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CN109837332A - 一种酵母菌菌落快速pcr扩增试剂盒及利用此试剂盒pcr扩增酵母菌菌落的方法 - Google Patents

一种酵母菌菌落快速pcr扩增试剂盒及利用此试剂盒pcr扩增酵母菌菌落的方法 Download PDF

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CN109837332A
CN109837332A CN201910126305.XA CN201910126305A CN109837332A CN 109837332 A CN109837332 A CN 109837332A CN 201910126305 A CN201910126305 A CN 201910126305A CN 109837332 A CN109837332 A CN 109837332A
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CN
China
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pcr amplification
bacterium colony
pcr
kit
saccharomycete
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Application number
CN201910126305.XA
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English (en)
Inventor
周辉
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Guangzhou Rui Rui Biological Technology Co Ltd
Original Assignee
Guangzhou Rui Rui Biological Technology Co Ltd
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Application filed by Guangzhou Rui Rui Biological Technology Co Ltd filed Critical Guangzhou Rui Rui Biological Technology Co Ltd
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Abstract

本发明公开了一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒及利用此试剂盒PCR扩增酵母菌菌落的方法。所示试剂盒包括:10×细胞裂解液、10×PCR反应液、dNTP、热启动Taq酶。与目前现有技术相比,该试剂盒无需经过加热煮沸,酚/氯仿抽提提取基因组等步骤,减少有毒物质的对实验人员的毒害;本发明操作快速、简便,节省了大量的时间;本发明直接裂解单克隆菌落,降低交叉污染,无假阳性;通过使用高PH的细胞壁裂解液,可以在短时间内对酵母菌细胞壁进行有效的裂解,充分释放酵母基因组,释放后的上清液与配套的PCR反应液混合后其PH值在PCR扩增的适宜范围内,可实现PCR快速扩增。

Description

一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒及利用此试剂盒PCR扩增 酵母菌菌落的方法
技术领域
本发明属于生物工程技术领域,具体涉及一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒及利用此试剂盒PCR扩增酵母菌菌落的方法。
背景技术
酵母菌是一种真菌微生物,其在自然界中分布广泛,属于典型的兼性厌氧微生物,可以将糖发酵成酒精和二氧化塘,广泛应用于食品领域,其次作为一种重要的工程菌,其在分子领域应用广泛,例如分子克隆领域作为真核生物受体细胞。在酵母分子克隆中,在对酵母菌进行外源基因的转化后需要进行PCR 以验证外源基因是否成功转化。传统的细菌进行菌落PCR时,可以直接挑取细菌的单菌落或者菌液进行,但是酵母菌不同于细菌,其细胞壁破壁困难,处理不当基因组释放不充分就会造成PCR扩增失败。
在对酵母菌基因进行PCR扩增时,传统的方法是对酵母菌总基因组进行提取之后再进行PCR扩增,这种方法可以获取纯度相对较高的基因组进行PCR扩增且扩增效果理想,但是针对酵母菌的转化率,研究人员可能需要对较多的菌落进行筛选鉴定,提取基因组不仅会耗费大量的时间,增加实验成本,且在基因组提取的过程中,由于样本较多,操作稍微不慎就会造成样本间的交叉污染,给后续实验带来困扰。
目前,酵母菌落PCR技术应用较为广泛,其免去了提取基因组的繁琐步骤,主要是预先对酵母菌进行细胞壁的处理,包括反复冻融破壁法,酶消化处理法,高温蒸煮法,延伸PCR预变性时间等,这些方法处理后的酵母菌虽可以有效的进行PCR扩增,但是预处理的时间也相对较长,操作繁琐,稳定性与扩增也有待进一步的提升。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明提供了一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒及利用此试剂盒PCR扩增酵母菌菌落的方法。开发出一种可以快速进行酵母菌菌落PCR扩增,且操作简单,结果稳定性好的方法。
本发明采取的技术方案为:
一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒,所述试剂盒包括:10×细胞裂解液、 10×PCR反应液、dNTP、热启动Taq酶。
所述10×细胞裂解液成分为:1L 10×细胞裂解液中含有:10-50mM KOH, 0.5-2.5%(w/v)的十二烷基硫酸钠,20-60%聚乙二醇200(v/v)
进一步地,所述10X细胞裂解液成分优选为:1L 10×细胞裂解液中含有: 20mM的KOH,1.5%(w/v)十二烷基硫酸钠60%聚乙二醇200(v/v)。
所述10×PCR反应液成分为:1L 10×PCR反应液中含有::100mM Tris-HCl, 500mMKCl,15mM MgCl2,0.01%(w/v)明胶,0.1%(v/v)聚乙二醇辛基苯基醚;所述10X PCR反应液的pH为8.3。
本发明还提供了利用所述的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒PCR扩增酵母菌菌落的方法,所述方法包括以下步骤:
(1)取酵母菌单菌落培养液;
(2)裂解酵母菌细胞;
(3)酵母菌基因组DNA进行PCR扩增;
(4)PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳,观测扩增结果。
进一步地,所述步骤(3)中,PCR扩增反应体系为:10×PCR反应液2.5 μL,2.5mMdNTP 2.5μL,10μmol上下游引物1μL,2.5μL上清液,1μL 热启动Taq酶,使用双蒸水补至25μL。
进一步地,所述步骤(3)中,PCR反应条件为:
所述步骤(4)中具体包括:配制1%琼脂糖凝胶,将PCR扩增液加至加样孔内,接通电泳仪电源,电泳参数:70V,30min,然后在紫外显影仪上观测扩增结果。
与目前现有技术相比,该试剂盒在使用过程中无需经过加热煮沸,酚/氯仿抽提等抽提基因组的步骤,减少有毒物质对实验人员的毒害;本发明操作快速、简便,节省了大量的时间;本发明直接裂解单克隆菌落,降低交叉污染,无假阳性;通过使用高PH的细胞壁裂解液,可以在短时间内对酵母菌细胞壁进行有效的裂解,充分释放酵母基因组,释放后的上清液与配套的PCR反应液混合后其 PH值在PCR扩增的适宜范围内,可实现PCR快速扩增。具体如下:
(1)操作快速、简便,节省了大量的时间,易推广使用。
(2)无需经过加热煮沸,酚/氯仿抽提等基因组提取步骤,减少有毒物质的对实验人员的毒害,提取液的上清液可以直接用作PCR反应的模板,简单快速的制备大批量PCR检测的模板,只需要微量的样本;
(3)直接裂解单克隆菌落,降低交叉污染,无假阳性;
(4)通过使用高PH的细胞壁裂解液,可以在短时间内对酵母菌细胞壁进行有效的裂解,充分释放酵母基因组,释放后的上清液与配套的PCR反应液混合后其PH值在PCR扩增的适宜范围内,可实现PCR快速扩增。
附图说明
图1为实施例2中毕赤酵母GS115菌落GAP基因的PCR扩增结果;
图2为实施例3中毕赤酵母GS115外源pYES2-GFP载体PCR扩增结果。
图3为本发明与经加热煮沸处理基因组后进行常规PCR的扩增结果对比
具体实施方式
实施例1
一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒,包括:10×裂解液、10×PCR反应液、 dNTP、热启动Taq酶;
每升10×裂解液中含有的成分为:20mM的KOH,1.5%(w/v)的十二烷基硫酸钠,60%(v/v)的聚乙二醇;
每升10×PCR反应液中含有的成分为:100mM Tris-HCl,500mM KCl,15 mM MgCl2,0.01%(w/v)明胶,0.1%(v/v)聚乙二醇辛基苯基醚,25℃时pH 8.3。
实施例2
利用实施例1中的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒PCR扩增毕赤酵母 GS115菌落GAP基因的方法,包括以下步骤:
(1)取毕赤酵母GS115单克隆菌落培养后的新鲜菌液500ul,13000转离心 20s,弃上清,向离心管中加入200μL细胞裂解液,使用微型涡旋仪涡旋15s使菌体与裂解液充分混匀后,室温静置3min,4℃、13000转离心30s,上清备用。
(2)制备PCR反应体系包含:10×PCR反应液2.5μL,2.5mM dNTP,2.5 μL,10umol上下游引物1μL,2.5μL裂解上清液,1μL热启动Taq酶,使用双蒸水补至25μL;
所述上游引物序列为:TTCAAGCAGCGTCACTCCTC;
所述下游引物TGTTCTGATTGCGCTTGCAC,PCR扩增产物片段大小为 740bp。
所述的PCR反应条件:
(3)PCR反应结束后,使用1%的琼脂糖凝胶进行电泳检测,检测结果如图1所示,扩增稳定,产物条带清晰,扩增效果理想。
实施例3
利用实施例1中的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒PCR扩增毕赤酵母 GS115菌落外源pYES2-GFP载体的方法,包括以下步骤:
(1)取毕赤酵母GS115单克隆菌落培养后的新鲜菌液500ul,13000转离心20s,弃上清,向离心管中加入200μL细胞裂解液,涡旋15s使菌体与裂解液充分混匀后,室温静置3min,4℃、13000转离心30s,上清备用。
(2)制备PCR反应体系包含:10×PCR反应液2.5μL,2.5mM的dNTP 2.5 μL,10umol的上下游引物1μL,2.5μL裂解上清液,1μL的热启动Taq酶,使用双蒸水补至25μL;
本实施例所扩增的片段使用pYES2-GFP通用测序引物,上游引物序列为:TAATACGACTCACTATAGGG;下游引物GTGACATAACTAATTACATGATG, PCR扩增产物片段大小为700bp;
所述的PCR反应条件:
(3)PCR反应结束后,使用1%的琼脂糖凝胶进行电泳检测,检测结果如图2所示,扩增稳定,产物条带清晰,扩增效果理想。
实施例4
利用实施例1中的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒PCR扩增毕赤酵母 GS115菌落GAP基因,所述方法与实施例1中方法相同。同时使用煮沸的方法处理酵母基因组,使用常规PCR扩增试剂盒进行扩增,具体方法如下:
(1)取毕赤酵母GS115单克隆菌落培养后的新鲜菌液500ul,13000转离心20s,弃上清,使用灭菌水洗涤一次,13000转离心20s,沉淀悬浮于200ul 的TE(10mmol的Tris-hcl,0.5mmol的EDTA)缓冲液中,在沸水中煮10min,冰浴10min,13000转离心5min,将上清液转移至新的1.5ml离心管中备用。
(2)制备PCR反应体系包含:10×常规PCR反应液2.5μL,2.5mM的 dNTP,2.5μL,10umol的上下游引物1μL,2.5μL步骤1中上清液,1μL 的Taq酶,使用双蒸水补至25μL。
所述上游引物序列为:TTCAAGCAGCGTCACTCCTC;
所述下游引物TGTTCTGATTGCGCTTGCAC,PCR扩增产物片段大小为 740bp。
所述的PCR反应条件:
(3)PCR反应结束后,使用1%的琼脂糖凝胶进行电泳检测,检测结果如图3所示,本发明扩增结果稳定,产物条带清晰,扩增效果理想,而使用常规的PCR扩增试剂盒扩增结果不稳定,条带也较暗,且较为耗费时间。
上述参照实施例对一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒及利用此试剂盒 PCR扩增酵母菌菌落的方法进行的详细描述,是说明性的而不是限定性的,可按照所限定范围列举出若干个实施例,因此在不脱离本发明总体构思下的变化和修改,应属本发明的保护范围之内。

Claims (8)

1.一种酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:10×细胞裂解液、10×PCR反应液、dNTP、热启动Taq酶。
2.根据权利要求1所述的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒,其特征在于,所述10×细胞裂解液成分为:1L 10×细胞裂解液中含有:10-50mM KOH,0.5-2.5%的十二烷基硫酸钠,20-60%聚乙二醇200。
3.根据权利要求1或2所述的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒,其特征在于,所述10×细胞裂解液成分优选为:1L 10×细胞裂解液中含有:20mM的KOH,1.5%十二烷基硫酸钠,60%聚乙二醇200。
4.根据权利要求1或2所述的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒,其特征在于,所述10×PCR反应液成分为:1L 10×PCR反应液中含有:100mM Tris-HCl,500mM KCl,15mM MgCl2,0.01%明胶,0.1%聚乙二醇辛基苯基醚;所述10×PCR反应液的pH为8.3。
5.利用权利要求1-4任意一项所述的酵母菌菌落快速PCR扩增试剂盒PCR扩增酵母菌菌落的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
(1)取酵母菌单菌落培养液;
(2)裂解酵母菌细胞;
(3)酵母菌基因组DNA进行PCR扩增;
(4)PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳,观测扩增结果。
6.根据权利要求5所述的PCR扩增酵母菌菌落的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,PCR扩增反应体系为:10×PCR反应液2.5μL,2.5mM dNTP 2.5μL,10μmol上下游引物1μL,2.5μL上清液,1μL热启动Taq酶,使用双蒸水补至25μL。
7.根据权利要求5所述的PCR扩增酵母菌菌落的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,PCR反应条件为:
8.根据权利要求5所述的PCR扩增酵母菌菌落的方法,其特征在于,所述步骤(4)中具体包括:配制1%琼脂糖凝胶,将PCR扩增液加至加样孔内,接通电泳仪电源,电泳参数:70V,30min,然后在紫外显影仪上观测扩增结果。
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