CN102766165A - 合成钼蝶呤前体z衍生物的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及合成钼蝶呤前体Z衍生物的方法。本发明提供制备式(I)化合物的合成方法;本发明还提供制备式(XIII)化合物的合成方法。本发明还提供有用的式(I)和式(XIII)化合物的中间体、衍生物、前药以及药用盐、溶剂化物和水合物。这些化合物用于治疗与钼辅酶缺乏相关的疾病。
Description
相关申请的交叉引用
本申请要求享有2011年2月18日提交的美国临时申请61/444,389、2011年6月20日提交的61/498,801、2011年6月20日提交的61/498,808、以及2012年2月15日提交的61/599,314的优先权,其全部内容通过引用的方式并入本申请。
技术领域
本申请提供了用于制备钼蝶呤(molybdopterin)衍生物前体Z的合成方法以及用于合成其的新的合成中间体。本申请也提供前体Z的有用的中间体、衍生物、前药以及药用盐、溶剂化物和水合物。这些化合物尤其用于治疗与钼辅酶缺乏(molybdenum cofactor deficiency)相关的疾病。
背景技术
钼辅酶(Moco)缺乏是一种多效性的遗传性障碍。Moco由共价连接至一个或两个与独特三环蝶呤部分连接的二硫醇盐的钼组成,通常称之为钼蝶呤(MPT)。Moco通过生物合成途径合成,所述生物合成途径可以根据生物合成中间体前体Z(环吡喃并蝶呤单磷酸盐(cyclic pyranopterinmonophosphate),cPMP)、MPT和腺苷酸化MPT分为四个步骤。Moco生物合成酶基因突变导致钼依赖酶亚硫酸盐-氧化酶、黄嘌呤氧化还原酶以及醛氧化酶产生的损失。鉴于所有这三种含有辅酶的酶类的活性都由于辅酶缺乏而受损,所述疾病的破坏性结果可上溯到亚硫酸盐-氧化酶活性的受损上。人Moco缺乏是一种罕见但是伴有严重神经症状的严重的疾病,所述神经症状包括脑衰减生长、不可治疗的发作、移位的晶状体(ocular lense)以及智力低下。直到最近,还没有有效的治疗手段,且患有Moco缺乏的病痛患者在幼年早期就死去。
现已发现,给药钼蝶呤衍生物前体Z(一种Moco生物合成途径中相对稳定的中间体)是一种针对人Moco缺乏以及涉及改变Moco合成的相关疾病的有效治疗方法(参见美国专利7,504,095)。然而如同大多数疾病替代疗法一样,该疗法受限于治疗活性剂的可利用度。
发明内容
先前已使用发酵方法制备前体Z(式(I)和(XIII)化合物)。然而这些方法存在稳定性问题、低收率以及大规模生产的成本阻碍。提出以下合成方法作为这些发酵方法的替代工艺。
本申请提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法:
该方法包括:
使式(II)化合物与式(III)化合物反应以制备式(IV)的化合物,所述式(II)化合物为:
所述式(III)化合物为:
所述式(IV)的化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基;
选择性保护式(IV)化合物以制备式(V)的化合物:
使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物:
以及使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
在一些实施方案中,所述药用盐是盐酸盐。
在一些实施方案中,所述式(II)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(III)化合物为受保护的或未保护的半乳糖、甘露糖、葡萄糖或古洛糖。例如,式(III)化合物可以是:
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛或苯亚甲基乙缩醛部分。
在一些实施方案中,步骤(a)包括在肼的存在下使式(II)化合物与式(III)化合物反应。例如,所述肼可以选自苯基肼和烷基肼。在一些实施方案中,所述肼是苯基肼。
在一些实施方案中,步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(V)磷酸化试剂反应。例如,P(V)磷酸化试剂可以选自:POCl3、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl2以及(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。在一些实施方案中,P(V)磷酸化试剂是POCl3。在一些实施方案中,步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(III)亚磷酸化试剂反应。例如,P(III)亚磷酸化试剂可以选自:P(OCH2CH2CN)2Cl、P(OCH2CH2CN)(NPr2-i)Cl以及氰基乙基-O-P[N(i-Pr)2)]。在一些实施方案中,步骤(c)进一步包括氧化所得的亚磷酸酯以制备化合物(VI)的磷酸酯。
在一些实施方案中,步骤(d)包括使式(VI)化合物与选自下述的氧化剂反应:RuO4、戴斯-马丁试剂(Dess-Martin)、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
在一些实施方案中,所述式(VII)化合物的脱保护在厌氧条件下进行。
在一些实施方案中,所述式(IV)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(V)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(VI)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(VII)化合物为:
在一些实施方案中,该方法进一步包括将式(I)配制为药物组合物。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:在肼的存在下,使式(II-A)化合物与式(III-A)化合物反应以制备式(IV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(III-A)化合物为:
所述式(IV-A)化合物为:
选择性地保护式(IV-A)化合物以制备式(V-A)化合物:
其中R1是保护基;
使式(V-A)化合物磷酸化以制备式(VI-A)化合物:
氧化式(VI-A)化合物以制备式(VII-A)化合物:
使式(VII-A)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请进一步提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:在肼的存在下,使式(II-A)化合物与式(III-A)化合物反应以制备式(IV-A)化合物;选择性地保护式(IV-A)化合物以制备式(V-B)化合物:
其中每个R1独立地为保护基;
使式(V-B)化合物磷酸化以制备式(VI-B)化合物:
氧化式(VI-B)化合物以制备式(VII-B)化合物:
使式(VII-B)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,包括:使式(II)化合物与式(VIII)化合物反应以制备式(IX)化合物,所述式(VIII)化合物为:
其中R2所述为H或保护基;
所述式(IX)化合物为:
选择性地保护式(IX)化合物以制备式(X)化合物:
其中R3为保护基;
氧化式(X)化合物以制备式(XI)化合物:
以及使式(XI)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请进一步提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括使式(II)化合物与式(III)化合物反应以制备式(IV)化合物;选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;氧化式(V)化合物以制备式(XII)化合物:
使式(XII)化合物磷酸化以制备式(VII)化合物;以及
使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请提供式(IV)化合物或其药用盐形式:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(IV)化合物或其药用盐形式可以为:
本申请还提供式(V)化合物或其药用盐形式:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(V)化合物或其药用盐形式可以选自:
本申请进一步提供式(VI)化合物或其药用盐形式:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(VI)化合物或其药用盐形式可以选自:
本申请提供式(VII)化合物或其药用盐形式:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(VII)化合物或其药用盐形式选自:
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:
使式(II)化合物与式(XXII)化合物反应以制备式(IV)化合物,所述式(XXII)化合物为:
选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备(VII)化合物;以及使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
在一些实施方案中,所述式(II)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(XXII)化合物为:
在一些实施方案中,所述步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(V)磷酸化试剂反应。例如,P(V)磷酸化试剂可以选自:POCl3、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl3以及(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。在一些实施方案中,P(V)磷酸化试剂是Cl2PO(OCH3)。
在一些实施方案中,步骤(d)包括使式(VI)化合物与选自下述的氧化剂反应:RuO4、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
在一些实施方案中,所述式(VII)化合物的脱保护在厌氧条件下进行。
在一些实施方案中,所述式(IV)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(V)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(VI)化合物为:
在一些实施方案中,所述式(VII)化合物为:
在一些实施方案中,该方法进一步包括将式(I)配制为药物组合物。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法:
该方法包括:在肼的存在下,使式(II-A)化合物与式(XXII-A)化合物反应以制备式(IV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(XXII-A)化合物为:
所述式(IV-A)化合物为:
选择性地保护式(IV-A)化合物以制备式(V-C)化合物:
使式(V-A)化合物磷酸化以制备式(VI-C)化合物:
氧化式(VI-C)化合物以制备式(VII-C)化合物:
使式(VII-C)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:
使式(XXIII)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团;
所述式(XXIV)化合物为:
使式(XXIV)化合物与式(II)化合物反应以制备式(XXV)化合物:
对式(XXV)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV)化合物;选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备(VII)化合物;以及使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
在一些实施方案中,式(XXIII)化合物选自:
例如,式(XXIV)化合物可以为:
在一些实施方案中,式(II)化合物为:
在一些实施方案中,式(XXV)化合物为:
在一些实施方案中,步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(V)磷酸化试剂反应。例如,P(V)磷酸化试剂可以选自:POCl3、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl3以及(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。在一些实施方案中,P(V)磷酸化试剂是Cl2PO(OCH3)。
在一些实施方案中,步骤(d)包括使式(VI)化合物与选自下述的氧化剂反应:RuO4、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
在一些实施方案中,式(VII)化合物的脱保护在厌氧条件下进行。
在一些实施方案中,式(XXIII)化合物为:
在一些实施方案中,式(XXIV)化合物为:
在一些实施方案中,式(XXV)化合物为:
在一些实施方案中,该方法进一步包括将式(I)配制为药物组合物。
在一些实施方案中,离去基团选自:甲苯磺酸酯、对溴苯磺酸酯、间硝基苯磺酸酯、甲磺酸酯、氧鎓、三氟甲磺酸酯、全氟丁基磺酸酯以及三氟乙基磺酸酯。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:使式(XXIII-A)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII-A)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团;
所述式(XXIV)化合物为:
使式(XXIV)化合物与式(II-A)化合物反应以制备式(XXV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(XXV-A)化合物为:
对式(XXV)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV-D)化合物:
选择性地保护式(IV-D)化合物以制备式(V-D)化合物:
使式(V-D)化合物磷酸化以制备式(VI-D)化合物:
氧化式(VI-D)化合物以制备(VII-D)化合物:
以及使式(VII-D)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请还提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐形式的方法:
该方法包括:
使式(II)化合物与式(III)化合物反应以制备式(IV)化合物,所述式(II)化合物为:
所述式(III)化合物为:
所述式(IV)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基;
选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物:
使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物:
氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物:
以及使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请还提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐,该方法包括:
使式(II)化合物与式(VIII)化合物反应以制备式(IX)化合物,所述式(VIII)化合物为:
其中:
R2是H或保护基,
所述式(IX)化合物:
选择性地保护式(IX)化合物以制备式(X)化合物:
其中R3是保护基;
氧化式(X)化合物以制备式(XV)化合物:
使式(XV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请进一步提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:使式(II)化合物与式(III)化合物反应以制备式(IV)化合物;选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物:
使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:氧化式(VI)化合物以制备式(VII)化合物;以及使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
在一些实施方案中,式(I)化合物或其药用盐可以通过如下来制备:使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(VII)化合物;以及使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请还提供一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(VII)化合物;使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
本申请还提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐形式的方法,该方法包括:氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物;以及使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
在一些实施方案中,式(XIII)化合物或其药用盐通过如下来制备:使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物;以及使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请还提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐形式的方法,该方法包括:选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物;以及使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请还提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:使式(II)化合物与式(XXII)化合物反应以制备式(IV)化合物;选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物;以及使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请还提供一种制备式(XIII)化合物或其药用盐的方法,该方法包括:使式(XXIIII)化合物反应以制备式(XXIV)化合物;使式(XXIV)化合物与式(II)化合物反应以制备式(XXV)化合物;对式(XXV)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV)化合物;选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物;使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物;氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物;以及使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
本申请进一步提供通过上述任意方法制备的式(I)化合物或其药用盐。在一些实施方案中,提供药物组合物,其包含通过上述任意方法制备的式(I)化合物或其药用盐,以及药用赋形剂。本申请还提供通过上述任意方法制备的式(XIII)化合物。在一些实施方案中,提供药物组合物,其包含通过上述任意方法制备的式(XIII)化合物或其药用盐,以及药用赋形剂。
本申请还提供一种制备式(XXIV)化合物或其药用盐的方法:
其中:
每个R1为H或保护基,该方法包括使式(XXIII)化合物与碱反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII)化合物为:
其中:
R4是H或离去基团。
附图说明
图1显示示例说明使用合成以及纯化的前体Z(cPMP)的Moco的体外合成的柱状图。
图2提供来自合成前体Z(cPMP)的MPT体外合成的三次重复的数据。
图3提供来自使用E.coli.制备的纯化的前体Z(cPMP)的MPT体外合成的三次重复的数据。
具体实施方式
可以理解的是,为了清楚起见,在分开的实施方案的上下文中所述的本发明的某些特征也可以在单一的实施方案中合并而提供。相反地,为了简洁起见,在单一的实施方案的上下文中所述的本发明的多个特征也可以单独或以任意合适的亚组合而提供。
除非另有说明,本申请使用的所有技术性和科学性术语具有通常被本公开所属领域的技术人员所理解的相同含义。将本申请引用的所有专利、申请、公开申请以及其它公开的全部内容通过引用的方式并入本申请。在本申请引用的术语具有多重定义的情况下,除非另作说明,本部分的定义为首先使用的。
对于术语″例如″和″诸如″以及其语法等效用语,短语″无限制地″理解为以下含义,除非另有明确说明。如本申请使用,术语“约”意在解释由于试验误差导致的变化。本申请报道的所有测量应理解为被术语“约”修改,无论术语是否明确使用,除非另作明确说明。如本申请使用,单数形式“a”、“an”和“the”包括复数形式的所指对象,除非上下文另作明确说明。
术语“盐”包括任意离子形式的化合物以及一种或者多种抗衡离子(阳离子和/或者阴离子)。盐也包括两性离子化合物(即含有一个或者多个阳离子和阴离子的分子,例如两性离子氨基酸)。出现在盐中的抗衡离子可包括任意的阳离子、阴离子或者两性离子。示例性阴离子包括但不限于:氯离子、溴离子、碘离子、硝酸根离子、硫酸根离子、硫酸氢根离子、亚硫酸根离子、亚硫酸氢根离子、磷酸根离子、酸性磷酸根离子、高氯酸根离子、氯酸根离子、亚氯酸根离子、次氯酸根离子、高碘酸根离子、碘酸根离子、亚碘酸根离子、次碘酸根离子、碳酸根离子、碳酸氢根离子、异烟酸根离子、乙酸根离子、三氯乙酸根离子、三氟乙酸根离子、乳酸根离子、水杨酸根离子、枸橼酸根离子、酒石酸根离子、泛酸根离子、酒石酸氢根离子、抗坏血酸根离子、琥珀酸根离子、马来酸根离子、龙胆酸根离子、富马酸根离子、葡糖酸根离子、葡糖二酸根离子、糖二酸根离子、甲酸根离子、苯甲酸根离子、谷氨酸根离子、甲磺酸根离子、三氟甲磺酸根离子、乙磺酸根离子、苯磺酸根离子、对甲苯磺酸根离子、对三氟甲基苯磺酸根离子、氢氧根离子、铝酸根离子和硼酸根离子。示例性阳离子包括但不限于:一价碱金属阳离子诸如锂、钠、钾和铯离子,以及二价碱土金属阳离子诸如铍、镁、钙、锶和钡离子。本发明也包括过渡金属阳离子诸如金、银、铜和锌离子,以及非金属阳离子诸如铵盐。
如本申请使用的术语“前药”是指这样的化合物,其在对受试者给药后,通过代谢或者化学方法进行化学转化以产生例如本申请所述的化合物和/或者其盐和/或者其溶剂化物。术语“前药”可包括形成的酯和碳酸酯,例如,通过使用本领域技术人员已知的方法使本申请所述的化合物的一个或者多个羟基与烷基、烷氧基或者芳基取代的酰化剂反应以产生例如相应的乙酸酯、特戊酸酯、甲基碳酸酯和苯甲酸酯。例如,含有羧基的化合物可形成生理学可水解的酯,其通过在体内水解以产生本发明化合物而作为前药。所述前药可口服给药,这是由于在许多情况下水解在消化酶的影响下发生。也可使用肠胃外给药,例如在水解在血液中发生的情况下。
本申请使用的术语“溶剂化物”意在描述分子络合物(molecularcomplex),其包含本发明的化合物以及化学量的一种或者多种药用溶剂分子,例如,乙醇。当溶剂为水时使用术语“水合物”。用于制备和鉴别水合物和溶剂化物的典型方法在K.J.Guillory,“Generation of Polymorphs,Hydrates,Solvates,and Amorphous Solids,”in:Polymorphism in Pharmaceutical Solids,ed.Harry G.Brittan,Vol.95,Marcel Dekker,Inc.,New York,1999第202-209页中描述,将其全部内容通过引用的方法并入本申请。
如本申请使用,含有用虚线和粗线描绘的一个或者多个立体中心的化学结构意在表明出现在化学结构中的一个或者多个立体中心的绝对立体化学。如本申请使用,通过单线表示的化学键不能表明立体选择(stereo-preference)。除非另作相反的说明,本申请示例说明的包括一个或者多个立体中心而不表明绝对或者相对立体化学的化学结构涵盖所有可能的化合物的立体异构形式(例如非对映异构体、对映异构体)及其混合物。具有单一粗线或者虚线和至少一条额外的单线的结构涵盖所有可能的非对映异构体的单一对映异构系列。
化合物的外消旋混合物的拆分可通过本领域已知的众多方法中的任意一种进行。示例性方法包括使用具有旋光的手性拆分酸、盐形成有机酸的分级重结晶。对于分级重结晶方法的适当拆分剂为例如,具有旋光的酸诸如D和L形式的酒石酸、二乙酰酒石酸、二苯甲酰酒石酸、扁桃酸、苹果酸、乳酸,或者各种具有旋光的樟脑磺酸类诸如樟脑磺酸。其它适于分级重结晶方法的拆分剂包括立体异构纯的形式的甲基苄基胺(例如其S和R形式或者非立体异构纯的形式)、2-苯基甘氨醇(glycinol)、降麻黄碱、麻黄碱、N-甲基麻黄碱、环己基乙基胺、1,2-二氨基环已烷等。
外消旋混合物的拆分也可通过在用具有旋光的拆分剂(例如二硝基苯甲酰苯基甘氨酸)填充的柱上洗脱来进行。适当的洗脱溶剂组合可由本领域技术人员确定。
本发明的混合物也可包括出现在中间体或者最终化合物中原子的所有同位素。同位素包括具有相同原子数但不同质量数的原子。例如,氢的同位素包括氚和氘。
本申请使用的术语“化合物”意在包括所述结构的所有立体异构体、几何异构体、互变异构体和同位素。通过命名或者结构鉴定为一种具体互变异构形式的本申请的化合物意在包括其它互变异构形式,除非另作说明。
所有化合物及其药用盐可与其它物质诸如水和溶剂(例如水合物和溶剂化物)一起存在。
在一些实施方案中,本发明的化合物或者其盐基本上为分离的。“基本上分离的”是指所述化合物至少部分或者基本上由其形成或者检测所处的环境分离。部分分离可包括例如,富含本发明化合物的组合物。基本上分离可包括含有按重量计至少约50%、至少约60%、至少约70%、至少约80%、至少约90%、至少约95%、至少约97%或者至少约99%的本发明化合物或者其盐的组合物。用于分离化合物及其盐的方法在本领域中是常规的。
本申请使用的短语“药用”是指这样的化合物、物质、组合物和/或者剂型,其在合理医学判断的范围内,适用于与人类和动物的组织接触,其无过度毒性、刺激、过敏反应或者其它问题或者并发症,且具有合理的受益/风险比。
如本申请使用的表述“环境温度”和“室温”在本领域中是可理解的,且通常是指这样的温度,例如反应温度,其约为反应进行所在的室内的温度,例如,约20℃至约30℃的温度。
本申请也提供本申请所述化合物的药用盐。如本申请使用的“药用盐”是指公开的化合物的衍生物,其中母体化合物通过将存在的酸或者碱部分转化为其盐形式进行修饰。药用盐的实例包括但不限于碱性残基诸如胺的无机或者有机酸盐;酸性残基诸如羧酸的碱盐或者有机盐;等。本申请提供的化合物的药用盐包括形成的母体化合物的常规无毒盐,例如,来自无毒无机或者有机酸的盐。本申请提供的化合物的药用盐可由含有碱性或者酸性部分的母体化合物通过常规化学方法合成。通常,所述盐可通过使这些化合物的游离酸或者碱形式与化学量的适当碱或者酸在水或者有机溶剂或者两者的混合物中反应来制备;在一些实施方案中,可使用非水介质如醚、乙酸乙酯、醇(例如甲醇、乙醇、异丙醇或者丁醇)或者乙腈(ACN)。适当盐的名单出现在Remington′s Pharmaceutical Sciences,17th ed.,MackPublishing Company,Easton,Pa.,1985,p.1418和Journal of PharmaceuticalScience,66,2(1977)中,将其各自的全部内容通过引用的方式并入本申请。用于制备盐形式的常规方法在例如Handbook of Pharmaceutical Salts :Properties,Selection,and Use,Wiley-VCH,2002中描述。
合成
本申请提供的化合物包括其盐可使用已知有机合成技术制备且可根据众多可能的合成途径中的任意一种来合成。
用于制备本申请提供的化合物的反应可在适当溶剂中进行,所述溶剂可被有机合成领域的技术人员容易地选择。适当的溶剂可基本上不与起始物质(反应物)、中间体或者产物在反应进行的温度(例如范围可在溶剂冷冻温度至溶剂沸腾温度内的温度)来反应。给定反应可在一种溶剂或者多于一种溶剂的混合物中进行。取决于具体反应步骤,技术人员可选择对于具体反应步骤的适当溶剂。
本申请提供的化合物的制备可包括各种化学基团的保护和脱保护。本领域技术人员可容易地确定对于保护和脱保护以及选择适当保护基团的需要。保护基团的化学性可出现在例如Protecting Group Chemistry,1st Ed.,Oxford University Press,2000;March’s Advanced Organic chemistry:Reactions,Mechanisms,and Structure,5th Ed.,Wiley-Interscience Publication,2001;和Peturssion,S.et al.,“Protecting Groups in Carbohydrate Chemistry,”J.Chem.Educ.,74(11),1297(1997)中,将其各自的全部内容通过引用的方式并入本申请。
反应可根据本领域任意适当的已知方法进行监测。例如,产物形成可通过分光镜方法(诸如核磁共振光谱法(例如1H或者13C)、红外光谱法、分光光度法(例如UV-可见光)、质谱法)或者色谱方法(诸如高效液相色谱法(HPLC)、液相色谱-质谱法(LCMS)或者薄层色谱法(TLC))进行监测。化合物可由本领域技术人员通过各种方法(包括高效液相色谱法(HPLC)(“Preparative LC-MS Purification:Improved Compound SpecificMethod Optimization”K.F.Blom,et al.,J.Combi.Chem.6(6)(2004),将其全部内容通过引用的方式并入本申请)和正相硅胶色谱法)进行纯化。
式(I)化合物以及其它有用的化合物及中间体可按照方案1所示形成。例如,式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与受保护的或未保护的式(III)的己糖反应以得到式(IV)的化合物。然后式(IV)的哌嗪环的环氮原子可以使用标准条件被选择性地保护,以得到式(V)衍生物。式(V)化合物的磷酸化可得到式(VI)的磷酸酯中间体。式(VI)的磷酸酯可以在合适的氧化条件下转化为式(VII)的二醇。最后,式(VII)化合物可以脱保护以得到式(I)化合物。
方案1
式(II)化合物:
在一些实施方案中,式(II)化合物的制备为:
其中每个R1独立地为H或保护基。
式(II)可包括,例如,化合物2,5,6-三氨基嘧啶-4(3H)-酮及其盐和衍生物:
如所描述的那样,某些式(II)结构的官能团(例如,氨基嘧啶环的2-位,以及3-位的环氮原子)可以用R1保护基保护。出于该目的,R1可以包含任意合适的氨基保护基,包括,但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基甲酰氨基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基选自氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
式(II)化合物可使用已知方法制备,诸如在Sharma et al.,Indian Journalof Chemistry,Section B:Organic Chemistry Including Medicinal Chemistry,43B,385(2004)中所述的方法。例如,2,5,6-三氨基嘧啶-4(3H)-酮如方案2所示制备。
方案2
式(II)化合物或其药用盐也可以包括互变异构结构:
式(III)化合物:
本申请其它实施方案提供式(III)化合物的制备:
其中每个R1独立地为H或保护基。
式(III)可包括,例如,受保护的或未保护的己糖。特别地,葡萄糖、甘露糖、半乳糖、阿洛糖、阿卓糖、古洛糖、艾杜糖、塔罗糖及其衍生物。己糖可以为D或L构型。例如,以下己糖都包括在式(III)范围内:
在一些实施方案中,己糖是受保护的或未保护的葡萄糖或半乳糖。例如,式(III)化合物可以为受保护的或未保护的半乳糖(例如,D-半乳糖)。在一些实施方案中,己糖是受保护的或未保护的古洛糖或半乳糖。
如所描述的那样,式(III)化合物可以为游离糖的形式(即,未保护的糖)。可选地,某些式(III)结构的羟基(例如,己糖3、4和5-位的羟基)可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意合适的羟基官能团,包括,但不限于醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
特别地,醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯和9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,在己糖的4和5-位的R1基团可合并以形成一个或多个以下受保护的己糖:
式(III)化合物可按照碳水化合物合成的已知方法来制备。保护碳水化合物的方法也是已知的,如在The Organic Chemistry of Sugars,Taylor & Francis,2006,p.181;和Peturssion,S.et al.,J.Chem.Educ.,74(11),1297(1997)中有述,将其各自的全部内容通过引用的方式并入本申请。
当被本领域技术人员认知且当在下文中讨论时,式(III)结构的立体化学可控制在式(I)的合成中后续的中间体的立体化学。此外,对一些羟基的保护可改善式(III)化合物的溶解度且调整连续反应步骤的立体专一性。
式(IV)化合物:
本申请提供的另一个实施方案涉及式(IV)化合物或其药用盐或水合物的制备:
其中每个R1独立地为H或保护基。
如所描述的那样,式(IV)化合物的氨基以及羟基可为受保护的或未保护的形式。例如,以未保护的形式的式(IV)化合物或其药用盐可包括化合物2-氨基-6,7-二羟基-8-(羟基甲基)-5a,6,7,8,9a,10-六氢-3H-吡喃并[3,2-g]蝶啶-4(5H)-酮:
某些式(IV)结构的氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括,但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二不己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基选自氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯和9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(IV)的己糖环成分的4和5-位的R1基团可合并以形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。
保护某些氨基和羟基可改善式(IV)化合物的溶解度。例如式(IV)乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(IV)化合物可通过使式(II)化合物与式(III)化合物反应以制备式(IV)化合物,所述式(II)化合物为:
所述式(III)化合物为:
所述式(IV)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
具体地,式(IV)化合物可通过式(II)化合物和式(III)化合物在任意可实现环化的试剂的存在下反应来制备。所述试剂可被技术人员容易地确定且可包括例如,经取代的或者未经取代的肼。适当肼试剂的非限制性实例包括苯基肼和烷基肼,例如,苯基肼和对硝基苯基肼。
也可以理解的是,式(IV)结构的异构体形式可调节合成式(I)的后续反应步骤的立体特异性。因此,特定异构体可在该合成步骤分离或,可选地,式(IV)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一些实施方案中,式(IV)化合物或其药用盐或水合物包括异构体:
在合成过程中,式(IV)产物的立体化学可任选通过处理式(III)的己糖的C-3和C-4位上的立体化学来控制。例如,衍生自葡萄糖、甘露糖、半乳糖、阿洛糖、阿卓糖、古洛糖、艾杜糖和塔罗糖的式(III)的反应物以及在糖的C-3和C-4位上的立体化学方面不同的衍生物将产生式(IV)的产物的不同的异构体混合物。
式(IV)合成的立体选择性也可通过在式(III)的化合物的一些位置上并入大量的保护基来控制。例如,在式(III)糖的C-3、C-4或者C-5位中的任意一个位置上引入异亚丙基乙缩醛可调整反应的立体选择性。
式(V)化合物:
本申请提供的另一个实施方案涉及式(V)化合物或其药用盐或水合物的制备:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(V)化合物包括化合物(V-A)或其药用盐:
其中R1是H或保护基。式(V)化合物也包括,例如,化合物2-氨基-6,7-二羟基-8-(羟基甲基)-4-氧代-5a,6,7,8,9a,10-六氢-3H-吡喃并[3,2-g]蝶啶-5(4H)-羧酸(9H-芴-9-基)甲酯或其药用盐:
在一些实施方案中,式(V)化合物可包括,例如,一种或多种的以下化合物:
在一些实施方案中,一个或多个以上化合物可由本领域技术人员通过多种方法分离,包括高效液相色谱(HPLC)(″Preparative LC-MS Purification:Improved Compound Specific Method Optimization″K.F.Blom,et al.,JCombi.Chem.6(6),874(2004),其全部内容并入本文作为参考)以及正相硅胶色谱。
如所描述的那样,某些式(V)结构的氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基选自氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯和9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(V)的己糖环成分的4和5-位的R1基团可合并以形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。
保护某些氨基和羟基可改善式(V)化合物的溶解度。例如,式(V)的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。式(V)化合物可通过选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物,所述式(IV)化合物为:
所述式(V)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
具体地,式(V)化合物可通过式(IV)化合物与任意试剂反应并使用实现在N5上选择性安置R1保护基的条件来制备。对于安置R1保护基的适当试剂和条件可由本领域技术人员容易地确定。例如,可使用活性氯化物衍生物安置氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc),如在E.Atherton et al.,“TheFluorenylmethoxycarbonyl Amino Protecting Group,”in The Peptides,S.Udenfriend and J.Meienhofer,Eds.,Academic Press,New York,1987,Vol.9,page 1中报道。使用氨基甲酸叔丁酯(Boc)的保护可通过使式(IV)的化合物与例如(Boc)2O在含水NaOH中反应来实现,如在D.Tarbell et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,69,730(1972)中所述。氨基甲酸甲酯和氨基甲酸乙酯可容易地引入,如在E.J.Corey et al.,Tetrahedron Lett.,1051(1978)中所述。
也可以理解的是,式(V)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(V)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一些实施方案中,式(V)化合物包括异构体:
另外,如上所述,式(V)化合物也包括互变异构结构:
式(VI)化合物:
在另一个实施方案中,制备式(VI)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(VI)化合物包括化合物(VI-A)或其药用盐:
其中R1是H或保护基。式(VI)化合也包括,例如,化合物或其药用盐:
在一些实施方案中,式(VI)化合物包括,例如,化合物(VI-B)或其药用盐:
在一些实施方案中,一种或多种以上化合物可由本领域技术人员通过多种方法分离,包括高效液相色谱(HPLC)(″Preparative LC-MS Purification:Improved Compound SpecificMethod Optimization”K.F.Blom,et al.,J.Combi.Chem.6(6)(2004),其全部内容通过引用的方式并入本申请)以及正相硅胶色谱。
如所描述的那样,某些式(VI)结构的氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基可选自基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯和9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯保护基团为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
保护某些氨基和羟基可改善式(VI)化合物的溶解度。例如式(VI)的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(Vl)化合物可通过磷酸化式(V)化合物以制备式(VI)化合物或其药用盐形式,所述式(V)化合物为:
所述式(VI)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
具体地,式(VI)化合物可通过使式(V)化合物与任意的适于形成式(VI)化合物的磷酸化试剂反应来制备。适当的磷酸化试剂和条件可容易地被本领域技术人员确定。例如,式(VI)化合物可通过将式(V)化合物用P(V)磷酸化试剂处理来获得。适当的P(V)磷酸化试剂包括但不限于POCl3、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl2、PO(OCH3)xCl3-x、PO(OCH3)Cl2、PO(OCH3)xCl3-x、PO(OCH3)Cl2和(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。在一些实施方案中,P(V)磷酸化试剂为POCl3。
在一个实施方案中,磷酸化反应可通过将式(V)化合物用POCl3在环境温度处理以得到式(VI)化合物来进行。在另一个实施方案中,式(VI)化合物通过将式(V)化合物用POCl3在60℃处理而形成。
磷酸化反应也可包括将式(V)化合物用P(III)亚磷酸化试剂处理以形成亚磷酸酯中间体。适当的P(III)亚磷酸化试剂包括例如,P(OCH2CH2CN)2Cl;P(OCH2CH2CN)(NPr2-i)Cl;和氰基乙基-O-P[N(i-Pr)2)]2。当P(III)亚磷酸化试剂用于磷酸化时,后续的氧化反应可用于得到相应的磷酸酯。当P(III)试剂用于合成式(VI)化合物时,Boc或者Cbz基团可用于式(IV)化合物的N5上的R1保护,这是由于用于亚磷酸化的碱性环境。
也可以理解的是,式(VI)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(VI)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一些实施方案中,式(VI)化合物包括异构体:
如上所述,式(VI)化合物也可以包括互变异构结构。
式(VII)化合物:
在另一个实施方案中,制备式(VII)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。例如,式(VII)化合物包括化合物(VII-A)或其药用盐:
其中R1为H或保护基。
式(VII)化合物也包括,例如,化合物或其药用盐:
在一些实施方案中,式(VII)化合物包括化合物(VII-B)或其药用盐:
或其药用盐。在一些实施方案中,一种或多种以上化合物可由本领域技术人员通过多种方法分离,包括高效液相色谱(HPLC)(″Preparative LC-MS Purification:ImprovedCompound Specific Method Optimization”K.F.Blom,et al.,J.Combi.Chem.6(6)(2004),其全部内容通过引用的方式并入本申请)以及正相硅胶色谱。
如所描述的那样,某些式(VII)结构的氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基可选自基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酸酯、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯和9-芴羧酸芳基酯。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
保护某些氨基和羟基可改善式(VII)化合物的溶解度。例如式(VII)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(VII)化合物可通过氧化式(VI)化合物以制备式(VII)化合物,所述式(VI)化合物为:
所述式(VII)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
在该合成中,式(VII)化合物可通过使式(VI)化合物与任意的适于选择性形成式(VII)的二醇的氧化剂反应来制备。适当的氧化剂和条件可被本领域技术人员容易地确定。例如,式(VII)化合物可通过将式(VI)化合物用钌化合物诸如RuO4 -/NMO处理来形成。也可使用其它氧化剂,诸如戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐、TFAA/DMSO、PDC、过氧化氢、无机过氧化物、硝酸、硝酸盐、亚氯酸盐、氯酸盐、高氯酸盐、次氯酸盐、过氧化物、碘、臭氧、氧化亚氮、氧化银、高锰酸盐、六价铬化合物、铬酸、重铬酸、三氧化铬、氯铬酸吡啶、过硫酸、亚砜、硫酸、Tollens试剂、2,2’-二吡啶基二硫化物(DPS)和四氧化锇。在一个实施方案中,使用一定的氧化条件由此化合物(VI)的吡嗪环不被氧化。在一些实施方案中,氧化剂选自RuO4 -/NMO、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
例如,氧化反应可通过将式(VI)化合物用RuO- 4/NMO在环境温度处理以得到式(VII)化合物来进行。在另一个实施方案中,式(VII)化合物通过将式(VI)化合物用RuO- 4/NMO在20-60℃或者20、25、30、35、40、45、50或者55℃的温度处理来形成。
也可以理解的是,式(VII)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(VII)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一些实施方案中,式(VII)化合物包括异构体或其药用盐:
如上显示,式(VII)化合物也可以包括互变异构结构或其药用盐:
式(I)化合物:
在一些实施方案中,制备式(I)化合物及其药用盐及水合物:
优选进行式(I)化合物的合成由此以实现所需立体化学且避免氧化,这是由于在化学合成过程中吡喃环的开环。
式(I)化合物可例如通过使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物,所述式(VII)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
在该合成中,脱保护可包括例如,在式(VII)化合物上的一些氨基和羟基保护基的连续脱保护或者一锅法脱保护以得到式(I)化合物。对于式(VII)化合物脱保护的适当的试剂和条件可被本领域技术人员容易地确定。例如,化合物(I)可通过将式(VII)化合物在一定条件下处理来形成,所述条件使羟基保护基诸如乙酸酯、异亚丙基和苯亚甲基保护基由式(VII)结构离去。例如,可通过Zemplén条件使用作为碱的催化剂NaOMe在甲醇中使乙酸酯基团断裂。苯亚甲基和异亚丙基可通过氢化作用或者使用酸性水解断裂,如在R.M.Hann et al.,J.Am.Chem.Soc.,72,561(1950)中报道。在另一个实例中,可进行脱保护,由此氨基保护基诸如氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基由式(VII)化合物断裂。可在温和条件下用胺碱(例如哌啶)除去氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)以得到游离胺和二苯并呋喃,如在E.Atherton et al.,“The FluorenylmethoxycarbonylAmino Protecting Group,”in The Peptides,S.Udenfriend and J.Meienhofer,Academic Press,New York,1987,p.1中所述。可在酸性条件(例如3M HCl在EtOAc中的溶液)下除去氨基甲酸叔丁酯(Boc),如在G.L.Stahl et al.,J.Org.Chem.,43,2285(1978)中报道。氢化作用可用于使氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基断裂,如在J.Meienhofer et al.,Tetrahedron Lett.,29,2983(1988)中所述。
为了防止在反应过程中式(I)的氧化,脱保护可在缺氧条件下进行。脱保护也可在环境温度或者约20-60℃(例如25、30、35、40、45、50或者55℃)的温度进行。
式(I)化合物可以药用盐的形式分离。例如,式(I)化合物可在HCl的存在下结晶以形成化合物的HCl盐形式。式(I)化合物也可被分离,例如通过用NaOH处理来沉淀为钠盐。式(I)化合物在一些反应和贮存条件下为不稳定的。在一些实施方案中,包含式(I)化合物的最终溶液可通过本领域已知的方法酸化。例如,如果在溶液中贮存,式(I)化合物可在酸性溶液中贮存。
可替换地,式(I)的化合物可如下制备,例如:
在肼的存在下反应,使式(II-A)化合物与式(III-A)化合物以制备式(IV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(III-A)化合物为:
所述式(IV-A)化合物为:
选择性地保护式(IV-A)化合物以制备式(V-A)化合物:
其中R1是保护基,如上所述;
使式(V-A)化合物磷酸化以制备式(VI-A)化合物:
氧化式(VI-A)化合物以制备式(VII-A)化合物:
使式(VII-A)化合物脱保护以制备式(I)化合物。例如,式(I)化合物可以按照方案3所示制备。方案3.
在另一个实施方案中,式(I)化合物可通过如下制备:
在肼的存在下反应,使式(II-A)化合物与式(III-A)化合物以制备式(IV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(III-A)化合物为:
所述式(IV-A)化合物为:
选择性地保护式(IV-A)化合物以制备式(V-B)化合物:
其中每个R1独立地为保护基,如上所述;
使式(V-B)化合物磷酸化以制备式(VI-B)化合物:
其中每个R1独立地为保护基,如上所述;
氧化式(VI-B)化合物以制备式(VII-B)化合物:
以及使式(VII-B)化合物脱保护以制备式(I)化合物。例如,式(I)化合物可以按照方案4所示制备。
方案4.
可选地,式(I)化合物可如方案5所示形成。式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与式(VIII)的磷酸化己糖偶联以得到式(IX)化合物。哌嗪环的环氮原子可以被保护得到式(X)化合物,其可以氧化得到式(XI)的二醇。然后式(XI)的二醇可以在合适的条件下脱保护并转化得到式(I)化合物。
方案5.
在该实施方案中,磷酸酯可在合成起始引入以避免在合成后续步骤时出现不期望的吡喃与呋喃异构体的平衡。例如,式(I)化合物可如在方案6所示制备。
方案6.
式I化合物也可以按照方案7所示形成。式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与式(III)化合物偶联以得到式(IV)的哌嗪衍生物。式(IV)化合物的哌嗪环氮原子可以在标准条件下被保护以得到式(V)的衍生物。式(V)结构可以被氧化以得到式(XII)化合物。使式(XII)化合物磷酸化得到式(VII)化合物。式(VII)化合物的整体脱保护以得到式(I)化合物。
方案7.
例如,式(I)化合物可以如方案8所示制备。
方案8.
在一个可选的实施方案中,式(I)化合物可以如方案9所示形成。式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与式(XVIII)的2-羰基己糖标准成分缩合以制备具有良好区域选择性的式(XX)的亚胺。进一步用路易斯酸(LA)(例如,TMSOTf)活化端基位置官能团(诸如乙酸酯)以得到式(XXI)的环化的化合物。可在平伏位置新生成糖苷键。氢化式(XXI)化合物可制备式(IV)化合物。选择性保护式(IV)化合物得到式(V)化合物,其被氧化以得到式(XII)化合物。然后式(XII)化合物可如本申请所述处理得到式(I)化合物。
方案9.
例如,式(I)化合物可以如方案10所示制备。
方案10.
可选地,式(I)化合物可以如方案11所示形成。在该合成中,式(II)的二氨基嘧啶酮与己糖标准成分的环化可在碱的存在下进行。用路易斯酸(LA)活化得到环化产物,其可被脱保护以形成未保护的酮。该酮可如本申请所述被磷酸化和/或整体脱保护得到式(I)化合物或式(XIII)化合物。方案11.
例如,式(I)化合物可以如方案12所示制备。
方案12.
在一个可选的实施方案中,式(I)化合物可以由化合物Z的环化反应制得,如方案13所示。
方案13.
可选地,式(I)化合物可以如方案14所示制备。式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与式(XXII)化合物偶联得到如式(IV)的哌嗪衍生物。式(IV)化合物的哌嗪环氮原子可以在标准条件下被保护以得到式(V)的衍生物。在一些实施方案中,式(V)化合物可在磷酸化前经历选择性地脱保护。例如,一个或多个羟基部分可在磷酸化前脱保护。使式(V)化合物磷酸化以得到式(VI)化合物。式(VI)结构可以被氧化以提供式(VII)化合物。式(VII)化合物的整体脱保护可得到式(I)化合物。
方案14.
例如,式(I)化合物或其药用盐可通过如下来制备:
在肼的存在下使式(II-A)化合物与式(XXII-A)化合物反应以制备式(IV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(XXII-A)化合物为:
所述式(IV-A)化合物为:
可选择性地保护式(IV-A)化合物以制备式(V-C)化合物:
其中每个R1是H或保护基,如本申请所述。然后可使化合物(V-C)磷酸化以得到式(VI-C)化合物:
然后可氧化式(VI-C)化合物以制备式(VII-C)化合物:
最后,使式(VII-C)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
可选地,式(I)化合物可以如方案15所示制备。式(XXIII)化合物可经历环氧化以得到式(XXIV)化合物。式(XXIV)化合物可与式(II)化合物偶联以制备式(XXV)化合物。式(XXV)化合物可经历闭环反应以得到式(IV)的哌嗪衍生物。式(IV)化合物的哌嗪环氮原子可以在标准条件下被保护以得到式(V)的衍生物。使式(V)化合物磷酸化得到式(VI)化合物。式(VI)结构可以被氧化以提供式(VII)化合物。可使式(VII)化合物整体脱保护以得到式(I)化合物。
方案15.
例如,式(I)化合物或其药用盐可通过如下来制备:
使式(XXIII-A)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII-A)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团,所述式(XXIV)化合物为:
使式(XXIV)化合物式(II-A)化合物反应以制备式(XXV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(XXV-A)化合物为:
对式(XXV-A)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV-D)化合物:
选择性保护式(IV-D)化合物以制备式(V-D)化合物:
其中每个R1是H或保护基。
使式(V-D)化合物磷酸化以制备式(VI-D)化合物:
氧化式(VI-D)化合物以制备式(VII-D)化合物:
最后,使式(VII-D)化合物脱保护以制备式(I)化合物。式(XII)化合物:
在另一个实施方案中,制备式(XII)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。
如所描述的那样,某些式(XII)结构的氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基可选自基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯以及9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯类保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
保护某些氨基和羟基可改善式(XII)化合物的溶解度。例如式(XII)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(XII)化合物可通过氧化式(V)化合物以制备式(XII)化合物,所述式(V)化合物为:
所述式(XII)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
在该合成中,式(XII)化合物可通过使式(V)化合物与任意的适于选择性形成式(XII)的二醇的氧化剂反应来制备。适当的氧化剂和条件可被本领域技术人员容易地确定。例如,式(XII)化合物可通过将式(V)化合物用钌化合物诸如RuO4 -/NMO处理来形成。也可使用其它氧化剂,诸如戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐、TFAA/DMSO、PDC、过氧化氢、无机过氧化物、硝酸、硝酸盐、亚氯酸盐、氯酸盐、高氯酸盐、次氯酸盐、过氧化物、碘、臭氧、氧化亚氮、氧化银、高锰酸盐、六价铬化合物、铬酸、重铬酸、三氧化铬、氯铬酸吡啶、过硫酸、亚砜、硫酸、Tollens试剂、2,2’-二吡啶基二硫化物(DPS)和四氧化锇。在一个实施方案中,使用一定的氧化条件由此化合物(XII)的吡嗪环不被氧化。在一些实施方案中,氧化剂选自RuO4 -/NMO、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐、TFAA/DMSO和PDC。
例如,氧化反应可通过将式(V)化合物用RuO- 4/NMO在环境温度处理以得到式(XII)化合物来进行。在另一个实施方案中,式(XII)化合物通过将式(V)化合物用RuO- 4/NMO在20-60℃(例如约20、25、30、35、40、45、50或者55℃)的温度处理来形成。
也可以理解的是,式(XII)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(XII)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
式(XIII)化合物:
在另一个实施方案中,制备式(XIII)化合物或其药用盐或水合物:
式(XIII)化合物或其药用盐或水合物也包括互变异构结构:
式(I)化合物为式(XIII)化合物和水的反应产物。由于在这两个产物间建立平衡,这两类物质在某些pH和条件下可能存在于水溶液中。本领域技术人员可控制合成条件(例如,在无水下进行)以分离纯化形式的式(XIII)的酮物质。
式(XIII)化合物可通过使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物,所述式(XIV)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
在该合成中,脱保护可包括例如,式(XIV)的一些氨基和羟基保护基的连续脱保护或者一锅法脱保护以得到式(XIII)化合物。对于式(XIV)化合物脱保护的适当的试剂和条件可被本领域技术人员容易地确定。例如,化合物(XIII)可通过将式(XIV)化合物在一定条件下处理来形成,所述条件使羟基保护基诸如乙酸酯、异亚丙基和苯亚甲基保护基由式(XIV)结构离去。例如,可通过Zemplén条件使用作为碱的催化剂NaOMe在甲醇中使乙酸酯基团断裂。苯亚甲基和异亚丙基可通过氢化作用或者使用酸性水解断裂,如在R.M.Hann et al.,J.Am.Chem.Soc.,72,561(1950)中报道。在另一个实例中,可进行脱保护,由此氨基保护基诸如氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基由式(XIV)化合物断裂。可在温和条件下用胺碱(例如哌啶)除去氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)以得到游离胺和二苯并呋喃,如在E.Atherton et al.,“The Fluorenylmethoxycarbonyl AminoProtecting Group,”in The Peptides,S.Udenfriend and J.Meienhofer,AcademicPress,New York,1987,p.1中所述。可在酸性条件(例如3M HCl在EtOAc中的溶液)下除去氨基甲酸叔丁酯(Boc),如在G.L.Stahl et al.,J.Org.Chem.,43,2285(1978)中报道。氢化作用可用于使氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基断裂,如在J.Meienhofer et al.,Tetrahedron Lett.,29,2983(1988)中所述。
为了防止在反应过程中式(XIII)的氧化,脱保护可在缺氧条件下进行。脱保护也可在环境温度或者20-60℃(或者25、30、35、40、45、50或者55℃)的温度进行。
可选地,式(XIII)化合物可以由方案16所示形成。式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与式(VIII)的磷酸化己糖偶联以得到式(IX)化合物。哌嗪环氮原子可以被保护以得到式(X)化合物,其可以被氧化以得到式(XV)的二醇。然后式(XV)的二醇可以在合适条件下脱保护以及转化为式(XIII)化合物。
方案16.
在另一个实施方案中,式(XIII)化合物可如方案17所示形成。例如,式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与受保护的或未保护的式(III)的己糖反应以得到式(IV)化合物。然后式(IV)哌嗪环的环氮原子可以在标准条件下被选择性地保护以得到式(V)衍生物。使式(V)化合物磷酸化可得到式(VI)的磷酸酯中间体。式(VI)的磷酸酯可以在合适的氧化条件下转化为式(XIV)的二醇。最后,式(XIV)化合物可以脱保护以得到式(XIII)化合物。
方案17
可选地,式(XIII)化合物可由方案18所示制备。式(II)的二氨基嘧啶酮化合物可以与式(XXII)化合物反应以得到式(IV)化合物。式(IV)化合物的哌嗪环氮原子可以在标准条件下被选择性地保护以得到式(V)衍生物。在一些实施方案中,式(V)化合物可在磷酸化前经历选择性地脱保护。例如,一个或多个羟基部分可在磷酸化前脱保护。使式(V)化合物磷酸化以得到式(VI)化合物。式(VI)结构可以被氧化以提供式(XIV)化合物。式(XIV)化合物的整体脱保护可得到式(XIII)化合物。
方案18
可选地,式(I)化合物可如方案19所示制备。式(XXIII)化合物可经历环氧化以得到式(XXIV)化合物。式(XXIV)化合物可与式(II)化合物偶联以制备式(XXV)化合物。式(XXV)化合物可经历闭环反应以得到式(IV)哌嗪衍生物。式(IV)化合物的哌嗪环氮原子可以在标准条件下被保护以得到式(V)衍生物。式(V)化合物的磷酸化得到式(VI)化合物。式(VI)结构可以被氧化以提供式(XIV)化合物。式(XIV)化合物的整体脱保护可得到式(I)化合物。
方案19
式(XIII)化合物可被分离为药用盐的形式。例如,式(XIII)化合物可在HCl存在下结晶以形成化合物的盐酸盐形式。式(XIII)化合物也可被分离,例如,通过用NaOH处理沉淀为钠盐。式(XIII)化合物在某些反应和存储条件下是不稳定的。在一些实施方案中,包含式(XIII)化合物的最终溶液可利用本领域已知方法进行酸化。例如,如果存储在溶液中,式(XIII)化合物可以存储在酸性溶液中。
式(XIV)化合物
在另一个实施方案中,制备式(XIV)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。
如所描述的那样,式(XIV)结构的某些氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基可选自基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯以及9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯类保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
保护某些氨基和羟基可改善式(XIV)化合物的溶解度。例如式(XIV)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(XIV)化合物可通过氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物,所述式(VI)化合物为:
所述式(XIV)化合物为:
其中:
每个R1独立地为H或保护基,如上所述。
在该合成中,式(XIV)化合物可通过使式(VI)化合物与任意的适于选择性形成式(XIV)的酮的氧化剂反应来制备。适当的氧化剂和条件可被本领域技术人员容易地确定。例如,式(XIV)化合物可通过将式(VI)化合物用钌化合物诸如RuO4 -/NMO处理来形成。也可使用其它氧化剂,诸如戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐、TFAA/DMSO、PDC、过氧化氢、无机过氧化物、硝酸、硝酸盐、亚氯酸盐、氯酸盐、高氯酸盐、次氯酸盐、过氧化物、碘、臭氧、氧化亚氮、氧化银、高锰酸盐、六价铬化合物、铬酸、重铬酸、三氧化铬、氯铬酸吡啶、过硫酸、亚砜、硫酸、Tollens试剂、2,2’-二吡啶基二硫化物(DPS)和四氧化锇。在一个实施方案中,使用一定的氧化条件由此化合物(XIV)的吡嗪环不被氧化。在一些实施方案中,氧化剂选自RuO4 -/NMO、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
例如,氧化反应可通过将式(VI)化合物用RuO- 4/NMO在环境温度处理以得到式(XIV)化合物来进行。在另一个实施方案中,式(XIV)化合物通过将式(VI)化合物用RuO- 4/NMO在20-60℃或者20、25、30、35、40、45、50或者55℃的温度处理来形成。
也可以理解的是,式(XIV)结构的异构形式可控制在式(XIII)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(XIV)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一个实施方案中,式(XIV)化合物包括异构体:
式(XIV)化合物也包括互变异构结构:
式(XXII)化合物
另一个实施方案涉及式(XXII)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。
如所描述的那样,式(XXII)化合物的羟基可为受保护的或未保护的形式。例如,未保护的形式的式(XXII)化合物可包括化合物(XXII-A)或其药用盐:
式(XXII)结构的某些羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的羟基官能团。例如,非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯以及9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯类保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXII)的己糖环成分的4和5-位的R1基团可合并以形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。
保护某些氨基和羟基可改善式(XXII)化合物的溶解度。例如式(XXII)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(XXII)化合物可按照已知方法(参见例如,Goswami,S.;Adak,A.K.Tetrahedron Lett.(2005),46,221-224)制备或可商业购买。
也可以理解的是,式(XXII)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(XXII)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一些实施方案中,式(XXII)化合物或其药用盐或水合物包括异构体:
式(XXIII)化合物
另一个实施方案涉及式(XXIII)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4是H或离去基团。
如所描述的那样,式(XXIII)化合物的羟基可为受保护的或未保护的形式。例如,未保护的形式的式(XXIII)化合物可包括化合物2-(烯丙基氧基)-6-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-3,4,5-三醇或其药用盐:
式(XXIII)结构的某些羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的羟基官能团。例如,非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯以及9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯类保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXIII)的己糖环成分的4和5-位的R1基团可合并以形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXIII)化合物可以为式(XXIII-A)化合物或其药用盐:
保护某些氨基和羟基可改善式(XXIII)化合物的溶解度。例如式(XXIII)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
如所描述的那样,R4可为离去基团。针对该目的,R4可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的羟基离去基团。例如,非限制的羟基保护基的实例可包括甲苯磺酸酯、对溴苯磺酸酯、间硝基苯磺酸酯、甲磺酸酯,氧鎓、三氟甲磺酸酯、全氟丁基磺酸酯以及三氟乙基磺酸酯。
式(XXIII)化合物可按照已知方法制备或可商业购买。
也可以理解的是,式(XXIII)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(XXIII)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一个实施方案中,式(XXII)化合物或其药用盐或水合物包括异构体:
式(XXIV)化合物
另一个实施方案涉及式(XXIV)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。
如所描述的那样,式(XXIV)化合物的羟基可为受保护的或未保护的形式。例如,未保护的形式的式(XXIV)化合物可包括2-(烯丙基氧基)-4-(羟基甲基)-3,7-二氧杂二环[4.1.0]庚烷-5-醇或其药用盐:
式(XXIV)结构的某些羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的羟基官能团。例如,非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯以及9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯类保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXIV)的己糖环成分的4和5-位的R1基团可合并以形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXIV)化合物包括化合物或其药用盐:
保护某些氨基和羟基可改善式(XXIV)化合物的溶解度。例如式(XXIV)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(XXIV)化合物可通过使式(XXIII)化合物与碱反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII)化合物为:
所述式(XXIV)化合物为:
其中R1独立地为H或保护基,以及R4是H或离去基团,如上所述。
在该合成中,式(XXIV)化合物可通过使式(XXIII)化合物与任意的适于选择性形成式(XXIV)的环氧化物的碱反应来制备。合适的碱及条件可由本领域技术人员容易地确定。例如,式(XXIV)化合物可在将式(XXIII)化合物用强碱诸如氢氧化钠处理后形成。也可使用其它碱诸如氢氧化钾、氢氧化钡、氢氧化铯、氢氧化锶、氢氧化钙、氢氧化镁、氢氧化锂、氢氧化铷、丁基锂、二异丙基氨基锂、二乙基氨基锂、氨基钠、氢化钠以及二(三甲基甲硅烷基)氨基锂。
例如,反应可通过将式(XXIII)化合物用氢氧化钠在有机溶剂中在约0℃(温热至室温过夜)处理以得到式(XXIV)化合物来进行。
也可以理解的是,式(XXIV)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(XXIV)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一个实施方案中,式(XXIV)化合物或其药用盐或水合物包括异构体:
式(XXV)化合物
另一个实施方案涉及式(XXV)化合物或其药用盐或水合物:
其中每个R1独立地为H或保护基。
如所描述的那样,式(XXV)化合物的羟基可为受保护的或未保护的形式。例如,未保护的形式的式(XXV)化合物可包括6-(烯丙基氧基)-5-((2,4-二氨基-6-羟基嘧啶-5-基)氨基)-2-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-3,4-二醇或其药用盐:
可选地,一个或多个羟基可被保护。例如,式(XXV)化合物可包括化合物6-(烯丙基氧基)-7-((2,4-二氨基-6-(苄基氧基)嘧啶-5-基)氨基)-2-苯基六氢吡喃并[3,2-d][1,3]二噁英-8-醇或其药用盐:
如所描述的那样,式(XXV)结构的某些氨基和/或羟基可用R1保护基保护。出于该目的,R1可包括任意的化学领域的技术人员选择的合适的氨基或羟基官能团。例如,本申请公开范围内的氨基保护基,包括但不限于氨基甲酸酯、酰胺、N-烷基或N-芳基衍生保护基。非限制的羟基保护基的实例可包括醚、酯、碳酸酯或磺酸酯保护基。R1保护基可以相同或不同。
具体地,氨基甲酸酯保护基可包括,例如,氨基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、氨基甲酸羧基苄酯(cbz)、氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9-(2-磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9-(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲酯(Tbfmoc)、氨基甲酸2-氯-3-茚基甲酯(Climoc)、氨基甲酸2,7-二-叔丁基[9-(10,10-二氧代-10,10,10,10-四氢噻吨基)]甲酯(DBD-Tmoc)、氨基甲酸1,1-二氧代苯并[b]噻吩-2-基甲酯(Bsmoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2-苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2-二溴乙酯(DB-t-boc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2,2,2-三氯乙酯(TCBoc)、氨基甲酸1-甲基-1-(4-联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1-(3,5-二-叔丁基苯基)-1-甲基乙酯(t-Bumeoc)、氨基甲酸N-(2-特戊酰基氨基)-1,1-二甲基乙酯、氨基甲酸2-[(2-硝基苯基)二硫基]-1-苯基乙酯(NpSSPeoc)、氨基甲酸2-(N,N-二环己基氨基甲酰基)乙酯、氨基甲酸1-金刚烷酯(1-Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸1-异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸4-硝基肉桂酰酯(Noc)、氨基甲酸3-(3’吡啶基)丙-2-烯酯(Paloc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸烷基二硫酯、氨基甲酸对甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对硝基苄酯(Pnz)、氨基甲酸对溴苄酯、氨基甲酸对氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2-甲基硫基乙酯、氨基甲酸2-甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2-(对甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2-(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4-甲基硫基苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫基苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2-膦酰基乙酯(Peoc)、氨基甲酸1,1-二甲基-2-氰基乙酯、氨基甲酸2-(4-硝基苯基)乙酯、氨基甲酸4-苯基乙酰氧基苄酯(PhAcOZ)和氨基甲酸间氯-对酰基氧基苄酯。在一些实施方案中,氨基甲酸酯保护基可选自基甲酸9-芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)和氨基甲酸羧基苄酯(cbz)保护基。
酰胺保护基可包括,例如,乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、戊-4-烯酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、2-甲基-2-(邻苯基偶氮苯氧基)丙酰胺)、4-氯丁酰胺、乙酰乙酰胺、3-(对羟基苯基)丙酰胺)和(N’-二硫基苄基氧基羰基氨基)乙酰胺。
醚保护基可包括甲基、甲氧基甲基(MOM)、苄基氧基甲基(BOM)、甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEM)、甲基硫基甲基(MTM)、苯基硫基甲基(PTM)、叠氮基甲基、氰基甲基、2,2-二氯-1,1-二氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、四氢吡喃基(THP)、1-乙氧基乙基(EE)、苯甲酰甲基、4-溴苯甲酰甲基、环丙基甲基、烯丙基、炔丙基、异丙基、环己基、叔丁基、苄基、2,6-二甲基苄基、4-甲氧基苄基(MPM-OAr)、邻硝基苄基、2,6-二氯苄基、3,4-二氯苄基、4-(二甲基氨基)羰基苄基、4-甲基亚硫酰基苄基(Msib)、9-蒽基甲基、4-吡啶甲基、七氟-对甲苯基、四氟-4-吡啶基、三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)和三异丙基甲硅烷基(TIPS)保护基。
酯类保护基可包括乙酰氧基(OAc)、甲酸芳基酯、乙酸芳基酯、乙酰丙酸芳基酯、新戊酸芳基酯、苯甲酸芳基酯以及9-芴羧酸芳基酯。在一个实施方案中,酯类保护基为乙酰氧基。
碳酸酯保护基可包括碳酸芳基酯·甲酯、碳酸1-金刚烷酯(Adoc-OAr)、碳酸叔丁酯(BOC-OAr)、氨基甲酸叔丁酯(Boc)、碳酸4-甲基亚硫酰基苄酯(Msz-OAr)、碳酸2,4-二甲基戊-3-酯(Doc-OAr)、碳酸芳基酯·2,2,2-三氯乙酯、碳酸芳基酯·乙烯酯、碳酸芳基酯·苄酯和碳酸芳基酯。
磺酸酯保护基可包括甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯和2-甲酰苯磺酸芳基酯。
在一些实施方案中,两个相邻的R1基团连接在一起形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXV)的己糖环成分的4和5-位的R1基团可合并以形成异亚丙基乙缩醛、苯亚甲基乙缩醛、1,5-二氧杂螺[5.5]十一烷(环亚己基乙缩醛)、6,10-二氧杂螺[4.5]癸烷(环亚戊基乙缩醛)或2-异丁基-2-甲基-1,3-二噁烷部分。例如,式(XXV)化合物可包括化合物或其药用盐:
保护某些氨基和羟基可改善式(XXV)化合物的溶解度。例如式(XXV)化合物的乙酰基衍生物的制备可改善溶解度及增加产物分离收率。
式(XXV)化合物可通过使式(XXIV)化合物与式(II)化合物反应以得到式(XXV)化合物来制备,所述式(XXIV)化合物为:
所述式(II)化合物为:
所述式(XXV)化合物为:
其中R1独立地为H或保护基,如上所述。在该合成中,式(XXV)化合物可通过使式(XXIV)化合物与式(II)化合物偶联以形成式(XXV)化合物来制备。适当的反应条件可被本领域技术人员容易地确定。例如,式(XXV)化合物可通过将式(XXIV)和(II)化合物在氧化剂诸如高氯酸锂的存在下处理来形成。也可使用其它氧化剂,诸如RuO4 -/NMO、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐、TFAA/DMSO、PDC、过氧化氢、无机过氧化物、硝酸、硝酸盐、亚氯酸盐、氯酸盐、高氯酸盐、次氯酸盐、过氧化物、碘、臭氧、氧化亚氮、氧化银、高锰酸盐、六价铬化合物、铬酸、重铬酸、三氧化铬、氯铬酸吡啶、过硫酸、亚砜、硫酸、Tollens试剂、2,2’-二吡啶基二硫化物(DPS)和四氧化锇。
例如,氧化反应可通过将式(XXIV)和(II)化合物的混合物用高氯酸锂在有机溶剂中处理同时加热(例如在约90℃)以得到式(XXV)化合物来进行。
也可以理解的是,式(XXV)结构的异构形式可控制在式(I)的合成中连续步骤的立体专一性。因此,特定异构体可在合成的该步骤中分离,或者可替换地,式(XXV)的异构体混合物可在合成的较后阶段完成且分离。
在一个实施方案中,式(XXV)化合物或其药用盐或水合物包括异构体:
然后式(XXV)化合物可用于制备式(IV)化合物。式(IV)化合物可通过使式(XXV)化合物与1,3-二甲基巴比妥酸反应以得到式(IV)化合物来制备,所述式(XXV)化合物为:
所述式(IV)化合物其中R1独立地H或保护基,如上所述。
在该合成中,式(IV)化合物可通过使式(XXV)化合物与1,3-二甲基巴比妥酸在催化剂的存在下反应以形成式(IV)化合物来制备。合适的催化剂和反应条件可以为本领域技术人员容易地决定。例如,式(XXV)化合物可通过将式(XXIV)化合物和式(II)化合物在催化剂诸如四(三苯基膦)钯(0)的存在下处理来形成。也可使用其它催化剂。
药物制剂和剂型
当用作药物时,本申请提供的化合物可以药物组合物的形式给药。这些组合物可以在药学领域中已知的方式制备,且可通过各种途径给药,其取决于局部治疗或者全身治疗是否是预期的且取决于待治疗的区域。给药可为局部给药(包括经皮、表皮、眼内给药和向粘膜包括鼻内、阴道内和直肠递送)、肺部给药(例如通过粉末剂或者气雾剂的吸入或者吹入,包括喷雾器;气管内或者鼻内给药)、口服给药或者肠胃外给药。肠胃外给药包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜内、肌内给药或者注射或者输注给药;或者颅内给药例如鞘内或者心室内给药。肠胃外给药可为单一推注给药的形式,或者可为例如,连续灌注泵形式。用于局部给药的药物组合物和制剂可包括透皮贴剂、软膏剂、洗剂、乳膏剂、凝胶剂、滴剂、栓剂、喷雾剂、液体制剂和粉末剂。常规的药物载体、含水、粉末或者含油基、增稠剂等可为必要的或者理想的。
本发明也提供药物组合物,其含有作为活性成分的本申请提供的化合物或其药用盐与一种或者多种药用载体(赋形剂)的组合。在一些实施方案中,所述组合物适于局部给药。在制备本申请提供的组合物的过程中,典型地将活性成分与赋形剂混合,用赋形剂稀释或者在所述载体内包裹,所述载体为例如胶囊剂、囊剂、纸剂或者其它包合剂(container)的形式。当所述赋形剂用作稀释剂时,其可为固体、半固体或者液体材料,其用作为对于活性成分的媒介物、载体或者介质。因此,组合物可为片剂、丸剂、粉末剂、锭剂、囊剂、扁囊剂、酏剂、混悬剂、乳剂、溶液剂、糖浆剂、气雾剂(作为固体或者在液体介质中)、含有例如按重量计达10%的活性化合物的软膏剂、软和硬明胶胶囊、栓剂、无菌注射溶液剂和无菌包装的粉末剂的形式。
在制备制剂的过程中,活性化合物研磨以得到适当粒度,之后将其与其它成分混合。如果活性化合物基本上为不溶的,则其可研磨为小于200目筛的粒度。如果活性化合物基本上为水溶性的,则粒度可通过研磨调整以达到在制剂中基本上均匀分布,例如约40目筛。
本申请提供的化合物可使用已知的研磨方法研磨,诸如湿磨以得到适于片剂和其它制剂类型的粒度。本申请提供的化合物的精细分散(纳米微粒)制剂可通过本领域已知方法制备,例如参见国际申请WO 2002/000196。
适当的赋形剂的一些实例包括乳糖、右旋糖、蔗糖、山梨醇、甘露醇、淀粉、阿拉伯胶、磷酸钙、藻朊酸盐、西黄蓍胶、明胶、硅酸钙、微晶纤维素、聚乙烯基吡咯烷酮、纤维素、水、糖浆和甲基纤维素。制剂可额外包括:润滑剂诸如滑石、硬脂酸镁和矿物油;润湿剂;乳化剂和助悬剂;防腐剂诸如甲基-和丙基羟基-苯甲酸酯;甜味剂;和调味剂。可配制本申请提供的组合物以使得在通过采用本领域已知方法对患者给药后提供活性成分的快速、持续或者延缓释放。
组合物可配制为单位剂型,每个剂量含有约5至约1000mg(1g)的活性成分,更常见的是约100至约500mg的活性成分。术语“单位剂型”是指与适当的药物赋形剂联合的适当用作对于人类受试者和其它哺乳动物的整体剂量的物理上独立的单位,每个单位含有得到预期治疗作用的计算的预先确定量的活性物质。
在一些实施方案中,本申请提供的组合物含有约5至约50mg的活性成分。本领域技术人员将认识到该实施的组合物含有约5至约10、约10至约15、约15至约20、约20至约25、约25至约30、约30至约35、约35至约40、约40至约45或者约45至约50mg的活性成分。
在一些实施方案中,本申请提供的组合物含有约50至约500mg的活性成分。本领域技术人员将认识到该实施的组合物含有约50至约100、约100至约150、约150至约200、约200至约250、约250至约300、约350至约400或者约450至约500mg的活性成分。
在一些实施方案中,本申请提供的组合物含有约500至约1000mg的活性成分。本领域技术人员将认识到该实施的组合物含有约500至约550、约550至约600、约600至约650、约650至约700、约700至约750、约750至约800、约800至约850、约850至约900、约900至约950或者约950至约1000mg的活性成分。
类似的剂量可在本申请提供的方法和用途中用于本申请所述的化合物。
活性化合物在宽的剂量范围内为有效的且通常以药用有效量进行给药。然而可理解的是实际给药的化合物的量通常由医师根据相关条件进行确定,所述条件包括待治疗的病症、所选的给药途径、实际给药的化合物、个体患者的年龄、体重和反应、患者症状的严重性等。
对于制备固体组合物诸如片剂,将主要的活性成分与药物赋形剂混合以形成含有本申请提供的化合物的均匀混合物的固体处方设计(preformulation)组合物。当这些处方设计组合物被认定为均匀时,典型地将活性成分在整个组合物中均匀分散,由此所述组合物可容易地细分为等效单位剂型诸如片剂、丸剂和胶囊剂。然后将该固体处方设计制剂细分为如上所述类型的单位剂型,其含有例如约0.1至约1000mg的本申请提供的活性成分。
本申请提供的片剂或者丸剂可被包衣或者另外配合以获得可提供长效作用优势的剂型。例如,所述片剂或者丸剂可包含内部剂量和外部剂量成分,所述外部剂量成分为在内部剂量成分外的包封形式。可通过肠溶层将两种成分分离,所述肠溶层用于在胃内防止崩解且允许内部成分完整进入到十二指肠内或者延缓释放。多种物质可用于所述肠溶层或者包衣层,所述物质包括多种聚合酸以及聚合酸与所述物质诸如虫胶、十六醇和乙酸纤维素的混合物。
可将本申请提供的化合物和组合物混合在内以用于口服或者注射给药的液体形式包括水溶液、适当矫味的糖浆剂、含水或者含油混悬液和具有食用油诸如棉子油、麻油、椰子油或者花生油的乳剂,以及酏剂和类似的药物媒介物。
在一些实施方案中,配制本申请提供的化合物以用于静脉内给药。适用于注射的药物组合物可包括无菌水溶液(水可溶的)或分散液以及用于临时制备无菌注射溶液或分散液的无菌粉末。对于静脉内给药,合适的载体包括生理盐水、抑菌水、Cremophor ELTM(BASF,Parsippany,NJ)或磷酸盐缓冲盐水(PBS)。在所有情况下,该组合物必须为无菌的且应当为达到存在容易的可注射性程度的流体。其在制备及存储环境下应该是稳定的,且必须能防止微生物诸如细菌和真菌的污染。该载体可以为溶剂或分散介质,其包含例如,水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等),及其合适的混合物。合适的流动性可以例如通过使用包衣诸如卵磷脂、在分散的情形下保持所需的粒度以及使用表面活性剂来保持。阻止微生物作用可以通过多种抗菌剂和抗真菌剂来实现,例如,对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗坏血酸、硫柳汞等。在许多情形下,优选在组合物中包括等渗剂,例如,糖类、多元醇诸如甘露醇、山梨醇、氯化钠。通过在组合物中包含延长吸收的试剂例如单硬脂酸铝和明胶可延长注射组合物的吸收。
无菌注射溶液可以通过将所需量的活性化合物在合适溶剂中根据需要与一种以上列举的成分或该成分的组合合并、接着过滤灭菌来制备。一般地,分散液通过将活性化合物与无菌媒介物合并来制备,所述无菌媒介物含有基础分散介质和以上列举的其它所需成分。在用于制备无菌注射溶液的无菌粉末的情况下,优选的制备方法为真空干燥和冻干,其得到活性成分与任意来自于之前无菌过滤溶液的另外的所需成分的粉末。
用于吸入或者吹入的组合物包括在药用含水或者有机溶剂或者它们的混合物中的溶液剂和混悬剂,以及粉末剂。所述液体或者固体组合物可含有适当的如上所述的药用赋形剂。在一些实施方案中,所述组合物通过口服或者鼻内吸入途径给药以达到局部或者全身作用。组合物可通过使用惰性气体进行喷雾。喷雾溶液可由喷雾装置或者可与面罩、帷罩(tent)或者间歇正压呼吸机连接的喷雾装置直接吸入。溶液、混悬液或者粉末组合物可进行口服给药或者由按照适当方式递送制剂的装置进行鼻部给药。
局部给药制剂可含有一种或者多种常规载体。在一些实施方案中,软膏剂可含有水和一种或者多种疏水性载体,所述载体选自例如液状石蜡、聚氧乙烯烷基醚、丙二醇、白凡士林等。乳膏剂的载体组合物可以与甘油和一种或者多种其它组分(例如单硬脂酸甘油酯、PEG-单硬脂酸甘油酯和十六烷基硬脂醇)混合的水为基础。可使用与其它组分(例如,甘油、羟基乙基纤维素等)适当混合的异丙醇和水配制凝胶剂。在一些实施方案中,局部给药制剂含有至少约0.1、至少约0.25、至少约0.5、至少约1、至少约2或者至少约5wt%的本申请提供的化合物。局部给药制剂可适当在例如100g(其任选与用于所选适应症的治疗相关)管内包装。
在一个实施方案中,本申请提供的化合物用保护化合物免于从体内快速消除的载体制备,诸如控制释放制剂,包括植入和微囊递送系统。可以使用生物可降解的、生物相容性聚合物,诸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯和聚乳酸。该制剂可以使用标准技术制备或可商购得到,例如,从Alza Corporation和Nova Pharmaceuticals,Inc得到。脂质体悬浮液(包括靶向所选择的具有对细胞抗原的单克隆抗体的细胞的脂质体)也可以用作药用载体。这些可以按照本领域技术人员已知方法制备,例如,如美国专利4,522,811所述。
对患者给药的化合物或者组合物的量将依照待给药的物质、给药目的(诸如预防或者治疗)、患者状态、给药方式等改变。在治疗应用中,可将组合物以足够治愈或者至少部分抑制疾病症状及其并发症的量对已经患有疾病的患者给药。有效剂量取决于待治疗的疾病状态以及临床医师的判断,所述判断取决于多种因素诸如疾病的严重性、患者的年龄、体重和一般状态等。
对患者给药的组合物可为如上所述的药物组合物的形式。这些组合物可通过常规灭菌技术进行灭菌,或者可进行无菌滤过。可包装含水溶液以使其如原样使用,或者将其低压冻干,所述低压冻干制剂在给药前与无菌含水载体混合。化合物制剂的pH典型地在3和11之间,更优选地在5至9之间,且最优选地在7至8之间。将理解的是一些前述赋形剂、载体或者稳定剂的用途将导致药物盐的形成。
本申请提供的化合物的治疗剂量可根据例如所采用治疗的具体用途、化合物的给药方式、患者的健康和状态以及开处方医师的判断来改变。在药物组合物中的本申请提供的化合物的比例或者浓度可按照众多因素改变,所述因素包括剂量、化学特征(例如疏水性)和给药途径。例如,本申请提供的化合物可在含有约0.1至约10%w/v的化合物的含水生理学缓冲溶液中提供以用于肠胃外给药。一些典型的剂量范围为约每天每千克体重1mg至约每天每千克体重1g。在一些实施方案中,剂量范围为约每天每千克体重0.01mg至约每天每千克体重100mg。剂量可能取决于诸如疾病或者病症的类型和进展程度、具体患者的整体健康状态、所选化合物的相对生物效能、赋形剂的制剂及其给药途径的变量。有效剂量可由来源于体外或者动物模型测试系统的剂量-响应曲线进行外推。
实施例
实施例1.制备前体Z(cPMP)
方案20
试验
空气敏感反应在氩气下进行。有机溶液经无水MgSO4干燥,并将溶剂减压蒸发。无水和色谱溶剂可商购获得(无水级溶剂购自Sigma-Aldrich FineChemicals)且无需任何进一步纯化即可使用。薄层色谱(t.l.c.)在涂覆有60F254硅胶的玻璃上或铝片上进行。如下对有机化合物进行显像:在紫外光下或使用钼酸铵(5wt%)以及硫酸铈(IV)4H2O(0.2wt%)在H2SO4(2M)水溶液中的溶液、I2(0.2%)和KI(7%)中之一在H2SO4(1M)中的溶液或0.1%茚三酮在EtOH中的溶液的浸染。色谱(快速柱)在硅胶(40-63μm)上进行,或在具有连续梯度装置的自动系统上进行。旋光度以1dm的径长记录,单位为10-1deg cm2g-1;浓度单位为g/100mL。1H NMR光谱在CDCl3、CD3OD(内标Me4Si,δ0ppm)或D2O(HOD,δ4.79ppm)中测量,以及13C NMR光谱在CDCl3(中心线,δ77.0ppm)、CD3OD(中心线,δ49.0ppm)或DMSO d6(中心线,δ39.7ppm)、D2O(无内标参考或内标CH3CN,δ1.47ppm)中测量。1H以及13C共振的指定基于2D(1H-1H DQF-COSY,1H-13C HSQC,HMBC)以及DEPT实验。31P NMR在202.3MHz运行以及不用参照进行报告。高分辨率电喷雾质谱(ESI-HRMS)在Q-TOF Tandem质谱仪上记录。微量分析通过CampbeU Microanalytical Department,University of Otago,Dunedin,NewZealand进行。A.制备(5aS,6R,7R,8R,9aR)-2-氨基-6,7-二羟基-8-(羟基甲基)-3H,4H,5H,5aH,6H,7H,8H,9aH,10H-吡喃并[3,2-g]蝶啶-4-酮一水合物(1)
将2,5,6-三氨基-3,4-二氢嘧啶-4-酮二盐酸盐(Pfieiderer,W.;Chem.Ber.1957,90,2272;Org.Synth.1952,32,45;Org Synth.1963,Coll.Vol.4,245,10.0g,46.7mmol)、D-半乳糖苯基腙(Goswami,S.;Adak,A.K.Tetrahedron Lett.2005,46,221-224,15.78g,58.4mmol)以及2-巯基乙醇(1mL)在MeOH-H2O的1∶1混合物(400mL)中搅拌并加热至回流(浴温110℃)且保持两小时。冷却至环境温度后,加入乙醚(500mL),振摇烧瓶以及将乙醚层倾出并弃去。分两份乙醚(500mL)进一步重复该操作,然后蒸发残留的挥发物。依次加入甲醇(40mL)、H2O(40mL)以及三乙胺(39.4mL,280mmol)以及用几毫克的1对混合物种晶。5分钟后,滤出黄色固体,用少量MeOH洗涤以及干燥得到1,其为一水合物(5.05g,36%),其具有用于进一步应用的合适的纯度。将分析部分由DMSO-EtOH或沸H2O中重结晶。MPt 226 dec.(c1.13,DMSO)。1H NMR(DMSO d6):δ10.19(bs,交换的D2O,1H),7.29(d,J=5.0Hz,缓慢交换的D2O,1H),5.90(s,交换的D2O,2H),5.33(d,J=5.4Hz,交换的D2O,1H),4.66(ddd,J~5.0,~1.3,~1.3Hz,1H),4.59(t,J=5.6Hz,交换的D2O,1H),4.39(d,J=10.3Hz,交换的D2O,1H),3.80(bt,J~1.8Hz,交换的D2O,1H),3.70(m,1H),3.58(dd,J=10.3,3.0Hz,1H),3.53(dt,J=10.7,6.4Hz,1H),3.43(ddd,J=11.2,5.9,5.9Hz,1H),3.35(t,J=6.4Hz,1H),3.04(宽多重峰,1H)。13C NMR(DMSO d6中心线δ39.7):δ156.3(C),150.4(C),148.4(C),99.0(C),79.4(CH),76.5(CH),68.9(CH),68.6(CH),60.6(CH2),53.9(CH)。C10H15N5O5H2O的分析计算值为39.60C,5.65H,23.09N,实测值为39.64C,5.71H,22.83N。
B.制备化合物2(a或b)以及3(a、b或c)
将一缩二碳酸二叔丁酯(10.33g,47.3mmol)以及DMAP(0.321g,2.63mmol)在50℃在氩气下加入到1(1.5g,5.26mmol)在无水THF(90mL)中的搅拌的混悬液中。20小时后,得到澄清溶液.蒸发溶剂并将残留物在硅胶上进行色谱法纯化(梯度为0至40%EtOAc在己烷中的溶液)得到两种产物馏分。第一产物洗脱为黄色泡沫状物(1.46g)。产物用1H NMR观测为两种化合物的混合物,其主要包含具有七个Boc基团的产物(2a或2b)。将样品由EtOAc-己烷结晶得到2a或2b,其为良好的晶状固体。MPt 189-191℃.(c 0.99,MeOH)。1H NMR(500MHz,CDCl3):δ5.71(t,J=1.7Hz,1H),5.15(dt,J=3.5,~1.0,1H),4.97(t,J=3.8,1H),4.35(宽三重峰,J=~1.7,1H),4.09-3.97(m,3H),3.91(m,1H),1.55,1.52,1.51,1.50,1.45(5s,45H),1.40(s,18H)。13C NMR(125.7MHz,CDCl3):δ152.84(C),152.78(C),151.5(C),150.9(C),150.7(2×C),150.3(C),149.1(C),144.8(C),144.7(C),118.0(C),84.6(C),83.6(C),83.5(C),82.7(3×C),82.6(C),76.3(CH),73.0(CH),71.4(CH),67.2(CH),64.0(CH2),51.4(CH),28.1(CH3),27.8(2x CH3),27.7(CH3),27.6(3×CH3)。MS-ESI+:C45H72N5O19 +,(M+H)+,计算值为986.4817,实测值为986.4818。C45H71N5O19H2O的计算值为54.39C,7.39H,6.34N;实测值为54.66C,7.17H,7.05N。获得第二馏分,其为黄色泡沫状物(2.68g),通过1H NMR发现该产物具有六个Boc基团存在(3a、3b或3c)。将少量的样品由EtOAc-己烷结晶得到无色晶体。(c,1.17,CHCl3)。1H NMR(500MHz,CDCl3):δ11.10(宽单峰,交换的D2O,1H),5.58(t,J=1.8Hz,1H),5.17(d,J=3.4Hz,1H),4.97(t,J=3.9Hz,1H),4.62(s,交换的D2O,1H),4.16(dd,J=11.3,5.9Hz,1H),4.12(dd,J=11.3,6.4Hz,1H),3.95(dt,J=6.1,1.1Hz,1H),3.76(m,1H),1.51,1.50,1.49,1.48,1.46(5s,54H)。13C NMR(125.7MHz,CDCl3):δ156.6(C),153.0(C),152.9(C),151.9(C),150.6(C),149.4(2×C),136.2(C),131.8(C),116.9(C),85.0(2×C),83.3(C),82.8(C),82.49(C),82.46(C),73.3(CH),71.5(CH),67.2(CH),64.5(CH2),51.3(CH),28.0,27.72,27.68,27.6(4×CH3)。MS-ESI+:C40H64N5O17 +,(M+H)+计算值为886.4287,实测值为886.4289。
C.制备化合物4a、4b或4c.
步骤1 将来自上述B的主要包含化合物2a或2b的第一馏分(1.46g,1.481mmol)溶解于MeOH(29mL)中,并加入甲醇钠在MeOH中的溶液(1M,8.14mL,8.14mmol)。在置于环境温度20小时后,将溶液用Dowex 50WX8(H+)树脂中和,然后将固体滤出,蒸发溶剂。
步骤2将来自上述B的主要包含3a、3b或3c的第二馏分(2.68g,3.02mmol)溶解于MeOH(54mL)中,加入甲醇钠在MeOH中的溶液(1M,12.10mL,12.10mmol)。在置于环境温度20小时后,将溶液用Dowex 50WX8(H+)树脂中和,然后将固体滤出,蒸发溶剂。
将来自上述步骤1和步骤2的产物合并,并在硅胶上进行色谱法纯化(梯度为0至15%MeOH在CHCl3中的溶液)得到4a、4b或4c,其为米色固体(1.97g)。1H NMR(500MHz,DMSO d6):δ12.67(宽单峰,交换的D2O,1H),5.48(d,J=5.2Hz,交换的D2O,1H),5.43(t,J=~1.9Hz,D2O交换后变为d,J=1.9Hz,1H),5.00(宽单峰,交换的D2O,1H),4.62(d,J=5.7Hz,交换的D2O,1H),4.27(d,J=6.0Hz,交换的D2O,1H),3.89(dt,J=5.2,3.8Hz,D2O交换后变为t,J=3.9Hz,1H),3.62(dd,J=6.0,3.7Hz,D2O交换后变为d,J=3.7Hz,1H),3.52-3.39(m,4H),1.42(s,9H),1.41(s,18H)。13C NMR(125.7MHz,DMSO d6):δ157.9(C),151.1,(C),149.8(2×C),134.6(C),131.4(C),118.8(C),83.5(2×C),81.3(C),78.2(CH),76.5(CH),68.1(CH),66.8(CH),60.6(CH2),54.4(CH),27.9(CH3),27.6(2×CH3)。MS-ESI+:C25H40N5O11 +,(M+H)+计算值为586.2719,实测值为586.2717。
D.制备化合物5a、5b或5c
将化合物4a、4b或4c(992mg,1.69mmol)溶于无水吡啶中并浓缩。在氮气气氛下将残留物溶于无水CH2Cl2(10mL)以及吡啶(5mL)中,将溶液于乙腈/干冰浴中冷却至-42℃。逐滴加入二氯磷酸甲酯(187μL,1.86mmol),并将混合物搅拌2小时20分钟。将水(10mL)加入至冷却溶液中,然后从冷浴中取出,用乙酸乙酯(50mL)和饱和NaCl溶液(30mL)稀释。分离有机部分并用饱和NaCl溶液洗涤。将合并的水相进一步用乙酸乙酯萃取两次,并将合并的有机层用MgSO4干燥并浓缩。经硅胶快速柱色谱法纯化(用2-20%甲醇于乙酸乙酯中的溶液洗脱)得到环状磷酸甲酯5a、5b或5c(731mg,65%)。1H NMR(500MHz,CDCl3):δ11.75(1H),5.59(t,J=1.8Hz,1H),5.30(s,1H),4.89(d,J=3.8Hz,1H),4.68(dt,J=12.6,2.0Hz,1H),4.44(m,1H),4.11(m,1H),4.12(m,1H),3.78(s,1H)3.70(s,1H),3.60(d,J=11.6Hz,3H),1.58(s,9H),1.49(s,18H)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ157.7(C),151.4(C),149.7(2C),134.3(C),132.1(C),117.8(C),84.5(2C),82.8(C),75.1(CH),69.8(CH2),68.8(CH),68.4(CH),56.0(CH),55.9(CH3),28.2(3CH3),27.8(6CH3)。31P NMR(500MHz,CDCl3):δ-5.7ppm。MS-ESI+:C26H40N5NaO13P+(M+Na)+计算值为684.2252,实测值为684.2251。
E.制备化合物6a、6b或6c
在氮气气氛下将化合物5a、5b或5c(223mg,0.34mmol)溶解于无水CH2Cl2(7mL)中。加入无水DMSO(104μL,1.46mmol),将溶液冷却至-78℃。逐滴加入三氟乙酸酐(104μL,0.74mmol),并将混合物搅拌40分钟。加入N,N-二异丙基乙基胺(513μL,2.94mmol),并继续在-78℃搅拌50分钟。加入饱和NaCl溶液(20mL),然后从冷浴中取出,用CH2Cl2(30mL)稀释。加入冰醋酸(170μL,8.75mmol),并搅拌混合物10分钟。分离各层,将水相用CH2Cl2(10mL)洗涤。将合并的有机相用5%盐酸水溶液、3∶1的饱和NaCl溶液∶10%NaHCO3溶液以及饱和NaCl溶液连续洗涤,用MgSO4干燥并浓缩得到化合物6a、6b或6c(228mg,当量),其具有用于进一步应用的合适的纯度。1H NMR(500MHz,CDCl3):δ5.86(m,1H),5.07(m,1H),4.70-4.64(m,2H),4.49-4.40(m,1H),4.27(m,1H),3.56,m,4H),1.49(s,9H),1.46(s,18H)ppm。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ157.5(C),151.1(C),150.6(2C),134.6(C),132.7(C),116.6(C),92.0(C),84.6(2C),83.6(C),78.0(CH),76.0(CH),70.4(CH2),67.9(CH),56.2(CH3)56.0(CH),28.2(3CH3),26.8(6CH3)ppm。31P NMR(500MHz,CDCl3):δ-6.3ppm。
F.制备化合物7:(4aR,5aR,11aR,12aS)-1,3,2-二氧杂膦基[4′,5′:5,6]吡喃并[3,2-g]蝶啶-10(4H)-酮,8-氨基-4a,5a,6,9,11,11a,12,12a-八氢-2,12,12-三羟基-2-氧化物
将化合物6a、6b或6c(10mg,14.8μmol)溶于无水乙腈(0.2mL)中并冷却至00℃。逐滴加入溴代三甲基甲硅烷(19.2μl,148μmol),并将混合物温热至环境温度,搅拌5小时,期间形成沉淀物。加入HCl(aq)(10μl,37%),将混合物进一步搅拌15分钟。将混合物离心15分钟(3000g),收集所得的沉淀物。加入乙腈(0.5mL),并将混合物进一步离心15分钟。将乙腈洗涤和离心步骤进一步重复两次,将所得的固体在高真空干燥得到化合物7(4mg,75%)。1H NMR(500MHz,D2O):δ5.22(d,J=1.6Hz,1H),4.34(dt,J=13,1.6Hz,1H),4.29-4.27(m,1H),4.24-4.18(m,1H),3.94(宽多重峰,1H),3.44(t,J=1.4Hz,1H)。31P NMR(500MHz,D2O):δ-4.8。MS-ESI+:C10H15N5O8P+,(M+H)+计算值为364.0653,实测值为364.0652。
实施例2.在Moco的体外合成中通过合成制备的前体Z(cPMP)与由大肠杆菌制备的前体Z(cPMP)的比较
使用合成前体Z(cPMP)以及由大肠杆菌纯化的cPMP的样品对Moco的体外合成进行比较。Moco合成也包括使用纯化成分大肠杆菌MPT合酶、桥连蛋白、钼酸盐、ATP以及脱辅基-亚硫酸盐氧化酶。参见美国专利7,504,095;以及“Biosynthesis and molecular biology of the molybdenumcofactor(Moco)”in Metal Ions in Biological Systems,Mendel,Ralf R.andSchwarz,Günter,Informa Plc,2002,Vol.39,pages 317-68。该测定基于cPMP向MPT的转化、随后使用重组桥连蛋白以及ATP的钼酸盐插入以及最终人脱辅基-亚硫酸盐氧化酶的重建。
如图1所示,来自合成的cPMP的Moco合成得到确认,以及与大肠杆菌纯化的cPMP相比未发现Moco转化的差异。
实施例3.在MPT的体外合成中通过合成制备的前体Z(cPMP)与由大肠杆菌制备的前体Z(cPMP)的比较
使用合成前体Z(cPMP)以及由大肠杆菌纯化的cPMP的样品对MPT的体外合成进行比较。MPT合成也包括使用来自大肠杆菌的体外组装的MPT合酶。参见美国专利7,504,095;以及“Biosynthesis and molecular biology of themolybdenum cofactor(Moco)”in Metal Ions in Biological Systems,Mendel,Ralf R.and Schwarz,Günter,Informa Plc,2002,Vol.39,pages 317-68。每个实验重复进行三次,并示于图2和3中。
如图2和3所示,来自合成的cPMP的MPT合成得到确认,以及与大肠杆菌纯化的cPMP相比未发现MPT转化的明显差异。所有样品中均观察到cPMP向MPT的线性转化,这证明了合成cPMP的同一性(参见图2)。认为各次重复之间的细微区别是由于合成cPMP的不精确的浓度确定(妨碍生色团的存在)。
实施例4.制备前体Z(cPMP)
A.制备起始物质
方案21.
B.引入保护的磷酸酯
方案22.
使用中间体[10](630mg)形成环状磷酸酯得到所需产物[11],其为非对映异构体的1∶1混合物(494mg,69%)。
方案23.
C.分子的氧化以整体脱保护
对仲醇氧化得到偕二醇成功证明了中间体[12],但是氧化产物[13]显示了显著的不稳定性而且不能被纯化。为此,尝试在氧化前对磷酸酯进行脱保护。然而,中间体[11]与TMSBr的反应导致完成分子的脱保护,得到中间体[14]。使用戴斯-马丁试剂氧化剂尝试将醇氧化为偕二醇,得到芳香化蝶啶[15]。
使用戴斯-马丁试剂氧化剂氧化中间体[11]得到起始物质、氧化产物以及多个副产物的混合物。最后使用实施例1中描述的方法氧化中间体[11]。处理后仅观察到部分氧化,得到[11]/[16]的2∶1混合物。粗混合物进行最后脱保护。得到灰白色固体以及用1H-NMR和HPLC-MS分析。这些分析显示cPMP连同脱保护的前体[11]一起产生。
由于分析性HPLC条件导致cPMP由主要杂质良好的分离,该方法可被重复于制备性HPLC以分离最终物质。
Claims (106)
2.权利要求1的方法,其中所述药用盐为盐酸盐。
4.权利要求1-3中任一项的方法,其中所述式(III)化合物是受保护的或未保护的半乳糖、甘露糖、葡萄糖或古洛糖。
6.权利要求1-5中任一项的方法,其中两个相邻的R1基团连接在一起以形成异亚丙基乙缩醛或苯亚甲基乙缩醛部分。
7.权利要求1-6中任一项的方法,其中所述步骤(a)包括在肼的存在下使式(II)化合物与式(III)化合物反应。
8.权利要求7的方法,其中所述肼选自苯基肼和烷基肼。
9.权利要求8的方法,其中所述肼为苯基肼。
10.权利要求1-9中任一项的方法,其中所述步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(V)磷酸化试剂反应。
11.权利要求10的方法,其中所述P(V)磷酸化试剂选自:POCl3、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl2和(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。
12.权利要求10的方法,其中所述P(V)磷酸化试剂是POCl3。
13.权利要求1-9中任一项的方法,其中所述步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(III)亚磷酸化试剂反应。
14.权利要求13的方法,其中所述P(III)亚磷酸化试剂选自:P(OCH2CH2CN)2Cl、P(OCH2CH2CN)(NPr2-i)Cl和氰基乙基-O-P[N(i-Pr)2)]。
15.权利要求13的方法,其中所述步骤(c)进一步包括氧化所得的亚磷酸酯以制备化合物(VI)的磷酸酯。
16.权利要求1-15中任一项的方法,其中步骤(d)包括使式(VI)化合物与选自下述的氧化剂反应:RuO4、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
17.权利要求1-16中任一项的方法,其中所述式(VII)化合物的脱保护在厌氧条件下进行。
22.权利要求1-21中任一项的方法,其中该方法进一步包括将式(I)化合物配制为药物组合物。
30.权利要求29的化合物,其中所述式(V)化合物选自:
或其药用盐形式。
35.式(VII)化合物:
或其药用盐形式,其中每个R1独立地为H或保护基。
58.权利要求55-57中任一项的方法,其中所述步骤(c)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(V)磷酸化试剂反应。
59.权利要求58的方法,其中所述P(V)磷酸化试剂选自:POCl3、PO(OCH3)xCl3-x、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl2以及(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。
60.权利要求58的方法,其中所述P(V)磷酸化试剂是ChPO(OCH3)。
61.权利要求55-60中任一项的方法,其中所述步骤(d)包括使式(VI)化合物与选自下述的氧化剂反应:TFAA/DMSO、RuO4、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
62.权利要求55-61中任一项的方法,其中所述式(VII)化合物的脱保护在厌氧条件下进行。
63.权利要求55-62中任一项的方法,其中所述式(IV)化合物为:
65.权利要求55-64中任一项的方法,其中所述式(VI)化合物为:
67.权利要求55-66中任一项的方法,其中所述方法进一步包括将式(I)配制为药物组合物。
69.一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法:
该方法包括:
(a)使式(XXIII)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团;
所述式(XXIV)化合物为:
(b)使式(XXIV)化合物与式(II)化合物反应以制备式(XXV)化合物,所述式(II)化合物为:
所述式(XXV)化合物为:
(c)对式(XXV)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV)化合物:
(d)选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物:
(e)使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物:
(f)氧化式(VI)化合物以制备式(VII)化合物:
(g)使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
70.权利要求69的方法,其中所述式(XXIII)化合物选自:
71.权利要求69-70中任一项的方法,其中所述式(XXIV)化合物为:
74.权利要求69-73中任一项的方法,其中所述步骤(e)的磷酸化包括使式(V)化合物与P(V)磷酸化试剂反应。
75.权利要求74的方法,其中所述P(V)磷酸化试剂选自:POCl3、PO(OCH3)xCl3-x、H3PO4、PO(OBn)xCl3-x、Cl3CCH2OP(O)Cl2以及(BnO)2P(O)OP(O)(OBn)2。
76.权利要求74的方法,其中所述P(V)磷酸化试剂是Cl2PO(OCH3)。
77.权利要求69-76中任一项的方法,其中所述步骤(f)包括使式(VI)化合物与选自下述的氧化剂反应:TFAA/DMSO、RuO4、戴斯-马丁试剂、DMSO/三氟甲磺酸酐和PDC。
78.权利要求69-77中任一项的方法,其中所述式(VII)化合物的脱保护在厌氧条件下进行。
79.权利要求69-78中任一项的方法,其中所述式(XXIII)化合物为:
80.权利要求69-79中任一项的方法,其中所述式(XXIV)化合物为:
82.权利要求69-81中任一项的方法,其中所述式(IV)化合物为:
84.权利要求69-83中任一项的方法,其中所述式(VI)化合物为:
86.权利要求69-85中任一项的方法,其中所述方法进一步包括将式(I)配制为药物组合物。
87.权利要求69-86中任一项的方法,其中离去基团选自:甲苯磺酸酯、对溴苯磺酸酯、间硝基苯磺酸酯、甲磺酸酯、氧鎓、三氟甲磺酸酯、全氟丁基磺酸酯以及三氟乙基磺酸酯。
88.一种制备式(I)化合物或其药用盐的方法:
该方法包括:
(a)使式(XXIII-A)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII-A)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团;所述式(XXIV)化合物为:
(b)使式(XXIV)化合物与式(II-A)化合物反应以制备式(XXV-A)化合物,所述式(II-A)化合物为:
所述式(XXV-A)化合物为:
(c)对式(XXV-A)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV-D)化合物:
(d)选择性地保护式(IV-D)化合物以制备式(V-D)化合物:
(e)使式(V-D)化合物磷酸化以制备式(VI-D)化合物:
(f)氧化式(VI-D)化合物以制备(VII-D)化合物:
(g)使式(VII-D)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
90.式(I)化合物或其药用盐:
其通过以下方法制备,所述方法包括:
(a)使式(XXIII)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团;
所述式(XXIV)化合物为:
(b)使式(XXIV)化合物与式(II)化合物反应以制备式(XXV)化合物,所述式(II)化合物为:
所述式(XXV)化合物为:
(c)对式(XXV)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV)化合物:
(d)选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物:
(e)使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物:
(f)氧化式(VI)化合物以制备式(VII)化合物:
(g)使式(VII)化合物脱保护以制备式(I)化合物。
92.一种制备式(XIII)化合物或其药用盐的方法:
该方法包括:
(a)使式(XXIII)化合物反应以制备式(XXIV)化合物,所述式(XXIII)化合物为:
其中每个R1独立地为H或保护基以及R4为H或离去基团;
所述式(XXIV)化合物为:
(b)使式(XXIV)化合物与式(II)化合物反应以制备式(XXV)化合物,所述式(II)化合物为:
所述式(XXV)化合物为:
(c)对式(XXV)化合物的成环反应进行催化以制备式(IV)化合物:
(d)选择性地保护式(IV)化合物以制备式(V)化合物:
(e)使式(V)化合物磷酸化以制备式(VI)化合物:
(f)氧化式(VI)化合物以制备式(XIV)化合物:
(g)使式(XIV)化合物脱保护以制备式(XIII)化合物。
93.药物组合物,其包含通过权利要求1的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
94.药物组合物,其包含通过权利要求23的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
95.药物组合物,其包含通过权利要求24的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
96.药物组合物,其包含通过权利要求25的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
97.药物组合物,其包含通过权利要求26的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
98.药物组合物,其包含通过权利要求55的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
99.药物组合物,其包含通过权利要求68的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
100.药物组合物,其包含通过权利要求69的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
101.药物组合物,其包含通过权利要求88的方法制备的式(I)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
102.药物组合物,其包含通过权利要求39的方法制备的式(XIII)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
103.药物组合物,其包含通过权利要求40的方法制备的式(XIII)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
104.药物组合物,其包含通过权利要求91的方法制备的式(XIII)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
105.药物组合物,其包含通过权利要求92的方法制备的式(XIII)化合物或其药用盐,及其药用赋形剂。
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| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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| C02 | Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001) | ||
| WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |
Application publication date: 20121107 |