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CN102300578A - 用于改变健康、安康和寿命的方法和组合物 - Google Patents

用于改变健康、安康和寿命的方法和组合物 Download PDF

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CN102300578A CN2009801559299A CN200980155929A CN102300578A CN 102300578 A CN102300578 A CN 102300578A CN 2009801559299 A CN2009801559299 A CN 2009801559299A CN 200980155929 A CN200980155929 A CN 200980155929A CN 102300578 A CN102300578 A CN 102300578A
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LifeSpan Extension LLC
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Abstract

本发明描述了抗氧化剂对生物系统(具体地包括不同的人细胞)效应的全面基因表达和其他分子分析的结果。基于这些分析,描述了改变或影响细胞、组织和生物体的方法和组合物。在多个实施方案中,提供了用于调节基因维持过程的活性以在活细胞中影响端粒长度和/或结构完整性的方法,以及用于调节由线粒体提供的细胞呼吸速率/效率、线粒体生物发生和维持线粒体膜电位的方法。示例性改变寿命的化合物包括天然和合成的抗氧化剂,如来自咖啡果、茶、浆果等的植物抗氧化剂和多酚化合物,包括但不限于咖啡酸、绿原酸、阿魏酸、奎尼酸、原花色素、泛醌、艾地苯醌或它们的合成形式或衍生物。

Description

用于改变健康、安康和寿命的方法和组合物
相关专利申请的交叉引用
本申请要求享有2008年12月1日提交的美国临时专利申请No.61/118,945的权益,该临时专利申请以引用的方式全本纳入本文。 
技术领域
本文描述了用于改变线粒体生物发生(biogenesis)和/或线粒体维持、呼吸效率、DNA维持、DNA修复、基因表达和/或基因功能以例如(在多个实施方案中)增加、延长或缩短寿命并且/或者延缓或加快细胞、组织、器官和/或生物体的衰老速率的方法和组合物。在示例性的实施方案中,这涉及改变端粒和端粒结构的维持或功能;对氧化应激和/或氧化DNA损伤的维持和控制、细胞反应;以及对环境损害、疾病、免疫应答或细胞遗传变化的细胞反应。 
背景技术
所有活细胞和生物体的寿命都有限。它们生存一段时间并死亡。细胞和生物体都有时序年龄和生物年龄。前者以天、月或年计算,而后者可用对许多生物学功能的复杂测试来测量,所述测试包括但不限于:基因表达、蛋白质产生或代谢通路。衰老速度也可测量,并且加快的衰老速度可被认为是“过早衰老”,而减慢的衰老速度可延长寿命。需要使细胞和生物体的健康寿命最大化,并且还需要通过延迟衰老速度和机能障碍或疾病状态的发作来延长所述健康寿命。还需要缩短不健康、染病的、损伤的或癌细胞的寿命并/或加速其凋亡。 
氧化应激是细胞和生物体机能障碍或疾病以及加速或过早衰老和死亡的一个主要原因。以适当的方式增强细胞或生物体抵抗或修复因环境损害、生活方式选择以及疾病和医学疗法产生的氧化应激所引起的损伤的能力,可以延长健康功能和/或寿命并且/或者延缓老化和衰老。抗氧化剂不仅具有中和活性氧簇的潜力,并且还可以通过影响多种其他关键细胞机制而提供关键的抗衰老益处。一个这类实例是端粒(和/或端粒单元和相关蛋白质和结构构型),端粒是位于染色体末端处的特殊染色质结构。端粒被DNA结合蛋白和相关蛋白质所包被,所述DNA结合蛋白包 括TRF1和TRF2,所述相关蛋白质为TIN2、TPP、POT1、Tankyrase 1和Rap1。端粒缩短提早或加速均可造成过早衰老和死亡。端粒酶是在保护这些区域中起关键作用的DNA聚合酶,但它也可能与癌症相关。因此,调节端粒酶活性的能力可提供主动或被动改变健康的机会。 
除了防止损伤外,延长活细胞的寿命——并且有可能延长器官、组织或整个生物体——的一种方法是修复损伤。控制细胞修复机制的基因如果以适当的方法激活或增强,可以有效地延长细胞的寿命。这可以采用几种形式:通过适当地修复损伤和/或通过使得细胞与其在自然状态相比活更长时间或更长久地复制其自身,延长受到损害或损伤细胞的寿命。 
哺乳动物线粒体是在有氧条件下通过被称作氧化磷酸化的过程产生超过90%的细胞ATP的细胞器。线粒体还参与脂肪酸代谢、激素产生、酮体产生、凋亡和Ca2+动态平衡。线粒体主要包含TCA循环(也被称作Kreb循环)、参与亚铁血红素生物合成的酶和电子传递链(OXPHOS系统)。由于为了维持氧化磷酸化所必须的大的氧化还原反应流,所述细胞器是产生活性氧簇(ROS)的部位,所述活性氧簇在受控产生时具有信号传递功能,但过度产生时是有毒的并且被认为是很多人疾病的诱因,所述疾病包括例如,帕金森病和其他人经变性病症、糖尿病和衰化过程本身。 
所述OXPHOS系统由5个大的多蛋白酶复合体组成,所述组合物共同将NADH和FADH2还原能转换至ATP。NADH泛醌氧化还原酶(复合体I)包含45个不同的亚基,而琥珀酸泛醌还原酶(复合体II)、泛醌-细胞色素c氧化还原酶(复合体III)、细胞色素c氧化酶(复合体IV)和ATP合酶(复合体V)分别具有4、11、13和16个亚基。尽管由5个独立的酶复合体(每个为“OXPHOS”复合体或“OXPHOS”酶)组成并且包含总共约89个亚基蛋白质(每个为“OXPHO蛋白”),所述OXPHOS系统一般被认为作为单个单位起作用。复合体之间的结构关联的证据已经支持该单个-单元概念,所述关联被认为可增强整体功能效力(Chen et al.,J.Biol.Chem.,279:31761-31768,2004;Ko et al.,J.Biol.Chem.,278:12305-12309,2003)。 
所述OXPHOS酶复合体中的4个复合体(复合体I、III、IV和V)具有双遗传来源。也就是说,它们由核DNA编码的蛋白质和mtDNA编 码的蛋白质组成。因此,复合体I的7个亚基、复合体III的1个亚基、复合体IV的3个亚基和复合体V的2个亚基由mtDNA编码。 
线粒体含有其自己的原核生物样DNA(mtDNA)。在哺乳动物中,该DNA是16kb的双链环状DNA,编码13个参与氧化磷酸化的不同多肽,以及2个rRNA和22个tRNA。mtDNA没有保护性的组蛋白并且有极少的修复机制,这导致相对较高的突变速率,所述突变速率在DNA接近OXPHOS系统(产生ROS的部位)时被进一步加强。mtDNA中突变和缺失会在人的一生中累积,并且当它们影响其数目足够改变氧化磷酸化的mtDNA拷贝时变得是生理相关的。 
与以两个拷贝存在的核基因组不同,mtDNA在哺乳动物细胞中以数千拷贝存在,所有拷贝用于翻译在所述细胞器内的细菌样核糖体上制造的基因产物。因此,mtDNA突变的遗传率和外显率都不是孟德尔式的,而是取决于每个细胞中野生型和突变mtDNA的相对量(%)。正常状态是100%野生型mtDNA或野生型同型异源性。mtDNA中的突变还可以是同质性的(存在于细胞的全部mtDNA中),在这种情况下它可能有功能性作用以及可能的致病效应。在单个细胞中存在突变体和野生型mtDNA分子的混合物被称为异质性。由于正常细胞具有过量的mtDNA和mtDNA编码蛋白质的容量,如果异质性突变体mtDNA以超过某阙值——一般是70-90%——的水平存在,则所述异质性突变体mtDNA被认为可引起改变的功能性(或致病的)表型。异质性的另一个结果是单个细胞内、细胞间和组织之间发生线粒体功能改变(Wallace,Science,283:1482-1488,1999;Chinnery and Turnbull,Mol.Med.Today,6:425-432,2000)。 
短暂缺血(缺氧)可导致局部产生过高水平的ROS,这可引起对线粒体的长期损害。出乎意料的是,在重新注入过程中对缺血组织突然重新供应氧被认为是ROS产生增加的近因。在短暂缺血的初始阶段,氧缺乏但是组织对ATP的需求仍然很高,致使除通过复合体IV将氧最终还原为水之外所述电子传递链也继续发挥作用。因此,复合体IV“上游”的还原电子受体积累至异常的高水平。当重新供应氧时,这些过量的还原的载体直接(不适当地)与氧反应,产生高毒性的部分还原的氧簇(Pitkanen and Robinson,J.Clin.Invest,98:345-351,1996;Genova et al., FEBS Lett.,505:364-368,2001),所述氧簇能够进行蛋白质、脂质和DNA修饰反应。所产生的氧化损伤预计主要出现在线粒体内,因为这样的自由基非常活跃以至于存在时间短,在找到靶标进行反应之前不会扩散很远。因此,OXPHOS蛋白质和mtDNA可能是受到这类氧化应激影响最大的细胞分子。所产生的mtDNA和OXPHOS蛋白质的缺陷可能导致ROS产生连续增长,ROS产生连续增长还会导致正反馈环破坏。 
氧化应激是细胞和生物体机能障碍或疾病以及加速或提早衰老和死亡的一个主要原因。线粒体功能或机能障碍、生物发生、死亡和再生也对衰老过程起至关重要作用。以有利的方式增强细胞或生物体抵抗或修复氧化应激所引起的损伤的能力可以延长健康功能和/或寿命和/或老化和衰老的减缓,所述氧化应激是由环境损害、生活方式选择以及疾病和医学疗法所产生的。 
扩展或延长寿命(健康的或不太健康的)的能力依赖于延长细胞(分化的特化细胞和未分化的干细胞和祖细胞)寿命的能力,以使细胞寿命更长或以使新细胞代替失去其功能或死亡的老化细胞。细胞通常具有由可能的细胞分裂次数确定的有限寿命。Hayflick极限理论讨论了寿命有限的一种观点。器官可由细胞再生以用干细胞群体更新其自身,但是干细胞和祖细胞本身寿命有限。延长分化细胞和/或干细胞和祖细胞的寿命的能力是延长生物体寿命的核心所在。 
发明内容
本文提供了可用于增加端粒酶活性并且/或者调节其他端粒维持基因以修复、维持或延长端粒结构从而延长健康细胞寿命的方法和组合物。在癌细胞中降低端粒酶活性,从而使得癌细胞死亡并且使健康细胞即便不是无限增殖也持续更长时间,这是另一种延长寿命的方法。本公开内容描述了在健康细胞和受激细胞中使用抗氧化剂提高或降低端粒酶活性的方法,所述抗氧化剂可调节影响、调节和/或控制端粒酶活性、所述端粒单元和相关组分的维持或者端粒长度的基因活性和/或蛋白质。 
可用于本文描述的方法中的示例性性化合物和组合物包括天然和合成的抗氧化剂,如来自咖啡果(例如,包括咖啡酸、绿原酸、阿魏酸、奎尼酸(quinic acid)和原花色素或它们的衍生物中的一种或混合物)的植物抗氧化剂化合物;来自本文所列的任何植物的植物抗氧化剂化合 物。在另一个示例性实施方案中,所述寿命和健康增加化合物是合成的/生物基因工程改造的艾地苯醌或其酯或衍生物。在一些实施方案中,如果所述调节化合物是天然存在的化合物,它可以不是天然存在的形式,例如它可以是合成形式或者所述天然存在形式的类似物或衍生物。 
重要地,本文描述的方法和组合物的实施方案提供了健康长寿的方面——即,健康的并且高相对质量的(细胞的、组织的、器官的和/或生物体的)寿命延长。 
因此,在多种实施方案中,提供了用于调节以下方面的方法:由线粒体提供的细胞呼吸的速率/效率、每个细胞的线粒体总数(线粒体生物发生)和线粒体膜电势。本文还提供了调节所述基因维持过程的活性的方法,例如维持(或修复)活细胞中的端粒的长度和/或结构完整性。 
本文还提供了用于延长活细胞、组织、器官或生物体的寿命的方法。在另一个实施方案中,描述了一种缩短患病的、不健康细胞或癌细胞寿命的方法。 
本文提供了以下组合物或方法,用于给予所述寿命和/或健康调节化合物以使其与活细胞接触从而增加(在一些实施方案中减少)所述细胞、含有所述细胞的组织和/或含有所述细胞的器官或生物体的寿命或健康。 
细胞可与调节化合物单独接触,或者与所述调节组合物与其他调节化合物或协同的非调节化合物的组合接触,所述协同的非调节化合物可增强向所述接触细胞的递送或者通过改变相关细胞过程间接增强调节效应,所述改变相关细胞过程之后会有利于所述调节化合物的活性。 
本文描述的实施例使用(常规的和新的)抗氧化剂化合物以直接调节对于端粒长度维持至关重要的基因/蛋白质和复合体的基因表达。 
本发明的前述和其他目标、特征和优点将通过以下详细的描述而变得更清晰,以下描述参考附图进行。 
附图说明
图1显示了端粒蛋白(telosome/shelterin)复合体和端粒结构的图示表示(Multani et al.,J Cell Sci 120:713-721,2007)。(A)所述端粒向自身折回并且形成双链的t-环和单链的D-环。该复合体可保护端粒在细胞周期的G2期免受不合适的NHEJ-和HR-介导的端粒DNA加工。所述6 组分端粒蛋白示意性地显示在所述t-环上,POT1与所述D-环相互作用。(B)在DNA复制过程中,假定复制叉处存在WRN使得所述复制复合体体有效地复制端粒DNA。(C)在端粒处存在WRN可利于所述D-环的解旋,使得端粒酶延长端粒。线性3’突出端(overhang)可能受POT1保护。 
图2示出了应激诱导的苯丙酸类(phenylpropanoid)中的生物合成关系(Dixon et al.,The Plant Cell 7:1085-1097,1995)。 
图3示出了咖啡果果实的图示。 
图4示出了导致过早衰老的环境损害的典型效应。 
图5示出了多种过早衰老剂及它们可产生的多种病理学。 
图6示出了皮肤过早衰老的代表性作用机制的图示。 
图7的曲线图显示了在培养的人皮肤成纤维细胞暴露于所列抗氧化剂化合物(绿茶、艾地苯醌或咖啡果提取物)24小时后,对于5个长寿基因(TPP1、TERF1、TERF2、TINF2和)的3次独立PCR引物测定的平均表达值。 
图8的曲线图显示了人心肌细胞在24小时和48小时时响应于 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631200061
处理的线粒体数目的变化。如所示,使用了5个系列稀释的 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631200062
图9的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于咖啡果24小时后VEGFA表达的相对变化。 
图10的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于咖啡果24小时后HMOX1表达的相对变化。 
对于图11-17,处理1=0.00001%咖啡果,0.0000005%绿原酸;2=0.0001%咖啡果,0.00005%绿原酸;3=0.01%咖啡果,0.005%绿原酸。 
图11的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后CCL4L1表达的相对变化。 
图12的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后DDC表达的相对变化。 
图13的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后NOS2A表达的相对变化。 
图14的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后SIRT1表达的相对变化。 
图15的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后TERT表达的相对变化。 
图16的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后PTGS2表达的相对变化。 
图17的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于绿原酸或咖啡果24小时后IFI44表达的相对变化。 
图18的曲线图示出了人成纤维细胞暴露于不同水平咖啡果24小时后SIRT1、SIRT2、SIRT3和SIRT4表达的相对变化。 
图19(a)、(b)和(c)的三曲线图组示出了人皮肤成纤维细胞暴露于绿原酸24小时后选择基因(定制阵列2)相对表达的相对变化。 
图20(a)至(h)的曲线图组示出了人皮肤成纤维细胞暴露于咖啡果24小时后选择基因(定制阵列2)表达的相对变化。 
图21的两曲线图示出了皮肤成纤维细胞暴露于(a)绿原酸或(b)咖啡果24小时后线粒体通路中基因的相对表达。 
图22的两曲线图示出了皮肤成纤维细胞暴露于(a)绿原酸或(b)咖啡果24小时后DNA修复通路中选择基因的相对表达。 
图23的曲线图示出了皮肤成纤维细胞暴露于咖啡果24小时后端粒维持通路中选择基因的相对表达。 
图24的曲线图示出了人皮肤成纤维细胞暴露于咖啡果24小时后PARP基因的相对表达。 
图25的曲线图示出了人皮肤成纤维细胞暴露于绿原酸24小时后具体基因的相对表达,该图表明了典型的喇叭形模式的剂量反应,显示出单方向变化然后在峰值表达水平后回到基线。随着剂量增加,所述基因反应增加或减少直至达到峰值表达水平。超过该剂量,所述化合物的浓度任何增加都得到所述效应的“逐渐缩小返回”或递减。该效应不是上调就是下调,不是双向的。 
图26的曲线图示出了人皮肤成纤维细胞暴露于绿原酸24小时后具体基因的相对表达,该图表明了典型的喇叭形模式的剂量反应,以负表达值起始,并且随着剂量增加它通过零表达值并且具有正表达值,直到 达到阈值剂量,然后回到与起始剂量类同的坐标轴另一侧。这是记录到的第一类双向剂量反应。 
图27的曲线图示出了人皮肤成纤维细胞暴露于绿原酸24小时后具体基因的相对表达,该图表明了典型的喇叭形模式的剂量反应,以正表达值起始,并且随着剂量增加它通过零表达值并且具有负表达值,直到达到阈值剂量,然后回到与起始剂量类同的坐标轴另一侧。这是记录到的第二类双向剂量反应。 
具体实施方式
端粒是随着细胞分裂变短的位于染色体末端的结构;端粒被认为是区分细胞复制可能发生多少次的生物钟(图1)。端粒是类似于鞋带末端塑料帽(防止鞋带解开)的保护性结构。随着每次细胞分裂这些端粒结构缩短,并且这种缩短伴随着衰老。最终,当端粒缩短至某一水平时细胞不再分裂,其代谢减缓,衰老并最终死亡。 
在出生后,端粒酶活性下降;但是在胚胎干细胞和祖细胞中,端粒酶被激活并且维持端粒长度和细胞的无限繁殖。然而,在大部分干细胞和祖细胞(尽管它们有增殖能力)中,端粒酶活性水平较低或没有活性。 
因此,即使在干细胞和祖细胞中,除了胚胎干细胞和祖细胞以及癌干细胞和祖细胞外,端粒变短也会出现在复制性衰老过程中,可能以比正常体细胞低的速率进行。这种端粒限制会阻止细胞在大量增殖之后存活并且从而抑制恶性转化或存活,但是与某些其他基因表达变化(例如p53肿瘤抑制因子的缺陷表达)结合后,它可有利于肿瘤形成或扩大。 
端粒变短不仅伴随着正常衰老,而且所述端粒单元的机能障碍与一些过早衰老症状和多种疾病(包括再生障碍性贫血和很多其他疾病)相关。 
端粒酶是逆转录酶修复酶,能够替换失去的端粒DNA结构。端粒酶的活性一般较低,但它是维持端粒长度的关键因子。端粒酶的活化可以更新细胞从而更新组织、器官或生物体,对端粒酶活性的调节在医学和延长寿命方面有很多应用。 
或者,不依赖于端粒酶的、基于重组的通路也可以是延长细胞寿命的一种方法。在这种端粒维持的方法中,最初在端粒酶缺陷酵母菌株酿 酒酵母(S.cerevisiae)EST1中发现,断裂诱导的复制的基因重组给末端添加了富含G的端粒重复片段,或者断裂诱导的复制出现在极其(但还有活力,即保留着重复片段)短的端粒和所述端粒的另一部分之间,实质上“延长”了所述端粒单元。这些极其短的端粒具有如此高的基因重组能力的事实引起了这样的思考,即这些端粒1)响应于端粒缺失而变得更具重组能力、2)极短的端粒可引发重组事件,或3)极短端粒是特定类型重组的优选底物。近来的证据表明有两条重组通路并且它们的特征是RAD50和RAD51——编码双链DNA断裂修复所必需的蛋白质的基因。然后,断裂诱导的复制(BIR)可以通过上述过程延长端粒。这种基因组不稳定性可导致双链DNA的断裂,而所述断裂必须被修复(该修复机制已被证明由KU70抑制)。在人细胞中,这些具体遗传学需求是未知的,然而,大量研究表明人染色体末端遭受到增强的重组水平,这在酵母ALT通路研究中被证实。对人细胞的研究表明端粒酶的作用可以通过维持基因组稳定性有效地抑制替代重组(alternate recombination)通路。依赖基于重组的端粒维持通路的细胞被迫表达端粒酶。这些细胞从未表明缩短的端粒是重组起始所必需的,因为表达的端粒酶会阻止这样的事件发生。也可能存在其他替代通路或机制。 
最近的一项研究也证明,TERT——端粒酶的催化亚基——的过表达可保护成纤维细胞不受氧化应激。当所述细胞处于氧化应激下时,如衰老的自由基理论支持的那样,线粒体膜失去电势,并且mtDNA随离子水平升高而被破坏。TERT主要是起到维持端粒长度的作用,但是在受到慢性氧化应激的细胞中,过表达TERT的细胞失去的端粒长度仅比受到相似应激且不表达TERT的细胞失去端粒长度的程度轻微一点。在所述同一研究中还已经证实,TERT(可逆地)以剂量/时间依赖的方式从细胞核中释放出来,此时它与线粒体共定位。在这些TERT过表达的细胞中,mtDNR受到保护,线粒体膜电势较高,自由基的浓度较低,这表明有较好的线粒体功能/活力和减小的损伤。 
端粒酶的酶活性是维持端粒单元或结构的长度的最清楚机制。调节端粒酶活性是延长活细胞寿命的一种方法。尽管在人体细胞中一般是受到抑制的,它可被某些修复机制、某些试剂活化并且还在癌症进程或转化中被活化。 
可以被用于调节或改变该端粒酶复合体或其亚基的基因表达的试剂在延长(或缩短)活细胞的寿命中可以起到至关重要的作用。延长活细胞寿命的此类试剂可以很多形式给药并且可被用于治疗疾病以及维持和增进健康。这些活细胞的范围可以是从人或动物细胞到植物细胞以及任何其他活细胞。因此了解端粒酶复合体对于选择可调节端粒酶活性的试剂是关键的。 
值得注意的一个亚基是端粒酶逆转录酶(TERT),它是催化亚基;值得注意的其他基因在下文列出。TERT基因表达受Sp1和c-myc转录因子(在人肿瘤中引人关注地经常改变的基因)的控制。 
被命名为SP1(或转录因子SP1,专一性蛋白1(Specificity Protein1))的基因已被证明当在人中过表达时会诱导凋亡。涉及到的凋亡通路需要SP1与所述DNA结合(通过锌指结构域)并且一般是细胞类型特异的。所述SP1调节的凋亡涉及BCLXL和BAX的改变(下调),其他胱冬蛋白酶或BCL2不受影响。它参与生物体早期发育中的基因表达以及当结合时调节转录。 
被命名为cMyc的基因编码结合其他基因DNA并且调节活性或转录的蛋白。估计cMyc转录因子可调节全部基因的约15%。诱导cMyc可通过结合/活化生长促进基因来促进细胞增殖/转化。当cMyc过表达或突变时,所述DNA结合不会正确地出现并且可导致癌症。cMyc通过很多通路(WNT、SHH、EGF等)激活,并且修饰很多靶基因的表达,导致多种生物学效应。cMyc还表明可通过诱导TERT的表达直接活化端粒酶。已经发现,除了转录,cMyc还可以影响细胞生长、分化、干细胞自我更新和凋亡。它在很多癌症中经常被发现上调。 
线粒体通过由电子传递系统产生三磷酸腺苷(ATP)而作为化学细胞能量的主要生产者起作用。通过顺梯度向下传递电子,形成ATP用于为细胞提供能量。此外,线粒体在细胞调节的其他方面发挥功能,例如线粒体膜电势(使离子跨膜转运以便于能量生产的电势量)是凋亡或编程性细胞死亡的关键调节因子。所述膜的质子泵功能力可有助于化合物的还原,导致能量产生,并且还有助于调节由自由基引起的氧化应激。如果在细胞呼吸过程中电子没有从复合体I传递到复合体III,线粒体也可以产生氧化应激。在实质上,会形成积压(back log)并且导致自由基 形成。所述泛醌和合成的艾地苯醌化合物和衍生物通过作为电子载体/传递试剂来发挥作用帮助从复合体I沿着呼吸链的传递,从而发挥作用缓解该电势积压。 
衰老的自由基理论假设衰老和相关退行性疾病是由自由基(在外轨道具有不成对的且不成分子键的电子的高反应性分子或原子{“自由的”})对细胞和组织的负效应而引起的。所述自由基在具有氧化酶的细胞内作为催化氧分子的副产物形成,还可在结缔组织中由微量的金属如铁、钴和锰形成。最常见的自由基是超氧离子(O2)、羟基团(OH)和脂质过氧化氢基团(LOO)。羟基团具有高度反应性(短半衰期)并且共价交联是最常见的效应。该交联还能通过产生更多自由基使所述循环持续。超氧离子甚至反应性更大,并且主要存在于细胞质中(在核中较少见)。过氧化氢分子更稳定并且能够穿过细胞膜和核膜与金属形成羟基。与过氧化氢分子直接接触的蛋白质也能被损坏,过氧化氢是使细胞处于氧化应激的一种最常见的方法。多不饱和脂肪酸的脂质过氧化作用是导致食物变腐败的一个因素。在动物活细胞中,经过过氧化作用的脂质膜变得僵硬并且渗透性更大,最终导致细胞质离子渗漏和细胞凋亡。 
衰老的线粒体理论称线粒体(细胞中通过电子传递系统和ATP合酶生成能量的细胞器)会由于编码电子传递系统的蛋白质的线粒体DNA损伤和改变而丧失功能(这与衰老的自由基理论类似,但是更广阔地着眼于遗传学、生物能学和细胞的膜电势,而不仅仅是自由基化学)。这种功能减少使得不能处理在细胞呼吸过程中生成的自由基并且引起进一步的氧化损伤(通过细胞色素渗漏至细胞质中使膜渗透性、丧失膜电势和触发编程性细胞死亡)并缩短细胞寿命。线粒体DNA在氧化应激中不受保护(最常见的损伤试剂是由氧化的鸟嘌呤碱基形成的8OHdG{8-羟基-2’-脱氧鸟苷}),因此对缺失/损害更敏感。如上文对生物机制的描述,这些突变在正常衰老过程中积累,最常见的是4977碱基对缺失,被称作共同缺失(common deletion)(在光衰老皮肤中显著增加)。当人成纤维细胞长期暴露于UVA照射时,有由单线态氧产生(自由基形成)引起的时间/剂量依赖性的共同缺失产生。该共同缺失的产生在存在单线态氧猝灭剂(抗氧化剂)的情况下减少并且通过热化学方法(氧化氚增强的单线态氧生产)在未被辐射的细胞中倍增,表明在自由基调节的线粒体缺 失形成和通过抗氧化剂防止其发生中有明确的作用。 
线粒体缺失在很多衰老疾病中已被证明是病因或辅助因子。在帕金森病中,在老年个体黑质神经元中大量线粒体缺失的明显证据已被证实。线粒体缺失和缺陷还在心脏病、阿尔茨海默病、疲劳综合征(fatigue syndrome)和很多遗传疾病中被鉴定到。在多种细胞类型——成纤维细胞、视网膜色素上皮细胞和神经元——中报道了mtDNA缺失增加。特别值得注意的是“净”mtDNA与所述“共同缺失”的比例,所述比例已被证明随细胞衰老、施加氧化应激而增加并且在癌细胞中有增加。抗氧化剂调节这些缺失产生的能力已被证明是剂量依赖的(较低剂量在减少所述共同缺失形成方面是有效的,而相反地较高剂量已被证明是无效的,并且事实上被认为作为电子供体起作用以及有助于产生ROS)。 
这些理论已被试验证据所支持,所述证据主要表明在新细胞和老细胞中线粒体之间有形态差异、老线粒体的膜电势降低、存在于老肌肉细胞中的细胞色素氧化酶(COX)的活性水平下降,并且mtDNA缺失、点突变和线粒体DNA结构的其他变化随年龄而增加。 
线粒体DNA的突变速率是核DNA的突变速率的10倍。这可能是由于线粒体中的修复DNA的能力有限。线粒体DNA对电子传递链中ATP产生过程中产生的氧自由基的损害尤其敏感。ROS部分地是在电子在复合体I或III上停止时产生,因而在电子传递中绕过复合体I是减少ROS的一种机制。线粒体DNA可附着在线粒体内膜上,所述线粒体内膜是氧基团的来源,而线粒体DNA还缺乏保护性的组蛋白,使得固有修复机制更加有限。这种积累的损伤能使得它难以拷贝DNA,或者在所述DNA中产生缺失和突变。该损伤经年累月不仅使得功能降低,而且产生过早衰老并且在一些情况下形成疾病状态。尽管线粒体有一定修复DNA的能力,还是应考虑保护、防卫或修复线粒体DNA和功能的能力的重要性。 
延长寿命的另外通路是直接增加线粒体呼吸或通过增加线粒体的总数来增加线粒体呼吸。NAD/NADH比值随线粒体呼吸增加而增大,线粒体呼吸增加与可诱导线粒体生物发生(可增加线粒体的数量)的PGC-1α的活化有关。因此,通过调节PGC-1α的活性来增加线粒体的数量是改变/调节寿命的化合物的靶标。 
已知由自由基或活性氧簇(ROS)产生的氧化应激可产生大范围的细胞损伤,所述损伤若不能完全修复会导致细胞损伤、伤害、衰老或凋亡。很多小的未完全修复的伤害随着时间积累使得细胞、组织、器官和最终地整个生物体的重要功能降低。这种损伤可出现在任何细胞组分中,但值得特别注意的是线粒体,它是活细胞的“能量工厂”并且为细胞活动提供能量,而且还控制被称为凋亡或编程性细胞死亡的过程。线粒体还具有与细胞核DNA分开的其自身独特DNA。与细胞核DNA不同,线粒体DNA修复DNA损伤的能力更加有限。同时,线粒体实际上可以产生其自己的自由基,作为正常细胞功能的一部分。因此,线粒体对于来自氧化应激的损伤尤其敏感,并且所述细胞损伤可以深刻地影响整个细胞的功能。这可能致使细胞寿命缩短并且最终使得整个生物体寿命缩短。 
总的来说,延长实足寿命与保护不受氧化应激损坏、使得线粒体内的DNA突变最小化和增加对热激的抗性有关。已证实暴露于有毒化学物质(如溴化乙锭)产生的被称为缺失的大量线粒体DNA突变增加会降低许多至关重要的线粒体功能,所述功能包括氧消耗,而所述氧消耗是产生细胞能量或ATP需要的。当提供一种抗氧化剂时,这些变化中的一些被阻止或最小化,表明增加环境诱导的ROS产生可导致线粒体基因或蛋白质表达改变,这种改变可通过某些抗氧化剂的保护作用来减少。长期氧化应激可导致过早衰老。 
一些研究已经表明,在没有氧化应激情况下诱导线粒体DNA改变也会加速细胞的衰老过程。慢性炎症也可以加速衰老过程。因此,尽管有很多衰老理论,很可能这些理论中很多理论涉及的过程均在衰老过程以及加速和过早衰老中起一些作用。其中最主要的似乎是氧化应激和ROS的作用以及线粒体DNA改变(二者对于氧化应激以及不依赖氧化应激的DNA改变来说都是次要的)以及炎症。所有这三种过程都可以适当的方式受到与这些过程相互作用的多种抗氧化剂的影响。不同的抗氧化剂有不同的作用机制,并且在ROS和氧化应激损伤中涉及不同的通路。因此,将抗氧化剂用于防止过早衰老并且作为氧化应激的解毒剂也有很好的证据,即使没有被完全了解。 
然而,一般而言,虽然防止细胞、器官、组织或生物体过早衰老是延长寿命的一种途径,但这些方法是主要是防止寿命提早缩短的方法。 以人为例,人都暴露于多种因子,所述因子包括但不局限于刚描述的那些,如果我们抵消这些因子将会有效延长寿命,但是这主要是防止损伤,而不是修复缩短寿命的损伤。 
为了真正地延长活细胞的寿命——从而延长器官、组织和整个生物体的寿命,除了防止损伤之外,修复损伤是有利的。如果控制细胞修复机制的基因被以合适的方法活化或增强,就可以有效延长细胞的寿命。这可以两种形式进行:通过恰当地修复损伤或者还可以通过使得细胞比其自然条件下更长久地生存或复制其自身来延长受到损伤或损害的细胞的寿命。 
癌细胞可通过一种被称作无限增殖化的过程来更长久地生存或复制其自身,这也可以在实验室的研究条件下中做出。一些人认为癌症是一种衰老形式,因为细胞修复机制没有完全地修复损伤或没有杀死不能修复的损伤细胞。一个实例是由UVB光损伤造成的皮肤癌类型。UV光已知可在DNA中产生被称作胸腺嘧啶二聚体的改变,籍此会有出现在DNA中的交联,该缺陷或突变可产生皮肤的基底细胞癌——一种由阳光引起的常见皮肤癌类型。还有DNA修复酶,如果所述修复酶适当地发挥其功能将会修复这些损伤并且防止皮肤癌发展。在基底细胞皮肤癌的情况下,阳光暴露可导致胸腺嘧啶二聚体(一种DNA损伤形式)形成,并且当所述DNA修复没有除去该UV诱导的损伤时,不是所有的交联都被切开。因此,DNA损伤积累可导致突变。除了诱变外,阳光可抑制局部的免疫系统,可能降低对于新癌细胞的免疫监视。这种危险主要是基于UV暴露和皮肤中保护性色素的程度,但还有一种被称为基底细胞痣综合征或格林综合征(Gorlin’s syndrome)的罕见综合征,其中由于DNA修复有缺陷,仅需要少得多的UV暴露。该综合征的诱因是染色体9q22.3上所述PTCH1肿瘤抑制因基因中的突变,所述突变可抑制刺猬信号传递通路(hedgehog signaling pathway),最终导致癌产生。尽管皮肤的基底细胞癌不是一种致命的癌症形式,它确实表明了环境损伤在癌产生中的作用,并且还有基因遗传在使得一些个体更容易或更不易有该问题方面以及在影响所述癌症的开始年龄和严重程度方面的作用。 
因此,如果考虑破坏细胞功能或器官功能从而限制健康寿命或导致使寿命缩短的致命结果的其他癌症,则可以更好地理解尽管有很多 导致寿命缩短的因素,还有很多减少或避免这些因素的方法,并且修复所述损伤的能力对于实现或优化健康寿命至关重要。 
延展或延长(健康的或不太健康的)寿命的能力在于延长细胞寿命的能力,所述细胞为分化的特化细胞和未分化的干细胞和祖细胞,以使细胞寿命更长或以使新细胞代替失去其功能或死亡的老化细胞。细胞通常具有由可能的细胞分裂次数确定的有限寿命。Hayflick极限理论讨论了一种寿命极限观点。器官可用细胞再生,以从干细胞群体更新自身,但是干细胞和祖细胞本身寿命有限。延长分化细胞和/或干细胞和祖细胞的寿命的能力是延长生物体寿命的核心。 
修复由环境或遗传因素引起的细胞损伤或DNA损伤的能力可延长细胞的寿命。延长这类细胞的自然寿命的能力还可延长细胞的寿命。这类细胞可以是分化细胞或干细胞。在更宽泛的范围内,如果其他介入因素限制或缩短器官或生物体的寿命,则这两事件的任一或两者都可导致整个器官或生物体寿命的延长。例外是,延长癌细胞或干细胞的寿命反过来可导致器官或生物体寿命的缩短,因此是不需要的。使癌细胞死亡而同时使健康细胞即便不是无限增殖也至少是活得更长是一个重要概念,因为长寿和肿瘤抑制在某些方面是相反的目标。端粒酶是决定细胞寿命的一个关键酶,其活化能够使细胞克服衰老,但也会使癌细胞增殖。因此,端粒酶的活性在延长或缩短活细胞寿命中变成要考虑的至关重要的问题。 
能够延长酵母细胞的寿命而不会降低复制能力的sirtuin(可增强DNA修复和抗氧化剂产生的细胞酶)和SIRT途径的发现是理解衰老的另一突破。Sirtuin和所述SIRT通路被认为是通过细胞内NAD/NADH比例和线粒体的相关能量代谢的变化进行调节。所述SIRT通路参与热限制过程,但对其机制了解甚少,主要认为是围绕CR产生的较低糖酵解情况。7个动物sirtuin中的3个(SIRT3、4和5)靶向线粒体。SIRT1本身还可调节线粒体活性。SIRT3的活性解释的最清楚,它在线粒体中作为特定酶的活化剂起作用,所述特定酶自发地形成NADPH——细胞抗应激系统再生所需的关键组分(这种替代的能量产生库可解释为何能量限制的应激性细胞事件似乎可延长细胞寿命;通过无需对食物的基本能量代谢生成NADPH)。白藜芦醇是这些sirtuin化合物中最有效的活化 剂。 
本文描述的技术与使用白藜芦醇和sirtuin调节不同,因为现有技术利用抗氧化剂化合物以直接调节对于维持端粒长度和/或线粒体膜稳定性/自由基消除至关重要的基因/蛋白质和复合体的基因表达,而所述sirtuin和白藜芦醇可改变所述细胞的能量代谢并且增强所述“抗应激”反应。此外,所述抗氧化剂艾地苯醌可通过帮助电子在电子传递系统中绕过复合体I(大部分ROS在此形成)而帮助降低线粒体中的ROS活性并且将电子移送至复合体III。 
出现的证据表明,微小RNA(miRNA)可能在衰老和癌症中都起到调节作用。miRNA似乎可影响诸如细胞周期、DNA修复、氧化应激反应和凋亡这类系统,并且已被证明在生命后期异常表达。鉴于此,本文还提供了改变一种或多种本文鉴定的影响寿命的基因的表达的方法。 
在体外和体内延长细胞的寿命都是有价值的。保护细胞使其免受应激或氧化应激反应或DNA损伤并且控制细胞周期或凋亡或干细胞活性可以潜在地延长所述细胞的寿命。 
I.缩写 
ANT                 ADP/ATP转运酶 
CoA                 辅酶A 
复合体I             NADH泛醌氧化还原酶 
复合体II            琥珀酸泛醌还原酶 
复合体III           泛醌-细胞色素c氧化还原酶 
复合体IV(或COX)     细胞色素c氧化酶 
复合体V(F1/F0ATP酶) ATP合酶 
IF1                 F1/F0ATP酶的抑制剂 
LC-MS/MS            液相色谱-质谱/质谱 
M F1F0              线粒体F1/F0ATP酶 
mAb                 单克隆抗体 
MALDI-TOF           基质辅助激光解吸/电离飞行时间 
mtDNA               线粒体DNA 
NADH                烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 
ORAC                氧自由基吸收能力 
OD                  光密度 
OMIM                在线人孟德尔遗传 
OXPHOS              氧化磷酸化 
PDH                 丙酮酸脱氢酶复合体 
PMSF                苯甲基磺酰氟 
ROS                 活性氧簇 
II.术语 
除非另有说明,技术术语按照常规用法使用。分子生物学中常规术语的定义可见于Benjamin Lewin,Genes V.published by Oxford University Press,1994(ISBN 0-19-854287-9);Kendrew et al.(edss.);The Encyclopedia of Molecular Biology,published by Blackwell Science Ltd.,1994(ISBN 0-632-02182-9);和Robert A.Meyers(ed.),Molecular Biology and Biotechnology:a Comprehensive Desk Reference,published by VCH Publishers,Inc.,1995(ISBN 1-56081-569-8)。 
为了便于阅读本发明的各种实施例,提供以下具体术语的解释: 
可寻址的:能够可靠地并且一致地定位并鉴定,如在阵列上可寻址的位置。 
抗氧化剂:能够减缓或防止电子从一个分子/原子转移至另一个分子/原子(氧化剂)的分子或原子。 
反义、正义和反基因:双链DNA(dsDNA)有两条链,一条5’->3’链,被称为正链,和一条3’->5’链(反向互补链),被称为负链。由于RAN聚合酶以5’->3’方向添加核酸,所述DNA的负链在转录过程中作为所述RNA的模板。因此,所形成的RNA将有与所述负链互补且与正链相同(除了U被T代替)的序列。 
反义分子是与RNA或DNA  链特异地杂交或特异地互补的分子。正义分子是与DNA负链特异地杂交或特异地互补的分子。反基因分子是指向dsDNA靶的反义或正义分子。 
凋亡:细胞通过其编程性死亡或失去生存力的过程。通常由细胞色素从线粒体中渗漏触发,并且伴随着信号传递级联(胱冬蛋白酶(caspase)或其他蛋白质),导致:线粒体和能量电势通过电子传递系 统降低、活性氧簇和自由基积累和膜完整性丧失。 
阵列:分子,特别是生物大分子(如多肽或核酸)或生物样本(如组织切片)排布于基底——通常是平的基底(如膜、板或载玻片)——上的可寻址位置。所述阵列可以是规则的(例如以统一的行和列排布)或是不规则的。阵列上可寻址位置的数量可变,例如可以从数个(例如3个)到超过50、100、200、500、1000、10000个或更多。“微阵列”是小型化至其可从显微镜检查评估获益的程度的阵列。 
在阵列内,每个排列的分子(例如寡核苷酸)或样本(更通常阵列的“特征”)是可寻址的,这是因为其位置在所述阵列表面上的至少二维内可以被可靠且一致地确定。因此,在有序的阵列中,每个特征的位置在样本被点在或者另外施加在所述阵列的表面时通常被指定至一个样本,并且可提供检索以使每个位置关联于合适的特征。 
通常,有序的阵列以对称网格模式排布,但是样本可以其他模式排布(例如,以放射状分布的线、螺旋线或规则的簇)。阵列是计算机可读的,因为可将计算机编程以将阵列上的具体地址与信息(如阵列样本的种类和杂交或结合数据,包括例如信号强度)关联。在计算机可读阵列形式的一些实例中,阵列表面上的单个点会被规则地排布,例如以Cartesian网格状线,这可通过计算机与地址信息关联。 
阵列上的样本施加点(或特征)可以呈现多种不同的形状。因此,尽管这里使用了术语“点”,它一般是指核酸或其他生物分子的局部沉积,并且不限于圆形区域或基本圆形区域。例如,对于阵列可使用基本方形的施加区域,这可以是基本为矩形的区域(例如条状印迹型施加)或三角形、卵形和不规则形状等。所述阵列基底本身的形状也不重要,但它通常是基本平的并且一般形状可以是矩形或方形。 
结合或相互作用:两种物质或分子之间的关联,如一个核酸分子与另一个核酸分子(或它本身)的杂交。在一些实施方案中,公开的阵列被用于检测标记的核酸分子(靶)与所述阵列的一个或多个特征中固定的核酸分子(探针)的结合。如果将(标记的)靶分子(通常是在溶液或悬液中)与所述阵列或者在所述阵列上孵育一段时间(通常是5分钟或更长,例如10分钟、20分钟、30分钟、60分钟、90分钟、120分钟或更长,例如过夜或甚至24小时)后,可检测量的分子与所述阵列的核 酸分子特征关联至其不能被较低严格度缓冲液(例如高盐(如3×SSC或更高),室温冲洗)的冲洗冲掉的程度,那么标记的靶分子“结合”于阵列上点中核酸分子。冲洗可在例如室温下进行,但也可使用其他温度(更高或更低温度)。至少基于序列同源性,靶会与所述阵列上不同特征内的探针核酸分子以不同程度结合,术语“结合”包括较强和较弱相互作用。因此,一些结合在所述阵列被更严格缓冲液(例如低盐(如约0.5至约1.5×SSC),55-65℃冲洗)冲洗后将仍然保持。 
当所述探针和靶分子都是核酸时,所述测试或参考分子与所述阵列上的特征的结合可以从所述探针和所述靶核酸之间的特异性互补方面来讨论。本文还考虑了基于蛋白质的阵列,其中所述探针分子是蛋白质或肽,或者包含蛋白质或肽,并且/或者其中所述靶分子是蛋白质或肽,或者包含蛋白质或肽。 
生物样本:可从生物体直接或间接得到的任何样本,包括全血、血浆、血清、泪水、粘液、唾液、尿液、胸膜液、脊髓液、胃液、汗液、精液、阴道分泌物、痰、来自溃疡和/或其他表面疹的液体、水疱、脓肿、组织、细胞(例如,成纤维细胞、外周血单核细胞或肌肉细胞)、细胞器(如线粒体)、器官,以及/或者组织、细胞(例如,成纤维细胞、外周血单核细胞或肌肉细胞)、细胞器(如线粒体)、器官和/或组织的提取物。“生物体”包括但不限于植物、动物或微生物。术语“动物”包括脊椎或无脊椎动物,如哺乳动物(例如人)、昆虫(例如黑腹果蝇(Drosophila melanogaster))、线虫(例如,秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans))和鱼(例如Danio rerio、aka、斑马鱼)。生物样本还可以是实验室研究样本,例如细胞培养上清液。可使用本领域技术人员熟知的方法来收集或得到所述样本。 
咖啡酸(3-(3,4-二羟苯基3,4-二羟基-肉桂酸反式-咖啡酸3,4-二羟基-反式-肉桂酸)2-丙烯酸(E)-3-(3,4-二羟苯基)-2-丙烯酸3,4-二羟基苯丙烯酸):正式名称为石炭酸,这种酚(来自芳香族烃的晶质酸化合物)化合物可从咖啡果中提取,并且已被证明可为抗癌生成剂、抗炎剂,并且具有抗氧化剂特性,具有与肉桂酸类似的化学结构。它可溶于水和醇。分离和表征咖啡酸的方法是本领域已知的;此外,该化合物可市购。 
肌肽:具有强抗氧化剂性质的天然氨基酸(它可帮助从系统中结合 并清除离子金属)。肌肽已被证明在培养中可延长用所述氨基酸处理的成纤维细胞的寿命,超过未处理细胞的Hayflick极限最多达10次分裂。肌肽还可帮助防止蛋白质和DNA分子的交联并且防止细胞损伤。 
儿茶素3-没食子酸酯(CG):具有抗氧化剂性质的绿茶的微量多酚成分。 
cDNA:没有内部非编码片段(例如,内含子)和决定转录的调节序列的DNA片段。举例来说,cDNA可在实验室中通过对从细胞中提取的信使RAN反转录来合成。 
细胞增殖:细胞生长和分裂(有丝分裂)导致的细胞数量增加的过程。 
细胞老化:细胞衰老以及失去细胞功能和生存能力(死亡)的过程。 
查耳酮:类黄酮生物合成的芳香族酮(含有羰基C=O基团的化合物)中间体,它可形成很多生物学上重要化合物的核心并且已被证明能够阻断电压依赖的钾通道。 
绿原酸(-[[3-(3,4-二羟基苯基)-1-氧代-2-丙烯基]氧]-1,4,5-三羟基环己烷羧酸):一些反式肉桂酸和奎尼酸(从咖啡酸和奎尼酸形成的最常见的单个绿原酸)之间形成的酯家族,并且是在咖啡及其果实中发现的一种主要酚类化合物。绿原酸已被证明能够有效地减少自由基(抗氧化剂能力)并且能够抑制肿瘤形成过程。用于分离和表征绿原酸的方法是本领域已知的;此外,该化合物可市购。 
可可豆:来自可可树的脂肪种子;它含有高水平的多酚类以及高水平的原花青素。可可豆荚具有粗糙的坚韧外皮,厚度因不同种类而不同,其中包有甜的粘滑的果肉,里面有30到50个大的豆子,所述豆子非常软、颜色为粉红或紫色。就是这些豆子含有可可油和固体可可(cocoa solid)(所述干固体物可产生可可粉并且两者的结合产生巧克力,基于存在的固体可可的量它可以有许多形式)。在豆子和豆荚本身内有所述多酚和原花青素化合物。这些化合物具有抗氧化剂抗癌、一氧化氮(并且更通常为自由基)调节能力,并且还可以有非类固醇抗炎症效应。这些多酚类和原花青素一般是通过发酵、干燥和研磨咖啡豆而从豆子中提取。 
咖啡果:咖啡树Coffea rubiaceae的果实。如果将咖啡果保持在不发酵状态并且保藏,则整个咖啡果的果肉、外皮(图3)(较低程度)和 黏液含有高水平的多酚类抗氧化剂。所述咖啡果的提取物一般是通过与溶剂接触产生,并且会包含营养物质。对所述提取物(或“茶”)进行进一步加工可使得可对所述咖啡果的各方面进行纯化。咖啡果提取物的一个市售生产商是VDF FutureCeuticals,Inc.(Momence,IL;商标为 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631200211
);其制品的大部分是绿原酸,以其他咖啡酸、原花色素等构成活性成分的剩余部分。举例来说,咖啡果提取物可如以前的描述进行制备(参见,例如美国公开文本2007/0281048和其中引用的其他专利文件;美国公开文本2006/0210689、2006/0263508和2009/0175973;以及PCT公开文本WO 2004/098320、WO 2004/098303、WO 2006/022764和WO 2004/098320)。 
通过(例如)离子交换柱和乙酸钠溶液分离咖啡的酸——包括咖啡酸、绿原酸、奎尼酸和阿魏酸,以及原花色素,将得到纯化的抗氧化剂组分。在绿色咖啡果中发现最大量的抗氧化剂,而熟咖啡果中的含量稍少。多酚类构成了咖啡果提取物的大部分活性成分;这些多酚包括绿原酸、咖啡因、咖啡酸、阿魏酸和奎尼酸等。对不同咖啡果提取物的代表性分析在例如美国公开文本No.2007/0281048的表2中显示。 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631200221
DNA(脱氧核糖核酸):DNA是含有大部分生物的遗传物质的长链多聚物(一些病毒的基因由核糖核酸(RNA)构成)。DNA多聚物中的重复单元是4种不同核苷酸,每种核苷酸都包含4种碱基(腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶)之一,所述碱基与脱氧核糖结合,而磷酸基团结合于所述脱氧核糖。三个核苷酸(被称为密码子)编码多肽中的每个氨基酸或终止信号。术语“密码子”还用于DNA序列转录成的mRNA中相应的(且互补的)三个核苷酸序列。 
富含的:术语“富含的”是指材料浓度是其天然浓度的(例如)至少约2、5、10、100或1000倍,有利地为至少0.01重量%。还考虑约0.5重量%、1重量%、5重量%、10重量%和20重量%的浓缩制剂。 
酶活性:酶(例如OXPHOS酶)的至少一种功能的可检测(并且通 常是可量化)特性,通常随时间或与标准曲线比较进行监测。用于检测、确定、监测和/或定量各种酶活性的方法是本领域技术人员熟知的。还熟知使用酶活性测定法来评估化合物(例如,测试化合物)影响酶功能(例如作为抑制剂或增强剂)的能力的方法。 
例如,“ATP酶活性”通常被认为是可检测地水解ATP的能力。ATP酶活性可使用本领域技术人员熟知的多种测定法进行测量,所述测定法包括本文中例如实施例2提供的那些测定法。在一些实施例中,通过检测(定量或定性地)由酶活性(如,复合体V活性)释放的游离磷酸在溶液中测量ATP酶活性。检测游离磷酸的方法是已知的并且包括例如比色技术和荧光技术(参见,例如,Aggeler et al,J.Biol.Chem.,277:33906-33912,2002)。在其他实施例中,固定的酶(例如,在测验片(dipstick)上免疫捕获的复合体V)的ATP酶活性是通过例如以下方式检测:通过荧光技术(例如,由Molecular Probes,Inc.提供的用于游离磷酸的基于荧光的测定法),或者通过直接应用基于组织的组织化学技术(参见,例如,Bancroft and Stevens,Theory and Practice of Histological Techniques,4th edition,London:Churchill-Li vins tone,1996)或其稍微修改的方案,例如考虑了组织切片与测验片相比的物理处理差异。 
“氧化还原酶活性”是酶可逆地氧化第一底物分子(从中除去质子和电子或还原性等价物)并同时还原第二底物分子(对其加上质子和电子或还原性等价物。第一和第二底物分子通常但不必须是蛋白质、碳水化合物、脂质或小的辅因子。 
氧化和/或还原可通过本领域已知的任何方法进行检测。在一些实施例中,可测量所述氧化的和/或还原的底物分子的物理性质的可检测变化;例如,在一些确定波长下的光密度(OD)变化。在具体的实施例中,可使用OD340来监测NAD/NADH氧化还原比(例如,在复合体I活性的测定法中),或者可使用OD600监测2,6-二氯酚靛酚的还原(例如,在复合体II活性的测定法中),或者可使用OD550监测细胞色素c(II)的氧化(例如,在复合体IV活性的测定法中)(参见,例如,Birch-Machin and Turnbull,Meth.Cell Biol.,65:97-117,2001)。在其他实施例中,氧化和/或还原可通过监测氧化还原酶的辅基性质的变化来检测;例如OD605/OD630的比值可用于监测复合体IV的亚铁血红素aa3(参见,例 如Rickwood et al.,in Mitochondria.A Practical Approach,ed.by Darley-Usmar et al.,Oxford:IRL Press,1987)。在另外其他实施例中,氧化和/或还原可通过将目的氧化或还原反应与另一更容易监测的氧化还原反应——例如显色底物(Birch-Machin and Turnbull,Meth.Cell Biol.,65:97-117,2001)或发荧光底物(Molecular Probes,Inc.)的氧化或还原反应——偶联进行监测。 
“还原酶活性”是酶还原(添加电子至)底物分子的能力,所述底物分子通常但不必须是蛋白质、碳水化合物、脂质或小的辅因子。所述还原性等价物可通过酶从一些其他分子得到,所述其他分子因此与所述还原酶/底物反应同时或者在所述还原酶/底物反应之前的某个时间被氧化。还原酶活性可通过使用本领域普通技术人员已知的多种测定法来测量。例如,对复合体II活性的测定法可按以下方式进行:通过监测OD600变化来观察所述氧化的底物2,6-二氯酚靛酚的还原(Birch-Machin &Turnbull,Meth.Cell Biology,65:97-117,2001)。 
“氧化酶活性”是酶氧化底物分子(除去其质子和电子或还原性等价物)的能力,所述底物分子通常但不必须是碳水化合物、脂质或小的辅因子。所述还原性等价物一般可由所述酶传递至某些其他分子,所述其他分子因此与所述氧化酶/底物反应同时或者在所述氧化酶/底物反应之前的某个时间被还原。氧化酶活性可通过使用多种本领域普通技术人员已知的多种测定法来测量。例如,复合体IV氧化酶活性可通过测量OD550观察细胞色素c的氧化来检测(Birch-Machin & Turnbull,Meth.Cell Biology,65:97-117,2001)。 
表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG):绿茶中发现的含量最丰富的抗氧化剂儿茶素。它是表没食子儿茶酚和没食子酸的酯。 
表儿茶素没食子酸酯(ECG):绿茶中发现的一种多酚,具有抗氧化剂性质。 
酯:由至少一个-OH(羟基)基团被-O-烷基(烷氧基)基团取代的酸组成的一类化合物。 
阿魏酸((E)-3-(4-羟基-3-甲氧基-苯基)丙-2-烯酸):作为其他芳香族化合物前体的化合物,最常见于植物细胞壁中,在其中它与二氢阿魏酸关联,以有利于木质素和多糖交联,赋予细胞壁刚性。它还见于咖啡果 中,具有抗氧化剂活性并且通过甲基化咖啡酸而生物合成。分离和表征阿魏酸的方法是本领域已知的;此外,该化合物可市购。 
自由基:在外层中具有单个未成对电子的任何原子或分子。 
FOXO1、3和4(Forkhead Box O1A、O3A和O4A):活化灭活凋亡机制的丝氨酸苏氨酸激酶。过表达引起细胞系多样性的生长抑制。 
没食子儿茶素没食子酸酯(GCG):绿茶中发现的抗氧化剂多酚类的一个成员。 
Gnetin H:具有抗氧化剂性质并且可模拟白藜芦醇作用的来自芍药种子的1,2-二苯乙烯(反式乙烷双键在双键的两个碳原子上被苯基取代的烃)白藜芦醇衍生物。 
高尔基体:参与对细胞产生和/或运送通过细胞的蛋白质和脂质的加工和包装的细胞器。 
Hayflick极限:在端粒酶缩短到临界长度和细胞开始老化前细胞可以进行有丝分裂的次数。每次有丝分裂都缩短端粒的长度并且将“衰老”的细胞推向老化。该极限被认为是身体可通过其控制癌细胞生长的机制;因为细胞进行有丝分裂的次数越多,有问题的突变或转录错误出现的几率越大。 
健康的长寿:使完整生物体(以及器官、组织和个体细胞)处于最佳遗传和功能健康状态的概念。尽管不限于这些方面,这意味着例如DNA没有受到显著的损伤或突变,并且处于与自然健康的婴儿或胎儿中出现的构型相当的状态。在其他实施方案中,DNA可通过例如修复或基因工程被改变成与所述状态相同或者更好。类似地,在一些实施方案中,线粒体数目和/或功能以及/或者呼吸效率类似地是最佳的或超最佳的。代谢通路和免疫功能也可以同样地被优化,而存在的环境损伤可被修复。固有的慢性衰老和/或来自正常细胞过程的氧化应激(如线粒体内自由基损伤)也被减轻、逆转、修复或恢复到年轻时的最佳功能状态或非常接近该状态。未被修复的不健康细胞甚至包括癌细胞,可通过凋亡而清除,或者这些细胞的死亡已被调节为加速进行。基因表达模式和通路被显著地以这样的方式重新调节、重置或重新给予信号,即以使所述细胞的功能和健康最佳并扩展由这些细胞构成的组织、器官和生物体。这些过程的至少一个或可能多个的一个最终结果是细胞达到最长寿命并且/或者 在它们的生命过程中功能最优或者功能的效率或效力最大。理解了这样的过程在衰老、疾病、饮食、伤害、环境暴露、药物或医学疗法副作用等产生了重大损失后可能才会发生,就可以理解即使部分达到一个或多个这些目标也能增加寿命长度或使得剩余寿命时间更加健康。因此,调节细胞功能以实现一个或多个这些目标是产生被称作健康长寿的状态的方法。在一些实例中,调节细胞活性以实现该目标可能涉及进行调节以提早杀死细胞并且以一种方式削弱细胞健康至细胞死亡的程度,目的是除去不健康的细胞,所述不健康的细胞可能会危害组织、器官或生物体,甚至会刺激不健康的或次优健康细胞的产生或者通过健康细胞的细胞分裂、新细胞的生物发生或细胞替换以新细胞代替不健康的或次优健康细胞,所述细胞替换是通过干细胞或自体移植物或同种异体移植物或其他类型的移植细胞(包括用于移植的经基因工程改造细胞)进行。在移植之前或之后用本发明的方法处理这类细胞也被认为是在这些“新”细胞中产生健康长寿的方法。 
高通量基因组学:使用阵列、微阵列或其他基因组技术以快速鉴定大量的基因或蛋白质,或者从正常或异常细胞或组织或从具有已知或未知表型和/或基因型的受试者的细胞和组织中分辨它们的结构、表达或功能的基因组或基因数据或分析技术的应用。 
组蛋白:在类似“线上的珠子”的真核染色体中与DNA结合的富含赖氨酸和精氨酸的碱性蛋白质。这些蛋白质可形成支架,DNA围绕其上形成染色质结构。 
HPGD(羟基前列腺素脱氢酶):参与多种细胞过程,特别是炎症。作为NAD依赖性脱氢酶,HPGD是主要的前列腺素降解酶。 
HSPA1A(热激蛋白70-KD蛋白1A):参与多种功能的高度保守遍在蛋白质。HSPA1A被认为是增殖性的,对于癌细胞当表达时参与凋亡和急性应激调节。 
HSPA1B(热激蛋白70-KD蛋白1B):对热、氧化损伤、自由基和有毒金属离子反应表达的“应激”蛋白质。结构和功能与其他热激蛋白(由于应激其可诱导性不同)相当,并且参与对损伤/应激的细胞反应。 
HSPA1L(热激蛋白70-KD蛋白1L):对热、氧化损伤、自由基和有毒金属离子反应表达的“应激”蛋白质。结构和功能与其他热激蛋白 (由于应激其可诱导性不同)相当,并且参与对损伤/应激的细胞反应。 
人细胞:获自物种人(Homo sapiens)的成员的细胞。所述细胞可获自任何来源——例如外周血、尿液、唾液、组织活检物、皮肤刮擦物、手术样本、羊膜穿刺样本和尸体解剖材料。从这些细胞可以分离生物组分,例如基因组或线粒体DNA、mRNA(用其可制备cDNA)、RNA和/或蛋白质。 
杂交:相互互补的核酸分子在互补核苷酸单元之间通过氢键——包括Watson-Crick、Hoogsteen或反转的Hoogsteen氢键——杂交。例如,腺嘌呤和胸腺嘧啶是互补碱基,它们可通过形成氢键配对。“互补”是指两个核酸单元之间的序列互补性。例如,如果寡核苷酸某一位置的核苷酸单元能够与DNA或RAN分子同一位置的核苷酸单元通过氢键键合,那么所述寡核苷酸在该位置相互互补。当所述寡核苷酸和所述DNA或RAN的每个分子中有足够数量的相应位置被可相互氢键合的核苷酸单元占据时,则它们是相互互补的。 
“可特异杂交”和“互补”是表示有足够程度的互补性使得所述寡核苷酸和所述DNA或RNA或PNA靶之间出现稳定且特异结合的术语。寡核苷酸不必与其靶核酸序列100%互补才是可特异杂交的。当寡核苷酸结合所述靶DNA或RNA分子会干扰所述靶DNA或RAN的正常功能,并且有足够的互补程度来避免所述寡核苷酸与非靶序列在特异结合所需的条件下(例如在体内测定情况中的生理条件下,或在所述测定进行的条件下)的非特异结合时,所述寡核苷酸就是可特异杂交的。 
导致具体严格性程度的杂交条件将依赖所选的杂交方法的性质和所使用杂交DNA的组成和长度而变化。一般而言,杂交的温度和杂交缓冲液的离子强度(特别是Na+浓度)将决定杂交的严格性。关于达到具体严格程度所需的杂交条件的计算由Sambrook等在Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989),第9和11章中讨论,所述文献以引用方式纳入本文。 
艾地苯醌(6-(10-羟基癸基)-2,3-二甲氧基-5-甲基-1,4-苯醌):参考德国专利文件DE3049039、欧洲专利788793和美国专利4436753、5059627、5916925、专利申请20050152857和WIPO 9907355,描述了口服、肠胃外给药或经皮给药艾地苯醌或衍生物用于治疗痴呆、神经生长因子的循 环系统疾病诱导和对抗晒伤细胞形成。用于分离和表征艾地苯醌的方法是本领域已知的;此外,该化合物是广泛市售的。艾地苯醌(idebenone)是自然界不存在的合成分子,并且可模拟泛醌和泛醇的结构和功能,对于氧化环氧电位和自由基猝灭能力具有相似的结果。 
还表明艾地苯醌可通过化学发光阻断24小时后出现的生育酚氧化产物的前氧化(pro-oxiditive)效应。在对由脂质氧化(由例如UV照射或自由基损伤)产生的脂质氢过氧化物的测量中,艾地苯醌被表明最大还原了所述测试抗氧化剂的产物(美国专利No.6,756,045)。 
艾地苯醌(化学)衍生物:艾地苯醌的衍生物也适用于本文描述的方法,包括维持端粒长度和延长细胞寿命长度。这样的衍生物可包括艾地苯醌的盐和/或酯,蛋白质结合形式或其他衍生物。艾地苯醌衍生物的实例包括艾地苯醌的酯,其中艾地苯醌被用糖胺聚糖类(GAGS)和/或它们的盐——例如具有如间-α-胰蛋白酶抑制剂的透明质酸酶抑制剂的分子量为1至1000000的HA(透明质酸)及其盐——酯化。亲水艾地苯醌的实例有艾地苯醌磺酸。 
IDH2(异柠檬酸盐脱氢酶2):在线粒体氧化还原平衡中负责起重要作用并且通过向NADPH依赖性抗氧化酶提供NADPH减轻由氧化应激引起的损伤的NADP依赖性异柠檬酸盐脱氢酶。 
IFI44(干扰素诱导蛋白44):由可能在对病毒诱导响应中产生的干扰素α和β而非γ诱导的干扰素诱导的应答元件。 
体外扩增:在样本或样品中增加核酸分子拷贝数的技术。体外增殖的一个实例是聚合酶链式反应,其中将从受试者收集的生物样本与寡核苷酸引物对接触,所述接触在能使所述引物和样本中的核酸模板杂交的条件下进行。所述引物在合适的条件下延伸,与模板分离,然后再退火、延伸并且分离以扩增所述核酸的拷贝数。 
体外扩增的产物可使用常规技术通过电泳、限制性内切酶切割模式、寡核苷酸杂交或连接和/或核酸测序来表征。 
体外扩增技术的其他实例包括链置换扩增(参见,美国专利No.5,744,311);无转录等温扩增(参见美国专利No.6,033,881);修复链式反应扩增(参见WO 90/01069);连接酶链式反应扩增(参见EP-A-320308);填隙连接酶链式反应扩增(gap filling ligase chain reaction  amplification,参见美国专利No.5,427,930);连接酶检测和PCR偶联(参见美国专利No.6,027,889);和NASBATM RNA无转录扩增(参见美国专利No.6,025,134)。 
分离的:“分离的”生物组分(如核酸分子、蛋白质或细胞器)已被从所述组分天然存在的生物体的细胞中其他生物组分(即,其他染色体和染色体外DNA和RNA、蛋白质和细胞器)中基本分离或纯化出来。已被“分离的”核酸和蛋白质包括由常规纯化方法纯化的核酸和蛋白质。所述术语还包括在宿主细胞中通过重组表达制备的核酸以及化学合成的核酸。 
角质形成细胞:组成95%的表皮并且是结构蛋白角蛋白的生产细胞的细胞类型。 
KL(Klotho):KL表达下降被认为是很多退化过程——包括动脉硬化、骨质疏松、皮肤萎缩和全身性衰老(general aging)——的诱发因素。KL通过转化成纤维细胞生长因子/FGFR家族成员并且介导经上皮钙转运和代谢发挥功能。对细胞钙水平的该效应可能与凋亡和膜电位有联系。 
KU70(甲状腺自身抗原,70kD;G22P1):细胞周期依赖性(在分裂间期与染色体结合,在前期解离)dsDNA结合复合体的一部分,被认为在DNA修复或转座中起作用。 
标签:与可通过光谱学、光化学、生物化学、免疫化学、电学、光学或化学方法检测的与分析物、分析物、检测试剂、类似物或结合配偶物结合的任何分子或组合物。标签的非限制性实例包括酶、胶体金颗粒、有色乳胶颗粒、放射性同位素、酶底物、辅因子、配体、化学发光或荧光试剂、半抗原、蛋白质吸附的银颗粒、蛋白质吸附的铁颗粒、蛋白质吸附的铜颗粒、蛋白质吸附的硒颗粒、蛋白质吸附的硫颗粒、蛋白质吸附的碲颗粒、蛋白质吸附的碳颗粒和蛋白质连接的染料sacs。标记方法和选择适合于各种目的的标签的原则在例如Sambrook et al,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,CSHL,New York,1989和Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publ.Assoc,and Wiley-Intersciences,1998中讨论。化合物(例如抗体)与标签连接可通过共价键、吸附过程、疏水键和/或如在螯合物等中的静电键或这些键和 相互作用的结合,并且/或者可能涉及连接基团。 
适合于与抗体——包括用于高通量筛选系统的抗体——缀合的可检测标签的具体实例包括放射性标签和使用各种化学连接基团或双官能肽连接物连接至所述抗体的其他可检测分子。末端羟基可用无机酸——例如32P磷酸盐,或14C有机酸酯化,或者其他酯化以提供至所述标签的连接基团。作为可检测标签的有关酶主要是水解酶,特别是酯酶和糖苷酶,或者是氧化还原酶,特别是过氧化物酶。荧光化合物包括荧光素及其衍生物、罗丹明及其衍生物、丹磺酰和伞形酮等。化学发光物包括萤光素和2,3-二氢酞嗪二酮(dihydrophthalazinedione)(例如,鲁米诺)等。 
朗格汉斯细胞:在皮肤中负责捕获、摄入和加工抗原和外源颗粒的表皮和淋巴结中发现的(树状)细胞。 
寿命:细胞、组织和生物体保持存活的时长。该术语有两方面:潜在(固有)寿命定义为所述细胞或生物体仅基于遗传因素的不变寿命,观察寿命定义为当所有损伤(氧化应激、营养不良)刺激作为因素参与时所述细胞或生物体保持存活的时长。 
脂质体或脂质体的:由双分子磷脂膜包裹的水性区室或袋,经常是微观的;脂质囊泡。脂质体被开发用于运送化合物和组合物,例如细胞;当所述脂质体与另一膜(例如,细胞膜)接触时,所述两膜融合并将囊状的脂质体组分释放到所述细胞中。这可有效地运送包裹在所述脂质体中的水性成分,通过或进入所接触的膜结合区室(例如细胞)。制备脂质体的方法是本领域技术人员熟知的。参见,例如,Betageri et al.,Liposome Drug Delivery Systems,Technomic Publishing Co.,Inc.,Lancaster,PA(1993)。 
LMNA(核纤层蛋白A/C):用于编码可确定细胞核大小和形状的蛋白质网络的结构组分的基因。被认为参与哈-格早老综合症的中间丝。 
黑素细胞:为皮肤、头发和眼睛提供颜色的色素生产细胞。它最常见于皮肤表皮底层和眼睛中间层。 
MDH1(可溶性苹果酸脱氢酶1):催化柠檬酸循环中的可逆反应(L-苹果酸+NAD形成NADH+草酰乙酸)。MDH1位于与IDH相同的染色体上。 
MDH2(线粒体苹果酸脱氢酶):线粒体结合脱氢酶。MDH2可催化 柠檬酸循环中的可逆反应(L-苹果酸+NAD形成NADH+草酰乙酸)。 
ME1(苹果酸酶1):联系柠檬酸循环和糖酵解通路的NADP+依赖性酶,催化苹果酸可逆氧化脱羧形成丙酮酸、CO2和NADPH。 
ME2(苹果酸酶2):由细胞核基因决定的线粒体酶,类似于ME1。 
ME3(苹果酸酶3)NADP+依赖性线粒体酶,使用NAD+或NADP+作为辅因子催化苹果酸氧化脱羧为丙酮酸。 
分生组织的:为未分化的或祖细胞样的特性,适用于细胞和组织。 
梅克尔细胞:脊椎动物表皮中发现的大的卵形细胞,与触感有关。 
线粒体(多个线粒体):小的膜包围细胞器,通过电子传递系统产生三磷酸腺苷来提供大部分的细胞化学能量。线粒体还参与细胞生长、细胞信号传递、细胞周期调节、凋亡和细胞分化。失去线粒体膜电位/功能和缺失mtDAN还被认为是细胞衰老的关键事件。 
线粒体生物发生:在细胞生命期过程中形成新线粒体的过程。 
线粒体损伤:线粒体组分——包括mtDNA、蛋白质(例如一种或多种OXPHOS蛋白质)或脂质——的物理变化,所述物理变化以这样的方式改变线粒体功能,即有损于细胞生理学、生长或准确复制。 
线粒体失调:线粒体功能改变引起的疾病,由线粒体组分(例如,线粒体蛋白质(例如一种或多种OXPHOS蛋白质)、mtDNA或脂质)的改变和组合改变引起,所述改变由遗传和/或环境因素——包括由正常细胞代谢过程引起的自身毒性——引起。“迟发性线粒体失调”或“迟发性疾病”是指如迟发性糖尿病(I型糖尿病)、亨廷顿氏病、帕金森病和阿尔茨海默病、ALS(肌萎缩性侧索硬化)和精神分裂症等这类疾病,其中所述受试者在早年没有所述疾病,但是在青春期或之后——有时迟至70或80岁——才出现所述疾病。 
MTND5(NADH脱氢酶亚基5):呼吸复合体的7个线粒体亚基之一。复合体I(亚基5是它的一部分)接受来自NADH的电子并将它们传递给泛醌并且使用释放的能量来驱动质子穿过线粒体内膜。 
MTHD1(亚甲基四氢叶酸脱氢酶1):在真核细胞中编码三官能蛋白质,所述蛋白质参与将1-碳衍生物转化为甲硫氨酸和嘌呤合成的底物。 
MTHFD1L(亚甲基四氢叶酸脱氢酶,NADP+依赖性1样):定位于线粒体并且参与那里的THF(四氢叶酸)合成。参与嘌呤和胸苷酸的合 成;支持细胞甲基化反应。 
MTHFR(5-10,亚甲基四氢叶酸还原酶):催化用于重甲基化甲硫氨酸的底物形成。 
NADK(NAD激酶):催化NADP形成,NADP被还原以作为多种生物化学反应的电子供体起作用。 
NADSYN1(NAD合成酶1):在NAD形成中负责最后一个步骤,氧化还原反应中的辅酶,转录后修饰的底物,普通细胞信号传递机制。 
NDUFA2、3、4、4L2、5、6、7、9、10和12(NADH-泛醌氧化还原酶1α,亚复合体2、3、4、4L2、5、6、7、9、10和12):编码在呼吸链中组成第一且最大复合体(复合体I)的各种亚复合体的基因。复合体I负责NADH氧化、泛醌还原和从线粒体中弹出质子。 
NDUFB2、3、5、6、7、8和9(NADH-泛醌氧化还原酶1β、亚复合体2、3、5、6、7、8和9):编码在呼吸链中第一且最大复合体(复合体I)的亲水区域中的各种亚复合体的基因。复合体I负责NADH氧化、泛醌还原和从线粒体中弹出质子。 
NDUFC2(NADH-泛醌氧化还原酶1亚基c2):编码在呼吸链中第一且最大复合体(复合体I)的亚基C2编码的基因。复合体I负责NADH氧化、泛醌还原和从线粒体中弹出质子。 
NDUFS2、4、5、7和8(NADH-泛醌氧化还原酶Fe-S蛋白2、4、5、7和8):编码在呼吸链中第一且最大复合体(复合体I)的铁硫蛋白(IP)部分的基因。复合体I负责NADH氧化、泛醌还原和从线粒体中弹出质子。 
NDUF V2和3(NADH-泛醌氧化还原酶黄素蛋白2和3):编码在呼吸链中第一且最大复合体(复合体I)的24kD部分的基因。复合体I负责NADH氧化、泛醌还原和从线粒体中弹出质子。 
NFKB1(核因子κB;亚基1):编码在参与炎症过程并负责诱导许多炎性蛋白质的蛋白质的基因。抑制NFKB1已表明会导致细胞生长延迟、凋亡和不适当的免疫细胞发育。 
NHP2L1(非组蛋白染色体蛋白质2,酿酒酵母,同系物样1):剪接体复合体的组分,为活化所述复合体所需。所述剪接体复合体参与从转录的RNA前体片段中除去内含子。 
NOX1、3、4和5(NADPH氧化酶1、3、4和5):与多种细胞类型的质膜结合,这些NADPH氧化酶通过以NADPH作为电子供体对氧进行1-电子还原协助过氧化物产生。 
NOXA1(NADPH氧化酶活化剂1):活化(与NOX更有效)产生活性氧物质(ROX)的多种NADPH氧化酶。 
NOXO1(NADPH氧化酶组织者1):负责将NOX活化剂靶向NOX并且将NOX移送至亚细胞区室。 
NRF1(核呼吸因子1):编码呼吸亚基和线粒体转录组分以及复制机制的转录因子,可使线粒体DNA转录。 
NRF2(核因子红细胞衍生样2样2):编码具有一些与FOS和JUN高度保守的区域的亮氨酸拉链转录因子家族的基因。调节SSAT基因的转录并且协助蛋白质相互作用。 
NQO1(NAD{P}H脱氢酶苯醌1):参与苯醌的解毒和对抗苯代谢物的2电子还原酶。 
核酸:单链或双链形式的脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸多聚物,除非另有限制,包括可以与天然存在的核苷酸类似的方式与核酸杂交的天然核苷酸的已知类似物。 
核酸阵列:核酸(如DNA或RNA)在基质上排布在指定的位置,如在cDNA阵列或寡核苷酸阵列中所见的。 
代表基因的核酸分子:适合于用作引物(例如用于体外扩增)、探针或其他指示分子并且提供相应基因信息的任意长度的任何核酸,例如DNA(内含子或外显子,或者内含子和外显子)、cDNA或RNA。 
核苷酸:形成RAN和DNA结构的磷酸、糖和碱基组(所述RNA或DNA由在所述组中涉及哪种糖——核糖或脱氧核糖——决定)。“核苷酸”包括但不限于包含与糖连接的碱基(如嘧啶、嘌呤或其合成类似物)或与氨基酸连接的碱基(如在肽核酸(PNA)中)的单体。核苷酸是多核苷酸中的一个单体。核苷酸序列是指多核苷酸中的碱基序列。 
寡核苷酸:线性单链多核苷酸序列,长度为2至约5000碱基,例如长至少6个核苷酸,例如至少10、12、15、18、20、25、50、100、200、1000或甚至5000个核苷酸的多核苷酸(如DNA或RNA)。寡核苷酸通常是合成的但也可以从天然存在的多核苷酸产生。 
寡核苷酸类似物是指与寡核苷酸功能类似、但具有非天然存在部分的部分。例如,寡核苷酸类似物可以含有非天然存在的部分,如改变的糖部分或间糖键,如硫代磷酸寡脱氧核苷酸。天然存在的多核苷酸的功能类似物可与RNA或DNA结合,包括PNA分子。这样的类似物分子还可与多肽或蛋白质结合或相互作用。 
氧化应激:细胞、组织或生物体中的不平衡,可导致以下能力减弱:减少(或解毒)生物活性化学中间体、修复由活性化学中间体造成的损伤,或者维持最常导致凋亡的细胞还原电势。 
PARP1(多ADP核糖聚合酶1):可以将改变的代谢条件以信号传递给染色质的染色质结合酶。NAD依赖性转录后ADP核糖基化在DNA修复(链断裂等)和细胞从DNA损伤恢复中起作用。PARP1活化是凋亡诱导因子从线粒体到核转运所需的(在PARP1依赖性细胞死亡中所需的)。PARP1可能在很多其他细胞类型和功能(纺锤细胞形成、神经元和基因靶向等)中起作用。 
PARP2(多ADP核糖聚合酶2):作为对DNA链断裂的早期细胞应答激活的ADP核糖基转移酶。该类型的酶通过ADP-核糖基化来修饰核蛋白质,所述ADP-核糖基化是DNA修复、凋亡调节以及维持基因组稳定性所需的。 
PGC-1α(过氧化物酶体增殖剂激活受体-γ,辅激活物1,α;PPARGC1A):核受体的转录辅激活物,可极大地增强PPAR γ、甲状腺激素受体的转录活性,活化呼吸链中关键酶的表达,增加线粒体DNA的细胞含量并且刺激线粒体生物发生。 
POLB(DNA聚合酶β):另一种DNA聚合酶,主要负责真核生物中DNA维持、复制、重组和药物抗性所需的碱基切除修复。 
POLD3(DNA指导的聚合酶δ3):DNA聚合酶δ复合体的一部分(与PCNA、POLD1、2和4一道)参与复制和修复。 
POLE(DNA聚合酶ε):真核细胞中负责DNA修复和染色体DNA复制的核聚合酶(4种中的1种)。 
POLG(DNA聚合酶γ):存在于核和线粒体中并在线粒体复制中起作用的酶。增强线粒体复制和转录的准确性的“校读”酶。 
POLI(DNA聚合酶ι):与到来的核苷酸和模板引物结合的晶质结 构的人DNA聚合酶。POLI通过直接越过DNA损伤加入脱氧核苷酸协助绕过DNA损伤。 
POLL(DNA聚合酶λ):人体中参与整个基因组复制和DNA修复过程(端粒介导的)的需多DNA聚合酶中的一种。 
多态性:同一基因群中的DNA序列差异。一般而言,一个基因由两种或多种可变形式(在核苷酸序列上有变化),所述可变形式可以是无害的或与疾病状态有关。这种与可能疾病状态的相关使得追踪和鉴定多态性成为一种可能用于确定所述疾病状态的原因性突变的方法。 
多酚(其中的一些可被称作源于茶的抗氧化剂):包含酯键的多酚,比如EGCG(表没食子儿茶素-3-没食子酸酯)、EGC(表没食子儿茶素)、ECG (表儿茶素-3-没食子酸酯)、EC(表儿茶素)、GCG(没食子儿茶素没食子酸酯)、GC(没食子儿茶素)、C(儿茶素)和/或CG(儿茶素没食子酸酯)可用于通过直接影响端粒长度维持单元和相关蛋白质的基因表达来延长活细胞寿命。该延长或维持端粒长度将增加复制能力和活细胞凋亡之前的时间,导致细胞“健康”和存活的持续时间延长。用于分离和鉴定多酚的方法是本领域熟知的;另外,多种纯化的多酚可市购。 
POT1(端粒保护1):编码广泛保守蛋白质(在真核生物中),所述蛋白质可结合富含G的端粒DNA链并保护染色体末端。 
PPARG(过氧化物酶体增殖剂活化蛋白γ):转录因子的核激素受体亚家族成员。PPAR可与类视黄醇受体家族成员形成异二聚体,这些结构可调节多种基因的转录/活化。具体地,PPARG被认为参与脂肪细胞分化、胰岛素原生物合成、胰岛素释放和炎性应答基因的活化。 
原花色素(低聚原花色素;OPC):在许多植物中最常见的类黄酮类型(植物次级代谢产物,包括儿茶素),最常见提取至酒中。它们还见于咖啡果中,可从中制取提取物,并且已表明能够吸收很多氧自由基。用于分离和鉴定原花色素的方法是本领域熟知的;此外,具体的原花色素化合物可市购。 
探针和引物:基于核酸分子(作为味觉感受器或可能的味觉感受器的指示物提供),可容易地制备核酸探针和引物。基于这些核酸分子的片段或部分来产生探针和引物也是合适的,特别是当为了区别单基因上的不同等位基因和单倍型时。对这些序列的相反互补物特异的探针和引物 以及对于5’和3’区域的探针和引物也是合适的。 
探针包含连接在可检测标签或其他受体分子上的分离核酸。常规的标签包括放射性同位素、酶底物、辅因子、配体、化学发光试剂和荧光试剂、半抗原和酶。用于标记方法和选择适于各种目的的标签的原则在例如Sambrook et al.,(In Molecular Cloning:A Laboratory Manual,CSHL,New York,1989)和Ausubel et al.(In Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York,1998)中讨论。 
引物是短核酸分子,例如长度为10个核苷酸或更长的DNA寡核苷酸。更长的DNA寡核苷酸可以是约15、20、25、30、或50个核苷酸或者更长。引物可以通过核酸杂交可与互补的靶DNA链退火以在所述引物和所述靶DNA链之间形成杂交体,然后所述引物被DNA聚合酶沿着所述靶DNA延伸。引物对可以用于扩增核酸序列,例如通过聚合酶链式反应(PCR)或本领域已知的其他体外核酸扩增方法。 
用于制备和使用核酸探针和引物的方法在例如Sambrook et al.(In Molecular Cloning:A Laboratory Manual,CSHL,New York,1989),Ausubel et al.(ed.)(In Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York,1998)和Innis et al.(PCR Protocols,A Guide to Methods and Applications,Academic Press,Inc.,San Diego,CA,1990)中描述。扩增引物对(例如,用于聚合酶链式反应扩增)可来自已知序列,例如本文描述任何苦味感受器序列及其特异性等位基因,例如通过使用为此目的的计算机程序——如PRIMER(Version 0.5, 
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1991,Whitehead Institute for Biomedical Research,Cambridge,MA)。 
本领域普通技术人员应理解,具体探针或引物的特异性随其长度增加而增加。因此,例如,含有苦味受体蛋白质编码核苷酸的30个连续核苷酸的引物与靶序列(例如指定的味觉受体蛋白的同源物)会以比仅有15个核苷酸的相应引物更高的特异性退火。因此,为了得到更高的特异性,可选择含有味觉受体基因的至少20、23、25、30、35、40、45、50个或更多的连续核苷酸的探针和引物。 
还提供了含有具体长度苦味受体-编码核苷酸序列的分离核酸分子。这样的分子可含有这些序列的至少10、15、20、23、25、30、35、40、45、50或更多(例如,至少100、150、200和300等)个连续核苷酸或 更多。这些分子可从公开序列(例如,基于序列长度具体核酸可被分为两半或四段,分离核酸分子可来自所述分子的第一半段或第二半段,或者所述四个四分之一段的任一段)的任何区域获得。cDNA或其他编码序列还可被分为更小区域,例如约8、16、20、50段等,具有类似的效果。 
举例来说,另一种分割方式是基于与其他苦味受体序列同源性相对较多或较少的序列的区域来分割苦味受体序列。 
可选择包含苦味受体核酸分子或其具体等位基因(如本文所描述的那些)的任何这些或其他部分的至少10、15、20、25、30、35、40、50、100、150、200、250、300个或更多个连续核苷酸的核酸分子。因此,代表性核酸分子可包含在数据表7或阵列2中列出的序列的至少10个连续核苷酸。 
原花青素:在植物特别是在茶和葡萄籽中出现的丹宁(可结合或收缩蛋白质的多酚化合物)化合物。原花青素通常与酒的苦味、涩味有关。所述化合物还有很高的抗氧化能力。用于分离和鉴定原花青素的方法是本领域已知的;此外,某些原花青素可市购。 
PTOP(ACD,鼠的同系物;ACD):负责将POT1定位至端粒的基因,可使端粒延长。PTOP可将POT1和TIN2与TRF1复合体结合。 
纯化的:术语纯化的并不要求绝对纯净;它只是意欲作为相对性术语。因此,例如,纯化的核酸制品是指其中具体蛋白质比所述核酸在其生成环境中(例如细胞内或在生物化学反应室中)更富集的制品。基本纯净的核酸制品可被纯化,使得所需的核酸占所述制品的全部核酸含量的至少50%。在一些实施方案中,基本纯化的核酸可占所述制品全部核酸含量的至少60%、至少70%、至少80%、至少85%至少90%或至少95%或更多。 
奎尼酸(1S,3R,4S,5R)-1,3,4,5-四羟基-环己烷羧酸:发现于19世纪,该晶质酸化合物通过水解绿原酸而合成,但天然存在于咖啡果中。该化合物被认为提供咖啡的“酸性”,除了具有其他咖啡果酸的抗氧化能力外,该化合物还是合成新合成化合物的多功能起始化合物。用于分离和鉴定奎尼酸的方法是本领域熟知的;此外,该化合物可市购。 
RAD50(酿酒酵母;同系物;RAD50):在酵母中,该基因通过末 端修复和染色体整合帮助修复双链DNA断裂(端粒维持的ALT通路)。在人体中它被认为具有非常相同的功能,因为它被发现可与以前描述的TRF2复合体关联。 
RAD51(酿酒酵母;同系物;RAD51):在原核细胞中,该基因编码负责促进双链DNA的同源部分的链交换的蛋白质(这也是端粒维持的ALT通路的一部分)。在真核细胞中,也认为功能是类似的,参与复制和链交换。 
RAP1(GTP酶活化蛋白1):编码p21蛋白家族的成员,其活性与GTP的结合和水解有关并且在细胞分化和生长中发挥功能。 
活性氧物质(ROS):很小的有机或无机高反应性离子或分子,在价电子层具有不成对电子,包括但不限于自由基、过氧化物和氧离子。 
再克隆:从先前克隆的(通过使用遗传重组和体外受精从单个“亲本”生物体的遗传物质形成遗传上相同的生物体)生物体的遗传物质制备遗传上相同的生物体的方法。 
白藜芦醇(3,5,4′-三羟基芪)属于被称为植物抗毒素的化合物家族。这些化合物由多种植物作为其应对应激、损伤、真菌侵入或UV损伤的天然防御机制的一部分合成,所述植物包括葡萄、蓼科杂草(knotweed)、蓝莓(blueberry)、某些松树和其他植物。在葡萄中,它们集中在葡萄皮中,在那里它们保护免受UV损伤并且发挥抗菌剂和抗病毒剂的功能。白藜芦醇可活化sirtuin,所述去sirtuin是在活生物体中产生至少部分摄热量限制的酶,所述摄热量限制在十分大范围的测试物种中被表明可延长这些生物体的寿命。 
活化sirtuin脱乙酰酶蛋白质家族成员可用于通过模拟摄热量限制产生寿命延长,这与通过在细胞中保护和修复端粒结构延长寿命不同。活化化合物可以是来自植物的多酚,例如查尔酮、芪、黄酮,或者来自植物或通过本文描述的其他合成方法形成的其他sirtuin调节化合物。用于分离和鉴定白藜芦醇的方法是本领域熟知的;此外,该化合物可市购。 
核糖体:参与转录或遗传密码从核酸表达为蛋白质的蛋白和RAN结构。 
序列同一性:两个核酸序列或两个氨基酸序列之间的相似性表示为序列相似性,或者被称作序列同一性。序列同一性一般以百分比同一性 (或相似性或同源性)来测量;所述百分比越高,所述两个序列越相似。当用标准方法对比时,核酸或蛋白质序列的同系物或直系同源物会具有相对较高程度的序列同一性。与亲缘关系较远的物种(例如人和秀丽隐杆线虫的序列)相比,当所述直系同源蛋白质或核酸源自亲缘关系更近的物种(例如人和黑猩猩的序列)时该同源性更显著。一般地,当比较人的直系同源序列时,直系同源物在核苷酸水平上具有至少50%的同一性并且在氨基酸水平上具有至少50%的同一性。 
用于比较的序列比对方法是已知的。多种程序和比对算法记载于:Smith & Waterman,Adv.Appl.Math.2:482,1981;Needleman & Wunsch,J.Mol.Biol.48:443,1970;Pearson & Lipman,Proc.Natl.Acad.Sci.USA85:2444,1988;Higgins & Sharp,Gene,73:237-44,1988;Higgins & Sharp,CABIOS 5:151-3,1989;Corpet et al.,Nuc.Acids Res.16:10881-90,1988;Huang et al.Computer Appls.Biosci.8,155-65,1992;和Pearson et al.,Meth.Mol.Bio.24:307-31,1994。Altschul et al.,J.Mol.Biol.215:403-10,1990给出了序列对比方法和同源性计算的详细见解。 
NCBI Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)(Altschul et al.,J.Mol Biol.215:403-10,1990)可从多种来源得到,包括National Center for Biotechnology Information(NCBI,Bethesda,MD)以及在互联网上,可与序列分析程序blastp、blastn、blastx、tblastn和tblastx结合使用。每个这样的来源还提供对如何使用该程序确定序列同一性的描述。 
同源序列的特征通常在于使用空位blastp设定为默认参数的NCBI Blast 2.0以全长比对计算与序列具有至少60%、70%、75%、80%、90%、95%或至少98%序列同一性。将以blastn程序搜索的查询序列用DUST(Hancock and Armstrong,Comput.Appl Biosci.10:67-70,1994)过滤。应理解,提供这些序列同一性范围仅是为了指导性目的;完全可以得到落在所提供的范围之外的具有极显著的同系物。 
但是,由于遗传密码的简并性,未显示出高度同一性的核酸序列也可以编码相似的氨基酸序列。应理解,可使用该简并性进行核酸序列改变以产生编码基本相同蛋白质的多个核酸序列。 
两个核酸分子密切相关另外指示,所述两个分子在严格条件下相互杂交(如在“特异性杂交”中所描述的)。 
SHC1(SHC转化蛋白1):通过将生长因子受体与所述RAS通路的成员偶联,可调节有丝分裂信号转导。由SHC1编码的蛋白质在很多信号传递通路中——特别是将活性氧损伤转变为细胞死亡中——作为衔接子(adaptor)起作用。 
小干扰RAN(siRNA):提供了可以在无脊椎动物和脊椎动物中物种中诱导基因特异性表达抑制的合成的或天然产生的小双链RNA(dsRNA)。这些RNA适合用于干扰或抑制靶基因表达,并且包含具有约15至约40个核苷酸(例如,20-25个核苷酸)的双链RNA,经常在每条链上含有长0至约5个核苷酸的3’和/或5’突出端,其中所述双链RNA的序列与需要干扰和抑制其表达的所述靶基因的一部分编码区域基本相同。所述双链RNA可形成自互补ssRNA、形成发夹的单链RNA或者DNA载体的表达。这些分子在RNA沉默中起作用,所述RNA沉默是一种通过以下方式降低/消除序列特异基因表达的方法,即将所述siRNA纳入RNA诱导的沉默复合体,促进所述靶mRNA的降解。 
特异性杂交:特异性杂交是指分子只与或基本只与特定核苷酸序列——当所述序列存在于复杂混合物(例如,总细胞DNA或RNA)中时——结合、成双链体或杂交。特异性杂交还可出现在不同严格条件下。 
导致具体严格程度的杂交条件会随所选杂交方法和组合物的性质以及所使用杂交DNA的长度而变化。一般而言,杂交温度和杂交缓冲液离子强度(特别是Na+浓度)将决定杂家的严格性。关于达到具体严格性程度所需杂交条件的计算由Sambrook等(In:Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,New York,1989 ch.9 and 11)讨论。仅举例说明,杂交实验可通过将DNA分子与靶DNA分子杂交来进行,所述靶DNA分子已经在琼脂糖凝胶上电泳并且通过DNA印迹(Southern,J.Mol.Biol.98:503,1975)——一种本领域熟知的技术,记载于Sambrook et al.(Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,New York,1989)中——转移至硝酸纤维素膜上。 
以[32P]-dCTP标记的靶核酸分子的常规杂交一般在下文描述的例如6×SSC的高离子强度的溶液中,在比解链温度Tm低20-25℃的温度下进行。对于DNA印迹上靶DNA分子含有10ng或更多的DNA的DNA杂交实验,一般使用1-2ng/ml放射性标记探针(等于109CPM/μg或更大 的特异性活性)进行杂交6-8小时。在杂交后,将硝酸纤维素滤膜冲洗,以除去背景杂交。冲洗条件应该尽量严格以除去背景杂交但是需要保持特异杂交信号。 
术语Tm代表在平衡时与所述靶序列互补的50%探针与所述靶序列杂交的温度(在规定的离子强度、pH和核酸浓度下)。由于所述靶序列一般过量存在,在Tm下50%的探针在平衡时被占据。这样的杂交分子的Tm可以从以下方程式中估计(Bolton and McCarthy,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 48:1390,1962): 
Tm=81.5℃-16.6(10g10[Na+])+0.41(%G+C)-0.63(%甲酰胺)-(600/1) 
其中l=以碱基对计的杂交物的长度。 
该方程式对区间0.01M至0.4M的Na+浓度是有效的,它对于高[Na+]的溶液的Tm计算不太准确。所述方程对G+C含量为区间30%至75%的DNA基本上是有效的,并且它可用于长度大于100个核苷酸的杂交(寡核苷酸探针的性能在Sambrook et al.Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,New York,1989的第11章详细描述)。 
因此,举例来说,对于来自cDNA(假定具有45%的GC)的150个碱基对的DNA探针,对给出具体严格性所需杂交条件的计算可以如下进行:对于该实例,假设在杂交后将所述滤膜在0.3×SSC溶液中洗涤,则:[Na+]=0.045M;%GC=45%;甲酰胺浓度=0;l=150碱基对;Tm=81.5-16.6(1og10[Na+])+(0.41×45)-(600/150);因此Tm=74.4℃。 
双链DNA的Tm随同一性每降低1%降低1-1.5℃(Bonner et al.,J.Mol.Biol.81:123,1973)。因此,对于该给定实例,在59.4-64.4℃下在0.3×SSC中洗涤所述滤膜将得到相当于90%的杂交严格度;也就是说,相对于所述靶cDNA具有超过10%序列变化的DNA分子将不会杂交。或者,在65.4-68.4℃下在0.3×SSC中洗涤所述杂交滤膜将产生94%的杂交严格度;也就是说,相对于所述靶cDNA具有超过6%序列变化的DNA分子将不会杂交。以上的实例完全以理论说明的方式给出。应理解,可使用其他杂交技术,并且实验条件的差异将使得需要改变严格度计算。 
严格条件可定义为具有超过25%、15%、10%、6%或2%序列变化(也被称作“错配”)的DNA分子在其下将不杂交的条件。严格条件是 序列依赖的,并且在不同情况下是不同的。较长的序列在较高温度下可特异杂交。一般而言,严格条件被选择为比具体序列在规定离子强度和pH下的热熔点Tm低约5℃。严格条件的实例是在pH为7.0至8.3下至少约0.01至1.0M Na离子浓度(或其他盐)的盐浓度,,以及对于短探针(例如10至50个核苷酸)至少约30℃的温度。严格条件还可以通过加入例如甲酰胺的去稳定剂来实现。例如,5×SSPE(750mM NaCl、50mM磷酸钠、5mM EDTA,pH 7.4)和25-30℃的温度的条件适合于等位基因特异性探针杂交。 
完全匹配的探针具有与具体靶序列完全互补的序列。该测试探针一般与所述靶序列的一部分(子序列)完全互补。术语“错配探针”是指其序列被特意选择以不与具体靶序列完全互补的探针。 
可以绝对或相对地定量转录水平。绝对定量可通过以下方式完成:纳入一种或多种已知浓度的靶核酸(例如对照核酸或具有已知量的所述靶核酸本身)并将未知的杂交强度与已知靶核酸参照(例如通过生成标准曲线)。 
固体支持物(或基底):不可溶或者通过后续反应使之不可溶的任何材料。本领域技术人员知道多种不同的固体支持物,所述固体支持物包括但不限于醋酸纤维素、反应板的孔壁、试管、聚苯乙烯珠、磁珠、膜、微粒(如乳胶颗粒)和羊(或其他动物)血红细胞。具有足够孔隙度以使得检测试剂可进入并且具有合适的表面亲和性以固定捕获试(例如单克隆抗体)的任何合适有孔材料都被该术语考虑。例如,硝酸纤维素的孔结构对广泛的多种试剂例如捕获试具有极好的吸收性质和吸附性质。尼龙具有相似的特性,因此也是适合的。微孔结构是可用的,在水合状态下具有凝胶结构的材料也是可用的。 
有用的固体支持物的其他实例包括:天然聚合碳水化合物及合成的其修饰、交联或取代衍生物,例如琼脂、琼脂糖、交联藻酸、取代和交联的瓜尔胶、纤维素酯(特别是带有硝酸和羧酸)、混合纤维素酯和纤维素醚;含有氮的天然聚合物,例如蛋白质和衍生物,包括交联的或改性的明胶;天然碳氢聚合物,如乳胶和橡胶;可制备为具有合适孔结构的合成聚合物,如烯类聚合物,包括聚乙烯、聚丙烯、聚苯乙烯、聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯及其部分水解的衍生物、聚丙烯酰胺、聚甲基丙烯酰 胺、上述缩聚物的共聚物和三元聚合物(如聚酯、聚酰胺)和其他聚合物,如聚氨基甲酸酯或聚环氧化物;多孔无机材料,如碱土金属和镁的硫酸盐或碳酸盐,包括硫酸钡、硫酸钙、碳酸钙、碱金属和碱土金属、铝和镁的硅酸盐;以及铝或硅的氧化物或氢氧化物,如粘土、氧化铝、滑石、高岭土、沸时、硅胶或玻璃(这些材料可与上述聚合材料一起用作滤膜);以及上述种类的混合物或共聚物,例如通过在已存在的天然聚合物上起始合成聚合物的聚合得到的接枝共聚物。 
上文描述的多孔固体支持物,如硝酸纤维素,被考虑优选是薄片或长条的形式。这样的薄片或长条的厚度可在很大限值内变化,例如约0.01至0.5mm、约0.02至0.45mm、约0.05至0.3mm、约0.075至0.25mm、约0.1至0.2mm或者约0.11至0.15mm。这样的薄片或长条的孔径可类似地在很大限值内变化,例如约0.025至15微米,或特别是约0.1至3微米;然而,孔径并不意欲是选择固体支持物的限制因素。固体支持物的流速,如果合适也可以在很大限值内变动,例如约12.5至90sec/cm(即50至300sec/4cm)、约22.5至62.5sec/cm(即90至250sec/4cm)、约25至62.5sec/cm(即100至250sec/4cm)、约37.5至62.5sec/cm(即150至250sec/4cm)或约50至62.5sec/cm(即200至250sec/4cm)。在本文描述的装置的具体实施方案中,所述流速为约62.5sec/cm(即250sec/4cm)。在本文描述的装置的其他具体实施方案中,所述流速是约37.5sec/cm(即150sec/4cm)。 
固体支持物的表面可通过引起试剂(例如捕获试剂)与所述支持物共价交联的化学方法来活化。然而,其他任何合适的方法都可用于将试剂(例如捕获试剂)固定至固体支持物,所述方法包括但不局限于离子相互作用、疏水相互作用和共价相互作用等。致使试剂固定在固相上的具体力对于本文描述的方法和装置并不重要。 
可因其吸附和固定试剂,如捕获试剂,的固有能力来选择固相。或者,所述固相可具有能够吸附和固定试剂——如捕获试剂——的能力的因子。所述因子可包括荷电物质,所述带电物质荷有与例如所述捕获试剂相反的电荷或者与所述捕获试剂缀合的荷电物质相反的电荷。在另一个实施方案中,一种具体结合成员可被固定在所述固相表面以固定其结合配偶物(例如捕获试剂)。因此,在该实例中,所述具体结合成员使得 所述捕获试剂能够与固相材料直接结合。 
除非物理上限制,固体支持物可以任意合适形状使用,例如膜、薄片、长条或板,或者它可被涂覆或结合或层压在合适的惰性载体上,如纸、玻璃、塑料膜或织物。 
受应激的细胞:被外部试剂通过化学、生物或机械干扰使得不能以其预期的能力完全发挥功能的细胞,所述外部试剂包括但不限于:自由基、ROS、毒素、UV照射和基因抑制剂如siRNA。 
牡丹醇(Suffruticosol)A和B:芪(具有反式乙烷双键并且所述双键的两个碳原子上有苯基取代的烃),来自芍药种子的具有抗氧化剂特性和模拟白藜芦醇作用的白藜芦醇衍生物。 
茶:植物材料的水性提取物,通常受温度调节(热或冷);所述提取物一般是叶(一般地,但不限于茶(Camellia sinensis)的干叶和/或发酵叶的绿茶或红茶;包括白茶),但是茶也可以制备自其他植物材料,包括树皮、花、种子和种皮等。EGCG——茶提取物(以及所有含有酯键的多酚)的主要成分——能够显示出被认为是通过蛋白体抑制机制对某些类型的癌症细胞有显著抑制效应,而不含有酯键的多酚显示出该效应降低或不显示该效应。在通过端粒长度维持机制延长寿命的情况下,没有这样的区别,认为所有形式的多酚都有效应。 
端粒酶:负责对被称为端粒的染色体末端的具体染色体结构进行损伤修复的酶(DNA聚合酶)。端粒酶向存在于真核生物染色体末端的端粒DNA链的3’末端添加具体DNA重复序列(所有的脊椎动物中都是TTAGGG)。端粒酶作为逆转录酶发挥功能,并且与RNA分子相连,所述RNA分子作为延长在复制后缩短的端粒的模板发挥作用。 
端粒单元:端粒(由染色质组成的大部分真核染色体的末端的重复序列)和所有相关蛋白质、酶和基因序列,包括但不限于TERT、TRF1、TERF2、TERF21P、DNA聚合酶、POLG、POLB、POLD3、POLE、POLI、POLL、PARP1、PARP2、PPARG、SHC1、HSPA1A、HSPA1B和HSPA1L。 
TERC(端粒酶RNA组分):被称作端粒酶RNA组分的人基因,作用是充当端粒重复的模板。 
TERF2(端粒重复序列结合因子2):在端粒的保护活性中起至关重 要的作用。TERF2可将端粒转变为大的双链环(被称作t环),所述双连环可为端粒的保护和复制提供一般性机制。 
TERF2IP(TERF2相互作用蛋白):遍在表达的蛋白质,由TERF2招募至端粒以调节端粒长度。该蛋白质参与RNA聚合酶II的活化并且是快速生长事件过程中的细胞功能和效率的核心。 
TFAM(转录因子A;线粒体的):通过结合存在于轻和重启动子中的核苷酸来活化线粒体转录。还通过形成RNA引物在线粒体复制过程中起启动子作用。 
TIN2(TRF1相互作用核因子2):人的端粒长度部分受控于以下反馈机制:其中通过端粒酶的端粒延长受限于所述TRF1复合体在染色体末端的积累。TRF1本身可被其相互作用配偶物端锚聚合酶-1的PARP活性抑制,所述端锚聚合酶-1可消除结合能力并且将TRF1复合体从端粒上移除。TIN2是端锚聚合酶1和TRF1复合体的中介体。用小干扰RNA短暂抑制TIN2可致使端粒TRF1信号减少。这些以及其他数据表明了TIN2是TRF1复合体中的PARP中介体并且解释了TIN2如何进行端粒长度的调节。 
转录:DNA通过其指导RNA合成的过程,其中DNA作为形成RNA核苷酸序列的核苷酸序列模板。 
TPP1(三肽基肽酶1):催化从多肽链上除去氨基酸的溶酶体蛋白质,具体而言,它从蛋白质的N末端连续除去三钛。 
TRF1(端粒重复结合因子1):通过结合至TTAGGG位点和端锚聚合酶、TIN2和PINX1来调节端粒长度。所述TRF1复合体与POT1(端粒保护物-1;单链端粒结合蛋白)相互作用,所述POT1可控制端粒酶介导的端粒延长。 
泛醌(也被称作辅酶Q10):电子传递/细胞呼吸/能量产生机制的关键组分,泛醌见于大部分真核细胞并且在有高能量需求的细胞(心脏、肝脏等)中大量存在。通过有氧细胞呼吸过程产生供细胞使用的ATP(人体全部能量的95%是以该方式产生的)。泛醌与电子传递有关并且与线粒体细胞呼吸密切相关,具体而言,它在复合体II和III之间作为传递剂。由于泛醌是氧还(氧化还原)剂,它呈现自由基猝灭能力。所述化合物的完全氧化形式为称作泛醌,当被吸收进入身体时其90%转变为“活 性”抗氧化剂形式的泛醇。分离和表征泛醌的方法是本领域熟知的;此外,该化合物可市购。 
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UVA1:三条太阳紫外线“带”(UVA、UVB和UVC)之一有较高能量和较长波长范围340nm-400nm的亚波长区间。UVA2:波长范围为320nm-340nm的太阳辐射。UVB:波长范围为280nm-315nm之间的太阳辐射,能够造成细胞DNA的直接损伤。UVC:通常经大气层过滤的短的最高能量波长的辐射(100nm-280nm)。 
葡萄抗毒素(viniferin):一种芪(具有反式乙烷双键并且所述双键的两个碳原子上有苯基取代的烃),具有抗氧化剂性质并且模拟白藜芦醇的效应的来自芍药种子的白藜芦醇衍生物。 
除非另有说明,本文使用的技术和科学术语具有与本发明所属技术领域的技术人员常规理解相同的含义。除了上下文有明确相反指示,否则单数术语“一”、“一种”和“该”包含复述的指示物。类似地,除非上下文有明确相反指示,否则词“或”意欲包括“和”。因此,“包含A或B”是指包含A或B,或者包含A和B。还应理解,对核酸或多肽给出的所有碱基大小或氨基酸大小,以及所有分子量或分子质量数值是近似值,并且为描述而提供。虽然下文描述合适的方法和材料,但是与本文描述的方法和材料类似的方法和材料可用于实施和测试本发明。本文提及的所有出版物、专利申请、专利和其他参考文献都以引用的方式全文纳入本文。冲突之处以本说明书(包括对术语的解释)为准。此外,所述材料、方法和实例仅是为了举例说明而非进行限制。 
III.一些实施方案的概述 
在第一个实施方案中,本文提供了一种用于调节细胞、组织、器官或生物体的寿命的方法,所述方法包括使所述细胞、组织、器官或生物体与本文讨论的一种(或多种)化合物或组合物接触,所述化合物或组合物如艾地苯醌或其类似物或衍生物;可可提取物;咖啡果提取物;奎尼酸或其类似物或衍生物;阿魏酸或其类似物或衍生物;原花色素、花色素、原花青素或花青素;绿原酸或其类似物或衍生物;茶提取物;或白藜芦醇或其衍生的组合物或与白藜芦醇在化学上相关的组合物。举例来说,在一些实例中,所述咖啡果提取物包含绿原酸、奎尼酸、阿魏酸、咖啡酸或原花色素的一种或多种。在另一个实例中,茶提取物包含一种或多种多酚,所述多酚选自EGCG(表没食子儿茶素-3-没食子酸酯)、EGC(表没食子儿茶素)、ECG(表儿茶素-3-没食子酸酯)、EC(表儿茶素)、GCG(没食子儿茶素没食子酸酯)、GC(没食子儿茶素)、C(儿茶素)和CG(儿茶素没食子酸酯)。在另一个实施方案中,衍生自白藜芦醇或者与白藜芦醇在化学上相关的组合物选自葡萄抗毒素、gnetin H和suffruticosol B。在另一个实例中,所述可可提取物包含选自以下的多酚和/或原花青素:(+)儿茶素、(-)表儿茶素、原花青素低聚体2至18、原花青素B-5、原花青素B-2、原花青素A-2和/或原花青素C-1。 
在提供的多个实施方案中,调节寿命包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。例如,调节(在一些情况下)包括增加至少一个所列基因的活性水平。在其他情况下,提供了一种其中调节包括降低至少一种所列基因的活性水平的方法。 
还提供了一种用于调节细胞、组织、器官或生物体的寿命的方法,其中调节包括调节以下基因的水平和/或活性:作为阵列2的部分列出的10个或更多个基因;作为阵列1的部分列出的基因;VEGFA,HMOX1,CCL4L1,DDC,NOS2A,SIRT1,TERT,PTGS2或IFI44;TERT, TERC,NRF2,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,TNKS 2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL和KU70;BCL2,SOD1,TP53,和SOD2;BCL2,SOD1,TP53,SOD2,BCL2L1,TIMM22,TOMM40,IMMP1L,CDKN2A,GADPH,ACTB,HRP1,和HGDC;PARP1,PARP2,TERT,TEP1,TPS3,JUN,PARP3,PARP4,TERF2,TINF2,和CDKN2A;PARP1,PARP2,TERT,TEP1,和TP53;TERF2,POT1,TERT,和TPP1;PAPR1,PARP2,PARP3,和PARP4;PARP2,CYP19A1,TEP1,BCL2,HSPA1A,ACE,TP53,和NFKB1;IGF1,IGF2,PPARG,IL10,APOE,TERT,TNF,HLA-DRA,DDC,CCL4L1,NOS2A,和GH1;PARP1,IL6,SIRTT1,KRAS,和HSPA1L;IGF1,IL6,PPARG,IL10,TERT,TNF,TEP1,HSPA1A,SIRT1,TP53,GH1,NOS2A和PPC中的4个或多个;或者本文描述其他基因列表;或这些具体列表的两个或多个的组合。 
在一个实施方案中,调节寿命包括调节至少一种所述端粒长度维持基因的活性或水平,例如提高至少一种端粒长度维持基因的水平或活性,或者降低至少一种端粒长度维持基因的水平或活性。 
在另一实施方案中,调节寿命包括调节端粒酶的活性或水平,例如提高端粒酶的水平或活性或者降低端粒酶的水平或活性。还提供了涉及差异调节一种或多种端粒长度维持基因的活性以延长健康细胞的寿命并且/或者缩短不健康细胞、疾病细胞、损伤细胞或癌细胞的寿命的方法。 
在提供的任一方法中,所述方法在体外在细胞中进行。可选地,所述细胞是哺乳动物细胞(例如选自角化细胞、成纤维细胞、黑素细胞、内皮细胞、朗格汉斯细胞、梅克尔细胞、脂肪细胞、神经细胞、毛发、汗液、油、干细胞和/或肌肉细胞的细胞)、植物细胞、微生物细胞、干细胞、自体细胞和/或同种异体细胞、胚胎或体外受精细胞。在不同的实施方案中,所述细胞是真核细胞或原核细胞。 
还另一个实施方案中,提供了一种用于调节对细胞、组织、器官或生物体的应激的反应或抗性的方法,包括调节选自数据表7所列基因和 作为阵列2一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。还提供了用于调节对应激的反应或抗性的方法,其中调节包括调节以下基因的水平和/或活性:作为阵列2一部分列出的10个或更多个基因;作为阵列1一部分列出的基因;VEGFA,HMOX1,CCL4L1,DDC,NOS2A,SIRT1,TERT,PTGS2,或IFI44;4个或多个TERT,TERC,NRF2,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,TNKS2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL和KU70;BCL2,SOD1,TP53,和SOD2;BCL2,SOD1,TP53,SOD2,BCL2L1,TIMM22,TOMM40,IMMP1L,CDKN2A,GADPH,ACTB,HRP1,和HGDC;PARP1,PARP2,TERT,TEP1,TPS3,JUN,PARP3,PARP4,TERF2,TINF2,和CDKN2A;PARP1,PARP2,TERT,TEP1,和TP53;TERF2,POT1,TERT,和TPP1;PAPR1,PARP2,PARP3,和PARP4;PARP2,CYP19A1,TEP1,BCL2,HSPA1A,ACE,TP53,和NFKB1;IGF1,IGF2,PPARG,IL10,APOE,TERT,TNF,HLA-DRA,DDC,CCL4L1,NOS2A,和GH1;PARP1,IL6,SIRTT1,KRAS,和HSPA1L;IGF1,IL6,PPARG,IL10,TERT,TNF,TEP1,HSPA1A,SIRT1,TP53,GH1,NOS2A和PPC;或者本文描述的其他基因列表;或这些具体列表的两个或多个的组合。举例来说,这些方法中的调节可涉及提高至少一种列出的基因的活性水平,或降低所述至少一种列出的基因的活性水平,或者提高一些基因的活性水平的同时降低另一些基因的活性水平。 
另一个实施方案是一种通过使细胞与本文描述的至少一种寿命调节剂接触来提高或降低所述细胞中线粒体的细胞呼吸和/或能力和/或生物发生的方法,所述寿命调节剂如艾地苯醌或其类似物或衍生物;可可提取物;咖啡果提取物;奎尼酸或其类似物或衍生物;阿魏酸或其类似物或衍生物;原花色素、花色素、原花青素或花青素;绿原酸或其他类似物或衍生物;茶提取物;或白藜芦醇或者衍生自白藜芦醇或与白藜芦醇在化学上相关的组合物。举例来说,在一些实例中,所述咖啡果提取物 包含绿原酸、奎尼酸、阿魏酸、咖啡酸或原花色素中的一种或多种。在另一实例中,茶提取物包含一种或多种多酚,所述多酚选自EGCG(表没食子儿茶素-3-没食子酸酯)、EGC(表没食子儿茶素)、ECG(表儿茶素-3-没食子酸酯)、EC(表儿茶素)、GCG(没食子儿茶素没食子酸酯)、GC(没食子儿茶素)、C(儿茶素)和CG(儿茶素没食子酸酯)。在另一实施例中,衍生自白藜芦醇或与白藜芦醇在化学上相关的组合物选自葡萄抗毒素、gnetin H和牡丹醇B。在另一个实施例中,所述可可提取物包含多酚和/或原花青素,所述多酚和/或原花青素选自(+)儿茶素、(-)表儿茶素、原花青素低聚体2至18、原花青素B-5、原花青素B-2、原花青素A-2和/或原花青素C-1。 
在该方法的另一实施例中,所述方法包括通过调节线粒体的生物发生或呼吸效率、加长端粒和/或调节影响上述因素的至少一个基因来延长细胞的寿命。 
还提供了这样的方法,所述方法包括通过调节PGC1α、SIRT1、SIRT3、SIRT4、SIRT5、NRF1和/或Tfam中的至少一种来增加或减少线粒体的增殖或生物发生。 
所提供的任一方法任选还包括在至少一个细胞中诱导线粒体再生或新线粒体生物发生。 
另一实施方案是一种用于调节、防止、推迟或逆转急性细胞死亡或凋亡,或者延长细胞、组织、器官或生物体的存活的方法,所述方法包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。例如,调节急性细胞死亡或凋亡包括增加或上调急性细胞死亡或凋亡。 
提供的另一方法是调节、增强、维持或产生更年轻、功能更强的皮肤和/或相关组织,包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。 
本文提供的方法可涉及调节所述至少一个基因的水平或活性,包括将所述细胞与反义或siRNA分子接触。 
还提供了影响寿命的核酸分子的集合,所述集合包括选自数据表7或阵列2所列核酸分子,或者数据表7或阵列2所列的核酸分子的片段的多个核酸分子。任选地,这样的集合被固定在阵列的固体表面,所述 阵列例如微阵列。 
还提供了筛选用于调节寿命的化合物的方法,所述方法涉及将测试化合物与表达影响寿命蛋白质(由数据表7所列的或作为阵列2的一部分所列的分离核酸分子所编码)的宿主细胞接触,并检测所述核酸序列表达的变化或编码蛋白质活性的变化,其中这样的变化表明所述测试化合物可用于调节寿命。任选地,这样的方法是高通量方法(例如以阵列样式),涉及将测试化合物平行地与宿主细胞的集合接触,每种所述宿主细胞都表达影响寿命的不同蛋白质,所述蛋白质由数据表7或作为阵列2的一部分所列的分离核酸分子编码;并且检测至少一种所述核酸序列的表达变化或至少一种所述编码的蛋白质的活性变化,其中这样的变化表明所述测试化合物可用于调节寿命。 
本文描述的另一种方法是一种用于鉴定具有逆转或抑制线粒体损伤潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:ACTB,BCL2,BCL2L1,CDKN2A,COX10,COX18,CPT1B,CPT2,DNAJC19,EGF,EGR2,FIS1,GAPDH,GRPEL1,HSP90AA1,LRPPRC,MFN1,MFN2,NOS3,OPA1,PARP3,PARP4,PPARGC1A,SIRT2,SIRT4,SLC25A1,SLC25A1,SLC24A2,SLC25A3,SLC25A4,SCL25A5,SLC25A10,SLC25A12,SLC25A13,SLC25A14,SLC25A15,SLC25A16,SLC25A17,SLC25A19,SLC25A2,SLC25A20,SLC25A21,SLC25A22,SLC25A23,SLC25A24,SLC25A25,SLC25A27,SLC25A3,SLC25A30,SLC25A31,SLC25A37,SLC25A4,SLC25A5,TIMM10,TIMM17A,TIMM17B,TIMM22,TIMM23,TIMM44,TIMM50,TIMM8A,TIMM8B,TIMM9,TOMM20,TOMM22,TOMM34,TOMM40,TOMM40L,TOMM70A,UCPl,UCP2,UCP3,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平升高或所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于线粒体健康或维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤的潜力。 
本文描述的另一种方法是一种用于鉴定具有逆转或抑制线粒体损伤潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AIFM2,AIP,BAK1,BBC3,BID,BNIP3,CLK1, HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,IMMP1L,IMMP2L,MIPEP,PARP1,PARP2,PMAIP1,RPL13A,SOD1,SOD2,SFN,SH3GLB1,UXT,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平下降或所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于线粒体健康或维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤的潜力。 
本文描述的另一种方法是一种用于鉴定具有增加或加速线粒体损伤潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:ACTB,BCL2,BCL2L1,CDKN2A,COX10,COX18,CPT1B,CPT2,DNAJC19,EGF,EGR2,FIS1,GAPDH,GRPEL1,HSP90AA1,LRPPRC,MFN1,MFN2,NOS3,OPA1,PARP3,PARP4,PPARGC1A,SIRT2,SIRT4,SLC25A1,SLC25A1,SLC24A2,SLC25A3,SLC25A4,SCL25A5,SLC25A10,SLC25A12,SLC25A13,SLC25A14,SLC25A15,SLC25A16,SLC25A17,SLC25A19,SLC25A2,SLC25A20,SLC25A21,SLC25A22,SLC25A23,SLC25A24,SLC25A25,SLC25A27,SLC25A3,SLC25A30,SLC25A31,SLC25A37,SLC25A4,SLC25A5,TIMM10,TIMM17A,TIMM17B,TIMM22,TIMM23,TIMM44,TIMM50,TIMM8A,TIMM8B,TIMM9,TOMM20,TOMM22,TOMM34,TOMM40,TOMM40L,TOMM70A,UCP1,UCP2,UCP3,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平升高或所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于线粒体健康或维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有增加或加速线粒体损伤的潜力。 
本文描述的另一种方法是一种用于鉴定具有增加或加速线粒体损伤潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AIFM2,AIP,BAK1,BBC3,BID,BNIP3,CLK1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,IMMP1L,IMMP2L,MIPEP,PARP1,PARP2,PMAIP1,RPL13A,SOD1,SOD2,SFN,SH3GLB1,UXT,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平下降或所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于线粒体健康或维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性 的升高表明所述试剂具有增加或加速线粒体损伤的潜力。 
在另一实施方案中,提供了一种用于鉴定具有逆转或抑制DNA损伤或线粒体缩短潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平: 
AK3,APEX1,APEX2,ATF2,ATM,ATR,ATRX,BARD1,BLM,BRIP1,CCNH,CDK7,CDKN2A,CIIEK1,CIIEK2,CSF2,CTPS,DDB1,DDB2,DIIFR,DMC1,ERCC1,ERCC2,ERCC3,ERCC4,ERCC5,ERCC6,ERCC8,EXO1,FANCA,FANCC,FANCF,FANCG,FEN1,GADD45A,GADD45G,GTF2H1,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4,JUN,LIG1,LIG3,LIG4,MAP2K6,MAPKAPK2,MLH1,MLH3,MRE11A,MSH2,MSH3,MSH4,MSH5,MSH6,NBN,NEIL1,NEIL2,NEIL3,NFKB1,NFKBIA,HK1,NUDT1,NUDT2,ODC1,PAPSS1,PAPSS2,PARP1,PARP3,PCNA,PMS1,PMS2,PNKP,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PRKDC,RAD1,RAD18,RAD21,RAD23A,RAD50,RAD51C,RAD51L1,RAD51L3,RAD52,RAD54B,RAD54L,RBBP8,SESN1,SLC23A2,TDG,TYMS,UBE2V2,UNG2,WRN,XAB2,XPA,XPC,XRCC1,XRCC2,XRCC3,XRCC4,XRCC5,XRCC6,ZNRD1,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平升高或所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于DNA或端粒维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤或端粒缩短的潜力。 
另一个实施例是一种用于鉴定具有逆转或抑制DNA损伤或线粒体缩短潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:B2M,BRCA1,BRCA2,BTG2,CIDEA,CIDEB,DDIT3,DKC1,GTSE1,MDM2,PCBP4,PDCD8,PINX1,PPP1R15A,RAD17,RELA,TELO2,TEP1,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平升高或所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于DNA或端粒维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤或端粒缩短的潜力。 
还提供了一种用于鉴定具有加速或引起或增强DNA损伤或端粒缩短潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AK3,APEX1,APEX2,ATF2,ATM,ATR,ATRX,BARD1,BLM,BRIP1,CCNH,CDK7,CDKN2A,CHEK1,CHEK2,CSF2,CTPS,DDB1,DDB2,DHFR,DMC1,ERCC1,ERCC2,ERCC3,ERCC4, ERCC5,ERCC6,ERCC8,EXO1,EANCA,EANCC,FANCF,FANCG,FEN1,GADD45A,GADD45G,GTF2H1,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4,JUN,LIG1,LIG3,LIG4,MAP2K6,MAPKAPK2,MLH1,MLH3,MRE11A,MSH2,MSH3,MSH4,MSH5,MSH6,NBN,NEIL1,NEIL2,NEIL3,NFKB1,NFKBIA,HK1,NUDT1,NUDT2,ODC1,PAPSS1,PAPSS2,PARP1,PARP3,PCNA,PMS1,PMS2,PNKP,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PRKDC,RAD1,RAD18,RAD21,RAD23A,RAD50,RAD51C,RAD51L1,RAD51L3,RAD52,RAD54B,RAD54L,RBBP8,SESN1,SLC23A2,TDG,TYMS,UBE2V2,UNG2,WRN,XAB2,XPA,XPC,XRCC1,XRCC2,XRCC3,XRCC4,XRCC5,XRCC6,ZNRD1,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平升高或所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于DNA或端粒维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有加速或引起或增强DNA损伤或端粒缩短的潜力。 
提供的另一种方法是一种用于鉴定具有加速或引起或者增强DNA损伤或端粒缩短潜力的试剂的方法,包括:使细胞与试剂接触;检测对应于以下基因的核酸分子的水平:B2M,BRCA1,BRCA2,BTG2,CIDEA,CIDEB,DDIT3,DKC1,GTSE1,MDM2,PCBP4,PDCD8,PINX1,PPP1R15A,RAD17,RELA,TELO2,TEP1,或者在所述试剂存在或不存在的情况下当基因水平下降或所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于DNA或端粒维持的本文指出的其他基因,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有加速或引起或者增强DNA损伤或端粒缩短的潜力。 
其他实施方案利用了本文的发现,即施用的化合物剂量对多个基因的上调和/或下调具有很大效应。因此,提供了一种用于在细胞中诱导TERT、POT1、TPP1和TERF2表达的第一方法,所述方法通过向所述细胞或含有所述细胞的生物体施用含有约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物来进行。在该方法的一些实施方案中,所述组合物含有不超过约0.01%(以重量计)的咖啡果提取物。或者,所述组合物还包含绿茶提取物、绿茶提取物的组分或艾地苯醌,例如一种 或多种约0.001%(以重量计)的绿茶提取物或约0.00004%(以重量计)的艾地苯醌。 
还提供了一种通过向细胞或含有所述细胞的生物体施用包含约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物在细胞中诱导PARP1、BCL2和p53表达的方法。在该方法的一些实施例中,所述组合物含有不超过约0.000005%(以重量计)的绿原酸。 
另一个实施方案是一种通过向细胞或含有所述细胞的生物体施用包含约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物在细胞中诱导NOS2A、NOS1和NOS3表达的方法,或者其中所述组合物包含不超过约0.01%的咖啡果提取物。 
在另一个实施方案中,提供了通过向细胞或含有所述细胞的生物体施用包含约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物在细胞中诱导CCL4L1表达的方法。该方法的实例涉及使用包含不超过约0.01%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物。 
本文还描述了其他实施方案,并且该列举不意欲穷举。 
IV.寿命延长 
很多因素都被证明会减少生物的寿命,但很少有因素被证明可延长寿命。 
然而,寿命延长的一个实例是一种被称作摄热量限制的饮食计划,所述摄热量限制被证明能够延长很多生物体的寿命。能够模仿摄热量限制的一些效应或者增加细胞对应激的抗性的试剂已经与NAD+补救通路一块被描述。被称作沉默信息调节蛋白(SIR)的基因家族成员参与基因沉默和DNA修复的多个过程。已经证明缺乏SIR2基因的酵母当被摄热量限制时不能够活的更长,因此认为所述SIR2基因介导摄热量限制的一些有益寿命延长效应。该家族中的其他基因包括可能具有类似效应的SIRT1。 
因此,Sirtuin调节化合物可用于延长一些活细胞的寿命,并且具有治疗和/或预防与衰老相关的多种疾病的可能性。一个这样的实例是天然存在于红酒中的白藜芦醇,它已被证明能够延长小鼠的寿命并且似乎可影响sirtuin家族的一些基因(尽管它还改变很多其他基因的表达和/或蛋 白质的产生)。 
基因水平上相对较小的改变如各种环境因子一样已被证明显著地改变衰老过程。随衰老过程发展的衰老的速度、生物体的健康以及总寿命受到复杂的控制并且是多种衰老理论的主题。 
V.寿命的改变 
本文提供了存在或不存在应激物(例如,环境应激如紫外辐射暴露)预刺激的情况下,在抗氧化剂化合物存在下基因表达变化的综合分析结果。还提供了剂量反应分析,描述基因反应随抗氧化剂化合物量变化的变化。基于本文提供的结果,通过有意地改变一种或多种所鉴定的基因的表达,可以使得方法方法作用于这样的表达变化,以影响(增加或减少)细胞、组织、器官和生物体的健康或寿命。 
本文的方法适用于增加人细胞(以及组织、器官和机体)以及非人动物、单细胞或多细胞生物体和植物等的细胞(以及组织、器官和机体)的健康和寿命。因此,应理解,当提及基因时,包括其他物种等的直系同源序列。 
健康长寿包括使得细胞“对抗”衰老或环境损伤或疾病,例如与功能下降相关的衰老或损伤或疾病(例如,当线粒体不再制造那么多的ATP时,改善线粒体呼吸或增加线粒体的数量或者同时改善线粒体呼吸并增加线粒体的数量),或者减少或消除“不健康”因素的表达/活性(例如MMP1胶原酶可被看作是不健康因素,因为它会降解胶原,而胶原降解反过来会破坏皮肤、关节等的结构完整性)。在后一个实例中,改变基因表达的“编程”可改善健康,例如减少或逆转对损伤(例如,环境或其他方面的——UV光暴露、吸烟和炎症等)的慢性反应,所述损伤引起/诱导了MMP1的过量产生,使得细胞、器官和生物体提早衰老。 
本文提供的方法可用于调节基因活性/表达,以缩短健康的细胞的寿命,例如以杀死癌细胞或其他有害细胞或消除发出“错误”基因或分子信号的细胞。当上述过程完成后,可以用健康的细胞(例如通过生物发生或使用干细胞)替换所述消除的或向下调节的细胞。或者,细胞可被编程以对抗所述消极信号——例如,通过以下方式响应MMP1的过量产生:调节细胞的表达以产生胶原来代替被MMP1降解的部分。 
本文关于基因表达响应抗氧化剂诱导的发现提供了一种可使健康和不健康影响平衡以产生更健康的长寿的系统。可将所述鉴定的基因重新编程(上调或下调,取决于所述基因和环境);当它们不能够被直接重新编程时,可将表达它们的细胞除去、失能、杀死(例如通过凋亡)或者残缺;并且当上述方面不可行时,其他基因通过在同一细胞或其他细胞中补偿性表达健康因子对抗或平衡所述不健康影响。同样地,所述对抗性影响可以是新细胞的生物发生、修复DNA损伤和/或预防DNA损伤。所有这些不同方法都可被用于影响细胞、组织、器官和生物体的寿命——延长寿命,或者通过引起致死性损伤或诱发凋亡(是除去细胞的另一种方法)缩短寿命。 
源于此的提取物、化合物或化合物的结合物可通过通常已知的方法来制备,并且多种来自天然的化合物可市购。由于来自天然的化合物不是实现活性化合物浓度的唯一途径,本发明包括合成形式,所述合成形式可通过从其他植物品种中分离以及来自合成途径,这些都被包括在权利要求书中。同样,本领域技术人员基于本领域的知识无需过度实验就能够预见其他合成途径。例如,对于所述化合物的酚性质,不同选择性保护方法,偶合加入有机金属、酚偶合和光化学反应在例如收敛法、线性法或生物模拟法中与合成有机化学家熟知的常规反应一起可产生进行所需端粒长度维持改变的合成衍生物。 
来自端粒酶活性实验的数据表明,绿茶在大部分测试环境下可增强端粒酶的可测量活性。在UVB暴露前给予绿茶的细胞显示出端粒酶活性的下降。也就是说,当细胞受到UVB应激并且被给予绿茶时,所述可测量端粒酶活性增加,而当所述细胞未受应激并且与绿茶接触时,所述端粒酶活性也上升(较年轻细胞比老细胞对所述增加的反应程度更强)。相反地,接受艾地苯醌处理的受应激和未受应激细胞都显示出端粒酶活性的下降。这些结果表明,通过在应激前将绿茶给予所述细胞,甚至是给予正常细胞,端粒酶活性在较年轻的细胞系中更高,表明维持端粒长度和更好地对抗/抵御基于氧化应激的DNA损伤的能力增加,从而减少和/或防止细胞损伤和凋亡信号传递事件。 
在定制微阵列实验中,数据表明所选的抗氧化剂化合物(绿茶、咖啡果和艾地苯醌)是有生物活性的,表明一些长寿相关基因的表达水平 在所有测试化合物中都有统计学显著变化。年龄36的细胞似乎是活跃的,PARP1、NADSYN1、IFI44、TERT和NFKBl的表达具有大的统计学变化。在暴露于UVB应激时所有这些基因都被下调,但当将所述细胞暴露于所述测试抗氧化剂化合物(以不同的时间间隔)然后进行应激时下调。与仅UVB(应激)的细胞中下降相比,TERT(负责端粒酶酶活性)的细胞中的升高非常强烈地表明,抗氧化剂化合物能够使得酶活性更高,以通过调节端粒的UV损伤来保持端粒长度完整(并且因此延长细胞寿命)。第二个值得注意的发现是,在较老(假设受到较大程度的环境损害并且端粒修复效率较低,端粒全长较短)细胞中,艾地苯醌和咖啡果处理的细胞(而不是绿茶处理的细胞)能够逆转UVB应激衰老细胞的表达水平。在这种情况下,考虑到所述细胞相对于较年轻细胞的年龄,UVB应激诱导的TERT下降程度甚至更大;但甚至更有意思的是,抗氧化剂反应比施用所述抗氧化剂的较年轻细胞甚至更强,这暗示着,至少对于艾地苯醌和咖啡果,越衰老/损伤越多/端粒长度维持的细胞机制的效率越低,某些抗氧化剂影响向长寿方向变化的能力越大。 
通过显著下调TNF{18倍},绿茶显示出对抗由该促炎性细胞因子引起的损伤的功能,绿茶还能够通过防止由炎性信号级联引起的凋亡导致细胞寿命延长。 
RT-PCR引物测定检查了与端粒复合体本身特异相关的基因,并且显示出咖啡果能够下调TINF2的表达,所述TINF2当表达时是端粒长度维持的负调节因子,并且表明了向端粒的加长和细胞长寿的有向变化。 
在人基因组阵列中,实验表明了抗氧化剂活性(艾地苯醌和咖啡果)在受应激和未受应激细胞中对整个基因表达谱的效应。所述数据表明,所述两种化合物有生物活性并且可影响具有多种功能(集中于衰老/长寿组)的许多基因,并且表明了抗氧化剂有如下能力:不仅可应用于影响自由基代谢,而且还可应用于直接影响负责端粒长度维持、细胞代谢、线粒体功能和炎症(所有这些被适当调节时可使得细胞寿命的可能延长和质量改善)的基因表达谱。 
在UV应激前或没有UV应激下施用所需要抗氧化剂可直接影响负责端粒长度维持的基因表达水平,并且可调节细胞寿命。端粒长度维持并不是细胞长寿涉及的唯一因素,抗氧化剂也已显示出调节这些表达水 平的能力,对能量产生和炎症应答的效应表明了存在通过单个抗氧化剂化合物延长寿命的多种方法。 
基于本文给出的工作,现在认识到至少表1和阵列2中所列出的全部基因(下文描述)都参与寿命、长寿、线粒体生物发生或健康、细胞呼吸健康和/或DNA或端粒维持。因此,考虑到了改变这些基因中任一种或多种的水平或表达可用于调节该过程。因此,至少以下基因被认为是寿命影响基因,并且可用于本文描述的一种或多种方法和/或组合物:1553575_at,1554007_at,1554948_at,1555846_a_at,1555875_at,1556097_at,1556216_s_at,1556242_a_at,1556332_at,1556545_at,1556936_at,1557118_a_at,1557286_at,1557287_at,1557302_at,1557341_x_at,1557348_at,1557383_a_at,1557667_at,1557740_a_at,1558105_a_at,1558236_at,1558237_x_at,1558250_s_at,1558401_at,1558445_at,1558515_at,1558604_a_at,1558605_at,1558750_a_at,1558801_at,1558836_at,1558837_a_at,1558890_at,1558906_a_at,1558920_at,1559229_at,1559867_at,1560071_a_at,1560208_at,1560579_s_at,1561064_a_at,1562012_at,1562013_a_at,1562056_at,1562098_at,1562777_at,1563012_x_at,1563414_at,1565495_at,1565577_s_at,1565783_at,1568633_a_at,1569129_s_at,1569765_at,1570061_at,1570100_at,182-FIP,208187_s_at,210230_at,213156_at,213158_at,213567_at,213817_at,213832_at,214202_at,214808_at,214862_x_at,214967_at,215128_at,215287_at,217166_at,217536_x_at,217540_at,217554_at,217604_at,220494_s_at,220726_at,221200_at,222184_at,222284_at,224769_at,224778_s_at,224811_at,225256_at,225356_at,225725_at,225893_at,225917_at,226203_at,226250_at,226282_at,226316_at,226362_at,226365_at,226392_at,226457_at,226458_at,226520_at,226532_at,226542_at,226546_at,226550_at,226773_at,226885_at,226964_at,227041_at,227044_at,227051_at,227061_at,227082_at,227121_at, 227126_at,227184_at,227193_at,227221_at,227252_at,227283_at,227306_at,227422_at,227503_at,227531_at,227533_at,227565_at,227623_at,227655_at,227663_at,227682_at,227929_at,227955_s_at,228032_s_at,228045_at,228049_x_at,228084_at,228156_at,228159_at,228216_at,228242_at,228304_at,228315_at,228333_at,228346_at,228390_at,228478_at,228528_at,228694_at,228740_at,228742_at,228750_at,228773_at,228781_at,228811_at,228812_at,228850_s_at,228955_at,228963_at,229024_at,229072_at,229121_at,229189_s_at,229190_at,229281_at,229297_at,229315_at,229319_at,229333_at,229359_at,229384_at,229460_at,229479_at,229512_at,229569_at,229572_at,229602_at,229615_at,229641_at,229699_at,229705_at,229710_at,229756_at,229757_at,229795_at,229810_at,229815_at,229948_at,229994_at,230003_at,230090_at,230127_at,230183_at,230211_at,230227_at,230240_at,230304_at,230345_at,230383_x_at,230406_at,230407_at,230431_at,230446_at,230449_x_at,230483_at,230503_at,230683_at,230741_at,230766_at,230773_at,230860_at,230927_at,230968_at,231055_at,231069_at,231193_s_at,231238_at,231576_at,231597_x_at,231890_at,231963_at,231993_t,232088_x_at,232125_at,232156_at,232484_at,232535_at,232538_at,232656_at,232795_at,232903_at,233105_at,233335_at,233354_at,233376_at,233485_at,233518_at,233723_at,233814_at,234340_at,234578_at,234723_x_at,234983_at,235000_at,235028_at,235046_at,235072_s_at,235078_at,235123_at,235124_at,235171_at,235207_at,235224_s_at,235227_at,235264_at,235279_at,235299_at,235302_at,235304_at,235352_at,235407_at,235427_at,235428_at,235434_at,235438_at,235459_at,235532_at,235556_at,235571_at,235581_at,235585_at,235612_at,235655_at,235658_at,235696_at,235733_at,235761_at,235764_at,235830_at,235831_at,235889_at,235890_at,235919_at,235931_at,235938_at,236004_at,236038_at,236089_at,236097_at,236105_at,236174_at,236180_at,236194_at,236196_at,236335_at,236344_at,236350_at,236364_at,236423_at,236433_at,236452_at,236619_at,236685_at,236787_at,236856_x_at,236875_at,236898_at,236922_at,236996_at,237071_at,237212_at,237290_at,237315_at,237416_at,237435_at,237622_at,237768_x_at,238030_at,238050_at,238109_at,238178_at,238250_at,238308_at,238360_s_at,238389_s_at,238431_at,238456_at,238463_at,238483_at,238501_at,238557_at,238559_at,238565_at,238573_at,238576_at,238604_at,238617_at,238620_at,238673_at,238684_at,238712_at,238733_at,238766_at,238782_at,238824_at,238861_at,238890_at,238932_at,238934_at,239066_at,239218_at,239231_at,239266_at,239278_at,239331_at,239370_at,239503_at,239543_s_at,239669_at,239708_at, 239710_at,239842_x_at,239845_at,239847_at,239866_at,239951_at,239973_at,240020_at,240095_at,240128_at,240165_at,240190_at,240219_at,240233_at,240366_at,240418_at,240523_at,240549_at,240557_at,240885_at,241114_s_at,241263_at,241359_at,241484_x_at,241689_at,241721_at,241722_x_at,241815_at,241823_at,241838_at,241863_x_at,241879_at,241887_at,241925_x_at,241936_x_at,242005_at,242051_at,242107_x_at,242134_at,242289_at,242312_x_at,242321_at,242323_at,242358_at,242366_at,242376_at,242421_at,242471_at,242486_at,242523_at,242606_at,242719_at,242818_x_at,242845_at,242979_at,243115_at,243179_at,243278_at,243302_at,243366_s_at,243404_at,243417_at,243489_at,243551_at,243564_at,243606_at,243641_at,243671_at,243680_at,243697_at,243707_at,243844_at,243907_at,243925_at,243934_at,243947_s_at,243976_at,244007_at,244025_at,244032_at,244242_at,244271_at,244350_at,244354_at,244533_at,244663_at,244677_at,244701_at,244779_at,244853_at,244855_at,244864_at,76P,A_23_P10605,A_23_P113263,A_23_113762,A_23_P13202,A_23_P134405,A_23_P170719,A_23_P205500,A_23_P44053,A_24_P136155,A_24_P144054,A_24_P195454,A_24_P195621,A_24_P229766,A_24_P247303,A_2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TGFBR3,TGM2,TH,THADA,THAP2,THAP5,THBD,THBS1,THBS2,THC2235542,THC2266906,THC2274697,THC2278725,THC2279825,THC2279910,THC2280343,THC2280741,THC2281350,THC2282972,THC2284350,THC2290002,THC2308340,THC2311764,THC2312756,THC2312785,THC2312955,THC2314215,THC2315330,THC2316649,THC2316768,THC2316936,THC2317182,THC2319152,THC2320257,THC2322443,THC2324430,THC2337372,THC2337493,THC2338537,THC2339241,THC2339455,THC2340757,THC2342473,THC2343350,THC2345075,THC2356023,THC2358845,THC2360810,THC2360912,THC2361491,THC2361914,THC2368209,THC2369020,THC2374442,THC2375512,THC2375853,THC2376418,THC2376586,THC2378378,THC2378839,THC2378865,THC2378994,THC2381061,THC2381707,THC2382717,THC2397757,THC2400593,THC2404671,THC2405319,THC2405710,THC2405842,THC2405936,THC2406017,THC2406779,THC2406786,THC2406944,THC2407334,THC2407737,THC2408033,THC2408757,THC2408828,THC2409451,THC2411515,THC2419011,THC2437177,THC2439773, THC2440027,THC2441367,THC2448178,THC2449905,THC2453866,THC2455353,THEM4,THOC4,THOC6,THOP1,THRAP2,THRAP3,THRB,THSD1,THSD4,THYN1,TIA1,TIAM2,TIGD1L,TIGD3,TIMELESS,TIMM10,TIMM13,TIMM22,TIMM50,TIMM8A,TIMP3,TIMP4,TINF2,TIPIN,TJP2,TK2,TLCD1,TLE3,TLE4,TLK1,TLN1,TLN2,TLOC1,TM2D1,TM4SF1,TM4SF4,TM7SF3,TMBIM1,TMC8,TMCC1,TMCO3,TMCO7,TMED4,TMEM100,TMEM103,TMEM106B,TMEM107,TMEM109,TMEM110,TMEM112,TMEM117,TMEM119,TMEM132D,TMEM140,TMEM150,TMEM154,TMEM158,TMEM162,TMEM166,TMEM168,TMEM170,TMEM171,TMEM19,TMEM22,TMEM29,TMEM30A,TMEM30B,TMEM33,TMEM35,TMEM37,TMEM38B,TMEM39A,TMEM42,TMEM46,TMEM47,TMEM48,TMEM57,TMEM63A,TMEM67,TMEM81,TMEPAI,TMF1,TMLHE,TMPO,TMTC1,TMTC2,TMTC3,TMTC4,TNC,TncRNA,TNFAIP3,TNFAIP6,TNFAIP8L1,TNFRSF10A,TNFRSF10B,TNFRSF10D,TNFRSF11B,TNFRSF12A,TNFRSF19,TNFRSF1B,TNFRSF21,TNFRSF25,TNFRSF6B,TNFSF12,TNFSF4,TNFSF9,TNIP2,TNKS,TNKS 1BP1,TNNC1,TNNC2,TNRC15,TNRC4,TNRC6A,TNRC6B,TNRC6C,TNRC8,TNS3,TNXB,TOB1,TOE1,TOLLIP,TOM1,TOMM34,TOMM40,TOP1,TOP2A,TOX,TOX2,TP53,TP53AP1,TP53INP1,TP53INP2,TPARL,TPCN1,TPCN2,TPD52L1,TPI1,TPM1,TPM2,TPM4,TPP1,TPR,TPX2,TRA16,TRA2A,TRABD,TRAF3,TRAF3IP1,TRAF3IP2,TRAF5,TRAFD1,TRAIP,TRAK1,TRAM2,TRAPPC2,TRAPPC6A,TRERF1,TRIB1,TRIB2,TRIM13,TRIM6,TRIM2,TRIM21,TRIM22,TRIM23,TRIM33,TRIM4,TRIM44,TRIM45,TRIM5,TRIM56,TRIM59,TRIM69,TRIM73,TRIO,TRIOBP,TRIP11,TRIP12,TRIP13,TRMT1,TRMT6,TRO,TROAP,TROVE2,TRPC1,TRPM7,TRPS1,TRPV2,TRY6,TSC22D3,TSC22D4,TSEN54,TSGA10,TSHZ1,TSHZ2,TSHZ3,TSPAN13,TSPAN14,TSPAN18,TSPAN2,TSPAN9,TSR1,TSR2,TSTA3,TTBK2,TTC12,TTC28,TTC3,TTC30B,TTC32,TTK,TTL,TTLL12,TTLL3,TTRAP,TTTY14,TUB,TUBA4A,TUBB2A,TUBB3,TUBB4,TUBG1,TUG1,TUSC3,TWIST2,TXLNA,TXN2,TXNDC4,TXNIP,TXNL4B,TXNRD1,TYRO3,U87972,UACA,UAP1,UAP1L1,UBE1L,UBE1L2,UBE2C,UBE2E1,UBE2H,UBE2M,UBE2NL,UBE2S,UBE2T,UBE2V2,UBE4B,UBIAD1,UBL3,UBN1,UBQLN1,UBQLN4,UBQLNL,UBR2,UBR4,UBXD1,UBXD5,UBXD7,UCHL5,UCK2,UEV3,UGCG,UHRF1,ULBP2,ULK2,UNC119,UNC84A,UNC84B,UNG,UNKL,UNQ338,UPP1,URLC9,USF2,USP10,USP21,USP25,USP3,USP30,USP32,USP34,USP36,USP45,USP47,USP52,USP53,USP54,USP6NL,USP7,USP9X,UST,UTP15,UTS2D,VAC14,VAMP4,VAPA,VAPB,VARS,VASH1,VASP,VCAN,VCP,VCPIP1,VDP,VDR,VEGFA,VEGFC,VEPH1,VGLL3, VIL2,VIM,VISA,VIT,VMD2,VPRBP,VPS13A,VPS13B,VPS13C,VPS13D,VPS24,VPS36,VPS41,VPS4A,VPS53,VRK1,VSIG8,VTI1A,W05707,WAPAL,WASF2,WBP1,WDFY2,WDFY3,WDHD1,WDR13,WDR19,WDR31,WDR32,WDR4,WDR45,WDR5,WDR51A,WDR60,WDR68,WDR76,WDR77,WDR79,WDR82,WFDC1,WFDC3,WFS1,WHSC1L1,WIPF1,WIPF2,WISP1,WISP2,WNK1,WNK4,WNT10A,WNT11,WNT16,WNT2,WNT5A,WNT5B,WRNIP1,WSB1,WSB2,WTAP,WWC1,WWC2,WWOX,WWTR1,XAF1,XDH,XG,XIST,XPA,XPNPEP3,XPO1,XPO5,XPOT,XRCC4,XRCC6BP1,XRN1,XRRA1,XYLT1,YAP1,YIPF6,YKT6,YOD1,YPEL1,YPEL2,YPEL3,YPEL4,YRDC,YTHDC2,YTHDF3,Z28739,ZAK,ZBED1,ZBED3,ZBED5,ZBTB10,ZBTB20,ZBTB24,ZBTB26,ZBTB3,ZBTB34,ZBTB41,ZBTB43,ZBTB44,ZC3H13,ZC3H6,ZC3HAV1L,ZCCHC10,ZCCHC11,ZCCHC3,ZDBF2,ZDHHC14,ZDHHC17,ZDHHC2,ZDHHC21,ZDHHC22,ZDHHC3,ZDHHC5,ZEB1,ZEB2,ZFAND2A,ZFAND2B,ZFAND5,ZFAND6,ZFHX3,ZFHX4,ZFP1,ZFP106,ZFP3,ZFP36L2,ZFP90,ZFPL1,ZFPM2,ZFX,ZFY,ZFYVE16,ZGPAT,ZHX1,ZHX2,ZHX3,ZIK1,ZKSCAN1,ZMAT3,ZMIZ1,ZMYM2,ZMYM4,ZMYM5,ZMYND10,ZMYND11,ZNF101,ZNF107,ZNF117,ZNF12,ZNF131,ZNF14,ZNF148,ZNF160,ZNF165,ZNF167,ZNF174,ZNF182,ZNF189,ZNF19,ZNF192,ZNF20,ZNF207,ZNF217,ZNF223,ZNF224,ZNF225,ZNF226,ZNF228,ZHF230,ZNF232,ZNF236,ZNF24,ZNF248,ZNF252,ZNF253,ZNF259,ZNF264,ZNF267,ZNF273,ZNF277,ZNF280D,ZNF282,ZNF286A,ZNF289,ZNF292,ZNF294,ZNF297B,ZNF302,ZNF313,ZNF317,ZNF323,ZNF326,ZNF331,ZNF333,ZNF334,ZNF33A,ZNF345,ZNF347,ZNF350,ZNF354C,ZNF367,ZNF37B,ZNF395,ZNF397,ZNF404,ZNF408,ZNF415,ZNF420,ZNF423,ZNF43,ZNF430,ZNF432,ZNF438,ZNF439,ZNF440,ZNF441,ZNF446,ZNF449,ZNF462,ZNF468,ZNF473,ZNF512,ZNF512B,ZNF516,ZNF517,ZNF521,ZNF529,ZNF532,ZNF551,ZNF555,ZNF557,ZNF560,ZNF564,ZNF567,ZNF569,ZNF57,ZNF573,ZNF585A,ZNF587,ZNF597,ZNF599,ZNF605,ZNF606,ZNF615,ZNF618,ZNF621,ZNF622,ZNF623,ZNF627,ZNF630,ZNF652,ZNF655,ZNF658,ZNF662,ZNF672,ZNF675,ZNF677,ZNF680,ZNF681,ZNF684,ZNF688,ZNF691,ZNF697,ZNF70,ZNF702,ZNF708,ZNF709,ZNF710,ZNF713,ZNF717,ZNF75,ZNF768,ZNF770,ZNF783,ZNF785,ZNF792,ZNF805,ZNF81,ZNF814,ZNF818,ZNF84,ZNF85,ZNF91,ZNF92,ZNF93,ZRF1,ZSCAN29,ZSWIM6,ZWILCH,ZWINT,ZXDB,ZYG11B,和ZYX. 
还认识到了,表达的变化是有方向的,因为对于一些基因,为了增加(或减少)长寿、健康或生物学健康,增加表达是有利的,而为了相 同的目的,其他基因的表达需要被减少。例如,对于端粒,上调(表达增加)TNKS和POT1是有益的(对于端粒维持并且从而增加长寿/健康/健康),而下调(表达减少)TNKS2、TRF1、TIN2和/或TRF2是有益的。同样,以下4个表格提供了本文所提供的两个具体阵列(阵列1和阵列2)中发现的基因以及参与线粒体维持和DNA修复的基因的有益上调和下调指示。在每个表格中,对于长寿/健康等来说,涂有阴影的基因下调是有益的,而没有阴影的基因上调是有益的。本文提供了能够实现这些基因上调和/下调的方法和组合物。 
阵列#1 
Figure 536292DEST_PATH_GSB00000637631200781
Figure 486930DEST_PATH_GSB00000637631200791
阵列2.0 
Figure 369436DEST_PATH_GSB00000637631200792
Figure 721920DEST_PATH_GSB00000637631200801
线粒体生物发生、维持等 
Figure 726785DEST_PATH_GSB00000637631200802
Figure 164719DEST_PATH_GSB00000637631200811
DNA修复、保持等 
Figure 398386DEST_PATH_GSB00000637631200812
Figure 870955DEST_PATH_GSB00000637631200821
Figure 909636DEST_PATH_GSB00000637631200841
考虑到的其他寿命或长寿应答基因集包括(不限于): 
TERT,TERC,NRF2,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,和TNKS2;TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44和NFKB1;HSPA1A,HSPA1B,和HSPA1L;MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL和KU70;TERT,TERC,NRF2,PARP1,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,端锚聚合酶1,端锚聚合酶2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL and KU70;TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,HSPA1A,HSPA1B,和HSPA1L;PARP1,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,端锚聚合酶1,端锚聚合酶2,TERF2, TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL,KU70,HSPA1A,HSPA1B,and HSPA1L;TERT,TERC,NRF2,PARP1,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,TNKS2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL,KU70,HSPA1A,HSPA1B,和HSPA;PGC1α,SIRT1,SIRT3,SIRT4,SIRT5,NRF1和Tfam;和TNKS,TNKS2,TRF1,TIN2,TPP1,POT1,RAP1,TRF2,和TERT. 
还考虑这些所列物的任何子集。 
示例性方法和组合物 
本文提供了用于调节控制端粒维持并且/或者控制寿命、衰老速度、衰老、疾病状态起始或对应激的应答(包括活细胞、组织、器官或生物体的凋亡和死亡)的基因表达或蛋白质产生或细胞信号传递的多种方法和组合物。 
所述方法包括使至少一种细胞与足量的调节化合物或化合物结合物接触,所述化合物结合物可以同时暴露或顺序暴露。这些组合物包括所描述的调节剂以及它们源于天然来源、生物合成来源或生物工程改造来源的类似物、衍生物。实现与一种或多种这类调节剂接触的常规途径可涉及在体内或离体或体外对至少一种细胞、组织、器官或生物体的任何已知递送或接触方法。 
植物被认为可来自任何植物门,包括苔藓植物门(Bryophyta)、裸蕨植物门(Psilophyta)、石松植物门(Lycophyta)、木贼门(Equisetophyta)、真蕨植物门(Filicophyta)、松柏门(Coniferophyta)、银杏门(Ginkgophyta)、苏铁门(Cycadophyta)、买麻藤门(Gnetophyta)和被子植物门(Angiospermophyta)。 
在不意欲限制于源自特定植物的化合物或组合物的情况下,考虑用以下具体植物来制备影响寿命的组合物:咖啡(例如,咖啡果提取物)、绿茶(例如,绿茶提取物)、蓝莓(blueberry)(例如,阿拉斯加州蓝莓)、酸果蔓类(cranberries)、越橘类(huckleberries)、阿萨伊浆果(acai berry)、枸杞类(goji berries)、黑莓(blackberry)、覆盆子(raspberry)、葡萄(scupernog)、草莓(strawberry)、柿(persimmon)、石榴(pomegranate)、越橘(lingonberry)、熊果(bearberry)、桑葚(mulberry)、欧洲越橘(bilberry)、野樱桃(choke cherry)、沙棘果(sea buckthorn berry)、枸杞、酸樱桃(tart cherry)、猕猴桃(kiwi)、李、杏、苹果、香蕉、浆果、黑莓、蓝莓、樱桃、酸果蔓、醋栗(currant)、西洋李(greengage)、葡萄、葡萄柚(grapefruit)、欧洲醋栗(gooseberry)、柠檬、桔子(mandarin)、甜瓜(melon)、柑橘(orange)、梨、桃、菠萝、欧洲李(plum)、覆盆子、草莓、甜樱桃、西瓜和野草莓(wild strawberry)。此外,还考虑来自树和灌木的提取物,包括例如红杉(sequoia)、沿海红杉(coastal redwood)、狐尾松(bristlecone pine)、桦木(birch)、黎巴嫩雪松(cedar of Lebanon)、乳香(frankincense)等。 
其他实例举例,组合物可来自于多叶菜或色拉植物[例如,繁穗苋(Amaranth;Amaranthus cruentus)、芝麻菜(Arugula;Eruca sativa)、甜菜(Beet greens;Beta vulgaris subsp.vulgaris)、Bitterleaf(Vernonia calvoana)、小白菜(Bok choy;Brassica rapa Chinensis group)、芜菁(Broccoli Rabe,Brassica rapa subsp.rapa)、抱子甘蓝(Brussels sprout;Brassica oleracea Gemmifera group)、卷心菜(cabbage;Brassica oleracea Capitata group)、欧洲猫儿菊(Catsear;Hypochaeris radicata)、芹菜(Apium graveolens)、莴笋(Celtuce;Lactuca sativa var.asparagina)、落葵(Ceylon spinach;Basella alba)、厚皮菜(Chard;Beta vulgaris var.cicla)、驱虫苋 (Chaya;Cnidoscolus aconitifolius subsp.aconitifolius)、繁缕(Chickweed;Stellaria)、菊苣(Chicory;Cichorium intybus)、白菜(Brassica rapa Pekinensis group)、野葵(Chinese Mallow;Malva verticillata)、苘蒿(Chrysanthemum leaves;Chrysanthemum coronarium)、甘蓝(Collard greens;Brassica oleracea)、拟缬草(Corn salad;Valerianella locusta)、水芹(Cress;Lepidium sativum)、蒲公英(Dandelion;Taraxacum officinale)、菊苣(Endive;Cichorium endivia)、土荆芥(Epazote;Chenopodium ambrosioides)、藜(Fat hen;Chenopodium  album)、蕨(Fiddlehead;Pteridium aquilinum,Athyrium esculentum)、凹槽瓜(Fluted pumpkin,Telfiria occidentalis)、芝麻菜(Garden Rocket,Eruca sativa)、金色海蓬子(Golden samphire,Inula crithmoides)、亨利藜(Good King Henry,Chenopodium bonus-henricus)、大车前(Greater Plantain;Plantago major)、芥蓝(Kai-lan;Brassica rapa Alboglabra group)、羽衣甘蓝(Kale;Brassica oleracea Acephala group)、小松菜(Komatsuna,Brassica rapa Pervidis或Komatsuna group)、猴面包树(Kuka,Adansonia spp.)、人参菜(Lagos bologi,Talinum fruticosum)、陆生水芹(Land cress,Barbarea verna)、莴苣(Lactuca sativa)、鱼腥草(Lizard′s tail;Houttuynia cordata)、棣棠(Melokhia,Corchorus olitorius,Corchorus capsularis)、京水菜叶(Mizuna greens,Brassica rapa Nipposinica group)、芥菜(Mustard;Sinapis alba)、番杏(New Zealand Spinach,Tetragonia tetragonioides)、榆钱菠菜(Orache;Atriplex hortensis)、Paracress(Acmella oleracea)、豌豆芽/叶(Pisum sativum)、美洲商陆(Polk;Phytolacca americana)、菊苣(Radicchio;Cichorium intybus)、海茴香(Samphire,Crithmum maritimum)、海甜菜(Sea beet;Beta vulgaris subsp.maritima)、海甘蓝(Seakale;Crambe maritima)、野苘蒿(Sierra Leone bologi,Crassocephalum spp.)、青箱(Soko;Celosia argentea)、酸模(Sorrel;Rumex acetosa)、菠菜(Spinacia oleracea)、马齿苋(Summer purslane;Portulaca oleracea)、瑞士甜菜(Swiss chard;Beta vulgaris subsp.cicla var.flavescens)、塌棵菜(Tatsoi;Brassica rapa Rosularis group)、萝卜叶(Turnip greens,Brassica rapa Rapifera group)、水田芥(Watercress;Nasturtium officinale)、蕹菜(Water spinach;Ipomoea aquatica)、冬马齿 苋(Winter purslane,Claytonia perfoliata)、欧蓍(Yarrow;Achillea millefolium)];结果和开花植物,如来自树[例如,鳄梨(Avocado;Persea americana)、面包树(Breadfruit;Artocarpus altilis)];或者来自一年生或多年生植物[例如,西葫芦(Acorn squash;Cucurbita pepo)、Armenian cucumber(Cucumis melo Flexuosus group)、茄子(Aubergine;Solanum melongena)、铃状椒(Bell pepper;Capsicum annuum)、苦瓜(Bitter melon;Momordica charantia)、小雀瓜(Caigua;cyclanthera pedata)、灯笼果(Cape Gooseberry;Physalis peruviana)、辣椒(Capsicum;Capsicum annuum)、Cayenne pepper(Capsicum frutescens)、佛手瓜(Chayote;Sechium edule)、红辣椒(Chili pepper;Capsicum annuum Longum group)、密生西葫芦(Courgette;Cucurbita pepo)、黄瓜(Cucumber;Cucumis sativus)、茄子(Eggplant;Solanum melongena)、丝瓜(Luffa;Luffa acutangula,Luffa aegyptiaca)、黑子南瓜(Malabar gourd;Cucurbita ficifolia)、Parwal(Trichosanthes dioica)、Pattypan squash(Cucurbita pepo)、Perennial cucumber (Coccinia grandis)、南瓜(Pumpkin;Cucurbita maxima,Cucurbita pepo)、蛇瓜(Snake gourd;Trichosanthes cucumerina)、Squash aka marrow(Cucurbita pepo)、Sweet corn aka corn;aka maize (玉米,Zea mays)、甜椒(Sweet pepper;Capsicum annuum Grossum group)、Tinda (Praecitrullus fistulosus)、毛酸浆(Tomatillo;Physalis philadelphica)、番茄(Tomato;Lycopersicon esculentum var)、冬瓜(Winter melon;Benincasa hispida)、西印度黄瓜(West Indian gherkin;Cucumis anguria)、Zucchini(Cucurbita pepo)];多年生或一年生植物的花芽[例如,洋蓟(Artichoke;Cynara cardunculus,C.scolymus)、球花甘蓝(Broccoli;Brassica oleracea)、花椰菜(Cauliflower;Brassica oleracea)、Squash blossoms(Cucurbita spp.);有荚植物[例如,美洲花生(American groundnut;Apios americana)、赤小豆(Azuki bean;Vigna angularis)、豇豆(Black-eyed pea,Vigna unguiculata subsp.unguiculata)、鹰嘴豆(Chickpea;Cicer arietinum)、菜豆(Common bean;Phaseolus vulgaris)、Drumstick(Moringa oleifera)、扁豆(Dolichos bean;Lablab purpureus)、蚕豆(Fava bean;Vicia faba)、四季豆(Green bean(Phaseolus vulgaris)、瓜尔豆(Guar;Cyamopsis tetragonoloba)、硬皮豆(Horse gram; Macrotyloma uniflorum)、Indian pea(Lathyrus sativus)、扁豆(Lentil;Lens culinaris)、利马豆(Lima Bean;Phaseolus lunatus)、Moth bean(Vigna acontifolia)、绿豆(Mung bean;Vigna radiata)、秋葵(Okra;Abelmoschus esculentus)、豌豆(Pisum sativum)、花生(Arachis hypogaea)、木豆(Pigeon pea;Cajanus cajan)、赤小豆(Ricebean,Vigna umbellata)、多花菜豆(Runner bean;Phaseolus coccineus)、大豆(Glycine max)、珍珠羽扇豆(Tarwi,tarhui,chocho;Lupinus mutabilis)、尖叶菜豆(Tepary bean;Phaseolus acutifolius)、绿豆(Urad bean,Vigna mungo)、刺毛黧豆(Velvet bean;Mucuna pruriens)、四棱豆(Winged bean;Psophocarpus tetragonolobus)、长豇豆(Yardlong bean;Vigna unguiculata subsp.sesquipedalis)];球茎和茎菜类植物[例如,芦笋(Asparagus;Asparagus officinalis)、刺菜蓟(Cardoon;Cynara cardunculus)、块根芹(Celeriac;Apium graveolens var.rapaceum)、芹菜(Celery;Apium graveolens)、象蒜(Elephant Garlic,Allium ampeloprasum var.ampeloprasum)、茴香(Florence fennel;Foeniculum vulgare var.dulce)、大蒜(Garlic;Allium sativum)、球茎甘蓝(Kohlrabi;Brassica oleracea Gongylodes group)、Kurrat(Allium ampeloprasum var.kurrat)、韭葱(Leek;Allium porrum)、莲藕(Lotus root;Nelumbo nucifera)、胭脂仙人掌(Nopal;Opuntia ficus-indica)、洋葱(Allium cepa)、Prussian asparagus(Ornithogalum pyrenaicum)、青葱(Shallot;Allium cepa Aggregatum group)、大葱(Welsh onion;Allium fistulosum)、野韭葱(Wild leek,Allium tricoccum)];根和块茎菜植物[例如,Ahipa(Pachyrhizus ahipa)、秘鲁胡萝卜(Arracacha;Arracacia xanthorrhiza)、竹笋(Bamboo shoot;Bambusa vulgaris and Phyllostachys edulis)、甜菜根(Beetroot;Beta vulgaris subsp.vulgaris)、黑小茴香(Black cumin;Bunium persicum)、牛蒡(Burdock;Arctium lappa)、Broadleaf arrowhead(Sagittaria latifolia)、克美莲(Camas;Camassia)、美人蕉(Canna,Canna spp.)、胡萝卜(Daucus carota)、木薯(Cassava;Manihot esculenta)、甘露子(Chinese artichoke;Stachys affinis)、萝卜(Daikon;Raphanus sativus Longipinnatus group)、块茎香豌豆(Earthnut pea;Lathyrus tuberosus)、魔芋(Elephant Foot yam,Amorphophallus_paeoniifolius)、野生香蕉(Ensete,Ensete ventricosum)、 姜(Ginger,Zingiber officinale)、牛蒡(Gobo,Arctium lappa)、汉堡欧芹(Hamburg parsley,Petroselinum crispum var.tuberosum)、菊芋(Jerusalem artichoke;Helianthus tuberosus)、豆薯(Jicama;Pachyrhizus erosus)、欧防风(Parsnip;Pastinaca sativa)、锥足草(Pignut;Conopodium majus)、香茶菜(Plectranthus,Plectranthus spp.)、马铃薯(Solanum tuberosum)、草原萝卜(Prairie turnip,Psoralea esculenta)、小红萝卜(Radish;Raphanus sativus)、芜箐甘蓝(Rutabaga;Brassica napus Napobrassica group)、蒜叶婆罗门参(Salsify;Tragopogon porrifolius)、鸦葱(Scorzonera,Scorzonera hispanica)、泽芹(Skirret;Sium sisarum)、甘薯(Sweet Potato或Kumara;Ipomoea batatas)、芋(Taro;Colocasia esculenta)、朱蕉(Ti;Cordyline fruticosa)、油莎豆(Tigernut;Cyperus esculentus)、芜青(Turnip;Brassica rapa Rapifera group)、乌卢库薯(Ulluco;Ullucus tuberosus)、山葵(Wasabi;Wasabia japonica)、荸荠(Water chestnut;Eleocharis dulcis)、菊薯(Yacón;Smallanthus sonchifolius)、山药(Yam;Dioscorea spp.)];以及甚至是海植物[例如,浒苔(Aonori;Monostroma spp.,Enteromorpha spp.)、Carola(Callophyllis variegata)、翅菜(Dabberlocks aka badderlocks;Alaria esculenta)、掌状红皮藻(Dulse;Palmaria palmata)、Gim(Porphyra spp.)、Hijiki(Hizikia fusiformis)、海带(Kombu;Laminaria japonica)、紫菜(Laver;Porphyra spp.)、水云(Mozuku;Cladosiphon okamuranus)、紫菜(Nori,Porphyra spp.)、Ogonori(Gracilaria spp.)、马尾藻(Sea grape;Caulerpa spp.)、海甘蓝(Seakale;Crambe maritima)、海白菜(Sea lettuce;Ulva lactuca)、裙带菜(Wakame;Undaria pinnatifida)],其中一些在分类学上甚至不是植物。 
本文描述的方法特别关注来自浆果的化合物和组合物,浆果被认为可产生很多(有益)植物化学物质。浆果的植物学定义是由单个子房产生的单果,如葡萄。浆果是最常见的肉果类型,其中整个子房都会成熟为可食的果皮。这些植物的花具有由两个或多个心皮融合而成的上位子房。种子包埋在子房的肉质中。然而,本文使用的术语“浆果”比植物学的定义的广,包括假浆果(例如,蓝莓)、聚合果(例如,黑莓和覆盆子)、核果(例如,朴树果(hackberry)和Acai palm)以及附果(例如, 草莓)。 
真浆果的实例包括:葡萄(Vitis vinifera)、番茄(Lycopersicon esculentum)和茄科(Solanaceae)的其他种,他们中许多都是有重要经济价值的,如辣椒(Capsicum)和茄子(Solarium melongena)、枸杞(Lycium barbarum,枸杞属(Lycium spp.);茄科)、garberry(小檗属;小檗科(Berberis;Berberidaceae)、红、黑和白醋栗(茶藨子属(Ribes spp.);茶藨子科(Grossulariaceae)),接骨木浆果(Sambucus niger;忍冬科(Caprifoliaceae)),醋栗(gooseberry;茶藨子属(Ribes spp.);茶藨子科(Grossulariaceae))、忍冬(honeysuckle;忍冬属(Lonicera spp.);忍冬科(Caprifoliaceae))(一些种(例如,honeyberry)的浆果是可食的,即使有些是有毒的,但适当纯化后也可提供有用的植物化学物质)、盾叶鬼臼(mayapple;鬼臼属(Podophyllum spp.);小檗科)、nannyberry或sheepberry(荚蒾属(Viburnum spp.);忍冬科(Caprifoliaceae))、Oregon-grape(Mahonia aquifolium;小檗科)和沙棘(Hippophae rhamnoides;胡颓子科(Elaeagnaceae))。本文对于术语“浆果”还考虑改良的多汁浆果,如柑橘属植物的果实。这样的果实,包括橘、金橘、葡萄柚、酸橙和柠檬是在植物学上被称为柑果的改良浆果。 
本文还具体考虑了花楸果(chokeberry,黑果腺肋花楸(Aronia melanocarpa);一般被称作黑花楸果),因其来自于高浓度酚植物化学物质(特别是花色素苷)的深紫色、几乎黑色色素沉着在科学上引起了注意。花楸果的总花色素苷是每100g鲜果1480mg,而原花色素浓度为每100g 664mg(Wu et al.,J Agric Food Chem.52:7846-7856,2004;Wu et al.,J Agric Food Chem.54:4069-4075,2006)。两个值在目前测量的植物中都处于最高值。花楸果主要在浆果的皮上产生这些色素以在恒暴露于紫外辐射中保护果肉和种子(Simon,HortScience 32(1):12-13,1997)。通过吸收蓝-紫光谱中的UV射线,色素可过滤强阳光。ORAC抗氧化剂强度科学测量证明了花楸果具有目前记录的最高值——每100g 16062微摩尔的Trolox当量(Nutrient Data Laboratory,Agriculture Research Service,US Department of Agriculture,2007年出版,题目是″Oxygen Radical Absorbance Capacity(ORAC)of Selected Foods,″,可见于互联网;参见该ORAC参考还提供了277种常见食物的抗氧化值)。花楸果中花色素 苷的分析已鉴定了以下的单个化学物质(除了已知存在于植物界的数百种化学物质以外):花青素-3-半乳糖苷、表儿茶素、咖啡酸、槲皮素、翠雀素、矮牵牛素、花葵素、甲基花青素和二甲翠雀素。所有这些都是抗氧化剂酚的类黄酮种类中的成员,并且发现它们以不同的浓度存在于大量的其他植物中。 
本文提及的很多“浆果”从科学定义上来讲不是真浆果,而事实上是核果、上位果或复合果。核果是单粒种子子房或瘦果产生的果实;示例性核果有朴树果(朴树属;大麻科(Celtis spp.;Cannabaceae))和Acai(Euterpe)(一种亚马逊地区生棕榈果)。上位果实是由下位子房形成的浆果样果实,其中包括花托。值得注意的实例有杜鹃花科(Ericaceae)的果实,包括蓝莓、越橘和酸果蔓。其他上位果实包括:熊果(Arctostaphylos spp.)、岩高兰果(crowberry,岩高兰属(Empetrum spp.))、越橘(Vaccinium vitis-idaea)、草莓树(strawberry tree,Arbutus unedo)和海葡萄(Coccoloba uvifera;蓼科(Polygonaceae))。黄瓜、甜瓜及其亲缘植物的果实是被称作“瓠果”的改良浆果。复合果是具有来自单个花的不同子房的种子的多个单果的集合或聚集体,包括:黑莓、欧洲露莓(dewberry)、boysenberry、olallieberry和泰莓(tayberry,悬钩子属(Rubus))、云莓(cloudberry,Rubus chamaemorus)、罗苷莓(loganberry,Rubus loganobaccus)、覆盆子(Rubus idaeus)和悬钩子属的其他种、美莓(salmonberry,Rubus spectabilis)、小花悬钩子(thimbleberry,Rubus parviflorus)、多腺悬钩子(wineberry,Rubus phoenicolasius)、杨梅和boysenberry。复果是紧密包装在一块的分离花的果实,如桑葚。其他是附果,其中可食部分不是由子房形成,如草莓。 
浆果的颜色是天然植物色素造成的。许多色素是多酚,如主要在浆果表皮和种子中的类黄酮、花色素苷和鞣酸。浆果色素一般是抗氧化剂,因此具有氧自由基吸收能力(“ORAC”),这在植物食物中非常高(Wu et al.,J.Agric.Food Chem.52(12):4026-4037,2004)。与良好的营养物含量一起,ORAC使得一些浆果在一些被称作“超级水果”功能食物类别中脱颖而出,并且被DataMonitor认定为2008年十大生长食物类别(Food Navigator-USA.com,″Fresh,super and organic top trends for2008″,November 28,2007)。 
调节化合物的其他来源以及制备含有所述调节化合物的组合物的方法可在文献中找到。参见,例如,欧洲申请公开文本EP1,985,280;Schmid 等″Plant Stem Cell Extract for Longevity of Skin and Hair″SOFW-Journal,134:30-35,2008;美国专利No.7,544,497,7,582,674;和国际专利公开文本No.WO/2007/084861。 
其他示例性调节化合物包括例如应激诱导的苯丙素(phenylpropanoid,参见,例如图2和Dixon等The Plant Cell 7:1085-1097,1995)。 
示例性调节化合物或试剂包括选自在咖啡果酸或提取物中包含的化合物,包括抗氧化剂化合物绿原酸、奎尼酸、咖啡酸、阿魏酸和原花色素。 
示例性调节化合物或试剂包括泛醌、艾地苯醌以及它们的类似物和衍生物,包括各种酯和共轭化合物。 
示例性调节化合物或试剂包括从可可得到的提取物以及类似物和衍生物。通过各种分离或纯化方法从可可豆得到的提取物、化合物或化合物结合物来自可可属(Theobroma)、Herrania的任何种或所述种的种内和种外杂种。还应理解,类似地,如果这类提取物或化合物来自这些种或杂种的基因工程改造的形式,那么它们也被包括在内。此外,这些化合物的合成制剂、类似物或衍生物以及来自天然或合成发酵方法的化合物同样也被包括在内。这些提取物或化合物优选包含多酚,如可可原花青素,如至少一种选自以下的可可原花青素:(+)儿茶素、(-)表儿茶素、原花青素低聚体2至18、原花青素B-5、原花青素B-2、原花青素A-2和原花青素C-1。 
示例性调节化合物或试剂包括从茶、中国茶(Camellia sinensis sinensis)、阿萨姆茶(Camellia sinensis assamica)或油茶(Camellia oleifera)通过天然方式或合成方式得到的提取物以及类似物和衍生物。 
示例性调节化合物或试剂包括白藜芦醇及其类似物和衍生物,包括葡萄抗生素、gnetin H和牡丹醇B。 
对于制备(绿)茶提取物的方法,参见,例如Perva-Uzunalic et al.,Food Chemistry 96(4):597-605,2006;Koiway & Masuzawa,Jpn.J.Appl.Phys 46:4936-4938,2007;美国专利No.4,668,525和3,080,237。含有多酚 的茶提取物或单个茶衍生的多酚有可从很多来源市购。举例来说,一个来源是Pharma Cosmetix Research,LLC(Richmond,VA),它是用于本文描述的多个实施例中的Premier Green Tea Extract Lot#10783的供应商。 
艾地苯醌(CAS no.58186-27-9)是可从大量供应商市购,包括例如Pharma Cosmetix Research,LLC(Richmond,VA),它是用于本文描述的多个实施例中的艾地苯醌Lot#27816的供应商。 
可使用本领域公认的方法来制备咖啡果提取物;例如,参见美国专利公开文本No.2007/0281048(2007年12月6日公开)。此外,被称为 
Figure 133944DEST_PATH_GSB00000637631200951
的咖啡果提取物可购自VDF FutureCeuticals,Inc.(Momence,IL);对于本文描述的一些实验,使用了来自VDF的 
Figure 195440DEST_PATH_GSB00000637631200952
Beauty Lot#02480000X5729。 
在一个实施方案中,可使用调节化合物或调节化合物结合物来延长皮肤或皮肤下的皮下组织中的一种或多种细胞类型的寿命,所述组织包括脂肪、筋膜、肌肉和血管。这样的处理可以是局部或全身的,并且可在有或没有渗透增强剂或疗法的存在下以本领域技术人员知道的多种方式递送。 
调节剂的表面递送可独特地延长所接触的皮肤或皮下组织中细胞的寿命,而不一定调节整个生物体的寿命。调节试剂的全身递送也可以到达皮肤,以产生寿命调节效应。 
表面制剂可包括但并不限于乳剂、润肤剂、凝胶剂、洗剂、溶液剂、微乳剂、悬浮剂、软膏剂、喷雾剂、延迟或延时释放制剂、贴片、可注射剂、可植入剂、储库剂、覆膜或其他制剂。 
可使用多种方法来增强渗透,包括可增强递送或者破坏皮肤屏障功能的脂质体或聚合物或其他基质递送系统、试剂;超声或声学辅助的递送;激光或机械破坏皮肤或者其他基于能量的装置,所述装置能够增强递送或破坏皮肤屏障功能,因而直接增强递送进入皮肤或穿过皮肤进入皮下组织。 
其他实施方案可包括与皮肤养护产品结合的递送,所述皮肤养护产品如化妆粉底、化妆品、唇膏、洗发剂、洁面乳、防晒品和身体洗剂。全身递送可包括但不限于口服、肠胃外、静脉内、皮内、肌内、直肠、 含服、舌下、阴道、眼、耳、鼻内、喷雾、注射、储库、导管、内窥镜或整合在可植入装置或试剂上或内部。 
在一个实施方案中,所述调节剂被用于减少一种或两种因素,所述因素造成衰老皮肤或提早衰老皮肤的外观,如细纹、皱纹、不均匀色素、皮肤色泽、皮肤弹性、皮肤厚度、孔径、皮肤下垂、失去皮下脂肪或皮肤胶原体积以及血管供应异常。 
在另一实施方案中,所述调节剂可与可保护皮肤不受来自任何光源的UV紫外线或IR红外损伤的试剂或方法结合使用,以增强、促进或产生DNA修复或端粒结构保护或修复,或者防止、消除或避免凋亡。所述伴随物可在同一制剂中同时使用,或者在作为抗氧化剂的化合物使用后24小时内顺序使用。 
一个优选的实施方案可包括与可模拟摄热量限制的试剂(如白藜芦醇或sirtuin通路调节试剂)结合使用可调节端粒的试剂。 
其他局部实施方案可单独或者与多种抗癌剂或疗法结合使用寿命调节剂以减少或缩短癌细胞的寿命,以改善或增强所述癌症的破坏,从而改善这类疗法的治愈率。 
另外的局部实施方案可靶向皮肤中的其他结构例如毛发或指甲。一种这类应用是防止、延缓或逆转毛发丧失或衰老的其他病症,如头发花白。所述调节剂可用于与毛发直接接触,或者它可以调节毛囊所在位置的皮肤的衰老或损伤以间接地减少毛发丧失。 
一个实施方案使用了调节剂来保护或修复端粒结构,以延长至少一种细胞的寿命。或者,调节剂可用于缩短至少一种细胞的寿命。尽管延长活细胞的寿命是本发明的一个很重要的功能,但在一些情况下,如患病细胞、损伤细胞或癌细胞中,需要加速此类细胞的死亡或者将无限增殖的细胞转变为寿命有限的细胞,这样它们能够被杀死或者更加响应其他疗法。 
有多种皮肤细胞可被单独或者以多种结合物靶向,以与调节化合物接触。这些皮肤细胞包括但不限于角质形成细胞、成纤维细胞、黑素细胞、朗格汉斯细胞、梅克尔细胞、神经细胞、内皮细胞、脂肪细胞(adipocyte or fat cell)、肌肉细胞和汗腺和脂腺的各种特化细胞、毛发结构细胞、指甲或者其他皮肤附属细胞。还可能需要调节干细胞或祖细胞的寿命。包 括线粒体、核糖体和高尔基体的亚细胞细胞器以及核DNA和线粒体DNA也可以是所述调节剂的间接靶标。 
另一个实施方案涉及将生物体的至少一种细胞与足量的调节化合物接触以保护、防御、逆转、挽救、恢复、复苏或者修复来自环境的急性应激、氧化应激、急性或慢性损伤或者疾病,包括严重损伤的细胞或者濒临死亡的细胞。这些细胞可以是皮肤细胞或者它们可以是来自组织、器官或生物体的任何部位的细胞。 
在另一个实施方案中,所述调节化合物可用于接触非存在于活生物中而是离体的(例如为移植制备的器官)或体外的一种或多种细胞。例如,被运输的供体器官会受到多种细胞应激并且具有有限的存活时长,所述调节剂可用于延长所述时长并且/或者增加在该时长期间内存在的功能健康细胞的数量。关于移植的细胞、组织或器官的另一个应用是修复端粒结构,以使移植之前或之后的寿命延长。例如,来自年老供体的供体肾脏可在移植前用调节剂处理,以延长用于移植给较年轻的移植受体的肾脏的寿命或者以使所移植的肾脏较不易凋亡或者被来自移植本身或在移植后给予的免疫抑制疗法损伤。 
体外受精以及胚胎和干细胞研究是另外的实施方案,其中所述调节剂可用于延长细胞的寿命。 
在另一个实施方案中,所述调节剂可用于延长生物体的后代或者克隆衍生物的寿命。已知体细胞和胚胎克隆产生的克隆生物体的寿命短于被克隆的原始生物体的寿命。所述调节剂可用于直接延长克隆生物体的寿命。另一个选择是在原始生物体或所述克隆体本身的再克隆事件中使用所述调节剂修复端粒结构。 
在一个实施方案中,所述调节剂可以接触被克隆或由分生组织过程扩展的植物细胞,其中所述细胞系已经变得衰老并且所述试剂可以帮助恢复存活力以延长所述植物细胞培养物的寿命,使得可以连续工业化生产所述植物的拷贝。 
可用的实施方案可以使用所述调节剂来处理自身免疫疾病,在所述自身免疫疾病中自身免疫和炎症过程缩短了细胞的寿命,从而产生疾病、伤残、提早衰老,甚至死亡。 
一个优选的实施方案将其他寿命调节剂与本文发明的调节剂整合, 目的是延长或缩短至少一种细胞的寿命。例如,缩短寿命的调节剂可以与抗癌治疗剂或治疗物一起被包括,目的是使所述癌靶细胞对所述疗法更敏感。另一个实例可以差异性地调节寿命,以使癌细胞的寿命缩短而正常的非癌细胞的寿命延长或至少被保护。 
延长心肌细胞的寿命的实施方案可用于延长整个生物体的寿命,例如人或动物,如马或宠物如猫或狗。调节剂可用于防止、消除或逆转急性损伤(如心肌梗死或心脏病发作或者缺血性发作)过程中的心肌细胞的凋亡,不仅保护这些细胞而且可以防止所述整个生物体的伤残或死亡。 
其他实施方案包括使得所述调节剂与细胞接触的多种不同的新方法,包括为了吸入所述试剂使其雾化成蒸汽浴或湿气;用于与所述试剂接触的浸渍布;可植入浸渍装置,如血管内支架或关节替换物或目镜植入物。调节剂的眼内注射可用于延长视网膜细胞的寿命。可注射填充剂一般用于皮肤和皮下组织,调节剂可以在随时间释放或延时释放的制剂中整合至所述植入物或试剂。用于激素治疗的经皮贴剂可整合用于全身递送的调节剂,作为抗衰老激素取代疗法的一部分。新的经口递送可包括整合至牙膏、漱口剂、口服锭剂、可嚼物质或牙线。 
经口递送的实施方案可包括本领域已知的多种形式,包括但不限于与多种药物结合的营养补剂或维生素、食品或饮料添加剂。通过基因工程改造的植物或动物或其他食品整合所述调节剂是给予调节剂的另一途径。 
一个关键的实施方案是将调节剂或化合物与其他调节寿命的化合物联合使用(结合、共同给予或顺序给予)。端粒结构维持调节化合物可与这样的试剂或化合物以这类方式结合,即所述试剂或化合物在活生物体内可直接或间接地模拟或产生摄热量限制生物化学过程和/或细胞过程。 
另一个相似的实施方案是将调节剂或化合物与调节线粒体的生物发生和/或呼吸能力的其他寿命调节化合物联合使用(结合、共同给予或顺序给予)。 
由于细胞与可损伤至少一种细胞或者可产生细胞应激和/或细胞炎性过程和/或氧化应激和/或DNA或端粒结构损伤和/或细胞凋亡的环境因素直接或间接相互作用导致的提早或加速衰老可通过使用端粒结构调节化合物、摄热量限制模拟化合物和可刺激更有效的线粒体呼吸活性并 且/或者可增加线粒体数量的化合物中至少一种的有效结合物或浓缩物而推迟、减速、消除、防止或甚至修复或逆转。 
在另一个实施方案中,端粒结构调节化合物可与至少一种线粒体生物发生调节化合物结合使用,以使得不仅线粒体的DNA和/或核DNA的端粒结构被保护,而且线粒体细胞器的数量也被调节。为了进一步延长寿命的目标,应当刺激、活化或增强端粒结构的维持,并且刺激线粒体实际数目的增加。 
在另一个实施方案中,在患病或者癌细胞的情况下将需要相反的目标,即加速这些异常细胞的死亡将成为目标,并且因此需要破坏端粒结构维持并且降低所述患病细胞或癌细胞的数目或呼吸效率。 
在另一个实施方案中,可能需要延长健康细胞的寿命并且缩短患病细胞或癌细胞的寿命,以使得组织、器官或整个生物体的健康寿命最大化。 
在一个实施方案中,调节剂例如可传递电子而非终止电子传递的艾地苯醌或其衍生物或类似物可通过将电子在线粒体内绕过复合体I沿电子传递系统传递并改为将电子传递给复合体III用于减少线粒体的氧化应激。复合体I可产生线粒体内固有产生的很多ROS和氧化应激(与暴露于外部环境应激或其他损伤生成的ROS不同),线粒体中和氧化应激的能力有限,因此线粒体呼吸效率随着时间下降,导致受到这种影响的细胞部分提早衰老或衰老或机能障碍或疾病状态。电子的这种绕过因此可以促进细胞寿命的延长,并且还可促进更健康的寿命。 
在另一个实施方案中,调节剂可改善或保护所述功能,或者甚至修复核糖体损伤。核糖体负责在蛋白质合成过程中从DNA指导翻译。因此,维持核糖体翻译活性的准确可延长寿命。目前有报道称,UVB辐射可诱导核糖体和磷酸化通路的持续活化(Tsai et al.,Radiat.Res.171(6):716-724,2009)。这些作者指出,紫外线B(UVB)辐射具有强烈的生物效应并且可调节很多基因的表达。尽管受UVB辐射影响的很多生物学通路仍是受争议,Tsai等使用环式设计的微阵列方法并应用了严格的统计学分析来鉴定UBV辐射后4、8、16或24小时的差异调节基因。在差异调节的基因组列表中最显著的生物学类别通过功能富集分析来提取出。所述作者用该方法确定了参与两个基本细胞过程——核糖体通路 和氧化磷酸化通路——的基因在UVB照射后被持续地活化。线粒体活性测定证实了UVB照射后最长达24小时的活性增强。这些结果表明核糖体和氧化磷酸化通路的持续活化可能在UVB辐射诱导的细胞反应中起关键作用。 
还考虑通过例如改变参与一氧化氮通路的一种或多种基因的表达来改善免疫功能的方法。一氧化氮(NO)的合成是固有免疫细胞的重要效应物功能之一。尽管一些报道已指出,槲寄生凝集素可诱导免疫细胞产生细胞因子,关于凝集素在NO产生中的活性的研究非常有限。例如,目前有报道称(Bong-Kang et al.,J.Biomed.Sci.,197-204,2007)朝鲜槲寄生(例如Viscum album coloratum)凝集素(KML-IIU)在鼠巨噬细胞系中可诱导NO合成。当在次最适浓度的IFN-y存在下用KML-IIU处理巨噬细胞时,NO生产以浓度依赖的方式被诱导(Id.)。 
在另一个实施方案中,通过核糖体活性调节来调节蛋白质合成的速率可用于延长细胞的寿命。 
在另一个实施方案中,可将核酸引入细胞以调节调节剂的水平,所述核酸与调节剂靶(例如端粒酶或sirtuin或电子传递蛋白)的序列有至少70%、80%、90%、99%的同一性。 
在另一个实施方案中,使用诊断学领域技术人员熟知的诊断端粒结构维持蛋白的水平的多种方法。使用这样的诊断可以确定生物体是否可能加速衰老或寿命缩短。在进行所述诊断之后,治疗有效量的调节试剂可用于处理所述生物体。然后,可以以合适周期性间隔测量该处理的效力,以评估所述处理的进展。这样的诊断方法还可用于筛选化合物和化合物制剂以及递送方法的效力和调节剂的最佳浓度。 
在另一个实施方案中,这样的诊断信息可与从所述生物体得到的多种其他信息结合,以形成给出衰老或寿命的相对值标尺的图谱或索引,用来将单个生物体相对于同种生物体的较大群体,或者相对于所述同种生物体的历史数据或可能关注的任何其他数据子集进行定位。该索引可能被看做是衰老索引或衰老衰老指数(aging ageing index)或长寿或寿命索引。 
在另一个实施方案中,来自所述索引的该数据可用于评估以调节剂进行处理干涉的需要,以及用来指导治疗性处理的剂量以及给药途径和 方案。它还可用于风险评估或用于预测性应用。还可以创造寿命延长因子或年龄保护或保护性因子或者抗衰老保护或保护性因子,以指导治疗或者以对调节试剂的效力进行赋值。 
在一个示例性的实施方案中,对人或动物诊断性测试寿命调节蛋白或因子的水平,然后相对于其他人或动物群体定级或分级,以及它们相对于该群体如何比较提供比对照组更长或更短寿命的相对风险因子。然后,可以选出寿命调节化合物或化合物组,以基于所述寿命延长因子治疗所述人和动物。这可以用于试图修复或改正现有损伤,或者它可以以预防的方式被用作寿命保护因子。然后,可使用诊断测试来评估所述治疗的效力,并指导使用所述调节因子进行治疗。 
在另一个实施方案中,为了通过使用人基因组或具体定制的cDNA微阵列来评估抗衰老基因的表达谱的目的,收集来自皮肤或任何内部器官或系统的口腔拭子、钻孔取物或刮取活组织检查物并与对照样本比较,所述对照样本可以来自年龄匹配的受试者、多个受试者的收集物集合或者同一受试者取自数年前或数年后。对该图谱的这种比较使得能够确定衰老对长寿/线粒体相关的遗传因子的相对效应。 
在另一个实施方案中,为了通过使用人基因组或具体定制的cDNA微阵列来评估抗衰老基因的表达谱的目的,从同一受试者的处理和未处理部位收集来自皮肤或任何内部器官或系统的口腔拭子、钻孔取物或刮取活组织检查物。该基因表达谱的比较可用于评估所述治疗方式改变/延长所述长寿或线粒体功能的能力。该实施方案可允许测试制剂水平,调节化合物作为活介入物结合应用和顺序应用。这一点的一个实例是将调节剂包括在施用给受试者的防晒霜中,然后进行测试,并且通过前述基因组数据确定效力的相对水平。 
组合物,包括药物组合物 
用于本发明方法的组合物可以常规的方式使用一种或多种生理可用的载体进行配制。化妆品或药用化妆品组合物的方法和形式是已知的。非限制性实例参见美国公开文本2009/0208433、日本公开文本JP08092057、JP2000319154;和英国公开文本GB2445265A。 
化合物及其生理可接受盐和溶剂化物可被配制,用于通过例如注射、 吸入或吹入(通过口或鼻)给药,或者口服、含服、肠胃外或直肠给药。所述化合物可局部施用于靶细胞(例如患病细胞或衰老细胞)存在的部位。 
化合物可被配制用于多种施用方法,所述施用方法包括全身给药(注射剂、丸剂形式、栓剂、吸入剂)和表面给药(乳剂、洗剂、凝胶、包裹剂、涂层绷带或贴片)以及局部给药。对于全身给药,优选注射,包括肌内给药、静脉内给药、腹膜内给药和皮下注射。所述注射剂可配制在液体溶液中,优选在生理相容性缓冲液(如Ringer溶液)中。此外,所述化合物可配制为固体形式,在使用前立即再溶解或悬浮。还包括冻干形式。 
对于经口腔给药,组合物的形式可以是,例如,以可药用赋形剂通过常规方法制备的片剂、锭剂或胶囊剂。所述片剂可通过本领域熟知方法进行包衣。用于经口腔给药的液体制剂的形式可以是,例如,溶液、糖浆或悬浮液,或者它们可以干产品存在,在使用前用水或其他合适载体调配。这样的液体制剂可以可药用添加剂如悬浮剂(例如山梨糖醇糖浆、纤维素衍生物或可食氢化油脂)、乳化剂(例如卵磷脂或阿拉伯树胶)、非水性载体(例如ationd oil、油性酯、乙醇或分馏的植物油)、防腐剂(例如甲基或丙基-对羟基苯甲酸酯或山梨酸)通过常规方法制备。如果合适,所述制剂还可包含缓冲盐、调味剂、着色剂和增甜剂。经口腔给药的制剂可被适当地配制,以得到所述活性化合物的受控释放。 
对于吸入给药,所述化合物可方便地以来自压缩包装物或喷雾器的气雾剂形式来递送。在压缩气雾剂的情况下,剂量单位可通过提供可送递计量量的阀门来确定。所述化合物可被准备,用于吸入器或吹入器中,并且可被配制为含有所述化合物的粉末混合物。 
所述化合物可被配制,用于通过注射(例如通过快速浓注或连续输注)肠胃外给药。所述组合物可包含配制剂,如悬浮剂、稳定剂和/或分散剂。或者,所述活性成分可以是用于在使用前与合适载体例如灭菌无热源水调配的粉末形式。 
缓释可植入制剂可包括被包被的装置,如血管支架或移植物、皮肤或皮下植入物、子宫颈环、牙科植入物或其他植入物或输注泵递送方法。 
所述化合物还可被配制在直肠组合物中,如栓剂或保留灌肠剂。 
除了之前描述的制剂之外,所述化合物还可配制为储库制剂。这类长效制剂可通过植入(例如皮下或肌内植入)或通过肌内注射来给药。 
所述化合物还可被配制,使得通过应用或加入超声、离子电渗、阻塞、声裂和/或其他机制进行皮下递送,与从单独应用所述制剂可以预计的相比,上述机制可扩大孔径、破坏表皮屏障、改变化学结构或另外驱使所述化合物进入皮肤或者增强皮肤吸收。这些方法还可通过增强吸收或使得所述化合物更具反应性或更有效的化学/物理变化来增强所述化合物的作用。 
药物组合物(包括化妆品制剂)可以包含以重量或体积计约0.00001至100%,如0.001至10%或0.1%至5%的一种或多种本文描述的化合物,例如咖啡果、艾地苯醌、肌肽、绿茶提取物或其他植物提取物或它们的组分。 
在一个实施方案中,本文描述的化合物被整合至含有表面载体的表面制剂,所述表面制剂一般适合于表面药物给药,并且包含本领域已知的任何此类材料。可选择所述表面载体,以提供所需形式的所述组合物,所述形式例如软膏剂、洗剂、乳剂、微乳剂、凝胶、油剂、溶液剂等,并且可由天然存在材料或合成起源材料构成。 
制剂可以是无色、无味的软膏剂、洗剂、乳剂、微乳剂和凝胶。 
化合物可被被整合至软膏剂,所述软膏剂一般是半固体制剂(一般基于凡士林或其他石油衍生物)。如本领域技术人员可理解的,待使用的具体软膏剂基质是将提供最适药物递送,并且优选将提供其他所需特性(例如润滑(emolliency)等)的软膏剂基质。乳剂软膏基质是油包水(W/O)乳剂或水包油(O/W)乳剂,并且包括例如十六烷醇、单硬脂酸甘油酯、羊毛脂和硬脂酸。示例性水溶软膏基质制备自多种分子量的聚乙二醇(PEG)。 
化合物可被整合至洗剂,所述洗剂一般是无需摩擦可即可用于皮肤表面的制剂,并且一般是液体或半液体制剂,其中固体颗粒(包括活性成分)存在于水或醇基质中。洗剂一般是固体悬浮剂并且可包含水包油型的液体油性乳剂。 
化合物可被整合至乳剂,所述乳剂一般是粘性液体或半固体乳剂,可以是水包油或油包水。乳剂基质是可水洗的并且含有油相、乳化剂和 水相。 
化合物可被整合至微乳剂,所述微乳剂是两种不混溶液体(如油和水)的热力学稳定、均质清澈的分散体,通过表面活性剂分子的界面层来稳定。 
化合物可被整合至凝胶制剂,所述凝胶制剂一般是半固体系统,由小无机颗粒构成的悬浮物(两相系统)或由基本均匀分布在载体液体中的大有机分子(单相凝胶)构成。单相凝胶可通过例如将所述活性试剂、载体液体与合适的胶凝剂组合在一起,并且混合直到产生典型的半固体产物来制备。尽管凝胶一般使用水性载体液体,醇和油也可用作所述载体液体。 
本领域技术人员所知的多种添加剂可被包括在制剂中,例如表面制剂。添加剂的实例包括但不限于增溶剂、皮肤渗透增强剂、遮光剂、防腐剂(例如,抗氧化剂)、胶凝剂、缓冲剂、表面活性剂(特别是非离子和两性表面活性剂)、乳化剂、软化剂、增稠剂、稳定剂、湿润剂、着色剂、香味剂等。除乳化剂、软化剂和防腐剂外,还特别优选包括增溶剂和/或皮肤渗透增强剂。制剂中还可包含其他活性剂,例如,其他抗炎试剂、镇痛剂、抗微生物剂、抗真菌剂、抗生素、维生素、抗氧化剂和防晒霜制剂中常见的防晒剂。 
局部皮肤处理组合物可包装在合适容器中,以适于其粘性和消费者随时使用。例如,洗剂或乳剂可被包装在瓶子或滚珠敷料器、或者喷射剂驱动喷雾装置或装有适合手指操作的泵的容器。可使用在调和时可将不同室中的产品混合的新式泵或调和器。当所述组合物是乳剂时,可简单地将其储存在不变形的瓶或挤压式容器中,如管或带盖的罐。所述组合物还可包括在如美国专利No.5,063,507所述的胶囊中。 
在另一个实施方案中,提供了用于口服或肠胃外给药的药物制剂,在这种情况下所述制剂可包含如上所述含有活性化合物的微乳剂,但是还可含有其他可特别适用于口服或肠胃外给药的药用载体、运载体和添加剂。或者,可基本如上文所述不经修改将含活性化合物的微乳剂口服或肠胃外给药。 
可通过例如全身、局部、眼内注射本文描述的化合物,或者通过植入释放本文描述的化合物缓释装置来治疗或预防病症。可使用聚合物来 控制释放。用于控制药物递送的各种可降解和不可降解聚合基质是本领域已知的(Langer,Accounts Chem.Res.26:537,1993)。例如,嵌段共聚物polaxamer 407在低温下是粘滞但可流动液体,而在体温下形成半固体凝胶。它已显示是一种有效的制剂载体,并且可以持续送递重组白细胞介素-2和脲酶(Johnston et al.,Pharm.Res.9:425,1992;Pec,J.Parent.Sci.Tech.44(2):58,1990)。或者,羟磷灰石已被用作用于蛋白质的控制释放的微载体(Ijntema et al.,Int.J.Pharm.112:215,1994)。在另一方面,脂质体被用于控制释放和脂质胶囊包裹的化合物的药物靶向(Betageri et al.,Liposome Drug Delivery Systems,Technomic Publishing Co.,Inc.,Lancaster,PA,1993)。治疗性蛋白质的受控送递的多种其他系统是已知的(例如,美国专利No.5,055,303;美国专利No.5,188,837;美国专利No.4,235,871;美国专利No.4,501,728;美国专利No.4,837,028;美国专利4,957,735;和美国专利No.5,019,369;美国专利No.5,055,303;美国专利No.5,514,670;美国专利No.5,413,797;美国专利No.5,268,164;美国专利5,004,697;美国专利No.4,902,505;美国专利No.5,506,206;美国专利5,271,961;美国专利No.5,254,342;和美国专利No.5,534,496)。 
本文描述的化合物可根据本领域的方法保存在无氧环境中。例如,白藜芦醇或其类似物可制备在封闭胶囊中用于口服给药。 
细胞,例如用本文描述的化合物离体处理的细胞,可用将移植物给予受试者的方法来给予。 
还考虑了本文描述的组合物可与其他化合物或药物——例如其他公认的抗氧化剂化合物、防晒霜、抗癌和抗感染剂、抗炎物质等——结合使用。 
阵列 
本文还提供了被发现受抗氧化剂影响和/或已被认为参与寿命延长、细胞长寿或健康、线粒体生物发生或功能、端粒维持或DNA准确性或修复等的基因集合。鉴定可响应抗氧化剂治疗并且以协调方式(例如以公认的通路,以与基因表达中的变化幅度和/或方向类似的方式等)起作用的基因集使得可以生产定制的阵列。这样的阵列可用在很多方面,包括但不限于表征已知抗氧化剂的活性、研究和鉴定潜在的新抗氧化剂组合 物、追踪抗氧化剂治疗方案的生物学效应(例如,在实验系统或受试者上),以及分析例如皮肤活检样本、血液或其他多种身体组分。 
在本发明说明书中,本文描述的具体阵列由SABiosciences(Fredrick,MA)(它们的步骤相关的信息可在网址sabiosciences.com/customarray_biomarker.php#hiw获得)构建。第一定制微阵列(“阵列1”)中的基因基于对先前公认的长寿基因和改变寿命的基因的彻底文献搜索进行选择。第二微阵列(阵列2)包括来自所述第一阵列的基因,加上与线粒体生物发生、呼吸效率、端粒维持的基因和对本文描述的Agilent和/或Affymetrix人基因组阵列分析有大反应的基因。对所述阵列的该定制化使得可进行聚焦的基因分析,这比分析整个人类基因组快得多。选择的阵列类型是适于BioRad iCycler的96孔板。最初的阵列是48基因集(包括所有需要的对照和供应商推荐的QC检查物),并且允许每个板运行两个样本。第二阵列由91个相关基因(其余位置是对照和QC检查物)。所述基因用SABioscience定制阵列在线设计工具选出,一旦输入所述有关基因符号,所述工具即给出参考序列(RefSeq)号。 
举例来说,以下列表提供了本文鉴定与寿命延长的某一方面有关或有联系的基因的两个不同阵列。这些示例性阵列的设计和使用在实施例中描述。 
阵列1(基因符号) 
实施例
  ACE   CCL4L1   GH1   IFI44   MAPK14   PTGS2   TNF
  ACTB   CLK1   HIGX1A   IGF1   NADSYN1   SHC1   TP53
  APOE   COX1   HLA-DRA   IGF2   NFKB1   SIRT1  
  BAX   CREBBP   HPRT1   IL10   NOS2A   SOD1  
  BCL2   CYP19A1   HSPA1A   IL1A   PARP1   SOD2  
  CASP2   DDC   HSPA1B   IL6   PARP2   TEP1  
  CASP9   GAPDH   HSPA1L   KRAS   PPARG   TERT  
阵列2 
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Figure 954635DEST_PATH_GSB00000637631201081
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试剂盒 
本文还提供了试剂盒,例如,用于治疗目的的试剂盒或调节细胞寿命或调节凋亡的试剂盒。试剂盒可以例如预先测量剂量包含一种或多种本文描述的活化或抑制化合物。试剂盒可以任选包含使细胞与所述化合物的接触装置和使用说明书。装置包括注射器和用于将化合物引入受试 者或将其施用于受试者的皮肤的其他装置。 
提供了包含确定与长寿、线粒体生物发生或死亡和/或端粒或DNA修复或维持相关的一种或多种基因(或其编码的蛋白质)的表达水平的必要试剂的试剂盒。本文提供了基因列表和基因集,对所述基因表达的检测(和/或定量)可使用试剂盒完成。所述试剂盒提供的说明书可包括校准曲线、图解、图示或图表等,以与确定的(例如,实验测量的)值或其他结果比较。 
A.检测mRNA表达的试剂盒 
试剂盒可用于检测mRNA表达水平。这样的试剂盒可包括合适量的一种或多种寡聚核苷酸引物,用于逆转录扩增反应,如上文描述的那些类似,具有现有技术明显的修饰可与RNA一块使用。 
在一些实施方案中,用于检测mRNA表达水平的试剂盒还可包括进行PT-PCR体外扩增反应必需的试剂,包括例如RNA样本制备试剂(包括例如,RNA酶抑制剂)、合适的缓冲液(例如聚合酶缓冲液)、盐(例如氯化镁)和脱氧核糖核苷酸(dNTP)。还可包括书面的说明书。 
试剂盒还可包括标记的或未标记的寡核苷酸探针,用于检测体外扩增的靶序列。此类探针的合适序列可以是落在所提供的两个寡核苷酸引物的退火位点之间任何序列,使得与所述探针互补的序列在PCR反应过程中被扩增。 
在所述试剂盒中提供一个或多个对照序列用于RT-PCR反应也是有利的。合适阳性对照序列的设计是相关领域普通技术人员熟知的。 
或者,试剂盒可与进行mRNA的定量或半定量Northern分析必需的试剂一块提供。这样的试剂盒包括,例如,至少一种用作探针的靶序列特异性寡核苷酸。可以任何常规的方式标记该寡聚核苷酸,所述方式包括选择的放射性同位素、酶底物、辅因子、配体、化学发光或荧光剂、半抗原或酶。 
还考虑了包含阵列的试剂盒,其中所述阵列的特征对应于本文鉴定与寿命、长寿、线粒体健康/维持/生物发生和/或端粒或DNA健康或维持有关的基因。 
B.用于检测蛋白质或肽表达的试剂盒 
用于检测蛋白质表达的试剂盒,包括例如对于待检测的每个蛋白质 靶的至少一种靶蛋白特异性结合试剂(例如,多克隆或单克隆抗体或抗体片段),并且可包括至少一种对照。所述蛋白特异性结合试剂和对照可被装在不同的容器中。所述试剂盒还可包括检测靶:试剂复合体的工具,例如所述试剂可被可检测地标记。如果所述可检测试剂未被标记,它可通过第二抗体或蛋白质A检测,例如在一些试剂盒中其可以在一个或多个分离的容器中提供。这样的技术是已知的。 
一些试剂盒中的其他组分包括进行所述测定的说明书。说明书使测试者可确定,例如与对照样本相比,蛋白质表达水平是否改变。所述试剂盒还可包括反应容器或辅助试剂,如色素原、缓冲液、酶等。 
仅举例来说,可建立有效且常规的免疫测定试剂盒例如酶联免疫吸附测定来检测人血清中的抗靶蛋白的抗体。可使用人靶cDNA构建表达载体,以在细菌或杆状病毒中产生重组人靶蛋白质。通过亲和纯化,可产生无限量的纯重组蛋白。 
一些实施方案中的测定试剂盒提供了重组蛋白作为抗原和酶缀合的——例如羊抗人IgG——作为第二抗体以及酶底物。这样的试剂盒可用于检测受试者的血清是否含有抗寿命延长相关靶蛋白(或它们的集合)的抗体。 
本说明书还通过以下实施例来进一步示例性说明,不应以任何方式将这些实施例解释为限制。所有引用的参考文献(包括本申请全文引用的文献参考文献、公开的专利和公开的专利申请)的内容以引用的方式明确地纳入本文。本文提及的任何公众可得的序列若其在2008年12月1日(第一优选权申请的提交日)可以得到则以引用的方式从所述公共数据库纳入本文。 
氧化应激、环境损伤和过早衰老的效应几乎与它们的起因一样多样(图4、5和6)。影响过早衰老和抗长寿效应的最常见机制通路包括AP1基质调节通路、线粒体DNA损伤/缺失、端粒缩短、炎症和癌细胞产生。这些通路受到UV辐射(所有类型和全波长)、热损伤、慢性或急性疾病状态/病状、吸烟、化学物质、饮食习惯和氧化应激/自由基形成形式的环境损伤的影响。所有这些效应可调节细胞基因反应、线粒体数量和/或效 力,以及以消极方式从细胞环境中除去ROS,很像抗氧化剂,并且其他所描述的化合物能够在延长寿命的方向上调节相同的反应。 
以下实验性实施例描述了将UV辐射用于影响之前描述的消极的或缩短寿命的效应。UV辐射被选为损伤产生剂有以下几个原因:1)它是文献中用于损伤培养细胞的常规模型,2)它的剂量可容易地控制和定向,并且3)它是最普遍存在的环境损伤源之一,在现实世界中细胞和组织每天会面对它。使用UV和H2O2不意味着以任何方式限制这些结果的应用或解释,而是想要作为可通过适当使用所述化合物实现的前长寿(pro-longevity)调节类型的实例。先前公认的环境作用因子(氧化应激、热损伤、吸烟、缺氧等)的任何方法可能已经用于或者可以用于进一步扩展以下这些实验性实施例。 
实施例1. 
该实施例示例性说明了通过应用调节化合物(以绿茶多酚为例)保护端粒长度维持和/或延长寿命。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到两种人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物是从高加索人种女性在36岁以及50岁的活组织样本(分别为AG7308和AG14271)建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺、2mM Glutamax I和1×MEM非必需氨基酸溶液的基本必需培养基中培养细胞。在不含胎牛血清的相同培养基中洗涤细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将每个细胞培养物以每孔约1.5×105个细胞接种在6孔组皿中,每孔4ml培养基。每个测试条件或对照接种3孔。 
实验阶段:在第3天,将孔用2ml培养基洗涤1次,再加入2ml无胎牛血清的培养基并且预孵育30-60分钟,然后以测试或对照条件激发。在所述预孵育之后,从孔中吸出培养基,将2.5ml在含1%胎牛血清的培养基中的测试或对照条件用吸液管加入到合适的孔中。 
所使用的绿茶多酚是Premier Green Tea Extract Lot#10783,获自Pharma Cosmetix Research,LLC(Richmond,VA)。将所述绿茶提取物以 w/v比称量至上述基本必需培养基+1%胎牛血清的储备溶液中,然后用MEM+1%胎牛血清连续稀释至测试浓度。 
测试了3种条件:(1)在UVB暴露前(而不是UVB暴露过程中或之后)将细胞暴露于所述测试条件4小时(2)在UVB暴露之后(而不是之前或过程中)将细胞暴露于所述测试条件(3)在UVB暴露之前、过程中和之后将细胞暴露于所述测试条件4小时。将未经测试条件的UVB暴露的和未暴露的细胞用作对照。在UVB暴露后24小时结束所述实验阶段。然后,将来自每个测试和对照参数的细胞用胰蛋白酶处理,通过离心收集,在PBS中洗涤3次,使用血细胞计数器进行细胞计数。将最终的沉淀物在-80℃下保存至进一步处理。 
UVB暴露:通过使用ThermoOriel太阳模拟模型SP66923-3056将细胞暴露于UVB,接受200mJ/cm2UVB。从培养皿的底部暴露细胞。针对所述培养皿中塑料的干扰,调整递送至所述细胞的UVB剂量。 
细胞提取物的制备:依照Allied Biotech,Inc,Quantitative Telomerase Detection Kit的说明书,用实验阶段后在-80℃下保存的细胞沉淀物制备用于PCR的提取物。简而言之,将沉淀物解冻并且立即重悬浮于200ul 1×裂解缓冲液/105至106个细胞。将所述悬浮液在冰上孵育30分钟,然后在4℃下以12000×g微量离心30分钟。将上清液等分并在-80℃下保存。 
端粒酶的检测:来自所述细胞的提取物使得可通过偶联所述提取物在寡核苷酸底物上形成端粒重复的能力来检测端粒酶活性,并且使用聚合酶链式反应来扩增所得到的延伸产物。然后,将这些产物用SYBR绿——当与双链DNA产物结合时发出绿色荧光的荧光检测试剂——来显示。每25μl PCR测定物包含12.5μl的2×QTD Premix、1.0μl的细胞提取物和11.5μl的Molecular GradeTM H2O(蒸馏的、去离子的、无菌过滤的水,超纯且无DNA酶、RNA酶和蛋白酶)。 
在25℃下,将所述样本在BioRad iCycler中处理20分钟以完成所述端粒酶反应。然后立即进行PCR起始活化步骤,在60℃下进行10分钟。然后,所述iCycler进行变性、退火和延伸(分别在95、60和72℃下30秒)系列反应40个循环。在所述延伸阶段进行SYBR绿检测。 
端粒酶检测结果:从所述iCycler中将N=3的结果下载至改良的阵 列分析程序,并检查所述结果的统计学显著性。原始分析在数据表1中提供。 
数据表1(端粒酶的水平——在寡核苷酸底物上形成端粒重复的能力;用绿茶提取物处理) 
Figure 353889DEST_PATH_GSB00000637631201151
Figure 253712DEST_PATH_GSB00000637631201161
实施例2 
本实施例示例性说明了通过应用调节化合物(艾地苯醌和咖啡果)保护端粒酶长度维持和/或延长寿命。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到两种人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物是从高加索人种女性在36岁以及50岁的活组织样本(分别为AG7308和AG14271)建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺、2mM Glutamax I和1×MEM非必需氨基酸溶液的基本必需培养基中培养细胞。在不含胎牛血清的相同培养基中洗涤细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将每个细胞培养物以每孔约1.5×105个细胞接种在6孔组皿中,每孔4ml培养基。每个测试条件或对照接种3孔。 
实验阶段:在第3天,将孔用2ml培养基洗涤1次,再加入2ml无胎牛血清的培养基并且预孵育30-60分钟,然后以测试或对照条件激发。在所述预孵育之后,从孔中吸出培养基,将2.5ml在含1%胎牛血清的培养基中的测试或对照条件用吸液管加入到合适的孔中。 
将所述咖啡果美容提取物(coffee cherry Beauty extract, 
Figure 134337DEST_PATH_GSB00000637631201171
VDF FutureCeuticals,Inc.,Momence,IL)置于先前描述的基本必需培养基+1%胎牛血清和DMSO中的1%咖啡果(w/v)的储备溶液中。用前述的MEM+1%FBS将该储备溶液以1∶10的比例稀释,直至达到测试浓度。在所述测试浓度下,所述DMSO含量少于0.01%——正好处于组织培养物的安全限制内。用溶于无菌乙醇中的所述1%储备溶液以类似的方式制备艾地苯醌稀释液。还用MEM+1%FBS稀释所述1%储备溶液,直至达到所述测试浓度。 
测试了3种条件:(1)在UVB暴露前(而不是UVB暴露过程中或之后)将细胞暴露于所述测试条件4小时(2)在UVB暴露之后(而不是之前或过程中)将细胞暴露在所述测试条件下(3)在UVB暴露之前、过程 中和之后将细胞暴露于所述测试条件4小时。将未经测试条件的UVB暴露的和未暴露的细胞用作对照。在UVB暴露后24小时结束所述实验阶段。然后,将来自每个测试和对照参数的细胞用胰蛋白酶处理,通过离心收集,在PBS中洗涤3次,使用血细胞计数器进行细胞计数。将最终的沉淀物在-80℃下保存至进一步处理。 
UVB暴露:通过使用ThermoOriel太阳模拟模型SP66923-3056将细胞暴露于UVB,接受200mJ/cm2UVB。从培养皿的底部暴露细胞。针对所述培养皿中塑料的干扰,调整递送至所述细胞的UVB剂量。 
细胞提取物的制备:依照Allied Biotech,Inc,Quantitative Telomerase Detection Kit的说明书,用实验阶段后在-80℃下保存的细胞沉淀物制备用于PCR的提取物。简而言之,将沉淀物解冻并且立即重悬浮于200ul 1×裂解缓冲液/105至106个细胞。将所述悬浮液在冰上孵育30分钟,然后在4℃下以12000×g微量离心30分钟。将上清液等分并在-80℃下保存。 
端粒酶的检测:来自所述细胞的提取物使得可通过偶联所述提取物在寡核苷酸底物上形成端粒重复的能力来检测端粒酶活性,并且使用聚合酶链式反应来扩增所得到的延伸产物。然后,将这些产物用SYBR绿——当与双链DNA产物结合时发出绿色荧光的荧光检测试剂——来显示。每25μl PCR测定物包含12.5μl的2×QTD Premix、1.0μl的细胞提取物和11.5μl的Molecular Grade H2O。 
在25℃下,将所述样本在BioRad iCycler中处理20分钟以完成所述端粒酶反应。然后立即进行PCR起始活化步骤,在60℃下进行10分钟。然后,所述iCycler进行变性、退火和延伸(分别在95、60和72℃下30秒)系列反应40个循环。在所述延伸阶段进行SYBR绿检测。 
端粒酶检测结果:从所述iCycler中将N=3的结果下载至改良的阵列分析程序,并检查所述结果的统计学显著性。原始分析在数据表2中提供。 
数据表2(端粒酶的水平——在寡核苷酸底物上形成端粒重复的能力;用艾地苯醌或咖啡果提取物处理) 
  与UnTx对照相比    
  36yo UVB单独   0.0001   97.01
  36yo UVB+艾地苯醌4hr   0.0001   90.51
  36yo UVB+艾地苯醌连续   0.0001   97.01
  36yo UVB+咖啡果4hr   0.0001   78.79
  36yo UVB+咖啡果连续   0.0002   101.59
  与UVBTx对照相比    
  36yo UVB单独   1.0000   -1.00
  36yoUVB+艾地苯醌4hr   0.7625   -1.07
  36yo UVB+艾地苯醌连续   1.0000   -1.00
  36yo UVB+咖啡果4hr   0.3712   -1.23
  36yo UVB+咖啡果连续   0.8971   1.05
  36yo艾地苯醌Vs.50yo艾地苯醌4hr   0.2102   1.46
  36yoUVA Vs.36yoUVB   0.5631   -1.19
  50yoUVA Vs.50yoUVB   N/A   -111.43
  36yoUntx Vs.36yoUVA   0.6440   -1.20
  36yo UVA Vs.50yo UVA   0.0532   1.68
结论(有良好的p值/统计学显著性): 
给予了绿茶的36岁细胞(即,来自36岁的人的细胞)比给予同样剂量的50岁细胞有更高水平的端粒酶活性(端粒酶活性+1.33倍或增加33%) 
在用1MED的UVB应激处理之前给予绿茶的36岁细胞与给予艾地苯醌的相同细胞相比端粒酶活性增加+2.8倍(约180%)。 
在用1MED的UVB应激处理之前给予绿茶的50岁细胞与给予艾地苯醌的相同细胞相比端粒酶活性增加+3.36倍(约236%)。 
给予艾地苯醌的36岁细胞的活性比未处理的细胞的活性小约53%。 
给予艾地苯醌且用1MED UVB应激处理的36岁细胞的活性比未处理的细胞的活性降低2.4倍,比UVB单独应激处理的细胞的活性低1.7倍。 
给予艾地苯醌且用1MED UVB应激处理的50岁细胞的端粒酶活性比未处理对照的端粒酶活性降低约2.61倍,比UVB处理的同样年龄的细胞低2.65倍。 
仅用绿茶处理的36岁细胞和UVB应激+绿茶处理的36岁细胞与 UVB处理的细胞相比端粒酶活性有略微的升高(分别为+1.55和+1.65)。 
与未受应激处理而接受艾地苯醌的同样年龄细胞相比,当对未用UVB应激处理的36岁细胞给予绿茶时端粒酶活性升高(+1.69倍或69%)。 
p值和统计学显著性较低的最终趋势表明,36岁未处理细胞的端粒酶活性比50岁未处理细胞低。 
实施例3。 
该实施例示例性说明了对与咖啡果提取物和艾地苯醌接触的细胞的衰老、寿命和端粒酶长度保持相关的基因表达谱的检查,证明了寿命和/或端粒长度延长特性。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到两种人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物是从高加索人种女性在36岁以及50岁的活组织样本(分别为AG7308和AG14271)建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺、2mM Glutamax I和1×MEM非必需氨基酸溶液的基本必需培养基中培养细胞。在不含胎牛血清的相同培养基中洗涤细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清含量。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将每个细胞培养物以每孔约1.5×105个细胞接种在6孔组皿中,每孔4ml培养基。每个测试条件或对照接种3孔。 
实验阶段:在第3天,将孔用2ml培养基洗涤1次,再加入2ml无胎牛血清的培养基并且预孵育30-60分钟,然后以测试或对照条件激发。在所述预孵育之后,从孔中吸出培养基,将2.5ml在含1%胎牛血清的培养基中的测试或对照条件用吸液管加入到合适的孔中。 
测试了9种条件:(1)在UV暴露前(而不是UV暴露过程中或之后)将细胞暴露于测试条件之一4小时(1μM艾地苯醌、0.001%咖啡果或0.001%绿茶提取物;来源或制备如上所述)(2)在UV暴露前、过程中和之后将细胞暴露于测试条件之一4小时。(3)将未经测试条件的UVA1、UVB暴露的或未暴露的细胞用作对照。在UV暴露后24小时结束所述 实验阶段。然后,将来自每个测试和对照参数的细胞制备,用于如下所述的RNA分离。 
UVB/UVA1暴露:通过使用ThermoOriel太阳模拟模型SP66923-3056将细胞暴露于UV,接受200mJ/cm2UVB/1MED UVA1。从培养皿的底部暴露细胞。对于所述培养皿中塑料的干扰,调整递送至所述细胞的UV剂量。 
RNA的制备:使用Qiagen RNEasy Plus Mini Kit依照制造商的方案分离RNA,所述方案可见于互联网网址qiagen.com/literature/Default.aspx?Term=&Language=EN&LiteratureT ype=4&ProductCategory=10162。在用于所述阵列前,在μQuant分光光度计中使用260/280nm读取方法对所述RNA进行定量和纯度检查。 
定制微阵列(“阵列1”)的建立和运行:通过Superarray Bioscience Corporation的定制阵列设计服务,开发了96孔RT-PCR微阵列(“阵列1”),以示例性说明如上处理的细胞中对参与长寿的具体基因以及相关质量控制物的遗传反应。根据制造商的指导并依照制造商推荐的方案进行所述阵列,所述制造商推荐的方案可见于互联网网址superarray.com/Manual/pcrarrayplate.pdf。 
定制微阵列结果:使用δCT法从所述微阵列确定结果,所述δCT法使用与对照基因的比较和目的基因的阙值循环,以生成相对表达值。全部实验条件组相互参考,数据在数据表3中提供。 
实施例4 
该实施例描述了对与绿茶多酚和艾地苯醌接触的细胞的衰老、寿命和端粒酶长度维持有关的基因表达谱的检查,证明了寿命和/或端粒长度延长特性。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到两种人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物是从高加索人种女性在36岁以及50岁的活组织样本(分别为AG7308和AG14271)建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺、2mM Glutamax I和1×MEM非必需氨基酸溶液的基本必需培养基中培养细 胞。在不含胎牛血清的相同培养基中洗涤细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清含量。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将每个细胞培养物以每孔约1.5×105个细胞接种在6孔组皿中,每孔4ml培养基。每个测试条件或对照接种3孔。 
实验阶段:在第3天,将孔用2ml培养基洗涤1次,再加入2ml无胎牛血清的培养基并且预孵育30-60分钟,然后以测试或对照条件激发。在所述预孵育之后,从孔中吸出培养基,将2.5ml在含1%胎牛血清的培养基中的测试或对照条件用吸液管加入到合适的孔中。 
测试了9种条件:(1)在UV暴露前(而不是UV暴露过程中或之后)将细胞暴露于测试条件之一4小时(1μM艾地苯醌、0.001%咖啡果或0.001%绿茶)(2)在UV暴露前、过程中和之后将细胞暴露于所述测试条件之一4小时。(3)将未经测试条件的UVA1、UVB暴露的或未暴露的细胞用作对照。在UV暴露后24小时结束所述实验阶段。然后,将来自每个测试和对照参数的细胞制备,用于如下所述的RNA分离。 
UVB/UVA1暴露:通过使用ThermoOriel太阳模拟模型SP66923-3056将细胞暴露于UV,接受200mJ/cm2UVB/1MED UVA1。从培养皿的底部暴露细胞。针对所述培养皿中塑料的干扰,调整递送至所述细胞的UV剂量。 
RNA的制备:使用Qiagen RNEasy Plus Mini Kit依照制造商的方案分离RNA,所述方案见于互联网网址qiagen.com/literature/Default.aspx?Term=&Language=EN&LiteratureT ype=4&ProductCategory=10162。 
在用于所述阵列前,在μQuant分光光度计中使用260/280nm读取方法对所述RNA的进行定量和纯度检查。 
定制微阵列的建立和运行:通过Superarray Bioscience Corporation的定制阵列设计服务,开发了96孔RT-PCR微阵列,以示例性说明如上处理的细胞中对参与长寿的具体基因以及相关质量控制物的遗传反应。根据制造商的指导并依照制造商推荐的方案进行所述阵列,所述方案可见于互联网网址superarray.com/Manual/pcrarrayplate.pdf。 
定制微阵列结果:使用δCT法从所述微阵列确定结果,所述δCT 法使用与对照基因的比较和目的基因的阙值循环,以生成相对表达值。全部实验条件组相互参考,数据在数据表4中提供。 
实施例5 
该实施例描述了对与绿茶多酚和咖啡果提取物接触的细胞的衰老、寿命和端粒酶长度维持有关的基因表达谱的检查,证明了寿命和/或端粒长度延长特性。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到两种人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物是从高加索人种女性在36岁以及50的活组织样本(分别为AG7308和AG14271)建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺、2mM Glutamax I和1×MEM非必需氨基酸溶液的基本必需培养基中培养细胞。在不含胎牛血清的相同培养基中洗涤细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清含量。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将每个细胞培养物以每孔约1.5×105个细胞接种在6孔组皿中,每孔4ml培养基。每个测试条件或对照接种3孔。 
实验阶段:在第3天,将孔用2ml培养基洗涤1次,再加入2ml无胎牛血清的培养基并且预孵育30-60分钟,然后以测试或对照条件激发。在所述预孵育之后,从孔中吸出培养基,将2.5ml在含1%胎牛血清的培养基中的测试或对照条件用吸液管加入到合适的孔中。 
测试了9种条件:(1)在UV暴露前(而不是UV暴露过程中或之后)将细胞暴露于测试条件之一4小时(1μM艾地苯醌、0.001%咖啡果或0.001%绿茶)(2)在UV暴露前、过程中和之后将细胞暴露于所述测试条件之一4小时。(3)将未经测试条件的UVA1、UVB暴露的或未暴露的细胞用作对照。在UV暴露后24小时结束所述实验阶段。然后,将来自每个测试和对照参数的细胞制备,用于如下所述的RNA分离。 
UVB/UVA1暴露:通过使用ThermoOriel太阳模拟模型SP66923-3056将细胞暴露于UV,接受200mJ/cm2UVB/1MED UVA1。从培养皿的底部暴露细胞。针对所述培养皿中塑料的干扰,调整递送至 所述细胞的UV剂量。 
RNA的制备:使用Qiagen RNEasy Plus Mini Kit依照供应商的方案分离RNA,所述方案可见于互联网网址qiagen.com/literature/Default.aspx?Term=&Language=EN&LiteratureT ype=4&ProductCategory=10162。在用于所述阵列前,在μQuant分光光度计中使用260/280nm读取方法对所述RNA的进行定量和纯度检查。 
定制微阵列(“阵列1”)的建立和运行:通过Superarray Bioscience Corporation的定制阵列设计服务,开发了96孔RT-PCR微阵列,以示例性说明如上处理的细胞中对参与长寿的具体基因以及相关质量控制物的遗传反应。根据制造商的指导并依照制造商推荐的方案进行所述阵列,所述方案可见于互联网网址superarray.com/Manual/pcrarrayplate.pdf。 
定制微阵列结果:使用δCT法从所述微阵列确定结果,所述δCT法使用与对照基因的比较和目的基因的阙值循环,以生成相对表达值。全部实验条件组相互参考,数据在数据表5中提供。 
实施例6 
该实施例描述对细胞进行UVA/UVB损害,证明了寿命和端粒酶长度维持基因表达谱降低。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到两种人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物是从高加索人种女性在36岁以及50岁的活组织样本(分别为AG7308和AG14271)建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺、2mM Glutamax I和1×MEM非必需氨基酸溶液的基本必需培养基中培养细胞。在不含胎牛血清的相同培养基中洗涤细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将每个细胞培养物以每孔约1.5×105个细胞接种在6孔组皿中,每孔4ml培养基。每个测试条件或对照接种3孔。 
实验阶段:在第3天,将孔用2ml培养基洗涤1次,再加入2ml无胎牛血清的培养基并且预孵育30-60分钟,然后以测试或对照条件激 发。在所述预孵育之后,从孔中吸出培养基,将2.5ml在含1%胎牛血清的培养基中的测试或对照条件用吸液管加入到合适的孔中。 
测试了9种条件:(1)在UV暴露前(而不是UV暴露过程中或之后)将细胞暴露于测试条件之一4小时(1μM艾地苯醌、0.001%咖啡果或0.001%绿茶)(2)在UV暴露前、过程中和之后将细胞暴露于所述测试条件之一4小时。(3)将未经测试条件的UVA1、UVB暴露的或未暴露的细胞用作对照。在UV暴露后24小时结束所述实验阶段。然后,将来自每个测试和对照参数的细胞制备,用于如下所述的RNA分离。 
UVB/UVA1暴露:通过使用ThermoOriel太阳模拟模型SP66923-3056将细胞暴露于UV,接受200mJ/cm2UVB/1MED UVA1。从培养皿的底部暴露细胞。针对所述培养皿中塑料的干扰,调整递送至所述细胞的UV剂量。 
RNA的制备:使用Qiagen RNEasy Plus Mini Kit依照制造商的方案分离RNA,所述方案可见于互联网网址qiagen.com/literature/Default.aspx?Term=&Language=EN&LiteratureT ype=4&ProductCategory=10162。在用于所述阵列前,在μQuant分光光度计中使用260/280nm读取方法对所述RNA的进行定量和纯度检查。 
定制微阵列的建立和运行:通过Superarray Bioscience Corporation的定制阵列设计服务,开发了96孔RT-PCR微阵列,以示例性说明如上处理的细胞中对参与长寿的具体基因以及相关质量控制物的遗传反应。根据制造商的指导并依照制造商推荐的方案进行所述阵列,所述方案可见于互联网网址superarray.com/Manual/pcrarrayplate.pdf。 
定制微阵列结果:使用δCT法从所述微阵列确定结果,所述δCT法使用与对照基因的比较和目的基因的阙值循环,以生成相对表达值。全部实验条件组相互参考,数据在数据表6中提供。 
结果总结(实施例3-6):对结果进行的分析表明: 
统计学上基因受最显著影响的条件是在咖啡果中连续孵育并暴露于UVB的50岁细胞,有7个基因改变。第二最显著的基因总数(6个基因改变)与在UVB暴露前连续给予或之前4小时给予绿茶的36岁细胞以及与艾地苯醌4小时孵育的36岁细胞有关。两细胞系当仅暴露于测试辐 射类型时,表现出TERT基因的显著的并且最小是4倍的降低。 
所述36岁细胞系中,暴露于UVB的细胞表现出PARP1、NADSYN1、IFI44、TERT和NFKB1的显著降低。在用抗氧化剂化合物处理的相同36岁细胞中,同样这些基因没有表现出明显的上调或下调,也没有显著地被上调。该改变的基因表达模式表明所述抗氧化剂化合物可提供一些“逆转或改善”由UVB暴露触发的基因表达的能力。 
Figure 436005DEST_PATH_GSB00000637631201261
在所述50岁细胞系中,以上陈述仍然保持正确。值得注意的是,在UVB暴露的细胞中唯一表现出统计学显著性的基因是TERT。它被下调,并且程度比36岁细胞更大。用抗氧化剂再次处理仍不显著,或者上调所述TERT基因。 
Figure 796579DEST_PATH_GSB00000637631201262
PARP1——在UVB暴露的36岁细胞中显著下调并且在暴露于抗氧化剂化合物的细胞中上调的基因——可能起到值得注意的功能,并且值得进一步研究。该基因本身参与DNA修复、凋亡和皮肤中最佳烟酸状态的维持。 
绿茶连续孵育+UVB处理的36岁细胞呈现TNF下调-18.44。TNF是促炎性细胞因子,在年龄相关疾病中起致病功能。 
仅用UVA1处理的50岁细胞显示出CYP19A1显著下调-10.5倍。CYP19A1是细胞色素P-450的变体,并且参与异生物质代谢和脱毒。 
实施例7 
该实施例示例性说明了向细胞施加调节化合物(绿茶多酚、咖啡果 提取物和艾地苯醌)表现出改变所述端粒长度维持复合体的关键组分的基因表达的能力。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物AG07999是从一名32岁的高加索人种女性的活组织样本建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺和2mM Glutamax I的基本必需培养基中培养细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将1ml的5.0-6.5×105个细胞/ml分别接种至含有20ml培养基的4个75cm2烧瓶的每一个中。 
实验阶段:在第4天,将所述培养基用吸除,并且替换为在20ml仅含1%胎牛血清的培养基中的测试条件。测试条件(制备和来源如上文)是1)1uM艾地苯醌2)0.001%咖啡果3)0.001%绿茶和4)载体对照。所有4种条件的最终载体浓度为0.01%DMSO。在第5天,经过暴露于测试条件24小时后,分离所述细胞并且使用RT2q PCR级RNA分离试剂盒(Superarray Bioscience Corporation)分离RNA。 
RNA的制备:依照制造商的方案使用RT2q PCR级RNA分离试剂盒来分离RNA,所述方案可见于互联网网址superarray.com/Manual/qpcrgrade.pdf。 
在用于所述阵列前,在μQuant分光光度计中使用260/280nm读取方法对所述RNA进行定量和纯度检查。 
进行qPCR引物测定:购买用于6个示例性目的基因(TERT、TPP1、TERF1、TERF2、TINF2、POT1)以及作为持家基因的18s核糖体RNA的测定法。根据制造商的指导并依照制造商推荐的方案进行所述测定法,所述方案可见于互联网网址superarray.com/Manual/realtimePCR.pdf。进行所述测定N=3并使用BioRad GeneX软件包进行分析。将所述阈值循环范围之外或者与所述测定不一致的任何数值从所述分析中剔除。 
qPCR引物测定的结果:使用δCT法从确定测定结果,所述δCT法使用对照基因的比较和目的基因的阈值循环来产生相对表达值(该过程由GeneX包处理)。结果(3次实验的平均值)在图7中显示。具有最低 百分数误差的结果是TERF2基因。 
如图7所示,咖啡果和艾地苯醌各影响2个基因的表达水平(咖啡果接近于影响第三个基因)。艾地苯醌影响TERF1和TERF2,而咖啡果影响TERF2和TINF2(端粒长度的负调节因子)。这可以表明稍微不同的作用机制或相同机制的不同时程/效力,但需要进一步的研究。 
所有抗氧化剂化合物的最大表达值见于TERF2测定中。TERF2被认为在端粒酶的保护活性中发挥功能。 
咖啡果下调TINF2,而TINF2本身是端粒长度的负调节因子,表明了合适浓度的咖啡果能够帮助维持或者可能增加细胞中端粒的长度。 
实施例8 
该实施例示例性说明了对暴露于寿命调节试剂(例如,绿茶多酚、艾地苯醌和咖啡果提取物,来源如上文)的细胞的全人基因组的分析,证明了在非端粒长度延长的其他通路中呈现长寿/寿命延长效应。 
细胞培养物:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物AG07999是从一名32岁的高加索人种女性的活组织样本建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺和2mM Glutamax I的基本必需培养基中培养细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
接种细胞:在第一天,将1ml的5.0-6.5×105个细胞/ml分别接种至含有20ml培养基的4个75cm2烧瓶的每一个中。 
实验阶段:在第4天,将所述培养基用吸除,并且替换为在20ml仅含1%胎牛血清的培养基中的测试条件。测试条件是1)1uM艾地苯醌2)载体对照。所有4种条件的最终载体浓度为0.01%DMSO。在第5天,经过暴露于测试条件24小时后,分离所述细胞并且使用RT2q PCR级RNA分离试剂盒(Superarray Bioscience Corporation)分离RNA。 
RNA的制备:依照制造商的方案使用Qiagen RNEasy Plus Mini试剂盒分离RNA,所述方案可见于互联网网址qiagen.com/literature/Default.aspx?Term=&Language=EN&LiteratureT  ype=4&ProductCategory=10162。在用于所述阵列前,在μQuant分光光度计中使用260/280nm读取方法对所述RNA进行定量和纯度检查。 
Agilent人全基因组阵列的分析:将来自两个样本的RNA送至北卡莱罗纳州Morrisville的Cogenics公司。Cogenics公司是一家技术发展水平位居前列的微阵列服务提供商,促进并加速工业和学术研究者的转录物组作谱和基因发现过程。Cogenics处理样本的方法如下:Cogenics公司收到并使用严格的标准化规程分析RNA样本,所述规程是被设计用于确保质量和监管链。使用Agilent Bioanalyzer microfluidics装置对每个样本进行彻底的质量分析,并且使用Nanodrop-1000分光光度计来对其精确定量。当使用Agilent寡核苷酸微阵列平台(Agilent Oligonucleotide Microarray Platform)时,使用Agilent Low-Input Linear Amplification试剂盒对样本进行荧光标记。在该步骤完成之后,使用上文所述的相同方法评估所述标记的cRNA产物。然后使这些标记的样本成为片段并与寡核苷酸微阵列杂交。洗涤所述微阵列,然后使用Agilent DNA微阵列扫描仪用Sure Scan技术进行扫描。用Agilent的Feature Extraction软件从扫描仪产生的图像提取数据。在这一点上,视检所扫描图像的缺陷,对所提取的数据进行统计学分析以保证测定的质量。可将提取的数据和图像装载至Rosetta Resolver Gene Expression Data Analysis System,用于从质量的观点和形成生物学知识两方面进行深入分析。 
Agilent人基因组阵列的结果:来自所述阵列的所述结果显示了用1μM艾地苯醌处理的样本与未处理细胞相比的整个人基因组的基因表达谱。 
目标1-将来自所述两个荧光团反向杂交复制物的基因表达数据结合,以形成代表目的生物学比较(Tx与UnTx比较)的单个数据表。产生表并且以制表键分割(tab-delimited)的文本文件形式提供。该文件包含由所述微阵列测量的每个转录物的对数比值、倍数变化、对数比p值等。 
使用Rosetta Resolver,基于按照本方案的背景进行的两个荧光团反向杂交结果汇编了单比值比较。计算所述比值,使得Tx样本在分子,UnTx样本在分母。产生表,保存为制表键分割的文本文件,并且在本报告所附的DVD中提供,在“目标1”子目录或“数据分析”目录下。 这些文件包含由所述微阵列上对每个转录物的对数比值、倍数变化、对数比p值等。 
目标2-使用常规标准(具体地,绝对倍数变化值>1.5,对数比p值<0.001)鉴定差异表达的转录物,用于目标1中产生的比较。产生表,并以制表键分割的文本文件形式提供。所述文件仅包含在所述比较情况下差异表达的转录物的对数比值、倍数变化、对数比p值等。 
鉴定差异表达的转录物的标准是绝对倍数变化值>1.5和对数比p值<0.001。这些标准适用于目标1中进行的比较。产生表,保存为制表键分割的文本文件,并且在本报告所附的DVD中提供,在“目标1”子目录或“数据分析”目录下。这些文件包含使用上述标准鉴定为差异表达的每个转录物的对数比值、倍数变化、对数比p值等。 
该实验的结果在数据表7中显示;该表列出了在整个人基因组中显示统计学显著变化的全部基因。所述显示统计学显著变化的基因可被分为亚组,例如基于处理时表达变化的方向、基因之间的关系(例如,通路参与)等。 
在用艾地苯醌和UVB处理后,以下基因的表达显示了统计学显著增加: 
ARHGAP27,MGC34034,AI446524,LIN28B,PSG9,MPPED2,DCP_22_6,DCP_22_4,DCP_22_0,,DCP_22_2,DCP_22_7,LOC440061,THC2319152,HRASLS,BPI,LOC348174,CD1C,ZNF224,TTBK2,C12orf42,ABHD13,AW901755,A_24_P799680,THC2378994,APOBEC3G,CDH7,A_24_P84738,EHF,PARP4,C7orf29,THC2369020,A_24_P289973,THC2378839,MFSD2,FAM40B,A_24_P7820,BC015334,KCNE3,THC2312756,C6orf89,,AQP10,AA918648,TUBB4,AK021467,LOC51581,MSR1,THC2339455,LOC389025,A_24_P622375,THC2407737,C10orf59,A_24_P942151,A_32_P157622,FAM84B,WWC2,ZNF597,TMEM162,THAP5,CR605947,OTUD6A,THC2440027,WRNIP1,PLA2G3,SOLH,MADCAM1,CPSF6,ENST00000356104,A_23_P10605,THC2378378,A_24_P524164,DCP_22_9,C6orf5,AI652920,KCNMB2,CD34,THC2397757,TXNDC4,THC2448178,CV326037,DAGLA,BANK1,KATNAL2,THC2382717,ITGA2,LOC645561,AA581414,SLC7A11,AL547361,AB011149,THC2343350,PCSK9,KCNH2,C17orf67,CNOT6L,THC2375853,THC2342473,THC2368209,AI709405,THC2322443,AA344632,WNT16,CNPY3,AI161396,DKFZP434P211,BE719776,TIGD3,THC2280741,SCFV,AI873070, THC2408828,THC2235542,SC4MOL,PTPRO,DHCR24,AF086205,STK4,DOCK3,CACNA2D1,THC2316768,SLC16A14,OR10A5,THC2437177,AK094571,A_24_P399341,CELSR1,AK026984,PTPN11,AF086329,THC2400593,IL2,CECR2,KLF8,CRY1,THC2397757,ZNF585A,ENST00000371408,NUDCD1,PGGT1B,DKFZp667E0512,CA13,AK094296,AI051172,ZNF347,THC2324430,GPR132,BCHE,ZNF785,THC2279910,CR598370,LOC344887,ENST00000354343,SEC24A,C8orf61,A_32_P205522,CINP,LRRIQ2,FLJ38973,AF086125,AI192327,ITGB2,BP872463,IL1RAP,TAS2R44,LOC153457,CDCA7,RNF111,A_32_P45087,BC008476,AK023647,AK074181,C14orf49,ZNF516,IL27RA,AA631975,BX448200,THC2419011,IGSF9,PIGL,E2F8,HNRPLL,C10orf27,NACA,TMEM154,TLK1,H43551,ANK1,A_23_P13202,AA725860,ENST00000366971,W05707,KIAA1432,SCD,KIAA1377,THC2411515,THC2339241,TRIM23,GRIA1,LOC374491,THC2266906,C4orf32,C11orf17,AL571926,A_32_P135790,AI263083,AI925475,THC2360810,NUPL1,FAM60A,AK001164,DCP_1_7,CSTA,PNPLA4,UTS2D,ATP8A2,和C13orf1. 
在用艾地苯醌和UVB处理后,以下基因的表达显示出了统计学显著降低: 
ZNF289,SDHC,HIST1H1A,A_23_P113762,GOLGA2LY1,FLJ43692,EVL,PSAP,KLHDC8B,AKAP12,NFAT5,SPATA13,A_23_P113263,A_32_P220567,SORD,LOC643668,ITSN1,HSP90AB1,LTB4R2,WNT10A,,FAM3A,AF212044,DENND4A,MDFI,THC2360912,FOXO4,FIP1L1,THC2290002,HSP90AB3P,STARD3,NOL14,FAM73B,ZC3H13,VCP,DYNC2H1,EHBP1,C6orf204,FABP6,LOC285923,PHKG1,MYO15B,GRLF1,HAB1,ZNF792,PLEKHA2,NLRC5,NIPBL,OTUD7B,NPB,LARS,RASL10B,SAFB2,MALL,GRAMD1B,CDC2L1,UBE2E1,TMEM109,CGNL1,AK000053,DENND1B,ETV4,PKD2,BM455859,BQ772270,HNRNPU,A_24_P84719,RCP9,TNRC15,ACTR2,KIAA0372,DDHD1,FER1L3,RIF1,KLHL17,MCAM,NPFFR1,C1orf144,PPFIBP1,ARFGAP1,WDR31,KLC3,CEP290,TJP2,TCF15,ANGPTL4,LRRC61,CLIP1,SKI,CCDC69,LOC650766,PIF1,AMAC1L2,RALBP1,NTRK3,ATF7IP,KIF14,FLJ22659,ZBED1,TNRC4,EP300,C1orf96,LRIT1,ZDHHC22,A_23_P170719,SMYD4,NOTCH2NL,GNAT1,PIK3R3,LOC729392,AHCTF1,RETN,C7orf51,LOC440836,MIA3,A_23_P44053,TUB,PRPH,TTTY14,FLJ35379,TMC8,DIAPH3,LOC641999,SHC2,THC2278725,KIAA1751,ZNF560,ZNF517,GSC2,and D31825. 
在用咖啡果和UVB处理后,以下基因的表达显示了统计学显著增加:ENST00000302942,ZNF224,DCP_22_0,DCP_22_4,DCP_22_6,DCP_22_7,DCP_22_2,A_24_P799680,THC2319152,LOC348174,DKFZP434P211,AK093508,C12orf42,CDRT15,WNT16,LOC389102,MGC39584,ENST00000356104,MTL5,WNK1,CA503034,LGI2,KRIT1,DCP_22_9,AF334588,H40632,ADAM32,LOC645561,KCNE1,SLC16A12,CDC2L6,DUSP13,PCSK1,BE766438,KIAA1333,TDO2,AF146694,FLJ39653,LOC90586,THC2408033,ZNF516,FLJ40330,THC2437177,T70285,FLJ22662,A_24_P524164,THC2407334,CR605947,THC2375512,SEC24A,THC2406779,AA586832,STYX,BX433326,RAB9B,CA843452,PLEKHK1,LOC728499,BQ000605,ZNF681,AF086125,GDF6,ENST00000306515,MYH8,T62549,AL040873,A_24_P622375,THC2397757,CELSR1,AB011149,DAGLA,THC2440027,FAM133A,AA019203,AW885990,TRIM59,THC2337493,ENST00000379108,AI559980,FLJ21777,LOC646371,GIPR,AA725860,CK818527,AK124806,TBC1D8B,LOC731884,BC015449,N4BP2,A1BG,BC015334,CASC5,EPR1,THC2455353,BU160948,LOC727820,ZNF347,PDE11A,DNAH2,MUPCDH,KIAA0226,AK126245,ZMIZ1,ENST00000380357,BE719776,KRT80,SEPSECS,ROPN1L,AK074181,LOC645238,C8orf61,BCHE,THC2397757,AI263083,LRRC2,POLE,THC2405842,THC2408828,H43551,ATP1A2,TXNDC4,PYROXD1,AF086329,BE644757,THC2266906,ZNF585A,FLJ38973,LOC644053,LOC338328,CR740121,AW167080,BX098411,NACA,CPNE4,AA043564,C22orf24,LOC441208,E2F8,Z28739,LOC128977,THC2343350,PGAP1,ZNF702,BC047110,AL566369,CA866957,AI457687,AW858928,A_24_P144054,A_32_P190944,USF2,C17orf67,FAM133A,BC036599,CYP20A1,GALNT4,AW191706,THC2279825,TMEM154,CA772440,GAS2L3,BC019907,DEPDC1B,LOC401022,ZDBF2,AL571926,ZNF236,PRDX3,MYEOV,AK055302,SHC4,THC2404671,AK092668,AK021606,KIAA1524,ENST00000379131,PRR15,USP6NL,CENPK,MAP4K3,BF195626,TM4SF4,CRY1,DB318210,AI925475,PHTF2,OPCML,RXFP3,AK075186,KIAA1217,HNRPLL,AF086017,和AK131472. 
在用咖啡果和UVB处理后,以下基因的表达显示了统计学显著降低: 
A_24_P136155,HSP90AB3P,A_24_P752362,MUM1,HERPUD2,PRO1051,GPRC5C,A_24_P84719,PICK1,SEC14L1,TMEM81,A_24_P229766,FER1L3,RIF1,FLJ10769,MAP4K4,ANAPC7,ARVCF,FLJ23754,TRIB2,TXNRD1,THC2340757,CRY2,PDE5A,SLAE,LOC442245,VCP,BM455859,LTB4R,SELENBP1,NOC2L,SKI,GBA2,SAFB2,KLHL17,ZDHHC17,PPFIBP1,RAI1,ZC3H13,PSAP,TOM1,PATZ1,ANKRD13D,TSPAN18,THC2360912,RALBP1,A_24_P835943,BU561469,NFATC2IP,M74720,CDC2L1,GGT1,WNT10A,CLIP1,HNRNPU,PLEKHA2,C1orf144,THC2356023,TMEM109,KIAA1715,MIA3,COL3A1,HAPLN3,A_32_P149404,PSAP,AKAP12,MAN1C1,MAP1LC3C,EMP1,LGI4,A_24_P922430,C12orf41,THC2361914,HAB1,AJ295984,A_32_P138933,ATP2B3,TAF4B,LOC729392,ANGPTL4,AHCTF1,A_24_P919931,EP300,C10orf39,KLF1,LOC648498,PIK3R3,LOC93349,KLC4,THC2290002,THC2282972,ENST00000342829,ALDH3A1,RASL10B,MGC23270,LYPLA2,TNFRSF21,LOC51152,MALL,A_24_P682550,C1QTNF4,ZBED1,NOTCH2NL,SPATA13,A_23_P44053,C14orf115,MKL2,FLJ31401,CCDC69,A_23_P170719,ABCB10,CROCCL2,FMNL1,C3,NFATC2,ELMO2,C9orf139,IGLL1,THC2361491,GIPC2,ZDHHC22,LOC389517,A_24_P3627,ADORA3,LOC644353,LOC440836,DIAPH3,TUB,BX100298,TH,OPRD1,LOC641999,ZNF814,FLJ25328,C11orf21,ENST00000327781,DLG2,PERLD1,THC2408757,THC2317182,KRTAP4-10,BC032901,FLJ35379,CCR2,MAGIX,THC2406786,MTHFD1L,CITED4,和KIAA1751. 
在用咖啡果处理后,以下基因的表达显示了统计学显著增加: 
GABRA2,THC2319152,A_24_P384379,DCP_22_4,DCP_22_0,DCP_22_7,DCP_22_6,DCP_22_2,A_24_P799680,ZNF224,AK093508,HAL,LOC389102,CREG2,A_23_P134405,C12orf42,AF334588,CDH7,THC2406017,FAM83H,LOC348174,THC2407334,TMEM162,THC2378839,THC2378994,FAM122C,AF034187,CXXC6,OTUD7A,LOC401317,CD28,NUDT10,MFSD2,CASC2,BI836739,THC2342473,MGC39584,LOC400752,TSGA10,AA451708,THC2316936,AA581414,C15orf5,WWC2,KCNE3,A_24_P622375,ZNF587,THAP5,DCP_22_9,AK022479,LOC152217,ZNF585A,KIR3DL1,THC2316768,THC2316649,LGI2,THC2338537,C10orf91,LOC147343,THC2312756,LOC642580,A_32_P71456,CA843452,SUZ12P,LOC727820,UBQLNL,FLJ11996,LOC730057,AK022268,BC008476,HESX1,C20orf74,THC2339455,GDF6,T62549,THC2337372,THC2368209,EPB41L4B,AK021467,CR617865,DKFZP434P211,AA019203,EGR2,THC2437177,C8orf66,SMCHD1,C17orf67,DTWD2,PRR15,THC2281350,LOC550643,A_24_P399341,A_24_P289973,NPL,hCG_1776047,THC2339241,NACA,BQ000605,AK023328,THC2397757,LCORL,THC2419011,GATA6, C11orf73,BX412469,COMMD6,GLIPR1L2,CILP,TBC1D8B,OBSCN,A_32_P9931,ZNF516,THC2279910,BE719776,AK074181,DAGLA,LOC645238,THC2381707,ATP1A2,PDE11A,THC2449905,THC2284350,UTS2D,THC2405936,BC047110,PDE11A,PACSIN1,SEMA6D,THC2453866,AK075186,CELSR1,ANK1,AI652920,THC2358845,THC2314215,ZFPM2,THC2378865,DMD,CDCA7,AL833114,LOC645561,ARHGAP20,NANOS1,THC2397757,PRDX3,GIPR,SCRG1,LYSMD4,ENST00000366930,BM986990,GPR132,AK055302,KATNAL2,FLJ11736,MGC24103,AA631975,AI263083,THC2376586,THC2280343,AK092379,KIAA1377,ENST00000256861,LRP5L,DB352368,A_32_P135790,P2RY4,THC2405319,MCTP2,THC2439773,H43551,C8orf61,BC015449,THC2312785,PDE4DIP,HES1,USP6NL,AF086187,PYROXD1,THC2345075,AV702101,DPY19L1P1,IKZF4,BCHE,AF086329,DB318193,CR740121,AK022339,C9orf53,THC2405842,PCDH7,THC2315330,AI192327,THC2381061,TRIM23,THC2409451,USP34,AK092668,AL041007,CB984746,THC2320257,SFRP4,THC2235542,THC2308340,THC2274697,PCDHB16,MAGI2,THC2405710,THC2343350,THC2441367,A_32_P45087,BC036599,LRRC2,TAF4,THC2376418,AK022044,AK026418,OSBPL10,和THC2406944. 
在用咖啡果处理后,以下基因的表达显示了统计学显著降低: 
PGS 1,A_24_P67268,TBCD,EIF4B,RCN3,SERPINB6,HABP4,A_24_P195454,LOC442013,MAPK13,ADAT1,C21orf2,C4orf23,CR616772,EWSR1,LOC339692,DYRK1A,TEF,ARF3,TPCN2,A_24_P607107,FOXO4,SF3B2,RGS 12,DDX54,TP53INP2,STARD3,SNX12,CSRP1,FDPSL2A,AKT1,STAT3,TOMM34,PIGG,APOBEC3C,NFATC2IP,KIF4A,THC2360912,SAFB2,ANAPC7,TGM2,ATP6V0E2,SMYD4,PMVK,TPCN1,LOC220729,FAM113A,NIPSNAP1,ANP32D,A_24_P375360,MAP7D1,ZNF282,A_23_P205500,HCP5,NBL1,BAX,FLJ23867,EIF4G1,KCTD17,M74720,THC2312955,A_24_P626812,MBD3,CDK5RAP3,COL9A1,CENTG3,KRT16,CAMKK1,FAM63A,TMBIM1,BAT1,NPB,CFL1,CDIPT,ARFRP1,HDAC11,STOML1,STIP1,CNDP2,A_24_P794833,FKBPL,SLC35C2,SMARCD2,BAP1,GRIPAP1,SYNGR2,SEMA4C,CUEDC2,THC2311764,MTCH1,MGC102966,SELENBP1,AP1S1,ATAD3B,NELF,EWSR1,PPIL2,LOC285923,PGS 1,LOC442245,MAN1B 1,DGKA,LTB4R2,PTPRU,RRBP1,LOC643668,IDH3B,ENO2,CAMK1,ADORA1,PPM1G,DBNL,TJP2,BCAP31,HARS,WDR82,MVK,EWSR1,SDHAL2,GAL3ST4,NFATC3,KRT16,RANGAP1,ZCCHC3,C12orf41,ANXA2P1,GBA2,NDE1,AGPAT6,PIK3IP1,TRAFD1,BAP1,RBM23,FLJ40113,P2RX5,MMP14,PAK1,AURKB,LOC220077,ACADS,LOC441455,PAFAH2,EWSR1,FUS,C1orf216,APOL2,BE379389,SERPINB6,PIAS3,UNC84B,ACP2,C20orf3,YKT6,WDR31,PVR,BRD4,NOC2L,ORC1L,COIL,A_24_P41483,PSMC3,DHTKD1,PPOX,HADHA,ST6GALNAC6,RAPGEF1,ZNF768,PSMD2,FKBP4,PQLC2,U87972,IFIT3,SELO,RFC3,KLHL17,PACSIN3,MAGI1,MAPK12,SMARCA4,OPRL1,TCF25,HSPA6,A_24_P195621,KIAA0913,KLHDC8B,GBA2,C1orf144,NFKBIB,ACAD10,TNIP2,PHKG1,SNX17,SNRP70,CCDC69,A_23_P44053,ETV4,CCNF,LGALS9,SEC24C,FLOT1,VCP,ST6GALNAC2,F2RL3,MALL,PAF1,PSAP,PSAP,TMEM109,SUV39H1,ENO1B,DNAJB2,TOM1,GRM4,ARFGAP1,VPRBP,POLE,C10orf10,AGPAT6,A_24_P315674,C20orf165,KLHDC4,A_24_P229766,TSR2,SFXN5,KIAA1715,DYSF,NBPF10,ZNF289,A_24_P928031,AA085955,FLJ35379,TUB,MAP2K7,ACE,TTTY14,CCDC19,IGHG1,E4F1,PPME1,KIAA1751,A_24_P913855,A_24_P247303,SMC4,MSH4,GPR120,NKPD1,GRM5,DCLK3,D90075,ADRA2B,THC2374442,A_32_P111919,ANKRD44,和MYCL1. 
来自该实验的数据还可被进一步分为另外的基因亚组,这里在以下表中提供:数据表8(端粒酶复合体基因);数据表9(DNA损伤和修复基因);数据表10(定制阵列I基因);数据表11(定制阵列II基因);数据表12(抗衰老基因);数据表13(炎性基因);数据表14(线粒体/细胞呼吸/线粒体生物发生基因);和数据表15(一氧化氮合酶基因)。 
还可以使用例如Rosetta Resolver基因表达数据分析系统(Rosetta Resolver Gene Expression Data Analysis System),通过本领域公认的通路将以咖啡果提取物处理而显示出表达的统计学显著改变的基因进行分类。还可通过Rosetta Resolver将基因分成被Gene Ontology定义的“通路”(参见,例如AmiGO,可在线获自amigo.genontology.org,具体是amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi)。与以下“通路”名称相应的通路定义还可见于互联网,例如在Gene Ontology网站。 
对于用咖啡果处理后8小时分析的样本,统计学显著的表达变化可见于以下一级GO(Gene Ontology)术语名“通路”中的基因:ATP分解代谢过程(2个基因);DNA代谢过程(5个基因);DNA修复(29个基因);DNA复制(33个基因);DNA复制检验点(4个基因);DNA复制起始(11个基因);有丝分裂细胞周期G1期(6个基因);JAK-STAT级联(7个基因);从RNA聚合酶II启动子延长RNA(4个基因);UDP-N-乙酰葡糖胺生物合成过程(1个基因);肌动蛋白细胞骨架组织(24个基因);肌动蛋白丝束形成(3个基因);MAPKKK活性的活化(4个基因);NF-κB-诱导的激酶活性的活化(5个基因);雄激素受体信号传递通路(11个基因);血管发生(24个基因);阴离子转运(5个基因);抗凋亡(23个基因);内源性抗原的抗原加工和呈递(6个基因);通过I类MHC的内源性肽抗原的抗原加工和呈递(7个基因);凋亡(49个基因);细胞芳香族化合物代谢过程(9个基因);胆汁酸和胆汁盐转运(2个基因);血液凝固(18个基因);cAMP代谢过程(4个基因);钙介导的信号传递(7个基因);微管胆汁酸转运(2个基因);碳水化合物转运(6个基因);细胞周期(67个基因);细胞周期停滞(32个基因);细胞周期检验点(6个基因);细胞分化(54个基因);细胞分裂(38个基因);细胞运动(29个基因);细胞组分组织(6个基因);细胞增殖(57个基因);细胞-细胞信号传递(50个基因);对饥饿的细胞反应(2个基因);柠檬 酸代谢过程(2个基因);辅酶A代谢过程(2个基因);环加氧酶通路(2个基因);细胞因子介导的信号传递通路(5个基因);锚定在质膜上的细胞骨架(6个基因);左/右对称性的决定(2个基因);多细胞生物体发育(72个基因);双链断裂修复(5个基因);表皮发育(13个基因);红细胞分化(3个基因);叶酸转运(4个基因);葡萄糖转运(6个基因);谷氨酰胺代谢过程(4个基因);甘油-3-磷酸代谢过程(4个基因);葡糖胺聚糖生物合成过程(9个基因);乙醛酸循环(2个基因);生长(6个基因);血红蛋白生物合成过程(3个基因);硫酸乙酰肝素蛋白聚糖生物合成过程(5个基因);后脑发育(3个基因);组蛋白乙酰化(4个基因);细胞铁离子动态平衡(7个基因);异柠檬酸盐代谢过程(2个基因);泌乳(5个基因);巨核细胞分化(2个基因);甲羟戊酸转运(3个基因);有丝分裂(24个基因)、有丝分裂染色体向纺锤极运动(2个基因);一元羧酸转运(3个基因);肌肉器官发育(23个基因);B细胞分化的负调节(3个基因);DNA复制的负调节(2个基因);JAK-STAT级联的负调节(2个基因);Ras蛋白信号转导的负调节(4个基因);细胞分化的负调节(1个基因);细胞增殖的负调节(37个基因);促卵泡激素分泌的负调节(5个基因);干扰素-γ生物合成过程的负调节(3个基因);脂蛋白脂酶活性的负调节(2个基因);巨噬细胞分化的负调节(3个基因);磷酸化的负调节(3个基因);编程性细胞死亡的负调节(1个基因);转录的负调节(16个基因);从RNA聚合酶II启动子的转录的负调节(19个基因);神经系统发育(47个基因);神经管闭合(2个基因);嗜中性粒细胞活化(2个基因);一氧化氮介导的信号转导(3个基因);核小体装配(14个基因);核苷酸分解代谢过程(2个基因);卵泡发育(3个基因);分娩(4个基因);肽交联(3个基因);磷脂酶C活性的活化(6个基因);I-κB激酶/NF-κB级联的正调节(17个基因);血管发生的正调节(5个基因);细胞粘附的正调节(4个基因);细胞生长的正调节(2个基因);细胞增殖的正调节(23个基因);成纤维细胞增殖的正调节(2个基因);促卵泡激素分泌的正调节(3个基因);脂质代谢过程的正调节(2个基因);神经发生的正调节(1个基因);有丝分裂细胞周期的正调节(1个基因);蛋白激酶活性的正调节(3个基因);蛋白质氨基酸的脱磷酸作用(35个基因);蛋白质复合体装配(27个基 因);嘌呤碱基生物合成过程(4个基因);嘌呤核苷酸生物合成过程(4个基因);嘧啶核苷酸代谢过程(3个基因);rRNA加工(13个基因);受体介导的内吞作用(13个基因);MAP激酶活性的调节(2个基因);骨矿化的调节(3个基因);胆固醇生物合成过程的调节(2个基因);细胞周期蛋白依赖的蛋白激酶活性的调节(19个基因);炎性反应的调节(2个基因);脂质代谢过程的调节(2个基因);有丝分裂的调节(5个基因);骨化的调节(1个基因);逆转录病毒基因组复制的调节(2个基因);依赖DNA的转录的调节(291个基因);转录起始前复合体装配的调节(3个基因);转化生长因子β受体信号传递通路的调节(3个基因);对药物的反应(5个基因);对外部刺激的反应(3个基因);对应激的反应(16个基因);骨骼系统发育(22个基因);鞘氨基醇分解代谢过程(1个基因);鞘氨醇代谢过程(1个基因);tRNA加工(8个基因);硫胺转运(2个基因);组织发育(2个基因);转录(226个基因);从RNA聚合酶II启动子的转录(36个基因);有丝分裂细胞周期的横向起始控制点(traversing start control point)(4个基因);和缬氨酸代谢过程(3个基因)。 
对于用咖啡果处理24小时后分析的样本,统计学显著表达变化可见于以下一级GO术语名通路中的基因:DNA损伤检验点(8个基因);DNA损伤反应、导致细胞周期停滞的p53类介导物的信号转导(3个基因);DNA代谢过程(11个基因);DNA重组(18个基因);DNA修复(61个基因);基因DNA复制(66个基因);DNA复制检验点(6个基因);DNA复制起始(12个基因);DNA复制-依赖性核小体组装(3个基因);DNA复制过程中的DNA链延长(4个基因);G0至G1的转变(3个基因);有丝分裂细胞周期G2/M转变(9个基因);L-谷氨酰胺转运(5个基因);MAPK从核中输出(3个基因);MAPK磷酸酶从核中输出,细霉素B敏感性(3个基因);NAD生物合成过程(5个基因);Rho蛋白信号转导(10个基因);UDP-N-乙酰葡糖胺转运(2个基因);UV保护(2个基因);肌动蛋白修饰(3个基因);MAPKK活性的活化(6个基因);MAPKKK活性的活化(4个基因);NF-κB-诱导的激酶活性的活化(6个基因);对活性氧簇的年龄依赖性反应(3个基因);细胞醛代谢过程(5个基因);血管发生(18个基因);凋亡(99个基因); 精氨酸分解代谢过程(6个基因);血液凝固(29个基因);cAMP代谢过程(4个基因);钙介导的信号传递(8个基因);微管胆汁酸转运(3个基因);心脏细胞分化(2个基因);细胞周期(133个基因);细胞周期停滞(30个基因);细胞周期检验点(9个基因);细胞死亡(12个基因);细胞分化(81个基因);细胞分裂(68个基因);细胞生长(15个基因);细胞迁移(11个基因);细胞增殖(105个基因);细胞识别(6个基因);细胞-细胞信号传递(72个基因);细胞-基质粘附(28个基因);细胞-底物连接(cell-substrate junction)组装(2个基因);趋化作用(28个基因);胶原原纤维组织(4个基因);补体激活(4个基因);皮质肌动蛋白细胞骨架组织(6个基因);细胞周期蛋白分解代谢过程(2个基因);细胞因子介导的信号传递通路(8个基因);胞质分裂(10个基因);dTDP生物合成过程(3个基因);dTTP生物合成过程(3个基因);脱氧核糖核苷二磷酸代谢过程(2个基因);子宫内胚胎发育(9个基因);昼夜节律同步(3个基因);上皮向间充质的转变(2个基因);红细胞分化(3个基因);染色质结构的建立或维持(13个基因);有丝分裂纺锤体定位的建立(2个基因);醚脂生物合成过程(2个基因);生殖细胞迁移(7个基因);胶质细胞迁移(2个基因);甘油-3-磷酸代谢过程(4个基因);糖蛋白生物合成过程(3个基因);葡糖胺聚糖生物合成过程(8个基因);性腺发育(3个基因);生长(7个基因);生长激素分泌(3个基因);血红蛋白生物合成过程(3个基因);组蛋白乙酰化(4个基因);过氧化氢分解代谢过程(3个基因);通过胞内信号的凋亡诱导(9个基因);通过死亡结构域受体的凋亡诱导(6个基因);负趋化作用的诱导(2个基因);正趋化作用的诱导(4个基因);胰岛素分泌(3个基因);内部蛋白氨基酸乙酰化(2个基因);间期-S DNA损伤检验点(2个基因);泌乳(4个基因);赖氨酸分解代谢过程(2个基因);巨核细胞分化(2个基因);中胚层迁移(2个基因);甲羟戊酸转运(4个基因);有丝分裂(52个基因);有丝分裂染色体凝集(5个基因);有丝分裂染色体向纺锤体极移动(2个基因);有丝分裂赤道板集合(2个基因);有丝分裂重组(4个基因);有丝分裂姐妹染色单体分离(4个基因);有丝分裂纺锤体延长(2个基因);一元羧酸转运(4个基因);马达轴突导向(motor axon guidance)(2个基因);肌肉器官发育(43个 基因);B细胞分化的负调节(3个基因);DNA复制的负调节(3个基因);T-辅助细胞2分化的负调节(3个基因);促卵泡激素分泌的负调节(7个基因);解旋酶活性的负调节(2个基因);干扰素-γ生物合成过程的负调节(3个基因);脂蛋白脂酶活性的负调节(2个基因);巨噬细胞分化的负调节(3个基因);磷酸化的负调节(3个基因);细胞周期的负调节(37个基因);蛋白质分解代谢过程的负调节(3个基因);姐妹染色单体粘连的负调节(2个基因);转录的负调节(25个基因);从RNA聚合酶II启动子的转录的负调节(30个基因);神经元识别(5个基因);神经递质摄入(4个基因);一氧化氮生物合成过程(5个基因);一氧化氮介导的信号转导(5个基因);核苷酸代谢过程(6个基因);核小体装配(32个基因);核苷酸生物合成过程(7个基因);核苷酸代谢过程(3个基因);核苷酸切除修复(7个基因);器官形态发生(31个基因);有机阴离子转运(9个基因);卵泡发育(4个基因);分娩(4个基因);戊糖磷酸支路(5个基因);肽基-氨基酸修饰(3个基因);磷酸肌醇介导的信号传递(15个基因);JNK级联的正调节(6个基因);T-辅助细胞1分化的正调节(3个基因);血管发生的正调节(5个基因);轴突发生的正调节(4个基因);细胞粘附的正调节(3个基因);成纤维细胞增殖的正调节(2个基因);促卵泡激素分泌的正调节(4个基因);葡萄糖输入的正调节(3个基因);有丝分裂中期/后期转变的正调节(3个基因);转化生长因子β受体信号传递通路的正调节(6个基因);蛋白质氨基酸乙酰化(4个基因);蛋白质氨基酸脱磷酸化(52个基因);蛋白质折叠(64个基因);蛋白质异低聚化(6个基因);蛋白质输入至线粒体内膜内(4个基因);蛋白质输入至线粒体基质内(3个基因);蛋白质定位(7个基因);蛋白质四聚体化(4个基因);蛋白质水解(109个基因);嘌呤核糖核苷一磷酸生物合成过程(4个基因);嘧啶核苷酸代谢过程(5个基因);丙酮酸转运(3个基因);rRNA加工(19个基因);I-κB激酶/NF-κB级联的调节(3个基因);MAP激酶活性的调节(3个基因);Wnt受体信号传递通路的调节(7个基因);细胞周期依赖性蛋白激酶活性的调节(18个基因);线粒体膜通透性的调节(2个基因);神经元分化的调节(5个基因);蛋白质稳定性的调节(5个基因);蛋白质水解的调节(6个基因);逆转录病毒基因组复制的调节(2个基因);从RNA 聚合酶II启动子的转录的调节(71个基因);转录的调节,DNA依赖性(447个基因);转化生长因子β受体信号传递通路的调节(4个基因);对药物的反应(7个基因);对外部刺激的反应(4个基因);对营养物质的反应(10个基因);对辐射的反应(7个基因);对过氧化物的反应(3个基因);对未折叠蛋白的反应(16个基因);感觉器官发育(2个基因);骨骼系统发育(35个基因);纺锤体组织(8个基因);过氧化物代谢过程(5个基因);突触组织(2个基因);tRNA加工(12个基因);转录(355个基因);转化生长因子β受体信号传递通路(13个基因);转运(126个基因);有丝分裂细胞周期的横向起始控制点(10个基因);输尿管芽发育(3个基因);囊泡运输(2个基因);缬氨酸代谢过程(6个基因);和病毒-宿主相互作用(6个基因)。 
实施例9 
该实施例描述了以多种抗氧化剂处理后对果蝇的存活/长寿的全动物分析。 
果蝇培养:从Carolina Biological Supply购买黑腹果蝇(Drosophila Melanogaster)的无翼变种。对这些果蝇喂食营养培养基(配方4-24),在孵化后18小时内收集实验果蝇以确保雌果蝇未交配。 
培养基:给果蝇以下组合: 
1)无蓝色染料的配方4-24用于喂食和暴露于抗氧化剂之后。 
2)添加了1%艾地苯醌或咖啡果提取物的配方4-24用于孵化之后的12天。4-24培养基的制备可以是与用无菌水水合的所有干组分以w/w比例(例如1%艾地苯醌和99%4-24),或者是以适当稀释的(咖啡果用无菌H2O稀释,艾地苯醌最初稀释于无菌乙醇中,然后用H2O连续稀释)测试化合物水合全部量的4-24培养基。 
3)添加了3%H2O2的配方4-24,以氧化应激所述AOX孵育后的果蝇(并缩短其寿命)。 
4)AOX孵育后滤纸上20%蔗糖溶液,以用作低营养培养基和已知的缩短寿命的试剂。 
所述果蝇在正常培养基中孵化并交配,然后被转移至含有不同水平(1%、0.1%或0.01%的艾地苯醌或咖啡果提取物)的小瓶中,或转移 至正常培养基用作对照组。将所述果蝇保持在所述抗氧化剂培养基中12天。然后,将所述果蝇转移至应激培养基中(3%H2O2或20%蔗糖溶液),所述应激培养基已被证明可缩短寿命。每天检查所有果蝇并根据需要更换培养基直到全部果蝇死亡。记录日期(进行12天抗氧化剂孵育后)。 
寿命结果:然后,计算每个组全部果蝇的累积平均寿命并与对照(未处理)果蝇的累积平均寿命相比较,以确定所述抗氧化剂是否延长寿命。按性别分开平均寿命增加以及将两种性别的平均寿命延长结合起来。将该寿命延长表示为对照值相比的百分比增加或减少。 
果蝇培养:从Carolina Biological Supply购买黑腹果蝇(Drosophila Melanogaster)的无翼变种。对这些果蝇喂食营养培养基(配方4-24),在孵化后18小时内收集实验果蝇以确保雌果蝇未交配。 
培养基:给果蝇以下组合1)无蓝色染料的配方4-24用于喂食和暴露于抗氧化剂之后,2)添加了1%艾地苯醌或咖啡果提取物的配方4-24用于孵化后12天,3)添加了3%H2O2的配方4-24以氧化应激所述AOX孵育后的果蝇(并且缩短其寿命),和4)AOX孵育后滤纸上20%蔗糖溶液,用作营养培养基和已知的缩短寿命的试剂。 
实验阶段:对所述果蝇进行的实验一般按照以下方式进行:1)所述果蝇在正常培养基中孵化并交配,然后被转移至含有不同水平(1%、0.1%或0.01%的艾地苯醌或咖啡果提取物)的小瓶中,或转移至正常培养基用作对照组。将所述果蝇保持在所述抗氧化剂培养基中12天。2)然后将所述果蝇转移至应激培养基中(3%H2O2或20%蔗糖溶液),所述应激培养基已被证明可缩短寿命。3)每天检查所有果蝇并根据需要更换培养基直到全部果蝇死亡。4)记录日期(进行12天抗氧化剂孵育后)。 
寿命结果:然后,计算每个组全部果蝇的累积平均寿命并与对照(未处理)果蝇的累积平均寿命相比较,以确定所述抗氧化剂是否延长寿命。按性别分开平均寿命增加以及将两种性别的平均寿命延长结合起来。将该寿命延长表示为与对照值相比的百分比增加或减少并在下文显示。 
  参数   雄性   雌性   两性平均
  H2O2   5.67天   5.11天   5.32天
  1%艾地苯醌+H2O2   5.32天   5.50天   5.75天
  1%咖啡果+H2O2   6.53天   7.71天   7.10天
  %变化艾地苯醌   +8%   -7%   +8%
  %变化咖啡果   +15%   +51%   +33%
       
  20%蔗糖   9.73天   12.2天   11.32天
  1%艾地苯醌+蔗糖   12.11天   11.7天   11.89天
  1%咖啡果+蔗糖   9.25天   13.1天   11.09天
  %变化艾地苯醌   +24%   -4%   +5%
  %变化咖啡果   -5%   +7%   -2%
上表显示出咖啡果或艾地苯醌对置于已知缩短寿命的培养基上且之后用所述抗氧化剂孵育12天的果蝇的寿命变化。在H2O2之前用所述咖啡果预处理达到了统计学显著性。 
  参数   雄性   雌性   两性平均
  0.01%艾地苯醌   未完成   23.4天   23.4天
  0.01%咖啡果   未完成   11天   11天
  0.1%艾地苯醌   未完成   10.2天   10.2天
  0.1%咖啡果   4.1天   未完成   4.1天
  1%艾地苯醌   8.1天   12.4天   10天
  1%咖啡果   10.25天   14.7天   12.6天
  未处理对照   26.5天   38.4天   33.4天
上表显示出当果蝇先孵化然后被直接置于仅含有所述抗氧化剂的培养基上时平均寿命的变化。 
实施例10 
该实施例提供了对添加了抗氧化剂并暴露于氧化应激(以UV辐射的形式)的所培养人成纤维细胞的典型基因表达谱的捕获系统。这提供了对如下基因的采样:与仅以UV辐射损伤的细胞相比,给予抗氧化剂并以UV处理时显著改变的基因。这些基因指示了涉及抗氧化剂补充和UV损伤的修复或保护通路。 
细胞培养:从National Institute on Aging Ceu Repository通过Coriell细胞库得到人皮肤成纤维细胞培养物。所述初始培养物AG07999是从一 名32岁的高加索人种女性的活组织样本建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺和2mM Glutamax I的基本必需培养基中培养细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
实验阶段:在第1天,将细胞接种至4个含有20ml培养基的75cm2烧瓶的每一个中。在第4天,将所述培养基吸除,并且替换为在20ml仅含1%胎牛血清的培养基中的测试条件(抗氧化剂添加物)。测试条件是1)1μM艾地苯醌;2)绿茶;3)咖啡果提取物,和4)未处理对照。 
还在用来自太阳模拟器/单色仪的UVA、UVB或UVA和UVB光组合应激后重复同样这些条件。在确定的时间点(例如,24小时、8小时以及更长——例如144小时)后,裂解所述细胞并提取RNA。然后,在Agilent人全基因组微阵列(Kronick,Expert Rev.Proteomics 1(1):19-28,2004)上处理所述RNA,汇编并分析结果。 
在分析过程中检查两个目标: 
目标1-将来自所述两个荧光团反向杂交复制物的基因表达数据结合,以形成代表目的生物学比较(Tx与UnTx比较)的单个数据表。生成表并且以制表键分割的文本文件形式提供。该文件包含由所述微阵列测量的每个转录物的对数比值、倍数变化、对数比p值等。 
目标2-使用常规标准(具体地,绝对倍数变化值>1.5,对数比p值<0.001)鉴定差异表达的转录物,用于目标1中产生的比较。生成表,并以制表键分割的文本文件形式提供。所述文件仅包含比较情况下差异表达的转录物的对数比值、倍数变化、对数比p值等。 
鉴定差异表达的转录物的标准是绝对倍数变化值>1.5和对数比p值<0.005。 
实施例11 
该实施例提供了对添加了抗氧化剂并暴露于另一形式氧化应激(以过氧化氢的形式)的所培养人成纤维细胞的典型基因表达谱的捕获系统。这提供了对如下基因的采样:当作为保护免遭H2O2诱导的氧化应激的方法给予抗氧化剂时显著改变的基因。这些基因指示了抗氧化剂对用H2O2 氧化应激的细胞的任何保护或有害效应。它还会证明H2O2诱导的氧化应激的作用机制与UV诱导的氧化应激之间的任何差异,为两种应激类型描述可能的修复剂靶。 
细胞培养:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到人皮肤成纤维细胞培养物。所述初始培养物AG07999是从一名32岁的高加索人种女性的活组织样本建立的。 
培养基:在添加了10%胎牛血清、2mM L-谷氨酰胺和2mM Glutamax I的基本必需培养基中培养细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%胎牛血清。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
实验阶段:在第1天,将细胞等量接种至6孔皿中。在第2天,将所述培养基吸除,并且替换为在培养基中的600μM H2O2。测试条件是:1)0.0001%的咖啡果提取物和2)仅H2O2的对照。 
这些条件可在后期扩展,以包括新提取物/化合物。在确定的时间点(例如,24小时、8小时以及更长——例如144小时)后,裂解所述细胞并提取RNA。然后,在Affymetrix人全基因组微阵列上处理所述RNA,汇编并分析结果。 
Affymetrix人全基因组微阵列结果:对所述数据的基本分析将涉及确定显著倍数变化、p值和基本统计。根据显著性、统计准确性和δ值来对数据进行分类。 
实施例12 
设计该实验以确定所测试的抗氧化剂化合物是否对所培养的人成纤维细胞(当给予抗氧化剂化合物或用H2O2应激,或者给予抗氧化剂并且用H2O2应激时)中的线粒体生物发生有任何效应。任何着色加深应与存在的线粒体数目的增加有关,因为细胞是以相同的覆盖率(confluency)和细胞数目接种的。 
细胞培养:从National Institute on Aging Cell Repository通过Coriell细胞库得到人皮肤成纤维细胞培养物。所述培养物AG07999是从一名32岁的高加索人种女性的活组织样本建立的 
培养基:在添加了10%胎牛血清(FBS)、2mM L-谷氨酰胺和2mM Glutamax I的基本必需培养基(MEM)中培养细胞。在24小时实验期间,细胞保持在相同的培养基中,但仅含1%的FBS。所有培养物在加湿室中在37℃和5%CO2下培养。 
实验阶段:在第1天,将细胞以相近的覆盖率接种至24孔组皿的500μl合适培养基中。在第2天,将所有孔中液体吸出。测试孔接受500μl在培养基中的抗氧化剂补充物(咖啡果提取物或艾地苯醌)。测试对照孔仅接受500μl培养基。在24小时、48小时或72小时后,将孔中液体吸出,并向每孔加入300μl在培养基中的线粒体绿色示踪物(MitoTracker Green)并且孵育1小时。在1小时后,将孔中液体吸出,并且用300μl合适的培养基洗涤2次,用荧光计读数。 
测试孔与对照相比的变化百分数(RFU或相对荧光单位)表明存在于接受所述抗氧化剂添加物处理的细胞中的线粒体数量的增加或减少。 
测试的咖啡果提取物稀释度是:0.01%、0.001%、0.0001%、0.00001%、0.000001%。测试的艾地苯醌稀释度是:10μM、1μM、0.1μM、0.01μM、0.001μM。 
结果:使用600μM H2O2诱导细胞应激30或60分钟,并使用咖啡果(CB)诱导细胞恢复,以下结果是在24小时和48小时得到: 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201471
实施例13 
设计该实验以确定所测试的抗氧化剂化合物是否对所培养的人心肌细胞(当给予抗氧化剂化合物或用H2O2应激,或者给予抗氧化剂并且用H2O2应激时)中的线粒体生物发生有任何效应。着色加深应与存在的线粒体数目的增加有关,因为细胞是以相同的覆盖率和细胞数目接种的。 
细胞培养:通过Promocell(德国)得到人心肌细胞。所述肌细 胞是从一名52岁的高加索人种女性建立的。 
培养基:在添加了Promocell推荐的并从其购买的添加物的肌细胞生长培养基中培养心肌细胞。该培养基用于所有生长阶段和使用所述肌细胞的实验。 
实验阶段:在第1天,以接近的覆盖率将肌细胞接种在24孔组皿的500μl合适培养基中。在第2天,将全部孔中液体吸出。测试孔接受500μl在培养基中的抗氧化剂补充物(咖啡提取物—— 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201481
)。测试对照孔仅接受500μl培养基。在24小时或48小时之后,将孔中液体吸出,并向每孔加入300μl在培养基中的线粒体绿色示踪物,并孵育1小时。在1小时后,将孔中液体吸出,并且用300μl培养基冲洗2次,用荧光计读数。 
测试孔与对照相比的变化百分数(RFU或相对荧光单位)表明存在于接受所述抗氧化剂添加物处理的细胞中的线粒体数量的增加或减少。 
测试的咖啡果提取物稀释度是:0.01%、0.001%、0.0001%、0.00001%、0.000001%。 
用 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201482
处理肌细胞的结果 
结果:与对照相比的计算%RFU 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201483
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201484
该数据还显示于表8。 
线粒体似乎对咖啡果提取物有两阶段反应。不囿于任何具体机制,依赖于剂量,咖啡果可以增加或减少线粒体的数量。 
实施例14 
该实施例提供了一种可用于确定添加抗氧化剂之后线粒体呼吸速率或效率的方法。 
细胞培养:通过Promocell(德国)得到人心肌细胞。所述肌细胞是从一名52岁的高加索人种女性建立的。 
培养基:在添加了Promocell推荐的并从其购买的添加物的肌细胞生长培养基中培养心肌细胞。该培养基用于所有生长阶段和使用所述肌细胞的实验。 
实验阶段:在第1天,以接近的覆盖率将肌细胞接种在24孔组皿的500μl合适培养基中。在第2天,将全部孔中液体吸出。测试孔接受500μl在培养基中的抗氧化剂补充物(咖啡果提取物)。测试对照孔仅接受500μl培养基。在确定的时间点(使用与前述实验相同的时间点,24小时、8小时,若需要还有144小时,以模拟苹果干细胞文献/专利的测试条件暴露)后,所述细胞将具有使用Clark电极或Seahorse XF24 Flux分析器根据推荐的方案测量的线粒体效率。 
待测试的咖啡果提取物稀释度:0.01%、0.001%、0.0001%、0.00001%和0.000001%。 
线粒体效率结果:对数据的基本分析包括确定显著变化、p值和基础统计。 
实施例15 
绿原酸激发实验,用于微阵列分析的RNA分离 
以接近的覆盖率将人皮肤成纤维细胞(ag07999)接种在6孔皿中,每孔4ml MEM,10%FBS。在接种24小时后,将孔中液体吸出,加入3ml在MEM(1%FBS)中的绿原酸稀释液,或者为对照孔仅加入MEM(1%FBS)。使用的绿原酸(Acros Organics,Geel,比利时)稀释度为:0.005%、0.0005%、0.00005%、0.000005%和0.0000005%。在用绿原酸激发24小时后,将孔中液体吸出,向每孔加入1ml胰蛋白酶-EDTA,涡旋并吸出。再次向每孔加入胰蛋白酶-EDTA,当细胞从底层释放时用MEM 10%FBS回收并离心成沉淀 物。 
依照使用RT2qPCR级RNA提取试剂盒(来自SABiosciencesCo.)的方案从收获的细胞中收集RNA。然后,将所述RNA用于产生cDNA(使用First Strand合成试剂盒,SABiosciences,依照制造商的说明书),使用定制RT-PCR微阵列(CAPH09464A,SABiosciences)(阵列1)和SYBR Green Reaction Mix(SABiosciences)在BioRad iCycler RT-PCR机器上进行。实施例16的数据在图19中显示;其他结果在下文描述并分析。 
实施例16 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201501
激发实验,用于微阵列分析的RNA提取 
以接近的覆盖率将人皮肤成纤维细胞(ag07999)接种在6孔皿中,每孔4ml MEM,10%FBS。在接种24小时后,将孔中液体吸出,加入3ml在MEM(1%FBS)中的咖啡果稀释液,或者为对照孔仅加入MEM(1%FBS)。使用的 
Figure DEST_PATH_GSB00000637631201502
稀释度为:0.1%、0.01%、0.005%、0.001%、0.0005%、0.0001%、0.00005%、0.00001%、0.000001%。在用咖啡果激发24小时后,将孔中液体吸出,向每孔加入1ml胰蛋白酶-EDTA,涡旋并吸出。再次向每孔加入胰蛋白酶-EDTA,当细胞从底层释放时用MEM 10%FBS回收并离心成沉淀物。 
依照使用RT2qPCR级RNA提取试剂盒(来自SABiosciences公司)的方案从收获的细胞中收集RNA。然后,将所述RNA用于产生cDNA(使用First Strand合成试剂盒,SABiosciences),使用定制RT-PCR微阵列(CAPH09464A,SABiosciences)(阵列2)和SYBR Green Reaction Mix(SABiosciences)在BioRad iCycler RT-PCR机器上进行。实施例15的数据在图20中显示;其他结果在下文描述并分析。 
实施例15和16的结果和讨论 
图9-18显示咖啡果提取物(0.000001%、0.0001%或0.01%)或绿原酸(0.000005%、0.00005%或0.005%)处理的人成纤维细胞的 具体基因(VEGFA、HMOX1、CCL4L1、DDC、NOS2A、SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT4、TERT、PTGS2和IFI44)的表达变化。 
图9(VEGFA;VEGF;血管内皮生长因子)显示了随咖啡果提取物浓度降低VEGFA的相对表达变化。较高浓度的咖啡果提取物(0.01%)可诱导该蛋白质的表达,而较低浓度(0.0001%和0.000001%)实际上会抑制该蛋白质的表达。VEGFA是相对分子量为45000的同型二聚体糖蛋白,是特异性作用于内皮细胞的唯一促细胞分裂原。它可能是体内肿瘤血管发生的主要调节因子。VEGFA是在危急情况下、肿瘤血管发生时促进葡萄糖通过血脑屏障的候选激素,VEGF和IL6在眼内组织中一起产生并且都涉及糖尿病黄斑水肿的发病。VEGF表达增加可用于改善伤口愈合,而表达减少对于治疗视网膜黄斑变性很重要。TGFB的表现被发现类似于对抗氧化剂的表达反应。 
VEGF参与新血管生长的刺激和抑制,这使得其成为伤口愈合和癌症以及视网膜黄斑变性和其他疾病中非常重要的基因。因此,本文的发现——抗氧化剂组合物(如咖啡果和绿原酸)可用于诱导或抑制VEGF表达——使得治疗这些病症的每一种的方法成为可能。 
胶原1A1(皮肤中的主要胶原)表现出与VEGF类似的剂量反应,因此认为(相对)较高浓度的抗氧化剂可用于皮肤的改善细纹、皱纹和其他方面。同时减少MMP-1胶原酶的表达或活性是非常有利的,因此MMP1下调是非常有用的(对所有浓度在大致相同的程度)。这尤其可用于皮肤抗衰老或修复衰老,并且可用于逆转、抑制、推迟或对抗皮肤真皮基质的缺陷,包括例如细纹、皱纹、松垂、影调等。 
图10(HMOX1;血红素加氧酶1)示出了随咖啡果提取物浓度降低,HMOX1相对表达的变化。较高浓度的咖啡果提取物(0.01%)可诱导该蛋白质的表达,而较低水平(0.0001%和0.000001%)实际上会抑制该蛋白质的表达——与针对VEGFA观察到的模式类似。HMOX1可催化血红素形成胆绿素的分解代谢中的限速步骤,所述胆绿素随后由胆绿素还原酶、游离铁和一氧化碳转变为胆红素。血红素加氧酶显示出抗氧化效应,并且所诱导的Hmox1可以保护对抗脂多糖诱导的感染性休克。 
图11(CCL4L1;也称为LAG1)显示出随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加HMOX1的相对表达变化。CCL4L1是染色体17的q-臂上簇集的数个细胞因子基因之一。细胞因子是参与免疫调节和炎性过程的分泌蛋白家族。该蛋白质与CCL4类似,所述CCL4通过与细胞受体CCR5结合抑制HIV进入。该基因的拷贝数因个体而不同;大部分个体在2倍基因组中有1-5个拷贝,但是极少个体不含该基因。已经提出,最有效的抗-HIV药物应该是增加任何CCL4蛋白质(即ACT2或LAG1)表达的药物,所述CCL4蛋白质对主要表达LAG1的以CCR5识别的B-细胞系具有最大亲和性。咖啡果暴露可导致CCL4L1的表达以剂量依赖的方式显著增加,其现在被研究用于改变免疫应答,特别是用于治疗HIV感染。相反,绿原酸显示出非线性的剂量反应,中等剂量(0.00005%)产生显著的CCL4L1抑制。 
图12(DDC;多巴脱羧酶)显示出随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加DDC相对表达的变化。DDC是参与两个代谢通路(生物胺(bioamine)和儿茶酚胺的生物合成)的酶,合成两种重要的神经递质:多巴胺和5’羟色胺。酪氨酸羟化酶(TH;OMIM 191290,儿茶酚胺合成中的限速酶)的多态性与人类长寿变化有关。在该图中显示的咖啡果增加表达的能力提供了一种用于改变神经递质产生的方法,并且可用于治疗抑郁、帕金森病、寿命延长和许多与衰老相关的其他临床疾病和代谢功能。 
图13(NOS2A;一氧化氮合酶2A)示出了随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加NOS2A相对表达的变化。一氧化氮(NO)是信使分子,在整个身体中具有多种多样且非常重要的功能。在大脑和周围神经系统中,NO表现出神经递质的多种特性;它参与与中风和神经变性疾病、平滑肌的神经调节(包括蠕动和阴茎勃起)有关的神经毒性。NO还负责内皮源性舒张因子(EDRF)活性调节血压。在巨噬细胞中,NO可介导杀肿瘤和杀菌作用,这一点由以下事实说明,即NO合酶(NOS)的抑制剂可阻断这些效应。NO还在线粒体生物发生中发挥重要的功能。上调或下调NO表达的能力(如该图中所示)对寿命、线粒体生物发生、健康长寿和总体良 好健康具有重要作用。咖啡果表现出剂量依赖的表达增加,而绿原酸显示出两阶段反应,依赖于剂量而上调或下调表达。 
图14(SIRT1,Sirtuin1)示出了随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加SIRT1相对表达的变化。SIRT1是应激-反应和染色质-沉默因子。它是NAD(+)-依赖的组蛋白脱乙酰基酶,参与多种核事件,如转录、DNA复制和DNA修复。SIRT1蛋白与p53蛋白结合并使其脱乙酰基化,所述脱乙酰基酶活性是体内沉默、重组抑制和寿命延长的原因。此外,SIRT1响应于DNA损伤和氧化应激而抑制p53-依赖性凋亡。所述SIRT1基因由热量限制饮食开启,这可保护细胞避免在应激下死亡并且可延长寿命。咖啡果和绿原酸各自呈现出对SIRT1表达增加或减少的非线性剂量反应曲线,绿原酸为总是减少表达而咖啡果可以增加或减少(并且因此调节)SIRT1表达。 
图15(TERT;端粒酶逆转录酶)示出了随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加TERT相对表达的变化。咖啡果显示出线性剂量反应,而绿原酸显示出非线性反应;相对TERT基因表达随着咖啡果浓度的增加而增加,但是会被不同量的绿原酸诱导或减少。咖啡果增加端粒维持的能力可延长寿命。 
图16(PTGS2;前列腺素-内过氧化物合酶2)示出了随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加PTGS2相对表达的变化。前列腺素合成调节的一种主要机制出现在环加氧酶(也被称为前列腺素-内过氧化物合成酶)的水平上。PTGS1参于产生用于细胞持家功能的前列腺素,而PTGS2与例如损伤、炎症和增殖的生物学事件有关。PTGS2编码促炎环加氧酶2,其被认为是前列腺素合成中的限速步骤,是炎症的重要中介物。咖啡果提取物的量增加诱导了PTGS2基因表达增加,直到在测试剂量下达到平台。相反,绿原酸显示出更加线性型的剂量反应,所述剂量反应在较高浓度下使PTGS2基因表达的显著降低。炎症,特别是慢性炎症,与很多疾病有关,并且与寿命减少(或者特别是健康寿命减少)直接或间接有关,因此,如该图中所示的显著降低PTGS2表达的能力是一个重要的“抗炎症”选择。同样,绿原酸也是不使用类固醇及它们伴随的不良副作 用而减少炎症的一个选择,因为绿原酸可部分地作为植物来源的“非类固醇抗炎”化合物发挥功能。 
图17(IFI44,也被称作p44;干扰素诱导的蛋白质44)示出了随咖啡果提取物和绿原酸(咖啡果提取物的组分)的浓度增加IFI44相对表达的变化。IFI44在感染了丙型肝炎或丁型肝炎病毒的黑猩猩肝脏中被诱导,但在感染了乙型肝炎病毒的黑猩猩的肝脏中未被诱导。其他人已提出,IFI44诱导是响应于病毒感染而产生的干扰素导致的。IFI44可被干扰素(IFN)-α(OMIM:147660)和IFN-β(OMIM:147640)诱导,但不会被IFN-γ诱导。绿原酸可显著降低表达并且减少干扰素产生,而咖啡果可增加表达,从而使得具有上调或下调该干扰素的基因表达的能力。 
图18:暴露咖啡果提取物24小时后人皮肤成纤维细胞中SIRT1-4的相对表达。SIRT基因编码作为使负责细胞调节(例如对应激因子的反应或调节长寿)的蛋白质脱乙酰基化的酶的蛋白质。在所有测试浓度下,咖啡果可下调SIRT1和SIRT4,但依赖于浓度可下调或上调SIRT2和SIRT3的表达。 
来自实施例15和16的基因还被分成多个更小集合,用于比较分析: 
图21示出了暴露于绿原酸(图21a)或咖啡果(图21b)后选择基因在线粒体功能/生物发生通路中的相对表达。对这些参与线粒体通路和生物发生的基因的反应对于咖啡果(主要增加基因表达)和绿原酸(主要减少基因表达)基本上是相反的。不仅基因表达变化的方向基本相反,而且在检查中不同剂量或浓度下个体基因表达方式也相反,绿原酸显示出喇叭形剂量反应曲线的连贯模式,最大表达在所述测试剂量的中间范围内,而所述咖啡提取物显示出更大的剂量反应变化并且对于所描述的很多但非全部基因是非线性的。 
图22示出了暴露于绿原酸(图22a)或咖啡果提取物(图22b)后选择基因在DNA修复通路中的相对表达。除了TERT外,咖啡果的整个模式基本上是在较低浓度下基因表达减少,但是随着剂量增加,基因表达的减少量变少,甚至可能变成正增加。TERT显示出随剂量或浓度渐增基因表达的线性增加,这对于DNA或端粒功能修复 是有利的。相反,对于所有描述的基因,绿原酸显示出非线性剂量反应,并且在TERT的情况下实际上减少基因表达,这与咖啡果的效应相反。 
图23显示出暴露于咖啡果提取物后选择基因在所述端粒维持通路中的相对表达。咖啡果使得TERT基因表达增加并且使POT1的表达减少,所述两种情况与端粒维持增强和可能的寿命延长有关,但是TERF2的减少不适用于此目标。较高剂量或浓度下会增加POT1下调,但随着浓度增加有非线性的TERT反应;然而,两者仍然是有利于延长寿命的表达模式。然而,TERF2在较低浓度下是不利的,但在较高浓度下变为有利于延长寿命。TPP1是可变的。POT1(端粒酶的保护)基因可形成重要的POT1-TPP1端粒复合体,所述复合体是端粒酶加工性复合体。TPP1表达是剂量反应可变的。在最高浓度下,TERF2、POT1、TPP1和TERT基因表达都有利于端粒维持增强和寿命延长。 
还注意到,KL(Klotho)表达随咖啡果水平的增加而增加(与TERT类似),并且在有TERT的情况下,更多的KL对于长寿和健康寿命是有利的。 
图24显示出暴露于咖啡果提取物后PARP1-4基因的相对表达。除其他功能外,PARP可活化信号传递以从线粒体中释放凋亡诱导因子(AIF),导致不依赖胱冬蛋白酶的通路,用于凋亡/编程性细胞死亡,并且可能具有与DNA修复和PARG基因功能相关的功能。PARP家族成员一般相互作用。PARP基因表达减少可有利于延长细胞寿命,这对于健康细胞是有价值的,但是相反地,对于患病细胞或癌细胞,也需要增加PARP表达并促进凋亡的能力,用于加速这些不健康细胞的死亡。因此,减少或增加PARP表达的调节能够用于组织、器官或生物体的总体长寿。 
图25的曲线图示出了暴露于绿原酸24小时后具体基因在人皮肤成纤维细胞中的相对表达,该图证明了剂量反应的典型喇叭形模式,表明了单向变化随后在达到峰值表达水平后回到基线。随着剂量增加,所述基因反应增加或者减少直到达到峰值表达水平。超过所述剂量,所述化合物浓度的任何增加都得到该效应的“逐渐缩小返回”或 递减。该效应可以是上调或下调,但不是双向的。 
图26的曲线图示出了暴露于绿原酸24小时后人皮肤成纤维细胞中具体基因的相对表达,该图证明了剂量反应的典型喇叭形模式,以负的表达值开始并且随着剂量增加它通过零表达值并具有正的表达值,直到达到阈值剂量,然后回到与所述起始剂量相似的坐标轴另一侧。这是记录到得第一类双向剂量反应。 
图27的曲线图示出了暴露于绿原酸24小时后人皮肤成纤维细胞中具体基因的相对表达,该图证明了剂量反应的典型喇叭形模式,以正表达值开始并且随着剂量增加通过零表达值并具有负的表达值,直到达到阈值剂量,然后回到与所述起始剂量相似的坐标轴另一侧。这是记录到得第二类双向剂量反应。 
可基于实施例15和16提供的所述数据得出其他一般性结论和联系。 
总的来说,咖啡果似乎具有“线性”剂量反应曲线,不论所述曲线是朝向上调还是下调。少量观察到的线性曲线反应从下到上调节,或者从下到上调节,这样使得同样咖啡果在观察的不同剂量下有“相反”效应。随剂量显示出线性表达变化的基因(总是被诱导(上调)或总是受抑制(下调))是基础的常规“药物剂量反应曲线”——一般剂量越高反应越大(但是注意到副作用可能会或者不会反映剂量)。然而,也有基因显示出非简单线性的清晰反应——这就突出了小心地调节影响寿命的试剂的剂量是非常重要的。 
总之,绿原酸也有非常一致的模式——因为对浓度变化几乎没有线性反应。绿原酸的所述剂量反应曲线基本上全都是喇叭形曲线,可以是都在基线上的(这样所有的剂量在喇叭形反应中导致上调),或者是都在基线下的(这样所有的剂量在喇叭形反应中导致下调),但是一些曲线跨过基线,并且像上文所述咖啡果一样从上到下调节或从下到上调节。仅有少量的基因对绿原酸的剂量反应是线性的。这是出人意料的结果。 
通过(一般地)比较以绿原酸观察到的曲线和以咖啡果观察到的曲线,很明显一些非常不同的事出现在所述咖啡果中。所述绿原酸在很多情况下似乎不是对基因表达的“主要”作用。然而,也有绿原酸 是主要作用的情况。特别注意的是,随着浓度/剂量变化,反应平衡改变,并且与咖啡果相比,有时仅绿原酸作用变为经常是“相反”的作用(参见,例如,图11-13、15)。 
总的来说,对于绿原酸,在0.000005%和0.0005%时总体有更大活性,从而突出了有利剂量——并且更普遍地,这种情况下更少比更多更有利(或者至少更有效)。 
不意欲囿于任何解释,对于在这些剂量反应分析中观察到的结果,一些观察到的效应可能是在一些情况下(例如低或高浓度下)表现为促氧化剂的抗氧化剂。此外,在一些情况下,绿原酸(单独地,或者作为咖啡果提取物的组分)或咖啡果提取物的另一组分可被转变为其他相关化学物质,所述转变可通过所述测试生物系统的组分或通过平衡相互转化(equilibrium interconversion)(可被相关浓度强烈影响)。还可能有其他化学反应进行。因此,观察到得是影响基因(或基因的集合)的“最终结果”,包括在影响被测定具体基因的通路上游某处发生的任何反应。 
在一些情况下,阻断的受体位点可被一种或其他绿原酸或者咖啡提取物中的组分(能够导致复杂相互作用)阻断或竞争性抑制(或刺激)。 
还认为,所观察到的一些效应是由于不同基因之间的“抵消损失(offsetting penalty)”,使得当诱导化合物浓度变化时,对基因的净效应从上到下或者从下到上,在所述通路中是直接的效应或更远的效应。 
还应理解,由于所使用的绿原酸和咖啡果提取物之间的固有差异可能会观察到不同效应。例如,所述培养的细胞可能优先吸收来自 提取物的化合物,或者可能优先吸收来自所述混合提取物的化合物的一些复合体,而所述纯化的绿原酸制品中没有所述化合物;甚至可能有来自所述混合提取物制品的协同影响。此外,直接使用的绿原酸的量被认为高于存在于咖啡果提取物中的绿原酸的量;这样,所述富集的绿原酸可能触发这样的效应,即所述效应仅在本文测定的咖啡果提取物水平之上的水平可见。 
在所述两个“活性更高的”浓度下,超过三分之一的所述测定基 因(使用阵列1)显示出显著反应。以整体剂量的好/坏以及对具体基因的效应幅度有变化。 
在所述更大的微阵列(阵列2.0)上,对于咖啡果提取物,在最高的浓度下观察到了更显著的变化,但是在所有三个浓度下有类似的变化(但是幅度不同,并且如所记录到的,一些基因从上到下或从下到上变化)。使用较高咖啡果剂量时,似乎对基因表达的效应一般增加,不管它们朝向哪个方向。包括在这其中的是,随着浓度增加,变得“较不好”的基因表达更多了。同时,这突出了剂量是特别重要的。 
实施例17 
在人组织样本中的剂量分析 
该实施例提供了可用于在人测试系统中分析影响寿命的化合物的不同剂量的效应的代表性方法。 
在第一个实施方案中,将在血清中的包含所述测试化合物的制剂(例如,包含一种或多种抗氧化剂化合物的组合物)例如每天两次在上午和下午局部施用于皮肤(例如面部皮肤)。任选地,对于研究中的不同受试者给予不同剂量的所述测试化合物,和/或不同的剂量方案。例如,该选择的方案进行12周。对常规皮肤养护不进行其他改变,但是可选地需要每天使用SPF 30氧化锌防晒霜来使得可以清晰地区分并识别所述测试化合物的影响。 
在处理前以及在处理开始后12周使用3.0mm穿孔器取受试者皮肤的活检样本(前者是为了得到初始基线)。在处理前和处理后从上部脸颊区域取活检样本。在所述基线处理前就诊时,在从耳后非阳光暴露区域取第三活检样本。然后,分析所述活检样本,以例如使用一种本文描述的定制微阵列来确定基因表达的变化。通过比较不同的活检样本,可以评估来自所述测试化合物疗法的基因表达的变化,以及来自环境/Uv光损伤的变化(通过比较光暴露皮肤和非暴露皮肤)。对于施用了不同剂量的测试化合物的多个受试者,可生成剂量反应曲线并确定最佳剂量。 
在第二个实施方案中,每天在上午用餐前口服含有测试化合物的制剂一次,持续24周。在开始处理前,取基线血液样本和皮肤活检 样本用于使用聚焦微阵列分析,所述微阵列如本文提供的一种定制微阵列。在24周时再次对这些样本取样并用相同的方法分析。通过比较来自不同样本的基因表达模式,可以评估所述测试化合物疗法带来的基因表达变化。对于施用了不同剂量的测试化合物的多个受试者,可生成剂量反应曲线并确定最佳剂量。 
用这些方法或类似的方法(可选地与基于细胞的微阵列分析结合或在所述分析后),可以表征例如不同植物制品(果皮对豆或种子对果肉对茎对树皮对叶片等),来自不同植物(如本文列出的植物)的制品、植物提取物的不同浓度、植物提取物的不同混合物、制备植物提取物的不同方法、来自天然存在的提取物的具体组分等的生物学效应和效力。 
实施例18 
应用足量艾地苯醌来改变细胞寿命的作用机制。 
处于氧化应激下的细胞有“停止”电子传递系统中复合体I附近电子的倾向,这反过来造成对细胞的损伤。如果所述电子传递系统不能将电子移动通过复合体I,可能会进一步形成ROS产生的反馈环,造成进一步的损伤。艾地苯醌化合物及其可传递电子的电子衍生物的一种作用机制是以下能力:即携带电子并绕过复合体I将它们传递至更下游的复合体III并且消除位于复合体I处的“瓶颈”和ROS产生增加的倾向。绕过复合体I可增加线粒体呼吸效率并且可减少ROS的产生/积累,并且向寿命延长方向调节所述细胞。 
实施例19 
在外用抗衰老组合物中使用调节化合物。 
可将含有一组咖啡果提取物量(例如,0.05%、0.1%、0.15%、0.2%、0.25%、0.3%、0.5%、0.75%、1%,2%)的稳定外用乳剂制剂每天两次应用于暴露于UV阳光的面部、胸部、前臂和手部的皮肤。所述活性调节化合物可穿透角化细胞存在的皮肤外部表皮层并且进入成纤维细胞和很多其他皮肤细胞(UV光由这些细胞吸收)存在的真皮层。细胞被UV光环境(这些皮肤暴露于其下)损伤。一些细胞 受到轻微或中度损伤,并且在这些细胞中产生了不同程度的直接DNA损伤,以及细胞中ROS升高,还有线粒体和膜损伤。一些细胞被“晒伤”且损伤严重到它们将进行凋亡,随后这些细胞将死亡。 
已经暴露于足量咖啡果提取物或调节化合物的细胞可由前述的机制防止或者修复DNA损伤。可调节一种或多种所述端粒维持基因的活性,来保护和防御或者甚至修复细胞核内DNA和/或线粒体DNA上端粒的结构完整性。由所述UV损伤引起的基因表达变化可以被抵消或撤销,或者前述的其他修复通路也可被活化,或者两种活性结合。 
线粒体内的ROS的活性也可被抵消或消除,这样就防止或者消除或者修复了所述细胞损伤。特别是羟基、过氧化氢和活性氮物质会受到这样的影响。 
所述线粒体DNA聚合酶Polγ的表达水平会受到调节以有利于线粒体DNA的修复。 
所述调节化合物还可以传递信号,用于新线粒体的生物发生和产生以及通过猝灭ROS来提高并保护线粒体呼吸效率。 
还可以停止已经起始的凋亡过程,从而防止细胞死亡。 
因此,通过保护端粒结构或通过防止ROS造成的氧化应激甚至通过防止细胞经凋亡的死亡,可使皮肤内多种细胞类型和具体细胞的寿命延长。还可以通过增加线粒体的实际数量来直接或间接地提高线粒体的功能大小或效率。当所述调节化合物活化或增加那些增加线粒体数目的基因(如基因PGC-1α)的活性或表达水平时,可出现线粒体生物发生或线粒体数目增加。 
存在维持端粒结构的其他通路,并且这些通路可代替所述常规维持通路被活化,或者在所述常规通路之外被活化。 
通过调节化合物对所述多种通路和作用机制的净效应使得皮肤的结构和功能保持更健康和更年轻的状态,这又使得皮肤保持更年轻的外表并且推迟过早的UV光衰老或使其最小化,所述过早的UV光衰老一般表现为细纹、皱纹、不均匀的色素沉着、皮肤失去光泽、皮肤失去弹性和影调、皮肤松弛、血液循环减少、经常地伤口愈合变慢以及过早的光衰老的各种其他迹象。因此,所述外用制剂可帮助维持年轻表观并且作为抗衰老外用制剂发挥功能。 
实施例20 
将调节剂与防晒霜制剂结合为外用皮肤养护洗剂。 
在阳光充足日参与户外运动前,将0.1%艾地苯醌和身体防晒霜氧化锌、0.05%的咖啡果提取酸的制剂以稳定外用洗剂形式施用于皮肤。该制剂每天定时使用一至两次使得所述调节剂以更大或更小的稳态或储库效应积累进入皮肤。急性阳光暴露和运动使得全波长的UV光的一部分进入了皮肤。所述调节化合物可帮助保护和防卫所述皮肤细胞,使之不受来自环境的UV光损伤。前述实施例中描述的基因表达变化说明,在UV暴露发生前这些调节剂对很多基因的表达水平也没有效应,只有在UV光急性暴露后多种基因表达的调节才开始出现在细胞内发动多种保护和修复机制,所述保护和修复机制可维持细胞的正常健康功能,并且相对于所述调节剂没有被纳入所述皮肤养护洗剂会出现的情况,保护和延长至少一些所述细胞的寿命。对UV光的反应取决于UV损伤的量,并且在一定程度上取决于接触细胞的UVB对UVA1光的比例,因为对于这些不同的UV光波长,所述基因反应和DNA损伤模式是不同的。该化合物混合物包括抗氧化剂艾地苯醌,所述艾地苯醌可更特异性地靶向并保护线粒体,因为它是一种天然存在的泛醌的衍生物,所述泛醌在线粒体功能和和电子传递中具有至关重要的作用。如前所述,艾地苯醌是较小的分子,因此可以更好地穿透进入皮肤,并且它还具有比泛醌更强的抗氧化剂活性。 
咖啡果提取物中的抗氧化剂及其效应以更低特异性地影响线粒体,并且通常靶向细胞中的多种细胞通路。因此,咖啡果提取物可帮助猝灭ROS的不同混合物和它们的通路,并且对多种保护和修复过程具有不同的基因表达调节模式。艾地苯醌和咖啡果提取物之间不同的基因表达可见于前述实施例。同样值得注意的是,这些基因表达谱中的一些仅在UV暴露发生后显示出对基因表达的调节效应,因此可表明所述调节化合物有表现为休眠方式的能力,直到出现氧化应激或DNA损伤或其他细胞损伤。 
实施例21 
使用含有所述调节化合物的口服补充剂延长宠物如猫和狗的生命。 
可将足量的艾地苯醌和/或咖啡果提取物包括在用于长期摄食的宠物食品,或者宠物维生素或营养补充剂片剂或其他制剂中。由于所述动物暴露于多种环境应激、疾病和氧化应激下,与它们没有接受所述调节化合物时相比,它们的组织和器官中的多种不同细胞会更长时间地保持它们线粒体呼吸效率和/或端粒结构。该过程不用于热量限制或使用模拟热量限制的化合物,它们导致原本是所述宠物的寿命的延长并且一般会延长所述动物的健康寿命。 
含有这些化合物的这类补充剂或食物还可与足量的热量限制模仿物(如白藜芦醇)结合,使得已知能延长寿命的热量限制通路和所述调解化合物效应都以这样的方式活化,所述方式即与仅使用白藜芦醇来补充所述宠物的饮食时会发生的宠物寿命延长相比更进一步延长所述宠物的寿命。 
实施例22 
使用调节化合物增强或提高癌症化学治疗剂的效力。 
选择可抑制所述端粒维持基因的调节寿命的化合物制剂,并将其与靶向癌细胞的化学治疗剂联合(但不必直接结合)给药。癌细胞逆转凋亡和急性细胞死亡的能力和/或对帮助保持或使所述癌细胞无限增殖化的端粒酶活性的破坏产生了显著较高的癌细胞死亡率,从而改善了所述化学治疗方法的临床结果并且也潜在地增加了治愈所述癌症的可能性。 
还可将这样的制剂用于减少有效治疗所述癌症所需的化学治疗剂的量或浓度,从而降低了所述化学治疗剂产生的副作用和不利事件的风险。 
另外一种可能性是使用寿命调节剂的结合物,使得上述事件会发生,而且另外使健康的非癌细胞受到保护,免受所述化学治疗剂或辐射的缩短寿命效应。这是差异调节,其中使得所述无限增殖化的癌细胞系基本上更容易死亡并且对所述癌症疗法敏感,而非癌细胞加强了保护、防卫和修复来自所述癌症疗法的损伤的能力。 
实施例23 
使用寿命调节剂保护或延长受到急性损伤的细胞的寿命。 
装入气雾剂吸入器的艾地苯醌0.05%可被用于治疗急性肺部损伤。例如,其肺部遭受急性烟雾吸入损伤的消防员或者暴露于环境危险物质(例如吸入如氯气的有毒气体)而遭受急性损伤的消防员可以重复使用吸入器或喷雾器来通过调节控制凋亡的细胞基因的表达,以帮助防止至关重要的肺组织的凋亡和细胞死亡。连续使用可帮助保护或修复端粒结构,使得细胞寿命不会缩短,从而使得肺作为器官不会随着所述患者变老而遭受过早衰老并且不会促进或直接造成整个器官或患者的寿命缩短。炎性通路如果以急性或慢性的方式活化可DNA损伤,线粒体失去效率也可被调节以延长所述细胞或器官的寿命。刺激额外线粒体的生物发生也可以帮助补偿死亡的细胞从而延长存活细胞的功能寿命或效率。另一个实例是9月11日在世贸中心的灾难中有毒化学物质的复杂混合物暴露于营救人员,在数年后发生了延迟发生的肺纤维化导致的严重伤残和吸入暴露造成的其他肺部问题,这些可通过使用所述吸入调节剂来减轻。 
实施例24 
延长植物寿命 
市售的一品红(poinsettia)和兰花(orchid)是主要的商业盆栽植物和开花作物。具有统一的植物大小、花色和其他物理特性以及开花时间和植物活力或健康是有利的,以便产生均一的植物并且以便所述植物都被给予相同的培养。克隆植物已经成为主要的商业项目,以便使得产生的所有植物是彼此同样的拷贝。这些植物最初产生自实验室中的无菌组织培养物,所述细胞系最终变得衰老,商业生产停止或者克隆过程中出现了突变,这会产生没有商业价值的畸形植物或花。咖啡植物本身中的咖啡果提取物能起到保护植物不受多种环境损伤以及应激和疾病损伤的作用。该植物克隆过程的组织培养培养基可将一种调节剂或调节剂结合物整合至所述培养基,以帮助延长细胞培养物的寿命从而可使所克隆的植物的商业生产更长时间。减少所述植物 中DNA损伤和突变的可能性也可能是有利的。另一种可能的有利之处是帮助防止或修复可能由杀虫剂或杀真菌剂产生的植物损伤,所述杀虫剂或杀真菌剂用来治疗一旦从组织培养长出来后这些植物的病害,因为花畸形可能是由对所述植物的DNA损伤引起的。 
实施例25 
在眼科滴眼液中使用调节剂。 
含有0.01%咖啡果提取物的眼科制剂被用作白内障的预防性治疗物。白内障被认为部分地是由环境损伤——例如UV光和/或自由基/ROS损伤——引起。在导致白内障出现的永久性结构蛋白质变化之前保护或修复这类损伤可推迟白内障的发生或者甚至防止白内障。 
实施例26 
使用调节化合物推迟灰发或白发的发生。 
毛发变灰或变白是衰老的迹象。灰发或白发出现的年龄变化很大。毛发中的色素由被称作黑素细胞的产色素细胞产生。所述黑素细胞由干细胞补充。与毛囊和毛发凸起(hair bulge)相关的黑素细胞干细胞的死亡被认为可导致灰发或白发的发生。由1.5%咖啡果提取物和0.5%艾地苯醌(还有可选的其他成分)组成的应用于头皮的外用制剂可用于延长黑素细胞或产生新黑素细胞的所述干细胞的寿命。 
通过延长它们的寿命,可维持毛发的自然色至比自然情况下本应出现不能维持的年龄更大的年龄,从而推迟灰发或白发的发生。可能出现多种作用机制,因为毛发会受到多种环境创伤或损伤,涵盖UV光、毛发养护产品、毛发干燥过程、拉直过程、来自吹发器的热量等。这些可损害DNA和端粒维持基因或损害线粒体,或者同时损害二者。所述黑素细胞和/或所述干细胞都可能受到影响。毛发变少或毛发损失使得头皮受到的UV暴露增加,这也可能加速过早衰老和毛发颜色变化或者毛发失去颜色。 
实施例27 
器官移植应用。 
准备运输并之后移植的器官可在这些时间段之前、过程中或之后或者在这些时间段的组合,被用以下溶液灌注,所述溶液仅含有咖啡果提取物或者含有与绿茶多酚的结合物以调节端粒结构维持的基因表达并且/或者调节控制线粒体生物发生的基因表达。虽然对凋亡发生的防止、减少或推迟以及细胞和器官本身的生存力,并且因此延长从器官获取到移植的时间以及可能改善所述器官在移植和/或之后的抗排斥疗法中存活能力是非常有利的,但同时一个重要的功能是调节所述端粒结构维持和/或线粒体生物发生。这在器官从较老的供体移植给较年轻的受体时尤其重要,这样所述器官本身的寿命延长超过若不经处理所能达到的长度。 
实施例28 
延长自体移植物的寿命。 
将来自组织细胞培养物的自体人皮肤成纤维细胞注射到数周前从其获取所述皮肤细胞的人面部的皱纹和痤疮伤疤中,所述皮肤细胞在移植回所述人的身体之前在体外培养。将有0.005%艾地苯醌的细胞培养物加入到所述细胞的最终培养物运输培养基中,之后将所述培养基冷冻用于运输至医生的工作场所,用于再植入所述人的面部。所述冷冻/解冻循环和运输以及注射过程会创伤性损伤或者杀死一定百分比的这些自体成纤维细胞。通过使用所述调节化合物,由于凋亡以及其他损伤造成的细胞死亡率降低,使得移植成功率更高。注射之后,线粒体的状态改善使得在产生如胶原的皮肤结构蛋白中具有更好的细胞功能,这又使得皱纹和/或痤疮疤痕的严重程度大大下降。 
实施例29 
证明多酚对端粒酶表达的对抗UVB辐射的保护作用。 
多酚(出现在绿茶和其他来源中)的抗氧化剂效应在文献中有很好的描述并且显示出明显的防日晒细胞能力。未被描述的是,将多酚加入UV辐射的细胞对所述细胞的基因表达谱有效应。具体地,发明人的实验中的细胞(36岁人皮肤成纤维细胞)已经表明,与辐射的对照细胞相比,在给予了多酚化合物的未辐射细胞中负责端粒酶活性 的基因增加至1.6倍,给予了多酚的辐射的细胞增加至1.7倍。这表明通过直接结合于基因启动子位点,或者通过细胞环境中由ROS还原/抗氧化剂效应或一些其他机制触发的第二信使系统。这些多酚化合物可触发细胞产生更多的端粒酶,所述端粒酶可保护DNA和端粒结构的完整性或端粒长度,致使所述细胞的寿命的可能延长。 
实施例30 
调节寿命的化合物证明了在暴露于UVB辐射的细胞中PARP1和TERT基因信号的产生增加。 
UVB辐射已被表明可影响如此暴露的细胞中TERT和PARP1的下调,这在前述实施例中包含的实验被证实。在这些实验中,暴露于UVB且未以任何调节寿命的化合物处理的细胞表现出TERT基因表达下降4.6倍(并因此指示寿命缩短/受损害),PARP1(参与DNA修复和凋亡的基因)下降5.1倍。当来自同一细胞系且年龄相同的细胞暴露于多种调节寿命的化合物时(在这些实验中测试的那些化合物,包括多酚、咖啡果和艾地苯醌)证明了这些相同基因的上调,与UVB暴露的对照细胞相比,在一些情况下PARP1上调11倍,TERT上调12倍(精确数字以及对测试的甚至50岁细胞中TERT的类似效应,参见上文实施例6),表明有寿命延长,并且有更好的修复机制在起作用,用于端粒长度和相关结构。 
实施例31 
与其他抗衰老皮肤养护产品的联合使用调节化合物。 
将含有0.5%咖啡果提取物和各为0.1%的抗氧化剂维生素E、维生素C、超氧化物歧化酶、根皮素、细胞分裂素、α硫辛酸、辅酶Q10、绿茶和葡萄籽提取物以及其他合适成分一起以形成稳定制剂的皮肤乳剂一天一次或两次施用于面部、颈部、胸部、手部和身体其他区域的(过早)衰老皮肤区域,以实现两个主要有利之处。第一有利之处是防止或延迟衰老,第二有利之处是修复或逆转皮肤细胞和相关组织中已存在的过早衰老,使得这些细胞的寿命和活力延长,并且还使所述皮肤的外观保持更年轻的状态。 
实施例32 
影响寿命的阵列的制造 
虽然本文描述了影响寿命的代表性基因阵列,但是也可以使用本领域公认的技术(如本文描述或参考的技术)但用基于本文描述的研究所定义的基因集来构建其他阵列。因此,考虑到了包含在本文数据表7和/或定制阵列2中列出的基因中至少一些的其他阵列。 
可使用本领域公认的技术来制造阵列,所述技术包括例如市售的定制阵列服务。 
实施例33 
影响寿命的基因阵列的用途 
有本文提供影响寿命的具体基因阵列(即,可用在阵列上的基因集)以及从本文讨论的基因中选择基因以形成其他阵列的指导,现在可有使用这些阵列的大量方法。 
仅举例来说,本文提供的所述阵列可用于:表征测试化合物、实验药物或已知药物、它们的提取物或富集级分或其中存在的单组分、这些物质的具体浓缩物(应用于细胞、组织、器官或整个生物体——随后从中得到遗传样本用于阵列分析)的影响寿命的特性;表征影响寿命的任何物质(如本文讨论的化合物和组合物)对不同细胞类型(例如,角化细胞、黑素细胞、肝细胞、心脏细胞、脑细胞、肌肉细胞、来自血液的细胞等)、不同动物或其他生物体、非本文表征的不同年龄的细胞/组织/器官/生物体、具体应激(例如,吸烟、缺氧、感染或其他疾病、损伤、环境毒物暴露、辐射暴露、不同的营养方案、以已知药物或实验药物进行的治疗,等)下的细胞/组织/器官/生物体的效应;表征当通过与本文详述的不同途径施用影响寿命的物质时的效应;等等。 
还考虑的是将所述阵列用于分析生物样本中与本文描述的影响的寿命组合物无关的长寿/健康长寿/寿命。例如,所提供的阵列可用于表征因衰老(例如,通过测试来自不同年龄受试者的样本,或来自同一受试者不同时间的样本)、环境暴露(例如,通过测试暴露于已 知或者疑似的毒物或其他环境条件的受试者的样本)、化学物质或辐射暴露、疾病(包括例如急性或慢性疾病、遗传疾病、传染病等)、饮食或健身项目(例如,以评估选择项目的有效性)以及考虑本文提供的教导可以得出的大量其他用途所引起的(长寿或寿命相关)基因表达的变化。 
所提供的阵列还可用于流行病学研究,例如评判卫生保健的差别;地理、人群、饮食等方面的差异。 
寿命相关基因的表达阵列可用于周期性地测试受试者以确定(类似于“早期警报”系统)涉及关键寿命的系统(如端粒维持、线粒体呼吸或生物发生等)中是否某些东西“出错”了。所述阵列还可被用作诊断工具。 
测定所述阵列的实际方法可以是常规的,本领域普通技术人员应理解如何制备和标记核酸分子,以应用于“探测”所述阵列。 
考虑到本发明公开的原理可应用于很多可能的实施方案,应理解,示例性的实施方案仅是本发明的优选实例,不应将其视为对本文发明范围的限制。相反,本发明的范围由以下的权利要求(包括其等同物)限定。因此,发明人要求落在这些权利要求的范围和精神之内的发明人的所有发明。 
数据表3(分15部分):与咖啡果提取物和艾地苯醌接触的细胞中与衰老、寿命和端粒长度维持相关的基因表达谱 
36y.o.仅咖啡果连续孵育 
Figure BPA00001409038701691
36y.o.与50y.o.仅咖啡果连续孵育 
Figure BPA00001409038701692
50y.o.仅咖啡果连续孵育 
Figure BPA00001409038701693
36y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701694
Figure BPA00001409038701701
36y.o与50y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701702
50y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701703
50y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育以及连续孵育 
Figure BPA00001409038701704
Figure BPA00001409038701711
36y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育以及连续孵育 
Figure BPA00001409038701712
36y.o.咖啡果+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701713
36y.o与50y.o.咖啡果+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701714
50y.o.咖啡果+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701715
Figure BPA00001409038701721
36y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育与艾地苯醌+UVB4小时孵育 
Figure BPA00001409038701722
36y.o.咖啡果+UVB连续孵育与艾地苯醌+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701723
50y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育与艾地苯醌+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701724
Figure BPA00001409038701731
50y.o.咖啡果+UVB连续孵育与艾地苯醌+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701732
数据表4(分为18部分):与绿茶多酚和艾地苯醌接触的细胞中与衰老、寿命和端粒长度维持相关的基因表达谱 
36y.o.绿茶+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701741
50y.o.绿茶+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701742
36y.o.与50y.o.艾地苯醌+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701752
36y.o.艾地苯醌+UVB 4小时孵育 
50y.o.艾地苯醌+UVB 4小时孵育 
36y.o.艾地苯醌+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701755
Figure BPA00001409038701761
36y.o.与50y.o.艾地苯醌+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701762
50y.o.艾地苯醌+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701763
36y.o.与50y.o.绿茶+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701764
Figure BPA00001409038701771
36y.o.艾地苯醌+UVB 4小时孵育与绿茶+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701772
50y.o.艾地苯醌+UVB 4小时孵育与绿茶+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701773
36y.o.绿茶+UVB4小时孵育以及连续孵育 
Figure BPA00001409038701774
50y.o.绿茶+UVB4小时孵育以及连续孵育 
36y.o.绿茶+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701782
50y.o.绿茶+UVB 4小时孵育 
Figure BPA00001409038701783
36y.o.与50y.o.绿茶+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701791
50y.o.艾地苯醌+UVB连续孵育与绿茶+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701792
36y.o.IDE+UVB连续孵育与绿茶+UVB连续孵育 
数据表5(分为4部分):与绿茶多酚和咖啡果提取物接触的细胞中与衰老、寿命和端粒长度维持相关的基因表达谱 
36y.o.咖啡果+UVB4小时孵育与绿茶+UVB4小时孵育 
Figure BPA00001409038701794
50y.o.咖啡果+UVB 4小时孵育与绿茶+UVB4小时孵育 
Figure BPA00001409038701802
36y.o.咖啡果+UVB连续孵育与绿茶+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701811
50y.o.咖啡果+UVB连续孵育与绿茶+UVB连续孵育 
Figure BPA00001409038701812
数据表6(分为6部分):对细胞的UVA/UVB损伤,证明寿命或端粒长度维持基因表达谱的下降 
36y.o.UVA1 
Figure BPA00001409038701813
36y.o.对50y.o.UVA1 
Figure BPA00001409038701821
50y.o.UVA1 
Figure BPA00001409038701822
36y.o.对50y.o.UVB 
Figure BPA00001409038701823
36y.o.UVB 
Figure BPA00001409038701824
50y.o.UVB 
数据表8:端粒复合体(人基因组表达值) 
Figure BPA00001409038701841
A:仅艾地苯醌表达 
B:艾地苯醌+UVB表达 
C:仅咖啡果表达 
D:咖啡果+UVB表达 
E:仅UVB表达 
F:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
G:仅H2O2表达(24小时) 
H:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
I:仅H2O2表达(8小时) 
J:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异 
K:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异 
数据表9:(DNA损伤和修复) 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  ABL1   X16416.1   1.0   -1.0   1.2   -1.0   1.1     -1.4   -1.5   1.1   1.1   0.1   0.0
  AK3   NM_016282.2   1.0   1.0   1.3   1.0   1.4     -1.4   -1.4   -1.5   -1.2   0.0   -0.2
  ANKRD17   NM_198889.1   -1.0   1.0   1.7   -1.0   1.0     1.6   1.1   1.3   1.5   0.5   -0.2
  APEX1   NM_001641.2   1.2   -1.1   -1.2   1.5   1.5     -1.0   1.0   1.1   1.1   -2.1   0.0
  APEX2   NM_014481.2   -1.1   1.0   -1.0   1.2   1.1     -1.4   -2.3   1.1   -1.2   0.9   2.3
  ATF2   NM_001880.2   1.1   -1.1   1.1   1.4   -1.1     -1.2   -1.1   -1.2   -1.8   -0.1   0.6
  ATIC   NM_004044.4   1.0   -1.0   -1.0   -1.1   -1.0     1.1   1.1   1.4   1.2   0.0   0.1
  ATM   U26455.1   1.2   1.9   -1.1   -1.2   1.0     1.1   -1.2   1.1   1.3   2.3   -0.2
  ATR   NM_001184.2   1.2   1.2   1.0   -1.2   1.1     -1.8   -1.7   -1.5   -1.5   0.0   0.0
  ATRX   NM_000489.2   1.0   -1.2   -1.4   -1.2   1.1     -1.7   -1.4   2.0   -1.9   -0.2   3.9
  ATXN3   NM_004993.3   -1.1   1.8   -1.2   -1.4   -1.2     1.0   1.1   1.0   1.3   0.0   -0.3
  B2M   NM_004048.2   -1.0   1.3   -1.4   1.0   -1.0     1.8   1.8   -1.1   1.0   0.0   -2.1
  BARD1   NM_000465.1   1.4   -1.1   -1.3   -1.2   1.1     1.3   1.3   1.2   -1.1   0.0   2.4
  BLM   NM_000057.1   1.0   1.2   1.3   -1.0   7.4     3.3   3.3   1.5   1.5   0.0   0.1
  BPNT1   NM_006085.3   -1.2   2.3   -1.7   -1.1   2.2     1.1   1.1   -1.4   1.2   0.0   -2.6
  BRCA1   Y08864.1   -1.0   1.1   1.0   1.1   1.4     1.7   1.8   -1.3   -1.1   -0.1   -0.2
  BRCA2   NM_000059.1   1.1   -1.1   1.0   -1.1   1.1     1.7   1.5   -1.0   1.4   0.3   -2.4
  BRIP1   NM_032043.1   1.0   1.0   1.1   1.3   1.6     2.2   2.4   1.7   1.7   -0.2   0.0
  RPL13A   X56932.1   -1.0   -1.1   1.0   -1.4   1.1     -1.0   -1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0
  BTG2   NM_006763.2   1.0   -1.1   -1.0   1.1   1.4     1.7   1.3   -1.2   -1.8   0.5   0.6
  CCNH   NM_001239.2   -1.1   1.2   -1.6   -1.4   -1.0     -1.5   1.0   1.3   1.5   -2.5   -0.3
  CDA   NM_001785.1   -1.5   -1.0   -1.2   1.4   1.0     2.7   2.4   -1.0   1.0   0.3   -2.1
  CDK7   NM_001799.2   1.0   1.0   1.1   1.2   1.2     1.1   1.2   -1.1   -1.1   -0.1   0.0
  CDKN1A   U03106.1   1.2   -1.3   1.1   1.2   -1.7     1.7   1.0   -1.2   1.2   0.7   -2.4
  CDKN2A   L27211.1   1.0   -1.0   -1.1   1.2   1.1     -1.1   -1.1   3.0   -1.1   -0.1   4.0
  CETN2   NM_004344.1   1.1   -1.1   -1.1   1.2   2.3     -1.1   -1.1   -1.1   -1.1   -0.1   0.0
  CHEK1   NM_001274.2   -1.5   1.1   1.0   -1.1   -1.1     -3.2   -3.7   1.2   -2.3   0.6   3.5
  CHEK2   NM_001005735.1   1.1   -1.0   -1.1   1.1   1.1     1.1   1.0   -1.2   -1.3   0.1   0.1
  CIB1   U85611.1   1.0   -1.0   1.0   1.0   1.0     1.4   1.3   1.1   1.0   0.1   0.0
  CIDEA   NM_001279.2   1.3   -2.1   -1.2   -1.1   -1.1     1.0   1.2   1.9   1.5   -0.2   0.4
  CIDEB   AF544398.1   -1.2   1.1   -1.3   -1.1   -1.1     1.6   1.7   -1.4   1.3   -0.1   -2.7
[0896] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  CRY1   NM_004075.2   1.0   2.1   -1.2   1.0   -1.1     1.6   1.7   -1.3   -1.1   -0.1   -0.1
  CRY2   NM_021117.1   -1.1   -1.4   1.0   1.8   1.4     1.3   1.1   1.2   -1.2   0.3   2.3
  CSF2   M11220.1   2.4   1.0   -1.1   -1.0   1.2     1.1   1.1   1.1   1.2   0.0   -0.1
  CTPS   NM_001905.1   1.0   1.1   1.0   1.0   1.2     2.8   2.9   3.4   3.0   0.0   0.4
  ALDOA   NM_000034.1   1.0   -1.3   1.2   -1.2   1.1     1.4   1.3   1.4   1.2   0.1   0.1
  DCLRE1C   AJ296101.1   1.0   1.1   1.0   1.0   1.1     -1.5   -1.5   -1.6   -1.6   0.0   0.0
  DDB1   NM_001923.2   1.9   1.1   -1.5   -1.2   1.2     -1.1   -1.1   1.2   1.1   0.0   0.1
  DDB2   NM_000107.1   1.0   -1.1   -1.8   2.0   1.2     -2.6   -3.3   -2.7   -3.0   0.7   0.3
  DDIT3   S40706.1   1.1   1.1   1.2   1.3   -1.0     1.3   1.3   -1.6   -1.3   0.0   -0.3
  K-ALPHA-1   NM_006082.1               1.8   1.6   1.3   1.2   0.2   0.1
  DHFR   NM_000791.2   1.0   -1.0   -1.0   1.3   1.0     -2.2   -1.6   -1.4   -1.1   -0.6   -0.3
  DKC1   NM_001363.2   1.0   1.0   2.0   1.0   1.2     1.1   1.1   1.4   1.4   0.0   0.0
  DMC1   NM_007068.2   1.1   -1.1   1.3   -2.4   1.2     1.2   1.1   1.2   1.1   0.1   0.1
  DPYS   NM_001385.1   1.1             1.0   -1.7   -1.0   -1.8   2.7   0.7
  DUT   NM_001948.3   1.5   -1.1   1.1   1.1   1.0     -1.0   1.0   1.0   1.0   -2.1   0.0
  E2F1   NM_005225.1   -1.5   1.1   1.1   1.1   1.1     2.6   2.4   2.4   2.4   0.2   0.0
  E2F2   NM_004091.1   -1.1   1.1   -1.0   -1.2   1.0     1.4   -1.1   1.0   1.2   2.5   -0.2
  E2F3   NM_001949.2   -1.5   1.3   -1.5   -1.5   -1.1     -1.2   -1.2   1.2   1.3   0.0   -0.1
  ENTPD4   NM_004901.1   1.1   -1.3   1.0   1.0   1.0     1.1   -1.1   -1.0   -1.1   2.2   0.0
  ERCC1   M28650.1   1.2   -1.1   1.0   -1.4   -1.1     1.1   1.1   1.9   1.8   0.0   0.1
  ERCC2   NM_000400.2   1.0   -1.0   -1.1   -1.0   1.1     1.3   1.1   2.0   1.6   0.2   0.3
  ERCC3   NM_000122.1   -1.0   -1.1   -1.1   -1.2   -1.0     1.1   1.2   1.2   1.3   -0.1   -0.1
  ERCC4   U64315.1   -1.1   1.9   1.0   1.0   1.0     -2.0   -2.0   -1.5   -1.6   0.0   0.1
  ERCC5   NM_000123.2   1.0   -1.2   -1.2   1.8   1.2     -1.2   -1.2   -1.2   -1.1   0.0   -0.1
  ERCC6   NM_000124.1   1.4   1.1   1.0   -1.3   1.0     -1.2   -1.2   -1.2   -1.1   0.0   -0.1
  ERCC8   NM_000082.2   -1.1   1.0   1.1   1.2   1.2     -1.0   1.1   -1.3   -1.4   -2.2   0.0
  ACTB   NM_001101.2   1.1   1.2   -1.1   1.2   -1.1   2.2   1.1   1.1   1.1   1.0   0.0   0.0
  ERH   NM_004450.1   1.0   1.3   -1.0   -1.2   1.5     -1.4   -1.9   -1.3   -1.1   0.5   -0.2
  EXO1   NM_006027.3   1.1   -1.0   1.2   1.0   -1.1     3.3   3.4   2.4   2.2   -0.1   0.2
  FANCA   NM_000135.2   1.0   1.1   1.6   1.4   1.2     1.1   1.0   1.9   1.7   0.0   0.2
  FANCC   NM_000136.2   -1.0   -1.1   -1.1   1.0   -2.1     -1.5   -1.2   1.1   -1.1   -0.3   2.2
  FANCF   NM_022725.2   -1.1   3.3   -1.2   1.9   1.1     -1.1   -1.3   -1.8   -1.5   0.2   -0.3
  FANCG   NM_004629.1   1.1   1.0   -1.1   1.2   -1.0     2.1   2.1   1.8   1.6   0.0   0.2
  FEN1   NM_004111.4   -1.0   -1.2   1.2   1.0   1.1     3.6   3.2   1.7   1.5   0.4   0.2
  FPGS   NM_004957.4   1.2   -1.1   -1.7   -1.2   1.3     1.1   1.2   1.3   1.2   0.0   0.1
  GADD45A   NM_001924.2   -1.1   -1.2   1.0   1.7   -1.0     3.3   2.8   1.6   1.9   0.4   -0.3
  GADD45G   NM_006705.2   1.0   1.1   -1.0   1.0   1.3     1.7   2.1   1.3   1.4   -0.3   -0.1
  GDA   NM_004293.2   1.0   1.0   1.3   1.2   -1.3     -2.1   -1.1   -1.0   1.1   -0.9   -2.1
  GML   NM_002066.1   -1.3   -1.0   -1.1   1.3   1.2     1.2   1.1   -1.2   -1.3   0.1   0.2
  GMPR   NM_006877.2   1.0   -1.4   -1.6   1.1   1.2     -1.2   1.1   1.0   1.1   -2.3   -0.1
  GTF2H1   NM_005316.2   1.1   1.0   1.1   -1.2   1.0     1.0   1.0   -1.1   -1.2   0.0   0.1
  GTF2H2   NM_001515.2   -1.2   1.0   -1.4   -1.4   -1.1     1.0   1.0   -1.1   -1.2   0.0   0.1
  GTF2H3   NM_001516.3   1.0   1.1   1.2   1.0   1.3     1.1   1.0   1.3   1.2   0.0   0.1
  GTF2H4   NM_001517.4   -1.4   -1.1   1.0   1.0   -1.1     1.0   1.1   1.1   1.1   -0.1   0.0
  GTSE1   NM_016426.4   -1.1   -1.4   -1.7   1.0   1.1     -2.4   1.3   -1.3   -4.5   -3.7   3.2
  HSP90AB1   NM_007355.2   1.1   -1.4   1.1   -1.6   1.3     -1.1   -1.1   -1.5   -1.5   0.0   0.0
  HUS1   NM_004507.2   1.0   1.3   1.0   1.1   -1.1     1.2   1.1   1.4   1.2   0.2   0.2
  IGHMBP2   AB208802.1   1.1   -1.4   -1.1   1.3   -1.1     2.3   1.5   1.1   1.1   0.8   0.1
  IHPK3   NM_054111.2   1.1   1.0   1.0   1.6   -1.3     1.3   1.4   1.0   -1.0   -0.1   2.0
  CHUK   NM_001278.2   1.0   -1.2   -1.1   1.0   -1.1     1.4   1.4   1.4   1.5   -0.1   -0.1
  INPPL1   NM_001567.2   -1.2   -1.5   1.1   1.0   1.2     -1.0   -1.0   1.2   1.2   0.0   0.0
  JUN   NM_002228.3   1.0   1.1   1.1   -1.1   -1.2     1.9   2.2   1.8   2.0   -0.3   -0.2
  XRCC6BP1   NM_033276.2   1.1   1.0   1.7   1.6   -1.1     -1.2   -1.3   -2.8   -2.6   0.0   -0.2
  LIG1   NM_000234.1   1.0   -1.3   1.1   -1.1   1.3     4.6   4.3   2.4   2.3   0.3   0.1
  LIG3   X84740.1   1.0   -1.8   1.2   1.1   -1.1     1.1   1.0   3.6   3.2   0.0   0.4
  LIG4   NM_002312.2   1.0   -1.2   1.0   -1.3   -2.0     1.0   1.1   1.1   1.2   -0.1   -0.1
  PPIE   AF042385.1   1.1   -1.2   -1.4   -1.0   -1.7     -2.3   -2.1   -1.5   -1.0   -0.2   -0.5
  MAP2K6   NM_002758.2   1.0   1.1   1.0   1.1   -1.1     1.0   -1.6   1.1   1.0   2.6   0.1
  MAPK12   NM_002969.2   -1.0   -1.5   1.0   1.0   1.0     -1.1   1.1   1.1   1.3   -2.2   -0.2
  MAPKAPK2   NM_032960.2   -1.4   -1.1   -1.2   1.1   1.1     1.3   1.3   1.3   1.3   0.0   0.0
  MBD4   NM_003925.1   1.0   -1.0   -1.0   1.0   1.1     1.3   1.4   1.0   1.0   -0.1   0.0
[0897] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  MDM2   NM_002392.2   1.1   1.7   1.5   -1.0   1.0     1.8   1.7   2.3   1.7   0.2   0.5
  MGMT   NM_002412.1   -1.3   -1.1   -1.2   -1.0   1.2     -1.3   -1.2   -1.0   -1.1   0.0   0.1
  MLH1   NM_000249.2   1.0   1.3   1.2   1.1   -1.3     1.1   1.1   -1.0   -1.1   -0.1   0.1
  MLH3   NM_014381.1   1.0   -1.1   -1.4   -1.1   1.1     -1.5   -1.7   -1.1   -1.1   0.2   0.0
  MMS19L   NM_022362.2     *   *   *   *     -1.7   -1.4   -1.1   -1.3   -0.3   0.2
  MNAT1   NM_002431.2   1.0   1.2   1.3   1.3   -1.4     -1.1   1.2   -1.1   1.1   -2.3   -2.2
  MPG   AY258284.1   1.0   -1.0   1.0   1.0   1.2     -1.2   -1.2   1.1   1.1   0.0   0.0
  MRE11A   AF022778.1   1.2   1.0   1.1   -1.1   1.1     1.0   1.2   -1.7   1.7   -0.2   -0.1
  GAPDH   NM_002046.2   -1.1   -1.2   1.2   1.0   1.2   -1.3   1.0   1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0
  MSH2   NM_000251.1   1.0   1.2   -1.1   1.3   1.3     1.9   1.6   1.0   1.2   0.4   -0.2
  MSH3   NM_002439.2   1.1   -1.0   -1.2   -1.1   1.3     -1.2   1.1   -2.8   -1.4   -2.3   -1.4
  MSH4   NM_002440.2   1.0   1.3   1.2   -2.5   1.1     1.1   -1.3   1.0   1.6   2.4   -0.5
  MSH5   NM_172166.1     *   *   *   *     -1.4   -1.2   -1.0   -1.1   -0.2   0.1
  MSH6   NM_000179.1   1.0   1.1   1.4   -1.1   1.2     -1.4   1.0   -2.3   -1.7   -2.4   -0.5
  MTAP   NM_002451.3   1.1   -1.2   1.6   -1.1   -1.2     1.3   1.3   2.6   2.8   0.0   -0.1
  MUTYH   NM_012222.1   -1.0   1.0   1.2   1.0   -1.1     1.0   1.3   1.0   1.1   -0.3   -0.1
  N4BP2   NM_018177.2   1.1   1.4   1.2   1.5   1.2     -2.2   -2.2   -1.6   -1.4   0.0   -0.2
  NBN   NM_002485.4   -1.2   1.0   1.2   -1.1   -1.1     1.2   1.1   1.6   1.3   0.1   0.3
  NEIL1   NM_024608.1   1.5   1.0   -1.1   1.2   -1.1     -2.3   -2.8   1.5   -1.9   0.5   3.3
  NEIL2   NM_145043.1   1.2   1.1   1.0   1.0   -1.4     1.2   1.2   1.3   1.2   0.0   0.1
  NEIL3   NM_018248.1   -1.0   -1.0   1.0   1.2   1.0     1.7   1.9   -1.0   -1.1   -0.2   0.1
  NFKB1   NM_003998.1   -1.5   -1.1   1.0   -1.2   1.1   1.7   -1.1   -1.4   1.1   -1.0   0.3   2.2
  NFKBIA   NM_020529.1   1.0   1.3   -1.1   -1.6   1.1     1.5   1.5   1.4   1.6   0.0   -0.2
  NP   NM_000270.1   -1.2   -1.1   1.0   1.0   -1.0     5.0   4.8   2.6   2.5   0.3   0.0
  NTHL1   NM_002528.4   1.1   -1.1   -1.2   -1.2   1.0     -1.0   -1.1   -1.2   -1.3   0.1   0.1
  HK1   M75126.1   -1.1   -1.1   1.0   1.4   -1.1     1.6   1.3   1.7   1.5   0.3   0.2
  NUDT1   NM_198952.1   1.3   -1.1   -1.0   1.0   -1.1     1.4   1.2   -1.3   -1.3   0.2   0.0
  NUDT2   NM_001161.3   -1.0   1.0   1.0   -1.4   -1.1     -1.2   -1.0   -1.6   -1.3   -0.1   -0.3
  OAS1   D00068.1   1.3   1.0   1.0   -1.1   1.0     -1.0   1.3   1.1   1.1   -2.3   0.0
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  HPRT1   NM_000194.1   1.2   1.3   1.0   1.2   -1.7     -2.1   -2.0   -1.4   -1.3   -0.1   -0.2
  OAS3   AB044545.1   1.0   1.0   1.0   1.1   2.7     -1.0   1.1   2.8   2.9   -2.1   -0.1
  ODC1   NM_002539.1   -1.0   1.0   -1.1   1.0   1.1     3.2   2.8   1.9   1.7   0.4   0.2
  OGG1   AF003595.1   -1.3   1.2   1.0   -1.1   1.1     1.4   1.4   1.3   1.2   0.0   0.1
  PAPSS1   NM_005443.4   -1.0   -1.1   -1.0   -1.1   -1.0     -1.8   -1.6   1.0   -1.1   -0.1   2.1
  PAPSS2   NM_001015880.1   -1.0   -1.1   -1.1   1.6   1.1     -1.2   1.3   2.0   1.9   -2.5   0.1
  PARP1   J03473.1   1.3   1.0   -1.0   1.3   -1.1   3.3   1.1   1.1   1.8   1.7   0.0   0.1
  PARP3   NM_005485.2   -1.0   -1.2   -1.4   -1.2   1.6     -1.7   -1.6   -1.3   -1.2   -0.1   0.0
  PCBP4   NM_033008.1   1.0   -1.0   -1.1   1.0   1.2     1.2   1.2   1.4   1.5   0.0   -0.1
  PCNA   NM_002592.1   2.4   1.1   1.4   1.2   -1.1     1.8   1.7   1.1   1.1   0.1   -0.1
  PDCD8   NM_145812.1     *   *   *   *     1.0   1.2   1.4   1.7   -0.2   -0.3
  PINX1   NM_017884.3   1.2   1.3   1.3   1.3   -1.2     2.2   2.3   1.5   1.6   -0.1   -0.1
  PMS1   NM_000534.3   1.0   1.0   1.3   1.3   -2.6     -1.8   -2.0   -4.2   -3.6   0.2   -0.6
  PMS2   NM_000535.3   1.1   -1.1   -1.2   -1.2   -1.2     -1.1   -1.5   -1.1   -1.5   0.4   0.4
  PMS2L1   XM-380025.2   1.0   1.1   1.0   1.0   1.2     1.3   1.3   -1.2   -1.1   0.0   -0.1
  PMS2L3   NM_001003686.1   1.0   -1.0   -1.2   1.8   -12.5     1.1   1.2   -1.3   -1.1   -0.1   -0.1
  PMS2L4   D38500.1     *   *   *   *     3.1   2.2   1.1   -2.2   0.9   3.2
  MDH1   NM_005917.1   -1.1   1.2   1.8   1.2   1.2     -1.4   -1.2   -1.4   -1.5   -0.1   0.1
  PNKP   NM_007254.2   1.0   -1.3   -1.0   1.6   -1.0     1.3   1.2   1.2   1.2   0.0   0.0
  POLB   NM_002690.1   -1.0   1.0   -2.7   1.0   -1.3     2.0   1.9   1.4   1.3   0.1   0.1
  POLD3   NM_006591.1   1.0   1.1   1.4   1.0   -1.0     1.8   2.4   2.2   1.6   -0.6   0.6
  POLE   NM_006231.2   -1.1   1.3   -1.1   -1.1   1.3     -1.0   1.6   1.1   1.3   -2.6   -0.2
  POLI   NM_007195.1   1.0   1.5   1.0   -1.7   1.3     -4.2   -3.9   -2.4   -2.0   -0.3   -0.4
  POLL   NM_013274.2   1.0   -1.2   1.3   -2.2   1.2     -2.1   -2.6   -1.6   -1.6   0.5   0.0
  POLR3H   NM_138338.2   1.0   1.1   1.0   -1.2   1.9     1.9   1.6   1.4   1.4   0.4   0.0
  PPP1R15A   NM_014330.2   1.0   -1.1   -1.1   -1.0   1.2     4.6   4.2   1.7   1.9   0.4   -0.2
  PRKDC   NM_006904.6   1.0   -1.1   1.0   -1.0   1.3     1.1   1.2   1.7   1.6   -0.1   0.1
  PRPS2   NM_002765.2   -1.1   -1.0   1.1   1.1   -2.3     -1.2   -1.0   -1.3   -1.1   -0.2   -0.2
  RAD1   NM_002853.2   -1.3   1.1   1.2   -1.0   -1.0     -1.4   -1.3   -1.0   1.0   -0.2   -2.1
  RAD17   NM_002873.1   -1.0   -1.1   1.0   1.0   1.1     -1.2   -1.1   -1.2   -1.2   0.0   -0.1
  RAD18   NM_020165.2   1.0   1.3   -1.1   1.1   -1.0     1.9   1.9   1.9   1.6   0.0   0.3
[0898] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  RAD21   NM_006265.1   1.0   1.1   1.0   1.0   1.3     1.1   1.1   -1.1   -1.1   0.0   0.0
  RAD23A   NM_005053.2   1.1   -1.4   1.3   1.6   1.1     1.4   1.4   1.0   1.1   0.0   0.0
  RAD23B   NM_002874.3   10   -1.2   1.3   1.2   -1.0     -1.9   -2.1   -1.4   -1.4   0.2   0.0
  RAD50   U63139.1     *   *   *   *     -1.6   -1.6   -1.1   -1.2   0.1   0.1
  RAD51   D14134.1   -1.4   1.0   -1.1   -1.7   1.2     -1.1   1.2   1.1   1.2   -2.2   -0.1
  RAD51C   NM_058216.1   -1.5   1.0   1.1   1.0   -1.0     1.2   1.3   -1.3   -1.4   -0.1   0.0
  RAD51L1   NM_002877.4   1.0   -1.2   1.5   1.5   1.2     2.0   1.8   -1.4   -1.1   0.2   -0.3
  RAD51L3   NM_133628.1   1.0   -1.4   -1.1   -1.3   1.0     1.2   1.3   1.3   1.3   -0.1   0.0
  RAD52   U12134.1   1.4   1.2   1.0   1.0   1.1     -1.4   -1.6   1.9   1.2   0.1   0.7
  RAD54B   NM_134434.1   1.1   1.2   -1.2   -1.4   1.1     2.9   2.9   1.4   1.5   0.0   0.0
  RAD54L   NM_003579.2   -1.0   -1.1   1.2   1.0   1.2     4.3   5.0   2.0   2.0   -0.7   0.1
  RAD9A   NM_004584.2   1.0   -1.1   -1.4   1.3   1.6     -3.5   -3.7   -2.0   -1.6   0.2   -0.4
  RBBP8   NM_002894.2   -1.1   1.3   1.1   1.0   -1.2     1.5   1.8   1.5   1.6   -0.2   -0.1
  RELA   L19067.1   1.0   -1.0   -1.5   1.0   1.1     1.3   1.2   1.1   -1.0   0.1   2.2
  REV1L   NM_016316.1     *   *   *   *     2.5   1.5   -1.0   -1.1   1.1   0.0
  REV3L   NM_002912.1   -1.1   -1.0   1.2   1.0   1.0     -1.8   -1.5   1.6   1.1   -0.3   0.5
  YWHAZ   M86400.1   -1.0   -1.1   1.0   1.0   -1.3     -1.2   -1.1   -1.2   -1.2   -0.1   0.0
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  RPA3   NM_002947.3   1.1   -1.0   1.1   1.8   1.0     1.5   -1.5   -1.3   1.1   3.0   -2.4
  RPS27A   NM_002954.3   1.0   1.3   1.1   1.0   1.2     -1.0   1.0   1.0   1.1   -2.0   0.0
  SEMA4A   NM_022367.2   1.0   1.1   1.0   1.1   2.3     2.8   3.0   5.3   4.4   -0.3   0.9
  SESN1   NM_014454.1   1.0   -1.1   -1.3   -1.3   1.3     1.6   1.2   -1.0   -1.3   0.4   0.3
  SLC23A1   NM_005847.3   -1.0   1.0   1.1   -1.1   1.1     -1.7   -1.3   -1.3   1.2   -0.4   -2.6
  SLC23A2   NM_203327.1   1.0   1.2   1.2   -1.2   1.2     -1.0   1.1   -1.0   -1.0   -2.1   0.0
  SLK   NM_014720.1   -1.0   1.1   1.0   -1.4   1.1     -1.1   -1.1   -1.1   1.1   0.0   -2.2
  SMC1L1   NM_006306.2     *   *   *   *     -1.4   1.2   1.1   -1.1   -2.6   2.1
  SMUG1   NM_014311.1   1.2   -1.1   1.0   1.1   -1.1     1.3   1.3   -1.1   -1.1   0.0   0.0
  SUMO1   NM_003352.4   1.2   -1.2   -1.6   1.1   1.3     -1.2   -1.0   -1.0   -1.1   -0.2   0.0
  RPS9   NM_001013.2   1.1   1.0   -1.1   1.0   -1.0     1.2   1.3   1.1   -1.2   -0.1   2.3
  TDG   NM_003211.3   -1.1   1.2   1.0   -1.1   2.1     -1.7   -2.7   -1.3   1.0   1.1   -2.3
  TELO2   A_23_P206237   1.1   -1.1   -1.4   1.0   1.0   1.6   1.8   1.8   2.0   2.0   0.0   0.0
  TEP1   NM_007110.2   1.1   1.1   1.5   1.2   1.1     -1.9   -1.7   -1.3   1.0   -0.2   -2.3
  TERF1   U40705.1   1.0   1.4   -1.0   -1.1   1.3     -1.4   -1.3   -1.5   -1.4   -0.1   -0.1
  TERF2   NM_005652.2   1.0   -1.1   1.2   -1.5   1.1     2.2   1.6   1.3   1.3   0.6   0.0
  TERF2IP   NM_018975.2   -1.1   -1.1   1.3   1.0   -1.1   1.2   1.3   1.3   1.0   1.0   0.1   0.0
  TERT   AF018167.1   1.1   -1.3   -1.0   1.3   1.0     -1.0   1.4   1.0   -1.1   -2.5   2.1
  TINF2   NM_012461.1   1.1   1.1   -1.4   -1.4   -1.0     -1.0   -1.1   -1.2   -1.1   0.0   -0.1
  TK1   NM_003258.1   1.1   -1.2   1.4   -1.2   1.0     -1.0   -1.2   1.4   1.5   0.2   -0.1
  TK2   NM_004614.2   -1.2   -1.2   1.0   -1.0   1.1     -2.0   -1.8   -3.8   -4.1   -0.2   0.2
  TNKS   NM_003747.1   1.1   1.6   1.3   1.2   1.0     2.2   2.2   1.8   1.9   0.0   -0.2
  TNKS1BP1   NM_033396.1   1.0   -1.3   1.7   2.1   2.4     -2.5   -2.6   -1.7   -1.2   0.1   -0.5
  TNKS2   NM_025235.2   -1.0   1.1   1.3   -1.2   -2.9     1.2   1.2   1.0   1.0   0.0   0.0
  SDS   NM_006843.1   1.0   1.2   1.0   1.1   1.4     1.4   1.5   -1.2   1.4   -0.1   -2.6
  top1   NM_003286.2   1.2   -1.4   1.0   1.0   1.1     1.9   1.7   2.2   1.5   0.2   0.7
  top2A   NM_001067.2   1.0   -1.3   -1.4   -1.1   2.6     -1.1   1.7   -1.4   -1.4   -2.7   -0.1
  top2B   NM_001068.2   -1.2   1.1   1.2   -1.0   -1.0     -1.6   -1.6   -1.0   -1.0   -0.1   0.0
  top3A   NM_004618.3   1.0   -1.0   -1.1   -1.0   -2.2     2.3   2.2   1.6   1.8   0.2   -0.2
  top3B   NM_003935.3   -1.0   -1.2   1.7   -2.7   -1.0   -1.1   -1.8   -1.3   1.5   1.7   -0.5   -0.2
  TP53   AF307851.1   -1.1   -1.3   -1.0   1.2   1.2     -2.1   -2.0   -1.5   -1.5   -0.2   0.0
  TP73   NM_005427.1   -1.0   -1.1   1.1   1.1   1.1     1.3   1.3   1.1   1.1   0.1   0.0
  TPMT   NM_000367.2   -1.0   -1.0   1.2   1.0   -1.2     -1.5   1.2   -1.1   -1.2   -2.7   0.1
  TREX1   NM_033628.2   -1.2   -1.1   -1.4   -1.0   -1.0     1.1   1.0   -1.1   -1.2   0.0   0.0
  TREX1   NM_130384.1   -1.2   -1.1   -1.4   -1.0   -1.0     1.1   1.0   -1.1   -1.2   0.0   0.0
  TREX2   AF267739.1   -1.2   1.7   1.0   1.0   -1.2     -2.1   -2.2   -2.5   -2.3   0.1   -0.2
  TYMS   NM_001071.1   1.0   1.1   1.0   2.0   1.3     -1.6   -1.3   -1.3   -1.0   -0.3   -0.2
  UBE2A   M74524.1   1.1   1.1   -1.0   -1.0   1.1     1.4   1.4   -1.2   -1.1   0.1   0.0
  UBE2B   NM_003337.2   1.1   -1.1   1.0   1.0   1.1     3.0   1.8   1.6   -1.2   1.2   2.8
  UBE2I   U45328.1   1.0   -1.3   -1.2   -1.1   1.2     -2.1   -1.7   -1.0   -1.3   -0.4   0.3
  UBE2N   NM_003348.3   1.0   -1.1   -1.3   2.8   -1.1     1.5   1.5   1.4   1.4   0.0   0.0
  UBE2V2   NM_003350.2   -1.1   -1.0   -1.3   -1.1   -2.4     -2.2   -1.9   -2.0   -1.5   -0.3   -0.4
[0899] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  UNG   X15653.1   1.0   -1.3   1.2   1.1   -1.2     1.1   1.0   1.9   1.7   0.1   0.2
  UNG2   NM_021147.2     *   *   *   *     1.1   1.0   1.9   1.7   0.1   0.2
  UPP1   NM_181597.1   -1.1   1.1   1.1   -1.2   1.1     3.1   2.5   3.3   3.0   0.7   0.2
  WRN   NM_000553.2   2.4   1.1   -1.0   1.3   1.1     -1.1   -1.0   1.4   1.6   -0.1   -0.2
  XAB2   NM_020196.2   1.0   1.0   -1.1   -1.2   1.1     -1.1   -1.3   -1.4   -1.1   0.2   -0.3
  XPA   NM_000380.2   -1.4   1.1   -1.2   -1.6   1.2     -1.6   -1.2   -1.8   -1.4   -0.4   -0.5
  XPC   NM_004628.3   -1.4   -1.3   1.3   1.5   1.6     -1.8   -1.9   -1.5   -1.4   0.1   -0.1
  XRCC1   NM_006297.1   -1.4   -1.3   -1.2   -1.1   1.2     1.2   1.3   1.1   1.0   -0.1   0.0
  TFRC   NM_003234.1   1.2   1.0   1.2   1.0   1.1     -2.0   -2.0   1.6   -1.8   0.1   3.4
  XRCC2   NM_005431.1   -1.2   1.0   1.2   1.0   1.1     2.1   2.6   1.9   1.5   -0.5   0.4
  XRCC3   NM_005432.2   1.1   1.2   1.6   1.3   -2.3     2.1   1.4   1.9   2.2   0.6   -0.3
  XRCC4   NM_022550.1   1.0   -1.1   1.0   -1.0   -1.0     -1.0   1.1   -1.5   -1.3   -2.1   -0.2
  XRCC5   NM_021141.2   1.6   -1.2   -1.3   1.0   1.1     -1.2   -1.1   1.1   1.3   -0.1   -0.3
  XRCC6   S38729.1   -1.0   -1.5   -1.6   -1.3   -1.1     1.2   1.1   -1.0   -1.1   0.1   0.1
  ZAK   NM_133646.1   1.0   1.4   1.0   -3.5   -2.3     1.8   1.7   1.7   1.7   0.1   0.0
  ZNRD1   X16416.1   -1.6   1.1   1.0   -1.0   1.2     1.1   1.1   -1.0   1.0   0.0   -2.0
A:仅艾地苯醌表达 
B:艾地苯醌+UVB表达 
C:仅咖啡果表达 
D:咖啡果+UVB表达 
E:仅UVB表达 
F:绿茶+UVB表达 
G:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
H:仅H2O2表达(24小时) 
I:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
J:仅H2O2表达(8小时) 
K:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(24小时) 
L:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(8小时) 
数据表10:定制阵列I基因 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  PARP1   NM_001618   1.3   1.0   -1.0   1.3   -1.1   4.4   1.1   1.1   1.8   1.7   0.0   0.1
  IGF1   NM_000618   1.0   1.0   1.2   1.4   1.2   -1.2   -1.0   -1.0   -1.4   -1.3   0.0   0.0
  SHC1   NM_003029   1.2   -1.2   -1.4   -1.0   -1.1   1.0   1.2   1.3   1.3   1.4   -0.1   -0.1
  IL1A   NM_000575   -1.0   1.0   1.1   1.0   -1.0   -5.3   1.1   -1.1   1.1   1.1   2.2   -0.1
  NADSYN1   NM_018161   1.2   -1.1   -1.3   -1.1   -1.5   3.4   -1.4   -1.4   1.3   1.2   0.0   0.1
  GAPDH   NM_002046   -1.1   -1.4   -1.5   1.1   1.1   1.1   1.0   1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0
  PARP2   NM_005484   1.3   1.2   1.1   1.0   -1.5   -6.5   1.9   2.0   -1.1   -1.1   -0.1   0.0
  IGF2   NM_000612   1.0   1.0   -1.2   1.0   1.3   1.1   1.2   1.9   -2.0   -1.3   -0.6   -0.7
  IFI44   NM_006417   -1.6   1.0   1.0   -1.6   1.1   2.7   -1.1   1.1   -2.0   -1.4   -2.2   -0.6
  IL6   NM_000600   -1.0   1.5   -1.3   1.0   1.0   -1.5   -1.2   -1.0   2.6   2.8   -0.2   -0.1
  BAX   NM_004324   1.3   1.3   1.3   -1.3   1.0   2.3   -1.5   -1.3   -1.0   1.0   -0.2   -2.0
  ACTB   NM_001101   1.0   -1.1   -1.2   1.4   -1.0   -1.8   1.1   1.1   1.1   1.0   0.0   0.0
  PPARG   NM_015869   -1.0   -1.2   1.5   -1.0   -1.1   -1.7   -1.3   -1.2   -1.1   -1.1   -0.1   0.0
  CLK1   NM_004071   1.0   -1.1   1.0   -1.3   1.1   1.7   1.6   1.8   -1.1   1.2   -0.2   -2.2
  CREBBP   NM_004380   -1.0   1.3   -1.2   1.0   -1.1   -1.8   -1.7   -2.3   -2.4   -1.9   0.5   -0.5
  IL10   NM_000572   1.1   1.1   1.2   1.0   -1.5   -2.8   3.0   2.2   1.1   1.2   0.8   0.0
  COX1   NP_536845   NF   NF   NF   NF   NF   -1.1   1.9   1.8   1.5   1.4   0.1   0.2
  HPRT1   NM_000194   1.2   1.3   1.0   1.2   -1.7   1.4   -2.1   -2.0   -1.4   -1.3   -0.1   -0.2
  APOE   NM_000041   1.0   -1.2   1.0   1.2   1.1   -1.6   1.2   1.4   -1.2   -1.7   -0.2   0.5
  TERT   NM_198255   1.1   -1.3   -1.0   1.3   1.0   1.2   -1.0   1.4   1.0   -1.1   -2.5   2.1
  CYP19A1   NM_000103   1.4   1.0   1.3   1.9   -1.7   -4.5   1.4   1.9   -2.5   -1.4   -0.6   -1.1
  TNF   NM_000594   1.1   -1.4   1.1   1.0   -1.1   -18.4   -1.7   -1.7   1.0   1.3   0.0   -0.3
  PTGS2   NM_000963   -1.2   1.3   1.5   -1.3   1.1   -2.0   1.9   1.9   6.0   5.8   0.1   0.2
  HIGX1A   SA_00105   NF   NF   NF   NF   NF   -23.5   -1.1   -1.1   -1.2   -1.1   0.1   -0.1
  HLA-DRA   NM_019111   1.0   1.0   1.4   -1.4   1.2   -16.6   -1.2   1.0   1.0   1.2   -2.2   -0.1
[0914] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  TEP1   NM_007110   1.0   -1.3   -1.1   -1.3   1.3   1.1   -1.9   -1.7   -1.3   1.0   -0.2   -2.3
  BCL2   NM_000633   1.0   1.2   -1.2   -1.1   1.0   3.5   -1.1   1.0   1.8   1.8   -2.2   0.0
  HSPA1A   NM_005345   1.4   -1.0   -1.1   1.1   1.0   2.1   3.4   4.4   -1.0   1.1   -1.0   -2.2
  HSPA1B   NM_005346   NF   NF   NF   NF   NF   3.5   4.4   5.2   1.2   1.3   -0.8   -0.1
  DDC   NM_000790   1.0   1.0   1.2   -1.1   -1.1   -12.2   1.2   -1.2   -1.3   1.0   2.4   -2.4
  SIRT1   NM_012238   -1.2   1.1   1.4   1.0   1.1   1.3   1.4   1.3   -1.0   1.1   0.1   -2.2
  KRAS   NM_004985   -1.2   -1.1   1.2   -1.1   1.2   1.6   -1.8   -2.3   1.5   -2.2   0.5   3.7
  SOD1   NM_000454   -1.0   1.0   -1.1   -1.0   1.1   1.2   -1.0   -1.0   -1.2   -1.1   0.0   0.0
  HSPA1L   NM_005527   1.0   -1.1   1.0   1.0   1.3   -3.9   1.4   1.5   1.5   1.9   -0.1   -0.4
  ACE   NM_000789   -1.0   -1.1   -1.8   1.1   -1.1   2.6   -2.9   -2.3   -1.2   -1.0   -0.6   -0.2
  TP53   NM_000546   -1.1   -1.3   -1.0   1.2   1.2   -1.2   -2.1   -2.0   -1.5   -1.5   -0.2   0.0
  SOD2   NM_000636   1.1   1.1   -1.1   -1.2   -1.0   1.3   2.8   2.3   1.6   1.5   0.5   0.1
  CASP9   NM_001229   -1.0   1.0   1.2   1.7   -1.0   2.5   1.0   1.2   1.1   1.3   -0.1   -0.2
  CCL4L1   NM_001001435   NF   NF   NF   NF   NF   -1.7   1.2   -1.1   1.9   -1.1   2.3   3.0
  GH1   NM_000515   1.0   1.3   -1.6   -1.2   1.2   -8.0   1.3   1.1   -1.2   -1.3   0.2   0.1
  MAPK14   NM_001315   1.0   -1.4   -1.1   1.0   -1.2   2.3   -1.3   -1.3   1.1   1.1   0.0   -0.1
  NOS2A   NM_000625   1.0   1.1   1.0   -1.6   -1.1   -10.6   -1.3   -2.0   1.1   -1.3   0.7   2.4
  CASP2   NM_032982   1.0   -1.3   1.3   1.0   1.3   2.1   1.1   1.0   -1.2   -1.4   0.0   0.2
  NFKB1   NM_003998   -1.5   -1.1   1.0   -1.2   1.1   2.6   -1.1   -1.4   1.1   -1.0   0.3   2.2
NF:未发现 
A:仅艾地苯醌表达 
B:艾地苯醌+UVB表达 
C:仅咖啡果表达 
D:咖啡果+UVB表达 
E:仅UVB表达 
F:绿茶+UVB表达 
G:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
H:仅H2O2表达(24小时) 
I:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
J:仅H2O2表达(8小时) 
K:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(24小时) 
L:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(8小时) 
数据表11:定制阵列II基因 
Figure BPA00001409038701891
A:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
B:仅H2O2表达(24小时) 
C:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
D:仅H2O2表达(8小时) 
E:仅艾地苯醌表达 
F:艾地苯醌+UVB表达 
G:仅咖啡果表达 
H:咖啡果+UVB表达 
I:仅UVB表达 
J:绿茶+UVB表达 
数据表12:抗衰老基因 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  ADAM1   Y09232.1   -1.4   -1.1   1.1   -1.1   -0.3   2.2            
  ANXA1   NM_000700.1   3.2   2.4   1.1   1.5   0.7   -0.4   -1.2   -1.1   1.0   1.0   -1.0  
  APBB1   L77864.1   1.4   1.4   1.6   1.6   0.1   0.0   -1.0   -1.4   1.3   -1.3   -1.1  
  APOB   NM_000384.1   -1.3   1.4   -1.0   -1.2   -2.7   0.2   1.0   1.0   1.0   -1.1   1.1  
  APOE   M12529.1   1.2   1.4   -1.2   -1.7   -0.2   0.5   1.2   -1.2   1.0   1.2   1.1   1.0
  AREG   NM_001657.1   4.6   4.2   -1.3   1.4   0.4   -2.7   1.0   1.0   1.0   1.4   -1.1  
  ATM   U26455.1   1.1   -1.2   1.5   1.3   2.3   0.3   -1.6   1.0   1.0   -1.1   1.0  
  BAT1   Z37166.1   -1.0   1.0   1.0   1.1   -2.1   -0.1   1.1   -1.2   1.3   1.0   1.1  
  BAX   NM_004324.1   -1.5   -1.3   -1.0   1.0   -0.2   -2.0   -1.1   -1.5   1.3   1.0   1.1   1.4
  BCL2   NM_000633.1   -1.1   1.0   1.8   1.8   -2.2   0.0   -1.1   1.2   -1.2   -1.1   1.0   4.2
  BCL2L1   NM_001191.1   1.2   1.2   1.1   -1.2   0.0   2.3   -1.3   1.0   1.0   -1.1   -1.1  
  BMP2   NM_001200.1   10.3   8.6   8.4   10.5   1.7   -2.1   1.3   -1.7   -1.1   1.2   1.1  
  BRCA2   NM_000059.1   1.7   1.5   1.3   1.4   0.3   -0.1   1.1   -1.1   1.0   -1.1   1.1  
  CANX   NM_001746.1   1.5   1.8   1.2   1.1   -0.3   0.1   -1.0   1.0   1.3   -1.1   -1.0  
  CASP7   NM_001227.2   -1.2   -1.1   -1.1   -1.1   -0.1   0.0   1.1   1.2   1.0   -1.0   -1.1  
  CASP8   X98172.1   1.2   1.0   -1.3   -1.7   0.1   0.4   -1.0   1.1   -1.1   -1.8   1.1  
  CCL5   NM_002985.1   1.4   1.6   -1.2   1.1   -0.1   -2.3   1.4   -2.1   -1.0   1.3   1.3  
  CCNA1   NM_003914.2   1.2   1.2   -1.0   1.2   0.0   -2.3   1.0   1.0   -1.1   -1.3   1.2  
  CCNB1   NM_031966.1   2.5   2.8   -1.8   -1.7   -0.3   -0.1   1.3   -1.1   -1.3   1.0   1.2  
  RPL13A   X56932.1   -1.0   -1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0   1.0   -1.1   1.0   -1.4   -1.1  
  CCND1   NM_053056.1   1.5   1.4   2.2   2.1   0.1   0.0   -2.1   -1.4   1.0   1.7   1.2  
  CCND2   NM_001759.2   1.3   1.1   -1.0   -1.2   0.2   0.2   -2.3   11.5   1.0   1.0   -1.4  
  CCND3   NM_001760.2   1.0   -1.1   1.2   1.5   2.1   -0.3   1.0   -1.2   -1.1   1.2   -1.1  
  CCNE1   NM_001238.1   -2.3   1.1   1.1   1.6   -3.4   -0.5   -1.0   1.2   1.4   -1.0   -1.2  
  CCNF   NM_001761.1   3.0   1.6   1.3   1.7   1.4   -0.4   1.0   -1.6   1.2   1.1   -1.2  
  CCNG1   U53328.1   -2.2   -2.1   -1.4   -1.6   -0.1   0.1   -1.1   -1.2   1.5   1.0   -1.1  
  CCNH   NM_001239.2   -1.5   1.0   1.3   1.5   -2.5   -0.3   1.0   1.2   -1.6   -1.4   -1.0  
  CDC42   NM_001791.2   -1.1   1.0   -1.2   -1.1   -2.2   0.0   1.1   1.5   -1.3   1.1   1.3  
  CDK2   NM_001798.2   2.2   2.4   1.7   1.6   -0.2   0.2   1.4   -1.4   1.3   1.0   -1.0  
[0944] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K  L
  CDK4   U79269.1   1.1   1.1   -1.1   -1.1   0.0   0.0   1.0   -1.0   1.1   -1.1   -1.0  
  CDK5R1   NM_003885.1   2.2   2.3   -1.0   -2.2   -0.1   1.1   -1.2   -1.1   1.1   1.4   1.1  
  CDKN1A   U03106.1   1.7   1.0   1.1   1.2   0.7   -0.1   -1.7   -1.3   1.1   1.2   -1.7  
  CDKN1B   NM_004064.2   -1.4   -1.3   -1.8   -1.7   0.0   -0.2   1.1   1.3   1.1   1.1   1.3  
  CDKN1C   NM_000076.1   -1.2   1.5   -2.2   -2.6   0.3   0.4   1.0   1.4   1.2   -1.0   2.2  
  CDKN2A   L27211.1   -1.1   -1.1   -1.1   -1.1   -0.1   0.0   -1.0   -1.0   -1.6   1.0   1.1  
  CENPA   U14518.1   2.4   3.0   -2.2   -1.8   -0.5   -0.3   1.5   -1.2   1.0   -1.2   -1.0  
  CENPF   U30872.1   1.7   1.3   -3.1   -2.2   0.4   -0.9   1.1   -1.2   -1.2   -1.2   1.1  
  CKB   M16364.1   1.1   1.0   1.1   -1.0   0.1   2.1   -1.3   -1.1   1.1   1.0   1.2  
  ALDOA   NM_000034.1   1.4   1.3   1.4   1.2   0.1   0.1   -1.2   1.1   1.1   -1.2   1.1  
  CLU   J02908.1   -1.1   1.0   1.9   2.6   -2.1   -0.8   1.2   -1.3   1.0   1.1   1.2  
  COL15A1   NM_001855.1   -2.9   -2.0   1.1   1.3   -0.9   -0.1   -1.9   1.2   -1.1   1.6   1.0  
  COL1A1   NM_000088.2   -1.1   -1.1   1.0   1.0   0.0   0.0   -1.1   -1.0   1.4   1.0   -1.8  
  COL3A1   NM_000090.2   -4.4   -5.3   -4.8   -5.7   0.9   1.0   1.2   -1.7   1.2   -2.0   -1.0  
  K-ALPHA-1   NM_006082.1   1.8   1.6   1.3   1.2   0.2   0.1            
  COL6A2   NM_058175.1   -1.1   -1.1   1.1   1.1   0.0   -0.1   -1.1   -1.2   -1.2   -1.1   -1.1  
  CSF2   M11220.1   1.1   1.1   1.1   1.2   0.0   -0.1   1.0   1.0   -1.1   -1.0   1.2  
  CST6   U62800.1   1.5   1.7   -1.0   -1.0   -0.1   0.0   -1.6   1.2   1.0   -1.2   1.2  
  CTGF   U14750.1   1.4   1.3   2.7   2.3   0.0   0.3   -1.2   1.4   1.4   1.1   -1.0  
  CTSD   M11233.1   4.2   4.5   1.4   2.1   -0.3   -0.7   -1.1   -1.2   1.4   1.3   2.0  
  CTSH   NM_004390.1   -1.3   -1.3   -1.2   -1.4   0.0   0.2   1.2   1.2   -1.3   1.4   -1.2  
  CTSS   M90696.1   1.2   1.1   -1.0   -1.0   0.2   0.0   -1.9   1.0   -1.4   -1.5   -1.1  
  CTSZ   AF136273.1   -1.3   -1.0   1.4   1.4   -0.3   0.0   -1.0   -1.1   1.6   1.2   -1.0  
  DDIT3   S40706.1   1.3   1.3   -1.6   -1.3   0.0   -0.3   -1.4   1.1   1.2   1.3   -1.0  
  DHFR   NM_000791.2   -2.2   -1.6   -1.4   -1.1   -0.6   -0.3   1.2   1.0   1.3   1.0   1.2  
  DNAJB1   D49547.1   1.4   1.6   -1.0   -1.1   -0.2   0.0   -1.1   -1.1   3.1   1.6   1.4  
  DPT   XM_001897.8   -3.4   2.6   -1.9   -1.7   -0.8   -0.2   1.4   1.1   1.0   1.3   1.1  
  DSG1   AF097935.1   -1.1   1.8   -1.3   -1.5   -2.9   0.2   1.0   1.4   -1.3   -1.0   -1.1  
  E2F1   NM_005225.1   2.6   2.4   2.4   2.4   0.2   0.0   1.4   1.1   1.1   1.1   1.1  
  E2F5   U31556.1   1.1   -1.1   1.3   1.1   2.3   0.2   -1.4   1.1   -1.1   1.0   -1.0  
  EEF1A1   AY043301.1   -1.5   -1.4   1.1   -1.0   -0.1   2.2   -1.0   -1.2   1.0   -1.3   -1.1  
  EGR1   NM_001964.1   1.3   1.2   -1.3   -1.6   0.1   0.2   -1.2   1.4   1.0   1.0   -1.3  
  ACTB   NM_001101.2   1.1   1.1   1.1   1.0   0.0   0.0     -1.1   -1.2   1.4   -1.1  
  EGR2   NM_000399.2   -6.6   -2.5   -1.8   1.0   -4.1   -2.9   -1.6   1.7   -1.3   -1.9   -1.6  
  EGR3   NM_004430.1   -1.6   -1.4   1.9   1.5   -0.2   0.3   -2.7   1.4   1.1   1.2   1.1  
  EIF3S6   NM_001568.1   -1.3   -1.3   1.2   1.2   0.0   0.0            
  EIF4A1   NM_001416.1   1.1   1.1   1.1   1.1   0.0   0.0   1.0   -1.1   -1.1   1.0   1.0  
  ELN   NM_000501.1   1.5   1.6   1.5   1.5   -0.1   0.0   1.0   1.0   1.3   1.3   -1.0  
  EPC2   AF286904.1   -1.1   -1.1   -1.2   -1.1   0.0   -0.1   1.0   1.3   1.0   1.3   -1.5  
  ETFB   NM_001985.1   -1.2   -1.6   -1.0   -1.1   0.4   0.0   1.0   -1.2   -1.1   1.0   1.4  
  EWSR1   NM_005243.1   1.5   1.5   1.7   1.4   0.0   0.4   1.1   -1.4   1.5   1.2   2.8  
  FES   X52192.1   -2.3   -2.6   -1.7   -1.3   0.3   -0.4   1.3   -1.4   1.2   1.0   1.0  
  FLG   M60502.1   1.0   1.1   -1.3   -1.1   -0.1   -0.2   -1.9   1.0   -1.4   1.0   1.6  
  FLT1   NM_002019.2   2.5   1.0   -1.6   -2.0   1.5   0.4   1.1   1.0   -1.2   -1.2   -1.2  
  FMOD   NM_002023.2   1.1   1.2   1.3   1.2   0.0   0.1   1.2   1.1   1.1   1.0   1.3  
  FN1   X02761.1   -2.4   -1.7   1.0   -1.2   -0.7   2.2   -1.5   -1.2   -1.2   -1.3   -1.2  
  FOS   NM_005252.2   1.4   1.3   1.1   -1.0   0.1   2.1   3.5   -1.4   1.4   1.2   -1.1  
  G6PD   NM_000402.1   -1.1   -1.1   -1.0   -1.2   0.0   0.2   -1.2   -1.2   1.3   -1.7   -1.2  
  GAA   NM_000152.2   -1.3   -1.3   1.4   1.5   0.0   0.0   1.0   -1.1   1.1   1.0   1.0  
  GLB1   M34423.1   -1.2   -1.4   1.0   1.1   0.2   0.0   -1.0   1.0   -1.0   1.0   -1.0  
  GPX1   M21304.1   -1.3   -1.3   -1.1   -1.1   0.0   0.0   -1.2   -1.1   -1.1   1.1   2.0  
  GRB2   NM_002086.1   1.1   -1.1   -1.1   -1.1   2.2   0.0   -1.1   -1.2   -1.1   -1.0   -1.0  
  GSTP1   NM_000852.2   1.1   1.0   -1.1   -1.0   0.1   -0.1   1.1   -1.1   1.0   1.0   1.0  
  GSTT1   NM_000853.1   -1.0   1.3   1.1   -1.2   -2.3   2.3   -1.2   1.1   -1.1   -1.1   -1.0  
  HBEGF   M60278.1   -1.1   -1.1   1.1   -1.1   0.0   2.1   -1.5   1.8   1.2   1.0   1.0  
  HIST1H2BK   NM_080593.1   2.9   2.4   1.1   1.1   0.5   0.0   -1.5   1.0   2.2   1.2   1.0  
  HIST1H3I   NM_003533.2   2.4   3.6   1.4   1.7   -1.2   -0.3   1.1   -1.1   -1.5   -1.3   1.3  
  HIST1H4I   NM_003495.2   -1.4   -1.4   -1.4   -1.1   0.0   -0.3   -1.1   1.1   2.6   -1.1   1.0  
  HLF   M95585.1   -2.4   1.0   -1.1   1.1   -3.5   -2.2   1.0   1.0   1.0   -1.5   1.1  
  HMOX1   NM_002133.1   34.2   22.3   6.2   6.2   11.9   0.0   1.1   1.0   1.4   1.1   -1.0  
  HSPA4   AB023420.1   1.1   -1.1   -1.8   -1.6   2.2   -0.3   -1.0   -1.2   -1.0   -1.2   -1.1  
[0945] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  HSPA6   NM_002155.1   24.1   56.4   1.4   6.4   -32.3   -5.0   1.4   -1.8   1.2   1.0   2.0  
  PPIE   AF042385.1   -2.3   -2.1   -1.5   -1.0   -0.2   -0.5   -1.1   -1.2   -1.4   -1.0   -1.7  
  HSPB1   AB020027.1   -1.2   -1.2   -1.3   -1.3   0.0   0.0   1.0   -1.1   -1.3   1.0   1.0  
  HSP90AA1   X15183.1   1.1   1.2   1.1   1.2   -0.1   0.0   1.2   -1.4   1.3   1.0   -1.0  
  KRT2B   M99063.1   -1.6   1.7   1.6   1.9   -3.3   -0.3            
  ICAM1   J03132.1   1.6   1.6   2.3   2.3   0.0   0.0   1.0   1.1   1.1   -1.2   -1.0  
  ID1   X77956.1   9.5   8.2   -1.0   -1.1   1.2   0.1   1.2   -1.0   -1.6   1.1   -1.5  
  ID2   M97796.1   1.2   1.2   -1.1   -1.0   0.0   -0.1   1.2   1.2   1.0   1.0   1.0  
  IFNG   X13274.1   1.2   1.0   1.3   -1.2   0.2   2.5   -1.0   -1.1   1.0   -1.2   2.3  
  IGF1   X57025.1   -1.0   -1.0   -1.4   -1.3   0.0   0.0   1.0   1.1   -1.1   1.2   1.2   -1.8
  IGF1R   NM_000875.2   -2.7   -2.6   -1.5   -1.5   -0.2   0.0   -1.2   -1.2   -1.5   1.2   1.0  
  IGFBP2   M35410.1   -2.1   1.0   1.2   1.2   -3.1   -0.1   -1.2   1.2   1.0   1.4   1.1  
  IGFBP3   X64875.1   -1.0   -1.1   1.1   1.1   0.0   0.0   -1.3   -1.1   1.2   -1.6   -1.3  
  IGFBP5   M65062.1   -3.9   -3.3   1.1   1.3   -0.6   -0.2   -1.4   1.2   1.1   1.4   1.2  
  IL10   NM_000572.1   3.0   2.2   1.1   1.2   0.8   0.0   -1.0   1.1   1.2   1.0   -1.5   -2.1
  GAPDH   NM_002046.2   1.0   1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0   -1.1   -1.4   -1.5   1.1   1.1  
  IL11   NM_000641.1   3.3   3.1   4.2   5.2   0.2   -1.0   -1.0   1.1   1.2   1.4   -1.1  
  IL11RA   NM_004512.1   -1.0   1.1   -1.1   -1.0   -2.2   0.0   1.1   -1.2   1.0   -1.0   -1.1  
  IL12A   M65291.1   1.8   1.7   1.6   2.1   0.1   -0.5   -2.1   -1.1   -1.6   1.2   1.1  
  IL15   NM_000585.1   -1.4   -1.3   -1.6   -1.4   -0.1   -0.2   -1.0   1.2   -1.0   2.3   1.1  
  IL1A   NM_000575.1   1.1   -1.1   1.1   1.1   2.2   -0.1   -1.0   1.0   1.1   1.0   -1.0   -3.0
  IL1B   M15330.1   1.5   1.6   -1.6   -1.1   -0.1   -0.5   -2.1   1.3   -1.1   1.0   1.1  
  IL2   U25676.1   -1.3   -1.4   1.1   -1.3   0.2   2.4   1.0   1.0   -1.3   1.5   1.0  
  IL3   M20137.1   1.5   1.1   1.4   -1.3   0.3   2.7   1.0   1.0   -1.2   1.1   -1.1  
  IL4   NM_000589.1   -2.8   -1.2   1.3   1.1   -1.6   0.2   1.1   1.4   1.3   1.0   -1.1  
  IL6   NM_000600.1   -1.2   -1.0   2.6   2.8   -0.2   -0.1   -1.4   1.5   -1.3   1.0   1.0   2.9
  IL8   NM_000584.1   18.7   21.7   14.8   15.9   -3.1   -1.1   1.0   1.0   1.0   1.0   1.1  
  IVL   M13903.1   1.2   1.1   1.2   1.2   0.1   -0.1   1.6   -2.0   -1.5   -1.2   1.2  
  JUND   NM_005354.2   -1.0   -1.3   -1.1   -1.1   0.3   0.0   1.1   1.3   -1.2   -1.3   1.1  
  KIF23   NM_004856.4   -1.3   1.0   -1.5   -1.3   -2.4   -0.2   1.3   -1.2   1.0   -1.1   1.1  
  KIF2C   NM_006845.2   4.0   4.4   -1.2   -1.3   -0.3   0.0   1.1   -1.3   1.4   1.1   1.3  
  KRT1   NM_006121.2   3.4   2.7   -1.4   1.1   0.7   -2.6   1.0   1.0   -1.1   -1.1   -1.0  
  KRT10   NM_000421.1   1.1   1.2   1.1   1.2   -0.1   -0.1   1.0   1.3   -1.1   -1.2   -1.3  
  KRT14   NM_000526.2   3.5   2.6   1.7   1.8   0.9   -0.1   -1.4   -1.1   1.1   1.1   1.0  
  HK1   M75126.1   1.6   1.3   1.7   1.5   0.3   0.2   1.0   -1.1   1.0   1.4   -1.1  
  KRT16   AF061812.1   1.4   1.4   -1.0   -1.2   0.0   0.2   -1.1   -1.2   1.6   -1.1   1.1  
  KRT17   X62571.1   2.0   1.7   1.4   1.7   0.2   -0.3   -2.8   -1.2   1.4   1.2   -2.5  
  KRT19   NM_002276.1   1.4   1.5   -1.4   -1.3   -0.1   -0.2   -1.7   -1.1   1.1   1.2   1.0  
  KRT6A   NM_005554.2   -1.2   -1.1   -1.0   1.1   -0.1   -2.1   1.0   -1.1   1.2   1.6   -1.5  
  HPRT1   NM_000194.1   -2.1   -2.0   -1.4   -1.3   -0.1   -0.2   1.1   1.3   1.0   1.2   -1.7  
  LTA   NM_000595.2   1.4   1.8   -2.2   1.0   -0.4   -3.2   -1.1   2.0   -1.1   -1.2   1.4  
  MAP2K1   NM_002755.2   1.5   1.4   1.4   1.3   0.1   0.0     -1.3   1.2   1.5   -1.1  
  MAP2K2   NM_030662.2   -1.2   -1.2   -3.3   -1.5   0.1   -1.8     -1.3   1.0   1.3   1.0  
  MAP2K4   NM_003010.1   1.1   1.1   -1.1   -1.1   0.1   0.0     1.3   1.0   1.6   -1.0  
  MAPK8   L26318.1   1.6   1.7   1.3   1.5   -0.2   -0.2   -1.3   1.1   -1.1   1.2   1.2  
  MAPK9   U09759.1   -1.2   -1.1   -1.0   1.0   0.0   -2.0   -1.0   -1.4   1.0   1.2   1.3  
  MAX   NM_002382.2   1.9   1.3   1.0   -1.5   0.7   2.5   -1.0   -1.1   -1.0   1.1   1.0  
  MCM2   D21063.1   3.2   3.0   2.5   2.1   0.2   0.4   1.4   -1.1   -1.5   1.4   2.3  
  MDM2   NM_002392.2   1.8   1.7   2.3   1.7   0.2   0.5   -2.1   -1.2   1.0   1.0   -1.1  
  MKI67   NM_002417.2   1.7   2.2   -1.1   -1.1   -0.5   0.0   1.4   -1.4   1.2   1.0   -1.1  
  MMP1   NM_002421.2   3.1   3.5   1.4   1.5   -0.5   -0.1   -1.4   -1.4   -1.1   -1.1   -1.0  
  MMP10   NM_002425.1   4.6   5.6   1.3   1.6   -1.0   -0.3   1.0   1.1   1.2   -1.1   -1.1  
  MMP11   NM_005940.1   3.3   2.3   -1.3   1.3   1.0   -2.6   1.1   -1.1   1.0   1.0   -1.1  
  MMP12   NM_002426.1   1.5   1.9   -1.1   1.1   -0.4   -2.2   1.7   1.2   -1.2   -1.1   -1.0  
  MMP13   NM_002427.1   -1.3   -1.6   -1.4   -1.4   0.3   0.0   1.0   1.0   1.0   -1.0   -1.8  
  MMP14   NM_004995.2   1.8   2.0   2.0   1.9   -0.2   0.1   -1.1   -1.8   1.0   1.0   1.1  
  MMP15   NM_002428.1   -2.1   -1.3   -1.2   -1.5   -0.8   0.3   -1.0   -1.1   -1.2   -1.3   1.2  
  MDH1   NM_005917.1   -1.4   -1.2   -1.4   -1.5   -0.1   0.1   1.0   1.0   1.1   1.0   1.3  
  MMP2   NM-004530.1   1.1   1.2   1.2   1.0   -0.1   0.1   -1.1   -1.1   1.1   -1.2   1.1  
  MMP3   NM_002422.2   1.1   1.1   1.0   1.0   0.0   0.0   2.3   -1.0   3.5   1.0   -1.2  
  MMP7   NM_002423.2   -1.2   -1.2   -1.3   -1.4   0.1   0.1   -1.6   1.0   -1.2   1.2   1.1  
[0946] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  MSRA   AF183420.1   -1.3   1.2   2.6   1.8   -2.5   0.8   -1.0   -1.0   1.0   1.0   1.1  
  MT2A   V00594.1   1.7   1.7   1.1   1.1   0.0   0.0   -1.3   1.1   1.1   1.2   1.3  
  MVK   M88468.1   -1.0   -1.2   -1.3   -1.5   0.2   0.2   1.6   1.1   1.4   -1.5   1.3  
  MYBL2   X13293.1   3.9   3.8   2.4   2.0   0.0   0.4   1.4   -1.1   -1.2   1.2   1.0  
  MYCBP   NM_012333.2   1.6   1.8   1.3   1.3   -0.2   0.0   -1.0   -1.3   -1.1   1.0   -1.1  
  NCK1   NM_006153.2   1.0   -1.1   -1.4   -1.4   2.2   0.1   1.0   1.1   1.0   -1.0   -1.5  
  NF1   NM_000267.1   -3.0   -1.7   -1.1   -1.1   -1.3   0.1   -1.1   1.2   1.2   1.1   1.0  
  NGFR   M14764.1   3.4   2.7   1.1   2.0   0.7   -0.9   1.0         -1.0  
  NR1D1   NM_021724.1   -4.7   4.1   4.6   5.4   0.6   -0.8   -1.6   1.1   1.3   -1.2   1.1  
  NRG1   M94165.1   4.3   3.9   1.2   -1.0   0.4   2.2   1.1   1.0   -2.0   -1.2   -1.6  
  ODC1   NM_002539.1   3.2   2.8   1.9   1.7   0.4   0.2   1.1   1.0   -1.1   1.0   1.1  
  PAK1   NM_002576.2   -1.1   1.0   1.2   1.2   -2.2   0.0   -1.0   -1.4   -1.8   -1.4   1.0  
  PARP1   J03473.1   1.1   1.1   1.8   1.7   0.0   0.1   1.2   1.0   -1.0   1.3   -1.1   3.3
  PCNA   NM_002592.1   1.8   1.7   1.1   1.1   0.1   -0.1   -1.0   1.1   1.4   1.2   -1.1  
  PDZK1IP1   U21049.1   -1.4   1.0   -1.0   -1.0   -2.4   0.0   1.0   1.0   -1.5   -1.4   1.0  
  PITRM1   AF061243.1   -1.2   1.1   -1.2   -2.1   -2.3   0.9   -1.1   -1.2   1.0   1.7   1.3  
  PKM2   M26252.1   -1.2   -1.1   1.1   1.1   -0.1   0.0   -1.1   -1.3   -1.2   -1.0   1.3  
  PLAT   NM_000930.2   1.7   1.6   3.7   3.4   0.1   0.3   -1.1   1.1   1.0   1.0   1.2  
  PLAU   NM_002658.1   3.3   3.5   7.5   7.3   -0.2   0.2   -1.6   1.0   -1.0   -1.9   1.1  
  PLAUR   NM_002659.1   4.7   4.7   3.2   3.3   0.0   -0.2   -1.1   -1.2   -1.4   -1.4   -1.2  
  PLK1   U01038.1   -2.7   -3.1   -2.3   -1.8   0.4   -0.5   1.3   -1.3   1.0   1.0   1.1  
  POLA2   NM_002689.2   1.2   1.8   1.5   1.1   -0.6   0.4   1.0   -1.3   1.3   -1.1   1.2  
  PRDX6   NM_004905.1   -1.7   -2.4   -1.1   -1.5   0.6   0.4   -1.5   1.1   1.0   1.0   -1.1  
  HTRA1   NM_002775.1   -1.1   -1.1   1.0   1.1   -0.1   0.0   1.1   1.0   -1.0   1.2   -1.0  
  PSMA2   NM_002787.1   1.1   1.1   -1.1   -1.0   0.0   0.0   1.1   1.0   1.2   -1.2   1.0  
  PSMA3   NM_002788.1   -1.2   -1.0   1.5   2.3   -0.1   -0.8   1.1   1.2   1.0   1.5   -1.3  
  YWHAZ   M86400.1   -1.2   -1.1   -1.2   -1.2   -0.1   0.0   1.0   1.1   1.0   -1.0   1.2  
  PSMC6   NM_002806.1   1.2   1.2   -1.0   -1.0   0.0   0.0   1.0   1.0   1.0   1.0   1.1  
  PSMD1   NM_002807.1   1.4   1.3   1.1   1.1   0.1   0.0   -1.0   -1.3   1.2   -1.1   1.1  
  PSMD11   AB003102.1   1.5   1.4   1.1   -1.0   0.1   2.1   1.1   -1.4   -1.1   1.2   -1.1  
  PSMD12   NM_002816.1   -1.0   1.0   -1.1   -1.0   -2.0   -0.1   1.0   1.1   -1.1   -1.1   -1.2  
  PTGS1   NM_000962.2   1.1   1.2   1.5   1.5   -0.1   0.0   1.2   -1.3   1.0   1.0   1.1  
  PTGS2   NM_000963.1   1.9   1.9   6.0   5.8   0.1   0.2   -1.3   1.3   1.5   -1.3   1.2  
  RAF1   X03484.1   1.2   -1.0   1.2   1.1   2.3   0.1   -1.0   -1.2   1.3   -1.6   2.1  
  RB1   NM_000321.1   -1.1   1.0   1.5   1.6   -2.2   -0.1   -1.5   1.2   1.2   1.3   -1.9  
  RET   NM_000323.2   1.7   1.8   -1.8   1.9   -0.1   -3.7   -1.0   1.0   1.1   1.1   1.2  
  RORA   U04897.1   -1.3   -1.1   2.0   1.6   -0.2   0.4   -1.2   -1.2   -1.1   1.0   1.1  
  RPL3   NM_000967.2   -1.1   -1.1   -1.0   -1.0   0.0   0.0   1.0   -1.4   -1.3   -1.1   -1.3  
  RPS10   NM_001014.2   1.8   1.8   1.3   1.5   0.1   -0.2   1.0   1.1   1.3   -1.2   -1.0  
  RPS9   NM_001013.2   1.2   1.3   1.1   -1.2   -0.1   2.3   1.2   -1.0   1.0   1.2   -1.1  
  RRAS   NM_006270.2   -1.2   -1.3   -1.3   -1.2   0.1   -0.1   -1.1   -1.1   -1.1   -1.0   1.0  
  RRM1   NM_001033.1   -1.5   -1.1   -2.7   -2.4   -0.4   -0.2   -1.0   1.0   1.0   1.0   -1.1  
  S100A10   M81457.1   -3.7   -4.6   -5.4   -4.9   0.9   -0.5   -1.7   1.0   1.1   1.2   1.3  
  S100A11   D38583.1   1.1   1.0   -1.1   1.0   0.0   -2.1   -1.1   -1.1   -1.5   1.0   -1.4  
  S100A7   M86757.1   9.4   13.0   2.4   3.1   -3.5   -0.8   2.7   1.3   -1.2   1.0   1.0  
  S100A8   NM_002964.2   1.4   1.3   1.1   -1.3   0.1   2.4   1.0   -1.1   -1.5   1.0   1.2  
  SERPINB2   J02685.1   24.8   25.0   9.2   9.0   -0.2   0.2   -2.9   1.0   1.1   1.0   -1.0  
  SERPINE1   M14083.1   1.0   1.2   1.7   1.6   -0.2   0.0   -1.4   -1.2   -1.1   -1.2   -2.2  
  SHC1   U73377.1   1.2   1.3   1.3   1.4   -0.1   -0.1   1.0   -1.2   -1.4   -1.0   1.6   1.3
  SLK   NM_014720.1   -1.1   -1.1   -1.1   1.1   0.0   -2.2   -1.0   1.1   1.0   -1.4   1.1  
  SMAD1   U59423.1   -1.2   -1.2   -1.4   -1.3   0.0   -0.1   1.2   1.6   1.0   1.0   1.2  
  SNCG   NM_003087.1   1.4   1.3   -1.2   -1.4   0.0   0.2   1.4   1.2   -1.0   1.0   1.0  
  SOD2   NM_000636.1   2.8   2.3   1.6   1.5   0.5   0.1   1.0   1.1   -1.1   -1.2   1.1   -1.3
  SPARC   NM_003118.1   -1.4   -1.0   1.3   1.5   -0.3   -0.2   -1.2   1.0   1.2   1.0   1.2  
  SDS   NM_006843.1   1.4   1.5   -1.2   1.4   -0.1   -2.6   -2.0   1.2   1.0   1.1   1.4  
  SPP1   NM_000582.1   2.2   1.3   1.3   1.2   0.9   0.2   -2.7   1.1   1.0   -1.0   1.6  
  SPRR1B   NM_003125.1   1.0   -1.2   -1.1   -1.3   2.2   0.2   1.0   1.0   1.0   -1.5   -1.2  
  SRI   NM_003130.1   -1.1   -1.0   -1.1   -1.0   -0.1   -0.1   -1.0   1.0   1.0   -1.3   -1.0  
  STAT5A   L41142.1   -1.3   -1.6   -1.0   1.1   0.3   -2.1   -1.0   -1.2   1.6   1.0   1.1  
  STOML2   AF282596.   1.2   1.1   1.1   -1.0   0.0   2.1   1.2   -1.2   -1.1   1.0   -1.1  
  TAGLN   M95787.1   2.7   2.7   1.9   1.9   0.0   0.1   -1.2   -1.1   -1.3   1.1   1.1  
[0947] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  TBXA2R   D38081.1   1.1   -1.1   -1.1   -1.1   2.2   0.0   -1.1   1.2   1.2   1.1   1.1  
  TERC   U86046.1   -3.3   -2.8   -1.5   -1.6   -0.4   0.1            
  TERF1   U40705.1   -1.4   -1.3   -1.5   -1.4   -0.1   -0.1   -1.0   1.4   -1.0   -1.1   1.0  
  TERT   AF018167.1   -1.0   1.4   1.0   -1.1   -2.5   2.1   1.1   -1.3   -1.0   1.3   1.0   1.2
  TFAP2A   M36711.1   1.8   1.7   3.0   4.2   3.5   -1.2   -1.2   -1.4   1.0   1.1   1.6  
  TFAP2B   X95694.1   -1.1   1.1   1.1   1.2   -2.2   -0.1   1.0   1.0   1.6   1.1   1.2  
  TFAP2C   NM_003222.2   -2.1   -1.9   1.0   -1.3   -0.2   2.3   -1.1   -1.3   -1.2   -1.2   -1.4  
  TGFA   NM_003236.1   4.7   4.1   4.5   4.4   0.5   0.1   1.0   -1.5   1.2   1.0   -1.0  
  TGFB1   NM_000660.1   2.0   1.9   1.3   1.2   0.2   0.1   1.0   -1.2   1.1   1.0   1.0  
  TGFBR2   D50683.1   1.2   1.1   -1.0   -1.2   0.1   0.2   -1.3   1.0   1.0   -1.6   -1.3  
  TGM1   NM_000359.1   5.2   1.2   -1.3   1.9   4.1   -3.2   -1.1   1.0   1.0   -1.0   1.1  
  TH   NM_000360.1   1.1   1.0   1.0   1.3   0.1   -0.3   1.6   -2.2   -1.0   1.5   2.5  
  THBS1   NM_003246.1   -1.9   -1.5   2.0   1.7   -0.4   0.2   -1.1   -1.2   1.2   1.1   1.2  
  TIMP1   NM_003254.1   -1.0   -1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0   -1.4   -1.3   1.0   -1.2   -1.4  
  TIMP2   NM_003255.2   -1.5   -1.4   -1.2   -1.1   -0.1   0.0   -1.4   1.2   1.0   1.4   1.3  
  TK1   NM_003258.1   -1.0   -1.2   1.4   1.5   0.2   -0.1   1.6   -1.2   1.4   -1.2   1.0  
  TM4SF1   M90657.1   -1.1   1.1   -1.6   -1.3   -2.2   -0.3   -1.1   -1.5   -1.4   1.0   -1.0  
  TNF   NM_000594.1   -1.7   -1.7   1.0   1.3   0.0   -0.3   1.1   -1.4   1.1   1.0   -1.2   -6.8
  TNFRSF11B   NM_002546.2   -3.8   -3.0   1.3   1.3   -0.8   0.0   1.0   1.0   -1.2   1.1   -1.4  
  TNFRSF1A   NM_001065.2   1.3   1.2   -1.3   -1.6   0.1   0.2   -1.1   -1.1   1.3   1.0   1.1  
  TFRC   NM_003234.1   -2.0   -2.0   1.6   -1.8   0.1   3.4   1.1   1.0   1.2   1.0   1.1  
  TNFRSF1B   NM_001066.1   1.2   1.4   2.7   2.7   -0.2   0.1   -1.8   -1.0   -1.0   1.0   1.1  
  top2A   NM_001067.2   -1.1   1.7   -1.4   -1.4   -2.7   -0.1   1.6   -1.3   -1.4   -1.1   2.6  
  TP53   AF307851.1   -2.1   -2.0   -1.5   -1.5   -0.2   0.0   1.1   -1.3   -1.0   1.2   1.2   -1.1
  TYMS   NM_001071.1   -1.6   -1.3   -1.3   -1.0   -0.3   -0.2   1.2   1.1   1.0   2.0   1.3  
  UBE2C   NM_007019.1   4.7   5.0   -1.2   -1.1   -0.3   -0.1   1.5   -1.2   1.1   1.0   -1.0  
  UBE2V1   NM_003349.3   -2.0   -5.1   -1.6   -1.7   3.1   0.1   -1.1   -1.1   -1.0   1.2   1.0  
  VEGFC   NM_005429.2   1.3   1.3   2.3   2.2   0.0   0.1   1.0   -1.0   -1.0   -1.0   2.1  
A:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
B:仅H2O2表达(24小时) 
C:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
D:仅H2O2表达(8小时) 
E:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(24小时) 
F:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(8小时) 
G:仅艾地苯醌表达 
H:艾地苯醌+UVB表达 
I:仅咖啡果表达 
J:咖啡果+UVB表达 
K:仅UVB表达 
L:绿茶+UVB表达 
数据表13:炎症基因 
  正式基因符号   Genbank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  ACTB   NM_001101.2   -1.0   -1.2   1.1   -1.1   1.1     1.1   1.1   1.1   1.0   0.0   0.0
  AGT   NM_000029.1   1.4   1.5   1.4   1.4   1.0     1.1   1.0   1.2   1.1   0.1   0.1
  AGTR1   M87290.1   -1.0   1.0   1.0   1.1   1.0     1.1   1.0   -1.0   -1.0   0.1   0.0
  ALDOA   NM_000034.1   1.2   -1.3   1.2   -1.2   1.1     1.4   1.3   1.4   1.2   0.1   0.1
  ALOX15   NM_001140.3   1.0   2.0   -1.2   1.6   1.3     1.7   2.3   1.9   1.1   -0.6   0.8
  ALOX5   NM_000698.1   1.1   1.0   -1.6   -1.2   -1.0     1.1   -2.3   4.1   4.2   3.4   0.0
  AMH   NM_000479.2   -1.0   -1.1   1.2   -1.1   -1.1     2.9   3.8   2.0   1.9   -0.8   0.0
  AREG   NM_001657.1   -1.2   1.0   1.0   1.4   -1.1     4.6   4.2   -1.3   1.4   0.4   -2.7
  ATF2   NM_001880.2   1.0   1.5   -1.3   -1.3   1.2     -1.2   -1.1   -1.2   -1.8   -0.1   0.6
  B2M   NM_004048.2   -1.0   -1.2   1.1   -1.6   -1.8     1.8   1.8   1.2   1.0   0.0   0.2
  BAD   NM_004322.2   1.0   -1.1   -1.2   1.0   1.2     1.5   1.6   1.6   1.2   -0.1   0.4
  BAG3   NM_004281.2   1.0   -1.1   1.0   -1.5   -1.4     1.8   1.6   1.3   1.2   0.2   0.1
  BCL2   NM_000633.1   1.0   1.2   -1.2   -1.1   1.0   3.5   -1.1   1.0   1.8   1.8   -2.2   0.0
  BCL3   NM_005178.2   1.1   1.1   1.0   1.3   -1.0     -1.1   -1.0   1.0   1.2   0.0   -0.1
  BDNF   M61176.1   -1.0   -1.1   1.2   -1.0   1.1     -1.1   -1.1   1.9   1.8   0.0   0.1
[0962] 
正式基因符号   Genbank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
BLR1   X68149.1   -1.2   1.2   1.6   -1.5   -1.1     1.6   1.2   -1.9   -1.1   0.4   -0.8
BMP1   M22488.1   1.4   -1.3   1.0   1.4   1.3     -1.6   -1.3   1.2   1.4   -0.3   -0.2
BMP2   NM_001200.1   1.1   -1.7   -1.1   1.2   1.0     10.3   8.6   8.4   10.5   1.7   -2.1
BMP3   NM_001201.1   1.0   1.0   -1.0   1.1   1.2     1.1   -1.1   -1.1   1.2   2.2   -2.3
BMP4   M22490.1   1.0   1.3   1.2   -1.1   1.5     4.3   4.4   -1.2   -2.4   -0.1   1.2
BMP6   NM_001718.2   -1.3   1.0   1.0   1.0   1.1     1.2   -1.4   -1.7   -1.6   2.6   -0.1
BMP7   NM_001719.1   1.1   1.8   1.0   -1.1   -2.2     1.3   1.0   -1.9   -2.0   0.3   0.0
BMPR2   D50516.1   -1.0   -1.2   2.4   -1.6   1.1     -2.2   -1.9   -1.4   -1.3   -0.3   -0.1
BSG   NM_001728.1   1.0   -1.1   1.3   -1.3   -1.0     -1.4   -1.3   -1.3   -1.3   0.0   -0.1
C3   NM_000064.1   -1.1   -1.2   1.3   -1.0   2.2     3.0   3.0   -1.1   -1.1   0.0   0.0
C5   NM_001735.2               -2.2   -2.7   -1.6   -1.6   0.6   0.0
CASP1   M87507.1   1.0   10   1.5   1.0   1.2     -4.5   -4.1   -1.1   -1.4   -0.4   0.3
CAV1   NM_001753.3   1.0   -1.5   1.2   1.0   1.2     -1.2   -1.2   -1.2   -1.2   0.0   0.0
CCL1   NM_002981.1   1.1   -1.1   1.1   1.0   1.1     -1.3   -1.5   -1.3   1.4   0.2   -2.7
CCL11   NM_002986.2   1.0   -1.6   -1.2   1.1   1.0     1.6   1.1   1.2   1.1   0.5   0.1
CCL13   NM_005408.2   1.1   1.0   -1.2   1.1   1.0     -1.3   -1.6   1.4   2.4   0.4   -1.0
CCL2   NM_002982.3   -1.1   1.1   -1.2   1.0   -1.1     1.4   2.0   4.2   4.6   -0.6   -0.5
CCL21   NM_002989.2   -1.2   -1.3   -1.0   -1.1   1.0     1.9   1.9   1.2   1.1   0.0   0.1
CCL5   NM_002985.1   -1.0   -2.1   -1.0   1.3   1.3     1.4   1.6   -1.2   1.1   -0.1   -2.3
CCL7   NM_006273.2   -1.0   -1.0   1.5   1.0   1.1     -1.2   -1.0   1.4   2.0   -0.1   -0.5
CCL8   NM_005623.2   1.1   1.0   1.0   -1.6   1.1     -1.2   -1.1   1.5   1.1   -0.2   0.5
CCR1   NM_001295.2   1.1   1.0   -1.8   1.0   -8.2     1.7   1.6   1.4   1.1   0.2   0.3
CCR2   NM_000647.3   1.2   1.0   -1.2   -1.1   -1.0     1.1   -1.4   1.2   1.2   2.6   0.0
CCR3   NM_001837.2   -1.3   -1.1   1.1   1.0   -1.1     1.1   2.1   -1.1   -1.6   -1.1   0.5
CCR4   NM_005508.4   1.2   1.8   1.3   1.1   1.1     -1.2   -1.2   -1.1   -1.2   0.1   0.1
CCR5   NM_000579.1   -1.1   -1.1   1.1   -1.1   1.1     -1.0   1.0   -1.7   1.0   -2.0   -2.7
CCR6   U68030.1   1.0   1.0   1.1   2.0   2.3     -1.0   1.1   2.7   1.5   -2.1   1.1
CCR7   NM_001838.2   1.0   1.5   1.3   -1.3   1.2     -1.2   -1.3   1.7   1.3   0.1   0.4
CCR8   NM_005201.2   1.0   1.0   1.2   1.2   1.6     -3.7   -1.9   -1.5   -2.2   -1.8   0.6
CD2   NM_001767.1   -1.0   1.6   1.0   -1.2   1.2     -1.0   1.1   1.8   1.4   -2.1   0.4
CD247   J04132.1   1.1   1.0   -1.4   1.3   -1.1     1.3   1.4   1.2   -1.4   -0.1   2.6
CD28   NM_006139.1   2.4   2.1   1.6   -1.0   1.1     1.6   1.1   -1.9   1.1   0.4   -3.1
CD3E   NM_000733.2   1.1   -1.2   -1.1   -1.0   1.4     1.1   1.2   -1.0   -1.1   0.0   0.1
CD3G   NM_000073.1   -1.5   1.4   1.0   1.3   -1.2     -1.1   -1.1   1.3   -1.1   0.0   2.4
CD40   NM_152854.1               -1.7   1.0   1.2   1.2   -2.7   0.0
CD40LG   NM_000074.1               -1.9   -1.7   -1.4   1.7   -0.2   -3.1
CD69   NM_001781.1   1.0   1.0   1.2   -1.3   1.2     -3.4   -2.5   -1.5   -1.4   -0.8   -0.1
CD80   NM_005191.1   -1.0   1.0   1.1   1.1   -1.0     2.4   1.7   1.7   1.8   0.7   -0.1
CD86   NM_006889.1   -1.0   -1.1   1.3   -1.7   1.1     1.1   1.1   1.2   1.3   0.0   -0.1
CDKN1A   U03106.1   1.2   -1.3   1.1   1.2   -1.7     1.7   1.0   1.1   1.2   0.7   -0.1
CDKN1B   NM_004064.2   -1.1   1.3   1.1   1.1   -1.1     -1.4   -1.3   -1.8   -1.7   0.0   -0.2
CDKN2B   U17075.1   -1.2   1.3   -1.1   1.2   -1.0     1.2   1.2   1.1   1.1   0.0   0.1
CEBPB   NM_005194.2   -1.2   -1.0   -1.0   1.0   -1.0     1.3   1.2   1.3   1.3   0.1   0.0
CFB   NM_001710.3   -1.1   -1.3   -1.1   1.0   -1.0     -3.1   -3.2   -1.2   1.2   0.1   -2.4
CNTF   NM_000614.2   *   *   *   *   *     2.8   2.5   -1.1   1.6   0.3   -2.7
CNTFR   M73238.1   -1.4   1.0   1.1   -1.1   -1.1     1.1   -1.1   1.5   1.4   2.2   0.1
COL1A1   NM_000088.2   1.0   -1.0   1.4   1.0   -1.8     -1.1   -1.1   1.0   1.0   0.0   0.0
COL1A2   NM_000089.2   1.0   -1.0   1.0   1.0   1.3     -2.6   -1.6   -1.6   -1.6   -0.9   0.0
COL3A1   NM_000090.2   1.0   -1.1   -1.8   1.1   -1.0     -4.4   -5.3   -4.8   -5.7   0.9   1.0
CRHR1   NM_004382.2   1.0   -1.2   1.1   -1.7   1.3     -1.5   -1.8   -1.7   -3.7   0.3   2.0
CRP   NM_000567.2   -1.0   1.0   1.5   1.0   1.1     -1.1   -1.9   -1.6   -1.9   0.9   0.3
CSF1   M37435.1   -1.1   -1.1   -1.3   1.2   -1.1     1.2   1.2   1.1   1.1   0.0   0.1
CSF1R   NM_005211.1   *   *   *   *   *     1.1   1.5   1.3   1.3   -0.4   0.0
CSF2   M11220.1   2.4   1.0   -1.1   -1.0   1.2     1.1   1.1   1.1   1.2   0.0   -0.1
CSF3   X03438.1   1.7   1.0   1.2   1.0   -1.0     1.9   1.8   -1.9   1.1   0.1   -3.0
CSF3R   M59820.1   1.0   -1.1   -1.3   1.1   1.2     1.2   -1.1   1.2   1.7   2.2   -0.4
CTGF   U14750.1   1.1   1.4   1.4   1.1   -1.2     1.4   1.3   2.7   2.3   0.0   0.3
CTLA4   NM_005214.2   1.0   1.2   1.0   1.1   1.0     -1.4   1.2   1.7   1.9   -2.6   -0.2
CX3CR1   NM_001337.2   -1.0   1.9   2.1   1.0   1.1     -1.1   -1.4   1.9   -1.4   0.4   3.3
CXCL12   NM_000609.3   1.0   1.1   1.0   1.0   1.3     -1.4   -1.5   1.2   1.2   0.1   0.0
CXCL2   NM_002089.1   1.6   1.3   -1.4   1.1   1.3     1.3   -1.1   1.1   1.1   2.4   0.0
[0963] 
  正式基因符号   Genbank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  CXCR4   NM_003467.2   1.2   1.0   -1.4   1.0   1.0     -1.3   1.4   -1.1   -1.1   -2.7   0.0
  DDR1   L11315.1   -1.2   1.2   1.0   1.0   1.4     2.1   2.0   1.3   1.3   0.0   0.0
  EDN2   M65199.1   1.2   1.0   -1.2   1.2   -1.1     1.1   1.0   -1.1   1.1   0.0   -2.2
  EDN3   J05081.1   1.2   1.0   1.2   1.0   1.0     1.2   1.1   -1.2   1.1   0.1   -2.3
  EDNRB   S57283.1   -1.0   1.0   -1.2   -1.8   -1.1     -1.1   -1.2   1.2   1.1   0.1   0.1
  EGF   NM_001963.2   1.0   1.0   -1.1   1.3   1.1     -1.2   1.2   1.7   -1.2   -2.4   3.0
  EGFR   NM_005228.1   1.8   -1.0   1.0   -1.0   -1.2     -1.5   -1.6   1.1   1.1   0.1   0.0
  EGR1   NM_001964.1   *   *   *   *   *     1.3   1.2   -1.3   -1.6   0.1   0.2
  EGR2   NM_000399.2   1.0   1.7   -1.3   -1.9   -1.6     -6.6   -2.5   -1.8   1.0   -4.1   -2.9
  EGR3   NM_004430.1   -1.0   1.4   1.1   1.2   1.1     -1.6   -1.4   1.9   1.5   -0.2   0.3
  ENG   NM_000118.1   1.0   -1.2   -1.2   1.1   1.9     2.2   -2.6   1.6   -1.5   0.4   3.1
  EP300   NM_001429.2   1.1   -2.4   -1.2   1.0   -1.1     1.7   1.7   -1.3   -1.0   -0.1   -0.3
  EPHA3   AF213459.1   1.8   1.7   1.1   -1.3   1.1     -1.1   -1.3   1.2   1.1   0.3   0.1
  EPHB1   NM_004441.3   1.1   -1.0   1.2   1.0   1.0     4.6   4.0   5.2   5.0   0.6   0.2
  EPHB2   AF025304.1   -1.0   -1.0   1.2   1.7   1.0     1.1   -1.4   -1.1   1.0   2.5   -2.1
  EPO   NM_000799.1   -1.0   -1.9   -1.1   1.4   1.2     -1.8   -2.4   -1.8   -1.9   0.6   0.2
  EPOR   NM_000121.2   -1.0   1.0   1.0   -1.3   1.0     1.6   1.5   -1.3   -1.4   0.1   0.1
  ERBB2   NM_004448.1   -1.0   -1.2   1.3   -1.2   1.1     -1.2   -1.3   1.4   1.4   0.1   0.1
  ERBB3   M29366.1   2.2   1.0   1.0   1.1   1.1     1.0   -1.0   -2.3   -1.8   2.0   -0.5
  ERBB4   NM_005235.1   -1.1   1.0   1.0   1.0   1.1     1.2   1.0   -1.0   -1.5   0.2   0.4
  F2R   NM_001992.2   -1.1   -1.1   1.3   1.0   -1.0     1.4   1.4   1.6   1.4   -0.1   0.2
  FADD   NM_003824.2   1.0   1.0   1.3   1.4   2.5     1.1   -1.0   1.0   -1.0   2.1   2.1
  FAS   NM_000043.3               -1.0   -1.0   -1.2   1.1   0.0   -2.3
  FASLG   NM_000639.1               1.2   1.3   1.1   1.4   -0.1   -0.3
  FCER2   M14766.1   1.1   1.0   1.0   1.3   1.0     -1.4   -1.7   1.5   1.4   0.3   0.1
  FCGR3A   NM_000569.6   -1.1   1.0   -1.7   1.0   -1.4     2.1   2.5   1.3   1.3   -0.4   0.0
  FGF1   X51943.1   -1.0   1.3   1.2   1.2   1.0     -1.0   -1.4   2.4   2.2   0.4   0.2
  FGF2   NM_002006.3   1.0   1.2   -1.2   1.1   1.1     -1.1   1.1   1.4   1.2   -2.2   0.3
  FGF3   NM_005247.2   1.0   1.2   1.1   1.4   -1.1     -3.6   -1.1   2.1   1.1   -2.5   1.1
  FGF5   AF535149.1   1.0   1.0   -1.3   -1.3   -1.3     -1.0   1.1   2.5   2.7   -2.1   -0.2
  FGF6   NM_020996.1   -1.3   1.0   -1.2   1.2   1.2     1.5   1.3   -1.0   1.1   0.2   -2.2
  FGF7   NM_002009.2   1.0   1.1   -1.1   -1.1   1.1     1.2   -1.4   1.0   -1.3   2.6   2.3
  FGF8   U36223.1   -1.1   -1.2   1.1   1.3   -1.0     -1.0   1.3   -1.5   -1.5   -2.3   0.0
  FGF9   NM_002010.1   1.4   1.2   1.6   1.2   -1.4     1.0   -1.1   -1.2   -1.2   2.1   0.0
  FGFR1   NM_000604.2   1.0   1.1   1.2   1.6   -1.0     -1.1   -1.0   1.4   1.5   0.0   -0.1
  FGFR2   M87770.1   1.5   1.0   1.3   -1.1   -1.2     1.3   1.2   1.2   1.0   0.1   0.2
  FGFR3   M58051.1   1.0   -1.5   1.0   -1.7   1.0     1.0   1.1   -1.3   1.0   0.0   -2.3
  FGFR4   L03840.1   1.0   1.4   1.2   1.0   1.3     1.2   1.5   1.0   1.1   -0.3   -0.1
  FLT1   NM_002019.2   *   *   *   *   *     2.5   1.0   -1.6   -2.0   1.5   0.4
  FLT3   Z26652.1   -1.0   1.0   1.4   1.1   1.3     1.3   -1.2   2.0   1.5   2.4   0.5
  FLT4   NM_002020.1   1.1   -1.5   -1.1   -1.0   -1.4     -1.1   1.1   -1.1   1.3   -2.3   -2.3
  FOS   NM_005252.2   1.0   -1.4   1.4   1.2   -1.1     1.4   1.3   1.1   -1.0   0.1   2.1
  FOSL1   NM_005438.2   1.0   -1.2   -1.3   1.1   1.6     2.2   2.2   2.7   2.5   0.0   0.3
  FSHR   NM_000145.2   -1.1   2.2   -1.4   1.0   1.0     -1.8   -2.1   1.8   -1.2   0.3   3.0
  FST   NM_006350.2   -1.2   -1.2   -1.2   -1.5   -1.0     -2.9   -2.4   1.8   2.0   -0.6   -0.2
  GAPDH   NM_002046.2   -1.1   -1.4   -1.5   1.1   1.1   1.1   1.0   1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0
  GATA3   NM_002051.1   1.0   -1.2   -1.1   -1.3   1.2     1.0   1.0   1.1   -1.1   0.0   2.2
  GATA4   NM_002052.2   1.1   1.0   1.1   -1.9   -1.0     -1.3   -1.3   -1.3   -1.2   0.0   -0.2
  GDNF   NM_199231.1   1.4   -1.3   -1.3   -1.2   1.0     2.4   1.6   1.8   1.9   0.8   -0.1
  HBEGF   M60278.1   -1.4   -1.9   1.3   -1.8   -1.0     -1.1   -1.1   1.1   -1.1   0.0   2.1
  HGF   X16323.1   1.1   1.3   -1.1   1.2   1.0     1.1   1.2   1.4   1.2   -0.2   0.2
  HIF1A   U29165.1   1.0   1.4   -1.5   1.0   1.1     1.0   1.1   1.5   1.8   -0.1   -0.3
  HK1   M75126.1   -1.1   -1.1   1.0   1.4   -1.1     1.6   1.3   1.7   1.5   0.3   0.2
  HPRT1   NM_000194.1   1.2   1.3   1.0   1.2   -1.7   1.4   -2.1   -2.0   -1.4   -1.3   -0.1   -0.2
  HRAS   NM_005343.2   -1.1   -1.1   -1.1   1.0   1.1     1.9   1.6   1.1   1.2   0.3   -0.1
  ICAM1   J03132.1   -1.0   1.1   1.1   -1.2   -1.0     1.6   1.6   2.3   2.3   0.0   0.0
  ICAM2   NM_000873.2   1.0   1.3   -1.1   -1.2   1.8     1.5   1.3   1.4   -1.1   0.2   2.5
  ICAM3   NM_002162.2   -1.0   -1.1   -1.7   1.0   1.5     1.5   -1.5   2.4   1.8   3.0   0.6
  IFNAR1   NM_000629.1   1.0   -1.2   1.2   -1.1   1.4     -1.8   -1.7   -1.5   -1.7   -0.1   0.1
  IGF1   X57025.1   1.0   1.0   1.2   1.4   1.2   -1.2   -1.0   -1.0   -1.4   -1.3   0.0   0.0
  IGF1R   NM_000875.2   -1.1   -1.2   -1.5   1.2   1.0     -2.7   -2.6   -1.5   -1.5   -0.2   0.0
[0964] 
  正式基因符号   Genbank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  IGF2   S77035.1   1.0   -1.7   1.4   -1.3   1.3   1.1   1.2   1.9   -2.0   -1.3   -0.6   -0.7
  IGFBP1   NM_000596.1   1.1   2.1   -1.2   1.1   1.1     2.2   -1.9   -1.3   -1.4   4.1   0.0
  IGFBP2   M35410.1   1.3   1.2   1.0   1.4   1.1     -2.1   1.0   1.2   1.2   -3.1   -0.1
  IGFBP3   X64875.1   -1.3   -1.1   1.2   -1.6   -1.3     -1.0   -1.1   1.1   1.1   0.0   0.0
  IGFBP4   NM_001552.1   1.0   -1.6   1.3   1.5   2.8     -1.1   1.1   -1.1   -1.3   -2.2   0.2
  IGFBP5   M65062.1   1.0   1.2   1.1   1.4   -1.1     -3.9   -3.3   1.1   1.3   -0.6   -0.2
  IGFBP6   M69054.1   1.0   -1.4   -1.0   1.0   1.3     -1.3   -1.3   -1.2   -1.1   0.0   0.0
  IL10   NM_000572.1   1.1   1.1   1.2   1.0   -1.5   -2.8   3.0   2.2   1.1   1.2   0.8   0.0
  IL10RA   NM_001558.2   1.0   -1.1   -1.4   -4.7   1.0     1.3   1.4   1.3   1.3   -0.1   0.0
  IL11   NM_000641.1   -1.1   1.1   1.2   1.4   -1.2     3.3   3.1   4.2   5.2   0.2   -1.0
  IL13   NM_002188.2   -1.1   1.0   1.1   -1.0   -1.2     -1.1   -1.0   -1.0   -1.3   -0.1   0.3
  IL13RA2   NM_000640.2   1.4   1.0   1.0   1.2   1.1     1.3   1.4   -1.0   1.1   -0.2   -2.1
  IL15   NM_000585.1   1.2   1.2   -1.0   2.3   1.1     -1.4   -1.3   -1.6   -1.4   -0.1   -0.2
  IL16   U82972.1   -1.4   1.0   1.0   1.1   1.3     1.6   -1.3   -1.2   2.0   -0.3   -3.1
  IL17   U32659.1   *   *   *   *   *     -1.6   -1.3   -1.2   2.0   -0.3   -3.1
  IL18   NM_001562.2   1.0   1.2   1.0   1.1   -1.2     -1.2   -2.3   -1.6   -1.1   1.2   -0.6
  IL1A   NM_000575.1   -1.0   1.0   1.1   1.0   -1.0   -5.3   1.1   -1.1   1.1   1.1   2.2   -0.1
  IL1B   M15330.1   *   *   *   *   *     1.5   1.6   -1.6   -1.1   -0.1   -0.5
  IL1R1   NM_000877.2   1.1   -1.2   -1.3   1.0   -1.3     1.4   1.9   1.3   1.7   -0.5   -0.4
  IL1RL1   AB012701.2   1.2   -2.6   1.0   -1.2   1.1     -1.2   -1.0   1.1   1.1   -0.2   0.0
  IL1RN   X52015.1   1.1   1.0   1.2   1.2   -1.1     1.3   1.5   1.2   1.3   -0.1   -0.1
  IL2   U25676.1   -1.1   2.2   1.6   1.1   1.0     -1.3   -1.4   1.1   -1.3   0.2   2.4
  IL23A   NM_016584.2   -2.1   1.0   1.0   1.1   1.2     1.5   -1.2   -1.2   -1.4   2.7   0.2
  IL2RA   NM_000417.1   1.2   1.0   -1.3   1.0   -1.1     -1.9   1.1   1.3   1.3   -3.0   0.0
  IL2RB   NM_000878.2   1.5   1.0   1.1   -1.3   -1.1     -1.9   -1.5   1.1   1.1   -0.3   -0.1
  IL2RG   NM_000206.1   -1.0   1.6   1.2   1.0   -1.0     1.1   1.1   -1.0   -1.1   0.0   0.1
  IL3   M20137.1   -1.1   1.0   -1.2   1.1   -1.1     1.5   1.1   1.4   -1.3   0.3   2.7
  IL4   NM_0000589.1   1.0   1.4   1.3   1.0   -1.1     -2.8   -1.2   1.3   1.1   -1.6   0.2
  IL4R   NM_0004181   -1.1   1.2   1.0   1.0   1.1     -1.2   1.0   -1.2   -1.1   -2.2   0.0
  IL5   NM_000879.2   -1.6   1.3   1.2   1.4   3.1     2.4   3.8   1.2   2.2   -1.5   -1.0
  IL5RA   NM_175726.1   1.0   1.0   -1.4   -1.5   -1.2     -1.0   1.2   1.2   1.1   -2.3   0.1
  IL6   NM_000600.1   -1.0   1.5   -1.3   1.0   1.0   -1.5   -1.2   -1.0   2.6   2.8   -0.2   -0.1
  IL6R   NM_000565.1   1.1   -1.0   1.6   1.0   1.1     1.9   1.5   1.0   1.2   0.4   -0.2
  IL7   NM_000880.2   -1.1   -1.0   1.2   1.2   1.0     -2.3   -1.3   -1.5   -1.3   -1.0   -0.2
  IL7R   NM_002185.2   -1.0   1.3   1.2   1.1   -1.2     -2.0   -1.5   1.6   1.6   -0.4   0.0
  IL8   NM_000584.1   -1.2   1.0   1.0   1.0   1.1     -2.0   21.7   14.8   15.9   -23.7   -1.1
  IL8RA   NM_000634.2   1.1   -1.7   -1.0   1.0   -1.0     1.2   1.2   1.0   -1.1   0.0   2.1
  IL8RB   NM_001557.2   1.4   1.0   1.3   1.7   1.3     1.0   1.5   -1.0   1.1   -0.5   -2.1
  IL9   NM_000590.1   -1.0   1.0   1.0   1.2   -1.0     1.2   1.1   -1.8   -2.6   0.2   0.8
  IRAK1   NM_001569.2   1.0   -1.4   -1.1   1.0   -1.1     1.2   1.2   1.4   1.2   0.0   0.2
  IRF1   NM_002198.1   1.0   -1.2   -1.6   1.0   1.2     1.1   1.1   1.2   1.1   0.0   0.1
  IRF2   NM_002199.2   1.2   1.3   1.0   -1.1   -1.1     2.1   -1.4   -2.5   -1.0   -0.8   -1.4
  IRF3   NM_001571.2   1.0   -1.4   -1.0   1.0   1.3     1.1   1.1   1.1   1.1   0.0   0.0
  IRF7   NM_001572.2   -1.1   1.1   1.4   1.3   -1.0     1.3   1.1   -1.4   -1.2   0.2   -0.1
  ISGF3G   NM_006084.3               -1.1   1.1   3.2   2.9   -2.2   0.4
  ITGB2   NM_000211.1   -1.0   -1.3   1.0   1.0   1.1     -1.1   1.7   -1.1   -1.2   -2.8   0.1
  ITK   NM_005546.3   1.0   1.0   -1.0   -1.1   1.1     -1.0   1.0   1.1   1.0   -2.0   0.1
  JAK1   NM_002227.1   1.1   1.0   1.1   -1.1   1.0     -1.3   1.1   -1.8   -3.5   -2.4   1.7
  JAK2   NM_004972.2   -1.1   1.1   -1.3   1.3   1.1     -1.5   -1.0   1.2   1.0   -0.5   0.2
  JAK3   NM_000215.2   1.0   1.0   -1.1   -1.1   -1.0     -1.1   -1.1   1.2   1.0   0.0   0.1
  JUN   NM_002228.3   1.0   -1.1   -1.1   -1.6   1.2     1.4   2.2   1.8   2.0   -0.8   -0.2
  K-ALPHA-1   NM_006082.1   *   *   *   *   *     1.8   1.6   1.3   1.2   0.2   0.1
  KDR   NM_002253.1   -1.2   1.0   1.0   -1.1   1.0     1.6   1.9   -1.1   1.0   -0.3   -2.1
  KIT   NM_000222.1   -1.3   1.4   -1.2   -1.1   -1.0     -87.7   -26.7   -1.4   -1.6   -60.9   0.2
  KITLG   NM_000899.1   -1.4   -1.4   1.1   1.0   1.1     -2.5   -2.9   -1.6   -1.4   0.4   -0.2
  KLK3   NM_001648.2   1.4   -1.0   1.2   1.0   1.3     -2.2   1.1   1.2   1.2   -3.3   0.0
  LAMP1   NM_005561.2   1.1   1.1   1.0   1.3   -1.2     -1.3   -1.1   1.0   1.0   -0.1   0.0
  LAT   NM_014387.2   1.1   -1.1   1.0   -1.1   -1.1     -1.5   -1.1   1.0   1.4   -0.4   -0.4
  LIF   NM_002309.2   1.1   -2.0   -1.1   1.1   -1.0     1.9   1.8   2.3   2.0   0.1   0.3
  LILRB4   NM_006847.2   1.0   -1.0   1.1   -1.4   -1.2     -1.1   1.5   -1.4   1.2   -2.6   -2.6
  LTA   NM_000595.2   1.9   2.0   -1.1   -1.2   1.4     1.4   1.8   -2.2   1.0   -0.4   -3.2
[0965] 
  正式基因符号   Genbank   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  LTBR   NM_002342.1   1.4   -1.4   1.1   -1.1   1.0     1.1   1.7   1.7   1.7   -0.6   0.0
  MAP2K1   NM_002755.2   -1.1   -1.3   1.2   1.5   -1.1     1.5   1.4   1.4   1.3   0.1   0.0
  MAP2K4   NM_003010.1   -1.0   1.3   1.0   1.6   -1.0     1.1   1.1   -1.1   -1.1   0.1   0.0
  MAP2K7   AF013589.1   1.0   1.8   1.0   -1.1   1.0     -1.5   -1.0   -1.3   -1.1   -0.5   -0.1
  MAP3K1   XM_042066.9   -1.1   1.6   -1.5   -1.3   -1.3     -2.0   -2.1   -1.4   -1.4   0.1   0.0
  MAP3K14   NM_003954.1   -1.0   -1.1   1.1   -1.1   -1.1     -1.4   -1.1   -1.2   1.2   -0.3   -2.5
  MAP3K7   AB009357.1   1.1   1.0   -1.3   1.0   -1.2     -2.5   -1.2   1.1   1.1   -1.3   0.0
  MAP3K8   NM_005204.2   1.0   -1.0   -1.0   1.0   1.1     1.5   2.1   1.3   1.2   -0.7   0.1
  MAPK14   AF100544.1   1.0   -1.4   -1.1   1.0   -1.2   2.3   -1.3   -1.3   1.1   1.1   0.0   -0.1
  MAPK3   X60188.1   1.5   -1.4   -1.5   1.0   1.6     -1.2   -1.4   -1.0   -1.1   0.2   0.1
  MAPK8   L26318.1   -1.2   1.4   1.4   1.3   1.1     -1.5   1.7   1.3   1.5   -3.2   -0.2
  MAPK9   U09759.1   -1.0   -1.4   1.0   1.2   1.3     -1.2   -1.1   -1.0   1.0   0.0   -2.0
  MDH1   NM_005917.1   -1.1   1.2   1.8   1.2   1.2     -1.4   -1.2   -1.4   -1.5   -0.1   0.1
  MET   NM_000245.1   -1.2   1.3   1.0   1.4   1.0     1.3   1.9   1.6   1.7   -0.6   -0.1
  MIF   NM_002415.1   1.0   -1.1   -1.2   1.0   -1.7     1.3   1.2   1.0   1.0   0.1   0.0
  MMP2   NM_004530.1   -1.1   -1.1   1.1   -1.2   1.1     -1.4   1.2   1.2   1.0   -2.6   0.1
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  MMP7   NM_002423.2   -1.1   1.0   -1.2   1.2   1.1     -1.2   -1.2   -1.3   -1.4   0.1   0.1
  MST1   NM_020998.2   -2.1   -1.1   1.2   1.1   1.2     -3.8   -1.9   -1.7   1.0   -2.0   -2.7
  MYC   NM_002467.2   1.0   1.2   -1.2   -1.3   -1.1     1.2   1.5   1.5   1.4   -0.2   0.0
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  NCAM1   NM_181351.1   -1.0   -1.3   1.1   1.1   1.2     -2.0   -1.5   -1.3   -1.2   -0.5   -0.1
  NFATC1   U80917.1   1.0   1.1   -1.6   1.0   -1.2     -3.5   -1.1   1.4   1.1   -2.4   0.3
  NFATC2   NM_173091.1   1.0   1.0   1.5   -1.1   -1.8     -1.6   1.3   1.2   1.4   -2.9   -0.2
  NFKB1   NM_003998.1   -1.5   -1.1   1.0   -1.2   1.1   2.6   -1.3   -1.4   1.1   -1.0   0.1   2.2
  NGFB   NM_002506.1   -1.1   -1.1   -1.1   1.0   -1.0     1.1   1.2   1.3   1.5   -0.1   -0.2
  NGFR   M14764.1   -1.1   1.0   -2.0   -1.2   -1.0     3.4   2.7   1.1   2.0   0.7   -0.9
  NRG1   M94165.1   1.4   1.1   -1.1   1.0   -1.6     1.2   3.9   1.2   -1.0   -2.8   2.2
  NTF3   NM_002527.2   1.9   1.1   -1.4   1.1   1.1     -1.3   -1.2   -1.1   -1.1   -0.1   -0.1
  NTF5   NM_006179.3   1.1   1.1   1.6   -1.1   1.3     1.6   -3.5   -2.9   -3.8   5.1   0.9
  NTRK1   NM_002529.2   1.4   1.0   -1.3   -1.1   1.9     -1.7   -1.9   1.1   2.0   0.1   -0.9
  ORM1   NM_000607.1   -1.1   -1.8   -1.0   -1.1   -1.4     -1.1   1.3   1.6   1.6   -2.4   0.0
  OSM   NM_020530.3   1.0   -1.6   -1.1   1.0   1.2     1.4   1.3   -1.9   -1.9   0.1   0.0
  P2RX7   NM_002562.4   -1.2   1.0   1.0   -1.2   1.3     -1.5   -1.6   -1.9   -1.7   0.0   -0.2
  PDGFA   X06374.1   -1.2   1.4   -1.3   1.0   1.0     -2.1   1.3   1.5   2.1   -3.5   -0.6
  PDGFB   NM_002608.1   1.5   -2.9   -1.0   -1.9   1.1     -1.1   1.8   -1.0   -2.2   -3.0   1.2
  PDGFRA   NM_006206.2   1.1   -1.1   1.3   1.1   -1.1     -3.3   -1.1   4.5   2.5   -2.3   1.9
  PDGFRB   NM_002609.2   1.1   1.1   -1.0   -1.3   1.0     -2.0   -1.7   -1.1   -1.2   -0.2   0.0
  PF4   NM_002619.1   -1.2   2.5   1.4   1.4   1.3     4.1   3.7   1.6   1.7   0.4   -0.2
  PGF   NM_002632.3   -1.3   -1.3   -1.3   -1.1   1.9     1.4   3.4   4.3   4.1   -2.0   0.3
  PLA2G2D   NM_012400.2   -1.1   -1.1   1.2   1.0   -1.1     -2.5   2.0   3.4   3.8   -4.5   -0.3
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  PLA2G4C   NM_003706.1   -1.3   1.1   1.0   1.0   1.3     -1.0   1.1   3.7   1.7   -2.1   1.9
  PLAA   NM_004253.2   1.0   -1.1   1.8   1.0   1.3     1.4   1.3   1.6   1.7   0.0   -0.1
  PML   BT009911.1   1.0   1.0   -1.1   -1.1   1.2     -3.4   -1.1   1.2   -1.0   -2.4   2.2
  PPARA   NM_005036.2   1.0   -1.0   1.0   -1.2   -1.3     -4.5   -3.6   -2.5   -2.7   -1.0   0.2
  PPARG   NM_015869.1   -1.0   -1.2   1.5   -1.0   -1.1   -1.7   -1.3   -1.2   -1.1   -1.1   -0.1   0.0
  PPBP   NM_002704.1   -2.3   1.0   2.1   -1.3   1.2     1.1   -1.4   -1.5   -1.6   2.5   0.2
  PPIE   AF042385.1   1.1   -1.2   -1.4   -1.0   -1.7     -2.3   -2.1   -1.5   -1.0   -0.2   -0.5
  PRDX5   NM_181652.1   1.1   -1.3   1.0   1.0   -1.1     -1.2   -1.2   -1.1   -1.1   0.0   0.0
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  PTGS2   NM_000963.1   -1.2   1.3   1.5   -1.3   1.1   -2.0   1.6   1.9   6.0   5.8   -0.3   0.2
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  PTPRC   NM_002838.2   -1.2   1.0   -1.1   1.0   -1.1     -1.4   -1.3   1.6   1.2   -0.1   0.4
  RENBP   NM_002910.4   -1.0   1.7   1.0   -1.6   -1.6     1.1   1.3   2.2   1.2   -0.2   1.0
  RET   NM_000323.2   1.0   1.0   1.1   1.1   1.2     -2.0   1.8   -1.8   1.9   -3.8   -3.7
  RPL13A   X56932.1   1.0   -1.1   1.3   1.0   1.0     -1.0   -1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0
  RPS9   NM_001013.2   -1.2   1.0   -1.1   1.0   -1.0     -1.1   1.3   1.1   -1.2   -2.3   2.3
  RUNX1   D43968.1   1.2   1.5   1.2   1.0   1.0     -2.5   1.5   3.0   2.9   -4.0   0.1
  RUNX2   NM_004348.1   1.0   -1.1   -1.2   1.0   1.0     -1.6   -1.1   -1.3   -1.3   -0.6   0.0
  S100A8   NM_002964.2   -1.0   -1.1   -1.5   1.0   1.2     1.1   1.3   1.1   -1.3   -0.3   2.4
[0966] 
  正式基因符号   Genban1   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K   L
  S100A9   NM_002965.2   1.3   1.0   -1.1   -1.1   -1.2     3.9   4.2   1.8   -1.9   -0.3   3.7
  SAA1   NM_000331.2   1.0   -3.2   1.1   -1.3   -1.0     1.2   1.8   1.1   -1.1   -0.7   2.1
  SDS   NM_006843.1   1.0   1.2   1.0   1.1   1.4     1.2   1.5   -1.2   1.4   -0.2   -2.6
  SELE   M30640.1   -1.1   1.4   1.1   1.0   -1.1     -1.7   -1.3   -1.2   -2.0   -0.4   0.8
  SELL   NM_000655.2   1.5   10   1.2   1.2   1.1     1.1   1.2   1.3   1.2   -0.1   0.1
  SERPINE1   M14083.1   1.0   -1.2   -1.1   -1.2   -2.2     1.0   1.2   1.7   1.6   -0.2   0.0
  SERPINE2   NM_006216.2   1.4   -1.3   -1.0   1.4   -1.1     -2.0   1.0   1.5   1.1   -3.0   0.4
  SLC1A2   NM_004171.2   1.0   1.0   -1.1   1.2   1.3     -7.2   -6.7   -2.1   -2.0   -0.5   0.0
  SOCS2   AF037989.1   1.1   1.1   1.1   -1.1   1.2     -1.8   -1.5   1.3   1.1   -0.3   0.2
  SP1   NM_138473.2   1.1   1.0   -1.3   1.2   -1.1     -1.6   -1.8   -1.7   -1.7   0.2   -0.1
  SRF   NM_003131.1   1.0   1.1   1.1   -1.2   -1.3     -1.2   -1.2   1.1   1.0   0.0   0.0
  STAT1   NM_007315.2   1.1   -1.2   1.0   1.1   1.1     -2.3   -1.5   1.2   1.1   -0.8   0.0
  STAT2   NM_005419.2   -1.1   -1.1   1.1   2.5   1.0     -2.7   -2.3   -1.4   -1.4   -0.4   0.0
  STAT4   NM_003151.2   -1.0   1.0   -1.6   1.3   1.1     -4.1   -3.7   -1.7   -1.5   -0.4   -0.2
  STAT6   NM_003153.3   1.0   1.1   1.3   1.0   -1.2     -1.8   -1.3   2.0   1.4   -0.5   0.6
  TAP1   NM_000593.5   1.0   -1.1   1.4   -1.1   1.3     -1.8   -1.2   -1.2   -1.2   -0.6   0.0
  TFRC   NM_003234.1   1.2   1.0   1.2   1.0   1.1     -2.0   -2.0   1.6   -1.8   0.1   3.4
  TGFB1   NM_000660.1   -1.1   -1.2   1.1   1.0   1.0     1.0   1.9   1.3   1.2   -0.8   0.1
  TGFBI   NM_000358.1   1.3   1.1   1.1   1.1   -1.1     1.0   1.0   -1.0   -1.1   0.0   0.0
  TGFBR1   NM_004612.1   -1.2   1.6   1.7   -1.2   1.1     -2.2   -1.5   -1.1   1.1   -0.8   -2.1
  THBD   NM_000361.2   1.0   -1.0   -1.2   -1.2   1.3     8.1   7.3   3.1   2.5   0.7   0.7
  THPO   D32047.1   1.0   1.4   -1.5   1.1   -1.3     -1.5   -1.0   -1.5   -2.1   -0.4   0.6
  TIMP1   NM_003254.1   1.3   -1.3   1.0   -1.2   -1.4     -1.0   -1.0   -1.0   -1.0   0.0   0.0
  TLR2   NM_003264.2   -1.5   1.0   -1.6   -1.0   1.0     -1.2   -1.2   -1.0   -1.1   0.0   0.1
  TLR4   U88880.1   -1.7   1.2   1.2   1.0   1.1     -3.9   -1.1   1.3   1.4   -2.8   -0.1
  TNF   NM_000594.1   1.1   -1.4   1.1   1.0   -1.1   -18.4   -1.7   -1.7   1.0   1.3   0.0   -0.3
  TNFAIP3   NM_006290.2   1.1   1.0   1.3   1.0   1.0     1.2   1.4   -1.4   1.5   -0.2   -2.9
  TNFRSF10A   NM_003844.2   -1.3   -1.6   1.1   -1.2   1.0     3.2   2.6   2.3   2.3   0.6   0.0
  TNFRSF10B   AF016266.1   1.0   1.1   -1.3   -1.1   1.2     1.1   -1.1   1.2   1.3   2.2   -0.1
  TNFRSF11A   NM_003839.1   1.0   1.0   1.0   1.0   -1.3     1.3   1.3   1.3   1.0   -0.1   0.2
  TNFRSF1A   NM_001065.2   1.0   -1.1   1.3   1.0   1.1     -1.0   1.2   -1.3   -1.6   -2.3   0.2
  TNFRSF1B   NM_001066.1   1.0   -1.0   -1.0   1.0   1.1     1.2   1.4   2.7   2.7   -0.2   0.1
  TNFRSF7   NM_001242.1               -1.1   1.1   1.8   1.8   -2.2   -0.1
  TNFRSF8   NM_001243.2   1.2   1.0   1.2   -1.4   1.1     -1.1   1.0   -1.5   -1.1   -2.1   -0.4
  TNFRSF9   NM_001561.4   -1.4   -1.9   -1.4   1.6   1.0     -1.3   1.4   1.0   -1.0   -2.7   2.0
  TNFSF10   NM_003810.2   1.1   1.0   1.3   -1.1   1.1     -4.8   -1.7   -1.8   -2.0   -3.1   0.2
  TNFSF11   NM_003701.2   -1.1   -1.1   1.4   1.2   -1.0     -1.5   1.1   1.2   2.0   -2.6   -0.8
  TNFSF14   AF064090.1   1.0   1.0   1.3   1.0   1.0     1.1   -1.6   -1.3   -2.9   2.6   1.5
  TNFSF4   NM_003326.2   1.0   1.5   2.3   1.7   1.3     -3.2   -3.8   -1.1   1.0   0.6   -2.1
  TNFSF7   NM_001252.2               -3.2   -3.8   -1.1   1.0   0.6   -2.1
  TNFSF8   NM_001244.2   1.2   1.0   1.2   -1.4   1.1     -2.1   -1.7   1.5   1.0   -0.4   0.4
  TRADD   NM_003789.2   1.1   -1.0   1.0   1.6   1.1     -1.1   -1.1   -1.2   -1.2   0.0   0.0
  TRAF1   NM_005658.3   -1.2   -1.1   1.0   -2.1   1.2     -1.2   1.1   -1.1   1.4   -2.3   -2.4
  TRAF2   NM_021138.3   -1.0   -1.2   1.1   -1.0   1.2     1.5   1.6   1.2   1.2   -0.2   0.0
  TRAF3   U21092.1   1.1   1.0   1.0   1.1   1.2     -1.0   1.8   1.6   1.7   -2.9   -0.1
  TRAF6   U78798.1   -1.0   1.1   -1.0   -1.1   1.6     -1.3   -1.7   -1.8   -1.7   0.3   -0.1
  VCAM1   M60335.1   -1.0   1.2   1.4   1.8   1.0     1.1   -1.4   -1.4   -2.3   2.4   0.9
  VEGF   AF022375.1               -2.2   -1.8   1.0   1.0   -0.5   0.0
  VEGFB   U43368.1   -1.2   1.0   1.4   1.0   1.3     -1.1   -1.1   1.3   1.2   0.0   0.1
  VEGFC   NM_005429.2   -1.0   -1.0   -1.0   -1.0   2.1     1.3   1.3   23   2.2   0.0   0.1
  YWHAZ   M86400.1   1.0   1.0   1.1   -1.2   1.1     -1.3   -1.1   -1.2   -1.2   -0.2   0.0
A:仅艾地苯醌表达 
B:艾地苯醌+UVB表达 
C:仅咖啡果表达 
D:咖啡果+UVB表达 
E:仅UVB表达 
F:绿茶+UVB表达 
G:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
H:仅H2O2表达(24小时) 
I:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
J:仅H2O2表达(8小时) 
K:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(24小时) 
L:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(8小时) 
数据表14:线粒体/细胞呼吸/线粒体生物发生基因 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   R   G   H   I   J   K
  ACTB   NM_001101   1.0   1.1   1.1   1.0   0.0   0.0   1.0   -1.1   -1.2   1.4   -1.0
  AIFM2   NM_032797   1.0   1.4   -1.5   -1.6   -0.4   0.1   1.0   1.2   1.0   1.0   1.2
  AIP   NM_003977   -1.4   -1.2   -1.3   -1.3   -0.2   0.0   -1.1   -1.2   1.2   1.1   -1.1
  B2M   NM_004048   -1.1   1.8   1.2   1.0   -2.9   0.2   -1.0   1.3   -1.4   1.0   -1.0
  BAK1   NM_001188   2.3   1.9   1.7   1.5   0.4   0.2   -1.1   -1.3   1.3   1.0   -1.0
  BBC3   NM_014417   1.0   1.2   -1.2   -1.2   -0.1   0.0   -1.2   1.3   1.4   1.2   1.0
  BCL2   NM_000633   -1.3   1.0   1.8   1.8   -2.3   0.0   1.2   1.6   1.3   1.0   1.1
  BCL2L1   NM_138578   -1.7   1.2   1.1   -1.2   -2.9   2.3   1.0   1.0   1.0   -1.1   2.7
  BID   NM_001196   -1.4   1.1   1.5   1.4   -2.6   0.1   -1.1   1.3   1.0   1.0   1.1
  BNIP3   NM_004052   1.1   -1.2   1.0   1.5   2.3   -0.5   1.0   1.1   -1.2   -1.4   1.3
  CDKN2A   NM_000077   -2.2   -1.1   -1.1   -1.1   -1.1   0.0   1.0   -1.0   -1.6   1.0   1.2
  COX10   NM_001303   1.1   1.6   1.1   1.3   -0.5   -0.3   1.1   1.1   1.0   -1.1   1.0
  COX18   NM_173827   -1.4   -1.3   -1.3   -1.3   0.0   0.0   -1.0   1.3   1.0   1.0   1.0
  CPT1B   NM_004377   -1.4   1.1   -1.0   -1.2   -2.6   0.2   -1.0   -1.7   -1.1   -1.4   1.0
  CPT2   NM_000098   -1.2   -1.3   -1.2   -1.2   0.1   0.1   -1.1   -1.2   -1.1   1.0   -1.0
  DNAJC19   NM_145261   -1.3   -1.0   -1.4   -1.2   -0.2   -0.2   1.1   1.2   -1.2   -1.5   -1.0
  DNM1L   NM_005690   -3.8   1.2   1.1   1.1   -4.9   0.0   -1.6   1.3   1.0   1.0   -1.1
  FIS1   NM_016068   -1.2   1.1   -2.5   -1.9   -2.3   -0.7   1.0   -1.3   2.9   -1.1   -1.1
  FXC1   NM_012192   -1.3   -1.5   1.3   1.1   0.2   0.2   1.2   1.1   1.0   1.0   -1.2
  GAPDH   NM_002046   -1.0   1.0   -1.0   -1.0   -2.0   0.0   -1.1   -1.4   -1.5   1.1   1.1
  GRPEL1   NM_025196   2.4   2.4   1.7   1.8   0.1   0.0   -2.6   1.2   1.2   -1.0   1.2
  HGDC   SA_00105   1.2   2.8   -1.7   1.2   -1.6   -2.9   1.2   1.1   1.6   1.0   -1.6
  HPRT1   NM_000194   -2.1   -2.0   -1.4   -1.3   -0.1   -0.2   1.2   1.3   1.0   1.2   -1.7
  HSP90AA1   NM_001017963   1.1   1.2   1.1   1.2   -0.1   0.0   1.0   1.0   1.0   1.0   1.3
  HSPD1   NM_002156   -1.3   3.1   2.1   2.0   -4.3   0.1   1.1   1.1   1.2   1.2   1.1
  IMMP1L   NM_144981   1.9   2.2   -1.2   1.1   -0.3   -2.2   -1.0   1.2   1.1   1.0   -1.2
  IMMP2L   NM_032549   -2.1   -1.2   -1.3   -1.2   -1.0   -0.1   1.5   -1.1   -1.1   -1.3   1.3
  LRPPRC   NM_133259   -2.1   -1.7   -1.5   -1.3   -0.3   -0.2   1.0   1.0   -1.0   -1.1   -1.4
  MFN1   NM_033540   -1.4   -1.1   -1.0   -1.1   -0.3   0.1   -1.0   1.1   1.0   1.0   -1.0
  MFN2   NM_014874   1.1   -1.3   1.4   1.3   2.4   0.0   -1.0   1.1   1.0   1.0   -1.1
  MIPEP   NM_005932   1.1   1.2   1.3   1.1   -0.1   0.2   -2.1   -1.2   -1.2   1.0   1.1
  MSTO1   NM_018116   2.7   2.5   1.7   1.6   0.2   0.2   1.0   -1.4   1.3   1.0   1.2
  MTX2   NM_006554   1.0   1.2   -1.3   -1.1   -0.2   -0.2   -1.0   1.0   -1.2   -1.1   -1.1
  NEFL   NM_006158   -1.9   1.6   1.6   -1.1   -3.5   2.6   -1.1   1.0   1.0   1.2   1.9
  OPA1   NM_130837   -2.2   1.4   1.9   1.7   -3.6   0.2   1.0   1.1   1.1   -1.0   1.3
  PMAIP1   NM_021127   4.3   4.0   3.4   3.4   0.3   0.0   -1.2   -1.2   1.3   1.4   1.2
  RHOT1   NM_018307   -1.3   -1.2   -1.2   -1.1   -0.1   -0.1   -1.2   -1.9   1.1   -1.1   -1.1
  RHOT2   NM_138769   -1.0   1.5   1.4   1.7   -2.5   -0.2   -1.4   -1.3   1.2   1.0   1.3
  RPL13A   NM_012423   -1.2   -1.0   -1.0   -1.0   -0.1   0.0   1.1   -1.1   1.0   -1.4   1.1
  SFN   NM_006142   3.4   1.7   1.4   1.5   1.7   -0.1   -1.1   1.0   1.3   1.0   -2.8
  SH3GLB1   NM_016009   -1.9   1.2   -1.1   -1.0   -3.1   0.0   1.0   -1.0   -1.1   -1.1   1.6
  SLC25A1   NM_005984   -1.4   -1.4   1.1   1.0   0.0   0.0   -1.4   -1.1   1.2   -1.1   1.6
  SLC25A10   NM_012140   2.2   2.2   1.5   1.6   0.0   -0.1   -1.1   -1.3   1.3   1.0   4.3
  SLC25A12   NM_003705   -1.2   -1.2   1.2   1.1   0.0   0.1   -1.1   1.2   1.0   -1.1   -1.1
  SLC25A13   NM_014251   1.0   2.0   1.9   1.6   -1.0   0.2   -1.1   1.0   -1.2   -1.5   1.0
  SLC25A14   NM_003951   1.1   1.3   -1.1   -1.0   -0.2   0.0   1.9   1.0   1.1   1.5   -1.7
  SLC25A15   NM_014252   1.4   1.7   1.5   1.2   -0.3   0.3   1.1   1.1   1.1   -1.0   -1.0
  SLC25A16   NM_152707   -1.4   -1.1   -1.2   -1.1   -0.2   -0.2   -1.1   1.2   -1.0   1.0   -1.1
  SLC25A17   NM_006358   1.4   1.4   1.4   1.3   0.0   0.1   1.1   -1.0   -1.2   -1.2   -1.2
  SLC25A19   NM_021734   1.7   1.5   1.3   1.3   0.1   0.0   1.2   -1.2   1.1   2.0   1.5
  SLC25A2   NM_031947   -1.2   1.0   1.7   1.0   -2.2   0.6   -1.0   -1.5   1.2   1.0   1.1
  SLC25A20   NM_000387   -1.1   1.0   -1.1   -1.2   -2.2   0.1   1.0   -1.1   1.3   -1.6   1.7
  SLC25A21   NM_030631   -1.7   -1.7   -1.3   2.8   0.0   -4.1   1.0   1.0   -1.3   1.3   1.1
[0981] 
  正式基因符号   GenBank   A   B   C   D   E   R   G   H   I   J   K
  SLC25A22   NM_024698   2.2   1.9   2.1   2.2   0.2   -0.1   -1.0   1.2   1.1   -1.5   1.6
  SLC25A23   NM_024103   -3.2   -3.9   1.1   -1.1   0.7   2.1   -1.2   1.0   1.0   1.1   1.8
  SLC25A24   NM_013386   -1.1   -1.0   1.2   1.2   -0.1   0.0   -1.0   1.3   2.1   1.7   1.1
  SLC25A25   NM_052901   3.2   3.2   2.5   2.6   0.1   -0.1   1.0   1.2   1.0   -1.2   -1.0
  SLC25A27   NM_004277   -3.6   1.3   2.0   1.2   -4.9   0.7   1.1   1.4   1.0   -1.2   1.2
  SLC25A3   NM_002635   -1.1   -1.1   -1.1   -1.1   0.0   0.0   -1.2   1.1   -1.1   1.0   1.3
  SLC25A30   NM_001010875   1.3   1.3   1.1   1.1   0.0   0.0   -1.6   -1.1   -1.2   1.0   1.2
  SLC25A31   NM_031291   1.3   -1.1   1.4   1.5   2.5   -0.2   -1.2   1.0   1.5   1.0   -1.1
  SLC25A37   NM_016612   -3.0   -1.6   1.7   2.0   -1.4   -0.3   -1.0   -1.6   -1.3   -1.3   -1.0
  SLC25A4   NM_001151   -1.1   1.1   1.2   1.0   -2.2   0.1   1.2   -1.3   -1.2   1.0   1.1
  SLC25A5   NM_001152   -1.9   -1.8   -1.1   -1.2   -0.2   0.1   1.0   1.1   1.3   1.7   9.1
  SOD1   NM_000454   -1.0   -1.0   -1.2   -1.1   0.0   0.0   -1.0   -1.1   -1.1   -1.0   -1.3
  SOD2   NM_000636   2.7   2.3   1.6   1.5   0.5   0.1   -1.2   1.0   -1.1   1.5   1.1
  STARD3   NM_006804   1.2   1.1   1.1   1.2   0.0   0.0   1.0   -1.9   -1.1   1.1   1.2
  TAZ   NM_000116   2.0   1.1   1.0   1.4   -3.1   -0.4   -1.1   -1.4   1.0   -2.4   1.0
  TIMM10   NM_012456   1.9   1.9   1.0   1.1   0.0   -0.1   1.2   1.1   1.0   1.0   2.7
  TIMM17A   NM_006335   1.3   1.5   1.1   1.3   -0.3   -0.2   -1.1   1.1   1.0   -1.3   -1.1
  TIMM17B   NM_005834   1.2   -1.0   -1.1   1.3   2.2   -2.3   1.0   -1.5   -1.0   -1.0   1.2
  TIMM22   NM_013337   1.3   1.3   1.0   -1.0   0.0   2.1   1.1   -1.1   1.3   1.4   1.0
  TIMM23   NM_006327   1.3   1.4   1.2   1.2   -0.1   0.0   1.1   -1.2   -1.0   -1.3   -1.1
  TIMM44   NM_006351   1.2   1.1   -1.0   -1.1   0.1   0.0   -1.2   -1.2   -1.4   -1.0   -1.0
  TIMM50   NM_001001563   1.4   1.9   1.2   1.1   -0.6   0.0   1.0   -1.0   -1.1   1.4   -1.1
  TIMM8A   NM_004085   1.9   1.9   1.6   1.9   0.0   -0.3   1.0   1.0   1.1   -1.1   1.1
  TIMM8B   NM_012459   1.5   1.4   -1.1   -1.1   0.1   0.0   -1.2   1.1   1.0   -1.4   1.0
  TIMM9   NM_012460   -1.1   1.1   -1.0   1.1   -2.1   -2.2   2.2   1.2   -1.0   1.2   1.4
  TOMM20   NM_014765   -1.1   -1.1   -1.1   -1.1   0.0   0.0   1.0   1.0   -1.9   -1.4   1.2
  TOMM22   NM_020243   -1.1   1.1   1.1   -1.1   -2.2   2.2   1.0   -1.1   -1.1   -1.3   -1.2
  TOMM34   NM_006809   1.9   2.0   1.0   1.1   -0.1   -0.1   1.2   -1.1   1.0   1.0   1.0
  TOMM40   NM_006114   2.4   2.2   1.6   1.9   0.2   -0.2   1.0   -1.8   1.2   1.0   1.3
  TOMM40L   NM_032174   1.6   1.3   1.5   1.3   0.2   0.1   1.0   -1.0   -1.1   -1.1   1.0
  TOMM70A   NM_014820   -1.0   -1.2   -2.1   1.2   0.2   -3.2   1.1   -1.3   1.1   -1.2   1.0
  TP53   NM_000546   -3.1   -2.0   -1.5   -1.5   -1.1   0.0   -1.1   -1.3   -1.0   1.2   1.2
  TSPO   NM_000714   1.0   -1.1   -1.1   -1.0   2.1   0.0   1.0   -1.1   1.1   1.2   1.1
  UCP1   NM_021833   1.1   1.2   1.4   1.1   -0.1   0.3   1.1   1.3   1.2   1.4   1.1
  UCP2   NM_003355   1.0   -1.2   -1.1   -1.1   2.2   0.1   1.0   -1.1   1.0   1.0   1.2
  UCP3   NM_003356   -1.1   -1.2   -1.1   -1.3   0.1   0.2   -1.1   1.1   1.1   1.4   1.0
  UXT   NM_004182   1.3   1.1   -1.2   -1.1   0.1   -0.1   1.0   -1.1   1.5   1.3   1.2
A:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
B:仅H2O2表达(24小时) 
C:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
D:仅H2O2表达(8小时) 
E:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(24小时) 
F:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(8小时) 
G:仅艾地苯醌表达 
H:艾地苯醌+UVB表达 
I:仅咖啡果表达 
J:咖啡果+UVB表达 
K:仅UVB表达 
数据表15:一氧化氮合酶基因 
  正式基因符号   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K
  AKT1   1.6   1.4   1.8   1.6   0.2   0.2   1.0   -1.6   -1.2   -1.2   -1.0
  ALOX12   1.1   2.2   -1.3   -1.9   -1.1   0.6   -1.1   1.8   1.0   1.0   1.0
  APOE   -1.1   1.1   -1.3   -1.0   -2.2   -0.3   1.0   -1.2   1.0   1.2   1.1
  ARG2   1.9   1.6   1.1   -1.2   0.3   2.2   1.0   1.2   -1.4   -1.0   1.1
[0995] 
  正式基因符号   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K
  ATOX1   1.6   1.5   1.1   1.1   0.1   -0.1   -1.0   -1.0   1.4   1.5   1.0
  CAMK1   1.1   1.1   1.8   1.6   0.0   0.2   -1.1   -1.7   1.2   1.1   -1.3
  CAT   -1.9   -1.8   -1.7   -1.4   -0.2   -0.3   1.2   -1.3   1.4   -1.1   1.2
  CCNA1   1.2   2.7   -1.0   1.2   -1.5   -2.3   1.0   1.0   -1.1   -1.3   1.2
  CCS   -1.3   -1.3   -1.2   -1.1   0.0   -0.2   -1.0   -1.2   -1.6   1.1   -2.2
  CDKN1A   1.3   1.2   -1.2   -1.1   0.2   -0.1   1.4   -1.1   -1.2   -1.2   -1.2
  CYBA   -1.0   -1.1   1.1   1.0   0.1   0.0   1.0   -1.2   1.1   -1.3   1.0
  CYGB   1.2   1.1   1.1   1.1   0.2   0.0   1.2   -1.4   1.2   1.0   1.1
  DDAH2   -2.8   -2.5   -2.9   -2.9   -0.2   0.0   1.1   1.0   1.0   4.4   -1.7
  DLG4   -1.8   -1.7   -1.5   -2.3   -0.1   0.9   1.0   -1.0   -1.2   -1.0   1.3
  DNCL1   -1.1   -1.9   -1.1   1.5   0.8   -2.6   1.0   1.0   -1.0   -1.1   1.3
  DND1   1.6   -3.5   1.2   1.1   5.1   0.2   1.0   -1.0   -1.2   -1.3   1.1
  DUOX1   -1.1   -1.6   -1.1   2.2   0.5   -3.2   1.0   1.2   1.2   1.4   2.0
  DUOX2   2.2   2.5   1.8   1.5   -0.2   0.3   -1.1   2.0   -1.2   -1.5   1.2
  DUSP1   4.3   3.3   3.4   2.9   1.0   0.5   -1.4   1.2   2.6   1.0   -1.0
  EGFR   -2.6   -4.0   -1.0   1.1   1.4   -2.1   1.8   -1.0   1.0   -1.0   -1.2
  EPX   -1.1   1.3   1.2   1.0   -2.4   0.2   -1.6   -2.2   -1.3   1.2   1.0
  FOXM1   -1.3   1.0   -1.1   -1.2   -2.3   0.1   -1.0   -1.5   1.3   -1.6   -1.1
  GCH1   2.4   2.2   1.6   1.4   0.3   0.2   1.0   -1.7   1.6   1.9   1.5
  GCHFR   -1.1   -1.1   -1.5   -1.4   0.1   -0.2   1.0   1.0   1.0   1.0   -1.1
  GLA   2.3   2.1   -1.0   -1.0   0.2   0.0   -1.2   1.0   1.0   -1.1   -1.3
  GLRX2   1.5   1.6   1.5   1.6   -0.1   -0.2   1.1   1.0   1.3   1.0   -1.0
  GPR156   1.3   1.1   1.8   1.4   0.2   0.4   1.3   1.3   1.0   1.0   -1.4
  GPX1   -1.3   -1.3   -1.1   -1.1   0.0   0.0   1.0   -1.1   -1.1   1.1   2.0
  GPX2   1.2   1.2   1.0   -1.2   0.0   2.2   1.0   -1.2   -1.1   1.0   1.2
  GPX3   1.1   1.0   -1.1   -1.0   0.1   -0.1   1.0   -1.2   1.1   -1.2   1.4
  GPX4   -1.4   -1.4   -1.3   -1.3   0.0   0.0   -1.3   -1.1   1.1   1.0   -1.6
  GPX5   1.1   -1.3   -1.6   -1.3   2.4   -0.3   1.0   1.4   -1.1   -1.2   -1.0
  GRIN2D   -1.1   -1.0   1.6   -1.0   -0.1   2.6   1.0   1.1   -1.2   1.2   -1.1
  GSS   1.1   1.2   -1.0   -1.0   0.0   0.0   -1.1   -1.1   1.2   1.2   -1.2
  HSP90AB1   1.1   1.0   1.0   1.1   0.0   -0.1   1.0   -1.3   -1.2   1.2   -1.6
  IL10   3.0   2.2   1.1   1.2   0.8   0.0   1.1   1.1   1.2   1.0   -1.5
  IL8   NA   NA   NA   NA   NA   NA   -1.2   1.0   1.0   1.0   1.1
  INS   -1.1   1.2   -1.1   1.6   -2.3   -2.7   -1.0   1.1   1.2   1.0   1.0
  JUN   1.4   1.9   1.2   1.8   -0.5   -0.7   1.0   -1.1   -1.1   -1.6   1.2
  KRT1   3.4   2.7   -1.4   1.1   0.7   -2.6   1.1   1.0   -1.1   -1.1   -1.0
  LPO   1.3   -1.7   -1.3   -2.2   2.9   0.9   1.1   1.1   1.5   1.1   -1.0
  MBL2   -1.4   -1.0   -1.4   1.2   -0.4   -2.6   1.0   1.0   -1.1   1.0   1.3
  MPO   1.1   -1.1   1.9   1.3   2.2   0.6   1.0   1.0   -1.3   -1.2   1.2
  MSRA   -1.4   -1.3   1.5   1.4   -0.1   0.1   1.0   1.2   1.4   1.4   1.2
  MT3   -1.3   -1.6   1.3   1.1   0.3   0.2   -1.1   1.1   1.2   -1.0   1.3
  MTL5   -1.1   1.0   1.0   1.1   -2.1   -0.1   1.5   -1.1   1.5   -1.1   1.1
  MYB   1.2   -1.1   1.6   1.5   2.3   0.1   1.0   1.0   1.1   -1.1   1.0
  NCF1   1.4   1.4   -1.6   1.0   0.0   -2.7   -1.7   -1.2   -1.5   -1.1   1.1
  NCF2   6.5   4.9   1.8   2.0   1.6   -0.2   1.1   1.6   -1.1   1.0   1.0
  NME5   -2.7   -3.0   -1.2   -1.8   0.3   0.5   1.0   1.2   1.7   1.0   -1.4
  NOS1   -1.0   -1.2   -1.3   1.1   0.2   -2.4   1.9   1.2   1.1   1.1   1.2
  NOS2A   -1.1   -1.1   -1.1   1.1   0.0   -2.2   1.0   1.1   1.0   -1.6   -1.1
  NOS3   -1.7   -2.6   1   1.1   0.9   -0.1   1.0   -1.0   1.0   1.2   -1.0
  NOSIP   -1.0   -1.1   1.4   1.3   0.1   0.1   1.0   -1.2   1.0   -1.3   -1.4
  NOSTRIN   1.2   1.5   1.4   1.4   -0.3   0.0   1.1   1.0   -1.4   -1.5   1.0
  NOX5   1.4   1.1   1.3   1.1   0.4   0.2   1.0   -1.2   1.2   1.1   1.2
  NQO1   -1.0   -1.1   -1.5   -1.5   0.0   0.0   -1.3   -1.2   1.1   -1.4   -1.0
  NRF1   -1.2   -1.2   1.2   1.3   0.0   -0.1   -1.0   -1.4   -1.1   -1.1   1.0
  NUDT1   1.4   1.2   -1.3   -1.3   0.2   0.0   1.3   -1.1   -1.0   1.0   -1.1
  OXR1   -1.4   1.2   -1.2   -1.3   -2.5   0.0   1.0   1.1   -1.3   -1.0   -1.0
  PGC   -1.2   1.2   -1.1   -1.1   -2.4   0.0   -1.2   1.2   1.2   1.0   1.2
  PKAR1B   -2.4   -1.7   1.7   2.3   -0.7   -0.7   1.1   -1.0   1.1   -1.0   -1.0
  PNKP   1.3   1.2   1.2   1.2   0.0   0.0   1.0   -1.3   -1.0   1.6   -1.0
[0996] 
  正式基因符号   A   B   C   D   E   F   G   H   I   J   K
  PP3CA   -1.1   -1.2   -1.3   -1.4   0.2   0.0   1.0   1.1   1.2   1.1   1.3
  PRDX2   1.0   1.1   -1.0   -1.1   -0.1   0.1   -1.3   1.0   1.1   1.0   -1.0
  PRDX6   1.1   1.0   1.1   1.1   0.0   0.0   -1.1   1.1   1.0   1.0   -1.1
  PREX1   -1.8   1.4   1.7   2.2   -3.2   -0.6   1.0   -1.1   1.2   1.0   -1.1
  PRG3   -2.2   -1.8   1.6   1.4   -0.4   0.2   1.0   -1.0   1.1   1.0   2.3
  PRKCA   1.2   -1.0   -1.0   -1.1   2.2   0.1   1.0   -1.1   2.1   1.5   1.0
  PRNP   -1.3   -1.1   -1.5   -1.6   -0.2   0.0   -1.0   1.0   1.3   1.1   1.0
  RNF7   3.2   4.2   -1.0   1.1   -1.0   -2.1   1.2   -1.0   1.4   1.0   1.0
  SCARA3   -1.5   -1.4   -1.1   -1.1   -0.1   0.0   1.1   -1.0   -1.2   1.0   1.3
  SCRT2   NA   NA   NA   NA   NA   NA   1.4   1.3   -1.4   1.0   1.1
  SELS   1.4   1.5   1.3   1.3   0.0   0.0   1.0   1.0   1.3   1.6   1.7
  SEPP1   -2.8   -3.4   -1.4   -1.1   0.6   -0.3   1.2   1.0   1.0   1.0   1.1
  SGK2   -1.3   -1.5   1.0   1.4   0.2   -0.4   1.2   -1.2   -1.0   -1.3   -1.0
  SIRT2   -1.1   -1.0   1.1   1.1   -0.1   0.0   -1.0   -1.1   -1.3   1.0   -1.1
  SOD1   -1.0   -1.0   -1.2   -1.1   0.0   0.0   -1.0   -1.1   -1.1   -1.0   -1.3
  SOD2   2.8   2.3   1.6   1.5   0.5   0.1   -1.2   1.0   -1.1   1.5   1.1
  SOD3   -1.1   1.0   1.1   1.1   -2.2   -0.1   -1.3   1.1   -1.1   -1.4   -1.1
  SRXN1   3.7   2.4   1.1   1.1   1.2   0.0   1.5   -1.1   1.0   1.1   1.5
  TFAM   1.2   1.4   -2.1   -1.8   -0.2   -0.3   -1.2   1.1   -1.2   -1.6   1.1
  TPO   -2.4   -2.0   -1.1   -1.7   -0.4   0.7   1.0   1.0   -1.8   1.0   1.1
  TROAP   3.0   3.9   -2.0   -1.5   -0.9   -0.5   -1.0   -1.1   -2.4   1.1   1.2
  TTN   -1.0   -1.0   -2.3   1.0   0.0   -3.3   1.0   1.3   1.0   1.5   -2.2
  TXNRD2   -1.2   -1.2   1.1   1.0   0.1   0.1   -1.3   -1.6   -1.2   -1.4   -1.1
  UNR   NA   NA   NA   NA   NA   NA   1.0   1.4   1.6   1.0   1.7
  VEGFA   1.3   1.4   1.3   1.5   -0.1   -0.1   -1.7   -1.3   1.2   -1.1   1.2
A:咖啡果+H2O2表达(24小时) 
B:仅H2O2表达(24小时) 
C:咖啡果+H2O2表达(8小时) 
D:仅H2O2表达(8小时) 
E:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(24小时) 
F:咖啡果+H2O2与仅H2O2表达之间的差异(8小时) 
G:仅艾地苯醌表达 
H:艾地苯醌+UVB表达 
I:仅咖啡果表达 
J:咖啡果+UVB表达 
K:仅UVB表达 
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Claims (73)

1.一种用于调节细胞、组织、器官或生物体的寿命的方法,包括使所述细胞、组织、器官或生物体与以下物质接触:
艾地苯醌或者其类似物或衍生物;
可可提取物;
咖啡果提取物;
奎尼酸或者其类似物或衍生物;
阿魏酸或者其类似物或衍生物;
原花色素、花色素、原花青素或花青素;
绿原酸或者其类似物或衍生物;
茶提取物;或
白藜芦醇或者衍生自白藜芦醇或与白藜芦醇在化学上相关的组合物。
2.权利要求1的方法,其中所述咖啡果提取物包含绿原酸、奎尼酸、阿魏酸、咖啡酸或原花色素中的一种或多种。
3.权利要求1的方法,其中所述茶提取物包含一种或多种多酚,所述多酚选自EGCG(表没食子儿茶素-3-没食子酸酯)、EGC(表没食子儿茶素)、ECG(表儿茶素-3-没食子酸酯)、EC(表儿茶素)、GCG(没食子儿茶素没食子酸酯)、GC(没食子儿茶素)、C(儿茶素)和CG(儿茶素没食子酸酯)。
4.权利要求1的方法,其中所述衍生自白藜芦醇或者与白藜芦醇在化学上相关的组合物选自葡萄抗毒素、gnetin H和牡丹醇B。
5.权利要求1的方法,其中所述可可提取物包含选自以下的多酚和/或原花青素:(+)儿茶素、(-)表儿茶素、原花青素低聚体2至18、原花青素B-5、原花青素B-2、原花青素A-2和/或原花青素C-1。
6.权利要求1的方法,其中所述调节寿命包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2的一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。
7.权利要求6的方法,其中调节包括增加至少一个所列基因的活性水平。
8.权利要求6的方法,其中调节包括降低至少一个所列基因的活性水平。
9.权利要求6的方法,其中调节包括调节以下基因的水平和/或活性:
(a)作为阵列2的一部分所列出的基因的10个或多个基因;
(b)作为阵列1的一部分所列出的基因;
(c)VEGFA,HMOX1,CCL4L1,DDC,NOS2A,SIRT1,TERT,PTGS2,或IFI44;
(d)TERT,TERC,NRF2,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,TNKS 2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL和KU70中的四个或多个;
(e)BCL2,SOD1,TP53和SOD2;
(f)BCL2,SOD1,TP53,SOD2,BCL2L1,TIMM22,TOMM40,IMMP1L,CDKN2A,GADPH,ACTB,HRP1和HGDC;
(g)PARP1,PARP2,TERT,TEP1,TPS3,JUN,PARP3,PARP4,TERF2,TINF2和CDKN2A;
(h)PARP1,PARP2,TERT,TEP1和TP53;
(i)TERF2,POT1,TERT和TPP1;
(j)PAPR1,PARP2,PARP3和PARP4;
(k)PARP2,CYP19A1,TEP1,BCL2,HSPA1A,ACE,TP53和NFKB1;
(l)IGF1,IGF2,PPARG,IL10,APOE,TERT,TNF,HLA-DRA,DDC,CCL4L1,NOS2A和GH1;
(m)PARP1,IL6,SIRTT1,KRAS和HSPA1L;
(n)IGF1,IL6,PPARG,IL10,TERT,TNF,TEP1,HSPA1A,SIRT1,TP53,GH1,NOS2A和PPC;
(o)本文描述的另一列基因;或
(p)(a)至(o)中的两个或多个的组合。
10.权利要求1的方法,其中调节所述寿命包括调节至少一种所述端粒长度维持基因的活性或水平。
11.权利要求10的方法,其中调节寿命包括增加至少一种端粒长度维持基因的水平或活性。
12.权利要求10的方法,其中调节寿命包括降低至少一种端粒长度维持基因的水平或活性。
13.权利要求10-12任一项的方法,其中所述端粒长度维持基因是PARP1。
14.权利要求1的方法,其中所述调节寿命包括调节端粒酶的活性或水平。
15.权利要求14的方法,其中调节寿命包括增加端粒酶的水平或活性。
16.权利要求14的方法,其中调节寿命包括降低端粒酶的水平或活性。
17.权利要求1的方法,包括差异地调节一种或多种端粒长度维持基因的活性,以使得延长健康细胞的寿命并且/或者缩短不健康细胞、患病细胞、损伤细胞或癌细胞的寿命。
18.权利要求1的方法,其中所述细胞是在体外。
19.权利要求1的方法,其中所述细胞是哺乳动物细胞。
20.权利要求1的方法,其中所述细胞是植物细胞。
21.权利要求1的方法,其中所述细胞是干细胞。
22.权利要求1的方法,其中所述细胞是自体细胞或同种异体细胞。
23.权利要求1的方法,其中所述细胞是胚胎或体外受精细胞。
24.权利要求1的方法,其中所述细胞是真核细胞。
25.权利要求1的方法,其中所述细胞是原核细胞。
26.权利要求1的方法,其中所述细胞选自角化细胞、成纤维细胞、黑素细胞、内皮细胞、朗格汉斯细胞、梅克尔细胞、脂肪细胞、神经细胞、毛发、汗液、油、干细胞和/或肌肉细胞。
27.一种用于调节对细胞、组织、器官或生物体的应激的反应或抗性的方法,包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2的一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。
28.权利要求27的方法,其中调节包括调节以下基因的水平和/或活性:
(a)作为阵列2的一部分所列出的基因的10个或更多基因;
(b)作为阵列1的一部分所列出的基因;
(c)VEGFA,HMOX1,CCL4L1,DDC,NOS2A,SIRT1,TERT,PTGS2,或IFI44;
(d)TERT,TERC,NRF2,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,TNKS 2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL和KU70中的四个或多个;
(e)BCL2,SOD1,TP53和SOD2;
(f)BCL2,SOD1,TP53,SOD2,BCL2L1,TIMM22,TOMM40,IMMP1L,CDKN2A,GADPH,ACTB,HRP1和HGDC;
(g)PARP1,PARP2,TERT,TEP1,TPS3,JUN,PARP3,PARP4,TERF2,TINF2和CDKN2A;
(h)PARP1,PARP2,TERT,TEP1和TP53;
(i)TERF2,POT1,TERT和TPP1;
(j)PAPR1,PARP2,PARP3和PARP4;
(k)PARP2,CYP19A1,TEP1,BCL2,HSPA1A,ACE,TP53和NFKB1;
(l)IGF1,IGF2,PPARG,IL10,APOE,TERT,TNF,HLA-DRA,DDC,CCL4L1,NOS2A和GH1;
(m)PARP1,IL6,SIRTT1,KRAS和HSPA1L;
(n)IGF1,IL6,PPARG,IL10,TERT,TNF,TEP1,HSPA1A,SIRT1,TP53,GH1,NOS2A和PPC;
(o)本文描述的另一列基因;或
(p)(a)至(o)中的两个或多个的组合。
29.权利要求27的方法,其中调节包括增加至少一个所列基因的活性水平。
30.权利要求27的方法,其中调节包括降低至少一个所列基因的活性水平。
31.一种通过使细胞与至少一种寿命调节剂接触来提高或降低所述细胞中线粒体的细胞呼吸和/或能力和/或生物发生的方法,所述寿命调节剂选自:
艾地苯醌或者其类似物或衍生物;
可可提取物;
咖啡果提取物;
奎尼酸或者其类似物或衍生物;
阿魏酸或者其类似物或衍生物;
原花色素、花色素、原花青素或花青素;
绿原酸或者其类似物或衍生物;
茶提取物;或
白藜芦醇或者衍生自白藜芦醇或与白藜芦醇在化学上相关的组合物。
32.权利要求31的方法,其中所述咖啡果提取物包含绿原酸、奎尼酸、阿魏酸、咖啡酸或原花色素的一种或多种。
33.权利要求31的方法,其中所述茶提取物包含一种或多种多酚,所述多酚选自EGCG(表没食子儿茶素-3-没食子酸酯)、EGC(表没食子儿茶素)、ECG(表儿茶素-3-没食子酸酯)、EC(表儿茶素)、GCG(没食子儿茶素没食子酸酯)、GC(没食子儿茶素)、C(儿茶素)和CG(儿茶素没食子酸酯)。
34.权利要求31的方法,其中衍生自白藜芦醇或者与白藜芦醇在化学上相关的组合物选自葡萄抗毒素、gnetin H和牡丹醇B。
35.权利要求31的方法,其中所述可可提取物包含选自以下的多酚和/或原花青素:(+)儿茶素、(-)表儿茶素、原花青素低聚体2至18、原花青素B-5、原花青素B-2、原花青素A-2和/或原花青素C-1。
36.权利要求31的方法,其中所述方法包括,通过调节线粒体的生物发生或呼吸效率、加长端粒和/或调节影响上述因素的至少一个基因来延长细胞的寿命。
37.权利要求31的方法,包括通过调节PGC1α、SIRT1、SIRT3、SIRT4、SIRT5、NRF1和/或Tfam中的至少一种来增加或减少线粒体的增殖或生物发生。
38.权利要求1至37任一项的方法,还包括在至少一个细胞中诱导线粒体再生或新线粒体的生物合成。
39.一种用于调节、防止、推迟或逆转急性细胞死亡或凋亡或者延长细胞、组织、器官或生物体的存活的方法,所述方法包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2的一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。
40.权利要求39的方法,其中调节急性细胞死亡或凋亡包括增加或上调急性细胞死亡或凋亡。
41.一种用于调节、增强、维持皮肤和/或相关组织的功能或产生更年轻的皮肤和/或相关组织的方法,包括调节选自数据表7所列基因和作为阵列2的一部分所列基因的至少一个基因的水平和/或活性。
42.权利要求1至41任一项的方法,其中调节至少一个基因的活性水平包括将细胞与反义或siRNA分子接触。
43.一种影响寿命的核酸分子的集合,所述集合包括选自数据表7或阵列2所列核酸分子,或数据表7或阵列2所列核酸分子的片段的多个核酸分子。
44.权利要求43的集合,其中所述集合的核酸分子固定在阵列中的固体表面上。
45.权利要求43的集合,其中所述集合的核酸分子固定在微阵列中的固体表面上。
46.权利要求45的微阵列集合,包含具有至少如下的序列的核酸分子:
(a)作为阵列1的一部分列出的基因;
(b)作为阵列2的一部分列出的基因;
(c)VEGFA,HMOX1,CCL4L1,DDC,NOS2A,SIRT1,TERT,PTGS2,或IFI44;
(d)TERT,TERC,NRF2,POT1,TRF1,TRF2,TIN2,TPP1,RAP1,TNKS,TNKS 2,TERF2,TERF2IP,POLG,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PARP2,PPARG,SHC1,PTOP,IFI44,NFKB1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,MTND5,HPGD,IDH2,MDH1,MDH2,ME1,ME2,ME3,MTHD1,MTHFD1L,MTHFR,NADK,NADSYN1,NDUFA2,NDUFA3,NDUFA4,NDUFA4L2,NDUFA5,NDUFA6,NDUFA7,NDUFA9,NDUFA10,NDUFA12,NDUFB2,NDUFB3,NDUFB5,NDUFB6,NDUFB7,NDUFB8,NDUFB9,NDUFC2,NDUFS2,NDUFS4,NDUFS5,NDUFS7,NDUFS8,NDUFV2,NDUFV3,NOX1,NOX3,NOX4,NOX5,NOXA1,NOXO1,NQO1,FOXO1,FOXO3,FOXO4,LMNA,NHP2L1,RAD50,RAD51,KL和KU70中的四个或多个;
(e)BCL2,SOD1,TP53和SOD2;
(f)BCL2,SOD1,TP53,SOD2,BCL2L1,TIMM22,TOMM40,IMMP1L,CDKN2A,GADPH,ACTB,HRP1和HGDC;
(g)PARP1,PARP2,TERT,TEP1,TPS3,JUN,PARP3,PARP4,TERF2,TINF2和CDKN2A;
(h)PARP1,PARP2,TERT,TEP1和TP53;
(i)TERF2,POT1,TERT和TPP1;
(j)PAPR1,PARP2,PARP3和PARP4;
(k)PARP2,CYP19A1,TEP1,BCL2,HSPA1A,ACE,TP53和NFKB1;
(l)IGF1,IGF2,PPARG,IL10,APOE,TERT,TNF,HLA-DRA,DDC,CCL4L1,NOS2A和GH1;
(m)PARP1,IL6,SIRTT1,KRAS和HSPA1L;
(n)IGF1,IL6,PPARG,IL10,TERT,TNF,TEP1,HSPA1A,SIRT1,TP53,GH1,NOS2A和PPC;
(o)本文描述的另一列基因;或
(p)(a)至(o)中的两个或多个的组合。
47.权利要求43的集合,其中每种核酸保存在不同的容器中。
48.权利要求47的集合,其中所述分离的容器是微量滴定板或其等同物的孔。
49.一种筛选可用于调节寿命的化合物的方法,包括:
将测试化合物与表达影响寿命的蛋白质的宿主细胞接触,所述蛋白质由数据表7所列或作为阵列2一部分所列的分离的核酸分子所编码,并且
检测所述核苷酸序列表达的变化或编码蛋白质活性的变化,其中这样的变化表明所述测试化合物可用于调节寿命。
50.权利要求49的方法,是一种高通量方法,包括:
平行地将测试化合物与宿主细胞的集合接触,所述宿主细胞每种均表达影响寿命的不同蛋白质,所述蛋白质由数据表7所列或作为阵列2一部分所列的分离的核酸分子编码;并且
检测至少一种所述核苷酸序列表达的变化或至少一种所述编码的蛋白质活性的变化,其中这样的变化表明所述测试化合物可用于调节寿命。
51.权利要求50的方法,其中所述宿主细胞的集合为阵列的形式。
52.一种用于鉴定具有逆转或抑制线粒体损伤的潜力的试剂的方法,包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:ACTB,BCL2,BCL2L1,CDKN2A,COX10,COX18,CPT1B,CPT2,DNAJC19,EGF,EGR2,FIS1,GAPDH,GRPEL1,HSP90AA1,LRPPRC,MFN1,MFN2,NOS3,OPA1,PARP3,PARP4,PPARGC1A,SIRT2,SIRT4,SLC25A1,SLC25A1,SLC24A2,SLC25A3,SLC25A4,SCL25A5,SLC25A10,SLC25A12,SLC25A13,SLC25A14,SLC25A15,SLC25A16,SLC25A17,SLC25A19,SLC25A2,SLC25A20,SLC25A21,SLC25A22,SLC25A23,SLC25A24,SLC25A25,SLC25A27,SLC25A3,SLC25A30,SLC25A31,SLC25A37,SLC25A4,SLC25A5,TIMM10,TIMM17A,TIMM17B,TIMM22,TIMM23,TIMM44,TIMM50,TIMM8A,TIMM8B,TIMM9,TOMM20,TOMM22,TOMM34,TOMM40,TOMM40L,TOMM70A,UCP1,UCP2,UCP3,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平升高或由所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于线粒体健康或维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤的潜力。
53.一种用于鉴定具有逆转或抑制线粒体损伤的潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AIFM2,AIP,BAK1,BBC3,BID,BNIP3,CLK1,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,IMMP1L,IMMP2L,MIPEP,PARP1,PARP2,PMAIP1,RPL13A,SOD1,SOD2,SFN,SH3GLB1,UXT,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平下降或由所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于线粒体健康或维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤的潜力。
54.一种用于鉴定具有增加或加速线粒体损伤的潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;
并且检测对应于以下基因的核酸分子的水平:ACTB,BCL2,BCL2L1,CDKN2A,COX10,COX18,CPT1B,CPT2,DNAJC19,EGF,EGR2,FIS1,GAPDH,GRPEL1,HSP90AA1,LRPPRC,MFN1,MFN2,NOS3,OPA1,PARP3,PARP4,PPARGC1A,SIRT2,SIRT4,SLC25A1,SLC25A1,SLC24A2,SLC25A3,SLC25A4,SCL25A5,SLC25A10,SLC25A12,SLC25A13,SLC25A14,SLC25A15,SLC25A16,SLC25A17,SLC25A19,SLC25A2,SLC25A20,SLC25A21,SLC25A22,SLC25A23,SLC25A24,SLC25A25,SLC25A27,SLC25A3,SLC25A30,SLC25A31,SLC25A37,SLC25A4,SLC25A5,TIMM10,TIMM17A,TIMM17B,TIMM22,TIMM23,TIMM44,TIMM50,TIMM8A,TIMM8B,TIMM9,TOMM20,TOMM22,TOMM34,TOMM40,TOMM40L,TOMM70A,UCP1,UCP2,UCP3,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平升高或由所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于线粒体健康或维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有增加或加速线粒体损伤的潜力。
55.一种用于鉴定具有增加或加速线粒体损伤的潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AIFM2,AIP,BAK1,BBC3,BID,BNIP3,CLKl,HSPA1A,HSPA1B,HSPA1L,IMMP1L,IMMP2L,MIPEP,PARP1,PARP2,PMAIP1,RPL13A,SOD1,SOD2,SFN,SH3GLB1,UXT,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平下降或由所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于线粒体健康或维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有增加或加速线粒体损伤的潜力。
56.权利要求52至55任一项的方法,其中所述线粒体损伤包括mtDNA耗尽或线粒体呼吸活性降低。
57.一种用于鉴定具有逆转或抑制DNA损伤或线粒体缩短潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AK3,APEX1,APEX2,ATF2,ATM,ATR,ATRX,BARD1,BLM,BRIP1,CCNH,CDK7,CDKN2A,CHEK1,CHEK2,CSF2,CTPS,DDB1,DDB2,DHFR,DMC1,ERCC1,ERCC2,ERCC3,ERCC4,ERCC5,ERCC6,ERCC8,EXO1,FANCA,FANCC,FANCF,FANCG,FEN1,GADD45A,GADD45G,GTF2H1,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4,JUN,LIG1,LIG3,LIG4,MAP2K6,MAPKAPK2,MLH1,MLH3,MRE11A,MSH2,MSH3,MSH4,MSH5,MSH6,NBN,NEIL1,NEIL2,NEIL3,NFKB1,NFKBIA,HK1,NUDT1,NUDT2,ODC1,PAPSS1,PAPSS2,PARP1,PARP3,PCNA,PMS1,PMS2,PNKP,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PRKDC,RAD1,RAD18,RAD21,RAD23A,RAD50,RAD51C,RAD51L1,RAD51L3,RAD52,RAD54B,RAD54L,RBBP8,SESN1,SLC23A2,TDG,TYMS,UBE2V2,UNG2,WRN,XAB2,XPA,XPC,XRCC1,XRCC2,XRCC3,XRCC4,XRCC5,XRCC6,ZNRD1,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平升高或由所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于DNA或端粒维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有逆转或抑制线粒体损伤或端粒缩短的潜力。
58.一种用于鉴定具有逆转或抑制DNA损伤或端粒缩短潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:B2M,BRCA1,BRCA2,BTG2,CIDEA,CIDEB,DDIT3,DKC1,GTSE1,MDM2,PCBP4,PDCD8,PINX1,PPP1R15A,RAD17,RELA,TELO2,TEP1,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平下降或由所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于DNA或端粒维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有逆转或抑制DNA损伤或端粒缩短的潜力。
59.一种用于鉴定具有加速、引起或增强DNA损伤或端粒缩短潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:AK3,APEX1,APEX2,ATF2,ATM,ATR,ATRX,BARD1,BLM,BRIP1,CCNH,CDK7,CDKN2A,CHEK1,CHEK2,CSF2,CTPS,DDB1,DDB2,DHFR,DMC1,ERCC1,ERCC2,ERCC3,ERCC4,ERCC5,ERCC6,ERCC8,EXO1,FANCA,FANCC,FANCF,FANCG,FEN1,GADD45A,GADD45G,GTF2H1,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4,JUN,LIG1,LIG3,LIG4,MAP2K6,MAPKAPK2,MLH1,MLH3,MRE11A,MSH2,MSH3,MSH4,MSH5,MSH6,NBN,NEIL1,NEIL2,NEIL3,NFKB1,NFKBIA,HK1,NUDT1,NUDT2,ODC1,PAPSS1,PAPSS2,PARP1,PARP3,PCNA,PMS1,PMS2,PNKP,POLB,POLD3,POLE,POLI,POLL,PRKDC,RAD1,RAD18,RAD21,RAD23A,RAD50,RAD51C,RAD51L1,RAD51L3,RAD52,RAD54B,RAD54L,RBBP8,SESN1,SLC23A2,TDG,TYMS,UBE2V2,UNG2,WRN,XAB2,XPA,XPC,XRCC1,XRCC2,XRCC3,XRCC4,XRCC5,XRCC6,ZNRD1,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平升高或由所述基因编码的蛋白质水平或活性升高时有利于DNA或端粒维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的下降表明所述试剂具有加速、引起或增强DNA损伤或端粒缩短的潜力。
60.一种用于鉴定具有加速、引起或增强DNA损伤或端粒缩短潜力的试剂的方法,所述方法包括:
使细胞与试剂接触;并且
检测对应于以下基因的核酸分子的水平:B2M,BRCA1,BRCA2,BTG2,CIDEA,CIDEB,DDIT3,DKC1,GTSE1,MDM2,PCBP4,PDCD8,PINX1,PPP1R15A,RAD17,RELA,TELO2,TEP1,或者本文指出的其他基因,所述其他基因即在所述试剂存在或不存在的情况下当所述基因水平下降或由所述基因编码的蛋白质水平或活性下降时有利于DNA或端粒维持,其中与所述试剂不存在的情况相比,在所述试剂存在的情况下所述水平或活性的升高表明所述试剂具有加速、引起或增强DNA损伤或端粒缩短的潜力。
61.一种在细胞中诱导TERT、POT1、TPP1和TERF2的表达的方法,所述方法是通过向所述细胞或含有所述细胞的生物体施用含有约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物。
62.权利要求61的方法,其中所述组合物含有不超过约0.01%(以重量计)的咖啡果提取物。
63.权利要求61或62的方法,其中所述组合物还包含绿茶提取物、绿茶提取物的组分或艾地苯醌。
64.权利要求63的方法,其中所述组合物还包含一种或多种约0.001%(以重量计)的绿茶提取物或约0.00004%(以重量计)的艾地苯醌。
65.权利要求61-64任一项的方法,其中与未给予所述化合物的同样细胞相比,给予了所述组合物的细胞中端粒保持得更长或者保持于更好的状态。
66.一种在细胞中诱导PARP1、BCL2和p53表达的方法,所述方法通过向所述细胞或含有所述细胞的生物体施用包含约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物。
67.权利要求66的方法,其中所述组合物包含不超过约0.000005%(以重量计)的绿原酸。
68.权利要求66或67的方法,其中与未施用所述组合物的同样细胞相比,所述细胞的凋亡受到抑制。
69.一种在细胞中诱导NOS2A、NOS1和NOS3的表达的方法,所述方法是通过向所述细胞或含有所述细胞的生物体施用包含约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物。
70.权利要求69的方法,其中所述组合物包含不超过约0.01%的咖啡果提取物。
71.一种在细胞中诱导CCL4L1表达的方法,所述方法是通过向细胞或含有所述细胞的生物体施用包含约0.000001%至约10%(以重量计)的咖啡果提取物的组合物。
72.权利要求71的方法,其中所述组合物包含不超过约0.01%(以重量计)的咖啡果提取物。
73.权利要求71或72的方法,其中与未施用所述组合物的细胞相比,所述细胞对微生物感染的抗性更强。
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