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CN114371135B - 一种用于评价银屑病的评价系统及应用 - Google Patents

一种用于评价银屑病的评价系统及应用 Download PDF

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CN114371135B CN202111239725.2A CN202111239725A CN114371135B CN 114371135 B CN114371135 B CN 114371135B CN 202111239725 A CN202111239725 A CN 202111239725A CN 114371135 B CN114371135 B CN 114371135B
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Abstract

本发明属于医疗信息技术领域,具体涉及一种评价银屑病的评价系统及应用。所述评价系统包括:数据获取模块,用于获取待检测样本血清的dsDNA含量;数据分析模块,用于根据所述dsDNA含量评价银屑病的情况;数据输出模块,根据所述银屑病的情况输出结果;若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量≥1.11ng/ml时,则输出为:非正常、超高风险。该评价系统的灵敏度为61.6%,特异度为74.8%,与其他类型的银屑病相关方法和设备相比,敏感性和特异性具有明显优势。

Description

一种用于评价银屑病的评价系统及应用
技术领域
本发明属于医疗信息技术领域,具体涉及一种评价银屑病的评价系统及应用。
背景技术
银屑病是一种具有季节性和纬度相关性的复发性自身免疫性疾病,其发病机制尚未阐明。临床观察研究发现,银屑病在冬季更容易被诱发、复发或加重,并具有高纬度地区患病率高于低纬度地区患病率的流行病学特征。导致银屑病患病率随季节和纬度变化的内在原因仍然是个谜。有研究证明包括纬度和季节在内的地理气候因素可能会通过影响免疫原性物质来影响疾病发展。dsDNA作为多种免疫疾病共同相关的先天免疫刺激物,影响着许多免疫性疾病的发生和发展。探究不同季节和纬度地区银屑病患者的血清dsDNA对于揭密银屑病为何具有季节性和纬度性变化趋势具有突破性作用。
血清中游离双链DNA(double-stranded DNA,dsDNA)作为一种先天免疫的刺激物是与免疫疾病密切相关的重要因素之一,具有高度的免疫原性并且可以被受体识别以引发先天免疫应答,从而激活免疫系统并最终导致自身免疫疾病的发生。dsDNA被报道和许多免疫炎症性疾病相关,包括特应性皮炎和类风湿性关节炎等,这些疾病在流行病学上大都具有潜在的纬度或季节性加重趋势。气候会影响免疫的生理状态甚至疾病的进展。有研究表明,欧洲人群免疫相关的基因转录组在冬季增加,作为自身免疫性疾病风险生物标志物的促炎因子也在冬季出现高峰。这些现象意味着包括纬度和季节在内的气候因素可能会通过影响免疫原性物质来影响疾病发展。
目前尚无研究对血清游离dsDNA进行高通量检测,无法系统描述健康人群血清游离dsDNA的基础水平,健康人群血清游离dsDNA的正常值范围至今没有确切标准。国际上对血清dsDNA的研究大都为定性研究,应用的领域主要集中在无创产前筛查尤其是肿瘤的序列确定上。少部分研究采用分光光度计等检测方法对dsDNA进行定量研究,但此方法无法投入大规模检测,在临床进行批量检测方面存在局限性。无论是健康人群还是银屑病人群,目前尚没有一个低成本准确性的方法对其血清dsDNA进行检测,也无法进行大样本量的定量分析,故二者之间的关联性分析难以实现。而且,现在没有研究对正常人群血清dsDNA的分布规律进行阐述,也没有研究对银屑病和血清dsDNA的相关性做出具体分析,银屑病和血清dsDNA的因果关系及其中包含的流行病学规律无从考究。
发明内容
本发明目的在于提供一种用于评价银屑病的评价系统,该评价系统可以预测未表型样本血清的表型情况,以及表型过的样本血清的表型变化情况。
所述评价系统包括:
数据获取模块,用于获取待检测样本血清的dsDNA含量;
数据分析模块,用于根据所述dsDNA含量评价银屑病的情况;
数据输出模块,根据所述银屑病的情况输出结果;
若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量≥1.11ng/ml时,则输出为:非正常、超高风险。
具体地,dsDNA作为多种免疫疾病共同相关的免疫刺激物,明确血清游离dsDNA在健康人群血清中的分布范围以及随季节和纬度的变化趋势对于指导dsDNA相关疾病的疾病诊断和治疗指导极为重要,血清游离dsDNA或可成为评估疾病风险以及预后的临床学指标。
具体地,从大量的样本检测的特征工作曲线分析发现,诊断银屑病的血清dsDNA最佳临界值为1.11ng/ml,灵敏度为61.6%,特异度为74.8%。多因素回归预测模型中,在引入血清dsDNA后可以使预测银屑病的曲线下面积从0.806显着增加到0.860(P<0.001)。当以dsDNA的最佳临界值为参考时,血清dsDNA水平与银屑病发病风险之间存在显著的剂量反应关系。
进一步,若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量为0.97ng/ml≤dsDNA含量<1.11ng/ml,则输出为:正常、高风险;所述dsDNA含量为0.86ng/ml≤dsDNA含量<0.97ng/ml,则输出为:正常;或若所述dsDNA含量为<0.86ng/ml,则输出为:其他病症可疑。
具体地,本发明首次呈现了健康中国人群血清dsDNA的基础水平波动区间,正常人群血清dsDNA中位数水平为0.97ng/ml(四分位间为:0.86~1.11ng/ml)。与此同时,健康人群中若血清dsDNA水平在0.97至1.11ng/ml之间,患银屑病的风险风险较高,可判定为高危人群。
进一步,为了更好的对潜在病人或者正常人(即检测样本血清为无表型样本血清)进行长期监控是否有患有银屑病的风险及风险程度,可以在不同时间获取血清样本,检测其dsDNA含量,进行记录,即若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述数据获取模块获取不同时间的两次以上的dsDNA含量,再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加一个标准差,风险增加1.84倍(OR:2.84,95%CI:2.01-4.01),所述输出模块输出是否正常和对应的风险倍数。
具体地,正常人群通过长期监测血清dsDNA可以提示该人群定向控制增加dsDNA的个人行为(例如吸烟、饮酒、感染、冻伤、创伤、使用细胞毒性药物等)来保持血清dsDNA保持较低水平,从而降低患病概率。高危人群通过长期监测血清dsDNA可以预测该人群的银屑病患病的动态风险以及患病的严重程度,血清dsDNA可以作为一种警戒值提示患者何时需要进行必要的临床干预,对于已经治疗的患者,动态监测血清dsDNA可以动态指示治疗效果,如果治疗后仍具有超过0.97ng/ml的血清dsDNA含量,可能提示患者仍有较高的复发风险和不完美的预后。对于血清dsDNA含量低于0.86ng/ml的的低dsDNA含量人群,具有患有其他关于dsDNA表达引起的疾病的风险,在动态监测dsDNA含量的变化可以警示该人群对dsDNA其他病症的进一步进行诊断和治疗。
进一步,若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量<1.11ng/ml时,所述病例模块记录的再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量的差值每增加一个0.12ng/ml,则银屑病发病风险OR值为4.88(95%CI:3.85-6.20),所述输出模块输出是否正常和对应的OR值;所述dsDNA含量≥1.11ng/ml时,所述病例模块记录的再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量的差值每增加一个0.34ng/ml,银屑病发病风险OR值为1.97(95%CI:1.74-2.22),所述输出模块输出是否正常和对应的OR值。
具体地,本发明对大样本量的银屑病人群以及健康人群的血清dsDNA进行检测,标化后进行多中心统计分析,确定了银屑病在严重度评分、患者生活习惯、患者生活的气候条件等方面与血清dsDNA的关联方向与关联强度。从多个方面验证了血清dsDNA与银屑病的相关性。同时,根据大样本量人群的流行病学统计结果,首次确定了银屑病人血清dsDNA的分布范围以及血清dsDNA诊断银屑病得临界值,对银屑病的诊断和预测具有重要的科学价值。研究结果表明,银屑病患者血清dsDNA显著高于正常人群,并符合高纬度地区患者血清dsDNA水平显著高于低纬度地区,冬季患者血清dsDNA水平显著高于夏季的患者血清dsDNA水平的规律。风险关联分析结果发现,血清dsDNA每增加1ng/ml,银屑病发病风险增加40.40倍(调整后的优势比,41.40;95%置信区间,32.32-53.03,P<0.001)。
进一步,若所述待检测样本血清为已表型过治愈血清样本,所述dsDNA含量≥1.11ng/m,则输出为:极易复发。如果临床治疗方案有效,表型消失,但血清dsDNA水平仍然高于1.11ng/ml,患者仍存在较高的复发风险,这对预后风险评估有重要意义。因此,可以对无银屑病病灶的治愈患者进行定期血清dsDNA检测,以监测患者银屑病的复发。
进一步,若所述待检测样本血清为已表型样本血清,所述数据获取模块获取不同时间的两次以上的dsDNA含量,所述数据分析模块使用PASI方法进行评价,所述数据输出模块输出相应的情况;所述PASI方法为以下方法中的一种:(1)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清的PASI-1评级为中度的风险增加0.66倍(OR:1.66,95%CI:1.10-2.50),PASI-1评级为重度的风险增加1.43倍(OR:2.43,95%CI:1.77-3.35);或(2)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清的PASI-2评级为中度的风险增加0.78倍(OR:1.78,95%CI:1.29-2.46),PASI-2评级为重度的风险增加1.38倍(OR:2.38,95%CI:1.59-3.57)。
进一步,血清dsDNA水平也被本发明证明与银屑病的严重程度呈显著正相关。
进一步,若所述待检测样本血清为已表型样本血清,所述数据获取模块获取不同时间的两次以上的dsDNA含量,所述数据分析模块使用BSA方法进行评价,所述数据输出模块输出相应的情况;所述BSA方法为以下方法中的一种:(1)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清的BSA-1评级为中度的风险增加0.83倍(OR:1.83,95%CI:1.12-2.97),BSA-1评级为重度的风险增加1.87倍(OR:2.87,95%CI:1.90-4.33);或(2)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清BSA-2评级为中度的风险增加0.66倍(OR:1.66,95%CI:1.13-2.45),BSA-2评级为重度的风险增加1.61倍(OR:2.61,95%CI:1.84-3.72)。
进一步,所述评价系统还包括病例模块,用于记录所述待检测样本血清不同时间的dsDNA含量、是否有银屑病史。
进一步,所述dsDNA含量的检测方法选自采用分光光度计或双链DNA定量检测等方法。
在某些具体实施例中,血清dsDNA的含量的检测方法采用双链DNA定量检测,具体为:
(1)血清采集:使用真空促凝管采集新鲜静脉全血室温放置1小时后,使用eppondorf离心机,4℃,4000rpm离心30分钟后取上清。
(2)血清保存:如短时间保存可将上清转移至EP管内保存在-80℃冰箱,若长时间保存使用冻存管保存在液氮中。
(3)检测(参考Biovision EZQuant dsDNA操作说明进行)准备:待血清样品收集完毕后进行检测。按照试剂盒中的说明书分别制备1x TE buffer、2x dsDNA染液和10ng/微升的标准品。
(4)标准曲线制备:按照Biovision EZQuant dsDNA说明书配制10ng/微升的标准品制备线性标准品,在每孔黑色酶标板中分别加入0,2,4,6,8和10微升的标准样品,将标准样用1xTE buffer补至50微升,每个浓度设置三个重复。
(5)样品的准备:在每孔黑色酶标板中加入10微升样品,后用1xTE buffer补至50微升,每个浓度设置三个重复。
(6)染色:在每孔中加入50微升2x dsDNA染液,放置摇床上,室温轻摇5分钟,注意避光。
(7)检测:待染色反应完成后立即进行上机检测,使用带有Ex/Em=480/530检测模块的酶标仪或相似设备。
(8)校准:每个孔板均应设计有标准曲线和0孔,检测结果出来后首先使用标准曲线和0孔进行校准。一般标准曲线直线线性关系的r2值应大于0.99检测结果较佳,数据方可使用。
本发明目的在于还提供一种dsDNA结合剂在制备银屑病检测试剂/试剂盒中的应用。所述dsDNA结合剂为能与dsDNA进行化学或者生物上的结合从而产生变化的物质。
本发明目的在于还提供一种治疗银屑病的设备,所述设备包含紫外线发射装置。
本发明实施例中,男性、40岁以上、冬季、北方、中纬度的城市、低气温、低紫外线水平、低湿度、低日照、低阳光时间城市人群的dsDNA水平显著较高,在所有气候影响因素中,紫外线对血清dsDNA的波动影响最大。通过紫外线干预疗法可能为dsDNA相关自身免疫疾病的进行治疗。同时提示,生活在高纬度和低纬度地区的健康人群,应适量接收紫外线照射以达到预防银屑病及其他相关自生免疫性疾病的目的。
本发明解释了一些生活行为习惯导致银屑病加重的原因以及某些临床治疗的有效性:在银屑病的临床治疗中,增加血清dsDNA的行为如吸烟、饮酒、皮肤损伤等可诱发或加重银屑病,而如保湿和接受紫外线照射等减少血清dsDNA的行为可治疗银屑病。
本发明目的在于还提供一种dsDNA的高通量检测分析方法,在此之前对于血清dsDNA的检测基本都是采用分光光度计,无法适应临床检验的需求对样品进行批量检测。
高通量检测分析方法包括:
(1)使用双链DNA定量检测法检测血清dsDNA含量;
(2)对检测结果使用标准曲线和0孔进行校准,保留所述标准曲线的直线线性关系的r2值大于0.99的数据;
(3)使用SPSS和R Version进行数据处理和分析。
进一步,所述方法还包括血清采集、血清保存备用等步骤。
在某些具体实施例中,所述检测分析方法为:
(1)血清采集:使用真空促凝管采集新鲜静脉全血室温放置1小时后,使用eppondorf离心机,4℃,4000rpm离心30分钟后取上清。
(2)血清保存:如短时间保存可将上清转移至EP管内保存在-80℃冰箱,若长时间保存使用冻存管保存在液氮中。
(3)检测(参考Biovision EZQuant dsDNA操作说明进行)准备:待血清样品收集完毕后进行检测。按照试剂盒中的说明书分别制备1x TE buffer、2x dsDNA染液和10ng/微升的标准品。
(4)标准曲线制备:按照Biovision EZQuant dsDNA说明书配制10ng/微升的标准品制备线性标准品,在每孔黑色酶标板中分别加入0,2,4,6,8和10微升的标准样品,将标准样用1xTE buffer补至50微升,每个浓度设置三个重复。
(5)样品的准备:在每孔黑色酶标板中加入10微升样品,后用1xTE buffer补至50微升,每个浓度设置三个重复。
(6)染色:在每孔中加入50微升2x dsDNA染液,放置摇床上,室温轻摇5分钟,注意避光。
(7)检测:待染色反应完成后立即进行上机检测,使用带有Ex/Em=480/530检测模块的酶标仪或相似设备。
(8)校准:每个孔板均应设计有标准曲线和0孔,检测结果出来后首先使用标准曲线和0孔进行校准。一般标准曲线直线线性关系的r2值应大于0.99检测结果较佳,数据方可使用。
(9)数据的统计学分析:使用SPSS23.0和R Version 4.0.2版软件进行数据处理和分析。所有检验均采用双侧检验,P值小于0.05被认为具有统计学意义。
本发明中,术语“无表型样本血清”指的是皮肤还没有出现临床症状的样本血清;“已表型过治愈血清样本指的是皮肤出现过临床症状但已经治愈的样本血清;“已表型样本血清”指的是已经出现临床症状的样本血清。
本发明中,术语“超高风险”指的是dsDNA含量已经超出正常水平,但是还没有表型,可能即将出现表型的情况。“正常、高风险”指的是dsDNA含量是正常的,但是有演化成银屑病的趋势,就像正常血糖中的高分段血糖指数。
本发明有益效果在于
本发明提供的用于评价银屑病的评价系统的灵敏度为61.6%,特异度为74.8%,与其他类型的银屑病相关方法和设备相比,敏感性和特异性具有明显优势。
本发明提供的循环系统游离dsDNA高通量检测方法较其他检测方法的检测灵敏度高,准确性好,结果稳定性高,检测周期短,检测效率高,检测成本低,便捷实惠,方法简单,比较适合临床大规模大批次的检测应用。
附图说明
图1为实验设计流程图。
图2为biotek cell vision5检测的标准曲线。
图3为flex station3检测的标准曲线。
图4为银屑病患者与对照组dsDNA水平的比较。
图5为分层后银屑病患者与对照组dsDNA水平的比较。
图6为不同分类亚组下对照组血清dsDNA水平的比较。
图7为血清dsDNA与银屑病关联的假设模型。
图8为血清dsDNA预测银屑病的ROC曲线。
图9为在多元逻辑回归模型中血清dsDNA预测银屑病的ROC曲线。
图10为dsDNA水平与银屑病发病风险之间的限制性三次样条曲线关系。
图11为不同地区dsDNA与银屑病风险的关系(a中国南方,b中国北方)。
图12为不同纬度间dsDNA与银屑病风险的关系(a低纬度,b高纬度)。
图13为不同温度下dsDNA与银屑病发病风险的关系(a低温,b高温)。
图14为不同季节间dsDNA与银屑病风险的关系(a春季和秋季,b夏季,c冬季)。
图15为不同紫外线度数下dsDNA与银屑病风险的关系(a低紫外线度数与中紫外线度数,b高紫外线度数)。
图16为dsDNA与银屑病风险在不同日光时间之间的关系(a低日光时间,b中等日光时间,c高日光时间)。
图17为不同强度日照时间下dsDNA与银屑病风险的关系。
图18为在不调整混杂因素的情况下,血清dsDNA含量与银屑病风险关系。
图19为血清dsDNA水平与银屑病分级的相关性分析。
其中,图11-17中,通过dsDNA的ROC曲线确定dsDNA值的参考值,用于预测不同地区所有受试者的银屑病情况。根据年龄、性别、体重指数、季节、纬度、温度、紫外线度、湿度、日光时间及日照时间进行调整。
具体实施方式
所举实施例是为了更好地对本发明进行说明,但并不是本发明的内容仅局限于所举实施例。所以熟悉本领域的技术人员根据上述发明内容对实施方案进行非本质的改进和调整,仍属于本发明的保护范围。
本发明实施例中,按照图1所示的流程进行试验验证。
本发明实施例中,开展本项检测需要的耗材:真空促凝管(BD Vacutainer,货号:367957,美国)、无酶EP管、冻存管、黑色96孔培养板(2Alfred Rd,Kennebunk ME04043,USA)、Biovision EZQuant dsDNA荧光检测试剂盒(Ex/Em=480/530)、nuclease-free水。
本发明实施例中,开展本项检测需要的设备:带有15ml适配器的离心机(Eppendorf,型号:5810R,德国),可进行Ex/Em=480/530酶标仪、摇床。
本发明实施例开展本项检测的样本选择:2016年至2020年招募中国12个不同纬度地区(南方/纬度≤30°;北方/纬度>30°)冬季(10-3月)和夏季(4-9月)的银屑病人群和健康人群(患者来自黑龙江、吉林、辽宁、新疆、内蒙古、山东、安徽、江苏、湖北、四川和广东省。健康对照来自黑龙江、辽宁、内蒙古、安徽、广东和福建省)。
本发明实施例中,所有健康对照人群从医院医疗中心体检中心入组,按照以下纳入标准纳入本研究:(1)自愿参加并签署知情同意书;(2)年龄和性别无限制;(3)在一个家庭单位中只招募一个对照;(4)对照人群为该医疗中心区域的常驻居民,没有长期外地旅居史。符合以下排除标准的对照被排除:(1)诊断为银屑病、自身免疫性疾病或全身性疾病的人,以及任何报告的银屑病家族史(包括一级、二级和三级亲属);(2)对照人群为非该医疗中心区域的常驻居民;(3)严重疾病导致身体健康状况不佳,如肿瘤,凝血功能障碍、重度贫血、不具备自主意识等;(4)志愿者被纳入研究一次以上;(5)志愿者的血液在实验前溶血。
本发明实施例中,每个参与者都签署了书面知情同意书。18岁以下或65岁以上的参与者还需要获得其监护人的知情同意。受过培训的现场技术人员使用统一的标准化问卷对受试者进行了访谈。所有银屑病人群均由二位高级皮肤科医生诊断为银屑病,经治愈且没有皮肤损伤的患者以及具有其他严重身体健康的严重疾病患者被排除在外,共纳入3069名银屑病患者和7041名健康人进行血清dsDNA水平的检测,共10110名受试者,平均年龄43.03±15.74岁。在所有参与者中,5640人为男性,占55.8%。所有入组的患者和健康人群均知情同意并自愿被收集1mL血样。该研究得到了机构伦理委员会的批准,并根据赫尔辛基宣言原则进行。在评估结果时,研究人员对实验期间的组别分配不知情。
本发明实施例中,开展本项检测的样本信息收集为:(1)银屑病患者:入院时收集有关人口统计学特征的数据。皮肤科医生记录并使用PASI评分和BSA评分来评估患者的病情。除此之外,也对患者其他疾病史,吸烟状况、酒精状况、入院时节、入院时血压,血脂,血糖,肝功能和其他临床实验室指标进行了采集。(2)健康对照人群:从医院体检中心获得健康人群的年龄、性别等基本人口统计学特征信息。除此之外,也收集体检时血压,血脂,血糖,肝功能和其他临床实验室指标信息。
本发明实施例中,开展本项检测的变量控制为:实验中的变量采集来自中国气象局、Weather Atlas和Earth Online收集的12个地区的月平均气温、紫外线(UV)指数、相对湿度、日照时间和日光时间等。
(1)根据Weather Atlas界定的纬度分类,0°到30°(不包含30°)是指低纬度,30°到60°(不包含60°)分为中纬度。
(2)根据中国地理位置划分,一般认为秦淮线将中国划分为北部地区和南部地区。
(3)从Weather Atlas获得6个地区的月平均紫外线指数。紫外线指数分为低(小于2)、中(3到5)、高(6和7)、非常高(8到10)和极端(11及以上)。
(4)相对湿度是指空气中的水分含量,从Weather Atlas查询并根据健康住房的适宜湿度进行量化,标准为40-70%相对湿度。相对湿度<70%和>70%分别分为低湿度和高湿度。
(5)日光时间表示从日出到日落的时间量,而日照时间则表示可以接受多少明亮的阳光。日光时间和日照时间按统计四分位数排序。日光时间分为8.7-11.1小时、11.2-13.3小时和13.4-15.7小时,分别定义为低日光时间、中日光时间和高日光时间。日照时间分为2-5.83小时、5.84-7.70小时和7.71-11.8小时,分别定义为低日照时间、中日照时间和高日照时间。
(6)银屑病的严重程度根据PASI和BSA进行分类。为了确保评估的准确性,使用了四种公认的分类方法来对银屑病的严重程度进行分类。PASI评分<8、8~12和>12分为第一种评估方法判定为轻度、中度或重度银屑病,其定义为PASI-1。PASI评分<10、10~20和>20被为第二种评估方法判定为轻度、中度或重度银屑病,其定义为PASI-2。BSA评分<5、5~10和>10是定义轻度、中度或重度银屑病的第三种方法,定义为BSA-1。BSA评分<10、10~20和>20是定义轻度、中度或重度银屑病的第四种方法,定义为BSA-2。
本发明实施例中,开展本项检测的具体步骤为:
(1)血清采集:使用真空促凝管采集新鲜静脉全血室温放置1小时后,使用eppondorf离心机,4℃,4000rpm离心30分钟后取上清。
(2)血清保存:如短时间保存可将上清转移至EP管内保存在-80℃冰箱,若长时间保存使用冻存管保存在液氮中。
(3)检测(参考Biovision EZQuant dsDNA操作说明进行)准备:待血清样品收集完毕后进行检测。按照试剂盒中的说明书分别制备1x TE buffer、2x dsDNA染液和10ng/微升的标准品。
(4)标准曲线制备:按照Biovision EZQuant dsDNA说明书配制10ng/微升的标准品制备线性标准品,在每孔黑色酶标板中分别加入0,2,4,6,8和10微升的标准样品,将标准样用1xTE buffer补至50微升,每个浓度设置三个重复。
(5)样品的准备:在每孔黑色酶标板中加入10微升样品,后用1xTE buffer补至50微升,每个浓度设置三个重复。
(6)染色:在每孔中加入50微升2x dsDNA染液,放置摇床上,室温轻摇5分钟,注意避光。
(7)检测:待染色反应完成后立即进行上机检测,使用带有Ex/Em=480/530检测模块的酶标仪或相似设备。
(8)校准:每个孔板均应设计有标准曲线和0孔,检测结果出来后首先使用标准曲线和0孔进行校准。一般标准曲线直线线性关系的r2值应大于0.99检测结果较佳,数据方可使用。
(9)数据的统计学分析:使用SPSS23.0和R Version 4.0.2版软件进行数据处理和分析。所有检验均采用双侧检验,P值小于0.05被认为具有统计学意义。
本发明实施例中,对荧光定量检测血清dsDNA的稳定性进行质控,使用了biotekcell vision5和flex station3两种检测设备对标准曲线进行了比较分析,r2分别为0.999和0.998,表明标准曲线制备较好,且仪器直接检测结果不具有差异性(如图2,图3所示)。
实施例1具有不同特征的银屑病人和正常人群血清dsDNA分布趋势
(1)银屑病组血清dsDNA水平显著高于对照组(P<0.001)(图4)。按地区、纬度、季节、温度、紫外线、湿度、日照时间和日照时间分层时,银屑病组与对照组血清dsDNA水平差异也分别显著(P<0.001)(图5)。
(2)对照组血清dsDNA的中位数水平为0.97ng/ml(四分位数间:0.86-1.11ng/ml)。男性、40岁以上、冬季、北方、中纬度、低温、低紫外线、低湿度、低日照、低日照时间的健康对照血清dsDNA水平显著较高。(图6,表1-表3)
表1不同特征的参与者(所有的参与者(n=10110))血清dsDNA比较
表2不同特征的参与者(患者(n=3069))血清dsDNA比较
表3不同特征的参与者(对比例(n=7041))血清dsDNA比较
(3)银屑病组血清dsDNA的中位数水平为1.18ng/ml(四分位数间距:1.02-1.39ng/ml)。银屑病患者在冬季、北方、中纬度、低温、低紫外线、低湿度、低日照和低日照时间的血清dsDNA水平显著升高(表1)。
(4)在银屑病患者中,有吸烟和饮酒习惯的患者血清dsDNA水平明显高于无这些特征的患者。不同类型银屑病的银屑病患者血清dsDNA水平不同(表4)。
表4不同特征患者血清dsDNA的比较
(5)将参与者血清dsDNA水平进行自然对数转化,用于探索气候因素的贡献。线性回归结果表明,紫外线、湿度、日照时间和日照时间与血清dsDNA水平呈负相关,紫外线是贡献最大的(图7)。
实施例2血清dsDNA在银屑病中的临床预测值
(1)在所有参与者中,根据ROC曲线,血清dsDNA预测银屑病的最佳临界值为1.11ng/ml,该临界值预测银屑病的敏感性和特异性分别为61.6%和74.8%(图8)。
(2)进一步构建逻辑回归模型来预测银屑病(自变量包括年龄、性别、BMI、地区、纬度、季节、温度、紫外线、湿度、日照时间、日光时间)。在多元逻辑回归模型中加入dsDNA后,预测效果增加,曲线下面积(AUC)从0.806增加到0.860(图9)。根据血清dsDNA的最佳截断值,血清dsDNA对不同特征的参与者的银屑病有很好的预测(表5)。
表5dsDNA截断的敏感性、特异性(1.11ng/ml)用于识别具有不同特征的所有参与者的银屑病情况
表6dsDNA截断的NPV、PPV和一致性率用于识别具有不同特征的所有参与者的银屑病情况
实施例3血清dsDNA可增加银屑病的发病风险
(1)调整年龄、性别、BMI、地区、纬度、温度、季节、紫外线、湿度、日照时间和日光时间后,Logistic回归模型显示,血清dsDNA每增加1ng/ml,银屑病风险增加40.40倍(OR:41.40,95%CI:32.32-53.03)。血清dsDNA四分位数分割后发现,银屑病发病几率随血清dsDNA四分位数水平的增加而增加,且存在显着的剂量反应关系。在地区、纬度、温度、季节、紫外线强度、湿度、日照时间和日照时间亚组中也发现了血清dsDNA水平与银屑病发病风险之间正向关联的类似结果(表7)。
表7dsDNA与银屑病发病风险的关系
(2)随着血清dsDNA的增加,银屑病的OR逐渐增加(图10)。当血清dsDNA<1.11ng/ml时,血清dsDNA每增加0.12ng/ml,银屑病发病风险OR为4.88(95%CI:3.85-6.20);当血清dsDNA≥1.11ng/ml时,血清dsDNA每增加一个标准偏差0.34ng/ml,银屑病发病风险OR为1.97(95%CI:1.74-2.22)(图10)。
(3)在银屑病不同亚组(不同地区,纬度、温度、季节、紫外线度、湿度、日照时间和日光时间)、血清dsDNA的不同临界值下,血清dsDNA与银屑病发病风险均呈正相关(图11-17)。对所有地区结果的Meta分析显示,在不调整混杂因素的情况下,血清dsDNA的每增加一个标准差,银屑病风险增加3.62倍(OR:4.62,95%CI:2.64-8.11);调整后混杂因素后,血清dsDNA每增加一个标准差,银屑病风险增加1.84倍(OR:2.84,95%CI:2.01-4.01)(图18)。
实施例5血清dsDNA与银屑病严重度(PASI和BSA评分)呈正相关
(1)在银屑病患者中,血清dsDNA每增加1ng/ml,PASI评分增加0.26分,BSA评分增加0.30分(表8)。
表8多中心患者dsDNA水平与PASI评分和BSA评分的线性相关性
(2)在大部分地区、纬度、温度、季节、紫外线强度、湿度、日照时间和日照时间的亚组中,血清dsDNA与PASI和BSA评分呈显著正相关。(表9)
表9多中心患者中dsDNA水平与PASI评分和BSA评分线性相关的亚组分析。
(3)血清dsDNA水平也与银屑病分级显著相关:血清dsDNA每增加1ng/ml,银屑病患者PASI-1评级为中度的风险增加0.66倍(OR:1.66,95%CI:1.10-2.50),PASI-1评级为重度的风险增加1.43倍(OR:2.43,95%CI:1.77-3.35);PASI-2评级为中度的风险增加0.78倍(OR:1.78,95%CI:1.29-2.46),PASI-2评级为重度的风险增加1.38倍(OR:2.38,95%CI:1.59-3.57);BSA-1评级为中度的风险增加0.83倍(OR:1.83,95%CI:1.12-2.97),BSA-1评级为重度的风险增加1.87倍(OR:2.87,95%CI:1.90-4.33);BSA-2评级为中度的风险增加0.66倍(OR:1.66,95%CI:1.13-2.45),BSA-2评级为重度的风险增加1.61倍(OR:2.61,95%CI:1.84-3.72)(图19,表10)。
表10多中心患者中dsDNA值与PASI评分和BSA评分风险之间的关系
(4)亚组分析显示分别在中纬度、高温和低温、高低紫外线、夏季和冬季、中高日照时间、中高日照时间、华北亚组中发现血清dsDNA水平与银屑病分级显著相关(表11)。
表11多中心患者中dsDNA与PASI评分和BSA评分风险之间的亚组分析
最后说明的是,以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管参照较佳实施例对本发明进行了详细说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换,而不脱离本发明技术方案的宗旨和范围,其均应涵盖在本发明的权利要求范围当中。

Claims (7)

1.一种用于评价银屑病的评价系统,其特征在于,包括:
数据获取模块,用于获取待检测样本血清的dsDNA含量;
数据分析模块,用于根据所述dsDNA含量评价银屑病的情况;
数据输出模块,根据所述银屑病的情况输出结果;
若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量≥1.11ng/ml时,则输出为:非正常、超高风险;若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量为0.97ng/ml≤dsDNA含量<1.11ng/ml,则输出为:正常、高风险;所述dsDNA含量为0.86ng/ml≤dsDNA含量<0.97ng/ml,则输出为:正常;或若所述dsDNA含量为<0.86ng/ml,则输出为:其他病症可疑;若所述待检测样本血清为已表型过治愈血清样本,所述dsDNA含量≥1.11ng/m,则输出为:极易复发。
2.根据权利要求1所述的评价系统,其特征在于,若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述数据获取模块获取不同时间的两次以上的dsDNA含量,再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加一个标准差,风险增加1.84倍,OR:2.84,95%CI:
2.01-4.01,所述输出模块输出是否正常和对应的风险倍数。
3.据权利要求1所述的评价系统,其特征在于,所述评价系统还包括病例模块,所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量<1.11ng/ml时,所述病例模块记录的再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量的差值每增加一个0.12ng/ml,则银屑病发病风险OR值为4.88,95%CI:3.85-6.20所述输出模块输出是否正常和对应的OR值;所述dsDNA含量≥1.11ng/ml时,所述病例模块记录的再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量的差值每增加一个0.34ng/ml,银屑病发病风险OR值为1.97,95%CI:1.74-2.22,所述输出模块输出是否正常和对应的OR值。
4.根据权利要求1所述的评价系统,其特征在于,若所述待检测样本血清为已表型样本血清,所述数据获取模块获取不同时间的两次以上的dsDNA含量,所述数据分析模块使用PASI方法进行评价,所述数据输出模块输出相应的情况;所述PASI方法为以下方法中的一种:(1)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清的PASI-1评级为中度的风险增加0.66倍,OR:1.66,95%CI:1.10-2.50,PASI-1评级为重度的风险增加1.43倍,OR:2.43,95%CI:1.77-3.35;或(2)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清的PASI-2评级为中度的风险增加0.78倍,OR:1.78,95%CI:1.29-2.46,PASI-2评级为重度的风险增加1.38倍,OR:2.38,95%CI:1.59-3.57。
5.根据权利要求1所述的评价系统,其特征在于,若所述待检测样本血清为已表型样本血清,所述数据获取模块获取不同时间的两次以上的dsDNA含量,所述数据分析模块使用BSA方法进行评价,所述数据输出模块输出相应的情况;所述BSA方法为以下方法中的一种:(1)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清的BSA-1评级为中度的风险增加0.83倍,OR:1.83,95%CI:1.12-2.97,BSA-1评级为重度的风险增加1.87倍,OR:2.87,95%CI:1.90-4.33;或(2)再后时间dsDNA含量与在前时间的dsDNA含量每增加1ng/ml,所述已表型样本血清BSA-2评级为中度的风险增加0.66倍,OR:1.66,95%CI:1.13-2.45,BSA-2评级为重度的风险增加1.61倍,OR:2.61,95%CI:1.84-3.72。
6.根据权利要求1所述的评价系统,其特征在于,所述评价系统还包括病例模块,用于记录所述待检测样本血清不同时间的dsDNA含量、是否有银屑病史。
7.dsDNA结合剂在制备银屑病检测试剂/试剂盒中的应用;应用包括:使用dsDNA结合剂测试dsDNA含量,若待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量≥1.11ng/ml时,则输出为:非正常、超高风险;若所述待检测样本血清为无表型样本血清,所述dsDNA含量为0.97ng/ml≤dsDNA含量<1.11ng/ml,则输出为:正常、高风险;所述dsDNA含量为0.86ng/ml≤dsDNA含量<0.97ng/ml,则输出为:正常;或若所述dsDNA含量为<0.86ng/ml,则输出为:其他病症可疑;若所述待检测样本血清为已表型过治愈血清样本,所述dsDNA含量≥1.11ng/m,则输出为:极易复发。
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