Χημικές οντότητες βιολογικού ενδιαφέροντος
| Περιεχόμενο | |
|---|---|
| Περιγραφή | Χημική βάση δεδομένων |
| Αντικείμενο | Χημικές οντότητες βιολογικού ενδιαφέροντος |
| Επαφή | |
| Ερευνητικό κέντρο | Ευρωπαϊκό εργαστήριο μοριακής βιολογίας |
| Εργαστήριο |  Ευρωπαϊκό ινστιτούτο βιοπληροφορικής |
| Πρώτη αναφορά | [1] |
| Πρόσβαση | |
| Ιστοσελίδα | ChEBI |
| URL λήψης | Downloads |
| URL υπηρεσίας ιστού | Web Service |
| Τελικό σημείο Sparql | BIO2RDF |
| Εργαλεία | |
| Διαδικτυακή εφαρμογή | ChEBI Website |
| Διάφορα | |
| Συχνότητα έκδοσης δεδομένων | μηνιαία |
| Πολιτική επιμέλειας | χειροκίνητη |
Οι Χημικές οντότητες βιολογικού ενδιαφέροντος (Chemical Entities of Biological Interest), γνωστές επίσης ως ChEBI,[1][2] είναι μια βάση δεδομένων και οντολογίας των μοριακών οντοτήτων (molecular entities) εστιασμένη σε 'μικρές' χημικές ενώσεις, που είναι μέρος της προσπάθειας των ανοικτών βιοϊατρικών οντολογιών ([Open Biomedical Ontologies). Ο όρος "μοριακή οντότητα (molecular entity)" αναφέρεται σε οποιοδήποτε "δομικά ή ισοτοπικά διακριτό άτομο, μόριο, ιόν, ζεύγος ιόντων (ion pair), χημική ρίζα, ριζικό ιόν (radical ion), σύμπλοκο (complex), διαμορφομερές (conformer), κλπ., που αναγνωρίζεται ως μια ξεχωριστή αναγνωρίσιμη οντότητα".[3] Οι εξεταζόμενες μοριακές οντότητες είναι είτε φυσικά, είτε συνθετικά προϊόντα, που έχουν ενδεχόμενη βιολογική δράση. Μόρια που κωδικοποιούνται άμεσα από το γονιδίωμα, όπως τα νουκλεϊκά οξέα, οι πρωτεΐνες και τα πεπτίδια που παράγονται από πρωτεΐνες με πρωτεολυτική διάσπαση (proteolytic cleavage), δεν περιλαμβάνονται -κατά κανόνα-στο ChEBI.
Το ChEBI χρησιμοποιεί την ονοματολογία, συμβολισμό και ορολογία της IUPAC και της επιτροπής ονοματολογίας της Διεθνούς Ένωσης Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας (NC-IUBMB).
Σκοπός και πρόσβαση
[Επεξεργασία | επεξεργασία κώδικα]Όλα τα δεδομένα της βάσης δεδομένων είναι μη ιδιοταγή ή παράγονται από μη ιδιοταγή πηγή. Είναι συνεπώς ελεύθερα προσπελάσιμα και διαθέσιμα στον καθέναν. Επιπλέον, κάθε στοιχείο δεδομένου είναι πλήρως ανιχνεύσιμο και αναφέρεται ρητά στην αρχική πηγή.
Τα δεδομένα ChEBI είναι διαθέσιμα μέσω μιας δημόσιας διεπαφής ιστού, υπηρεσίας ιστού και μεταφορτώσεων.
Παραπομπές
[Επεξεργασία | επεξεργασία κώδικα]- ↑ 1,0 1,1 De Matos, P.; Alcantara, R.; Dekker, A.; Ennis, M.; Hastings, J.; Haug, K.; Spiteri, I.; Turner, S. και άλλοι. (2009). «Chemical Entities of Biological Interest: An update». Nucleic Acids Research 38 (Database issue): D249–54. doi:. PMID 19854951.
- ↑ Degtyarenko, K.; De Matos, P.; Ennis, M.; Hastings, J.; Zbinden, M.; McNaught, A.; Alcantara, R.; Darsow, M. και άλλοι. (2007). «ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest». Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D344–50. doi:. PMID 17932057.
- ↑ IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). Online corrected version: (2006–) "molecular entity".
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
[Επεξεργασία | επεξεργασία κώδικα]
 |
Αυτό το λήμμα σχετικά με χημεία χρειάζεται επέκταση. Μπορείτε να βοηθήσετε την Βικιπαίδεια επεκτείνοντάς το. |