10:31-40)。具有刺激活性的激动性scFv已有描述(参 见,例如,Peter等,J Bioi Chern 2003 25278(38):36740-7;Xie等, Nat Biotech 1997 15(8):768-71;Ledbetter等,Crit Rev Immunol 1997 17(5-6):427-55;Ho等,BioChim BiophysActa 2003 1638(3):257-66)。
本文使用的“F(ab)”是指结合抗原但是是单价的并且不具有Fc 部分的抗体结构的片段,例如,由木瓜蛋白酶消化的抗体产生两个 F(ab)片段和一个Fc片段(例如,重(H)链恒定区;不结合抗原的 Fc区)。
本文使用的“F(ab’)2”是指由胃蛋白酶消化完整IgG抗体产生的 抗体片段,其中该片段具有两个抗原结合(ab’)(二价)区,其中每个 (ab’)区包含两条分开的氨基酸链,H链的一部分通过S-S键与轻(L) 链连接用于结合抗原,其中H链的剩余部分连接在一起。“F(ab’)2” 片段可以分裂成两个单独的Fab’片段。
本文使用的术语“载体”是指任何遗传元件,比如质粒、噬菌体、 转座子、粘粒、染色体、病毒、病毒粒子等,其当关联有适当的控制 元件时能够复制,并且其可以将基因序列转移到细胞中。因此,该术 语包括克隆和表达载体,以及病毒载体和质粒载体。
本文使用的术语“表达载体”是指一种重组核酸序列,即重组 DNA分子,其含有期望编码序列和在特定宿主生物体中表达可操作 连接的编码序列所必需的适当的核酸序列。用于在原核生物中表达所 必需的核酸序列通常包括启动子、操纵子(可选的)和核糖体结合位 点,通常伴随其它序列。已知真核细胞利用启动子、增强子和终止子 及聚腺苷酸化信号。
本文使用的“CDR”定义为抗体的氨基酸序列的互补决定区,其 为免疫球蛋白重链和轻链的高变区。参见例如Kabat等,Sequences of Proteins of ImmunologicalInterest,4th U.S.Department of Health and Human Services,National Institutesof Health(1987)。通常,抗体在可 变区包含三条重链和三条轻链CDR或CDR区。CDR提供用于将抗 体与抗原或表位结合的大多数接触残基。在某些实施方式中,使用 Kabat系统(Kabat,E.A.,等(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第五版,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242))划分CDR区。
本文使用的术语“亲和力(affinity)”是指结合强度的量度。不 受理论的束缚,亲和力取决于抗体结合位点和抗原决定簇之间的立体 化学配合的紧密程度、它们之间接触区域的大小以及带电和疏水基团 的分布。亲和力还包括术语“亲合力(avidity)”,其是指形成可逆复 合物后抗原-抗体键的强度。用于计算抗体对抗原的亲和力的方法在 本领域是已知的,包括使用结合实验来计算亲和力。功能试验(例如, 流式细胞术试验)中的抗体活性也反映抗体亲和力。可以使用功能试 验(例如,流式细胞术试验)对抗体进行表型鉴定并比较亲和力。
本发明的方法中有用的核酸分子包括任何编码本发明多肽或其 片段的核酸分子。这样的核酸分子不需要与内源核酸序列100%相同, 但通常表现出基本同一性。与内源序列具有“基本同一性”的多核苷 酸通常能够与双链核酸分子的至少一条链杂交。“杂交”是指在各种 严格条件下,在互补多核苷酸序列(例如,本文所述的基因)或其部 分之间配对以形成双链分子。(参见,例如,Wahl,G.M.和S.L.Berger (1987)Methods Enzymol,152:399;Kimmel,A.R.(1987)Methods Enzymol,152:507)。
例如,严格的盐浓度通常小于约750mM NaCl和75mM柠檬酸 三钠、优选小于约500mM NaCl和50mM柠檬酸三钠、更优选小于 约250mM NaCl和25mM柠檬酸三钠。低严格杂交可以在不存在有 机溶剂例如甲酰胺的情况下获得,而高严格杂交可以在至少约35% 甲酰胺、更优选至少约50%甲酰胺的存在下获得。严格温度条件通 常包括至少约30℃、更优选至少约37℃、最优选至少约42℃的温度。 改变其它参数,例如杂交时间、洗涤剂例如十二烷基硫酸钠(SDS) 的浓度、以及载体DNA的包含或排除,对本领域技术人员来说是熟 知的。通过根据需要组合这些不同条件来实现各种严格的水平。在优 选的实施方式中,杂交将在30℃下在750mM NaCl、75mM柠檬酸 三钠和1%SDS中发生。在更优选的实施方式中,杂交将在37℃下在 500mM NaCl、50mM柠檬酸三钠、1%SDS、35%甲酰胺和100μg/ml 变性鲑鱼精子DNA(ssDNA)中发生。在最优选的实施方式中,杂 交将在42℃下在250mM NaCl、25mM柠檬酸三钠、1%SDS、50% 甲酰胺和200μg/ml ssDNA中发生。这些条件的可用变化对于本领域 技术人员将是显而易见的。
对于大多数应用,杂交后的洗涤步骤也将在严格性上变化。洗涤 严格性条件可以通过盐浓度和温度来定义。如上文,可以通过降低盐 浓度或通过升高温度来提高洗涤严格性。例如,洗涤步骤的严格的盐 浓度优选小于约30mM NaCl和3mM柠檬酸三钠、最优选小于约15 mM NaCl和1.5mM柠檬酸三钠。洗涤步骤的严格温度条件通常包括 至少约25℃、更优选至少约42℃、甚至更优选至少约68℃的温度。 在优选的实施方式中,洗涤步骤将在25℃下在30mM NaCl、3mM 柠檬酸三钠和0.1%SDS中发生。在更优选的实施方式中,洗涤步骤 将在42℃下在15mM NaCl、1.5mM柠檬酸三钠和0.1%SDS中发 生。在更优选的实施方式中,洗涤步骤将在68℃下在15mM NaCl、 1.5mM柠檬酸三钠和0.1%SDS中发生。这些条件的另外的变化对 于本领域技术人员将是显而易见的。杂交技术是本领域技术人员熟知 的,并且描述于例如Benton和Davis(Science 196:180,1977); Grunstein和Rogness(Proc.Natl.Acad.Sci.,USA 72:3961,1975);Ausubel等(Current Protocols inMolecular Biology,Wiley Interscience, New York,2001);Berger和Kimmel(Guide toMolecular Cloning Techniques,1987,Academic Press,New York);和Sambrook等,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,NewYork。
“基本同一性”是指与参照氨基酸序列(例如,本文所述的任何 一种氨基酸序列)或核酸序列(例如,本文所述的任何一种核酸序列) 表现出至少50%同一性的多肽或核酸分子。优选地,这样的序列在 氨基酸水平或核酸与用于比较的序列至少60%、更优选80%或85%、 更优选90%、95%或甚至99%相同。
序列同一性通常使用序列分析软件(例如,Sequence Analysis SoftwarePackage of the Genetics Computer Group,University of Wisconsin BiotechnologyCenter,1710University Avenue,Madison, Wis.53705、BLAST、BESTFIT、GAP或PILEUP/PRETTYBOX程序) 衡量。这样的软件通过对各种取代、缺失和/或其它修饰指定同源性 程度来匹配相同或相似的序列。在确定同一性程度的示例性方法中, 可以使用BLAST程序,e-3和e-100之间的概率得分表示密切相关的 序列。
本文使用的术语“类似物”是指结构相关的多肽或核酸分子,其 具有参照多肽或核酸分子的功能。
本文使用的术语“配体”是指结合受体的分子。特别地,配体结 合另一个细胞上的受体,允许细胞到细胞的识别和/或相互作用。
本文使用的术语“疾病”是指破坏或干扰细胞、组织或器官的正 常功能的任何病症或障碍。疾病的实例包括瘤形成或细胞的病原体感 染。
本文使用的术语“有效量”是指足以具有治疗效果的量。在某些 实施方式中,“有效量”是足以阻止、改善或抑制瘤形成的持续增殖、 生长或转移(例如,侵袭或迁移)的量。
本文使用的术语“异源核酸分子或多肽”是指并非正常存在于细 胞中或由细胞获得的样品中的核酸分子(例如,cDNA、DNA或RNA 分子)或多肽。该核酸可以来自另一生物体,或者其可以是例如细胞 或样品中并非正常表达的mRNA分子。
本文使用的术语“免疫应答细胞”是指在免疫应答中起作用的细 胞、或其祖细胞、或其子代。
本文使用的术语“调节”是指正或负地改变。示例性调节包括约 1%、约2%、约5%、约10%、约25%、约50%、约75%或约100% 的变化。
本文使用的术语“增加”是指正向地改变至少约5%,包括但不 限于正向地改变5%、约10%、约25%、约30%、约50%、约75% 或约100%。
本文使用的术语“减少”是指负向地改变至少约5%,包括但不 限于负向地改变约5%、约10%、约25%、约30%、约50%、约75% 或约100%。
本文使用的术语“分离的细胞”是指与天然伴随细胞的分子和/ 或细胞组分分离的细胞。
本文使用的术语“分离的”、“纯化的”或“生物纯的”是指不同 程度地游离于在其天然状态中发现的正常伴随的组分之外的物质。 “分离”表示从原始来源或环境分开的程度。“纯化”表示比分离更 高的分开程度。“纯化的”或“生物纯的”蛋白质与其它物质充分分离,使得任何杂质不会实质上影响蛋白质的生物学性质或引起其他不 良后果。也就是说,如果本发明的核酸或肽在通过重组DNA技术产 生时基本上不含细胞物质、病毒物质或培养基,或化学合成时基本上 不含化学前体或其它化学品,则其是纯化的。纯度和均一性通常使用 分析化学技术、例如聚丙烯酰胺凝胶电泳或高效液相色谱法测定。术 语“纯化的”可以表示核酸或蛋白质在电泳凝胶中产生基本上一条带。 对于可以进行修饰(例如磷酸化或糖基化)的蛋白质,不同的修饰可 以产生不同的分离的蛋白质,其可以单独纯化。
本文使用的术语“分泌的”是指多肽通过内质网、高尔基体的分 泌通路从细胞中释放,以及作为在细胞质膜瞬时融合的囊泡将蛋白质 释放到细胞外。
本文使用的术语“特异性地结合”或“特异性地结合到”或“特 异性靶向”是指多肽或其片段识别并结合目的生物分子(例如多肽), 但其基本上不识别结合样品中的其他分子,例如天然地包括本发明多 肽的生物样品中的其他分子。
本文使用的术语“治疗(treating、treatment)”是指试图改变所 治疗的个体或细胞的疾病过程的临床干预,并且可以用于预防,或在 临床病理过程期间进行。治疗的治疗效果包括但不限于预防疾病的发 生或复发、症状的缓解、疾病的任何直接或间接病理学后果的减少、 预防转移、降低疾病进展的速度、减轻或缓和疾病状态、和缓解或改 善的预后。通过预防疾病或病症的进展,治疗可以防止受侵袭或诊断 的受试者或疑似患有病症的受试者中的病症引起的恶化,而且治疗可 以预防具有病症风险或疑似患有病症的受试者中病症或病症症状的 发作。
本文使用的术语“受试者”是指任何动物(例如哺乳动物),包 括但不限于人、非人灵长类动物、啮齿动物等(例如,其将是特定治 疗的受者、或从其中收获细胞)。
二.Fc受体样5(FcRL5)
Fc受体样5(FcRL5)(也称作“CD307e”或“IRTA2”)是用于 治疗多发性骨髓瘤的合理靶标,因其在B细胞和浆细胞上表达。 FcRL5与IgG的Fc部分结合且促进B细胞受体信号传导和B细胞增 殖(Franco等,Journal of immunology 190,5739-5746(2013); Dement-Brown等,Journal of leukocyte biology 91,59-67(2012))。发现 作为用于来自新鲜或冷冻的患者样品的恶性浆细胞的FACS标志物, FcRL5是CD138的替代物,平均相对MFI在10-55之间(n=23)(Ise 等,Leukemia 21,169-174(2007))。另一研究通过FACS证实了在来自所测试的大部分慢性淋巴细胞白血病(CLL)和套细胞淋巴瘤案例以 及全部多发性骨髓瘤(MM)(n=8)案例的主要患者样品上FcRL5 的细胞表面表达(Ise等(2007))。第三个团队在来自正常骨髓(n=7)、 在MGUS(n=16)且在MM(n=16)中的浆细胞上发现高表面染色 (在所有三组中MFI相似,与同种型对照相比增加~1000倍)(Elkins 等,Molecular cancertherapeutics 11,2222-2232(2012))。FcRL5在 1q21上,且已经发现其在B细胞恶性肿瘤中参与1q21异常 (Hatzivassiliou等,Immunity 14,277-289(2001))。在48%的被诊断 MM患者和67%的复发患者中发现有1q21的扩增,且该扩增与更差 的预后相关联(An等,Haematologica 99,353-359(2014))。靶向FcRL5 的抗体-药物缀合物可有效治疗MM的体内鼠模型(Elkins等 (2012))。
人FcRL5氨基酸序列的非限制性实例可见于GenBank蛋白质登 录号:AAI01070.1;XP_011508332.1;XP_011508334.1; XP_011508333.1;XP_011508332.1;和NP_001182317.1。
在某些非限制性实施方式中,FcRL5是具有SEQ ID NO:899所 示的氨基酸序列的人FcRL5或其片段。SEQ ID NO:899提供如下:
Figure BDA0003882604390000341
在某些实施方式中,FcRL5包含9个免疫球蛋白(Ig)样结构域, 例如结构域1、结构域2、结构域3、结构域4、结构域5、结构域6、 结构域7、结构域8和结构域9(参见图3A和3C)。在某些实施方式 中,FcRL5的结构域9包含SEQ ID NO:900所示的氨基酸序列。SEQ ID NO:900提供如下。
Figure BDA0003882604390000342
在某些实施方式中,FcRL5的结构域9可以具有SEQ ID NO:963 所示的氨基酸序列或其片段。SEQ ID NO:963提供如下:
Figure BDA0003882604390000351
在某些实施方式中,结构域1可以包含SEQ ID NO:899的氨基酸 23-100;结构域2可以包含SEQ ID NO:899的氨基酸105-185;结构 域3可以包含SEQ ID NO:899的氨基酸191-273;结构域4可以包含 SEQ ID NO:899的氨基酸287-373;结构域5可以包含SEQ IDNO:899 的氨基酸380-466;结构域6可以包含SEQ ID NO:899的氨基酸 490-555;结构域7可以包含SEQ ID NO:899的氨基酸565-638;结构 域8可以包含SEQ ID NO:899的氨基酸658-731;且结构域9可以包 含SEQ ID NO:899的氨基酸754-835。
在某些实施方式中,FcRL5的结构域9包含与SEQ ID NO:900 或963的氨基酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、 87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、 98%或99%同源的氨基酸序列。
三.嵌合抗原受体(CAR)
嵌合抗原受体(CAR)是工程化的受体,其将感兴趣的特异性移 植或赋予到免疫效应细胞。CAR可以用于通过逆转录病毒载体促进 其编码序列的转移将单克隆抗体的特异性移植到T细胞上。
有三代CAR。“第一代”CAR通常由细胞外抗原结合结构域(例 如单链可变片段(scFv))与跨膜结构域融合,再与T细胞受体链的 胞质/细胞内结构域融合而组成。“第一代”CAR通常具有来自CD3ζ 链的细胞内结构域,其是来自内源性TCR信号传导的主要传递者。 “第一代”CAR可以提供重新的抗原识别并且通过在单个融合分子 中的CD3ζ链信号传导结构域激活CD4+和CD8+ T细胞,而不依赖 HLA介导的抗原递呈。“第二代”CAR将来自各种共刺激分子(例如 CD28、4-1BB、ICOS、OX40)的细胞内结构域添加到CAR的胞质 尾部,以向T细胞提供额外的信号。“第二代”CAR包含既提供共刺 激(例如CD28或4-1BB)又提供激活(CD3ζ)的那些CAR。临床 前研究表明,“第二代”CAR可以提高T细胞的抗肿瘤活性。例如, 在慢性淋巴细胞白血病(CLL)和急性淋巴细胞白血病(ALL)患者 中,靶向CD19分子的临床试验证实了“第二代”CAR修饰的T细 胞的强烈功效。“第三代”CAR包含提供多种共刺激(例如CD28和 4-1BB)和激活(CD3ζ)的那些CAR。
根据本发明公开的主题,CAR包含细胞外抗原结合结构域、跨 膜结构域和细胞内结构域,其中细胞外抗原结合结构域结合FcRL5。 在一具体非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域是scFv。在一 具体非限制性实施方式中,细胞外抗原结合结构域是任选交联的Fab。 在一具体非限制性实施方式中,细胞外结合结构域是F(ab)2。在一具 体非限制性实施方式中,任一前述分子可以包含在具有异源序列的融 合蛋白中以形成细胞外抗原结合结构域。
在某些非限制性实施方式中,本公开内容的CAR的细胞外抗原 结合结构域与FcRL5或FcRL5的结构域9具有高结合特异性以及高 结合亲和力。在某些非限制性实施方式中,本公开内容的CAR的细 胞外抗原结合结构域与FcRL5的结构域8具有高结合特异性以及高 结合亲和力。在某些非限制性实施方式中,本公开内容的CAR的细 胞外抗原结合结构域与FcRL5的结构域7具有高结合特异性以及高 结合亲和力。例如,在这些实施方式中,CAR的细胞外抗原结合结 构域(实施为例如scFv或其类似物)与FcRL5(或FcRL5的结构域 8或结构域9)结合,解离常数(Kd)为约3x10-6M或更低。在某 些实施方式中,Kd为约1x10-6M或更低、约1x10-7M或更低、约 1x10-8M或更低、约1x10-9M或更低、约1x10-10M或更低、或约 1x10-11M或更低。在某些实施方式中,Kd为约1x10-11M至约3x10-6 M、1x10-10M至约3x10-6M、或约1x10-9M至约3x10-6M,比如 约1x10-9M至约1x10-8M、约1x10-8M至约1x10-7M、或约1x10-7 M至约1x10- 6M、或约1x10-6M至约3x10-6M。
本发明公开的CAR的细胞外抗原结合结构域(例如以scFv或其 类似物的实施方式)与FcRL5(或FcRL5的结构域8或结构域9)的 结合可以通过例如酶联免疫吸附法(ELISA)、放射免疫法(RIA)、 FACS分析、生物检测法(例如,生长抑制)或蛋白质印迹法检测来 确认。这些试验中的每一种通常通过使用对目的复合物特异的标记试 剂(例如,抗体或scFv)来检测特定目的蛋白质-抗体复合物的存在。 例如,可以将scFv放射性标记并用于放射免疫法(RIA)(见例如 Weintraub,B.,Principles of Radioimmunoassays,SeventhTraining Course on Radioligand Assay Techniques,The Endocrine Society,3月,1986,其引入本文以供参考)。放射性同位素可以通过比如使用γ计 数器或闪烁计数器或通过放射自显影术的方法检测。在某些实施方式 中,用荧光标志物标记FcRL5靶向的细胞外抗原结合结构域。荧光 标志物的非限制性实例包括绿色荧光蛋白(GFP)、蓝色荧光蛋白(例 如EBFP、EBFP2、Azurite和mKalama1)、青色荧光蛋白(例如ECFP、 Cerulean和CyPet)和黄色荧光蛋白(例如YFP、Citrine、Venus和 YPet)。在某些实施方式中,FcRL5靶向的人scFv用GFP标记。
在某些实施方式中,本发明公开的CAR的细胞外抗原结合结构 域包含单链可变片段(scFv)。在一个具体实施方式中,本发明公开 的CAR的细胞外抗原结合结构域包含与人FcRL5特异性地结合的人 scFv。在另一具体实施方式中,本发明公开的CAR的细胞外抗原结合结构域包含与人FcRL5特异性地结合的鼠scFv。在某些实施方式 中,本发明公开的CAR的细胞外抗原结合结构域包含与FcRL5的结 构域7的至少一部分特异性地结合的scFv。在某些实施方式中,本发 明公开的CAR的细胞外抗原结合结构域包含与FcRL5的结构域8的 至少一部分特异性地结合的scFv。在某些实施方式中,本发明公开的 CAR的细胞外抗原结合结构域包含与FcRL5的结构域9的至少一部 分特异性地结合的scFv。例如,并且并非以限制性的方式,FcRL5 的结构域9包含SEQ ID NO:900或963所示的氨基酸序列、或其片段。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域是得自两种市售的结 合人FcRL5上不同细胞外表位的小鼠杂交瘤的鼠scFv,其已在Franco 等,Journal of Immunology(2013);190:5739-5746;Ise等,Clinical cancer research:an official fournal of theAmerican Association for Cancer Research(2005);11:87-96;和Ise等,Clinicalchemistry and laboratory medicine:CCLM/FESCC(2006);44:594-602中加以表征,这 些文件各个的全部内容引入本文以供参考。在某些实施方式中,细胞 外抗原结合结构域是源自与人FcRL5结合的抗体的重链可变区和轻 链可变区的鼠scFv,该抗体例如为抗体F56和F119,公开于Ise等 (2005),其全部内容引入本文以供参考。
CAR的细胞外抗原结合结构域
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,其包含选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、 SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ IDNO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917和SEQ ID NO:921的氨基酸序列,其中scFv 抗体与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,其包含选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:12、 SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ IDNO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ IDNO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ IDNO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915和SEQ ID NO:919的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有如下所提供的SEQ ID NO:915所示 序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000391
编码SEQ ID NO:915的氨基酸序列的核酸序列在如下所提供的 SEQ ID NO:916中示出。
Figure BDA0003882604390000392
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有如下所提供的SEQ ID NO:917所示 序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000401
编码SEQ ID NO:917的氨基酸序列的核酸序列在如下所提供的 SEQ ID NO:918中示出。
Figure BDA0003882604390000402
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有如下所提供的SEQ ID NO:919所示 序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000403
编码SEQ ID NO:3的氨基酸序列的核酸序列在如下所提供的 SEQ ID NO:920中示出。
Figure BDA0003882604390000404
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有如下所提供的SEQ ID NO:921所示 序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000405
编码SEQ ID NO:921的氨基酸序列的核酸序列在如下所提供的 SEQ ID NO:922中示出。
Figure BDA0003882604390000406
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:144所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:144的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:142 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:143所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:143的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:141 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:216所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:216的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:214 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:215所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:215的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:213 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:220所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:220的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:218 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:219所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:219的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:217 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:236所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:236的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:234 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:235所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:235的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:232 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:268所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:268的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:266 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:267所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:267的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:265 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:172所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:172的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:170 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:171所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:171的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:169 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,该重链可变区包含具有SEQ ID NO:116所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:116的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:114 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻 链可变区,该轻链可变区包含具有SEQ ID NO:115所示序列的氨基 酸。编码SEQ ID NO:115的氨基酸序列的核酸序列在SEQ ID NO:113 中示出。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQ IDNO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQ IDNO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ IDNO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ IDNO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ IDNO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ IDNO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917、SEQ ID NO:921的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、 SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:16、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ IDNO:40、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ IDNO:64、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ IDNO:88、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ ID NO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ ID NO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ ID NO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:917和SEQ ID NO:921的氨基 酸序列,其中细胞外结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:3所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:4所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:7所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:8所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:11所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:12所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:15所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:16所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:19所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:20所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:23所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:24所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:27所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:28所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:31所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:32所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:35所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:36所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:39所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:40所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:43所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:44所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:47所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:48所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:51所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:52所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:55所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:56所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:59所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:60所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:63所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:64所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:67所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:68所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:71所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:72所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:75所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:76所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:79所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:80所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:83所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:84所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:87所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:88所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:91所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:92所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:95所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:96所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:99所示序列的氨基酸;和 (b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:100所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:103所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:104所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:107所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:108所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:111所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:112所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:115所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:116所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:119所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:120所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:123所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:124所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:127所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:128所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:131所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:132所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:135所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:136所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:139所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:140所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:143所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:144所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:147所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:148所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:151所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:152所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:155所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:156所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:159所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:160所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:163所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:164所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:167所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:168所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:171所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:172所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:175所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:176所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:179所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:180所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:183所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:184所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:187所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:188所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:191所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:192所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:195所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:196所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:199所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:200所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:203所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:204所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:207所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:208所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:211所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:212所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:215所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:216所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:219所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:220所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:223所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:224所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:227所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:228所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:231所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:232所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:235所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:236所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:239所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:240所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:243所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:244所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:247所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:248所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:251所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:252所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:255所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:256所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:259所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:260所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:263所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:264所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:267所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:268所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:271所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:272所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:275所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:276所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:279所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:280所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:283所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:284所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:287所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:288所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:291所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:292所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:279所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:280所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:283所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:284所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:287所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:288所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:291所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:292所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:295所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:296所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:299所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:300所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:303所示序列的氨基酸; 和(b)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:304所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:915所示序列的氨基酸; 和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:917所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:919所示序列的氨基酸; 和(b)轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:921所示序列的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区和轻链可变区,该重链可变区和轻链可变区包含与本文所述 并在表1-76中公开的氨基酸序列同源的氨基酸序列。例如,并且并 非以限制性的方式,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含轻链可 变区,其包含与选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、 SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ IDNO:63、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ IDNO:87、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQ ID NO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917和SEQ ID NO:921的氨基酸序列至少80%、 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、 92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,其包含与选自SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:12、 SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ IDNO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ IDNO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQ IDNO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQ IDNO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQ IDNO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQ IDNO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQ IDNO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915和SEQ ID NO:919的氨基酸序列至少80%、 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:19、SEQID NO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:43、SEQID NO:47、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:67、SEQID NO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:91、SEQID NO:95、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:115、SEQ ID NO:119、SEQ ID NO:123、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:131、SEQ ID NO:135、SEQID NO:139、SEQ ID NO:143、SEQ ID NO:147、SEQ ID NO:151、SEQ ID NO:155、SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:163、SEQ ID NO:167、SEQ ID NO:171、SEQ ID NO:175、SEQ ID NO:179、SEQID NO:183、SEQ ID NO:187、SEQ ID NO:191、SEQ ID NO:195、SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:203、SEQ ID NO:207、SEQ ID NO:211、SEQ ID NO:215、SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:223、SEQID NO:227、SEQ ID NO:231、SEQ ID NO:235、SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:243、SEQ ID NO:247、SEQ ID NO:251、SEQ ID NO:255、SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:263、SEQ ID NO:267、SEQID NO:271、SEQ ID NO:275、SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:283、SEQ ID NO:287、SEQ ID NO:291、SEQ ID NO:295、SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:303、SEQ ID NO:917和SEQ ID NO:921的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与选自SEQ ID NO:4、 SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20、SEQID NO:24、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQID NO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQID NO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92、SEQID NO:96、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:112、SEQ ID NO:116、SEQ ID NO:120、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:128、SEQ ID NO:132、SEQ ID NO:136、SEQID NO:140、SEQ ID NO:144、SEQ ID NO:148、SEQ ID NO:152、SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:160、SEQ ID NO:164、SEQ ID NO:168、SEQ ID NO:172、SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:180、SEQID NO:184、SEQ ID NO:188、SEQ ID NO:192、SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:200、SEQ ID NO:204、SEQ ID NO:208、SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:220、SEQ ID NO:224、SEQID NO:228、SEQ ID NO:232、SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:240、SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:248、SEQ ID NO:252、SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:260、SEQ ID NO:264、SEQ ID NO:268、SEQID NO:272、SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:280、SEQ ID NO:284、SEQ ID NO:288、SEQ ID NO:292、SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:300、SEQ ID NO:304、SEQ ID NO:915和SEQ ID NO:919的氨基酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、 87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、 98%或99%同源的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:143所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:144所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:215所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:216所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:219所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:220所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:235所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:236所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:267所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:268所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:915所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:917所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:919所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:921所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:115所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:116所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:171所示的氨基酸序列至少 80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同源的氨基酸序列;和(b)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:172所示的氨基 酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、 89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 同源的氨基酸序列,其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5多肽结合。
包含与上述序列的VH和VL区具有高(即80%或更大)同源性 的VH和/或VL区的细胞外抗原结合结构域(例如scFv)可以通过诱 变(例如,定点或PCR介导的诱变)、随后使用本文所述结合试验测 试所编码的改变的scFv的保留功能(即结合亲和力)来获得。在某 些实施方式中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、 97%、98%或99%同一性的VL序列相对于参考序列包含替换(例如 保守性替换以产生序列的保守性修饰)、插入或缺失,但包含该序列 的细胞外抗原结合结构域(例如scFv)保留与FcRL5结合的能力。 在某些实施方式中,具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96%、97%、98%或99%同一性的VH序列相对于参考序列包含替换 (例如保守性替换)、插入或缺失,但包含该序列的细胞外抗原结合 结构域(例如scFv)保留与FcRL5结合的能力。在某些实施方式中, 在所公开的序列中替换、插入和/或缺失总共约1至约10个氨基酸。 例如,并且并非以限制性的方式,VH序列或VL序列可以具有至多约 一个、至多约两个、至多约三个、至多约四个、至多约五个、至多约 六个、至多约七个、至多约八个、至多约九个或至多约十个修饰和/ 或替换的氨基酸残基。保守性修饰的非限制性实例提供如下,例如在 表231内。
本发明公开的主题还提供细胞外抗原结合结构域(例如scFv), 其包含重链可变区和轻链可变区CDR,例如CDR1、CDR2和CDR3, 如本文表229和230中所公开。使用Kabat系统(Kabat,E.A.等,(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest,第五版,U.S. Department of Health and Human Services,NIH Publication No. 91-3242)划分CDR区。本公开内容还提供包含本文所公开的抗体序 列的保守性修饰的细胞外抗原结合结构域(例如scFv)。例如,并且 并非以限制性的方式,本发明公开的主题的细胞外抗原结合结构域 (例如scFv)包含含有CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区以 及含有CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区,其中这些CDR 序列中的一种或多种包含本文所公开的指定氨基酸序列或其保守性 修饰,并且其中细胞外抗原结合结构域保留期望的功能特性。参见表 229和230。
在某些实施方式中,本发明公开的主题提供包含轻链可变区的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv),其中轻链可变区包含:(a)CDR1, 其包含选自SEQ ID NO:312、3118、324、329、338、343、348、352、 357、363、369、381、390、397、401、406、416、423、428、433、447、460、468、474、477、483、490、498、503、508、518、533、 540、544、547、556、562、568、571、580、585、588、926和932 及其保守性修饰的氨基酸序列;(b)CDR2,其包含选自SEQ ID NO:313、319、330、344、349、358、364、370、382、385、391、 398、409、417、429、434、438、448、454、461、469、478、484、 487、504、513、523、534、429、448、548、557、563、572、575、 586、927和933及其保守性修饰的氨基酸序列;以及(c)CDR3, 其包含选自SEQ ID NO:314、320、325、331、339、345、350、353、 359、365、371、377、383、386、392、395、399、402、407、410、 414、418、419、424、430、435、439、443、449、452、455、457、 462、465、470、479、485、488、491、493、495、499、505、509、 514、519、524、528、530、531、535、541、542、545、549、554、 558、564、569、573、576、581、592、928和934及其保守性修饰 的氨基酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区,其中重链可变区包含:(a)CDR1,其包含选自SEQ ID NO: 309、315、321、326、332、335、340、346、354、360、366、372、 378、387、393、403、411、420、425、436、440、444、471、480、 500、510、515、520、525、537、551、559、565、582、589、923 和929及其保守性修饰的氨基酸序列;(b)CDR2,其包含选自SEQ ID NO:310、316、322、327、333、336、341、355、361、367、373、 379、388、404、412、421、426、431、441、445、450、466、472、 475、481、496、501、506、511、516、521、526、538、552、560、 566、583、590、924和930及其保守性修饰的氨基酸序列;以及(c) CDR3,其包含选自SEQ ID NO:311、317、323、328、334、337、 342、347、351、356、362、368、374、376、380、384、389、394、 396、400、405、408、412、415、422、427、432、437、442、446、451、453、456、458、459、463、464、467、473、476、482、486、 489、492、494、497、502、507、512、517、522、527、529、532、 536、539、543、546、550、553、555、561、567、570、574、577、 578、579、584、578、587、591、925和931及其保守性修饰的氨基 酸序列。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:463的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:318的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:515的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:516的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:517的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:318的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:403的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:404的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:532的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:533的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:534的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:535的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:543的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:544的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:448的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:545的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:372的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:475的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:570的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:571的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:572的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:573的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:440的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:441的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:442的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:329的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:330的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:443的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:309的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:310的氨基 酸序列或其保守性修饰;以及(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ IDNO:489的氨基酸序列或其保守性修饰。在某些实施方式中,细胞外 抗原结合结构域(例如scFv)包含:(a)轻链可变区CDR1,其包含 SEQ ID NO:490的氨基酸序列或其保守性修饰;(b)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:313的氨基酸序列或其保守性修饰;以及 (c)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列或其 保守性修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:923所示序列或其 保守性修饰的氨基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:924所示序列或其保守性修饰的氨基酸;以及(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:925所示序列或其保守性修饰的氨基 酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)轻链可变 区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:926所示序列或其保守性修饰的氨 基酸;(b)轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:927所示序列 或其保守性修饰的氨基酸;以及(c)轻链可变区CDR3,其包含具 有SEQ ID NO:928所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:929所示序列或其 保守性修饰的氨基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:930所示序列或其保守性修饰的氨基酸;以及(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:931所示序列或其保守性修饰的氨基 酸。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域包含:(a)轻链可变 区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:932所示序列或其保守性修饰的氨 基酸;(b)轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:933所示序 列或其保守性修饰的氨基酸;以及(c)轻链可变区CDR3,其包含 具有SEQ ID NO:934所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
本发明公开的主题提供细胞外抗原结合结构域(例如scFv),其 包含含有CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可变区以及含有CDR1、 CDR2和CDR3序列的轻链可变区,其中:(a)重链可变区CDR3包 含选自SEQ ID NO:311、317、323、328、334、337、342、347、351、 356、362、368、374、376、380、384、389、394、396、400、405、 408、412、415、422、427、432、437、442、446、451、453、456、 458、459、463、464、467、473、476、482、486、489、492、494、 497、502、507、512、517、522、527、529、532、536、539、543、 546、550、553、555、561、567、570、574、577、578、579、584、 578、587、591、925和931及其保守性修饰的氨基酸序列;且(b) 轻链可变区CDR3包含选自SEQ ID NO:314、320、325、331、339、 345、350、353、359、365、371、377、383、386、392、395、399、 402、407、410、414、418、419、424、430、435、439、443、449、 452、455、457、462、465、470、479、485、488、491、493、495、 499、505、509、514、519、524、528、530、531、535、541、542、 545、549、554、558、564、569、573、576、581、592、928和934 及其保守性修饰的氨基酸序列;其中细胞外抗原结合结构域与人 FcRL5特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:463的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:419的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:517的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:531的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:532的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:535的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中抗体或其抗原结合片段与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:543的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:545的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:570的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:573的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中抗体或其抗原结合片段与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:925所示序列或其 保守性修饰的氨基酸;和(b)轻链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:928所示序列或其保守性修饰的氨基酸;其中细胞外抗原结合结 构域与FcRL5特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:931所示序列或其 保守性修饰的氨基酸;和(b)轻链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:934所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:442的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:443的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:489的氨基酸序列或其 保守性修饰;和(b)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:491的 氨基酸序列或其保守性修饰;其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,本发明公开的主题提供细胞外抗原结合结构 域(例如scFv),其包含含有CDR1、CDR2和CDR3序列的重链可 变区以及含有CDR1、CDR2和CDR3序列的轻链可变区,其中:(a) 重链可变区CDR1包含选自SEQ ID NO:309、315、321、326、332、 335、340、346、354、360、366、372、378、387、393、403、411、 420、425、436、440、444、471、480、500、510、515、520、525、 537、551、559、565、582、589、923和929及其保守性修饰的氨基 酸序列;(b)重链可变区CDR2包含选自SEQ ID NO:310、316、322、 327、333、336、341、355、361、367、373、379、388、404、412、 421、426、431、441、445、450、466、472、475、481、496、501、 506、511、516、521、526、538、552、560、566、583、590、924 和930,及其保守性修饰的氨基酸序列;(c)重链可变区CDR3包含选 自SEQ ID NO:311、317、323、328、334、337、342、347、351、356、362、368、374、376、380、384、389、394、396、400、405、408、 412、415、422、427、432、437、442、446、451、453、456、458、 459、463、464、467、473、476、482、486、489、492、494、497、 502、507、512、517、522、527、529、532、536、539、543、546、 550、553、555、561、567、570、574、577、578、579、584、578、 587、591、925和931及其保守性修饰的氨基酸序列;(d)轻链可变 区CDR1包含选自SEQ ID NO:312、3118、324、329、338、343、 348、352、357、363、369、381、390、397、401、406、416、423、 428、433、447、460、468、474、477、483、490、498、503、508、 518、533、540、544、547、556、562、568、571、580、585、588、926和932及其保守性修饰的氨基酸序列;(e)轻链可变区CDR2包 含选自SEQ ID NO:313、319、330、344、349、358、364、370、382、385、391、398、409、417、429、434、438、448、454、461、469、 478、484、487、504、513、523、534、429、448、548、557、563、 572、575、586、927和933及其保守性修饰的氨基酸序列;且(f) 轻链可变区CDR3包含选自SEQ ID NO:314、320、325、331、339、 345、350、353、359、365、371、377、383、386、392、395、399、 402、407、410、414、418、419、424、430、435、439、443、449、452、455、457、462、465、470、479、485、488、491、493、495、 499、505、509、514、519、524、528、530、531、535、541、542、 545、549、554、558、564、569、573、576、581、592、928和934 及其保守性修饰的氨基酸序列;其中细胞外抗原结合结构域与FcRL5 特异性地结合。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基 酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:463的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其 包含SEQ ID NO:318的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;和(f) 轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:419的氨基酸序列或其保守性 修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:515的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:516的氨基 酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:517的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其 包含SEQ ID NO:318的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:319的氨基酸序列或其保守性修饰;和(f) 轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:531的氨基酸序列或其保守性 修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:403的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:404的氨基 酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:532的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其 包含SEQ ID NO:533的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:534的氨基酸序列或其保守性修饰;和(f) 轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:535的氨基酸序列或其保守性 修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:411的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:412的氨基 酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:543的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其 包含SEQ ID NO:544的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:448的氨基酸序列或其保守性修饰;和(f) 轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:545的氨基酸序列或其保守性 修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:372的氨基酸序列或其 保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:475的氨基 酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:570的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1,其 包含SEQ ID NO:571的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变区 CDR2,其包含SEQ ID NO:572的氨基酸序列或其保守性修饰;和(f) 轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:573的氨基酸序列或其保守性 修饰。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:923所示序列或其 保守性修饰的氨基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:924所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:925所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(d) 轻链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:926所示序列或其保守性 修饰的氨基酸;(e)轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:927 所示序列或其保守性修饰的氨基酸;和(f)轻链可变区CDR3,其包 含具有SEQ ID NO:928所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含: (a)重链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:929所示序列或其 保守性修饰的氨基酸;(b)重链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:930所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(c)重链可变区CDR3,其包含具有SEQ ID NO:931所示序列或其保守性修饰的氨基酸;(d) 轻链可变区CDR1,其包含具有SEQ ID NO:932所示序列或其保守性 修饰的氨基酸;(e)轻链可变区CDR2,其包含具有SEQ ID NO:933 所示序列或其保守性修饰的氨基酸;和(f)轻链可变区CDR3,其包 含具有SEQ ID NO:934所示序列或其保守性修饰的氨基酸。
在某些实施方式中,本发明公开的抗-FcRL5抗体或其抗原结合 片段包含:(a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:440的氨基酸 序列或其保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:441 的氨基酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:442的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1, 其包含SEQ ID NO:329的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变 区CDR2,其包含SEQ ID NO:330的氨基酸序列或其保守性修饰;和 (f)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:443的氨基酸序列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,本发明公开的抗-FcRL5抗体或其抗原结合 片段包含:(a)重链可变区CDR1,其包含SEQ ID NO:309的氨基酸 序列或其保守性修饰;(b)重链可变区CDR2,其包含SEQ ID NO:310 的氨基酸序列或其保守性修饰;(c)重链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:489的氨基酸序列或其保守性修饰;(d)轻链可变区CDR1, 其包含SEQ ID NO:490的氨基酸序列或其保守性修饰;(e)轻链可变 区CDR2,其包含SEQ ID NO:313的氨基酸序列或其保守性修饰; 和(f)轻链可变区CDR3,其包含SEQ ID NO:491的氨基酸序列或 其保守性修饰。
本文使用的术语“保守性序列修饰”和“保守性修饰”是指不显 著影响或改变包含氨基酸序列的本发明公开的CAR(例如,细胞外 抗原结合结构域)的结合特征的氨基酸修饰。这种保守性修饰包括氨 基酸替换、添加和缺失。可以通过本领域已知的标准技术,比如定点 诱变和PCR介导的诱变,将修饰引入本发明公开主题的人scFv中。 可以根据其物理化学性质如电荷和极性将氨基酸分组。
保守性氨基酸替换是其中氨基酸残基被相同组内的氨基酸取代 的替换。例如,氨基酸可以通过电荷分类:带正电荷的氨基酸包括赖 氨酸、精氨酸、组氨酸,带负电荷的氨基酸包括天冬氨酸、谷氨酸, 中性电荷氨基酸包括丙氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、谷氨酰胺、甘氨 酸、异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏 氨酸、色氨酸、酪氨酸和缬氨酸。此外,氨基酸可以通过极性分类: 极性氨基酸包括精氨酸(碱性极性)、天冬酰胺、天冬氨酸(酸性极 性)、谷氨酸(酸性极性)、谷氨酰胺、组氨酸(碱性极性)、赖氨酸 (碱性极性)、丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸;非极性氨基酸包括丙氨酸、 半胱氨酸、甘氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨 酸、色氨酸和缬氨酸。因此,CDR区内的一个或多个氨基酸残基可 以被来自相同组的其他氨基酸残基替换,并且可以使用本文所述的功 能检定测试改变的抗体的保留功能(即,以上(c)至(l)中所述的 功能)。在某些实施方式中,在指定序列或CDR区内改变不超过一个、 不超过两个、不超过三个、不超过四个、不超过五个残基。示例性保 守性氨基酸替换在表231中示出。
表231
Figure BDA0003882604390000691
Figure BDA0003882604390000701
在某些非限制性实施方式中,CAR的细胞外抗原结合结构域可 以包含连接细胞外抗原结合结构域的重链可变区和轻链可变区的接 头。本文使用的术语“接头”是指共价连接两个或多个多肽或核酸使 得它们彼此连接的官能团(例如,化学的或多肽)。本文使用的“肽 接头”是指用于将两种蛋白质偶联在一起(例如,偶联VH和VL结构 域)的一个或多个氨基酸。肽接头的非限制性实例公开于Shen等,Anal. Chem.80(6):1910-1917(2008)。
在一个非限制性实例中,接头是包含具有SEQ ID NO:897所示序 列的氨基酸的G4S接头。在某些实施方式中,编码SEQ ID NO:897 的氨基酸序列的核苷酸序列在SEQ IDNO:898中示出。在一个非限制 性实例中,接头包含具有SEQ ID NO:307所示序列的氨基酸。在某些 实施方式中,编码SEQ ID NO:307的氨基酸序列的核苷酸序列在SEQ ID NO:305中示出。
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:901 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000711
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:902 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000712
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:903 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000713
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:904 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000714
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:905 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000715
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:906 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000716
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:907 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000717
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:908 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000718
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:909 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000719
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:910 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000721
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:911 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000722
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:912 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000723
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:913 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000724
在某些实施方式中,接头包含具有如下所提供的SEQ ID NO:914 所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000725
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含重 链可变区、轻链可变区以及重链可变区与轻链可变区之间的接头肽。 包含重链可变区、轻链可变区和接头肽的本公开内容的细胞外抗原结 合结构域例如scFv的非限制性实例公开于表77-152中。例如,并且 并非以限制性的方式,本公开内容的包含重链可变区、轻链可变区和 接头肽的细胞外抗原结合结构域包含选自SEQ ID NO:594、SEQ ID NO:596、SEQ ID NO:598、SEQ IDNO:600、SEQ ID NO:602、SEQ ID NO:604、SEQ ID NO:606、SEQ ID NO:608、SEQ ID NO:610、SEQ ID NO:612、SEQ ID NO:614、SEQ ID NO:616、SEQ ID NO:618、SEQ ID NO:620、SEQ IDNO:622、SEQ ID NO:624、SEQ ID NO:626、SEQ ID NO:628、SEQ ID NO:630、SEQ ID NO:632、SEQ ID NO:634、SEQ ID NO:636、SEQ ID NO:638、SEQ ID NO:640、SEQ ID NO:642、SEQ IDNO:644、SEQ ID NO:646、SEQ ID NO:648、SEQ ID NO:650、SEQ ID NO:652、SEQ ID NO:654、SEQ ID NO:656、SEQ ID NO:658、SEQ ID NO:660、SEQ ID NO:662、SEQ ID NO:664、SEQ IDNO:666、SEQ ID NO:668、SEQ ID NO:670、SEQ ID NO:672、SEQ ID NO:674、SEQ ID NO:676、SEQ ID NO:678、SEQ ID NO:680、SEQ ID NO:682、SEQ ID NO:684、SEQ ID NO:686、SEQ IDNO:688、SEQ ID NO:690、SEQ ID NO:692、SEQ ID NO:694、SEQ ID NO:696、SEQ ID NO:698、SEQ ID NO:700、SEQ ID NO:702、SEQ ID NO:704、SEQ ID NO:706、SEQ ID NO:708、SEQ IDNO:710、SEQ ID NO:712、SEQ ID NO:714、SEQ ID NO:716、SEQ ID NO:718、SEQ ID NO:720、SEQ ID NO:722、SEQ ID NO:724、SEQ ID NO:726、SEQ ID NO:728、SEQ ID NO:730、SEQ IDNO:732、SEQ ID NO:734、SEQ ID NO:736、SEQ ID NO:738、SEQ ID NO:740、SEQ ID NO:742、SEQ ID NO:744及其保守性修饰的氨基酸 序列(如表77-152中所示)。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:650的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:664的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:678的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:700的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:702的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:710的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:726的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:650的氨基酸序 列或其保守性修饰。
在某些实施方式中,具有重链可变区、轻链可变区和接头肽的细 胞外抗原结合结构域(例如scFv)包含SEQ ID NO:678的氨基酸序 列或其保守性修饰。
此外,细胞外抗原结合结构域能够包含将初生蛋白引导至内质网 的前导序列或信号肽。如果要将CAR糖基化并锚定在细胞膜中,信 号肽或前导序列可能是很重要的。信号序列或前导序列可以是存在于 新合成的蛋白质的N-末端将该蛋白质引导进入分泌途径的肽序列 (约5、约10、约15、约20、约25或约30个氨基酸长)。在非限制 性实例中,信号肽共价接合至细胞外抗原结合结构域的5’端。在某些 实施方式中,信号肽包含CD8多肽,其包含具有如下所提供的SEQ ID NO:26所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000741
编码SEQ ID NO:935的氨基酸序列的核苷酸序列在如下所提供 的SEQ ID NO:936中示出:
Figure BDA0003882604390000742
在另一实施方式中,信号肽包含具有如下所提供的SEQ ID NO:937所示序列的氨基酸。
Figure BDA0003882604390000743
编码SEQ ID NO:937的氨基酸序列的核苷酸序列在如下所提供 的SEQ ID NO:938中示出:
Figure BDA0003882604390000744
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域例如人scFv包含重 链可变区、轻链可变区、重链可变区与轻链可变区之间的接头肽、以 及His-标签和HA-标签。在某些实施方式中,His-标签和HA-标签的 氨基酸序列包含SEQ ID NO:308的氨基酸序列。编码SEQ ID NO:308 的核苷酸序列是SEQ ID NO:306。
在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域例如人scFv与包含 SEQ ID NO:899所示的氨基酸序列的人FcRL5多肽结合。在某些实 施方式中,细胞外抗原结合结构域例如人scFv与结构域9(例如SEQ ID NO:899的氨基酸754-835)中的表位结合。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域例如人scFv与结构域8(例如SEQ ID NO:899 的氨基酸658-731)中的表位结合。在某些实施方式中,细胞外抗原 结合结构域例如人scFv与结构域9内的包含SEQ ID NO:899的氨基 酸829-840的表位结合。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域例如人scFv与结构域8内的包含SEQ ID NO:899的氨基酸657-667 的表位结合。例如,并且并非以限制性的方式,细胞外抗原结合结构 域例如人scFv与包含氨基酸序列RSETVTLYITGL(SEQ ID NO:964) 的表位结合。在某些实施方式中,在某些实施方式中,本公开内容的 抗体或其抗原结合片段与包含氨基酸序列SRPILTFRAPR(SEQ ID NO:965)的表位结合。
CAR的跨膜结构域
在某些非限制性实施方式中,CAR的跨膜结构域包含跨越膜的 至少一部分的疏水性α螺旋。不同的跨膜结构域产生不同的受体稳定 性。在抗原识别之后,受体簇和信号被传递到细胞。根据本发明公开 的主题,CAR的跨膜结构域包含CD8多肽、CD28多肽、CD3ζ多肽、CD4多肽、4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、CTLA-4多肽、PD-1 多肽、LAG-3多肽、2B4多肽、BTLA多肽、合成肽(不基于与免疫 应答相关的蛋白)、或其组合。
在某些实施方式中,本发明公开的CAR的跨膜结构域包含CD28 多肽。CD28多肽可以具有与NCBI参考号为P10747或NP_006130 (SEQ ID NO:939)的序列至少约85%、约90%、约95%、约96%、 约97%、约98%、约99%或100%同源的氨基酸序列或其片段,且/ 或可以任选地包含至多一个或至多两个或至多三个保守性氨基酸替 换。在非限制性实施方式中,CD28多肽可以具有作为SEQ ID NO:939 的保守部分且至少20、或至少30、或至少40、或至少50且至多220 个氨基酸长的氨基酸序列。或者或另外,在非限制性的各种实施方式 中,CD28多肽具有SEQ ID NO:939的氨基酸1-220、1-50、50-100、 100-150、150-200或200-220的氨基酸序列。在某些实施方式中,本 发明公开主题的CAR包含:跨膜结构域,其包含CD28多肽;以及 细胞内结构域,其包含含有CD28多肽的共刺激信号传导区。在某些 实施方式中,跨膜结构域和细胞内结构域中包含的CD28多肽具有 SEQ ID NO:939的氨基酸114-220的氨基酸序列。
SEQ ID NO:939提供如下:
Figure BDA0003882604390000761
根据本发明公开的主题,“CD28核酸分子”是指编码CD28多肽 的多核苷酸。在某些实施方式中,编码包含在本发明公开的CAR的 跨膜结构域和细胞内结构域(例如共刺激信号传导区)中的CD28多 肽(SEQ ID NO:939的氨基酸114-220)的CD28核酸分子包含具有 如下所提供的SEQ ID NO:940所示序列的核酸。
Figure BDA0003882604390000762
在某些实施方式中,本发明公开的CAR的跨膜结构域包含CD8 多肽。CD8多肽可以具有与NCBI参考号为AAH25715(SEQ ID NO:960)的序列至少约85%、约90%、约95%、约96%、约97%、 约98%、约99%或100%的氨基酸序列或其片段,且/或可以任选地包 含至多一个或至多两个或至多三个保守性氨基酸替换。在非限制性实 施方式中,CD8多肽可以具有作为SEQ ID NO:960的保守部分且至 少20、或至少30、或至少40、或至少50、或至少70、或至少100、 或至少150、或至少200、且至多235个氨基酸长的氨基酸序列。或 者或另外,在非限制性的各种实施方式中,CD8多肽具有SEQ ID NO:960的氨基酸1-235、1-50、50-100、100-150、150-200、130-210 或200-235的氨基酸序列。本发明公开主题的CAR包含含有CD8多 肽的跨膜结构域。在某些实施方式中,跨膜结构域中包含的CD8多 肽具有SEQ ID NO:960的氨基酸137-207的氨基酸序列。
SEQ ID NO:960提供如下:
Figure BDA0003882604390000771
根据本发明公开的主题,“CD8核酸分子”是指编码CD8多肽的 多核苷酸。在某些实施方式中,编码包含在本发明公开的CAR的跨 膜结构域和细胞内结构域(例如共刺激信号传导区)中的CD8多肽 (SEQ ID NO:960的氨基酸137-207)的CD8核酸分子包含具有如下 所提供的SEQ ID NO:961所示序列的核酸。
Figure BDA0003882604390000772
在某些非限制性实施方式中,CAR还可包含将细胞外抗原结合 结构域连接至跨膜结构域的间隔区(spacer)。间隔区可以是足够柔性 的,以允许抗原结合结构域在不同方向上定向,以利于抗原识别。间 隔区可以是来自IgG1的铰链区、或免疫球蛋白的CH2CH3区和CD3 的部分。
CAR的细胞内结构域
在某些非限制性实施方式中,CAR的细胞内结构域可包含可激 活或刺激细胞(例如,淋巴谱系的细胞,例如T细胞)的CD3ζ多肽。 CD3ζ包含3个ITAM,并且在结合抗原后将激活信号传递到细胞(例 如,淋巴谱系的细胞,例如T细胞)。该CD3ζ多肽可具有与SEQ ID NO:941所示序列至少约85%、约90%、约95%、约96%、约97%、 约98%、约99%或约100%同源的氨基酸序列或其片段,且/或可任 选地包含至多一个或至多两个或至多三个保守性氨基酸替换。在非限 制性实施方式中,CD3ζ多肽可以具有作为SEQ ID NO:941的保守部 分且至少20、或至少30、或至少40、或至少50、且至多163个氨基 酸长的氨基酸序列。或者或另外,在非限制性的各种实施方式中, CD3ζ多肽具有SEQ ID NO:941的氨基酸1-163、1-50、50-100、100-150 或150-163的氨基酸序列。在某些实施方式中,本发明公开的CAR 的细胞内结构域中包含的CD3ζ多肽具有SEQ ID NO:941的氨基酸 52-163的氨基酸序列。
SEQ ID NO:941提供如下:
Figure BDA0003882604390000781
根据本发明公开的主题,“CD3ζ核酸分子”是指编码CD3ζ多肽 的多核苷酸。在某些实施方式中,编码包含在本发明公开的CAR的 细胞内结构域中的CD3ζ多肽(SEQ ID NO:941的氨基酸52-163)的 CD3ζ核酸分子包含具有如下所提供的SEQ ID NO:942所示序列的核酸。
Figure BDA0003882604390000782
在某些非限制性实施方式中,CAR的细胞内结构域还包含至少 一个信号传导区。该至少一个信号传导区可以包含CD28多肽、4-1BB 多肽、OX40多肽、ICOS多肽、DAP-10多肽、PD-1多肽、CTLA-4 多肽、LAG-3多肽、2B4多肽、BTLA多肽、合成肽(不基于与免疫 应答相关的蛋白)、或其组合。
在某些实施方式中,信号传导区是共刺激信号传导区。在某些实 施方式中,共刺激区包含至少一个共刺激分子,其可以提供最佳淋巴 细胞激活。本文使用的“共刺激分子”是指淋巴细胞对抗原的有效应 答所需的除抗原受体或其配体之外的细胞表面分子。至少一个共刺激 信号传导区可包含CD28多肽、4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、 DAP-10多肽、或其组合。共刺激分子可以结合共刺激配体,共刺激 配体是在细胞表面上表达的蛋白质,其在结合其受体时产生共刺激应 答,即实现当抗原结合其CAR分子时所提供的刺激的细胞内应答。 共刺激配体包括但不限于CD80、CD86、CD70、OX40L、4-1BBL、 CD48、TNFRSF14和PD-L1。作为一个实例,4-1BB配体(即4-1BBL) 可结合4-1BB(也称为“CD137”)以提供细胞内信号,其与CAR信 号联合诱导CAR+T细胞的效应细胞功能。U.S.7,446,190中公开了包 含细胞内结构域的CAR,其细胞内结构域包含含有4-1BB、ICOS或 DAP-10的共刺激信号传导区(例如,在US7,446,190中,编码4-1BB 的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示,编码ICOS的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示,编码DAP-10的核苷酸序列如SEQ ID NO:17所示), 其全部内容引入本文以供参考。在某些实施方式中,CAR的细胞内 结构域包含含有CD28多肽的共刺激信号传导区。在某些实施方式中, CAR的细胞内结构域包含共刺激信号传导区,其包含两种共刺激分 子:CD28和4-1BB或CD28和OX40。
4-1BB可以作为肿瘤坏死因子(TNF)配体并具有刺激活性。 4-1BB多肽可以具有与NCBI参考号为P41273或NP_001552(SEQ ID NO:943)的序列至少约85%、约90%、约95%、约96%、约97%、 约98%、约99%或100%同源的氨基酸序列或其片段,且/或可任选 地包含至多一个或至多两个或至多三个保守性氨基酸替换。在某些实 施方式中,本发明公开的CAR的细胞内结构域中包含的4-1BB多肽 具有SEQ ID NO:943的氨基酸214-255的氨基酸序列。SEQ ID NO:943提供如下:
Figure BDA0003882604390000791
根据本发明公开的主题,“4-1BB核酸分子”是指编码4-1BB多 肽的多核苷酸。在某些实施方式中,编码包含在本发明公开的CAR 的细胞内结构域中的4-1BB多肽(SEQ ID NO:943的氨基酸214-255) 的4-1BB核酸分子包含具有如下所提供的SEQ ID NO:962所示序列的核酸。
Figure BDA0003882604390000792
OX40多肽可以具有与NCBI参考号为P43489或NP_003318 (SEQ ID NO:944)的序列至少约85%、约90%、约95%、约96%、 约97%、约98%、约99%或100%同源的氨基酸序列或其片段,且/ 或可以任选地包含至多一个或至多两个或至多三个保守性氨基酸替 换。
SEQ ID NO:944提供如下:
Figure BDA0003882604390000801
根据本发明公开的主题,“OX40核酸分子”是指编码OX40多肽 的多核苷酸。
ICOS多肽可以具有与NCBI参考号为NP_036224(SEQ ID NO:945)的序列至少约85%、约90%、约95%、约96%、约97%、 约98%、约99%或100%同源的氨基酸序列或其片段,且/或可以任选 地包含至多一个或至多两个或至多三个保守性氨基酸替换。
SEQ ID NO:945提供如下:
Figure BDA0003882604390000802
根据本发明公开的主题,“ICOS核酸分子”是指编码ICOS多肽 的多核苷酸。
CTLA-4是由活化的T细胞表达的抑制性受体,其在由相应的配 体(分别为CD80和CD86;B7-1和B7-2)接合时介导活化的T细胞 抑制或无反应性(anergy)。在临床前和临床研究中,尽管通过系统 性抗体输注引起的CTLA-4阻断增强了内源性抗肿瘤应答,但在临床环境中具有显著的不可预见的毒性。
CTLA-4包含细胞外V结构域、跨膜结构域和胞质尾区。已经表 征了编码不同亚型的替代剪接变体。膜结合亚型作为通过二硫键互连 的同源二聚体起作用,而可溶性亚型则作为单体起作用。细胞内结构 域类似于CD28的结构域,因为其没有内在的催化活性并且包含能够 结合PI3K、PP2A和SHP-2的一个YVKM基序和一个能够结合包含 SH3的蛋白质的富含脯氨酸的基序。CTLA-4在抑制T细胞应答中的 一种作用似乎直接通过TCR-近端信号传导蛋白比如CD3和LAT的 SHP-2和PP2A去磷酸化。CTLA-4也可通过与CD28竞争CD80/86 结合而间接影响信号传导。CTLA-4也已显示与PI3K、CD80、AP2M1 和PPP2R5A结合和/或相互作用。
根据本发明公开的主题,CTLA-4多肽可具有与 UniProtKB/Swiss-Prot参考号为P16410.3(SEQ ID NO:946)至少约 85%、约90%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或约100% 同源的(本文中的同源性可使用标准软件如BLAST或FASTA确定) 氨基酸序列或其片段,且/或可任选地包含至多一个或至多两个或至 多三个保守性氨基酸替换。
SEQ ID NO:946提供如下:
Figure BDA0003882604390000811
根据本发明公开的主题,“CTLA-4核酸分子”是指编码CTLA-4 多肽的多核苷酸。
PD-1是与表达在内源性巨噬细胞和树突细胞上的其相应配体 PD-L1和PD-L2接合时活化T细胞的负免疫调节剂。PD-1是268个 氨基酸的I型膜蛋白。PD-1具有两种配体PD-L1和PD-L2,它们是 B7家族的成员。该蛋白质的结构包含细胞外IgV结构域,其后是跨 膜区和细胞内尾区。细胞内尾区包含位于免疫受体酪氨酸类抑制基序 和免疫受体酪氨酸类开关基序的两个磷酸化位点,PD-1负调节TCR 信号。SHP-1和SHP-2磷酸酶在配体结合时结合PD-1的细胞质尾部。 PD-L1的上调是肿瘤细胞逃避宿主免疫系统的一种机制。在临床前和 临床试验中,通过拮抗性抗体引起的PD-1阻断诱导由宿主内源性免 疫系统介导的抗肿瘤反应。
根据本发明公开的主题,PD-1多肽可以具有与NCBI参考号为 NP_005009.2(SEQID NO:947)的序列至少约85%、约90%、约95%、 约96%、约97%、约98%、约99%或约100%同源的氨基酸序列或其 片段,且/或可以任选地包含至多一个或至多两个或至多三个保守性 氨基酸替换。
SEQ ID NO:947提供如下:
Figure BDA0003882604390000821
根据本发明公开的主题,“PD-1核酸分子”是指编码PD-1多肽 的多核苷酸。
淋巴细胞活化蛋白3(LAG-3)是免疫细胞的负免疫调节剂。 LAG-3属于免疫球蛋白(Ig)超家族,并且含有4个胞外Ig样结构 域。LAG3基因含有8个外显子。序列数据、外显子/内含子组成和染 色体定位都表明LAG3与CD4的密切关系。LAG3也被称为CD223 (分化簇223)。
根据本发明公开的主题,LAG-3多肽可以具有与 UniProtKB/Swiss-Prot参考号为P18627.5(SEQ ID NO:948)至少约 85%、约90%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或约100% 同源的氨基酸序列,且/或可以任选地包含至多一个或至多两个或至 多三个保守性氨基酸替换。
SEQ ID NO:948提供如下
Figure BDA0003882604390000822
根据本发明公开的主题,“LAG-3核酸分子”是指编码LAG-3多 肽的多核苷酸。
自然杀伤细胞受体2B4(2B4)介导NK细胞和T细胞亚群上的 非MHC限制性细胞杀伤。到目前为止,2B4的功能仍在研究中,其 中2B4-S亚型被认为是激活受体,2B4-L亚型被认为是免疫细胞的负 免疫调节剂。2B4在结合其高亲和力配体CD48时变得契合。2B4含 有酪氨酸类开关基序,这是一种允许蛋白质与各种磷酸酶结合的分子 开关。2B4也被称为CD244(分化簇244)。
根据本发明公开的主题,2B4多肽可以具有与 UniProtKB/Swiss-Prot参考号为Q9BZW8.2(SEQ ID NO:949)至少约 85%、约90%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或约100% 同源的氨基酸序列或其片段,且/或可以任选地包含至多一个或至多 两个或至多三个保守性氨基酸替换。
SEQ ID NO:949提供如下:
Figure BDA0003882604390000831
根据本发明公开的主题,“2B4核酸分子”是指编码2B4多肽的 多核苷酸。
在T细胞激活期间诱导B和T淋巴细胞衰减子(BTLA)表达, 并且BTLA保持在Th1细胞上表达而不在Th2细胞上表达。与PD1 和CTLA4一样,BTLA与B7同源物B7H4相互作用。然而,与PD-1 和CTLA-4不同的是,BTLA通过与肿瘤坏死家族受体(TNF-R)的 相互作用表现T细胞抑制,而不仅仅是细胞表面受体的B7家族。 BTLA是肿瘤坏死因子(受体)超家族成员14(TNFRSF14)的配体, 也称为疱疹病毒侵入介体(HVEM)。BTLA-HVEM复合物负调节T 细胞免疫应答。已显示BTLA活化抑制人CD8+癌症特异性T细胞的 功能。BTLA也称为CD272(分化簇272)。
根据本发明公开的主题,BTLA多肽可具有与 UniProtKB/Swiss-Prot参考号为Q7Z6A9.3(SEQ ID NO:950)至少约 85%、约90%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或约100%同源的氨基酸序列或其片段,且/或可以任选地包含至多一个或 至多两个或至多三个保守性氨基酸替换。
SEQ ID NO:950提供如下:
Figure BDA0003882604390000841
根据本发明公开的主题,“BTLA核酸分子”是指编码BTLA多 肽的多核苷酸。
在某些实施方式中,CAR包含与人FcRL5特异性地结合的细胞 外抗原结合区、包含CD28多肽的跨膜结构域、以及包含CD3ζ多肽 和共刺激信号传导区的细胞内结构域,该共刺激信号传导区包含 CD28多肽,如图9所示。如图9所示,CAR还包含共价接合至细胞 外抗原结合结构域的5’端的信号肽或前导序列。信号肽包含CD8多 肽。
在某些实施方式中,本发明公开的主题的CAR还可包含用于在 人细胞中表达核酸序列的诱导型启动子。用于表达CAR基因的启动 子可以是组成型启动子,比如泛素C(UbiC)启动子。
本发明公开的主题还提供编码本文所述的FcRL5靶向的CAR或 其功能部分的分离的核酸分子。在某些实施方式中,分离的核酸分子 编码本发明公开的FcRL5靶向的CAR,其包含与人FcRL5特异性地 结合的scFv、包含CD28多肽的跨膜结构域、以及包含CD3ξ多肽和共刺激信号传导区的细胞内结构域,该共刺激信号传导区包含CD28 多肽。在某些实施方式中,scFv是全人scFv。在某些实施方式中,scFv 是鼠scFv。在某些非限制性实施方式中,分离的核酸分子包含具有以 下提供的SEQ ID NO:951所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390000851
Figure BDA0003882604390000852
具有SEQ ID NO:951 的核苷酸序列的分离的核酸分子编码包含鼠scFv、包含CD28多肽的 跨膜结构域、以及包含CD3ξ多肽和共刺激信号传导区的细胞内结构 域的FcRL-5-靶向的CAR,其中鼠scFv包含:包含具有SEQID NO:915所示序列的氨基酸的重链可变区、包含具有SEQ ID NO:917 所示序列的氨基酸的轻链可变区、以及位于重链可变区与轻链可变区 之间具有SEQ ID NO:897的氨基酸序列的接头,该共刺激信号传导区 包含CD28多肽。
在另一具体非限制性实例中,分离的核酸分子包含具有以下所提 供的SEQ IDNO:952所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390000861
Figure BDA0003882604390000862
具有SEQ ID NO:952的核苷酸序列的分离的核酸分子编码包含鼠scFv、包含CD28 多肽的跨膜结构域、以及包含CD3ξ多肽和共刺激信号传导区的细胞 内结构域的FcRL-5-靶向的CAR,其中鼠scFv包含:包含具有SEQ ID NO:919所示序列的氨基酸的重链可变区、包含具有SEQ ID NO:921 所示序列的氨基酸的轻链可变区、以及位于链可变区与轻链可变区之 间具有SEQ ID NO:897的氨基酸序列的接头,该共刺激信号传导区包 含CD28多肽。
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:953所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390000871
Figure BDA0003882604390000881
Figure BDA0003882604390000891
Figure BDA0003882604390000901
Figure BDA0003882604390000902
具有 SEQ IDNO:953的核苷酸序列的分离的核酸分子编码FcRL-5-靶向的 CAR(指定为31FcRL5靶向的BBz CAR),该CAR包含全人scFv (由SEQ ID NO:953的核苷酸207-998编码)、跨膜结构域、以及细 胞内结构域,其中全人scFv包含:重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:116所示序列的氨基酸;轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:115 所示序列的氨基酸;以及位于重链可变区与轻链可变区之间具有SEQ ID NO:307的氨基酸序列的接头,跨膜结构域包含具有SEQ IDNO: 960的137-207的CD8多肽,且细胞内结构域包含含有SEQ ID NO: 941的氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包含具有SEQ ID NO:943的 氨基酸214-255的4-1BB多肽的共刺激信号传导区。SEQ ID NO:953 的核苷酸270-998编码人scFv。SEQ ID NO:953的核苷酸1008-1220编码包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:953的核苷酸 1221-1346编码包含在细胞内结构域中的4-1BB多肽。SEQ ID NO: 953的核苷酸1347-1685编码包含在细胞内结构域中的CD3ζ多肽。 SEQ ID NO:953的其它部分示于表232中。
表232
Figure BDA0003882604390000911
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:954所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390000912
Figure BDA0003882604390000921
Figure BDA0003882604390000931
Figure BDA0003882604390000941
具有SEQ ID NO:954的核苷酸序列的分离的核酸分子编码FcRL-5- 靶向的CAR(指定为39FcRL5靶向的BBz CAR),该CAR包含全 人scFv(由SEQ ID NO:954的核苷酸207-1013编码)、跨膜结构域、 以及细胞内结构域,其中全人scFv包含:重链可变区,其包含具有 SEQID NO:144所示序列的氨基酸;轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:143所示序列的氨基酸;以及位于重链可变区与轻链可变区之间 具有SEQ ID NO:307的氨基酸序列的接头,跨膜结构域包含具有SEQ ID NO:960的137-207的CD8多肽,且细胞内结构域包含含有SEQ ID NO:941的氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包含具有SEQ ID NO:943 的氨基酸214-255的4-1BB多肽的共刺激信号传导区。SEQ ID NO: 954的核苷酸207-1013编码人scFv。SEQ ID NO:954的核苷酸 1023-1235编码包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:954 的核苷酸1236-1361编码包含在细胞内结构域中的4-1BB多肽。SEQ ID NO:954的核苷酸1362-1700编码包含在细胞内结构域中的CD3ζ 多肽。SEQ ID NO:954的其它部分示于表233中。
表233
Figure BDA0003882604390000951
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:955所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390000952
Figure BDA0003882604390000961
Figure BDA0003882604390000971
Figure BDA0003882604390000981
Figure BDA0003882604390000982
具有SEQ ID NO:955的核苷酸序列的分 离的核酸分子编码FcRL-5-靶向的CAR(指定为69FcRL5靶向的BBz CAR),该CAR包含全人scFv(由SEQ ID NO:955的核苷酸207-1037 编码)、跨膜结构域、以及细胞内结构域,其中全人scFv包含:重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:172所示序列的氨基酸;轻链可变区, 其包含具有SEQ IDNO:171所示序列的氨基酸;以及位于重链可变区 与轻链可变区之间具有SEQ ID NO:307的氨基酸序列的接头,跨膜结 构域包含具有SEQ ID NO:960的137-207的CD8多肽,且细胞内结 构域包含含有SEQ ID NO:941的氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包 含具有SEQ ID NO:943的氨基酸214-255的4-1BB多肽的共刺激信 号传导区。SEQ ID NO:955的核苷酸207-1037编码人scFv。SEQ ID NO:955的核苷酸1047-1259编码包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:955的核苷酸1260-1385编码包含在细胞内结构域中的 4-1BB多肽。SEQ ID NO:955的核苷酸1386-1724编码包含在细胞内 结构域中的CD3ζ多肽。SEQ ID NO:955的其它部分示于表234中。
表234
Figure BDA0003882604390000991
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:956所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390001001
Figure BDA0003882604390001011
Figure BDA0003882604390001021
具有SEQ ID NO:956的核苷酸序列的分离的核酸分子编码FcRL-5- 靶向的CAR(指定为104FcRL5靶向的BBz CAR),该CAR包含全 人scFv(由核苷酸207-1010编码)、跨膜结构域、以及细胞内结构域, 其中全人scFv包含:重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:216所示序列的氨基酸;轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:215所示序列的 氨基酸;以及位于重链可变区与轻链可变区之间具有SEQ ID NO:307 的氨基酸序列的接头,跨膜结构域包含具有SEQ ID NO:960的 137-207的CD8多肽,且细胞内结构域包含含有SEQ ID NO:941的 氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包含具有SEQ ID NO:943的氨基酸 214-255的4-1BB多肽的共刺激信号传导区。SEQ ID NO:956的核苷 酸207-1010编码人scFv。SEQ ID NO:956的核苷酸1020-1232编码 包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:956的核苷酸 1233-1358编码包含在细胞内结构域中的4-1BB多肽。SEQ ID NO: 956的核苷酸1359-1697编码包含在细胞内结构域中的CD3ζ多肽。 SEQ ID NO:956的其它部分示于表235中。
表235
Figure BDA0003882604390001031
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:957所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390001041
Figure BDA0003882604390001051
Figure BDA0003882604390001061
Figure BDA0003882604390001062
具有SEQ ID NO:957的核苷酸序列的分离的核酸分子编码FcRL-5-靶向的CAR(指定为105FcRL5靶向的BBz CAR),该CAR 包含全人scFv(由核苷酸207-1019编码)、跨膜结构域、以及细胞内 结构域,其中全人scFv包含:重链可变区,其包含具有SEQ ID NO:220 所示序列的氨基酸;轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:219所示序 列的氨基酸;以及位于重链可变区与轻链可变区之间具有SEQ ID NO:307的氨基酸序列的接头,跨膜结构域包含具有SEQ ID NO:960 的137-207的CD8多肽,且细胞内结构域包含含有SEQ ID NO:941 的氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包含具有SEQ ID NO:943的氨基 酸214-255的4-1BB多肽的共刺激信号传导区。SEQ ID NO:957的核 苷酸207-1019编码人scFv。SEQ ID NO:957的核苷酸1029-1241编 码包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:957的核苷酸 1242-1367编码包含在细胞内结构域中的4-1BB多肽。SEQ ID NO: 957的核苷酸1368-1706编码包含在细胞内结构域中的CD3ζ多肽。 SEQ ID NO:957的其它部分示于表236中。
表236
Figure BDA0003882604390001071
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:958所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390001081
Figure BDA0003882604390001091
Figure BDA0003882604390001101
Figure BDA0003882604390001111
Figure BDA0003882604390001112
具有SEQ ID NO:958的核苷酸序列的分离的核酸分 子编码FcRL-5-靶向的CAR(指定为109FcRL5靶向的BBz CAR), 该CAR包含全人scFv(由核苷酸207-1031编码)、跨膜结构域、以 及细胞内结构域,其中全人scFv包含:重链可变区,其包含具有SEQ IDNO:236所示序列的氨基酸;轻链可变区,其包含具有SEQ ID NO:235所示序列的氨基酸;以及位于重链可变区与轻链可变区之间 具有SEQ ID NO:307的氨基酸序列的接头,跨膜结构域包含具有SEQ ID NO:960的137-207的CD8多肽,且细胞内结构域包含含有SEQ ID NO:941的氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包含具有SEQ ID NO:943 的氨基酸214-255的4-1BB多肽的共刺激信号传导区。SEQ ID NO: 957的核苷酸207-1031编码人scFv。SEQ ID NO:958的核苷酸 1041-1253编码包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:958 的核苷酸1254-1379编码包含在细胞内结构域中的4-1BB多肽。SEQ ID NO:958的核苷酸1380-1718编码包含在细胞内结构域中的CD3ζ 多肽。SEQ ID NO:958的其它部分示于表237中。
表237
Figure BDA0003882604390001113
Figure BDA0003882604390001121
在某些实施方式中,分离的核酸分子包含具有以下所提供的SEQ ID NO:959所示序列的核酸:
Figure BDA0003882604390001122
Figure BDA0003882604390001131
Figure BDA0003882604390001141
Figure BDA0003882604390001151
Figure BDA0003882604390001152
具有SEQ ID NO:959的核苷酸序列的分离的核酸分子编 码FcRL-5-靶向的CAR(指定为117FcRL5靶向的BBz CAR),该 CAR包含全人scFv(由SEQ ID NO:959的核苷酸207-1025编码)、 跨膜结构域、以及细胞内结构域,其中全人scFv包含:重链可变区, 其包含具有SEQ ID NO:268所示序列的氨基酸;轻链可变区,其包含 具有SEQ ID NO:267所示序列的氨基酸;以及位于重链可变区与轻链 可变区之间具有SEQ ID NO:307的氨基酸序列的接头,跨膜结构域包 含具有SEQ ID NO:960的137-207的CD8多肽,且细胞内结构域包 含含有SEQ ID NO:941的氨基酸52-163的CD3ξ多肽以及包含具有 SEQ ID NO:943的氨基酸214-255的4-1BB多肽的共刺激信号传导 区。SEQ ID NO:959的核苷酸207-1025编码人scFv。SEQID NO:959 的核苷酸1035-1247编码包含在跨膜结构域中的CD8多肽。SEQ ID NO:959的核苷酸1248-1373编码包含在细胞内结构域中的4-1BB多 肽。SEQ ID NO:959的核苷酸1374-1712编码包含在细胞内结构域中 的CD3ζ多肽。SEQ ID NO:959的其它部分示于表238中。
表238
Figure BDA0003882604390001161
在某些实施方式中,分离的核酸分子编码本发明公开的FcRL5 靶向的CAR的功能部分。本文使用的术语“功能部分”是指本发明 公开的FcRL5靶向的CAR的任何部分或片段,该部分或片段保留 FcRL5靶向的CAR(亲本CAR)的生物活性。例如,功能部分包括 保留识别靶细胞的能力以治疗疾病例如多发性骨髓瘤至与亲本CAR 相似、相同或甚至更高程度的本发明公开的FcRL5靶向的CAR的部 分或片段。在某些实施方式中,编码本发明公开的FcRL5靶向的CAR 的功能部分的分离的核酸分子可以编码包含例如SEQ ID NO:951、 SEQ ID NO:952、SEQ ID NO:953、SEQ ID NO:954、SEQ ID NO:955、 SEQ ID NO:956、SEQ ID NO:957、SEQ ID NO:958或SEQ ID NO:959 所示的核酸序列的亲本CAR的例如约10%、20%、25%、30%、35%、 40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90% 和95%或更多的蛋白质。
三.免疫应答细胞
本发明提供了表达包含细胞外抗原结合结构域、跨膜结构域和细 胞内结构域的CAR的免疫应答细胞,其中细胞外抗原结合结构域与 FcRL5(例如人FcRL5)特异性地结合,如上所述。在某些实施方式 中,细胞外抗原结合结构域与FcRL5的结构域7特异性地结合。在 某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域与FcRL5的结构域8特异 性地结合。在某些实施方式中,细胞外抗原结合结构域与FcRL5的 结构域9特异性地结合。可以对免疫应答细胞转导CAR,使得该细 胞表达CAR。本发明公开的主题还提供使用这样的细胞来治疗肿瘤 例如多发性骨髓瘤(MM)的方法。本发明公开的主题的免疫应答细 胞可以是淋巴谱系的细胞。包括B、T和自然杀伤(NK)细胞的淋 巴谱系提供抗体的产生、细胞免疫系统的调节、血液中的外来试剂的 检测、宿主外来细胞的检测等。淋巴谱系的免疫应答细胞的非限制性 实例包括T细胞、自然杀伤(NK)细胞、细胞毒性T淋巴细胞(CTL)、 调节性T细胞、胚胎干细胞和多能干细胞(例如,可分化成淋巴样细 胞的多能干细胞)。T细胞可以是在胸腺中成熟的淋巴细胞,并且主 要负责细胞介导的免疫。T细胞参与获得性免疫系统。本发明公开主 题的T细胞可以是任何类型的T细胞,包括但不限于T辅助细胞、 细胞毒性T细胞、记忆T细胞(包括中心记忆T细胞、干细胞样记 忆T细胞(或干样记忆T细胞)和两种类型的效应记忆T细胞(例如,TEM细胞和TEMRA细胞)、调节性T细胞(也称为抑制性T细胞)、 自然杀伤T细胞、粘膜相关恒定T细胞和γδT细胞。在某些实施方 式中,表达CAR的T细胞表达Foxp3以实现和维持T调节表型。自 然杀伤(NK)细胞可以是作为细胞介导的免疫的一部分并且在先天 免疫应答期间起作用的淋巴细胞。NK细胞不需要预先活化以便对靶 细胞发挥其细胞毒性作用。细胞毒性T细胞(CTL或杀伤T细胞) 是能够诱导受感染的体细胞或肿瘤细胞死亡的T淋巴细胞的亚类。
本发明公开主题的免疫应答细胞可以表达特异性地结合FcRL5 (例如人FcRL5)的细胞外抗原结合结构域(例如scFV、任选交联 的Fab、或F(ab)2),用于治疗多发性骨髓。这样的免疫应答细胞可以 施用于有此需要的受试者(例如人受试者),用于治疗多发性骨髓瘤。 在某些实施方式中,免疫应答细胞是T细胞。T细胞可以是CD4+ T 细胞或CD8+ T细胞。在某些实施方式中,T细胞是CD4+ T细胞。在 另一实施方式中,T细胞是CD8+ T细胞。
本发明公开的免疫应答细胞还可以转导有至少一种共刺激配体, 使得免疫应答细胞共表达或经诱导以共表达FcRL5特异性的CAR和 该至少一种共刺激配体。FcRL5特异性CAR与至少一种共刺激配体 之间的相互作用提供了对于免疫应答细胞(例如,T细胞)的完全激 活而言重要的非抗原特异性信号。共刺激配体包括但不限于肿瘤坏死 因子(TNF)超家族成员和免疫球蛋白(Ig)超家族配体。TNF是参 与全身炎症并刺激急性期反应的细胞因子。它的主要作用是调节免疫 细胞。TNF超家族的成员具有许多共同的特征。大多数TNF超家族 成员被合成作为包含短胞质区段和相对长的细胞外区的II型跨膜蛋 白(细胞外C-末端)。TNF超家族成员包括但不限于神经生长因子 (NGF)、CD40L(CD40L)/CD154、CD137L/4-1BBL、TNF-α、 CD134L/OX40L/CD252、CD27L/CD70、Fas配体(FasL)、 CD30L/CD153、肿瘤坏死因子β(TNFβ)/淋巴毒素-α(LTα)、淋巴毒素 -β(LTβ)、CD257/B细胞激活因子(BAFF)/Blys/THANK/Tall-1、糖皮 质激素诱导的TNF受体配体(GITRL)和TNF相关性细胞凋亡诱导 配体(TRAIL)、LIGHT(TNFSF14)。免疫球蛋白(Ig)超家族是参 与细胞识别、结合或粘附过程的大量细胞表面的可溶性蛋白质。这些 蛋白质与免疫球蛋白共享结构特征——它们具有免疫球蛋白结构域 (折叠)。免疫球蛋白超家族配体包括但不限于CD80和CD86、CD28 的两种配体、PD-1的配体PD-L1/(B7-H1)。在某些实施方式中,该至 少一种共刺激配体选自4-1BBL、CD80、CD86、CD70、OX40L、CD48、 TNFRSF14、PD-L1、及其组合。在某些实施方式中,免疫应答细胞 转导有一种共刺激配体4-1BBL。在某些实施方式中,免疫应答细胞 转导有两种共刺激配体4-1BBL和CD80。转导有至少一种共刺激配 体的CAR描述于美国专利第8,389,282号,其全部内容引入以供参考。
此外,本发明公开的免疫应答细胞还可以转导有至少一种细胞因 子,使得免疫应答细胞分泌该至少一种细胞因子以及表达FcRL5特 异性的CAR。在某些实施方式中,该至少一种细胞因子选自IL-2、 IL-3、IL-6、IL-7、IL-11、IL-12、IL-15、IL-17和IL-21。在某些实施方式中,细胞因子是IL-12。
FcRL5特异性或FcRL5靶向的人淋巴细胞可以用于外周供体淋 巴细胞,例如其公开于Sadelain,M.,等2003Nat Rev Cancer 3:35-45 (公开了遗传修饰成表达CAR的外周供体淋巴细胞);Morgan,R.A., 等2006Science 314:126-129(公开了经遗传修饰以表达包含α和β 异源二聚体的全长肿瘤抗原识别T细胞受体复合物的外周供体淋巴 细胞);Panelli,M.C.,等2000J Immunol 164:495-504;Panelli,M.C., 等2000J Immunol 164:4382-4392(公开了源自肿瘤活检中肿瘤浸润 淋巴细胞(TIL)的淋巴细胞培养物);和Dupont,J.,等2005Cancer Res 65:5417-5427;Papanicolaou,G.A.,等2003Blood 102:2498-2505(公开了使用人工抗原递呈细胞(AAPC)或脉冲树突状细胞选择性体外扩 增的抗原特异性外周血白细胞)。免疫应答细胞(例如T细胞)可以 是自体的、非自体的(例如同种异体的)、或在体外衍生自工程化的 祖细胞或干细胞。
在某些实施方式中,本发明公开的免疫应答细胞(例如T细胞) 表达约1至约4、约2至约4、约3至约4、约1至约2、约1至约3、 或约2至约3载体拷贝数/细胞的本发明公开的FcRL5特异性的CAR。
未纯化的CTL的来源可以是任何本领域已知的,比如骨髓、胎 儿、新生儿或成人或其他造血细胞来源,例如胎肝、外周血或脐带血。 可以采用各种技术来分离细胞。例如,阴性选择方法可以初步除去非 CTL。单克隆抗体对于鉴定与特定细胞谱系和/或分化阶段相关的用于 阳性和阴性选择的标志物特别有用。
大部分终末分化的细胞可以通过相对粗糙的分离在初始除去。例 如,磁珠分离可以用于初始除去大量不相关的细胞。优选地,在细胞 分离之前,至少约80%、通常至少70%的总造血细胞将被除去。
分离步骤包括但不限于密度梯度离心;重调(resetting);偶联至 改变细胞密度的颗粒;用抗体包被的磁珠进行磁性分离;亲和层析; 与mAb结合或联合使用的细胞毒试剂,包括但不限于补体和细胞毒 素;和用附着于例如板、芯片的固体基质的抗体淘选、淘洗或任何其 他方便的技术。
用于分离和分析的技术包括但不限于流式细胞术,其可具有不同 程度的复杂性,例如多个颜色通道、低角度和钝角光散射检测通道、 阻抗通道。
通过使用与死细胞相关的染料比如碘化丙啶(PI),可以相对于 死细胞来选择细胞。优选地,将细胞收集在包含2%胎牛血清(FCS) 或0.2%牛血清白蛋白(BSA)或任何其它合适的培养基中,优选无 菌的、等渗培养基。
四.载体
免疫应答细胞(例如,T细胞、CTL细胞、NK细胞)的遗传修 饰可以通过用重组DNA或RNA构建体转导基本上同源的细胞组合 物来实现。载体可以是逆转录病毒载体(例如,γ逆转录病毒),其 用于将DNA或RNA构建体导入宿主细胞基因组。例如,可以将编 码FcRL5特异性的CAR的多核苷酸克隆到逆转录病毒载体中,并且 可以从其内源启动子、从逆转录病毒长末端重复序列或从替代的内部 启动子驱动表达。
也可使用非病毒载体或RNA。可以使用随机染色体整合或靶向 整合(例如使用核酸酶、转录激活子样效应物核酸酶(TALEN)、锌 指核酸酶(ZFN)和/或规律成簇间隔短回文重复(CRISPR)或转基 因表达(例如使用天然或化学修饰的RNA)。
对于细胞的初始遗传修饰以提供表达FcRL5特异性的CAR的细 胞,通常使用逆转录病毒载体进行转导,然而可以使用任何其它合适 的病毒载体或非病毒递送系统。对于细胞的后续遗传修饰以提供包含 含有至少两种共刺激配体的抗原递呈复合物的细胞,逆转录病毒基因 转移(转导)同样证明是有效的。逆转录病毒载体和合适的组装线的 联合也是合适的,其中衣壳蛋白对于感染人细胞是有功能的。已知各 种产生双嗜性病毒的细胞系,包括但不限于PA12(Miller等(1985) Mol.Cell.Biol.5:431-437);PA317(Miller等(1986)Mol.Cell.Biol. 6:2895-2902);和CRIP(Danos等(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:6460-6464)。非嗜性颗粒也是合适的,例如,用VSVG、RD114 或GALV包衣假型包装的颗粒和本领域已知的任何其它颗粒。
可能的转导方法还包括将细胞与生产细胞的直接共培养,例如通 过Bregni等(1992)Blood 80:1418-1422的方法,或者用单独的病 毒上清或具有或没有合适的生长因子和聚阳离子的浓缩载体储备液 培养,例如通过Xu等(1994)Exp.Hemat.22:223-230;和Hughes 等(1992)J.Clin.Invest.89:1817的方法。
转导病毒载体可用于在免疫应答细胞中表达共刺激配体(例如 4-1BBL和IL-12)。优选地,选择的载体表现出高的感染效率和稳定 的整合和表达(参见例如Cayouette等,Human Gene Therapy 8: 423-430,1997;Kido等,Current Eye Research 15:833-844,1996; Bloomer等,Journal of Virology 71:6641-6649,1997;Naldini等, Science 272:263-267,1996;和Miyoshi等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 94:10319,1997)。可以使用的其他病毒载体包括例如腺病毒、慢病 毒和腺相关病毒载体、牛痘病毒、牛乳头瘤病毒或疱疹病毒,比如 Epstein-Barr病毒(也参见例如,Miller,Human Gene Therapy 15-14, 1990;Friedman,Science 244:1275-1281,1989;Eglitis等, BioTechniques 6:608-614,1988;Tolstoshev等,Current Opinion in Biotechnology 1:55-61,1990;Sharp,The Lancet337:1277-1278,1991; Cornetta等,Nucleic Acid Research and Molecular Biology36:311-322, 1987;Anderson,Science 226:401-409,1984;Moen,Blood Cells 17: 407-416,1991;Miller等,Biotechnology 7:980-990,1989;Le Gal La Salle等,Science 259:988-990,1993;和Johnson,Chest 107:77S-83S, 1995的载体)。逆转录病毒载体已充分开发,并已用于临床环境中 (Rosenberg等,N.Engl.J.Med 323:370,1990;Anderson等,美国专利号5,399,346)。
在某些非限制性实施方式中,表达本发明公开的FcRL5靶向的 CAR的载体是逆转录病毒载体,例如293galv9逆转录病毒载体。
非病毒方法也可以用于在细胞中表达蛋白质。例如,可以通过在 脂质转染(Feigner等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84:7413,1987;Ono 等,Neuroscience Letters17:259,1990;Brigham等,Am.J.Med.Sci. 298:278,1989;Staubinger等,Methods inEnzymology 101:512,1983)、 去唾液酸血清类粘蛋白-多聚赖氨酸缀合物(Wu等,Journalof Biological Chemistry 263:14621,1988;Wu等,Journal of Biological Chemistry264:16985,1989)的存在下施用核酸、或通过在外科条件 下的微注射(Wolff等,Science247:1465,1990)将核酸分子引入细 胞中。用于基因转移的其它非病毒方法包括体外使用磷酸钙、DEAE 葡聚糖、电穿孔和原生质体融合的转染。脂质体对于将DNA递送到 细胞中也可以是潜在有益的。正常基因移植到受试者的受影响组织中 也可以通过将正常核酸离体转移到可培养细胞类型(例如,自体的或 异源的原代细胞或其子代)中来实现,之后将细胞(或其子代)注射 到靶组织中或全身注射。重组受体也可以使用转座酶或靶向核酸酶 (例如锌指核酸酶、(兆碱基)大范围核酸酶或TALE核酸酶)获得 或得到。瞬时表达可以通过RNA电穿孔获得。
用于多核苷酸治疗方法的cDNA表达可以由任何合适的启动子 (例如,人巨细胞病毒(CMV)、猿猴病毒40(SV40)或金属硫蛋 白启动子)引导,并且受任何合适的哺乳动物调节元件或内含子(例 如,延伸因子1α增强子/启动子/内含子结构)调节。例如,如果需要, 可以使用已知优先引导特定细胞类型中的基因表达的增强子来引导 核酸的表达。所使用的增强子可以包括但不限于特征为组织或细胞特 异性增强子的那些增强子。或者,如果使用基因组克隆作为治疗性构 建体,则调节可以通过同源调节序列介导,或如果需要,通过来自包 括上述任何启动子或调节元件的异源来源的调节序列介导。
所得细胞可以在类似于未修饰细胞的条件下生长,由此可以扩增 修饰的细胞并用于多种目的。
五.多肽及类似物和多核苷酸
本发明公开的主题中还包括特异性地结合FcRL5(例如人 FcRL5)的细胞外抗原结合结构域(例如scFv,比如源自抗体F56和 F119的scFv、Fab或(Fab)2)、CD3ζ、CD8、CD28等多肽或其片段、 以及其编码多核苷酸,将它们以当在免疫应答细胞中表达时增强其抗 肿瘤活性的方式进行修饰。在某些实施方式中,本发明公开的主题还 提供特异性地结合结构域9FcRL5(例如人FcRL5的结构域7、结构 域8或结构域9)的细胞外抗原结合结构域(例如scFv、Fab或(Fab)2)、 CD3ζ、CD8、CD28等多肽或其片段、以及其编码多核苷酸,将它们 以当在免疫应答细胞中表达时增强其抗肿瘤活性的方式进行修饰。
本发明公开的主题提供通过产生序列中的改变来优化氨基酸序 列或核酸序列的方法。这样的改变包括某些突变、缺失、插入或翻译 后修饰。本发明公开的主题还包括本发明公开主题的任何天然存在的 多肽的类似物。类似物可以通过氨基酸序列差异、通过翻译后修饰或 通过两者而不同于本发明公开主题的天然存在的多肽。本发明公开主 题的类似物通常可以表现出与本发明公开主题的天然存在的氨基酸 序列的全部或部分至少约85%、约90%、约91%、约92%、约93%、 约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或更高同一 性。序列比较的长度为至少5、10、15、20、25、50、75、100或更 多个氨基酸残基。同样,在确定同一性程度的示例性方法中,可以使 用BLAST程序,e-3和e-100之间的概率得分表示密切相关的序列。修 饰包括多肽的体内和体外化学衍生化,例如乙酰化、羧化、磷酸化或糖基化;这样的修饰可以在多肽合成或加工期间或在用分离的修饰酶 处理之后发生。类似物还可以通过一级序列的改变而不同于本发明公 开主题的天然存在的多肽。这些改变包括天然和诱导的遗传变异体 (例如,产生自通过照射或暴露于甲磺酸乙酯的随机诱变或通过如 Sambrook,Fritsch和Maniatis,Molecular Cloning:A Laboratory Manual (第二版)CSH Press,1989,或同上Ausubel等所述的位点特异性诱 变)。还包括环化肽、分子和类似物,其包含除L-氨基酸外的残基, 例如D-氨基酸或非天然存在的或合成的氨基酸,例如β或γ氨基酸。
除了全长多肽之外,本发明公开的主题还提供本发明公开的主题 的多肽或肽结构域中任一者的片段。片段可以是至少5、10、13或 15个氨基酸。在某些实施方式中,片段是至少20个连续氨基酸、至 少30个连续氨基酸或至少50个连续氨基酸。在某些实施方式中,片 段是至少60至80、100、200、300或更多个连续氨基酸。本发明公 开的主题的片段可以通过本领域普通技术人员已知的方法产生,或者 可以由正常的蛋白质加工产生(例如从新生多肽中除去生物活性不需 要的氨基酸或通过备选mRNA剪接或备选蛋白质加工事件除去氨基 酸)。
非蛋白质类似物具有设计为模拟本发明蛋白质的功能活性的化 学结构。这样的类似物根据本发明公开的主题的方法施用。这样的类 似物可能超过原始多肽的生理活性。模拟设计的方法是本领域公知 的,并且可以根据这样的方法通过修饰化学结构来进行类似物的合 成,使得当在免疫应答细胞中表达时,所得的类似物增加原始多肽的 抗肿瘤活性。这些化学修饰包括但不限于取代替代的R基团和改变参 考多肽的特定碳原子的饱和度。蛋白质类似物可以对体内降解相对耐 受,导致施用时更长的治疗效果。用于测量功能活性的试验包括但不 限于下文实施例中描述的那些。
根据本发明公开的主题,编码特异性地结合FcRL5的细胞外抗 原结合结构域(例如scFV(例如源自抗体F56和F119的scFv)、Fab、 Fab’或(Fab’)2)、CD3ζ、CD8、CD28的多核苷酸可以通过密码子优化 进行修饰。密码子优化可以改变天然存在的和重组的基因序列,以在 任何给定的表达系统中实现最高可能水平的生产力。蛋白质表达的不 同阶段涉及的因素包括密码子适应性、mRNA结构以及转录和翻译中 的各种顺式元件。本领域技术人员已知的任何合适的密码子优化方法 或技术可用于修饰本发明公开主题的多核苷酸,包括但不限于 OPTIMUMGENETM、Encor优化和Blue Heron。
六.施用
可以全身或直接向受试者提供本发明公开的主题的FcRL5特异 性的CAR和表达它的免疫应答细胞,用于治疗或预防瘤形成。在某 些实施方式中,将FcRL5特异性的CAR和表达它的免疫应答细胞直 接注射到目标器官(例如,受瘤形成影响的器官)中。或者或另外,将FcRL5特异性的CAR和表达它的免疫应答细胞通过例如施用到循 环系统中(例如,肿瘤血管系统)间接提供给目标器官。可以在施用 细胞和组合物之前、期间或之后提供扩增和分化剂,以增加体外或体 内T细胞的产生。
本发明公开主题的FcRL5特异性的CAR和表达它的免疫应答细 胞可以以任何生理学可接受的手段施用,通常是血管内施用,尽管也 可以将它们引入骨或其他方便的部位,其中细胞可以找到合适的再生 和分化的部位(例如,胸腺)。通常,可以施用至少1×105个细胞, 最终达到1×1010个或更多。包含表达FcRL5特异性的CAR的免疫 应答细胞的细胞群体可以包含纯化的细胞群体。本领域技术人员可以 使用各种公知的方法,比如荧光激活细胞分选(FACS),容易地确定 细胞群体中免疫应答细胞的百分比。包含经遗传修饰的表达FcRL5 特异性的CAR的免疫应答细胞的细胞群体中的纯度范围可以是约 50%至约55%、约55%至约60%、约65%至约70%、约70%至约 75%、约75%至约80%、约80%至约85%、约85%至约90%、约 90%至约95%、或约95至约100%。本领域技术人员可以容易地调 整剂量(例如,纯度的降低可能需要增加剂量)。免疫应答细胞可通 过注射、导管等引入。如果需要,还可以包含因子,包括但不限于白 细胞介素,例如IL-2、IL-3、IL 6、IL-11、IL-7、IL-12、IL-15、IL-21 以及其它白细胞介素,集落刺激因子,比如G-、M-和GM-CSF,干 扰素,例如γ-干扰素。
本发明公开主题的组合物包括药物组合物,其包含表达FcRL5 特异性的CAR的免疫应答细胞和药学上可接受的载体。施用可以是 自体的或非自体的。例如,表达FcRL5特异性的CAR的免疫应答细 胞和包含它的组合物可以从一个受试者获得,并施用于相同受试者或 不同的相容受试者。可以通过局部注射,包括导管给药、全身注射、 局部注射、静脉内注射或胃肠外给药来施用本发明公开主题的外周血 来源的T细胞或其子代(例如,体内、离体或体外衍生的)。当施用 本发明公开主题的药物组合物(例如包含表达FcRL5特异性的CAR的免疫应答细胞的药物组合物)时,通常可以将其配制成单位剂量可 注射形式(溶液、悬浊液、乳浊液)。
七.制剂
本发明公开主题的表达总体FcRL5特异性的CAR的免疫应答细 胞和包含它的组合物可以方便地作为无菌液体制剂提供,例如等渗水 溶液、悬浊液、乳浊液、分散液或粘性组合物,其可以缓冲至选定的 pH。液体制剂通常比凝胶、其它粘性组合物和固体组合物更容易制 备。此外,液体组合物更方便施用,特别是通过注射。另一方面,粘 性组合物可以在适当的粘度范围内配制,以提供与特定组织的更长的 接触时间。液体或粘性组合物可以包含载体,其可以是包含例如水、 盐水、磷酸盐缓冲盐水、多元醇(例如甘油、丙二醇、液体聚乙二醇 等)和合适的其混合物的溶剂或分散介质。
如果需要,无菌可注射溶液可以通过将包含表达本发明公开主题 的总体FcRL5特异性的CAR的免疫应答细胞的组合物掺入所需量的 具有各种量的其它成分的合适溶剂中进行制备。这样的组合物可以与 合适的载体、稀释剂或赋形剂如无菌水、生理盐水、葡萄糖、右旋糖 等混合。组合物也可以是冻干的。根据给药途径和所需制剂,组合物 可以包含辅助物质,比如润湿剂、分散剂或乳化剂(例如甲基纤维素)、 pH缓冲剂、凝胶或增粘添加剂、防腐剂、调味剂、着色剂等。可以 参考标准教科书,比如引入本文以供参考的“REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCE”,第17版,1985,来制备合适的制 剂,而无需过多的实验。
可以加入增强组合物的稳定性和无菌性的各种添加剂,包括抗微 生物防腐剂、抗氧化剂、螯合剂和缓冲剂。可以通过各种抗细菌剂和 抗真菌剂,例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸等来确保防 止微生物的作用。可注射药物形式的延长吸收可以通过使用延迟吸收 的试剂,例如明矾单硬脂酸盐和明胶来实现。然而,根据本发明,使 用的任何载体、稀释剂或添加剂必须与表达本发明公开主题的总体 FcRL5特异性的CAR的免疫应答细胞相容。
组合物可以是等渗的,即它们可以具有与血液和泪液相同的渗透 压。本发明公开主题的组合物的所需等渗性可使用氯化钠或其它药学 上可接受的试剂比如右旋糖、硼酸、酒石酸钠、丙二醇或其它无机或 有机溶质来完成。特别优选氯化钠用于含有钠离子的缓冲液。
如果需要,组合物的粘度可以使用药学上可接受的增稠剂保持在 选定的水平。可以使用甲基纤维素,因为它容易购得且经济可行并且 易于操作。其它合适的增稠剂包括例如黄原胶、羧甲基纤维素、羟丙 基纤维素、卡波姆等。增稠剂的浓度可以取决于所选择的试剂。重要 的是使用将实现所选定的粘度的量。显然,合适的载体和其它添加剂 的选择将取决于确切的给药途径和特定剂型的性质,例如液体剂型 (例如,是否将组合物配制成溶液、悬浊液、凝胶或另一液体形式, 比如时间释放形式或液体填充形式)。
本领域技术人员将认识到,组合物的组分应当选择为化学惰性 的,并且不会影响如本发明公开主题中所述的免疫应答细胞的存活力 或功效。对化学和药学原理的技术人员将不存在问题,或者可以从本 公开和本文引用的文献通过参考标准教科书或通过简单实验(不涉及 过多实验),容易地避免问题。
关于本发明公开主题的免疫应答细胞的治疗用途的一个考虑是 获得最佳效果所必需的细胞的量。待施用的细胞的量将根据所治疗的 受试者而变化。在某些实施方式中,将约104至约1010、约105至约 109、或约106至约108个本发明公开主题的免疫应答细胞施用于受试 者。更有效的细胞可以以甚至更小的数量施用。在某些实施方式中, 将至少约1x108、约2x108、约3x108、约4x108和约5x108个本 发明公开主题的免疫应答细胞施用于人受试者。精确确定将被认为是 有效剂量的量可以基于每个受试者个体的因素,包括其大小、年龄、 性别、体重和特定受试者的状况。剂量可以由本领域技术人员从本公 开和本领域的知识中容易地确定。
本领域技术人员可容易地确定组合物中细胞和任选的添加剂、媒 介物和/或载体的量,并且确定哪些在本发明公开的主题的方法中施 用。通常,任何添加剂(除了活性细胞和/或物质之外)在磷酸盐缓 冲盐水中以约0.001wt%至约50wt%的溶液的量存在,并且活性成 分是以微克至毫克的数量级,比如约0.0001wt%至约5wt%、约 0.0001wt%至约1wt%、约0.0001wt%至约0.05wt%、约0.001wt% 至约20wt%、约0.01wt%至约10wt%或约0.05wt%至约5wt%存 在。对于要施用于动物或人的任何组合物,以及对于任何特定的施用 方法,应当确定毒性,比如通过在合适的动物模型例如啮齿动物比如 小鼠中测定致死剂量(LD)和LD 50;和引起合适的应答的组合物的 剂量、其中组分的浓度和施用组合物的时间。这样的确定根据本领域 技术人员的知识、本公开和本文引用的文献并不需要过度实验。并且, 可以在没有过度实验的情况下确定顺序施用的时间。
八.治疗方法
肿瘤微环境.
肿瘤具有敌对于宿主免疫应答的微环境,其涉及恶性细胞的一连 续机制以保护自身免于免疫识别和清除。这种“不利的肿瘤微环境” 包括多种免疫抑制因子,包括浸润性调节性CD4+ T细胞(Treg)、骨 髓衍生抑制细胞(MDSC)、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、包括IL-10 和TGF-β的免疫抑制性细胞因子,以及靶向由活化T细胞(CTLA-4 和PD-1)表达的免疫抑制性受体的配体的表达。这些免疫抑制机制 在维持耐受性和抑制不适当的免疫应答中起作用,然而在肿瘤微环境 内,这些机制阻止有效的抗肿瘤免疫应答。总之,这些免疫抑制因子 可以诱导过继转移的CAR修饰的T细胞在遇到靶向的肿瘤细胞时显 著的无反应性或凋亡。
肿瘤免疫学的挑战.
有效的肿瘤免疫需要肿瘤抗原识别和免疫效应细胞的无对抗的 肿瘤清除。肿瘤抗原必须包含由肿瘤递呈并且可以被特异性细胞毒性 T淋巴细胞(CTL)识别的肽表位。引发的CTL必须扩增到足够数量 并迁移到肿瘤位点,在其中它们成熟为效应物以实现其功能,这种功 能通过辅助性T细胞增强并由Treg和抑制性巨噬细胞抑制。
使用工程化改造的T淋巴细胞的靶向T细胞疗法.
T细胞工程是一个开创性的战略,以潜在解决许多以前观察到的 早期免疫治疗方法的缺点。在过去一年中,研究人员报道了复发的 (Brentjens等,Blood 118,4817-4828(2011)和Brentjens等,Science translational medicine 5,177ra138(2013))、耐药(chemorefractory)白 血病和转移性黑色素瘤(Hunder等,N.Engl.J.Med.358,2698-2703(2008);Rosenberg等,Nat.Rev.Cancer 8,299-308(2008);和Dudley 等,J Clin Oncol26,5233-5239(2008))中的显著的完全缓解,其是靶 向特定抗原(分别为CD19和NY-ESO-1)的自体外周血T细胞获得 的。
遗传方法的原理:细胞工程可以用于将T细胞重定向至肿瘤抗原 并增强T细胞功能。遗传性T细胞修饰的一个动力是增强T细胞存 活和扩增并抵消T细胞死亡、无反应性和免疫抑制的潜力。还可以改 进T细胞的遗传靶向以防止正常组织的不期望的破坏。
嵌合抗原受体(CAR):可以通过转移编码CAR的基因产生肿瘤 特异性T细胞(Brentjens等,Clin.Cancer Res.13,5426-5435(2007); Gade等,Cancer Res.65,9080-9088(2005);Maher等,Nat.Biotechnol. 20,70-75(2002);Kershaw等,J Immunol 173,2143-2150(2004); Sadelain等,Curr Opin Immunol(2009);和Hollyman等,J Immunother32,169-180(2009))。第二代CAR包含肿瘤抗原结合结构域,其融合 到能够激活T细胞的细胞内信号传导结构域,以及设计为增强T细 胞效能和持续性的共刺激结构域(Sadelain等,Cancer discovery 3, 388-398(2013))。因此CAR设计可以协调抗原识别与信号传导,这是生理上由两个单独的复合物TCR异二聚体和CD3复合物承担的两 种功能。CAR的细胞外抗原结合结构域通常来源于鼠单克隆抗体 (mAb)或来自受体或其配体。因此,抗原识别是非MHC限制的 (Riviere等,Curr Hematol Rep 3,290-297(2004);和Stephan等,Nat.Med.13,1440-1449(2007)),因此使用相同的CAR适用于表达靶抗原 的任何患者。通过CAR的抗原结合触发细胞内结构域中免疫受体酪 氨酸类激活基序(ITAM)的磷酸化,启动细胞裂解诱导、细胞因子 分泌和增殖所需的信号传导级联。由于抗原识别的MHC限制被绕过,CAR靶向T细胞的功能不受HLA下调或抗原加工装置中的缺陷的影 响。
T细胞对于扩增和存活的要求:肿瘤特异性T细胞的增殖在离体 是需要的,并且在体内可以说是期望的。T细胞增殖必须伴随T细胞 存活以允许绝对T细胞扩增和持续。为了响应抗原而增殖,T细胞必 须接收两种信号。一种是由抗原递呈细胞(APC)的表面上展示的抗 原肽/MHC复合物的TCR识别所提供(Sadelain等,Curr Opin Immunol (2009))。另一种由T细胞共刺激受体,比如CD28或4-1BB受体所 提供。虽然T细胞的细胞裂解活性不需要伴随的共刺激,但是如先前 所证明的(Maher等,Nat.Biotechnol.20,70-75(2002);Sadelain等, Cancer discovery 3,388-398(2013);Krause等,J Exp Med 188,619-626 (1998);Gong等,Neoplasia.1,123-127(1999);和Lyddane等, J.Immunol.176,3306-3310(2006)),对于提供共刺激信号以维持过继 转移T细胞的抗肿瘤功能,存在关键需求。
免疫监测:淋巴细胞是多功能“药物”,其在输注后表现出动态 演变效应。在遇到抗原时,肿瘤特异性T细胞活化和/或释放多种可 以触发肿瘤杀伤、T细胞增殖和其它免疫细胞的募集或免疫调节的蛋 白质。因此,测量哪些蛋白质从哪些细胞分泌、以什么数量和在什么 时间点,产生了针对特定患者为什么反应或不反应的深刻见解,并且 为设计更有效的试验提供关键反馈。这些试验系统将允许直接和有意 义的临床方法比较,从而有助于设计合理的下一代治疗策略。
对于治疗,施用的量是有效产生所需效果的量。可以在一次或系 列施用中提供有效量。可以在推注或通过连续灌注提供有效量。
“有效量”(或“治疗有效量”)是足以在治疗后影响有益或期望 的临床结果的量。可以以一个或多个剂量将有效量施用于受试者。在 治疗方面,有效量是足以减轻、改善、稳定、逆转或减缓疾病的进展 或以其它方式减少疾病的病理学后果的量。有效量通常由医生根据具 体情况确定,并且在本领域技术人员的技能范围内。当确定合适剂量 以达到有效量时,通常考虑几个因素。这些因素包括受试者的年龄、 性别和体重、所治疗的病症、病症的严重程度以及施用的免疫应答细 胞的剂型和有效浓度。
对于使用抗原特异性T细胞的过继免疫治疗,通常输注约106至 约1010(例如约109)范围内的细胞剂量。当将免疫应答细胞施用于 受试者并随后分化时,免疫应答细胞诱导为特异性针对一种特定抗原(例如,FcRL5)。T细胞的“诱导”可以包括比如通过缺失或无反应 性实现的抗原特异性T细胞的失活。失活对于建立或重建比如在自身 免疫性疾病中的耐受性特别有用。本发明公开主题的免疫应答细胞可 以通过本领域已知的任何方法施用,包括但不限于胸膜施用、静脉内 施用、皮下施用、结内施用、肿瘤内施用、鞘内施用、胸膜内施用、 腹膜内施用和直接施用于胸腺。在某些实施方式中,免疫应答细胞和 包含它的组合物静脉施用于需要的受试者。
本发明公开的主题提供使用表达FcRL5特异性的CAR的免疫应 答细胞(例如,T细胞)的各种方法。例如,本发明公开的主题提供 减少受试者的肿瘤负荷的方法。在一个非限制性实例中,减少肿瘤负 荷的方法包括将有效量的本发明公开的免疫应答细胞施用于受试者, 从而在受试者中诱导肿瘤细胞死亡。本发明公开的免疫应答细胞可以 减少受试者中肿瘤细胞的数量、减小肿瘤尺寸和/或根除肿瘤。适当 肿瘤的非限制性实例包括多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤(尤其是套 细胞)、霍奇金淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴细胞 白血病(ALL)、毛细胞白血病、伯基特淋巴瘤和瓦氏巨球蛋白血症。
本发明公开的主题还提供增加或延长患有瘤形成的受试者的存 活的方法。在一个非限制性实例中,增加或延长患有瘤形成的受试者 的存活的方法包括将有效量的本发明公开的免疫应答细胞施用于受 试者,从而增加或延长受试者的存活。该方法可以减少或根除受试者 中的肿瘤负荷。本发明公开的主题还提供用于治疗或预防受试者中的 瘤形成的方法,包括将本发明公开的免疫应答细胞施用于受试者。
本文使用的术语“瘤形成”是指以细胞或组织的病理增殖及其随 后向其它组织或器官的迁移或侵袭为特征的疾病。瘤形成生长通常是 不受控制的和进行性的,并且在不会引起或将导致正常细胞增殖停止 的条件下发生。瘤形成可以影响多种细胞类型、组织或器官,包括但 不限于选自膀胱、结肠、骨、脑、乳腺、软骨、神经胶质、食管、输 卵管、胆囊、心脏、肠、肾脏、肝脏、肺、淋巴结、神经组织、卵巢、 胸膜、胰腺、前列腺、骨骼肌、皮肤、脊髓、脾、胃、睾丸、胸腺、 甲状腺、气管、泌尿生殖道、输尿管、尿道、子宫和阴道的器官,或 其组织或细胞类型。瘤形成包括癌症,例如肉瘤(sarcomas)、癌 (carcinoma)或浆细胞瘤(浆细胞的恶性肿瘤)。
可使用本发明公开主题的免疫应答细胞抑制其生长的癌症包括 通常对免疫治疗应答的癌症。用于治疗的癌症的非限制性实例包括多 发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤(尤其是套细胞)、霍奇金淋巴瘤、慢 性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、毛细胞白 血病、伯基特淋巴瘤和瓦氏巨球蛋白血症。在某些实施方式中,癌症 是多发性骨髓瘤。
另外,本发明公开的主题提供响应受试者中的癌细胞而增加免疫 激活细胞因子产生的方法。在一个非限制性实例中,该方法包括将本 发明公开的免疫应答细胞施用于受试者。免疫激活细胞因子可以是粒 细胞巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、TNF-α、 IL-2、IL-3、IL-6、IL-11、IL-7、IL-12、IL-15、IL-21、干扰素调节 因子7(IRF7)、及其组合。在某些实施方式中,本发明公开主题的 包含FcRL5特异性的CAR的免疫应答细胞增加GM-CSF、IFN-γ和/ 或TNF-α的产生。
进行治疗的合适的人受试者通常包括可以通过临床标准区分的 两个治疗组。具有“晚期疾病”或“高肿瘤负荷”的受试者是具有临 床可测量的肿瘤(例如多发性骨髓瘤)的受试者。临床可测量的肿瘤 是可以基于肿瘤块检测的(例如通过触诊、CAT扫描、声波图、乳房 X线照片或X射线;在其本身上的阳性生物化学或组织病理学标志 物不足以鉴定该群体)的肿瘤。将本发明公开主题中实施的药物组合 物施用于这些受试者以引起抗肿瘤反应,目的是减轻他们的病症。理 想地,结果是发生肿瘤块的减小,但是任何临床改善均构成益处。临 床改善包括降低的肿瘤(例如多发性骨髓瘤)的风险或进展速率或病 理学后果的减少。
第二组合适的受试者在本领域中称为“辅助组”。他们是患有瘤 形成(例如多发性骨髓瘤)史但已对另一种治疗模式应答的个体。先 前的治疗可以包括但不限于手术切除、放射治疗和传统化疗。结果, 这些个体没有临床可测量的肿瘤。然而,他们被怀疑在原始肿瘤部位 附近或通过转移而处于疾病进展的风险中。该组可以进一步细分为高 风险和低风险个体。根据在初始治疗之前或之后观察到的特征进行细 分。这些特征在临床领域中是已知的,并且对于每种不同的瘤形成被 适当地定义。通常的高风险亚组的特征是其中肿瘤(例如多发性骨髓 瘤)已侵入邻近组织或显示淋巴结参与的那些。另一组具有瘤形成(例如多发性骨髓瘤)的遗传易感性,但尚未证实瘤形成(例如多发性骨 髓瘤)的临床表现。例如,对于仍然处于育龄期但在与乳腺癌相关的 遗传突变的测试为阳性的妇女,可希望预防性地接受本文所述的一种 或多种抗原结合片段的治疗以防止瘤形成的发生,直到适合于进行预 防性手术。
受试者可以具有晚期形式的疾病(例如多发性骨髓瘤),在这种 情况下,治疗目标可以包括缓解或逆转疾病进展和/或减轻副作用。 受试者可以具有病史,对此他们已经经过治疗,在这种情况下,治疗 目标通常包括复发风险的降低或延迟。
可以对表达FcRL5特异性的CAR的免疫应答细胞(例如,T细 胞)引入进一步修饰以避免或最小化免疫并发症(称为“恶性T细胞 转化”)的风险,例如移植物抗宿主病(GvHD),或当健康组织表达 与肿瘤细胞相同的靶抗原时,导致与GvHD相似的结果。这个问题的 潜在解决方案是将自杀基因工程化到表达CAR的T细胞中。合适的 自杀基因包括但不限于单纯疱疹病毒胸苷激酶(hsv-tk)、诱导型半胱 天冬酶9自杀基因(iCasp-9)和截短的人表皮生长因子受体(EGFRt) 多肽。在某些实施方式中,自杀基因是EGFRt多肽。EGFRt多肽可 以通过施用抗EGFR单克隆抗体(例如西妥昔单抗(cetuximab))来 使T细胞能够清除。EGFRt可以共价接合到FcRL5特异性的CAR的 细胞内结构域的3’端。可以将自杀基因包含在含有编码本发明公开的 FcRL5特异性的CAR的核酸的载体中。以这种方式,施用一种设计 为在恶性T细胞转化期间(例如GvHD)活化自杀基因的前药(例如, 可以活化iCasp-9的前药如AP1903)引发自杀基因活化的表达CAR 的T细胞的凋亡。
九.试剂盒
本发明公开的主题提供用于治疗或预防瘤形成(例如多发性骨髓 瘤)的试剂盒。在某些实施方式中,试剂盒包含治疗或预防组合物, 其以单位剂量形式包含有效量的包含FcRL5特异性的CAR的免疫应 答细胞。在具体实施方式中,细胞还表达至少一种共刺激配体。在某 些实施方式中,试剂盒包含含有治疗性或预防性疫苗的无菌容器;这 样的容器可以是盒、安瓿、瓶、小瓶、管子、袋子、小袋、泡罩包装 或本领域已知的其它合适的容器形式。这样的容器可以由塑料、玻璃、 层压纸、金属箔或适合于保存药物的其它材料制成。
如果需要,免疫应答细胞与用于将细胞施用于患有或有风险发生 瘤形成(例如多发性骨髓瘤)的受试者的说明书一起提供。说明书通 常将包括关于使用组合物用于治疗或预防瘤形成(例如多发性骨髓 瘤)的信息。在其它实施方式中,说明书包括以下当中的至少一种: 治疗剂的描述;用于治疗或预防瘤形成(例如多发性骨髓瘤)或其症 状的剂量方案和给药;注意事项;警告;适应症;禁忌症;过剂量信 息;不良反应;动物药理学;临床研究;和/或参考文献。说明书可 直接打印在容器(如果存在的话)上,或作为贴于容器的标签,或者 作为提供于容器中或与容器在一起的单独的纸、册、卡或折叠印刷品。
十.示例性细胞外抗原结合结构域(例如scFv)
表1
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十一.示例性细胞外抗原结合结构域(例如scFv),其包含重链可 变区、轻链可变区和接头肽
表77
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表78
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表137
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表138
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表139
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表141
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表142
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表143
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表144
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表145
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表146
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表147
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表148
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表149
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表151
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表152
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十二.示例性细胞外抗原结合结构域(例如scFv),其包含重链可变区、轻 链可变区、接头肽以及His-标签和HA-标签
表153
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表154
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表155
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表156
Figure BDA0003882604390002602
表157
Figure BDA0003882604390002603
Figure BDA0003882604390002611
表158
Figure BDA0003882604390002612
Figure BDA0003882604390002621
表159
Figure BDA0003882604390002622
表160
Figure BDA0003882604390002623
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表161
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表162
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表163
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表164
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表165
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表166
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表167
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表168
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表169
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表170
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表171
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表172
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表173
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表174
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表175
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表176
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表177
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表178
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表179
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表180
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表181
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表182
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表183
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表184
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表185
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表186
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表187
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表188
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表189
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表190
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表191
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表192
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表193
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表194
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表195
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表196
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表197
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表198
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表199
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表200
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表201
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表202
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表203
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表204
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表205
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表206
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表207
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表208
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表209
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表210
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表211
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表212
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表213
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表214
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表215
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表216
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表217
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表218
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表219
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表220
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表221
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表222
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表223
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表224
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表225
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表226
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表227
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表228
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表230
CDR CDR序列 SEQ ID NO
VHCDR1 IFGLH SEQ ID NO:923
VHCDR2 YISGDSNTIYYADTVKG SEQ ID NO:924
VHCDR3 NSYYALDY SEQ ID NO:925
VLCDR1 RASSSVSSSYLH SEQ ID NO:926
VLCDR2 STSNLAS SEQ ID NO:927
VLCDR3 QQYSGYPWT SEQ ID NO:928
VHCDR1 SFGMH SEQ ID NO:929
VHCDR2 YISSGSNNIYFADTVKG SEQ ID NO:930
VHCDR3 SEYYGSSHMDY SEQ ID NO:931
VLCDR1 KASQNVGTNVA SEQ ID NO:932
VLCDR2 SATYRNS SEQ ID NO:933
VLCDR3 QQYNRYPYT SEQ ID NO:934
实施例
除非另有说明,本发明的实践采用分子生物学(包括重组技术)、 微生物学、细胞生物学、生物化学和免疫学的常规技术,其完全在本 领域技术人员的能力范围内。这些技术在文献中有充分解释,比如 “Molecular Cloning:A Laboratory Manual”,第二版(Sambrook,1989); “Oligonucleotide Synthesis”(Gait,1984);“Animal Cell Culture”(Freshney,1987);“Methods in Enzymology”“Handbook of Experimental Immunology”(Weir,1996);“Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells”(Miller和Calos,1987);“Current Protocols in Molecular Biology”(Ausubel,1987);“PCR:The PolymeraseChain Reaction”,(Mullis,1994);“Current Protocols in Immunology”(Coligan,1991)。这些技术适用于制备本发明的多核苷酸和多肽,并且照此可以 在做出和实施本发明时考虑。在下面的部分中将讨论用于具体实施方 式的特别有用的技术。
提出以下实施例以便为本领域普通技术人员提供如何进行和利用 本发明的试验、筛选和治疗方法的完全公开和说明,并且不意在限制 发明人视为其发明的发明范围。
实施例1.各种组织中的FcRL5表达
在各种组织中评估和评价人FcRL5的表达。如图1所示,人FcRL5 在淋巴瘤和多发性骨髓瘤中高度表达,但在其它组织中并非如此。图1 的顶图示出人FcRL5在来自癌细胞系百科全书(CCLE)的肿瘤细胞系 中的差异表达。图1的底图示出人FcRL5在来自BioGPS的正常组织 中的差异表达。如图1所示,相比于其它恶性细胞,人FcRL5表达限 于MM和淋巴瘤。正常表达似乎限于B-细胞和浆细胞。基于发明人对 CD19靶向的CAR T细胞的患者经验,潜在FcRL5靶向的CAR T细胞 根除这些正常细胞类型可能没有显著的不良反应。生理抗体产生的任 何缺乏均可以通过静脉免疫球蛋白治疗解决。
实施例2.使用全人噬菌体展示库选择FcRL5特异性ScFv
使用细胞淘选策略用人scFv天然和半合成噬菌体子库进行针对 FcRL5的噬菌体展示选择。在阳性淘选中使用过表达FcRL5的3T3细 胞,在阴性淘选中使用过表达FcRL1、2、3、4和6的3T3细胞(总 共5个细胞系)(图2)。然后洗脱结合的克隆并将其用于感染大肠杆菌(E.Coli)XL1-Blue。如前所述地纯化细菌中表达的scFv噬菌体克隆 (Yasmina等,Probingthe binding mechanism and affinity of tanezumab,a recombinant humanized anti-NGF monoclonal antibody,using a repertoire of biosensors.Protein Science2008,17(8):1326-1335;Roberts等, Vaccination with CD20 peptides induces abiologically active,specific immune response in mice.Blood 2002,99(10):3748-3755)。进行约3至约 4轮淘选,以使与FcRL5特异性地结合的scFv噬菌体克隆富集。通过ELISA法针对His-标签FcRL5测定阳性克隆。
还使用过表达FcRL5的细胞系3T3和Raji通过流式细胞术测试阳 性克隆对活细胞表面上FcRL5的结合。然后洗涤细胞,并使用以下步 骤进行染色:首先可以用纯化的scFv噬菌体克隆对细胞进行染色,然 后用小鼠抗-M13 mAb进行染色,最后用缀合于PE的马抗小鼠Ig进行 染色。各个染色步骤在冰上在30-60分钟内完成,并且在各个染色步骤 之间将细胞洗涤两次。
通过筛选识别并确认出对FcRL5特异性的76个独特克隆(参见表 1-229和图2)。
实施例3.选择对FcRL5的结构域9特异性的ScFv
FcRL5包含9个细胞外免疫球蛋白样结构域(结构域1-9),且可 以以可溶同种型、糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定型同种型和跨膜型同种 型存在于细胞内(图3A)。如图3A所示,FcRL5的跨膜型同种型具有 结构域9;而可溶同种型和GPI锚定型同种型则不然。
为测试scFv是否对于FcRL5的结构域9具有特异性,进一步将 76个克隆在过表达编码具有结构域9缺失的FcRL5(FcRL5Δdom9) 的载体的3T3细胞上加以筛选,且进一步在过表达全长FcRL5的Raji 细胞上加以筛选(图3B-D)。与对过表达FcRL5的3T3细胞的结合相比,一些克隆对过表达FcRL5-结构域9缺失的3T3细胞显示出降低的 或减少的结合。图4、5、6、7和8分别显示ET200-39、ET200-104、 ET200-105、ET200-109和ET200-117对FcRL5的结构域9的特异性。
实施例4.鼠FcRL5特异性的CAR的构建体
为了产生靶向人FcRL5的scFv,获得两个市售的结合人FcRL5上 不同细胞外表位的小鼠杂交瘤(Franco(2013);Ise等(2005);Ise等 (2006))。从这些杂交瘤获得两种靶向人FcRL5的scFv。一种scFv通 过合成带有具有SEQ ID NO:897的氨基酸序列的G4S接头的如Ise等 (2005)中所述的鼠抗人FcRL5抗体F56的重链和轻链可变区来产生。 第二种scFv通过合成带有具有SEQ ID NO:897的氨基酸序列的G4S 接头的如Ise等(2005)中所述的鼠抗人FcRL5抗体F119的重链和轻链 可变区来产生。
产生两种FcRL5 CAR:F56 FcRL5-28z CAR和F119 FcRL5-28z CAR。F56 FcRL5-28zCAR和F119 FcRL5-28z CAR具有相似的结构, 例如各自具有包含CD28多肽的跨膜结构域,以及包含CD3ξ多肽和包 含CD28多肽的共刺激信号传导区的细胞内结构域,如图9A所示。F56 FcRL5-28z CAR包含源自抗体F56的scFv,且F119 FcRL5-28z CAR 包含源自抗体F119的scFv。将F56 FcRL5-28z CAR和F119 FcRL5-28z CAR中的各个克隆到逆转录病毒载体293galv9中。对人T细胞(来自 健康供体的未选择的(CD4和CD8)人T细胞)转导F56 FcRL5-28z CAR 和F119 FcRL5-28z CAR中的各个,使得T细胞表达F56 FcRL5-28z CAR或F119FcRL5-28z CAR。
实施例5.人FcRL5特异性的CAR的构建体
该实施例公开了使用本文所述的全人scFv产生靶向人FcRL5的 CAR。使用ET200-31 scFv、ET200-39 scFv、ET200-69 scFv、ET200-104 scFv、ET200-105 scFv、ET200-109scFv和ET200-117 scFv来产生具 有4-1BB共刺激结构域和CD3ξ多肽的第二代FcRL5靶向的CAR,其 称为31FcRL5 BBz CAR、39FcRL5 BBz CAR、69FcRL5 BBz CAR、 104FcRL5 BBz CAR、105FcRL5 BBz CAR、109FcRL5 BBz CAR和 117FcRL5 BBz CAR(参见图9B-16)。FcRL5靶向的包含4-1BB的CAR 具有相似的结构,例如各自具有CD8a多肽跨膜结构域,以及包含由 CD3ξ多肽和4-1BB多肽组成的共刺激信号传导区的细胞内结构域,如 图9B所示。将这些FcRL5靶向的CAR的各个克隆到SFG逆转录病毒 载体中,作为例子,包含4-1BB的CAR载体示于图10-16中。然后将 这些病毒载体转导到HEK 293galv9病毒包装细胞中,以便产生稳定的 用于产生CAR+T细胞的包装系。
实施例6.T细胞中人FcRL5特异性的CAR的表达
使用来自逆转录病毒galv9 HEK 293包装细胞的上清液对人原代T 细胞进行转导,以表达FcRL5靶向的4-1BBz CAR(使用抗-FcRL5 ET200-104 scFv产生)。FcRL5靶向的CAR的细胞表面表达通过与修 饰成包含His标签的重组人FcRL5结合、随后与PE缀合的抗-HIS标 签二抗的结合而测定,如图17所示。细胞表面检测通过流式细胞术验 证。如图17所示,FcRL5靶向的CAR在转导的T细胞上表达。
实施例7.人FcRL5特异性的CAR的细胞毒性
使用转导成表达荧光素酶和FcRL5抗原或对照GPRC5D(不相关 抗原)的Raji(伯基特淋巴瘤细胞系)细胞分析FcRL5靶向的4-1BB CAR T细胞的细胞毒性效果。将使用抗-FcRL5 ET200-69 scFv产生的 表达4-1BB CAR的T细胞用于这些实验(本文中也称作“αFcRL5-69 BBz”)。在36h共培养之后通过生物荧光成像(BLI)测定活细胞数目。 如图18所示,FcRL5靶向的CAR T细胞特异性地裂解转导成表达荧 光素酶和FcRL5抗原的Raji细胞(图18),但不裂解表达对照GPRC5D 的Raji细胞,该细胞由GPRC5D靶向的CAR T细胞裂解(图18)。
实施例8.人FcRL5特异性的CAR的细胞因子分泌
该实施例描述了FcRL5靶向的CAR T细胞的细胞因子分泌。将使 用抗-FcRL5ET200-69 scFv产生的表达4-1BB CAR的T细胞用于这些 实验。FcRL5靶向的CAR T细胞在转导有FcRL5或CD19的单层3T3 细胞上共培养24h之后的IL-2、INFγ和TNFα分泌通过Luminex多重 分析来评估。如图19所示,通过FcRL5靶向的CAR T细胞的CAR进 行的信号传导诱导与T细胞活化一致的细胞因子分泌。
实施例9.人FcRL5特异性的CAR的增殖
该实施例描述了FcRL5靶向的CAR T细胞在抗原刺激时的增殖。 将使用抗-FcRL5ET200-69 scFv产生的表达4-1BB CAR的T细胞用于 这些实验。将500,000FcRL5-或CD19-靶向的CAR+T细胞/ml置于已 转导有FcRL5或CD19的单层3T3细胞(3T3-FcRL;3T3-CD19)上。 4天后,对CAR+T细胞进行染色,然后通过包括已知浓度的计数微珠 的流式细胞术进行计数。如图20所示,FcRL5靶向的CAR T细胞的 抗原刺激诱导增殖。与3T3-FcRL5细胞共培养的FcRL5靶向的CAR T 细胞扩增至比与3T3-CD19细胞共培养的FcRL5靶向的CAR T细胞多 2.9倍,而与3T3-CD19细胞共培养的对照CD19靶向的CAR T细胞类 似地扩增至比与3T3-FcRL5细胞共培养的CD19靶向的CAR T细胞多 2.5倍(图20)。
实施例10.人抗-FcRL5抗体的表位作图
通过Pepscan分析两种抗-FcRL5双特异抗体ET200-104和 ET200-117以确定表位特异性。参见表239。靶蛋白是包含SEQ ID NO: 899的氨基酸1-851的人FcRL5。
表231
名称 来源 浓度 位置
ET200-104双特异性scFV 2.0mg/ml +4℃/22
ET200-117双特异性scFV 1.6mg/ml +4℃/22
方法
CLIPS技术的原理.CLIPS技术在结构上将肽固定为指定的三维结 构。这导致甚至最复杂的结合位点的功能模拟。CLIPS技术现在常规 地用于使肽文库形成单、双或三环结构以及片层和螺旋样折叠(图21)。
组合CLIPS文库筛选细节.CLIPS文库筛选从利用组合的矩阵设计 将靶蛋白转变成达10,000个重叠肽构建体的文库开始。在固体载体上, 合成线性肽矩阵,其随后形成空间确定的CLIPS构建体(图22)。代 表正确构象的非连续表位的两部分的构建体以高亲和性结合抗体,对 亲和力进行检测并定量。呈现不完整表位的构建体以较低的亲和力结 合抗体,而不含有表位的构建体根本不结合抗体。亲和力信息用于反 复的筛选以详细地限定表位的序列和构象。
热度图分析.热度图是数据的图形表示,其中在二维图中变量所取 的值以颜色表示。对于双环CLIPS肽,这样的二维图可得自第一和第 二环的独立序列。例如,图24中描绘的16个CLIPS肽的序列实际上 是环1中4个独特子序列(图23中颜色为蓝色)和环2中4个独特子 序列(图23中颜色为绿色)的排列。因此,观察到的ELISA数据(图 24A中颜色为红色)可以以4×4矩阵作图,其中各个X坐标对应于第 一环的序列,并且各个Y坐标对应于第二环的序列。例如针对CLIPS 肽CLSSERERVEDLFEYECELLTSEPIFHCRQEDC(在图24A中以箭 头示出)观察到的ELISA值可以见于图24B的第三行第三列(用箭头 和红框示出)。为进一步便于可视化,可将ELISA值用连续梯度的颜色 替代。在此情况下,极低值颜色为绿色,极高值颜色为红色,且均值 颜色为黑色(参见图24C)。对于上述实施例,均值为0.71。当将此彩 图应用于图24B中描绘的数据矩阵时,得到彩色热度图(参见图24D, 为了更加清楚仍示出原始数据)。
肽的合成.为重建靶分子的表位,合成了肽文库。通过用专有亲水 性聚合物配方进行接枝,接着使用二环己基碳二亚胺(DCC)和N-羟 基苯并三唑(HOBt),与叔丁氧羰基-六亚甲基二胺(BocHMDA)进 行反应,随后使用三氟乙酸(TFA)裂解Boc-基团,得到氨基官能化的聚丙烯载体。通过定制改良的JANUS液体处理站(Perkin Elmer) 使用标准Fmoc-肽合成在氨基官能化的固体载体上合成肽。使用 Pepscan的专有的支架上化学连接肽(Chemically Linked Peptides on Scaffolds,CLIPS)技术进行结构模拟物的合成。CLIPS技术使得肽构 成为单环、双环、三环、片层折叠、螺旋样折叠及它们的组合成为可 能。CLIPS模板与半胱氨酸残基联接。肽中的多个半胱氨酸的侧链与 一个或两个CLIPS模板联接。例如,将P2 CLIPS(2,6-双(溴甲基)吡啶) 的0.5mM溶液溶于碳酸氢铵(20mM,pH 7.8)/乙腈(1:3(v/v))中。 将此溶液加至肽阵列上。CLIPS模板结合到肽阵列(具有3μl孔的455孔板)的固相结合肽中存在的两个半胱氨酸的侧链。将肽阵列在被覆 盖于溶液中的同时在溶液中轻柔晃动30-60分钟。最后,用过量的H2O 彻底清洗肽阵列,并于70℃在含有1%SDS/0.1%β-巯基乙醇的PBS(pH 7.2)的断裂缓冲液(disrupt-buffer)中超声处理30分钟,接着在H2O 中再超声处理45分钟。携带肽的T3 CLIPS以类似的方式制备,但现 在具有三个半胱氨酸。
ELISA筛选.在基于PEPSCAN的ELISA中测试抗体对各个合成肽 的结合。将肽阵列与一抗溶液一起孵育(4℃下过夜)。洗涤后,在25℃ 将肽阵列与适当的抗体过氧化物酶偶联物(SBA)的1/1000稀释液一 起孵育一小时。洗涤后,加入过氧化物酶底物2,2’-连氮-二-3-乙基苯并 噻唑磺酸(ABTS)和2μl/ml的3%H2O2。一小时后,测量颜色显影。 用电荷耦合器件(CCD)摄像机和图像处理系统对颜色显影进行定量。
数据处理.从CCD摄像机得到的数值在0-3000mAU的范围内,与 标准96-孔板酶标仪(ELISA-reader)类似。对结果定量并存储到Peplab 数据库中。偶尔有孔中含有气泡导致假阳性值,手动检查卡片并将气 泡引起的任何值记为0。
合成质量控制.为验证合成肽的质量,并行地合成一组单独的阳性 和阴性对照肽。它们用抗体57.9筛选(参考文献Posthumus等人,J. Virology,1990,64:3304-3309)。
结果
筛选.抗体结合取决于多因素的组合,包括ELISA缓冲液中的抗体 浓度和竞争性蛋白质的量和性质。而且,预包被条件(在与试验样品 孵育之前对肽阵列的特别处理)影响结合。这些细节汇总于表240中。 对于Pepscan缓冲液和预处理(SQ),数字表示竞争性蛋白质(马血清 和卵清蛋白的组合)的相对量。
表240.筛选条件
标号 稀释度 样品缓冲液 预处理
ET200-104 8μg/ml PBS-吐温 PBS-吐温
ET200-117 3μg/ml PBS-吐温 0.1%SQ
抗体ET200-104和ET200-117在Nunc Maxisorp板上以1μg/ml涂 布用于ELISA,并用与小卡筛选中所使用的相同的缀合物羊抗人 Ig-HRP(Southern Biotech;#2010/05)加以检测。对于ET200-104和 ET200-117,对于第二Ab的一些稀释物得到信号>1OD,表明二抗很 适合于检测这些mAb。
赫塞汀在不存在封闭缓冲液的情况下以高浓度用作内部阴性对 照。赫塞汀与具有共同序列LRGSPLILYRF、LRGSSPILYWF和 APRGSPPILYW的肽结合(图25)。包含前述序列的肽从测试样品的表 位候选物中排除。
当在低严格条件下且在高浓度下测试时,抗体ET200-104结合所 有组中的多个肽基序(图26)。基于针对赫塞汀(内部阴性对照)所得 到的结果,大多数结合的肽疑是非特异性亲水相互作用的结果。然而, 认为包含基序657SRPILTFRAPR667的肽的结合是特异性的,且独特地归 因于样品ET200-104。
当在低严格条件下测试时,抗体ET200-117导致在所有组上的多 个肽基序的较弱结合。针对所有组获得的数据的累积数据分析表明, 抗体独特地识别包含Fc受体样蛋白5的结构域9中肽段 829RSETVTLYITGL840的区域,这与赫塞汀内部阴性对照和ET200-104 不同。大多数结合的其它肽也疑是非特异性亲水相互作用的结果,该 非特异性亲水相互作用共享在低严格条件下针对抗体ET200-104所记 录的相同的结合模式。
结论
对于ET200-104和ET200-117相对于赫塞汀收集的结果的累积数 据分析表明,抗体ET200-104靶向Fc受体样蛋白5的结构域8内的残 基657SRPILTFRAPR667,且抗体ET200-117靶向结构域9内的残基 829RSETVTLYITGL840。另外,对于两种样品与由赫塞汀非特异性地结合的肽,记录了多个信号。对于ET200-104鉴定的表位候选物使用公 共可得的Fc受体样蛋白5的3D模型(图27)进行可视化。对于 ET200-117的表位候选物位于靶标的非模型部分内,因此无法对其可视 化。
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从前面的描述中,显然可以对本文所述的本发明进行变化和修改, 以使它适用于各种用途和条件。这些实施方式也在所附权利要求的范 围内。
本说明书中提到的所有专利和出版物以及通过登录号或参考号提 到的序列均并入本文以供参考,其程度如同具体地和单独地指明每个 独立的专利和出版物以及序列并入本文以供参考。

Claims (20)

1.一种嵌合抗原受体(CAR),其包含与Fc受体样5(FcRL5)结合的细胞外抗原结合结构域,跨膜结构域和细胞内结构域,其中所述细胞外抗原结合结构域包含:
(aa)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:313所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:310所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:311所示氨基酸序列的CDR3;
(ab)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:320所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:315所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:316所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:317所示氨基酸序列的CDR3;
(ac)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:324所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:325所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:321所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:322所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:323所示氨基酸序列的CDR3;
(ad)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:329所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:330所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:331所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:326所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:327所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:328所示氨基酸序列的CDR3;
(ae)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:329所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:330所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:331所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:332所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:333所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:334所示氨基酸序列的CDR3;
(af)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:338所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:330所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:339所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:335所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:336所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:337所示氨基酸序列的CDR3;
(ag)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:343所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:344所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:345所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:340所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:341所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:342所示氨基酸序列的CDR3;
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(ak)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:363所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:364所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:365所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:360所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:361所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:362所示氨基酸序列的CDR3;
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(ap)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:329所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:385所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:386所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:310所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:384所示氨基酸序列的CDR3;
(aq)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:390所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:391所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:392所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:387所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:388所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:389所示氨基酸序列的CDR3;
(ar)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:395所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:393所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:355所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:394所示氨基酸序列的CDR3;
(as)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:397所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:398所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:399所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:346所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:327所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:396所示氨基酸序列的CDR3;
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(ba)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:428所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:429所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:430所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:425所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:426所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:427所示氨基酸序列的CDR3;
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(bc)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:423所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:438所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:439所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:436所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:388所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:437所示氨基酸序列的CDR3;
(bd)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:329所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:330所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:443所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:440所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:441所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:442所示氨基酸序列的CDR3;
(be)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:447所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:448所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:449所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:444所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:445所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:446所示氨基酸序列的CDR3;
(bf)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:452所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:450所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:451所示氨基酸序列的CDR3;
(bg)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:369所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:454所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:455所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:453所示氨基酸序列的CDR3;
(bh)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:457所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:456所示氨基酸序列的CDR3;
(bi)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:329所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:330所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:331所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:346所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:327所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:458所示氨基酸序列的CDR3;
(bj)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:460所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:461所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:462所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:459所示氨基酸序列的CDR3;
(bk)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:419所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:463所示氨基酸序列的CDR3;
(bl)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:423所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:438所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:465所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:436所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:388所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:464所示氨基酸序列的CDR3;
(bm)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:468所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:469所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:470所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:466所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:467所示氨基酸序列的CDR3;
(bn)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:474所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:358所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:465所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:471所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:472所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:473所示氨基酸序列的CDR3;
(bo)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:477所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:478所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:479所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:372所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:475所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:476所示氨基酸序列的CDR3;
(bp)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:483所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:484所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:485所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:480所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:481所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:482所示氨基酸序列的CDR3;
(bq)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:433所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:487所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:488所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:346所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:327所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:486所示氨基酸序列的CDR3;
(bs)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:313所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:493所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:310所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:492所示氨基酸序列的CDR3;
(bt)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:490所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:349所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:495所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:403所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:404所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:494所示氨基酸序列的CDR3;
(bu)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:498所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:344所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:499所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:403所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:496所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:497所示氨基酸序列的CDR3;
(bv)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:503所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:504所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:505所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:500所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:501所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:502所示氨基酸序列的CDR3;
(bw)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:508所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:349所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:509所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:403所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:506所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:507所示氨基酸序列的CDR3;
(bx)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:513所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:514所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:510所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:511所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:512所示氨基酸序列的CDR3;
(by)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:518所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:519所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:515所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:516所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:517所示氨基酸序列的CDR3;
(bz)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:348所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:523所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:524所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:520所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:521所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:522所示氨基酸序列的CDR3;
(ca)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:406所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:398所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:528所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:525所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:526所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:527所示氨基酸序列的CDR3;
(cb)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:530所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:529所示氨基酸序列的CDR3;
(cc)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:531所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:515所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:516所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:517所示氨基酸序列的CDR3;
(cd)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:533所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:534所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:535所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:403所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:404所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:532所示氨基酸序列的CDR3;
(ce)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:428所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:429所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:430所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:425所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:426所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:536所示氨基酸序列的CDR3;
(cf)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:540所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:398所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:541所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:537所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:538所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:539所示氨基酸序列的CDR3;
(cg)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:406所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:398所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:542所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:537所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:538所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:539所示氨基酸序列的CDR3;
(ch)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:544所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:448所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:545所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:543所示氨基酸序列的CDR3;
(ci)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:547所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:548所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:549所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:546所示氨基酸序列的CDR3;
(cj)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:313所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:310所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:550所示氨基酸序列的CDR3;
(ck)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:513所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:310所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:550所示氨基酸序列的CDR3;
(cl)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:406所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:398所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:554所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:551所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:552所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:553所示氨基酸序列的CDR3;
(cm)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:556所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:557所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:558所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:309所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:310所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:555所示氨基酸序列的CDR3;
(cn)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:562所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:563所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:564所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:559所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:560所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:561所示氨基酸序列的CDR3;
(co)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:568所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:504所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:569所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:565所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:566所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:567所示氨基酸序列的CDR3;
(cp)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:571所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:572所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:573所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:372所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:475所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:570所示氨基酸序列的CDR3;
(cq)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:343所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:575所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:576所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:403所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:404所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:574所示氨基酸序列的CDR3;
(cr)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:313所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:411所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:412所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:577所示氨基酸序列的CDR3;
(cs)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:313所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:346所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:327所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:578所示氨基酸序列的CDR3;
(ct)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:580所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:438所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:581所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:436所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:388所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:579所示氨基酸序列的CDR3;
(cu)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:585所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:313所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:582所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:583所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:584所示氨基酸序列的CDR3;
(cv)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:312所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:586所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:314所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:346所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:327所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:578所示氨基酸序列的CDR3;
(cw)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:588所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:385所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:375所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:403所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:404所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:587所示氨基酸序列的CDR3;
(cx)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:318所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:319所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:592所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:589所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:590所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:591所示氨基酸序列的CDR3;
(cy)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:926所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:927所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:928所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:923所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:924所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:925所示氨基酸序列的CDR3;或
(cz)轻链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:932所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ IDNO:933所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:934所示氨基酸序列的CDR3;和重链可变区,其包含:包含SEQ ID NO:929所示氨基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO:930所示氨基酸序列的CDR2、和包含SEQ ID NO:931所示氨基酸序列的CDR3。
2.一种嵌合抗原受体(CAR),其包含与Fc受体样5(FcRL5)结合的细胞外抗原结合结构域,跨膜结构域和细胞内结构域,其中所述细胞外抗原结合结构域包含:
(aa)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:3所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:4所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ab)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:7所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:8所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ac)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:11所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:12所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ad)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:299所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:300所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ae)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:15所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:16所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(af)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:19所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:20所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ag)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:23所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:24所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ah)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:27所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:28所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ai)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:31所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:32所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(aj)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:35所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:36所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ak)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:39所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:40所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(al)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:43所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:44所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(am)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:47所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:48所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(an)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:51所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:52所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ao)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:55所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:56所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ap)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:59所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:60所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(aq)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:63所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:64所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ar)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:67所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:68所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(as)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:71所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:72所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(at)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:75所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:76所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(au)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:79所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:80所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(av)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:83所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:84所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(aw)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:87所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:88所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ax)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:91所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:92所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ay)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:95所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:96所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(az)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:99所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:100所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ba)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:103所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:104所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bb)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:107所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:108所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bc)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:111所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:112所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bd)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:115所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:116所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(be)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:119所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:120所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bf)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:123所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:124所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bg)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:127所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:128所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bh)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:131所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:132所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bi)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:135所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:136所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bj)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:139所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:140所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bk)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:143所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:144所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bl)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:147所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:148所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bm)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:151所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:152所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bn)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:155所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:156所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bo)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:159所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:160所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bp)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:163所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:164所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bq)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:167所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:168所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bs)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:175所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:176所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bt)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:179所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:180所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bu)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:183所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:184所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bv)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:187所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:188所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bw)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:191所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:192所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bx)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:195所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:196所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(by)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:199所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:200所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(bz)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:203所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:204所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ca)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:207所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:208所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cb)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:211所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:212所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cc)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:215所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:216所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cd)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:219所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:220所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ce)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:223所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:224所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cf)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:227所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:228所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cg)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:231所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:232所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ch)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:235所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:236所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ci)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:239所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:240所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cj)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:243所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:244所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ck)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:247所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:248所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cl)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:251所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:252所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cm)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:255所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:256所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cn)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:259所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:260所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(co)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:263所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:264所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cp)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:267所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:268所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cq)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:271所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:272所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cr)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:275所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:276所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cs)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:279所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:280所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(ct)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:283所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:284所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cu)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:287所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:288所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cv)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:291所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:292所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cw)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:303所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:304所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cx)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:295所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:296所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;
(cy)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:915所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:917所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3;或
(cz)轻链可变区,其包含:SEQ ID NO:919所示轻链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3,和重链可变区,其包含:SEQ ID NO:921所示重链可变区序列的CDR1、CDR2和CDR3。
3.根据权利要求1或2所述的CAR,其中
(aa)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列;
(ab)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列;
(ac)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列;
(ad)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:299所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:300所示的氨基酸序列;
(ae)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:15所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列;
(af)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列;
(ag)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:23所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:24所示的氨基酸序列;
(ah)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:28所示的氨基酸序列;
(ai)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:32所示的氨基酸序列;
(aj)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:35所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:36所示的氨基酸序列;
(ak)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:39所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:40所示的氨基酸序列;
(al)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:44所示的氨基酸序列;
(am)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:47所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:48所示的氨基酸序列;
(an)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:51所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列;
(ao)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:55所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:56所示的氨基酸序列;
(ap)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:59所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:60所示的氨基酸序列;
(aq)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:63所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:64所示的氨基酸序列;
(ar)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:67所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:68所示的氨基酸序列;
(as)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:71所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:72所示的氨基酸序列;
(at)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:75所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:76所示的氨基酸序列;
(au)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:79所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:80所示的氨基酸序列;
(av)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:83所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:84所示的氨基酸序列;
(aw)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:88所示的氨基酸序列;
(ax)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:91所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列;
(ay)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:95所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:96所示的氨基酸序列;
(az)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:99所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:100所示的氨基酸序列;
(ba)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:103所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:104所示的氨基酸序列;
(bb)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:107所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:108所示的氨基酸序列;
(bc)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:111所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:112所示的氨基酸序列;
(bd)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:115所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:116所示的氨基酸序列;
(be)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:119所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:120所示的氨基酸序列;
(bf)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:123所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:124所示的氨基酸序列;
(bg)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:127所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:128所示的氨基酸序列;
(bh)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:131所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:132所示的氨基酸序列;
(bi)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:135所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:136所示的氨基酸序列;
(bj)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:139所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:140所示的氨基酸序列;
(bk)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:143所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:144所示的氨基酸序列;
(bl)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:147所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:148所示的氨基酸序列;
(bm)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:151所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:152所示的氨基酸序列;
(bn)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:155所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:156所示的氨基酸序列;
(bo)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:159所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:160所示的氨基酸序列;
(bp)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:163所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:164所示的氨基酸序列;
(bq)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:167所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:168所示的氨基酸序列;
(bs)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:175所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:176所示的氨基酸序列;
(bt)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:179所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:180所示的氨基酸序列;
(bu)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:183所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:184所示的氨基酸序列;
(bv)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:187所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:188所示的氨基酸序列;
(bw)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:191所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:192所示的氨基酸序列;
(bx)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:195所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:196所示的氨基酸序列;
(by)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:199所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:200所示的氨基酸序列;
(bz)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:203所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:204所示的氨基酸序列;
(ca)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:207所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:208所示的氨基酸序列;
(cb)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:211所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:212所示的氨基酸序列;
(cc)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:215所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:216所示的氨基酸序列;
(cd)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:219所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:220所示的氨基酸序列;
(ce)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:223所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:224所示的氨基酸序列;
(cf)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:227所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:228所示的氨基酸序列;
(cg)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:231所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:232所示的氨基酸序列;
(ch)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:235所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:236所示的氨基酸序列;
(ci)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:239所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:240所示的氨基酸序列;
(cj)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:243所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:244所示的氨基酸序列;
(ck)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:247所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:248所示的氨基酸序列;
(cl)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:251所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:252所示的氨基酸序列;
(cm)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:255所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:256所示的氨基酸序列;
(cn)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:259所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:260所示的氨基酸序列;
(co)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:263所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:264所示的氨基酸序列;
(cp)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:267所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:268所示的氨基酸序列;
(cq)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:271所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:272所示的氨基酸序列;
(cr)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:275所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:276所示的氨基酸序列;
(cs)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:279所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:280所示的氨基酸序列;
(ct)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:283所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:284所示的氨基酸序列;
(cu)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:287所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:288所示的氨基酸序列;
(cv)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:291所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:292所示的氨基酸序列;
(cw)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:303所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:304所示的氨基酸序列;
(cx)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:295所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:296所示的氨基酸序列;
(cy)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:915所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:917所示的氨基酸序列;或
(cz)所述轻链可变区包含SEQ ID NO:919所示的氨基酸序列,并且所述重链可变区包含SEQ ID NO:921所示的氨基酸序列。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的CAR,其中所述细胞外抗原结合结构域包含SEQ IDNO:594、SEQ ID NO:596、SEQ ID NO:598、SEQ ID NO:600、SEQ ID NO:602、SEQ ID NO:604、SEQ ID NO:606、SEQ ID NO:608、SEQ ID NO:610、SEQ ID NO:612、SEQ ID NO:614、SEQ IDNO:616、SEQ ID NO:618、SEQ ID NO:620、SEQ ID NO:621、SEQ ID NO:624、SEQ ID NO:626、SEQ ID NO:628、SEQ ID NO:630、SEQ ID NO:632、SEQ ID NO:634、SEQ ID NO:636、SEQ IDNO:638、SEQ ID NO:640、SEQ ID NO:642、SEQ ID NO:644、SEQ ID NO:646、SEQ ID NO:648、SEQ ID NO:650、SEQ ID NO:652、SEQ ID NO:654、SEQ ID NO:656、SEQ ID NO:658、SEQ IDNO:660、SEQ ID NO:662、SEQ ID NO:664、SEQ ID NO:666、SEQ ID NO:668、SEQ ID NO:670、SEQ ID NO:672、SEQ ID NO:674、SEQ ID NO:676、SEQ ID NO:680、SEQ ID NO:682、SEQ IDNO:684、SEQ ID NO:686、SEQ ID NO:688、SEQ ID NO:690、SEQ ID NO:692、SEQ ID NO:694、SEQ ID NO:696、SEQ ID NO:698、SEQ ID NO:700、SEQ ID NO:702、SEQ ID NO:704、SEQ IDNO:706、SEQ ID NO:708、SEQ ID NO:710、SEQ ID NO:712、SEQ ID NO:714、SEQ ID NO:716、SEQ ID NO:718、SEQ ID NO:720、SEQ ID NO:722、SEQ ID NO:724、SEQ ID NO:726、SEQ IDNO:728、SEQ ID NO:730、SEQ ID NO:732、SEQ ID NO:734、SEQ ID NO:736、SEQ ID NO:738、SEQ ID NO:740、SEQ ID NO:742或SEQ ID NO:744所示的氨基酸序列。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的CAR,其中所述跨膜结构域包含CD8多肽、CD28多肽、CD3ζ多肽、CD4多肽、4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、CTLA-4多肽、PD-1多肽、LAG-3多肽、2B4多肽、BTLA多肽、合成肽、或其组合。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的CAR,其中所述细胞内结构域还包含至少一个信号传导区。
7.根据权利要求6所述的CAR,其中所述至少一个信号传导区包含CD28多肽、4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、PD-1多肽、CTLA-4多肽、LAG-3多肽、2B4多肽、BTLA多肽、合成肽、或其组合。
8.根据权利要求6或7所述的CAR,其中所述信号传导区包含至少一个共刺激信号传导区。
9.根据权利要求8所述的CAR,其中所述至少一个共刺激信号传导区包含CD28多肽、4-1BB多肽、OX40多肽、ICOS多肽、DAP-10多肽、或其组合。
10.一种核酸分子,其编码权利要求1-9中任一项所述的嵌合抗原受体(CAR)。
11.一种载体,其包含权利要求10所述的核酸分子。
12.一种免疫应答细胞,其包含权要求1-9中任一项所述的CAR、权利要求10所述的核酸分子或权利要求11所述的载体。
13.根据权利要求12所述的免疫应答细胞,其中所述免疫应答细胞选自T细胞、自然杀伤(NK)细胞、细胞毒性T淋巴细胞(CTL)、调节性T细胞、人胚胎干细胞、淋巴样祖细胞、T细胞-前体细胞和可分化成淋巴样细胞的多能干细胞。
14.一种T细胞,其包含权要求1-9中任一项所述的CAR、权利要求10所述的核酸分子或权利要求11所述的载体。
15.一种用于产生与Fc受体样5(FcRL5)结合的免疫应答细胞的方法,其包括将编码权利要求1-9中任一项所述的CAR的核酸分子、权利要求10所述的核酸分子或权利要求11所述的载体引入所述免疫应答细胞。
16.一种药物组合物,其包含权利要求12或13所述的免疫应答细胞或权利要求14所述的T细胞,以及药学上可接受的赋形剂。
17.一种用于治疗肿瘤的试剂盒,其包含权利要求12或13所述的免疫应答细胞或权利要求14所述的T细胞。
18.根据权利要求17所述的试剂盒,其中所述肿瘤选自多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、毛细胞白血病、伯基特淋巴瘤和瓦氏巨球蛋白血症。
19.权利要求12或13所述的免疫应答细胞或权利要求14所述的T细胞在制造用于在受试者中治疗肿瘤、用于减少肿瘤的肿瘤负荷、或用于增加或延长患有肿瘤的受试者的生存期的药物中的用途。
20.根据权利要求19所述的用途,其中所述肿瘤选自多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、毛细胞白血病、伯基特淋巴瘤和瓦氏巨球蛋白血症。
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