商业合同纠纷遵循《民法典》所规定的3年诉讼时效规则。由于诉讼时效是法定制度，不能由当事人自行约定变更或排除适用，因此人民法院对于任何试图通过协议方式延长、缩短或提前放弃诉讼时效权益的行为均予否认和禁止。具体而言，《民法典》第一百八十八条明确，向人民法院主张民事权利的诉讼时效为3年。在特定情形下，此期限可依法延长或缩短。超过法定期限的（如自权利受损日起20年后），人民法院将不再予以保护。
法律依据
《民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。