检测查重发表都可以的哦。
申请书是不会查的，因为这个东西是不会进入到对比库中。但如果别人的申请书也引用了很多已有的文献，那就有可能查出来是重复的。所以，建议您写好以后，还是先用检测工具自己检测一下。在文天下论文检测网有各种检测工具可供选择的。
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