以影响因子为参考依据。目前SCI期刊的分区主要有中科院JCR分区表以及汤森路透JCR分区两种，两种分区的划分都主要以影响因子为参考依据，只不过标准有所不同而已。已经发表的SCI论文，可以在SCI数据库中检索到文献记录之后，在摘要信息显示页面点击查看期刊影响信息可以显示期刊的最新影响因子、5年平均影响因子、以及期刊分区信息，可以确定发表的SCI论文在哪个区的。由于不同学科之间的SCI期刊很难进行比较和评价，中国科学院国家科学图书馆世界科学前沿分析中心(原中国科学院文献情报中心)，对目前SCI核心库加上扩展库期刊的影响力等因素，以年度和学科为单位，对SCI期刊进行4个等级的划分。一般而言，发表在1区和2区的SCI论文，通常被认为是该学科领域的比较重要的成果。